View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5523_low_15 (Length: 248)

Name: NF5523_low_15
Description: NF5523
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5523_low_15
NF5523_low_15
[»] chr4 (67 HSPs)
chr4 (25-245)||(1724321-1724542)
chr4 (25-239)||(19534324-19534539)
chr4 (26-245)||(26564694-26564914)
chr4 (25-239)||(6482046-6482262)
chr4 (1-232)||(12825449-12825680)
chr4 (25-245)||(39046815-39047036)
chr4 (25-232)||(47550364-47550573)
chr4 (34-239)||(37107280-37107486)
chr4 (25-245)||(48459343-48459565)
chr4 (3-245)||(5902598-5902847)
chr4 (58-239)||(37348992-37349174)
chr4 (5-245)||(9230146-9230385)
chr4 (26-232)||(43893103-43893311)
chr4 (25-245)||(11027934-11028157)
chr4 (25-232)||(32585363-32585573)
chr4 (25-239)||(31752324-31752540)
chr4 (25-245)||(6382283-6382506)
chr4 (40-233)||(21423735-21423930)
chr4 (25-245)||(7608832-7609054)
chr4 (40-232)||(11122895-11123089)
chr4 (25-232)||(44317409-44317619)
chr4 (25-239)||(7985136-7985348)
chr4 (6-239)||(32596177-32596410)
chr4 (25-245)||(42299653-42299872)
chr4 (25-245)||(31918569-31918792)
chr4 (31-195)||(47239402-47239568)
chr4 (77-245)||(13770518-13770687)
chr4 (25-195)||(55826634-55826807)
chr4 (6-244)||(39188379-39188616)
chr4 (114-239)||(425692-425818)
chr4 (25-195)||(39375192-39375362)
chr4 (99-245)||(42774623-42774771)
chr4 (66-228)||(28695194-28695357)
chr4 (139-245)||(29755456-29755562)
chr4 (25-107)||(15987273-15987355)
chr4 (8-118)||(31782604-31782713)
chr4 (20-100)||(25941147-25941226)
chr4 (25-112)||(19883067-19883154)
chr4 (90-196)||(13015327-13015440)
chr4 (121-245)||(4766419-4766546)
chr4 (25-112)||(4741227-4741314)
chr4 (145-227)||(15987372-15987455)
chr4 (8-102)||(21544586-21544679)
chr4 (25-126)||(10302067-10302168)
chr4 (25-118)||(10574430-10574523)
chr4 (25-102)||(29527819-29527896)
chr4 (25-128)||(8843816-8843918)
chr4 (25-128)||(8856780-8856882)
chr4 (25-120)||(36306774-36306869)
chr4 (25-120)||(42907875-42907970)
chr4 (8-104)||(25298828-25298923)
chr4 (58-138)||(53906349-53906429)
chr4 (25-112)||(47103735-47103822)
chr4 (25-102)||(15733537-15733614)
chr4 (31-120)||(21956831-21956920)
chr4 (168-245)||(53906437-53906514)
chr4 (3-62)||(11173020-11173078)
chr4 (25-100)||(14605936-14606011)
chr4 (25-80)||(33615340-33615395)
chr4 (34-120)||(12075651-12075737)
chr4 (8-102)||(30266325-30266418)
chr4 (8-102)||(30285770-30285863)
chr4 (20-66)||(43309526-43309571)
chr4 (25-94)||(3737791-3737860)
chr4 (25-105)||(33516082-33516163)
chr4 (68-100)||(9280943-9280975)
chr4 (52-100)||(35304554-35304602)
[»] chr8 (49 HSPs)
chr8 (3-245)||(17469112-17469354)
chr8 (25-245)||(34139304-34139525)
chr8 (25-245)||(24568796-24569016)
chr8 (20-233)||(43113632-43113845)
chr8 (25-245)||(1012474-1012696)
chr8 (25-245)||(45235921-45236143)
chr8 (25-232)||(20399461-20399670)
chr8 (25-232)||(24870034-24870242)
chr8 (14-239)||(29108822-29109048)
chr8 (25-232)||(27932282-27932491)
chr8 (14-239)||(1063369-1063595)
chr8 (4-239)||(36131907-36132141)
chr8 (25-245)||(32302916-32303139)
chr8 (14-245)||(39445576-39445799)
chr8 (4-221)||(14186205-14186418)
chr8 (40-195)||(24927855-24928012)
chr8 (40-245)||(11255033-11255236)
chr8 (25-239)||(17220579-17220790)
chr8 (25-239)||(34021341-34021554)
chr8 (1-195)||(34776972-34777173)
chr8 (139-239)||(35215367-35215467)
chr8 (25-112)||(37960972-37961059)
chr8 (90-245)||(2075909-2076066)
chr8 (25-245)||(4230740-4230951)
chr8 (25-138)||(40248381-40248494)
chr8 (96-245)||(28977195-28977346)
chr8 (134-245)||(29089567-29089677)
chr8 (25-120)||(8545359-8545454)
chr8 (3-122)||(9642340-9642458)
chr8 (4-122)||(5700337-5700454)
chr8 (25-112)||(17084117-17084204)
chr8 (25-118)||(15068598-15068690)
chr8 (168-245)||(40248502-40248579)
chr8 (46-94)||(2075867-2075915)
chr8 (14-126)||(27056555-27056666)
chr8 (30-90)||(35215549-35215609)
chr8 (14-69)||(5858652-5858706)
chr8 (25-118)||(2183616-2183709)
chr8 (25-112)||(14687390-14687477)
chr8 (25-100)||(27777208-27777283)
chr8 (68-127)||(30481474-30481533)
chr8 (25-94)||(10297467-10297536)
chr8 (25-120)||(12468229-12468323)
chr8 (25-120)||(28345474-28345569)
chr8 (14-112)||(39379581-39379676)
chr8 (26-120)||(30904029-30904123)
chr8 (27-80)||(6388528-6388581)
chr8 (25-121)||(15173890-15173986)
chr8 (68-112)||(29918598-29918642)
[»] chr7 (71 HSPs)
chr7 (25-247)||(5376945-5377168)
chr7 (25-245)||(27850336-27850556)
chr7 (25-245)||(12980238-12980460)
chr7 (25-245)||(18825882-18826103)
chr7 (1-228)||(3920417-3920644)
chr7 (25-245)||(2630584-2630805)
chr7 (25-245)||(16078875-16079096)
chr7 (3-224)||(26622834-26623055)
chr7 (30-232)||(46127198-46127398)
chr7 (33-239)||(24425249-24425455)
chr7 (25-245)||(17885326-17885548)
chr7 (25-245)||(16866030-16866252)
chr7 (25-232)||(30650505-30650714)
chr7 (1-217)||(26004461-26004675)
chr7 (14-245)||(45379967-45380200)
chr7 (40-193)||(18125253-18125408)
chr7 (25-245)||(35074330-35074553)
chr7 (25-232)||(7779882-7780091)
chr7 (25-232)||(21702533-21702742)
chr7 (25-245)||(25782917-25783138)
chr7 (32-239)||(44734374-44734583)
chr7 (25-239)||(39456025-39456239)
chr7 (25-245)||(37182136-37182357)
chr7 (1-231)||(41103528-41103768)
chr7 (25-245)||(41741460-41741681)
chr7 (58-239)||(37579130-37579312)
chr7 (25-245)||(45885775-45885997)
chr7 (25-239)||(39316862-39317078)
chr7 (58-245)||(44985949-44986130)
chr7 (41-195)||(17851765-17851921)
chr7 (25-231)||(25979927-25980135)
chr7 (25-245)||(38139802-38140025)
chr7 (25-195)||(25905539-25905711)
chr7 (39-245)||(44794052-44794259)
chr7 (25-245)||(45708875-45709094)
chr7 (55-245)||(37196038-37196230)
chr7 (25-192)||(16811644-16811812)
chr7 (25-168)||(3226956-3227100)
chr7 (77-239)||(23328477-23328641)
chr7 (25-138)||(10072436-10072549)
chr7 (14-193)||(24753088-24753256)
chr7 (25-159)||(38152835-38152970)
chr7 (62-195)||(44658496-44658631)
chr7 (25-245)||(43507294-43507528)
chr7 (142-228)||(5916194-5916280)
chr7 (3-112)||(23475252-23475360)
chr7 (168-245)||(26004675-26004752)
chr7 (25-118)||(27063324-27063417)
chr7 (25-118)||(31425998-31426091)
chr7 (25-107)||(3157084-3157166)
chr7 (168-245)||(3227698-3227775)
chr7 (3-112)||(19439999-19440107)
chr7 (25-118)||(32546182-32546275)
chr7 (1-112)||(23533591-23533700)
chr7 (25-112)||(33841074-33841161)
chr7 (25-119)||(27063127-27063221)
chr7 (25-111)||(27896485-27896571)
chr7 (28-118)||(28309482-28309572)
chr7 (25-104)||(10995844-10995923)
chr7 (25-112)||(18683970-18684057)
chr7 (20-94)||(10990866-10990940)
chr7 (32-138)||(3274700-3274802)
chr7 (25-102)||(21750788-21750865)
chr7 (34-119)||(24903406-24903490)
chr7 (25-118)||(44845145-44845238)
chr7 (174-245)||(38152763-38152834)
chr7 (58-120)||(3774057-3774119)
chr7 (139-192)||(16900440-16900493)
chr7 (148-229)||(17120543-17120624)
chr7 (25-118)||(30839144-30839237)
chr7 (170-238)||(10072357-10072425)
[»] chr3 (55 HSPs)
chr3 (25-245)||(4557315-4557536)
chr3 (25-245)||(4016054-4016275)
chr3 (25-245)||(53631761-53631982)
chr3 (29-228)||(42758248-42758448)
chr3 (25-245)||(48390827-48391048)
chr3 (25-228)||(54317018-54317222)
chr3 (25-245)||(34119515-34119734)
chr3 (25-245)||(44172482-44172704)
chr3 (25-245)||(44179182-44179404)
chr3 (25-245)||(44953445-44953667)
chr3 (25-245)||(19111592-19111812)
chr3 (30-245)||(29842164-29842381)
chr3 (25-239)||(22535851-22536067)
chr3 (46-245)||(31126826-31127026)
chr3 (25-245)||(49579920-49580142)
chr3 (25-245)||(34025810-34026032)
chr3 (39-195)||(44639180-44639338)
chr3 (14-232)||(52198023-52198243)
chr3 (25-195)||(39655283-39655455)
chr3 (25-239)||(30682684-30682898)
chr3 (30-239)||(830872-831081)
chr3 (40-232)||(7469803-7469997)
chr3 (25-245)||(39728527-39728749)
chr3 (1-245)||(49025537-49025781)
chr3 (25-245)||(52572465-52572687)
chr3 (25-245)||(44252603-44252825)
chr3 (25-232)||(44106802-44107011)
chr3 (14-192)||(29284245-29284424)
chr3 (25-195)||(23154075-23154245)
chr3 (25-231)||(23580698-23580905)
chr3 (25-245)||(43582434-43582655)
chr3 (39-230)||(17146174-17146367)
chr3 (25-245)||(34154274-34154492)
chr3 (25-245)||(10823706-10823925)
chr3 (58-239)||(6738437-6738620)
chr3 (58-245)||(20086865-20087053)
chr3 (87-245)||(41937074-41937233)
chr3 (3-128)||(23546925-23547055)
chr3 (25-134)||(48305651-48305760)
chr3 (97-152)||(23910326-23910382)
chr3 (33-112)||(30904834-30904912)
chr3 (58-108)||(31271300-31271350)
chr3 (139-232)||(48306661-48306755)
chr3 (25-126)||(10043292-10043393)
chr3 (116-195)||(23547073-23547154)
chr3 (68-118)||(1772452-1772502)
chr3 (25-107)||(30616291-30616373)
chr3 (25-62)||(55438787-55438824)
chr3 (162-239)||(55438828-55438905)
chr3 (34-104)||(3385875-3385945)
chr3 (138-196)||(14208307-14208364)
chr3 (24-105)||(34593128-34593209)
chr3 (3-63)||(1337080-1337139)
chr3 (33-101)||(27937740-27937808)
chr3 (25-73)||(41937023-41937071)
[»] chr5 (55 HSPs)
chr5 (7-245)||(12447238-12447476)
chr5 (39-239)||(35194014-35194215)
chr5 (25-245)||(17853304-17853524)
chr5 (25-245)||(4582975-4583197)
chr5 (46-239)||(1218619-1218812)
chr5 (31-245)||(35311679-35311894)
chr5 (25-245)||(4920682-4920904)
chr5 (7-245)||(38006463-38006701)
chr5 (25-245)||(2412737-2412958)
chr5 (76-239)||(27088414-27088577)
chr5 (3-239)||(2985010-2985246)
chr5 (25-231)||(18206888-18207096)
chr5 (61-245)||(30115340-30115525)
chr5 (25-232)||(30996466-30996674)
chr5 (25-239)||(15890069-15890284)
chr5 (25-245)||(5908699-5908921)
chr5 (25-245)||(40517662-40517884)
chr5 (25-232)||(42987490-42987699)
chr5 (84-239)||(3573087-3573243)
chr5 (14-245)||(28045511-28045743)
chr5 (30-239)||(8453389-8453598)
chr5 (25-239)||(12866562-12866779)
chr5 (25-239)||(6155931-6156145)
chr5 (25-245)||(13402015-13402235)
chr5 (26-245)||(22694913-22695134)
chr5 (25-239)||(12834585-12834802)
chr5 (60-245)||(3564773-3564960)
chr5 (25-245)||(29245962-29246184)
chr5 (58-195)||(6092562-6092701)
chr5 (78-230)||(42717696-42717849)
chr5 (100-245)||(33862270-33862415)
chr5 (25-232)||(20973507-20973705)
chr5 (25-245)||(27302746-27302965)
chr5 (25-231)||(6369566-6369773)
chr5 (20-120)||(38972905-38973004)
chr5 (25-89)||(33728012-33728076)
chr5 (25-122)||(10127062-10127152)
chr5 (48-162)||(15564576-15564691)
chr5 (25-99)||(28569032-28569106)
chr5 (31-112)||(29664962-29665043)
chr5 (25-112)||(6810149-6810236)
chr5 (7-94)||(10822520-10822606)
chr5 (71-177)||(33420388-33420494)
chr5 (26-120)||(12457500-12457594)
chr5 (25-118)||(23045002-23045095)
chr5 (25-120)||(8020598-8020693)
chr5 (25-112)||(27900412-27900499)
chr5 (25-120)||(18451896-18451991)
chr5 (25-128)||(40187668-40187770)
chr5 (58-112)||(18116550-18116604)
chr5 (58-112)||(43523750-43523804)
chr5 (168-245)||(10126964-10127041)
chr5 (31-112)||(16311310-16311391)
chr5 (14-118)||(12915458-12915561)
chr5 (25-117)||(32574949-32575041)
[»] chr1 (52 HSPs)
chr1 (25-245)||(44615485-44615707)
chr1 (25-245)||(44792862-44793084)
chr1 (25-239)||(29871295-29871510)
chr1 (14-228)||(34673282-34673496)
chr1 (25-239)||(9982900-9983115)
chr1 (25-245)||(45866195-45866417)
chr1 (25-245)||(12494868-12495089)
chr1 (62-245)||(49741054-49741238)
chr1 (14-239)||(19572512-19572737)
chr1 (25-245)||(29936273-29936495)
chr1 (25-239)||(17134810-17135026)
chr1 (25-239)||(16433177-16433386)
chr1 (25-245)||(40087474-40087695)
chr1 (25-245)||(18354090-18354312)
chr1 (25-245)||(24236771-24236993)
chr1 (1-245)||(3627972-3628219)
chr1 (25-232)||(36187230-36187439)
chr1 (25-245)||(17091969-17092191)
chr1 (25-247)||(28297788-28298013)
chr1 (25-239)||(35936839-35937042)
chr1 (39-245)||(42439694-42439902)
chr1 (14-232)||(51421728-51421947)
chr1 (26-245)||(50426672-50426887)
chr1 (55-245)||(23966729-23966922)
chr1 (14-245)||(34610930-34611162)
chr1 (25-245)||(5180902-5181118)
chr1 (25-245)||(34060035-34060251)
chr1 (25-245)||(49250783-49251005)
chr1 (25-245)||(42707847-42708062)
chr1 (25-225)||(16408823-16409021)
chr1 (25-239)||(44632151-44632361)
chr1 (25-162)||(23490781-23490919)
chr1 (25-245)||(24710715-24710926)
chr1 (62-162)||(13390354-13390455)
chr1 (58-199)||(2514671-2514814)
chr1 (90-245)||(39616160-39616317)
chr1 (25-112)||(16903515-16903602)
chr1 (5-120)||(48125674-48125788)
chr1 (25-128)||(39219234-39219337)
chr1 (90-245)||(20774489-20774647)
chr1 (143-231)||(13020559-13020648)
chr1 (26-118)||(10450070-10450162)
chr1 (25-105)||(10778577-10778657)
chr1 (25-118)||(16237314-16237407)
chr1 (25-111)||(23058459-23058545)
chr1 (20-94)||(34085245-34085318)
chr1 (32-113)||(8880439-8880520)
chr1 (25-118)||(35069899-35069992)
chr1 (39-120)||(41476976-41477057)
chr1 (24-120)||(25154836-25154932)
chr1 (20-80)||(33293537-33293596)
chr1 (138-193)||(38733901-38733956)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (25-245)||(33250-33471)
[»] chr6 (46 HSPs)
chr6 (7-245)||(14505943-14506181)
chr6 (6-239)||(24602848-24603081)
chr6 (25-239)||(12678104-12678318)
chr6 (25-245)||(2367182-2367404)
chr6 (25-232)||(10142528-10142737)
chr6 (25-245)||(32853700-32853922)
chr6 (40-245)||(30816114-30816323)
chr6 (80-245)||(14032413-14032579)
chr6 (25-207)||(27738666-27738850)
chr6 (25-205)||(11762342-11762523)
chr6 (25-195)||(24225604-24225776)
chr6 (25-245)||(3483933-3484155)
chr6 (25-245)||(27534540-27534762)
chr6 (25-232)||(5863393-5863602)
chr6 (25-245)||(7393897-7394118)
chr6 (25-232)||(12141254-12141463)
chr6 (27-239)||(12309441-12309648)
chr6 (40-239)||(14254821-14255021)
chr6 (25-245)||(10188090-10188305)
chr6 (3-189)||(32053000-32053193)
chr6 (25-138)||(32532505-32532618)
chr6 (140-239)||(14410959-14411058)
chr6 (1-106)||(14410842-14410946)
chr6 (139-239)||(14245110-14245210)
chr6 (25-112)||(15498315-15498402)
chr6 (25-104)||(20349063-20349142)
chr6 (25-120)||(13769055-13769150)
chr6 (25-99)||(28079706-28079780)
chr6 (20-120)||(29341239-29341338)
chr6 (30-88)||(9442445-9442503)
chr6 (25-118)||(9458843-9458936)
chr6 (3-84)||(14034521-14034601)
chr6 (168-245)||(32532420-32532497)
chr6 (25-120)||(256502-256597)
chr6 (25-112)||(18908884-18908971)
chr6 (26-112)||(9458654-9458740)
chr6 (3-120)||(8320784-8320900)
chr6 (5-94)||(32959869-32959957)
chr6 (25-72)||(30986284-30986331)
chr6 (26-87)||(20610993-20611054)
chr6 (25-118)||(29199895-29199988)
chr6 (170-231)||(32052927-32052988)
chr6 (59-128)||(34346049-34346118)
chr6 (68-128)||(16405463-16405523)
chr6 (3-120)||(9402572-9402687)
chr6 (25-122)||(19366990-19367087)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (38-245)||(31942209-31942417)
chr2 (3-232)||(6027878-6028108)
chr2 (25-245)||(13705371-13705593)
chr2 (25-239)||(14540649-14540860)
chr2 (25-245)||(37106556-37106771)
chr2 (25-232)||(37999353-37999562)
chr2 (39-245)||(8915961-8916169)
chr2 (25-239)||(19104847-19105066)
chr2 (25-192)||(24414142-24414311)
chr2 (25-239)||(45256686-45256902)
chr2 (25-245)||(12193837-12194059)
chr2 (25-245)||(13830593-13830814)
chr2 (39-245)||(42798012-42798221)
chr2 (25-245)||(30846802-30847025)
chr2 (25-245)||(7314658-7314880)
chr2 (25-245)||(9632243-9632465)
chr2 (26-245)||(36128117-36128339)
chr2 (25-232)||(45115428-45115637)
chr2 (25-232)||(10208440-10208649)
chr2 (25-245)||(44746119-44746341)
chr2 (62-232)||(10920515-10920687)
chr2 (39-245)||(16226761-16226958)
chr2 (135-245)||(37472850-37472961)
chr2 (138-245)||(18106214-18106322)
chr2 (25-119)||(35248395-35248489)
chr2 (25-118)||(43371539-43371632)
chr2 (14-107)||(22900791-22900883)
chr2 (25-94)||(37472769-37472838)
chr2 (25-118)||(38342529-38342622)
chr2 (25-120)||(25210361-25210456)
chr2 (25-120)||(35965319-35965413)
chr2 (182-239)||(37319805-37319862)
chr2 (31-118)||(3547152-3547239)
chr2 (5-84)||(35409158-35409236)
chr2 (43-120)||(4961479-4961556)
chr2 (25-122)||(15546726-15546823)
chr2 (34-106)||(34214676-34214748)
chr2 (52-118)||(42576598-42576664)
chr2 (25-118)||(44057868-44057962)
chr2 (25-94)||(6164483-6164552)
chr2 (25-81)||(33175252-33175308)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (3-232)||(90467-90702)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (8-232)||(197321-197545)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (5-245)||(36012-36251)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (25-239)||(14638-14853)
[»] scaffold0519 (1 HSPs)
scaffold0519 (40-245)||(10157-10360)
[»] scaffold0189 (1 HSPs)
scaffold0189 (32-245)||(4113-4329)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (83-239)||(6269-6426)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (66-245)||(33440-33624)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (159-245)||(14290-14376)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (25-94)||(4591-4660)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (25-118)||(2954-3047)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (32-128)||(107408-107504)
[»] scaffold0182 (1 HSPs)
scaffold0182 (30-93)||(16977-17040)
[»] scaffold0902 (1 HSPs)
scaffold0902 (158-239)||(748-829)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (168-245)||(32685-32761)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (25-100)||(211367-211442)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (44-102)||(105498-105556)
scaffold0013 (44-102)||(128150-128208)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (25-86)||(67766-67827)
scaffold0008 (25-86)||(75609-75670)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 67)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 1724321 - 1724542
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1724321 ttttccccgatttcaaaacatgggtatgggacgggtaacggttatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactact 1724420  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  1724421 ttatgttgatatgtcatgttattttgttagataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatg 1724520  T
Q  224 ttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  1724521 ttaaagtgaacatattgttgga 1724542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19534539 - 19534324
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  19534539 ttttctccgattttaaaatctgggtatgggacgggtaacaggtatataggtacccacctcgaactcatacccaaacccgtcacgaatgtagaaaattatt 19534440  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  19534439 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatctaaaggagcaactaaatcaatcggtctaacaaatg 19534340  T
Q  224 ttaaagtgaacatatt 239  Q
    ||||||||| ||||||    
T  19534339 ttaaagtgagcatatt 19534324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26564914 - 26564694
Alignment:
Q  26 tttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactt 125  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  26564914 tttccccgatttcaaaacgcgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaaaccatacccaaacccgtcccaaatgcagaaaactactt 26564815  T
Q  126 tatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgt 224  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||| ||||| |||||||||    
T  26564814 tatgttgatatgtcatgttagtttgtttgataactgccgtgttataaaaactatcattgatatttaacggaacaactaaatcaatcggtcaaacaaatgt 26564715  T
Q  225 taaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  26564714 taaagtgaacatattgttgga 26564694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 6482046 - 6482262
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaat-tac 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||  ||     
T  6482046 ttttccccaatttaaaaacacgggtatgggacgagtaaagggtatatatgtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgcaaaaaaactaa 6482145  T
Q  124 tttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    |||||  |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  6482146 tttatattgatatgccatgttattttgtttgataattgtcgtgttataaaaactaacattgatatttaaaggagaaactaaatcaatcggtctaacaaat 6482245  T
Q  223 gttaaagtgaacatatt 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  6482246 gttaaagtgaacatatt 6482262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 12825449 - 12825680
Alignment:
Q  1 ttcccgttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaac 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||  |||| |||||    
T  12825449 ttcccgttttgactgagtttgggtttt-ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacggatatatacgtacccaccctgaacctatacccaaac 12825547  T
Q  101 ccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaa 199  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  12825548 ctgtcccgagtgcagaaaattactttatgttgatatatcatgttattttgtttgataattatcgtgttataaaaactaaaattgatatttaaaggagcaa 12825647  T
Q  200 ttaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtga 232  Q
     ||||||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  12825648 ctaaatcaattggtctaataaatattaaagtga 12825680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 39047036 - 39046815
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| || ||||||||| |||| | |||||||||    
T  39047036 ttttccccaatttccaaacacgggtatgggacatgtaacgggtatataggtacccactccaaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattact 39046937  T
Q  125 ttatggtgatatgtatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||  | ||||||||||||    
T  39046936 ttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccgttgatatttaaaggattaactaaatcattccgtctaacaaatg 39046837  T
Q  224 ttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||| ||| |||||| |||||    
T  39046836 ttaaaatgagcatattgttgga 39046815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Original strand, 47550364 - 47550573
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | ||||||| |    
T  47550364 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacaggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattatt 47550463  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    |||||||||||    
T  47550464 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaat 47550563  T
Q  223 gttaaagtga 232  Q
    || |||||||    
T  47550564 gtgaaagtga 47550573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 37107486 - 37107280
Alignment:
Q  34 atttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtga 133  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||    |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37107486 atttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaatttataccaaaatatatcccgaatgcagaaaattactttatgttga 37107387  T
Q  134 tatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtga 232  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||| |||||| |||||| ||||| |||    
T  37107386 tatgtcatgttattttgtttgataattgccatgttataaaaactaccattggtatttaaagaagcaactaaatcaatcggtctgacaaatattaaaatga 37107287  T
Q  233 acatatt 239  Q
     ||||||    
T  37107286 gcatatt 37107280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 48459565 - 48459343
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||| |||| | |||||||||    
T  48459565 ttttccccgatttcaaaacatgggtatggaacgggtaacaggtatataggtacccaccccgaacccatacccatacccatcccaaatgtaaaaaattact 48459466  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    |||||| ||||    
T  48459465 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaaaaaat 48459366  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    |||||||||| |||||| |||||    
T  48459365 gttaaagtgagcatattgttgga 48459343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Original strand, 5902598 - 5902847
Alignment:
Q  3 cccgttttgactgggtgtgggt-----ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacaca 97  Q
    |||||||||||||||| |||||     ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  5902598 cccgttttgactgggtttgggtatgggttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccataccca 5902697  T
Q  98 aacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaagga 195  Q
    |||||||||| |||| | |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5902698 aacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatcttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagga 5902797  T
Q  196 gtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
      || ||||| |    ||||||||||||| ||||||| | |||| |||||    
T  5902798 tcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttgga 5902847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 58 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 37349174 - 37348992
Alignment:
Q  58 ggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcata 156  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| |||    
T  37349174 ggtaatgggtatataggtatccaccctgaacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaattattttatgttgatatgccatgttattttgtttgata 37349075  T
Q  157 attgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 239  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  37349074 attctcgcgttataaaaactaccgttgatatttaaaggagcaactaaattaatcggtctaacaaatcttaaagtgagcatatt 37348992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9230385 - 9230146
Alignment:
Q  5 cgttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgt 104  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||    
T  9230385 cgttttgattgggtttgggtttttcccaaatttataa-cacgggtataggacggataacgagtatataggtatccatcccaaactcataaccaaacccgt 9230287  T
Q  105 cccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaagg--agtaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||  |    | |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |    
T  9230286 cccgaatgcagaaaattaccat----taatatgtcatgttattttgtttgataactgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggaaagcaact 9230191  T
Q  202 aaatcaaccggtctaacaaatgtt-aaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  9230190 aaatcaatcggtctaacaaatgttaaaagtgaacatattgttgga 9230146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43893311 - 43893103
Alignment:
Q  26 tttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactt 125  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||| | |||| |||||    
T  43893311 tttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtatccaccccgaattcatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactt 43893212  T
Q  126 tatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |    ||||||||||||    
T  43893211 tatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaattattttgtctaacaaatg 43893112  T
Q  224 ttaaagtga 232  Q
    | |||||||    
T  43893111 tgaaagtga 43893103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11028157 - 11027934
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg-cagaaaattac 123  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||  | ||||||||    
T  11028157 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacccaaacctgtcccaaatgtaaaaaaattac 11028058  T
Q  124 tttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaa 221  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  || |||||||    ||||||||||    
T  11028057 tttatattgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactactatttatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaa 11027958  T
Q  222 tgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||| ||||||| | |||| |||||    
T  11027957 tgtgaaagtgatcttattgttgga 11027934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32585573 - 32585363
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||| | ||| |||||    
T  32585573 ttttctccgatttcaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccctgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaacttact 32585474  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaact-accattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaa 221  Q
    ||||| | ||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||  || |||||||  | |||||||||     
T  32585473 ttatgtttatatgtcttgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaat 32585374  T
Q  222 tgttaaagtga 232  Q
    |||||||||||    
T  32585373 tgttaaagtga 32585363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 31752540 - 31752324
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| | |||||||||    
T  31752540 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacgagtaacgagtatataggttcccaccccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattact 31752441  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||| ||  || |||||||  | ||||| |||||    
T  31752440 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaacaatgatatttaaaagatcaactaaatcattccgtctatcaaat 31752341  T
Q  223 gttaaagtgaacatatt 239  Q
    |||||||||| ||||||    
T  31752340 gttaaagtgagcatatt 31752324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 6382283 - 6382506
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg-cagaaaattac 123  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||  | |||| ||     
T  6382283 ttttctccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactat 6382382  T
Q  124 tttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaa 221  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |    ||||||||||    
T  6382383 tttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaa 6382482  T
Q  222 tgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||| ||||||| | |||| |||||    
T  6382483 tgtgaaagtgagcttattgttgga 6382506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 40 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21423930 - 21423735
Alignment:
Q  40 aaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatg-t 138  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||| ||||||| |    
T  21423930 aaacacgggtatgagacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacacaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgtt 21423831  T
Q  139 atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaa 233  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |    ||||||||||||| ||||||||    
T  21423830 atattattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgaa 21423735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 7609054 - 7608832
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||    
T  7609054 ttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactact 7608955  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
     |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||  || ||||| |    |||||||||||    
T  7608954 ctatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactgtcattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaat 7608855  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    || ||||||| | |||| |||||    
T  7608854 gtgaaagtgagcttattgttgga 7608832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 232
Target Start/End: Original strand, 11122895 - 11123089
Alignment:
Q  40 aaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatg-t 138  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||||||| ||||||| |    
T  11122895 aaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgtt 11122994  T
Q  139 atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtga 232  Q
     ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||| |    ||||||||||||| |||||||    
T  11122995 ttgttattttgttttataattgtcatgttaataaaaagtaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtga 11123089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44317619 - 44317409
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg-cagaaaattac 123  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||  | |||| |||    
T  44317619 ttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactac 44317520  T
Q  124 tttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaa 221  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||| |    ||||||||||    
T  44317519 tttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactacgattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaa 44317420  T
Q  222 tgttaaagtga 232  Q
    ||| |||||||    
T  44317419 tgtgaaagtga 44317409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 7985136 - 7985348
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| | ||||  ||||    |||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |    
T  7985136 ttttctccgatttcaaaacatgggtatgggacggataacatgtat----gtactcatcccgaacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaagtatt 7985231  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaa-ctaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  7985232 ttatgttgataagtcatgttattttgtttgataattgtcgtgttataaaaaactaccgttgatatttaaatgagcaactaaatcaattggtctaacaaat 7985331  T
Q  223 gttaaagtgaacatatt 239  Q
    ||||||||||| |||||    
T  7985332 gttaaagtgaaaatatt 7985348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Original strand, 32596177 - 32596410
Alignment:
Q  6 gttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtc 105  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||  |||    
T  32596177 gttttgaatgggt-tggggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtccccacctcaaactcatacccaaacttgtc 32596275  T
Q  106 ccgaatgcagaaaattactttatggtgatat-gtatgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaa 204  Q
     |||||| ||||||||| |||||| ||||||   |||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||    
T  32596276 tcgaatgtagaaaattattttatgttgatataccatgtcatttggtttgataattgtcatgttataaaaactagcattaatatttgaaggaacaactaaa 32596375  T
Q  205 tcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 239  Q
    |||    ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  32596376 tcattaagtctaacaaattttaaagtgagcatatt 32596410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 42299872 - 42299653
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||| |||  | |||| ||||    
T  42299872 ttttccccgatttcaaaacacgg-tatgg-acgggtaacgggtatataggtacccaccctgaacccatactcaaacacgtcccaaatata-aaaagtact 42299776  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| || ||||||| ||  ||||||||||    
T  42299775 ttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgtcttgttaataaaaactactgttgatatttaaatgagcaactaaatcatcctctctaacaaat 42299676  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  42299675 gttaaagtgaacatattgttgga 42299653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 31918569 - 31918792
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg-cagaaaattac 123  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||  | |||| |||    
T  31918569 ttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgagtaatgggtatatagttacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactac 31918668  T
Q  124 tttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaa 221  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |    ||||||||||    
T  31918669 tttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaa 31918768  T
Q  222 tgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||| ||||||| | |||| |||||    
T  31918769 tgtgaaagtgagcttattgttgga 31918792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 195
Target Start/End: Original strand, 47239402 - 47239568
Alignment:
Q  31 ccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatgg 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || ||| ||||| |||| | ||||||| ||||||     
T  47239402 ccgattttaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggttcccaccctgaacccatacccatacctgtcccaaatgtaaaaaattattttatgt 47239501  T
Q  131 tgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaagga 195  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  47239502 tgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaagga 47239568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 77 - 245
Target Start/End: Original strand, 13770518 - 13770687
Alignment:
Q  77 cccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaac 175  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||| | ||| |  |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  13770518 cccaccccgaactcatactcaaacccgtcccgaatgcataaaactattttatgttaataagccatgttattttgtttgataattaccgtgttataaaaac 13770617  T
Q  176 taccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
     |||||| |||||| |||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13770618 gaccattaatatttgaaggagcaactaaatcaatcggtcaaacaaatgttaaagtgaacatattgttgga 13770687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 195
Target Start/End: Original strand, 55826634 - 55826807
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg-cagaaaattac 123  Q
    ||||||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||  | |||| |||    
T  55826634 ttttccccgatctcgaaacacaggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatatccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactac 55826733  T
Q  124 tttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaagga 195  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55826734 tttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcacgttaataaaaactaccattgatatttaaagga 55826807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 39188616 - 39188379
Alignment:
Q  6 gttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacagg-taacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgt 104  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||  ||||| || || |||||| |||||||||||| ||||| ||| |||   ||||| | |    
T  39188616 gttttgattgggtttgggtttt-ccctgattttaaaacacgtctatggaacggggtaacggatatataggtacc-accccaaacccatgtccaaactcat 39188519  T
Q  105 cccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaa 203  Q
    |||||||||| ||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  || |||    
T  39188518 cccgaatgcataaaattgttttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataactgtcgtgtta-aaaaactaccatttatatttaaagaaaaaactaa 39188420  T
Q  204 atcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgg 244  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39188419 atcaatcgttctaacaaatgttaaagtgaacatattgttgg 39188379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 114 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 425818 - 425692
Alignment:
Q  114 agaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccgg 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||| |||    
T  425818 agaaaattactttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgtcatgttataaaaactaccattgatatttaaaagaacaactaaatcaatcgg 425719  T
Q  213 tctaacaaatgttaaagtgaacatatt 239  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  425718 tctaacaaatcttaaagtgaacatatt 425692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 39375362 - 39375192
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgc-agaaaattac 123  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| | | ||||| |||||||||||| | ||| | ||||||||    
T  39375362 ttttccccgatttcaaaatacgggtataggacgggtaacgggtatatagatatccaccccaatcacatactcaaacccgtcccaattgcaaaaaaattac 39375263  T
Q  124 tttatggtgatatgtatgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaagga 195  Q
    |||| | |||| |  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  39375262 tttacgttgatgt-catgttattttgtttgataattgccgtgttataaaaactaccactaatatttaaagga 39375192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 42774771 - 42774623
Alignment:
Q  99 acccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaaggag 196  Q
    ||||||||  |||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  42774771 acccgtccaaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggat 42774672  T
Q  197 taattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
     || |||||||  |  |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  42774671 caactaaatcattccttctaacaaatgttaaaatgaacatattgttgga 42774623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 228
Target Start/End: Original strand, 28695194 - 28695357
Alignment:
Q  66 gtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgta-tgttattttgtttcataattgtcgt 164  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| | |||  || ||||| ||||||| ||||||| | ||||||||| ||| |||||||||      
T  28695194 gtatataggtactcaccccgaactcatacccaaactcgtctcaaatataggaaattgctttatgttgatatgcaatgttattttatttgataattgtcac 28695293  T
Q  165 gttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaa 228  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||  |||| ||||||||||||||    
T  28695294 gttataaaaactatcattaatatttaaaggagcaactaaatcattcggtttaacaaatgttaaa 28695357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 245
Target Start/End: Original strand, 29755456 - 29755562
Alignment:
Q  139 atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatat 238  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||  ||||    
T  29755456 atgttattttgtttgataattaccgtgttataaacactaccattgatatttaaagaagtaactaaatcaatcgatctaacaaatgttaaaatgagtatat 29755555  T
Q  239 tcttgga 245  Q
    | |||||    
T  29755556 tgttgga 29755562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 107
Target Start/End: Original strand, 15987273 - 15987355
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtccc 107  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15987273 ttttcccagattttaaaacacgggtatgggatgggtaacgggtatatagatacccaccccgaacccatacccaaacccgtccc 15987355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 31782713 - 31782604
Alignment:
Q  8 tttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtccc 107  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||     
T  31782713 tttgactgggtttgggtttt-ccccgatttcaaaatacgggtacggtacaggtaacggggatatatgtacccaccccaaactcatacccaaaccttacct 31782615  T
Q  108 gaatgcagaaa 118  Q
    |||||||||||    
T  31782614 gaatgcagaaa 31782604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 25941226 - 25941147
Alignment:
Q  20 tgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaac 100  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  25941226 tgggtttttccc-gatttcaaaacacgggtacgggacaggtaacgggaagataggtacccaccccgaacccatacccaaac 25941147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 112
Target Start/End: Original strand, 19883067 - 19883154
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  19883067 ttttccccgattttaaaacacggatacgggaagggtaacggggatataggtatccaccccgaaccgatacacaaactcgtcccgaatg 19883154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 90 - 196
Target Start/End: Original strand, 13015327 - 13015440
Alignment:
Q  90 catacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcata------attgtcgtgttataaaaactaccatt 182  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||      ||| || |||||||||||||||||||    
T  13015327 catactcaaacccgtctcgaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattttcattttcatgttataaaaactaccatt 13015426  T
Q  183 gatatttaaaggag 196  Q
    ||||||||||||||    
T  13015427 gatatttaaaggag 13015440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 245
Target Start/End: Original strand, 4766419 - 4766546
Alignment:
Q  121 tactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttat--aaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaa 217  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||  || |||||||     |||||    
T  4766419 tactttatgttgatatgttatgttattttatttgataattgtcatgttaataaaaaactatcattgatatttaaaggataaactaaatcattacctctaa 4766518  T
Q  218 caaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  4766519 caaatgttaaagtaaacatattgttgga 4766546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 112
Target Start/End: Original strand, 4741227 - 4741314
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg 112  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||||||| | |||| || ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  4741227 ttttcctcgattttaaaacatgggtatgggacggataacagggatataagtacccaccccgaacccatacaaaaacccgttccgaatg 4741314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 227
Target Start/End: Original strand, 15987372 - 15987455
Alignment:
Q  145 ttttgtttcataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaa 227  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  | ||||||||||||||||    
T  15987372 ttttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaa 15987455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 21544679 - 21544586
Alignment:
Q  8 tttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaaccc 102  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21544679 tttgattgggtttggatttttccc-gatttcaaaatacgggtacgggacaggtaatggggatatatgtacccaccccgaacccatacccaaaccc 21544586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 10302168 - 10302067
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| || | ||||||| |||| | |||||||||    
T  10302168 ttttccccgatttcaaagtacgggtatgagacgggtaacggggttatatgtacccaccccgaacccatacccatatccgtcccaaatgtaaaaaattact 10302069  T
Q  125 tt 126  Q
    ||    
T  10302068 tt 10302067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 118
Target Start/End: Original strand, 10574430 - 10574523
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaa 118  Q
    ||||||||||||| | || || |||| ||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||    
T  10574430 ttttccccgatttcataatacaggtacgggacgggtaacggggatatatgtacccgccccgaactcatacccaaaccctacccgaatgtagaaa 10574523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 29527896 - 29527819
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaaccc 102  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  29527896 ttttccccgatttcaaaatacgggtacgtgacgggtaacggggatatatgtacccaccccgaacccatacccaaaccc 29527819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 8843816 - 8843918
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||  ||||| |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| |    
T  8843816 tttttcccgattttaaaacacaggtgcgggacgggtagcggggatatagatacccaccc-gaactcatacccaaacccgtcgtgaatgtagaaaattaat 8843914  T
Q  125 ttat 128  Q
    ||||    
T  8843915 ttat 8843918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 8856780 - 8856882
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||  ||||| |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| |    
T  8856780 tttttcccgattttaaaacacaggtgcgggacgggtagcggggatatagatacccaccc-gaactcatacccaaacccgtcgtgaatgtagaaaattaat 8856878  T
Q  125 ttat 128  Q
    ||||    
T  8856879 ttat 8856882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 36306869 - 36306774
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaat 120  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||| | ||||||   | || ||||||||||||||||| |||||||    
T  36306869 ttttctccgatttcaaaacacgggtatgagacggttaacggggatataggtacctaacccgaagctacactcaaacccgtcccgaatgtagaaaat 36306774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 42907970 - 42907875
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaat 120  Q
    ||||| |||| || ||||||||| || |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  42907970 ttttctccgaattcaaaacacggatacgggacgagtaatggggatataggtacccaccccgagcccatacccaaactcgtcccgaatgtagaaaat 42907875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 104
Target Start/End: Original strand, 25298828 - 25298923
Alignment:
Q  8 tttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgt 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  25298828 tttgactgggtttgggtttttccg-gatttcaaaacacgggtacgggatgggtaatggggatatagctgtccaccccgaacccatacccaaacccgt 25298923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 58 - 138
Target Start/End: Original strand, 53906349 - 53906429
Alignment:
Q  58 ggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt 138  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||   |||| |||||| |||| | |||||||||| ||| ||||||||    
T  53906349 ggtaacaggtatataggtacccaccccgaacccatatctaaactcgtcccaaatgtaaaaaattacttcatgttgatatgt 53906429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 47103822 - 47103735
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg 112  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||| ||| | ||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||    
T  47103822 ttttccccaatttcaaaatacgggtacggggcgggtaacgcggatatatgtacccaccccgaacccatacccaaaccctacccgaatg 47103735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 102
Target Start/End: Original strand, 15733537 - 15733614
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaaccc 102  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||| | ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15733537 ttttcctcgatttcaaaatacgggtacgagacgggtaacggagatatatgtacccaccccgaactcgtactcaaaccc 15733614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 120
Target Start/End: Original strand, 21956831 - 21956920
Alignment:
Q  31 ccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaat 120  Q
    ||||||| |||||||||||| || |   |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||  |||||| |||||||    
T  21956831 ccgattttaaaacacgggtacggaatgagtaacggggatataggtgcccaccccgaacccatacccaaactcgttacgaatgtagaaaat 21956920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 245
Target Start/End: Original strand, 53906437 - 53906514
Alignment:
Q  168 ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||  || |||||||  |  |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  53906437 ataaaaactactattgatatttaatggatcaactaaatcattccttctaacaaatgttaaagtgaacgtattgttgga 53906514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 11173078 - 11173020
Alignment:
Q  3 cccgttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaa 62  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  11173078 cccgatttgactgggtttgggtttt-ccccgatttcaaaatacgggtacgggacaggtaa 11173020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 100
Target Start/End: Original strand, 14605936 - 14606011
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaac 100  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||| | ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14605936 ttttctccgatttcaaaatacgggtacgagacgggtaacagggatatatgtacccaccccgaacccatacccaaac 14606011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 80
Target Start/End: Original strand, 33615340 - 33615395
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtaccca 80  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  33615340 ttttcctcgatttaataaaacaggtatgggacgggtaacggggatataggtaccca 33615395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 120
Target Start/End: Original strand, 12075651 - 12075737
Alignment:
Q  34 atttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaat 120  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||  || | ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  12075651 atttcaaaacacgggtacgtgacaggtaatagggagatatgtacccaccccaaactcgtactcaaactcgtccggaatgtagaaaat 12075737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 102
Target Start/End: Original strand, 30266325 - 30266418
Alignment:
Q  8 tttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaaccc 102  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || ||||| | || |||||||  |||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  30266325 tttgactgggtttggtttttttcc-gatttcataatacgggtacaggacgggtaacggggatatatgtatccaccccgaacccatacccaaaccc 30266418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 30285863 - 30285770
Alignment:
Q  8 tttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaaccc 102  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || ||||| | || |||||||  |||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  30285863 tttgactgggtttggtttttttcc-gatttcataatacgggtacaggacgggtaacggggatatatgtatccaccccgaacccatacccaaaccc 30285770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 43309571 - 43309526
Alignment:
Q  20 tgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacggg 66  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  43309571 tgggtttttccc-gatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacggg 43309526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 3737860 - 3737791
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatac 94  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| ||||||| |||||    
T  3737860 tttttcccaatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgaggttatatgtacccatcccgaacccatac 3737791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 105
Target Start/End: Original strand, 33516082 - 33516163
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaa-acacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtc 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||  |||||| || ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  33516082 ttttctccgatttaaaaaacacgggtacgagatgggtaacagggatataagtacccaccccgaacctatacccaaacccgtc 33516163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 100
Target Start/End: Original strand, 9280943 - 9280975
Alignment:
Q  68 atataggtacccaccccgaactcatacacaaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9280943 atataggtacccaccccgaactcatactcaaac 9280975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 100
Target Start/End: Original strand, 35304554 - 35304602
Alignment:
Q  52 gggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaac 100  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  35304554 gggacgggtaacggggatataggtacctaccccaaactcatacccaaac 35304602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 49)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17469354 - 17469112
Alignment:
Q  3 cccgttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaaccc 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  17469354 cccgttttgactgggtttgggtttt-ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaaccc 17469256  T
Q  103 gtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaatt 201  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |    
T  17469255 gtcccaactgcagaaaactactttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgccttgttataaaagctaccattgatatttaaaggagaaact 17469156  T
Q  202 aaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    |||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  17469155 aaatcaatgggtctaaaaaattttaaagtgaacatattgttgga 17469112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 34139525 - 34139304
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaa-ttac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  34139525 ttttccccgatttaaaaacacggatataggacatgtaacaggtatataggtacccaccccgaac-catacccaaacccgtcccgaatgcaaaaaaattac 34139427  T
Q  124 tttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    |||||| |||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  34139426 tttatgttgatagaccatgttattttgtttgataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaaacaaatcaatcggtctaacaaat 34139327  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  34139326 gttaaagtgaacatattgttgga 34139304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24569016 - 24568796
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    |||| |||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  24569016 tttttcccgatttcacaacatgggtatgggacaggtagcgggtatataggtatccaccccgaacccatactcaaatccgtcccgaatggagaaaactact 24568917  T
Q  125 ttatggtgatatgtatgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgt 224  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||    
T  24568916 ttatgttgatatgtcagttattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatgt 24568817  T
Q  225 taaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  24568816 taaagtgaacatattgttgga 24568796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 43113632 - 43113845
Alignment:
Q  20 tgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaa 119  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  43113632 tgggtttttccc-gatttcaaaacacgggcatgggacgggtaacaggtatataggtacccaccccgaactcatacccaaatccgtctcgaatgcagaaaa 43113730  T
Q  120 ttactttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaac 218  Q
     ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||| |||| ||||    
T  43113731 ctacttcatgttgatatgttatgttattttgttagataattgtcgtgttataaaaactatcattgatatttgaaggagcaactaaatcaatcggtataac 43113830  T
Q  219 aaatgttaaagtgaa 233  Q
    |||||||||||||||    
T  43113831 aaatgttaaagtgaa 43113845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1012696 - 1012474
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaat--ta 122  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||   ||    
T  1012696 ttttccccgatttaaaa-catgagtatgggacgggtaatgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaactcgtcccgaatgcaaaaaaaacta 1012598  T
Q  123 ctttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaa 221  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  1012597 ctttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgctgtgttataaaaagtaccattgatatttaaaggagcaactaaatcaatcggtctaacaaa 1012498  T
Q  222 tgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  1012497 tgttaaagtgaacatattgttgga 1012474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 45236143 - 45235921
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||| |||| | ||||||| |    
T  45236143 ttttccctgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaatgggtatataggtacccaccccgaacccatatccatacccgtcccaaatgtaaaaaattaat 45236044  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  | |||||||||||    
T  45236043 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattatcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaat 45235944  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  45235943 gttaaagtgaacatattgttgga 45235921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20399670 - 20399461
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  20399670 ttttctccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatagatacccaccccgaacccattcccaaacccgtcccgaatgcaaaaaattatt 20399571  T
Q  125 ttatggtgatat-gtatgttattttgttt-cataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||||||   |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||||||    
T  20399570 ttatgttgatataccatgttattttttttatataattgtcgtgttataaaaactagcattgatatttaaaggaccaaccaaatcaatcggtctaacaaat 20399471  T
Q  223 gttaaagtga 232  Q
    ||||||||||    
T  20399470 gttaaagtga 20399461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Original strand, 24870034 - 24870242
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||| |||| | |||||||||    
T  24870034 ttttccccgattttaaaacacgggtatgtgacgggtaacgggtatataggtacccaccccgagcccatacctaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 24870133  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||  || |||||||  | ||||||||||||    
T  24870134 ttatgttgatatgtcatgttaatttgtttgataattgtcatgttaataaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatg 24870233  T
Q  224 ttaaagtga 232  Q
    |||||||||    
T  24870234 ttaaagtga 24870242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 29108822 - 29109048
Alignment:
Q  14 tgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgc 113  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||     
T  29108822 tgggtatgggtttttccc-gattttaaaacatgggtatgggacgggtaacgggtatatatgtacccaccccgaacccatacccatacccgtcccaaatgt 29108920  T
Q  114 agaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccg 211  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||        
T  29108921 aaaaaattactttatgttgatatgtcatattattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttgaaggatcaattaaatcattac 29109020  T
Q  212 gtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29109021 gtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 29109048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27932491 - 27932282
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| |||| | ||||||| |    
T  27932491 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgagtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatactcatatccgtcccaaatgtaaaaaattatt 27932392  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    |||||||||||    
T  27932391 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaattaaatcattacgtctaacaaat 27932292  T
Q  223 gttaaagtga 232  Q
    ||||||||||    
T  27932291 gttaaagtga 27932282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1063595 - 1063369
Alignment:
Q  14 tgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgc 113  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||| | ||     
T  1063595 tgggtatgggtttttccc-gatttcaaaacacgggtatgggacggttaacgggtatataagtacccaccccgaactcatacccaaatccatcccaagtgt 1063497  T
Q  114 agaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccg 211  Q
    | |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||  || |||||||  |     
T  1063496 aaaaaattactttatgttgatatgtcttgttattttgtttgataattgtcatgttgataaaaattaccattgatatttaaacgatcaactaaatcattcc 1063397  T
Q  212 gtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1063396 gtctaacaaatgttaaagtgaacgtatt 1063369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Original strand, 36131907 - 36132141
Alignment:
Q  4 ccgttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccg 103  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| |||| |||| |||||||| ||||||||  ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  36131907 ccgttttgattgggtttgagtttt-cccctatttcaaaacacgagtatgggatgggtaaagggcatacaggtatccaccccgaactcatacacaaatccg 36132005  T
Q  104 tcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaatta 202  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||| || |||||    
T  36132006 tcccgaatgcagaaagttattttat-gttatatgtcatgttattttgtttgataattgccgtgttataaaaattaccattaaaatttaaagaagcaatta 36132104  T
Q  203 aatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 239  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  36132105 aattaatcggtcaaacaaatgttaaaatgagcatatt 36132141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32303139 - 32302916
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg-cagaaaattac 123  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||  | |||| ||     
T  32303139 ttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactat 32303040  T
Q  124 tttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaa 221  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |    ||||||||||    
T  32303039 tttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaa 32302940  T
Q  222 tgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||| ||||||| | |||| |||||    
T  32302939 tgtgaaagtgagcttattgttgga 32302916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 39445576 - 39445799
Alignment:
Q  14 tgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgc 113  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||     
T  39445576 tgggtatgggtttttccc-gatttcaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtttataggtacccaccccgaactcatacccatacccgtcccaaatgt 39445674  T
Q  114 agaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccg 211  Q
    | |||        |||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||  |     
T  39445675 aaaaa--------atgtagatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatattt-aatgatcaattaaatcattcc 39445765  T
Q  212 gtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  39445766 gtctaacaaatgttaaagtgagcatattgttgga 39445799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14186418 - 14186205
Alignment:
Q  4 ccgttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccg 103  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||| | ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||    
T  14186418 ccgttttgattgggtttgagtttttctc-gatttcaaaacacgggtatgggatgggtaacggatatataggtactcaccctgaacccatacccaaacccg 14186320  T
Q  104 tcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaatta 202  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14186319 tcctgaatgtagaaaattaatttatgttaatatgccatgttattttgtttgataacagtcgtgtt----aaactaccattgatatttaaaggagtaacta 14186224  T
Q  203 aatcaaccggtctaacaaa 221  Q
    ||||||  |||||||||||    
T  14186223 aatcaattggtctaacaaa 14186205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24928012 - 24927855
Alignment:
Q  40 aaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatg-t 138  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||| |||||||||  |||||| |    
T  24928012 aaacacgggtatgagacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgtggatatgtt 24927913  T
Q  139 atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaagga 195  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24927912 atgttattttgtttgataattgtcatcttaataaaaactaccattgatatttaaagga 24927855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 245
Target Start/End: Original strand, 11255033 - 11255236
Alignment:
Q  40 aaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgta 139  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||| |||| | ||||||||||| || |||||||||    
T  11255033 aaacacgggtatgggacggataacaggtatataggtacccactacgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttgtgttgatatgta 11255132  T
Q  140 tgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatat 238  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||   |  ||||||||||  || |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  11255133 tgttattttgtttgataattgtcatattaataaaaactacc---gtcatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatat 11255229  T
Q  239 tcttgga 245  Q
    | |||||    
T  11255230 tgttgga 11255236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17220790 - 17220579
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  | | | || |||||||||||||||||||||| |     || ||||||||| |||| | || ||||||    
T  17220790 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggatggatgatggttatataggtacccaccccgaaccc-----catacccgtcccaaatgtaaaagattact 17220696  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    |||||||||||    
T  17220695 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttgaaggatcaattaaatcattacgtctaacaaat 17220596  T
Q  223 gttaaagtgaacatatt 239  Q
    |||||||||| ||||||    
T  17220595 gttaaagtgagcatatt 17220579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 34021554 - 34021341
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    |||||| |||||| |||| |||| ||||| ||  ||||| || |||||||||| |||||| |||  ||||||| || ||||| ||||||||||||| | |    
T  34021554 ttttccacgattttaaaatacggatatggaacgagtaacaggaatataggtacacaccccaaaccaatacacagactcgtcctgaatgcagaaaatca-t 34021456  T
Q  125 ttatggtgatatgtatgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgt 224  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||    ||||||||||||    
T  34021455 ttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgtcattatataaaaactactattgatatttaaaggagcaacgaaatcaattaatctaacaaatgt 34021356  T
Q  225 taaagtgaacatatt 239  Q
    |||||||| ||||||    
T  34021355 taaagtgagcatatt 34021341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 34777173 - 34776972
Alignment:
Q  1 ttcccgttttgactgggtgtgggt-----ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcataca 95  Q
    |||||||||||||||||| |||||     |||| |||||| | ||||||||||||||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  34777173 ttcccgttttgactgggtttgggtatgggtttttcccgatctcaaaacacgggtatggaacgagtaacaggtatttaggtacccaccccgaacccatacc 34777074  T
Q  96 caaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaag 193  Q
    |||| || |||| |||| | ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34777073 caaatccatcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgcaatgttaataaaaactaccattgatatttaaag 34776974  T
Q  194 ga 195  Q
    ||    
T  34776973 ga 34776972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 35215467 - 35215367
Alignment:
Q  139 atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatat 238  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35215467 atgttattttgtttgataattgtcgtgttataaaaactacccttgatatttaatggagcaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgaacatat 35215368  T
Q  239 t 239  Q
    |    
T  35215367 t 35215367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 112
Target Start/End: Original strand, 37960972 - 37961059
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37960972 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacaggtatataggtacacaccccgaactcatacccaaacccgtcccaaatg 37961059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 245
Target Start/End: Original strand, 2075909 - 2076066
Alignment:
Q  90 catacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatat 187  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  2075909 catacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatat 2076008  T
Q  188 ttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||  || |||||||    ||||||||||||| ||||||| | |||| |||||    
T  2076009 ttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttgga 2076066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 4230740 - 4230951
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||           ||| |||||||||||| |||| | |||||||||    
T  4230740 ttttccccgatctcaaaacacaggtatgggacgagtaacgggtatataggtaccca-----------tacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 4230828  T
Q  125 ttatggtgata-tgtatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||    |||||||||||    
T  4230829 ttatgttgatacattatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaat 4230928  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    || ||||||| | |||| |||||    
T  4230929 gtaaaagtgagcttattgttgga 4230951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 138
Target Start/End: Original strand, 40248381 - 40248494
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || | ||||||| |||| | |||||||||    
T  40248381 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacggataacgggtatataggtacccatcccgaacccatacccatatccgtcccaaatgtaaaaaattact 40248480  T
Q  125 ttatggtgatatgt 138  Q
    ||||| ||||||||    
T  40248481 ttatgttgatatgt 40248494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 245
Target Start/End: Original strand, 28977195 - 28977346
Alignment:
Q  96 caaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaag 193  Q
    |||||||||||| |||| | |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  28977195 caaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaat 28977294  T
Q  194 gagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||  || ||||| |    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  28977295 gatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgaacttattgttgga 28977346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29089677 - 29089567
Alignment:
Q  134 tatgtatgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaa 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||| ||||||| ||    
T  29089677 tatgtatgttattttgtttgataattattgtgttattaaaactatcattgatatttaaaggagcaactaaattaatgggtctaacaaat-ttaaagtaaa 29089579  T
Q  234 catattcttgga 245  Q
    |||||| |||||    
T  29089578 catattgttgga 29089567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 120
Target Start/End: Original strand, 8545359 - 8545454
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaat 120  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||    
T  8545359 ttttctccgatttcaaaacacgggtatggaacgagtaacggggatatagatacccaccccgaacccatactcaaactcgtcccaaatgtagaaaat 8545454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 9642340 - 9642458
Alignment:
Q  3 cccgttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaaccc 102  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||  || ||| ||||||| ||||| || ||||    
T  9642340 cccgctttgactgggtttgggtttt-ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacggggttatatatatccatcccgaacccatactcataccc 9642438  T
Q  103 gtcccgaatgcagaaaatta 122  Q
    ||||| |||| | |||||||    
T  9642439 gtcccaaatgtaaaaaatta 9642458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 5700454 - 5700337
Alignment:
Q  4 ccgttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccg 103  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||     
T  5700454 ccgttttgactgggtttaagttttt-cccgatttcaaaacacaggtatgagactggtaacggggatatagatacccacctcgaacccatacccaaatcca 5700356  T
Q  104 tcccgaatgcagaaaatta 122  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  5700355 tcccgaatgtataaaatta 5700337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 112
Target Start/End: Original strand, 17084117 - 17084204
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg 112  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||    
T  17084117 ttttctccgattttaaaacacgggtacgagacgggtaacggggatatagatacccaccccgaactcatatccaaacccatcacgaatg 17084204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 118
Target Start/End: Original strand, 15068598 - 15068690
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaa 118  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |||||    
T  15068598 ttttccccgatttcaaaatacgggtacgggacaggtaacggg-atatatgtatccaccccgaacccatacccgaaccctacccgaatgtagaaa 15068690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 168 - 245
Target Start/End: Original strand, 40248502 - 40248579
Alignment:
Q  168 ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  | |||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  40248502 ataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattcagtctaacaaatgttaaagtgagaatattgttgga 40248579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 2075915 - 2075867
Alignment:
Q  46 gggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatac 94  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2075915 gggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatac 2075867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Original strand, 27056555 - 27056666
Alignment:
Q  14 tgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgc 113  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||  || |||||||||| |||||||||  ||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||     
T  27056555 tgggtttgggtttttccc-gatttcaaagtacaggtatgggacgggtaacggggttatatctacccaccccgaacccatacacatactcgtcccaaatgt 27056653  T
Q  114 agaaaattacttt 126  Q
    | |||||||||||    
T  27056654 aaaaaattacttt 27056666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 35215609 - 35215549
Alignment:
Q  30 cccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactc 90  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  35215609 cccgatttcaaaacacgggtatgagacgggtaacgagtatataggtacccaccccaaactc 35215549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 69
Target Start/End: Original strand, 5858652 - 5858706
Alignment:
Q  14 tgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtat 69  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5858652 tgggtttgggtttttccc-gatttaaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtat 5858706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 118
Target Start/End: Original strand, 2183616 - 2183709
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaa 118  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||| | || |||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||    
T  2183616 ttttctccgatttcaaaatacgggtacgagagaggtaatggagatatatgtacccaccccgaactcatactcaaaccctacccgaatgtagaaa 2183709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 14687477 - 14687390
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg 112  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | ||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  14687477 ttttccccgatttcaaaacacaggtatgggacgagaaacagggatatatgtatccaccccgaacccatacccaaactcgtcctgaatg 14687390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 100
Target Start/End: Original strand, 27777208 - 27777283
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaac 100  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27777208 tttttcccgatttcaaaacacaggtacgggacaggtaacagagatacaggtacccaccccgaacccatacccaaac 27777283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 127
Target Start/End: Original strand, 30481474 - 30481533
Alignment:
Q  68 atataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattacttta 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||||||| ||||    
T  30481474 atataggtacccaccccgaacccatacccaaactcgtcccgaatgtaaaaaattaattta 30481533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 10297536 - 10297467
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatac 94  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| |||||    
T  10297536 ttttccccgatttcaaaatacggggacgggacaggtaacggggatatatgtacctaccctgaacccatac 10297467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 120
Target Start/End: Original strand, 12468229 - 12468323
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaat 120  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||| | |||| |||| ||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||||    
T  12468229 ttttcctcgatttcgaaacacgggtacgagacatgtaatggg-atgtaggtaccaaccccgaactcatactcaaattcgttccgaatgtagaaaat 12468323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 28345569 - 28345474
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaat 120  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||  |||  ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||| |||||||    
T  28345569 ttttacccgattccaaaacacgggtacaggatgggtaacgaggatataggcacccaccccgaacccatacccaaacttgtcctgaatgtagaaaat 28345474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 112
Target Start/End: Original strand, 39379581 - 39379676
Alignment:
Q  14 tgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg 112  Q
    ||||| ||||||||  |||||| | |||||||||||| ||||| ||||| | | ||| | |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  39379581 tgggtatgggtttt--cccgatctcaaaacacgggtacgggacgggtaatgaggataaaagtacccaccc-gaactcatactcaaactcgtcccgaatg 39379676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 30904123 - 30904029
Alignment:
Q  26 tttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaat 120  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| | ||| ||||| ||  ||||| |||||||||||  || ||||| |||| | |||||||||| |||||||    
T  30904123 tttcctcgatttcaaaacacgggtacgagacgggtaatggagatataagtacccaccccatacccatacccaaatcagtcccgaatgtagaaaat 30904029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 80
Target Start/End: Original strand, 6388528 - 6388581
Alignment:
Q  27 ttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtaccca 80  Q
    ||||||||||| ||||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6388528 ttccccgattttaaaacacgggtacaagacgggtaacggggatataggtaccca 6388581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 121
Target Start/End: Original strand, 15173890 - 15173986
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaatt 121  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||| ||||| |||||  |  ||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||   |||||||| ||||||||    
T  15173890 tttttcccgatttcaaaatacgggtacgggacgggtaaatgagatatatgtatccacctcgaactcatactcaaaccgtacccgaatgtagaaaatt 15173986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 29918642 - 29918598
Alignment:
Q  68 atataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg 112  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  29918642 atatatgtacccaccccgaaaccatacacaaacccgtcccaaatg 29918598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 71)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5377168 - 5376945
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  5377168 ttttccccgatttcaaaacacaggtatgggacgggtaaagggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaatctgtcccgaatgcagaaaattact 5377069  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    ||||| |||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||    
T  5377068 ttatgttgatatatcatgtaattttgtttgataattgtcgtgttataaaaactaccaatgatatttaaaggagcaactaaatcaatcggtttaacaaatg 5376969  T
Q  224 ttaaagtgaacatattcttggaca 247  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||    
T  5376968 ttaaaatgagcatattgttggaca 5376945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 27850336 - 27850556
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27850336 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtgtataggtacccatcccgaacccatacccaaacccgtcccgaatgtagaaaattact 27850435  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    ||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  27850436 ttacgatgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcgtgttataaaaactttcattgatatttaaaggagcaactaaatcaatcgatctaacaaatg 27850535  T
Q  224 ttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||| ||| |||||| |||||    
T  27850536 ttaaa-tgagcatattgttgga 27850556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12980460 - 12980238
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaat-tac 123  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||  ||     
T  12980460 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaatgggtatataagtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgcaaaaaaaatat 12980361  T
Q  124 tttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  12980360 tttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattttcgtgttataaaaactatcattgatatttaaaggagcaactaaatcaatcggtctaacaaat 12980261  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  12980260 gttaaagtgaacatattgttgga 12980238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 18825882 - 18826103
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| ||| |||||||||| |    
T  18825882 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccgtacccaaacccatcccaaatacagaaaattatt 18825981  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    ||| | |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  || |||||||| ||||||||||||||    
T  18825982 ttacgttgatatgccatgttattttgtttgataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatataaaagaacaactaaatcaatcggtctaacaaatg 18826081  T
Q  224 ttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||| |||||| |||||    
T  18826082 ttaaagtgagcatattattgga 18826103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3920644 - 3920417
Alignment:
Q  1 ttcccgttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  3920644 ttcccgttttgactgggtttgggtttt-ccccgatttcaaaacactggtatgggacggataacaggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaaa 3920546  T
Q  101 ccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaa 199  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  3920545 ctgtcccgaatgtagaaaattattttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgccatgttataaaaactaccattgatatttaaaggaacaa 3920446  T
Q  200 ttaaatcaaccggtctaacaaatgttaaa 228  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||    
T  3920445 ctaaatgaatcggtctaacaaatgttaaa 3920417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 2630584 - 2630805
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaat-tac 123  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  2630584 ttttccccgatttaaaa-catgggtatgggacgggtgacgggtatatagatacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccgaatgcaaaaaaactac 2630682  T
Q  124 tttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||| |||||    
T  2630683 tttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgccgtattataaaaactaccattgatatttaaatgagcaactaaatcaatcggtctatcaaat 2630782  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  2630783 gttaaagtgaacatattgttgga 2630805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16079096 - 16078875
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||| ||||| ||||  |||| ||||||||||||    
T  16079096 ttttctccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtgcccaccccaaacctatacccaaactcgtcatgaatacagaaaattact 16078997  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    ||| | |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  16078996 ttacgttgatatgccatgttattttgtttgataattgtcgtgttataaaaactacccttgatatttaaaggagaaactaaatcaatcggtctaaaaaatg 16078897  T
Q  224 ttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  16078896 ttaaagtgaacatattgttgga 16078875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26623055 - 26622834
Alignment:
Q  3 cccgttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaaccc 102  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  26623055 cccgttttgagtgggtttgggtttt-ccctgatttcaaaacacgggtatgggatgggtaatgggtatataagtacccaccccgaacccatacccaaactc 26622957  T
Q  103 gtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaatt 201  Q
    ||  |||||||| ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26622956 gtttcgaatgcaaaaaattattttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgttgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagcaatt 26622857  T
Q  202 aaatcaaccggtctaacaaatgt 224  Q
    |||||||  |||| |||||||||    
T  26622856 aaatcaattggtcaaacaaatgt 26622834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 232
Target Start/End: Original strand, 46127198 - 46127398
Alignment:
Q  30 cccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatg 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  46127198 cccgatttaaaatcacgggtatgggacggataacaggtgtataggtacccacaccgatctcatactcaaacccgtcccaaatgcagaaaattattttatg 46127297  T
Q  130 gtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaa 228  Q
       |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  46127298 ---atatgtcatgttattttgtttgatcattgtcgtgttataataactaccattgatatttaaaggaacaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaa 46127394  T
Q  229 gtga 232  Q
    ||||    
T  46127395 gtga 46127398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 33 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24425455 - 24425249
Alignment:
Q  33 gatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||   ||||||||| || |||||| ||||||||| |||| ||    
T  24425455 gatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccctgaccccatttccaaacccgttccaaatgcataaaattactatatgttg 24425356  T
Q  133 atatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtg 231  Q
    |||||  |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24425355 atatgccatgttattctgtttgataattatcgtgttataaaaactaccattgatatttaaagga-caaataaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtg 24425257  T
Q  232 aacatatt 239  Q
    | ||||||    
T  24425256 agcatatt 24425249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17885548 - 17885326
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| || ||||||||| |||| | |||||||||    
T  17885548 ttttccccgattttaaaacatgggtatgggacgggtaacgggtatataggttccaaccccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattact 17885449  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgt-tataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  |  |||| |||||    
T  17885448 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgtcaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccatctatcaaat 17885349  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  17885348 gttaaagtgaacatattgttgga 17885326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16866252 - 16866030
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||||||||    
T  16866252 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgagtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 16866153  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||    |||||||||||    
T  16866152 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgccatgttaataaaaactatcattgatatttaaatgattaactaaatcattttgtctaacaaat 16866053  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    || ||||||| | |||| |||||    
T  16866052 gtgaaagtgagcttattgttgga 16866030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30650714 - 30650505
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||| | |||||||||    
T  30650714 ttttccccaatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaatccgtcccaaatgtaaaaaattact 30650615  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    |||||||||||    
T  30650614 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgccatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaat 30650515  T
Q  223 gttaaagtga 232  Q
    || |||||||    
T  30650514 gtgaaagtga 30650505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 26004461 - 26004675
Alignment:
Q  1 ttcccgttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||   |||    
T  26004461 ttcccgttttgactgggtttgggtttt-cctcgatttcaaaacttgggtatgggacgggtaacaggtatatagatacccaccccgaacccatacc--aac 26004557  T
Q  101 ccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaa 199  Q
     || ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||  |    
T  26004558 tcgccccgaatgcagaaaattactttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgtcttcttataaaaactatcattgatatttaaaggagcga 26004657  T
Q  200 ttaaatcaaccggtctaa 217  Q
     |||||||| ||||||||    
T  26004658 ctaaatcaatcggtctaa 26004675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 45380200 - 45379967
Alignment:
Q  14 tgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg- 112  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| ||||     
T  45380200 tgggtatgggtttttccc-gatttcaaaatacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacctaaactcgtcccaaatgt 45380102  T
Q  113 cagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaacc 210  Q
     | |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||       
T  45380101 aaaaaaattactttatgttgacatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcagtt 45380002  T
Q  211 ggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
     ||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  45380001 cgtctaacaaatgttaaagtgagcgtattgttgga 45379967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 193
Target Start/End: Original strand, 18125253 - 18125408
Alignment:
Q  40 aaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatg-t 138  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||||||| ||||||| |    
T  18125253 aaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacgcatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgtt 18125352  T
Q  139 atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaag 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18125353 atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaag 18125408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 35074553 - 35074330
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg-cagaaaattac 123  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||  | |||| |||    
T  35074553 ttttccccgatcttaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaacccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactac 35074454  T
Q  124 tttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaa 221  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |    ||||||||||    
T  35074453 tttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaa 35074354  T
Q  222 tgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||| ||||||| | |||| |||||    
T  35074353 tgtgaaagtgagcttattgttgga 35074330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7780091 - 7779882
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||| | ||| ||| |    
T  7780091 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacggataatgggtatataggtacccaccccgaacctatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaatttatt 7779992  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    |||||||||||    
T  7779991 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaat 7779892  T
Q  223 gttaaagtga 232  Q
    || |||||||    
T  7779891 gtgaaagtga 7779882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21702742 - 21702533
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||| | |||| ||||    
T  21702742 ttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccataccccaacccgtcccaaatgtaaaaaactact 21702643  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| |    |||||||||||    
T  21702642 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccatttatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaat 21702543  T
Q  223 gttaaagtga 232  Q
    || |||||||    
T  21702542 gtgaaagtga 21702533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 25782917 - 25783138
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25782917 ttttctccgattataaaacacgggtatgagacggataatgggtatataggtacccaccccgaactcataccaaaatccgtcccgaatgcagaaaattact 25783016  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    ||||| | |||| | || ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||  ||||||||||||| || |||||||| |||| ||| ||||     
T  25783017 ttatgttaatatctcatattattttgtttgataattgcagtgttataaaaactatcatcaatatttaaaggagcaactaaatcaatcggtataataaata 25783116  T
Q  224 ttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||| || ||| |||||    
T  25783117 ttaaagtgagcacattgttgga 25783138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 239
Target Start/End: Original strand, 44734374 - 44734583
Alignment:
Q  32 cgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggt 131  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||| | |||||||||||||| |    
T  44734374 cgatttcaaaacacgggtatgggaccggtaatgggtatataggtacccaccccgaacccatacacatatccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgtt 44734473  T
Q  132 gatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaag 229  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||    ||||||||||| ||||||    
T  44734474 gatatgtcatgttattttatttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttgaaggatcaattaaatcattacgtctaacaaatattaaag 44734573  T
Q  230 tgaacatatt 239  Q
     || ||||||    
T  44734574 cgagcatatt 44734583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 39456025 - 39456239
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| | |||||||||    
T  39456025 ttttccccgatttcaaaacatgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaac-catactcatacccgtcccaaatgta-aaaattact 39456122  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgt-gttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| | | || ||||||| |||||||||||||  |||||  ||||||||||    |||||||||||    
T  39456123 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgccatggtaataaaaattaccattgatattggaaggatcaattaaatcattacgtctaacaaat 39456222  T
Q  223 gttaaagtgaacatatt 239  Q
    |||||||||| ||||||    
T  39456223 gttaaagtgagcatatt 39456239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 37182357 - 37182136
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||  |||||| ||||| || ||||||||| |||| | |||||||      
T  37182357 ttttctccgaattcaaaacacgggtatgggacgggtagcgggtatataggtactca-tccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattatc 37182259  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    |||||||||||    
T  37182258 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattgtgtctaacaaat 37182159  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  37182158 gttaaagtgaacatattgttgga 37182136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41103768 - 41103528
Alignment:
Q  1 ttcccgttttgactgggtgtgggt-----ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcataca 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  41103768 ttcccgttttgactgggtgtgggtatgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacggttaacgggtatataagtacccaccccgaacccataca 41103669  T
Q  96 caaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccat---tgatattta 190  Q
     ||||||||||  |||| | ||||||| |||||| |||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||| ||||||   |||||||||    
T  41103668 taaacccgtcctaaatgtaaaaaattattttatgttgatatctcttgttattttgtttgataattgtcatgttaatacaaattaccattgatgatattta 41103569  T
Q  191 aaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtg 231  Q
    |||||  || |||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  41103568 aaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtg 41103528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 41741460 - 41741681
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||| |||| | |||||||||    
T  41741460 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacggataacgggtatgtaggtaccca-cccgaacccatattcatacccgtcccaaatgtaaaaaattact 41741558  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    |||||||||||    
T  41741559 ttatactgatatgtcatgttattttgtttgataattatcatgttaataaaaactaccattgatatttaacggatcaattaaatcattacgtctaacaaat 41741658  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    |||||||||| |||||| |||||    
T  41741659 gttaaagtgagcatattgttgga 41741681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 58 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 37579312 - 37579130
Alignment:
Q  58 ggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcata 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| | ||| | ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| |||    
T  37579312 ggtaacgggtatataggtacccaccccgaacctatacccaaagctgtctcaaatgcagaaaattactttatgttgctatgccatgttattttgtttgata 37579213  T
Q  157 attgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 239  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||| || |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  37579212 attgtcatgttataaaaattatcattgatatttaaatgagcaactaaatcaatccatctaacaaatgttaaagtgagcatatt 37579130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 45885775 - 45885997
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||| |||| | |||||||||    
T  45885775 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacaagtatataggtacccaccccgaacccataccaaaatccgtcccaaatgtaaaaaattact 45885874  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||  || | |||||    |||||||||||    
T  45885875 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgccatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaacttaatcattttgtctaacaaat 45885974  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    || ||||||| | |||| |||||    
T  45885975 gtgaaagtgagcttattgttgga 45885997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 39317078 - 39316862
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||| || |||||||||| || | ||||| | |||| | ||||||| |    
T  39317078 ttttcctcgatttcaaaacacgggtatgggacgggtagcgggtatatatgtatccatcctgaactcatacccatatccgtctcaaatgtaaaaaattatt 39316979  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||    |||||||||||    
T  39316978 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttgaaggatcgattaaatcattacgtctaacaaat 39316879  T
Q  223 gttaaagtgaacatatt 239  Q
    |||||||||| ||||||    
T  39316878 gttaaagtgagcatatt 39316862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Original strand, 44985949 - 44986130
Alignment:
Q  58 ggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgtatgttattttgtttcataa 157  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||      ||||||| |||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  44985949 ggtaacgggtatataaatacccactccgaactcatac------ccgtcccaaatgtaaaaaatta-tttatgttgatatgtatgttattttgtttgataa 44986041  T
Q  158 ttgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44986042 ttgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatattgttgga 44986130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 41 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17851921 - 17851765
Alignment:
Q  41 aacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatg-ta 139  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| |||| | |||| ||||||||| ||||||| ||    
T  17851921 aacacgggtatgggacgggtaacggatatataggtacccatcccgaacccatacccaaacccatcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgtta 17851822  T
Q  140 tgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaagga 195  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  17851821 tgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaagga 17851765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 231
Target Start/End: Original strand, 25979927 - 25980135
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||| || | || |||| | ||||||| |    
T  25979927 ttttccccgatttcaaaacacaggtatgagacgggtaacggatatatatgtacccaccccaaactcatacccaaatcctttccaaatgtaaaaaattatt 25980026  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||    
T  25980027 ttatgttgaaatgtcatgttattttgtttgataattatcatgttaataaaaacttacattgatatttaaaggattaaataaatcattccgtctaacaaat 25980126  T
Q  223 gttaaagtg 231  Q
    |||||||||    
T  25980127 gttaaagtg 25980135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 38139802 - 38140025
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg-cagaaaattac 123  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||||  | |||||||     
T  38139802 ttttccccaatttcaaaacacgagtatgggacgggtaatgagtatataagtacccaccccgaacccataaccaaacccgtctcaaatgtaaaaaaattat 38139901  T
Q  124 tttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaa 221  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||  | ||||||||||    
T  38139902 tttatattgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaa 38140001  T
Q  222 tgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||||| | |||| |||||    
T  38140002 tgttaaagtgagcgtattgttgga 38140025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25905711 - 25905539
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaac-ccgtcccgaatgcagaaaattac 123  Q
    |||||||| || | ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| | |||||||     
T  25905711 ttttccccaatctcaaaacacaggtatgggacgggtaacgggtacataggta-ccaccccgaactcatacccaaacatcgtcccaaatgtaaaaaattat 25905613  T
Q  124 tttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaagga 195  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25905612 tttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagga 25905539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 245
Target Start/End: Original strand, 44794052 - 44794259
Alignment:
Q  39 aaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatg- 137  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||| | ||||||| |||||| |||||||     
T  44794052 aaaacacgggtatgagacgggtaacgagtata-aggtacccaccccgaacccatacccaaacctgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgt 44794150  T
Q  138 tatgttattttgtttcataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacat 236  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||  || |||||||    ||||||||||||| ||||||| | |    
T  44794151 tatgttattttgtttgataattgtcatgttactaaaaactaccattgatacttaaatgatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgagctt 44794250  T
Q  237 attcttgga 245  Q
    ||| |||||    
T  44794251 attgttgga 44794259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 45708875 - 45709094
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||   | ||| ||||    
T  45708875 ttttctccgatctcaaaacacgggtattggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacctaaacccgtccaaaat---gtaaaatact 45708971  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||    |||||||||||    
T  45708972 ttatgttgatatgttatattattttgtttgataattgtcatattaataaaaattaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaat 45709071  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    || ||||||| | |||| |||||    
T  45709072 gtgaaagtgagcttattgttgga 45709094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Original strand, 37196038 - 37196230
Alignment:
Q  55 acaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatg-tatgttattttgtttc 153  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  37196038 acaggtaatgggtatatagctacccaccccgaatccatacccaaacccgtcataaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttg 37196137  T
Q  154 ataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||  || |||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  37196138 ataactgtcatgttaataaaaactaccattgatatataaaagatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgagcgtattattgga 37196230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16811812 - 16811644
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||| | ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||| ||||||| |||| | |||||||||    
T  16811812 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgagacggataatgggtatatagataccca-cccgaacccatacccaaagccgtcccaaatgtaaaaaattact 16811714  T
Q  125 ttatggtgatat-gtatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaa 192  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16811713 ttatgttgatatattatgttattttgtttgataattgccatgttaataaaaactaccattgatatttaaa 16811644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 168
Target Start/End: Original strand, 3226956 - 3227100
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| || || | |||| |||| | ||||||| |    
T  3226956 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacaggaatataggtacccaccccgaacccatactcatacacatcccaaatgtaaaaaattatt 3227055  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtta 168  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3227056 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgtta 3227100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23328641 - 23328477
Alignment:
Q  77 cccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattacttt-atggtgatatgtat-gttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaa 174  Q
    |||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||| |||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  23328641 cccaccccgatcctatacccaaacccgtcccgaatggagaaaattatttttatgttgacatgtcttgttattttgtttgataattgtcgtgctataaaaa 23328542  T
Q  175 ctaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 239  Q
     || ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  23328541 ttatcattgatatttaaaggaataactaaatcaatcggtctaataaatgctaaagtgagcatatt 23328477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 10072549 - 10072436
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| |||| | |||||||||    
T  10072549 ttttccccgatttcaaaacacgggtatggaacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccataaccgtcccaaatgtaaaaaattact 10072450  T
Q  125 ttatggtgatatgt 138  Q
    ||||| ||||||||    
T  10072449 ttatgttgatatgt 10072436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24753256 - 24753088
Alignment:
Q  14 tgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgc 113  Q
    ||||| ||||||||  |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||           ||| |||||||||||| ||||     
T  24753256 tgggtatgggtttt--cccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtaccca-----------tacccaaacccgtcccaaatgt 24753170  T
Q  114 agaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaag 193  Q
    | ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24753169 aaaaaattattttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaag 24753088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 38152970 - 38152835
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| | ||||||| |    
T  38152970 ttttccccgatttcaaaacatgggtatggaacggataacggctatataggtacccaccccgaacccatacctaaacccgtcccaaatgtaaaaaattatt 38152871  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataatt 159  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  38152870 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataatt 38152835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 195
Target Start/End: Original strand, 44658496 - 44658631
Alignment:
Q  62 acgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattg 160  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||| || |||| | |||| || |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  44658496 acgggtatataggtacctatcccgaacccatacccaaacccgtaccaaatgtaaaaaaatattttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattg 44658595  T
Q  161 tcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaagga 195  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44658596 tcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagga 44658631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 43507528 - 43507294
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  | || |||||| |||| | ||||||| |    
T  43507528 ttttccccgatttcaaaacatgggtatgagacgggtaacgggtatataggcacccaccctgaacccatacctatactcgtcccaaatgtaaaaaattatt 43507429  T
Q  125 ttatggtgata-------------tgtatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaacc 210  Q
    ||||| |||||             ||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||  |    
T  43507428 ttatgttgatatgtcatgttattttgtatgttattttgtttgataattgtcatattaataaaaactaccattgatatttaaaagatcaactaaatcattc 43507329  T
Q  211 ggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
     ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  43507328 cgtctaacaaattttaaagtgagcatattgttgga 43507294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 228
Target Start/End: Original strand, 5916194 - 5916280
Alignment:
Q  142 ttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaa 228  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  5916194 ttattttgtttgataattgctgtgttatcaaaactaccattgatatttaaaggagtaaatcaatcaatcggtctaacaaatgttaaa 5916280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 112
Target Start/End: Original strand, 23475252 - 23475360
Alignment:
Q  3 cccgttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaaccc 102  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  ||||| ||| ||||| ||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  23475252 cccgctttgactgggtttgggtttttccc-gatttcaaaacacgggtttgggatgggtaatggggatatatgtacccacttcgaacccatacccaaaccc 23475350  T
Q  103 gtcccgaatg 112  Q
    ||||||||||    
T  23475351 gtcccgaatg 23475360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 168 - 245
Target Start/End: Original strand, 26004675 - 26004752
Alignment:
Q  168 ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  26004675 ataaaaactaccattgatatttaaaggagcgactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaaatgagcatattgttgga 26004752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 27063417 - 27063324
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaa 118  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||| |||||    
T  27063417 ttttccccgatttaataatacgggtacgggacgggtaacgggaatatatgtacccaccccgaactcataccccaaccctacccgaatgtagaaa 27063324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 31426091 - 31425998
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaa 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||    
T  31426091 ttttccccgatttaaaaatacgggtatgagacgggtaacggggatatatgtatccaccccgaacgcatacccaaaccctacccgaatgtagaaa 31425998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 3157166 - 3157084
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtccc 107  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||    
T  3157166 ttttccccgatttcaaaatatgggtatgggacggataacggggatataggtacccacaccgaacctatacccaaacccgtccc 3157084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 168 - 245
Target Start/End: Original strand, 3227698 - 3227775
Alignment:
Q  168 ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  | |||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  3227698 ataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttgaagtgagcatattgttgga 3227775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 112
Target Start/End: Original strand, 19439999 - 19440107
Alignment:
Q  3 cccgttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaaccc 102  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||  ||||| ||| ||||| ||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  19439999 cccgctttgactgggtttgagtttt-ccctgatttgaaaacacgggtttgggatgggtaatggggatatatgtacccacttcgaacccatacccaaaccc 19440097  T
Q  103 gtcccgaatg 112  Q
    ||||||||||    
T  19440098 gtcccgaatg 19440107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 32546275 - 32546182
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaa 118  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||| || || ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||    
T  32546275 tttttcccgatttcaaaatacgggtacggaacgggtaacggggatatatgtacccaccccgaacccatacccaaaccctacccgaatgtagaaa 32546182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 23533591 - 23533700
Alignment:
Q  1 ttcccgttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaac 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||  ||||| ||| ||||| ||||||||  ||||| ||||| |||||    
T  23533591 ttcccgatttgactgggtttgggtttt-ccccgatttgaaaatacgggtatgcgatgggtaatggg-atatatgtacccacttcgaacccatacccaaac 23533688  T
Q  101 ccgtcccgaatg 112  Q
     |||||||||||    
T  23533689 tcgtcccgaatg 23533700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 33841161 - 33841074
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |  |||| |||| |||||||||| ||||| || ||||||||| ||||    
T  33841161 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacatggttatatgtactcaccccgaacccatactcatacccgtcccaaatg 33841074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 27063221 - 27063127
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaa 119  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||  |||| | ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||    
T  27063221 ttttcctcgatttcaaaatacgggtacaggacggataacggggatatatgtactcaccccgaactcatacccaaaccctacccgaatgtagaaaa 27063127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 111
Target Start/End: Original strand, 27896485 - 27896571
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaat 111  Q
    |||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||||||||  |||| | ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  27896485 ttttcccttatttcaaaacatgggtatgggacgggtaacggggttatatgcaccaaccccgaactcatacccatacccgtcccgaat 27896571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 28309572 - 28309482
Alignment:
Q  28 tccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaa 118  Q
    |||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||    
T  28309572 tccctgatttcaaaatacgggtacgggacgggtaacgggaatatatgtatctaccccgaactcatacccaaaccctacccgaatgtagaaa 28309482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 104
Target Start/End: Original strand, 10995844 - 10995923
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgt 104  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||  ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  10995844 ttttccccgatttcaagacacgggtatgggacgggtaacagggttatatatacccaccccgaacccatacccatacccgt 10995923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 18684057 - 18683970
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg 112  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||| || ||||| ||| ||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||    
T  18684057 ttttccccgatttcaaaatacgggtacgggacgggtaacagggatatatgtatccacctcgaacccatacccaaaccctacccgaatg 18683970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 94
Target Start/End: Original strand, 10990866 - 10990940
Alignment:
Q  20 tgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatac 94  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||  || ||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  10990866 tgggtttttccccgatttcaaaatacgggtacgggacgggtaatagggatataggtatccaccctgaattcatac 10990940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 138
Target Start/End: Original strand, 3274700 - 3274802
Alignment:
Q  32 cgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggt 131  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||  |||| |||||||  ||| ||||| ||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  3274700 cgattttaaaacactggtatgggccaaataacaggtatattcgtagccacctcgaacccata----aacccgtcccgaatgtagaaaattacattatgtt 3274795  T
Q  132 gatatgt 138  Q
    |||||||    
T  3274796 gatatgt 3274802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 21750865 - 21750788
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaaccc 102  Q
    |||| |||||||| |||| |||| |||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21750865 tttttcccgatttcaaaatacggatatgagacgggtgacggggatatatgtacccacctcgaactcatacccaaaccc 21750788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 24903490 - 24903406
Alignment:
Q  34 atttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaa 119  Q
    |||| |||||| || |||| ||||||||   |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  24903490 atttcaaaacaaggttatgagacaggtagtaggtatataggtacccaccca-aactcatacacaaacccatcccggatgtagaaaa 24903406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 118
Target Start/End: Original strand, 44845145 - 44845238
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaa 118  Q
    ||||||||||||| | || ||||||| ||||| | ||| | | |||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||    
T  44845145 ttttccccgatttcataatacgggtacgggacggttaatgaggatatatttacccaccccgaacccatacacaaaccctgcccgaatgtagaaa 44845238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 38152834 - 38152763
Alignment:
Q  174 actaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    |||||||||||||| |||||||  || |||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  38152834 actaccattgatatctaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgagcgtattgttgga 38152763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 3774119 - 3774057
Alignment:
Q  58 ggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaat 120  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||  |||||||    
T  3774119 ggtaacgaggatataggtacccaccctgaacccatactcaaatccgtcccgaatttagaaaat 3774057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16900493 - 16900440
Alignment:
Q  139 atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaa 192  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  16900493 atgttatttggtttcataaatgtcatgttataaaaatttccattggtatttaaa 16900440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17120624 - 17120543
Alignment:
Q  148 tgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaag 229  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||  |  |||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||| || |||||||||||    
T  17120624 tgtttgataattgacatgttataaaatttgtcattgatatttaaatgagcaatcaaatcatccggtcaaaaaaatgttaaag 17120543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 118
Target Start/End: Original strand, 30839144 - 30839237
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaa 118  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||  |||||| | ||||| ||| | ||||||||||||| | ||||||   |||||||| |||||    
T  30839144 ttttccctgatttcaaaatacgggtatgggacgagtaacgtggatatatgtatctaccccgaactcatgcccaaaccttacccgaatgtagaaa 30839237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10072425 - 10072357
Alignment:
Q  170 aaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatat 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  || |||||||  | | ||||||||||||||||||| |||||    
T  10072425 aaaaactaccattgataattaaatgatcaactaaatcattccgcctaacaaatgttaaagtgagcatat 10072357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 55)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 4557315 - 4557536
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||||||    
T  4557315 ttttccccgttttcaaaacatgggtatgggacgggtaacgagtatataggtacccaccccgaacccatacccaaatctatcccgaatgcagaaaattact 4557414  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  4557415 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatg 4557514  T
Q  224 ttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  4557515 ttaaagtgaacatattgttgga 4557536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 4016054 - 4016275
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||     
T  4016054 ttttccccgatttcaaaacatgggtatgggacggataacgggtatataggtacccactccgaacccatacccaaactcgtcccgaatgcagaaaactacc 4016153  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  4016154 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgatgtgttataaaaactactatcgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtctaacaaatg 4016253  T
Q  224 ttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  4016254 ttaaagtgaacatattgttgga 4016275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 53631982 - 53631761
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    |||||||  |||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  53631982 ttttcccaaattttaaaacacgtgtatgagacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatactcaaactcgtcccgaatctagaaaattact 53631883  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||    
T  53631882 ttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgccgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagcaactaaatcgatcggtctaacaaatg 53631783  T
Q  224 ttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
     |||||||| |||||| |||||    
T  53631782 ataaagtgagcatattgttgga 53631761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 29 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 42758448 - 42758248
Alignment:
Q  29 ccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttat 128  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  42758448 ccccgatttcaaaacacaggtatgggacgggtaacaggtatataggtatgcaccccgaacccatacccaaacccgtcccgaacgaagaaaattactttat 42758349  T
Q  129 ggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaa 227  Q
    | |||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42758348 gttgatatgccatgttattttgtttgataattgccatgttataaaaactatcattgatatttaaaggagcaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaa 42758249  T
Q  228 a 228  Q
    |    
T  42758248 a 42758248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 48390827 - 48391048
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||| || |||||||||||| | | |||||||||    
T  48390827 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggaatataggtacccatcctgaacccatacccatacccgtcccgaacgtaaaaaattact 48390926  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||  | ||||||||||||    
T  48390927 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaaaaaaactaccattgatatttaaaagatcaactaaatcattccgtctaacaaatg 48391026  T
Q  224 ttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    || ||||||||||||| |||||    
T  48391027 ttgaagtgaacatattgttgga 48391048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 54317222 - 54317018
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| || | |||||||||||    
T  54317222 ttttccccgatttcaaaacacaagtataggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccattcccaaacccgtcccaaacgaagaaaattact 54317123  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||    
T  54317122 ttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgccgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaatcaacatgtctaacaaatg 54317023  T
Q  224 ttaaa 228  Q
    |||||    
T  54317022 ttaaa 54317018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 34119734 - 34119515
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  34119734 tttttcccgattttaaaacacgggtatgagacggataacaggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaatccgtcccaaatgcagaaaactact 34119635  T
Q  125 ttatggtgatatgtatgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgt 224  Q
    || || |||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  34119634 ttgtgttgatatgcca-ttattttgtttgataattgtcgtgttataaaaactaacattgatattgaaatgagcaactaaatcaatcggtctaacaaatgt 34119536  T
Q  225 taaagtgaacatattcttgga 245  Q
    |||||||| |||||| |||||    
T  34119535 taaagtgagcatattgttgga 34119515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 44172704 - 44172482
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||||||||    
T  44172704 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataagtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 44172605  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||    |||||||||||    
T  44172604 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccactgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaat 44172505  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    || ||||||| | |||| |||||    
T  44172504 gtgaaagtgagcgtattgttgga 44172482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 44179404 - 44179182
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||||||||    
T  44179404 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataagtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 44179305  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||    |||||||||||    
T  44179304 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccactgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaat 44179205  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    || ||||||| | |||| |||||    
T  44179204 gtgaaagtgagcgtattgttgga 44179182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 44953445 - 44953667
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||    
T  44953445 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtactcaccccgaactcatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaactact 44953544  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |    |||||||||||    
T  44953545 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaat 44953644  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    || ||||||| | |||| |||||    
T  44953645 gtgaaagtgagcttattgttgga 44953667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19111812 - 19111592
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||  | ||||||||||||| ||||||||||  ||| ||| | ||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  19111812 tttttcccgatttcaaaacacgggtacgggatggataacgggtatataagtacccaccctaaacccatgcccaaacccgtacaaaatgtagaaaattact 19111713  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||    
T  19111712 ttatgtt-atatgtcatgttattttgtttgataattttcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaactaaatcaattggtataacaaatg 19111614  T
Q  224 ttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||| |||||| |||||    
T  19111613 ttaaagtgatcatattgttgga 19111592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 30 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29842381 - 29842164
Alignment:
Q  30 cccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatg 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| | |||| | ||||||||||||||    
T  29842381 cccgattttaaaacacgggtatgggactggtaacgggaatataggtacccaccccgaacccatactcatacccgtctcaaatgtaaaaaattactttatg 29842282  T
Q  130 gtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaa 227  Q
     |||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    |||||||||||||| |    
T  29842281 ttgatttgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcatttcgtctaacaaatgttga 29842182  T
Q  228 agtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||| |||||| |||||    
T  29842181 agtgagcatattgttgga 29842164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 22535851 - 22536067
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| || |||||  |||| | ||||||| |    
T  22535851 ttttccccaatttcaaaacacggatatgggacgggtaacgggtatacaggcacccaccccgaacccatacacatactcgtcctaaatgtaaaaaattatt 22535950  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  | |||||||||||    
T  22535951 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattctgtctaacaaat 22536050  T
Q  223 gttaaagtgaacatatt 239  Q
    |||||||||| ||||||    
T  22536051 gttaaagtgagcatatt 22536067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 245
Target Start/End: Original strand, 31126826 - 31127026
Alignment:
Q  46 gggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgtta 144  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||| || || |||||||  ||||||    
T  31126826 gggtatgggacgggtaacatgtatataggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgcagaaaactacattgtgttgatatgccatgtta 31126925  T
Q  145 ttttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgg 244  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  31126926 ttttgtttgataattgtcgtattataaaaactaacattgatattgaaaggagcaactaaatcaatcagtctaacaaatgttaaagtgagcatattgttgg 31127025  T
Q  245 a 245  Q
    |    
T  31127026 a 31127026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 49580142 - 49579920
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||||||||    
T  49580142 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataggtacccacctcgaacccatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 49580043  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    |||||||||||    
T  49580042 ttatattgatatgttatgttattttgtttgatgattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaat 49579943  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    || ||||||| | |||| |||||    
T  49579942 gtgaaagtgagcttattgttgga 49579920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 34026032 - 34025810
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| | ||||||| |    
T  34026032 ttttccccgatttcaaaacacaggtatgggacgggtaacgagtatataggtttccaccccgaactcatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattatt 34025933  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||  |  |||| |||||    
T  34025932 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaattaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccatctatcaaat 34025833  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||| || |||||| |||||    
T  34025832 gttaaagggagcatattgttgga 34025810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 39 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 44639338 - 44639180
Alignment:
Q  39 aaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatg- 137  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||| | ||||||| |||||| |||||||     
T  44639338 aaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgttccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgt 44639239  T
Q  138 tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaagga 195  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44639238 tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagga 44639180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 52198243 - 52198023
Alignment:
Q  14 tgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgc 113  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||     
T  52198243 tgggtatgggtttttccc-gatctcaaaacacaggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgttccaaatgt 52198145  T
Q  114 agaaaattactttatggtgatatg-tatg-ttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaacc 210  Q
    | |||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||       
T  52198144 aaaaaattactttacgttgatatgctatgtttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattt 52198045  T
Q  211 ggtctaacaaatgttaaagtga 232  Q
     ||||||||||||| |||||||    
T  52198044 tgtctaacaaatgtgaaagtga 52198023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 195
Target Start/End: Original strand, 39655283 - 39655455
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| | |||| | |||| ||||    
T  39655283 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacaggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacccgtctcaaatgtaaaaaactact 39655382  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaagga 195  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39655383 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagga 39655455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 30682898 - 30682684
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||| || | |||||  ||||  || || ||||| |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30682898 ttttccccgacttaaaaatacggatatgagatatgtaacaagtatc-agatatccacctcgaacctatactcaaacccgtcctgaatgtagaaaattact 30682800  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||    
T  30682799 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataatggtcatgttataaaaactatcattgatatttaaaggagcaattaaatcattcgttctaacaaatg 30682700  T
Q  224 ttaaagtgaacatatt 239  Q
    ||||||||||||||||    
T  30682699 ttaaagtgaacatatt 30682684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 831081 - 830872
Alignment:
Q  30 cccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatg 129  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  831081 cccgttttcaaaacacgggtatgagacggataacgagtatat-ggtacccaccctgaacccatacccaaattcgtcccgaatgcagaaaattactttatg 830983  T
Q  130 gtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaa 228  Q
     | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||  ||||||| |||||||||     
T  830982 ttaatatgctatgttattttgtttgataattgccgtcttataaaaactatcattgatattttaaggagaaactaaatcaattggtctaaaaaatgttaac 830883  T
Q  229 gtgaacatatt 239  Q
    |||| ||||||    
T  830882 gtgagcatatt 830872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 232
Target Start/End: Original strand, 7469803 - 7469997
Alignment:
Q  40 aaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatg-t 138  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | || | |||||||||  |||||| |    
T  7469803 aaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacacaaacccgtcccaaatgtaaaacactactttatgtggatatgtt 7469902  T
Q  139 atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtga 232  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |    ||||||||||||| |||||||    
T  7469903 atgttattttgtttgataattgtcatcttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtga 7469997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 39728749 - 39728527
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    |||||| |||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||||||||    
T  39728749 ttttcctcgatctcaaaatacgggtatgggatgggtaacgggtatataagtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 39728650  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||    |||||||||||    
T  39728649 ttatgttgatatgtaatgttattttgtttgataattgttctgttaataaaaactatcattgatatttaaaagattaactaaatcattttgtctaacaaat 39728550  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    || ||||||| | |||| |||||    
T  39728549 gtgaaagtgagcttattgttgga 39728527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 49025781 - 49025537
Alignment:
Q  1 ttcccgttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaac 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||| ||||| |||||    
T  49025781 ttcctgttttgactgggtttgggtttt-ccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacaggtatataggtacaca-tccgaacccatacccaaac 49025684  T
Q  101 ccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagta 198  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  49025683 ccgtcccaaatgtaaaaaattactttgtgttgatatgttatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatca 49025584  T
Q  199 attaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    | |||||||    |||||| |||||| ||||||| | |||| |||||    
T  49025583 actaaatcattttgtctaataaatgtgaaagtgagcttattattgga 49025537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 52572687 - 52572465
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||||||| |||| | |||||||||    
T  52572687 ttttcctcgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatagggacccaccccgaatccatactcaagcccgtcccaaatgtaaaaaattact 52572588  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||    |||||||||||    
T  52572587 ttatgttaatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagtatcaactaaatcattttgtctaacaaat 52572488  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    || ||||||| | |||| |||||    
T  52572487 gtgaaagtgagcttattgttgga 52572465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 44252825 - 44252603
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||  | |||| ||||    
T  44252825 ttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgtgtaacaggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatataaaaaactact 44252726  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||  || ||||| |    |||||||||||    
T  44252725 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaat 44252626  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    || ||||||| | |||| |||||    
T  44252625 gtgaaagtgagcttattgttgga 44252603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Original strand, 44106802 - 44107011
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||||||||    
T  44106802 ttttccccaatcttaaaacacgggtatgggacgcgtaacggatatataggtatctaccccgaacccatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 44106901  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    |||| ||||||    
T  44106902 ttatgttaatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtcttacaaat 44107001  T
Q  223 gttaaagtga 232  Q
    || |||||||    
T  44107002 gtgaaagtga 44107011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 29284424 - 29284245
Alignment:
Q  14 tgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgc 113  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  |||     
T  29284424 tgggtatgggtttttccc-gatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccagcccgaacccatacccaaacccgtcccagatgt 29284326  T
Q  114 agaaaattactttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaa 192  Q
    | |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  29284325 aaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattaatatttaaa 29284245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 195
Target Start/End: Original strand, 23154075 - 23154245
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| || |||  |||| |||| | |||||||||    
T  23154075 ttttccccgatttcaaa-cacgggtatggaacgggtaacgagtatataggtacccactccgaacccatactcatacctatcccaaatgtaaaaaattact 23154173  T
Q  125 ttatggtgatatgtatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaagga 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  23154174 ttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccgttgatatttaaagga 23154245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23580905 - 23580698
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||   |||| |||| | ||||||| |    
T  23580905 ttttccccaatttcaaaacacgagtatgaaacgggtaacgggtatataggtacccactccgaacccatacccacacttatcccaaatgtaaaaaattatt 23580806  T
Q  125 ttatggtgatatgtatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||  | || |||||||||    
T  23580805 ttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactactattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtataacaaatg 23580706  T
Q  224 ttaaagtg 231  Q
    ||||||||    
T  23580705 ttaaagtg 23580698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 43582655 - 43582434
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||| |||| | |||||||||    
T  43582655 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacgggtaacgtgtatgtaggtaccca-cccgaacccatattcatacccgtcccaaatgtaaaaaattact 43582557  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgt-tataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||||| || |||  |||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||    |||||||||||    
T  43582556 ttatattgatatgtcatgttattttgtttgataattatcatgtaaataaaaactaccattgatatttaacggatcaactaaatcattacgtctaacaaat 43582457  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    |||||||||| |||||| |||||    
T  43582456 gttaaagtgagcatattgttgga 43582434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 230
Target Start/End: Original strand, 17146174 - 17146367
Alignment:
Q  39 aaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatg- 137  Q
    |||||| |||||||| || |||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||| |||||||     
T  17146174 aaaacatgggtatggaacgggtaacagttatataggtatccaccccgaacccatacacaaacccttcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt 17146273  T
Q  138 tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagt 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||    ||||||||||||| |||||    
T  17146274 tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagt 17146367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 34154492 - 34154274
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg-cagaaaattac 123  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||  || ||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||  | ||||||||    
T  34154492 ttttccccgatttcaaaacatgggtatgaaacgggtaacaagaatataggtacccaccccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaaattac 34154393  T
Q  124 tttatggtgatatgtatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    |||||| |||    ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    |||||||||||    
T  34154392 tttatgttga----tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattatgtctaacaaat 34154297  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
     |||||||||||||||| |||||    
T  34154296 attaaagtgaacatattgttgga 34154274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 10823706 - 10823925
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| ||||||   |||||| ||||| ||||||  |||| |||| | |||||||||    
T  10823706 ttttctccgatctcaaaacacgggtatgagattgataacgggtatataagtaccc---ccgaacccatacccaaacctctcccaaatgtaaaaaattact 10823802  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    |||||||||||    
T  10823803 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaat 10823902  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    || ||||||||| |||| |||||    
T  10823903 gtgaaagtgaacttattgttgga 10823925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 58 - 239
Target Start/End: Original strand, 6738437 - 6738620
Alignment:
Q  58 ggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcata 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| || ||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  6738437 ggtaacgggtatataggtacccaccccaaatccatactcatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgata 6738536  T
Q  157 attgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 239  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||    |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  6738537 attgccatgttaataaaaactaccattgatattggaaggatcaattaaatcattatgtctaacagatgttaaagtgagcatatt 6738620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20087053 - 20086865
Alignment:
Q  58 ggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcata 156  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||| |||| | ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| || |||    
T  20087053 ggtaatgggtatataggtacccaccccgaaccc-tactcatacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgttattttgcttgata 20086955  T
Q  157 attgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  |  |||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  20086954 attgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccatctaacaaatgttaaagtgggcatattgttgga 20086865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 245
Target Start/End: Original strand, 41937074 - 41937233
Alignment:
Q  87 actcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgat 185  Q
    |||||||| ||||| |||| | ||||||||||| |||||| || ||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  41937074 actcatacccaaactcgtctcaaatgcagaaaactactttgtgttgacatgtcatattattttgtttgataattgtcgtgttataaagactaacattgat 41937173  T
Q  186 atttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||| ||| ||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  41937174 attgaaatgaacaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgagcatgttgttgga 41937233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 128
Target Start/End: Original strand, 23546925 - 23547055
Alignment:
Q  3 cccgttttgactgggtgtgggt-----ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacaca 97  Q
    |||||||||||||||| |||||     ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  23546925 cccgttttgactgggtttgggtatgggttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccataccca 23547024  T
Q  98 aacccgtcccgaatgcagaaaattactttat 128  Q
    ||| |||||| |||| | |||| ||||||||    
T  23547025 aactcgtcccaaatgtaaaaaactactttat 23547055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 134
Target Start/End: Original strand, 48305651 - 48305760
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| || |||| | |||||||||    
T  48305651 ttttccccaatttcaaaacacgggtatggaacgagtatcgggtatataggtacccaccccgaacctatacccaaacccgttccaaatgtaaaaaattact 48305750  T
Q  125 ttatggtgat 134  Q
    ||||| ||||    
T  48305751 ttatgttgat 48305760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 152
Target Start/End: Original strand, 23910326 - 23910382
Alignment:
Q  97 aaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgttt 152  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23910326 aaacccgtcccgaatgtagaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgttt 23910382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 112
Target Start/End: Original strand, 30904834 - 30904912
Alignment:
Q  33 gatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg 112  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||    
T  30904834 gatttcaaaacacgggtacgggacgggta-cggggatataggtacccaccccgaacccatacccaaatccgtctcgaatg 30904912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 108
Target Start/End: Original strand, 31271300 - 31271350
Alignment:
Q  58 ggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccg 108  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31271300 ggtaactgggatataggtacccaccccgaactcatactcaaacccgtcccg 31271350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 232
Target Start/End: Original strand, 48306661 - 48306755
Alignment:
Q  139 atgttattttgtttcataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtga 232  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |  || |||||||  | ||||||||||| |||||||||    
T  48306661 atgttaatttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaagtatcaactaaatcattccgtctaacaaatattaaagtga 48306755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 126
Target Start/End: Original strand, 10043292 - 10043393
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||| | ||| |||||| ||||||||||| |||||||||  |||| | ||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||  | |||||||||    
T  10043292 ttttccctggtttcaaaacatgggtatgggacgggtaacggggttatatgcacccaccccgaacccatacccatacccatcccgaatataaaaaattact 10043391  T
Q  125 tt 126  Q
    ||    
T  10043392 tt 10043393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 195
Target Start/End: Original strand, 23547073 - 23547154
Alignment:
Q  116 aaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaagga 195  Q
    |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  23547073 aaaactactttatgttaatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactagcatttatatttaaagga 23547154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 118
Target Start/End: Original strand, 1772452 - 1772502
Alignment:
Q  68 atataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaa 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  1772452 atatatgtacccaccccgaactcatacacaaaccctacccgaatgtagaaa 1772502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 107
Target Start/End: Original strand, 30616291 - 30616373
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtccc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |  ||||  || ||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  30616291 ttttccccgatttcaaaacacggatatgggacgggtaacgaggttatatataaccaccccgaacccatacccatacccgtccc 30616373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 62
Target Start/End: Original strand, 55438787 - 55438824
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaa 62  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55438787 ttttccccaatttaaaaacacgggtatgggacaggtaa 55438824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 239
Target Start/End: Original strand, 55438828 - 55438905
Alignment:
Q  162 cgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 239  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || |||||||| || | |||||||||||||| | ||||||||    
T  55438828 cgtgttattaaaactaccatcgatatttggaggagcaactaaatcaatcgctttaacaaatgttaaaataaacatatt 55438905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 104
Target Start/End: Original strand, 3385875 - 3385945
Alignment:
Q  34 atttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgt 104  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||  |||||  ||||||||    
T  3385875 atttcaaaacacgggtacgggacaggtaacgaggatataggtagccaccacgaatccataccaaaacccgt 3385945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 14208364 - 14208307
Alignment:
Q  138 tatgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggag 196  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  14208364 tatgttatttggtttgataattgtcatgttataaaaa-tgtcattgatatttaaaggag 14208307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 34593209 - 34593128
Alignment:
Q  24 tttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtc 105  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||   ||||||||||| | ||||  ||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  34593209 tttttcctcgattttaaaacatgggtacaagacaggtaacgagaatatcagtacccatcccgaactcatacccaaatccgtc 34593128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 1337139 - 1337080
Alignment:
Q  3 cccgttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaac 63  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||    
T  1337139 cccgttttgactgggtttggg-ttttcaccgatttcaaaacaagtgtatgggacgggtaac 1337080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 27937808 - 27937740
Alignment:
Q  33 gatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacc 101  Q
    ||||| |||||| | |||| ||||||||||| || ||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  27937808 gattttaaaacatgtgtataggacaggtaacagggatagaggtacacaccacgaactcatacccaaacc 27937740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 73
Target Start/End: Original strand, 41937023 - 41937071
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatatag 73  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  41937023 ttttccccgattttaaaacacgagtatgagacggataacgggtatatag 41937071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 55)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12447476 - 12447238
Alignment:
Q  7 ttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcc 106  Q
    |||||||||||| |||||||| ||  ||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  12447476 ttttgactgggtttgggtttt-ccttgattgtaaaacacaggtatgggacaggtaatgggtatataggtacccaccccgaacctatacccaaacccgtcc 12447378  T
Q  107 cgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaat 205  Q
    | |||  |||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12447377 caaatatagaaaactactttatgttaatatgtcatgttattttgtttgataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagcagttaaat 12447278  T
Q  206 caaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  12447277 caatcgatctaacaaatgttaaagtgaatatattgttgga 12447238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 39 - 239
Target Start/End: Original strand, 35194014 - 35194215
Alignment:
Q  39 aaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatg- 137  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||     
T  35194014 aaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaactcatactcaaacccgtcccgaatgtagaaaattactttatgttaatatgc 35194113  T
Q  138 tatgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacata 237  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  35194114 tatgttattttgtttgataattgctgtgttataaaaactaccattgatatttaaagaataaactaaatcaattggtctaaaaaatgttaaagtgaacata 35194213  T
Q  238 tt 239  Q
    ||    
T  35194214 tt 35194215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 17853304 - 17853524
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||||| |||| | |||||||||    
T  17853304 ttttccccgatttcaaa-cacgggtatgggacgggtaacggatatatagatacccactccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattact 17853402  T
Q  125 ttatggtgatatgtatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  | ||||||||||||    
T  17853403 ttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatg 17853502  T
Q  224 ttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  17853503 ttaaagtgaacatattgttgga 17853524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4583197 - 4582975
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| || ||||||||| |||| | |||||||||    
T  4583197 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggttcccaccccaaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattact 4583098  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  | ||||| |||||    
T  4583097 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctatcaaat 4582998  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    |||||||||| |||||| |||||    
T  4582997 gttaaagtgagcatattgttgga 4582975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 46 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1218812 - 1218619
Alignment:
Q  46 gggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgtatgttat 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||| |||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  1218812 gggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccactccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatttgtatgttat 1218713  T
Q  146 tttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 239  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1218712 tttgtttgataattgtcatgttaaaaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 1218619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 35311894 - 35311679
Alignment:
Q  31 ccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatgg 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||| |||| | ||||||| ||||||     
T  35311894 ccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacagatatataggtacccactccgaacccatactcatacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgt 35311795  T
Q  131 tgatatgtatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaag 229  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  | ||||||||||||||||||    
T  35311794 tgatatgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaag 35311695  T
Q  230 tgaacatattcttgga 245  Q
    ||| |||||| |||||    
T  35311694 tgagcatattgttgga 35311679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4920904 - 4920682
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||||||||    
T  4920904 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtatccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 4920805  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||    |||||||||||    
T  4920804 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaatgatcaactaaatcattttgtctaacaaat 4920705  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    || ||||||| | |||| |||||    
T  4920704 gtgaaagtgagcttattattgga 4920682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Original strand, 38006463 - 38006701
Alignment:
Q  7 ttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcc 106  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  38006463 ttttgactgggtttgggtttt-ccccaatttcaaaatacgggtatgggacgcgtaacagatatataggtacccaccccgaacccatacccaaatccgtcc 38006561  T
Q  107 cgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaat 205  Q
    ||||||  |||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  38006562 cgaatgttgaaaattaatttatgttaatatgtcatgttattttgtttgataatagtcgtattataaaaaccaccattgatatttaaaggagcaactaaat 38006661  T
Q  206 caaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    |||  |||||||||| |||||||  || |||||| |||||    
T  38006662 caattggtctaacaattgttaaaacgagcatattgttgga 38006701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 2412737 - 2412958
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||| || ||||  |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2412737 tttttcccaatttcaaaacacgggtatgggataaataacgggtatatatgtacccatcctgaaccaatacccaaactcgtcccgtatgcagaaaattact 2412836  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||     
T  2412837 ttatattgatatgtcatgttattttgtttgataattgttgtgtcataaaaactacaattgatatttaaaggagcaactaaattaatcggtctaacaaata 2412936  T
Q  224 ttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||| |||||| |||||    
T  2412937 ttaaagtgagcatattgttgga 2412958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 76 - 239
Target Start/End: Original strand, 27088414 - 27088577
Alignment:
Q  76 acccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgtatgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaac 175  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  27088414 acccaccccgaacccatacccaaacccgtctcgaatgtagaaaattattttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgttatgttataaaaac 27088513  T
Q  176 taccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 239  Q
    || |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  27088514 tatcattgatatttaaaggagcaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtaagcatatt 27088577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2985246 - 2985010
Alignment:
Q  3 cccgttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaaccc 102  Q
    |||||||||||||||| || ||||| | ||||||| || ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||  ||||| |||| |     
T  2985246 cccgttttgactgggtttgagtttt-ctccgatttcaagacatgggtttgggacgggtaacgggtatataggtactcatcccgaaaccatacccaaatct 2985148  T
Q  103 gtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaatt 201  Q
    ||| |||||  ||||||||| |||||  |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  2985147 gtctcgaatatagaaaattattttatattgatatgtcatgttattttatttgataattgttgtgttataaaaactatcattgatatttaaaggagcaact 2985048  T
Q  202 aaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 239  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2985047 aaatcaatcggtctaacaaatattaaagtgagcatatt 2985010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18207096 - 18206888
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    |||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18207096 ttttcctcgatttcaaaactcgtgtatgggacaggtaacaggtatataggtacccaccc-gaacccatattcaaacccgtcccgaatgtagaaaattact 18206998  T
Q  125 t-tatggtgatatgt-atgttattttgtttcataatt-gtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaa 221  Q
    | |||| |||||||  |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  18206997 tctatgttgatatgccatgttattttgtttaataatttgccgtgttataaaaactactaatgatatttaaaggagcaactaaatcaatcggtctaacaaa 18206898  T
Q  222 tgttaaagtg 231  Q
    | ||||||||    
T  18206897 tattaaagtg 18206888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 61 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 30115525 - 30115340
Alignment:
Q  61 aacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataatt 159  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  30115525 aacgggtatattggtacccatcccgaacccatattcaaacccgtcccgaatgcataaaattattttatgttgatatgctatgttattttgtttgataatt 30115426  T
Q  160 gtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  30115425 gccgtgttataaaaaccaccatttatatttaaaggagcaactaaatcgatcagtctaacaaatgttaaagtgagcatattgttgga 30115340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30996674 - 30996466
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||| | |||||||||    
T  30996674 ttttctccgattttaaaacacgagtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaacacacacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 30996575  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||| | |||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||  | ||||||| |||    
T  30996574 ttaagttgatatgccatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccgttgatatttaaaggatcaaataaatcattccgtctaac-aat 30996476  T
Q  223 gttaaagtga 232  Q
    ||||||||||    
T  30996475 gttaaagtga 30996466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15890284 - 15890069
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||| |||| | |||||||||    
T  15890284 ttttctccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtaccca-cccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattact 15890186  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |    |||||||||||    
T  15890185 ttatgttgatatgtcatgttattttatttgataattgtcatattaatgaaaactaccattgatatttgaaggatcaattaaataattacgtctaacaaat 15890086  T
Q  223 gttaaagtgaacatatt 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  15890085 gttaaagtgaacatatt 15890069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 5908699 - 5908921
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||| |||||||||||| |||| | |||||||||    
T  5908699 ttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatatgtacacaccccaaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 5908798  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |    |||||||||||    
T  5908799 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaat 5908898  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    || ||||||| | |||| |||||    
T  5908899 gtgaaagtgagcttattgttgga 5908921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 40517884 - 40517662
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| || | | ||||||| |    
T  40517884 ttttccccgatcccaaaacacgggtatgggatgggtaacgggtatatagttacccaccccgaacccatactcaaacccgtcccaaaggtaaaaaattatt 40517785  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    |||||||||||    
T  40517784 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaat 40517685  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    || ||||||| | |||| |||||    
T  40517684 gtgaaagtgagcttattgttgga 40517662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Original strand, 42987490 - 42987699
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||| | ||||||| |    
T  42987490 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgtgtaacggatatataggtacccatcccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattatt 42987589  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||    |||||||||||    
T  42987590 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaat 42987689  T
Q  223 gttaaagtga 232  Q
    || |||||||    
T  42987690 gtgaaagtga 42987699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 84 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 3573243 - 3573087
Alignment:
Q  84 cgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccatt 182  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3573243 cgaacccatactcaaacccctcccgaatgtagaaaattattttatgttgatatgtcatgttattctgtttgataattgtcgtgttataaaaactaccatt 3573144  T
Q  183 gatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 239  Q
    |||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3573143 gatattcaaaggagcaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 3573087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 28045743 - 28045511
Alignment:
Q  14 tgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgc 113  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| |||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||||     
T  28045743 tgggtatgggtttttccctaattcaaaa-cacgaatatgggacgggtaacgggtatataggtaccca-cccgaacccatacccatacccgtcccaaatgt 28045646  T
Q  114 agaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt--ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaacc 210  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||       
T  28045645 aaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgttttataattgttatgttaaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcatta 28045546  T
Q  211 ggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28045545 cgtctaacaaatgttaaagtgaacatattgttgga 28045511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 239
Target Start/End: Original strand, 8453389 - 8453598
Alignment:
Q  30 cccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacc-cgtcccgaatgcagaaaattactttat 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||| |||||| || |||||| |||| | |||||| |||| ||||||||| |||||    
T  8453389 cccgatttcaaaacacgggtatgggatgggtaacagatatataggtacacaccccaaagtcatactcaaaactcgtcccaaatgtagaaaattagtttat 8453488  T
Q  129 ggtgatatgtatgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaa 228  Q
    | | ||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||    
T  8453489 gttaatatgtc-gttattttgtttaataattgtcatgttataaaaattaccattgatatttaaaggagtaactaaatcattcggtcaaacaaatgttaaa 8453587  T
Q  229 gtgaacatatt 239  Q
     ||| ||||||    
T  8453588 atgagcatatt 8453598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 12866562 - 12866779
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||| | |||||||||    
T  12866562 ttttctccgatttcaaaacatgggtatgggacgggtaacaggtatataggtacccaccgcgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattact 12866661  T
Q  125 ttatggtgatatg--tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaa 221  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||      ||||||||||    
T  12866662 ttatgttgatatgtctatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttgaatgatcaattaaattgttacgtctaacaaa 12866761  T
Q  222 tgttaaagtgaacatatt 239  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  12866762 tgttaaagtgagcatatt 12866779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 6155931 - 6156145
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | ||||  ||||||||||    
T  6155931 ttttccccgatttcaaaacacgggtataggacaggtaa--ggtatatatgtacccaccccgaacccatacccaaaaccgtcacaaatgttgaaaattact 6156028  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| | |||||  |||||||||||||| ||||||||| || || |||||| || |||||||||||||||||| || |||||||  | |||||||||||    
T  6156029 ttatgtttatatgacatgttattttgtttgataattgtcatggtaataaaaaatatcattgatatttaaaggagcaaataaatcattccgtctaacaaat 6156128  T
Q  223 gttaaagtgaacatatt 239  Q
    |||||||||| ||||||    
T  6156129 gttaaagtgagcatatt 6156145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 13402015 - 13402235
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||  | ||||||||| |||| | |||||||||    
T  13402015 tttttcccgattttcaaacacgggtatggaacgggtaacgggtatttaggtacccactccgaaccca-accgatacccgtcccaaatgtaaaaaattact 13402113  T
Q  125 ttatggtgatatgtatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||    ||||||||||||    
T  13402114 ttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactactattgatatttaaaggatcaactaaatcatttcgtctaacaaatg 13402213  T
Q  224 ttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||| ||| |||||| |||||    
T  13402214 ttaaaatgagcatattgttgga 13402235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 245
Target Start/End: Original strand, 22694913 - 22695134
Alignment:
Q  26 tttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactt 125  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  22694913 tttccccgatctcaaaatacgggtatgggacgactaacgggtatagaggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattattt 22695012  T
Q  126 tatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||    ||||||||||||    
T  22695013 tatgttgatatgtaatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactatatcattttgtctaacaaatg 22695112  T
Q  224 ttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    | ||||||| | |||| |||||    
T  22695113 tgaaagtgagcttattgttgga 22695134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 12834585 - 12834802
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||| || |||| |||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||| |||| | ||||||| |    
T  12834585 ttttctccaatttcaaaacatggatatgggacgggtaacaggtatataggtacctaccccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattaat 12834684  T
Q  125 ttatggtgatatg--tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaa 221  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||     ||||||||||    
T  12834685 ttatgttgatatgtctatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttgaatgatcaattaaatcgttacgtctaacaaa 12834784  T
Q  222 tgttaaagtgaacatatt 239  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  12834785 tgttaaagtgagcatatt 12834802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 245
Target Start/End: Original strand, 3564773 - 3564960
Alignment:
Q  60 taacgggtatataggtaccc-accccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgtatgttattttgtttcataat 158  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||| ||||  || |||||| || |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  3564773 taacaggtatataggtaccctactccgaacccatatccatacccgttccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtatgttattttgtttgataat 3564872  T
Q  159 tgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3564873 tgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgagcatattgttgga 3564960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 29245962 - 29246184
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||| |||| |||| | ||||||| |    
T  29245962 ttttctccgatttcaaaacacgggtatgggacgaataacatgtatataggtacccaccccaaacccatacccatacccatcccaaatgtaaaaaattatt 29246061  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||| | |  ||||||||||  | |||||||||||    
T  29246062 ttatgttggtatgtcatgttattttgtttgataattgttatgttaataaacactaccattgatatttaatgaatcaattaaatcattccgtctaacaaat 29246161  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    |||||||||| |||||| |||||    
T  29246162 gttaaagtgagcatattgttgga 29246184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 58 - 195
Target Start/End: Original strand, 6092562 - 6092701
Alignment:
Q  58 ggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatg-tatgttattttgtttcata 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  6092562 ggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaatccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttgata 6092661  T
Q  157 attgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaagga 195  Q
    ||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6092662 attgcaatgttaataaaaactaccattgatatttaaagga 6092701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 78 - 230
Target Start/End: Original strand, 42717696 - 42717849
Alignment:
Q  78 ccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttc-ataattgtcgtgttataaaaac 175  Q
    |||||| |||| ||| | |||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  42717696 ccaccctgaacccatgctcaaatccgtcctgaatgcagaaaattactt-atgttgacatgccatgatattttgttttgataattgtcgtgttataaaaac 42717794  T
Q  176 taccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagt 230  Q
    || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42717795 tatcattgatatttaaaggagaaactaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagt 42717849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 100 - 245
Target Start/End: Original strand, 33862270 - 33862415
Alignment:
Q  100 cccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagta 198  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||  |    
T  33862270 cccgtcccgaatgcagaaaactattttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgtcatgttgtaaaaactacgattgatatttaaatgacca 33862369  T
Q  199 attaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    | ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33862370 actaaatcaa-tgggctaacaaatgttaaagtgaacatattgttgga 33862415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Original strand, 20973507 - 20973705
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||| |||| | |||||||||    
T  20973507 ttttccccgattttcaaacacgggtatgggatgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccata-----------cccaaatgtaaaaaattact 20973595  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |  || |||||||  | |||||| ||||    
T  20973596 ttatgttgatatgtcatggtattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatgtaaagtatcaactaaatcattccgtctaaaaaat 20973695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 27302746 - 27302965
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | ||||   |||||||||||||||||||||  ||||  || || |||||| || | | |||||||||    
T  27302746 ttttccccgatttcaaaacacggatatgagacggataacaaatatataggtacccaccccgaatccatagtcatacacgtcccaaacgtaaaaaattact 27302845  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  ||  |  ||||||||||||||||||||  || |||||||  |  |||||||||||    
T  27302846 ttatgttaatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgt--tactacgtaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccatctaacaaatg 27302943  T
Q  224 ttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||| |||||| |||||    
T  27302944 ttaaagtgatcatattgttgga 27302965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6369773 - 6369566
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||| ||||| |||| ||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||   |||||||||  |||| | |||||||||    
T  6369773 ttttccctgatttcaaaatacgagtatgggag-ggtaacgtgtatatatgtacccaccccgaacccatactttaacccgtccaaaatgtaaaaaattact 6369675  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||||  ||  ||||||||||||| |||||| || |||| || ||||||||| ||||| |||||| ||  || |||||||  | |||||||||||    
T  6369674 ttatgttgatgcgtcgtgttattttgtttgataattatcatgttaatgaaaactaccgttgatgtttaaaagatcaactaaatcattccgtctaacaaat 6369575  T
Q  223 gttaaagtg 231  Q
    |||||||||    
T  6369574 gttaaagtg 6369566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 38973004 - 38972905
Alignment:
Q  20 tgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaa 119  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  38973004 tgggtttttccc-gatttcaaaacatgggtatgggataggtaacgggaatataggtacccaccccgaacccatactcaaacccatctcaaatgcataaaa 38972906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 89
Target Start/End: Original strand, 33728012 - 33728076
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaact 89  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33728012 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaact 33728076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 10127152 - 10127062
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaatta 122  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||||||    
T  10127152 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggac-------gggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaatta 10127062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 15564691 - 15564576
Alignment:
Q  48 gtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttatt 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||  |||  || ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||   |||||||| ||||||||    
T  15564691 gtatgggatgggtaacgggtatatctgtattcatcccgaactcatactcaaactcgtcccgaatgtagaaaattactttacattgatatgtcatgttatt 15564592  T
Q  147 ttgtttcataattgtc 162  Q
    || ||| | |||||||    
T  15564591 ttttttgaaaattgtc 15564576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 28569032 - 28569106
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  28569032 ttttccccgatttcaaaatgcgggtacgggacgggtaacggggatataggtacccaccccgaacccatacccaaa 28569106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 29665043 - 29664962
Alignment:
Q  31 ccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg 112  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||  ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29665043 ccgatttcaaaacacgggtacatgatgggtaacggggatataggtacccacttcgaactcatacccaaacccgtcccgaatg 29664962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 6810236 - 6810149
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg 112  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| || || ||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  6810236 ttttccccgattttagaacacgggtacggaacgggtaacgaggatataagtactcaccccgaacccatacccaaacccatcccgaatg 6810149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 94
Target Start/End: Original strand, 10822520 - 10822606
Alignment:
Q  7 ttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatac 94  Q
    |||||||||| | |||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||    
T  10822520 ttttgactggatttgggtttt-ctccgatttcaaaacacgggtataggacgggtaacggggttatatgtacccaccccgaacccatac 10822606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 71 - 177
Target Start/End: Original strand, 33420388 - 33420494
Alignment:
Q  71 taggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttat 169  Q
    ||||||||||  | |||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||| | |||||  |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  33420388 taggtacccattctgaacccatacccaaacccgtcttgaatgtagaaaat-attttatattgatatgtcatgttattttatttgataattgtcgtgttat 33420486  T
Q  170 aaaaacta 177  Q
    ||||||||    
T  33420487 aaaaacta 33420494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 12457594 - 12457500
Alignment:
Q  26 tttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaat 120  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||    |||||   || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  12457594 tttcctcgatttcaaaatacgggtatgggacaggtaacatagatataaacactcactccgaactcatacccaaacccgtcccgaatgtagaaaat 12457500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 118
Target Start/End: Original strand, 23045002 - 23045095
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaa 118  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||  |||||||| |||||    
T  23045002 ttttccccgatttcaaaatacgggtacgggatgggtaacggagatatatgtacccaccccgaacccataccaaaaccctacccgaatgtagaaa 23045095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 8020693 - 8020598
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaat 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  | |  |||||| || |||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||    
T  8020693 ttttccccgatttcaaaacacgggtactgaatgggtaacagggatataggtactcatctcgaactcatacgcaaacccgttctgaatgtagaaaat 8020598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 112
Target Start/End: Original strand, 27900412 - 27900499
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg 112  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||||||| | ||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  27900412 tttttcccgatttcaaaacatgggtatgggacgggtaatgtggatataggtacccatctcgaacccatacccaaatccgccccgaatg 27900499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 120
Target Start/End: Original strand, 18451896 - 18451991
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaat 120  Q
    ||||||||||||| |||| || |||| | |||| |||||    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || |||||||    
T  18451896 ttttccccgatttgaaaatacaggtacgagacatgtaacacagatataagtacccaccccgaactcataatcaaactcgtcccgattgtagaaaat 18451991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 40187668 - 40187770
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    |||||||| |||| |||||||||||  | ||| ||||||||  |||||||||  || ||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||| |    
T  40187668 ttttccccaatttcaaaacacgggtgcgagacgggtaacggagatataggtattca-cccaaactcatacccaaactcgtcccgaatatagaaaattaat 40187766  T
Q  125 ttat 128  Q
    ||||    
T  40187767 ttat 40187770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 112
Target Start/End: Original strand, 18116550 - 18116604
Alignment:
Q  58 ggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg 112  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  18116550 ggtaacggggatatatgtatccaccccgaactcatacccaaaccctacccgaatg 18116604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 43523804 - 43523750
Alignment:
Q  58 ggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg 112  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  43523804 ggtaacggggatatatgtatccaccccgaactcatacccaaaccctacccgaatg 43523750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10127041 - 10126964
Alignment:
Q  168 ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||    ||||||||||||| ||||||| | |||| |||||    
T  10127041 ataaaaactaccattgatatttaaaagatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttgga 10126964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 112
Target Start/End: Original strand, 16311310 - 16311391
Alignment:
Q  31 ccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg 112  Q
    ||||||| |||||||| ||| | ||| | |||| || ||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||| ||||||    
T  16311310 ccgatttcaaaacacgagtacgagacggataacagggatataggtacccaccccgaacccatattcaaacctgtctcgaatg 16311391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 12915561 - 12915458
Alignment:
Q  14 tgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgc 113  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| | || || || ||||||||||||| ||| ||| | |||||||| |||||  ||||| |||||||  ||||||||     
T  12915561 tgggtttgggtttttccc-gatttcataatacaggcatgggacaggtaatggggatacatgtacccactccgaagccatacccaaaccctacccgaatgt 12915463  T
Q  114 agaaa 118  Q
    |||||    
T  12915462 agaaa 12915458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 117
Target Start/End: Original strand, 32574949 - 32575041
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaa 117  Q
    ||||||||||||| ||||||| | || ||||  ||||||  | ||||| ||||||| ||||||| || || |||||||| |||||||| ||||    
T  32574949 ttttccccgatttcaaaacacagatacgggatgggtaacatggatatatgtacccatcccgaacccaaacccaaacccgccccgaatgtagaa 32575041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 52)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 44615485 - 44615707
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaat-tac 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| || ||||  |||    
T  44615485 ttttccctgatttaaaaacacgggtatgggacgggtaacaggtatataggtacccaccccaaactcatacccaaacccgtcccaaatccaaaaaaactac 44615584  T
Q  124 tttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    |||||  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  44615585 tttatcttgatatgccatgttattttgtttgataattgtcgtgttataaaaactattattgatatttaaaggagaaactaaatcaatcggtctaacaaat 44615684  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  44615685 gttaaagtgaacatattgttgga 44615707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 44793084 - 44792862
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaat-tac 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| || ||||  |||    
T  44793084 ttttccctgatttaaaaacacgggtatgggacgggtaacaggtatataggtacccaccccaaactcatacccaaacccgtcccaaatccaaaaaaactac 44792985  T
Q  124 tttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    |||||  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  44792984 tttatcttgatatgccatgttattttgtttgataattgtcgtgttataaaaactattattgatatttaaaggagaaactaaatcaatcggtctaacaaat 44792885  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  44792884 gttaaagtgaacatattgttgga 44792862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 29871295 - 29871510
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  29871295 ttttctccgatttcaaaacatgggtatgggacaggtaactggtatataggtacccaccctgaactcatacccaaacccgtcccgaatgtagaaaattatt 29871394  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||     
T  29871395 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattcccatgttataaaaactaccattgatatttaaaggagcaactacatcaatcggtctaacaaata 29871494  T
Q  224 ttaaagtgaacatatt 239  Q
    ||||| ||| ||||||    
T  29871495 ttaaaatgagcatatt 29871510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 228
Target Start/End: Original strand, 34673282 - 34673496
Alignment:
Q  14 tgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgc 113  Q
    ||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| |     
T  34673282 tgggtttgggtttttccca-atttcaaaacacgggtatgagactggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacctgttccgaacga 34673380  T
Q  114 agaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccgg 212  Q
    |||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  34673381 agaaaactactttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgccgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagcaactaaatcaaccgg 34673480  T
Q  213 tctaacaaatgttaaa 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  34673481 tctaacaaatgttaaa 34673496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 9982900 - 9983115
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9982900 ttttccccaatttcaaaacacgggaatgggatgggtaacgagtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccatcccgaatgcagaaaattact 9982999  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    ||||| | |||| | |||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  9983000 ttatgttaatatatcatgttattttgtttgataattctcatgttatcaaaactaccattgatattcaaaggagcaactaaattaatcggtctaacaaatg 9983099  T
Q  224 ttaaagtgaacatatt 239  Q
    ||||||||| ||||||    
T  9983100 ttaaagtgagcatatt 9983115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 45866195 - 45866417
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||| |||| | |||||||||    
T  45866195 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacaggtaatgagtatataggtacccaccccaaactcatacccatacccatcccaaatgtaaaaaattact 45866294  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  | |||||||||||    
T  45866295 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattatcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattctgtctaacaaat 45866394  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  45866395 gttaaagtgaacatattgttgga 45866417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12495089 - 12494868
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  12495089 tttttcccgatttcaaaacacggatatgggacgtgtaacgggtatataggtacccacctcgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtagaaaactact 12494990  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
     |||| ||| |||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||  | ||||||||||||||    
T  12494989 atatgttgacatgacatgttattttgttttataattggcgtgttataaaaactaccactgatatttaaaggagcaactaaatttatcggtctaacaaatg 12494890  T
Q  224 ttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  12494889 ttaaagtgaacatattgttgga 12494868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 49741054 - 49741238
Alignment:
Q  62 acgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  49741054 acgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactactttatgttaatatgttatgttattttgtttgataattg 49741153  T
Q  161 tcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49741154 atgtgttataaaaactactattgatatttaaaggagcaactaaataaatcggtttaacaaatgttaaagtgaacatattgttgga 49741238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 19572512 - 19572737
Alignment:
Q  14 tgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgc 113  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||     
T  19572512 tgggtatgggtttttccc-gatttcaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatactcatacccgtcccaaatgt 19572610  T
Q  114 agaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccg 211  Q
    | ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||        
T  19572611 aaaaaattattttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgccatgttaataaaaactaccattgata-ttgaaggatcaattaaatcattac 19572709  T
Q  212 gtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19572710 gtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 19572737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29936495 - 29936273
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||||||||    
T  29936495 ttttccccgatctcaaaatacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 29936396  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    |||||||||||    
T  29936395 ttatgttgatatgtaatgttatttttttttataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaat 29936296  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    || ||||||| | |||| |||||    
T  29936295 gtgaaagtgagcttattgttgga 29936273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17135026 - 17134810
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| || || ||||||  ||| | |||||||||    
T  17135026 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacgggtaacgggtatataggtaccatccccgaacccatacccatactcgtcccatatgtaaaaaattact 17134927  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    |||||||||||    
T  17134926 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcatttcgtctaacaaat 17134827  T
Q  223 gttaaagtgaacatatt 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  17134826 gttaaagtgaacatatt 17134810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 16433177 - 16433386
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||   |||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  16433177 ttttctccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacggatatataggtaccc---ccgaacccatacccaaacccaccccaaatgcagaaaattact 16433273  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||     
T  16433274 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgta---ttataaaaactaccattgatatttaaaggagcaactaaatcaattggtctaacaaata 16433370  T
Q  224 ttaaagtgaacatatt 239  Q
    ||||||||| ||||||    
T  16433371 ttaaagtgagcatatt 16433386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 40087474 - 40087695
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| | |||||||||    
T  40087474 ttttccccgattcaaaa-cacaggtatgggatgagtaacgggaatataggtacccaccccgaactcatactcatacccgtcccaaatgtaaaaaattact 40087572  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  | |||||||||||    
T  40087573 ttatgttgatatatcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaat 40087672  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    |||||||||| |||||| |||||    
T  40087673 gttaaagtgagcatattgttgga 40087695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 18354090 - 18354312
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||  |||| || || |||||| |||| | ||||||| |    
T  18354090 ttttccccgatttcaaaacatgggtatgggacgggtaacgggtatataagttcccaccccgaaccgatacccatactcgtcccaaatgtaaaaaattatt 18354189  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||  | ||||| |||||    
T  18354190 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaagatcaactaaatcattccgtctatcaaat 18354289  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  18354290 gttaaagtgaacatattgttgga 18354312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 24236771 - 24236993
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | ||||||| |    
T  24236771 ttttccccgatctcaaaacacgggtatggaacggggaacgggtatataggtacccaccccgaacccatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaattatt 24236870  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||    |||||||||||    
T  24236871 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaat 24236970  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    || |||||| || |||| |||||    
T  24236971 gtgaaagtggacttattgttgga 24236993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 3627972 - 3628219
Alignment:
Q  1 ttcccgttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaac 100  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||  |    
T  3627972 ttcccgttttgactgggtataggtttt-ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatgtaggtacccaccccgaacccatactcattc 3628070  T
Q  101 ccgtcccgaatg--cagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggag 196  Q
    | ||||| ||||   | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| |||     
T  3628071 cagtcccaaatgtaaaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattatcatgttaataaaaactaccattaatatttaacggat 3628170  T
Q  197 taattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
     || |||||||    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3628171 caactaaatcattacgtctaacaaatgttaaagtgagcatattgttgga 3628219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Original strand, 36187230 - 36187439
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||| | ||| ||| |    
T  36187230 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccctgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaagttatt 36187329  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||    |||||||||||    
T  36187330 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaatgatcaactaaatcattttgtctaacaaat 36187429  T
Q  223 gttaaagtga 232  Q
    || |||||||    
T  36187430 gtgaaagtga 36187439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 17091969 - 17092191
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | || ||||||||| |||| | |||||||||    
T  17091969 ttttccccgattttataacacaggtatgggacgcgtaacgggtatataggcactcaccccgaacccatgcccatacccgtcccaaatgtaaaaaattact 17092068  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||  |  ||||| ||||    
T  17092069 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattccatctaataaat 17092168  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  17092169 gttaaagtgaacatattgttgga 17092191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28298013 - 28297788
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg-cagaaaattac 123  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||  | |||| ||     
T  28298013 ttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactat 28297914  T
Q  124 tttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaa 221  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |    ||||||||||    
T  28297913 tttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaattattttgtctaacaaa 28297814  T
Q  222 tgttaaagtgaacatattcttggaca 247  Q
    ||| ||||||| | |||| |||||||    
T  28297813 tgtgaaagtgagcttattgttggaca 28297788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 35936839 - 35937042
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||            |||||||||  ||||| |||||||||||    
T  35936839 ttttccccgatttcaaatcacgagtatgggacggataacgggtatataggtacccacccc------------aaacccgtcatgaatgtagaaaattact 35936926  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||    
T  35936927 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataatttccgtgttacaaaaactaccattgatatttaaaggagcaactaaatcaattggtctaacaaatg 35937026  T
Q  224 ttaaagtgaacatatt 239  Q
    ||||||||| ||||||    
T  35937027 ttaaagtgagcatatt 35937042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 245
Target Start/End: Original strand, 42439694 - 42439902
Alignment:
Q  39 aaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatg- 137  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | |||| |||| | |||||||||||||| |||||||     
T  42439694 aaaacatgggtatgggacgagtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatatccaaactcatcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgt 42439793  T
Q  138 tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacat 236  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||    ||||||||||||||||||||| | |    
T  42439794 tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgttaaagtgagctt 42439893  T
Q  237 attcttgga 245  Q
    ||| |||||    
T  42439894 attgttgga 42439902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 51421947 - 51421728
Alignment:
Q  14 tgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgc 113  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||     
T  51421947 tgggtatgggtttttccc-gatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacatgtatatatgtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgt 51421849  T
Q  114 agaaaattactttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccg 211  Q
    | ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||        
T  51421848 aaaaaattactctatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgccatgttaataaaaactaccattgctatttaaaggatcaactaaatcatttt 51421749  T
Q  212 gtctaacaaatgttaaagtga 232  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  51421748 gtctaacaaatgtgaaagtga 51421728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 245
Target Start/End: Original strand, 50426672 - 50426887
Alignment:
Q  26 tttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactt 125  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||      ||||||| |||| | ||| ||||||    
T  50426672 tttccctgatttcaaaacacgggtatgagacggataacgggtatataggtacccaccccgaacccatac------ccgtcccaaatgtaaaaatttactt 50426765  T
Q  126 tatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||  | |||| |||||||    
T  50426766 tatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtcttacaaatg 50426865  T
Q  224 ttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||| |||||| |||||    
T  50426866 ttaaagtgagcatattgttgga 50426887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23966922 - 23966729
Alignment:
Q  55 acaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg-cagaaaattactttatggtgatatg-tatgttattttgttt 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||  | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23966922 acaggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatactcatacccgtcccaaatgtaaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgttt 23966823  T
Q  153 cataattgtcgtg-ttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
     ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23966822 gataattgtcatgtttataaaaactactattgatatttaaagtatcaactaaatcattccatctaacaaatgttaaagtgagcatattgttgga 23966729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 34611162 - 34610930
Alignment:
Q  14 tgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgc 113  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||     
T  34611162 tgggtatgggtttttccc-gatctcaaaacacgggtatgggacatgtaacgtgtatataggtactcaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgt 34611064  T
Q  114 agaaaattactttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccg 211  Q
    | || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| |        
T  34611063 aaaatactactttatgttgatatgttatattattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaagatcaactaaataatttt 34610964  T
Q  212 gtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||| |||||    
T  34610963 gtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttgga 34610930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5181118 - 5180902
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||      |||| || |||| | ||||||| |    
T  5181118 ttttccccgatttcaaaatacgggtatgggacgggtaacgggtatataggcacccaccccaaacccatac------ccgttccaaatgtaaaaaattatt 5181025  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    |||||||||||    
T  5181024 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcatttcgtctaacaaat 5180925  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
     ||||||||| |||||| |||||    
T  5180924 tttaaagtgagcatattgttgga 5180902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 34060035 - 34060251
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaa-ttac 123  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||      ||||||| | || | |||| ||||    
T  34060035 ttttcctcgatttcaaaacacgggtatgagacggataacaggtatataggtacccactccgaacccatac------ccgtcccaattgtaaaaaaattac 34060128  T
Q  124 tttatggtgatatgtatgttattttgtttcataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||  | |||||||||||    
T  34060129 tttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaacaaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaat 34060228  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    |||||||||| |||||| |||||    
T  34060229 gttaaagtgagcatattgttgga 34060251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 49250783 - 49251005
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||    
T  49250783 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaatgggtatataggtatccacctcgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactact 49250882  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||  || ||||| |    |||||||||||    
T  49250883 ttatgttgatatgttatgctattttgtttgataattgtcatgttgataaaaactatcattgatatttaaaagatcaactaaattattttgtctaacaaat 49250982  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    || ||||||| | |||| |||||    
T  49250983 gtgaaagtgagcttattgttgga 49251005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 42707847 - 42708062
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||| |||| |||||      ||||||| |||| | ||||||| |    
T  42707847 ttttctccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggaatataagtactcaccc-gaacccatac------ccgtcccaaatgtaaaaaattatt 42707939  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  | |||||||| ||    
T  42707940 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacagat 42708039  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    |||||||||| |||||| |||||    
T  42708040 gttaaagtgagcatattgttgga 42708062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16409021 - 16408823
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||  || |||| | |||||||||    
T  16409021 ttttccccaatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacaggtatataggtaccgaccccgaacccatagctaaacccgctccaaatgtaaaaaattact 16408922  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    |||||    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  | |||||||||||    
T  16408921 ttatg----tatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaat 16408826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 44632151 - 44632361
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||| |||||  |||  ||||  ||||| |||||  ||||  |||||||||     
T  44632151 ttttctccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacaggtgtatgggtatccaccgtgaatccatatccaaactcgtcctaaatgtcgaaaattacg 44632250  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    ||     ||||||  || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||    
T  44632251 tt-----gatatgccatattattttgtttgacaattgtcgtgttataaaaactatcattgatatttaaaggagcaactaaatcaataggtctaacaaatg 44632345  T
Q  224 ttaaagtgaacatatt 239  Q
    ||||||||| ||||||    
T  44632346 ttaaagtgatcatatt 44632361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 162
Target Start/End: Original strand, 23490781 - 23490919
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| | |||| || |    
T  23490781 ttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccataccaaaacccgtcccaaatgtaaaaaactaat 23490880  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtc 162  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  23490881 ttatgtggatatgttatgttattttgtttgataattgtc 23490919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24710926 - 24710715
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||           ||| |||||||||||| |||| | |||||||||    
T  24710926 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtaccca-----------tactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 24710838  T
Q  125 ttatggtgata-tgtatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||    |||||||||||    
T  24710837 ttatgttgatacattatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaat 24710738  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    || ||| ||| | |||| |||||    
T  24710737 gtgaaaatgagcttattgttgga 24710715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 62 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 13390455 - 13390354
Alignment:
Q  62 acgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  13390455 acgggtatataggtacccaccccgaactcatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattg 13390356  T
Q  161 tc 162  Q
    ||    
T  13390355 tc 13390354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 2514814 - 2514671
Alignment:
Q  58 ggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgat-atgt-atgttattttgtttcat 155  Q
    ||||| ||| |||||| || ||||||||||  |||||  ||| | |||||||||||| ||||||| |||||| |||  |||| |||||||||||||| ||    
T  2514814 ggtaaagggcatatagatatccaccccgaatacatacctaaatctgtcccgaatgcataaaattattttatgttgaacatgtcatgttattttgtttgat 2514715  T
Q  156 aattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaa 199  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2514714 aattgccgtgtaataaaaactaccattgatatttaaagtagtaa 2514671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 39616317 - 39616160
Alignment:
Q  90 catacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatat 187  Q
    ||||| || ||||||||| |||| | ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||    
T  39616317 catacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgttattttgtttgctaattatcatgttaataaaaattaccattgatat 39616218  T
Q  188 ttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||| ||  | ||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  39616217 ttaaatgatcagttaaatcattccgtctaacagatgttaaagtgagcatattgttgga 39616160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16903602 - 16903515
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg 112  Q
    |||| ||| |||| |||||||| ||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16903602 tttttcccaattttaaaacacgagtacgggataggtaatggggatataggtacccaccccgaactcatacccaaacccgtcccgaatg 16903515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 48125674 - 48125788
Alignment:
Q  5 cgttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgt 104  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||  ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  48125674 cgttttgactgagtttggatttttcct-gattttaaaacacgggtacgggacgggtaacgaggatataggtatccaccccgaacccatacccaaactcgt 48125772  T
Q  105 cccgaatgcagaaaat 120  Q
    | |||||| |||||||    
T  48125773 cgcgaatgtagaaaat 48125788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 39219337 - 39219234
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |  |||| ||||||||| |    
T  39219337 ttttccccgattttaaaacacgggtacggaacaagtaacggggatacatgtacccaccccgaacccatacccaaactcgttctaaatgtagaaaattaat 39219238  T
Q  125 ttat 128  Q
    ||||    
T  39219237 ttat 39219234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20774647 - 20774489
Alignment:
Q  90 catacacaaacccgtcccgaatgcagaaaat-tactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgata 186  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | ||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||   |||||||    
T  20774647 catacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaacttttattgata 20774548  T
Q  187 tttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    |||||||||  || ||||| |    ||||||||||||| ||||||| | |||| |||||    
T  20774547 tttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaatgtgaaagtgagcttattgttgga 20774489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 143 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13020648 - 13020559
Alignment:
Q  143 tattttgtttcataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtg 231  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||  | ||||||||||| ||||||||    
T  13020648 tattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagtatcaactaaatcattccgtctaacaaatattaaagtg 13020559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 118
Target Start/End: Original strand, 10450070 - 10450162
Alignment:
Q  26 tttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaa 118  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||| ||| | |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||    
T  10450070 tttccccaattttaaaatacgggtacggggcgggtaacagggatatatgtacccaccccgaactcatacccaaaccctacccgaatgtagaaa 10450162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 105
Target Start/End: Original strand, 10778577 - 10778657
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtc 105  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  10778577 tttttcccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacggggttatagatatccaccccgaacccatactcatacccgtc 10778657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 118
Target Start/End: Original strand, 16237314 - 16237407
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaa 118  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| | ||||| ||||  ||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||    
T  16237314 ttttccccgatttcaaaatacgggtaagggacgggtaacgaggatatatgtactaaccccgaacccatacccaaaccctacccgaatgtagaaa 16237407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 23058545 - 23058459
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaat 111  Q
    ||||| ||||||| ||||  || ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||    
T  23058545 ttttctccgatttcaaaatgcgagtacgagacgggtaacggggatataggtacccaccccgaacccatacccaaaccctacccgaat 23058459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 34085318 - 34085245
Alignment:
Q  20 tgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatac 94  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||    
T  34085318 tgggtttttccc-gatttcaaaacacgagtatgggatgggtaacggggttatatgtacccaccccgaacccatac 34085245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 8880520 - 8880439
Alignment:
Q  32 cgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgc 113  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||| |||||| | || ||||| |||||||||||| |||||    
T  8880520 cgatttaaaaacacgagtacaggacaggtaatggggataaaggtatccaccctggacccatacccaaacccgtcccaaatgc 8880439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 118
Target Start/End: Original strand, 35069899 - 35069992
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaa 118  Q
    ||||||||||||| | || |||||||   ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||    
T  35069899 ttttccccgatttcataatacgggtacaagacgggtaacagggatatatgtacccaccccgaacccatactcaaaccctacccgaatgtagaaa 35069992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 120
Target Start/End: Original strand, 41476976 - 41477057
Alignment:
Q  39 aaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaat 120  Q
    |||| ||| ||| ||||| | ||||| | ||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  41476976 aaaatacgagtacgggacggataacgtggatatatgtacccaccccgaatccatacccaaacccgtcccgaaagcagaaaat 41477057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 120
Target Start/End: Original strand, 25154836 - 25154932
Alignment:
Q  24 tttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaat 120  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||| |||||  |||| ||| ||||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||| ||||  |||||||    
T  25154836 ttttttcccgatttcaaaacacgagtacgggacgagtaatggggatataagtacccacttcgaactcatgcccaaacccgtcctgaatttagaaaat 25154932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 80
Target Start/End: Original strand, 33293537 - 33293596
Alignment:
Q  20 tgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtaccca 80  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||    
T  33293537 tgggtttttccc-gatttcaaaacacgggtatgggacgggtaatggggatataggaaccca 33293596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 38733956 - 38733901
Alignment:
Q  138 tatgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaag 193  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  38733956 tatgttatttggtttgataattgtcatgttataaaaattgtcattgatatttaaag 38733901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 33471 - 33250
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  33471 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatatgtacccaccccgaacccatacccaaactcgtcccgaatgcagaaaactact 33372  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    ||||| ||| |||  ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||| ||    
T  33371 ttatgttgacatgccatgttattttgtttggtaattgttgtgttataaaaactacgattgatatttaaaggaacaactaaatcaatcggtctaacaattg 33272  T
Q  224 ttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||| |||||||| |||||    
T  33271 ttaaagtaaacatattgttgga 33250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 46)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14506181 - 14505943
Alignment:
Q  7 ttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcc 106  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  14506181 ttttgactgggtttgggtttt-ccccgatttcaaaacacaggtatgggacgggtaacaagtatttaggtacccaccccgaacccatacttaaacccgtcc 14506083  T
Q  107 cgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaat 205  Q
    | ||||||||||| |||||| || |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||    
T  14506082 caaatgcagaaaactactttgtgttgatatgtcacgttattttgtttgataattgtcgtgttataaaaactaacattgatattgaaaggagcaactaaat 14505983  T
Q  206 caaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  14505982 caatcagtctaacaaatgttaaagtgagcatattgttgga 14505943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 239
Target Start/End: Original strand, 24602848 - 24603081
Alignment:
Q  6 gttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtc 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  24602848 gttttgactgggtttgggtttt-cccagatttcaaaacatgggtatgtgacgggtaacaggtatatagatacccaccccgaacccatacccaaacccatc 24602946  T
Q  106 ccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaa 204  Q
     |||||| |||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  24602947 acgaatgtagaaaattactttatgttgatgtgccatgttattttgtttgataattgacgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggaacaactaaa 24603046  T
Q  205 tcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 239  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24603047 tcaatcggtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 24603081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 12678104 - 12678318
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  12678104 ttttccccgatttcaagacacaggtatgggacgggtaaagggtatataggtacccaccctgaacccatacccaaacccgtcccgaattgagaaaattatt 12678203  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||| |    
T  12678204 ttatattgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcgtgttataaaaattatcattgatatttaaaggagcaactaaatcaatcggtctaataaa-g 12678302  T
Q  224 ttaaagtgaacatatt 239  Q
    ||||||||| ||||||    
T  12678303 ttaaagtgagcatatt 12678318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2367404 - 2367182
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||||||||    
T  2367404 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataagtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatggaaaaaattact 2367305  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    |||||||||||    
T  2367304 ttatgtggatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggataaactaaatcattttgtctaacaaat 2367205  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    |||||||||| | |||| |||||    
T  2367204 gttaaagtgagcttattgttgga 2367182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Original strand, 10142528 - 10142737
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| | ||||||| |    
T  10142528 ttttccccgatctcaaaaaacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacccaaacctgtcccaaatgtaaaaaattatt 10142627  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    |||||||||||    
T  10142628 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaat 10142727  T
Q  223 gttaaagtga 232  Q
    || |||||||    
T  10142728 gtgaaagtga 10142737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32853922 - 32853700
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||||||||    
T  32853922 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 32853823  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||    |||||||||||    
T  32853822 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgccatgttaataaaaactaccattgatatttaaatgatcaactaaatcattttgtctaacaaat 32853723  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    || ||||||| | |||| |||||    
T  32853722 gtgaaagtgagcttattgttgga 32853700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 40 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 30816323 - 30816114
Alignment:
Q  40 aaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaat---tactttatggtgatat 136  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    ||||||||| ||||||    
T  30816323 aaacacgggtatgggatgggtaatgggtatataggaacccaccccgaacccatatccaaacccgtcccgaatgcaaaaaaaaactactttatgttgatat 30816224  T
Q  137 gt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaaca 235  Q
    || |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  30816223 gtgatgttattttgttggataattgccgtgttataaaaactaccattgacatttaaaggagcacctaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgtaca 30816124  T
Q  236 tattcttgga 245  Q
    |||| |||||    
T  30816123 tattgttgga 30816114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 80 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14032579 - 14032413
Alignment:
Q  80 accccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactac 178  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  14032579 accccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgcataaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgttgtgttataaaaactat 14032480  T
Q  179 cattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  14032479 cattgatatttaaaggagcaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgagcatattgttgga 14032413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27738850 - 27738666
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||||||||    
T  27738850 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacagatatatatgtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 27738751  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatca 207  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  27738750 ttatgttgatatgttatgttattttgtatgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggagcaactaaatca 27738666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11762523 - 11762342
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  11762523 tttttcccgatttctaaacaagggtatgggacgggtaacgggtatataggtgtccaccccgaactcatacccaaacccatcccaaatgtagaaaattact 11762424  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaat 205  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  11762423 ttatgttgatatgccatgttattttgttatataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttataggagcaactaaat 11762342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24225776 - 24225604
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||| | ||||||| |    
T  24225776 ttttccccgatctcaaaacacggatatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatgcccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattatt 24225677  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaagga 195  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24225676 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagga 24225604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 3483933 - 3484155
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||    
T  3483933 ttttccccgatctcgaaacacgggtatgggatgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactact 3484032  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |    |||||||||||    
T  3484033 ttatgtggatatgttatgttattttgtttcataattgtcatcttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaat 3484132  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    || ||||||| | |||| |||||    
T  3484133 gtgaaagtgagcttattgttgga 3484155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27534762 - 27534540
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||    
T  27534762 ttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaatccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactact 27534663  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |  || ||||| |    |||||||||||    
T  27534662 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaagaatcaactaaataattttgtctaacaaat 27534563  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    || ||||||||| |||| |||||    
T  27534562 gtgaaagtgaacttattgttgga 27534540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Original strand, 5863393 - 5863602
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||| || |    
T  5863393 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatagatacccacctcgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaatatt 5863492  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    |||||| ||||    
T  5863493 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattatcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaaaaaat 5863592  T
Q  223 gttaaagtga 232  Q
    || |||||||    
T  5863593 gtgaaagtga 5863602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 7393897 - 7394118
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||| ||| ||| |    
T  7393897 ttttccccgatttcaaaacacgagtaagagacggataatgggtatataggtatccaccccgaacccatactcaaactcatcctgaatgcataaatttatt 7393996  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    ||||| || ||| | || ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||    
T  7393997 ttatgttggtatatcatattattttgtttgataattaccgtgttataaaaactaacattgatatttaaaggaacaactaaatcaatcggtctaacaaatg 7394096  T
Q  224 ttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  7394097 ttaaagtgaacatattgttgga 7394118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12141463 - 12141254
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    |||||||| || | ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | ||||||| |    
T  12141463 ttttccccaatctcaaaacacggatatgggacgggtgacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattatt 12141364  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||    |||||||||||    
T  12141363 ttatgttgatacgttatgttattttgtttgataattgtcatcttaataaaaactaacattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaat 12141264  T
Q  223 gttaaagtga 232  Q
    || |||||||    
T  12141263 gtgaaagtga 12141254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12309648 - 12309441
Alignment:
Q  27 ttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattacttt 126  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  12309648 ttccctgatttcaaaacacgggtatggaacgggtaacaggtatatatgtacccaccccgaaccgatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattacttt 12309549  T
Q  127 atggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgtt 225  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||      |||| |||||||||||||||| | ||||||||||    ||||||||||||||    
T  12309548 atgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatatt------actatcattgatatttaaaggggcaattaaatcatttcgtctaacaaatgtt 12309455  T
Q  226 aaagtgaacatatt 239  Q
    ||||| ||||||||    
T  12309454 aaagtaaacatatt 12309441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14255021 - 14254821
Alignment:
Q  40 aaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt- 138  Q
    |||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||  |||| ||||| ||||  |||||| |||||| | ||| |||||||| ||||||||     
T  14255021 aaacacgggtatgggacgtgtaacggaaatataggtacccaccatgaacccatacccaaattcgtcccaaatgcaaataataactttatgttgatatgtc 14254922  T
Q  139 atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatat 238  Q
    |||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  14254921 atgttattttgtttgaaatttgatgtgttataaaaactatcattgatatttaaaggagcgattaaatcattcggtctaataaatgttaaagtcaacatat 14254822  T
Q  239 t 239  Q
    |    
T  14254821 t 14254821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 10188090 - 10188305
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||| | ||||||| |    
T  10188090 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggac-------gggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccatcccaaatgtaaaaaattatt 10188182  T
Q  125 ttatggtgatat-gtatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    |||||||||||    
T  10188183 ttatgttgatatattatgttattttgttcgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaat 10188282  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    || ||||||| | |||| |||||    
T  10188283 gtgaaagtgagcttattgttgga 10188305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 32053193 - 32053000
Alignment:
Q  3 cccgttttgactgggtgtgggt-----ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacaca 97  Q
    |||||||||||||||| |||||     ||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||    
T  32053193 cccgttttgactgggtttgggtatgggttttccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaacgggtatatatgtacccaccccaaacccataccca 32053094  T
Q  98 aacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatattt 189  Q
    |||||||||  |||| | |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||  || ||||||||    
T  32053093 aacccgtccaaaatgtaaaaaaatactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattatcatgttaataaaaacttacaatgatattt 32053000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 32532618 - 32532505
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| | |||||||||    
T  32532618 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaatgggtatataggtacccaccccgaacccatactcatacccgtcccaaatgtaaaaaattact 32532519  T
Q  125 ttatggtgatatgt 138  Q
    ||||| ||||||||    
T  32532518 ttatgttgatatgt 32532505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 140 - 239
Target Start/End: Original strand, 14410959 - 14411058
Alignment:
Q  140 tgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 239  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14410959 tgttattttgtttgataattgtcgtgttataaaaaccatcattgatatttaaaggagaaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgagcatatt 14411058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 14410842 - 14410946
Alignment:
Q  1 ttcccgttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaac 100  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14410842 ttcccgttttgactaggtttgagtttt-cccagatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaac 14410940  T
Q  101 ccgtcc 106  Q
    ||||||    
T  14410941 ccgtcc 14410946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14245210 - 14245110
Alignment:
Q  139 atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatat 238  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14245210 atgttattttgtttgaaaattgtcgtgttataaaaactaccattaatatttaaaggagcgactaaatcattcggtctaataaatgttaaagtgaacatat 14245111  T
Q  239 t 239  Q
    |    
T  14245110 t 14245110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 15498402 - 15498315
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||| ||||    
T  15498402 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacaggtaatgggtatataggtacccatcccgaacccacacccaaacccgtcccaaatg 15498315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 20349142 - 20349063
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgt 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20349142 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgagtaacggggatataggtacccaccccgaactcatacccaaatccgt 20349063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 13769150 - 13769055
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaat 120  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||||| |||||||    
T  13769150 ttttccccgacttcaaaacatgggtatgggacgggtaacggacatataggtacccacccagaacccatatccaaacccgtcctgaatgtagaaaat 13769055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 28079706 - 28079780
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  28079706 ttttccccgatttcaaaacatgggtacgggacgggtaacggggatataggtacccaccccgaacccatacccaaa 28079780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 29341338 - 29341239
Alignment:
Q  20 tgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaa 119  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  29341338 tgggtttttccc-gattttcaaacatgggcatgagacgggtaacggagatataggtacccatcccaaactcatacccaaacccgtcccgaatgtagaaaa 29341240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 9442503 - 9442445
Alignment:
Q  30 cccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaac 88  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9442503 cccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatagaggtacccactccgaac 9442445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 9458936 - 9458843
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaa 118  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||| |||||    
T  9458936 ttttccccgatttaataatacgggtacgggatgggtaacgggaatatatgtacccaccccgaacttatacccaaactctacccgaatgtagaaa 9458843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 14034601 - 14034521
Alignment:
Q  3 cccgttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccacccc 84  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||| || ||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14034601 cccgttttgactgggtttgagtttt-ccccgattttaagacacaagtatgagacgggtaacgggtatataggtacccacccc 14034521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 168 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32532497 - 32532420
Alignment:
Q  168 ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32532497 ataaaaactaccaatgatatttaaaggaccaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgagcatattattgga 32532420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 120
Target Start/End: Original strand, 256502 - 256597
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaat 120  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| | ||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||  |||| |||||||    
T  256502 ttttccccgatttcaaaacatgggtacgagacgggtaatgggcatataggtacccaccccaaacccatacccaaacccctcctaaatgtagaaaat 256597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 18908971 - 18908884
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg 112  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||    
T  18908971 ttttccccgatttcaaaatacggatatgggacgggtaacaaggatatatgtacccaccccaaactcatacccaaaccctacccgaatg 18908884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 9458740 - 9458654
Alignment:
Q  26 tttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg 112  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||  ||||||||    
T  9458740 tttccccaatttcaaaatacgggtacgggacagataacggggatatatgtacccacctcgaactcatacccaaatcctacccgaatg 9458654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 120
Target Start/End: Original strand, 8320784 - 8320900
Alignment:
Q  3 cccgttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaaccc 102  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||| |||| |||| |||||||||||| || ||||||||| || |||||| || | ||||||||| ||||| || ||||    
T  8320784 cccgctttgactaggtttgggtttt-ccccaatttcaaaacacgggtacggaacaggtaacagggatatagatatcgaccccgaacccatacccagaccc 8320882  T
Q  103 gtcccgaatgcagaaaat 120  Q
    || | ||||||| |||||    
T  8320883 gttctgaatgcaaaaaat 8320900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 32959957 - 32959869
Alignment:
Q  5 cgttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatac 94  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||  |||| |||||||||||| || || ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  32959957 cgttttgattgggtttgggtttt-ccctaatttcaaaacacgggtacggaacgggtaacggggatataggtatccaccccgaacccatac 32959869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 30986331 - 30986284
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatata 72  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30986331 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatata 30986284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 87
Target Start/End: Original strand, 20610993 - 20611054
Alignment:
Q  26 tttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaa 87  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  20610993 tttccccgatttcaaaatacgggtaggggacgggtaacgggaatatatgtatccaccccgaa 20611054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 118
Target Start/End: Original strand, 29199895 - 29199988
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaa 118  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||| || ||||| ||| | ||||||||| ||||| ||||| |  |||||||| |||||    
T  29199895 ttttccccgatttcaaaatacgggtacgggacgggtaacagggatatatgtatctaccccgaacccatacccaaactctacccgaatgtagaaa 29199988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32052988 - 32052927
Alignment:
Q  170 aaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtg 231  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  32052988 aaaaacttacattgatatttaaaggattaaataaatcattccgtctaacaaatgttaaagtg 32052927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 128
Target Start/End: Original strand, 34346049 - 34346118
Alignment:
Q  59 gtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttat 128  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||   |||| |||| |||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  34346049 gtaacggggatataggtacccaccccgaatctatacccaaatccgttccgaatgtagaaaattaatttat 34346118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 128
Target Start/End: Original strand, 16405463 - 16405523
Alignment:
Q  68 atataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttat 128  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  16405463 atatatgtacacaccctgaactcatactcaaacccgtcccgaaattagaaaattactttat 16405523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 9402687 - 9402572
Alignment:
Q  3 cccgttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaaccc 102  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||| |||||  |||| ||||||  | ||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||||     
T  9402687 cccgctttgactggatttgggtttt-ccccgatttcaaaacatgggtacaggacgggtaacatggatataggtgtcca-cccgaacccatactcaaacct 9402590  T
Q  103 gtcccgaatgcagaaaat 120  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  9402589 gtctcgaatgtagaaaat 9402572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 19367087 - 19366990
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaatta 122  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||  | |||||| | |||||| | ||| ||||| ||||||| ||  ||||| |||||||||    
T  19367087 ttttccccaattttaaaacacgggtatgagacgggtaacatgaatatagttgcccacctcaaacccatacccaaacccttcttgaatgtagaaaatta 19366990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 38 - 245
Target Start/End: Original strand, 31942209 - 31942417
Alignment:
Q  38 aaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatg 137  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||  |||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  31942209 aaaaacacgggtatgagacgggtaacaggtatataagtacccaccccaaacccataaccaaacctgtcacaaatgcagaaaactactttatgctgatatg 31942308  T
Q  138 t-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacat 236  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  31942309 ccatgttattttgtttgataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagcaactaaatcagtcggtctaacaaatgttaaagtgaacat 31942408  T
Q  237 attcttgga 245  Q
    ||| |||||    
T  31942409 attgttgga 31942417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 232
Target Start/End: Original strand, 6027878 - 6028108
Alignment:
Q  3 cccgttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaaccc 102  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  6027878 cccgttttgattgggtttgggtttt-ccccgattttaaaacatgggtatgagacgggtaacaggtatataggtacccaccccgaacccatactcataccc 6027976  T
Q  103 gtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgttat-aaaaactaccattgatatttaaaggagtaat 200  Q
    |||| |||||||||||| || |||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||     
T  6027977 gtcctgaatgcagaaaagtattttatgttgataagccatgttattttgtttgataattgtcgtgttataaaaaactatcattgatatttaaaggagcaac 6028076  T
Q  201 taaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtga 232  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6028077 taaatcaattggtctaacaaatgttaaagtga 6028108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 13705371 - 13705593
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||   |||||||||    
T  13705371 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacctaaacccgtcccaaatgtgaaaaattact 13705470  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  | || ||||||||    
T  13705471 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtataacaaat 13705570  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    |||||||||| | |||| |||||    
T  13705571 gttaaagtgagcgtattgttgga 13705593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14540860 - 14540649
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||  ||||| |||| |||||||||| | |||||||||||    
T  14540860 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacaggtaacgggtatataggcacccactcggaatccatactcaaatccgtcccgaacgtagaaaattact 14540761  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||    
T  14540760 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcgtgttataaaaactac----gatatttaaaggagcaactaaatcaatcagtctaacaaatg 14540665  T
Q  224 ttaaagtgaacatatt 239  Q
    ||||||||| ||||||    
T  14540664 ttaaagtgagcatatt 14540649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 37106771 - 37106556
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||      ||||||| |||| | |||||||||    
T  37106771 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccactccgaacccatac------ccgtcccaaatgtaaaaaattact 37106678  T
Q  125 ttatggtgatatgtatgttattttgtttcataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  | ||||||||||||    
T  37106677 ttatgttgatatatatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatg 37106578  T
Q  224 ttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||| |||||| |||||    
T  37106577 ttaaagtgagcatattgttgga 37106556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 37999562 - 37999353
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||    
T  37999562 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgagacgggtaacgggtatataagtacccaccccgaactcatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 37999463  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||    |||||||||||    
T  37999462 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaagaatcaactaaatcattttgtctaacaaat 37999363  T
Q  223 gttaaagtga 232  Q
    || |||||||    
T  37999362 gtgaaagtga 37999353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 39 - 245
Target Start/End: Original strand, 8915961 - 8916169
Alignment:
Q  39 aaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatg- 137  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | ||||||| |||||| |||||||     
T  8915961 aaaacacgggtatgggacgggtaacaggtatataggtacccaccccgaacccatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgt 8916060  T
Q  138 tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacat 236  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |    ||||||||||||| ||||||| | |    
T  8916061 tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggattaactaaattattttgtctaacaaatgtgaaagtgagctt 8916160  T
Q  237 attcttgga 245  Q
    ||| |||||    
T  8916161 attgttgga 8916169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 19104847 - 19105066
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacggg----tatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaat 120  Q
    |||||||||||||  |||||||||    |||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19104847 ttttccccgatttccaaacacgggcctgtatgggatgtgtaacgggtatataggtatccacctcgaatccatactcaaacccgtcccgaatgcagaaaat 19104946  T
Q  121 tactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaaca 219  Q
    ||||||||| |||  ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| || |||||| | ||||||||||    
T  19104947 tactttatgttgacgtgtcatgttattttgtttaataattgccgtgttataaaaactactatcgatatttaaaagagcaactaaatcgatcggtctaaca 19105046  T
Q  220 aatgttaaagtgaacatatt 239  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  19105047 aatgttaaagtgagcatatt 19105066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 192
Target Start/End: Original strand, 24414142 - 24414311
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||    
T  24414142 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacaggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactact 24414241  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaa 192  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24414242 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaa 24414311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 45256902 - 45256686
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| | |||||||||    
T  45256902 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacggttaatgggtatataagtacccaccccgaacccatacctaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 45256803  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||  | |||||||||||    
T  45256802 ttattttgatatgtcttgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaattaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaat 45256703  T
Q  223 gttaaagtgaacatatt 239  Q
    |||||||||||| ||||    
T  45256702 gttaaagtgaacgtatt 45256686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 12193837 - 12194059
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||||  || ||||||||| |||| | |||||||||    
T  12193837 tttttcccgatttcagaacacgggtatgggacgggtaatgggtatatagatacccacctcgaatccatatccatacccgtcccaaatgtaaaaaattact 12193936  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||  | |||||||||||    
T  12193937 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattatcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactacatcattccgtctaacaaat 12194036  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  12194037 gttaaagtgaacatattgttgga 12194059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13830814 - 13830593
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||| | |||||||||    
T  13830814 ttttcctcgatctcaaaacacgggtatgggac-ggtaacgggtatataagtacccaccccgaacccatactcaaacctgtcccaaatgtaaaaaattact 13830716  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgt-tataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    |||||||||||    
T  13830715 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgtaaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaat 13830616  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    || ||||||| | |||| |||||    
T  13830615 gtgaaagtgagcttattgttgga 13830593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 39 - 245
Target Start/End: Original strand, 42798012 - 42798221
Alignment:
Q  39 aaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg-cagaaaattactttatggtgatatg 137  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  42798012 aaaacacgggtatgagacgggtaacgggtatataagtacccaccccgaacccatacacaaacctgtcccaaatgtaaaaaaattactttatgttgatatg 42798111  T
Q  138 -tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaaca 235  Q
     ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    ||||||||||||| ||||||| |     
T  42798112 ttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgagct 42798211  T
Q  236 tattcttgga 245  Q
    |||| |||||    
T  42798212 tattgttgga 42798221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 30847025 - 30846802
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg-cagaaaattac 123  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||  | |||| |||    
T  30847025 ttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaattgtaaaaaaactac 30846926  T
Q  124 tttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaa 221  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |    ||||||||||    
T  30846925 tttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaa 30846826  T
Q  222 tgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||| ||||||| | |||| |||||    
T  30846825 tgtgaaagtgagcttattgttgga 30846802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 7314658 - 7314880
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| | ||||||| |    
T  7314658 ttttccccgattttaaaatacgagtatgggacgggtaacgggtatataggttcccaccccgaacccatacccacacccgtcccaaatgtaaaaaattatt 7314757  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| | || |||| |||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||  | ||||| |||||    
T  7314758 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataaatatcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattccgtctatcaaat 7314857  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    |||||||||  |||||| |||||    
T  7314858 gttaaagtgggcatattgttgga 7314880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9632465 - 9632243
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||    
T  9632465 ttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaatgggtatataggtatccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactact 9632366  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |    |||||||||||    
T  9632365 ttatgttgatatgttatgttatttttttttataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaat 9632266  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    || ||||||| | |||| |||||    
T  9632265 gtgaaagtgagcttattgttgga 9632243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 245
Target Start/End: Original strand, 36128117 - 36128339
Alignment:
Q  26 tttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatg-cagaaaattact 124  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||  | |||| ||||    
T  36128117 tttccccgatctcgaaacacgggtatgggatgggtaacgggtatataggtactcaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactact 36128216  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |    |||||||||||    
T  36128217 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaataattttgtctaacaaat 36128316  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    || ||||||||| |||| |||||    
T  36128317 gtgaaagtgaacttattgttgga 36128339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 45115637 - 45115428
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||| |||| |||| | ||||||||     
T  45115637 ttttcctcgatttcaaaacacgggtatgagacgggtaacaggtatataggtacccatcccgaacccatagttaaacccatcccaaatgtaaaaaattaca 45115538  T
Q  125 ttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |||||| ||||    
T  45115537 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaattaaatcattttgtctaataaat 45115438  T
Q  223 gttaaagtga 232  Q
    ||||||||||    
T  45115437 gttaaagtga 45115428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Original strand, 10208440 - 10208649
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||| |||| | |||||||||    
T  10208440 ttttccccaatcttaaaacacgggtatgggacgggtaatggatatataggtacctaccccgaacccatactcaaaccagtcccaaatgtaaaaaattact 10208539  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    |||| ||||||    
T  10208540 ttatgttaatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtcttacaaat 10208639  T
Q  223 gttaaagtga 232  Q
    || |||||||    
T  10208640 gtgaaagtga 10208649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 44746119 - 44746341
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  44746119 ttttccccgatttcaaaacacgaatatgggacgggtaatgggtatatatgtacccacttcaaactcatactcaaacccgtcccaaatgtagaaaatcact 44746218  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgt-gttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaat 222  Q
    ||||  |||||||  |||||||||| ||| || |||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |  | |||||||||||    
T  44746219 ttatcttgatatgccatgttattttatttgatcattgtaatggttataaaaactatcattgatatttaaaggagcaaataaattattccgtctaacaaat 44746318  T
Q  223 gttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    |||| ||||| |||||| |||||    
T  44746319 gttagagtgagcatattgttgga 44746341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10920687 - 10920515
Alignment:
Q  62 acgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattg 160  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  10920687 acggatatataggtatccaccccgaacccatacccaaatccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattg 10920588  T
Q  161 tcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtga 232  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||    ||||||||||||| |||||||    
T  10920587 tcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaactaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtga 10920515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 245
Target Start/End: Original strand, 16226761 - 16226958
Alignment:
Q  39 aaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt 138  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |         |||||| ||||||||| | ||||||||||| | |||| ||| |||| |||    
T  16226761 aaaacaagggtatgggacgggtaacgggtatataggtactc---------tcatacccaaacccgttcggaatgcagaaact-acttcatgttgatttgt 16226850  T
Q  139 -atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacata 237  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  16226851 catgttattttatttgataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaattagcaactaaatcaattggtctaagaaatgttaaagtgaatata 16226950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 135 - 245
Target Start/End: Original strand, 37472850 - 37472961
Alignment:
Q  135 atgtatgttattttgtttcataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaa 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  | |||||||||||||||||||||     
T  37472850 atgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactaccattgatatttaaaggatcaactaaatcattctgtctaacaaatgttaaagtgag 37472949  T
Q  234 catattcttgga 245  Q
    |||||| |||||    
T  37472950 catattgttgga 37472961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 245
Target Start/End: Original strand, 18106214 - 18106322
Alignment:
Q  138 tatgttattttgtttcataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacat 236  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    ||||||||||||| ||||||||| |    
T  18106214 tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggatcaattaaatcattttgtctaacaaatgtgaaagtgaactt 18106313  T
Q  237 attcttgga 245  Q
    ||| |||||    
T  18106314 attgttgga 18106322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 119
Target Start/End: Original strand, 35248395 - 35248489
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaa 119  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  35248395 ttttccacgattacaaaacacgggtatgggacgggtaaaggggataaaggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcctgaatgtagaaaa 35248489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 43371632 - 43371539
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaa 118  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |||||    
T  43371632 ttttccccgattttaaaatacgggtacgggacgggtaacggggatatatgtacccaccccaaactcatacccaaaccctacccgaatgtagaaa 43371539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22900883 - 22900791
Alignment:
Q  14 tgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtccc 107  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22900883 tgggtttgggtttttccc-gatttcaaaacacgggtatgggacgagtaacggggttatatatacccaccccgaactcatacccatacccgtccc 22900791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 94
Target Start/End: Original strand, 37472769 - 37472838
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatac 94  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||    
T  37472769 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatttaggtacccacttcgaacccatac 37472838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 118
Target Start/End: Original strand, 38342529 - 38342622
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaa 118  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||    
T  38342529 ttttccccgattttaaaatacggatacgggacgggtaacggggatatatgtacccaccccgaacccatacccaaaccctacccgaatgtagaaa 38342622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 25210456 - 25210361
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaat 120  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  25210456 tttttcccgactttaaaacacgggtatgggacgggtaacgaggatatatgtacccaccccaaacccataccaaaacccctcccgaatgtagaaaat 25210361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 35965413 - 35965319
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaat 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |   |||| ||| ||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  35965413 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgg-atgtgtaatggggatacatgtacccactccgaacccatacccaaacccgtcccgaatgtagaaaat 35965319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 37319862 - 37319805
Alignment:
Q  182 tgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 239  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37319862 tgatatttaaagtagcaactaaatcaatcggtctaacaaatgttaaaatgaacatatt 37319805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 3547239 - 3547152
Alignment:
Q  31 ccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaa 118  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||  |||||||| |||||    
T  3547239 ccgatttcaaaatacgggtacgggacgggtaacggagatatatgtacccaccccgaacccatatccaaaccctacccgaatgtagaaa 3547152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 84
Target Start/End: Original strand, 35409158 - 35409236
Alignment:
Q  5 cgttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccacccc 84  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  35409158 cgttttgactgggtttgggtttt-ccccgatttcaaaacactagtacgggaaaggtaacgtagatataggtacccacccc 35409236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 120
Target Start/End: Original strand, 4961479 - 4961556
Alignment:
Q  43 cacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaat 120  Q
    ||||||||||||||  ||||| || |||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  4961479 cacgggtatgggacgtgtaacagggatataggtacacacctcgaacccatacccaaactcgtcccgaatatagaaaat 4961556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15546823 - 15546726
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaatta 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |  ||||  ||||||||| |||| ||||| || |||| |||| |||| | |||||||    
T  15546823 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacatggttatatatacccaccctgaacccatacccatacccttcccaaatgtaaaaaatta 15546726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Original strand, 34214676 - 34214748
Alignment:
Q  34 atttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcc 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||| ||| ||||| || ||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  34214676 atttcaaaacacgggtacgggacatgtatcggttatattggcacccacttcgaactcatactcaaacccgtcc 34214748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 42576664 - 42576598
Alignment:
Q  52 gggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaa 118  Q
    ||||| ||||| || |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||| |||||    
T  42576664 gggacgggtaatggatatatatgtacccaccctgaacccatacacaaaccctacccgaatgtagaaa 42576598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 44057962 - 44057868
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtaccca-ccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaa 118  Q
    ||||||| ||||| |||| || |||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||    
T  44057962 ttttccctgatttcaaaataccggtacgggacgggtaatggggatatatgtacccacccccgaacccatacccaaaccctacccgaatgtagaaa 44057868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 94
Target Start/End: Original strand, 6164483 - 6164552
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatac 94  Q
    |||||||| |||| ||||   ||||| ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6164483 ttttccccaatttcaaaatttgggtacgggacgggtaacggtgatatatgtacccaccccgaactcatac 6164552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 33175308 - 33175252
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccac 81  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |||| || ||||||||||||||||    
T  33175308 ttttctccgattttaaaacacgggtacgggtcgggtagcgtgtatataggtacccac 33175252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 90702 - 90467
Alignment:
Q  3 cccgttttgactgggtgtgggt-----ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacaca 97  Q
    |||||||||||||||| |||||     ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  90702 cccgttttgactgggtttgggtatgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacggttaacgggtatattggtaccctccccgaacccatacaca 90603  T
Q  98 aacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggag 196  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  90602 aattcgtcctgaatgcagaaaattattttatgttgatatgccatgttattttgtttaataattgatgtgttattaaaacaaccattgatatttaaaggag 90503  T
Q  197 taattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtga 232  Q
     || |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  90502 caaataaatcaatcggtctaacaaatattaaagtga 90467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 232
Target Start/End: Original strand, 197321 - 197545
Alignment:
Q  8 tttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtccc 107  Q
    ||||||| ||| || |||||||||  |||| ||||||||| |||| |||| ||||| || |||||||||||||  |||||   |||| ||||||||||||    
T  197321 tttgactaggtttgagtttttccct-atttcaaaacacggatatgagacaagtaacaggcatataggtacccaaaccgaatctatacccaaacccgtccc 197419  T
Q  108 gaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatc 206  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  197420 gaatgcagaaaattactttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattaccttgttataaaaactaccattgatatttaaaggagcaactaaatc 197519  T
Q  207 aaccggtctaacaaatgttaaagtga 232  Q
    || ||||||||||||| |||||||||    
T  197520 aatcggtctaacaaatattaaagtga 197545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36251 - 36012
Alignment:
Q  5 cgttttgactgggtgtgggtttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgt 104  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||    
T  36251 cgttttgattgggtttgggtttttcccaaatttataa-cacgggtataggacggataacgagtatataggtatccatcccaaactcataaccaaacccgt 36153  T
Q  105 cccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaagg--agtaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||  |    | |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |    
T  36152 cccgaatgcagaaaattaccat----taatatgtcatgttattttgtttgataactgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggaaagcaact 36057  T
Q  202 aaatcaaccggtctaacaaatgtt-aaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  36056 aaatcaatcggtctaacaaatgttaaaagtgaacatattgttgga 36012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14853 - 14638
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattact 124  Q
    ||||| ||||||| |||||||  | ||||||| | ||| |||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| |    
T  14853 ttttctccgatttcaaaacacatgcatgggacggataatgggtatataggtacccaccttgaacacatacccaaactcgtcccaaatgtagaaaattatt 14754  T
Q  125 ttatggtgatatg-tatgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatg 223  Q
    | ||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||    
T  14753 taatgttgatatgatatattattttgtttgataattattgtgttgtaaaaactaccattgatatttaaaggagcaactaaatcaatcggtttaacaaatg 14654  T
Q  224 ttaaagtgaacatatt 239  Q
    ||||||||| ||||||    
T  14653 ttaaagtgagcatatt 14638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0519 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0519
Description:

Target: scaffold0519; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10360 - 10157
Alignment:
Q  40 aaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgta 139  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||| |||| | ||||||||||| || |||||||||    
T  10360 aaacacgggtatgggacggataacaggtatataggtacccactacgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttgtgttgatatgta 10261  T
Q  140 tgttattttgtttcataattgtcgtgtt-ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatat 238  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||   |  ||||||||||  || |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  10260 tgttattttgtttgataattgtcatattaataaaaactacc---gtcatttaaaggatcaactaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgaacatat 10164  T
Q  239 tcttgga 245  Q
    | |||||    
T  10163 tgttgga 10157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:

Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4329 - 4113
Alignment:
Q  32 cgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaat-tactttatgg 130  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||  | ||| ||||| ||||| |||||| |||| | ||||  |||||||||     
T  4329 cgatttcaaaacacgggtatgagactggtaacgagtatatttgtacccacttcaaacccatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaaaatactttatgt 4230  T
Q  131 tgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgtta-taaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaa 228  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||  |  ||||||||||||||||    
T  4229 tgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaactatcattgatatttaaaggagcaactaaatcattccatctaacaaatgttaaa 4130  T
Q  229 gtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||||| |||||    
T  4129 gtgaacatattgttgga 4113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6426 - 6269
Alignment:
Q  83 ccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattttgtttcataattgtcgtgttataaaaactaccat 181  Q
    ||||||||| ||  ||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  6426 ccgaactcacaccaaaacccgtctcaaatgcagaaagttactttatgttgatatgccatgttattttgtttgatagttgtcgtgctataaaaattaccat 6327  T
Q  182 tgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 239  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  6326 tgaaatttaaaggagcaactaaatcaatcgatctaacaaatgttaaagtgaacatatt 6269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 66 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 33624 - 33440
Alignment:
Q  66 gtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatggtgatatgt-atgttattt---tg-tttcataattg 160  Q
    ||||||| || | |||||| ||| ||||  |||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||   || ||| ||||||     
T  33624 gtatataagtcctcaccccaaacccataaccaaacccgtcacaaatgcagaaaactactttatgatgatatgccatgttatttatttgatttgataattt 33525  T
Q  161 tcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  33524 tcgtgttataaaaactaccattgatatttaaagaagcaattaaatcagtcggtgtaacaaatattaaagtgaacatattgttgga 33440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 159 - 245
Target Start/End: Original strand, 14290 - 14376
Alignment:
Q  159 tgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14290 tgtcatgttataaaaactaccattgatatttaaaggaacaattaaatcaatcggtctaacaaatgttaaagtgaacatattgttgga 14376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 94
Target Start/End: Original strand, 4591 - 4660
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatac 94  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  4591 ttttccccaatttcaaaatacgggtatgggacaggtaacagggatatagctacccaccacgaacccatac 4660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 3047 - 2954
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaa 118  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||  |||| | |||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||    
T  3047 ttttccccgatttcaaaatacgggtacaggacggataactgggatatatgtacccaccccgaacccatactcaaaccctacccgaatgtagaaa 2954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 128
Target Start/End: Original strand, 107408 - 107504
Alignment:
Q  32 cgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttat 128  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||| |    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||  ||||||||||||||    
T  107408 cgatttcaaaacacaggtatgggacgggtagcatagatataagtacccaccccgaactcatattcaaactcgttccgaatgttgaaaattactttat 107504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 17040 - 16977
Alignment:
Q  30 cccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcata 93  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  17040 cccgatttcaaaatacgtgtatgggacgggtgacggggatatatgtacccaccccgaactcata 16977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0902 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0902
Description:

Target: scaffold0902; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 829 - 748
Alignment:
Q  158 ttgtcgtgttataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatatt 239  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  ||||||  || || || |||||||| ||||||||||||    
T  829 ttgtcatgttataaaacctaccattgatatttaaagtagcaaccaaatcattcgatcaaagaaatgttatagtgaacatatt 748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 245
Target Start/End: Original strand, 32685 - 32761
Alignment:
Q  168 ataaaaactaccattgatatttaaaggagtaattaaatcaaccggtctaacaaatgttaaagtgaacatattcttgga 245  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32685 ataaaaactaccagtgatatttaatg-atcaattaaatcattccgtctaacaaatgttaaagtgagcatattgttgga 32761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 211442 - 211367
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaac 100  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||| | ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  211442 ttttctccgatttcaaaatacgggtacgagacgggtaacagggatatatgtacccaccccgaacccatacccaaac 211367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 102
Target Start/End: Original strand, 105498 - 105556
Alignment:
Q  44 acgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaaccc 102  Q
    ||||||| ||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  105498 acgggtacgggacgggtaacagggatatatgtacccaccccgaacccatacccaaaccc 105556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 102
Target Start/End: Original strand, 128150 - 128208
Alignment:
Q  44 acgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacacaaaccc 102  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  128150 acgggtacgggacgggtaatggggatatatgtacccaccccgaacccatacccaaaccc 128208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 67827 - 67766
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccga 86  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  67827 ttttccccgattttaaaatacggatacgggacggataacggggatatatgtacccaccccga 67766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 75670 - 75609
Alignment:
Q  25 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccga 86  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  75670 ttttccccgattttaaaatacggatacgggacggataacggggatatatgtacccaccccga 75609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University