View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5489-Insertion-9 (Length: 485)

Name: NF5489-Insertion-9
Description: NF5489
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5489-Insertion-9
NF5489-Insertion-9
[»] chr6 (77 HSPs)
chr6 (8-464)||(28786063-28786519)
chr6 (8-464)||(28792184-28792640)
chr6 (8-464)||(28780924-28781380)
chr6 (8-464)||(27718325-27718781)
chr6 (8-464)||(27724791-27725247)
chr6 (8-464)||(27610948-27611404)
chr6 (8-464)||(27698440-27698895)
chr6 (8-464)||(26802223-26802683)
chr6 (8-464)||(27604651-27605113)
chr6 (8-451)||(27678744-27679187)
chr6 (8-417)||(27592966-27593375)
chr6 (8-451)||(27706348-27706791)
chr6 (8-417)||(27677560-27677969)
chr6 (8-368)||(27531143-27531503)
chr6 (61-464)||(26655774-26656177)
chr6 (61-464)||(26761745-26762148)
chr6 (8-387)||(26884025-26884406)
chr6 (10-459)||(31284078-31284527)
chr6 (161-464)||(27229019-27229320)
chr6 (29-451)||(27338032-27338454)
chr6 (29-451)||(27398772-27399194)
chr6 (61-367)||(26646361-26646667)
chr6 (61-367)||(26752329-26752635)
chr6 (8-419)||(26861446-26861854)
chr6 (28-355)||(25481636-25481963)
chr6 (61-420)||(26622805-26623164)
chr6 (61-420)||(26728783-26729142)
chr6 (64-464)||(26823631-26824025)
chr6 (29-355)||(25579613-25579939)
chr6 (25-354)||(28234459-28234787)
chr6 (104-355)||(26142759-26143010)
chr6 (29-355)||(26055820-26056146)
chr6 (29-355)||(26075790-26076116)
chr6 (7-464)||(27427551-27428003)
chr6 (29-355)||(25538434-25538760)
chr6 (29-355)||(26048739-26049065)
chr6 (29-355)||(26069908-26070234)
chr6 (13-351)||(28242702-28243040)
chr6 (25-354)||(28226845-28227174)
chr6 (25-331)||(28181032-28181338)
chr6 (13-387)||(28325343-28325717)
chr6 (125-393)||(28185222-28185490)
chr6 (10-306)||(26848603-26848899)
chr6 (128-245)||(25506975-25507092)
chr6 (23-270)||(26937073-26937320)
chr6 (64-318)||(28139472-28139726)
chr6 (114-270)||(28149917-28150072)
chr6 (114-270)||(28297765-28297921)
chr6 (114-270)||(28514152-28514308)
chr6 (10-343)||(28098317-28098650)
chr6 (190-318)||(26635621-26635749)
chr6 (190-318)||(26741587-26741715)
chr6 (78-354)||(27214312-27214588)
chr6 (78-354)||(27234640-27234916)
chr6 (47-319)||(29825957-29826229)
chr6 (114-354)||(26341986-26342226)
chr6 (134-351)||(26893543-26893760)
chr6 (212-317)||(26959097-26959202)
chr6 (10-318)||(26949592-26949900)
chr6 (190-318)||(26974983-26975111)
chr6 (218-354)||(27665273-27665409)
chr6 (190-305)||(26811453-26811568)
chr6 (391-464)||(25538358-25538431)
chr6 (224-312)||(26617263-26617351)
chr6 (224-312)||(26723191-26723279)
chr6 (120-354)||(2184183-2184417)
chr6 (224-318)||(25071590-25071684)
chr6 (390-464)||(26055744-26055818)
chr6 (391-464)||(25481560-25481633)
chr6 (391-464)||(26048663-26048736)
chr6 (391-464)||(26069832-26069905)
chr6 (391-464)||(26075714-26075787)
chr6 (391-464)||(26142683-26142756)
chr6 (200-241)||(28481232-28481273)
chr6 (200-241)||(29793656-29793697)
chr6 (200-249)||(29733186-29733235)
chr6 (200-348)||(29697465-29697613)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (8-464)||(13578-14034)
scaffold0277 (8-485)||(4617-5094)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (8-451)||(7323-7766)
[»] scaffold0349 (3 HSPs)
scaffold0349 (8-464)||(3367-3824)
scaffold0349 (8-464)||(14302-14756)
scaffold0349 (323-464)||(8062-8203)
[»] scaffold1254 (1 HSPs)
scaffold1254 (146-451)||(1-306)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (28-462)||(18699353-18699787)
chr4 (28-468)||(18655430-18655870)
chr4 (28-468)||(18679520-18679960)
chr4 (63-468)||(18731492-18731897)
chr4 (63-422)||(18724073-18724432)
chr4 (7-464)||(18073552-18074004)
chr4 (275-464)||(17989250-17989437)
chr4 (10-345)||(5090902-5091237)
chr4 (32-97)||(17989013-17989078)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (32-446)||(28164320-28164733)
chr1 (27-443)||(28127631-28128042)
chr1 (28-422)||(268310-268704)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (28-411)||(29273736-29274119)
chr8 (190-367)||(31903733-31903910)
chr8 (134-249)||(16373134-16373249)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (25-354)||(34620-34949)
scaffold0038 (13-351)||(42864-43202)
scaffold0038 (25-354)||(27343-27672)
scaffold0038 (13-387)||(116658-117032)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (7-464)||(59360-59812)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (25-331)||(58245-58551)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (114-345)||(3279592-3279823)
chr2 (200-354)||(17993822-17993976)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (26-268)||(16688992-16689234)
[»] scaffold0781 (1 HSPs)
scaffold0781 (302-354)||(91-143)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 397; Significance: 0; HSPs: 77)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 28786519 - 28786063
Alignment:
Q  8 ttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttg 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28786519 ttttcatgcccagccaatgcttcaccataacgacctgtatgatgtcgcacattagtaggatcgacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttg 28786420  T
Q  108 tctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaat 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  28786419 tcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgat 28786320  T
Q  208 ggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattt 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28786319 ggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattt 28786220  T
Q  308 ccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattg 407  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28786219 ccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatag 28786120  T
Q  408 ccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28786119 ccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 28786063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 28792640 - 28792184
Alignment:
Q  8 ttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttg 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28792640 ttttcatgcccagccaatgcttcaccataacgacctgtatgatgtcgcacattagtaggatcgacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttg 28792541  T
Q  108 tctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaat 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  28792540 tcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgat 28792441  T
Q  208 ggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattt 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28792440 ggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattt 28792341  T
Q  308 ccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattg 407  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28792340 ccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatag 28792241  T
Q  408 ccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28792240 ccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 28792184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 28781380 - 28780924
Alignment:
Q  8 ttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttg 107  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28781380 ttttcatgtccagccaatgcttcaccataaggacctgtatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttg 28781281  T
Q  108 tctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaat 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  28781280 tcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgat 28781181  T
Q  208 ggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattt 307  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28781180 ggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattg 28781081  T
Q  308 ccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattg 407  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| || |    
T  28781080 ccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagaggaaaatgaagaggaagaggaaggtaattgcatag 28780981  T
Q  408 ccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 464  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28780980 ccatgataattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 28780924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 464
Target Start/End: Original strand, 27718325 - 27718781
Alignment:
Q  8 ttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27718325 ttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttg 27718424  T
Q  108 tctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaat 207  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27718425 tcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaat 27718524  T
Q  208 ggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattt 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27718525 ggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattt 27718624  T
Q  308 ccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattg 407  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27718625 ccggtaaaactgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatgggagaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatag 27718724  T
Q  408 ccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 464  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27718725 ccatgagaattgagagaaataggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaat 27718781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 464
Target Start/End: Original strand, 27724791 - 27725247
Alignment:
Q  8 ttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27724791 ttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttg 27724890  T
Q  108 tctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaat 207  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27724891 tcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaataggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaat 27724990  T
Q  208 ggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattt 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27724991 ggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattt 27725090  T
Q  308 ccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattg 407  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27725091 ccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatag 27725190  T
Q  408 ccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 464  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27725191 ccatgacaattgagagaaataggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaat 27725247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 8 - 464
Target Start/End: Original strand, 27610948 - 27611404
Alignment:
Q  8 ttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27610948 ttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatgtcgcactttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttg 27611047  T
Q  108 tctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaat 207  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27611048 tcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaat 27611147  T
Q  208 ggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattt 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27611148 ggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctcttggaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattt 27611247  T
Q  308 ccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattg 407  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| || ||||||| | |||| || |    
T  27611248 ccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaagaagaggaagctaattgcatag 27611347  T
Q  408 ccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 464  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27611348 ccatgaaaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaat 27611404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 8 - 464
Target Start/End: Original strand, 27698440 - 27698895
Alignment:
Q  8 ttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27698440 ttttcatgctcagccaatgctttgccataactacctttatgatgtctcacattagttggttccacaccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttg 27698539  T
Q  108 tctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaat 207  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27698540 tctcgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttgagagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaat 27698639  T
Q  208 ggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattt 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27698640 ggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattt 27698739  T
Q  308 ccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattg 407  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  27698740 ccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactgatgaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatag 27698839  T
Q  408 ccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 464  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27698840 ccatgagaattgagagaaataggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaat 27698895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 8 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 26802683 - 26802223
Alignment:
Q  8 ttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  26802683 ttttcatgctcagccaatgcttcaccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaataggcaagacgaggcgaccctttg 26802584  T
Q  108 tctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaat 207  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26802583 tcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaat 26802484  T
Q  208 ggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattt 307  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  26802483 ggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattg 26802384  T
Q  308 ccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattg 407  Q
    || |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||| || || || |    
T  26802383 cccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatag 26802284  T
Q  408 ccataagaattgagagaaattggatgaa----aaaagagtttgagaattcagaatatgaat 464  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26802283 ccatgaaaattgtgagaaattggatgaaaaaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaat 26802223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 8 - 464
Target Start/End: Original strand, 27604651 - 27605113
Alignment:
Q  8 ttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttg 107  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27604651 tttttatgctcagccaatgcttgaccgtaactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgacgcgaccctttg 27604750  T
Q  108 tctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaat 207  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  27604751 tcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaaggaagaagaggcatatttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaat 27604850  T
Q  208 ggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattt 307  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27604851 ggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattttcatcaatgaaggtatgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattg 27604950  T
Q  308 ccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaa------gaggatgaggaaggtgatt 401  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||      ||||||||||||||| |||    
T  27604951 ccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaaatgaagaggatgaggatgaggaaggtaatt 27605050  T
Q  402 gtattgccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 464  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27605051 gcatagccatgagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaat 27605113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 8 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 27679187 - 27678744
Alignment:
Q  8 ttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  27679187 ttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttacgatgtcgcacaacagtaggttccacaccaaagaaaacaggcagaacgaggcgaccctttg 27679088  T
Q  108 tctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaat 207  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679087 tcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaat 27678988  T
Q  208 ggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27678987 ggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagaccattcttatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattc 27678888  T
Q  308 ccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattg 407  Q
    ||||| ||||| |  ||||||||| | || || ||||||||||| ||||||||  || |  || || ||| ||||| ||| |||||||||||||| || |    
T  27678887 ccggtgaaaccgtaccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtactcataggaaattgaagtggaagaggaaggtgattgcatag 27678788  T
Q  408 ccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaat 451  Q
    |||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27678787 ccatgagattttagagaaattagatgaaaaaagagtttgagaat 27678744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 8 - 417
Target Start/End: Original strand, 27592966 - 27593375
Alignment:
Q  8 ttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  27592966 ttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacagggcgaccctttg 27593065  T
Q  108 tctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaat 207  Q
    ||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27593066 tcttgtagcaatgaatgatgtggtcaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaat 27593165  T
Q  208 ggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27593166 ggccttgagaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagaccattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattg 27593265  T
Q  308 ccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattg 407  Q
    ||||| ||||| |  ||||||||| | || || ||||||||||| ||||||||  || |  || || ||| ||||| ||| |||||||||||||| || |    
T  27593266 ccggtgaaaccgtaccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtaatcataggaaattgaagtggaagaggaaggtgattgcatag 27593365  T
Q  408 ccataagaat 417  Q
    |||| |||||    
T  27593366 ccatgagaat 27593375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 8 - 451
Target Start/End: Original strand, 27706348 - 27706791
Alignment:
Q  8 ttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  27706348 ttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttacgatgtcgcacaatagtaggttctacaccaaataaaacaggcagaacgaggcgaccctttg 27706447  T
Q  108 tctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaat 207  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27706448 tcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcataggtgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaat 27706547  T
Q  208 ggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||  |  ||||||||||| | |||||||||||||  || |||||||||||||||     
T  27706548 ggccttgagaagtgatggtgtgatttcatcccttctttgaagttcatgattgtcaatgaaggtgtggattcccttgtcatcaaaagccttgtagagattg 27706647  T
Q  308 ccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattg 407  Q
    || || ||||| |  |||||||||   || || ||||||||||| ||||||||  || |  || || ||| ||||| ||| ||| |||||||||| || |    
T  27706648 cctgtgaaaccgtaccgagtgtcacctcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtactcataggaaattgaagtggaagagaaaggtgattgcatag 27706747  T
Q  408 ccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaat 451  Q
    |||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27706748 ccatgagattttagagaaattagatgaaaaaagagtttgagaat 27706791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 8 - 417
Target Start/End: Original strand, 27677560 - 27677969
Alignment:
Q  8 ttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  27677560 ttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatgtcgcacaatagtaggttccacagcaaagaaaacaggcagaacgaggcgaccctttg 27677659  T
Q  108 tctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaat 207  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27677660 tcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacagcaataaaaatcctagactcttcaat 27677759  T
Q  208 ggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |  ||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  27677760 ggccttgagaagtgatggtgtgatttcatcccctctttgaagttcatgattgtcaatgaaggtgtggattcccttgtcatcaagagccttgtagagattg 27677859  T
Q  308 ccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattg 407  Q
    ||||| ||||| |  ||||||||| | || || ||| ||||||| ||||||||  || |  || || ||| ||||| ||| |||||||||||||| || |    
T  27677860 ccggtgaaaccgtaccgagtgtcacttcctctgaaattgaggaatacttggtatttgtactcataggaaattgaagtggaagaggaaggtgattgcatag 27677959  T
Q  408 ccataagaat 417  Q
    |||| |||||    
T  27677960 ccatgagaat 27677969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 8 - 368
Target Start/End: Original strand, 27531143 - 27531503
Alignment:
Q  8 ttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttg 107  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| || | ||| ||||    
T  27531143 tttttatgcacagctaatgcttcaccatatctacctgtgtgatgtcgcacatcagtaggatccacaccaataaaaacaggcaaaacaagacaaccctttg 27531242  T
Q  108 tctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaat 207  Q
    | |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||   ||||  ||||||||   |||||| || ||||||||||||||||| | ||||||    
T  27531243 tatcgtagcaatgagtgatgtgaacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttttcagaaaatacgggaataaaaatcctagatttttcaat 27531342  T
Q  208 ggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattt 307  Q
    ||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27531343 ggcattttttagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatagattcccttgtcagtaagagccttgtagagattt 27531442  T
Q  308 ccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatg 368  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27531443 ccggtaaaaccgtggcgagtgtccgcgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatg 27531503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 61 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 26656177 - 26655774
Alignment:
Q  61 agtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtg 160  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    | ||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||      
T  26656177 agtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 26656078  T
Q  161 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 260  Q
    |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26656077 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcat 26655978  T
Q  261 caatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 360  Q
    ||||||| || | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26655977 caatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggta 26655878  T
Q  361 agtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattgccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatat 460  Q
      | ||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  26655877 tttaaacccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgagagaaaatggatgaaaaaagagtttgggaatgcagaatat 26655778  T
Q  461 gaat 464  Q
    ||||    
T  26655777 gaat 26655774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 61 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 26762148 - 26761745
Alignment:
Q  61 agtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtg 160  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    | ||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||      
T  26762148 agtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagat 26762049  T
Q  161 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 260  Q
    |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26762048 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcat 26761949  T
Q  261 caatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 360  Q
    ||||||| || | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26761948 caatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggta 26761849  T
Q  361 agtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattgccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatat 460  Q
      | ||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  26761848 tttaaacccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgagagaaaatggatgaaaaaagagtttgggaatgcagaatat 26761749  T
Q  461 gaat 464  Q
    ||||    
T  26761748 gaat 26761745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 8 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 26884406 - 26884025
Alignment:
Q  8 ttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttg 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26884406 ttttcatggtcagccaatgcttcaccataactacctgtatgatgtcgcacatcagtaggatccacaccaacaaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttg 26884307  T
Q  108 tctcgtagcaatgaataa--tgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttca 205  Q
    |||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||| ||||||   ||||  ||||||||| ||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  26884306 tctcgtagcagtgaatgacatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttca 26884207  T
Q  206 atggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagat 305  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||   ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26884206 atggccttgatgagtgatggtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagat 26884107  T
Q  306 ttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagagga 387  Q
    |||| || |||||||  ||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  26884106 ttccagtgaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagagga 26884025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 31284527 - 31284078
Alignment:
Q  10 ttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtc 109  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |    
T  31284527 ttcatgcttagccaatgcttctccataactacctctatgatgtcgcacatgagaaggatccacgccaaagaaaacgggcaaaacgaggcgaccattttgc 31284428  T
Q  110 tcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatgg 209  Q
    |  ||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    |||| ||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  31284427 ttatacaagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgacgaagaggcatagttggcagaaaacacggggataaaaatcctagactcttcaatgg 31284328  T
Q  210 ccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttcc 309  Q
    | |||   |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31284327 cattgtcgagtgatggtgtgatttcatcccctctttgaagttcactatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgcc 31284228  T
Q  310 ggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattgcc 409  Q
    ||| |||||||  ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||| || || ||| ||||||||| ||||||| |||||| || |||    
T  31284227 ggtgaaaccataccgagtgtcacttcccctgaaactaaggaatacttggtatttgaatacataggaaattgaagaggaagaggaagatgattgcatagcc 31284128  T
Q  410 ataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaata 459  Q
    || ||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  31284127 atgagatttgagagaatatggatgaagaaagaatttgagaatgcagaata 31284078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 161 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 27229320 - 27229019
Alignment:
Q  161 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 260  Q
    |||||||||  |||||| |  ||||||||||||| ||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27229320 gcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatccgagattcgtcaatggccttgacgagtgatggtgtgatttcgtctcctctttgaagatcattgtcat 27229221  T
Q  261 caatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 360  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27229220 caatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggta 27229121  T
Q  361 agtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattgccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatat 460  Q
    ||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  27229120 agtgaatccaaaggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgtatagccatgagacttgagagaaattggatg--aaaagagttttagaatgcagaatat 27229023  T
Q  461 gaat 464  Q
    ||||    
T  27229022 gaat 27229019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 29 - 451
Target Start/End: Original strand, 27338032 - 27338454
Alignment:
Q  29 tcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaataatgt 128  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||| || | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    | |||  |||||| |||||| ||||| ||||    
T  27338032 tcaccataactcccagtctgatgtcgtacgtgagtaggatccgcaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccccttgtcttgtagcagtgaatgatgt 27338131  T
Q  129 gaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgt 228  Q
    | |||||||||||||||||||||   ||||  ||||||||   |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27338132 ggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatagtttgcagaaaatatgggaatcaaaatcctagactcttcaatggccttgacaagtgatggtgt 27338231  T
Q  229 gatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtg 328  Q
    | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |   |||||    
T  27338232 gctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtaaagagtg 27338331  T
Q  329 tcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattgccataagaattgagagaaatt 428  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||     
T  27338332 tcaatgtccctaaaactgaggaacacatggtatttgaacccagaggaaattgaagaggaagaggaaagtgattgcatagccatgagaattgagagaaata 27338431  T
Q  429 ggatgaaaaaagagtttgagaat 451  Q
     |||||||||| |||||||||||    
T  27338432 agatgaaaaaaaagtttgagaat 27338454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 29 - 451
Target Start/End: Original strand, 27398772 - 27399194
Alignment:
Q  29 tcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaataatgt 128  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||| || | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    | |||  |||||| |||||| ||||| ||||    
T  27398772 tcaccataactcccagtctgatgtcgtacgtgagtaggatccgcaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccccttgtcttgtagcagtgaatgatgt 27398871  T
Q  129 gaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgt 228  Q
    | |||||||||||||||||||||   ||||  ||||||||   |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27398872 ggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatagtttgcagaaaatatgggaatcaaaatcctagactcttcaatggccttgacaagtgatggtgt 27398971  T
Q  229 gatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtg 328  Q
    | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |   |||||    
T  27398972 gctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtaaagagtg 27399071  T
Q  329 tcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattgccataagaattgagagaaatt 428  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||     
T  27399072 tcaatgtccctaaaactgaggaacacatggtatttgaacccagaggaaattgaagaggaagaggaaagtgattgcatagccatgagaattgagagaaata 27399171  T
Q  429 ggatgaaaaaagagtttgagaat 451  Q
     |||||||||| |||||||||||    
T  27399172 agatgaaaaaaaagtttgagaat 27399194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 61 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26646667 - 26646361
Alignment:
Q  61 agtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtg 160  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  26646667 agtaggatccacgccatagaaaacgggcaaaacgagacgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagag 26646568  T
Q  161 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||    
T  26646567 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcat 26646468  T
Q  261 caatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 360  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||||||| ||||||| ||  ||||||| || |||||    
T  26646467 caatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagatgtccagtaaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagttgaggaagacctggta 26646368  T
Q  361 agtgaat 367  Q
     ||||||    
T  26646367 ggtgaat 26646361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 61 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26752635 - 26752329
Alignment:
Q  61 agtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtg 160  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  26752635 agtaggatccacgccatagaaaacgggcaaaacgagacgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagag 26752536  T
Q  161 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||    
T  26752535 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcat 26752436  T
Q  261 caatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 360  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||||||| ||||||| ||  ||||||| || |||||    
T  26752435 caatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagatgtccagtaaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagttgaggaagacctggta 26752336  T
Q  361 agtgaat 367  Q
     ||||||    
T  26752335 ggtgaat 26752329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 26861854 - 26861446
Alignment:
Q  8 ttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttg 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||| |||     
T  26861854 ttttcatgcttagccaatgcttcaccataaatacctctatgatgtcgcacattagtaggatccatgccatagaaaacaggcaaaacgacgcgacccttt- 26861756  T
Q  108 tctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaat 207  Q
      || | ||| | ||| || || |||||||| ||||| ||||||   |||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26861755 --tccttgcagttaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttggcagaaaacacaggaatgaaaattctagactcttcaat 26861658  T
Q  208 ggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattt 307  Q
    ||| |||   ||||||  | |||||||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26861657 ggcattgtcgagtgatcttttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagatta 26861558  T
Q  308 ccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattg 407  Q
    |||||||||||||  ||||||||| | || || ||||||||||| || |||||  ||||| || || |||  |||||||| ||| |||||||||| || |    
T  26861557 ccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacctggtatttgaatccataggaaatggaagaggaagagcaaggtgattgcatag 26861458  T
Q  408 ccataagaattg 419  Q
    |||| |||||||    
T  26861457 ccatcagaattg 26861446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 25481963 - 25481636
Alignment:
Q  28 ttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaataatg 127  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||| || || || | || ||  ||||||| |||||| ||||| |||    
T  25481963 ttcaccataactacatgtatgacgtcgaacatcagtaggatccacaccatagaaaacgggtaatactaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatg 25481864  T
Q  128 tgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtg 227  Q
    || |||||||||||||| ||||||   ||||  |||||||||  |||||| |  |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25481863 tggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatacaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtg 25481764  T
Q  228 tgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||   | ||||||    
T  25481763 tgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagt 25481664  T
Q  328 gtcagtgcccctaaaactgaggaacact 355  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  25481663 gtcactgcccctgaaattgaggaacact 25481636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 61 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 26623164 - 26622805
Alignment:
Q  61 agtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtg 160  Q
    |||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||   |||       
T  26623164 agtaggatccacgccatagaagacgggcaaaacgagacgaccctttgttttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatat 26623065  T
Q  161 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 260  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||  |||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||   ||||    
T  26623064 gcatagttgggagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcgatagcattgtcaagtgatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcat 26622965  T
Q  261 caatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 360  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||    
T  26622964 caatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccgtaccgagtgtcactgcctctgaaacttaggaacacttggta 26622865  T
Q  361 agtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattgccataagaattga 420  Q
      |||||  | || ||| ||||||||| ||||| |||||||| || ||||| | ||||||    
T  26622864 tttgaattgataggaaattgaagaggaagaggatggtgattgcatagccatgataattga 26622805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 61 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 26729142 - 26728783
Alignment:
Q  61 agtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtg 160  Q
    |||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||   |||       
T  26729142 agtaggatccacgccatagaagacgggcaaaacgagacgaccctttgttttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatat 26729043  T
Q  161 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcat 260  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||  |||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||   ||||    
T  26729042 gcatagttgggagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcgatagcattgtcaagtgatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcat 26728943  T
Q  261 caatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggta 360  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||    
T  26728942 caatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccgtaccgagtgtcactgcctctgaaacttaggaacacttggta 26728843  T
Q  361 agtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattgccataagaattga 420  Q
      |||||  | || ||| ||||||||| ||||| |||||||| || ||||| | ||||||    
T  26728842 tttgaattgataggaaattgaagaggaagaggatggtgattgcatagccatgataattga 26728783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 64 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 26824025 - 26823631
Alignment:
Q  64 aggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggca 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  || ||||    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||   |||| ||||    
T  26824025 aggatccacaccatagaaaacaggcaaaacgaggcgccccttttccttgtagacgcgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggca 26823926  T
Q  164 tagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaa 263  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||| ||  ||||| ||| ||||||||||| |||   |||||||    
T  26823925 tagttggcagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattattgagtgattgttcgattttatcccctctttgaagttcacgatcatcaa 26823826  T
Q  264 tgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagt 363  Q
      ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||  |    
T  26823825 aaaaggtgtggattcccttgtctgtaagagccttgtagagattgccggtaaattcataccgagtgtcagcgcctctaaaactgagaaacacttggtattt 26823726  T
Q  364 gaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattgccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaa 463  Q
    |||  || |  ||| ||||      ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  26823725 gaaatcatatgaaactgaa------gaggaagttgactgcatagccatgagaattgagagaaattggacgaagaaagagtttgagaatgcagaatatgaa 26823632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 25579939 - 25579613
Alignment:
Q  29 tcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaataatgt 128  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||| |  | |||||| |||||| || ||||||| ||||| || | || ||  ||||||| |||||| ||||| ||||    
T  25579939 tcaccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatgt 25579840  T
Q  129 gaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgt 228  Q
    | |||||||||||||| ||||||   ||||  |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25579839 ggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgt 25579740  T
Q  229 gatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtg 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||   | |||||||    
T  25579739 gatttcatctcctctttgaagatcattatcatcaaagaaggtacgaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaagtgttgcgagtg 25579640  T
Q  329 tcagtgcccctaaaactgaggaacact 355  Q
    ||| |||| || |||||||||||||||    
T  25579639 tcactgcctctgaaactgaggaacact 25579613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 28234787 - 28234459
Alignment:
Q  25 tgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaata 124  Q
    ||||| ||||||||| || || ||||||||||| | || ||| |||||| || ||||||  |||||||| ||||| |  |||  |||| |||| | |||     
T  28234787 tgctttaccataactgcccttgtgatgtcgcacgtgagaaggttccacatcatagaaaattggcaaaactaggcgtctattttcctcgaagca-taaatg 28234689  T
Q  125 atgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatg 224  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||  ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28234688 atgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatg 28234589  T
Q  225 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcg 324  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||||  | ||||||||| |||||||||||| |||    
T  28234588 gtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtgacaaagagctctatagagattttcggtaaaaccatagcg 28234489  T
Q  325 agtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 354  Q
    ||||||| | || |||||||| ||||||||    
T  28234488 agtgtcactacctctaaaactaaggaacac 28234459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 104 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 26143010 - 26142759
Alignment:
Q  104 tttgtctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactctt 203  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||  |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||| ||||    
T  26143010 tttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattctt 26142911  T
Q  204 caatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagag 303  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  26142910 caatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaacaagagccttatagag 26142811  T
Q  304 atttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacact 355  Q
    ||| ||||||||    | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26142810 attaccggtaaatttgttgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 26142759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 26056146 - 26055820
Alignment:
Q  29 tcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaataatgt 128  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||| |  | |||||| |||||| || ||||||| ||||| || | || ||  ||||| | |||||| ||||| ||||    
T  26056146 tcaccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgt 26056047  T
Q  129 gaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgt 228  Q
    | |||||||||||||| ||||||   ||||  |||||||||  |||||| |  ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||| |||    
T  26056046 ggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcccagattcttcgatggccttgacaagtgatgatgt 26055947  T
Q  229 gatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtg 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||   | |||||||    
T  26055946 gatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtg 26055847  T
Q  329 tcagtgcccctaaaactgaggaacact 355  Q
    ||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  26055846 tcactgcccctgaaaatgaggaacact 26055820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 26076116 - 26075790
Alignment:
Q  29 tcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaataatgt 128  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||| |  | |||||| |||||| || ||||||| ||||| || | || ||  ||||| | |||||| ||||| ||||    
T  26076116 tcaccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgt 26076017  T
Q  129 gaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgt 228  Q
    | |||||||||||||| ||||||   ||||  |||||||||  |||||| |  ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||| |||    
T  26076016 ggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcccagattcttcgatggccttgacaagtgatgatgt 26075917  T
Q  229 gatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtg 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||   | |||||||    
T  26075916 gatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtg 26075817  T
Q  329 tcagtgcccctaaaactgaggaacact 355  Q
    ||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  26075816 tcactgcccctgaaattgaggaacact 26075790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 464
Target Start/End: Original strand, 27427551 - 27428003
Alignment:
Q  7 attttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgacctttt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  27427551 attttcatgctcagccaatgctttaccatacctacctgtatgatgtcgcacatcagtaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcaacccttg 27427650  T
Q  107 gtctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaa 206  Q
    || | |||||| ||||| ||||| ||||||  |||||| ||| ||   ||||  |||||||||  |||||| |  ||||| |||||||| || |||||||    
T  27427651 gttttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaa 27427750  T
Q  207 tggccttgagaagtga-tggtgtgatttcatctcctctttgaaga------tcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgt 299  Q
    |          | ||| |||||||| ||  |||| ||||||||||      |||| |||||||  ||||||    |||||||||||| ||||||||||      
T  27427751 t----------aatgattggtgtgactttgtctcttctttgaagatcactgtcatcgtcatcatggaaggtacgaattcccttgtcaataagagccttca 27427840  T
Q  300 agagatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtga 399  Q
    ||||||| ||||| ||||| |  |||||||| |||||| || || |||||||||| | |||| |||||||| || |||||||||||||  || ||||| |    
T  27427841 agagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacacatcgtaactgaatgcataggaaaatgaagaggaatagaaaggtaa 27427940  T
Q  400 ttgtattgccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 464  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||  ||||  | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  27427941 ttgcatggccatgagaattgagagaaataagatg--agaagagtttgagaatgcagaatatgaat 27428003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 25538760 - 25538434
Alignment:
Q  29 tcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaataatgt 128  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||| |  | |||||| |||||| || ||||||| ||||| || | || ||  ||||||| |||||| ||||| || |    
T  25538760 tcaccataactcccactctgatgtcgtaactgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatct 25538661  T
Q  129 gaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgt 228  Q
    | |||||||||||||| ||||||   ||||  |||||||||  |||||| |  ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25538660 ggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaattctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgt 25538561  T
Q  229 gatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtg 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||    | |||||||    
T  25538560 gatttcatctcctctttcaagatcattatcatctatgaaagtactaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaatttgttgcgagtg 25538461  T
Q  329 tcagtgcccctaaaactgaggaacact 355  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25538460 tcactgcccctgaaactgaggaacact 25538434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 26049065 - 26048739
Alignment:
Q  29 tcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaataatgt 128  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| |  | |||||| |||||| || | ||||| ||||| || | || ||  ||||||| |||||| ||||| ||||    
T  26049065 tcaccataacttccactatgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcataaaaaacgggcaatactaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatgt 26048966  T
Q  129 gaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgt 228  Q
    | |||||||||||||| ||||||   ||||  |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||   |||||    
T  26048965 ggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttccatggccttgacaagtttgggtgt 26048866  T
Q  229 gatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtg 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||   | |||||||    
T  26048865 gatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtg 26048766  T
Q  329 tcagtgcccctaaaactgaggaacact 355  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26048765 tcactgcccctgaaactgaggaacact 26048739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 26070234 - 26069908
Alignment:
Q  29 tcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaataatgt 128  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| |  | |||||| |||||| || | ||||| ||||| || | || ||  ||||||| |||||| ||||| ||||    
T  26070234 tcaccataacttccactatgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcataaaaaacgggcaatactaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatgt 26070135  T
Q  129 gaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgt 228  Q
    | |||||||||||||| ||||||   ||||  |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||   |||||    
T  26070134 ggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttccatggccttgacaagtttgggtgt 26070035  T
Q  229 gatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtg 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||   | |||||||    
T  26070034 gatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtg 26069935  T
Q  329 tcagtgcccctaaaactgaggaacact 355  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26069934 tcactgcccctgaaactgaggaacact 26069908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 28243040 - 28242702
Alignment:
Q  13 atgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcg 112  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||  | ||||||| ||| |||| ||| |||||| || ||||||  |||||||| ||||| || ||| ||| |    
T  28243040 atgctcagccagtgctttaccataactgccaatctgatgtctcacgttagaaggttccacatcatagaaaattggcaaaactaggcgtccatttttcttg 28242941  T
Q  113 tagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcct 212  Q
     |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||  ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28242940 cagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcct 28242841  T
Q  213 tgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggt 312  Q
    ||| |||||||||||| ||||  || |||| | |||| ||  ||||||||||||||||    |||||||| | |  |||| | |||||||||||||| ||    
T  28242840 tgaaaagtgatggtgttattttgtcacctcctggaagttctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcttacaaagatctttgtagagatttccagt 28242741  T
Q  313 aaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaa 351  Q
    ||||||||  ||||||||| | || |||||||| |||||    
T  28242740 aaaaccataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaa 28242702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 28227174 - 28226845
Alignment:
Q  25 tgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaata 124  Q
    ||||| ||||||||| || || ||||||||||||| || ||| |||||| || ||||||  |||||||| ||||| |  |||  || | ||||||||||     
T  28227174 tgctttaccataactgcccttgtgatgtcgcacatgagaaggttccacatcatagaaaattggcaaaacaaggcgccgattttccttgaagcaatgaatg 28227075  T
Q  125 atgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatg 224  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||  ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  28227074 atgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatgaccttgaaaagtgatg 28226975  T
Q  225 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcg 324  Q
     ||| |||||||| |||| |||||| ||  | ||||||| ||| || |  |||||||| | |  |||| |  ||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  28226974 atgttatttcatcacctccttgaagctctctatcatcaaagaatgtgtgaattcccttcttacaaagatcactgtagagatttccagtaaaaccataacg 28226875  T
Q  325 agtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 354  Q
    ||||||| | || |||||||| ||||||||    
T  28226874 agtgtcaatacctctaaaactaaggaacac 28226845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 28181338 - 28181032
Alignment:
Q  25 tgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaata 124  Q
    ||||| ||||||||| || || ||||||||||| | || ||| |||||| || ||||||  |||||||| || || ||  ||  || | |||| |||||     
T  28181338 tgctttaccataactgcccttgtgatgtcgcacgtgagaaggttccacatcatagaaaattggcaaaactagacgcccgctttccttgaagcagtgaatg 28181239  T
Q  125 atgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatg 224  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||  ||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28181238 atgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatg 28181139  T
Q  225 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcg 324  Q
     ||| ||||| || |||| |||||| ||  ||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||  | | ||||||||| ||||||||||  ||    
T  28181138 atgttatttcttcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctattgagatttccagtaaaaccataacg 28181039  T
Q  325 agtgtca 331  Q
    |||||||    
T  28181038 agtgtca 28181032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 28325717 - 28325343
Alignment:
Q  13 atgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcg 112  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||| || || ||||||||||| | || ||| |||||| |  ||||||| ||| |||| ||||| || |||   | |    
T  28325717 atgctcggccagtgctttaccataactgcccttgtgatgtcgcacgtgagaaggttccacatcgtagaaaactggctaaactaggcgcccattttctttg 28325618  T
Q  113 tagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcct 212  Q
     |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    ||||  ||||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28325617 aagcagtgaataatgtggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggcct 28325518  T
Q  213 tgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggt 312  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || |||||||||||||||||    |||| |||   |  |||| | |||||||||||||| ||    
T  28325517 tgaaaagtgacggtgttatttcgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaaggtacgaattctcttcctacaaagatctttgtagagatttccagt 28325418  T
Q  313 aaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagagga 387  Q
    ||||||||  ||||||||| | || |||||||| |||||||| |  || |||||| || || |||| ||||||||    
T  28325417 aaaaccataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccataggaaaaggaagagga 28325343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 125 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 28185490 - 28185222
Alignment:
Q  125 atgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatg 224  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||  ||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28185490 atgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatg 28185391  T
Q  225 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcg 324  Q
     ||| ||||| || |||| |||||| ||  ||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||  | | ||||||||| ||||||| ||  ||    
T  28185390 atgttatttcttcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctattgagatttccagtaaaacgataacg 28185291  T
Q  325 agtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgagga 393  Q
    ||||||| | || ||||| || |||||||| |  || |||||| || || | || ||||||||||||||    
T  28185290 agtgtcactacctctaaagctaaggaacacgtcataggtgaatccataggagaaggaagaggatgagga 28185222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26848899 - 26848603
Alignment:
Q  10 ttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtc 109  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||  || ||||||||||||| || ||| || |  ||| |||||||||| | ||| | || ||| |||  |    
T  26848899 ttcatgcttagcaagtgcttcaccataactactattctgatgtcgcacatgagaaggttctatgccatagaaaacaggaataaccatgctacccttttcc 26848800  T
Q  110 tcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatgg 209  Q
    | | |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    ||||||||||||||   ||| || ||| ||||  ||||||| || |||||||||     
T  26848799 ttggagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagtggcatagttctcagagaatacaagaatggaaatcctcgagtcttcaatgt 26848700  T
Q  210 ccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatt 306  Q
     |||||| || || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| || ||||||||    
T  26848699 tcttgaggagcgaaggtgtgatctcatcaccactctgaagatccttgtcatcaatgaaggttcggattccattgtcagaaagagctttatagagatt 26848603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 128 - 245
Target Start/End: Original strand, 25506975 - 25507092
Alignment:
Q  128 tgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtg 227  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||  |||  | ||||||||    
T  25506975 tgaacaagttcctccaaacaaaattttgaagaggcatagttgatagaaagaaccggaataaaaatcctagattcttcaatggcgatgacgactgatggtg 25507074  T
Q  228 tgatttcatctcctcttt 245  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25507075 tgatttcatctcctcttt 25507092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 26937320 - 26937073
Alignment:
Q  23 aatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaa 122  Q
    |||||| |||||||||| ||  | || ||||| || | || |||||||||  || |||||| ||||||||  ||  |||||||||||| | |||| | ||    
T  26937320 aatgctgcaccataactcccagtttggtgtcgaacgtgagaaggatccacttcatagaaaataggcaaaattagatgaccttttgtcttgaagcagtcaa 26937221  T
Q  123 taatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtga 222  Q
      ||||| |||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||| || ||||| ||   |||||  || |||||||| ||||||| ||||||    
T  26937220 cgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtggcatagttgatagagaatacaggtatggcaatcccggaatcttcaattgccttgacaagtga 26937121  T
Q  223 tggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 270  Q
    |||||||||||| |||||||  || || || |||||||||||||||||    
T  26937120 tggtgtgatttcttctcctccatggagctccttgtcatcaatgaaggt 26937073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 28139726 - 28139472
Alignment:
Q  64 aggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggca 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |  |  || ||||| | | |||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    |||| ||||    
T  28139726 aggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccaaacatccctttgtgttgaagcagtcaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaacgaagaagaggca 28139627  T
Q  164 tagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaa 263  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |  ||||| ||||  ||||| || |||| |||||| ||  | |||||||    
T  28139626 tagttgatggaaaacacagggatgaaaatcctagattcttcaatggcttttacgagtgacggtgatatttcgtcacctccttgaagctccctatcatcaa 28139527  T
Q  264 tgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 318  Q
    | || || | ||||||   ||||  |||||| |||||||||||||| || |||||    
T  28139526 taaaagtgtggattccacagtcacgaagagctttgtagagatttccagtgaaacc 28139472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 28150072 - 28149917
Alignment:
Q  114 agcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcctt 213  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||   ||||  | |||||||||||| || |  ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  28150072 agcagtgaataatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagtatagttgatagagaagattggaatgaaaatcctggactcttcaatggcctt 28149973  T
Q  214 gagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 270  Q
    ||| ||||||||||||||||| || |||| || ||| ||  | ||||||||||||||    
T  28149972 gag-agtgatggtgtgatttcgtcccctcgttaaagctccgtatcatcaatgaaggt 28149917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 270
Target Start/End: Original strand, 28297765 - 28297921
Alignment:
Q  114 agcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcctt 213  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||  ||||| ||| |||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||  |||    
T  28297765 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatgtgctt 28297864  T
Q  214 gagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 270  Q
    || |||||||||||| ||||| || |||| || ||| ||  ||||||||||||||||    
T  28297865 gaaaagtgatggtgttatttcgtcacctcctttaagctctctgtcatcaatgaaggt 28297921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 28514308 - 28514152
Alignment:
Q  114 agcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcctt 213  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||  ||||| ||| |||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||  |||    
T  28514308 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatgtgctt 28514209  T
Q  214 gagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 270  Q
    || |||||||||||| ||||| || |||| || ||| ||  ||||||||||||||||    
T  28514208 gaaaagtgatggtgttatttcgtcacctcctttaagctctctgtcatcaatgaaggt 28514152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 343
Target Start/End: Original strand, 28098317 - 28098650
Alignment:
Q  10 ttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtc 109  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| | || ||| |||||  || | |||| ||| ||||||| || ||| |||       
T  28098317 ttcatgcttagctaatgcttcaccataactccccgtctgatgtcgcacgtgagaaggttccacgtcacaaaaaataggaaaaacgaagcaacccttttct 28098416  T
Q  110 tcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatgg 209  Q
    ||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    ||||  ||||||||  |||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  28098417 tcgtaacggtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcatagttcttagagaagaccggaattaaaatcctggactcttcgatgg 28098516  T
Q  210 ccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttcc 309  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||  ||| |||   |||||||| || |  |||||||||||   || |||   ||||  |||||| ||||||||||||||    
T  28098517 ccttgacaagggattgtgtgattctatcaccttcatgaagatctttatggtcaatgaaggtgcggactcctccgtcacaaagagctttgtagagatttcc 28098616  T
Q  310 ggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaa 343  Q
     ||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  28098617 agtaaaaccataccgagtgtcggtgcccctaaaa 28098650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 190 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 26635749 - 26635621
Alignment:
Q  190 aatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagta 289  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||| || || |||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  26635749 aatcctcgactcttcaatgctcttgaggagcgaaggtgtgatttcatccccttttttaagctccttgtcatcaatgaaggtgttgattcctttgtcagaa 26635650  T
Q  290 agagccttgtagagatttccggtaaaacc 318  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||    
T  26635649 agagctttatagaggttaccggtgaaacc 26635621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 190 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 26741715 - 26741587
Alignment:
Q  190 aatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagta 289  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||| || || |||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  26741715 aatcctcgactcttcaatgctcttgaggagcgaaggtgtgatttcatccccttttttaagctccttgtcatcaatgaaggtgttgattcctttgtcagaa 26741616  T
Q  290 agagccttgtagagatttccggtaaaacc 318  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||    
T  26741615 agagctttatagaggttaccggtgaaacc 26741587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 27214588 - 27214312
Alignment:
Q  78 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaa 177  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||  || | |||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||    || ||    
T  27214588 agaaaacaggtagaacaaggcgacctttttccttggagcaatgagtgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtagcatagttctctgagaa 27214489  T
Q  178 cacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgatt 277  Q
     |||  || | ||||||| || ||||||||   |||| | || || | ||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||  ||||    
T  27214488 tacaataacagaaatcctcgagtcttcaattttcttgtggagcgaagatgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggatt 27214389  T
Q  278 cccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 354  Q
    || ||||||  |||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||| | ||||||    
T  27214388 cctttgtcacaaagagctttatagagattaccggtgaaaccgtgtcgagtgtcggtacccctgaaactaatgaacac 27214312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 354
Target Start/End: Original strand, 27234640 - 27234916
Alignment:
Q  78 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaa 177  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||  || | |||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||    || ||    
T  27234640 agaaaacaggtagaacaaggcgacctttttccttggagcaatgagtgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtagcatagttctctgagaa 27234739  T
Q  178 cacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgatt 277  Q
     |||  || | ||||||| || ||||||||   |||| | || || | ||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||  ||||    
T  27234740 tacaataacagaaatcctcgagtcttcaattttcttgtggagcgaagatgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggatt 27234839  T
Q  278 cccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 354  Q
    || ||||||  |||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||| | ||||||    
T  27234840 cctttgtcacaaagagctttatagagattaccggtgaaaccgtgtcgagtgtcggtacccctgaaactaatgaacac 27234916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 29826229 - 29825957
Alignment:
Q  47 tgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagc 146  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||| ||  ||| |   || | ||  || || |||||||| || ||||    
T  29826229 tgatgtcgcacatgagaaggatccacatcatagaaaataggcaaaacgagacgacccttcctcttgacacactcaactatatgcacaagttcatctaagc 29826130  T
Q  147 aaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttg 246  Q
    ||||    ||||  ||||| ||| |||| || | ||||||    |||||||| |||| ||| ||||| | |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  29826129 aaaacgaagaagaagcataattggtagagaaaataggaatggctatcctagattcttgaattgccttcacaagtgagggtgtgatttcgtcccctctttg 29826030  T
Q  247 aagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacca 319  Q
    ||| || |||||||||||||||||    |||  ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  29826029 aagctctttgtcatcaatgaaggtgcgaattttcttgtcagttagagctttgtagagattgccggtaaaacca 29825957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 354
Target Start/End: Original strand, 26341986 - 26342226
Alignment:
Q  114 agcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcctt 213  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    ||||  ||||||||||| || || |  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  26341986 agcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaagcatagttgattgagaaaattggaatgaaaatcctggactcttcaatggcttt 26342085  T
Q  214 gagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggta 313  Q
    || ||||||| |||||||||  || ||||  ||||| ||  | ||||||||||||||   || |||   ||||   |||||  | |||| ||| || |||    
T  26342086 gacaagtgattgtgtgattttgtcacctccatgaagctccctatcatcaatgaaggtgcggactccaccgtcacatagagctctatagatattgccagta 26342185  T
Q  314 aaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 354  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  26342186 aaaccatagcgagtgccaatgcccctaaaattgaggaacac 26342226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 351
Target Start/End: Original strand, 26893543 - 26893760
Alignment:
Q  134 agttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgattt 233  Q
    ||||| ||||| |||||| | ||||  |||||||||||||| |  || |||||  | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  26893543 agttcttccaaacaaaatatagaagaagcatagttgatagagaggactggaatgtatatcatagactcttcaattgccttgataagtgatggtgagattt 26893642  T
Q  234 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagt 333  Q
    | || ||||| ||||| ||  | |||||||||||||| |  |||||  | |||  |||||| || || ||||  || |||||||||   ||||||||||     
T  26893643 cgtcacctctatgaagctctgtatcatcaatgaaggtgtgaattccactatcacaaagagctttataaagatgacccgtaaaaccaaaacgagtgtcaga 26893742  T
Q  334 gcccctaaaactgaggaa 351  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  26893743 gcctctaaaattgaggaa 26893760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 26959202 - 26959097
Alignment:
Q  212 ttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccgg 311  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| || ||||| || ||||    
T  26959202 ttgagaagcgaaggtgtgatttcatccccttttttaagctctttgtcatcaatgaaggtgtcgattcctttgtcagaaagagctttatagaggttaccgg 26959103  T
Q  312 taaaac 317  Q
    | ||||    
T  26959102 tgaaac 26959097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 26949900 - 26949592
Alignment:
Q  10 ttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtc 109  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||   || ||||||||||| | || ||| || ||| || ||||||| |||| ||| ||||||||||||  |    
T  26949900 ttcatgcttagcaagtgcttcaccataactataattctgatgtcgcacgtgagaaggttctacatcatagaaaactggcagaacaaggcgacctttttcc 26949801  T
Q  110 tcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatgg 209  Q
    | | || | ||||| || || ||||||||||| || ||||||   ||||  ||||| |   ||||||| ||   |||   ||| || || ||||||||      
T  26949800 ttgaagtagtgaatgatatggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcatattccttagaaaagacgataatggcaattctcgattcttcaattc 26949701  T
Q  210 ccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttcc 309  Q
     |||||| ||||| ||||||||||| || ||| | ||||| || || |||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| || |||||||| ||    
T  26949700 tcttgaggagtgaaggtgtgatttcgtcacctttctgaagctccttatcatcaatgaaggttcggattcccttgtcagagagagctttatagagattacc 26949601  T
Q  310 ggtaaaacc 318  Q
    ||| |||||    
T  26949600 ggtgaaacc 26949592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 26975111 - 26974983
Alignment:
Q  190 aatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagta 289  Q
    |||||| || |||||||||  |||||| || || ||||||||||| || ||| ||| ||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |    
T  26975111 aatcctcgagtcttcaatgctcttgaggagcgaaggtgtgatttcgtccccttttttaagctccttgtcatcaatgaagatgttgattcctttgtcagaa 26975012  T
Q  290 agagccttgtagagatttccggtaaaacc 318  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||    
T  26975011 agagctttatagaggttaccggtgaaacc 26974983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 354
Target Start/End: Original strand, 27665273 - 27665409
Alignment:
Q  218 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaac 317  Q
    ||||| ||||||||||| || ||  || |||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  27665273 agtgaaggtgtgatttcgtcaccagttggaagctccttgtcatcaatgaaggtgtggattcctttgtcagaaagagccttatagaggttaccggtgaaac 27665372  T
Q  318 catggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 354  Q
    ||   |||||||| || ||||| ||||| | ||||||    
T  27665373 caaatcgagtgtcggtacccctgaaactaatgaacac 27665409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26811568 - 26811453
Alignment:
Q  190 aatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagta 289  Q
    ||||||||| | |||||||  |||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||  |||||| ||||||  |    
T  26811568 aatcctagagtgttcaatgctcttgaggagcgaaggtgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaa 26811469  T
Q  290 agagccttgtagagat 305  Q
    ||||| || |||||||    
T  26811468 agagctttatagagat 26811453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 391 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 25538431 - 25538358
Alignment:
Q  391 ggaaggtgattgtattgccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 464  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||    
T  25538431 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaat 25538358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26617351 - 26617263
Alignment:
Q  224 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggt 312  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||  || ||| ||||||  |||||| || |||||||| |||||    
T  26617351 ggtgtgatttcatcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggactcctttgtcacaaagagctttatagagattgccggt 26617263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26723279 - 26723191
Alignment:
Q  224 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggt 312  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||  || ||| ||||||  |||||| || |||||||| |||||    
T  26723279 ggtgtgatttcatcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggactcctttgtcacaaagagctttatagagattgccggt 26723191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 2184417 - 2184183
Alignment:
Q  120 gaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaag 219  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||  ||||||||  | || || ||||| || ||||| || |||||||||||||| || | |||    
T  2184417 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagttctttgagaaaacagggatgaaaattctggactcttcaatggctttcataag 2184318  T
Q  220 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacca 319  Q
    ||||| ||| |||||| | |||| |||||| || | ||||||  |||| || | || |||  | | |   ||||| | ||| ||||| ||||||||||||    
T  2184317 tgatgctgttatttcaccccctcgttgaagctcctcgtcatccttgaaagtgtggactccacttttacatagagcatcgtaaagattgccggtaaaacca 2184218  T
Q  320 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 354  Q
    |||||||||||||  || || ||||| ||||||||    
T  2184217 tggcgagtgtcagctcctctgaaacttaggaacac 2184183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 25071684 - 25071590
Alignment:
Q  224 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaacc 318  Q
    ||||||||||| || ||||| | ||| || ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||| || || ||||| |||||||||||    
T  25071684 ggtgtgatttcgtcacctctcttaagctctttgtcatcaataaaggtgtggattcctttgtcagaaagagctttataaagattaccggtaaaacc 25071590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 26055818 - 26055744
Alignment:
Q  390 aggaaggtgattgtattgccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 464  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||    
T  26055818 aggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaat 26055744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 391 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 25481633 - 25481560
Alignment:
Q  391 ggaaggtgattgtattgccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 464  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||||||||||||| | ||||| |||  |||||||||||    
T  25481633 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaaaactttgaaaatggagaatatgaat 25481560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 391 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 26048736 - 26048663
Alignment:
Q  391 ggaaggtgattgtattgccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 464  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||    
T  26048736 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaat 26048663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 391 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 26069905 - 26069832
Alignment:
Q  391 ggaaggtgattgtattgccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 464  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||    
T  26069905 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaat 26069832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 391 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 26075787 - 26075714
Alignment:
Q  391 ggaaggtgattgtattgccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 464  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||    
T  26075787 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaat 26075714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 391 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 26142756 - 26142683
Alignment:
Q  391 ggaaggtgattgtattgccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 464  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||    
T  26142756 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaat 26142683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 241
Target Start/End: Original strand, 28481232 - 28481273
Alignment:
Q  200 tcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcct 241  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28481232 tcttcaattgctttgagaagtgatggtgtgatttcatctcct 28481273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 241
Target Start/End: Original strand, 29793656 - 29793697
Alignment:
Q  200 tcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcct 241  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29793656 tcttcaattgctttgagaagtgatggtgtgatttcatctcct 29793697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 249
Target Start/End: Original strand, 29733186 - 29733235
Alignment:
Q  200 tcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaag 249  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  29733186 tcttcaattgctttgagaagtgatggtgtgatttcttcgcctttttgaag 29733235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 348
Target Start/End: Original strand, 29697465 - 29697613
Alignment:
Q  200 tcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgt 299  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||| || ||| |||| ||||| |||   | ||| ||||||  |||||| || |    
T  29697465 tcttcaattgctttgagaagtgatggtgtgatttcttcgccttttttaagctccttggcatccatgaaagttcgaactcctttgtcatcaagagctttct 29697564  T
Q  300 agagatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgag 348  Q
     |||||  ||||| |||||||| ||||| ||   ||| |||||||||||    
T  29697565 tgagataaccggtgaaaccatgacgagtatcctcgcctctaaaactgag 29697613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 464
Target Start/End: Original strand, 13578 - 14034
Alignment:
Q  8 ttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttg 107  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13578 ttttcatgtccagccaatgcttcaccataacgacctgtatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttg 13677  T
Q  108 tctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaat 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  13678 tcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgat 13777  T
Q  208 ggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattt 307  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13778 ggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattg 13877  T
Q  308 ccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattg 407  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| || |    
T  13878 ccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagaggaaaatgaagaggaagaggaaggtaattgcatag 13977  T
Q  408 ccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 464  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13978 ccatgataattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 14034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 485
Target Start/End: Original strand, 4617 - 5094
Alignment:
Q  8 ttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4617 ttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttcagatgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttg 4716  T
Q  108 tctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaat 207  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    |||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  4717 tcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaaaaggcatagaagatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaat 4816  T
Q  208 ggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattt 307  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4817 ggccttgcggagggatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattt 4916  T
Q  308 ccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattg 407  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4917 ccggtaaaaccgtggcgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatag 5016  T
Q  408 ccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaatttaatgaataagtttttgtgg 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5017 ccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaatttaatgaataagtttttgtgg 5094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 7766 - 7323
Alignment:
Q  8 ttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttg 107  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7766 ttttcatgtccagccaatgcttcaccataacgacctgtatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttctg 7667  T
Q  108 tctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaat 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  7666 tcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgat 7567  T
Q  208 ggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattt 307  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7566 ggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattg 7467  T
Q  308 ccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattg 407  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||| ||||||||| || |    
T  7466 ccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcatatgaaaatgaagaggaagagggaggtgattgcatag 7367  T
Q  408 ccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaat 451  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7366 ccatgagaattgagagaaattagatgaaaaaagagtttgagaat 7323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 464
Target Start/End: Original strand, 3367 - 3824
Alignment:
Q  8 ttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  3367 ttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttacgatgtcgcacaatagtaggttccacaccaaataaaacaggcagaacgaggcgaccctttg 3466  T
Q  108 tctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatag-ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaa 206  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  3467 tcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcataggttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaa 3566  T
Q  207 tggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatt 306  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3567 tggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatt 3666  T
Q  307 tccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatt 406  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3667 tccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtata 3766  T
Q  407 gccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 464  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3767 gccatgacaattgagagaaataggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaat 3824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 8 - 464
Target Start/End: Original strand, 14302 - 14756
Alignment:
Q  8 ttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14302 ttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttg 14401  T
Q  108 tctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaat 207  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14402 tcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaaa-ggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaat 14500  T
Q  208 ggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattt 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14501 ggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattt 14600  T
Q  308 ccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattg 407  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  14601 ccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactgatgaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatag 14700  T
Q  408 ccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 464  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14701 ccatgagaattgagagaaataggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaat 14756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 323 - 464
Target Start/End: Original strand, 8062 - 8203
Alignment:
Q  323 cgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattgccataagaattgaga 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8062 cgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatgggagaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgaga 8161  T
Q  423 gaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 464  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8162 gaaataggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaat 8203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold1254
Description:

Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 146 - 451
Target Start/End: Original strand, 1 - 306
Alignment:
Q  146 caaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctcttt 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 caaaattttgaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctcttt 100  T
Q  246 gaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaact 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  101 gaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaact 200  T
Q  346 gaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattgccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagttt 445  Q
     |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  201 aaggaacacttggtaagtgaatgcatatgaaaatgaagaggaagagggaggtgattgcatagccatgagaattgagagaaattagatgaaaaaagagttt 300  T
Q  446 gagaat 451  Q
    ||||||    
T  301 gagaat 306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 28 - 462
Target Start/End: Original strand, 18699353 - 18699787
Alignment:
Q  28 ttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaataatg 127  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||| |  | ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  18699353 ttcaccataactcccactttgatgtcgtatgtgagtaggatctacgccatagaaaacaggcaaaacgagacgaccttttgtcttgtagcagtgaatgatg 18699452  T
Q  128 tgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtg 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||   |||||||||     
T  18699453 tgaacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtt 18699552  T
Q  228 tgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagt 327  Q
    |||||||||| || ||||| || |||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||| |  |||||    
T  18699553 tgatttcatccccactttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagctttgtagagatggccagtaaaaccgtcacgagt 18699652  T
Q  328 gtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattgccataagaattgagagaaat 427  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||     
T  18699653 gtcagtgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgcatagccatgagaattgagagaaac 18699752  T
Q  428 tggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatga 462  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18699753 tagatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga 18699787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 28 - 468
Target Start/End: Original strand, 18655430 - 18655870
Alignment:
Q  28 ttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaataatg 127  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||| |  | |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| |||    
T  18655430 ttcaccataacttccagtttgatgtcgtatgtgagtaggatccacgccatagaaaacaggaaaaacgagacgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatg 18655529  T
Q  128 tgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtg 227  Q
     | |||||||||||||| ||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||   |||||||||     
T  18655530 cggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaagatcctagactcttgaatggcattgtcgagtgatggtt 18655629  T
Q  228 tgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagt 327  Q
    |||||||||| || ||||| || |||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||| |  |||||    
T  18655630 tgatttcatccccactttgcagctcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagctttgtagagatgcccagtaaaaccgttacgagt 18655729  T
Q  328 gtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattgccataagaattgagagaaat 427  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| | ||||||||||||     
T  18655730 gtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgcctagccatgaaaattgagagaaac 18655829  T
Q  428 tggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaatttaa 468  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  18655830 tggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgagtttaa 18655870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 28 - 468
Target Start/End: Original strand, 18679520 - 18679960
Alignment:
Q  28 ttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaataatg 127  Q
    |||||||||||||||  | |||||||  |  | ||||||||||||  || |||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||| ||||| |||    
T  18679520 ttcaccataactaccactttgatgtcatatgtgagtaggatccacgacatagaaaacaggcaaaacaagacgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatg 18679619  T
Q  128 tgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtg 227  Q
    || |||||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||   |||||||||     
T  18679620 tggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtt 18679719  T
Q  228 tgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagt 327  Q
    |||||||||| |||||||| || |||  ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |  |||||    
T  18679720 tgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcctttgtcagtaagagccttgtagagatgaccagtaaaaccgttacgagt 18679819  T
Q  328 gtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattgccataagaattgagagaaat 427  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||     
T  18679820 gtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagagaatgaggaaggtgattgcatagccatgaaaatagagagaaac 18679919  T
Q  428 tggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaatttaa 468  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  18679920 tggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgagtttaa 18679960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 63 - 468
Target Start/End: Original strand, 18731492 - 18731897
Alignment:
Q  63 taggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggc 162  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||   |||| |||    
T  18731492 taggatccacgccatagaaaacaggcaaaacaagacgaccctttgtcttgtagcagtgcatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggc 18731591  T
Q  163 atagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||   ||||||||| |||||||||| |||||||| || |||  |||||||    
T  18731592 atagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatca 18731691  T
Q  263 atgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaag 362  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||  || |||||||| |  ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18731692 atgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagctctgtagagatggccagtaaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaag 18731791  T
Q  363 tgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattgccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatga 462  Q
    |||||  | || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18731792 tgaatcgataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgcatagccatgaaaatcgagagaaactggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga 18731891  T
Q  463 atttaa 468  Q
     |||||    
T  18731892 gtttaa 18731897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 63 - 422
Target Start/End: Original strand, 18724073 - 18724432
Alignment:
Q  63 taggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggc 162  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||| || || ||||| |||||||||| ||| ||||||   |||| |||    
T  18724073 taggatccacgccatagaaaacaggcaaaacaagacgaccctttgtcttgtagcagtgcatgatgtggacaagttcgttcaaacaaaatgaagaagaggc 18724172  T
Q  163 atagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||   ||||||||| |||||||||| |||||||| || |||  |||||||    
T  18724173 atagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatca 18724272  T
Q  263 atgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaag 362  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |  ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18724273 atgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatgaccagtaaaaccgttacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaag 18724372  T
Q  363 tgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattgccataagaattgaga 422  Q
    |||||  | || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  18724373 tgaatcgataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaga 18724432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 18074004 - 18073552
Alignment:
Q  7 attttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgacctttt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  18074004 attttcatgctcagccaatgctttaccatacctacctgtatgatgtcgcacatcagtaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcaacccttg 18073905  T
Q  107 gtctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaa 206  Q
    || | |||||| ||||| ||||| ||||||  |||||| ||| ||   ||||  |||||||||  |||||| |  ||||| |||||||| || |||||||    
T  18073904 gttttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaa 18073805  T
Q  207 tggccttgagaagtga-tggtgtgatttcatctcctctttgaaga------tcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgt 299  Q
    |          | ||| |||||||| ||  |||| ||||||||||      |||| |||||||  ||||||    |||||||||||| ||||||||||      
T  18073804 t----------aatgattggtgtgactttgtctcttctttgaagatcactgtcatcgtcatcatggaaggtacgaattcccttgtcaataagagccttca 18073715  T
Q  300 agagatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtga 399  Q
    ||||||| ||||| ||||| |  |||||||| |||||| || || |||||||||| | |||| |||||||| || |||||||||||||  || ||||| |    
T  18073714 agagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacacatcgtaactgaatgcataggaaaatgaagaggaatagaaaggtaa 18073615  T
Q  400 ttgtattgccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 464  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||  ||||  | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18073614 ttgcatggccatgagaattgagagaaataagatg--agaagagtttgagaatgcagaatatgaat 18073552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 275 - 464
Target Start/End: Original strand, 17989250 - 17989437
Alignment:
Q  275 attcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagc 374  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |  |||||||| |||||| || || |||||||||| | |||| |||||||| ||     
T  17989250 attcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacacatcgtaactgaatgcatagg 17989349  T
Q  375 aaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattgccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 464  Q
    |||||||||||||  || ||||| |||| || ||||| |||||||||||||||  ||||  | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  17989350 aaaatgaagaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaattgagagaaataagatg--agaagagtttgagaatgcagaatatgaat 17989437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 345
Target Start/End: Original strand, 5090902 - 5091237
Alignment:
Q  10 ttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtc 109  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||  | |||| |||||||| || ||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||| |||  |    
T  5090902 ttcatgctcagcaagtgcttcaccataacttccagtctgatatcgcacatgagaaggttccacaccatagaaaataggcaaaaccaggcaaccattttcc 5091001  T
Q  110 tcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatgg 209  Q
    | | |||| |||||||| || |||||||| || || |||||    ||||  ||||||| | |||| || ||   ||| | |||| |||| |||| |||||    
T  5091002 ttggagcagtgaataatatggacaagttcatctaaacaaaacgaagaagaagcatagtggttagagaaaacgataatgacaatcttagattcttgaatgg 5091101  T
Q  210 ccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttcc 309  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||  |||||||  ||||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||| ||   ||||| |  |||||||||||    
T  5091102 ccttgagaagtgacggtgttatttggtctcctcgctgaagctctctgtcatcaatgaaggtgtgaattcccttgacacgtagagcttcatagagatttcc 5091201  T
Q  310 ggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaact 345  Q
     |||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||    
T  5091202 agtaaaaccgtaacgagtgtcggtgcctctaaaact 5091237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 97
Target Start/End: Original strand, 17989013 - 17989078
Alignment:
Q  32 ccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaac-aggcaaaacgagg 97  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17989013 ccatacctacctgtatgatgtcgcacatcag-aggttccacaccaaagaaaacaaggcaaaacgagg 17989078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 32 - 446
Target Start/End: Original strand, 28164320 - 28164733
Alignment:
Q  32 ccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaataatgtgaa 131  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |    
T  28164320 ccataactccctgtatgatgtcgcacatcagtaggatccacgccaa-gaaaacaggcaaaactaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtgga 28164418  T
Q  132 caagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgat 231  Q
    ||||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||  | ||| ||||||||    
T  28164419 caagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagataacacaggaataaaaattcaagatttttcaatggccttgatgaatgacggtgtgat 28164518  T
Q  232 ttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtgtca 331  Q
    ||| |||||||| | |||||||   ||||||||||| || |  |||||||||||   ||| ||||| |||||||  || || ||||| |  |||||||||    
T  28164519 ttcttctcctctctcaagatcacaatcatcaatgaatgtgtgaattcccttgtcgtcaagggccttatagagatggccagtgaaaccgtcacgagtgtca 28164618  T
Q  332 gtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattgccataagaattgagagaaattgga 431  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||| ||||||||| |||||| | ||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  28164619 ctgcccctaaaactgaggaacacttggtatgtgaatccataggaaattgaagaggaagaggaatgcgatcgtatagccatgagaattgacagaaattgga 28164718  T
Q  432 tgaaaaaagagtttg 446  Q
    ||| |||||||||||    
T  28164719 tgagaaaagagtttg 28164733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 443
Target Start/End: Original strand, 28127631 - 28128042
Alignment:
Q  27 cttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaataat 126  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||    
T  28127631 cttcaccataactccctgtatgatatcgcacatcagtaggatccacgccaaagaaaacaggcaaaactaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgat 28127730  T
Q  127 gtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggt 226  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||   |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||| |||    
T  28127731 gtgcacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttggtagaaaatacaggaataaaaattctagattcttcaatggcctttaaaagtgacggt 28127830  T
Q  227 gtgatttcat-ctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcga 325  Q
    |||||||  | ||||||| | ||||| |   ||||||||||| || | |||||||||||||  ||| |||||||||||||  || || ||||| |  |||    
T  28127831 gtgatttttttctcctctctcaagattacaatcatcaatgaatgtgtggattcccttgtcataaagggccttgtagagatggccagtgaaaccgtcacga 28127930  T
Q  326 gtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattgccataagaattgagagaa 425  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| || || ||| ||||      |||||| ||||||| || ||||| |||||||| | ||    
T  28127931 gtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtatgtgaatccataggaaattgaa------gaggaatgtgattgcatagccatgagaattgacaaaa 28128024  T
Q  426 attggatgaaaaaagagt 443  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  28128025 attggatgagaaaagagt 28128042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 422
Target Start/End: Original strand, 268310 - 268704
Alignment:
Q  28 ttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaataatg 127  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||| |  | |||||||||||| ||| |||| || ||||||| ||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| |||    
T  268310 ttcaccataactcccactttgatgtcgtatgtgagtaggatccacgccatagaagacgggcaaaatgagacgaccctttttcttgtagcagtgaatgatg 268409  T
Q  128 tgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtg 227  Q
    || |||||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||     
T  268410 tggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtt 268509  T
Q  228 tgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagt 327  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||| |  |||||    
T  268510 tgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccctcacgagt 268609  T
Q  328 gtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattgccataagaattgaga 422  Q
    ||||  ||| || ||  ||||||| || ||||| |  ||| || |  | | ||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||| |||||    
T  268610 gtcaccgcctctgaagttgaggaagacctggtaggcaaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaactgaga 268704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 136; Significance: 9e-71; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 411
Target Start/End: Original strand, 29273736 - 29274119
Alignment:
Q  28 ttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaataatg 127  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||| |  | |||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||| ||||| |||    
T  29273736 ttcaccataactcccactttgatgtcgtatgtgagtaggatccacgccatagaagacaggcaaaatgagacgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatg 29273835  T
Q  128 tgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtg 227  Q
    || |||||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||   ||||||| |     
T  29273836 tggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagactcttcaatgacattgtcgagtgatgatt 29273935  T
Q  228 tgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagt 327  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||  ||||||| |  |||||    
T  29273936 tgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagtcttgtagagatggccaataaaaccgtcacgagt 29274035  T
Q  328 gtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtattgccat 411  Q
    ||||  ||| |||||  ||||||| || |||||||||||| || |  | | ||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  29274036 gtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 29274119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 190 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 31903910 - 31903733
Alignment:
Q  190 aatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagta 289  Q
    |||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| ||||| | ||||||||| |||  |    
T  31903910 aatcctagactcttcaattgcctctaaaagtgatggtgtgatttcatgtcctctttgaagttcttcatcgtcaataaaggtgtggattcccttatcataa 31903811  T
Q  290 agagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaat 367  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||   ||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||    
T  31903810 agagctttgtagagatttccagtaaaaccatagcgagtgtctaagcctctaaagctgaggaacacatcgtaggtgaat 31903733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 249
Target Start/End: Original strand, 16373134 - 16373249
Alignment:
Q  134 agttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgattt 233  Q
    ||||| |||||||||||  | |||| |||||||||  ||||||| | |   ||| |||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||| ||||| |    
T  16373134 agttcatccaagcaaaagctagaagaggcatagttcgtagaaaatataattatacaaatcctagactcttcgattgccttaaaaagcgatggagtgatct 16373233  T
Q  234 catctcctctttgaag 249  Q
    |||||||| |||||||    
T  16373234 catctcctatttgaag 16373249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 34949 - 34620
Alignment:
Q  25 tgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaata 124  Q
    ||||| ||||||||| || || ||||||||||| | || ||| |||||| || ||||||  |||||||| || || ||  ||  || | |||| |||||     
T  34949 tgctttaccataactgcccttgtgatgtcgcacgtgagaaggttccacatcatagaaaattggcaaaactagacgcccgctttccttgaagcagtgaatg 34850  T
Q  125 atgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatg 224  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||  ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34849 atgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatg 34750  T
Q  225 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcg 324  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||||  | ||||||||| |||||||||||| |||    
T  34749 gtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtgacaaagagctctatagagattttcggtaaaaccatagcg 34650  T
Q  325 agtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 354  Q
    ||||||| | || |||||||| ||||||||    
T  34649 agtgtcactacctctaaaactaaggaacac 34620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 43202 - 42864
Alignment:
Q  13 atgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcg 112  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||  | ||||||| ||| |||| ||| |||||| || ||||||  |||||||| ||||| || ||| ||| |    
T  43202 atgctcagccagtgctttaccataactgccaatctgatgtctcacgttagaaggttccacatcatagaaaattggcaaaactaggcgtccatttttcttg 43103  T
Q  113 tagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcct 212  Q
     |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||  ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43102 cagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcct 43003  T
Q  213 tgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggt 312  Q
    ||| |||||||||||| ||||  || |||| | |||| ||  ||||||||||||||||    |||||||| | |  |||| | |||||||||||||| ||    
T  43002 tgaaaagtgatggtgttattttgtcacctcctggaagttctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcttacaaagatctttgtagagatttccagt 42903  T
Q  313 aaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaa 351  Q
    ||||||||  ||||||||| | || |||||||| |||||    
T  42902 aaaaccataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaa 42864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 27672 - 27343
Alignment:
Q  25 tgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaata 124  Q
    ||||| ||||||||| || || ||||||||||||| || ||| |||||| || ||||||  |||||||| ||||| |  |||  || | ||||||||||     
T  27672 tgctttaccataactgcccttgtgatgtcgcacatgagaaggttccacatcatagaaaattggcaaaacaaggcgccgattttccttgaagcaatgaatg 27573  T
Q  125 atgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatg 224  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   ||||  ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  27572 atgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatgaccttgaaaagtgatg 27473  T
Q  225 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcg 324  Q
     ||| |||||||| |||| |||||| ||  | ||||||| ||| || |  |||||||| | |  |||| |  ||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  27472 atgttatttcatcacctccttgaagctctctatcatcaaagaatgtgtgaattcccttcttacaaagatcactgtagagatttccagtaaaaccataacg 27373  T
Q  325 agtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 354  Q
    ||||||| | || |||||||| ||||||||    
T  27372 agtgtcaatacctctaaaactaaggaacac 27343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 117032 - 116658
Alignment:
Q  13 atgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcg 112  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||| || || ||||||||||| | || ||| |||||| |  ||||||| ||| |||| ||||| || |||   | |    
T  117032 atgctcggccagtgctttaccataactgcccttgtgatgtcgcacgtgagaaggttccacatcgtagaaaactggctaaactaggcgcccattttctttg 116933  T
Q  113 tagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcct 212  Q
     |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    ||||  ||||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  116932 aagcagtgaataatgtggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggcct 116833  T
Q  213 tgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggt 312  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || |||||||||||||||||    |||| |||   |  |||| | |||||||||||||| ||    
T  116832 tgaaaagtgacggtgttatttcgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaaggtacgaattctcttcctacaaagatctttgtagagatttccagt 116733  T
Q  313 aaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagagga 387  Q
    ||||||||  ||||||||| | || |||||||| |||||||| |  || |||||| || || |||| ||||||||    
T  116732 aaaaccataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccataggaaaaggaagagga 116658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 59812 - 59360
Alignment:
Q  7 attttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgacctttt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  59812 attttcatgctcagccaatgctttaccatacctacctgtatgatgtcgcacatcagtaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcaacccttg 59713  T
Q  107 gtctcgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaa 206  Q
    || | |||||| ||||| ||||| ||||||  |||||| ||| ||   ||||  |||||||||  |||||| |  ||||| |||||||| || |||||||    
T  59712 gttttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaa 59613  T
Q  207 tggccttgagaagtga-tggtgtgatttcatctcctctttgaaga------tcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgt 299  Q
    |          | ||| |||||||| ||  |||| ||||||||||      |||| |||||||  ||||||    |||||||||||| ||||||||||      
T  59612 t----------aatgattggtgtgactttgtctcttctttgaagatcactgtcatcgtcatcatggaaggtacgaattcccttgtcaataagagccttca 59523  T
Q  300 agagatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagagcaaaatgaagaggatgaggaaggtga 399  Q
    ||||||| ||||| ||||| |  |||||||| |||||| || || |||||||||| | |||| |||||||| || |||||||||||||  || ||||| |    
T  59522 agagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacacatcgtaactgaatgcataggaaaatgaagaggaatagaaaggtaa 59423  T
Q  400 ttgtattgccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 464  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||  ||||  | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  59422 ttgcatggccatgagaattgagagaaataagatg--agaagagtttgagaatgcagaatatgaat 59360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 331
Target Start/End: Original strand, 58245 - 58551
Alignment:
Q  25 tgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaata 124  Q
    ||||| ||||||||| || |  ||||||||||| | || ||| |||||  || ||||||  |||||||| ||||| || | |  |||| |||| |||||     
T  58245 tgctttaccataacttccatcttgatgtcgcacgtgagaaggttccacgtcatagaaaattggcaaaactaggcgcccatattcctcgaagcagtgaatg 58344  T
Q  125 atgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatg 224  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||   ||||  |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  58345 atgtggacaagttcgttcaagcaaaatgaagaagaagcatagttgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactctttaatggccttgaaaagtgatg 58444  T
Q  225 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccatggcg 324  Q
    |||| ||||| || |||| |||||| ||  ||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  58445 gtgttatttcgtcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctgtagagatttccagtaaaaccatagcg 58544  T
Q  325 agtgtca 331  Q
    |||||||    
T  58545 agtgtca 58551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 114 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3279823 - 3279592
Alignment:
Q  114 agcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcctt 213  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||  |||||||||||||| || || |||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  3279823 agcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatatagaagaagcatagttgatagagaagaccggaataaaaatcatggactcttcgatggcctt 3279724  T
Q  214 gagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggta 313  Q
    || ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||  | ||||||||||||||   || |||   |||| | | |||  | ||||||||||| |||    
T  3279723 gacaagtgattgtgtgatttcatcacctccatgaagctccctatcatcaatgaaggtgcagaatccaccgtcacttaaagctctatagagatttccagta 3279624  T
Q  314 aaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaact 345  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3279623 aaaccatagcgagtgtcagtgcccctaaaact 3279592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 354
Target Start/End: Original strand, 17993822 - 17993976
Alignment:
Q  200 tcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgt 299  Q
    |||||||||  |||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||   ||||||||||||| |||||| || |    
T  17993822 tcttcaatgctcttgaggagcgacggtgtgatttcatcacctctctgaagctctttgtcatcgatgaaggttcgaattcccttgtcagaaagagctttat 17993921  T
Q  300 agagatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 354  Q
    ||||||| ||||| |||||||  ||||| || || ||||| ||||| | ||||||    
T  17993922 agagattaccggtgaaaccatatcgagtatcggtacccctgaaactaatgaacac 17993976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16689234 - 16688992
Alignment:
Q  26 gcttcaccataactacctttatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtctcgtagcaatgaataa 125  Q
    |||||||||||||| ||  | ||||||| |||||  | |||||||||  || |||||||||||||||| || ||||||||||    | ||| || ||| |    
T  16689234 gcttcaccataacttccaatctgatgtctcacatgcgaaggatccacgtcatagaaaacaggcaaaactagccgaccttttgcactgaagccatcaatga 16689135  T
Q  126 tgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatgg 225  Q
    |||  |||||||| ||||| |||||    |||   ||||||||  |||||||||| || ||   |||||| || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  16689134 tgttgacaagttcatccaaacaaaacgaggaaaatgcatagttcttagaaaacacggggattgcaatccttgagtcttcaattgccttgataagtgatgg 16689035  T
Q  226 tgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaag 268  Q
    ||||||||  || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  16689034 tgtgattttgtcacctctctgaagttccttgtcatcaatgaag 16688992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0781 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0781
Description:

Target: scaffold0781; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 302 - 354
Target Start/End: Original strand, 91 - 143
Alignment:
Q  302 agatttccggtaaaaccatggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 354  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  || || ||||| ||||||||    
T  91 agattgccggtaaaaccatggcgagtgtcagctcctctgaaacttaggaacac 143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University