View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5591_low_2 (Length: 518)

Name: NF5591_low_2
Description: NF5591
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5591_low_2
NF5591_low_2
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (12-518)||(17433-17938)
[»] chr2 (15 HSPs)
chr2 (12-518)||(27192646-27193152)
chr2 (12-518)||(27842460-27842966)
chr2 (12-518)||(27509531-27510037)
chr2 (12-518)||(24268626-24269132)
chr2 (12-518)||(24245982-24246486)
chr2 (12-518)||(21395527-21396033)
chr2 (12-451)||(35609877-35610315)
chr2 (14-518)||(41919755-41920235)
chr2 (236-518)||(17683609-17683891)
chr2 (258-518)||(28665985-28666234)
chr2 (258-518)||(37824819-37825068)
chr2 (14-170)||(28665754-28665910)
chr2 (14-170)||(37824588-37824744)
chr2 (202-347)||(3642920-3643065)
chr2 (12-126)||(17683469-17683583)
[»] scaffold0073 (3 HSPs)
scaffold0073 (12-518)||(32089-32595)
scaffold0073 (14-423)||(3-412)
scaffold0073 (462-518)||(19614-19670)
[»] chr5 (13 HSPs)
chr5 (12-518)||(25542349-25542855)
chr5 (12-518)||(3690134-3690640)
chr5 (12-518)||(3876147-3876653)
chr5 (12-518)||(17871195-17871699)
chr5 (14-518)||(27881241-27881745)
chr5 (12-518)||(14192368-14192874)
chr5 (14-518)||(37373093-37373597)
chr5 (12-518)||(39883340-39883838)
chr5 (12-464)||(30346185-30346637)
chr5 (12-498)||(37261482-37261966)
chr5 (14-518)||(8428143-8428636)
chr5 (12-464)||(10025189-10025641)
chr5 (12-464)||(24629509-24629954)
[»] chr8 (7 HSPs)
chr8 (14-518)||(25218123-25218627)
chr8 (12-518)||(21113300-21113806)
chr8 (14-517)||(7821996-7822499)
chr8 (14-511)||(25208605-25209102)
chr8 (277-518)||(30307334-30307575)
chr8 (14-216)||(30325934-30326136)
chr8 (462-518)||(31978533-31978589)
[»] chr4 (10 HSPs)
chr4 (14-518)||(35856064-35856568)
chr4 (14-518)||(13337392-13337896)
chr4 (12-464)||(55558679-55559131)
chr4 (12-518)||(49710330-49710835)
chr4 (163-518)||(1860834-1861189)
chr4 (188-502)||(617956-618270)
chr4 (258-518)||(38518253-38518513)
chr4 (258-518)||(49786641-49786890)
chr4 (14-169)||(13344441-13344596)
chr4 (14-169)||(49786410-49786565)
[»] chr3 (12 HSPs)
chr3 (14-518)||(10968340-10968843)
chr3 (12-518)||(32928-33434)
chr3 (12-518)||(50410329-50410831)
chr3 (12-518)||(13530196-13530702)
chr3 (12-518)||(10110757-10111263)
chr3 (12-518)||(11368805-11369301)
chr3 (13-518)||(10000564-10001069)
chr3 (35-518)||(10237712-10238194)
chr3 (14-369)||(52918332-52918687)
chr3 (12-498)||(10038807-10039282)
chr3 (258-518)||(11362416-11362678)
chr3 (412-518)||(52918223-52918328)
[»] chr6 (11 HSPs)
chr6 (12-518)||(30881484-30881988)
chr6 (115-518)||(2201838-2202241)
chr6 (12-423)||(12517526-12517937)
chr6 (188-518)||(18344282-18344612)
chr6 (258-518)||(10187701-10187961)
chr6 (301-518)||(15333800-15334017)
chr6 (375-518)||(29639947-29640090)
chr6 (12-126)||(10188571-10188685)
chr6 (12-119)||(2200454-2200561)
chr6 (375-518)||(31510118-31510261)
chr6 (258-367)||(18814054-18814163)
[»] chr1 (10 HSPs)
chr1 (30-514)||(2452690-2453175)
chr1 (12-518)||(16042182-16042688)
chr1 (12-518)||(36207372-36207878)
chr1 (16-518)||(6310554-6311056)
chr1 (14-518)||(37389710-37390214)
chr1 (12-508)||(2329333-2329829)
chr1 (41-518)||(48774920-48775397)
chr1 (12-464)||(52500795-52501240)
chr1 (188-518)||(48233535-48233865)
chr1 (289-518)||(18148845-18149074)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (12-518)||(186711-187215)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (12-518)||(182968-183474)
scaffold0003 (110-518)||(165688-166098)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (12-518)||(320892-321398)
[»] chr7 (9 HSPs)
chr7 (12-518)||(9000701-9001207)
chr7 (12-518)||(21069618-21070124)
chr7 (12-518)||(22843961-22844466)
chr7 (78-518)||(5828177-5828617)
chr7 (14-518)||(12780706-12781210)
chr7 (12-464)||(42232210-42232663)
chr7 (14-518)||(7036877-7037381)
chr7 (258-518)||(12785791-12786040)
chr7 (14-170)||(12785560-12785716)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (12-518)||(4816-5322)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (12-518)||(19163-19668)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (12-518)||(124-634)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (12-464)||(28275-28727)
[»] scaffold1139 (2 HSPs)
scaffold1139 (272-518)||(1157-1403)
scaffold1139 (12-218)||(1474-1680)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (12-341)||(13833-14162)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (258-494)||(39937-40173)
scaffold0107 (12-216)||(42434-42638)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (258-518)||(48749-48998)
scaffold0090 (14-170)||(48518-48674)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (470-518)||(16841-16889)


Alignment Details
Target: scaffold0356 (Bit Score: 403; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Original strand, 17433 - 17938
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17433 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctgcaaagttaatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 17532  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  17533 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagacctttccgtggaatgacaagagttttatgtggt 17632  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||  || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  17633 gatttcaggcagctattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggc-ttttgtaatgtgt 17731  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||      
T  17732 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttagcaagtggatactctcaattggagacag 17831  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 511  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17832 caacgaagcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 17931  T
Q  512 gtgtatc 518  Q
    |||||||    
T  17932 gtgtatc 17938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 27193152 - 27192646
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27193152 catcatcgcttatgatggaaaaggatagtcctagggctgacctggtgcgtgctgcaaaattgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 27193053  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  27193052 ctttgaggcagttgaccgatcaatgcgttatatcatgtacaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttggtggaatgacaatagttttaggtggt 27192953  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||||||||| || |||| | ||| ||||||| ||||||  || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  27192952 gatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgtaatttgt 27192853  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||  |||     
T  27192852 tgaggctgattgttaatatgagattgggtgcatctttgatacctgtagagcaggaagaaattcataattttgacaagtggatactctcaactggtgacgg 27192753  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 511  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27192752 caacgacgcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttatagacttt 27192653  T
Q  512 gtgtatc 518  Q
    |||||||    
T  27192652 gtgtatc 27192646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 27842966 - 27842460
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27842966 catcatcgcttatgatggaaaaggatagtcctagggctgacctggtgcgtgctgcaaaattgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 27842867  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  27842866 ctttgaggcagttgaccgatcaatgcgttatatcatgtacaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttggtggaatgacaatagttttaggtggt 27842767  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||||||||| || |||| | ||| ||||||| ||||||  || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  27842766 gatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgtaatttgt 27842667  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||  |||     
T  27842666 tgaggctgattgttaatatgagattgggtgcatctttgatacctgtagagcaggaagaaattcataattttgacaagtggatactctcaactggtgacgg 27842567  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 511  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27842566 caacgacgcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttatagacttt 27842467  T
Q  512 gtgtatc 518  Q
    |||||||    
T  27842466 gtgtatc 27842460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 27510037 - 27509531
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||| || ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27510037 catcattgcttacgatgcaaaaggacagacctagggcagatctggtgcatgctgcaaagttgataatttaggatgaggcttcaatgatgcaccgatggtg 27509938  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||  || ||||||||||    
T  27509937 ttttgaggcagttgaccgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaatgagtttagacattttggtggaatgacagtagttttaggtggt 27509838  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||||||||| || |||| | ||| |||| || ||||||  |  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  27509837 gatttcaggcagatattgcctgttgtccaaaaaggaacgagacaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgtaatgtat 27509738  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||      
T  27509737 tgaggcttactgttaatataagattgggtgcatctttgctacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtagatactctcaattggagacag 27509638  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 511  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27509637 caacgacgcttcagatgagaatggtgagatgaaggtagaaattcctaaagatttgctcatgtcggacacaacaaattcgttgatatcacttatagacttt 27509538  T
Q  512 gtgtatc 518  Q
    |||||||    
T  27509537 gtgtatc 27509531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Original strand, 24268626 - 24269132
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24268626 catcatcgcttacgatggaaaatgatagtcctaggacagacctggtgcatgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccactgatgcactgatggtg 24268725  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  24268726 ttttgaggcagttgaccgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacaagtttaaaccatttggtggaatgacaatagttttaggtggt 24268825  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||| ||||| || |||| | ||| ||||||| ||||||  || || |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||| || ||||||||    
T  24268826 gatatcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcacagatatgtgcttattttaatgtgt 24268925  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    ||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  24268926 tgacgcttattgttaatatgcgattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaagtggatactctgaattggagacgg 24269025  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 511  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24269026 caacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttatagacttt 24269125  T
Q  512 gtgtatc 518  Q
    |||||||    
T  24269126 gtgtatc 24269132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 24246486 - 24245982
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||     
T  24246486 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacttggtgcgtgctgcaaagttgataatttg--atgaggctccaatgatgcactgatggta 24246389  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |  || ||||||||||    
T  24246388 ttttgaggcagttgaccgatcaatacgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaatgagtttagaccttttggtggaatcatagtagttttaggtggt 24246289  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaca-ggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtg 310  Q
    ||||| ||| || |||| ||||| ||||||| | ||||    | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24246288 gatttaaggcagatattgcatgttgtccgaaaaaggaatgatgcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgtaatgtg 24246189  T
Q  311 ttgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacg 410  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||    
T  24246188 ttgaggcttactgttaatatgagattgg-tgaatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatgttggcatgtggattctctcaattggagacg 24246090  T
Q  411 acaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactt 510  Q
     |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  24246089 gcaacgacgctttggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctaaagatttgctcataacggacacaacaaatccgtggatgtcacttatagacct 24245990  T
Q  511 tgtgtatc 518  Q
    ||||||||    
T  24245989 tgtgtatc 24245982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 21396033 - 21395527
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21396033 catcatcgcttaagatgctaaaggatagtcctagggcagacttggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 21395934  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||   || ||||||||||    
T  21395933 ttttgaggctgttgaccgatcattgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgcgcttaaaccttttggtggaatgaccgtagttttaggtggt 21395834  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||||| ||| || |||| | ||| ||||||  ||||||  ||  | |||||||||| |||||  ||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  21395833 gattttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctccgtcaattcgtcaaagttatgggcttattgtaatgtgt 21395734  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  21395733 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagatcaggaagaaattgctaatttcggcaagtggatactctcaattggagacgg 21395634  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 511  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21395633 caacgatgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgttgatgtcgcttatagacttt 21395534  T
Q  512 gtgtatc 518  Q
    || ||||    
T  21395533 gtatatc 21395527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 12 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 35610315 - 35609877
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35610315 catcatcacttacgatggaaaaggatagtcctaaggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatg-tgcaccgatggtg 35610217  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    |||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||   | ||||||||||    
T  35610216 ttttgaagcaattgaccgatcaatacgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttggtagaatgacagttgttttaggtggt 35610117  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||||||||| |  |||| | ||| | ||||| ||||||  || || |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  35610116 gatttcaggcatatattgcctgttgcccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgccccaatcaattcattaaagatatggacttattataatgtgt 35610017  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  35610016 tgaggcttactgttaatatgacattgggtgcatcttcggtacctttagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggagacgg 35609917  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaa 451  Q
    |||||| | |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  35609916 caacgaagtttcggatcagaatggtgaaatgaaggtagaa 35609877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 518
Target Start/End: Original strand, 41919755 - 41920235
Alignment:
Q  14 tcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41919755 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 41919854  T
Q  114 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 213  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||| ||             ||      
T  41919855 ttgaggcagttgaccgatcattgcttgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgcacttaaaccttttggtggaatggca-------------gtag 41919941  T
Q  214 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttg 313  Q
    ||| ||| || |||| | ||| ||||||  ||||||  ||   ||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  41919942 ttttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccatatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttg 41920041  T
Q  314 aggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgaca 413  Q
    |||||| ||           ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  41920042 aggcttgct-----------attggatgcatctttggtacctgtagagcaggaagaaattgataatttttgcaagtggatactctcaattggagacggca 41920130  T
Q  414 acgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 513  Q
    |||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41920131 acgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 41920230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 236 - 518
Target Start/End: Original strand, 17683609 - 17683891
Alignment:
Q  236 gtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttgaggcttactgttaatattagat 335  Q
    ||||||| ||||||  || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  17683609 gtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgagcttattgtaatgtgttaaggcttattgttaatatgagat 17683708  T
Q  336 tgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatgg 435  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  17683709 tgggtgcatcttcgatacctgtagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcagatgagaatgg 17683808  T
Q  436 tgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatc 518  Q
    | |||||||||||||| ||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17683809 taaaatgaaggtagaaattcctgaatattcgctcatattggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatc 17683891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 258 - 518
Target Start/End: Original strand, 28665985 - 28666234
Alignment:
Q  258 atattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgc 357  Q
    |||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           ||||| |||||||||||||||| |    
T  28665985 atattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttgaggcttgct-----------attggatgcatcttcggtacctac 28666073  T
Q  358 agagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcct 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  28666074 agagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcct 28666173  T
Q  458 aaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatc 518  Q
     |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28666174 gaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatc 28666234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 258 - 518
Target Start/End: Original strand, 37824819 - 37825068
Alignment:
Q  258 atattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgc 357  Q
    |||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           ||||| |||||||||||||||| |    
T  37824819 atattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttgaggcttgct-----------attggatgcatcttcggtacctac 37824907  T
Q  358 agagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcct 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  37824908 agagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcct 37825007  T
Q  458 aaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatc 518  Q
     |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37825008 gaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatc 37825068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Original strand, 28665754 - 28665910
Alignment:
Q  14 tcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28665754 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtccttgggcagacctggtgtgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 28665853  T
Q  114 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacg 170  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28665854 ttgaggcagttgaccgatcattgcttgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacg 28665910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Original strand, 37824588 - 37824744
Alignment:
Q  14 tcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37824588 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtccttgggcagacctggtgtgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 37824687  T
Q  114 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacg 170  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37824688 ttgaggcagttgaccgatcattgcttgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacg 37824744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 202 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3643065 - 3642920
Alignment:
Q  202 tttaggtggtgatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttt 301  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| | ||| | ||||| ||||||  || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  3643065 tttaggtggtgatttcaggtagatattgcctgttgcccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttat 3642966  T
Q  302 tgtaatgtgttgaggcttactgttaatattagattgggtgcatctt 347  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3642965 tgtaatttgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctt 3642920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Original strand, 17683469 - 17683583
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17683469 catcatcgcttacgatgaaaaaggatagtcgtagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttggaatgaggctctaatgatgcaccaatggtg 17683568  T
Q  112 ttttgaggcagttga 126  Q
    |||||||||||||||    
T  17683569 ttttgaggcagttga 17683583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 32595 - 32089
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32595 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcttagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 32496  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||| | ||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||    
T  32495 ttttgaggcagctgaccgatcattgcgtgatatcatgtccaagcacgatcccgtaaacgcgcttaaaccttttggtggaatgacagtagttttaggtggt 32396  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||||||||| || |||| | ||| ||||||  ||||||  ||    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||    
T  32395 gatttcaggcagatattgcctgttgtccgacgaggaacgaggccagatattgttgatgcctcagtcaattcgtcaaagatatgtgcttattgtaatgtgt 32296  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  32295 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggatacgg 32196  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 511  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32195 caacgatgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 32096  T
Q  512 gtgtatc 518  Q
    |||||||    
T  32095 gtgtatc 32089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 412 - 3
Alignment:
Q  14 tcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  412 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctaatgcatgctgcaaagttgataatttggggtgaggctccaatgatgcaccaatggtgtt 313  T
Q  114 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 213  Q
    |||||| |||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   ||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||    
T  312 ttgaggtagttgaccgatcattacgtgatatcatgttcaagaatgatcccttaaacgcacttaaaccttttggtggaatgacagtagttttaggtggtga 213  T
Q  214 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttg 313  Q
    ||| ||| || |||| | | |  |||||  ||||||  ||  | |||||||||| | |||  ||||||| ||||| |||| | ||| ||||||||| |||    
T  212 ttttaggcagatattgccttttttccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgtctcggtcaattcgtcaaatatattggcttattgtaatgttttg 113  T
Q  314 aggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgaca 413  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  112 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaagaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggca 13  T
Q  414 acgacgcttc 423  Q
    |||| |||||    
T  12 acgatgcttc 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 462 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 19670 - 19614
Alignment:
Q  462 atttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatc 518  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19670 atttgctgatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttataaactttgtgtatc 19614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 13)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Original strand, 25542349 - 25542855
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25542349 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttaagatgaggctccaatgatgcactgatggtg 25542448  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || ||||||||||    
T  25542449 ttttgaggaagttgaccgattaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttaaaccatttggtggaatgacagtagttttaggtggt 25542548  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||||||||| || ||||   ||| ||||||| ||||||  || || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25542549 gatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgtggcagaatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgtaatgtgt 25542648  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  25542649 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcaaagcagaaagaaattgctaactttggcaagtggatactctcaattggagacgg 25542748  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 511  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25542749 caacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagattttctcatatcggacacaacaaatatgttgatgtcacttatagacttt 25542848  T
Q  512 gtgtatc 518  Q
    |||||||    
T  25542849 gtgtatc 25542855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 3690640 - 3690134
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3690640 catcatcacttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcctgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgaaccgatggtg 3690541  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||||    
T  3690540 ttttgaggcagttgaccaatcaatgcatgatatcatatccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttggtggaatgatagtagttttaggtggt 3690441  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||||||||| || ||||   ||| ||||||| ||||||  || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  3690440 gatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgtaatgtgt 3690341  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  3690340 tgaggcttacagttaatatgagattgggtgcatcttcgggacctgcagagcaggaagaaactgctaattttggcaagtggatactctcaattggagacgg 3690241  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 511  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  3690240 caacgacacttcgaatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcccaaagatttgctcatatccgatacaacaaattcgttgatgtcactaatggacttt 3690141  T
Q  512 gtgtatc 518  Q
    || ||||    
T  3690140 gtatatc 3690134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Original strand, 3876147 - 3876653
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  3876147 catcatcacttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcctgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgaaccgatgatg 3876246  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||||    
T  3876247 ttttgaggcagttgaccaatcaatgcatgatatcatatccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttggtggaatgatagtagttttaggtggt 3876346  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||||||||| || ||||   ||| ||||||| ||||||  || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  3876347 gatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgtaatgtgt 3876446  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  3876447 tgaggcttacagttaatatgagattgggtgcatcttcgggacctgcagagcaggaagaaactgctaattttggcaagtggatactctcaattggagacgg 3876546  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 511  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  3876547 caacgacgcttcgaatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcccaaagatttgctcatatccgatacaacaaattcgttgatgtcactaatggacttt 3876646  T
Q  512 gtgtatc 518  Q
    || ||||    
T  3876647 gtatatc 3876653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Original strand, 17871195 - 17871699
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||  | |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17871195 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggaagacatggtgcatgtagaaaagttgataatatggaatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 17871294  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||    
T  17871295 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgt-atatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttggtggaaagacaaaagttttaggtggt 17871393  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||||||||| || |||| |||||  |||||| ||||||  || |  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  17871394 gatttcaggcagatattgcatgtcatccgaaaaggaacgaggcatgatattgttgatgcctcaatcagttcatcaaagatatgagcttattgtaatgtgt 17871493  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |     
T  17871494 tgaggcttactgttaatatgggattgggtgcatctttggtacctgcagagcaggaataaattgctaattttggcaaatggatactctcaattagagaagg 17871593  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 511  Q
    ||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17871594 caacggcgcttcggatgag-atggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacatt 17871692  T
Q  512 gtgtatc 518  Q
    |||||||    
T  17871693 gtgtatc 17871699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 14 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 27881745 - 27881241
Alignment:
Q  14 tcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27881745 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcaaacctgatgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 27881646  T
Q  114 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 213  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||    
T  27881645 ttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgcgcttaaaccttttggtggaatgacagtagttttaggtggtga 27881546  T
Q  214 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttg 313  Q
    ||| ||| || |||| ||||| ||||||  ||||||  ||  | |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27881545 ttttaggcagatattgcatgttgtccgaggaggaacaaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcatcaaagatatgggcttattgtaatgtgttg 27881446  T
Q  314 aggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgaca 413  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  27881445 aggcttaccgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacatgcagagcaggtagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggagacggca 27881346  T
Q  414 acgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 513  Q
    |||| |||||  |||| ||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27881345 acgatgcttcggatgacaatggtgaaataaaggtagaaactcctgaagatttgctgatatcggacccaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 27881246  T
Q  514 gtatc 518  Q
    |||||    
T  27881245 gtatc 27881241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Original strand, 14192368 - 14192874
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14192368 catcatcacttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatg-tgcaccgatggtg 14192466  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccc-taaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtgg 210  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||    
T  14192467 ttttgaagcaattgaccgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatccccctaaacgagtttagaccttttggtggaatgacagttgttttaggtgg 14192566  T
Q  211 tgatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtg 310  Q
    |||||||||| |  |||| ||||| | ||||| ||||||  || || |||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||||    
T  14192567 tgatttcaggcatatattgcatgttgcccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgccccaattaattcattaaagatatgggcttattataatgtg 14192666  T
Q  311 ttgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacg 410  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  14192667 ttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgtagagtaggaagaaattgctaattttgacaagtggatactctcaattggagacg 14192766  T
Q  411 acaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactt 510  Q
     |||||| | |||  || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14192767 gcaacgaagtttcggatcagaatggtgaaatgaaggtagaaatttctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttatagactt 14192866  T
Q  511 tgtgtatc 518  Q
    ||||||||    
T  14192867 tgtgtatc 14192874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 14 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 37373597 - 37373093
Alignment:
Q  14 tcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37373597 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgagactccaatgatgcaccgatggtgtt 37373498  T
Q  114 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 213  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| ||||||| |||  || ||||||||||||    
T  37373497 ttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgcacttaaaccttttggtggaatcacagtagttttaggtggtga 37373398  T
Q  214 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttg 313  Q
    ||| | | || |||| | ||| ||| ||  ||||||  ||  | |||||||||| || ||  ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  37373397 ttttaagcagatattgcctgttgtctgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcgtcggtcaattcgtcaaagatatgggcttattgtaatgtgttg 37373298  T
Q  314 aggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgaca 413  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  37373297 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggca 37373198  T
Q  414 acgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 513  Q
    |||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37373197 acgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacataacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 37373098  T
Q  514 gtatc 518  Q
    |||||    
T  37373097 gtatc 37373093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 39883838 - 39883340
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39883838 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctaaggcagacctggtgcgtgctgcaaagctgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 39883739  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||        ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||  || |||| |||||    
T  39883738 ttttgaggcagctgaccgatcattgc--------atgtccaagaatgatcccctaaacgcgcttaaaccttttggtggaatgacagtagttttacgtggt 39883647  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||||||||| || |||| | ||| |||| |  ||||||  ||  | |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| | ||| ||||||| |||    
T  39883646 gatttcaggcagatattgcctgttgtcctaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcagtcaattcgtcaaagatattggcttattgtaatatgt 39883547  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  39883546 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcagcttcggtacatgcagagcatgaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggagacgg 39883447  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 511  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39883446 caacgacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagatattcctaaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 39883347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 12 - 464
Target Start/End: Original strand, 30346185 - 30346637
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  30346185 catcatcacttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctgatgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgagactccattgatgcactgatggtg 30346284  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  30346285 ttttgaggcagttgaccgatcaatgcgtgatatcatgtccaagattgatcccctaaacgagtttaaactatttggtggaatgacaatagttttaggtggt 30346384  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||| ||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||  || || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||    
T  30346385 gatgtcaggcagatattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaagatatgtgcttattttaatgtgt 30346484  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    | || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  30346485 taagacttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaagtggatactctgaattggagacgg 30346584  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatt 464  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  30346585 caacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatt 30346637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 37261966 - 37261482
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  37261966 catcattgcttacgatggaaaaggatagtcctaggacagacctggtgcgtgctgtaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcattgatggtg 37261867  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| |||||    
T  37261866 ttttgaggaagttgactgatcaatgcgcgatatcatgtctaggaatgatcctttaaacgagtttagacctttcggtggaatgacaatagttttatgtggt 37261767  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    |||||||||||| |||| | ||| ||| ||| ||||||  || || |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  37261766 gatttcaggaagatattgcctgttgtctgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgtctcgatcaattcatcaaagatatgagcttattgtaatgtgt 37261667  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  37261666 tgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaagaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggagacgg 37261567  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtc 498  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| || || |  |||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||    
T  37261566 caacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgcttatattggacacaacaa--ccgttgatgtc 37261482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 14 - 518
Target Start/End: Original strand, 8428143 - 8428636
Alignment:
Q  14 tcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8428143 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 8428242  T
Q  114 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 213  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||| ||  || ||||||||||||    
T  8428243 ttgaggcagttgaccgatcattgcttgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgcacttaaaccttttggtggaatggcagtagttttaggtggtga 8428342  T
Q  214 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttg 313  Q
    ||| ||| || |||| | ||| ||||||  ||||||  ||    |||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  8428343 ttttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccagatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatgggcttattgtaatgttttg 8428442  T
Q  314 aggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgaca 413  Q
    |||||| ||           ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  8428443 aggcttgct-----------attggatgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggca 8428531  T
Q  414 acgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 513  Q
    |||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8428532 acgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 8428631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 12 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 10025641 - 10025189
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  10025641 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctggggcagacctagtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccattgatgcactgatggtg 10025542  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  10025541 ttttgaggcagttgaccgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttaaaccatttggtggaatgacaatagttttaggtggt 10025442  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||| | ||| || |||| | ||  ||||||| ||||||  || | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| || | ||||||    
T  10025441 gatattaggcagatattgcctgctgtccgaaaaggaacgaggcaatatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaagatatgtgcttattttgatgtgt 10025342  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||     
T  10025341 tgagacttactgttaatatgagactgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaagtggatactctgaattagagacgg 10025242  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatt 464  Q
     ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10025241 taacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctaaagatt 10025189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 12 - 464
Target Start/End: Original strand, 24629509 - 24629954
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24629509 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggaagacctgatgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccattgatgcactgatggtg 24629608  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  24629609 ttttgaggcagttggccgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttaaaccatttggtggaatgacaatagttttaggtggt 24629708  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||| ||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||  || || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||    
T  24629709 gatatcaggcagatattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaagatatgtgcttattttaatgtgt 24629808  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||       ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24629809 tgagacttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaaga-------aatttcggcaagtggatactctgaattggagacga 24629901  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatt 464  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24629902 caacaacgcttcggatgagaatggttaaatgaaggtagaaattcctgaagatt 24629954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 7)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 14 - 518
Target Start/End: Original strand, 25218123 - 25218627
Alignment:
Q  14 tcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25218123 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 25218222  T
Q  114 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 213  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||    
T  25218223 ttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgcacttaaaccttttggtggaatgacagtagttttaggtggtga 25218322  T
Q  214 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttg 313  Q
    ||| ||| || |||| | ||| ||||||  ||||||  ||  | |||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  25218323 ttttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatgggcttattgtaatgtgttg 25218422  T
Q  314 aggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgaca 413  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  25218423 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggca 25218522  T
Q  414 acgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 513  Q
    |||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25218523 acgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 25218622  T
Q  514 gtatc 518  Q
    |||||    
T  25218623 gtatc 25218627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Original strand, 21113300 - 21113806
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21113300 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctaggacagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccattgatgcactgatggtg 21113399  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  21113400 ttttgcggcagttgaccgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacaagtttaaaccatttggtggaatgacaatagttttaggtggt 21113499  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||| ||||| || |||| | ||| ||||||| ||||||  || || |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||| || ||||||||    
T  21113500 gatatcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcacagatatgtgcttattttaatgtgt 21113599  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  21113600 tgacgcttactgttaatatgcgattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaagtggatactctgaattggagacgg 21113699  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 511  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21113700 caacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgcttatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttatagacttt 21113799  T
Q  512 gtgtatc 518  Q
    |||||||    
T  21113800 gtgtatc 21113806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 14 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 7822499 - 7821996
Alignment:
Q  14 tcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 113  Q
    ||||||||| | ||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7822499 tcatcgcttgcgatgaaagaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 7822400  T
Q  114 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 213  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    ||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||    
T  7822399 ttgaggcagttgaccgatcattgcatgatatcatgtccaaaaatgatcccctaaacacacttaaaccttttggtggaatgacagtagttttaggtggtga 7822300  T
Q  214 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttg 313  Q
    ||| ||| || |||| | | | ||||||  ||||||  ||  |  ||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  7822299 ttttaggcagatattgcctattgtccgaggaggaacgaggccgattattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatgagcttattgtaatgtgttg 7822200  T
Q  314 aggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgaca 413  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7822199 aggcttactgttaatatgagattgagtgcatcttcggtacctgtagagcaggaagaaattgcgaatttttgtaagtggatactctcaattggagacgaca 7822100  T
Q  414 acgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 513  Q
    |||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7822099 acgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 7822000  T
Q  514 gtat 517  Q
    ||||    
T  7821999 gtat 7821996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 14 - 511
Target Start/End: Original strand, 25208605 - 25209102
Alignment:
Q  14 tcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25208605 tcatcgcttacgatggaaaaggaaagtcctagggcagacctgatgcgtgctccaaagttgataatttgggatgagactccaatgatgcaccgatggtgtt 25208704  T
Q  114 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 213  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||     ||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||    
T  25208705 ttgaggcagttgaccgatcattgtgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaagacacttaaaccttttggtggaatgacagtagttttaggtggtga 25208804  T
Q  214 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttg 313  Q
    ||| ||| || |||| | |||  |||||  ||||||  ||  | |||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  25208805 ttttaggcagatattgcctgttttccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatgagcttattgtaatgtgttg 25208904  T
Q  314 aggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgaca 413  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25208905 aggcttaatgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggacgaaattactaatttttgcaagtggatactctcaattggagacgaca 25209004  T
Q  414 acgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 511  Q
    |||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25209005 acgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatgtcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 25209102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 277 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 30307575 - 30307334
Alignment:
Q  277 caattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgct 376  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30307575 caattcgtcaaagatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagtgggaagaaattgct 30307476  T
Q  377 aattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcgg 476  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||   ||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  30307475 aatttttgcaagtagatactctcaattggagacgacaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaatgtagaaattcctgaagatttgctgatatcgg 30307376  T
Q  477 acacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30307375 acacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatc 30307334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30326136 - 30325934
Alignment:
Q  14 tcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 113  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30326136 tcatcgcttacgatggaaaatgatagtcctagggcagacctggtgcatgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 30326037  T
Q  114 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 213  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||  || ||||||| ||||    
T  30326036 ttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgcacttaaaccttttggtggaatgacagtagttttaggttgtga 30325937  T
Q  214 ttt 216  Q
    |||    
T  30325936 ttt 30325934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 462 - 518
Target Start/End: Original strand, 31978533 - 31978589
Alignment:
Q  462 atttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatc 518  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31978533 atttgctgatatcgggcacaacaaatctgttgatgtcacttataaactttgtgtatc 31978589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 10)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 14 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 35856568 - 35856064
Alignment:
Q  14 tcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35856568 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 35856469  T
Q  114 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 213  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||    
T  35856468 ttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgcacttaaaccttttggtggaatgacagtagttttaggtggtga 35856369  T
Q  214 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttg 313  Q
    ||| ||| || |||| | ||| ||||||  ||||||  ||  | |||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  35856368 ttttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatgggcttattgtaatgtgttg 35856269  T
Q  314 aggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgaca 413  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  35856268 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggca 35856169  T
Q  414 acgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 513  Q
    |||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35856168 acgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 35856069  T
Q  514 gtatc 518  Q
    |||||    
T  35856068 gtatc 35856064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 14 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 13337896 - 13337392
Alignment:
Q  14 tcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13337896 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtggt 13337797  T
Q  114 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 213  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||    
T  13337796 ttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacacacttaaaccttttggtggaatgacagtagttttaggtggtga 13337697  T
Q  214 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttg 313  Q
    ||| ||| || |||| | ||| ||||||  ||||||  ||  | |||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||   || |||||||||||||    
T  13337696 ttttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatgatattattgtaatgtgttg 13337597  T
Q  314 aggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgaca 413  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13337596 aggtttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacgaca 13337497  T
Q  414 acgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 513  Q
    |||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13337496 acgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcatgaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgtttatgtcacttatagactttgt 13337397  T
Q  514 gtatc 518  Q
    |||||    
T  13337396 gtatc 13337392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 12 - 464
Target Start/End: Original strand, 55558679 - 55559131
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  55558679 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccattgatgcactgatggtg 55558778  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  55558779 ttttgaggcagttgaccgatcaatgcgtgatatcatgtccaaaaatgatcccctaaacgagtttaaaccatttggtggaatgacaatagttttaggtggt 55558878  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||| ||||| || |||| | ||| ||||||| ||||||  || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||    
T  55558879 gatatcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcagtatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaagatatgtgcttattttaatgtgt 55558978  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  55558979 tgagacttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaagtggatactctgaattggagacgg 55559078  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatt 464  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  55559079 caacaacgcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatt 55559131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 49710835 - 49710330
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49710835 catcatcgcttaagatgcaaaaggatagtcctagggcagaccttgtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcatcgatggtg 49710736  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||  |||||||||||| || ||||||||||    
T  49710735 ttttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgcgcttaaacctttcggtggaatgacaatagttttaggtggt 49710636  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||||| ||| || |||| | ||| || |||  ||||||  ||    |||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||  ||| |||||||||||    
T  49710635 gattttaggcagatattgcctgttgttcgaggaggaacgaggccagatattgttgatgcctccgtcaattcgttaaagatatgagcttattgtaatgtgt 49710536  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  49710535 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagaacagaaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggacacgg 49710436  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 511  Q
    |||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49710435 caacgatgcttcggatgaaaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatcc-ttgatgtcacttatagacttt 49710337  T
Q  512 gtgtatc 518  Q
    |||||||    
T  49710336 gtgtatc 49710330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 163 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 1861189 - 1860834
Alignment:
Q  163 cctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtgatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatatt 262  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||  | |||||||||||||||| |  |||| | ||| ||||||| ||||||  || || |||||    
T  1861189 cctaaacgagtttaaaccatttggtggaatgacaatagtgtaaggtggtgatttcaggcaaatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatatt 1861090  T
Q  263 gttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagc 362  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1861089 gttgatgcatcaatcaattcattaaagatatgggcttattttaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagc 1860990  T
Q  363 aggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaaga 462  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1860989 agaaagaaattgctaattttggcaagtggatactctgaattggagacgacaacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctaaaga 1860890  T
Q  463 tttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatc 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1860889 tttgctcatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatc 1860834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 188 - 502
Target Start/End: Original strand, 617956 - 618270
Alignment:
Q  188 ggaatgacaagagatttaggtggtgatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaa 287  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| | || |||| ||||| ||| ||| ||||||  || |  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  617956 ggaatgacaatagctttaggtggtgatttcaagcagatattgcatgttgtctgaaaaggaacgaggcatgatattgttgatgcctcaatcaattcatcaa 618055  T
Q  288 agatatggactttttgtaatgtgttgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaa 387  Q
    |||||| | ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  618056 agatataggcttattgtaatttgttgaggctaactgttaatatgagattgagtgcatctttggtatctgcagagcaggaagaaattcctaattttaacaa 618155  T
Q  388 gtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaat 487  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  618156 gtgaatactctcaattggagacgacaacgaagcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaat 618255  T
Q  488 ccgttgatgtcactt 502  Q
    ||||| |||||||||    
T  618256 ccgttcatgtcactt 618270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 258 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 38518513 - 38518253
Alignment:
Q  258 atattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgc 357  Q
    |||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38518513 atattgttaatgcctcggtcaattcgtcaaagatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgc 38518414  T
Q  358 agagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcct 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  38518413 agagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgctttgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcct 38518314  T
Q  458 aaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatc 518  Q
     |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38518313 gaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatc 38518253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 258 - 518
Target Start/End: Original strand, 49786641 - 49786890
Alignment:
Q  258 atattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgc 357  Q
    |||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           ||||| |||||||||||||||| |    
T  49786641 atattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttgaggcttgct-----------attggatgcatcttcggtacctac 49786729  T
Q  358 agagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcct 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  49786730 agagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcct 49786829  T
Q  458 aaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatc 518  Q
     |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49786830 gaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatc 49786890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13344596 - 13344441
Alignment:
Q  14 tcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13344596 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtggt 13344497  T
Q  114 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaac 169  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13344496 ttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaac 13344441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 169
Target Start/End: Original strand, 49786410 - 49786565
Alignment:
Q  14 tcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49786410 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtccttgggcagacctggtgtgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 49786509  T
Q  114 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaac 169  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49786510 ttgaggcagttgaccgatcattgcttgatatcatgtccaagaatgatcccctaaac 49786565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 12)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 14 - 518
Target Start/End: Original strand, 10968340 - 10968843
Alignment:
Q  14 tcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968340 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 10968439  T
Q  114 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 213  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  || ||||| ||||||    
T  10968440 ttgaggcagttgaccgatcaatgcatgatatcaggtccaagaatgatcccctaaacgattttagaccttttggtggaatgacagtagttttagatggtga 10968539  T
Q  214 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttg 313  Q
    ||||||| || ||||   ||| |||||||  ||| |  || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  10968540 tttcaggcagatattgtctgtagtccgaaacggatcgagggaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggtttattgtaatgtgttg 10968639  T
Q  314 aggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgaca 413  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||    
T  10968640 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcagtacctatagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggacactctcaattggagatggca 10968739  T
Q  414 acgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 513  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10968740 acgacgcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaatttct-gagatttgctgatatcggacacaacaaatccgttgatgccacttatagactttgt 10968838  T
Q  514 gtatc 518  Q
    |||||    
T  10968839 gtatc 10968843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 33434 - 32928
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33434 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcatagttgataatttgggatgaggctccgatgatgcaccgatggtg 33335  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  33334 ttttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgcacttaaaccttttggtggaatgacaatagttttaggtggt 33235  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||||| ||| || |||| ||||| ||||||  ||||||   |  | |||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  33234 gattttaggcagatattgcatgttgtccgaggaggaacgacgccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatgggcttattgtaatgtgt 33135  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||     
T  33134 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattagagacgg 33035  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 511  Q
    |||| | |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33034 caacaatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatggacttt 32935  T
Q  512 gtgtatc 518  Q
    |||||||    
T  32934 gtgtatc 32928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 50410831 - 50410329
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50410831 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgtgatgaggctccaatgatgcaccaatggtg 50410732  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  50410731 ttttgaggcagttgaccgatcaatgtgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttataccttttcgtggaatgacagtagttttaggtggt 50410632  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||||||||| || || | | ||| ||||| | || |||  || |  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||    
T  50410631 gatttcaggcagatactgcctgttgtccgtaaagcaacgaggcacgatatttttgatgcctcaatcaattcatcaaagatattggcttattctaatgtgt 50410532  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||     
T  50410531 tgaggcttactgttaatatgagattgagtgcatcttcggtacctgtagagcaggaataaattgctaattttggcaagtggatactctcaattagagacgg 50410432  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 511  Q
     ||||||||||   ||||||||||||||||||    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50410431 taacgacgctttggatgagaatggtgaaatga----agaaattcctgaagattttctcatatcggacacaacaaatccgctgatgtcacttatagacttt 50410336  T
Q  512 gtgtatc 518  Q
    |||||||    
T  50410335 gtgtatc 50410329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 13530702 - 13530196
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||    
T  13530702 catcatcgcttacgatagaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggataaggctccgatgatacaccaatggtg 13530603  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  || ||||| ||||    
T  13530602 ttttgagacagttgaccgatcaatgcgtcatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagacctttcgatggaatgacagtagttttagctggt 13530503  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||||||||| || |||| | ||| |||| || ||||||  || |  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  13530502 gatttcaggcagatattgcctgttgtccaaaaaggaacgaggcacgatattgttgatgcctcaatcaattcatcacagatatgggcttattgtaatgtgt 13530403  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||     
T  13530402 agaggcttactgttaatatgagattgagtgcatcttcggtacctgtagagcaggaataaattgctaattttggcaagtatatactctcaattggagacgg 13530303  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 511  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13530302 caacgacgcatcaggtgagaatggtgaaatgaaggtagaaattctagaagatttggtcatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 13530203  T
Q  512 gtgtatc 518  Q
    |||||||    
T  13530202 gtgtatc 13530196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 10111263 - 10110757
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  10111263 catcatctcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacttggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctctaatgatgcactgatggtg 10111164  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||| || ||||||||||    
T  10111163 ttttgaggcagttgaccgatcaatgtgtggtatcatgtccaagaatgattccctaaacgagtttaaaccatttgatggaatgacaatagttttaggtggt 10111064  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||||||||| || |||| | ||| ||||||| ||||||  || || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||    
T  10111063 gatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaagatatgagcttattttaatgtgt 10110964  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    | | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||     
T  10110963 taatgcttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctacagagcagaaagaaattgctaattttggcaagtggatactatgaattggagacgg 10110864  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 511  Q
    |||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  10110863 caacaacgcttcggaggagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcagacgcaacaaatctgttgatgtcacttacagacttt 10110764  T
Q  512 gtgtatc 518  Q
    |||||||    
T  10110763 gtgtatc 10110757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 11369301 - 11368805
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11369301 catcatcgcttaagatggaaaaggatagtcctaggca-gacctggtgcatgcttcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 11369203  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  || |||| |||||    
T  11369202 ttttgaggcagttgaccaatcaatgcatgatatcatatccaagaatgatcccctatacgagtttagaccttttggtggaatgacagtagttttaagtggt 11369103  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||||||||| |  ||||   ||| ||||||| ||||||  || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11369102 gatttcaggcatatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 11369003  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  11369002 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcgggacctgcagagaaggaagaaactgataattttggcaagtggataccctcaattggagagga 11368903  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 511  Q
    |||||         ||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11368902 caacg---------atgagaatggtgaaatgaatgtagaaattcccgaagatttgctcatatccgacacaacaaatccgttgatgtcactcatagacttt 11368812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 13 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 10001069 - 10000564
Alignment:
Q  13 atcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgt 112  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  10001069 atcatctcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacttggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctctaatgatgcactgatggtgt 10000970  T
Q  113 tttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtg 212  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||| || ||||||||| |    
T  10000969 tttgaggcagttgaccgatcaatgtgtggtatcatgtccaagaatgattccctaaacgagtttaaaccatttgatggaatgacaatagttttaggtgggg 10000870  T
Q  213 atttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgtt 312  Q
    |||||||| || | || | ||| ||||||| ||||||  || || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  10000869 atttcaggcagatgttgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaagatatgggcttattttaatgtgtt 10000770  T
Q  313 gaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgac 412  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |    
T  10000769 aaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagtagaaagaaattgttaattttggcaagtggatactatgaattggagacggc 10000670  T
Q  413 aacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttg 512  Q
    ||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  10000669 aacaacgcttcggaggagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcagatgcaacaaatctgttgatatcacttacagactttg 10000570  T
Q  513 tgtatc 518  Q
    ||||||    
T  10000569 tgtatc 10000564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 35 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 10238194 - 10237712
Alignment:
Q  35 gatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgatcgatcaa 134  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10238194 gatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctctaatgatgcactgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaa 10238095  T
Q  135 tgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtgatttcaggaagctatttcatgt 234  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  10238094 tgtgtggtatcatgtccaggaatgattccctaaacgagtttaaaccatttgatggaatgacaatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcttgt 10237995  T
Q  235 ggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttgaggcttactgttaatattaga 334  Q
     ||||||| ||||||  || || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  10237994 tgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaagatatgggcttattttaatgtgttaaggcttactgttaatataaga 10237895  T
Q  335 ttgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatg 434  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||  | | |||||    
T  10237894 ttggatgcatctttggtacctgctgagcagaaagaaattgctaattttggcaagtggatactctgaattggagacggcaacaacgcttcgga-gggaatg 10237796  T
Q  435 gtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatc 518  Q
    ||||||| | ||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10237795 gtgaaataacggtagaaattcctgaagaattgctcatatcagacgcaacaaatctgttgatgtcacttacagactttgtgtatc 10237712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 14 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 52918687 - 52918332
Alignment:
Q  14 tcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52918687 tcatcgcttacgatggaaaaggataatcctagggtagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 52918588  T
Q  114 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 213  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||    
T  52918587 ttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacaagtttagaccttttggtggaatgacagtagttttaggtggtga 52918488  T
Q  214 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttg 313  Q
    ||||||| || |||| ||||| ||||||| |||| |  || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||    
T  52918487 tttcaggcagatattgcatgtagtccgaaaaggatcgagggaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatacgagcttattgtaatgtgttg 52918388  T
Q  314 aggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaaga 369  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  52918387 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgtagagtaggaaga 52918332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 10039282 - 10038807
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||           ||     
T  10039282 catcatcgcttacgctggagaaggatagtcatagggcagacctggtgcgtactgtaaaattgataatttgggatggggctccaatg-----------gtc 10039194  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||    
T  10039193 ttttgaggaagttgactgatcaatgcgtgatatcatgtctaggaatgatcccttaaacgagtttagaccttttggtggaatgacaatagttttatgtggt 10039094  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||||||| |||| |||| ||||| ||| ||| ||||||  || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  10039093 gatttcaagaagatattgcatgttgtctgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgtaatgtgt 10038994  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||     
T  10038993 tgaggcttattgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaagaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattgaagacgg 10038894  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtc 498  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| || ||    |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  10038893 caacgacgctttagatgagaatggtgaaacgaaggtataaattttcgaagatttgcttatatcagacacaacaaatctgttgatgtc 10038807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 258 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 11362678 - 11362416
Alignment:
Q  258 atattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgc 357  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  11362678 atattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttacagttaatatgagattgggtgcatcttcgggacctgc 11362579  T
Q  358 agagcaggaagaaattgctaattttggcaagtgg--atactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttc 455  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  11362578 agagcaagaataaactgctaattttggcaagtggatatactctcaattggagacgacaacgacgcttcgaatgagaatggtgaaatgaagggggaaattc 11362479  T
Q  456 ctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatc 518  Q
    |  ||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11362478 ccgaagatttactcatatccgatacaacaaattcgttgatgtcactaatagactttgtatatc 11362416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 412 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 52918328 - 52918223
Alignment:
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 511  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||   || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||     
T  52918328 caacgacgcttcggatgggaatggtgaaatgaaggtagaaattcctga-gatttgccgttaccggacacaacaaatctgttgatgccacttatagacttc 52918230  T
Q  512 gtgtatc 518  Q
    |||||||    
T  52918229 gtgtatc 52918223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 11)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 30881988 - 30881484
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30881988 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggaagacctggtgcatgtagaaaagttgataatatggaatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 30881889  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||    
T  30881888 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgt-atatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttggtggaaagacaaaagttttaggtggt 30881790  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||||||||| || |||| |||||  |||||| ||||||  || |  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  30881789 gatttcaggcagatattgcatgtcatccgaaaaggaacgaggcatgatattgttgatgcctcaatcagttcatcaaagatatgagcttattgtaatgtgt 30881690  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |     
T  30881689 tgaggcttactgttaatatgggattgggtgcatctttggtacctgcagagcaggaataaattgctaattttggcaaatggatactctcaattagagaagg 30881590  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 511  Q
    ||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30881589 caacggcgcttcggatgag-atggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacatt 30881491  T
Q  512 gtgtatc 518  Q
    |||||||    
T  30881490 gtgtatc 30881484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 115 - 518
Target Start/End: Original strand, 2201838 - 2202241
Alignment:
Q  115 tgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtgat 214  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||     
T  2201838 tgaggcagttgaccgatcaaagcgtgatatcatgtccaagaatgaccccctaaacgagtttagaccttttggtggaatgacagtagttttaggtggtgac 2201937  T
Q  215 ttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttga 314  Q
    |||||| || |||| |   | ||||||| |||| |  || || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||| ||    
T  2201938 ttcaggcagatattgcccattgtccgaaaaggatcgaggcaggatattgttgatgcctcgatcaattcatcaaagatataggcatattgtaatgtgtcga 2202037  T
Q  315 ggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaa 414  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    
T  2202038 ggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacttgcagagcatgaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggagaaggcaa 2202137  T
Q  415 cgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtg 514  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2202138 cgacgcttcaaatgagaatggtgaaatgaatgtagaaattcccgaagatttgctcatatcgaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtg 2202237  T
Q  515 tatc 518  Q
    ||||    
T  2202238 tatc 2202241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 12 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 12517937 - 12517526
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12517937 catcatcgcttacgatggaaaatgatagtcctagggcaggcatggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 12517838  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    ||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||    
T  12517837 ttttgaggcagctgaccgatcattgtgtgatatcatgtccaagaatgatcctctaaacgcgcttaaaccttttggtggaatgacagtagttttaggtggt 12517738  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||||||||| || |||| | ||| ||||||  ||||||  ||  | |||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  12517737 gatttcaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcagttaattcgtcaaagatatgggcttattgtaatgtgt 12517638  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12517637 tgaagcttactgttaatatgagattgggtgcatcttctgttcctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggagacga 12517538  T
Q  412 caacgacgcttc 423  Q
    ||||||| ||||    
T  12517537 caacgacacttc 12517526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 188 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 18344612 - 18344282
Alignment:
Q  188 ggaatgacaagagatttaggtggtgatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaa 287  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||  || || |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18344612 ggaatgacaatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaatttatcaa 18344513  T
Q  288 agatatggactttttgtaatgtgttgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaa 387  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  18344512 agatatgggcttattgtaatttgttgaggcttactgttaatatgagattgagtgcatctttggtatctacagagcaggaagaaattcctaattttgacaa 18344413  T
Q  388 gtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaat 487  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18344412 gtgaatactctcaattggagacgacaacgaagcttcagatgagaatagtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaat 18344313  T
Q  488 ccgttgatgtcacttatagactttgtgtatc 518  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18344312 ccgttcatgtcacttatagactttgtgtatc 18344282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 258 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 10187961 - 10187701
Alignment:
Q  258 atattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgc 357  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||     
T  10187961 atattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttattgttaatatgagattgggtgcatcttcgatacctgt 10187862  T
Q  358 agagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcct 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10187861 agagcaggaagaaattgctaattttcgcacgtggatgctctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtaaaatgaaggtagaaattcct 10187762  T
Q  458 aaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatc 518  Q
     || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10187761 gaatatttgctcatattggacacaaaaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatc 10187701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 301 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 15334017 - 15333800
Alignment:
Q  301 ttgtaatgtgttgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctca 400  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15334017 ttgtaatgtgttgaagcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcgatacctgcagagcaagaagaaattgctaattttggcaagtggatactctca 15333918  T
Q  401 attggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcac 500  Q
    |||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  15333917 attggagacggcaacgacgcttcggatgagaatagtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgttgatatcgtacgtaacaaatccgttgatgtcac 15333818  T
Q  501 ttatagactttgtgtatc 518  Q
    | ||||||||||||||||    
T  15333817 taatagactttgtgtatc 15333800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 375 - 518
Target Start/End: Original strand, 29639947 - 29640090
Alignment:
Q  375 ctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatc 474  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  29639947 ctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatc 29640046  T
Q  475 ggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatc 518  Q
       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29640047 aaccacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatc 29640090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 10188685 - 10188571
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10188685 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcgtagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttggaatgaggctctaatgatgcaccaatggtg 10188586  T
Q  112 ttttgaggcagttga 126  Q
    |||||||||||||||    
T  10188585 ttttgaggcagttga 10188571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 119
Target Start/End: Original strand, 2200454 - 2200561
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  2200454 catcatcgcttacgatggaaaaagatagtcctaggggagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttggaatgaggctccaatgatgcaccgatagtg 2200553  T
Q  112 ttttgagg 119  Q
    ||||||||    
T  2200554 ttttgagg 2200561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 375 - 518
Target Start/End: Original strand, 31510118 - 31510261
Alignment:
Q  375 ctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatc 474  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||   ||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||    
T  31510118 ctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgtttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaatttcttaagatttgctgatatc 31510217  T
Q  475 ggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatc 518  Q
       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31510218 aaccacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatc 31510261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 258 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18814163 - 18814054
Alignment:
Q  258 atattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgc 357  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||     
T  18814163 atattgttgatcccttaatcaattcatcaaagatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcgttggtacctgt 18814064  T
Q  358 agagcaggaa 367  Q
    ||||||||||    
T  18814063 agagcaggaa 18814054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 10)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 30 - 514
Target Start/End: Original strand, 2452690 - 2453175
Alignment:
Q  30 aaaaggatagtcctaggga-agaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgatc 128  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2452690 aaaaggatagtcctaggggcagacctggtgcgtgctgtaatgttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgatc 2452789  T
Q  129 gatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtgatttcaggaagctatt 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  2452790 gatcaatgtgtgatatcatgtccaagaatgaccccttaaacgagtttagaacttttggtggaatgacagtagttttaggtggtgatttcaggaagatatt 2452889  T
Q  229 tcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttgaggcttactgttaat 328  Q
     |   | ||||||| |||| |  || || |||||||||| || |||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2452890 gcccattgtccgaaaaggatcgaggcaggatattgttgatgcttcaatcaattcatcaaagatataggcatattgtaatgtgtcgaggcttactgttaat 2452989  T
Q  329 attagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatg 428  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  2452990 atgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcatgaagaaattgctaattttgacaagtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcaaatg 2453089  T
Q  429 agaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtg 514  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2453090 agaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcgaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtg 2453175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 16042688 - 16042182
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16042688 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctcaaatgatgcaccgatggtg 16042589  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    ||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||  || |||| |||||    
T  16042588 ttttgaggcagctgactgatcattgtgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgcgcttaaaccttttggtggaatgacagtagttttacgtggt 16042489  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||||||||| || |||| | ||| |||| |  ||||||  ||  | |||||||||| |||||| | ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||    
T  16042488 gatttcaggcagatattgcctgttgtcctaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcagttaattcgtcaaagatattggcttattgtaatgtgt 16042389  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16042388 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcagcttcggtacatgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggagacgg 16042289  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 511  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16042288 caacgacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgttgatgtcgcttatagacttt 16042189  T
Q  512 gtgtatc 518  Q
    |||||||    
T  16042188 gtgtatc 16042182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 36207878 - 36207372
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  36207878 catcatcgcttacgatggaaaagaatagtcctagggtagacctggtgcgtgctgcaacgttgataatttgggatgaggctccaatcatgcactaatggtg 36207779  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||    
T  36207778 ttttgaggcagttgactgatcaatgtgtgataccatgtccaagaatgatcccttaaatgagtttagaccttttggtggaatgacagtagttttaggtggt 36207679  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||||||||  || |||| | ||| ||| ||| |||||   || || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  36207678 gatttcagacagatattgcctgttgtctgaaaaggaaagaggcaggatattattgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgagtttattgtaatgtgt 36207579  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||     
T  36207578 tgaggcttactgttaatatgagattgggttcatcttcggtacctgcaaagcaggaagaaattgataattttggcaagtggatactctcaattgaagacgg 36207479  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 511  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36207478 caacgacgcttcggatgagaatggtgaattgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccgacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 36207379  T
Q  512 gtgtatc 518  Q
    |||||||    
T  36207378 gtgtatc 36207372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 16 - 518
Target Start/End: Original strand, 6310554 - 6311056
Alignment:
Q  16 atcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtttt 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6310554 atcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctgatgcatgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtttt 6310653  T
Q  116 gaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtgatt 215  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  6310654 gaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgcacttaaaccttttggtggaacgacaatagttttaggtggtgatt 6310753  T
Q  216 tcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttgag 315  Q
    | ||| || ||||   ||| ||||||  |||||   ||    |||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  6310754 ttaggcagatattgtctgttgtccgaggaggaatgaggcctgatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatgggcttattgtaatgtgttgag 6310853  T
Q  316 gcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaac 415  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| ||||    
T  6310854 gcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatagtctccattggagacggcaac 6310953  T
Q  416 gacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgt 515  Q
    || |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6310954 gatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagattcgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgt 6311053  T
Q  516 atc 518  Q
    |||    
T  6311054 atc 6311056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 14 - 518
Target Start/End: Original strand, 37389710 - 37390214
Alignment:
Q  14 tcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||    
T  37389710 tcatcgcttacaatggaaaaggatagtcccagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgagactccaatgatacaatgatggtgtt 37389809  T
Q  114 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 213  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||   ||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  37389810 ttgaggcagttgaccaatcattgcgtgatatcatggccaagaatgatcccttaaacgcacttaaaccttttggtggaatgacaatagttttaggtggtga 37389909  T
Q  214 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttg 313  Q
    ||| ||| || |||| | ||| ||||||  ||||||  ||  | |||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  37389910 ttttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggctggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatgggcttattgtaatgtgttg 37390009  T
Q  314 aggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgaca 413  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  37390010 aggcttactattaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatattctcaattggagacggca 37390109  T
Q  414 acgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 513  Q
    | || |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37390110 aagatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 37390209  T
Q  514 gtatc 518  Q
    |||||    
T  37390210 gtatc 37390214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 12 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 2329829 - 2329333
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||| |||   ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2329829 catcatcgcttactatggaaaaggacagtcctagggcagacctggtgtgtgctgcaaagttgataattttttatgagtctccaatgatgcaccaatggtg 2329730  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    |||||||  |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |   | ||||||||||    
T  2329729 ttttgagaaagtttaccgatcaatgtgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacaagtttagaccttttcgtggaatgatagtggttttaggtggt 2329630  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||||||||| || || | | ||| |||||   || |||  || |  |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  2329629 gatttcaggcagatactacctgttgtccgtgaagcaacgaggcacgatattgttaatgccttaatcaattcatcaaagatatgggcttattgtaatatgt 2329530  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||     
T  2329529 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcctcttcgttacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattagagacgg 2329430  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagac 508  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2329429 caacgacgcttcggatgagaatggtaaaatgaaggtagaaattcctgaagattttctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagac 2329333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 41 - 518
Target Start/End: Original strand, 48774920 - 48775397
Alignment:
Q  41 cctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtg 140  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||    
T  48774920 cctagggcagacctggtgcgtgcttcaaagttgataatttgtgatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaagcagttgaccaatcaatgcatg 48775019  T
Q  141 atatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtgatttcaggaagctatttcatgtggtccg 240  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||   || ||||||||||||||||||  |  ||||  |||| |||||    
T  48775020 atatcatatccaagaatgatcccttaaacgagtttagaccttttggaggaatgacggtagttttaggtggtgatttcagacaaatattgtatgttgtccg 48775119  T
Q  241 aacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttgaggcttactgttaatattagattgggt 340  Q
    || ||||||  || || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48775120 aaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaatatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatcagattgggt 48775219  T
Q  341 gcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaa 440  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  48775220 gcatcttcgggacctacagagcagaaagaaactgctaattttggcaagtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcgaatgagaatggtgaaa 48775319  T
Q  441 tgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatc 518  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  48775320 tgaaggtagaaattcccgaagatttgctcatatccgacacaacaaattctttgatgtcactaatacactttgtatatc 48775397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 12 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 52501240 - 52500795
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  52501240 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggaagacctgatgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccattgatgcactgatggtg 52501141  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  52501140 ttttgaggcagttggccgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttaaaccatttggtggaatgacaatagttttaggtggt 52501041  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||| ||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||  || || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||    
T  52501040 gatatcaggcagatattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaagatatgtgcttattttaatgtgt 52500941  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||       ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  52500940 tgagacttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaaga-------aatttcggcaagtggatactctgaattggagacga 52500848  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatt 464  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  52500847 caacaacgcttcggatgagaatggttaaatgaaggtagaaattcctgaagatt 52500795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 188 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 48233865 - 48233535
Alignment:
Q  188 ggaatgacaagagatttaggtggtgatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaa 287  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||| | ||| ||||||| ||||||  |  || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48233865 ggaatgacaatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgagacaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaa 48233766  T
Q  288 agatatggactttttgtaatgtgttgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaa 387  Q
    |||||||   || ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  48233765 agatatgtgtttattgtaatttgttgaggcttactgttgatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcaggaagaaattcctaattttgacaa 48233666  T
Q  388 gtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaat 487  Q
    ||| |||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  48233665 gtgaatactctcaacttgagacgacaacgacgcttcagatgagaatggggaaatgaaggtagaaattcctgaagatttactcatatcgaacacaacaaat 48233566  T
Q  488 ccgttgatgtcacttatagactttgtgtatc 518  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48233565 ccgctgatgtcacttatagactttgtgtatc 48233535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 289 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 18149074 - 18148845
Alignment:
Q  289 gatatggactttttgtaatgtgttgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaag 388  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18149074 gatatggacttattttaatgtgttaaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 18148975  T
Q  389 tggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 488  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||  |||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18148974 tggatactctgaattggagacggcaataacgcttcgaaggagaatggtgaaatgaaggtagaaatttatgaagattttctcatatcggacacaacaaatc 18148875  T
Q  489 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatc 518  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18148874 tgttgatgtcacttatcgactttgtgtatc 18148845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 187215 - 186711
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||    
T  187215 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcac--ctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgagatgaggctccaatgatgcactcatggtg 187118  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || ||||||||||    
T  187117 ttttgaggtagttgaacgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttaaaccatttggtggaatgacagtagttttaggtggt 187018  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||||||| | || |||| | ||| ||||||| ||||||  || || |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  187017 gatttcaagcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcaccaatcaattcatcaaagatatgggcttattgtaatgttt 186918  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  186917 taaggcctactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacttgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggagacgg 186818  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 511  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  186817 caacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcgtacacaacaaatctgttgatgtcacttatagacttt 186718  T
Q  512 gtgtatc 518  Q
    |||||||    
T  186717 gtgtatc 186711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 183474 - 182968
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  183474 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttaataatttgggattaggctccaatgatgtaccgatggtg 183375  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||||    
T  183374 ttttgaggcagttgaccaatcaatgcatgatatcatatccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttggtggaatgatagtagttttaggtggt 183275  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||||||||| || ||||   ||| ||||||| |||||   || || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  183274 gatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaatgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaagatatggccttattgtaatgtgt 183175  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  183174 tgaggcttacagttaatatgatattgggtgcatcttcgggacctgcagagcaggaagaaactgctaattttggcaagtggatactctcaattggagacgg 183075  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 511  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  183074 caacgacgcttcgaatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcccgaagatttgctcatatccgatacaacaaattcgttgatgtcactaatagacttt 182975  T
Q  512 gtgtatc 518  Q
    || ||||    
T  182974 gtatatc 182968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 110 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 166098 - 165688
Alignment:
Q  110 tgttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtg 209  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||    
T  166098 tgttttgaggcagttgaccaatcaatgcatgatatcatatccaagaatgatcacctaaacgagtttagaccttttggtggaatgatagtagttttaggtg 165999  T
Q  210 gtgatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgt 309  Q
    ||||||||||| || ||||   ||| ||||||| ||||||  || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  165998 gtgatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgtaatgt 165899  T
Q  310 gttgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtgg--atactctcaattggaa 407  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  165898 gttgaggcttacagttaatatgagattgggtgcatcttcgggacctgcagagcaagaataaactgctaattttggcaagtggatatactctcaattggag 165799  T
Q  408 acgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttataga 507  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  165798 acgacaacgacgcttcgaatgagaatggtgaaatgaagggggaaattcccgaagatttactcatatccgatacaacaaattcgttgatgtcactaataga 165699  T
Q  508 ctttgtgtatc 518  Q
    |||||| ||||    
T  165698 ctttgtatatc 165688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Original strand, 320892 - 321398
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    |||||||||||   || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  320892 catcatcgcttgtgatagaaaaggatagtcctagggaagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatacatcgatggtg 320991  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  320992 ttttgaggcatttgatcgatcaatgggtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacaactttagaccttttggtggaatgacaagagttttaggtggt 321091  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||||||||| || ||||   ||| ||||||| ||||||  || || |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  321092 gatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgccttaatcaattcatcaacgatatgggcttattgtaatgtgt 321191  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||     
T  321192 tgaggcttacttttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatattctcaatttgagacgg 321291  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 511  Q
    |||  | |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  321292 caattatgcttcggttgataatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacaaaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 321391  T
Q  512 gtgtatc 518  Q
     ||||||    
T  321392 ttgtatc 321398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Original strand, 9000701 - 9001207
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9000701 catcatcgcttaagatggaaaaggatagtcctagggcagacctgatgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 9000800  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||  || ||||||| ||    
T  9000801 ttttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgcgcttaaaccttttggtggaatgacagtagttttaggttgt 9000900  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||||| ||| || |||| | | | ||||||  ||||||  ||  | |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9000901 gattttaggcagatattgcctattgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcagtcaattcgtcaaagatatgggcttattgtaatgtgt 9001000  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  9001001 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcatagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggatacgg 9001100  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 511  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9001101 caacgatgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcttgaagatttgttgatatcggacacaacaaatccgttgatgtctcttatagacttt 9001200  T
Q  512 gtgtatc 518  Q
    || ||||    
T  9001201 gtttatc 9001207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Original strand, 21069618 - 21070124
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| | | ||||||||||||||| |  |||||||    
T  21069618 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaacttgataatttcgaacgaggctccaatgatgtattgatggtg 21069717  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  || ||||||||||    
T  21069718 ttttgaggcatttcatcggtcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccatttggtggaatcacagtagttttaggtggt 21069817  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||||||||| || |||| | ||| ||||||| ||||||  || || |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||| |    
T  21069818 gatttcaggtagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcattaaagatatgggtttattgtaatgtat 21069917  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  21069918 cgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttgacaagtggatactctcaattggagacgg 21070017  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 511  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21070018 caacgacgtttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 21070117  T
Q  512 gtgtatc 518  Q
    |||||||    
T  21070118 gtgtatc 21070124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 22844466 - 22843961
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22844466 catcatcgcttacgattgaaaaggatagtcctagggaagacctggtgcatgtagcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 22844367  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||    
T  22844366 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttggtggaaagacaaaagttttaggtggt 22844267  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||||||| | || |||| |||||  |||||| ||||||  || |  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  22844266 gatttcatgcagatattgcatgtcatccgaaaaggaacgaggcatgatattgttgatgcctcaatcagttcatcaaagatatgagcttattgtaatgtgt 22844167  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || | |     
T  22844166 tgaggcttactgttaatatgggattgggtgcatctttggtacctgtagagcaggaataaattgctaattttggcaattggatactcttaattagagaagg 22844067  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 511  Q
    ||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  22844066 caacgtcgcttcggatgag-atggtgaaatgaaggtagaaattcttgaagatttgctcatatctgacacaacaaatctgttgatgtcacttatagacatt 22843968  T
Q  512 gtgtatc 518  Q
    |||||||    
T  22843967 gtgtatc 22843961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 78 - 518
Target Start/End: Original strand, 5828177 - 5828617
Alignment:
Q  78 tttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttag 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5828177 tttgggatgaggctccaatgatgcactgatggtgttttgaggcagttgatcgatcaatgtgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttaa 5828276  T
Q  178 accttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtgatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatc 277  Q
    ||| ||| ||||||||| |  || ||||||||||||||||||| || |||| | ||| ||||||| ||||||  || || |||||||||| || ||||||    
T  5828277 accatttggtggaatgatattagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatc 5828376  T
Q  278 aattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgcta 377  Q
    ||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5828377 aattcatcaaagatatgggtttattttaatgtgttgaggcttactattaatatgagattgagtgcatcttcggtacctgcagagcagaaagaaattgcta 5828476  T
Q  378 attttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcgga 477  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5828477 attttggcaagtggatactctgaattggagacggcaacaacgcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcgga 5828576  T
Q  478 cacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatc 518  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5828577 cacaacaaatcttttgatgtcacttatagactttgtgtatc 5828617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 14 - 518
Target Start/End: Original strand, 12780706 - 12781210
Alignment:
Q  14 tcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12780706 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctacaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 12780805  T
Q  114 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 213  Q
    ||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  12780806 ttgaggcagttgtccgatcattgtttgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgcacttaaaccttttggtggaatgacaatagttttaggtggtga 12780905  T
Q  214 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttg 313  Q
    ||| ||| || | || | ||| |||| |  ||||||  ||  | |||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  12780906 ttttaggcagatgttgcctgtagtccaaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatgagcttattgtaatgtgttg 12781005  T
Q  314 aggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgaca 413  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12781006 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgtagagcaagaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacgaca 12781105  T
Q  414 acgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 513  Q
    | || |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12781106 atgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatataagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 12781205  T
Q  514 gtatc 518  Q
    |||||    
T  12781206 gtatc 12781210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 12 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 42232663 - 42232210
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  42232663 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccattgatgcactgatggtg 42232564  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagattt-aggtgg 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || ||| ||||||    
T  42232563 ttttgaggcagttgaccgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttaaaccatttggtggaatgacaatagtttttaggtgg 42232464  T
Q  211 tgatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtg 310  Q
    |||| ||||| || |||| | ||| ||||||| ||||||  || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||    
T  42232463 tgatatcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcagtatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaagatatgtgcttattttaatgtg 42232364  T
Q  311 ttgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacg 410  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  42232363 ttgagacttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagtagaaagaaattgctaattttggcaagtggatactctgaattggagacg 42232264  T
Q  411 acaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatt 464  Q
     |||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  42232263 gcaacaacggttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatt 42232210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 14 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 7037381 - 7036877
Alignment:
Q  14 tcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7037381 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctaatgcatgctgcaaagttgataatttggggtgaggctccaatgatgcaccaatggtgtt 7037282  T
Q  114 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 213  Q
    |||||| |||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   ||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||    
T  7037281 ttgaggtagttgaccgatcattacgtgatatcatgttcaagaatgatcccttaaacgcacttaaaccttttggtggaatgacagtagttttaggtggtga 7037182  T
Q  214 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttg 313  Q
    ||| ||| || |||| | ||| ||||||  ||||||  ||  | |||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  7037181 ttttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatataggcttattgtaatgtgttg 7037082  T
Q  314 aggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgaca 413  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  7037081 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaagaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggca 7036982  T
Q  414 acgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 513  Q
    |||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7036981 acgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagattcgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 7036882  T
Q  514 gtatc 518  Q
    |||||    
T  7036881 gtatc 7036877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 258 - 518
Target Start/End: Original strand, 12785791 - 12786040
Alignment:
Q  258 atattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgc 357  Q
    |||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           ||||| |||||||||||||||| |    
T  12785791 atattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttgaggcttgct-----------attggatgcatcttcggtacctac 12785879  T
Q  358 agagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcct 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  12785880 agagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcct 12785979  T
Q  458 aaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatc 518  Q
     |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12785980 gaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatc 12786040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Original strand, 12785560 - 12785716
Alignment:
Q  14 tcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12785560 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtccttgggcagacctggtgtgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 12785659  T
Q  114 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacg 170  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12785660 ttgaggcagttgaccgatcattgcttgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacg 12785716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Original strand, 4816 - 5322
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4816 catcatcgcttacgatagaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggatccaatgatgcactgatggtg 4915  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || ||||| ||||    
T  4916 ttttgaggcagttgaccgatcaatgcatgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttaaaccatttggtggaatgacaatagttttagatggt 5015  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||||| ||| || |||| | | | || |||| ||||||  || || |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  ||| || ||||||||    
T  5016 gattttaggcagatattgcctattgttcgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcataaaagatatgtgcttattttaatgtgt 5115  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  5116 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctttgatacctgcaaagcagaaagaaattgctaattttggcaagtggatactctgacttggagacga 5215  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 511  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5216 caacagcgcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatctattgatgtcacttatagacttt 5315  T
Q  512 gtgtatc 518  Q
    |||||||    
T  5316 gtgtatc 5322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 19668 - 19163
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19668 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcttaggtcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcactgatggtg 19569  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  19568 ttttgaggcagttgaccgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttaaatcatttggtggaatgacaatagttttaggtggt 19469  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
     |||||||| || ||||   ||| ||||||| ||||||  || || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  19468 aatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaagatatgggcttattttaatgtgt 19369  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||| |||     
T  19368 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctttgatacctgcagagcagaaagaaattgctaa-tttggcaaggggatactttgaattggagacgg 19270  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 511  Q
    |||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19269 caacaacgcttcggatgagaatgatgaaatgaaggtagaaatttctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatatgttgatgtcacttatagacttt 19170  T
Q  512 gtgtatc 518  Q
    |||||||    
T  19169 gtgtatc 19163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 12 - 518
Target Start/End: Original strand, 124 - 634
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||  ||||||    
T  124 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcttagggcagaccaggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggttaaggctccaatgatgcactaatggtg 223  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcat----gtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttagg 207  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||    || ||||||    
T  224 ttttgaggcagctgaccgatcattgcgtgatatcattcatgtccaagcatgatcccctaaacgcgcttaaaccttttggtggaatgaaggtagttttagg 323  T
Q  208 tggtgatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaat 307  Q
    ||||||||||||| || ||||   ||| ||||||  ||||||  ||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  324 tggtgatttcaggcagatattgtctgttgtccgaggaggaacaaggccggatattgttgatgcctcaatcaattcgtcaaagatatgggcttattgtaat 423  T
Q  308 gtgttgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaa 407  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  424 gtgttgaggcttactattaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggag 523  T
Q  408 acgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttataga 507  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  524 acggcaacgacgcttcggatgagaatgatgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaacccgttgatgtcacttataaa 623  T
Q  508 ctttgtgtatc 518  Q
    |||||||||||    
T  624 ctttgtgtatc 634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 12 - 464
Target Start/End: Original strand, 28275 - 28727
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28275 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccattgatgcactgatggtg 28374  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || || |||||||    
T  28375 ttttgaggcagttgaccgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttaaaccatttggtggaatgacaatagtttaaggtggt 28474  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||| ||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||  || || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| || ||||| ||    
T  28475 gatatcaggcagatattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaagatatgtgcttattttaatgagt 28574  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 411  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||      
T  28575 tgagacttactgttaatatgagattggatgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaagtggatactctgaattgaagacag 28674  T
Q  412 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatt 464  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  28675 caacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatt 28727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1139 (Bit Score: 183; Significance: 9e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold1139
Description:

Target: scaffold1139; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 272 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 1403 - 1157
Alignment:
Q  272 tcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaa 371  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||    
T  1403 tcaatcaattcatcaaagatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgggattgggtgcatcttaggtacatgtatagcaggaagaaa 1304  T
Q  372 ttgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcat 471  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1303 tttctaattttggcaagtggatactctcaattggagacgacaacgactcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcat 1204  T
Q  472 atcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatc 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1203 atcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatc 1157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1139; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1680 - 1474
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1680 catcatcgcttaaaatgaaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttaataattttggttgaggctcaaatgatgcaccgatggtg 1581  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||||    
T  1580 ttttgaggcagttgaccgatcaatgcgtgatatcatgtccaataatgatcccctaaacgagtttagaccttttggtggaatgatagtagttttaggtggt 1481  T
Q  212 gatttca 218  Q
    |||||||    
T  1480 gatttca 1474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 13833 - 14162
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  13833 catcattgcttacgatggaaaaggatagtcttagggcagacctggtgcgtgctgcaaagatgataatttgggatgaggctccaatgatgcactaatggtg 13932  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| || || ||||||||||    
T  13933 ttttgaggcagttgacagatcaatgagtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttaaaccatttggtggaatgataatagttttaggtggt 14032  T
Q  212 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaacaggaactcggtagtatattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgt 311  Q
    ||||||||| || |||| | ||| ||||||| ||||||  || |  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||| || |||| |||    
T  14033 gatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaagatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaatatatgggcttattttaatatgt 14132  T
Q  312 tgaggcttactgttaatattagattgggtg 341  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  14133 tgaggcttactattaatatgagattgggtg 14162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 258 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 40173 - 39937
Alignment:
Q  258 atattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgc 357  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  40173 atattgttgatgcctcagtcaattcgtcaaagatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgtgtgcatcttcggtacctac 40074  T
Q  358 agagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcct 457  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  40073 agagcaggaagaaattgctaactttggcaagtgaatactctcaattggagatggcaacgatgcttcggatgagaatggtgaaataaaggtagaaattctt 39974  T
Q  458 aaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttga 494  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39973 gaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgttga 39937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42638 - 42434
Alignment:
Q  12 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 111  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| | |  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42638 catcatcgcttaagatggaaaaggatagtcttagggcatacttggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcactgatggtg 42539  T
Q  112 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 211  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||    
T  42538 ttttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgtgcttaaaccttttggtggaatgacagtagttttaggtggt 42439  T
Q  212 gattt 216  Q
    |||||    
T  42438 gattt 42434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 258 - 518
Target Start/End: Original strand, 48749 - 48998
Alignment:
Q  258 atattgttgaggcctcaatcaattcatcaaagatatggactttttgtaatgtgttgaggcttactgttaatattagattgggtgcatcttcggtacctgc 357  Q
    |||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||           ||||| |||||||||||||||| |    
T  48749 atattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttgaggcttgct-----------attggatgcatcttcggtacctac 48837  T
Q  358 agagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcct 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  48838 agagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcct 48937  T
Q  458 aaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatc 518  Q
     |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48938 gaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatc 48998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Original strand, 48518 - 48674
Alignment:
Q  14 tcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48518 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtccttgggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 48617  T
Q  114 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacg 170  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48618 ttgaggcagttgaccgatcattgcttgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacg 48674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 470 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 16889 - 16841
Alignment:
Q  470 atatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatc 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16889 atatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatc 16841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University