View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5489_low_13 (Length: 453)

Name: NF5489_low_13
Description: NF5489
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5489_low_13
NF5489_low_13
[»] chr7 (17 HSPs)
chr7 (1-428)||(36222212-36222644)
chr7 (98-438)||(11279391-11279736)
chr7 (106-438)||(46846320-46846658)
chr7 (97-438)||(23759608-23759955)
chr7 (98-438)||(33312894-33313239)
chr7 (98-430)||(294772-295106)
chr7 (225-438)||(23107887-23108106)
chr7 (98-438)||(6967047-6967393)
chr7 (98-438)||(17866353-17866699)
chr7 (98-438)||(3861907-3862244)
chr7 (296-438)||(17863298-17863440)
chr7 (190-438)||(24783308-24783560)
chr7 (296-436)||(36843141-36843281)
chr7 (220-437)||(23313382-23313605)
chr7 (296-436)||(9765694-9765843)
chr7 (20-90)||(36218240-36218310)
chr7 (26-82)||(35957369-35957425)
[»] chr5 (12 HSPs)
chr5 (106-438)||(33574988-33575326)
chr5 (98-438)||(15532200-15532547)
chr5 (103-438)||(15542387-15542729)
chr5 (195-438)||(26712439-26712688)
chr5 (195-438)||(26982177-26982426)
chr5 (106-438)||(14616437-14616774)
chr5 (181-438)||(34405748-34406009)
chr5 (190-438)||(7650035-7650287)
chr5 (98-436)||(22159646-22159992)
chr5 (103-358)||(11988867-11989133)
chr5 (98-201)||(26711464-26711567)
chr5 (98-201)||(26981201-26981304)
[»] chr3 (8 HSPs)
chr3 (97-438)||(22626311-22626657)
chr3 (98-438)||(11138570-11138915)
chr3 (98-438)||(39563510-39563856)
chr3 (296-438)||(13979386-13979528)
chr3 (301-436)||(46731396-46731531)
chr3 (336-438)||(47412082-47412184)
chr3 (137-242)||(20536376-20536479)
chr3 (336-438)||(35366276-35366377)
[»] chr6 (20 HSPs)
chr6 (98-438)||(13017189-13017536)
chr6 (106-438)||(22221623-22221959)
chr6 (106-438)||(22247458-22247794)
chr6 (209-437)||(30978322-30978557)
chr6 (98-438)||(14790518-14790864)
chr6 (98-438)||(14795546-14795892)
chr6 (296-436)||(20527367-20527507)
chr6 (222-436)||(15534958-15535177)
chr6 (224-437)||(16883576-16883795)
chr6 (297-436)||(19664870-19665008)
chr6 (296-438)||(32704458-32704600)
chr6 (296-436)||(1838376-1838515)
chr6 (311-438)||(12980711-12980837)
chr6 (311-438)||(12983598-12983724)
chr6 (298-420)||(7769594-7769716)
chr6 (296-363)||(27649077-27649144)
chr6 (224-290)||(11183962-11184028)
chr6 (224-270)||(15540643-15540689)
chr6 (404-436)||(15538123-15538155)
chr6 (314-358)||(32427281-32427325)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (98-438)||(31528288-31528635)
chr2 (108-438)||(31626449-31626784)
chr2 (197-438)||(16294798-16295044)
chr2 (97-438)||(40017876-40018225)
chr2 (98-438)||(13709970-13710315)
chr2 (96-438)||(23673343-23673690)
chr2 (98-438)||(36326826-36327171)
chr2 (296-438)||(32575890-32576032)
chr2 (302-364)||(8427199-8427260)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (98-438)||(12171882-12172218)
chr4 (98-426)||(2541796-2542128)
chr4 (181-438)||(647288-647549)
chr4 (195-438)||(650574-650821)
chr4 (297-436)||(26062898-26063037)
chr4 (299-434)||(26060491-26060626)
chr4 (299-349)||(11649440-11649490)
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (106-438)||(9762-10101)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (106-438)||(24193-24529)
[»] chr8 (6 HSPs)
chr8 (104-436)||(12575306-12575644)
chr8 (220-437)||(41778864-41779086)
chr8 (296-438)||(13096921-13097062)
chr8 (222-358)||(14418445-14418585)
chr8 (298-438)||(44008201-44008335)
chr8 (299-349)||(41836429-41836479)
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (98-438)||(13493162-13493508)
chr1 (220-438)||(34066244-34066468)
chr1 (296-436)||(39546144-39546284)
chr1 (96-428)||(10764829-10765167)
chr1 (300-438)||(32506062-32506200)
chr1 (106-438)||(13495887-13496224)
chr1 (296-438)||(27282311-27282453)
chr1 (103-436)||(1936528-1936869)
chr1 (298-438)||(21153155-21153295)
chr1 (219-430)||(16190299-16190516)
chr1 (311-438)||(22456711-22456837)
chr1 (298-438)||(15297232-15297371)
chr1 (378-438)||(22453421-22453481)
chr1 (378-438)||(23990374-23990434)
chr1 (311-411)||(49147825-49147924)
chr1 (221-290)||(8435289-8435358)
chr1 (401-438)||(22104680-22104717)
chr1 (26-93)||(18125078-18125145)
chr1 (226-285)||(23990262-23990322)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (299-438)||(7199-7338)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (296-438)||(2807-2949)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (299-438)||(2591-2732)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (296-437)||(6014-6155)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (222-358)||(133-273)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 341; Significance: 0; HSPs: 17)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 428
Target Start/End: Original strand, 36222212 - 36222644
Alignment:
Q  1 attgttgaaattacttgtctgtggatagctcttggattggttcaatccttgaatggaagtgaaaagctagagaatattgcaatagaatatattcgtgtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36222212 attgttgaaattacttgtctgtggatagctcttggattggttcaatccttgaatggaagtgaaaagctagagaatattgcaatagaatatattcgtgtga 36222311  T
Q  101 tggatatttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaaaattcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattattaaaaag 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36222312 tggatatttggcaaatgaaccaaattcaattgaagtaataaaaattcgttaccacgaggattgtatttaatttctacgtagcaatttcattattaaaaag 36222411  T
Q  201 gatgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagattg----- 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  36222412 gatgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttctaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagattgagaga 36222511  T
Q  296 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 395  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  36222512 agtatggttaagtccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaattttcactcctagttcaatcaatgattatttagtttcactacaaattaacttagt 36222611  T
Q  396 aattctatccaatctcttgacctagaattctcc 428  Q
    |||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  36222612 aattttacctaatctcttgacctagaattctcc 36222644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 98 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 11279736 - 11279391
Alignment:
Q  98 tgatggatatttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaaaattcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattattaaa 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  11279736 tgatgaatatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaaaatttgtttccacaaggactatatttaatttctacttagcaatttcattattaaa 11279637  T
Q  198 aaggatgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagattg-- 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      
T  11279636 aaggatgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacgaataaagattggtttttagaagattgag 11279537  T
Q  296 ---agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaactt 392  Q
       |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11279536 agaagtatggttaagtccttcgaatctttcgaagttctcctctggtaatttgcactcctagttcaataaatgattatttagtttcacgacagattaactt 11279437  T
Q  393 agtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11279436 agtaattctacccaatctcttgacctaggattctccccgcaagtga 11279391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 106 - 438
Target Start/End: Original strand, 46846320 - 46846658
Alignment:
Q  106 atttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaaaattcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattattaaaaaggatgt 205  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  46846320 atttggcaagtgaatcagattcaatcgaagtaataaaaatatgtttccacgaggactgtatttaatttctacttagcaatttcattattaaaaaggatgt 46846419  T
Q  206 ataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaa-caaagaaagattggtttttagaagattgag-----ta 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||  ||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||     ||    
T  46846420 ataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgaattcttattataaactgactaaaaaacaataaaagattggtttttagaaaattgagagaagta 46846519  T
Q  300 tggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaatt 399  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  46846520 tggttaagtccttcgaatcctccgaagttcttctatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttagtttcacgacagattaacctaataatt 46846619  T
Q  400 ctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46846620 ctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 46846658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 97 - 438
Target Start/End: Original strand, 23759608 - 23759955
Alignment:
Q  97 gtgatggatatttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaaaa-ttcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattatta 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| || ||| |||    
T  23759608 gtgatagatatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaaaagttcgtttctacgaggactgtatttaacttctacttagcaaattcatt-tta 23759706  T
Q  196 aaaaggatgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggttttt-agaagatt 294  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||| |||| ||     
T  23759707 aaaaggatgtataaa-tttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaatc 23759805  T
Q  295 g-----agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcct-agttcaatcaatgattatttaatttcacgacagatta 388  Q
    |     |||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23759806 gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggatta 23759905  T
Q  389 acttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23759906 acttagtaattctacccaatctcttgccctagaattctccccgcaagtga 23759955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 98 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 33313239 - 33312894
Alignment:
Q  98 tgatggatatttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaaaattcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattattaaa 197  Q
    |||| ||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||| |||||||||    
T  33313239 tgatagatatttgagaagtgaaacaaattcaatcgaagtaataaaaattcgtttctacgaggactgtatt-aacttctacttagcaatttcattattaaa 33313141  T
Q  198 aaggatgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactg-attaaaaacaaagaaagattggtttttagaagat-tg 295  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||  || |||||| |||||||| || ||    
T  33313140 aaggatgtgtaaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaacggaattaaaaataataaaggattgg-ttttagaaaatctg 33313042  T
Q  296 ag-----tatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaac 390  Q
    ||      ||||||||||| |||||||| || |||| |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  33313041 agagaaaaatggttaagtccttcgaatcctctgaagctctcctatggtaatttgctttcctaattcaatcaatgattatttagtttcacgacgaattaac 33312942  T
Q  391 ttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33312941 ttagtaattctacccaatcttttgacctagaattctccccgcaagtga 33312894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 98 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 295106 - 294772
Alignment:
Q  98 tgatggatatttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaaaa-ttcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattattaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || || ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  295106 tgatggatatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaaaaatttgtgtccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattattaa 295007  T
Q  197 aaaggatgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagattga 296  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||| || |||||||||| |||| |||||    
T  295006 aaaggatgtaataaatttatattgatgcccgaggcagt--agttg-ttttgtaacataagctggttaaaagcaaataaggattggtttt-agaaaattga 294911  T
Q  297 g-----tatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaact 391  Q
    |     |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||  |||||||||||||     
T  294910 gagaagtatggttaagtctttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatgcaatcaatgattatctaattcaacgacagattaaca 294811  T
Q  392 tagtaattctatccaatctcttgacctagaattctcccc 430  Q
     ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  294810 aagtaattatacccaatctcttgaactagaattctcccc 294772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 225 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 23108106 - 23107887
Alignment:
Q  225 cctaggcagttgagttgat-tttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagatt---gagta---tggttaagtcattcgaat 317  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||| |||| |||   ||| |   |||||||| | |||||||    
T  23108106 cctagacagttgagttgatgtttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattggtttt-agaaaattagagagaaatgtggttaagaccttcgaat 23108008  T
Q  318 cttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaattctatccaatctcttgacc 417  Q
    | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||||| |    
T  23108007 catccgaagctctcctatggtaatttgcactcctagttcaaacaatgattatttagtttcacaacagattaacttagtaactctacccaattccttgagc 23107908  T
Q  418 tagaattctccccgcaagtga 438  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  23107907 tataattctccccgcaagtga 23107887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 98 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 6967393 - 6967047
Alignment:
Q  98 tgatggatatttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaaaa--ttcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattatta 195  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||  | ||| ||||| ||| ||  ||||| || |||||||  ||  |||| ||||||   |||||||  |||| |    
T  6967393 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 6967294  T
Q  196 aaaaggatgtataaaatttatattggt-gccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagatt 294  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |   |||||||  |||| |||||||| |||| |||    
T  6967293 aaaaggatgtataaa-tttatattgattgccctaggcagttgagttg-ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaag-ttggttttcagaatatt 6967197  T
Q  295 g------agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagatta 388  Q
           |||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||| |||| ||||||    
T  6967196 agagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgatagatta 6967097  T
Q  389 acttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  6967096 acaaagtaattctacccaatctcttaacctagaattctccccgcatgtga 6967047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 98 - 438
Target Start/End: Original strand, 17866353 - 17866699
Alignment:
Q  98 tgatggatatttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaaaa--ttcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattatta 195  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||  | ||| ||||| ||| ||  ||||| || |||||||  ||  |||| ||||||   |||||||  |||| |    
T  17866353 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 17866452  T
Q  196 aaaaggatgtataaaatttatattggt-gccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagatt 294  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||  |   |||||||  |||| |||||||| |||| |||    
T  17866453 aaaaggatgtataaa-tttatattgattgccctaggcagttgagctg-ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaag-ttggttttcagaatatt 17866549  T
Q  295 g------agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagatta 388  Q
           ||||||||| || | |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||| |||||||||||    
T  17866550 agagagaagtatggtttagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagatta 17866649  T
Q  389 acttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17866650 acaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtga 17866699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 98 - 438
Target Start/End: Original strand, 3861907 - 3862244
Alignment:
Q  98 tgatggatatttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaa-aattcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattattaa 196  Q
    |||| ||||||||||||||| || | | |||||| |||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  3861907 tgatagatatttggcaagtgtactagagtcaatcgaagtaataaataatttgtatccacgaggattgttattaacttctacttagcaatttcattattaa 3862006  T
Q  197 aaaggatgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttt--gtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagatt 294  Q
    || |||||||| ||||| |   || |||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| || |||    
T  3862007 aa-ggatgtattaaattcaa--tgatgccctaggcagttcaattgattttttgtaacataaactgattaaaaacaataaaagattgg-ttttataaaatt 3862102  T
Q  295 ------gagtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagatta 388  Q
           |||||| ||||| | |||||||| | |||||||||| ||        |||||||||| |||||  ||||||||| || ||  |||||||||||    
T  3862103 agagagaagtatgattaagaccttcgaatccttcgaagttctccta--------tgcactcctaattcaagaaatgattatctagttcaacgacagatta 3862194  T
Q  389 acttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3862195 acaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 3862244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 296 - 438
Target Start/End: Original strand, 17863298 - 17863440
Alignment:
Q  296 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 395  Q
    |||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||  |||    
T  17863298 agtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagt 17863397  T
Q  396 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17863398 aattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtga 17863440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 190 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 24783560 - 24783308
Alignment:
Q  190 ttattaaaaaggatgtataaaatttatattggt-gccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttag 288  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | | || |||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||  |||| |||||||| ||    
T  24783560 ttatcaaaaaggatgtataaa-tttatattgattgtccaaggcagttgagttg-ttttgtaacataaacttaaataaaacaataaaag-ttggttttaag 24783464  T
Q  289 aagattg------agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgac 382  Q
    || |||       |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| || ||| ||||     
T  24783463 aatattagagagaagtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcatatggtaattttcattcctaattcaatcaatgattatctagtttaacgag 24783364  T
Q  383 agattaacttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24783363 agattaacaaagtaattatacccaatctcttgacctagaattctctccgcaagtga 24783308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 296 - 436
Target Start/End: Original strand, 36843141 - 36843281
Alignment:
Q  296 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 395  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||  |||||||||||||  | |    
T  36843141 agtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaattcgcactcctacttcaatcaatgattatctagttcaacgacagattaacaaatt 36843240  T
Q  396 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagt 436  Q
    || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36843241 aactctacccaatctcttgacctagagttctccccgcaagt 36843281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 437
Target Start/End: Original strand, 23313382 - 23313605
Alignment:
Q  220 ggtgccctaggcagttgagttgatttt-gtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagattg------agtatggttaagtcatt 312  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||| |||| |||       |||||||||||| | ||    
T  23313382 ggtgccctaggtagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagaatggtttt-agaaaattagagagaagtatggttaagacctt 23313480  T
Q  313 cgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaattctatccaatctct 412  Q
     ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||  ||||| ||| ||||||   |||| |||| |||||||||    
T  23313481 tgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactactaattcaaacaatgattatctaggttcacaacatattaacactgtaactctacccaatctct 23313580  T
Q  413 tgacctagaattctccccgcaagtg 437  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  23313581 tggcctagaattctccccgcaagtg 23313605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 296 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 9765843 - 9765694
Alignment:
Q  296 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacga---------cagat 386  Q
    |||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||         |||||    
T  9765843 agtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttcacgagtttcacggcagat 9765744  T
Q  387 taacttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagt 436  Q
    ||||  ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9765743 taacaaagtaactctacccaatctcttgacctataattctccctgcaagt 9765694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 90
Target Start/End: Original strand, 36218240 - 36218310
Alignment:
Q  20 tgtggatagctcttggattggttcaatccttgaatggaagtgaaaagctagagaatattgcaatagaatat 90  Q
    |||||||| | |||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  36218240 tgtggataccccttggattagttcaacccataaatggaagtgaaaagctagagcatattgccagagaatat 36218310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 35957425 - 35957369
Alignment:
Q  26 tagctcttggattggttcaatccttgaatggaagtgaaaagctagagaatattgcaa 82  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  35957425 tagcccttggattagttcaatccctaaatggaagtgaaaagctggaaagtattgcaa 35957369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 12)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 106 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 33575326 - 33574988
Alignment:
Q  106 atttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaaaa-ttcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattattaaaaaggatg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33575326 atttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaaaaattcgttttcacgaggactgtatttaacttctatttagcaattttattattaaaaaggatg 33575227  T
Q  205 tataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagattgag-----ta 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||||||     ||    
T  33575226 tataaa-tttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattgagagaagta 33575128  T
Q  300 tggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagtt-caatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaat 398  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  33575127 tggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctaattacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaat 33575028  T
Q  399 tctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33575027 tctacccaatctcttgatctagaattctccccgcaagtga 33574988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 98 - 438
Target Start/End: Original strand, 15532200 - 15532547
Alignment:
Q  98 tgatggatatttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaaaa-ttcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattattaa 196  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  15532200 tgatagatatttggcatgtgaaccaaattcgatcgaagtaataaaaaattcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattattaa 15532299  T
Q  197 aaaggatgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggttttt-agaagattg 295  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||| |||| ||||    
T  15532300 aaaggatgtataaa-tttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaattg 15532398  T
Q  296 -----agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcct-agttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaa 389  Q
         |||||||||||||| |||||||| ||  ||| |||| | ||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15532399 agagaagtatggttaagtccttcgaatcctctaaagctctcctgtggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacagattaa 15532498  T
Q  390 cttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532499 cttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 15532547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 103 - 438
Target Start/End: Original strand, 15542387 - 15542729
Alignment:
Q  103 gatatttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaaaa-ttcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattattaaaaagg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||    
T  15542387 gatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaaaaattcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttaacaatttcattattaaaaagg 15542486  T
Q  202 atgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggttttt-agaagattg----- 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||| |||| ||||         
T  15542487 atgtataaa-tttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaattgagaga 15542585  T
Q  296 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcct-agttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttag 394  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||  ||| |||| | ||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15542586 agtatggttaagtccttcgaatcctctaaagctctcctgtggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacagattaacttag 15542685  T
Q  395 taattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15542686 taattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 15542729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 195 - 438
Target Start/End: Original strand, 26712439 - 26712688
Alignment:
Q  195 aaaaaggatgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactga-ttaaaaacaaagaaagattggtttttagaagat 293  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |   ||||||||||||| |||| ||    
T  26712439 aaaaaggatgtgtaaaatttatattagtgccctagacagttgagttgattttgtaacataaacaaaattaaaaatagtaaaagattggtttt-agaaaat 26712537  T
Q  294 -tgagt-----atggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagatt 387  Q
     ||||      ||||||||||| |||||||| ||||| | |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26712538 ctgagagaagaatggttaagtctttcgaatcctccgacgctctcctatgataatttgcactcctaattcaatcaatgattatttagtttcacgacagatt 26712637  T
Q  388 aacttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26712638 aacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 26712688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 195 - 438
Target Start/End: Original strand, 26982177 - 26982426
Alignment:
Q  195 aaaaaggatgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactga-ttaaaaacaaagaaagattggtttttagaagat 293  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |   ||||||||||||| |||| ||    
T  26982177 aaaaaggatgtgtaaaatttatattagtgccctagacagttgagttgattttgtaacataaacaaaattaaaaatagtaaaagattggtttt-agaaaat 26982275  T
Q  294 -tgagt-----atggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagatt 387  Q
     ||||      ||||||||||| |||||||| ||||| | |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26982276 ctgagagaagaatggttaagtctttcgaatcctccgacgctctcctatgataatttgcactcctaattcaatcaatgattatttagtttcacgacagatt 26982375  T
Q  388 aacttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26982376 aacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 26982426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 106 - 438
Target Start/End: Original strand, 14616437 - 14616774
Alignment:
Q  106 atttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaa--aattcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattattaaaaaggat 203  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||  ||||||| || |||||||  ||  |||| ||||||   |||||||  |||| |||||||||    
T  14616437 atttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatcaaaaaggat 14616535  T
Q  204 gtataaaatttatattggtg-ccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagattg------a 296  Q
    |||| || ||||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |   |||||||  |||| ||| |||| |||| |||       |    
T  14616536 gtatgaa-tttatattgattaccctaggaagttgagttg-ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaag-ttgattttaagaatattagagagaa 14616632  T
Q  297 gtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagta 396  Q
    ||||||||||| | || ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||  ||||    
T  14616633 gtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaattttcactcctaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagta 14616732  T
Q  397 attctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14616733 attctacccaatctcttgacctataattctccccgcaagtga 14616774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 181 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 34406009 - 34405748
Alignment:
Q  181 gcaattttattattaaaaaggatgtataaaatttatattggt-gccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagatt 279  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |   |||||||  |||| ||    
T  34406009 gcaatttctttatcaaaaaggatgtataaa-tttatattgattgccctaggcagttgagttg-ttgtgtaacataaacgtaaataaaacaataaaag-tt 34405913  T
Q  280 ggtttttagaagattg------agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaa 373  Q
    |||||| |||| |||       |||||||||||| | ||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||     
T  34405912 ggttttcagaatattagagagaagtatggttaagaccttcaaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctag 34405813  T
Q  374 tttcacgacagattaacttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  34405812 tttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctcctcgcatgtga 34405748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 190 - 438
Target Start/End: Original strand, 7650035 - 7650287
Alignment:
Q  190 ttattaaaaaggatgtataaaatttatattggt-gccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttag 288  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |   |||||||  |||| ||| |||| ||    
T  7650035 ttatcaaaaaggatgtataaa-tttatattgattgccctaggcagttgagttg-ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaag-ttgcttttaag 7650131  T
Q  289 aagattg------agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgac 382  Q
    || |||       |||||||||||| |||| ||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| | ||     
T  7650132 aatattagagagaagtatggttaagacatttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagtttaaagat 7650231  T
Q  383 agattaacttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||||||||   |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7650232 agattaacaaggtaattctactcaatctctttacctagaattctccccgcaagtga 7650287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 22159992 - 22159646
Alignment:
Q  98 tgatggatatttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaaaa-ttcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattattaa 196  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||  || | ||    
T  22159992 tgatagatatttgacaagtgtaccaaattcgatcgaagtaataaaaaatttgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttctttgtcaa 22159893  T
Q  197 aaaggatgtata--aaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttg-taacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagat 293  Q
    ||||||||||||  ||||| | |  | |||||||||||||||  ||| ||||  |||  |||||  |   |||||||  ||| ||||||||| |||| ||    
T  22159892 aaaggatgtatattaaattcaaag-gttgccctaggcagttggattggtttttataaagtaaacgtaaataaaacaataaaa-attggttttaagaatat 22159795  T
Q  294 t---gag---tatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagatt 387  Q
    |   |||   |||||||||| | || ||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| || ||  |||| |||||    
T  22159794 tagagagaaatatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaaatcgcactcctagttcaatcaatgactatctagttcaacgatagatt 22159695  T
Q  388 aacttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagt 436  Q
    |||  ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  22159694 aacaaagtaactctacccaatctcttgacctagagttctccccacaagt 22159646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 358
Target Start/End: Original strand, 11988867 - 11989133
Alignment:
Q  103 gatatttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaa-aattcgtttctacgaggattgtatttaaattcta--cgtagcaattttattattaaaaa 199  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |  ||  |||| |||||  | ||||||||| |||| ||| ||    
T  11988867 gatatttgacaagtgaatcaaattcaatcgaagtaataaataattcgtttccacgagaaccgttcttaacttctatacttagcaatttcattagtaataa 11988966  T
Q  200 ggatgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttga-ttttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagatt---- 294  Q
    ||| |||||  |  |  | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||| | |||||||| |||        
T  11988967 ggacgtatattaaattcaatggtcccctaggcagttgagttgatttttgtaacataaacagattaaaaacgataaaagatt-gattttagaaaattagag 11989065  T
Q  295 --gagtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctc--atatggtaatttgcactcctagttcaa 358  Q
       |||| ||||||| | |||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  11989066 agaagtaaggttaagaccttcgaatcctccaaagttctcctatatggtaatttgcactcctagttcaa 11989133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 98 - 201
Target Start/End: Original strand, 26711464 - 26711567
Alignment:
Q  98 tgatggatatttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaat-aaaaattcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattattaa 196  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||| ||||||||| ||||| ||    
T  26711464 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaaaattcgtttccacgaggactgta-ttaacttctacttagcaatttcattatcaa 26711562  T
Q  197 aaagg 201  Q
    |||||    
T  26711563 aaagg 26711567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 98 - 201
Target Start/End: Original strand, 26981201 - 26981304
Alignment:
Q  98 tgatggatatttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaat-aaaaattcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattattaa 196  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||| ||||||||| ||||| ||    
T  26981201 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaaaattcgtttccacgaggactgta-ttaacttctacttagcaatttcattatcaa 26981299  T
Q  197 aaagg 201  Q
    |||||    
T  26981300 aaagg 26981304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 8)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 97 - 438
Target Start/End: Original strand, 22626311 - 22626657
Alignment:
Q  97 gtgatggatatttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaaaa-ttcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattatta 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  22626311 gtgatagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaaaagttcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 22626410  T
Q  196 aaaaggatgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagattg 295  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| | |  ||||||| ||||    
T  22626411 aaaaggatgtataaa-tttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaac-aataaagaattggatttagaaaattg 22626508  T
Q  296 -----agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcct-agttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaa 389  Q
         |||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22626509 agagaagtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggattaa 22626608  T
Q  390 cttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626609 cttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 22626657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 98 - 438
Target Start/End: Original strand, 11138570 - 11138915
Alignment:
Q  98 tgatggatatttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaaaa-ttcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattattaa 196  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  11138570 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaaaagttcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattattaa 11138669  T
Q  197 aaaggatgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagattg- 295  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||| | |  || |||| ||||     
T  11138670 aaaggatgtataaa-tttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaac-aatatagaattggattcagaaaattga 11138767  T
Q  296 ----agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcct-agttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaac 390  Q
        |||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  11138768 gagaagtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggattaac 11138867  T
Q  391 ttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11138868 ttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 11138915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 98 - 438
Target Start/End: Original strand, 39563510 - 39563856
Alignment:
Q  98 tgatggatatttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaaaa-ttcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattattaa 196  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| || |||||| ||||||||| ||||| ||    
T  39563510 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcaatcaaagtaataaaaaattcgtttccacgaggactgtatt-aacttctacttagcaatttcattataaa 39563608  T
Q  197 aaaggatgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaac-tgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagat-t 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |   ||||||||| |||||||| || |    
T  39563609 aaaggatgtgtaaaatttatattagtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaacaaaattaaaaatagtaaaagattgg-ttttagaaaatct 39563707  T
Q  295 g-----agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaa 389  Q
    |     || ||||||||||| |||||||| ||||| | |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  39563708 gagagaagaatggttaagtccttcgaatcctccgacgctctcctatgataatttgcactcctaattcaatcaatggttatttagtttcacgacagattaa 39563807  T
Q  390 cttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39563808 cttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 39563856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 296 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 13979528 - 13979386
Alignment:
Q  296 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 395  Q
    |||||||||||| | || ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13979528 agtatggttaagacctttgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactccaagttcaaacaatgattatttagtttcatgacagattaacttagt 13979429  T
Q  396 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13979428 aactctatccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtga 13979386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 301 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 46731531 - 46731396
Alignment:
Q  301 ggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaattc 400  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||  ||||| ||    
T  46731531 ggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcatatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagttcaacgacatattaacaaagtaactc 46731432  T
Q  401 tatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagt 436  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  46731431 tacccaatctcttgacctggagttctccccgcaagt 46731396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 336 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 47412184 - 47412082
Alignment:
Q  336 ggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaag 435  Q
    |||||||||||| |  | ||||||||||| | || |||||| || ||||||||||    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47412184 ggtaatttgcacccacaattcaatcaatgttcatctaatttaacaacagattaacacgataattctactcaatctcttgacctagaattctctccgcaag 47412085  T
Q  436 tga 438  Q
    |||    
T  47412084 tga 47412082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 242
Target Start/End: Original strand, 20536376 - 20536479
Alignment:
Q  137 aataaaaattcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattattaaaaaggatgtataaaatttatattggtgccctaggcagttg 236  Q
    |||||||  |||| || ||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||   |  |||||||||||||||||    
T  20536376 aataaaagatcgtatccacgaggactgtatttaacttctacttagaaatttcattattaaaaaggatgtagtaaatt--caagggtgccctaggcagttg 20536473  T
Q  237 agttga 242  Q
     |||||    
T  20536474 ggttga 20536479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 336 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 35366377 - 35366276
Alignment:
Q  336 ggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaag 435  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||| | || |||||| |||||| ||||||    ||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  35366377 ggtaatttgcaccccaa-ttcaatcaatgttcatataatttaacgacaaattaacaagataattctactcaatctcttgacctagaactctctccgcgag 35366279  T
Q  436 tga 438  Q
    |||    
T  35366278 tga 35366276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 20)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 98 - 438
Target Start/End: Original strand, 13017189 - 13017536
Alignment:
Q  98 tgatggatatttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaaaa-ttcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattattaa 196  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  13017189 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaaaagttcgtttccacgaggactatatttaacttctacttagcaatttcattattaa 13017288  T
Q  197 aaaggatgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggttttt-agaagattg 295  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||| |||| ||||    
T  13017289 aaaggatgtataaa-tttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttcagaaaattg 13017387  T
Q  296 -----agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcct-agttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaa 389  Q
         |||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  13017388 agagaagtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatatgatcaatgattatttagtttcacgacggattaa 13017487  T
Q  390 cttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13017488 cttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 13017536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 106 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22221959 - 22221623
Alignment:
Q  106 atttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataa-aaattcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattattaaaaaggatg 204  Q
    |||||||||||| ||||||  | ||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||| | ||||||  ||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  22221959 atttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaattcgtttccacgaggactatatttagcttctactaagcaatttcattattaaaaaggatg 22221860  T
Q  205 tataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagattgagt-----a 299  Q
    |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||  ||  |||||||||||||| ||||||      |    
T  22221859 tataaattat-tattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaa--taaactaattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattgagagaagca 22221763  T
Q  300 tggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagtt-caatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaat 398  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  22221762 tggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcttaaatacaatcaatgattatttagtatcacgacggattaacttagtaat 22221663  T
Q  399 tctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22221662 tctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 22221623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 106 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22247794 - 22247458
Alignment:
Q  106 atttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataa-aaattcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattattaaaaaggatg 204  Q
    |||||||||||| ||||||  | ||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||| | ||||||  ||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  22247794 atttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaattcgtttccacgaggactatatttagcttctactaagcaatttcattattaaaaaggatg 22247695  T
Q  205 tataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagattgagt-----a 299  Q
    |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||  ||  |||||||||||||| ||||||      |    
T  22247694 tataaattat-tattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaa--taaactaattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattgagagaagca 22247598  T
Q  300 tggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagtt-caatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaat 398  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  22247597 tggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcttaaatacaatcaatgattatttagtatcacgacggattaacttagtaat 22247498  T
Q  399 tctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22247497 tctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 22247458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 209 - 437
Target Start/End: Original strand, 30978322 - 30978557
Alignment:
Q  209 aaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggttttta-gaagattgag-----tatgg 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| ||| ||||||     |||||    
T  30978322 aaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaattgagagaagtatgg 30978421  T
Q  303 ttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagtt-caatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaattct 401  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30978422 ttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattct 30978521  T
Q  402 atccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtg 437  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30978522 acccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtg 30978557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 98 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 14790864 - 14790518
Alignment:
Q  98 tgatggatatttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaaaa--ttcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattatta 195  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||  | ||| ||||| ||| ||  ||||| || |||||||  ||  |||| ||||||   |||||||  |||| |    
T  14790864 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 14790765  T
Q  196 aaaaggatgtataaaatttatattggt-gccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagatt 294  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |   |||||||  |||| |||||||| |||| |||    
T  14790764 aaaaggatgtataaa-tttatattgattgccctaggcagttgagttg-ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaag-ttggttttcagaatatt 14790668  T
Q  295 g------agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagatta 388  Q
           |||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||| |||||||||||    
T  14790667 agagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagatta 14790568  T
Q  389 acttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14790567 acaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtga 14790518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 98 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 14795892 - 14795546
Alignment:
Q  98 tgatggatatttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaaaa--ttcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattatta 195  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||  | ||| ||||| ||| ||  |||||  |||||||||  ||  |||| ||||||   |||||||  |||| |    
T  14795892 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtacctacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 14795793  T
Q  196 aaaaggatgtataaaatttatattggt-gccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagatt 294  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |   |||||||  |||| |||||||| |||| |||    
T  14795792 aaaaggatgtataaa-tttatattgattgccctaggcagttgagttg-ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaag-ttggttttcagaatatt 14795696  T
Q  295 g------agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagatta 388  Q
           |||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||| |||||||||||    
T  14795695 agagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagatta 14795596  T
Q  389 acttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14795595 acaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtga 14795546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 296 - 436
Target Start/End: Original strand, 20527367 - 20527507
Alignment:
Q  296 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 395  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | |    
T  20527367 agtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctaacttcacgacagattaacaaatt 20527466  T
Q  396 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagt 436  Q
    || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20527467 aactttacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagt 20527507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 222 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 15535177 - 15534958
Alignment:
Q  222 tgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagattga------gtatggttaagtcattcga 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||  |||| |||||||| | || ||| |      ||||||||||| | ||| |    
T  15535177 tgccctaggcagttgagttgattttgtaaaacaaatagattaaaaacaataaaagtttggtttt-acaaaattaaagtgatgtatggttaagaccttcaa 15535079  T
Q  316 atcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaattctatccaatctcttga 415  Q
    ||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||  |||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||    
T  15535078 atcctccgaagttttcctatggtaatttgcattcctaattcaatcaatgattatctagttcaacgacagattaacaaagtaactctaaccaatctcttga 15534979  T
Q  416 cctagaattctccccgcaagt 436  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  15534978 cctagagttctccccgcaagt 15534958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 224 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 16883795 - 16883576
Alignment:
Q  224 ccctaggcagttgagttgatttt-gtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagattg------agtatggttaagtcattcgaa 316  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||| |||| |||       |||||||||||| ||||||||    
T  16883795 ccctaggcagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattggtttt-agaaaattagagagaagtatggttaagacattcgaa 16883697  T
Q  317 tcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaattctatccaatctcttgac 416  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||  ||||||| ||||||||  | |||  ||| |||||||||||||    
T  16883696 tccttcgaagttctcctatggtaatttgcactactaattcaaacaatgattatctatgttcacgaaagattaacacaataaccctacccaatctcttgac 16883597  T
Q  417 ctagaattctccccgcaagtg 437  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  16883596 ctagaattctccccacaagtg 16883576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 297 - 436
Target Start/End: Original strand, 19664870 - 19665008
Alignment:
Q  297 gtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagta 396  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||    
T  19664870 gtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatct-agttcacgacagattaacaaagta 19664968  T
Q  397 attctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagt 436  Q
    | |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19664969 actctacccaatatcttgacctagagttctccccgcaagt 19665008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 296 - 438
Target Start/End: Original strand, 32704458 - 32704600
Alignment:
Q  296 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 395  Q
    |||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||  |||    
T  32704458 agtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaacagagt 32704557  T
Q  396 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  32704558 aattctacccaatctcttgaaatagaattctccccgcatgtga 32704600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 296 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 1838515 - 1838376
Alignment:
Q  296 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 395  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||  |||    
T  1838515 agtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatg-taattcgcactcctagttcaatcaacgattatttagttcaacgacagattaacaaagt 1838417  T
Q  396 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagt 436  Q
    || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1838416 aactctacccaatctcttgacctagagttctccccgcaagt 1838376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 311 - 438
Target Start/End: Original strand, 12980711 - 12980837
Alignment:
Q  311 ttcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaattctatccaatct 410  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  |||||| || |||| ||||||||||| |  | || ||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  12980711 ttcgaatcctccgaagttctcctatgaaaatttgtaccccta-ttcaatcaatgttcgtctagtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatct 12980809  T
Q  411 cttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12980810 cttgacctagaattctctccgcaagtga 12980837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 311 - 438
Target Start/End: Original strand, 12983598 - 12983724
Alignment:
Q  311 ttcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaattctatccaatct 410  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||| || || |||| ||||||||||| |  | || ||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  12983598 ttcgaatcctccgaagttctcctatgaaaatctgtaccccta-ttcaatcaatgttcgtctagtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatct 12983696  T
Q  411 cttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12983697 cttgaccttgaattctctccgcaagtga 12983724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 420
Target Start/End: Original strand, 7769594 - 7769716
Alignment:
Q  298 tatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaa 397  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||| |  | ||||||||||| | ||||| ||| |||||| ||||||  |||||    
T  7769594 tatggttaagaccttcgaatcctccgatgctcttatatggtaatttgcaccctcaattcaatcaatgttcatttagtttaacgacatattaacaaagtaa 7769693  T
Q  398 ttctatccaatctcttgacctag 420  Q
    |||||  |||||| |||||||||    
T  7769694 ttctactcaatcttttgacctag 7769716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 27649144 - 27649077
Alignment:
Q  296 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaat 363  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  27649144 agtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcacttctaattcaagcaat 27649077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 290
Target Start/End: Original strand, 11183962 - 11184028
Alignment:
Q  224 ccctaggcagttgagttga-ttttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaa 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||  |||| |||||||||||||    
T  11183962 ccctaggcagttgagttgatttttgtaacataaacgtaataaaaacaataaaag-ttggtttttagaa 11184028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 224 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15540689 - 15540643
Alignment:
Q  224 ccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaa 270  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||    
T  15540689 ccctaggcagttgagttgattttctaaaataaagggattaaaaacaa 15540643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 404 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 15538155 - 15538123
Alignment:
Q  404 ccaatctcttgacctagaattctccccgcaagt 436  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15538155 ccaatctcttgacctagagttctccccgcaagt 15538123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 314 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 32427325 - 32427281
Alignment:
Q  314 gaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaa 358  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  32427325 gaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaa 32427281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 98 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 31528635 - 31528288
Alignment:
Q  98 tgatggatatttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaaaa-ttcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattattaa 196  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  31528635 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaaaaatttgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattattaa 31528536  T
Q  197 aaaggatgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggttttt-agaagattg 295  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||| |||| ||||    
T  31528535 aaaggatgtataaa-tttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaattg 31528437  T
Q  296 -----agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcct-agttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaa 389  Q
         |||||||||||||| |||||||| ||  ||| |||| | ||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31528436 agagaagtatggttaagtccttcgaatcctctaaagctctcctgtggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacagattaa 31528337  T
Q  390 cttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31528336 cttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 31528288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 108 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 31626784 - 31626449
Alignment:
Q  108 ttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaaaattcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattattaaaaaggatgtat 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  31626784 ttggtaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaaaattcgtttcaatgaggactgtatt-aacttctacttagcaatttcattattaaaaaggatgtgt 31626686  T
Q  208 aaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactga-ttaaaaacaaagaaagattggtttttagaagat-tgagt-----at 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||  || |||||||||| |||| || ||||      ||    
T  31626685 aaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaaaggaattaaaaataataaaggattggtttt-agaaaatctgagagaagaat 31626587  T
Q  301 ggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaattc 400  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31626586 ggttaagtcattcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaattattatttagtttcacgacagattaacttagtaattc 31626487  T
Q  401 tatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31626486 tacccaatctcttgacctagaattctccctgcaagtga 31626449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 197 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 16295044 - 16294798
Alignment:
Q  197 aaaggatgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagattga 296  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||    
T  16295044 aaaggatgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgattttgtatcataaaccgattaaaaacaaataaagattagttttcagaaaattga 16294945  T
Q  297 g-----tatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaact 391  Q
    |     |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16294944 gagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctagtttaatcaatgattatttagtttcacgacagattaact 16294845  T
Q  392 tagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16294844 tagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 16294798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 97 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 40018225 - 40017876
Alignment:
Q  97 gtgatggatatttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaaaa-ttcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattatta 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||  || |||| || |||||| ||| || | |||||||| ||||||    
T  40018225 gtgatgaatatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaaaaatttgttttcacaaggagtgcatttaacttcgacttggcaatttttttatta 40018126  T
Q  196 aaaaggatgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagattg 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||||    || ||||    
T  40018125 aaaaggatgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttga-tttgtaacataaacggattaaaaacaataagagactggtttaagaaaaattg 40018027  T
Q  296 -----agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattattt---aatttcacgacagatt 387  Q
         |||||||||||| | |||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||   | ||| ||||||||||    
T  40018026 agagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactctcctatggtaatttgcactcctaattcaaccaatgattatttataagttttacgacagatt 40017927  T
Q  388 aacttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    |||| |||| ||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  40017926 aactcagtacttctccccaatcctttgacctagaattctccccgcaagtga 40017876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 98 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 13710315 - 13709970
Alignment:
Q  98 tgatggatatttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaaaattcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattattaaa 197  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  13710315 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaaaattcgtttttacgagaactgtatttaacttctacttagcaatttcattattaaa 13710216  T
Q  198 aaggatgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagatt--- 294  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||       
T  13710215 aaggatgtataaaatttatattgatgcctgaggaagttgagttga-gttgtaacataaacggattaaaaacaataaaagattgg-ttttagaaaatttga 13710118  T
Q  295 ---gagtatggttaagtcattcgaatcttccg-aagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaac 390  Q
        |||||||||||| | ||| |||| || | ||| |||| |||| ||||||||||||||| || |  |||||||||| || ||  || ||||||||||    
T  13710117 gagaagtatggttaagaccttcaaatcatctgaaagctctcctatgataatttgcactcctaatttaggcaatgattatctagttcaacaacagattaac 13710018  T
Q  391 ttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
      |||||||||| || ||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  13710017 aaagtaattctacccgatctcttgacccataattctcccctcaagtga 13709970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 96 - 438
Target Start/End: Original strand, 23673343 - 23673690
Alignment:
Q  96 tgtgatggatatttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaa--aattcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattat 193  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||  ||||||| || |||||||  ||  |||| ||||||  | ||||||  ||||    
T  23673343 tgtgatagagatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcaacaatttctttat 23673441  T
Q  194 taaaaaggatgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgat-tttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaaga 292  Q
     ||||||||||||| ||||| |   |  |||||||||||||||  |||   ||||||| |||||| ||||||||||||  |||| |||||||| |||| |    
T  23673442 caaaaaggatgtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaaacaataaaagtttggtttt-agaaaa 23673538  T
Q  293 tt-----ga-gtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagat 386  Q
    ||     || ||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||| ||    
T  23673539 ttagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagtttaacgacaaat 23673638  T
Q  387 taacttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23673639 taacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtga 23673690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 98 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 36327171 - 36326826
Alignment:
Q  98 tgatggatatttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaa--aattcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattatta 195  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||  ||||||| || |||||||  ||  |||| ||||||   |||||||  |||| |    
T  36327171 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaacttctactctgcaatttctttatca 36327073  T
Q  196 aaaaggatgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgat-tttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagatt 294  Q
    |||| ||||||| ||||| | | |  ||||||||| ||||   ||| | ||||||| |||||| ||||||||||||  |||| |||||||| |||| |||    
T  36327072 aaaaagatgtattaaattcaaagt--tgccctaggaagttagattggtatttgtaaaataaacggattaaaaacaataaaagtttggtttt-agaaaatt 36326976  T
Q  295 -----ga-gtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagatta 388  Q
         || ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  36326975 agagagatgtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcatatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctaatttaacgatagatta 36326876  T
Q  389 acttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36326875 acaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccctgcaagtga 36326826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 296 - 438
Target Start/End: Original strand, 32575890 - 32576032
Alignment:
Q  296 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 395  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32575890 agtatggttaagaccttcgaatcctccgaagctctcctatgataatttgcactcctagttcaaaaaatgattatttagtttcacgacagattaacttagt 32575989  T
Q  396 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    || |||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  32575990 aactctaccaaatcccttgacctagaattctccccacaagtga 32576032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 8427260 - 8427199
Alignment:
Q  302 gttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatg 364  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  8427260 gttaagacattcgaatcatccgatgttcttatttggtaatttgcacccct-gttcaatcaatg 8427199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 98 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 12172218 - 12171882
Alignment:
Q  98 tgatggatatttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaaaat--tcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattatta 195  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  12172218 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaaaaagatcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 12172119  T
Q  196 aaaaggatgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaaga-ttggtttttagaagatt 294  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||         
T  12172118 aaaaggatgtataaa-tttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaac-aataaagatttggtttctaga----- 12172026  T
Q  295 gagtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcct-agttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaactta 393  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  12172025 -agtatggttaagtccttggaatcttccgaagctcgcctatggtaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaactta 12171927  T
Q  394 gtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12171926 gtaattctacccaatctcttgacctacaattctccccgcaagtga 12171882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 98 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 2542128 - 2541796
Alignment:
Q  98 tgatggatatttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaa-aattcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattattaa 196  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||    
T  2542128 tgatagatatttggcaagtgtaccaaagtcaatcgaagtaataaataattcgtatccacgaggactgtatttaacttctactgagcaatttcattattaa 2542029  T
Q  197 aaaggatgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatt-ttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagattg 295  Q
    ||||||||||| ||||| |   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| || ||||||| ||| |||     
T  2542028 aaaggatgtattaaattcaa--tggtgccctaggcagttgagtttattcttgtaacataaacggattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaatta 2541931  T
Q  296 a----gtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaact 391  Q
    |    ||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| || ||  |||||||||||||     
T  2541930 aagaggtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcttatggtaatttgtactcctatttcaagcaatgattatctagttaaacgacagattaaca 2541831  T
Q  392 tagtaattctatccaatctcttgacctagaattct 426  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  2541830 aagtaattttatccaatctcttgacctaaaattct 2541796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 181 - 438
Target Start/End: Original strand, 647288 - 647549
Alignment:
Q  181 gcaattttattattaaaaaggatgtataaaatttatattggt-gccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagatt 279  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |   |||||||  |||| ||    
T  647288 gcaatttctttatcaaaaaggatgtataaa-tttatattgattgccctaggcatttgagttg-ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaag-tt 647384  T
Q  280 ggtttttagaagattg------agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaa 373  Q
    |||||| |||| |||       ||||||||||||   |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||     
T  647385 ggttttcagaatattagagagaagtatggttaagatcttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctag 647484  T
Q  374 tttcacgacagattaacttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  647485 tttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtga 647549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 438
Target Start/End: Original strand, 650574 - 650821
Alignment:
Q  195 aaaaaggatgtataaaatttatattggt-gccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagat 293  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |   |||||||  |||| |||||||| | || ||    
T  650574 aaaaaggatgtataaa-tttatattgattgccctaggcatttgagttg-ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaag-ttggttttcataatat 650670  T
Q  294 tg------agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagatt 387  Q
    |       |||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||| ||||||||||    
T  650671 tagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagatt 650770  T
Q  388 aacttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  650771 aacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtga 650821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 297 - 436
Target Start/End: Original strand, 26062898 - 26063037
Alignment:
Q  297 gtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagta 396  Q
    ||||||||||| | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||  |||||||||||||  ||||    
T  26062898 gtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagttcaacgacagattaacaaagta 26062997  T
Q  397 attctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagt 436  Q
    | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26062998 actctacccaatctcttgacctagagttctccccgcaagt 26063037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 299 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 26060626 - 26060491
Alignment:
Q  299 atggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaat 398  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  ||| ||| ||||||||  |||||     
T  26060626 atggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagcttcccgatagattaacaaagtaac 26060527  T
Q  399 tctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaa 434  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26060526 tctacccaatctcttgacctagaattctccctgcaa 26060491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 349
Target Start/End: Original strand, 11649440 - 11649490
Alignment:
Q  299 atggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactc 349  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11649440 atggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactc 11649490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 106 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 10101 - 9762
Alignment:
Q  106 atttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaaa--attcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattattaaaaaggat 203  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||  |  ||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  10101 atttggcaagtgaatcaaattcgatcgaagtaataaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattattaaaaaggat 10002  T
Q  204 gtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagattgag-----t 298  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||||||     |    
T  10001 gtataaa-tttatattggtcccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaataattggtttttagaaaattgagagaagt 9903  T
Q  299 atggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagtt-caatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaa 397  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  9902 atggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaa 9803  T
Q  398 ttctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9802 ttctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 9762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 106 - 438
Target Start/End: Original strand, 24193 - 24529
Alignment:
Q  106 atttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataa-aaattcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattattaaaaaggatg 204  Q
    |||||||||||| ||||||  | ||| ||||| ||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||  | |||||| ||||||||||||||||    
T  24193 atttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaatttgtttccacgaggactgtatttaacttctactcaacaatttcattattaaaaaggatg 24292  T
Q  205 tataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagattgagt-----a 299  Q
    |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||||||      |    
T  24293 tataaattat-tattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaa--taaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattgagagaagca 24389  T
Q  300 tggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagtt-caatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaat 398  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  24390 tggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacaataaatgattatttagtatcacgacggattaacttagtaat 24489  T
Q  399 tctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24490 tctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 24529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 6)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 104 - 436
Target Start/End: Original strand, 12575306 - 12575644
Alignment:
Q  104 atatttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaa-aattcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattattaaaaagga 202  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||| |||  |||| ||||||  | ||| || ||||||||||||||    
T  12575306 atatttggcaagtgtaccaaattcaatcgaagtaataaataattcgtatccacgaggactgttgttaacttctactcaacaagttcattattaaaaagga 12575405  T
Q  203 tgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttga-ttttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagatt------g 295  Q
    ||||| |||||   | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||           
T  12575406 tgtattaaatt--caatggtgccctaggcagttgagttgatttttgtaacataaattgattaaaaacaataaaagattgg-ttttagaaaattagagaga 12575502  T
Q  296 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 395  Q
    |||||||||||| |  | ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || || ||| |||||||||||||  |||    
T  12575503 agtatggttaagaccattgaatcctccgaagttttcttatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgataatctagtttaacgacagattaacaaagt 12575602  T
Q  396 aattctatccaatctctt-gacctagaattctccccgcaagt 436  Q
    ||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12575603 aattctacctaatctcttaaacctagaattctccccgcaagt 12575644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 220 - 437
Target Start/End: Original strand, 41778864 - 41779086
Alignment:
Q  220 ggtgccctaggcagttgagttgatttt-gtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagattga------gtatggttaagtcatt 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||  |||||||| |||  |||||||| |      ||||||||||| | ||    
T  41778864 ggtgccctaggcagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattgattt--agaagattaaagagaagtatggttaagacctt 41778961  T
Q  313 cgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaattctatccaatctct 412  Q
    | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||  || ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||  | ||| |||| |||||||||    
T  41778962 caaatcttccgaagttctcctatgctaatttgcactagtaattcaaacaatgattatctaggttcacgacagattaacacaataactctacccaatctct 41779061  T
Q  413 tgacctagaattctccccgcaagtg 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  41779062 tgacctagaattctccccgcaagtg 41779086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 296 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 13097062 - 13096921
Alignment:
Q  296 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 395  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| || || |||||||||| || ||  | || ||||||||  |||    
T  13097062 agtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttatcctatg-taatttgcactcctaatttaagcaatgattatctagttcaatgaaagattaacaaagt 13096964  T
Q  396 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13096963 aattctacccaatctcttggcctagaattctccccgcaagtga 13096921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 222 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 14418585 - 14418445
Alignment:
Q  222 tgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagattg------agtatggttaagtcattcga 315  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||| |||| |||       |||||||||||| |||||||    
T  14418585 tgccctaggcagttgagttggtttt-taacataaacaaattaaaaacaataaaag-ttggttttaagaatattagagagaagtatggttaagacattcga 14418488  T
Q  316 atcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaa 358  Q
    ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  14418487 atcctccgaatttctcctatgataatttgcactcctaattcaa 14418445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 298 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 44008335 - 44008201
Alignment:
Q  298 tatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaa 397  Q
    |||||||| | | |||||||| ||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||     |||||||    
T  44008335 tatggttatgaccttcgaatcctccgaagctcgcctttggtaatctgcactcctagttcaaacaatgattatttagtttcacgataga-----ttagtaa 44008241  T
Q  398 ttctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
     |||| | |||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  44008240 ctctaccaaatccctcgacctagaattct-cccgcaagtga 44008201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 349
Target Start/End: Original strand, 41836429 - 41836479
Alignment:
Q  299 atggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactc 349  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41836429 atggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactc 41836479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 98 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 13493508 - 13493162
Alignment:
Q  98 tgatggatatttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaaaa--ttcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattatta 195  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||  | ||| ||||| ||| ||  ||||| || |||||||  ||  |||| ||||||   |||||||  |||| |    
T  13493508 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 13493409  T
Q  196 aaaaggatgtataaaatttatattggt-gccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagatt 294  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |   |||||||  |||| |||||||| |||| |||    
T  13493408 aaaaggatgtataaa-tttatattgattgccctaggcagttgagttg-ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaag-ttggttttcagaatatt 13493312  T
Q  295 g------agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagatta 388  Q
           |||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||| |||||||||||    
T  13493311 agagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagatta 13493212  T
Q  389 acttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13493211 acaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtga 13493162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 220 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 34066468 - 34066244
Alignment:
Q  220 ggtgccctaggcagttgagttgatttt-gtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagattg------agtatggttaagtcatt 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||| |||| |||       |||||||||||| | ||    
T  34066468 ggtgccctaggcagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattggtttt-agaaaattagagagaagtatggttaagacctt 34066370  T
Q  313 cgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaattctatccaatctct 412  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  34066369 cgaatcctccgaagttctcctatgataatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagtttaacgatagattaacaaagtaattctacccaatctct 34066270  T
Q  413 tgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||    
T  34066269 tgaccttgaattctctccgcaagtga 34066244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 296 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 39546284 - 39546144
Alignment:
Q  296 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 395  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||  |||    
T  39546284 agtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcatatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttcacgacagattaacaaagt 39546185  T
Q  396 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagt 436  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39546184 aactctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagt 39546144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 96 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 10765167 - 10764829
Alignment:
Q  96 tgtgatggatatttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaaaa--ttcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattat 193  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||  | ||| ||||| ||| ||  ||||| || |||||||  ||  |||| ||||||   |||||||  ||||    
T  10765167 tgtgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttat 10765068  T
Q  194 taaaaaggatgtataaaatttatattggt-gccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaaga 292  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |   |||||||  |||| |||||||| |||| |    
T  10765067 caaaaaggatgtataaa-tttatattgattgccctaggcagttgagttg-ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaag-ttggttttcagaata 10764971  T
Q  293 ttg------agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagat 386  Q
    ||       |||||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| || ||| |||||||||    
T  10764970 ttagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaacttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagat 10764871  T
Q  387 taacttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctcc 428  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10764870 taacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctcc 10764829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 300 - 438
Target Start/End: Original strand, 32506062 - 32506200
Alignment:
Q  300 tggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaatt 399  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||  |||||||    
T  32506062 tggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaatt 32506161  T
Q  400 ctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32506162 ctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 32506200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 106 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 13496224 - 13495887
Alignment:
Q  106 atttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaa--aattcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattattaaaaaggat 203  Q
    ||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||  ||||||| || |||||||  ||  |||| ||||||   |||||||  |||| |||||||||    
T  13496224 atttgacaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatcaaaaaggat 13496126  T
Q  204 gtataaaatttatattggt-gccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagattg------a 296  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |   |||||||  |||| ||| |||| |||| |||       |    
T  13496125 gtataaa-tttatattgattgtcctaggcagttgaattg-ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaag-ttgattttaagaatattagagagaa 13496029  T
Q  297 gtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagta 396  Q
    ||||||||||| | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||   ||||    
T  13496028 gtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctactttaacgacagattaagaaagta 13495929  T
Q  397 attctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13495928 attatatccaatctcttgacctagaattctacccgcaagtga 13495887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 296 - 438
Target Start/End: Original strand, 27282311 - 27282453
Alignment:
Q  296 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 395  Q
    |||||||||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||  ||||| |||||||  |||    
T  27282311 agtatggttaagactttcgaattctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagttcaacgaccgattaacaaagt 27282410  T
Q  396 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27282411 aattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 27282453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 103 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 1936869 - 1936528
Alignment:
Q  103 gatatttggcaagtgaaccaaattcaatccaagtaataaa-aattcgtttctacgaggattgtatttaaattctacgtagcaattttattattaaaaagg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||| || | ||   |  |||| |||||| | ||||||| |||| ||| || |    
T  1936869 gatatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaatgaataattcatttccacaatgaccattgttaacttctacttggcaatttcattagtaataacg 1936770  T
Q  202 atgtataaaatttatattggt-gccctaggcagttgagttgatt-ttgtaacataaactga-ttaaaaacaaagaaagattggtttttagaagattg--- 295  Q
    |||||| ||||| | || ||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    |||  |||||||| |||| |||        
T  1936769 atgtattaaattca-atgggttgacctaggcagttgagttgattgttgtatcataaactgaattaaaaacggtaaaattttggtttt-agaaaattagag 1936672  T
Q  296 ---agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaactt 392  Q
       |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||      
T  1936671 agaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatctagcttcacgaaagattaacaa 1936572  T
Q  393 agtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagt 436  Q
    ||||| |||| | ||||||||||  || | ||||||||||||||    
T  1936571 agtaactctaccaaatctcttgatttatagttctccccgcaagt 1936528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 298 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 21153295 - 21153155
Alignment:
Q  298 tatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaa 397  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||| | ||| | |||||||||||||| || | ||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||  |||||    
T  21153295 tatggttaagaccttcgaatcctccgatgctcttaaatggtaatttgcacccccaattcaatcaatgttcatttagtttaacgacagattaacacagtaa 21153196  T
Q  398 ttctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21153195 ttctactcaatctcttgacctagaattctctccgcaagtga 21153155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 219 - 430
Target Start/End: Original strand, 16190299 - 16190516
Alignment:
Q  219 tggtgccctaggcagttgagttgat-tttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagattga------gtatggttaagtcat 311  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| |      ||||||||||| | |    
T  16190299 tggtgccctaggaaattgagttgatgtttgtaacataaacgaattaaaaacaat-aaagattggtttt-agaaaattaaagagaagtatggttaagacct 16190396  T
Q  312 tcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaat-tctatccaatct 410  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||||||| || ||| |||||| ||||||  | |||| | || |||||||    
T  16190397 tcgaatcctccgaagttctcctatgataatttgcactcttaattcaagcaatgattatctagtttaacgacaaattaacaaaataatatatacccaatct 16190496  T
Q  411 cttgacctagaattctcccc 430  Q
    ||||||| | ||||||||||    
T  16190497 cttgacccataattctcccc 16190516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 311 - 438
Target Start/End: Original strand, 22456711 - 22456837
Alignment:
Q  311 ttcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaattctatccaatct 410  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |||||| || |||| ||||||||||| |  | || ||| |||||||| ||||  |||||||||| |||||||    
T  22456711 ttcgaatcctccgaagttctcctatggaaatttgtaccccta-ttcaatcaatgttcgtctagtttaacgacagactaacaaagtaattctacccaatct 22456809  T
Q  411 cttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22456810 cttgacctagaattctctccgcaagtga 22456837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 298 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 15297371 - 15297232
Alignment:
Q  298 tatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaa 397  Q
    |||| ||||| | |||||||| ||||| |||||   | |||||||||||| || | ||||||||||  | || || ||| |||||||||||||  |||||    
T  15297371 tatgattaagaccttcgaatcctccgatgttcttccacggtaatttgcaccccaa-ttcaatcaatattcatctagtttaacgacagattaacaaagtaa 15297273  T
Q  398 ttctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15297272 ttctacccaatctcttgacctagaattctctctgcaagtga 15297232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 378 - 438
Target Start/End: Original strand, 22453421 - 22453481
Alignment:
Q  378 acgacagattaacttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22453421 acgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctctccgcaagtga 22453481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 378 - 438
Target Start/End: Original strand, 23990374 - 23990434
Alignment:
Q  378 acgacagattaacttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23990374 acgacagattaacaaagtaattctacccaatcacttgacctagaattctccccgcaagtga 23990434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 49147924 - 49147825
Alignment:
Q  311 ttcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaattctatccaatct 410  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |||||| || |||| ||||||||||| |  | || ||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  49147924 ttcgaatcctccgaagttctcctatggaaatttgtaccccta-ttcaatcaatgttcgtctagtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatct 49147826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8435358 - 8435289
Alignment:
Q  221 gtgccctaggcagttgagttga-ttttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||  |||| |||||||||||||    
T  8435358 gtgccctaggcagttgagttgatttttgtaacataaacataataaaaacaataaaag-ttggtttttagaa 8435289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 401 - 438
Target Start/End: Original strand, 22104680 - 22104717
Alignment:
Q  401 tatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22104680 tatccaatctcttgacctagaattctccccgtaagtga 22104717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 18125145 - 18125078
Alignment:
Q  26 tagctcttggattggttcaatccttgaatggaagtgaaaagctagagaatattgcaatagaatatatt 93  Q
    |||| |||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  18125145 tagcccttggattagttcaaccccggaacggaagtgaaaaactagaggatattgcaagagaatatatt 18125078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Original strand, 23990262 - 23990322
Alignment:
Q  226 ctaggcagttgagttgatttt-gtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttt 285  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||  |||||| ||||||    
T  23990262 ctaggcagttgagttaatttttgtaacatatacggattaaaaacaataaaagataggtttt 23990322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 299 - 438
Target Start/End: Original strand, 7199 - 7338
Alignment:
Q  299 atggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagtaat 398  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||   |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7199 atggttaagtccttcgaatcctctgatactctcctatggtaatttgtactcctaattcaatcaatgattatttagtttcacgacagattaacttagtaat 7298  T
Q  399 tctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7299 tctattcaatctcttgacttagaattctccccgcaagtga 7338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 296 - 438
Target Start/End: Original strand, 2807 - 2949
Alignment:
Q  296 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 395  Q
    ||||| |||||| | || ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||    
T  2807 agtatcgttaagacctttgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatatagtttcacgaaagattaaggtagt 2906  T
Q  396 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2907 aattctaccaaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 2949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 299 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2591
Alignment:
Q  299 atggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagta-- 396  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||   |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  2732 atggttaagtccttcgaatcctctgatactctcctatggtaacttgcactcctaattcaatcaatgattatttagtttcacgacagattaacttagtaat 2633  T
Q  397 attctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 438  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2632 attctactcaatctcttgacctagaattctccccgcaagtga 2591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 296 - 437
Target Start/End: Original strand, 6014 - 6155
Alignment:
Q  296 agtatggttaagtcattcgaatcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatttaatttcacgacagattaacttagt 395  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||  | |    
T  6014 agtatggttaagaccttcgaatcctccgaggttctcctatggtaatttgcactactaattcaaacaatgattatctaggttcacgacagattaacacaat 6113  T
Q  396 aattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtg 437  Q
    || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6114 aactctacccaatctcttgatctagaattctccccgcaagtg 6155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 222 - 358
Target Start/End: Original strand, 133 - 273
Alignment:
Q  222 tgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagattg------agtatggttaagtcattcga 315  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||| |||| |||       |||||||||||| |||||||    
T  133 tgccctaggcagttgagttggtttt-taacataaacaaattaaaaacaataaaag-ttggttttaagaatattagagagaagtatggttaagacattcga 230  T
Q  316 atcttccgaagttctcatatggtaatttgcactcctagttcaa 358  Q
    ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  231 atcctccgaatttctcctatgataatttgcactcctaattcaa 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University