View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5492-Insertion-5 (Length: 506)

Name: NF5492-Insertion-5
Description: NF5492
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5492-Insertion-5
NF5492-Insertion-5
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (12-503)||(30400-30890)
[»] chr3 (72 HSPs)
chr3 (8-503)||(28194760-28195245)
chr3 (384-503)||(23371406-23371524)
chr3 (384-503)||(51300630-51300748)
chr3 (388-503)||(14763664-14763778)
chr3 (384-500)||(10834038-10834152)
chr3 (384-504)||(12339773-12339892)
chr3 (384-499)||(324307-324421)
chr3 (384-506)||(9577690-9577809)
chr3 (384-499)||(14179443-14179557)
chr3 (384-503)||(14670991-14671109)
chr3 (384-503)||(14682490-14682608)
chr3 (384-499)||(43889560-43889674)
chr3 (384-499)||(52989656-52989770)
chr3 (384-499)||(14966241-14966355)
chr3 (384-499)||(16796558-16796672)
chr3 (394-504)||(15465142-15465251)
chr3 (385-499)||(54876322-54876435)
chr3 (384-501)||(10542366-10542482)
chr3 (384-497)||(12469975-12470087)
chr3 (390-503)||(37427783-37427895)
chr3 (384-504)||(5223371-5223490)
chr3 (384-503)||(16643240-16643358)
chr3 (388-484)||(44494893-44494988)
chr3 (384-475)||(50242996-50243086)
chr3 (385-499)||(17691644-17691756)
chr3 (390-499)||(18700247-18700355)
chr3 (384-499)||(21837497-21837610)
chr3 (384-475)||(43550376-43550466)
chr3 (386-497)||(15246093-15246204)
chr3 (386-497)||(15265214-15265325)
chr3 (384-447)||(9533419-9533482)
chr3 (386-468)||(15207040-15207122)
chr3 (384-493)||(32402893-32403002)
chr3 (386-488)||(316202-316304)
chr3 (385-444)||(23318650-23318709)
chr3 (390-503)||(8928369-8928481)
chr3 (390-503)||(34852596-34852708)
chr3 (384-494)||(13919408-13919516)
chr3 (432-506)||(3264997-3265070)
chr3 (432-506)||(36527809-36527882)
chr3 (390-459)||(14568899-14568970)
chr3 (385-441)||(17248221-17248276)
chr3 (385-441)||(24340657-24340713)
chr3 (385-441)||(37642199-37642255)
chr3 (384-439)||(37251101-37251156)
chr3 (383-441)||(8899221-8899278)
chr3 (388-441)||(29172565-29172618)
chr3 (390-442)||(2051138-2051190)
chr3 (390-442)||(52523666-52523718)
chr3 (385-441)||(53070633-53070688)
chr3 (461-504)||(4588864-4588907)
chr3 (461-504)||(11854708-11854751)
chr3 (374-441)||(43550447-43550513)
chr3 (374-441)||(50242949-50243015)
chr3 (383-441)||(7781325-7781382)
chr3 (383-441)||(9707585-9707642)
chr3 (383-441)||(10247701-10247758)
chr3 (437-499)||(11914003-11914064)
chr3 (383-441)||(13151768-13151825)
chr3 (383-441)||(13154233-13154290)
chr3 (383-441)||(16282789-16282846)
chr3 (383-441)||(16454259-16454316)
chr3 (383-441)||(17463305-17463362)
chr3 (383-441)||(34159453-34159510)
chr3 (427-489)||(38311759-38311820)
chr3 (383-441)||(38961869-38961926)
chr3 (383-441)||(41124014-41124071)
chr3 (383-441)||(45606885-45606942)
chr3 (383-441)||(55476618-55476675)
chr3 (385-429)||(12119704-12119747)
chr3 (385-441)||(17672753-17672808)
chr3 (393-441)||(22147467-22147515)
[»] chr1 (48 HSPs)
chr1 (8-429)||(14295114-14295533)
chr1 (8-429)||(51130703-51131122)
chr1 (384-503)||(635916-636034)
chr1 (384-503)||(22124354-22124472)
chr1 (384-497)||(52940811-52940923)
chr1 (384-503)||(20958177-20958295)
chr1 (384-503)||(21043215-21043333)
chr1 (384-503)||(28312583-28312701)
chr1 (384-503)||(20437926-20438045)
chr1 (384-503)||(13881315-13881433)
chr1 (384-503)||(14800598-14800721)
chr1 (384-503)||(14809472-14809595)
chr1 (384-499)||(27653156-27653270)
chr1 (384-499)||(48603525-48603639)
chr1 (385-459)||(47190713-47190787)
chr1 (384-475)||(45574740-45574830)
chr1 (385-502)||(21533808-21533923)
chr1 (384-475)||(22130764-22130853)
chr1 (384-502)||(48520581-48520698)
chr1 (384-503)||(41781523-41781640)
chr1 (427-503)||(16372066-16372141)
chr1 (390-503)||(32649780-32649892)
chr1 (384-447)||(41049969-41050032)
chr1 (400-459)||(20329121-20329181)
chr1 (401-456)||(11945571-11945626)
chr1 (384-440)||(16368220-16368276)
chr1 (383-442)||(21896188-21896247)
chr1 (384-447)||(50614049-50614112)
chr1 (384-447)||(50621877-50621940)
chr1 (384-442)||(16758780-16758838)
chr1 (8-93)||(20454037-20454123)
chr1 (390-503)||(29534617-29534729)
chr1 (385-439)||(35261015-35261069)
chr1 (390-502)||(2332914-2333025)
chr1 (385-441)||(433137-433193)
chr1 (410-498)||(16381256-16381346)
chr1 (383-442)||(21861502-21861561)
chr1 (387-442)||(26065068-26065123)
chr1 (374-441)||(45574811-45574877)
chr1 (392-447)||(50686737-50686792)
chr1 (385-439)||(13212841-13212894)
chr1 (383-441)||(13988993-13989050)
chr1 (385-439)||(21347091-21347144)
chr1 (383-441)||(21475065-21475122)
chr1 (383-441)||(21923269-21923326)
chr1 (383-441)||(29776815-29776872)
chr1 (383-441)||(31612440-31612497)
chr1 (385-429)||(21477659-21477703)
[»] chr5 (45 HSPs)
chr5 (8-429)||(36314690-36315110)
chr5 (384-506)||(42960608-42960729)
chr5 (384-503)||(37598816-37598934)
chr5 (384-499)||(6765901-6766015)
chr5 (384-503)||(25574403-25574520)
chr5 (384-503)||(25575596-25575713)
chr5 (384-503)||(28370955-28371073)
chr5 (384-503)||(23469872-23469989)
chr5 (384-503)||(25576789-25576906)
chr5 (384-499)||(30138862-30138976)
chr5 (402-499)||(22107386-22107482)
chr5 (385-501)||(26732768-26732882)
chr5 (384-465)||(33895589-33895670)
chr5 (382-502)||(21809513-21809632)
chr5 (385-501)||(26740581-26740695)
chr5 (382-502)||(21731393-21731512)
chr5 (385-488)||(21328150-21328252)
chr5 (427-503)||(22336636-22336711)
chr5 (427-503)||(22340174-22340249)
chr5 (388-439)||(38145441-38145492)
chr5 (391-503)||(10816471-10816582)
chr5 (391-503)||(23538497-23538608)
chr5 (385-432)||(20572025-20572072)
chr5 (385-498)||(15796494-15796607)
chr5 (385-441)||(2154593-2154648)
chr5 (385-441)||(20901988-20902043)
chr5 (393-498)||(27988869-27988978)
chr5 (385-441)||(40725984-40726040)
chr5 (384-447)||(22178153-22178216)
chr5 (385-439)||(25743852-25743908)
chr5 (383-441)||(264746-264803)
chr5 (383-441)||(20909139-20909196)
chr5 (427-489)||(22750264-22750325)
chr5 (383-441)||(29330061-29330118)
chr5 (383-441)||(29346107-29346164)
chr5 (383-441)||(29348580-29348637)
chr5 (383-441)||(29351053-29351110)
chr5 (384-438)||(29448137-29448191)
chr5 (383-441)||(32027520-32027577)
chr5 (383-441)||(39363511-39363568)
chr5 (8-93)||(41860940-41861026)
chr5 (383-441)||(42245343-42245400)
chr5 (385-442)||(22144179-22144236)
chr5 (444-504)||(18356264-18356323)
chr5 (385-441)||(36154763-36154818)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (8-429)||(633-1051)
[»] chr7 (79 HSPs)
chr7 (8-429)||(16495541-16495959)
chr7 (384-506)||(20619446-20619568)
chr7 (384-503)||(130750-130869)
chr7 (384-503)||(11525497-11525616)
chr7 (384-503)||(11661341-11661459)
chr7 (384-503)||(14566237-14566355)
chr7 (384-503)||(18872395-18872513)
chr7 (388-506)||(16008610-16008727)
chr7 (384-503)||(18607522-18607640)
chr7 (388-506)||(42462015-42462132)
chr7 (386-506)||(9033281-9033401)
chr7 (384-503)||(38519441-38519559)
chr7 (384-506)||(10501357-10501478)
chr7 (384-503)||(11768852-11768972)
chr7 (384-499)||(46580609-46580723)
chr7 (384-506)||(14157038-14157159)
chr7 (384-506)||(32301353-32301474)
chr7 (384-503)||(14422019-14422138)
chr7 (384-499)||(14258523-14258637)
chr7 (384-499)||(14273587-14273701)
chr7 (384-499)||(16460699-16460813)
chr7 (384-503)||(16996291-16996408)
chr7 (384-499)||(16998665-16998779)
chr7 (384-504)||(1858765-1858884)
chr7 (384-499)||(16579831-16579945)
chr7 (384-499)||(16585718-16585832)
chr7 (384-503)||(20487610-20487728)
chr7 (384-504)||(25927185-25927301)
chr7 (385-503)||(9177600-9177717)
chr7 (384-475)||(13647503-13647593)
chr7 (385-503)||(17060358-17060476)
chr7 (386-459)||(9725595-9725668)
chr7 (384-504)||(13918459-13918578)
chr7 (384-503)||(17017401-17017519)
chr7 (384-488)||(14929154-14929257)
chr7 (384-488)||(15352620-15352723)
chr7 (385-447)||(1867929-1867991)
chr7 (385-447)||(15008433-15008495)
chr7 (390-503)||(16109453-16109565)
chr7 (384-488)||(48991266-48991367)
chr7 (384-447)||(147708-147771)
chr7 (384-447)||(2529987-2530050)
chr7 (385-447)||(20220124-20220186)
chr7 (405-503)||(837311-837408)
chr7 (405-503)||(1202491-1202588)
chr7 (426-499)||(15720068-15720140)
chr7 (394-503)||(16091827-16091934)
chr7 (390-502)||(38828298-38828409)
chr7 (418-498)||(18203887-18203965)
chr7 (405-503)||(833315-833412)
chr7 (405-503)||(1198495-1198592)
chr7 (374-441)||(13647456-13647522)
chr7 (374-441)||(15081918-15081984)
chr7 (385-442)||(2280053-2280110)
chr7 (385-441)||(17061895-17061950)
chr7 (385-441)||(19486678-19486734)
chr7 (461-504)||(18279375-18279418)
chr7 (461-504)||(18283338-18283381)
chr7 (383-441)||(456448-456505)
chr7 (437-499)||(8940322-8940383)
chr7 (427-489)||(10896687-10896748)
chr7 (383-441)||(11393265-11393322)
chr7 (383-441)||(11972623-11972680)
chr7 (383-441)||(14949100-14949157)
chr7 (427-489)||(15167285-15167346)
chr7 (383-441)||(15376691-15376748)
chr7 (383-441)||(16232647-16232704)
chr7 (383-441)||(18430839-18430896)
chr7 (383-441)||(20385101-20385158)
chr7 (383-441)||(21189573-21189630)
chr7 (383-441)||(24702365-24702422)
chr7 (383-441)||(24704812-24704869)
chr7 (383-441)||(27216987-27217044)
chr7 (383-441)||(32125618-32125675)
chr7 (383-441)||(41523044-41523101)
chr7 (383-441)||(41525506-41525563)
chr7 (390-442)||(12255730-12255782)
chr7 (385-429)||(12756651-12756694)
chr7 (385-441)||(44116636-44116691)
[»] scaffold1539 (1 HSPs)
scaffold1539 (384-506)||(1004-1126)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (384-503)||(3025-3144)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (384-503)||(142650-142769)
scaffold0020 (403-499)||(169702-169797)
[»] chr8 (56 HSPs)
chr8 (384-506)||(17438150-17438272)
chr8 (384-503)||(5083087-5083206)
chr8 (384-503)||(17086087-17086205)
chr8 (386-503)||(37515774-37515890)
chr8 (384-503)||(23667877-23667996)
chr8 (384-503)||(18833631-18833749)
chr8 (384-504)||(25363136-25363255)
chr8 (384-505)||(17460986-17461106)
chr8 (384-505)||(22237953-22238073)
chr8 (384-499)||(19808296-19808410)
chr8 (384-503)||(20502035-20502153)
chr8 (384-503)||(23659476-23659594)
chr8 (384-503)||(23943927-23944045)
chr8 (384-486)||(25484173-25484274)
chr8 (389-502)||(22963351-22963464)
chr8 (384-504)||(14397796-14397915)
chr8 (384-503)||(22253099-22253217)
chr8 (385-497)||(16799561-16799673)
chr8 (385-488)||(22995927-22996029)
chr8 (384-447)||(27941588-27941651)
chr8 (384-498)||(19154819-19154932)
chr8 (385-486)||(28397635-28397735)
chr8 (385-447)||(37116473-37116535)
chr8 (384-456)||(21346166-21346239)
chr8 (394-498)||(20533352-20533455)
chr8 (385-447)||(2418808-2418870)
chr8 (385-447)||(35026797-35026859)
chr8 (393-502)||(14103167-14103275)
chr8 (384-447)||(17439439-17439502)
chr8 (385-441)||(13508019-13508075)
chr8 (385-441)||(13597551-13597607)
chr8 (384-447)||(17266926-17266989)
chr8 (384-447)||(22364786-22364849)
chr8 (436-499)||(23409868-23409930)
chr8 (384-442)||(20498692-20498750)
chr8 (385-439)||(22419349-22419403)
chr8 (426-503)||(23914106-23914183)
chr8 (385-441)||(41598315-41598370)
chr8 (385-428)||(22525659-22525702)
chr8 (384-447)||(24353145-24353208)
chr8 (374-441)||(25484244-25484310)
chr8 (383-441)||(1484529-1484586)
chr8 (383-441)||(4483407-4483464)
chr8 (383-441)||(5853270-5853327)
chr8 (393-431)||(13665189-13665227)
chr8 (393-431)||(13724464-13724502)
chr8 (383-441)||(14409422-14409479)
chr8 (383-441)||(15203209-15203266)
chr8 (383-441)||(19896395-19896452)
chr8 (383-441)||(20046173-20046230)
chr8 (383-441)||(20403354-20403411)
chr8 (383-441)||(22001880-22001937)
chr8 (383-441)||(24486022-24486079)
chr8 (383-441)||(32810058-32810115)
chr8 (427-489)||(44476753-44476814)
chr8 (427-489)||(44480015-44480076)
[»] chr2 (61 HSPs)
chr2 (384-506)||(19201908-19202030)
chr2 (388-503)||(21237821-21237936)
chr2 (384-503)||(9241995-9242113)
chr2 (384-503)||(19662354-19662472)
chr2 (384-503)||(21073426-21073544)
chr2 (384-506)||(34137006-34137127)
chr2 (384-499)||(18358667-18358781)
chr2 (388-503)||(30643984-30644098)
chr2 (388-503)||(6261081-6261196)
chr2 (384-499)||(21081670-21081784)
chr2 (384-499)||(23069217-23069331)
chr2 (384-499)||(27472492-27472606)
chr2 (384-499)||(34874146-34874260)
chr2 (394-504)||(31345184-31345293)
chr2 (384-475)||(22173727-22173817)
chr2 (400-498)||(23287438-23287534)
chr2 (384-503)||(9784750-9784867)
chr2 (393-501)||(26392453-26392559)
chr2 (389-497)||(18546883-18546991)
chr2 (385-488)||(43947306-43947408)
chr2 (385-447)||(20520127-20520189)
chr2 (390-503)||(22703167-22703279)
chr2 (391-503)||(13101577-13101689)
chr2 (384-442)||(23791404-23791462)
chr2 (385-442)||(24529508-24529564)
chr2 (374-441)||(22173798-22173864)
chr2 (384-439)||(23207410-23207465)
chr2 (374-441)||(24642825-24642891)
chr2 (384-447)||(25109013-25109076)
chr2 (385-439)||(22413070-22413124)
chr2 (437-499)||(24671068-24671129)
chr2 (383-441)||(32039476-32039533)
chr2 (385-441)||(23708553-23708609)
chr2 (393-433)||(24834804-24834844)
chr2 (390-441)||(19671960-19672010)
chr2 (384-447)||(23004874-23004937)
chr2 (384-442)||(7666-7724)
chr2 (383-441)||(571524-571581)
chr2 (383-441)||(6726122-6726179)
chr2 (383-441)||(18809070-18809127)
chr2 (383-441)||(21155038-21155095)
chr2 (383-441)||(22105540-22105597)
chr2 (383-441)||(23130989-23131046)
chr2 (383-441)||(23133456-23133513)
chr2 (437-499)||(23707275-23707336)
chr2 (383-441)||(23709510-23709567)
chr2 (383-441)||(23711991-23712048)
chr2 (383-441)||(24367901-24367958)
chr2 (384-442)||(24697539-24697597)
chr2 (383-441)||(24898173-24898230)
chr2 (383-441)||(24900656-24900713)
chr2 (383-441)||(24903133-24903190)
chr2 (383-441)||(24905610-24905667)
chr2 (383-441)||(24908085-24908142)
chr2 (437-499)||(24918183-24918244)
chr2 (383-441)||(26505506-26505563)
chr2 (383-441)||(26507984-26508041)
chr2 (383-441)||(28577226-28577283)
chr2 (383-441)||(34402500-34402557)
chr2 (383-441)||(39682440-39682497)
chr2 (393-433)||(26903443-26903483)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (384-503)||(2604-2723)
scaffold0507 (384-442)||(7992-8050)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (384-503)||(7500-7617)
scaffold0111 (384-503)||(14619-14736)
[»] chr4 (51 HSPs)
chr4 (384-503)||(15041895-15042014)
chr4 (384-503)||(15112410-15112529)
chr4 (384-503)||(18212801-18212919)
chr4 (384-503)||(14852809-14852928)
chr4 (384-503)||(24047233-24047351)
chr4 (384-503)||(32306929-32307047)
chr4 (386-503)||(13591862-13591978)
chr4 (385-497)||(16043087-16043198)
chr4 (384-499)||(10056711-10056825)
chr4 (384-499)||(17048068-17048182)
chr4 (384-503)||(26050409-26050526)
chr4 (384-498)||(17333352-17333467)
chr4 (389-506)||(40907137-40907253)
chr4 (384-475)||(51463766-51463856)
chr4 (384-473)||(23803163-23803251)
chr4 (390-503)||(40906983-40907094)
chr4 (385-488)||(15791857-15791960)
chr4 (388-469)||(26789440-26789521)
chr4 (384-475)||(630602-630692)
chr4 (386-488)||(14825551-14825653)
chr4 (384-475)||(12611117-12611204)
chr4 (390-503)||(4831475-4831587)
chr4 (390-503)||(4834770-4834882)
chr4 (390-503)||(14047708-14047820)
chr4 (390-505)||(30146453-30146567)
chr4 (384-447)||(53082085-53082148)
chr4 (380-442)||(13780-13842)
chr4 (384-447)||(46640389-46640452)
chr4 (374-441)||(51463837-51463903)
chr4 (383-441)||(18215252-18215309)
chr4 (385-442)||(52243128-52243185)
chr4 (374-441)||(12611070-12611136)
chr4 (424-503)||(26045268-26045345)
chr4 (383-441)||(1837487-1837544)
chr4 (383-441)||(7641170-7641227)
chr4 (437-499)||(14746570-14746631)
chr4 (383-441)||(15118330-15118387)
chr4 (383-441)||(15355302-15355359)
chr4 (384-442)||(43198486-43198544)
chr4 (383-441)||(44615415-44615472)
chr4 (383-441)||(52312637-52312694)
chr4 (438-506)||(14185045-14185112)
chr4 (393-433)||(15365208-15365248)
chr4 (385-441)||(15367821-15367876)
chr4 (385-441)||(15371333-15371388)
chr4 (385-441)||(15373614-15373669)
chr4 (385-441)||(15402834-15402889)
chr4 (393-433)||(27996050-27996090)
chr4 (385-441)||(44102341-44102396)
chr4 (383-439)||(44773065-44773120)
chr4 (385-441)||(44928858-44928914)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (384-503)||(7422-7541)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (384-503)||(1963-2081)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (384-503)||(110722-110840)
[»] chr6 (57 HSPs)
chr6 (384-503)||(23838243-23838361)
chr6 (388-503)||(4476893-4477007)
chr6 (384-503)||(18453251-18453369)
chr6 (384-499)||(15817455-15817569)
chr6 (384-499)||(19773476-19773590)
chr6 (384-498)||(33443122-33443232)
chr6 (384-504)||(23414952-23415071)
chr6 (384-499)||(14979321-14979435)
chr6 (384-499)||(15705377-15705491)
chr6 (384-499)||(28103832-28103946)
chr6 (384-475)||(20556792-20556882)
chr6 (384-499)||(25619656-25619770)
chr6 (385-499)||(20136743-20136855)
chr6 (385-499)||(22196014-22196126)
chr6 (385-498)||(23076806-23076918)
chr6 (384-499)||(22806005-22806118)
chr6 (384-475)||(25754983-25755073)
chr6 (382-502)||(16493216-16493335)
chr6 (384-504)||(27556710-27556829)
chr6 (385-498)||(18177606-18177719)
chr6 (385-498)||(18199350-18199463)
chr6 (385-498)||(18204152-18204265)
chr6 (387-456)||(18896252-18896321)
chr6 (385-498)||(35008224-35008336)
chr6 (385-497)||(20224018-20224129)
chr6 (385-497)||(22118002-22118113)
chr6 (384-447)||(25752840-25752903)
chr6 (385-459)||(23528041-23528115)
chr6 (385-503)||(23539038-23539155)
chr6 (400-503)||(20182862-20182962)
chr6 (400-503)||(22153029-22153129)
chr6 (385-456)||(19362540-19362611)
chr6 (385-498)||(23538884-23538996)
chr6 (391-503)||(29416845-29416956)
chr6 (384-453)||(18706423-18706492)
chr6 (385-441)||(8227445-8227501)
chr6 (385-441)||(19847929-19847984)
chr6 (384-447)||(18696611-18696674)
chr6 (374-441)||(20556863-20556929)
chr6 (385-439)||(17105864-17105918)
chr6 (393-433)||(15896074-15896114)
chr6 (385-441)||(18456846-18456901)
chr6 (383-439)||(22782356-22782411)
chr6 (374-441)||(25754936-25755002)
chr6 (383-441)||(2291158-2291215)
chr6 (383-441)||(8055156-8055213)
chr6 (383-441)||(12742444-12742501)
chr6 (383-441)||(18334570-18334627)
chr6 (383-441)||(19005173-19005230)
chr6 (383-441)||(24422674-24422731)
chr6 (390-503)||(25738450-25738561)
chr6 (383-441)||(26924618-26924675)
chr6 (383-441)||(33861921-33861978)
chr6 (383-441)||(33864405-33864462)
chr6 (388-441)||(19858902-19858954)
chr6 (385-442)||(25644451-25644508)
chr6 (393-433)||(19656075-19656115)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (384-503)||(55618-55737)
[»] scaffold1783 (1 HSPs)
scaffold1783 (388-499)||(490-600)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (384-503)||(36249-36367)
scaffold0107 (384-499)||(10018-10132)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (384-503)||(132985-133103)
scaffold0019 (384-447)||(29325-29388)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (384-506)||(8097-8218)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (384-502)||(17572-17689)
scaffold0293 (384-504)||(20144-20263)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (384-506)||(713-834)
scaffold0010 (385-442)||(60649-60706)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (390-503)||(10232-10344)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (384-503)||(6093-6211)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (384-503)||(18101-18219)
[»] scaffold0169 (1 HSPs)
scaffold0169 (384-503)||(29357-29476)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (384-503)||(21235-21353)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (384-499)||(105153-105267)
scaffold0023 (383-441)||(94538-94595)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (384-499)||(126028-126142)
[»] scaffold2080 (1 HSPs)
scaffold2080 (386-500)||(696-809)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (384-506)||(24531-24652)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (386-503)||(221143-221258)
scaffold0012 (385-442)||(225536-225593)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (384-503)||(3936-4055)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (393-505)||(15809-15920)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (384-503)||(921-1039)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (384-499)||(20823-20937)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (384-506)||(225-346)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (384-504)||(39320-39439)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (384-503)||(9655-9772)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (384-499)||(1808-1922)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (385-499)||(75763-75876)
[»] scaffold1419 (2 HSPs)
scaffold1419 (385-494)||(101-209)
scaffold1419 (385-425)||(1-41)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (384-504)||(17641-17760)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (384-504)||(31191-31310)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (384-499)||(6684-6798)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (386-503)||(19582-19698)
scaffold0106 (437-499)||(15225-15286)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (385-498)||(206459-206570)
[»] scaffold1439 (2 HSPs)
scaffold1439 (384-475)||(280-370)
scaffold1439 (374-441)||(233-299)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (384-475)||(124-214)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (387-506)||(120074-120192)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (384-490)||(67342-67447)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (384-447)||(2426-2489)
[»] scaffold0394 (2 HSPs)
scaffold0394 (384-475)||(12232-12322)
scaffold0394 (374-441)||(12185-12251)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (384-506)||(4630-4751)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (393-503)||(11215-11323)
scaffold0040 (393-503)||(22315-22423)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (388-473)||(3265-3349)
[»] scaffold0914 (1 HSPs)
scaffold0914 (389-488)||(1785-1884)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (415-499)||(15030-15113)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (388-456)||(26016-26084)
scaffold0046 (393-456)||(16861-16924)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (386-488)||(22361-22463)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (386-488)||(14056-14158)
scaffold0005 (384-447)||(267785-267848)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (405-506)||(7900-8000)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (384-475)||(82246-82340)
scaffold0037 (461-504)||(80426-80469)
scaffold0037 (374-441)||(82199-82265)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (393-506)||(10539-10651)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (384-456)||(2360-2432)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (403-499)||(85618-85713)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (383-459)||(332427-332503)
[»] scaffold0790 (1 HSPs)
scaffold0790 (396-491)||(6116-6210)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (393-506)||(29738-29851)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (390-503)||(146254-146366)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (385-447)||(97131-97193)
scaffold0006 (385-447)||(106409-106471)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (385-454)||(3712-3781)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (388-456)||(57931-57999)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (384-461)||(13432-13507)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (390-503)||(48396-48508)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (385-447)||(128904-128966)
scaffold0022 (384-440)||(78453-78509)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (393-502)||(604-712)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (384-447)||(6216-6279)
[»] scaffold0123 (3 HSPs)
scaffold0123 (384-447)||(661-724)
scaffold0123 (384-434)||(6330-6379)
scaffold0123 (387-447)||(25231-25290)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (380-442)||(53478-53540)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (385-441)||(11595-11651)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (385-445)||(16034-16094)
scaffold0357 (385-442)||(13259-13316)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (385-441)||(17961-18017)
scaffold0247 (385-439)||(2108-2161)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (385-441)||(38190-38246)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (384-447)||(38442-38505)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (384-447)||(18171-18234)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (374-441)||(1249-1315)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (385-447)||(130-192)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (387-441)||(9877-9930)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (385-441)||(30059-30114)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (385-441)||(79264-79319)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (393-433)||(446631-446671)
scaffold0001 (385-439)||(85559-85612)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (384-447)||(1731-1794)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (461-504)||(58810-58853)
scaffold0028 (383-441)||(134338-134395)
scaffold0028 (383-441)||(136807-136864)
scaffold0028 (383-441)||(139276-139333)
scaffold0028 (383-441)||(141745-141802)
scaffold0028 (383-441)||(144214-144271)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (437-499)||(632-693)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (437-499)||(1279-1340)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (437-499)||(15070-15131)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (383-441)||(20874-20931)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (383-441)||(14074-14131)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (383-441)||(37948-38005)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (385-439)||(164570-164623)
[»] scaffold0741 (1 HSPs)
scaffold0741 (437-506)||(4256-4324)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (384-429)||(19818-19863)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (388-441)||(158433-158485)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (385-433)||(14547-14595)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (385-429)||(27683-27727)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (385-441)||(16911-16966)


Alignment Details
Target: scaffold0013 (Bit Score: 395; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 30890 - 30400
Alignment:
Q  12 tttcacaaaacattaattttaactaacgtagtctgatgctaatacctttagaaagaaatatattgcttaacaggctaatgatgctaatacatttaatcat 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30890 tttcacaaaatattaattttaactaacgtagtctgatgctaatacctgtagaaagaaatatattgcttaacaggctaatgatgctaatacatt-aatcat 30792  T
Q  112 gcatttatttatttagtattttatttatgaattgttgctacactactagnnnnnnnggatagagttgctacactagtaattatttacgtatcgtggctaa 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30791 gcatttatttatttagtgttttatttatgaattgttgctacattagtattttttttggatagagttgctacactagtaattatttacgtgtcgtggctaa 30692  T
Q  212 tttcaaataggctataaactgagtatccttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcaccgaatatttgctgctattttggccaaaagaatatattaaa 311  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30691 tttcaaataggttataaacttagtatacttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcaccgaatatttgctgctattttggccgaaagaatatattaaa 30592  T
Q  312 atttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatgttacgtgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgat 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30591 atttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatgttatgtgattttgttcatgatttgatgttgttagtaatgtgat 30492  T
Q  412 atatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  30491 atatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgcttaagttgttgattgattattatttgacattgttatgtcttgagatgtttatgtg 30400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 371; Significance: 0; HSPs: 72)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 28195245 - 28194760
Alignment:
Q  8 ctagtttcacaaaacattaattttaactaacgtagtctgatgctaatacctttagaaagaaatatattgcttaacaggctaatgatgctaatacatttaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28195245 ctagtttcacaaaacattaattttaactaacgtagtctgatgctaatacctgtagaaagaaatatattgcttaacaggctaatgatgctaatacatt-aa 28195147  T
Q  108 tcatgcatttatttatttagtattttatttatgaattgttgctacactactagnnnnnnnggatagagttgctacactagtaattatttacgtatcgtgg 207  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28195146 tcatgcatttatttatttagtgttttatttatgaattgttgctacactagtatttgttttggatagagttgctacactagtaattatttacgtgtcgtgg 28195047  T
Q  208 ctaatttcaaataggctataaactgagtatccttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcaccgaatatttgctgctattttggccaaaagaatatat 307  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28195046 ctaatttcaaataggttataaactgagtatacttctaaaggattatatgcatatgtatgagcaccgaatatttgctgctattttggccgaaagaatatat 28194947  T
Q  308 taaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatgttacgtgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatg 407  Q
    |||||||          || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28194946 taaaatta---------atgtttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatgttacgtgtttttgttcatgatttgatgttgttagtaatg 28194856  T
Q  408 tgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28194855 tgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtg 28194760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 23371406 - 23371524
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  23371406 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgtta 23371504  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23371505 tatcttgagatgtttatgtg 23371524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 51300748 - 51300630
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  51300748 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgtta 51300650  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  51300649 tatcttgagatgtttatgtg 51300630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 388 - 503
Target Start/End: Original strand, 14763664 - 14763778
Alignment:
Q  388 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatc 487  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  14763664 atttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttatatc 14763762  T
Q  488 ttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||    
T  14763763 ttgagatgtttatgtg 14763778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 384 - 500
Target Start/End: Original strand, 10834038 - 10834152
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  10834038 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt-gtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtta 10834135  T
Q  484 tatcttgagatgtttat 500  Q
    |||||||||||||||||    
T  10834136 tatcttgagatgtttat 10834152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 384 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 12339892 - 12339773
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  12339892 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 12339794  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtgt 504  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  12339793 tatcttgagatgtttacgtgt 12339773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 324421 - 324307
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  324421 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 324323  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||||    
T  324322 tatcttgagatgttta 324307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 384 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 9577809 - 9577690
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||| ||| |||    
T  9577809 tatgatttgatgttgttagtaatgtgacatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaaggtgttg-ttgattatcatttgatattgtta 9577711  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtgttg 506  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  9577710 tatcttgaga--tttatgtgttg 9577690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 14179557 - 14179443
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  14179557 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 14179459  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||||    
T  14179458 tatcttgagatgttta 14179443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 14671109 - 14670991
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||  || |||    
T  14671109 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatgttgtta 14671011  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14671010 tatcttgagatgtttatgtg 14670991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 14682608 - 14682490
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||  || |||    
T  14682608 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatcttgtta 14682510  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14682509 tatcttgagatgtttatgtg 14682490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Original strand, 43889560 - 43889674
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  43889560 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 43889658  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||||    
T  43889659 tatcttgagatgttta 43889674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Original strand, 52989656 - 52989770
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  52989656 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 52989754  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||||    
T  52989755 tatcttgagatgttta 52989770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 14966355 - 14966241
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  14966355 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaaattgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 14966257  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||||    
T  14966256 tatcttgagatgttta 14966241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 16796672 - 16796558
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  16796672 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 16796574  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    |||||||| |||||||    
T  16796573 tatcttgaaatgttta 16796558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 394 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 15465251 - 15465142
Alignment:
Q  394 tgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgaga 493  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  15465251 tgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgcttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttatatcttgaga 15465153  T
Q  494 tgtttatgtgt 504  Q
    |||||| ||||    
T  15465152 tgtttacgtgt 15465142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 385 - 499
Target Start/End: Original strand, 54876322 - 54876435
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 484  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||    
T  54876322 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 54876420  T
Q  485 atcttgagatgttta 499  Q
    |||||||||||||||    
T  54876421 atcttgagatgttta 54876435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 384 - 501
Target Start/End: Original strand, 10542366 - 10542482
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||  || |||    
T  10542366 tatgatttgatgtcgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatgttgtta 10542464  T
Q  484 tatcttgagatgtttatg 501  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10542465 tatcttgagatgtttatg 10542482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 384 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 12470087 - 12469975
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  12470087 tatgatgtgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 12469989  T
Q  484 tatcttgagatgtt 497  Q
    ||||||||||||||    
T  12469988 tatcttgagatgtt 12469975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 390 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 37427895 - 37427783
Alignment:
Q  390 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatctt 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||| | | |||||||||    
T  37427895 ttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatatatgatgtttaagttgttga-tgattatcatttgatactgttatatctt 37427797  T
Q  490 gagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||    
T  37427796 gagatgtttatgtg 37427783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 384 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 5223490 - 5223371
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  5223490 tatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 5223392  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtgt 504  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  5223391 tatcttgagatgtttacgtgt 5223371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 16643358 - 16643240
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  16643358 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataggatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 16643260  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    |||||  |||||||||||||    
T  16643259 tatctcaagatgtttatgtg 16643240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 388 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 44494988 - 44494893
Alignment:
Q  388 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 484  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  44494988 atttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattattat 44494893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 384 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 50243086 - 50242996
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttga 475  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  50243086 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatgatttga 50242996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 385 - 499
Target Start/End: Original strand, 17691644 - 17691756
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 484  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||  |||||||    
T  17691644 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgataatcatttgatgttattat 17691742  T
Q  485 atcttgagatgttta 499  Q
    ||| |||||||||||    
T  17691743 atc-tgagatgttta 17691756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 390 - 499
Target Start/End: Original strand, 18700247 - 18700355
Alignment:
Q  390 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatctt 489  Q
    ||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||| ||| |||||||||    
T  18700247 ttgatgttgatggtaatataatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttaattatcatttgatattgttatatctt 18700345  T
Q  490 gagatgttta 499  Q
    ||||||||||    
T  18700346 gagatgttta 18700355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 21837610 - 21837497
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| ||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  21837610 tatgatttaatgatgatagtaatgtaataaatttgtatatgcatt-tgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 21837513  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||||    
T  21837512 tatcttgagatgttta 21837497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 384 - 475
Target Start/End: Original strand, 43550376 - 43550466
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttga 475  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  43550376 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatg-ttgattatgatttga 43550466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 386 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 15246204 - 15246093
Alignment:
Q  386 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatt-atataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 484  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| ||| ||||    
T  15246204 tgatttgatgttgttattaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcctttgatattgttat 15246106  T
Q  485 atcttgagatgtt 497  Q
     ||| || |||||    
T  15246105 gtctggatatgtt 15246093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 386 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 15265325 - 15265214
Alignment:
Q  386 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatt-atataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 484  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| ||| ||||    
T  15265325 tgatttgatgttgttattaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcctttgatattgttat 15265227  T
Q  485 atcttgagatgtt 497  Q
     ||| || |||||    
T  15265226 gtctggatatgtt 15265214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 384 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 9533482 - 9533419
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9533482 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg 9533419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 386 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 15207122 - 15207040
Alignment:
Q  386 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatt-atataagatgcttaagttgatgattgattat 468  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15207122 tgatttgatgttgttattaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatg-ttgattat 15207040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 384 - 493
Target Start/End: Original strand, 32402893 - 32403002
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgctt-aagttgatgattgattattatttgacattatt 482  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | |||||||||||||||| ||| ||    
T  32402893 tatgatttgttgttgcgagtaatgtgatatagttttatatgcattatgtgaattatctaagatgtttaaagttgct-attgattattatttgatattgtt 32402991  T
Q  483 atatcttgaga 493  Q
    |||||||||||    
T  32402992 atatcttgaga 32403002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 386 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 316304 - 316202
Alignment:
Q  386 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-cttaagttgatgattgattattatttgacattattat 484  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||    
T  316304 tgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatg-ttgattattcttggatattgttat 316206  T
Q  485 atct 488  Q
    ||||    
T  316205 atct 316202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 385 - 444
Target Start/End: Original strand, 23318650 - 23318709
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag 444  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23318650 atgatttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataag 23318709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 390 - 503
Target Start/End: Original strand, 8928369 - 8928481
Alignment:
Q  390 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatct 488  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  8928369 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatct 8928466  T
Q  489 tgagatgtttatgtg 503  Q
    |||||||| ||||||    
T  8928467 tgagatgtctatgtg 8928481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 390 - 503
Target Start/End: Original strand, 34852596 - 34852708
Alignment:
Q  390 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatct 488  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  34852596 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatct 34852693  T
Q  489 tgagatgtttatgtg 503  Q
    |||||||| ||||||    
T  34852694 tgagatgtctatgtg 34852708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 384 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 13919516 - 13919408
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||  |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||||||||| ||| | | |||    
T  13919516 tatgatttaatgtttatagcgatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaag-tgttg-ttgattattatgtgataatgtta 13919419  T
Q  484 tatcttgagat 494  Q
    |||||||||||    
T  13919418 tatcttgagat 13919408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 432 - 506
Target Start/End: Original strand, 3264997 - 3265070
Alignment:
Q  432 tgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttg 506  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3264997 tgaattatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcatgagatgtttatgtgttg 3265070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 432 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 36527882 - 36527809
Alignment:
Q  432 tgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttg 506  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||| |||||||||||    
T  36527882 tgaattatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatatttatgtgttg 36527809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 459
Target Start/End: Original strand, 14568899 - 14568970
Alignment:
Q  390 ttgatgttgttagtaatgtgatatat--ttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatg 459  Q
    |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  14568899 ttgatgttgttgttaatgtgatatataattgtatatgcgttatgtgaattatatatgatgtttaggttgatg 14568970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Original strand, 17248221 - 17248276
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17248221 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 17248276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Original strand, 24340657 - 24340713
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24340657 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24340713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Original strand, 37642199 - 37642255
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  37642199 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 37642255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 384 - 439
Target Start/End: Original strand, 37251101 - 37251156
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 439  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||    
T  37251101 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattat 37251156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 8899278 - 8899221
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  8899278 ttatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 8899221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 388 - 441
Target Start/End: Original strand, 29172565 - 29172618
Alignment:
Q  388 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  29172565 atttgatgttgatagtattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 29172618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 442
Target Start/End: Original strand, 2051138 - 2051190
Alignment:
Q  390 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 442  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  2051138 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatata 2051190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 442
Target Start/End: Original strand, 52523666 - 52523718
Alignment:
Q  390 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 442  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  52523666 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatata 52523718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Original strand, 53070633 - 53070688
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  53070633 atgatttgatgttgttag-attgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 53070688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 504
Target Start/End: Original strand, 4588864 - 4588907
Alignment:
Q  461 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgt 504  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4588864 ttgattatcatttgaaattgttatatcttgagatgtttatgtgt 4588907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 11854751 - 11854708
Alignment:
Q  461 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgt 504  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  11854751 ttgattattatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 11854708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 441
Target Start/End: Original strand, 43550447 - 43550513
Alignment:
Q  374 tgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||    
T  43550447 tgatgttgattatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatacattacttgaattatat 43550513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 50243015 - 50242949
Alignment:
Q  374 tgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||  ||||||||||    
T  50243015 tgatgttgattatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 50242949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 7781325 - 7781382
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  7781325 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 7781382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 9707585 - 9707642
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  9707585 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 9707642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 10247701 - 10247758
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  10247701 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 10247758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 499
Target Start/End: Original strand, 11914003 - 11914064
Alignment:
Q  437 tatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgttta 499  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||    
T  11914003 tatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 11914064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 13151768 - 13151825
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  13151768 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 13151825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 13154233 - 13154290
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  13154233 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 13154290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 16282789 - 16282846
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  16282789 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 16282846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 16454259 - 16454316
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  16454259 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 16454316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 17463362 - 17463305
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  17463362 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 17463305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 34159510 - 34159453
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  34159510 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 34159453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 427 - 489
Target Start/End: Original strand, 38311759 - 38311820
Alignment:
Q  427 ttatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatctt 489  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||| ||| |||||||||    
T  38311759 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattaccatttgatattgttatatctt 38311820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 38961869 - 38961926
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  38961869 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 38961926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 41124071 - 41124014
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  41124071 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 41124014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 45606885 - 45606942
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  45606885 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 45606942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 55476675 - 55476618
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  55476675 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 55476618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 385 - 429
Target Start/End: Original strand, 12119704 - 12119747
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcatta 429  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  12119704 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcatta 12119747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 17672808 - 17672753
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  17672808 atgatttgatgatgtta-tattgtgatataattatatatgcattatttgaattatat 17672753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 393 - 441
Target Start/End: Original strand, 22147467 - 22147515
Alignment:
Q  393 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  22147467 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 22147515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 48)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 8 - 429
Target Start/End: Original strand, 14295114 - 14295533
Alignment:
Q  8 ctagtttcacaaaacattaattttaactaacgtagtctgatgctaatacctttagaaagaaatatattgcttaacaggctaatgatgctaatacatttaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14295114 ctagtttcacaaaacattaattttaactaacgtagtctgatgctaatacctttagaaagaaatatactgcttaacaggctaatgatgctaatacatt-aa 14295212  T
Q  108 tcatgcatttatttatttagtattttatttatgaattgttgctacactactagnnnnnnnggatagagttgctacactagtaattatttacgtatcgtgg 207  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  14295213 tcatgcatttatttatttagtgttttatttatgaattgttgctacattagtagtttttttggatagagttgctacactagtaattatttacgtgtcttgg 14295312  T
Q  208 ctaatttcaaataggctataaactgagtatccttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcaccgaatatttgctgctattttggccaaaagaatatat 307  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14295313 ctaatttcaaataggttataaagtgagtatacttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcaccgaatatttgctgctattttggccgaaagaatatat 14295412  T
Q  308 taaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatgttacgtgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatg 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  14295413 taaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatattacgcgattttgttcataatttgatgttgtta-taatg 14295511  T
Q  408 tgatatatttgtatatgcatta 429  Q
    | ||||| |||||||| |||||    
T  14295512 ttatataattgtatatacatta 14295533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 8 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 51131122 - 51130703
Alignment:
Q  8 ctagtttcacaaaacattaattttaactaacgtagtctgatgctaatacctttagaaagaaatatattgcttaacaggctaatgatgctaatacatttaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51131122 ctagtttcacaaaacattaattttaactaacgtagtctgatgctaatacctttagaaagaaatatactgcttaacaggctaatgatgctaatacatt-aa 51131024  T
Q  108 tcatgcatttatttatttagtattttatttatgaattgttgctacactactagnnnnnnnggatagagttgctacactagtaattatttacgtatcgtgg 207  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  51131023 tcatgcatttatttatttagtgttttatttatgaattgttgctacattagtagtttttttggatagagttgctacactagtaattatttacgtgtcttgg 51130924  T
Q  208 ctaatttcaaataggctataaactgagtatccttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcaccgaatatttgctgctattttggccaaaagaatatat 307  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51130923 ctaatttcaaataggttataaagtgagtatacttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcaccgaatatttgctgctattttggccgaaagaatatat 51130824  T
Q  308 taaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatgttacgtgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatg 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  51130823 taaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatattacgcgattttgttcataatttgatgttgtta-taatg 51130725  T
Q  408 tgatatatttgtatatgcatta 429  Q
    | ||||| |||||||| |||||    
T  51130724 ttatataattgtatatacatta 51130703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 635916 - 636034
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  635916 tatgatttgatgttgttagcaatgtgat-tatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgcttaagttgatgattgaatattatttgacattgtta 636014  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    |||||||| || ||||||||    
T  636015 tatcttgaaatatttatgtg 636034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 22124472 - 22124354
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  22124472 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 22124374  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22124373 tatcttgagatgtttatgtg 22124354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 384 - 497
Target Start/End: Original strand, 52940811 - 52940923
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||    
T  52940811 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatgtagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattattatttggtattgtta 52940909  T
Q  484 tatcttgagatgtt 497  Q
    ||||||||||||||    
T  52940910 tatcttgagatgtt 52940923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 20958295 - 20958177
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| | |    
T  20958295 tatgttttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtca 20958197  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20958196 tatcttgagatgtttatgtg 20958177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 21043215 - 21043333
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||| ||| |||    
T  21043215 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-ttttattatcatttgatattgtta 21043313  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21043314 tatcttgagatgtttatgtg 21043333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 28312701 - 28312583
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  28312701 tatgatttgatgtttttagtaatgagatatatttgtatatacattatgtggattttataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtta 28312603  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28312602 tatcttgagatgtttatgtg 28312583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 20437926 - 20438045
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-cttaagttgatgattgattattatttgacattatt 482  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||    
T  20437926 tatgatttgatgctgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtt 20438024  T
Q  483 atatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  20438025 atatcttgaggtgtttatgtg 20438045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 13881315 - 13881433
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  13881315 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 13881413  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    |||||  |||||||||||||    
T  13881414 tatctcaagatgtttatgtg 13881433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 14800721 - 14800598
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgtta-gtaatgtgatatat----ttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacat 478  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  14800721 tatgatttgatgttgttaagtaacgtgatatatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattattatttgatat 14800623  T
Q  479 tattatatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    | ||||||||||| |||||||||||    
T  14800622 tgttatatcttgatatgtttatgtg 14800598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 14809595 - 14809472
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgtta-gtaatgtgatatat----ttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacat 478  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  14809595 tatgatttgatgttgttaagtaacgtgatatatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattattatttgatat 14809497  T
Q  479 tattatatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    | ||||||||||| |||||||||||    
T  14809496 tgttatatcttgatatgtttatgtg 14809472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Original strand, 27653156 - 27653270
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  27653156 tatgatttaatgttgatagtaatgtattatatttgtatatgcattatgagaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 27653254  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||||    
T  27653255 tatcttgagatgttta 27653270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 48603639 - 48603525
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  48603639 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatacattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 48603541  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
     |||||||||||||||    
T  48603540 gatcttgagatgttta 48603525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 385 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 47190787 - 47190713
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatg 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  47190787 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtaaattatataagatgtttaagttgatg 47190713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 384 - 475
Target Start/End: Original strand, 45574740 - 45574830
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttga 475  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  45574740 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatg-ttgattatgatttga 45574830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 385 - 502
Target Start/End: Original strand, 21533808 - 21533923
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 484  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| ||| ||||    
T  21533808 atgatttaatgttgatagaaatgtgatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag-tgttg-ttgattattatttgatattgttat 21533905  T
Q  485 atcttgagatgtttatgt 502  Q
    ||| | ||| ||||||||    
T  21533906 atcctaagaagtttatgt 21533923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 384 - 475
Target Start/End: Original strand, 22130764 - 22130853
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttga 475  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||||||    
T  22130764 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatg--tgattatgatttga 22130853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 384 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 48520698 - 48520581
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-cttaagttgatgattgattattatttgacattatt 482  Q
    ||||| |||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||    
T  48520698 tatgaattgatgttataaataatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttgatg-ttgtttattatttgatattgtt 48520600  T
Q  483 atatcttgagatgtttatgt 502  Q
    ||||| ||||||||| ||||    
T  48520599 atatc-tgagatgttcatgt 48520581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 41781523 - 41781640
Alignment:
Q  384 tatgatttgat-gttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatt 482  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | || |||||||| ||||||  || ||    
T  41781523 tatgatttgattgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag--gttg-ttgattatcatttgatgttgtt 41781619  T
Q  483 atatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  41781620 atatcttgaaatgtttatgtg 41781640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 427 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 16372141 - 16372066
Alignment:
Q  427 ttatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16372141 ttatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtg 16372066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 390 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 32649892 - 32649780
Alignment:
Q  390 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatct 488  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  32649892 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatct 32649795  T
Q  489 tgagatgtttatgtg 503  Q
    |||||||| ||||||    
T  32649794 tgagatgtctatgtg 32649780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 384 - 447
Target Start/End: Original strand, 41049969 - 41050032
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  41049969 tatgatttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatg 41050032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 400 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 20329181 - 20329121
Alignment:
Q  400 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-cttaagttgatg 459  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  20329181 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgttaattatataagatgttttaagttgatg 20329121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 401 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 11945626 - 11945571
Alignment:
Q  401 agtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttg 456  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  11945626 agtaatgtaatatatttgtatatacattctgtgaattatataagatgtttaagttg 11945571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 440
Target Start/End: Original strand, 16368220 - 16368276
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattata 440  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||    
T  16368220 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattata 16368276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 442
Target Start/End: Original strand, 21896188 - 21896247
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 442  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  21896188 ttatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatata 21896247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 384 - 447
Target Start/End: Original strand, 50614049 - 50614112
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  50614049 tatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatg 50614112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 384 - 447
Target Start/End: Original strand, 50621877 - 50621940
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  50621877 tatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatg 50621940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 384 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 16758838 - 16758780
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 442  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  16758838 tatgatttgttgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatata 16758780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 93
Target Start/End: Original strand, 20454037 - 20454123
Alignment:
Q  8 ctagtttcacaaaacattaattttaactaac-gtagtctgatgctaatacctttagaaagaaatatattgcttaacaggctaatgat 93  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  |||||||| || |||| |||||||||||| | ||||| | |||||||||    
T  20454037 ctagtttcacagaagattaattttaactaacagtagcatgatgctattagcttttgaaagaaatatactacttaagaagctaatgat 20454123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 29534729 - 29534617
Alignment:
Q  390 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatct 488  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||  | |||||||||||| |||| |||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||  ||||||||    
T  29534729 ttgatgttgttaatgatgtggtatattttcaaatgcattatgtggaattttatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatatcgttatatct 29534632  T
Q  489 tgagatgtttatgtg 503  Q
    |||||||| ||||||    
T  29534631 tgagatgtctatgtg 29534617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 439
Target Start/End: Original strand, 35261015 - 35261069
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 439  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||    
T  35261015 atgatttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattat 35261069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 502
Target Start/End: Original strand, 2332914 - 2333025
Alignment:
Q  390 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatct 488  Q
    |||||||||||| | | ||| || ||||| | |||||||||||| | ||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  2332914 ttgatgttgttaatgacgtggtagatttgcaaatgcattatgtggacttatataggatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatct 2333011  T
Q  489 tgagatgtttatgt 502  Q
    |||||||| |||||    
T  2333012 tgagatgtctatgt 2333025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 433193 - 433137
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  433193 atgatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 433137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 410 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 16381346 - 16381256
Alignment:
Q  410 atatatttgtatatgcatt-atgtgaattatataagatgcttaa--gttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgttt 498  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||  ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||| |||| |||||    
T  16381346 atatatttgtatatgcattgatgtgaattatacaatatgtttaaatgttgatg-ttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttt 16381256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 383 - 442
Target Start/End: Original strand, 21861502 - 21861561
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 442  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  21861502 ttatgatatgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatata 21861561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 26065123 - 26065068
Alignment:
Q  387 gatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 442  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  26065123 gatttgatgtcattaataatgtgatatatttgtatatgtattacttgaattatata 26065068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 441
Target Start/End: Original strand, 45574811 - 45574877
Alignment:
Q  374 tgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  45574811 tgatgttgattatgatttgatgttctta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 45574877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 50686792 - 50686737
Alignment:
Q  392 gatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  50686792 gatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 50686737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 385 - 439
Target Start/End: Original strand, 13212841 - 13212894
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 439  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  13212841 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 13212894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 13989050 - 13988993
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  13989050 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 13988993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 385 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 21347144 - 21347091
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 439  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  21347144 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 21347091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 21475065 - 21475122
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  21475065 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 21475122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 21923269 - 21923326
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  21923269 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 21923326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 29776872 - 29776815
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  29776872 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 29776815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 31612497 - 31612440
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  31612497 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 31612440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 385 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 21477703 - 21477659
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcatta 429  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21477703 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatacgcatta 21477659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 45)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 8 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 36315110 - 36314690
Alignment:
Q  8 ctagtttcacaaaacattaattttaactaacgtagtctgatgctaatacctttagaaagaaatatattgcttaacaggctaatgatgctaatacatttaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36315110 ctagtttcacaaaacattaattttaactaacgtagtctgatgctaatacctttagaaagaaatatactgcttaacaggctaatgatgctaatacatt-aa 36315012  T
Q  108 tcatgcatttatttatttagtattttatttatgaattgttgctacactactagnnnnnnn-ggatagagttgctacactagtaattatttacgtatcgtg 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  36315011 tcatgcatttatttatttagtgttttatttatgaattgttgctacattagtagttttttttggatagagttgctacactagtaattatttacgtgtcttg 36314912  T
Q  207 gctaatttcaaataggctataaactgagtatccttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcaccgaatatttgctgctattttggccaaaagaatata 306  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36314911 gctaatttcaaataggttataaagtgagtatacttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcaccgaatatttgctgctattttggccgaaagaatata 36314812  T
Q  307 ttaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatgttacgtgattttgtttatgatttgatgttgttagtaat 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  36314811 ttaaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatattacgcgattttgttcataatttgatgttgtta-taat 36314713  T
Q  407 gtgatatatttgtatatgcatta 429  Q
    || ||||| |||||||| |||||    
T  36314712 gttatataattgtatatacatta 36314690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 384 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 42960729 - 42960608
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  42960729 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgtta 42960631  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtgttg 506  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  42960630 tatcttgagatgtttatgtgttg 42960608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 37598816 - 37598934
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  37598816 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgtta 37598914  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  37598915 tatcttgagatgtttatgtg 37598934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 6766015 - 6765901
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||    
T  6766015 tatgatttaatgttgatagtaatgtattatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatg-ttgattattatttgatgttgtta 6765917  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||||    
T  6765916 tatcttgagatgttta 6765901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 25574403 - 25574520
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||  |||    
T  25574403 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatta-ttgaaatagtta 25574500  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  25574501 tatcttgagatgtttatgtg 25574520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 25575596 - 25575713
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||  |||    
T  25575596 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatta-ttgaaatagtta 25575693  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  25575694 tatcttgagatgtttatgtg 25575713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 28370955 - 28371073
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  28370955 tatgatctgatgttgttagtaatgagatatatttgcatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgtta 28371053  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28371054 tatcttgagatgtttatgtg 28371073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 23469989 - 23469872
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | |  ||    
T  23469989 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgata-tggta 23469892  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23469891 tatcttgagatgtttatgtg 23469872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 25576789 - 25576906
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||    
T  25576789 tatgattttatgttgatagtaatgtgatatagttgtatatgcatgatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatta-ttgatattgtta 25576886  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  25576887 tatcttgagatgtttatgtg 25576906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Original strand, 30138862 - 30138976
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||  || |||    
T  30138862 tatgatttaatgttcgtagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatgttgtta 30138960  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||||    
T  30138961 tatcttgagatgttta 30138976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 402 - 499
Target Start/End: Original strand, 22107386 - 22107482
Alignment:
Q  402 gtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||    
T  22107386 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 22107482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 385 - 501
Target Start/End: Original strand, 26732768 - 26732882
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 484  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||   |  ||||||||||||||| ||| ||||    
T  26732768 atgatttaatgttgatagaaatgtgatatatttgtatatgcattatgtggattaaataagatgtttaagt--gtcgttgattattatttgatattgttat 26732865  T
Q  485 atcttgagatgtttatg 501  Q
    ||| |||||||||||||    
T  26732866 atcctgagatgtttatg 26732882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 384 - 465
Target Start/End: Original strand, 33895589 - 33895670
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgat 465  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  33895589 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgtttgat 33895670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 382 - 502
Target Start/End: Original strand, 21809513 - 21809632
Alignment:
Q  382 tttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattat 481  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |  | |||||||||   || |    
T  21809513 tttatgaattgaggttgttagtaatgtgatatatt-gtatatgcattatgtgatttacataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttggtgttgt 21809611  T
Q  482 tatatcttgagatgtttatgt 502  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  21809612 tctatcttgagatgtttatgt 21809632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 385 - 501
Target Start/End: Original strand, 26740581 - 26740695
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 484  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||| ||| ||||    
T  26740581 atgatttaatgttgatagaaatgtgatatatttgtatatgcattatgtggattaaataagatgtttaag-tgttg-ttgattattatttgatattgttat 26740678  T
Q  485 atcttgagatgtttatg 501  Q
    ||| | |||||||||||    
T  26740679 atccttagatgtttatg 26740695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 382 - 502
Target Start/End: Original strand, 21731393 - 21731512
Alignment:
Q  382 tttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattat 481  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |  | |||||||||   || |    
T  21731393 tttatgaattgaggttgttagtaatgagatatatt-gtatatgcattatgtgatttacataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttggtgttgt 21731491  T
Q  482 tatatcttgagatgtttatgt 502  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  21731492 tctatcttgagatgtttatgt 21731512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 385 - 488
Target Start/End: Original strand, 21328150 - 21328252
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 484  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||  |||    
T  21328150 atgatttgatgttataaataatgtgatatagttgtatatgcattatgtgatttatgtaagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgctat 21328248  T
Q  485 atct 488  Q
    ||||    
T  21328249 atct 21328252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 427 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 22336711 - 22336636
Alignment:
Q  427 ttatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22336711 ttatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtg 22336636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 427 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 22340249 - 22340174
Alignment:
Q  427 ttatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22340249 ttatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtg 22340174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 388 - 439
Target Start/End: Original strand, 38145441 - 38145492
Alignment:
Q  388 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 439  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38145441 atttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattat 38145492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 10816582 - 10816471
Alignment:
Q  391 tgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatctt 489  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| | ||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  10816582 tgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggagttatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatctt 10816485  T
Q  490 gagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||| ||||||    
T  10816484 gagatgtctatgtg 10816471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 23538608 - 23538497
Alignment:
Q  391 tgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatctt 489  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  23538608 tgatgttgttaacgatgtggtatatttgaaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatgatttgatattgttatatctt 23538511  T
Q  490 gagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||| ||||||    
T  23538510 gagatgtctatgtg 23538497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20572072 - 20572025
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgt 432  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20572072 atgatttgatgttgttagtaatgtaatatagttgtatatgcattatgt 20572025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 385 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 15796607 - 15796494
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaag-ttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||  ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| |||  ||    
T  15796607 atgatttgatgttgctaataatgtgatataattgtatatacagtatgcgaattataagagatgtttaagattgatg-ttgattatcatttgatattgcta 15796509  T
Q  484 tatcttgagatgttt 498  Q
    |||| |||| |||||    
T  15796508 tatcatgagctgttt 15796494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Original strand, 2154593 - 2154648
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2154593 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 2154648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Original strand, 20901988 - 20902043
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20901988 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 20902043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 498
Target Start/End: Original strand, 27988869 - 27988978
Alignment:
Q  393 atgttgttagtaatgtgatata--tttgtatatgcatt-atgtgaattatataagatgcttaa--gttgatgattgattattatttgacattattatatc 487  Q
    |||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||  ||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||    
T  27988869 atgttgttaagaatgtgatataaatttgtatatgcattgatgtgaattatacaagatgtttaaatgttgatg-ttgattatcatttgatattgttatatc 27988967  T
Q  488 ttgagatgttt 498  Q
     |||| |||||    
T  27988968 atgagctgttt 27988978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 40726040 - 40725984
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  40726040 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 40725984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 384 - 447
Target Start/End: Original strand, 22178153 - 22178216
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  22178153 tatgattggatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 22178216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 385 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 25743908 - 25743852
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtga--tatatttgtatatgcattatgtgaattat 439  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25743908 atgatttggtgttgttattaatgtgacatatatttatatatgcattatgtgaattat 25743852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 264746 - 264803
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  264746 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 264803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 20909196 - 20909139
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  20909196 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 20909139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 427 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 22750325 - 22750264
Alignment:
Q  427 ttatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatctt 489  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||| ||| |||||||||    
T  22750325 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattaccatttgatattgttatatctt 22750264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 29330118 - 29330061
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  29330118 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 29330061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 29346164 - 29346107
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  29346164 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 29346107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 29348637 - 29348580
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  29348637 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 29348580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 29351110 - 29351053
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  29351110 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 29351053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 384 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 29448191 - 29448137
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatta 438  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  29448191 tatgatttgatgttgataataaggtgatgtatttgtatatgcattacatgaatta 29448137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 32027577 - 32027520
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  32027577 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 32027520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 39363568 - 39363511
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  39363568 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 39363511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 93
Target Start/End: Original strand, 41860940 - 41861026
Alignment:
Q  8 ctagtttcacaaaacattaattttaactaac-gtagtctgatgctaatacctttagaaagaaatatattgcttaacaggctaatgat 93  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| | |||||||||||| | ||||| | |||||||||    
T  41860940 ctagtttgacagaagattaattttaactaacagtagcatgatgctattacctattgaaagaaatatactacttaagaagctaatgat 41861026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 42245343 - 42245400
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  42245343 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 42245400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 22144236 - 22144179
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 442  Q
    |||| |||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  22144236 atgaattgatgttgtttacaatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatata 22144179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 444 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 18356323 - 18356264
Alignment:
Q  444 gatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgt 504  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18356323 gatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 18356264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Original strand, 36154763 - 36154818
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  36154763 atgatttgatgatgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 36154818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 8 - 429
Target Start/End: Original strand, 633 - 1051
Alignment:
Q  8 ctagtttcacaaaacattaattttaactaacgtagtctgatgctaatacctttagaaagaaatatattgcttaacaggctaatgatgctaatacatttaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  633 ctagtttcacaaaacattaattttaactaacgtagtctgatgctaatacctttagaaagaaatatactgcttaacaggctaatgatgctaatacatt-aa 731  T
Q  108 tcatgcatttatttatttagtattttatttatgaattgttgctacactactagnnnnnnnggatagagttgctacactagtaattatttacgtatcgtgg 207  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||       ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  732 tcatgcatttatttatttagtgttttatttatgaattgttgctacattagtagtttttt-ggatagatttgctacactagtaattatttacgtgtcttgg 830  T
Q  208 ctaatttcaaataggctataaactgagtatccttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcaccgaatatttgctgctattttggccaaaagaatatat 307  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  831 ctaatttcaaataggttataaagtgagtatacttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcatcgaatatttgctgctattttggccgaaagaatatat 930  T
Q  308 taaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatgttacgtgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatg 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  931 taaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatattacgcgattttgttcataatttgatgttgtta-taatg 1029  T
Q  408 tgatatatttgtatatgcatta 429  Q
    | ||||| |||||||| |||||    
T  1030 ttatataattgtatatacatta 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 79)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 8 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 16495959 - 16495541
Alignment:
Q  8 ctagtttcacaaaacattaattttaactaacgtagtctgatgctaatacctttagaaagaaatatattgcttaacaggctaatgatgctaatacatttaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16495959 ctagtttcacaaaacattaattttaactaacgtagtctgatgctaatacctttagaaagaaatatactgcttaacaggctaatgatgctaatacatt-aa 16495861  T
Q  108 tcatgcatttatttatttagtattttatttatgaattgttgctacactactagnnnnnnnggatagagttgctacactagtaattatttacgtatcgtgg 207  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||       ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  16495860 tcatgcatttatttatttagtgttttatttatgaattgttgctacattagtagtttttt-ggatagatttgctacactagtaattatttacgtgtcttgg 16495762  T
Q  208 ctaatttcaaataggctataaactgagtatccttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcaccgaatatttgctgctattttggccaaaagaatatat 307  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16495761 ctaatttcaaataggttataaagtgagtatacttctaaaggattatgtgcatatgtatgagcatcgaatatttgctgctattttggccgaaagaatatat 16495662  T
Q  308 taaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatgttacgtgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatg 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  16495661 taaaatttcatagtaatatctttacaggcatgatagttatattgaaaattattttatgatattacgcgattttgttcataatttgatgttgtta-taatg 16495563  T
Q  408 tgatatatttgtatatgcatta 429  Q
    | ||||| |||||||| |||||    
T  16495562 ttatataattgtatatacatta 16495541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 384 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 20619568 - 20619446
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20619568 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataatatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgtta 20619469  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtgttg 506  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20619468 tatcttgagatgtttatgtgttg 20619446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 130750 - 130869
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  130750 tatgatttgatgttattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataaggtgtttaagttgatgattgattattatttgatattgtta 130849  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  130850 tatcttgagatgtttctgtg 130869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 11525497 - 11525616
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  11525497 tatgatatgatgttattagtaatttgatatattggtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgattgattattatttgatattgtta 11525596  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  11525597 tatcctgagatgtttatgtg 11525616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 11661459 - 11661341
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  11661459 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtta 11661361  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11661360 tatcttgagatgtttatgtg 11661341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 14566355 - 14566237
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  14566355 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgtta 14566257  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14566256 tatcttgagatgtttatgtg 14566237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 18872513 - 18872395
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  18872513 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgtta 18872415  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18872414 tatcttgagatgtttatgtg 18872395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 388 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 16008727 - 16008610
Alignment:
Q  388 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatc 487  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  16008727 atttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttatatc 16008629  T
Q  488 ttgagatgtttatgtgttg 506  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16008628 ttgagatgtttatgtgttg 16008610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 18607640 - 18607522
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  18607640 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattttta 18607542  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  18607541 tatattgagatgtttatgtg 18607522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 388 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 42462132 - 42462015
Alignment:
Q  388 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatc 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||    
T  42462132 atttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatattcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttatatc 42462034  T
Q  488 ttgagatgtttatgtgttg 506  Q
    |||||||||||||||||||    
T  42462033 ttgagatgtttatgtgttg 42462015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 386 - 506
Target Start/End: Original strand, 9033281 - 9033401
Alignment:
Q  386 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattata 485  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||| |||||    
T  9033281 tgatttgatgttgttaataatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgcattattatttgatattgttata 9033380  T
Q  486 tcttgagatgtttatgtgttg 506  Q
    || |||||| |||||||||||    
T  9033381 tcctgagatatttatgtgttg 9033401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 38519559 - 38519441
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  38519559 tatgatttgatgttattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattgtataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtta 38519461  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  38519460 tatcttgagatgtttatgtg 38519441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 384 - 506
Target Start/End: Original strand, 10501357 - 10501478
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  10501357 tatgatttgattttattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 10501455  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtgttg 506  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  10501456 tatcttgagatgtttatgtgttg 10501478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 11768852 - 11768972
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattg--attattatttgacattat 481  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||| ||| |    
T  11768852 tatgatttgaggttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgaaaatattatttgatattgt 11768950  T
Q  482 tatatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  11768951 tatatcttgagatgattatgtg 11768972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Original strand, 46580609 - 46580723
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  46580609 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 46580707  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||||    
T  46580708 tatcttgagatgttta 46580723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 384 - 506
Target Start/End: Original strand, 14157038 - 14157159
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  14157038 tatgatttgatatcattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 14157136  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtgttg 506  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14157137 tatcttgagatgtttatgtgttg 14157159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 384 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 32301474 - 32301353
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  32301474 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatctttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 32301376  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtgttg 506  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  32301375 tatcttgagatgtttacgtgttg 32301353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 14422138 - 14422019
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-cttaagttgatgattgattattatttgacattatt 482  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||    
T  14422138 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggatcatataagatgttttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtt 14422040  T
Q  483 atatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  14422039 atatcttgaggtgtttatgtg 14422019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 14258637 - 14258523
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  14258637 tatgatttgatattgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 14258539  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||||    
T  14258538 tatcttgagatgttta 14258523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 14273701 - 14273587
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  14273701 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 14273603  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||||    
T  14273602 tatcttgagatgttta 14273587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Original strand, 16460699 - 16460813
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||  || |||    
T  16460699 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatgttgtta 16460797  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||||    
T  16460798 tatcttgagatgttta 16460813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 16996408 - 16996291
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  || || |||||| | |||||| ||| |||    
T  16996408 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaa-atgttg-ttgattttcatttgatattgtta 16996311  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16996310 tatcttgagatgtttatgtg 16996291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 16998779 - 16998665
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  16998779 tatgatttaatgttgataataatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 16998681  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||||    
T  16998680 tatcttgagatgttta 16998665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 384 - 504
Target Start/End: Original strand, 1858765 - 1858884
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  1858765 tatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 1858863  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtgt 504  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  1858864 tatcttgagatgtttacgtgt 1858884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 16579945 - 16579831
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||||||  || |||    
T  16579945 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg-tttttgattatcatttgatgttgtta 16579847  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||||    
T  16579846 tatcttgagatgttta 16579831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Original strand, 16585718 - 16585832
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||||||  || |||    
T  16585718 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg-tttttgattatcatttgatgttgtta 16585816  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||||    
T  16585817 tatcttgagatgttta 16585832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 20487728 - 20487610
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||  || |||    
T  20487728 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatgttgtta 20487630  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    | ||||||||| ||||||||    
T  20487629 tgtcttgagatatttatgtg 20487610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 384 - 504
Target Start/End: Original strand, 25927185 - 25927301
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||| |||||| ||| |||    
T  25927185 tatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttg----ttgattatcatttgatattgtta 25927280  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtgt 504  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  25927281 tatcttgagatgtttacgtgt 25927301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 385 - 503
Target Start/End: Original strand, 9177600 - 9177717
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 484  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||    
T  9177600 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattattat 9177698  T
Q  485 atcttgagatgtttatgtg 503  Q
    || | || ||||| |||||    
T  9177699 atttggatatgttaatgtg 9177717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 384 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 13647593 - 13647503
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttga 475  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  13647593 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatg-ttgattatgatttga 13647503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 385 - 503
Target Start/End: Original strand, 17060358 - 17060476
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-cttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||  ||||| ||| |||    
T  17060358 atgatttaatgttgatagtaatgtcaaatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttgaag-ttgattatcgtttgatattgtta 17060456  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  17060457 tattttgagatgtttatgtg 17060476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 386 - 459
Target Start/End: Original strand, 9725595 - 9725668
Alignment:
Q  386 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatg 459  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9725595 tgatttaatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgatg 9725668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 384 - 504
Target Start/End: Original strand, 13918459 - 13918578
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| || || ||||| |||||| ||  |||    
T  13918459 tatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatatatgatgtttaagttgttg-ttaattatcatttgatatcgtta 13918557  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtgt 504  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  13918558 tatcttgagatgtttacgtgt 13918578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 17017401 - 17017519
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| | ||||  ||||||    
T  17017401 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatatgaattatttaagatgtttaagttgttg-ttgattatcacttgatgttatta 17017499  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||| || ||||| |||||    
T  17017500 tatctggatatgttaatgtg 17017519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 384 - 488
Target Start/End: Original strand, 14929154 - 14929257
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||     
T  14929154 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttggatatgcattatgtgaagtatttaagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttg 14929252  T
Q  484 tatct 488  Q
    |||||    
T  14929253 tatct 14929257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 384 - 488
Target Start/End: Original strand, 15352620 - 15352723
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||     
T  15352620 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttggatatgcattatgtgaagtatttaagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttg 15352718  T
Q  484 tatct 488  Q
    |||||    
T  15352719 tatct 15352723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 385 - 447
Target Start/End: Original strand, 1867929 - 1867991
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  1867929 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatg 1867991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 385 - 447
Target Start/End: Original strand, 15008433 - 15008495
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  15008433 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatg 15008495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 390 - 503
Target Start/End: Original strand, 16109453 - 16109565
Alignment:
Q  390 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgt-gaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatct 488  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| |||  |||||||    
T  16109453 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgtaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgctatatct 16109550  T
Q  489 tgagatgtttatgtg 503  Q
    |||||||| ||||||    
T  16109551 tgagatgtctatgtg 16109565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 384 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 48991367 - 48991266
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| | |||| |||||||    
T  48991367 tatgatttaatgttgatagtaat-tgatatatt-gtatatgcattatctgaattatttaagatgtttaagttgttg-ttgattatcacttgatattatta 48991271  T
Q  484 tatct 488  Q
    |||||    
T  48991270 tatct 48991266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 384 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 147771 - 147708
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  147771 tatgatttgatgttgtgagtaatgagatatatttgtataagcattatgtggattatatgagatg 147708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 384 - 447
Target Start/End: Original strand, 2529987 - 2530050
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    |||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2529987 tatgatttaatgttgatagtgatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatg 2530050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 385 - 447
Target Start/End: Original strand, 20220124 - 20220186
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  20220124 atgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatgatg 20220186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 503
Target Start/End: Original strand, 837311 - 837408
Alignment:
Q  405 atgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  837311 atgtgttatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtg 837408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 503
Target Start/End: Original strand, 1202491 - 1202588
Alignment:
Q  405 atgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1202491 atgtgttatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtg 1202588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 426 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 15720140 - 15720068
Alignment:
Q  426 attatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgttta 499  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||    
T  15720140 attaagtgaattagataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 15720068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 394 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 16091934 - 16091827
Alignment:
Q  394 tgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgaga 493  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||| || || |||||||| |||||| |||||||||| | || |    
T  16091934 tgttgttaataatgttacatatttgtatacgcattatgtggattatatatgatgattaag-tgttg-ttgattatcatttgatattattatatttggata 16091837  T
Q  494 tgtttatgtg 503  Q
    |||| |||||    
T  16091836 tgttaatgtg 16091827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 38828409 - 38828298
Alignment:
Q  390 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatct 488  Q
    |||||||||||| | | ||| || ||||| | |||||||||||| | ||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  38828409 ttgatgttgttaatgacgtggtagatttgcaaatgcattatgtggacttatataggatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattattatatct 38828312  T
Q  489 tgagatgtttatgt 502  Q
    |||||||| |||||    
T  38828311 tgagatgtctatgt 38828298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 418 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 18203965 - 18203887
Alignment:
Q  418 gtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgttt 498  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18203965 gtatatgcattgtgtggattatatatgatgattaagt-gttg-ttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 18203887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 405 - 503
Target Start/End: Original strand, 833315 - 833412
Alignment:
Q  405 atgtgatatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| || |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  833315 atgtggtatatttgcaaatgcattatgtgaaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcaattgatattgttatatcttgagatgtctatgtg 833412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 405 - 503
Target Start/End: Original strand, 1198495 - 1198592
Alignment:
Q  405 atgtgatatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| || |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1198495 atgtggtatatttgcaaatgcattatgtgaaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcaattgatattgttatatcttgagatgtctatgtg 1198592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 374 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 13647522 - 13647456
Alignment:
Q  374 tgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  13647522 tgatgttgattatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 13647456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 374 - 441
Target Start/End: Original strand, 15081918 - 15081984
Alignment:
Q  374 tgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  15081918 tgatgttgattatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatat 15081984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 385 - 442
Target Start/End: Original strand, 2280053 - 2280110
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 442  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  2280053 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatata 2280110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Original strand, 17061895 - 17061950
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  17061895 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 17061950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Original strand, 19486678 - 19486734
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||    
T  19486678 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatat 19486734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 18279418 - 18279375
Alignment:
Q  461 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgt 504  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18279418 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgt 18279375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 18283381 - 18283338
Alignment:
Q  461 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgt 504  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18283381 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgt 18283338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 456505 - 456448
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  456505 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 456448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 8940383 - 8940322
Alignment:
Q  437 tatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgttta 499  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||    
T  8940383 tatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 8940322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 427 - 489
Target Start/End: Original strand, 10896687 - 10896748
Alignment:
Q  427 ttatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatctt 489  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||| ||| |||||||||    
T  10896687 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattaccatttgatattgttatatctt 10896748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 11393265 - 11393322
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  11393265 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 11393322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 11972680 - 11972623
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  11972680 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 11972623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 14949100 - 14949157
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  14949100 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 14949157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 427 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 15167346 - 15167285
Alignment:
Q  427 ttatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatctt 489  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||| ||| |||||||||    
T  15167346 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattaccatttgatattgttatatctt 15167285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 15376691 - 15376748
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  15376691 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 15376748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 16232704 - 16232647
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  16232704 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 16232647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 18430896 - 18430839
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  18430896 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 18430839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 20385101 - 20385158
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  20385101 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 20385158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 21189573 - 21189630
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  21189573 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 21189630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 24702422 - 24702365
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24702422 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24702365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 24704869 - 24704812
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24704869 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24704812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 27217044 - 27216987
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  27217044 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 27216987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 32125675 - 32125618
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  32125675 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 32125618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 41523101 - 41523044
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  41523101 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 41523044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 41525563 - 41525506
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  41525563 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 41525506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 442
Target Start/End: Original strand, 12255730 - 12255782
Alignment:
Q  390 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 442  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  12255730 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatata 12255782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 385 - 429
Target Start/End: Original strand, 12756651 - 12756694
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcatta 429  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  12756651 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcatta 12756694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 44116691 - 44116636
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||    
T  44116691 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatat 44116636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 384 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 1126 - 1004
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1126 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattctta 1027  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtgttg 506  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1026 tatcttgagatgtttatgtgttg 1004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 116; Significance: 9e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 3144 - 3025
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3144 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgtta 3045  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3044 tatcttgagatgtttatgtg 3025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 116; Significance: 9e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 142769 - 142650
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  142769 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgtta 142670  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  142669 tatcttgagatgtttatgtg 142650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 403 - 499
Target Start/End: Original strand, 169702 - 169797
Alignment:
Q  403 taatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgttta 499  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||    
T  169702 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 169797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 56)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 384 - 506
Target Start/End: Original strand, 17438150 - 17438272
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17438150 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataatatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgtta 17438249  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtgttg 506  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  17438250 tatcttgagatgtttatgtgttg 17438272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 5083087 - 5083206
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5083087 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatcatataagatccttaagttgatgattgattattatttgacattgtta 5083186  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5083187 tatcttgagatgtttatgtg 5083206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 17086087 - 17086205
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||    
T  17086087 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatatttaagttgatg-ttgattattatttggtattgtta 17086185  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17086186 tatcttgagatgtttatgtg 17086205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 386 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 37515890 - 37515774
Alignment:
Q  386 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattata 485  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||    
T  37515890 tgatttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttata 37515792  T
Q  486 tcttgagatgtttatgtg 503  Q
    |||||| |||||||||||    
T  37515791 tcttgatatgtttatgtg 37515774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 23667996 - 23667877
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||| ||| |||    
T  23667996 tatgatttgaggttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatatgaattatataagatgtttaagttgatgttaaaatattatttgatattgtta 23667897  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  23667896 tatcttgagatggttatgtg 23667877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 18833749 - 18833631
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-cttaagttgatgattgattattatttgacattatt 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||    
T  18833749 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatgtgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttgatg-ttgtttattatttgatattgtt 18833651  T
Q  483 atatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  18833650 atatc-tgagatgtttatgtg 18833631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 384 - 504
Target Start/End: Original strand, 25363136 - 25363255
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  25363136 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 25363234  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtgt 504  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  25363235 tatcttgagatgtttacgtgt 25363255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 384 - 505
Target Start/End: Original strand, 17460986 - 17461106
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  17460986 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 17461084  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtgtt 505  Q
    |||||  |||||||||||||||    
T  17461085 tatctctagatgtttatgtgtt 17461106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 384 - 505
Target Start/End: Original strand, 22237953 - 22238073
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  22237953 tatgatttaatgttgatagtaatgtattatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 22238051  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtgtt 505  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  22238052 tatcttgagatgtttacgtgtt 22238073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Original strand, 19808296 - 19808410
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  19808296 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttatgttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 19808394  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||||    
T  19808395 tatcttgagatgttta 19808410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 20502035 - 20502153
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||| |||| |||||| ||| |||    
T  20502035 tatgatttgatgttgttagtaatatgacatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttatgttgttg-ttggttatcatttgatattgtta 20502133  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  20502134 tatcttgagatatttatgtg 20502153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 23659594 - 23659476
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  23659594 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 23659496  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    |||||  |||||||||||||    
T  23659495 tatctcaagatgtttatgtg 23659476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 23943927 - 23944045
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| | |||| |||||||    
T  23943927 tatgatttgatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttg-ttgattatcacttgatattatta 23944025  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||| || ||||| |||||    
T  23944026 tatctggatatgttaatgtg 23944045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 384 - 486
Target Start/End: Original strand, 25484173 - 25484274
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||    
T  25484173 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatgatttgatgttatta 25484271  T
Q  484 tat 486  Q
    |||    
T  25484272 tat 25484274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 389 - 502
Target Start/End: Original strand, 22963351 - 22963464
Alignment:
Q  389 tttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatct 488  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| | ||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||    
T  22963351 tttgatgttgttggtaatgtgatataattgtatatgcattgtgtgaattataaaatatgttaaagttgatgttgaattattatttgatattgttatatct 22963450  T
Q  489 tgagatgtttatgt 502  Q
    ||||||||||||||    
T  22963451 tgagatgtttatgt 22963464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 384 - 504
Target Start/End: Original strand, 14397796 - 14397915
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||| | |||| ||| |||    
T  14397796 tatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgctg-ttgattatcaattgatattgtta 14397894  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtgt 504  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  14397895 tatcttgagatgtttacgtgt 14397915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 22253099 - 22253217
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| ||| |||    
T  22253099 tatgatttgatgttcttagtaatgtgataaagttatatatgcattatgtggatcacataagatgtttaagttgatg-ttaattatcatttgatattgtta 22253197  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  22253198 tatcttgagatgtatatgtg 22253217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 385 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 16799673 - 16799561
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-cttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  16799673 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaaatatataagatgttttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtta 16799575  T
Q  484 tatcttgagatgtt 497  Q
    ||||| || |||||    
T  16799574 tatctggatatgtt 16799561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 385 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 22996029 - 22995927
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 484  Q
    |||||||||||||   | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||    
T  22996029 atgatttgatgttaaaaataatgtgatatagttgtatatgcattatgtgatttatgtaagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttat 22995931  T
Q  485 atct 488  Q
    ||||    
T  22995930 atct 22995927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 384 - 447
Target Start/End: Original strand, 27941588 - 27941651
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  27941588 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatatgagatg 27941651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 384 - 498
Target Start/End: Original strand, 19154819 - 19154932
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| || |||||||  | |||| |||||||    
T  19154819 tatgatttaatgttgatactaatgtaatatatttgtatatgcattatctgaattatttaagatgtttaagttgttg-ttgattagcacttgatattatta 19154917  T
Q  484 tatcttgagatgttt 498  Q
    ||||| || ||||||    
T  19154918 tatctggatatgttt 19154932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 385 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 28397735 - 28397635
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-cttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||| || || ||| |||    
T  28397735 atgatttaatgttgttaataatgtgatatatt-gtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatg-ttgattattcttggatattgtta 28397638  T
Q  484 tat 486  Q
    |||    
T  28397637 tat 28397635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 385 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 37116535 - 37116473
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  37116535 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatg 37116473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 384 - 456
Target Start/End: Original strand, 21346166 - 21346239
Alignment:
Q  384 tatgatttgat-gttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttg 456  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21346166 tatgatttgattgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatatttaagttg 21346239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 394 - 498
Target Start/End: Original strand, 20533352 - 20533455
Alignment:
Q  394 tgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgaga 493  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| || | |||| |||||||||||| || |    
T  20533352 tgttgatagtaatgtaatataattgtatatgcattttgtgaattatttaagatgtttaagttgttg-ttgatcatcacttgatattattatatctggata 20533450  T
Q  494 tgttt 498  Q
    |||||    
T  20533451 tgttt 20533455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 385 - 447
Target Start/End: Original strand, 2418808 - 2418870
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2418808 atgatttgatgttgttaacaatgtgatatgattgtatatgcattatgtgaattatatatgatg 2418870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 385 - 447
Target Start/End: Original strand, 35026797 - 35026859
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35026797 atgatttgatgttgttaataatgtgatatgattttatatgcattatgtgaattatatatgatg 35026859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 502
Target Start/End: Original strand, 14103167 - 14103275
Alignment:
Q  393 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgag 492  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||||||| ||    
T  14103167 atgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttaag 14103265  T
Q  493 atgtttatgt 502  Q
     |||| ||||    
T  14103266 ttgttaatgt 14103275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 384 - 447
Target Start/End: Original strand, 17439439 - 17439502
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  17439439 tatgatttaatgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatg 17439502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Original strand, 13508019 - 13508075
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  13508019 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 13508075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Original strand, 13597551 - 13597607
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  13597551 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 13597607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 384 - 447
Target Start/End: Original strand, 17266926 - 17266989
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  17266926 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatgatg 17266989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 384 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 22364849 - 22364786
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  22364849 tatgatttgatgttgttaataaagtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 22364786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 23409930 - 23409868
Alignment:
Q  436 ttatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgttta 499  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||    
T  23409930 ttatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 23409868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 384 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 20498750 - 20498692
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 442  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  20498750 tatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatata 20498692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 439
Target Start/End: Original strand, 22419349 - 22419403
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 439  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22419349 atgatttaatgttgtcaataatgtgatatgattgtatatgcattatgtgaattat 22419403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 426 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 23914183 - 23914106
Alignment:
Q  426 attatgtgaatta-tataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | |||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  23914183 attatgtgaattaatataagatgtttaagttgttgct-gattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttatgtg 23914106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 41598370 - 41598315
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  41598370 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 41598315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 22525702 - 22525659
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcatt 428  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22525702 atgatttaatgttgttggtaatgtcatatatttgtatatgcatt 22525659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 24353208 - 24353145
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||  |||||| |||| ||||    
T  24353208 tatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatacgatg 24353145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 441
Target Start/End: Original strand, 25484244 - 25484310
Alignment:
Q  374 tgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  25484244 tgatgttgattatgatttgatgttatta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 25484310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 1484586 - 1484529
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  1484586 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 1484529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 4483464 - 4483407
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  4483464 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 4483407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 5853270 - 5853327
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  5853270 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 5853327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 393 - 431
Target Start/End: Original strand, 13665189 - 13665227
Alignment:
Q  393 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatg 431  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  13665189 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatg 13665227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 393 - 431
Target Start/End: Original strand, 13724464 - 13724502
Alignment:
Q  393 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatg 431  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  13724464 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatg 13724502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 14409422 - 14409479
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  14409422 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 14409479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 15203209 - 15203266
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  15203209 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 15203266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 19896452 - 19896395
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  19896452 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 19896395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 20046173 - 20046230
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  20046173 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 20046230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 20403411 - 20403354
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  20403411 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 20403354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 22001937 - 22001880
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  22001937 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 22001880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 24486022 - 24486079
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24486022 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24486079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 32810115 - 32810058
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  32810115 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 32810058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 427 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 44476814 - 44476753
Alignment:
Q  427 ttatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatctt 489  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||| ||| |||||||||    
T  44476814 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattaccatttgatattgttatatctt 44476753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 427 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 44480076 - 44480015
Alignment:
Q  427 ttatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatctt 489  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||| ||| |||||||||    
T  44480076 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattaccatttgatattgttatatctt 44480015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 61)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 384 - 506
Target Start/End: Original strand, 19201908 - 19202030
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19201908 tatgatttgaagttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatatgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgtta 19202007  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtgttg 506  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19202008 tatcttgagatgtttatgtgttg 19202030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 388 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 21237936 - 21237821
Alignment:
Q  388 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatc 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||    
T  21237936 atttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgatgaattattatttgatattgttatatc 21237837  T
Q  488 ttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||    
T  21237836 ttgagatgtttatgtg 21237821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 9242113 - 9241995
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  9242113 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtta 9242015  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9242014 tatcttgagatgtttatgtg 9241995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 19662354 - 19662472
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  19662354 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgtta 19662452  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19662453 tatcttgagatgtttatgtg 19662472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 21073426 - 21073544
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  21073426 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatattcattatgtggattatataagatatttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtta 21073524  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21073525 tatcttgagatgtttatgtg 21073544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 384 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 34137127 - 34137006
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  34137127 tatgatgtgatgttactagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtta 34137029  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtgttg 506  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  34137028 tctcttgagatgtttatgtgttg 34137006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Original strand, 18358667 - 18358781
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||    
T  18358667 tatgatttaatgttgatagtaatgtattatatttgtatatgcaatatgtgaattatataagatgcttaagttgatg-ttgattattatttgatgttgtta 18358765  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||||    
T  18358766 tatcttgagatgttta 18358781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 388 - 503
Target Start/End: Original strand, 30643984 - 30644098
Alignment:
Q  388 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatc 487  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  30643984 atttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagtagat-attgattatcatttgatattgttatatc 30644082  T
Q  488 ttgagatgtttatgtg 503  Q
    |||||| |||||||||    
T  30644083 ttgagacgtttatgtg 30644098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 388 - 503
Target Start/End: Original strand, 6261081 - 6261196
Alignment:
Q  388 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtata-tgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatat 486  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  6261081 atttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatattgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttatat 6261179  T
Q  487 cttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||| |||||||||    
T  6261180 cttgagacgtttatgtg 6261196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Original strand, 21081670 - 21081784
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  21081670 tatgatttaatgttgatactaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttttta 21081768  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    |||||| |||||||||    
T  21081769 tatctttagatgttta 21081784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Original strand, 23069217 - 23069331
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||| | | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  23069217 tatgatttgatgttgatggcaatgtaatatatttttatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 23069315  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||||    
T  23069316 tatcttgagatgttta 23069331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 27472606 - 27472492
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  27472606 tatgatttaatgttgatagtaatataatatatttgtatatgcattatgtgaattatataatatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 27472508  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||||    
T  27472507 tatcttgagatgttta 27472492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Original strand, 34874146 - 34874260
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  34874146 tatgatttaatgttgaaagtattgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 34874244  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||||    
T  34874245 tatcttgagatgttta 34874260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 394 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 31345293 - 31345184
Alignment:
Q  394 tgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgaga 493  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  31345293 tgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttatatcttgaga 31345195  T
Q  494 tgtttatgtgt 504  Q
    |||||| ||||    
T  31345194 tgtttacgtgt 31345184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 384 - 475
Target Start/End: Original strand, 22173727 - 22173817
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttga 475  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22173727 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattaagtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatgatttga 22173817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 400 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 23287534 - 23287438
Alignment:
Q  400 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgttt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| || || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23287534 tagtaatgtgatatatttgtatatgcaatatgtggattatatatgatgattaag-tgttg-ttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 23287438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 9784867 - 9784750
Alignment:
Q  384 tatgatttgat-gttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatt 482  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | || |||||||| ||| ||  || ||    
T  9784867 tatgatttgattgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag--gttg-ttgattatcattggatgttgtt 9784771  T
Q  483 atatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9784770 atatcttgagatgtttatgtg 9784750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 393 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 26392559 - 26392453
Alignment:
Q  393 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgag 492  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||  ||  ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  26392559 atgttgatagaaaggtgatatatttgtatatgcattatgtggattagataagatgtttaagt--attgttgattattatttgatattgttatatcctgag 26392462  T
Q  493 atgtttatg 501  Q
    |||||||||    
T  26392461 atgtttatg 26392453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 389 - 497
Target Start/End: Original strand, 18546883 - 18546991
Alignment:
Q  389 tttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatt-atataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatc 487  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||  |||||||||| ||||||||  ||||| ||| |||| ||    
T  18546883 tttgatgttgttagtaatgtgatacatttgtatatgcattatgtaaattaatgtaagatgtctaagttgatg-ttgattatcctttgatattgttatgtc 18546981  T
Q  488 ttgagatgtt 497  Q
    | || |||||    
T  18546982 tggatatgtt 18546991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 385 - 488
Target Start/End: Original strand, 43947306 - 43947408
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgct-taagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||| || || ||| |||    
T  43947306 atgatttaatgttgttaataatgtgatata-ttgtatatgcactatgtgaattatatgagatgttgtaagttgatg-ttgattattcttggatattgtta 43947403  T
Q  484 tatct 488  Q
    |||||    
T  43947404 tatct 43947408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 385 - 447
Target Start/End: Original strand, 20520127 - 20520189
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  20520127 atgatttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatg 20520189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 22703279 - 22703167
Alignment:
Q  390 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatct 488  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||| || |||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  22703279 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaaattg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatct 22703182  T
Q  489 tgagatgtttatgtg 503  Q
    |||||||| ||||||    
T  22703181 tgagatgtctatgtg 22703167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 391 - 503
Target Start/End: Original strand, 13101577 - 13101689
Alignment:
Q  391 tgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgt-gaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttga-cattattatatct 488  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| || |||||||| ||||||  ||| ||||||||    
T  13101577 tgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgataatttttatatct 13101674  T
Q  489 tgagatgtttatgtg 503  Q
    |||||||| ||||||    
T  13101675 tgagatgtctatgtg 13101689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 384 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 23791462 - 23791404
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 442  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  23791462 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatata 23791404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 385 - 442
Target Start/End: Original strand, 24529508 - 24529564
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 442  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24529508 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatata 24529564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 374 - 441
Target Start/End: Original strand, 22173798 - 22173864
Alignment:
Q  374 tgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  22173798 tgatgttgattatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 22173864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 384 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 23207465 - 23207410
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 439  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||    
T  23207465 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattat 23207410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 374 - 441
Target Start/End: Original strand, 24642825 - 24642891
Alignment:
Q  374 tgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24642825 tgatgttgattatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24642891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 384 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 25109076 - 25109013
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  25109076 tatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 25109013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 439
Target Start/End: Original strand, 22413070 - 22413124
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 439  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||    
T  22413070 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattat 22413124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 24671129 - 24671068
Alignment:
Q  437 tatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgttta 499  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24671129 tatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 24671068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 32039476 - 32039533
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  32039476 ttatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 32039533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Original strand, 23708553 - 23708609
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23708553 atgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 23708609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 433
Target Start/End: Original strand, 24834804 - 24834844
Alignment:
Q  393 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg 433  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24834804 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgtg 24834844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 19672010 - 19671960
Alignment:
Q  390 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  19672010 ttgatgttgtta-taatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 19671960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 23004937 - 23004874
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    |||||||| | ||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23004937 tatgatttaacgttgttaatgatgttaaatatttgtatatgcattatgtggattatatatgatg 23004874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 384 - 442
Target Start/End: Original strand, 7666 - 7724
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 442  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  7666 tatgatttaatgttgttgttaatgtgatataattgtatatacattacttgaattatata 7724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 571581 - 571524
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  571581 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 571524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 6726179 - 6726122
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  6726179 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 6726122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 18809127 - 18809070
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  18809127 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 18809070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 21155038 - 21155095
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  21155038 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 21155095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 22105597 - 22105540
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  22105597 ttataatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 22105540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 23131046 - 23130989
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23131046 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 23130989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 23133513 - 23133456
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23133513 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 23133456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 499
Target Start/End: Original strand, 23707275 - 23707336
Alignment:
Q  437 tatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgttta 499  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||    
T  23707275 tatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 23707336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 23709510 - 23709567
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23709510 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 23709567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 23711991 - 23712048
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23711991 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 23712048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 24367958 - 24367901
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24367958 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24367901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 384 - 442
Target Start/End: Original strand, 24697539 - 24697597
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 442  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||| ||||    
T  24697539 tatgattttatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtata 24697597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 24898173 - 24898230
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24898173 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24898230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 24900656 - 24900713
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24900656 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24900713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 24903133 - 24903190
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24903133 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24903190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 24905610 - 24905667
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24905610 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24905667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 24908085 - 24908142
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24908085 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24908142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 24918244 - 24918183
Alignment:
Q  437 tatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgttta 499  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||    
T  24918244 tatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 24918183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 26505563 - 26505506
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  26505563 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 26505506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 26508041 - 26507984
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  26508041 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 26507984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 28577283 - 28577226
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  28577283 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 28577226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 34402500 - 34402557
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  34402500 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 34402557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 39682497 - 39682440
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  39682497 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 39682440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 393 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 26903483 - 26903443
Alignment:
Q  393 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg 433  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  26903483 atgttgttagtaatgtgatatacttatacatgcattatgtg 26903443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 2604 - 2723
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  2604 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacatggata 2703  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2704 tatcttgagatgtttatgtg 2723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 384 - 442
Target Start/End: Original strand, 7992 - 8050
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 442  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||||    
T  7992 tatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatata 8050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 7617 - 7500
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7617 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgtta 7518  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||  ||||||||||||    
T  7517 tatctt--gatgtttatgtg 7500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 14736 - 14619
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14736 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgtta 14637  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||  ||||||||||||    
T  14636 tatctt--gatgtttatgtg 14619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 51)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 15041895 - 15042014
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  15041895 tatgatttgatgttcttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgattaagttgatgattgattattatttgacattgata 15041994  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  15041995 tatcttaagatgtttatgtg 15042014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 15112529 - 15112410
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  15112529 tatgatttgatgtttttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgattaagttgatgattgattattatttgacattgata 15112430  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  15112429 tatcttaagatgtttatgtg 15112410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 18212919 - 18212801
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  18212919 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtta 18212821  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18212820 tatcttgagatgtttatgtg 18212801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 14852809 - 14852928
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||| ||| |||    
T  14852809 tatgatttgaggttgttagtaatgtgatatatttgcatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtta 14852908  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14852909 tatcttgagatgtttatgtg 14852928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 24047233 - 24047351
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  24047233 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtta 24047331  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  24047332 tatcttaagatgtttatgtg 24047351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 32306929 - 32307047
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||    
T  32306929 tatggtttgatgttgatagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattattatttaatattgtta 32307027  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  32307028 tatcttgagatgtttatgtg 32307047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 386 - 503
Target Start/End: Original strand, 13591862 - 13591978
Alignment:
Q  386 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattata 485  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||    
T  13591862 tgatttaatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttata 13591960  T
Q  486 tcttgagatgtttatgtg 503  Q
    | ||||||||||||||||    
T  13591961 ttttgagatgtttatgtg 13591978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 385 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 16043198 - 16043087
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||    
T  16043198 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttat 16043100  T
Q  485 atcttgagatgtt 497  Q
    |||||||||||||    
T  16043099 atcttgagatgtt 16043087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 10056825 - 10056711
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  10056825 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 10056727  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||||    
T  10056726 tatcttgagatgttta 10056711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Original strand, 17048068 - 17048182
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  17048068 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtacatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 17048166  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||||    
T  17048167 tatcttgagatgttta 17048182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 26050409 - 26050526
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || || |||||| | |||||| ||| |||    
T  26050409 tatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag-tgttg-ttgattttcatttgatattgtta 26050506  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  26050507 tatcttgagatgtttttgtg 26050526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 384 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 17333467 - 17333352
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaa--gttgatgattgattattatttgacattat 481  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||  |||| ||||| |||||||||||| ||| |    
T  17333467 tatgatttaatgttgttagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtggattatatatgatgattaagtgttgttgatt-attattatttgatattgt 17333369  T
Q  482 tatatcttgagatgttt 498  Q
    |||||||||||||||||    
T  17333368 tatatcttgagatgttt 17333352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 389 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 40907253 - 40907137
Alignment:
Q  389 tttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatct 488  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  40907253 tttgatgttgttaatgatgtgaaatatttgtaaatgcattatgtggattatatatgatgtttatgttgatg-ttgattatcatttgatatttttatatct 40907155  T
Q  489 tgagatgtttatgtgttg 506  Q
    ||||||||||||||||||    
T  40907154 tgagatgtttatgtgttg 40907137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 384 - 475
Target Start/End: Original strand, 51463766 - 51463856
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttga 475  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  51463766 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatgatttga 51463856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 384 - 473
Target Start/End: Original strand, 23803163 - 23803251
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattattt 473  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  23803163 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatgattt 23803251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 390 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 40907094 - 40906983
Alignment:
Q  390 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatctt 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  40907094 ttgatgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcatgatgtggattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatctt 40906997  T
Q  490 gagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||    
T  40906996 gagatgtttatgtg 40906983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 385 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 15791960 - 15791857
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 484  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |  |||||  ||||| ||| ||||    
T  15791960 atgatttgatgttgttaataatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatacaagatgtttaagttgatgttgaattatcctttgatattgttat 15791861  T
Q  485 atct 488  Q
    ||||    
T  15791860 atct 15791857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 388 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 26789521 - 26789440
Alignment:
Q  388 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatt-atataagatgcttaagttgatgattgattatt 469  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26789521 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatg-ttgattatt 26789440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 384 - 475
Target Start/End: Original strand, 630602 - 630692
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttga 475  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  630602 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttaaagttgatg-ttgattatgatttga 630692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 386 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 14825653 - 14825551
Alignment:
Q  386 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-cttaagttgatgattgattattatttgacattattat 484  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||    
T  14825653 tgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatg-ttgattattcttggatattgttat 14825555  T
Q  485 atct 488  Q
    ||||    
T  14825554 atct 14825551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 384 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 12611204 - 12611117
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttga 475  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12611204 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcatt---tgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatgatttga 12611117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 390 - 503
Target Start/End: Original strand, 4831475 - 4831587
Alignment:
Q  390 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatct 488  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  4831475 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatct 4831572  T
Q  489 tgagatgtttatgtg 503  Q
    |||||||| ||||||    
T  4831573 tgagatgtctatgtg 4831587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 390 - 503
Target Start/End: Original strand, 4834770 - 4834882
Alignment:
Q  390 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatct 488  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  4834770 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatct 4834867  T
Q  489 tgagatgtttatgtg 503  Q
    |||||||| ||||||    
T  4834868 tgagatgtctatgtg 4834882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 14047820 - 14047708
Alignment:
Q  390 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatct 488  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  14047820 ttgatattgttaatgatgtggtatattcgtaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatct 14047723  T
Q  489 tgagatgtttatgtg 503  Q
    |||||||| ||||||    
T  14047722 tgagatgtctatgtg 14047708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 390 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 30146567 - 30146453
Alignment:
Q  390 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatct 488  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||| | |||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  30146567 ttgatattgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattaagtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatct 30146470  T
Q  489 tgagatgtttatgtgtt 505  Q
    |||||||| ||||||||    
T  30146469 tgagatgtctatgtgtt 30146453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 384 - 447
Target Start/End: Original strand, 53082085 - 53082148
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  53082085 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 53082148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 380 - 442
Target Start/End: Original strand, 13780 - 13842
Alignment:
Q  380 tgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 442  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  13780 tgtttatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatata 13842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 384 - 447
Target Start/End: Original strand, 46640389 - 46640452
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  46640389 tatgatttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 46640452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 374 - 441
Target Start/End: Original strand, 51463837 - 51463903
Alignment:
Q  374 tgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  51463837 tgatgttgattatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattatttgaattatat 51463903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 18215252 - 18215309
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  18215252 ttatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 18215309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 385 - 442
Target Start/End: Original strand, 52243128 - 52243185
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 442  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||    
T  52243128 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatata 52243185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 12611136 - 12611070
Alignment:
Q  374 tgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||  ||||||||||    
T  12611136 tgatgttgattatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 12611070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 424 - 503
Target Start/End: Original strand, 26045268 - 26045345
Alignment:
Q  424 gcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| || || |||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  26045268 gcattatgtggattatataagatgtttaag-tgttg-ttgattttcatttgatattgttatatcttgagatgtttttgtg 26045345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 1837487 - 1837544
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||    
T  1837487 ttattatttgatgttgtta-taatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatat 1837544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 7641170 - 7641227
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  7641170 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 7641227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 499
Target Start/End: Original strand, 14746570 - 14746631
Alignment:
Q  437 tatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgttta 499  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||    
T  14746570 tatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 14746631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 15118330 - 15118387
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  15118330 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 15118387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 15355302 - 15355359
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  15355302 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatat 15355359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 384 - 442
Target Start/End: Original strand, 43198486 - 43198544
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 442  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  43198486 tatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatata 43198544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 44615472 - 44615415
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  44615472 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 44615415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 52312694 - 52312637
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  52312694 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 52312637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 438 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 14185112 - 14185045
Alignment:
Q  438 atataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttg 506  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||   | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  14185112 atatgagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgatgttatatcttgagacgtttatgtgttg 14185045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 393 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 15365248 - 15365208
Alignment:
Q  393 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg 433  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  15365248 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgaattatgtg 15365208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 15367876 - 15367821
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||    
T  15367876 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatat 15367821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 15371388 - 15371333
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||    
T  15371388 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatat 15371333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 15373669 - 15373614
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||    
T  15373669 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatat 15373614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 15402889 - 15402834
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||    
T  15402889 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatat 15402834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 393 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 27996090 - 27996050
Alignment:
Q  393 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg 433  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  27996090 atgttgttagtaatgtgatacaattatatatgcattatgtg 27996050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 44102396 - 44102341
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  44102396 atgatttgatgatgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 44102341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 383 - 439
Target Start/End: Original strand, 44773065 - 44773120
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 439  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  44773065 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 44773120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Original strand, 44928858 - 44928914
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||| ||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  44928858 atgattttatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 44928914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 7422 - 7541
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  7422 tatgattatatgctgttagtaatgtgatatatttgtgtatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgata 7521  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7522 tatcttgagatgtttatgtg 7541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 2081 - 1963
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  2081 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtta 1983  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1982 tatcttgagatgtttatgtg 1963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 110840 - 110722
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||    
T  110840 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgtta 110742  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  110741 tatcttgagatgtttatgtg 110722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 57)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 23838361 - 23838243
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  23838361 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtta 23838263  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23838262 tatcttgagatgtttatgtg 23838243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 388 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 4477007 - 4476893
Alignment:
Q  388 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatc 487  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  4477007 atttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttatatc 4476909  T
Q  488 ttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||    
T  4476908 ttgagatgtttatgtg 4476893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 18453369 - 18453251
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  18453369 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgattttgtta 18453271  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18453270 tatcttgagatgtttatgtg 18453251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Original strand, 15817455 - 15817569
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||| ||| |||    
T  15817455 tatgatttgatgttgttagtaatgtggtatatttgaatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatg-ttaattatcatttgatattgtta 15817553  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||||    
T  15817554 tatcttgagatgttta 15817569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Original strand, 19773476 - 19773590
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| |||||| ||| |||    
T  19773476 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg-ttcttgattatcatttgatattgtta 19773574  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||||    
T  19773575 tatcttgagatgttta 19773590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 384 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 33443232 - 33443122
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    ||||||||||||||| ||| |||    
T  33443232 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttg----ttgattattatttgatattgtta 33443137  T
Q  484 tatcttgagatgttt 498  Q
    |||||||||||||||    
T  33443136 tatcttgagatgttt 33443122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 384 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 23415071 - 23414952
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  23415071 tatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 23414973  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtgt 504  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  23414972 tatcttgagatgtttacgtgt 23414952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Original strand, 14979321 - 14979435
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  14979321 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 14979419  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    |||||  |||||||||    
T  14979420 tatctcaagatgttta 14979435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Original strand, 15705377 - 15705491
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||| |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  15705377 tatggtttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtttatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 15705475  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||||    
T  15705476 tatcttgagatgttta 15705491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Original strand, 28103832 - 28103946
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  28103832 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattatgtgaattatataagttgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 28103930  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    || |||||||||||||    
T  28103931 taccttgagatgttta 28103946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 384 - 475
Target Start/End: Original strand, 20556792 - 20556882
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttga 475  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20556792 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatgatttga 20556882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Original strand, 25619656 - 25619770
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  25619656 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatttttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 25619754  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    |||||  |||||||||    
T  25619755 tatctcaagatgttta 25619770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 385 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 20136855 - 20136743
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 484  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||    
T  20136855 atgatttgatgttgttagttatgtgatataattgtatat-cattatgtggattatatatgatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttat 20136758  T
Q  485 atcttgagatgttta 499  Q
    |||||||||||||||    
T  20136757 atcttgagatgttta 20136743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 385 - 499
Target Start/End: Original strand, 22196014 - 22196126
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 484  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||    
T  22196014 atgatttgatgttgttagttatgtgatataattgtatat-cattatgtggattatatatgatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttat 22196111  T
Q  485 atcttgagatgttta 499  Q
    |||||||||||||||    
T  22196112 atcttgagatgttta 22196126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 385 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 23076918 - 23076806
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 484  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||| || |||||||| | |||| ||||||||    
T  23076918 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgttg-ttgattatcacttgatattattat 23076820  T
Q  485 atcttgagatgttt 498  Q
    |||| || ||||||    
T  23076819 atctggatatgttt 23076806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 22806118 - 22806005
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  22806118 tatgatttaatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 22806021  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||| ||||||||    
T  22806020 tatcttgtgatgttta 22806005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 384 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 25755073 - 25754983
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttga 475  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  25755073 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattttataagatgtttaagttgatg-ttgattatgatttga 25754983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 382 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 16493335 - 16493216
Alignment:
Q  382 tttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattat 481  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |  | |||||||||   || |    
T  16493335 tttatgaattgaggttgttagtaatgtgatatatt-gtatatgcattatgtgatttacataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttggtgttgt 16493237  T
Q  482 tatatcttgagatgtttatgt 502  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  16493236 tctatcttgagatgtttatgt 16493216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 384 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 27556829 - 27556710
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| || ||||||  || |||    
T  27556829 tatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttg-ttgatcatcatttgatgttgtta 27556731  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtgt 504  Q
    ||| |||||||||||| ||||    
T  27556730 tatattgagatgtttacgtgt 27556710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 385 - 498
Target Start/End: Original strand, 18177606 - 18177719
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaag-ttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  18177606 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatg-ttgattatcatttgatattgtta 18177704  T
Q  484 tatcttgagatgttt 498  Q
    |||| |||| |||||    
T  18177705 tatcatgagttgttt 18177719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 385 - 498
Target Start/End: Original strand, 18199350 - 18199463
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaag-ttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  18199350 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatg-ttgattatcatttgatattgtta 18199448  T
Q  484 tatcttgagatgttt 498  Q
    |||| |||| |||||    
T  18199449 tatcatgagttgttt 18199463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 385 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 18204265 - 18204152
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaag-ttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  18204265 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatg-ttgattatcatttgatattgtta 18204167  T
Q  484 tatcttgagatgttt 498  Q
    |||| |||| |||||    
T  18204166 tatcatgagttgttt 18204152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 387 - 456
Target Start/End: Original strand, 18896252 - 18896321
Alignment:
Q  387 gatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttg 456  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18896252 gatttaatgttgttagtaatgggatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg 18896321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 385 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 35008336 - 35008224
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 484  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||| | |||| ||||||||    
T  35008336 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatattcattacatgaattatatatgatgtttaagttg-tttttgattatcacttgatattattat 35008238  T
Q  485 atcttgagatgttt 498  Q
    |||| || ||||||    
T  35008237 atctggatatgttt 35008224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 385 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 20224129 - 20224018
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 484  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| | |||| ||||||||    
T  20224129 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtgtatgaattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttg-ttgattatcacttgatattattat 20224031  T
Q  485 atcttgagatgtt 497  Q
    |||| || |||||    
T  20224030 atctggatatgtt 20224018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 385 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 22118113 - 22118002
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 484  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| | |||| ||||||||    
T  22118113 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtgtatgaattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttg-ttgattatcacttgatattattat 22118015  T
Q  485 atcttgagatgtt 497  Q
    |||| || |||||    
T  22118014 atctggatatgtt 22118002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 384 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 25752903 - 25752840
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25752903 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 25752840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 385 - 459
Target Start/End: Original strand, 23528041 - 23528115
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatg 459  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  23528041 atgatttgatgttgatagtaatgtgatgtagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagtcgatg 23528115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 385 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 23539155 - 23539038
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 484  Q
    ||||||| |||||  || ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||| || ||||| |||||| ||| ||||    
T  23539155 atgatttaatgttaataataaggtgatatatttgtaaatgcattatgtggattatatatgatgtttatgttgatg-ttaattatcatttgatattgttat 23539057  T
Q  485 atcttgagatgtttatgtg 503  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  23539056 atcttgagatgtatatgtg 23539038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 400 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 20182962 - 20182862
Alignment:
Q  400 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || |||| |||||||| || || ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  20182962 tagtaatgtgatatagttgtatatgcatt--gtgaattatgtatgatgtttaagttgttg-ttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 20182866  T
Q  500 tgtg 503  Q
    ||||    
T  20182865 tgtg 20182862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 400 - 503
Target Start/End: Original strand, 22153029 - 22153129
Alignment:
Q  400 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || |||| |||||||| || || ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22153029 tagtaatgtgatatagttgtatatgcatt--gtgaattatgtatgatgtttaagttgttg-ttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 22153125  T
Q  500 tgtg 503  Q
    ||||    
T  22153126 tgtg 22153129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 385 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 19362611 - 19362540
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttg 456  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  19362611 atgatttaatgttgttagtaatgtgatataattttatatgcattatgtgaattatttaagatgttcaagttg 19362540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 385 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 23538996 - 23538884
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 484  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| |||||| | |||||| ||| ||||    
T  23538996 atgaattgatgttgttgttaatgtgatatagttgtatatgcgttatgtgaatgatatatgatgtttaggttgatg-ttgattgtcatttgatattgttat 23538898  T
Q  485 atcttgagatgttt 498  Q
    ||| |||| |||||    
T  23538897 atcatgagctgttt 23538884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 503
Target Start/End: Original strand, 29416845 - 29416956
Alignment:
Q  391 tgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatctt 489  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || || ||||| |||||| ||| |||||||||    
T  29416845 tgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttaattatcatttgatattgttatatctt 29416942  T
Q  490 gagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||| ||||||    
T  29416943 gagatgtctatgtg 29416956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 384 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 18706492 - 18706423
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaag 453  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||    
T  18706492 tatgatttgatgttgttaataatgtcatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaag 18706423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Original strand, 8227445 - 8227501
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  8227445 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 8227501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Original strand, 19847929 - 19847984
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19847929 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 19847984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 384 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 18696674 - 18696611
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  18696674 tatgatttaatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 18696611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 374 - 441
Target Start/End: Original strand, 20556863 - 20556929
Alignment:
Q  374 tgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  20556863 tgatgttgattatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 20556929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 17105918 - 17105864
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 439  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17105918 atgaattgatgttgttaataacgtgatatagttgtatatgaattatgtgaattat 17105864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 15896114 - 15896074
Alignment:
Q  393 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg 433  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15896114 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgtg 15896074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 18456901 - 18456846
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  18456901 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 18456846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 383 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 22782411 - 22782356
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 439  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  22782411 ttatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 22782356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 25755002 - 25754936
Alignment:
Q  374 tgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||  ||||||||||    
T  25755002 tgatgttgattatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 25754936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 2291158 - 2291215
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  2291158 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 2291215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 8055213 - 8055156
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  8055213 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 8055156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 12742501 - 12742444
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  12742501 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 12742444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 18334570 - 18334627
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  18334570 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 18334627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 19005230 - 19005173
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  19005230 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 19005173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 24422731 - 24422674
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24422731 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24422674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 390 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 25738561 - 25738450
Alignment:
Q  390 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatctt 489  Q
    |||||||||||| |  | || |||||||| | |||||||||||| |||||  | |||| |||||||||   |||||||||| |||| ||| | |||||||    
T  25738561 ttgatgttgttaatgctatggtatatttgcaaatgcattatgtggattatgaatgatgtttaagttgag--ttgattattaattgatattgtcatatctt 25738464  T
Q  490 gagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||| ||||||    
T  25738463 gagatgtctatgtg 25738450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Original strand, 26924618 - 26924675
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  26924618 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 26924675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 33861978 - 33861921
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  33861978 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 33861921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 33864462 - 33864405
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  33864462 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 33864405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 441
Target Start/End: Original strand, 19858902 - 19858954
Alignment:
Q  388 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  19858902 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 19858954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 25644508 - 25644451
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 442  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  25644508 atgatttgatgttgtttttgatgtgatataattgtatacgcattacttgaattatata 25644451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 393 - 433
Target Start/End: Original strand, 19656075 - 19656115
Alignment:
Q  393 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg 433  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  19656075 atgttgttagtaatgtgatatacttatacatgcattatgtg 19656115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 55618 - 55737
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||| ||| |||    
T  55618 tatgatttgaggttgttagtaatgtgatatatttgcatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtta 55717  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  55718 tatcttgagatgtttatgtg 55737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1783
Description:

Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 388 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 600 - 490
Alignment:
Q  388 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatc 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||| ||| |||||||    
T  600 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttaatg-ttaattatcatttgatattgttatatc 502  T
Q  488 ttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||    
T  501 ttgagatgttta 490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 36367 - 36249
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  |||||||| |||||| ||| |||    
T  36367 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttg-tcgttgattatcatttgatattgtta 36269  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36268 tatcttgagatgtttatgtg 36249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Original strand, 10018 - 10132
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  10018 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatacattctgtgaattatataagatgtttaagatgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 10116  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||||    
T  10117 tatcttgagatgttta 10132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 133103 - 132985
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  133103 tatgatttgatgttgttagtaataagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtta 133005  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  133004 tatcttgaaatgtttatgtg 132985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 384 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 29388 - 29325
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  29388 tatgatttactgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaagtatttaagatg 29325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 384 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 8218 - 8097
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  8218 tatgatttgatgtcattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 8120  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtgttg 506  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  8119 tatcttgagatgtttatgtgttg 8097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 384 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 17689 - 17572
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  17689 tatgatttgaagttgttggtaatgtgatatagttgtatatgccttatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgtta 17591  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgt 502  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17590 tatcttgagatgtttatgt 17572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 384 - 504
Target Start/End: Original strand, 20144 - 20263
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||| || |||||||  |||||| ||| |||    
T  20144 tatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttttatatgcactatgtgaattatatataatgtttaagttgttg-ttgattagcatttgatattgtta 20242  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtgt 504  Q
     ||||||||||||||| ||||    
T  20243 aatcttgagatgtttacgtgt 20263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 384 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 834 - 713
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |   | | |    
T  834 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-ttgattattatttcatgatgtga 736  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtgttg 506  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  735 tatcttgagatgtttatgtgttg 713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 442
Target Start/End: Original strand, 60649 - 60706
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 442  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  60649 atgatttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatata 60706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 390 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 10344 - 10232
Alignment:
Q  390 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatctt 489  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  10344 ttgatgttgttagtaatgtgatgtagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatga-tgattattatttgatattgttacatctt 10246  T
Q  490 gagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||    
T  10245 gagatgtttatgtg 10232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 6093 - 6211
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||  || |||    
T  6093 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatgttgtta 6191  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6192 tatcttgagatgtttatgtg 6211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 18101 - 18219
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| ||| |||    
T  18101 tatgatttgatattgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatg-tttattatcatttgatattgtta 18199  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  18200 tatcttgagatatttatgtg 18219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 29357 - 29476
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||| ||| |||    
T  29357 tatgatttgaggttgttagtaatgtgatatatttgcatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgtta 29456  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  29457 tatcttgagaagtttatgtg 29476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 21353 - 21235
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  21353 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgttaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 21255  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21254 tatcttgagatgtttatgtg 21235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 105267 - 105153
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| |||||| ||| |||    
T  105267 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattttttgaattatataagatgtttaatttgatg-ttaattatcatttgatattgtta 105169  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||||    
T  105168 tatcttgagatgttta 105153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 94595 - 94538
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  94595 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 94538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 126142 - 126028
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  126142 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 126044  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||||    
T  126043 tatcttgagatgttta 126028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2080 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold2080
Description:

Target: scaffold2080; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 386 - 500
Target Start/End: Original strand, 696 - 809
Alignment:
Q  386 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattata 485  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  ||||| ||| |||||    
T  696 tgatctgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcttttgatattgttata 794  T
Q  486 tcttgagatgtttat 500  Q
    |||||||||||||||    
T  795 tcttgagatgtttat 809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 384 - 506
Target Start/End: Original strand, 24531 - 24652
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  24531 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 24629  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtgttg 506  Q
    |||||||| ||||||| ||||||    
T  24630 tatcttgaaatgtttaagtgttg 24652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 386 - 503
Target Start/End: Original strand, 221143 - 221258
Alignment:
Q  386 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattata 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||    
T  221143 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataaga-ctttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttata 221240  T
Q  486 tcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||    
T  221241 tcttgagatgtttatgtg 221258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 385 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 225593 - 225536
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 442  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  225593 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatata 225536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 4055 - 3936
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-cttaagttgatgattgattattatttgacattatt 482  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||  | | ||    
T  4055 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgatg-ttgattatcatttggtaatgtt 3957  T
Q  483 atatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3956 atatcttgagatgtttatgtg 3936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 393 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 15920 - 15809
Alignment:
Q  393 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgag 492  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||||||||||    
T  15920 atgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgag 15822  T
Q  493 atgtttatgtgtt 505  Q
    ||||||| |||||    
T  15821 atgtttacgtgtt 15809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 1039 - 921
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  1039 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttatatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 941  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  940 tatcttgagatgtttatgtg 921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 20937 - 20823
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  20937 tatgatttgatgttaatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 20839  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||||    
T  20838 tatcttgagatgttta 20823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 384 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 346 - 225
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  346 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatttgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 248  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtgttg 506  Q
    |||||||| ||||||| ||||||    
T  247 tatcttgatatgtttacgtgttg 225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 384 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 39439 - 39320
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  39439 tatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 39341  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtgt 504  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  39340 tatcttgagatgtttacgtgt 39320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 384 - 503
Target Start/End: Original strand, 9655 - 9772
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||    
T  9655 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattgtatggattatataagatgtttaag-tgatg-ttgattatcatttgatattgtta 9752  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  9753 tatcttgagatgtctatgtg 9772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Original strand, 1808 - 1922
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||   | |||    
T  1808 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgatgtta 1906  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||||    
T  1907 tatcttgagatgttta 1922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 385 - 499
Target Start/End: Original strand, 75763 - 75876
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||    
T  75763 atgatttgatgttgttagtaatgtgataaaattgtatttgcattatgtggattatatatgatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgttat 75861  T
Q  485 atcttgagatgttta 499  Q
    |||||||||||||||    
T  75862 atcttgagatgttta 75876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 385 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 209 - 101
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 484  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||    
T  209 atgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattttatatgatgtttaagttgatga-tgtttatcatttgatattgttat 111  T
Q  485 atcttgagat 494  Q
    ||||||||||    
T  110 atcttgagat 101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 385 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 41 - 1
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgc 425  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  41 atgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 384 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 17760 - 17641
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  17760 tatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgaattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 17662  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtgt 504  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  17661 tatcttgagatgtttacgtgt 17641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 384 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 31310 - 31191
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || || ||||| |||||| ||| |||    
T  31310 tatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttg-tttattatcatttgatattgtta 31212  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtgt 504  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  31211 tatcttgagatgtttacgtgt 31191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 6798 - 6684
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| |||    
T  6798 tatgatttgaggttgatggtaatgtaatatatttgtatatgtagtatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatattgtta 6700  T
Q  484 tatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||||    
T  6699 tatcttgagatgttta 6684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 386 - 503
Target Start/End: Original strand, 19582 - 19698
Alignment:
Q  386 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaga-tgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 484  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  19582 tgatttgatgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagattttttaagttgatg-ttgattattgtttgacattgttat 19680  T
Q  485 atcttgagatgtttatgtg 503  Q
    || ||||||||||| ||||    
T  19681 at-ttgagatgtttctgtg 19698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 499
Target Start/End: Original strand, 15225 - 15286
Alignment:
Q  437 tatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgttta 499  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||    
T  15225 tatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 15286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 385 - 498
Target Start/End: Original strand, 206459 - 206570
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattat 484  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| || || ||||||||||||||| ||| ||||    
T  206459 atgatttaatattgttagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtggattatacaagatgattaag-tgttg-ttgattattatttgatattgttat 206556  T
Q  485 atcttgagatgttt 498  Q
    ||||||||||||||    
T  206557 atcttgagatgttt 206570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 384 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 370 - 280
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttga 475  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  370 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagctgatg-ttgattatgatttga 280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 299 - 233
Alignment:
Q  374 tgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||  ||||||||||    
T  299 tgatgttgattatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 384 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 214 - 124
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttga 475  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  214 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatg-ttgattatgatttga 124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 387 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 120192 - 120074
Alignment:
Q  387 gatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatat 486  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||  |||||||| |||||| ||| ||||||    
T  120192 gatttgatgttgatgataatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaactatatcagatgtttaagtt-attgttgattatcatttgatattgttatat 120094  T
Q  487 cttgagatgtttatgtgttg 506  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  120093 cttgagatgtttacgtgttg 120074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 384 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 67447 - 67342
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||    
T  67447 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttttatatgcattatgtgaattgtataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgtta 67349  T
Q  484 tatcttg 490  Q
    |||||||    
T  67348 tatcttg 67342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 384 - 447
Target Start/End: Original strand, 2426 - 2489
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2426 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg 2489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 384 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 12322 - 12232
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttga 475  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  12322 tatggtttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttcaagttgatg-ttgattatgatttga 12232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 374 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 12251 - 12185
Alignment:
Q  374 tgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  12251 tgatgttgattatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 12185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 384 - 506
Target Start/End: Original strand, 4630 - 4751
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattatta 483  Q
    |||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||| ||||||| || ||| |||||||    
T  4630 tatgatttaatgatgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttgaaatgtttaagttgttga-tgattatcatatgatattatta 4728  T
Q  484 tatcttgagatgtttatgtgttg 506  Q
    ||||| || ||||| ||||||||    
T  4729 tatctggatatgttaatgtgttg 4751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 393 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 11323 - 11215
Alignment:
Q  393 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgag 492  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||| ||||    
T  11323 atgttattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatttggattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatcctgag 11226  T
Q  493 atgtttatgtg 503  Q
    |||||||||||    
T  11225 atgtttatgtg 11215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 393 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 22423 - 22315
Alignment:
Q  393 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgag 492  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||| ||||    
T  22423 atgttattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatatggattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatcctgag 22326  T
Q  493 atgtttatgtg 503  Q
    |||||||||||    
T  22325 atgtttatgtg 22315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 388 - 473
Target Start/End: Original strand, 3265 - 3349
Alignment:
Q  388 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattattt 473  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  3265 atttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttaatg-ttgattatcattt 3349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0914
Description:

Target: scaffold0914; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 389 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 1884 - 1785
Alignment:
Q  389 tttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatta-tataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatc 487  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||    
T  1884 tttgatgttgttaatgatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattattataaggagtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttatatc 1786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 415 - 499
Target Start/End: Original strand, 15030 - 15113
Alignment:
Q  415 tttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgttta 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||    
T  15030 tttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 15113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 388 - 456
Target Start/End: Original strand, 26016 - 26084
Alignment:
Q  388 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttg 456  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  26016 atttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgttcaagttg 26084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 393 - 456
Target Start/End: Original strand, 16861 - 16924
Alignment:
Q  393 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttg 456  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16861 atgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgttcaagttg 16924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 386 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 22463 - 22361
Alignment:
Q  386 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-cttaagttgatgattgattattatttgacattattat 484  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||    
T  22463 tgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatg-ttgattattcttggatattgttat 22365  T
Q  485 atct 488  Q
    ||||    
T  22364 atct 22361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 386 - 488
Target Start/End: Original strand, 14056 - 14158
Alignment:
Q  386 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-cttaagttgatgattgattattatttgacattattat 484  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||    
T  14056 tgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatg-ttgattattcttggatattgttat 14154  T
Q  485 atct 488  Q
    ||||    
T  14155 atct 14158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 384 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 267848 - 267785
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  267848 tatgatttgatggtgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 267785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 405 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 8000 - 7900
Alignment:
Q  405 atgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-cttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtg 503  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8000 atgtaatatatttgtgtatggattatgtgaattatataagatgttttaagttgatg-ttgcttattatttgatattgttatatc-tgagatgtttatgtg 7903  T
Q  504 ttg 506  Q
    |||    
T  7902 ttg 7900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 384 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 82340 - 82246
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcat----tatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttga 475  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  82340 tatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatgatttga 82246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 504
Target Start/End: Original strand, 80426 - 80469
Alignment:
Q  461 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgt 504  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  80426 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgt 80469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 82265 - 82199
Alignment:
Q  374 tgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||  ||||||||||    
T  82265 tgatgttgattatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 82199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 393 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 10651 - 10539
Alignment:
Q  393 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgag 492  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || ||| |||| |||    
T  10651 atgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttacatctagag 10553  T
Q  493 atgtttatgtgttg 506  Q
    ||||||||||||||    
T  10552 atgtttatgtgttg 10539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 384 - 456
Target Start/End: Original strand, 2360 - 2432
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttg 456  Q
    |||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  2360 tatgatttaatgttgatagtaatttaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttg 2432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 403 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 85713 - 85618
Alignment:
Q  403 taatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgttta 499  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||    
T  85713 taatgtgatataatcgtatacgcattacatgaattatatatgatgcttaagttgatg-ttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgttta 85618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 383 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 332503 - 332427
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatg 459  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||    
T  332503 ttatgattttatgttgaaagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattataaattatgtttaagttgatg 332427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0790 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0790
Description:

Target: scaffold0790; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 396 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 6210 - 6116
Alignment:
Q  396 ttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttga 491  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| || || |||| |||||| ||| |||||||||||    
T  6210 ttgttaataatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattttatatgatgtttaagttgagga-tgtttatcatttgatattgttatatcttga 6116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 393 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 29851 - 29738
Alignment:
Q  393 atgttgttagtaatgtgatatattt-gtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttga 491  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||| ||    
T  29851 atgttgatagtaatgtaatatattttgtatgtgcattatgtgaagtatttaagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatattgttatatctgga 29753  T
Q  492 gatgtttatgtgttg 506  Q
     |||||  |||||||    
T  29752 tatgttattgtgttg 29738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 390 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 146366 - 146254
Alignment:
Q  390 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatct 488  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  146366 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatct 146269  T
Q  489 tgagatgtttatgtg 503  Q
    |||||||| ||||||    
T  146268 tgagatgtctatgtg 146254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 385 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 97193 - 97131
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  97193 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatg 97131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 385 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 106471 - 106409
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  106471 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatg 106409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 385 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 3781 - 3712
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagt 454  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3781 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgtattatgtggattatataagatgtttaagt 3712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 388 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 57999 - 57931
Alignment:
Q  388 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttg 456  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||    
T  57999 atttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatttaaaatgttcaagttg 57931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 384 - 461
Target Start/End: Original strand, 13432 - 13507
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgat 461  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  13432 tatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtat--gcattatctgaattatataagatgtttaagttgttgat 13507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 48508 - 48396
Alignment:
Q  390 ttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatct 488  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  48508 ttgatattgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tg-ttgattatcatttgatattgttatatct 48411  T
Q  489 tgagatgtttatgtg 503  Q
    |||||||| ||||||    
T  48410 tgagatgtctatgtg 48396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 385 - 447
Target Start/End: Original strand, 128904 - 128966
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||    
T  128904 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatgaattatatatgatg 128966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 78509 - 78453
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattata 440  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||    
T  78509 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattata 78453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 502
Target Start/End: Original strand, 604 - 712
Alignment:
Q  393 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgag 492  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||||||| ||    
T  604 atgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttaag 702  T
Q  493 atgtttatgt 502  Q
     |||| ||||    
T  703 ttgttaatgt 712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 384 - 447
Target Start/End: Original strand, 6216 - 6279
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  6216 tatgatttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 6279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 384 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 724 - 661
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  724 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 384 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 6379 - 6330
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtga 434  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6379 tatgatttggtgttgttaataatgtgatata-ttgtatatgcattatgtga 6330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 387 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 25290 - 25231
Alignment:
Q  387 gatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||    
T  25290 gatttgatgttgtaa-taatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatgatg 25231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 380 - 442
Target Start/End: Original strand, 53478 - 53540
Alignment:
Q  380 tgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 442  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  53478 tgtttatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatata 53540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 11651 - 11595
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  11651 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 11595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 445
Target Start/End: Original strand, 16034 - 16094
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaga 445  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16034 atgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataaga 16094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 385 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 13316 - 13259
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 442  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  13316 atgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatata 13259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Original strand, 17961 - 18017
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  17961 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 18017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 385 - 439
Target Start/End: Original strand, 2108 - 2161
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 439  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  2108 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 2161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Original strand, 38190 - 38246
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  38190 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 38246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 384 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 38505 - 38442
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  38505 tatgatttgatgttgagattaatgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 38442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 384 - 447
Target Start/End: Original strand, 18171 - 18234
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  18171 tatgttttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 18234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 374 - 441
Target Start/End: Original strand, 1249 - 1315
Alignment:
Q  374 tgattttgtttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  1249 tgatgttgattatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatat 1315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 192 - 130
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  192 atgatttgatgttgttaataatgttatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 9930 - 9877
Alignment:
Q  387 gatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9930 gatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 9877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 30114 - 30059
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30114 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgaattatttgaattatat 30059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Original strand, 79264 - 79319
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  79264 atgatttgatgttgtta-tattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatat 79319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 446671 - 446631
Alignment:
Q  393 atgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg 433  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  446671 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgtg 446631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 385 - 439
Target Start/End: Original strand, 85559 - 85612
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 439  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  85559 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 85612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 447
Target Start/End: Original strand, 1731 - 1794
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 447  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  | ||||||||| ||||    
T  1731 tatgatttgacgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacataaattatatatgatg 1794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 504
Target Start/End: Original strand, 58810 - 58853
Alignment:
Q  461 ttgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgt 504  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  58810 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgt 58853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 134395 - 134338
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  134395 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 134338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 136864 - 136807
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  136864 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 136807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 139333 - 139276
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  139333 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 139276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 141802 - 141745
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  141802 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 141745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 144271 - 144214
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  144271 ttattatttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 144214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 693 - 632
Alignment:
Q  437 tatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgttta 499  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||    
T  693 tatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 499
Target Start/End: Original strand, 1279 - 1340
Alignment:
Q  437 tatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgttta 499  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||    
T  1279 tatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 1340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 15131 - 15070
Alignment:
Q  437 tatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgttta 499  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||    
T  15131 tatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 15070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 20931 - 20874
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  20931 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 20874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 14131 - 14074
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  14131 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 14074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 38005 - 37948
Alignment:
Q  383 ttatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  38005 ttattatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 37948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 385 - 439
Target Start/End: Original strand, 164570 - 164623
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 439  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  164570 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 164623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 506
Target Start/End: Original strand, 4256 - 4324
Alignment:
Q  437 tatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattattatatcttgagatgtttatgtgttg 506  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4256 tatatatgatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgatatgtttacgtgttg 4324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 384 - 429
Target Start/End: Original strand, 19818 - 19863
Alignment:
Q  384 tatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcatta 429  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  19818 tatgatttgatgttattaataatgtgatataaatgtatatgcatta 19863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 441
Target Start/End: Original strand, 158433 - 158485
Alignment:
Q  388 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  158433 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 158485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 385 - 433
Target Start/End: Original strand, 14547 - 14595
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtg 433  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14547 atgatttaaagttgttggtaatgtgatataattatatatgcattatgtg 14595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 385 - 429
Target Start/End: Original strand, 27683 - 27727
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcatta 429  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27683 atgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcatta 27727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 16966 - 16911
Alignment:
Q  385 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 441  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  16966 atgatttgatgatgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 16911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University