View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5490-Insertion-2 (Length: 1015)

Name: NF5490-Insertion-2
Description: NF5490
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5490-Insertion-2
NF5490-Insertion-2
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (8-1015)||(29271096-29272111)
chr8 (16-758)||(22023430-22024174)
chr8 (587-639)||(15038975-15039026)
chr8 (839-906)||(22023251-22023320)
[»] chr6 (83 HSPs)
chr6 (7-1015)||(27715756-27716772)
chr6 (7-1015)||(27608376-27609393)
chr6 (11-1015)||(27695851-27696862)
chr6 (176-818)||(27703642-27704281)
chr6 (11-818)||(27674834-27675644)
chr6 (353-1015)||(27680871-27681542)
chr6 (310-820)||(27590539-27591049)
chr6 (11-776)||(26804651-26805404)
chr6 (164-816)||(28794507-28795159)
chr6 (16-768)||(31286720-31287477)
chr6 (9-848)||(26648546-26649381)
chr6 (9-848)||(26754514-26755349)
chr6 (164-666)||(28788631-28789135)
chr6 (7-275)||(27681596-27681864)
chr6 (9-752)||(25547128-25547885)
chr6 (9-752)||(25513035-25513780)
chr6 (9-503)||(26145405-26145902)
chr6 (9-495)||(27601980-27602467)
chr6 (577-816)||(28788386-28788622)
chr6 (163-733)||(26058086-26058670)
chr6 (163-733)||(26078056-26078640)
chr6 (584-795)||(26625387-26625597)
chr6 (584-795)||(26731364-26731574)
chr6 (380-768)||(26863752-26864139)
chr6 (449-752)||(26658139-26658441)
chr6 (449-752)||(26764110-26764412)
chr6 (13-768)||(26886250-26887010)
chr6 (377-757)||(26825978-26826357)
chr6 (155-548)||(26979773-26980168)
chr6 (379-757)||(26850824-26851201)
chr6 (561-752)||(25485207-25485397)
chr6 (163-358)||(25485546-25485741)
chr6 (379-733)||(25076030-25076383)
chr6 (378-698)||(25581921-25582240)
chr6 (540-752)||(26145013-26145224)
chr6 (155-357)||(25076450-25076652)
chr6 (163-276)||(26658620-26658733)
chr6 (163-276)||(26764591-26764704)
chr6 (167-275)||(26826528-26826636)
chr6 (592-768)||(27529116-27529291)
chr6 (163-272)||(25582346-25582458)
chr6 (9-198)||(26952334-26952523)
chr6 (583-752)||(27602555-27602723)
chr6 (90-358)||(26625697-26625956)
chr6 (90-358)||(26731674-26731933)
chr6 (378-494)||(27662843-27662959)
chr6 (587-752)||(26637716-26637880)
chr6 (163-268)||(26638048-26638153)
chr6 (587-752)||(26743682-26743846)
chr6 (163-268)||(26744014-26744119)
chr6 (379-731)||(26951958-26952309)
chr6 (379-500)||(27425224-27425345)
chr6 (163-274)||(26961751-26961862)
chr6 (840-1014)||(26804377-26804559)
chr6 (380-736)||(26961287-26961642)
chr6 (212-275)||(26876213-26876276)
chr6 (9-127)||(27662630-27662748)
chr6 (378-482)||(25485410-25485514)
chr6 (11-127)||(27590386-27590502)
chr6 (9-64)||(25582557-25582612)
chr6 (9-64)||(26058769-26058824)
chr6 (9-64)||(26078739-26078794)
chr6 (449-500)||(27528973-27529024)
chr6 (9-125)||(26851299-26851415)
chr6 (592-776)||(27425437-27425620)
chr6 (978-1014)||(28788148-28788184)
chr6 (978-1014)||(28794269-28794305)
chr6 (16-126)||(25485778-25485888)
chr6 (16-66)||(25491406-25491456)
chr6 (840-1014)||(26648343-26648525)
chr6 (840-1014)||(26754311-26754493)
chr6 (845-1014)||(27675702-27675879)
chr6 (583-620)||(26145288-26145325)
chr6 (978-1014)||(27591246-27591282)
chr6 (979-1014)||(27425846-27425881)
chr6 (840-908)||(26657994-26658064)
chr6 (840-908)||(26763965-26764035)
chr6 (840-908)||(27704334-27704404)
chr6 (16-66)||(28795257-28795307)
chr6 (840-908)||(31286575-31286645)
chr6 (977-1014)||(26625134-26625171)
chr6 (977-1014)||(26731111-26731148)
chr6 (977-1014)||(31286463-31286500)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (7-941)||(15251-16189)
[»] scaffold0277 (4 HSPs)
scaffold0277 (163-795)||(2100-2735)
scaffold0277 (164-816)||(11064-11716)
scaffold0277 (978-1014)||(2956-2992)
scaffold0277 (978-1014)||(11919-11955)
[»] scaffold0419 (3 HSPs)
scaffold0419 (150-795)||(9651-10299)
scaffold0419 (978-1014)||(9394-9430)
scaffold0419 (16-66)||(10383-10433)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (11-842)||(265591-266418)
chr1 (379-768)||(28125321-28125709)
chr1 (379-768)||(28130352-28130747)
chr1 (380-686)||(26138160-26138465)
chr1 (977-1014)||(266590-266627)
chr1 (163-272)||(26138642-26138751)
[»] scaffold1870 (2 HSPs)
scaffold1870 (450-795)||(932-1277)
scaffold1870 (978-1014)||(675-711)
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (163-848)||(18728953-18729628)
chr4 (163-848)||(18677017-18677692)
chr4 (451-848)||(18721810-18722206)
chr4 (451-795)||(18697139-18697483)
chr4 (583-848)||(18653346-18653610)
chr4 (451-848)||(18687351-18687746)
chr4 (163-356)||(18726450-18726645)
chr4 (163-262)||(18721531-18721630)
chr4 (379-500)||(18076210-18076331)
chr4 (163-356)||(18682174-18682369)
chr4 (163-262)||(18687066-18687165)
chr4 (163-262)||(18696860-18696959)
chr4 (11-125)||(18686914-18687028)
chr4 (11-66)||(18652783-18652838)
chr4 (11-66)||(18676865-18676920)
chr4 (11-66)||(18696708-18696763)
chr4 (11-66)||(18721379-18721434)
chr4 (163-356)||(18652935-18653128)
chr4 (592-776)||(18075935-18076118)
chr4 (299-356)||(18721667-18721724)
chr4 (387-427)||(18682391-18682431)
chr4 (387-427)||(18726667-18726707)
chr4 (979-1014)||(18075674-18075709)
chr4 (16-66)||(18728806-18728856)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (385-752)||(17990853-17991219)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (379-500)||(62018-62139)
scaffold0003 (592-776)||(61743-61926)
scaffold0003 (979-1014)||(61482-61517)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 805; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 805; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 1015
Target Start/End: Original strand, 29271096 - 29272111
Alignment:
Q  8 tataaaacaacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatgattcacaatattcaacagaaagctcttttagatttggtggaatc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29271096 tataaaacaacaactaacctgactcattaacattcttttacttgaggaactcaatgattcacaatattcaacagaaagctcttttagatttggtggaatc 29271195  T
Q  108 cctctgatttccttaagagaagcgcagccactcacattaattttataaagatggagacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatg 207  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29271196 cctctaatttccttaagagaatggcagccactcatattaattttataaagatggagacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatg 29271295  T
Q  208 ataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattcgtctgagaggttgcactcttcgagagtaagctgtgtcacatttga 307  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| || ||||||||||| |||||||||||||     
T  29271296 ataagtctagatatgtcacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattcatctgagaagtcgcaatcgtcgagagtaagatgtgtcacatttgg 29271395  T
Q  308 gaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcattccaaatttcactgataactcatgaagttcactgagattttgaaatgaaaat 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29271396 gaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaagctcagcattccagctttcactgataactcatgaagttcactgagattttgaaatgaaaat 29271495  T
Q  408 ggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaaccactga 507  Q
    || |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29271496 ggaagttctgcaatgaaagtatgatgcaacaaaatattgtctatatttttcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactcacacaaccactga 29271595  T
Q  508 gattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaat 607  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29271596 gattcaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaatgtttgagctttttgcaagcatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaat 29271695  T
Q  608 cgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtattcaca 707  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29271696 cgaattgtgaa-ttgtagttaaattatcacaattttcaaacgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtattcaca 29271794  T
Q  708 tcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacacaagaaagaaacaataaataaactaaaaatcaaagactataatactttcatag 807  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29271795 tcggtccaatatcaagactttcatatcctgaaacttctgcataaacacaagaaagaaacaataaataaactaaaaatcaaagactataatactttcatag 29271894  T
Q  808 tgatttcttttcttgacggaaac-aaatcattgtgaagttatttcacttgccttgttt-aaatactagatgacagacacttcgat-aacatcctttccat 904  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29271895 tgatttcttttgttgacggaaacaaaatcattgtgaagttatttcacttgccttgtttaaaatactagatgacagacacttcgataaacatcctttccat 29271994  T
Q  905 ttc-atacactc-aacttcttggtaaatgcttgagacctccag-aaaatggccattttcg-agatagctg-tttgag-tttgtcatcttcttgaaggcct 998  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29271995 ttcaatacactcaaacttcttggtaaatgcttgagacctccagaaaaatggccattttcgaagataactgttttgagttttgtcatcttcttgaaggcct 29272094  T
Q  999 ttcctttcttgtctatc 1015  Q
    |||||||||||||||||    
T  29272095 ttcctttcttgtctatc 29272111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 22024174 - 22023430
Alignment:
Q  16 aacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatgattcacaatattcaacagaaagctcttttagatttggtggaatccctctgat 115  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||  || | |    ||||||||  ||  |||||||||||||||||||| ||    
T  22024174 aacaacaaacctgactcaataacattcttctacttgaggaactcaatgatttgcattctattgcagaaagcctttcaagatttggtggaatccctctaat 22024075  T
Q  116 ttccttaagagaagcgcagccactcacattaattttataaagatggagacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatgataagtct 215  Q
    ||||| || |||   ||||| |  || |||||      ||| | || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||   |||||||||    
T  22024074 ttcctcaacagatttgcagcgatccaaattaagaacccaaacaaggtgacattcattaaggcactcgggaagaattttgaaattgttattcgataagtct 22023975  T
Q  216 agatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattcgtctgagaggttgcac---tcttcgagagtaagctgtgtcacatttgagaaca 312  Q
    ||       | ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||  ||||||||||    |||  |||| |||||| |||||||||||  ||||    
T  22023974 agcgtaaccatattaacacaacacttgagaaatattgggaggcattcatcaaagaggttgcagcaatctcggagactaagctctgtcacatttggaaaca 22023875  T
Q  313 ctattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcattccaaatttcactgataactcatgaagttcactgagattttgaaatgaaaatggcag 412  Q
    |||| ||||| || |||||||||| ||||||||| || |  |||||| ||  |  |  |  |  || ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||     
T  22023874 ctatagaataaattttatcattatattttgggaaactgaatattccacatccccatagttgcg-ataaagtttactgagattttgaaaagaagatggcaa 22023776  T
Q  413 ttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaaccactgagattc 512  Q
    ||||| ||||||||||| || |||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||      ||| | |    
T  22023775 ttctcttatggaagtattatacaacgaaatatattctatatttttcatcttgcataataattttggaaaac--tcgagactcctacacttggagagttcc 22023678  T
Q  513 aattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaa---tcg 609  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||| | |  || |  |||||||||| |||| | ||  ||||||||||| || ||||||  |   |||    
T  22023677 aatttcttaagtgatgccaaacctaatggtggaaaacgctcgagattgctgcaaccatctgcattcaagatttcaagtttactttggtgtctgatcgtcg 22023578  T
Q  610 aattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtattcacatc 709  Q
    |||||| || ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||   | ||||  || || ||||||||      
T  22023577 aattgtcaa-ttgtaattaaattcttacaattttcaaacgataacttttctaaatttggaagacctgagacattacgtatataggtaaaatattcacaat 22023479  T
Q  710 ggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacacaag 758  Q
    |||   |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22023478 ggtatgacgtcaagactttcatattctggaacttctgcataaacacaag 22023430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 587 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 15039026 - 15038975
Alignment:
Q  587 aagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaa 639  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15039026 aagtttatttaggtatccagtcgaattgtgaa-ttgtaattaaattatcacaa 15038975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 839 - 906
Target Start/End: Complemental strand, 22023320 - 22023251
Alignment:
Q  839 gtgaagttatttcacttgccttg-tttaaatactagatgacagacacttcgat-aacatcctttccattt 906  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  22023320 gtgaagttatttcacttgccttgctcaaaatactagatgatagagactccgataaacatcctttccattt 22023251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 579; Significance: 0; HSPs: 83)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 579; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 1015
Target Start/End: Original strand, 27715756 - 27716772
Alignment:
Q  7 atataaaacaacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatgattcacaatattcaacagaaagctcttttagatttggtggaat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||   ||   ||  || |||||||||||||||||||||    
T  27715756 atataaaacaacaactaacctgactcattaatattcttttacttgaggaactcaatgattgacatccttgtgcattaatctcttttagatttggtggaat 27715855  T
Q  107 ccctctgatttccttaagagaagcgcagccactcacattaattttataaagatggagacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaat 206  Q
    |||||| ||||||| ||| ||  |||||   | ||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  27715856 ccctctaatttcctcaagggactcgcagtaccccacattaatttcaacaagatggtgacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaattgctatat 27715955  T
Q  207 gataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattcgtctgagaggttgcactcttcgagagtaagctgtgtcacatttg 306  Q
     |||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||    
T  27715956 aataagtttagagatgtcatattaacacaccacttgagaactcttcggagacattcatctgagaggttgcaatggtagagagtaagctgtgtcacatttg 27716055  T
Q  307 agaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcattccaaatttcactgataactcatgaagttcactgagattttgaaatgaaaa 406  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27716056 aaaacactattgaatacatcttatcattctgttttgggaacctcagcattccatatgtcactgataacttatgaagttcactaagattttgaaatgaaaa 27716155  T
Q  407 tggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaaccactg 506  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||  ||||    
T  27716156 tggcagttctcctatggaagtattacacaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactcttgagactcctgcaagaactg 27716255  T
Q  507 agattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaa 606  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27716256 agattcaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaatgttcgaccttattgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttattaaggtgtccaa 27716355  T
Q  607 tcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtattcac 706  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||    
T  27716356 tcgaattgtgaa-ttgtaattaaattataacatctttcaaacgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatatttac 27716454  T
Q  707 atcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacacaagaaagaaacaataaataaactaaaaatcaaagact-ataatactttcat 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27716455 atcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacacaagaaagaaacaataaataaactaaaaatcaaagactaatattactttcat 27716554  T
Q  806 agtgatttcttttcttgacggaaac-aaatcattgtgaagttatttcacttgccttgttt-aaatactagatgacagacacttcgat-aacatcctttcc 902  Q
    | |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27716555 actgattt-ttttgttgacggaaacaaaatcattgtgaagttatttcacttgccttgtttaaaatcctagatgacagacacttcgataaacatcctttcc 27716653  T
Q  903 atttc-atacactc-aacttcttggtaaatgcttgagacctccagaa-aatggccattttcga-gatagctg-tttgag-tttgtcatcttcttgaaggc 996  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||| | || ||||||||||  |||| ||||||||||||| | ||||  || ||| || ||||||||||||||||||||    
T  27716654 atttcaatacactcaaactgcttggaagatacttgagacctttagaacaatggccattttcaatgataagtgttttcagttttgtcatcttcttgaaggc 27716753  T
Q  997 ctttcctttcttgtctatc 1015  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27716754 ctttcctttcttgtctatc 27716772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 543; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 1015
Target Start/End: Original strand, 27608376 - 27609393
Alignment:
Q  7 atataaaacaacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatgattcacaatattcaacagaaagctcttttagatttggtggaat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |      ||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  27608376 atataaaacaacaactaacctgactcattaactttcttttacttgaggaactcaatgatttgcattcgcttgcagaaagccatttaagatttggtggaat 27608475  T
Q  107 ccctctgatttccttaagagaagcgcagccactcacattaattttataaagatggagacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaat 206  Q
    |||||| ||||||| ||| ||  ||||| | |||||| |||||  |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  27608476 ccctctaatttcctcaagggactcgcagtccctcacagtaattagaacaagatggtgacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaattgctatat 27608575  T
Q  207 gataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattcgtctgagaggttgcactcttcgagagtaagctgtgtcacatttg 306  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||| |||||    
T  27608576 gataagtctagacatgtcacattaacaaaccacttgagaagtattgggagacattcatctgagaggttgcaatccatgagagtaagctctgtcatatttg 27608675  T
Q  307 agaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcattccaaatttcactgataactcatgaagttcactgagattttgaaatgaaaa 406  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27608676 aaaacactattgaatacatcttatcattctgttttgggaacctcagcgttccatttgccactgataactcttgaagttcactgagattttgaaatgaaaa 27608775  T
Q  407 tggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaaccactg 506  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27608776 tggcagttctcttatggaagtactaatcaacaaaatattgtctatctttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaaccactg 27608875  T
Q  507 agattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaa 606  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27608876 agattcaatttcttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaacgttcgagctttctgcaaccatatgcacttaaccattcaagtttatttaggtgtccaa 27608975  T
Q  607 tcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtattcac 706  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||  |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27608976 tagaattgtgaa-ttgtaattaaattatcacaacatgtaaacgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcac 27609074  T
Q  707 atcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacacaagaaagaaac-aataaataaactaaaaatcaaagactataatactttcat 805  Q
    |   || |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  27609075 aatagttcaatgtcaagactttcatattctgaaacttctgcatacacacaaggaagaaacaaatcaataaattaaaactcaaagacaataatactttcat 27609174  T
Q  806 agtgatttcttttcttgacggaaac-aaatcattgtgaagttatttcacttgccttgttt-aaatactagatgacagacacttcgat-aacatcctttcc 902  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27609175 actgatttcttttgttgactgaaacaaaatcattgtgaagttatttcacttgccttgtttaaaatattagatgacagacacttcgataaacatcctttcc 27609274  T
Q  903 atttc-atacactc-aacttcttggtaaatgcttgagacctccag-aaaatggccattttcga-gatagctg-tttgag-tttgtcatcttcttgaaggc 996  Q
    ||||| |||||| | |||| ||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||  || ||| || ||||||||||||||||||||    
T  27609275 atttcaatacacgcaaactgcttggaagatacttcagacctccagaaaaatggccattttcaatgataagtgttttcagttttgtcatcttcttgaaggc 27609374  T
Q  997 ctttcctttcttgtctatc 1015  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27609375 ctttcctttcttgtctatc 27609393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 1015
Target Start/End: Original strand, 27695851 - 27696862
Alignment:
Q  11 aaaacaacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatgattcacaatattcaacagaaagctcttttagatttggtggaatccct 110  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||  || |  | | || | ||   |   ||||||||||||||||||    
T  27695851 aaaacaacaacaaacctgactcattaacattcttctacatgatgaactcaatgatttgcattcataagcatagagacttccaagatttggtggaatccct 27695950  T
Q  111 ctgatttccttaagagaagcgcagccactcacattaattttataaagatggagacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatgata 210  Q
    || ||||||| ||| ||   ||||   |||||| ||||||    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||    
T  27695951 ctaatttcctcaagggacttgcagtacctcacaataatttccacaagatggtgactttcactaaggcactctggaagaattttgaaatcgctatatgata 27696050  T
Q  211 agtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattcgtctgagaggttgcactcttcgagagtaagctgtgtcacatttgagaa 310  Q
    | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||   ||||| ||||| ||||| |||||| ||    
T  27696051 aatctagatatgtcatattaacacaccacttgagaagtattgggagacattcatctgagaggtagcaatcgaagagagaaagctttgtcatatttgaaaa 27696150  T
Q  311 cactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcattccaaatttcactgataactcatgaagttcactgagattttgaaatgaaaatggc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||  |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27696151 cactattgaatacatcttatcattatgttctgggaacctcaggattccatatgacactgtgaactcatcaagttcactgagattttgaaatgaaaatggc 27696250  T
Q  411 agttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaaccactgagat 510  Q
    |||| |||||||||| ||| |   |    ||| |  | ||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |   | |||  ||||||    
T  27696251 agttttcctatggaaatataaaatatatcaatctcttttatatgtgccatcttgcataataattctggaaaattttcgagacacgagccacccatgagat 27696350  T
Q  511 tcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcga 610  Q
    | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27696351 taagttccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaatgtttgagctttctgtaaccagttacacttaacctttcaagtttacttaggtgtccaatcga 27696450  T
Q  611 attgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtattcacatcg 710  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||       
T  27696451 attgtgaatt-gtaattaaattcttacaatgttcaaacgataacttttctaaatttgaaaggcttgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatc 27696549  T
Q  711 gtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacacaagaaagaaacaataaataaactaaaaatcaaagact-ataatactttcatagtg 809  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  27696550 gtccaatgtcaagattttcatattctggaacttctgcataaacacaagaaagaaacaataaataaactaaaaatcaaagactaatattactttcatactg 27696649  T
Q  810 atttcttttcttgacggaaacaaatcattgtgaagttatttcacttgccttgttt-aaatactagatgacagacacttcgat-aacatcctttccatttc 907  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27696650 atttcttttgttgacggaaacaaaata-actgaagttatttcacttgccttgtttaaaatactagttgacagacacttcgataaacatcccttccatttc 27696748  T
Q  908 -atacactc-aacttcttggtaaatgcttgagacctccag-aaaatggccattttcga-gatagctg-tttgag-tttgtcatcttcttgaaggcctttc 1001  Q
     |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27696749 aatacactcaaacttcttggtagatgcttgagaccttcagaaaaatggccattttcaatgataactgttttgagttttgtcatcttcttgaaggcctttc 27696848  T
Q  1002 ctttcttgtctatc 1015  Q
    ||||||||||||||    
T  27696849 ctttcttgtctatc 27696862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 176 - 818
Target Start/End: Original strand, 27703642 - 27704281
Alignment:
Q  176 gcactcaggaagaattttgaaatagttaaatgataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattcgtctgagaggttg 275  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |   |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27703642 gcactcaggaagaattttgaaattgttgtacattaagtctagagatgtcatattaacacaccacttgagaagtattgggagacattcatctgagaggttg 27703741  T
Q  276 cactcttcgagagtaagctgtgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcattccaaatttcactgataact 375  Q
    || |    ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||    
T  27703742 caatggcagagagtaagttgtgtcacatttaaaaacactattgaatacatcttatcattctgttttgggaacctcagcattccatttaccactgataact 27703841  T
Q  376 catgaagttcactgagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattc 475  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27703842 catcaagttcactgagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatagaagtatgctgcaaccaaatattatctatatttgtcatcttgcataataattc 27703941  T
Q  476 tggaaaactatcgagactctcacaaccactgagattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagctctctgcaaccatatgca 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||| |||||    
T  27703942 tggaaaactatcgagactctcacaataacggagattcaattctttaagagatgctaaccctaaaggtggaaaacgtttgaactccctgcaaccaaatgca 27704041  T
Q  576 cttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcct 675  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27704042 cttaacctttcaagtttatttaggtggccaatcgaattgtgaa-tcgtaattaaattatcacaatattcaaacgataacttttctaaatttgaaaggcct 27704140  T
Q  676 gagacatcggggatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacac-aagaaagaaacaataaata 774  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  27704141 gagacatcgggtatatgtgttaaatatttacaatggtccaatgtcaagactgtcatatccgggaacttctgcataaacacaaaggaagaaactataaata 27704240  T
Q  775 aactaaaaatcaaagactataatactttcatagtgatttctttt 818  Q
    || |||||| |||| |||   |||||||||||||||||||||||    
T  27704241 aattaaaaagcaaacact---atactttcatagtgatttctttt 27704281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 818
Target Start/End: Original strand, 27674834 - 27675644
Alignment:
Q  11 aaaacaacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatgattcacaatattcaacagaaagctcttttagatttggtggaatccct 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |  |   | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27674834 aaaacaacaactaacctgactcattaacattcttctacatgaggaactcaatgatttacattgatatgcggaaagctctttaagatttggtggaatccct 27674933  T
Q  111 ctgatttccttaagagaagcgcagccactcacattaattttataaagatggagacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatgata 210  Q
    || ||||||| |||||||| ||||  |  || |  ||  |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  27674934 ctaatttcctcaagagaagagcagtaatgcaaaccaagatgcttaagatggtgacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaattgttatgtgata 27675033  T
Q  211 agtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattcgtctgagaggttgcactcttcgagagtaagctgtgtcacatttgagaa 310  Q
    |||||||  ||   ||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||| | ||   |||||| |||||| ||||| ||    
T  27675034 agtctagcaattccacattaacacaccacttaagaactatttggagatattcatctgagaggttgcactcgtagattctaagctttgtcacctttgaaaa 27675133  T
Q  311 cactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcattccaaatttc---actgataactcatgaagttcactgagattttgaaatgaaaat 407  Q
    |||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  || |   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27675134 cactttagaatacattctatcattatgttttgggaacctcagcattctagcttcccgtactgataactcatcaagttcactgagattttgaaatgaagat 27675233  T
Q  408 ggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaat-attgtct---atatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaacca 503  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||  | | |||| | | |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| |    
T  27675234 ggcaattctcctatggatatattata-atctaaatcaatctctttgatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactcttgagactcgaacaacaa 27675332  T
Q  504 ctgagattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtc 603  Q
    | || || || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27675333 cagatatccagttccttaagagatgccaaccctaaaggtggaaaacgtttgagctttctgcaaccaaatgcacttaacctttcaagtttgtttaggtgtc 27675432  T
Q  604 caatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtatt 703  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27675433 caatcgaattgtgaa-ttgtaattaaattataacaacattcaaacgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatatt 27675531  T
Q  704 cacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacac-aagaaagaaacaataaataaactaaaaatcaaagactataatacttt 802  Q
    ||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||| |||| |||   |||||||    
T  27675532 cacaatggtccaatatcaagattgtcatatcctggaacttctgcataaacacaaaggaagaaactataaataaattaaaaagcaaacact---atacttt 27675628  T
Q  803 catagtgatttctttt 818  Q
    ||||||||||||||||    
T  27675629 catagtgatttctttt 27675644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 27681542 - 27680871
Alignment:
Q  353 cattccaaatttcactgataactcatgaagttcactgagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctata 452  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |    ||| |  | ||||    
T  27681542 cattccagatgtcactgttaactcatgaagttcactgagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagtattagatatatcaatctcttttata 27681443  T
Q  453 tttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaaccactgagattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtt 552  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||  ||  |||  |||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  27681442 tgtgccatcttgcataataattctggaaaattatcaagacactcacactcatagagtatcaatttcttaagagatgccaaccctaaaggtcgaaaatgtt 27681343  T
Q  553 taagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgata 652  Q
      |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |  ||| ||||    
T  27681342 cgagctttctgcaaccatatgcacttaaccattcaagtttatttaggtgtccaatagaattgtgaatt-gtaattaaattatcacaacatgtaaacgata 27681244  T
Q  653 acttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaa 752  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  27681243 acttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatagtccaatgtcaagactttcatattctgaaacttctgcataca 27681144  T
Q  753 cacaagaaagaaac-aataaataaactaaaaatcaaagactataatactttcatagtgatttcttttcttgacggaaac-aaatcattgtgaagttattt 850  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27681143 cacaaggaagaaacaaatcaataaattaaaaatcaaagacaataatactttcatactgatttcttttgttgactgaaacaaaatcattgtgaagttattt 27681044  T
Q  851 cacttgccttgttt-aaatactagatgacagacacttcgat-aacatcctttccatttc-atacactc-aacttcttggtaaatgcttgagacctccag- 945  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||| | || ||||||||||||||     
T  27681043 cacttgccttgtttaaaatactagatgacagacacttcgataaacatcctttccatttcaatacacgcaaactgcttggaagatacttgagacctccaga 27680944  T
Q  946 aaaatggccattttcga-gatagctg-tttgag-tttgtcatcttcttgaaggcctttcctttcttgtctatc 1015  Q
    |||| |||||||||| | ||||  || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27680943 aaaaaggccattttcaatgataagtgttttcagttttgtcatcttcttgaaggcctttcctttcttgtctatc 27680871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 310 - 820
Target Start/End: Original strand, 27590539 - 27591049
Alignment:
Q  310 acactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcattccaaatttc---actgataactcatgaagttcactgagattttgaaatgaaaa 406  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  27590539 acactatagaatacattctatcattatgttttgggaacctcagcattccaaattcccgtactgataactcatcaagttcactgagattttgaaatgaaga 27590638  T
Q  407 tggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaaccactg 506  Q
    ||||| ||||| |||||||||||     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| | ||||| |       
T  27590639 tggcaattctcgtatggaagtataccaaaaccaaatcttgtctatatttgtcatcttgcataataattttggaaaacttttgagactataacaacaagaa 27590738  T
Q  507 agattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaa 606  Q
    || |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27590739 agcttcaattctttaagagatgccaaccctaaaggtggaaaacgtttgagcgtcctgcaaccaaatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaa 27590838  T
Q  607 tcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtattcac 706  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27590839 tcgaattgtgaatt-gtaattaaattcttacaatattcaaatgataacttttctaaatttgaaagccctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcac 27590937  T
Q  707 atcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacac-aagaaagaaacaataaataaactaaaaatcaaagactataatactttcat 805  Q
    |  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||| |||| |||   ||||||||||    
T  27590938 aatggtccaatatcaagattgtcatatcctggaacttctgcataaacacaaaggaagaaactataaataaattaaaaagcaaacact---atactttcat 27591034  T
Q  806 agtgatttcttttct 820  Q
    |||||||||||||||    
T  27591035 agtgatttcttttct 27591049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 11 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 26805404 - 26804651
Alignment:
Q  11 aaaacaacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatgattcacaatattcaacagaaagctcttttagatttggtggaatccct 110  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||   |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26805404 aaaacaacaacaaacctgactcattaacattcttctacttgatgaactcaatgatttacatccttctgcagaaagctcttttagattcggtggaatccct 26805305  T
Q  111 ctgatttccttaagagaagcgcagccactcacattaattttataaagatggagacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatgata 210  Q
    || ||||||| |||||| | ||||  |  || || ||  |  | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   |||||    
T  26805304 ctaatttcctcaagagatgtgcagtaagacaaatcaagatgcttaagatggtgacattcactaagacactcaggaagaattttgaaattgttgtttgata 26805205  T
Q  211 agtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattcgtctgagaggttgcactcttcgagagtaagctgtgtcacatttgagaa 310  Q
    | ||||| | |   ||||||||||||||||| |||| |||| ||||  |||| |||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||| ||    
T  26805204 actctagttcttcaacattaacacaccacttaagaactatttggaggtattcatctgagaggttgcaatctttgagactaagctctgtcacatttgaaaa 26805105  T
Q  311 cactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcattccaaatttc---actgataactcatgaagttcactgagattttgaaatgaaaat 407  Q
    || ||| |||||||| ||||||||               |||||||||| ||| |   ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  26805104 cattatagaatacattttatcatt---------------cagcattccacattcccgtactgataactcatcaagttcactcagattttgaaatgaagat 26805020  T
Q  408 ggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaaccactga 507  Q
     ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||  |    
T  26805019 agcaattctcctatgggagtataattcaaccaaatacagtctatgtttgtcatctcgcataataattttggaaaactcttgagactatcacaacaacata 26804920  T
Q  508 gattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaat 607  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804919 gattcaattctttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaacgttcaagcttgctgcaaccaaatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaat 26804820  T
Q  608 cgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtattca-c 706  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||| || ||| || |||||||||||||||  ||| ||||||| ||| || || || ||||| ||||||      
T  26804819 cgaattgtcaa-ttgtaattaaattctcacaatatttaaacgagaacttttctaaattttgaagacctgagagatcaggtatgtgggttaaatattcatt 26804721  T
Q  707 atcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacacaagaaagaaac-aataaataaa 776  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26804720 atc-gtccaatgtcaagactttcatattttggaaattctgcataaacacaaggaagaaacaaataaataaa 26804651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 164 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 28795159 - 28794507
Alignment:
Q  164 acattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatgataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattcg 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||  |||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  28795159 acattcactaaggcactcaggaataaatttgaaattgttccatgataagtctagcaatttcacattaacacaccacttgagaaatattgggagacattca 28795060  T
Q  264 tctgagaggttgcactcttcgagagtaagctgtgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcattccaaatt 363  Q
    |||||||||||||| ||   |||| |||||| | ||| |||||| |||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  28795059 tctgagaggttgcagtcgctgagactaagctttctcaaatttgaaaacactatagaatacatttgatcattctgttttgggaacctcatcattccacatt 28794960  T
Q  364 tcact---gataactcatgaagttcactgagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcat 460  Q
     ||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |   |  | ||| |  |  |||||||||||    
T  28794959 ccactactgataactcatcaagttcattgagattttgaaatgaagatggcaattctcctatggaagtataagatataccaatctctttgatatttgtcat 28794860  T
Q  461 cttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaaccactgagattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagctct 560  Q
    |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||  |  ||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||  ||||      
T  28794859 cttgcataataattttggaaaattcttgagactctcacaaaaagagagatccaattcgttaagagatgccaaccctaaaggtggaaaacgttcgagcttg 28794760  T
Q  561 ctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttct 660  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||  ||||| | |||| || ||||||||     
T  28794759 ctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaattgaattgtgaa-ttgtaattaatttacgacaatatgcaaacgagaacttttcc 28794661  T
Q  661 aaatttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacacaagaa 760  Q
    ||||||  ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||   ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  28794660 aaattttgaagacctgagacatcaggtatatgggttaaatattcacacttgtccaatgtcaagactttcatgttctggaacttctgcataaacacaagga 28794561  T
Q  761 agaaac-aataaataaactaaaaatcaaagactataatactttcatagtgatttctt 816  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||| |||   ||||| |||||||||||||||    
T  28794560 agaaacaaataaataaattaaaaattaaacact---atactatcatagtgatttctt 28794507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 31287477 - 31286720
Alignment:
Q  16 aacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatgattcacaatattcaacagaaagctcttttagatttggtggaatccctctgat 115  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |  | | | ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  31287477 aacaacaaacctgactcgttaacattcttctacttgaggaactcaacgattcacatttataagcggaaagctcttcaagatttggtggaatccctctaat 31287378  T
Q  116 ttccttaagagaagcgcagccactcacatt-aattttataaagatggagacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaat---agttaaatgataa 211  Q
    ||||| ||||||   ||| | | ||  ||| ||   | |  | | || |||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||   |||||   |||||    
T  31287377 ttcctcaagagacttgcaacaa-tcgaattcaaagatcttcataaggtgacattcattaagacactcgggaagaatattgaaattgaagttatgcgataa 31287279  T
Q  212 gtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattcgtctgagaggttgcactcttcgagagtaagctgtgtcacatttgagaac 311  Q
    ||||||   | | ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  31287278 gtctagccttttcacattaacaaaccacttgagaagtattggtaaacattcatctgagaggttgcaattttggagactaagctgtgtcacatttgaaaac 31287179  T
Q  312 actattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcattccaaatttcact---gataactcatgaagttcactgagattttgaaatgaaaatg 408  Q
    ||||| ||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||   ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31287178 actatagaattaattttgtcattatgttttgggaacctcagcattccacatctctctattgatatgtcattaagttcactgagattttgaaatgaagatg 31287079  T
Q  409 gcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaaccactgag 508  Q
    ||| ||||||||||||||||| |   ||| |||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |  |||    
T  31287078 gcaattctcctatggaagtattaacaaacaaaatacgttttatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactattgagactcacacaaaaagagag 31286979  T
Q  509 attcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatc 608  Q
     | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | || ||||  |||||||||  ||||||||    ||||||||||||| |||| |||||     
T  31286978 ttccaattccttaagagatgccaaacctaagggtggaaaacgcttgagcttgctgcaaccaattgcacttatgaattcaagtttattttggtggccaatt 31286879  T
Q  609 gaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtattcacat 708  Q
    |||| || |||| |||||||||||   ||||  || |||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||     
T  31286878 gaatcgtcaatt-gtaattaaatttctacaaaatttaaatgagaacttctctatatttgaaagacctgagacatcaggtatatgtgttaaatattcacaa 31286780  T
Q  709 cggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacacaagaaagaaacaa 768  Q
      ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  31286779 tcgtccaatgtcaagactttcatattctggaacttctgcgtaaacacaaggaagaaacaa 31286720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 9 - 848
Target Start/End: Complemental strand, 26649381 - 26648546
Alignment:
Q  9 ataaaacaacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatgattcacaatattcaa--cagaaagctcttttagatttggtggaat 106  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  26649381 ataaaacaacaacgaacctgactcaataacattcttctacttgaggaactcaatgattcacatc--tcaatgcagaaagccatttaagatttggtggaat 26649284  T
Q  107 ccctctgatttccttaagagaagcgcagccactcacattaattttataaagatggagacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaat 206  Q
    ||| || ||||||| |||||| |  |||||   |||  |||||| |  ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||   |    
T  26649283 ccccctaatttcctcaagagaggtacagccgtccacgataatttcaacaagatggtgacattcactaaggaactcgggaagaattttgaaattgttcttt 26649184  T
Q  207 gataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattcgtctgagaggttgcactcttcgagagtaagctgtgtcacatttg 306  Q
    | |||| |||||| | | | |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| ||  |||||||||| | |||||||  ||| ||   ||||||||    
T  26649183 gctaagactagatttttcagattaacacaccatttgagaattattaggagactttcatcaaagaggttgcaattttcgagaacaagatgatccacatttg 26649084  T
Q  307 agaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcattccaaatttcactgataactcatgaagttcactgagattttgaaatgaaaa 406  Q
    | |||||||  ||||| || ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |   ||  |||| | |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  26649083 aaaacactacagaataaattttatcattaggttttgggaacctaaacattccaaatatg--tgtaaact-acgaagttcactgagattatgaaatgaaga 26648987  T
Q  407 tggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaaccactg 506  Q
    ||||| ||||||||| |||||   |  |||  ||||||  | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||    
T  26648986 tggcaattctcctattgaagttctagacaaaaaaatatgttttatatttctcattttgcataataattctggaaaattctttagactctcacaaccactg 26648887  T
Q  507 agattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaa 606  Q
    || | ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | || ||||  ||||||| |  ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  26648886 agttccaattgcttaagagatgtcaaccctaagggtggaaaacgcttgagcttgctgcaacaacctgcatctaagctttcaagtttatttaggtgcccaa 26648787  T
Q  607 tcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtattcac 706  Q
    | || | || |||| ||||||||||| | ||||     |||||| |||||||||||||||  |||  |||||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  26648786 ttgagtcgtcaatt-gtaattaaattcttacaaaacataaatgagaacttttctaaattttgaagatctgagacatcaggtatatgagttaaatattcac 26648688  T
Q  707 atcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacacaagaaagaaac-aataaataaactaaaaatcaaagactataatactttcat 805  Q
    | | || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||| |||   ||||| ||||    
T  26648687 aacagttcaatgtcaagactttcatattctggaacttctgcataaacacaaggaacaaacaaataaataaattaaaaatcaaacact---atactctcat 26648591  T
Q  806 agtgattt-cttttcttgacggaaac-aaatcattgtgaagttat 848  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  26648590 agtgatttgtttttgttgacggaaacaaaatcattgtgaatttat 26648546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 9 - 848
Target Start/End: Complemental strand, 26755349 - 26754514
Alignment:
Q  9 ataaaacaacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatgattcacaatattcaa--cagaaagctcttttagatttggtggaat 106  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  26755349 ataaaacaacaacgaacctgactcaataacattcttctacttgaggaactcaatgattcacatc--tcaatgcagaaagccatttaagatttggtggaat 26755252  T
Q  107 ccctctgatttccttaagagaagcgcagccactcacattaattttataaagatggagacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaat 206  Q
    ||| || ||||||| |||||| |  |||||   |||  |||||| |  ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||   |    
T  26755251 ccccctaatttcctcaagagaggtacagccgtccacgataatttcaacaagatggtgacattcactaaggaactcgggaagaattttgaaattgttcttt 26755152  T
Q  207 gataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattcgtctgagaggttgcactcttcgagagtaagctgtgtcacatttg 306  Q
    | |||| |||||| | | | |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| ||  |||||||||| | |||||||  ||| ||   ||||||||    
T  26755151 gctaagactagatttttcagattaacacaccatttgagaattattaggagactttcatcaaagaggttgcaattttcgagaacaagatgatccacatttg 26755052  T
Q  307 agaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcattccaaatttcactgataactcatgaagttcactgagattttgaaatgaaaa 406  Q
    | |||||||  ||||| || ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |   ||  |||| | |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  26755051 aaaacactacagaataaattttatcattaggttttgggaacctaaacattccaaatatg--tgtaaact-acgaagttcactgagattatgaaatgaaga 26754955  T
Q  407 tggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaaccactg 506  Q
    ||||| ||||||||| |||||   |  |||  ||||||  | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||    
T  26754954 tggcaattctcctattgaagttctagacaaaaaaatatgttttatatttctcattttgcataataattctggaaaattctttagactctcacaaccactg 26754855  T
Q  507 agattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaa 606  Q
    || | ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | || ||||  ||||||| |  ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  26754854 agttccaattgcttaagagatgtcaaccctaagggtggaaaacgcttgagcttgctgcaacaacctgcatctaagctttcaagtttatttaggtgcccaa 26754755  T
Q  607 tcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtattcac 706  Q
    | || | || |||| ||||||||||| | ||||     |||||| |||||||||||||||  |||  |||||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  26754754 ttgagtcgtcaatt-gtaattaaattcttacaaaacataaatgagaacttttctaaattttgaagatctgagacatcaggtatatgagttaaatattcac 26754656  T
Q  707 atcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacacaagaaagaaac-aataaataaactaaaaatcaaagactataatactttcat 805  Q
    | | || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||| |||   ||||| ||||    
T  26754655 aacagttcaatgtcaagactttcatattctggaacttctgcataaacacaaggaacaaacaaataaataaattaaaaatcaaacact---atactctcat 26754559  T
Q  806 agtgattt-cttttcttgacggaaac-aaatcattgtgaagttat 848  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  26754558 agtgatttgtttttgttgacggaaacaaaatcattgtgaatttat 26754514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 164 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 28789135 - 28788631
Alignment:
Q  164 acattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatgataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattcg 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  28789135 acattcactaaggcactcaggaataagtttgaaattgttccatgataagtctagatatgtcacataaacacaccacttgagaaatattgggagacattca 28789036  T
Q  264 tctgagaggttgcactcttcgagagtaagctgtgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcattccaaatt 363  Q
    |||||||| ||||| |  | ||||  ||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  28789035 tctgagagcttgcaattattgagaacaagatttgtcacttttgaaaacactatagaatacatttgatcattctgttttgggaacctcagcattccagctt 28788936  T
Q  364 tc---actgataactcatgaagttcactgagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcat 460  Q
     |   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| || |  |||||||||||    
T  28788935 cccgtactgttaactcatgaagttcactgagattttgaaatgaagatggcaattctcttatggaagtattctgcaaccaaatctttttaatatttgtcat 28788836  T
Q  461 cttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaaccactgagattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagctct 560  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||  |  |||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||  ||  || |      
T  28788835 cttgcataataattttggaaaactcttgagactcccacaatgagagagattcaattcattaagggatgccaaccctaaaggtggaaaactttcgagtttg 28788736  T
Q  561 ctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttct 660  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||  ||||| | |||| || ||||||||     
T  28788735 ctgcaatcaaatgcatttaacctttcaagtttatttaggtgtccaattgaattgtgaa-ttgtaattaatttacgacaatatgcaaacgagaacttttcc 28788637  T
Q  661 aaattt 666  Q
    ||||||    
T  28788636 aaattt 28788631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 27681864 - 27681596
Alignment:
Q  7 atataaaacaacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatgattcacaatattcaacagaaagctcttttagatttggtggaat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  | || |||||||||||||||||||||||||    
T  27681864 atataaaacaacaactaacctgactcattaacattcttctacttgaggaactcaatgatttacaatatctagcacaaagctcttttagatttggtggaat 27681765  T
Q  107 ccctctgatttccttaagagaagcgcagccactcacattaattttataaagatggagacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaat 206  Q
    |||||| ||||||| ||||||  ||||||   |||||||||||| |  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  27681764 ccctctaatttcctcaagagactcgcagcacatcacattaatttcaacaagatggtgacattcacgaaggcactcaggaagaattttgaaattgctaaat 27681665  T
Q  207 gataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattcgtctgagaggttg 275  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27681664 gataagtctagatgtgtcatattaacacaccacttgagaactattgggagacattcatctgagaggttg 27681596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 25547885 - 25547128
Alignment:
Q  9 ataaaacaacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatgattcacaatattcaacagaaagctcttttagatttggtggaatcc 108  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |  ||  || |||||  ||  ||||||||||||||||    
T  25547885 ataaaaaaacaacaaacctgactcattaacattcttatacttgaggaactcaatgaataacactcgtctgcaaaaagcctttcaagatttggtggaatcc 25547786  T
Q  109 ctctgatttccttaagagaagcgcagccactcacattaattttataaagatggagacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaata---gttaaa 205  Q
    |||| ||||||| |||| ||  ||||    ||| || || ||  | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    |||       
T  25547785 ctctaatttcctcaagaaaattgcagttcttcaaataaagttgtttaagatggtgacattcgctaaggcactcaggaagaattgtgaaattatcgttctc 25547686  T
Q  206 tgataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattcgtctgagaggttgcactcttcgagagtaagctgtgtcacattt 305  Q
     |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   | |  |||   ||  |||  |||||||    
T  25547685 cgataagtctagaaatgtcacattaacaaaccacttgagaagtattgggagacattcatctgagaggttgttgtttctgaggtcaacatgttccacattt 25547586  T
Q  306 gagaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcattc--caaatttc----------actgataactcatgaagttcactgagat 393  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||  |  |  ||          | || ||||   ||||||||||||| ||    
T  25547585 gaaaacactattgaattcattttatcattatattttgggaacctgagctttccccctaggtcgtatccagatattgttaaccgttgaagttcactgaaat 25547486  T
Q  394 tttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagact 493  Q
    ||||||||||| | |||| |||| |||| ||||||| ||  | |   ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||    
T  25547485 tttgaaatgaatacggcaattcttctatagaagtatcatatatcttgatatcttttatatttgtcatcttgcataataattctggaaaattcttgagact 25547386  T
Q  494 ctcacaaccactgagattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagttta 593  Q
    |||||||  |  ||  |  |||| ||||||||| | ||    ||| ||||| ||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  25547385 ctcacaataagagatttcaaatttcttaagagagggcagctgtaagggtgggaaatgctcaagctctaagcaaccatatgcatttaagatttcaagttta 25547286  T
Q  594 tttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatatgt 693  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| | |  ||| ||  ||||||||| ||||  ||| || |||||||| || |||||     
T  25547285 tttaggtgtccaatcgaactgtgaa-ttgtaattaaactatgacattctcgaaaggagcacttttctagatttcgaagacccgagacatcaggtatatgg 25547187  T
Q  694 gttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaa 752  Q
    ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||    
T  25547186 gttaaatattcacaaagatccaatatcaagactttcatatagttgaactcctgcataaa 25547128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 25513780 - 25513035
Alignment:
Q  9 ataaaacaacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatgattcacaatattcaacagaaagctcttttagatttggtggaatcc 108  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |  ||  || |||||  ||  ||||||||||||||||    
T  25513780 ataaaaaaacaacaaacctgactcattaacattcttatacttgaggaactcaatgaataacactcgtctgcaaaaagcctttcaagatttggtggaatcc 25513681  T
Q  109 ctctgatttccttaagagaagcgcagccactcacattaattttataaagatggagacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatga 208  Q
    |||| ||||||| |||||    |||     ||| || ||  |  | |||| || || |||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||    ||    
T  25513680 ctctaatttcctcaagagccttgcaaaacttcaaataaagatgcttaagacggtgatattcaccaaggcactcgggaagaattgtgaaattgttctccga 25513581  T
Q  209 taagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattcgtctgagaggttgcactcttcgagagtaagctgtgtcacatttgag 308  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||   |||   ||| |||  |||||||||     
T  25513580 taagtctagaaatgtcacattaacaaaccacttgagaagtattgggagacattcatctgagacgttgttgtcactgaggtcaagatgttccacatttgaa 25513481  T
Q  309 aacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcattccaaatttc---actgataactcatgaagttcactgagattttgaaatgaaa 405  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||   |      | || ||||   | ||||||||||| |||||||||||||     
T  25513480 aacactattgaattcattttatcattatattttgggaacctgagctttcctcctccagatattgttaaccgttaaagttcactgaaattttgaaatgaag 25513381  T
Q  406 atggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaaccact 505  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||  | |  |||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||      
T  25513380 atggcaattcttctatggaagtatcatatatctcaatatcttttatatttgtcatcttacataataattctggaaaattcttgagactcttacacccaga 25513281  T
Q  506 gagattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtcca 605  Q
    ||  |  |||| ||||||||| | ||    ||| ||||| ||| | | | | |  ||||||||| ||| | ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25513280 gatttcaaatttcttaagagagggcagctgtaagggtgggaaaagctcaggtttgctgcaaccacatgtatttaagatttcaagtttatttaggtgtcca 25513181  T
Q  606 atcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtattca 705  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |  |||| | |||||||||| ||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  25513180 atcgaaatgtgaatt-gtaattaaactatcacaatatcgaaataagaacttttctagatttggaagacccgagacatcgggtatatgggttaaatattca 25513082  T
Q  706 catcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaa 752  Q
    ||    | |||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||||    
T  25513081 caaaaattcaatgtcaagactttcatatagttgaactcctgcataaa 25513035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 26145902 - 26145405
Alignment:
Q  9 ataaaacaacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatgattcacaatattcaacagaaagctcttttagatttggtggaatcc 108  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |  ||  || |||||  ||  ||||||||||||||||    
T  26145902 ataaaaaaacaacaaacctgactcattaacattcttatacttgaggaactcaatgaataacactcgtctgcacaaagcctttcaagatttggtggaatcc 26145803  T
Q  109 ctctgatttccttaagagaagcgcagccactcacattaattttataaagatggagacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatga 208  Q
    |||| ||||||| |||||   ||||     ||| || ||  |  | |||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    ||    
T  26145802 ctctaatttcctcaagagcctcgcaaaacttcaaataaagatgcttaagacggtgacattcaccaaggcactcgggaagaattgtgaaatagttctccga 26145703  T
Q  209 taagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattcgtctgagaggttgcactcttcgagagtaagctgtgtcacatttgag 308  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||  |||   ||  |||  |||||||||     
T  26145702 taagtctagaaatgtcacattaacaaaccacttgagaagtattgggagacattcatccgagaggttgttgtctctgaggtcaacatgttccacatttgaa 26145603  T
Q  309 aacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcattccaaat---ttcactgataactcatgaagttcactgagattttgaaatgaaa 405  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||||   |      | || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||     
T  26145602 aacactattgaattcattgtatcattatattttgggaacctgagctttccccctccagatattgttaaccgttgaagttcactgaaattttgaaatgaat 26145503  T
Q  406 atggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaacca 503  Q
    || ||| |||| |||||||||||| ||  | |  |||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  26145502 atcgcaattcttctatggaagtatcatatatctcaatatcttttatatttgtcatcttacataataattctggaaaattcttgagactctcacaacca 26145405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 495
Target Start/End: Original strand, 27601980 - 27602467
Alignment:
Q  9 ataaaacaacaa-ctaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatgattcacaatattcaaca-gaaagctcttttagatttggtggaat 106  Q
    |||||||||||| | |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |   || ||||  | ||| |||||||||||||     
T  27601980 ataaaacaacaaacaaacctgactcaataacattcttctacttgaggaactcaatgattcacagtcctttgcatgaaatat-tttaagatttggtggaaa 27602078  T
Q  107 ccctctgatttccttaagagaagcgcagccactcacattaattttataaagatggagacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaat 206  Q
    |||||| ||||||| |||| |   |||||||  ||||| ||| || | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |        
T  27602079 ccctctaatttcctcaagaaacttgcagccatccacataaatgtttttaagaaggtgacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaattgctctca 27602178  T
Q  207 gataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattcgtctgagaggttgcactcttcgagagtaagctgtgtcacatttg 306  Q
    |||||| |||||| |   ||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| || ||| |   |||| ||  |||||||||    
T  27602179 gataagactagattttccacattaacacaccacattagaagtattcggagaaattcatctgagaggttgctcttttcaattctaagatggttcacatttg 27602278  T
Q  307 agaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcattccaaat---ttcactgataactcatgaagttcactgagattttgaaatga 403  Q
    | || ||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||   |  | |  |||   || |||||||||||||||||||| |||    
T  27602279 aaaatactatagaattcattttatcattttgttttgggaacctgagcattccacattgatatatttgtaagcgatcaagttcactgagattttgaattga 27602378  T
Q  404 aaatggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactct 495  Q
    |||||| | ||   | ||| |||| | || |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  27602379 aaatggaaatt---ccatgcaagtttcattcaaccaaatatcttttaaatttgtcatcttgcataataattctggaaaactcttgagactct 27602467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 577 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 28788622 - 28788386
Alignment:
Q  577 ttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctg 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||| | |||| || |||||||| ||||||  ||| ||||    
T  28788622 ttaacctttcaagtttatttaggtgtccaattgaattgtgaatt-gtaattaatttacgacaatatgcaaacgagaacttttccaaattttgaagacctg 28788524  T
Q  677 agacatcggggatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacacaagaaagaaac-aataaataa 775  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||||||   ||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  28788523 agacatcaggtatatgggttaaatattcacacttgtccaatgtcaagactttcatgttctggaaattctgcataaacacaaggaagaaacaaataaataa 28788424  T
Q  776 actaaaaatcaaagactataatactttcatagtgatttctt 816  Q
    | ||||||| ||| |||   ||||| |||||||||||||||    
T  28788423 attaaaaattaaacact---atactatcatagtgatttctt 28788386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 163 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 26058670 - 26058086
Alignment:
Q  163 gacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaat---agttaaatgataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagaca 259  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||   ||||| | ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26058670 gacattcaccaaggcactcgggaagaattgtgaaattgtagttacaggataaatctagaaatgtcacattaacaaaccacttgagaagtattgggagaca 26058571  T
Q  260 ttcgtctgagaggttgcactcttcgagagtaagctgtgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcattcc- 358  Q
    ||| ||||||||| ||    || ||||  |||| |||  ||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||     
T  26058570 ttcatctgagaggctgttgcctgcgaggttaagatgttccacatttgaaatcactattgaattcattttatcattatattttgggaacctgagctttccc 26058471  T
Q  359 ---aaatttc--------actgataactcatgaagttcactgagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgt 447  Q
       |  || |        | || ||||   ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||  | |  |||||  |    
T  26058470 tgtaggttgcctccagatattgttaaccgttgaagtttactgaaattttgaaatgaatatggcaattcttctatggaagtatcatatatctcaatatctt 26058371  T
Q  448 ctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaaccactgagattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaa 547  Q
     ||||||||||||||  |||||||||||||||||| | | ||||||| ||||| || |||  |  |||| ||||||||| | ||    ||| ||||| ||    
T  26058370 ttatatttgtcatctcacataataattctggaaaattcttgagactcacacaatcagtgatttcaaatttcttaagagagggcagctgtaagggtgggaa 26058271  T
Q  548 atgtttaagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaa 647  Q
    ||| | ||| || ||||||||| ||| |  |||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||   |  |||    
T  26058270 atgctcaagttcgctgcaaccaaatgtatctaagatttcaagtttatttagatgtccaatcgaactgtgaattt-taattaaactatcacatcctcgaaa 26058172  T
Q  648 tgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatat 733  Q
     ||  ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||| | | | ||||||| |||  ||||||||||    
T  26058171 ggagcacttttctagatttggaagacctgagacatcgggtatatgggttaaatattgagaaccgtccaatgtcataactttcatat 26058086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 163 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 26078640 - 26078056
Alignment:
Q  163 gacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaat---agttaaatgataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagaca 259  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||   ||||| | ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26078640 gacattcaccaaggcactcgggaagaattgtgaaattgtagttacaggataaatctagaaatgtcacattaacaaaccacttgagaagtattgggagaca 26078541  T
Q  260 ttcgtctgagaggttgcactcttcgagagtaagctgtgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcattcc- 358  Q
    ||| ||||||||| ||    || ||||  |||| |||  ||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||     
T  26078540 ttcatctgagaggctgttgcctgcgaggttaagatgttccacatttgaaatcactattgaattcattttatcattatattttgggaacctgagctttccc 26078441  T
Q  359 ---aaatttc--------actgataactcatgaagttcactgagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgt 447  Q
       |  || |        | || ||||   ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||  | |  |||||  |    
T  26078440 tgtaggttgcctccagatattgttaaccgttgaagtttactgaaattttgaaatgaatatggcaattcttctatggaagtatcatatatctcaatatctt 26078341  T
Q  448 ctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaaccactgagattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaa 547  Q
     ||||||||||||||  |||||||||||||||||| | | ||||||| ||||| || |||  |  |||| ||||||||| | ||    ||| ||||| ||    
T  26078340 ttatatttgtcatctcacataataattctggaaaattcttgagactcacacaatcagtgatttcaaatttcttaagagagggcagctgtaagggtgggaa 26078241  T
Q  548 atgtttaagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaa 647  Q
    ||| | ||| || ||||||||| ||| |  |||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||   |  |||    
T  26078240 atgctcaagttcgctgcaaccaaatgtatctaagatttcaagtttatttagatgtccaatcgaactgtgaattt-taattaaactatcacatcctcgaaa 26078142  T
Q  648 tgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatat 733  Q
     ||  ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||| | | | ||||||| |||  ||||||||||    
T  26078141 ggagcacttttctagatttggaagacctgagacatcgggtatatgggttaaatattgagaaccgtccaatgtcataactttcatat 26078056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 584 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 26625597 - 26625387
Alignment:
Q  584 ttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatc 683  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |  | |||| ||||||||||| | ||||   | |||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  26625597 ttcaagtttatttaggtgcccaattgagtcatcaatt-gtaattaaatttttacaaaaattaaatgtcaacttttgtaaatttgaaaggcctgagatatc 26625499  T
Q  684 ggggatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacacaagaaagaaacaataaataaactaaaaa 783  Q
    ||| ||||||||||| | |||||||  ||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26625498 gggtatatgtgttaaatgttcacattcgtccaatgttaatactttcatattctggaacttctgcataaacacaaggaagaaacaataaataaattaaaaa 26625399  T
Q  784 tcaaagactata 795  Q
    ||||| ||||||    
T  26625398 tcaaacactata 26625387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 584 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 26731574 - 26731364
Alignment:
Q  584 ttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatc 683  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |  | |||| ||||||||||| | ||||   | |||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  26731574 ttcaagtttatttaggtgcccaattgagtcatcaatt-gtaattaaatttttacaaaaattaaatgtcaacttttgtaaatttgaaaggcctgagatatc 26731476  T
Q  684 ggggatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacacaagaaagaaacaataaataaactaaaaa 783  Q
    ||| ||||||||||| | |||||||  ||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26731475 gggtatatgtgttaaatgttcacattcgtccaatgttaatactttcatattctggaacttctgcataaacacaaggaagaaacaataaataaattaaaaa 26731376  T
Q  784 tcaaagactata 795  Q
    ||||| ||||||    
T  26731375 tcaaacactata 26731364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 380 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 26864139 - 26863752
Alignment:
Q  380 aagttcactgagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctgga 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | |  |||||  || |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26864139 aagttcactgagattttgaaatgaaaatgacaattctcttatggaagtttcagacaaccggatctcttttatatttatcatcttgcataataattctgga 26864040  T
Q  480 aaactatcgagactctcacaaccactgagattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagctctctgcaaccatatgcactta 579  Q
    ||||| | ||| ||   |||  ||  ||| | ||||  ||||||||||| |||   ||| |||||||||   |  ||||  ||||||   | |||| |||    
T  26864039 aaactcttgagtctgaaacactcatagagttccaatatcttaagagatgccaattgtaagggtggaaaactctcgagcttgctgcaatactttgcaatta 26863940  T
Q  580 acctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgaga 679  Q
       ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||  | |||||||||||||||| |||  | ||||    
T  26863939 gggtttcaagtttatttaggtacccaatcgagttgtgaatt-gtaattaaattatgacaatttataaacaacaacttttctaaatttggaagatcggaga 26863841  T
Q  680 catcggggatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacacaagaaagaaacaa 768  Q
    ||| ||| |||   ||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26863840 cattgggtatacaggttaaatattcacaatagtccaatatcaagactttcatattctcgaacttctgcataaacacaaagaagaaacaa 26863752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 449 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 26658441 - 26658139
Alignment:
Q  449 tatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaaccactgagattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaa 548  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  | | |||||||| ||| | |||||| |  |||||||||||||| |  |  | ||| |||||||||    
T  26658441 tatatttgacatcttgcatagtaattctggaaatttcttgagactcttacaccaactgagttgaaattccttaagagagggaagccgtaagggtggaaaa 26658342  T
Q  549 tgtttaagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaat 648  Q
      |   | || ||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||    
T  26658341 cttacgatctttctgcaaccatatgcatctaagatttcaagtttatttaggtatccaactgaattgtgaatt-gtaattaaattagcacaatttcgaaat 26658243  T
Q  649 gataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgca 748  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||   ||||||| ||| || ||||||||  | ||||| |||||    
T  26658242 gagaacttttctaaatttgagagacctgagacattgggtatatgggttaaatattcacaatcgtccaatgtcatgaatttcatattattgaactcctgca 26658143  T
Q  749 taaa 752  Q
    ||||    
T  26658142 taaa 26658139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 449 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 26764412 - 26764110
Alignment:
Q  449 tatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaaccactgagattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaa 548  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  | | |||||||| ||| | |||||| |  |||||||||||||| |  |  | ||| |||||||||    
T  26764412 tatatttgacatcttgcatagtaattctggaaatttcttgagactcttacaccaactgagttgaaattccttaagagagggaagccgtaagggtggaaaa 26764313  T
Q  549 tgtttaagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaat 648  Q
      |   | || ||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||    
T  26764312 cttacgatctttctgcaaccatatgcatctaagatttcaagtttatttaggtatccaactgaattgtgaatt-gtaattaaattagcacaatttcgaaat 26764214  T
Q  649 gataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgca 748  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||   ||||||| ||| || ||||||||  | ||||| |||||    
T  26764213 gagaacttttctaaatttgagagacctgagacattgggtatatgggttaaatattcacaatcgtccaatgtcatgaatttcatattattgaactcctgca 26764114  T
Q  749 taaa 752  Q
    ||||    
T  26764113 taaa 26764110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 26887010 - 26886250
Alignment:
Q  13 aacaacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatgattcacaatattcaacagaaagctcttttagatttggtggaatccctct 112  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |  || | |  | ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26887010 aacaaaaacaaacctgactcaataacattcttctacttgaggaactcaatgaatggcattttatagcagaaaggtctttaagatttggtggtatccctct 26886911  T
Q  113 gatttccttaagagaagcgcagccactcacattaattttataaagatggagacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatgataag 212  Q
     ||||||| ||||||   |||   | |||  | || | |   |||| || |||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||   |||||||    
T  26886910 aatttcctcaagagacttgcaatgattcaattcaagtatcctaagaaggtgacattccttaaggcactcgggaagaattttgaaattgttctttgataag 26886811  T
Q  213 tctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattcgtctgagaggttgcactcttcgagagtaagctgtgtcacatttgagaaca 312  Q
    ||||||| | | ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||   |||||| ||||  || | ||| | |||   |  ||||||||| || |    
T  26886810 tctagatgtttcacattaacaaaccacttgagaagcattggaagacattcaaatgagagattgctttcgtagagtgaaagagattccacatttgaaaata 26886711  T
Q  313 ctattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcattccaaat---ttcactgataactcatgaagttcactgagattttgaaatgaaaatgg 409  Q
    |||| | |||||| || ||| |||||||||||||||| | |||||||  |   |  | || ||  | | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26886710 ctataggatacattttgtcaatatgttttgggaaccttaacattccacttcgatatattgttacgtgacgaagttcactgagattttcaaatgaaaatgg 26886611  T
Q  410 cagttctcctatggaagt---atgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaaccactg 506  Q
    || | |||||||||||||   || ||| |||  ||| |  | || ||||||||||||||||||||||||||| ||  | | |||||||  ||||  |  |    
T  26886610 caatcctcctatggaagtgttattatgtaacgcaatctcttttaaatttgtcatcttgcataataattctgggaatttcttgagactcctacaataagag 26886511  T
Q  507 agattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaa 606  Q
    || |  |||||||| ||||| | ||    ||| |||||||||   | |||||   ||||    |  ||| ||||  |||||||||||||||| |  ||||    
T  26886510 agttcaaattccttgagagagggcagctgtaagggtggaaaactctcaagcttgatgcatttcttcgcatttaagatttcaagtttatttagcttcccaa 26886411  T
Q  607 tcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtattcac 706  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| | ||| ||||| |||||||    
T  26886410 tcgaatcgtgaatt-gtaattaaattattactcttttcaactgagaacttttctaaatttagaagacctgagacattgggtacatgggttaaatattcac 26886312  T
Q  707 atcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacacaagaaagaaacaa 768  Q
    |   ||| ||| |||||||||||||    | ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26886311 aattgtcaaatgtcaagactttcatgaagtcgaacttctgcataaacacaaagaagaaacaa 26886250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 377 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 26826357 - 26825978
Alignment:
Q  377 atgaagttcactgagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattct 476  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||    | ||| ||||||||||  |||||||||| |    
T  26826357 atgaagttcattgagatttcgaaatgaagatggcaattctcctatggaagtatcatacaaacaaattccttttatttttgtcatctcacataataatttt 26826258  T
Q  477 ggaaaactatcgagactctcacaaccactgagattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagctctctgcaaccatatgcac 576  Q
    |||||||| | |||||||| ||| |||  ||| ||||| |||||||| || | ||| | ||| |||||||||   |  ||||  ||||||   | ||||     
T  26826257 ggaaaactcttgagactcttacagccagagagtttcaaatccttaagggagggcaaccgtaagggtggaaaactctcgagcttgctgcaattctctgcat 26826158  T
Q  577 ttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctg 676  Q
    ||||  |||||||||||| |||||  ||||||||  ||| || ||||||||||||||  ||| |||| |||||| || ||||||||  ||| ||| | ||    
T  26826157 ttaagatttcaagtttatctaggtacccaatcgagatgtcaa-ttgtaattaaattacgacattttttaaatgagaatttttctaatattggaagacatg 26826059  T
Q  677 agacatcggggatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacacaa 757  Q
    |||||||||| || || ||||| | || |||   |||||||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  26826058 agacatcgggtatgtgggttaaatgttgacacttgtccaatgaaaagactttcatattctcgaacttctgcataaacacaa 26825978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 155 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 26980168 - 26979773
Alignment:
Q  155 aagatggagacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatgataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattggg 254  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||   |  ||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26980168 aagatggtgacattcattaaggcactcaggtagaattttgaaattgttgt-tcttaagtttaaatatgtcacattaacaaaccacttgagaagtattggg 26980070  T
Q  255 agacattcgtctgagaggttgcactcttcgagagtaagctgtgtc-acatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagc 353  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||   |   ||| | || || |  ||||| |||||||  | || |||  |||||||||  ||||||||||| |||    
T  26980069 agacattcatctgagaggttggtctctctaaatataa-cagtatccatttttgaaaacactacaggattcattctatcattatactttgggaacctgagc 26979971  T
Q  354 attccaaat---ttcactgataactcatgaagttcactgagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtcta 450  Q
    |||| || |   |  |||  |||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||| ||| || | ||    
T  26979970 attctaactcgatatacttctaagcaatgaagttcactgagatattgaaatgaaaatggcaattctcctatggaagtattagagaacccaatctttttta 26979871  T
Q  451 tatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaaccactgagattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaa 548  Q
    ||||| |||| |  |||||||||||||||||||| | |||||| |||||  ||  ||| | ||||||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  26979870 tatttttcatttgacataataattctggaaaacttttgagactatcacactcagagagttccaattccttaagagagggcaaatgtaagggtggaaaa 26979773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 379 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 26851201 - 26850824
Alignment:
Q  379 gaagttcactgagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctgg 478  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26851201 gaagttcactgagatttttaaatgaagatggcaattctcctatggaagtacgatgtaactcaatctcttctatatttgtcatcttgcataataattctgg 26851102  T
Q  479 aaaactatcgagactctcacaaccactgagattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagctctctgcaaccatatgcactt 578  Q
    |||| | | |||||||  ||| | |   |   |||||||||||||||| | |||   ||| |||||||||   | |||||   |||||||  |||||  |    
T  26851101 aaaattcttgagactcgaacacctagataatatcaattccttaagagagggcaattgtaagggtggaaaactctcaagcttgttgcaaccccatgcatct 26851002  T
Q  579 aacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgag 678  Q
    ||  ||||||||||| | ||||  ||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||   | |||||| | |||||||||||||| ||| || |||    
T  26851001 aagatttcaagtttaatcaggtacccaattgaattgtgaa-ttgtaattaaactatgacaacaatgaaatgagagcttttctaaatttggaagtccagag 26850903  T
Q  679 acatcggggatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacacaa 757  Q
    ||||| |  ||||| ||||| |||| | | | ||||||| |||||  ||| || |  | ||||||||||||||||||||    
T  26850902 acatcagatatatgggttaaatatttagaaccgtccaatgtcaagtttttaatgttgttgaacttctgcataaacacaa 26850824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 561 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 25485397 - 25485207
Alignment:
Q  561 ctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttct 660  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||  ||||| |  ||||||  ||||||||    
T  25485397 ctgcaaccatatgcatttaagatttcaagtttatttaggtgtccaatcgaactgggaa-ttgtaattaaactaaaacaatatcgaaatgagcacttttct 25485299  T
Q  661 aaatttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaa 752  Q
    | ||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    |||||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||||    
T  25485298 agatttggaagacccgagacatcgggtatatgggttaaatattcacaaaaatccaatgtcaagactttcatatagttgaactcctgcataaa 25485207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 163 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 25485741 - 25485546
Alignment:
Q  163 gacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatgataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattc 262  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25485741 gacattcaccaaggcactcgggaagaattgtgaaattgttctgcgataagtctagaaatgtcacattaacaaaccacttgagaagtattgggagacattc 25485642  T
Q  263 gtctgagaggttgcactcttcgagagtaagctgtgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcattcc 358  Q
     ||||||||||||   | |  |||   ||  |||  ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||| ||| ||||    
T  25485641 atctgagaggttgttgtttctgagctcaacatgttccacatttgaaaacactattgaattcattttatcattatatttttggaacctgagctttcc 25485546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 379 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 25076383 - 25076030
Alignment:
Q  379 gaagttcactgagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctgg 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||| ||||| | |  | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  25076383 gaagttcactgagattttgaaatgaaaatggcaattctcctatggaagtaccgtccaacaaaatacttttcaaatttgtcatcttgcacaataattctgg 25076284  T
Q  479 aaaactatcgagactctcacaaccactgagattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagctctctgcaaccatatgcactt 578  Q
    |||||| | |||||||  |||  ||   || ||||||||||||||||| | ||  | ||| |||||||||  ||| ||||    |||      |||| ||    
T  25076283 aaaactcttgagactccaacactcagaaagtttcaattccttaagagagggcagccgtaagggtggaaaacttttgagcttatagcatttccttgcattt 25076184  T
Q  579 aacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgag 678  Q
    |   ||||||||||| |||||  |||||| |||||||||| |||||||||| ||   ||| ||||  ||||| | |||||||||||||| ||| ||||||    
T  25076183 atgatttcaagtttacttaggcatccaattgaattgtgaa-ttgtaattaagttccaacacttttttaatgagatcttttctaaatttggaagacctgag 25076085  T
Q  679 acatcggggatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatat 733  Q
    |||||||| ||||| |||||  | | | |  ||| ||||||||||||||||||||    
T  25076084 acatcgggtatatgagttaaagagtaaaaatggttcaatatcaagactttcatat 25076030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 378 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 25582240 - 25581921
Alignment:
Q  378 tgaagttcactgagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctg 477  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |   ||  | |   ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25582240 tgaagttcactgaaattttgaaatgaatatggcaattcttctatggaaatggcatatatcttgatatcttttatatttctcatcttgcataataattctg 25582141  T
Q  478 gaaaactatcgagactctcacaaccactgagattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagctctctgcaaccatatgcact 577  Q
    ||||| | | ||||||||||||   |  ||  |  |||| ||||||||| | ||    ||| ||||| ||||| | ||| |  ||||||||||||||| |    
T  25582140 gaaaattcttgagactctcacacttagagatttcaaatttcttaagagagggcagctgtaagggtgggaaatgctcaagtttgctgcaaccatatgcatt 25582041  T
Q  578 taacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctga 677  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||  ||||  || ||||||  ||||||||| ||||| ||| || ||    
T  25582040 taagatttcaagtttatttaggtgtccaatcgaactgtgaa-ttgtaattaaactaaaacaaaattgaaatgagcacttttctagatttggaagacccga 25581942  T
Q  678 gacatcggggatatgtgttaa 698  Q
    ||||||||| ||||| |||||    
T  25581941 gacatcgggtatatgggttaa 25581921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 540 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 26145224 - 26145013
Alignment:
Q  540 ggtggaaaatgtttaagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaa 639  Q
    ||||||||||| | |||||  ||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| | |||||     
T  26145224 ggtggaaaatgctcaagcttgctgcaaccagatgcatttaagatttcaagtttatttaggtgtccaatcgaactgtgaa-ttctaattaaactttcacag 26145126  T
Q  640 ttttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctgga 739  Q
    |||| ||| ||  ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||  | |   || |||| |||||||||||||||  | ||    
T  26145125 ttttgaaaggagcacttttctagatttggaagacctgagacatcgggtatatgggttaaatatcgagaatagttcaatgtcaagactttcatatagttga 26145026  T
Q  740 acttctgcataaa 752  Q
    ||| |||||||||    
T  26145025 actcctgcataaa 26145013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 155 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 25076652 - 25076450
Alignment:
Q  155 aagatggagacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatgataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattggg 254  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    || |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  25076652 aagatggcgacattcactaaggcactcgggaagaattttgaaatcattgttagacaagtctagatatttcacattaacaaaccacttgagaagtattgga 25076553  T
Q  255 agacattcgtctgagaggttgcactcttcgagagtaagctgtgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagca 354  Q
    |||||||| ||||| ||| ||   || | |||| |||| ||| ||||| |||| |||||||| ||||  || ||||||| || |||  ||||||| ||||    
T  25076552 agacattcatctgaaaggatgttatcgtggagattaagatgtttcacacttgataacactatagaattaattttatcatcatctttacggaacctgagca 25076453  T
Q  355 ttc 357  Q
    |||    
T  25076452 ttc 25076450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 163 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 26658733 - 26658620
Alignment:
Q  163 gacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatgataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattc 262  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||   |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  26658733 gacattcactaaggcactcgggtagaattttgaaattgttctttgataagtttagatatttcacattaacacaccacttgagaagtattggaagacagtc 26658634  T
Q  263 gtctgagaggttgc 276  Q
     |||||||| ||||    
T  26658633 atctgagagattgc 26658620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 163 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 26764704 - 26764591
Alignment:
Q  163 gacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatgataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattc 262  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||   |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  26764704 gacattcactaaggcactcgggtagaattttgaaattgttctttgataagtttagatatttcacattaacacaccacttgagaagtattggaagacagtc 26764605  T
Q  263 gtctgagaggttgc 276  Q
     |||||||| ||||    
T  26764604 atctgagagattgc 26764591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 167 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 26826636 - 26826528
Alignment:
Q  167 ttcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatgataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattcgtct 266  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||   ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||    
T  26826636 ttcactaaggcactcaggaataattttgaatttgttccctgataagtctagagatgtcacattaacacaccacttgagaaatatcgggagacatccatct 26826537  T
Q  267 gagaggttg 275  Q
    |||||||||    
T  26826536 gagaggttg 26826528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 592 - 768
Target Start/End: Original strand, 27529116 - 27529291
Alignment:
Q  592 tatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatat 691  Q
    ||||||||| || ||  |||||||||||| |||| |||||||| |||  || |||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||    
T  27529116 tatttaggtatctaagtgaattgtgaatt-gtaactaaattatgacatcttacaaacgagaacttttctaaatttggaagccctgagacatccggtatat 27529214  T
Q  692 gtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacacaagaaagaaacaa 768  Q
    | ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  27529215 gggttaaatattcacaattgttcaatatcaagactttcatatcttcaaacttctgcataaacacgaagaagaaacaa 27529291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 163 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25582458 - 25582346
Alignment:
Q  163 gacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaat---agttaaatgataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagaca 259  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||   ||||| | ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25582458 gacattcaccaaggcactcgggaagaattgtgaaattgtagttacaggataaatctagaaatgtcacattaacaaaccacttgagaagtattgggagaca 25582359  T
Q  260 ttcgtctgagagg 272  Q
    ||| |||||||||    
T  25582358 ttcatctgagagg 25582346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 26952523 - 26952334
Alignment:
Q  9 ataaaacaacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatgattcacaatattcaacagaaagctcttt-tagatttggtggaatc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||| || || |||| | |  ||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  26952523 ataaaacaacaacaaacctgactcaatagcattcttctacttgcggaactcaacgactcgcaatctactgcagaaag-tctttctagattcggtggaatc 26952425  T
Q  108 cctctgatttccttaagagaagcgcagccactcacattaattttataaagatggagacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaat 198  Q
    ||||||||||||| ||| |||  |||||||  |||  ||| || |  ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26952424 cctctgatttcctcaagggaatagcagccatccacgataacttcaacaagatggtggcattcactaaggcactcgggaagaattttgaaat 26952334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 583 - 752
Target Start/End: Original strand, 27602555 - 27602723
Alignment:
Q  583 tttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacat 682  Q
    |||||||| | ||||||  |||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27602555 tttcaagtctgtttaggaatccaactgaattgtgaatt-gtaattaaattctcacaaaattgaaacgataacttttctaaatttggaagtcctgagacat 27602653  T
Q  683 cggggatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaa 752  Q
    |||| || || ||||| |||| ||| | || |||| |||| ||||||||||  | |||||||||||||||    
T  27602654 cgggtatttgggttaaatattgacaactgttcaatttcaatactttcatatagttgaacttctgcataaa 27602723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 90 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 26625956 - 26625697
Alignment:
Q  90 tttagatttggtggaatccctctgatttccttaagagaagcgcagccactcacattaattttataaagatggagacattcactaaggcactcaggaagaa 189  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||   | |||||   |   |||| || |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26625956 tttagatttggtggaatccctctaatttcctcaagagactcgcagccatctaaattaaggatcctaagaaggtgacattcattaaggcattcaggaagaa 26625857  T
Q  190 ttttgaaatag---ttaaatgataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattcgtctgagaggttgcactcttcgag 286  Q
    |||||| |  |   ||    ||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||   |||    
T  26625856 ttttgataccgacgttctccgataagtctagatgtttcacattaacaaaccacttgagaattattgggagatattcatctgagaggttgcattccctgag 26625757  T
Q  287 agtaagctgtgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcattcc 358  Q
    |  ||||| ||||||||            |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26625756 acaaagctctgtcacat------------ttgaatacattttatcattatgttttgggaacctcagcattcc 26625697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 90 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 26731933 - 26731674
Alignment:
Q  90 tttagatttggtggaatccctctgatttccttaagagaagcgcagccactcacattaattttataaagatggagacattcactaaggcactcaggaagaa 189  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||   | |||||   |   |||| || |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26731933 tttagatttggtggaatccctctaatttcctcaagagactcgcagccatctaaattaaggatcctaagaaggtgacattcattaaggcattcaggaagaa 26731834  T
Q  190 ttttgaaatag---ttaaatgataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattcgtctgagaggttgcactcttcgag 286  Q
    |||||| |  |   ||    ||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||   |||    
T  26731833 ttttgataccgacgttctccgataagtctagatgtttcacattaacaaaccacttgagaattattgggagatattcatctgagaggttgcattccctgag 26731734  T
Q  287 agtaagctgtgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcattcc 358  Q
    |  ||||| ||||||||            |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26731733 acaaagctctgtcacat------------ttgaatacattttatcattatgttttgggaacctcagcattcc 26731674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 378 - 494
Target Start/End: Original strand, 27662843 - 27662959
Alignment:
Q  378 tgaagttcactgagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctg 477  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |   |||||||| |  | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27662843 tgaagttcattgagatttttaaatgaaaatggcatttcttctatggaagtatcacataaccaaatctcttttatatttgacatcttgcataataattctg 27662942  T
Q  478 gaaaactatcgagactc 494  Q
    ||||||| | |||||||    
T  27662943 gaaaactcttgagactc 27662959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 587 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 26637880 - 26637716
Alignment:
Q  587 aagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggg 686  Q
    ||||||| |||| || |||||||||| ||||||| |||||| |||| | ||| |||| ||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  26637880 aagtttacttagctgcccaatcgaatcgtgaatt-gtaattcaatttttacactttttaaacgagaacttttcaaaatttgatagacctgagacatcggg 26637782  T
Q  687 gatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaa 752  Q
     ||||| ||||| || | |||  ||| |||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  26637781 tatatgagttaaatagtgacaatggttcaatgtcaagactttcatatagttgaacttctgcataaa 26637716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26638153 - 26638048
Alignment:
Q  163 gacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatgataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattc 262  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||   || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26638153 gacatacactaaggcactcaggaagaattttgaaattgttaccagataagtataacaatttcacattagcacaccacttgagaagtattgggagacattc 26638054  T
Q  263 gtctga 268  Q
     |||||    
T  26638053 atctga 26638048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 587 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 26743846 - 26743682
Alignment:
Q  587 aagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggg 686  Q
    ||||||| |||| || |||||||||| ||||||| |||||| |||| | ||| |||| ||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  26743846 aagtttacttagctgcccaatcgaatcgtgaatt-gtaattcaatttttacactttttaaacgagaacttttcaaaatttgatagacctgagacatcggg 26743748  T
Q  687 gatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaa 752  Q
     ||||| ||||| || | |||  ||| |||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  26743747 tatatgagttaaatagtgacaatggttcaatgtcaagactttcatatagttgaacttctgcataaa 26743682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26744119 - 26744014
Alignment:
Q  163 gacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatgataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattc 262  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||   || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26744119 gacatacactaaggcactcaggaagaattttgaaattgttaccagataagtataacaatttcacattagcacaccacttgagaagtattgggagacattc 26744020  T
Q  263 gtctga 268  Q
     |||||    
T  26744019 atctga 26744014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 379 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 26952309 - 26951958
Alignment:
Q  379 gaagttcactgagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctgg 478  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| || | ||  | |  ||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26952309 gaagttcactgagatttccaaatgaaaatggcaattctcctatggatgtttcatatatcgtaatctcttttatatttgtcatcttgcataataattctgg 26952210  T
Q  479 aaaactatcgagactctcacaaccactgagattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagct-ctctgcaaccatatgcact 577  Q
    ||| || | ||||||||||||  ||  ||| |||||||||| |||||| | |||   ||| | |||||||   | ||||| ||| |||    |  ||| |    
T  26952209 aaagctcttgagactctcacactcagagagtttcaattcctcaagagagggcaactgtaaggatggaaaactctcaagctgctc-gcagtactcggcatt 26952111  T
Q  578 taacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctga 677  Q
    |||  ||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||  || |||||  || |||||| || |||| |||||||| ||| |||||    
T  26952110 taagattttaagtttatttaggtacccaaccgaattgtgaa-ttgtaattaacctaacacaaccttgaaatgagaagttttttaaatttggaagacctga 26952012  T
Q  678 gacatcggggatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcat 731  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || ||||    ||||||| |||||| ||||||    
T  26952011 gacatcgggtatatgagttaaatagtcactattgtccaatgtcaagattttcat 26951958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 379 - 500
Target Start/End: Original strand, 27425224 - 27425345
Alignment:
Q  379 gaagttcactgagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctgg 478  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |  | |||| | |||   | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27425224 gaagttcactaagattttgaaaggaaaatggaaattctcctatggaagtttccttcaacaagatagattttatatttgtcatcttgcataataattctgg 27425323  T
Q  479 aaaactatcgagactctcacaa 500  Q
    |||||| | |||||||| ||||    
T  27425324 aaaactcttgagactcttacaa 27425345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 163 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 26961862 - 26961751
Alignment:
Q  163 gacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatgataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattc 262  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||      ||| | |||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  26961862 gacattcactaaggcactcgggaagaattttgaaattgttcttcattaattttagagatgtcacattaacaaacaacttgagaagtattgggagacattc 26961763  T
Q  263 gtctgagaggtt 274  Q
     |||||||||||    
T  26961762 atctgagaggtt 26961751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 840 - 1014
Target Start/End: Complemental strand, 26804559 - 26804377
Alignment:
Q  840 tgaagttatttcacttgccttg-tttaaatactagatgacagacacttcgat-aacatcctttccatttc-atacactc-aacttcttggtaaatgcttg 935  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||  || |||| ||||| | || ||||    
T  26804559 tgaagttatttcacttgccttgcttaaaatactagatgatagagactccgataaacatcctttccatttcaatactatcaaactgcttggaagatacttg 26804460  T
Q  936 agacctccag-aaaatggccattttcga-gatagctgtt-tgag-tttgtcatcttcttgaaggcctttcctttcttgtctat 1014  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||| | ||||  |||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  26804459 agaccttcagaaaaatgtccattttcaatgataagtgttctcagttttgtcatctttttgaaggcctttcctttctggtctat 26804377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 26961642 - 26961287
Alignment:
Q  380 aagttcactgagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctgga 479  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |   |    ||| |  | |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26961642 aagttcactgagatattgaaatgaaaatggaaattctcctatggaagtatcacaaagattaatctcttttatatttgtcatttggcataataattctgga 26961543  T
Q  480 aaactatcgagactctcacaaccactgagattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagctctctgcaaccatatgcactta 579  Q
    ||||| | |||||| |||||   |  ||| | ||||||||||||||| | ||||  ||| |||||||||   |  ||||    |||||| |  |||||||    
T  26961542 aaacttttgagactatcacacttagagagttccaattccttaagagagggcaaatgtaagggtggaaaactctcgagcttgaggcaacccttcgcactta 26961443  T
Q  580 acctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgaga 679  Q
    |   |||||| |||||||| |  | ||| ||||||| ||||| ||||||| ||   ||||||||||||||| ||||||  |||||||  ||||| |||||    
T  26961442 agtgttcaagcttatttagcttccaaatggaattgtcaattt-taattaagtttcgacaattttcaaatgagaactttattaaattttgaaggcttgaga 26961344  T
Q  680 catcggggatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcct 736  Q
    ||| ||| |||||  ||||  ||| ||  | |||||||||||||  |||||||||||    
T  26961343 cattgggtatatggattaaagattgactcctgtccaatatcaagtgtttcatatcct 26961287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 26876276 - 26876213
Alignment:
Q  212 gtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattcgtctgagaggttg 275  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  26876276 gtctagatatctcacattaacacaccacttgagaagtagtgggagacattcatctgagaagttg 26876213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 127
Target Start/End: Original strand, 27662630 - 27662748
Alignment:
Q  9 ataaaacaacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatgattcacaatattcaacagaaagctcttttagatttggtggaatcc 108  Q
    |||||| || ||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||   |||  || |||| | | ||||||| ||||||||||    
T  27662630 ataaaataaaaacaaacctgactcaataacattcttctacttgaggaactcaatgatttacatccttctgcataaagatttgttagattgggtggaatcc 27662729  T
Q  109 ctctgatttccttaagaga 127  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  27662730 ctctaatttcctcaagaga 27662748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 378 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 25485514 - 25485410
Alignment:
Q  378 tgaagttcactgagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctg 477  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||  | |  |||||  | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25485514 tgaatttcactgaaattttgaaatgaatatggcaattcttctatggaagtatcatatatcttaatatcttttatatttgacatcttacataataattctg 25485415  T
Q  478 gaaaa 482  Q
    |||||    
T  25485414 gaaaa 25485410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 127
Target Start/End: Original strand, 27590386 - 27590502
Alignment:
Q  11 aaaacaacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatgattcacaatattcaacagaaagctcttttagatttggtggaatccct 110  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    | | ||  || | |||  ||||||||||||||||||    
T  27590386 aaaacaacaacaaacctgattcattaacattcttctacttgatgaactcaatgattcacatccataagcatcaaccacttcaagatttggtggaatccct 27590485  T
Q  111 ctgatttccttaagaga 127  Q
    || ||||||| ||||||    
T  27590486 ctaatttcctcaagaga 27590502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 25582612 - 25582557
Alignment:
Q  9 ataaaacaacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatga 64  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25582612 ataaaaaaacaacaaacctgactcattaacattcttatacttgaggaactcaatga 25582557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 26058824 - 26058769
Alignment:
Q  9 ataaaacaacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatga 64  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26058824 ataaaaaaacaacaaacctgactcattaacattcttatacttgaggaactcaatga 26058769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 26078794 - 26078739
Alignment:
Q  9 ataaaacaacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatga 64  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26078794 ataaaaaaacaacaaacctgactcattaacattcttatacttgaggaactcaatga 26078739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 449 - 500
Target Start/End: Original strand, 27528973 - 27529024
Alignment:
Q  449 tatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaa 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  27528973 tatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactcttgagactcttacaa 27529024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 26851415 - 26851299
Alignment:
Q  9 ataaaacaacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatgattcacaatattcaacagaaagctcttttagatttggtggaatcc 108  Q
    ||||||||| ||| |||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||  |||| |    |||| || |  |||||||| ||||||||||    
T  26851415 ataaaacaataacaaacctgactcaataacattcttctgcttgaggaactcaatgatttgcaatctattgcagacaggtaatttagattcggtggaatcc 26851316  T
Q  109 ctctgatttccttaaga 125  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  26851315 ctctaatttcctcaaga 26851299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 592 - 776
Target Start/End: Original strand, 27425437 - 27425620
Alignment:
Q  592 tatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatat 691  Q
    ||||||||| || ||  |||||||||||| |||| |||||||| |||  || |||| || |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||  |||    
T  27425437 tatttaggtatctaagtgaattgtgaatt-gtaactaaattatgacatcttgcaaacgagaacttttctaaatttggaagccatgagacatcgggtgtat 27425535  T
Q  692 gtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacacaagaaagaaacaataaataaa 776  Q
       |||| | || |||   ||| |||||||| |||||||||| ||  | ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||    
T  27425536 agattaaatcttgacaattgtcgaatatcaacactttcatattctcaagcttctgcataaacacacagaagaaacaaaaaataaa 27425620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 978 - 1014
Target Start/End: Complemental strand, 28788184 - 28788148
Alignment:
Q  978 ttgtcatcttcttgaaggcctttcctttcttgtctat 1014  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28788184 ttgtcatcttcttgaaggcctttcctttcttgtctat 28788148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 978 - 1014
Target Start/End: Complemental strand, 28794305 - 28794269
Alignment:
Q  978 ttgtcatcttcttgaaggcctttcctttcttgtctat 1014  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28794305 ttgtcatcttcttgaaggcctttcctttcttgtctat 28794269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 25485888 - 25485778
Alignment:
Q  16 aacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatgattcacaatattcaacagaaagctcttttagatttggtggaatccctctgat 115  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| |  |   || |||||  ||  |||||||||||||||||||| ||    
T  25485888 aacaacaaacctgactcattaacattcttatacttgaggaattcaatgaataacactcgtttgcaaaaagcctttcaagatttggtggaatccctctaat 25485789  T
Q  116 ttccttaagag 126  Q
    ||||| |||||    
T  25485788 ttcctcaagag 25485778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 66
Target Start/End: Original strand, 25491406 - 25491456
Alignment:
Q  16 aacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatgatt 66  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25491406 aacaacaaacctgactcaataacattcttctacttgaggaactcaatgatt 25491456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 840 - 1014
Target Start/End: Complemental strand, 26648525 - 26648343
Alignment:
Q  840 tgaagttatttcacttgccttgtttaaa-tactagatgacagacacttcgataa-catcctttccatttca-tacactcaa-cttcttggtaaatgcttg 935  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||  ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| | ||  ||     
T  26648525 tgaagttatataacttgccttgcttaaaatactagatgatagagactctgataaacatcctttccatttcaatactctcaaactgcttggaagatattta 26648426  T
Q  936 agacctccagaaaa-tggccattttcga-gatagctgttt-gagttt-gtcatcttcttgaaggcctttcctttcttgtctat 1014  Q
    ||||||  |||||| || |||||||| | ||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26648425 agacctttagaaaaatgaccattttcaatgataagtgttttgagttttgtcatcttcttgaaggcctttcctttctggtctat 26648343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 840 - 1014
Target Start/End: Complemental strand, 26754493 - 26754311
Alignment:
Q  840 tgaagttatttcacttgccttgtttaaa-tactagatgacagacacttcgataa-catcctttccatttca-tacactcaa-cttcttggtaaatgcttg 935  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||  ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| | ||  ||     
T  26754493 tgaagttatataacttgccttgcttaaaatactagatgatagagactctgataaacatcctttccatttcaatactctcaaactgcttggaagatattta 26754394  T
Q  936 agacctccagaaaa-tggccattttcga-gatagctgttt-gagttt-gtcatcttcttgaaggcctttcctttcttgtctat 1014  Q
    ||||||  |||||| || |||||||| | ||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26754393 agacctttagaaaaatgaccattttcaatgataagtgttttgagttttgtcatcttcttgaaggcctttcctttctggtctat 26754311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 845 - 1014
Target Start/End: Original strand, 27675702 - 27675879
Alignment:
Q  845 ttatttcacttgccttgtttaaa-tactagatgacagacacttcgataa-catcctttccatttca-tacactcaa-cttcttggtaaatgcttgagacc 940  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||| |||| ||||| ||||||| |||||||| | |  |||| || ||||| | ||||||||||||    
T  27675702 ttatttcacttgccttgcttaaaatactagacgagagagactttgataaacatccttcccatttcaatgctttcaaactgcttggaagatgcttgagacc 27675801  T
Q  941 tccagaa-aatggccattttcga-gatagctgtttg--agtttgtcatcttcttgaaggcctttcctttcttgtctat 1014  Q
    |  |||| ||||||||||||| | ||||  |||||   |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27675802 tttagaacaatggccattttcaatgataagtgttttcaatcttgtcatctttttgaaggcctttcctttcttgtctat 27675879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 26145325 - 26145288
Alignment:
Q  583 tttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26145325 tttcaagtttatttaggtgtccaatcgagttgtgaatt 26145288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 978 - 1014
Target Start/End: Original strand, 27591246 - 27591282
Alignment:
Q  978 ttgtcatcttcttgaaggcctttcctttcttgtctat 1014  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27591246 ttgtcatctttttgaaggcctttcctttcttgtctat 27591282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 979 - 1014
Target Start/End: Original strand, 27425846 - 27425881
Alignment:
Q  979 tgtcatcttcttgaaggcctttcctttcttgtctat 1014  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27425846 tgtcatcttcttgaaggcctttccattcttgtctat 27425881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 840 - 908
Target Start/End: Complemental strand, 26658064 - 26657994
Alignment:
Q  840 tgaagttatttcacttgccttgttt-aaatactagatgacagacacttcg-ataacatcctttccatttca 908  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||| |  |||||||||||||||||    
T  26658064 tgaacttatttcacttgccttgtttgaaatacaagatgatagagacttcgaaggacatcctttccatttca 26657994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 840 - 908
Target Start/End: Complemental strand, 26764035 - 26763965
Alignment:
Q  840 tgaagttatttcacttgccttgttt-aaatactagatgacagacacttcg-ataacatcctttccatttca 908  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||| |  |||||||||||||||||    
T  26764035 tgaacttatttcacttgccttgtttgaaatacaagatgatagagacttcgaaggacatcctttccatttca 26763965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 840 - 908
Target Start/End: Original strand, 27704334 - 27704404
Alignment:
Q  840 tgaagttatttcacttgccttg-tttaaatactagatgacagacacttcgat-aacatcctttccatttca 908  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||| |||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  27704334 tgaagttatttcacttgccttgcttaaaatactagacgatagagactttgataaacatccttcccatttca 27704404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 28795307 - 28795257
Alignment:
Q  16 aacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatgatt 66  Q
    |||||| |||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28795307 aacaacaaacctgactcaatagcattcttctacttgaggaactcaatgatt 28795257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 840 - 908
Target Start/End: Complemental strand, 31286645 - 31286575
Alignment:
Q  840 tgaagttatttcacttgccttg-tttaaatactagatgacagacacttcgat-aacatcctttccatttca 908  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||| | || ||||||||||||||||||    
T  31286645 tgaagttacttcacttgccttgcttaaaatactagatgatagagactccaataaacatcctttccatttca 31286575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 977 - 1014
Target Start/End: Complemental strand, 26625171 - 26625134
Alignment:
Q  977 tttgtcatcttcttgaaggcctttcctttcttgtctat 1014  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  26625171 tttgtcatcttcctgaaggcctttcctttctggtctat 26625134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 977 - 1014
Target Start/End: Complemental strand, 26731148 - 26731111
Alignment:
Q  977 tttgtcatcttcttgaaggcctttcctttcttgtctat 1014  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  26731148 tttgtcatcttcctgaaggcctttcctttctggtctat 26731111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 977 - 1014
Target Start/End: Complemental strand, 31286500 - 31286463
Alignment:
Q  977 tttgtcatcttcttgaaggcctttcctttcttgtctat 1014  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  31286500 tttgtcatcttcttgaaggccattcctttctggtctat 31286463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 557; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 557; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 941
Target Start/End: Complemental strand, 16189 - 15251
Alignment:
Q  7 atataaaacaacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatgattcacaatattcaacagaaagctcttttagatttggtggaat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||   ||   ||  || |||||||||||||||||||||    
T  16189 atataaaacaacaactaacctgactcattaatattcttttacttgaggaactcaatgattgacatccttgtgcattaatctcttttagatttggtggaat 16090  T
Q  107 ccctctgatttccttaagagaagcgcagccactcacattaattttataaagatggagacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaat 206  Q
    |||||| ||||||| ||| ||  |||||   | ||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  16089 ccctctaatttcctcaagggactcgcagtaccccacattaatttcaacaagatggtgacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaattgctatat 15990  T
Q  207 gataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattcgtctgagaggttgcactcttcgagagtaagctgtgtcacatttg 306  Q
     |||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||    
T  15989 aataagtttagagatgtcatattaacacaccacttgagaactcttcggagacattcatctgagaggttgcaatggtagagagtaagctgtgtcacatttg 15890  T
Q  307 agaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcattccaaatttcactgataactcatgaagttcactgagattttgaaatgaaaa 406  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15889 aaaacactattgaatacatcttatcattctgttttgggaacctcagcattccatatgtcactgataacttatgaagttcactaagattttgaaatgaaaa 15790  T
Q  407 tggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaaccactg 506  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||  ||||    
T  15789 tggcagttctcctatggaagtattacacaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactcttgagactcctgcaagaactg 15690  T
Q  507 agattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaa 606  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15689 agattcaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaatgttcgaccttattgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttattaaggtgtccaa 15590  T
Q  607 tcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtattcac 706  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||    
T  15589 tcgaattgtgaa-ttgtaattaaattataacatctttcaaacgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatatttac 15491  T
Q  707 atcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacacaagaaagaaacaataaataaactaaaaatcaaagact-ataatactttcat 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15490 atcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacacaagaaagaaacaataaataaactaaaaatcaaagactaatattactttcat 15391  T
Q  806 agtgatttcttttcttgacggaaac-aaatcattgtgaagttatttcacttgccttgttt-aaatactagatgacagacacttcgat-aacatcctttcc 902  Q
    | |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15390 actgattt-ttttgttgacggaaacaaaatcattgtgaagttatttcacttgccttgtttaaaatcctagatgacagacacttcgataaacatcctttcc 15292  T
Q  903 atttc-atacactc-aacttcttggtaaatgcttgagacct 941  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||| | || ||||||||||    
T  15291 atttcaatacactcaaactgcttggaagatacttgagacct 15251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 4)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 163 - 795
Target Start/End: Original strand, 2100 - 2735
Alignment:
Q  163 gacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatgataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattc 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2100 gacattcactaaggcactcaggaataagtttgaaattgttatatgataagtctagagatgtcacattaacacaccacttgagaaatattgggagacattc 2199  T
Q  263 gtctgagaggttgcactcttcgagagtaagctgtgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcattccaaat 362  Q
     |||||||| ||||| || | |||| |||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  2200 atctgagagcttgcaatcatggagaataagatttgtcacttttgaaaacactatagaatacatttgatcattctgttttgggaacctcagcattccacat 2299  T
Q  363 ttcact---gataactcatgaagttcactgagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaat-attgtctatatttgtc 458  Q
    | |  |   | ||||  |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |  ||||||||||| ||| || |||||||||    
T  2300 tcccatagcgttaacagaaaaagttcattgagattttgaaatgaagatggcaattctcttatggaagttttctgcaaccaaatcattttc-atatttgtc 2398  T
Q  459 atcttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaaccactgagattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagct 558  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  |  || ||||||||| ||||| ||||  |  ||||||||||||||| |||  || |    
T  2399 atcttgcataataattttggaaaactcttgagactctcacaataagagatattcaattcattaagggatgcaagccctaaaggtggaaaacgttcgagtt 2498  T
Q  559 ctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataactttt 658  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||    
T  2499 tgctgcaaccatttgcacttaacctttcaagtttattgaggtgtccaattgaattgtgaatt-gtaattaaattctcacaatattcaaaggagaactttt 2597  T
Q  659 ctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacacaag 758  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| | ||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  2598 ctaaattttgaagacctgagacatcaggtatatgggttaaatattcacacctgtccaatgtcaagattttcatgttctggaacttctgcataaacacaag 2697  T
Q  759 aaagaaac-aataaataaactaaaaatcaaagactata 795  Q
     ||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||||||    
T  2698 gaagaaacaaataaattaattaaaaattaaacactata 2735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 164 - 816
Target Start/End: Original strand, 11064 - 11716
Alignment:
Q  164 acattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatgataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattcg 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  11064 acattcactaaggcactcaggaataagtttgaaattgttccatgataagtctagatatgtcacataaacacaccacttgagaaatattgggagacattca 11163  T
Q  264 tctgagaggttgcactcttcgagagtaagctgtgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcattccaaatt 363  Q
    |||||||| ||||| |  | |||    || | |||||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  11164 tctgagagcttgcaattatagagttctagttttgtcacttttgaaaacactatagaatacatttgatcattctgttttgggaacctcagcattccagctt 11263  T
Q  364 tc---actgataactcatgaagttcactgagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcat 460  Q
     |   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| || |  |||||||||||    
T  11264 cccgtactgttaactcatgaagttcactgagattttgaaatgaagatggcaattctcttatggaagtattctgcaaccaaatctttttaatatttgtcat 11363  T
Q  461 cttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaaccactgagattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagctct 560  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||  |  |||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||  ||  || |      
T  11364 cttgcataataattttggaaaactcttgagactcccacaatgagagagattcaattcattaagggatgccaaccctaaaggtggaaaactttcgagtttg 11463  T
Q  561 ctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttct 660  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||| | |||| || ||||||||     
T  11464 ctgcaatcaaatgcatttaacctttcaagtttatttaggtgtccaattgaattgtgaatt-gtaattaatttacgacaatatgcaaacgagaacttttcc 11562  T
Q  661 aaatttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacacaagaa 760  Q
    ||||||  ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||   ||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |    
T  11563 aaattttgaagacctgagacatcaggtatatgggttaaatattcacacttgtccaatgtcaagactttcatgttctggaaattctgcataaacacaagga 11662  T
Q  761 agaaac-aataaataaactaaaaatcaaagactataatactttcatagtgatttctt 816  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||| |||   ||||| |||||||||||||||    
T  11663 agaaacaaataaataaattaaaaattaaacact---atactatcatagtgatttctt 11716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 978 - 1014
Target Start/End: Original strand, 2956 - 2992
Alignment:
Q  978 ttgtcatcttcttgaaggcctttcctttcttgtctat 1014  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2956 ttgtcatcttcttgaaggcctttcctttcttgtctat 2992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 978 - 1014
Target Start/End: Original strand, 11919 - 11955
Alignment:
Q  978 ttgtcatcttcttgaaggcctttcctttcttgtctat 1014  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11919 ttgtcatcttcttgaaggcctttcctttcttgtctat 11955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 3)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 150 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 10299 - 9651
Alignment:
Q  150 ttataaagatggagacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatgataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagta 249  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||   ||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||| ||    
T  10299 ttattaagaaggtgacattcactaaggcactcaggaataagtttgaaattgttccttgataagtctagcaatttcacattaacacaccacttgagaaata 10200  T
Q  250 ttgggagacattcgtctgagaggttgcactcttcgagagtaagctgtgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacct 349  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |  | ||||  ||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  10199 ttgggagacattcatctgagagcttgcaattattgagaacaagatttgtcacttttgaaaacactatagaatacatttgatcattctgttttgggaacct 10100  T
Q  350 cagcattccaaatttcact---gataactcatgaagttcactgagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattg 446  Q
    |||||||||| ||| |  |   | ||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |  |||||||||||  |     
T  10099 cagcattccacattcccatagcgttaactgaaaaagttcattgagattttgaaatgaagatggcaattctcttatggaagttttctgcaaccaaatcgtt 10000  T
Q  447 tctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaaccactgagattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaa 546  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  |  || ||||||||| ||||| ||||  |  |||||||||||||    
T  9999 ttcatatttgtcatcttgcataataattttggaaaactcttgagactctcacaataagagatattcaattcattaagggatgcaagccctaaaggtggaa 9900  T
Q  547 aatgtttaagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaa 646  Q
    || |||  || |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  9899 aacgttcgagtttgctgcaaccatttgcacttaacctttcaagtttattgaggtgtccaattgaattgtgaatt-gtaattaaattctcacaatattcaa 9801  T
Q  647 atgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctg 746  Q
    | || |||||||||||||||  ||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| | ||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||    
T  9800 aggagaacttttctaaattttgaagacctgagacatcaggtatatgggttaaatattcacacctgtccaatgtcaagattttcatgttctggaacttctg 9701  T
Q  747 cataaacacaagaaagaaac-aataaataaactaaaaatcaaagactata 795  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  9700 cataaacacaaggaagaaacaaataaataaattaaaaattaaacactata 9651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 978 - 1014
Target Start/End: Complemental strand, 9430 - 9394
Alignment:
Q  978 ttgtcatcttcttgaaggcctttcctttcttgtctat 1014  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9430 ttgtcatcttcttgaaggcctttcctttcttgtctat 9394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 10433 - 10383
Alignment:
Q  16 aacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatgatt 66  Q
    |||||| |||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10433 aacaacaaacctgactcaatagcattcttctacttgaggaactcaatgatt 10383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 222; Significance: 1e-121; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 842
Target Start/End: Original strand, 265591 - 266418
Alignment:
Q  11 aaaacaacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatgattcacaatattcaacagaaagctcttttagatttggtggaatccct 110  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |  || |  |   || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  265591 aaaacaacaacaaacctgactcaataacattcttttacttgaggaactcaatgagttgcattcatacgcaaaaagctctttaagatttggtggaatccct 265690  T
Q  111 ctgatttccttaagagaagcgcagccactcacattaattttataaagatggagacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatgata 210  Q
    || ||||||| |||| |   ||||  |||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |      ||    
T  265691 ctaatttcctcaagatacttgcagtaactcacgttaattttaacaagatggtgacattcactaaggcactcaggaagagttttgaacttgctcttcatta 265790  T
Q  211 agtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattcgtctgagaggttgcactcttcgagagtaagctgtgtcacatttgagaa 310  Q
    ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   | | |||| | |||   | | ||||| || ||    
T  265791 agtttagatatatcacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattcatctgagagattgttatttacgagtgaaagagcttttacattggaaaa 265890  T
Q  311 cactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcattccaaatttcact---gataactcatgaagttcactgagattttgaaatgaaaat 407  Q
    |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||   ||||||||  |  | ||   ||||||  |  |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  265891 cactatagaatacattttcccattatgttttgggaacc---gcattccacgtccctctagtgataaccgagaaagtccactgagattttgaaatgaagat 265987  T
Q  408 ggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaaccactga 507  Q
    |||| ||||| ||||||||| | || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||  ||| |||  ||    
T  265988 ggcaattctcttatggaagtttcatacaacaaaatattttctatatttgtcatcttgcataataattttggaaagctattgagactccaacacccagaga 266087  T
Q  508 gattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaat 607  Q
    | | || |||||||||||| | ||    ||| |||||||||   || |||| |||||||||   ||||  |||  ||||||||||| ||||||  ||||     
T  266088 gttccatttccttaagagagggcagttgtaagggtggaaaactctttagctttctgcaacccattgcatctaagatttcaagtttaattaggtacccaac 266187  T
Q  608 cgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtattcaca 707  Q
     |||||||||||| ||||||||||| | ||||| || |||||| | ||||| |||||| | ||| ||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||    
T  266188 tgaattgtgaatt-gtaattaaattcttacaatctttaaatgagagcttttttaaattaggaagtcctgagacatcagatatatgggttaaatattcaca 266286  T
Q  708 tcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacacaagaaagaaacaataaataaactaaaaatcaaagactataatactttcatag 807  Q
      |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||    
T  266287 atggtctaatatcaagacattcatatcctggaacttctgcatacacacaag-gagaaacaataaataaactaaaaatcaaagact---atactctcatag 266382  T
Q  808 tgatttcttttcttgacggaaac-aaatcattgtga 842  Q
    |||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  266383 tgattttttttgttgacgtaaacaaaatcattgtga 266418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 379 - 768
Target Start/End: Original strand, 28125321 - 28125709
Alignment:
Q  379 gaagttcactgagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctgg 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||   | |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28125321 gaagttcactgagattttgaaatgaaaatggtaattctcttatggaagttccacgcaaccaaatctcttctatatttgtcatcttgcctaataattctgg 28125420  T
Q  479 aaaactatcgagactctcacaaccactgagattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagctctctgcaaccatatgcactt 578  Q
    |||||| | ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| | | |||   ||| || ||||||   |  ||||  |||||||| | ||||  |    
T  28125421 aaaactcttgagactctcacattcactgagtttcaattccttaagacaggtcaactgtaaggggggaaaactctcgagcttgctgcaaccttctgcatct 28125520  T
Q  579 aacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgag 678  Q
    ||   |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||   ||||    
T  28125521 aagacttcaagtttatttaggtacccaatcgaattgtgaatt-gtaattaaattatcacaatatgcaaatgagaacttttctaaatttggaagatgtgag 28125619  T
Q  679 acatcggggatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacacaagaaagaaacaa 768  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||   || |||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  28125620 acatcgggtatatgggttaaatattcacaaaagttcaaagtcaagactttcatattctcgaacttctgcataaacacaaagaagaaacaa 28125709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 379 - 768
Target Start/End: Original strand, 28130352 - 28130747
Alignment:
Q  379 gaagttcactgagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctgg 478  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | |  ||||| ||| |  | ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28130352 gaagttcacttagattttgaaatgaaaatggtaattctcttatggaagtttcactcaacctaatctcttgtatatttgtcaacttgcctaataattctgg 28130451  T
Q  479 aaaactatcgagactctcacaaccactgagattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagctctctgcaaccatatgcactt 578  Q
    |||  | | ||||||||||||  | ||||| | ||||||||||||||| | ||| | ||| || |||||||  || ||||  |||||||| | |||| ||    
T  28130452 aaattttttgagactctcacattccctgagttccaattccttaagagaagtcaaccgtaaggggggaaaattcttgagcttcctgcaaccctttgcattt 28130551  T
Q  579 aacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatt------tgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaagg 672  Q
    ||   |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||     
T  28130552 aagacttcaagtttatttaggtacccaatagaattgtgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaatgagaacttttctaaatttggaaga 28130651  T
Q  673 cctgagacatcggggatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacacaagaaagaaacaa 768  Q
      |||||||| ||| ||||  ||||| |||| |||   || |||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  28130652 tgtgagacattgggtatattggttaaatatttacagaagttcaatgtcaagactttcgtattctcgaacttctgcataaacacaaagaagaaacaa 28130747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 380 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 26138465 - 26138160
Alignment:
Q  380 aagttcactgagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctgga 479  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   || ||||||||| |  | ||||||||||| | | |  | ||||||||||    
T  26138465 aagttcactgaaattttgaaatgaaaatggcaattctcctatggaggttccatacaaccaaatgtcttttatatttgtcaacctaccaactaattctgga 26138366  T
Q  480 aaactatcgagactctcacaaccactgagattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagctctctgcaaccatatgcactta 579  Q
    ||||| | |||||||| ||||  |  ||| | ||||| ||||||||| | |||   ||| |||||||||   |  ||||   ||||||| | |||| |||    
T  26138365 aaactcttgagactcttacaaatagagagttccaatttcttaagagaggtcaactgtaagggtggaaaactctcgagcttgatgcaaccctttgcattta 26138266  T
Q  580 acctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgaga 679  Q
    |  |||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||    
T  26138265 aggtttcaagtttatttaggaacccaattgaattgtgaatt-gtaattaaattgttacaattttcaaatgagaacttttctaaattttgaagacctgaga 26138167  T
Q  680 catcggg 686  Q
    |||||||    
T  26138166 catcggg 26138160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 977 - 1014
Target Start/End: Original strand, 266590 - 266627
Alignment:
Q  977 tttgtcatcttcttgaaggcctttcctttcttgtctat 1014  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  266590 tttgtcatcttcttgaaggcctttcctttctggtctat 266627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26138751 - 26138642
Alignment:
Q  163 gacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatgataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattc 262  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||   | ||||| ||||||  | |||||| ||||| || |||||| |||||| | ||||||    
T  26138751 gacattcattaaggcactcaggaagaattttaaaatcattacccggtaagtatagatacttcacattagcacacaacctgagaattattggaacacattc 26138652  T
Q  263 gtctgagagg 272  Q
     |||||||||    
T  26138651 atctgagagg 26138642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1870 (Bit Score: 151; Significance: 2e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold1870
Description:

Target: scaffold1870; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 450 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 1277 - 932
Alignment:
Q  450 atatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaaccactgagattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaat 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  |  || ||||||||| ||||| ||||  |  |||||||||||||||     
T  1277 atatttgtcatcttgcataataattttggaaaactcttgagactctcacaataagagatattcaattcattaagggatgcaagccctaaaggtggaaaac 1178  T
Q  550 gtttaagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatg 649  Q
    |||  || |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  1177 gttcgagtttgctgcaaccatttgcacttaacctttcaagtttattgaggtgtccaattgaattgtgaatt-gtaattaaattctcacaatattcaaagg 1079  T
Q  650 ataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcat 749  Q
    | |||||||||||||||  ||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| | ||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  1078 agaacttttctaaattttgaagacctgagacatcaggtatatgggttaaatattcacacctgtccaatgtcaagattttcatgttctggaacttctgcat 979  T
Q  750 aaacacaagaaagaaac-aataaataaactaaaaatcaaagactata 795  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||||||    
T  978 aaacacaaggaagaaacaaataaattaattaaaaattaaacactata 932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1870; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 978 - 1014
Target Start/End: Complemental strand, 711 - 675
Alignment:
Q  978 ttgtcatcttcttgaaggcctttcctttcttgtctat 1014  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  711 ttgtcatcttcttgaaggcctttcctttcttgtctat 675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 163 - 848
Target Start/End: Original strand, 18728953 - 18729628
Alignment:
Q  163 gacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatgataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattc 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||| | |||||||||| || | ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18728953 gacattcactaaggcactcaggaagaattttgaactgaccaaaggttaagtctagaaatttcacattaatacaccacttgagaactatttggagacattc 18729052  T
Q  263 gtctgagaggttgcactcttcgagagtaagctgtgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcattccaaat 362  Q
     | || ||| ||||| |  | ||    |||      ||||||||| |||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  18729053 atatgggagattgcaatgattgaattcaagaacatccacatttgaaaacattatagaatacattttctcattatgttttgggaacctgagcatttcacat 18729152  T
Q  363 ttcactgataactcatgaagttcactg-agattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatc 461  Q
      ||   ||||    |||   | |||| |||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||| | |  ||  | ||| |  | | |||||||||||    
T  18729153 gcca---ataa----tga---taactggagatattgaaatgaaaatggcaattctcttgtggaagttttacacattccaatctcttttgtatttgtcatc 18729242  T
Q  462 ttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaaccactgagattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagctctc 561  Q
    || |||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||  | |||| | ||||||||||||||| | ||  |  || ||||||||||  | |||||       
T  18729243 ttacataataattctggaaaactcttgagtctcttacaataagtgaggtccaattccttaagagagggcagccgcaagggtggaaaattctcaagcttga 18729342  T
Q  562 tgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttcta 661  Q
    |||| ||  ||||| ||||  |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||| || ||| || || |||||||    
T  18729343 tgcatccccatgcatttaagatttcaagtttatttagcttcccaatcgaatcgtgaatt-gcaattaaattgtcacaatattgaaacgagaatttttcta 18729441  T
Q  662 aatttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacacaagaaa 761  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||||| |||| |||   ||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||  ||    
T  18729442 aatttggaagacctgagacattgggtatatgggttaaatattgacacttgtccaatgtcaagactttcatatcctcaaacctctgcataaacaaaaagaa 18729541  T
Q  762 gaaac-aataaataaactaaaaatcaaagactataatactttcatagtgat-ttcttttcttgacggaaac-aaatcattgtgaagttat 848  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| ||| |||   ||||| |||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  18729542 gaaacaaacaaataaattaaaaataaaacact---atactctcatagtgatattattttcttgacagaaacaaaatcattgtgaatttat 18729628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 163 - 848
Target Start/End: Original strand, 18677017 - 18677692
Alignment:
Q  163 gacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatgataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattc 262  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||    
T  18677017 gacattcattaaggcactcgggaagaattttgaaattgccaaaggataagtctagaaatttcacattaacacacaacttgagaactatttggagaccttc 18677116  T
Q  263 gtctgagaggttgcactcttcgagagtaagctgtgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcattccaaat 362  Q
     | || ||| ||||| |  | ||||  |||   |  ||||||||| |||  |||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||| || ||    
T  18677117 atatgggagattgcaataatggagatgaagagtttccacatttgaaaaccttattgaatacattttctcattatgttttgtgaacctgagcatttcacat 18677216  T
Q  363 ttcactgataactcatgaagttcactgagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatct 462  Q
      |  |    | | || |||    ||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||   |  ||  | ||| |  | | ||||||||||||    
T  18677217 cgccgt----agtgat-aag----ctgagattttgaaatgaaaatggcaattctgttgtggaagttatacacattccaatctcttttgtatttgtcatct 18677307  T
Q  463 tgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaaccactgagattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagctctct 562  Q
    | |||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||  |  ||| | ||||||||| ||||| | ||  | ||| ||||||||||  | |||||   |    
T  18677308 tacataataattctggaaaactcttgagtctcttacaaaaagagaggtccaattccttcagagagggcagccataagggtggaaaattctcaagcttggt 18677407  T
Q  563 gcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaa 662  Q
    |||  |  ||||| ||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |  ||| || || ||||||||    
T  18677408 gcatgcccatgcatttaagatttcaagtttatttaggttcccaatcgaatcgtgaatt-gcaattaaattatcacaaaatcgaaacgagaatttttctaa 18677506  T
Q  663 atttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacacaagaaag 762  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||||| |||  |||   ||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  |||    
T  18677507 atttggaagacctgagacattgggtatatgggttaaatatagacaatagtccaatgtcaagactttcatatcctcaaacctctgcataaacacaaagaag 18677606  T
Q  763 aaac-aataaataaactaaaaatcaaagactataatactttcatagtgat-ttcttttcttgacggaaac-aaatcattgtgaagttat 848  Q
    |||| || ||||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  18677607 aaacaaacaaataaattaaaaatcaaacact---atactctcatagtgatattattttcttgacagaaacaaaatcattgtgaatttat 18677692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 451 - 848
Target Start/End: Original strand, 18721810 - 18722206
Alignment:
Q  451 tatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaaccactgagattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatg 550  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||  |  ||| | |||||||| |||||| | ||  | ||| |||||||||      
T  18721810 tatttgtcatcttacataatagttctggaaaactcttgagtctctcacaaaaagagaggtccaattcctcaagagagggcagccataagggtggaaaact 18721909  T
Q  551 tttaagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatga 650  Q
     | |||||   |||| ||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||  |  ||| ||    
T  18721910 ctcaagcttgatgcatccagatgcatttaagatttcaagtttatttaggttcccaatcgaatcgtgaact-gcaattaaattatcacaaaatcgaaacga 18722008  T
Q  651 taacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcata 750  Q
     || ||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||||| |||| |||   ||||||| ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||    
T  18722009 gaatttttctaaatttggaagacctgagacattgggtatatgggttaaatattgacacttgtccaatgtcaagactttcatatgctcaaacctctgcata 18722108  T
Q  751 aacacaagaaagaaac-aataaataaactaaaaatcaaagactataatactttcatagtgat-ttcttttcttgacggaaac-aaatcattgtgaagtta 847  Q
    |||||||  ||||||| || ||||||| ||||||| ||| |||   ||||| |||||||||| || ||||||||||  |||| ||||||||||||| |||    
T  18722109 aacacaaagaagaaacaaacaaataaattaaaaataaaacact---atactctcatagtgatattattttcttgacataaacaaaatcattgtgaattta 18722205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 451 - 795
Target Start/End: Original strand, 18697139 - 18697483
Alignment:
Q  451 tatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaaccactgagattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatg 550  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||  ||||  |  ||  | ||||||||| ||||| | ||  | ||| |||||||||      
T  18697139 tatttgtcatcttacataataattctggaaaactcttgagtctcctacaataagagatgtccaattccttcagagagggcagccataagggtggaaaact 18697238  T
Q  551 tttaagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatga 650  Q
     | |||||  ||||| ||| ||||| |||   ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||| | ||||||||| | ||| |||||||| ||    
T  18697239 ctcaagcttgctgcatccacatgcatttatgatttcaagtttatttaggttcctaatcgaatcgtgaatt-gcaattaaattgttacatttttcaaacga 18697337  T
Q  651 taacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcata 750  Q
     || | ||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||||| |||| |||   ||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  18697338 gaattcttctaaatttggaagacctgagacattgggtatatgggttaaatattgacaattgtccaatgtcaagactttcatatcctcaaacctctgcata 18697437  T
Q  751 aacacaagaaagaaac-aataaataaactaaaaatcaaagactata 795  Q
    |||||||  ||||||| || ||||| | ||||||||||| ||||||    
T  18697438 aacacaaagaagaaacaaacaaatatattaaaaatcaaatactata 18697483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 583 - 848
Target Start/End: Original strand, 18653346 - 18653610
Alignment:
Q  583 tttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacat 682  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||||  ||||  || ||| || || | ||||||||| | ||| ||| ||||||    
T  18653346 tttcaagtttatttaggttcccaatcgaatcgtgaatt-gcaattaaattaatacaaaattgaaacgagaattattctaaattaggaagacctaagacat 18653444  T
Q  683 cggggatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacacaagaaagaaac-aataaataaactaaa 781  Q
     ||| ||||| ||||| |||| |||   ||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  ||||||| || ||||||| ||||    
T  18653445 tgggtatatgggttaaatattgacaattgtccaatgtcaagactttcatatcctcaaacctctgcataaacacaaagaagaaacaaacaaataaattaaa 18653544  T
Q  782 aatcaaagactataatactttcatagtgat-ttcttttcttgacggaaac-aaatcattgtgaagttat 848  Q
    ||||||| |||   ||||| |||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  18653545 aatcaaacact---atactctcatagtgatattattttcttgacagaaacaaaatcattgtgaatttat 18653610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 451 - 848
Target Start/End: Original strand, 18687351 - 18687746
Alignment:
Q  451 tatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaaccactgagattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatg 550  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||  ||||  |  ||  | ||||||||| ||||| | ||  | ||| |||||||||      
T  18687351 tatttgtcatcttacataataattctggaaaactcttgagtctcctacaataagagatgtccaattccttcagagagggcagccataagggtggaaaact 18687450  T
Q  551 tttaagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatga 650  Q
     | |||||  ||||| ||| ||||| |||   ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||| || ||| ||    
T  18687451 ctcaagcttactgcatccacatgcatttatgatttcaagtttatttaggttccaaatcgaatcgtgaatt-gcaattaaattattacaatattaaaacga 18687549  T
Q  651 taacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcata 750  Q
     || | ||||||||||| ||| ||| |||||| ||| ||||| ||||| |||| |||   ||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  18687550 gaattattctaaatttggaagacctaagacattgggtatatgggttaaatattgacaattgtccaatgtcaagactttcatatcctcaaacctctgcata 18687649  T
Q  751 aacacaagaaagaaacaat-aaataaactaaaaatcaaagactataatactttcatagtgat-ttcttttcttgacggaaacaaatcattgtgaagttat 848  Q
    |||||||  |||||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||   || || || |||| || |||||||||| |||  ||||||||||||| ||||    
T  18687650 aacacaaagaagaaacaaacaaataaattaaaaataaaacactata---ctctcgtaatgatattattttcttgacagaacaaaatcattgtgaatttat 18687746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 163 - 356
Target Start/End: Original strand, 18726450 - 18726645
Alignment:
Q  163 gacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatgataagtctagatatgttacatta--acacaccacttgagaagtattgggagacat 260  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||| || | ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  18726450 gacattcactaaggcactcgggaagaattttgaaattgccaaaggataagtctagaaatttcacattaacacacacaacttgagaactatttggagacat 18726549  T
Q  261 tcgtctgagaggttgcactcttcgagagtaagctgtgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcatt 356  Q
    || | || ||| ||||| || | || |  |||   |  ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18726550 tcatatgggagattgcaatcattgaaacgaagaccttccacatttgaaaacattattgaatacattttatcattatgttttgggaacctgagcatt 18726645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 163 - 262
Target Start/End: Original strand, 18721531 - 18721630
Alignment:
Q  163 gacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatgataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattc 262  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  18721531 gacattcattaaggcactcaggaagaattttgaaatagccaaaggataagtctagaaatttcacattaacacacgacttgagaactatttggagacattc 18721630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 379 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 18076331 - 18076210
Alignment:
Q  379 gaagttcactgagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctgg 478  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |  | |||| | |||   | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18076331 gaagttcactaagattttgaaaggaaaatggaaattctcctatggaagtttccttcaacaagatagattttatatttgtcatcttgcataataattctgg 18076232  T
Q  479 aaaactatcgagactctcacaa 500  Q
    |||||| | |||||||| ||||    
T  18076231 aaaactcttgagactcttacaa 18076210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 356
Target Start/End: Original strand, 18682174 - 18682369
Alignment:
Q  163 gacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatgataagtctagatatgttacatta--acacaccacttgagaagtattgggagacat 260  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||| || | ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  18682174 gacattcactaaggcactcgggaagaattttgaaattgccaaaggataagtctagaaatttcacattaacacacacgacttgagaactatttggagacat 18682273  T
Q  261 tcgtctgagaggttgcactcttcgagagtaagctgtgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcatt 356  Q
    || | || ||| | | |   | |||||  |||   |  |||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18682274 tcatatgggagatagtaacttccgagataaagaacttccacattcgaaaacattattgaatacattttatcattatgttttgggaacctgagcatt 18682369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 262
Target Start/End: Original strand, 18687066 - 18687165
Alignment:
Q  163 gacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatgataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattc 262  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||| ||||||| |||| || | |||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||    
T  18687066 gacattcactaaggcactcgggaagaattttgaaattgccaaaggataagtttagaaatttcacattaacacacgacttaagaactatttggagacattc 18687165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 262
Target Start/End: Original strand, 18696860 - 18696959
Alignment:
Q  163 gacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatgataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattc 262  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |  ||  ||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  18696860 gacattcactaaggcactcgggaagaattttgaatttgccaagggataagtttagatatttcacattaacacacgacttgagaactatttggagacattc 18696959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 125
Target Start/End: Original strand, 18686914 - 18687028
Alignment:
Q  11 aaaacaacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatgattcacaatattcaacagaaagctcttttagatttggtggaatccct 110  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |   ||  ||| | ||| ||||| ||||||||||||    
T  18686914 aaaacaacaacaaacctgactcaataacattcttctacttgaggaactcaatgatttacaatcatatgcatcaagatatttgagattcggtggaatccct 18687013  T
Q  111 ctgatttccttaaga 125  Q
    || ||||||| ||||    
T  18687014 ctaatttcctcaaga 18687028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 66
Target Start/End: Original strand, 18652783 - 18652838
Alignment:
Q  11 aaaacaacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatgatt 66  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18652783 aaaacaacaacaaacctgactcaataacattcttctacttgaggaactcaatgatt 18652838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 66
Target Start/End: Original strand, 18676865 - 18676920
Alignment:
Q  11 aaaacaacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatgatt 66  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18676865 aaaacaacaacaaacctgactcaataacattcttctacttgaggaactcaatgatt 18676920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 66
Target Start/End: Original strand, 18696708 - 18696763
Alignment:
Q  11 aaaacaacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatgatt 66  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18696708 aaaacaacaacaaacctgactcaataacattcttctacttgaggaactcaatgatt 18696763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 66
Target Start/End: Original strand, 18721379 - 18721434
Alignment:
Q  11 aaaacaacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatgatt 66  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18721379 aaaacaacaacaaacctgactcaataacattcttctacttgaggaactcaatgatt 18721434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 356
Target Start/End: Original strand, 18652935 - 18653128
Alignment:
Q  163 gacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatgataagtctagatatgttacattaacacaccacttgagaagtattgggagacattc 262  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |  |   ||||||  |||| || | |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  18652935 gacattcattaaggtactcgggaagaattttgaaattgcaacgggataagcttagaaatttcacattaacacacgacttgagaactatttggagacattc 18653034  T
Q  263 gtctgagaggttgcactcttcgagagtaagctgtgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcatt 356  Q
     | || ||| | | |  | ||||||  |||   |  ||||||||| |||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18653035 atatgggagatagtaagcatcgagatgaagagtttccacatttgaaaacattatagaatacattttctcattatgttttgggaacctgagcatt 18653128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 592 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 18076118 - 18075935
Alignment:
Q  592 tatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatat 691  Q
    ||||||||| || ||  |||||||||||| |||| |||||||| |||  || |||| || |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||  |||    
T  18076118 tatttaggtatctaagtgaattgtgaatt-gtaactaaattatgacatcttgcaaacgagaacttttctaaatttggaagccatgagacatcgggtgtat 18076020  T
Q  692 gtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacacaagaaagaaacaataaataaa 776  Q
       |||| | || |||   ||| |||||||| |||||||||| ||  | ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||    
T  18076019 agattaaatcttgacaattgtcgaatatcaacactttcatattctcaagcttctgcataaacacacagaagaaacaaaaaataaa 18075935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 299 - 356
Target Start/End: Original strand, 18721667 - 18721724
Alignment:
Q  299 cacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaacctcagcatt 356  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18721667 cacatttgaaaacattatagaatacattttctcattatgttttgggaacctgagcatt 18721724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 387 - 427
Target Start/End: Original strand, 18682391 - 18682431
Alignment:
Q  387 ctgagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18682391 ctgagattttgaaatgaaaatggcaattctcttatggaagt 18682431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 387 - 427
Target Start/End: Original strand, 18726667 - 18726707
Alignment:
Q  387 ctgagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18726667 ctgagattttgaaatgaaaatggcaattctcttatggaagt 18726707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 979 - 1014
Target Start/End: Complemental strand, 18075709 - 18075674
Alignment:
Q  979 tgtcatcttcttgaaggcctttcctttcttgtctat 1014  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18075709 tgtcatcttcttgaaggcctttccattcttgtctat 18075674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 66
Target Start/End: Original strand, 18728806 - 18728856
Alignment:
Q  16 aacaactaacctgacacattaacattcttttacttgaggaactcaatgatt 66  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18728806 aacaacaaacctgactcaataacattcttctagttgaggaactcaatgatt 18728856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 80; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 385 - 752
Target Start/End: Original strand, 17990853 - 17991219
Alignment:
Q  385 cactgagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaact 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17990853 cactgagattttgaaatgaaaatggcaattctcctatggaactatctgccaaccaaatatgttctatctttgtcatcttgcataataattctggaaaact 17990952  T
Q  485 atcgagactctcacaaccactgagattcaattccttaagagatgacaaacctaaaggtggaaaatgtttaagctctctgcaaccatatgcacttaacctt 584  Q
     |  ||  ||  ||| | |   || | ||||| ||||||||||| |||   ||| || ||||||   |  ||||  || ||||| | |||| ||||  ||    
T  17990953 ctttaggttcctacatctagatagttccaatttcttaagagatgccaactgtaagggaggaaaactctcgagcttgctacaaccctgtgcatttaagatt 17991052  T
Q  585 tcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcg 684  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||| || |||  ||  ||| ||||||||||||    
T  17991053 tcaagtttatttaggtacccaatcgaatcgtgaa-ttgtaattaaattattacactcttcaaatgagaactcttttaagctttgaagacctgagacatcg 17991151  T
Q  685 gggatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaa 752  Q
    || || |   |||| |||| ||| ||||  ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17991152 ggtattttcattaaatattgacaacggttaaatgtcaagactttcatattctcgaacttctgcataaa 17991219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 54; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 379 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 62139 - 62018
Alignment:
Q  379 gaagttcactgagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagtatgatgcaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctgg 478  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |  | |||| | |||   | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  62139 gaagttcactaagattttgaaaggaaaatggaaattctcctatggaagtttccttcaacaagatagattttatatttgtcatcttgcataataattctgg 62040  T
Q  479 aaaactatcgagactctcacaa 500  Q
    |||||| | |||||||| ||||    
T  62039 aaaactcttgagactcttacaa 62018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 592 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 61926 - 61743
Alignment:
Q  592 tatttaggtgtccaatcgaattgtgaatttgtaattaaattatcacaattttcaaatgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatat 691  Q
    ||||||||| || ||  |||||||||||| |||| |||||||| |||  || |||| || |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||  |||    
T  61926 tatttaggtatctaagtgaattgtgaatt-gtaactaaattatgacatcttgcaaacgagaacttttctaaatttggaagccatgagacatcgggtgtat 61828  T
Q  692 gtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctggaacttctgcataaacacaagaaagaaacaataaataaa 776  Q
       |||| | || |||   ||| |||||||| |||||||||| ||  | ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||    
T  61827 agattaaatcttgacaattgtcgaatatcaacactttcatattctcaagcttctgcataaacacacagaagaaacaaaaaataaa 61743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 979 - 1014
Target Start/End: Complemental strand, 61517 - 61482
Alignment:
Q  979 tgtcatcttcttgaaggcctttcctttcttgtctat 1014  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  61517 tgtcatcttcttgaaggcctttccattcttgtctat 61482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University