View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5606_low_14 (Length: 271)

Name: NF5606_low_14
Description: NF5606
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5606_low_14
NF5606_low_14
[»] chr7 (20 HSPs)
chr7 (19-261)||(22328653-22328895)
chr7 (19-261)||(2389955-2390196)
chr7 (19-261)||(6431644-6431885)
chr7 (39-251)||(34310991-34311202)
chr7 (19-261)||(4512644-4512884)
chr7 (29-251)||(3258678-3258899)
chr7 (19-261)||(29608414-29608650)
chr7 (19-261)||(48599588-48599819)
chr7 (19-261)||(6360166-6360407)
chr7 (19-261)||(2361225-2361466)
chr7 (39-251)||(4510823-4511024)
chr7 (39-251)||(4508981-4509182)
chr7 (39-261)||(22269647-22269866)
chr7 (128-261)||(32358199-32358331)
chr7 (22-250)||(5116318-5116545)
chr7 (39-150)||(8359593-8359703)
chr7 (117-225)||(22552791-22552897)
chr7 (47-192)||(43363697-43363839)
chr7 (44-88)||(1360434-1360478)
chr7 (122-150)||(23794191-23794219)
[»] chr3 (27 HSPs)
chr3 (39-258)||(6095874-6096091)
chr3 (29-261)||(46860143-46860374)
chr3 (19-261)||(34490886-34491127)
chr3 (39-261)||(30235798-30236018)
chr3 (39-261)||(36018523-36018744)
chr3 (39-261)||(43402065-43402285)
chr3 (29-261)||(41819787-41820016)
chr3 (39-251)||(43404008-43404218)
chr3 (19-261)||(47303925-47304165)
chr3 (19-261)||(54593377-54593619)
chr3 (29-261)||(5434142-5434374)
chr3 (19-250)||(40913022-40913253)
chr3 (39-261)||(49199745-49199966)
chr3 (39-261)||(55302240-55302460)
chr3 (48-261)||(4569624-4569835)
chr3 (63-261)||(28074290-28074485)
chr3 (39-261)||(34795542-34795762)
chr3 (39-237)||(1683184-1683381)
chr3 (102-257)||(39127236-39127389)
chr3 (72-261)||(26323821-26324008)
chr3 (51-261)||(36796079-36796293)
chr3 (29-160)||(20937431-20937560)
chr3 (137-192)||(31340448-31340503)
chr3 (39-192)||(35138981-35139133)
chr3 (117-194)||(41509996-41510072)
chr3 (19-74)||(26323330-26323385)
chr3 (114-187)||(1737239-1737311)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (39-261)||(8665080-8665300)
chr4 (19-261)||(55085619-55085861)
chr4 (39-261)||(40630657-40630877)
chr4 (19-251)||(26363948-26364179)
chr4 (29-261)||(33989535-33989765)
chr4 (19-261)||(41964089-41964329)
chr4 (19-261)||(54882693-54882934)
chr4 (29-261)||(35662115-35662345)
chr4 (29-261)||(46703174-46703403)
chr4 (47-261)||(6655629-6655841)
chr4 (19-261)||(50674100-50674341)
chr4 (19-261)||(379051-379292)
chr4 (47-261)||(50262981-50263193)
chr4 (39-207)||(8647864-8648031)
chr4 (19-251)||(12073076-12073306)
chr4 (89-264)||(2209378-2209551)
chr4 (98-261)||(27417285-27417446)
chr4 (38-261)||(46569820-46570041)
chr4 (72-251)||(33089582-33089759)
chr4 (23-251)||(26699704-26699933)
chr4 (29-251)||(3785773-3785993)
chr4 (148-261)||(8653273-8653385)
chr4 (39-248)||(22883028-22883235)
chr4 (39-248)||(22934692-22934899)
chr4 (29-188)||(34112357-34112515)
chr4 (47-261)||(35370620-35370833)
chr4 (89-260)||(38811404-38811573)
chr4 (142-261)||(10071558-10071676)
chr4 (139-238)||(10071966-10072065)
chr4 (29-208)||(25723482-25723659)
chr4 (65-240)||(35369740-35369914)
chr4 (39-192)||(12119281-12119432)
chr4 (19-189)||(41961152-41961324)
chr4 (94-251)||(47514831-47514987)
chr4 (38-192)||(6200138-6200291)
chr4 (134-200)||(6719319-6719384)
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (38-261)||(38746678-38746899)
chr5 (19-261)||(40146934-40147175)
chr5 (19-261)||(213141-213383)
chr5 (19-261)||(27015205-27015446)
chr5 (47-260)||(28277989-28278201)
chr5 (39-261)||(5057721-5057940)
chr5 (48-261)||(27637900-27638109)
chr5 (41-260)||(316439-316655)
chr5 (51-253)||(35615852-35616052)
chr5 (98-261)||(16642212-16642372)
chr5 (19-261)||(4160307-4160546)
chr5 (29-225)||(33906294-33906488)
chr5 (89-200)||(10055031-10055141)
chr5 (91-261)||(30792913-30793080)
chr5 (98-251)||(30802624-30802775)
chr5 (39-260)||(14689685-14689902)
chr5 (29-189)||(21205917-21206076)
chr5 (47-93)||(16641223-16641269)
chr5 (212-261)||(33906578-33906627)
[»] chr1 (32 HSPs)
chr1 (29-261)||(7482495-7482726)
chr1 (39-261)||(28242061-28242281)
chr1 (41-261)||(42298252-42298470)
chr1 (19-261)||(29135921-29136161)
chr1 (39-238)||(37167992-37168190)
chr1 (19-261)||(34603249-34603489)
chr1 (19-251)||(11348381-11348612)
chr1 (39-232)||(37033348-37033540)
chr1 (19-261)||(34602594-34602834)
chr1 (19-261)||(193285-193525)
chr1 (39-251)||(37879186-37879396)
chr1 (38-261)||(19754164-19754385)
chr1 (19-261)||(13547343-13547584)
chr1 (19-261)||(13549254-13549495)
chr1 (19-238)||(47114867-47115085)
chr1 (39-261)||(47255615-47255829)
chr1 (29-261)||(6808119-6808350)
chr1 (39-248)||(19752372-19752578)
chr1 (47-241)||(41135513-41135705)
chr1 (29-252)||(9109666-9109888)
chr1 (39-152)||(31925981-31926093)
chr1 (165-238)||(31928208-31928281)
chr1 (107-174)||(6068377-6068443)
chr1 (69-239)||(16216800-16216967)
chr1 (119-194)||(3331283-3331357)
chr1 (116-194)||(28318110-28318188)
chr1 (73-151)||(4535783-4535861)
chr1 (100-194)||(38747052-38747144)
chr1 (159-223)||(22079045-22079109)
chr1 (47-174)||(12318764-12318889)
chr1 (39-95)||(25651922-25651978)
chr1 (29-88)||(22079166-22079225)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (39-261)||(7001-7221)
[»] chr2 (15 HSPs)
chr2 (19-261)||(42288364-42288604)
chr2 (19-261)||(1631986-1632227)
chr2 (39-252)||(24397738-24397951)
chr2 (19-251)||(45726613-45726843)
chr2 (39-261)||(33647841-33648063)
chr2 (19-261)||(17450264-17450504)
chr2 (19-261)||(35447138-35447379)
chr2 (27-267)||(42261873-42262111)
chr2 (74-260)||(7450975-7451158)
chr2 (51-261)||(30218321-30218529)
chr2 (47-150)||(16676027-16676130)
chr2 (29-88)||(43730992-43731051)
chr2 (127-189)||(24197643-24197704)
chr2 (128-261)||(40935543-40935675)
chr2 (119-186)||(34811585-34811651)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (19-261)||(80537-80778)
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (19-261)||(42435245-42435486)
chr8 (19-261)||(11383659-11383900)
chr8 (47-236)||(40328476-40328664)
chr8 (67-261)||(2999823-3000016)
chr8 (39-251)||(40221428-40221638)
chr8 (50-261)||(44353468-44353674)
chr8 (76-261)||(22976207-22976389)
chr8 (29-261)||(40585397-40585628)
chr8 (48-261)||(3846103-3846313)
chr8 (149-261)||(4283219-4283330)
chr8 (47-189)||(9633820-9633959)
chr8 (19-131)||(4283325-4283438)
chr8 (164-261)||(20686456-20686552)
chr8 (72-261)||(3817641-3817829)
chr8 (69-253)||(40535533-40535713)
chr8 (118-189)||(28461305-28461375)
chr8 (118-194)||(10101513-10101588)
chr8 (84-186)||(11136888-11136989)
chr8 (19-87)||(18655246-18655315)
chr8 (119-194)||(10020179-10020254)
chr8 (19-88)||(33655559-33655628)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (47-261)||(11231-11443)
[»] chr6 (11 HSPs)
chr6 (19-261)||(3808962-3809204)
chr6 (19-261)||(2973193-2973435)
chr6 (39-261)||(5043301-5043520)
chr6 (19-260)||(17762661-17762903)
chr6 (29-251)||(21593349-21593569)
chr6 (39-235)||(603355-603550)
chr6 (29-247)||(22425090-22425308)
chr6 (68-261)||(26800443-26800634)
chr6 (19-261)||(26830378-26830619)
chr6 (47-225)||(17757790-17757969)
chr6 (40-251)||(25072868-25073076)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (39-261)||(18276-18495)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (27-267)||(490708-490946)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (27-261)||(1669-1901)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 20)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Original strand, 22328653 - 22328895
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaacccc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  22328653 acccttagcttttgattacataaggatattctcttttagtttcccaagattcacccaagttgctcacaaatgactctctactcatgtttttcccaaccct 22328752  T
Q  119 atgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22328753 atgaatctctccccaaaaggcaccaactcttttcctaagagccccctcttttggttctccaagatttacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatc 22328852  T
Q  219 ctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22328853 ctcaacctttagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 22328895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 2390196 - 2389955
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| ||| |||||||    
T  2390196 acccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactatccactcatgtgttttccaaccc 2390097  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagat 217  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||     
T  2390096 catgaatct-tccccaaaagccaccaacccttttcgcaatagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagac 2389998  T
Q  218 cctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  2389997 cctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtttcctcctttg 2389955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 6431885 - 6431644
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  6431885 acccttagcatttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctacactcatgtgttttccaaccc 6431786  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagat 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||     
T  6431785 catgaatct-tccccaaaaggcaccaaccctttccccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagttttgaacctcacccaaagac 6431687  T
Q  218 cctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  6431686 cctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttccctcctttg 6431644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 39 - 251
Target Start/End: Original strand, 34310991 - 34311202
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||| || |||||||||||    
T  34310991 taaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttccatccccatgaacct-tccccaaaagg 34311089  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaa 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || |||||||| |||||||||| |    
T  34311090 caccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaggaccctcaacctttagtatctaca 34311189  T
Q  239 taccctaaaagtt 251  Q
    |||||||||||||    
T  34311190 taccctaaaagtt 34311202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Original strand, 4512644 - 4512884
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||    
T  4512644 acccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttccaaaccc 4512743  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagat 217  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||     
T  4512744 catgaatct-tccccaaaaggcaccaaccc-tttcccaagagccccctcttttggttctctaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagac 4512841  T
Q  218 cctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  4512842 cctcaacctttagaatctaaa-accctaaaagttccctcctttg 4512884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 3258899 - 3258678
Alignment:
Q  29 tttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctct 128  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||  |||||| | ||||||| |||||||||||| |    
T  3258899 tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctaataaaagactctccactcatatgtttcccatccccatgaatct-t 3258801  T
Q  129 ccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccatt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||    
T  3258800 ccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccatctttttgttctccaagattcacatcatgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaaccttt 3258701  T
Q  229 agtatctaaataccctaaaagtt 251  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  3258700 agtatctacataccctaaaagtt 3258678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 29608650 - 29608414
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || |||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||    
T  29608650 acccttagcctttgatttcactaagaatcttctattttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccc 29608551  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagat 217  Q
    ||||||||      |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||     
T  29608550 catgaatc------caaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagttttgaacctcacccaaagac 29608457  T
Q  218 cctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  29608456 cctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttccctcctttg 29608414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Original strand, 48599588 - 48599819
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  48599588 acccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctctactcatgttttttccaaccc 48599687  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagat 217  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||          |||||||||||||||||| ||||||  |||||||     
T  48599688 catgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttgg----------ttcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagac 48599776  T
Q  218 cctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  48599777 cctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttccctcctttg 48599819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Original strand, 6360166 - 6360407
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| |    
T  6360166 acccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttgatttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttttcaactc 6360265  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagat 217  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||     
T  6360266 catgaatct-tcttcaaaaggcaccattccttttctcaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagac 6360364  T
Q  218 cctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  6360365 cctcaacctttaatatctaaa-accctaaaagttctctcctttg 6360407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Original strand, 2361225 - 2361466
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||    
T  2361225 acccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcataagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccc 2361324  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagat 217  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||  || || |||  |||||||     
T  2361325 catgaatc-atccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttgattcttcaagattcacatcttgaaggattgaatctcacccaaagac 2361423  T
Q  218 cctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    |||||| | |||||||||||| | ||||||||||  ||||||||    
T  2361424 cctcaatctttagtatctaaa-atcctaaaagttccctcctttg 2361466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 39 - 251
Target Start/End: Original strand, 4510823 - 4511024
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4510823 taaggatcttctcttttggtttcacaagactcaccaaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tccccaaaagg 4510921  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaa 238  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||         ||||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  4510922 caccaaccc-tttcccaagagctccctcttttggtt--------ctcacatcttgaagctttgaacctcacccaaaaaccctcaacctttagtatctaaa 4511012  T
Q  239 taccctaaaagtt 251  Q
     ||||||||||||    
T  4511013 -accctaaaagtt 4511024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 251
Target Start/End: Original strand, 4508981 - 4509182
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4508981 taaggatcttatcttttggtttcacaagactcaccaaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tccccaaaagg 4509079  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaa 238  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||         ||||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  4509080 caccaaccc-tttcccaagagctccctcttttggtt--------ctcacatcttgaagctttgaacctcacccaaaaaccctcaacctttagtatctaaa 4509170  T
Q  239 taccctaaaagtt 251  Q
     ||||||||||||    
T  4509171 -accctaaaagtt 4509182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 39 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22269866 - 22269647
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||  ||||||  |||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  22269866 taaggatcttctattttggtttcacaagactcacccaagtttctctcaatagactctccactcatgtgtttcccctccccatgaatct-tccccaaaagg 22269768  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaa 238  Q
    ||||||| |||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| |||||| | |||||||||| |    
T  22269767 caccaactctttccc-aagagcccc-tcttttggttctccaagattcacatcttgtagctttgaacctcacccaaagaccctcaaactttagtatctaca 22269670  T
Q  239 taccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    ||||||||| |||  ||||||||    
T  22269669 taccctaaatgttccctcctttg 22269647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 128 - 261
Target Start/End: Original strand, 32358199 - 32358331
Alignment:
Q  128 tccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| |    
T  32358199 tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctt 32358298  T
Q  228 tagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  32358299 tagtatctaaa-accctaaaagttccctcctttg 32358331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 5116545 - 5116318
Alignment:
Q  22 cttaacttttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatg 121  Q
    |||||| ||||||| | | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||    | | || ||| |||| || |||    
T  5116545 cttaacctttgatttcctgaggatcttctcttttggttacccaagactcacctaagtttatcacaaatgaccctcatttgaagtgtttaccaatccaatg 5116446  T
Q  122 aatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctc 221  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||| ||  | ||||| ||||    
T  5116445 aatctctctccaaaaggcaccgaccctctccc-aagagccccctcttttggttctcaaagattcacatcttgaagttttgaacatcacctaaagaccctc 5116347  T
Q  222 aaccattagtatctaaataccctaaaagt 250  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  5116346 aacctttagtatttaaataccctaaaagt 5116318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 150
Target Start/End: Original strand, 8359593 - 8359703
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8359593 taaggattttctcttttggtttcacaagactcatccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tccccaaaagg 8359691  T
Q  139 caccaacccttt 150  Q
    ||||||||||||    
T  8359692 caccaacccttt 8359703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Original strand, 22552791 - 22552897
Alignment:
Q  117 ccatgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaaga 216  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||| || |||  |||||||    
T  22552791 ccatgaatcttttcccaaaaggcaccaaccgtttcc--aagagccccctcttttggttctctaagattcacattttgaccctttaaatctcacccaaaga 22552888  T
Q  217 tcctcaacc 225  Q
     ||||||||    
T  22552889 ccctcaacc 22552897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 192
Target Start/End: Original strand, 43363697 - 43363839
Alignment:
Q  47 ttctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacc 146  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||   ||||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  43363697 ttctcttttggtctctcaagattcacccaaattgctcac-aaggactctcatctcatgtgtttctcaa-cccttgaatctcttcccaaaaggaaccaa-c 43363793  T
Q  147 cttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatctt 192  Q
      | ||| |||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  43363794 aatgtcccaagagctccctcttttagttctccaagatacacatctt 43363839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Original strand, 1360434 - 1360478
Alignment:
Q  44 atattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaa 88  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  1360434 atattctcttttggttttccaagactcactcaagttgctcgcaaa 1360478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 150
Target Start/End: Original strand, 23794191 - 23794219
Alignment:
Q  122 aatctctccccaaaaggcaccaacccttt 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23794191 aatctctccccaaaaggcaccaacccttt 23794219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 27)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 39 - 258
Target Start/End: Original strand, 6095874 - 6096091
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6095874 taaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tccccaaaagg 6095972  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaa 238  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  6095973 caccaacccttttcaaaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa 6096072  T
Q  239 taccctaaaagttttctcct 258  Q
     |||||||||||| ||||||    
T  6096073 -accctaaaagttctctcct 6096091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 29 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 46860374 - 46860143
Alignment:
Q  29 tttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctct 128  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||| |    
T  46860374 tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccatccctatgaatct-t 46860276  T
Q  129 ccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccatt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||    
T  46860275 ccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcatgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaaccttt 46860176  T
Q  229 agtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  46860175 agtatctacataccctaaaagttctctcatttg 46860143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 34491127 - 34490886
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| |    
T  34491127 acccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttttcaactc 34491028  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagat 217  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||     
T  34491027 catgaatct-tctccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagac 34490929  T
Q  218 cctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  34490928 cctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttctctcctttg 34490886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 39 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 30236018 - 30235798
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  30236018 taaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaacttgctcacaaatgactctccactcttgtgttttccaaccccatgaatat-tccccaaaagg 30235920  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaa 238  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  30235919 caccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa 30235820  T
Q  239 taccctaaaagttttctcctttg 261  Q
     |||||||||||| |||||||||    
T  30235819 -accctaaaagttctctcctttg 30235798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 39 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 36018744 - 36018523
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  36018744 taaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccattcatgtgtttcccatccccatggatct-tccccaaaagg 36018646  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaa 238  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  36018645 caccaacccttttcccaaaagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcatccaaagaccctcaacctttagtatctaca 36018546  T
Q  239 taccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    |||||| |||||| |||||||||    
T  36018545 taccctgaaagttctctcctttg 36018523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 39 - 261
Target Start/End: Original strand, 43402065 - 43402285
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43402065 taaggatcttctcttttggtttcacaagacttacccaagttgttcacaaatgattctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tccccaaaagg 43402163  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaa 238  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  43402164 caccaacccttttctcaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa 43402263  T
Q  239 taccctaaaagttttctcctttg 261  Q
     ||||||||||||  ||||||||    
T  43402264 -accctaaaagttccctcctttg 43402285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 261
Target Start/End: Original strand, 41819787 - 41820016
Alignment:
Q  29 tttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctct 128  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||      
T  41819787 tttgatttcataaagatcttctcttttggtttcataagactcactcaagttgctcacaaatgagtctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatctt- 41819885  T
Q  129 ccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccatt 228  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||    
T  41819886 -cccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctctaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaaccttt 41819984  T
Q  229 agtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  41819985 agtatctaaa-aacctaaaagttatctcctttg 41820016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 39 - 251
Target Start/End: Original strand, 43404008 - 43404218
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  43404008 taaggatcttctcttttagtttcacaagactcacccaagttgctcccaaatgactctccactcatgtgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaagg 43404106  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaa 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  43404107 caccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaactttgaacctcacccaaagaccctcaacttttagtatctaaa 43404206  T
Q  239 taccctaaaagtt 251  Q
     ||||||||||||    
T  43404207 -accctaaaagtt 43404218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 47304165 - 47303925
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    |||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| |||||||||||    
T  47304165 acccttagtttttgatttcactaaggatattctcttttggttttacaagactcacctaagttgctcacaaaa-actctccactcatgtgtttcccaaccc 47304067  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagat 217  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||     
T  47304066 catgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagac 47303968  T
Q  218 cctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    | |||||  |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  47303967 cttcaacatttagtatctaaa-accataaaagttctctcctttg 47303925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 54593619 - 54593377
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || ||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| ||| |||    
T  54593619 acccttagcctttgatttcactaaggatcttctattttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttccatccc 54593520  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagat 217  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||     
T  54593519 catgaatct-tccccaaaaggtaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaggac 54593421  T
Q  218 cctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  54593420 cctcaacctttagtatctacataccctaaaagttccctcctttg 54593377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 29 - 261
Target Start/End: Original strand, 5434142 - 5434374
Alignment:
Q  29 tttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctct 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5434142 tttgattacataaggatcttctcttttggtttcccaagactcacccaacttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcctaaccccatgaatctct 5434241  T
Q  129 ccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccatt 228  Q
    ||| ||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||| |||  ||    
T  5434242 ccctaaaaaacactaacccttttcccaagagccccctcttttggttctataagatttacatcttgaagctttaaacctccctcaaagacccttaactttt 5434341  T
Q  229 agtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
     ||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  5434342 ggtatctaaatatcctaaaagttccctcctttg 5434374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 40913253 - 40913022
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  40913253 acccttaacctttaatttcactaaggatcttctcttttgctttcacaagactcacccaatttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccc 40913154  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagat 217  Q
    |||||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||     
T  40913153 catgaatcttctccaaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacattttgaagctttgaacctcacccaaagac 40913054  T
Q  218 cctcaaccattagtatctaaataccctaaaagt 250  Q
    ||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  40913053 cctaaacctttagtatctaaa-accctaaaagt 40913022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 39 - 261
Target Start/End: Original strand, 49199745 - 49199966
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactca-cccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaag 137  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49199745 taaggatcttctcttttggtttcacaagactcaacccaagttgctcacaaaagactctccactcatatgtttcccaaccccatgaatct-tccccaaaag 49199843  T
Q  138 gcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaa 237  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  49199844 gcaccaacccttttcacaatagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaactttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaa 49199943  T
Q  238 ataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    | ||||||||||||  ||||||||    
T  49199944 a-accctaaaagttccctcctttg 49199966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 39 - 261
Target Start/End: Original strand, 55302240 - 55302460
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||  |||||||| ||| |||||| ||||||| | |||| ||||||    
T  55302240 taaggatcttctcttttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagaatctccactcatgtgttttccaacctcatgaatttttccc-aaaagg 55302338  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaa 238  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  55302339 caccaacccttttcccaagagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcatccaaagaccctcaacttttagtatctaaa 55302438  T
Q  239 taccctaaaagttttctcctttg 261  Q
     ||||||||||||| ||||||||    
T  55302439 -accctaaaagtttcctcctttg 55302460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 48 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 4569835 - 4569624
Alignment:
Q  48 tctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaaccc 147  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   |||    
T  4569835 tctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tccccaataggcacaccccc 4569737  T
Q  148 ttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaataccctaaa 247  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  4569736 ttttcccaagagccccctcttttgattctccaagatttacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaa 4569638  T
Q  248 agttttctcctttg 261  Q
    ||||  ||||||||    
T  4569637 agttccctcctttg 4569624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 28074485 - 28074290
Alignment:
Q  63 caagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccc 162  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||  ||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||| || ||||||||    
T  28074485 caagactcacctaagtttctctcaatagactctccactcatgtgtttcccatccccatgaatct-tccccaaaacgcaccaactatttccc-aagagccc 28074388  T
Q  163 cctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28074387 cctcttttggttctccaagattcacatcttgaaactttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtttcctcctttg 28074290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 34795762 - 34795542
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||    | |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34795762 taaggatcttctcttttggtctcccaagactcacccaagtttcttacaaaa-actctcctttgatgtgtatcccaaccccatgaatctctcctcaaaagg 34795664  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaa 238  Q
    ||  || ||| | |||| || ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||  |||| || | |||||| ||||||||||||    
T  34795663 catgaaacctctcccta-gaaccccctcttctggttctccaagattcagatcttgaagctttgaacatcacccaacgaccatcaacctttagtatctaaa 34795565  T
Q  239 taccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    ||||||||||| | |||||||||    
T  34795564 taccctaaaagatctctcctttg 34795542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1683381 - 1683184
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||| | |  |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  1683381 taaggatcttctcttttggtctcacaagactcaccaaagttgctcataaatgattatccactcatgtgttttccaaccccatgaatctcttcccaaaatg 1683282  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagc-ttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaa 237  Q
    ||||||||| ||||| || | ||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||| || |||  ||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  1683281 caccaaccc-tttccgaaaaaccttctcttttggttctccaagattcacat-ttgaaacatttgaatctcacccaaagaccctcaacctttagtttctaa 1683184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 39127389 - 39127236
Alignment:
Q  102 atgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagctttt 201  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||||     
T  39127389 atgtgtttcccaacctcatgaatctctcccaaaaaggcaccaactctcttcc-aagagtcccctattttagttctctaagattcatatcttgaagctttg 39127291  T
Q  202 aacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcc 257  Q
    ||||| ||||||||  ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  39127290 aacct-caccaaaggccccaaacctttagtatgtaaataccctaaaagttctctcc 39127236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 261
Target Start/End: Original strand, 26323821 - 26324008
Alignment:
Q  72 cccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttg 171  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    | |||| |||| ||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| || || ||||| ||||||||    
T  26323821 cccaagttgctcacaaa-gactctcctttgatgtgtttctcaaccccatgaatctctgctgaaaatgcaccaaccctttccc-aatagccctctcttttg 26323918  T
Q  172 gttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
     || | ||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| || |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  26323919 attcttcaagatttacatcttgaagctttgaacttcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaatatcttaaaagtttcctcctttg 26324008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 36796293 - 36796079
Alignment:
Q  51 cttttggtttccc-aagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaaccctt 149  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||||||||  |||| ||| | |||| ||||| |||||||||||||||||   ||| | ||||    
T  36796293 cttttggtttccttaagattcacccaagttgctaaccaatgactctccactcttgtgtctcccgaccccgtgaatctctccccaaaatcaaccga-cctt 36796195  T
Q  150 ttcctaagagccccctcttttggttttcca----agattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaatacccta 245  Q
    || | ||||| |||||||||||||| | ||    || || ||||||||||||||| ||||||  | ||||| | |||||| ||||| ||||| | |||||    
T  36796194 tttcaaagagtcccctcttttggttcttcaaaagaggtttacatcttgaagctttgaacctcatctaaagaccttcaacctttagtttctaagttcccta 36796095  T
Q  246 aaagttttctcctttg 261  Q
    |||||| |||||||||    
T  36796094 aaagttatctcctttg 36796079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 20937560 - 20937431
Alignment:
Q  29 tttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctct 128  Q
    ||||||| | |||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| |||||  |  | |||| |||  ||||| |||||||||||    
T  20937560 tttgatttcctaagaatcttctcttttggtctcccaagaatcacccaagtttgtcacaaa-gactcccttttgatgtgtttttcaaccacatgaatctct 20937462  T
Q  129 ccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagc 160  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20937461 cctcaaaaggcaccaa-ccttttcctaagagc 20937431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 192
Target Start/End: Original strand, 31340448 - 31340503
Alignment:
Q  137 ggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatctt 192  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31340448 ggcaccaaccattttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatctt 31340503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 35138981 - 35139133
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||    | || | ||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  35138981 taaggatcttctattttggtctcccaagactcattcaagttgctcataaa-gactctcatttgatttgttttccaacctcatgaatctctcctcaaaagg 35139079  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccct-cttttggttttccaagattcacatctt 192  Q
    || ||||||||| || |||| |||  | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  35139080 catcaacccttt-ccgaagaacccatttcttttggttctccaagattcacatctt 35139133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 41510072 - 41509996
Alignment:
Q  117 ccatgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttga 194  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||| | || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  41510072 ccatgaatctctccctaaaaggcattaacccttt-cctaaaagctctcttttttggttttccaatattcacatcttga 41509996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Original strand, 26323330 - 26323385
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcaccc 74  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26323330 acccttagcttttgatttcctaaggatattcttttttggtctcccaagactcaccc 26323385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 187
Target Start/End: Original strand, 1737239 - 1737311
Alignment:
Q  114 accccatgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcac 187  Q
    ||||||| |||| |||| |||||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||||    
T  1737239 accccataaatccctccacaaaagacacgaacccttttcc-aagagtccgctcttttggttccccaagattcac 1737311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 39 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 8665300 - 8665080
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8665300 taaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcctgtgtttcccaaccccatgaatct-tccccaaaagg 8665202  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaa 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8665201 caccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa 8665102  T
Q  239 taccctaaaagttttctcctttg 261  Q
     |||||||||||| |||||||||    
T  8665101 -accctaaaagttctctcctttg 8665080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Original strand, 55085619 - 55085861
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  55085619 acccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacacaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccc 55085718  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttg-aagcttttaacctccaccaaaga 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  55085719 catgaatct-tccccaaaaggcaccaaccctttccccaagagccccctcttttggttctccaagatttacatcttgaaagcttttaacctcacccaaaga 55085817  T
Q  217 tcctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
     |||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  55085818 ccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttccctcctttg 55085861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 39 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 40630877 - 40630657
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40630877 taaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tccccaaaagg 40630779  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaa 238  Q
    ||||||||||||||  || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  40630778 caccaacccttttcacaaaagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa 40630679  T
Q  239 taccctaaaagttttctcctttg 261  Q
     |||||||||||||  |||||||    
T  40630678 -accctaaaagtttcatcctttg 40630657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26364179 - 26363948
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  26364179 acccttagcatttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccc 26364080  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagat 217  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||      
T  26364079 catgaatct-tctccaaaaggccccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaaggc 26363981  T
Q  218 cctcaaccattagtatctaaataccctaaaagtt 251  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  26363980 cctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtt 26363948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 33989765 - 33989535
Alignment:
Q  29 tttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctct 128  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  33989765 tttgattacctaaggatcttctcttttggtttcaaaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaatcccatgaatctct 33989666  T
Q  129 ccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccatt 228  Q
     ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| | ||    
T  33989665 -cccaaaaggcaccaa-ccttctcccaagagccccctattttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaaacttt 33989568  T
Q  229 agtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  33989567 agtatctaaataccctaaaagttatctgctttg 33989535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 41964329 - 41964089
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  41964329 acccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctctactcatgtgtttcccaaccc 41964230  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagat 217  Q
    ||||||||| |||| |||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||     
T  41964229 catgaatctttccc-aaaag--actaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcatgaagctttgaacctcacccaaagac 41964133  T
Q  218 cctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  41964132 cctcaacctttagtatctacataccctaaaagttccctcctttg 41964089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 54882934 - 54882693
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||    
T  54882934 acccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacgagactcacccaagtttctcacaaaagactctacactcatgtgtttcccaaccc 54882835  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagat 217  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||     
T  54882834 catgaatct-tctccaaaaggcaccaacccttttcataagagccccctcttttggttctccaagattcacattttgaagctttgaacctcacccaaagac 54882736  T
Q  218 cctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  54882735 cctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttccctcctttg 54882693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 35662345 - 35662115
Alignment:
Q  29 tttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctct 128  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||  | |||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  35662345 tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaagaactctccattcatgtgttttccaaccccatgaatct-t 35662247  T
Q  129 ccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccatt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||  ||||||| ||    
T  35662246 ccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttctccaagattcacatattgaagctttgaacctcacccaaagactctcaaccttt 35662147  T
Q  229 agtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||| ||||    
T  35662146 agtatctaaa-atcctaaaagttctctcatttg 35662115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 46703403 - 46703174
Alignment:
Q  29 tttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctct 128  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||  | ||||||||| |||| |||||||||||| |    
T  46703403 tttgatttcctaaggattttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctgacaaaagactctccattcatgtttt-cccatccccatgaatct-t 46703306  T
Q  129 ccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccatt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||    
T  46703305 ccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttgattctcgaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaaccttt 46703206  T
Q  229 agtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  46703205 agtatctaaa-accctaaaagttctctcctttg 46703174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 6655841 - 6655629
Alignment:
Q  47 ttctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacc 146  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  6655841 ttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcagaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacc 6655743  T
Q  147 cttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaataccctaa 246  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  6655742 ctttccccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttaaagttttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaa 6655644  T
Q  247 aagttttctcctttg 261  Q
    |||||  ||||||||    
T  6655643 aagttccctcctttg 6655629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Original strand, 50674100 - 50674341
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||    
T  50674100 acccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccc 50674199  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagat 217  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||     
T  50674200 catgaatct-ttcccataaggcaccaacccttttcattagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagac 50674298  T
Q  218 cctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    ||| |||  ||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||    
T  50674299 ccttaacatttagtatttaaa-accctaaaagttccctcctttg 50674341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 379292 - 379051
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaacccc 118  Q
    ||||||| | ||||||| | ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||  | |    
T  379292 acccttagcctttgatttcctaaggatcttctcttttgatttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccattctc 379193  T
Q  119 atgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatc 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||  |    
T  379192 atgaatct-tccccaaaaggcaccgacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcatgaagctttgaacctcacccaaagtcc 379094  T
Q  219 ctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    ||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||||||    
T  379093 ctcaacctttagtatctacaaatcctaaaagttctctcctttg 379051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 47 - 261
Target Start/End: Original strand, 50262981 - 50263193
Alignment:
Q  47 ttctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacc 146  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50262981 ttctcttttggtttcacaagagtcaccgaggttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacc 50263079  T
Q  147 cttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaataccctaa 246  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  50263080 ctttttccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagactctcaacctttagtgtctaaa-accctaa 50263178  T
Q  247 aagttttctcctttg 261  Q
    |||||  ||||||||    
T  50263179 aagttccctcctttg 50263193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 39 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8648031 - 8647864
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8648031 taaggatcttctcttttgatttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcctgtgtttcccaaccccatgaatct-tccccaaaagg 8647933  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctc 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8647932 caccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctc 8647864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12073306 - 12073076
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  12073306 acccttagcatttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcataagactcacccaagttgctcacaaaagactcttcactcatgtgttttccaaccc 12073207  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaaccc-ttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaaga 216  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  12073206 catgaa--tcttcccaaaaggcaccaaccctttttcccaagag-cccctcttttggttctccaagatttacatcttgaagctttgaacctcacccaaaga 12073110  T
Q  217 tcctcaaccattagtatctaaataccctaaaagtt 251  Q
     |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  12073109 ccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtt 12073076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 89 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 2209551 - 2209378
Alignment:
Q  89 tgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcaca 188  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  2209551 tgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagtcccctcgtttggttctccaagattcaca 2209453  T
Q  189 tcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttgctt 264  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||    
T  2209452 tcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaatctttagtatctaaa-accctaaaagttccctcatttgctt 2209378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 98 - 261
Target Start/End: Original strand, 27417285 - 27417446
Alignment:
Q  98 actcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagc 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27417285 actcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tccccaaaagacaccaacccctttcccaagagccccttcttttggttctccaagattcacatcttaaagc 27417383  T
Q  198 ttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    ||| ||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  27417384 tttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttccctcctttg 27417446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 261
Target Start/End: Original strand, 46569820 - 46570041
Alignment:
Q  38 ataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaag 137  Q
    |||||||  |||||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||| |||| |  |||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  46569820 ataaggaccttctcttttggtttcataagattcacctaagttgttcacaaaagactttccactcatttgtttcccaaccccatgaatctttccc-aaaag 46569918  T
Q  138 gcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaa 237  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||| | |||||  |||||||||||    
T  46569919 gcaccaatccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacctaaagaccttcaacatttagtatctaa 46570018  T
Q  238 ataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    | ||||||||| ||  ||||||||    
T  46570019 a-accctaaaatttccctcctttg 46570041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 33089759 - 33089582
Alignment:
Q  72 cccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttg 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||  | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  33089759 cccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttttcgaccccatgaatctctctccaaaagacaccaaccctctccc-aagagccccctcttttg 33089661  T
Q  172 gttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaataccctaaaagtt 251  Q
     || ||||||||||||||||| || |||| ||||||  ||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  33089660 attctccaagattcacatcttcaaactttgaacctcacccaaagaccctcaatctttagtatctaaata-cctaaaagtt 33089582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 251
Target Start/End: Original strand, 26699704 - 26699933
Alignment:
Q  23 ttaacttttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatga 122  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  |||||||| |||| | |||||||| |  ||||| |||| ||||| |||  |||||||| | |||| |||||||||    
T  26699704 ttaacctttgattacataaagatcatctcttttagttttctaagactcatctgagttgttcactaatgaatctccactcatgtatctcccgaccccatga 26699803  T
Q  123 atctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccc-tcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctc 221  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||||| | |||| ||||| || ||||| | || |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||    
T  26699804 atctcttctgaaaaggcaccaaccctttttccaagatcccccttcatttggctctctaagattcacatcttgaagttttgaacctcaaccaaagatcttc 26699903  T
Q  222 aaccattagtatctaaataccctaaaagtt 251  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  26699904 aacctttagtatctaaatgccctacaagtt 26699933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 3785993 - 3785773
Alignment:
Q  29 tttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctct 128  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||    | | || || | | ||||||| | |||||    
T  3785993 tttgatttcctaaggatattctcttttggtctcccaagactcgcacaatttgctcacaaa-gactctcctttgaagtgttcctcgaccccataattctct 3785895  T
Q  129 ccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccatt 228  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||  | |||||  ||||||| ||    
T  3785894 cctcaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaatctcgcctaaagactctcaaccttt 3785796  T
Q  229 agtatctaaataccctaaaagtt 251  Q
    |||||| |  || ||||||||||    
T  3785795 agtatccatgtatcctaaaagtt 3785773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 8653385 - 8653273
Alignment:
Q  148 ttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaataccctaaa 247  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  8653385 ttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaa 8653287  T
Q  248 agttttctcctttg 261  Q
    |||| |||||||||    
T  8653286 agttctctcctttg 8653273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 248
Target Start/End: Original strand, 22883028 - 22883235
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    | |||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  22883028 taaggatcttctcttttggtctcctaagactcgcccaaattgctcacaaa-gactctcatttgatgtgtttcctaaccctatgagtctctctccaaaagg 22883126  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaa 238  Q
     | || |||| | || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||| |  ||||||| ||||||||||||    
T  22883127 tatcagccctctccc-aagagccccctctttttgttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcactcaaatagtctcaacctttagtatctaaa 22883225  T
Q  239 taccctaaaa 248  Q
    ||||||||||    
T  22883226 taccctaaaa 22883235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 248
Target Start/End: Original strand, 22934692 - 22934899
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    | |||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  22934692 taaggatcttctcttttggtctcctaagactcgcccaaattgctcacaaa-gactctcatttgatgtgtttcctaaccctatgagtctctctccaaaagg 22934790  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaa 238  Q
     | || |||| | || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||| |  ||||||| ||||||||||||    
T  22934791 tatcagccctctccc-aagagccccctctttttgttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcactcaaatagtctcaacctttagtatctaaa 22934889  T
Q  239 taccctaaaa 248  Q
    ||||||||||    
T  22934890 taccctaaaa 22934899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 34112515 - 34112357
Alignment:
Q  29 tttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctct 128  Q
    ||||||| | ||||||| |||  ||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  34112515 tttgatttcctaaggatcttcagttttgtttttccaagattcatccaagttgctcacagatgactctccactcatgtgttttccaaccccgtgaacctct 34112416  T
Q  129 ccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcaca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||    
T  34112415 ccccaaaaggcaccaaccctttt-ctaagagcctcgtctttaggttatccaagattcaca 34112357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 261
Target Start/End: Original strand, 35370620 - 35370833
Alignment:
Q  47 ttctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacc 146  Q
    |||| ||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||    | ||||||||  ||||| |||||||||||  | |||||| |||||||    
T  35370620 ttctattttggtatccatagactcacccaagttgcttacaaa-gactctcctttgatgtttttatcaacctcatgaatctctttcgaaaagggaccaacc 35370718  T
Q  147 cttttcctaagagccccctctttt-ggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaatacccta 245  Q
    || | || |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  35370719 ctctccc-aagaaccccctcttttaggttctccaagattcacatcttaaagctttgaacctctcccaaagaccctcaacctttagtatctaaatacctta 35370817  T
Q  246 aaagttttctcctttg 261  Q
    ||||||  ||||||||    
T  35370818 aaagttccctcctttg 35370833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 38811404 - 38811573
Alignment:
Q  89 tgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcaca 188  Q
    |||||||  ||| |||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  38811404 tgactctccacttatgtgtttcctaacctcatgaatctctccgcaaaagacaccaaccctttccc-aagagcccc-tctttgggttctccaagattcaca 38811501  T
Q  189 tcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctccttt 260  Q
    |||| ||||||| ||||||  ||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  38811502 tcttaaagctttgaacctcacccaaataccctcaacctttagtatctaagtaccctaaaagttccctccttt 38811573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 10071676 - 10071558
Alignment:
Q  142 caacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaatac 241  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  10071676 caacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttaaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-ac 10071578  T
Q  242 cctaaaagttttctcctttg 261  Q
    | ||||||||  ||||||||    
T  10071577 cttaaaagttccctcctttg 10071558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10072065 - 10071966
Alignment:
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaa 238  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10072065 caccaacccttttcacaagagccccctcttttagttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa 10071966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 208
Target Start/End: Original strand, 25723482 - 25723659
Alignment:
Q  29 tttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctct 128  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||| ||| | |||| ||||||  |||||| ||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  25723482 tttgattacttaagggtcttctctttcggtctaccaaaactcacttaagttgttcacaaa-gactctcttttgatgtgtttcccaaccccacgaagctct 25723580  T
Q  129 ccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctcc 208  Q
    | ||||||||||  |||| || ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25723581 ctccaaaaggcattaaccattatcc-aagagctccctcttttggttctccaagattcacattttgaagctttgaacctcc 25723659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 65 - 240
Target Start/End: Original strand, 35369740 - 35369914
Alignment:
Q  65 agactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccc 164  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| | |  | |||| ||||  |||| |||||||||||  | |||||| ||||||||| | || |||| |||||    
T  35369740 agactcacccaagttgcttacaaa-gactatcttttgatgtgtttctaaacctcatgaatctctttcgaaaagggaccaaccctctccc-aagaaccccc 35369837  T
Q  165 tctttt-ggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaata 240  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  35369838 tcttttaggttctccaagattcacatcttaaatctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaata 35369914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12119432 - 12119281
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||   ||| |||| |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  12119432 taaggatcttctcttttggtttcacaagacacacccaaattgctcacaaatgattcaccactaatgtgtttcgcaaccccatgaatct-tcccaaaaggg 12119334  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatctt 192  Q
     |||||||| ||||| |||||  |||| ||||  || ||||||||||| |||||    
T  12119333 aaccaaccc-tttcccaagagttcccttttttaattctccaagattcatatctt 12119281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 41961324 - 41961152
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaa-----gttgctcacaaatgactctttactcatgtttttccca 113  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     |||||||||| | ||||||    | |||| |||||||    
T  41961324 acccttagcttttgatttcctaaggatattcttttttggtctcccaagactcacccaagttacgttgctcacata-gactctcctttaatgtgtttccca 41961226  T
Q  114 accccatgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacat 189  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||  |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||    
T  41961225 a-cccatgaatctctccccaaaaagcaccga-ccttctccctagagccccctttttcggttctacaagattcacat 41961152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 251
Target Start/End: Original strand, 47514831 - 47514987
Alignment:
Q  94 ctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttg 193  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |  | ||| |||||| || |||  | ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  47514831 ctttactcatgtgtttcccaaccctatgcacatttcctcaaaagacatcaa-tcatttcccaagagtccactcttttggttcaccaagattcatatcttg 47514929  T
Q  194 aagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaataccctaaaagtt 251  Q
    ||||||| ||| ||  || |||| | |||||| ||||| | ||| |||||||||||||    
T  47514930 aagctttgaacttcacccgaagaccttcaacctttagtgtttaagtaccctaaaagtt 47514987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 192
Target Start/End: Original strand, 6200138 - 6200291
Alignment:
Q  38 ataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaag 137  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||| ||| |||| |||||||  || ||||||   ||||||| |||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  6200138 ataaggatcttctcttttggtatctcaagattcatccaaattgctca-taaggactctcatctcatgtgtttctcaaccccacatatctctccccaaaag 6200236  T
Q  138 gcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatctt 192  Q
    | ||| | |  | ||| |||||| || |||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  6200237 gaacccaactctgtcccaagagctccatcttttagttctccaagatacacatctt 6200291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 6719384 - 6719319
Alignment:
Q  134 aaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttt 200  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6719384 aaaggcatcaaccctttccc-aagaatccactcttttagttttccaagattcacatcttgaaccttt 6719319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 38 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 38746899 - 38746678
Alignment:
Q  38 ataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaag 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38746899 ataaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcgcaaatgactctccactcacgtgtttcccaaccccatgaatct-tccccaaaag 38746801  T
Q  138 gcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaa 237  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  38746800 gcaccaacccttttcttaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaactttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaa 38746701  T
Q  238 ataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    | |||||||||||| |||||||||    
T  38746700 a-accctaaaagttctctcctttg 38746678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 40147175 - 40146934
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||    
T  40147175 acccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccc 40147076  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagat 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||     
T  40147075 catgaatct-tccccaaaaggcaccaaccattttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagac 40146977  T
Q  218 cctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  40146976 cctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtttcatcctttg 40146934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 213383 - 213141
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||    
T  213383 acccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccc 213284  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggtt-ttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaaga 216  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  213283 catgaatct-tctccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctcccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaaga 213185  T
Q  217 tcctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
     |||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  213184 ccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttccctcctttg 213141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27015446 - 27015205
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||    
T  27015446 acccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggttttacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccc 27015347  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagat 217  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||     
T  27015346 catgattct-tccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgatcctcacccaaagac 27015248  T
Q  218 cctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  27015247 cctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttccctcctttg 27015205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 28278201 - 28277989
Alignment:
Q  47 ttctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacc 146  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28278201 ttctcttttgatttcacaagactcacccaagttgctcacaatagtctctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaacc 28278103  T
Q  147 cttttcctaagagccccc-tcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaatacccta 245  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  28278102 cttttcccaagagcccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcatccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-acccta 28278004  T
Q  246 aaagttttctccttt 260  Q
    ||||||| |||||||    
T  28278003 aaagtttcctccttt 28277989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 39 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5057940 - 5057721
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  5057940 taaggatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaagg 5057842  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaa 238  Q
    |||||||| |||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  5057841 caccaacctttttcccaaaag-cccctcttttggttctcaaagattcacatcttgaagctttgatcctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa 5057743  T
Q  239 taccctaaaagttttctcctttg 261  Q
     |||||||||||| |||||||||    
T  5057742 -accctaaaagttctctcctttg 5057721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 48 - 261
Target Start/End: Original strand, 27637900 - 27638109
Alignment:
Q  48 tctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaaccc 147  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||    
T  27637900 tctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcataaaagactcttcactcatgtgtttcctaaccccatgaa--tcttcccaaaatgcaccaaccc 27637997  T
Q  148 ttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaataccctaaa 247  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  27637998 ttttcccaagagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaa-ctttgaacctcacccaaagattctcaacctttagtatctaaa-accttaaa 27638095  T
Q  248 agttttctcctttg 261  Q
    ||||  ||||||||    
T  27638096 agttccctcctttg 27638109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 41 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 316655 - 316439
Alignment:
Q  41 aggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggca 140  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  316655 aggattttctcttttggtctcccaagattcacc-aagttgctcacaaa-gactctcttttgatgtgtttcccaaccttatgaatctctccccaaaaggca 316558  T
Q  141 ccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaata 240  Q
    |||||||| | || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  316557 ccaaccctctccc-aagagcccccccttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaagta 316459  T
Q  241 ccctaaaagttttctccttt 260  Q
    |  |||||||| ||||||||    
T  316458 caataaaagttctctccttt 316439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 51 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 35616052 - 35615852
Alignment:
Q  51 cttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacccttt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||   | |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  35616052 cttttggtttcccaagactcaccaaagttgattacaaa-gactcttcttttatgtgtttctcaactccatgaatctctccccaaaaggcatcaccccttt 35615954  T
Q  151 tcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaataccctaaaagt 250  Q
     || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  35615953 ccc-aagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcactcaaagaccctcaacctttagtatctaaatactctaaaagt 35615855  T
Q  251 ttt 253  Q
    |||    
T  35615854 ttt 35615852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 261
Target Start/End: Original strand, 16642212 - 16642372
Alignment:
Q  98 actcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagc 197  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  16642212 actcatgtgtttcctaaccccatgaatctgtccccaaaaggcaccaaccctttccc-aagagccc--tcttttggttcttcaagattcacttcttgaagc 16642308  T
Q  198 ttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    ||| ||||||  ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16642309 tttgaacctcacccaaagaccatcaacctttagtatctaaataccctaaaagtgctctcctttg 16642372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 4160546 - 4160307
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaacccc 118  Q
    ||||||| | ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||| | | | ||||||||||     
T  4160546 acccttagcctttaattacctaaggatcttctcttttggtttcccaagattcaccctagttgctcacaaatgactctccacttacg-tgttcccaaccct 4160448  T
Q  119 atgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatc 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||| | ||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||| || |||| ||| | |||| || | |    
T  4160447 atgaatctctccccaaaagacacttaccc-tctcccaagagccccctcttttagttctccaggattcacttctttaaactttgaacat-cacccaaaacc 4160350  T
Q  219 ctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  4160349 ctcaaactttagtatctaaataccctaaatgttctctcatttg 4160307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 225
Target Start/End: Original strand, 33906294 - 33906488
Alignment:
Q  29 tttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctct 128  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    | |||| |||| |||||||||||||||||    
T  33906294 tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcactaa-gtctctcctttgatgtgtttctcaaccccatgaatctct 33906392  T
Q  129 ccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaacc 225  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| ||||  ||||||   |||||| ||||||||    
T  33906393 ccccaaaaggcaccaaccc-tctcccaagagcccccttttttggttctacaagattcacattttgaggcttcgaacctcactcaaagaccctcaacc 33906488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 89 - 200
Target Start/End: Original strand, 10055031 - 10055141
Alignment:
Q  89 tgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcaca 188  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  10055031 tgactctctactcatgtgtttcccaaccccgtgaatctctccccataaggcaccaaacc-tttcccaagagccctctcttttggttctccaagattcaca 10055129  T
Q  189 tcttgaagcttt 200  Q
    ||||||||||||    
T  10055130 tcttgaagcttt 10055141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 91 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 30793080 - 30792913
Alignment:
Q  91 actctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatc 190  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||| | | |||||||| ||||||| | |||||    
T  30793080 actctctactcatgtgtttcccaaccccatgaatatctccccaaaaggcaccaa-ccttttcccaa-agccacatattttggttctccaaga-taacatc 30792984  T
Q  191 ttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    |||||||||| ||| ||  | ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  30792983 ttgaagctttgaacatcacctaaagaccctcaacctttagtatctaattaccctaaaagtttactcatttg 30792913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 98 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 30802775 - 30802624
Alignment:
Q  98 actcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagc 197  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || |||| | ||||| ||||||    
T  30802775 actcatgtgttttctaaccccatgaatctctccccaaaaggcacaaaccc-tttcccaagagcctcctcttttggttctctaaga-taacatcatgaagc 30802678  T
Q  198 ttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaataccctaaaagtt 251  Q
    ||| ||||||  | ||||| ||||||||   | |||||||||||||||||||||    
T  30802677 tttgaacctcacctaaagaccctcaacctagaatatctaaataccctaaaagtt 30802624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 260
Target Start/End: Original strand, 14689685 - 14689902
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||| |||||    | |||| |||||||  | || ||||||||||  ||||||    
T  14689685 taaggatcttttcttttggtgtcccaagacttatctaagttgctcacaaat-actctccttttatgtgtttcccattctcacgaatctctcc--aaaagg 14689781  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaa 238  Q
    ||||||||||||  | |||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||   |||||| ||| |||| | | ||||||||    
T  14689782 caccaaccctttcac-aagaaccccttcttttggttctccaaaattcacatcttgaaactttgaacatcactcaaagacccttaaccttcactatctaaa 14689880  T
Q  239 taccctaaaagttttctccttt 260  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  14689881 tgccctaaaagttttctccttt 14689902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 189
Target Start/End: Original strand, 21205917 - 21206076
Alignment:
Q  29 tttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctct 128  Q
    ||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||| || | |||||||| || || ||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  21205917 tttgatttcataaggttcttcacttttagtttcctaaaattcacccaaatttctgacaaatgactcctcactcatgtgtttcccaaccctatgaacctct 21206016  T
Q  129 ccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacat 189  Q
    ||  ||||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||| || |||||||||||    
T  21206017 ccgaaaaagacaccaaccc-tttccaaagaaccccatcttttggttctctaagattcacat 21206076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 93
Target Start/End: Original strand, 16641223 - 16641269
Alignment:
Q  47 ttctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgact 93  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  16641223 ttctcttttggtttcacaagactcaccaaagttgttcacaattgact 16641269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 261
Target Start/End: Original strand, 33906578 - 33906627
Alignment:
Q  212 aaagatcctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  33906578 aaagaacctcaacctttaatatctaaataccctaaaagttctcttctttg 33906627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 32)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 29 - 261
Target Start/End: Original strand, 7482495 - 7482726
Alignment:
Q  29 tttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctct 128  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  7482495 tttgatttcctaaggatcttctctttttgtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-t 7482593  T
Q  129 ccccaaaaggcaccaacccttttcctaagag-ccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccat 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| |    
T  7482594 ccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagcccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaaccgt 7482693  T
Q  228 tagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7482694 tagtatctaaa-accctaaaagtttcctcctttg 7482726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 39 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 28242281 - 28242061
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||||||||   |||||||||    
T  28242281 taaggatattctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccttatgaatctt--cccaaaagg 28242184  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaa 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  28242183 caccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacattttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaca 28242084  T
Q  239 taccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    |||||||||||||  ||||||||    
T  28242083 taccctaaaagttccctcctttg 28242061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 41 - 261
Target Start/End: Original strand, 42298252 - 42298470
Alignment:
Q  41 aggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggca 140  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  42298252 aggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcgcaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggca 42298350  T
Q  141 ccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaata 240  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| |    
T  42298351 ccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-a 42298449  T
Q  241 ccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    ||||||||||||  |||||||    
T  42298450 ccctaaaagtttcatcctttg 42298470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 29136161 - 29135921
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||    
T  29136161 acccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaaaactctccactcatgtttttcc-aaccc 29136063  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagat 217  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||     
T  29136062 catgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcactcaaagac 29135964  T
Q  218 cctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  29135963 cctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttccctcctttg 29135921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 39 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 37168190 - 37167992
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37168190 taaggatcttctcttttagtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tccccaaaagg 37168092  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaa 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  37168091 caccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaaaaccctcaacctttagtatctaaa 37167992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 34603489 - 34603249
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaacccc 118  Q
    ||||||| | ||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||| ||||||||    
T  34603489 acccttagcctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagacttttcactcatgtgttttccaacccc 34603390  T
Q  119 atgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatc 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| |    
T  34603389 atgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacatcacccaaagacc 34603291  T
Q  219 ctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
     |||||| ||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  34603290 ttcaacctttaatatctaaa-accctaaaagttccctcctttg 34603249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 11348612 - 11348381
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  11348612 acccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgttttccaaccc 11348513  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagat 217  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||     
T  11348512 catgaatct-tctccaaaaggcaccagaccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaactttgaacctcacccaaagac 11348414  T
Q  218 cctcaaccattagtatctaaataccctaaaagtt 251  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  11348413 cctcaacccttagtatctaaa-accctaaaagtt 11348381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 39 - 232
Target Start/End: Original strand, 37033348 - 37033540
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  37033348 taaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaacctcatgaatct-tcctcaaaagg 37033446  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagta 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||||||    
T  37033447 caccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagta 37033540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Original strand, 34602594 - 34602834
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaacccc 118  Q
    ||||||| | ||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||| ||||||||    
T  34602594 acccttagcctttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagacttttcactcatgtgttttccaacccc 34602693  T
Q  119 atgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatc 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| |    
T  34602694 atgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttaccaagagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacatcacccaaagacc 34602792  T
Q  219 ctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
     |||||| ||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  34602793 ttcaacctttaatatctaaa-accctaaaagttccctcctttg 34602834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 193525 - 193285
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||    
T  193525 acccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcatccaagttgctcacaaaagactcttcacacatgtgtttcccaaccc 193426  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagat 217  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | |||||     
T  193425 catgaatctt--cccaaaaggcaccaaccttttccccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcatgaagctttgaacctcaccgaaagac 193328  T
Q  218 cctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  193327 cctcaacctttaatatctaaa-accctaaaagttatctcctttg 193285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 39 - 251
Target Start/End: Original strand, 37879186 - 37879396
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  37879186 taaggatcttctcttttgatttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaattt-tccccaaaagg 37879284  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaa 238  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  37879285 caccaacctttttcacaagagccccctctttttgttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagatcctcaacatttagtatctaaa 37879384  T
Q  239 taccctaaaagtt 251  Q
     ||||||| ||||    
T  37879385 -accctaacagtt 37879396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 38 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 19754385 - 19754164
Alignment:
Q  38 ataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaag 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19754385 ataaggattttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tccccaaaag 19754287  T
Q  138 gcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaa 237  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||     
T  19754286 gcaccaacccttttcacaagagccccctctcttggttttccaagattcaaatcatggtgctttgaacctcacccaaagacccttaacctttagtatctag 19754187  T
Q  238 ataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    | ||||||||||||  ||||||||    
T  19754186 a-accctaaaagttccctcctttg 19754164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Original strand, 13547343 - 13547584
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || |||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  13547343 acccttagcctttgatttcactaagtatcttctcttttggtttcacaagattcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttccaaccc 13547442  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagat 217  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||     
T  13547443 catgaattt-tcctcaaaaggcaccgacccttttcacaagagctccctcttttggttatccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagac 13547541  T
Q  218 cctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  13547542 cctcaacctttagtatctaaa-actctaaaagttctctcctttg 13547584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Original strand, 13549254 - 13549495
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || |||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  13549254 acccttagcctttgatttcactaagtatcttctcttttggtttcacaagattcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttccaaccc 13549353  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagat 217  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||     
T  13549354 catgaattt-tcctcaaaaggcaccgacccttttcacaagagctccctcttttggttatccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagac 13549452  T
Q  218 cctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  13549453 cctcaacctttagtatctaaa-actctaaaagttctctcctttg 13549495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 47115085 - 47114867
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattacat-aaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||| |||||||||||    
T  47115085 acccttagcctttgatttcattaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccattcatgtgtttcccaaccc 47114986  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagat 217  Q
    |||||||||   ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||     
T  47114985 catgaatctt--cccaaaaggtaccaaccctgttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacagcttgaagctttgaacctcacccaaagac 47114888  T
Q  218 cctcaaccattagtatctaaa 238  Q
    |||||| | ||| ||||||||    
T  47114887 cctcaatctttaatatctaaa 47114867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 261
Target Start/End: Original strand, 47255615 - 47255829
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||  | |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  47255615 taaggatcttctcttttggtttcacaagactcact-aagttgctcacaaaagactctccaatcatgtgtttcccaaccc-atgaatct-tccccaaaagg 47255711  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaa 238  Q
    |||||    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  47255712 cacca----ttttcccaagagccccatcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa 47255807  T
Q  239 taccctaaaagttttctcctttg 261  Q
     ||||||||||||  ||||||||    
T  47255808 -accctaaaagttccctcctttg 47255829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 6808350 - 6808119
Alignment:
Q  29 tttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctct 128  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  6808350 tttgattacataatgatcttctcttttggttttccattactcaccctagttgctcacaaatgactcttcattcatgtgttttccaaccccatgaatctct 6808251  T
Q  129 ccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaaga-tcctcaaccat 227  Q
     |||||||| ||| ||  || |  | ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | |||||  |||||||| |    
T  6808250 tcccaaaagacacaaaatctct--ccaagagcccaatcttttggttctccaagattcacatcttgaagttttgaacctcacctaaagacccctcaacctt 6808153  T
Q  228 tagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    ||||||||||| |  |||||||||| ||||||||    
T  6808152 tagtatctaaaaaatctaaaagtttcctcctttg 6808119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19752578 - 19752372
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||  |||||  |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  19752578 taaggatcttctcttttggtttcacaagactcatctaagttgctcacaaaatactctccactcatgtgtttcccaactcaatgaatct-tccccaaaagg 19752480  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaa 238  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||  ||||||  ||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  19752479 caccaa-ccttttcataagagccccatcttttggttctccaagattcacattatgacgcttagaacctcacccaaagaccttcaacctttagtatctaaa 19752381  T
Q  239 taccctaaaa 248  Q
     |||||||||    
T  19752380 -accctaaaa 19752372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 41135705 - 41135513
Alignment:
Q  47 ttctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacc 146  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41135705 ttctcttttggtttcctaagactcacccaagtttctcacaaa-gactctcctttgatgtgtttcccaaccccatgaatctctccctaaaaggcaccaacc 41135607  T
Q  147 cttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaatac 241  Q
    | | ||| || | |  |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  41135606 c-tctcccaaaatcttcctcttttggttctccaagatccacatcttgaaggtttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaatac 41135513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 252
Target Start/End: Original strand, 9109666 - 9109888
Alignment:
Q  29 tttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctct 128  Q
    ||||||||| | | ||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    | |||| | |||||||| |||||||||||    
T  9109666 tttgattacctcatgatcttctattttgatttcccaagactcatccaaattgctcacaaaagactctcatttgatgtgtctcccaacctcatgaatctct 9109765  T
Q  129 ccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccatt 228  Q
    ||||||||| || ||||||| | || | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||| | |||||||| ||    
T  9109766 ccccaaaagacatcaaccctctccc-atgagtccccttttttggttctccaagattcacatcttgaagttttgaacctcacccaaataccctcaaccttt 9109864  T
Q  229 agtatctaaataccctaaaagttt 252  Q
    ||||| || |||||| ||||||||    
T  9109865 agtatttatataccccaaaagttt 9109888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 152
Target Start/End: Original strand, 31925981 - 31926093
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  31925981 taaggatcttctcttttggtttcacaagtctcacccaagttgctcacaaaagattctccactcacgtgtttcccaaacccatgaatct-tccccaaaagg 31926079  T
Q  139 caccaacccttttc 152  Q
    ||||||||||||||    
T  31926080 caccaacccttttc 31926093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Original strand, 31928208 - 31928281
Alignment:
Q  165 tcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaa 238  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  31928208 tcttttggttttctaagattcacatcttgaagctttgaacctcatccaaagactctcaacctttagtatctaaa 31928281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6068443 - 6068377
Alignment:
Q  107 tttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggtt 174  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6068443 tttcccaaccttatgaatctcttcccaaaagacaccaacc-ttttcctaagagccccctcttttggtt 6068377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 239
Target Start/End: Original strand, 16216800 - 16216967
Alignment:
Q  69 tcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctctt 168  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||   ||||||| ||| ||||| | |||||| |||  |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16216800 tcactcaagttgctcacaa-tgactctcctctcatgtgtttgccaacac-atgaatttctatccaaaatgcaccaacccttttcg-aagagccccctctt 16216896  T
Q  169 ttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaat 239  Q
    |||||| | ||||||  |||||||||| |||| ||  ||  ||||||| ||| |||| ||||| |||||||    
T  16216897 ttggttcttcaagatatacatcttgaacctttgaatatcacccaaagacccttaacctttagtttctaaat 16216967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 3331357 - 3331283
Alignment:
Q  119 atgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttga 194  Q
    ||||||||||||| ||| | ||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3331357 atgaatctctcccaaaacgacacgaaccctttccc-aagagccccctcttttggttctctaagattcacatcttga 3331283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 194
Target Start/End: Original strand, 28318110 - 28318188
Alignment:
Q  116 cccatgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagcccc-ctcttttggttttccaagattcacatcttga 194  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28318110 cccatgaatctctccccaaaatgcactaaccc-tttcccaagaacccctctcttttggttatccaaaattcacatcttga 28318188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 151
Target Start/End: Original strand, 4535783 - 4535861
Alignment:
Q  73 ccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaaccctttt 151  Q
    |||||||||||||||| |||| |  |||||||| |||  ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  4535783 ccaagttgctcacaaacgactatccactcatgtgtttttcaaccccatgaatctattcccaaaagacaccaaccctttt 4535861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 38747052 - 38747144
Alignment:
Q  100 tcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttga 194  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||    
T  38747052 tcatgtgttttccaaccctatgaacctctctccaaaaggcaccaaccctttttc-aagagccccc-gttttggttgtctaagattcatatcttga 38747144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22079109 - 22079045
Alignment:
Q  159 gccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaa 223  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||    
T  22079109 gccccctcttttggttctttaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaa 22079045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 174
Target Start/End: Original strand, 12318764 - 12318889
Alignment:
Q  47 ttctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacc 146  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    | |||| |||| ||| || |||||  |||||||||||||||||||||    
T  12318764 ttctattttggtctcccaagactcacccaagttgctcataaa-aactctcctttgatgtgtttctcaatcctatgaacttctccccaaaaggcaccaacc 12318862  T
Q  147 cttttcctaagagccccctcttttggtt 174  Q
    | | ||| |||||||| ||| |||||||    
T  12318863 c-tctcccaagagccctctcatttggtt 12318889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 25651978 - 25651922
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactct 95  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  25651978 taaggatcttcacttttgctttcccaagattcacccaagttgctcacatataactct 25651922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 22079225 - 22079166
Alignment:
Q  29 tttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaa 88  Q
    ||||||| |||||| || || | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  22079225 tttgatttcataagcatcttatattttggtttgccaagactcacctaagttgctcacaaa 22079166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 39 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 7221 - 7001
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  7221 taaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgttttccaaccccatgaatct-tccccaaaagg 7123  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaa 238  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  7122 caccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa 7023  T
Q  239 taccctaaaagttttctcctttg 261  Q
     ||||||||||||  ||||||||    
T  7022 -accctaaaagttccctcctttg 7001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 15)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Original strand, 42288364 - 42288604
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||    
T  42288364 acccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccc 42288463  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagat 217  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||     
T  42288464 catgaatctt--cccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagttttgaacctcacccaaagac 42288561  T
Q  218 cctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  42288562 cctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttctctcatttg 42288604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Original strand, 1631986 - 1632227
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||    
T  1631986 acccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccc 1632085  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagat 217  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||     
T  1632086 catgaatct-tccccaaaagacaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttccccaagattcacatcttgaagctttgaacctcactcaaagac 1632184  T
Q  218 cctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  1632185 cctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttccctcctttg 1632227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 39 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 24397951 - 24397738
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||| |||| |||||||| ||||||    
T  24397951 taaggatattctcttttggtttcacaagactaacccaaattggtcacaaatgactctccactcatgtgtttaccagcccgatgagtctctccctaaaagg 24397852  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaa 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||| | |||||| ||||||||||||    
T  24397851 caccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacattttgaagctttgaacctcacacaaagaccgtcaacctttagtatctaaa 24397752  T
Q  239 taccctaaaagttt 252  Q
    ||||||||||||||    
T  24397751 taccctaaaagttt 24397738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 45726843 - 45726613
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||    
T  45726843 acccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacatgactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttccaaaccc 45726744  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagat 217  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||     
T  45726743 catgaatct-tccccaaaaggcaccaaccc-tttcccaagagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagac 45726646  T
Q  218 cctcaaccattagtatctaaataccctaaaagtt 251  Q
     ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  45726645 tctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtt 45726613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 39 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 33648063 - 33647841
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||   ||||||| || |||| ||| |||||||||||| ||||||| | ||| |||||| | ||||||||||| |||||||    
T  33648063 taaggatcttctcttttggttttataagactcgcctaagtagctaacaaatgactctctactcatatgttttccaacctcgtgaatctctcctcaaaagg 33647964  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaa 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  33647963 caccaacccttttcccaagagcctcctcttttgattctccaagattcacatcttgaaactttgaacctcacccaaagaccttcaacctttagtatctaaa 33647864  T
Q  239 taccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    ||| ||||||||| |||||||||    
T  33647863 tactctaaaagttctctcctttg 33647841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 17450504 - 17450264
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactcttta-ctcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| | ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||| ||||||| |||    
T  17450504 acccttagcctttgatttcctaatgatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagtttctcacaattgactccttcgctcatgtgtttcccatccc 17450405  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagat 217  Q
    ||||||||| || | ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||     
T  17450404 catgaatctttcac-aaagggcaccaaccctttccc-aagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcactcaaagac 17450307  T
Q  218 cctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  17450306 cctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttccctcctttg 17450264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Original strand, 35447138 - 35447379
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || |||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||    
T  35447138 acccttagcctttgatttcactaagtatcttctcttttggttttacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccc 35447237  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttc-caagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaaga 216  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||| |    
T  35447238 catgaatct-ttcccaaaaggcaccaacccttttcacaagag-cccctcttttggttctctcaagactcacatcttgaagctttgaacctcacacaaata 35447335  T
Q  217 tcctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  35447336 ctctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttctctcctttg 35447379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 267
Target Start/End: Original strand, 42261873 - 42262111
Alignment:
Q  27 cttttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatct 126  Q
    ||||||||| | ||| ||||| |||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| |||  |||||    | |||| |||||||| |||||||||||    
T  42261873 cttttgatttcctaatgatatactcttttggtctcgtaagactcgcccaagttgctcataaaa-actctcctttgatgtgtttcccaatcccatgaatct 42261971  T
Q  127 ctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaacca 226  Q
    ||| || ||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||     
T  42261972 ctcacctaaaggcaccaaccctct-ccaaagagcccccttttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacct 42262070  T
Q  227 ttagtatctaaataccctaaaagttttctcctttgcttctc 267  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  |||||||| |||||    
T  42262071 ttagtatctacataccctaaaagctccctcctttggttctc 42262111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 74 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 7451158 - 7450975
Alignment:
Q  74 caagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  7451158 caagttgctcacaaatgactctccactcatgtgttttccaaccccataaatct-tctccaaaagtcatcaaccctttaccaaagagccccctcttttggt 7451060  T
Q  174 tttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctccttt 260  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  7451059 tctccaagattcacatcctgaagctttgaacctcacccaaaga-cgccaacctttagtatctaaa-accctaaaagttccctccttt 7450975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 51 - 261
Target Start/End: Original strand, 30218321 - 30218529
Alignment:
Q  51 cttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacccttt 150  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||    |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  30218321 cttttggtttcgcaagactcactcaagttgctcacaaa-gattctcctttggtgtgtttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcactaactctct 30218419  T
Q  151 tcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaataccctaaaagt 250  Q
     ||  | ||||| |  |||||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||  ||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  30218420 cccata-agccctcatttttggttgtccaagattcacattttgatgttttgaacctcacccaaagaccctcaacatatagtatctaaataccctaaaagt 30218518  T
Q  251 tttctcctttg 261  Q
    |  ||||||||    
T  30218519 tccctcctttg 30218529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 16676130 - 16676027
Alignment:
Q  47 ttctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacc 146  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| | || ||||||| |||| ||||||  ||||| | ||||||||||  |||||| |||||  ||||||||||||||    
T  16676130 ttctcttttggtctcccaagtttcaactaacttgctcagaaataactcttctctcatatgtttcccaaccaaatgaatttctccttaaaaggcaccaacc 16676031  T
Q  147 cttt 150  Q
    ||||    
T  16676030 cttt 16676027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 43731051 - 43730992
Alignment:
Q  29 tttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaa 88  Q
    ||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  43731051 tttgatttcctacggatattctattttggtttcccaagattcacccaaattgctcacaaa 43730992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24197704 - 24197643
Alignment:
Q  127 ctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacat 189  Q
    |||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24197704 ctccccaaaaggcaccaaccctctccc-aagagtcccctcttttggttccccaagattcacat 24197643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 261
Target Start/End: Original strand, 40935543 - 40935675
Alignment:
Q  128 tccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccat 227  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| | ||  |||| || |||  ||||||  |||||||| |    
T  40935543 tccccaataggcaccaaccc-tttcccaagagcctcatcttttggttctcctagattcacatttggacactttgaatctctcccaaaggccctcaacctt 40935641  T
Q  228 tagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    |||| ||||| | ||||||| | | |||||||||    
T  40935642 tagtttctaagttccctaaacggtctctcctttg 40935675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 186
Target Start/End: Original strand, 34811585 - 34811651
Alignment:
Q  119 atgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattca 186  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||| || ||||||||    
T  34811585 atgaatatctcccaaaaaggcaccaacctttttcc-aaaaaccccctcttttggttctctaagattca 34811651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Original strand, 80537 - 80778
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||    
T  80537 acccttagcctttgatttcactaaggatctactcttttagtttcccaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccgctcatgtgtttcccaaccc 80636  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagat 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||     
T  80637 catgaatct-tccccaaaaggcaccaacccttttcataagagccccctcttttggttctccaagattcaaatcttgaagctttgaacctcacccaaagac 80735  T
Q  218 cctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  80736 cctcaacctctagtatctaaa-accctaaaagttccctcctttg 80778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Original strand, 42435245 - 42435486
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||  | |||| | |||||||||||    
T  42435245 acccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcactcaagttgctcacaaaagactctccattcatatgtttcccaaccc 42435344  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagat 217  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||     
T  42435345 catgaatct-tccccaaaagtcaccaacctttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagac 42435443  T
Q  218 cctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  42435444 cctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtttcctcctttg 42435486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 11383900 - 11383659
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||| |||| |||||||||||    
T  11383900 acccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactttccacttatgtatttcccaaccc 11383801  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagat 217  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||     
T  11383800 catgaatct-tcctcaaaaggcaccaacccttttcacaatagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagac 11383702  T
Q  218 cctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  11383701 cctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttccctcctttg 11383659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 47 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 40328664 - 40328476
Alignment:
Q  47 ttctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacc 146  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  40328664 ttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctacactcatgtgtttcccatccccatgaatct-tccctaaaaggcaccaacc 40328566  T
Q  147 cttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatcta 236  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||| ||| || | ||||||||||    
T  40328565 cttttcccaagaaccccctcttttggttctccaagattcacatcatgaagctttgaacctcacccaaagaccctaaatctttagtatcta 40328476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 67 - 261
Target Start/End: Original strand, 2999823 - 3000016
Alignment:
Q  67 actcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctc 166  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||| | | || |||| |||||||    
T  2999823 actcgcccaagttgctcacaattgactctctactcatgtgtttctcatccccatgaatctttccccaaaagacaccaaccatatccc-aagaaccccctc 2999921  T
Q  167 ttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  2999922 ttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacatcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaattccctaaaagttctctcctttg 3000016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 40221638 - 40221428
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40221638 taaggatcttctcttttggttttacaagactcacctaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tccccaaaagg 40221540  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaa 238  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| | | ||||||  ||||||| | || ||| |||||||| |||    
T  40221539 cactaacccctttcccaagagccccctattttggttctcgaagattcacatcttgaagttctaaacctcatccaaagaccttccacctttagtatc-aaa 40221441  T
Q  239 taccctaaaagtt 251  Q
     ||||||||||||    
T  40221440 aaccctaaaagtt 40221428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 44353674 - 44353468
Alignment:
Q  50 tcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaaccctt 149  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||     
T  44353674 tcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcaccgatgactctccactcatgtgttttccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaaccctc 44353576  T
Q  150 ttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaataccctaaaag 249  Q
    |||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||   |||||||| ||| ||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  44353575 ttcacaagagccccctcttttagttctccaagattc---tcttgaagttttaaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaag 44353480  T
Q  250 ttttctcctttg 261  Q
    ||  ||||||||    
T  44353479 ttccctcctttg 44353468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22976389 - 22976207
Alignment:
Q  76 agttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttt 175  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||     
T  22976389 agttgctcacaatagactcttcactcatgtgttttc-aaccccatgaatct-tccccaaaaggcaccaaccctttttccaagagcctcctcttttggttc 22976292  T
Q  176 tccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||  ||||||||    
T  22976291 tccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-actctaaaagttcactcctttg 22976207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 40585628 - 40585397
Alignment:
Q  29 tttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctct 128  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    | |||| ||| | ||||||||||||||||    
T  40585628 tttgatttcctaaggatcttctcttttggtctaccaatactcacccaaattgctcacaaa-gactctcctttgatgtgttttcaaaccccatgaatctct 40585530  T
Q  129 ccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccatt 228  Q
    | ||||||| || ||||||| | |  |||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  || |||| ||    
T  40585529 caccaaaagacatcaaccctctccaaaagagcccactcttttgattctcaaatattcacatcttgaagctttgaacctcaaccaaagactcttaaccttt 40585430  T
Q  229 agtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  40585429 agtatctaaatactctaaaagttatttcctttg 40585397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 261
Target Start/End: Original strand, 3846103 - 3846313
Alignment:
Q  48 tctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaaccc 147  Q
    ||||||||||| ||| |||| | |||||| ||||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  3846103 tctcttttggtatccaaagatttacccaatttgctcacaaa-gaatcttctctcatgtgtttcccaaccccatgaatctctccccaaaagacaccaactc 3846201  T
Q  148 ttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaataccctaaa 247  Q
    |||||| ||||| | | |||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| || |||   |||  | |||||||| ||||| || || |||||| ||    
T  3846202 ttttcc-aagag-ctcttcttttggttcttcaagattcacattatgaacctttgaatctcactcaagaaccctcaacctttagtttcaaagtaccctgaa 3846299  T
Q  248 agttttctcctttg 261  Q
    ||||||||||||||    
T  3846300 agttttctcctttg 3846313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 149 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 4283330 - 4283219
Alignment:
Q  149 tttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaataccctaaaa 248  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  4283330 tttcccaaaagccccctcttttggttctccaagatccacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaa 4283232  T
Q  249 gttttctcctttg 261  Q
    ||| |||||||||    
T  4283231 gttctctcctttg 4283219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 189
Target Start/End: Original strand, 9633820 - 9633959
Alignment:
Q  47 ttctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacc 146  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  9633820 ttctcgtttggtttcctaagattcacccaagttgctcacaaatgactctcatcttatgtgtttaccaaccccattaatctct-cccaaaaggtaccaacc 9633918  T
Q  147 cttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacat 189  Q
     |||||  |||||| || ||||||| || | ||||||||||||    
T  9633919 tttttc--aagagcgccatcttttgattattcaagattcacat 9633959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 4283438 - 4283325
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||    
T  4283438 acccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcaaccaagtttctcacaaaagactttccactcatgtgtttcccaaccc 4283339  T
Q  118 catgaatctctccc 131  Q
    ||||||||| ||||    
T  4283338 catgaatctttccc 4283325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 261
Target Start/End: Original strand, 20686456 - 20686552
Alignment:
Q  164 ctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  20686456 ctcttttggttatccaagattcacatcttgaagctttgaa-cttcaccaaagatcctcaacatttagtatctaagtaccctgaaagttccctcctttg 20686552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 261
Target Start/End: Original strand, 3817641 - 3817829
Alignment:
Q  72 cccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccc--cctcttt 169  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||  || |||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||    
T  3817641 cccaatttgctcacaaa-gaatcttctcttatgtattttccaaccccatgaatctttctccaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctaattcttt 3817738  T
Q  170 tggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    ||||| | ||||| || |||||| || |||| ||  | |  || | | |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3817739 tggttcttcaagaatcccatcttcaacctttgaatttac-tcagaaaccctcaacctttagtttctaagtaccctaaaagttttctcctttg 3817829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 69 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 40535713 - 40535533
Alignment:
Q  69 tcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctctt 168  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| |||| | ||||||  | |  |||||||||| |||||||||  | |||| |||||||||    
T  40535713 tcacctaagttgctcacaa-tgactcttctctcatgtgttttccaatcacatgaacttttatccaaaaggcatcaaccctttctc-aagaaccccctctt 40535616  T
Q  169 ttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaataccctaaaagtttt 253  Q
    |||||| |  ||||| |||| |||||| |||| |||| ||  |||||| | |||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  40535615 ttggttctaaaagatccacaacttgaaactttgaaccacc--caaagaccatcaatctttagtatctaaataccctaaaaatttt 40535533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28461375 - 28461305
Alignment:
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacat 189  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28461375 catgaatctatccccaaaaggaaccaaccattt-cctaagagcttcctcttttggttctccaagattcacat 28461305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 194
Target Start/End: Original strand, 10101513 - 10101588
Alignment:
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttga 194  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  10101513 catgaatctcttcccaaaatgcagcaaccctttccc-aagagcctcctcttttggttctccaaggttcacattttga 10101588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 11136989 - 11136888
Alignment:
Q  84 acaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagat 183  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| || |||| ||||| |||||||||||||||| | |||  ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||    
T  11136989 acaaatgactctccactcatgtgttttcctacccaatgaacctctccccaaaaggcatcgaccaatttcc-aagagccctctcttttagttctccaaaat 11136891  T
Q  184 tca 186  Q
    |||    
T  11136890 tca 11136888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 18655315 - 18655246
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaa 87  Q
    ||||||| | ||||||| || ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  18655315 acccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttgatttcacaagactcaccgaagttgctcacaa 18655246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 10020254 - 10020179
Alignment:
Q  119 atgaatctctccccaaaagg-caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttga 194  Q
    ||||||||||||| |||| | ||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  10020254 atgaatctctcccaaaaatgacacgaaccctttccc-aagagccccctcttttggttctctaagattcacatattga 10020179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 88
Target Start/End: Original strand, 33655559 - 33655628
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaa 88  Q
    ||||||||| |||||||   ||||||| |||||||||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  33655559 acccttaacctttgattttctaaggatcttctcttttgttctcctaagattcacccaaattgctcacaaa 33655628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 47 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 11443 - 11231
Alignment:
Q  47 ttctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacc 146  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11443 ttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcagaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaaggcaccaacc 11345  T
Q  147 cttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaataccctaa 246  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  11344 ctttccccaagagccccatcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaa 11246  T
Q  247 aagttttctcctttg 261  Q
    |||||  ||||||||    
T  11245 aagttccctcctttg 11231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 11)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Original strand, 3808962 - 3809204
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  3808962 acccttagcctttgatttcactaaggattttctcttttggttttacaagactcacccaagttgctcacaaatgactctccactcatgtgtttcccaaccc 3809061  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagag-ccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaaga 216  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  3809062 catgaatct-tctccaaaaggaaccaacccttttcacaagagcccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaaga 3809160  T
Q  217 tcctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
     |||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  3809161 ccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttccctcctttg 3809204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Original strand, 2973193 - 2973435
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||| |||||||||||    
T  2973193 acccttagcctttgatttcactaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgttcacaaatgactctgcattcatgtgtttcccaaccc 2973292  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagat 217  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||     
T  2973293 catgaatct-tcccaaaaaagcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagac 2973391  T
Q  218 cctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    | |||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||||||    
T  2973392 cttcaacctttagtatctacaaaccctaaaagttccctcctttg 2973435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 39 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5043520 - 5043301
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  5043520 taaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaaattgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatctt--cccaaaagg 5043423  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaa 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  5043422 caccaacccttttcccaagagccctctcttttggttctccaagattctcatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaatctttagtatctaaa 5043323  T
Q  239 taccctaaaagttttctcctttg 261  Q
     ||||||||||||  ||||||||    
T  5043322 -accctaaaagttccctcctttg 5043301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 17762903 - 17762661
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||| |||||||||||    
T  17762903 acccttagcctttgatttcactaaggatcttctctttttgtttcacaagactcacccaagttgctcccaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccc 17762804  T
Q  118 catgaatctctcccc-aaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaaga 216  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||    
T  17762803 catgaatctaacccccaaaaggcaccaaaccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagccttgaacttcacccaaaga 17762704  T
Q  217 tcctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctccttt 260  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  17762703 tcctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagttctctccttt 17762661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21593569 - 21593349
Alignment:
Q  29 tttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctct 128  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  21593569 tttgatttcctaaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcaaaaatgactctccactcatgtgttttccaaccccatgaatct-t 21593471  T
Q  129 ccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccatt 228  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||  ||||||| |||||||  ||    
T  21593470 ctccaaaaggcaccaaccctttccccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttaaatctttgaacctcacccaaagaccctcaacattt 21593371  T
Q  229 agtatctaaataccctaaaagtt 251  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  21593370 agtatctaaa-accctaaaagtt 21593349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 39 - 235
Target Start/End: Original strand, 603355 - 603550
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  603355 taaggatcttctcttttggtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaggacactccactcatgtgtttcccaaccccatgaatct-tctccaaaagg 603453  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatct 235  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||| |||||    
T  603454 caccaaccctttcctcaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcatccaaagaccctcaacctttactatct 603550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 29 - 247
Target Start/End: Original strand, 22425090 - 22425308
Alignment:
Q  29 tttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctct 128  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  22425090 tttgatttcctaaggatattctcttttggtttcacaagactaaccgaagttgctcttaaatgactcttcacccatgtgtttcacaaccccatgaatct-t 22425188  T
Q  129 ccccaaaaggcaccaacccttttcctaagag--ccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaacca 226  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |  ||||||| ||||||||     
T  22425189 ccccaaaatgcaccaacccttatcccaagaggcccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctctgaaccacacccaaagaccctcaacct 22425288  T
Q  227 ttagtatctaaataccctaaa 247  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  22425289 ttagtatctaaa-accctaaa 22425308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 68 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 26800634 - 26800443
Alignment:
Q  68 ctcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctct 167  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  26800634 ctcacccaagttgctctcaatagactctccactcatgtgtttcccatccc-atgaatct-tccccaaaaggcaccaacctttttcccaagagccccctct 26800537  T
Q  168 tttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26800536 tttggttatccatgatccacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctacataccctaaaagttttctcctttg 26800443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Original strand, 26830378 - 26830619
Alignment:
Q  19 acccttaacttttgattaca-taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccc 117  Q
    ||||||| | ||||||| || |||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||    
T  26830378 acccttagcctttgatttcactaagaatcttctcttttggtttcacaagactcgcccaagttgctcacaaatgactctgcgctcatctgtttcccaaccc 26830477  T
Q  118 catgaatctctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagat 217  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    ||||||     
T  26830478 catgaatct-tctccaaaaggcaccaacctttttcccaagagactcctcttttggttctccaagattcacatcttgaagttttaaaccttactcaaagac 26830576  T
Q  218 cctcaaccattagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    ||||| || ||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  26830577 cctcagcctttattatctaaa-accctaaaagttccctcctttg 26830619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17757969 - 17757790
Alignment:
Q  47 ttctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatct-ctccccaaaaggcaccaac 145  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||    
T  17757969 ttctctttttgtttcacaagactcacccaagttgctcacaaaagactctccactcatgtgtttcccaaccccatgaatctaacccccaaaatgcaccaac 17757870  T
Q  146 ccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaacc 225  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || |||  ||||||| | ||||||    
T  17757869 ccttttcacaagagccccctattttggttctccaacattcacatcttcaagctttgaatctcacccaaagaccatcaacc 17757790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 25073076 - 25072868
Alignment:
Q  40 aaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggc 139  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||| | || ||| ||||||    | |||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  25073076 aaggatcttctcttttggtttcccaagacctatccaagtttcacataaa-gactctcctttgatgtgtttccaaaccctatgaatctcttcccaagaggc 25072978  T
Q  140 accaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaat 239  Q
    || | ||||||||| |||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  25072977 acaatcccttttcc-aagagccccc-ctttgggttctcaaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaat 25072880  T
Q  240 accctaaaagtt 251  Q
    ||||||||||||    
T  25072879 accctaaaagtt 25072868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 39 - 261
Target Start/End: Original strand, 18276 - 18495
Alignment:
Q  39 taaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatctctccccaaaagg 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||| ||| | |||| |||||||||  ||||||||||    
T  18276 taaggatcttctcttttggttttacaagactcactcaagttgctcacaaataactctccactcatgtgttttc-aacctcatgaatcttcccccaaaagg 18374  T
Q  139 caccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaaccattagtatctaaa 238  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| || ||||| |||||||||||     
T  18375 caccaacccttttcacaagagccccctctttttgttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagacccgcaacctttagtatctaa- 18473  T
Q  239 taccctaaaagttttctcctttg 261  Q
     | |||| |||||||||||||||    
T  18474 -aacctataagttttctcctttg 18495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 267
Target Start/End: Original strand, 490708 - 490946
Alignment:
Q  27 cttttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatct 126  Q
    ||||||||| | ||| ||||| |||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| |||  |||||    | |||| |||||||| |||||||||||    
T  490708 cttttgatttcctaatgatatactcttttggtctcgtaagactcgcccaagttgctcataaaa-actctcctttgatgtgtttcccaatcccatgaatct 490806  T
Q  127 ctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaacca 226  Q
    ||| || ||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||     
T  490807 ctcacctaaaggcaccaaccctct-ccaaagagcccccttttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacct 490905  T
Q  227 ttagtatctaaataccctaaaagttttctcctttgcttctc 267  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  |||||||| |||||    
T  490906 ttagtatctacataccctaaaagctccctcctttggttctc 490946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 261
Target Start/End: Original strand, 1669 - 1901
Alignment:
Q  27 cttttgattacataaggatattctcttttggtttcccaagactcacccaagttgctcacaaatgactctttactcatgtttttcccaaccccatgaatct 126  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    | |||| |||| ||||  |||||||||    
T  1669 cttttgatttcctaaggatcttctcttttgatctcccaagactcgcccaagttgctcacaa-tgactctcatatgatgtgtttctcaactacatgaatct 1767  T
Q  127 ctccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaacca 226  Q
    |||| |||||| |||||| |||   || ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | |||  ||||||| | ||||||     
T  1768 ctccacaaaagacaccaagcctcgccc-aagagtcccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttggagctcacccaaagaccttcaacct 1866  T
Q  227 ttagtatctaaataccctaaaagttttctcctttg 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1867 ttagtatctaaataccctaaaagttctctcatttg 1901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University