View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5603_low_2 (Length: 465)

Name: NF5603_low_2
Description: NF5603
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5603_low_2
NF5603_low_2
[»] chr5 (10 HSPs)
chr5 (6-447)||(29965018-29965459)
chr5 (6-447)||(30009339-30009780)
chr5 (22-445)||(30007314-30007737)
chr5 (9-445)||(30001185-30001621)
chr5 (35-445)||(29953779-29954189)
chr5 (24-445)||(30043261-30043682)
chr5 (22-445)||(29995525-29995947)
chr5 (18-445)||(30067778-30068205)
chr5 (25-428)||(29946808-29947211)
chr5 (9-431)||(29944820-29945242)
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (145-236)||(31890612-31890703)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 398; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 447
Target Start/End: Original strand, 29965018 - 29965459
Alignment:
Q  6 gtcgaagaatatgatttgaagaagttgaattacttagatatggtggttgatgagacattaagactttaccccgttggacccttattacttcctcgtgaat 105  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29965018 gtcgaagagaatgatttgaagaagttgaattacttagatatggtggttgatgagacattaagactttaccctgttggacccttattacttcctcgtgaat 29965117  T
Q  106 gtagagaaagcataacaattgatggatattttataaaggaaaagacacgagttatagtaaatgcatgggctatagggagagattcaaatgtttggtcaga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  29965118 gtagagaaagcataacaattgatggatattttataaaggaaaagacacgagttatagtaaatgcatgggctatagggagagattcaaatatttggttaga 29965217  T
Q  206 aaatgctgatgagttttatccagagagatttagtgataagaaaatgaattatcaaggacaagaatttgaatctataccatttggttcaggtcgtagacgt 305  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29965218 aaacgctgatgagttttatccagagagatttagtgataagaaaatgaattatcaaggacagcaatttgaatctataccatttggttcaggtcgtagacgt 29965317  T
Q  306 tgtcctgggattcaattgggtttggttactgttagatttgttgtagctcaattggtgcattcctttaattgggaacttccacataatattagcccttccg 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29965318 tgtcctgggattcaattgggtttggttacggttagatttgttgtagctcaattggtgcattgctttaattgggaacttccacataatattagcccttcca 29965417  T
Q  406 atttgaatatggaagagaaatttggagtcactataccaaggg 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29965418 atttgaatatggaagagaaatttggagtcactataccaaggg 29965459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 30009780 - 30009339
Alignment:
Q  6 gtcgaagaatatgatttgaagaagttgaattacttagatatggtggttgatgagacattaagactttaccccgttggacccttattacttcctcgtgaat 105  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30009780 gtcgaagagaatgatttgaagaagttgaattacttagatatggtggttgatgagacattaagactttaccctgttggacccttattacttcctcgtgaat 30009681  T
Q  106 gtagagaaagcataacaattgatggatattttataaaggaaaagacacgagttatagtaaatgcatgggctatagggagagattcaaatgtttggtcaga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  30009680 gtagagaaagcataacaattgatggatattttataaaggaaaagacacgagttatagtaaatgcatgggctatagggagagattcaaatatttggttaga 30009581  T
Q  206 aaatgctgatgagttttatccagagagatttagtgataagaaaatgaattatcaaggacaagaatttgaatctataccatttggttcaggtcgtagacgt 305  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30009580 aaacgctgatgagttttatccagagagatttagtgataagaaaatgaattatcaaggacagcaatttgaatctataccatttggttcaggtcgtagacgt 30009481  T
Q  306 tgtcctgggattcaattgggtttggttactgttagatttgttgtagctcaattggtgcattcctttaattgggaacttccacataatattagcccttccg 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30009480 tgtcctgggattcaattgggtttggttacggttagatttgttgtagctcaattggtgcattgctttaattgggaacttccacataatattagcccttcca 30009381  T
Q  406 atttgaatatggaagagaaatttggagtcactataccaaggg 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30009380 atttgaatatggaagagaaatttggagtcactataccaaggg 30009339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 22 - 445
Target Start/End: Original strand, 30007314 - 30007737
Alignment:
Q  22 tgaagaagttgaattacttagatatggtggttgatgagacattaagactttaccccgttggacccttattacttcctcgtgaatgtagagaaagcataac 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  30007314 tgaagaagtttaattacttagatatggttgttgatgaaaccttaagactttatcctgttggacccttattaatccctcgtgaatgtagagagagcataac 30007413  T
Q  122 aattgatggatattttataaaggaaaagacacgagttatagtaaatgcatgggctatagggagagattcaaatgtttggtcagaaaatgctgatgagttt 221  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  30007414 aattgatggatattttataacgaaaaagactcgagttatagtaaatgcatgggctattgggagagattgtaacgtttggtcagaaaatgctgatgaattt 30007513  T
Q  222 tatccagagagatttagtgataagaaaatgaattatcaaggacaagaatttgaatctataccatttggttcaggtcgtagacgttgtcctgggattcaat 321  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  30007514 tacccagagagatttattgacaagaaaatgaattatcaaggacatgagtttgaatctataccatttggttctggtcgtaggcgttgtcctggaattcaat 30007613  T
Q  322 tgggtttggttactgttagatttgttgtagctcaattggtgcattcctttaattgggaacttccacataatattagcccttccgatttgaatatggaaga 421  Q
    |||||||  |||  ||||  || ||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  30007614 tgggtttaattatcgttaagttggttatagctcaatttgtgcattgctttaactgggaacttccacataatattagtccttccaatttgaatatggagga 30007713  T
Q  422 gaaatttggagtcactataccaag 445  Q
    |||||||||| || ||||||||||    
T  30007714 gaaatttggactctctataccaag 30007737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 9 - 445
Target Start/End: Original strand, 30001185 - 30001621
Alignment:
Q  9 gaagaatatgatttgaagaagttgaattacttagatatggtggttgatgagacattaagactttaccccgttggacccttattacttcctcgtgaatgta 108  Q
    |||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||| ||| |||||| | |||||||||||||    
T  30001185 gaagaaaaggatttgaagaattttaattacctagatatggtggttgatgaaaccttaagactttatcctgttgcacctttattaatccctcgtgaatgta 30001284  T
Q  109 gagaaagcataacaattgatggatattttataaaggaaaagacacgagttatagtaaatgcatgggctatagggagagattcaaatgtttggtcagaaaa 208  Q
    |||| | ||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  30001285 gagagaacataacaattgatgattattctataaaagaaaagacacgagttatagtaaatgcatgggcaattgggagagatcctgatgtttggtcagaaaa 30001384  T
Q  209 tgctgatgagttttatccagagagatttagtgataagaaaatgaattatcaaggacaagaatttgaatctataccatttggttcaggtcgtagacgttgt 308  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30001385 tgctgaagaattttacccagagagatttattgagaaaaaaatgaattatctcggacaagagtttgaatctataccatttggttctggtcgtagacgttgt 30001484  T
Q  309 cctgggattcaattgggtttggttactgttagatttgttgtagctcaattggtgcattcctttaattgggaacttccacataatattagcccttccgatt 408  Q
    ||||| |||||||||||| || |||| ||||  || ||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  30001485 cctggaattcaattgggtatgattacggttaagttggttatagctcaattcgtgcattgctttaactgggaacttccacataatattagtccttccaatt 30001584  T
Q  409 tgaatatggaagagaaatttggagtcactataccaag 445  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  30001585 tgaatatggaggagaaatttggactcactataccaag 30001621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 35 - 445
Target Start/End: Original strand, 29953779 - 29954189
Alignment:
Q  35 ttacttagatatggtggttgatgagacattaagactttaccccgttggacccttattacttcctcgtgaatgtagagaaagcataacaattgatggatat 134  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  29953779 ttacttagagatggtggttcatgaaactttaagactttaccctgttgcacccttattactccctcgtgaatgtagagagagtgtaacaattgatggatat 29953878  T
Q  135 tttataaaggaaaagacacgagttatagtaaatgcatgggctatagggagagattcaaatgtttggtcagaaaatgctgatgagttttatccagagagat 234  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  29953879 tttataaaggaaaagactcgagttatagtaaatgcatgggctatagggagagattcaaatgtttggtcagaaaatgccgaagaattttacccagagagat 29953978  T
Q  235 ttagtgataagaaaatgaattatcaaggacaagaatttgaatctataccatttggttcaggtcgtagacgttgtcctgggattcaattgggtttggttac 334  Q
    | | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||| |||||| || ||    
T  29953979 tcattggcaagaaaatgaattatcaaggacaagagtttgaatctctaccatttggttctggccgcagacgttgtcctggaattcaatcgggtttagtgac 29954078  T
Q  335 tgttagatttgttgtagctcaattggtgcattcctttaattgggaacttccacataatattagcccttccgatttgaatatggaagagaaatttggagtc 434  Q
     ||||  || ||| | || |||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  29954079 cgttaagttggttattgcccaattggtgcattgttttgattgggaacttccatataatatcagtccttccaatttgaatatggaggagaaatttggactc 29954178  T
Q  435 actataccaag 445  Q
    |||||||||||    
T  29954179 actataccaag 29954189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 24 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 30043682 - 30043261
Alignment:
Q  24 aagaagttgaattacttagatatggtggttgatgagacattaagactttaccccgttggacccttattacttcctcgtgaatgtagagaaagcataacaa 123  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||| || | |||||||||| |||||| |||| |||||    
T  30043682 aagaagttgaattatttagatatggtggttgatgagaccttaagactttaccccgtagcaccgttactagtccctcgtgaatctagagagagcacaacaa 30043583  T
Q  124 ttgatggatattttataaaggaaaagacacgagttatagtaaatgcatgggctatagggagagattcaaatgtttggtcagaaaatgctgatgagtttta 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | || |||||    
T  30043582 ttgatggttattttataaaggaaaagacacgacttatagtaaatgcatgggcaatagggagagatcctaatgtttggtcagaaaatgctaaagaatttta 30043483  T
Q  224 tccagagagatttagtgataagaaaatgaattatcaaggacaagaatttgaatctataccatttggttcaggtcgtagacgttgtcctgggattcaattg 323  Q
     ||||||||||||   || || |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  30043482 cccagagagatttgtagagaaaaaaatgaattatcttggacaagagtttgaatctataccatttggttctggtcgtaggcgttgtcctggaattcaattg 30043383  T
Q  324 ggtttggttactgttagatttgttgtagctcaattggtgcattcctttaattgggaacttccacataatattagcccttccgatttgaatatggaagaga 423  Q
    |||||  ||||||||| ||| ||| ||||||||||  | ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||    
T  30043382 ggtttaattactgttaaattggttatagctcaatttatccattgttttaactgggaacttccacataatattagtccctccaatttgaatatggaggaga 30043283  T
Q  424 aatttggagtcactataccaag 445  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  30043282 aatttggactcactataccaag 30043261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 22 - 445
Target Start/End: Original strand, 29995525 - 29995947
Alignment:
Q  22 tgaagaagttgaattacttagatatggtggttgatgagacattaagactttaccccgttggacccttattacttcctcgtgaatgtagagaaagcataac 121  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| || | |||||||| | |||||| |||| ||     
T  29995525 tgaagaagttgaattatttagatatggtggttgatgagaccttaagactttaccctgttgcaccattactagtccctcgtgagtctagagagagcacaat 29995624  T
Q  122 aattgatggatattttataaaggaaaagacacgagttatagtaaatgcatgggctatagggagagattcaaatgtttggtcagaaaatgctgatgagttt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| || || |||    
T  29995625 aattgatggttattttataaaggaaaagacacgacttatagtaaatgcatgggcaatagggagagatcctaatgtttggtcagaaaatgccgaagaattt 29995724  T
Q  222 tatccagagagatttagtgataagaaaatgaattatcaaggacaagaatttgaatctataccatttggttcaggtcgtagacgttgtcctgggattcaat 321  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29995725 tatccagagagatttattgagaa-aaactgaattatctcggacaagagtttgaatctataccatttggttctagtcgtaggcgttgtcctggaattcaat 29995823  T
Q  322 tgggtttggttactgttagatttgttgtagctcaattggtgcattcctttaattgggaacttccacataatattagcccttccgatttgaatatggaaga 421  Q
    |||||||  ||||  |||  || ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||| ||    
T  29995824 tgggtttaattacgattaagttggttatagctcaatttgtgcattgctttaattgggaacttccacataatattagttcttctagtttgaatatggagga 29995923  T
Q  422 gaaatttggagtcactataccaag 445  Q
     ||||||||| |||||||||||||    
T  29995924 aaaatttggactcactataccaag 29995947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 30068205 - 30067778
Alignment:
Q  18 gatttgaagaagttgaattacttagatatggtggttgatgagacattaagactttaccccgttggacccttattacttcctcgtgaatgtagagaaagca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||| ||||||| || | |||| | |||||||||| | ||    
T  30068205 gatttgaagaagttgaattacttagatatggtggttgatgaaaccttaagactgtatcctgttgcacccttactagtccctcctaaatgtagagagaaca 30068106  T
Q  118 taacaattgatggatattttataaaggaaaagacacgagttatagtaaatgcatgggctatagggagagattcaaatgtttggtcagaaaatgctgatga 217  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  30068105 taacaattgatgattattttataaaggaaaagacgagaattatggtaaatgcatgggcaatagggagagatcctaatgtttggtcagaaaatgctgaaga 30068006  T
Q  218 gttttatccagagagatttagtgataagaaaatgaattatcaaggacaagaatttgaatctataccatttggttcaggtcgtagacgttgtcctgggatt 317  Q
     ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||  | ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| |||    
T  30068005 attttatccaaagagatttattgaaaagaaaatgaattatcaaagacaagagtttgaaagtttaccatttgattatggtcgtagacgttgccctggaatt 30067906  T
Q  318 caattgggtttggttactgttagatttgttgtagctcaattggtgcattcctttaattgggaacttccacataatattagcccttccgatttgaatatgg 417  Q
    |||||||||||   ||||||||  || ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||    
T  30067905 caattgggtttaactactgttaagttggttatagctcaatttgtgcattgctttaattgggaactttcacataatattagtccattcaatttgaatatgg 30067806  T
Q  418 aagagaaatttggagtcactataccaag 445  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||    
T  30067805 aggagaaatttggactcactataccaag 30067778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 25 - 428
Target Start/End: Original strand, 29946808 - 29947211
Alignment:
Q  25 agaagttgaattacttagatatggtggttgatgagacattaagactttaccccgttggacccttattacttcctcgtgaatgtagagaaagcataacaat 124  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  29946808 agaagttaagttacttagatatggtggttcatgaaactttaagactttaccctgttgcacccttgttactccctcgtgaatgtagagagagtataacaat 29946907  T
Q  125 tgatggatattttataaaggaaaagacacgagttatagtaaatgcatgggctatagggagagattcaaatgtttggtcagaaaatgctgatgagttttat 224  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||  ||| || ||| ||    
T  29946908 tgatggatattttataatggaaaagacacgagttatagtaaatgcatgggctatagagagagattctagtgtttggtcagaaaattatgaagaatttcat 29947007  T
Q  225 ccagagagatttagtgataagaaaatgaattatcaaggacaagaatttgaatctataccatttggttcaggtcgtagacgttgtcctgggattcaattgg 324  Q
    ||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||  | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  29947008 ccagaaagatttattgacatgaaaatgaattatgaaggacataagtttaaatctataccatttggttctggtcgtagacgttgtcctggaattgaaatgg 29947107  T
Q  325 gtttggttactgttagatttgttgtagctcaattggtgcattcctttaattgggaacttccacataatattagcccttccgatttgaatatggaagagaa 424  Q
    ||||| | ||  ||| | | ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  29947108 gtttgatcacaattaaaatggttatagctcaattggtacattgctttaattgggaacttccatgtaatattagtccttccaatttgaatatggaggagaa 29947207  T
Q  425 attt 428  Q
    ||||    
T  29947208 attt 29947211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 431
Target Start/End: Original strand, 29944820 - 29945242
Alignment:
Q  9 gaagaatatgatttgaagaagttgaattacttagatatggtggttgatgagacattaagactttaccccgttggacccttattacttcctcgtgaatgta 108  Q
    |||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | || |||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  29944820 gaagaaaaggatttgaagaattttaattacttagatatggtggttgatgaaactttaagacttcatccagtttcacccttcttactccctcgtgaatgta 29944919  T
Q  109 gagaaagcataacaattgatggatattttataaaggaaaagacacgagttatagtaaatgcatgggctatagggagagattcaaatgtttggtcagaaaa 208  Q
    |||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  29944920 gagagaacataacaattgatggttattttgtaaaggaaaagacacgagttatagtaaatgcatttacaatagcgagagatcctaatgtttggtcagaaaa 29945019  T
Q  209 tgctgatgagttttatccagagagatttagtgataagaaaatgaattatcaaggacaagaatttgaatctataccatttggttcaggtcgtagacgttgt 308  Q
    |||||| || |||| ||||||||| |||| | |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| |  |||||||| |||||     
T  29945020 tgctgaagaattttgtccagagaggtttattaataagaaattgaattatgaaggacaagagtttgaaagtataccatttggatttggtcgtaggcgttgc 29945119  T
Q  309 cctgggattcaattgggtttggttactgttagatttgttgtagctcaattggtgcattcctttaattgggaacttccacataatattagcccttccgatt 408  Q
    ||||| |||||||||| ||||   |||||||| ||     |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||  |||    
T  29945120 cctggaattcaattggctttgaggactgttaggttaagcatagctcaattggtgcattgctttaattggaaacttccatataatattagtccttctaatt 29945219  T
Q  409 tgaatatggaagagaaatttgga 431  Q
    |||| ||||| ||||||||||||    
T  29945220 tgaacatggatgagaaatttgga 29945242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 236
Target Start/End: Original strand, 31890612 - 31890703
Alignment:
Q  145 aaaagacacgagttatagtaaatgcatgggctatagggagagattcaaatgtttggtcagaaaatgctgatgagttttatccagagagattt 236  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| | |||||||||||  | ||||||||||| || ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  31890612 aaaagacaagaattttaataaatgcatggacaatagggagagacactaatgtttggtcggataatgctgagacgttttatccagagagattt 31890703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University