View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5517-Insertion-6 (Length: 587)

Name: NF5517-Insertion-6
Description: NF5517
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5517-Insertion-6
NF5517-Insertion-6
[»] chr2 (171 HSPs)
chr2 (8-509)||(24918254-24918755)
chr2 (8-509)||(24681558-24682059)
chr2 (8-509)||(23706765-23707265)
chr2 (8-509)||(24671139-24671640)
chr2 (87-509)||(24642375-24642797)
chr2 (7-403)||(22105685-22106081)
chr2 (10-425)||(24368024-24368439)
chr2 (8-409)||(24529094-24529495)
chr2 (131-509)||(38967593-38967971)
chr2 (8-425)||(6726245-6726662)
chr2 (8-425)||(21154555-21154972)
chr2 (8-425)||(41523620-41524037)
chr2 (8-409)||(23709080-23709480)
chr2 (8-397)||(45027452-45027840)
chr2 (98-409)||(39682527-39682838)
chr2 (98-409)||(18809157-18809467)
chr2 (98-409)||(23711651-23711961)
chr2 (7-409)||(32214476-32214869)
chr2 (98-409)||(28577313-28577623)
chr2 (98-409)||(571611-571922)
chr2 (98-409)||(23131076-23131386)
chr2 (98-409)||(34402160-34402470)
chr2 (98-409)||(23133543-23133853)
chr2 (98-409)||(26505593-26505903)
chr2 (98-409)||(26508071-26508381)
chr2 (8-330)||(41523427-41523749)
chr2 (98-409)||(32039136-32039446)
chr2 (131-409)||(20261433-20261711)
chr2 (8-330)||(21154362-21154684)
chr2 (8-308)||(23931775-23932075)
chr2 (131-409)||(24897866-24898143)
chr2 (131-409)||(24905303-24905580)
chr2 (131-423)||(10684433-10684725)
chr2 (131-409)||(24900349-24900626)
chr2 (131-409)||(24902826-24903103)
chr2 (131-409)||(24907778-24908055)
chr2 (8-325)||(23706573-23706889)
chr2 (131-409)||(23135804-23136071)
chr2 (101-330)||(23708980-23709209)
chr2 (223-420)||(25616384-25616581)
chr2 (164-330)||(22105951-22106117)
chr2 (164-326)||(41523390-41523552)
chr2 (166-327)||(23931949-23932110)
chr2 (164-330)||(24529057-24529223)
chr2 (166-330)||(24918626-24918790)
chr2 (164-330)||(6726533-6726699)
chr2 (164-330)||(23706536-23706702)
chr2 (164-330)||(24368312-24368478)
chr2 (164-330)||(24681930-24682096)
chr2 (164-328)||(32214440-32214604)
chr2 (167-328)||(45027418-45027579)
chr2 (164-330)||(21154325-21154491)
chr2 (164-330)||(24671511-24671677)
chr2 (8-136)||(20261513-20261641)
chr2 (135-232)||(31345570-31345667)
chr2 (411-509)||(6726214-6726312)
chr2 (392-509)||(21154886-21155003)
chr2 (392-509)||(22105632-22105749)
chr2 (392-509)||(24367993-24368110)
chr2 (8-137)||(28577391-28577520)
chr2 (8-137)||(18809235-18809364)
chr2 (8-137)||(23131155-23131284)
chr2 (8-137)||(23133622-23133751)
chr2 (8-137)||(23711754-23711883)
chr2 (8-137)||(24368119-24368248)
chr2 (8-137)||(34402262-34402391)
chr2 (8-136)||(10684503-10684631)
chr2 (8-137)||(571690-571819)
chr2 (8-137)||(39682606-39682735)
chr2 (7-137)||(23135872-23136002)
chr2 (8-137)||(24897936-24898065)
chr2 (8-137)||(24900419-24900548)
chr2 (8-137)||(24902896-24903025)
chr2 (8-137)||(24905373-24905502)
chr2 (8-137)||(26505671-26505800)
chr2 (8-137)||(26508149-26508278)
chr2 (8-137)||(24642489-24642618)
chr2 (8-137)||(24907848-24907977)
chr2 (7-137)||(24529286-24529416)
chr2 (9-137)||(32039240-32039368)
chr2 (30-137)||(25616474-25616581)
chr2 (392-486)||(41523951-41524045)
chr2 (8-137)||(38967772-38967901)
chr2 (365-479)||(21368352-21368466)
chr2 (439-509)||(24898068-24898138)
chr2 (439-509)||(24905505-24905575)
chr2 (439-509)||(24907980-24908050)
chr2 (444-509)||(18809162-18809227)
chr2 (444-509)||(23709410-23709475)
chr2 (444-509)||(23711891-23711956)
chr2 (338-409)||(6726209-6726279)
chr2 (439-509)||(24900551-24900621)
chr2 (439-509)||(24903028-24903098)
chr2 (444-509)||(26505598-26505663)
chr2 (444-509)||(26508076-26508141)
chr2 (444-509)||(28577318-28577383)
chr2 (342-409)||(21154942-21155008)
chr2 (338-409)||(22105627-22105697)
chr2 (338-409)||(23707200-23707270)
chr2 (338-409)||(24642732-24642802)
chr2 (98-149)||(27920402-27920453)
chr2 (87-146)||(31345480-31345539)
chr2 (338-409)||(38967588-38967658)
chr2 (444-509)||(24529424-24529490)
chr2 (444-509)||(25616400-25616466)
chr2 (444-509)||(39682532-39682598)
chr2 (444-502)||(45027782-45027840)
chr2 (209-310)||(67339-67440)
chr2 (241-322)||(16900803-16900884)
chr2 (241-322)||(16994194-16994275)
chr2 (339-440)||(21368338-21368439)
chr2 (265-329)||(31345490-31345554)
chr2 (443-509)||(571616-571683)
chr2 (338-405)||(24367992-24368058)
chr2 (338-405)||(24681557-24681623)
chr2 (338-409)||(24918249-24918319)
chr2 (212-310)||(12727711-12727809)
chr2 (200-310)||(24686597-24686707)
chr2 (443-509)||(32039375-32039441)
chr2 (212-310)||(34823750-34823848)
chr2 (386-475)||(23799448-23799537)
chr2 (341-405)||(24671138-24671201)
chr2 (439-509)||(10684635-10684706)
chr2 (439-509)||(20261438-20261509)
chr2 (443-509)||(23131081-23131148)
chr2 (443-509)||(23133548-23133615)
chr2 (443-509)||(34402398-34402465)
chr2 (200-310)||(19887274-19887384)
chr2 (240-310)||(27261332-27261402)
chr2 (278-330)||(24642373-24642425)
chr2 (418-508)||(21368375-21368466)
chr2 (339-422)||(23799448-23799531)
chr2 (200-310)||(11232212-11232322)
chr2 (200-310)||(22514059-22514169)
chr2 (200-310)||(28776661-28776771)
chr2 (411-479)||(14184257-14184325)
chr2 (242-310)||(22274022-22274090)
chr2 (432-479)||(1384398-1384445)
chr2 (470-509)||(23135809-23135848)
chr2 (344-479)||(22686076-22686221)
chr2 (214-272)||(34135061-34135119)
chr2 (436-508)||(23799467-23799540)
chr2 (242-310)||(22283255-22283323)
chr2 (214-330)||(27920325-27920441)
chr2 (435-479)||(36736884-36736928)
chr2 (436-479)||(20915475-20915518)
chr2 (436-479)||(21316427-21316470)
chr2 (436-479)||(21336320-21336363)
chr2 (436-479)||(22690051-22690094)
chr2 (436-479)||(22694647-22694690)
chr2 (386-440)||(1384405-1384459)
chr2 (433-479)||(9784873-9784919)
chr2 (444-478)||(21154885-21154919)
chr2 (386-440)||(21316430-21316484)
chr2 (386-440)||(21336323-21336377)
chr2 (444-478)||(22105716-22105750)
chr2 (386-440)||(22690037-22690091)
chr2 (386-440)||(22694633-22694687)
chr2 (444-478)||(24368077-24368111)
chr2 (214-256)||(24788042-24788084)
chr2 (386-440)||(25085696-25085750)
chr2 (386-479)||(25587473-25587563)
chr2 (436-478)||(28345842-28345884)
chr2 (386-440)||(28345845-28345899)
chr2 (386-440)||(36736888-36736942)
chr2 (214-256)||(44584590-44584632)
chr2 (415-479)||(21316545-21316609)
chr2 (415-479)||(21336438-21336502)
chr2 (386-430)||(22686072-22686116)
chr2 (19-63)||(24788042-24788086)
chr2 (19-63)||(44584588-44584632)
[»] chr4 (161 HSPs)
chr4 (7-509)||(52872619-52873121)
chr4 (8-509)||(19617614-19618115)
chr4 (8-509)||(14746059-14746560)
chr4 (8-466)||(362337-362795)
chr4 (8-509)||(19857701-19858193)
chr4 (8-409)||(14970254-14970655)
chr4 (8-409)||(3515221-3515622)
chr4 (8-419)||(15495721-15496132)
chr4 (8-425)||(52312760-52313176)
chr4 (98-409)||(15117990-15118300)
chr4 (100-422)||(44772723-44773044)
chr4 (8-328)||(362668-362988)
chr4 (98-409)||(7640824-7641134)
chr4 (99-406)||(29267570-29267877)
chr4 (131-409)||(15534395-15534673)
chr4 (8-330)||(52313047-52313369)
chr4 (131-409)||(44615502-44615780)
chr4 (131-409)||(50222010-50222287)
chr4 (131-409)||(36038084-36038362)
chr4 (131-409)||(19242914-19243192)
chr4 (133-409)||(49547446-49547722)
chr4 (98-361)||(1837157-1837420)
chr4 (87-330)||(14745945-14746188)
chr4 (131-409)||(14048791-14049069)
chr4 (284-509)||(18214992-18215217)
chr4 (164-425)||(11958-12219)
chr4 (8-222)||(18214751-18214965)
chr4 (312-508)||(15355070-15355266)
chr4 (27-281)||(14185477-14185731)
chr4 (122-349)||(30147189-30147416)
chr4 (164-330)||(19858064-19858230)
chr4 (164-330)||(52872583-52872749)
chr4 (167-330)||(18214717-18214880)
chr4 (164-330)||(362859-363025)
chr4 (164-330)||(14970217-14970383)
chr4 (166-330)||(3515493-3515657)
chr4 (164-330)||(19617577-19617743)
chr4 (164-330)||(52313240-52313406)
chr4 (196-330)||(15495716-15495850)
chr4 (87-230)||(22725351-22725494)
chr4 (8-136)||(15534475-15534603)
chr4 (220-330)||(14185621-14185731)
chr4 (392-509)||(12133-12250)
chr4 (7-137)||(3515300-3515430)
chr4 (7-137)||(19857871-19858001)
chr4 (392-509)||(52312729-52312846)
chr4 (8-136)||(36038164-36038292)
chr4 (8-136)||(49547514-49547642)
chr4 (8-137)||(15118093-15118222)
chr4 (291-409)||(18239250-18239367)
chr4 (7-137)||(362473-362603)
chr4 (8-137)||(11995-12124)
chr4 (8-137)||(44772824-44772953)
chr4 (417-509)||(15496922-15497014)
chr4 (8-137)||(29267646-29267775)
chr4 (8-137)||(19242993-19243122)
chr4 (8-137)||(44615581-44615710)
chr4 (8-137)||(50222080-50222209)
chr4 (164-238)||(12778386-12778460)
chr4 (8-137)||(1837260-1837389)
chr4 (8-136)||(14048871-14048999)
chr4 (8-137)||(7640927-7641056)
chr4 (131-198)||(12033444-12033511)
chr4 (338-405)||(19857700-19857767)
chr4 (444-509)||(15118230-15118295)
chr4 (444-509)||(50222217-50222282)
chr4 (214-310)||(14951270-14951366)
chr4 (214-330)||(22725286-22725401)
chr4 (338-409)||(12185-12255)
chr4 (338-409)||(18215152-18215222)
chr4 (444-509)||(29267572-29267638)
chr4 (444-509)||(18239297-18239362)
chr4 (444-509)||(44772961-44773026)
chr4 (338-409)||(15355202-15355272)
chr4 (443-509)||(19242919-19242986)
chr4 (338-409)||(52312724-52312794)
chr4 (200-310)||(14995644-14995754)
chr4 (444-509)||(44615507-44615573)
chr4 (214-308)||(55377199-55377293)
chr4 (214-310)||(25120048-25120144)
chr4 (338-409)||(14746495-14746565)
chr4 (338-409)||(15496949-15497019)
chr4 (338-409)||(19618050-19618120)
chr4 (338-409)||(52873056-52873126)
chr4 (444-509)||(362399-362465)
chr4 (91-137)||(18214992-18215038)
chr4 (444-509)||(7641064-7641129)
chr4 (209-310)||(43281694-43281795)
chr4 (214-310)||(18293669-18293765)
chr4 (439-509)||(15534400-15534471)
chr4 (386-476)||(14629408-14629498)
chr4 (260-326)||(14745925-14745991)
chr4 (444-509)||(15355096-15355162)
chr4 (164-222)||(15489659-15489717)
chr4 (444-509)||(15496051-15496117)
chr4 (200-310)||(17146279-17146389)
chr4 (200-310)||(18247739-18247849)
chr4 (87-137)||(30147208-30147258)
chr4 (200-310)||(47357183-47357293)
chr4 (439-507)||(14048798-14048867)
chr4 (361-479)||(26922388-26922502)
chr4 (214-310)||(5683369-5683465)
chr4 (200-308)||(15287858-15287966)
chr4 (200-308)||(15294968-15295076)
chr4 (214-310)||(22355073-22355169)
chr4 (442-509)||(49547649-49547717)
chr4 (439-509)||(36038089-36038160)
chr4 (444-509)||(3515226-3515292)
chr4 (200-310)||(10643746-10643856)
chr4 (444-509)||(14970584-14970650)
chr4 (200-310)||(16731676-16731786)
chr4 (212-310)||(18168293-18168391)
chr4 (8-45)||(12778423-12778460)
chr4 (386-442)||(19566638-19566694)
chr4 (386-479)||(46740440-46740543)
chr4 (432-479)||(15041842-15041889)
chr4 (432-479)||(15112535-15112582)
chr4 (98-141)||(18239250-18239293)
chr4 (416-479)||(25512938-25513001)
chr4 (436-479)||(25513031-25513074)
chr4 (208-322)||(9198544-9198658)
chr4 (200-310)||(19020009-19020119)
chr4 (260-310)||(19698032-19698082)
chr4 (260-310)||(19708617-19708667)
chr4 (386-440)||(46740552-46740606)
chr4 (7-48)||(30147297-30147338)
chr4 (390-474)||(26445062-26445146)
chr4 (470-509)||(1837413-1837452)
chr4 (436-479)||(10272792-10272835)
chr4 (436-479)||(12622676-12622719)
chr4 (436-479)||(13164410-13164453)
chr4 (436-479)||(14508054-14508097)
chr4 (436-479)||(46740566-46740609)
chr4 (444-478)||(12132-12166)
chr4 (200-310)||(8374040-8374150)
chr4 (386-440)||(10272778-10272832)
chr4 (386-440)||(13164396-13164450)
chr4 (383-479)||(13164522-13164624)
chr4 (436-478)||(14629459-14629501)
chr4 (243-321)||(20595850-20595928)
chr4 (386-440)||(26445159-26445213)
chr4 (436-478)||(26445174-26445216)
chr4 (386-440)||(40229656-40229710)
chr4 (436-478)||(40229671-40229713)
chr4 (444-478)||(52312813-52312847)
chr4 (372-409)||(362299-362336)
chr4 (338-423)||(14629408-14629493)
chr4 (164-209)||(14745886-14745931)
chr4 (164-205)||(15355028-15355069)
chr4 (205-250)||(18218868-18218912)
chr4 (349-430)||(25512934-25513015)
chr4 (415-508)||(26922389-26922479)
chr4 (392-440)||(9621699-9621747)
chr4 (386-430)||(12622672-12622716)
chr4 (386-430)||(14508050-14508094)
chr4 (8-117)||(14995644-14995753)
chr4 (386-430)||(15041849-15041893)
chr4 (386-430)||(15112531-15112575)
chr4 (214-310)||(19435087-19435183)
chr4 (427-479)||(35660062-35660114)
chr4 (386-430)||(46740436-46740480)
[»] chr5 (127 HSPs)
chr5 (8-509)||(20901468-20901970)
chr5 (8-509)||(20917394-20917895)
chr5 (8-420)||(17516711-17517123)
chr5 (8-409)||(2154179-2154580)
chr5 (8-425)||(29330181-29330597)
chr5 (8-425)||(32027643-32028060)
chr5 (98-409)||(20909226-20909536)
chr5 (98-405)||(23064731-23065038)
chr5 (98-409)||(264406-264716)
chr5 (98-409)||(39245350-39245660)
chr5 (98-409)||(39363598-39363908)
chr5 (7-330)||(17516517-17516840)
chr5 (98-405)||(38619654-38619960)
chr5 (98-409)||(29346194-29346504)
chr5 (98-409)||(29348667-29348977)
chr5 (98-409)||(29351140-29351450)
chr5 (12-330)||(295826-296144)
chr5 (131-409)||(10732611-10732888)
chr5 (99-409)||(42245004-42245313)
chr5 (7-330)||(32028318-32028641)
chr5 (8-330)||(32028124-32028447)
chr5 (8-330)||(32027931-32028254)
chr5 (131-409)||(37804573-37804851)
chr5 (164-330)||(17516481-17516647)
chr5 (164-330)||(20901431-20901597)
chr5 (200-409)||(9776572-9776781)
chr5 (166-330)||(32028511-32028675)
chr5 (167-330)||(2154145-2154308)
chr5 (164-330)||(29330468-29330634)
chr5 (164-330)||(295785-295951)
chr5 (164-330)||(20917357-20917523)
chr5 (392-509)||(32027612-32027729)
chr5 (8-139)||(296015-296146)
chr5 (392-509)||(29330150-29330267)
chr5 (8-136)||(37804643-37804771)
chr5 (8-137)||(20909304-20909433)
chr5 (8-137)||(38619729-38619858)
chr5 (8-137)||(264509-264638)
chr5 (8-137)||(10732681-10732810)
chr5 (8-137)||(23064806-23064935)
chr5 (8-137)||(39363677-39363806)
chr5 (8-137)||(29346272-29346401)
chr5 (8-137)||(39245428-39245557)
chr5 (8-137)||(42245106-42245235)
chr5 (8-137)||(29348745-29348874)
chr5 (8-137)||(29351218-29351347)
chr5 (338-409)||(20901904-20901975)
chr5 (8-136)||(9776652-9776780)
chr5 (444-509)||(264646-264711)
chr5 (444-509)||(20909231-20909296)
chr5 (444-509)||(39245355-39245420)
chr5 (444-509)||(42245243-42245308)
chr5 (338-409)||(29330145-29330215)
chr5 (338-409)||(32027607-32027677)
chr5 (444-509)||(10732818-10732883)
chr5 (214-310)||(27183182-27183278)
chr5 (338-409)||(20917830-20917900)
chr5 (443-509)||(23064732-23064799)
chr5 (443-509)||(38619655-38619722)
chr5 (444-509)||(17517041-17517107)
chr5 (200-310)||(22883903-22884013)
chr5 (342-430)||(18743948-18744036)
chr5 (386-479)||(18743839-18743929)
chr5 (212-310)||(1220355-1220453)
chr5 (444-509)||(2154509-2154575)
chr5 (389-479)||(21399891-21399981)
chr5 (200-310)||(43444008-43444118)
chr5 (386-479)||(1628163-1628256)
chr5 (241-310)||(10778832-10778901)
chr5 (444-509)||(29346199-29346264)
chr5 (444-509)||(29348672-29348737)
chr5 (444-509)||(29351145-29351210)
chr5 (214-322)||(23506491-23506599)
chr5 (395-478)||(18743953-18744036)
chr5 (341-440)||(21399896-21399995)
chr5 (443-509)||(39363603-39363670)
chr5 (200-310)||(11903-12013)
chr5 (212-310)||(23511127-23511225)
chr5 (200-310)||(25426177-25426287)
chr5 (339-440)||(1628169-1628270)
chr5 (200-308)||(7424879-7424987)
chr5 (214-310)||(11342190-11342286)
chr5 (439-509)||(9776577-9776648)
chr5 (439-509)||(37804775-37804846)
chr5 (200-310)||(21933242-21933352)
chr5 (200-310)||(21939412-21939522)
chr5 (200-310)||(22367094-22367204)
chr5 (200-310)||(35581340-35581450)
chr5 (200-310)||(36990638-36990748)
chr5 (241-310)||(1168832-1168901)
chr5 (241-310)||(11212734-11212803)
chr5 (386-459)||(20198501-20198574)
chr5 (241-310)||(21074249-21074318)
chr5 (386-479)||(14026527-14026630)
chr5 (386-479)||(14026590-14026693)
chr5 (339-440)||(18743825-18743923)
chr5 (436-479)||(21503315-21503358)
chr5 (386-440)||(16062669-16062723)
chr5 (200-310)||(18778605-18778715)
chr5 (386-440)||(20198312-20198366)
chr5 (240-310)||(32950213-32950283)
chr5 (386-439)||(20198375-20198428)
chr5 (411-476)||(30613814-30613879)
chr5 (214-310)||(19499428-19499524)
chr5 (214-310)||(22755172-22755268)
chr5 (386-479)||(26749355-26749458)
chr5 (214-310)||(31478936-31479032)
chr5 (214-310)||(35791738-35791834)
chr5 (390-509)||(1628104-1628234)
chr5 (436-479)||(8833876-8833919)
chr5 (436-479)||(16062844-16062887)
chr5 (436-479)||(20198309-20198352)
chr5 (436-479)||(26749418-26749461)
chr5 (411-466)||(30611864-30611919)
chr5 (437-479)||(16062683-16062725)
chr5 (386-440)||(16062830-16062884)
chr5 (448-509)||(18743974-18744036)
chr5 (436-478)||(21399724-21399766)
chr5 (386-440)||(21399727-21399781)
chr5 (386-440)||(26749341-26749395)
chr5 (386-440)||(26761718-26761772)
chr5 (444-478)||(29330234-29330268)
chr5 (444-478)||(32027696-32027730)
chr5 (383-440)||(23200145-23200202)
chr5 (339-380)||(24067282-24067323)
chr5 (386-430)||(8833879-8833923)
chr5 (214-310)||(17909033-17909129)
[»] chr7 (189 HSPs)
chr7 (8-509)||(15081389-15081890)
chr7 (8-509)||(8940393-8940897)
chr7 (8-509)||(14269504-14270005)
chr7 (19-509)||(45847213-45847704)
chr7 (8-409)||(16213898-16214299)
chr7 (8-409)||(21189143-21189543)
chr7 (98-409)||(15376351-15376661)
chr7 (98-409)||(20384761-20385071)
chr7 (98-409)||(27217074-27217385)
chr7 (98-409)||(16410273-16410583)
chr7 (98-409)||(456535-456846)
chr7 (98-405)||(13869566-13869872)
chr7 (98-409)||(16232734-16233045)
chr7 (164-509)||(8468859-8469194)
chr7 (98-423)||(26355619-26355943)
chr7 (98-423)||(26358071-26358395)
chr7 (98-409)||(18627780-18628090)
chr7 (98-409)||(18640486-18640796)
chr7 (8-330)||(14269311-14269633)
chr7 (131-409)||(41523131-41523409)
chr7 (131-409)||(41525593-41525871)
chr7 (8-330)||(8940769-8941091)
chr7 (131-409)||(11303461-11303739)
chr7 (131-409)||(14948793-14949070)
chr7 (131-409)||(32125705-32125982)
chr7 (8-330)||(14156626-14156944)
chr7 (98-409)||(11392937-11393235)
chr7 (131-409)||(16108359-16108637)
chr7 (114-423)||(29796810-29797119)
chr7 (114-423)||(29800629-29800938)
chr7 (131-403)||(23664623-23664895)
chr7 (122-409)||(18430926-18431212)
chr7 (131-409)||(24702452-24702720)
chr7 (131-409)||(24704899-24705167)
chr7 (333-509)||(38897995-38898171)
chr7 (131-329)||(25926800-25926998)
chr7 (133-330)||(10501066-10501263)
chr7 (164-425)||(11972746-11973007)
chr7 (131-329)||(1856900-1857097)
chr7 (131-329)||(13918073-13918272)
chr7 (167-330)||(38897741-38897904)
chr7 (231-403)||(13841274-13841446)
chr7 (166-330)||(14269276-14269440)
chr7 (167-330)||(14156592-14156755)
chr7 (164-330)||(8940962-8941128)
chr7 (164-330)||(16214170-16214336)
chr7 (164-324)||(15081352-15081512)
chr7 (164-330)||(21189106-21189272)
chr7 (167-297)||(10500934-10501064)
chr7 (8-143)||(38897775-38897910)
chr7 (88-245)||(11310133-11310289)
chr7 (8-146)||(25926870-25927008)
chr7 (168-330)||(17985092-17985254)
chr7 (8-136)||(11303541-11303669)
chr7 (8-136)||(23664693-23664821)
chr7 (392-509)||(11972715-11972832)
chr7 (8-137)||(15376454-15376583)
chr7 (8-137)||(16410351-16410480)
chr7 (8-137)||(20384864-20384993)
chr7 (8-137)||(24702521-24702650)
chr7 (8-137)||(24704968-24705097)
chr7 (10-161)||(10501136-10501288)
chr7 (8-136)||(29796904-29797032)
chr7 (8-136)||(29800723-29800851)
chr7 (8-146)||(1856970-1857107)
chr7 (8-137)||(456614-456743)
chr7 (7-137)||(8940572-8940706)
chr7 (8-137)||(13869641-13869770)
chr7 (8-137)||(14948863-14948992)
chr7 (8-137)||(18627858-18627987)
chr7 (8-137)||(27217153-27217282)
chr7 (8-136)||(16108429-16108557)
chr7 (8-137)||(16232813-16232942)
chr7 (8-137)||(18640564-18640693)
chr7 (8-137)||(32125783-32125912)
chr7 (8-146)||(13918143-13918282)
chr7 (8-137)||(11972841-11972970)
chr7 (8-137)||(26355722-26355851)
chr7 (8-137)||(26358174-26358303)
chr7 (8-137)||(41523210-41523339)
chr7 (8-137)||(41525672-41525801)
chr7 (7-161)||(14156818-14156969)
chr7 (8-161)||(17985125-17985279)
chr7 (7-137)||(45847394-45847524)
chr7 (8-137)||(8469028-8469157)
chr7 (338-405)||(45847638-45847705)
chr7 (22-137)||(11393041-11393156)
chr7 (444-509)||(14949000-14949065)
chr7 (444-509)||(15376591-15376656)
chr7 (11-125)||(18431016-18431130)
chr7 (444-509)||(20385001-20385066)
chr7 (444-509)||(32125710-32125775)
chr7 (338-413)||(11972706-11972780)
chr7 (446-509)||(18430931-18430994)
chr7 (392-466)||(13841264-13841338)
chr7 (444-509)||(16410278-16410343)
chr7 (443-509)||(456540-456607)
chr7 (443-509)||(11393163-11393230)
chr7 (443-509)||(13869567-13869634)
chr7 (338-409)||(14269940-14270010)
chr7 (338-409)||(15081825-15081895)
chr7 (443-509)||(16232739-16232806)
chr7 (443-509)||(27217079-27217146)
chr7 (338-409)||(38898106-38898176)
chr7 (443-509)||(41523136-41523203)
chr7 (443-509)||(41525598-41525665)
chr7 (38-137)||(13841347-13841446)
chr7 (444-509)||(18640491-18640556)
chr7 (444-509)||(21189473-21189538)
chr7 (164-233)||(23461795-23461864)
chr7 (214-310)||(11286976-11287072)
chr7 (243-331)||(11310239-11310327)
chr7 (338-409)||(8940388-8940458)
chr7 (8-71)||(10500968-10501031)
chr7 (392-479)||(15119919-15120006)
chr7 (241-310)||(125965-126034)
chr7 (444-509)||(18627785-18627850)
chr7 (444-509)||(26355859-26355924)
chr7 (444-509)||(26358311-26358376)
chr7 (338-430)||(15119918-15120010)
chr7 (439-509)||(11303466-11303537)
chr7 (447-509)||(16213903-16213966)
chr7 (439-509)||(29796829-29796900)
chr7 (439-509)||(29800648-29800719)
chr7 (212-310)||(15951605-15951703)
chr7 (386-459)||(43747669-43747742)
chr7 (390-466)||(13745567-13745643)
chr7 (439-509)||(16108561-16108632)
chr7 (200-310)||(7822013-7822123)
chr7 (200-310)||(7829324-7829434)
chr7 (439-508)||(23664825-23664895)
chr7 (200-310)||(27102511-27102621)
chr7 (200-310)||(27109859-27109969)
chr7 (200-310)||(27175705-27175815)
chr7 (200-310)||(38784603-38784713)
chr7 (387-475)||(14153617-14153703)
chr7 (241-310)||(15760779-15760848)
chr7 (436-508)||(38294567-38294640)
chr7 (214-310)||(32495064-32495160)
chr7 (436-479)||(20619574-20619617)
chr7 (386-479)||(33556900-33557002)
chr7 (339-416)||(13745569-13745646)
chr7 (387-440)||(15576614-15576667)
chr7 (386-459)||(38294564-38294637)
chr7 (386-479)||(38294723-38294815)
chr7 (214-310)||(1937800-1937896)
chr7 (214-310)||(10000998-10001094)
chr7 (386-479)||(15576550-15576653)
chr7 (214-298)||(16202768-16202852)
chr7 (8-40)||(20110747-20110779)
chr7 (8-40)||(23461832-23461864)
chr7 (339-403)||(38294567-38294631)
chr7 (436-479)||(8473053-8473096)
chr7 (436-479)||(8514384-8514427)
chr7 (436-479)||(8851880-8851923)
chr7 (432-479)||(9743719-9743766)
chr7 (436-479)||(33556897-33556940)
chr7 (436-479)||(36301540-36301583)
chr7 (436-479)||(37538497-37538540)
chr7 (436-479)||(37538651-37538694)
chr7 (436-479)||(43747765-43747808)
chr7 (436-479)||(48213649-48213692)
chr7 (339-479)||(8472945-8473087)
chr7 (386-440)||(8473039-8473093)
chr7 (444-478)||(13841305-13841339)
chr7 (433-479)||(14258643-14258689)
chr7 (386-440)||(15120029-15120083)
chr7 (433-479)||(16460647-16460693)
chr7 (433-479)||(16579951-16579997)
chr7 (433-479)||(16585666-16585712)
chr7 (433-479)||(20487734-20487780)
chr7 (437-479)||(25941537-25941579)
chr7 (386-440)||(37538483-37538537)
chr7 (386-440)||(37538637-37538691)
chr7 (386-440)||(43747751-43747805)
chr7 (372-409)||(8468854-8468891)
chr7 (436-508)||(13745560-13745633)
chr7 (364-409)||(13841226-13841270)
chr7 (444-508)||(15119918-15119983)
chr7 (200-321)||(15167530-15167651)
chr7 (436-477)||(15576547-15576588)
chr7 (205-282)||(29004416-29004492)
chr7 (386-430)||(8851883-8851927)
chr7 (481-509)||(13841231-13841259)
chr7 (201-233)||(20110747-20110779)
chr7 (386-430)||(25941533-25941577)
chr7 (386-430)||(36301543-36301587)
chr7 (201-313)||(43277120-43277232)
chr7 (386-430)||(48213652-48213696)
[»] scaffold0747 (5 HSPs)
scaffold0747 (8-509)||(703-1204)
scaffold0747 (181-330)||(1075-1224)
scaffold0747 (164-299)||(1226-1360)
scaffold0747 (8-107)||(1225-1323)
scaffold0747 (338-409)||(698-768)
[»] chr6 (149 HSPs)
chr6 (8-509)||(18914046-18914547)
chr6 (8-508)||(19005266-19005766)
chr6 (10-509)||(31630090-31630590)
chr6 (11-409)||(1598271-1598668)
chr6 (8-409)||(30676257-30676658)
chr6 (8-409)||(19847519-19847916)
chr6 (7-409)||(25688716-25689118)
chr6 (19-409)||(26924199-26924588)
chr6 (98-409)||(18334230-18334540)
chr6 (98-409)||(24422761-24423071)
chr6 (98-409)||(33864492-33864802)
chr6 (98-409)||(2290818-2291128)
chr6 (98-409)||(8055243-8055554)
chr6 (98-409)||(22782441-22782751)
chr6 (131-409)||(33862008-33862285)
chr6 (131-409)||(12742531-12742809)
chr6 (8-330)||(1598542-1598864)
chr6 (131-409)||(1540582-1540859)
chr6 (8-330)||(25688988-25689310)
chr6 (164-409)||(34963587-34963832)
chr6 (131-409)||(28289007-28289283)
chr6 (131-409)||(19858593-19858867)
chr6 (164-389)||(25535641-25535866)
chr6 (189-409)||(17377576-17377796)
chr6 (8-326)||(18914422-18914740)
chr6 (131-409)||(12942415-12942681)
chr6 (98-326)||(26924085-26924313)
chr6 (164-409)||(23992637-23992881)
chr6 (8-229)||(8864-9085)
chr6 (18-237)||(25737028-25737247)
chr6 (131-329)||(23415258-23415456)
chr6 (131-329)||(27557016-27557214)
chr6 (287-508)||(15875526-15875737)
chr6 (131-283)||(15892079-15892231)
chr6 (167-330)||(1871-2034)
chr6 (167-330)||(8830-8993)
chr6 (164-330)||(19005637-19005803)
chr6 (8-171)||(1905-2068)
chr6 (42-207)||(22981321-22981486)
chr6 (42-207)||(23806922-23807087)
chr6 (131-268)||(17883168-17883305)
chr6 (167-330)||(19847485-19847648)
chr6 (164-330)||(1598735-1598901)
chr6 (164-326)||(18914615-18914777)
chr6 (164-330)||(30676220-30676386)
chr6 (164-330)||(31630051-31630217)
chr6 (7-173)||(112-278)
chr6 (167-330)||(79-242)
chr6 (8-137)||(17377588-17377717)
chr6 (8-146)||(27557006-27557144)
chr6 (8-137)||(1598349-1598478)
chr6 (8-137)||(23992715-23992844)
chr6 (198-330)||(25689181-25689313)
chr6 (8-146)||(23415248-23415386)
chr6 (8-137)||(1540652-1540781)
chr6 (8-137)||(18334333-18334462)
chr6 (8-137)||(24422839-24422968)
chr6 (8-137)||(25535700-25535829)
chr6 (8-137)||(26924381-26924510)
chr6 (8-137)||(33862086-33862215)
chr6 (8-137)||(33864570-33864699)
chr6 (8-136)||(28289077-28289205)
chr6 (8-137)||(12742610-12742739)
chr6 (214-330)||(25737128-25737244)
chr6 (8-137)||(34963666-34963795)
chr6 (8-137)||(2290921-2291050)
chr6 (7-137)||(19847711-19847837)
chr6 (8-137)||(22782519-22782648)
chr6 (8-137)||(8055322-8055451)
chr6 (8-137)||(31630281-31630410)
chr6 (338-409)||(31630524-31630595)
chr6 (8-137)||(19858663-19858789)
chr6 (235-330)||(22981321-22981416)
chr6 (235-330)||(23806992-23807087)
chr6 (444-509)||(1540789-1540854)
chr6 (444-509)||(1598276-1598341)
chr6 (444-509)||(18334470-18334535)
chr6 (444-509)||(23992642-23992707)
chr6 (444-509)||(24422766-24422831)
chr6 (444-509)||(26924518-26924583)
chr6 (444-509)||(33862013-33862078)
chr6 (444-509)||(33864497-33864562)
chr6 (386-479)||(35056694-35056787)
chr6 (8-71)||(15892149-15892212)
chr6 (444-509)||(2291058-2291123)
chr6 (444-509)||(19858797-19858862)
chr6 (444-509)||(22782446-22782511)
chr6 (443-509)||(8055248-8055315)
chr6 (338-409)||(18914041-18914111)
chr6 (338-409)||(19005260-19005330)
chr6 (444-509)||(19847845-19847911)
chr6 (214-310)||(19984132-19984228)
chr6 (8-71)||(17883238-17883301)
chr6 (339-479)||(35056631-35056781)
chr6 (8-136)||(12942495-12942611)
chr6 (200-310)||(16240296-16240406)
chr6 (200-310)||(16556944-16557054)
chr6 (200-310)||(16633500-16633610)
chr6 (200-310)||(16650174-16650284)
chr6 (444-509)||(30676587-30676653)
chr6 (444-509)||(34963592-34963658)
chr6 (214-310)||(35016017-35016113)
chr6 (439-509)||(12942420-12942491)
chr6 (200-310)||(25904474-25904585)
chr6 (444-509)||(12742536-12742602)
chr6 (444-509)||(25688721-25688787)
chr6 (200-310)||(27654596-27654706)
chr6 (214-310)||(22226582-22226679)
chr6 (214-310)||(21776109-21776205)
chr6 (338-409)||(15875520-15875590)
chr6 (94-133)||(15875698-15875737)
chr6 (239-310)||(22593620-22593691)
chr6 (200-310)||(10487971-10488081)
chr6 (200-310)||(16377247-16377357)
chr6 (200-310)||(16384571-16384681)
chr6 (200-310)||(16826367-16826477)
chr6 (444-509)||(17377725-17377791)
chr6 (241-310)||(1555527-1555596)
chr6 (241-310)||(33315116-33315185)
chr6 (200-308)||(19609582-19609690)
chr6 (386-450)||(32259078-32259142)
chr6 (444-494)||(25535641-25535692)
chr6 (214-256)||(10905418-10905460)
chr6 (433-479)||(22806124-22806170)
chr6 (355-409)||(25656843-25656897)
chr6 (241-310)||(16133087-16133156)
chr6 (436-508)||(35056717-35056790)
chr6 (19-63)||(10905416-10905460)
chr6 (8-44)||(25737028-25737064)
chr6 (439-509)||(28289209-28289278)
chr6 (436-479)||(10445379-10445422)
chr6 (436-479)||(13284937-13284980)
chr6 (436-479)||(20411373-20411416)
chr6 (436-479)||(25920959-25921002)
chr6 (436-479)||(25921022-25921065)
chr6 (436-479)||(29044491-29044534)
chr6 (433-479)||(19773424-19773470)
chr6 (386-440)||(20411376-20411430)
chr6 (386-440)||(22556422-22556476)
chr6 (386-440)||(22556529-22556583)
chr6 (260-310)||(23153035-23153085)
chr6 (200-310)||(25175112-25175222)
chr6 (386-440)||(29044477-29044531)
chr6 (339-397)||(32259078-32259136)
chr6 (437-479)||(32259102-32259144)
chr6 (386-440)||(35056617-35056671)
chr6 (200-313)||(18455448-18455561)
chr6 (241-321)||(19443697-19443777)
chr6 (389-425)||(22556481-22556517)
[»] chr1 (99 HSPs)
chr1 (8-509)||(16274803-16275306)
chr1 (8-509)||(29298355-29298856)
chr1 (8-403)||(27161134-27161529)
chr1 (8-425)||(29776938-29777355)
chr1 (8-466)||(31612523-31612980)
chr1 (98-409)||(13989080-13989390)
chr1 (8-425)||(22122561-22122979)
chr1 (8-409)||(15859543-15859956)
chr1 (98-409)||(21474724-21475035)
chr1 (8-330)||(31612851-31613173)
chr1 (131-409)||(21840981-21841258)
chr1 (131-409)||(21922962-21923239)
chr1 (131-409)||(16362132-16362410)
chr1 (122-357)||(13227129-13227364)
chr1 (122-357)||(29535317-29535552)
chr1 (99-409)||(23593372-23593682)
chr1 (167-425)||(22050543-22050801)
chr1 (164-330)||(15859506-15859672)
chr1 (8-270)||(16401274-16401536)
chr1 (164-330)||(29298727-29298893)
chr1 (164-330)||(22122524-22122691)
chr1 (164-330)||(16274766-16274932)
chr1 (164-330)||(31613044-31613210)
chr1 (167-323)||(9044711-9044867)
chr1 (87-271)||(10812632-10812816)
chr1 (166-330)||(29777226-29777390)
chr1 (163-330)||(16401407-16401574)
chr1 (166-330)||(27161099-27161263)
chr1 (164-320)||(40129387-40129543)
chr1 (392-509)||(22050715-22050832)
chr1 (392-509)||(29776907-29777024)
chr1 (8-137)||(22050577-22050706)
chr1 (164-255)||(43543269-43543360)
chr1 (7-137)||(27161326-27161456)
chr1 (392-509)||(22122893-22123010)
chr1 (8-137)||(13989158-13989287)
chr1 (8-130)||(9044745-9044867)
chr1 (392-509)||(31612532-31612649)
chr1 (8-137)||(13227156-13227285)
chr1 (8-137)||(21923032-21923161)
chr1 (392-509)||(27161465-27161582)
chr1 (8-137)||(21474827-21474956)
chr1 (8-137)||(21841059-21841188)
chr1 (8-137)||(23593474-23593603)
chr1 (8-137)||(29535344-29535473)
chr1 (8-137)||(16362211-16362340)
chr1 (338-409)||(16275240-16275311)
chr1 (131-198)||(41372896-41372963)
chr1 (8-127)||(40129387-40129506)
chr1 (444-509)||(13989085-13989150)
chr1 (444-509)||(21923169-21923234)
chr1 (338-409)||(22050767-22050837)
chr1 (338-409)||(29776902-29776972)
chr1 (444-509)||(15859886-15859951)
chr1 (444-509)||(21840986-21841051)
chr1 (443-509)||(21474963-21475030)
chr1 (338-409)||(29298350-29298420)
chr1 (260-330)||(10812612-10812682)
chr1 (8-62)||(43543269-43543323)
chr1 (443-509)||(16362137-16362204)
chr1 (338-409)||(22122945-22123015)
chr1 (443-509)||(23593610-23593677)
chr1 (339-409)||(27161518-27161587)
chr1 (214-310)||(21858592-21858688)
chr1 (212-310)||(21650881-21650979)
chr1 (242-310)||(44035860-44035928)
chr1 (200-310)||(17003909-17004019)
chr1 (241-310)||(22366527-22366596)
chr1 (164-209)||(43630292-43630337)
chr1 (386-479)||(7321570-7321673)
chr1 (386-466)||(12710137-12710217)
chr1 (214-310)||(18060588-18060684)
chr1 (386-479)||(18120834-18120937)
chr1 (387-442)||(24720477-24720532)
chr1 (386-440)||(50544130-50544184)
chr1 (386-439)||(50544005-50544058)
chr1 (386-430)||(50544077-50544121)
chr1 (436-479)||(7321567-7321610)
chr1 (436-479)||(12710177-12710220)
chr1 (436-479)||(22824127-22824170)
chr1 (387-442)||(24720414-24720469)
chr1 (436-479)||(50544144-50544187)
chr1 (386-440)||(18120757-18120811)
chr1 (386-440)||(18120820-18120874)
chr1 (444-478)||(22050714-22050748)
chr1 (444-478)||(22122892-22122926)
chr1 (444-478)||(27161464-27161498)
chr1 (444-478)||(29776991-29777025)
chr1 (444-478)||(31612616-31612650)
chr1 (386-440)||(50543878-50543932)
chr1 (383-440)||(1642847-1642904)
chr1 (386-439)||(21244600-21244653)
chr1 (436-476)||(635867-635907)
chr1 (386-430)||(7321633-7321677)
chr1 (386-430)||(22824130-22824174)
chr1 (214-282)||(24815242-24815310)
chr1 (436-476)||(39060387-39060427)
chr1 (214-310)||(45574442-45574538)
chr1 (386-430)||(48301153-48301197)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (8-509)||(30132-30634)
scaffold0149 (163-330)||(30505-30672)
scaffold0149 (340-409)||(30127-30196)
[»] chr8 (186 HSPs)
chr8 (8-508)||(16401472-16401972)
chr8 (8-509)||(38549552-38550054)
chr8 (8-509)||(19936455-19936946)
chr8 (7-405)||(27471963-27472361)
chr8 (8-420)||(32121931-32122343)
chr8 (11-409)||(16412866-16413264)
chr8 (8-405)||(15070778-15071175)
chr8 (8-393)||(24048841-24049225)
chr8 (8-425)||(20403477-20403894)
chr8 (8-425)||(15202726-15203143)
chr8 (7-403)||(19896541-19896937)
chr8 (98-409)||(1484616-1484926)
chr8 (98-409)||(14409082-14409392)
chr8 (98-409)||(5852930-5853240)
chr8 (164-509)||(1326635-1326980)
chr8 (98-423)||(14823975-14824299)
chr8 (8-331)||(15202533-15202856)
chr8 (98-409)||(4483494-4483804)
chr8 (7-330)||(19896807-19897130)
chr8 (131-409)||(24485714-24485992)
chr8 (98-409)||(20045833-20046143)
chr8 (8-330)||(38549360-38549681)
chr8 (131-409)||(18677735-18678013)
chr8 (97-402)||(16198115-16198420)
chr8 (131-409)||(22001967-22002244)
chr8 (131-409)||(4542044-4542321)
chr8 (16-330)||(16401287-16401601)
chr8 (107-330)||(16401186-16401408)
chr8 (139-329)||(14397419-14397609)
chr8 (200-402)||(25657892-25658094)
chr8 (99-299)||(45290186-45290386)
chr8 (338-509)||(20982498-20982670)
chr8 (204-425)||(45290385-45290606)
chr8 (164-330)||(27471927-27472093)
chr8 (164-330)||(32122214-32122380)
chr8 (349-509)||(13425241-13425402)
chr8 (164-330)||(20403765-20403931)
chr8 (164-330)||(38549323-38549488)
chr8 (165-330)||(16412827-16412992)
chr8 (164-330)||(15071046-15071212)
chr8 (164-330)||(15202496-15202662)
chr8 (164-322)||(24049104-24049262)
chr8 (338-459)||(13425336-13425457)
chr8 (164-330)||(19897000-19897166)
chr8 (392-509)||(45290520-45290637)
chr8 (164-330)||(19936418-19936584)
chr8 (392-509)||(20403446-20403563)
chr8 (411-509)||(32810150-32810248)
chr8 (8-137)||(14824067-14824196)
chr8 (8-137)||(18677805-18677934)
chr8 (411-509)||(19896488-19896586)
chr8 (11-137)||(45290385-45290511)
chr8 (8-137)||(1484694-1484823)
chr8 (8-137)||(14409185-14409314)
chr8 (8-137)||(25657893-25658022)
chr8 (8-146)||(14397481-14397619)
chr8 (392-509)||(15203057-15203174)
chr8 (8-137)||(1326672-1326801)
chr8 (8-137)||(4483573-4483702)
chr8 (8-137)||(5853033-5853162)
chr8 (8-137)||(16198187-16198316)
chr8 (8-137)||(16413056-16413185)
chr8 (8-137)||(24485784-24485913)
chr8 (164-298)||(11361034-11361168)
chr8 (8-137)||(4542114-4542243)
chr8 (8-137)||(20045936-20046065)
chr8 (8-137)||(22002045-22002174)
chr8 (164-256)||(32810263-32810355)
chr8 (338-409)||(20982604-20982675)
chr8 (7-109)||(45290287-45290389)
chr8 (338-413)||(32810141-32810215)
chr8 (338-409)||(38549988-38550059)
chr8 (439-509)||(4542246-4542316)
chr8 (444-509)||(1484621-1484686)
chr8 (444-509)||(5853170-5853235)
chr8 (444-509)||(14409322-14409387)
chr8 (444-509)||(22001972-22002037)
chr8 (343-479)||(5082945-5083081)
chr8 (338-409)||(20403441-20403511)
chr8 (338-409)||(45290572-45290642)
chr8 (338-409)||(1326915-1326985)
chr8 (443-509)||(15070779-15070846)
chr8 (338-409)||(19896483-19896553)
chr8 (8-115)||(11361024-11361131)
chr8 (200-310)||(15319988-15320098)
chr8 (200-310)||(15500357-15500467)
chr8 (339-409)||(19936882-19936951)
chr8 (444-509)||(20046073-20046138)
chr8 (241-310)||(29759429-29759498)
chr8 (342-430)||(21513619-21513707)
chr8 (214-310)||(24717724-24717820)
chr8 (387-479)||(38988717-38988809)
chr8 (387-479)||(39019814-39019906)
chr8 (386-508)||(5082935-5083058)
chr8 (338-409)||(15203109-15203179)
chr8 (338-409)||(16401908-16401978)
chr8 (8-63)||(32810263-32810318)
chr8 (444-509)||(16413193-16413259)
chr8 (444-509)||(24485921-24485987)
chr8 (444-509)||(27472294-27472360)
chr8 (444-509)||(32121947-32122013)
chr8 (241-310)||(13663129-13663198)
chr8 (444-509)||(14823994-14824059)
chr8 (386-479)||(18815603-18815696)
chr8 (339-440)||(18815609-18815710)
chr8 (241-310)||(22007126-22007195)
chr8 (444-507)||(16198115-16198179)
chr8 (214-310)||(17150629-17150725)
chr8 (395-479)||(21513623-21513707)
chr8 (443-509)||(4483499-4483566)
chr8 (339-479)||(38988654-38988804)
chr8 (339-479)||(39019751-39019901)
chr8 (212-310)||(39114415-39114513)
chr8 (386-459)||(21513527-21513600)
chr8 (386-479)||(36733296-36733389)
chr8 (339-440)||(36733302-36733403)
chr8 (107-161)||(3844554-3844609)
chr8 (339-478)||(13425284-13425423)
chr8 (200-310)||(223304-223414)
chr8 (200-310)||(272163-272273)
chr8 (200-310)||(643576-643686)
chr8 (200-310)||(688075-688185)
chr8 (200-310)||(736927-737037)
chr8 (200-310)||(829382-829492)
chr8 (200-310)||(860822-860932)
chr8 (110-156)||(11360951-11360997)
chr8 (444-509)||(16401802-16401868)
chr8 (444-509)||(18677942-18678008)
chr8 (240-310)||(22089412-22089482)
chr8 (346-430)||(5083001-5083085)
chr8 (383-439)||(18819447-18819503)
chr8 (386-479)||(23669840-23669943)
chr8 (444-498)||(24048841-24048896)
chr8 (444-507)||(25658030-25658094)
chr8 (386-509)||(18815540-18815674)
chr8 (223-310)||(21493050-21493137)
chr8 (386-440)||(17979199-17979253)
chr8 (260-310)||(18611952-18612002)
chr8 (386-440)||(18819387-18819441)
chr8 (386-440)||(23669952-23670006)
chr8 (386-508)||(38988740-38988873)
chr8 (386-508)||(39019837-39019970)
chr8 (383-440)||(6573734-6573791)
chr8 (241-310)||(18618830-18618899)
chr8 (241-310)||(22146977-22147046)
chr8 (386-479)||(22473855-22473958)
chr8 (436-479)||(17438101-17438144)
chr8 (436-479)||(17979133-17979176)
chr8 (436-479)||(18819384-18819427)
chr8 (436-479)||(20517901-20517944)
chr8 (436-479)||(22207535-22207578)
chr8 (436-479)||(22258942-22258985)
chr8 (436-479)||(22355990-22356033)
chr8 (387-479)||(23669966-23670068)
chr8 (436-479)||(36405764-36405807)
chr8 (386-509)||(36733233-36733367)
chr8 (436-479)||(38988833-38988876)
chr8 (436-479)||(39019930-39019973)
chr8 (386-440)||(5080287-5080341)
chr8 (432-478)||(5082928-5082974)
chr8 (386-440)||(6573800-6573854)
chr8 (386-440)||(17979136-17979190)
chr8 (444-478)||(20403530-20403564)
chr8 (386-440)||(20517904-20517958)
chr8 (433-479)||(21346114-21346160)
chr8 (448-509)||(21513645-21513707)
chr8 (386-440)||(22258945-22258999)
chr8 (436-478)||(22473919-22473961)
chr8 (386-440)||(23669826-23669880)
chr8 (433-479)||(23914215-23914261)
chr8 (386-440)||(36405767-36405821)
chr8 (8-146)||(15319989-15320126)
chr8 (8-146)||(15500358-15500495)
chr8 (215-272)||(24678771-24678828)
chr8 (19-117)||(24717722-24717820)
chr8 (387-440)||(38988640-38988693)
chr8 (387-440)||(39019737-39019790)
chr8 (439-479)||(6573737-6573777)
chr8 (427-479)||(12800589-12800641)
chr8 (386-430)||(17438104-17438148)
chr8 (216-268)||(19866496-19866548)
chr8 (386-430)||(22207531-22207575)
chr8 (386-430)||(22473851-22473895)
chr8 (436-476)||(22473984-22474024)
chr8 (214-282)||(39364118-39364186)
chr8 (214-282)||(44522816-44522884)
[»] scaffold0043 (4 HSPs)
scaffold0043 (8-478)||(9936-10406)
scaffold0043 (8-330)||(10277-10599)
scaffold0043 (167-330)||(10470-10633)
scaffold0043 (444-509)||(10010-10076)
[»] scaffold0741 (5 HSPs)
scaffold0741 (8-409)||(3850-4251)
scaffold0741 (8-330)||(3657-3979)
scaffold0741 (87-326)||(3543-3782)
scaffold0741 (444-509)||(4180-4246)
scaffold0741 (278-330)||(3541-3593)
[»] chr3 (193 HSPs)
chr3 (8-409)||(27165466-27165867)
chr3 (8-420)||(46822464-46822876)
chr3 (8-409)||(53301051-53301452)
chr3 (8-425)||(38961385-38961803)
chr3 (8-405)||(8499738-8500135)
chr3 (8-405)||(10557126-10557523)
chr3 (8-425)||(41124137-41124554)
chr3 (8-425)||(16282305-16282723)
chr3 (8-425)||(17444311-17444728)
chr3 (98-409)||(17463392-17463702)
chr3 (98-409)||(34159540-34159850)
chr3 (8-347)||(20629739-20630078)
chr3 (98-409)||(6468772-6469082)
chr3 (98-409)||(45606544-45606855)
chr3 (98-409)||(55476705-55477015)
chr3 (164-461)||(12119357-12119654)
chr3 (98-409)||(13153893-13154203)
chr3 (98-405)||(15412649-15412955)
chr3 (11-330)||(55318854-55319173)
chr3 (101-409)||(10247364-10247671)
chr3 (130-402)||(13436520-13436792)
chr3 (131-409)||(7781017-7781295)
chr3 (131-409)||(15977747-15978024)
chr3 (98-407)||(13151428-13151736)
chr3 (131-409)||(54521036-54521314)
chr3 (99-409)||(16453918-16454229)
chr3 (159-409)||(12567774-12568023)
chr3 (159-409)||(13544239-13544487)
chr3 (135-425)||(25237041-25237331)
chr3 (131-361)||(28848292-28848522)
chr3 (132-409)||(29544513-29544790)
chr3 (164-389)||(24513910-24514135)
chr3 (135-403)||(25229476-25229744)
chr3 (16-245)||(36528340-36528569)
chr3 (27-251)||(16358234-16358458)
chr3 (131-329)||(5223677-5223875)
chr3 (131-329)||(15465448-15465646)
chr3 (97-329)||(26054901-26055133)
chr3 (8-197)||(13937520-13937709)
chr3 (8-229)||(14567432-14567653)
chr3 (87-254)||(15007868-15008038)
chr3 (164-330)||(41124425-41124591)
chr3 (164-337)||(10379613-10379786)
chr3 (164-330)||(10557394-10557560)
chr3 (164-330)||(27165738-27165904)
chr3 (164-330)||(38961348-38961514)
chr3 (164-330)||(46822747-46822913)
chr3 (164-330)||(53301014-53301180)
chr3 (252-409)||(12305359-12305516)
chr3 (381-509)||(11913865-11913993)
chr3 (167-330)||(55318817-55318980)
chr3 (164-330)||(20629702-20629868)
chr3 (166-330)||(13937485-13937649)
chr3 (164-327)||(8500009-8500172)
chr3 (30-245)||(3264323-3264538)
chr3 (8-149)||(55319044-55319185)
chr3 (199-330)||(14567430-14567561)
chr3 (164-330)||(17444274-17444440)
chr3 (8-137)||(10379620-10379749)
chr3 (164-330)||(16282268-16282434)
chr3 (8-146)||(15465438-15465576)
chr3 (8-137)||(24513969-24514098)
chr3 (8-136)||(29544582-29544710)
chr3 (392-509)||(17444642-17444759)
chr3 (392-509)||(25237010-25237127)
chr3 (8-146)||(26055005-26055143)
chr3 (392-509)||(38961717-38961834)
chr3 (8-136)||(54521116-54521244)
chr3 (411-509)||(8899313-8899411)
chr3 (164-330)||(17393201-17393367)
chr3 (392-509)||(41124106-41124223)
chr3 (8-137)||(12119394-12119523)
chr3 (392-509)||(16282636-16282754)
chr3 (209-331)||(36528447-36528569)
chr3 (8-146)||(5223667-5223805)
chr3 (8-137)||(13436592-13436721)
chr3 (8-137)||(15977825-15977954)
chr3 (8-137)||(17463470-17463599)
chr3 (8-137)||(34159618-34159747)
chr3 (131-220)||(12305525-12305614)
chr3 (8-137)||(28848362-28848491)
chr3 (8-137)||(55476783-55476912)
chr3 (220-330)||(16358234-16358344)
chr3 (8-134)||(15412727-15412853)
chr3 (8-137)||(6468875-6469004)
chr3 (8-137)||(12567852-12567981)
chr3 (8-137)||(13544317-13544445)
chr3 (8-137)||(45606647-45606776)
chr3 (223-331)||(3264323-3264431)
chr3 (8-137)||(7781087-7781216)
chr3 (8-137)||(10247464-10247593)
chr3 (8-137)||(13151531-13151660)
chr3 (8-137)||(13153996-13154125)
chr3 (8-137)||(16454021-16454151)
chr3 (8-137)||(25237136-25237265)
chr3 (393-466)||(20630075-20630148)
chr3 (338-405)||(9707484-9707551)
chr3 (439-509)||(13154128-13154198)
chr3 (444-509)||(6469012-6469077)
chr3 (444-509)||(12567779-12567844)
chr3 (444-509)||(13544244-13544309)
chr3 (444-509)||(16454159-16454224)
chr3 (8-161)||(17393176-17393330)
chr3 (444-509)||(17463397-17463462)
chr3 (444-509)||(34159545-34159610)
chr3 (444-509)||(55476710-55476775)
chr3 (338-409)||(8899308-8899378)
chr3 (338-409)||(16282689-16282759)
chr3 (338-409)||(17444694-17444764)
chr3 (392-466)||(25229466-25229540)
chr3 (444-505)||(15977756-15977817)
chr3 (8-137)||(25229549-25229678)
chr3 (443-509)||(9707483-9707550)
chr3 (443-509)||(27165471-27165538)
chr3 (338-405)||(38961769-38961835)
chr3 (443-509)||(45606783-45606850)
chr3 (164-230)||(8899418-8899484)
chr3 (212-310)||(16934822-16934920)
chr3 (200-322)||(25058286-25058408)
chr3 (444-509)||(46822480-46822546)
chr3 (87-136)||(12305439-12305488)
chr3 (443-509)||(7781223-7781290)
chr3 (443-509)||(8499739-8499806)
chr3 (338-409)||(11913928-11913998)
chr3 (443-509)||(15412650-15412717)
chr3 (338-405)||(25237009-25237075)
chr3 (443-509)||(53301380-53301447)
chr3 (444-509)||(12119531-12119597)
chr3 (439-509)||(13151663-13151733)
chr3 (240-310)||(51158683-51158753)
chr3 (444-509)||(10247601-10247666)
chr3 (241-310)||(49231768-49231837)
chr3 (266-330)||(15007988-15008052)
chr3 (439-509)||(12305364-12305435)
chr3 (339-479)||(25201247-25201397)
chr3 (439-509)||(54521041-54521112)
chr3 (444-509)||(10557127-10557193)
chr3 (200-310)||(14528624-14528734)
chr3 (7-61)||(15007868-15007922)
chr3 (338-440)||(17044293-17044395)
chr3 (411-477)||(40812133-40812199)
chr3 (386-479)||(25201310-25201403)
chr3 (444-507)||(13436520-13436584)
chr3 (242-310)||(30152450-30152518)
chr3 (241-308)||(54039167-54039234)
chr3 (200-310)||(1468613-1468723)
chr3 (208-310)||(2281000-2281102)
chr3 (200-310)||(8276473-8276583)
chr3 (185-231)||(10555766-10555812)
chr3 (212-310)||(17956840-17956938)
chr3 (8-50)||(36528342-36528384)
chr3 (386-479)||(21846199-21846292)
chr3 (386-479)||(54331025-54331121)
chr3 (392-479)||(17044307-17044394)
chr3 (223-310)||(21026096-21026183)
chr3 (200-310)||(8269362-8269472)
chr3 (386-479)||(11191505-11191599)
chr3 (200-310)||(12808505-12808615)
chr3 (444-508)||(17044330-17044395)
chr3 (434-479)||(18700189-18700234)
chr3 (240-320)||(8023778-8023858)
chr3 (8-129)||(25058286-25058407)
chr3 (214-310)||(28557370-28557466)
chr3 (342-440)||(11191491-11191590)
chr3 (432-479)||(12470093-12470140)
chr3 (436-479)||(17207567-17207610)
chr3 (339-430)||(21846205-21846296)
chr3 (444-494)||(24513910-24513961)
chr3 (470-509)||(28848515-28848554)
chr3 (436-478)||(3528197-3528239)
chr3 (386-440)||(3528200-3528254)
chr3 (8-38)||(10555766-10555796)
chr3 (433-479)||(14671115-14671161)
chr3 (433-479)||(14682614-14682660)
chr3 (339-397)||(15025934-15025992)
chr3 (444-478)||(16282635-16282669)
chr3 (8-58)||(16358408-16358458)
chr3 (386-440)||(17207427-17207481)
chr3 (444-478)||(17444641-17444675)
chr3 (386-440)||(25201233-25201287)
chr3 (444-478)||(25229507-25229541)
chr3 (444-478)||(25237094-25237128)
chr3 (444-478)||(38961716-38961750)
chr3 (437-479)||(50351874-50351916)
chr3 (8-37)||(8899418-8899447)
chr3 (241-310)||(16820462-16820531)
chr3 (436-477)||(17207632-17207673)
chr3 (355-424)||(40812133-40812202)
chr3 (386-459)||(54331144-54331217)
chr3 (386-430)||(17207563-17207607)
chr3 (386-430)||(18700194-18700238)
chr3 (392-440)||(33564509-33564557)
chr3 (386-430)||(50351876-50351920)
[»] scaffold0317 (3 HSPs)
scaffold0317 (8-409)||(6483-6884)
scaffold0317 (164-330)||(6446-6612)
scaffold0317 (444-509)||(6813-6879)
[»] scaffold0574 (2 HSPs)
scaffold0574 (8-402)||(6682-7066)
scaffold0574 (164-330)||(6937-7103)
[»] scaffold0716 (3 HSPs)
scaffold0716 (8-409)||(4908-5309)
scaffold0716 (164-330)||(5180-5346)
scaffold0716 (444-509)||(4913-4979)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (25-407)||(17004-17386)
scaffold0023 (98-409)||(94625-94935)
scaffold0023 (167-330)||(16953-17116)
scaffold0023 (8-137)||(94703-94832)
scaffold0023 (8-137)||(17180-17309)
scaffold0023 (444-509)||(94630-94695)
scaffold0023 (444-509)||(17317-17383)
scaffold0023 (241-310)||(154892-154961)
[»] scaffold0306 (6 HSPs)
scaffold0306 (8-372)||(10887-11251)
scaffold0306 (8-409)||(15136-15526)
scaffold0306 (166-330)||(10852-11016)
scaffold0306 (164-330)||(15398-15563)
scaffold0306 (444-509)||(15141-15207)
scaffold0306 (444-479)||(11217-11252)
[»] scaffold0494 (3 HSPs)
scaffold0494 (164-509)||(227-573)
scaffold0494 (11-137)||(267-393)
scaffold0494 (338-409)||(507-578)
[»] scaffold0134 (3 HSPs)
scaffold0134 (98-409)||(38035-38346)
scaffold0134 (8-137)||(38114-38243)
scaffold0134 (443-509)||(38040-38107)
[»] scaffold0040 (5 HSPs)
scaffold0040 (8-360)||(43002-43354)
scaffold0040 (214-405)||(13380-13571)
scaffold0040 (164-330)||(43225-43391)
scaffold0040 (20-137)||(13379-13496)
scaffold0040 (443-509)||(13503-13570)
[»] scaffold0444 (3 HSPs)
scaffold0444 (97-413)||(13602-13918)
scaffold0444 (8-137)||(13685-13814)
scaffold0444 (443-509)||(13611-13678)
[»] scaffold0278 (4 HSPs)
scaffold0278 (11-366)||(7996-8351)
scaffold0278 (8-330)||(8225-8547)
scaffold0278 (164-327)||(8421-8584)
scaffold0278 (8-137)||(8032-8161)
[»] scaffold0230 (10 HSPs)
scaffold0230 (52-409)||(23122-23479)
scaffold0230 (131-409)||(14161-14439)
scaffold0230 (7-208)||(22917-23118)
scaffold0230 (164-330)||(22881-23047)
scaffold0230 (8-137)||(14240-14369)
scaffold0230 (8-137)||(23271-23400)
scaffold0230 (244-330)||(23121-23207)
scaffold0230 (444-509)||(14166-14232)
scaffold0230 (444-509)||(23408-23474)
scaffold0230 (164-212)||(20714-20762)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (11-341)||(501347-501676)
scaffold0001 (164-330)||(501550-501716)
scaffold0001 (8-137)||(501358-501486)
scaffold0001 (356-409)||(501298-501351)
scaffold0001 (214-268)||(139591-139645)
[»] scaffold1792 (6 HSPs)
scaffold1792 (52-409)||(421-778)
scaffold1792 (7-208)||(782-983)
scaffold1792 (164-330)||(853-1019)
scaffold1792 (8-137)||(500-629)
scaffold1792 (244-330)||(693-779)
scaffold1792 (444-509)||(426-492)
[»] scaffold0044 (4 HSPs)
scaffold0044 (97-409)||(40614-40925)
scaffold0044 (8-137)||(40692-40821)
scaffold0044 (444-509)||(40619-40684)
scaffold0044 (200-322)||(37848-37969)
[»] scaffold0695 (3 HSPs)
scaffold0695 (133-409)||(6161-6436)
scaffold0695 (8-137)||(6239-6368)
scaffold0695 (444-509)||(6166-6231)
[»] scaffold0254 (3 HSPs)
scaffold0254 (131-409)||(20961-21240)
scaffold0254 (8-137)||(21040-21169)
scaffold0254 (443-509)||(20966-21033)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (131-409)||(11503-11781)
scaffold0029 (7-133)||(11586-11712)
scaffold0029 (444-509)||(11508-11574)
[»] scaffold0422 (3 HSPs)
scaffold0422 (131-409)||(3237-3515)
scaffold0422 (8-136)||(3317-3445)
scaffold0422 (439-509)||(3242-3313)
[»] scaffold0363 (3 HSPs)
scaffold0363 (131-409)||(9456-9733)
scaffold0363 (8-137)||(9534-9663)
scaffold0363 (444-509)||(9461-9526)
[»] scaffold0028 (15 HSPs)
scaffold0028 (131-409)||(134425-134702)
scaffold0028 (131-409)||(136894-137171)
scaffold0028 (131-409)||(139363-139640)
scaffold0028 (131-409)||(141832-142109)
scaffold0028 (131-409)||(144301-144578)
scaffold0028 (8-137)||(134503-134632)
scaffold0028 (8-137)||(136972-137101)
scaffold0028 (8-137)||(139441-139570)
scaffold0028 (8-137)||(141910-142039)
scaffold0028 (8-137)||(144379-144508)
scaffold0028 (444-509)||(134430-134495)
scaffold0028 (444-509)||(136899-136964)
scaffold0028 (444-509)||(139368-139433)
scaffold0028 (444-509)||(141837-141902)
scaffold0028 (444-509)||(144306-144371)
[»] scaffold0151 (2 HSPs)
scaffold0151 (11-330)||(36749-37068)
scaffold0151 (7-179)||(36938-37110)
[»] scaffold0711 (3 HSPs)
scaffold0711 (13-329)||(7243-7558)
scaffold0711 (42-330)||(7079-7367)
scaffold0711 (8-199)||(7430-7621)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (131-357)||(68227-68453)
scaffold0064 (7-137)||(68254-68384)
[»] scaffold1296 (3 HSPs)
scaffold1296 (8-243)||(1634-1869)
scaffold1296 (166-330)||(1740-1904)
scaffold1296 (7-51)||(1633-1677)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (201-409)||(53612-53820)
scaffold0022 (1-137)||(53605-53741)
scaffold0022 (444-509)||(53749-53815)
[»] scaffold0074 (3 HSPs)
scaffold0074 (164-409)||(38359-38604)
scaffold0074 (8-118)||(38396-38506)
scaffold0074 (443-509)||(38532-38599)
[»] scaffold0513 (2 HSPs)
scaffold0513 (326-509)||(10647-10830)
scaffold0513 (338-409)||(10765-10835)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (131-329)||(33465-33663)
scaffold0138 (8-146)||(33455-33593)
[»] scaffold0200 (2 HSPs)
scaffold0200 (131-329)||(17947-18145)
scaffold0200 (8-146)||(17937-18075)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (131-329)||(31497-31695)
scaffold0051 (8-146)||(31487-31625)
[»] scaffold0436 (2 HSPs)
scaffold0436 (131-330)||(8311-8510)
scaffold0436 (8-144)||(8304-8440)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (8-208)||(18352-18552)
scaffold0322 (164-330)||(18423-18589)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (131-329)||(39626-39824)
scaffold0117 (8-136)||(39626-39754)
[»] scaffold1427 (3 HSPs)
scaffold1427 (220-409)||(1642-1831)
scaffold1427 (27-136)||(1722-1831)
scaffold1427 (439-509)||(1647-1718)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (131-329)||(19759-19957)
scaffold0293 (8-146)||(19829-19967)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (314-509)||(15030-15215)
scaffold0106 (338-409)||(15150-15220)
scaffold0106 (214-308)||(41259-41353)
[»] scaffold0059 (3 HSPs)
scaffold0059 (239-396)||(57708-57865)
scaffold0059 (46-137)||(57774-57865)
scaffold0059 (444-501)||(57708-57766)
[»] scaffold0454 (4 HSPs)
scaffold0454 (253-409)||(10987-11142)
scaffold0454 (131-198)||(1-68)
scaffold0454 (444-509)||(10992-11057)
scaffold0454 (87-137)||(11065-11115)
[»] scaffold0114 (5 HSPs)
scaffold0114 (274-425)||(28039-28190)
scaffold0114 (392-509)||(28008-28125)
scaffold0114 (338-409)||(28003-28073)
scaffold0114 (87-137)||(28134-28184)
scaffold0114 (444-478)||(28092-28126)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (381-509)||(1141-1269)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (164-322)||(113317-113475)
scaffold0014 (21-161)||(113284-113425)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (161-245)||(75605-75689)
scaffold0042 (7-50)||(75644-75687)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (393-509)||(9950-10067)
scaffold0145 (338-409)||(9945-10016)
scaffold0145 (340-402)||(10005-10067)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (200-310)||(6195-6305)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (164-244)||(398-478)
scaffold0021 (8-50)||(399-441)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (200-310)||(8566-8676)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (200-310)||(30470-30580)
scaffold0107 (8-146)||(30442-30579)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (239-310)||(12519-12590)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (200-310)||(725-835)
scaffold0266 (8-117)||(725-834)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (241-310)||(6970-7039)
[»] scaffold0174 (3 HSPs)
scaffold0174 (345-466)||(15287-15408)
scaffold0174 (398-508)||(15297-15408)
scaffold0174 (339-416)||(15284-15361)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (214-310)||(32120-32216)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (214-310)||(40628-40724)
[»] scaffold0123 (3 HSPs)
scaffold0123 (393-479)||(16242-16326)
scaffold0123 (340-440)||(16228-16326)
scaffold0123 (446-508)||(16263-16326)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (200-310)||(1375-1485)
[»] scaffold1186 (3 HSPs)
scaffold1186 (386-476)||(293-383)
scaffold1186 (436-478)||(344-386)
scaffold1186 (338-423)||(293-378)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (242-308)||(15780-15846)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (200-310)||(110064-110174)
scaffold0035 (200-310)||(118565-118675)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (240-310)||(39965-40035)
scaffold0034 (240-310)||(45448-45518)
scaffold0034 (240-310)||(79003-79073)
scaffold0034 (433-479)||(120201-120247)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (386-476)||(187885-187975)
scaffold0005 (436-478)||(187882-187924)
scaffold0005 (338-423)||(187890-187975)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (241-310)||(1296-1365)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (456-508)||(35955-36007)
scaffold0100 (350-403)||(35955-36007)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (214-310)||(53946-54042)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (214-310)||(19913-20009)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (241-308)||(912-979)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (240-310)||(868-938)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (200-310)||(18205-18315)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (200-310)||(28469-28579)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (200-310)||(38375-38485)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (386-478)||(7238-7327)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (386-479)||(24648-24751)
scaffold0162 (436-479)||(24645-24688)
scaffold0162 (386-440)||(24711-24765)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (215-310)||(8097-8192)
[»] scaffold0959 (1 HSPs)
scaffold0959 (208-322)||(1219-1333)
[»] scaffold0231 (2 HSPs)
scaffold0231 (386-440)||(18298-18352)
scaffold0231 (386-440)||(18361-18415)
[»] scaffold0108 (2 HSPs)
scaffold0108 (386-440)||(7502-7556)
scaffold0108 (436-479)||(7499-7542)
[»] scaffold0639 (3 HSPs)
scaffold0639 (386-479)||(7313-7416)
scaffold0639 (436-479)||(7310-7353)
scaffold0639 (386-430)||(7376-7420)
[»] scaffold0730 (2 HSPs)
scaffold0730 (386-425)||(7173-7212)
scaffold0730 (386-425)||(7236-7275)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (436-479)||(2555-2598)
scaffold0507 (386-430)||(2558-2602)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (215-310)||(1959-2054)
[»] scaffold0379 (2 HSPs)
scaffold0379 (436-479)||(9999-10042)
scaffold0379 (386-440)||(9985-10039)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (436-479)||(29846-29889)
[»] scaffold0170 (2 HSPs)
scaffold0170 (436-479)||(3150-3193)
scaffold0170 (386-430)||(3146-3190)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (386-425)||(8251-8290)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (411-450)||(1226-1265)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (436-479)||(36278-36321)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (436-479)||(62023-62066)
scaffold0063 (386-440)||(62009-62063)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (436-479)||(46658-46701)
scaffold0045 (386-440)||(46661-46715)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (436-479)||(142775-142818)
scaffold0020 (386-430)||(142771-142815)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (436-479)||(29394-29437)
scaffold0019 (386-430)||(29390-29434)
[»] scaffold1539 (1 HSPs)
scaffold1539 (437-479)||(1195-1237)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (433-479)||(6041-6087)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (433-479)||(13380-13426)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (97-143)||(233-279)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (386-448)||(66756-66818)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (214-251)||(53939-53976)
[»] scaffold1223 (1 HSPs)
scaffold1223 (427-479)||(574-626)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 413; Significance: 0; HSPs: 171)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 24918755 - 24918254
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  24918755 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaataccgttggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 24918656  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  24918655 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtagagaattggt 24918556  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24918555 cttaagtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 24918456  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918455 actgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 24918356  T
Q  408 tacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatga 507  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918355 tatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgcatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatga 24918256  T
Q  508 ag 509  Q
    ||    
T  24918255 ag 24918254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 24682059 - 24681558
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||  ||       |||||||| ||||||||||||    
T  24682059 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagcattctaatgccgttagtctgacatcaaaaagatttatagagcttgagttatgg 24681960  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24681959 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaaatgaaaactggtattggttggtacagaattggt 24681860  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24681859 cttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttgggcttccaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 24681760  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681759 actgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 24681660  T
Q  408 tacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatga 507  Q
    || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681659 tatatgaatgtatttgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatga 24681560  T
Q  508 ag 509  Q
    ||    
T  24681559 ag 24681558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 509
Target Start/End: Original strand, 23706765 - 23707265
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||        ||||||||||||||||||||    
T  23706765 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttatagttatggatgttacctttctaatgccgtaggtctgacgtcaaaacgaattatagaacttgagttatgg 23706864  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23706865 tcaaattactgcacgtaagtcacagctaatatttatgaatttcagcacaacttt-tccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggt 23706963  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23706964 cttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 23707063  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23707064 actgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 23707163  T
Q  408 tacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatga 507  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23707164 tatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatga 23707263  T
Q  508 ag 509  Q
    ||    
T  23707264 ag 23707265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 24671640 - 24671139
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  | |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  24671640 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagctttctaatgccatttatttgacatcaaaaatatttatagaacttgagttatgg 24671541  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24671540 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttaagaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgcaaactggtatttattggtacagaattggt 24671441  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  24671440 cttaggtgtaaaaacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgttgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttattgtcaaatt 24671341  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24671340 actgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 24671241  T
Q  408 tacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatga 507  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24671240 tatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttacgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatga 24671141  T
Q  508 ag 509  Q
    ||    
T  24671140 ag 24671139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 509
Target Start/End: Original strand, 24642375 - 24642797
Alignment:
Q  87 tttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24642375 tttatagaacttgagttatggtcaaataactacacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaaagaaaactggt 24642474  T
Q  187 attgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatag 286  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642475 attgattggtacagaattgctcttaggtgtaaacccaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatag 24642574  T
Q  287 aacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatat 386  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642575 aacttaagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatat 24642674  T
Q  387 tgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatac 486  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24642675 tgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgcgaatac 24642774  T
Q  487 gatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  24642775 gatattgtacatgattgatgaag 24642797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 7 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22106081 - 22105685
Alignment:
Q  7 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||    
T  22106081 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaatgatttatagaacttgagttatg 22105982  T
Q  107 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgg 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22105981 gtcaaattactacacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtgcagaattgg 22105882  T
Q  207 tcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaat 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22105881 tcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaat 22105782  T
Q  307 tacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 403  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  22105781 tactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 22105685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 10 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 24368439 - 24368024
Alignment:
Q  10 ttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||| ||||||||||    
T  24368439 ttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttaagttatggtc 24368340  T
Q  110 aaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24368339 aaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcaacacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtct 24368240  T
Q  210 tagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattac 309  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  24368239 taggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagttaaattac 24368140  T
Q  310 ttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| |||||||||||| |  ||    
T  24368139 tgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatcatgttgtttatgattgatgaattagta 24368040  T
Q  410 catgaatgtatatgtt 425  Q
     ||| |||||||||||    
T  24368039 tatgtatgtatatgtt 24368024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 8 - 409
Target Start/End: Original strand, 24529094 - 24529495
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  24529094 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 24529193  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24529194 tcatattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccaaatttaaaatgaaaacttgtattgattggtacaaaattggt 24529293  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||    
T  24529294 cttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagcacttgagatatggtgaaatt 24529393  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  24529394 actaaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgt 24529493  T
Q  408 ta 409  Q
    ||    
T  24529494 ta 24529495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 131 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 38967971 - 38967593
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  38967971 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaatacgaaagttg 38967872  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||| || |||||||||||    
T  38967871 tagatatggatgttaggtttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagtatttatagaacttgagttatagtgaaattactgcacgcagctcacagtgaat 38967772  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  38967771 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgttgaagtgttatatgaacgtatatgtttagga 38967672  T
Q  431 gtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967671 gtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 38967593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 8 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 6726662 - 6726245
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  6726662 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 6726563  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  6726562 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacataagtggt 6726463  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  6726462 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttaagttatagtcaaatt 6726363  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| |||||||||||| |      
T  6726362 actgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattag 6726263  T
Q  408 tacatgaatgtatatgtt 425  Q
    || ||| |||||||||||    
T  6726262 tatatgtatgtatatgtt 6726245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 8 - 425
Target Start/End: Original strand, 21154555 - 21154972
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||       ||||||||| |||||||| ||    
T  21154555 aattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaatttgagttacgg 21154654  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21154655 tcaaattactgcacgtagatcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaatttgt 21154754  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21154755 cttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaatt 21154854  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| || ||||||||| |      
T  21154855 actgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttataattgatgaattag 21154954  T
Q  408 tacatgaatgtatatgtt 425  Q
    || ||| |||||||||||    
T  21154955 tatatgtatgtatatgtt 21154972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 8 - 425
Target Start/End: Original strand, 41523620 - 41524037
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  41523620 aattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtatggatgttatctttataatgcccttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 41523719  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41523720 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattagt 41523819  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  41523820 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaacgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaatt 41523919  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||  || ||||| |||||||||||| |      
T  41523920 actgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattag 41524019  T
Q  408 tacatgaatgtatatgtt 425  Q
    || ||| |||||||||||    
T  41524020 tatatgtatgtatatgtt 41524037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 8 - 409
Target Start/End: Original strand, 23709080 - 23709480
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  23709080 aattcgtcctaggtgtaaacacgtaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 23709179  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  23709180 tctaattactgcacataggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaatactggtattgattggtacataattggt 23709279  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23709280 cttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgcagttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaatt 23709379  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  23709380 actgcacgtaggtcacaatgaagaattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgt 23709478  T
Q  408 ta 409  Q
    ||    
T  23709479 ta 23709480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 8 - 397
Target Start/End: Original strand, 45027452 - 45027840
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||| |||       |||||||||||| ||||||||    
T  45027452 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttcgaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaactttagttatgg 45027551  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45027552 tcaaattactacacgtaggtcacagtgattttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 45027651  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  45027652 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgaattatagtcaaatt 45027751  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  45027752 actgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 45027840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 39682838 - 39682527
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682838 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 39682739  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39682738 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 39682639  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  39682638 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgatt 39682539  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  39682538 gatgaagtgtta 39682527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 18809467 - 18809157
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809467 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 18809368  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809367 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 18809268  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  18809267 tagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 18809169  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  18809168 gatgaagtgtta 18809157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Original strand, 23711651 - 23711961
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23711651 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 23711750  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23711751 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 23711850  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  23711851 tagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 23711949  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  23711950 gatgaagtgtta 23711961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 7 - 409
Target Start/End: Original strand, 32214476 - 32214869
Alignment:
Q  7 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatg 106  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||       |||||||||||| |||||||    
T  32214476 aaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgctctgacgtcaaaacaatttatagaacttaagttatg 32214575  T
Q  107 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttt-tatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattg 205  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32214576 gtcaaattacagcacgtaggtcacagtgatttttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattg 32214675  T
Q  206 gtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaa 305  Q
     |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  32214676 ttcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaa 32214775  T
Q  306 ttacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 405  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  32214776 ttactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta----------gtatatgtttgtgtatacgatattgttcatgattgatgaagt 32214865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 28577623 - 28577313
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28577623 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 28577524  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577523 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 28577424  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  28577423 tagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacaatattgtccatgatt 28577325  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  28577324 gatgaagtgtta 28577313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 571922 - 571611
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  571922 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggta 571823  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  571822 cataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacgtcaaaaggatttatagaatttgagtta 571723  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  571722 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgatt 571623  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
     |||||||||||    
T  571622 aatgaagtgtta 571611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 23131386 - 23131076
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23131386 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt-gaaatgaaaactggtattgattggta 23131288  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131287 cataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 23131188  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  23131187 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgatt 23131088  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  23131087 gatgaagtgtta 23131076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Original strand, 34402160 - 34402470
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34402160 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt-gaaatgaaaactggtattgattggta 34402258  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402259 cataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 34402358  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  34402359 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgatt 34402458  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  34402459 gatgaagtgtta 34402470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 23133853 - 23133543
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23133853 tgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt-gaaatgaaaactggtattgattggta 23133755  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133754 cataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 23133655  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  23133654 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgatt 23133555  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  23133554 gatgaagtgtta 23133543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 26505903 - 26505593
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505903 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaaccttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 26505804  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  26505803 cagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaactagagtta 26505704  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||    
T  26505703 tagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattttccatgatt 26505605  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  26505604 gatgaagtgtta 26505593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 26508381 - 26508071
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26508381 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaaccttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 26508282  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  26508281 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaagaatttatagaactagagtta 26508182  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||    
T  26508181 tagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattttccatgatt 26508083  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  26508082 gatgaagtgtta 26508071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 8 - 330
Target Start/End: Original strand, 41523427 - 41523749
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  41523427 aattggtcttacgtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 41523526  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523527 tcaaattactgcacgtaggtcacagtaaatttttatgaatttcagcacaactttgtacgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggt 41523626  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41523627 cttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtatggatgttatctttataatgcccttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatt 41523726  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  41523727 actgcacgtaggtcacagtgaat 41523749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Original strand, 32039136 - 32039446
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039136 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 32039235  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
     || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  32039236 aaggattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaattttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttaagtta 32039335  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||| ||||||     
T  32039336 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatctgatattgtccatgatc 32039434  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  32039435 gatgaagtgtta 32039446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 20261711 - 20261433
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20261711 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 20261612  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  20261611 taggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaag 20261512  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  20261511 aattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgtta 20261433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 8 - 330
Target Start/End: Original strand, 21154362 - 21154684
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| || | |    
T  21154362 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaatgatttatagaacttgacttttag 21154461  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  21154462 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcagaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgttatagaattggt 21154561  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  21154562 cctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaatttgagttacggtcaaatt 21154661  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||| ||||||| |||||||||||    
T  21154662 actgcacgtagatcacagtgaat 21154684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 8 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 23932075 - 23931775
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||       |||||||||||| ||||||||    
T  23932075 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatttcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaactttagttatgg 23931976  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23931975 tcaatttacttcacttaggtcacagtgtatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggt 23931876  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23931875 cttaggtgtaaacactaaagttgtaggtattgatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 23931776  T
Q  308 a 308  Q
    |    
T  23931775 a 23931775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Original strand, 24897866 - 24898143
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24897866 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttg 24897965  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  24897966 taggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaat 24898065  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  24898066 aattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 24898143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Original strand, 24905303 - 24905580
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24905303 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttg 24905402  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  24905403 taggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaat 24905502  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  24905503 aattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 24905580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 131 - 423
Target Start/End: Original strand, 10684433 - 10684725
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  10684433 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttg 10684532  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  10684533 taggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaag 10684632  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatg 423  Q
    |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||| ||| || ||||||    
T  10684633 aattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatg 10684725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Original strand, 24900349 - 24900626
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24900349 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttg 24900448  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  24900449 taggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaat 24900548  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  24900549 aattgtatatgattgatgaattagtatatgaatttatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 24900626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Original strand, 24902826 - 24903103
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24902826 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttg 24902925  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  24902926 taggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaat 24903025  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  24903026 aattgtatatgattgatgaattagtatatgaatttatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 24903103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Original strand, 24907778 - 24908055
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  24907778 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacatgaaagttg 24907877  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  24907878 taggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaat 24907977  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  24907978 aattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 24908055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 8 - 325
Target Start/End: Original strand, 23706573 - 23706889
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||   |||||       |||||||||||||||||||||    
T  23706573 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatggtgttggttctatgtcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 23706672  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23706673 tcaagttactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaacttt-tccgaatttgaaatgaaaacggctattgattggtacagaattggt 23706771  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  23706772 cttaggtgtaaacacgaaagttatagttatggatgttacctttctaatgccgtaggtctgacgtcaaaacgaattatagaacttgagttatggtcaaatt 23706871  T
Q  308 acttcacgtaggtcacag 325  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  23706872 actgcacgtaagtcacag 23706889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 23136071 - 23135804
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23136071 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 23135972  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23135971 taggtataaatgttagctttctaatcccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23135872  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  23135871 aattgaatatgattgatgaattagtatatg-----------ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 23135804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 101 - 330
Target Start/End: Original strand, 23708980 - 23709209
Alignment:
Q  101 gttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacag 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23708980 gttatggtcaaattactgcacttaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgattttgaaatgaaaactggtattgattggcacag 23709079  T
Q  201 aattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatga 300  Q
    |||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  23709080 aattcgtcctaggtgtaaacacgtaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 23709179  T
Q  301 tcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    || ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  23709180 tctaattactgcacataggtcacagtgaat 23709209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 223 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 25616581 - 25616384
Alignment:
Q  223 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtca 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25616581 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatcgtcaaattacttcacgtaggtca 25616482  T
Q  323 cagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtat 420  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25616481 caatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtat 25616384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22106117 - 22105951
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22106117 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 22106018  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22106017 tctgatgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 22105951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 164 - 326
Target Start/End: Original strand, 41523390 - 41523552
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523390 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccataattggtcttacgtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 41523489  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagt 326  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  41523490 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 41523552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 166 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23932110 - 23931949
Alignment:
Q  166 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 265  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  23932110 gaatttgaaatgaaagctggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatttcgttggtc 23932011  T
Q  266 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtg 327  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  23932010 tgacgtcaaaacgatttatagaactttagttatggtcaatttacttcacttaggtcacagtg 23931949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Original strand, 24529057 - 24529223
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24529057 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccttaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 24529156  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  24529157 tatgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 166 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 24918790 - 24918626
Alignment:
Q  166 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 265  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||     
T  24918790 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaataccgttggtc 24918691  T
Q  266 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24918690 tgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24918626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 6726699 - 6726533
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6726699 ccgaatttgaaatgaaatctcatattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 6726600  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6726599 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 6726533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Original strand, 23706536 - 23706702
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  23706536 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatggtgttgg 23706635  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||  |  ||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23706636 ttctatgtcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcacagtgaat 23706702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 24368478 - 24368312
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24368478 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaatagttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 24368379  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||  |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24368378 tctgatgtcaaaacgatttatagaacttaagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24368312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 24682096 - 24681930
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |    
T  24682096 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagcattctaatgccgttag 24681997  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24681996 tctgacatcaaaaagatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24681930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 164 - 328
Target Start/End: Original strand, 32214440 - 32214604
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  32214440 ccgaatttaaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgc 32214539  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtga 328  Q
    | |||| ||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  32214540 tctgacgtcaaaacaatttatagaacttaagttatggtcaaattacagcacgtaggtcacagtga 32214604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 167 - 328
Target Start/End: Original strand, 45027418 - 45027579
Alignment:
Q  167 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttt 266  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |    
T  45027418 aatttgaaatggaatctggtgttgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttcgaatgtcgttggtct 45027517  T
Q  267 gacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtga 328  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  45027518 gacgtcaaaacgatttatagaactttagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtga 45027579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Original strand, 21154325 - 21154491
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21154325 ccgaatttgaaatgaaatctagtattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 21154424  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||  |||||| |||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  21154425 tctgatgtcaaaatgatttatagaacttgacttttagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 21154491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 24671677 - 24671511
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||      
T  24671677 ccgaatttggaatgaaatctggtattgatatgtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagctttctaatgccattta 24671578  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  24671577 tttgacatcaaaaatatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 24671511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 20261641 - 20261513
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  20261641 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 20261542  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20261541 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 20261513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 135 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31345667 - 31345570
Alignment:
Q  135 aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgta 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  31345667 aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgta 31345570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 411 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 6726312 - 6726214
Alignment:
Q  411 atgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726312 atgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 6726214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 392 - 509
Target Start/End: Original strand, 21154886 - 21155003
Alignment:
Q  392 atgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatat 491  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21154886 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttataattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatat 21154985  T
Q  492 tgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21154986 tgtccatgattgatgaag 21155003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 392 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 22105749 - 22105632
Alignment:
Q  392 atgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatat 491  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  22105749 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtaaatgttgtgaatacgatat 22105650  T
Q  492 tgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22105649 tgtccatgattgatgaag 22105632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 392 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 24368110 - 24367993
Alignment:
Q  392 atgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatat 491  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24368110 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatcatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatat 24368011  T
Q  492 tgtccatgattgatgaag 509  Q
    | ||||||||||||||||    
T  24368010 tttccatgattgatgaag 24367993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 28577520 - 28577391
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  28577520 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 28577421  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577420 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 28577391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 18809364 - 18809235
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  18809364 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 18809265  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809264 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18809235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 23131284 - 23131155
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  23131284 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 23131185  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23131184 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 23131155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 23133751 - 23133622
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  23133751 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 23133652  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23133651 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 23133622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 23711754 - 23711883
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  23711754 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 23711853  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23711854 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23711883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 24368248 - 24368119
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  24368248 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatag 24368149  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24368148 ttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24368119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 34402262 - 34402391
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  34402262 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 34402361  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34402362 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 34402391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 136
Target Start/End: Original strand, 10684503 - 10684631
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||| |||||    
T  10684503 aattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagctatgg 10684602  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 136  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10684603 tcaaattactgcacgtagatcacagtgaa 10684631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 571819 - 571690
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||| |||       ||||||||| |||||||||||    
T  571819 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacgtcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 571720  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  571719 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 571690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 39682735 - 39682606
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||| |||||||||||    
T  39682735 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 39682636  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39682635 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 39682606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 23136002 - 23135872
Alignment:
Q  7 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| |||  ||       ||||||||||| |||||||     
T  23136002 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatcccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 23135903  T
Q  107 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135902 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23135872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 24897936 - 24898065
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  24897936 aattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 24898035  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24898036 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaat 24898065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 24900419 - 24900548
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  24900419 aattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 24900518  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24900519 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaat 24900548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 24902896 - 24903025
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  24902896 aattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 24902995  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24902996 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaat 24903025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 24905373 - 24905502
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  24905373 aattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 24905472  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24905473 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaat 24905502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 26505800 - 26505671
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||| ||||||| |    
T  26505800 aattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaactagagttatag 26505701  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505700 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26505671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 26508278 - 26508149
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| || |||  ||       ||||||||||| ||||||| |    
T  26508278 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaagaatttatagaactagagttatag 26508179  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26508178 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26508149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 24642489 - 24642618
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||  ||       |||||||||||| ||||||||    
T  24642489 aattgctcttaggtgtaaacccaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttaagttatgg 24642588  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24642589 tcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 24642618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 24907848 - 24907977
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  24907848 aattggtcataggtgtaaacatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 24907947  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24907948 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaat 24907977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 137
Target Start/End: Original strand, 24529286 - 24529416
Alignment:
Q  7 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||  ||       ||||||| ||||||| ||||    
T  24529286 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagcacttgagatatg 24529385  T
Q  107 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    || ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24529386 gtgaaattactaaacgtaggtcacagtgaat 24529416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 137
Target Start/End: Original strand, 32039240 - 32039368
Alignment:
Q  9 attggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||| |||||||||| |||  ||       ||||||||| || |||||||||    
T  32039240 attggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaattttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttaagttatggt 32039339  T
Q  109 caaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32039340 caaattactgaacgtaggtcacagtgaat 32039368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 25616581 - 25616474
Alignment:
Q  30 gaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 129  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||       ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25616581 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatcgtcaaattacttcacgtaggtca 25616482  T
Q  130 cagtgaat 137  Q
    || |||||    
T  25616481 caatgaat 25616474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 392 - 486
Target Start/End: Original strand, 41523951 - 41524045
Alignment:
Q  392 atgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatac 486  Q
    |||||||||||| |  || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  41523951 atgattgatgaattagtatacgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatac 41524045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 38967901 - 38967772
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  38967901 aattggtcttaggtgtaaatacgaaagttgtagatatggatgttaggtttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagtatttatagaacttgagttatag 38967802  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    | ||||||||||||| || |||||||||||    
T  38967801 tgaaattactgcacgcagctcacagtgaat 38967772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 365 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 21368466 - 21368352
Alignment:
Q  365 tatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtata 464  Q
    ||||||||  ||||||  || |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  21368466 tatatgttgttgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattata 21368367  T
Q  465 tgcatgtatatgttg 479  Q
    || ||||||||||||    
T  21368366 tgaatgtatatgttg 21368352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 439 - 509
Target Start/End: Original strand, 24898068 - 24898138
Alignment:
Q  439 ttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898068 ttgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 24898138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 439 - 509
Target Start/End: Original strand, 24905505 - 24905575
Alignment:
Q  439 ttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905505 ttgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 24905575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 439 - 509
Target Start/End: Original strand, 24907980 - 24908050
Alignment:
Q  439 ttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24907980 ttgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 24908050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 18809227 - 18809162
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809227 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 18809162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 23709410 - 23709475
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709410 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 23709475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 23711891 - 23711956
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23711891 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 23711956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 6726279 - 6726209
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6726279 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 6726209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 439 - 509
Target Start/End: Original strand, 24900551 - 24900621
Alignment:
Q  439 ttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900551 ttgtatatgattgatgaattagtatatgaatttatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 24900621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 439 - 509
Target Start/End: Original strand, 24903028 - 24903098
Alignment:
Q  439 ttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903028 ttgtatatgattgatgaattagtatatgaatttatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 24903098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 26505663 - 26505598
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26505663 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattttccatgattgatgaag 26505598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 26508141 - 26508076
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26508141 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattttccatgattgatgaag 26508076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 28577383 - 28577318
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28577383 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaag 28577318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 342 - 409
Target Start/End: Original strand, 21154942 - 21155008
Alignment:
Q  342 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21154942 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 21155008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 22105697 - 22105627
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22105697 tatgattgatgaattagtatatgtatgtaaatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 22105627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Original strand, 23707200 - 23707270
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  23707200 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 23707270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Original strand, 24642732 - 24642802
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  24642732 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtacatgattgatgaagtgtta 24642802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 149
Target Start/End: Original strand, 27920402 - 27920453
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaattt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27920402 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaattt 27920453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 31345539 - 31345480
Alignment:
Q  87 tttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31345539 tttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaa 31345480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 38967658 - 38967588
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  38967658 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 38967588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 24529424 - 24529490
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529424 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 24529490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 25616466 - 25616400
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25616466 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 25616400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 39682598 - 39682532
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682598 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 39682532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 444 - 502
Target Start/End: Original strand, 45027782 - 45027840
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgatt 502  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45027782 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgatt 45027840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 67440 - 67339
Alignment:
Q  209 ttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatta 308  Q
    |||| ||| |||| |||| ||||||||   |||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  67440 ttagttgttaacatgaaaattgtaggttaagatgttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 67341  T
Q  309 ct 310  Q
    ||    
T  67340 ct 67339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 241 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16900884 - 16900803
Alignment:
Q  241 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtca 322  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16900884 tgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacgtgggtca 16900803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 241 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16994275 - 16994194
Alignment:
Q  241 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtca 322  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16994275 tgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacgtgggtca 16994194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 339 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21368439 - 21368338
Alignment:
Q  339 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatg 438  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  21368439 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatg 21368340  T
Q  439 tt 440  Q
    ||    
T  21368339 tt 21368338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 265 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 31345554 - 31345490
Alignment:
Q  265 ttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaa 329  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31345554 ttgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 31345490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 571683 - 571616
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  571683 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattaatgaag 571616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 338 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 24368058 - 24367992
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  24368058 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattttccatgattgatgaagt 24367992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 338 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 24681623 - 24681557
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24681623 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 24681557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 24918319 - 24918249
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  24918319 tatgattgatgaattagtatatgtatgcatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 24918249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12727809 - 12727711
Alignment:
Q  212 gatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    |||||||||||||||| | |||| ||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12727809 gatgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttgggttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 12727711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 24686597 - 24686707
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  24686597 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgcgttatg 24686696  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  24686697 atcaaattact 24686707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Original strand, 32039375 - 32039441
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  32039375 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatctgatattgtccatgatcgatgaag 32039441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 34823848 - 34823750
Alignment:
Q  212 gatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34823848 gatgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatgacgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 34823750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 386 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 23799537 - 23799448
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatat 475  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||  ||| ||| ||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23799537 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgttgaatatgatgttattcatgattgatgaattattatatgaatgtatat 23799448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 341 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 24671201 - 24671138
Alignment:
Q  341 gattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24671201 gattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 24671138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 439 - 509
Target Start/End: Original strand, 10684635 - 10684706
Alignment:
Q  439 ttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatat-gttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10684635 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaag 10684706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 439 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 20261509 - 20261438
Alignment:
Q  439 ttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatat-gttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20261509 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaag 20261438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 23131148 - 23131081
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23131148 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaag 23131081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 23133615 - 23133548
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23133615 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaag 23133548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Original strand, 34402398 - 34402465
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34402398 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaag 34402465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 19887274 - 19887384
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  19887274 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 19887373  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    || ||||||||    
T  19887374 attaaattact 19887384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27261402 - 27261332
Alignment:
Q  240 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||  |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  27261402 atgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaataatttttataacttgagttatgatcaaattact 27261332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 330
Target Start/End: Original strand, 24642373 - 24642425
Alignment:
Q  278 gatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24642373 gatttatagaacttgagttatggtcaaataactacacgtaggtcacagtgaat 24642425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 418 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 21368466 - 21368375
Alignment:
Q  418 tatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgc-gaatacgatattgtccatgattgatgaa 508  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  21368466 tatatgttgttgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 21368375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 23799531 - 23799448
Alignment:
Q  339 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatat 422  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || || ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  23799531 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgttgaatatgatgttattcatgattgatgaattattatatgaatgtatat 23799448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 11232212 - 11232322
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  11232212 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 11232311  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  11232312 atcaaattact 11232322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 22514059 - 22514169
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  22514059 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 22514158  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  22514159 atcaaattact 22514169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 28776661 - 28776771
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  28776661 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 28776760  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  28776761 atcaaattact 28776771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 411 - 479
Target Start/End: Original strand, 14184257 - 14184325
Alignment:
Q  411 atgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  ||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  14184257 atgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgtttatacttgatgaattattgtatgaatgtatatgttg 14184325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22274090 - 22274022
Alignment:
Q  242 gttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22274090 gttagctttctaatggccttggtttgatgtctaaatgatttttaaaacttgagttatgatcaaattact 22274022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 432 - 479
Target Start/End: Original strand, 1384398 - 1384445
Alignment:
Q  432 tataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  1384398 tataatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 1384445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 470 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 23135848 - 23135809
Alignment:
Q  470 gtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135848 gtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 23135809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22686221 - 22686076
Alignment:
Q  344 tgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgt---- 439  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || || ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| || |||| ||| ||||        
T  22686221 tgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtttttcatgattgatgaattattatatgaatatatatattgatgaatatgatgtcata 22686122  T
Q  440 ------tgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
          |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  22686121 tgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 22686076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 272
Target Start/End: Original strand, 34135061 - 34135119
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttc 272  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  34135061 tgtacacatgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaattgctttggtttgacttc 34135119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 436 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 23799540 - 23799467
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg-cgaatacgatattgtccatgattgatgaa 508  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||| || | |||||||||||||    
T  23799540 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgttgaatatgatgttattcatgattgatgaa 23799467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22283323 - 22283255
Alignment:
Q  242 gttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || ||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  22283323 gttagctttctaatggccttggtttgatgtctaaatgatttttaatacttgagttatgatcaaattact 22283255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 330
Target Start/End: Original strand, 27920325 - 27920441
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttca 313  Q
    |||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    ||||||||| |||||||||| ||    
T  27920325 tgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgca 27920424  T
Q  314 cgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||||||||||||    
T  27920425 cgtaggtcacagtgaat 27920441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 435 - 479
Target Start/End: Original strand, 36736884 - 36736928
Alignment:
Q  435 aatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  36736884 aatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 36736928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 20915518 - 20915475
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20915518 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 20915475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Original strand, 21316427 - 21316470
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  21316427 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 21316470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Original strand, 21336320 - 21336363
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  21336320 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 21336363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22690094 - 22690051
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  22690094 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 22690051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22694690 - 22694647
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  22694690 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 22694647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Original strand, 1384405 - 1384459
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  1384405 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtt 1384459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 9784919 - 9784873
Alignment:
Q  433 ataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  9784919 ataatgttgttcatgattgatgatttattatatgaatgtatatgttg 9784873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 478
Target Start/End: Original strand, 21154885 - 21154919
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21154885 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 21154919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Original strand, 21316430 - 21316484
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  21316430 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtt 21316484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Original strand, 21336323 - 21336377
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  21336323 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtt 21336377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 22105750 - 22105716
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22105750 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 22105716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22690091 - 22690037
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  22690091 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatcatgtt 22690037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22694687 - 22694633
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  22694687 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatcatgtt 22694633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 24368111 - 24368077
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24368111 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 24368077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 214 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24788084 - 24788042
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 256  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24788084 tgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttatctttccaatg 24788042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 25085750 - 25085696
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||    
T  25085750 ttgttcatgattgatgaattattacatgaatgtacatgttaatgaatatgatgtt 25085696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Original strand, 25587473 - 25587563
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||| ||| ||||  | ||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  25587473 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatgtgttgatgaatatgatgt--tatatga-tgttgaattattatatgaatgtatatgttg 25587563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 478
Target Start/End: Original strand, 28345842 - 28345884
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  28345842 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 28345884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Original strand, 28345845 - 28345899
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  28345845 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtt 28345899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Original strand, 36736888 - 36736942
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  36736888 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtt 36736942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 214 - 256
Target Start/End: Original strand, 44584590 - 44584632
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  44584590 tgtaaacacaaaagttgtaggtatgtatgttagctttccaatg 44584632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 415 - 479
Target Start/End: Original strand, 21316545 - 21316609
Alignment:
Q  415 atgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||| |||||    
T  21316545 atgtatacgttgatgaatatgatgttgtttatgaatgatgaattattatgtggatgtatgtgttg 21316609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 415 - 479
Target Start/End: Original strand, 21336438 - 21336502
Alignment:
Q  415 atgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||| |||||    
T  21336438 atgtatacgttgatgaatatgatgttgtttatgaatgatgaattattatgtggatgtatgtgttg 21336502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 22686116 - 22686072
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga 430  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  22686116 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatga 22686072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 24788086 - 24788042
Alignment:
Q  19 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatg 63  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  24788086 ggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttatctttccaatg 24788042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 63
Target Start/End: Original strand, 44584588 - 44584632
Alignment:
Q  19 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatg 63  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  44584588 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgtatgttagctttccaatg 44584632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 406; Significance: 0; HSPs: 161)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 509
Target Start/End: Original strand, 52872619 - 52873121
Alignment:
Q  7 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||       ||||||||||||||||||||    
T  52872619 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattctgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 52872718  T
Q  107 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52872719 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatgtttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattgg 52872818  T
Q  207 tcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaat 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52872819 tcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaat 52872918  T
Q  307 tacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtg 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  52872919 tactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgatgtg 52873018  T
Q  407 ttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatg 506  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52873019 ttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattaatatacgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatg 52873118  T
Q  507 aag 509  Q
    |||    
T  52873119 aag 52873121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 509
Target Start/End: Original strand, 19617614 - 19618115
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |       ||||| |||||||||||||||    
T  19617614 aattggtcttaggtgtagacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctaacgccaaaatgatttattgaacttgagttatgg 19617713  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19617714 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagagttggt 19617813  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19617814 cttaggtgttaacacaaaagttataggtatggatgttagctttctaatgctgttggtgtgacttcaaaaggatttatagaagttgagttatggtcaaatt 19617913  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19617914 actgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 19618013  T
Q  408 tacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatga 507  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618014 tatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatga 19618113  T
Q  508 ag 509  Q
    ||    
T  19618114 ag 19618115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 509
Target Start/End: Original strand, 14746059 - 14746560
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  14746059 aattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 14746158  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14746159 tcaaattactgcacgtagatcatagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 14746258  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||| | |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14746259 cttcggtgtaaggacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgactttaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 14746358  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  14746359 actgcacgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatatatgtatatgtttgtgaatactattatgttcatgattgatgaagtgt 14746458  T
Q  408 tacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatga 507  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14746459 tatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgcgaatatgatattgtccatgattgatga 14746558  T
Q  508 ag 509  Q
    ||    
T  14746559 ag 14746560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 362795 - 362337
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  362795 aattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacatcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 362696  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  362695 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgattttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacaaaattagt 362596  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  362595 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttagtttgacttcaaaacgatttatagaacttgatttatggtcaaatt 362496  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  362495 actgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgt 362396  T
Q  408 tacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatg 466  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362395 tatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatg 362337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 19858193 - 19857701
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  19858193 aattggtcttaggtgcaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 19858094  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19858093 tcaaattattgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatgagaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggt 19857994  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19857993 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaataatttatagaacttgatttatggtcaaatt 19857894  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19857893 actgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat----------atgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgt 19857804  T
Q  408 tacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatg 506  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19857803 tatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatg 19857704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 409
Target Start/End: Original strand, 14970254 - 14970655
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  14970254 aattggtcttaggtgataacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 14970353  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14970354 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggt 14970453  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14970454 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatt 14970553  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14970554 actgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcataattgatgaagtgt 14970653  T
Q  408 ta 409  Q
    ||    
T  14970654 ta 14970655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 8 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 3515622 - 3515221
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||       |||||||||||||||||||||    
T  3515622 aattggtcttaggcgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctcacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 3515523  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  3515522 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaattttagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgatcggtacaaaattggt 3515423  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  3515422 cttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagctatggtcaaatt 3515323  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3515322 actgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgtatgtatatttttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgt 3515223  T
Q  408 ta 409  Q
    ||    
T  3515222 ta 3515221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 8 - 419
Target Start/End: Original strand, 15495721 - 15496132
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  15495721 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 15495820  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15495821 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcctaatttggaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 15495920  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  15495921 cttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttaaattcgaaaggttttatagaacttgagttatggtcaaatt 15496020  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15496021 actgcacgtaagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttctgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgt 15496120  T
Q  408 tacatgaatgta 419  Q
    || |||||||||    
T  15496121 tatatgaatgta 15496132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 8 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 52313176 - 52312760
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||       |||||||||||||| ||||||    
T  52313176 aattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgcctttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgatttatgg 52313077  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52313076 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaagtttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 52312977  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  52312976 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggttttacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtc-aatt 52312878  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| |||||||||||| |      
T  52312877 actgcacgcaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattag 52312778  T
Q  408 tacatgaatgtatatgtt 425  Q
    || ||| |||||||||||    
T  52312777 tatatgtatgtatatgtt 52312760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Original strand, 15117990 - 15118300
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15117990 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 15118089  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118090 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 15118189  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  15118190 tagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 15118288  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  15118289 gatgaagtgtta 15118300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 100 - 422
Target Start/End: Original strand, 44772723 - 44773044
Alignment:
Q  100 agttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  44772723 agttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaacattgtccgaattttaaatgaaaactggtatttattggtaga 44772822  T
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  44772823 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttata 44772922  T
Q  300 atcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattga 399  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  44772923 gtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattga 44773021  T
Q  400 tgaagtgttacatgaatgtatat 422  Q
    |||||||||| ||| || |||||    
T  44773022 tgaagtgttatatgtatatatat 44773044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 8 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 362988 - 362668
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||       ||||||||| |||||||||||    
T  362988 aattggtcttaggtgtaaacccgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaatttgagttatgg 362889  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362888 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatatcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 362789  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  362788 cttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacatcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaatt 362689  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtga 328  Q
    ||| ||||||||||| |||||    
T  362688 actgcacgtaggtcatagtga 362668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Original strand, 7640824 - 7641134
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7640824 tgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 7640923  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7640924 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccattggtttcacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 7641023  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  | |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  7641024 tagttaaattactgcctgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatatttttcatgatt 7641122  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  7641123 gatgaagtgtta 7641134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 99 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 29267877 - 29267570
Alignment:
Q  99 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtac 198  Q
    |||||||| | ||| |||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29267877 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtctcagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtac 29267778  T
Q  199 agaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29267777 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttat 29267678  T
Q  299 gatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattg 398  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  29267677 ggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgcgaatacgatattgtccatgattg 29267578  T
Q  399 atgaagtg 406  Q
    ||||||||    
T  29267577 atgaagtg 29267570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 15534673 - 15534395
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15534673 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 15534574  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  15534573 taggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaag 15534474  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  15534473 aattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgtta 15534395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 8 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 52313369 - 52313047
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  52313369 aattgatcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 52313270  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |    
T  52313269 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattgat 52313170  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  52313169 cttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgcctttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgatttatggtcaaatt 52313070  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  52313069 actgcacgtaggtcacagtgaat 52313047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 44615780 - 44615502
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  44615780 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaatttg 44615681  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44615680 taggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 44615581  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  44615580 aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 44615502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Original strand, 50222010 - 50222287
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  50222010 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagatg 50222109  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50222110 taggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 50222209  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  50222210 aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 50222287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 36038362 - 36038084
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  36038362 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggccttaggtgtaaacacgaaagttg 36038263  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  36038262 taggtatggatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaag 36038163  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  36038162 aattgtttatgattgatgaattaagatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgtta 36038084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 19243192 - 19242914
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||    
T  19243192 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaacgaaaactggtattgattggtacagaattagtcttaggtataaacaagaaagttg 19243093  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||| |||||||    
T  19243092 taggtatgtatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgaacgtaggtcatagtgaat 19242993  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  19242992 aattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 19242914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 133 - 409
Target Start/End: Original strand, 49547446 - 49547722
Alignment:
Q  133 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgta 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  49547446 tgaatttttatgaatttcagcacaaatttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgta 49547545  T
Q  233 ggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  49547546 ggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaagaa 49547645  T
Q  333 ttgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  49547646 ttatttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgtta 49547722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Original strand, 1837157 - 1837420
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837157 tgagttaaggtcaaattactgcacataggtcaccgtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 1837256  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  1837257 cagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttaaaaaggatttatagaactagagtta 1837356  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt 361  Q
    |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837357 tagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt 1837420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 87 - 330
Target Start/End: Original strand, 14745945 - 14746188
Alignment:
Q  87 tttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggt 186  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745945 tttatagcacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtaaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggt 14746044  T
Q  187 attgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatag 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  14746045 attgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatag 14746144  T
Q  287 aacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  14746145 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcatagtgaat 14746188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 14049069 - 14048791
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  14049069 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacataattggttttaggtgtaaacatgaaagttg 14048970  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  14048969 tgggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttacagaacttgtgttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaag 14048870  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||    
T  14048869 aattgtttatgattgataaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaggtgtta 14048791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 284 - 509
Target Start/End: Original strand, 18214992 - 18215217
Alignment:
Q  284 tagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacta 383  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  18214992 tagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttattaatacga 18215091  T
Q  384 tattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaa 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  18215092 tattgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagcatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaa 18215191  T
Q  484 tacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  18215192 tacgatattgtccatgattgatgaag 18215217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 164 - 425
Target Start/End: Original strand, 11958 - 12219
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11958 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatcaatgttagctttctaatgtcgttgg 12057  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12058 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 12157  T
Q  364 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtt 425  Q
    |||||||||| ||  || ||| ||||| |||||||||||| |  || ||| |||||||||||    
T  12158 gtatatgtttatgtgtattatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 12219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 18214751 - 18214965
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  18214751 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 18214850  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18214851 tcatattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 18214950  T
Q  208 cttagatgtaaacac 222  Q
    ||||| |||||||||    
T  18214951 cttaggtgtaaacac 18214965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 312 - 508
Target Start/End: Original strand, 15355070 - 15355266
Alignment:
Q  312 cacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttaca 411  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15355070 cacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttata 15355169  T
Q  412 tgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaa 508  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355170 tgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 15355266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 14185731 - 14185477
Alignment:
Q  27 cacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||       ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14185731 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgaacgtagg 14185632  T
Q  127 tcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaa 226  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  14185631 tcacagtgaatctttaggaatttcagcacaacttttcccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgttaacatgaaa 14185532  T
Q  227 gttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatt 281  Q
    ||||||| || |  ||||||||||| | || | ||||| |||||| |||| ||||    
T  14185531 gttgtagataagtgtgttagctttccagtggctttggtgtgacttgaaaatgatt 14185477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 122 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 30147416 - 30147189
Alignment:
Q  122 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaaca 221  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  30147416 gtaggtcttagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaaatggaattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaaca 30147317  T
Q  222 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtc 321  Q
    | ||||||||| |||||||| | |  ||   |||| | ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  30147316 caaaagttgtaagtatggatataaaattaaaaatgacattggtatgacaacaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacataggtc 30147217  T
Q  322 acagtgaataattgaatatgattgatga 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30147216 acagtgaataattgaatatgattgatga 30147189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 19858230 - 19858064
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858230 ccgaatttgaaatgaaaaatggtattgattggtacagaattggtcttaggtgcaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 19858131  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19858130 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 19858064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Original strand, 52872583 - 52872749
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  52872583 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattctgttgg 52872682  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52872683 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52872749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 167 - 330
Target Start/End: Original strand, 18214717 - 18214880
Alignment:
Q  167 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttt 266  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  18214717 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtct 18214816  T
Q  267 gacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  18214817 gacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 18214880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 363025 - 362859
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  363025 ccgaatttgaaatgaaatgtggtattgatttgtatagaattggtcttaggtgtaaacccgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 362926  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  362925 tctgacgtcaaaaagatttatagaatttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 362859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Original strand, 14970217 - 14970383
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14970217 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgatttgtacacaattggtcttaggtgataacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 14970316  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14970317 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14970383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 166 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 3515657 - 3515493
Alignment:
Q  166 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 265  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  3515657 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggcgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 3515558  T
Q  266 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3515557 tcacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 3515493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Original strand, 19617577 - 19617743
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19617577 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacataattggtcttaggtgtagacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 19617676  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | | ||  ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19617677 tctaacgccaaaatgatttattgaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19617743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 52313406 - 52313240
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52313406 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 52313307  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52313306 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52313240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 196 - 330
Target Start/End: Original strand, 15495716 - 15495850
Alignment:
Q  196 tacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagt 295  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  15495716 tacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagt 15495815  T
Q  296 tatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15495816 tatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15495850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 87 - 230
Target Start/End: Original strand, 22725351 - 22725494
Alignment:
Q  87 tttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggt 186  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |    
T  22725351 tttataggacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacactgaatctttatgaatttcagcacaacttttcccaaatttgaaatgaaaactgat 22725450  T
Q  187 attgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  22725451 attgataggtacagaattggtctttggtgtaaacatgaaagttg 22725494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 15534603 - 15534475
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  15534603 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 15534504  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15534503 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 15534475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 220 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 14185731 - 14185621
Alignment:
Q  220 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtagg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||    
T  14185731 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgaacgtagg 14185632  T
Q  320 tcacagtgaat 330  Q
    |||||||||||    
T  14185631 tcacagtgaat 14185621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 392 - 509
Target Start/End: Original strand, 12133 - 12250
Alignment:
Q  392 atgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatat 491  Q
    |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  12133 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgtgtattatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatat 12232  T
Q  492 tgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12233 tgtccatgattgatgaag 12250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 3515430 - 3515300
Alignment:
Q  7 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||| ||||    
T  3515430 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagctatg 3515331  T
Q  107 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515330 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 3515300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 19858001 - 19857871
Alignment:
Q  7 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       |||||||||||||| |||||    
T  19858001 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaataatttatagaacttgatttatg 19857902  T
Q  107 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19857901 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19857871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 392 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 52312846 - 52312729
Alignment:
Q  392 atgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatat 491  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  52312846 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatat 52312747  T
Q  492 tgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  52312746 tgtccatgattaatgaag 52312729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 36038292 - 36038164
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  36038292 aattggccttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 36038193  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36038192 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 36038164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 136
Target Start/End: Original strand, 49547514 - 49547642
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  49547514 aattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 49547613  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49547614 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 49547642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 15118093 - 15118222
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  15118093 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 15118192  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118193 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15118222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 291 - 409
Target Start/End: Original strand, 18239250 - 18239367
Alignment:
Q  291 tgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgtt 390  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||     
T  18239250 tgagttattgtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaatttttgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtc 18239348  T
Q  391 catgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18239349 catgattgatgaagtgtta 18239367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 362603 - 362473
Alignment:
Q  7 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatg 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||  ||       |||||||||||||| |||||    
T  362603 aaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttagtttgacttcaaaacgatttatagaacttgatttatg 362504  T
Q  107 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362503 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 362473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 11995 - 12124
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  11995 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatcaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 12094  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12095 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 12124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 44772824 - 44772953
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  44772824 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttatag 44772923  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44772924 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 44772953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 417 - 509
Target Start/End: Original strand, 15496922 - 15497014
Alignment:
Q  417 gtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15496922 gtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaag 15497014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 29267775 - 29267646
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||| |||  ||       ||||||||| |||||||||||    
T  29267775 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 29267676  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29267675 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 29267646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 19243122 - 19242993
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  19243122 aattagtcttaggtataaacaagaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 19243023  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    | ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19243022 ttaaattactgaacgtaggtcatagtgaat 19242993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 44615710 - 44615581
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||| ||||||| |    
T  44615710 aattggtcttaagtgtaaacacgaaatttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 44615611  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615610 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 44615581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 50222080 - 50222209
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||| ||||||| |    
T  50222080 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagatgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 50222179  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222180 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 50222209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 164 - 238
Target Start/End: Original strand, 12778386 - 12778460
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatg 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12778386 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatg 12778460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 1837260 - 1837389
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  |        ||||||||||| ||||||| |    
T  1837260 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttaaaaaggatttatagaactagagttatag 1837359  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1837360 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 1837389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14048999 - 14048871
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       |||| |||||||| |||||||    
T  14048999 aattggttttaggtgtaaacatgaaagttgtgggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttacagaacttgtgttatgg 14048900  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 136  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14048899 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaa 14048871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 7640927 - 7641056
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| | |  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  7640927 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccattggtttcacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 7641026  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    | ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  7641027 ttaaattactgcctgtaggtcacagtgaat 7641056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 131 - 198
Target Start/End: Original strand, 12033444 - 12033511
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12033444 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtaaagattggtac 12033511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 338 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 19857767 - 19857700
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19857767 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 19857700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 15118230 - 15118295
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118230 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 15118295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 50222217 - 50222282
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222217 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 50222282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14951366 - 14951270
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14951366 tgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 14951270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 214 - 330
Target Start/End: Original strand, 22725286 - 22725401
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttca 313  Q
    |||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  22725286 tgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttctaatc-cgttggtttgacatcaaaatgatttataggacttgagttatggtcaaattactgca 22725384  T
Q  314 cgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||||||||||| |||||    
T  22725385 cgtaggtcacactgaat 22725401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Original strand, 12185 - 12255
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  12185 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 12255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Original strand, 18215152 - 18215222
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18215152 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 18215222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 29267638 - 29267572
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29267638 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 29267572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 18239297 - 18239362
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239297 tatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 18239362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 44772961 - 44773026
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44772961 tatgattgatgaattagtatacgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 44773026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Original strand, 15355202 - 15355272
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15355202 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgtta 15355272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 19242986 - 19242919
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242986 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 19242919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 52312794 - 52312724
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  52312794 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattaatgaagtgtta 52312724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14995754 - 14995644
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14995754 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatgtcgttggtttgaggtctaaatgatttttagaacttgagttatg 14995655  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  14995654 atcaaattact 14995644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 44615573 - 44615507
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615573 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 44615507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 214 - 308
Target Start/End: Original strand, 55377199 - 55377293
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatta 308  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55377199 tgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 55377293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Original strand, 25120048 - 25120144
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||| ||||||| ||||||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25120048 tgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 25120144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Original strand, 14746495 - 14746565
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  14746495 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgtta 14746565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Original strand, 15496949 - 15497019
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15496949 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgtta 15497019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Original strand, 19618050 - 19618120
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  19618050 tatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 19618120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Original strand, 52873056 - 52873126
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  52873056 tatgattgatgaattaatatacgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 52873126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 362465 - 362399
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  362465 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaag 362399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 137
Target Start/End: Original strand, 18214992 - 18215038
Alignment:
Q  91 tagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18214992 tagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18215038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 7641064 - 7641129
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  7641064 tatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatatttttcatgattgatgaag 7641129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 310
Target Start/End: Original strand, 43281694 - 43281795
Alignment:
Q  209 ttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatta 308  Q
    |||| ||| |||| |||| ||||||||   |||||||||||||||||| |  |||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43281694 ttaggtgttaacatgaaaattgtaggttaagatgttagctttctaatggctatggttttacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 43281793  T
Q  309 ct 310  Q
    ||    
T  43281794 ct 43281795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Original strand, 18293669 - 18293765
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||   ||||||| ||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18293669 tgtaaacatgaaagttttagataattatgttagatttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 18293765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 439 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 15534471 - 15534400
Alignment:
Q  439 ttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatat-gttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15534471 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaag 15534400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 386 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 14629498 - 14629408
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg 476  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| || |||||||||||| | |||| |||||||||    
T  14629498 ttgtttatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtcgttcattattgatgaattattgtatgaatgtatatg 14629408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 326
Target Start/End: Original strand, 14745925 - 14745991
Alignment:
Q  260 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagt 326  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  14745925 ttggtctgacgtcaaaacgatttatagcacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 14745991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 15355096 - 15355162
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15355096 tatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaag 15355162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 222
Target Start/End: Original strand, 15489659 - 15489717
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacac 222  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15489659 ccgaatttgaaatgaagtctggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacac 15489717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 15496051 - 15496117
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgc-gaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15496051 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttctgaatacgatattgttcatgattgatgaag 15496117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 17146279 - 17146389
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  17146279 gaattggactttgatgtaaacattaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 17146378  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    || ||||||||    
T  17146379 attaaattact 17146389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18247849 - 18247739
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  18247849 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 18247750  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    || ||||||||    
T  18247749 attaaattact 18247739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 30147258 - 30147208
Alignment:
Q  87 tttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  30147258 tttatagaacttgagttatggtcaaattactacacataggtcacagtgaat 30147208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 47357293 - 47357183
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  47357293 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggccttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagatatg 47357194  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    || ||||||||    
T  47357193 attaaattact 47357183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 439 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 14048867 - 14048798
Alignment:
Q  439 ttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatga 507  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  14048867 ttgtttatgattgataaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtcaatgattgatga 14048798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 479
Target Start/End: Original strand, 26922388 - 26922502
Alignment:
Q  361 tatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattag 460  Q
    ||||||||||||  ||||||  || |||||||||| ||||||| | |||     ||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||     
T  26922388 tatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgactgatgaattatta----tatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattat 26922483  T
Q  461 tatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  26922484 tatatgaatgtatatgttg 26922502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Original strand, 5683369 - 5683465
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||| ||||||| ||||||    ||||||||||| ||||   |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5683369 tgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttccaatggttttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 5683465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 308
Target Start/End: Original strand, 15287858 - 15287966
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  15287858 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 15287957  T
Q  300 atcaaatta 308  Q
    |||||||||    
T  15287958 atcaaatta 15287966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 308
Target Start/End: Original strand, 15294968 - 15295076
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  15294968 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 15295067  T
Q  300 atcaaatta 308  Q
    |||||||||    
T  15295068 atcaaatta 15295076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Original strand, 22355073 - 22355169
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22355073 tgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 22355169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 442 - 509
Target Start/End: Original strand, 49547649 - 49547717
Alignment:
Q  442 tttatgattgatgaattagtatatgcatgtatat-gttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49547649 tttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaag 49547717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 439 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 36038160 - 36038089
Alignment:
Q  439 ttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36038160 ttgtttatgattgatgaattaagatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaag 36038089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 3515292 - 3515226
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3515292 tatgattgatgaattattatatgtatgtatatttttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaag 3515226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10643856 - 10643746
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||   |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  10643856 gaattggactttggtgcaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggttttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagatatg 10643757  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    || ||||||||    
T  10643756 attaaattact 10643746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 14970584 - 14970650
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14970584 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcataattgatgaag 14970650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16731786 - 16731676
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||     
T  16731786 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctctctaatggctttggtttgacttccaaatgattttttgaacttgagttatc 16731687  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    || ||||||||    
T  16731686 ataaaattact 16731676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18168391 - 18168293
Alignment:
Q  212 gatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  18168391 gatgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttgatttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 18168293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 45
Target Start/End: Original strand, 12778423 - 12778460
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatg 45  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12778423 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatg 12778460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 442
Target Start/End: Original strand, 19566638 - 19566694
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgt 442  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  19566638 ttgttcatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgt 19566694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 46740543 - 46740440
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga----------gtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatat 475  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||           ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  46740543 ttgttcatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtcctatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatat 46740444  T
Q  476 gttg 479  Q
    ||||    
T  46740443 gttg 46740440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 432 - 479
Target Start/End: Original strand, 15041842 - 15041889
Alignment:
Q  432 tataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15041842 tataatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 15041889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 432 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 15112582 - 15112535
Alignment:
Q  432 tataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15112582 tataatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 15112535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 141
Target Start/End: Original strand, 18239250 - 18239293
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaattttt 141  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18239250 tgagttattgtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaattttt 18239293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 25513001 - 25512938
Alignment:
Q  416 tgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||| ||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  25513001 tgtatacgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 25512938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 25513074 - 25513031
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  25513074 atgttgtttatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 25513031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 9198658 - 9198544
Alignment:
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||  |||||||||||  |||||||||   ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||| ||||| |||||||    
T  9198658 cttagttgtaaacatgaaagttttatatatggatgttatatttctaatggatttggtcttacttcaaaatgatttctacaacttgatttatggtcaaatt 9198559  T
Q  308 acttcacgtaggtca 322  Q
    | | |||||| ||||    
T  9198558 aatacacgtatgtca 9198544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19020119 - 19020009
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||    ||||||||||||||||   |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  19020119 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggttttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 19020020  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    || ||||||||    
T  19020019 attaaattact 19020009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 310
Target Start/End: Original strand, 19698032 - 19698082
Alignment:
Q  260 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19698032 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 19698082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 310
Target Start/End: Original strand, 19708617 - 19708667
Alignment:
Q  260 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19708617 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 19708667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 46740606 - 46740552
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  46740606 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgagtatgatgtt 46740552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 30147338 - 30147297
Alignment:
Q  7 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggat 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  30147338 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaagtatggat 30147297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 26445146 - 26445062
Alignment:
Q  390 tcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtata 474  Q
    |||||||| ||||| | ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||| |||||||| |||||  |||||||    
T  26445146 tcatgatttatgaattattatacgaatgtatatgttgatgaatataatgttgttcataattaatgaattactatataaatgtata 26445062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 509
Target Start/End: Original strand, 1837413 - 1837452
Alignment:
Q  470 gtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1837413 gtatatgttgtgaaaacgatattgtccatgattgatgaag 1837452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 10272835 - 10272792
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  10272835 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 10272792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 12622719 - 12622676
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  12622719 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 12622676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 13164453 - 13164410
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  13164453 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 13164410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 14508097 - 14508054
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  14508097 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 14508054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 46740609 - 46740566
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  46740609 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 46740566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 478
Target Start/End: Original strand, 12132 - 12166
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12132 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 12166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8374150 - 8374040
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||    ||||| |||||||||| | ||| ||| || || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  8374150 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttaactttctaatggctttgattttacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 8374051  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    || ||||||||    
T  8374050 attaaattact 8374040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 10272832 - 10272778
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  10272832 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgattatgatgtt 10272778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 13164450 - 13164396
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  13164450 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtt 13164396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 13164624 - 13164522
Alignment:
Q  383 atattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtat--atgtttatgag----tataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg 476  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||  |||  |||||     ||| | |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  13164624 atattgttcatgattgatgaattattatatgaatgtattgatgaatatgatgtcatatgacgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 13164525  T
Q  477 ttg 479  Q
    |||    
T  13164524 ttg 13164522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 14629501 - 14629459
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  14629501 atgttgtttatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgtt 14629459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 243 - 321
Target Start/End: Original strand, 20595850 - 20595928
Alignment:
Q  243 ttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtc 321  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| | ||||  |||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  20595850 ttagctttctaatggctttggtttgacatgaaaataatttttagattttgagttatgatgaaaatacttcaagtaggtc 20595928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 26445213 - 26445159
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  26445213 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtt 26445159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 26445216 - 26445174
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  26445216 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 26445174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 40229710 - 40229656
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  40229710 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtt 40229656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 40229713 - 40229671
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  40229713 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 40229671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 52312847 - 52312813
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52312847 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 52312813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 362336 - 362299
Alignment:
Q  372 ttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  362336 ttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgtta 362299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 14629493 - 14629408
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatg 423  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||||  ||||||  || | |||||| ||||||||| | ||  |||||||||||||    
T  14629493 tatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtcgttcattattgatgaattattgtatgaatgtatatg 14629408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 209
Target Start/End: Original strand, 14745886 - 14745931
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtct 209  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  14745886 ccgaatttgaaatgaaatttggtattgataggtccagaattggtct 14745931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 205
Target Start/End: Original strand, 15355028 - 15355069
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  15355028 ccgaatttgaaatgaaaactggtatcgattgctacataattg 15355069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 250
Target Start/End: Original strand, 18218868 - 18218912
Alignment:
Q  205 ggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcttt 250  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18218868 ggtcttag-tgtaaacatgaaagttgtaggtatgaatgttagcttt 18218912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 25513015 - 25512934
Alignment:
Q  349 aattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga 430  Q
    ||||| ||||||  |||||| |||  ||||||  || |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  25513015 aattattatatgggtgtatacgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatga 25512934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 508
Target Start/End: Original strand, 26922389 - 26922479
Alignment:
Q  415 atgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg-cgaatacgatattgtccatgattgatgaa 508  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||| |||| |||||||||| |||    ||||||||||||  ||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  26922389 atgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgactgatgaattattat----atgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 26922479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 392 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 9621747 - 9621699
Alignment:
Q  392 atgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  9621747 atgattgatgaattattacatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtt 9621699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 12622716 - 12622672
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga 430  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  12622716 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatga 12622672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 14508094 - 14508050
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga 430  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  14508094 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatga 14508050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 14995753 - 14995644
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    ||| |||||||||||| ||||||| ||| |||       ||| ||||||||||||||||     
T  14995753 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatgtcgttggtttgaggtctaaatgatttttagaacttgagttatga 14995654  T
Q  108 tcaaattact 117  Q
    ||||||||||    
T  14995653 tcaaattact 14995644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 430
Target Start/End: Original strand, 15041849 - 15041893
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga 430  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  15041849 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatga 15041893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 15112575 - 15112531
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga 430  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  15112575 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatga 15112531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Original strand, 19435087 - 19435183
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| ||||| |||   |||||||||||| ||| ||||    
T  19435087 tgtaaacatgaaagttgtagataactttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatact 19435183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 427 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 35660114 - 35660062
Alignment:
Q  427 atgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||| ||| |||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  35660114 atgaatatgatgttgttcattattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 35660062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 46740480 - 46740436
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga 430  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  46740480 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatga 46740436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 402; Significance: 0; HSPs: 127)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 509
Target Start/End: Original strand, 20901468 - 20901970
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||| ||||||||    
T  20901468 aattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtatggatgtcagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaactttagttatgg 20901567  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901568 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcaacacaactttgtccgattttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 20901667  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20901668 cttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 20901767  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20901768 actgcacgtaggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgt 20901867  T
Q  408 tacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatg 506  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20901868 tatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatg 20901967  T
Q  507 aag 509  Q
    |||    
T  20901968 aag 20901970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 509
Target Start/End: Original strand, 20917394 - 20917895
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||       |||||| ||||||||||||||    
T  20917394 aattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgctggtctgacgtcaaaatcatttataaaacttgagttatgg 20917493  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917494 tcaaattactacacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattcgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 20917593  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20917594 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaatt 20917693  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| |||||||||||| |      
T  20917694 actgcacgtaagtcacggtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattag 20917793  T
Q  408 tacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatga 507  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20917794 tatatgaatgtatatgtttatgagtattatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatcttgtccatgattgatga 20917893  T
Q  508 ag 509  Q
    ||    
T  20917894 ag 20917895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 420
Target Start/End: Original strand, 17516711 - 17517123
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||       ||||||||||||||||||| |    
T  17516711 aattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatcg 17516810  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17516811 tcgaattactgcacataggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 17516910  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17516911 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatcgtcaaatt 17517010  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  17517011 actgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgt 17517110  T
Q  408 tacatgaatgtat 420  Q
    || ||| ||||||    
T  17517111 tatatgtatgtat 17517123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 8 - 409
Target Start/End: Original strand, 2154179 - 2154580
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||       |||||||||||| |||||| |    
T  2154179 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttttaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttaagttatag 2154278  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154279 tcaaattactgcacgtatgtcacggtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 2154378  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2154379 cttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatgaatattagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 2154478  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  2154479 actgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatactgtccatgattgatgaagtgt 2154578  T
Q  408 ta 409  Q
    ||    
T  2154579 ta 2154580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 8 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 29330597 - 29330181
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  29330597 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaaggccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 29330498  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330497 tcaaattaatgcacgtatgtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggt 29330398  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  29330397 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgctgttggtttgatttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaatt 29330298  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||  || ||||| |||||||||||| |      
T  29330297 actgcacgtaggtaacagtgaa-aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttacgagtatgatgttgtttatgattgatgaattag 29330199  T
Q  408 tacatgaatgtatatgtt 425  Q
    || ||| |||||||||||    
T  29330198 tatatgtatgtatatgtt 29330181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 8 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 32028060 - 32027643
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||       |||||||| ||||||||||||    
T  32028060 aattggtcttaggtgtaaacacaaaaattgtatttatggatgttagctttctaatgccattggtcggacgtcaaaacgatttatagagcttgagttatgg 32027961  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027960 tcaaattactgcacgtaagtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 32027861  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  32027860 cttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaatt 32027761  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| |||||||||||| |      
T  32027760 actgcacgtaggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattag 32027661  T
Q  408 tacatgaatgtatatgtt 425  Q
    || ||| |||||||||||    
T  32027660 tatatgtatgtatatgtt 32027643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 20909536 - 20909226
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909536 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 20909437  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909436 cataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 20909337  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  20909336 tagtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 20909238  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  20909237 gatgaagtgtta 20909226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 98 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 23065038 - 23064731
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23065038 tgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaattaaaactggtattgattggta 23064939  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064938 cagaattggtcttagatataaacacgaaagttgtaggtatggatgtcagctttctagtgccgttcgtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 23064839  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  23064838 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataatttattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgatt 23064739  T
Q  398 gatgaagt 405  Q
    ||||||||    
T  23064738 gatgaagt 23064731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Original strand, 264406 - 264716
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264406 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaaccttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 264505  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264506 cagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 264605  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  264606 tagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 264704  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  264705 gatgaagtgtta 264716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 39245660 - 39245350
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245660 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttgagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 39245561  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39245560 cataattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgattta 39245461  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  39245460 tagttaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 39245362  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  39245361 gatgaagtgtta 39245350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 39363908 - 39363598
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39363908 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt-gaaatgaaaactggtattgattggta 39363810  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39363809 cataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttgatttgacttcaaaatgatttatagaacttgagtta 39363710  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    || ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  39363709 tggtcaaattactgaacgtaggtcacactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgatt 39363610  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  39363609 gatgaagtgtta 39363598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 7 - 330
Target Start/End: Original strand, 17516517 - 17516840
Alignment:
Q  7 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||    
T  17516517 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 17516616  T
Q  107 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgg 206  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  17516617 gtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgatttttaaatgaaaaatggtattgattggcacagaattgg 17516716  T
Q  207 tcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaat 306  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  17516717 tcctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatcgtcgaat 17516816  T
Q  307 tacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||| ||| |||||||||||||||    
T  17516817 tactgcacataggtcacagtgaat 17516840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 98 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 38619960 - 38619654
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  38619960 tgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacaatgaaattttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt-gaaataaaaactggtattgattggta 38619862  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619861 cataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 38619762  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  38619761 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgatt 38619662  T
Q  398 gatgaagt 405  Q
    ||||||||    
T  38619661 gatgaagt 38619654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 29346504 - 29346194
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346504 tgagttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 29346405  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  29346404 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgattta 29346305  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  29346304 tactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 29346206  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  29346205 gatgaagtgtta 29346194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 29348977 - 29348667
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348977 tgagttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 29348878  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  29348877 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcaaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgattta 29348778  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  29348777 tactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 29348679  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  29348678 gatgaagtgtta 29348667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 29351450 - 29351140
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29351450 tgagttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 29351351  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  29351350 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcaaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgattta 29351251  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  29351250 tactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 29351152  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  29351151 gatgaagtgtta 29351140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 330
Target Start/End: Original strand, 295826 - 296144
Alignment:
Q  12 ggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtcaa 111  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||  ||       |||||||||||||||||||||||||    
T  295826 ggtcttaggtgtaaccatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgatctgacatcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaa 295925  T
Q  112 attactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtctta 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  295926 attactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtctta 296025  T
Q  212 gatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattactt 311  Q
    | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  296026 ggtgtatacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 296125  T
Q  312 cacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  296126 cacgtaggtcacactgaat 296144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Original strand, 10732611 - 10732888
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10732611 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 10732710  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  10732711 taggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtagatcacagtgaat 10732810  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  10732811 aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgattttgtccatgattgatgaagtgtta 10732888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 99 - 409
Target Start/End: Original strand, 42245004 - 42245313
Alignment:
Q  99 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtac 198  Q
    |||||||| | ||| |||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42245004 gagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatac 42245103  T
Q  199 agaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  42245104 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaatggatttatagaactatagttat 42245203  T
Q  299 gatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattg 398  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  42245204 agtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattg 42245302  T
Q  399 atgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||    
T  42245303 atgaagtgtta 42245313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 32028641 - 32028318
Alignment:
Q  7 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||  ||       |||||||| |||||||||||    
T  32028641 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatatcgttggtctgacatcaaaacgatttatagagcttgagttatg 32028542  T
Q  107 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32028541 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgg 32028442  T
Q  207 tcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaat 306  Q
    | |||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||  |||||| |||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  32028441 ttttaggtgaaaacacgaaagttgtaggtatatatgttagctttctagtgctgttggtctgacgtcaaaacaatttatagagcttgagttatggtcaaat 32028342  T
Q  307 tacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||| ||||||||||||| |||||    
T  32028341 tactgcacgtaggtcacaatgaat 32028318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 32028447 - 32028124
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| |||||||||| |||       |||||||| ||||||||||||    
T  32028447 aattggttttaggtgaaaacacgaaagttgtaggtatatatgttagctttctagtgctgttggtctgacgtcaaaacaatttatagagcttgagttatgg 32028348  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||    
T  32028347 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggt 32028248  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg-tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaat 306  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  32028247 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttttgacgtcaaaacgatttatagagcttgagttatggtcaaat 32028148  T
Q  307 tacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  32028147 tactgcacgtaggtcatagtgaat 32028124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 8 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 32028254 - 32027931
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtct-gatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||       |||||||| |||||||||||    
T  32028254 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttttgacgtcaaaacgatttatagagcttgagttatg 32028155  T
Q  107 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  32028154 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaattgttattgattggtacagaattgg 32028055  T
Q  207 tcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaat 306  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| | |||||  ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  32028054 tcttaggtgtaaacacaaaaattgtatttatggatgttagctttctaatgccattggtcggacgtcaaaacgatttatagagcttgagttatggtcaaat 32027955  T
Q  307 tacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||| |||||| |||||| |||||    
T  32027954 tactgcacgtaagtcacaatgaat 32027931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Original strand, 37804573 - 37804851
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37804573 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcataatttgaaatgaaaactggcattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 37804672  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||     
T  37804673 taggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattaatgcacgtaggtcacagtgaag 37804772  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||| |||||| ||||    
T  37804773 aattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattaatgaagcgtta 37804851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Original strand, 17516481 - 17516647
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17516481 ccgaatttgaaatgaaaaccggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 17516580  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17516581 tctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 17516647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Original strand, 20901431 - 20901597
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20901431 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtatggatgtcagctttctaatgccgttgg 20901530  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20901531 tctgacgtcaaaacgatttatagaactttagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20901597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 200 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 9776781 - 9776572
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9776781 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagctatg 9776682  T
Q  300 atcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattga 399  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||     
T  9776681 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgg 9776582  T
Q  400 tgaagtgtta 409  Q
    ||||| ||||    
T  9776581 tgaagggtta 9776572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 166 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 32028675 - 32028511
Alignment:
Q  166 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 265  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  32028675 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatatcgttggtc 32028576  T
Q  266 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  32028575 tgacatcaaaacgatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 32028511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 167 - 330
Target Start/End: Original strand, 2154145 - 2154308
Alignment:
Q  167 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttt 266  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  2154145 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttttaatgtcgttggtct 2154244  T
Q  267 gacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  2154245 gacgtcaaaacgatttatagaacttaagttatagtcaaattactgcacgtatgtcacggtgaat 2154308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 29330634 - 29330468
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  29330634 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaaggccgttgg 29330535  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  29330534 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattaatgcacgtatgtcacagtgaat 29330468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Original strand, 295785 - 295951
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  || | |||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  295785 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataagtccggaataggtcttaggtgtaaccatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttga 295884  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  295885 tctgacatcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 295951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Original strand, 20917357 - 20917523
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  20917357 ccgaatttgaaatgaaatcaggtattgataggtccataattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgctgg 20917456  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  20917457 tctgacgtcaaaatcatttataaaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacaatgaat 20917523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 392 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 32027729 - 32027612
Alignment:
Q  392 atgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatat 491  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  32027729 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatat 32027630  T
Q  492 tgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||    
T  32027629 tgtccatgattgatgaag 32027612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 139
Target Start/End: Original strand, 296015 - 296146
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  296015 aattggtcttaggtgtatacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 296114  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaattt 139  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  296115 tcaaattactgcacgtaggtcacactgaattt 296146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 392 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 29330267 - 29330150
Alignment:
Q  392 atgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatat 491  Q
    |||||||||||| |  || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  29330267 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttacgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatat 29330168  T
Q  492 tgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29330167 tgtccatgattgatgaag 29330150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 136
Target Start/End: Original strand, 37804643 - 37804771
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       |||||| ||||||||||||||    
T  37804643 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatgg 37804742  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 136  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37804743 tcaaattaatgcacgtaggtcacagtgaa 37804771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 20909433 - 20909304
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  20909433 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 20909334  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20909333 tcaaattactgcacgtaggtcagagtgaat 20909304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 38619858 - 38619729
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  38619858 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 38619759  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38619758 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 38619729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 264509 - 264638
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  264509 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 264608  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264609 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 264638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 10732681 - 10732810
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||| ||||||| |    
T  10732681 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 10732780  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10732781 tcaaattactgcacgtagatcacagtgaat 10732810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 23064935 - 23064806
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  23064935 aattggtcttagatataaacacgaaagttgtaggtatggatgtcagctttctagtgccgttcgtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 23064836  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23064835 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 23064806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 39363806 - 39363677
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  39363806 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttgatttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 39363707  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  39363706 tcaaattactgaacgtaggtcacactgaat 39363677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 29346401 - 29346272
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       |||||||||||||| ||||      
T  29346401 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatac 29346302  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29346301 tcaaattactgcacgtaggtcagagtgaat 29346272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 39245557 - 39245428
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       |||||||||||||| |||| |    
T  39245557 aattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatag 39245458  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245457 ttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39245428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 42245106 - 42245235
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| |||  ||       |||||||||||  |||||| |    
T  42245106 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaatggatttatagaactatagttatag 42245205  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245206 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 42245235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 29348874 - 29348745
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||| |||  ||       |||||||||||||| ||||      
T  29348874 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcaaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatac 29348775  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29348774 tcaaattactgcacgtaggtcagagtgaat 29348745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 29351347 - 29351218
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||| |||  ||       |||||||||||||| ||||      
T  29351347 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcaaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatac 29351248  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29351247 tcaaattactgcacgtaggtcagagtgaat 29351218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Original strand, 20901904 - 20901975
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20901904 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 20901975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 9776780 - 9776652
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||   |||| ||||||||||| |||||||| |||  ||       ||||||||||||||| |||||    
T  9776780 aattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagctatgg 9776681  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9776680 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 9776652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 264646 - 264711
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  264646 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 264711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 20909296 - 20909231
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909296 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 20909231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 39245420 - 39245355
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245420 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 39245355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 42245243 - 42245308
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245243 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 42245308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 29330215 - 29330145
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  29330215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 29330145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 32027677 - 32027607
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  32027677 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 32027607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 10732818 - 10732883
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10732818 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgattttgtccatgattgatgaag 10732883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Original strand, 27183182 - 27183278
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27183182 tgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 27183278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Original strand, 20917830 - 20917900
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  20917830 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatcttgtccatgattgatgaagtgtta 20917900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 23064799 - 23064732
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064799 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 23064732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 38619722 - 38619655
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619722 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 38619655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 17517041 - 17517107
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17517041 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 17517107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 22883903 - 22884013
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22883903 gaattggccttgggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagctttctaatggctttggtttgacgttcaaatgatttttagaacttgagttatg 22884002  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  22884003 atcaaattact 22884013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 342 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 18744036 - 18743948
Alignment:
Q  342 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga 430  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  18744036 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatga 18743948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 18743929 - 18743839
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |   ||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  18743929 ttgttcatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaat---atgatgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 18743839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Original strand, 1220355 - 1220453
Alignment:
Q  212 gatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1220355 gatgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 1220453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 2154509 - 2154575
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2154509 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatactgtccatgattgatgaag 2154575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 389 - 479
Target Start/End: Original strand, 21399891 - 21399981
Alignment:
Q  389 ttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  21399891 ttcaggattgatgaattattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgttgttcatggttgatgaattattatatgaatgtatatgttg 21399981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 43444008 - 43444118
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43444008 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 43444107  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    || ||||||||    
T  43444108 attaaattact 43444118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Original strand, 1628163 - 1628256
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    ||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||| || |||||| | ||||||||||    
T  1628163 ttgttaatgattgatgaactattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttaatgattgatgaagtattatatgaaagtatatgttg 1628256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 310
Target Start/End: Original strand, 10778832 - 10778901
Alignment:
Q  241 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10778832 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 10778901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 29346264 - 29346199
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||| ||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346264 tatgatggatcaactagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 29346199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 29348737 - 29348672
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||| ||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348737 tatgatggatcaactagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 29348672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 29351210 - 29351145
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||| ||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29351210 tatgatggatcaactagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 29351145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 214 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 23506599 - 23506491
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttca 313  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||   ||||||| ||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  23506599 tgtaaacatgaaagttttagataattatgttagttttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgtgttatgatcaaattactaca 23506500  T
Q  314 cgtaggtca 322  Q
    ||| |||||    
T  23506499 cgtgggtca 23506491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 395 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 18744036 - 18743953
Alignment:
Q  395 attgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  18744036 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgtt 18743953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 341 - 440
Target Start/End: Original strand, 21399896 - 21399995
Alignment:
Q  341 gattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || ||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  21399896 gattgatgaattattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgttgttcatggttgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtt 21399995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 39363670 - 39363603
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39363670 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaag 39363603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12013 - 11903
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  12013 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 11914  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    || ||||||||    
T  11913 attaaattact 11903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23511225 - 23511127
Alignment:
Q  212 gatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||   | ||||||||| ||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23511225 gatgtaaacataaaagttttaggtaattaagttagctttttaatggctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 23511127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25426287 - 25426177
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  25426287 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 25426188  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    || ||||||||    
T  25426187 attaaattact 25426177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 440
Target Start/End: Original strand, 1628169 - 1628270
Alignment:
Q  339 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatg 438  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||  ||||||  || ||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||    
T  1628169 atgattgatgaactattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttaatgattgatgaagtattatatgaaagtatatgttgatgaatatgatg 1628268  T
Q  439 tt 440  Q
    ||    
T  1628269 tt 1628270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 7424987 - 7424879
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  7424987 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 7424888  T
Q  300 atcaaatta 308  Q
    |||||||||    
T  7424887 atcaaatta 7424879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11342286 - 11342190
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||| ||||||||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11342286 tgtaaacatgaaagttgtagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 11342190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 439 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 9776648 - 9776577
Alignment:
Q  439 ttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatat-gttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  9776648 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattggtgaag 9776577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 439 - 509
Target Start/End: Original strand, 37804775 - 37804846
Alignment:
Q  439 ttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatat-gttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  37804775 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattaatgaag 37804846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 21933242 - 21933352
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  21933242 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 21933341  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  21933342 atcaaattact 21933352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 21939412 - 21939522
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  21939412 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 21939511  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  21939512 atcaaattact 21939522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 22367094 - 22367204
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| || |||||||| ||||    
T  22367094 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttaaaacttgagatatg 22367193  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    || ||||||||    
T  22367194 attaaattact 22367204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 35581450 - 35581340
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  35581450 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 35581351  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  35581350 atcaaattact 35581340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 36990638 - 36990748
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  36990638 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 36990737  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  36990738 atcaaattact 36990748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 310
Target Start/End: Original strand, 1168832 - 1168901
Alignment:
Q  241 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  1168832 tgttagctttctaatggctttggtttggcttccaaatgattttttggacttgagttatgatcaaattact 1168901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 310
Target Start/End: Original strand, 11212734 - 11212803
Alignment:
Q  241 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||| || || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11212734 tgttagctttcttatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 11212803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 386 - 459
Target Start/End: Original strand, 20198501 - 20198574
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaatta 459  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||||||| || ||||||||||||    
T  20198501 ttgtccatgattgatgaagtattatatgaaggtatatgttaatgaatatgatgttgttcataattgatgaatta 20198574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 310
Target Start/End: Original strand, 21074249 - 21074318
Alignment:
Q  241 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  21074249 tgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 21074318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Original strand, 14026527 - 14026630
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga----------gtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatat 475  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||           ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  14026527 ttgttcatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatacgatgtcctatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatat 14026626  T
Q  476 gttg 479  Q
    ||||    
T  14026627 gttg 14026630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Original strand, 14026590 - 14026693
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgag----------tataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatat 475  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||          ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  14026590 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgagtatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattaatatatgaatgtatat 14026689  T
Q  476 gttg 479  Q
    ||||    
T  14026690 gttg 14026693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 339 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 18743923 - 18743825
Alignment:
Q  339 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatg 438  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||  ||||   |||  ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  18743923 atgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaa---tatgatgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatg 18743827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 21503358 - 21503315
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  21503358 atgttgtttatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 21503315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16062723 - 16062669
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  16062723 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatataatgtt 16062669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 18778605 - 18778715
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||    |||||| ||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  18778605 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagatttctaatggctttggttttacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 18778704  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    || ||||||||    
T  18778705 attaaattact 18778715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Original strand, 20198312 - 20198366
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20198312 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgagtatgatgtt 20198366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 32950283 - 32950213
Alignment:
Q  240 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| || |||  |||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  32950283 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaataatttttagaatgtgagttatgatcaaattact 32950213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 386 - 439
Target Start/End: Original strand, 20198375 - 20198428
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgt 439  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  20198375 ttgttcatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgt 20198428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 411 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 30613879 - 30613814
Alignment:
Q  411 atgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg 476  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||| |||| |||||| || ||||||    
T  30613879 atgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttaatgattgatggattattatatgaatatatatg 30613814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19499524 - 19499428
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||  | |||||||||| || ||| || || ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  19499524 tgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatagctttggtttgacgtccaaatgagttttagaacttgagatatgattaaattact 19499428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22755268 - 22755172
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  ||||||||| | ||    ||||| |||| |||||||||| |||||| ||||    
T  22755268 tgtaaacatgaaagttgtagatatggatgttagctttcatatgtatttggtttgaatccatttagatttctagagcttgagttattatcaaaatact 22755172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 26749458 - 26749355
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt----------gtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatat 475  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||          ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  26749458 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatat 26749359  T
Q  476 gttg 479  Q
    ||||    
T  26749358 gttg 26749355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31479032 - 31478936
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||  |||| ||||||| ||| ||||    
T  31479032 tgtaaacatgaaagttttagataaagatgttagctttataatgactttggtttgacttaaaaagaatttttagattttgatttatgatgaaaatact 31478936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Original strand, 35791738 - 35791834
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| |  |||  |||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  35791738 tgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgttcaaataatttttagaacttgagatatgattaaattact 35791834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 509
Target Start/End: Original strand, 1628104 - 1628234
Alignment:
Q  390 tcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgt----------tgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||          |||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  1628104 tcatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtcatatgatgttgttaatgattgatgaactattatatgaatgtatatgttg 1628203  T
Q  480 -cgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
      ||||| ||| ||||  |||||||||||||    
T  1628204 atgaatatgatgttgttaatgattgatgaag 1628234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Original strand, 8833876 - 8833919
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  8833876 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 8833919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 16062887 - 16062844
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  16062887 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 16062844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Original strand, 20198309 - 20198352
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20198309 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 20198352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 26749461 - 26749418
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  26749461 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 26749418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 411 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 30611919 - 30611864
Alignment:
Q  411 atgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatg 466  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  30611919 atgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttaatgatcgatgaattattatatg 30611864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 16062725 - 16062683
Alignment:
Q  437 tgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  16062725 tgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 16062683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16062884 - 16062830
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  16062884 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtt 16062830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 448 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 18744036 - 18743974
Alignment:
Q  448 attgatgaattagtatatgcatgtatatgttg-cgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  18744036 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaag 18743974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 478
Target Start/End: Original strand, 21399724 - 21399766
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21399724 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 21399766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Original strand, 21399727 - 21399781
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  21399727 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtt 21399781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 26749395 - 26749341
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  26749395 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtt 26749341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 26761772 - 26761718
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||    
T  26761772 ttgttcatgattgatgaattattacatgaatgtacatgttgatgaatatgatgtt 26761718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 29330268 - 29330234
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29330268 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 29330234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 32027730 - 32027696
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32027730 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 32027696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 440
Target Start/End: Original strand, 23200145 - 23200202
Alignment:
Q  383 atattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  23200145 atattgttcattattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtt 23200202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 24067323 - 24067282
Alignment:
Q  339 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaata 380  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  24067323 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtttatgaata 24067282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 430
Target Start/End: Original strand, 8833879 - 8833923
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga 430  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  8833879 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatga 8833923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17909129 - 17909033
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| ||||| |||   |||||||||||| ||| ||||    
T  17909129 tgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatact 17909033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 401; Significance: 0; HSPs: 189)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 509
Target Start/End: Original strand, 15081389 - 15081890
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  15081389 aattggtcttagaagtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 15081488  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15081489 ttaaattactgcacgtaggtcacaattaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggt 15081588  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15081589 cttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaatt 15081688  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15081689 actgcacgtaggtctaagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 15081788  T
Q  408 tacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatga 507  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15081789 tatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatga 15081888  T
Q  508 ag 509  Q
    ||    
T  15081889 ag 15081890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 8940897 - 8940393
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  8940897 aattggtcttaggtgtaaacaa-aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 8940799  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  8940798 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttaagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgctattgattggtacaaaattggt 8940699  T
Q  208 cttagatgtaaacac----gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatca 303  Q
    ||||| |||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8940698 cttaggtgtaaacacacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtca 8940599  T
Q  304 aattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 403  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940598 aattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 8940499  T
Q  404 gtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattg 503  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940498 gtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatttatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattg 8940399  T
Q  504 atgaag 509  Q
    ||||||    
T  8940398 atgaag 8940393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 509
Target Start/End: Original strand, 14269504 - 14270005
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||       |||||||||||||||||||      
T  14269504 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttggtatgacgtcaaaaaaatttatagaacttgagttatca 14269603  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269604 tcaaattattgcacgcaggtcagagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 14269703  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14269704 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggttcgacttcaaaaggatttatagaaattgagttatggtcaaatt 14269803  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14269804 tttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgt 14269903  T
Q  408 tacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatga 507  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14269904 tatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatga 14270003  T
Q  508 ag 509  Q
    ||    
T  14270004 ag 14270005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 19 - 509
Target Start/End: Original strand, 45847213 - 45847704
Alignment:
Q  19 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtcaaattactg 118  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||| | |||||||||| ||||||| ||| |||       ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45847213 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttaactttctaatgtcgttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 45847312  T
Q  119 cacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaa 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  45847313 cacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaaataatattgattggtacaaaattggtcttaggtataa 45847412  T
Q  219 acacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtag 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  45847413 acacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaactctgttagtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcacgtag 45847512  T
Q  319 gtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgt 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  45847513 gtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgtctgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatacgaatgt 45847612  T
Q  419 atatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45847613 atatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaag 45847704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 8 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 16214299 - 16213898
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  16214299 aattggtcttaggtgtaaacacaaaggttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 16214200  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16214199 tcatattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggt 16214100  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||     
T  16214099 cttacgtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatg 16214000  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16213999 actgcacgtaggtcacagtgaataattgaataagattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgt 16213900  T
Q  408 ta 409  Q
    ||    
T  16213899 ta 16213898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 8 - 409
Target Start/End: Original strand, 21189143 - 21189543
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  21189143 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttttaatgccgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 21189242  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21189243 tcaaattactgcacgtaggtcagagtgaatttttatgaatttccgcacaactttgtccaaatttgaaatgaaaactggtatttattggtacagagttggt 21189342  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21189343 cttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgaatgttagctttttaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaatt 21189442  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  21189443 actgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtata-gtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgt 21189541  T
Q  408 ta 409  Q
    ||    
T  21189542 ta 21189543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Original strand, 15376351 - 15376661
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376351 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 15376450  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376451 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 15376550  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  15376551 tagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 15376649  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  15376650 gatgaagtgtta 15376661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Original strand, 20384761 - 20385071
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20384761 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 20384860  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20384861 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 20384960  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  20384961 tagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 20385059  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  20385060 gatgaagtgtta 20385071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 27217385 - 27217074
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217385 tgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 27217286  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27217285 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 27217186  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27217185 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgatt 27217086  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  27217085 gatgaagtgtta 27217074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 16410583 - 16410273
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410583 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 16410484  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410483 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 16410384  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  16410383 tagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatcaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 16410285  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  16410284 gatgaagtgtta 16410273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 456846 - 456535
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  456846 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacattgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaaccggtattgattggta 456747  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  456746 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 456647  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  456646 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgatt 456547  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  456546 gatgaagtgtta 456535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 98 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 13869872 - 13869566
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13869872 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt-gaaatgaaaactggtattgattggta 13869774  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869773 cataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 13869674  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    || | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  13869673 tggttaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgatt 13869574  T
Q  398 gatgaagt 405  Q
    ||||||||    
T  13869573 gatgaagt 13869566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 16233045 - 16232734
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16233045 tgagttaaggtcaaattactgcacataggtcaccgtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 16232946  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16232945 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgaattcaaaaggatttatagaatttgagtta 16232846  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16232845 ttgtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgatt 16232746  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  16232745 gatgaagtgtta 16232734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 8469194 - 8468859
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  8469194 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttagttttctaatgacgttgg 8469095  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8469094 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcatgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 8468995  T
Q  364 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtat 463  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  8468994 gtatatgtttttgaatacgatattgttcatgattgatgaaatgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagta- 8468896  T
Q  464 atgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
             ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8468895 ---------tatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 8468859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 98 - 423
Target Start/End: Original strand, 26355619 - 26355943
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26355619 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggta 26355718  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355719 cagaattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 26355818  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||| ||| |||    
T  26355819 tagtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg-ttgtaaatacgatattgtccataatt 26355917  T
Q  398 gatgaagtgttacatgaatgtatatg 423  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||    
T  26355918 gatgaagtgttatatgtatatatatg 26355943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 98 - 423
Target Start/End: Original strand, 26358071 - 26358395
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26358071 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggta 26358170  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26358171 cagaattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 26358270  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||| ||| |||    
T  26358271 tagtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg-ttgtaaatacgatattgtccataatt 26358369  T
Q  398 gatgaagtgttacatgaatgtatatg 423  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||    
T  26358370 gatgaagtgttatatgtatatatatg 26358395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 18628090 - 18627780
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  18628090 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttaaaatgaaaactgatattgattggca 18627991  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18627990 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgattta 18627891  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | | |||||    
T  18627890 tagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattttccgtgatt 18627792  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  18627791 gatgaagtgtta 18627780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 18640796 - 18640486
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  18640796 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttaagaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggca 18640697  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18640696 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttataatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgattta 18640597  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||    
T  18640596 tagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattactatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattttccatgatt 18640498  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  18640497 gatgaagtgtta 18640486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 8 - 330
Target Start/End: Original strand, 14269311 - 14269633
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||       ||||||||||||||||||| |    
T  14269311 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttattg 14269410  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269411 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 14269510  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14269511 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttggtatgacgtcaaaaaaatttatagaacttgagttatcatcaaatt 14269610  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | | |||| |||||| |||||||    
T  14269611 attgcacgcaggtcagagtgaat 14269633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 41523409 - 41523131
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  41523409 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacataaaagttg 41523310  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41523309 taggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 41523210  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  41523209 aattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 41523131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 41525871 - 41525593
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  41525871 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacataaaagttg 41525772  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41525771 taggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 41525672  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  41525671 aattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 41525593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 8 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 8941091 - 8940769
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||     
T  8941091 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgaagtcaaaatgatttatagaacttgagttatgc 8940992  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaattttt-atgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgg 206  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8940991 tcaaactactgcacataggtcgcagtgaattttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacataattgg 8940892  T
Q  207 tcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaat 306  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8940891 tcttaggtgtaaaca-aaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaat 8940793  T
Q  307 tacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  8940792 tactgcacgtaggtcacagtgaat 8940769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 11303739 - 11303461
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11303739 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 11303640  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  11303639 taggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaag 11303540  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  11303539 aattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgtta 11303461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Original strand, 14948793 - 14949070
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14948793 agtgaatttttatgaattttagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 14948892  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14948893 taggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14948992  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  14948993 aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 14949070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 32125982 - 32125705
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32125982 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 32125883  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32125882 taggtataaatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 32125783  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  32125782 aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 32125705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 8 - 330
Target Start/End: Original strand, 14156626 - 14156944
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||       |||||||||||||| |||||     
T  14156626 aattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgacttatga 14156725  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14156726 tcaaattaccgcatgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaaccttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggt 14156825  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| |    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  14156826 cttaggt----acactaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacgtgagttatgttcaaatt 14156921  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  14156922 actgcacgtaggtcacagtgaat 14156944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Original strand, 11392937 - 11393235
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11392937 tgagttaaggtcaaattactgcacataggtcaccgtgaatttttatgaatttcagcataactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 11393036  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||             |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11393037 caga-------------gtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 11393123  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11393124 tggtcaaattactgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgatt 11393223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Original strand, 16108359 - 16108637
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16108359 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 16108458  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||     
T  16108459 taggtatggatgttagttttctaatgctgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtacgtcacagtgaag 16108558  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  16108559 aattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacaatattgtcaatgattgatgaagtgtta 16108637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 114 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 29797119 - 29796810
Alignment:
Q  114 tactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaga 213  Q
    |||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  29797119 tactccacggaggtcttagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttagg 29797020  T
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttca 313  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  29797019 tgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagctatggtcaaattactgca 29796920  T
Q  314 cgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatg 413  Q
    ||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||| |||    
T  29796919 cgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagggttatatg 29796820  T
Q  414 aatgtatatg 423  Q
     || ||||||    
T  29796819 tatatatatg 29796810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 114 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 29800938 - 29800629
Alignment:
Q  114 tactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaga 213  Q
    |||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  29800938 tactccacggaggtcttagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttagg 29800839  T
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttca 313  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  29800838 tgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagctatggtcaaattactgca 29800739  T
Q  314 cgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatg 413  Q
    ||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||| |||    
T  29800738 cgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagggttatatg 29800639  T
Q  414 aatgtatatg 423  Q
     || ||||||    
T  29800638 tatatatatg 29800629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 131 - 403
Target Start/End: Original strand, 23664623 - 23664895
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23664623 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaaatggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 23664722  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||     
T  23664723 taggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcatgtaggtcacagtgaag 23664822  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 403  Q
    |||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  23664823 aattgttgatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaa 23664895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 122 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 18431212 - 18430926
Alignment:
Q  122 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaaca 221  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18431212 gtaggtcttagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaactggtcttaggtgtaaaca 18431113  T
Q  222 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtc 321  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||  |    
T  18431112 cgaaagttgtaggtatgaatcttaggtttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtagaac 18431013  T
Q  322 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18431012 atagtgaataattgaatctgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 18430926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 24702720 - 24702452
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24702720 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttg 24702621  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24702620 taggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24702521  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24702520 aattgaatatgattcatgaattagtat----------atgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgtta 24702452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 24705167 - 24704899
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24705167 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttg 24705068  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24705067 taggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24704968  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24704967 aattgaatatgattcatgaattagtat----------atgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgtta 24704899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 333 - 509
Target Start/End: Original strand, 38897995 - 38898171
Alignment:
Q  333 ttgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagt 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38897995 ttgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagt 38898094  T
Q  433 ataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38898095 atgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 38898171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 131 - 329
Target Start/End: Original strand, 25926800 - 25926998
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25926800 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 25926899  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaa 329  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25926900 taggtatggatattagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaaagagttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 25926998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 133 - 330
Target Start/End: Original strand, 10501066 - 10501263
Alignment:
Q  133 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgta 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  10501066 tgaatttttatgaatttcagcacaaccttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagagttggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 10501165  T
Q  233 ggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  10501166 ggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtttgacttcaaatggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgaaggtcatagtgaat 10501263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 164 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 11973007 - 11972746
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  11973007 ccgaacttaaaatgaaatctggtattgataggtccagaatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 11972908  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 363  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11972907 tttgacttcaaaaggatctatagaacttgagttatagtcaaattactgtacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 11972808  T
Q  364 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtt 425  Q
    | |||||||| ||| ||  || ||||| |||||||||||| |  || ||| |||||||||||    
T  11972807 gcatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 11972746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 131 - 329
Target Start/End: Original strand, 1856900 - 1857097
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1856900 agtgaatttttatgaatttcagaacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtaccgaattggtcttaggtgtaaacacg-aagttg 1856998  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaa 329  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1856999 taggtatgaatgttagctttctaatgtcattggtctgacgtcaaaacgatttatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 1857097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 131 - 329
Target Start/End: Original strand, 13918073 - 13918272
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtc-ttagatgtaaacacgaaagtt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |    
T  13918073 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtctttaggtgtaaacacgaaaact 13918172  T
Q  230 gtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaa 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  13918173 gtaggtatgaatgttagctttctaattccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 13918272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 167 - 330
Target Start/End: Original strand, 38897741 - 38897904
Alignment:
Q  167 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttt 266  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38897741 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaactcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttt 38897840  T
Q  267 gacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38897841 gacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38897904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 231 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 13841446 - 13841274
Alignment:
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13841446 taggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 13841347  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  13841346 aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 13841274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 166 - 330
Target Start/End: Original strand, 14269276 - 14269440
Alignment:
Q  166 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 265  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14269276 gaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtt 14269375  T
Q  266 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||  |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14269376 tgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14269440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 167 - 330
Target Start/End: Original strand, 14156592 - 14156755
Alignment:
Q  167 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttt 266  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14156592 aatttgaaacaaaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttt 14156691  T
Q  267 gacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  14156692 gacttcaaaaggatttatagaacttgacttatgatcaaattaccgcatgtaggtcacagtgaat 14156755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 8941128 - 8940962
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8941128 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 8941029  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||| ||||||||    
T  8941028 tctgaagtcaaaatgatttatagaacttgagttatgctcaaactactgcacataggtcgcagtgaat 8940962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16214336 - 16214170
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16214336 ccgaatttgaaatgaaatttggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaggttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 16214237  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  16214236 tatgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 16214170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 164 - 324
Target Start/End: Original strand, 15081352 - 15081512
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15081352 ccgaatttgaaatgaaatatggtattgataggtccataattggtcttagaagtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 15081451  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcaca 324  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  15081452 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcaca 15081512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Original strand, 21189106 - 21189272
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  21189106 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaacaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttttaatgccgttgg 21189205  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21189206 tctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaat 21189272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 167 - 297
Target Start/End: Original strand, 10500934 - 10501064
Alignment:
Q  167 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttt 266  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10500934 aatttgaaacaaaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgataacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttt 10501033  T
Q  267 gacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10501034 gacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 10501064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 143
Target Start/End: Original strand, 38897775 - 38897910
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  38897775 aattggtcttaggtgtaaactcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 38897874  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38897875 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttat 38897910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 88 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11310289 - 11310133
Alignment:
Q  88 ttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggta 187  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||    
T  11310289 ttatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaatatttatgaatttcagcacaacctttcccgaatttgaaatgaaaact-gta 11310191  T
Q  188 ttgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 245  Q
    |||||  ||||| |||||||||||| |||   ||| |||||||||||||| |||||||    
T  11310190 ttgataagtacataattggtcttaggtgttttcacaaaagttgtaggtatagatgtta 11310133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 146
Target Start/End: Original strand, 25926870 - 25927008
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||        ||||||||||||||||||||    
T  25926870 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaaagagttatagaacttgagttatgg 25926969  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  25926970 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaa 25927008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 168 - 330
Target Start/End: Original strand, 17985092 - 17985254
Alignment:
Q  168 atttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttg 267  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||||    
T  17985092 atttcaaatgaaatctggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtaaggatgttaaatttctaatggagttggtttg 17985191  T
Q  268 acttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | | ||||| ||| | |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17985192 attccaaaatgatatttagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtcatagtgaat 17985254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 11303669 - 11303541
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||| |||||||||||    
T  11303669 aattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 11303570  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11303569 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 11303541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 136
Target Start/End: Original strand, 23664693 - 23664821
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  23664693 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 23664792  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 136  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  23664793 tcaaattattgcatgtaggtcacagtgaa 23664821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 392 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 11972832 - 11972715
Alignment:
Q  392 atgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatat 491  Q
    |||||||||||| |  || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  11972832 atgattgatgaattagtatatgaatgcatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatat 11972733  T
Q  492 tgtccatgattgatgaag 509  Q
    || |||||||||||||||    
T  11972732 tgcccatgattgatgaag 11972715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 15376454 - 15376583
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  15376454 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 15376553  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376554 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15376583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16410480 - 16410351
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  16410480 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 16410381  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410380 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16410351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 20384864 - 20384993
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  20384864 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 20384963  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20384964 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20384993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 24702650 - 24702521
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  24702650 aattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 24702551  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702550 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24702521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 24705097 - 24704968
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  24705097 aattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 24704998  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704997 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24704968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 161
Target Start/End: Original strand, 10501136 - 10501288
Alignment:
Q  10 ttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtc 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||||    
T  10501136 ttggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtttgacttcaaatggatttatagaacttgagttatggtc 10501235  T
Q  110 aaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttat-gaatttcagcacaacttt 161  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  10501236 aaattactgcacgaaggtcatagtgaatttttatggactttcagtacaacttt 10501288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 29797032 - 29796904
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||| |||||    
T  29797032 aattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagctatgg 29796933  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 136  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29796932 tcaaattactgcacgtagatcacagtgaa 29796904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 29800851 - 29800723
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||| |||||    
T  29800851 aattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagctatgg 29800752  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 136  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29800751 tcaaattactgcacgtagatcacagtgaa 29800723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 146
Target Start/End: Original strand, 1856970 - 1857107
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| |||       |||||| ||||||||||||||    
T  1856970 aattggtcttaggtgtaaacacgaa-gttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcattggtctgacgtcaaaacgatttatataacttgagttatgg 1857068  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1857069 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaa 1857107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 456743 - 456614
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||| |||||||||||    
T  456743 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 456644  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  456643 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 456614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 8940706 - 8940572
Alignment:
Q  7 aaattggtcttaggtgtaa----acacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagt 102  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||    
T  8940706 aaattggtcttaggtgtaaacacacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagt 8940607  T
Q  103 tatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940606 tatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 8940572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 13869770 - 13869641
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  13869770 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 13869671  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13869670 ttaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 13869641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 14948863 - 14948992
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||| ||||||| |    
T  14948863 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 14948962  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14948963 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14948992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 18627987 - 18627858
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       |||||||||||||| |||| |    
T  18627987 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatag 18627888  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18627887 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18627858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 27217282 - 27217153
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||| |||||||||||    
T  27217282 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 27217183  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27217182 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 27217153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 136
Target Start/End: Original strand, 16108429 - 16108557
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  16108429 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgctgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 16108528  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 136  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16108529 tcaaattactacacgtacgtcacagtgaa 16108557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16232942 - 16232813
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||| ||||||||| |    
T  16232942 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgaattcaaaaggatttatagaatttgagttattg 16232843  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16232842 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 16232813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 18640693 - 18640564
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||  ||       |||||||||||||| |||| |    
T  18640693 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttataatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatag 18640594  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640593 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18640564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 32125912 - 32125783
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| |||  ||       ||||||||||| ||||||| |    
T  32125912 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 32125813  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125812 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 32125783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 146
Target Start/End: Original strand, 13918143 - 13918282
Alignment:
Q  8 aattggtctt-aggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatg 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||| |||       ||||||||||||||||||||    
T  13918143 aattggtctttaggtgtaaacacgaaaactgtaggtatgaatgttagctttctaattccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 13918242  T
Q  107 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  13918243 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaaatcttatgaa 13918282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11972970 - 11972841
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       | ||||||||||||||||| |    
T  11972970 aatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatctatagaacttgagttatag 11972871  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11972870 tcaaattactgtacgtaggtcacagtgaat 11972841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 26355722 - 26355851
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  26355722 aattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 26355821  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26355822 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 26355851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 26358174 - 26358303
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  26358174 aattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 26358273  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26358274 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 26358303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 41523339 - 41523210
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||| |||||||||||    
T  41523339 aattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 41523240  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41523239 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 41523210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 41525801 - 41525672
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||| |||||||||||    
T  41525801 aattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 41525702  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41525701 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 41525672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Original strand, 14156818 - 14156969
Alignment:
Q  7 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatg 106  Q
    |||||||||||||||    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||  ||       |||||||||| |||||||||    
T  14156818 aaattggtcttaggt----acactaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacgtgagttatg 14156913  T
Q  107 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttat-gaatttcagcacaacttt 161  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  14156914 ttcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatggactttcagtacaacttt 14156969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 161
Target Start/End: Original strand, 17985125 - 17985279
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |  |||||||||  |||||| ||||  |       | | ||||||||||||||| |    
T  17985125 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtaaggatgttaaatttctaatggagttggtttgattccaaaatgatatttagaacttgagttatag 17985224  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatg-aatttcagcacaacttt 161  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17985225 tcaaattactacacgtaggtcatagtgaatttttatgaaatttcagcacaacttt 17985279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 137
Target Start/End: Original strand, 45847394 - 45847524
Alignment:
Q  7 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatg 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||| || |||  ||       ||||||||||||||||||||    
T  45847394 aaattggtcttaggtataaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaactctgttagtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatg 45847493  T
Q  107 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45847494 gtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 45847524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 8469157 - 8469028
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||||     
T  8469157 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttagttttctaatgacgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatga 8469058  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  8469057 tcaaattactgcatgtaggtcacaatgaat 8469028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 338 - 405
Target Start/End: Original strand, 45847638 - 45847705
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 405  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45847638 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 45847705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 137
Target Start/End: Original strand, 11393041 - 11393156
Alignment:
Q  22 gtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtcaaattactgcac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  11393041 gtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaac 11393140  T
Q  122 gtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||| |||||||    
T  11393141 gtaggtcatagtgaat 11393156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 14949000 - 14949065
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949000 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 14949065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 15376591 - 15376656
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376591 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 15376656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 18431130 - 18431016
Alignment:
Q  11 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||| ||||||| ||||    
T  18431130 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatcttaggtttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtca 18431031  T
Q  111 aattactgcacgtag 125  Q
    |||||||||||||||    
T  18431030 aattactgcacgtag 18431016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 20385001 - 20385066
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385001 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 20385066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 32125775 - 32125710
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125775 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 32125710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 338 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 11972780 - 11972706
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatg 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11972780 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgcccatgattgatgaagtgttacatg 11972706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 446 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 18430994 - 18430931
Alignment:
Q  446 tgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430994 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 18430931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 392 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 13841338 - 13841264
Alignment:
Q  392 atgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatg 466  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13841338 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatg 13841264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 16410343 - 16410278
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410343 tatgattgatgaattagtatatcaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 16410278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 456607 - 456540
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  456607 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 456540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Original strand, 11393163 - 11393230
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393163 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 11393230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 13869634 - 13869567
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869634 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 13869567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Original strand, 14269940 - 14270010
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  14269940 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 14270010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Original strand, 15081825 - 15081895
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15081825 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 15081895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 16232806 - 16232739
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232806 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 16232739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 27217146 - 27217079
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217146 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 27217079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Original strand, 38898106 - 38898176
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  38898106 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 38898176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 41523203 - 41523136
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523203 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 41523136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 41525665 - 41525598
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525665 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 41525598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 13841446 - 13841347
Alignment:
Q  38 taggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13841446 taggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 13841347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 18640556 - 18640491
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18640556 tatgattgatgaattactatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattttccatgattgatgaag 18640491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 21189473 - 21189538
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189473 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatagtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 21189538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 233
Target Start/End: Original strand, 23461795 - 23461864
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtag 233  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23461795 ccgaatttgaaatgaagtctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 23461864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11287072 - 11286976
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11287072 tgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgtcttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 11286976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 243 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 11310327 - 11310239
Alignment:
Q  243 ttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaata 331  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| || ||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11310327 ttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaata 11310239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 8940458 - 8940388
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  8940458 tatgattgatgaattagtatatttatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 8940388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 71
Target Start/End: Original strand, 10500968 - 10501031
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggt 71  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10500968 aattggtcttaggtgataacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggt 10501031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 392 - 479
Target Start/End: Original strand, 15119919 - 15120006
Alignment:
Q  392 atgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15119919 atgatttatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 15120006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 126034 - 125965
Alignment:
Q  241 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  126034 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgagttttagaacttgagttatgatcaaattact 125965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 18627850 - 18627785
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18627850 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattttccgtgattgatgaag 18627785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 26355859 - 26355924
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26355859 tatgattgattaattagtatatgaatgtatatgttgtaaatacgatattgtccataattgatgaag 26355924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 26358311 - 26358376
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26358311 tatgattgattaattagtatatgaatgtatatgttgtaaatacgatattgtccataattgatgaag 26358376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 338 - 430
Target Start/End: Original strand, 15119918 - 15120010
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga 430  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  15119918 tatgatttatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatga 15120010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 439 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 11303537 - 11303466
Alignment:
Q  439 ttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatat-gttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11303537 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaag 11303466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 447 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 16213966 - 16213903
Alignment:
Q  447 gattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16213966 gattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaag 16213903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 439 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 29796900 - 29796829
Alignment:
Q  439 ttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatat-gttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29796900 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaag 29796829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 439 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 29800719 - 29800648
Alignment:
Q  439 ttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatat-gttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29800719 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaag 29800648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Original strand, 15951605 - 15951703
Alignment:
Q  212 gatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||    || ||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  15951605 gatgtaaacacgaaagttttagataattttggtagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 15951703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 43747742 - 43747669
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaatta 459  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||||||| || ||||||||||||    
T  43747742 ttgttcatgattgatgaagtattatatgaaagtatatgttgatgaatatgatgttgttcataattgatgaatta 43747669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 390 - 466
Target Start/End: Original strand, 13745567 - 13745643
Alignment:
Q  390 tcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatg 466  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  13745567 tcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattaatgaattattatatg 13745643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 439 - 509
Target Start/End: Original strand, 16108561 - 16108632
Alignment:
Q  439 ttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatat-gttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16108561 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacaatattgtcaatgattgatgaag 16108632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7822123 - 7822013
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  7822123 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 7822024  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  7822023 atcaaattact 7822013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7829434 - 7829324
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  7829434 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 7829335  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  7829334 atcaaattact 7829324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 439 - 508
Target Start/End: Original strand, 23664825 - 23664895
Alignment:
Q  439 ttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatat-gttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaa 508  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23664825 ttgttgatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaa 23664895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 27102511 - 27102621
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  27102511 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 27102610  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  27102611 atcaaattact 27102621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 27109859 - 27109969
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  27109859 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 27109958  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  27109959 atcaaattact 27109969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27175815 - 27175705
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  27175815 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 27175716  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  27175715 atcaaattact 27175705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 38784603 - 38784713
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  38784603 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 38784702  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  38784703 atcaaattact 38784713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 387 - 475
Target Start/End: Original strand, 14153617 - 14153703
Alignment:
Q  387 tgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatat 475  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || | ||| ||||  | |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  14153617 tgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgataaatatgatgt--tatatgattgatgaattattatatgaatgtatat 14153703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 310
Target Start/End: Original strand, 15760779 - 15760848
Alignment:
Q  241 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  15760779 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 15760848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 38294640 - 38294567
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaa 508  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  38294640 atgttgttcatgattgatgaattattctatgaatgtatatgttggcgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 38294567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Original strand, 32495064 - 32495160
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||| ||||||| ||||||   | |||| |||||||||| | |||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  32495064 tgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttatctttctaatggctttggtttgatgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcatattact 32495160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 20619617 - 20619574
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20619617 atgttgtttatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 20619574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Original strand, 33556900 - 33557002
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataa---------tgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg 476  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |         ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  33556900 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgtgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 33556999  T
Q  477 ttg 479  Q
    |||    
T  33557000 ttg 33557002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 339 - 416
Target Start/End: Original strand, 13745569 - 13745646
Alignment:
Q  339 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaat 416  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || |||||||||||| ||||| | ||| ||||||    
T  13745569 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattaatgaattattatatgaat 13745646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 387 - 440
Target Start/End: Original strand, 15576614 - 15576667
Alignment:
Q  387 tgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15576614 tgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgagtatgatgtt 15576667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 386 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 38294637 - 38294564
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaatta 459  Q
    |||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||   || ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  38294637 ttgttcatgattgatgaattattctatgaatgtatatgttggcgaatatgatgttgttcatgattgatgaatta 38294564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 38294815 - 38294723
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    ||||||||||||||  || | ||| |||||||| || ||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  38294815 ttgttcatgattgaa-aattattatatgaatgtgtacgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaaagtatatgttg 38294723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Original strand, 1937800 - 1937896
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||| ||||||| ||||||   | |||| |||||||||| | |||||||||| || ||| || || ||||| || ||||||||||||||||||    
T  1937800 tgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttatctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgaattttagaattttagttatgatcaaattact 1937896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Original strand, 10000998 - 10001094
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||    
T  10000998 tgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgggatatgattaagttact 10001094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Original strand, 15576550 - 15576653
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgt----------tgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatat 475  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||| ||||          |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  15576550 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgtagatgagtatgatgttatatgatgctgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatat 15576649  T
Q  476 gttg 479  Q
    ||||    
T  15576650 gttg 15576653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 298
Target Start/End: Original strand, 16202768 - 16202852
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 298  Q
    ||||||||  |||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||  | ||||| ||||| |||||||||    
T  16202768 tgtaaacataaaagttgtaggtagtgatgttagatttctaatggctttggttttacttcatgatgatttctagaatttgagttat 16202852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 20110779 - 20110747
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 40  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110779 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 20110747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 40
Target Start/End: Original strand, 23461832 - 23461864
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 40  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23461832 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 23461864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 38294631 - 38294567
Alignment:
Q  339 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 403  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||| | |||||  || ||||||||||||||||||    
T  38294631 atgattgatgaattattctatgaatgtatatgttggcgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 38294567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 8473096 - 8473053
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  8473096 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 8473053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Original strand, 8514384 - 8514427
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  8514384 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 8514427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Original strand, 8851880 - 8851923
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  8851880 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 8851923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 432 - 479
Target Start/End: Original strand, 9743719 - 9743766
Alignment:
Q  432 tataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  9743719 tataatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatatatatgttg 9743766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Original strand, 33556897 - 33556940
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  33556897 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 33556940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Original strand, 36301540 - 36301583
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  36301540 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 36301583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 37538540 - 37538497
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  37538540 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 37538497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 37538694 - 37538651
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  37538694 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 37538651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 43747808 - 43747765
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  43747808 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 43747765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Original strand, 48213649 - 48213692
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  48213649 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 48213692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 339 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 8473087 - 8472945
Alignment:
Q  339 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttc-atg-attgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataa 436  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || || |   ||| ||| ||||| | ||| |||||||||| |||| |||| ||| |    
T  8473087 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttataggatgtatttatgaattattatatgaatgtatgtgttgatgaatatga 8472988  T
Q  437 tgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||| || ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||    
T  8472987 tgttattcatgattgatgaattattatacaaatgtatatgttg 8472945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 8473093 - 8473039
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  8473093 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtt 8473039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 13841339 - 13841305
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13841339 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 13841305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 14258689 - 14258643
Alignment:
Q  433 ataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  14258689 ataatgttgttcatgattgatgatttattatatgaatgtatatgttg 14258643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Original strand, 15120029 - 15120083
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||    
T  15120029 ttgttcatgattgatgaattattacatgaatgtacatgttgatgaatatgatgtt 15120083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Original strand, 16460647 - 16460693
Alignment:
Q  433 ataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  16460647 ataatgttgttcatgattgatgatttattatatgaatgtatatgttg 16460693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 16579997 - 16579951
Alignment:
Q  433 ataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  16579997 ataatgttgttcatgattgatgatttattatatgaatgtatatgttg 16579951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Original strand, 16585666 - 16585712
Alignment:
Q  433 ataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  16585666 ataatgttgttcatgattgatgatttattatatgaatgtatatgttg 16585712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 20487780 - 20487734
Alignment:
Q  433 ataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  20487780 ataatgttgttcatgattgatgatttattatatgaatgtatatgttg 20487734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 25941579 - 25941537
Alignment:
Q  437 tgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  25941579 tgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 25941537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 37538537 - 37538483
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  37538537 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtt 37538483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 37538691 - 37538637
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  37538691 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgattatgatgtt 37538637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 43747805 - 43747751
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  43747805 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtt 43747751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 8468891 - 8468854
Alignment:
Q  372 ttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  8468891 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 8468854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 508
Target Start/End: Original strand, 13745560 - 13745633
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg-cgaatacgatattgtccatgattgatgaa 508  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||||| |||||    
T  13745560 atgttgatcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattaatgaa 13745633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 13841270 - 13841226
Alignment:
Q  364 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  13841270 gtatatgttt-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 13841226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 508
Target Start/End: Original strand, 15119918 - 15119983
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg-cgaatacgatattgtccatgattgatgaa 508  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  15119918 tatgatttatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 15119983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 15167651 - 15167530
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||||| |||| || || |||   ||||||||||    
T  15167651 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatg 15167552  T
Q  300 atcaaattacttcacgtaggtc 321  Q
    || ||| |||| || |||||||    
T  15167551 atgaaaatactccaagtaggtc 15167530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 477
Target Start/End: Original strand, 15576547 - 15576588
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgt 477  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15576547 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgt 15576588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 29004492 - 29004416
Alignment:
Q  205 ggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 282  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  29004492 ggtcttag-tgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgattt 29004416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 430
Target Start/End: Original strand, 8851883 - 8851927
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga 430  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  8851883 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatga 8851927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 481 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 13841259 - 13841231
Alignment:
Q  481 gaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13841259 gaatacgatattgtccatgattgatgaag 13841231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 201 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20110779 - 20110747
Alignment:
Q  201 aattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtag 233  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20110779 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 20110747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 25941577 - 25941533
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga 430  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  25941577 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatga 25941533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 430
Target Start/End: Original strand, 36301543 - 36301587
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga 430  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  36301543 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatga 36301587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 201 - 313
Target Start/End: Original strand, 43277120 - 43277232
Alignment:
Q  201 aattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatga 300  Q
    |||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || | |||||||||||| |||| ||||| |||   |||||||||||    
T  43277120 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttcaagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatga 43277219  T
Q  301 tcaaattacttca 313  Q
    | ||| |||||||    
T  43277220 tgaaaatacttca 43277232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 430
Target Start/End: Original strand, 48213652 - 48213696
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga 430  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  48213652 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatga 48213696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 389; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 1204 - 703
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||    
T  1204 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 1105  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  1104 tcaaattactacacgcaggtcatagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagcattcgt 1005  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1004 cttaggagtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaattatttatagaacttgagttatggtcaaatt 905  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  904 actgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatttgtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagttt 805  T
Q  408 tacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatga 507  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  804 tatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgattaattagtatatgtatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatga 705  T
Q  508 ag 509  Q
    ||    
T  704 ag 703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 181 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 1224 - 1075
Alignment:
Q  181 actggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggat 280  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  |||||| |||    
T  1224 actggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaaagat 1125  T
Q  281 ttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  1124 ttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgcaggtcatagtgaat 1075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 164 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1360 - 1226
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  1360 ccgaatttgaaatgaaatctcatattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttct-atgccgttgg 1262  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1261 tctgacgtctaaacgatttatagaacttgagttatg 1226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 1323 - 1225
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  1323 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttct-atgccgttggtctgacgtctaaacgatttatagaacttgagttatgg 1225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 768 - 698
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  768 tatgattgattaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 377; Significance: 0; HSPs: 149)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 18914547 - 18914046
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||       || ||||||||||||||||||    
T  18914547 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaataccgttggtctgaagtcaaaacgattgatagaacttgagttatgg 18914448  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  18914447 tcaaagtactgcacgtaggtcacagtcaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtatttattggtacataattggt 18914348  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  18914347 cttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaactttctaatgctgttggtttaacttcaaaaggatgtatagaacttgagttatggtcaaatt 18914248  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18914247 actgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtaaatacgatattgttcatgattgatgaagtgt 18914148  T
Q  408 tacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatga 507  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18914147 tatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttatgaatacgatattgtccatgattgatga 18914048  T
Q  508 ag 509  Q
    ||    
T  18914047 ag 18914046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 19005766 - 19005266
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||     
T  19005766 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatgt 19005667  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  19005666 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacatctttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattagt 19005567  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19005566 cttaggtgtaaacacaaaaattgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 19005467  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||    
T  19005466 actgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattactataggtatgtatatgtttgtgaatgcgatattgttcataattgatgaaatgt 19005367  T
Q  408 tacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatga 507  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19005366 tatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatga 19005267  T
Q  508 a 508  Q
    |    
T  19005266 a 19005266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Original strand, 31630090 - 31630590
Alignment:
Q  10 ttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||||    
T  31630090 ttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagttatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtc 31630189  T
Q  110 aaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtct 209  Q
    |||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630190 aaattactacatgtatgtcacagcgaatttttatgaatttcagcacaattttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtct 31630289  T
Q  210 tagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattac 309  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  31630290 taggtgtaaacacgaaatttgtaggtatagacgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattat 31630389  T
Q  310 ttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    | |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  31630390 tgcacgtatgtcacaatgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgataaagtgtta 31630489  T
Q  410 catgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaa 508  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630490 tatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 31630589  T
Q  509 g 509  Q
    |    
T  31630590 g 31630590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 1598668 - 1598271
Alignment:
Q  11 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtca 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||||||||    
T  1598668 tggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacatcaaaacaatttatagaacttgagttatggtca 1598569  T
Q  111 aattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtctt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598568 aattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtctt 1598469  T
Q  211 agatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  1598468 aggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtcatagtcaaattact 1598369  T
Q  311 tcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  1598368 gcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 1598271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 8 - 409
Target Start/End: Original strand, 30676257 - 30676658
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  30676257 aattggtcttaggtgataagactaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttgctctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 30676356  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30676357 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggt 30676456  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||    
T  30676457 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaataatttatagaacttgagttatggtaaaatt 30676556  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30676557 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgt 30676656  T
Q  408 ta 409  Q
    ||    
T  30676657 ta 30676658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 8 - 409
Target Start/End: Original strand, 19847519 - 19847916
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||       ||||||||||||||||||| |    
T  19847519 aattggtcctaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattagtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatcg 19847618  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19847619 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggt 19847718  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||     ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19847719 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgc----tagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 19847814  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  19847815 actgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgt 19847914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 7 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 25689118 - 25688716
Alignment:
Q  7 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||       ||||||||||||| ||||||    
T  25689118 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtcggacgtcaaaaaaatttatagaacttgcgttatg 25689019  T
Q  107 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgg 206  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  25689018 gtcatattactgcacgtaggtcatagtgaatttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatcaaaactggtatttattggtaccgaattgg 25688919  T
Q  207 tcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaat 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  25688918 tcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttgtaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaaattgagttatggtcaaat 25688819  T
Q  307 tacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtg 406  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  25688818 tactgcacgtaggtgacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatttttgtgaatacgatattgtccatgattgaggaagtg 25688719  T
Q  407 tta 409  Q
    |||    
T  25688718 tta 25688716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 19 - 409
Target Start/End: Original strand, 26924199 - 26924588
Alignment:
Q  19 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtcaaattactg 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924199 ggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 26924298  T
Q  119 cacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaa 218  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  26924299 cacgtaggtcacagttaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattgttcttaggtgtaa 26924398  T
Q  219 acacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtag 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||     
T  26924399 acacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtac 26924498  T
Q  319 gtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  26924499 gtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 26924588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Original strand, 18334230 - 18334540
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334230 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 18334329  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334330 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 18334429  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  18334430 tagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 18334528  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  18334529 gatgaagtgtta 18334540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 24423071 - 24422761
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24423071 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 24422972  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422971 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 24422872  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  24422871 tagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 24422773  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  24422772 gatgaagtgtta 24422761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 33864802 - 33864492
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864802 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 33864703  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864702 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 33864603  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  33864602 tagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 33864504  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  33864503 gatgaagtgtta 33864492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Original strand, 2290818 - 2291128
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2290818 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 2290917  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2290918 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagtta 2291017  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |    
T  2291018 tagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgact 2291116  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  2291117 gatgaagtgtta 2291128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 8055554 - 8055243
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055554 tgagttaaggtcaaattactgcacataggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 8055455  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8055454 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 8055355  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    || ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  8055354 tggtcaaattactgaatgtaggtcacaatgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgatt 8055255  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  8055254 gatgaagtgtta 8055243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 22782751 - 22782441
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  22782751 tgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaaatggtattaattggta 22782652  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  22782651 cagaattggtcttaggtgtaagtaggaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaatttgagtta 22782552  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||    
T  22782551 tggtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgatt 22782453  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  22782452 gatgaagtgtta 22782441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 33862285 - 33862008
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33862285 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 33862186  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33862185 taggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 33862086  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  33862085 aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 33862008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 12742809 - 12742531
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12742809 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 12742710  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12742709 taggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcaagtaggtcacagtgaat 12742610  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||    
T  12742609 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgaccttgtccatgattgatgaagtgtta 12742531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 8 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 1598864 - 1598542
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||        |||||||||||||||||||||    
T  1598864 aattggtcataagtgtaaacattaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgacgttaaaacgatttatagaacttgagttatgg 1598765  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  1598764 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataaatggt 1598665  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1598664 cttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacatcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaatt 1598565  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  1598564 actgcacgtaggtcacagtgaat 1598542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Original strand, 1540582 - 1540859
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1540582 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgcaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 1540681  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1540682 taggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1540781  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  1540782 aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 1540859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 8 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 25689310 - 25688988
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  25689310 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtgtggatgtcagcattctaatgacgttggtctgacatcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 25689211  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25689210 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaatttttatgaatatcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggt 25689111  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||  |||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  25689110 cttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtcggacgtcaaaaaaatttatagaacttgcgttatggtcatatt 25689011  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||| ||||||||||| |||||||    
T  25689010 actgcacgtaggtcatagtgaat 25688988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 164 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 34963832 - 34963587
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963832 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 34963733  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 363  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963732 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacatagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 34963633  T
Q  364 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34963632 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgtta 34963587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Original strand, 28289007 - 28289283
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  28289007 agtgaatttttatgaattttagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtctcaggtgtaaacacaaaagttg 28289106  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  28289107 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaag 28289206  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  28289207 aattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtga--gcgatattgtccatgattgatgaagtgtta 28289283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Original strand, 19858593 - 19858867
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  19858593 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattgatcttaggtgtaaacacaaaagttg 19858692  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||| ||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19858693 taggtatgaatgt---ctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaat 19858789  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  19858790 aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ctgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 19858867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 164 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 25535866 - 25535641
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25535866 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 25535767  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 363  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25535766 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 25535667  T
Q  364 gtatatgtttgtgaatactatattgt 389  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  25535666 gtatatgtttgtgaatacgatattgt 25535641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 189 - 409
Target Start/End: Original strand, 17377576 - 17377796
Alignment:
Q  189 tgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaa 288  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17377576 tgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaagtatttatagaa 17377675  T
Q  289 cttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattg 388  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17377676 cttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaaatagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattg 17377775  T
Q  389 ttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  17377776 ttcatgattgatgaagtgtta 17377796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 8 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 18914740 - 18914422
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||| |||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  18914740 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgtcgttggtctgacatcaaaaaaatttatagaacttgagttatgg 18914641  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  18914640 tcaaattactgcacgtaggtcacagtaaacttttatgaattttagcacaacttagaccgaattttaaattaatactggtattgattggtacataattggt 18914541  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  18914540 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaataccgttggtctgaagtcaaaacgattgatagaacttgagttatggtcaaagt 18914441  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagt 326  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  18914440 actgcacgtaggtcacagt 18914422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 12942681 - 12942415
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12942681 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 12942582  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||     
T  12942581 ta------------agctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcgaattactgcacgtaggtcacagtgaag 12942494  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  12942493 aattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgtta 12942415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 98 - 326
Target Start/End: Original strand, 26924085 - 26924313
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924085 tgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 26924184  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||| | ||| | |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26924185 cagaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagtta 26924284  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagt 326  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||    
T  26924285 tggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 26924313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 164 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 23992881 - 23992637
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  23992881 ccgaatttgaaatgaaatccggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtcagctttctaatgttgttgg 23992782  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 363  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23992781 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaatttactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 23992682  T
Q  364 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  23992681 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 23992637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 8864 - 9085
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  8864 aattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 8963  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8964 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattttaaatgaaaactggtaatgattggtacagaattggt 9063  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagtt 229  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  9064 cttaggtgtaaacacgaaagtt 9085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25737247 - 25737028
Alignment:
Q  18 aggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtcaaattact 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||       |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  25737247 aggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacatgagttatggtcatattact 25737148  T
Q  118 gcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgta 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  25737147 gcatgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattcgtcttaggtgta 25737048  T
Q  218 aacacgaaagttgtaggtat 237  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  25737047 aacacgaaagttgtaggtat 25737028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 131 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 23415456 - 23415258
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  23415456 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttg 23415357  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaa 329  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  23415356 taggtatggatgttagttttctaatgccattggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcactgtgaa 23415258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 131 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 27557214 - 27557016
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27557214 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgctattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttg 27557115  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaa 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| | ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27557114 taggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgttaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 27557016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 287 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 15875737 - 15875526
Alignment:
Q  287 aacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatat 386  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||| ||||    
T  15875737 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtaaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt----------ttgtgaatacgatat 15875648  T
Q  387 tgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatac 486  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  15875647 tgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattattatatgtatgtatatgttgtgaatac 15875548  T
Q  487 gatattgtccatgattgatgaa 508  Q
    ||||||||  |||||| |||||    
T  15875547 gatattgtaaatgattaatgaa 15875526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 131 - 283
Target Start/End: Original strand, 15892079 - 15892231
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15892079 agtgaaattttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 15892178  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattta 283  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15892179 taggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattta 15892231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 167 - 330
Target Start/End: Original strand, 1871 - 2034
Alignment:
Q  167 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttt 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1871 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtct 1970  T
Q  267 gacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1971 gacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 2034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 167 - 330
Target Start/End: Original strand, 8830 - 8993
Alignment:
Q  167 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttt 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8830 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtct 8929  T
Q  267 gacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8930 gacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 8993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 19005803 - 19005637
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005803 ccgaatttgaaatgaaatttggtattgattagtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 19005704  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19005703 tctgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatgttcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19005637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 171
Target Start/End: Original strand, 1905 - 2068
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  1905 aattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 2004  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattt 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2005 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattt 2068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 207
Target Start/End: Original strand, 22981321 - 22981486
Alignment:
Q  42 tatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaattttt 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22981321 tatggatgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaattttt 22981420  T
Q  142 atgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22981421 atgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 22981486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23807087 - 23806922
Alignment:
Q  42 tatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaattttt 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23807087 tatggatgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaattttt 23806988  T
Q  142 atgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23806987 atgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 23806922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 131 - 268
Target Start/End: Original strand, 17883168 - 17883305
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  17883168 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtctttggtgtaaacacgaaagttg 17883267  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttga 268  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17883268 taggtatggatgttagcattctaatgtcgttggtttga 17883305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 167 - 330
Target Start/End: Original strand, 19847485 - 19847648
Alignment:
Q  167 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttt 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |    
T  19847485 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcctaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattagtct 19847584  T
Q  267 gacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19847585 gacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19847648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 1598901 - 1598735
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  1598901 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgataggtccagaattggtcataagtgtaaacattaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttgg 1598802  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1598801 tctgacgttaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1598735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 164 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 18914777 - 18914615
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  18914777 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataagtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgtcgttgg 18914678  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagt 326  Q
    | |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  18914677 tctgacatcaaaaaaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 18914615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Original strand, 30676220 - 30676386
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  30676220 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgaatggtacataattggtcttaggtgataagactaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttgc 30676319  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30676320 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 30676386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Original strand, 31630051 - 31630217
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630051 ccgaatttaaaatgaaatctggtattgataagtacatagttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagttatggatgttagctttctaatgtcgttgg 31630150  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  31630151 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacatgtatgtcacagcgaat 31630217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 173
Target Start/End: Original strand, 112 - 278
Alignment:
Q  7 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatg 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||       |||||| |||||||||||||    
T  112 aaattggtcttaggtgtatacacgaaagttgaaggtatggatgttagttttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatataacttgagttatg 211  T
Q  107 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttga 173  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  212 gtcaaagtactgcacgtaggtcatagtgaatttttgtgaatttcagcacaactttgttcgaatttga 278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 167 - 330
Target Start/End: Original strand, 79 - 242
Alignment:
Q  167 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttt 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  79 aatttaaaatgaaaactggtattgagttgtacaaaattggtcttaggtgtatacacgaaagttgaaggtatggatgttagttttctaatgtcgttggtct 178  T
Q  267 gacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  179 gacgtcaaaacgatttatataacttgagttatggtcaaagtactgcacgtaggtcatagtgaat 242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 17377588 - 17377717
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  17377588 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaagtatttatagaacttgagttatgg 17377687  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17377688 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 17377717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 27557144 - 27557006
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||        |||||||||||||||||||||    
T  27557144 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgttaaaacaatttatagaacttgagttatgg 27557045  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 146  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  27557044 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaaatcttatgaa 27557006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 1598478 - 1598349
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||       |||||||||||||||| || |    
T  1598478 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtcatag 1598379  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598378 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1598349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 23992844 - 23992715
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  23992844 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtcagctttctaatgttgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 23992745  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  23992744 tcaatttactgcacgtaggtcacaatgaat 23992715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 198 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 25689313 - 25689181
Alignment:
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  25689313 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtgtggatgtcagcattctaatgacgttggtctgacatcaaaacaatttatagaacttgagtta 25689214  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    || |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  25689213 tggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 25689181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23415386 - 23415248
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  23415386 aatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccattggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 23415287  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 146  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  23415286 tcaagttactgcacgtaggtcactgtgaaatcttatgaa 23415248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 1540652 - 1540781
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  1540652 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 1540751  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1540752 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1540781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 18334333 - 18334462
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  18334333 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 18334432  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334433 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18334462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 24422968 - 24422839
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  24422968 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 24422869  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422868 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24422839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 25535829 - 25535700
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  25535829 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 25535730  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  25535729 tcaaattactgcatgtaggtcatagtgaat 25535700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 26924381 - 26924510
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  26924381 aattgttcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 26924480  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  26924481 tcaaattactgcacgtacgtcatagtgaat 26924510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 33862215 - 33862086
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  33862215 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 33862116  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33862115 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 33862086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 33864699 - 33864570
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  33864699 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 33864600  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864599 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 33864570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 136
Target Start/End: Original strand, 28289077 - 28289205
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  28289077 aattggtctcaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 28289176  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28289177 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 28289205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 12742739 - 12742610
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  12742739 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 12742640  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12742639 tcaaattactgcaagtaggtcacagtgaat 12742610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 214 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 25737244 - 25737128
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttca 313  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||    
T  25737244 tgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacatgagttatggtcatattactgca 25737145  T
Q  314 cgtaggtcacagtgaat 330  Q
     ||||||||||||||||    
T  25737144 tgtaggtcacagtgaat 25737128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 34963795 - 34963666
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  34963795 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 34963696  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  34963695 tcaaattactgcacatagatcacagtgaat 34963666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 2290921 - 2291050
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||| ||||||| |    
T  2290921 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 2291020  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291021 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 2291050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 137
Target Start/End: Original strand, 19847711 - 19847837
Alignment:
Q  7 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||  || ||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||||    
T  19847711 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggt----atgctagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 19847806  T
Q  107 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847807 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19847837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 22782648 - 22782519
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||| |||||||||||    
T  22782648 aattggtcttaggtgtaagtaggaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaatttgagttatgg 22782549  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22782548 tcaaattactgcacataggtcacagtgaat 22782519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 8055451 - 8055322
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||| |||  ||       ||||||||| |||||||||||    
T  8055451 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 8055352  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  8055351 tcaaattactgaatgtaggtcacaatgaat 8055322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 31630281 - 31630410
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  31630281 aattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtaggtatagacgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 31630380  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  31630381 tcaaattattgcacgtatgtcacaatgaat 31630410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Original strand, 31630524 - 31630595
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  31630524 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 31630595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 19858663 - 19858789
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  19858663 aattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgt---ctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 19858759  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19858760 tcaaattactgcacataggtcacagtgaat 19858789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 235 - 330
Target Start/End: Original strand, 22981321 - 22981416
Alignment:
Q  235 tatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  | | |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22981321 tatggatgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 22981416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 235 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23807087 - 23806992
Alignment:
Q  235 tatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  | | |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  23807087 tatggatgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23806992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 1540789 - 1540854
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1540789 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 1540854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 1598341 - 1598276
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598341 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 1598276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 18334470 - 18334535
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334470 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 18334535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 23992707 - 23992642
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23992707 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 23992642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 24422831 - 24422766
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422831 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 24422766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 26924518 - 26924583
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924518 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 26924583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 33862078 - 33862013
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33862078 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 33862013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 33864562 - 33864497
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864562 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 33864497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 35056787 - 35056694
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  35056787 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgattatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 35056694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 71
Target Start/End: Original strand, 15892149 - 15892212
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15892149 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggt 15892212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 2291058 - 2291123
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2291058 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgactgatgaag 2291123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 19858797 - 19858862
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858797 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgctgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 19858862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 22782511 - 22782446
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22782511 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaag 22782446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 8055315 - 8055248
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055315 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 8055248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 18914111 - 18914041
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18914111 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtta-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 18914041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 19005330 - 19005260
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  19005330 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgtta 19005260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 19847845 - 19847911
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847845 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 19847911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Original strand, 19984132 - 19984228
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||| ||||||| ||||||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19984132 tgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatgactttggtttgacctccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 19984228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 71
Target Start/End: Original strand, 17883238 - 17883301
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggt 71  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  17883238 aattggtctttggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcattctaatgtcgttggt 17883301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 339 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 35056781 - 35056631
Alignment:
Q  339 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga-------- 430  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| ||  || |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||            
T  35056781 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgattatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgattatgatg 35056682  T
Q  431 --gtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
       ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  35056681 ttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 35056631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 12942611 - 12942495
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||| ||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  12942611 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta------------agctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 12942524  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 136  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  12942523 tcgaattactgcacgtaggtcacagtgaa 12942495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16240406 - 16240296
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  16240406 gaattggacttcggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttaggacttgagttatg 16240307  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  16240306 atcaaattact 16240296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 16556944 - 16557054
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16556944 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 16557043  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  16557044 atcaaattact 16557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 16633500 - 16633610
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16633500 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 16633599  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  16633600 atcaaattact 16633610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 16650174 - 16650284
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || || ||||||||||||||||    
T  16650174 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgaattttagaacttgagttatg 16650273  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  16650274 atcaaattact 16650284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 30676587 - 30676653
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30676587 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaag 30676653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 34963658 - 34963592
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34963658 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaag 34963592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Original strand, 35016017 - 35016113
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35016017 tgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttgctttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 35016113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 439 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 12942491 - 12942420
Alignment:
Q  439 ttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatat-gttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12942491 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaag 12942420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25904585 - 25904474
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttat-agaacttgagttat 298  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| | ||||||||||||||    
T  25904585 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttttagaacttgagttat 25904486  T
Q  299 gatcaaattact 310  Q
    ||||||||||||    
T  25904485 gatcaaattact 25904474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 12742602 - 12742536
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  12742602 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgaccttgtccatgattgatgaag 12742536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 25688787 - 25688721
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtata-tgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25688787 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatttttgtgaatacgatattgtccatgattgaggaag 25688721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 27654596 - 27654706
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  27654596 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 27654695  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    || ||||||||    
T  27654696 attaaattact 27654706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Original strand, 22226582 - 22226679
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttat-agaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22226582 tgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttttagaacttgagttatgatcaaattact 22226679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Original strand, 21776109 - 21776205
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  21776109 tgtaaacatgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgccaaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 21776205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 15875590 - 15875520
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||    
T  15875590 tatgattgatgaattattatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtaaatgattaatgaaatgtta 15875520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 15875737 - 15875698
Alignment:
Q  94 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15875737 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 15875698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 310
Target Start/End: Original strand, 22593620 - 22593691
Alignment:
Q  239 gatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22593620 gatgttagctttctaatggatttagtttgacttccaaatgatttttataacttgagttatgatcaaattact 22593691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10488081 - 10487971
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  10488081 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 10487982  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  10487981 atcaaattact 10487971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 16377247 - 16377357
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  16377247 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 16377346  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  16377347 atcaaattact 16377357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 16384571 - 16384681
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  16384571 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 16384670  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  16384671 atcaaattact 16384681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 16826367 - 16826477
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| |||||||||||  |    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  16826367 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagacaattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 16826466  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    || ||||||||    
T  16826467 attaaattact 16826477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 17377725 - 17377791
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17377725 tatgattgatgaaatagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaag 17377791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1555596 - 1555527
Alignment:
Q  241 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  1555596 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 1555527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 310
Target Start/End: Original strand, 33315116 - 33315185
Alignment:
Q  241 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  33315116 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttaaaacttgagttatgatcaaattact 33315185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 19609690 - 19609582
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || |||  |||| ||||||||||| ||||    
T  19609690 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaataatttttagaacttgagatatg 19609591  T
Q  300 atcaaatta 308  Q
    |||||||||    
T  19609590 atcaaatta 19609582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 32259142 - 32259078
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgatt 450  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||    
T  32259142 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgatt 32259078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 25535692 - 25535641
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgt 494  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25535692 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 25535641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 256
Target Start/End: Original strand, 10905418 - 10905460
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 256  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10905418 tgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaatg 10905460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22806170 - 22806124
Alignment:
Q  433 ataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  22806170 ataatgttgtttatgattgatgatttattatatgaatgtatatgttg 22806124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 25656897 - 25656843
Alignment:
Q  355 tatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  25656897 tatatgtatgtatatatttgtgactacgatattgtccaagattgatgaagtgtta 25656843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 241 - 310
Target Start/End: Original strand, 16133087 - 16133156
Alignment:
Q  241 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||   |||||||||||| ||| ||||    
T  16133087 tgttagctttccaatgtcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatact 16133156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 436 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 35056790 - 35056717
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg-cgaatacgatattgtccatgattgatgaa 508  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  || || ||| |||| |||||||||||||    
T  35056790 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgattatgatgttgttcatgattgatgaa 35056717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 63
Target Start/End: Original strand, 10905416 - 10905460
Alignment:
Q  19 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatg 63  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10905416 ggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaatg 10905460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 25737064 - 25737028
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 44  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25737064 aattcgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 25737028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 439 - 509
Target Start/End: Original strand, 28289209 - 28289278
Alignment:
Q  439 ttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatat-gttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||| ||   ||||||||||||||||||||||||    
T  28289209 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtga--gcgatattgtccatgattgatgaag 28289278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 10445422 - 10445379
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  10445422 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 10445379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 13284980 - 13284937
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  13284980 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 13284937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Original strand, 20411373 - 20411416
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20411373 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 20411416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 25921002 - 25920959
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  25921002 atgttgtttatgattgatgaattattatgtgaatgtatatgttg 25920959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 25921065 - 25921022
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  25921065 atgttgtttatgattgatgaattattatacgaatgtatatgttg 25921022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 29044534 - 29044491
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  29044534 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 29044491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Original strand, 19773424 - 19773470
Alignment:
Q  433 ataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  19773424 ataatgttgttcatgattgatgatttattatatgaatgtatatgttg 19773470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Original strand, 20411376 - 20411430
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  20411376 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtt 20411430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22556476 - 22556422
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||||    
T  22556476 ttgttcatgattgatgaagtattatatgaaggtatatgttgatgaatatgatgtt 22556422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22556583 - 22556529
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  22556583 ttgttcatgattgatgaagtattatttgaatgtatatgttaatgaatatgatgtt 22556529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23153085 - 23153035
Alignment:
Q  260 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  23153085 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgataaaattact 23153035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25175222 - 25175112
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | ||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||  ||||| ||||    
T  25175222 gaattggactttggtgtaaacatcaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagatattgagatatg 25175123  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    || ||||||||    
T  25175122 attaaattact 25175112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 29044531 - 29044477
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  29044531 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtt 29044477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 339 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 32259136 - 32259078
Alignment:
Q  339 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || ||||||||||||    
T  32259136 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgatt 32259078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 32259144 - 32259102
Alignment:
Q  437 tgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  32259144 tgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 32259102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 35056671 - 35056617
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  35056671 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtt 35056617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 313
Target Start/End: Original strand, 18455448 - 18455561
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| | || | |||||||||||| |||| ||||| | |   ||||||||||    
T  18455448 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtaattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatg 18455547  T
Q  300 atcaaattacttca 313  Q
    || ||| |||||||    
T  18455548 atgaaaatacttca 18455561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 241 - 321
Target Start/End: Original strand, 19443697 - 19443777
Alignment:
Q  241 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtc 321  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||| |||   ||||| |||||  ||| |||| ||||||||||    
T  19443697 tgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgaagaaaatactccacgtaggtc 19443777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 389 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 22556517 - 22556481
Alignment:
Q  389 ttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtt 425  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22556517 ttcatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgtt 22556481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 99)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 509
Target Start/End: Original strand, 16274803 - 16275306
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  16274803 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatatcattggtctgacgtcaaaactatttatagaacttgagttatgg 16274902  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16274903 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaatgtttatgaattttagcacaactctgtccgaattggaaatgaaaactggtattgattggtacataattggt 16275002  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaa-tgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaat 306  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16275003 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaaatgtcattggtttcacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaat 16275102  T
Q  307 tacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtg 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16275103 tactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatacgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaattcgatattgttcatgattgatgaagtg 16275202  T
Q  407 ttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgat 505  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275203 ttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgcgaatacgatattgtccatgattgat 16275302  T
Q  506 gaag 509  Q
    ||||    
T  16275303 gaag 16275306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 29298856 - 29298355
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||       |||||| ||||||||||||||    
T  29298856 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgttctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatgg 29298757  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29298756 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggt 29298657  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  29298656 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaatt 29298557  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| |||||||||||| |      
T  29298556 actgcacataagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattag 29298457  T
Q  408 tacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatga 507  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29298456 tatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatatatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatga 29298357  T
Q  508 ag 509  Q
    ||    
T  29298356 ag 29298355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 8 - 403
Target Start/End: Original strand, 27161134 - 27161529
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||       |||||||||||||| ||||||    
T  27161134 aattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgaattatgg 27161233  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27161234 tcaaattactgcatgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaacaggtattgattggtacaaaattggt 27161333  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27161334 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatt 27161433  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 403  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  27161434 actgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttatgaataaaatattgttaatgattgatgaa 27161529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 8 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 29777355 - 29776938
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||        |||||||||||||||||||||    
T  29777355 aattagtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgttaaaacgatttatagaacttgagttatgg 29777256  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29777255 tcaaattactgaacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggt 29777156  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29777155 cttaggtgtaatcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgggttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 29777056  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| |||||||||||| |      
T  29777055 actgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattag 29776956  T
Q  408 tacatgaatgtatatgtt 425  Q
    || ||| |||||||||||    
T  29776955 tatatgtatgtatatgtt 29776938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 8 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 31612980 - 31612523
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  31612980 aattggtcttaggtgtaaacactaaagttataggtatggatttaagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 31612881  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31612880 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaccgaattggt 31612781  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  31612780 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttcaaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaatt 31612681  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||  |||||||| |||||||||||| |      
T  31612680 actgcacgtaggtcaaagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatcagtatgatattgtttatgattgatgaattag 31612581  T
Q  408 tacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatg 466  Q
    || ||| ||||||||| || ||| || ||| ||||  |||||||||||| || ||||||    
T  31612580 tatatgtatgtatatg-ttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtattatatg 31612523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 13989390 - 13989080
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989390 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 13989291  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989290 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 13989191  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  13989190 tagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 13989092  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  13989091 gatgaagtgtta 13989080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 8 - 425
Target Start/End: Original strand, 22122561 - 22122979
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaa-gttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatg 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |  ||       ||| ||||||||||||||||    
T  22122561 aattggtcttaggtgtaaacactaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttttacttcaaaacgatttgtagaacttgagttatg 22122660  T
Q  107 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgg 206  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22122661 gtcaaattactgcacatagatcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgataggtccagaattgg 22122760  T
Q  207 tcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaat 306  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  22122761 tcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaacgatttatagaacttgggttatagtcaaat 22122860  T
Q  307 tacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtg 406  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| |||||||||||| ||    
T  22122861 tactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattg 22122960  T
Q  407 ttacatgaatgtatatgtt 425  Q
     || ||| |||| ||||||    
T  22122961 gtatatgtatgtttatgtt 22122979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 8 - 409
Target Start/End: Original strand, 15859543 - 15859956
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||     
T  15859543 aattggtcttaggtgtatacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacctcaaaactatttatagaacttgagttatga 15859642  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtca-------------cagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattg 194  Q
    ||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15859643 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaattgtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattg 15859742  T
Q  195 gtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 294  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15859743 gtacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatacaacttgag 15859842  T
Q  295 ttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatg 394  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||| ||||    
T  15859843 ttatggtcaaataactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat-cttgcgaatacgatattgtccatg 15859941  T
Q  395 attgatgaagtgtta 409  Q
     ||||||||||||||    
T  15859942 gttgatgaagtgtta 15859956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Original strand, 21474724 - 21475035
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21474724 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatatgaaatgaaaaccggtattgattggta 21474823  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21474824 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 21474923  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  21474924 tggtcaaattactaaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgatt 21475023  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  21475024 gatgaagtgtta 21475035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 8 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 31613173 - 31612851
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  31613173 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaggtttctaataccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 31613074  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31613073 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaactgaaaactggtattgattggtatagaattggt 31612974  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31612973 cttaggtgtaaacactaaagttataggtatggatttaagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaatt 31612874  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  31612873 actgcacgtaggtcacagtgaat 31612851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 21841258 - 21840981
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21841258 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 21841159  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  21841158 taggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaat 21841059  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21841058 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgtta 21840981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Original strand, 21922962 - 21923239
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21922962 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 21923061  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21923062 taggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 21923161  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21923162 aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 21923239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 16362410 - 16362132
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  16362410 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacgaaagttg 16362311  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16362310 taggtatggaagttagctttctaatgcggttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttaagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 16362211  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16362210 aatttattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgttaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 16362132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 122 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 13227364 - 13227129
Alignment:
Q  122 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaaca 221  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13227364 gtaggtcttagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 13227265  T
Q  222 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtc 321  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  13227264 cgaaagttttatgtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtc 13227165  T
Q  322 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13227164 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 13227129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 122 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 29535552 - 29535317
Alignment:
Q  122 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaaca 221  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  29535552 gtaggtcttagtgaatttttatgaatttcaacacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaaca 29535453  T
Q  222 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtc 321  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  29535452 cgaaagttgtatgtatggatgttagctttctagtgtcgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtc 29535353  T
Q  322 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29535352 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 29535317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 99 - 409
Target Start/End: Original strand, 23593372 - 23593682
Alignment:
Q  99 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtac 198  Q
    |||||||| | |||||||| || | |||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23593372 gagttatgatgaaattactccaaggaggtcttagtgaattttcacgaatttcagcacaactttgtccgagtttgaaatgaaaactggtattgattggtgc 23593471  T
Q  199 agaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 298  Q
    | |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||||||| |||||    
T  23593472 ataattagtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaataatttatagaacttgcgttat 23593571  T
Q  299 gatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattg 398  Q
      | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  23593572 agttaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgatta 23593671  T
Q  399 atgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||    
T  23593672 atgaagtgtta 23593682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 167 - 425
Target Start/End: Original strand, 22050543 - 22050801
Alignment:
Q  167 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttt 266  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  22050543 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcaatggtct 22050642  T
Q  267 gacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgta 366  Q
     |  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22050643 aatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgta 22050742  T
Q  367 tatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtt 425  Q
    ||||||| ||| ||  || ||||| |||||||||||| |  || ||| |||||||||||    
T  22050743 tatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 22050801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Original strand, 15859506 - 15859672
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15859506 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtatacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgg 15859605  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15859606 tctgacctcaaaactatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15859672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 16401536 - 16401274
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||| | ||        |||||| ||||||||||||||    
T  16401536 aattggtcttaggtgtagacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctatttccattggtctaacgtggaaaggatttatataacttgagttatgg 16401437  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||     
T  16401436 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaacttttcccgaatttgaaatgaaaactggtattggtcggtacaaaattggc 16401337  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 270  Q
     ||   |||||||| ||||||| ||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  16401336 atttagtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttccaatggctttggtttgact 16401274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 29298893 - 29298727
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  29298893 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgt 29298794  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29298793 tctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 29298727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Original strand, 22122524 - 22122691
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaa-gttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 262  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22122524 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacactaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttg 22122623  T
Q  263 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  22122624 gttttacttcaaaacgatttgtagaacttgagttatggtcaaattactgcacatagatcacagtgaat 22122691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Original strand, 16274766 - 16274932
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  16274766 ccgaatttgaaatggaatctggtgttgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatatcattgg 16274865  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16274866 tctgacgtcaaaactatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 16274932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 31613210 - 31613044
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  31613210 ccgaatttgaaatgaaatatggtattgataggttcataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaggtttctaataccgttgg 31613111  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31613110 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 31613044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 167 - 323
Target Start/End: Original strand, 9044711 - 9044867
Alignment:
Q  167 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttt 266  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  9044711 aatttgaaataaaaactggtattgatcggtacagaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagttttctaatgccgttggtct 9044810  T
Q  267 gacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcac 323  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  9044811 aacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcac 9044867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 87 - 271
Target Start/End: Original strand, 10812632 - 10812816
Alignment:
Q  87 tttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggt 186  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10812632 tttataaaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttctatgaatttcagcacaactttctccgaatttgaaattaaaactggt 10812731  T
Q  187 attgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgactt 271  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| |||||| |||| ||    ||||||||||| | || | ||||||||||||    
T  10812732 attgatcggtactgaattgatcttaggtgtaaacatgaaagtcgtagataattgtgttagctttccagtgcctttggtttgactt 10812816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 166 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 29777390 - 29777226
Alignment:
Q  166 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 265  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  29777390 gaatttgaaataaaaactggtattgatcggtacagaattagtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtc 29777291  T
Q  266 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  29777290 tgacgttaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacaatgaat 29777226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 163 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16401574 - 16401407
Alignment:
Q  163 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 262  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||    
T  16401574 tccgaatttgaaataaaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgtagacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctatttccattg 16401475  T
Q  263 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    || | || |  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16401474 gtctaacgtggaaaggatttatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16401407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 330
Target Start/End: Original strand, 27161099 - 27161263
Alignment:
Q  166 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 265  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||     
T  27161099 gaatttgaaatggaatatagtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttggtc 27161198  T
Q  266 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27161199 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 27161263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 164 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 40129543 - 40129387
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  40129543 ccgaatttgaaatgaaatatggtattgataggtccagaattgatcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgtcgttgg 40129444  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggt 320  Q
    | || | |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  40129443 tctggcatcaaaacgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggt 40129387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 392 - 509
Target Start/End: Original strand, 22050715 - 22050832
Alignment:
Q  392 atgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatat 491  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22050715 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatat 22050814  T
Q  492 tgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22050815 tgtccatgattgatgaag 22050832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 392 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 29777024 - 29776907
Alignment:
Q  392 atgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatat 491  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  29777024 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatat 29776925  T
Q  492 tgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29776924 tgtccatgattgatgaag 29776907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 22050577 - 22050706
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| |||||       |||||||||||||||||||||    
T  22050577 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcaatggtctaatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 22050676  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22050677 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 22050706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 164 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 43543360 - 43543269
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43543360 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaat 43543269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 137
Target Start/End: Original strand, 27161326 - 27161456
Alignment:
Q  7 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||||    
T  27161326 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatg 27161425  T
Q  107 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27161426 gtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 27161456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 392 - 509
Target Start/End: Original strand, 22122893 - 22123010
Alignment:
Q  392 atgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatat 491  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  22122893 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattggtatatgtatgtttatgttgtgaatacgatat 22122992  T
Q  492 tgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22122993 tgtccatgattgatgaag 22123010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 13989287 - 13989158
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  13989287 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 13989188  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989187 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 13989158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 130
Target Start/End: Original strand, 9044745 - 9044867
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| | |||       |||||||||||||||||||||    
T  9044745 aattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagttttctaatgccgttggtctaacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 9044844  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcac 130  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9044845 tcaaattactgcacgtaggtcac 9044867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 392 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 31612649 - 31612532
Alignment:
Q  392 atgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatat 491  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  31612649 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatcagtatgatattgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacaatat 31612550  T
Q  492 tgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31612549 tgtccatgattgatgaag 31612532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 13227285 - 13227156
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  13227285 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttttatgtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 13227186  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13227185 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 13227156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 21923032 - 21923161
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||| ||||||| |    
T  21923032 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 21923131  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923132 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 21923161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 392 - 509
Target Start/End: Original strand, 27161465 - 27161582
Alignment:
Q  392 atgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatat 491  Q
    |||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27161465 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttatgaataaaatattgttaatgattgatgaattagtatatatatgtatatgttgcgaatacgatat 27161564  T
Q  492 tgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27161565 tgtccatgattgatgaag 27161582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 21474827 - 21474956
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||| |||||||||||    
T  21474827 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 21474926  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21474927 tcaaattactaaacgtaggtcacagtgaat 21474956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 21841188 - 21841059
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  21841188 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatag 21841089  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||    
T  21841088 tcaaattacttcatgtaggtaacagtgaat 21841059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 23593474 - 23593603
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||       ||||||||||||| ||||| |    
T  23593474 aattagtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaataatttatagaacttgcgttatag 23593573  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23593574 ttaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 23593603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 29535473 - 29535344
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  29535473 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctagtgtcgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatgg 29535374  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29535373 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 29535344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16362340 - 16362211
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||  ||       ||||||||| || ||||||||    
T  16362340 aattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaatgcggttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttaagttatgg 16362241  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16362240 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 16362211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Original strand, 16275240 - 16275311
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16275240 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 16275311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 131 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 41372963 - 41372896
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  41372963 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtaaagattggtac 41372896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 40129506 - 40129387
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||   ||       ||||||||||||||||||| |    
T  40129506 aattgatcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgtcgttggtctggcatcaaaacgatttatagaacttgagttatag 40129407  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  40129406 tcaaattactgcacgtaggt 40129387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 13989150 - 13989085
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989150 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 13989085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 21923169 - 21923234
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923169 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 21923234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Original strand, 22050767 - 22050837
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22050767 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 22050837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 29776972 - 29776902
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  29776972 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 29776902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 15859886 - 15859951
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15859886 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatcttgcgaatacgatattgtccatggttgatgaag 15859951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 21841051 - 21840986
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21841051 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaag 21840986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Original strand, 21474963 - 21475030
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21474963 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 21475030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 29298420 - 29298350
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  29298420 tatgattgatgaattagtatatatatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 29298350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 330
Target Start/End: Original strand, 10812612 - 10812682
Alignment:
Q  260 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10812612 ttggtttgacttcaaaatgatttataaaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10812682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 43543323 - 43543269
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaat 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43543323 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaat 43543269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 16362204 - 16362137
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16362204 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgttaatacgatattgtccatgattgatgaag 16362137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Original strand, 22122945 - 22123015
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22122945 tatgattgatgaattggtatatgtatgtttatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 22123015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Original strand, 23593610 - 23593677
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23593610 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattaatgaag 23593677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 339 - 409
Target Start/End: Original strand, 27161518 - 27161587
Alignment:
Q  339 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27161518 atgattgatgaattagtatatatatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 27161587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21858688 - 21858592
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||| | | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21858688 tgtaaacatgaaagttttagatagttatgttagctttctaacggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 21858592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Original strand, 21650881 - 21650979
Alignment:
Q  212 gatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  21650881 gatgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttaaaactagagttatgatcaaattact 21650979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 242 - 310
Target Start/End: Original strand, 44035860 - 44035928
Alignment:
Q  242 gttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  44035860 gttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttataacttgagttatgatcaaattact 44035928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17004019 - 17003909
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  17004019 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 17003920  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  17003919 atcaaattact 17003909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22366596 - 22366527
Alignment:
Q  241 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22366596 tgttagctttctaatgactttggtttgacatcgaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 22366527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 209
Target Start/End: Original strand, 43630292 - 43630337
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtct 209  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  43630292 ccgaatttgaaatgaaatatggtattgattggtacagaattggtct 43630337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Original strand, 7321570 - 7321673
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtata----------atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatat 475  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||||          |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  7321570 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatataatgttacatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatat 7321669  T
Q  476 gttg 479  Q
    ||||    
T  7321670 gttg 7321673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 12710217 - 12710137
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatg 466  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| | ||||| || |||| ||||||    
T  12710217 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcacgattgctggattattatatg 12710137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Original strand, 18060588 - 18060684
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| |||||  | |||||||| |||||| ||||||||    
T  18060588 tgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttaaaaacttgagatatgattaaattact 18060684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 18120937 - 18120834
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga----------gtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatat 475  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||           ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18120937 ttgttcatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtcctatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatat 18120838  T
Q  476 gttg 479  Q
    ||||    
T  18120837 gttg 18120834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 387 - 442
Target Start/End: Original strand, 24720477 - 24720532
Alignment:
Q  387 tgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgt 442  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  24720477 tgttcatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgt 24720532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 50544184 - 50544130
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  50544184 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgagtattatgtt 50544130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 386 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 50544058 - 50544005
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgt 439  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  50544058 ttgttcatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgt 50544005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 386 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 50544121 - 50544077
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga 430  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  50544121 ttgttcatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatga 50544077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Original strand, 7321567 - 7321610
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  7321567 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 7321610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 12710220 - 12710177
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  12710220 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 12710177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Original strand, 22824127 - 22824170
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  22824127 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 22824170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 442
Target Start/End: Original strand, 24720414 - 24720469
Alignment:
Q  387 tgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgt 442  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  24720414 tgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgt 24720469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 50544187 - 50544144
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  50544187 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 50544144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 18120811 - 18120757
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||||    
T  18120811 ttgttcatgattgatgaagtattatatgaaggtatatgttgatgaatatgatgtt 18120757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 18120874 - 18120820
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  18120874 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtt 18120820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 478
Target Start/End: Original strand, 22050714 - 22050748
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22050714 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 22050748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 478
Target Start/End: Original strand, 22122892 - 22122926
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22122892 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 22122926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 478
Target Start/End: Original strand, 27161464 - 27161498
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27161464 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 27161498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 29777025 - 29776991
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29777025 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 29776991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 31612650 - 31612616
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31612650 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 31612616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 50543932 - 50543878
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  50543932 ttgttcatgattgataaagtattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtt 50543878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 1642904 - 1642847
Alignment:
Q  383 atattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    ||||| ||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  1642904 atatttttcattattgatgaattattatatgaatgtatatgtttatgaatatgatgtt 1642847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 439
Target Start/End: Original strand, 21244600 - 21244653
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgt 439  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||| ||| ||||    
T  21244600 ttgttcatgattgatgaattattacatgaatgtatatattgatgaatatgatgt 21244653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 476
Target Start/End: Original strand, 635867 - 635907
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg 476  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  635867 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 635907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 430
Target Start/End: Original strand, 7321633 - 7321677
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga 430  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  7321633 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatga 7321677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 430
Target Start/End: Original strand, 22824130 - 22824174
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga 430  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  22824130 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatga 22824174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 282
Target Start/End: Original strand, 24815242 - 24815310
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 282  Q
    |||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  24815242 tgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgtctttggtttgacttgaaaatgattt 24815310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 39060427 - 39060387
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg 476  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  39060427 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 39060387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Original strand, 45574442 - 45574538
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| ||||| |||   |||||||||||| ||| ||||    
T  45574442 tgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatact 45574538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 48301197 - 48301153
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga 430  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  48301197 ttgttcatgattgatgaaatattatatgaatgtatatgttgatga 48301153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 30634 - 30132
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| |||       |||||| ||||| ||||||||    
T  30634 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaatgccattggtgtgacgtcaaaacgatttataaaactttagttatgg 30535  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30534 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcaacacaactttgtccgattttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 30435  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  30434 cttcggtgtaaacattaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtttcacttcaaaaggatttgtagtacttgagttatggtcaaatt 30335  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30334 actgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgt 30235  T
Q  408 tacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatg 506  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30234 tatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttatttgtgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatg 30135  T
Q  507 aag 509  Q
    |||    
T  30134 aag 30132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 163 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 30672 - 30505
Alignment:
Q  163 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  30672 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaatgccattg 30573  T
Q  263 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    || |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30572 gtgtgacgtcaaaacgatttataaaactttagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 30505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 30196 - 30127
Alignment:
Q  340 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  30196 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 30127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 186)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 508
Target Start/End: Original strand, 16401472 - 16401972
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  16401472 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaacgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 16401571  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  16401572 tcaaattacagcacgtatgccacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattgatacataattggt 16401671  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||    
T  16401672 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattgatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatagtcagatt 16401771  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401772 acagcaggtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 16401871  T
Q  408 tacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatga 507  Q
    || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401872 tatacgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatga 16401971  T
Q  508 a 508  Q
    |    
T  16401972 a 16401972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 509
Target Start/End: Original strand, 38549552 - 38550054
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  38549552 aattgatcttaggtataaacacggaagttgtaggtatggatgttagctttttaattccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 38549651  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  38549652 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcatcacaactttgtccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtaaagaattggt 38549751  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  38549752 cttaggtataaacacaaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaaat 38549851  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  38549852 actgcacgtatgtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaatttt 38549951  T
Q  408 tacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatg 506  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38549952 tatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatacgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatg 38550051  T
Q  507 aag 509  Q
    |||    
T  38550052 aag 38550054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 509
Target Start/End: Original strand, 19936455 - 19936946
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||  ||        ||||||||||||||||||||     
T  19936455 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtagctatggatattagctttctaattccgttggtctggcgttaaaacgatttatagaacttgagttatgc 19936554  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19936555 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 19936654  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  19936655 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgtcattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgaggtatagtcaaatt 19936754  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19936755 actgcacgtaggtcacagtgaataattgtttatgattgatgaatta----------gtatatgtttgtgaatattatattgttcatgattgatgaagtgt 19936844  T
Q  408 tacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatga 507  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19936845 tatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgttcatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatga 19936944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 405
Target Start/End: Original strand, 27471963 - 27472361
Alignment:
Q  7 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||    
T  27471963 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 27472062  T
Q  107 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27472063 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgagtttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattgg 27472162  T
Q  207 tcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaat 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27472163 tcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaat 27472262  T
Q  307 tacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 405  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27472263 tactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 27472361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 32122343 - 32121931
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||    
T  32122343 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 32122244  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |    
T  32122243 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgtaaactgatattgattggtacagaattgtt 32122144  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32122143 cttaggtgtaaacacgaatgttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatt 32122044  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  32122043 actgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgcatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgt 32121944  T
Q  408 tacatgaatgtat 420  Q
    || ||| ||||||    
T  32121943 tatatgtatgtat 32121931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 16412866 - 16413264
Alignment:
Q  11 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||    
T  16412866 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtca 16412965  T
Q  111 aattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtctt 210  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16412966 aattactatacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtctt 16413065  T
Q  211 agatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16413066 aggtgtaaacacgacagttgtaggtatggatgttagcttgctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 16413165  T
Q  311 tcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16413166 tcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgtta 16413264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 8 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 15071175 - 15070778
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  15071175 aattgatcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 15071076  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15071075 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggt 15070976  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  15070975 cttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttaaaaatgatttatacaacttgagttatggtcaaatt 15070876  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 405  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15070875 actgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 15070778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 8 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 24049225 - 24048841
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||       |||||| ||||||||||||||    
T  24049225 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatgg 24049126  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24049125 tcaaattactgcacgtaggtcaaaataaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacataattggt 24049026  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24049025 cttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaatt 24048926  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcat 393  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  24048925 actgca-gtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtncat 24048841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 8 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 20403894 - 20403477
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  20403894 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 20403795  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20403794 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatgtttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggt 20403695  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  20403694 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttgaaaaggatttatagaacttgagttattgtcatatt 20403595  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| |||||||||||| |      
T  20403594 actgcgcgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattag 20403495  T
Q  408 tacatgaatgtatatgtt 425  Q
    || ||| |||||||||||    
T  20403494 tatatgtatgtatatgtt 20403477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 8 - 425
Target Start/End: Original strand, 15202726 - 15203143
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  15202726 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgctattggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatgg 15202825  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15202826 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatatttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaacgaaaactggtattgattggtacagaattggt 15202925  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15202926 cttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaatt 15203025  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||  || || || |||||||||||| |      
T  15203026 actgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttatttatgattgatgaattag 15203125  T
Q  408 tacatgaatgtatatgtt 425  Q
    || ||| |||||||||||    
T  15203126 tatatgtatgtatatgtt 15203143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 7 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 19896937 - 19896541
Alignment:
Q  7 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||||    
T  19896937 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatg 19896838  T
Q  107 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19896837 gtcaaattactgcaagtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattttaaatgaaaactggtattgattggtagagaattgg 19896738  T
Q  207 tcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaat 306  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  19896737 tcttaggtgtaaacacgaaaattgtaggtatgaattttaactttctagcgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaat 19896638  T
Q  307 tacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 403  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  19896637 tactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatgtgattgatgaattaggatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 19896541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 1484926 - 1484616
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484926 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 1484827  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484826 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 1484727  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  1484726 tagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 1484628  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  1484627 gatgaagtgtta 1484616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Original strand, 14409082 - 14409392
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409082 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 14409181  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409182 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 14409281  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  14409282 tagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 14409380  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  14409381 gatgaagtgtta 14409392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Original strand, 5852930 - 5853240
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5852930 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 5853029  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5853030 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagtta 5853129  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  5853130 tagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 5853228  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  5853229 gatgaagtgtta 5853240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Original strand, 1326635 - 1326980
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  1326635 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaagtgtaaaaacgaaagttgtaggtatgaatgttatctttctaatgtcgttgg 1326734  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 363  Q
    | |||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1326735 tctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 1326834  T
Q  364 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtat 463  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||    
T  1326835 gtacatgtttgtaaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgcttttgtttatgattgatgaattggtat 1326934  T
Q  464 atgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1326935 atgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 1326980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 98 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 14824299 - 14823975
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14824299 tgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 14824200  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14824199 tagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 14824100  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| | |||||||    
T  14824099 tagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg-ttgtaaatacgatattatccatgatt 14824001  T
Q  398 gatgaagtgttacatgaatgtatatg 423  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||    
T  14824000 gatgaagtgttatatgtatatatatg 14823975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 8 - 331
Target Start/End: Original strand, 15202533 - 15202856
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  15202533 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 15202632  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15202633 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaacgttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggt 15202732  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15202733 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgctattggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaatt 15202832  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaata 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  15202833 actgcacgtaggtcacagtgaata 15202856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 4483804 - 4483494
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  4483804 tgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt-gaaatgaaaactggtatttattggta 4483706  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483705 cataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 4483606  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    || ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  4483605 tggtcaaattactgaacgtaggtcacactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgatt 4483506  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  4483505 gatgaagtgtta 4483494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 7 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 19897130 - 19896807
Alignment:
Q  7 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatg 106  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||    
T  19897130 aaattggtcttagctgtaaatacaaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 19897031  T
Q  107 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19897030 gtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattttaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattgg 19896931  T
Q  207 tcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaat 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19896930 tcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaat 19896831  T
Q  307 tacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||| || ||||||||||||||||    
T  19896830 tactgcaagtaggtcacagtgaat 19896807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Original strand, 24485714 - 24485992
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  24485714 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacgaaagttg 24485813  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24485814 taggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttataaaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24485913  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24485914 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgtta 24485992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Original strand, 20045833 - 20046143
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20045833 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggta 20045932  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20045933 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttcacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 20046032  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||    
T  20046033 tagtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattttccatgatt 20046131  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  20046132 gatgaagtgtta 20046143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 8 - 330
Target Start/End: Original strand, 38549360 - 38549681
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  38549360 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctaatgtcgttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 38549459  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38549460 tcaaattactgcacgtagg-cacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttaaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgat 38549558  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38549559 cttaggtataaacacggaagttgtaggtatggatgttagctttttaattccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatt 38549658  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  38549659 actgcacgtaggtcacagtgaat 38549681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Original strand, 18677735 - 18678013
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  18677735 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattttaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttg 18677834  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18677835 taggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18677934  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  18677935 aattgaatatgattgatgaattagtatgtatatgtatatgtttgtgaatacgatattatccatgattgatgaagtgtta 18678013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 97 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 16198420 - 16198115
Alignment:
Q  97 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggt 196  Q
    ||||| |||| | ||| |||| |||| |||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16198420 ttgagatatgattaaaatactccacggaggtcttagtgaaattttatgaatttcaccacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggt 16198321  T
Q  197 acagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtt 296  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  16198320 acagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccgttggtttgactttaaaaatatttatagaacttgagtt 16198221  T
Q  297 atgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgat 396  Q
    ||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16198220 atggtccaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgat 16198121  T
Q  397 tgatga 402  Q
    ||||||    
T  16198120 tgatga 16198115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 22002244 - 22001967
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22002244 agtgaatttgtatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttg 22002145  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  22002144 taggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacattgaat 22002045  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22002044 aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 22001967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Original strand, 4542044 - 4542321
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4542044 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 4542143  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  4542144 taggtataaatgttagctttctaatgccgttcgcttgacttcaaaatgatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcgcagtgaat 4542243  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  4542244 aattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 4542321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 330
Target Start/End: Original strand, 16401287 - 16401601
Alignment:
Q  16 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtcaaatta 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||       |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401287 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaatta 16401386  T
Q  116 ctgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatg 215  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  16401387 cagcacgtaggtcacagtgaatgtttatgaatttcaatacaactttgtcagaatttgaaatgcaaactggtattgattggtacgtaattggtcttaggtg 16401486  T
Q  216 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  16401487 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaacgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattacagcacg 16401586  T
Q  316 taggtcacagtgaat 330  Q
    || | |||| |||||    
T  16401587 tatgccacaatgaat 16401601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 107 - 330
Target Start/End: Original strand, 16401186 - 16401408
Alignment:
Q  107 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  16401186 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattgg 16401285  T
Q  207 tcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaat 306  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16401286 t-ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaat 16401384  T
Q  307 tacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||  |||||||||||||||||||    
T  16401385 tacagcacgtaggtcacagtgaat 16401408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 139 - 329
Target Start/End: Original strand, 14397419 - 14397609
Alignment:
Q  139 tttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatg 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14397419 tttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagctgtaggtatg 14397518  T
Q  239 gatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaa 329  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14397519 aatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttgtagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 14397609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 200 - 402
Target Start/End: Original strand, 25657892 - 25658094
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25657892 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgtttgtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 25657991  T
Q  300 atcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattga 399  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  25657992 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatttgatattgttcatgattga 25658091  T
Q  400 tga 402  Q
    |||    
T  25658092 tga 25658094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 99 - 299
Target Start/End: Original strand, 45290186 - 45290386
Alignment:
Q  99 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtac 198  Q
    |||||||| | ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290186 gagttatgatgaaaatactcaacgtaggtcacagttaatttttatgaatttcagcacaactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtac 45290285  T
Q  199 agaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 298  Q
    | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290286 aaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 45290385  T
Q  299 g 299  Q
    |    
T  45290386 g 45290386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 338 - 509
Target Start/End: Original strand, 20982498 - 20982670
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataat 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  20982498 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgat 20982597  T
Q  438 gttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20982598 gttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 20982670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 204 - 425
Target Start/End: Original strand, 45290385 - 45290606
Alignment:
Q  204 tggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatca 303  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45290385 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtca 45290484  T
Q  304 aattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 403  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  45290485 aattactgcacgtagatcatagtgaataattgaatatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 45290584  T
Q  404 gtgttacatgaatgtatatgtt 425  Q
     |  || ||| |||||||||||    
T  45290585 ttagtatatgtatgtatatgtt 45290606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Original strand, 27471927 - 27472093
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471927 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 27472026  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27472027 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27472093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 32122380 - 32122214
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32122380 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 32122281  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32122280 tctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 32122214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 349 - 509
Target Start/End: Original strand, 13425241 - 13425402
Alignment:
Q  349 aattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatga 448  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13425241 aattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatga 13425340  T
Q  449 ttgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13425341 ttgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaag 13425402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20403931 - 20403765
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20403931 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 20403832  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20403831 tctgacgtcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20403765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Original strand, 38549323 - 38549488
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38549323 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 38549422  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  38549423 tatgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg-cacagtgaat 38549488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 165 - 330
Target Start/End: Original strand, 16412827 - 16412992
Alignment:
Q  165 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggt 264  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16412827 cgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggt 16412926  T
Q  265 ttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
     |||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16412927 ctgatgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactatacgtaggtcacagtgaat 16412992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15071212 - 15071046
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15071212 ccgaatttgaaataaaaactggtattgatcggtaaagaattgatcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 15071113  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15071112 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 15071046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Original strand, 15202496 - 15202662
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  15202496 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgatagatccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttgg 15202595  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15202596 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 15202662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 164 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24049262 - 24049104
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24049262 ccgaatttgaaatgaaatatggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 24049163  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtca 322  Q
    | |||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  24049162 tctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 24049104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 338 - 459
Target Start/End: Original strand, 13425336 - 13425457
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataat 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  13425336 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgat 13425435  T
Q  438 gttgtttatgattgatgaatta 459  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13425436 gttgtttatgattgatgaatta 13425457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 19897166 - 19897000
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  19897166 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttagctgtaaatacaaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccgttgg 19897067  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  19897066 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 19897000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 392 - 509
Target Start/End: Original strand, 45290520 - 45290637
Alignment:
Q  392 atgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatat 491  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  45290520 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatat 45290619  T
Q  492 tgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45290620 tgtccatgattgatgaag 45290637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Original strand, 19936418 - 19936584
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  19936418 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtagctatggatattagctttctaattccgttgg 19936517  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | || | | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  19936518 tctggcgttaaaacgatttatagaacttgagttatgctcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 19936584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 392 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 20403563 - 20403446
Alignment:
Q  392 atgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatat 491  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  20403563 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatat 20403464  T
Q  492 tgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20403463 tgtccatgattgatgaag 20403446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 411 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 32810248 - 32810150
Alignment:
Q  411 atgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32810248 atgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 32810150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14824196 - 14824067
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  14824196 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 14824097  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14824096 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14824067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 18677805 - 18677934
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  18677805 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatgg 18677904  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18677905 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18677934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 411 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 19896586 - 19896488
Alignment:
Q  411 atgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896586 atgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatatatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 19896488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 137
Target Start/End: Original strand, 45290385 - 45290511
Alignment:
Q  11 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||||||||    
T  45290385 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtca 45290484  T
Q  111 aattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  45290485 aattactgcacgtagatcatagtgaat 45290511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 1484823 - 1484694
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  1484823 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 1484724  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484723 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1484694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 14409185 - 14409314
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  14409185 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 14409284  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409285 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14409314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 25657893 - 25658022
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  25657893 aattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgtttgtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 25657992  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25657993 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 25658022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 146
Target Start/End: Original strand, 14397481 - 14397619
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||  ||       ||| |||||||||||||||||    
T  14397481 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagctgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttgtagaacttgagttatgg 14397580  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14397581 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaa 14397619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 392 - 509
Target Start/End: Original strand, 15203057 - 15203174
Alignment:
Q  392 atgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatat 491  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  15203057 atgattgatgaattaatatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttatttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaataagatat 15203156  T
Q  492 tgtccatgattgatgaag 509  Q
    | ||||||||||||||||    
T  15203157 tatccatgattgatgaag 15203174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 1326672 - 1326801
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||| |||       |||||| ||||||||||||||    
T  1326672 aattggtcttaagtgtaaaaacgaaagttgtaggtatgaatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatgg 1326771  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1326772 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1326801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 4483702 - 4483573
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  4483702 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 4483603  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4483602 tcaaattactgaacgtaggtcacactgaat 4483573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 5853033 - 5853162
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||| ||||||| |    
T  5853033 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 5853132  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853133 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 5853162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16198316 - 16198187
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  |        |||||||||||||||||||||    
T  16198316 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccgttggtttgactttaaaaatatttatagaacttgagttatgg 16198217  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16198216 tccaattactgcacgtaggtcacaatgaat 16198187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 16413056 - 16413185
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  16413056 aattggtcttaggtgtaaacacgacagttgtaggtatggatgttagcttgctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 16413155  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16413156 tcaaattacttcacgtagatcacagtgaat 16413185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 24485784 - 24485913
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       |||||| |||||||||||| |    
T  24485784 aattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttataaaacttgagttatag 24485883  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24485884 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24485913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 164 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 11361168 - 11361034
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  11361168 ccgaatttgaaatgaaatctagtattgataggtgcataattggtcttaggtgtaaacacaaaacttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttgg 11361069  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 298  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11361068 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttaagttat 11361034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 4542114 - 4542243
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |  |||  ||       ||||||||||| ||||||| |    
T  4542114 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttcgcttgacttcaaaatgatttatagaactagagttatag 4542213  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4542214 tcaaattactgcacgtaggtcgcagtgaat 4542243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 20045936 - 20046065
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| | |  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  20045936 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttcacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 20046035  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20046036 tcaaattactgcatgtaggtcatagtgaat 20046065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 22002174 - 22002045
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  22002174 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatag 22002075  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22002074 tcaaattactgcacgtaggtaacattgaat 22002045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 32810355 - 32810263
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 256  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32810355 ccgaatttgaaatgaaatctaatattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttgtaatg 32810263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Original strand, 20982604 - 20982675
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20982604 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 20982675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 109
Target Start/End: Original strand, 45290287 - 45290389
Alignment:
Q  7 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||||    
T  45290287 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 45290386  T
Q  107 gtc 109  Q
    |||    
T  45290387 gtc 45290389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 338 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 32810215 - 32810141
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatg 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32810215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttacatg 32810141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Original strand, 38549988 - 38550059
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  38549988 tatgattgatgaattagtatacgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 38550059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 439 - 509
Target Start/End: Original strand, 4542246 - 4542316
Alignment:
Q  439 ttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542246 ttgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 4542316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 1484686 - 1484621
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484686 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 1484621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 5853170 - 5853235
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853170 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 5853235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 14409322 - 14409387
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409322 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 14409387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 22002037 - 22001972
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22002037 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 22001972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 343 - 479
Target Start/End: Original strand, 5082945 - 5083081
Alignment:
Q  343 ttgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgt 442  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || || |||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  5082945 ttgatgaattattatatgaatgtatatgttcatgaatatgatgtttttcatggttaatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgt 5083044  T
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  5083045 tcatgattgatgaattattatatgaatgtttatgttg 5083081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 20403511 - 20403441
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20403511 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 20403441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Original strand, 45290572 - 45290642
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  45290572 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 45290642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Original strand, 1326915 - 1326985
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  1326915 tatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 1326985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 15070846 - 15070779
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070846 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 15070779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 19896553 - 19896483
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  19896553 tatgattgatgaattagtatatgtatatatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 19896483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 11361131 - 11361024
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||       |||||||||||| |||||| |    
T  11361131 aattggtcttaggtgtaaacacaaaacttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttaagttatag 11361032  T
Q  108 tcaaatta 115  Q
    | ||||||    
T  11361031 ttaaatta 11361024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 15319988 - 15320098
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15319988 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataactatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 15320087  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  15320088 atcaaattact 15320098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 15500357 - 15500467
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15500357 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataactatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 15500456  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  15500457 atcaaattact 15500467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 339 - 409
Target Start/End: Original strand, 19936882 - 19936951
Alignment:
Q  339 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  19936882 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 19936951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 20046073 - 20046138
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20046073 tatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattttccatgattgatgaag 20046138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 241 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29759498 - 29759429
Alignment:
Q  241 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29759498 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 29759429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 342 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 21513707 - 21513619
Alignment:
Q  342 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga 430  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  21513707 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttgatga 21513619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Original strand, 24717724 - 24717820
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||| ||||||| ||||||   ||||||| ||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24717724 tgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagatttctaatgcctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 24717820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 387 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 38988809 - 38988717
Alignment:
Q  387 tgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  38988809 tgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatgttcatgattgatgaattattatatgaatttatatgttg 38988717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 387 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 39019906 - 39019814
Alignment:
Q  387 tgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  39019906 tgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatgttcatgattgatgaattattatatgaatttatatgttg 39019814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 386 - 508
Target Start/End: Original strand, 5082935 - 5083058
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg-cgaat 484  Q
    ||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||| || |||||||| |||||| ||||||||||||  ||||    
T  5082935 ttgttcatggttgatgaattattatatgaatgtatatgttcatgaatatgatgtttttcatggttaatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaat 5083034  T
Q  485 acgatattgtccatgattgatgaa 508  Q
    | ||| |||| |||||||||||||    
T  5083035 atgatgttgttcatgattgatgaa 5083058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Original strand, 15203109 - 15203179
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||||    
T  15203109 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaataagatattatccatgattgatgaagtgtta 15203179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Original strand, 16401908 - 16401978
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  16401908 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgtta 16401978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 32810318 - 32810263
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatg 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32810318 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttgtaatg 32810263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 16413193 - 16413259
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16413193 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaag 16413259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 24485921 - 24485987
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24485921 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaag 24485987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 27472294 - 27472360
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27472294 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaag 27472360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 32122013 - 32121947
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32122013 tatgattgatgaattagtatatgtatgcatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 32121947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 310
Target Start/End: Original strand, 13663129 - 13663198
Alignment:
Q  241 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13663129 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 13663198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 14824059 - 14823994
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14824059 tatgattgattaattagtatatgaatgtatatgttgtaaatacgatattatccatgattgatgaag 14823994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Original strand, 18815603 - 18815696
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||| || |||||| | ||||||||||    
T  18815603 ttgttcatgattgatgaattattatgtgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatgaaggtatatgttg 18815696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 339 - 440
Target Start/End: Original strand, 18815609 - 18815710
Alignment:
Q  339 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatg 438  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||||||  ||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||    
T  18815609 atgattgatgaattattatgtgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatgaaggtatatgttgatgaatatgatg 18815708  T
Q  439 tt 440  Q
    ||    
T  18815709 tt 18815710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 310
Target Start/End: Original strand, 22007126 - 22007195
Alignment:
Q  241 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22007126 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 22007195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 444 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 16198179 - 16198115
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatga 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16198179 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 16198115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Original strand, 17150629 - 17150725
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||| |||||||| || ||   ||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  17150629 tgtaaacatgaaagttgcagataattatgttagctttctaatggctttggttggacttccaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 17150725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 395 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 21513707 - 21513623
Alignment:
Q  395 attgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  21513707 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttg 21513623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 4483566 - 4483499
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4483566 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaag 4483499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 339 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 38988804 - 38988654
Alignment:
Q  339 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatg 438  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  ||  ||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||| ||| |||    
T  38988804 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatgttcatgattgatgaattattatatgaatttatatgttgatgaatatgatg 38988705  T
Q  439 t----------tgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |          |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  38988704 ttatatgatgatgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 38988654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 339 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 39019901 - 39019751
Alignment:
Q  339 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatg 438  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  ||  ||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||| ||| |||    
T  39019901 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatgttcatgattgatgaattattatatgaatttatatgttgatgaatatgatg 39019802  T
Q  439 t----------tgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |          |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  39019801 ttatatgatgatgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 39019751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 39114513 - 39114415
Alignment:
Q  212 gatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||| ||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  39114513 gatgtaaacatgaaagttttagataattatgttagttttctaatggctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcagattact 39114415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 21513600 - 21513527
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaatta 459  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| || | ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21513600 ttgttcatgattgatgaagtattatatgaaggtatatgttgataaatatgatgttgtttataattgatgaatta 21513527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Original strand, 36733296 - 36733389
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||| || |||||||||||| || |||||| | ||||||||||    
T  36733296 ttgttcatgattgatgatttattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtttttcatgattgatgaagtattatatgaaggtatatgttg 36733389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 440
Target Start/End: Original strand, 36733302 - 36733403
Alignment:
Q  339 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatg 438  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||  ||||||  || || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||    
T  36733302 atgattgatgatttattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtttttcatgattgatgaagtattatatgaaggtatatgttgatgaatatgatg 36733401  T
Q  439 tt 440  Q
    ||    
T  36733402 tt 36733403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 161
Target Start/End: Original strand, 3844554 - 3844609
Alignment:
Q  107 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatg-aatttcagcacaacttt 161  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3844554 gtcaaattactacacgtaggtcatagtgaatttttatgaaatttcagcacaacttt 3844609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 478
Target Start/End: Original strand, 13425284 - 13425423
Alignment:
Q  339 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatg 438  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| |||||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||| ||  ||     
T  13425284 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgata 13425383  T
Q  439 ttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    ||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  13425384 ttgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtt 13425423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 223304 - 223414
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  223304 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 223403  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    || ||||||||    
T  223404 attaaattact 223414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 272163 - 272273
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  272163 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 272262  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  272263 atcaaattact 272273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 643686 - 643576
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  643686 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 643587  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  643586 atcaaattact 643576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 688075 - 688185
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  688075 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 688174  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    || ||||||||    
T  688175 attaaattact 688185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 736927 - 737037
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  736927 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 737026  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    || ||||||||    
T  737027 attaaattact 737037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 829492 - 829382
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  829492 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 829393  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  829392 atcaaattact 829382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 860822 - 860932
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  860822 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 860921  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    || ||||||||    
T  860922 attaaattact 860932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 11360997 - 11360951
Alignment:
Q  110 aaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcaca 156  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11360997 aaattactgcacgtagatcatagtgaatttttatgaatttcagcaca 11360951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 16401802 - 16401868
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16401802 tatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaag 16401868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 18677942 - 18678008
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18677942 tatgattgatgaattagtatgtatatgtatatgtttgtgaatacgatattatccatgattgatgaag 18678008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 240 - 310
Target Start/End: Original strand, 22089412 - 22089482
Alignment:
Q  240 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22089412 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatattaagaacttgagttatgatcaaattact 22089482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 430
Target Start/End: Original strand, 5083001 - 5083085
Alignment:
Q  346 atgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga 430  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || |||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||    
T  5083001 atgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtttatgttgatga 5083085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 383 - 439
Target Start/End: Original strand, 18819447 - 18819503
Alignment:
Q  383 atattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgt 439  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18819447 atattgttcataattgatgaagtattatatgaatgtatatgtttatgaatatgatgt 18819503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 23669943 - 23669840
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga----------gtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatat 475  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||           ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23669943 ttgttcatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtcctatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatat 23669844  T
Q  476 gttg 479  Q
    ||||    
T  23669843 gttg 23669840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 24048896 - 24048841
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccat 498  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  24048896 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtncat 24048841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 507
Target Start/End: Original strand, 25658030 - 25658094
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatga 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||  |||||||| ||||||||||||    
T  25658030 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatttgatattgttcatgattgatga 25658094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 509
Target Start/End: Original strand, 18815540 - 18815674
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgt----------tgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatat 475  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||          |||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  18815540 ttgttcataattgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtcatatgatgttgttcatgattgatgaattattatgtgaatgtatat 18815639  T
Q  476 gttg-cgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||  ||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  18815640 gttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaag 18815674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 310
Target Start/End: Original strand, 21493050 - 21493137
Alignment:
Q  223 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||   || | |||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21493050 gaaagttgaagatatggatgttagctttcatttgccattggttggacttcatttagatttatagaacttgagttatgatcaaaatact 21493137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Original strand, 17979199 - 17979253
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  17979199 ttgttcatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtt 17979253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18612002 - 18611952
Alignment:
Q  260 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18612002 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 18611952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Original strand, 18819387 - 18819441
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  18819387 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgagtatgatgtt 18819441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 23670006 - 23669952
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  23670006 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgagtattatgtt 23669952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 38988873 - 38988740
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgt----------tgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatat 475  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||          |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  38988873 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgatgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatat 38988774  T
Q  476 gttg-cgaatacgatattgtccatgattgatgaa 508  Q
    ||||  ||||| |||  ||| |||||||||||||    
T  38988773 gttgatgaatatgatgatgttcatgattgatgaa 38988740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 39019970 - 39019837
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgt----------tgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatat 475  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||          |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  39019970 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgatgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatat 39019871  T
Q  476 gttg-cgaatacgatattgtccatgattgatgaa 508  Q
    ||||  ||||| |||  ||| |||||||||||||    
T  39019870 gttgatgaatatgatgatgttcatgattgatgaa 39019837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 383 - 440
Target Start/End: Original strand, 6573734 - 6573791
Alignment:
Q  383 atattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  6573734 atattgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaaaataatgtt 6573791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 241 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18618899 - 18618830
Alignment:
Q  241 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| | || ||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18618899 tgttagctttctaatggctttggtttgccgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 18618830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 241 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22147046 - 22146977
Alignment:
Q  241 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    ||||||||||||  || | |||||||||| || |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22147046 tgttagctttcttttggctttggtttgacgtccaaataatttttagaacttgagttatgatcaaattact 22146977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22473958 - 22473855
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgt----------tgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatat 475  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||          |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22473958 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtcctatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatat 22473859  T
Q  476 gttg 479  Q
    ||||    
T  22473858 gttg 22473855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Original strand, 17438101 - 17438144
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  17438101 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 17438144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Original strand, 17979133 - 17979176
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  17979133 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 17979176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Original strand, 18819384 - 18819427
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  18819384 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 18819427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Original strand, 20517901 - 20517944
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20517901 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 20517944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22207578 - 22207535
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  22207578 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 22207535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Original strand, 22258942 - 22258985
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  22258942 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 22258985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22356033 - 22355990
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  22356033 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 22355990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 23670068 - 23669966
Alignment:
Q  387 tgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga----------gtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg 476  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||           ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  23670068 tgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 23669969  T
Q  477 ttg 479  Q
    |||    
T  23669968 ttg 23669966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Original strand, 36405764 - 36405807
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  36405764 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 36405807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 509
Target Start/End: Original strand, 36733233 - 36733367
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgt----------tgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatat 475  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||          |||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  36733233 ttgttcatgattgataaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtcctatgatgttgttcatgattgatgatttattatatgaatgtatat 36733332  T
Q  476 gttg-cgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||  ||||| ||| || | ||||||||||||||    
T  36733333 gttgatgaatatgatgtttttcatgattgatgaag 36733367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 38988876 - 38988833
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  38988876 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 38988833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 39019973 - 39019930
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  39019973 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 39019930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 5080341 - 5080287
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  5080341 ttgttcatgattgatgaattattagatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtt 5080287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 432 - 478
Target Start/End: Original strand, 5082928 - 5082974
Alignment:
Q  432 tataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  5082928 tataatgttgttcatggttgatgaattattatatgaatgtatatgtt 5082974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Original strand, 6573800 - 6573854
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||    
T  6573800 ttgttcatgattgatgaattattacatgaatgtacatgttgatgaatatgatgtt 6573854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Original strand, 17979136 - 17979190
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  17979136 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgacgagtatgatgtt 17979190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 20403564 - 20403530
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20403564 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 20403530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Original strand, 20517904 - 20517958
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  20517904 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtt 20517958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Original strand, 21346114 - 21346160
Alignment:
Q  433 ataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  21346114 ataatgttgttcatgattgatgatttattatatgaatgtatatgttg 21346160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 448 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 21513707 - 21513645
Alignment:
Q  448 attgatgaattagtatatgcatgtatatgttgc-gaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  21513707 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaag 21513645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #167
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Original strand, 22258945 - 22258999
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  22258945 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtt 22258999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #168
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 22473961 - 22473919
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  22473961 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 22473919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 23669880 - 23669826
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  23669880 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtt 23669826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #170
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 23914261 - 23914215
Alignment:
Q  433 ataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  23914261 ataatgttgttcatgattgatgatttattatatgaatgtatatgttg 23914215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #171
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Original strand, 36405767 - 36405821
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  36405767 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtt 36405821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 146
Target Start/End: Original strand, 15319989 - 15320126
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   |||| |||||||||||| | ||||| ||| |||       ||| ||||||||||||||||     
T  15319989 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataactatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 15320088  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 146  Q
    |||||||||| ||| | |||||  |||||||||| ||||    
T  15320089 tcaaattactacacatgggtca-tgtgaatttttgtgaa 15320126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 146
Target Start/End: Original strand, 15500358 - 15500495
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   |||| |||||||||||| | ||||| ||| |||       ||| ||||||||||||||||     
T  15500358 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataactatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 15500457  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 146  Q
    |||||||||| ||| | |||||  |||||||||| ||||    
T  15500458 tcaaattactacacatgggtca-tgtgaatttttgtgaa 15500495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 272
Target Start/End: Original strand, 24678771 - 24678828
Alignment:
Q  215 gtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttc 272  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||   |||||||||||||    
T  24678771 gtaaacatgaaagttgtaggtatggaagttaaatttctaatgaatttggtttgacttc 24678828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 117
Target Start/End: Original strand, 24717722 - 24717820
Alignment:
Q  19 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtcaaattact 117  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||   |||| || ||||||||||| ||||| ||| |||       ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24717722 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagatttctaatgcctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 24717820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 38988693 - 38988640
Alignment:
Q  387 tgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  38988693 tgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtt 38988640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #177
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 39019790 - 39019737
Alignment:
Q  387 tgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  39019790 tgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtt 39019737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 439 - 479
Target Start/End: Original strand, 6573737 - 6573777
Alignment:
Q  439 ttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  6573737 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 6573777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 427 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 12800641 - 12800589
Alignment:
Q  427 atgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||| ||| |||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  12800641 atgaatatgatgttgttcattattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 12800589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 430
Target Start/End: Original strand, 17438104 - 17438148
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga 430  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  17438104 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatga 17438148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 216 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 19866548 - 19866496
Alignment:
Q  216 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttga 268  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | |||||||||    
T  19866548 taaacatgaaagttgtaggtatgaaagttagatttctaatggctttggtttga 19866496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 22207575 - 22207531
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga 430  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  22207575 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatga 22207531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 22473895 - 22473851
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga 430  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  22473895 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatga 22473851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 22474024 - 22473984
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg 476  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22474024 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatg 22473984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 39364186 - 39364118
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 282  Q
    |||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  39364186 tgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgattt 39364118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 282
Target Start/End: Original strand, 44522816 - 44522884
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 282  Q
    |||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  44522816 tgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgattt 44522884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 10406 - 9936
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  10406 aattggtcttatgtgtcaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtctgacatcaaaacgatttatagaacttgagttattg 10307  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  10306 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgactgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagtgttggt 10207  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10206 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 10107  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10106 atttcatgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtgtgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgt 10007  T
Q  408 tacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10006 tatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 9936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 8 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 10599 - 10277
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||       ||||||||||||| |||||||    
T  10599 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgcgttatgg 10500  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10499 tcaaattactgcatgtaggtcacaatgaatttttgtgaatttcagcacaactttatctgaatttaaaatgaaaactggtattgattggtacataattggt 10400  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10399 cttatgtgtcaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtctgacatcaaaacgatttatagaacttgagttattgtcaaatt 10300  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  10299 actgcacgtaggtcacagtgaat 10277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 167 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 10633 - 10470
Alignment:
Q  167 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttt 266  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  10633 aatttgaactgaaatctggtattgataggtccataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtct 10534  T
Q  267 gacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||| |||||    
T  10533 gacgtcaaaaagatttatagaacttgcgttatggtcaaattactgcatgtaggtcacaatgaat 10470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 10076 - 10010
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10076 tatgattgatgaattagtatatgtgtgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaag 10010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 5)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 8 - 409
Target Start/End: Original strand, 3850 - 4251
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||       |||||  |||||||||||||     
T  3850 aattggtcttaggtggaaacacgaaagttgtaggtattgatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaacgatttatgaaacttgagttatga 3949  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 4049  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    | ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4050 cataggtgtaaacatgaaaggtgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 4149  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  4150 actgcacgtgggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatattatattgtccatgattgatgaagtgt 4249  T
Q  408 ta 409  Q
    ||    
T  4250 ta 4251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 8 - 330
Target Start/End: Original strand, 3657 - 3979
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||       |||||  |||||||||||||     
T  3657 aattggtcttagctgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgaggtcaaaacgatttatgtaacttgagttatgc 3756  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3757 tcaaattactgaacgtaggtcacagttaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 3856  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||  |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3857 cttaggtggaaacacgaaagttgtaggtattgatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaacgatttatgaaacttgagttatgatcaaatt 3956  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  3957 actgcacgtaggtcacagtgaat 3979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 87 - 326
Target Start/End: Original strand, 3543 - 3782
Alignment:
Q  87 tttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3543 tttatagaacttgagttatggtcaaaatactgcacgtaggtcactgtgaatttttatgaatttcaacacaagtttgtccgaatttgaaatgaaaactggt 3642  T
Q  187 attgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatag 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| |||||||      
T  3643 attgattggtacagaattggtcttagctgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgaggtcaaaacgatttatgt 3742  T
Q  287 aacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagt 326  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  3743 aacttgagttatgctcaaattactgaacgtaggtcacagt 3782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 4180 - 4246
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4180 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatattatattgtccatgattgatgaag 4246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 330
Target Start/End: Original strand, 3541 - 3593
Alignment:
Q  278 gatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  3541 gatttatagaacttgagttatggtcaaaatactgcacgtaggtcactgtgaat 3593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 193)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 8 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 27165867 - 27165466
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||       ||||||||||||||||||| |    
T  27165867 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatag 27165768  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165767 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcaacacaactttgtccgattttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 27165668  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165667 cttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatcttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 27165568  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  27165567 actgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgt 27165468  T
Q  408 ta 409  Q
    ||    
T  27165467 ta 27165466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 8 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 46822876 - 46822464
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||       |||||| |||||||||||| |    
T  46822876 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatcg 46822777  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  46822776 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgattttgaaatgaaaagtggtattgattggtaaacaattggt 46822677  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46822676 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 46822577  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  46822576 actgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgt 46822477  T
Q  408 tacatgaatgtat 420  Q
    || ||| ||||||    
T  46822476 tatatgtatgtat 46822464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 8 - 409
Target Start/End: Original strand, 53301051 - 53301452
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  53301051 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 53301150  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53301151 tcaaattactgcacataggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgaccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggt 53301250  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  53301251 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaatt 53301350  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  53301351 actgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtacatgattgatgaagtgt 53301450  T
Q  408 ta 409  Q
    ||    
T  53301451 ta 53301452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 8 - 425
Target Start/End: Original strand, 38961385 - 38961803
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  38961385 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 38961484  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38961485 tcaaattgctgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggt 38961584  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaat-gtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaat 306  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  38961585 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagccttctaatggccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaat 38961684  T
Q  307 tacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtg 406  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| |||||||||||| |     
T  38961685 tactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaatta 38961784  T
Q  407 ttacatgaatgtatatgtt 425  Q
     || ||| |||||||||||    
T  38961785 gtatatgtatgtatatgtt 38961803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 8 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 8500135 - 8499738
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  8500135 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 8500036  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8500035 tcaagttactgcacgtaggtcacagtgtatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggt 8499936  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  8499935 cttaggtgtaaacacgaaagttgtagatatggaagttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtgaaatt 8499836  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 405  Q
    ||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  8499835 acggaacataggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattaatgaagt 8499738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 8 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 10557523 - 10557126
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||       |||||||||||||||||||||    
T  10557523 aattggtcttagttgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtcggacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 10557424  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  10557423 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagaacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaaataattggt 10557324  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  10557323 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttagttttacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcagatt 10557224  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 405  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  10557223 actgcacataggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaattcgatattgtccatgattgatgaagt 10557126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 8 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 41124554 - 41124137
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||     
T  41124554 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatga 41124455  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124454 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatgtgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 41124355  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  41124354 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgatttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaatt 41124255  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| |||||||||||| |      
T  41124254 attgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaactagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattag 41124155  T
Q  408 tacatgaatgtatatgtt 425  Q
    || ||| |||||||||||    
T  41124154 tatatgtatgtatatgtt 41124137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 8 - 425
Target Start/End: Original strand, 16282305 - 16282723
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||  ||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||    
T  16282305 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttatctttttaatgttgttagtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 16282404  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16282405 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattggt 16282504  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16282505 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttattgtcaaatt 16282604  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattg-ttcatgattgatgaagtg 406  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||| || |||||||||||| |     
T  16282605 actgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgttttatgattgatgaatta 16282704  T
Q  407 ttacatgaatgtatatgtt 425  Q
     || ||| |||||||||||    
T  16282705 gtatatgtatgtatatgtt 16282723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 8 - 425
Target Start/End: Original strand, 17444311 - 17444728
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||| | |||       |||||| |||||||| |||||    
T  17444311 aattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaagtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctaacgtcaaaacaatttatacaacttgagctatgg 17444410  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17444411 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 17444510  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  17444511 cttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttattgaacttgagttatagtcaaatt 17444610  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
      | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| |||||||||||| |      
T  17444611 tttgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattag 17444710  T
Q  408 tacatgaatgtatatgtt 425  Q
    || ||| |||||||||||    
T  17444711 tatatgtatgtatatgtt 17444728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 17463702 - 17463392
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463702 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 17463603  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463602 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 17463503  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  17463502 tagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 17463404  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  17463403 gatgaagtgtta 17463392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 34159850 - 34159540
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159850 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 34159751  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159750 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 34159651  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  34159650 tagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 34159552  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  34159551 gatgaagtgtta 34159540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Original strand, 20629739 - 20630078
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |        |||||||||||||||||||||    
T  20629739 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttataggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacattaaagcgatttatagaacttgagttatgg 20629838  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20629839 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaacttgtattgattggtacagaattggt 20629938  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20629939 cttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 20630038  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgat 347  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630039 actgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgat 20630078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Original strand, 6468772 - 6469082
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6468772 tgagttatggtcaaattactgcacgtatgtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 6468871  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6468872 cagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttggaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagtta 6468971  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  6468972 tagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 6469070  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  6469071 gatgaagtgtta 6469082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Original strand, 45606544 - 45606855
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606544 tgagttaaggtcaaattactgcacataggtcaccgtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 45606643  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45606644 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 45606743  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    || ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  45606744 tggtcaaattactgaatgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgatt 45606843  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  45606844 gatgaagtgtta 45606855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 55477015 - 55476705
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  55477015 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaattaaaactggtattgactggta 55476916  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55476915 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagtta 55476816  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  55476815 tagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 55476717  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  55476716 gatgaagtgtta 55476705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 164 - 461
Target Start/End: Original strand, 12119357 - 12119654
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12119357 ccgaatttgaaataaaaactggtattgatcagtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttgg 12119456  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119457 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 12119556  T
Q  364 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagt 461  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12119557 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtattatatgaatgtatatatttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagt 12119654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Original strand, 13153893 - 13154203
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13153893 tgagttaaggtcaaattactgcacataggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 13153992  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13153993 cagaattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 13154092  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  13154093 tagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 13154191  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  13154192 gatgaagtgtta 13154203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 98 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 15412955 - 15412649
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15412955 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt-gaaatgaaaactggtattgattggta 15412857  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15412856 cataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgattta 15412757  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15412756 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgtataattgattatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgatt 15412657  T
Q  398 gatgaagt 405  Q
    ||||||||    
T  15412656 gatgaagt 15412649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 330
Target Start/End: Original strand, 55318854 - 55319173
Alignment:
Q  11 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||||||||    
T  55318854 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatggtagctttctaatgccgttggtatgacatcaaaacgatttatagaacttgagttatggtca 55318953  T
Q  111 aattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtctt 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55318954 aattactgcacgtaggtcgcagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccaaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtctt 55319053  T
Q  211 agatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  55319054 aggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgaattatggtcaaattact 55319153  T
Q  311 tcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
     |||||| ||||||||||||    
T  55319154 gcacgtaagtcacagtgaat 55319173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 101 - 409
Target Start/End: Original strand, 10247364 - 10247671
Alignment:
Q  101 gttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacag 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247364 gttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacag 10247463  T
Q  201 aattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatga 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||      
T  10247464 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatac 10247563  T
Q  301 tcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgat 400  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10247564 tcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 10247662  T
Q  401 gaagtgtta 409  Q
    |||||||||    
T  10247663 gaagtgtta 10247671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 130 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 13436792 - 13436520
Alignment:
Q  130 cagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagtt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||    
T  13436792 cagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgagtttgaaatgaaaacttgtattgattggtacataattggtcttaggtataaatacgaaagtt 13436693  T
Q  230 gtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaa 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  13436692 gtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacagtgaa 13436593  T
Q  330 taattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatga 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13436592 taattgaatatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 13436520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Original strand, 7781017 - 7781295
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  7781017 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttg 7781116  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  7781117 taggtataaacgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacataggtcacagtgaat 7781216  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  7781217 aattgattatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 7781295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 15978024 - 15977747
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15978024 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 15977925  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15977924 taggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15977825  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15977824 aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgataaagtgtta 15977747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 98 - 407
Target Start/End: Original strand, 13151428 - 13151736
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13151428 tgagttaaggtcaaattactgcacataggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggaa 13151527  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151528 cagaattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 13151627  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||| ||||  |    
T  13151628 tagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaaggtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgcct 13151726  T
Q  398 gatgaagtgt 407  Q
    ||||||||||    
T  13151727 gatgaagtgt 13151736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 54521314 - 54521036
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54521314 agtgaatttttatggatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 54521215  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  54521214 tgggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaag 54521115  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  54521114 aattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgtta 54521036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 99 - 409
Target Start/End: Original strand, 16453918 - 16454229
Alignment:
Q  99 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttt-tatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    |||||||| | ||| |||| || |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16453918 gagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaattttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 16454017  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaa-ggatttatagaacttgagtt 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  16454018 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatggatttatagaactatagtt 16454117  T
Q  297 atgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgat 396  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  16454118 atagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgat 16454216  T
Q  397 tgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||    
T  16454217 tgatgaagtgtta 16454229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 159 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 12568023 - 12567774
Alignment:
Q  159 tttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  12568023 tttgtccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgcc 12567924  T
Q  259 gttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtata 358  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567923 gttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtata 12567824  T
Q  359 tgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  12567823 tgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 12567774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 159 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 13544487 - 13544239
Alignment:
Q  159 tttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  13544487 tttgtccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgcc 13544388  T
Q  259 gttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtata 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544387 gttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaa-tactgcacgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtata 13544289  T
Q  359 tgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  13544288 tgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 13544239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 135 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 25237331 - 25237041
Alignment:
Q  135 aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtagg 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  25237331 aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaattggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttgg 25237232  T
Q  235 tatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataatt 334  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25237231 tatgaatgttaggtttctaatgccgtgtgtttaacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataatt 25237132  T
Q  335 gaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtt 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| |||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  25237131 gaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 25237041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 131 - 361
Target Start/End: Original strand, 28848292 - 28848522
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28848292 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtactgaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 28848391  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28848392 taggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 28848491  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgt 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848492 aattgaatatgattgatgaattagtatatgt 28848522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 132 - 409
Target Start/End: Original strand, 29544513 - 29544790
Alignment:
Q  132 gtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29544513 gtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactgttattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgt 29544612  T
Q  232 aggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaata 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  29544613 aggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgatttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaaga 29544712  T
Q  332 attgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || |  |||||||  ||||||||||||||||||    
T  29544713 attgtttatgattgatgaattaatatatgtatctatatatttgttaaaatgatattgtcaatgattgatgaagtgtta 29544790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 164 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 24514135 - 24513910
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24514135 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgatagctccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 24514036  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 363  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24514035 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 24513936  T
Q  364 gtatatgtttgtgaatactatattgt 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  24513935 gtatatgtttgtgaatactatattgt 24513910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 135 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 25229744 - 25229476
Alignment:
Q  135 aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtagg 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  25229744 aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaattggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttgg 25229645  T
Q  235 tatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataatt 334  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  25229644 tatgaatgttaggtttctaatgccgtgtgtttaacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactacacataagtcacagtgaataatt 25229545  T
Q  335 gaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  25229544 gaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 25229476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36528569 - 36528340
Alignment:
Q  16 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtcaaatta 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36528569 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaatta 36528470  T
Q  116 ctgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatg 215  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  36528469 ctgcacgtaggtcatagtgaatatttatgaatttcagcacaacctttcccgaatttgaaatgaaaactggtattgataagtacagaattggtcttagatg 36528370  T
Q  216 taaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36528369 taaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 36528340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 27 - 251
Target Start/End: Original strand, 16358234 - 16358458
Alignment:
Q  27 cacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  16358234 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaacggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcgcatagg 16358333  T
Q  127 tcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaa 226  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16358334 tcacattgaatttttatgaatttcagcacaattttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaa 16358433  T
Q  227 gttgtaggtatggatgttagctttc 251  Q
    ||| ||| ||| |||||||||||||    
T  16358434 gttttagatatagatgttagctttc 16358458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 131 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 5223875 - 5223677
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  5223875 agtgaatttttatgaatttcagaacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattcgtcttaggtgtaaacacgaaagtta 5223776  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaa 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5223775 taggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgatcaaattactccacgtaggtcacagtgaa 5223677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 131 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15465646 - 15465448
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15465646 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 15465547  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaa 329  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15465546 taggtatgaatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 15465448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 97 - 329
Target Start/End: Original strand, 26054901 - 26055133
Alignment:
Q  97 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggt 196  Q
    |||||||||| | ||| |||| || | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26054901 ttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaaggaaaattggtattgattggt 26055000  T
Q  197 acagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtt 296  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  26055001 acataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagtt 26055100  T
Q  297 atgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaa 329  Q
    ||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  26055101 atggtaaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 26055133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 197
Target Start/End: Original strand, 13937520 - 13937709
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||       ||||||||||||| |||||||    
T  13937520 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgtgttatgg 13937619  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13937620 tcaaattactgcacgtaggccacggtgaatttttatgaattttagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggta 13937709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 14567432 - 14567653
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  14567432 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctaacatcaaaaggatttatagaacttgagttatag 14567531  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  14567532 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaacttttcccgaatttgaaatgaaaactggtattggtaggtacagaattggc 14567631  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagtt 229  Q
    ||| | |||||||| |||||||    
T  14567632 ctttggtgtaaacatgaaagtt 14567653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 87 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15008038 - 15007868
Alignment:
Q  87 tttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaa---act 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  15008038 tttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaagtact 15007939  T
Q  184 ggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaa 254  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15007938 ggtattgattggtacaaaattggttttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaa 15007868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 41124591 - 41124425
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41124591 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgg 41124492  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41124491 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 41124425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 164 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 10379786 - 10379613
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10379786 ccgaatatgaaataaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 10379687  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaa 337  Q
    | |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10379686 tctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 10379613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 10557560 - 10557394
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10557560 ccgaatttgaaacgaaatatggtattgattggtacagaattggtcttagttgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 10557461  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10557460 tcggacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10557394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 27165904 - 27165738
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27165904 ccgaatttgaaataaaaactagtattgatcggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttgg 27165805  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27165804 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27165738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Original strand, 38961348 - 38961514
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961348 ccgaatttgaaatgaaatatggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 38961447  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  38961448 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattgctgcacgtaggtcacagtgaat 38961514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 46822913 - 46822747
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822913 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacataattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 46822814  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| |||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  46822813 tctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 46822747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Original strand, 53301014 - 53301180
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53301014 ccgaatttgaaataaaaacaagtattgatcggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgtcgttgg 53301113  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  53301114 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaat 53301180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 252 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 12305516 - 12305359
Alignment:
Q  252 taatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaat 351  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  12305516 taatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaat 12305417  T
Q  352 tagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  12305416 taatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgtta 12305359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 381 - 509
Target Start/End: Original strand, 11913865 - 11913993
Alignment:
Q  381 ctatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgc 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  11913865 ctatattgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtacatgttgc 11913964  T
Q  481 gaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11913965 gaatacgatattgtccatgattgatgaag 11913993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 167 - 330
Target Start/End: Original strand, 55318817 - 55318980
Alignment:
Q  167 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttt 266  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  55318817 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatggtagctttctaatgccgttggtat 55318916  T
Q  267 gacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  55318917 gacatcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcgcagtgaat 55318980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Original strand, 20629702 - 20629868
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629702 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttataggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 20629801  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| | |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20629802 tctgacattaaagcgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 20629868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 166 - 330
Target Start/End: Original strand, 13937485 - 13937649
Alignment:
Q  166 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 265  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13937485 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggacaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtc 13937584  T
Q  266 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  13937585 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgtgttatggtcaaattactgcacgtaggccacggtgaat 13937649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 8500172 - 8500009
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  8500172 ccgaatttgaaataaaaactggtattgatcgatatagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttgg 8500073  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtg 327  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8500072 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcacagtg 8500009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 30 - 245
Target Start/End: Original strand, 3264323 - 3264538
Alignment:
Q  30 gaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 129  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| | ||| |||        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3264323 gaaagttgtaggtatggatgttagatttctaaggccgttgatttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtca 3264422  T
Q  130 cagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagtt 229  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||   ||||||||||    
T  3264423 cagtgaatatttatgaatttcagcacaacctttcctgaatttgaaatgaaaattggtattgataagtatagaattgatcttaggtgtcttcacgaaagtt 3264522  T
Q  230 gtaggtatggatgtta 245  Q
    ||||||||||||||||    
T  3264523 gtaggtatggatgtta 3264538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 149
Target Start/End: Original strand, 55319044 - 55319185
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||| ||||||    
T  55319044 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgaattatgg 55319143  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaattt 149  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55319144 tcaaattactgcacgtaagtcacagtgaatttttatgaattt 55319185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 199 - 330
Target Start/End: Original strand, 14567430 - 14567561
Alignment:
Q  199 agaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14567430 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctaacatcaaaaggatttatagaacttgagttat 14567529  T
Q  299 gatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14567530 agtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 14567561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Original strand, 17444274 - 17444440
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17444274 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaagtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 17444373  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | | || ||||||  ||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17444374 tctaacgtcaaaacaatttatacaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 17444440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 10379749 - 10379620
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  10379749 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 10379650  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10379649 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10379620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Original strand, 16282268 - 16282434
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| |    
T  16282268 ccgaatttaaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttatctttttaatgttgttag 16282367  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  16282368 tctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 16282434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 15465576 - 15465438
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  15465576 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 15465477  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15465476 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaa 15465438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 24514098 - 24513969
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  24514098 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 24513999  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24513998 tcaaattactgcacgtagatcacagtgaat 24513969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 136
Target Start/End: Original strand, 29544582 - 29544710
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||       |||||||||||||||||||||    
T  29544582 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgatttcaaaagaatttatagaacttgagttatgg 29544681  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29544682 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 29544710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 392 - 509
Target Start/End: Original strand, 17444642 - 17444759
Alignment:
Q  392 atgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatat 491  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  17444642 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatat 17444741  T
Q  492 tgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17444742 tgtccatgattgatgaag 17444759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 392 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 25237127 - 25237010
Alignment:
Q  392 atgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatat 491  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  25237127 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatat 25237028  T
Q  492 tgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25237027 tgtccatgattgatgaag 25237010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 146
Target Start/End: Original strand, 26055005 - 26055143
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  26055005 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 26055104  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 146  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  26055105 taaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaa 26055143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 392 - 509
Target Start/End: Original strand, 38961717 - 38961834
Alignment:
Q  392 atgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatat 491  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  38961717 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatat 38961816  T
Q  492 tgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||    
T  38961817 tgtccatgattgatgaag 38961834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 54521244 - 54521116
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  54521244 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtgggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 54521145  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54521144 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 54521116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 411 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 8899411 - 8899313
Alignment:
Q  411 atgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899411 atgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 8899313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 17393367 - 17393201
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    |||||||| |||||||  ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  17393367 ccgaatttcaaatgaactcttctattgatcggtacagaattggtcttagatgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacctttccaatggcgttgg 17393268  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||| | ||||||  |||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  17393267 tttgactccaaaatgatttttagaacattagttatagtcaaattactacacataggtcatagtgaat 17393201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 392 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 41124223 - 41124106
Alignment:
Q  392 atgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatat 491  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  41124223 atgattgatgaactagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatat 41124124  T
Q  492 tgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||| |||||    
T  41124123 tgtccatgattggtgaag 41124106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 12119394 - 12119523
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  12119394 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 12119493  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119494 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 12119523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 392 - 509
Target Start/End: Original strand, 16282636 - 16282754
Alignment:
Q  392 atgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgttt-atgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgata 490  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16282636 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgttttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgata 16282735  T
Q  491 ttgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16282736 ttgtccatgattgatgaag 16282754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 209 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 36528569 - 36528447
Alignment:
Q  209 ttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatta 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36528569 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaatta 36528470  T
Q  309 cttcacgtaggtcacagtgaata 331  Q
    || ||||||||||| ||||||||    
T  36528469 ctgcacgtaggtcatagtgaata 36528447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 5223805 - 5223667
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||       ||||||||||||||||||||     
T  5223805 aattcgtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatga 5223706  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 146  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  5223705 tcaaattactccacgtaggtcacagtgaaatcttatgaa 5223667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 13436721 - 13436592
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  13436721 aattggtcttaggtataaatacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 13436622  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  13436621 tccaattactgcacgtaggtcacagtgaat 13436592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 15977954 - 15977825
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  15977954 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatag 15977855  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977854 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15977825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 17463599 - 17463470
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  17463599 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 17463500  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463499 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 17463470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 34159747 - 34159618
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  34159747 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 34159648  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159647 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 34159618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 131 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12305614 - 12305525
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaac 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12305614 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaac 12305525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 28848362 - 28848491
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||| ||||||| |    
T  28848362 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 28848461  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848462 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 28848491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 55476912 - 55476783
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||| ||||||| |    
T  55476912 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 55476813  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476812 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 55476783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 330
Target Start/End: Original strand, 16358234 - 16358344
Alignment:
Q  220 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtagg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||    
T  16358234 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaacggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcgcatagg 16358333  T
Q  320 tcacagtgaat 330  Q
    ||||| |||||    
T  16358334 tcacattgaat 16358344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15412853 - 15412727
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  ||       |||||||||||||| ||||||    
T  15412853 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatgg 15412754  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtg 134  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15412753 tcaaattactgaacgtaggtcacagtg 15412727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 6468875 - 6469004
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  6468875 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttggaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatag 6468974  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6468975 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6469004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 12567981 - 12567852
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  12567981 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatag 12567882  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||    
T  12567881 tcaaattacttcatgtaggtaacagtgaat 12567852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 13544445 - 13544317
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  13544445 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 13544346  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13544345 tcaaa-tactgcacgtaggtaacagtgaat 13544317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 45606647 - 45606776
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||| |||||||||||    
T  45606647 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 45606746  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  45606747 tcaaattactgaatgtaggtcacagtgaat 45606776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 223 - 331
Target Start/End: Original strand, 3264323 - 3264431
Alignment:
Q  223 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtca 322  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||| || ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  3264323 gaaagttgtaggtatggatgttagatttctaaggccgttgatttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtca 3264422  T
Q  323 cagtgaata 331  Q
    |||||||||    
T  3264423 cagtgaata 3264431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 7781087 - 7781216
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  7781087 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaacgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 7781186  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7781187 tcaaattactgaacataggtcacagtgaat 7781216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 10247464 - 10247593
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       |||||||||||||| ||||      
T  10247464 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatac 10247563  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10247564 tcaaattactgcacgtaggtcagagtgaat 10247593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 13151531 - 13151660
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  13151531 aattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 13151630  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13151631 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaat 13151660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 13153996 - 13154125
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  13153996 aattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 13154095  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13154096 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaat 13154125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 16454021 - 16454151
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtc-nnnnnnntttatagaacttgagttatg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||        |||||||||||  ||||||     
T  16454021 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatggatttatagaactatagttata 16454120  T
Q  107 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454121 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16454151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 25237265 - 25237136
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||  || | |  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  25237265 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttggtatgaatgttaggtttctaatgccgtgtgtttaacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 25237166  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25237165 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 25237136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 393 - 466
Target Start/End: Original strand, 20630075 - 20630148
Alignment:
Q  393 tgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatg 466  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630075 tgattgatgaagtgttatctgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatg 20630148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 338 - 405
Target Start/End: Original strand, 9707484 - 9707551
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9707484 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 9707551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 439 - 509
Target Start/End: Original strand, 13154128 - 13154198
Alignment:
Q  439 ttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154128 ttgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 13154198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 6469012 - 6469077
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469012 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 6469077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 12567844 - 12567779
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567844 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 12567779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 13544309 - 13544244
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544309 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 13544244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 16454159 - 16454224
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454159 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 16454224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 17393330 - 17393176
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||| |||   |       ||| |||||| | |||||| |    
T  17393330 aattggtcttagatgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacctttccaatggcgttggtttgactccaaaatgatttttagaacattagttatag 17393231  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatg-aatttcagcacaacttt 161  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17393230 tcaaattactacacataggtcatagtgaatttttatgaaatttcagcacaacttt 17393176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 17463462 - 17463397
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463462 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 17463397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 34159610 - 34159545
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159610 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 34159545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 55476775 - 55476710
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476775 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 55476710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 8899378 - 8899308
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  8899378 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 8899308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Original strand, 16282689 - 16282759
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16282689 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 16282759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Original strand, 17444694 - 17444764
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  17444694 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 17444764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 392 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 25229540 - 25229466
Alignment:
Q  392 atgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatg 466  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25229540 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatg 25229466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 444 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 15977817 - 15977756
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgat 505  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15977817 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgat 15977756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 25229678 - 25229549
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||  || | |  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  25229678 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttggtatgaatgttaggtttctaatgccgtgtgtttaacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 25229579  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  25229578 tcaaattactacacataagtcacagtgaat 25229549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Original strand, 9707483 - 9707550
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707483 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 9707550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 27165538 - 27165471
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165538 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 27165471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 338 - 405
Target Start/End: Original strand, 38961769 - 38961835
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  38961769 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 38961835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Original strand, 45606783 - 45606850
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606783 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 45606850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8899484 - 8899418
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8899484 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 8899418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Original strand, 16934822 - 16934920
Alignment:
Q  212 gatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16934822 gatgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 16934920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 25058408 - 25058286
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25058408 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatg 25058309  T
Q  300 atcaaattacttcacgtaggtca 322  Q
    ||||||||||| ||| |||||||    
T  25058308 atcaaattactacacataggtca 25058286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 46822546 - 46822480
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822546 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 46822480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 12305488 - 12305439
Alignment:
Q  87 tttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12305488 tttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 12305439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Original strand, 7781223 - 7781290
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781223 ttatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 7781290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 8499806 - 8499739
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8499806 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattaatgaag 8499739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Original strand, 11913928 - 11913998
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  11913928 tatgattgatgaattagtatatgtatgtacatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 11913998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 15412717 - 15412650
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412717 ttatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 15412650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 338 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 25237075 - 25237009
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 405  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25237075 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 25237009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Original strand, 53301380 - 53301447
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53301380 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtacatgattgatgaag 53301447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 12119531 - 12119597
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12119531 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaag 12119597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 439 - 509
Target Start/End: Original strand, 13151663 - 13151733
Alignment:
Q  439 ttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13151663 ttgtatatgattgatgaattagtatatgaaggtatatgttgtgaatacgatattgtccatgcctgatgaag 13151733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 240 - 310
Target Start/End: Original strand, 51158683 - 51158753
Alignment:
Q  240 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51158683 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 51158753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 10247601 - 10247666
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||| ||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247601 tatgatggatcaactagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 10247666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 49231837 - 49231768
Alignment:
Q  241 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49231837 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 49231768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 266 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15008052 - 15007988
Alignment:
Q  266 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15008052 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 15007988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 439 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 12305435 - 12305364
Alignment:
Q  439 ttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatat-gttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12305435 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaag 12305364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 339 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 25201397 - 25201247
Alignment:
Q  339 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagta----- 433  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| |||||| |||| ||         
T  25201397 atgattgatgaattattatatgaatgtatatattgatgaatatgatattgttcatgattaatgaattattatatgaatgtttatgttgatgaatatgatg 25201298  T
Q  434 -----taatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
         | |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  25201297 ttatgtgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 25201247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 439 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 54521112 - 54521041
Alignment:
Q  439 ttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatat-gttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54521112 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaag 54521041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 10557193 - 10557127
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10557193 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaattcgatattgtccatgattgatgaag 10557127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 14528624 - 14528734
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||    
T  14528624 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggatttggtttgacttccaaatgatttttagaactttagttatg 14528723  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    || ||||||||    
T  14528724 attaaattact 14528734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 15007922 - 15007868
Alignment:
Q  7 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaa 61  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15007922 aaattggttttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaa 15007868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 338 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 17044395 - 17044293
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataat 437  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||   |||||  || |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||| ||| ||    
T  17044395 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatattgacgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattacatgaatgtacatgttgatgaatatgat 17044296  T
Q  438 gtt 440  Q
    |||    
T  17044295 gtt 17044293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 411 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 40812199 - 40812133
Alignment:
Q  411 atgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgt 477  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  40812199 atgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgtttatgattgatgaatttttatatgaatgtatatgt 40812133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 25201403 - 25201310
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| || |||| ||| || ||||| |||||| |||||||| |||||| |||| |||||||    
T  25201403 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatattgatgaatatgatattgttcatgattaatgaattattatatgaatgtttatgttg 25201310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 444 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 13436584 - 13436520
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatga 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  13436584 tatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 13436520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 242 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 30152518 - 30152450
Alignment:
Q  242 gttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  30152518 gttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaatttgagttatgatcaaattact 30152450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 308
Target Start/End: Original strand, 54039167 - 54039234
Alignment:
Q  241 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatta 308  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  54039167 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgatcaaatta 54039234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 1468613 - 1468723
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  1468613 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 1468712  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  1468713 atcaaattact 1468723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 208 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2281102 - 2281000
Alignment:
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||| ||| | | ||||||||||||||  |  |||| || ||||||||||||||| |||||    
T  2281102 cttagttgtaaacatgaaagttttaggtatgtatgttacctttgtaaaggctttggtttgacttcattattatttctataacttgagttatgattaaatt 2281003  T
Q  308 act 310  Q
    |||    
T  2281002 act 2281000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 8276473 - 8276583
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  8276473 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtcgaaatgatttttagaacttgagatatg 8276572  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    || ||||||||    
T  8276573 attaaattact 8276583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10555812 - 10555766
Alignment:
Q  185 gtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgt 231  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10555812 gtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgt 10555766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 310
Target Start/End: Original strand, 17956840 - 17956938
Alignment:
Q  212 gatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||| || ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  17956840 gatgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacatctaaatgatatttagaacttgagttatgatcaaattact 17956938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 36528384 - 36528342
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgt 50  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36528384 aattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgt 36528342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Original strand, 21846199 - 21846292
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||| |||| ||| ||||  || | |||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  21846199 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtataagttgatgaatatgatgtcattcaagattgatgaactattatatgaatgtatatgttg 21846292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Original strand, 54331025 - 54331121
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatg-agtataatgttgtttatgattgatgaat--tagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||   ||| |||||||| |||||||||||||  || |||||| ||||||||||||    
T  54331025 ttgttcatgattgatgaattgttatatgaatatatatgttgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattatattatatgaatgtatatgttg 54331121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 392 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 17044394 - 17044307
Alignment:
Q  392 atgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||| || | || ||| |||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||    
T  17044394 atgattgatgaattattatatgaatgtatatattgacgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattacatgaatgtacatgttg 17044307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21026183 - 21026096
Alignment:
Q  223 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||  ||| || ||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21026183 gaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatggctttgttttgaagtcataatgatgttcagatcttgagttatgatcaaaatact 21026096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 8269362 - 8269472
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | | |||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  8269362 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggcttgggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 8269461  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    || ||||||||    
T  8269462 attaaattact 8269472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 11191599 - 11191505
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgttt-atgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||| | ||| |||||||| |||| || |||| ||| |||||||| || |||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  11191599 ttgttcattattgatgaattattatatgaatgtttatgattgatgaatatgatgttgttcattattgatgaattattgtatgaatgtatatgttg 11191505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12808615 - 12808505
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||| |||| |  || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  12808615 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttagtttcaggtccaaacgatttttagaacttgagatatg 12808516  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    || ||||||||    
T  12808515 attaaattact 12808505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 444 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 17044395 - 17044330
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg-cgaatacgatattgtccatgattgatgaa 508  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  17044395 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatattgacgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 17044330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 434 - 479
Target Start/End: Original strand, 18700189 - 18700234
Alignment:
Q  434 taatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  18700189 taatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 18700234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 8023858 - 8023778
Alignment:
Q  240 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggt 320  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||| |||| ||||| ||||  |||||||||||| ||| |||| || ||||||    
T  8023858 atgttagctttctaatggcttgggtttgacttaaaaatgatttctagattttgagttatgatgaaaatactacaagtaggt 8023778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 25058407 - 25058286
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    ||| |||||||||||| ||||||| ||| |||       ||| ||||||||||||||||     
T  25058407 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatga 25058308  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtca 129  Q
    |||||||||| ||| |||||||    
T  25058307 tcaaattactacacataggtca 25058286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 28557466 - 28557370
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | ||| |||||  || ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  28557466 tgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttcaaatggctttgatttgaagtccaaatgatatttagaacttgagttatgatcaaattact 28557370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 11191590 - 11191491
Alignment:
Q  342 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg-tgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||| ||| ||||||  || |||||||| ||||||||| | ||  ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  11191590 attgatgaattattatatgaatgtttatgattgatgaatatgatgttgttcattattgatgaattattgtatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtt 11191491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 432 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 12470140 - 12470093
Alignment:
Q  432 tataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  12470140 tataatgttgttcatgattgatgatttattatatgaatgtatatgttg 12470093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 17207610 - 17207567
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  17207610 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 17207567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 430
Target Start/End: Original strand, 21846205 - 21846296
Alignment:
Q  339 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga 430  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||||  || |  |||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  21846205 atgattgatgaattattatatgaatgtataagttgatgaatatgatgtcattcaagattgatgaactattatatgaatgtatatgttgatga 21846296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 24513961 - 24513910
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgt 494  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  24513961 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgt 24513910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 509
Target Start/End: Original strand, 28848515 - 28848554
Alignment:
Q  470 gtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28848515 gtatatgttgtgaatacgatattttccatgattgatgaag 28848554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 478
Target Start/End: Original strand, 3528197 - 3528239
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  3528197 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 3528239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Original strand, 3528200 - 3528254
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  3528200 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtt 3528254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 10555796 - 10555766
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgt 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10555796 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgt 10555766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 14671161 - 14671115
Alignment:
Q  433 ataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  14671161 ataatgttgttcatgattgatgatttattatatgaatgtatatgttg 14671115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 14682660 - 14682614
Alignment:
Q  433 ataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  14682660 ataatgttgttcatgattgatgatttattatatgaatgtatatgttg 14682614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 339 - 397
Target Start/End: Original strand, 15025934 - 15025992
Alignment:
Q  339 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |  ||||||  |||||||||||||||    
T  15025934 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgatgatgaatatgatattgttcatgatt 15025992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 478
Target Start/End: Original strand, 16282635 - 16282669
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16282635 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 16282669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 58
Target Start/End: Original strand, 16358408 - 16358458
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttc 58  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||| |||||||    
T  16358408 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttttagatatagatgttagctttc 16358458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 17207481 - 17207427
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||||    
T  17207481 ttgttcatgattgatgaagtattatatgaaggtatatgttgatgaatatgatgtt 17207427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 478
Target Start/End: Original strand, 17444641 - 17444675
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17444641 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 17444675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 25201287 - 25201233
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  25201287 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtt 25201233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 25229541 - 25229507
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25229541 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 25229507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 25237128 - 25237094
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25237128 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 25237094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 478
Target Start/End: Original strand, 38961716 - 38961750
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38961716 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 38961750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 479
Target Start/End: Original strand, 50351874 - 50351916
Alignment:
Q  437 tgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  50351874 tgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 50351916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 8899447 - 8899418
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899447 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 8899418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16820531 - 16820462
Alignment:
Q  241 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||   || ||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16820531 tgttagctttctaatggcattggtttggtgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 16820462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 17207673 - 17207632
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgt 477  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17207673 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgt 17207632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 40812202 - 40812133
Alignment:
Q  355 tatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgt 424  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||  || ||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  40812202 tatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgtttatgattgatgaatttttatatgaatgtatatgt 40812133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 459
Target Start/End: Original strand, 54331144 - 54331217
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaatta 459  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || || ||| ||||| || |  || ||||||||||| ||||||||||||    
T  54331144 ttgttcatgattgatgaagtattatataaaggtacatgttgataaacatgatgttgtttataattgatgaatta 54331217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 17207607 - 17207563
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga 430  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  17207607 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatga 17207563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 430
Target Start/End: Original strand, 18700194 - 18700238
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga 430  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  18700194 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatga 18700238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 392 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 33564557 - 33564509
Alignment:
Q  392 atgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  33564557 atgattgatgaattattacatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtt 33564509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 430
Target Start/End: Original strand, 50351876 - 50351920
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga 430  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  50351876 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatga 50351920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 3)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 8 - 409
Target Start/End: Original strand, 6483 - 6884
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  6483 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 6582  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6583 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaattttaatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggt 6682  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6683 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttccaatgccgttggtccgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaatt 6782  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6783 actacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgtccatgattgatgaagtgt 6882  T
Q  408 ta 409  Q
    ||    
T  6883 ta 6884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Original strand, 6446 - 6612
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  6446 ccgaatttgaaatgaaatgtggtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttgg 6545  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6546 tctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 6813 - 6879
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6813 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgtccatgattgatgaag 6879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 2)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 8 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 7066 - 6682
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  7066 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 6967  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6966 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 6867  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6866 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 6767  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatga 402  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6766 actgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat----------atgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 6682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 7103 - 6937
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7103 ccgaatatgaaatgaaaattgctattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 7004  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7003 tatgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 3)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 8 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 5309 - 4908
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||       | |||||||||||||||||||    
T  5309 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagttttcttatgccgttggtctgacgtcaaaacgatatatagaacttgagttatgg 5210  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5209 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttggccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggt 5110  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  5109 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccaatggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaatt 5010  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5009 acagcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgt 4910  T
Q  408 ta 409  Q
    ||    
T  4909 ta 4908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 5346 - 5180
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  5346 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagttttcttatgccgttgg 5247  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5246 tctgacgtcaaaacgatatatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 5180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 4979 - 4913
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4979 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaag 4913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 25 - 407
Target Start/End: Original strand, 17004 - 17386
Alignment:
Q  25 aacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||       |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17004 aacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgatatcaaaaaggtttatagaacttgagttatgatcaaattaatgcacgta 17103  T
Q  125 ggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacga 224  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  17104 ggtcatagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaacttgtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacga 17203  T
Q  225 aagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcaca 324  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  17204 aagttgtaggtatttttgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaca 17303  T
Q  325 gtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17304 gtgaatagttgaatatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgt 17386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 94935 - 94625
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94935 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 94836  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94835 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 94736  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  94735 tagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 94637  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  94636 gatgaagtgtta 94625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 167 - 330
Target Start/End: Original strand, 16953 - 17116
Alignment:
Q  167 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16953 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaatttgtgttaggggataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtct 17052  T
Q  267 gacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  17053 gatatcaaaaaggtttatagaacttgagttatgatcaaattaatgcacgtaggtcatagtgaat 17116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 94832 - 94703
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  94832 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 94733  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94732 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 94703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 17180 - 17309
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  17180 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatttttgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 17279  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17280 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 17309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 94695 - 94630
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  94695 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 94630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 17317 - 17383
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17317 tatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaag 17383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 310
Target Start/End: Original strand, 154892 - 154961
Alignment:
Q  241 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||  || |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  154892 tgttagctttataatgacgttggtttgaggtccaaatcatttttagaacttgagttatgatcaaattact 154961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 6)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 8 - 372
Target Start/End: Original strand, 10887 - 11251
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  10887 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 10986  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10987 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaattttcctgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggt 11086  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||  ||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  11087 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttccaatgccgttggtccgacgtcaaaacgatttatagtacttgagttatggtcaaatt 11186  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 372  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11187 actacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 11251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 8 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 15526 - 15136
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  15526 aattggtcttag-tgtaaacacgaaagttgtaggtatggacgttagctttctaatgtcgttggtctgacatcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 15428  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||          |||| |||||    
T  15427 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatgtttatgaatttcagcacaactttgttcgaatttgaaatgaaaactggta----------cagatttggt 15338  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15337 cttaggtgtaaccacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgctggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaatt 15238  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgt 407  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15237 actgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatttatatgtttgtgaatactatattgtccatgattgatgaagtgt 15138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 166 - 330
Target Start/End: Original strand, 10852 - 11016
Alignment:
Q  166 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 265  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||     
T  10852 gaatttgaaatgaaatgtggtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtc 10951  T
Q  266 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10952 tgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 11016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15563 - 15398
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15563 ccgaatttgaaatgaaatctggtattaataggtccagaattggtcttag-tgtaaacacgaaagttgtaggtatggacgttagctttctaatgtcgttgg 15465  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15464 tctgacatcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 15207 - 15141
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15207 tatgattgatgaattagtatatgtatttatatgtttgtgaatactatattgtccatgattgatgaag 15141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 479
Target Start/End: Original strand, 11217 - 11252
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11217 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttg 11252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 3)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 164 - 509
Target Start/End: Original strand, 227 - 573
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  227 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataaatggtcttaggtgtaaacaagaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 326  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 363  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  327 tttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtat 426  T
Q  364 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtat 463  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  427 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgataaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtat 526  T
Q  464 atgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  527 atgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaag 573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 137
Target Start/End: Original strand, 267 - 393
Alignment:
Q  11 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtca 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||||||||    
T  267 tggtcttaggtgtaaacaagaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttatggtca 366  T
Q  111 aattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  367 aattactgcacgtaggtcacagtgaat 393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Original strand, 507 - 578
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  507 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgtta 578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 3)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 98 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 38346 - 38035
Alignment:
Q  98 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38346 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 38247  T
Q  198 cagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38246 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtta 38147  T
Q  298 tgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 397  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  38146 tggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgatt 38047  T
Q  398 gatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||    
T  38046 gatgaagtgtta 38035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 38243 - 38114
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||| |||||||||||    
T  38243 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 38144  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38143 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 38114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 38107 - 38040
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38107 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 38040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 5)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 43354 - 43002
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  43354 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 43255  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  43254 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacatttttggt 43155  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  43154 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagggtttatagaacttgagttatagtcaaatt 43055  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg 360  Q
    | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43054 agtgcacgtaggtcacagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatg 43002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 214 - 405
Target Start/End: Original strand, 13380 - 13571
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |    
T  13380 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcttactagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactgaa 13479  T
Q  314 cgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 405  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  13480 cgtaggtcacaatgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 13571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 43391 - 43225
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43391 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgg 43292  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43291 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 43225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 137
Target Start/End: Original strand, 13379 - 13496
Alignment:
Q  20 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtcaaattactgc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||  ||       |||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  13379 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcttactagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactga 13478  T
Q  120 acgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||| |||||    
T  13479 acgtaggtcacaatgaat 13496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Original strand, 13503 - 13570
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13503 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaag 13570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 3)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 13918 - 13602
Alignment:
Q  97 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggt 196  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13918 ttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggt 13819  T
Q  197 acagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtt 296  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13818 acagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaatgttatctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagtt 13719  T
Q  297 atgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgat 396  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13718 atggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgat 13619  T
Q  397 tgatgaagtgttacatg 413  Q
    |||||||||||||||||    
T  13618 tgatgaagtgttacatg 13602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 13814 - 13685
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||| |||||||||||    
T  13814 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaatgttatctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 13715  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13714 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 13685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 13678 - 13611
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13678 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 13611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 4)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 11 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 8351 - 7996
Alignment:
Q  11 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtca 110  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| |||       ||||||||||||||||||||||||    
T  8351 tggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatccccttggtttgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtca 8252  T
Q  111 aattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtctt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8251 aattactacacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacagaattggtctt 8152  T
Q  211 agatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  8151 aggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgaattatggtcaaattact 8052  T
Q  311 tcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgta 366  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8051 gcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgta 7996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 8 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 8547 - 8225
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| |||       |||||| ||||||||||||||    
T  8547 aattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaattccattggtatgacgtcaaaaagatttatacaacttgagttatgg 8448  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  8447 tgaaattactgcacgtaggtcacagtgcatttttatgattttcagcacaactttgtccgaatgtgaaatgaaaactggtattgattggtacataactggt 8348  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8347 cttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatccccttggtttgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaatt 8248  T
Q  308 acttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  8247 actacacgtaggtcacagtgaat 8225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 8584 - 8421
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||    
T  8584 ccgaatttgaaatggaaactggtattgattggtacataattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaattccattgg 8485  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtg 327  Q
    | |||| |||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  8484 tatgacgtcaaaaagatttatacaacttgagttatggtgaaattactgcacgtaggtcacagtg 8421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 8032
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||  ||       ||||||||| |||| ||||||    
T  8161 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgaattatgg 8062  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8061 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 8032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 10)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 52 - 409
Target Start/End: Original strand, 23122 - 23479
Alignment:
Q  52 agctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttca 151  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23122 agctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaatttgtatgaatttca 23221  T
Q  152 gcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttc 251  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  23222 gcacaactttgtccaaatttgaaatgaaaactggtatttattgatatagaattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttc 23321  T
Q  252 taatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaat 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23322 taatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaat 23421  T
Q  352 tagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  23422 tagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 23479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 14439 - 14161
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14439 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaacgttg 14340  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  14339 taggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 14240  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  14239 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 14161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Original strand, 22917 - 23118
Alignment:
Q  7 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||| |||||||||    
T  22917 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacatgagttatg 23016  T
Q  107 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgg 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  23017 gtcatattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttttccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacaaaattgg 23116  T
Q  207 tc 208  Q
    ||    
T  23117 tc 23118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Original strand, 22881 - 23047
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22881 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatgccgttgg 22980  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  22981 tctgacgtcaaaacgatttatagaacatgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 23047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14369 - 14240
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||| |||||||||||    
T  14369 aattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 14270  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14269 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 14240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 23271 - 23400
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  23271 aattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 23370  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23371 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 23400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 244 - 330
Target Start/End: Original strand, 23121 - 23207
Alignment:
Q  244 tagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  23121 tagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 23207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 14232 - 14166
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14232 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 14166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 23408 - 23474
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23408 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 23474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 212
Target Start/End: Original strand, 20714 - 20762
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttag 212  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20714 ccgaattggaaatgaaatctgatattgattggtacagaattggtcttag 20762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 501676 - 501347
Alignment:
Q  11 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||    
T  501676 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtca 501577  T
Q  111 aattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtctt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  501576 aattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaacattgtgcgaatttgaaatgaaaagtgatattgattgttacagaattggtctt 501477  T
Q  211 agatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501476 atgtgtaaacacgaaagttgtagg-atagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgatcaaattact 501378  T
Q  311 tcacgtaggtcacagtgaataattgaatatg 341  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501377 gcacgtaggtcacagtgaataattgaatatg 501347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 501716 - 501550
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  501716 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 501617  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  501616 tctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 501550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 501486 - 501358
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||||     
T  501486 aattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtagg-atagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatga 501388  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501387 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 501358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 356 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 501351 - 501298
Alignment:
Q  356 atatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  501351 atatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgatgtgtta 501298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 214 - 268
Target Start/End: Original strand, 139591 - 139645
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttga 268  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||    
T  139591 tgtaaacatgaaagtcgtaggtatgaaagttagctttctaatggctttggtttga 139645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 6)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 52 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 778 - 421
Alignment:
Q  52 agctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttca 151  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  778 agctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaatttgtatgaatttca 679  T
Q  152 gcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttc 251  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  678 gcacaactttgtccaaatttgaaatgaaaactggtatttattgatatagaattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttc 579  T
Q  252 taatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaat 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  578 taatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaat 479  T
Q  352 tagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  478 tagtatatgtaagtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 983 - 782
Alignment:
Q  7 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||    
T  983 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 884  T
Q  107 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgg 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  883 gtcatattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttttccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacaaaattgg 784  T
Q  207 tc 208  Q
    ||    
T  783 tc 782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 1019 - 853
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1019 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatgccgttgg 920  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  919 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 629 - 500
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  629 aattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 530  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  529 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 244 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 779 - 693
Alignment:
Q  244 tagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  779 tagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 492 - 426
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  492 tatgattgatgaattagtatatgtaagtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 4)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 97 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 40925 - 40614
Alignment:
Q  97 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40925 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaattaaaactggtattgattggt 40826  T
Q  197 acagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtt 296  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40825 acagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtt 40726  T
Q  297 atgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgat 396  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  40725 atagtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgat 40627  T
Q  397 tgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||    
T  40626 tgatgaagtgtta 40614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 40821 - 40692
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  40821 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 40722  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40721 tcaaattactgcacgtaggtcagagtgaat 40692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 40684 - 40619
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40684 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 40619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 37969 - 37848
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  37969 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttcaaatggctttggtttgacttccaaatgattt-tagaacttgagttatg 37871  T
Q  300 atcaaattacttcacgtaggtca 322  Q
    ||||||||||| ||| |||||||    
T  37870 atcaaattactacacataggtca 37848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 3)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 133 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 6436 - 6161
Alignment:
Q  133 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgta 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6436 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattcattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 6337  T
Q  233 ggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataa 332  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6336 ggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataa 6237  T
Q  333 ttgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6236 ttgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 6161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 6368 - 6239
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  6368 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 6269  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6268 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 6231 - 6166
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6231 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 6166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 3)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 21240 - 20961
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaat-gaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagtt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21240 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatagaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagtt 21141  T
Q  230 gtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaa 329  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21140 gtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaa 21041  T
Q  330 taattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21040 taattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 20961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 21169 - 21040
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  21169 aattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 21070  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21069 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 21040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 21033 - 20966
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21033 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 20966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 11781 - 11503
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||    
T  11781 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcggaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgatacttg 11682  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  11681 taggtatggatgttagctttctattgccgttgggttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagttaat 11582  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11581 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgtta 11503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 11712 - 11586
Alignment:
Q  7 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||  ||       |||||||||||||||||||     
T  11712 aaattggtcttaggtgtaaacacgatacttgtaggtatggatgttagctttctattgccgttgggttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttata 11613  T
Q  107 gtcaaattactgcacgtaggtcacagt 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  11612 gtcaaattactgcacgtaggtcacagt 11586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 11574 - 11508
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11574 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaag 11508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 3)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 3515 - 3237
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  3515 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattgttacataattgttcttagttgtaaacacgaaagttg 3416  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  3415 taggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaag 3316  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  3315 aattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgtta 3237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 3445 - 3317
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  3445 aattgttcttagttgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 3346  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3345 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 3317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 439 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 3313 - 3242
Alignment:
Q  439 ttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3313 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaag 3242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 3)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 9733 - 9456
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9733 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtatttattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 9634  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  9633 taggtatgaatgttagctctctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaat 9534  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  9533 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgtta 9456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 9663 - 9534
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  9663 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctctctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatag 9564  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9563 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaat 9534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 9526 - 9461
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9526 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaag 9461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 15)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 134702 - 134425
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  134702 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttg 134603  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  134602 taggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 134503  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  134502 aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 134425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 137171 - 136894
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  137171 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttg 137072  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  137071 taggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 136972  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  136971 aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 136894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 139640 - 139363
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  139640 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttg 139541  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  139540 taggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 139441  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  139440 aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 139363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 142109 - 141832
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  142109 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttg 142010  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  142009 taggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 141910  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  141909 aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 141832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 144578 - 144301
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  144578 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttg 144479  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  144478 taggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 144379  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  144378 aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 144301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 134632 - 134503
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||| ||||||| |    
T  134632 aattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 134533  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134532 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 134503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 137101 - 136972
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||| ||||||| |    
T  137101 aattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137002  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  137001 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 136972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 139570 - 139441
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||| ||||||| |    
T  139570 aattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 139471  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139470 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 139441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 142039 - 141910
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||| ||||||| |    
T  142039 aattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 141940  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  141939 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 141910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 144508 - 144379
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||| ||||||| |    
T  144508 aattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 144409  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144408 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 144379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 134495 - 134430
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  134495 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 134430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 136964 - 136899
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  136964 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 136899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 139433 - 139368
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  139433 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 139368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 141902 - 141837
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  141902 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 141837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 144371 - 144306
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  144371 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaag 144306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 330
Target Start/End: Original strand, 36749 - 37068
Alignment:
Q  11 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||| |||       ||||||||||||||||||||||||    
T  36749 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaactttctaatgttgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtca 36848  T
Q  111 aattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtctt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||||||||| | | |||| ||| |    
T  36849 aattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttatcaaaatttgaaatgaaaactaatattgattggaaaaaaattagtcat 36948  T
Q  211 agatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36949 agatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 37048  T
Q  311 tcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
     ||||||| ||| |||||||    
T  37049 gcacgtagatcatagtgaat 37068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Original strand, 36938 - 37110
Alignment:
Q  7 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatg 106  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||    
T  36938 aaattagtcatagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 37037  T
Q  107 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37038 gtcaaattactgcacgtagatcatagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaa 37110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 3)
Name: scaffold0711
Description:

Target: scaffold0711; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 329
Target Start/End: Original strand, 7243 - 7558
Alignment:
Q  13 gtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | | |||||||| ||||||||||| |||       |||||| |||||||||||||||||||    
T  7243 gtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttatccttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttataaaacttgagttatggtcaaa 7342  T
Q  113 ttactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttag 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7343 ttattgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaacattgttcgaatttgaaatgaaa-ctggtattgattggtacagaattggtcttgg 7441  T
Q  213 atgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttc 312  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  7442 gtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacatcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactac 7541  T
Q  313 acgtaggtcacagtgaa 329  Q
    |||||||||||||||||    
T  7542 acgtaggtcacagtgaa 7558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 42 - 330
Target Start/End: Original strand, 7079 - 7367
Alignment:
Q  42 tatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaattttt 141  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  7079 tatggatgttagctttctaatgccgttgctctgccgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgacttttt 7178  T
Q  142 atgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggat 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  7179 atgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgcaatctggtattgattggtaaagaatatgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaat 7278  T
Q  242 gttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  7279 gttatccttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttataaaacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 7367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 199
Target Start/End: Original strand, 7430 - 7621
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  7430 aattggtcttgggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacatcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 7529  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7530 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaaattttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 7621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 131 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 68453 - 68227
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  68453 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttatgtgtaaacacgaaagttg 68354  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    || |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  68353 tatgtatggatgttagctttctagtgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 68254  T
Q  331 aattgaatatgattgatgaattagtat 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  68253 aattgaatatgattgatgaattagtat 68227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 68384 - 68254
Alignment:
Q  7 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatg 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||  ||       ||||||||||||||||||||    
T  68384 aaattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctagtgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 68285  T
Q  107 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  68284 gtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 68254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 175; Significance: 6e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1869 - 1634
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||| |    
T  1869 aattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 1770  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  1769 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacaaaattggt 1670  T
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgt 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1669 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgt 1634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 166 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 1904 - 1740
Alignment:
Q  166 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 265  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1904 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 1805  T
Q  266 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1804 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 1677 - 1633
Alignment:
Q  7 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtg 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1677 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtg 1633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 165; Significance: 6e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 201 - 409
Target Start/End: Original strand, 53612 - 53820
Alignment:
Q  201 aattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatga 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  53612 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtcaaagggatttatagaacttgagatatgg 53711  T
Q  301 tcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgat 400  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53712 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatattatattgttcatgattgat 53811  T
Q  401 gaagtgtta 409  Q
    |||||||||    
T  53812 gaagtgtta 53820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 53605 - 53741
Alignment:
Q  1 cccaacaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttga 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||       ||||||||||||||    
T  53605 cccatcaaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtcaaagggatttatagaacttga 53704  T
Q  101 gttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53705 gatatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 53741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Original strand, 53749 - 53815
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  53749 tatgattgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatattatattgttcatgattgatgaag 53815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 158; Significance: 9e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 164 - 409
Target Start/End: Original strand, 38359 - 38604
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||  ||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38359 ccgaatttgaaataaaaattagtattgatccgtaaagaattgatcttagggctaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 38458  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||  |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38459 tttgacttcaaaatgatttatagaatttgagttatgttcaaattactgtatgtttgtcatattgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtat 38558  T
Q  364 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38559 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgtta 38604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 118
Target Start/End: Original strand, 38396 - 38506
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||  ||       ||||||||| ||||||||||     
T  38396 aattgatcttagggctaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaatttgagttatgt 38495  T
Q  108 tcaaattactg 118  Q
    |||||||||||    
T  38496 tcaaattactg 38506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Original strand, 38532 - 38599
Alignment:
Q  443 ttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38532 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaag 38599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 326 - 509
Target Start/End: Original strand, 10647 - 10830
Alignment:
Q  326 tgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtt 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10647 tgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtt 10746  T
Q  426 tatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10747 tatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatactgtccataattgatgaag 10830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Original strand, 10765 - 10835
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  10765 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatactgtccataattgatgaagtgtta 10835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 131 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 33663 - 33465
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  33663 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttg 33564  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaa 329  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  33563 taggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtctgacgtaaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacggtgaa 33465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 33593 - 33455
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||        |||||||||||||||||||||    
T  33593 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtctgacgtaaaaacgatttatagaacttgagttatgg 33494  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  33493 tcaaattactgcacgtaggtcacggtgaaatcttatgaa 33455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 131 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 18145 - 17947
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  18145 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttg 18046  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaa 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  18045 taggtatggatgttagctttctaataccattggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaa 17947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 18075 - 17937
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  18075 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccattggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 17976  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 146  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  17975 tcaaattactgcacataggtcacagtgaaatcttatgaa 17937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 131 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 31695 - 31497
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31695 agtgaatttttatgaatttcatcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 31596  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaa 329  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31595 taggtattaatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 31497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 31625 - 31487
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  31625 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattaatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 31526  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 146  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31525 ttaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaa 31487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 148; Significance: 8e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 131 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 8510 - 8311
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  8510 agtgaatttttatgaatttcagcacagctttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtatagaattgctcttaggtgtaaacatgaaagttg 8411  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  8410 taggtatggatgttagctttctaatgctattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtaaaattactgcacgttggtcacagtgaat 8311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 8440 - 8304
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||  ||       |||||||||||||||||||||    
T  8440 aattgctcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgctattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 8341  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatg 144  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8340 taaaattactgcacgttggtcacagtgaatttttatg 8304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 148; Significance: 8e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18552 - 18352
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||       |||||||||||||||||||||    
T  18552 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 18453  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18452 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggcattgattggtacagaaatggt 18353  T
Q  208 c 208  Q
    |    
T  18352 c 18352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 164 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 18589 - 18423
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18589 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcattgg 18490  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 330  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18489 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 18423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 143; Significance: 8e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 131 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 39824 - 39626
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  39824 agtgaacttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttg 39725  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaa 329  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | ||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39724 tagttatggatgttagctttctaatgccattggtctaacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattattacacgtaggtcacagtgaa 39626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 39754 - 39626
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||       |||||||||||||||||||||    
T  39754 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagttatggatgttagctttctaatgccattggtctaacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 39655  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 136  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39654 tcaaattattacacgtaggtcacagtgaa 39626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 220 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 1831 - 1642
Alignment:
Q  220 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtagg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  1831 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 1732  T
Q  320 tcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  1731 tcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatttatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgtta 1642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 1831 - 1722
Alignment:
Q  27 cacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1831 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 1732  T
Q  127 tcacagtgaa 136  Q
    ||||||||||    
T  1731 tcacagtgaa 1722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 439 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 1718 - 1647
Alignment:
Q  439 ttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1718 ttgtttatgattgatgaattaatatatgtatttatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaag 1647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 135; Significance: 5e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 131 - 329
Target Start/End: Original strand, 19759 - 19957
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  19759 agtgaatttttatgaatttcagcaaaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacgcaaaagttg 19858  T
Q  231 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaa 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19859 taggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgaattatataacttgagttatcgtcaaattactacacgtaggtcatagtgaa 19957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 146
Target Start/End: Original strand, 19829 - 19967
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||        ||||| |||||||||||| |    
T  19829 aattggtcttaggtgtaaacgcaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgaattatataacttgagttatcg 19928  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 146  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||    
T  19929 tcaaattactacacgtaggtcatagtgaaatcttatgaa 19967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 133; Significance: 7e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 314 - 509
Target Start/End: Original strand, 15030 - 15215
Alignment:
Q  314 cgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatg 413  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  15030 cgtaggtcatagtgaataattgaatatgattaatgaattagtat----------atgtttgtgaatactatattgttcataattgatgaagtgttatatg 15119  T
Q  414 aatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15120 aatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgcgaatacaatattgtccatgattgatgaag 15215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Original strand, 15150 - 15220
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15150 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgtta 15220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 214 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 41353 - 41259
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatta 308  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||   ||||||| ||||||||| | |||| |||||||| |||  |||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  41353 tgtaaacatgaaagttttagataattatgttagatttctaatggctttggcttgacttccaaattatttttagaacttgcattatgatcaaatta 41259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 239 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 57865 - 57708
Alignment:
Q  239 gatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaat 338  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  57865 gatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatacttgaat 57766  T
Q  339 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgat 396  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  57765 atgagtgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgat 57708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 57865 - 57774
Alignment:
Q  46 gatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||       |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57865 gatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 57774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 57766 - 57708
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgat 501  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  57766 tatgagtgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgat 57708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 113; Significance: 6e-57; HSPs: 4)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 253 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 11142 - 10987
Alignment:
Q  253 aatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatt 352  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11142 aatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaatt 11043  T
Q  353 agtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  11042 agtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgtta 10987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 131 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 68 - 1
Alignment:
Q  131 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtac 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68 agtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtac 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 444 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 11057 - 10992
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11057 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaag 10992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11115 - 11065
Alignment:
Q  87 tttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  11115 tttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaat 11065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 96; Significance: 9e-47; HSPs: 5)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 274 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 28190 - 28039
Alignment:
Q  274 aaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28190 aaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 28091  T
Q  374 gtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtt 425  Q
     ||| ||  || ||||| |||||||||||| |  || ||| |||||||||||    
T  28090 atgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 28039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 392 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 28125 - 28008
Alignment:
Q  392 atgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatat 491  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  28125 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatat 28026  T
Q  492 tgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28025 tgtccatgattgatgaag 28008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 28073 - 28003
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  28073 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 28003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 28184 - 28134
Alignment:
Q  87 tttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 137  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28184 tttatagaacttgagttatagtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 28134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 28126 - 28092
Alignment:
Q  444 tatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28126 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 28092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 381 - 509
Target Start/End: Original strand, 1141 - 1269
Alignment:
Q  381 ctatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgc 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| || || ||||||     
T  1141 ctatattgttcatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattaataaattagtatatgaatataaatgttga 1240  T
Q  481 gaatacgatattgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1241 gaataagatattgtccatgattgatgaag 1269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 164 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 113475 - 113317
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  113475 ccgaatttgaaataaaaactggtattgatcggtgcggatttggcctttgatgtaaacatggaagttgtaggtatggatgttacatttctaatgacgttgg 113376  T
Q  264 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattacttcacgtaggtca 322  Q
    ||||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  113375 tttgactccaaaatgagttttagaacttgagttatggtcaaattactaaacgtaggtca 113317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 113425 - 113284
Alignment:
Q  21 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatggtcaaattactgca 120  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| |||   |        || |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  113425 tgtaaacatggaagttgtaggtatggatgttacatttctaatgacgttggtttgactccaaaatgagttttagaacttgagttatggtcaaattactaaa 113326  T
Q  121 cgtaggtcacagtgaatttttat-gaatttcagcacaacttt 161  Q
    ||||||||| ||| || ||||||  |||||||||||||||||    
T  113325 cgtaggtcatagtaaagttttataaaatttcagcacaacttt 113284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 161 - 245
Target Start/End: Original strand, 75605 - 75689
Alignment:
Q  161 tgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 245  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75605 tgtccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 75689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 50
Target Start/End: Original strand, 75644 - 75687
Alignment:
Q  7 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgt 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75644 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgt 75687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 10067 - 9950
Alignment:
Q  393 tgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg-ttgcgaatacgatat 491  Q
    ||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||    
T  10067 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtacgatgttgtttatgattgatgagttagtatatgtatgtataagtttgtgaatacgatat 9968  T
Q  492 tgtccatgattgatgaag 509  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  9967 tgtacatgattgatgaag 9950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 338 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 10016 - 9945
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgtta 409  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  10016 tatgattgatgagttagtatatgtatgtataagtttgtgaatacgatattgtacatgattgatgaagtgtta 9945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 340 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 10067 - 10005
Alignment:
Q  340 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatga 402  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||||| |||||||||||    
T  10067 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtacgatgttgtttatgattgatga 10005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 6195 - 6305
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6195 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttatagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctaaatgatttttagaacttgagttatg 6294  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  6295 atcaaattact 6305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 478 - 398
Alignment:
Q  164 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtt 244  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  478 ccgaatttgaaataaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtcgtacgtatggatgtt 398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 441 - 399
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgt 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  441 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagtcgtacgtatggatgt 399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8676 - 8566
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||    
T  8676 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctagatgatttttagaacttgagttatg 8577  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  8576 atcaaattact 8566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 30580 - 30470
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30580 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 30481  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  30480 atcaaattact 30470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 30579 - 30442
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   |||| |||||||||||| | ||||| ||| |||       ||| ||||||||||||||||     
T  30579 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 30480  T
Q  108 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 146  Q
    |||||||||| ||| | |||||  |||||||||| ||||    
T  30479 tcaaattactacacatgggtca-tgtgaatttttgtgaa 30442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 239 - 310
Target Start/End: Original strand, 12519 - 12590
Alignment:
Q  239 gatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12519 gatgttagctttctaatggctttgggttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 12590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 835 - 725
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||   | ||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  835 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattacgttagctttctaatggctttggtctgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 736  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  735 atcaaattact 725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 834 - 725
Alignment:
Q  8 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtgagctttctaatgccgttggtctgatgtcnnnnnnntttatagaacttgagttatgg 107  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||   | || |||||||||||| | ||||||||| |||       ||| ||||||||||||||||     
T  834 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattacgttagctttctaatggctttggtctgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 735  T
Q  108 tcaaattact 117  Q
    ||||||||||    
T  734 tcaaattact 725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 310
Target Start/End: Original strand, 6970 - 7039
Alignment:
Q  241 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6970 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 7039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 15408 - 15287
Alignment:
Q  345 gatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgttt 444  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || || ||||||||||||||| | |||  |||||||||||||  |||| ||| || |||||     
T  15408 gatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttattcatgattgatgaattattatttgaatgtatatgtcgatgaatatgatattgttc 15309  T
Q  445 atgattgatgaattagtatatg 466  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  15308 atgattgatgaattattatatg 15287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 398 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 15408 - 15297
Alignment:
Q  398 gatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg-cgaatacgatattgtcc 496  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||||||||||||| ||| || |||||||||| |  ||||| |||||||| |    
T  15408 gatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttattcatgattgatgaattattatttgaatgtatatgtcgatgaatatgatattgttc 15309  T
Q  497 atgattgatgaa 508  Q
    ||||||||||||    
T  15308 atgattgatgaa 15297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 339 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 15361 - 15284
Alignment:
Q  339 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaat 416  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  15361 atgattgatgaattattatttgaatgtatatgtcgatgaatatgatattgttcatgattgatgaattattatatgaat 15284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Original strand, 32120 - 32216
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||| ||||||| ||||||   | ||||||||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32120 tgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 32216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 40724 - 40628
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||| ||||||| ||||||   | ||||||||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40724 tgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 40628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 393 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 16326 - 16242
Alignment:
Q  393 tgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  16326 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaatt--tatatgaatgtatatgttg 16242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16326 - 16228
Alignment:
Q  340 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgt 439  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  16326 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaa--tttatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgt 16229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 16326 - 16263
Alignment:
Q  446 tgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttgc-gaatacgatattgtccatgattgatgaa 508  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  16326 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 16263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1375
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || || ||||||||||||||||    
T  1485 gaattggccttcggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgagttttagaacttgagttatg 1386  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  1385 atcaaattact 1375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold1186
Description:

Target: scaffold1186; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 386 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 383 - 293
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg 476  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| || |||||||||||| | |||| |||||||||    
T  383 ttgtttatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtcgttcattattgatgaattattgtatgaatgtatatg 293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 386 - 344
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  386 atgttgtttatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgtt 344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 378 - 293
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatg 423  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||||  ||||||  || | |||||| ||||||||| | ||  |||||||||||||    
T  378 tatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtcgttcattattgatgaattattgtatgaatgtatatg 293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15846 - 15780
Alignment:
Q  242 gttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatta 308  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15846 gttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 15780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 110064 - 110174
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | ||| |||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  110064 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattacgttagctttctaatggctttgatttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatg 110163  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  110164 atcaaattact 110174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Original strand, 118565 - 118675
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | ||| |||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  118565 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattacgttagctttctaatggctttgatttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatg 118664  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  118665 atcaaattact 118675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 40035 - 39965
Alignment:
Q  240 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40035 atgtcagctttctaatggctttggttttacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 39965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 45518 - 45448
Alignment:
Q  240 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45518 atgttagctttctaatggctttggttttacttccaaataatttttagaacttgagttatgatcaaattact 45448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 79073 - 79003
Alignment:
Q  240 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  79073 atgttagctttctaattgctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 79003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 120247 - 120201
Alignment:
Q  433 ataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  120247 ataatgttgttcatgattgatgatttattatatgaatgtatatgttg 120201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 386 - 476
Target Start/End: Original strand, 187885 - 187975
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatg 476  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| || |||||||||||| | |||| |||||||||    
T  187885 ttgtttatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtcgttcattattgatgaattattgtatgaatgtatatg 187975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 478
Target Start/End: Original strand, 187882 - 187924
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  187882 atgttgtttatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgtt 187924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 423
Target Start/End: Original strand, 187890 - 187975
Alignment:
Q  338 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatg 423  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||||  ||||||  || | |||||| ||||||||| | ||  |||||||||||||    
T  187890 tatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtcgttcattattgatgaattattgtatgaatgtatatg 187975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 310
Target Start/End: Original strand, 1296 - 1365
Alignment:
Q  241 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1296 tgttagctttctaatggttttggtttgatttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 1365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 456 - 508
Target Start/End: Original strand, 35955 - 36007
Alignment:
Q  456 attagtatatgcatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35955 attagtatatgtatgtatatgttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaa 36007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 350 - 403
Target Start/End: Original strand, 35955 - 36007
Alignment:
Q  350 attagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 403  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  35955 attagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaa 36007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 54042 - 53946
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||   |||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  54042 tgtaaacatgaaagttttagataattatgttaactttctaatggctttggtttgactttcaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 53946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Original strand, 19913 - 20009
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | |||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19913 tgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttccaatggctttggtttgaagtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 20009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 979 - 912
Alignment:
Q  241 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatta 308  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  979 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttataacttgaattatgatcaaatta 912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 240 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 938 - 868
Alignment:
Q  240 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  938 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtgcaaatgatttttagaacctgagttatgatcaaattact 868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18315 - 18205
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||  || ||| ||||| || |||||||||||||    
T  18315 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgaggtccaaatgatttttataacttgagttatg 18216  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  18215 atcaaattact 18205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 28579 - 28469
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||    | |||| ||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| || |||||||||||||    
T  28579 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataatttttttagttttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttataacttgagttatg 28480  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  28479 atcaaattact 28469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 38485 - 38375
Alignment:
Q  200 gaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 299  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  38485 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 38386  T
Q  300 atcaaattact 310  Q
    |||||||||||    
T  38385 atcaaattact 38375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 386 - 478
Target Start/End: Original strand, 7238 - 7327
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgtt 478  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||  | ||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  7238 ttgttcatgattgatgaagtattagatgaatgtatatgttgatgaatatgatgt--tatatga-tgatgaattactatatgaatgcatatgtt 7327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Original strand, 24648 - 24751
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgag----------tataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatat 475  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||          ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  24648 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgagtatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatat 24747  T
Q  476 gttg 479  Q
    ||||    
T  24748 gttg 24751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Original strand, 24645 - 24688
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  24645 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 24688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Original strand, 24711 - 24765
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  24711 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtt 24765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 310
Target Start/End: Original strand, 8097 - 8192
Alignment:
Q  215 gtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    ||||||| |||||||||||  |   ||||||||| ||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  8097 gtaaacatgaaagttgtagacaattatgttagctatctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 8192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0959 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0959
Description:

Target: scaffold0959; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 1333 - 1219
Alignment:
Q  208 cttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaatt 307  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||  |||||||||   ||||| | ||||||||| | ||| || ||||||| ||||| |||||||    
T  1333 cttagatgtaaacataaaagttttatatatggatgttatatttctaatggatttggtctcacttcaaaatgttttctaaaacttgatttatggtcaaatt 1234  T
Q  308 acttcacgtaggtca 322  Q
    ||| ||| |||||||    
T  1233 actacacataggtca 1219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Original strand, 18298 - 18352
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  18298 ttgttcatgattgatgaagtattatatgaaagtatatgttgatgaatataatgtt 18352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Original strand, 18361 - 18415
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  18361 ttgttcatgattgatgaataattatatgaatgtatatgttgatgagtatgatgtt 18415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Original strand, 7502 - 7556
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7502 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgagtatgatgtt 7556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Original strand, 7499 - 7542
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  7499 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 7542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Original strand, 7313 - 7416
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt----------gtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatat 475  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||          ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  7313 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatat 7412  T
Q  476 gttg 479  Q
    ||||    
T  7413 gttg 7416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Original strand, 7310 - 7353
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  7310 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 7353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 430
Target Start/End: Original strand, 7376 - 7420
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga 430  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  7376 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatga 7420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 425
Target Start/End: Original strand, 7173 - 7212
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtt 425  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  7173 ttgttcatgattgatgaattgttatatgaatgtatatgtt 7212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 425
Target Start/End: Original strand, 7236 - 7275
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtt 425  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  7236 ttgttcatgattgatgaattgttatatgaatgtatatgtt 7275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Original strand, 2555 - 2598
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  2555 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 2598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 430
Target Start/End: Original strand, 2558 - 2602
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga 430  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  2558 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatga 2602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2054 - 1959
Alignment:
Q  215 gtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattact 310  Q
    ||||||| |||||||||||  |   ||||||||| |||  || | |||||||||| || |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2054 gtaaacatgaaagttgtagacaattatgttagctatcttttggctttggtttgacgtccaaattatttttagaacttgagttatgatcaaattact 1959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 10042 - 9999
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  10042 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 9999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 10039 - 9985
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  10039 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtt 9985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 29889 - 29846
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  29889 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 29846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 3193 - 3150
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  3193 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 3150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 3190 - 3146
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga 430  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  3190 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatga 3146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 8290 - 8251
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtt 425  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  8290 ttgttcatgattgatgaattgttatatgaatgtatatgtt 8251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 411 - 450
Target Start/End: Original strand, 1226 - 1265
Alignment:
Q  411 atgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatgatt 450  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  1226 atgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgattatgatt 1265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Original strand, 36278 - 36321
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  36278 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 36321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 62066 - 62023
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  62066 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 62023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 62063 - 62009
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  62063 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtt 62009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Original strand, 46658 - 46701
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  46658 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 46701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 440
Target Start/End: Original strand, 46661 - 46715
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgtt 440  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  46661 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatcatgtt 46715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 142818 - 142775
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  142818 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 142775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 142815 - 142771
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga 430  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  142815 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatga 142771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 29437 - 29394
Alignment:
Q  436 atgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  29437 atgttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 29394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 29434 - 29390
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatga 430  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  29434 ttgttcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatga 29390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 1237 - 1195
Alignment:
Q  437 tgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  1237 tgttgtttatggttgatgaattattatatgaatgtatatgttg 1195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Original strand, 6041 - 6087
Alignment:
Q  433 ataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  6041 ataatgttgttcatgattgatgatttattatatgaatgtatatgttg 6087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Original strand, 13380 - 13426
Alignment:
Q  433 ataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  13380 ataatgttgttcatgattgatgatttattatatgaatgtatatgttg 13426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 143
Target Start/End: Original strand, 233 - 279
Alignment:
Q  97 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttat 143  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  233 ttgatttatggtcaaactactacacgtaggtcacaatgaatttttat 279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 448
Target Start/End: Original strand, 66756 - 66818
Alignment:
Q  386 ttgttcatgattgatgaagtgttacatgaatgtatatgtttatgagtataatgttgtttatga 448  Q
    |||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||    
T  66756 ttgttcatgaatgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatga 66818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 53976 - 53939
Alignment:
Q  214 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttc 251  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53976 tgtaaacatgaaagttgtaggtatggacgttagctttc 53939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1223 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1223
Description:

Target: scaffold1223; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 427 - 479
Target Start/End: Original strand, 574 - 626
Alignment:
Q  427 atgagtataatgttgtttatgattgatgaattagtatatgcatgtatatgttg 479  Q
    |||| ||| |||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  574 atgaatatgatgttgttcattattgatgaattattatatgaatgtatatgttg 626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University