View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5569_low_2 (Length: 823)

Name: NF5569_low_2
Description: NF5569
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5569_low_2
NF5569_low_2
[»] chr1 (30 HSPs)
chr1 (29-715)||(37530507-37531205)
chr1 (32-731)||(48072907-48073627)
chr1 (33-731)||(32352786-32353492)
chr1 (30-285)||(3692569-3692824)
chr1 (32-191)||(14119714-14119874)
chr1 (272-548)||(21528345-21528626)
chr1 (316-548)||(36306012-36306245)
chr1 (288-406)||(48265540-48265658)
chr1 (32-186)||(48265760-48265914)
chr1 (754-809)||(37531204-37531259)
chr1 (32-186)||(36305728-36305882)
chr1 (266-399)||(30970437-30970570)
chr1 (32-186)||(21528105-21528259)
chr1 (37-186)||(36929116-36929265)
chr1 (630-729)||(39430840-39430939)
chr1 (668-729)||(13867311-13867372)
chr1 (646-729)||(20796236-20796319)
chr1 (667-729)||(5809181-5809243)
chr1 (673-731)||(19014460-19014518)
chr1 (646-727)||(49264444-49264525)
chr1 (646-722)||(25504479-25504555)
chr1 (668-727)||(3544581-3544640)
chr1 (650-717)||(38070415-38070482)
chr1 (131-180)||(3073799-3073848)
chr1 (672-729)||(45795880-45795937)
chr1 (277-388)||(16873332-16873443)
chr1 (270-344)||(7396595-7396669)
chr1 (674-728)||(13112767-13112821)
chr1 (288-342)||(36929367-36929421)
chr1 (668-729)||(52692072-52692133)
[»] chr5 (28 HSPs)
chr5 (32-732)||(34480900-34481613)
chr5 (29-275)||(6264151-6264397)
chr5 (272-723)||(10486404-10486876)
chr5 (32-290)||(32918262-32918520)
chr5 (32-167)||(15499707-15499842)
chr5 (275-409)||(587703-587837)
chr5 (32-185)||(10486963-10487116)
chr5 (593-725)||(588033-588165)
chr5 (646-731)||(30509523-30509608)
chr5 (646-731)||(30549863-30549948)
chr5 (596-725)||(31864763-31864892)
chr5 (668-729)||(476814-476875)
chr5 (630-722)||(35122191-35122283)
chr5 (672-732)||(42259885-42259945)
chr5 (266-361)||(31862771-31862866)
chr5 (650-729)||(33170241-33170320)
chr5 (670-728)||(23923488-23923546)
chr5 (267-388)||(19513305-19513426)
chr5 (671-732)||(22174469-22174530)
chr5 (266-361)||(4400055-4400150)
chr5 (630-725)||(19512947-19513042)
chr5 (630-717)||(31864352-31864439)
chr5 (668-722)||(380502-380556)
chr5 (326-360)||(27117029-27117063)
chr5 (275-361)||(29094374-29094460)
chr5 (266-344)||(30509929-30510007)
chr5 (266-344)||(30550269-30550347)
chr5 (311-388)||(35122546-35122623)
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (30-731)||(23346943-23347664)
chr6 (32-726)||(26205292-26206000)
chr6 (32-713)||(25317798-25318493)
chr6 (30-731)||(15673767-15674493)
chr6 (29-293)||(8872761-8873025)
chr6 (43-186)||(1682995-1683138)
chr6 (32-186)||(33630041-33630195)
chr6 (646-729)||(13086118-13086201)
chr6 (668-729)||(14686486-14686547)
chr6 (646-722)||(19256219-19256295)
chr6 (646-722)||(33640496-33640572)
chr6 (277-396)||(4474887-4475006)
chr6 (668-727)||(14843617-14843676)
chr6 (668-731)||(19350545-19350608)
chr6 (630-732)||(11469131-11469233)
chr6 (272-366)||(33630281-33630375)
chr6 (646-722)||(503017-503093)
chr6 (630-722)||(33805343-33805435)
chr6 (696-731)||(12687242-12687277)
chr6 (668-731)||(29976484-29976547)
chr6 (692-726)||(34434885-34434919)
chr6 (295-388)||(9565574-9565667)
chr6 (695-732)||(15161270-15161307)
chr6 (695-732)||(15472102-15472139)
chr6 (668-729)||(25350823-25350884)
chr6 (668-717)||(32186284-32186333)
[»] chr4 (23 HSPs)
chr4 (30-731)||(20674964-20675686)
chr4 (32-731)||(23872952-23873672)
chr4 (30-727)||(2631340-2632058)
chr4 (32-731)||(55298564-55299276)
chr4 (30-509)||(8486699-8487179)
chr4 (272-729)||(3129467-3129935)
chr4 (272-548)||(8654752-8655029)
chr4 (313-542)||(47541150-47541380)
chr4 (583-729)||(7662786-7662940)
chr4 (32-186)||(3130021-3130175)
chr4 (32-190)||(7663277-7663435)
chr4 (272-465)||(7663002-7663195)
chr4 (42-185)||(8655116-8655259)
chr4 (32-186)||(47540869-47541023)
chr4 (596-722)||(19648231-19648357)
chr4 (266-361)||(29553607-29553702)
chr4 (646-729)||(42952983-42953066)
chr4 (650-729)||(55725184-55725263)
chr4 (668-729)||(43516226-43516287)
chr4 (646-722)||(8935653-8935729)
chr4 (630-729)||(19114999-19115098)
chr4 (311-361)||(49926133-49926183)
chr4 (668-729)||(2072141-2072202)
[»] chr3 (34 HSPs)
chr3 (30-731)||(29309350-29310072)
chr3 (30-731)||(6175954-6176676)
chr3 (30-524)||(2813203-2813698)
chr3 (29-381)||(25872955-25873309)
chr3 (33-390)||(23601718-23602075)
chr3 (30-260)||(14904134-14904364)
chr3 (29-425)||(9379038-9379434)
chr3 (272-548)||(49731611-49731888)
chr3 (32-166)||(7146985-7147119)
chr3 (434-555)||(14904005-14904127)
chr3 (630-729)||(30166822-30166921)
chr3 (41-185)||(49731975-49732119)
chr3 (313-548)||(30167023-30167259)
chr3 (32-190)||(30167383-30167541)
chr3 (668-729)||(40513202-40513263)
chr3 (630-729)||(21740001-21740100)
chr3 (668-729)||(31675532-31675593)
chr3 (668-729)||(31920829-31920890)
chr3 (668-729)||(34829994-34830055)
chr3 (665-726)||(55367208-55367269)
chr3 (630-722)||(36709473-36709565)
chr3 (650-729)||(962641-962720)
chr3 (650-729)||(3141434-3141513)
chr3 (272-375)||(18368808-18368911)
chr3 (266-388)||(14867625-14867747)
chr3 (668-717)||(19875844-19875893)
chr3 (596-729)||(43121152-43121285)
chr3 (630-722)||(42674924-42675016)
chr3 (674-726)||(47772921-47772973)
chr3 (638-729)||(10868174-10868265)
chr3 (630-729)||(15481236-15481335)
chr3 (480-539)||(25388552-25388611)
chr3 (266-360)||(26010225-26010319)
chr3 (323-388)||(15481597-15481662)
[»] chr7 (25 HSPs)
chr7 (32-731)||(13439997-13440717)
chr7 (32-400)||(45942795-45943163)
chr7 (37-336)||(45235899-45236198)
chr7 (272-729)||(15653185-15653661)
chr7 (32-554)||(12378401-12378921)
chr7 (37-197)||(3104853-3105013)
chr7 (630-729)||(46626385-46626484)
chr7 (32-186)||(15653747-15653901)
chr7 (32-186)||(46623649-46623803)
chr7 (665-732)||(23887681-23887748)
chr7 (665-732)||(23898857-23898924)
chr7 (646-729)||(13553662-13553745)
chr7 (668-731)||(27218598-27218661)
chr7 (665-732)||(33821034-33821101)
chr7 (274-389)||(43105497-43105612)
chr7 (646-722)||(45993154-45993230)
chr7 (668-723)||(19544886-19544941)
chr7 (266-388)||(19728665-19728787)
chr7 (267-361)||(27941361-27941455)
chr7 (133-191)||(43105356-43105414)
chr7 (630-722)||(41340096-41340188)
chr7 (402-529)||(46624007-46624135)
chr7 (628-731)||(17856290-17856393)
chr7 (272-339)||(46623889-46623956)
chr7 (131-180)||(22819765-22819814)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (33-732)||(13550069-13550782)
chr2 (32-519)||(43627443-43627931)
chr2 (32-413)||(33547816-33548197)
chr2 (318-728)||(26894091-26894522)
chr2 (318-728)||(26899530-26899961)
chr2 (32-372)||(22052571-22052911)
chr2 (392-732)||(13550881-13551235)
chr2 (29-413)||(31085452-31085836)
chr2 (32-250)||(9949242-9949460)
chr2 (630-729)||(45422083-45422182)
chr2 (313-548)||(45421744-45421981)
chr2 (32-190)||(45421463-45421621)
chr2 (646-729)||(9668484-9668567)
chr2 (266-340)||(31774862-31774936)
chr2 (646-729)||(11233968-11234051)
chr2 (53-196)||(26179959-26180101)
chr2 (605-722)||(36804658-36804774)
chr2 (667-729)||(11196951-11197013)
chr2 (597-715)||(16213708-16213826)
chr2 (668-727)||(12646122-12646181)
chr2 (690-725)||(42051753-42051788)
chr2 (267-344)||(11028049-11028126)
chr2 (626-687)||(25380914-25380975)
chr2 (275-388)||(35488024-35488137)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (30-518)||(16420719-16421208)
chr8 (32-344)||(2872134-2872446)
chr8 (272-729)||(7452536-7453014)
chr8 (29-204)||(35405646-35405821)
chr8 (32-186)||(19384752-19384906)
chr8 (32-186)||(7452296-7452450)
chr8 (646-729)||(43249282-43249365)
chr8 (272-366)||(19384572-19384666)
chr8 (646-729)||(24794325-24794408)
chr8 (667-729)||(6245682-6245744)
chr8 (32-77)||(412513-412558)
chr8 (630-722)||(44082497-44082589)
chr8 (278-388)||(12134518-12134628)
chr8 (662-723)||(8902422-8902483)
chr8 (665-726)||(29721391-29721452)
chr8 (646-722)||(4987550-4987626)
chr8 (630-726)||(11393829-11393925)
chr8 (669-729)||(18187748-18187808)
chr8 (665-729)||(36025119-36025183)
chr8 (668-729)||(12341168-12341229)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (313-729)||(134332-134769)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (313-729)||(312159-312596)
scaffold0002 (313-729)||(327613-328050)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (583-725)||(4038-4180)
scaffold0131 (442-547)||(4229-4335)
[»] scaffold0418 (3 HSPs)
scaffold0418 (583-729)||(8114-8266)
scaffold0418 (32-190)||(7619-7777)
scaffold0418 (272-465)||(7859-8052)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (668-729)||(34087-34148)
[»] scaffold0308 (1 HSPs)
scaffold0308 (630-722)||(17708-17800)
[»] scaffold0189 (1 HSPs)
scaffold0189 (662-726)||(6683-6747)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (697-731)||(63775-63809)
[»] scaffold1350 (1 HSPs)
scaffold1350 (676-729)||(153-206)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 528; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 528; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 715
Target Start/End: Original strand, 37530507 - 37531205
Alignment:
Q  29 tgtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcac 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  37530507 tgtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacgcacgaggacatgtcaggcgatagcacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcgataaacggtcac 37530606  T
Q  129 gaaggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  37530607 gaaggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatagtctacggcctaaggtacctgagagactaa 37530706  T
Q  229 caaacgatatgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaa 328  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37530707 caaactatatgcacctcgaactatgtatccactagatgggtctggaagccacacccaactatctacaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaa 37530806  T
Q  329 gccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtctg 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37530807 gccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtctg 37530906  T
Q  429 ttacagacatagtcttattctctgttaactcaaacaa-cgactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcggaccaaaacgaagtatc 527  Q
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37530907 ccacatacatagtcttattctctgttaactcaaacaaccgactaagtctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcagaccaaaacgaagtatc 37531006  T
Q  528 agccccatcaccaactctcctca----------acaccagtcgctaccaccatctccatccctcaccctaagacgactcacctccgaccaccaacaa-ga 616  Q
    |||||||||| ||||||||||||          | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37531007 agccccatcatcaactctcctcacctgatcctcaaaccagccgctaccaccatctccatccctcaccctaagacgactcacctccgaccaccaacaatga 37531106  T
Q  617 aactctccagcccccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccat 715  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37531107 aactctccggcccccaacctgccacctaactcgccatacctgacaactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacgccat 37531205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 48073627 - 48072907
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaa 131  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||| | |||||||||| ||| |  ||||||| || ||||||||| |||||||| | ||| || ||||| |    
T  48073627 gccgattcaggatgaccgtagccagcaacacacgaagacatgtcagacgacaacacccgtcgagcaatcaaatttgtccttgttgttaaacgatcacgga 48073528  T
Q  132 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaacaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||  || ||  ||||||||| ||||  |||||    
T  48073527 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccagatcattgtcggcgaccttaggtacctgtgagattaacaa 48073428  T
Q  232 acgatatgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagcc 331  Q
    || ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48073427 actatatgcacctcgaactgtgtaaccaccagatgggtccggaagccacacccagctatctgaaacaataggattcaaggaaacatcaagaagtaaagcc 48073328  T
Q  332 ctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtctgtta 431  Q
    | |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  48073327 ccacactcatctagcaactcctcctcccactcccataacctacgtctccacctccacacctccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtcggcaa 48073228  T
Q  432 cagacatagtcttattctctgttaactcaaacaa-cgactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcggaccaaaacgaagtatcagc 530  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |    
T  48073227 cggacatagacttattctctgttaactcaaacaaccgcctaaaccgcacacaaagaggagcctcccctatccacctatcagaccaaaacgaagtaacaac 48073128  T
Q  531 cccatcaccaactctcctcaac-------------accagtcgctaccaccatctccatccctcaccctaagacgactcacctccgaccaccaacaagaa 617  Q
    | ||||||||||||||||||||             ||||  ||||||||||||| ||  |||   |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  48073127 cgcatcaccaactctcctcaacacctgatccccaaaccacccgctaccaccatcgcctaccccatccctaagacgcctcacctccgaccaccagcaagaa 48073028  T
Q  618 actctccagccc-------ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaac 710  Q
    || |||| ||||       |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  48073027 acactccggcccccaacctccaacctgccacctaattcgccatacctgtcgactaaaacccgataccacaaaccacctctatccaccaacatccgccaac 48072928  T
Q  711 accatttccctaacaaagcta 731  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  48072927 accattttcctaacaaagcta 48072907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 33 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 32353492 - 32352786
Alignment:
Q  33 ccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaag 132  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |     
T  32353492 ccgattcaggatgaccacattcagcaacactcgaagacatgtcaggcgacaacacccgtctagcaatcaaatttgtccttgttggtaaacgatcacggat 32353393  T
Q  133 gagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaacaaa 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||  || || |||||| ||| ||||  ||||||    
T  32353392 gagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacactaaatccatatcatagtcggcgacctgaggtatctgagagattaacaaa 32353293  T
Q  233 cgatatgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccc 332  Q
    | |||||  || |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32353292 ctatatgttcctcgaactttgtatccaccagatgggtccggaagccacacccagctatctgaaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccc 32353193  T
Q  333 tacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtctgttac 432  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  32353192 tacactcatctagcaactcctccttccactgccataacctacgtctccacctccacacctccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtcggccac 32353093  T
Q  433 agacatagtcttattctctgttaactcaaacaa-cgactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcggaccaaaacgaagtatcagcc 531  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||| ||    
T  32353092 ggacatagacttattctctgttaactcaaacaaccgcctaaatcgcacacaaagaggagcctcccctatccacatatcagaccaaaacgaagtgtcaacc 32352993  T
Q  532 ccatcaccaactctcctcaacaccagtcgctaccaccatctccatccctca-ccctaagacgactcacctccgaccaccaacaagaaactctccagccc- 629  Q
    |||||||||||||||||||||||| |   ||   |||| | |  | || || |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||     
T  32352992 ccatcaccaactctcctcaacacctgatcctcaaacca-cccgctaccacatccctaagacgcctcacctccgaccaccagcatgaaacactccggcccc 32352894  T
Q  630 ------ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaa 723  Q
          |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32352893 caacctccaacctgccacctaattcgccatacctagcgactaaaaccctataccacaaaccacctctatccaccaacatccgccaacaccattttcctaa 32352794  T
Q  724 caaagcta 731  Q
    ||||||||    
T  32352793 caaagcta 32352786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 285
Target Start/End: Original strand, 3692569 - 3692824
Alignment:
Q  30 gtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  3692569 gtgccgattcaggatgaccacagccagcaacacacgaggacatgtccggcgacaacacccgtctagcaatcaaatttgtccttgttggtaaacgatcacg 3692668  T
Q  130 aaggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaac 229  Q
     ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||  || ||| || |||| ||||| ||||  |||    
T  3692669 gaggagccgccgcgcaaaaacgaaaaccttcaagggaacctgtttttgccacaccaaattcagagcataatcgacgacctgaggcacctgagagattaac 3692768  T
Q  230 aaacgatatgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaagccacaccca 285  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3692769 aaactatatgcacctcgaactgtgtatccaccagatgggtccggaagccacaccca 3692824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 191
Target Start/End: Original strand, 14119714 - 14119874
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |    
T  14119714 gccgattcaggatgaccacaaccaacaacacacgaggacatgtcaggcgacaacacccgtctagcaatcaaatttgtccttgttggtaaacgatcacgga 14119813  T
Q  132 ggagcctccacgcaaaaacggaaacctt-caagggaacctgtttgtgccacaccaaatcca 191  Q
     |||||||||||| |||||  ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  14119814 tgagcctccacgcgaaaacaaaaaccttacaaaaaaacctgtttgtgccacaccaaatcca 14119874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 272 - 548
Target Start/End: Original strand, 21528345 - 21528626
Alignment:
Q  272 ggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctaca----ctcctctagcaacccctcctcccactgccat 367  Q
    |||||||| ||||  ||||||| |||||| |||  ||||  |||||||||||||||||||||||     | || ||| ||   |||||||||||| ||||    
T  21528345 ggaagccaaacccgtctatctgaaacattcggaaacaagagaacatcaagaagtaaagccctacgtctccaccgctaacatgtcctcctcccactaccat 21528444  T
Q  368 aacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtctgttacagacatagtcttattctctgttaactcaaaca-ac 466  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||| |||||||   ||||||||   |||||||||||||||||||||||  |    
T  21528445 aacctacgtctccacctccacataaccccccattgctccgaatcaacagagaacaagtctccaacagacatgaacttattctctgttaactcaaacagcc 21528544  T
Q  467 gactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcggaccaaaacgaagtatcagccccatcaccaactctcct 548  Q
     || ||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||  |||| ||||| |||||    
T  21528545 tacgaaaacggacacaaaaaggaacatcccctaaccacctatccaaccaaaacaacgtatcagcttcatctccaaccctcct 21528626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 316 - 548
Target Start/End: Original strand, 36306012 - 36306245
Alignment:
Q  316 atcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaaca 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||  |||||  | ||||| ||||||||    
T  36306012 atcaagaagtaaagccctacactcctctaacatctcctccttccactgccacaatctacgcctccacctccaaacaaccccctgctgctccaaatcaaca 36306111  T
Q  416 gagagcaagtctgttacagacatagtcttattctctgttaactcaaaca-acgactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcggacc 514  Q
    |||| ||||||||  ||| ||||   ||||||||| |||||||||||||  | || |||    ||||| | |||||| |||||||||||||||||  |||    
T  36306112 gagaacaagtctgccacatacatgagcttattctccgttaactcaaacagtctacgaaaaaggacacagaaaggaacatcccctaaccacctatcatacc 36306211  T
Q  515 aaaacgaagtatcagccccatcaccaactctcct 548  Q
    ||||| | |||||||  ||||| ||||| |||||    
T  36306212 aaaacaacgtatcagaaccatctccaaccctcct 36306245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 288 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 48265658 - 48265540
Alignment:
Q  288 tatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctcca 387  Q
    |||||| |||||| |||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48265658 tatctgaaacattcggaaacaagagaacatcaagaagtaaagccctacactccgctaacaactcctcctcccactgccacaacctacgtctccacctcca 48265559  T
Q  388 cacttccccccaccgctcc 406  Q
    ||   |||||| |||||||    
T  48265558 cataaccccccgccgctcc 48265540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 48265914 - 48265760
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaa 131  Q
    |||| ||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||  |||||  ||||||| || ||||||||| ||| |||||||||| || ||  | |    
T  48265914 gccgtttctggatgaccgcaactagcgacacataaggacatgtcattcgataacacccgtcgagcaatcaaattagtctttgtcggtaaacgatcctgga 48265815  T
Q  132 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaa 186  Q
    |||| ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48265814 ggagtctccaagcaaaaactaaaatcttcaagggaacctgtttgtgccacaccaa 48265760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 754 - 809
Target Start/End: Original strand, 37531204 - 37531259
Alignment:
Q  754 atacttttgtttttggactgaatttaatgaatatatgtatgtgtgttgtggaatgt 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37531204 atacttttgtttttggactgaatttaatgaatatatgtatgtgtgttgtggaatgt 37531259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 32 - 186
Target Start/End: Original strand, 36305728 - 36305882
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaa 131  Q
    |||| |||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||| ||| || ||||||||| ||| |  | ||||| || || |  |    
T  36305728 gccgtttcaggatgatcgcaaccagcgacacataaggacatatcaggcgacaacacctgtcgagcaatcaaattagtcttcattggtaaccgatccctga 36305827  T
Q  132 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaa 186  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36305828 ggagtctccacgcaaaaactgaaaccttcaagggaacctgtttgtgccaaaccaa 36305882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 266 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 30970570 - 30970437
Alignment:
Q  266 gggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgcc 365  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | | || | |||||||||||  ||    
T  30970570 gggtcgggaagccacacccatttatctgaaacattaggagacaaagaaacatcaagaagtaaggccctacactccgccaccatctcctcctcccacgccc 30970471  T
Q  366 ataacctacgtctccacctccacacttcccccca 399  Q
    | || ||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  30970470 acaatctacgcctccacctccacacatcctccca 30970437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 186
Target Start/End: Original strand, 21528105 - 21528259
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaa 131  Q
    |||| ||| ||||||||  |||||||  |||| ||||||||||||  |||||  ||||| | || ||||||||| ||| |||||||||| || ||  | |    
T  21528105 gccgtttccggatgaccgtaaccagcggcacataaggacatgtcattcgataacacccgacgagcaatcaaattagtctttgtcggtaaacgatcttgga 21528204  T
Q  132 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaa 186  Q
    | || ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21528205 gtagtctccaagcaaaaactgaaatcttcaagggaacctgtttgtgccacaccaa 21528259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 186
Target Start/End: Original strand, 36929116 - 36929265
Alignment:
Q  37 ttcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaaggagc 136  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| | |  || |||| || ||||||||| ||| | || ||||| || ||    |||||     
T  36929116 ttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcaggcaacaacactcgtcgagcaatcaaattagtcttcgttggtaaccgatccttgaggagt 36929215  T
Q  137 ctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaa 186  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36929216 ctccatgcaaaaactgaaaccttcaagggaacctgtttgtgccaaaccaa 36929265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 630 - 729
Target Start/End: Original strand, 39430840 - 39430939
Alignment:
Q  630 ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  39430840 ccaacctcccaccaacctcgccataacgggcgactagaacactataccacaaccctactctatctaccaacatcctccaacaccacttacctaacaaagc 39430939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 668 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 13867372 - 13867311
Alignment:
Q  668 accctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13867372 accctataccataaaccacctctatccaccaacatccgccaacaccatttacctaacaaagc 13867311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 646 - 729
Target Start/End: Original strand, 20796236 - 20796319
Alignment:
Q  646 ctcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    ||||||||| | |||||||| |||  |||||||||||||  |||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  20796236 ctcgccataacgggcgactagaacattataccacaaccctactctatttaccaacatcctccaacaccatttacctaacaaagc 20796319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 667 - 729
Target Start/End: Original strand, 5809181 - 5809243
Alignment:
Q  667 aaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  5809181 aaccctataccagagcccacctttgtccaccaacatccgccaacaccatgtacctaacaaagc 5809243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 673 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 19014518 - 19014460
Alignment:
Q  673 ataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagcta 731  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  19014518 ataccaaaacccacctctgtccaccaacatccgccaactccatttacctagcaaagcta 19014460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 646 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 49264525 - 49264444
Alignment:
Q  646 ctcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaa 727  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| ||| ||||||||||  |||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  49264525 ctcgccataacgggcgactataacactacaccacaaccctactctatctaccaacatcttccaacaccatttacctaacaaa 49264444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 646 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 25504555 - 25504479
Alignment:
Q  646 ctcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttcccta 722  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||| || ||||| || || || ||||||| |||||||||||||||||    
T  25504555 ctcgccataacgggcgactaaaactctataccaaaaaccacccctatccactaacatcctccaacaccatttcccta 25504479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 668 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 3544640 - 3544581
Alignment:
Q  668 accctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaa 727  Q
    ||||||||||| || ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3544640 accctataccaaaaaccatctctatctaccaacattcgccaacaccatttacctaacaaa 3544581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 650 - 717
Target Start/End: Original strand, 38070415 - 38070482
Alignment:
Q  650 ccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccattt 717  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  38070415 ccataccttgccaccaaaactctataccacaaccctcctctatccaccaacaaccgccaacaccattt 38070482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 180
Target Start/End: Original strand, 3073799 - 3073848
Alignment:
Q  131 aggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgcca 180  Q
    ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3073799 aggagtctccacgcaaaaatagagaccttcaagggaacctgtttgtgcca 3073848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 672 - 729
Target Start/End: Original strand, 45795880 - 45795937
Alignment:
Q  672 tataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    ||||||| || |||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45795880 tataccataaaccacctttatccaccaacatccgccaacaccatttacctaacaaagc 45795937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 16873443 - 16873332
Alignment:
Q  277 ccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgt 376  Q
    ||||| ||| || |||| |||||||||   ||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||  ||   |||||||||   ||| |||||||||    
T  16873443 ccacaaccatctgtctgaaacattaggcaacaaagaaacatcaagcagtaaagccctaagctcctctaataaaatctcctcccaagcccacaacctacgt 16873344  T
Q  377 ctccacctccac 388  Q
    ||||||||||||    
T  16873343 ctccacctccac 16873332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 270 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 7396669 - 7396595
Alignment:
Q  270 ccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctcta 344  Q
    |||| ||||||||||| | || || |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  7396669 ccggtagccacacccaacgatttgaaacattagcatgcaaagaaacatcaagcagtaaaatcctacactcctcta 7396595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 674 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 13112821 - 13112767
Alignment:
Q  674 taccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaag 728  Q
    |||||||||||  || |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  13112821 taccacaacccctctttgtccaccaacatcctccaacaccatttccccaacaaag 13112767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 342
Target Start/End: Original strand, 36929367 - 36929421
Alignment:
Q  288 tatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctc 342  Q
    |||||| |||||| |||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36929367 tatctgaaacatttggaaacaagagaacatcaagaagtaaagccctacactcctc 36929421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 668 - 729
Target Start/End: Original strand, 52692072 - 52692133
Alignment:
Q  668 accctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    ||||||||||| |||||  |||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  52692072 accctataccagaacccctctctatccaccaacatcctccaacaccattttcctaataaagc 52692133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 506; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 506; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 732
Target Start/End: Original strand, 34480900 - 34481613
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaa 131  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||    
T  34480900 gccgattcaggataaccacccccagcaacacacgaagacatgtcaggcgatagcacccgtctagaaatcaaatttaaccttgtcggtaaacggtcacgaa 34480999  T
Q  132 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaacaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||         |||| |||||    
T  34481000 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatagtctacggcctgag---------agactaacaa 34481090  T
Q  232 acgatatgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagcc 331  Q
    || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34481091 actatatgcacctcgaactgtgtatccactagatgggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagcc 34481190  T
Q  332 ctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtctgtta 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |    
T  34481191 ctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacagagagcaaatatgcca 34481290  T
Q  432 cagacatagtcttattctctgttaactcaaacaa-cgactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcggaccaaaacgaagtatcagc 530  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34481291 cagacatagacttattctctgttaactcaaacaaccgactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcggaccaaaacgaagtatcagc 34481390  T
Q  531 cccatcaccaactctcctcaac--------------accagtcgctaccaccatctccatccctcaccctaagacgactcacctccgaccaccaacaaga 616  Q
    ||||||||||||||||||||||              ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34481391 cccatcaccaactctcctcaacacctgatcctcaaaaccagccgctaccaccaactccatccctcaccctaagacgactcacctccaaccaccaacaaga 34481490  T
Q  617 aactctccagccc-------ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaa 709  Q
    |||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34481491 aactctccggcccccaacctccaacctgccacctaactcgccatacctggcggctaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaa 34481590  T
Q  710 caccatttccctaacaaagctat 732  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  34481591 caccatttccctaacaaagctat 34481613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 6264397 - 6264151
Alignment:
Q  29 tgtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcac 128  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||    
T  6264397 tgtgccgattcgggatgaccacaaccagcaacatacgaggacatgtcaggcgacaacacccgtctagaaatcaaatttgtccttgtcggtaaacaatcac 6264298  T
Q  129 gaaggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaa 228  Q
    ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||| ||||  ||    
T  6264297 gaatgagcctccatgcgaaaacggaaaccttcaaggaaacctgtttgtgccacaccaaatccagagcatagtctacgacctgaggtacctgcgagattaa 6264198  T
Q  229 caaacgatatgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaa 275  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6264197 caaactatatgcacctcgaactgtgtatccaccagatgggtccggaa 6264151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 272 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 10486876 - 10486404
Alignment:
Q  272 ggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacc 371  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||| ||||    
T  10486876 ggaagccaaacccatctatctgaaacattcggaaacaagagaacatcaagaagtaaagccctacactccgctaacatgtcctcctcccactgccacaacc 10486777  T
Q  372 tacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtctgttacagacatagtcttattctctgttaactcaaaca-acgact 470  Q
    ||||||||||||||||||   |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||   |||||||| ||||||||||||||  | ||     
T  10486776 tacgtctccacctccacataaccccccgctgctccgaatcaacagagaacaagtctgccacagacatgaacttattctatgttaactcaaacagcctacg 10486677  T
Q  471 aaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcggaccaaaacgaagtatcagccccatcaccaactctcc-----------tcaac--accag 557  Q
    ||| |  ||||||| |||||  |||||||||||||||||  |||||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||           |||||  |||||    
T  10486676 aaaacggacacaaaaaggaagatcccctaaccacctatccaaccaaaacaacgtatcagctccatctccaaccctcctagccacatgatcaacaaaccag 10486577  T
Q  558 tcgctaccaccatctccatccctcaccctaagacgactcacctccgaccaccaacaagaaactctccagccc-------ccaacctgccacctaactcgc 650  Q
      ||   | ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||| ||||       |||||||||||||||| ||||    
T  10486576 ctgcactctccatcaccatcactacccctaagacgactcacctccctccaccaacacgaaacactccggcccccaacctccaacctgccacctaattcgc 10486477  T
Q  651 catacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaa 723  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10486476 catacctggcaactaaaaccgtataccacaaaccatctatgtccaccaacatccgccaacaccatttccctaa 10486404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 32 - 290
Target Start/End: Original strand, 32918262 - 32918520
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| || || || |    
T  32918262 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgacaacacccgtctagcaatcaaatttgtctttgttggtaaacgatctcgga 32918361  T
Q  132 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaacaa 231  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || || |||||||||| |||   |||||    
T  32918362 tgagcctccacgcgaaaacggacaccttcaagggaacctgtttgtgtcacaccaaatccagagcatagtctgcgacctgaggtacctgagaggtcaacaa 32918461  T
Q  232 acgatatgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaagccacacccagctat 290  Q
    || ||||||||| ||||||||||  |||| | |||| |||||||| ||||||| |||||    
T  32918462 actatatgcaccacgaactgtgtaaccaccatatggatccggaagtcacaccctgctat 32918520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15499842 - 15499707
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaa 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |  |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |  ||||| |    
T  15499842 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacgaggacatgtcaggcaccaacacccgtctagcaatcaaatttgtccttgttggtaaacaatcacgga 15499743  T
Q  132 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaa 167  Q
     ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  15499742 tgagcctccacgcaaaaacggacactttcaagggaa 15499707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 275 - 409
Target Start/End: Original strand, 587703 - 587837
Alignment:
Q  275 agccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctac 374  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||  ||||| |||||    
T  587703 agccacactcatctatctgaaacattaggatacaaagaaacatcaagaagtaaagccctacactcctctaacatatcctcctcccacatccatagcctac 587802  T
Q  375 gtctccacctccacacttccccccaccgctccgaa 409  Q
    | ||||||||||| || ||||||||  ||||||||    
T  587803 gcctccacctccagacatccccccaatgctccgaa 587837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 10487116 - 10486963
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaa 131  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  |||||  ||||| | || ||||||||| ||| |||||||||| || ||  | |    
T  10487116 gccgtttccggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatgtcattcgataacacccgacgagcaatcaaattagtctttgtcggtaaacgatcctgga 10487017  T
Q  132 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacacca 185  Q
    |||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10487016 ggagtctccaagcaaaaactgaaatcttcaagggaacctgtttgtgccacacca 10486963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 593 - 725
Target Start/End: Original strand, 588033 - 588165
Alignment:
Q  593 actcacctccgaccaccaacaagaaactctccagcccccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgt 692  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| | |||  || |||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||| ||| |    
T  588033 actcacctccttccaccaacaagaaccactctggcgcccaacctcccatctaattcgccatatctggcaactaacaccctataccataaaccacatctat 588132  T
Q  693 ctaccaacatccgccaacaccatttccctaaca 725  Q
    | |||| ||||| ||||||||| || |||||||    
T  588133 caaccagcatcctccaacaccactttcctaaca 588165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 646 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 30509608 - 30509523
Alignment:
Q  646 ctcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagcta 731  Q
    ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||| ||| |||| ||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  30509608 ctcgccataacgggcgactaaaacctgataccacaagccatctctatctactaacaacctccaacaccatttccctagcaaagcta 30509523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 646 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 30549948 - 30549863
Alignment:
Q  646 ctcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagcta 731  Q
    ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||| ||| |||| ||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  30549948 ctcgccataacgggcgactaaaacctgataccacaagccatctctatctactaacaacctccaacaccatttccctagcaaagcta 30549863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 725
Target Start/End: Original strand, 31864763 - 31864892
Alignment:
Q  596 cacctccgaccaccaacaagaaactctccagcccccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtcta 695  Q
    |||||||  ||||||| ||||| | ||||  || ||||||| |||||||  |||||||| |||| || ||||||||||||||| || || ||||| || |    
T  31864763 cacctcccgccaccaagaagaaccactccgaccgccaacctcccacctatttcgccatagctggtgattaaaaccctataccataagcctcctctatcca 31864862  T
Q  696 ccaacatccgccaacaccatttccctaaca 725  Q
    | ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  31864863 ctaacatcctccaacaccatttacctaaca 31864892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 668 - 729
Target Start/End: Original strand, 476814 - 476875
Alignment:
Q  668 accctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    ||||||||||| || ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  476814 accctataccaaaaaccatctctatctaccaacattcgccaacaccatttacctaacaaagc 476875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 630 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 35122283 - 35122191
Alignment:
Q  630 ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttcccta 722  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||| ||  |||| || || ||||||| |||||||||||||||||    
T  35122283 ccaaccttccacctatttcgccataacgggcgactaaaacctgataccacaatccttctctatccactaacatcctccaacaccatttcccta 35122191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 672 - 732
Target Start/End: Original strand, 42259885 - 42259945
Alignment:
Q  672 tataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagctat 732  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  42259885 tataccaaaacccacctctatccaccaacatccgtcaacaccatttacctaacaaggctat 42259945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 266 - 361
Target Start/End: Original strand, 31862771 - 31862866
Alignment:
Q  266 gggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccac 361  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| || || ||||| || ||| |||||||||||||||||||||  ||||||  | | |||| |||||||||||    
T  31862771 gggtctggaagccacacccatctatttgaaatattagaatgcaaagaaacatcaagaagtaaagccacacactctgccaacaactcctcctcccac 31862866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 650 - 729
Target Start/End: Original strand, 33170241 - 33170320
Alignment:
Q  650 ccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    |||||||| || ||||| ||||||  |||||||||| |||| ||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  33170241 ccatacctagccactaacaccctacgccacaacccatctctctctactaacaacctccaacaccattttcctaacaaagc 33170320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 670 - 728
Target Start/End: Original strand, 23923488 - 23923546
Alignment:
Q  670 cctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaag 728  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  23923488 cctataccaaaacccacctctgtcaactaacatcctccatcaccatttccctaaaaaag 23923546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 19513426 - 19513305
Alignment:
Q  267 ggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgcca 366  Q
    |||| |||||||| |||||   ||||| || |||||||  ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||  |||    
T  19513426 ggtcaggaagccaaacccaagaatctgaaatattaggaaacaaagaaatatcaagcagtaatgccctacactcctctagtaaaacctcctcccacgccca 19513327  T
Q  367 taacctacgtctccacctccac 388  Q
     ||||| || ||||| ||||||    
T  19513326 caacctccgcctccaactccac 19513305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 671 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 22174530 - 22174469
Alignment:
Q  671 ctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagctat 732  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  22174530 ctataccataacccacctctatccaccaacaacctccaacaccatctacctaacaaagctat 22174469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 361
Target Start/End: Original strand, 4400055 - 4400150
Alignment:
Q  266 gggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccac 361  Q
    ||||| |||||||| |||||   ||||| || |||||||  ||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  4400055 gggtcaggaagccaaacccaagaatctgaaatattaggaaacaaagaaacatcaagcagtaagaccctacactcctctaataaaccctcctcccac 4400150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 630 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 19513042 - 19512947
Alignment:
Q  630 ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaaca 725  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||| | |||||| | ||| ||||||||||| ||  || | || |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  19513042 ccaacctcccaccaacctcgccataacgggcgacaagaacactataccacaaacctactttatcgaccaacatcctccaacaccatttacctaaca 19512947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 630 - 717
Target Start/End: Original strand, 31864352 - 31864439
Alignment:
Q  630 ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccattt 717  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| |||| || |||||| |||||||| || || ||||| || || ||||||| ||||||||||||    
T  31864352 ccaacctcccacctatttcgccatagctggtgattaaaacactataccataagcctcctctatccactaacatcctccaacaccattt 31864439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 668 - 722
Target Start/End: Original strand, 380502 - 380556
Alignment:
Q  668 accctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttcccta 722  Q
    ||||||||||| || ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  380502 accctataccagaaaccatctctatccaccaacatccgccaacaccatttgccta 380556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 326 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27117063 - 27117029
Alignment:
Q  326 aaagccctacactcctctagcaacccctcctccca 360  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27117063 aaagccctacactcctctaccaacccctcctccca 27117029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 29094460 - 29094374
Alignment:
Q  275 agccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccac 361  Q
    |||||| ||||  |||||| ||||||||||  ||| || | |||||  |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29094460 agccactcccatatatctgaaacattaggaaccaaagagatatcaaatagtagagccctacactcctctagcaaagcctcctcccac 29094374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 30510007 - 30509929
Alignment:
Q  266 gggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctcta 344  Q
    ||||| || ||||||| ||| ||||||| |||||||||   ||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  30510007 gggtcaggtagccacaaccatctatctgaaacattaggcaacaaagaaacatcaagcagtaaagccctaagctcctcta 30509929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 30550347 - 30550269
Alignment:
Q  266 gggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctcta 344  Q
    ||||| || ||||||| ||| ||||||| |||||||||   ||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  30550347 gggtcaggtagccacaaccatctatctgaaacattaggcaacaaagaaacatcaagcagtaaagccctaagctcctcta 30550269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 35122623 - 35122546
Alignment:
Q  311 gaaacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccac 388  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||  ||   |||||||||   ||| |||||||||||||||||||||    
T  35122623 gaaacatcaagcagtaaagccctaagctcctctaataaagtctcctcccaagcccacaacctacgtctccacctccac 35122546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 401; Significance: 0; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 23347664 - 23346943
Alignment:
Q  30 gtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacg 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  23347664 gtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacgaggacatgtcaggcgatggcacccgtctagcaatcaaatttgtccttgttggtaaacgatcacg 23347565  T
Q  130 aaggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaac 229  Q
     | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || || ||||||||| | |||  |||    
T  23347564 gatgagcctccacgcaaaaacgaaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccatagcatagtcggcgacctgaggtacctag-agattaac 23347466  T
Q  230 aaacgatatgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaag 329  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23347465 aaactatatgcacctcgaactgtgtatccaccagatgggtccggaagccacacccagctatctgaaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaag 23347366  T
Q  330 ccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtctgt 429  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  23347365 ccctacactcatctagcaactcctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacctccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtcggc 23347266  T
Q  430 tacagacatagtcttattctctgttaactcaaacaa-cgactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcggaccaaaacgaagtatca 528  Q
     || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||    
T  23347265 gacggacatagacttattctctgttaactcaaacaaccgcctaaaccgcacacaaagaggagcctcccctatccacctatcagaccaaaacgaggtgtca 23347166  T
Q  529 gccccatcaccaactctcctcaacaccag-------------tcgctaccaccatctccatccctcaccctaagacgactcacctccgaccaccaacaag 615  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |              ||||||||||||| ||  ||||  ||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  23347165 accccatcaccaactctcctcaacacctgatcctcaaacctcccgctaccaccatcgcctaccctatccctaagtcgcctcacctccgaccaccagcaag 23347066  T
Q  616 aaactctccagccc-------ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgcca 708  Q
    |||| |||| ||||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||    
T  23347065 aaacactccggcccccaacctccaacctgccacctaattcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaaaccacctctatccaccagcatccgcca 23346966  T
Q  709 acaccatttccctaacaaagcta 731  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  23346965 acaccattttcctaacaaagcta 23346943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 726
Target Start/End: Original strand, 26205292 - 26206000
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaa 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| |||||| | ||||| || || || |    
T  26205292 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacgaggacatgtcaggcgacaacacccgtctagcaatcaaattagtcctttttggtaaacgatctcgga 26205391  T
Q  132 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaacaa 231  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || || |||| ||||| |||   |||||    
T  26205392 tgagcctccacgcaaaaacggacaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatagtccgcgacctgaggaacctgagaggtcaacaa 26205491  T
Q  232 acgatatgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagcc 331  Q
    || ||||||||| ||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26205492 actatatgcaccacgaacagtgtaaccaccagatgggtccggaagccacacctagctatctgaaacattaggattcaaagaaacatcaagaagtaaagcc 26205591  T
Q  332 ctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtctgtta 431  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |  |    
T  26205592 ctacactcctctagcaactcctcctcccactgccataacctacgtatccacctccacaaatccccccaccgctttgaatcaacagatagcaagtccgcca 26205691  T
Q  432 cagacatagtcttattctctgttaactcaaacaa-cgactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcggaccaaaacgaagtatcagc 530  Q
    | ||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  26205692 cggacataaacttattctttgttaactcaaacaaccgactaaacctcacacgaagaggagcctcccttatccacctatcgaaccaaaacgatgtatcagc 26205791  T
Q  531 cccatcaccaactctcctcaac-------------accagtcgctaccaccatctccatccctcaccctaagacgactcacctccgaccaccaacaagaa 617  Q
    | ||||||||||||||||||||             ||||  ||||||||||| | ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26205792 ctcatcaccaactctcctcaacacctgatccttaaaccaaccgctaccaccaacaccaaccctacccctaagacgactcacctccgaccaccaacaagaa 26205891  T
Q  618 actctccagcccccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccattt 717  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  26205892 actctccgtcccccaacctgccacctaattcgccatatctggcgactaaaaccgtataccacaaaccacctctatcaaccaataaccgccaacaccattt 26205991  T
Q  718 ccctaacaa 726  Q
    || ||||||    
T  26205992 ccttaacaa 26206000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 713
Target Start/End: Original strand, 25317798 - 25318493
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaa 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| |||||| | ||||| || || || |    
T  25317798 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacgaggacatgtcaggcgacaacacccgtctagcaatcaaattagtcctttttggtaaacgatctcgga 25317897  T
Q  132 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaacaa 231  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || || |||| ||||| |||   |||||    
T  25317898 tgagcctccacgcaaaaacggacaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatagtccgcgacctgaggaacctgagaggtcaacaa 25317997  T
Q  232 acgatatgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagcc 331  Q
    || ||||||||| ||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25317998 actatatgcaccacgaacagtgtaaccaccagatgggtccggaagccacacctagctatctgaaacattaggattcaaagaaacatcaagaagtaaagcc 25318097  T
Q  332 ctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtctgtta 431  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |  |    
T  25318098 ctacactcctctagcaactcctcctcccactgccataacctacgtatccacctccacaaatccccccaccgctttgaatcaacagatagcaagtccgcca 25318197  T
Q  432 cagacatagtcttattctctgttaactcaaacaa-cgactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcggaccaaaacgaagtatcagc 530  Q
    | ||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25318198 cggacataaacttattctttgttaactcaaacaaccgactaaacctcacacgaagaggagcctcccttatccacctatcgaaccaaaacgatgtatcagc 25318297  T
Q  531 cccatcaccaactctcctcaac-------------accagtcgctaccaccatctccatccctcaccctaagacgactcacctccgaccaccaacaagaa 617  Q
    | ||||||||||||||||||||             ||||  ||||||||||| | ||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25318298 ctcatcaccaactctcctcaacacctgatccttaaaccaaccgctaccaccaacaccaaccctacacctaagacgactcacctccgaccaccaacaagaa 25318397  T
Q  618 actctccagcccccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacacc 713  Q
    |||||||  |||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| || ||||| || ||||| | ||||| |||||    
T  25318398 actctccgtcccccaccctgcgacctaattcgccatatctggcgacaaaaaccgtataccacaaaccccctctatcaaccaaaaaccgcccacacc 25318493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 731
Target Start/End: Original strand, 15673767 - 15674493
Alignment:
Q  30 gtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacg 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| || || ||    
T  15673767 gtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacaagaggacatgtcaggcgacaacacccttctagcaatcaaatttgtccttgttggtaaacgatcccg 15673866  T
Q  130 aaggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaac 229  Q
     | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| || |||||||||| ||||  |||    
T  15673867 gatgagcctccacgcaaaaacggaccccttcaagggaacctgcttgtgccacaccaaatccagagcatagtcgacgacctgaggtacctgagagattaac 15673966  T
Q  230 aaacgatatgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaag 329  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15673967 aaactatatgcacctcgaactgtgtaaccaccagatgggtccggaagccacacccagctatctgaaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaag 15674066  T
Q  330 ccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttcc----ccccaccgctccgaatcaacagagagcaagt 425  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  15674067 ccctgcactcatctagcaactcctcctcccactgccacaacctacgtctccacctccacacctccccggccccaacgctctgaatcaacagagagtaagt 15674166  T
Q  426 ctgttacagacatagtcttattctctgttaactcaaacaa-cgactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcggaccaaaacgaagt 524  Q
    | |  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  15674167 cggccacagacatagacttattctccgttaactcaaacaaccgcctaaaccgcacgcaaagaggagcctcccctatccacctatcagaccaaaacgaagt 15674266  T
Q  525 atcagccccatcaccaactctcctcaac-------------accagtcgctaccaccatctccatccctcaccctaagacgactcacctccgaccaccaa 611  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||             ||||  ||| |||||| || ||   | |  ||||||| || |||||||||||||||||     
T  15674267 ctcaaccccatcaccaactctcctcaacacccgatcctcaaaccacccgccaccaccgtcgcctaacatatccctaagtcgcctcacctccgaccaccag 15674366  T
Q  612 caagaaactctccagccc-------ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatcc 704  Q
    | ||||||||||| ||||       |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||    
T  15674367 ctagaaactctccggcccccaacctccaacctgccacctaattcaccatatctggcgactaaaaccctataccacaaaccatctcggtccaccaacatcc 15674466  T
Q  705 gccaacaccatttccctaacaaagcta 731  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15674467 gccaacaccattttcctaacaaagcta 15674493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 8873025 - 8872761
Alignment:
Q  29 tgtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcac 128  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  8873025 tgtgccgattcgggatgaccacaaccagcaacgcacgaggacatgtcaggcgacaacacccgtctagaaatcaaatttgtccttgtcggtaaacgatcac 8872926  T
Q  129 gaaggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaa 228  Q
     || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||| ||||  ||    
T  8872925 aaatgagcctccacgcgaaaacggaaaccttcaagggaaccagtttgtgccacaccaaatccagagcatagtctacgacctgaggtacctgagagattaa 8872826  T
Q  229 caaacgatatgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaagccacacccagctatctg 293  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8872825 caaactataagcaccttgaactgtgtatccaccatatgggtccggaagccacacccagctatctg 8872761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 186
Target Start/End: Original strand, 1682995 - 1683138
Alignment:
Q  43 atgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaaggagcctccac 142  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  |||||  ||||||| || ||||||||| ||| |||||||||| || ||| | ||||| |||||     
T  1682995 atgaccgcaaccagcgacacataaggacatgtcattcgataacacccgtcgagcaatcaaattagtctttgtcggtaaacgatcaaggaggagtctccaa 1683094  T
Q  143 gcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaa 186  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1683095 gcaaaaactgaaatcttcaagggaacctgtttgtaccacaccaa 1683138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 186
Target Start/End: Original strand, 33630041 - 33630195
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaa 131  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  |||||  ||||||| || ||||||||| ||| |||||||||| || || || |    
T  33630041 gccgtttccggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatgtcattcgataacacccgtcgagcaatcaaattagtctttgtcggtaaacgatctcgga 33630140  T
Q  132 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaa 186  Q
    |||  ||| | |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33630141 ggaatctctaagcaaaaactgaaatcttcaagggaacatgtttgtgccacaccaa 33630195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 646 - 729
Target Start/End: Original strand, 13086118 - 13086201
Alignment:
Q  646 ctcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13086118 ctcgccataacgggcgactagaacactataccacaaacctactctatctaccaacatcctccaacaccatttacctaacaaagc 13086201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 668 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 14686547 - 14686486
Alignment:
Q  668 accctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14686547 accctataccaaaatccgcctctatccaccaacatccgccaacaccatttacctaacaaagc 14686486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 646 - 722
Target Start/End: Original strand, 19256219 - 19256295
Alignment:
Q  646 ctcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttcccta 722  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||| || ||||| || || || ||||||| |||||||||||||||||    
T  19256219 ctcgccataacgggcgactaaaactctataccaaaaaccacccctatccactaacatcctccaacaccatttcccta 19256295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 646 - 722
Target Start/End: Original strand, 33640496 - 33640572
Alignment:
Q  646 ctcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttcccta 722  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||| || ||||| || || || ||||||| |||||||||||||||||    
T  33640496 ctcgccataacgggcgactaaaactctataccaaaaaccacccctatccactaacatcctccaacaccatttcccta 33640572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 396
Target Start/End: Original strand, 4474887 - 4475006
Alignment:
Q  277 ccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgt 376  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||   ||| ||||||| ||| | ||||| |||| |||||||||  ||   ||||||||||  ||| |||||||||    
T  4474887 ccacacccatctgtctgaaacattaggcagcaaagaaacattaagcaataaagtcctaaactcctctaataaattctcctcccacgcccacaacctacgt 4474986  T
Q  377 ctccacctccacacttcccc 396  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  4474987 ctccacctccacccttcccc 4475006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 668 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 14843676 - 14843617
Alignment:
Q  668 accctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaa 727  Q
    ||||||||||| || ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14843676 accctataccaaaaaccatctctatctaccaacattcgccaacaccatttacctaacaaa 14843617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 668 - 731
Target Start/End: Original strand, 19350545 - 19350608
Alignment:
Q  668 accctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagcta 731  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| || | ||||||||    
T  19350545 accctataccaaaacccacctctatctatcaacaaccgccaacaccatttacccatcaaagcta 19350608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 630 - 732
Target Start/End: Original strand, 11469131 - 11469233
Alignment:
Q  630 ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    ||||||| |||||||  || ||||| | ||||||||| || | ||||||||||||  || | ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||    
T  11469131 ccaacctcccacctacgtcaccatatcgggcgactaacacacgataccacaacccttctttatctaccaacatcctccaacaccatttacctagcaatgc 11469230  T
Q  730 tat 732  Q
    |||    
T  11469231 tat 11469233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 366
Target Start/End: Original strand, 33630281 - 33630375
Alignment:
Q  272 ggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgcca 366  Q
    ||||| || ||||| ||||||| |||||| |||  ||||  |||||||| || |||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||    
T  33630281 ggaagtcaaacccatctatctgaaacattcggaaacaagagaacatcaaaaaataaagccctacactccgctaacatctcctcctcccactgcca 33630375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 646 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 503093 - 503017
Alignment:
Q  646 ctcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttcccta 722  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||| || || ||||| || || || ||||||| |||||||||||||||||    
T  503093 ctcgccataacgggcgactaaaactctatatcaaaaaccacccctatccactaacatcctccaacaccatttcccta 503017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 630 - 722
Target Start/End: Original strand, 33805343 - 33805435
Alignment:
Q  630 ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttcccta 722  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||||||   ||||||||| ||  |||| || || ||||||| |||||||||||||||||    
T  33805343 ccaacctcccacctatttcgccatagcgggcgactaaaacatgataccacaatccttctctatccactaacatcctccaacaccatttcccta 33805435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 696 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 12687277 - 12687242
Alignment:
Q  696 ccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagcta 731  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12687277 ccaacatccgccaacaccacttccctaacaaagcta 12687242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 668 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 29976547 - 29976484
Alignment:
Q  668 accctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagcta 731  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||| || | ||||||||    
T  29976547 accctataccaaaacccacctctatctatcaacaaccgccaacgccatttacccatcaaagcta 29976484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 692 - 726
Target Start/End: Original strand, 34434885 - 34434919
Alignment:
Q  692 tctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaa 726  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34434885 tctaccaacatccgccaacaccatttacctaacaa 34434919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 388
Target Start/End: Original strand, 9565574 - 9565667
Alignment:
Q  295 aacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccac 388  Q
    ||||||||||  ||| || | ||||| |||||| | | ||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||| ||||| ||||||    
T  9565574 aacattaggaaccaaagagatatcaaaaagtaacgtcttacactcctctagcaaagcctcctcccacgcccacaacctacgcctccaactccac 9565667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 695 - 732
Target Start/End: Original strand, 15161270 - 15161307
Alignment:
Q  695 accaacatccgccaacaccatttccctaacaaagctat 732  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15161270 accaacatacgccaacaccacttccctaacaaagctat 15161307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 695 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 15472139 - 15472102
Alignment:
Q  695 accaacatccgccaacaccatttccctaacaaagctat 732  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15472139 accaacatacgccaacaccacttccctaacaaagctat 15472102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 668 - 729
Target Start/End: Original strand, 25350823 - 25350884
Alignment:
Q  668 accctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||    
T  25350823 accctataccagaacccatctctatccaccaacatcctccaaaaccattttcctaataaagc 25350884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 668 - 717
Target Start/End: Original strand, 32186284 - 32186333
Alignment:
Q  668 accctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccattt 717  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||    
T  32186284 accctataccaaaacccacctctatccaccaacaactgccaacaccattt 32186333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 23)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 731
Target Start/End: Original strand, 20674964 - 20675686
Alignment:
Q  30 gtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacg 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  20674964 gtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacgaagacatgtcaggcgaaagcacccatctagcaatcaaatttgtccttgttggtaaacgatcacg 20675063  T
Q  130 aaggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaac 229  Q
     | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||  || || |||||||||| ||||  |||    
T  20675064 gatgagcctccacgcaaaaacgaaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaacaaatccatagcatagtcggcgacctgaggtacctgagagattaac 20675163  T
Q  230 aaacgatatgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaag 329  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20675164 aaactatatgcacctcgaactgtgtatccaccagatgggtccggaagccacacccagctatctgaaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaag 20675263  T
Q  330 ccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtctgt 429  Q
     ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |     
T  20675264 tcctacactcatcaagcaactcctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacctccccccaccgctccgaatcaacaaagagcaagtcggc 20675363  T
Q  430 tacagacatagtcttattctctgttaactcaaacaa-cgactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcggaccaaaacgaagtatca 528  Q
     || || |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  20675364 cacggatatagacttattctctgttaactcaaacaaccgcctaaaccgcacacaaagaggagcctcccctaaccacctatcagaccaaaacgaagtgtca 20675463  T
Q  529 gccccatcaccaactctcctcaac-------------accagtcgctaccaccatctccatccctcaccctaagacgactcacctccgaccaccaacaag 615  Q
     |||||||||||||||||||||||             ||||  ||||||||||||| ||  ||||  ||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  20675464 accccatcaccaactctcctcaacacctgatcctcaaaccacccgctaccaccatcgcctaccctatccctaagtcgcctcacctccgaccaccagcaag 20675563  T
Q  616 aaactct-------ccagcccccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgcca 708  Q
    |||||||       ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20675564 aaactcttcggcccccaacctccaacctgccacctatttcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaaaccacctctgtccaccaacatccgcca 20675663  T
Q  709 acaccatttccctaacaaagcta 731  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  20675664 acaccattttcctaacaaagcta 20675686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 23873672 - 23872952
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaa 131  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||| |  ||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |    
T  23873672 gccgattcaggatgaccgcaaccagcaacacacgaagacatgtcagacgacaacacccgtcgagcaatcaaatttgtccttgttggtaaacgatcacgga 23873573  T
Q  132 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaacaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |  || ||||||||||||||||||  |||||    
T  23873572 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccagatcatcgacggcgaccggaggtacctgggagattaacaa 23873473  T
Q  232 acgatatgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagcc 331  Q
    || ||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23873472 actataggcacctcgaactgtgtaaccaccagatgggtccggaagccacacccagctatctgaaacaataggattcaaggaaacatcaagaagtaaagcc 23873373  T
Q  332 ctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtctgtta 431  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  23873372 ctacactcatctagcaactcctcctcccactgccattacctacgtctccacctccacacctccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtcggcaa 23873273  T
Q  432 cagacatagtcttattctctgttaactcaaacaa-cgactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcggaccaaaacgaagtatcagc 530  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  23873272 cggacatagacttattctctgttaactcaaacaaccgcctaaaccgcacacacagaggagcctccccaatccacctatcagaccaaaacgaagtatcgac 23873173  T
Q  531 cccatcaccaactctcctcaac-------------accagtcgctaccaccatctccatccctcaccctaagacgactcacctccgaccaccaacaagaa 617  Q
    ||||||||||||||||||||||             ||||  ||||||||||||| ||  |||   |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  23873172 cccatcaccaactctcctcaacacctgatcctcaaaccacccgctaccaccatcgcctaccccatccctaagacgcctcacctccgaccaccagcaagaa 23873073  T
Q  618 actctccagccc-------ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaac 710  Q
    || |||| ||||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  23873072 acactccggcccccaacctccaacctgccacctaattcgccatacctggcgactaaaacccgataccacaaaccacctctatctaccaacatccgccaac 23872973  T
Q  711 accatttccctaacaaagcta 731  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  23872972 accattttcctaacaaagcta 23872952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 727
Target Start/End: Original strand, 2631340 - 2632058
Alignment:
Q  30 gtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacg 129  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  2631340 gtgccgactcaggatgaccacatccaccaacacacgaggacatgtctggcgacaacacccgtctagcaatcaaatttgtccttgttggtaaacgatcacg 2631439  T
Q  130 aaggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaac 229  Q
     ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  || ||| || |||  ||||| ||||  |||    
T  2631440 gaggagccgccacacaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaattcagagcataatcgacgacctgagtcacctgagagattaac 2631539  T
Q  230 aaacgatatgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaag 329  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2631540 aaactatatgcacctcgaactgtgtatccaccagatgggtccggaagccacacccagctatctgaaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaag 2631639  T
Q  330 ccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtctgt 429  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  2631640 ccctacactcatctagcaactcctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacctccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtcggc 2631739  T
Q  430 tacagacatagtcttattctctgttaactcaaacaa-cgactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcggaccaaaacgaagtatca 528  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  2631740 cacagacatagacttattctctgttaactcaaacaaccgcctaaaccgcacacaaagaggagcctcccctatccacctatcagaccaaaatgaagtgtca 2631839  T
Q  529 gccccatcaccaactctcctca-------------acaccagtcgctaccaccatctccatccctcaccctaagacgactcacctccgaccaccaacaag 615  Q
     |||||||||||||||||||||             | ||||  ||||||||||||| ||  ||||  ||||||  || ||||||||||||||||| ||||    
T  2631840 accccatcaccaactctcctcatcacctgatcctcaaaccacccgctaccaccatcacctaccctgtccctaaatcgcctcacctccgaccaccagcaag 2631939  T
Q  616 aaactctccagccc-------ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgcca 708  Q
    ||||||| | ||||       |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||    
T  2631940 aaactcttcggcccctaacctccaacctgccacctaattcgccatacctggcaactaaaaccctataccacaaaccacccttgtccaccaacatccgcca 2632039  T
Q  709 acaccatttccctaacaaa 727  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2632040 acaccatttccctaacaaa 2632058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 731
Target Start/End: Original strand, 55298564 - 55299276
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaa 131  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||| ||| |  ||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |    
T  55298564 gccgattcaggatgaccgcagccagcaacacacgaagacatgtcagacgacaacacccgtcgagcaatcaaatttgtccttgttggtaaacgatcacgga 55298663  T
Q  132 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaacaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |  || ||||||||||||| ||||  |||||    
T  55298664 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccagatcatcgacggcgaccggaggtacctgagagattaacaa 55298763  T
Q  232 acgatatgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagcc 331  Q
    || ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55298764 actatatgcacctcgaactgtgtaaccaccagatgggtccggaagccacacccagctatctgaaacaataggattcaaggaaacatcaagaagtaaagcc 55298863  T
Q  332 ctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtctgtta 431  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  55298864 ctacactcatctagcaactcctcctcccactgccataaactacgtctccacctccacacctccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtcggcaa 55298963  T
Q  432 cagacatagtcttattctctgttaactcaaacaa-cgactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcggaccaaaacgaagtatcagc 530  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| |||        |||||||| ||||||||||||||| || |    
T  55298964 cggacatagacttattctctgttaactcaaacaaccgcctaaaccgcatacaaagaggagcct--------cacctatcagaccaaaacgaagtaacaac 55299055  T
Q  531 cccatcaccaactctcctcaac-------------accagtcgctaccaccatctccatccctcaccctaagacgactcacctccgaccaccaacaagaa 617  Q
    ||||||||||||||||||||||             ||||  ||||||||||||| ||  |||   |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  55299056 cccatcaccaactctcctcaacacctgatccccaaaccacccgctaccaccatcgcctaccccatccctaagacgcctcacctccgaccaccagcaagaa 55299155  T
Q  618 actctccagccc-------ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaac 710  Q
    || |||| ||||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  55299156 acactccggcccccaacctccaacctgccacctaattcgccatacctggcgactaaaacccgataccacaaaccacctctatccaccaacatccgccaac 55299255  T
Q  711 accatttccctaacaaagcta 731  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  55299256 accattttcctaacaaagcta 55299276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 30 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 8487179 - 8486699
Alignment:
Q  30 gtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacg 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| | || |||||    
T  8487179 gtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacgaggacatgtcaggcgacaacacccgtctagcaatcaaatttgtccttgttggttaacgatcacg 8487080  T
Q  130 aaggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaac 229  Q
     | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || || |||||||||| || |  |||    
T  8487079 gatgagcctccacgcaaaaacagaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccatagcatagtcggcgacctgaggtacctgagacattaac 8486980  T
Q  230 aaacgatatgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaag 329  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8486979 aaactatatgcacctcgaactgtgtatccaccatataggtccggaagccacacccagctatctgaaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaag 8486880  T
Q  330 ccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtctgt 429  Q
    |||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||       
T  8486879 ccctacactaatctagcaactccttctcccactgccataacctacgtctccacctccacacctccccccaccggtccgaatcaacagagagcaagtcgac 8486780  T
Q  430 tacagacatagtcttattctctgttaactcaaacaa-cgactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatc 509  Q
     || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  8486779 gacggacatagacttattctctgttaactcaaacaaccgcctaaaccgcacacaaagaggagcctcccctatccacctatc 8486699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 272 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 3129935 - 3129467
Alignment:
Q  272 ggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacc 371  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |   |||||||||||||| || |    
T  3129935 ggaagccaaacccatctatctgaaacattcggaagcaagagaacatcaagaagtaaagccctacactccgctaacatc---tcctcccactgccacaaac 3129839  T
Q  372 tacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtctgttacagacatagtcttattctctgttaactcaaacaa-cgact 470  Q
     ||||||||||||||||    ||||   | |||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||   |||||||||||||||||||||||  | |||    
T  3129838 aacgtctccacctccacgtaacccctagctgctccgaatcaatagagaacaagtctgccacagacatgaacttattctctgttaactcaaacagtctact 3129739  T
Q  471 aaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcggaccaaaacgaagtatcagccccatcaccaactctcct-----------caaca--ccag 557  Q
    ||| |  ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||||||| | |||||||| ||||| ||||| |||||           |||||  ||||    
T  3129738 aaaacggacacaaaaaggaacatcccctaaccacctaccaaaccaaaacaatgtatcagctccatctccaaccctcctagccacatgatcaacaaaccag 3129639  T
Q  558 tcgctaccaccatctccatccctcaccctaagacgactcacctccgaccaccaacaagaaactctccagcccccaacctgccacctaactcgccatacct 657  Q
     |||   | ||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3129638 ccgccctctccatcaccatcactacccctaaaacgactcacctccctccaccaacacgaaacactccggcccccaacctgccacctaattcgccatacct 3129539  T
Q  658 ggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    | | |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3129538 gacaactaaaaccctataccacaaaccacctctatccaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 3129467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 272 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 8655029 - 8654752
Alignment:
Q  272 ggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacc 371  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||| ||||    
T  8655029 ggaagccaaacccatctatctgaaacattcggaaacaagagaacatcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccactgccacaacc 8654930  T
Q  372 tacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtctgttacagacatagtcttattctctgttaactcaaaca-acgact 470  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||  | ||     
T  8654929 tacgtctccacctccacaaaaccccccactgctccgaatcaacagataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacg 8654830  T
Q  471 aaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcggaccaaaacgaagtatcagccccatcaccaactctcct 548  Q
     || |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| | |||| ||| ||||| ||||| |||||    
T  8654829 gaaacggacacaaaaaggaacatcccctaaccacctatccaaccaaaacaacgtattagctccatctccaaccctcct 8654752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 313 - 542
Target Start/End: Original strand, 47541150 - 47541380
Alignment:
Q  313 aacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatca 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||   | |||  | |||||||||||    
T  47541150 aacatcaagaagtaaagccctacactccgctaacatctcctccttccactgccacaaacgacgtctccacctccacataactcccggctgctccgaatca 47541249  T
Q  413 acagagagcaagtctgttacagacatagtcttattctctgttaactcaaaca-acgactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcgg 511  Q
    ||||| | ||||||||  ||||||||   |||||||||||||||||||||||  | || ||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||      
T  47541250 acagaaaacaagtctgccacagacatgaacttattctctgttaactcaaacagtctacaaaaacgaacacaaaaaggaacatcccctaaccacctatcaa 47541349  T
Q  512 accaaaacgaagtatcagccccatcaccaac 542  Q
    |||||||| | |||||| | ||||| |||||    
T  47541350 accaaaacaacgtatcatctccatctccaac 47541380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 583 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 7662940 - 7662786
Alignment:
Q  583 ccctaagacgactcacctccgaccaccaacaagaaactctccagccccc--------aacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctat 674  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| |||| ||||||        || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||    
T  7662940 ccctaatacgactcacctccccccaccaacacgaaacactccggcccccgaacctccaatctgccacctaattcgccatacctagcaactaagacactat 7662841  T
Q  675 accacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7662840 accacaaaccacctctgtccaccaacatccgccaacaccatttacctaacaaagc 7662786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 32 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3130175 - 3130021
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaa 131  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||  |||||  ||||||| || ||||||||| ||| |||||||||| || || || |    
T  3130175 gccgtttctggatgaccgcaaccagctacacataaagacatgtcattcgataacacccgtcgagcaatcaaattagtctttgtcggtaaacgatctcgga 3130076  T
Q  132 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaa 186  Q
    |||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3130075 ggagtctccaagcaaaaactgaaatcttcaagggaacctgtttgtgtcacaccaa 3130021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 32 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 7663435 - 7663277
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaa 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||  |  |||| || || |||||| || ||| | || ||||| || || || |    
T  7663435 gccgattcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcggcaacacccttcgagcaatcaagttagtcttcgttggtaaacgatctcgga 7663336  T
Q  132 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatcc 190  Q
     ||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7663335 tgagtctccacgcaaaaactgataccttcaaggaaacctgtttgtgccacaccaaatcc 7663277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 272 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 7663195 - 7663002
Alignment:
Q  272 ggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacc 371  Q
    |||||||| |||||  |||||| |||||| |||  |||   ||||||||||||||||||| |||||||| ||| || | |||||||||||||||| || |    
T  7663195 ggaagccaaacccatgtatctgaaacattcggaaacaaaagaacatcaagaagtaaagccatacactccactaacatctcctcctcccactgccacaatc 7663096  T
Q  372 tacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtctgttacagacatagtcttattctctgttaactcaaacaa 465  Q
    |||| ||||||||||| |    ||||  | ||||| |||||||||||| ||||||||  | ||||||   |||||||||| |||||||||||||    
T  7663095 tacgcctccacctccaaaaaaacccctgctgctccaaatcaacagagaacaagtctgccatagacatgagcttattctctattaactcaaacaa 7663002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 8655259 - 8655116
Alignment:
Q  42 gatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaaggagcctcca 141  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||  ||||| | || |||||||||  || |||| ||||| || ||  | ||||| |||||    
T  8655259 gatgaccacaaccagcgacacataaggacatgtgatgcgataacacccgacgagcaatcaaattaatctttgttggtaaccgatcctggaggagtctcca 8655160  T
Q  142 cgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacacca 185  Q
     |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8655159 agcaaaaactgaaatcttcaagggaacctgattgtgccacacca 8655116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 186
Target Start/End: Original strand, 47540869 - 47541023
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaa 131  Q
    |||| ||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||  |||||  ||||||| || ||||||||| ||| | ||| |||| || ||  | |    
T  47540869 gccgtttccggatgaccgcatccagcgacacataaggacatgtcattcgataacacccgtcgagcaatcaaattagtcttcgtcagtaaacgatcctgga 47540968  T
Q  132 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaa 186  Q
    |||  ||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47540969 ggaatctcaatgcaaaaactgaaatcttcaagggaacctgtttgtgccacaccaa 47541023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 596 - 722
Target Start/End: Original strand, 19648231 - 19648357
Alignment:
Q  596 cacctccgaccaccaacaagaaactctccagcccccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtcta 695  Q
    |||||||  ||||||| |||||   |||| ||||||||||| ||||  | ||||||||| | |||||||||||| |||||||| || ||||| || || |    
T  19648231 cacctcccgccaccaagaagaacaactccggcccccaacctcccacacacctcgccataacaggcgactaaaactctataccaaaaaccacccctatcca 19648330  T
Q  696 ccaacatccgccaacaccatttcccta 722  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||    
T  19648331 ctaacatcctccaacaccatttcccta 19648357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 29553702 - 29553607
Alignment:
Q  266 gggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccac 361  Q
    ||||| ||||| ||||||||   ||||| |||||||  |||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  29553702 gggtcaggaagtcacacccaaagatctgaaacattaacattcaaagaaacatcaaacagtaaagtcctacactcctctaacaactcctcctcccac 29553607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 646 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 42953066 - 42952983
Alignment:
Q  646 ctcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    ||||||||| | |||||| | ||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  42953066 ctcgccataacgggcgacaagaacactataccacaaacctactctatctaccaacatcctccaacaccatttacctaacaaagc 42952983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 650 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 55725263 - 55725184
Alignment:
Q  650 ccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| || ||| |||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  55725263 ccatacctagccaccaacaccctataccataatccatctctatctactaacaacctccaacaccatttccctaacaaagc 55725184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 668 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 43516287 - 43516226
Alignment:
Q  668 accctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  43516287 accctataccataaaccacctctatccgccaacatctgccaacaccatttacctaacaaagc 43516226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 646 - 722
Target Start/End: Original strand, 8935653 - 8935729
Alignment:
Q  646 ctcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttcccta 722  Q
    ||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || ||||| || || || ||||||| |||||||||||||||||    
T  8935653 ctcgccataacgagcgactaaaactctataccaaaaaccacccctatccactaacatcctccaacaccatttcccta 8935729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 630 - 729
Target Start/End: Original strand, 19114999 - 19115098
Alignment:
Q  630 ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    ||||||| |||| ||  |||||||| |  ||||||||||| |||||||| || ||||| || || || |||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  19114999 ccaacctcccacatacttcgccataacgagcgactaaaactctataccaaaatccacccctatccactaacaacctccaacaccatttccctaataaagc 19115098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 49926183 - 49926133
Alignment:
Q  311 gaaacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccac 361  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  49926183 gaaacatcaagcagaaaagccctacactccactaacaactcctcctcccac 49926133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 668 - 729
Target Start/End: Original strand, 2072141 - 2072202
Alignment:
Q  668 accctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||    
T  2072141 accctataccacatccctcctctatccaccaacatctgccatcaccatttacctaataaagc 2072202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 731
Target Start/End: Original strand, 29309350 - 29310072
Alignment:
Q  30 gtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacg 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| || |||||||| ||||| || |||||    
T  29309350 gtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacgaggacatgtcaggcgacagcacccgtctagcaatcaagtttgtccttgttggtaaacgatcacg 29309449  T
Q  130 aaggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaac 229  Q
     ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || || |||| ||||| || |  |||    
T  29309450 gaggagccgccacgtaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccagagcatagtcggcgacctgaggcacctgagaaattaac 29309549  T
Q  230 aaacgatatgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaag 329  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  29309550 aaactatatgcacctcgaactgtgtatccactagatgggtccggaagccacacccaactatctgaaacattaggattcaatgaaacatcaagaagtaacg 29309649  T
Q  330 ccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtctgt 429  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |     
T  29309650 ccctacactcatctagcaactcctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacctccccccaccgctccgaatcgacagagagcaagtcggc 29309749  T
Q  430 tacagacatagtcttattctctgttaactcaaacaa-cgactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcggaccaaaacgaagtatca 528  Q
     || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  29309750 cacggacatagacttattctctgttaactcaaacaaccgcctaaaccgcacacaaagaggagcctcccctatccacctatcagaccaaaacgaagtgtca 29309849  T
Q  529 gccccatcaccaactctcctcaac-------------accagtcgctaccaccatctccatccctcaccctaagacgactcacctccgaccaccaacaag 615  Q
     |||||||||||||||||||||||             ||||  ||||||||||||| ||  ||||  ||||||  || ||||||||||||||||| ||||    
T  29309850 accccatcaccaactctcctcaacacctgattctcaaaccacccgctaccaccatcacctaccctgtccctaattcgcctcacctccgaccaccagcaag 29309949  T
Q  616 aaactctccagccc-------ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgcca 708  Q
    ||||||||| ||||       |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  29309950 aaactctccggcccccaacctccaacctgccacctaattcggcatacctggcgactaaaaccctataccacaaaccacctttgtccaccaacatccgcca 29310049  T
Q  709 acaccatttccctaacaaagcta 731  Q
    ||||||||| |||||||| ||||    
T  29310050 acaccattttcctaacaatgcta 29310072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 6176676 - 6175954
Alignment:
Q  30 gtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacg 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  6176676 gtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacgaggacatgtcaggcgacaacacccgtctagcaatcaaattagtccttgttggtaaacgatcacg 6176577  T
Q  130 aaggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaac 229  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  || || ||||||| || ||||  |||    
T  6176576 gatgagcctccatgcaaaaacagaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacacaaaatccatagcatagtcggcgacctgaggtacttgagagattaac 6176477  T
Q  230 aaacgatatgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaag 329  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6176476 aaactatatgcacctcgaactgtgtatccaccagatgggtccagaagccacacccagttatctgaaacattaggattcaaagaaacatcaagaagtaaag 6176377  T
Q  330 ccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtctgt 429  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  6176376 ccctacactcatctagcaactcctcctcccactgctataacctacgtctccacctccacacctccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtcggc 6176277  T
Q  430 tacagacatagtcttattctctgttaactcaaacaa-cgactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcggaccaaaacgaagtatca 528  Q
     || ||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  6176276 gacggacatagacttattctctattaactcaaacaaccgtctaaaccgcacacaaagaggagcctcccctatccacctatcagaccaaaacgaagtgtca 6176177  T
Q  529 gccccatcaccaactctcctcaac-------------accagtcgctaccaccatctccatccctcaccctaagacgactcacctccgaccaccaacaag 615  Q
     |||||||||| | |||| |||||             ||||  ||||||||||||| ||  ||||  ||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  6176176 accccatcacccattctcatcaacacctgatcctcaaaccacccgctaccaccatcgcctaccctatccctaagtcgcctcacctccgaccaccagcaag 6176077  T
Q  616 aaactctccagccc-------ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgcca 708  Q
    |||| |||| ||||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  6176076 aaacactccggcccccaacctccaacctgccacctaattcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaaaccacctctgtccaccagcatccgcca 6175977  T
Q  709 acaccatttccctaacaaagcta 731  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  6175976 acaccattttcctaacaaagcta 6175954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 2813698 - 2813203
Alignment:
Q  30 gtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacg 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  2813698 gtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacgaggacatgtcaggcgacagcacccgtctagcaatcaaatttgtccttgttggtaaacgatcacg 2813599  T
Q  130 aaggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaac 229  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || || |||||| | | ||||  |||    
T  2813598 gatgagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccatagcatagtcggcgacctgaggtatccgagagattaac 2813499  T
Q  230 aaacgatatgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaag 329  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2813498 aaactatatgcacctcgaactatgtatccaccagatgggtccggaagccacacccagctatctgaaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaag 2813399  T
Q  330 ccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtctgt 429  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  2813398 ccctacactcatctagcaactcctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacctccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtcggc 2813299  T
Q  430 tacagacatagtcttattctctgttaactcaaacaa-cgactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcggaccaaaacgaagt 524  Q
     || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  2813298 aacggacatagacttattctctgttaactcaaacaaccgcctaaaccgcacacaaagaggagcctcccctatccacctatcagaccaaaacgaagt 2813203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 29 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 25873309 - 25872955
Alignment:
Q  29 tgtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcac 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  25873309 tgtgccgattcaggatgaccacacccagcaacacacgaagacatgtcaagcgataacacccgtctagaaatcaaatttatccttgtcggtaaacggtcac 25873210  T
Q  129 gaaggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccg--gaggtacctgggagacg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||| |||||     
T  25873209 gaaggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatagtctacggccactgaggtacctgagagact 25873110  T
Q  227 aacaaacgatatgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagta 326  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25873109 aacaaactatatgcacctcgaactgtgtatccactagatgggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaaaaagta 25873010  T
Q  327 aagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctcca 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25873009 aagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctcca 25872955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 33 - 390
Target Start/End: Original strand, 23601718 - 23602075
Alignment:
Q  33 ccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaag 132  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |     
T  23601718 ccgattcaggatgaccacaaacagcaacacacgaagacatgtcaggcgacaacacccgtctagcaatcaaatttgtccttgttggtaaacgatcacggat 23601817  T
Q  133 gagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaacaaa 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||  || ||| ||||||||| ||||  ||||||    
T  23601818 gagcctccacgcaaaaacagaaacctccaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccagatcatagtcggcgaccgaaggtacctgagagattaacaaa 23601917  T
Q  233 cgatatgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccc 332  Q
    | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23601918 ctatatgcacctcgaactgtgtatccactagatgggtccgaaagccacacccagctatctgaaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccc 23602017  T
Q  333 tacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacac 390  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23602018 tacactcatctagcaactcctcctcccactgccataacctatgtctccacctccacac 23602075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14904364 - 14904134
Alignment:
Q  30 gtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacg 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  14904364 gtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacatacgaggacatgtcaggcaacagcacccgtctagcaatcaaatttgtccttgttggtaaacgatcacg 14904265  T
Q  130 aaggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaac 229  Q
     | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||| |||||||||| ||||  |||    
T  14904264 gatgagcctcaacgcaaaaatggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccatagcatagtcggcggcctgaggtacctgagagattaac 14904165  T
Q  230 aaacgatatgcaccgcgaactgtgtgtccac 260  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  14904164 aaactatatgcacctcgaactgtgtatccac 14904134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 425
Target Start/End: Original strand, 9379038 - 9379434
Alignment:
Q  29 tgtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcac 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||| |  ||| |||||  ||||||||| ||  |||| ||||| || ||||    
T  9379038 tgtgccgtttcaggatgaccacaaccatcaatacacaaggacatgtaagacgacaacacctgtctaacaatcaaatttgtttttgttggtaaacgatcac 9379137  T
Q  129 gaaggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaa 228  Q
      | |||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||   ||  |  | | |||| |||| |||   ||    
T  9379138 agatgagcctccacgcaaaaactgataccttcaagaaaacctgactgtgccacaccaaatccaaagcagaatcctcaccagaaggttcctgagaggttaa 9379237  T
Q  229 caaacgatatgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaa 328  Q
    ||||  ||||||||| |||||  | |  || |  || |  ||||| ||||||  |||  |||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||     
T  9379238 caaatcatatgcaccacgaacattatagccccctgacgaatccggcagccacgtccatgtatctgaaacattgggatacaaggaaacatcaagtagtaat 9379337  T
Q  329 gccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagt 425  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||    
T  9379338 gccctacactccgctaacatcccctcctcccactgccataacctgcgcctccacctccacaaatccccccactgctctgaatcaacatagaacaagt 9379434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 272 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 49731888 - 49731611
Alignment:
Q  272 ggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacc 371  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||| || |    
T  49731888 ggaagccaaacccatctatctgaaacattcagaaacaagagaacatcaagaagtaaagccctacactccgccaacaactcctcctcccactgccacaaac 49731789  T
Q  372 tacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtctgttacagacatagtcttattctctgttaactcaaaca-acgact 470  Q
    ||||||||||||||||||   |||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||  ||| ||||   |||||||||||||||||||||||  | ||     
T  49731788 tacgtctccacctccacataaccccccgctgctccggatcaacagagaacaagtctgccacatacatgaacttattctctgttaactcaaacagtctacg 49731689  T
Q  471 aaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcggaccaaaacgaagtatcagccccatcaccaactctcct 548  Q
    ||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| | || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  49731688 aaaacggacacaaaaaggaacatcccctaaccacctatcaaaccaaaacaatgtgtcagctccatctccaaccctcct 49731611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 166
Target Start/End: Original strand, 7146985 - 7147119
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaa 131  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |    
T  7146985 gccgattcaggatgaccacaatcagcaacacacgaagacatgtcaggcgacaacacccgtctagcaatcaaatttgtccttgttggtaaacgatcacgga 7147084  T
Q  132 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaaggga 166  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7147085 tgagcctccacgcaaaaacggaaacctttaaggga 7147119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 434 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 14904127 - 14904005
Alignment:
Q  434 gacatagtcttattctctgttaactcaaacaac-gactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcggaccaaaacgaagtatcagccc 532  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  14904127 gacatagacttattctctgtaaactcaaacaaccgcctaaaccgcacacaaagaggagcctcccctatccacctatcagaccaaaacgaagtgtcaaccc 14904028  T
Q  533 catcaccaactctcctcaacacc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14904027 catcaccaactctcctcaacacc 14904005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 630 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 30166921 - 30166822
Alignment:
Q  630 ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30166921 ccaacctgccacctaattcgccatacctggcaactaagacactataccacaaaccacctctgtcaaccaacatccgccaacaccatttacctaacaaagc 30166822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 41 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 49732119 - 49731975
Alignment:
Q  41 ggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaaggagcctcc 140  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  |||||  ||||||| || ||||||||| ||| |||||||||| || || || ||||| ||||    
T  49732119 ggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatgtcattcgataacacccgtcgagcaatcaaattagtctttgtcggtaaacgatcccggaggagtctcc 49732020  T
Q  141 acgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacacca 185  Q
    | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49732019 aagcaaaaactgaaatcttcaagggaacctgtttgtgccacacca 49731975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 313 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 30167259 - 30167023
Alignment:
Q  313 aacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatca 412  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| || | |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |   | |||  | |||||  ||||    
T  30167259 aacatcaagaagtaaagtcctacactccgctaacatctcctcctcccactgccacaatctacgcctccacctccaaaaaacaccctgctgctccagatca 30167160  T
Q  413 acagagagcaagtctgttacagacatagtcttattctctgttaactcaaacaa-cgactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcgg 511  Q
    ||||||| ||||||||  ||| ||||   |||||||||||||||||||||||| | || ||| |  ||||| |  ||||| |||||||||||||||||      
T  30167159 acagagaacaagtctgccacaaacatgagcttattctctgttaactcaaacaatctacgaaaacggacacagaacggaacatcccctaaccacctatcca 30167060  T
Q  512 accaaaacgaagtatcagccccatcaccaactctcct 548  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||| |||||    
T  30167059 accaaaacaacgtatcagaaccatcaccaaccctcct 30167023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 30167541 - 30167383
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaa 131  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||| ||  |  |||| || || |||||| || ||| | || ||||| || ||||| |    
T  30167541 gccgattcaggctgaccgcaaccagcgacacataaggagatatcagtcggcaacacccttcgagcaatcaagttagtcttcgttggtaatcgatcacgga 30167442  T
Q  132 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatcc 190  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30167441 ggagtctccacgcaaaaactgaaacattcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatcc 30167383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 668 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 40513263 - 40513202
Alignment:
Q  668 accctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40513263 accctataccataaaccacctctatccaccaacatccgccaacaccatttacctaacaaagc 40513202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 630 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 21740100 - 21740001
Alignment:
Q  630 ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| | |||||||| ||| | |||||| || ||  |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21740100 ccaacctcccacctacttcgccataacgggcgactagaacacaataccataaacctactctatctaccaacatcctccaacaccatttacctaacaaagc 21740001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 668 - 729
Target Start/End: Original strand, 31675532 - 31675593
Alignment:
Q  668 accctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    ||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31675532 accctataccaaaaaccacctctatccaccaacattcgccaacaccatttacctaacaaagc 31675593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 668 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 31920890 - 31920829
Alignment:
Q  668 accctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    ||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31920890 accctataccaaaaaccacctctatccaccaacattcgccaacaccatttacctaacaaagc 31920829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 668 - 729
Target Start/End: Original strand, 34829994 - 34830055
Alignment:
Q  668 accctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    ||||||||||| |||||| || | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34829994 accctataccataacccaactatatccaccaacatccgccaacaccatttacctaacaaagc 34830055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 665 - 726
Target Start/End: Original strand, 55367208 - 55367269
Alignment:
Q  665 aaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaa 726  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  55367208 aaaaccttataccacaacccacctctatcaactaacatcctccaacaccattttcctaacaa 55367269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 630 - 722
Target Start/End: Original strand, 36709473 - 36709565
Alignment:
Q  630 ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttcccta 722  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||||||   ||||||||||||  ||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||    
T  36709473 ccaacctcccacctacttcgccataacgggcgactaaaacatgataccacaacccttctctgtcaactaacatcctccaacaccatttaccta 36709565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 650 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 962720 - 962641
Alignment:
Q  650 ccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    |||||||| || ||||| ||||||  |||||||||| |||| ||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  962720 ccatacctagccactaacaccctacgccacaacccatctctctctactaacaacctccaacaccattttcctaacaaagc 962641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 650 - 729
Target Start/End: Original strand, 3141434 - 3141513
Alignment:
Q  650 ccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    |||||||| || ||||| ||||||  |||||||||| |||| ||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  3141434 ccatacctagccactaacaccctacgccacaacccatctctctctactaacaacctccaacaccattttcctaacaaagc 3141513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18368911 - 18368808
Alignment:
Q  272 ggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacc 371  Q
    ||||||||| ||||  |||||| ||||||||||  ||| || | |||||  ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| ||||    
T  18368911 ggaagccactcccaaatatctgaaacattaggacacaaagagatatcaaatagtaatgccctacactcctctagcaaagcctcctcccacacccacaacc 18368812  T
Q  372 tacg 375  Q
    ||||    
T  18368811 tacg 18368808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 14867747 - 14867625
Alignment:
Q  266 gggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgcc 365  Q
    ||||| |||||||| |||||   ||||| || |||||||  ||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||  ||  |||||||||||  ||    
T  14867747 gggtcaggaagccaaacccaagaatctgaaatattaggaaccaaagaaacatcaagtattaaggccctacactcctctaataaaacctcctcccacgccc 14867648  T
Q  366 ataacctacgtctccacctccac 388  Q
    | ||||| |||||||| ||||||    
T  14867647 acaacctccgtctccaactccac 14867625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 668 - 717
Target Start/End: Original strand, 19875844 - 19875893
Alignment:
Q  668 accctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccattt 717  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  19875844 accctataccaaaacccacctctatctatcaacaaccgccaacaccattt 19875893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 596 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 43121285 - 43121152
Alignment:
Q  596 cacctccgaccaccaacaagaaactctccagcccccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtcta 695  Q
    |||||||  ||||||| |||||   |||| ||||||||||| | |||||  |||||||| | |||||||||||| | |||||| || ||||  || || |    
T  43121285 cacctccctccaccaagaagaacaactccggcccccaacctcctacctatttcgccataacgggcgactaaaactcgataccaaaaaccactcctatcaa 43121186  T
Q  696 ccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    | | ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  43121185 caagcatcctccaacaccattttcctaacaaagc 43121152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 630 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 42675016 - 42674924
Alignment:
Q  630 ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttcccta 722  Q
    ||||||| ||| |||  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||  |||| || || ||||||| |||||||||||| ||||    
T  42675016 ccaacctcccatctacttcgccataacgggcgactaaaacctgataccacaacccttctctatcaactaacatcctccaacaccatttaccta 42674924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 674 - 726
Target Start/End: Original strand, 47772921 - 47772973
Alignment:
Q  674 taccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaa 726  Q
    |||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47772921 taccacaacccctctttgtccaccaacatccgccaacaccatttccccaacaa 47772973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 638 - 729
Target Start/End: Original strand, 10868174 - 10868265
Alignment:
Q  638 ccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    ||||||| || |||||| |  ||||||| ||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  10868174 ccacctaccttgccataacgagcgactagaacactatatcagaaacctactctatctaccaacatcctccaacaccatttacctaacaaagc 10868265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 630 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 15481335 - 15481236
Alignment:
Q  630 ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    ||||||| |||||||  | |||||| | |||||||| |||   ||||||||||||  ||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  15481335 ccaacctcccacctactttgccataacgggcgactagaacatgataccacaacccttctctgtcaactaacatcctccaacaccatttacctaataaagc 15481236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 480 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 25388611 - 25388552
Alignment:
Q  480 acaaagaggaacctcccctaaccacctatcggaccaaaacgaagtatcagccccatcacc 539  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||    
T  25388611 acaaagaggaacacctcctaaccacctatcataccaaaagaaagtatcagccccatcacc 25388552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 360
Target Start/End: Original strand, 26010225 - 26010319
Alignment:
Q  266 gggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctccca 360  Q
    ||||| || |||||||||||  |||||| ||||||||||  ||  |||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  26010225 gggtctgggagccacacccatttatctgaaacattaggaaacacagaaacatcacatagtaaagtcctacactcctctaccaattcctcctccca 26010319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 323 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 15481662 - 15481597
Alignment:
Q  323 agtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccac 388  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||| | ||||| ||||||    
T  15481662 agtaacgccctacactcctctagcaaagcctcctcccacgtccatagcctaggcctccaactccac 15481597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 371; Significance: 0; HSPs: 25)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 731
Target Start/End: Original strand, 13439997 - 13440717
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaa 131  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||| ||| |  ||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |    
T  13439997 gccgattcaggatgaccgcagccagcaacacacgaagacatgtcagacgacaacacccgtcgagcaatcaaatttgtccttgttggtaaacgatcacgga 13440096  T
Q  132 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaacaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |  || ||||||||||||| ||||  |||||    
T  13440097 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccagatcatcgacggcgaccggaggtacctgagagattaacaa 13440196  T
Q  232 acgatatgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagcc 331  Q
    || ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13440197 actatatgcacctcgaactgtgtaaccaccagatgggtccggaagccacacccagctatctgaaacaataggattcaaggaaacatcaagaagtaaagcc 13440296  T
Q  332 ctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtctgtta 431  Q
    | |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  13440297 caacactcatctagcaactcctcctcccactaccataaactacgtctccacctccacacctccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtcggcaa 13440396  T
Q  432 cagacatagtcttattctctgttaactcaaacaa-cgactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcggaccaaaacgaagtatcagc 530  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |    
T  13440397 cggacatagacttattctctgttaactcaaacaaccgcctaaaccgcacacaaagaggagcctcccctatccacctatcagaccaaaacgaagtaacaac 13440496  T
Q  531 cccatcaccaactctcctcaac-------------accagtcgctaccaccatctccatccctcaccctaagacgactcacctccgaccaccaacaagaa 617  Q
    ||||||||||||||||||||||             ||||  ||||||||||||| ||  |||   |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13440497 cccatcaccaactctcctcaacacctgatccccaaaccacccgctaccaccatcgcctaccccatccctaagacgcctcacctccgaccaccagcaagaa 13440596  T
Q  618 actctccagccc-------ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaac 710  Q
    || |||| ||||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  13440597 acactccggcccccaacctccaacctgccacctaattcgccatacctggcgactaaaacccgataccacaaaccacctctatccaccaacatccgccaac 13440696  T
Q  711 accatttccctaacaaagcta 731  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  13440697 accattttcctaacaaagcta 13440717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 32 - 400
Target Start/End: Original strand, 45942795 - 45943163
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaa 131  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| || || |  |    
T  45942795 gccgactcaggatgaccacaaccaacaacacacgaggatatgtcaggcgacaacacccgtttagcaatcaaattagtccttgttggtaaacgatctcaga 45942894  T
Q  132 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaacaa 231  Q
     |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| || || |||| ||||| |||   |||||    
T  45942895 tgagcctccacgcgaaaacggacaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaattcagagcatagtctgcgacctgaggaacctgagaggtcaacaa 45942994  T
Q  232 acgatatgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagcc 331  Q
    || ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45942995 actatatgcaccacgaactgtgtaaccaccagatgggtccggaagccacacccagctatctgaaacattaggattcaaagaaacatcaagaagtaaagcc 45943094  T
Q  332 ctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccac 400  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  45943095 ctacactcctctagcaactcctcctcccactgccataatctacatctccacctccacacatccctccac 45943163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 336
Target Start/End: Original strand, 45235899 - 45236198
Alignment:
Q  37 ttcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaaggagc 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||||||| | |||||||||  || |||| ||||| || ||||| | ||||    
T  45235899 ttcaggatgaccacaaccaacaacacacgaggacatgtcaggcgacatcacccgtcttgcaatcaaatttatctttgttggtaaacgatcacggatgagc 45235998  T
Q  137 ctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaacaaacgat 236  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| |||   ||||||| ||    
T  45235999 ctccacgcgaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgtcacaccaaatccaaagcatagtctacgacatgaggtacctgagaggttaacaaactat 45236098  T
Q  237 atgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctaca 336  Q
    ||||||| |||| |||||  |||| ||| | || || |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45236099 atgcaccacgaattgtgtacccaccagacgagttcgaaagccacacccaactatctgaaacaataggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctaca 45236198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 272 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 15653661 - 15653185
Alignment:
Q  272 ggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacc 371  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||| || |    
T  15653661 ggaagccaaacccatctatctgaaacattcggaaacaagagaacatcaagaagtaaagccctacactccgctaacatctcctcctcccactgccacaatc 15653562  T
Q  372 tacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtctgttacagacatagtcttattctctgttaactcaaaca-acgact 470  Q
    |||| ||||||||||| |   |||||  | ||||| |||||||||||| ||||||||  | ||||||   ||||||||| |||||||||||||  | ||     
T  15653561 tacgcctccacctccagaaaaccccctgctgctccaaatcaacagagaacaagtctgccatagacatgagcttattctccgttaactcaaacagtctacg 15653462  T
Q  471 aaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcggaccaaaacgaagtatcagccccatcaccaactctcct-----------caac--accag 557  Q
    ||| |   |||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| | |||||||  ||||| ||||| |||||           ||||  ||||     
T  15653461 aaaacgggcacaaaaaggaacatcccctaaccacctatcaaaccaaaacaacgtatcagatccatctccaaccctcctagccacgtggccaacaaaccac 15653362  T
Q  558 tcgctaccaccatctccatccctcaccctaagacgactcacctccgaccaccaacaagaaactctccagccc-------ccaacctgccacctaactcgc 650  Q
     | | | |||| || ||| | ||  ||||||||||||||||||||  ||||||||| || || |||| ||||       |||||||||||||||| ||||    
T  15653361 ccacaatcaccctcaccaacactatccctaagacgactcacctccctccaccaacacgacacactccggcccccaacctccaacctgccacctaattcgc 15653262  T
Q  651 catacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15653261 catacctggcaactaagaccctatac--caaaccacctctgtccaccaacatccgccaacaccatttacctaacaaagc 15653185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 12378921 - 12378401
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaa 131  Q
    |||| ||||| ||| | ||| |||||||||||| | |||||||||| ||  |  ||| |||||| ||||| |||  || |||| ||||| || ||||| |    
T  12378921 gccgtttcagaatgtctacagccagcaacacacgatgacatgtcagtcgtcaacacctgtctagcaatcagatttatctttgttggtaaccgatcacgga 12378822  T
Q  132 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaacaa 231  Q
     ||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||   ||  ||||   | || | | || |   | |||    
T  12378821 tgagtctccacacaaaaactgataccttcaagggaacctggttgtgccacaccaactctgaagcagactccccggcaacaagttcttaggtggttagcaa 12378722  T
Q  232 acgatatgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagcc 331  Q
    |  ||| ||||| ||||||||||  ||||  || || ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||   |||    
T  12378721 atcataagcaccacgaactgtgtagccacatgacggatccgggagccaaacccagctatctaaaacattaggatacagggaaacatcaagaagt---gcc 12378625  T
Q  332 ctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtctgtta 431  Q
    ||||||||| ||| || | |||||||||||||||| ||||| || |||| |||| |||  ||||||||||||| ||| | |||| ||| ||| | ||  |    
T  12378624 ctacactccgctaacatctcctcctcccactgccacaacctgcgcctccgcctcaacaaatccccccaccgcttcgacttaacaaagaacaaatttgcca 12378525  T
Q  432 cagacatagtcttattctctgttaactcaaaca-acgactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcggaccaaaacgaagtatcagc 530  Q
    |||||||  ||||||||||  ||||||||||||  | |  | ||| | |||| |||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||  ||||||||    
T  12378524 cagacatgatcttattctccattaactcaaacagtctatgataccgctcacagagaggaacatcccctatccacctatcataccaaaacgttgtatcagc 12378425  T
Q  531 cccatcaccaactctcctcaacac 554  Q
    | |||||||||| |||| ||||||    
T  12378424 ctcatcaccaaccctccgcaacac 12378401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 197
Target Start/End: Original strand, 3104853 - 3105013
Alignment:
Q  37 ttcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaaggagc 136  Q
    ||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||  |||||||| ||| |||| ||||| || ||||| | ||||    
T  3104853 ttcaggatgtccgcagccaacaacacacaaggacatgtcagccgccagcacccgtctagctatcaaatttgtctttgttggtaaacgatcacggatgagc 3104952  T
Q  137 ctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcat 197  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3104953 atccacacaaaaactgaaaccttcaaggaaacctgattgtgccacaccaaatccaaagcat 3105013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 630 - 729
Target Start/End: Original strand, 46626385 - 46626484
Alignment:
Q  630 ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46626385 ccaacctgccacctaattcgccatacctggcaactaagacactataccacaaaccacctctgtccaacaacatccgccaacaccatttacctaacaaagc 46626484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 32 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15653901 - 15653747
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaa 131  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||  |  ||||||| || |||||| || ||| |||| ||||| || || || |    
T  15653901 gccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcggcaacacccgtcgagcaatcaagttagtctttgttggtaaacgatcccgga 15653802  T
Q  132 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaa 186  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15653801 ggagtctccacgcaaaaactgataccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaa 15653747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 186
Target Start/End: Original strand, 46623649 - 46623803
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaa 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||  |  |||| || || |||||| ||  || | || ||||| || || || |    
T  46623649 gccgattcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcggcaacacccttcgagcaatcaagttattcttcgttggtaaacgatcccgga 46623748  T
Q  132 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaa 186  Q
     ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46623749 tgagtctccacgcaaaaactgataccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaa 46623803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 665 - 732
Target Start/End: Original strand, 23887681 - 23887748
Alignment:
Q  665 aaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagctat 732  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  23887681 aaaaccctataccagaactcacctctgtctaccagcatcctccaacaccattttcctaacaaagctat 23887748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 665 - 732
Target Start/End: Original strand, 23898857 - 23898924
Alignment:
Q  665 aaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagctat 732  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  23898857 aaaaccctataccagaactcacctctgtctaccagcatcctccaacaccattttcctaacaaagctat 23898924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 646 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 13553745 - 13553662
Alignment:
Q  646 ctcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  13553745 ctcgccataacgggcgactagaacactataccacaaccctactctatctaccaacatcctccaacaccatttatctaacaaagc 13553662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 668 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 27218661 - 27218598
Alignment:
Q  668 accctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagcta 731  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27218661 accctataccaaaatccacctctatctatcaacaaccgccaacaccatttacctaacaaagcta 27218598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 665 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 33821101 - 33821034
Alignment:
Q  665 aaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagctat 732  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||| ||||||||    
T  33821101 aaaaccctataccagaacccatctctgtctaccagcatcctccaacaccatttttctaataaagctat 33821034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 389
Target Start/End: Original strand, 43105497 - 43105612
Alignment:
Q  274 aagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataaccta 373  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||| |||  ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||  ||| || | |||||||||| ||||| |||||     
T  43105497 aagccaaacccatctatctgaaacattcggaaacaaggaaacattaaagagtaacgccctacactctgctaacatctcctcctcccattgccacaacctg 43105596  T
Q  374 cgtctccacctccaca 389  Q
    || |||||||||||||    
T  43105597 cgcctccacctccaca 43105612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 646 - 722
Target Start/End: Original strand, 45993154 - 45993230
Alignment:
Q  646 ctcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttcccta 722  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||| || ||||| || || || ||||||| |||||||||||||||||    
T  45993154 ctcgccataacgggcgactaaaactctataccaaaaaccacccctatccactaacatcctccaacaccatttcccta 45993230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 668 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 19544941 - 19544886
Alignment:
Q  668 accctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaa 723  Q
    ||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19544941 accctataccaaaacccatctctatccaccaacatccgccaacaccatttgcctaa 19544886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 388
Target Start/End: Original strand, 19728665 - 19728787
Alignment:
Q  266 gggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgcc 365  Q
    ||||| |||||||| |||||   ||||| || |||||||  ||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||  ||  |||||||||||  ||    
T  19728665 gggtcaggaagccaaacccaaaaatctgaaatattaggaaacaaagaaacatcaagtagtaagaccctacactcctctaataaaacctcctcccacgccc 19728764  T
Q  366 ataacctacgtctccacctccac 388  Q
    | ||||| |||||||| ||||||    
T  19728765 acaacctccgtctccaactccac 19728787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 27941455 - 27941361
Alignment:
Q  267 ggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccac 361  Q
    |||| ||||||||||||||   ||||| || ||||  |||||| ||||||||||  ||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27941455 ggtcaggaagccacacccaaagatctgaaatattaacattcaaagaaacatcaaacagtaaagtcttacactcctctaacaactcctcctcccac 27941361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 191
Target Start/End: Original strand, 43105356 - 43105414
Alignment:
Q  133 gagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatcca 191  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  43105356 gagcctccacgcaaaaactgacaccttcaggggaacctaatggtgccacaccaaatcca 43105414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 630 - 722
Target Start/End: Original strand, 41340096 - 41340188
Alignment:
Q  630 ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttcccta 722  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||    |||||||| ||  |||| || || ||||||| |||||||||||||||||    
T  41340096 ccaacctcccacctacctcgccatatcgggcgactaaaacatggtaccacaaaccttctctatccactaacatcctccaacaccatttcccta 41340188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 402 - 529
Target Start/End: Original strand, 46624007 - 46624135
Alignment:
Q  402 gctccgaatcaacagagagcaagtctgttacagacatagtcttattctctgttaactcaaaca-acgactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaa 500  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||   ||||||||| |||||||||||||  |  | ||| |  ||||| | |||||| ||||||||    
T  46624007 gctccaaatcaacagagaacaagtctgccacagacatgagcttattctccgttaactcaaacagtctgcgaaaacggacacagaaaggaacatcccctaa 46624106  T
Q  501 ccacctatcggaccaaaacgaagtatcag 529  Q
    |||||||||  |||||||| | |||||||    
T  46624107 ccacctatcaaaccaaaacaacgtatcag 46624135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 628 - 731
Target Start/End: Original strand, 17856290 - 17856393
Alignment:
Q  628 ccccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaa 727  Q
    |||| |||| |||||||  |||||||| | ||||||||||||   ||||||||| ||  |||| || || ||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  17856290 cccccacctcccacctatttcgccataacgggcgactaaaacatgataccacaatccttctctatccactaacatcctccaacaccatttccctagcaat 17856389  T
Q  728 gcta 731  Q
    ||||    
T  17856390 gcta 17856393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 339
Target Start/End: Original strand, 46623889 - 46623956
Alignment:
Q  272 ggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactc 339  Q
    |||||||| |||||  |||||| |||||| |||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  46623889 ggaagccaaacccatgtatctgaaacattcggagacaagataacatcaagaagtaaagccctacactc 46623956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22819814 - 22819765
Alignment:
Q  131 aggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgcca 180  Q
    ||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||    
T  22819814 aggagtctccacgcaaaaatagataccttcaagggaacctgtttatgcca 22819765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 33 - 732
Target Start/End: Original strand, 13550069 - 13550782
Alignment:
Q  33 ccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaag 132  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || || || |     
T  13550069 ccgattcaggatgaccacaaccagtaacacacgaggacatgtcatgcgacaacacccgtctagcaatcaaattagtccttgttggtaaacgatctcggat 13550168  T
Q  133 gagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaacaaa 232  Q
    |||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |  || |||| ||||| ||    ||||||    
T  13550169 gagcctccacacgaaaacgaacaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatagtccgctacctgaggaacctgagaagtcaacaaa 13550268  T
Q  233 cgatatgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccc 332  Q
    | |||||||||  |||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  13550269 ctatatgcaccatgaacagtgtaaccaccagatgggtccggaagccacacccagctatctgaaacattaggatccaaagaaacatcaagaattaaagccc 13550368  T
Q  333 tacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtctgttac 432  Q
    | ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |  ||    
T  13550369 tgcactcctctagcaagtcctcatcccactgccataacctacgtctccacctccacacatccccccactgctccgaatcaacagaaagcaagtccgccac 13550468  T
Q  433 agacatagtcttattctctgttaactcaaacaa-cgactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcggaccaaaacgaagtatcagcc 531  Q
      | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||| |||    
T  13550469 gaatatagacttattctctgttaactcaaacaaccgactaaacctcacacgaagaggagcctcccctatccacctatcgaaccaaaatgatgtatctgcc 13550568  T
Q  532 ccatcaccaactctcctcaac-------------accagtcgctaccaccatctccatccctcaccctaagacgactcacctccgaccaccaacaagaaa 618  Q
    |||||||||||||||||||||             ||||| ||||||||||| | ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13550569 ccatcaccaactctcctcaacacctgatcctcaaaccagccgctaccaccaacaccaaccctacccctaagacgactcacctccgaccaccaacaagaaa 13550668  T
Q  619 ctctccagcccccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttc 718  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||| || |||||||||||||    
T  13550669 ctctccggcccccaacctgccacctaattcgccatatctggcaactaaaaccctataccacaaatcacctctatcaaccaacaacctccaacaccatttc 13550768  T
Q  719 cctaacaaagctat 732  Q
    |||||||| |||||    
T  13550769 cctaacaatgctat 13550782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 32 - 519
Target Start/End: Original strand, 43627443 - 43627931
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaa 131  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |    
T  43627443 gccgattcaggatgaccacaatcagcaacacgcgaagacatgtcaggcgacaacacccgtctagcaatcaaatttgtccttgttggtaaacgatcacgga 43627542  T
Q  132 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaacaa 231  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  || ||||||| ||||| ||||  |||||    
T  43627543 tgagcctccacgcaaaaacggaaacctttaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaatcatagtcggcgaccggaggaacctgagagattaacaa 43627642  T
Q  232 acgatatgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagcc 331  Q
    || ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43627643 actatatgcacctcgaactgtgtatccaccagatgggtccggaagccacacccagctatctgaaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagcc 43627742  T
Q  332 ctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtctgtta 431  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |  |    
T  43627743 ctacactcatctagcaactcctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacctccccccacctctccgaatcaatagagagcaagtcggcca 43627842  T
Q  432 cagacatagtcttattctctgttaactcaaacaa-cgactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcggaccaaaac 519  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  43627843 cgaacatagacttattctctgttaactcaaacaaccgcctaaaccgcacacaaagaggagactcccctatccacctatcagacctaaac 43627931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 32 - 413
Target Start/End: Original strand, 33547816 - 33548197
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaa 131  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||| || ||||||||| |||||||| | ||| || ||||| |    
T  33547816 gccgattcaggatgaccgcagccagcaacacacaaagacatgtcagacgacaacacccgtcgagcaatcaaatttgtccttgttgataaacgatcacgga 33547915  T
Q  132 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaacaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |  || ||||||||||||| ||||  |||||    
T  33547916 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccagatcatcgacggcgaccggaggtacctgagagattaacaa 33548015  T
Q  232 acgatatgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagcc 331  Q
    || ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33548016 actatatgcacctcgaactgtgtaaccaccagatgggtccggaagccacacccagctatctgaaacaataggattcaaggaaacatcaagaagtaaagcc 33548115  T
Q  332 ctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaa 413  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33548116 ctacactcatctagcaactcctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacctccccccaccgctccgaatcaa 33548197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 318 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 26894522 - 26894091
Alignment:
Q  318 caagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacaga 417  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  26894522 caagaagtaaagccctacactcatctagcaactcctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacaccttcccccaccgctccgaagcaacaga 26894423  T
Q  418 gagcaagtctgttacagacatagtcttattctctgttaactcaaacaa-cgactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcggaccaa 516  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  26894422 gagcaagtcggtgacagacatagacttattctctgttaactcaaacaaccgcctaaaccgcacacaaagaggagcctcccctatccacctatcagaccaa 26894323  T
Q  517 aacgaagtatcagccccatcaccaactctcctcaac-------------accagtcgctaccaccatctccatccctcaccctaagacgactcacctccg 603  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||             ||||  ||||||||||||| ||  ||||  ||||||| || ||||||||||    
T  26894322 aacgaagtgtcaaccccatcaccaactctcctcaacacctgatcctcaaaccacccgctaccaccatcgcctaccctatccctaagtcgcctcacctccg 26894223  T
Q  604 accaccaacaagaaactctccagccc-------ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctac 696  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||       |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  26894222 accaccagcaagaaacactccggcccccaacctccaacctgccacctatttcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaaaccacctatgtccac 26894123  T
Q  697 caacatccgccaacaccatttccctaacaaag 728  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26894122 caacatccgccaacaccattttcctaacaaag 26894091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 318 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 26899961 - 26899530
Alignment:
Q  318 caagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacaga 417  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  26899961 caagaagtaaagccctacactcatctagcaactcctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacaccttcccccaccgctccgaagcaacaga 26899862  T
Q  418 gagcaagtctgttacagacatagtcttattctctgttaactcaaacaa-cgactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcggaccaa 516  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  26899861 gagcaagtcggtgacagacatagacttattctctgttaactcaaacaaccgcctaaaccgcacacaaagaggagcctcccctatccacctatcagaccaa 26899762  T
Q  517 aacgaagtatcagccccatcaccaactctcctcaac-------------accagtcgctaccaccatctccatccctcaccctaagacgactcacctccg 603  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||             ||||  ||||||||||||| ||  ||||  ||||||| || ||||||||||    
T  26899761 aacgaagtgtcaaccccatcaccaactctcctcaacacctgatcctcaaaccacccgctaccaccatcgcctaccctatccctaagtcgcctcacctccg 26899662  T
Q  604 accaccaacaagaaactctccagccc-------ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctac 696  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||       |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  26899661 accaccagcaagaaacactccggcccccaacctccaacctgccacctatttcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaaaccacctatgtccac 26899562  T
Q  697 caacatccgccaacaccatttccctaacaaag 728  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26899561 caacatccgccaacaccattttcctaacaaag 26899530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 32 - 372
Target Start/End: Original strand, 22052571 - 22052911
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaa 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   |  |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |    
T  22052571 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacgaggacatatcaggcaccaacacccttctagcaatcaaatttgtccttgttggtaaacgatcacgga 22052670  T
Q  132 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaacaa 231  Q
     |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||| |  || |||||||| | ||    |||||    
T  22052671 tgagcctccacgcgaaaacggacaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccagggcaaagtctgcaacctgaggtaccagagaagtcaacaa 22052770  T
Q  232 acgatatgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagcc 331  Q
     | ||||||||| ||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22052771 gctatatgcacctcgaactgtgtaaccaccagaggggtccggaagccacacccagctatctgaaacattaggattcaaagaaacatcaagaagtaaagcc 22052870  T
Q  332 ctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacct 372  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22052871 ctacactcctctagcaactcctcctcccactgccataacct 22052911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 392 - 732
Target Start/End: Original strand, 13550881 - 13551235
Alignment:
Q  392 tccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtctgttacagacatagtcttattctctgttaactcaaacaac-gactaaacctcacacaaagaggaa 490  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |  ||  | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  13550881 tccccccactgctccgaatcaacagaaagcaagtccgccacgaatatagacttattctctgttaactcaaacaaccgactaaacctcacacgaagaggag 13550980  T
Q  491 cctcccctaaccacctatcggaccaaaacgaagtatcagccccatcaccaactctcctcaacacc-------------agtcgctaccaccatctccatc 577  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||             || ||||||||||| | ||| |    
T  13550981 cctcccctatccacctatcgaaccaaaatgatgtatctgccccatcaccaactctcctcaacacctgatcctcaaaccagccgctaccaccaacaccaac 13551080  T
Q  578 cctcaccctaagacgactcacctccgaccaccaacaagaaactctccagcccccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctatacc 677  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13551081 cctacccctaagacgactcacctccgaccaccaacaagaaactctccggcccccaacctgccacctaattcgccatatctggcaactaaaaccctatacc 13551180  T
Q  678 acaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagctat 732  Q
    ||||  ||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  13551181 acaaatcacctctatcaaccaacaacctccaacaccatttccctaacaatgctat 13551235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 29 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 31085836 - 31085452
Alignment:
Q  29 tgtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcac 128  Q
    ||||||| ||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||| ||| || | ||||| || ||||    
T  31085836 tgtgccgtttcaggatgtccgcacccagcaacacacgaggacatgtcagacgacagcacccgtctagcaatcaaatttgtctttcttggtaaacgatcac 31085737  T
Q  129 gaaggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaa 228  Q
    | | ||||||||||||||||||| |    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || |  |||||||||| |||   ||    
T  31085736 ggatgagcctccacgcaaaaacgaattatttcaagagaacctgtttgtgccacaccaaatccagagcatagtcctcgacatgaggtacctgagaggttaa 31085637  T
Q  229 caaacgatatgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaa 328  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||  ||||  || || |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31085636 caaactatatgcaccacgaattgtgtagccacctgacggatttggaagccacacccagctatctgaaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaa 31085537  T
Q  329 gccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaa 413  Q
    |||||||||||  ||| || | ||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  31085536 gccctacactctgctaacagctcctcctcccactgtcacaacctgcatctccacctccacacatccccccactgctctgaatcaa 31085452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 32 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9949460 - 9949242
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaa 131  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||    
T  9949460 gccgattcaggatgaccacacccagcaacacacgaagacatgtcaggcgatagcacccgtctagaaatcaaatttaaccttgtcggtaaacggtcacgaa 9949361  T
Q  132 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaacaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  9949360 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaaagaaacctgtttgtgccacaccaaatccaaaacatagtctacggcctgaggtacctgagagactaacaa 9949261  T
Q  232 acgatatgcaccgcgaact 250  Q
    || ||||||||| ||||||    
T  9949260 actatatgcacctcgaact 9949242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 630 - 729
Target Start/End: Original strand, 45422083 - 45422182
Alignment:
Q  630 ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45422083 ccaacctgccacctaattcgccatacctggcaactaagacactataccacaaaccacctttgtccaccaacatccgccaacaccatttacctaacaaagc 45422182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 313 - 548
Target Start/End: Original strand, 45421744 - 45421981
Alignment:
Q  313 aacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctcc-acacttccccccaccgctccgaatc 411  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||| | || ||||| |||||||||| | |    ||||  | |||||  |||    
T  45421744 aacatcaagaagaaaagccctacactccgctaacatctcctcctcccactgcgacaatctacgcctccacctccaaaaaaaacccctgctgctccagatc 45421843  T
Q  412 aacagagagcaagtctgttacagacatagtcttattctctgttaactcaaacaa-cgactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcg 510  Q
    |||||||| ||||||||  ||| ||||   |||||||||||||||||||||||| | || ||| |  ||||| |  ||||| |||||||||||||||||     
T  45421844 aacagagaacaagtctgccacatacatgagcttattctctgttaactcaaacaatctacgaaaacggacacagaacggaacatcccctaaccacctatcc 45421943  T
Q  511 gaccaaaacgaagtatcagccccatcaccaactctcct 548  Q
     |||||||| | |||||||  ||||||||||| |||||    
T  45421944 aaccaaaacaacgtatcagaaccatcaccaaccctcct 45421981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 190
Target Start/End: Original strand, 45421463 - 45421621
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaa 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||  |  |||| || || |||||| || ||| | || ||||| || ||  | |    
T  45421463 gccgattcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcggcaacacccttcgagcaatcaagttagtcttcgttggtaaacgatcctgga 45421562  T
Q  132 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatcc 190  Q
     ||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45421563 tgagtctccacacaaaaactgataccttcaagggaacctgtttgtgtcacaccaaatcc 45421621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 646 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 9668567 - 9668484
Alignment:
Q  646 ctcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  9668567 ctcgccataacgggcgactagaacactataccacaaccctactctatctaccaacatcctccaacactatttacctaacaaagc 9668484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 266 - 340
Target Start/End: Original strand, 31774862 - 31774936
Alignment:
Q  266 gggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcc 340  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  31774862 gggtcgggaagccacacccatctatctgaaacattaggagacaaagaaacatcaagaagtaaggccttacactcc 31774936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 646 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 11234051 - 11233968
Alignment:
Q  646 ctcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  11234051 ctcgccataacgggcgactagaacactataccacaaacctactctatctaccaacatcgtccaacaccatttacctaacaaagc 11233968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 26180101 - 26179959
Alignment:
Q  53 ccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaaggagcctccacgcaaaaacgg 152  Q
    ||||||| ||| ||| | ||||||||||| || |||| ||||| ||| |||||  || |||| ||||| || ||||| | |||| ||||||||||||| |    
T  26180101 ccagcaatacaaaagcaaatgtcaggcgacagcaccc-tctagcaattaaatttatctttgttggtaaccgatcacggatgagcatccacgcaaaaactg 26180003  T
Q  153 aaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagca 196  Q
    | |||||||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||    
T  26180002 ataccttcaacggaatatgattgtaccacaccaaatccaaagca 26179959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 605 - 722
Target Start/End: Original strand, 36804658 - 36804774
Alignment:
Q  605 ccaccaacaagaaactctccagcccccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatcc 704  Q
    ||||||| ||||| | |||| ||||||||||| |||| |  ||||||||| | |||||||||||| | ||||||||| ||  |||| ||||| |||||||    
T  36804658 ccaccaagaagaaccactcc-gcccccaacctcccacatgcctcgccataacgggcgactaaaacacgataccacaaaccttctctctctactaacatcc 36804756  T
Q  705 gccaacaccatttcccta 722  Q
     |||||||||||| ||||    
T  36804757 tccaacaccattttccta 36804774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 667 - 729
Target Start/End: Original strand, 11196951 - 11197013
Alignment:
Q  667 aaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| || |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  11196951 aaccctataccataacccgcctctatccaccatcattcgccaacaccatttgcctaacaaagc 11197013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 597 - 715
Target Start/End: Original strand, 16213708 - 16213826
Alignment:
Q  597 acctccgaccaccaacaagaaactctccagcccccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctac 696  Q
    |||||| |||||||  ||||||| |||| |||||| |||| |||||||  |||||||| | ||||||||||||   ||||||| ||||  ||||||| ||    
T  16213708 acctcccaccaccacaaagaaacactccggccccccacctcccacctacttcgccataacgggcgactaaaacatgataccacgacccttctctgtcaac 16213807  T
Q  697 caacatccgccaacaccat 715  Q
     ||||||  ||||||||||    
T  16213808 taacatcttccaacaccat 16213826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 668 - 727
Target Start/End: Original strand, 12646122 - 12646181
Alignment:
Q  668 accctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaa 727  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| || |||||||||||| |||||||||    
T  12646122 accctataccacaatccatctctatctactaacaacctccaacaccattttcctaacaaa 12646181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 690 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 42051788 - 42051753
Alignment:
Q  690 tgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaaca 725  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42051788 tgtctaccaacatccgccaacaccatttacctaaca 42051753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 344
Target Start/End: Original strand, 11028049 - 11028126
Alignment:
Q  267 ggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctcta 344  Q
    ||||||| ||||| ||||| || |||| |||||||| || ||| ||||||||| | | ||||| ||||||||||||||    
T  11028049 ggtccggtagccaaacccacctgtctgaaacattagcatacaaagaaacatcacgcaataaagtcctacactcctcta 11028126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 626 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 25380975 - 25380914
Alignment:
Q  626 gcccccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacc 687  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||  |||||||| || |||||    
T  25380975 gcccccaacctcccacctacctcgccataacgggcgactaaaattctataccaaaaaccacc 25380914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 388
Target Start/End: Original strand, 35488024 - 35488137
Alignment:
Q  275 agccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctac 374  Q
    |||||| ||||  |||||| ||||||||||  ||| || | |||||  |||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||    
T  35488024 agccactcccatatatctgaaacattaggaaccaaagagatatcaaatagtagagccatacactcctctagcaaagcctcctcccacgcccacaacctac 35488123  T
Q  375 gtctccacctccac 388  Q
    | | ||| ||||||    
T  35488124 gccgccaactccac 35488137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 30 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 16421208 - 16420719
Alignment:
Q  30 gtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacg 129  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  16421208 gtgccgattcaggatgaccacagccagcaacacacgaggacatgtccggcgacaacacccgtctagcaatcaaatttgtccttgttggtaaacgatcacg 16421109  T
Q  130 aaggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaac 229  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  || ||| || |||  ||||| ||||  |||    
T  16421108 gaggagccgccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaattcagagcataatcgacgacctgagacacctgagagattaac 16421009  T
Q  230 aaacgatatgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaag 329  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16421008 aaactatatgcacctcgaactgtgtgaccaccagatgggtccggaagccacacccagctatctgaaacattaggattcaaggaaacatcgagaagtaaag 16420909  T
Q  330 ccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtctgt 429  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  16420908 ccctacgctcatctagcaactcctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacctccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtcggc 16420809  T
Q  430 tacagacatagtcttattctctgttaactcaaacaa-cgactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcggaccaaaa 518  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16420808 cacagacatagacttattctctgttaactcaaacaaccgcctaaaccgcacacaaagaggagcctcccctatccacctatcagaccaaaa 16420719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 32 - 344
Target Start/End: Original strand, 2872134 - 2872446
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaa 131  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||| |  |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |    
T  2872134 gccgattcaggatgaccacaatcagcaacacacgaagacatatcaggcgacaacacccgtctagcaatcaaatttgtccttgttggtaaacgatcacgga 2872233  T
Q  132 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctacggccggaggtacctgggagacgaacaa 231  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  || ||||||| ||||| ||||  |||||    
T  2872234 tgagcctccacgcaaaaacggaaacctttaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaatcatagtcggcgaccggaggaacctgagagattaacaa 2872333  T
Q  232 acgatatgcaccgcgaactgtgtgtccactagatgggtccggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagcc 331  Q
    || ||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2872334 actatatgcacctcgaactgtgtatccaccagaggggtccggaagccacacccagctatctgaaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagcc 2872433  T
Q  332 ctacactcctcta 344  Q
    |||||||| ||||    
T  2872434 ctacactcatcta 2872446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 272 - 729
Target Start/End: Original strand, 7452536 - 7453014
Alignment:
Q  272 ggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacc 371  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || |    
T  7452536 ggaagccaaacccatctatctgaaacattcggaaacaagagaacatcaagaagtaaagccctacactcctctaataacacctcctcccactgccacaatc 7452635  T
Q  372 tacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtctgttacagacatagtcttattctctgttaactcaaaca-acgact 470  Q
    |||| ||||||||||| ||  |||||  | ||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||  ||||||||| |||||||||||||  | ||     
T  7452636 tacgcctccacctccaaacaaccccctgctgctccaaatcaacagagaacaagtctgccacagacataagcttattctccgttaactcaaacagtctacg 7452735  T
Q  471 aaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcggaccaaaacgaagtatcagccccatcaccaactctcct---ca----------acaccag 557  Q
    ||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||||||  |||||||| | |||||||  ||||| ||||| |||||   ||          | ||||     
T  7452736 aaaacggacacagaaaggaacatcccctaaccacctatcataccaaaacaacgtatcagaaccatctccaaccctcctagccacgtgggcgagaaaccac 7452835  T
Q  558 tcgctaccaccatctccatccctcaccctaagacgactcacctccgaccaccaacaagaaactctccagccc-------ccaacctgccacctaactcgc 650  Q
     | | | |||| || ||| | ||  ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||| ||||       |||||||||||||||| ||||    
T  7452836 ccacaatcaccctcaccaacactatccctaagacgactcacctccctccaccaacacgaaacactccggcccccaacctccaacctgccacctaattcgc 7452935  T
Q  651 catacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  7452936 catacctggaaactaagatcctataccacaaaccacctctgtccaccaacatccgccaacaccacttacctaacaaagc 7453014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 204
Target Start/End: Original strand, 35405646 - 35405821
Alignment:
Q  29 tgtgccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcac 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |  |||||||| | ||||||||| ||| |||| ||||| || ||||    
T  35405646 tgtgccgtttcaggatgaccacaaccagcaacacacgaggacatgtcgggcgacaacacccgtcttgcaatcaaatttgtctttgttggtaaacgatcac 35405745  T
Q  129 gaaggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatccaaagcatggtctac 204  Q
    | | |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  35405746 ggatgagcctccacgcgaaaacgaaaaccttcaagagaacctgtttgtgccacaccaaatccagagcatagtctac 35405821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 19384906 - 19384752
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaa 131  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  |||||  ||||||| || ||||||||| ||| | |||||||| || || || |    
T  19384906 gccgtttccggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatgtcattcgataacacccgtcgagcaatcaaattagtcttcgtcggtaaacgatctcgga 19384807  T
Q  132 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaa 186  Q
     ||| ||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19384806 agagtctccatgcaaaaactgagatcttcaagggaacctgtttgtgccacaccaa 19384752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 32 - 186
Target Start/End: Original strand, 7452296 - 7452450
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaa 131  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| | |  ||||||| || ||||||||| ||| | || ||||| || ||    |    
T  7452296 gccgtttcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcaggcaacaacacccgtcgagcaatcaaattagtcttcgttggtaaccgatccttga 7452395  T
Q  132 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaa 186  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7452396 ggagtctccatgcaaaaactgaaaccttcaagggaacctgtttgtgccaaaccaa 7452450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 646 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 43249365 - 43249282
Alignment:
Q  646 ctcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||  |||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  43249365 ctcgccatagcgggcgactagaacactataccacaaccctactctatctaccaatatcctccaacaccatttacctaacaaagc 43249282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 19384666 - 19384572
Alignment:
Q  272 ggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgcca 366  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||| | |||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||    
T  19384666 ggaagccaaacccatctatctgaaacactcggaaacaagagaacatcaagaagtaaagccctacactccactaacatctcctcctcccactgcca 19384572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 646 - 729
Target Start/End: Original strand, 24794325 - 24794408
Alignment:
Q  646 ctcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    ||||||||| | |||||| | ||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24794325 ctcgccataacgggcgacaagaacactataccacaaacctactctatctaccaacatcctccaacaccatttacctaacaaagc 24794408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 667 - 729
Target Start/End: Original strand, 6245682 - 6245744
Alignment:
Q  667 aaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    |||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  6245682 aaccctataccagagcccacctctatccaccaacatccgccaacacaatttacctaacaaagc 6245744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 412558 - 412513
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcag 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  412558 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacgaggacatatcag 412513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 630 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 44082589 - 44082497
Alignment:
Q  630 ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttcccta 722  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||  |||| || || ||||||| |||||||||||| ||||    
T  44082589 ccaacctcccacctacttcgccataacgggcgactaaaacctgataccacaacccttctctatcaactaacatcctccaacaccatttaccta 44082497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 388
Target Start/End: Original strand, 12134518 - 12134628
Alignment:
Q  278 cacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtc 377  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||   |  ||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  ||| ||| |||| |    
T  12134518 cacacccatctatctgaaacattaggaaaaacagaaacgtcaaatagtaaagccctacactcctctaccaagtcctcctcccacgcccacaacgtacgcc 12134617  T
Q  378 tccacctccac 388  Q
     ||||||||||    
T  12134618 gccacctccac 12134628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 662 - 723
Target Start/End: Original strand, 8902422 - 8902483
Alignment:
Q  662 actaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaa 723  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||| |||||    
T  8902422 actaacaccctataccacaagccagctctatcaactaacatccgccaacaccattttcctaa 8902483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 665 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 29721452 - 29721391
Alignment:
Q  665 aaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaa 726  Q
    ||||||||||||||||||||||||   || || ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  29721452 aaaaccctataccacaacccaccttgatcaactaacatcctccaacaccatttgcctaacaa 29721391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 646 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 4987626 - 4987550
Alignment:
Q  646 ctcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttcccta 722  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||| || ||||| |  || || ||||||| |||||||||||||||||    
T  4987626 ctcgccataacgggcgactaaaactctataccaaaaaccacccccatccactaacatcctccaacaccatttcccta 4987550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 630 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 11393925 - 11393829
Alignment:
Q  630 ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaa 726  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||| | |||||| | ||| ||||||||||| ||  |||| || ||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  11393925 ccaacctcccaccaacctcgccataacgggcgacaagaacactataccacaaacctactctatcgaccaacaacctccaacaccatttacctaacaa 11393829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 669 - 729
Target Start/End: Original strand, 18187748 - 18187808
Alignment:
Q  669 ccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  | |||||||||||| |||||||||||    
T  18187748 ccctataccacaaaccacctctatctactaacaatctccaacaccatttacctaacaaagc 18187808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 665 - 729
Target Start/End: Original strand, 36025119 - 36025183
Alignment:
Q  665 aaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  36025119 aaaactctataccataaccctcctctatccaccaacatccgccaacaccattatcctaataaagc 36025183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 668 - 729
Target Start/End: Original strand, 12341168 - 12341229
Alignment:
Q  668 accctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    |||||| |||||||||| ||||| || || ||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  12341168 accctaaaccacaaccctcctctatccactaacatcctccaacaccactttcctaacaaagc 12341229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 132; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 313 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 134769 - 134332
Alignment:
Q  313 aacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatca 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||    
T  134769 aacatcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccactgccacaacctacgtctccacctccacaaaaccccccactgctccgaatca 134670  T
Q  413 acagagagcaagtctgttacagacatagtcttattctctgttaactcaaaca-acgactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcgg 511  Q
    | ||| | ||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||  | ||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||      
T  134669 atagataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacggaaacggacacaaaaaggaacatcccctaaccacctatcca 134570  T
Q  512 accaaaacgaagtatcagccccatcaccaactctcct-------------caacaccagtcgctaccaccatctccatccctcaccctaagacgactcac 598  Q
    |||||||| | |||| ||| ||||| ||||| |||||             | | ||||  | ||  | ||| | ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  134569 accaaaacaacgtattagctccatctccaaccctcctagccacaagatcaccaaaccaacccctctctccagcaccatcactacccctaagacgactcac 134470  T
Q  599 ctccgaccaccaacaagaaactctccagccc-------ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctg 691  Q
    ||||  ||||||||| ||||| |||| ||||       |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  134469 ctccctccaccaacatgaaacactccggcccccaacctccaacctgccacctaattcgccatacctggcaactaaaaccctataccacaaaccatctcta 134370  T
Q  692 tctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134369 tccaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 134332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 132; Significance: 4e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 313 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 312596 - 312159
Alignment:
Q  313 aacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatca 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||    
T  312596 aacatcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccactgccacaacctacgtctccacctccacaaaaccccccactgctccgaatca 312497  T
Q  413 acagagagcaagtctgttacagacatagtcttattctctgttaactcaaaca-acgactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcgg 511  Q
    | ||| | ||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||  | ||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||      
T  312496 atagataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacggaaacggacacaaaaaggaacatcccctaaccacctatcca 312397  T
Q  512 accaaaacgaagtatcagccccatcaccaactctcct-------------caacaccagtcgctaccaccatctccatccctcaccctaagacgactcac 598  Q
    |||||||| | |||| ||| ||||| ||||| |||||             | | ||||  | ||  | ||| | ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  312396 accaaaacaacgtattagctccatctccaaccctcctagccacaagatcaccaaaccaacccctctctccagcaccatcactacccctaagacgactcac 312297  T
Q  599 ctccgaccaccaacaagaaactctccagccc-------ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctg 691  Q
    ||||  ||||||||| ||||| |||| ||||       |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  312296 ctccctccaccaacatgaaacactccggcccccaacctccaacctgccacctaattcgccatacctggcaactaaaaccctataccacaaaccatctcta 312197  T
Q  692 tctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  312196 tccaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 312159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 313 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 328050 - 327613
Alignment:
Q  313 aacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacctacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatca 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||    
T  328050 aacatcaagaagtaaagccctacactccgctaacaagtcctcctcccactgccacaacctacgtctccacctccacaaaaccccccactgctccgaatca 327951  T
Q  413 acagagagcaagtctgttacagacatagtcttattctctgttaactcaaaca-acgactaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcgg 511  Q
    | ||| | ||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||  | ||  || |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||      
T  327950 atagataacaagtctgccacagacataaacttattctctgttaactcaaacagcctacggaaacggacacaaaaaggaacatcccctaaccacctatcca 327851  T
Q  512 accaaaacgaagtatcagccccatcaccaactctcct-------------caacaccagtcgctaccaccatctccatccctcaccctaagacgactcac 598  Q
    |||||||| | |||| ||| ||||| ||||| |||||             | | ||||  | ||  | ||| | ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  327850 accaaaacaacgtattagctccatctccaaccctcctagccacaagatcaccaaaccaacccctctctccagcaccatcactacccctaagacgactcac 327751  T
Q  599 ctccgaccaccaacaagaaactctccagccc-------ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctg 691  Q
    ||||  ||||||||| ||||| |||| ||||       |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  327750 ctccctccaccaacatgaaacactccggcccccaacctccaacctgccacctaattcgccatacctggcaactaaaaccctataccacaaaccatctcta 327651  T
Q  692 tctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  327650 tccaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 327613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 583 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 4180 - 4038
Alignment:
Q  583 ccctaagacgactcacctccgaccaccaacaagaaactctccagcccccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaac 682  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  4180 ccctaatacgactcacctccctccaccaccacgaaacactccggcccccaacctgccacctaattcgccatacctggcaactaaaaccctataccacaaa 4081  T
Q  683 ccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaaca 725  Q
    ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4080 ccatctctatccaccaacatccgccaacaccatttccctaaca 4038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 4335 - 4229
Alignment:
Q  442 cttattctctgttaactcaaacaacg-actaaacctcacacaaagaggaacctcccctaaccacctatcggaccaaaacgaagtatcagccccatcacca 540  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  || ||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| | |||| ||| ||||| |||    
T  4335 cttattctctattaactcaaacagcctacgaaaacggacacaaaaaggaacatcccctaaccacctatccaaccaaaacaacgtatgagctccatctcca 4236  T
Q  541 actctcc 547  Q
    || ||||    
T  4235 accctcc 4229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 68; Significance: 6e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 583 - 729
Target Start/End: Original strand, 8114 - 8266
Alignment:
Q  583 ccctaagacgactcacctccgaccaccaacaagaaactctccagcccccaacct-------gccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctata 675  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| |||| |||||||||||       ||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||    
T  8114 ccctaatacgactcacctccc-ccaccaacacgaaacactccggcccccaacctccaatctgccacctaattcgccatacctagcaactaagacactata 8212  T
Q  676 ccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8213 ccacaaaccacctctgtccaccaacatccgccaacaccatttacctaacaaagc 8266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 32 - 190
Target Start/End: Original strand, 7619 - 7777
Alignment:
Q  32 gccgattcaggatgaccacaaccagcaacacacaaggacatgtcaggcgatagtacccgtctagaaatcaaattcgtccttgtcggtaagcggtcacgaa 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||  |  |||| || || |||||| || ||| | || ||||| || || || |    
T  7619 gccgattcaggatgaccgcaaccagcgacacataaggacatatcagtcggcaacacccttcgagcaatcaagttagtcttcgttggtaaacgatctcgga 7718  T
Q  132 ggagcctccacgcaaaaacggaaaccttcaagggaacctgtttgtgccacaccaaatcc 190  Q
     ||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7719 tgagtctccacgcaaaaactgataccttcaaggaaacctgtttgtgccacaccaaatcc 7777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 272 - 465
Target Start/End: Original strand, 7859 - 8052
Alignment:
Q  272 ggaagccacacccagctatctgcaacattaggattcaaggaaacatcaagaagtaaagccctacactcctctagcaacccctcctcccactgccataacc 371  Q
    |||||||| |||||  |||||| |||||| |||  |||   ||||||||||||||||||| |||||||| ||| || | |||||||||||||||| || |    
T  7859 ggaagccaaacccatgtatctgaaacattcggaaacaaaagaacatcaagaagtaaagccatacactccactaacatctcctcctcccactgccacaatc 7958  T
Q  372 tacgtctccacctccacacttccccccaccgctccgaatcaacagagagcaagtctgttacagacatagtcttattctctgttaactcaaacaa 465  Q
    |||| ||||||||||| |    ||||  | ||||| |||||||||||| ||||||||  | ||||||   |||||||||| |||||||||||||    
T  7959 tacgcctccacctccaaaaaaacccctgctgctccaaatcaacagagaacaagtctgccatagacatgagcttattctctattaactcaaacaa 8052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 668 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 34148 - 34087
Alignment:
Q  668 accctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    ||||||||||| || ||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  34148 accctataccaaaaaccatctctctctaccaacattcgccaacaccttttacctaacaaagc 34087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 630 - 722
Target Start/End: Original strand, 17708 - 17800
Alignment:
Q  630 ccaacctgccacctaactcgccatacctggcgactaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttcccta 722  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||||||   ||||||||| ||  |||| || || ||||||| |||||||||||||||||    
T  17708 ccaacctcccacctatttcgccataacgggcgactaaaacatgataccacaatccttctctatccactaacatccaccaacaccatttcccta 17800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:

Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 662 - 726
Target Start/End: Original strand, 6683 - 6747
Alignment:
Q  662 actaaaaccctataccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaa 726  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  6683 actaaaaccctataccacaaaccgcctcgctctaccaacatcctccaacatcacttgcctaacaa 6747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 697 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 63809 - 63775
Alignment:
Q  697 caacatccgccaacaccatttccctaacaaagcta 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  63809 caacatccgccaacaccatttccctagcaaagcta 63775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1350 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1350
Description:

Target: scaffold1350; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 676 - 729
Target Start/End: Original strand, 153 - 206
Alignment:
Q  676 ccacaacccacctctgtctaccaacatccgccaacaccatttccctaacaaagc 729  Q
    |||||| ||| |||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  153 ccacaatccatctctatctactaacaacctccaacaccatttccctaacaaagc 206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University