View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5570_low_27 (Length: 201)

Name: NF5570_low_27
Description: NF5570
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5570_low_27
NF5570_low_27
[»] chr1 (41 HSPs)
chr1 (19-177)||(37013058-37013220)
chr1 (25-177)||(26192281-26192438)
chr1 (23-177)||(1973878-1974036)
chr1 (23-177)||(1988665-1988823)
chr1 (17-177)||(18096112-18096277)
chr1 (17-177)||(20315135-20315299)
chr1 (17-177)||(27066784-27066948)
chr1 (17-177)||(25020173-25020336)
chr1 (17-177)||(21459333-21459496)
chr1 (17-177)||(34823672-34823836)
chr1 (17-177)||(16155588-16155751)
chr1 (17-177)||(20327366-20327530)
chr1 (25-177)||(49336461-49336617)
chr1 (17-172)||(19747437-19747596)
chr1 (17-187)||(25038577-25038753)
chr1 (23-187)||(52948879-52949049)
chr1 (17-177)||(20316884-20317048)
chr1 (24-177)||(22961615-22961772)
chr1 (17-174)||(41543025-41543186)
chr1 (17-177)||(2369615-2369779)
chr1 (17-177)||(13965751-13965914)
chr1 (25-177)||(18384056-18384212)
chr1 (26-177)||(21793463-21793620)
chr1 (17-187)||(25043789-25043965)
chr1 (17-177)||(42034918-42035082)
chr1 (93-177)||(12420194-12420277)
chr1 (17-177)||(4951134-4951298)
chr1 (26-177)||(21820654-21820811)
chr1 (23-177)||(25822357-25822515)
chr1 (17-177)||(2117559-2117724)
chr1 (17-173)||(8540965-8541125)
chr1 (17-173)||(8606204-8606364)
chr1 (17-177)||(30548818-30548982)
chr1 (93-177)||(25868131-25868214)
chr1 (30-177)||(22957175-22957325)
chr1 (102-177)||(34000660-34000734)
chr1 (116-177)||(21904521-21904581)
chr1 (95-151)||(22892366-22892421)
chr1 (139-177)||(19867793-19867831)
chr1 (132-174)||(22959167-22959209)
chr1 (95-151)||(22892213-22892268)
[»] chr4 (46 HSPs)
chr4 (20-177)||(13792228-13792389)
chr4 (17-187)||(16397953-16398129)
chr4 (17-187)||(16250151-16250326)
chr4 (23-177)||(8841894-8842052)
chr4 (17-177)||(13401980-13402145)
chr4 (23-187)||(518871-519041)
chr4 (23-187)||(521377-521547)
chr4 (17-177)||(17827191-17827355)
chr4 (17-177)||(17836582-17836746)
chr4 (20-177)||(16059077-16059239)
chr4 (17-177)||(30652376-30652535)
chr4 (17-177)||(17144433-17144598)
chr4 (23-177)||(4837193-4837352)
chr4 (23-187)||(17420483-17420653)
chr4 (17-177)||(16630237-16630401)
chr4 (17-177)||(10422487-10422651)
chr4 (17-177)||(15670784-15670948)
chr4 (17-177)||(17162293-17162458)
chr4 (17-177)||(6405021-6405185)
chr4 (17-177)||(5292104-5292268)
chr4 (17-177)||(5301763-5301927)
chr4 (17-177)||(21846990-21847154)
chr4 (17-177)||(21856582-21856746)
chr4 (17-177)||(21902853-21903017)
chr4 (17-177)||(21912445-21912609)
chr4 (17-177)||(27679769-27679933)
chr4 (17-177)||(27689424-27689588)
chr4 (17-177)||(17984065-17984228)
chr4 (17-177)||(18104615-18104778)
chr4 (17-177)||(40922548-40922711)
chr4 (17-177)||(2830690-2830854)
chr4 (17-177)||(6692923-6693086)
chr4 (17-177)||(6703329-6703492)
chr4 (17-177)||(3486643-3486807)
chr4 (17-177)||(3495966-3496130)
chr4 (23-187)||(26459130-26459300)
chr4 (25-177)||(16210167-16210322)
chr4 (17-177)||(44889723-44889887)
chr4 (17-177)||(41527004-41527166)
chr4 (17-177)||(16253940-16254104)
chr4 (93-177)||(53945305-53945388)
chr4 (102-177)||(7843053-7843127)
chr4 (17-177)||(7845933-7846097)
chr4 (17-177)||(14599850-14600014)
chr4 (95-177)||(16081473-16081554)
chr4 (17-81)||(11477607-11477671)
[»] chr2 (37 HSPs)
chr2 (17-177)||(16901331-16901496)
chr2 (17-177)||(16994722-16994887)
chr2 (17-187)||(32935886-32936061)
chr2 (23-187)||(27159103-27159273)
chr2 (23-187)||(27169451-27169621)
chr2 (17-177)||(45191541-45191705)
chr2 (17-177)||(4459082-4459246)
chr2 (23-177)||(19343026-19343184)
chr2 (17-177)||(9501871-9502034)
chr2 (17-177)||(9513237-9513400)
chr2 (17-177)||(18651923-18652086)
chr2 (17-177)||(18664041-18664204)
chr2 (17-177)||(4468707-4468871)
chr2 (17-177)||(5345825-5345989)
chr2 (23-187)||(22902850-22903020)
chr2 (17-177)||(2997808-2997971)
chr2 (19-180)||(21109920-21110086)
chr2 (23-177)||(22907986-22908144)
chr2 (20-177)||(69284-69445)
chr2 (17-177)||(28451031-28451195)
chr2 (17-177)||(29424057-29424221)
chr2 (17-177)||(5335973-5336137)
chr2 (17-177)||(17489395-17489558)
chr2 (17-177)||(37862225-37862389)
chr2 (17-177)||(38929619-38929783)
chr2 (17-177)||(41026016-41026181)
chr2 (17-177)||(44637767-44637931)
chr2 (33-164)||(15474683-15474818)
chr2 (17-177)||(3604757-3604921)
chr2 (17-177)||(22678861-22679025)
chr2 (17-177)||(38956961-38957125)
chr2 (17-177)||(45015417-45015581)
chr2 (17-167)||(22671731-22671885)
chr2 (17-164)||(12571301-12571452)
chr2 (17-177)||(24695696-24695857)
chr2 (95-155)||(40408152-40408211)
chr2 (95-158)||(22146566-22146628)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (17-187)||(13675465-13675640)
chr8 (17-187)||(21986930-21987105)
chr8 (17-187)||(21996464-21996639)
chr8 (17-177)||(14880878-14881042)
chr8 (17-177)||(14893228-14893392)
chr8 (23-187)||(26361520-26361690)
chr8 (17-177)||(21202027-21202190)
chr8 (17-177)||(21212443-21212606)
chr8 (17-177)||(21335003-21335166)
chr8 (23-187)||(14438134-14438304)
chr8 (17-177)||(9324227-9324390)
chr8 (17-177)||(31990845-31991009)
chr8 (17-177)||(31998434-31998598)
chr8 (17-177)||(2689474-2689639)
chr8 (36-177)||(33773321-33773466)
chr8 (17-177)||(20530064-20530228)
chr8 (93-187)||(3988297-3988392)
chr8 (25-177)||(11429662-11429818)
chr8 (95-177)||(12900501-12900582)
chr8 (23-174)||(23014227-23014382)
chr8 (93-167)||(6760603-6760676)
chr8 (95-177)||(21461892-21461973)
chr8 (93-177)||(12840647-12840730)
chr8 (95-177)||(18537438-18537519)
chr8 (141-177)||(17269564-17269600)
[»] chr5 (41 HSPs)
chr5 (17-187)||(18208638-18208813)
chr5 (17-187)||(18217976-18218151)
chr5 (17-187)||(21682892-21683067)
chr5 (23-187)||(20948562-20948732)
chr5 (23-187)||(20958931-20959101)
chr5 (17-177)||(30942677-30942841)
chr5 (17-177)||(30952099-30952263)
chr5 (17-177)||(36317150-36317315)
chr5 (17-177)||(37646719-37646884)
chr5 (17-177)||(22172640-22172804)
chr5 (17-177)||(37537608-37537773)
chr5 (17-177)||(4037367-4037531)
chr5 (23-177)||(19547636-19547794)
chr5 (17-177)||(32071145-32071308)
chr5 (17-177)||(37818303-37818467)
chr5 (17-177)||(26191216-26191379)
chr5 (17-177)||(26201798-26201961)
chr5 (17-177)||(33940025-33940188)
chr5 (17-177)||(33950425-33950588)
chr5 (17-177)||(21754239-21754403)
chr5 (17-177)||(21763526-21763690)
chr5 (17-177)||(18390939-18391102)
chr5 (17-177)||(19887076-19887240)
chr5 (17-177)||(27273569-27273733)
chr5 (17-177)||(8764558-8764721)
chr5 (23-177)||(27578544-27578702)
chr5 (17-177)||(13571067-13571231)
chr5 (17-177)||(18361982-18362145)
chr5 (26-174)||(20897668-20897822)
chr5 (17-177)||(27412853-27413016)
chr5 (17-177)||(34129877-34130041)
chr5 (17-177)||(23376152-23376316)
chr5 (17-177)||(11410302-11410465)
chr5 (17-187)||(19781307-19781483)
chr5 (17-177)||(31917516-31917680)
chr5 (23-177)||(37298202-37298360)
chr5 (25-177)||(22245323-22245479)
chr5 (17-177)||(42089892-42090058)
chr5 (17-177)||(204854-205018)
chr5 (93-177)||(20904011-20904094)
chr5 (17-177)||(20807941-20808105)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (17-177)||(20254-20419)
[»] chr7 (52 HSPs)
chr7 (17-177)||(24539658-24539823)
chr7 (17-177)||(15987858-15988022)
chr7 (17-187)||(27989797-27989974)
chr7 (17-177)||(15374408-15374573)
chr7 (23-187)||(5614634-5614804)
chr7 (23-187)||(41028310-41028480)
chr7 (20-174)||(12574890-12575048)
chr7 (23-174)||(13284903-13285058)
chr7 (23-177)||(12826571-12826729)
chr7 (17-177)||(19800804-19800968)
chr7 (17-177)||(14247695-14247860)
chr7 (17-177)||(5381006-5381169)
chr7 (17-177)||(5390644-5390807)
chr7 (17-177)||(6535189-6535352)
chr7 (17-177)||(6545510-6545673)
chr7 (17-177)||(8501754-8501917)
chr7 (17-177)||(8512224-8512387)
chr7 (17-177)||(9534432-9534595)
chr7 (17-177)||(26304260-26304423)
chr7 (17-177)||(26362395-26362558)
chr7 (17-177)||(32109522-32109685)
chr7 (17-177)||(44898003-44898166)
chr7 (17-177)||(44908428-44908591)
chr7 (17-177)||(43984364-43984528)
chr7 (17-177)||(5927840-5928003)
chr7 (19-177)||(9007651-9007813)
chr7 (17-177)||(11625558-11625721)
chr7 (17-177)||(16131108-16131271)
chr7 (17-177)||(16141657-16141820)
chr7 (17-177)||(46497819-46497982)
chr7 (17-177)||(46508431-46508594)
chr7 (17-177)||(14946815-14946979)
chr7 (17-177)||(9544715-9544878)
chr7 (17-177)||(26307820-26307983)
chr7 (17-177)||(32099085-32099248)
chr7 (23-187)||(31825429-31825599)
chr7 (17-177)||(19586451-19586615)
chr7 (17-177)||(7018598-7018762)
chr7 (17-177)||(7033960-7034124)
chr7 (17-177)||(10416688-10416852)
chr7 (17-177)||(45554261-45554425)
chr7 (61-177)||(12516011-12516131)
chr7 (17-177)||(2991082-2991245)
chr7 (43-173)||(12088056-12088190)
chr7 (38-177)||(12770808-12770951)
chr7 (17-177)||(42621796-42621960)
chr7 (23-177)||(42596093-42596251)
chr7 (61-177)||(12492206-12492326)
chr7 (93-177)||(13130622-13130705)
chr7 (61-177)||(8340955-8341074)
chr7 (95-151)||(40703344-40703399)
chr7 (95-151)||(40703188-40703246)
[»] chr3 (40 HSPs)
chr3 (17-177)||(2488068-2488233)
chr3 (25-177)||(13118637-13118794)
chr3 (17-177)||(11459843-11460007)
chr3 (25-176)||(25433821-25433977)
chr3 (23-187)||(24872406-24872576)
chr3 (23-187)||(49386562-49386732)
chr3 (17-177)||(5654823-5654986)
chr3 (17-177)||(9537840-9538003)
chr3 (17-177)||(9548166-9548329)
chr3 (17-177)||(4372244-4372408)
chr3 (17-177)||(4381985-4382149)
chr3 (17-177)||(4781642-4781806)
chr3 (17-177)||(8973551-8973714)
chr3 (17-177)||(8984106-8984269)
chr3 (17-177)||(16334613-16334776)
chr3 (17-177)||(19827426-19827590)
chr3 (17-177)||(20492735-20492899)
chr3 (17-177)||(6423012-6423175)
chr3 (17-177)||(1684448-1684611)
chr3 (17-177)||(11184-11348)
chr3 (17-177)||(6433439-6433602)
chr3 (17-177)||(14801621-14801788)
chr3 (17-187)||(20293750-20293926)
chr3 (17-177)||(4023324-4023487)
chr3 (17-177)||(10002622-10002786)
chr3 (17-177)||(12386937-12387102)
chr3 (17-177)||(20743904-20744068)
chr3 (38-177)||(23503061-23503205)
chr3 (20-174)||(10507054-10507212)
chr3 (20-174)||(10507868-10508026)
chr3 (61-177)||(38817157-38817278)
chr3 (18-177)||(51977681-51977844)
chr3 (93-177)||(24773550-24773633)
chr3 (95-177)||(683006-683087)
chr3 (113-177)||(24814638-24814701)
chr3 (30-124)||(17734856-17734955)
chr3 (30-124)||(19036125-19036224)
chr3 (95-174)||(11043908-11043986)
chr3 (23-89)||(24794148-24794214)
chr3 (100-159)||(20649571-20649627)
[»] scaffold0811 (1 HSPs)
scaffold0811 (17-177)||(2505-2669)
[»] scaffold0313 (3 HSPs)
scaffold0313 (23-177)||(6480-6638)
scaffold0313 (23-177)||(10262-10420)
scaffold0313 (23-148)||(20637-20766)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (23-177)||(34766068-34766226)
chr6 (17-177)||(1597862-1598027)
chr6 (17-177)||(22222675-22222840)
chr6 (17-177)||(22248510-22248675)
chr6 (17-177)||(9034121-9034284)
chr6 (23-177)||(24692521-24692679)
chr6 (17-177)||(29541150-29541314)
chr6 (17-177)||(24921191-24921354)
chr6 (17-177)||(24930227-24930390)
chr6 (17-177)||(31358266-31358429)
chr6 (17-177)||(31367996-31368159)
chr6 (17-175)||(16322026-16322188)
chr6 (17-175)||(16334174-16334336)
chr6 (17-177)||(3286551-3286714)
chr6 (17-177)||(12455758-12455921)
chr6 (17-177)||(14792307-14792470)
chr6 (17-177)||(16898651-16898814)
chr6 (17-177)||(18160766-18160929)
chr6 (17-177)||(18170578-18170741)
chr6 (17-177)||(20912987-20913150)
chr6 (17-177)||(26019603-26019767)
chr6 (17-177)||(18202251-18202415)
chr6 (34-177)||(19363790-19363937)
chr6 (17-177)||(16909304-16909467)
chr6 (17-177)||(17826556-17826720)
chr6 (30-174)||(8562498-8562646)
chr6 (23-177)||(20968552-20968710)
chr6 (23-177)||(27786700-27786858)
chr6 (17-177)||(30657073-30657237)
chr6 (17-187)||(18705506-18705682)
chr6 (17-187)||(18711441-18711617)
chr6 (17-177)||(26169119-26169283)
chr6 (17-173)||(15504139-15504300)
chr6 (93-177)||(12989052-12989135)
chr6 (17-177)||(790217-790381)
chr6 (93-177)||(7753917-7754000)
chr6 (61-187)||(18335663-18335794)
chr6 (93-177)||(6314680-6314763)
chr6 (30-177)||(28093346-28093491)
chr6 (17-55)||(7754043-7754081)
chr6 (106-172)||(9760731-9760794)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (23-177)||(8131-8290)
[»] scaffold0553 (1 HSPs)
scaffold0553 (17-177)||(40-204)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (17-177)||(233189-233352)
scaffold0014 (17-177)||(147411-147575)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (17-177)||(65-229)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (17-177)||(19475-19639)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (17-177)||(7043-7206)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (17-177)||(110968-111132)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (17-177)||(309220-309383)
scaffold0005 (17-177)||(217364-217528)
[»] scaffold0591 (2 HSPs)
scaffold0591 (17-177)||(1653-1818)
scaffold0591 (95-177)||(1-82)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (17-177)||(8841-9005)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (17-177)||(73927-74091)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (17-177)||(16149-16313)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (17-177)||(18563-18727)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (30-177)||(6208-6359)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (17-177)||(55044-55208)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (23-177)||(28213-28371)
scaffold0058 (17-177)||(49417-49581)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (23-177)||(39768-39926)
[»] scaffold0764 (1 HSPs)
scaffold0764 (23-147)||(1-129)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (26-174)||(55354-55504)
scaffold0018 (26-174)||(59303-59453)
scaffold0018 (26-174)||(60731-60881)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (17-177)||(8815-8979)
[»] scaffold0265 (1 HSPs)
scaffold0265 (26-177)||(11998-12155)
[»] scaffold0308 (1 HSPs)
scaffold0308 (93-187)||(19753-19848)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (93-177)||(395059-395142)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (17-177)||(92078-92242)
[»] scaffold0360 (1 HSPs)
scaffold0360 (17-187)||(972-1149)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (17-177)||(1157-1321)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (105-187)||(30843-30926)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (23-175)||(208-364)
[»] scaffold0015 (2 HSPs)
scaffold0015 (19-177)||(196590-196754)
scaffold0015 (132-177)||(189983-190028)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (102-177)||(67013-67087)
scaffold0057 (30-89)||(66263-66322)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (17-177)||(27975-28139)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 112; Significance: 8e-57; HSPs: 41)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Original strand, 37013058 - 37013220
Alignment:
Q  19 caagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||  |||    
T  37013058 caagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagttgatgtaattgttcaagtgaacaagattgtaaagtgcaggatttgagaggttatctataac 37013157  T
Q  114 atcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37013158 atcgtagtgg-aaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 37013220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26192438 - 26192281
Alignment:
Q  25 ggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaag-attgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatcat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||     ||||||||||||||||||| ||||||    
T  26192438 ggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcat 26192339  T
Q  119 agtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26192338 agtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 26192281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1974036 - 1973878
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||     |||||||| |||||||||| |||||    
T  1974036 aaggtgtaagcctgctgaggctaagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatca 1973937  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1973936 tagtggaaaa-tctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 1973878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1988823 - 1988665
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||     |||||||| |||||||||| |||||    
T  1988823 aaggtgtaagcctgctgaggctaagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatca 1988724  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1988723 tagtggaaaa-tctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 1988665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18096277 - 18096112
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||     ||||||||||||||||||    
T  18096277 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaagttgtgtaattgttcaggtgaacaaagattctaaggtgcaggatttgagaggttatctca 18096178  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18096177 aacatcatagtgcaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 18096112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 20315135 - 20315299
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga--tgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatct 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||    
T  20315135 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaataca---gaattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatct 20315231  T
Q  109 caaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20315232 caaacatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 20315299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 27066784 - 27066948
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  27066784 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacataat-tgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 27066882  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27066883 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 27066948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 25020173 - 25020336
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  25020173 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 25020270  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  25020271 agcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 25020336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 21459333 - 21459496
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  21459333 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 21459431  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21459432 gcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 21459496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 34823672 - 34823836
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||     || ||||||| |||||||||||    
T  34823672 agcaagaaggtgtaagcctgttgaggcttagagaatacagttgttgtcattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggatttgagcggttatctcaa 34823771  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  34823772 acatcatagtag-aaactctcataagattgtgagaaatggactaacccacattggatgaaccacta 34823836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 16155588 - 16155751
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctca 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||     || | ||||||||||||||||    
T  16155588 agcaagaaggtgcaagcttgctgaggcttagagaataca--tgattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 16155685  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16155686 agcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 16155751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20327530 - 20327366
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  20327530 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcatagagaatacataat-tgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 20327432  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20327431 agcatcatagtgggaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 20327366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 177
Target Start/End: Original strand, 49336461 - 49336617
Alignment:
Q  25 ggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagta-----tttgagaggttatctcaaacatcat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| || ||||||||| |||     |||||||||||||||||| ||||||    
T  49336461 ggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagagg-tgtaagtgttcaggtgagcacagattgtaaggtacaggatttgagaggttatctcaagcatcat 49336559  T
Q  119 agtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  49336560 agtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 49336617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 19747596 - 19747437
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||| | ||||||||||     ||||||||| ||||||||    
T  19747596 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacaaattgtaaagtgcaggatttgagagattatctca 19747498  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaac 172  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  19747497 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaac 19747437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25038753 - 25038577
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga--tgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatct 108  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||     ||||||||||||||||    
T  25038753 agcaacaaggtgcaagcctgttgaggcttagagaataca---gaattgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatct 25038657  T
Q  109 caaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  25038656 caagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacacacattgggggaaccactataaatttctgtg 25038577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 52949049 - 52948879
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||     |||||||| |||||||||| |||||    
T  52949049 aaggtgtaagtctgctgaggctaagagaatacaattgttgtaattgttcaggtgaacaaggttgtaaggtgcagaatttgagaagttatctcaagcatca 52948950  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    || ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  52948949 taatggaaaa-tctcacaaaactgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 52948879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20317048 - 20316884
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga--tgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatct 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||  |||||||||| |||||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||    
T  20317048 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcatagagaataca---gaattgtaattgtttaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatct 20316952  T
Q  109 caaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20316951 caagcatcatagtgggaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 20316884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 177
Target Start/End: Original strand, 22961615 - 22961772
Alignment:
Q  24 aggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |   |  |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||     |||||||||||||||||||||||||    
T  22961615 aggtgcaagcctgctgaggcttagagaatataga-gtggtaagtgtttaggtgaacacagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaaacatca 22961713  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22961714 tagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 22961772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 41543186 - 41543025
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||   | |||| |||||| ||||||| ||||||||| ||     ||||||| ||||||||||    
T  41543186 agcaacaaggtgcaagcctactgaggcttagagaatacatagta-gtaagtgttcatgtgaacatagattgtaaggtgcaggatttgaggggttatctca 41543088  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaacca 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41543087 aacatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaacca 41543025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2369779 - 2369615
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaaga-ttgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||| | |||||| ||     |||| ||||||||||| |    
T  2369779 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatatt-tgtaattgttcacgtgaacaaaaattgtaaggtgcatgattttagaggttatctaa 2369681  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||    
T  2369680 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagtccacattaggtgaaccacta 2369615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 13965751 - 13965914
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  13965751 agcaacaaggtgcaaacctgctgaggcttagagaatacatg-gttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 13965849  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |  |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  13965850 attatcatagtgg-aaactctctcaagattgtg-ggagtggactaacccacattggctgaaccacta 13965914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 177
Target Start/End: Original strand, 18384056 - 18384212
Alignment:
Q  25 ggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatcat 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||||||||| | |||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18384056 ggtgcaagcctgctcaggcttagagaatacaaa-gttgtaattgtttatgtgaacaaagattgtaaggtgtaggatttgagaggttatctcaagcatcat 18384154  T
Q  119 agtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18384155 agtagaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 18384212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 177
Target Start/End: Original strand, 21793463 - 21793620
Alignment:
Q  26 gtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaa-ttgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatcat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||     |||||||||||||||| || ||||||    
T  21793463 gtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggttttgtaaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgtaggatttgagaggttatctaaagcatcat 21793562  T
Q  119 agtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21793563 agtggaaa-ctcccacaagattgtgaggagtggactaaaccacattgggtgaaccacta 21793620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25043965 - 25043789
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaa-----agtatttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||     ||||| |||||||||||||| |||||||||     || ||||||||||||||||||    
T  25043965 agcaacaaggtgcaagcctgccgaggcttagagaacacaaaat-tgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaagatgcaggatttgagaggttatctca 25043867  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  25043866 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacacacattgggggaaccactataaatttctgtg 25043789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 42034918 - 42035082
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga--tgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||     | |||| |||||||||    
T  42034918 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaataca---gaattgtaattgttctggtgaacaaagattgtaaggtgcaggacttgaaaggttatct 42035014  T
Q  109 caaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||    
T  42035015 caagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacgttgggtgaactacta 42035082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 177
Target Start/End: Original strand, 12420194 - 12420277
Alignment:
Q  93 atttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12420194 atttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 12420277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 4951134 - 4951298
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||     ||||| |||||||||||||  ||||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  4951134 agcaacaaggtgcaagtctgctgaggcttagagaatacaaaat-tgtaagtgttcaggtgaactcagattgtaaggtgcatgatttgagaggttatctca 4951232  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  4951233 agcatcatagtggaaa-ctttcacaagattgtgaggagtggactaacccacattaggggaaccacta 4951298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21820811 - 21820654
Alignment:
Q  26 gtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaa-ttgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatcat 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  |  ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||     |||||||||||||||||||  |||||    
T  21820811 gtgcaagcctggtgaggcttagagaatacaggttgtgtaaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagtatcat 21820712  T
Q  119 agtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  21820711 agtggaaa-ctttcacaagattgggaggagtggactaacccacattgggtgtaccacta 21820654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 25822515 - 25822357
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   | || || ||||||||||| || | ||||||| ||     ||| ||||||||||||||| ||||    
T  25822515 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagagg-tgcaagtgttcaggtgagcacatattgtaaggtgcaagattagagaggttatctcaagcatc 25822417  T
Q  117 atagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  25822416 atagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattggaggaaccacta 25822357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 2117559 - 2117724
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaag-attgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||| |||| || ||     | ||||||||||||||||    
T  2117559 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga-gttgtaatttttcaggtgaacaaggattgaaaggtgcaggacttgagaggttatctca 2117657  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggacta-accctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  2117658 agcaccatagtggaaa-ctctcacaagattgtgagaagtggactagccccacattgggtgaaccacta 2117724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Original strand, 8540965 - 8541125
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     |||||||| |||||||||    
T  8540965 agcaacaaggtgcaagtctgctgatgcttagagaatacaga-gttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagatgttatctca 8541063  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaacc 173  Q
    | |||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  8541064 agcatcgtagtggaaa-ctctcacaatcttgtgaggagtggactaacccacattgggggaacc 8541125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Original strand, 8606204 - 8606364
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     |||||||| |||||||||    
T  8606204 agcaacaaggtgcaagtctgctgatgcttagagaatacaga-gttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagatgttatctca 8606302  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaacc 173  Q
    | |||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  8606303 agcatcgtagtggaaa-ctctcacaatcttgtgaggagtggactaacccacattgggggaacc 8606364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 30548982 - 30548818
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||||| | ||     | ||||||||||||||||    
T  30548982 agcaacaaggtgcaagtctgcttaggcttagagaatacaga-gttgtaattgttcaggtgaacaaagattgttatgtgcaggacttgagaggttatctca 30548884  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  30548883 agcaccatagtggaaa-ctcttacaagattgtgaggagtggactagcccacgttgggtgaaccacta 30548818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 177
Target Start/End: Original strand, 25868131 - 25868214
Alignment:
Q  93 atttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  25868131 atttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaa-ctcttacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 25868214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 177
Target Start/End: Original strand, 22957175 - 22957325
Alignment:
Q  30 aagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatcatagtgga 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||  ||||||| | ||||   |||||||||     || ||||| | ||||||||| | ||||||| |    
T  22957175 aagcctgctgaggtttagagaatacaattg-tgtatatgttcagattaacatttttgtaaagtgcaggatctgagaaggtatctcaaataccatagtgca 22957273  T
Q  125 aaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  22957274 aa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattggatgaaccacta 22957325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 177
Target Start/End: Original strand, 34000660 - 34000734
Alignment:
Q  102 gttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  34000660 gttatatcaaacaacatagtggaaa-ctcttacaagattgtgacgagtagactaacccacattgggtgaaccacta 34000734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21904581 - 21904521
Alignment:
Q  116 catagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  21904581 catagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacgttgggtgaaccacta 21904521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 151
Target Start/End: Original strand, 22892366 - 22892421
Alignment:
Q  95 ttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtgg 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22892366 ttgagaggttatctcaagcatcatagtgg-aaattctcacaagattgtgaggagtgg 22892421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19867831 - 19867793
Alignment:
Q  139 ttgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19867831 ttgtgaggagtggactaacccatattgggtgaaccacta 19867793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 174
Target Start/End: Original strand, 22959167 - 22959209
Alignment:
Q  132 cacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaacca 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  22959167 cacaagattgtgaggagtggactaacccatattggatgaacca 22959209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 151
Target Start/End: Original strand, 22892213 - 22892268
Alignment:
Q  95 ttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtgg 151  Q
    |||||| ||||||| || |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22892213 ttgagaagttatcttaagcatcatggtggaaat-tctcacaagattgtgaggagtgg 22892268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 107; Significance: 8e-54; HSPs: 46)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13792389 - 13792228
Alignment:
Q  20 aagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaaca 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||||||||||| ||    
T  13792389 aagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacattttttgtaatttttcaggtgaacaagattgtaaggtgcatgatttgagaggttatctcaagca 13792290  T
Q  115 tcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13792289 tcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 13792228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 187
Target Start/End: Original strand, 16397953 - 16398129
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||| |||||    
T  16397953 agcaaaaaggtgtaagcctgctgaggcttagagaatacaattgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagtgcaggatttgagaggttacctcaa 16398052  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  16398053 acatcatagt-gaaaactctcacaagatcgtgaggagtggactaaaccacattggatgaaccactataaatttctgtg 16398129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 187
Target Start/End: Original strand, 16250151 - 16250326
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  16250151 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 16250248  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16250249 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 16250326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 8841894 - 8842052
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||||    
T  8841894 aaggtgtaagcctgctgaggctaagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagtgcagaatttgagaggttatctcaagcatca 8841993  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  8841994 tagt-gaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccatagtgggtgaaccacta 8842052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13402145 - 13401980
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  13402145 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagttggtgtaattgttcagttgaacaaagattgtaaggtgcggaatttgagaggttatctca 13402046  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  13402045 agcatcgtagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacatttggtgaaccacta 13401980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 519041 - 518871
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||     |||||||| |||||||||| |||||    
T  519041 aaggtgtaagcctgctgaggctaagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatca 518942  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  518941 tagtggaaaa-tctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 518871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 521547 - 521377
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||     |||||||| |||||||||| |||||    
T  521547 aaggtgtaagcctgctgaggctaagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatca 521448  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  521447 tagtggaaaa-tctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 521377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17827355 - 17827191
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaag-attgtaaagt-----atttgagaggttatctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||     |||||||||||||||||    
T  17827355 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaaggattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctc 17827258  T
Q  110 aaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17827257 aagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 17827191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17836746 - 17836582
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaag-attgtaaagt-----atttgagaggttatctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||     |||||||||||||||||    
T  17836746 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaaggattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctc 17836649  T
Q  110 aaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17836648 aagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 17836582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 177
Target Start/End: Original strand, 16059077 - 16059239
Alignment:
Q  20 aagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||     |||||||||||||||||||||    
T  16059077 aagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagttggcgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaaac 16059176  T
Q  114 atcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16059177 atcatagtggaaat-tcttacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 16059239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 30652376 - 30652535
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaac-aagattgtaaagtatttgagaggttatctcaaacat 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  30652376 agcaagaaggtacaagcctgctgatgcttagagaatacagttggcgtaattgttcaggtgaacaaagattg-caaggatttgagaggttatctcaaacat 30652474  T
Q  116 catagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||    
T  30652475 catagtgg-aaactctcacaagattgtgaggagttgactaaccaacattgggggaaccacta 30652535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 17144433 - 17144598
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaag-attgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  17144433 agcaataaggtgcaagcctgctgaggtttagagaatacagttgttgtaattgttccggtgaacaaggattgtaaggtgtaggatttgagaggttatctca 17144532  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  17144533 agcatcgtagtg-aaaactctcacaagattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 17144598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4837352 - 4837193
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaag-attgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatc 116  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||     ||||||||||||||||||||||||    
T  4837352 aaggtgcaagcctgctgttgcttagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaaacatc 4837253  T
Q  117 atagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4837252 ataatagaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 4837193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17420653 - 17420483
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||     |||||||| |||||||||| |||||    
T  17420653 aaggtgtaagcctgctgaggctaagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatca 17420554  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17420553 tagtggaaaa-tctcacaaaactgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 17420483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 16630237 - 16630401
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga--tgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatct 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||    
T  16630237 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaataca---gaattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatct 16630333  T
Q  109 caaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16630334 caagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 16630401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 10422487 - 10422651
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  10422487 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga-gttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 10422585  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  10422586 agcatcataatggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 10422651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 15670784 - 15670948
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  15670784 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga-gttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 15670882  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15670883 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacatagggtgaaccacta 15670948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 17162293 - 17162458
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     |||||| |||||||||||    
T  17162293 agcaacaaggttcaagcctgctgaggcttagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgataggttatctca 17162392  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  17162393 agcatcatagtggaaa-ctctcagaagattatgaggagtggactatcccacattgggtgaaccacta 17162458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 6405185 - 6405021
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgta-----aagtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||     || ||||||||||||||||||||    
T  6405185 agcaagaaggtgcaagattgctgaggcttagagaatacaattgttgtaatttttcaggtgaacaagattgtaaggtgaaatatttgagaggttatctcaa 6405086  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||  ||||||||||    
T  6405085 gcatcatattgg-aaactctcacaagattgtgaggagtggactagcccatattgtttgaaccacta 6405021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 5292268 - 5292104
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||     | |||||||||||||||    
T  5292268 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctc 5292171  T
Q  110 aaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5292170 aagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 5292104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 5301927 - 5301763
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||     | |||||||||||||||    
T  5301927 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctc 5301830  T
Q  110 aaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5301829 aagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 5301763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 21846990 - 21847154
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||     | |||||||||||||||    
T  21846990 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctc 21847087  T
Q  110 aaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21847088 aagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 21847154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 21856582 - 21856746
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||     | |||||||||||||||    
T  21856582 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctc 21856679  T
Q  110 aaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21856680 aagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 21856746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 21902853 - 21903017
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||     | |||||||||||||||    
T  21902853 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctc 21902950  T
Q  110 aaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21902951 aagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 21903017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 21912445 - 21912609
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||     | |||||||||||||||    
T  21912445 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctc 21912542  T
Q  110 aaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21912543 aagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 21912609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27679933 - 27679769
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||     | |||||||||||||||    
T  27679933 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctc 27679836  T
Q  110 aaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  27679835 aagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 27679769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27689588 - 27689424
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||     | |||||||||||||||    
T  27689588 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctc 27689491  T
Q  110 aaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  27689490 aagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 27689424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17984228 - 17984065
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  17984228 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 17984131  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  17984130 agcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 17984065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18104778 - 18104615
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  18104778 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 18104681  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18104680 agcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 18104615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 40922548 - 40922711
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  40922548 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 40922645  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  40922646 agcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 40922711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 2830690 - 2830854
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  2830690 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacatattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 2830788  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  2830789 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 2830854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 6692923 - 6693086
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||| |||||||||||||| ||     | |||||||||||||||||    
T  6692923 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggagaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 6693021  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  6693022 gcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 6693086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 6703329 - 6703492
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||| |||||||||||||| ||     | |||||||||||||||||    
T  6703329 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggagaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 6703427  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  6703428 gcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 6703492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 3486807 - 3486643
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||     | |||||||||||||||    
T  3486807 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctc 3486710  T
Q  110 aaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3486709 aagcatcatagtagaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 3486643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 3496130 - 3495966
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||     | |||||||||||||||    
T  3496130 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctc 3496033  T
Q  110 aaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3496032 aagcatcatagtagaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 3495966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 187
Target Start/End: Original strand, 26459130 - 26459300
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||| ||||| | ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||     |||||||| ||||||||||||||||    
T  26459130 aaggtgtaagcccgatgaggctaagagaatactgttgttgtaattgttcaggtgaacaaggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaaacatca 26459229  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  26459230 tagtggaaaa-tctcacaaaactgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 26459300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16210322 - 16210167
Alignment:
Q  25 ggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaaacatcat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||| |||||||||     || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16210322 ggtgcaagcctgctgaggcttagagaataca-gaggtgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaggtacaggatttgagaggttatctcaagcatcat 16210224  T
Q  119 agtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16210223 agtgg-aaactctcacaagatttagaggagtggactaacccacattggg-gaaccacta 16210167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 44889723 - 44889887
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||| |||||| | ||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  44889723 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga-gttgtaagtgttcagttgaacacatattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 44889821  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||    
T  44889822 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacacccattgggggaactacta 44889887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 41527004 - 41527166
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaac-aagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||     ||||||||||||||||      
T  41527004 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggttgtgtaactgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaagatttgagaggttatcttt 41527103  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | ||||||||||||||   ||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  41527104 agcatcatagtggaaa---ctctcaagattgtgagaagtggactaa-ccacattgggtgaaccacta 41527166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 16253940 - 16254104
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||||| | ||     | ||||||||||||||||    
T  16253940 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga-gttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtgaggtgcaggacttgagaggttatctca 16254038  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||    
T  16254039 agcaccatagtggaaa-ctctcacaaaattgtgaggagtagactagcccacgttgggtgaaccacta 16254104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 53945388 - 53945305
Alignment:
Q  93 atttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  53945388 atttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 53945305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 7843127 - 7843053
Alignment:
Q  102 gttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  7843127 gttatctcaagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacgttgggtgaaccacta 7843053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 7846097 - 7845933
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga--tgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatct 108  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||  ||||| | |||||||||||| | ||||||| ||     | ||||||||||||||    
T  7846097 agcaacaaggtgcaatcctgctgaggcttagaaaataca---gaattgtaagtattcaggtgaacataaattgtaaggtgcaggacttgagaggttatct 7846001  T
Q  109 caaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  7846000 caagcatcataggggaaa-ctctcataagattgtgaggagtggactagcccacgttgggtgaaccacta 7845933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14600014 - 14599850
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaa-----agtatttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||| | ||||||     || |||| |||||||||||||    
T  14600014 agcaagaaggtgcaagccagttgtggcttagagaatacatg-gttataattgttcaggtgaacaaaggttgtaagatgcaggatttaagaggttatctca 14599916  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |  |||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||    
T  14599915 agtatcatagttgaaa-ctctcataggattgtgaggagtggaccagcccacattaggtgaaccacta 14599850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16081554 - 16081473
Alignment:
Q  95 ttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16081554 ttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 16081473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 81
Target Start/End: Original strand, 11477607 - 11477671
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa 81  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||    
T  11477607 agcaagaaggtgcaagtctgccaaggcttatagaatacatgagttgtaattgttcaagtgaacaa 11477671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 107; Significance: 8e-54; HSPs: 37)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16901496 - 16901331
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  16901496 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggattgtaaagtgcaggatttgagaggttatctca 16901397  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16901396 accatcatagtgg-aaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 16901331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16994887 - 16994722
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  16994887 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggattgtaaagtgcaggatttgagaggttatctca 16994788  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16994787 accatcatagtgg-aaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 16994722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 32936061 - 32935886
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  32936061 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 32935964  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  32935963 agcatcatagtggaaa-ctttcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 32935886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27159273 - 27159103
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||     |||||||| |||||||||| |||||    
T  27159273 aaggtgtaagcctgctgaggctaagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatca 27159174  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27159173 tagtggaaaa-tctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 27159103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27169621 - 27169451
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||     |||||||| |||||||||| |||||    
T  27169621 aaggtgtaagcctgctgaggctaagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatca 27169522  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27169521 tagtggaaaa-tctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 27169451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 45191541 - 45191705
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga--tgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatct 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||    
T  45191541 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaataca---gaattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatct 45191637  T
Q  109 caaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45191638 caagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 45191705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 4459082 - 4459246
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||     | |||||||||||||||    
T  4459082 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacat--gattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctc 4459179  T
Q  110 aaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  4459180 aagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 4459246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 19343026 - 19343184
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||     |||||||| ||||||| || |||||    
T  19343026 aaggtgtaagcctgctgaggcttagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggttgtaaggtgtaggatttgagaagttatctaaatcatca 19343125  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19343126 tagtcaaaaa-tctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 19343184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 9502034 - 9501871
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  9502034 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 9501936  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9501935 gcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 9501871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 9513400 - 9513237
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  9513400 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 9513302  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9513301 gcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 9513237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 18651923 - 18652086
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  18651923 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 18652021  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18652022 gcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 18652086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 18664041 - 18664204
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  18664041 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 18664139  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18664140 gcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 18664204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 4468707 - 4468871
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||     | |||||||||||||||    
T  4468707 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctc 4468804  T
Q  110 aaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  4468805 aagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 4468871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 5345989 - 5345825
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaac-aagattgtaaagt-----atttgagaggttatctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||     | |||||||||||||||    
T  5345989 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacgaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctc 5345892  T
Q  110 aaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5345891 aagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 5345825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 187
Target Start/End: Original strand, 22902850 - 22903020
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||| || |||| ||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||     |||||||| |||||||||| |||||    
T  22902850 aaggtgtaaacctgttgaggctaagagaatatagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggttgtaatgtgtatgatttgagaagttatctcaagcatca 22902949  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22902950 tagtggaaaa-tctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 22903020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2997971 - 2997808
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  2997971 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 2997874  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  2997873 agcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 2997808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 180
Target Start/End: Original strand, 21109920 - 21110086
Alignment:
Q  19 caagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||     |||||||||||||||||||     
T  21109920 caagaaggtgcaagcctgctgagacttagagaatatatgtgttgtaattgttcagttgaacaaagattgtaaggtgtaggatttgagaggttatctcaag 21110019  T
Q  113 catcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccactaaat 180  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  21110020 catcatagttgaaa-ctctcacaagattgcgaggagtggactagtccacattgggtgaaccactaaat 21110086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22908144 - 22907986
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| |||||| ||     |||||||| |||||||||| |||||    
T  22908144 aaggtgtaagcctgctgaggctaagagaatacaattgttgtaattaatcaggtgaacaaggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatca 22908045  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22908044 taatggaaaa-tctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 22907986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 69445 - 69284
Alignment:
Q  20 aagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaaca 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||| ||     ||||||||||||||||||||||    
T  69445 aagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaataatattttaaggtgcatgatttgagaggttatctcaaaca 69346  T
Q  115 tcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| | ||||||||    
T  69345 tcatagttg-aaattctcacaagattgtgaggagtggactagccaacattggataaaccacta 69284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 28451031 - 28451195
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  28451031 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga-gttgtaagtgttcatgtgaacacagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 28451129  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  28451130 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 28451195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 29424057 - 29424221
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  29424057 agcaagaaggtgcaagcctgttgaggcttagagagtacaga-gttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcatgacttgagaggttatctca 29424155  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  29424156 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 29424221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 5336137 - 5335973
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaac-aagattgtaaagt-----atttgagaggttatctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||     | |||||||||||||||    
T  5336137 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacgaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctc 5336040  T
Q  110 aaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5336039 aagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtagactagcccacattgggtgaaccacta 5335973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 17489395 - 17489558
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  17489395 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatatag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 17489492  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  17489493 agcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 17489558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 37862389 - 37862225
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga--tgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatct 108  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     | ||||||||| ||||    
T  37862389 agcaaaaaggtgcaagcctgttgaggcttagagaataca---gaattgtaattgttcaggtgaacaatgattgtaaggtgcaggacttgagaggtcatct 37862293  T
Q  109 caaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37862292 caagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 37862225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 38929783 - 38929619
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  38929783 agcaacaaggtgcaagcctgttgaggcttagagaatacaaa-gttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 38929685  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  38929684 agcaccatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacgttgggtgaaccacta 38929619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 41026181 - 41026016
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaac-aagattgtaa-----agtatttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||     || |||||||||||| |||||    
T  41026181 agcaagaaggtgcaagcctgatgaggcttagagaatacaattgatataattgtttaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttgtctca 41026082  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | ||||||  ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  41026081 agcatcatgatgg-aaactctcgcaagattgtgaagagtggactaacccacattggatgaaccacta 41026016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 44637931 - 44637767
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||| || |||| |||| ||     ||||||||||||||||||    
T  44637931 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagt-gttgtaagtgttcaggtgatcacagatggtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 44637833  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  44637832 aacatcaaagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtgggctaacccacattgggggaaccacta 44637767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 33 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 15474818 - 15474683
Alignment:
Q  33 cctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaa 127  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||     |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  15474818 cctgctaaggcttagagaatacaattgttgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcatgatttgagaagttatctcaagcatcatagtggaaaa 15474719  T
Q  128 ctctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcatt 164  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15474718 -tctcacaagattgtaaggagtggactaacccacatt 15474683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 3604921 - 3604757
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||  | ||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  3604921 agcaacaaggtgcaagcttgctgaggcttagagaatacaaa-gttgtaagtgttcaggtgaacgcatattgtaaggtgcgggatttgagaggttatctca 3604823  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  3604822 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 3604757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22679025 - 22678861
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  22679025 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacatattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 22678927  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  22678926 agcattatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgagggaaccacta 22678861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 38957125 - 38956961
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  38957125 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga-gttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 38957027  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||    
T  38957026 agcaccatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacgttggatgaaccacta 38956961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 45015417 - 45015581
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  45015417 agcaacaaggtgcaagcctgctgaagcttagagaatacaga-gttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 45015515  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  45015516 agcaccatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacgttgggtgaaccacta 45015581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22671885 - 22671731
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  22671885 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacatattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 22671787  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattggg 167  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22671786 agcattatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattggg 22671731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 164
Target Start/End: Original strand, 12571301 - 12571452
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  12571301 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacataat-tgtaagtgtttaggtgaacatagattgtaaggtgtaggatttgagaggttatctca 12571399  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcatt 164  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  12571400 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgagtagtggactaacccacatt 12571452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24695857 - 24695696
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaac-aagattgtaa-----agtatttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||||||||     || | ||||||||||||||||    
T  24695857 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaataca-gagttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 24695759  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  24695758 agcaccatagtgg-aaactctcacaagattgt---gagtggactagcccacgttgggtgaaccacta 24695696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 40408211 - 40408152
Alignment:
Q  95 ttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggacta 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40408211 ttgagaggttatctcaaacatcataatggaaaa-tctcacaagattgtgaggagtggacta 40408152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 158
Target Start/End: Original strand, 22146566 - 22146628
Alignment:
Q  95 ttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacc 158  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  22146566 ttgagagattatctcaagcatcatagtgg-aaattcttacaagattgtgagaagtggattaacc 22146628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 187
Target Start/End: Original strand, 13675465 - 13675640
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  13675465 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 13675562  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13675563 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 13675640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21987105 - 21986930
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  21987105 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 21987008  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21987007 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 21986930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21996639 - 21996464
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  21996639 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 21996542  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21996541 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 21996464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14881042 - 14880878
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  14881042 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacataat-tgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcagaatttgagaggttatctca 14880944  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14880943 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 14880878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14893392 - 14893228
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  14893392 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagtat-tgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgtaggatttgagaggttatctca 14893294  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14893293 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 14893228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 26361690 - 26361520
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||     |||||||| ||||||| || |||||    
T  26361690 aaggtgtaagcctgctgaggctaagagaatacagttgttgtaattgctcaggtgaacaaggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatcttaagcatca 26361591  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26361590 tagtggaaaa-tctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 26361520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21202190 - 21202027
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  21202190 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 21202092  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21202091 gcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 21202027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21212606 - 21212443
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  21212606 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 21212508  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21212507 gcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 21212443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 21335003 - 21335166
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  21335003 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 21335101  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21335102 gcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 21335166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 187
Target Start/End: Original strand, 14438134 - 14438304
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||     |||||||| | ||||| || |||||    
T  14438134 aaggtgtaagcctgctgaggctaagagaatacagttgttgtaattgatcaggtgaacaaggttgtaaggtgaaggatttgagaagatatctaaagcatca 14438233  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14438234 tagtggaaaa-tctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 14438304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 9324390 - 9324227
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  9324390 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 9324293  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9324292 agcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 9324227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 31991009 - 31990845
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga--tgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaa-----agtatttgagaggttatct 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  |||||||||||||||||||| |||||||||     || ||||||||||||||||    
T  31991009 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaataca---gaattgtaattgttcaggtgaacagagattgtaagatgcaggatttgagaggttatct 31990913  T
Q  109 caaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  31990912 caagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtagactaacccacattgggggaaccacta 31990845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 31998598 - 31998434
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga--tgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaa-----agtatttgagaggttatct 108  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||  |||||||||||| |||||||| ||||||||     || ||||||||||||||||    
T  31998598 agcaacaaggtgcaagcctgccgaggcttagagaataca---gaattgtaattgttcatgtgaacaaagattgtaagatgcaggatttgagaggttatct 31998502  T
Q  109 caaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  31998501 caagcatcatagtggaaat-tctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 31998434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2689639 - 2689474
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaac-aagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  2689639 agcaagaaggtgcaagtatgctgaggattagagaatacatgtgttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaagatttgagaggttatctca 2689540  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| || ||||||    
T  2689539 agcataatagtgg-aaactttcacaagattgtgagaagtggactagcccacattgggcgagccacta 2689474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 33773466 - 33773321
Alignment:
Q  36 gctgaggcttagagaatacatttga--tgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  33773466 gctgaggcttagagaataca---gaattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaa- 33773371  T
Q  128 ctctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  33773370 ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 33773321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20530228 - 20530064
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga--tgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatct 108  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||   ||  |||||||||||||| |||||| |||||||| ||     |||||| |||||||||    
T  20530228 agcaacaaggtgtaagcctgttgaggcttagagaataca---gaattgtaattgttcaggagaacaaagattgtaaggtgcaggatttgataggttatct 20530132  T
Q  109 caaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20530131 caagcatcatagtggaaaa-tctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 20530064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 93 - 187
Target Start/End: Original strand, 3988297 - 3988392
Alignment:
Q  93 atttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3988297 atttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 3988392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 11429818 - 11429662
Alignment:
Q  25 ggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatcat 118  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  || || || ||||||||||| || | ||||||| ||     ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  11429818 ggtgcaagcttgctgaggcttagagaatacagatg-tgcaactgttcaggtgagcacaaattgtaaggtgcaggatttgagtggttatctcaagcatcat 11429720  T
Q  119 agtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  11429719 agtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccaccttgggggaaccacta 11429662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 95 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12900582 - 12900501
Alignment:
Q  95 ttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12900582 ttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 12900501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23014382 - 23014227
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga--tgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaaca 114  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||     ||||||||||||||||||| ||    
T  23014382 aaggtgcaagcctgttgaggcttaaagaataca---gaattgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagca 23014286  T
Q  115 tcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaacca 174  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||    
T  23014285 tcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagttgactaacccacgttgggggaacca 23014227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 93 - 167
Target Start/End: Original strand, 6760603 - 6760676
Alignment:
Q  93 atttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattggg 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  6760603 atttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtaaggagtggactaacccacattggg 6760676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 95 - 177
Target Start/End: Original strand, 21461892 - 21461973
Alignment:
Q  95 ttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  21461892 ttgagaggttatctcaagcaccatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacgttgggtgaaccacta 21461973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12840730 - 12840647
Alignment:
Q  93 atttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12840730 atttgagagggtatctcaagcatcataatggaaat-tctcacaagattgtgaggagtggattaacccacattgggtgaaccacta 12840647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 177
Target Start/End: Original strand, 18537438 - 18537519
Alignment:
Q  95 ttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  18537438 ttgagaggttatttcaagcattatagtggaaat-tctcacaagattgtgaggagtggattaacccacattggatgaaccacta 18537519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 177
Target Start/End: Original strand, 17269564 - 17269600
Alignment:
Q  141 gtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17269564 gtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 17269600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 41)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18208813 - 18208638
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  18208813 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 18208716  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18208715 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 18208638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18218151 - 18217976
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  18218151 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 18218054  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18218053 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 18217976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 187
Target Start/End: Original strand, 21682892 - 21683067
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  21682892 agcaagaaggtgcaagcctgttgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 21682989  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21682990 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 21683067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 187
Target Start/End: Original strand, 20948562 - 20948732
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||     |||||||| |||||||||| |||||    
T  20948562 aaggtgtaagcctgctgaggctaagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggttgtaaggtgtaggatttgagaagttatctcaagcatca 20948661  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20948662 tagtggaaaa-tctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 20948732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 187
Target Start/End: Original strand, 20958931 - 20959101
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||     |||||||| |||||||||| |||||    
T  20958931 aaggtgtaagcctgctgaggctaagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggttgtaaggtgtaggatttgagaagttatctcaagcatca 20959030  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20959031 tagtggaaaa-tctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 20959101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 30942841 - 30942677
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaag-attgtaaagt-----atttgagaggttatctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||     |||||||||||||||||    
T  30942841 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaaggattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctc 30942744  T
Q  110 aaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30942743 aagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 30942677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 30952263 - 30952099
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaag-attgtaaagt-----atttgagaggttatctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||     |||||||||||||||||    
T  30952263 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaaggattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctc 30952166  T
Q  110 aaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30952165 aagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 30952099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 36317150 - 36317315
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  36317150 agcaagaagatgcaagcctgctgaggcttagagaatacagttggcgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 36317249  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  36317250 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattggaggaaccacta 36317315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 37646884 - 37646719
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaag-attgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| | ||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  37646884 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagatgttgtaattgttcaggtgaacaaggaatgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 37646785  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37646784 agcatcatagtggaaa-ctctcaaaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 37646719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22172804 - 22172640
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga--tgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatct 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||    
T  22172804 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaataca---gaattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatct 22172708  T
Q  109 caaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22172707 caagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 22172640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 37537773 - 37537608
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaag-attgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| | ||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  37537773 agcaacaaggtgcaagtctgctgaggcttagagaatacagatgttgtaattgttcaggtgaacaaggaatgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 37537674  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37537673 agcatcataatggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 37537608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4037531 - 4037367
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga--tgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatct 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||    
T  4037531 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaataca---gaattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatct 4037435  T
Q  109 caaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4037434 caagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 4037367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19547794 - 19547636
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||| |||||||||| |||||    
T  19547794 aaggtgtaagcctgctgagactaagagaatatagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggttgtaaagtgtaggatttgagaagttatctcaagcatca 19547695  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  19547694 tagtggaaaa-tctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 19547636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 32071145 - 32071308
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||     || | ||||||||||||||||    
T  32071145 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaataca--tgattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 32071242  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  32071243 agcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 32071308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 37818303 - 37818467
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga--tgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatct 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     |||||||||||| |||    
T  37818303 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaataca---gaattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttctct 37818399  T
Q  109 caaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37818400 caagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 37818467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26191379 - 26191216
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  26191379 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 26191281  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  26191280 gcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 26191216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26201961 - 26201798
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  26201961 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 26201863  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  26201862 gcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 26201798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 33940025 - 33940188
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  33940025 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 33940123  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  33940124 gcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 33940188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 33950425 - 33950588
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  33950425 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 33950523  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  33950524 gcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 33950588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 21754239 - 21754403
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||     | |||||||||||||||    
T  21754239 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctc 21754336  T
Q  110 aaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21754337 aagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 21754403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 21763526 - 21763690
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||     | |||||||||||||||    
T  21763526 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctc 21763623  T
Q  110 aaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21763624 aagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 21763690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 18390939 - 18391102
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  18390939 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 18391036  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18391037 agcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 18391102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19887240 - 19887076
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga--tgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatct 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||    
T  19887240 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaataca---gaattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatct 19887144  T
Q  109 caaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  19887143 caagcatcatagaggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 19887076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27273733 - 27273569
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  27273733 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaaaat-tgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcagaatttgagaggttatctca 27273635  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27273634 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattatgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 27273569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 8764721 - 8764558
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  8764721 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 8764623  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  8764622 gcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccatattgggtgaaccacta 8764558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27578702 - 27578544
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatc 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     |||| |||||||||||||| ||||    
T  27578702 aaggtgcaagtctgctgaggcttagagaatacagg-gttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaagatttaagaggttatctcaagcatc 27578604  T
Q  117 atagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27578603 ttagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 27578544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13571231 - 13571067
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga--tgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatct 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||     |||||||||||| |||    
T  13571231 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaataca---gaattgtaattgttcaggtgaacaaagattataaggtgcaggatttgagaggttctct 13571135  T
Q  109 caaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13571134 caagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtaaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 13571067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 18361982 - 18362145
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  18361982 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgtttaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 18362079  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18362080 agcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 18362145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 174
Target Start/End: Original strand, 20897668 - 20897822
Alignment:
Q  26 gtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaa-ttgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatcat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||     |||||||||||||||| || ||||||    
T  20897668 gtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggttttgtaaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaagatttgagaggttatctaaagcatcat 20897767  T
Q  119 agtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaacca 174  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20897768 agtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaacca 20897822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 27412853 - 27413016
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     | |||| |||||||||||    
T  27412853 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgataggttatctca 27412950  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  27412951 agcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtgaggagtggactagcccacattaggtgaaccacta 27413016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 34130041 - 34129877
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaaga-ttgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||||||||||||||| | |||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  34130041 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacataat-tgtagttgttcaggtgaacaaaaattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 34129943  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  34129942 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgacgagtggactaacccacattgggggaaccacta 34129877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 23376316 - 23376152
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||     | |||||||||||||||||    
T  23376316 agcaagaaggagcaagcctgttgacgcttagagaatacagttgttgtacttgttcagctgaacaagattgtaaggtgcaggaattgagaggttatctcaa 23376217  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||    
T  23376216 gcatcataggggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccatattgggttaaccacta 23376152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 11410465 - 11410302
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||| ||||||    
T  11410465 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggtcatctca 11410368  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  11410367 agcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattggatgaaccacta 11410302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 187
Target Start/End: Original strand, 19781307 - 19781483
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaa-----agtatttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||     ||||| |||||||||||||| |||||||||     || ||||||||||||||||||    
T  19781307 agcaacaaggtgcaagcctgccgaggcttagagaacacaaaat-tgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaagatgcaggatttgagaggttatctca 19781405  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  19781406 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 19781483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 31917516 - 31917680
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga--tgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatct 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||     ||||||||||||||||    
T  31917516 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaataca---gaattgtaattgttcaggtgaacaaagtttgtaaggtgcaggatttgagaggttatct 31917612  T
Q  109 caaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  31917613 caagcatcatagtggcaa-ctctcacaagattgtgaggattggactagcccacgttgggtgaaccacta 31917680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 37298360 - 37298202
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga--tgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaaca 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  | ||| ||||||||||||||| | |||||| ||     ||||||||| ||||||||| ||    
T  37298360 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaataca---gaattataactgttcaggtgaacaaagtttgtaaggtgcatgatttgagagtttatctcaagca 37298264  T
Q  115 tcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  37298263 tcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 37298202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 177
Target Start/End: Original strand, 22245323 - 22245479
Alignment:
Q  25 ggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatcat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| || | ||||||| ||     ||||||||||||||||||| ||||||    
T  22245323 ggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagagg-tgtaagtgttcaggtgagcacatattgtaaggtgcatgatttgagaggttatctcaagcatcat 22245421  T
Q  119 agtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22245422 agtggaaa-ctctcataagattgtgaggaattgactaacccgcattgggggaaccacta 22245479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 42090058 - 42089892
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| || ||||||||     |||| |||||||||||||    
T  42090058 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacataat-tgtaagtgttcaggtgaacaaagactgtaaagtgcaggatttaagaggttatctca 42089960  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggag---tggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  42089959 agcatca-agtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtgctggactaacccacatcgggggaaccacta 42089892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 205018 - 204854
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||| |||| ||| |||||| |||||||| ||     | || |||| ||||||||    
T  205018 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaaaat-tgtaaatgttaaggagaacaaagattgtaaggtgcaagaattaagagattatctca 204920  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  204919 agcaacatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 204854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 93 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20904094 - 20904011
Alignment:
Q  93 atttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20904094 atttgagaggttatctcaagcatcatagttgaaa-ctttcacaagattgggaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 20904011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 20807941 - 20808105
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga--tgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatct 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||  ||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||     ||||||||||||||||    
T  20807941 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatata---gaattgtaagtgttcaggtgaatacagattctaaggtgcaggatttgagaggttatct 20808037  T
Q  109 caaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||    
T  20808038 caagcatcatggtggaaa-ctctcacaagagtgtgaggagtggactaacccacattcgaggaaccacta 20808105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20419 - 20254
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaag-attgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  20419 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 20320  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20319 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 20254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 52)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24539823 - 24539658
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaag-attgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  24539823 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagatgttgtaattgttcaggtgaacaaggattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 24539724  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24539723 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 24539658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15988022 - 15987858
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||     |||||||||||||||||||    
T  15988022 agcaagaaggtgcaagcctgcttaggcttagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaacattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaa 15987923  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  15987922 acatcatagtagaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagctcacattgggtgaaccacta 15987858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 187
Target Start/End: Original strand, 27989797 - 27989974
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaag-attgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  27989797 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 27989896  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27989897 agcatcatagtggaaa-ctctcacgagattgtgaggagtggactaacgcacattgggtgaaccactataaatttctgtg 27989974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 15374408 - 15374573
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaag-attgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  15374408 agcaacaatgtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagttgttgtaattgttcaagtgaacaaggattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 15374507  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15374508 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 15374573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5614804 - 5614634
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||     |||||||| |||||||||| |||||    
T  5614804 aaggtgtaagcctactgaggctaagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatca 5614705  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5614704 tagtggaaaa-tctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 5614634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 187
Target Start/End: Original strand, 41028310 - 41028480
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||     |||||||| |||||||||| |||||    
T  41028310 aaggtgtaagcctgctgaggctaagagaatactgttgttgtaattgttcaggtgaacaaggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatca 41028409  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41028410 tagtggaaaa-tctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 41028480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Original strand, 12574890 - 12575048
Alignment:
Q  20 aagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaaca 114  Q
    ||||||||||||| ||   ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||    
T  12574890 aagaaggtgcaagtctatcgaggcttggagaatacagttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagtgcaggatttgagaggttatctcaaaca 12574989  T
Q  115 tcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaacca 174  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  12574990 tcatagtgg-aaactctcacaagatcgtgaggagtggagtaacccacattgggggaacca 12575048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13285058 - 13284903
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||     |||||||| |||||||||| |||||    
T  13285058 aaggtgtaagcctgctgaggctaagagaatacaattgttgtaattgttcaggtgaacaaggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatca 13284959  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaacca 174  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13284958 tagtggaaaa-tctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaacca 13284903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12826729 - 12826571
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||     |||||||| |||||||||| |||||    
T  12826729 aaggtgtaatcctgctgaggctaagagaatacaattgttgtaattgttcaggtgaacaaggttgtaaggtgcaagatttgagaagttatctcaagcatca 12826630  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12826629 tagtggaaaa-tctcacaagattgtgagtagtggactaacccacattgggtgaaccacta 12826571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 19800804 - 19800968
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga--tgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaa-----agtatttgagaggttatct 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||     || ||||||||||||||||    
T  19800804 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaataca---gaattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaagatgcaggatttgagaggttatct 19800900  T
Q  109 caaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  19800901 caagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 19800968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14247860 - 14247695
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  || |||||||||||| |||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  14247860 agcaagaaggtgcaagcctgctgatgcttagagaattcaggtgttgtaattgttcaagtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 14247761  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  14247760 agcatcatagtggaaa-ctctcaaaagattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 14247695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 5381169 - 5381006
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  5381169 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 5381071  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5381070 gcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 5381006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 5390807 - 5390644
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  5390807 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 5390709  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5390708 gcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 5390644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 6535189 - 6535352
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  6535189 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 6535287  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  6535288 gcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 6535352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 6545510 - 6545673
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  6545510 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 6545608  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  6545609 gcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 6545673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 8501754 - 8501917
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  8501754 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 8501852  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  8501853 gcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 8501917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 8512224 - 8512387
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  8512224 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 8512322  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  8512323 gcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 8512387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 9534595 - 9534432
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||| ||     | |||||||||||||||||    
T  9534595 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga-gttgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 9534497  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  9534496 gcaccatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacgttgggtgaaccacta 9534432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 26304260 - 26304423
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  26304260 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 26304358  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  26304359 gcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 26304423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26362558 - 26362395
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  26362558 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 26362460  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  26362459 gcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 26362395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 32109522 - 32109685
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  32109522 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 32109620  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  32109621 gcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 32109685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 44898003 - 44898166
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  44898003 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 44898101  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  44898102 gcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 44898166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 44908428 - 44908591
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  44908428 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 44908526  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  44908527 gcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 44908591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 43984364 - 43984528
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaac-aagattgtaaagt-----atttgagaggttatctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||     | |||||||||||||||    
T  43984364 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacgaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctc 43984461  T
Q  110 aaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  43984462 aagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 43984528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 5927840 - 5928003
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  5927840 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 5927937  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5927938 agcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 5928003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Original strand, 9007651 - 9007813
Alignment:
Q  19 caagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| |||| | ||     ||||||||||||||||||| |    
T  9007651 caagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagttgttgtaattgttcaactgaacaaggttgtcatgtgcatgatttgagaggttatctcaagc 9007750  T
Q  114 atcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  9007751 atcatagtggaaa-ctctctcaagattgtgaggagtggactggcccacattggatgaaccacta 9007813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 11625721 - 11625558
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  11625721 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 11625624  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  11625623 agcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 11625558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16131271 - 16131108
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  16131271 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 16131174  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16131173 agcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 16131108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16141820 - 16141657
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  16141820 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 16141723  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16141722 agcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 16141657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 46497819 - 46497982
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  46497819 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 46497916  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  46497917 agcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 46497982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 46508431 - 46508594
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  46508431 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 46508528  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  46508529 agcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 46508594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 14946815 - 14946979
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||| || | |||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  14946815 agcaacaaagtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaag-gttgtaattgttcaggtgaataaagtttgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 14946913  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14946914 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 14946979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 9544878 - 9544715
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||| ||     | |||||||||||||||||    
T  9544878 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga-gttgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 9544780  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||    
T  9544779 gcaccatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtagactagcccacgttgggtgaaccacta 9544715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 26307820 - 26307983
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||| ||     | |||||||||||||||||    
T  26307820 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgtttaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 26307918  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  26307919 gcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 26307983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 32099085 - 32099248
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  32099085 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 32099183  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||  |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  32099184 gcattttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 32099248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 187
Target Start/End: Original strand, 31825429 - 31825599
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||| |||| ||||| |||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||     |||||||| |||||||||| |||||    
T  31825429 aaggtgtaagcttgctgtggctaagagaatacagttattgtaattgttcaggtgaacaaggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatca 31825528  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31825529 tagtggaaaa-tctcacaaaattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 31825599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 19586451 - 19586615
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga--tgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatct 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     ||||||||| ||||||    
T  19586451 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaataca---gaattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcatgatttgagagattatct 19586547  T
Q  109 caaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  19586548 caagcatcatagtggaaa-ctctcacaagaatgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 19586615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 7018762 - 7018598
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   | |||||||||| |||||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  7018762 agcaataaggtgcaagactgttgaggcttagagaatgcaga-gttgtaattgttgaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 7018664  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7018663 aacatcatagtggaaacct-tcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 7018598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 7034124 - 7033960
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   | |||||||||| |||||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  7034124 agcaataaggtgcaagactgttgaggcttagagaatgcaga-gttgtaattgttgaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 7034026  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7034025 aacatcatagtggaaacct-tcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 7033960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 10416688 - 10416852
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |   | ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  10416688 agcaacaaggtgcaagactgctgaggcttagagaatataga-gttgtaagtgttcaggtgaacacatattgtaaggtgcatgatttgagaggttatctca 10416786  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10416787 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 10416852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 45554261 - 45554425
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  45554261 agcaacaaggtgcaagcctgctgagacttagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacatattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 45554359  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  45554360 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacctacattgggggaaccacta 45554425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 177
Target Start/End: Original strand, 12516011 - 12516131
Alignment:
Q  61 tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggacta 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  12516011 tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagtgcgggatttgagaggttatcttaaacatcatagtgggaa-ctctcacaagatcgtgaggagtggagta 12516109  T
Q  156 accctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||| ||||||| |||||||||    
T  12516110 acccacattgggggaaccacta 12516131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2991245 - 2991082
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||  || | |||||||||| |||||||| | |||||||||     ||||||||||||||||||    
T  2991245 agcaagaatgtgcaagcctgctgaggcttaga--atacaggtgttataattgttcaagtgaacaaaggttgtaaagtgtaggatttgagaggttatctca 2991148  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |  |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2991147 agaatcatagtggaaat-tctcacaatattgtgagtagtggactaacccacattgggtgaaccacta 2991082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 43 - 173
Target Start/End: Original strand, 12088056 - 12088190
Alignment:
Q  43 cttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaag 137  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||     |||||||| |||||||||| |||| || ||||||| |||||||||    
T  12088056 cttatagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatcttattggaaaa-tctcacaag 12088154  T
Q  138 attgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaacc 173  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12088155 attgtgaggagtggactaacccacattgggtgaacc 12088190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 177
Target Start/End: Original strand, 12770808 - 12770951
Alignment:
Q  38 tgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactctc 132  Q
    |||||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||     ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12770808 tgaggcttagagaatataggtgttgtaactgttcaggtgaacaaggttgtaaggtgcaagatttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaa-ctctc 12770906  T
Q  133 acaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   | |||||||||||||    
T  12770907 acaagattgtgaggagtggactagcccatgtcgggtgaaccacta 12770951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 42621796 - 42621960
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  42621796 agcaacaaagtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga-gttgttattgttcagatgaacaaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 42621894  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||    
T  42621895 agcaccatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcacacgttgggtgaaccacta 42621960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 42596093 - 42596251
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||| |||||| || ||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||     || |||||||| |||||||||| |||||    
T  42596093 aaggtgtaagcctactaaggctaagagaatacagttgttgtaattgttcacgtgaacaaggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatca 42596192  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||    
T  42596193 tagt-gaaaaatctcacaaaactgtgaggagtagactgacccacattgggggaaccacta 42596251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 177
Target Start/End: Original strand, 12492206 - 12492326
Alignment:
Q  61 tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggacta 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||     |||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  12492206 tgtaattgtttaggtgaacaagattgtaaagtgcagaatttgaaaggttatctcaaacatcatagtaggaa-ctctcacaagatcgtgaggagtggagta 12492304  T
Q  156 accctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||| ||||||  |||||||||    
T  12492305 acccacattggaggaaccacta 12492326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 93 - 177
Target Start/End: Original strand, 13130622 - 13130705
Alignment:
Q  93 atttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  13130622 atttgagaggttatctcaagcatcatagtgcaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacgttgggtgaaccacta 13130705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 177
Target Start/End: Original strand, 8340955 - 8341074
Alignment:
Q  61 tgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggact 154  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||     ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  8340955 tgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcatagtgg-aaactctcacaagattgt--ggagtggaat 8341051  T
Q  155 aaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||||| ||||||| |||||||||    
T  8341052 aacccacattgggggaaccacta 8341074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 151
Target Start/End: Original strand, 40703344 - 40703399
Alignment:
Q  95 ttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtgg 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  40703344 ttgagaggttatctcaagcatcatagtgg-aaattctcacaagattgtgaggagtgg 40703399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 151
Target Start/End: Original strand, 40703188 - 40703246
Alignment:
Q  95 ttgagaggttatctcaa---acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtgg 151  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  40703188 ttgagaggttatctcaagcaacatcatagtggaaat-tctcacaagattgtgaggagtgg 40703246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 40)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2488233 - 2488068
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaag-attgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  2488233 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggattgtaaggtgcaagatttgagaggttatctca 2488134  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  2488133 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattggatgaaccacta 2488068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13118794 - 13118637
Alignment:
Q  25 ggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaag-attgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatcat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||     ||||||||||||||||||| ||||||    
T  13118794 ggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggattgtaacgtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcat 13118695  T
Q  119 agtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13118694 agtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 13118637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 11459843 - 11460007
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||      || |||||||||||||||||||    
T  11459843 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagttgttgtaattgtttaggtgaacaatattgtaggatgcaggatttgagaggttatctcaa 11459942  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  11459943 acatcatagtg-aaaactctcataagattgtgagaagtggactaacccacaatgggtgaaccacta 11460007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Original strand, 25433821 - 25433977
Alignment:
Q  25 ggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaag-attgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatcat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||     ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25433821 ggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaattgttgtaattgttcaggtgaacaaggattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatcat 25433920  T
Q  119 agtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccact 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25433921 agtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccact 25433977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24872576 - 24872406
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||     |||||||| |||||||||| |||||    
T  24872576 aaggtgtaagcctgctgaggctaagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatca 24872477  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24872476 tagtggaaaa-tctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 24872406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 49386732 - 49386562
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||     |||||||| ||||||||||||||||    
T  49386732 aaggtgtaagcttgctgaggctaagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggttgtaaggtgcatgatttgagaagttatctcaaacatca 49386633  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  49386632 tagtggaaaa-tctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 49386562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 5654986 - 5654823
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  5654986 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 5654888  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5654887 gcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 5654823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 9537840 - 9538003
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  9537840 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 9537938  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9537939 gcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 9538003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 9548166 - 9548329
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  9548166 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 9548264  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9548265 gcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 9548329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 4372244 - 4372408
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaac-aagattgtaaagt-----atttgagaggttatctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||     | |||||||||||||||    
T  4372244 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacgaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctc 4372341  T
Q  110 aaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  4372342 aagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 4372408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 4381985 - 4382149
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaac-aagattgtaaagt-----atttgagaggttatctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||     | |||||||||||||||    
T  4381985 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacgaagattgtatggtgcaggacttgagaggttatctc 4382082  T
Q  110 aaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  4382083 aagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 4382149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4781806 - 4781642
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga--tgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatct 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||    
T  4781806 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaataca---gaattgtaactgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatct 4781710  T
Q  109 caaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4781709 caagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 4781642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 8973551 - 8973714
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  8973551 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 8973648  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  8973649 agcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 8973714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 8984106 - 8984269
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  8984106 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 8984203  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  8984204 agcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 8984269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16334776 - 16334613
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  16334776 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 16334679  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16334678 agcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 16334613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19827590 - 19827426
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga--tgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatct 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     |||||||||||| |||    
T  19827590 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaataca---gaattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttctct 19827494  T
Q  109 caaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  19827493 caagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggcgaaccacta 19827426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 20492735 - 20492899
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||| || | |||||| ||     |||||||||||| |||||    
T  20492735 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaag-gttgtaattgttcaggtgaataaagtttgtaaggtgcaggatttgagaggttttctca 20492833  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20492834 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 20492899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 6423012 - 6423175
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||| |||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  6423012 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttctggtgaacaagattgtaagctgcaggacttgagaggttatctcaa 6423110  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  6423111 gcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 6423175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1684611 - 1684448
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  1684611 agcaagaaggtgcaagcctgccgaggcttagagaatacaa--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 1684514  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1684513 agcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 1684448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 11348 - 11184
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  11348 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga-gttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 11250  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  11249 agcaccatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacgttgggtgaaccacta 11184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 6433439 - 6433602
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  6433439 agcaagaaggtgcaatcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 6433537  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  6433538 gcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcctacattgggtgaaccacta 6433602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14801788 - 14801621
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacat--ttgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatct 108  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||  ||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||     ||||||||||||||||    
T  14801788 agcaacaaggtgcaagcctgttgaggcttacacaatacataattattgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatct 14801689  T
Q  109 caaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14801688 caagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 14801621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 187
Target Start/End: Original strand, 20293750 - 20293926
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga--tgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatct 108  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||     ||||||||||||||||    
T  20293750 agcaacaaggtgtaagcctgctgaggcttagagaataca---gaattgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatct 20293846  T
Q  109 caaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||||||||||||    
T  20293847 caagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacgttgggtgaaccactataaatttctgtg 20293926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4023487 - 4023324
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  4023487 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagg-gttgtaattattcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 4023389  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    || |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4023388 aatatcatagtgg-aaactctctcaagattgtg-ggagtggactaacccacattggctgaaccacta 4023324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10002786 - 10002622
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  10002786 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga-gttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 10002688  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  10002687 agtaccatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacgttgggtgaaccacta 10002622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 12386937 - 12387102
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaaga-ttgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |  ||||| ||||||||||||||| | |||||| ||     |||||| |||||||||||    
T  12386937 agcaacaaggtgcaagactgctaaggcttagagaatacaggttgtgtaactgttcaggtgaacaaaaattgtaaggtgtaggatttgaaaggttatctca 12387036  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  12387037 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacgttgggtgaaccacta 12387102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20744068 - 20743904
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||   | ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  20744068 agcaacaaggtgcaagactgctgaggcttagaaaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacatattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 20743970  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20743969 agcatcatagtg-aaaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 20743904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 23503205 - 23503061
Alignment:
Q  38 tgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactct 131  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||     |||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||    
T  23503205 tgaggcttagagaatacagttgtttgtaattgttcagatgaacaagattgtaaggtgcaaaatttgatagggtatcttaagcatcatagtg-aaaactct 23503107  T
Q  132 cacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23503106 cacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 23503061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10507212 - 10507054
Alignment:
Q  20 aagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaac 113  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||||| |    
T  10507212 aagaaggtgcagacctgttgaggcttagagaatacagg-gttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggttcaggatttgagaggttatctcaagc 10507114  T
Q  114 atcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaacca 174  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10507113 atcatagtggaaa-cactcacaagattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaacca 10507054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10508026 - 10507868
Alignment:
Q  20 aagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaac 113  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||||| |    
T  10508026 aagaaggtgcagacctgttgaggcttagagaatacagg-gttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggttcaggatttgagaggttatctcaagc 10507928  T
Q  114 atcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaacca 174  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10507927 atcatagtggaaa-cactcacaagattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaacca 10507868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 38817278 - 38817157
Alignment:
Q  61 tgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggact 154  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  38817278 tgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaaacatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgagaagtggact 38817180  T
Q  155 aaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  38817179 aacccacattgggtgaaccacta 38817157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 51977844 - 51977681
Alignment:
Q  18 gcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||  |||||||||||||| | ||||||| ||     |||||||||||||||||||    
T  51977844 gcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga-gttgtaggtgttcaggtgaacacaaattgtaaggtgcaagatttgagaggttatctcaa 51977746  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  51977745 gcatcatagtggaaa-ctctcactagattgtgaggagtgaactaacccacattgggggaaccacta 51977681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 177
Target Start/End: Original strand, 24773550 - 24773633
Alignment:
Q  93 atttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24773550 atttgaaaggttatctcaagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 24773633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 683087 - 683006
Alignment:
Q  95 ttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  683087 ttgagaggttatctcaagcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 683006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 177
Target Start/End: Original strand, 24814638 - 24814701
Alignment:
Q  113 catcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24814638 catcatagtggaaaa-tctcacaagattgtgagtagtggactaacccacattgggtgaaccacta 24814701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 124
Target Start/End: Original strand, 17734856 - 17734955
Alignment:
Q  30 aagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaaacatcatagtgga 124  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||     || |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17734856 aagcctggtgaggctaagagaatacagttgttgtaattgttcaggcgaacaaggttgtaaggtgtaggatttgagaagttatctcaagcatcatagtgga 17734955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 124
Target Start/End: Original strand, 19036125 - 19036224
Alignment:
Q  30 aagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaaacatcatagtgga 124  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||     || |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19036125 aagcctgatgaggctaagagaatacagttgttgtaattgttcaggcgaacaaggttgtaaggtgtaggatttgagaagttatctcaagcatcatagtgga 19036224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 11043986 - 11043908
Alignment:
Q  95 ttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaacca 174  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||    
T  11043986 ttgagaggttatctcaagcattatagtg-aaaattctcataagattgtgaggagtggattagcccatattgggtgaacca 11043908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 89
Target Start/End: Original strand, 24794148 - 24794214
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa 89  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24794148 aaggtgtaagcctgatgaggctaagataatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggttgtaa 24794214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 20649627 - 20649571
Alignment:
Q  100 aggttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccc 159  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  20649627 aggttgtctcaaacatcatagtgg-aaactctcaca--attgtaaggagtgcactaaccc 20649571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0811 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0811
Description:

Target: scaffold0811; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2669 - 2505
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaa 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||     |||||||||||||||||||    
T  2669 agcaagaaggtgcaatcctgctgaggcttagagaatacagttgatgtaattgttcagttgaacaacattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaa 2570  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||    
T  2569 gcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacattgaatgaaccacta 2505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0313
Description:

Target: scaffold0313; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 6480 - 6638
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||     |||||||| |||||||||| |||||    
T  6480 aaggtgtaagcctgctgaggctaagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatca 6579  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6580 tagtggaaaa-tctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 6638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 10262 - 10420
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||     |||||||| |||||||||| |||||    
T  10262 aaggtgtaagcctgctgaggctaagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatca 10361  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10362 tagtggaaaa-tctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 10420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 148
Target Start/End: Original strand, 20637 - 20766
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||     || |||||||| |||||||||| |||||    
T  20637 aaggtgtaagcctgctgaggctaagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatca 20736  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggag 148  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20737 tagtggaaaa-tctcacaagattgtgaggag 20766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 34766068 - 34766226
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||     |||||||| |||||||||| |||||    
T  34766068 aaggtgtaagcctgctgaggctaagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatca 34766167  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34766168 tagtggaaaa-tctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 34766226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 1597862 - 1598027
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaag-attgtaaagta-----tttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||      |||||||||||||||||    
T  1597862 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagatgttgtaattgttcatgtgaacaaggattgtaaggtgcagggtttgagaggttatctca 1597961  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1597962 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 1598027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22222840 - 22222675
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  22222840 agcaagaaagtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagttggcgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 22222741  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  22222740 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaactcacattgggggaaccacta 22222675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22248675 - 22248510
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  22248675 agcaagaaagtgcaagcctgctgaggcttagagaatacagttggcgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 22248576  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  22248575 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaactcacattgggggaaccacta 22248510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 9034121 - 9034284
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||| || ||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||    
T  9034121 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga-gttgtaattgttcgggcgaacaagattgtaaattgcaggatttgagaggttatctcaa 9034219  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  9034220 acatcatagtggaaa-ctcccacaagattgtgtggagtggactaactcacattgggtgaaccacta 9034284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 24692521 - 24692679
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||     |||||||| |||||||||| |||||    
T  24692521 aaggtgtaagcctgctgaggctaagagagtacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggttgtaaggtgcatgatttgagaagttatctcaagcatca 24692620  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24692621 tagtggaaaa-tctcacaagattgtgaggagttgactaacccacattgggtgaaccacta 24692679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 29541150 - 29541314
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga--tgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     | ||||||||||||||    
T  29541150 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaataca---gaattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatct 29541246  T
Q  109 caaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  29541247 caagcatcatagtg-aaaactctcacaagattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 29541314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24921354 - 24921191
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  24921354 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 24921256  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24921255 gcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 24921191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24930390 - 24930227
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  24930390 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 24930292  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24930291 gcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 24930227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 31358266 - 31358429
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  31358266 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 31358364  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  31358365 gcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 31358429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 31367996 - 31368159
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||||||||||||    
T  31367996 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 31368094  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  31368095 gcatcttagtgg-aaactctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 31368159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 175
Target Start/End: Original strand, 16322026 - 16322188
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaac-aagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  16322026 agcaacaaggtgcaagcctgttgaggcttagagaatacataat-tgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtacatgatttgagaggttatctca 16322124  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac 175  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16322125 agcatcatagtgg-aaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccac 16322188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 175
Target Start/End: Original strand, 16334174 - 16334336
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaac-aagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  16334174 agcaacaaggtgcaagcctgttgaggcttagagaatacataat-tgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtacatgatttgagaggttatctca 16334272  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac 175  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16334273 agcatcatagtgg-aaactctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccac 16334336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 3286551 - 3286714
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  3286551 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 3286648  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3286649 agcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 3286714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 12455758 - 12455921
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  12455758 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 12455855  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12455856 agcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 12455921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 14792307 - 14792470
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  14792307 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 14792404  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  14792405 agcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactatcccacattgggtgaaccacta 14792470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 16898651 - 16898814
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  16898651 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 16898748  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16898749 agcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 16898814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 18160766 - 18160929
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  18160766 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 18160863  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18160864 agcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 18160929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 18170578 - 18170741
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  18170578 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaa--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 18170675  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18170676 agcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 18170741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 20912987 - 20913150
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  20912987 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 20913084  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  20913085 agcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 20913150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26019767 - 26019603
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga--tgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatct 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||    
T  26019767 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaataca---gaattgtaactgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatct 26019671  T
Q  109 caaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26019670 caagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 26019603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 18202251 - 18202415
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  18202251 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagaaaatacaga-gttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaagatttgagaggttatctca 18202349  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  18202350 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattggggaaaccacta 18202415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 177
Target Start/End: Original strand, 19363790 - 19363937
Alignment:
Q  34 ctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaac 128  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||     ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19363790 ctgctgaggctaagagaatacatttgttgaaattgttcaggcgaacaagattgtaaggtgcatgatttgagaggttatctcaagcatcatagtg-aaaac 19363888  T
Q  129 tctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  19363889 tctcacaatattgtgagaagtggactaacccacattgggcgaaccacta 19363937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 16909304 - 16909467
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  16909304 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtaaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 16909401  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16909402 agcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 16909467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 17826556 - 17826720
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | | ||||||||||||||||||| |||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  17826556 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga-gttataattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 17826654  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  17826655 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacgttgggtgaaccacta 17826720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 8562646 - 8562498
Alignment:
Q  30 aagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatcatagtgga 124  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||     |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8562646 aagcctgctgaggctaagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatcatagtgga 8562547  T
Q  125 aaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaacca 174  Q
    ||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  8562546 aaa-tctcacaaaactgtgaggagtggactaacccacattgggggaacca 8562498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 20968552 - 20968710
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     | ||||||||||||||||| || |    
T  20968552 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga-gttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaagcacc 20968650  T
Q  117 atagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  20968651 atagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacgttgggtgaaccacta 20968710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27786858 - 27786700
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||     | |||||||||||||||||  ||||    
T  27786858 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaatcgttgtaagtgttcaggtgaacaatattgtaaggtgcaagagttgagaggttatctcaagtatca 27786759  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||| |||||    
T  27786758 tagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccatattggatgaatcacta 27786700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 30657237 - 30657073
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  30657237 agcaacaaggtgcaagcgtgctgaggcttagagaatacagg-gttgtaagtgttcaggtgaacacatattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 30657139  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  30657138 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgagggaaccacta 30657073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18705682 - 18705506
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga--tgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatct 108  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||     ||||||||||||||||    
T  18705682 agcaacaaggtgtaatcctgctgaggcttagagaataca---gaattgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaggtgcaagatttgagaggttatct 18705586  T
Q  109 caaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  18705585 caagcatcatagttgaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 18705506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18711617 - 18711441
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga--tgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatct 108  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||     ||||||||||||||||    
T  18711617 agcaacaaggtgtaaacctgctgaggcttagagaataca---gaattgtaagtgttcaggtgaacacagattgtaaggtgcaagatttgagaggttatct 18711521  T
Q  109 caaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  18711520 caagcatcatagttgaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccactataaatttctgtg 18711441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 26169119 - 26169283
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga--tgtaattgttcaggtgaacaag-attgtaaagt-----atttgagaggttatct 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| |||||||| ||||| | ||||||| ||     ||||||||||||||||    
T  26169119 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaataca---gaattgtaagtgttcaggagaacacggattgtaaggtgcaggatttgagaggttatct 26169215  T
Q  109 caaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26169216 caagcatcatagtggaga-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 26169283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Original strand, 15504139 - 15504300
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaac-aagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||     ||||||| ||||||||||    
T  15504139 agcaagaaggtggaagcctgctgaggcttagagaatatatgtgttgtaattgttcagctgaacaaagattgtaaggtgcaagatttgagtggttatctca 15504238  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaacc 173  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||  ||| ||||||||    
T  15504239 agcatcatagtgg-aaactctcacaagattgtgggaagtggactagcccatattaggtgaacc 15504300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12989135 - 12989052
Alignment:
Q  93 atttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12989135 atttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 12989052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 790381 - 790217
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| || | ||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  790381 agcaacaagttgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgagcacaaattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 790283  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  790282 agcatcatagtggaaa-ctctcacaaaattgtgaggagtggactaacccacattggaggaaccacta 790217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 7754000 - 7753917
Alignment:
Q  93 atttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7754000 atttgagaggttatctaaaacatcatagaggaaa-ctcacacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 7753917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Original strand, 18335663 - 18335794
Alignment:
Q  61 tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggacta 155  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||     ||||||||  |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18335663 tgtaattgttcaggtgaa-aaggttgtaaggtgtaggatttgagaaattatcttaagcatcatagtggaaaa-tctcacaagattgtgaggagtggacta 18335760  T
Q  156 accctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    |||| |||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  18335761 acccacattggttgaacctctataaatttctgtg 18335794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 6314763 - 6314680
Alignment:
Q  93 atttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||||   ||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||| ||||    
T  6314763 atttgagagggtatctcaagcatcataatggaatt-tctcacaagattgtgaggagtagattatcccacattgggtgaactacta 6314680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 177
Target Start/End: Original strand, 28093346 - 28093491
Alignment:
Q  30 aagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaaacatcatagtgga 124  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||  |  |||| ||||||||||||||||||||||||     || ||||||||    ||||||| ||||| ||| ||    
T  28093346 aagcctgccgagacttagagaatacaggt--tgtagttgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggatttgaga----atctcaagcatcacagt-ga 28093438  T
Q  125 aaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| || |||   || ||||||||||||    
T  28093439 aaattctcacaagattgtgaggagtggattagcccatgttaggtgaaccacta 28093491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 7754081 - 7754043
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaataca 55  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7754081 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaataca 7754043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 9760794 - 9760731
Alignment:
Q  106 tctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaac 172  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| | |||| |||||    
T  9760794 tctcaagcatcgtagtggaaaactctcac---attgtgaggagtggactagcccacgttggatgaac 9760731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 8131 - 8290
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaag-attgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||     ||||||||||||||||||||||||    
T  8131 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatgttgtgtaattgttcaagtgaacaaggattgtaaggtgccagatttgagaggttatctcaaacatc 8230  T
Q  117 atagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8231 ataatggaaa-ctctcataagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 8290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 87; Significance: 6e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 204 - 40
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  204 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaaaat-tgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaagatttgagaggttatctca 106  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  105 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 40  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 233352 - 233189
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  233352 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 233255  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  233254 agcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 233189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 147411 - 147575
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  147411 agcaggaaggtgcaagcatgctgaggcttagagaatacataat-tgtaattgttcagttgaacaaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 147509  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  147510 aacatcatagta-ataactctcagaagattgtgaggagtggactaaccgacattggatgaaccacta 147575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 65 - 229
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  65 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga-gttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 163  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  164 agcaccatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacgttgggtgaaccacta 229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 19475 - 19639
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  19475 agcaacaaggtgcaagcctactgaggcttagagaatacataat-tgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 19573  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  19574 ggcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 19639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 82; Significance: 6e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 7206 - 7043
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||| |||||||||||||| ||     | |||||||||||||||||    
T  7206 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggag-tgtaattgttcaggagaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctcaa 7108  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7107 gcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 7043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 111132 - 110968
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga--tgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatct 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||| |||||||  ||     ||||||||||||||||    
T  111132 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaataca---gaattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtatggtgcaggatttgagaggttatct 111036  T
Q  109 caaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  111035 caagcatcatagtgaaaaa-tctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 110968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 309383 - 309220
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  309383 agcaagaaggtgcaagcctgttgaggcttagagaatacag--gattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 309286  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  309285 agcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 309220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 217364 - 217528
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaa-----agtatttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||| | ||||||     || |||| |||||||||||||    
T  217364 agcaagaaggtgcaagccagttgtggcttagagaatacatg-gttataattgttcaggtgaacaaaggttgtaagatgcaggatttaagaggttatctca 217462  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |  |||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||    
T  217463 agtatcatagttgaaa-ctctcataggattgtgaggagtggaccagcccacattaggtgaaccacta 217528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0591 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0591
Description:

Target: scaffold0591; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 1653 - 1818
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaac-aagattgtaa-----agtatttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||| ||     || |||||||| |||||||||    
T  1653 agcaagaaggtgcaagcctgctgaagcttagagaatacatgtgctgtaattgttcaagtgaacaaagattgcaaggtgcaggatttgagaagttatctca 1752  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  |||||||||||    
T  1753 agcatcatagtgg-aaactctcacaagattgtgaggagttgactagcccacattcagtgaaccacta 1818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0591; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 95 - 177
Target Start/End: Original strand, 1 - 82
Alignment:
Q  95 ttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1 ttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 82  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 8841 - 9005
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  8841 agcaataaggtgcaagcttgctgaggcttagagaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacatattgtaaggtgcatgatttgagaggttatctca 8939  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  8940 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 9005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 74091 - 73927
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     | ||||||| ||||||||    
T  74091 agcaacaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaga-gttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggttcaggacttgagagattatctca 73993  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  73992 agcaccatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacgttgggtgaaccacta 73927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 16149 - 16313
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaa 111  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||     | |||||||||||||||||    
T  16149 agcaagaaggagcaagcctgttgacgcttagagaatacagttgttgtacttgttcagctgaacaagattgtaaggtgcaggaattgagaggttatctcaa 16248  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||    
T  16249 gcatcataggggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccatattgggttaaccacta 16313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 77; Significance: 6e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18727 - 18563
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgat-gtaattgttcaggtgaacaag-attgtaaagt-----atttgagaggttatctc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||     | |||||||||||||||    
T  18727 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaa--gattgtaattgttcaggtgaacaaggattgtaaggtgcgggacttgagaggttatctc 18630  T
Q  110 aaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    || |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18629 aagcatcttagtggaaa-ctctcacaggattgtggggagtggactagcccacattgggtgaaccacta 18563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 77; Significance: 6e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 6359 - 6208
Alignment:
Q  30 aagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatcatagtgga 124  Q
    ||||||||||||| || |||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||| ||     ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  6359 aagcctgctgaggttttgagaatacaggtgttgtaattgttcaggtgaacaaggttgtaaggtgtaggatttgagaggttatctcaagcattatagtgga 6260  T
Q  125 aaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  6259 aa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacattggatgaaccacta 6208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 75; Significance: 9e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 55208 - 55044
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  55208 agcaacaaggtgcaagtctgctgaggcttagagaatacaga-gttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggacttgagaggttatctca 55110  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  55109 agcaccatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagcccacgttgggtgaaccacta 55044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 73; Significance: 1e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 28371 - 28213
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||   | ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||     ||||||||||||||||||| ||||    
T  28371 aaggtgcaagcctgctgaggcttagaaaatacaga-gttgtaagtgttcaggtgaacacatattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagcatc 28273  T
Q  117 atagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  28272 atagtggaaa-ctctcacaagactgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 28213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 49581 - 49417
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |   | ||||  |||||||||||||| | ||||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  49581 agcaacaaggtgcaagtctgctgaggcttagaaaatataga-gttgtatgtgttcaggtgaacacatattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctca 49483  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  49482 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagactgtaaggtgtggactaacccacattgggggaaccacta 49417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 39926 - 39768
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||     |||||||| |||||||||| |||||    
T  39926 aaggtgtaagcatgttgaggcttagagaatatagttattgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggtgcgtgatttgagaagttatctcaagcatca 39827  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | ||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  39826 tcgtggaaaaa-ctcacaagattgtgagaaggggactaacccacattgggtgaaccacta 39768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0764 (Bit Score: 70; Significance: 9e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0764
Description:

Target: scaffold0764; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 129 - 1
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctcaaacatca 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||     || |||||||| |||||||||| |||||    
T  129 aaggtgtaagcctgctgaggctaagagaatacagttgttgtaattgttcaggtgaacaaggttgtaaggtgcaggatttgagaagttatctcaagcatca 30  T
Q  118 tagtggaaaactctcacaagattgtgagga 147  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29 tagtggaaaa-tctcacaagattgtgagga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 174
Target Start/End: Original strand, 55354 - 55504
Alignment:
Q  26 gtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatcata 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||     |||||||||||||||||||||||||||    
T  55354 gtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggttgtgtaattgttcaggtgaacgtagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaaacatcata 55453  T
Q  120 gtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaacca 174  Q
    |||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  55454 gtgg-aaactctcac---attgtgaggagtggactaacccacattgaatgaacca 55504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 174
Target Start/End: Original strand, 59303 - 59453
Alignment:
Q  26 gtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatcata 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||     |||||||||||||||||||||||||||    
T  59303 gtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggttgtgtaattgttcaggtgaacgtagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaaacatcata 59402  T
Q  120 gtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaacca 174  Q
    |||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  59403 gtgg-aaactctcac---attgtgaggagtggactaacccacattgaatgaacca 59453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 174
Target Start/End: Original strand, 60731 - 60881
Alignment:
Q  26 gtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaaca-agattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatcata 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||     |||||||||||||||||||||||||||    
T  60731 gtgcaagcctgctgaggcttagagaatacaggttgtgtaattgttcaggtgaacgtagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaaacatcata 60830  T
Q  120 gtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaacca 174  Q
    |||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  60831 gtgg-aaactctcac---attgtgaggagtggactaacccacattgaatgaacca 60881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 8815 - 8979
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||||| | ||     | ||||||||||||||||    
T  8815 agcaacaaggtgcaagtcttctgaggcttagagaatacaga-gttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtgaggtgcaggacttgagaggttatctca 8913  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||    
T  8914 aacaccatagtg-aaaactctcacaagattgtgaggagtggactagtccacgttgggtgaaccacta 8979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0265
Description:

Target: scaffold0265; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 177
Target Start/End: Original strand, 11998 - 12155
Alignment:
Q  26 gtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaa-ttgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaaacatcat 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  |  ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||     |||||||||||||||||||  |||||    
T  11998 gtgcaagcctggtgaggcttagagaatacaggttgtgtaaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggatttgagaggttatctcaagtatcat 12097  T
Q  119 agtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  12098 agtggaaa-ctttcacaagattgggaggagtggactaacccacattgggtgtaccacta 12155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 187
Target Start/End: Original strand, 19753 - 19848
Alignment:
Q  93 atttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19753 atttgagaagttatctcaagcatcatagtggaaaa-tctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 19848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 65; Significance: 9e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 395142 - 395059
Alignment:
Q  93 atttgagaggttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  395142 atttgagaggttatctcaagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggggaaccacta 395059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 64; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 92242 - 92078
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga--tgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaaagt-----atttgagaggttatct 108  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     | |||| |||||||||    
T  92242 agcaacaaggtgcaagcctactgaggcttagagaataca---gaattgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaaggtgcaggacttgataggttatct 92146  T
Q  109 caaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||    
T  92145 caagcaccatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactagctcacgttgggtgaaccacta 92078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360 (Bit Score: 60; Significance: 8e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 187
Target Start/End: Original strand, 972 - 1149
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgc-aagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa-----agtatttgagaggttatctca 110  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||     || | |||||||| |||||||    
T  972 agcaagaaagtgctaagcctgttgaggcttacagaatatagttgttgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaggcgcaggagttgagagggtatctca 1071  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| || ||  | ||| |||||||||  ||||||||||||    
T  1072 agcatcatagtgg-aaattctcacaagattgtgaggaatggattagcctacgttgagtgaaccactataaatttctgtg 1149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 59; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1321 - 1157
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaa-----agtatttgagaggttatctca 110  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||| | ||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||||     || | || |||||||||||||    
T  1321 agcaacaaggtgcaaggctgttgaggcttatataatacaga-gttgtaattgttcaggtgaacaaagattgtaagatgcaggacttcagaggttatctca 1223  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  1222 agcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgttaggagtggactatcccacgttgggtgaaccacta 1157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 30926 - 30843
Alignment:
Q  105 atctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac--taaatttctgtg 187  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  30926 atctcaagcatcatagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccactataaatttctgtg 30843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 55; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 364 - 208
Alignment:
Q  23 aaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaag-attgtaa-----agtatttgagaggttatctcaaacatc 116  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||||||   | |||||||||| ||||||||||  |||||||     || | ||||||||||||||||| ||||    
T  364 aaggtgcaagccagctgaaccttagagaatacaga-gttgtaattgtttaggtgaacaaatattgtaagatgcaggacttgagaggttatctcaagcatc 266  T
Q  117 atagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccac 175  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||    
T  265 atagtggaaa-ctctcacaagattgtgaggagttgactagcccacgttgggtgaaccac 208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 54; Significance: 3e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 196754 - 196590
Alignment:
Q  19 caagaaggt-gcaagcctgctgaggcttagagaatacatttga-tgtaattgttcaggtgaacaagattgtaaagt-----atttgagaggttatctcaa 111  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||  ||||||| | ||||   |||||||||     || ||||| | ||||||||    
T  196754 caagaaggttgcaagcctgccgaggcttagagaatacaattgtgtgtatatgttcagattaacatttttgtaaagtgaaggatctgagaaggtatctcaa 196655  T
Q  112 acatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  196654 ataccatagtgtaaa-ctctcacaagattgtgaggagtggactaacccacattgggtgaaccacta 196590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 190028 - 189983
Alignment:
Q  132 cacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  190028 cacaagattgcgaggagtggactaacccatattgggtgaaccacta 189983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 177
Target Start/End: Original strand, 67013 - 67087
Alignment:
Q  102 gttatctcaaacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    ||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  67013 gttatctgaagcatcatagtg-aaaattctcacaagattgtgaggagtgtactaacccacattgagtgaaccacta 67087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 89
Target Start/End: Original strand, 66263 - 66322
Alignment:
Q  30 aagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaagattgtaa 89  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  66263 aagcctgatgagtcttagagaatacaattattgtaattgtttaagtgaacaagattgtaa 66322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 28139 - 27975
Alignment:
Q  17 agcaagaaggtgcaagcctgctgaggcttagagaatacatttgatgtaattgttcaggtgaacaa-gattgtaa-----agtatttgagaggttatctca 110  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||   | |||||||  |||||||||||| ||||||||     || ||||||  |||||| |||    
T  28139 agcaagaaggtgcgagcctactgaggcttaaagaatacagg-gttgtaattactcaggtgaacaaagattgtaagatgcaggatttgaagggttatgtca 28041  T
Q  111 aacatcatagtggaaaactctcacaagattgtgaggagtggactaaccctcattgggtgaaccacta 177  Q
    | |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||  ||||| |||| |||||    
T  28040 agcatcatagtggaaa-ctctgacaagattgcgaggagtggactagcccaaattggatgaagcacta 27975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University