View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5580_low_11 (Length: 204)

Name: NF5580_low_11
Description: NF5580
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5580_low_11
NF5580_low_11
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (1-204)||(6565-6768)
scaffold0621 (1-204)||(8496-8703)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (1-204)||(5673-5876)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (1-204)||(19294-19498)
[»] chr7 (59 HSPs)
chr7 (1-204)||(18005676-18005880)
chr7 (1-204)||(67775-67978)
chr7 (1-204)||(44014208-44014408)
chr7 (1-204)||(16219604-16219808)
chr7 (1-194)||(47831837-47832030)
chr7 (3-204)||(16056360-16056561)
chr7 (1-194)||(811029-811222)
chr7 (2-204)||(22072944-22073149)
chr7 (1-204)||(12901353-12901558)
chr7 (1-204)||(15754776-15754978)
chr7 (1-138)||(34200816-34200951)
chr7 (1-138)||(16495432-16495567)
chr7 (1-138)||(11995983-11996118)
chr7 (1-94)||(12255789-12255884)
chr7 (1-138)||(28505254-28505389)
chr7 (1-148)||(2280061-2280210)
chr7 (79-190)||(9389599-9389709)
chr7 (1-131)||(13647355-13647487)
chr7 (1-204)||(20220076-20220279)
chr7 (1-161)||(1867924-1868086)
chr7 (1-97)||(38227511-38227606)
chr7 (1-157)||(14044776-14044935)
chr7 (1-157)||(14354806-14354965)
chr7 (1-148)||(19486686-19486835)
chr7 (1-97)||(10063813-10063909)
chr7 (1-97)||(18456408-18456503)
chr7 (1-131)||(18430739-18430870)
chr7 (1-93)||(3564363-3564455)
chr7 (9-97)||(26212034-26212122)
chr7 (1-97)||(12698861-12698958)
chr7 (1-148)||(15008441-15008590)
chr7 (3-93)||(48273421-48273511)
chr7 (1-131)||(456348-456479)
chr7 (1-131)||(11393291-11393422)
chr7 (1-131)||(11972523-11972654)
chr7 (1-131)||(14949126-14949257)
chr7 (1-131)||(15376717-15376848)
chr7 (1-131)||(16232547-16232678)
chr7 (1-131)||(18640299-18640430)
chr7 (1-131)||(20385127-20385258)
chr7 (1-131)||(21189599-21189730)
chr7 (1-131)||(24702265-24702396)
chr7 (1-131)||(27216887-27217018)
chr7 (1-131)||(32125518-32125649)
chr7 (1-131)||(41522944-41523075)
chr7 (1-131)||(41525406-41525537)
chr7 (1-97)||(9509219-9509315)
chr7 (140-204)||(16324175-16324239)
chr7 (1-131)||(17061919-17062050)
chr7 (1-90)||(10589069-10589158)
chr7 (1-131)||(16410086-16410217)
chr7 (1-131)||(24704715-24704843)
chr7 (1-93)||(24275198-24275289)
chr7 (4-90)||(40443424-40443509)
chr7 (1-131)||(44116536-44116667)
chr7 (1-93)||(15144037-15144128)
chr7 (1-97)||(16386242-16386339)
chr7 (56-92)||(16324135-16324171)
chr7 (1-41)||(27847881-27847921)
[»] chr2 (47 HSPs)
chr2 (1-204)||(25175880-25176084)
chr2 (1-204)||(28406006-28406211)
chr2 (1-204)||(7619-7824)
chr2 (1-204)||(18786789-18786994)
chr2 (1-132)||(7679615-7679746)
chr2 (1-125)||(22134175-22134297)
chr2 (1-204)||(23207307-23207512)
chr2 (52-204)||(23791356-23791509)
chr2 (1-138)||(23071905-23072040)
chr2 (1-131)||(19671860-19671991)
chr2 (1-131)||(22105439-22105571)
chr2 (5-148)||(23708561-23708706)
chr2 (52-204)||(25108970-25109123)
chr2 (1-97)||(298809-298906)
chr2 (52-160)||(24697536-24697645)
chr2 (1-131)||(20520152-20520284)
chr2 (1-97)||(23060543-23060639)
chr2 (1-131)||(18808970-18809101)
chr2 (1-131)||(23130889-23131020)
chr2 (1-131)||(23133356-23133487)
chr2 (1-131)||(23709536-23709667)
chr2 (1-131)||(23712017-23712148)
chr2 (1-131)||(24367801-24367932)
chr2 (1-131)||(34402526-34402657)
chr2 (1-131)||(39682340-39682471)
chr2 (1-97)||(23076472-23076568)
chr2 (1-97)||(23654381-23654477)
chr2 (1-69)||(38138-38205)
chr2 (1-128)||(23135617-23135745)
chr2 (1-131)||(571424-571555)
chr2 (1-131)||(6726022-6726153)
chr2 (1-90)||(20309138-20309225)
chr2 (1-131)||(21155064-21155195)
chr2 (1-148)||(22413078-22413229)
chr2 (1-131)||(28577126-28577257)
chr2 (1-131)||(32039502-32039633)
chr2 (1-97)||(22731229-22731325)
chr2 (1-97)||(23285895-23285987)
chr2 (1-125)||(23004778-23004905)
chr2 (1-93)||(23103396-23103486)
chr2 (9-97)||(23660061-23660148)
chr2 (1-131)||(24898199-24898331)
chr2 (1-131)||(24900682-24900814)
chr2 (1-131)||(24903159-24903291)
chr2 (1-131)||(24905636-24905768)
chr2 (1-131)||(24908111-24908243)
chr2 (1-131)||(32214925-32215056)
[»] chr1 (40 HSPs)
chr1 (1-204)||(22921756-22921960)
chr1 (1-204)||(33681037-33681241)
chr1 (1-132)||(22237657-22237789)
chr1 (1-125)||(21754075-21754198)
chr1 (1-204)||(21861456-21861661)
chr1 (1-204)||(52927869-52928061)
chr1 (1-148)||(20248309-20248454)
chr1 (1-185)||(21896162-21896347)
chr1 (1-138)||(14295507-14295642)
chr1 (1-138)||(20918634-20918769)
chr1 (52-204)||(50686694-50686847)
chr1 (1-204)||(50614002-50614208)
chr1 (1-204)||(50621830-50622036)
chr1 (79-194)||(35981586-35981700)
chr1 (1-149)||(21161746-21161892)
chr1 (1-194)||(16368184-16368377)
chr1 (1-194)||(41049933-41050127)
chr1 (79-152)||(49261448-49261521)
chr1 (1-160)||(16758679-16758841)
chr1 (79-190)||(20636957-20637067)
chr1 (1-84)||(35261086-35261169)
chr1 (1-131)||(45574846-45574978)
chr1 (23-138)||(22130863-22130976)
chr1 (1-93)||(50210212-50210304)
chr1 (39-138)||(51130632-51130729)
chr1 (1-131)||(13988893-13989024)
chr1 (1-131)||(21475091-21475222)
chr1 (1-131)||(21923295-21923426)
chr1 (1-90)||(34509810-34509899)
chr1 (1-149)||(16093825-16093976)
chr1 (1-97)||(21026710-21026806)
chr1 (1-93)||(21840794-21840885)
chr1 (1-97)||(22532299-22532395)
chr1 (1-97)||(27250724-27250820)
chr1 (1-131)||(23593739-23593870)
chr1 (1-131)||(29298164-29298294)
chr1 (1-47)||(38801433-38801479)
chr1 (1-131)||(433039-433168)
chr1 (1-131)||(26064968-26065100)
chr1 (1-42)||(20847205-20847245)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (1-204)||(40061-40265)
scaffold0023 (1-204)||(100404-100608)
scaffold0023 (1-131)||(94438-94569)
scaffold0023 (1-131)||(44481-44613)
scaffold0023 (1-44)||(119905-119948)
scaffold0023 (1-48)||(101529-101576)
scaffold0023 (1-131)||(17444-17575)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (1-194)||(2543-2736)
[»] chr8 (54 HSPs)
chr8 (1-204)||(38855139-38855342)
chr8 (1-185)||(23760751-23760935)
chr8 (1-204)||(21673734-21673937)
chr8 (1-194)||(6520398-6520590)
chr8 (1-194)||(21285627-21285820)
chr8 (1-148)||(26355643-26355789)
chr8 (1-185)||(983312-983497)
chr8 (1-138)||(5866230-5866365)
chr8 (1-204)||(37116377-37116583)
chr8 (1-138)||(21491025-21491160)
chr8 (1-204)||(17266879-17267085)
chr8 (1-166)||(13508009-13508176)
chr8 (1-138)||(17140946-17141081)
chr8 (1-204)||(20498592-20498797)
chr8 (1-166)||(13597541-13597708)
chr8 (1-185)||(24353050-24353235)
chr8 (1-160)||(17439436-17439598)
chr8 (52-204)||(22364744-22364896)
chr8 (1-138)||(21249414-21249550)
chr8 (1-138)||(21255252-21255388)
chr8 (1-131)||(17612069-17612201)
chr8 (1-97)||(22626766-22626861)
chr8 (1-97)||(16092337-16092433)
chr8 (1-97)||(21918995-21919091)
chr8 (1-97)||(22875095-22875190)
chr8 (1-90)||(16199647-16199735)
chr8 (1-90)||(31971287-31971375)
chr8 (1-131)||(1484429-1484560)
chr8 (1-131)||(5853296-5853427)
chr8 (1-131)||(14409448-14409579)
chr8 (1-131)||(20046199-20046330)
chr8 (1-131)||(20403254-20403385)
chr8 (1-131)||(22001780-22001911)
chr8 (1-90)||(28649046-28649135)
chr8 (1-97)||(7372808-7372904)
chr8 (1-97)||(20536238-20536334)
chr8 (1-130)||(19801387-19801516)
chr8 (1-97)||(26219744-26219838)
chr8 (52-99)||(40492844-40492891)
chr8 (1-131)||(15203235-15203366)
chr8 (1-131)||(16413320-16413451)
chr8 (1-90)||(21395984-21396071)
chr8 (1-90)||(21790477-21790564)
chr8 (1-97)||(18818404-18818500)
chr8 (1-97)||(21923923-21924019)
chr8 (1-84)||(6759288-6759371)
chr8 (1-84)||(23406409-23406492)
chr8 (1-97)||(26225288-26225382)
chr8 (1-48)||(18879276-18879322)
chr8 (1-131)||(4483308-4483438)
chr8 (1-90)||(21389454-21389541)
chr8 (1-90)||(21778780-21778867)
chr8 (1-42)||(45131047-45131087)
chr8 (47-138)||(21383887-21383978)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1-204)||(14584-14788)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (29-194)||(2116-2281)
[»] chr5 (42 HSPs)
chr5 (1-204)||(21502042-21502247)
chr5 (1-204)||(21329384-21329588)
chr5 (1-204)||(26011922-26012126)
chr5 (1-204)||(21565572-21565776)
chr5 (1-204)||(20026827-20027032)
chr5 (1-137)||(22959489-22959623)
chr5 (4-148)||(19668931-19669073)
chr5 (1-138)||(19660791-19660926)
chr5 (1-204)||(22178106-22178312)
chr5 (1-131)||(22144079-22144211)
chr5 (79-138)||(21741486-21741545)
chr5 (1-72)||(36314607-36314678)
chr5 (1-97)||(21729059-21729155)
chr5 (1-97)||(21808384-21808480)
chr5 (23-125)||(29448054-29448159)
chr5 (1-97)||(23390491-23390587)
chr5 (1-148)||(40725883-40726032)
chr5 (1-97)||(22075049-22075145)
chr5 (2-93)||(9077983-9078074)
chr5 (1-97)||(22412214-22412309)
chr5 (1-97)||(24493599-24493694)
chr5 (1-131)||(264772-264903)
chr5 (1-96)||(8286838-8286934)
chr5 (1-131)||(10732944-10733075)
chr5 (1-131)||(11581203-11581334)
chr5 (1-131)||(29329961-29330092)
chr5 (1-131)||(39363411-39363542)
chr5 (1-97)||(1096497-1096593)
chr5 (1-97)||(13025341-13025436)
chr5 (1-97)||(13095525-13095620)
chr5 (1-131)||(20902012-20902144)
chr5 (1-95)||(25431424-25431518)
chr5 (1-131)||(20909039-20909170)
chr5 (1-90)||(24529250-24529339)
chr5 (1-131)||(42245369-42245500)
chr5 (1-77)||(21997549-21997625)
chr5 (1-97)||(25421562-25421658)
chr5 (37-97)||(20766115-20766175)
chr5 (1-131)||(29346007-29346138)
chr5 (1-43)||(37723933-37723975)
chr5 (1-42)||(21293020-21293060)
chr5 (1-41)||(26740697-26740736)
[»] chr3 (69 HSPs)
chr3 (1-204)||(15470954-15471157)
chr3 (1-204)||(16103810-16104013)
chr3 (1-194)||(14234517-14234712)
chr3 (1-204)||(16097358-16097562)
chr3 (1-190)||(12174164-12174350)
chr3 (1-125)||(32307707-32307830)
chr3 (1-124)||(49668044-49668167)
chr3 (1-122)||(9512950-9513067)
chr3 (1-122)||(9520925-9521042)
chr3 (1-138)||(13210283-13210418)
chr3 (8-125)||(1644642-1644757)
chr3 (1-204)||(37251054-37251259)
chr3 (1-148)||(52523669-52523820)
chr3 (1-97)||(27165277-27165373)
chr3 (1-148)||(24340665-24340814)
chr3 (1-97)||(23274717-23274813)
chr3 (79-152)||(1465350-1465423)
chr3 (1-97)||(12399239-12399335)
chr3 (9-97)||(53301545-53301634)
chr3 (1-204)||(22110238-22110443)
chr3 (1-131)||(43925988-43926121)
chr3 (1-148)||(37642207-37642356)
chr3 (1-97)||(42386440-42386536)
chr3 (80-204)||(49389517-49389642)
chr3 (1-97)||(14572619-14572714)
chr3 (1-97)||(21618476-21618570)
chr3 (1-97)||(36166625-36166719)
chr3 (1-93)||(606324-606417)
chr3 (1-90)||(18438564-18438653)
chr3 (1-131)||(43550482-43550614)
chr3 (1-97)||(14972884-14972980)
chr3 (1-97)||(17487886-17487982)
chr3 (1-97)||(17499368-17499464)
chr3 (1-148)||(22147467-22147616)
chr3 (33-148)||(2051141-2051260)
chr3 (1-69)||(11424783-11424850)
chr3 (1-97)||(24153204-24153299)
chr3 (1-131)||(7781351-7781482)
chr3 (1-131)||(8899121-8899252)
chr3 (1-131)||(16282815-16282946)
chr3 (1-131)||(17446659-17446790)
chr3 (1-131)||(17463205-17463336)
chr3 (1-131)||(17672653-17672784)
chr3 (1-131)||(29172587-29172718)
chr3 (1-131)||(34159353-34159484)
chr3 (1-131)||(38961895-38962026)
chr3 (1-131)||(45606911-45607042)
chr3 (1-131)||(53070657-53070788)
chr3 (1-131)||(55476518-55476649)
chr3 (1-97)||(13442304-13442400)
chr3 (1-97)||(43840962-43841058)
chr3 (9-97)||(14576828-14576915)
chr3 (1-40)||(28194720-28194759)
chr3 (1-128)||(28848618-28848746)
chr3 (1-131)||(9707611-9707742)
chr3 (1-131)||(12567587-12567718)
chr3 (1-131)||(13544052-13544183)
chr3 (1-131)||(16454285-16454416)
chr3 (1-90)||(20698437-20698526)
chr3 (1-93)||(6469178-6469269)
chr3 (1-97)||(23083356-23083452)
chr3 (1-97)||(26686917-26687013)
chr3 (1-93)||(40213720-40213811)
chr3 (141-204)||(43927304-43927367)
chr3 (1-88)||(55500969-55501055)
chr3 (1-131)||(13151794-13151926)
chr3 (1-131)||(13154259-13154391)
chr3 (1-131)||(10247727-10247858)
chr3 (1-93)||(25476384-25476476)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (1-204)||(62228-62429)
scaffold0028 (1-122)||(132688-132809)
scaffold0028 (1-131)||(134238-134369)
scaffold0028 (1-131)||(136707-136838)
scaffold0028 (1-131)||(139176-139307)
scaffold0028 (1-131)||(144114-144245)
scaffold0028 (1-131)||(141645-141776)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-204)||(10557-10761)
[»] chr4 (45 HSPs)
chr4 (1-194)||(39706187-39706379)
chr4 (1-204)||(12288096-12288301)
chr4 (1-125)||(12774037-12774160)
chr4 (1-157)||(13784-13942)
chr4 (1-94)||(52243192-52243287)
chr4 (1-204)||(43198439-43198646)
chr4 (1-138)||(15551847-15551982)
chr4 (1-204)||(53082038-53082243)
chr4 (6-204)||(8846391-8846606)
chr4 (79-190)||(15099457-15099567)
chr4 (79-190)||(15190424-15190534)
chr4 (1-204)||(46640342-46640547)
chr4 (9-138)||(16596686-16596813)
chr4 (1-93)||(16377522-16377612)
chr4 (1-97)||(23374354-23374450)
chr4 (1-97)||(8574864-8574958)
chr4 (1-131)||(44615315-44615446)
chr4 (1-97)||(16270231-16270326)
chr4 (1-131)||(12311-12442)
chr4 (1-90)||(7088907-7088996)
chr4 (1-131)||(15118356-15118487)
chr4 (1-131)||(18215278-18215409)
chr4 (1-131)||(19618176-19618307)
chr4 (1-131)||(44773091-44773222)
chr4 (1-131)||(52312537-52312668)
chr4 (1-97)||(7798804-7798900)
chr4 (1-97)||(12902787-12902883)
chr4 (1-97)||(14280343-14280438)
chr4 (1-97)||(22636465-22636561)
chr4 (1-97)||(54798749-54798845)
chr4 (1-97)||(6899921-6900016)
chr4 (1-97)||(16239965-16240060)
chr4 (1-96)||(52873363-52873458)
chr4 (1-131)||(44928883-44929015)
chr4 (1-97)||(7893733-7893829)
chr4 (1-93)||(14038678-14038770)
chr4 (53-94)||(15464929-15464970)
chr4 (1-97)||(44052859-44052955)
chr4 (1-48)||(3096323-3096369)
chr4 (1-88)||(14053306-14053392)
chr4 (1-36)||(17046517-17046552)
chr4 (1-128)||(18239426-18239554)
chr4 (1-131)||(1837513-1837644)
chr4 (1-131)||(19242726-19242857)
chr4 (1-42)||(17333307-17333347)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (1-204)||(2691-2897)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (1-194)||(12796-12989)
[»] chr6 (52 HSPs)
chr6 (3-204)||(23019438-23019640)
chr6 (1-204)||(19652225-19652427)
chr6 (30-204)||(22080626-22080800)
chr6 (1-204)||(19668401-19668606)
chr6 (1-204)||(1561333-1561535)
chr6 (1-138)||(28496427-28496562)
chr6 (1-138)||(29808838-29808973)
chr6 (1-139)||(9098465-9098605)
chr6 (1-72)||(27333238-27333309)
chr6 (1-72)||(27393978-27394049)
chr6 (1-126)||(20109168-20109295)
chr6 (1-86)||(4185827-4185912)
chr6 (1-86)||(4186397-4186482)
chr6 (1-144)||(31155346-31155488)
chr6 (1-97)||(16496274-16496370)
chr6 (26-86)||(4668217-4668277)
chr6 (26-86)||(4675064-4675124)
chr6 (1-131)||(1595576-1595707)
chr6 (1-94)||(25644350-25644444)
chr6 (1-148)||(8227453-8227602)
chr6 (1-93)||(29060570-29060662)
chr6 (1-131)||(22782254-22782385)
chr6 (1-93)||(19303540-19303631)
chr6 (102-194)||(28103796-28103887)
chr6 (1-84)||(20076730-20076812)
chr6 (1-131)||(2291184-2291315)
chr6 (1-131)||(12742344-12742475)
chr6 (1-131)||(18334596-18334727)
chr6 (1-131)||(19005073-19005204)
chr6 (1-131)||(19858923-19859054)
chr6 (1-131)||(24422574-24422705)
chr6 (1-131)||(30676714-30676845)
chr6 (1-131)||(33861821-33861952)
chr6 (1-131)||(33864305-33864436)
chr6 (1-93)||(18409826-18409918)
chr6 (1-97)||(20360955-20361051)
chr6 (52-158)||(18696569-18696675)
chr6 (1-90)||(16920634-16920721)
chr6 (1-97)||(17287791-17287887)
chr6 (52-160)||(18706387-18706495)
chr6 (1-93)||(25629354-25629446)
chr6 (1-93)||(25688529-25688620)
chr6 (1-131)||(20556898-20557027)
chr6 (1-128)||(1540918-1541046)
chr6 (1-36)||(22831533-22831568)
chr6 (1-90)||(20638285-20638374)
chr6 (1-131)||(34963400-34963531)
chr6 (1-90)||(35245616-35245703)
chr6 (1-93)||(20593803-20593895)
chr6 (1-194)||(23076760-23076955)
chr6 (1-77)||(25656656-25656731)
chr6 (102-150)||(18896256-18896304)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (1-194)||(6021-6214)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (3-204)||(10428-10630)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (1-202)||(6641-6843)
scaffold0333 (1-202)||(14021-14223)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (1-204)||(32566-32769)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (1-148)||(22613-22761)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (1-204)||(129935-130139)
scaffold0010 (1-94)||(60713-60807)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (1-204)||(159-362)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (1-194)||(12969-13162)
scaffold0138 (52-204)||(18124-18277)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (1-204)||(6842-7043)
scaffold0556 (53-204)||(8097-8249)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (1-194)||(933-1125)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (1-194)||(1112-1305)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (1-204)||(160714-160917)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (1-148)||(45735-45883)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (1-204)||(7963-8165)
scaffold0218 (18-132)||(29242-29354)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (1-204)||(136254-136460)
scaffold0021 (1-204)||(144962-145168)
scaffold0021 (1-93)||(174796-174886)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (1-204)||(6169-6375)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (1-204)||(38346-38552)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (1-204)||(128856-129061)
scaffold0022 (1-204)||(78352-78556)
scaffold0022 (1-97)||(116457-116551)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (1-157)||(53482-53640)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (1-138)||(1025-1160)
[»] scaffold0046 (3 HSPs)
scaffold0046 (1-138)||(11322-11457)
scaffold0046 (1-138)||(2027-2162)
scaffold0046 (1-90)||(28444-28533)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-204)||(12598-12802)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (4-138)||(15694-15826)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (1-78)||(23897-23974)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (1-97)||(38697-38793)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (3-194)||(103536-103720)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (1-97)||(1062-1158)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (1-77)||(15792-15868)
scaffold0020 (159-204)||(15719-15765)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (1-204)||(97035-97241)
scaffold0006 (1-204)||(106313-106519)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (52-193)||(87-228)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (1-122)||(32128-32249)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (1-148)||(11494-11643)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (1-148)||(38198-38347)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (1-97)||(3146-3241)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (2-204)||(7945-8151)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (1-204)||(19771-19976)
scaffold0080 (1-97)||(39943-40038)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (1-148)||(17969-18118)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (1-131)||(25136-25268)
scaffold0123 (52-160)||(619-727)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (1-90)||(13158-13247)
scaffold0357 (1-94)||(16098-16191)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (1-97)||(39507-39602)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-97)||(75210-75305)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (1-93)||(3185-3277)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (1-94)||(27747-27840)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (26-86)||(9133-9193)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (1-138)||(34153-34288)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (1-90)||(4879-4968)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (1-97)||(44702-44798)
scaffold0122 (1-93)||(26064-26156)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-97)||(1881-1977)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (1-97)||(32952-33047)
scaffold0120 (1-97)||(45958-46053)
scaffold0120 (1-93)||(16143-16235)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-97)||(25926-26021)
scaffold0026 (1-97)||(39888-39983)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (52-193)||(1696-1836)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-97)||(13241-13337)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (1-93)||(17214-17308)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-131)||(20383-20513)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (1-204)||(580-784)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (29-138)||(2398-2505)
[»] scaffold0145 (2 HSPs)
scaffold0145 (1-97)||(32972-33067)
scaffold0145 (1-97)||(38791-38886)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-204)||(267690-267895)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (1-97)||(24297-24394)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-131)||(20774-20905)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (1-131)||(37848-37979)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (1-90)||(1319-1406)
scaffold0106 (1-90)||(7296-7383)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (1-90)||(51612-51699)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (1-131)||(158454-158585)
scaffold0003 (1-93)||(339949-340038)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (1-97)||(1982-2078)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-93)||(10800-10891)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (1-90)||(15466-15554)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (29-148)||(225465-225585)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (1-128)||(13419-13547)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (1-131)||(4721-4852)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (1-90)||(10427-10514)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (1-131)||(13974-14105)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (1-97)||(1043-1139)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (1-90)||(13527-13615)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (1-93)||(9269-9360)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (1-97)||(3500-3596)
scaffold0292 (1-97)||(373-468)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-90)||(32097-32184)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-97)||(51943-52039)
scaffold0011 (1-97)||(167973-168069)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (1-88)||(16312-16397)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (7-90)||(20946-21030)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (1-55)||(28806-28861)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (1-97)||(8528-8620)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (4-131)||(40430-40558)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (83-125)||(2261-2303)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (1-90)||(5132-5219)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (8-97)||(4544-4633)
scaffold0228 (8-97)||(12126-12215)
scaffold0228 (8-97)||(22078-22167)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (1-131)||(29959-30090)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-131)||(11315-11446)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (1-93)||(16599-16691)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (1-97)||(4554-4650)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (1-97)||(6116-6215)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (53-97)||(27912-27956)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (1-78)||(2705-2784)


Alignment Details
Target: scaffold0621 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 6565 - 6768
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6565 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaa 6664  T
Q  101 cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataacaactt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6665 cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataacaactt 6764  T
Q  201 agtt 204  Q
    ||||    
T  6765 agtt 6768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 8496 - 8703
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat-ca 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||    
T  8496 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattca 8595  T
Q  100 -acataattcatataatgtatatacaat--tatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aac 195  Q
     | ||||||||  |||||||||||||||  |||||  |||||  |||||||| |  ||||||  || ||| ||||||| || |||| ||||||||| |||    
T  8596 tatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaattcatatacat-cagtcttactggaacaacatcagcaagataaac 8694  T
Q  196 aacttagtt 204  Q
    |||||||||    
T  8695 aacttagtt 8703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 5673 - 5876
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5673 tcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtatgaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaa 5772  T
Q  101 cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataacaactt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  5773 cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataaaaactt 5872  T
Q  201 agtt 204  Q
    ||||    
T  5873 agtt 5876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 169; Significance: 8e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 19294 - 19498
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19294 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaa 19393  T
Q  101 cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaact 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  19394 cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcagggttactgaaacaacaacatcaagataaacaact 19493  T
Q  200 tagtt 204  Q
    |||||    
T  19494 tagtt 19498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 169; Significance: 8e-91; HSPs: 59)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 18005676 - 18005880
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18005676 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtatggaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaa 18005775  T
Q  101 cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaact 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18005776 cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaact 18005875  T
Q  200 tagtt 204  Q
    |||||    
T  18005876 tagtt 18005880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 67775 - 67978
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  67775 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaa-tatcaa 67873  T
Q  101 cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaact 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  67874 cataattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggctcactgaaacaacaacagcaagataaacaact 67973  T
Q  200 tagtt 204  Q
    |||||    
T  67974 tagtt 67978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 44014208 - 44014408
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||    
T  44014208 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac---atctcaaatatcaa 44014304  T
Q  101 cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataacaactt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44014305 cataattcatataatgtatatacagttatataccattaaaaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataacaactt 44014404  T
Q  201 agtt 204  Q
    ||||    
T  44014405 agtt 44014408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16219808 - 16219604
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||| |    
T  16219808 tcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcttaaacatcaa 16219709  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16219708 acataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-taattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaac 16219610  T
Q  199 ttagtt 204  Q
    ||||||    
T  16219609 ttagtt 16219604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 47831837 - 47832030
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| ||| |    
T  47831837 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcatatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaa 47831936  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  47831937 acataattcatataatgtatatacaattatataacattagcgacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataa 47832030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 204
Target Start/End: Original strand, 16056360 - 16056561
Alignment:
Q  3 atgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa-c 101  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |    
T  16056360 atgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgcaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcaaac 16056458  T
Q  102 ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaactt 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  16056459 ataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-tcattcaggcttaccgaaacaacaacatcaagataaacaactt 16056557  T
Q  201 agtt 204  Q
    ||||    
T  16056558 agtt 16056561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 811222 - 811029
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||| ||| |    
T  811222 tcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcattaacatcataaacatcaa 811123  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  811122 acataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaactacaacagcaagataa 811029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 22072944 - 22073149
Alignment:
Q  2 catgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||| | | ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||    
T  22072944 catgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcactatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaa 22073043  T
Q  101 -cataat-tcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaaga-taacaa 197  Q
     |||||  |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||    
T  22073044 acataaactcatgtaatgtatatgcaattatataacattaacaacaacattagattata-taattcaggcttactgaaacaacaacatcaagacaaacaa 22073142  T
Q  198 cttagtt 204  Q
    |||||||    
T  22073143 cttagtt 22073149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 12901353 - 12901558
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||| ||||  |  |||||||||||||||||| |||||||  || ||||||| |||  |||    
T  12901353 tcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaataattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacagcaacatcacaac-atc 12901451  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 196  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  12901452 atacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaatcata-taattcaagcttactgaaacaacaacaacaagataaaca 12901550  T
Q  197 acttagtt 204  Q
    ||||||||    
T  12901551 acttagtt 12901558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15754978 - 15754776
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||||||||| |    
T  15754978 tcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatcaa 15754882  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattaga-tcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 197  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| | ||||||  | |||| ||||||| ||||  ||||||||||| |||||    
T  15754881 acataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaaattcatatgca-tcagtcttactggaatattaacagcaagataaacaa 15754783  T
Q  198 cttagtt 204  Q
    |||||||    
T  15754782 cttagtt 15754776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 34200816 - 34200951
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| |||| |    
T  34200816 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcaa 34200912  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 138  Q
    || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  34200913 acttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 34200951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 16495432 - 16495567
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca- 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| |||||     
T  16495432 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcag 16495528  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 138  Q
    || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16495529 acttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 16495567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 11996118 - 11995983
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||   |||||||||| |    
T  11996118 tcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatattgaatgtaaatcaacaa---ctcaaatatcaa 11996022  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 138  Q
    || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11996021 acttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 11995983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 12255884 - 12255789
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  12255884 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagtcagtatgcaaatcaattcatgatataacaatatcaaatgaaattctacaacatctcaaa 12255789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 28505389 - 28505254
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||  || ||| |||   ||||| |||| |    
T  28505389 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcggatataaatcagcaa---ctcaattatcaa 28505293  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 138  Q
    || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  28505292 acttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 28505254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 2280210 - 2280061
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tca 99  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  2280210 tcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatattca 2280111  T
Q  100 -acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 148  Q
     | |||||||| |||||  ||||| ||||||||  |||||  ||||||||    
T  2280110 tatataattcaaataatacatataaaattatatcacattataaacaacat 2280061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 9389709 - 9389599
Alignment:
Q  79 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaat 178  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||  |||  ||| ||||||||||| |||    
T  9389709 tcaacaacatctcatatatcaacataattcatacaatgtatatacaattatataacattatcatcaatattagaatata-caatccaggcttactggaat 9389611  T
Q  179 aacaacagcaag 190  Q
     |||||| ||||    
T  9389610 gacaacatcaag 9389599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 13647355 - 13647487
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  13647355 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 13647453  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13647454 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 13647487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20220279 - 20220076
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||| ||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||| |||    
T  20220279 tcatacagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaa---atcaacatctcaaacatc 20220183  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-ca 196  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||  ||| |||||||||||| || |||||||| ||||||| ||    
T  20220182 atatataattcatgtaatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaaatcat-ctaaatcaggcttactggaacaacaacagtaagataagca 20220084  T
Q  197 acttagtt 204  Q
    ||||||||    
T  20220083 acttagtt 20220076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 1868086 - 1867924
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||    
T  1868086 tcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatgaacaacatctcaaacatc 1867988  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaa 161  Q
    | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | ||||| ||||    
T  1867987 atatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatcttaa 1867924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 38227511 - 38227606
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  38227511 tcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatat 38227606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 14044776 - 14044935
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa-caacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||   ||| ||  || ||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||| ||    
T  14044776 tcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaacagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaatcaacatctcaaacat 14044874  T
Q  98 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcata 157  Q
    || | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| ||||||    
T  14044875 catatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacattaaatcata 14044935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 14354806 - 14354965
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa-caacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||   ||| ||  || ||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||| ||    
T  14354806 tcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaacagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaatcaacatctcaaacat 14354904  T
Q  98 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcata 157  Q
    || | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| ||||||    
T  14354905 catatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacattaaatcata 14354965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 19486835 - 19486686
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaat-atca 99  Q
    ||||||||||||||||  |||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| ||||    
T  19486835 tcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatca 19486736  T
Q  100 -acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 148  Q
     | ||||||||  | ||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  19486735 catataattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 19486686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 10063909 - 10063813
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  10063909 tcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgcacaacatcatgatataataatatcgaacacaagtaaacaacatctcaaatat 10063813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 18456503 - 18456408
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18456503 tcatgcagcttagttaaataacgat-agcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatat 18456408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 18430739 - 18430870
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||  |||  |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||      
T  18430739 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattc 18430836  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18430837 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18430870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 3564455 - 3564363
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||| || |||||||||||||||    
T  3564455 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 3564363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 97
Target Start/End: Original strand, 26212034 - 26212122
Alignment:
Q  9 cttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  26212034 cttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 26212122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 12698861 - 12698958
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa--tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||   || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  12698861 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 12698958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 15008590 - 15008441
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||  |||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  15008590 tcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacacctcaaacatc 15008492  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 148  Q
    | | ||||||||  ||||| |||||||| |||||  |||||  ||||||||    
T  15008491 atatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacat 15008441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 93
Target Start/End: Original strand, 48273421 - 48273511
Alignment:
Q  3 atgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 93  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  48273421 atgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 48273511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 456348 - 456479
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  456348 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 456445  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  456446 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 456479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 11393422 - 11393291
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  11393422 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 11393325  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  11393324 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 11393291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 11972523 - 11972654
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  11972523 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 11972620  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  11972621 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 11972654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 14949257 - 14949126
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  14949257 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 14949160  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  14949159 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 14949126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 15376848 - 15376717
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  15376848 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 15376751  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15376750 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 15376717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 16232547 - 16232678
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  16232547 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 16232644  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16232645 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 16232678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 18640299 - 18640430
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  18640299 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 18640396  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18640397 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18640430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 20385258 - 20385127
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  20385258 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 20385161  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20385160 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20385127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21189730 - 21189599
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  21189730 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 21189633  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21189632 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 21189599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 24702265 - 24702396
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  24702265 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 24702362  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24702363 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24702396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 27216887 - 27217018
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  27216887 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 27216984  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  27216985 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 27217018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 32125518 - 32125649
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  32125518 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 32125615  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  32125616 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 32125649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 41522944 - 41523075
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  41522944 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 41523041  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  41523042 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 41523075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 41525406 - 41525537
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  41525406 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 41525503  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  41525504 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 41525537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 9509219 - 9509315
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| | || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  9509219 tcatgcagcttagttaaataa-caacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 9509315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 204
Target Start/End: Original strand, 16324175 - 16324239
Alignment:
Q  140 caacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtt 204  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16324175 caacaacattagattatac-aattcaggcttactgaaacaacaacagcaagatcaacaacttagtt 16324239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 17062050 - 17061919
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||  || |||||| ||||  | ||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||| |||||| ||| ||    
T  17062050 tcatgcagcttagttaaataacaatcagcaactcag-cagtatacaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaagtcagcaacgtctcaattattaa 17061952  T
Q  101 c--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    |  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17061951 catataattcaagtaatgcatatacaattatat 17061919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 10589069 - 10589158
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 90  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| | ||| || ||||| ||||  ||||| | ||||||||||||||||||    
T  10589069 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacatatgcagtatacaaaaacaacatgacataatcatatcaattgcaattcaacaacatct 10589158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 16410086 - 16410217
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  16410086 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 16410183  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  16410184 acatataattcaagtaatacatatacaattatat 16410217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 24704715 - 24704843
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||  | || || |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||  |    
T  24704715 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaa--aacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattca 24704810  T
Q  101 c--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    |  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24704811 catataattcaagtaatgcatatacaattatat 24704843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 24275198 - 24275289
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  24275198 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 24275289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 90
Target Start/End: Original strand, 40443424 - 40443509
Alignment:
Q  4 tgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 90  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||  |||| || ||||| |||| |||||| | | ||||||| ||||||||    
T  40443424 tgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaacaaa-cagcatgacataataatatcaatttcaattcatcaacatct 40443509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 44116536 - 44116667
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  44116536 tcatgcagcttggttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 44116633  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||   |||| ||||||||||||||    
T  44116634 acatataattcaagcaatgcatatacaattatat 44116667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 15144128 - 15144037
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||| | || || ||||| | |||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  15144128 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacat-ctcagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaacaacatctcaa 15144037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 16386339 - 16386242
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | || | |||| |||||||| ||||||    
T  16386339 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgtatttcatcaacatcttaaatat 16386242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Original strand, 16324135 - 16324171
Alignment:
Q  56 gatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctca 92  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16324135 gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctca 16324171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 27847921 - 27847881
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagt 41  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  27847921 tcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagt 27847881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 169; Significance: 8e-91; HSPs: 47)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 25175880 - 25176084
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25175880 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaa 25175979  T
Q  101 cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaact 199  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  25175980 cataattcatataacgtatatataattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaact 25176079  T
Q  200 tagtt 204  Q
    |||||    
T  25176080 tagtt 25176084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 28406006 - 28406211
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28406006 tcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca 28406105  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 198  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  28406106 acttaattcataaaatgtatatacaattatataccattaacaacaacaatagatcatattaaattaggcttactaaaacaacaacagcaagataaacaac 28406205  T
Q  199 ttagtt 204  Q
    ||||||    
T  28406206 ttagtt 28406211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7824 - 7619
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tca 99  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | |||    
T  7824 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattca 7725  T
Q  100 -acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 197  Q
     | ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||    
T  7724 tatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattaacaacaacattaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacaacatgataaacaa 7626  T
Q  198 cttagtt 204  Q
    |||||||    
T  7625 cttagtt 7619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18786994 - 18786789
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||  |||    
T  18786994 tcatgcagcttagttaaataacaatcagtaacataggtagtatgcaaaccagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaacaacgtcacaac-atc 18786896  T
Q  99 aa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 196  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  18786895 aaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaataacattcaatcata-taatttaggcttactgaaacaacaacagcatgataaaca 18786797  T
Q  197 acttagtt 204  Q
    ||||||||    
T  18786796 acttagtt 18786789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 7679615 - 7679746
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||  ||| ||| |    
T  7679615 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc-aatgtaagtcatcaacatcataaacatcaa 7679713  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatata 132  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7679714 acataattcatgtaatgtatatataattatata 7679746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 22134297 - 22134175
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||    
T  22134297 tcatgcagcttagttaaatatc-aacagcaacataggcagtatgcaaatcatcataatataacaatatcgaatgcaa-tcaataacatctcatttatcaa 22134200  T
Q  101 cataattcatataatgtatatacaa 125  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||    
T  22134199 cataatccatttaatgtatatacaa 22134175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 23207307 - 23207512
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||   |     
T  23207307 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgacatctcaacatta 23207406  T
Q  99 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caa 197  Q
     | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||  || |||||||| ||||||| |||    
T  23207407 taaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcata-taattcaggcttacttgaacaacaacagtaagataagcaa 23207505  T
Q  198 cttagtt 204  Q
    |||||||    
T  23207506 cttagtt 23207512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 204
Target Start/End: Original strand, 23791356 - 23791509
Alignment:
Q  52 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 150  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| || | | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| |    
T  23791356 tcatgatataaaaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatca 23791455  T
Q  151 gatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtt 204  Q
     |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23791456 aatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataaacaacttagtt 23791509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 23072040 - 23071905
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||   ||||| |||| |    
T  23072040 tcatgcagcttagttaaataacgaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatataaatcagcaa---ctcaattatcaa 23071944  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 138  Q
    || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23071943 acttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 23071905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 19671860 - 19671991
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca- 99  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||   |||     
T  19671860 tcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaatattcac 19671959  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    | ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  19671960 atataattcaagtaatgcatatacaattatat 19671991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 22105439 - 22105571
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  22105439 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacttctcaattattc 22105537  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22105538 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 22105571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 23708706 - 23708561
Alignment:
Q  5 gcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat--caaca 102  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||| ||   || |    
T  23708706 gcagcttagttaaataacagatagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaattgcaaatcatcgacatctcaaacattcaaata 23708607  T
Q  103 taattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 148  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  23708606 taattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 23708561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 52 - 204
Target Start/End: Original strand, 25108970 - 25109123
Alignment:
Q  52 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 150  Q
    |||||||||||||||||| ||   || ||||||| |||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||   ||||  |||||||| |    
T  25108970 tcatgatataacaatatcaaagcaaaatcaacaatatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatca 25109069  T
Q  151 gatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtt 204  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  25109070 aatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtt 25109123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 298906 - 298809
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  298906 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 298809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 24697645 - 24697536
Alignment:
Q  52 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 150  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | | ||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| |    
T  24697645 tcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatctcaaacttcatatacaattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacataa 24697546  T
Q  151 gatcatatta 160  Q
     |||||||||    
T  24697545 aatcatatta 24697536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 20520284 - 20520152
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  20520284 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagtacataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacatctcaaacatc 20520186  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    | | ||||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  20520185 atatataattcaagtaatgcatatacaaatatat 20520152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 23060543 - 23060639
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  23060543 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 23060639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 18808970 - 18809101
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  18808970 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 18809067  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18809068 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18809101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 23130889 - 23131020
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  23130889 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 23130986  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  23130987 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 23131020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 23133356 - 23133487
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  23133356 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 23133453  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  23133454 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 23133487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23709667 - 23709536
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  23709667 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 23709570  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  23709569 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 23709536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23712148 - 23712017
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  23712148 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 23712051  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  23712050 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 23712017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 24367801 - 24367932
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  24367801 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 24367898  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24367899 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24367932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 34402657 - 34402526
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  34402657 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 34402560  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  34402559 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 34402526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 39682340 - 39682471
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  39682340 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 39682437  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  39682438 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 39682471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 23076472 - 23076568
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  23076472 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaatatcttaaatat 23076568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 23654477 - 23654381
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| || ||||| |||||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  23654477 tcatgcagcttagttaaataa-caacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 23654381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 38205 - 38138
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 69  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  38205 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 38138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 23135617 - 23135745
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  23135617 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 23135714  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaatta 128  Q
    ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  23135715 acatataattcaagtaatgcatatacaatta 23135745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 571424 - 571555
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| | |      
T  571424 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattgttc 571521  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  571522 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 571555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 6726022 - 6726153
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||| || |||||||| |||||| |||      
T  6726022 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaagtcaacaacgtctcaattattc 6726119  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  6726120 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 6726153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 20309138 - 20309225
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 90  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||  || ||||| ||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  20309138 tcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacataattatatcaaattcaattcatcaacatct 20309225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21155195 - 21155064
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||| |||||| |||      
T  21155195 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacgtctcaattattc 21155098  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21155097 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 21155064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 22413229 - 22413078
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatat--cgaatgcaattcaacaacatctcaaata 96  Q
    ||||||| |||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| || |    
T  22413229 tcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatatcaaatgcaaatcaacaacatctc-aaca 22413131  T
Q  97 tca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 148  Q
    ||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||    
T  22413130 tcataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacat 22413078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 28577126 - 28577257
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||| || |||||||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||| |||      
T  28577126 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacgca-acagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaagccaacaacgtctcaattattc 28577223  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  28577224 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 28577257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 32039633 - 32039502
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  32039633 tcatgcagcttagttaaataa-caacagtaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 32039536  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  32039535 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 32039502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 22731325 - 22731229
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||| | ||||||    
T  22731325 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatattaaatat 22731229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 23285895 - 23285987
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||  | || || |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  23285895 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaa--aaca-gacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 23285987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 23004778 - 23004905
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||   |||  |  ||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  23004778 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggtagtacataaaatagttcaggatataataatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatc 23004877  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaa 125  Q
    | | ||||| || |||||| ||||||||    
T  23004878 atatataatccacataatgcatatacaa 23004905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 23103486 - 23103396
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 93  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| || |  ||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  23103486 tcatgcagcttagttaaataa-aaacagcaacataggcagtatacaaa-cagcatgacatgattatatcaaattcaattcatcaacatctcaa 23103396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 97
Target Start/End: Original strand, 23660061 - 23660148
Alignment:
Q  9 cttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| | || ||  |||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  23660061 cttagttaaacaac-aacagcaacataggcagtatacgaaacaggatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaacatcttaaatat 23660148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 24898331 - 24898199
Alignment:
Q  1 tcatgcagctt-agttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  24898331 tcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 24898234  T
Q  99 aacata--attcatataatgtatatacaattatat 131  Q
     |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24898233 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24898199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 24900814 - 24900682
Alignment:
Q  1 tcatgcagctt-agttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  24900814 tcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 24900717  T
Q  99 aacata--attcatataatgtatatacaattatat 131  Q
     |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24900716 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24900682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 24903291 - 24903159
Alignment:
Q  1 tcatgcagctt-agttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  24903291 tcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 24903194  T
Q  99 aacata--attcatataatgtatatacaattatat 131  Q
     |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24903193 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24903159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 24905768 - 24905636
Alignment:
Q  1 tcatgcagctt-agttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  24905768 tcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 24905671  T
Q  99 aacata--attcatataatgtatatacaattatat 131  Q
     |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24905670 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24905636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 24908243 - 24908111
Alignment:
Q  1 tcatgcagctt-agttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  24908243 tcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 24908146  T
Q  99 aacata--attcatataatgtatatacaattatat 131  Q
     |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24908145 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24908111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 32215056 - 32214925
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  32215056 tcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 32214959  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  32214958 acatataattcaagtaatgcatatataattatat 32214925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 169; Significance: 8e-91; HSPs: 40)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22921960 - 22921756
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22921960 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaa 22921861  T
Q  101 cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaact 199  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22921860 caaaattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaact 22921761  T
Q  200 tagtt 204  Q
    |||||    
T  22921760 tagtt 22921756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 33681037 - 33681241
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |    
T  33681037 tcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcgtcaacatctcaaatatcaa 33681136  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||  || ||||||| |||||| ||||||    
T  33681137 acataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactagaacaacaacaacaagataaacaac 33681235  T
Q  199 ttagtt 204  Q
    ||||||    
T  33681236 ttagtt 33681241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 22237657 - 22237789
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  22237657 tcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaa 22237756  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatata 132  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22237757 acataattcatgtaatgtatatacaattatata 22237789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 21754075 - 21754198
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21754075 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaattatcaa 21754173  T
Q  101 cataattcatataatgtatatacaa 125  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||    
T  21754174 cataatccatttaatgtatatacaa 21754198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21861661 - 21861456
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tca 99  Q
    ||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | |||    
T  21861661 tcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattca 21861562  T
Q  100 -acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 197  Q
     | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  21861561 tatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcatatcataat-attcaggcttactgaaacaacaatagcaagataaacaa 21861463  T
Q  198 cttagtt 204  Q
    |||||||    
T  21861462 cttagtt 21861456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 52928061 - 52927869
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||| |    
T  52928061 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat------------catctcaaatatcaa 52927974  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  52927973 acataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaacaatagcaagataaacaac 52927875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 20248309 - 20248454
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   || ||||||| |    
T  20248309 tcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaa---cttaaatatcaa 20248405  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 148  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  20248406 acataagtcatgtaatgtatatacaattatatatcattataaacaacat 20248454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21896347 - 21896162
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tca 99  Q
    ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | |||    
T  21896347 tcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattca 21896248  T
Q  100 -acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaaca 185  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  21896247 tatataattcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataat-attcaggcttactgaaacaacaaca 21896162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 14295642 - 14295507
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca- 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| |||||     
T  14295642 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcag 14295546  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 138  Q
    || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14295545 acttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 14295507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 20918634 - 20918769
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| |||| |    
T  20918634 tcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcaa 20918730  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 138  Q
    || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20918731 acttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 20918769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 204
Target Start/End: Original strand, 50686694 - 50686847
Alignment:
Q  52 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 150  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||      
T  50686694 tcatgatataacaatgtcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcg 50686793  T
Q  151 gatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtt 204  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  50686794 gatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtt 50686847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 50614208 - 50614002
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  50614208 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatc 50614109  T
Q  99 aac-ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaaga-taaca 196  Q
        ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| | |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||  ||||    
T  50614108 ttttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaagtaacaacggtaagacaaaca 50614010  T
Q  197 acttagtt 204  Q
    ||||||||    
T  50614009 acttagtt 50614002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 50622036 - 50621830
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  50622036 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatc 50621937  T
Q  99 aac-ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaaga-taaca 196  Q
        ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| | |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||  ||||    
T  50621936 ttttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaagtaacaacggtaagacaaaca 50621838  T
Q  197 acttagtt 204  Q
    ||||||||    
T  50621837 acttagtt 50621830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 35981700 - 35981586
Alignment:
Q  79 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaat 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||  |||  ||| ||||||||||| |||    
T  35981700 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatgcaattatataacattatcatcaacattagaatata-caatccaggcttactggaat 35981602  T
Q  179 aacaacagcaagataa 194  Q
     |||||| ||||||||    
T  35981601 gacaacatcaagataa 35981586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 21161746 - 21161892
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaat-atca 99  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| || ||||    
T  21161746 tcatgcaacttagttaaacaacaaacagcaacaaa-acagtatgcaaatcatcgtgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac--ttcatatcatca 21161842  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatt 149  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||    
T  21161843 acataaatcatacaatgtttatacacttatataacatcaacgacatcatt 21161892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16368377 - 16368184
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||    
T  16368377 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacaattcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacatctcaac-atc 16368280  T
Q  99 aac-ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa 194  Q
        ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16368279 gtttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataa 16368184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 41050127 - 41049933
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||  |||  |  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||    
T  41050127 tcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctc-aacatc 41050029  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa 194  Q
    | | ||||||||  ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||| | | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41050028 atatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacgtcaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataa 41049933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 152
Target Start/End: Original strand, 49261448 - 49261521
Alignment:
Q  79 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattaga 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  49261448 tcaacaacatctcaaatatcaacataatttatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattaga 49261521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 16758679 - 16758841
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||   ||    
T  16758679 tcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaacaacatcacaacattc 16758778  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatta 160  Q
    | | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||  | |||||||||    
T  16758779 atatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacaacaaatcatatta 16758841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 190
Target Start/End: Original strand, 20636957 - 20637067
Alignment:
Q  79 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaat 178  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |  |||  ||||||||||||||| |||    
T  20636957 tcaacaacatcccaaatacaaacataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattaaaaaata-caattcaggcttactggaat 20637055  T
Q  179 aacaacagcaag 190  Q
     |||||| ||||    
T  20637056 gacaacatcaag 20637067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 35261169 - 35261086
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 84  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  35261169 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca 35261086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 45574978 - 45574846
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||| | ||||||| |||||||| |||||| ||| |    
T  45574978 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataataccaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatta 45574880  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  45574879 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 45574846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 22130976 - 22130863
Alignment:
Q  23 caacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatat 121  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||| ||||    
T  22130976 caacagcaacataggcagtatccaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtaatgcatat 22130880  T
Q  122 acaattatataccatta 138  Q
    ||||||||||| |||||    
T  22130879 acaattatataacatta 22130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 50210304 - 50210212
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 93  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  50210304 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 50210212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 138
Target Start/End: Original strand, 51130632 - 51130729
Alignment:
Q  39 agtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccatt 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  51130632 agtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatt 51130728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 13988893 - 13989024
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  13988893 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 13988990  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13988991 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 13989024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21475222 - 21475091
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  21475222 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 21475125  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21475124 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 21475091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21923426 - 21923295
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  21923426 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 21923329  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21923328 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 21923295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 34509810 - 34509899
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 90  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  34509810 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaatgcaagtcaacaacatct 34509899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 16093976 - 16093825
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaa-caacatctcaaatat 97  Q
    ||||||| | |||||||  ||| || |||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  16093976 tcatgcaacatagttaataaacaaatagcaacataggcagtatagaaaacagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaaacaacatctcaaacat 16093878  T
Q  98 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatt 149  Q
    || |  |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| | |||||||    
T  16093877 cataggtaattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattaaaatcaacatt 16093825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 21026710 - 21026806
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| | |||||| |||||  |||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  21026710 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaatataggcagtatacaaaatcagcatgacgtaaatatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 21026806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 21840794 - 21840885
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  21840794 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 21840885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 22532299 - 22532395
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  || ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  22532299 tcatgcaatttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatccattgcaattcaacaacatcttaaatat 22532395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 27250820 - 27250724
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  27250820 tcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 27250724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23593870 - 23593739
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  23593870 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 23593773  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  23593772 acatataattcaagtaatgcatatataattatat 23593739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 29298164 - 29298294
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  29298164 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga-ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 29298260  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29298261 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29298294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 38801479 - 38801433
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaa 47  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  38801479 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtgcaa 38801433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 433039 - 433168
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||     |||||| || |||||| ||||  ||||| || |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||      
T  433039 tcatgcagcttagttaaataacg----gcaacacaggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattc 433134  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  433135 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 433168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 26064968 - 26065100
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    ||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||| |||||   |||  |  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  26064968 tcatgcagcttagttgataaacaaacagcaacataggcagtacataaaataattcatgatataacaatacc-aatgcaaatcaacaacatctcaaagatc 26065066  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    | | ||||||||  ||||  |||||||| |||||    
T  26065067 atatataattcaagtaatacatatacaaatatat 26065100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 20847245 - 20847205
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagta 42  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  20847245 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagta 20847205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 40265 - 40061
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40265 tcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaa 40166  T
Q  101 cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaact 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  40165 cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacataagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacatcaaggtaaacaact 40066  T
Q  200 tagtt 204  Q
    |||||    
T  40065 tagtt 40061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 100404 - 100608
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  100404 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataataatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatattaa 100503  T
Q  101 cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaact 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  100504 cataattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaatttaggcttactgaaacaacaacaacaagataaacaact 100603  T
Q  200 tagtt 204  Q
    |||||    
T  100604 tagtt 100608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 94438 - 94569
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  94438 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 94535  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  94536 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 94569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 44481 - 44613
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat--catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||   || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||     
T  44481 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatt 44578  T
Q  99 aac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
     ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  44579 cacatataattcaagtaatgcatatagaattatat 44613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 119905 - 119948
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatg 44  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  119905 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg 119948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 101529 - 101576
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa 48  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  101529 tcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 101576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 17575 - 17444
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  17575 tcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 17478  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  17477 acatataattcaagtaatgcatatataattatat 17444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2736 - 2543
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2736 tcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggcagtatgtaaatcatcatgttataacaatattgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaa 2637  T
Q  101 cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  2636 cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacatcagcaagataa 2543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 54)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 38855342 - 38855139
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38855342 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaa 38855243  T
Q  101 cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaact 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  38855242 cataattcatataatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaact 38855144  T
Q  200 tagtt 204  Q
    |||||    
T  38855143 tagtt 38855139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23760935 - 23760751
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  23760935 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgtaaatcatcatgatataacaatattgaattcaaatcaacaacatctcaaatatcaa 23760836  T
Q  101 cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaaca 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  23760835 cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatttattcaggcttactgaaacaacaaca 23760751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 21673734 - 21673937
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21673734 tcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaa 21673833  T
Q  101 cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataacaactt 200  Q
     |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  21673834 tataatttatttaatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaagcttactgaaacaacaacaacaagataacaactt 21673933  T
Q  201 agtt 204  Q
    ||||    
T  21673934 agtt 21673937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 6520398 - 6520590
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |||||    
T  6520398 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaa 6520497  T
Q  101 cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa 194  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6520498 cataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataa 6520590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 21285627 - 21285820
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  21285627 tcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcaa 21285726  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa 194  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21285727 acatagttcatgtaatgtatatacaattatatatcattaacaacaatattagattata-taattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataa 21285820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 26355789 - 26355643
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||    
T  26355789 tcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcacgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcagccatcaa 26355691  T
Q  101 cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 148  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  26355690 catattccatttaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 26355643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 983497 - 983312
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | || |||    
T  983497 tcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaacaagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaacaacatcac-aacatc 983399  T
Q  99 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaaca 185  Q
     |||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  983398 aaacataattcatgtaatgtatatacagctatataacattatcaacaacattcaatcata-taattcagacttactgaaacaacaaca 983312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 5866365 - 5866230
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| |||| |    
T  5866365 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcaa 5866269  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 138  Q
    || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  5866268 acttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 5866230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 37116377 - 37116583
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  37116377 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatc 37116476  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-ca 196  Q
    | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | |||||  ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  37116477 atatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcat-ctaaatcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagca 37116575  T
Q  197 acttagtt 204  Q
    ||||||||    
T  37116576 acttagtt 37116583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 21491025 - 21491160
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||   ||||| |||| |    
T  21491025 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatattgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcaa 21491121  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 138  Q
    || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  21491122 acttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 21491160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17267085 - 17266879
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||   ||| |   |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  17267085 tcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacggttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatc 17266986  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-ca 196  Q
    | | ||||||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  17266985 atatataattcttgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcata-taattcaggctcactgaaacaacaacagtaagataagca 17266887  T
Q  197 acttagtt 204  Q
    ||||||||    
T  17266886 acttagtt 17266879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 13508176 - 13508009
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||  |    
T  13508176 tcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcacaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaaatattca 13508077  T
Q  101 c--ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcag 166  Q
    |  ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||  ||||||||    
T  13508076 catataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataattcag 13508009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 17140946 - 17141081
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||| || ||| |||   ||||| |||| |    
T  17140946 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaatccatcatgacataataatatcgaatgtaaatcatcaa---ctcaattatcaa 17141042  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 138  Q
    || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  17141043 acttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 17141081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 20498592 - 20498797
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tca 99  Q
    ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | |||    
T  20498592 tcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaatagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattca 20498691  T
Q  100 -acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 197  Q
     | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||| ||  |||| ||||| |||| | ||||| |||||| |||||    
T  20498692 tatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcata-tacatcagtcttaccgaaacatcaacatcaagataaacaa 20498790  T
Q  198 cttagtt 204  Q
    |||||||    
T  20498791 cttagtt 20498797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 13597708 - 13597541
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| |||||||  |    
T  13597708 tcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatcccaaatattca 13597609  T
Q  101 c--ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcag 166  Q
    |  ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| | |||||  ||||||||    
T  13597608 catataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataattcag 13597541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 24353050 - 24353235
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  24353050 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacatctcaaacatc 24353148  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaaca 185  Q
      | | ||||||| ||||| ||||||| ||||||   ||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  24353149 gtatacaattcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaaca 24353235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 17439598 - 17439436
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  17439598 tcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatc 17439499  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatta 160  Q
    | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  | |||||||| |||||||||    
T  17439498 atatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattatcaacattaaatcatatta 17439436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 204
Target Start/End: Original strand, 22364744 - 22364896
Alignment:
Q  52 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 150  Q
    |||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  | |||  |||||||| |    
T  22364744 tcatgatataacaatatcaaa-gaaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcactttattaacaacatca 22364842  T
Q  151 gatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtt 204  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22364843 aatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtt 22364896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 21249414 - 21249550
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaac-agcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 98  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| ||||     
T  21249414 tcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattcatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatca 21249510  T
Q  99 aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 138  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  21249511 aacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 21249550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 21255252 - 21255388
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaac-agcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc- 98  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| ||||     
T  21255252 tcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattcatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatca 21255348  T
Q  99 aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 138  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  21255349 aacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 21255388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 17612201 - 17612069
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaat-atca 99  Q
    ||||||||||||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| ||||    
T  17612201 tcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatca 17612102  T
Q  100 -acataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
     | ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17612101 catataattcaagtaatgcatatacaattatat 17612069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 22626766 - 22626861
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  22626766 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatacaaatcaacaacatcttaaatat 22626861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 16092433 - 16092337
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16092433 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 16092337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 21919091 - 21918995
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  || ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  21919091 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 21918995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 22875095 - 22875190
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||| || |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22875095 tcatgcagcttagttaaatagc-agcagcaacacaggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 22875190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 16199735 - 16199647
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 90  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | | ||||||| | ||||||    
T  16199735 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattcaaa-caacatgacataataatatcaatttcaattcatctacatct 16199647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 31971287 - 31971375
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 90  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| | | ||||||| ||||||||    
T  31971287 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaattccaattcatcaacatct 31971375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 1484429 - 1484560
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  1484429 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 1484526  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  1484527 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 1484560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 5853427 - 5853296
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  5853427 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 5853330  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  5853329 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 5853296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 14409579 - 14409448
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  14409579 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 14409482  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  14409481 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 14409448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 20046330 - 20046199
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  20046330 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattt 20046233  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20046232 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20046199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 20403254 - 20403385
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  20403254 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 20403351  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20403352 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20403385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 22001780 - 22001911
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  22001780 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 22001877  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22001878 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 22001911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 28649135 - 28649046
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 90  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  28649135 tcatgcagcttagttaaataacaaa-agcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 28649046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 7372808 - 7372904
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  7372808 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatat 7372904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 20536238 - 20536334
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  20536238 tcatgcagcttagttaaataa-caacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 20536334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 19801516 - 19801387
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| |||| || ||||| |||| |||||| || |||| |||||||| |||||| |||  |    
T  19801516 tcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacaca-acagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgtctcaattattca 19801419  T
Q  101 c--ataattcatataatgtatatacaattata 130  Q
    |  ||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  19801418 catataattcaagtaatgcatatacaattata 19801387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 26219744 - 26219838
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||| ||||  |  |||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  26219744 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacacag-cagtatacaaaatagtatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 26219838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 40492891 - 40492844
Alignment:
Q  52 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  40492891 tcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatca 40492844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 15203366 - 15203235
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||| || |||||||| |||||| |||      
T  15203366 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaagtcaacaacgtctcaattattc 15203269  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15203268 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 15203235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 16413451 - 16413320
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  16413451 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 16413354  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  16413353 acatataattcaagtaatgcatatataattatat 16413320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 21396071 - 21395984
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 90  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||  || ||||| ||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  21396071 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa--cagcatgagataattatatcaaattcaattcatcaacatct 21395984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 21790564 - 21790477
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 90  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||  || ||||| ||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  21790564 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa--cagcatgagataattatatcaaattcaattcatcaacatct 21790477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 18818500 - 18818404
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | || || |||||| ||||| ||||||    
T  18818500 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacatcatcttaaatat 18818404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 21924019 - 21923923
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | | ||| || ||||| || | |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  21924019 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 21923923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 6759288 - 6759371
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 84  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  6759288 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 6759371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 23406409 - 23406492
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 84  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||    
T  23406409 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 23406492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 26225382 - 26225288
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||| ||| |||| ||  |||| |||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26225382 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acaatatacaaaacagtatgacataataatatcaaatacaagtcaacaacatctcaaatat 26225288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 18879322 - 18879276
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  18879322 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaa 18879276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 4483308 - 4483438
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  4483308 tcatgcagcttagttaa-taac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 4483404  T
Q  100 acata--attcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  4483405 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 4483438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 21389541 - 21389454
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 90  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| |||  || ||||| ||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  21389541 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa--cagcatgacataattatatcaaattcaattcatcaacatct 21389454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 21778867 - 21778780
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 90  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| |||  || ||||| ||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  21778867 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa--cagcatgacataattatatcaaattcaattcatcaacatct 21778780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 45131087 - 45131047
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagta 42  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  45131087 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagta 45131047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 138
Target Start/End: Original strand, 21383887 - 21383978
Alignment:
Q  47 aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 138  Q
    ||||||||| ||||||||||  | ||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||  ||||||||| |||||    
T  21383887 aatcatcat-atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaaatatcaaacataattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21383978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 149; Significance: 7e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14788 - 14584
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14788 tcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagtaagaaaatcatcatgatatagtaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaa 14689  T
Q  101 cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagata-acaact 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14688 cataattcatataatgtatatactattatataccattaacaaaaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagatatacaact 14589  T
Q  200 tagtt 204  Q
    |||||    
T  14588 tagtt 14584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 138; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 29 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2281 - 2116
Alignment:
Q  29 caacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaatta 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2281 caacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcagcataattcatataatgtatatacaatta 2182  T
Q  129 tataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa 194  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2181 tataccattaacaacaacattggatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataa 2116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 134; Significance: 6e-70; HSPs: 42)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21502247 - 21502042
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| |||||    
T  21502247 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaatcagcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcatcatcttaaacatcaa 21502148  T
Q  101 -cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 198  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21502147 acataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaac 21502048  T
Q  199 ttagtt 204  Q
    ||||||    
T  21502047 ttagtt 21502042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21329588 - 21329384
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||  ||| ||| |    
T  21329588 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcataatataacaatatcgaattcaagtcatcaacatcataaacatcaa 21329489  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  21329488 acataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataaacaac 21329390  T
Q  199 ttagtt 204  Q
    ||||||    
T  21329389 ttagtt 21329384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26012126 - 26011922
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||| ||| |    
T  26012126 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaagcaacatgatataacaatatcaaatgtgaatcaacaacatctcaaacatcaa 26012027  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||    
T  26012026 acataattcatgtaatgtatatacaattatataacatcaacaacaacatcagattata-tagttcaggcttactgaaacaacaataacaagataaacaac 26011928  T
Q  199 ttagtt 204  Q
    ||||||    
T  26011927 ttagtt 26011922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 21565572 - 21565776
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |    
T  21565572 tcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatccaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatttcaaatatcaa 21565671  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||  || ||||||| |||||| ||||||    
T  21565672 acataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactagaacaacaacaacaagataaacaac 21565770  T
Q  199 ttagtt 204  Q
    ||||||    
T  21565771 ttagtt 21565776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20027032 - 20026827
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||  |||    
T  20027032 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatccaaaacagttcatgatataataatatcaaatgcaattcaacaacatcacaac-atc 20026934  T
Q  99 aa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 196  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||    
T  20026933 aaacataattcatgtaatgtatatacaactatatagcattatcaacaacattaaaacata-taattcaggcttactgaaacaactacaacaagataaaca 20026835  T
Q  197 acttagtt 204  Q
    ||||||||    
T  20026834 acttagtt 20026827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 22959623 - 22959489
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   |||||||||| |    
T  22959623 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatattgaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatcaa 22959527  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccatt 137  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22959526 acataagtcatgtaatgtatatacaattatataacatt 22959489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 148
Target Start/End: Original strand, 19668931 - 19669073
Alignment:
Q  4 tgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aaca 102  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||| ||||    
T  19668931 tgcagctcagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaatcatcgtgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatcaaaca 19669027  T
Q  103 taattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 148  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  19669028 taagtcctgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 19669073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 19660926 - 19660791
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||  || |||||||   ||||| |||| |    
T  19660926 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcttgatataatgatatcgaatataaatcaacaa---ctcaattatcaa 19660830  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 138  Q
    || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  19660829 acttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 19660791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22178312 - 22178106
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    ||||||| |||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  22178312 tcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatc 22178213  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-ca 196  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||   |||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  22178212 atatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatccaatcata-taatttaggtttactgaaacaacaacagtaagataagca 22178114  T
Q  197 acttagtt 204  Q
    ||||||||    
T  22178113 acttagtt 22178106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 22144079 - 22144211
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| | |||    
T  22144079 tcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaattgcaaatcaacaacatctcaaacattca 22144178  T
Q  100 -acataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
     | ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22144179 tatataattcaagtaatgcatatacaattatat 22144211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 21741545 - 21741486
Alignment:
Q  79 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccatta 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21741545 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataacatta 21741486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 36314607 - 36314678
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 72  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  36314607 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaa 36314678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 21729155 - 21729059
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  21729155 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 21729059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 21808480 - 21808384
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  21808480 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 21808384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 125
Target Start/End: Original strand, 29448054 - 29448159
Alignment:
Q  23 caacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtat 119  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||    
T  29448054 caacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatacgtaattcatgtaatgcat 29448153  T
Q  120 atacaa 125  Q
    ||||||    
T  29448154 atacaa 29448159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 23390587 - 23390491
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  23390587 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 23390491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 40725883 - 40726032
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaat-atca 99  Q
    ||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| ||||    
T  40725883 tcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaagcatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatca 40725982  T
Q  100 -acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 148  Q
     | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  40725983 catataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 40726032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 22075049 - 22075145
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  22075049 tcattcagcttagttaaataac-aacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 22075145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 93
Target Start/End: Original strand, 9077983 - 9078074
Alignment:
Q  2 catgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 93  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  9077983 catgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaagtcaacaacatctcaa 9078074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 22412214 - 22412309
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||| |||||||||||||||| |  | |||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22412214 tcatgtagcttagttaaataacgataa-caacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 22412309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 24493599 - 24493694
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||| ||||| |||| || |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  24493599 tcatgcagcttggttaagtaac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatat 24493694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 264903 - 264772
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  264903 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 264806  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  264805 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 264772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 8286934 - 8286838
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc--aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata 96  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |  ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| |||||    
T  8286934 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaata 8286838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 10733075 - 10732944
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  10733075 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 10732978  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  10732977 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 10732944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 11581334 - 11581203
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||| ||| |||||| |||      
T  11581334 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaataacgtctcaattattc 11581237  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11581236 acgtataattcaagtaatgtatatacaattatat 11581203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 29329961 - 29330092
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  29329961 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 29330058  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29330059 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29330092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 39363411 - 39363542
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  39363411 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 39363508  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  39363509 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 39363542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 1096497 - 1096593
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||  || ||| | |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1096497 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatcaaatgcaaatcaacaacatctcacatat 1096593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 13025341 - 13025436
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||   ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  13025341 tcatgcagcatagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacatattgatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatat 13025436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 13095525 - 13095620
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||   ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  13095525 tcatgcagcatagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacatattgatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatat 13095620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 20902144 - 20902012
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa--atat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||| ||||||  || |    
T  20902144 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaagtcaacaacgtctcaattattt 20902047  T
Q  98 ca-acataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    || | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  20902046 cacatataattcaaataatgcatatacaattatat 20902012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 25431424 - 25431518
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaat 95  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||    
T  25431424 tcatgcatcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaat 25431518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 20909039 - 20909170
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  20909039 tcatgcagcttagttaaataa-caaaagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 20909136  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20909137 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20909170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 24529250 - 24529339
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 90  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  24529250 tcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaatgcaagtcaacaacatct 24529339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 42245500 - 42245369
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  42245500 tcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 42245403  T
Q  100 acata--attcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  42245402 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 42245369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 21997625 - 21997549
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 77  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  21997625 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 21997549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 25421562 - 25421658
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  25421562 tcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacagcatcttaaatat 25421658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 20766175 - 20766115
Alignment:
Q  37 acagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20766175 acagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 20766115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 29346007 - 29346138
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| || | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  29346007 tcatacagcttagttaaataa-caacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 29346104  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29346105 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29346138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 37723933 - 37723975
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat 43  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  37723933 tcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtat 37723975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 21293060 - 21293020
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagta 42  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21293060 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagta 21293020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 26740736 - 26740697
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagt 41  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26740736 tcatgcagcttagttaa-taaacaacagcaacatagacagt 26740697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 134; Significance: 6e-70; HSPs: 69)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 15470954 - 15471157
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |    
T  15470954 tcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaacatcaa 15471053  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  15471054 acataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaac-ttagatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataaacaac 15471151  T
Q  199 ttagtt 204  Q
    ||||||    
T  15471152 ttagtt 15471157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 16103810 - 16104013
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  16103810 tcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaatatcaa 16103908  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  ||| || ||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  16103909 acataattcatttaatgtatataaaattatataacattataaacaacatcaattcatatggatt-agtcttactggaacaacaacagcaagataaacaac 16104007  T
Q  199 ttagtt 204  Q
    ||||||    
T  16104008 ttagtt 16104013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 14234517 - 14234712
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| ||| |    
T  14234517 tcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaa 14234616  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactga--aataacaacagcaagataa 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |  ||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||    
T  14234617 acataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatta-aacaattcaggcttactgaacaacaacaacaacaagataa 14234712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 16097358 - 16097562
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  16097358 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatcatcatcatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaa 16097457  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  16097458 acataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaacaacagcaagataaacaac 16097556  T
Q  199 ttagtt 204  Q
    ||||||    
T  16097557 ttagtt 16097562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 12174350 - 12174164
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| |    
T  12174350 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa---aacaacaactcaaatatcaa 12174254  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaag 190  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||   ||||||  | |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  12174253 acataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacattgattcatatgca-tcagtcttactggaacaacaacagcaag 12174164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 32307707 - 32307830
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  32307707 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaattatcaa 32307805  T
Q  101 cataattcatataatgtatatacaa 125  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||    
T  32307806 cataatccatttaatgtatatacaa 32307830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 49668167 - 49668044
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaa-catctcaaatatca 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||    
T  49668167 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaat-caacaaacatctcatttatca 49668069  T
Q  100 acataattcatataatgtatataca 124  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||    
T  49668068 acataatccatttaaagtatataca 49668044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 9512950 - 9513067
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||  ||||||    
T  9512950 tcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaat----caacatctcatttatcaa 9513045  T
Q  101 cataattcatataatgtatata 122  Q
    |||||| ||| |||||||||||    
T  9513046 cataatccatttaatgtatata 9513067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 9520925 - 9521042
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||  ||||||    
T  9520925 tcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaat----caacatctcatttatcaa 9521020  T
Q  101 cataattcatataatgtatata 122  Q
    |||||| ||| |||||||||||    
T  9521021 cataatccatttaatgtatata 9521042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 13210418 - 13210283
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   || ||||||| |    
T  13210418 tcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgcaaatcaacaa---cttaaatatcaa 13210322  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 138  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  13210321 acataagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 13210283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 1644757 - 1644642
Alignment:
Q  8 gcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaacataatt 107  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  1644757 gcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatgcaaatcatcattatataacaatatcgaatacaa-tcaacaatatctcaattatcaacataatc 1644660  T
Q  108 catataatgtatatacaa 125  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  1644659 catttaatgtatatacaa 1644642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 37251259 - 37251054
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||    
T  37251259 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctc-aacatc 37251161  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 196  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | |||||| |||||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  37251160 ataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcata-taattcagacttactggaacaacaacagtaagataaaca 37251062  T
Q  197 acttagtt 204  Q
    ||||||||    
T  37251061 acttagtt 37251054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 52523820 - 52523669
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-t 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |    
T  52523820 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaacatt 52523721  T
Q  98 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 148  Q
    || | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  52523720 catatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 52523669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 27165277 - 27165373
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  27165277 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgcaaaacaacatgatataccaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatat 27165373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 24340814 - 24340665
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||  |    
T  24340814 tcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgcacaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaaatattca 24340715  T
Q  101 c--ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 148  Q
    |  ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  24340714 catataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 24340665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 23274717 - 23274813
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  23274717 tcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaaatat 23274813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 1465423 - 1465350
Alignment:
Q  79 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattaga 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||    
T  1465423 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatgtaatgtatatacaattgtataacattatcatcaacattaga 1465350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 12399239 - 12399335
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12399239 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaaatgcaattcaacaacatcttaaatat 12399335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 53301634 - 53301545
Alignment:
Q  9 cttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattca-acaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||||    
T  53301634 cttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcattcaatatctcaaatat 53301545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22110443 - 22110238
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  |||    
T  22110443 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacagcatctcaac-atc 22110345  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-ca 196  Q
    | | | ||||||| |||||  |||||| ||||||  |||||  |||||| | | ||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  22110344 atatagaattcatgtaatgcgtatacatttatatcacattattaacaacttcaaatcatac-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagca 22110246  T
Q  197 acttagtt 204  Q
    ||||||||    
T  22110245 acttagtt 22110238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 43925988 - 43926121
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  43925988 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatc 43926087  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    | | | ||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  43926088 atatacaattcatgtaatgcatatacatttatat 43926121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 37642356 - 37642207
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaat-atca 99  Q
    ||||||||||||||||  |||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| ||||    
T  37642356 tcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatca 37642257  T
Q  100 -acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 148  Q
     | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  37642256 catataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 37642207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 42386440 - 42386536
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  42386440 tcatgcagtttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 42386536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 49389642 - 49389517
Alignment:
Q  80 caacaacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaat 178  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| ||     
T  49389642 caacaacatctcaactatcaaacataattcatttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaac 49389544  T
Q  179 aacaacagcaagat-aacaacttagtt 204  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  49389543 aacaacaacaagataaacaacttagtt 49389517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 14572619 - 14572714
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||  | |||||||||||| ||||||    
T  14572619 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgagagtcaacaacatcttaaatat 14572714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 21618476 - 21618570
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21618476 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 21618570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 36166625 - 36166719
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  36166625 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacacag-cagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 36166719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 606417 - 606324
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 93  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| |   ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  606417 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcacataaatcagttcatgatataacaatatc-aatgcaattcaacaacatctcaa 606324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 18438564 - 18438653
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 90  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  || |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  18438564 tcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 18438653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 43550614 - 43550482
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||||||||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  43550614 tcatgcagcttagttaaataatga-cagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 43550516  T
Q  100 acata--attcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    |||||  |||||  ||||||||||||||||||||    
T  43550515 acatataattcaagtaatgtatatacaattatat 43550482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 14972884 - 14972980
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14972884 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaacatctcatatat 14972980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 17487886 - 17487982
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  17487886 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 17487982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 17499368 - 17499464
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  17499368 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 17499464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 22147616 - 22147467
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaat-atca 99  Q
    ||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| ||||    
T  22147616 tcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcggtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatca 22147517  T
Q  100 -acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 148  Q
     | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  22147516 catataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 22147467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 2051260 - 2051141
Alignment:
Q  33 atagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaatta 128  Q
    |||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  2051260 ataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaatta 2051161  T
Q  129 tataccattaacaacaacat 148  Q
    |||  |||||  ||||||||    
T  2051160 tatcacattataaacaacat 2051141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 11424850 - 11424783
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 69  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  11424850 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataacaatatc 11424783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 24153299 - 24153204
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||  ||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  24153299 tcatgcagcttagttaaataacgat-agcaacataggtagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatat 24153204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 7781482 - 7781351
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  7781482 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaacgtctcaattattc 7781385  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  7781384 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 7781351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 8899121 - 8899252
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  8899121 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 8899218  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  8899219 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 8899252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 16282946 - 16282815
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| |||      
T  16282946 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatattgaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 16282849  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16282848 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 16282815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 17446790 - 17446659
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  17446790 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 17446693  T
Q  100 acata--attcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17446692 acatatcattcaagtaatgcatatacaattatat 17446659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 17463205 - 17463336
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  17463205 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 17463302  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17463303 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 17463336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 17672653 - 17672784
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  17672653 tcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacatag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaacgtctcaattattc 17672750  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  17672751 acatataattcaaataatgcatatataattatat 17672784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 29172718 - 29172587
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  29172718 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 29172621  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29172620 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 29172587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 34159353 - 34159484
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  34159353 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 34159450  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  34159451 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 34159484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 38962026 - 38961895
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  38962026 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 38961929  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  38961928 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 38961895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 45607042 - 45606911
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  45607042 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 45606945  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  45606944 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 45606911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 53070788 - 53070657
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||| || || || |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  53070788 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacata-acagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 53070691  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  53070690 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 53070657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 55476518 - 55476649
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  55476518 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 55476615  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  55476616 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 55476649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 13442304 - 13442400
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  13442304 tcatgcagcttagttaaataa-caacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 13442400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 43840962 - 43841058
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  43840962 tcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatat 43841058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 14576915 - 14576828
Alignment:
Q  9 cttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | | || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  14576915 cttagttaaataac-aacagcaacatagacagtataaacaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 14576828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 28194720 - 28194759
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacag 40  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28194720 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacag 28194759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 28848746 - 28848618
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  28848746 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 28848649  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaatta 128  Q
    ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  28848648 acatataattcaagtaatgcatatacaatta 28848618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 9707742 - 9707611
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||| ||| |||||||| |||||| |||      
T  9707742 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatacaagtcaacaacgtctcaattattc 9707645  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  9707644 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 9707611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 12567587 - 12567718
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  12567587 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-caatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 12567684  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  12567685 acatataattcaagtaatgcatatataattatat 12567718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 13544052 - 13544183
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  13544052 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-caatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 13544149  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  13544150 acatataattcaagtaatgcatatataattatat 13544183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 16454416 - 16454285
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  16454416 tcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 16454319  T
Q  100 acata--attcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16454318 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 16454285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 20698526 - 20698437
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 90  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || |||||  ||| |||||| | ||||||||| ||||||||    
T  20698526 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatcaattgcaattcatcaacatct 20698437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 6469269 - 6469178
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  6469269 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 6469178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 23083452 - 23083356
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  23083452 tcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 23083356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 26686917 - 26687013
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  26686917 tcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatat 26687013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 40213811 - 40213720
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgca-aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 93  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||| || || |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  40213811 tcatgtagcttagttaaataac-aacatcaacacag-cagtatacataaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 40213720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 204
Target Start/End: Original strand, 43927304 - 43927367
Alignment:
Q  141 aacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtt 204  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43927304 aacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtt 43927367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 55500969 - 55501055
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 88  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  55500969 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 55501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 13151926 - 13151794
Alignment:
Q  1 tcatgcagctt-agttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  13151926 tcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 13151829  T
Q  99 aacata--attcatataatgtatatacaattatat 131  Q
     |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13151828 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 13151794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 13154391 - 13154259
Alignment:
Q  1 tcatgcagctt-agttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||     
T  13154391 tcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 13154294  T
Q  99 aacata--attcatataatgtatatacaattatat 131  Q
     |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  13154293 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 13154259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 10247858 - 10247727
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  10247858 tcatacagcttagttaaataac-aacagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 10247761  T
Q  100 acata--attcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  10247760 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 10247727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 25476476 - 25476384
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 93  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25476476 tcatgtagcttagttaaaaaac-aacagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 25476384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 62228 - 62429
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  62228 tcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgaaaaacatcatggtataataatatcgaatgca---caacaacatctcaaatatcaa 62324  T
Q  101 cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaact 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  62325 cataattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacatcattagttcataacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaact 62424  T
Q  200 tagtt 204  Q
    |||||    
T  62425 tagtt 62429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 132688 - 132809
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||| |||||| |||||    
T  132688 tcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatacaacaatatcgaatgtaa-tcatcaacgtctcaattatca 132786  T
Q  100 acataattcatataatgtatata 122  Q
    ||||||| ||| |||||||||||    
T  132787 acataatccatttaatgtatata 132809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 134238 - 134369
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  134238 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 134335  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  134336 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 134369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 136707 - 136838
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  136707 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 136804  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  136805 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 136838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 139176 - 139307
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  139176 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 139273  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  139274 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 139307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 144114 - 144245
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  144114 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 144211  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  144212 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 144245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 141645 - 141776
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  141645 tcatgtagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 141742  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  141743 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 141776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 130; Significance: 1e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 10557 - 10761
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |    
T  10557 tcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaacatcga 10656  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10657 acataattcatgtaatgtatatacaattatatgacattaacaacaacattagattata-taattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaac 10755  T
Q  199 ttagtt 204  Q
    ||||||    
T  10756 ttagtt 10761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 130; Significance: 1e-67; HSPs: 45)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 39706379 - 39706187
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||| |||||    
T  39706379 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatgaacatcataaacatcaa 39706280  T
Q  101 cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa 194  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  39706279 cataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatcata-taattcaggcttactaaaacaacaacagcaagataa 39706187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12288301 - 12288096
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||    
T  12288301 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatcacaac-atc 12288203  T
Q  99 aa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 196  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12288202 aaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaccaacaacattaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaaca 12288104  T
Q  197 acttagtt 204  Q
    ||||||||    
T  12288103 acttagtt 12288096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 12774037 - 12774160
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12774037 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatacaa-tcaacaacatctcaattatcaa 12774135  T
Q  101 cataattcatataatgtatatacaa 125  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||    
T  12774136 cataatccatttaatgtatatacaa 12774160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 13942 - 13784
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tca 99  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  13942 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattca 13843  T
Q  100 -acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcata 157  Q
     | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | ||||||    
T  13842 tatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcata 13784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 52243287 - 52243192
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  52243287 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcagttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaacaacatctcaaa 52243192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 43198646 - 43198439
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-t 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||| |||||||||| |    
T  43198646 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgcaaaacaattcatgatataaccatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatatt 43198547  T
Q  98 ca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aac 195  Q
    || | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| |  ||||||  ||| || ||||||| || | ||||| |||||| |||    
T  43198546 catatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaattcatatgcatt-agtcttactggaacatcaacaacaagataaac 43198448  T
Q  196 aacttagtt 204  Q
    |||||||||    
T  43198447 aacttagtt 43198439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 15551847 - 15551982
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | || |||||||   ||||| |||| |    
T  15551847 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaatccatcatgatataataatatcgaaggtaaatcaacaa---ctcaattatcaa 15551943  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 138  Q
    || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15551944 acttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 15551982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 53082243 - 53082038
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||| |||    
T  53082243 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatctcaaacatc 53082145  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-ca 196  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  53082144 atatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagca 53082046  T
Q  197 acttagtt 204  Q
    ||||||||    
T  53082045 acttagtt 53082038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 204
Target Start/End: Original strand, 8846391 - 8846606
Alignment:
Q  6 cagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgc----------------aattcaacaacatc 89  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||                || ||| |||||||    
T  8846391 cagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgagataacaatatcgaatgctaacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 8846490  T
Q  90 tcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagca 188  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| || ||||||  ||    
T  8846491 tcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaacaactaca 8846589  T
Q  189 agat-aacaacttagtt 204  Q
    |||| ||||||||||||    
T  8846590 agataaacaacttagtt 8846606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 190
Target Start/End: Original strand, 15099457 - 15099567
Alignment:
Q  79 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaat 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||  ||| ||||||||||| |||    
T  15099457 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatata-caatccaggcttactggaat 15099555  T
Q  179 aacaacagcaag 190  Q
     |||||| ||||    
T  15099556 gacaacatcaag 15099567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 190
Target Start/End: Original strand, 15190424 - 15190534
Alignment:
Q  79 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaat 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||  ||| ||||||||||| |||    
T  15190424 tcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatata-caatccaggcttactggaat 15190522  T
Q  179 aacaacagcaag 190  Q
     |||||| ||||    
T  15190523 gacaacatcaag 15190534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 46640547 - 46640342
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||| || |||    
T  46640547 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgaaaatcaataacatctc-aacatc 46640449  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-ca 196  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  ||| |  |||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||| ||    
T  46640448 atatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacatcattaacaacatcaaatcata-taattcaggtttactgaaacaataacagtaagataagca 46640350  T
Q  197 acttagtt 204  Q
    ||||||||    
T  46640349 acttagtt 46640342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Original strand, 16596686 - 16596813
Alignment:
Q  9 cttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataatt 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||   ||||| |||| ||| ||| |    
T  16596686 cttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcatcaa---ctcaattatcaaacttaagt 16596782  T
Q  108 catataatgtatatacaattatataccatta 138  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16596783 catgtaatgtatatacaattatataacatta 16596813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 16377612 - 16377522
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 93  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16377612 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 16377522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 23374450 - 23374354
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  23374450 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 23374354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 8574958 - 8574864
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  8574958 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgtaattcaacaacatctcaaatat 8574864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 44615315 - 44615446
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  44615315 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 44615412  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  44615413 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 44615446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 16270326 - 16270231
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| | |||||||||| ||||||    
T  16270326 tcatgcagcttaattaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagttaacaacatcttaaatat 16270231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 12442 - 12311
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  12442 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 12345  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  12344 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 12311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 7088907 - 7088996
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 90  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| ||||||||    
T  7088907 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatct 7088996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 15118487 - 15118356
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  15118487 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 15118390  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  15118389 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 15118356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 18215409 - 18215278
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  18215409 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 18215312  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18215311 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18215278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 19618307 - 19618176
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  19618307 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 19618210  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  19618209 acctataattcaagtaatgcatatataattatat 19618176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 44773222 - 44773091
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  44773222 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 44773125  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  44773124 acaaataattcaagtaatgcatatacaattatat 44773091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 52312537 - 52312668
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  52312537 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 52312634  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  52312635 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 52312668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 7798804 - 7798900
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  7798804 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcatcaacatcttaaatat 7798900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 12902787 - 12902883
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | || |||||| |||||||| ||||||    
T  12902787 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaattcatcaacatcttaaatat 12902883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 14280343 - 14280438
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  14280343 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacgg-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 14280438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 22636465 - 22636561
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  22636465 tcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 22636561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 54798845 - 54798749
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  54798845 tcatgcagcttagttgaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 54798749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 6899921 - 6900016
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||| || |||   |||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  6899921 tcatgcatcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacaacatagcataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatat 6900016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 16240060 - 16239965
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||| |||| ||||||||| || ||||| |||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16240060 tcatgcaacttaattaaataac-aatagcaaaataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatat 16239965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 52873458 - 52873363
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata 96  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| |||||    
T  52873458 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaata 52873363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 44929015 - 44928883
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| ||| || ||||||| |||| |||||||||| |||      
T  44929015 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaatgcaagtcaataacatctcaattattc 44928917  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  44928916 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 44928883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 7893733 - 7893829
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  7893733 tcatgcagcttagttaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatat 7893829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 14038678 - 14038770
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 93  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  || ||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14038678 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 14038770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 15464970 - 15464929
Alignment:
Q  53 catgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaa 94  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  15464970 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaa 15464929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 44052859 - 44052955
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  44052859 tcatgcagctcagttaaataa-caacatcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 44052955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 3096323 - 3096369
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  3096323 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaa 3096369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 14053392 - 14053306
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 88  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | | ||||||| ||||||    
T  14053392 tcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatacaaa-cagcatgacataataatatcaatttcaattcatcaacat 14053306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Original strand, 17046517 - 17046552
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatag 36  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17046517 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 17046552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18239554 - 18239426
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  18239554 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 18239457  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaatta 128  Q
    ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  18239456 acatataattcaagtaatgcatatacaatta 18239426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 1837644 - 1837513
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||| | ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  1837644 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataataccaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 1837547  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| |||||| |||||||    
T  1837546 acatataattcaagtaatgcatatacgattatat 1837513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 19242726 - 19242857
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  19242726 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 19242823  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  19242824 acatataattcaagtaatgcatatataattatat 19242857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 17333307 - 17333347
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagta 42  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17333307 tcatgcagcttagttaa-taaacaacagcaacatagacagta 17333347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2897 - 2691
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||     
T  2897 tcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcag 2798  T
Q  101 cataattcatataatg----tatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aac 195  Q
    | ||||||||| ||||    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  2797 cttaattcataaaatgtatatatatacaat--tataccattaacaacaacaatagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaac 2700  T
Q  196 aacttagtt 204  Q
    |||||||||    
T  2699 aacttagtt 2691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 119; Significance: 5e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 12796 - 12989
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| ||| |    
T  12796 tcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaa 12895  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12896 acataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaataacaacattagatcata-taattcaggcttactggaacaacaacagcaagataa 12989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 116; Significance: 3e-59; HSPs: 52)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 204
Target Start/End: Original strand, 23019438 - 23019640
Alignment:
Q  3 atgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aac 101  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  23019438 atgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaac 23019537  T
Q  102 ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaactt 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23019538 ataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacgacattagattata-tagttcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaactt 23019636  T
Q  201 agtt 204  Q
    ||||    
T  23019637 agtt 23019640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 19652225 - 19652427
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  19652225 tcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaacatcaa 19652323  T
Q  101 cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaact 199  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  19652324 cataatccatttaaagtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaataacagcaagataaacaact 19652422  T
Q  200 tagtt 204  Q
    |||||    
T  19652423 tagtt 19652427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22080800 - 22080626
Alignment:
Q  30 aacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaattat 129  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22080800 aacataggcagtatgcaaaacatcatgatataacaatatcgaatgcacag-aacaacatctcaaacatcgtcataattaatataatgtatatacatttat 22080702  T
Q  130 ataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtt 204  Q
    ||| ||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22080701 ataacattaacaacatcattaggtcatatcaatttaggcttactgaaacaacaagagcaagataagcaacttagtt 22080626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 19668401 - 19668606
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | || |||    
T  19668401 tcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatcac-aacatc 19668499  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 196  Q
    | || |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||| ||  |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19668500 atacgtaattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacactacatcata-tacatcagacttactgaaacaacaacagcaagataaaca 19668598  T
Q  197 acttagtt 204  Q
    ||||||||    
T  19668599 acttagtt 19668606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 1561333 - 1561535
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||||||||| |    
T  1561333 tcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatcaa 1561429  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattaga-tcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 197  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| | ||||||  | |||| ||||||| ||||  ||||||||||| |||||    
T  1561430 acataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaaattcatatgca-tcagtcttactggaatattaacagcaagataaacaa 1561528  T
Q  198 cttagtt 204  Q
    |||||||    
T  1561529 cttagtt 1561535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 28496562 - 28496427
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   |||||||||| |    
T  28496562 tcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaaatatcaa 28496466  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 138  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  28496465 acataagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 28496427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 29808973 - 29808838
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   |||||||||| |    
T  29808973 tcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaaatatcaa 29808877  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 138  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  29808876 acataagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 29808838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 9098605 - 9098465
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || | || |||    
T  9098605 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgcaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcatttcaacaacttcac-aacatc 9098507  T
Q  99 -aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaa 139  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9098506 aaacataattcatgtaatgtatatataattatataacattaa 9098465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 27333309 - 27333238
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333309 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 27333238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 27394049 - 27393978
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394049 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 27393978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 20109168 - 20109295
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tca 99  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  20109168 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacataatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattca 20109267  T
Q  100 -acataattcatataatgtatatacaat 126  Q
     | ||||||||  |||||||||||||||    
T  20109268 tatataattcaagtaatgtatatacaat 20109295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 4185912 - 4185827
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 86  Q
    ||||||||| |||||||| |||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4185912 tcatgcagcatagttaaacaacagacagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 4185827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 4186397 - 4186482
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 86  Q
    ||||||||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4186397 tcatgcagcatagttaaacaacaggcagcaacatagacagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 4186482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 31155488 - 31155346
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaa-cagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaat-atc 98  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| || |||    
T  31155488 tcatgcaacttagttaaataacaaaacagcaac-taaacagtatgcaagtcatcgtgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac--ttcatatcatc 31155392  T
Q  99 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaaca 144  Q
    ||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||| ||| |||||||    
T  31155391 aacataaatcatgcaatgtttatacatttatataacatcaacaaca 31155346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 16496274 - 16496370
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  16496274 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 16496370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 4668277 - 4668217
Alignment:
Q  26 cagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 86  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4668277 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 4668217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 4675124 - 4675064
Alignment:
Q  26 cagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 86  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4675124 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 4675064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 1595576 - 1595707
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||      
T  1595576 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaattcaacaacgtctcaattattc 1595673  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  1595674 acatataattcaagtaatggatatacaattatat 1595707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 25644350 - 25644444
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaa 94  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||    
T  25644350 tcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatcaacatctcaaa 25644444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 8227602 - 8227453
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaat-atca 99  Q
    ||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| ||||    
T  8227602 tcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatca 8227503  T
Q  100 -acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 148  Q
     | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  8227502 catataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 8227453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 29060570 - 29060662
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 93  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29060570 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 29060662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 22782254 - 22782385
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tc 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| || ||    
T  22782254 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 22782351  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    | ||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22782352 acacataattcaagtaatgcatatacaattatat 22782385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 19303631 - 19303540
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 93  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19303631 tcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacacaggaagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 19303540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 28103887 - 28103796
Alignment:
Q  102 ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa 194  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28103887 ataattcacataatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataa 28103796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 20076730 - 20076812
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaaca 84  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  20076730 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtaaacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaaca 20076812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 2291315 - 2291184
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  2291315 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 2291218  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  2291217 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 2291184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 12742344 - 12742475
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  12742344 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 12742441  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  12742442 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 12742475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 18334727 - 18334596
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  18334727 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 18334630  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18334629 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 18334596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 19005073 - 19005204
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  19005073 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 19005170  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  19005171 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 19005204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 19859054 - 19858923
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  19859054 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 19858957  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  19858956 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 19858923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 24422574 - 24422705
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  24422574 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 24422671  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  24422672 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 24422705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 30676845 - 30676714
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  30676845 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 30676748  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  30676747 acatataattcaagtaatgcatatataattatat 30676714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 33861821 - 33861952
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  33861821 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 33861918  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  33861919 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 33861952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 33864305 - 33864436
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  33864305 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 33864402  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  33864403 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 33864436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 18409918 - 18409826
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 93  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18409918 tcatgcagctcagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 18409826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 20361051 - 20360955
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  20361051 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 20360955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 158
Target Start/End: Original strand, 18696569 - 18696675
Alignment:
Q  52 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 150  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| || |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||||    
T  18696569 tcatgatataacaatatc-aaagcaaatcaataacatctccaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatta 18696667  T
Q  151 gatcatat 158  Q
     |||||||    
T  18696668 aatcatat 18696675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 16920721 - 16920634
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 90  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||  |||||||| ||||  ||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  16920721 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtatacaa--catcatgacataagtatatcaaattccattcatcaacatct 16920634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 17287887 - 17287791
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||  || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  17287887 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatat 17287791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 160
Target Start/End: Original strand, 18706387 - 18706495
Alignment:
Q  52 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 150  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| |    
T  18706387 tcatgatataacaatatc-aaagcaaatcaataacatcttaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatgacattattaacaacatca 18706485  T
Q  151 gatcatatta 160  Q
     |||||||||    
T  18706486 aatcatatta 18706495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 25629446 - 25629354
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 93  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||| |  |||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25629446 tcatgcagcttagttaaattac-aacaggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 25629354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 25688529 - 25688620
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||| ||||||    
T  25688529 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacata-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaactgcaagtcaacaacgtctcaa 25688620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 20557027 - 20556898
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||  |||| |||||| ||||||| |||||||| |||| ||| |||    
T  20557027 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatggcataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctc-aatttca 20556931  T
Q  100 -acataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
     | ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20556930 catataattcaagtaatgcatatacaattatat 20556898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 1541046 - 1540918
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  1541046 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 1540949  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaatta 128  Q
    ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  1540948 acatataattcaagtaatgcatatacaatta 1540918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Original strand, 22831533 - 22831568
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatag 36  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22831533 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 22831568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 20638374 - 20638285
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 90  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||| | ||||||||    
T  20638374 tcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaatttatcaacatct 20638285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 34963400 - 34963531
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  34963400 tcatgcaacttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 34963497  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  34963498 acatataattcaagtaatgcatatataattatat 34963531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 35245616 - 35245703
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 90  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||| |||  || ||||| |||| |||||| | | ||||||| ||||||||    
T  35245616 tcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtatacaa--caacatgacataataatatcaatttcaattcatcaacatct 35245703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 20593803 - 20593895
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 93  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  20593803 tcatgcagctcagttaaataaa-aacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 20593895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 23076760 - 23076955
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcat--catgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||   ||| |||  |  ||||||| |||||| | ||  | ||||||||| || ||| |||    
T  23076760 tcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaacaacaacttaaacatc 23076859  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa 194  Q
    | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | ||||| |  || |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23076860 atatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatat-caggcttactgaaacaacaacagtaagataa 23076955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 25656656 - 25656731
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 77  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  25656656 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacatag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 25656731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 18896304 - 18896256
Alignment:
Q  102 ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 150  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  18896304 ataattcacataatgcatatacaattatatcccattactaacaacatta 18896256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 6214 - 6021
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||| ||| |    
T  6214 tcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcattaacatcataaacatcaa 6115  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  6114 acataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaataacagcaagataa 6021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 112; Significance: 8e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10630 - 10428
Alignment:
Q  3 atgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aac 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  10630 atgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaac 10531  T
Q  102 ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaactt 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| || ||||||| |||||| ||||||||    
T  10530 ataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaacaacaacaagataaacaactt 10432  T
Q  201 agtt 204  Q
    ||||    
T  10431 agtt 10428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 112; Significance: 8e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 6641 - 6843
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | || |||   ||| |||||    
T  6641 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcgaatgcaagttatcatcattataaacatcaa 6740  T
Q  101 -cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 198  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  6741 acataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcata-taattcaagcttactaaaacaacaacagcaagataaacaac 6839  T
Q  199 ttag 202  Q
    ||||    
T  6840 ttag 6843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 14021 - 14223
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | || |||   ||| |||||    
T  14021 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcgaatgcaagttatcatcattataaacatcaa 14120  T
Q  101 -cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 198  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  14121 acataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcata-taattcaagcttactaaaacaacaacagcaagataaacaac 14219  T
Q  199 ttag 202  Q
    ||||    
T  14220 ttag 14223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 32566 - 32769
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  32566 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaacatcaa 32664  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||    
T  32665 acataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaaaaacattagattata-taattcaggcttactgaaacaataacaacaagataaacaac 32763  T
Q  199 ttagtt 204  Q
    ||||||    
T  32764 ttagtt 32769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 22761 - 22613
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  22761 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaa 22662  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 148  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  22661 acataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 22613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 129935 - 130139
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  129935 tcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaa 130034  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |  ||||||  | |||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  130035 acataattcatgtaatgtatatacaattatataacattgtaaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttactggaacaacaacagcaagataaacaac 130133  T
Q  199 ttagtt 204  Q
    ||||||    
T  130134 ttagtt 130139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 60807 - 60713
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaa 94  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  60807 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagctcatgatataccaatatc-aatgcaaatcaacaacatctcaaa 60713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 159 - 362
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  159 tcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaa 258  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataacaact 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  |||||||| |  ||||||  | |||| || |||  || |||||||||||||||||||||    
T  259 acataattcatgtaatgtatatacaattatataatattataaacaacatcaattcatatgta-tcagtctcactagaacaacaacagcaagataacaact 357  T
Q  200 tagtt 204  Q
     ||||    
T  358 cagtt 362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 12969 - 13162
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| ||| |    
T  12969 tcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcagcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaa 13068  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa 194  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13069 acataattcgtgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattat-ccaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataa 13162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18277 - 18124
Alignment:
Q  52 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 150  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||| |    
T  18277 tcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatca 18178  T
Q  151 gatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-caacttagtt 204  Q
     | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||    
T  18177 aaacata-taattcaggcttactgaaacaacaacagtgagataagcaacttagtt 18124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 6842 - 7043
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   |||||||||| |    
T  6842 tcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatattgaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatcaa 6938  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 198  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||  | |||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  6939 acataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacattaattcatatgca-tcagtcttactggaacaacaacagcaagataaacaac 7037  T
Q  199 ttagtt 204  Q
    ||||||    
T  7038 ttagtt 7043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 53 - 204
Target Start/End: Original strand, 8097 - 8249
Alignment:
Q  53 catgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa-cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattag 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8097 catgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattag 8196  T
Q  152 atcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtt 204  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  8197 attata-taattcaggcttactgaaacaacaacagcaggataaacaacttagtt 8249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 1125 - 933
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  ||| ||| |    
T  1125 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatgcagatcatcatgatataacaacatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaa 1026  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  1025 acataattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagat--ttacaattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataa 933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 1112 - 1305
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||| ||||| ||| |    
T  1112 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatacaggtcatcaacatttcaaacatcaa 1211  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa 194  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||| ||  |||| ||||||| || ||||||| ||||||||    
T  1212 acataattcatggaatgtatatacaactatataacattaacaacaacatcaaatcata-tacatcagtcttactggaacaacaacaacaagataa 1305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 94; Significance: 4e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 160714 - 160917
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  160714 tcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaa-tcaacaacatgtcaaatatcaa 160812  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaac 198  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||  | |||| ||||| |||| ||||||| |||||| ||||||    
T  160813 acataagtcatgtaatatatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgca-tcagtcttaccgaaacaacaacaacaagataaacaac 160911  T
Q  199 ttagtt 204  Q
    ||||||    
T  160912 ttagtt 160917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 89; Significance: 4e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 45883 - 45735
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| |    
T  45883 tcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgtaagtcatcaacatctcaattatcaa 45784  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 148  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  45783 acataattcatgtgatgtatatacaattatataacattataaacaacat 45735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8165 - 7963
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||  |||    
T  8165 tcatgcagcttagttaacaaacaaacagcaacataggcagtatacaaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaaatcaacaacatcacaac-atc 8067  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 196  Q
    | | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||    
T  8066 atatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacattaaatcata-taattcaggcttactga---aacaacagcaagataaaca 7971  T
Q  197 acttagtt 204  Q
    ||||||||    
T  7970 acttagtt 7963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 29354 - 29242
Alignment:
Q  18 ataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatg 116  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| || ||| |||   ||||| |||| ||| ||| |||| || ||    
T  29354 ataacaaacagcaacataggtagtattcaaactatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatgtactg 29258  T
Q  117 tatatacaattatata 132  Q
    ||||||||||||||||    
T  29257 tatatacaattatata 29242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 136460 - 136254
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    ||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||| |||||  |||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||   |||    
T  136460 tcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatcacatc-atc 136362  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatt-agatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aac 195  Q
      ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  136361 gtacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaac 136263  T
Q  196 aacttagtt 204  Q
    |||||||||    
T  136262 aacttagtt 136254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 145168 - 144962
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    ||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||| |||||  |||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||   |||    
T  145168 tcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatcacatc-atc 145070  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatt-agatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aac 195  Q
      ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  145069 gtacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaac 144971  T
Q  196 aacttagtt 204  Q
    |||||||||    
T  144970 aacttagtt 144962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 174796 - 174886
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 93  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||  || ||||| || |  ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  174796 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacatgattatatcaaattcaattcaacaacatctcaa 174886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 77; Significance: 6e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6375 - 6169
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  6375 tcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatc 6276  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-ca 196  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||    
T  6275 atatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatcaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacagtgagataagca 6177  T
Q  197 acttagtt 204  Q
    ||||||||    
T  6176 acttagtt 6169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 77; Significance: 6e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 38346 - 38552
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  38346 tcatgcagcttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatctcaaacatc 38445  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-ca 196  Q
    | | ||||||||| ||||| |||||||  |||||  ||||||   |||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  38446 atatataattcatgtaatgcatatacatatatatcacattaatctcaacatcaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagca 38544  T
Q  197 acttagtt 204  Q
    ||||||||    
T  38545 acttagtt 38552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 73; Significance: 1e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 129061 - 128856
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  129061 tcatgcagcttagttaa-taacaaacagcaacataggcagtacataaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatc 128963  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-ca 196  Q
    | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | |||||  ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  128962 atatataattcatgtaatggatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcat-ctaaatcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagca 128864  T
Q  197 acttagtt 204  Q
    ||||||||    
T  128863 acttagtt 128856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 78352 - 78556
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||    
T  78352 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacatctcaac-atc 78449  T
Q  99 aac-ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-ca 196  Q
        ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  78450 gtttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatat-aattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagca 78548  T
Q  197 acttagtt 204  Q
    ||||||||    
T  78549 acttagtt 78556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 116457 - 116551
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||| || ||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  116457 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaacagcatgacataatcatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 116551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 71; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 53640 - 53482
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tca 99  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  53640 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattca 53541  T
Q  100 -acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcata 157  Q
     | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | ||||||    
T  53540 tatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcata 53482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 1160 - 1025
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca- 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| |||||     
T  1160 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcag 1064  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 138  Q
    || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1063 acttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 1025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 11322 - 11457
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| |||| |    
T  11322 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcaa 11418  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 138  Q
    || ||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  11419 acttaagtcatgtaatgtatatactattatataacatta 11457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 2027 - 2162
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-a 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| |||| |    
T  2027 tcatgcagcttagttaaataacaaacacaaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcaa 2123  T
Q  100 acataattcatataatgtatatacaattatataccatta 138  Q
    || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  2124 acttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 2162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 28444 - 28533
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 90  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  28444 tcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatct 28533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 68; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 12598 - 12802
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata--tc 98  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |     
T  12598 tcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatactta 12697  T
Q  99 aacataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaa 197  Q
     | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| | || |||   ||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12698 tatataattca-gtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaataatacacatt-agacttactgaaacaacaacagcaagataaacaa 12795  T
Q  198 cttagtt 204  Q
    |||||||    
T  12796 cttagtt 12802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 138
Target Start/End: Original strand, 15694 - 15826
Alignment:
Q  4 tgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aaca 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||| |||| |||     
T  15694 tgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcaaact 15790  T
Q  103 taattcatataatgtatatacaattatataccatta 138  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15791 taagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 15826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 23974 - 23897
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaat 78  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23974 tcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaat 23897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 65; Significance: 9e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 38793 - 38697
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  38793 tcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatat 38697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 65; Significance: 9e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 103720 - 103536
Alignment:
Q  3 atgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    |||||||||||||||  ||  |||||||||||||  |||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||      ||  |    
T  103720 atgcagcttagttaataaataaacagcaacataggtagtataaaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacaacaacatc------at--a 103629  T
Q  101 cataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa 194  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  103628 cataattcatgtaatgtatatacaactacataacattaacaacaacattaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacaggaagataa 103536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 1062 - 1158
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | | ||| |||||||||||||||    
T  1062 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatacgaatcatcaacatctcaaatat 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 15868 - 15792
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 77  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15868 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcgaatgcaa 15792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 159 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15765 - 15719
Alignment:
Q  159 taattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aacaacttagtt 204  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15765 taattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtt 15719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 97035 - 97241
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  97035 tcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatc 97134  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-ca 196  Q
    | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | |||||  ||  ||||||||||||||| |||||||| |||| || ||    
T  97135 atatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcat-ctatatcaggcttactgaaacaacaacagtaagaaaagca 97233  T
Q  197 acttagtt 204  Q
    ||||||||    
T  97234 acttagtt 97241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 106313 - 106519
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  106313 tcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatc 106412  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-ca 196  Q
    | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | |||||  ||  ||||||||||||||| |||||||| |||| || ||    
T  106413 atatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcat-ctatatcaggcttactgaaacaacaacagtaagaaaagca 106511  T
Q  197 acttagtt 204  Q
    ||||||||    
T  106512 acttagtt 106519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 59; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 193
Target Start/End: Original strand, 87 - 228
Alignment:
Q  52 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 150  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||| |    
T  87 tcatgatataacaatatcagatgcaaatcaataacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatataacattattaacaacatca 186  T
Q  151 gatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagata 193  Q
     ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  187 aatcat-ttaatttaggcttactgaaacaacaacagtaagata 228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 59; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 32128 - 32249
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||| |||||    
T  32128 tcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgtaa-tcatcaacgtctcaattatca 32226  T
Q  100 acataattcatataatgtatata 122  Q
    ||||||| ||| |||||||||||    
T  32227 acataatccatttaatgtatata 32249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 11494 - 11643
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaat-atca 99  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| ||||    
T  11494 tcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatca 11593  T
Q  100 -acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 148  Q
     | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  11594 catataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 11643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 38347 - 38198
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaat-atca 99  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||||||||| ||||    
T  38347 tcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatca 38248  T
Q  100 -acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 148  Q
     | ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  38247 catataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 38198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 57; Significance: 5e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 3241 - 3146
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  3241 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 3146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 57; Significance: 5e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8151 - 7945
Alignment:
Q  2 catgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tc 98  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||    
T  8151 catgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgcaaatcagctcatgatataataatatcaaatgaaattcaacaacatcttaaacattc 8052  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 196  Q
    | | ||||||||  ||||||||||| ||||||||  |||||  |||||||| | |||||| ||  |||| || |||| || |||| ||||||||| ||||    
T  8051 atatataattcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcata-tacatcagtctcactggaacaacatcagcaagataaaca 7953  T
Q  197 acttagtt 204  Q
    ||||||||    
T  7952 acttagtt 7945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 57; Significance: 5e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19976 - 19771
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||    
T  19976 tcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatctc-agcatc 19878  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-ca 196  Q
    | | |||| |||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  || ||||| | |||||| ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||| ||    
T  19877 ataaataactcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaataacatcaaatcata-taattcatgcttactggaacaacaacagtaagataagca 19779  T
Q  197 acttagtt 204  Q
    ||||||||    
T  19778 acttagtt 19771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 39943 - 40038
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  39943 tcatgcagcttaattaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcatgtcaataacatcttaaatat 40038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 55; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 18118 - 17969
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  || |||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||  |    
T  18118 tcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgcacaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaaatattca 18019  T
Q  101 c--ataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacat 148  Q
    |  ||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  18018 catataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 17969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 55; Significance: 8e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 25136 - 25268
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  25136 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacgatatc-aatgcaaatcaacaacatctcaaacatc 25234  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    | | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  25235 atatataattcatgtaatgtatatacaaatatat 25268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 160
Target Start/End: Original strand, 619 - 727
Alignment:
Q  52 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 150  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||| |    
T  619 tcatgatataacaatatc-aaagcaaatcaataacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatca 717  T
Q  151 gatcatatta 160  Q
     |||||||||    
T  718 aatcatatta 727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 54; Significance: 3e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 13158 - 13247
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 90  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  13158 tcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatct 13247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 16191 - 16098
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaa 94  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  16191 tcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaacatctcaaa 16098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 39507 - 39602
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  39507 tcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 39602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 75305 - 75210
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  75305 tcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 75210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 50; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 3277 - 3185
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 93  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  || |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  3277 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgtaattcaacaacatctcaa 3185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 50; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 27840 - 27747
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaa 94  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  27840 tcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaacatctcaaa 27747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 86
Target Start/End: Original strand, 9133 - 9193
Alignment:
Q  26 cagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaac 86  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9133 cagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaac 9193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 34153 - 34288
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||   |||| ||||||    
T  34153 tcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaacccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaa 34249  T
Q  101 -cataattcatataatgtatatacaattatataccatta 138  Q
     | ||| |||  |||| |||||||||||||||| |||||    
T  34250 acttaagtcaagtaatatatatacaattatataacatta 34288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 4879 - 4968
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 90  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4879 tcatgcagattagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaaatgcaattcaacaacatct 4968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 44798 - 44702
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  44798 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 44702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 26156 - 26064
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  26156 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaattcaacaacgtctcaa 26064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 1881 - 1977
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  1881 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 1977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 33047 - 32952
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||| |||| || ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  33047 tcatgcagcttagttaattaac-aacagcaacacaggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 32952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 45958 - 46053
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||| |||| || ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  45958 tcatgcagcttagttaattaac-aacagcaacacaggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 46053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 16143 - 16235
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| || || ||||| | |||||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  16143 tcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaacatcatctcaa 16235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 25926 - 26021
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||  ||||||| |||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  25926 tcatgaagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaatatcatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacatctcaaatat 26021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 39888 - 39983
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||  ||||||| |||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  39888 tcatgaagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaatatcatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacatctcaaatat 39983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1836 - 1696
Alignment:
Q  52 tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacatta 150  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||| | |||||| || ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||| | |    
T  1836 tcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctc-aacatcatatataatttatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacgtca 1738  T
Q  151 gatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagata 193  Q
     |||||| |||||||||||||||| || ||||| || ||||||    
T  1737 aatcata-taattcaggcttactggaacaacaatagtaagata 1696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 13241 - 13337
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  13241 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 13337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 17308 - 17214
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat---catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 93  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17308 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 17214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 20513 - 20383
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||  |    
T  20513 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-tcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattca 20416  T
Q  101 c--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    |  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20415 catataattcaagtaatgcatatacaattatat 20383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 580 - 784
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | || |||    
T  580 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacatc-ccaacatc 677  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagat-aaca 196  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||||| | ||||   ||||   | || || | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||    
T  678 atatataattcatgtaatgcatatacattaatatcatattatttaaaagatcaaatcata-taattcaggcttactgaaacaacaacagttagataaaca 776  T
Q  197 acttagtt 204  Q
    ||||||||    
T  777 acttagtt 784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 2505 - 2398
Alignment:
Q  29 caacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc-aacataattcatataatgtatatacaatt 127  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||   ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  2505 caacttagaccgtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaa---ctcaattatcaaacttaagtcatttaatgtatatacaatt 2409  T
Q  128 atataccatta 138  Q
    ||||| |||||    
T  2408 atataacatta 2398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 32972 - 33067
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| | |||||||||| ||||||    
T  32972 tcatgcagcttaattaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagttaacaacatcttaaatat 33067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 38791 - 38886
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| | |||||||||| ||||||    
T  38791 tcatgcagcttaattaaataa-caatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaataaacaacatcttaaatat 38886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 267690 - 267895
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatc 98  Q
    ||||||| |||||||||  ||| |||| |||||||  ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| || |||    
T  267690 tcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaatatctc-aacatc 267788  T
Q  99 a-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaataacaacagcaagataa-ca 196  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||| ||| | |||||| | || |||||||||||||| |||| ||| ||| ||| ||    
T  267789 atatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaccatcaaatcata-tcatccaggcttactgaaacaacagcagtaagctaagca 267887  T
Q  197 acttagtt 204  Q
    ||||||||    
T  267888 acttagtt 267895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 24394 - 24297
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa--tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||   || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  24394 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 24297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 20774 - 20905
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  20774 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 20871  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20872 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 20905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 37848 - 37979
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  37848 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 37945  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  37946 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 37979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 1319 - 1406
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 90  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||  |||||||| ||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  1319 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtacaa--catcatgacataattatatcaaattcaattcatcaacatct 1406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 7296 - 7383
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 90  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||  || ||||| ||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  7296 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa--caacatgaaataattatatcaaattcaattcatcaacatct 7383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 51612 - 51699
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 90  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||  ||| | ||| ||||||| ||||||||    
T  51612 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaa--catcatgacataattataacaaattcaattcatcaacatct 51699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 158585 - 158454
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  158585 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 158488  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  158487 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 158454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 340038 - 339949
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  340038 tcatgcagcttagttaaataac--acaacaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaat-caagtcaacaacatctcaa 339949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 1982 - 2078
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  1982 tcatgcagcttagttaattaac-aacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 2078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 10800 - 10891
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  10800 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 10891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 15554 - 15466
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 90  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| | | ||||||| ||||||||    
T  15554 tcatgcagcttagttaaataa-caagagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaatttcaattcatcaacatct 15466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 148
Target Start/End: Original strand, 225465 - 225585
Alignment:
Q  29 caacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaata-tca-acataattcatataatgtatatacaat 126  Q
    |||||||| ||||||||||| || | |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||| | ||||||||  ||||| |||||||||    
T  225465 caacatagtcagtatgcaaaacagcgtgatataataatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaat 225563  T
Q  127 tatataccattaacaacaacat 148  Q
    |||||  |||||  ||||||||    
T  225564 tatatcacattataaacaacat 225585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 13419 - 13547
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  13419 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 13516  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaatta 128  Q
    ||  ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  13517 acatataattcaagtaatgcatatacaatta 13547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 4721 - 4852
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  4721 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 4818  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  4819 acatataattcaagtaatgcatatataattatat 4852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 10514 - 10427
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 90  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||  || ||||| |||| |||||| | | ||||||||||||||||    
T  10514 tcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatct 10427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 13974 - 14105
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  13974 tcatgcagcttagataaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 14071  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  14072 acatataattcaagtaatgcatatacaattatat 14105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 1139 - 1043
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | |||  | ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  1139 tcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 1043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 13527 - 13615
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 90  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| || | |||||| | | | ||||| ||||||||    
T  13527 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacatgataatatcaatttcgattcatcaacatct 13615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 9269 - 9360
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||   ||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  9269 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 9360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 3500 - 3596
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  3500 tcatgtagcttagttaaataactaa-agcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 3596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 373 - 468
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||| ||||  | |||||  ||| |||||| | || || |||||||||||| ||||||    
T  373 tcatgcagcttagttaaataa-caacaataacataggcagtatacaaaatagcatgacgtaataatatcaattggaagtcaacaacatcttaaatat 468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 32097 - 32184
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 90  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||| |||||| | | ||||||| ||||||||    
T  32097 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtaaacaaa-caacatgacataataatatcaatttcaattcatcaacatct 32184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 51943 - 52039
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  51943 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatat 52039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 168069 - 167973
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | |||  | ||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  168069 tcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 167973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 16312 - 16397
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacat 88  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||  || ||||| ||||  ||||| ||| ||||||| ||||||    
T  16312 tcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacataattatatcaaattcaattcatcaacat 16397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 90
Target Start/End: Original strand, 20946 - 21030
Alignment:
Q  7 agcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 90  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||| || ||||| ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  20946 agcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatct 21030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 28861 - 28806
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacca-acagcaacatagacagtatgcaaatcatcat 55  Q
    |||||||||||||||||| |||   |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28861 tcatgcagcttagttaaacaacattacagcaacataggcagtatgcaaatcatcat 28806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 8620 - 8528
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||  ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  8620 tcatgcagcttagttaaataac----agcaacataggcagtatcaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatat 8528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Original strand, 40430 - 40558
Alignment:
Q  4 tgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatcaaca 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||  |||    
T  40430 tgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacaggatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcaca 40527  T
Q  103 t--aattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    |  ||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  40528 taaaattcaagtaatgcatatacaattatat 40558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 2303 - 2261
Alignment:
Q  83 caacatctcaaatatcaacataattcatataatgtatatacaa 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2303 caacatctcgaatatcaacataatccatttaatgtatatacaa 2261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 5219 - 5132
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatct 90  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||| |||  |||||||| ||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  5219 tcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggtattatacaa--catcatgacataattatatcaaattcaattcatcaacatct 5132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 97
Target Start/End: Original strand, 4544 - 4633
Alignment:
Q  8 gcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||  |||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  4544 gcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 4633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 97
Target Start/End: Original strand, 12126 - 12215
Alignment:
Q  8 gcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||  |||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  12126 gcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 12215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 97
Target Start/End: Original strand, 22078 - 22167
Alignment:
Q  8 gcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||  |||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22078 gcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 22167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 29959 - 30090
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | || || |||||||| |||||| |||      
T  29959 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgtaagtcaacaacgtctcaattattc 30056  T
Q  100 ac--ataattcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    ||  |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  30057 acatataattcaaataattcatatacaattatat 30090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 11315 - 11446
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatatca 99  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||      
T  11315 tcatgcaacttagttaaataa-caacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 11412  T
Q  100 acata--attcatataatgtatatacaattatat 131  Q
    |||||  |||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  11413 acatatgattcaagtaatgcatatataattatat 11446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 16691 - 16599
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||| || |||||| ||||||||    
T  16691 tcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatggaagtcaacagcatctcaa 16599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 4554 - 4650
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| | || || ||||| | |||||| |||  ||||||||||||||| ||||||    
T  4554 tcatgcaacttagttaaataa-caacaacagcataggcagtatgcaacagcagcaagatatcataatatcaaatataattcaacaacatcttaaatat 4650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 6215 - 6116
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataac--caacagcaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||| | ||| || ||||| || | |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  6215 tcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 6116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 97
Target Start/End: Original strand, 27912 - 27956
Alignment:
Q  53 catgatataacaatatcgaatgcaattcaacaacatctcaaatat 97  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27912 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 27956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 2705 - 2784
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaccaacagcaacatagacagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaat 78  Q
    |||||||||||||| ||   || ||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  2705 tcatgcagcttagtcaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaat 2784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University