View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5470_low_6 (Length: 335)

Name: NF5470_low_6
Description: NF5470
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5470_low_6
NF5470_low_6
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (1-335)||(6274-6608)
scaffold0310 (22-335)||(1-314)
[»] chr7 (47 HSPs)
chr7 (1-335)||(7283926-7284260)
chr7 (31-318)||(3895089-3895376)
chr7 (31-335)||(15822327-15822631)
chr7 (31-335)||(11287464-11287768)
chr7 (31-335)||(45452063-45452366)
chr7 (31-318)||(44865294-44865582)
chr7 (31-335)||(12369735-12370040)
chr7 (31-318)||(143703-143991)
chr7 (31-308)||(35094890-35095166)
chr7 (31-335)||(39046523-39046823)
chr7 (31-335)||(12759034-12759340)
chr7 (31-335)||(26070161-26070464)
chr7 (31-335)||(26093948-26094251)
chr7 (27-335)||(47289828-47290138)
chr7 (31-318)||(13862828-13863113)
chr7 (32-318)||(16569902-16570189)
chr7 (32-318)||(16595473-16595760)
chr7 (31-335)||(12248015-12248321)
chr7 (31-335)||(49047569-49047874)
chr7 (20-335)||(13377576-13377894)
chr7 (20-335)||(17223819-17224138)
chr7 (31-335)||(13274834-13275129)
chr7 (72-331)||(16914866-16915124)
chr7 (27-318)||(9838943-9839236)
chr7 (27-318)||(48356708-48357001)
chr7 (27-318)||(9611371-9611665)
chr7 (248-318)||(3049647-3049717)
chr7 (248-318)||(42056410-42056480)
chr7 (248-317)||(2028986-2029055)
chr7 (248-316)||(2190307-2190375)
chr7 (20-245)||(14271782-14272009)
chr7 (248-318)||(111390-111460)
chr7 (248-318)||(126479-126549)
chr7 (31-327)||(31501228-31501526)
chr7 (2-62)||(126739-126799)
chr7 (248-318)||(32494167-32494237)
chr7 (1-62)||(111139-111200)
chr7 (1-62)||(32493916-32493977)
chr7 (183-318)||(16919623-16919758)
chr7 (133-292)||(28722200-28722359)
chr7 (1-62)||(1936887-1936948)
chr7 (1-62)||(3060272-3060333)
chr7 (31-245)||(34241101-34241317)
chr7 (133-225)||(14935517-14935609)
chr7 (133-225)||(15363110-15363202)
chr7 (31-104)||(25124407-25124482)
chr7 (248-292)||(1937133-1937177)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (1-335)||(1428-1762)
[»] chr3 (80 HSPs)
chr3 (31-335)||(12349434-12349739)
chr3 (31-335)||(50111946-50112251)
chr3 (31-335)||(8631837-8632142)
chr3 (31-318)||(54424076-54424364)
chr3 (31-335)||(317405-317708)
chr3 (31-318)||(13817576-13817862)
chr3 (31-335)||(16995956-16996259)
chr3 (31-315)||(17100720-17101004)
chr3 (31-315)||(17101405-17101689)
chr3 (31-335)||(19570586-19570888)
chr3 (31-318)||(16181842-16182128)
chr3 (31-335)||(14298468-14298773)
chr3 (31-335)||(14304095-14304400)
chr3 (31-335)||(22144167-22144472)
chr3 (31-335)||(6154226-6154531)
chr3 (31-335)||(35123743-35124047)
chr3 (31-335)||(17938621-17938925)
chr3 (31-305)||(34439237-34439513)
chr3 (31-318)||(14295502-14295790)
chr3 (31-318)||(14301129-14301417)
chr3 (26-318)||(17522780-17523072)
chr3 (90-318)||(55440803-55441032)
chr3 (31-270)||(38527841-38528079)
chr3 (31-335)||(3578136-3578440)
chr3 (130-335)||(53898450-53898655)
chr3 (135-318)||(19260839-19261022)
chr3 (31-318)||(11060902-11061189)
chr3 (153-335)||(6146764-6146946)
chr3 (31-335)||(11328859-11329161)
chr3 (31-335)||(17139555-17139861)
chr3 (31-315)||(16880190-16880477)
chr3 (31-335)||(12560131-12560436)
chr3 (35-335)||(14059112-14059413)
chr3 (31-135)||(6146664-6146769)
chr3 (136-335)||(12488727-12488926)
chr3 (20-316)||(17191607-17191906)
chr3 (107-280)||(11196291-11196457)
chr3 (90-314)||(39656594-39656817)
chr3 (31-165)||(14527975-14528110)
chr3 (23-318)||(3576323-3576621)
chr3 (239-335)||(12349834-12349930)
chr3 (20-245)||(17204818-17205046)
chr3 (31-318)||(30207280-30207570)
chr3 (248-318)||(3992614-3992684)
chr3 (109-335)||(15876115-15876341)
chr3 (248-318)||(2844255-2844325)
chr3 (242-335)||(14528118-14528212)
chr3 (248-318)||(16261517-16261587)
chr3 (248-318)||(53771105-53771175)
chr3 (136-245)||(47784767-47784876)
chr3 (248-318)||(30153006-30153076)
chr3 (248-318)||(38167978-38168048)
chr3 (248-318)||(54685422-54685492)
chr3 (1-62)||(7854306-7854367)
chr3 (31-318)||(14814658-14814948)
chr3 (248-318)||(23492437-23492507)
chr3 (248-318)||(33341945-33342015)
chr3 (1-62)||(3992874-3992935)
chr3 (1-62)||(15857133-15857194)
chr3 (1-62)||(19232090-19232151)
chr3 (1-62)||(54037994-54038055)
chr3 (1-62)||(55513194-55513255)
chr3 (248-318)||(7854046-7854116)
chr3 (8-62)||(17955861-17955915)
chr3 (252-318)||(17956109-17956175)
chr3 (248-318)||(45581695-45581765)
chr3 (1-62)||(2844515-2844576)
chr3 (31-318)||(9590648-9590937)
chr3 (136-318)||(12953028-12953210)
chr3 (248-318)||(54038245-54038315)
chr3 (31-225)||(14080666-14080863)
chr3 (2-62)||(45581955-45582016)
chr3 (20-65)||(15550919-15550964)
chr3 (1-62)||(16744011-16744072)
chr3 (20-67)||(38810898-38810945)
chr3 (31-104)||(51961031-51961106)
chr3 (135-225)||(6228625-6228715)
chr3 (31-157)||(11882113-11882240)
chr3 (133-225)||(31412331-31412423)
chr3 (133-225)||(50313344-50313436)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (31-335)||(22738-23043)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (31-335)||(717-1022)
scaffold0673 (40-318)||(6749-7028)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (12-318)||(15348-15654)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (31-335)||(11603-11908)
[»] chr4 (44 HSPs)
chr4 (31-318)||(55376494-55376780)
chr4 (31-318)||(44055979-44056266)
chr4 (31-333)||(30457952-30458255)
chr4 (31-335)||(53704629-53704933)
chr4 (31-335)||(23269829-23270134)
chr4 (50-335)||(45458769-45459055)
chr4 (31-335)||(16732216-16732520)
chr4 (31-318)||(12837096-12837383)
chr4 (35-318)||(8872372-8872654)
chr4 (31-335)||(34395304-34395609)
chr4 (31-318)||(44346891-44347177)
chr4 (31-335)||(21959359-21959663)
chr4 (31-318)||(53907604-53907882)
chr4 (31-246)||(20813442-20813658)
chr4 (31-318)||(819826-820099)
chr4 (31-318)||(52265403-52265691)
chr4 (31-335)||(27961018-27961324)
chr4 (31-318)||(13809405-13809693)
chr4 (31-335)||(15044875-15045181)
chr4 (31-318)||(30232391-30232679)
chr4 (31-335)||(18494224-18494528)
chr4 (112-324)||(47535042-47535254)
chr4 (31-335)||(15109243-15109549)
chr4 (27-318)||(7185735-7186027)
chr4 (172-335)||(41165983-41166146)
chr4 (31-318)||(41256263-41256552)
chr4 (72-318)||(18276498-18276743)
chr4 (248-318)||(14951826-14951896)
chr4 (248-318)||(15272433-15272503)
chr4 (1-62)||(54118138-54118199)
chr4 (31-318)||(14901296-14901584)
chr4 (31-318)||(15013177-15013465)
chr4 (248-304)||(5682648-5682704)
chr4 (248-318)||(25119328-25119398)
chr4 (1-62)||(25119077-25119138)
chr4 (10-62)||(5682407-5682459)
chr4 (31-318)||(7964606-7964894)
chr4 (250-324)||(10104380-10104454)
chr4 (27-318)||(38764773-38765066)
chr4 (242-324)||(40885676-40885758)
chr4 (250-315)||(15675219-15675284)
chr4 (133-225)||(40904932-40905024)
chr4 (248-315)||(31115697-31115764)
chr4 (20-67)||(41165838-41165885)
[»] chr8 (44 HSPs)
chr8 (31-335)||(20573087-20573392)
chr8 (31-335)||(41246705-41247009)
chr8 (31-314)||(20561526-20561810)
chr8 (31-335)||(22234700-22235003)
chr8 (31-333)||(37611717-37612020)
chr8 (31-335)||(20481652-20481955)
chr8 (31-335)||(19992952-19993254)
chr8 (31-335)||(21681049-21681356)
chr8 (174-335)||(20653944-20654105)
chr8 (31-206)||(25122618-25122793)
chr8 (20-335)||(21198035-21198352)
chr8 (22-335)||(23837245-23837561)
chr8 (31-335)||(39446660-39446966)
chr8 (188-335)||(20647882-20648029)
chr8 (31-304)||(22981351-22981622)
chr8 (35-135)||(7000524-7000624)
chr8 (20-245)||(17285341-17285570)
chr8 (136-335)||(38533696-38533895)
chr8 (27-318)||(26011558-26011848)
chr8 (27-318)||(5854678-5854971)
chr8 (27-318)||(15933362-15933655)
chr8 (31-121)||(20529748-20529839)
chr8 (248-318)||(274507-274577)
chr8 (248-318)||(641272-641342)
chr8 (248-318)||(827078-827148)
chr8 (248-318)||(16039002-16039072)
chr8 (27-318)||(29306481-29306776)
chr8 (248-318)||(41506930-41507000)
chr8 (1-62)||(16404870-16404931)
chr8 (1-62)||(24716732-24716793)
chr8 (248-318)||(39115339-39115409)
chr8 (1-62)||(274767-274828)
chr8 (1-62)||(641021-641082)
chr8 (1-62)||(826827-826888)
chr8 (1-318)||(33528489-33528808)
chr8 (248-318)||(24716983-24717053)
chr8 (1-62)||(39115599-39115660)
chr8 (27-318)||(22742828-22743122)
chr8 (136-318)||(22735839-22736021)
chr8 (248-289)||(24385873-24385914)
chr8 (31-318)||(38635541-38635831)
chr8 (255-325)||(22497329-22497399)
chr8 (112-220)||(23151810-23151918)
chr8 (31-67)||(31194217-31194253)
[»] chr6 (40 HSPs)
chr6 (31-308)||(18570353-18570630)
chr6 (31-335)||(32898837-32899142)
chr6 (31-335)||(16086064-16086369)
chr6 (31-335)||(16106563-16106868)
chr6 (31-335)||(22440981-22441285)
chr6 (98-335)||(31628315-31628552)
chr6 (31-335)||(18432690-18432994)
chr6 (31-316)||(13014603-13014890)
chr6 (31-318)||(18777210-18777481)
chr6 (31-335)||(18398985-18399290)
chr6 (31-335)||(25367130-25367437)
chr6 (20-318)||(22361649-22361948)
chr6 (20-335)||(21623215-21623533)
chr6 (31-314)||(21410944-21411228)
chr6 (136-335)||(18381684-18381883)
chr6 (150-335)||(28195108-28195294)
chr6 (248-324)||(18583375-18583451)
chr6 (248-318)||(26089799-26089869)
chr6 (31-324)||(17083093-17083386)
chr6 (31-318)||(18629502-18629791)
chr6 (248-318)||(15742341-15742411)
chr6 (248-318)||(23994987-23995057)
chr6 (27-245)||(17556909-17557127)
chr6 (248-318)||(18002617-18002687)
chr6 (248-318)||(35015278-35015348)
chr6 (183-318)||(25651301-25651436)
chr6 (31-200)||(33324874-33325046)
chr6 (253-335)||(25744331-25744413)
chr6 (1-62)||(18583641-18583702)
chr6 (1-62)||(19983162-19983223)
chr6 (1-62)||(35015027-35015088)
chr6 (31-200)||(35135906-35136078)
chr6 (91-225)||(29605607-29605739)
chr6 (31-222)||(16887685-16887879)
chr6 (248-302)||(19983412-19983466)
chr6 (31-222)||(15079606-15079795)
chr6 (250-318)||(35009569-35009637)
chr6 (91-225)||(22848172-22848304)
chr6 (252-318)||(29665938-29666004)
chr6 (250-314)||(27740907-27740971)
[»] chr5 (36 HSPs)
chr5 (31-318)||(21397156-21397444)
chr5 (31-335)||(24183027-24183332)
chr5 (1-318)||(11584115-11584435)
chr5 (31-315)||(4865330-4865613)
chr5 (31-335)||(28261568-28261867)
chr5 (31-335)||(1168100-1168404)
chr5 (31-335)||(20712123-20712428)
chr5 (31-333)||(11337081-11337384)
chr5 (31-335)||(19405584-19405891)
chr5 (31-310)||(21646636-21646914)
chr5 (98-318)||(24475644-24475861)
chr5 (70-318)||(21906781-21907011)
chr5 (31-318)||(3673926-3674215)
chr5 (20-318)||(19862273-19862574)
chr5 (31-314)||(16595576-16595860)
chr5 (53-225)||(23981433-23981606)
chr5 (31-335)||(23493966-23494272)
chr5 (26-335)||(5450731-5451043)
chr5 (31-335)||(7728467-7728774)
chr5 (31-318)||(28902255-28902545)
chr5 (31-318)||(28938650-28938940)
chr5 (20-318)||(21222492-21222791)
chr5 (31-318)||(432527-432815)
chr5 (248-318)||(21650759-21650829)
chr5 (27-318)||(21617080-21617374)
chr5 (248-318)||(2031874-2031944)
chr5 (248-318)||(11342749-11342819)
chr5 (31-245)||(21310603-21310819)
chr5 (248-308)||(21205000-21205060)
chr5 (31-318)||(23466521-23466787)
chr5 (31-245)||(21297069-21297285)
chr5 (31-318)||(37983428-37983717)
chr5 (91-225)||(22885799-22885932)
chr5 (250-315)||(22053963-22054028)
chr5 (253-315)||(18531200-18531262)
chr5 (133-225)||(29918122-29918214)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (31-335)||(9984-10289)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (14-280)||(20274-20541)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (31-335)||(117857-118163)
scaffold0035 (31-335)||(109356-109662)
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (31-323)||(9783959-9784249)
chr1 (31-335)||(49967697-49968002)
chr1 (72-335)||(21718275-21718537)
chr1 (31-335)||(22403005-22403310)
chr1 (38-318)||(41212136-41212415)
chr1 (31-318)||(35054820-35055108)
chr1 (31-215)||(35522247-35522432)
chr1 (20-335)||(20177222-20177540)
chr1 (136-318)||(27329757-27329938)
chr1 (31-318)||(16645976-16646266)
chr1 (31-318)||(51627558-51627847)
chr1 (31-318)||(16656702-16656992)
chr1 (248-335)||(35522432-35522519)
chr1 (20-245)||(13376741-13376969)
chr1 (27-318)||(37233750-37234043)
chr1 (273-335)||(9784238-9784300)
chr1 (248-319)||(15861547-15861618)
chr1 (31-318)||(17608992-17609281)
chr1 (31-225)||(22143256-22143451)
chr1 (248-318)||(21860075-21860145)
chr1 (248-318)||(44035092-44035162)
chr1 (1-62)||(21860335-21860396)
chr1 (1-62)||(41218729-41218790)
chr1 (1-62)||(41394528-41394589)
chr1 (1-62)||(44034841-44034902)
chr1 (248-318)||(22367083-22367152)
chr1 (31-318)||(21195078-21195368)
chr1 (31-200)||(19603279-19603449)
chr1 (31-225)||(8537803-8538000)
chr1 (31-225)||(8603042-8603239)
chr1 (250-315)||(20445747-20445812)
chr1 (250-315)||(20531512-20531577)
chr1 (31-225)||(49997174-49997371)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (31-335)||(60853-61159)
scaffold0001 (66-335)||(70552-70822)
scaffold0001 (31-170)||(79785-79925)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (31-335)||(254710-255014)
scaffold0011 (31-335)||(261316-261620)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (31-331)||(72-370)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (31-335)||(132144-132450)
scaffold0021 (27-316)||(88341-88631)
scaffold0021 (31-318)||(11751-12041)
scaffold0021 (31-259)||(16022-16253)
scaffold0021 (31-259)||(25553-25784)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (50-335)||(252903-253189)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (31-335)||(191-496)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (31-318)||(4627-4913)
scaffold0447 (31-318)||(9241-9527)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (31-335)||(25258-25563)
scaffold0158 (130-335)||(25005-25210)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (31-335)||(11464-11768)
[»] chr2 (37 HSPs)
chr2 (31-335)||(271217-271521)
chr2 (31-335)||(4448028-4448333)
chr2 (31-335)||(25875816-25876119)
chr2 (31-318)||(23836601-23836888)
chr2 (31-335)||(32465905-32466207)
chr2 (31-335)||(25602071-25602377)
chr2 (31-335)||(36890581-36890885)
chr2 (31-335)||(28974096-28974400)
chr2 (31-270)||(27261916-27262156)
chr2 (31-335)||(24571188-24571492)
chr2 (31-335)||(22579758-22580059)
chr2 (26-318)||(68056-68351)
chr2 (20-335)||(43645940-43646259)
chr2 (31-315)||(31146073-31146360)
chr2 (242-318)||(6879501-6879577)
chr2 (1-62)||(19794599-19794660)
chr2 (1-62)||(22284279-22284340)
chr2 (136-323)||(22775206-22775393)
chr2 (136-323)||(22780584-22780771)
chr2 (252-318)||(21274174-21274240)
chr2 (248-318)||(22274786-22274856)
chr2 (248-308)||(22284029-22284089)
chr2 (27-225)||(19666685-19666884)
chr2 (1-62)||(20627208-20627269)
chr2 (1-62)||(22275046-22275107)
chr2 (252-316)||(9653021-9653085)
chr2 (1-65)||(15633535-15633599)
chr2 (31-210)||(23821534-23821714)
chr2 (31-210)||(23830613-23830793)
chr2 (206-318)||(25305509-25305622)
chr2 (20-225)||(19660037-19660243)
chr2 (1-62)||(43642851-43642912)
chr2 (183-318)||(9636809-9636944)
chr2 (31-225)||(19669003-19669199)
chr2 (250-315)||(24341519-24341584)
chr2 (250-318)||(25265520-25265588)
chr2 (289-335)||(27261853-27261899)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (31-335)||(5143-5446)
scaffold0480 (31-335)||(8776-9082)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (31-335)||(9034-9339)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (31-335)||(7616-7922)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (31-318)||(14938-15224)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (31-335)||(85379-85683)
scaffold0014 (31-335)||(159346-159651)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (31-318)||(11548-11837)
scaffold0359 (31-335)||(1364-1667)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (31-318)||(7235-7522)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (31-335)||(112441-112745)
scaffold0022 (31-315)||(102815-103102)
scaffold0022 (151-335)||(109637-109821)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (31-318)||(24623-24911)
scaffold0037 (248-334)||(95023-95109)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (92-335)||(4988-5231)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (31-310)||(48219-48496)
scaffold0068 (31-310)||(61667-61944)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (1-222)||(19820-20041)
scaffold0122 (14-222)||(24137-24345)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (31-335)||(38345-38650)
[»] scaffold0740 (1 HSPs)
scaffold0740 (31-316)||(4351-4635)
[»] scaffold0016 (6 HSPs)
scaffold0016 (31-335)||(164262-164565)
scaffold0016 (1-62)||(162048-162109)
scaffold0016 (1-62)||(166134-166195)
scaffold0016 (248-318)||(162299-162369)
scaffold0016 (248-318)||(166385-166455)
scaffold0016 (20-246)||(116440-116664)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (31-335)||(70660-70964)
scaffold0031 (72-328)||(31098-31352)
scaffold0031 (27-318)||(97088-97381)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (31-318)||(33726-34014)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (31-335)||(471-776)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (31-335)||(21559-21862)
scaffold0120 (31-335)||(31258-31561)
scaffold0120 (31-140)||(47445-47554)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (35-335)||(1963-2263)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (27-318)||(46229-46521)
scaffold0034 (31-318)||(40722-41010)
scaffold0034 (248-318)||(79928-79998)
scaffold0034 (1-62)||(80188-80249)
[»] scaffold0342 (3 HSPs)
scaffold0342 (72-318)||(6004-6251)
scaffold0342 (248-318)||(572-642)
scaffold0342 (1-62)||(322-383)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (1-155)||(1-155)
[»] scaffold0025 (4 HSPs)
scaffold0025 (135-318)||(146665-146848)
scaffold0025 (27-318)||(53410-53703)
scaffold0025 (95-225)||(85690-85818)
scaffold0025 (250-315)||(8917-8982)
[»] scaffold0816 (1 HSPs)
scaffold0816 (31-182)||(2961-3112)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (31-335)||(33622-33928)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (31-316)||(3385-3671)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (24-318)||(76733-77030)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (31-261)||(7927-8157)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (31-318)||(2211-2499)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (27-318)||(197143-197436)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (20-318)||(6907-7208)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (235-335)||(618-718)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (27-318)||(69521-69814)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (112-318)||(2589-2795)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (20-315)||(35545-35843)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (136-318)||(6725-6907)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (241-335)||(32250-32344)
scaffold0091 (241-335)||(41959-42053)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (137-335)||(28583-28781)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (90-335)||(93728-93972)
scaffold0032 (248-318)||(55645-55715)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (248-318)||(17525-17595)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (250-318)||(89584-89652)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (27-318)||(31084-31377)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (31-225)||(8167-8363)
scaffold0123 (248-335)||(8057-8145)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (248-318)||(1099-1169)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (248-318)||(13507-13577)
scaffold0251 (248-318)||(21481-21551)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (248-318)||(15013-15083)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (274-335)||(3346-3407)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (31-200)||(1440-1611)
scaffold0456 (31-200)||(8585-8756)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (248-318)||(6664-6734)
[»] scaffold0686 (3 HSPs)
scaffold0686 (248-318)||(6204-6274)
scaffold0686 (1-62)||(5747-5808)
scaffold0686 (1-62)||(5953-6014)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (248-318)||(9628-9698)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (248-318)||(31401-31471)
scaffold0184 (1-62)||(31150-31211)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (248-318)||(41373-41443)
scaffold0078 (1-62)||(41633-41694)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (31-225)||(1242-1438)
scaffold0409 (31-225)||(9497-9693)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (31-200)||(89760-89929)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (31-199)||(10845-11014)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (255-318)||(10094-10157)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (248-318)||(12641-12711)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (248-318)||(186647-186716)
scaffold0004 (248-318)||(193609-193678)
scaffold0004 (27-225)||(27654-27856)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (150-335)||(11141-11326)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (248-318)||(149-219)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (31-222)||(22323-22516)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (1-62)||(30418-30479)
scaffold0116 (274-318)||(30155-30199)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (31-127)||(70201-70298)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (31-225)||(855-1052)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (27-318)||(23562-23855)
scaffold0080 (27-245)||(43688-43908)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (183-318)||(22063-22198)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (183-318)||(108074-108208)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (255-318)||(373-436)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (1-62)||(42678-42736)
scaffold0132 (250-318)||(13571-13639)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (20-62)||(1393-1435)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (253-318)||(41713-41778)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (242-318)||(17428-17504)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (242-318)||(61341-61417)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (250-318)||(51312-51380)


Alignment Details
Target: scaffold0310 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Original strand, 6274 - 6608
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgctta 100  Q
    |||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6274 gtgaagcttgagttaatagtgggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgctta 6373  T
Q  101 attggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 200  Q
    |||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6374 attggatgaattgattaactgttcataaatgatgaaattcgtgctatatttatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattggattgttgtt 6473  T
Q  201 agttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttca 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6474 agttgaaatacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattcgtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttaa 6573  T
Q  301 tgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  6574 tgatcaattgatgttgttattgatatgtcttgttg 6608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 22 - 335
Target Start/End: Original strand, 1 - 314
Alignment:
Q  22 ggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1 ggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaaatg 100  T
Q  122 gtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaag 221  Q
     | |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  101 ttaataaatgatgaaattcgtgctatatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattggattgttgttagttgaaatacatgttcaaag 200  T
Q  222 tatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttttt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  201 tatgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattcgtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttaatgatcaattgatgttgttgtt 300  T
Q  322 gatatgtcatgttg 335  Q
    ||||||||||||||    
T  301 gatatgtcatgttg 314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 47)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Original strand, 7283926 - 7284260
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgctta 100  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7283926 gtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttatatgataagtgctta 7284025  T
Q  101 attggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  7284026 attggatgaattgattaattgttcataagtggtgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtgtgaagttatggatgattgaattgttatt 7284125  T
Q  201 agttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttca 300  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7284126 agttgaattgtatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatcctttgttgttgttgaattgtgataagtttca 7284225  T
Q  301 tgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7284226 tgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttg 7284260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 3895376 - 3895089
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 130  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  3895376 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataatt 3895277  T
Q  131 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaag 230  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||     
T  3895276 gatgaaattcatgctctaattctgatgaaatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattgcatgttcaaagtatgaaaaa 3895177  T
Q  231 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3895176 tgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 3895089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 15822327 - 15822631
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  15822327 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcagttatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 15822426  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||    
T  15822427 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgttg-gatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaaatgtatgaa 15822525  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15822526 aatggtatatgttgaaaatatgctcaaatggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtc 15822625  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  15822626 atgttg 15822631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 11287768 - 11287464
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  11287768 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgtttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 11287670  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11287669 tgatgaaattagtgctctgattatgttgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 11287570  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||    
T  11287569 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtc 11287470  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  11287469 atgttg 11287464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 45452063 - 45452366
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  45452063 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataag 45452162  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45452163 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattggattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 45452262  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||| ||||   ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  45452263 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaatttgtga--catgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgtcgttgttgttgatatgtc 45452360  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  45452361 atgttg 45452366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 44865582 - 44865294
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  44865582 taaggtaagggggttaga-ttcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataag 44865484  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||     
T  44865483 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtgtatga- 44865385  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  44865384 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgattaattgttgttgtt 44865294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 12369735 - 12370040
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||      
T  12369735 taaggtaagggggttagatttcatcattatcatttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaa 12369834  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12369835 tgattaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttacggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 12369934  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| || ||     
T  12369935 atgggtatctgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgccttgttgttgttgaattgtgataactttcatgattaattgatgttgttgttgctaagtg 12370034  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  12370035 atgttg 12370040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 143991 - 143703
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  143991 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtataaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 143892  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  143891 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttataaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 143794  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  143793 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgttgtt 143703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 31 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 35095166 - 35094890
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 130  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35095166 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 35095067  T
Q  131 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag-aa 229  Q
    |||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  35095066 gatgaaattcatgctctaattgtgataacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtatatgaaa 35094968  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 308  Q
     | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | | ||||||||||||||    
T  35094967 atgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcactgttgttgatgaattgttaaatgtttcatgatcaat 35094890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 39046523 - 39046823
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39046523 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgttatttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 39046622  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  ||||||||    ||| ||    
T  39046623 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattattgttagttgaattgtatgttcaa---ttgaaaa 39046719  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
     |  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |  |||    
T  39046720 atgagtatatg-tgaaaatat-ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtc 39046817  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  39046818 atgttg 39046823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12759340 - 12759034
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 128  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  12759340 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgtttaattgggtgaattgattaattgttcataa 12759241  T
Q  129 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 228  Q
     |||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |    
T  12759240 atgatgaaatttgtgctccaattatgatgatatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaaatgtgaaa 12759141  T
Q  229 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 328  Q
    |   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||    
T  12759140 aaggggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttggtgaattatgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagt 12759041  T
Q  329 catgttg 335  Q
    |||||||    
T  12759040 catgttg 12759034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 26070161 - 26070464
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 128  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||     
T  26070161 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatg-gtatgaataagtgcttaattgtgt-aattgattaattgttcataa 26070257  T
Q  129 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 228  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26070258 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 26070357  T
Q  229 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 328  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  26070358 aaatggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagt 26070457  T
Q  329 catgttg 335  Q
     ||||||    
T  26070458 gatgttg 26070464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 26093948 - 26094251
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 128  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||     
T  26093948 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatg-gtatgaataagtgcttaattgtgt-aattgattaattgttcataa 26094044  T
Q  129 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 228  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26094045 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 26094144  T
Q  229 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 328  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  26094145 aaatggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagt 26094244  T
Q  329 catgttg 335  Q
     ||||||    
T  26094245 gatgttg 26094251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 27 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 47290138 - 47289828
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtc 124  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47290138 taattaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttcaattatttgtatgaaaaatgcttaattggatgaattgattaattgttc 47290039  T
Q  125 atatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gt 222  Q
    |||  |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  47290038 ataaatgatgaaattcgagctctaattatgatgccatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgt 47289940  T
Q  223 atgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttg 322  Q
    |||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||  ||    
T  47289939 atga-aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgctgttgctg 47289841  T
Q  323 atatgtcatgttg 335  Q
     || |||||||||    
T  47289840 ttaagtcatgttg 47289828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Original strand, 13862828 - 13863113
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     |||||||||| ||||| |||||||||  ||||      
T  13862828 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaa----gcttaattgggtgaatagattaattgtccataaa 13862923  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13862924 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 13863023  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||    
T  13863024 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatattcatgttcaattgttgttgtt 13863113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Original strand, 16569902 - 16570189
Alignment:
Q  32 aaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||      
T  16569902 aaggtaagggggttaaaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggat-aattgattatttgctcataaa 16569999  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16570000 tgatgaaattcgtgctctcattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgatttgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaa 16570099  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
      |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16570100 aatggtatatctggaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgtt 16570189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 32 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16595760 - 16595473
Alignment:
Q  32 aaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||      
T  16595760 aaggtaagggggttaaaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggat-aattgattatttgctcataaa 16595663  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16595662 tgatgaaattcgtgctctcattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgatttgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaa 16595563  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
      |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16595562 aatggtatatctggaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgtt 16595473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 12248015 - 12248321
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatca-cttttgtaa-ttttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  | ||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  12248015 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatatattgcaatttttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaattggat-aattgattacttgttcata 12248112  T
Q  128 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 227  Q
      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  12248113 aatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttattagttgaatttcatgtttaaagtatgag 12248212  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatat 326  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||     
T  12248213 aaaatagtatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaatggatgttgttgttgctaa 12248312  T
Q  327 gtcatgttg 335  Q
    || ||||||    
T  12248313 gtgatgttg 12248321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 49047569 - 49047874
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||  ||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| ||| |    
T  49047569 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgccatttttcaattgtta-tatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcaga 49047666  T
Q  128 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 227  Q
      || |  |||| |||||| | |||| |||||||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  49047667 attgttagaatttgtgctccaattataatgacatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgag 49047766  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatat 326  Q
    |   |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  49047767 agagtggtatatgttg-aaatatgctcaattggttgaattatgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaa 49047865  T
Q  327 gtcatgttg 335  Q
    || ||||||    
T  49047866 gtgatgttg 49047874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13377894 - 13377576
Alignment:
Q  20 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || |||||| |||||| || ||||  | ||| ||    
T  13377894 ttggtgataattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-gtatgaataagtgattcattgagt-aatcga 13377797  T
Q  115 ttaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatg 214  Q
    ||||||| |||||  || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||| ||||    
T  13377796 ttaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatg 13377697  T
Q  215 ttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatg 313  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||| || ||| ||| ||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  13377696 ttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aattatactcaaattgattaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatg 13377598  T
Q  314 ttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    ||||| ||| || || ||||||    
T  13377597 ttgttgttgctaagtaatgttg 13377576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 335
Target Start/End: Original strand, 17223819 - 17224138
Alignment:
Q  20 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactttt---gtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||   |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||  | |||      
T  17223819 ttggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttttagtgtaatttttcaattattt-tatgattaagtgcttaattgagtaaata- 17223916  T
Q  114 attaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacat 213  Q
    |||||||| ||| |  || |  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| |||    
T  17223917 attaattgttcaaagttgttataattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcacgaagttgtggataattgaattgttgtttgtgaaatttcat 17224016  T
Q  214 gttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgat 312  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||| || ||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  ||||  ||||| |||||||||    
T  17224017 gttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aattatactcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgttgtaagagtcatgttcaattgat 17224115  T
Q  313 gttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    |||||| ||| || || ||||||    
T  17224116 gttgttgttgctaagtgatgttg 17224138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13275129 - 13274834
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||  ||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  13275129 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgccatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcata 13275032  T
Q  128 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 227  Q
      || |  ||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||| | |||||| | | |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  13275031 attgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcaagaagttgttggtaattgaattgttgttagtaaaatttcatgttcaaagtatgag 13274932  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatat 326  Q
    ||  |||||||||           |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  13274931 aaagtggtatatg-----------ctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaa 13274843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 331
Target Start/End: Original strand, 16914866 - 16915124
Alignment:
Q  72 ttttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatg 170  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||  || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||    
T  16914866 ttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatg 16914963  T
Q  171 tatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatg 269  Q
     ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| |||  || |||||||||||  ||||||| ||  | |||||| ||    
T  16914964 catgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgttatatgttgaat-tatgctctaaacgttgaattgtg 16915062  T
Q  270 cattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcat 331  Q
    |  ||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||| ||| || |||||    
T  16915063 ctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtcat 16915124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 9839236 - 9838943
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgg 122  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||  | |  ||||||||||     
T  9839236 taattaaggtaagagggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatcattaagtgcttaattgagt-acgtgattaattgt 9839139  T
Q  123 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 222  Q
    |||||  || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  9839138 tcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 9839039  T
Q  223 atgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||| |||  || ||||||||| || ||||||| || || |||||| |||  ||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||    
T  9839038 atgtgaaagtgttatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgtt 9838943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 48357001 - 48356708
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggt 123  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| || ||||||||||  | || |||||||||| |    
T  48357001 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcattcgttgtatgattaaatgcttaattgagt-aagtgattaattgtt 48356903  T
Q  124 catatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagta 223  Q
    ||||  || | ||||| |||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  48356902 catagttgttaaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagta 48356803  T
Q  224 tgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    || |||  || |||||||||||  ||||||| || || |||||| ||   ||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||    
T  48356802 tgtgaaagtgttatatgttgaat-tatgctctaaatgttgaattgtgttatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgtt 48356708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 9611665 - 9611371
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgg 122  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||  | |  ||||||||||     
T  9611665 taattaaggtaagagggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatcattaagtgcttaattgagt-acgtgattaattgt 9611568  T
Q  123 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 222  Q
    |||||  || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  9611567 tcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 9611468  T
Q  223 atgagaagttggtatatgttgaaaatatgct--caattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||| |||  || ||||||||| || ||||||   || || |||||| |||  ||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||    
T  9611467 atgtgaaagtgttatatgttg-aattatgcttctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgtt 9611371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 3049717 - 3049647
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3049717 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 3049647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 42056410 - 42056480
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  42056410 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgtt 42056480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 2029055 - 2028986
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2029055 tatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgt 2028986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 248 - 316
Target Start/End: Original strand, 2190307 - 2190375
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttg 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  2190307 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttg 2190375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 245
Target Start/End: Original strand, 14271782 - 14272009
Alignment:
Q  20 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||| ||    
T  14271782 ttggtgataattaaggtaagggaattagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-ga 14271879  T
Q  115 ttaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatg 214  Q
    ||||||| |||||  || | |||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||| ||||| || | ||||||| |||||||||| ||  |||| ||||    
T  14271880 ttaattgttcatagttg-tcaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattcaattgttgttggtgaaattgcatg 14271978  T
Q  215 ttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaa 245  Q
    ||||||||||| |||  || |||||||||||    
T  14271979 ttcaaagtatgtgaaaatgatatatgttgaa 14272009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 111390 - 111460
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  111390 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 111460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 126549 - 126479
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  126549 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 126479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 31501526 - 31501228
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatca-taatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    |||||||||||||||||  |||| || |||||| ||  |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| || || |||||| ||| ||||    
T  31501526 taaggtaagggggttagaattcaacaataatcaattagttgtaattttca-ttaattgcatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattatttgttcat 31501429  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 226  Q
    |  |||||||||| ||| |||| |||||| || ||||||| ||  ||||| ||   ||||||||||||||| || ||  |||| |||||||| ||||||     
T  31501428 agttgatgaaattagtgatctaattatgaagatatgtttaaatacatgaaattggtgataattgaattgttattggtgaaattgcatgttcatagtatgt 31501329  T
Q  227 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgata 325  Q
    |||  || |||||  |||| | |||||||| ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||| ||| ||    
T  31501328 gaaaatgatatattgtgaata-atgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgtta 31501230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 126799 - 126739
Alignment:
Q  2 tgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  126799 tgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 126739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 32494167 - 32494237
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||    
T  32494167 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgtt 32494237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 111139 - 111200
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  111139 gtgaagcttgagctaaaagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 111200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 32493916 - 32493977
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  32493916 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 32493977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16919758 - 16919623
Alignment:
Q  183 gataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgt 281  Q
    |||||| |||||||| || ||  |||| |||||||||| ||||||||  || |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||    
T  16919758 gataatcgaattgttattggtgaaatttcatgttcaaaatatgagaaagtgatatatgttgaat-tatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgt 16919660  T
Q  282 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||  || || | |||||||||||||    
T  16919659 tgaattgtgataagaatcgtgtttaattgatgttgtt 16919623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 28722359 - 28722200
Alignment:
Q  133 tgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagtt 232  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||| |||  |    
T  28722359 tgaaattcgtgctctagttatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat 28722260  T
Q  233 ggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgat 292  Q
    | |||||  || || ||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  28722259 gatatattgtg-aattatgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgat 28722200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 1936887 - 1936948
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  1936887 gtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtttttatcataatca 1936948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 3060333 - 3060272
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  3060333 gtgaagctagagctaatagttggagataatgaaggtaagggggtaagtctttatcataatca 3060272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Original strand, 34241101 - 34241317
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| ||||| |||||||  | || |||||||||| |||||    
T  34241101 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgattaattgagt-aagtgattaattgttcata 34241199  T
Q  128 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 227  Q
      |||| ||||||||| | || ||||||||  ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||| |||||||| |    
T  34241200 gttgataaaattcgtgttataattatgatgttatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttaaaagtatgtg 34241299  T
Q  228 aagttggtatatgttgaa 245  Q
    ||  |  |||||||||||    
T  34241300 aaagtaatatatgttgaa 34241317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14935609 - 14935517
Alignment:
Q  133 tgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 225  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||    
T  14935609 tgaaattcgtgctctagttatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 14935517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15363202 - 15363110
Alignment:
Q  133 tgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 225  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||    
T  15363202 tgaaattcgtgctctagttatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 15363110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 25124482 - 25124407
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  25124482 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattg 25124407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 292
Target Start/End: Original strand, 1937133 - 1937177
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgat 292  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||    
T  1937133 tatgctcaattggtgaattatgtatggttgttgatgaattatgat 1937177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1762 - 1428
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgctta 100  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1762 gtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttggatgataagtgctta 1663  T
Q  101 attggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 200  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1662 attgggtgaattgattaattgttcctatgtgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 1563  T
Q  201 agttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttca 300  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||  ||| |||||||||||||||||||    
T  1562 ggttgaattatatgttcaaagtatgagaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgttgaattatgttatgtgattgatgaattgtgataagtttca 1463  T
Q  301 tgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    ||||||||  |||||| | ||| ||||||||||||    
T  1462 tgatcaataaatgttgctgttgctatgtcatgttg 1428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 80)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 12349434 - 12349739
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||      
T  12349434 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgtccataaa 12349533  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12349534 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtataaatttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtgagaa 12349633  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12349634 gttgttatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtc 12349733  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  12349734 atgttg 12349739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 50111946 - 50112251
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  50111946 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 50112045  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50112046 tgatgaaattcatgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 50112145  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||    
T  50112146 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtc 50112245  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  50112246 atgttg 50112251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8632142 - 8631837
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || || |    
T  8632142 taaggtaagggggttaggattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattaattaattgttcttaag 8632043  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8632042 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtttgagaa 8631943  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||    
T  8631942 gttggtatatgttgaaaatatgcttatttagtgaattatgctttgttgttgttggattgtgataagtttcataacaaattgatgttgttgttgatatgtc 8631843  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  8631842 atgttg 8631837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 54424364 - 54424076
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt-aattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  54424364 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttatttcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 54424265  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54424264 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgtggttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 54424165  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54424164 attgatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 54424076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 317405 - 317708
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 130  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  317405 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 317504  T
Q  131 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaag 230  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||     
T  317505 gatgaaattcgtgctctaagtatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatgaaaaa 317604  T
Q  231 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtca 330  Q
    | ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |  ||||    
T  317605 tgggtatgtg-tgaaaatatgctaaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtca 317703  T
Q  331 tgttg 335  Q
    |||||    
T  317704 tgttg 317708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 13817862 - 13817576
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 130  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  13817862 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgtacatatgt 13817763  T
Q  131 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaga 228  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  13817762 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaatt-atgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga-a 13817665  T
Q  229 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    | | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13817664 aatgggtatatg-tggaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgtt 13817576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 16995956 - 16996259
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 130  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  16995956 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattattcataagt 16996055  T
Q  131 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaag 230  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||     
T  16996056 ggtgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttacttgaattgtatgttcaaagtatgaaaaa 16996155  T
Q  231 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtca 330  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |  ||||    
T  16996156 tgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtca 16996254  T
Q  331 tgttg 335  Q
    |||||    
T  16996255 tgttg 16996259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 31 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17101004 - 17100720
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||      
T  17101004 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctattttcaatt-tttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtccataaa 17100906  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  17100905 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaac 17100806  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 315  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17100805 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 17100720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 31 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17101689 - 17101405
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||      
T  17101689 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctattttcaatt-tttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtccataaa 17101591  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  17101590 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaac 17101491  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 315  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17101490 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 17101405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 19570586 - 19570888
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 130  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19570586 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaatttttcatatgt 19570684  T
Q  131 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaag 230  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||     
T  19570685 gatgaaatttgtgctctaattttgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaa 19570783  T
Q  231 ttg-gtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
     || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |  |||    
T  19570784 atgagtatatg-tggaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtc 19570882  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  19570883 atgttg 19570888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Original strand, 16181842 - 16182128
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 130  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  16181842 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 16181941  T
Q  131 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaga 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||| |    
T  16181942 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttaaattacatgttcaaagtgtatga-a 16182039  T
Q  229 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    | | ||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16182040 aatgggtatgtg-tgaaaatatgccaaattggtgaattatgcattgtcgttgatgaattgtgataagtttaatgatcaattgttgttgtt 16182128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14298773 - 14298468
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  14298773 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 14298674  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||     
T  14298673 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgtggttagttgaattacatgttcaaagtgtatgat 14298574  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
     | | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14298573 atggttacgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattaatatgtc 14298474  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  14298473 atgttg 14298468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14304400 - 14304095
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  14304400 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 14304301  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||     
T  14304300 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgtggttagttgaattacatgttcaaagtgtatgat 14304201  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
     | | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14304200 atggttacgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattaatatgtc 14304101  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  14304100 atgttg 14304095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 22144167 - 22144472
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt-gtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||      
T  22144167 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactttttgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaactgttcataac 22144266  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 227  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  22144267 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 22144364  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatg 327  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |    
T  22144365 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaagtatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaag 22144464  T
Q  328 tcatgttg 335  Q
     |||||||    
T  22144465 ccatgttg 22144472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 6154226 - 6154531
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  6154226 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattataattttcaattatttctatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataag 6154325  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaag--tatgag 227  Q
    | ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  6154326 tcatgaaattcgtcctctaattataatgacatgtttagatgtatgaaattatgaatagttgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtttatga- 6154423  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatg 327  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |    
T  6154424 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttattgttaag 6154523  T
Q  328 tcatgttg 335  Q
    ||||||||    
T  6154524 tcatgttg 6154531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 35124047 - 35123743
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  35124047 taaggtaaaggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 35123948  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaa-agtatgaga 228  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||| |    
T  35123947 tgatgaaattcgtactttaattatgatgacgtgtttggatgtatgaaattatggataattgaattgttgttagtcgaattacatgttaaagtgtatgaaa 35123848  T
Q  229 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 328  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35123847 ag--ggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttattgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgt 35123750  T
Q  329 catgttg 335  Q
    |||||||    
T  35123749 catgttg 35123743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17938925 - 17938621
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| || |  |    
T  17938925 taagataagggggttagggttcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcttgag 17938826  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||  |||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17938825 tgatgaaattcgtgctctaattatggtgacatgtttggatgtataaagc-atggttaagcgaattgttgttagttgaattgcatgttcaaagtatgagaa 17938727  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17938726 gttgatatatgttgaaaatatgcttaattgatgaattatgctttgttgttgttggattgtggttattttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtc 17938627  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  17938626 atgttg 17938621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 31 - 305
Target Start/End: Original strand, 34439237 - 34439513
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||| | ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  34439237 taaggtaaggagattagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgtttaattggatgaattgattaattgttcataag 34439336  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgttta-gatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  34439337 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttatgaggtatgaagttatggataaatgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgtaa 34439436  T
Q  229 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatc 305  Q
    | | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  34439437 aatgggtatgtgtttaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattatgataagtttcatgatc 34439513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 14295790 - 14295502
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||      
T  14295790 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgctaaaatgggtgaattgattaattgttcataaa 14295692  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14295691 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaattcatgttcaaagtatgagaa 14295592  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14295591 aatggtatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgtt 14295502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 14301417 - 14301129
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||      
T  14301417 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgctaaaatgggtgaattgattaattgttcataaa 14301319  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14301318 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaattcatgttcaaagtatgagaa 14301219  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14301218 aatggtatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgtt 14301129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 318
Target Start/End: Original strand, 17522780 - 17523072
Alignment:
Q  26 ataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtc 124  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||    
T  17522780 ataactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgagaagtgcttatttgggtgaattgattatttgttc 17522878  T
Q  125 atatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtat 224  Q
    |||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17522879 ataaatgatgaacttcgtgctctaattatgatgacagttttggatgtatgaagatgtggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtat 17522978  T
Q  225 gagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
     | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17522979 aacaaaatggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttattgatgaattgtgataagtttcatgaccaattgatgttgtt 17523072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 90 - 318
Target Start/End: Original strand, 55440803 - 55441032
Alignment:
Q  90 ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataatt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  55440803 ataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataatt 55440902  T
Q  190 gaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattg 288  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |  |||||| |||||||||    
T  55440903 gaattgttgttagtggaatttcatgttcaaagtatgagaaaatgatatatgatgaaaatatgctcaactggttgaattatactatgttgtggttgaattg 55441002  T
Q  289 tgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55441003 tgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 55441032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 31 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 38528079 - 38527841
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 130  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  38528079 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaactatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaat 38527980  T
Q  131 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaga 228  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  38527979 gatgaaattcgtgctataattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaatt-atgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga-a 38527882  T
Q  229 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgc 270  Q
    | | ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38527881 aatgggtatgtg-ggaaaatatgctcaattggtgaattatgc 38527841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3578440 - 3578136
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 128  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||     
T  3578440 taaggtaagcgggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatt-gtaggaataagtgcttaattgggtaaattgattaattgttcataa 3578342  T
Q  129 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 228  Q
     |||||| |||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3578341 atgatgatattcattctctaattatgatgacatgttga-atgtatgaagttatggataattgaattgttattagttgaatttcatgttcaaagtatgaga 3578243  T
Q  229 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatg 327  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |    
T  3578242 aaatagtatatgttgaaaatatgctcaactggttgaattacgctatgttgtggttgaattgcgataagtttcatgatcaattgat-ttgttgttgctaag 3578144  T
Q  328 tcatgttg 335  Q
    ||||||||    
T  3578143 tcatgttg 3578136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 130 - 335
Target Start/End: Original strand, 53898450 - 53898655
Alignment:
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt--atgag 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||  ||||     
T  53898450 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatctatgaagttatgaataattgaattgt-gttagttgcattaaatgttcaaagtgtatgaa 53898548  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatg 327  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  53898549 aa-tgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgcattgtgataagtttcatgatcaattaatgttgttgttgatatg 53898647  T
Q  328 tcatgttg 335  Q
    ||||||||    
T  53898648 tcatgttg 53898655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 135 - 318
Target Start/End: Original strand, 19260839 - 19261022
Alignment:
Q  135 aaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttgg 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||    
T  19260839 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatggg 19260938  T
Q  235 tatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19260939 tatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatactaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 19261022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Original strand, 11060902 - 11061189
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 128  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||   ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||| | ||      
T  11060902 taaggtaagggggttggaattcatcataatcataattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggat-aattaattatttgttaatgg 11060999  T
Q  129 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 228  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| | || |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  11061000 atgatgaaattcgtgctctaattatgatca-atttttaaatgtatgaagttatgaataattggattgttgttagttgaatttcaggttcaaagtatgaga 11061098  T
Q  229 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||    
T  11061099 aaatggtatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatagtcatgttcaattgatgttgtt 11061189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 335
Target Start/End: Original strand, 6146764 - 6146946
Alignment:
Q  153 tgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt--atgagaagttggtatatgttgaaaatat 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| || | ||||| ||||||||||||    
T  6146764 tgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgta-ttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaaa-tgggtatgtgttgaaaatat 6146861  T
Q  251 gctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| || |||||||||    
T  6146862 gctcaattggtgaatcatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatggtcaattgttgctgttgttgttaagtcatgttg 6146946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 11328859 - 11329161
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 125  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||    
T  11328859 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 11328956  T
Q  126 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 225  Q
    ||  || |  ||||||||||| | |||||||||||||||     | || ||||| |  ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  11328957 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtt-----gcataaagttgttaataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatg 11329051  T
Q  226 agaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgat 324  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  11329052 agaaagtggtatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgct 11329150  T
Q  325 atgtcatgttg 335  Q
    | || ||||||    
T  11329151 aagtgatgttg 11329161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17139861 - 17139555
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||   |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||| || ||||    
T  17139861 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattcttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaagtgttcat 17139764  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 226  Q
    |  || |  ||||||||||| | ||||||||||||||||  ||| |||||||| | | |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||| |||||    
T  17139763 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaactatga 17139664  T
Q  227 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgata 325  Q
    |||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  17139663 gaaaatggtatatgttg-aaatatgctcaattggttgaatcatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgcta 17139565  T
Q  326 tgtcatgttg 335  Q
     || ||||||    
T  17139564 agtgatgttg 17139555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16880477 - 16880190
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 125  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || ||||||  ||||| |||||||  | ||||||||||||| |||    
T  16880477 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-gtatgaacaagtgtttaattgagt-aattgattaattgttca 16880380  T
Q  126 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 225  Q
    ||  || |  ||||||||||| | ||| ||||| ||||||  ||| | |||||| | |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  16880379 taattgtttgaattcgtgctccaattacgatgatatgtttgaatgcaagaagttgttgataattgaattgttgttagtaaaatttcatgttcaaagtatg 16880280  T
Q  226 agaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtg-aattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 315  Q
    ||||  ||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  16880279 agaaagtggtatatgtt-agaatatgctcaatttgtgaaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgtt 16880190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 12560131 - 12560436
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  12560131 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcata 12560228  T
Q  128 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 227  Q
      || |  ||||||||||| | ||||||||  ||| ||  |||  ||||||||| |||| ||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||    
T  12560229 attgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgattgaatgcttgaagttattgatacttgaatttttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgag 12560328  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatat 326  Q
    ||  |||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||| ||     
T  12560329 aaagtggtatatgt-gaaaatatgcccaactggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatatgattcatgatcaatggatgttgttgttgctaa 12560427  T
Q  327 gtcatgttg 335  Q
    || ||||||    
T  12560428 gtgatgttg 12560436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 335
Target Start/End: Original strand, 14059112 - 14059413
Alignment:
Q  35 gtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt--aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtg 131  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||| |||||| ||||   ||    
T  14059112 gtaagggggttataattcatcataatcattttagtgcaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgact-aattgactaattgttcatgattg 14059209  T
Q  132 atgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagt 231  Q
     |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||||      
T  14059210 ttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgtttttagagaaatttcatgttcaaagtatgagaaaa 14059309  T
Q  232 tggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtca 330  Q
    ||  |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| || ||| ||||| |    
T  14059310 tgacatatgttg-aaatatgctcaatttgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatattcatgttcaattgatgttattgttgctatgtga 14059408  T
Q  331 tgttg 335  Q
    |||||    
T  14059409 tgttg 14059413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 135
Target Start/End: Original strand, 6146664 - 6146769
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  6146664 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataag 6146763  T
Q  130 tgatga 135  Q
    ||||||    
T  6146764 tgatga 6146769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 136 - 335
Target Start/End: Original strand, 12488727 - 12488926
Alignment:
Q  136 aattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggt 235  Q
    ||||| ||||||| |||||||    ||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |  |||| |||||||||||||||||||  || |    
T  12488727 aattcatgctctaattatgatattgtgtttggatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttgatgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgat 12488826  T
Q  236 atatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgtt 334  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || || |||||    
T  12488827 atatgttgaat-tatgctcaaattgatgaattatgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtt 12488925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17191906 - 17191607
Alignment:
Q  20 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||  ||||||||| ||||| || ||||||  || ||||||||||  | ||| ||    
T  17191906 ttggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcacaatcattttagtgtaatttttcaattgtt-gtatgaacaattgcttaattgagtaaat-ga 17191809  T
Q  115 ttaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatg 214  Q
    ||||||| |||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||  |||| ||||    
T  17191808 ttaattgttcatagatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataatcgaattgttgttggtgaaatttcatg 17191709  T
Q  215 ttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatg 313  Q
    |||||||||||||||  || | ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||   |||||||| ||||||||||||||  ||||| | ||||||||    
T  17191708 ttcaaagtatgagaaagtgatttatgttg-aattatgctcaaattgatgaattatgttatgttgttgctgaattgtgataagaatcatgtttaattgatg 17191610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 280
Target Start/End: Original strand, 11196291 - 11196457
Alignment:
Q  107 tgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttga 206  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11196291 tgaattgattaattgttcatggatgatgaaatttgtgctctaataatgatgatatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttga 11196390  T
Q  207 attacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttg 280  Q
    |||  ||||        ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||    
T  11196391 attttatgt--------tgagaaaatggtatatgttgaaaatatgcttaattggttgaattatgatttgttgttg 11196457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 39656817 - 39656594
Alignment:
Q  90 ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataatt 189  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||  || | |||| ||||||| | ||||||||  ||||||  || |||||| ||   |||||||    
T  39656817 ataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaatccgtgctccaattatgatgttatgtttgaatttatgaaattggtgataatt 39656719  T
Q  190 gaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattg 288  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  39656718 gaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattg 39656620  T
Q  289 tgataagtttcatgatcaattgatgt 314  Q
    |  |||| |||||| |||||||||||    
T  39656619 ttgtaagattcatgttcaattgatgt 39656594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 165
Target Start/End: Original strand, 14527975 - 14528110
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 128  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||     
T  14527975 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattaggtgaattgattaattgttcataa 14528073  T
Q  129 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgttt 165  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14528074 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgttt 14528110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 318
Target Start/End: Original strand, 3576323 - 3576621
Alignment:
Q  23 gtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgatta 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||| || ||| || ||||||||||||||  | ||| |||||    
T  3576323 gtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattgtt-gtacgaataagtgcttaattgagtaaat-gatta 3576420  T
Q  118 attggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttc 217  Q
    |||| ||| |  || |  ||||||| ||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||    
T  3576421 attgttcaaagttgttataattcgtactctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttc 3576520  T
Q  218 aaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttg 316  Q
    || |||||||||  || ||||| ||| || ||||||| ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||    
T  3576521 aatgtatgagaaagtgatatatattg-aattatgctcaaattgatggattatgctatgttgttgttgaattgtgataagagtcatgtttgattgatgttg 3576619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 239 - 335
Target Start/End: Original strand, 12349834 - 12349930
Alignment:
Q  239 tgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||    
T  12349834 tgttgataatatgctcaattggtgaattatgcatcgtagttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttg 12349930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17205046 - 17204818
Alignment:
Q  20 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||  ||||||||| ||||| |  ||| ||  |||||||||||||  | ||| ||    
T  17205046 ttggtgataattaaggtaagggggttagaattccatcataatcattttagtgtaatttttcaattgtg-gtacgaacaagtgcttaattgagtaaat-ga 17204949  T
Q  115 ttaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatg 214  Q
    ||||||| |||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| || | |||||| ||||||||||| ||  |||| ||||    
T  17204948 ttaattgttcatagatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataatcgaattgttgttggtgaaatttcatg 17204849  T
Q  215 ttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaa 245  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||    
T  17204848 ttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaa 17204818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30207570 - 30207280
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 125  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||  |||    
T  30207570 taaggtaagggggttataattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattattca 30207473  T
Q  126 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 225  Q
    ||   | |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  || | |||||||||||||||    
T  30207472 tactggttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatg 30207373  T
Q  226 agaagttggtatatgttgaaaatatgc-tcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||  || ||||||||| || ||||| | ||||| |||||| |||  |||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  30207372 agaaagtgatatatgttg-aattatgcttaaattgatgaattgtgctatgttgttgttcaattgtgataagattcaagttcaattgaagttgtt 30207280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 3992684 - 3992614
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3992684 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 3992614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 109 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15876341 - 15876115
Alignment:
Q  109 aattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaat 208  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| |||| ||| | ||||| ||||||||||||  |  |||    
T  15876341 aattgattaattgttcatagatgatgaaattcgtgctctaattatgataatatgtttaaatgcatgatgttgttgataactgaattgttgttgatgaaat 15876242  T
Q  209 tacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcat-tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatca 306  Q
    |  |||||| |||||||||||  || ||||| ||| ||  || ||| ||||| || ||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  15876241 tttatgttccaagtatgagaaagtgatatatcttg-aatgatactcaaattgttggattat-cataagttgttgttgaattgtgataagattcatgttca 15876144  T
Q  307 attgatgttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    |||||||||||| ||| || || ||||||    
T  15876143 attgatgttgttgttggtaagtgatgttg 15876115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 2844325 - 2844255
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2844325 tatgctcaattggtgaattatgcatggttcttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 2844255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 242 - 335
Target Start/End: Original strand, 14528118 - 14528212
Alignment:
Q  242 tgaaaatatgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||    
T  14528118 tgaaaatatgctcaattggttgaatcatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttg 14528212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16261587 - 16261517
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16261587 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgtt 16261517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 53771175 - 53771105
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  53771175 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgtt 53771105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 136 - 245
Target Start/End: Original strand, 47784767 - 47784876
Alignment:
Q  136 aattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggt 235  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||  || |    
T  47784767 aattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgat 47784866  T
Q  236 atatgttgaa 245  Q
    ||||||||||    
T  47784867 atatgttgaa 47784876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30153076 - 30153006
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  30153076 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 30153006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 38168048 - 38167978
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  38168048 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtaataagtttcatgatcaatagatgttgtt 38167978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 54685422 - 54685492
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  54685422 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 54685492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 7854367 - 7854306
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7854367 gtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 7854306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Original strand, 14814658 - 14814948
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatc-ataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    |||||||||||||||||  |||| | ||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||| || || |||||| ||| ||||    
T  14814658 taaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattatttgctcat 14814756  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 226  Q
    |  || ||||||||||||| || ||||| ||| ||||||  ||  ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||     
T  14814757 agttgttgaaattcgtgctttaattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgt 14814856  T
Q  227 gaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||  || |||||  || || | ||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||    
T  14814857 gaaaatgatatattgtg-aattgtgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgataagaatcatgtttaattgatgttgtt 14814948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 23492507 - 23492437
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23492507 tatgctcaaatggtgaattatggatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgtt 23492437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 33342015 - 33341945
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  33342015 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattatgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 33341945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 3992935 - 3992874
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3992935 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 3992874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 15857133 - 15857194
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15857133 gtgaagctagagctaatacttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 15857194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 19232151 - 19232090
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  19232151 gtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcttaatca 19232090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 54037994 - 54038055
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  54037994 gtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 54038055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 55513255 - 55513194
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  55513255 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 55513194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 7854116 - 7854046
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  7854116 tatgttcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 7854046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 62
Target Start/End: Original strand, 17955861 - 17955915
Alignment:
Q  8 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17955861 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 17955915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 318
Target Start/End: Original strand, 17956109 - 17956175
Alignment:
Q  252 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  17956109 ctcaattggtgtattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 17956175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 45581765 - 45581695
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||    
T  45581765 tatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgtt 45581695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 2844576 - 2844515
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  2844576 gtgaagctagagctaatagtttgagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 2844515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Original strand, 9590648 - 9590937
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |  ||||||||| ||||||||||||| || || || ||||||| |||||    
T  9590648 taaggtaaggggattagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcaaattgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtggttaattgttcata 9590746  T
Q  128 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 227  Q
      || | |||| |||||||||  |||||||| ||||||  ||| || || ||   |||||||||||||||||| ||  || | ||||||||||||||| |    
T  9590747 gttgttaaaatccgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcattaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatgtg 9590846  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||  ||||||    || || ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||| || |||| ||   |||| |||||||||||||||    
T  9590847 aaagtggtatgatatg-aattatgctcaatttgttgaattatgctatgttgttgttgagttctgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 9590937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 12953210 - 12953028
Alignment:
Q  136 aattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggt 235  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||  ||||||||| ||  |||| ||||||||||||||  |||  || |    
T  12953210 aattcgtgttctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattagattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatatgaaagtgtt 12953111  T
Q  236 atatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||  ||||||| || || |||||| |||  |||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||||||||    
T  12953110 atatgttgaat-tatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagatttatgtttaattgatgttgtt 12953028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 54038245 - 54038315
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||| | |||||||    
T  54038245 tatgctaaattggtgaattatgcatggttgttgatgaaatgtgatatgtttcatgattaatggttgttgtt 54038315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14080863 - 14080666
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 125  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| ||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||  ||    
T  14080863 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaactatg-gtatgaataagtgtttaattggataaat-gattaattgtgca 14080766  T
Q  126 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 225  Q
    ||  || | |||||||||||| |  |||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||||||    
T  14080765 tagatgttaaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgtggttagtgaatttgcatgttcaaagtatg 14080666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 45582016 - 45581955
Alignment:
Q  2 tgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaag-ggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  45582016 tgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaaggggggttagtttttatcataatca 45581955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 15550964 - 15550919
Alignment:
Q  20 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt 65  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15550964 ttggtgataattaagataagggggttagaattcatcataatcactt 15550919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 16744011 - 16744072
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| || | ||||||||    
T  16744011 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacgaggttagtctttaccataatca 16744072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 67
Target Start/End: Original strand, 38810898 - 38810945
Alignment:
Q  20 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt 67  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  38810898 ttggtgataactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattttt 38810945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 104
Target Start/End: Original strand, 51961031 - 51961106
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  51961031 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattg 51961106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 225
Target Start/End: Original strand, 6228625 - 6228715
Alignment:
Q  135 aaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 225  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||  ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||    
T  6228625 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcatagtatg 6228715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 157
Target Start/End: Original strand, 11882113 - 11882240
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 128  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||| || || |||||| ||| || ||     
T  11882113 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgtaacttttaatttgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattatttgttcttag 11882211  T
Q  129 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatg 157  Q
     || |||| ||| ||||||| ||||||||    
T  11882212 atgttgaatttcatgctctaattatgatg 11882240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 225
Target Start/End: Original strand, 31412331 - 31412423
Alignment:
Q  133 tgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 225  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||  ||  ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||    
T  31412331 tgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 31412423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 50313436 - 50313344
Alignment:
Q  133 tgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 225  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| ||||||   || ||||| |||  |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||    
T  50313436 tgaaattcgtgctcttgttataatgatatgtttgagtgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 50313344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23043 - 22738
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  23043 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatcaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 22944  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22943 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttttgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 22844  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  22843 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttttgtc 22744  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  22743 atgttg 22738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 717 - 1022
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||    
T  717 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattgagtgaattgattgattgttcatatg 816  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  817 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattggattgttgttagatgaattacatgttcaaagtatgaaaa 916  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
     | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  917 atgggtatgagttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttattgatgatttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgatatgtc 1016  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  1017 atgttg 1022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 40 - 318
Target Start/End: Original strand, 6749 - 7028
Alignment:
Q  40 ggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaat 138  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6749 ggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgatcagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcatatgtgatgaaat 6848  T
Q  139 tcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgagaagttggta 236  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| || | ||||    
T  6849 tcgtgctctaattacgaggacatgtttagatgtatgaagttatgaatagttgaattgttgttggttgaattacatgttcagagtgtatga-aaatgggta 6947  T
Q  237 tatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6948 tgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgtt 7028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 12 - 318
Target Start/End: Original strand, 15348 - 15654
Alignment:
Q  12 gctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaat 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15348 gctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcattcatcataatcacttttgtaattttaaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaat 15447  T
Q  112 tgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattac 211  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  15448 tgattaattgttcataagtggtgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggacaattgaattgttgttagttgaattgt 15547  T
Q  212 atgttcaaagtat-gagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattg 310  Q
    |||||||||||||  | || | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15548 atgttcaaagtataaaaaaatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattg 15646  T
Q  311 atgttgtt 318  Q
     |||||||    
T  15647 ttgttgtt 15654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 11603 - 11908
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11603 taagctaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 11702  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    |||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  11703 tgatgaaatttgtactctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggatgaattacatgttcaaagtatgaaaa 11802  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
     | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  11803 atgggtattagttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtc 11902  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  11903 atgttg 11908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 44)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Original strand, 55376494 - 55376780
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 130  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55376494 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcacttttgaaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 55376593  T
Q  131 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaag 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||     
T  55376594 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttctaagtatgaaaaa 55376693  T
Q  231 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    | ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55376694 tgggtatgtg-tgaaaatatactcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgtt 55376780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 44056266 - 44055979
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  44056266 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 44056167  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44056166 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat-tttgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 44056068  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
     |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44056067 atgaatatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 44055979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 31 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 30458255 - 30457952
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  30458255 taaggtaagggggttagaattcatcataattacttattgtaattttgaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 30458156  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  30458155 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttagatgtatgaagttatggataattaaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgtaaa 30458056  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||    
T  30458055 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattacgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtc 30457956  T
Q  330 atgt 333  Q
    ||||    
T  30457955 atgt 30457952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 53704629 - 53704933
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53704629 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgttatttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 53704728  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  53704729 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatgaaaa 53704828  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
     | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |  |||    
T  53704829 atgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtc 53704927  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  53704928 atgttg 53704933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 23269829 - 23270134
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  23269829 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgtttaattggatgaattgattaattgttcataag 23269928  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  23269929 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 23270026  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatg 327  Q
    || | ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  23270027 aaatgggtatgtgttgaaaatatactcaattgatgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtatcatgatcaattgatgttgttgttgttaag 23270126  T
Q  328 tcatgttg 335  Q
    ||||||||    
T  23270127 tcatgttg 23270134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 50 - 335
Target Start/End: Original strand, 45458769 - 45459055
Alignment:
Q  50 ttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctcta 148  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  45458769 ttcatcataatcatttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataagtgatgaaatttgtgctcta 45458868  T
Q  149 tttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaat 248  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| || ||    
T  45458869 attatgatgacatgtttagatgtatgaagtgatagataattgaattgttgttagttgaattacatgctcaaaatatgagaagtttgtatatgttaaagat 45458968  T
Q  249 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45458969 atgttcaattggtgaattatgctttgctgttgttgaattgtgataagtttcatgaccaattgatgttgttgttgatatgtcatgttg 45459055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16732520 - 16732216
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttc-aattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||| | ||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  16732520 taaggtaaagaggttagaattcatcataatcattattgcaattttttaattagt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 16732422  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16732421 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 16732322  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||    
T  16732321 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaagtc 16732222  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  16732221 atgttg 16732216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Original strand, 12837096 - 12837383
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||      
T  12837096 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctattttcaatt-tttgaatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtccataaa 12837194  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12837195 tgatgatattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 12837294  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  12837295 attggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatggtcaatggatgttgtt 12837383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 35 - 318
Target Start/End: Original strand, 8872372 - 8872654
Alignment:
Q  35 gtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatg 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  8872372 gtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtggtg 8872471  T
Q  135 aaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttgg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| || | ||    
T  8872472 aaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagctatgaatgattgaagtgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatgaaaaatggg 8872571  T
Q  235 tatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  8872572 tatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcgttgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgtt 8872654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 34395609 - 34395304
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||      
T  34395609 taaggtaagggggttagaattcatcattatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaactgattaattgttcataaa 34395510  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt--atgag 227  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  34395509 tgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtaatgaataattgaattgt-gttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 34395411  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatg 327  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  34395410 aa-tgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatg 34395312  T
Q  328 tcatgttg 335  Q
    ||||||||    
T  34395311 tcatgttg 34395304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 44347177 - 44346891
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 130  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  44347177 taaggtaagggagttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 44347078  T
Q  131 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag-aa 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  44347077 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtaagaaa 44346979  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
     | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  44346978 atgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatacattgttgttcatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgtt 44346891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 21959359 - 21959663
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||| |||| |||||      
T  21959359 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttatttgggtgaattaattgattgttcataaa 21959458  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||| ||    
T  21959459 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttaaatgtatgaagttatggatatttgaattgttgttgattgaattacat-ctcaaagtatgaaaa 21959557  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||    
T  21959558 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtc 21959657  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  21959658 atgttg 21959663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Original strand, 53907604 - 53907882
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 130  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||||||    
T  53907604 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtagttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggat--------taattgttcatatgt 53907695  T
Q  131 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaag 230  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| ||     
T  53907696 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttattagttggattgtatgttcaaagtatgaaaaa 53907795  T
Q  231 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    | ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  53907796 tgggtatgtg-tgaaaatatgcccaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaatgtttcatgatcaattgttgttgtt 53907882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 31 - 246
Target Start/End: Original strand, 20813442 - 20813658
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  20813442 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttaaattatttgtatgaaaaatgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 20813541  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20813542 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 20813641  T
Q  230 gttggtatatgttgaaa 246  Q
     | ||||| ||||||||    
T  20813642 atgggtatgtgttgaaa 20813658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Original strand, 819826 - 820099
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  819826 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttaattatttgtatgaaaaatgcttaattgggtgaattgattaattgttcataag 819925  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||     | ||| ||    
T  819926 tgatgaaattcgtgctctaattatggtgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt-gttg--------gtt-----tgtga-aa 820010  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
     |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  820011 atgtgtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgtt 820099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Original strand, 52265403 - 52265691
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  52265403 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgtttaattgggt-aattgattaattgttcata 52265500  T
Q  128 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 227  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||    
T  52265501 gatgatgaaattcgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaattttatgttcaaagtatgag 52265600  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  52265601 aaagtggtatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgcaatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgtt 52265691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27961324 - 27961018
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||   |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  27961324 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattgttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 27961227  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 226  Q
    |  || |  ||| ||||||| | ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27961226 aattgttagaatccgtgctccaattatgatgacatgtttgaatgcatgaagttatgaataattgaattgttgttagtggaatttcatgttcaaagtatga 27961127  T
Q  227 -gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgat 324  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||   | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27961126 agaagt-ggtatatgttg-aaatatgctaaattggttgaattatgttatattgttgttgaattgttataagattcatgatcaattgatgttgttgttgtt 27961029  T
Q  325 atgtcatgttg 335  Q
    | || ||||||    
T  27961028 aagtgatgttg 27961018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Original strand, 13809405 - 13809693
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttg-taattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||  | |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||    
T  13809405 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgccatttttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaattgattaattgttcata 13809502  T
Q  128 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 227  Q
      || |  ||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||| |||||||| | | |||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||||    
T  13809503 attgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgagatttcatgttcaaagtatgag 13809602  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaatt-ggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13809603 aaaatggtatatgttg-aaatatgctcaattagttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgtt 13809693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15045181 - 15044875
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||| |||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  15045181 taaggtaagggggttagatttcatcataatcattttagtttaaattctcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 15045084  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 226  Q
    |  || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  15045083 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatga 15044984  T
Q  227 gaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgata 325  Q
    |||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  15044983 gaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgcta 15044885  T
Q  326 tgtcatgttg 335  Q
     || ||||||    
T  15044884 agtgatgttg 15044875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Original strand, 30232391 - 30232679
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt--caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  30232391 taaggtaagagggttagaattcatcataatcacttattgcaattttttcaattatg-gtatgaataagtgcttaattgtgt-aattgattaattgttcat 30232488  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 226  Q
    |  || |  ||||||||||| | ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || | |||| ||||||||||     
T  30232489 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtttgtatatatgaagttatg-ataattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgt 30232587  T
Q  227 gaa--gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||  || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30232588 gaaaagtgggt-tatgt-gaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgtt 30232679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 18494224 - 18494528
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 128  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||  |||||| || |||||||||||  | ||||||| ||||| |||||     
T  18494224 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatg-gtatgaataggtgcttaattgtgt-aattgatcaattgttcataa 18494321  T
Q  129 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 228  Q
     || |  ||||||||||| | |||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || | |||| |||||||||||||    
T  18494322 ttgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgttcgtatgtatgaagttatg-ataattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgaga 18494420  T
Q  229 agt-tggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatat 326  Q
    |   ||||||||||||||| | |||||||||||| | || ||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||| ||| ||     
T  18494421 aaaatggtatatgttgaaa-tgtgctcaattggttggatgatgctatgttgttgttgaattgtgttaagattcatgatcaattgttgctgttgttgttaa 18494519  T
Q  327 gtcatgttg 335  Q
    || ||||||    
T  18494520 gtgatgttg 18494528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 112 - 324
Target Start/End: Original strand, 47535042 - 47535254
Alignment:
Q  112 tgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattac 211  Q
    |||||||||| |||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |    
T  47535042 tgattaattgttcataaatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttc 47535141  T
Q  212 atgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattg 310  Q
    | ||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||    
T  47535142 aagttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattatgataagaatcatgttcaattg 47535240  T
Q  311 atgttgtttttgat 324  Q
    | |||||| |||||    
T  47535241 acgttgttgttgat 47535254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 15109243 - 15109549
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||| |||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||  ||||    
T  15109243 taaggtaagggggttagatttcatcataatcattttagtttaaattctcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattattcat 15109340  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 226  Q
    |   | |  ||||| ||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  15109341 aatagttagaattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatga 15109440  T
Q  227 gaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgata 325  Q
    |||  || ||||||||| || ||| ||| ||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  15109441 gaaagtgatatatgttg-aattatactcaaattgataaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgcta 15109539  T
Q  326 tgtcatgttg 335  Q
     || ||||||    
T  15109540 agtaatgttg 15109549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 318
Target Start/End: Original strand, 7185735 - 7186027
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtc 124  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||| ||    
T  7185735 taattaaggtaaggaggttagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttc 7185833  T
Q  125 atatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtat 224  Q
    |||  || | ||||| |||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| |||  |||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||| |||||    
T  7185834 atagttgttaaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtat 7185933  T
Q  225 gagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    | |||  || ||||||||| || | ||| | || || |||||| |||  |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||    
T  7185934 gtgaaaatgatatatgttg-aattgtgcactaaatgatgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgtt 7186027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Original strand, 41165983 - 41166146
Alignment:
Q  172 atgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgc 270  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||    
T  41165983 atgaagttgttgataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgc 41166081  T
Q  271 attgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
      ||||||||||||||||||  |||  ||||| ||||||||||||||| ||| || || ||||||    
T  41166082 tatgttgttgttgaattgtggcaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttg 41166146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Original strand, 41256263 - 41256552
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||  ||||||| | ||||||||||||| || || |||||||||| ||||    
T  41256263 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagttgtaatttttcatttgttgtatgtttaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcat 41256361  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 226  Q
    |  || |||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||     
T  41256362 agttgttgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgttga-atgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgt 41256460  T
Q  227 gaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||  || |||||  || || ||||||| ||||| |||||| |||   ||||||||||||||||||| ||   |||| | |||||||||||||    
T  41256461 gaaaatgatatattgtg-aattatgctcaaattgttgaattgtgctaggttgttgttgaattgtgatgagaaccatgtttaattgatgttgtt 41256552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 18276743 - 18276498
Alignment:
Q  72 ttttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatg 170  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | |  |||||||||| |||||  || | ||||||||||||||  |||||||| ||||||  |||    
T  18276743 ttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattgagt-atgtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaaatatgatgatatgtttgaatg 18276646  T
Q  171 tatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatg 269  Q
     ||||| ||   ||||||| |||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||| |||  || ||||||||| || ||||||| || || |||||| ||    
T  18276645 catgaaattggtgataattaaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagcatgtgaaagtgttatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattgtg 18276547  T
Q  270 cattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |  | |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  18276546 ctatattgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgtt 18276498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 14951896 - 14951826
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  14951896 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 14951826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 15272433 - 15272503
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  15272433 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgttccatgatcaatagatgttgtt 15272503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 54118138 - 54118199
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54118138 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 54118199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 14901584 - 14901296
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||  || |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||| ||||    
T  14901584 taaggtaagggggttaaatttcatcataatcattttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcat 14901487  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 226  Q
    || || |  ||||||||||||| ||||||  | ||||||  ||||||||| || | || ||||| ||||||||| ||  |||| ||||||  ||||||||    
T  14901486 atttgttataattcgtgctctaattatgacaatatgtttgaatgtatgaaattgttgaaaattg-attgttgttggtgaaatttcatgtttgaagtatga 14901388  T
Q  227 gaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||  || ||||||||  |||||||||| || || |||||||||   |||| || |||||||||| ||||  ||||  |||||||||||||||    
T  14901387 gaaagtgatatatgtt-taaatatgctcaaaatgttgaattatgatatgttattattgaattgtggtaagaatcatattcaattgatgttgtt 14901296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Original strand, 15013177 - 15013465
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||||| || || ||||| | ||||||||||||| || || |||||||||| ||||    
T  15013177 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagttgtaattttcatttgtt-gtatgtttaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcat 15013274  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 226  Q
    |  || | |||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||     
T  15013275 agttgtttaaattcgtgctctaattatgatgatatgttga-atgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgt 15013373  T
Q  227 gaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||  ||  ||||  || || ||||||| ||||| |||||| |||   ||||||||||||||||||| ||  ||||| | ||||||| |||||    
T  15013374 gaaaatgacatattgtg-aattatgctcaaattgttgaattgtgctaggttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatattgtt 15013465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 248 - 304
Target Start/End: Original strand, 5682648 - 5682704
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgat 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5682648 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgat 5682704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 25119328 - 25119398
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  25119328 tatgatcaattggtgaattatgcatggtttttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 25119398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 25119077 - 25119138
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  25119077 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggagttagtttttatcataatca 25119138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 62
Target Start/End: Original strand, 5682407 - 5682459
Alignment:
Q  10 gagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  5682407 gagctaatagttggtgataattaaggtaagtgggttagtttttatcataatca 5682459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Original strand, 7964606 - 7964894
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||  | || ||| |||||| |||||    
T  7964606 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgagtaattgttcata 7964704  T
Q  128 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 227  Q
      || | |||| ||||||||| ||||||||| ||||||  ||  ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||| ||||||| |    
T  7964705 gttgttaaaatccgtgctctaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttc-aagtatgtg 7964803  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||  || ||||||||| || ||||||| || || |||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||  ||||| | ||||||| |||||    
T  7964804 aaagtgttatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgattttgtt 7964894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 324
Target Start/End: Original strand, 10104380 - 10104454
Alignment:
Q  250 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgat 324  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  10104380 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttgttgat 10104454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 38765066 - 38764773
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagtgttcatc-ataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgataa-gtgcttaattggatgaattgattaattgg 122  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||| | ||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||||| ||||||| ||| || ||||||||| ||      
T  38765066 taattaaggtaagagggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgataaagtgcttagttgaat-aattgattatttt- 38764969  T
Q  123 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 222  Q
    |||||  || ||||||||||||| || |||||  || ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||    
T  38764968 tcatagttgttgaaattcgtgctttaattatggggatatgtttgaatgaatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcatagt 38764869  T
Q  223 atgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||| |||  || |||||  || || | ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||| |||| |||| ||  ||||| | |||||||||||||    
T  38764868 atgtgaaaatgttatattgtg-aattgtgctcaaattgttgaattatgcgatgttgttgttcaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgtt 38764773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 324
Target Start/End: Original strand, 40885676 - 40885758
Alignment:
Q  242 tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgat 324  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||   ||| ||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  40885676 tgaaattatgctcaattggtgaactttgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttgttgat 40885758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 315
Target Start/End: Original strand, 15675219 - 15675284
Alignment:
Q  250 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 315  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  15675219 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 15675284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 225
Target Start/End: Original strand, 40904932 - 40905024
Alignment:
Q  133 tgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 225  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||  ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||    
T  40904932 tgaaattcgtgctctagttatgatgatatgtttgaatacatgaaattgctgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 40905024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 31115764 - 31115697
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 315  Q
    ||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  31115764 tatgctcaattggtgaattttcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 31115697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 67
Target Start/End: Original strand, 41165838 - 41165885
Alignment:
Q  20 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt 67  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  41165838 ttggtgataattaacgtaagggggttagaattcatcataatcattttt 41165885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 44)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 20573087 - 20573392
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  20573087 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 20573186  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  20573187 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 20573286  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
       ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20573287 aagggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatcctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtc 20573386  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  20573387 atgttg 20573392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 41247009 - 41246705
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||      
T  41247009 taaggtaagggggttagagttcatcataatcacttattgtaattttcaattagttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaatttttcataaa 41246910  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||    
T  41246909 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttagatgtatgaagttatgaataattaaattgttgttggttgaattacatgttaaaagtaggaaaa 41246810  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
     | |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  41246809 atgggtatatgatg-aaatatgcttaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtc 41246711  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  41246710 atgttg 41246705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 31 - 314
Target Start/End: Original strand, 20561526 - 20561810
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  20561526 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 20561625  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20561626 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatagataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 20561725  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 314  Q
     |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20561726 attggtatatgttgaaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 20561810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 22234700 - 22235003
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 130  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||    
T  22234700 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattgaatgaattgattaattgttcataagt 22234799  T
Q  131 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaga 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||| |    
T  22234800 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacgtgtttagatgtatgaagttatgaataatttaattg-tgttagttgaattacatgctcaaagtgtatga-a 22234897  T
Q  229 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 328  Q
    | | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |  ||    
T  22234898 aatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagt 22234996  T
Q  329 catgttg 335  Q
    |||||||    
T  22234997 catgttg 22235003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 31 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 37612020 - 37611717
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  37612020 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattataattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattagatgaattgattaattgttcataag 37611921  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  37611920 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttataaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 37611823  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatg 327  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| || |    
T  37611822 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaag 37611723  T
Q  328 tcatgt 333  Q
    ||||||    
T  37611722 tcatgt 37611717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20481955 - 20481652
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||       
T  20481955 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcacttttgtaattttcaattaat-gtatgaataagtgcttaattggat-aattgattatttgttcatgga 20481858  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20481857 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 20481758  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
     | | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  20481757 atggatatgtgttgataatatgctcaattggtgaattatactttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtc 20481658  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  20481657 atgttg 20481652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 19992952 - 19993254
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 130  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  19992952 taaggtaagggggttataattcatcataatcacttttgtaattt-caattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaat 19993050  T
Q  131 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaga 228  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||| |    
T  19993051 gatgaaatccgtactctaattatgatgacatgtttagatgtacgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacttgttcaaagtgtatga-a 19993148  T
Q  229 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 328  Q
    | | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||| |  ||    
T  19993149 aatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataaatttcatcatcaattgttgttgttgttgtttagt 19993247  T
Q  329 catgttg 335  Q
    |||||||    
T  19993248 catgttg 19993254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21681356 - 21681049
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  21681356 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaatttgttgaattgattaattgttcata 21681258  T
Q  128 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 227  Q
      |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||  |||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  21681257 aatgataaaattcgtgatctaattatgatgacatatttgaatgtataagtttatggataattgaattattgttagttgaatttcatgtttaaagtatgag 21681158  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatat 326  Q
    |    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  21681157 agaagggtatatgttgaaaatatgctcaattggttaaattatgctttgttgttgttgaattgtgattagtttcatgatcaattgatgttgttactggtat 21681058  T
Q  327 gtcatgttg 335  Q
    || ||||||    
T  21681057 gtgatgttg 21681049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 174 - 335
Target Start/End: Original strand, 20653944 - 20654105
Alignment:
Q  174 gaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatt 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||       
T  20653944 gaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaattggtatatattgaaaatatgcttaattggtgaattatgctaa 20654043  T
Q  274 gttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||    
T  20654044 gttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaggtcatgttg 20654105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25122793 - 25122618
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 130  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  25122793 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattataattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaat 25122694  T
Q  131 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttga 206  Q
    ||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  25122693 gatcaaattcgtgctccaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgctagttga 25122618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 335
Target Start/End: Original strand, 21198035 - 21198352
Alignment:
Q  20 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgat 115  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  | |||||||    
T  21198035 ttggtgataattaagataagggggttagaattcattataatcattttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattgagt-aattgat 21198132  T
Q  116 taattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgt 215  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||| |||||    
T  21198133 taattgttcatagatgatgaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgtagataattgaattgttgttggtgaaatttcatgt 21198232  T
Q  216 tcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 314  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||   |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||    
T  21198233 tcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgttatgttgttgttgaattgtggtaagaatcatgttcaattgatgt 21198331  T
Q  315 tgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    |||| ||| || || ||||||    
T  21198332 tgttgttgctaagtgatgttg 21198352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23837561 - 23837245
Alignment:
Q  22 ggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttttgta---attttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  ||   |||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||| ||||    
T  23837561 ggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttaatatagattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gatt 23837464  T
Q  117 aattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgtt 216  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |  |||| ||||||    
T  23837463 aattgttcatagatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttaaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttattgaaatttcatgtt 23837364  T
Q  217 caaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 315  Q
    |||||||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||    
T  23837363 caaagtatgagaaagtgatatatgttg-aactatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgtt 23837265  T
Q  316 gtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    ||| ||| || || ||||||    
T  23837264 gttgttgctaagtgatgttg 23837245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 39446660 - 39446966
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  39446660 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataaatgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 39446757  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg- 225  Q
    |  || |  ||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||     
T  39446758 aattgttagaattcatgctccaattatgatgacatgtttgaatgcttgaagttgtggataattgaattgttgttagtggaatttcatgtttaaagtatga 39446857  T
Q  226 agaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgat 324  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  39446858 agaag-tgttatatgttg-aaatatgctaaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgct 39446955  T
Q  325 atgtcatgttg 335  Q
    | || ||||||    
T  39446956 aagtgatgttg 39446966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 188 - 335
Target Start/End: Original strand, 20647882 - 20648029
Alignment:
Q  188 ttgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaatt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  20647882 ttgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaattggtatatgttgaaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaatt 20647981  T
Q  288 gtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||    
T  20647982 gtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaggtcatgttg 20648029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 22981622 - 22981351
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  | ||| |||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |    
T  22981622 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatatattgcaatttttcaatt--ttgtatgaataagtgcttaattgggt-aattgattaattgttcaga 22981526  T
Q  128 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 227  Q
    ||  |||||||| |||||||| ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||    
T  22981525 tg--atgaaatttgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgag 22981428  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgat 304  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22981427 aaagtggtatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgat 22981351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 135
Target Start/End: Original strand, 7000524 - 7000624
Alignment:
Q  35 gtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatg 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7000524 gtaagggggttagttttcatcataatcacttttttaattttcaattatttgtatgataagtgcttaataggatgaattgattaattgttcatatgtgatg 7000623  T
Q  135 a 135  Q
    |    
T  7000624 a 7000624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17285570 - 17285341
Alignment:
Q  20 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||   |||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  17285570 ttggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-gtatgattaagtgcttaattgaat-aattg 17285473  T
Q  114 attaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacat 213  Q
    | |||||| |||||  || |  ||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||| |||    
T  17285472 aataattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttaaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcat 17285373  T
Q  214 gttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaa 245  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  17285372 gttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaa 17285341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 136 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 38533895 - 38533696
Alignment:
Q  136 aattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggt 235  Q
    ||||||| ||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||||  ||||    
T  38533895 aattcgtactccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaatctcatgttcaaagtatgagaaaatggt 38533796  T
Q  236 atatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgtt 334  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| || || |||||    
T  38533795 atatgttgaaa-tatgctcaaattattgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaggtgatgtt 38533697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 26011848 - 26011558
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgg 122  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||  | || ||||||||||     
T  26011848 taattaaggtaagggggtta---ttcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtgtttaattgagt-aagtgattaattgt 26011754  T
Q  123 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 222  Q
    |||||  || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  26011753 tcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcaaagt 26011654  T
Q  223 atgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||| |||  || ||||||||| || ||||||| || || |||||| |||  |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||    
T  26011653 atgtgaaagtgttatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttgaattgatgttgtt 26011558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 5854971 - 5854678
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgg 122  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||     
T  5854971 taattaaggtaaggaggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgt 5854874  T
Q  123 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 222  Q
    |||||  || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||    
T  5854873 tcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggcgataattgaattgttgttggtgaaatagcatgttcaaagt 5854774  T
Q  223 atgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||  |||  || |||||||||||  ||||||| || || ||| || |||  |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  5854773 atatgaaagtgttatatgttgaat-tatgctctaaatgttgagttgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgtt 5854678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 15933655 - 15933362
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagtgtt-catcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgg 122  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  || ||||||||||     
T  15933655 taattaaggtaagggggttagaattaaatcataatcatttagtgtaatttttcaatta-ttgtatgattaagtgcttaatt-gagtaagtgattaattgt 15933558  T
Q  123 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 222  Q
    |||||  || | ||||| |||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  15933557 tcatagttgttaaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 15933458  T
Q  223 atgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||| |||  || || |||||| || ||||||| || || |||||| ||   ||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||    
T  15933457 atgtgaaagtgttaaatgttg-aattatgctctaaatgttgaattgtgttatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgtt 15933362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 121
Target Start/End: Original strand, 20529748 - 20529839
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattg 121  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20529748 taaggtaagggggttataattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattg 20529839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 274577 - 274507
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  274577 tatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 274507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 641272 - 641342
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  641272 tatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 641342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 827078 - 827148
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  827078 tatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 827148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 16039002 - 16039072
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16039002 tatgctcaattagtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 16039072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 29306776 - 29306481
Alignment:
Q  27 taattaaggtaag-ggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattg 121  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||  |||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  29306776 taattaaggtaagaggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattgattg 29306678  T
Q  122 gtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaag 221  Q
     |||||  || | | ||||||||||||  |||||||| |||||   ||| ||||| |||  |||||||||||||||||| ||  | ||  ||||||||||    
T  29306677 ttcatagatgttaatattcgtgctctaactatgatgatatgttctaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaatttgtatgttcaaag 29306578  T
Q  222 tatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    | || |||  || |||||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||    
T  29306577 tttgtgaaaatgatatatgttgaat-tatgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgtt 29306481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 41506930 - 41507000
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  41506930 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 41507000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 16404870 - 16404931
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16404870 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 16404931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 24716732 - 24716793
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24716732 gtgaagctagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 24716793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 39115409 - 39115339
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  39115409 tatgctcaattggtgaattatgcatagttgttgatgaatcgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 39115339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 274828 - 274767
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  274828 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 274767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 641021 - 641082
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  641021 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 641082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 826827 - 826888
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  826827 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 826888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 33528808 - 33528489
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgc 97  Q
    |||||||| ||||||  | || ||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| ||||||    
T  33528808 gtgaagtttgagctaggaatttgtgctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgc 33528709  T
Q  98 ttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgtt 197  Q
    ||||||| || || |||||||||| || ||  || |||| | ||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| || | |||||||||||||||    
T  33528708 ttaattgaat-aagtgattaattgttcttagatgttgaattccgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattgaattgtt 33528610  T
Q  198 gttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagt 296  Q
    |||  |  ||||  || |||  |||||  |||  || ||||||||| || | ||||| || || |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||     
T  33528609 gttgatgaaattgtatcttcttagtatatgaaaatgatatatgttg-aattgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgaga 33528511  T
Q  297 ttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||||| | |||||||||||||    
T  33528510 ttcatgtttaattgatgttgtt 33528489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 24716983 - 24717053
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| ||||| | |||||||    
T  24716983 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatttgtttcatgttcaatggttgttgtt 24717053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 39115660 - 39115599
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  39115660 gtgaagcttgagctaatagttggtaataattaaggtaagggtgttagttttcatcataatca 39115599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 22743122 - 22742828
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagtgttcatc-ataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgg 122  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| | ||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||||| |||     
T  22743122 taattaaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttagttgaat-aattgattatttgt 22743024  T
Q  123 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 222  Q
    |||||  || ||||||||||||| |  ||||| ||| ||||||   || ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||    
T  22743023 tcatagttgttgaaattcgtgctttgattatggtgatatgtttgagtgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagt 22742924  T
Q  223 atgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||| |||  || |||||  || || | ||||| || || |||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||  ||||| | |||||||||||||    
T  22742923 atgtgaaaatgatatattgtg-aattgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgtt 22742828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 318
Target Start/End: Original strand, 22735839 - 22736021
Alignment:
Q  136 aattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagt-tgg 234  Q
    ||||||||||| | ||||||| | ||||| | ||| |||||||  | ||||||||| |||||||| ||  || | |||||||||||||| | ||   ||     
T  22735839 aattcgtgctccaattatgataatatgttga-atgcatgaagtggttgataattgagttgttgttggtaaaacttcatgttcaaagtataaaaaaaatga 22735937  T
Q  235 tatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||||||||||  |||| |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22735938 tatatgttgaat-tatgatcaaattgatgaattatactatgttgttgttggattgtgataagattcatgttcaattgatgttgtt 22736021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 289
Target Start/End: Original strand, 24385873 - 24385914
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgt 289  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  24385873 tatgctcaattggtgaattaagcattgttgttgatgaattgt 24385914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Original strand, 38635541 - 38635831
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatc-ataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    |||||||||||||||||  |||| | ||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||| || || ||| |  ||| ||||    
T  38635541 taaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattgaat-aagtgaatctttgttcat 38635639  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 226  Q
    |  || |||||||||||||||| |||| |||| ||||||  ||  ||||| |||  |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| | ||||     
T  38635640 agttgttgaaattcgtgctctagttatcatgatatgtttgaatacatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcataatatgc 38635739  T
Q  227 gaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||  || |||||  || || ||| ||| ||||| |||||| ||   ||||||||||||||| |||| ||  ||||| | |||||||||||||    
T  38635740 gaaaatgatatattgtg-aattatactcaaattgttgaattgtgttatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgtt 38635831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 325
Target Start/End: Original strand, 22497329 - 22497399
Alignment:
Q  255 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgata 325  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  22497329 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgata 22497399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 220
Target Start/End: Original strand, 23151810 - 23151918
Alignment:
Q  112 tgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattac 211  Q
    |||||||||| |||||| || | ||||||||| || | ||||||||| || |||  ||| |||||  ||  |||||||||||||||||| ||  |||| |    
T  23151810 tgattaattgttcatatttgttaaaattcgtgttccaattatgatgatatatttgaatgcatgaaactagtgataattgaattgttgttggtgaaatttc 23151909  T
Q  212 atgttcaaa 220  Q
    |||||||||    
T  23151910 atgttcaaa 23151918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 67
Target Start/End: Original strand, 31194217 - 31194253
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt 67  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  31194217 taaggtaagggggttagttttcatcataatcattttt 31194253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 31 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 18570630 - 18570353
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 130  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  18570630 taaggtaagggggttagaattcatcataatcaattttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 18570531  T
Q  131 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaag 230  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  18570530 gatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgatgttatggataattgaattgttattagttaaattacatgttcaaagtatgaaaaa 18570431  T
Q  231 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 308  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18570430 tgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 18570353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 32899142 - 32898837
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||      
T  32899142 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattattggtatgaaaagtgcttaatttggtgaattgattaattgttcataaa 32899043  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32899042 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 32898943  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||    
T  32898942 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgaagttgttgttgtttagtc 32898843  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  32898842 atgttg 32898837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16086369 - 16086064
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||      
T  16086369 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattaattgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaa 16086270  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  16086269 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtttgttgaattacatgttcaaagtacgaaaa 16086170  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
     | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16086169 atgggtatgtgttgaaaatatgcttaattggtgaattataccttgttgttgttgaattatgataagtttcatgatcatttgatgttgttgttgatatgtc 16086070  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  16086069 atgttg 16086064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16106868 - 16106563
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||| || ||      
T  16106868 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattaattgtatgaaaagtgcttaattgagtgaattaattaattgttcgtaaa 16106769  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16106768 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 16106669  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
     |  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16106668 atgagtatgtgttgaaaatatgcttaattggtgaattataccttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcatttgatgttgttgttgatatgtc 16106569  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  16106568 atgttg 16106563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22441285 - 22440981
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 130  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |    
T  22441285 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgcaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattgagtgaattgattaattgttcatatat 22441186  T
Q  131 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaag 230  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  | ||||||||||||| ||||||||| ||     
T  22441185 gatgaaattcgtactctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgtgatggggtgaattacatgttaaaagtatgaaaaa 22441086  T
Q  231 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtca 330  Q
    | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||    
T  22441085 tgggtatgagttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttcatgatttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtca 22440986  T
Q  331 tgttg 335  Q
    |||||    
T  22440985 tgttg 22440981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 98 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 31628552 - 31628315
Alignment:
Q  98 ttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgtt 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||  || | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31628552 ttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtattcgaattatgattacatgtttagatgtatgaagttattgataattgaattgtt 31628453  T
Q  198 gttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31628452 gttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtt 31628353  T
Q  298 tcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31628352 tcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttg 31628315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18432994 - 18432690
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaa-ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||      
T  18432994 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaaattttcaattatt-gtatgaaaagagcttaattgggtgaattgattatttgttcataaa 18432896  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  18432895 tgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatacttgaattgttgttgattgaattacatgttaaaagtatgaaaa 18432796  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
     | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||     
T  18432795 atgggtgtatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgatgttgttgatatgtt 18432696  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  18432695 atgttg 18432690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 31 - 316
Target Start/End: Original strand, 13014603 - 13014890
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattat--ttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  13014603 taaggtaagggggttagaatttatcataatcacttattgtaattttcaattatgtttgtatgaaaagtgctaaattgggtgaattgattaattgttcata 13014702  T
Q  128 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 227  Q
     ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||     
T  13014703 agtgatgaaattcgtgctttaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgtt-gaagtatgaa 13014801  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttg 316  Q
    || | |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13014802 aaatgggtatgagttggaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcaagatcaattgttgttg 13014890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 18777481 - 18777210
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||                  |||||      
T  18777481 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattggaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgt-----------------tcataaa 18777399  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18777398 agatgaaattcgtgttctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 18777299  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
     | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18777298 atgggtatgtgttgaaaatatgttcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatgaatgttgtt 18777210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18399290 - 18398985
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||| |||||| |||||    
T  18399290 taaggtaagggggttagaattcttcataatcattttagtgtaaatttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgactaattgttcata 18399193  T
Q  128 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 227  Q
      || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||    
T  18399192 attgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgag 18399093  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatat 326  Q
    ||  | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| ||     
T  18399092 aaaatagtatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaa 18398994  T
Q  327 gtcatgttg 335  Q
    || ||||||    
T  18398993 gtgatgttg 18398985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 25367130 - 25367437
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||    
T  25367130 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattg-agcaattgattaattgttcat 25367227  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatg-gataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 225  Q
    |  || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  |||||||||||| |  |||||| |||||||||||||   |||| |||||||||||||||    
T  25367228 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgtatgaagttttttgataatggaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatg 25367327  T
Q  226 agaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgat 324  Q
    ||||  |||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  25367328 agaaagtggtttatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattgtgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgct 25367426  T
Q  325 atgtcatgttg 335  Q
    | || ||||||    
T  25367427 aagtgatgttg 25367437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 318
Target Start/End: Original strand, 22361649 - 22361948
Alignment:
Q  20 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||| |  || |||||    
T  22361649 ttggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattg-agcaaatgatt 22361746  T
Q  117 aattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgtt 216  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| || | ||||||||||||||||||  |  |||| ||||||    
T  22361747 aattgttcatagatgataaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattgaattgttgttgctgaaatttcatgtt 22361846  T
Q  217 caaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 315  Q
    |||||||||||||  ||  ||| |||| || ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  22361847 caaagtatgagaaagtgacataagttg-aattatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgaaattcatgttcaattgatgtt 22361945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21623533 - 21623215
Alignment:
Q  20 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaattt-tcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  |||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||    
T  21623533 ttggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttctcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattga 21623436  T
Q  115 ttaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatg 214  Q
    ||||||| |||||  || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |  |||| ||||    
T  21623435 ttaattgttcataaatgttagaattcgtgctccaattatgatggtatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttgctgaaatttcatg 21623336  T
Q  215 ttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatg 313  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  ||||| || |||||||    
T  21623335 ttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagaatcatgttctattgatg 21623237  T
Q  314 ttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    ||||| ||| || || ||||||    
T  21623236 ttgttgttgctaagtgatgttg 21623215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 314
Target Start/End: Original strand, 21410944 - 21411228
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||    
T  21410944 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattg-aggaattgactaattgttcat 21411041  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 226  Q
    |   | |  |||| |||||| | ||||||||  |||| |  ||| |||||||| | ||||||||||| |||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  21411042 aatcgttagaatttgtgctccaattatgatgttatgtatgaatgcatgaagttgttgataattgaatggttgttaaataaatttcatgttcaaagtatga 21411141  T
Q  227 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 314  Q
    |||  |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||  ||||| ||||| ||| || | || ||||||  ||||||||||    
T  21411142 gaaagtggtatatgttg-aaatatgctcaaattgtgaattatgctatgttgatgttggattatgctgagattcatgtgcaattgatgt 21411228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 335
Target Start/End: Original strand, 18381684 - 18381883
Alignment:
Q  136 aattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggt 235  Q
    |||| |||||||| ||||||||| || |||  ||  |||||||| | ||||||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||  || |    
T  18381684 aatttgtgctctaattatgatgatatttttgaatacatgaagttgttgataattgaatggttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgat 18381783  T
Q  236 atatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgtt 334  Q
    ||||||||||  |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||| || || |||||    
T  18381784 atatgttgaat-tatgcttaaattgttgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtt 18381882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 150 - 335
Target Start/End: Original strand, 28195108 - 28195294
Alignment:
Q  150 ttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaata 249  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| || ||||     
T  28195108 ttatgatgatatgtttgaatgtatgaagttgttgataattgaattgttgttagtaaaatttcatgttcatagtatgagaaaatggtatatgatg-aaatg 28195206  T
Q  250 tgctcaatt-ggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataag-tttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    ||||||||| | ||||||||||  || ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||| ||| ||| || || ||||||    
T  28195207 tgctcaattagttgaattatgccatgatgttgttgaattgtgatgagattttatgatcaattgttgtggttgttgctaagtgatgttg 28195294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 248 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 18583451 - 18583375
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgat 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18583451 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgttgttgat 18583375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 26089869 - 26089799
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26089869 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 26089799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 324
Target Start/End: Original strand, 17083093 - 17083386
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 128  Q
    |||||||||||||||||  |||||  |||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||| |||||     
T  17083093 taaggtaagggggttagaattcattttaatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcatag 17083191  T
Q  129 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 228  Q
     || | | |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| |  || ||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||| |||||| ||    
T  17083192 ttgttaatattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaattggtg-ataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtga 17083290  T
Q  229 agttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgat 324  Q
    |  || |||||||||||  | ||||| || || |||||| |||  |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||| |||||    
T  17083291 aaatgatatatgttgaat-tgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgat 17083386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Original strand, 18629502 - 18629791
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| ||||| ||||||| || || |||||||||| |||||    
T  18629502 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaattttttatttgttgtatgattaagtgtttaattgaat-aagtgattaattgttcata 18629600  T
Q  128 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 227  Q
      || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| |    
T  18629601 gttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtg 18629700  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||  ||||||||  || || |||||||  | || |||||| |||  |||| ||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||    
T  18629701 aaagtggtatattgtg-aattatgctctgaatgttgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgtt 18629791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 15742341 - 15742411
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15742341 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgtt 15742411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 23995057 - 23994987
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23995057 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgtt 23994987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 245
Target Start/End: Original strand, 17556909 - 17557127
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatca-cttttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggt 123  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||| ||| || || ||||||||||||| || ||||||||| ||| |    
T  17556909 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatctagtgtaatttttcattaattgcattattaagtgcttaattgaat-aattgattatttgtt 17557007  T
Q  124 catatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagta 223  Q
    ||||  || | |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  17557008 catagttgtt-aaattcgtgctctaattatgatgatatgttt-gatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagta 17557105  T
Q  224 tgagaagttggtatatgttgaa 245  Q
    || |||  || |||||||||||    
T  17557106 tgtgaaagtgttatatgttgaa 17557127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 18002617 - 18002687
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18002617 tatgctcaattgatgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgtt 18002687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 35015278 - 35015348
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  35015278 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 35015348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 25651436 - 25651301
Alignment:
Q  183 gataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgt 281  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| |||  || ||||||||| || ||||||| || || |||||| |||  |||||||||    
T  25651436 gataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgttatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgt 25651338  T
Q  282 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||||| |||| || |||||| |||||||||||||||    
T  25651337 tgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgtt 25651301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 33325046 - 33324874
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatt--ttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 125  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  |||||||  |||||||| | |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  33325046 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaattatttcaattaat-gtatgaataagtgattaattggat-aattgattaattgttca 33324949  T
Q  126 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 200  Q
    ||  || | ||||||||||||||  || ||||| ||||||  ||| ||||| || | ||||||||||||||||||    
T  33324948 tagatgttaaaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaaattgttgataattgaattgttgtt 33324874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 253 - 335
Target Start/End: Original strand, 25744331 - 25744413
Alignment:
Q  253 tcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| |  |||||||||    
T  25744331 tcaagtggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtcatgttg 25744413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 18583702 - 18583641
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18583702 gtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 18583641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 19983162 - 19983223
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19983162 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 19983223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 35015027 - 35015088
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  35015027 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 35015088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 200
Target Start/End: Original strand, 35135906 - 35136078
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt--caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 125  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||| |||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  35135906 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaattttttcaattatt-gtatgaataagtgattaattagat-aattgattaattgttca 35136003  T
Q  126 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 200  Q
    ||  || | ||||||||||||||  || ||||| ||||||  ||| ||||| ||   ||||||||||||||||||    
T  35136004 tagatgttaaaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgtt 35136078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29605739 - 29605607
Alignment:
Q  91 taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattg 190  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||| |||||  || |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||| ||||| |||  ||||||||    
T  29605739 taagtgcttaattgaat-aagtgattatttgttcatagttgttgaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaa-ttagtgataattg 29605642  T
Q  191 aattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 225  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||    
T  29605641 aattgttgttggtgaaattacatgttcatagtatg 29605607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 222
Target Start/End: Original strand, 16887685 - 16887879
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt-gt---aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 125  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||   | |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| || || |||||||||| |||    
T  16887685 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtataatttttcaatta-ttgtatgaataagtgattaattgaat-aaatgattaattgttca 16887782  T
Q  126 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 222  Q
    ||  || | ||||||||||||||  |||||| | ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||| ||||||| ||  | || ||||||||||||    
T  16887783 tagatgttaaaattcgtgctctaactatgataatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaactgttgttggtgaatttgcatgttcaaagt 16887879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 302
Target Start/End: Original strand, 19983412 - 19983466
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatg 302  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19983412 tatgctcaattagtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatg 19983466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 222
Target Start/End: Original strand, 15079606 - 15079795
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||| ||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  15079606 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcattttagtgtaatttttcaattattt-tatgaataagggattaattggat-aattgattaattattcat 15079702  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 222  Q
    |  || | ||||||||||||||  || ||||| |||||   ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  15079703 agatgtt-aaattcgtgctctaactaggatgatatgttgt-atgcatgaagttgaggataattgaattgttgtt-gtgaaattgcatgttcaaagt 15079795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 318
Target Start/End: Original strand, 35009569 - 35009637
Alignment:
Q  250 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||   |||| |||||||||||||||    
T  35009569 tgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 35009637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22848304 - 22848172
Alignment:
Q  91 taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattg 190  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||| ||| |||||  || ||||||||||||  || ||||||||| ||||||| ||| | ||| ||   ||||||||    
T  22848304 taagtgcttagttgaat-aattgatta-ttgttcatagttgttgaaattcgtgcattaattatgatgatatgtttaaatgcaagaaattggtgataattg 22848207  T
Q  191 aattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 225  Q
    |||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||    
T  22848206 aattgttgttggtgaaatttcatgttcatagtatg 22848172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 29666004 - 29665938
Alignment:
Q  252 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||| |||   |||||||||||| || |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  29666004 ctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgttgtt 29665938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27740971 - 27740907
Alignment:
Q  250 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 314  Q
    ||||||||||||||||| |||   || |||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||    
T  27740971 tgctcaattggtgaattttgctaagtcgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgt 27740907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 36)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 21397444 - 21397156
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  21397444 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataag 21397345  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  21397344 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 21397247  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21397246 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgtt 21397156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 24183027 - 24183332
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  24183027 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 24183126  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||    
T  24183127 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagtcatggataattgaattgttgttagtcgaattacatgttcaaagtgtatgaa 24183226  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24183227 aagggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatgagtttcatgatcaattgatggtgttgttgatatgtc 24183326  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  24183327 atgttg 24183332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 11584435 - 11584115
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgctta 100  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11584435 gtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgctta 11584336  T
Q  101 attggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 200  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11584335 attggatgaattaattaattgttcatgagtggtgaaattcgtgctctatttatgatgacatatttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 11584236  T
Q  201 agttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgc---attgttgttgttgaattgtgataagtt 297  Q
    ||||||| | ||||||  |||| |  |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||    
T  11584235 agttgaaattcatgtttcaagtgtatgaaaagggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgttgaattgtgatatgtt 11584136  T
Q  298 tcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  11584135 tcatgatcaatggttgttgtt 11584115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 31 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 4865613 - 4865330
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 130  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  4865613 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaat 4865514  T
Q  131 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaag 230  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||     
T  4865513 ggtgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatgaaaaa 4865414  T
Q  231 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 315  Q
    | |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4865413 tgggtat-gggtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgtggttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgtt 4865330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28261867 - 28261568
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 130  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  28261867 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 28261768  T
Q  131 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaag 230  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||     
T  28261767 ggtgaaattcgtgctctagttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatgaaaa- 28261669  T
Q  231 ttggtatatgt-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
         |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| |  |||    
T  28261668 -----atatgtgtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattgtgatatgttttatgatcaattgttgttgttgttgtttagtc 28261574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 1168100 - 1168404
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| || | ||||||||||||||| |||||      
T  1168100 taaggtaagggggttagaattcatcata-tcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaaatgcttattttggtgaattgattaattgttcataaa 1168198  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1168199 tgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataatagaatggttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 1168298  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  1168299 aatgatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcaatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtc 1168398  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  1168399 atgttg 1168404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20712428 - 20712123
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 128  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||     
T  20712428 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttatttgcaattttcaattacttgtatgaaaagtgcttaattgagtgaattgattaattgttcataa 20712329  T
Q  129 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 228  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  20712328 -tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataactgaattgttgttgattgaattacatgttcaaagtatgaaa 20712230  T
Q  229 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 328  Q
    | | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  20712229 aatgggtatgtgttgataatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttgttgttaagt 20712130  T
Q  329 catgttg 335  Q
    |||||||    
T  20712129 catgttg 20712123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 333
Target Start/End: Original strand, 11337081 - 11337384
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 128  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  11337081 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggatgaattggttaattgttcataa 11337179  T
Q  129 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 228  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11337180 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 11337279  T
Q  229 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 328  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  11337280 atatggtaaatgttgaaaatatgctcatttggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagt 11337379  T
Q  329 catgt 333  Q
    |||||    
T  11337380 catgt 11337384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19405891 - 19405584
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  19405891 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcata 19405793  T
Q  128 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 227  Q
      ||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19405792 aatgatgaaatttatgctctaattatgatgacatatttgaatgtatgaagttatggataattgaattattgttagttgaatttcatgttcaaagtatgag 19405693  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaatt-ggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatat 326  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||    
T  19405692 aaaagggtatatgttgaaaatatgctcaattagttgaattatgattcgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatattgttactggtat 19405593  T
Q  327 gtcatgttg 335  Q
    || ||||||    
T  19405592 gtgatgttg 19405584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 31 - 310
Target Start/End: Original strand, 21646636 - 21646914
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||    
T  21646636 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcacttattgcaattt-caattatttgtatgaaaagtgcttatttgggtgaattgattaaatgttcatatg 21646734  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  |||    
T  21646735 tgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttaaaagtgtatgaa 21646833  T
Q  230 gttggtatatgt-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattg 310  Q
      |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21646834 aatgg-gtatgtatgaaaatatgttcaattggtgaattatgtatcgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattg 21646914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 98 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 24475861 - 24475644
Alignment:
Q  98 ttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgtt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  24475861 ttaattggatgaattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgttctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-t 24475763  T
Q  198 gttagttgaattacatgttcaaa--gtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataag 295  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |    
T  24475762 gttagttgaattacatgttcaaagtgtatga-aaatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgt--tatg 24475667  T
Q  296 tttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  24475666 tttcatgatcaattgttgttgtt 24475644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 21907011 - 21906781
Alignment:
Q  70 aattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagat 169  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  21907011 aattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagac 21906912  T
Q  170 gtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||                  |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21906911 atatgaagttatggataattgaattgatgttggttgaattacatgttcaaagta------------------tgaaaatatgttcaattgatgaattatg 21906830  T
Q  270 cattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21906829 ctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 21906781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 3674215 - 3673926
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  3674215 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 3674118  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 226  Q
    |  || |  ||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||  || ||||| | ||||||||||||||||||||   |||| |||| |||||||||||    
T  3674117 aattgttagaattcgtgctcaaattatgatgatatgtttgaatacattaagttgttgataattgaattgttgttagggaaatttcatgatcaaagtatga 3674018  T
Q  227 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||  ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3674017 gaaagtggtatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 3673926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 19862574 - 19862273
Alignment:
Q  20 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  |||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||  | || ||||    
T  19862574 ttggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcatttgttgtatgaataagtgcttaattgagt-aagtgat 19862476  T
Q  116 taattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgt 215  Q
    |||||| |||||  || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||| |||||    
T  19862475 taattgttcatagatgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgt 19862376  T
Q  216 tcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 314  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||    
T  19862375 tcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagaatcatgtgcaattgatgt 19862277  T
Q  315 tgtt 318  Q
    ||||    
T  19862276 tgtt 19862273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16595860 - 16595576
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||| |||||| ||||    
T  16595860 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgactaattgttcat 16595763  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 226  Q
    |  || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||    
T  16595762 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgatagagaaatttcatgttcaaagtatga 16595663  T
Q  227 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 314  Q
    |||  |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||   ||||| ||||||||| || | || |||||| |||||||||||    
T  16595662 gaaagtggtatatgttg-aaatatgctcaaattgtgaattatgttatgttgatgttgaattatgttgagattcatgttcaattgatgt 16595576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 53 - 225
Target Start/End: Original strand, 23981433 - 23981606
Alignment:
Q  53 atcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctattt 151  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  23981433 atcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgataagtgcttaatttagtgcattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgctctaatt 23981532  T
Q  152 atgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 225  Q
    ||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||||||    
T  23981533 atgatgatatgtttgtatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatg 23981606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23494272 - 23493966
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||   |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||  |||||||| ||||    
T  23494272 taaggtaagggggttagaaatcatcataatcatttttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aatcaattaattgttcat 23494175  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 226  Q
    |  || |  ||||||||||| |  ||||||||||||||   ||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||    
T  23494174 aattgttagaattcgtgctccaactatgatgacatgttcgaatgcatgaagttgtggaaaattgaattgttattagtggaattttatgttcaaagtatga 23494075  T
Q  227 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgata 325  Q
      | | |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  23494074 agaataggtatatgttgaga-tatgcgaaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgcta 23493976  T
Q  326 tgtcatgttg 335  Q
     || ||||||    
T  23493975 agtgatgttg 23493966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 335
Target Start/End: Original strand, 5450731 - 5451043
Alignment:
Q  26 ataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || | || | ||| ||||||||||  | ||||||||||||    
T  5450731 ataattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-gcataaataaatgcttaattgagt-aattgattaatt 5450828  T
Q  121 ggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa 220  Q
    | |||||  || |  ||||| ||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||    
T  5450829 gttcataattgttagaattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 5450928  T
Q  221 gtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttt 319  Q
    |||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||     
T  5450929 gtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataaaattcatgttcaactgatgttgttg 5451027  T
Q  320 ttgatatgtcatgttg 335  Q
    ||| || || ||||||    
T  5451028 ttgctaagtgatgttg 5451043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7728774 - 7728467
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg---taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||   ||| |||  |||  |||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  7728774 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttggtgtaaattttcatttgttgtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 7728676  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 226  Q
    |  || |  ||||||| ||| | |||||| |  || |||  ||| ||||| ||   ||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  7728675 aattgttagaattcgtactccaattatgaagttatatttgaatggatgaaattggtgataattgatttgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatga 7728576  T
Q  227 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgata 325  Q
    |||  || |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  7728575 gaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgcta 7728477  T
Q  326 tgtcatgttg 335  Q
     || ||||||    
T  7728476 agtgatgttg 7728467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 28902545 - 28902255
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg----taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 125  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |     |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||    
T  28902545 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttgtagtgttaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 28902448  T
Q  126 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 225  Q
    ||  || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| || ||||| | |||||||||||||||||| ||  || | | |||||||||||||    
T  28902447 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcataaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcgtgttcaaagtatg 28902348  T
Q  226 agaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||  || |||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  28902347 agaaagtgatatatgttgaat-tatgctcaaattgatcaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgtt 28902255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 28938940 - 28938650
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg----taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 125  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |     |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||    
T  28938940 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttgtagtgttaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 28938843  T
Q  126 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 225  Q
    ||  || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| || ||||| | |||||||||||||||||| ||  || | | |||||||||||||    
T  28938842 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcataaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcgtgttcaaagtatg 28938743  T
Q  226 agaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||  || |||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  28938742 agaaagtgatatatgttgaat-tatgctcaaattgatcaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgtt 28938650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 318
Target Start/End: Original strand, 21222492 - 21222791
Alignment:
Q  20 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgat 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  |  ||||||    
T  21222492 ttggtgataattaaggtatgggggttagagttcaatcataattatttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattgagt--attgat 21222588  T
Q  116 taattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgt 215  Q
    |||||| |||||  || |  ||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   ||||||| |||||||||| ||  |||| |||||    
T  21222589 taattgttcatagttgttagaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattaaattgttgttggtgaaattgcatgt 21222688  T
Q  216 tcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 314  Q
    |||||||||  |||  || |||||||||||  ||||||| || || | |||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  21222689 tcaaagtatatgaaagtgttatatgttgaat-tatgctctaaatgtttaattgtgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattaatgt 21222787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 432815 - 432527
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  || |||||| ||||| || | |||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||    
T  432815 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttactgcaatttttcaattgtt-gcatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgatcata 432718  T
Q  128 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 227  Q
      || | ||||||| |||| | ||||||||| ||||||  ||| ||| |||| | |||||||||||||||||| ||  || | |||||||||||||||||    
T  432717 attgttaaaattcgcgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgtagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatgag 432618  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||  || ||||||||| || ||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  432617 aaaatgatatatgttg-aattatgctcaaattgatgaattatactatgttgttgttggattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgtt 432527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 21650829 - 21650759
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21650829 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 21650759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 21617374 - 21617080
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgg 122  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  | ||  |||||||||     
T  21617374 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattgagt-aagggattaattgt 21617277  T
Q  123 tcatatgtgatga-aattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaag 221  Q
    ||||  ||  | | ||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||| ||||||||||||  |||| ||||||| |||    
T  21617276 tcattagttgttagaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattggattgttgttagtgaaattgcatgttccaag 21617177  T
Q  222 tatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||  |||  || |||||||||||  ||||||| || || |||||| | |  |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  21617176 tatatgaaagtgttatatgttgaac-tatgctctaaatgttgaattgttctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgtt 21617080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 2031944 - 2031874
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  2031944 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 2031874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 11342819 - 11342749
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  11342819 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 11342749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Original strand, 21310603 - 21310819
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||  |||||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||    
T  21310603 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcattttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcata 21310701  T
Q  128 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 227  Q
      || | ||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| || |    
T  21310702 aatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtttgtg 21310801  T
Q  228 aagttggtatatgttgaa 245  Q
    ||  || |||||||||||    
T  21310802 aaaatgatatatgttgaa 21310819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 248 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21205060 - 21205000
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21205060 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat 21205000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 23466787 - 23466521
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 128  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||  | ||||||||||||| |||||     
T  23466787 taaggtaagggggttagaattcatcataatcaattattgcaattttcaattatt-gtatgaataagtgattaattgtgt-aattgattaattgttcataa 23466690  T
Q  129 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 228  Q
     |  |  ||||||||||| | |||||   ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  || | |||| |||||||||||||    
T  23466689 ttattagaattcgtgctccaattatggcaacatgtttgtatgtaagaagttatg-ataattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgaga 23466591  T
Q  229 agt-tggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |   |||| |||||||||| ||||||||||||||                    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23466590 aaaatggtgtatgttgaaa-tatgctcaattggt--------------------tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 23466521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Original strand, 21297069 - 21297285
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| | |||  |||||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||    
T  21297069 taaggtaagggggttagaattcatcataattattttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcata 21297167  T
Q  128 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 227  Q
      || | |||||||| |||||  |||||||| ||||||  | | ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| || |    
T  21297168 aatgttaaaattcgtcctctaactatgatgatatgtttgaacgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtttgtg 21297267  T
Q  228 aagttggtatatgttgaa 245  Q
    ||  || |||||||||||    
T  21297268 aaaatgatatatgttgaa 21297285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 37983717 - 37983428
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||    
T  37983717 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcata 37983619  T
Q  128 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 227  Q
      || | ||||| ||||||||| |||| ||| || |||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| ||| ||||||||||| |    
T  37983618 gttgttaaaatttgtgctctatctatggtgatatatttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatattcaaagtatgtg 37983519  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||  || |||||  || || ||||||| || || |||||| |||  |||| |||||||||||| || ||  ||||| | |||||||||||||    
T  37983518 aaagtgatatattgtg-aattatgctctaaatgttgaattgtgctatgttattgttgaattgtaatgagaatcatgtttaattgatgttgtt 37983428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22885932 - 22885799
Alignment:
Q  91 taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattg 190  Q
    |||||||||||||| || ||||||| | ||| ||||   || ||||||||||||| || ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   ||||||||    
T  22885932 taagtgcttaattgaat-aattgataatttgttcatggttgttgaaattcgtgctttaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattg 22885834  T
Q  191 aattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 225  Q
    |||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||    
T  22885833 aattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 22885799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 315
Target Start/End: Original strand, 22053963 - 22054028
Alignment:
Q  250 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 315  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  22053963 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 22054028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 315
Target Start/End: Original strand, 18531200 - 18531262
Alignment:
Q  253 tcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 315  Q
    |||||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  18531200 tcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 18531262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29918214 - 29918122
Alignment:
Q  133 tgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 225  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||  ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||    
T  29918214 tgaaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 29918122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10289 - 9984
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaa-ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  10289 taaggtaagggggttagaattcataataatcattattgcaaattttcaattctttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 10190  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaa--agtatgag 227  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  10189 tgataaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagagtatgaa 10090  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatg 327  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10089 aag--ggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatg 9992  T
Q  328 tcatgttg 335  Q
    ||||||||    
T  9991 tcatgttg 9984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 14 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 20541 - 20274
Alignment:
Q  14 taatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20541 taatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattg 20442  T
Q  114 attaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacat 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  20441 attaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtat 20342  T
Q  214 gttcaaagt--atgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 280  Q
    |||||||||  |||| || | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  20341 gttcaaagtgtatgaaaa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggttaattatgctttgttgttg 20274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 117857 - 118163
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt---caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  117857 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattggctgaattgattaattgttcata 117955  T
Q  128 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 227  Q
      |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  117956 aatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 118055  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |    
T  118056 aagttggtatatgttgaaaatatgttcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaag 118155  T
Q  328 tcatgttg 335  Q
    ||||||||    
T  118156 tcatgttg 118163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 109356 - 109662
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt---caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  109356 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattggctgaattgattaattgttcata 109454  T
Q  128 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 227  Q
      |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109455 aatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 109554  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatg 327  Q
    || ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  109555 aaattggtatatattgaaaatatgataaattggtgaattatgctaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaag 109654  T
Q  328 tcatgttg 335  Q
    ||||||||    
T  109655 tcatgttg 109662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 31 - 323
Target Start/End: Original strand, 9783959 - 9784249
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |    
T  9783959 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttactgcaattttcaattattggtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgataaattgttcataag 9784058  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  9784059 tgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttgattgaattacatgttcaaagtatgagaa 9784158  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttga 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9784159 gttggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgc---tttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttga 9784249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 49968002 - 49967697
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |      
T  49968002 taaggtaagggggttagaattcatcgtaatcacttattgtaattttcaattatttgcatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcaaaaa 49967903  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  49967902 tcatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaattataaaaa 49967803  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  49967802 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgatacgtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtc 49967703  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  49967702 atgttg 49967697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 72 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21718537 - 21718275
Alignment:
Q  72 ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgt 171  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21718537 ttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcatggatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgt 21718439  T
Q  172 atgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgca 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21718438 atgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaattggtatgtgttcaaaatatgctcaattggtgaattatgct 21718339  T
Q  272 ttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21718338 atgttgttgatgatttgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttg 21718275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 22403005 - 22403310
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  22403005 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataag 22403104  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  22403105 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtctagatgtatgaagttatgaataattaaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 22403202  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatg 327  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| || |    
T  22403203 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgattaactgttgttgttgttgttaag 22403302  T
Q  328 tcatgttg 335  Q
    ||||||||    
T  22403303 tcatgttg 22403310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 38 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 41212415 - 41212136
Alignment:
Q  38 agggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaa 137  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  41212415 agggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgtttaattggatgaattgattaattgttcataaatgatgaaa 41212316  T
Q  138 ttcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtat 237  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| || | |||||    
T  41212315 ttcgtgctctaattatgatgacctgtttagaggtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaactgtatgttcaaagtatgaaaaatgggtat 41212216  T
Q  238 atgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
     || | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  41212215 gtg-taaaaatatgctcaattagtgaattatgcactgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgtt 41212136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 35055108 - 35054820
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta-attttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||      
T  35055108 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcacttatttctattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattggttaattgttcataaa 35055009  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35055008 tgatttaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 35054909  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35054908 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgtagttgatgaactgtgataagtttcatgatcaatggatgttgtt 35054820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 31 - 215
Target Start/End: Original strand, 35522247 - 35522432
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  35522247 taaggtaagggagttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagggcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 35522346  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35522347 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgt 35522432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20177540 - 20177222
Alignment:
Q  20 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattga 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||  | ||||||    
T  20177540 ttggtgataattaaggtaatggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattatt-gtatgtttaagtgcttaattgagt-aattga 20177443  T
Q  115 ttaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatg 214  Q
    ||||||| |||||  || |  ||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||| | |||||| | |||||||||||||||||| ||  |||| ||||    
T  20177442 ttaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgttttaatgcacgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatg 20177343  T
Q  215 ttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatg 313  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||   ||| | ||||||||||    
T  20177342 ttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaaaagtcaagttcaattgatg 20177244  T
Q  314 ttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    ||||| ||| || || ||||||    
T  20177243 ttgttgttgctaagtgatgttg 20177222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 136 - 318
Target Start/End: Original strand, 27329757 - 27329938
Alignment:
Q  136 aattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa--gttg 233  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || | |||| |||||||||| |||  || |    
T  27329757 aattcgtgctccaattatgatgacatgtttgtatatatgaagttatg-ataattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgtgaaaagtgg 27329855  T
Q  234 gtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27329856 gt-tatgt-gaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgtt 27329938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16646266 - 16645976
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 125  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||    
T  16646266 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 16646169  T
Q  126 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 225  Q
    ||  || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | ||||||| ||||| |||| ||  |||| |||||||||||||||    
T  16646168 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataatttaattgatgttggtaaaatttcatgttcaaagtatg 16646069  T
Q  226 agaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||  || |||||||||||  ||| ||||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  16646068 agaaagtgatatatgttgaat-tattctcaaattgattaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgtt 16645976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Original strand, 51627558 - 51627847
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| |||||||| || | |||| ||||||||||||||  | ||||||||| ||| ||||    
T  51627558 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaatttcaattgtt-gcatgaataagtgcttaattgagt-aattgattatttgttcat 51627655  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 226  Q
    |   | |  |||| |||||| | ||||||||| ||| ||  ||| ||||| || | ||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||    
T  51627656 aatcgttagaatttgtgctccaattatgatgatatgcttgaatgcatgaatttgttgatgattgaattgttgttagtgaaacttcatgttcaaagtatga 51627755  T
Q  227 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||   || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51627756 gaaaatggtatatgttg-aaatatgttcaattggttgaattatgatatggtgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgtt 51627847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16656992 - 16656702
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg----taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 125  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||     |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||    
T  16656992 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgttaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 16656895  T
Q  126 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 225  Q
    ||  || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| || ||||| | |||||||||||||||||| ||  || | | |||||||||||||    
T  16656894 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcataaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcgtgttcaaagtatg 16656795  T
Q  226 agaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||  || |||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  16656794 agaaagtgatatatgttgaat-tatgctcaaattgatcaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgtt 16656702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 248 - 335
Target Start/End: Original strand, 35522432 - 35522519
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  35522432 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatacgtcatgttg 35522519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 245
Target Start/End: Original strand, 13376741 - 13376969
Alignment:
Q  20 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||   | ||||||    
T  13376741 ttggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaatttagt-aattga 13376838  T
Q  115 ttaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttg-aattacat 213  Q
    ||||||| |||||  |||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||| | ||||||| |||||||| | |||| |||| |||    
T  13376839 ttaattgttcatagatgatgagaatcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattaaattgttg-tcgttgaaatttcat 13376937  T
Q  214 gttcaaagtatg-agaagttggtatatgttgaa 245  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13376938 gttcaaagtatgaagaag-tggtatatgttgaa 13376969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 318
Target Start/End: Original strand, 37233750 - 37234043
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgg 122  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||  | || ||| ||||||     
T  37233750 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtattattaagtgcttaattgagt-aagtgagtaattgt 37233847  T
Q  123 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 222  Q
    | |||  || |  |||||||||| || ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  37233848 taatagttgttagaattcgtgctttagttatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtaaaattgcatgttcaaagt 37233947  T
Q  223 atgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||  |||  || ||||||||| || ||||||| || || ||||||||||  |||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  37233948 atatgaaagtgatatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattatgctatgttgtggttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgtt 37234043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 273 - 335
Target Start/End: Original strand, 9784238 - 9784300
Alignment:
Q  273 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9784238 tgttgttgttgaattgtgataagtttcaagatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttg 9784300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 248 - 319
Target Start/End: Original strand, 15861547 - 15861618
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttt 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  15861547 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttt 15861618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 17609281 - 17608992
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  | || |||||| ||| ||||    
T  17609281 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattagttgatcat 17609184  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 226  Q
    |  || |  ||||||||||||| ||||||||| || |||  ||| ||||| ||   |||||||| ||||||||| ||  |||| ||||||||||||||      
T  17609183 agttgttagaattcgtgctctaattatgatgatatatttgaatgcatgaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatat 17609084  T
Q  227 gaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||  || |||||||||||  ||||||| || || |||||| |||  ||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||| |||||||    
T  17609083 gaaagtgttatatgttgaat-tatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgttgttgtt 17608992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 225
Target Start/End: Original strand, 22143256 - 22143451
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  22143256 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcattttagtgtaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggataaat-gattaattgttcat 22143352  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 225  Q
    |  || | ||||||||||||||  ||||||||  |||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||||||    
T  22143353 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatgtgtttgtatgcatgaaatttgtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatg 22143451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 21860145 - 21860075
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||    
T  21860145 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgtt 21860075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 44035092 - 44035162
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  44035092 tatgctcatttggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 44035162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 21860396 - 21860335
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21860396 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 21860335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 41218790 - 41218729
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  41218790 gtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcatgatca 41218729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 41394589 - 41394528
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  41394589 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 41394528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 44034841 - 44034902
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  44034841 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 44034902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 22367152 - 22367083
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  22367152 tatgctcaattggtgaat-atgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 22367083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 21195368 - 21195078
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    |||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||  ||||||| | ||||||||||||| || || |||||||||| ||||    
T  21195368 taaggtaaggggtttagaattcaatcataatcatttagttgtaatttttcatttgttgtatgtttaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcat 21195270  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 226  Q
    |  || | |||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||| ||||||     
T  21195269 agttgttaaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgt 21195170  T
Q  227 gaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||  || |||||  || || ||||||| ||||| |||||| |||   ||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||    
T  21195169 gaaaatgatatattgtg-aattatgctcaaattgttgaattgtgctaggttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattaatgttgtt 21195078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19603449 - 19603279
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  19603449 taaggtaagggggctagaattcatcataatca-tttagtgcaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 19603353  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 200  Q
    |  || | |||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||||||||| ||   ||||||||| ||||||||    
T  19603352 aattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgtatgaaattggtgataattgatttgttgtt 19603279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 225
Target Start/End: Original strand, 8537803 - 8538000
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    ||||||||||| |||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||||| | | ||||    
T  8537803 taaggtaagggagttagaattcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttagttgaat-aattgattattcgttcat 8537901  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 225  Q
       || ||||||||||||| |  ||||||||| ||||||  ||| ||||| |||  |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||    
T  8537902 ggttgttgaaattcgtgctttgattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 8538000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 225
Target Start/End: Original strand, 8603042 - 8603239
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    ||||||||||| |||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||||| | | ||||    
T  8603042 taaggtaagggagttagaattcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttagttgaat-aattgattattcgttcat 8603140  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 225  Q
       || ||||||||||||| |  ||||||||| ||||||  ||| ||||| |||  |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||    
T  8603141 ggttgttgaaattcgtgctttgattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 8603239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 20445812 - 20445747
Alignment:
Q  250 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 315  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||    
T  20445812 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgtt 20445747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 20531577 - 20531512
Alignment:
Q  250 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 315  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||    
T  20531577 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgtt 20531512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 225
Target Start/End: Original strand, 49997174 - 49997371
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcat-cataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||| || || |||||| ||| ||||    
T  49997174 taaggtaagggggttagaattcaaacataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattatttgttcat 49997272  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 225  Q
       || ||||||| |||| ||| ||||| ||| ||||||  || |||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||    
T  49997273 gattgttgaaatttgtgccctagttatggtgatatgtttgaatatatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 49997371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 61159 - 60853
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 128  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  61159 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataa 61060  T
Q  129 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 228  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  61059 atgatgaaattcgtgctctaattatgataacatgtttagatgtatgatgttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaa 60960  T
Q  229 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 328  Q
    | | ||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  60959 aatgggtatgtgttaaaaatatacttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgt 60860  T
Q  329 catgttg 335  Q
    |||||||    
T  60859 catgttg 60853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 66 - 335
Target Start/End: Original strand, 70552 - 70822
Alignment:
Q  66 ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgttt 165  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  70552 ttgtaattttcaattatttgtaagaaaagtgcttatttggatgagttgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgttt 70651  T
Q  166 agatgtatgaagtta-tggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaa 264  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  70652 agatgtatgaagttaatgaataattgatttattgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaagtaggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaa 70751  T
Q  265 ttatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |  |||||||||    
T  70752 ttatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcattggatgttgttgttgtttagtcatgttg 70822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 170
Target Start/End: Original strand, 79785 - 79925
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||| ||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  79785 taagctaagggggttagaattgatcataatcactcattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 79884  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatg 170  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  79885 tgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatg 79925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 254710 - 255014
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    ||||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  254710 taaggtaagggggatataattcatcataatcacttattgtaattt-caattatttgtatgataagtgtttaattggatgaattgattaattgttcatata 254808  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 227  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||     
T  254809 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgcttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttg-tagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 254906  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatg 327  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  254907 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatg 255006  T
Q  328 tcatgttg 335  Q
    ||||||||    
T  255007 tcatgttg 255014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 261316 - 261620
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    ||||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  261316 taaggtaagggggatataattcatcataatcacttattgtaattt-caattatttgtatgataagtgtttaattggatgaattgattaattgttcatata 261414  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 227  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||     
T  261415 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgcttagatgtatgaagttatgaataattgaattgtag-tagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 261512  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatg 327  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  261513 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatg 261612  T
Q  328 tcatgttg 335  Q
    ||||||||    
T  261613 tcatgttg 261620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 31 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 370 - 72
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||      
T  370 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaa 271  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  270 tgatgaaattcgtgctcta---atgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattgcatgttcaaagtatgagaa 174  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  173 attggtatatgttgaaaatatgctcaattcgtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtc 74  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 132144 - 132450
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 128  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  132144 taaggtaagggggttggaattcatcataatcacttattgcaatttttcaattatttctatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataa 132243  T
Q  129 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 228  Q
     ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  132244 atgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtttgttgaattatatgttcaaagtatgaaa 132343  T
Q  229 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 328  Q
    | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  132344 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatcgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagt 132443  T
Q  329 catgttg 335  Q
    |||||||    
T  132444 catgttg 132450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 88631 - 88341
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 125  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||  ||    
T  88631 taataaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctattttcaattatttgtatgaaaagtgtttaattgggtgaattgattaattgtcca 88532  T
Q  126 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 225  Q
    ||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  88531 taaatgatgaaattcgtgctataattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattaaaatgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 88432  T
Q  226 agaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttg 316  Q
    | || | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  88431 aaaaatgggtatgtgttgaaaatatgatcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttg 88341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 12041 - 11751
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta--attttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||    | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  12041 taaggtaaggtggttagaattcatcataatcatttttggtgcaatttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggtcaattgattaattgttcata 11943  T
Q  128 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 227  Q
      ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11942 aatgatgaatttcgtgctctaattatgatgacatgtttcaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgag 11843  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||   | |||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11842 aaaaagatatgagttgaaaacatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtagaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 11751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16253 - 16022
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta--attttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggt-cat 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    | ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  16253 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttggtgcaatttcaattatt-gtatgaacaagtgcttaattgggtgaattgattaatttgttcat 16155  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 226  Q
    |  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16154 aaatgatgaaatccgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatga 16055  T
Q  227 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattg 259  Q
    |||  || |||  ||||||||||||||| ||||    
T  16054 gaaaatgatatgagttgaaaatatgctccattg 16022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25784 - 25553
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta--attttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggt-cat 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    | ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  25784 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttggtgcaatttcaattatt-gtatgaacaagtgcttaattgggtgaattgattaatttgttcat 25686  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 226  Q
    |  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25685 aaatgatgaaatccgtgctctaattatgatgacatgttttaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatga 25586  T
Q  227 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattg 259  Q
    |||  || |||  ||||||||||||||| ||||    
T  25585 gaaaatgatatgagttgaaaatatgctccattg 25553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 50 - 335
Target Start/End: Original strand, 252903 - 253189
Alignment:
Q  50 ttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctcta 148  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||  |||| ||||||||||| |     
T  252903 ttcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtgcataaatgataaaattcgtgctttg 253002  T
Q  149 tttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaat 248  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  253003 attatgatgacatgtttggatgtatgaagttagggataattgaattgttgttagttgaattacattttcaaagtatgagaaattggtatatgttgaaaat 253102  T
Q  249 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  253103 atgctcaattggtgaatcatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgtttttgttaagtcatgttg 253189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 496 - 191
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  496 taaggtaagggggttagaattaatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 397  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||  |||| |  |||    
T  396 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaaattcatgtttcaagtgtatgaa 297  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  296 aagggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtc 197  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  196 atgttg 191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 4913 - 4627
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 130  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  4913 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactt--gtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatat 4816  T
Q  131 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaag 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  4815 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaaa 4716  T
Q  231 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  4715 tgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtttaattgtgataatattcattttcaattgatgttgtt 4627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 9527 - 9241
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 130  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  9527 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactt--gtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatat 9430  T
Q  131 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaag 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  9429 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaaa 9330  T
Q  231 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  9329 tgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtttaattgtgataatattcattttcaattgatgttgtt 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25563 - 25258
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  25563 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 25464  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| |  |||    
T  25463 tgatgaaatttgtgctctatttatgatgacatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaaattcatgtttcaagtgtaggaa 25364  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  25363 aagggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgttgttgatatggc 25264  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  25263 atgttg 25258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 130 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25210 - 25005
Alignment:
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| |  |||    
T  25210 tgatgaaatttgtgctctatttatgatgacatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaaattcatgtttcaagtgtaggaa 25111  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  25110 aagggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgttgttgatatggc 25011  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  25010 atgttg 25005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11768
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||      
T  11464 taaggtatgggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttaattatttgtatgaaaagtgtttaattgt-tgaattgattaattgttcataaa 11562  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  11563 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttgattgaattacatgttcaaagtatgaaaa 11662  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
     | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11663 atgggtatgtgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatcagtttcatgatcaatttatgttgttgttgatatgtc 11762  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  11763 atgttg 11768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 37)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 271521 - 271217
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||      
T  271521 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattattcataaa 271423  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  271422 tgaagaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 271323  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  271322 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtc 271223  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  271222 atgttg 271217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 4448028 - 4448333
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||      
T  4448028 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttatatgaaaagtgcttaattgagtgaattgattaattgttcataaa 4448127  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  4448128 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 4448227  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
     | ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4448228 atgggtttgtgttgaaaatatgttcaattggtgaatgatgctttgttgttgttgaattatgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtc 4448327  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  4448328 atgttg 4448333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 25875816 - 25876119
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 130  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  25875816 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgtttaattggatgaattgattaattgttcataagt 25875915  T
Q  131 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaga 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  25875916 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaatt-atgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga-a 25876013  T
Q  229 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 328  Q
    | | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| || ||||||| ||| |  ||    
T  25876014 aatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgcttcatgatcaaatgttgttgttattgtttagt 25876112  T
Q  329 catgttg 335  Q
    |||||||    
T  25876113 catgttg 25876119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Original strand, 23836601 - 23836888
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 130  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  23836601 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgaatgataagtgcttaattagatgaattgattaattgttcataagt 23836700  T
Q  131 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt--atgaga 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||| |    
T  23836701 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgt-gttagtggaattacatgttcaaagtgtatgaaa 23836799  T
Q  229 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    | | ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23836800 a-tgggtatgtgtgaaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgtt 23836888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 32466207 - 32465905
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 130  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  32466207 taaggtaagggg-ttagtcttcatcataatcacttttgaaaattttaattatttgtacgataagtgcttatttgaatgaattgattaattgttcatatgt 32466109  T
Q  131 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaag 230  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||     
T  32466108 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatgaaaaa 32466009  T
Q  231 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtca 330  Q
    | | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||    
T  32466008 tggatatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttcttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtca 32465910  T
Q  331 tgttg 335  Q
    |||||    
T  32465909 tgttg 32465905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25602377 - 25602071
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  25602377 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcatg 25602279  T
Q  128 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 227  Q
      ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25602278 gatgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgag 25602179  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatg 327  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  25602178 aaattgatatatgttgaaaatatgctcaattggtgagttatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatg 25602079  T
Q  328 tcatgttg 335  Q
    ||||||||    
T  25602078 tcatgttg 25602071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 36890581 - 36890885
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||      
T  36890581 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgttattttcaattatg-gtatgaaaagtgcttatttgggtgaattgattaattgttcataaa 36890679  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36890680 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatggcatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 36890779  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
      ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||     
T  36890780 aatggaatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctatgttgttgataaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgctaagtg 36890879  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  36890880 atgttg 36890885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28974400 - 28974096
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||      
T  28974400 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattatttcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaatttggtgaattgattaattgttcataaa 28974302  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28974301 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataatagaattgttgttaattgaattacatgttcaaagtatgagaa 28974202  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
      |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  28974201 aatggtatatgttgaaaatatgctcatttggcgaattatgctatgttgttgatgaattgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtc 28974102  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  28974101 atgttg 28974096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 27262156 - 27261916
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  27262156 taaggtaagggagttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatg 27262058  T
Q  128 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 227  Q
      |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27262057 gatgatgaaatttgtgccctaattatgatgacatgtttggatgtataaagttatggataattgaattgttgttagttcaattacatgttcaaagtatgag 27261958  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgc 270  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27261957 aaattggtatatgttgaaaatatgctc-attggtgaattatgc 27261916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 24571188 - 24571492
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaat-tttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 128  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||     
T  24571188 taaggttagggggttagaattcatcataatcattattgcaatgtttcaattatt-gtatgaataaatgcttaattgggt-aattgattaattgttcatag 24571285  T
Q  129 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 228  Q
     ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||   |||| ||||||||| ||||||||    
T  24571286 atgatgaaattcgtgctctaattttgatgacacgtttgaatgcatgaagttgtggatacttgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaggtatgaga 24571385  T
Q  229 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatg 327  Q
    |  || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  24571386 aaatgatatatgttg-aaatatgctcaattggttgaattatgctatgtttttgttgaattgtgttaagattcatgatcaattgatgttgttgttgttaag 24571484  T
Q  328 tcatgttg 335  Q
    | ||||||    
T  24571485 tgatgttg 24571492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 22579758 - 22580059
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 128  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||     
T  22579758 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgtgt-aattgattaattgttcataa 22579855  T
Q  129 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag- 227  Q
     || |  ||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  || |  ||| |||| |||||||     
T  22579856 ttgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtttgtatgtatgaagttat-gataattgaattgttgttggtgaaactttatgatcaaggtatgaga 22579954  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatat 326  Q
    ||  || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  22579955 aaaatgttatatgttg-aaatatgctcaattggttgaattatgc---tttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgctgctgatat 22580050  T
Q  327 gtcatgttg 335  Q
    || ||||||    
T  22580051 gtgatgttg 22580059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 68351 - 68056
Alignment:
Q  26 ataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt-gt---aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaatt 120  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||   |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||  ||| ||||||||    
T  68351 ataactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtataaattttcaatt-gttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaatagattaatt 68254  T
Q  121 ggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa 220  Q
    | |||||  || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||    
T  68253 gttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 68154  T
Q  221 gtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  68153 gtatgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgtt 68056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 43646259 - 43645940
Alignment:
Q  20 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||   |||| |||| | |  |||||||| |||||| |||||||  | ||| ||    
T  43646259 ttggtgataattaaggtaagggggttagaattcagtcataatcatttttagtgtaaatttccaattgttgtatgaataagtgtttaattgagtaaat-ga 43646161  T
Q  115 ttaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatg 214  Q
    ||||||| ||| |  || |  ||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||| |||||||| | |||||||| ||||||||| ||  |||| ||||    
T  43646160 ttaattgttcaaagttgttataattcgtgctctaattatgttgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattggattgttgttggtgaaatttcatg 43646061  T
Q  215 ttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatg 313  Q
    || ||||||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||  ||||| ||||||||||    
T  43646060 tttaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaactgtggtaagaatcatgttcaattgatg 43645962  T
Q  314 ttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    ||||| ||| || || ||||||    
T  43645961 ttgttgttgctaagtgatgttg 43645940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 315
Target Start/End: Original strand, 31146073 - 31146360
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatca-cttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 125  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||   ||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||  ||    
T  31146073 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatcttttgtgtaaattttcaaattgttgtatgaataagtgcttaactgagt-aattgattaattgtcca 31146171  T
Q  126 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 225  Q
    ||  || |  |||||||| || | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||||||    
T  31146172 taattgttagaattcgtgttccaattatgatggtatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaattttatgttcaaagtatg 31146271  T
Q  226 agaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 315  Q
    ||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  || |||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||    
T  31146272 agaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatg-tgttgttgaattgtaataagattcctgttcaattgatgtt 31146360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 242 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 6879577 - 6879501
Alignment:
Q  242 tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  6879577 tgaaaatatactcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgatatgtttaatgatcaattgttgttgtt 6879501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 19794599 - 19794660
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19794599 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 19794660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 22284340 - 22284279
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22284340 gtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 22284279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 323
Target Start/End: Original strand, 22775206 - 22775393
Alignment:
Q  136 aattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggt 235  Q
    ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | | |||||||||||||||| ||  || | |||||||||||||||||||  |  |    
T  22775206 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatgagaaagttat 22775305  T
Q  236 atatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttga 323  Q
    ||||||||||  | || |||| ||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||    
T  22775306 atatgttgaat-tgtgttcaaatttatgaattatgctatgttgtagttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgttgttga 22775393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 323
Target Start/End: Original strand, 22780584 - 22780771
Alignment:
Q  136 aattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggt 235  Q
    ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | | |||||||||||||||| ||  || | |||||||||||||||||||  |  |    
T  22780584 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatgagaaagttat 22780683  T
Q  236 atatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttga 323  Q
    ||||||||||  | || |||| ||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||    
T  22780684 atatgttgaat-tgtgttcaaatttatgaattatgctatgttgtagttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgttgttga 22780771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 252 - 318
Target Start/End: Original strand, 21274174 - 21274240
Alignment:
Q  252 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21274174 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtaatatgtttcatgatcaatagatgttgtt 21274240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 22274856 - 22274786
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||| | |||||||    
T  22274856 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaatggttgttgtt 22274786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 248 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22284089 - 22284029
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  22284089 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaat 22284029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19666884 - 19666685
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggt 123  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||| || || |||||||||| |    
T  19666884 taattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcaatta-ttgtatgaataaatgcttaattgaat-aagtgattaattgtt 19666787  T
Q  124 catatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagta 223  Q
    ||||  || | |||||| |||||||  ||| |||| ||||||  ||| ||||| ||   ||||||||||||||| || ||  | || |||||||||||||    
T  19666786 catagttgttaaaattcatgctctaactataatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgtttttggtgaatttgcatgttcaaagta 19666687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 20627208 - 20627269
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  20627208 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacggggttagtctttatcataatca 20627269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 22275107 - 22275046
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  22275107 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcctttatcataatca 22275046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 316
Target Start/End: Original strand, 9653021 - 9653085
Alignment:
Q  252 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttg 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||    
T  9653021 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgcgatatttttcatgatcaatagatgttg 9653085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 15633599 - 15633535
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt 65  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  15633599 gtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtctttatcataatcactt 15633535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 210
Target Start/End: Original strand, 23821534 - 23821714
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||| | ||| | |||||||||||||  | || |||||||||| |||||    
T  23821534 taaggtaagggggttagatttcattataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gcatgcttaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcata 23821631  T
Q  128 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatta 210  Q
      || | |||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||| | |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23821632 gttgttaaaattcgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcaggaagttgttgataattgaattgttgttgattgaatta 23821714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 210
Target Start/End: Original strand, 23830613 - 23830793
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||| | ||| | |||||||||||||  | || |||||||||| |||||    
T  23830613 taaggtaagggggttagatttcattataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gcatgcttaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcata 23830710  T
Q  128 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatta 210  Q
      || | |||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||| | |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23830711 gttgttaaaattcgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcaggaagttgttgataattgaattgttgttgattgaatta 23830793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 25305622 - 25305509
Alignment:
Q  206 aattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttg-ttgttgaattgtgataagtttcatga 303  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || ||| |||||||  ||||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||  |||||     
T  25305622 aatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatgtgttgaat-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgattgttgaattgtggtaagagtcatgt 25305524  T
Q  304 tcaattgatgttgtt 318  Q
    |||||||||||||||    
T  25305523 tcaattgatgttgtt 25305509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19660243 - 19660037
Alignment:
Q  20 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgatt 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||  |||  |||||||| |||||| |||| ||||  || |||||    
T  19660243 ttggtgataattaaggtaa-ggggttagaattcatcataatcactttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgtttaa-tggaataagtgatt 19660146  T
Q  117 aattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgtt 216  Q
    | ||| || ||  || |||| ||||||||||| ||||||||| |||||   ||  ||||| ||   |||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||    
T  19660145 atttgttcttagatgttgaatttcgtgctctaattatgatgatatgttcgtatacatgaaattggtgataattgaattattgttggtgaaattgcatgtt 19660046  T
Q  217 caaagtatg 225  Q
    || ||||||    
T  19660045 catagtatg 19660037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 43642851 - 43642912
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||    
T  43642851 gtgaagctagagctaatagttggagataattaagggaaggaggttagtctttatcataatca 43642912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 9636944 - 9636809
Alignment:
Q  183 gataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgt 281  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||| |||  || |||||  ||||  ||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||    
T  9636944 gataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaat-tatgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgt 9636846  T
Q  282 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||    
T  9636845 tgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgtt 9636809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 225
Target Start/End: Original strand, 19669003 - 19669199
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaa-ttttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||    
T  19669003 taaggtaacggggttagaattcatcataatcattttagtgtaatttttcaatta-ttgtatgaataagtgattaattggat-aaatgattaattgttcat 19669100  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 225  Q
    |  || | |||| | |||||||  |||| ||| ||||||  ||| ||||| ||   ||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||| |||||||    
T  19669101 agatgttaaaatccatgctctaactatggtgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgagttgttgttggtgaaattgcatgttctaagtatg 19669199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 315
Target Start/End: Original strand, 24341519 - 24341584
Alignment:
Q  250 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 315  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  24341519 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 24341584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 318
Target Start/End: Original strand, 25265520 - 25265588
Alignment:
Q  250 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||   |||| |||||||||||||||    
T  25265520 tgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 25265588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27261899 - 27261853
Alignment:
Q  289 tgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||    
T  27261899 tgataagtttcatgatcaattgatattgttgttgctaagtcatgttg 27261853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 5143 - 5446
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 130  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  5143 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttctaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 5242  T
Q  131 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaga 228  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  5243 gatgaaattcgtgctcttattatgatgagatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga-a 5340  T
Q  229 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 328  Q
    | | ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  5341 aataggtatgtg-cgaaaatatgctcaattggtgaattaggcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagt 5439  T
Q  329 catgttg 335  Q
    |||||||    
T  5440 catgttg 5446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 8776 - 9082
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta--attttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   ||||||||||||| |||||    
T  8776 taaggtaagggggttagagttcatcataatcatttttggtgcaatttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggaaaattgattaattgttcata 8874  T
Q  128 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 227  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8875 aatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgag 8974  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatat 326  Q
    ||  || ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  8975 aaaatgatatatgttg-atatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaa 9073  T
Q  327 gtcatgttg 335  Q
    || ||||||    
T  9074 gtgatgttg 9082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9339 - 9034
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt--caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 128  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| | ||| ||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||  |||||     
T  9339 taaggtaagggggttagaatttatcataatcattattgcaattttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgagtgaattgattaatttttcataa 9241  T
Q  129 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 228  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9240 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 9141  T
Q  229 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| || ||    
T  9140 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgatttgtgataagtttcaagatcacttgatgttgttgttgctaagt 9041  T
Q  329 catgttg 335  Q
    |||||||    
T  9040 catgttg 9034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7922 - 7616
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  7922 taaggtaagggggttagaattcatcataattacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 7823  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgac-atgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 228  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  7822 tgatgaaattcatgatctaattatgatgcctatgtttagatgtatgaagttataaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaa 7723  T
Q  229 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 328  Q
    | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  7722 aatgggtatatgatgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattatgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagt 7623  T
Q  329 catgttg 335  Q
    |||||||    
T  7622 catgttg 7616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 15224 - 14938
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 130  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  15224 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatatgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 15125  T
Q  131 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaga 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||  |||||| |    
T  15124 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttagattacatgttcaaagtgtatga-a 15027  T
Q  229 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    | | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  15026 aatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgtt 14938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 85683 - 85379
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||      
T  85683 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtttataaa 85585  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85584 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 85485  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
     ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  85484 attggtatatattgaaaatatgcttaattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtc 85385  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  85384 atgttg 85379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 159651 - 159346
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  159651 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtacgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 159553  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  159552 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataatggcattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaa 159453  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 328  Q
      || |||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  159452 aatgatatgagttgaaattatgctcaattggttgaattatgctatgttgatgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagt 159353  T
Q  329 catgttg 335  Q
     ||||||    
T  159352 gatgttg 159346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Original strand, 11548 - 11837
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  11548 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 11647  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgag 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||     
T  11648 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttcttggttgaattacatgttcaaagtgtatga- 11746  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  11747 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattagtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgttgtt 11837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1667 - 1364
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||      
T  1667 taaggcaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatt--caattatttgtatgaaaagtggttaattgaatgaattgattaattgtgtataaa 1570  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1569 tgatgaaattcgtgctctaatcatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttggtggttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 1470  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
     | ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1469 atgggtatgtgatgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtc 1370  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  1369 atgttg 1364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 7522 - 7235
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 130  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  7522 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactt--gtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatat 7425  T
Q  131 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaag 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  7424 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaaa 7325  T
Q  231 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaatt-gatgttgtt 318  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||  |||||  |||||| |||||||||    
T  7324 tgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtttaattgtgataatattcattttcaattggatgttgtt 7235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 112441 - 112745
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||      
T  112441 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtacttatttgggtgaattgattaattgttcataaa 112539  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  112540 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaacaattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 112639  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||    
T  112640 attggtatatgttgaaaatatgctcaattagtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatttatgttgttgttgttaagtc 112739  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  112740 atgttg 112745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 315
Target Start/End: Original strand, 102815 - 103102
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 125  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||    
T  102815 taaggtaaggggtttataattcatcataatcattttttgtgtaaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 102912  T
Q  126 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 225  Q
    ||  || |  ||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  102913 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagtttttgataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatg 103012  T
Q  226 agaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 315  Q
    ||||  ||||||||| ||  |||||||| || ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  103013 agaaagtggtatatggtg-gaatatgctaaatttgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataacattcatgttcaattgatgtt 103102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 151 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 109821 - 109637
Alignment:
Q  151 tatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatat 250  Q
    |||||||| ||||||  ||  |||||||| | ||||||||||||||||||| |  |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  109821 tatgatgatatgtttgaatccatgaagttgttgataattgaattgttgttaatgaaatttcatgtttaaagtatgagaaagtggtatatgttgaaa-tat 109723  T
Q  251 gctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    |||||| ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| || || ||||||    
T  109722 gctcaaattgttgaattttgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtgatgttg 109637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Original strand, 24623 - 24911
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||  ||||      
T  24623 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgaaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattaggtgaattgattaattgtccataaa 24722  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24723 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttattgataattaaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 24822  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
     | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24823 atgggtatgtgttgaacatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 24911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 248 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 95109 - 95023
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgtt 334  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||    
T  95109 tatgctcaattagtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgataagtgatgtt 95023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 92 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 5231 - 4988
Alignment:
Q  92 aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattga 191  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5231 aagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattga 5132  T
Q  192 attgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtga 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5131 attgttgttagttgaattacatgttcacagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgatttgttgttgttgaattgtga 5032  T
Q  292 taagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  5031 taagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttg 4988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 48496 - 48219
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 130  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  48496 taaggtaagggg-ttagaatttatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 48398  T
Q  131 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaag 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||     
T  48397 gatgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattttatgttcaaagtatgaaaaa 48298  T
Q  231 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattg 310  Q
    | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48297 tgggtatgtgtt-aaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattg 48219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 61944 - 61667
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 130  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  61944 taaggtaagggg-ttagaatttatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 61846  T
Q  131 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaag 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||     
T  61845 gatgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattttatgttcaaagtatgaaaaa 61746  T
Q  231 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattg 310  Q
    | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  61745 tgggtatgtgtt-aaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattg 61667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 19820 - 20041
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgctta 100  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19820 gtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgctta 19919  T
Q  101 attggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19920 attggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 20019  T
Q  201 agttgaattacatgttcaaagt 222  Q
    |||||||||  |||||||||||    
T  20020 agttgaattgtatgttcaaagt 20041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 222
Target Start/End: Original strand, 24137 - 24345
Alignment:
Q  14 taatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24137 taatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattg 24236  T
Q  114 attaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacat 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  24237 attaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtat 24336  T
Q  214 gttcaaagt 222  Q
    |||||||||    
T  24337 gttcaaagt 24345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 38650 - 38345
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||      
T  38650 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaa 38551  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  38550 tgatgaaatacgcgctctaattatgatgacatgtttagatttatgaatttatgaataattgaatttttgttggttgaattacatgttcaaaggaagagaa 38451  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||    
T  38450 atgggtatatgttgaaaatatgctcaattggcgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgacgttgttgttgtttagtc 38351  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  38350 atgttg 38345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0740
Description:

Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 31 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4635 - 4351
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 130  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  4635 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacgtttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 4536  T
Q  131 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaga 228  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  4535 gatgaaattcgtgctctaattataatgacatgtttagatgtatcaaattatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga-a 4438  T
Q  229 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttg 316  Q
    | | ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4437 aatgggtatgtg-tgaaaatatgttcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagttttatgatcaattgttgttg 4351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 6)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 164565 - 164262
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 130  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  164565 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattaattgtatggtaagtgcttaattggatgaattgattaatttttcataagt 164466  T
Q  131 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa--gtatgaga 228  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  164465 gatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga-a 164368  T
Q  229 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 328  Q
    | | ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| |  ||    
T  164367 aatgggtatgtg-tgaagatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagt 164269  T
Q  329 catgttg 335  Q
    |||||||    
T  164268 catgttg 164262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 162048 - 162109
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  162048 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 162109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 166134 - 166195
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  166134 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 166195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 162299 - 162369
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  162299 tatgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 162369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 166385 - 166455
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  166385 tatgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 166455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 246
Target Start/End: Original strand, 116440 - 116664
Alignment:
Q  20 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt---tgtaattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||   ||||| |||  | |  ||||||| |||||||||||||||  | |||| ||    
T  116440 ttggtgataattaaggtaagggggttagatttcatcataatcatttttagtgtaaattttgaatggttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatt-at 116538  T
Q  116 taattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgt 215  Q
    |||||| |||||  || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  | | ||||| || | ||||||||||||||     || |  || |||||    
T  116539 taattgctcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaaggcatgaaattgttgataattgaattgt-----gtgggttttcatgt 116633  T
Q  216 tcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaa 246  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  116634 tcaaagtatgagaaaatgatatatgttgaaa 116664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 70964 - 70660
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||| | | |||      
T  70964 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgtaattttcagttatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaatagtttataaa 70866  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  70865 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatt-catgttcaaagtatgagaa 70767  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 328  Q
      ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  70766 aatggaatatgttgaaaatatgcttaattggttgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctgatatat 70667  T
Q  329 catgttg 335  Q
     ||||||    
T  70666 gatgttg 70660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 72 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 31352 - 31098
Alignment:
Q  72 ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgt 171  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  31352 ttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattatttgttcataaatgataaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgt 31254  T
Q  172 atgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaa-ttatgc 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||     
T  31253 atgaagttatggataattgaattgtggttagttgaatt-catgttcaaagtataagaaaatggtatatgttgaaaatatgctcaatttgttaagttatg- 31156  T
Q  271 attgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgt 328  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  31155 tttgtagttgttgaattgtgataagtttcatgattaattgatgttgttgctgatatgt 31098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 318
Target Start/End: Original strand, 97088 - 97381
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgg 122  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||| | |||| |||||||  || | ||||||||||     
T  97088 taatgaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaatta-ttgtatgatttagtgtttaattgagtg-agtgattaattgt 97185  T
Q  123 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 222  Q
    |||||  || | | |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| || || ||   |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  97186 tcatagttgttaagattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcataaaattggtgataattgaattgttgttggtggaattgcatgttcaaagt 97285  T
Q  223 atgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||| |||  || ||||||||| || ||||||| || || ||||||||||  ||||| ||||||||| |||| || |||||| ||||||||| |||||    
T  97286 atgtgaaagtgttatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattatgctatgttggtgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatattgtt 97381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 34014 - 33726
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatat 128  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  34014 taaggtaaggggattagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattact-gtatgattaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcgtaa 33916  T
Q  129 gtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 228  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33915 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatagataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 33816  T
Q  229 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    | |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33815 aattggtatatgttgaaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 33726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 471 - 776
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttg-taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||| || ||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  471 taaggtaagggggttagaattcatcata-tcatttattgctatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcata 568  T
Q  128 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 227  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  569 aatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaaattatggataatagaattgttgttaattgaattacatgttcaaagtatgag 668  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatg 327  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  669 aaaatggtatatgttgaaaatatgctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaag 768  T
Q  328 tcatgttg 335  Q
    ||||||||    
T  769 tcatgttg 776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21862 - 21559
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||  ||||||||||  |||||||||||||| |||||      
T  21862 taaggtaagggggttataattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaaaggcttaattgggcgaattgattaattgttcataaa 21764  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21763 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatg-ataattggattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 21665  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || |||    
T  21664 aatggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgattatttgatgttgttgttgctaagtc 21565  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  21564 atgttg 21559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 31561 - 31258
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||      
T  31561 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggcgaattgattaattgttcataaa 31463  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 229  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31462 tgatgaaattcatgatctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatg-ataattggattgttgttagttgaattaaatgttcaaagtatgagaa 31364  T
Q  230 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtc 329  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| || |||    
T  31363 aatggtatatgttgaaaatatgctcaattggtaaattatactatgttgttgatgaattgtgataagtttcattatcaattgatgtttttgttgctaagtc 31264  T
Q  330 atgttg 335  Q
    ||||||    
T  31263 atgttg 31258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 140
Target Start/End: Original strand, 47445 - 47554
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||      
T  47445 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggcgaattgattaattgttcataaa 47543  T
Q  130 tgatgaaattc 140  Q
    |||||||||||    
T  47544 tgatgaaattc 47554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 35 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 2263 - 1963
Alignment:
Q  35 gtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgat 133  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||    
T  2263 gtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgctcataaatgat 2165  T
Q  134 gaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttg 233  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||    
T  2164 gaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgcgaaaatg 2065  T
Q  234 gtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatg 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  2064 gtatatgatgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatg-tgttgttgatttgttataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatg 1966  T
Q  333 ttg 335  Q
    |||    
T  1965 ttg 1963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 27 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 46521 - 46229
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtca 125  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  46521 taattaaggtaagagggttataattcatcataatcatttattgcaatttttaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttca 46423  T
Q  126 tatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttg-aattacatgttcaaagta- 223  Q
    ||  ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||     
T  46422 taaatgatgaaattcgtactctaattttgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaacttcatgatcaaagtat 46323  T
Q  224 -tgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
     ||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46322 gtgaaaagtgggt-tatg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgtt 46229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 41010 - 40722
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatg 129  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  41010 taaggtaagggggttataattcatcataatcatttattgcaatttttaattatt-gtatgaatagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 40912  T
Q  130 tgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttg-aattacatgttcaaagta--tga 226  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||  |||    
T  40911 tgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaacttcatgatcaaagtatgtga 40812  T
Q  227 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
     |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40811 aaagtgggt-tatg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatattgttgttacattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgtt 40722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 79998 - 79928
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||    
T  79998 tatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgtt 79928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 80249 - 80188
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  80249 gtgaagcttgagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 80188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 72 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 6251 - 6004
Alignment:
Q  72 ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgt 171  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||    
T  6251 ttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaatttggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgacgacatgtttgaatgt 6153  T
Q  172 atgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag-aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatg 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  6152 atgaagttatggataattggattgttgttggtagaatttcatgttcaaagtatgagaaaaatggtatatgttgaaaatatgctcaattggttaaattatg 6053  T
Q  270 cattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  6052 ctatgtggttgttgaattgtgataatattcatgttcaattgatgttgtt 6004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 572 - 642
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  572 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 322 - 383
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||    
T  322 gtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaacggggttattctttatcataatca 383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 155 - 1
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgctta 100  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  155 gtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgctta 56  T
Q  101 attggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatga 155  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  55 attggatgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctatttatga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 135 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 146848 - 146665
Alignment:
Q  135 aaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttgg 234  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||    
T  146848 aaattcatgctttaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgtataattgaactgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatggg 146749  T
Q  235 tatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  146748 tatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 146665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 53703 - 53410
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgg 122  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||     
T  53703 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgt 53606  T
Q  123 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 222  Q
    |||||  || |  ||||| ||||||| | ||||||| ||||||  ||| ||||  ||   |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  53605 tcatagttgttagaattcatgctctaataatgatgatatgtttgaatgcatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 53506  T
Q  223 atgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||| |||| || ||||||||| || ||||||| || || | ||||||||  | |||||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||    
T  53505 atgtgaaggtgttatatgttg-aattatgctctaaatgttcaattatgctattttgttgatgaattgtgatgagattcatgttcaatggatgttgtt 53410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 85818 - 85690
Alignment:
Q  95 tgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaatt 194  Q
    |||||||||| || || |||||||||| |||||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  85818 tgcttaattgaat-aagtgattaattgttcatagttgttgaaattcgtgctctaattatgatgatatgttta-atgcatgaaattggtgataattgaatt 85721  T
Q  195 gttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 225  Q
    |||||| ||  |||| |||||||| ||||||    
T  85720 gttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 85690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8982 - 8917
Alignment:
Q  250 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 315  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| | || ||| ||||||||||||    
T  8982 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgtt 8917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0816 (Bit Score: 124; Significance: 9e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0816
Description:

Target: scaffold0816; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 31 - 182
Target Start/End: Original strand, 2961 - 3112
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgt 130  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  2961 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataaatgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 3060  T
Q  131 gatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 182  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3061 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatg 3112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Original strand, 33622 - 33928
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  33622 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataaatgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 33719  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg- 225  Q
    |  || |  ||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||     
T  33720 aattgttagaattcatgctccaattatgatgacatgtttgaatgcttgaagttgtggataattgaattgttgttagtggaatttcatgtttaaagtatga 33819  T
Q  226 agaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgat 324  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  33820 agaag-tgttatatgttg-aaatatgctaaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgct 33917  T
Q  325 atgtcatgttg 335  Q
    | || ||||||    
T  33918 aagtgatgttg 33928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3671 - 3385
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  3671 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttacaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcata 3574  T
Q  128 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 227  Q
      || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||    
T  3573 attgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttatttataattgaattgttgttagagaaatttaatgttcaaagtatgag 3474  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttg 316  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3473 aaagtggtatatg-tgaaaatatgctcaattggtccaattatgctatgttgtagttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttg 3385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 318
Target Start/End: Original strand, 76733 - 77030
Alignment:
Q  24 tgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||  | |||||| |||    
T  76733 tgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtacttaattgagt-aattgagtaa 76830  T
Q  119 ttggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttca 218  Q
    ||| |||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||    
T  76831 ttgttcatagatgatgaaattcatgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 76930  T
Q  219 aagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgt 317  Q
    |||||||||||  || ||||||||| || |||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  76931 aagtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgttcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtgagattcatgttcaattgatgttgt 77029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 8157 - 7927
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  8157 taaggtaagggggttagaattcatcgtaatcatttattgcaattttacaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcata 8060  T
Q  128 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 227  Q
    | || |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||    
T  8059 tttgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttatttataattgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgag 7960  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggt 261  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7959 aaagtggtatatg-tgaaaatatgctcaattggt 7927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Original strand, 2211 - 2499
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt--aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  |||||| |||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||  |||||    
T  2211 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgcaatttttaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattaatcata 2308  T
Q  128 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 227  Q
      |  |  ||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  2309 attattagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgag 2408  T
Q  228 aagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||  ||  |||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  2409 aaagtgacatatgttg-aattatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattatgataagactcatgttcaattgatgttgtt 2499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 318
Target Start/End: Original strand, 197143 - 197436
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggt 123  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  197143 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattggat-aagtgattaattgtt 197241  T
Q  124 catatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagta 223  Q
    | ||  || |||| |||| |||||| ||||||||| ||||||  ||||||||| || | |||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||||    
T  197242 cttagatgttgaatttcgggctctaattatgatgatatgtttgaatgtatgaaattgttgataattgaattgttgttggtgaaattgcaagttcaaagta 197341  T
Q  224 tgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    || |||  || |||| |||| || ||||||| || || |||||| | |  |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  197342 tgtgaaagtgttataagttg-aattatgctctaaatgttgaattgtcctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgtt 197436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 318
Target Start/End: Original strand, 6907 - 7208
Alignment:
Q  20 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||| |||  |||||||||  | |  |||||||| ||||||||||||||  | ||| |||    
T  6907 ttggtgataattaaggtaagggggttagaattcaattataatcattttaatgtaatttttcaatcgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gat 7005  T
Q  116 taattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgt 215  Q
    |  ||| |||||  ||   |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||  ||||    
T  7006 ttgttgttcataattgtcaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagtgaaatttaatgt 7105  T
Q  216 tcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 314  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||| |||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  7106 tcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgtttaattatgttatgttgttattggattgtgataagaatcatgttcaattgatgt 7204  T
Q  315 tgtt 318  Q
    ||||    
T  7205 tgtt 7208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 235 - 335
Target Start/End: Original strand, 618 - 718
Alignment:
Q  235 tatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgtt 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||    
T  618 tatatgttgaaaatatgctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttactaagtcatgtt 717  T
Q  335 g 335  Q
    |    
T  718 g 718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 69814 - 69521
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgg 122  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |  || ||||||||||     
T  69814 taattaagataagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattg-agaaagtgattaattgt 69717  T
Q  123 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 222  Q
    |||||  || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||    ||||||||||||||||  ||  |||| |||||| |||||    
T  69716 tcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttaaatgcatgaaattggttataattgaattgttgtaggtgaaattgcatgtttaaagt 69617  T
Q  223 atgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||| |||  || |||||||||||  ||||||| || || |||||| |||  |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  69616 atgtgaaagtgttatatgttgaat-tatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgtt 69521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 2795 - 2589
Alignment:
Q  112 tgattaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattac 211  Q
    |||||||||| |||||  || | |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |    
T  2795 tgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttggatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgc 2696  T
Q  212 atgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattg 310  Q
    |||||||||||||  |||  || ||||||||| || ||||||| || || ||||||||||  ||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||    
T  2695 atgttcaaagtatatgaaagtgttatatgttg-aattatgctctaaatgttgaattatgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattg 2597  T
Q  311 atgttgtt 318  Q
    ||||||||    
T  2596 atgttgtt 2589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 35843 - 35545
Alignment:
Q  20 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||| || |||||| || |||||||||||  | ||  ||    
T  35843 ttggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattgtt-gtatgaataggtgcttaattgagtaaaa-ga 35746  T
Q  115 ttaattggtcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatg 214  Q
    ||||||| ||| |  |  |  ||||||||||| | | ||||||| ||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  35745 ttaattgttcaaagttcttataattcgtgctccaatcatgatgatatgtttgaatgcatgaagttattgataattgaattgttgttagtgaaatttcatg 35646  T
Q  215 ttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatg 313  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||| || ||| ||| ||||| ||| ||||||  ||||||||||||| |||| ||||  ||||| ||||||||||    
T  35645 ttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aattatactcaaattgttgatttatgctatgttgttgttgaaatgtggtaagagtcatgttcaattgatg 35547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 136 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 6907 - 6725
Alignment:
Q  136 aattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggt 235  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||  || |    
T  6907 aattcgtgctataattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgat 6808  T
Q  236 atatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||||||| || | ||||| ||||| ||||||||||  || | ||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||    
T  6807 atatgttg-aattttgctcaaattgttgaattatgctatgctattgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgtt 6725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 241 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 32344 - 32250
Alignment:
Q  241 ttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |  |||||||||    
T  32344 ttgaaaatatgctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttg 32250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 241 - 335
Target Start/End: Original strand, 41959 - 42053
Alignment:
Q  241 ttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |  |||||||||    
T  41959 ttgaaaatatgctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttg 42053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 137 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28781 - 28583
Alignment:
Q  137 attcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggta 236  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| || | ||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||  || ||    
T  28781 attcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaacttgttgataactgaattgttgttggtgaaattatatgttcaaagtatgagaaagtgata 28682  T
Q  237 tatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||   |||||||||||||||||  ||||  | ||| ||||||||||||||| ||| || || ||||||    
T  28681 tatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatggtatgttgttgttgaattgtagtaagaattatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttg 28583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 335
Target Start/End: Original strand, 93728 - 93972
Alignment:
Q  90 ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcatatgtgat-gaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataat 188  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||  || | ||||||||||||| | ||||||||| |||| |  ||| |||||||| | ||||||    
T  93728 ataagtgcttaattgggtaaatt-attaattgttcataactgttagaaattcgtgctccaattatgatgatatgtatgtatgcatgaagtttttgataat 93826  T
Q  189 tgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaatt 287  Q
    ||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| ||||  |||| |||||  || ||||||| ||||    
T  93827 tgaatggttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgagaaaatggtatttgttg-aaatatgctcaaattattgaagtatgctatg-tgttgttaaatt 93924  T
Q  288 gtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    ||||| |  |||||| ||||||||||||||| || ||| || ||||||    
T  93925 gtgatgaaattcatgttcaattgatgttgttattaataagtgatgttg 93972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 55715 - 55645
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55715 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 55645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 17525 - 17595
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17525 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 17595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 250 - 318
Target Start/End: Original strand, 89584 - 89652
Alignment:
Q  250 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  89584 tgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttaaattgtgataagtttcatgaacaattgatgttgtt 89652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 31377 - 31084
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgg 122  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||     
T  31377 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgt 31280  T
Q  123 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 222  Q
    |||||  || |  ||||||||||||| ||||||||| || |||  ||| ||||| ||   |||||||| ||||||||| ||  |||| |||||||| |||    
T  31279 tcatagttgttagaattcgtgctctaattatgatgatatatttgaatgcatgaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatgttcatagt 31180  T
Q  223 atgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||| |||  || |||||||||||  ||||||  || || |||||| |||  |||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  31179 atgtgaaagtgttatatgttgaat-tatgctttaaatgttgaattgtgctatgttcttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgtt 31084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8363 - 8167
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  8363 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttaatgtaatttttcaattatt-gtatgaataagtgattaattggataaat-gattaattgttcat 8266  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 225  Q
    |  || | ||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||||||    
T  8265 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatg 8167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8145 - 8057
Alignment:
Q  248 tatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  8145 tatgctcaattgggtgaattatgctatgttgttgtggaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgctatgtgatgttg 8057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 1099 - 1169
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1099 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgtt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 13507 - 13577
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13507 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgtt 13577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 21481 - 21551
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21481 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgtt 21551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 15083 - 15013
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15083 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgtt 15013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3407 - 3346
Alignment:
Q  274 gttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3407 gttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttg 3346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 200
Target Start/End: Original strand, 1440 - 1611
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||| ||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  1440 taaggtaaggggtttagaattcatcataattattttagtgtaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggataaat-gattaattgttcat 1537  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 200  Q
    |  || | ||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||| ||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  1538 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattagtgataattgaattgttgtt 1611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 200
Target Start/End: Original strand, 8585 - 8756
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||| ||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  8585 taaggtaaggggtttagaattcatcataattattttagtgtaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggataaat-gattaattgttcat 8682  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 200  Q
    |  || | ||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||| ||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  8683 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattagtgataattgaattgttgtt 8756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 6664 - 6734
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  6664 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttgatgatcaatagatcttgtt 6734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 6204 - 6274
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  6204 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 6274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 5747 - 5808
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5747 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 5808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 5953 - 6014
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5953 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 6014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 9628 - 9698
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9628 tatgctcaattagtgacttatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtt 9698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 31401 - 31471
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  31401 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 31471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 31150 - 31211
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  31150 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatca 31211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 41443 - 41373
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  41443 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 41373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 41694 - 41633
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  41694 gtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatca 41633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 225
Target Start/End: Original strand, 1242 - 1438
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaa-ttttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||  ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  1242 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatattagtgtaatttttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaattggat-aaatgattaattgttcat 1339  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 225  Q
    |  || | ||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||| || || ||   |||||||| ||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||    
T  1340 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcataaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatggtcaaagtatg 1438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 225
Target Start/End: Original strand, 9497 - 9693
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaa-ttttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||  ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  9497 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatattagtgtaatttttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaattggat-aaatgattaattgttcat 9594  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 225  Q
    |  || | ||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||| || || ||   |||||||| ||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||    
T  9595 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcataaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatggtcaaagtatg 9693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 200
Target Start/End: Original strand, 89760 - 89929
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  89760 taaggtaagggggttagaattcatcataatctttttagtgtaattttcaatta-ttgtatgaataagtgattaattggat-aattgattaattgttcata 89857  T
Q  128 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 200  Q
      || | |||||||||||| |  |||||||| ||||||  ||| ||||| ||   |||| |||||||||||||    
T  89858 gatg-ttaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgatacttgaattgttgtt 89929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 11014 - 10845
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta--attttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||  |||||||| |||||    
T  11014 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtataattttcaattatt-gtatgaataagtgattaattggataaata-attaattgttcata 10917  T
Q  128 tgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgt 199  Q
      || |  |||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||| ||   ||||||||| |||||||    
T  10916 gatgttataattcgtgctctatctatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgagttgttgt 10845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 255 - 318
Target Start/End: Original strand, 10094 - 10157
Alignment:
Q  255 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10094 aattggcgaattatgcttggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgtt 10157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 12641 - 12711
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||    
T  12641 tatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgtt 12711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 186647 - 186716
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  186647 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgat-tattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgtt 186716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 193609 - 193678
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  193609 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgat-tattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgtt 193678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27856 - 27654
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgg 122  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||| | ||||||||||||| || ||| ||||| || |    
T  27856 taattaaggtaagggggttagatttcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgcttaagtgcttaattgaataaat-gattattttg 27758  T
Q  123 -tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaag 221  Q
     |||||  || ||||||| |||||||  ||||||||| ||||||  ||  ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||    
T  27757 ctcatagttgttgaaatttgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcatag 27658  T
Q  222 tatg 225  Q
    ||||    
T  27657 tatg 27654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 11326 - 11141
Alignment:
Q  150 ttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaata 249  Q
    ||||||||| ||||||  ||| |||||  ||  |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| || |||  || ||||||||| || ||    
T  11326 ttatgatgatatgtttgaatgcatgaaactagtgataattgaattgttgtttgtgaaatttcatgttcaaagtgtgtgaaagtgatatatgttg-aatta 11228  T
Q  250 tgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttg 335  Q
    ||||| ||| | |||| |||||  | ||||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  11227 tgctcaaatagttgaaatatgctatcttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgctatgtgatgttg 11141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 149 - 219
Alignment:
Q  248 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |  ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  149 tatgctcaattggtgaattatgcataataattgatgaattatgataagtttcatgatcaataaatgttgtt 219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 222
Target Start/End: Original strand, 22323 - 22516
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg---taattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |   || |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  22323 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgttattttttaatta-ttgtatgaataagtgattaattggatg-attgattgattgttcat 22420  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 222  Q
    |  || | ||||||||||||||  || ||| | ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||||    
T  22421 agatgttaaaattcgtgctctaactaggataatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagt 22516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 30479 - 30418
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  30479 gtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaagggggttatttttcatcataatca 30418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30199 - 30155
Alignment:
Q  274 gttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  30199 gttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt 30155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 127
Target Start/End: Original strand, 70201 - 70298
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt--aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattggtcata 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||| |||| || || ||||||||||||| |||||    
T  70201 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttgtgaaattttcaatta-ttgtatgaataagtgattaaatgtat-aattgattaattgttcata 70298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 225
Target Start/End: Original strand, 855 - 1052
Alignment:
Q  31 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggtcat 126  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||  || || |||||| ||| ||||    
T  855 taaggtaagggggttagatttcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattaaat-aagtgattatttgttcat 953  T
Q  127 atgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 225  Q
    |  || | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||  ||  ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||    
T  954 agttgttaaaattcgtgttctaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 318
Target Start/End: Original strand, 23562 - 23855
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattggt 123  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||| ||||||| | |  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||||| ||| |    
T  23562 taattaagataagggggttagaattcaatcataatgattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttagttgaat-aattgattatttgtt 23660  T
Q  124 catatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagta 223  Q
    ||||  || ||||||||||||| || ||||| ||| ||||||  ||  ||||| || | |||||||||||||||||| |   |||| |||||||| ||||    
T  23661 catagttgttgaaattcgtgctttaattatggtgatatgtttgtatacatgaaatttttgataattgaattgttgttggagaaattgcatgttcatagta 23760  T
Q  224 tgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    || |||  || |||||  || || | ||||| || || |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||| ||||||    
T  23761 tgtgaaaatgatatattgtg-aattgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgacgttgtt 23855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 245
Target Start/End: Original strand, 43688 - 43908
Alignment:
Q  27 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgg 122  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||     
T  43688 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattgtt-gtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgt 43785  T
Q  123 tcatatgtgatgaaattcgtgctctatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 222  Q
    |||||  || | |||||  ||||||| ||||||||  ||||||  ||| ||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||     
T  43786 tcatagttgttaaaattaatgctctaattatgatgctatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagg 43885  T
Q  223 atgagaagttggtatatgttgaa 245  Q
    ||  |||  || |||||||||||    
T  43886 atatgaaagtgatatatgttgaa 43908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 22198 - 22063
Alignment:
Q  183 gataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgt 281  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||| |||  ||||||||  ||||  | ||||| || || ||||||  ||  |||||||||    
T  22198 gataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatggtatattgtgaat-tgtgctctaaatgttgaattgggctatgttgttgt 22100  T
Q  282 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||| || |||||| | |||||||||||||    
T  22099 tgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgtt 22063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 108208 - 108074
Alignment:
Q  183 gataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgt 281  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||| |||  ||||||||  || || ||||||| || || |||||||||| ||||| ||||    
T  108208 gataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatggtatattatg-aattatgctctaaatgttgaattatgc-ttgttattgt 108111  T
Q  282 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||| |   ||||| | |||||||||||||    
T  108110 tgaattgtgatgaagatcatgtttaattgatgttgtt 108074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 255 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 436 - 373
Alignment:
Q  255 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||    
T  436 aattgttgaattatgctatgttattgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgtt 373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 42736 - 42678
Alignment:
Q  1 gtgaagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  42736 gtgaagctagagctaatagttggagataa---aggtaagggggttagtttttatcataatca 42678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 13639 - 13571
Alignment:
Q  250 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||   |||| |||||||||||||||    
T  13639 tgctcaattgatgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 13571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 62
Target Start/End: Original strand, 1393 - 1435
Alignment:
Q  20 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 62  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1393 ttggtgataattgaggtaagggggttagaattcatcataatca 1435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 41778 - 41713
Alignment:
Q  253 tcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||   |||| |||||||||||||||    
T  41778 tcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 41713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 318
Target Start/End: Original strand, 17428 - 17504
Alignment:
Q  242 tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||    
T  17428 tgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgtt 17504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 318
Target Start/End: Original strand, 61341 - 61417
Alignment:
Q  242 tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||    
T  61341 tgaaattatgcttaattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgtt 61417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 318
Target Start/End: Original strand, 51312 - 51380
Alignment:
Q  250 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 318  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| |||| ||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||    
T  51312 tgctcaattggtgaattatgttatgtggttgatgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgtt 51380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University