View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5498-Insertion-1 (Length: 1064)

Name: NF5498-Insertion-1
Description: NF5498
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5498-Insertion-1
NF5498-Insertion-1
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (6-378)||(1355-1730)
[»] chr3 (146 HSPs)
chr3 (9-378)||(10769133-10769512)
chr3 (457-790)||(49439221-49439547)
chr3 (9-378)||(38449227-38449606)
chr3 (9-378)||(38455714-38456093)
chr3 (9-378)||(49151229-49151607)
chr3 (9-378)||(49157296-49157674)
chr3 (9-378)||(10760814-10761193)
chr3 (9-378)||(8331404-8331782)
chr3 (9-378)||(30051266-30051643)
chr3 (9-378)||(11839889-11840268)
chr3 (9-378)||(42191384-42191763)
chr3 (9-378)||(42197326-42197705)
chr3 (9-378)||(10244498-10244877)
chr3 (9-378)||(10238376-10238755)
chr3 (9-378)||(17055957-17056334)
chr3 (63-378)||(28964497-28964811)
chr3 (65-378)||(26429639-26429960)
chr3 (9-378)||(55003576-55003944)
chr3 (214-378)||(23138795-23138959)
chr3 (224-377)||(53071640-53071793)
chr3 (800-985)||(47809589-47809780)
chr3 (236-378)||(24643891-24644033)
chr3 (218-378)||(11846359-11846520)
chr3 (66-322)||(46656353-46656610)
chr3 (807-985)||(52628953-52629135)
chr3 (802-987)||(43125828-43126017)
chr3 (805-985)||(47257792-47257977)
chr3 (805-987)||(40130957-40131144)
chr3 (804-983)||(38416721-38416905)
chr3 (822-983)||(46134357-46134521)
chr3 (805-994)||(51452749-51452942)
chr3 (807-986)||(22399095-22399278)
chr3 (804-959)||(46126015-46126171)
chr3 (803-986)||(49330035-49330223)
chr3 (805-985)||(53943586-53943770)
chr3 (63-247)||(48128260-48128451)
chr3 (807-987)||(41464349-41464534)
chr3 (805-988)||(7855112-7855300)
chr3 (822-987)||(29625844-29626012)
chr3 (822-987)||(51170050-51170218)
chr3 (807-988)||(24100279-24100464)
chr3 (805-986)||(42291840-42292026)
chr3 (806-989)||(27066977-27067165)
chr3 (807-986)||(28048392-28048576)
chr3 (805-988)||(32234396-32234583)
chr3 (806-985)||(40419834-40420018)
chr3 (803-986)||(43612043-43612231)
chr3 (806-986)||(48739232-48739417)
chr3 (822-988)||(37313395-37313564)
chr3 (806-985)||(2665999-2666183)
chr3 (808-987)||(55453245-55453429)
chr3 (76-373)||(2982458-2982764)
chr3 (806-959)||(35748310-35748465)
chr3 (802-959)||(40643828-40643987)
chr3 (807-989)||(51102378-51102565)
chr3 (804-985)||(44806683-44806869)
chr3 (804-959)||(39634569-39634725)
chr3 (807-986)||(44222827-44223011)
chr3 (822-959)||(48609751-48609888)
chr3 (822-983)||(52215077-52215241)
chr3 (805-987)||(52638839-52639026)
chr3 (51-142)||(13837534-13837625)
chr3 (830-985)||(24376572-24376730)
chr3 (822-992)||(41732520-41732693)
chr3 (808-959)||(43021742-43021896)
chr3 (831-985)||(39053393-39053550)
chr3 (35-211)||(13444847-13445027)
chr3 (802-985)||(20754388-20754576)
chr3 (806-989)||(40804509-40804697)
chr3 (809-955)||(43183944-43184092)
chr3 (823-959)||(53832502-53832638)
chr3 (822-985)||(47894837-47895003)
chr3 (822-985)||(7755324-7755489)
chr3 (807-988)||(37324537-37324723)
chr3 (807-989)||(5560025-5560219)
chr3 (822-985)||(36368938-36369103)
chr3 (805-985)||(41216454-41216639)
chr3 (244-373)||(8474543-8474673)
chr3 (822-955)||(18946935-18947068)
chr3 (236-378)||(34300055-34300197)
chr3 (822-959)||(35594149-35594286)
chr3 (822-982)||(41293336-41293498)
chr3 (4-119)||(11846222-11846340)
chr3 (822-955)||(46949406-46949538)
chr3 (851-984)||(53637841-53637978)
chr3 (63-372)||(12108891-12109203)
chr3 (805-922)||(52864556-52864673)
chr3 (823-921)||(33550485-33550582)
chr3 (822-938)||(51146232-51146348)
chr3 (214-360)||(17601912-17602058)
chr3 (63-180)||(53069279-53069386)
chr3 (870-987)||(54159052-54159173)
chr3 (802-987)||(48546835-48547014)
chr3 (848-941)||(37758975-37759069)
chr3 (857-938)||(47182049-47182131)
chr3 (313-378)||(9586490-9586555)
chr3 (805-985)||(53115446-53115620)
chr3 (822-989)||(34279738-34279897)
chr3 (805-959)||(39141123-39141269)
chr3 (805-985)||(55000176-55000350)
chr3 (881-985)||(42998853-42998960)
chr3 (822-986)||(25641644-25641800)
chr3 (803-985)||(42589829-42590005)
chr3 (881-989)||(25353549-25353661)
chr3 (881-985)||(55379984-55380092)
chr3 (119-214)||(13367114-13367209)
chr3 (822-987)||(49130575-49130732)
chr3 (822-959)||(54401215-54401341)
chr3 (804-987)||(51415966-51416143)
chr3 (822-987)||(54707237-54707394)
chr3 (807-991)||(24688107-24688285)
chr3 (877-988)||(2227995-2228110)
chr3 (881-996)||(30251565-30251684)
chr3 (896-987)||(17665603-17665698)
chr3 (889-983)||(41882063-41882161)
chr3 (896-986)||(47511019-47511113)
chr3 (889-989)||(21597220-21597324)
chr3 (889-989)||(28576184-28576288)
chr3 (807-959)||(38156632-38156775)
chr3 (243-314)||(27103272-27103344)
chr3 (804-959)||(31286790-31286936)
chr3 (896-959)||(45058911-45058975)
chr3 (803-985)||(41635796-41635972)
chr3 (881-959)||(51143845-51143924)
chr3 (63-144)||(34300348-34300429)
chr3 (141-185)||(17593487-17593531)
chr3 (822-959)||(37028751-37028877)
chr3 (877-956)||(41609098-41609178)
chr3 (896-959)||(52756150-52756214)
chr3 (119-213)||(9760506-9760600)
chr3 (804-881)||(44945932-44946010)
chr3 (889-959)||(50731986-50732057)
chr3 (889-959)||(50780799-50780870)
chr3 (63-105)||(24643773-24643815)
chr3 (127-191)||(24643817-24643878)
chr3 (806-893)||(30429226-30429314)
chr3 (889-985)||(48726070-48726170)
chr3 (896-989)||(51224117-51224213)
chr3 (803-881)||(48534003-48534082)
chr3 (9-40)||(17593446-17593477)
chr3 (896-954)||(40022107-40022166)
chr3 (877-959)||(47402810-47402892)
chr3 (877-954)||(8847718-8847796)
chr3 (245-322)||(27088019-27088097)
chr3 (902-959)||(44946014-44946072)
chr3 (300-358)||(52222937-52222995)
[»] chr7 (118 HSPs)
chr7 (9-378)||(3811333-3811711)
chr7 (9-375)||(3817475-3817850)
chr7 (9-378)||(351404-351781)
chr7 (18-378)||(338998-339366)
chr7 (9-378)||(28421123-28421501)
chr7 (63-378)||(5849147-5849469)
chr7 (70-376)||(35148236-35148549)
chr7 (63-375)||(22742149-22742469)
chr7 (102-378)||(26383286-26383569)
chr7 (11-378)||(5979340-5979719)
chr7 (163-378)||(35152849-35153071)
chr7 (9-190)||(20238762-20238946)
chr7 (10-374)||(43539616-43539979)
chr7 (9-214)||(15843733-15843942)
chr7 (9-214)||(15860842-15861051)
chr7 (63-352)||(26380751-26381023)
chr7 (805-986)||(33839713-33839899)
chr7 (822-986)||(33423292-33423459)
chr7 (807-959)||(45690097-45690251)
chr7 (805-987)||(46913107-46913296)
chr7 (803-986)||(17855427-17855615)
chr7 (807-983)||(23393051-23393232)
chr7 (807-987)||(25893917-25894102)
chr7 (805-994)||(2341659-2341854)
chr7 (805-985)||(47066975-47067160)
chr7 (807-987)||(33695821-33696006)
chr7 (806-986)||(35355887-35356072)
chr7 (824-985)||(31586848-31587012)
chr7 (805-959)||(36389385-36389541)
chr7 (803-985)||(40670563-40670750)
chr7 (805-983)||(49171360-49171543)
chr7 (807-987)||(22979647-22979832)
chr7 (807-987)||(47740331-47740516)
chr7 (807-986)||(27018115-27018299)
chr7 (806-985)||(35328068-35328252)
chr7 (822-982)||(15877553-15877716)
chr7 (807-989)||(48609677-48609864)
chr7 (824-986)||(33411259-33411424)
chr7 (823-959)||(5183843-5183979)
chr7 (822-985)||(10028488-10028654)
chr7 (805-986)||(45482657-45482843)
chr7 (807-983)||(20165814-20165995)
chr7 (805-985)||(35757018-35757203)
chr7 (806-985)||(37846015-37846199)
chr7 (807-990)||(45063357-45063543)
chr7 (800-985)||(26579710-26579900)
chr7 (805-994)||(33332780-33332973)
chr7 (805-938)||(35767524-35767659)
chr7 (806-983)||(31625706-31625887)
chr7 (829-986)||(33870244-33870404)
chr7 (822-987)||(19563445-19563613)
chr7 (800-959)||(41990852-41991012)
chr7 (822-986)||(43499484-43499651)
chr7 (807-959)||(29446867-29447020)
chr7 (63-167)||(35150761-35150865)
chr7 (804-925)||(41904269-41904391)
chr7 (807-987)||(5712166-5712351)
chr7 (143-294)||(42767505-42767661)
chr7 (806-936)||(30076526-30076658)
chr7 (852-986)||(33720082-33720220)
chr7 (807-937)||(28233936-28234068)
chr7 (233-354)||(18666880-18667006)
chr7 (851-985)||(31429520-31429658)
chr7 (822-919)||(44405418-44405514)
chr7 (829-959)||(44564367-44564497)
chr7 (822-985)||(10618298-10618457)
chr7 (806-959)||(37127966-37128110)
chr7 (263-375)||(8824431-8824542)
chr7 (262-359)||(30219501-30219598)
chr7 (805-985)||(35752032-35752206)
chr7 (881-985)||(33393328-33393436)
chr7 (822-986)||(36816862-36817018)
chr7 (12-138)||(7608306-7608437)
chr7 (822-985)||(43489218-43489373)
chr7 (822-985)||(48085858-48086013)
chr7 (881-996)||(16482847-16482966)
chr7 (881-986)||(7257380-7257489)
chr7 (822-986)||(24228540-24228696)
chr7 (805-881)||(46898014-46898091)
chr7 (73-319)||(18656883-18657132)
chr7 (881-987)||(15644010-15644120)
chr7 (802-985)||(24923019-24923196)
chr7 (822-987)||(46817438-46817595)
chr7 (62-151)||(3677876-3677965)
chr7 (881-989)||(44003434-44003546)
chr7 (822-895)||(45502833-45502905)
chr7 (896-985)||(47906838-47906931)
chr7 (822-955)||(2332052-2332174)
chr7 (804-959)||(7876325-7876471)
chr7 (896-959)||(26941611-26941675)
chr7 (153-275)||(7608146-7608276)
chr7 (897-959)||(29098780-29098843)
chr7 (881-959)||(47460836-47460915)
chr7 (822-959)||(498205-498331)
chr7 (896-959)||(21718146-21718210)
chr7 (900-959)||(39453558-39453618)
chr7 (236-291)||(16914037-16914092)
chr7 (259-302)||(24689729-24689772)
chr7 (896-986)||(32556685-32556779)
chr7 (880-940)||(26456157-26456218)
chr7 (896-985)||(29610635-29610728)
chr7 (896-985)||(39323616-39323709)
chr7 (896-986)||(44659843-44659936)
chr7 (881-986)||(21649442-21649552)
chr7 (888-959)||(29863044-29863116)
chr7 (877-960)||(38448508-38448592)
chr7 (896-959)||(39866694-39866758)
chr7 (896-987)||(25037587-25037682)
chr7 (663-730)||(32787872-32787939)
chr7 (923-985)||(30077043-30077108)
chr7 (921-959)||(35557759-35557797)
chr7 (822-864)||(39866762-39866803)
chr7 (9-51)||(42767459-42767501)
chr7 (888-984)||(7720574-7720674)
chr7 (63-108)||(12803893-12803938)
chr7 (63-96)||(24690848-24690881)
chr7 (881-941)||(37443666-37443727)
chr7 (903-955)||(45502902-45502955)
[»] chr1 (121 HSPs)
chr1 (9-378)||(31051161-31051540)
chr1 (9-378)||(31057661-31058040)
chr1 (9-378)||(34739603-34739981)
chr1 (4-378)||(25387663-25388045)
chr1 (4-378)||(25381694-25382078)
chr1 (10-376)||(8093011-8093386)
chr1 (9-378)||(50305814-50306185)
chr1 (51-378)||(1077861-1078196)
chr1 (63-378)||(44409617-44409940)
chr1 (63-373)||(38152184-38152495)
chr1 (11-378)||(27954778-27955158)
chr1 (63-378)||(24926981-24927311)
chr1 (802-986)||(31307999-31308188)
chr1 (74-360)||(24963940-24964229)
chr1 (807-986)||(45538151-45538335)
chr1 (807-989)||(3611131-3611318)
chr1 (801-997)||(21139406-21139607)
chr1 (805-987)||(44661967-44662154)
chr1 (822-988)||(4068700-4068869)
chr1 (805-985)||(5981169-5981354)
chr1 (822-988)||(24245042-24245211)
chr1 (807-988)||(26085398-26085583)
chr1 (806-985)||(39646567-39646751)
chr1 (822-994)||(17994968-17995143)
chr1 (805-987)||(23984752-23984939)
chr1 (807-986)||(33112818-33113001)
chr1 (805-985)||(31040708-31040893)
chr1 (214-378)||(25275425-25275589)
chr1 (807-985)||(25678259-25678442)
chr1 (807-992)||(47671578-47671768)
chr1 (807-987)||(25058685-25058870)
chr1 (805-988)||(6327546-6327733)
chr1 (822-982)||(43251713-43251876)
chr1 (807-988)||(26277173-26277359)
chr1 (822-985)||(23220952-23221112)
chr1 (822-986)||(41999813-41999980)
chr1 (823-959)||(42863893-42864029)
chr1 (822-987)||(46616546-46616714)
chr1 (798-988)||(47187101-47187296)
chr1 (807-985)||(37620192-37620375)
chr1 (822-984)||(33884088-33884253)
chr1 (822-984)||(33959999-33960164)
chr1 (806-983)||(38790196-38790378)
chr1 (807-959)||(47383732-47383886)
chr1 (822-985)||(49253992-49254158)
chr1 (805-985)||(23932507-23932692)
chr1 (803-986)||(35692659-35692848)
chr1 (807-987)||(51057068-51057253)
chr1 (805-988)||(38331857-38332045)
chr1 (807-985)||(36566329-36566512)
chr1 (833-986)||(31844374-31844530)
chr1 (823-985)||(24885500-24885665)
chr1 (850-983)||(25518815-25518952)
chr1 (804-984)||(26524886-26525071)
chr1 (822-959)||(26794332-26794469)
chr1 (824-985)||(5980067-5980231)
chr1 (823-959)||(28888609-28888745)
chr1 (822-986)||(3285400-3285566)
chr1 (807-985)||(46967041-46967224)
chr1 (806-959)||(50774245-50774400)
chr1 (807-959)||(35273624-35273778)
chr1 (807-959)||(47317343-47317497)
chr1 (805-989)||(48373499-48373679)
chr1 (217-360)||(33458290-33458434)
chr1 (805-954)||(42313359-42313510)
chr1 (822-984)||(46784423-46784588)
chr1 (827-955)||(36003162-36003290)
chr1 (807-985)||(49398988-49399171)
chr1 (804-913)||(4808720-4808830)
chr1 (807-952)||(2450529-2450676)
chr1 (828-938)||(45475866-45475975)
chr1 (827-941)||(51045618-51045732)
chr1 (872-984)||(51403074-51403189)
chr1 (870-987)||(2556910-2557031)
chr1 (870-982)||(31979999-31980115)
chr1 (271-360)||(4280165-4280254)
chr1 (807-987)||(27983603-27983772)
chr1 (804-988)||(33073207-33073385)
chr1 (823-987)||(10928064-10928220)
chr1 (235-291)||(12184013-12184069)
chr1 (806-910)||(4156472-4156577)
chr1 (807-899)||(13312531-13312624)
chr1 (807-985)||(41467632-41467804)
chr1 (795-988)||(42234836-42235022)
chr1 (807-959)||(2657331-2657474)
chr1 (892-992)||(13313249-13313355)
chr1 (881-985)||(2954854-2954962)
chr1 (822-959)||(6626041-6626167)
chr1 (881-985)||(52367882-52367990)
chr1 (881-985)||(26685855-26685963)
chr1 (807-959)||(30289910-30290053)
chr1 (822-937)||(47772189-47772304)
chr1 (896-987)||(26472258-26472353)
chr1 (877-987)||(39475843-39475956)
chr1 (881-985)||(38716311-38716419)
chr1 (881-985)||(27924722-27924830)
chr1 (804-985)||(51155587-51155761)
chr1 (822-988)||(29770666-29770824)
chr1 (880-987)||(33187337-33187448)
chr1 (897-987)||(24649802-24649896)
chr1 (807-881)||(38718167-38718242)
chr1 (881-986)||(10920198-10920307)
chr1 (822-959)||(4953080-4953206)
chr1 (334-378)||(12184095-12184139)
chr1 (896-959)||(32448676-32448740)
chr1 (889-985)||(39637899-39637996)
chr1 (881-959)||(1388501-1388580)
chr1 (881-987)||(5961331-5961441)
chr1 (881-959)||(48683394-48683473)
chr1 (900-986)||(4243573-4243663)
chr1 (896-989)||(46428332-46428429)
chr1 (881-986)||(52323936-52324045)
chr1 (831-990)||(13281588-13281739)
chr1 (78-151)||(33458145-33458218)
chr1 (807-881)||(41895164-41895239)
chr1 (896-959)||(44544125-44544189)
chr1 (74-121)||(12183820-12183867)
chr1 (822-881)||(34752331-34752389)
chr1 (881-919)||(31286568-31286606)
chr1 (896-960)||(35991678-35991743)
chr1 (896-956)||(44293534-44293595)
[»] chr4 (148 HSPs)
chr4 (4-378)||(48160576-48160960)
chr4 (4-378)||(48166795-48167179)
chr4 (9-378)||(6257369-6257747)
chr4 (9-378)||(10733516-10733892)
chr4 (9-378)||(10739503-10739879)
chr4 (9-378)||(10947285-10947661)
chr4 (9-378)||(10953272-10953648)
chr4 (63-378)||(26957023-26957346)
chr4 (9-378)||(24287604-24287982)
chr4 (64-372)||(50168218-50168532)
chr4 (112-378)||(26971824-26972097)
chr4 (4-376)||(44831771-44832155)
chr4 (9-190)||(33458431-33458614)
chr4 (9-190)||(33461556-33461739)
chr4 (10-360)||(49976236-49976585)
chr4 (65-378)||(17627002-17627317)
chr4 (807-985)||(53854430-53854612)
chr4 (806-987)||(2826681-2826866)
chr4 (807-987)||(21366609-21366794)
chr4 (807-991)||(31532135-31532324)
chr4 (807-988)||(51363003-51363188)
chr4 (807-985)||(27373075-27373257)
chr4 (806-987)||(42085204-42085390)
chr4 (807-985)||(39587781-39587962)
chr4 (822-986)||(237475-237642)
chr4 (805-959)||(34276575-34276731)
chr4 (33-372)||(35177413-35177770)
chr4 (807-987)||(29478357-29478542)
chr4 (807-986)||(23437590-23437774)
chr4 (804-987)||(53461813-53462001)
chr4 (807-985)||(9798464-9798647)
chr4 (822-994)||(32366677-32366852)
chr4 (805-995)||(42765840-42766034)
chr4 (807-988)||(44984757-44984943)
chr4 (822-985)||(397401-397567)
chr4 (807-987)||(47344653-47344838)
chr4 (807-987)||(54574940-54575125)
chr4 (805-984)||(146427-146611)
chr4 (822-983)||(6019929-6020093)
chr4 (822-987)||(41702476-41702644)
chr4 (807-988)||(26091258-26091444)
chr4 (822-985)||(54607961-54608127)
chr4 (803-986)||(19387684-19387872)
chr4 (806-986)||(39077543-39077728)
chr4 (807-986)||(49881059-49881247)
chr4 (64-299)||(50155657-50155897)
chr4 (806-985)||(43471694-43471878)
chr4 (804-987)||(50233997-50234185)
chr4 (802-985)||(50457805-50457993)
chr4 (806-987)||(3170623-3170809)
chr4 (807-984)||(18462013-18462195)
chr4 (807-985)||(41949381-41949566)
chr4 (805-937)||(48657868-48658002)
chr4 (822-985)||(55056276-55056442)
chr4 (804-983)||(22618511-22618693)
chr4 (807-959)||(54425010-54425163)
chr4 (800-959)||(55776073-55776233)
chr4 (800-959)||(55840251-55840411)
chr4 (807-985)||(407753-407934)
chr4 (805-959)||(45797507-45797663)
chr4 (822-981)||(31972353-31972515)
chr4 (807-985)||(56022998-56023181)
chr4 (822-985)||(29777274-29777440)
chr4 (806-986)||(31914196-31914380)
chr4 (822-984)||(35446506-35446670)
chr4 (822-959)||(6285335-6285472)
chr4 (822-959)||(41560356-41560493)
chr4 (802-941)||(52728302-52728442)
chr4 (807-987)||(54086407-54086590)
chr4 (804-990)||(47662099-47662290)
chr4 (804-985)||(3692207-3692393)
chr4 (822-985)||(23609086-23609252)
chr4 (801-985)||(31070068-31070256)
chr4 (807-987)||(42033172-42033357)
chr4 (822-959)||(50534659-50534796)
chr4 (803-985)||(2243457-2243644)
chr4 (805-986)||(14017374-14017558)
chr4 (807-985)||(55519826-55520009)
chr4 (828-983)||(42222292-42222450)
chr4 (73-369)||(19686551-19686854)
chr4 (804-985)||(38591667-38591849)
chr4 (805-931)||(36532828-36532956)
chr4 (818-983)||(48259524-48259691)
chr4 (823-983)||(22468788-22468951)
chr4 (807-985)||(48313556-48313737)
chr4 (822-985)||(1932762-1932928)
chr4 (822-993)||(50536641-50536815)
chr4 (807-988)||(41632007-41632192)
chr4 (62-191)||(4632192-4632322)
chr4 (822-959)||(53834071-53834208)
chr4 (827-959)||(33897517-33897649)
chr4 (801-903)||(35595772-35595875)
chr4 (9-104)||(10733410-10733507)
chr4 (9-104)||(10947179-10947276)
chr4 (822-959)||(48654842-48654985)
chr4 (823-919)||(42509365-42509460)
chr4 (808-908)||(35344868-35344968)
chr4 (850-939)||(52396774-52396865)
chr4 (849-987)||(54805657-54805803)
chr4 (822-955)||(51951714-51951846)
chr4 (262-360)||(50426882-50426980)
chr4 (881-985)||(1662323-1662431)
chr4 (318-378)||(33461797-33461857)
chr4 (822-988)||(37239107-37239265)
chr4 (807-985)||(9997931-9998103)
chr4 (805-959)||(43890956-43891101)
chr4 (807-959)||(45633779-45633922)
chr4 (803-883)||(48259700-48259780)
chr4 (878-985)||(27398664-27398775)
chr4 (318-378)||(33458672-33458732)
chr4 (881-983)||(14335165-14335271)
chr4 (881-983)||(27580120-27580226)
chr4 (881-985)||(573802-573910)
chr4 (828-959)||(5117461-5117581)
chr4 (822-985)||(52461365-52461517)
chr4 (822-985)||(31881331-31881486)
chr4 (881-985)||(38547665-38547773)
chr4 (822-984)||(54715035-54715189)
chr4 (62-162)||(33045085-33045185)
chr4 (804-987)||(34835174-34835351)
chr4 (822-988)||(54216309-54216467)
chr4 (889-985)||(43231502-43231601)
chr4 (828-959)||(4486604-4486724)
chr4 (62-140)||(32284542-32284620)
chr4 (896-988)||(3293102-3293198)
chr4 (828-958)||(22620622-22620741)
chr4 (822-879)||(33048990-33049046)
chr4 (881-985)||(46720024-46720132)
chr4 (226-358)||(4632012-4632140)
chr4 (822-911)||(42558270-42558350)
chr4 (803-881)||(47812002-47812081)
chr4 (896-991)||(54216815-54216914)
chr4 (63-138)||(3769434-3769509)
chr4 (807-985)||(15060289-15060461)
chr4 (802-959)||(20351837-20351985)
chr4 (881-984)||(6371313-6371420)
chr4 (896-988)||(11972208-11972304)
chr4 (896-959)||(46708820-46708884)
chr4 (896-959)||(49014126-49014190)
chr4 (904-983)||(42557583-42557666)
chr4 (807-985)||(34552318-34552490)
chr4 (828-881)||(27873571-27873623)
chr4 (822-879)||(33289801-33289857)
chr4 (822-985)||(52688348-52688503)
chr4 (881-959)||(27872607-27872686)
chr4 (795-874)||(3291793-3291873)
chr4 (882-959)||(18206583-18206665)
chr4 (848-881)||(51981521-51981554)
[»] chr6 (60 HSPs)
chr6 (9-378)||(8650967-8651346)
chr6 (4-378)||(4580480-4580864)
chr6 (9-378)||(21191030-21191413)
chr6 (9-378)||(25353830-25354207)
chr6 (37-345)||(31756410-31756728)
chr6 (63-378)||(21770787-21771107)
chr6 (9-378)||(25343244-25343620)
chr6 (63-378)||(21197250-21197584)
chr6 (70-378)||(21783545-21783868)
chr6 (80-378)||(30905819-30906123)
chr6 (70-286)||(21789768-21789999)
chr6 (800-985)||(5882505-5882695)
chr6 (794-988)||(22551048-22551247)
chr6 (804-959)||(26377201-26377358)
chr6 (822-983)||(2892189-2892353)
chr6 (805-986)||(2593850-2594036)
chr6 (806-959)||(11988973-11989128)
chr6 (822-986)||(14891396-14891563)
chr6 (823-985)||(7345130-7345295)
chr6 (822-987)||(7393603-7393771)
chr6 (822-987)||(16703363-16703531)
chr6 (806-985)||(24168090-24168274)
chr6 (805-994)||(34527860-34528054)
chr6 (807-987)||(8615237-8615422)
chr6 (801-981)||(18101489-18101674)
chr6 (804-941)||(22341785-22341924)
chr6 (243-378)||(17581221-17581356)
chr6 (63-247)||(17581384-17581572)
chr6 (804-986)||(19415530-19415717)
chr6 (801-986)||(599890-600080)
chr6 (822-987)||(1970708-1970876)
chr6 (807-986)||(28947085-28947269)
chr6 (802-984)||(959899-960086)
chr6 (239-378)||(6096927-6097067)
chr6 (808-992)||(19281056-19281245)
chr6 (806-985)||(10507907-10508091)
chr6 (807-959)||(24224070-24224224)
chr6 (807-959)||(33452572-33452726)
chr6 (805-959)||(5294799-5294955)
chr6 (805-959)||(5299351-5299507)
chr6 (822-983)||(30743465-30743629)
chr6 (859-985)||(30467656-30467786)
chr6 (805-955)||(23261927-23262079)
chr6 (109-378)||(1105930-1106206)
chr6 (254-378)||(12801956-12802081)
chr6 (82-214)||(28728071-28728202)
chr6 (881-986)||(7167580-7167689)
chr6 (807-987)||(28948845-28949019)
chr6 (822-987)||(13329378-13329535)
chr6 (806-959)||(15965461-15965605)
chr6 (245-290)||(1283280-1283325)
chr6 (906-986)||(929657-929741)
chr6 (892-959)||(1939579-1939647)
chr6 (896-959)||(4487555-4487619)
chr6 (822-881)||(3786845-3786903)
chr6 (62-165)||(20745394-20745497)
chr6 (9-47)||(32035450-32035488)
chr6 (807-881)||(18661830-18661905)
chr6 (270-360)||(13007350-13007441)
chr6 (890-959)||(375797-375867)
[»] chr2 (100 HSPs)
chr2 (9-378)||(30964944-30965323)
chr2 (9-378)||(31001993-31002372)
chr2 (9-378)||(28683109-28683487)
chr2 (9-378)||(13149848-13150232)
chr2 (9-364)||(31007985-31008350)
chr2 (11-378)||(44716971-44717348)
chr2 (9-378)||(13455716-13456095)
chr2 (9-378)||(13461657-13462036)
chr2 (9-378)||(36750031-36750410)
chr2 (57-378)||(35084893-35085222)
chr2 (57-378)||(35090866-35091195)
chr2 (65-378)||(19879211-19879536)
chr2 (143-378)||(35439671-35439913)
chr2 (63-378)||(23343180-23343493)
chr2 (68-291)||(11048776-11049010)
chr2 (214-378)||(35442211-35442375)
chr2 (163-371)||(7771508-7771722)
chr2 (804-987)||(17600832-17601020)
chr2 (807-987)||(23901775-23901960)
chr2 (799-985)||(4034590-4034781)
chr2 (807-994)||(38997090-38997282)
chr2 (807-985)||(746464-746647)
chr2 (805-987)||(6594456-6594643)
chr2 (807-985)||(10244582-10244765)
chr2 (822-985)||(6430471-6430637)
chr2 (823-985)||(2324907-2325072)
chr2 (807-987)||(27400399-27400584)
chr2 (807-990)||(26710338-26710526)
chr2 (806-959)||(14660473-14660628)
chr2 (807-985)||(45370988-45371171)
chr2 (801-986)||(13815212-13815402)
chr2 (803-959)||(34518394-34518552)
chr2 (806-985)||(27651033-27651217)
chr2 (806-985)||(40635216-40635400)
chr2 (822-986)||(10424592-10424759)
chr2 (807-985)||(11184970-11185153)
chr2 (807-983)||(32327361-32327542)
chr2 (807-959)||(4609653-4609807)
chr2 (807-984)||(5726128-5726310)
chr2 (803-984)||(7892684-7892870)
chr2 (807-959)||(14697537-14697691)
chr2 (804-985)||(27024413-27024599)
chr2 (805-985)||(1091949-1092134)
chr2 (807-986)||(37620867-37621054)
chr2 (828-988)||(15925075-15925238)
chr2 (822-983)||(33427664-33427828)
chr2 (807-956)||(11159651-11159802)
chr2 (831-987)||(32608376-32608535)
chr2 (807-984)||(32948445-32948626)
chr2 (823-991)||(40735456-40735627)
chr2 (807-959)||(2914138-2914292)
chr2 (803-959)||(32856432-32856590)
chr2 (63-152)||(35438925-35439014)
chr2 (801-986)||(37255331-37255516)
chr2 (805-985)||(40037141-40037325)
chr2 (831-950)||(9444726-9444845)
chr2 (823-935)||(25294886-25294998)
chr2 (831-987)||(8432942-8433101)
chr2 (863-990)||(42899908-42900039)
chr2 (232-322)||(29832878-29832968)
chr2 (822-938)||(1229675-1229791)
chr2 (848-959)||(12842130-12842242)
chr2 (848-958)||(41172486-41172597)
chr2 (807-913)||(447633-447740)
chr2 (848-916)||(28014860-28014928)
chr2 (825-913)||(12827137-12827223)
chr2 (822-991)||(39103039-39103200)
chr2 (284-378)||(23283860-23283955)
chr2 (807-987)||(12333497-12333669)
chr2 (804-986)||(21734897-21735073)
chr2 (881-985)||(35126778-35126886)
chr2 (881-985)||(44481826-44481934)
chr2 (805-959)||(13543622-13543767)
chr2 (807-959)||(35158050-35158193)
chr2 (908-988)||(12814609-12814693)
chr2 (224-308)||(31651318-31651402)
chr2 (64-126)||(29034697-29034759)
chr2 (896-985)||(28641371-28641464)
chr2 (807-959)||(29687068-29687211)
chr2 (807-959)||(39301197-39301340)
chr2 (822-959)||(145309-145435)
chr2 (822-955)||(3711664-3711786)
chr2 (822-959)||(19428443-19428569)
chr2 (822-959)||(27331325-27331455)
chr2 (822-985)||(43898988-43899142)
chr2 (848-959)||(27764904-27765005)
chr2 (891-959)||(30545848-30545917)
chr2 (896-959)||(3266323-3266387)
chr2 (897-985)||(12730059-12730151)
chr2 (900-955)||(34249296-34249352)
chr2 (804-881)||(2688726-2688804)
chr2 (896-987)||(40544155-40544250)
chr2 (849-959)||(4258517-4258616)
chr2 (255-319)||(8342606-8342671)
chr2 (897-989)||(2000417-2000513)
chr2 (75-214)||(28765369-28765508)
chr2 (267-329)||(28765248-28765311)
chr2 (63-125)||(29833079-29833142)
chr2 (805-846)||(42900795-42900837)
chr2 (896-941)||(43356141-43356187)
[»] chr5 (89 HSPs)
chr5 (9-378)||(28525550-28525928)
chr5 (9-378)||(28531646-28532024)
chr5 (11-378)||(7389713-7390090)
chr5 (9-378)||(41296896-41297278)
chr5 (9-378)||(12686343-12686721)
chr5 (9-378)||(12692445-12692823)
chr5 (16-378)||(32097193-32097564)
chr5 (16-378)||(32094392-32094764)
chr5 (64-378)||(30384607-30384926)
chr5 (63-373)||(20499760-20500078)
chr5 (63-378)||(30771900-30772221)
chr5 (63-378)||(19059991-19060316)
chr5 (32-256)||(14609909-14610141)
chr5 (807-989)||(24253377-24253564)
chr5 (808-983)||(15398483-15398663)
chr5 (822-987)||(43326396-43326564)
chr5 (63-378)||(19066332-19066650)
chr5 (828-986)||(3466704-3466865)
chr5 (824-990)||(15683785-15683954)
chr5 (806-985)||(35626037-35626221)
chr5 (806-988)||(43262182-43262369)
chr5 (822-959)||(27938925-27939062)
chr5 (822-987)||(6901796-6901964)
chr5 (822-983)||(18479685-18479849)
chr5 (806-985)||(39932578-39932762)
chr5 (807-985)||(5184971-5185154)
chr5 (822-986)||(7722047-7722214)
chr5 (822-985)||(40886045-40886210)
chr5 (822-990)||(25831515-25831685)
chr5 (806-987)||(739703-739889)
chr5 (807-959)||(12648825-12648979)
chr5 (822-959)||(31938925-31939062)
chr5 (797-988)||(27501045-27501241)
chr5 (824-986)||(5137713-5137878)
chr5 (803-950)||(29789291-29789440)
chr5 (805-986)||(28424793-28424977)
chr5 (238-374)||(14609752-14609888)
chr5 (807-959)||(2484292-2484446)
chr5 (807-959)||(13504742-13504896)
chr5 (808-985)||(27278474-27278660)
chr5 (807-941)||(34451296-34451432)
chr5 (823-959)||(40278876-40279012)
chr5 (241-365)||(8706792-8706916)
chr5 (823-959)||(40110262-40110397)
chr5 (798-988)||(890902-891096)
chr5 (804-959)||(38756484-38756642)
chr5 (804-959)||(763751-763908)
chr5 (824-987)||(4149691-4149847)
chr5 (848-985)||(40632498-40632630)
chr5 (805-985)||(33617584-33617758)
chr5 (75-183)||(26318492-26318599)
chr5 (877-988)||(12558090-12558204)
chr5 (807-989)||(19295725-19295901)
chr5 (69-178)||(26509674-26509781)
chr5 (796-959)||(38015503-38015657)
chr5 (881-987)||(36472348-36472458)
chr5 (889-985)||(2585461-2585561)
chr5 (805-985)||(23195246-23195420)
chr5 (880-959)||(5120053-5120132)
chr5 (807-987)||(27503376-27503550)
chr5 (822-959)||(42658679-42658805)
chr5 (795-986)||(13957668-13957853)
chr5 (807-983)||(31293989-31294170)
chr5 (822-985)||(36365462-36365617)
chr5 (822-959)||(3656585-3656711)
chr5 (805-959)||(5497301-5497446)
chr5 (84-214)||(33753476-33753606)
chr5 (806-951)||(27390633-27390769)
chr5 (807-953)||(38492647-38492783)
chr5 (889-986)||(38637982-38638083)
chr5 (900-986)||(42247865-42247955)
chr5 (896-985)||(9424671-9424764)
chr5 (881-985)||(24167848-24167956)
chr5 (269-358)||(26318676-26318765)
chr5 (804-878)||(612754-612830)
chr5 (896-959)||(6973091-6973155)
chr5 (896-959)||(9374581-9374645)
chr5 (900-959)||(14972006-14972066)
chr5 (823-959)||(36948508-36948631)
chr5 (888-986)||(1402576-1402678)
chr5 (822-881)||(33623956-33624014)
chr5 (828-959)||(6206912-6207032)
chr5 (881-986)||(18327237-18327346)
chr5 (306-378)||(25408435-25408504)
chr5 (264-360)||(26509492-26509584)
chr5 (84-181)||(33849110-33849207)
chr5 (897-967)||(3940411-3940483)
chr5 (889-983)||(40686900-40686998)
chr5 (280-360)||(22647931-22648012)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (9-378)||(173054-173432)
[»] chr8 (85 HSPs)
chr8 (9-378)||(5542324-5542704)
chr8 (9-378)||(10699646-10700025)
chr8 (9-378)||(10705455-10705833)
chr8 (9-378)||(36818589-36818967)
chr8 (9-378)||(32896629-32897008)
chr8 (9-378)||(32890505-32890884)
chr8 (55-378)||(22219939-22220270)
chr8 (63-372)||(42033420-42033740)
chr8 (9-377)||(42993167-42993541)
chr8 (9-378)||(14417578-14417936)
chr8 (63-378)||(39735768-39736081)
chr8 (9-378)||(9934900-9935274)
chr8 (219-378)||(39727668-39727827)
chr8 (805-987)||(32984075-32984262)
chr8 (807-983)||(2714550-2714730)
chr8 (806-989)||(5946042-5946230)
chr8 (828-986)||(45236588-45236749)
chr8 (807-983)||(10646124-10646305)
chr8 (796-988)||(13356109-13356306)
chr8 (807-985)||(24079901-24080084)
chr8 (822-986)||(41862218-41862385)
chr8 (807-984)||(40435153-40435335)
chr8 (822-985)||(43328706-43328872)
chr8 (805-985)||(33730639-33730824)
chr8 (805-985)||(37956420-37956605)
chr8 (805-959)||(33981661-33981817)
chr8 (824-986)||(25185897-25186062)
chr8 (828-991)||(29048426-29048592)
chr8 (806-985)||(6365985-6366169)
chr8 (805-959)||(9303572-9303728)
chr8 (822-983)||(31830972-31831136)
chr8 (822-994)||(17718739-17718914)
chr8 (822-985)||(13760665-13760831)
chr8 (807-988)||(37419936-37420122)
chr8 (807-987)||(41653892-41654077)
chr8 (803-984)||(9013684-9013869)
chr8 (807-984)||(9734255-9734435)
chr8 (806-956)||(45258541-45258692)
chr8 (799-984)||(2275913-2276102)
chr8 (822-985)||(37301342-37301508)
chr8 (822-959)||(32114277-32114414)
chr8 (805-985)||(41231945-41232130)
chr8 (807-959)||(35628805-35628959)
chr8 (801-922)||(41981534-41981656)
chr8 (805-931)||(12032986-12033114)
chr8 (822-954)||(44088460-44088592)
chr8 (822-986)||(22878389-22878556)
chr8 (63-179)||(39727528-39727645)
chr8 (63-175)||(1883039-1883151)
chr8 (855-954)||(45066641-45066741)
chr8 (822-938)||(3904126-3904241)
chr8 (822-933)||(25248087-25248198)
chr8 (824-987)||(41639911-41640077)
chr8 (822-983)||(42701306-42701471)
chr8 (263-376)||(1883264-1883378)
chr8 (804-919)||(31336163-31336279)
chr8 (214-378)||(17954123-17954289)
chr8 (803-983)||(3211207-3211380)
chr8 (881-959)||(39915887-39915966)
chr8 (886-956)||(41981464-41981535)
chr8 (881-988)||(33896907-33897017)
chr8 (806-985)||(4447294-4447467)
chr8 (807-988)||(10378305-10378480)
chr8 (796-959)||(117318-117472)
chr8 (822-985)||(31940314-31940468)
chr8 (822-985)||(41843252-41843407)
chr8 (879-986)||(31148953-31149063)
chr8 (822-959)||(32373744-32373869)
chr8 (896-989)||(27243218-27243315)
chr8 (896-989)||(27254793-27254890)
chr8 (822-959)||(4975424-4975550)
chr8 (896-959)||(40458851-40458915)
chr8 (881-986)||(3490463-3490572)
chr8 (881-994)||(26196381-26196497)
chr8 (822-881)||(9713782-9713840)
chr8 (113-147)||(1171215-1171249)
chr8 (243-281)||(11641418-11641456)
chr8 (276-337)||(30890531-30890593)
chr8 (63-99)||(1171249-1171285)
chr8 (807-881)||(2379236-2379311)
chr8 (896-990)||(9509479-9509577)
chr8 (822-881)||(40649848-40649906)
chr8 (836-881)||(41425460-41425503)
chr8 (922-959)||(33622571-33622608)
chr8 (896-984)||(38631652-38631744)
[»] scaffold0208 (2 HSPs)
scaffold0208 (10-378)||(12012-12390)
scaffold0208 (9-378)||(6139-6518)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (9-378)||(783-1141)
[»] scaffold1114 (2 HSPs)
scaffold1114 (116-378)||(680-949)
scaffold1114 (63-136)||(950-1023)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (158-378)||(13890-14117)
[»] scaffold0185 (2 HSPs)
scaffold0185 (149-375)||(5587-5821)
scaffold0185 (58-121)||(5826-5889)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (807-987)||(11133-11317)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (804-985)||(13759-13945)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (805-985)||(39554-39739)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (805-985)||(75242-75427)
[»] scaffold0949 (1 HSPs)
scaffold0949 (807-982)||(1871-2051)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (806-959)||(176682-176837)
scaffold0007 (805-985)||(278005-278192)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (822-985)||(2449-2615)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (803-985)||(18850-19037)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (833-985)||(32560-32715)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (807-922)||(4596-4712)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (806-933)||(3133-3262)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (9-72)||(5465-5530)
[»] scaffold0085 (1 HSPs)
scaffold0085 (80-360)||(38063-38349)
[»] scaffold2003 (1 HSPs)
scaffold2003 (881-988)||(98-209)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (881-987)||(4618-4729)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (881-987)||(3389-3500)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (881-988)||(14740-14851)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (881-984)||(20541-20648)
[»] scaffold0721 (1 HSPs)
scaffold0721 (807-985)||(7089-7262)
[»] scaffold0449 (1 HSPs)
scaffold0449 (338-373)||(1281-1316)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (882-959)||(19245-19327)


Alignment Details
Target: scaffold0440 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 6 - 378
Target Start/End: Original strand, 1355 - 1730
Alignment:
Q  6 catccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||    
T  1355 catccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactgatttggtttttcctcaaccggtacatt 1454  T
Q  104 tatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-ttt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  1455 tatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattaggattt 1554  T
Q  203 cccattattccgggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattac 302  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1555 tccattattccgggtcatccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattac 1654  T
Q  303 ttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1655 ttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttacccac 1730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 146)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Original strand, 10769133 - 10769512
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctgaca--cacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10769133 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaatacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 10769232  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  10769233 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc 10769332  T
Q  205 cattattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagcctta 298  Q
    |||||||||      ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10769333 cattattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagcctta 10769432  T
Q  299 ttacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10769433 ttacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 10769512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 457 - 790
Target Start/End: Original strand, 49439221 - 49439547
Alignment:
Q  457 gattggtaatacaccaaatggcaaatgtgttgtgcaaaatatcaaacttaaacaccacaagtaatagcatactccacattcatgtttacaccataaagaa 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49439221 gattggtaatacaccaaatggcaaatgtgttgtgcaaaatatcaaacttaaacaccacaagtaatagcatactccacattcatgtttacaccataaagaa 49439320  T
Q  557 aactgatcatcgtaagtgctgcaaaattgttaacataaacgcatcaactaaaaggagattagaccaaggataaattattgtattaaaataaaccatcggt 656  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  49439321 aactggtcatcgtaagtgctgcaaaattgttaacataaacgcatcaactaaaaggagattagaccaaggataaattattgtattaaaataaaccatcgat 49439420  T
Q  657 ttaatgagatgaaaactttgttgtcaatgaggtgcggccaacccaaaagttggggtggagcagaagcggggagcggtatggacactatttcagccatgca 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49439421 ttaatgagatgaaaactttgttgtcaatgaggtgcggccaacccaaaagttggggcggagcagaagcggggagcggtatggacactatttcagccatgca 49439520  T
Q  757 aattgcaatcactaaaactaacgaaagtatgaaa 790  Q
    ||       |||||||||||||||||||||||||    
T  49439521 aa-------cactaaaactaacgaaagtatgaaa 49439547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Original strand, 38449227 - 38449606
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38449227 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 38449326  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||    
T  38449327 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcc 38449426  T
Q  205 cattattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagcctta 298  Q
    |||||||||      ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38449427 cattattccgttaatgggtcatccggacatccactcattaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagcctta 38449526  T
Q  299 ttacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38449527 ttacttaatttgatcactaatcaactaagactcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 38449606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Original strand, 38455714 - 38456093
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38455714 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 38455813  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||    
T  38455814 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcc 38455913  T
Q  205 cattattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagcctta 298  Q
    |||||||||      ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38455914 cattattccgttaatgggtcatccggacatccactcattaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagcctta 38456013  T
Q  299 ttacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38456014 ttacttaatttgatcactaatcaactaacactcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 38456093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 289; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 49151607 - 49151229
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  49151607 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttat 49151508  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttccc 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  49151507 gcctcacgttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttccc 49151408  T
Q  206 attattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttat 299  Q
    ||||||||      ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49151407 attattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaacagccttat 49151308  T
Q  300 tacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49151307 tacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatattttcccac 49151229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 289; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 49157674 - 49157296
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  49157674 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttat 49157575  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttccc 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  49157574 gcctcacgttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttccc 49157475  T
Q  206 attattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttat 299  Q
    ||||||||      ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49157474 attattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaacagccttat 49157375  T
Q  300 tacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49157374 tacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatattttcccac 49157296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Original strand, 10760814 - 10761193
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  10760814 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccagtacctttat 10760913  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||    
T  10760914 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggtcattagggtttcc 10761013  T
Q  205 cattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagcctta 298  Q
    ||||||||||      || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10761014 cattattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagcctta 10761113  T
Q  299 ttacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10761114 ttacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 10761193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 8331782 - 8331404
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8331782 ccctctcgtcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctaaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 8331683  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttccc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||    
T  8331682 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacagtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttccc 8331583  T
Q  206 attattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttat 299  Q
    ||||||||      ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  8331582 attattccgttaatgggtcatccggacatccactcattaagtccatatcaactgattaaatatttaattaattatccaattagaaatcttatatccttat 8331483  T
Q  300 tacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8331482 tacttaatttgatcactaatcaactaaggtccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgtccac 8331404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Original strand, 30051266 - 30051643
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  30051266 ccctctaatcgacaacaataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttat 30051365  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattaggtttccca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||    
T  30051366 gcctcaagttctcttcagatgggcagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcca 30051465  T
Q  207 ttattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttatt 300  Q
    |||||||      ||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  30051466 ttattccgttaatgggccatccggacatccactcgttaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatatctttatt 30051565  T
Q  301 acttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30051566 acttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 30051643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Original strand, 11839889 - 11840268
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11839889 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 11839988  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  11839989 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc 11840088  T
Q  205 cattattcc------gggtcatccggacatccaccca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagc 294  Q
    |||||||||      ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  11840089 cattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagc 11840184  T
Q  295 cttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11840185 cttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccac 11840268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Original strand, 42191384 - 42191763
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42191384 ccctctcatcaacaactataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 42191483  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  42191484 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc 42191583  T
Q  205 cattattcc------gggtcatccggacatccaccca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagc 294  Q
    |||||||||      ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  42191584 cattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagc 42191679  T
Q  295 cttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42191680 cttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccac 42191763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Original strand, 42197326 - 42197705
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42197326 ccctctcatcaacaactataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 42197425  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  42197426 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc 42197525  T
Q  205 cattattcc------gggtcatccggacatccaccca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagc 294  Q
    |||||||||      ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  42197526 cattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagc 42197621  T
Q  295 cttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42197622 cttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccac 42197705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Original strand, 10244498 - 10244877
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  10244498 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatatgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacatttat 10244597  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  10244598 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc 10244697  T
Q  205 cattattcc------gggtcatccggacatccaccca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagc 294  Q
    |||||||||      ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  10244698 cattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagc 10244793  T
Q  295 cttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10244794 cttattacttaatttgaacactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccac 10244877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Original strand, 10238376 - 10238755
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  10238376 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggatatgatatgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacatttat 10238475  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  10238476 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc 10238575  T
Q  205 cattattcc------gggtcatccggacatccaccca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagc 294  Q
    |||||||||      ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  10238576 cattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagc 10238671  T
Q  295 cttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10238672 cttattacttaatttgaacactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccac 10238755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 227; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Original strand, 17055957 - 17056334
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17055957 ccctctaatcaacaacggtaaccaaagataggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 17056056  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttccc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||    
T  17056057 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacgatgtattggggaccatagcctcttttatattggatgtccattagggtttccc 17056156  T
Q  206 attattccg-----ggtcatccggacatccaccca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagcct 296  Q
    |||||||||      | ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  17056157 attattccgttaataggcatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagcct 17056252  T
Q  297 tattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17056253 tattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagataatataattattattacgatatttgcccac 17056334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 63 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 28964811 - 28964497
Alignment:
Q  63 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattg 162  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||        ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28964811 gttagcggcggctaatttggttcttcctcaaccg--------atgcctcgagttctcttcagatggggagaagagagagttttccgtgtacggtatattg 28964720  T
Q  163 gggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||||||||      |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28964719 gggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttctcattattccgttaatggaccatccggacatccactcattgagtccatatcaactaat 28964620  T
Q  256 taaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataa 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  28964619 taaatatttaattaattatccaattagaaatctaataactttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaatttataaatagctaatataa 28964520  T
Q  356 ttattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  28964519 ttattgttacgatatttgcccac 28964497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 65 - 378
Target Start/End: Original strand, 26429639 - 26429960
Alignment:
Q  65 tagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattgg 163  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26429639 tagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattgg 26429738  T
Q  164 ggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcccattattcc------gggtcatccggacatccaccca--ttgagtccatatcaactaa 254  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| | |||| ||||||||||||||||      ||| ||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||    
T  26429739 ggaccatagcctcttttatactggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagcccatatcaactaa 26429838  T
Q  255 ttaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaata 352  Q
    |||||    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26429839 ttaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaata 26429934  T
Q  353 taattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  26429935 taattattattacgatatttgcccac 26429960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Original strand, 55003576 - 55003944
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctgaca--cacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||||    
T  55003576 ccctctaatcaacaacgataaccaaagagaaaagatgatctgaaatacacaatagagttagcggcggctgatttggttc---ctcaatcggtacctttat 55003672  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattaggtttccca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||      | ||||||||    
T  55003673 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgtcgtgtacggtatattggggaccataacctcttttatattggatg------acgtttccca 55003766  T
Q  207 ttattcc------gggtcatccggacatccaccca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagcct 296  Q
    |||||||      ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  55003767 ttattccgttaatgggtcatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagcct 55003862  T
Q  297 tattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| |  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  55003863 tattacttaatttgatcactaataaattaaggctctaaattgataaataactaatataattattattacgatatttgtccac 55003944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 214 - 378
Target Start/End: Original strand, 23138795 - 23138959
Alignment:
Q  214 gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatc 313  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23138795 gggtcatccggacatccactcattaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagtcttattacttaatttgatc 23138894  T
Q  314 actaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23138895 actaatcaactaagactcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 23138959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 224 - 377
Target Start/End: Original strand, 53071640 - 53071793
Alignment:
Q  224 gacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaac 323  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53071640 gacatccactcattgagttcatatcaactaattaaatattcaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaac 53071739  T
Q  324 taaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgccca 377  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53071740 taaggctcacaattgataaataactaatataattattgttatgatatttgccca 53071793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 800 - 985
Target Start/End: Original strand, 47809589 - 47809780
Alignment:
Q  800 aatataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatcca 897  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  47809589 aataaaaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatcca 47809688  T
Q  898 tgaactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  47809689 tgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 47809780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 236 - 378
Target Start/End: Original strand, 24643891 - 24644033
Alignment:
Q  236 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaa 335  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  24643891 ttgagtccatatcaattaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttgttacttaatttgatcactaatcaactaagactcacaa 24643990  T
Q  336 ttgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24643991 ttgataaataactaatgtaattattgttaggatatttgcccac 24644033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 218 - 378
Target Start/End: Original strand, 11846359 - 11846520
Alignment:
Q  218 catccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcact 316  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11846359 catccggacatccactcattgactcaatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaattagccttattacttaatttgatcact 11846458  T
Q  317 aatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||| | |||||| |  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11846459 aatccattaaggctctaaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccac 11846520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 66 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 46656610 - 46656353
Alignment:
Q  66 agcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattgggg 165  Q
    |||||||  |||||| | ||||||| |||||| ||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||  ||||      |||||| |||||||     
T  46656610 agcggcgattgatttggctcttccttaaccggcacctttatgtctctaattctattcagatggggagaagagaatgttt------tacggtgtattggga 46656517  T
Q  166 accatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaa 258  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  | | |||| |||||||||||||||      |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  46656516 accataacctcttttatattggataaccaatagggtttcccattattccgttaataggtcatccggacatccactcatcgagtacatatcaactaattaa 46656417  T
Q  259 atatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46656416 atatttaattaattatccaattagaaatctaatagctttattacttaatttgatcactaatcaa 46656353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 807 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 52629135 - 52628953
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-taccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 905  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52629135 ggtgacaactagggtaccatggaagaatggtggataatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 52629037  T
Q  906 cttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  52629036 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaataaacc 52628953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 802 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 43126017 - 43125828
Alignment:
Q  802 tataaggtgacaactaggtacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatga 900  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43126017 tataaggtgacaactaggtacctataaaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatga 43125919  T
Q  901 actatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  43125918 actatcttgaccccaccaataaattgctcattttcattgattagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 43125828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 805 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 47257977 - 47257792
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47257977 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaac 47257879  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  47257878 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 47257792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 805 - 987
Target Start/End: Original strand, 40130957 - 40131144
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40130957 aaggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 40131055  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  40131056 tatcttgaccccacagacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 40131144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 804 - 983
Target Start/End: Original strand, 38416721 - 38416905
Alignment:
Q  804 taaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 901  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38416721 taaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacgtaagcacatttttaagtggtatccatgaa 38416819  T
Q  902 ctatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaa 983  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  38416820 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 38416905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 822 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 46134521 - 46134357
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  46134521 ccatgaaagaatggtgaataatttacctc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 46134423  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaa 983  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  46134422 aattgctcattttcattggttggtaggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 46134357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 805 - 994
Target Start/End: Original strand, 51452749 - 51452942
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-taccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51452749 aaggtgacaattagggtaccatggaagaatgatgggtaatttaccct-aaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccataaact 51452847  T
Q  904 atcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttatataaa 994  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  51452848 atcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaactttatttaaa 51452942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 807 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 22399278 - 22399095
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22399278 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagctacataagcacatttt-aagtggtttccatgaacta 22399181  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22399180 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 22399095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 804 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 46126171 - 46126015
Alignment:
Q  804 taaggtgacaactagg-taccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46126171 taaggtgacaactagggtaccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtatccatgaac 46126073  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||    
T  46126072 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattatccac 46126015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 803 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 49330223 - 49330035
Alignment:
Q  803 ataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatga 900  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49330223 ataaggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgagtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatga 49330125  T
Q  901 actatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  49330124 actatcttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 49330035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 805 - 985
Target Start/End: Original strand, 53943586 - 53943770
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactag-gtaccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  53943586 aaggtgacaactagagtaccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagctacataagtatatttttaagtggtatccatgaact 53943684  T
Q  904 atcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  53943685 atcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 53943770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 63 - 247
Target Start/End: Original strand, 48128260 - 48128451
Alignment:
Q  63 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattg 162  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  48128260 gttagcagcggctgatttggttcttcctcaactggtacctttatgcctttagttctcttcagacagggagaagagaatgtttgccgtgtacggtatattg 48128359  T
Q  163 gggaccatagcctcttttatattagatggctatt-aggtttcccattattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48128360 gggaccatagcctcttttatattggatgaccattaaggttttccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcattgagtccatat 48128451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 807 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 41464534 - 41464349
Alignment:
Q  807 ggtgacaactag-gtacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41464534 ggtgacaactagagtacccatggaagaatgctgggtaatttacctc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 41464436  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  41464435 tcttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 41464349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 805 - 988
Target Start/End: Original strand, 7855112 - 7855300
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7855112 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatccc-aaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccttgaac 7855210  T
Q  903 tatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac-att-ttcaag-gtaatctagaaaaaacctta 988  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  7855211 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaacctta 7855300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 822 - 987
Target Start/End: Original strand, 29625844 - 29626012
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29625844 ccatagaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattaaccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 29625942  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  29625943 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 29626012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 822 - 987
Target Start/End: Original strand, 51170050 - 51170218
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  51170050 ccatggaagaatggtgggtaatttactcc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 51170148  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  51170149 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacctt 51170218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 807 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 24100464 - 24100279
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  24100464 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctc-aaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtat-catgaacta 24100367  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctta 988  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24100366 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 24100279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 805 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 42292026 - 42291840
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  42292026 aaggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagtacattttcaagtggtatctatgaac 42291928  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  42291927 tatcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 42291840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 806 - 989
Target Start/End: Original strand, 27066977 - 27067165
Alignment:
Q  806 aggtgacaactagg-ta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27066977 aggtgacaactagggtatccatggaagaatgatgggtaatttatccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatattcatgaact 27067075  T
Q  904 atcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttat 989  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27067076 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggttggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacgttat 27067165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 807 - 986
Target Start/End: Original strand, 28048392 - 28048576
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28048392 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccca-aattaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 28048490  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  28048491 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 28048576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 805 - 988
Target Start/End: Original strand, 32234396 - 32234583
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  32234396 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatagtgggtaatttaccct-aaccaatacacattagccacataagcatatttt-aagtggtatccatgaac 32234493  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctta 988  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  32234494 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 32234583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 806 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 40420018 - 40419834
Alignment:
Q  806 aggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40420018 aggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgagtaatttacccc-aatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 40419920  T
Q  904 atcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  40419919 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 40419834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 803 - 986
Target Start/End: Original strand, 43612043 - 43612231
Alignment:
Q  803 ataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatga 900  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43612043 ataaggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatga 43612141  T
Q  901 actatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac-att-ttcaag-gtaatctagaaaaaacct 986  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  43612142 actatcttgaccacgccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaatgtaatctagaaaaaacct 43612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 806 - 986
Target Start/End: Original strand, 48739232 - 48739417
Alignment:
Q  806 aggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48739232 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaaca 48739330  T
Q  904 atcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||   || ||||||||||||||||||    
T  48739331 atcttgaccccaccaacaaatttctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaagtaatctagaaaaaacct 48739417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 822 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 37313564 - 37313395
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  37313564 ccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtgatattcatgaactatcttgaccccaccaaca 37313466  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctta 988  Q
    ||||| |||||||||||| || || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  37313465 aattgttcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 37313395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 806 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 2666183 - 2665999
Alignment:
Q  806 aggtgacaactag-gtacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2666183 aggtgacaactagagtacccatgaaagaatagtgggtaatttaccat-aaccaatacacattagccacataagcacagttttaagtggtatccatgaact 2666085  T
Q  904 atcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  2666084 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 2665999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 808 - 987
Target Start/End: Original strand, 55453245 - 55453429
Alignment:
Q  808 gtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 905  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55453245 gtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttacctc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 55453343  T
Q  906 cttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  55453344 cttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttgatgagtaaattacccaccattcttcaaaggtaacctagaaaaaacctt 55453429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 76 - 373
Target Start/End: Original strand, 2982458 - 2982764
Alignment:
Q  76 gatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcct 175  Q
    ||||| ||||||| ||||   ||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||  |||    
T  2982458 gatttggttcttcttcaataagtatctttatgtcttaagttctcttcagatagggagaaaagagagttcgccgtatatggtatatttgggaccatgacct 2982557  T
Q  176 cttttatattagatggctattaggtttcccattattcc------gggtcatccggacatccaccc--attgagtccatatcaactaattaaatatttaat 267  Q
    |||||||||| | |||  |||||| ||  ||||||||       ||||||||| |||||  || |  |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2982558 cttttatatttgttggtcattaggattttcattattcttttaatgggtcatcctgacatatactcgtattgagtttatatcaactaattaaatatttaat 2982657  T
Q  268 taattatccaattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacg 366  Q
    ||||| | ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||| | ||||||||||| ||||     
T  2982658 taatttttcaattagaaatctaaatatctttattatttaatttgatcactaatcaaataaggctcgctattgataaatagattatataattattattaca 2982757  T
Q  367 atatttg 373  Q
    |||||||    
T  2982758 atatttg 2982764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 806 - 959
Target Start/End: Original strand, 35748310 - 35748465
Alignment:
Q  806 aggtgacaactagg-ta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35748310 aggtgacaactagggtatccatggaagaatgatgggtaatttatccc-aaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaact 35748408  T
Q  904 atcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  35748409 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccac 35748465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 802 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 40643987 - 40643828
Alignment:
Q  802 tataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatg 899  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||     
T  40643987 tatatggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatgatatccata 40643889  T
Q  900 aactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  40643888 aactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccac 40643828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 807 - 989
Target Start/End: Original strand, 51102378 - 51102565
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-taccat-ggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  51102378 ggtgacaactagggtaccaacggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataaatacatttttaagtgatatccatgaacta 51102476  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttat 989  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51102477 tcttgaccccaccaacaaattactcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttat 51102565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 804 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 44806869 - 44806683
Alignment:
Q  804 taaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 901  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||  | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44806869 taaggtgacaactagggtacccatgaaagaattgtggataatttacttc-aaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 44806771  T
Q  902 ctatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  44806770 ctatcttgattccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 44806683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 804 - 959
Target Start/End: Original strand, 39634569 - 39634725
Alignment:
Q  804 taaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 901  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39634569 taaggtgacaactagggtacccatggaagaattgtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 39634667  T
Q  902 ctatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  39634668 ctat-ttgaccccaccaacaaattactcattttcattggttggtgggtaaaatacccac 39634725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 807 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 44223011 - 44222827
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  44223011 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtattcatgaacaa 44222913  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac-atttt--caaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||   |||||||| ||||||||||||    
T  44222912 tcttgaccccaccaacaaatttctcattttcattggttgatgggtaaattacccactatttttcaaaggtaatttagaaaaaacct 44222827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 822 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 48609888 - 48609751
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  48609888 ccatggaagaatggtgggtaatttaccct-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttaaccccaccaaca 48609790  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||    
T  48609789 aattgctcattttcattggttggtggataaattatccac 48609751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 822 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 52215241 - 52215077
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  52215241 ccatagaagaatggtgagtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgactccaccaaca 52215143  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaa 983  Q
    |||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  52215142 aattgctcatgttcattagttggtgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 52215077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 805 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 52639026 - 52638839
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  52639026 aaggtgacaactagggtacccatagaataatggtgggtaatttacctc-aatcaatacacattagccacagaagcacatttttaagtggtatccatgaat 52638928  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-cat--tttcaaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  52638927 tatcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttcgttggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacctt 52638839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 51 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 13837625 - 13837534
Alignment:
Q  51 acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13837625 acacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt 13837534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 830 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 24376730 - 24376572
Alignment:
Q  830 gaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-aattgctc 928  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  24376730 gaatggtgggtaatttacccc-aacaaatacacataagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgatcccaccaacaaattgctc 24376632  T
Q  929 attttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  24376631 attttcattggttggtgcgtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 24376572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 822 - 992
Target Start/End: Complemental strand, 41732693 - 41732520
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  41732693 ccatggaaggatggtgggtaatttacccc-aatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaaca 41732595  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaaccttatata 992  Q
    |||||||||||||||||| ||  | | ||||||| ||| ||||||   |||||||||||||||||||||| ||||    
T  41732594 aattgctcattttcattgattgatggataaattatccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaaccttttata 41732520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 808 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 43021896 - 43021742
Alignment:
Q  808 gtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 905  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43021896 gtgacaactagggtacctatgaaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacatattagctacataagcacatttttaagtggtattcatgaactat 43021798  T
Q  906 cttga-ccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  43021797 cttgacccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccac 43021742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 831 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 39053550 - 39053393
Alignment:
Q  831 aatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-aattgctca 929  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  39053550 aatgatgggtaatttacccc-aacgaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccatcaacaaattgatca 39053452  T
Q  930 ttttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  39053451 ttttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 39053393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 13445027 - 13444847
Alignment:
Q  35 gagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggag 132  Q
    |||| ||||||||||||  |||| || || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13445027 gagatgtgatgatctgaaccacaaaacagggttagtggcggctgatttggttcttcctcaaccgatacttttatgcctcaagttctcttcagatggggag 13444928  T
Q  133 aagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcccattatt 211  Q
    |||||||| | | |  ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  13444927 aagagagaatatcgttgtgtacggtgtattggggaccataacctattttatattggatggccattagggtttcccattatt 13444847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 802 - 985
Target Start/End: Original strand, 20754388 - 20754576
Alignment:
Q  802 tataaggtgacaactagg-tac-catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatg 899  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  20754388 tataaggtgacaactagggtactcatggaataatggtgggtaatttatccc-aaccaatacacattagccacataaacatatttttaagtgatatccatg 20754486  T
Q  900 aactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  20754487 aactatcttgactctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 20754576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 806 - 989
Target Start/End: Original strand, 40804509 - 40804697
Alignment:
Q  806 aggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40804509 aggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccct-aactaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaact 40804607  T
Q  904 atcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttat 989  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  40804608 atcttgatcctaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaatcttat 40804697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 809 - 955
Target Start/End: Complemental strand, 43184092 - 43183944
Alignment:
Q  809 tgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 906  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43184092 tgacaactagggtacctatggaagaatggtgagtaatttacctc-aaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 43183994  T
Q  907 ttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattac 955  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  43183993 ttgatctcaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattac 43183944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 823 - 959
Target Start/End: Original strand, 53832502 - 53832638
Alignment:
Q  823 catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-a 921  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  53832502 catggaagaatggtggataatttacccc-aaccaatacatattagccacataagcccctttttaattggtatccataaactatcttgacaccaccaacaa 53832600  T
Q  922 attgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  53832601 attgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 53832638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 822 - 985
Target Start/End: Original strand, 47894837 - 47895003
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47894837 ccatggaagaatggtggatgatttacctc-aactaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 47894935  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-cat--tttcaaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||  ||| ||||||||||| ||||||||    
T  47894936 aattgttcattttcattagttggtaggtaaattatccaccattctttaaaggtaatctaaaaaaaacc 47895003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 822 - 985
Target Start/End: Original strand, 7755324 - 7755489
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  7755324 ccatggaagaatgatgggttatttacccc-aagcaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtatccataatctatcttgaccccaccaaca 7755421  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  7755422 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 7755489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 807 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 37324723 - 37324537
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||||||||    
T  37324723 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatccc-aaccaatacacattagccacataaatatatttttaagtggtatacatgaacta 37324625  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctta 988  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| | |||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  37324624 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacctaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 37324537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 807 - 989
Target Start/End: Original strand, 5560025 - 5560219
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tac-catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacatta--gctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5560025 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtggataatttacccc-aaccaatagacattatagtcacataagcatatttttaagtggtatccatgaac 5560123  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctc-----attttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttat 989  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||     ||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5560124 tatcttgaccccacaaacaaattgctcatttaattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttat 5560219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 822 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 36369103 - 36368938
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36369103 ccatggaaga-tggtgggtaatttaccct-aaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 36369006  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||| ||| ||| || ||||||||| | | |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  36369005 aattgctcatttttattagttggtgggtaaattatcgaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 36368938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 805 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 41216639 - 41216454
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactag-gtacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||| ||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41216639 aaggtgacaactagagtacctatggaagaatagtgggtaatttatccc-aattaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 41216541  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-cat--tttcaaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | | ||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  41216540 tatattaaccccaccaacaaattgcttattttcattggttgatggataaattacccaccatcctttaaaggtaatctagaaaaaacc 41216454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 244 - 373
Target Start/End: Original strand, 8474543 - 8474673
Alignment:
Q  244 atatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaact-aaggcccacaattgataa 342  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  8474543 atatcaattaattaaatatttaattaattattgaattataaatctaataacattattacttaatttgatcactaatcaattaaaggcccacaattgatta 8474642  T
Q  343 atagctaatataattattgttacgatatttg 373  Q
    | || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  8474643 aaagttaatataattattattacgatatttg 8474673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 822 - 955
Target Start/End: Complemental strand, 18947068 - 18946935
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18947068 ccatggaagaatggtgggtaatttgtctc-aaccaatacacattagtcacataagcacatttttaactggtatccatgaactatcttgaccccacaaaca 18946970  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattac 955  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18946969 aattgttcattttcattggttggtaggtaaattac 18946935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 34300197 - 34300055
Alignment:
Q  236 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaa 335  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |||  | |||||    
T  34300197 ttgagttcatatcaattaattaaatatttaattaattatccaattaaaaatttaatagtcttattacttaattcaattactaatcaattaattctcacaa 34300098  T
Q  336 ttgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  34300097 ttgataaatagttaatataattattattatgatgtttgcccac 34300055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 822 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 35594286 - 35594149
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||     
T  35594286 ccatggaagaatggtgggtaatttatccc-aactaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactatcttgaccccatcaaca 35594188  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||    
T  35594187 aattgctcatttttattgattggtgggtaaattacccac 35594149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 822 - 982
Target Start/End: Original strand, 41293336 - 41293498
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||     
T  41293336 ccatagaagaatggtgggtaatttaccct-aaccaatacacattagccacataagcaca-ttttaagtggtattcatgaattatcttgatcccaccaaca 41293433  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaa 982  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  41293434 aattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaa 41293498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Original strand, 11846222 - 11846340
Alignment:
Q  4 aacatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctg--acacacaatagagttagcggcggctga-tttagttcttcctcaaccggtac 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||    
T  11846222 aacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgattttggttcttcctcaaccggaac 11846321  T
Q  101 ctttatgcctcaagttctc 119  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  11846322 ctttatgccgcaagttctc 11846340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 822 - 955
Target Start/End: Complemental strand, 46949538 - 46949406
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||     
T  46949538 ccatggaagaatggtgggtaatttatcc--aaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatcttgatcccgccaaca 46949441  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattac 955  Q
    ||||| ||||||||||||||  || ||||||||||    
T  46949440 aattgttcattttcattggtcggtgggtaaattac 46949406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 851 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 53637978 - 53637841
Alignment:
Q  851 caaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggta 949  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||    
T  53637978 caaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaattatcctgaccccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggta 53637879  T
Q  950 aattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaac 984  Q
    ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  53637878 aattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 53637841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 372
Target Start/End: Original strand, 12108891 - 12109203
Alignment:
Q  63 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattg 162  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||     |||| || |||| ||| ||||||||||||||| | |||||    
T  12108891 gttagcggcgactgatttggttcttctttaaccggtacctttatgcctcaagttc-----agatcggaagaaaagatagtttgccgtgtacgatgtattg 12108985  T
Q  163 gggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccgg------gtcatccggacatccacccat--tgagtccatatcaacta 253  Q
     ||||| ||  ||||||||||||  ||| | |||    |||| ||||||||||       ||||||  |||||| || |||  |||||||||||||| ||    
T  12108986 aggaccgtactctcttttatattgaatgaccattgttatttctcattattccgttaacgagtcatctagacatcaactcatattgagtccatatcaatta 12109085  T
Q  254 attaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatat 353  Q
    || |||| |||||| ||||||| ||||||||| || ||| | |||| ||||||||| |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| ||||||     
T  12109086 atcaaatgtttaatcaattatctaattagaaa-cttataacattatcacttaattttatcactaatcaattaaagatcacaattgataaataactaatac 12109184  T
Q  354 aattattgttacgatattt 372  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  12109185 aattattattacgatattt 12109203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 805 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 52864673 - 52864556
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  52864673 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttactc--aaccaatatacattagctacataaacacatttttaaatggtatccatgaac 52864576  T
Q  903 tatcttgaccccaccaacaa 922  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  52864575 tatcttgaccccaccaacaa 52864556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 823 - 921
Target Start/End: Original strand, 33550485 - 33550582
Alignment:
Q  823 catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 921  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  33550485 catggaagaatggtgggtaatttacctc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaattatcttaaccccaccaaca 33550582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 822 - 938
Target Start/End: Original strand, 51146232 - 51146348
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-c 920  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  51146232 ccatgaaagaatggtgggtaatttacctc-aatcaatacacattagccacataagcaaatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaata 51146330  T
Q  921 aattgctcattttcattg 938  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  51146331 aattgttcattttcattg 51146348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 214 - 360
Target Start/End: Original strand, 17601912 - 17602058
Alignment:
Q  214 gggtcatccggacatccacccat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaattt 309  Q
    ||||||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17601912 gggtcattcggacatccaatcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaattt 17602007  T
Q  310 gatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 360  Q
    || |||||||||| |||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  17602008 gaccactaatcaattaaggctctaaattgataaataactaatataattatt 17602058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 63 - 180
Target Start/End: Original strand, 53069279 - 53069386
Alignment:
Q  63 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattg 162  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  53069279 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacct----------agttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattg 53069368  T
Q  163 gggaccatagcctctttt 180  Q
     |||||||||||||||||    
T  53069369 aggaccatagcctctttt 53069386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 870 - 987
Target Start/End: Original strand, 54159052 - 54159173
Alignment:
Q  870 acataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac-att-ttca 966  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||    
T  54159052 acataagcacatttttaagtggtatctatgaactatcttgactccaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttca 54159151  T
Q  967 ag-gtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    |  |||||||||||||||||||    
T  54159152 aaagtaatctagaaaaaacctt 54159173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 802 - 987
Target Start/End: Original strand, 48546835 - 48547014
Alignment:
Q  802 tataaggtgacaactagg-ta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatg 899  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||    
T  48546835 tataagatgacaactagggtatccatggaagaatggtggataatttacccc-aatcaatacacat---------aagcacatttttaagtggtatccatg 48546924  T
Q  900 aactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  48546925 aactat-ttga-cccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacctt 48547014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 848 - 941
Target Start/End: Complemental strand, 37759069 - 37758975
Alignment:
Q  848 ccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggtt 941  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||    
T  37759069 ccccaaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatctatgaactatcttgacttcatcaacaaattgctcattttcattggtt 37758975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 857 - 938
Target Start/End: Complemental strand, 47182131 - 47182049
Alignment:
Q  857 atacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattg 938  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47182131 atacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccataaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattg 47182049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 313 - 378
Target Start/End: Original strand, 9586490 - 9586555
Alignment:
Q  313 cactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9586490 cactaatcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccac 9586555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 805 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 53115620 - 53115446
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||           ||| |||||||||||||||||| |||    
T  53115620 aaggtgacaactagggtacctatggaaaaatggtggataatttacccc-aaccaataaacatt-----------cacctttttaagtggtatccataaac 53115533  T
Q  903 tatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  53115532 tatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 53115446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 822 - 989
Target Start/End: Original strand, 34279738 - 34279897
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 921  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||           ||||||||||||||||||||| || |    
T  34279738 ccatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgaccccacaaata 34279825  T
Q  922 a-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttat 989  Q
    | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  34279826 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaaccttat 34279897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 805 - 959
Target Start/End: Original strand, 39141123 - 39141269
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactaggt-accatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |         || ||||||||    
T  39141123 aaggtgataactaggttaccatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aatcaatacacattagccacataagcacatat---------attcatgaact 39141212  T
Q  904 atcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  39141213 atcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 39141269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 805 - 985
Target Start/End: Original strand, 55000176 - 55000350
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||           |||||||    
T  55000176 aaggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaac 55000263  T
Q  903 tatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  55000264 tatcttgaccctacaaataaattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttctaaggtaatttagaaaaaacc 55000350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 881 - 985
Target Start/End: Original strand, 42998853 - 42998960
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-cattttc-aaggtaatctag 977  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| | ||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  42998853 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgatcattatgattggttggtgggtaaattacccaccattttcaaaggtaatctag 42998952  T
Q  978 aaaaaacc 985  Q
    ||||||||    
T  42998953 aaaaaacc 42998960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 822 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 25641800 - 25641644
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 921  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||           ||||||||||||||||||| || |    
T  25641800 ccatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatattta-----------tgaactatcttgaccccacaaata 25641713  T
Q  922 a-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  25641712 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 25641644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 803 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 42590005 - 42589829
Alignment:
Q  803 ataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatga 900  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||           |||||    
T  42590005 ataaggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catga 42589918  T
Q  901 actatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  42589917 actatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 42589829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 881 - 989
Target Start/End: Complemental strand, 25353661 - 25353549
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatcta 976  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||| || ||||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  25353661 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgcttattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 25353562  T
Q  977 gaaaaaaccttat 989  Q
    |||||||||||||    
T  25353561 gaaaaaaccttat 25353549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 881 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 55380092 - 55379984
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatcta 976  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  55380092 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 55379993  T
Q  977 gaaaaaacc 985  Q
    |||||||||    
T  55379992 gaaaaaacc 55379984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 214
Target Start/End: Original strand, 13367114 - 13367209
Alignment:
Q  119 cttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcccattattccg 214  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  13367114 cttcagatggggagaagagcggttttgctatgtacggtatattggggaccatagcctc-tttatattggatggtcattagggtttcccattattccg 13367209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 822 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 49130732 - 49130575
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-c 920  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||           ||| ||||||||||||||||| || |||      
T  49130732 ccatagaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactatcttgacctcatcaata 49130645  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  49130644 aattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 49130575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 822 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 54401341 - 54401215
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 921  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||           ||||||||||||||||||||| || |    
T  54401341 ccatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgaccccacaaata 54401254  T
Q  922 a-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  54401253 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 54401215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 804 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 51416143 - 51415966
Alignment:
Q  804 taaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 901  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||           || ||||||    
T  51416143 taaggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacat-----------atacatgaa 51416056  T
Q  902 ctatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  51416055 ctatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 51415966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 822 - 987
Target Start/End: Original strand, 54707237 - 54707394
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 921  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||           ||||||||||||||||||||| || |    
T  54707237 ccatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgaccccacaaata 54707324  T
Q  922 a-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    | ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  54707325 aattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 54707394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 807 - 991
Target Start/End: Complemental strand, 24688285 - 24688107
Alignment:
Q  807 ggtgacaactaggta--ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||| ||           |||||||||    
T  24688285 ggtgacaactaggttacccatgaaagaatgatggataatttacccc-aaccagtagacattagccacataaacacatatt-----------catgaacta 24688198  T
Q  905 tcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccaca--ttttc-aaggtaatctagaaaaaaccttatat 991  Q
    | |||||||||| || || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  24688197 ttttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccacaatttttcaaaggtaatttagaaaaaacattatat 24688107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 877 - 988
Target Start/End: Original strand, 2227995 - 2228110
Alignment:
Q  877 cacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaa 972  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||  | |||||||| |||| ||||||   |||||||    
T  2227995 cacattttgaagtgatatctatgaactatcttgacctcaccaataaattgcttattttcattggttgatcggtaaatttcccaccatttttcaaaggtaa 2228094  T
Q  973 tctagaaaaaacctta 988  Q
    ||||||||||||||||    
T  2228095 tctagaaaaaacctta 2228110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 881 - 996
Target Start/End: Original strand, 30251565 - 30251684
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatcta 976  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||| ||  |||||||||||| ||||||   |||||| ||||    
T  30251565 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgagtaaattacccaccatttttcaaaggtagtcta 30251664  T
Q  977 gaaaaaaccttatataaata 996  Q
    ||||||||||| ||| ||||    
T  30251665 gaaaaaaccttttatcaata 30251684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 896 - 987
Target Start/End: Original strand, 17665603 - 17665698
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttca-aggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  17665603 catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcataggtaatttagaaaaaacctt 17665698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 889 - 983
Target Start/End: Original strand, 41882063 - 41882161
Alignment:
Q  889 tggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaa 983  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  41882063 tggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 41882161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 896 - 986
Target Start/End: Original strand, 47511019 - 47511113
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||   |||||||| ||||||||||||    
T  47511019 catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacct 47511113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 889 - 989
Target Start/End: Original strand, 21597220 - 21597324
Alignment:
Q  889 tggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccaca--ttttcaa-ggtaatctagaaaaaac 984  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||| || |||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||||||    
T  21597220 tggtatccataaactatcttgatcccaccaataaattgctcattataattggttggtgggtaaattactcaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaac 21597319  T
Q  985 cttat 989  Q
    |||||    
T  21597320 cttat 21597324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 889 - 989
Target Start/End: Original strand, 28576184 - 28576288
Alignment:
Q  889 tggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-cat--tttcaaggtaatctagaaaaaac 984  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||  | ||||||||||||| |||  ||  |||||||||||||||||||    
T  28576184 tggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgttcattttcatcggttgatgggtaaattacccatcatacttcaaaggtaatctagaaaaaac 28576283  T
Q  985 cttat 989  Q
    |||||    
T  28576284 cttat 28576288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 807 - 959
Target Start/End: Original strand, 38156632 - 38156775
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||           ||| |||||||||    
T  38156632 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaacta 38156719  T
Q  905 tcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  38156720 tcttgaccccacaaataaattgttcattttaattggttggtgggtaaattacccac 38156775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 314
Target Start/End: Original strand, 27103272 - 27103344
Alignment:
Q  243 catatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatc-taatagccttattacttaatttgatca 314  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||||| |||||||||    
T  27103272 catatcaattaattaaatatttaattaattatccaatttaaaatcttaattgtcttattactttatttgatca 27103344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 804 - 959
Target Start/End: Original strand, 31286790 - 31286936
Alignment:
Q  804 taaggtgacaactagg-tac-catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 901  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||  |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||           ||||||    
T  31286790 taaggtgacaactaggctactcatgaaagaatgatgagtaatttactcc-aaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaa 31286877  T
Q  902 ctatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  31286878 ctatcttgaccccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccac 31286936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 896 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 45058975 - 45058911
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  45058975 catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 45058911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 803 - 985
Target Start/End: Original strand, 41635796 - 41635972
Alignment:
Q  803 ataaggtgacaactaggta--ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatga 900  Q
    |||||||||||||||| |   ||||| ||||||| ||| ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||| ||           |||||    
T  41635796 ataaggtgacaactagattacccatgaaagaatgatgggtaatttacctc-aatcaatacacattagccacataagcacatatt-----------catga 41635883  T
Q  901 actatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  41635884 actatcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 41635972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 881 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 51143924 - 51143845
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||    
T  51143924 tttttaggtggtatccataaactatattgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccac 51143845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 34300429 - 34300348
Alignment:
Q  63 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttt 144  Q
    |||||||||| || |||| ||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||    
T  34300429 gttagcggcgacttatttggttattcttcaaccggtactttcatgcctcaagttctcttcatacgaggagatgagagagttt 34300348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 185
Target Start/End: Original strand, 17593487 - 17593531
Alignment:
Q  141 gtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatatt 185  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17593487 gtttgccgtgtacggtatatttgggaccagagcctcttttatatt 17593531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 822 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 37028877 - 37028751
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 921  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||           |||||||||||||||| |||| || |    
T  37028877 ccatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataaacacatatt-----------catgaactatcttgactccacaaata 37028790  T
Q  922 a-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    | ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  37028789 aattgctcattttcattggttggtggataaattacccac 37028751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 877 - 956
Target Start/End: Complemental strand, 41609178 - 41609098
Alignment:
Q  877 cacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacc 956  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| || || |||| || || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  41609178 cacatttttaggtagtatccatgaactattttaactccactaataaattgctcattttcattagttggtaggtaaattacc 41609098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 896 - 959
Target Start/End: Original strand, 52756150 - 52756214
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  52756150 catgaactatcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttagtgggtaaataacccac 52756214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9760600 - 9760506
Alignment:
Q  119 cttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcccattattcc 213  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||| |  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  9760600 cttcagatggggagaagagcggttttactatgtacggtatattggggaccatatcctc-tttatattggatgaccattagggtttcctattattcc 9760506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 804 - 881
Target Start/End: Original strand, 44945932 - 44946010
Alignment:
Q  804 taaggtgacaactagg-tac-catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacat 881  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44945932 taaggtgacaactaggctacgcatgaaagaatgatgaataatttacctc-aaccaatacacattagccacataagcacat 44946010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 889 - 959
Target Start/End: Original strand, 50731986 - 50732057
Alignment:
Q  889 tggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||| || ||||||||||||||    
T  50731986 tggtatccataaactaccttgaccccaccaacaaattgctcattaagattggttggtgggtaaattacccac 50732057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 889 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 50780870 - 50780799
Alignment:
Q  889 tggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||| || ||||||||||||||    
T  50780870 tggtatccataaactaccttgaccccaccaacaaattgctcattaagattggttggtgggtaaattacccac 50780799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 105
Target Start/End: Original strand, 24643773 - 24643815
Alignment:
Q  63 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtaccttta 105  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24643773 gttagcggcggctgatttggttctttctcaaccggtaccttta 24643815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 191
Target Start/End: Original strand, 24643817 - 24643878
Alignment:
Q  127 ggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatgg 191  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  24643817 ggggagaagagagagtttgtcgt--acggtgtattgggg-ccatagcctcttttatattggatgg 24643878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 806 - 893
Target Start/End: Original strand, 30429226 - 30429314
Alignment:
Q  806 aggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggta 893  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  30429226 aggtgacaactagggtacctacggaagaatggtggataatttatccc-aattaatacatattagtcacataaacacatttttaagtggta 30429314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 889 - 985
Target Start/End: Original strand, 48726070 - 48726170
Alignment:
Q  889 tggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-cat--tttcaaggtaatctagaaaaaac 984  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||| || ||||| |||||||||| || || ||||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||||    
T  48726070 tggtatccatgaactgtcttgactctaccaataaattgcttattttcattgattggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatttagaaaaaac 48726169  T
Q  985 c 985  Q
    |    
T  48726170 c 48726170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 896 - 989
Target Start/End: Original strand, 51224117 - 51224213
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttat 989  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  51224117 catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcatttttatt-gttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaaccttat 51224213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 803 - 881
Target Start/End: Original strand, 48534003 - 48534082
Alignment:
Q  803 ataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacat 881  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  48534003 ataaggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aaccgatacacattagccacataagcacat 48534082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 40
Target Start/End: Original strand, 17593446 - 17593477
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagagg 40  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17593446 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagagg 17593477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 896 - 954
Target Start/End: Complemental strand, 40022166 - 40022107
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaatta 954  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  40022166 catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaatta 40022107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 877 - 959
Target Start/End: Original strand, 47402810 - 47402892
Alignment:
Q  877 cacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||| ||  | | ||||||||||||    
T  47402810 cacatttttaaatggtatc-atgaactatcttgaccctaccaataaattgttcattttcattgattgatggataaattacccac 47402892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 877 - 954
Target Start/End: Original strand, 8847718 - 8847796
Alignment:
Q  877 cacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaatta 954  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||    
T  8847718 cacatttttaagtggtattcgtgaactattttgatcccaccaataaattgttcatttttattagttggtatgtaaatta 8847796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 322
Target Start/End: Original strand, 27088019 - 27088097
Alignment:
Q  245 tatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatc-taatagccttattacttaatttgatcactaatcaa 322  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  27088019 tatcaattaattagatttttaattaattatccaatttaaaatcttaattgtcttaatactttatttgatcattaatcaa 27088097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 902 - 959
Target Start/End: Original strand, 44946014 - 44946072
Alignment:
Q  902 ctatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  44946014 ctatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccac 44946072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 358
Target Start/End: Original strand, 52222937 - 52222995
Alignment:
Q  300 tacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataatta 358  Q
    |||||||||  ||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  52222937 tacttaattatatcactaattaattaaggccccaaattgataaatagataatataatta 52222995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 297; Significance: 1e-166; HSPs: 118)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Original strand, 3811333 - 3811711
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  3811333 ccctctcatcaacaacgataacaaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccagtacctttat 3811432  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttccc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||    
T  3811433 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttccc 3811532  T
Q  206 attattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttat 299  Q
    ||||||||      ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3811533 attattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttat 3811632  T
Q  300 tacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3811633 tacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 3811711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 3817475 - 3817850
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  3817475 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccagtacctttat 3817574  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttccc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||    
T  3817575 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttccc 3817674  T
Q  206 attattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttat 299  Q
    ||||||||      ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3817675 attattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttat 3817774  T
Q  300 tacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcc 375  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3817775 tacttaatttcatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcc 3817850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 351781 - 351404
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  351781 ccctctcatcaacaacgataaccaaa-agaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttat 351683  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttccc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  351682 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttccc 351583  T
Q  206 attattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttat 299  Q
    ||||||||      ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  351582 attattccagtaatgggccatccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaatagccttat 351483  T
Q  300 tacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  351482 tacttaatttgatcactaatcaactaaggctgacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 351404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 339366 - 338998
Alignment:
Q  18 caacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagt 115  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  339366 caacaatgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagt 339267  T
Q  116 tctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattaggtttcccattattcc-- 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||      
T  339266 tctcttcagatggggagaagagagagtttgtcgtgtacggtatattggggaccatgacctcttttatattggatggccattaggtttcccattattccag 339167  T
Q  214 ----gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaattt 309  Q
        ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  339166 taatgggccatccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaatagccttattacttaattt 339067  T
Q  310 gatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  339066 gatcactaatcaactaaggctgacaattgataaatagctaatataattattgttatgatatttgcccac 338998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Original strand, 28421123 - 28421501
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28421123 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 28421222  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttccc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  28421223 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttccc 28421322  T
Q  206 attattcc------gggtcatccggacatccaccca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagcc 295  Q
    ||||||||      ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  28421323 attattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagcc 28421418  T
Q  296 ttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28421419 ttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccac 28421501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 63 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 5849469 - 5849147
Alignment:
Q  63 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattg 162  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5849469 gttagcggcgtctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttatcttcagatggggagaaaagagagtttgccgtgtacggtatattg 5849370  T
Q  163 gggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaat 255  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| ||||||||||      |  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5849369 aggaccatagcctcttttatattggatgaccattaaggtttctcattattccgttaatggaccatccgaacatccactcattgagtccatatcaactaat 5849270  T
Q  256 taaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataa 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  5849269 taaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaataactaatataa 5849170  T
Q  356 ttattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  5849169 ttattgttacgatatttacccac 5849147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 70 - 376
Target Start/End: Original strand, 35148236 - 35148549
Alignment:
Q  70 gcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggacca 169  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  35148236 gcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaaattctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggatca 35148335  T
Q  170 tagcctcttttatattagatggctattag-gtttcccattattccgg------gtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatat 262  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |       | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35148336 tagcctcttttatattggatggccattagagtttcccattattctgttaatgagccatccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatat 35148435  T
Q  263 ttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35148436 ttaattaattatccaattagaaatccaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcataattgataaatagctaatataattattgt 35148535  T
Q  363 tacgatatttgccc 376  Q
    ||||||||||||||    
T  35148536 tacgatatttgccc 35148549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 63 - 375
Target Start/End: Original strand, 22742149 - 22742469
Alignment:
Q  63 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttt-gccgtgtacggtatatt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22742149 gttagcggcggctgatttggtttttcatcaactggtacctttatgcctcaagttctcttcagattgggagaagagagagttttgccatgtacggtatatt 22742248  T
Q  162 ggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaa 254  Q
    || |||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  22742249 ggagaccatagtctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtccatatcaactac 22742348  T
Q  255 ttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatata 354  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  22742349 ttatatatttaattaattatctaattagaaatctaatagccttattacttaattttatcactaatcaactaaggctcacagttgataaataactaatata 22742448  T
Q  355 attattgttacgatatttgcc 375  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  22742449 attattgttacggtatttgcc 22742469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 102 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 26383569 - 26383286
Alignment:
Q  102 tttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-t 200  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |    
T  26383569 tttatgcctcaagttctcttcaaatagggagaagagagagtttgccgtgtccggtgtattagggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggt 26383470  T
Q  201 ttcccattattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagc 294  Q
    |||||||||||||      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26383469 ttcccattattccattaatgggtcatccggacatccactcattgagtccatattcattaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagc 26383370  T
Q  295 cttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  26383369 cttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattatgatatttgcccac 26383286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 378
Target Start/End: Original strand, 5979340 - 5979719
Alignment:
Q  11 ctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  5979340 ctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccggtacttttatgc 5979439  T
Q  109 ctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctctttta-tattagatggctattag-gtttccc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||| | |||||  ||||||    
T  5979440 ctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattggggaccataacctcttttattattggatgaccattagactttccc 5979539  T
Q  206 attattccg------ggtcatccggacatccaccca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagcc 295  Q
    ||||||| |      || |||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  5979540 attattctgttaattggccatccgaacatccatccatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagcc 5979635  T
Q  296 ttattacttaatttgatcactaatcaactaa-ggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5979636 ttattacttaatttgatcactaatcaattaagggctctaaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccac 5979719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 163 - 378
Target Start/End: Original strand, 35152849 - 35153071
Alignment:
Q  163 gggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35152849 gggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcattgagtccatatcaactaat 35152948  T
Q  256 taaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataa 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  35152949 taaatatttaattaattatccaattagaaatcgaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaatatctaatataa 35153048  T
Q  356 ttattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  35153049 ttattgttacgatatttgcccac 35153071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 20238946 - 20238762
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20238946 ccctctcatcaacaacaataaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 20238847  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatg 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20238846 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatg 20238762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 43539979 - 43539616
Alignment:
Q  10 cctctcatcaacaacgataaccaaagagagg---tgatgatctgacacaca----atagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacct 102  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||    |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43539979 cctctcaacaacaacgataaacaaagagaggaggtgatgatctgaaacacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccagtacct 43539880  T
Q  103 ttatgcctcaagttctcttcagatgg---ggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-g 198  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || | |||| |    
T  43539879 ttatgcctaaagttctcttcagatgggaaggagaagagagagtttgccgtgcacggtatattggggaccataacctcttttatattgggtgaccattagg 43539780  T
Q  199 gtttcccattattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaata 292  Q
    |||| || |||||||      ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||                 |||| |||||||| |    
T  43539779 gttttccgttattccgttaatgggtcatccagacatccactcattgagtccatatcaattaattaaat-----------------attataaatctaa-a 43539698  T
Q  293 gccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgc 374  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  43539697 accttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaaatgataaataattaatataattatttttacgatatttgc 43539616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15843942 - 15843733
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  15843942 ccctctaatcaacaacaataaccaaagagaggagatgatcggaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaactggtacatttat 15843843  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgta-cggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattag-gtttcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||    
T  15843842 gcctcaagttctcttcagatggggagaatagagagtttgccgtgtaccggtgtattggagaccataacctcttttatattggatgaccattagagtttcc 15843743  T
Q  205 cattattccg 214  Q
    ||||||||||    
T  15843742 cattattccg 15843733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15861051 - 15860842
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  15861051 ccctctaatcaacaacaataaccaaagagaggagatgatcggaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaactggtacatttat 15860952  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgta-cggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattag-gtttcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||    
T  15860951 gcctcaagttctcttcagatggggagaatagagagtttgccgtgtaccggtgtattggagaccataacctcttttatattggatgaccattagagtttcc 15860852  T
Q  205 cattattccg 214  Q
    ||||||||||    
T  15860851 cattattccg 15860842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 26381023 - 26380751
Alignment:
Q  63 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattg 162  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||  | | || ||    
T  26381023 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaactgctacctttatgcctaaagttttcttcagatcgggagaagagagagtttgtcgtgtctgatgtactg 26380924  T
Q  163 gggaccatagcctcttttatattagatggctatt-aggtttcccattattccgggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaata 261  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| | ||| || |||||||||| |  ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||                 
T  26380923 gggaccatag-ctcttttatattggatgaccattaagatttcccatta-tatgggtcatccggacatgcactcattgagttcatatc------------- 26380839  T
Q  262 tttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaata 352  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26380838 ---aattaattatccaattagaaatctaatagccttattatttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaatagctaata 26380751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 805 - 986
Target Start/End: Original strand, 33839713 - 33839899
Alignment:
Q  805 aaggtgacaacta-ggtacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33839713 aaggtgacaactaaggtacccatggaagaatggtggataatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 33839811  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  33839812 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 33839899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 822 - 986
Target Start/End: Original strand, 33423292 - 33423459
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33423292 ccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 33423390  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  33423391 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 33423459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 807 - 959
Target Start/End: Original strand, 45690097 - 45690251
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45690097 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 45690195  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  45690196 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 45690251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 805 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 46913296 - 46913107
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcaca--tttttaagtggtatccatga 900  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  46913296 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacacatttttaagtggtatccatga 46913198  T
Q  901 actatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  46913197 actatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtaggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 46913107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 803 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 17855615 - 17855427
Alignment:
Q  803 ataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatga 900  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17855615 ataaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtagtatccatga 17855517  T
Q  901 actatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-cat--tttcaaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  17855516 actatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacct 17855427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 807 - 983
Target Start/End: Original strand, 23393051 - 23393232
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23393051 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttacccc-aaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaacta 23393149  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac-att-ttc-aaggtaatctagaaaaaa 983  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23393150 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 23393232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 807 - 987
Target Start/End: Original strand, 25893917 - 25894102
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25893917 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 25894015  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  25894016 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 25894102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 805 - 994
Target Start/End: Original strand, 2341659 - 2341854
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc--atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 901  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2341659 aaggtgacaactagggtaccccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagttgtatccatgaa 2341757  T
Q  902 ctatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttatataaa 994  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2341758 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaaccttatataaa 2341854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 805 - 985
Target Start/End: Original strand, 47066975 - 47067160
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47066975 aaggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 47067073  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-cat--tttcaaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  47067074 tatcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacc 47067160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 807 - 987
Target Start/End: Original strand, 33695821 - 33696006
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-ta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33695821 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 33695919  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  33695920 tcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 33696006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 806 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 35356072 - 35355887
Alignment:
Q  806 aggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35356072 aggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaact 35355974  T
Q  904 atcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  35355973 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacct 35355887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 824 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 31587012 - 31586848
Alignment:
Q  824 atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caa 922  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  31587012 atggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaataaa 31586914  T
Q  923 ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  31586913 ttgctcattttcattggttagtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 31586848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 805 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 36389541 - 36389385
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36389541 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaac 36389443  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  36389442 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 36389385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 803 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 40670750 - 40670563
Alignment:
Q  803 ataaggtgacaacta-ggtacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatga 900  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40670750 ataaggtgacaactaaggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatga 40670652  T
Q  901 actatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  40670651 actatcttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggttggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 40670563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 805 - 983
Target Start/End: Original strand, 49171360 - 49171543
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tac-catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49171360 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttaccct-aaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaac 49171458  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaa 983  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  49171459 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 49171543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 807 - 987
Target Start/End: Original strand, 22979647 - 22979832
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22979647 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatatacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaacta 22979745  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  22979746 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 22979832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 807 - 987
Target Start/End: Original strand, 47740331 - 47740516
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-ta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  47740331 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatattcatgaacta 47740429  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  47740430 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 47740516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 807 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 27018299 - 27018115
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27018299 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttactcc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 27018201  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  27018200 tcttgaccacaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 27018115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 806 - 985
Target Start/End: Original strand, 35328068 - 35328252
Alignment:
Q  806 aggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35328068 aggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 35328166  T
Q  904 atcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttca-aggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  35328167 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaatttacccaccattcttcataggtaatttagaaaaaacc 35328252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 822 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 15877716 - 15877553
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15877716 ccatggaagaatggtgggtaatttatccc-aaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 15877618  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaa 982  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  15877617 aattgctcattttcatttgttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaa 15877553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 807 - 989
Target Start/End: Original strand, 48609677 - 48609864
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  48609677 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgtataatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatacatgaatta 48609775  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttat 989  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48609776 tcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttat 48609864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 824 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 33411424 - 33411259
Alignment:
Q  824 atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-aa 922  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33411424 atggaagaatggtgggtaatttatccc-aaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaa 33411326  T
Q  923 ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  33411325 ttgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatcaagaaaaaacct 33411259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 823 - 959
Target Start/End: Original strand, 5183843 - 5183979
Alignment:
Q  823 catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-a 921  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5183843 catggaagaatggtgggtaatttacctc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgttatccatgaactatcttgaccccaccaacaa 5183941  T
Q  922 attgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  5183942 attgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 5183979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 822 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 10028654 - 10028488
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  10028654 ccatggaagaatagtgggtaatttaccct-aaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccataaactatcttgaccccaccaaca 10028556  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  10028555 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 10028488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 805 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 45482843 - 45482657
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tac-catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  45482843 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttacctc-aaccaatacacatcagtcacataagcatatttttaagtgatatccatgaac 45482745  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  45482744 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 45482657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 807 - 983
Target Start/End: Original strand, 20165814 - 20165995
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20165814 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgagtaatttacctc-aacctatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaacta 20165912  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaa 983  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20165913 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 20165995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 805 - 985
Target Start/End: Original strand, 35757018 - 35757203
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35757018 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgagtaatttacccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtat-catgaac 35757116  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || | ||||||| ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  35757117 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcgttggttggtggataaattatccaccattcttcaaagttaatctagaaaaaacc 35757203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 806 - 985
Target Start/End: Original strand, 37846015 - 37846199
Alignment:
Q  806 aggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  37846015 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccataaatt 37846113  T
Q  904 atcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-cat--tttcaaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  37846114 atcttgatcccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacc 37846199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 807 - 990
Target Start/End: Original strand, 45063357 - 45063543
Alignment:
Q  807 ggtgacaactag-gtacca-tggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45063357 ggtgacaactagagtaccaatgaaagaatggtggataatttacctc-aac--atacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 45063453  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttata 990  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45063454 tcttgactccatcaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttata 45063543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 800 - 985
Target Start/End: Original strand, 26579710 - 26579900
Alignment:
Q  800 aatataaggtgacaactagg-ta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatcca 897  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||    
T  26579710 aatacaaggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aatcaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtataca 26579808  T
Q  898 tgaactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  26579809 tgaactatcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattgatttgtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 26579900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 805 - 994
Target Start/End: Complemental strand, 33332973 - 33332780
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  33332973 aaggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttacctc-aatcaatacacattagccgcataagcatatttttaagtggtatc-atgaac 33332876  T
Q  903 tatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttatataaa 994  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33332875 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttaaataaa 33332780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 805 - 938
Target Start/End: Complemental strand, 35767659 - 35767524
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-ta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35767659 aaggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccatataaacacatttttaagtggtatccatgaac 35767561  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattg 938  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35767560 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattg 35767524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 806 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 31625887 - 31625706
Alignment:
Q  806 aggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31625887 aggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgg-taatttactcc-aaccaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 31625790  T
Q  904 atcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaa 983  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  31625789 atcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcgaaggtaatctagaaaaaa 31625706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 829 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 33870404 - 33870244
Alignment:
Q  829 agaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-aattgct 927  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33870404 agaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtattcatgaactatcttgaccccaccaacaaattgct 33870306  T
Q  928 cattttcattggttagtaggtaaattaccca-cat--tttcaaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||| ||| |||  ||| ||||| |||||||||||||||    
T  33870305 catttacattggttggtgggtaaattatccaccattctttaaaggtgatctagaaaaaacct 33870244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 822 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 19563613 - 19563445
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  19563613 ccatggaagaatggtgggtaatttacctt-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatattcatgaactatcttgaccccaccaaca 19563515  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    ||||| ||||||||||||||| || | ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19563514 aattgttcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 19563445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 800 - 959
Target Start/End: Original strand, 41990852 - 41991012
Alignment:
Q  800 aatataaggtgacaactaggtacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccat 898  Q
    |||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41990852 aataaaaggtgataattaggtacccatggaagaatggtgagtaatttatcca-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctat 41990950  T
Q  899 gaactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||    
T  41990951 gaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgtgtaaattatccac 41991012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 822 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 43499651 - 43499484
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43499651 ccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aactaatatacattggccacataagtatatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 43499553  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-cat--tttcaaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| || |||  ||| ||||||||||| |||||||||    
T  43499552 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattctttaaaggtaatctaaaaaaaacct 43499484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 807 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 29447020 - 29446867
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||   | ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29447020 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatta--ctccaaccaatacacattagtcacataagcatatttttaagtggtatccatgaacta 29446923  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  29446922 tcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccac 29446867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 167
Target Start/End: Original strand, 35150761 - 35150865
Alignment:
Q  63 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattg 162  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  35150761 gttagcggcggctgatttggttattcttcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattg 35150860  T
Q  163 gggac 167  Q
    |||||    
T  35150861 gggac 35150865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 804 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 41904391 - 41904269
Alignment:
Q  804 taaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 901  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41904391 taaggtgacaactaggatacttatggaagaatggtggataatttacccc-aaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 41904293  T
Q  902 ctatcttgaccccaccaacaattg 925  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  41904292 ctatcttgacctcaccaacaattg 41904269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 807 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 5712351 - 5712166
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||| || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5712351 ggtgacaactagggtacccatgaaaaaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccataaacta 5712253  T
Q  905 tcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac-att-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  5712252 tcttgaccccactaataaattggtcattttcattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 5712166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 143 - 294
Target Start/End: Original strand, 42767505 - 42767661
Alignment:
Q  143 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 235  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||||| |||||||||      | |||||| ||||||||| ||    
T  42767505 ttgccgtgtacggtatattcgggaccatagcctcttttatat---atggccattagggtttcctattattccgttaatggatcatccagacatccactca 42767601  T
Q  236 ttga-gtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagc 294  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42767602 ttgaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattaaaaatctaatagc 42767661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 806 - 936
Target Start/End: Original strand, 30076526 - 30076658
Alignment:
Q  806 aggtgacaactagg-ta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30076526 aggtgacaactagggtatccatggaagaatgatgggtaatttacgcc-aactaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 30076624  T
Q  904 atcttgaccccaccaac-aattgctcattttcat 936  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30076625 atcttgaccccaccaacaaattgatcattttcat 30076658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 852 - 986
Target Start/End: Original strand, 33720082 - 33720220
Alignment:
Q  852 aaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaa 950  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||| || |||||    
T  33720082 aaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaactatcttgactccatcaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaa 33720181  T
Q  951 attacccac-att-ttcaag-gtaatctagaaaaaacct 986  Q
    ||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  33720182 attacccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaacct 33720220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 807 - 937
Target Start/End: Original strand, 28233936 - 28234068
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28233936 ggtgacaactagggtacccatgaaagaaaggtgggtagtttacccc-aaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 28234034  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcatt 937  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28234035 tcttaaccccaccaacaaattgctcattttcatt 28234068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 233 - 354
Target Start/End: Original strand, 18666880 - 18667006
Alignment:
Q  233 ccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaat---tatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaa--ctaag 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||    
T  18666880 ccattgagtccatatcaactaattaaaaatttaattaataactatacaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcacttatcaattataag 18666979  T
Q  328 gcccacaattgataaatagctaatata 354  Q
    || |||  |||||||||| ||||||||    
T  18666980 gctcacggttgataaataactaatata 18667006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 851 - 985
Target Start/End: Original strand, 31429520 - 31429658
Alignment:
Q  851 caaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggta 949  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||    
T  31429520 caaccaatacacattagtcacataaacacatttttaagtggtatccatgtactatcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggata 31429619  T
Q  950 aattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||| ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  31429620 aatcacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacc 31429658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 822 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 44405514 - 44405418
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa 919  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44405514 ccatggaagaatggtaggtaatttacctc-aaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccctaccaa 44405418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 829 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 44564497 - 44564367
Alignment:
Q  829 agaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgct 927  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||  |||||||    
T  44564497 agaatggtggataatttacccc-aaccaatacacattagtcacataagcatatttttaagtggtatctatgaactatcttgacaccactaataaattgct 44564399  T
Q  928 cattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
     ||||| |||| || || ||||||||| ||||    
T  44564398 tatttttattgattggtgggtaaattatccac 44564367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 822 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 10618457 - 10618298
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||     
T  10618457 ccatggaagaatggtgggtaatttatccc-aaccaatacacattagccacataaacatatttttaagtggtattcatgaactat-------ccaccaaca 10618366  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||    
T  10618365 aattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaatgtaatctagaaaaaacc 10618298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 806 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 37128110 - 37127966
Alignment:
Q  806 aggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||           |||||||    
T  37128110 aggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttacccc-aaccaatacacattagctacataagcacatattt-----------atgaact 37128023  T
Q  904 atcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  37128022 atcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 37127966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 8824542 - 8824431
Alignment:
Q  263 ttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgt 362  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8824542 ttaattaattatctaaa-agaaatctaatatccttattacctaattcgatcattaatcaattaagcctcacaattgataaatagctaatataattattat 8824444  T
Q  363 tacgatatttgcc 375  Q
     | ||||||||||    
T  8824443 aaagatatttgcc 8824431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 359
Target Start/End: Original strand, 30219501 - 30219598
Alignment:
Q  262 tttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattat 359  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||| |||||    
T  30219501 tttaattaactatctaattagaaatctaataactttataacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattaataaataactactattattat 30219598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 805 - 985
Target Start/End: Original strand, 35752032 - 35752206
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||           |||||||    
T  35752032 aaggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaac 35752119  T
Q  903 tatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  35752120 tatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 35752206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 881 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 33393436 - 33393328
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac---attttcaaggtaatcta 976  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||    |||| |||||||||||    
T  33393436 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccactattttttaaaggtaatcta 33393337  T
Q  977 gaaaaaacc 985  Q
    |||||||||    
T  33393336 gaaaaaacc 33393328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 822 - 986
Target Start/End: Original strand, 36816862 - 36817018
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 921  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||           ||||||||||||||||||||| || |    
T  36816862 ccatgaaagaatgatggataatttacccc-aaccaatacatattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgaccccacaaata 36816949  T
Q  922 a-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  36816950 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 36817018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 7608437 - 7608306
Alignment:
Q  12 tctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctgacacaca-ata---gagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatg 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||   |  ||||||||| ||||||| || |||||| || |||||||||||||    
T  7608437 tctcatcaacaatgataaccaaagagatgagatgatctgaaacacacataagcggattagcggcgactgatttggtacttcctaaatcggtacctttatg 7608338  T
Q  108 cctcaagttctcttcagat-ggggagaagaga 138  Q
     |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  7608337 actcaagttctcttccgatgggggagaagaga 7608306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 822 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 43489373 - 43489218
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 921  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||           ||||||||||||||||||||| || |    
T  43489373 ccatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgaccccacaaata 43489286  T
Q  922 a-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  43489285 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattattcaaaggtaatttagaaaaaacc 43489218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 822 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 48086013 - 48085858
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-c 920  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||           ||| ||||||||||||||| ||||| ||      
T  48086013 ccatgaaagaatgatggataatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactatcttgatcccacaaata 48085926  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  48085925 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 48085858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 881 - 996
Target Start/End: Original strand, 16482847 - 16482966
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatcta 976  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| || || ||||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  16482847 tttttaggtggtatccataaaccatcttgaccccaccaataaattgctcattatcattgattggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 16482946  T
Q  977 gaaaaaaccttatataaata 996  Q
    |||||||||| ||| |||||    
T  16482947 gaaaaaacctaatagaaata 16482966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 881 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 7257489 - 7257380
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatcta 976  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  7257489 tttttaggtggtattcataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccatcatttttcgaaggtaatcta 7257390  T
Q  977 gaaaaaacct 986  Q
    ||||||||||    
T  7257389 gaaaaaacct 7257380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 822 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 24228696 - 24228540
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 921  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| || ||           ||||||||||||||||||||| || |    
T  24228696 ccatgaaagaatgatggataatttaccca-aaccaatacacattagccacataagcatatatt-----------catgaactatcttgaccccacaaata 24228609  T
Q  922 a-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  24228608 aattgctcattttcattggttggttggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 24228540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 805 - 881
Target Start/End: Original strand, 46898014 - 46898091
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-ta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacat 881  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46898014 aaggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacat 46898091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 319
Target Start/End: Original strand, 18656883 - 18657132
Alignment:
Q  73 gctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatag 172  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||| |||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||| |||  ||||| ||| ||||    
T  18656883 gctgatttggttcttcctcaactgttacttttatgtctttagttctcttcagacggagagaagagaaagtttgtcgtgtatggtgcattggagacaatag 18656982  T
Q  173 cctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatattta 265  Q
    ||||||  |   | |||| | |||||| ||| ||||||||        ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| || ||||| ||    ||    
T  18656983 cctcttacagtgt-gatgcc-attaggatttaccattattgtattaatgggtcatccagacatccactcatagagtccatattaattaatttaaa---ta 18657077  T
Q  266 attaattatccaattagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaat 319  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18657078 attaattatccaaataaaaatctaattagccttattacttaatgtgatcactaat 18657132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 881 - 987
Target Start/End: Original strand, 15644010 - 15644120
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac---attttcaaggtaatcta 976  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||    |||| ||| |||||||    
T  15644010 tttttaggtggtatccataaactattttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccattttttaaagataatcta 15644109  T
Q  977 gaaaaaacctt 987  Q
    |||||||||||    
T  15644110 gaaaaaacctt 15644120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 802 - 985
Target Start/End: Original strand, 24923019 - 24923196
Alignment:
Q  802 tataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatg 899  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| ||||| | ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||           ||||    
T  24923019 tataaggtgacaactaggctacccatgaaagaaggatgggtaatttacctc-aaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catg 24923106  T
Q  900 aactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  24923107 aattatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 24923196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 822 - 987
Target Start/End: Original strand, 46817438 - 46817595
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 921  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||           ||||||||||||||||||||| || |    
T  46817438 ccatgaaagaatgatgggtaatttatccc-aaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgaccccacaaata 46817525  T
Q  922 a-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    | || |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  46817526 aattactcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 46817595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 3677965 - 3677876
Alignment:
Q  62 agttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgt 151  Q
    ||||| |||| | ||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||    
T  3677965 agttaccggcagttgatttgtttcttcctcaaccgatacttttatgcctcaatttctcttcagatggagagaagagaatgtttgtcgtgt 3677876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 881 - 989
Target Start/End: Original strand, 44003434 - 44003546
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatcta 976  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||| | ||| ||| || ||||||||||||| ||||||   |||||||| ||    
T  44003434 tttttaggtggtatccataaactatcttgactccaccaataaattgctcattatgattagttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaattta 44003533  T
Q  977 gaaaaaaccttat 989  Q
    |||||||||||||    
T  44003534 gaaaaaaccttat 44003546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 822 - 895
Target Start/End: Original strand, 45502833 - 45502905
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatc 895  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  45502833 ccatggaagaacggtgggtaatttacctc-aaccaatatacattagctacataagcatatttttaaatggtatc 45502905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 896 - 985
Target Start/End: Original strand, 47906838 - 47906931
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  47906838 catgaactatcttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtaggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 47906931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 822 - 955
Target Start/End: Complemental strand, 2332174 - 2332052
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-c 920  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||           ||| ||||||||||||||| ||||||||      
T  2332174 ccatggaaaaatggtggataattta-ccccaaccaatacacagtaaccacataagcaca-----------tattcatgaactatcttgatcccaccaata 2332087  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattac 955  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  2332086 aattgctcatattcattggttggtgggtaaattac 2332052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 804 - 959
Target Start/End: Original strand, 7876325 - 7876471
Alignment:
Q  804 taaggtgacaactagg-tacca-tggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 901  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||           ||| ||||||    
T  7876325 taaggtgacaactaggctaccaatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagtaca-----------tattcatgaa 7876412  T
Q  902 ctatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  7876413 ctatcttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccac 7876471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 896 - 959
Target Start/End: Original strand, 26941611 - 26941675
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26941611 catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 26941675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 7608276 - 7608146
Alignment:
Q  153 cggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccat 245  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||  |||||| |||  ||||||| |      ||||||||||||||||||| |||| |  ||||    
T  7608276 cggtgtattggggaccataacatcttttatattggatggtcattagggtttttcattatttcattaatgggtcatccggacatccactcattaaccccat 7608177  T
Q  246 atcaactaattaaa-tatttaattaattatc 275  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7608176 atcaactaattaaaatatttaattaattatc 7608146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 897 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 29098843 - 29098780
Alignment:
Q  897 atgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  29098843 atgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 29098780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 881 - 959
Target Start/End: Original strand, 47460836 - 47460915
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||| || ||||||||| ||||    
T  47460836 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattataattggttggtgggtaaattatccac 47460915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 822 - 959
Target Start/End: Original strand, 498205 - 498331
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 921  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||           ||||||||||||||||||||| || |    
T  498205 ccatgaaagaatgatggataatttatccc-aaccaatacatattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgaccccacaaata 498292  T
Q  922 a-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    | || |||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  498293 aattactcattttcattagttggtgggtaaattacccac 498331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 896 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 21718210 - 21718146
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  21718210 catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccac 21718146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 900 - 959
Target Start/End: Original strand, 39453558 - 39453618
Alignment:
Q  900 aactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  39453558 aactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 39453618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 291
Target Start/End: Original strand, 16914037 - 16914092
Alignment:
Q  236 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaat 291  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16914037 ttgagttcatatcaattaattaaatatataattaattattcaattagaaatttaat 16914092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 24689772 - 24689729
Alignment:
Q  259 atatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattac 302  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24689772 atatttaattaattatcaaattaaaaatctaatagccttattac 24689729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 896 - 986
Target Start/End: Original strand, 32556685 - 32556779
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    |||||||||||||| |||||| || || ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  32556685 catgaactatcttgtccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 32556779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 880 - 940
Target Start/End: Complemental strand, 26456218 - 26456157
Alignment:
Q  880 atttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggt 940  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26456218 atttttaagaagtattcatgaactatcttgatcccaccaataaattgctcattttcattggt 26456157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 896 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 29610728 - 29610635
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  29610728 catgaactatcttaaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 29610635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 896 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 39323709 - 39323616
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  39323709 catgaactatcttgaccccacaaataaattgttcattttaattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 39323616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 896 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 44659936 - 44659843
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccacatt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    ||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||| || | |||||||||  |||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  44659936 catgaactatcttgaccccataaataaattgctcattttcattggttggtggataaattaccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 44659843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 881 - 986
Target Start/End: Original strand, 21649442 - 21649552
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt---caaggtaatct 975  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| |  | || || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    ||||||||||    
T  21649442 tttttaggtggtatccataaactatcttaaatctactaataaattgctcattttcattggttaataagtaaattacccatcattttttcaaaggtaatct 21649541  T
Q  976 agaaaaaacct 986  Q
    | |||||||||    
T  21649542 aaaaaaaacct 21649552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 888 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 29863116 - 29863044
Alignment:
Q  888 gtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||| || ||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  29863116 gtggtatccatgaactattttgattccaccaataaattattcattttcattggttggtgggtaaattacccac 29863044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 877 - 960
Target Start/End: Original strand, 38448508 - 38448592
Alignment:
Q  877 cacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccaca 960  Q
    |||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| || || ||||||||| |||||    
T  38448508 cacatttttaggtgatattcataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattgattggtgggtaaattatccaca 38448592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 896 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 39866758 - 39866694
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| || ||  |||||||||||||    
T  39866758 catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgagtaaattacccac 39866694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 896 - 987
Target Start/End: Original strand, 25037587 - 25037682
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||| || || |||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  25037587 catgaactatcttgaccccaccaataaattgatcattttaattgattggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 25037682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 663 - 730
Target Start/End: Original strand, 32787872 - 32787939
Alignment:
Q  663 agatgaaaactttgttgtcaatgaggtgcggccaacccaaaagttggggtggagcagaagcggggagc 730  Q
    |||||||| | | |||||||||| || ||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||    
T  32787872 agatgaaatcatagttgtcaatgcggcgcggccaacccaaaaattggagcggagcaggagcggggagc 32787939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 923 - 985
Target Start/End: Original strand, 30077043 - 30077108
Alignment:
Q  923 ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-cat--tttcaaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  30077043 ttgcccattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacc 30077108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 921 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 35557797 - 35557759
Alignment:
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  35557797 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 35557759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 822 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 39866803 - 39866762
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacat 864  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39866803 ccatgaaagaatggtggataattta-ccccaaccaatacacat 39866762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 51
Target Start/End: Original strand, 42767459 - 42767501
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga 51  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  42767459 ccctctcatcaacaacgataatcaaagagagaagatgatctga 42767501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 888 - 984
Target Start/End: Original strand, 7720574 - 7720674
Alignment:
Q  888 gtggtatccatgaactatcttgacccca-ccaacaattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaa 983  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | | |  ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||   ||||||||| ||||||||    
T  7720574 gtggtatccatgaactatcttaacccaatctataaattgcttatttttattggttagtggataaattacccaccatttttcaaaggtaatcaagaaaaaa 7720673  T
Q  984 c 984  Q
    |    
T  7720674 c 7720674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 12803938 - 12803893
Alignment:
Q  63 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgc 108  Q
    ||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  12803938 gttagcgacgactgattaggttcttcctcaaccggtacctttatgc 12803893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 24690881 - 24690848
Alignment:
Q  63 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccg 96  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24690881 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccg 24690848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 881 - 941
Target Start/End: Original strand, 37443666 - 37443727
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggtt 941  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||    
T  37443666 tttttaggtggtatctataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggtt 37443727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 903 - 955
Target Start/End: Original strand, 45502902 - 45502955
Alignment:
Q  903 tatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattac 955  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  45502902 tatcttgacccaactaacaaattgctcattttcattgattggtaggtaaattac 45502955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 294; Significance: 1e-164; HSPs: 121)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 31051540 - 31051161
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  31051540 ccctttcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttccttaaccggtacctttat 31051441  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  31051440 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc 31051341  T
Q  205 cattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagcctta 298  Q
    ||||||||||      || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31051340 cattattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagcctta 31051241  T
Q  299 ttacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31051240 ttacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 31051161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 31058040 - 31057661
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  31058040 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctaaaacacacaatagagttagcggcgactgatttggttcttccttaaccggtacctttat 31057941  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||    
T  31057940 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggatcatagcctcttttatattgtatggccattagggtttcc 31057841  T
Q  205 cattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagcctta 298  Q
    ||||||||||      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31057840 cattattccgttaatgggtcatccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagcctta 31057741  T
Q  299 ttacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31057740 ttacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 31057661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 34739981 - 34739603
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34739981 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagagaaaatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 34739882  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttccc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  34739881 gcctcaagttctcttcagattgggagaagagagagtttgtcgtgtacggtatattggggaccacagcctcttttatattggatggccattagggtttccc 34739782  T
Q  206 attattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttat 299  Q
    ||||||||      ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34739781 attattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaatagccttat 34739682  T
Q  300 tacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34739681 tacttaatttgatcactaatcaactaaggccctcaatttataaatagctaatataattattgttacgatattttcccac 34739603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 4 - 378
Target Start/End: Original strand, 25387663 - 25388045
Alignment:
Q  4 aacatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacc 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25387663 aacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacc 25387762  T
Q  102 tttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-gg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  25387763 tttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattaggg 25387862  T
Q  200 tttcccattattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-t 291  Q
    ||||||||||||||      ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  25387863 tttcccattattccattaatgggccatccggacatccactcattaagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaatt 25387958  T
Q  292 agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25387959 agccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaataaataatataattattattacgatatttgcccac 25388045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 4 - 378
Target Start/End: Original strand, 25381694 - 25382078
Alignment:
Q  4 aacatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacc 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25381694 aacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacc 25381793  T
Q  102 tttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-gg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  25381794 tttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattaggg 25381893  T
Q  200 tttcccattattcc------gggtcatccggacatccaccca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa 290  Q
    ||||||||||||||      ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || |||||||||||    
T  25381894 tttcccattattccattaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaa 25381989  T
Q  291 -tagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25381990 ttagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccac 25382078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 10 - 376
Target Start/End: Original strand, 8093011 - 8093386
Alignment:
Q  10 cctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctgacaca--caa-tagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8093011 cctctcatcaacaacgataaccaaagagatgagatgatctgaaacaaacaactag-gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 8093109  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttccc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||||| ||||||    
T  8093110 gcctcaagttctcttcagatggggagaaaagagagtttgccgtgttcggtatattggggaccatagcctcttttatatttgatgatcgttagggtttccc 8093209  T
Q  206 attattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttat 299  Q
    |||||||||      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8093210 attattccgttaatgggtcatccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaacatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttat 8093309  T
Q  300 tacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgccc 376  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8093310 tacttaatttgattattaatcaactaagactcacaattgataaataactaatataattattgttacggcatttgccc 8093386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 50306185 - 50305814
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||           
T  50306185 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta------- 50306093  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttccc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||    
T  50306092 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagaatttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttccc 50305993  T
Q  206 attattccg------ggtcatccggacatccacccat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agcc 295  Q
    |||||||||      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  50305992 attattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagcc 50305897  T
Q  296 ttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50305896 ttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccac 50305814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 51 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1078196 - 1077861
Alignment:
Q  51 acacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgt 149  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  1078196 acacacaatagagttagcggccgctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggtgagaagagagagtattgccgt 1078097  T
Q  150 gtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcccattattcc------gggtcatccggacatccaccca--ttgag 240  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||      ||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  1078096 gtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcatgttgag 1077997  T
Q  241 tccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattg 338  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  1077996 tccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattg 1077901  T
Q  339 ataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1077900 ataaatagctaatataattattattacgatatttgcccac 1077861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 63 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 44409940 - 44409617
Alignment:
Q  63 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttt-gccgtgtacggtatatt 161  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  || ||||    
T  44409940 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgtcgtgtatagtgtatt 44409841  T
Q  162 ggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaa 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||      || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  44409840 ggggaccataacctcttttatattggatggccattagggtttctcattattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtccatattaactaa 44409741  T
Q  255 ttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatata 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44409740 ttaaatatttaattaattatccaattagaaacctaatagccttattacctaatttaatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatata 44409641  T
Q  355 attattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  44409640 attattattacgatatttgcccac 44409617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 63 - 373
Target Start/End: Original strand, 38152184 - 38152495
Alignment:
Q  63 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattg 162  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||    
T  38152184 gttagcggcagctaatttggttcttcttcaaccggtacctttatgcttcaagttttctttagatggggagaagaacgagtttgtcgtgtacggtgtattg 38152283  T
Q  163 gggaccatagcctcttttatattagatggctattaggtttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaatt 256  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||      |||||||||||||||     ||||||| ||||||||||||||    
T  38152284 ggaaccatagcctcttttatattggatggtcattaggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatc-----attgagttcatatcaactaatt 38152378  T
Q  257 aaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataat 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  38152379 aaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaataattaatataat 38152478  T
Q  357 tattgttacgatatttg 373  Q
    ||||||||| |||||||    
T  38152479 tattgttacaatatttg 38152495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27955158 - 27954778
Alignment:
Q  11 ctctcatcaacaacgataaccaaagagagg---tgatgatctga--cacacaataga--gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctt 103  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||   |||||||||||  ||||||| | |  |||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27955158 ctctcaacaacaacgataaagaaagagaggatgtgatgatctgaaacacacaacaaaatgttaacgacgactgatttagttattcctcaaccggtacctt 27955059  T
Q  104 tatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tt 201  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||   || ||||||||| |||| | ||||||||||| |||| | |||| | ||    
T  27955058 tatgtcttaagttctct-cagatggggagaagagaatgtattgtcgtgt---gtgtattggggatcataacatcttttatattggatgaccattatgatt 27954963  T
Q  202 tcccattattcc------gggtcatccggacatccacccat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatag 293  Q
    ||||||||||||      | | |||||  |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27954962 tcccattattccactaatgagccatccatacatccactcatattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcaaattagaaatctaatag 27954863  T
Q  294 ccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  27954862 ccttattacttaatttgatcactaatcaattaagcctcacaattgataaataactaatataattagtattacgatttttgcccac 27954778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 63 - 378
Target Start/End: Original strand, 24926981 - 24927311
Alignment:
Q  63 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattg 162  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  |||||    
T  24926981 gttagtggcagctgatttggttcttcctcaaccggtacctatatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttccacgtatggagtattg 24927080  T
Q  163 gggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcccattattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaat 255  Q
    || |||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||      ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  24927081 ggaaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccagacatcca-ccattgagtccatatccattaat 24927179  T
Q  256 taaatatttaattaatta--------tccaattagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatag 346  Q
    ||| || |||||||||||        || || ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||    
T  24927180 taattaattaattaattaattaatattctaaatagaaatcttataagccttgttacttaatttgatcactaatcaattaagactccaaattgataaatag 24927279  T
Q  347 ctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  24927280 ctaatataattattatagagatatttgcccac 24927311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 802 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 31308188 - 31307999
Alignment:
Q  802 tataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatg 899  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31308188 tataaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatg 31308090  T
Q  900 aactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  31308089 aactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 31307999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 74 - 360
Target Start/End: Original strand, 24963940 - 24964229
Alignment:
Q  74 ctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagc 173  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| | |||| || ||||||    
T  24963940 ctgatttggttcttcctcaaccagtacatttatgcctcaagtcctcttcagatggggagaagagagagtttgccacatacggtgtcttggtgatcatagc 24964039  T
Q  174 ctcttttatattagatggctattaggtttcccattattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaat 267  Q
     |||||||||||||||| | |||||| || ||||| ||||      ||||||| | |||||||||||||||||| |||||| | |||||||    |||||    
T  24964040 atcttttatattagatgacaattagggtttccatttttccgttaatgggtcattcagacatccacccattgagttcatatccattaattaa----ttaat 24964135  T
Q  268 taattatccaattagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 360  Q
    ||||  || || ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  24964136 taatattctaaatagaaatcttataagctttattacttaatttgatcactaatcaattaaggcttcaaattgataaatagctaatataattatt 24964229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 807 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 45538335 - 45538151
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45538335 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 45538237  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  45538236 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 45538151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 807 - 989
Target Start/End: Complemental strand, 3611318 - 3611131
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3611318 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 3611220  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttat 989  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  3611219 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaaccttat 3611131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 801 - 997
Target Start/End: Original strand, 21139406 - 21139607
Alignment:
Q  801 atataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccat 898  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21139406 atatatggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccat 21139504  T
Q  899 gaactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac---attttcaaggtaatctagaaaaaaccttatataaa 994  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   | ||  |||||||||||||||||||  |||||| |    
T  21139505 gaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatacttcaaaggtaatctagaaaaaactatatatata 21139604  T
Q  995 tat 997  Q
    |||    
T  21139605 tat 21139607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 805 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 44662154 - 44661967
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44662154 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaac 44662056  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  44662055 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 44661967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 822 - 988
Target Start/End: Original strand, 4068700 - 4068869
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4068700 ccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 4068798  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaacctta 988  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| |||||    
T  4068799 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaagcctta 4068869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 805 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 5981354 - 5981169
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5981354 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttactcc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 5981256  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  5981255 tatcttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 5981169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 822 - 988
Target Start/End: Original strand, 24245042 - 24245211
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24245042 ccatggaagaatggtggataatttacccc-aactaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 24245140  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctta 988  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24245141 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 24245211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 807 - 988
Target Start/End: Original strand, 26085398 - 26085583
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26085398 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaacta 26085496  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttcaaggtaatctagaaaaaacctta 988  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  26085497 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaggtaatctagtaaaaacctta 26085583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 806 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 39646751 - 39646567
Alignment:
Q  806 aggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39646751 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttacccc-aaccaatacacattagttacataagcacatttttaagtggtatccatgacct 39646653  T
Q  904 atcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  39646652 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggcaatctagaaaaaacc 39646567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 822 - 994
Target Start/End: Original strand, 17994968 - 17995143
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  17994968 ccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaattatcttgaccccaccaaca 17995066  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttatataaa 994  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  17995067 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccataaataaa 17995143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 805 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 23984939 - 23984752
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23984939 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aatcaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 23984841  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  23984840 tatcttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 23984752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 807 - 986
Target Start/End: Original strand, 33112818 - 33113001
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-taccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 905  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33112818 ggtgacaactagggtaccatgaaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 33112916  T
Q  906 cttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  33112917 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaatttacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 33113001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 805 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 31040893 - 31040708
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31040893 aaggtgacaactagggtacccatggaataatggtgggtaatttacctc-aaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaac 31040795  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  31040794 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 31040708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 214 - 378
Target Start/End: Original strand, 25275425 - 25275589
Alignment:
Q  214 gggtcatccggacatccacccat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaattt 309  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25275425 gggtcatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaattt 25275520  T
Q  310 gatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25275521 gatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccac 25275589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 807 - 985
Target Start/End: Original strand, 25678259 - 25678442
Alignment:
Q  807 ggtgacaacta-ggtacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25678259 ggtgacaactatggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 25678357  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  25678358 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 25678442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 807 - 992
Target Start/End: Complemental strand, 47671768 - 47671578
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47671768 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 47671670  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttatata 992  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47671669 tcttgacccctccaacaaatagctcattttcattggttggtcggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttatata 47671578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 807 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 25058870 - 25058685
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25058870 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 25058772  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25058771 ttttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 25058685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 805 - 988
Target Start/End: Original strand, 6327546 - 6327733
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6327546 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatagtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagtca-ataagcacatttttaagtggtatccatgaac 6327643  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctta 988  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  6327644 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 6327733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 822 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 43251876 - 43251713
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  43251876 ccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgacctcaccaaca 43251778  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaa 982  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||    
T  43251777 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatctagaaaaa 43251713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 807 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 26277359 - 26277173
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  26277359 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatccc-aaccaatacacattagccacataaacaaatttttaagtggtatccatgaacta 26277261  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctta 988  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  26277260 tcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 26277173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 822 - 985
Target Start/End: Original strand, 23220952 - 23221112
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23220952 ccatggaagaatggtggata-------cccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 23221044  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23221045 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 23221112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 822 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 41999980 - 41999813
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  41999980 ccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacaatcttgaccccaccaaca 41999882  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    |||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||    
T  41999881 aatttctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacct 41999813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 823 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 42864029 - 42863893
Alignment:
Q  823 catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-a 921  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42864029 catggaagaatggtggataatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtagtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa 42863931  T
Q  922 attgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  42863930 atagctcattttcattggttggtgggtaaattatccac 42863893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 822 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 46616714 - 46616546
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  46616714 ccatggaagaatggtggataatttacccc-aaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtgatattcatgaactatcttgaccccaccaaca 46616616  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    ||||| |||||||||||| || || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  46616615 aattgttcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 46616546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 798 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 47187296 - 47187101
Alignment:
Q  798 ttaatataaggtgacaacta-ggtacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatc 895  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47187296 ttaataaaaggtgacaactacggtacccatgaaagaatggtggataatttaccat-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatc 47187198  T
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca--cattttc-aaggtaatctagaaaaaacctta 988  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||   || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  47187197 cataaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgagtaaattactcatcaatcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 47187101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 807 - 985
Target Start/End: Original strand, 37620192 - 37620375
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tac-catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37620192 ggtgacaactagggtacacatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataaggacatttttaagtggtatccatgaacta 37620290  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  37620291 tcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 37620375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 822 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 33884253 - 33884088
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  33884253 ccatggaaaaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtatctatgaactatcttgaccccaccaaca 33884155  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-cat--tttcaaggtaatctagaaaaaac 984  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||    
T  33884154 aattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaac 33884088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 822 - 984
Target Start/End: Original strand, 33959999 - 33960164
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  33959999 ccatggaaaaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtatctatgaactatcttgaccccaccaaca 33960097  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-cat--tttcaaggtaatctagaaaaaac 984  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||    
T  33960098 aattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaac 33960164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 806 - 983
Target Start/End: Original strand, 38790196 - 38790378
Alignment:
Q  806 aggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  38790196 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatccc-aaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccataaact 38790294  T
Q  904 atcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaa 983  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  38790295 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattaccaaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 38790378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 807 - 959
Target Start/End: Original strand, 47383732 - 47383886
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacca-tggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47383732 ggtgacaactagggtaccaatgaaagaatggtgggtaatttatccc-aatcaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 47383830  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  47383831 tcttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccac 47383886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 822 - 985
Target Start/End: Original strand, 49253992 - 49254158
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  49253992 ccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacatattagccatataagcacatttttaagtggtatccataaactatcttgaccccaccaaca 49254090  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  49254091 aattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 49254158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 805 - 985
Target Start/End: Original strand, 23932507 - 23932692
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||  | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23932507 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctgatc-aatacacattagccacataagcacatttttaagtggtgtccatgaac 23932605  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  23932606 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatcaagaaaaaacc 23932692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 803 - 986
Target Start/End: Original strand, 35692659 - 35692848
Alignment:
Q  803 ataaggtgacaactag-gta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatga 900  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  35692659 ataaggtgacaactagagtatccatggaagaacggtgggtaatttacctc-aaccaatacacattagccacataaacacatttttaagcggtatccatga 35692757  T
Q  901 actatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtagg-taaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  35692758 actatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 35692848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 807 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 51057253 - 51057068
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51057253 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttacctc-aactaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgatcta 51057155  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  51057154 tcttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggttggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 51057068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 805 - 988
Target Start/End: Original strand, 38331857 - 38332045
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactag-gtacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  38331857 aaggtgacaactagagtacccatggaagaatggtgggtaatttatccc-aaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatattcatgaac 38331955  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctta 988  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  38331956 tatcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 38332045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 807 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 36566512 - 36566329
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36566512 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccg-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 36566414  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac-att-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||   || ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  36566413 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgaatatattacccactattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 36566329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 833 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 31844530 - 31844374
Alignment:
Q  833 tggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-aattgctcatt 931  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31844530 tggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgacctcaccaacaaattgctcatt 31844432  T
Q  932 ttcattggttagtaggtaaattacccacattttc---aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||  || |   |||||||||||||||||||||    
T  31844431 ttcattggttggtgggtaaattatccaccattcctcaaaggtaatctagaaaaaacct 31844374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 823 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 24885665 - 24885500
Alignment:
Q  823 catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-a 921  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24885665 catggaagaatggtgggtaatttaccct-aaccaatacacattatccacataaacatatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa 24885567  T
Q  922 attgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  24885566 attgatcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 24885500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 850 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 25518952 - 25518815
Alignment:
Q  850 ccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggt 948  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||    
T  25518952 ccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggt 25518853  T
Q  949 aaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaa 983  Q
    |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  25518852 aaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 25518815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 804 - 984
Target Start/End: Original strand, 26524886 - 26525071
Alignment:
Q  804 taaggtgacaactagg-ta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 901  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  26524886 taaggtgacaactagggtatccatggaagaatagtgggtaatttacccc-aatcaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatctataaa 26524984  T
Q  902 ctatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaac 984  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26524985 ctatcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 26525071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 822 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 26794469 - 26794332
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  26794469 ccatggaagaatggtgagtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactattttgaccccaccaaca 26794371  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  26794370 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccac 26794332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 824 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 5980231 - 5980067
Alignment:
Q  824 atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-aa 922  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  5980231 atggaaaaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacatattagccacataagctaatttttaagtggtatccattaactatcttgaccccaccaacaaa 5980133  T
Q  923 ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  5980132 ttgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 5980067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 823 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 28888745 - 28888609
Alignment:
Q  823 catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-a 921  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  28888745 catggaagaatggtggataatttatctc-aatcaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatcttgatcccaccaacaa 28888647  T
Q  922 attgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  28888646 attgatcattttcattggttggtgggtaaattacccac 28888609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 822 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 3285566 - 3285400
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3285566 ccatggaagaatggtgggtaatttaccct-aatcaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 3285469  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    |||| |||||||||||||||| || | ||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3285468 aattactcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 3285400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 807 - 985
Target Start/End: Original strand, 46967041 - 46967224
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||| ||  ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46967041 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatgatgggtaatttatcct-aacaaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 46967139  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  46967140 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 46967224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 806 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 50774400 - 50774245
Alignment:
Q  806 aggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50774400 aggtgacaactagggtacccatggaagaaaggtgggtaatttatccc-aaccaatacacattggtcacataagcatatttttaagtggtatccatgaact 50774302  T
Q  904 atcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  50774301 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggttaattacccac 50774245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 807 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 35273778 - 35273624
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35273778 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgtgtaatttacctc-aatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 35273680  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||    
T  35273679 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattatccac 35273624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 807 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 47317497 - 47317343
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47317497 ggtgacaactagggtacccatagaagaatgatgagtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatacatgaacta 47317399  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||    
T  47317398 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgaataaattacccac 47317343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 805 - 989
Target Start/End: Complemental strand, 48373679 - 48373499
Alignment:
Q  805 aaggtgacaacta-ggta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48373679 aaggtgacaactaaggtatccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacat---------aagcacatttttaagtggtatccatgaac 48373590  T
Q  903 tatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttat 989  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48373589 tatcttgaccccaccaataaactgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttat 48373499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 217 - 360
Target Start/End: Original strand, 33458290 - 33458434
Alignment:
Q  217 tcatccggacatccacccat-tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcac 315  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33458290 tcatccggacatccactcacattagtccatatcagttaattaaatatttaagtaattatctagttagaaatctaatagcattattacttaatttgatcac 33458389  T
Q  316 taatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 360  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  33458390 taatcaattaaggctcacaattgataaataaccaatataactatt 33458434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 805 - 954
Target Start/End: Original strand, 42313359 - 42313510
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tac-catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  42313359 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtattaatgaac 42313457  T
Q  903 tatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaatta 954  Q
    ||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  42313458 tatcttgactccaccaataaatttctcattttcattggttggtgggtaaatta 42313510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 822 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 46784588 - 46784423
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||     
T  46784588 ccatggaagaatgatgggtaatttactcc-aaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatctttacttctccaaca 46784490  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccacattttc---aaggtaatctagaaaaaac 984  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  || |   |||||||||||||||||||    
T  46784489 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcctcaaaggtaatctagaaaaaac 46784423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 827 - 955
Target Start/End: Complemental strand, 36003290 - 36003162
Alignment:
Q  827 gaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccacca-acaattg 925  Q
    |||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  36003290 gaagaatggtgggtaatttatccg-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccagtaaattg 36003192  T
Q  926 ctcattttcattggttagtaggtaaattac 955  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||    
T  36003191 ctcattttcattgattggtgggtaaattac 36003162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 807 - 985
Target Start/End: Original strand, 49398988 - 49399171
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  49398988 ggtgacaactaggatacccatggaagaatagtgggtaatttacccc-aaccaatagacattagccacataaacacatttttaagtggtatccataaacta 49399086  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||||||||| || || | ||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  49399087 tcttaactccaccaacaaattgctcattttcattgattggtggataaattacctaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 49399171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 804 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 4808830 - 4808720
Alignment:
Q  804 taaggtgacaactagg-ta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 901  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4808830 taaggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 4808732  T
Q  902 ctatcttgaccc 913  Q
    ||||||||||||    
T  4808731 ctatcttgaccc 4808720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 807 - 952
Target Start/End: Complemental strand, 2450676 - 2450529
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2450676 ggtgacaactaggatacccatggaagaatgataggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaacta 2450578  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaat 952  Q
    ||||||  |||| ||| |||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  2450577 tcttgattccactaacaaattactcattttcattggttggtgggtaaat 2450529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 828 - 938
Target Start/End: Original strand, 45475866 - 45475975
Alignment:
Q  828 aagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgc 926  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  45475866 aagaatggtgggtaatttaccc--aaccaatacacattagccacataagcacatttgtaagtggtatccatcaactatcttgaccccaccaataaattgc 45475963  T
Q  927 tcattttcattg 938  Q
    ||||||||||||    
T  45475964 tcattttcattg 45475975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 827 - 941
Target Start/End: Original strand, 51045618 - 51045732
Alignment:
Q  827 gaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-aattg 925  Q
    |||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  51045618 gaagaatggtgggtaatttaccct-aatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcataaactatcttgaccccaccaacaaatta 51045716  T
Q  926 ctcattttcattggtt 941  Q
    ||||||||||||||||    
T  51045717 ctcattttcattggtt 51045732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 872 - 984
Target Start/End: Original strand, 51403074 - 51403189
Alignment:
Q  872 ataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aa 967  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||    
T  51403074 ataagcacatttt-aagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaa 51403172  T
Q  968 ggtaatctagaaaaaac 984  Q
    |||||||||||||||||    
T  51403173 ggtaatctagaaaaaac 51403189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 870 - 987
Target Start/End: Original strand, 2556910 - 2557031
Alignment:
Q  870 acataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca-attgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc- 965  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||| |||| |||     
T  2556910 acataaacacatttttaagtggtattcatgaactatcttgaccccaccaacagattgctcattttcattagttagtggataaattatccaccattcttca 2557009  T
Q  966 aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  2557010 aaggtaatctagaaaaaacctt 2557031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 870 - 982
Target Start/End: Original strand, 31979999 - 31980115
Alignment:
Q  870 acataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc- 965  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||     
T  31979999 acataaggacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccctaacaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttca 31980098  T
Q  966 aaggtaatctagaaaaa 982  Q
    |||||||||||||||||    
T  31980099 aaggtaatctagaaaaa 31980115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 271 - 360
Target Start/End: Original strand, 4280165 - 4280254
Alignment:
Q  271 ttatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 360  Q
    ||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4280165 ttatcaaattagatatctaataatcttattacttaatttgatcactaatcaattaaggttcacaattgataaatagttaatataattatt 4280254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 807 - 987
Target Start/End: Original strand, 27983603 - 27983772
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||              
T  27983603 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtat---------- 27983691  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
          |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27983692 ------ccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 27983772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 804 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 33073385 - 33073207
Alignment:
Q  804 taaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 901  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||           ||| ||||||    
T  33073385 taaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatatacattagccacataagcaca-----------tattcatgaa 33073298  T
Q  902 ctatcttgaccccacc-aacaattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaacctta 988  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||   |||||||| ||||||||||||||    
T  33073297 ctatcttgaccccacctataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 33073207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 823 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 10928220 - 10928064
Alignment:
Q  823 catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-ca 921  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||           ||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  10928220 catggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactatcttgaccccaccaataa 10928133  T
Q  922 attgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    |||| |||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  10928132 attgttcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 10928064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 235 - 291
Target Start/End: Original strand, 12184013 - 12184069
Alignment:
Q  235 attgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaat 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12184013 attgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaaatagaaatctaat 12184069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 806 - 910
Target Start/End: Complemental strand, 4156577 - 4156472
Alignment:
Q  806 aggtgacaactag-gtacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4156577 aggtgacaactagagtacccatggaaaaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataaatacatttttaagtggtatccataaact 4156479  T
Q  904 atcttga 910  Q
    || ||||    
T  4156478 atattga 4156472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 807 - 899
Target Start/End: Original strand, 13312531 - 13312624
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatg 899  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13312531 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatatacattagccacataagcacatatttaagtggtatccatg 13312624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 807 - 985
Target Start/End: Original strand, 41467632 - 41467804
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||           |||||||||    
T  41467632 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 41467719  T
Q  905 tcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  41467720 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 41467804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 795 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 42235022 - 42234836
Alignment:
Q  795 tatttaatataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggt 892  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||| ||            
T  42235022 tatttactttaaggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccc--aaccaatacacattaaccacataagcacatatt-------- 42234933  T
Q  893 atccatgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctta 988  Q
       ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  42234932 ---catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 42234836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 807 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 2657474 - 2657331
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||           |||||||||    
T  2657474 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 2657387  T
Q  905 tcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  2657386 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 2657331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 892 - 992
Target Start/End: Original strand, 13313249 - 13313355
Alignment:
Q  892 tatccatgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccaca--ttttcaagg---taatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||  | ||||| |   ||||||||||||||||    
T  13313249 tatccatgaactatcttaaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccacaattcttcaaaggtataatctagaaaaaacc 13313348  T
Q  986 ttatata 992  Q
    |||||||    
T  13313349 ttatata 13313355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 881 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 2954962 - 2954854
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-cattt-tc-aaggtaatcta 976  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| || || ||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  2954962 tttttaagtggtatccattaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattgattggtgggtaaattacccaccatttgtcaaaggtaatcta 2954863  T
Q  977 gaaaaaacc 985  Q
    |||||||||    
T  2954862 gaaaaaacc 2954854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 822 - 959
Target Start/End: Original strand, 6626041 - 6626167
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-c 920  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||           ||| ||||||||||||||||||||| ||      
T  6626041 ccatgaaagaatgatggataatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactatcttgaccccacaaata 6626128  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  6626129 aattgctcattttcattggttggtggataaattacccac 6626167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 881 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 52367990 - 52367882
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccaca---ttttcaaggtaatcta 976  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||   |||| ||||||||| |    
T  52367990 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccctaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccacaattttttaaaggtaatcca 52367891  T
Q  977 gaaaaaacc 985  Q
    |||||||||    
T  52367890 gaaaaaacc 52367882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 881 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 26685963 - 26685855
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatcta 976  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  26685963 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccctaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 26685864  T
Q  977 gaaaaaacc 985  Q
    |||||||||    
T  26685863 gaaaaaacc 26685855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 807 - 959
Target Start/End: Original strand, 30289910 - 30290053
Alignment:
Q  807 ggtgacaacta-ggtac-catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||           ||| |||||||||    
T  30289910 ggtgacaactaaggtactcatggaagaatggtggataattta-cctcaaccaatacacattaaccacataagcaca-----------tattcatgaacta 30289997  T
Q  905 tcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  30289998 tcttgactccaccaataaattgctcatattcactggttggtgggtaaattacccac 30290053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 822 - 937
Target Start/End: Original strand, 47772189 - 47772304
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||  |||||| ||||||||||| ||||||  || |||||| ||||||| ||||||     
T  47772189 ccatggaagaatggtgtgtaatttactcc-aaccaatatacattagtcacataaacacatttttaaatggtatatataaactattttgaccctaccaaca 47772287  T
Q  921 aattgctcattttcatt 937  Q
    ||||||| |||||||||    
T  47772288 aattgcttattttcatt 47772304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 896 - 987
Target Start/End: Original strand, 26472258 - 26472353
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  26472258 catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 26472353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 877 - 987
Target Start/End: Original strand, 39475843 - 39475956
Alignment:
Q  877 cacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaa 972  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||| ||||||   ||||||     
T  39475843 cacatttttaggtggtatccataaactatcttga-cccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccatcatttttcaaaggtac 39475941  T
Q  973 tctagaaaaaacctt 987  Q
    |||||||||||||||    
T  39475942 tctagaaaaaacctt 39475956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 881 - 985
Target Start/End: Original strand, 38716311 - 38716419
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac---attttcaaggtaatcta 976  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||    |||| ||| |||||||    
T  38716311 tttttaggtggtatccataaattatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccattttttaaagataatcta 38716410  T
Q  977 gaaaaaacc 985  Q
    |||||||||    
T  38716411 gaaaaaacc 38716419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 881 - 985
Target Start/End: Original strand, 27924722 - 27924830
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatcta 976  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||| ||||||   || ||||||||    
T  27924722 tttttaggtggtatccataaactatcttgatcccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaagtaatcta 27924821  T
Q  977 gaaaaaacc 985  Q
    |||||||||    
T  27924822 gaaaaaacc 27924830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 804 - 985
Target Start/End: Original strand, 51155587 - 51155761
Alignment:
Q  804 taaggtgacaacta-ggtaccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||  |||||| ||||           ||| |||||||    
T  51155587 taaggtgacagctaaggtaccatggaagaatggtgggtaattta-ccctaatcaatacacattagtcacataaacaca-----------tattcatgaac 51155674  T
Q  903 tatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||    
T  51155675 tatcttgactccaccaataaattgttcatattcattggttggtgggtaaattacccatcatttttcaaaggtaatttagaaaaaacc 51155761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 822 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 29770824 - 29770666
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 921  Q
    ||||| || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||           ||||||||||||||||||||| || |    
T  29770824 ccatgaaaaaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgaccccacaaata 29770737  T
Q  922 a-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctta 988  Q
    | ||||||||||||||| ||| || | ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  29770736 aattgctcattttcattagttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 29770666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 880 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 33187448 - 33187337
Alignment:
Q  880 atttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-cat--tttcaaggtaatct 975  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||| |||  ||| ||| ||||||    
T  33187448 atttttaagtggtatctataaactatcttgatccaaccaataaattgctcattttcattggttggtgtgtaaattatccaccattctttaaagataatct 33187349  T
Q  976 agaaaaaacctt 987  Q
    ||||||||||||    
T  33187348 agaaaaaacctt 33187337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 897 - 987
Target Start/End: Original strand, 24649802 - 24649896
Alignment:
Q  897 atgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  24649802 atgaactatcttgaccccaccaataaataactcattttcattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 24649896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 807 - 881
Target Start/End: Original strand, 38718167 - 38718242
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-taccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacat 881  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  38718167 ggtgacaactaggctaccatgaaagaatgatgggtaatttactcccaaccgatatacattagccacataagcacat 38718242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 881 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 10920307 - 10920198
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatcta 976  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  |||| | ||||||| || ||||||||||||| ||||||   ||| |||||||    
T  10920307 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgtgcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaagataatcta 10920208  T
Q  977 gaaaaaacct 986  Q
    ||||||||||    
T  10920207 gaaaaaacct 10920198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 822 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 4953206 - 4953080
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 921  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||           ||||||||||||||| ||||| || |    
T  4953206 ccatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattaaccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgatcccacaaata 4953119  T
Q  922 a-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    | |||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  4953118 aattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccac 4953080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 378
Target Start/End: Original strand, 12184095 - 12184139
Alignment:
Q  334 aattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12184095 aattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccac 12184139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 896 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 32448740 - 32448676
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  32448740 catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccac 32448676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 889 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 39637996 - 39637899
Alignment:
Q  889 tggtatccat-gaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac-att-ttca-aggtaatctagaaaaaa 983  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||     |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  39637996 tggtatccattgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggtg----ggtaaattacccaccattcttcataggtaatctagaaaaaa 39637901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 881 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 1388580 - 1388501
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||  | ||||||| || ||||||||||||||    
T  1388580 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccctaccaataaattgctcatcatgattggttggtgggtaaattacccac 1388501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 881 - 987
Target Start/End: Original strand, 5961331 - 5961441
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatcta 976  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| | ||| ||| || ||||||||| ||| ||||||   || ||||||||    
T  5961331 tttttaggtggtatccataaactatcttgatcccaccaataaattgctcattatgatttgttggtgggtaaattatccaccatttttcaaaagtaatcta 5961430  T
Q  977 gaaaaaacctt 987  Q
    |||||||||||    
T  5961431 gaaaaaacctt 5961441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 881 - 959
Target Start/End: Original strand, 48683394 - 48683473
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||||| || ||||||||||||||    
T  48683394 tttttaggtggtatccataaactatcttgactccaccaataaattgttcattatgattggttggtgggtaaattacccac 48683473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 900 - 986
Target Start/End: Original strand, 4243573 - 4243663
Alignment:
Q  900 aactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  4243573 aactatcttgaccccacaaataaattactcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattattcaaaggtaatttagaaaaaacct 4243663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 896 - 989
Target Start/End: Original strand, 46428332 - 46428429
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaaccttat 989  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||| ||||    
T  46428332 catgaactatcttgaccccatcaataaattgctcatattcattggttgctgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacattat 46428429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 881 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 52324045 - 52323936
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatcta 976  Q
    |||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||  ||||| ||||| | ||||||| || ||||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  52324045 tttttaggtggtattcataaattatcttgaccccaccaataaattgttcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 52323946  T
Q  977 gaaaaaacct 986  Q
     |||||||||    
T  52323945 aaaaaaacct 52323936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 831 - 990
Target Start/End: Original strand, 13281588 - 13281739
Alignment:
Q  831 aatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctca 929  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||           ||| |||||||||| |||||||||| ||  ||||| |||    
T  13281588 aatgatggataatttacctc-aaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactattttgaccccacaaataaattgttca 13281675  T
Q  930 ttttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttata 990  Q
    || ||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  13281676 ttgtcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaactttata 13281739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 151
Target Start/End: Original strand, 33458145 - 33458218
Alignment:
Q  78 tttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgt 151  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||| ||  |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  33458145 tttagttctttctcaactggtagctttatgtctatagttctattcgtatgggaagaagagagagtttgccgtgt 33458218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 807 - 881
Target Start/End: Original strand, 41895164 - 41895239
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacat 881  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41895164 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacacc-aaccaatacacattagccacataagcacat 41895239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 896 - 959
Target Start/End: Original strand, 44544125 - 44544189
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| || || ||||||||| ||||    
T  44544125 catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattatccac 44544189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 121
Target Start/End: Original strand, 12183820 - 12183867
Alignment:
Q  74 ctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 121  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12183820 ctgatttggttatttctcaaccgctacctttatgcctcaagttctctt 12183867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 822 - 881
Target Start/End: Original strand, 34752331 - 34752389
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacat 881  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34752331 ccatgaaagaatgatgggtaatttactcc-aaccaatacacattagccacataagcacat 34752389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 881 - 919
Target Start/End: Original strand, 31286568 - 31286606
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa 919  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31286568 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccaccaa 31286606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 896 - 960
Target Start/End: Original strand, 35991678 - 35991743
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccaca 960  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| | ||| || | |||||||||||||    
T  35991678 catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcaattgttggtggataaattacccaca 35991743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 896 - 956
Target Start/End: Original strand, 44293534 - 44293595
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattacc 956  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||  | |||||||||||    
T  44293534 catgaactatcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttgatgggtaaattacc 44293595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 148)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 4 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 48160960 - 48160576
Alignment:
Q  4 aacatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacc 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||    
T  48160960 aacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccagtacc 48160861  T
Q  102 tttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-gg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  48160860 tttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatatttgatggccattaggg 48160761  T
Q  200 tttcccattattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatag 293  Q
    ||||||||||||||      ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48160760 tttcccattattccgttaatgggccatccgaacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatag 48160661  T
Q  294 ccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48160660 ccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 48160576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 4 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 48167179 - 48166795
Alignment:
Q  4 aacatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacc 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||    
T  48167179 aacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccagtacc 48167080  T
Q  102 tttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-gg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  48167079 tttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattaggg 48166980  T
Q  200 tttcccattattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatag 293  Q
    ||||||||||||||      ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48166979 tttcccattattccgttaatgggccatccgaacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatag 48166880  T
Q  294 ccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48166879 ccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 48166795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Original strand, 6257369 - 6257747
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6257369 ccctctcatcaacaacgataaccaaagtgaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 6257468  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattaggtttccc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| || ||    
T  6257469 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcc 6257568  T
Q  206 attattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttat 299  Q
    ||||||||      ||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6257569 attattccgttaatgggccatccggatatccactcattgagcccatatcaattaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagctttat 6257668  T
Q  300 tacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6257669 tacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccac 6257747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Original strand, 10733516 - 10733892
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  10733516 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttcctcaaccgatacctttat 10733615  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttccc 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  10733616 gcctcaaattctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttatattggatggccattagggtttccc 10733713  T
Q  206 attattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttat 299  Q
    ||||||||      ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10733714 attattccgttaatgggccatccggacatccactcattaagtccatatcaactaatcaaatacttaattaattatccaattagaaatctaatagccttat 10733813  T
Q  300 tacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10733814 tacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccac 10733892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Original strand, 10739503 - 10739879
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  10739503 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccgatacctttat 10739602  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttccc 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  10739603 gcctcaaattctcttcagatggggagaagagagagtttaccgtgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttatattggatggccattagggtttccc 10739700  T
Q  206 attattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttat 299  Q
    ||||||||      ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10739701 attattccgttaatgggtcatccggacatccactcattaagtccatatcaactaatcaaatacttaattaattatccaatcagaaatctaatagccttat 10739800  T
Q  300 tacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10739801 tacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccac 10739879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Original strand, 10947285 - 10947661
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  10947285 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttcctcaaccgatacctttat 10947384  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttccc 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  10947385 gcctcaaattctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttatattggatggccattagggtttccc 10947482  T
Q  206 attattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttat 299  Q
    ||||||||      ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10947483 attattccgttaatgggccatccggacatccactcattaagtccatatcaactaatcaaatacttaattaattatccaattagaaatctaatagccttat 10947582  T
Q  300 tacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10947583 tacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccac 10947661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Original strand, 10953272 - 10953648
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  10953272 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccgatacctttat 10953371  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttccc 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  10953372 gcctcaaattctcttcagatggggagaagagagagtttaccgtgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttatattggatggccattagggtttccc 10953469  T
Q  206 attattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttat 299  Q
    ||||||||      ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10953470 attattccgttaatgggtcatccggacatccactcattaagtccatatcaactaatcaaatacttaattaattatccaatcagaaatctaatagccttat 10953569  T
Q  300 tacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10953570 tacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccac 10953648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 63 - 378
Target Start/End: Original strand, 26957023 - 26957346
Alignment:
Q  63 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatatt 161  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26957023 gttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatatt 26957122  T
Q  162 ggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccgg------gtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaa 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||       | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26957123 ggggaccatagcctcttttatatttgatggccattagggtttcccattattccgttaatgagccatccggacatccactcattgagtccatatcaactaa 26957222  T
Q  255 ttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatata 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26957223 ttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagtcttattacttaatttgatcactaattaattaaggctcacaattgataaatagctaatata 26957322  T
Q  355 attattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  26957323 attattgttacgatatttgcccac 26957346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24287982 - 24287604
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24287982 ccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 24287883  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||    
T  24287882 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattgggga-catagcctcttttatattggatgaccattagggtttcc 24287784  T
Q  205 cattattcc------gggtcatccggacatccaccca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagc 294  Q
    |||||||||      ||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||| || ||||||||||| ||||    
T  24287783 cattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaatat----ttaaatatccaaaatagaaatctaattagc 24287688  T
Q  295 cttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24287687 cttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaatttataaatagctaatataattattattacgatatttgcccac 24287604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 64 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 50168532 - 50168218
Alignment:
Q  64 ttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattgg 163  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||| ||||||    
T  50168532 ttagcggcggttgatttagttcttcctcaac-ggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggagagaaaagagagttttgcgtgtacggtgtattgg 50168434  T
Q  164 ggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaatt 256  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| | |||||| ||| |||||||| ||      |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50168433 ggaccatagcctcttttatattgaatgaccattagggttttccattatttcgttaatgggtcattcggtcatccactcattgagtccatatcaactaatt 50168334  T
Q  257 aaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  50168333 aaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttgttacttgatttgaccactaatcaattaagactcacaattgataaatagctaatataat 50168234  T
Q  357 tattgttacgatattt 372  Q
    |||| |||||||||||    
T  50168233 tattattacgatattt 50168218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 112 - 378
Target Start/End: Original strand, 26971824 - 26972097
Alignment:
Q  112 aagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattaggtttcccattat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| || |||||||    
T  26971824 aagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagtctcttttatattggatggccattagggtttccattat 26971923  T
Q  211 tccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattactt 304  Q
    ||||      |  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26971924 tccgttaatggaccatccagacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatatccttatcactt 26972023  T
Q  305 aatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26972024 aatttgatcactaatcaattaagactcacaattgataaatagctaatataattattgttacaatatttgcccac 26972097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 376
Target Start/End: Original strand, 44831771 - 44832155
Alignment:
Q  4 aacatccctctcatcaacaacgataaccaaagagag-----gtgatgatctgacacaca----atagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaac 94  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| || ||||||     |||||||||||| |||||    |||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  44831771 aacaaccctctcaacaacaacgataaacagagagagagaaggtgatgatctgaaacacacaaaatagggttagcgacggctgatgtggttcttcctcaac 44831870  T
Q  95 cggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggcta 194  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  44831871 cggtatttttatgcctcaagttctcttcggatgcggagaagagagagtt----gtgttcggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgacca 44831966  T
Q  195 ttagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatc 287  Q
    ||||| ||||| |||||||||      |  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  44831967 ttagggtttccaattattccgttaatggaccatccggacatgcactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatctaattaaaaatc 44832066  T
Q  288 taatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgccc 376  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44832067 ttataaccttattacttaatttgatcactaatcaactaagatctataattgataaataactaatataattattgttacaatatttgccc 44832155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 190
Target Start/End: Original strand, 33458431 - 33458614
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  33458431 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttctttctcaaccgatacctttat 33458530  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatg 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33458531 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagaaagtttgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatg 33458614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 190
Target Start/End: Original strand, 33461556 - 33461739
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33461556 ccctctcatcaacaacgataatcaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttat 33461655  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatg 190  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33461656 gcctcaagttcttttcagatggggagaagagagagtttaccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatg 33461739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 49976585 - 49976236
Alignment:
Q  10 cctctcatcaacaacgataaccaaagagagg---tgatgatctgacacaca----ata-gagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacc 101  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||||||||| | |||||    ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  49976585 cctctcaacaacaacgataaacaaagagaggaggtgatgatctcaaacacacaaaataagggttagcggcggctgatttggttcttcctcaac-ggtac- 49976488  T
Q  102 tttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||    
T  49976487 tttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggt-----ggagaccataacctcttttatattggatggccattagggt 49976393  T
Q  201 ttcccattattccgggtcatccggacatccaccc--attgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaat-agcctt 297  Q
    || |||||||| |  ||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||    |||||||||  || ||  | ||||||||| ||||||    
T  49976392 tttccattattac--gtcatccagacatccacccatattgaatccatatccattaattaa----ttaattaatattctaaacaaaaatctaataagcctt 49976299  T
Q  298 attacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  49976298 attacttaatttgatcactaatcaattaaggctccaaattaataaatagctaatataattatt 49976236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 65 - 378
Target Start/End: Original strand, 17627002 - 17627317
Alignment:
Q  65 tagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggg 164  Q
    ||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||     |||||| || |||||||    
T  17627002 tagcgacggctagttttgttcttcctcaaccggtacttttatgcttctagttctcttcagatggggagaagagaatgt-----gtgtactgtgtattggg 17627096  T
Q  165 gaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaatta 257  Q
    || ||| ||||||||||||||  |   | |||||| ||| | |||||||||      |||||||| ||||||| | |||||||||||||| || |||| |    
T  17627097 gatcatggcctcttttatatttaacaaccattagggttttcaattattccgttaatgggtcatcctgacatcccctcattgagtccatattaattaatca 17627196  T
Q  258 aatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataatt 357  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17627197 aatatttaattaattatctaattggaaatctaataggcttattacttaatttaatcactaatcaattcagactcacaatcgataaatagctaatataatt 17627296  T
Q  358 attgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||| ||||||||||| |||||    
T  17627297 attattacgatattttcccac 17627317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 807 - 985
Target Start/End: Original strand, 53854430 - 53854612
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-taccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 905  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53854430 ggtgacaactagggtaccatggaagaatggtgggtaatttacctc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 53854528  T
Q  906 cttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  53854529 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 53854612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 806 - 987
Target Start/End: Original strand, 2826681 - 2826866
Alignment:
Q  806 aggtgacaactagg-taccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2826681 aggtgacaactagggtaccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaacta 2826779  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  2826780 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagggaatctagaaaaaacctt 2826866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 807 - 987
Target Start/End: Original strand, 21366609 - 21366794
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21366609 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 21366707  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21366708 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaccctt 21366794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 807 - 991
Target Start/End: Original strand, 31532135 - 31532324
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31532135 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccct-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 31532233  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttatat 991  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31532234 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtaggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttatat 31532324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 807 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 51363188 - 51363003
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-taccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 905  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51363188 ggtgacaactagggtaccatggaagaatggtgggtaatttactcc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 51363090  T
Q  906 cttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctta 988  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  51363089 cttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 51363003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 807 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 27373257 - 27373075
Alignment:
Q  807 ggtgacaactag-gtaccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 905  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27373257 ggtgacaattagagtaccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 27373159  T
Q  906 cttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-cat--tttcaaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  27373158 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacc 27373075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 806 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 42085390 - 42085204
Alignment:
Q  806 aggtgacaacta-ggtacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42085390 aggtgacaactatggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 42085292  T
Q  904 atcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-cat--tttcaaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  42085291 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacctt 42085204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 807 - 985
Target Start/End: Original strand, 39587781 - 39587962
Alignment:
Q  807 ggtgacaactaggtaccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 906  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39587781 ggtgacaattaggtaccatggaagaatggtgggtaatttaccct-aaccaatatacattagttatataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 39587879  T
Q  907 ttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  39587880 ttgaccccaccaacaaattgctcatattcattggttggtaggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 39587962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 822 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 237642 - 237475
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  237642 ccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgttatccatgaactatcttgaccccaccaaca 237544  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-cat--tttcaaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  237543 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacct 237475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 805 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 34276731 - 34276575
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34276731 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 34276633  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  34276632 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 34276575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 33 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 35177770 - 35177413
Alignment:
Q  33 aagagaggtgatgatctgacacaca----atagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatgg 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    ||||||||||||||| |||||||  || || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  35177770 aagagaggtgatgatctgaaacacacaacatagagttagcggcgcctgatttgattatttctcaaccgatacatttatgcctcaagttctcttcagatga 35177671  T
Q  129 ggagaaga-gagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcat 220  Q
    |||||  | ||    |||  ||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| |||| | |||||| |||| |||||||||       ||||||    
T  35177670 ggagaccatgatttattgttgtgtacggtgtattgaggactataacctcttttatattggatgaccattagggtttctcattattcctttaataggtcat 35177571  T
Q  221 ccggacatccaccc--attgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 318  Q
    || ||||| ||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35177570 ccagacatacactcgtattgagtccatgtcaacaaattaaatatttaaataattatctaattagaaaactaacagccttattacttaatttgatcactaa 35177471  T
Q  319 tcaactaaggc----ccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatattt 372  Q
    |||| ||| ||     || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  35177470 tcaattaatgctcgttcataattgataaatatctaatataattattattacgatattt 35177413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 807 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 29478542 - 29478357
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29478542 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttacccc-aactaatacacattagccatataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 29478444  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  29478443 tcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 29478357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 807 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 23437774 - 23437590
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23437774 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgagtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaacta 23437676  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23437675 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 23437590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 804 - 987
Target Start/End: Original strand, 53461813 - 53462001
Alignment:
Q  804 taaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 901  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53461813 taaggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 53461911  T
Q  902 ctatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttca-aggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  53461912 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaatttacccaccattcttcataggtaatttagaaaaaacctt 53462001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 807 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 9798647 - 9798464
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9798647 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccct-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 9798549  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  9798548 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 9798464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 822 - 994
Target Start/End: Original strand, 32366677 - 32366852
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32366677 ccatggaagaatggtgggtaatttaccac-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 32366775  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttatataaa 994  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  32366776 aattgctcattttcattggttggtgagtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacctaatataaa 32366852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 805 - 995
Target Start/End: Original strand, 42765840 - 42766034
Alignment:
Q  805 aaggtgacaacta-ggtacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  42765840 aaggtgacaactaaggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacattagcacatttttaagtggtat-catgaac 42765937  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttatataaat 995  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42765938 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccatatataaat 42766034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 807 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 44984943 - 44984757
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44984943 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 44984845  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaacctta 988  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||| |||||    
T  44984844 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaccctta 44984757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 822 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 397567 - 397401
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  397567 ccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagtcacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 397469  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  397468 aattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 397401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 807 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 47344838 - 47344653
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  47344838 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgaataatttacccc-aaccaatacacattagccacataaacatatttttaagtggtatccatgaacta 47344740  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  47344739 tcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 47344653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 807 - 987
Target Start/End: Original strand, 54574940 - 54575125
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54574940 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 54575038  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  54575039 tcttgaccccaccaccaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttctaagataatctagaaaaaacctt 54575125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 805 - 984
Target Start/End: Original strand, 146427 - 146611
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactag-gtac-catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146427 aaggtgacaactagagtacgcatagaagaatggtgggtaatttaccac-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 146525  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaac 984  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  146526 tatcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 146611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 822 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 6020093 - 6019929
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  6020093 ccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactattttgaccccaccaaca 6019995  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaa 983  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  6019994 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 6019929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 822 - 987
Target Start/End: Original strand, 41702476 - 41702644
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  41702476 ccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttaaccccaccaaca 41702574  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  41702575 aattgttcattttcattggttggtgggtaagttacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 41702644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 807 - 988
Target Start/End: Original strand, 26091258 - 26091444
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26091258 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttactcc-aaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaacta 26091356  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-cat--tttcaaggtaatctagaaaaaacctta 988  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  || |||| |||| ||||||||||||||    
T  26091357 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttccaagataatttagaaaaaacctta 26091444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 822 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 54608127 - 54607961
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 921  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54608127 ccatggaagaatgatggataatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatacatgaactatcttgaccccaccaaca 54608029  T
Q  922 a-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac-att-ttcaag-gtaatctagaaaaaacc 985  Q
    | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  54608028 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaacc 54607961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 803 - 986
Target Start/End: Original strand, 19387684 - 19387872
Alignment:
Q  803 ataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatga 900  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19387684 ataaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatga 19387782  T
Q  901 actatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||   || ||||||||||||||||||    
T  19387783 acaatcttgaccccaccaacaaatttctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaacgtaatctagaaaaaacct 19387872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 806 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 39077728 - 39077543
Alignment:
Q  806 aggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39077728 aggtgacaactagggtacccatggaagaatgttgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaact 39077630  T
Q  904 atcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  39077629 atcttaaccccaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 39077543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 807 - 986
Target Start/End: Original strand, 49881059 - 49881247
Alignment:
Q  807 ggtgacaactag-gtacc-atggaagaatggtggataatttacccc---caaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 901  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49881059 ggtgacaactagagtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccgcccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaa 49881158  T
Q  902 ctatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  49881159 ctatcttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 49881247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 50155897 - 50155657
Alignment:
Q  64 ttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggag-aagagagagtttgccgtgtacggtatattg 162  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  50155897 ttagcggcggctgatttgattctttctcgactggtacctttatgccttaagttcttttcagatgaggagaaagagagagttttgcgtgtacggtgtattg 50155798  T
Q  163 gggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcccattattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaat 255  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||   |||| |||||| ||||| | |      || ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||    
T  50155797 gggaccataacttcttttatattggatgatcattatggtttctcattagttcgttaatggatcatccggacatccac---tcgagtccatatcaactaat 50155701  T
Q  256 taaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50155700 taaatatttaattaattatccaattaaaaatctaatagccttat 50155657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 806 - 985
Target Start/End: Original strand, 43471694 - 43471878
Alignment:
Q  806 aggtgacaactagg-ta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43471694 aggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataatcacatttttaagtggtatccatgaact 43471792  T
Q  904 atcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  43471793 atcttgaccacaccaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 43471878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 804 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 50234185 - 50233997
Alignment:
Q  804 taaggtgacaactagg-ta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 901  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50234185 taaggtgacaactagggtatccatagaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccattaa 50234087  T
Q  902 ctatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| || | ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  50234086 ctatcttgatcccaccaacaaatttctcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 50233997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 802 - 985
Target Start/End: Original strand, 50457805 - 50457993
Alignment:
Q  802 tataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatg 899  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50457805 tataagatgacaactagggtacccatggaagaatggtgtataatttacctc-aaccaatacacattagcaacataagcacatttttaagtggtatccatg 50457903  T
Q  900 aactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || || | ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  50457904 aactatcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattgattggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 50457993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 806 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 3170809 - 3170623
Alignment:
Q  806 aggtgacaactag-gta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  3170809 aggtgacaactagagtatccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatattcatgaact 3170711  T
Q  904 atcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| || |||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  3170710 atcttgaccccaccaacaaattgttcatttttattggttggtgggtaaattacacaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 3170623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 807 - 984
Target Start/End: Original strand, 18462013 - 18462195
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18462013 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtgatttacctc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 18462111  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaac 984  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18462112 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 18462195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 807 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 41949566 - 41949381
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacata--agcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41949566 ggtgacaactagggtacctatgaaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacatataagcacatttttaagtggtatccatgaac 41949468  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  41949467 tatcttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 41949381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 805 - 937
Target Start/End: Complemental strand, 48658002 - 48657868
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48658002 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttacccc-aaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 48657904  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcatt 937  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48657903 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcatt 48657868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 822 - 985
Target Start/End: Original strand, 55056276 - 55056442
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  55056276 ccatgaaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagttgtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 55056374  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  55056375 aattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 55056442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 804 - 983
Target Start/End: Original strand, 22618511 - 22618693
Alignment:
Q  804 taaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 901  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||   |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22618511 taaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacct--aaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 22618608  T
Q  902 ctatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaa 983  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22618609 ctatcttga-cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 22618693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 807 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 54425163 - 54425010
Alignment:
Q  807 ggtgacaactag-gtaccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 905  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54425163 ggtgacaactagtgtaccatggaagaatcgtgggtaatttacccc-aaccaatagacattagtcacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 54425065  T
Q  906 cttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  54425064 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggtcggtgggtaaattacccac 54425010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 800 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 55776233 - 55776073
Alignment:
Q  800 aatataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatcca 897  Q
    |||| ||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55776233 aataaaaggtgacaactagggtacttatgaaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatcca 55776135  T
Q  898 tgaactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  55776134 tgaactatcttga-cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 55776073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 800 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 55840411 - 55840251
Alignment:
Q  800 aatataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatcca 897  Q
    |||| ||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55840411 aataaaaggtgacaactagggtacttatgaaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatcca 55840313  T
Q  898 tgaactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  55840312 tgaactatcttga-cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 55840251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 807 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 407934 - 407753
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  407934 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtggataatta--ccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagt-gtatccatgaacta 407838  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  407837 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 407753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 805 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 45797663 - 45797507
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45797663 aaggtgacaactagggtacctatggaagaatggtaggtaatttatccc-aaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaac 45797565  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  45797564 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccac 45797507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 822 - 981
Target Start/End: Original strand, 31972353 - 31972515
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  31972353 ccatgaaagaatggtgggtaatttacccc-aatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaactatcttgaccccaccaaca 31972451  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaa 981  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||    
T  31972452 aattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaa 31972515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 807 - 985
Target Start/End: Original strand, 56022998 - 56023181
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56022998 ggtgacaactagggtacccatgaaaaaatgatggataatttacccc-aaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 56023096  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac-att-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  56023097 tcttgaccccactaacaaattggtcattttcattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 56023181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 822 - 985
Target Start/End: Original strand, 29777274 - 29777440
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-c 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||      
T  29777274 ccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatccgtaaactatctcgaccccaccaata 29777372  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  29777373 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 29777440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 806 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 31914380 - 31914196
Alignment:
Q  806 aggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31914380 aggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagcc-cataagcacatttttaagtggtatccatgaact 31914283  T
Q  904 atcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccaca--ttttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||  | ||| ||||||||||| |||||||||    
T  31914282 atcttgaccccaccaacaaattgctcagtttcattggttggtgggtaaattatccacaattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacct 31914196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 822 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 35446670 - 35446506
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||     
T  35446670 ccatggaagaatggtggataatttacccc-aaccaatacacattagccaaataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgaccccatcaaca 35446572  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-cat--tttcaaggtaatctagaaaaaac 984  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||  ||  |||||||||||||||||||    
T  35446571 aattgctcattttcattggtcggt-ggtaaattacccaccattcttaaaaggtaatctagaaaaaac 35446506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 822 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 6285472 - 6285335
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-c 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  6285472 ccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactattttgaccccaccaata 6285374  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  6285373 aattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccac 6285335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 822 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 41560493 - 41560356
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  41560493 ccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgatcccaccaaca 41560395  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||    
T  41560394 aattgctcatttttattggttggtgggtaaattatccac 41560356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 802 - 941
Target Start/End: Original strand, 52728302 - 52728442
Alignment:
Q  802 tataaggtgacaactagg-taccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatga 900  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52728302 tatagggtgacaactagggtaccatggaagaatggtgggtaatttacctc-aaccaatacgcattagtcacataagcacatttttaagtggtattcatga 52728400  T
Q  901 actatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggtt 941  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52728401 actatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggtt 52728442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 807 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 54086590 - 54086407
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54086590 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatgcacattagccacataagcacatttttaagcggtatccatgaacta 54086492  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttcaaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| || | ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  54086491 tcttga-cccaccaacaaattactcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaagtaatctagaaaaaacctt 54086407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 804 - 990
Target Start/End: Original strand, 47662099 - 47662290
Alignment:
Q  804 taaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 901  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  47662099 taaggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccattaa 47662197  T
Q  902 ctatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttata 990  Q
    |||| ||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47662198 ctatattgacaccactaacaaattactcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattattcaaaggtaatctagaaaaaaccttata 47662290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 804 - 985
Target Start/End: Original strand, 3692207 - 3692393
Alignment:
Q  804 taaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 901  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  3692207 taaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccct-aaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatcaataaa 3692305  T
Q  902 ctatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  3692306 ctatcttaatcccaccaacaaattactcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattattcaaaggtaatctagaaaaaacc 3692393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 822 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 23609252 - 23609086
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  23609252 ccatggaagaatggtgagtaatttacctc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccgtgaactatcttgaccccaccaaca 23609154  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac-att-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||| ||| || || |||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  23609153 aattgctcattttcgttgattggtgggtaaattacccactattcttcaaagataatctagaaaaaacc 23609086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 801 - 985
Target Start/End: Original strand, 31070068 - 31070256
Alignment:
Q  801 atataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccat 898  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  31070068 atataaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctc-aaccaatacacattagtcacatgagcacatttttaagtggtat-cat 31070165  T
Q  899 gaactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  31070166 gaactatcttgactccaccagcaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 31070256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 807 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 42033357 - 42033172
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| | | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42033357 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatctc-aaccaatatacattagctacataaacacatttttaagtggtatccatgaacta 42033259  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  42033258 tcttgactccaccaacaaattgctcattttaattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacctt 42033172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 822 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 50534796 - 50534659
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-c 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  50534796 ccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaata 50534698  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||| |||| || || ||||| ||||||||    
T  50534697 aattgctcatttttattgattggtgggtaagttacccac 50534659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 803 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 2243644 - 2243457
Alignment:
Q  803 ataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatga 900  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2243644 ataaggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttactcc-aactaatacacataagccacataaatacatttttaagtggtatccatga 2243546  T
Q  901 actatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  2243545 actatcttgacccgaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 2243457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 805 - 986
Target Start/End: Original strand, 14017374 - 14017558
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||  | ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  14017374 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggcaggtaatttacctc-aaccaatacacattagccacataaacacactt--aagtggtatccatgaac 14017470  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  14017471 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcgttggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 14017558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 807 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 55520009 - 55519826
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55520009 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttaccac-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 55519911  T
Q  905 tcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac-att-ttcaag-gtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||| || | ||||||| |||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  55519910 tcttgatcccaccaaaaaattgctcattttcattagttggtggataaattatccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaacc 55519826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 828 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 42222450 - 42222292
Alignment:
Q  828 aagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgc 926  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||     
T  42222450 aagaatggtgtgtaatttacctc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatcaatgaactatcttgaccccaccaataaattgt 42222352  T
Q  927 tcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaa 983  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  42222351 tcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 42222292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 73 - 369
Target Start/End: Original strand, 19686551 - 19686854
Alignment:
Q  73 gctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatag 172  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||  | | ||||| | || ||||    
T  19686551 gctgatttggttcgttctcaaccggtaccattatgcctcaatttctcttgggatgaggagaagagagagtttgccttgt--gatgtattgag-actatag 19686647  T
Q  173 cctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatattta 265  Q
     |||||||||||| |||||  | |||| |||| ||||||| ||      |||||||| |||||||||   |||||| |||||||| |||||||||||| |    
T  19686648 tctcttttatattggatggtcagtagggtttctcattatttcgttaatgggtcatccagacatccactgcttgagttcatatcaattaattaaatattca 19686747  T
Q  266 attaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagcta---atataattattgt 362  Q
    |||||||||   |||| |||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||   ||||||||||| |    
T  19686748 attaattattttattataaatttaacagtcttattatttaatttgatcactaatcaattaagacacacaatcgataaatagctaattatataattattat 19686847  T
Q  363 tacgata 369  Q
    |||||||    
T  19686848 tacgata 19686854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 804 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 38591849 - 38591667
Alignment:
Q  804 taaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 901  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    | |||||||||||||    
T  38591849 taaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctc-aaccaatacacattagccacataagcacatt----aatggtatccatgaa 38591755  T
Q  902 ctatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac-att-ttcaag-gtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  38591754 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgagtaaattacccaccattcttcaaatgtaatctagaaaaaacc 38591667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 805 - 931
Target Start/End: Original strand, 36532828 - 36532956
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36532828 aaggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttaccat-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 36532926  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcatt 931  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36532927 tatcttgaccccaccaacaaattgctcatt 36532956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 818 - 983
Target Start/End: Original strand, 48259524 - 48259691
Alignment:
Q  818 ggtaccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccacc 917  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  48259524 ggtaccatggaagaatggtgggtaatttaccct-aatcaatacatattagccacataagcacatttt-aagtggtattcatgaactatcttgactccacc 48259621  T
Q  918 aac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttcaa-ggtaatctagaaaaaa 983  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  48259622 aactaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaagggtaatctagaaaaaa 48259691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 823 - 983
Target Start/End: Original strand, 22468788 - 22468951
Alignment:
Q  823 catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-a 921  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  22468788 catggaaaaatggtgggtaatttacctc-aaccaatacacattagccacataaacatatttttaagtggtatctatgaactatcttgatcccaccaacaa 22468886  T
Q  922 attgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaa 983  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22468887 attgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 22468951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 807 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 48313737 - 48313556
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  48313737 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccct-aaccaatatatattagctacataagcatatttt-aagtggtatccatgaacta 48313640  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  48313639 tcttga-cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 48313556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 822 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 1932928 - 1932762
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||| || |||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||     
T  1932928 ccatgaaaaaatgatggataatttatccc-aaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactatcttgaccccactaaca 1932830  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac-att-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  1932829 aattggtcattttcattggttggtgggtaaattacctactattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 1932762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 822 - 993
Target Start/End: Original strand, 50536641 - 50536815
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  50536641 ccatagaagaatggtgggtaatttacccc-aactaatacacattagtcacataaacatatttttaagtggtatccattaactatcttgaccccaccaaca 50536739  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac-att-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttatataa 993  Q
    |||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  50536740 aatttctcattttcatcggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaatctaaaaaaaaccttaaataa 50536815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 807 - 988
Target Start/End: Original strand, 41632007 - 41632192
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  41632007 ggtgacaactaggatacccatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacatattagccatataagtacatttttaagcgatatccatgaacta 41632105  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctta 988  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  41632106 tcttga-cccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 41632192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 4632322 - 4632192
Alignment:
Q  62 agttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatat 160  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||    
T  4632322 agttagcggcttctgatttggttcttcctcaaccggtatctttatgcctcaagttctcttcagatgagaagaagagaaagtattgtcatgtactgtatat 4632223  T
Q  161 tggggaccatagcctcttttatattagatgg 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  4632222 tggggaccataacctcttttatattggatgg 4632192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 822 - 959
Target Start/End: Original strand, 53834071 - 53834208
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  53834071 ccatggaagaatggtgggtaatttacttc-aatcaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccgcaccaaca 53834169  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  53834170 aattgctcattttcattgattgttgggtaaattacccac 53834208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 827 - 959
Target Start/End: Original strand, 33897517 - 33897649
Alignment:
Q  827 gaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-aattg 925  Q
    |||||||||||| |||||||  || ||  ||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33897517 gaagaatggtgggtaatttattcc-aattaatacacattagccatataatcatatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattg 33897615  T
Q  926 ctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  33897616 ctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 33897649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 801 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 35595875 - 35595772
Alignment:
Q  801 atataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccat 898  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35595875 atatatggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccat 35595777  T
Q  899 gaact 903  Q
    |||||    
T  35595776 gaact 35595772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Original strand, 10733410 - 10733507
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtaccttt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  10733410 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttcctcaaccgataccttt 10733507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Original strand, 10947179 - 10947276
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtaccttt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  10947179 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatttgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttcctcaaccgataccttt 10947276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 822 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 48654985 - 48654842
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacat------tagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgacccca 915  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||      |||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||    
T  48654985 ccatggaagaatggtaggtaatttacccc-aaccaatacacatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatctatcaactatcttgactcca 48654887  T
Q  916 ccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  48654886 ccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccac 48654842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 823 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 42509460 - 42509365
Alignment:
Q  823 catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa 919  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42509460 catggaagaatggtggataatttatcct-aaccaatacacattagtcacataaacacatttttaagtggtatccatgaactattttgaccccaccaa 42509365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 808 - 908
Target Start/End: Complemental strand, 35344968 - 35344868
Alignment:
Q  808 gtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 905  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35344968 gtgacaactaggatacctatggaagaatggtggataatttacca--aaccaatacacattagccacataagcacattttcaagtggtatccatgaactat 35344871  T
Q  906 ctt 908  Q
    |||    
T  35344870 ctt 35344868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 850 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 52396865 - 52396774
Alignment:
Q  850 ccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc-ttgaccccaccaac-aattgctcattttcattgg 939  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52396865 ccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactatctttaaccccaccaacaaattgctcattttcattgg 52396774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 849 - 987
Target Start/End: Original strand, 54805657 - 54805803
Alignment:
Q  849 cccaaccaatacacattagctacataag----cacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttag 943  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||| || |    
T  54805657 cccaaccaatacacattagccacataaataaacacatttttaagtggtatctatgaactatcttaatcccaccaacaaattgttcattttcattgattgg 54805756  T
Q  944 taggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    | ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  54805757 tgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 54805803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 822 - 955
Target Start/End: Complemental strand, 51951846 - 51951714
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||  |||     
T  51951846 ccatggaagaatggtgggtaatttacac--aaccaatatacattagccacataagcacatttttaactgatatccatgaactatcttgactccattaaca 51951749  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattac 955  Q
    ||||| |||||||||||| || || | ||||||||    
T  51951748 aattgttcattttcattgattggtggataaattac 51951714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 262 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 50426980 - 50426882
Alignment:
Q  262 tttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 360  Q
    ||||||||||||||  |||  |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  50426980 tttaattaattatctcattgaaaatttaataactttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacacttgataaataactaatataattatt 50426882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 881 - 985
Target Start/End: Original strand, 1662323 - 1662431
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatcta 976  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  1662323 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtaggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 1662422  T
Q  977 gaaaaaacc 985  Q
    |||||||||    
T  1662423 gaaaaaacc 1662431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 318 - 378
Target Start/End: Original strand, 33461797 - 33461857
Alignment:
Q  318 atcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33461797 atcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattgttacgataattgcccac 33461857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 822 - 988
Target Start/End: Original strand, 37239107 - 37239265
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 921  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||           ||||||||||||||||||||| || |    
T  37239107 ccatgaaagaatgatggataatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgaccccacaaata 37239194  T
Q  922 a-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctta 988  Q
    | ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  37239195 aattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 37239265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 807 - 985
Target Start/End: Original strand, 9997931 - 9998103
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||           ||| |||||||||    
T  9997931 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaacta 9998018  T
Q  905 tcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||    
T  9998019 tcttgatcccaccaataaattactcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacc 9998103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 805 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 43891101 - 43890956
Alignment:
Q  805 aaggtgacaacta-ggta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||           ||| |||||||    
T  43891101 aaggtgacaactatggtatccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaac 43891014  T
Q  903 tatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||| ||||| |||||||  |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  43891013 tatattgactccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccac 43890956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 807 - 959
Target Start/End: Original strand, 45633779 - 45633922
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||           |||||||||    
T  45633779 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 45633866  T
Q  905 tcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  45633867 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 45633922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 803 - 883
Target Start/End: Original strand, 48259700 - 48259780
Alignment:
Q  803 ataaggtgacaactagg-taccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacattt 883  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  48259700 ataaggtgacaactagggtaccatggaagaatggtgggtaattta-ccccaatcaatacatattagccacataagcacattt 48259780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 878 - 985
Target Start/End: Original strand, 27398664 - 27398775
Alignment:
Q  878 acatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaat 973  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| | ||||||| || ||||||||||||| ||||||   || |||||    
T  27398664 acatttttaagtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgcgcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaagtaat 27398763  T
Q  974 ctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||    
T  27398764 ctagaaaaaacc 27398775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 318 - 378
Target Start/End: Original strand, 33458672 - 33458732
Alignment:
Q  318 atcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33458672 atcaactaaggctcacaattgataaatagttaatataattattgttacgataattgcccac 33458732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 881 - 983
Target Start/End: Original strand, 14335165 - 14335271
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatcta 976  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||   |||||||||||    
T  14335165 tttttaggtggtatctatgaactatcttgaccctaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacctaccatttttcaaaggtaatcta 14335264  T
Q  977 gaaaaaa 983  Q
    |||||||    
T  14335265 gaaaaaa 14335271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 881 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 27580226 - 27580120
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatcta 976  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  27580226 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 27580127  T
Q  977 gaaaaaa 983  Q
    |||||||    
T  27580126 gaaaaaa 27580120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 881 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 573910 - 573802
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac---attttcaaggtaatcta 976  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||||    |||| |||||||||||    
T  573910 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgttcattatgattggttggtaggtaaattacccaccattttttaaaggtaatcta 573811  T
Q  977 gaaaaaacc 985  Q
    |||| ||||    
T  573810 gaaacaacc 573802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 828 - 959
Target Start/End: Original strand, 5117461 - 5117581
Alignment:
Q  828 aagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgc 926  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||           ||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  5117461 aagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgaccccacaaataaattgc 5117548  T
Q  927 tcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  5117549 tcattttcattggttggtgggtaaattacccac 5117581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 822 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 52461517 - 52461365
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 921  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||           ||||||||||||||||||||| || |    
T  52461517 ccatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgaccccacaaata 52461430  T
Q  922 a-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccacattttcaaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    | ||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||  ||  |||||||| |||||||||||    
T  52461429 aattgctcatttttattggttggtgggtaaattacacaccattcaaaggtaatttagaaaaaacc 52461365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 822 - 985
Target Start/End: Original strand, 31881331 - 31881486
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 921  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||           ||||||||||||||||||||| || |    
T  31881331 ccatgaaagaatgatgaataatttaccct-aaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgaccccacaaata 31881418  T
Q  922 a-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttca-aggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  31881419 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcataggtaatttagaaaaaacc 31881486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 881 - 985
Target Start/End: Original strand, 38547665 - 38547773
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatcta 976  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  38547665 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 38547764  T
Q  977 gaaaaaacc 985  Q
     ||||||||    
T  38547765 aaaaaaacc 38547773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 822 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 54715189 - 54715035
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 921  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||           |||||||||| ||||||||||||| |    
T  54715189 ccatggaagaatggtgggtaatttacctc-aactaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatgttgaccccaccaata 54715102  T
Q  922 a-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaac 984  Q
    | |||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||   |||||||| ||||||||||    
T  54715101 aattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaac 54715035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 33045185 - 33045085
Alignment:
Q  62 agttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatatt 161  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||   | |||||||||||| || | |||| ||||| ||||    
T  33045185 agttaacggcggctgatttagttctttctcaaccggtacttttatatctcaagttctcttcaatcgcggagaagagagaattcgtcgtgaacggtgtatt 33045086  T
Q  162 g 162  Q
    |    
T  33045085 g 33045085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 804 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 34835351 - 34835174
Alignment:
Q  804 taaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 901  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||           ||| ||||||  |||||| ||| ||    
T  34835351 taaggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttacccc-aaccaataaacatt-----------cacctttttagatggtattcataaa 34835264  T
Q  902 ctatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||| || ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  34835263 ctatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 34835174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 822 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 54216467 - 54216309
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 921  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||           ||||||||||||||| ||||| || |    
T  54216467 ccatgaaagaatgatcgataatttacccc-aaccaatacacattagcaacataagcacatatt-----------catgaactatcttgatcccacaaata 54216380  T
Q  922 a-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctta 988  Q
    | ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  54216379 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 54216309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 889 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 43231601 - 43231502
Alignment:
Q  889 tggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttcaaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  43231601 tggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcatttttattggttgatggataaattacccaccattcttcaaagtaatctagaaaaaacc 43231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 828 - 959
Target Start/End: Original strand, 4486604 - 4486724
Alignment:
Q  828 aagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgc 926  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||           |||||| |||||||||||||| || || ||||    
T  4486604 aagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaattatcttgaccccacaaataaattgc 4486691  T
Q  927 tcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4486692 tcattttcattggttggtgggtaaattacccac 4486724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 32284620 - 32284542
Alignment:
Q  62 agttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagaga 140  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  32284620 agttagtggcgactgatttggttcttcctcgatcggtacctttaggcctcaagttttcttcagatgaggagaatagaga 32284542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 896 - 988
Target Start/End: Original strand, 3293102 - 3293198
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaacctta 988  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||   |||||||| ||||||||||||||    
T  3293102 catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 3293198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 828 - 958
Target Start/End: Complemental strand, 22620741 - 22620622
Alignment:
Q  828 aagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgc 926  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||           ||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  22620741 aagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatatacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgaccccacaaataaattgc 22620654  T
Q  927 tcattttcattggttagtaggtaaattaccca 958  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  22620653 tcattttcattggttggtgggtaaattaccca 22620622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 822 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 33049046 - 33048990
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcac 879  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33049046 ccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcac 33048990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 881 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 46720132 - 46720024
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatcta 976  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||| ||||||   ||| |||||||    
T  46720132 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccatcaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaagttaatcta 46720033  T
Q  977 gaaaaaacc 985  Q
    |||||||||    
T  46720032 gaaaaaacc 46720024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 4632140 - 4632012
Alignment:
Q  226 catccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatag-ccttattacttaatttgatcactaatcaact 324  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||    |||||||||  || || |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  4632140 catccactcatt-agtccatatccactaattaa----ttaattaatactctaagtagaaatctaataaaccttattacttaatttgattactaatcaatt 4632046  T
Q  325 aaggcccacaattgataaatagctaatataatta 358  Q
    ||| |    |||||||||||| ||||||||||||    
T  4632045 aagacttcaaattgataaataactaatataatta 4632012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 822 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 42558350 - 42558270
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgac 911  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||        ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42558350 ccatggaagaatggtggataattta-ccctaatcaatacacattagc--------cacatttttaagtggtatctatgaactatcttgac 42558270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 803 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 47812081 - 47812002
Alignment:
Q  803 ataaggtgacaactagg-ta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacat 881  Q
    |||||||||||| |||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47812081 ataaggtgacaattagggtatccatagaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacat 47812002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 896 - 991
Target Start/End: Original strand, 54216815 - 54216914
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaaccttatat 991  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||| ||||    
T  54216815 catgaactatcttgaccccaccaataaattgttcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacctaatat 54216914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 3769509 - 3769434
Alignment:
Q  63 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagaga 138  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||    
T  3769509 gttagtggcggctgatttggttcttcctcaacccgtatatttatgcctatagttcttttcagatagggagaagaga 3769434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 807 - 985
Target Start/End: Original strand, 15060289 - 15060461
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||           |||||||||    
T  15060289 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatccc-aaccaatacacattggccacataagcacatatt-----------catgaacta 15060376  T
Q  905 tcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  15060377 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 15060461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 802 - 959
Target Start/End: Original strand, 20351837 - 20351985
Alignment:
Q  802 tataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatg 899  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||           ||| ||||    
T  20351837 tataaggtgacaactagactacccatgaaagaatgatgggtaatttatccc-aaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatg 20351924  T
Q  900 aactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20351925 aactatcttgatcccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccac 20351985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 881 - 984
Target Start/End: Original strand, 6371313 - 6371420
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac-atttt--caaggtaatcta 976  Q
    |||||| |||||| || | || ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||| || |||||||||||||| |||||   |||||||||||    
T  6371313 tttttaggtggtaaccctaaattatcttgaccccaccaataaattgctcattataattggttggtgggtaaattacccactatttttcaaaggtaatcta 6371412  T
Q  977 gaaaaaac 984  Q
    ||||||||    
T  6371413 gaaaaaac 6371420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 896 - 988
Target Start/End: Original strand, 11972208 - 11972304
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctta 988  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  11972208 catgaactatcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgagtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 11972304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 896 - 959
Target Start/End: Original strand, 46708820 - 46708884
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  46708820 catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccac 46708884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 896 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 49014190 - 49014126
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  49014190 catgaactatcttgaccccacaaataaattactcattttcattggttggtgggtaaattacccac 49014126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 904 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 42557666 - 42557583
Alignment:
Q  904 atcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaa 983  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  42557666 atcttgaccccaccaacaaattactcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 42557583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 807 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 34552490 - 34552318
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||| ||           |||||||||    
T  34552490 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttactcc-aaccaatacacattagccgcataagcacatatt-----------catgaacta 34552403  T
Q  905 tcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||| |||  || || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  34552402 tcttgacaccataaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 34552318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 828 - 881
Target Start/End: Original strand, 27873571 - 27873623
Alignment:
Q  828 aagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacat 881  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27873571 aagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacat 27873623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 822 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 33289857 - 33289801
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcac 879  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33289857 ccatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcac 33289801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 822 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 52688503 - 52688348
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-c 920  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |           ||| |||||||||| |||| ||||| ||      
T  52688503 ccatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcata-----------tattcatgaactattttgatcccacaaata 52688416  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  52688415 aattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttctaaggtaatttagaaaaaacc 52688348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 881 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 27872686 - 27872607
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| | ||||||| || ||||||||| ||||    
T  27872686 tttttaggtggtatccataaactatcttgatcccactaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattatccac 27872607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 795 - 874
Target Start/End: Original strand, 3291793 - 3291873
Alignment:
Q  795 tatttaatataaggtgacaactagg-ta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacata 874  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| || ||||| ||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3291793 tatttaatttaaggtgacaattaggctatccatgaaagaatgatgagtaatttacccc-aaccaatacacattagccacata 3291873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 882 - 959
Target Start/End: Original strand, 18206583 - 18206665
Alignment:
Q  882 ttttaagtggtatccatgaac----tatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||   |||||||||||||||    
T  18206583 ttttaggtggtatccatgaactatatatcttgaccccaccaataaattgttcattttcattgattgagaggtaaattacccac 18206665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 848 - 881
Target Start/End: Original strand, 51981521 - 51981554
Alignment:
Q  848 ccccaaccaatacacattagctacataagcacat 881  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51981521 ccccaaccaatacacattagccacataagcacat 51981554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 60)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Original strand, 8650967 - 8651346
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8650967 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 8651066  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||    
T  8651067 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcc 8651166  T
Q  205 cattattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagcctta 298  Q
    |||||||||      ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8651167 cattattccgttaatgggccatccggacatccactcattaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagtctta 8651266  T
Q  299 ttacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8651267 ttacttaatttgatcactaatcaactaagactcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 8651346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 4 - 378
Target Start/End: Original strand, 4580480 - 4580864
Alignment:
Q  4 aacatccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctgacacac--aatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacc 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4580480 aacaaccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacgcaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacc 4580579  T
Q  102 tttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-gg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  4580580 tttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattaggg 4580679  T
Q  200 tttcccattattcc------gggtcatccggacatccaccca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa 290  Q
    ||||||||||||||      ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || |||||||||||    
T  4580680 tttcccattattccattaatgggtcatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaa 4580775  T
Q  291 -tagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4580776 ttagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccac 4580864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Original strand, 21191030 - 21191413
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21191030 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatatgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 21191129  T
Q  107 gcc---tcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtt 201  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  21191130 gcctcatcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtaaggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattatggtt 21191229  T
Q  202 tcccattattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaa-tagc 294  Q
    || |||||||||      ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  21191230 tcacattattccgttaatgggccatccgaacatccactcattgaatccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaattagc 21191329  T
Q  295 cttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21191330 catattacttaatttgatcactaatcaattaaggctctaaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccac 21191413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25354207 - 25353830
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25354207 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 25354108  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattag-gtttcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  25354107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattagatgaccattagagtttcc 25354008  T
Q  205 cattattcc------gggtcatccggacatccaccca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaa-tagcc 295  Q
    |||||||||      ||| |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  25354007 cattattccgttaatgggccatccggatatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaa-aataaatctaattagcc 25353913  T
Q  296 ttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25353912 ttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccac 25353830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 37 - 345
Target Start/End: Original strand, 31756410 - 31756728
Alignment:
Q  37 gaggtgatgatctgacacaca----atagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggag 132  Q
    ||||||||||||||| |||||    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31756410 gaggtgatgatctgaaacacacaatatagggttagcggcggctgatttggttcttcctcaacaggtacctttatacctcaagttctcttcagatggggag 31756509  T
Q  133 aagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattcc-----gggtcatccggac 226  Q
    ||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||     |||||||||||||    
T  31756510 aagagagagtttgtcgtgtttgatatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccttaatgggtcatccggac 31756609  T
Q  227 atccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaa 326  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31756610 atccactcattgagtccatatcaactaattaattatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaa 31756709  T
Q  327 ggcccacaattgataaata 345  Q
    | |||||||||||||||||    
T  31756710 gacccacaattgataaata 31756728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 63 - 378
Target Start/End: Original strand, 21770787 - 21771107
Alignment:
Q  63 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttt-gccgtgtacggtatatt 161  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21770787 gttagcagcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatgg--agaagagagagttttgccgtgtacggtgtatt 21770884  T
Q  162 ggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg-----ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaat 255  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  21770885 ggggaccgtagcctcttttatattggttggccattagggtttcccattattccgttaatggtcatccggacatccactcattaagtccatatcaactaat 21770984  T
Q  256 taaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataa 355  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21770985 taaatatttaattaattattcaattagaaatctaatagttttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataa 21771084  T
Q  356 ttattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  21771085 ttattgttacgatatttgtccac 21771107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25343620 - 25343244
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25343620 ccctttcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 25343521  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||    
T  25343520 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattgggga-catagcctcttttatattggatgaccattagggtttcc 25343422  T
Q  205 cattattcc------gggtcatccggacatccaccca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaa-tagcc 295  Q
    |||||||||      ||  |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  25343421 cattattccgttaatggaccatccgaacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaa-aataaatctaattagcc 25343327  T
Q  296 ttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25343326 ttattacttaatttaatcactaatcaattaaggttcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccac 25343244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 63 - 378
Target Start/End: Original strand, 21197250 - 21197584
Alignment:
Q  63 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-----------ttgccgtgt 151  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||    
T  21197250 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtatctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgagtattgccgtgt 21197349  T
Q  152 acggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattaggttt-cccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtcca 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||      || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  21197350 acggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattaggttttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtcca 21197449  T
Q  245 tatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaa 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||    
T  21197450 tatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcagttaaggctctaaattgataaa 21197549  T
Q  344 tagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21197550 taactaatataattattattacgatatttacccac 21197584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 70 - 378
Target Start/End: Original strand, 21783545 - 21783868
Alignment:
Q  70 gcggctgatttagttcttcctcaaccgg------tacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttt-gccgtgtacggtatattg 162  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21783545 gcggctgatttggttcttcctcaaccggcacctttacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgccgtgtacggtgtattg 21783644  T
Q  163 gggac--catagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaacta 253  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||      |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  21783645 gggacaccatagcctcttttatattggatgcc-attagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcattaagtccatatcaacta 21783743  T
Q  254 attaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatat 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  21783744 attaaatatttaattaattatccaattagaaatttaatagttttattacttaatttgatcactaatccactaagactcacaattgataaatagttaatat 21783843  T
Q  354 aattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||    
T  21783844 aattattattacgatatttacccac 21783868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 80 - 378
Target Start/End: Original strand, 30905819 - 30906123
Alignment:
Q  80 tagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttt 179  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  30905819 tagttcttcctcaattggtatatttatgcctcaagttctcttcagatgggg-gaagagagagtttgtcgagtacggtgtattgggaaccatagcctcttt 30905917  T
Q  180 tatattagatggctatta-ggtttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaatt 272  Q
    |||||| |||| | |||| ||||||||||||||| |      | |||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30905918 tatattggatgaccattatggtttcccattattctgttaaaggatcatccagacatctactcatagagtccatatcaactaattaaatatttaattaatt 30906017  T
Q  273 atccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatattt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  30906018 atccaattagaaatctaatagccttattactttatttggttactaatcaactaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacgatattt 30906117  T
Q  373 gcccac 378  Q
    ||||||    
T  30906118 gcccac 30906123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 286
Target Start/End: Original strand, 21789768 - 21789999
Alignment:
Q  70 gcggctgatttagttcttcctcaaccgg------tacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag-tttgccgtgtacggtatattg 162  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  21789768 gcggctgatttggttcttcctcaaccggcacctttacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgccgtgtacggtgtattg 21789867  T
Q  163 ggg--accatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcccattattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaacta 253  Q
    |||  |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||      ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  21789868 gggacaccatagcctcttttatattggat-gccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcattaagtccatatcaacta 21789966  T
Q  254 attaaatatttaattaattatccaattagaaat 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21789967 attaaatatttaattaattatccaattagaaat 21789999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 800 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 5882695 - 5882505
Alignment:
Q  800 aatataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatcca 897  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5882695 aataaaaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatcca 5882597  T
Q  898 tgaactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  5882596 tgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 5882505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 794 - 988
Target Start/End: Original strand, 22551048 - 22551247
Alignment:
Q  794 atatttaatataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtgg 891  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22551048 atatttaatttatggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaggtgg 22551146  T
Q  892 tatccatgaactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  22551147 tatccatgaactatcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 22551246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 804 - 959
Target Start/End: Original strand, 26377201 - 26377358
Alignment:
Q  804 taaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 901  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26377201 taaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 26377299  T
Q  902 ctatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26377300 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 26377358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 822 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 2892353 - 2892189
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2892353 ccatagaagaatggtggataatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 2892255  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaa 983  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  2892254 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 2892189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 805 - 986
Target Start/End: Original strand, 2593850 - 2594036
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2593850 aaggtgacaactagggtacctatggaagaatggtggataatttatccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 2593948  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccaca--ttttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||  | ||| ||| |||||||||||||||||    
T  2593949 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccacaattcttcaaagataatctagaaaaaacct 2594036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 806 - 959
Target Start/End: Original strand, 11988973 - 11989128
Alignment:
Q  806 aggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11988973 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaact 11989071  T
Q  904 atcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11989072 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccac 11989128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 822 - 986
Target Start/End: Original strand, 14891396 - 14891563
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14891396 ccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 14891494  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  14891495 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggcaatctagaaaaaacct 14891563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 823 - 985
Target Start/End: Original strand, 7345130 - 7345295
Alignment:
Q  823 catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-a 921  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  7345130 catggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactattttgaccccaccaacaa 7345228  T
Q  922 attgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac-att-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  7345229 attgctcattttcattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 7345295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 822 - 987
Target Start/End: Original strand, 7393603 - 7393771
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7393603 ccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 7393701  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-cat--tttcaaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| || |||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  7393702 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacctt 7393771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 822 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 16703531 - 16703363
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  16703531 ccatggaagaatgatgcgtaatttacccc-aaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccataaactatcttgaccccaccaaca 16703433  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  16703432 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 16703363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 806 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 24168274 - 24168090
Alignment:
Q  806 aggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24168274 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 24168176  T
Q  904 atcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  24168175 atcttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 24168090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 805 - 994
Target Start/End: Original strand, 34527860 - 34528054
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34527860 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaat 34527958  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaaccttatataaa 994  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||   ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  34527959 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctaaaaaaaaccataaataaa 34528054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 807 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 8615422 - 8615237
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8615422 ggtgacaactagggtacccatggaagaatagtgggtaatttaccct-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 8615324  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  8615323 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 8615237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 801 - 981
Target Start/End: Original strand, 18101489 - 18101674
Alignment:
Q  801 atataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccat 898  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18101489 atatatggtgacaactaggatacccatggaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccat 18101587  T
Q  899 gaactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaa 981  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  18101588 gaactattttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaa 18101674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 804 - 941
Target Start/End: Original strand, 22341785 - 22341924
Alignment:
Q  804 taaggtgacaacta-ggtacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 901  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22341785 taaggtgacaactaaggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 22341883  T
Q  902 ctatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggtt 941  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22341884 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggtt 22341924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 243 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 17581356 - 17581221
Alignment:
Q  243 catatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataa 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  17581356 catatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaccataatagtcttattacttaatttgatcactaatcaattgaggctcacaattgataa 17581257  T
Q  343 atagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17581256 atagttaatataattattattacgatatttgcccac 17581221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 63 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17581572 - 17581384
Alignment:
Q  63 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag-tttgccgtgtacggtatatt 161  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||   ||    
T  17581572 gttagtggcagctgatttggttcttcctcaacttgtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgtcgtgtacagt---tt 17581476  T
Q  162 ggggaccatagcctcttttatattagatggctattaggtttcccattattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatat 247  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17581475 ggggaccatagcctcttttatattggacggttattaggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcattgagtccatat 17581384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 804 - 986
Target Start/End: Original strand, 19415530 - 19415717
Alignment:
Q  804 taaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 901  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19415530 taaggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttactcc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgag 19415628  T
Q  902 ctatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  19415629 ctatcttgaccccaccaacaaattggtcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 19415717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 801 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 600080 - 599890
Alignment:
Q  801 atataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccat 898  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  600080 atatatggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtggataatttatccc-aaccaatacaaattagtcacataaacacatttttaagtggtatccat 599982  T
Q  899 gaactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  599981 gaactatcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 599890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 822 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 1970876 - 1970708
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  1970876 ccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtgatattcatgaactatcttgaccccaccaaca 1970778  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    ||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1970777 aattgtttattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 1970708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 807 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 28947269 - 28947085
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||    
T  28947269 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctc-aaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatacatgaatta 28947171  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  28947170 tcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 28947085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 802 - 984
Target Start/End: Original strand, 959899 - 960086
Alignment:
Q  802 tataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatg 899  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  959899 tatatggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatctatg 959997  T
Q  900 aactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaac 984  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  959998 aattatcttgaccccaccaacaaattgctcatttccattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 960086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 239 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6097067 - 6096927
Alignment:
Q  239 agtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaa-ttagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaatt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||    
T  6097067 agtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcaaaattagaaatttaatagccttattacttaatttcatcactaatcaagtaaggctgacaatt 6096968  T
Q  338 gataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    || |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6096967 gacaaataagtaatataattattgttactatatttgcccac 6096927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 808 - 992
Target Start/End: Original strand, 19281056 - 19281245
Alignment:
Q  808 gtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 905  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19281056 gtgacaactaggctacctatgaaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatattcatgaactat 19281154  T
Q  906 cttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttatata 992  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || || |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  19281155 cttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggcaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccatatata 19281245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 806 - 985
Target Start/End: Original strand, 10507907 - 10508091
Alignment:
Q  806 aggtgacaactagg-ta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10507907 aggtgacaactagggtagccatcgaagaatggtgggtagtttacccc-aaccaatacacattagccacgtaagcacatttttaagtggtatccatgaact 10508005  T
Q  904 atcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  10508006 atcttgaccccaccaacaaattgctcattatcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacc 10508091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 807 - 959
Target Start/End: Original strand, 24224070 - 24224224
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tac-catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||| || | ||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24224070 ggtgacaactaggatactcatgaaagaatagtaggtaatttacctc-aaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 24224168  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  24224169 tcttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 24224224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 807 - 959
Target Start/End: Original strand, 33452572 - 33452726
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33452572 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgagtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaacta 33452670  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  33452671 tcttgaccccaacaacaaattattcattttcattggttggtggataaattacccac 33452726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 805 - 959
Target Start/End: Original strand, 5294799 - 5294955
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tac-catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||| | || ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5294799 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgagtaatttacctc-aatcaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 5294897  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  5294898 tatcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccac 5294955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 805 - 959
Target Start/End: Original strand, 5299351 - 5299507
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tac-catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||| | || ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5299351 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgagtaatttacctc-aatcaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 5299449  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  5299450 tatcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccac 5299507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 822 - 983
Target Start/End: Original strand, 30743465 - 30743629
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||     
T  30743465 ccatgaaagaatggtaggtaatttatccc-aaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccataaactatcttgatctcaccaaca 30743563  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaa 983  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  30743564 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 30743629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 859 - 985
Target Start/End: Original strand, 30467656 - 30467786
Alignment:
Q  859 acacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccc 957  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  30467656 acacattagccacataagcacatgtttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgtttggtgggtaaattaccc 30467755  T
Q  958 a-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  30467756 accattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 30467786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 805 - 955
Target Start/End: Original strand, 23261927 - 23262079
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23261927 aaggtgacaactagggtacctatgaaagaacggtggataatttacccc-aaccaatacatattaacctcataagcacatttttaagtgatatccatgaac 23262025  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattac 955  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23262026 tatcttaaccccatcaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 23262079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1106206 - 1105930
Alignment:
Q  109 ctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttt-gccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttccca 206  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||||||| ||||  ||||||||||| |||| |||||| |  |||   |||| ||||| |||    
T  1106206 ctcaagttctcttcacatagggagaagagaaagttttgacgtgtacagtat--tggggaccatatcctcatttatactcaatgatcattacggttttcca 1106109  T
Q  207 ttattccgg------gtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaatt-aaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttat 299  Q
    ||||| ||       ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  | ||| |||| ||||||||||||    
T  1106108 ttatttcgttaatgagtcatccggacatccactcattgaatccatattaattaatttaaatatttaattaattatgtagttaaaaatttaatagccttat 1106009  T
Q  300 tacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
     | ||||||||| |||||||||| |||  |  |||||||||||||| | ||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  1106008 catttaatttgaacactaatcaaataaaacttacaattgataaatatcaaatataattattactaccatatttgcccac 1105930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 254 - 378
Target Start/End: Original strand, 12801956 - 12802081
Alignment:
Q  254 attaaatatttaattaattatccaattagaaatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaata 352  Q
    |||||||| |||||||||  || || ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  12801956 attaaataattaattaatattctaaatagaaatctaataagctttattacttaaattgatcactaatcaattaaggctccaaattgacaaatagctaata 12802055  T
Q  353 taattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||| |   |||||||||||||    
T  12802056 taattattatagagatatttgcccac 12802081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28728202 - 28728071
Alignment:
Q  82 gttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctctttta 181  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||  || | | ||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  28728202 gttcttcctcaaccggtacctcgatgccctaa-tgcgcttcagatggggagaagagcggttttgctgtgtacggtatattggggaccatagcctc-atta 28728105  T
Q  182 tattagatggctatta-ggtttcccattattccg 214  Q
    |||  |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  28728104 tataggatggccattagggtttcccattattccg 28728071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 881 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 7167689 - 7167580
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatcta 976  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  7167689 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccactaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 7167590  T
Q  977 gaaaaaacct 986  Q
    ||||||||||    
T  7167589 gaaaaaacct 7167580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 807 - 987
Target Start/End: Original strand, 28948845 - 28949019
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||           |||||| ||    
T  28948845 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcatatatt-----------catgaatta 28948932  T
Q  905 tcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  28948933 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 28949019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 822 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 13329535 - 13329378
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-c 920  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||           |||||||||||| ||||||| ||      
T  13329535 ccatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatattt-----------atgaactatcttaaccccacaaata 13329448  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  13329447 aattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 13329378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 806 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 15965605 - 15965461
Alignment:
Q  806 aggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||           ||| |||||| |    
T  15965605 aggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataaacaca-----------tattcatgaagt 15965518  T
Q  904 atcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15965517 atcttaaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 15965461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 1283325 - 1283280
Alignment:
Q  245 tatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaa 290  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1283325 tatcaattaattaaatatataattaattatccaattagaaatctaa 1283280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 906 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 929741 - 929657
Alignment:
Q  906 cttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  929741 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 929657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 892 - 959
Target Start/End: Original strand, 1939579 - 1939647
Alignment:
Q  892 tatccatgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  1939579 tatccatgaattatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggtttataggtaaattatccac 1939647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 896 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 4487619 - 4487555
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  4487619 catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccac 4487555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 822 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 3786903 - 3786845
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacat 881  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  3786903 ccatgaaagaatgatggataatttacccc-aactaatacacattagccacataagcacat 3786845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 20745497 - 20745394
Alignment:
Q  62 agttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatatt 161  Q
    ||||||||| | || |||| ||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  | ||| |||| | |||| |||||||| ||||    
T  20745497 agttagcggtgactaatttggtttttcctcaatcggtacttttaagccccaagttctcttcagatggaaataagtgagaatatgccatgtacggtgtatt 20745398  T
Q  162 gggg 165  Q
    ||||    
T  20745397 gggg 20745394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 47
Target Start/End: Original strand, 32035450 - 32035488
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgat 47  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32035450 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgat 32035488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 807 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 18661905 - 18661830
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacat 881  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  18661905 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttatccc-aaccaatacatattagccacataagcacat 18661830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 13007441 - 13007350
Alignment:
Q  270 attatccaattagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 360  Q
    |||||| || ||||||| |||| || ||||||  |||||||||||| ||||||| || ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13007441 attatctaactagaaatttaattagtcttattgtttaatttgatcattaatcaattagggctccaaattgataaataactaatataattatt 13007350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 890 - 959
Target Start/End: Original strand, 375797 - 375867
Alignment:
Q  890 ggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| | ||| ||| |||||||||||||||||    
T  375797 ggtattcataaactatcttgaccccaccaataaattgcgcattatgattagttggtaggtaaattacccac 375867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 100)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 30965323 - 30964944
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30965323 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccggtacctttat 30965224  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  30965223 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggccattaggatttcc 30965124  T
Q  205 cattattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagcctta 298  Q
    |||||||||      ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30965123 cattattccgttaatgggccatccggacatccactcattgaatccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagtctta 30965024  T
Q  299 ttacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30965023 ttacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 30964944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 31002372 - 31001993
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31002372 ccctctcatcaacaacgataaccaaaaagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccggtacctttat 31002273  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  31002272 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgttgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattatggtttcc 31002173  T
Q  205 cattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagcctta 298  Q
    ||||||||||      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31002172 cattattccgttaatgggtcatccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagcctta 31002073  T
Q  299 ttacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31002072 ttacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttatgatatttgcccac 31001993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Original strand, 28683109 - 28683487
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28683109 ccctctcatcaacaacgataaccaaggagagtggatgatctgaaacacacaatagagttaacagcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 28683208  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttccc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  28683209 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttccc 28683308  T
Q  206 attattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttat 299  Q
    ||||||||      ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28683309 attattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatgtttaattatttatccaattagaaatctaatagccttat 28683408  T
Q  300 tacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28683409 tacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaataactaatataattattgttacgatatttgcccac 28683487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Original strand, 13149848 - 13150232
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13149848 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 13149947  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggg-----gagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg- 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |     ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||     
T  13149948 gcctcaagttctcttcagatgagatgaggagaagagagaatattgccgtgtacggtatattggggaccataacctcttttatattagatgaccattaggg 13150047  T
Q  200 tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatag 293  Q
    |||||||||||||||      ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13150048 tttcccattattccgttaatgggtcatccgtacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatag 13150147  T
Q  294 ccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13150148 ccttattacttaatttgatcaataatcaactaatgcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 13150232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 9 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 31008350 - 31007985
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  31008350 ccctctcatcaacaacgataaccaaaaagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccggtacttttat 31008251  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  31008250 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgttgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattatggtttcc 31008151  T
Q  205 cattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagcctta 298  Q
    ||||||||||      |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31008150 cattattccgttaatgggtcattcggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagcctta 31008051  T
Q  299 ttacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgtta 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31008050 ttacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgtta 31007985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 378
Target Start/End: Original strand, 44716971 - 44717348
Alignment:
Q  11 ctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44716971 ctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgc 44717070  T
Q  109 ctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttccca 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| |||    
T  44717071 ctcaagttctcttcagatggggagaagagatagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggtcattagggttttcca 44717170  T
Q  207 ttattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttatt 300  Q
    |||||||      ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44717171 ttattccgttaatgggccatccggacatccactcattaagtccatatcaactaattatatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttatt 44717270  T
Q  301 acttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44717271 acttaatttgatcactaatcaactaagactcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatgtgcccac 44717348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 13456095 - 13455716
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13456095 ccctctcatcaacaactataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 13455996  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  13455995 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc 13455896  T
Q  205 cattattcc------gggtcatccggacatccaccca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagc 294  Q
    |||||||||      ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  13455895 cattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagc 13455800  T
Q  295 cttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13455799 cttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccac 13455716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 13462036 - 13461657
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13462036 ccctctcatcaacaactataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 13461937  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  13461936 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc 13461837  T
Q  205 cattattcc------gggtcatccggacatccaccca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagc 294  Q
    |||||||||      ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  13461836 cattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagc 13461741  T
Q  295 cttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13461740 cttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccac 13461657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 36750410 - 36750031
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  36750410 ccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtatctttat 36750311  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  36750310 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattggagaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc 36750211  T
Q  205 cattattcc------gggtcatccggacatccaccca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagc 294  Q
    |||||||||      ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||    
T  36750210 cattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaaatatccaaaatagaaatctaattagc 36750115  T
Q  295 cttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36750114 cttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccac 36750031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 57 - 378
Target Start/End: Original strand, 35084893 - 35085222
Alignment:
Q  57 aatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacgg 155  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35084893 aatagggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacgg 35084992  T
Q  156 tatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcccattattcc------gggtcatccggacatccaccca--ttgagtccata 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||      ||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  35084993 tatattggggaccatagcctcttttatattggatagccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccata 35085092  T
Q  247 tcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaat 344  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  35085093 tcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaat 35085188  T
Q  345 agctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35085189 agctaatataattattattacgatatttgcccac 35085222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 57 - 378
Target Start/End: Original strand, 35090866 - 35091195
Alignment:
Q  57 aatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacgg 155  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35090866 aatagggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacgg 35090965  T
Q  156 tatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcccattattcc------gggtcatccggacatccaccca--ttgagtccata 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||      ||| ||||||||||||||| ||  ||||||| |||    
T  35090966 tatattggggaccatagcctcttttatattggatagccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtctata 35091065  T
Q  247 tcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaat 344  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  35091066 tcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaat 35091161  T
Q  345 agctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  35091162 agctaatataattattattacgatatttacccac 35091195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 65 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19879536 - 19879211
Alignment:
Q  65 tagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttt-gccgtgtacggtatattgg 163  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  19879536 tagcggcggctgatttgattcttcttcaatcggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgccgtgtacgatgtattgg 19879437  T
Q  164 ggaccatagcctcttttatatta-----gatggctattaggtttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaact 252  Q
     ||||||| |||||||||| |||     |||||| |||| ||||||||||||||||      ||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||| |    
T  19879436 cgaccataacctcttttatgttatattggatggccattaagtttcccattattccgttaatgggtcatctggacattcactcattgagtcaatatcaatt 19879337  T
Q  253 aattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaata 352  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19879336 aattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattaataaatagctaata 19879237  T
Q  353 taattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||    
T  19879236 tagttattattacgatattttcccac 19879211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 143 - 378
Target Start/End: Original strand, 35439671 - 35439913
Alignment:
Q  143 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccaccca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||      || ||||||||||||||| ||    
T  35439671 ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca 35439770  T
Q  236 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaa 335  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  35439771 ttaagttcatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaatcaaggctcacaa 35439870  T
Q  336 ttgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35439871 ttgataaataacgaatataattattgttacgatatttgcccac 35439913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 63 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 23343493 - 23343180
Alignment:
Q  63 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattg 162  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23343493 gttagcagcggctgatttggttcttcctcaaccgatacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttcccgtgtacggtgtattg 23343394  T
Q  163 gggaccatagcctcttttatattagatggctattaggtttcccattattc------cgggtcatccggacatccacc--cattgagtccatatcaactaa 254  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| || |||||||||       ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |        
T  23343393 gggaccatagcctcttttatattggatggtcattagggtttccattattctgttaatgggtcatccggacatccacctatattgagtccatatcca---- 23343298  T
Q  255 ttaaatatttaattaatta-tccaattagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaata 352  Q
            ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||| |||||    
T  23343297 --------ttaattaattactctaaatagaaatctaataagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctccaaattgataaatagttaata 23343206  T
Q  353 taattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||    
T  23343205 taattattattatgatatttgtccac 23343180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 68 - 291
Target Start/End: Original strand, 11048776 - 11049010
Alignment:
Q  68 cggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagaga----gtttgccgtgtacggtatattgg 163  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| | ||||||    
T  11048776 cggcgactaatttggttcttcctcaactggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttggtttgccgtgtacgatgtattgg 11048875  T
Q  164 ggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcccattattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaatt 256  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11048876 ggaccatagcctcttttatattggatcgccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccagacatccacccattgagtccatatcaactaatt 11048975  T
Q  257 aaatatttaattaattatccaattagaaatctaat 291  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  11048976 aaatatttaattaattatctaatcagaaatctaat 11049010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 214 - 378
Target Start/End: Original strand, 35442211 - 35442375
Alignment:
Q  214 gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatc 313  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35442211 gggtcatccggacatccactcattaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatc 35442310  T
Q  314 actaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35442311 actaatcaatcaaggctcacaattgataaatagcgaatataattattgttacgatatttacccac 35442375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 163 - 371
Target Start/End: Original strand, 7771508 - 7771722
Alignment:
Q  163 gggaccatagcctcttttatattagatggctattaggtttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtcca-tatcaactaat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |      |||||||||||| ||||| ||| ||||||  |||||||||||    
T  7771508 gggaccataacct-ttttatattggatgacgattaggtttcccattattctgttaatgggtcatccggacgtccactcatcgagtcccgtatcaactaat 7771606  T
Q  256 taaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataa 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  7771607 taaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagctttattacttaatttgatcagtaatcaactaagacttacaattgataaatagctaatataa 7771706  T
Q  356 ttattgttacgatatt 371  Q
    ||||||||||||||||    
T  7771707 ttattgttacgatatt 7771722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 804 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 17601020 - 17600832
Alignment:
Q  804 taaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 901  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17601020 taaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 17600922  T
Q  902 ctatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  17600921 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 17600832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 807 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 23901960 - 23901775
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23901960 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 23901862  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23901861 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaccctt 23901775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 799 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 4034781 - 4034590
Alignment:
Q  799 taatataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatcc 896  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4034781 taatataaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatcc 4034683  T
Q  897 atgaactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  4034682 atgaactatcttaaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 4034590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 807 - 994
Target Start/End: Complemental strand, 38997282 - 38997090
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-ta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38997282 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatagacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 38997184  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttatataaa 994  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  38997183 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacaatatataaa 38997090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 807 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 746647 - 746464
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  746647 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaacta 746549  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  746548 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 746464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 805 - 987
Target Start/End: Original strand, 6594456 - 6594643
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594456 aaggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttacccc-aaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 6594554  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  6594555 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 6594643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 807 - 985
Target Start/End: Original strand, 10244582 - 10244765
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10244582 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatatacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 10244680  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  10244681 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 10244765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 822 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 6430637 - 6430471
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6430637 ccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 6430539  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  6430538 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcgaaggtaatctagaaaaaacc 6430471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 823 - 985
Target Start/End: Original strand, 2324907 - 2325072
Alignment:
Q  823 catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-a 921  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2324907 catggaagaatggtgggtaatttatccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa 2325005  T
Q  922 attgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  2325006 attgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 2325072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 807 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 27400584 - 27400399
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27400584 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagctacataagtacatttttaagtggtatccatgaacta 27400486  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27400485 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 27400399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 807 - 990
Target Start/End: Complemental strand, 26710526 - 26710338
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26710526 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacatcagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 26710428  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttata 990  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26710427 tcttgaccccaccaacaaaatgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttata 26710338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 806 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 14660628 - 14660473
Alignment:
Q  806 aggtgacaactagg-tac-catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14660628 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttacacc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 14660530  T
Q  904 atcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14660529 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 14660473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 807 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 45371171 - 45370988
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45371171 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 45371073  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  45371072 tcttgaccccgccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 45370988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 801 - 986
Target Start/End: Original strand, 13815212 - 13815402
Alignment:
Q  801 atataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccat 898  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13815212 atatatggtgacaactagggtacccatgaaagaaaggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccat 13815310  T
Q  899 gaactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  13815311 gaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 13815402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 803 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 34518552 - 34518394
Alignment:
Q  803 ataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatga 900  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34518552 ataaggtgacaactagggtacccatggaagaatagtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatga 34518454  T
Q  901 actatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  34518453 actatcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 34518394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 806 - 985
Target Start/End: Original strand, 27651033 - 27651217
Alignment:
Q  806 aggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27651033 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 27651131  T
Q  904 atcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  27651132 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgggcggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 27651217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 806 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 40635400 - 40635216
Alignment:
Q  806 aggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40635400 aggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 40635302  T
Q  904 atcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  40635301 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaatttacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 40635216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 822 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 10424759 - 10424592
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10424759 ccatggaagaatggtgggtaatttacctc-aaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 10424661  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  10424660 aattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 10424592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 807 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 11185153 - 11184970
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185153 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagtcatataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 11185055  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11185054 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacctaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 11184970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 807 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 32327542 - 32327361
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32327542 ggtgacaactagggtacctatggaagaatgatggataatttaccct-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaacta 32327444  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaa 983  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  32327443 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggctggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 32327361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 807 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 4609807 - 4609653
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4609807 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgttggataatttacccc-aaccaatacacattaggcacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 4609709  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  4609708 tcttgaccccaccaacaaattacttattttcattagttggtgggtaaattacccac 4609653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 807 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 5726310 - 5726128
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-ta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5726310 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccct-aaccaatacacattagccatataaacacatttttaagtggtaaccatgaacta 5726212  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaac 984  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  5726211 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 5726128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 803 - 984
Target Start/End: Original strand, 7892684 - 7892870
Alignment:
Q  803 ataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatga 900  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7892684 ataaggtgacaactagggtatctatggaagaatggtgggtaatttaccca-aaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatga 7892782  T
Q  901 actatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaac 984  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  7892783 actatattgaccccgccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 7892870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 807 - 959
Target Start/End: Original strand, 14697537 - 14697691
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14697537 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccga-ccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 14697635  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  14697636 tcttgatcacaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccac 14697691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 804 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 27024599 - 27024413
Alignment:
Q  804 taaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 901  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27024599 taaggtgacaactagggtacccatggaagaataatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagtcacataatcatatttttaagtggtatccatgaa 27024501  T
Q  902 ctatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  27024500 ctatcttgaccccaccaataaattgctcattttcattggtttgtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 27024413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 805 - 985
Target Start/End: Original strand, 1091949 - 1092134
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1091949 aaggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacatattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaac 1092047  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  1092048 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 1092134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 807 - 986
Target Start/End: Original strand, 37620867 - 37621054
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tac-catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37620867 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtggataatttatcca-aaccaatacacataagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 37620965  T
Q  905 tcttg---accccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    |||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  37620966 tcttgagtaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacct 37621054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 828 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 15925238 - 15925075
Alignment:
Q  828 aagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgc 926  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  15925238 aagaatgatggataatttacctc-aaccaatacacattagctacataagcatatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaataaattac 15925140  T
Q  927 tcattttcattggttagtaggtaaattaccca-cat--tttcaaggtaatctagaaaaaacctta 988  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||| |||  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  15925139 tcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttgaaaggtaatctagaaaaaacctta 15925075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 822 - 983
Target Start/End: Original strand, 33427664 - 33427828
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  33427664 ccatgaaagaatggtgtgtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactatcttgaccccaccaaca 33427762  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaa 983  Q
    |||||||||||||||||||||  | | ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  33427763 aattgctcattttcattggttgatggataaattacccaccattattcaaaggtaatctagaaaaaa 33427828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 807 - 956
Target Start/End: Complemental strand, 11159802 - 11159651
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11159802 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttacccc-atccaatacacaatagccacataaacacatttttaagtggcatccatgaacta 11159704  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacc 956  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11159703 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtaggtaaattacc 11159651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 831 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 32608535 - 32608376
Alignment:
Q  831 aatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-aattgctca 929  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  32608535 aatggtgagtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatacatgaactatcttgacaccaccaacaaattgctca 32608437  T
Q  930 ttttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  32608436 ttttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 32608376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 807 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 32948626 - 32948445
Alignment:
Q  807 ggtgacaactag-gtacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32948626 ggtgacaactagagtacccatagaagaatgatgggtaatttacctc-aaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaact- 32948529  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-cat--tttcaaggtaatctagaaaaaac 984  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||    
T  32948528 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaac 32948445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 823 - 991
Target Start/End: Complemental strand, 40735627 - 40735456
Alignment:
Q  823 catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-a 921  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| | || ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  40735627 catggaagaatgatgggtaatttacctc-aatcaatacacattagccgcataagtacatttttaagtggtatccataaactatcttgaccccaccaacaa 40735529  T
Q  922 attgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttatat 991  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40735528 attgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttatat 40735456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 807 - 959
Target Start/End: Original strand, 2914138 - 2914292
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-ta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2914138 ggtgacaactaggatatccatggaagaatggtgggtaatttacctc-aaccgatacacatcagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 2914236  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  2914237 tcttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccac 2914292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 803 - 959
Target Start/End: Original strand, 32856432 - 32856590
Alignment:
Q  803 ataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatga 900  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32856432 ataaggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttacctc-aaccaatatacattagccacataagcacatttgtaagtggtatccatga 32856530  T
Q  901 actatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  32856531 actatcttgatcccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccac 32856590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 152
Target Start/End: Original strand, 35438925 - 35439014
Alignment:
Q  63 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgta 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35438925 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgta 35439014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 801 - 986
Target Start/End: Original strand, 37255331 - 37255516
Alignment:
Q  801 atataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccat 898  Q
    |||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37255331 atattaggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttatccc-aaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccat 37255429  T
Q  899 gaactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccacattttcaaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||  |||   ||  |||||||||||||||||||||    
T  37255430 gaactatcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaatt--ccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 37255516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 805 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 40037325 - 40037141
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-taccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    ||||||||||||||| ||||   ||| |||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40037325 aaggtgacaactagggtacccatgaaaaatgatgggtaatttacctc-aaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatctatgaact 40037227  T
Q  904 atcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac-att-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  40037226 atcttgaccccaccaacaaattggtcattttcattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 40037141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 831 - 950
Target Start/End: Complemental strand, 9444845 - 9444726
Alignment:
Q  831 aatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-aattgctca 929  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  9444845 aatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccagcaaattgctca 9444747  T
Q  930 ttttcattggttagtaggtaa 950  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  9444746 ttttcattggttggtgggtaa 9444726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 823 - 935
Target Start/End: Complemental strand, 25294998 - 25294886
Alignment:
Q  823 catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-a 921  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25294998 catggaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa 25294900  T
Q  922 attgctcattttca 935  Q
    ||||||||||||||    
T  25294899 attgctcattttca 25294886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 831 - 987
Target Start/End: Original strand, 8432942 - 8433101
Alignment:
Q  831 aatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-aattgctca 929  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  8432942 aatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagtatattttaaagtggtatccatgaactatcttgaccacaccaacaaattgctca 8433040  T
Q  930 ttttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  8433041 ttttcattggttggcaggtaaattatccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacctt 8433101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 863 - 990
Target Start/End: Complemental strand, 42900039 - 42899908
Alignment:
Q  863 attagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-ca 960  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||    
T  42900039 attagccacataagcgcatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattaccaacca 42899940  T
Q  961 tt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttata 990  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  42899939 ttcttcgaaggtaatctagaaaaaaccatata 42899908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 232 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 29832968 - 29832878
Alignment:
Q  232 cccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaa 322  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29832968 cccattgagtccatatcaattaattaaatatttaattaattatccaattaaaagtctaatagtcttattacttaattttatcactaatcaa 29832878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 822 - 938
Target Start/End: Complemental strand, 1229791 - 1229675
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  1229791 ccatggaagaatggtgggtaatttatccc-aaccaatatatattagccagataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccatcaaca 1229693  T
Q  921 aattgctcattttcattg 938  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  1229692 aattgttcattttcattg 1229675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 848 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 12842242 - 12842130
Alignment:
Q  848 ccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtag 946  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| || |    
T  12842242 ccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaattggtatccaagaactatcttgactccaccaacaaattactcattttcattggttggtgg 12842143  T
Q  947 gtaaattacccac 959  Q
     ||||||||||||    
T  12842142 ataaattacccac 12842130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 848 - 958
Target Start/End: Complemental strand, 41172597 - 41172486
Alignment:
Q  848 ccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtag 946  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||| || |    
T  41172597 ccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtacctttgaactatcttgacctcaccaataaattactcattttcattggttggtgg 41172498  T
Q  947 gtaaattaccca 958  Q
    ||||||||||||    
T  41172497 gtaaattaccca 41172486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 807 - 913
Target Start/End: Original strand, 447633 - 447740
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  447633 ggtgacaactagggtacccatggatgaatggtgggtaatttatccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatacatgaacta 447731  T
Q  905 tcttgaccc 913  Q
    |||||||||    
T  447732 tcttgaccc 447740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 848 - 916
Target Start/End: Original strand, 28014860 - 28014928
Alignment:
Q  848 ccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccac 916  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28014860 ccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccac 28014928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 825 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 12827223 - 12827137
Alignment:
Q  825 tggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccc 913  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  12827223 tggaaaaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtat-catgaactatcttaaccc 12827137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 822 - 991
Target Start/End: Complemental strand, 39103200 - 39103039
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-c 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||           ||| |||||||||| ||||||||| |||      
T  39103200 ccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactattttgaccccatcaata 39103113  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaaccttatat 991  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||    
T  39103112 aattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaaccttatat 39103039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 284 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 23283955 - 23283860
Alignment:
Q  284 aatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23283955 aatctaataagccttattacttaatttgatcactaatcaattaagactccaaattgataaataactaatataattattattacgatatttgtccac 23283860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 807 - 987
Target Start/End: Original strand, 12333497 - 12333669
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-taccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 905  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||           ||| ||||||||||    
T  12333497 ggtgacaactaggctaccatgaaagaatgatgggtaatttaccc--aaccaatacacattagccacataagcaca-----------tatacatgaactat 12333583  T
Q  906 cttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  12333584 cttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 12333669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 804 - 986
Target Start/End: Original strand, 21734897 - 21735073
Alignment:
Q  804 taaggtgacaactagg-tac-catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 901  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||           ||| ||||||    
T  21734897 taaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttacctc-aaccaatatacattagccacataagcaca-----------tattcatgaa 21734984  T
Q  902 ctatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||   |||||||| ||||||||||||    
T  21734985 ctatcttgacccccccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacct 21735073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 881 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 35126886 - 35126778
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac--attttc-aaggtaatcta 976  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||   ||||| |||||||||||    
T  35126886 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccgtttttcaaaggtaatcta 35126787  T
Q  977 gaaaaaacc 985  Q
    |||||||||    
T  35126786 gaaaaaacc 35126778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 881 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 44481934 - 44481826
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatcta 976  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  44481934 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 44481835  T
Q  977 gaaaaaacc 985  Q
    |||||||||    
T  44481834 gaaaaaacc 44481826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 805 - 959
Target Start/End: Original strand, 13543622 - 13543767
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||           |||||||    
T  13543622 aaggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccct-aaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaac 13543709  T
Q  903 tatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13543710 tatcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtaggtaaattacccac 13543767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 807 - 959
Target Start/End: Original strand, 35158050 - 35158193
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||           |||||||||    
T  35158050 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagtcacataagcacatatt-----------catgaacta 35158137  T
Q  905 tcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  35158138 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 35158193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 908 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 12814693 - 12814609
Alignment:
Q  908 tgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctta 988  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  12814693 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 12814609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 224 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 31651402 - 31651318
Alignment:
Q  224 gacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatt 308  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||| |  |||||||||||||    
T  31651402 gacatcgactcattgagtccatatcaattaattaaatatttaattaattatctacataaaaatctaattgatttattacttaatt 31651318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 29034759 - 29034697
Alignment:
Q  64 ttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagat 126  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29034759 ttagcggtggctgatttgattcttcctcaactggtacctttatgtctcaagttctcttcagat 29034697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 896 - 985
Target Start/End: Original strand, 28641371 - 28641464
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  28641371 catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 28641464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 807 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 29687211 - 29687068
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||| ||           |||||||||    
T  29687211 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccat-aaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 29687124  T
Q  905 tcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  29687123 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 29687068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 807 - 959
Target Start/End: Original strand, 39301197 - 39301340
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-ta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||| ||           |||||||||    
T  39301197 ggtgacaactaggctatccatgaaagaatgatggataatttaccct-aaccaatacacattagtcatataagcacatatt-----------catgaacta 39301284  T
Q  905 tcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  39301285 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 39301340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 822 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 145435 - 145309
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 921  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||           |||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  145435 ccatgaaagaatgatgggtaatttatccc-aaccaatacacattagccacataagcac-----------gtattcatgaactatcttgaccccacaaata 145348  T
Q  922 a-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    | ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  145347 aattgctcattttcattggttggtggataaattacccac 145309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 822 - 955
Target Start/End: Complemental strand, 3711786 - 3711664
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 921  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||           ||||||||||||||||||||| || |    
T  3711786 ccatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccgcataagcacatatt-----------catgaactatcttgaccccacaaata 3711699  T
Q  922 a-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattac 955  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  3711698 aattgctcattttcattgattggtaggtaaattac 3711664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 822 - 959
Target Start/End: Original strand, 19428443 - 19428569
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccacca-ac 920  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||           ||| ||||||||||||||||||||| |       
T  19428443 ccatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactatcttgaccccacaagta 19428530  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  19428531 aattgctcattttcattggtcggtgggtaaattacccac 19428569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 822 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 27331455 - 27331325
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 921  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||| | ||       | |||||||||||||||||| || || |    
T  27331455 ccatgaaagaatgatggataatttacccc-aactaatacatattagccacataagcacatatata-------ttcatgaactatcttgaccctacaaata 27331364  T
Q  922 a-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    | ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  27331363 aattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccac 27331325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 822 - 985
Target Start/End: Original strand, 43898988 - 43899142
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 921  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||           ||||||||||||||||||||  || |    
T  43898988 ccatgaaagaatgatgggtaatttaccc--aaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgaccccataaata 43899074  T
Q  922 a-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    | ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||   |||||||| |||||||||||    
T  43899075 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacc 43899142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 848 - 959
Target Start/End: Original strand, 27764904 - 27765005
Alignment:
Q  848 ccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtag 946  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||           |||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||| || |    
T  27764904 ccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactattttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgg 27764992  T
Q  947 gtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||||    
T  27764993 gtaaattacccac 27765005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 891 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 30545917 - 30545848
Alignment:
Q  891 gtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||    
T  30545917 gtatccacgaactatcttgaccccaccaataagttgctcatttttattgtttggtaggtaaattatccac 30545848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 896 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 3266387 - 3266323
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  3266387 catgaactatcttgaccccataaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 3266323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 897 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 12730151 - 12730059
Alignment:
Q  897 atgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  12730151 atgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 12730059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 900 - 955
Target Start/End: Complemental strand, 34249352 - 34249296
Alignment:
Q  900 aactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattac 955  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34249352 aactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtaggtaaattac 34249296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 804 - 881
Target Start/End: Original strand, 2688726 - 2688804
Alignment:
Q  804 taaggtgacaactagg-ta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacat 881  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2688726 taaggtgacaactaggctatccatgaaagaatgatgagtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacat 2688804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 896 - 987
Target Start/End: Original strand, 40544155 - 40544250
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| || |||||| || ||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  40544155 catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaactatccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 40544250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 849 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 4258616 - 4258517
Alignment:
Q  849 cccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtagg 947  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||           |||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||| || ||    
T  4258616 cccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgaccc-acaaataaattgctcattttcattggttggtggg 4258529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 319
Target Start/End: Original strand, 8342606 - 8342671
Alignment:
Q  255 ttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaat 319  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  8342606 ttaaacatataattaattatctaattagaaatctaattaatcttattatttaatttgatcactaat 8342671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 897 - 989
Target Start/End: Original strand, 2000417 - 2000513
Alignment:
Q  897 atgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttat 989  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  2000417 atgaactattttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaaccttat 2000513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28765508 - 28765369
Alignment:
Q  75 tgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcc 174  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||| ||  | ||||| | |  ||||| |||||| ||| || | |||||||| |||    
T  28765508 tgatttggttcttcctcaataggtaccttgatgcctcaaattctcttcggaatgagagaatataatgtttgtcgtgtatggtgtaat-gggaccattgcc 28765410  T
Q  175 tcttttatattagatggctattag-gtttcccattattccg 214  Q
    |||||||||||  || || ||||| |||| |||||||||||    
T  28765409 tcttttatattgaatcgccattagagttttccattattccg 28765369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 28765311 - 28765248
Alignment:
Q  267 ttaattatccaattagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggc 329  Q
    |||||||||||| || |||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  28765311 ttaattatccaaataaaaatataattagccttatcatttaatttgatcactaatcaattaaggc 28765248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 29833142 - 29833079
Alignment:
Q  63 gttagcggcggctga-tttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 125  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  29833142 gttagcggcggctaaatttggttcttcctcaaccgatacatttatccttcaagttctcttcaga 29833079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 805 - 846
Target Start/End: Complemental strand, 42900837 - 42900795
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactaggtac-catggaagaatggtggataattta 846  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  42900837 aaggtgacaactaggtacacatggaagaatggtgggtaattta 42900795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 896 - 941
Target Start/End: Complemental strand, 43356187 - 43356141
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggtt 941  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  43356187 catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggtt 43356141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 89)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Original strand, 28525550 - 28525928
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28525550 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagtcagcggtggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttat 28525649  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttccc 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  28525650 gcctcacgttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttccc 28525749  T
Q  206 attattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttat 299  Q
    ||||||||      ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28525750 attattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaacagccttat 28525849  T
Q  300 tacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28525850 tacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatattttcccac 28525928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Original strand, 28531646 - 28532024
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  28531646 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagtcagcggtggctgatttgattcttcctcaaccagtacctttat 28531745  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttccc 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  28531746 gcctcacgttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtatattggagaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttccc 28531845  T
Q  206 attattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttat 299  Q
    |||||||||      || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28531846 attattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaacagccttat 28531945  T
Q  300 tacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28531946 tacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatattttcccac 28532024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 11 - 378
Target Start/End: Original strand, 7389713 - 7390090
Alignment:
Q  11 ctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7389713 ctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgc 7389812  T
Q  109 ctcaagttctcttcagatggggagaagagagag-tttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattag-gtttccca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  7389813 ctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgccgtgtacagtatattgggaaccatagcctcttttatattggatggccattagagtttccca 7389912  T
Q  207 ttattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttatt 300  Q
    |||||||      |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7389913 ttattccgttaatgggtcatccgaacatccactcattaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttatt 7390012  T
Q  301 acttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  7390013 acttaatttgatcactaatcaactaagactcacaattgataaatagctaatataattatcgttacgatattttcccac 7390090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 41297278 - 41296896
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41297278 ccctctcatcaacaacgataaccaaggagaggaggtgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 41297179  T
Q  107 gcctcaagt---tctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tt 201  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||    
T  41297178 gcctcaagtagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtt 41297079  T
Q  202 tcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagcc 295  Q
    ||||||||||| |      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41297078 tcccattattctgttaatgggtcatccggacatccactcattgagtccatatcaattaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagcc 41296979  T
Q  296 ttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41296978 ttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccac 41296896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Original strand, 12686343 - 12686721
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12686343 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 12686442  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttccc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  12686443 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatatttgatggccattagggtttccc 12686542  T
Q  206 attattcc------gggtcatccggacatccaccca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagcc 295  Q
    ||||||||      ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  12686543 attattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagcc 12686638  T
Q  296 ttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12686639 ttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccac 12686721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Original strand, 12692445 - 12692823
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12692445 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 12692544  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttccc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  12692545 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatatttgatggccattagggtttccc 12692644  T
Q  206 attattcc------gggtcatccggacatccaccca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagcc 295  Q
    ||||||||      ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  12692645 attattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagcc 12692740  T
Q  296 ttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12692741 ttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccac 12692823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 378
Target Start/End: Original strand, 32097193 - 32097564
Alignment:
Q  16 atcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32097193 atcaacaacgataaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaa 32097292  T
Q  114 gttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcccattatt 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  32097293 gttctcttcagatggggagaatagagagtatttccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattatt 32097392  T
Q  212 cc------gggtcatccggacatccaccca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaatagccttattac 302  Q
    ||      ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||||   |||||||     
T  32097393 ccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagcttattat 32097488  T
Q  303 ttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32097489 ttaatttgatcactaaccaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccac 32097564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 378
Target Start/End: Original strand, 32094392 - 32094764
Alignment:
Q  16 atcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaa 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32094392 atcaacaacaataaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctaatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaa 32094491  T
Q  114 gttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcccattatt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  32094492 gttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtatttgggaccatagcctcttttatattagatggccattagggtttcccattatt 32094591  T
Q  212 cc------gggtcatccggacatccaccca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttatta 301  Q
    ||      ||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  32094592 ccgttaatgggccatccggacatacactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagccttatta 32094687  T
Q  302 cttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32094688 cttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagttaatataattattattacgatatttgcccac 32094764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 64 - 378
Target Start/End: Original strand, 30384607 - 30384926
Alignment:
Q  64 ttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattgg 163  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  30384607 ttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccggtacctttatacctcgagttctcttcagatggggagaagagaatgtttgccgtgtacggtgtattgg 30384706  T
Q  164 ggaccatagcctcttttatattagatggctattaggtttcccattattccgg------gtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaatta 257  Q
    | ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||       ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| | |||| |    
T  30384707 g-accatagtctcttttatattggatgactattagattttccattattccgttaatgagtcatccagacatccactcattgaatccatatctattaatga 30384805  T
Q  258 aatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataatt 357  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  30384806 aatatttaattaattatctaattagaaatccaatagccttattacttaatttaatcactaatcaattaaggctcacaactgataaatagctaatataatt 30384905  T
Q  358 attgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||| |||| ||||||| ||||    
T  30384906 attattacaatatttgtccac 30384926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 63 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20500078 - 20499760
Alignment:
Q  63 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttt-gccgtgtacggtatatt 161  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  20500078 gttagcagcggttgatttggttcttccttaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcaaatggagagaacagagagttttgccgtgtacggtgtatt 20499979  T
Q  162 ggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaa 254  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||| ||| |||||||| ||      || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  20499978 ggggaccatagcctcttatttattggatgaccattagggttttccattatttcgttaatgggccatccagacatccactcattgagtccatatcaattaa 20499879  T
Q  255 ttaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatata 354  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  20499878 ttaaatatttaattaattatcttactagaaatctaatagtcttattacttaatttgatcactaatcaattaagactcacaattgataaatagctaatata 20499779  T
Q  355 attattgttacgatatttg 373  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  20499778 attattattacgatatttg 20499760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 63 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 30772221 - 30771900
Alignment:
Q  63 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattg 162  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||    
T  30772221 gttagcggcggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgtcgtgtctgatatattg 30772122  T
Q  163 gggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccat--tgagtccatatcaacta 253  Q
     ||||||||| ||||| |||||| ||||   || ||| |||  |||||||| |      |||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  30772121 tggaccatagtctcttctatattggatgatcatcagggtttttcattattctgttaatgggtcatccagacatccactcatattgagtccatatcaacta 30772022  T
Q  254 attaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatat 353  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||   |||||||||    
T  30772021 attaattatttaattaattatccaataagaaactttatagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaactgata---agctaatat 30771925  T
Q  354 aattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  30771924 aattattattacgatatttgcccac 30771900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 63 - 378
Target Start/End: Original strand, 19059991 - 19060316
Alignment:
Q  63 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattg 162  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||  | | |||||    
T  19059991 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaactggtacttttatgcctcaagttctcttcatatcgggagaagagagagtttgtcgtgtctgatgtattg 19060090  T
Q  163 gggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcccattattcc------gggtcatccggacatccaccc--attgagtccatatcaacta 253  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||      ||| ||||| ||||||||| |  |||||||||||||| | ||    
T  19060091 gggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggacatccagacatccactcatattgagtccatatccatta 19060190  T
Q  254 attaaatatttaattaattatccaattagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaata 352  Q
    ||||| || |||||||||  || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |  |||||| ||||||||||||    
T  19060191 attaattaattaattaatattctaaatagaaatctaataagccttattacttaatttgatcactaatcaattaagtctccaaattgacaaatagctaata 19060290  T
Q  353 taattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||| |   |||||||||||||    
T  19060291 taattattatggagatatttgcccac 19060316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 32 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14610141 - 14609909
Alignment:
Q  32 aaagagaggtgatgatctgacaca--caatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg 129  Q
    ||||||||| |||||||||| |||  ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14610141 aaagagaggagatgatctgaaacaaacaaaagggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacttttatgcctaaagttctcttcagatggg 14610042  T
Q  130 gagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattaggtttcccattattcc------gggtcatccg 223  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| || ||||||||||      ||| ||||||    
T  14610041 gagaaaagaaagtttgccgtgttcggtgtattggggaccataacctcttttacattagatgaccattagggtttccattattccgttaatgggccatccg 14609942  T
Q  224 gacatccacccattgagtccatatcaactaatt 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14609941 gacatccactcattgagtccatatcaattaatt 14609909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 807 - 989
Target Start/End: Complemental strand, 24253564 - 24253377
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24253564 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 24253466  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttat 989  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24253465 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttat 24253377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 808 - 983
Target Start/End: Original strand, 15398483 - 15398663
Alignment:
Q  808 gtgacaactag-gtacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 905  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15398483 gtgacaactagagtacctatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 15398581  T
Q  906 cttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaa 983  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15398582 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 15398663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 822 - 987
Target Start/End: Original strand, 43326396 - 43326564
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43326396 ccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataggcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 43326494  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  43326495 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 43326564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 378
Target Start/End: Original strand, 19066332 - 19066650
Alignment:
Q  63 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattg 162  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  19066332 gttagcggcagctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgtcgtgtccggtgtattg 19066431  T
Q  163 gggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcccattattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaat 255  Q
    ||||||| | ||| ||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||| |      ||||||||| ||||||||| |||  | |||||||| | ||||    
T  19066432 gggaccacaacctattttatattggatggtcattagggttttccattatttcgttaatgggtcatccagacatccactcatata-tccatatccattaat 19066530  T
Q  256 taaatatttaattaattatccaattagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatata 354  Q
    |||    | |||||||  || || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |   ||||| |||||  |||||||    
T  19066531 taa----tcaattaatattctaaatagaaatctaataagccttgttacttaatttgatcactaatcaattaaggctccagattgacaaataattaatata 19066626  T
Q  355 attattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||| |   |||||||||||||    
T  19066627 attattatggagatatttgcccac 19066650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 828 - 986
Target Start/End: Original strand, 3466704 - 3466865
Alignment:
Q  828 aagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-aattgc 926  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3466704 aagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgc 3466802  T
Q  927 tcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3466803 tcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 3466865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 824 - 990
Target Start/End: Complemental strand, 15683954 - 15683785
Alignment:
Q  824 atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-aa 922  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15683954 atggaagaatggtggataatttacccc-aaccaatacacattagccatataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaa 15683856  T
Q  923 ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttata 990  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15683855 ttgctcattttcattggttggtgggtaaattacacatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaactttata 15683785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 806 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 35626221 - 35626037
Alignment:
Q  806 aggtgacaactag-gtacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35626221 aggtgacaactagagtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 35626123  T
Q  904 atcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  35626122 atcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 35626037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 806 - 988
Target Start/End: Original strand, 43262182 - 43262369
Alignment:
Q  806 aggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43262182 aggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 43262280  T
Q  904 atcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctta 988  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  43262281 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtaggttaattacccaccattcttcaaaggtaatatagaaaaaacctta 43262369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 822 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 27939062 - 27938925
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27939062 ccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 27938964  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  27938963 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 27938925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 822 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 6901964 - 6901796
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  6901964 ccatggaagaatggtgggtaatttacctc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaactatcttgaccccaccaaca 6901866  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  6901865 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacctt 6901796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 822 - 983
Target Start/End: Original strand, 18479685 - 18479849
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  18479685 ccatagaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactattttgaccccaccaaca 18479783  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaa 983  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18479784 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 18479849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 806 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 39932762 - 39932578
Alignment:
Q  806 aggtgacaactag-gtacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39932762 aggtgacaactagagtacccatggaagaatggttggtaatttacctc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 39932664  T
Q  904 atcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  39932663 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 39932578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 807 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 5185154 - 5184971
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5185154 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgagtaatttacccc-aatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaacta 5185056  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  5185055 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 5184971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 822 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 7722214 - 7722047
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7722214 ccatggaagaatggtgggtaatttaccca-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 7722116  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  7722115 aattgctcattttcattggttggtgagtaaattacccaccattcttcaaaggcaatctagaaaaaacct 7722047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 822 - 985
Target Start/End: Original strand, 40886045 - 40886210
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40886045 ccatggaagaatggtgggtaatttaccct-aaccaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 40886142  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  40886143 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 40886210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 822 - 990
Target Start/End: Complemental strand, 25831685 - 25831515
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  25831685 ccatgaaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaattggtatccatgaactat-ttgaccccaccaaca 25831588  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttata 990  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25831587 aattgcttattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttata 25831515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 806 - 987
Target Start/End: Original strand, 739703 - 739889
Alignment:
Q  806 aggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  739703 aggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttatccc-aaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 739801  T
Q  904 atcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  739802 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 739889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 807 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 12648979 - 12648825
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-ta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12648979 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 12648881  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  12648880 tcttaaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccac 12648825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 822 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 31939062 - 31938925
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31939062 ccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagtcatataaacacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 31938964  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  31938963 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 31938925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 797 - 988
Target Start/End: Original strand, 27501045 - 27501241
Alignment:
Q  797 tttaatataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtat 894  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27501045 tttaatacatggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaac-aatacacattagccacataagcacatttttaagtggtat 27501143  T
Q  895 ccatgaactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctta 988  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || | ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27501144 ccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacctta 27501241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 824 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 5137878 - 5137713
Alignment:
Q  824 atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-aa 922  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  || ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5137878 atggaagaatggtggataatttactca-aatcaatacatattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaa 5137780  T
Q  923 ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  5137779 ttgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 5137713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 803 - 950
Target Start/End: Original strand, 29789291 - 29789440
Alignment:
Q  803 ataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatga 900  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29789291 ataaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatccc-aaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatga 29789389  T
Q  901 actatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaa 950  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  29789390 actatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaa 29789440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 805 - 986
Target Start/End: Original strand, 28424793 - 28424977
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactag-gta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28424793 aaggtgacaactagagtatccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaac 28424891  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac-at--tttcaaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||  | | |||||||||||| ||  ||  |||||||||||||||||||||    
T  28424892 tatcttgaccccaccaacaaattg--cattttcattggttgatggataaattacccactatccttcaaaggtaatctagaaaaaacct 28424977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 238 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14609888 - 14609752
Alignment:
Q  238 gagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaatt 337  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14609888 gagtccatatcaattaattaaatgtttaattaattatcttactagaaatctaatagttttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaatt 14609789  T
Q  338 gataaatagctaatataattattgttacgatatttgc 374  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14609788 gataagtaactaatataattattattacgatatttgc 14609752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 807 - 959
Target Start/End: Original strand, 2484292 - 2484446
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2484292 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttactcc-aaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtagtatccatgaacta 2484390  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  2484391 tcttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccac 2484446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 807 - 959
Target Start/End: Original strand, 13504742 - 13504896
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-ta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13504742 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtggataatttatccc-aactaatacatattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 13504840  T
Q  905 tcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  13504841 tcttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccac 13504896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 808 - 985
Target Start/End: Original strand, 27278474 - 27278660
Alignment:
Q  808 gtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaa---- 901  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||        
T  27278474 gtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatatacattagccacgtaagcacatttttaagtggtatccatgaattat 27278572  T
Q  902 ctatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  27278573 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 27278660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 807 - 941
Target Start/End: Complemental strand, 34451432 - 34451296
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-ta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34451432 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 34451334  T
Q  905 tcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggtt 941  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  34451333 tattgaccccaccaataaattgctcattttcattggtt 34451296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 823 - 959
Target Start/End: Original strand, 40278876 - 40279012
Alignment:
Q  823 catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-a 921  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| | | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  40278876 catggaagaatgatgggtaatttatctc-aatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaattatgttgaccccaccaacaa 40278974  T
Q  922 attgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  40278975 attgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 40279012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 241 - 365
Target Start/End: Original strand, 8706792 - 8706916
Alignment:
Q  241 tccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgat 340  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  8706792 tccatatcaattaattaaatatttaataaattatctaattagaaatttaatcgtcttatcacttaatttgatcactaatcaattaagacccacagttgat 8706891  T
Q  341 aaatagctaatataattattgttac 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  8706892 aaatagctaatataattattattac 8706916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 823 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 40110397 - 40110262
Alignment:
Q  823 catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-a 921  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  40110397 catggaagaatggtagataatttaccct-aactaatatacattaaccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactatcttga-cccaccaacaa 40110300  T
Q  922 attgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  40110299 attgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 40110262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 798 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 891096 - 890902
Alignment:
Q  798 ttaatataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatc 895  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  891096 ttaatattaggtgacaattaggatacccatggaagaatggtaggtaatttaccct-aaccaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtatc 890999  T
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac-att-ttcaag-gtaatctagaaaaaacctta 988  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||| || | ||||||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  890998 catgaactatcttgactcgaccaacaaattgctcattttcattagttggtggataaattatccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaacctta 890902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 804 - 959
Target Start/End: Original strand, 38756484 - 38756642
Alignment:
Q  804 taaggtgacaactagg-tacc-atgg-aagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatga 900  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||| ||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38756484 taaggtgacaactagggtacctatgggaagaattgtgggtaatttatctc-aactaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatga 38756582  T
Q  901 actatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  || || ||||||||||||||    
T  38756583 actatcttgatcccaccaacaaattgctcattttcatttattggtgggtaaattacccac 38756642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 804 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 763908 - 763751
Alignment:
Q  804 taaggtgacaactag-gta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 901  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  763908 taaggtgacaactagagtatccatcaaagaatgatgggtaatttacccc-aactaatacatattagccacataagtacatttttaagtgatatccatgaa 763810  T
Q  902 ctatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||||| ||  |||||||||||||    
T  763809 ctatcttaactccaccaacaaattactcatttttattggttggtgagtaaattacccac 763751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 824 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 4149847 - 4149691
Alignment:
Q  824 atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-aa 922  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||          | ||||||||||| ||    
T  4149847 atggaagaatggtgagtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatcca----------taaccccaccaacaaa 4149759  T
Q  923 ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  4149758 ttgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatatagaaaaaacctt 4149691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 848 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 40632630 - 40632498
Alignment:
Q  848 ccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtag 946  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  40632630 ccccaaccaatacacattagccacataagcacc---------ggtatccatgaactatcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgg 40632540  T
Q  947 gtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  40632539 gtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 40632498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 805 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 33617758 - 33617584
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tac-catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||           |||||||    
T  33617758 aaggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgagtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaac 33617671  T
Q  903 tatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||    
T  33617670 tatcttgaccccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacc 33617584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 183
Target Start/End: Original strand, 26318492 - 26318599
Alignment:
Q  75 tgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcc 174  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||||||| |||||||    
T  26318492 tgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttctcttcagatggg-agaagagagagtttgtcgtttccgatatattggggatcatagcc 26318590  T
Q  175 tcttttata 183  Q
    |||| ||||    
T  26318591 tcttatata 26318599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 877 - 988
Target Start/End: Original strand, 12558090 - 12558204
Alignment:
Q  877 cacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaa 972  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||| ||| |||||||    
T  12558090 cacatttttaagtggtatc-atgaactatcttgaccacatcaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaa 12558188  T
Q  973 tctagaaaaaacctta 988  Q
    ||||||||||||||||    
T  12558189 tctagaaaaaacctta 12558204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 807 - 989
Target Start/End: Complemental strand, 19295901 - 19295725
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||           || |||||||||    
T  19295901 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacat-----------atacatgaacta 19295814  T
Q  905 tcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaaccttat 989  Q
    |||| ||||||| || || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||    
T  19295813 tcttaaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaaccttat 19295725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26509781 - 26509674
Alignment:
Q  69 ggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggacc 168  Q
    ||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  26509781 ggcggctgatttgatacttcctcaatcggtacctttatgcctctagttctcatcagat--ggaaaagggagagtttaccgtgtacggtatatcgtggacc 26509684  T
Q  169 atagcctctt 178  Q
    ||| ||||||    
T  26509683 ataacctctt 26509674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 796 - 959
Target Start/End: Original strand, 38015503 - 38015657
Alignment:
Q  796 atttaatataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggta 893  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||           ||    
T  38015503 atttaaaataaggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcaca-----------ta 38015590  T
Q  894 tccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  38015591 ttcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccac 38015657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 881 - 987
Target Start/End: Original strand, 36472348 - 36472458
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatcta 976  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||| || | ||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  36472348 ttttaaagtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtggataaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 36472447  T
Q  977 gaaaaaacctt 987  Q
    |||||||||||    
T  36472448 gaaaaaacctt 36472458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 889 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 2585561 - 2585461
Alignment:
Q  889 tggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaac 984  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  2585561 tggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaac 2585462  T
Q  985 c 985  Q
    |    
T  2585461 c 2585461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 805 - 985
Target Start/End: Original strand, 23195246 - 23195420
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||||||  || |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||           |||||||    
T  23195246 aaggtgacaactaggctacccatgaaagaatgacgggtaatttactcc-aaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaac 23195333  T
Q  903 tatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-cat--tttcaaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||||||||    
T  23195334 tatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatttagaaaaaacc 23195420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 880 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 5120132 - 5120053
Alignment:
Q  880 atttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  5120132 atttttaagtggtatc-atgaactatcttgaccctaccaataaattggtcattttcattggttggtgggtaaattacccac 5120053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 807 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 27503550 - 27503376
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||           |||||||||    
T  27503550 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 27503463  T
Q  905 tcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  27503462 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 27503376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 822 - 959
Target Start/End: Original strand, 42658679 - 42658805
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 921  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||           ||||||||||||||||||||| || |    
T  42658679 ccatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcatatatt-----------catgaactatcttgaccccacaaata 42658766  T
Q  922 a-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  42658767 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 42658805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 795 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 13957853 - 13957668
Alignment:
Q  795 tatttaatataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggt 892  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||| ||| ||            
T  13957853 tattaaatataaggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacctc-aaccaatacacattagtcacataagcgcatatt-------- 13957763  T
Q  893 atccatgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
       ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  13957762 ---catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 13957668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 807 - 983
Target Start/End: Original strand, 31293989 - 31294170
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||  ||| |   || |||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  31293989 ggtgacaactagggtacccatgtaagaatggtgggtaatttactcc-aaccaataaccatcaatcacgtaagcatatttttaagtggtattcatggacta 31294087  T
Q  905 tcttgaccccaccaacaatt-gctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-cat--tttcaaggtaatctagaaaaaa 983  Q
     |  ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||  ||| ||||||||||||||||||    
T  31294088 cccggaccctaccaataatttgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaa 31294170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 822 - 985
Target Start/End: Original strand, 36365462 - 36365617
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 921  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||           ||||||||||||||||||||| || |    
T  36365462 ccatgaaagaatgatggctaatttacctc-aaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgaccccacaaata 36365549  T
Q  922 a-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    | ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  36365550 aattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 36365617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 822 - 959
Target Start/End: Original strand, 3656585 - 3656711
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 921  Q
    ||||| ||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||           ||||||||||||||||||||  || |    
T  3656585 ccatgaaagaatgatgagtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgaccccaaaaata 3656672  T
Q  922 a-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  3656673 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 3656711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 805 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 5497446 - 5497301
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||           ||| |||||||    
T  5497446 aaggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatccc-aaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaac 5497359  T
Q  903 tatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||| |||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  5497358 tattttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccac 5497301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 214
Target Start/End: Original strand, 33753476 - 33753606
Alignment:
Q  84 tcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttata 183  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| || || ||| ||||| |||||||| |    
T  33753476 tctttctcaaacggtatttttatgcctcaagttctccttggatggggagaagagagagtatggtgtgtacggtgtactgaggaacataggctctttta-a 33753574  T
Q  184 ttagatggctatta-ggtttcccattattccg 214  Q
    |  |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  33753575 tatgatggtcattagggtttcccattattccg 33753606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 806 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 27390769 - 27390633
Alignment:
Q  806 aggtgacaactagg-tac-catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||           ||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  27390769 aggtgacaactagggtactcatggaagaatggtggataatttacccc-aaccaatgaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaact 27390682  T
Q  904 atcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaa 951  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||| || ||||||    
T  27390681 atcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaa 27390633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 807 - 953
Target Start/End: Complemental strand, 38492783 - 38492647
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-taccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 905  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||           ||| ||||||||||    
T  38492783 ggtggcaactaggctaccatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagtcacataagcaca-----------tattcatgaactat 38492696  T
Q  906 cttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaatt 953  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  38492695 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaatt 38492647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 889 - 986
Target Start/End: Original strand, 38637982 - 38638083
Alignment:
Q  889 tggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaac 984  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||| | ||||||| || | ||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  38637982 tggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattactcattatgattggttggtggataaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaac 38638081  T
Q  985 ct 986  Q
    ||    
T  38638082 ct 38638083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 900 - 986
Target Start/End: Original strand, 42247865 - 42247955
Alignment:
Q  900 aactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  42247865 aactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 42247955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 896 - 985
Target Start/End: Original strand, 9424671 - 9424764
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  9424671 catgaactatcttgaccccacaaataaattactcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 9424764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 881 - 985
Target Start/End: Original strand, 24167848 - 24167956
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatcta 976  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| | ||| | ||||||| || | ||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  24167848 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgtttattatgattggttggtggataaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 24167947  T
Q  977 gaaaaaacc 985  Q
    |||||||||    
T  24167948 gaaaaaacc 24167956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 269 - 358
Target Start/End: Original strand, 26318676 - 26318765
Alignment:
Q  269 aattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataatta 358  Q
    ||||||| || || |||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||| | || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  26318676 aattatctaaataaaaatctaatatctttattaattaatttaatcactaatcaattaagtctcagaattgatagataactaatataatta 26318765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 804 - 878
Target Start/End: Original strand, 612754 - 612830
Alignment:
Q  804 taaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagca 878  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  612754 taaggtgacaactaggatacccatggaagaatactgagtaatttactcccaaccaatacacattagccacataagca 612830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 896 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 6973155 - 6973091
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  6973155 catgaactatcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccac 6973091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 896 - 959
Target Start/End: Original strand, 9374581 - 9374645
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  9374581 catgaactatcttgaccccataaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 9374645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 900 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 14972066 - 14972006
Alignment:
Q  900 aactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14972066 aactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 14972006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 823 - 959
Target Start/End: Original strand, 36948508 - 36948631
Alignment:
Q  823 catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa 922  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||           |||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  36948508 catgcaagaatggtgggtaatttaccct--accaatacacattagccacataagcacat-----------atccatgaactatctt-accctaccaataa 36948593  T
Q  923 -ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
     ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  36948594 attgctcattttcattggttggtgggtaaattatccac 36948631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 888 - 986
Target Start/End: Original strand, 1402576 - 1402678
Alignment:
Q  888 gtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaa 983  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||||| | ||||||| || | ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  1402576 gtggtatccataaactatcttgatcccaccaataaattactcattatgattggttggtggataaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 1402675  T
Q  984 cct 986  Q
    |||    
T  1402676 cct 1402678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 822 - 881
Target Start/End: Original strand, 33623956 - 33624014
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacat 881  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  33623956 ccattgaaaaatggtggataatttacccc-aaccgatacacattagccacataagcacat 33624014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 828 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 6207032 - 6206912
Alignment:
Q  828 aagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgc 926  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||           ||| |||||||||| |||||||| | ||  ||||||    
T  6207032 aagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactattttgaccccccaaataaattgc 6206945  T
Q  927 tcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  6206944 tcattttaattggttggtgggtaaattacccac 6206912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 881 - 986
Target Start/End: Original strand, 18327237 - 18327346
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatcta 976  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||| |||| | ||||||| || ||||||||| ||| ||||||   ||| |||||||    
T  18327237 tttttaggtggtatccataaactatcttgactccaccaataaattgcgcattataattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaagataatcta 18327336  T
Q  977 gaaaaaacct 986  Q
    ||||||||||    
T  18327337 gaaaaaacct 18327346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 306 - 378
Target Start/End: Original strand, 25408435 - 25408504
Alignment:
Q  306 atttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    ||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  25408435 atttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaata---tatataattacttttacgatatttgtccac 25408504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 26509584 - 26509492
Alignment:
Q  264 taattaattatccaattagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 360  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||     | |||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  26509584 taattaattatccaaatagaaatctaatcattcttgttacttaatttgatcact-----attaaggctccaaattgataaatagttaatataattatt 26509492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 181
Target Start/End: Original strand, 33849110 - 33849207
Alignment:
Q  84 tcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctctttta 181  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||  |||||| || || || ||| ||||| ||||||||    
T  33849110 tctttctcaaacggtatttttatgcctcaagttctccttggatggggagaagagagagtatggtgtgtacagtgtactgaggaacataggctctttta 33849207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 897 - 967
Target Start/End: Original strand, 3940411 - 3940483
Alignment:
Q  897 atgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-cattttcaa 967  Q
    ||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  3940411 atgaattatcttgaccgcaccaataaattgctcattttcatttgttggtgggtaaattacccaccattttcaa 3940483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 889 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 40686998 - 40686900
Alignment:
Q  889 tggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccacattttc---aaggtaatctagaaaaaa 983  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||| | ||||||| || | ||||||||||||  ||||   ||||||||||||||||||    
T  40686998 tggtattcataaactatcttgaccccaccaataaattactcattatgattggttggtggataaattacccaccatttctcaaaggtaatctagaaaaaa 40686900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 360
Target Start/End: Original strand, 22647931 - 22648012
Alignment:
Q  280 tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 360  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| || |||| | |  |||| |||||||  |||||||||||||    
T  22647931 tagaaatctaattagtcttattacttaatttgataactaattaattaagactccaaatttataaataattaatataattatt 22648012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Original strand, 173054 - 173432
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  173054 ccctcttatcaacaacgataaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccagtacctttat 173153  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttccc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||    
T  173154 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtatacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttccc 173253  T
Q  206 attattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttat 299  Q
    |||||||||      |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  173254 attattccgttaatagaacatccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttat 173353  T
Q  300 tacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  173354 tacttaatttgatcactaatcaactaagacccacaattgataaatcgctaatataattattattacgatatttgcccac 173432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 85)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Original strand, 5542324 - 5542704
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5542324 ccctctcatcaacaacgataaccaaagaggggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 5542423  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  5542424 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc 5542523  T
Q  205 cattattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaa-tagcctt 297  Q
    |||||||||      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||    
T  5542524 cattattccgttaatgggtcatccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaattagtctt 5542623  T
Q  298 attacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5542624 attacttaatttgatcactaatcaattaaggctctaaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccac 5542704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 10700025 - 10699646
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10700025 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggaaatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 10699926  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcc 204  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||| |||||    
T  10699925 gcctcaagttttcgtcagatggagagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagtctcttttatatttgatgaccattagggtttcc 10699826  T
Q  205 cattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagcctta 298  Q
    ||||| ||||      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10699825 cattactccgttaatgggtcatccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagcctaa 10699726  T
Q  299 ttacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10699725 ttacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaataactagtataattattgttacgatatttgcccac 10699646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 10705833 - 10705455
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10705833 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttat 10705734  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattaggtttccc 205  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||    
T  10705733 ggcttaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggagaccatagcctcttttatatttgatgactattagggtttcc 10705634  T
Q  206 attattcc------gggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttat 299  Q
    ||||||||      ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  10705633 attattccgttaatgggccatccggacatccactcattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattattcaattagaaatctaatagttttat 10705534  T
Q  300 tacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10705533 tacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatattcgcccac 10705455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 36818967 - 36818589
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36818967 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 36818868  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttccc 205  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  36818867 gcctcaagttctcatcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatatttgatagccattagggtttccc 36818768  T
Q  206 attattcc------gggtcatccggacatccaccca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagcc 295  Q
    ||||||||      ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| || ||    
T  36818767 attattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattaacc 36818672  T
Q  296 ttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36818671 ttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccac 36818589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 32897008 - 32896629
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32897008 ccctctcatcaacaacaataaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 32896909  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  32896908 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc 32896809  T
Q  205 cattattcc------gggtcatccggacatccaccca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagc 294  Q
    |||||||||      ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  32896808 cattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagc 32896713  T
Q  295 cttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32896712 cttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccac 32896629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 32890884 - 32890505
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32890884 ccctctcatcaacaacaataaccaaagagatgagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 32890785  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  32890784 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc 32890685  T
Q  205 cattattcc------gggtcatccggacatccaccca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagc 294  Q
    |||||||||      ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  32890684 cattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagc 32890589  T
Q  295 cttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32890588 cttattacttaatttgatcactaatcaattaagggtcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccac 32890505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 55 - 378
Target Start/End: Original strand, 22219939 - 22220270
Alignment:
Q  55 acaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtac 153  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22219939 acaataaagttagtggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtac 22220038  T
Q  154 ggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccata 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||      || ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22220039 ggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccattcattgagtccata 22220138  T
Q  247 tcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatag 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  22220139 tcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatacccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcttacgattgataaatag 22220238  T
Q  347 ctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22220239 ctaatataactattgttacgatatttgcccac 22220270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 63 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 42033740 - 42033420
Alignment:
Q  63 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattg 162  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  42033740 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggagagaagagagagtttgccgtgtacaatgtattg 42033641  T
Q  163 gggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg----------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaac 251  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||          || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42033640 gggaccatagcctcctttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggcgggccatccggacatccactcattgagtccatatcaac 42033541  T
Q  252 taattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaat 351  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  42033540 taattaaatatttaattaattatctaattagaaatctaataaccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaat 42033441  T
Q  352 ataattattgttacgatattt 372  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  42033440 ataattattgttacgatattt 42033420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 377
Target Start/End: Original strand, 42993167 - 42993541
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42993167 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 42993266  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  42993267 gcctcaagttctcttcagatggggagaa---agagtattgccgtgttcggtatattggggaccataacctcttttatattggatggcgattagggtttcc 42993363  T
Q  205 cattattcc------gggtcatccggacatccaccca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagc 294  Q
    |||||||||      ||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  42993364 cattattccgttaatgggccat-cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagc 42993458  T
Q  295 cttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgccca 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42993459 cttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgccca 42993541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 14417936 - 14417578
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  14417936 ccctctaatcaacgacgataaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagttttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacgtttat 14417837  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattaggtttccca 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        |  | ||||  |||  |     
T  14417836 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctctttt-------tttcccatta--ttt--cg 14417748  T
Q  207 ttattccgggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaa 306  Q
    ||| |  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14417747 ttaat--gggacatccgaacatccactcattgagcccatatcaactaattaaatattcaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaa 14417650  T
Q  307 tttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  14417649 tttgatcactaatcaactaagactcacaattgataaataactaatataattattattacgatattttcccac 14417578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 63 - 378
Target Start/End: Original strand, 39735768 - 39736081
Alignment:
Q  63 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttt-gccgtgtacggtatatt 161  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||        
T  39735768 gttagcggcggctgatttgattcttccttaactggtacatttatgcctcaagtactcttcagatggggagaagagagagttttgtcgtgtacggta---- 39735863  T
Q  162 ggggaccatagcctcttttatattagatggctattaggtttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaat 255  Q
         ||| |||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||      ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  39735864 -----ccagagcctcttttatattagatggccattagggtttcccttattccgttaatgggtcatccggacatccactgattgagtccatatcaactaat 39735958  T
Q  256 taaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataa 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  39735959 taaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaatgctcacaattgataaatagctaatataa 39736058  T
Q  356 ttattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  39736059 ttattgttacgatatttgtccac 39736081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 9935274 - 9934900
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  9935274 ccctctaatcaacaacgttaaccaaagataggagatgatctgaaacacacaatagatttagcggcggctgatttggttcttcctcaatcggtacctttat 9935175  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattaggtttccca 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  9935174 gcctcaagttctcttcagatggggagaag--agagtttgtcgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttat-ttggatggccattaggtttccca 9935078  T
Q  207 ttattcc------gggtcatccggacatccaccca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagcct 296  Q
    |||||||      |||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||  |||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| |||| |    
T  9935077 ttattccgttaatgggtcatccggatatccactcatgttgagtccatatcaataaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagctt 9934982  T
Q  297 tattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  9934981 tattacttaatttgatcactaatcaattaagactcacaattgataaataactaatataattattattacaatatttacccac 9934900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 219 - 378
Target Start/End: Original strand, 39727668 - 39727827
Alignment:
Q  219 atccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 318  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39727668 atccggacatccactcattgagtccatatcaattaattaaatatttaattaattatccaattagaaatttaatagccttattacttaatttgatcactaa 39727767  T
Q  319 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39727768 tcaactaagtctcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 39727827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 805 - 987
Target Start/End: Original strand, 32984075 - 32984262
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32984075 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 32984173  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  32984174 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 32984262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 807 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 2714730 - 2714550
Alignment:
Q  807 ggtgacaactag-gtaccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 905  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2714730 ggtgacaactaaagtaccatggaagaatggtggataatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 2714632  T
Q  906 cttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaa 983  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  2714631 cttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 2714550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 806 - 989
Target Start/End: Complemental strand, 5946230 - 5946042
Alignment:
Q  806 aggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5946230 aggtgacaactagggtacctatgaaagaatggtggataatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 5946132  T
Q  904 atcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttat 989  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5946131 atcttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttat 5946042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 828 - 986
Target Start/End: Original strand, 45236588 - 45236749
Alignment:
Q  828 aagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgc 926  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  45236588 aagaatggtggataatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaataaattgc 45236686  T
Q  927 tcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  45236687 tcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 45236749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 807 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 10646305 - 10646124
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10646305 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagaacatttttaagtggtatccatgaacta 10646207  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac-atttt--caaggtaatctagaaaaaa 983  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||    
T  10646206 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccactatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 10646124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 796 - 988
Target Start/End: Original strand, 13356109 - 13356306
Alignment:
Q  796 atttaatataaggtgacaactag-gtacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggta 893  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13356109 atttaaaacaaggtgacaactagagtacccatggaagaatgatggataatttacccc-aaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggta 13356207  T
Q  894 tccatgaactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccacatt--ttc-aaggtaatctagaaaaaacctta 988  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  ||| || |||||||| |||||||||||    
T  13356208 tccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccacctttcttcaaatgtaatctaaaaaaaacctta 13356306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 807 - 985
Target Start/End: Original strand, 24079901 - 24080084
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24079901 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 24079999  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  24080000 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctacaaaaaacc 24080084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 822 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 41862385 - 41862218
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  41862385 ccatggaagaatggtgggtaatttactcc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgaccccaccaaca 41862287  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  41862286 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 41862218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 807 - 984
Target Start/End: Original strand, 40435153 - 40435335
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tac-catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40435153 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 40435251  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaac 984  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  40435252 tcttgacctcaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaagttacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 40435335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 822 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 43328872 - 43328706
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43328872 ccatggaagaatggtgggtaatttaccct-aatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 43328774  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  43328773 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 43328706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 805 - 985
Target Start/End: Original strand, 33730639 - 33730824
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-ta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33730639 aaggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 33730737  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  33730738 tatcttgaccccaccaacaaattgctcatattaattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacc 33730824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 805 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 37956605 - 37956420
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-ta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37956605 aaggtgacaactagggtatccatgaaataatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 37956507  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  37956506 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 37956420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 805 - 959
Target Start/End: Original strand, 33981661 - 33981817
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33981661 aaggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccgcataagcacatttttaagtggtatccatgaac 33981759  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  33981760 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccac 33981817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 824 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 25186062 - 25185897
Alignment:
Q  824 atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-aa 922  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  25186062 atggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaattatcttgaccccaccaacaaa 25185964  T
Q  923 ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-cat--tttcaaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||| ||||    
T  25185963 ttgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaatacct 25185897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 828 - 991
Target Start/End: Original strand, 29048426 - 29048592
Alignment:
Q  828 aagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-aattgc 926  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  29048426 aagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgc 29048524  T
Q  927 tcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttatat 991  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  29048525 tcattttcattggttagtgggtaaattatccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacctaatat 29048592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 806 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 6366169 - 6365985
Alignment:
Q  806 aggtgacaactagg-ta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6366169 aggtgacaactagggtatccatgaaagaatggtgggtaatttatccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 6366071  T
Q  904 atcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  6366070 atattgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 6365985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 805 - 959
Target Start/End: Original strand, 9303572 - 9303728
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9303572 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccga-ccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaac 9303670  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  9303671 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccac 9303728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 822 - 983
Target Start/End: Original strand, 31830972 - 31831136
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31830972 ccatggaagaatggtaggtaatttaccca-aatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 31831070  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaa 983  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  31831071 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 31831136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 822 - 994
Target Start/End: Original strand, 17718739 - 17718914
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-c 920  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  17718739 ccatggaagaatggtgggtaatttactcc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccatcaata 17718837  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttatataaa 994  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17718838 aattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaatcttatgtaaa 17718914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 822 - 985
Target Start/End: Original strand, 13760665 - 13760831
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13760665 ccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aatcaatacacattagccacagaagcacatttttaaatggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 13760763  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  13760764 aattgttcattttcattggttggtaggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatcttgaaaaaacc 13760831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 807 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 37420122 - 37419936
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||   || |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37420122 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttacctt-aatcaatacacattagtcacataagcacatttttaagtagtatccatgaacta 37420024  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctta 988  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  37420023 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 37419936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 807 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 41654077 - 41653892
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41654077 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaatta 41653979  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  41653978 ttttgaccccatcaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 41653892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 803 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 9013869 - 9013684
Alignment:
Q  803 ataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatga 900  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9013869 ataaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacct--aaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatga 9013772  T
Q  901 actatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaac 984  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  9013771 actatcttgactccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacctaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 9013684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 807 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 9734435 - 9734255
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9734435 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatta--ccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagt-gtatccatgaacta 9734339  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaac 984  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  9734338 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 9734255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 806 - 956
Target Start/End: Complemental strand, 45258692 - 45258541
Alignment:
Q  806 aggtgacaactag-gtaccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45258692 aggtgataactagagtaccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagttacataaacacatttttaaatggtatccatgaacta 45258594  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacc 956  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  45258593 tcttgacccctccaacaaattgctcatttacattggttggtgggtaaattacc 45258541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 799 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 2276102 - 2275913
Alignment:
Q  799 taatataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatcc 896  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2276102 taatataaggtgacaactagtctacccatggaagaatgatgggtaatttaccct-aatcaatacacattagccacataagcatatttt-aagtggtatcc 2276005  T
Q  897 atgaactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaac 984  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  2276004 atgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 2275913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 822 - 985
Target Start/End: Original strand, 37301342 - 37301508
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  37301342 ccatgaaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatatacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactattttggccccaccaaca 37301440  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  37301441 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 37301508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 822 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 32114414 - 32114277
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  32114414 ccatggaagaatggtgggtaatttacctc-aaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactattttgaccctaccaaca 32114316  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  32114315 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 32114277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 805 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 41232130 - 41231945
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-ta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41232130 aaggtgacaactagggtatccatggaggaatagtgggtaatttacccc-aaccaatacacattggtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 41232032  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  41232031 tatcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacc 41231945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 807 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 35628959 - 35628805
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tac-catggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  35628959 ggtgacaactagggtactcatagaagaatggtgggtaatttactcc-aaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtattcttgaacta 35628861  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  35628860 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 35628805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 801 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 41981656 - 41981534
Alignment:
Q  801 atataaggtgacaactagg-ta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccat 898  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41981656 atatatggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccat 41981558  T
Q  899 gaactatcttgaccccaccaacaa 922  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  41981557 gaactatcttgaccccaccaacaa 41981534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 805 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 12033114 - 12032986
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12033114 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 12033016  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcatt 931  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12033015 tatcttgaccgcaccaacaaattgctcatt 12032986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 822 - 954
Target Start/End: Original strand, 44088460 - 44088592
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  44088460 ccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgatcccaccaaca 44088558  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaatta 954  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||    
T  44088559 aattgctcatttttattggttggtgagtaaatta 44088592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 822 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 22878556 - 22878389
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgacccc-accaac 920  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  22878556 ccatagaagaattgtggataatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaacaaaa 22878458  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacct 986  Q
    ||||| |||||||||||||   || | ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22878457 aattgatcattttcattggaaggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 22878389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 179
Target Start/End: Original strand, 39727528 - 39727645
Alignment:
Q  63 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag-tttgccgtgtacggtatatt 161  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  39727528 gttagcggctgctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagtactcttgagatggggagaagagagagttttgttgtgtacggtatatt 39727627  T
Q  162 ggggaccatagcctcttt 179  Q
    |||||||||| |||||||    
T  39727628 ggggaccatatcctcttt 39727645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 63 - 175
Target Start/End: Original strand, 1883039 - 1883151
Alignment:
Q  63 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattg 162  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||    
T  1883039 gttagcggcggctaatttggttcttcctcaaccagtacctttatgtctcaagttctcttcagatggggagaagagaaagtttgccgtgtattgtgtattg 1883138  T
Q  163 gggaccatagcct 175  Q
    |||||||||||||    
T  1883139 gggaccatagcct 1883151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 855 - 954
Target Start/End: Original strand, 45066641 - 45066741
Alignment:
Q  855 caatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaatt 953  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  45066641 caatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatt 45066740  T
Q  954 a 954  Q
    |    
T  45066741 a 45066741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 822 - 938
Target Start/End: Complemental strand, 3904241 - 3904126
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  3904241 ccatggaagaatggtgggtaatttaccct-aaccaatacacaatagccacataagcacatttttaagtggtat-catgaactatcttgaccccaccaaca 3904144  T
Q  921 aattgctcattttcattg 938  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3904143 aattgctcattttcattg 3904126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 822 - 933
Target Start/End: Complemental strand, 25248198 - 25248087
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25248198 ccatggaagaatgatgggtaatttactcc-aaccaatacacattagcaacataagcacattttaaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 25248100  T
Q  921 aattgctcatttt 933  Q
    |||||||||||||    
T  25248099 aattgctcatttt 25248087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 824 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 41640077 - 41639911
Alignment:
Q  824 atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caa 922  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  41640077 atggaagaatggtgggtaatttatccc-aactaatacacattagccacataaacatatttttaagcggtatctatgaactatcttgaccccaccaataaa 41639979  T
Q  923 ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    ||| ||||||||||||||| || |||||||||| || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41639978 ttgttcattttcattggttggtgggtaaattactcatcattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacctt 41639911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 822 - 983
Target Start/End: Original strand, 42701306 - 42701471
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcaca---tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccacca 918  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   || |||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  42701306 ccatggaaggatggtggataattta-ccccaaccaatacacattag--tcacaagcacattttttttaagtggtattcatgaactatcttgaccccacta 42701402  T
Q  919 ac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaa 983  Q
    || ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  42701403 acaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattattcaaaggtaatctagaaaaaa 42701471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 376
Target Start/End: Original strand, 1883264 - 1883378
Alignment:
Q  263 ttaattaattatccaattagaaatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattg 361  Q
    |||||||||  || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||     
T  1883264 ttaattaatattctaaatagaaatctaataagccttattacttaatttgatcactaatcaagtaaggctccaaattgataaatagctaatataattatta 1883363  T
Q  362 ttacgatatttgccc 376  Q
    |||||||||||||||    
T  1883364 ttacgatatttgccc 1883378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 804 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 31336279 - 31336163
Alignment:
Q  804 taaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 901  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  31336279 taaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttgcccc-aaccaatacacattagccatataaacatatttttaagtggtatccatgaa 31336181  T
Q  902 ctatcttgaccccaccaa 919  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31336180 ctatcttgaccccaccaa 31336163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 214 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 17954289 - 17954123
Alignment:
Q  214 gggtcatccggacatccacccatt--gagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattactt----aat 307  Q
    |||||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||    | |||||||||||||| ||||||||||    |||    
T  17954289 gggtcatctgaacatccactcattttgagtccatatcaactaattaattaattaattaatta----aatagaaatctaataggcttattactttagtaat 17954194  T
Q  308 ttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
     |||||||||||||| |||| | |  ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||    
T  17954193 ctgatcactaatcaattaagtctccaaattgataaatagctaatataattattataaagatattttcccac 17954123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 803 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 3211380 - 3211207
Alignment:
Q  803 ataaggtgacaacta-ggtacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatga 900  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||           |||||    
T  3211380 ataaggtgacaactatggtacccatggaagaatggtgggtaatttactcc-aacgaatacacattagccacataagcacatatt-----------catga 3211293  T
Q  901 actatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-cattttc-aaggtaatctagaaaaaa 983  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  3211292 actatcttaaccccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccattttcaaaggtaatttagaaaaaa 3211207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 881 - 959
Target Start/End: Original strand, 39915887 - 39915966
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  39915887 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccac 39915966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 886 - 956
Target Start/End: Complemental strand, 41981535 - 41981464
Alignment:
Q  886 aagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacc 956  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  41981535 aagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacc 41981464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 881 - 988
Target Start/End: Original strand, 33896907 - 33897017
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-cattttc-aaggtaatctag 977  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  33896907 tttttaggtggtatctataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccattttcaaaggtaatctag 33897006  T
Q  978 aaaaaacctta 988  Q
    |||||||||||    
T  33897007 aaaaaacctta 33897017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 806 - 985
Target Start/End: Original strand, 4447294 - 4447467
Alignment:
Q  806 aggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||           ||| ||||||||    
T  4447294 aggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatatacattagccacataagcaca-----------tattcatgaact 4447381  T
Q  904 atcttgaccccacc-aacaattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||    
T  4447382 atcttgaccccacctataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacc 4447467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 807 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 10378480 - 10378305
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||| ||           |||||||||    
T  10378480 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttacctc-aaccaatacatattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 10378393  T
Q  905 tcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaacctta 988  Q
    ||||||||||||| | || |||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||   |||||||| ||||||||||||||    
T  10378392 tcttgaccccacctataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 10378305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 796 - 959
Target Start/End: Original strand, 117318 - 117472
Alignment:
Q  796 atttaatataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggta 893  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||| ||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||             
T  117318 atttaatatttggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgaataatttacccg-aaccaatacacattagccacataagcacatatt--------- 117407  T
Q  894 tccatgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
      ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  117408 --catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 117472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 822 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 31940468 - 31940314
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 921  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||           ||||||||||||||||||||| || |    
T  31940468 ccatgaaagaatgatgggtaatttaccc--aaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgaccccacaaata 31940382  T
Q  922 a-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  31940381 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 31940314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 822 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 41843407 - 41843252
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 921  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||           |||||||||||| |||||||| || |    
T  41843407 ccatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatctggaccccacaaata 41843320  T
Q  922 a-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||    
T  41843319 aattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacc 41843252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 879 - 986
Target Start/End: Original strand, 31148953 - 31149063
Alignment:
Q  879 catttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaatt-gctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatc 974  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| || | ||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||   |||||||||    
T  31148953 catttttaagtggtatc-atgaactatcttaaccccatcaataaatagctcattttcattggttagtgaataaattacccaccatttttcaaaggtaatc 31149051  T
Q  975 tagaaaaaacct 986  Q
    ||||||||||||    
T  31149052 tagaaaaaacct 31149063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 822 - 959
Target Start/End: Original strand, 32373744 - 32373869
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 921  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||| ||           |||||||||||||||||||||||| |    
T  32373744 ccatggaagaatggtgg-taatttacccc-aaccaatacacattaatcacataagcacatatt-----------catgaactatcttgaccccaccaata 32373830  T
Q  922 a-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    | |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  32373831 aattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccac 32373869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 896 - 989
Target Start/End: Original strand, 27243218 - 27243315
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttat 989  Q
    |||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27243218 catgaactatcttggccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaaccttat 27243315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 896 - 989
Target Start/End: Original strand, 27254793 - 27254890
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaaccttat 989  Q
    |||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27254793 catgaactatcttggccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaaccttat 27254890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 822 - 959
Target Start/End: Original strand, 4975424 - 4975550
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaaca 921  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||| ||           ||||||||||||||||||||| || |    
T  4975424 ccatgaaagaatgatggataatttaccca-aaccaatacacattagccatataagcacatatt-----------catgaactatcttgaccccacaaata 4975511  T
Q  922 a-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    | ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  4975512 aattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccac 4975550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 896 - 959
Target Start/End: Original strand, 40458851 - 40458915
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  40458851 catgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 40458915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 881 - 986
Target Start/End: Original strand, 3490463 - 3490572
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatcta 976  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||| ||||||   |||||||| ||    
T  3490463 tttttaggtggtaaccataaattatcttgaccccaccaataaattgctcattataattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaattta 3490562  T
Q  977 gaaaaaacct 986  Q
    ||||||||||    
T  3490563 gaaaaaacct 3490572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 881 - 994
Target Start/End: Original strand, 26196381 - 26196497
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctag 977  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |  | ||| | ||||||| || ||||||||||||| ||||||   |||||||||||     
T  26196381 tttttaggtggtatccataaactattttgaccccaccaataaattgttattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctaa 26196480  T
Q  978 aaaaaaccttatataaa 994  Q
    ||||||||||| |||||    
T  26196481 aaaaaaccttaaataaa 26196497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 822 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 9713840 - 9713782
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacat 881  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9713840 ccatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacat 9713782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 1171249 - 1171215
Alignment:
Q  113 agttctcttcagatggggagaagagagagtttgcc 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1171249 agttctcttcagatggggagaagagagagtttgcc 1171215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 11641456 - 11641418
Alignment:
Q  243 catatcaactaattaaatatttaattaattatccaatta 281  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11641456 catatcaattaattaaatatttaattaattatccaatta 11641418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 276 - 337
Target Start/End: Original strand, 30890531 - 30890593
Alignment:
Q  276 caattagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaatt 337  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  30890531 caattagaaatctaattagtcttattaattaatttgatcactaatcaattaagactcacaatt 30890593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 1171285 - 1171249
Alignment:
Q  63 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1171285 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta 1171249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 807 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 2379311 - 2379236
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-ta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacat 881  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2379311 ggtgacaactaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagtcacataagcacat 2379236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 896 - 990
Target Start/End: Original strand, 9509479 - 9509577
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-cat--tttcaaggtaatctagaaaaaaccttata 990  Q
    ||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||| || |||||||||| || |||  ||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  9509479 catgaactatcttaaccccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacacaccattctttaaaggtaatttagaaaaaaccatata 9509577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 822 - 881
Target Start/End: Original strand, 40649848 - 40649906
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacat 881  Q
    ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40649848 ccatgaaagaatgatgggtagtttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacat 40649906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 836 - 881
Target Start/End: Original strand, 41425460 - 41425503
Alignment:
Q  836 tggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacat 881  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41425460 tggataatttaccc--aaccaatacacattagccacataagcacat 41425503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 922 - 959
Target Start/End: Original strand, 33622571 - 33622608
Alignment:
Q  922 attgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  33622571 attgctcattttcattggttggtgggtaaattacccac 33622608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 896 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 38631744 - 38631652
Alignment:
Q  896 catgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaaac 984  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||  | ||||||||| ||| ||||||   |||||||| ||||||||||    
T  38631744 catgaactatcttgaccacaccaataaattgctcatattcattggttgatgggtaaattatccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaac 38631652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208 (Bit Score: 245; Significance: 1e-135; HSPs: 2)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 10 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12390 - 12012
Alignment:
Q  10 cctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12390 cctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatg 12291  T
Q  108 cctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttccc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  12290 cctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttccc 12191  T
Q  206 attattcc------gggtcatccggacatccaccca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagcc 295  Q
    ||||||||      ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  12190 attattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagcc 12095  T
Q  296 ttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12094 ttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccac 12012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6518 - 6139
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6518 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttat 6419  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctatta-ggtttcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  6418 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcc 6319  T
Q  205 cattattcc------gggtcatccggacatccaccca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagc 294  Q
    |||||||||      ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  6318 cattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagc 6223  T
Q  295 cttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6222 cttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctttaaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccac 6139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Original strand, 783 - 1141
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctga--cacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttat 106  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  783 ccctctaatcaacgacgataaccaaagagagaagatgatctgaaacacacaatagttttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacgtttat 882  T
Q  107 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattaggtttccca 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        |  | ||||  |||  |     
T  883 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctctttt-------tttcccatta--ttt--cg 971  T
Q  207 ttattccgggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaa 306  Q
    ||| |  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  972 ttaat--gggacatccgaacatccactcattgagcccatatcaactaattaaatattcaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaa 1069  T
Q  307 tttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  1070 tttgatcactaatcaactaagactcacaattgataaataactaatataattattattacgatattttcccac 1141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1114 (Bit Score: 135; Significance: 8e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold1114
Description:

Target: scaffold1114; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 116 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 949 - 680
Alignment:
Q  116 tctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||| |    
T  949 tctcttcagatggggagaagagagagtttgtcgtgtacagtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattctg 850  T
Q  215 ------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatt 308  Q
          |||||||  ||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  849 ttaatgggtcatctagacattcactcattgagtacatatcagttaattaaatatttaatcaattatctgattttaaatctaatagccttattacttaatt 750  T
Q  309 tgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  749 tgatcactaatcaattgaggctcacaattgataaataactaatataattattattatgatattttcccac 680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1114; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 63 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 1023 - 950
Alignment:
Q  63 gttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaaga 136  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1023 gttagtggcggctgatttggttcttcctcaaccgttatctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaaga 950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 133; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 158 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 14117 - 13890
Alignment:
Q  158 tattggggaccatagcctcttttatattagatggctattagg-tttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccattgagtccatatcaa 250  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||      |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  14117 tattggggaccataacctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcattgaatccatatcaa 14018  T
Q  251 ctaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaa 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14017 ctaattaaatatttaattaattatccaattacaaatctaatagaattattacttaatttgatcactagtcaattaaggctcacgattgataaatagctaa 13918  T
Q  351 tataattattgttacgatatttgcccac 378  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||    
T  13917 tataattattattactatattttcccac 13890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 125; Significance: 8e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 149 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 5821 - 5587
Alignment:
Q  149 tgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggctattaggtttcccattattccg------ggtcatccggacatccacccat--tgag 240  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||| |      ||||||||| |||||||| |||  ||||    
T  5821 tgtacgatgtattgggaaccatagcctcttttatattgaatggccgttaggtttcccattattctgttaatgggtcatccgaacatccactcatattgag 5722  T
Q  241 tccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgat 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  5721 tccatatcaactaattaaatatttaattaattatcgaattagaaatctaatagtcatattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgat 5622  T
Q  341 aaatagctaatataattattgttacgatatttgcc 375  Q
    ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  5621 aaataactaatataattattatagcgatatttgcc 5587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 5889 - 5826
Alignment:
Q  58 atagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 121  Q
    |||| ||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5889 atagggttagcgacgactaatttggttcttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttatctt 5826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 118; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 807 - 987
Target Start/End: Original strand, 11133 - 11317
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11133 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 11231  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttcaaggtaatctagaaaaaacctt 987  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  11232 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttaaaggtaatctagaaaaaccctt 11317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 108; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 804 - 985
Target Start/End: Original strand, 13759 - 13945
Alignment:
Q  804 taaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 901  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13759 taaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 13857  T
Q  902 ctatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  13858 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 13945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 107; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 805 - 985
Target Start/End: Original strand, 39554 - 39739
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39554 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 39652  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  39653 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 39739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 107; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 805 - 985
Target Start/End: Original strand, 75242 - 75427
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactaggt-acca-tggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 902  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  75242 aaggtgacaactaggttaccaatggaagaatggtgaataatttacccc-aaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatgcatgaac 75340  T
Q  903 tatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  75341 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 75427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0949 (Bit Score: 103; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0949
Description:

Target: scaffold0949; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 807 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 2051 - 1871
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2051 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttactcc-aaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaacta 1953  T
Q  905 tcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatctagaaaaa 982  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||    
T  1952 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaa 1871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 97; Significance: 4e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 806 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 176837 - 176682
Alignment:
Q  806 aggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  176837 aggtgacaactaggatacccatagaagaatggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagtacattttcaagtggtatccatgaact 176739  T
Q  904 atcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  176738 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtcggtaaattacccac 176682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 805 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 278192 - 278005
Alignment:
Q  805 aaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagt--ggtatccatga 900  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  278192 aaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatccc-aaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggggtatccatga 278094  T
Q  901 actatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  278093 actatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgagtaatttacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 278005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 92; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 822 - 985
Target Start/End: Original strand, 2449 - 2615
Alignment:
Q  822 ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac- 920  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  2449 ccatggaagaatgatgagtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccctaccaaca 2547  T
Q  921 aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  2548 aattgctcattttcattggttggtggataatttacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 2615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 803 - 985
Target Start/End: Original strand, 18850 - 19037
Alignment:
Q  803 ataaggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatga 900  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||  || ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18850 ataaggtgacaactagggtacccatggaagaattgtggataatttattcc-aactaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatga 18948  T
Q  901 actatcttgaccccaccaac-aattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  18949 attatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacc 19037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 81; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 833 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 32715 - 32560
Alignment:
Q  833 tggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaac-aattgctcatt 931  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  32715 tggtgggtaatttacccc-aaccaatacacattaaccacataaacacatttttaaatggtatccatgaactatcttgatcccaccaacaaattgctcatt 32617  T
Q  932 ttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  32616 ttcattggttggtgggttaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 32560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 78; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 807 - 922
Target Start/End: Original strand, 4596 - 4712
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4596 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatccc-aaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccataaacta 4694  T
Q  905 tcttgaccccaccaacaa 922  Q
    |||| |||||||||||||    
T  4695 tctttaccccaccaacaa 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 75; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 806 - 933
Target Start/End: Complemental strand, 3262 - 3133
Alignment:
Q  806 aggtgacaacta-ggta-ccatggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 903  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3262 aggtgacaactaaggtatccatagaagaatggtgagtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaact 3164  T
Q  904 atcttgaccccaccaac-aattgctcatttt 933  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  3163 atcttgatcccaccaacaaattgctcatttt 3133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 51; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 5530 - 5465
Alignment:
Q  9 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggtgatgatctg--acacacaatagagttagcggcg 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5530 ccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaacacacaatagagttagcggcg 5465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0085 (Bit Score: 49; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0085
Description:

Target: scaffold0085; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 38349 - 38063
Alignment:
Q  80 tagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctctt 178  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||  | |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  38349 tagttcttcctcaactgatacctttatgtctcaagttctcttcagatgggaagaatagagtgtattatcatgtacggtgtattggagaccataacctctt 38250  T
Q  179 ttatattagatggctatta-ggtttcccattattccg------ggtcatccggacatccacc-cattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaa 270  Q
     ||  |  ||||   |||| ||||| | |||||||||      |||||||  ||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||    |||||||    
T  38249 ata-gtgtgatgatcattagggttttctattattccgttaatcggtcatctagacatccaccatattaagtccatatcaattaattaaa----taattaa 38155  T
Q  271 ttatccaattagaaatctaa--tagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattatt 360  Q
    |||| | | |||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||     |||||||||||| |||||| |||||||    
T  38154 ttattcgaatagaaatctaaattaaccttgttacttaatttgatcactattcaattaaggtttcaaattgataaataactaataaaattatt 38063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2003 (Bit Score: 45; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold2003
Description:

Target: scaffold2003; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 881 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 209 - 98
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa-ttgctcattttcattggttagtaggtaaattacccaca--ttttcaa-ggtaatcta 976  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||   ||||||| |||||||||    
T  209 tttttaggtggtattcataaactatcttgactccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 110  T
Q  977 gaaaaaacctta 988  Q
    ||||||||||||    
T  109 gaaaaaacctta 98  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 45; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 881 - 987
Target Start/End: Original strand, 4618 - 4729
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctca-ttttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatct 975  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| || | ||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  4618 tttttaaatggtatccatgaactatcttgacctcaccaataaattactcatttttcattggttggtggataaattacccaccatttttgaaaggtaatct 4717  T
Q  976 agaaaaaacctt 987  Q
    ||||||||||||    
T  4718 agaaaaaacctt 4729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 45; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 881 - 987
Target Start/End: Complemental strand, 3500 - 3389
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctca-ttttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatct 975  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| || | ||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  3500 tttttaaatggtatccatgaactatcttgacctcaccaataaattactcatttttcattggttggtggataaattacccaccatttttgaaaggtaatct 3401  T
Q  976 agaaaaaacctt 987  Q
    ||||||||||||    
T  3400 agaaaaaacctt 3389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 45; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 881 - 988
Target Start/End: Complemental strand, 14851 - 14740
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatcta 976  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  14851 tttttaggtggtattcataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 14752  T
Q  977 gaaaaaacctta 988  Q
    || |||||||||    
T  14751 gacaaaacctta 14740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 41; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 881 - 984
Target Start/End: Original strand, 20541 - 20648
Alignment:
Q  881 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattaccca-catttt--caaggtaatcta 976  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  20541 tttttaggtggtatccataaattatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 20640  T
Q  977 gaaaaaac 984  Q
    ||||||||    
T  20641 gaaaaaac 20648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0721 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0721
Description:

Target: scaffold0721; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 807 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 7262 - 7089
Alignment:
Q  807 ggtgacaactagg-tacc-atggaagaatggtggataatttacccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 904  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||           |||||||||    
T  7262 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatccc-aaccaatacacattggccacataagcacatatt-----------catgaacta 7175  T
Q  905 tcttgaccccaccaa-caattgctca-ttttcattggttagtaggtaaattaccca-catt-ttc-aaggtaatctagaaaaaacc 985  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  7174 tcttgaccccacaaataaattgctcatttttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 7089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0449 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0449
Description:

Target: scaffold0449; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 373
Target Start/End: Original strand, 1281 - 1316
Alignment:
Q  338 gataaatagctaatataattattgttacgatatttg 373  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1281 gataaatagctaatataattattattacgatatttg 1316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 882 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 19327 - 19245
Alignment:
Q  882 ttttaagtggtatccatgaac----tatcttgaccccaccaa-caattgctcattttcattggttagtaggtaaattacccac 959  Q
    ||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||   |||||||||||||||    
T  19327 ttttaggtggtatccatgaactatatatcttgaccccaccaataaattgttcattttcattgattgagaggtaaattacccac 19245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University