View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5625-Insertion-4 (Length: 918)

Name: NF5625-Insertion-4
Description: NF5625
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5625-Insertion-4
NF5625-Insertion-4
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (8-912)||(4180918-4181817)
chr7 (8-347)||(14610132-14610472)
chr7 (8-347)||(12856557-12856897)
chr7 (8-347)||(26050789-26051129)
chr7 (8-347)||(26060148-26060488)
chr7 (8-347)||(26055902-26056242)
chr7 (8-347)||(26065261-26065601)
chr7 (8-345)||(12851442-12851780)
chr7 (8-413)||(35352330-35352727)
chr7 (8-510)||(37459771-37460276)
chr7 (8-334)||(11056393-11056720)
chr7 (10-267)||(5436707-5436964)
chr7 (8-181)||(14615198-14615371)
chr7 (278-476)||(5440242-5440453)
chr7 (278-476)||(5449252-5449463)
chr7 (482-558)||(12852003-12852079)
chr7 (482-558)||(12857116-12857192)
chr7 (482-558)||(26051348-26051424)
chr7 (482-558)||(26056461-26056537)
chr7 (482-558)||(26060707-26060783)
chr7 (482-558)||(26065820-26065896)
chr7 (368-474)||(12851826-12851936)
chr7 (368-474)||(12856939-12857049)
chr7 (368-474)||(26051171-26051281)
chr7 (368-474)||(26056284-26056394)
chr7 (368-474)||(26060530-26060640)
chr7 (368-474)||(26065643-26065753)
chr7 (722-810)||(286850-286938)
chr7 (502-558)||(2248853-2248909)
chr7 (99-154)||(31892721-31892776)
chr7 (513-558)||(37459703-37459748)
chr7 (722-765)||(4180628-4180671)
chr7 (513-558)||(35352121-35352166)
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (8-474)||(18608594-18609064)
chr8 (8-347)||(34107997-34108337)
chr8 (8-347)||(26981972-26982312)
chr8 (28-347)||(14318711-14319031)
chr8 (28-347)||(14315007-14315327)
chr8 (28-347)||(26987085-26987405)
chr8 (15-345)||(43956947-43957278)
chr8 (15-464)||(10340921-10341385)
chr8 (10-347)||(25953255-25953593)
chr8 (8-311)||(18884832-18885136)
chr8 (277-462)||(1781877-1782066)
chr8 (225-347)||(18494272-18494395)
chr8 (434-558)||(43956651-43956775)
chr8 (482-558)||(14318416-14318492)
chr8 (482-558)||(26981676-26981752)
chr8 (482-558)||(26986790-26986866)
chr8 (482-558)||(34108558-34108634)
chr8 (482-558)||(18493978-18494054)
chr8 (368-474)||(14314855-14314965)
chr8 (368-474)||(14318559-14318669)
chr8 (368-474)||(18494121-18494230)
chr8 (368-474)||(26981819-26981929)
chr8 (368-474)||(34108381-34108491)
chr8 (368-463)||(43956805-43956904)
chr8 (377-475)||(25953118-25953220)
chr8 (368-474)||(26986933-26987043)
chr8 (482-558)||(14314712-14314788)
chr8 (723-791)||(34190745-34190813)
chr8 (730-794)||(1283337-1283401)
chr8 (512-558)||(10340698-10340744)
chr8 (512-555)||(18608435-18608478)
chr8 (723-794)||(35751630-35751701)
chr8 (753-814)||(8826433-8826494)
chr8 (735-792)||(30959320-30959377)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (8-474)||(24508804-24509264)
chr6 (29-463)||(20752093-20752533)
chr6 (8-347)||(21275541-21275881)
chr6 (10-463)||(21936641-21937114)
chr6 (10-345)||(24509473-24509809)
chr6 (10-474)||(21937340-21937826)
chr6 (10-345)||(2887264-2887596)
chr6 (10-345)||(2888986-2889318)
chr6 (126-352)||(11183257-11183484)
chr6 (12-138)||(12909401-12909527)
chr6 (12-138)||(12934508-12934634)
chr6 (432-557)||(11182989-11183114)
chr6 (724-825)||(11434556-11434657)
chr6 (359-458)||(24509841-24509944)
chr6 (482-558)||(21276100-21276176)
chr6 (726-820)||(11436422-11436516)
chr6 (765-843)||(34243492-34243570)
chr6 (432-558)||(20751881-20752006)
chr6 (502-561)||(21936405-21936464)
chr6 (368-474)||(21275923-21276033)
chr6 (432-558)||(21937902-21938028)
chr6 (502-556)||(12909621-12909675)
chr6 (502-556)||(12934728-12934782)
chr6 (20-86)||(26910709-26910775)
chr6 (432-516)||(21936470-21936554)
chr6 (723-773)||(1100001-1100051)
chr6 (434-516)||(12909533-12909615)
chr6 (434-516)||(12934640-12934722)
[»] chr1 (47 HSPs)
chr1 (10-516)||(44523933-44524452)
chr1 (15-473)||(13654110-13654568)
chr1 (8-462)||(16050974-16051433)
chr1 (26-464)||(19310611-19311063)
chr1 (8-474)||(1187595-1188071)
chr1 (8-347)||(28598077-28598417)
chr1 (8-347)||(28574065-28574405)
chr1 (39-347)||(3465272-3465581)
chr1 (10-474)||(43358521-43359003)
chr1 (28-467)||(10186532-10186992)
chr1 (10-267)||(29681361-29681617)
chr1 (38-267)||(48366228-48366457)
chr1 (16-200)||(35624793-35624977)
chr1 (183-347)||(3468010-3468175)
chr1 (274-474)||(21431625-21431841)
chr1 (208-391)||(35626140-35626329)
chr1 (252-414)||(17414576-17414728)
chr1 (11-211)||(17415418-17415618)
chr1 (37-191)||(21431918-21432073)
chr1 (482-558)||(28574624-28574700)
chr1 (482-558)||(28598636-28598712)
chr1 (482-558)||(43359129-43359205)
chr1 (432-558)||(16051462-16051588)
chr1 (368-474)||(28574447-28574557)
chr1 (368-474)||(28598459-28598569)
chr1 (482-558)||(3468395-3468471)
chr1 (368-474)||(3468218-3468328)
chr1 (432-516)||(10186365-10186449)
chr1 (432-516)||(19311090-19311174)
chr1 (502-557)||(17414304-17414359)
chr1 (502-560)||(1188333-1188391)
chr1 (502-556)||(13654676-13654730)
chr1 (502-552)||(19311180-19311230)
chr1 (502-556)||(35653036-35653090)
chr1 (315-467)||(35653204-35653363)
chr1 (502-547)||(10186056-10186101)
chr1 (735-814)||(26779702-26779781)
chr1 (504-558)||(3696111-3696165)
chr1 (432-510)||(10185966-10186044)
chr1 (730-811)||(14761710-14761791)
chr1 (482-522)||(3696167-3696207)
chr1 (93-346)||(3696403-3696654)
chr1 (502-554)||(10186307-10186359)
chr1 (737-776)||(18543679-18543718)
chr1 (432-474)||(21431566-21431608)
chr1 (525-559)||(35626558-35626592)
chr1 (501-558)||(21430777-21430833)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (15-473)||(143871-144329)
scaffold0006 (502-556)||(144437-144491)
[»] chr4 (49 HSPs)
chr4 (28-452)||(34279479-34279908)
chr4 (10-467)||(32429244-32429718)
chr4 (8-347)||(35095796-35096136)
chr4 (10-460)||(18670611-18671076)
chr4 (8-474)||(47071176-47071651)
chr4 (10-347)||(18716256-18716597)
chr4 (15-347)||(35090690-35091023)
chr4 (75-474)||(54859121-54859525)
chr4 (10-347)||(18736929-18737270)
chr4 (15-347)||(30019946-30020279)
chr4 (141-558)||(34128122-34128540)
chr4 (38-414)||(3424718-3425106)
chr4 (10-260)||(3415336-3415586)
chr4 (8-229)||(14646483-14646704)
chr4 (276-467)||(14643696-14643897)
chr4 (432-558)||(34279254-34279381)
chr4 (267-474)||(3409552-3409778)
chr4 (339-467)||(22118826-22118960)
chr4 (482-558)||(32429034-32429110)
chr4 (360-463)||(30019803-30019909)
chr4 (432-549)||(54858987-54859104)
chr4 (482-558)||(35091242-35091318)
chr4 (297-461)||(25618264-25618435)
chr4 (482-558)||(35096355-35096431)
chr4 (432-516)||(14643588-14643672)
chr4 (432-516)||(47071668-47071752)
chr4 (432-522)||(22118984-22119074)
chr4 (8-86)||(34128574-34128652)
chr4 (724-794)||(35318352-35318422)
chr4 (368-474)||(35091065-35091175)
chr4 (368-474)||(35096178-35096288)
chr4 (502-558)||(47071758-47071814)
chr4 (726-794)||(52305811-52305879)
chr4 (722-785)||(35317614-35317677)
chr4 (500-558)||(3424114-3424172)
chr4 (502-564)||(14643520-14643582)
chr4 (501-558)||(22119073-22119130)
chr4 (735-814)||(50464282-50464361)
chr4 (432-558)||(25618050-25618175)
chr4 (267-328)||(34602060-34602121)
chr4 (438-517)||(34601886-34601965)
chr4 (722-794)||(44348074-44348146)
chr4 (735-782)||(48339548-48339595)
chr4 (512-558)||(3409329-3409375)
chr4 (502-558)||(30019638-30019692)
chr4 (735-794)||(52306640-52306699)
chr4 (432-474)||(25618192-25618234)
chr4 (749-794)||(30057938-30057983)
chr4 (736-773)||(39819416-39819453)
[»] chr3 (75 HSPs)
chr3 (8-347)||(6853048-6853388)
chr3 (8-347)||(5458108-5458448)
chr3 (8-347)||(5481584-5481924)
chr3 (8-347)||(8458079-8458419)
chr3 (8-347)||(8464518-8464858)
chr3 (10-463)||(29827198-29827652)
chr3 (8-347)||(4049575-4049915)
chr3 (8-347)||(6858151-6858491)
chr3 (8-347)||(10591391-10591731)
chr3 (28-347)||(10673034-10673354)
chr3 (28-347)||(10678149-10678469)
chr3 (8-345)||(1302343-1302681)
chr3 (8-347)||(31076498-31076838)
chr3 (8-347)||(31081603-31081943)
chr3 (8-347)||(33702696-33703036)
chr3 (7-345)||(33703067-33703405)
chr3 (8-347)||(4054709-4055049)
chr3 (12-414)||(20890833-20891223)
chr3 (8-242)||(10586384-10586618)
chr3 (28-474)||(49784281-49784746)
chr3 (38-351)||(3187546-3187858)
chr3 (141-414)||(18024188-18024450)
chr3 (482-558)||(49784873-49784949)
chr3 (480-558)||(33702400-33702478)
chr3 (482-558)||(4050135-4050211)
chr3 (482-558)||(4055269-4055345)
chr3 (482-558)||(5481289-5481365)
chr3 (482-558)||(6852753-6852829)
chr3 (482-558)||(6857856-6857932)
chr3 (482-558)||(8465077-8465153)
chr3 (482-558)||(10584659-10584735)
chr3 (236-347)||(10584954-10585066)
chr3 (482-558)||(10672739-10672815)
chr3 (482-558)||(10677852-10677928)
chr3 (482-558)||(31076201-31076277)
chr3 (482-556)||(20891476-20891550)
chr3 (485-558)||(269507-269580)
chr3 (482-558)||(8458639-8458715)
chr3 (482-554)||(10591100-10591172)
chr3 (482-558)||(31081308-31081384)
chr3 (485-558)||(1302045-1302118)
chr3 (368-474)||(4049958-4050068)
chr3 (368-474)||(5481432-5481542)
chr3 (368-474)||(10584802-10584912)
chr3 (368-473)||(5457956-5458065)
chr3 (724-794)||(7725652-7725722)
chr3 (368-463)||(8464900-8464999)
chr3 (368-474)||(1302188-1302298)
chr3 (368-474)||(4055092-4055202)
chr3 (724-785)||(7723967-7724028)
chr3 (368-474)||(10672882-10672992)
chr3 (368-474)||(33702543-33702653)
chr3 (502-558)||(29827829-29827885)
chr3 (368-464)||(10591249-10591349)
chr3 (368-474)||(6852896-6853006)
chr3 (368-474)||(6857999-6858109)
chr3 (368-474)||(31076346-31076456)
chr3 (368-474)||(31081451-31081561)
chr3 (482-558)||(5457817-5457888)
chr3 (507-558)||(18023914-18023965)
chr3 (368-474)||(8458461-8458572)
chr3 (368-414)||(33703450-33703496)
chr3 (368-474)||(10677995-10678107)
chr3 (723-784)||(9299780-9299841)
chr3 (512-556)||(18023324-18023368)
chr3 (726-785)||(23773333-23773392)
chr3 (723-810)||(35653011-35653098)
chr3 (735-785)||(23706903-23706953)
chr3 (735-785)||(23725359-23725409)
chr3 (735-785)||(23743815-23743865)
chr3 (727-785)||(28723055-28723113)
chr3 (724-794)||(51469676-51469746)
chr3 (730-771)||(9173693-9173734)
chr3 (723-784)||(9299241-9299302)
chr3 (736-785)||(43023296-43023345)
[»] chr5 (37 HSPs)
chr5 (8-347)||(39903613-39903953)
chr5 (8-347)||(39908726-39909066)
chr5 (15-464)||(2022738-2023203)
chr5 (8-347)||(9877635-9877975)
chr5 (8-347)||(9872520-9872860)
chr5 (28-463)||(35368856-35369321)
chr5 (8-347)||(13556401-13556741)
chr5 (10-293)||(43378207-43378491)
chr5 (28-333)||(25183882-25184186)
chr5 (273-463)||(43540737-43540929)
chr5 (100-407)||(4555512-4555809)
chr5 (432-558)||(13556105-13556231)
chr5 (726-835)||(24252291-24252400)
chr5 (482-558)||(9872225-9872301)
chr5 (482-558)||(9877340-9877416)
chr5 (482-558)||(39904172-39904248)
chr5 (482-558)||(39909285-39909361)
chr5 (368-463)||(13556259-13556358)
chr5 (8-104)||(4553630-4553727)
chr5 (368-474)||(9872368-9872478)
chr5 (368-474)||(9877483-9877593)
chr5 (368-474)||(39909108-39909218)
chr5 (722-794)||(36423169-36423241)
chr5 (432-516)||(43540626-43540710)
chr5 (507-558)||(4555967-4556018)
chr5 (384-462)||(43379554-43379631)
chr5 (356-459)||(43402092-43402200)
chr5 (512-558)||(2024421-2024467)
chr5 (368-462)||(39903995-39904093)
chr5 (738-794)||(14394667-14394723)
chr5 (502-558)||(43540564-43540620)
chr5 (482-553)||(24091794-24091865)
chr5 (501-558)||(35368623-35368680)
chr5 (735-794)||(10143148-10143207)
chr5 (98-133)||(36203227-36203262)
chr5 (432-522)||(35368679-35368769)
chr5 (735-784)||(7120908-7120957)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (8-347)||(14917478-14917818)
chr2 (8-347)||(17720622-17720962)
chr2 (10-460)||(42779953-42780419)
chr2 (28-347)||(45120174-45120494)
chr2 (13-360)||(16284209-16284559)
chr2 (76-474)||(30283394-30283809)
chr2 (8-195)||(39196121-39196308)
chr2 (203-463)||(716230-716503)
chr2 (726-825)||(39738813-39738912)
chr2 (482-559)||(45120714-45120791)
chr2 (482-558)||(14917183-14917259)
chr2 (10-108)||(716131-716229)
chr2 (482-558)||(17720000-17720076)
chr2 (482-558)||(17720327-17720403)
chr2 (482-558)||(39178926-39179002)
chr2 (368-474)||(45120537-45120647)
chr2 (482-558)||(30283251-30283327)
chr2 (368-474)||(14917326-14917436)
chr2 (368-474)||(17720470-17720580)
chr2 (362-463)||(20892305-20892409)
chr2 (432-520)||(42780450-42780538)
chr2 (512-558)||(42780550-42780596)
chr2 (724-763)||(43992336-43992375)
chr2 (512-546)||(20892110-20892144)
[»] scaffold0223 (4 HSPs)
scaffold0223 (128-347)||(2115-2335)
scaffold0223 (8-175)||(7246-7413)
scaffold0223 (368-474)||(1963-2073)
scaffold0223 (482-558)||(1820-1896)
[»] scaffold0391 (2 HSPs)
scaffold0391 (8-201)||(16375-16568)
scaffold0391 (8-94)||(16280-16366)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (8-229)||(170586-170807)
scaffold0005 (276-467)||(173395-173596)
scaffold0005 (432-516)||(173620-173704)
scaffold0005 (502-564)||(173710-173772)
[»] scaffold0756 (1 HSPs)
scaffold0756 (28-106)||(3933-4011)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (724-814)||(2759-2849)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 683; Significance: 0; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 683; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 912
Target Start/End: Complemental strand, 4181817 - 4180918
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  4181817 tatataacttgattgttagaaagaggttgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcgtatggggttgtcacactaa 4181718  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4181717 cctttaggttcgattcttccccaccaataactctatattggatgcaattggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 4181618  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaatcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaag 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4181617 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggtttatggttcgagcaatcactcatgcattagagaattgatggatgatttagattaag 4181518  T
Q  308 agaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattcttgtttctgtgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgac 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4181517 agaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctcgtttatgtgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgac 4181418  T
Q  408 ccttca----cgagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaaaggttctatgtatatgaatgatttccatg 503  Q
     |||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||             ||     
T  4181417 tcttcatatgagagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacccctttgccaaaagattctatgtat-------------ata 4181331  T
Q  504 aagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaacacaaggtgcatttctatacattaaactaaatgac-nnnnnnnnnnn 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
T  4181330 aagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaacacaaggtgcatttctatacattaaactaaatgacaaaaaaaataaa 4181231  T
Q  603 ccataagtcaccaatgtcaaaacgctcatataaaaacatggccaccgctccaa--nnnnnnnnnnnctctctccccctcattttcttcttcttcatccat 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4181230 ccataagtcaccaatgtcaaaacgctcatataaaaacatggccacctctccaatttttttttctctctctctccccctccttttcttcttcttcatccat 4181131  T
Q  701 tgatatgaggtggtttatcgctgaggatgtatagtatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatttgattaaaagtttat 800  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4181130 tgatatgaggtggtttatcgctgaggatgtatagtatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatttgattaaaagtttat 4181031  T
Q  801 ggctgagatttaaatgctcacttaatatacaacatgcacctctatttttctctcacgcgcgcctcttactcttcttcttctt-catacaacaaactaaac 899  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4181030 ggctgagatttaaatgctcacttaatataccacatgcacctctatttttctctcacgcgcgcctcttgctcttcttcttcttccatacaacaaactaaac 4180931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Original strand, 14610132 - 14610472
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  14610132 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaa 14610231  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  14610232 cctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccagcgaatccccttcaggatactatgagtttcttgacgtgtat 14610331  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14610332 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataa 14610431  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14610432 gagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattct 14610472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Original strand, 12856557 - 12856897
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  12856557 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaa 12856656  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  12856657 cctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtat 12856756  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12856757 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataa 12856856  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
     ||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12856857 tagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattct 12856897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Original strand, 26050789 - 26051129
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  26050789 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaa 26050888  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  26050889 cctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtat 26050988  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26050989 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataa 26051088  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
     ||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26051089 tagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattct 26051129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Original strand, 26060148 - 26060488
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  26060148 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaa 26060247  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  26060248 cctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtat 26060347  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26060348 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataa 26060447  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
     ||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26060448 tagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattct 26060488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Original strand, 26055902 - 26056242
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26055902 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatgaggttgccacactaa 26056001  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  26056002 cctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtat 26056101  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26056102 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataa 26056201  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
     ||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26056202 tagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattct 26056242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Original strand, 26065261 - 26065601
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26065261 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatgaggttgccacactaa 26065360  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  26065361 cctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtat 26065460  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26065461 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataa 26065560  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
     ||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26065561 tagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattct 26065601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 8 - 345
Target Start/End: Original strand, 12851442 - 12851780
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  12851442 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaaactgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaa 12851541  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  12851542 cctttaggttcgattcgaacacaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccgacgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtat 12851641  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12851642 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataa 12851741  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaatt 345  Q
     ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  12851742 tagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaacaaaatt 12851780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 8 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 35352727 - 35352330
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    ||||||||||||||| | | |||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| |||||||  |||||||| |||||||||    
T  35352727 tatataacttgattgatgggaagaggttcctgcacttgaaacatggaaagtttaatggttaagcatgtaaaactcaaagcgcatggggttaccacactaa 35352628  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||  |||||    
T  35352627 cctttaggttcaattcgcccccaccaataattgtatattggatgcaataggaatgaccagcgaatcctcttcaggatactatgagttccatgatgtgtat 35352528  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||  |  ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  35352527 tgcacaaccacatcaagagtaactcctaacagtattttatagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatggtttatagtaa 35352428  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattcttgt-ttctgtgtgtgt-caaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatat 404  Q
              |||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  35352427 ----------gagaattatgttgttaatgtgacaaaattcttgtattgtgt-tgtgtccaaattaatgcccaaatgtcaagcatatatggtgcattatat 35352339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 37460276 - 37459771
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||| || ||||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||||| | |||||  | ||| || ||| |||||    
T  37460276 tatataacttgattgctggaaagagactgttggacttgaaacctgaaatttttaatgattatgcatgtaaaacttaaagcgcacggg-ttcccatactaa 37460178  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||| ||| ||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  37460177 cctatagcttcaattcacccccaccaataactgtatattggatgcaataagaatgaccgatgaatccacttcatgatactatgagttccttgatgtgtat 37460078  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |   |||||||  ||||| || ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  37460077 tgcacaaccacatcaagcgtatctcttaacaatattttacagatatatggtttcagcaattcgctaatgcatcagagaattgatggatgatttagagtaa 37459978  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattcttgtttctgtgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatga 406  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | | | ||| |||  || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||     
T  37459977 gagaatgtgggagaattatgttgttcatgtaacataattcctatatttgtatgt-ccatattaatgcccaaatgtcaagtatttatagtgcattatatgt 37459879  T
Q  407 cccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaaaggttctatgtatatgaatgatttccat 502  Q
    || |||||    ||||||||||   ||||| ||||||  |||||| |||||||||| ||| | || |||||| | | | |||||||||||||||| ||||    
T  37459878 ccattcacatgagagaaaacacgcatttgatttgaattgatgttatggttcattaaacactcatttgccaaaggttacaatgtatatgaatgattcccat 37459779  T
Q  503 gaagagtt 510  Q
    ||||||||    
T  37459778 gaagagtt 37459771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 334
Target Start/End: Original strand, 11056393 - 11056720
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  11056393 tatatatcttgtttgttgggaagaggttgctgcacttgaaacatgaaatgtttaatgattatgcatgtaaaactcaaagcgcatggggttgccacactaa 11056492  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    |||||| ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  11056493 cctttatgtgtgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgaatgaccgacgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtgt 11056592  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  11056593 tgcacaatcacaccaaacgtatctcctaatagtattttacagatttatggttccaacaattcactcatgcattaaagaattgatggatgatttaaagtaa 11056692  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaat 334  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||    
T  11056693 gagaatgataaagaattatgttgttaat 11056720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5436964 - 5436707
Alignment:
Q  10 tataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacc 109  Q
    |||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| | ||||||  |||||||||||| || ||||    
T  5436964 tatatcttgatcgttgggaagatgctgctgcacttgaaacttgaaaaatctaatggttatgcatgtaaact-caaagcgcatggggttgccataccaacc 5436866  T
Q  110 tttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaata-ggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtatt 208  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5436865 tttaggttcgatttgcccccaccaataactgtatattggatgcaataaggaatgaccggcgaattcccttgaggatactatgaggtccttgacgtgtatt 5436766  T
Q  209 gcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaat 267  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |  ||||||||| ||||||    
T  5436765 gcacaaccacaccaagcgtatctcctaacaatattttacagatttatggttcaagcaat 5436707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 181
Target Start/End: Original strand, 14615198 - 14615371
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  14615198 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggtttccacactaa 14615297  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcat 181  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  14615298 cctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcat 14615371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 278 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 5440453 - 5440242
Alignment:
Q  278 ttagagaattgatggatgatttagactaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaa-------ttcttgtt-tctgtgtgtgtc-aaatt 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||       |||||||| | | |||||||| |||||    
T  5440453 ttagagaattgatcgatgatttagagtaagggaatgagggagaattatgttgttaatgtaataaaaattcttgttcttgttgtttttgtgtgtccaaatt 5440354  T
Q  369 aatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccc 464  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  5440353 aaagcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacacccatttgacttgaatcaatgttatggttcattaatcaccc 5440254  T
Q  465 cttggccaaaag 476  Q
    |||  |||||||    
T  5440253 ctttcccaaaag 5440242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 278 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 5449463 - 5449252
Alignment:
Q  278 ttagagaattgatggatgatttagactaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaa-------ttcttgtt-tctgtgtgtgtc-aaatt 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||       |||||||| | | |||||||| |||||    
T  5449463 ttagagaattgatcgatgatttagagtaagggaatgagggagaattatgttgttaatgtaataaaaattcttgttcttgttgtttttgtgtgtccaaatt 5449364  T
Q  369 aatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccc 464  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  5449363 aaagcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacacccatttgacttgaatcaatgttatggttcattaatcaccc 5449264  T
Q  465 cttggccaaaag 476  Q
    |||  |||||||    
T  5449263 ctttcccaaaag 5449252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Original strand, 12852003 - 12852079
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12852003 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 12852079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Original strand, 12857116 - 12857192
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12857116 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 12857192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Original strand, 26051348 - 26051424
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26051348 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 26051424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Original strand, 26056461 - 26056537
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26056461 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 26056537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Original strand, 26060707 - 26060783
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26060707 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 26060783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Original strand, 26065820 - 26065896
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26065820 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 26065896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Original strand, 12851826 - 12851936
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||  ||| |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  12851826 taatgcccaaatgtcaagtatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctatttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacc 12851925  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  12851926 cttttgccaaa 12851936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Original strand, 12856939 - 12857049
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  12856939 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 12857038  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  12857039 cttttgccaaa 12857049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Original strand, 26051171 - 26051281
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  26051171 taatgcctaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 26051270  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  26051271 cttttgccaaa 26051281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Original strand, 26056284 - 26056394
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  26056284 taatgcctaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 26056383  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  26056384 cttttgccaaa 26056394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Original strand, 26060530 - 26060640
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  26060530 taatgcctaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 26060629  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  26060630 cttttgccaaa 26060640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Original strand, 26065643 - 26065753
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  26065643 taatgcctaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 26065742  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  26065743 cttttgccaaa 26065753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 722 - 810
Target Start/End: Original strand, 286850 - 286938
Alignment:
Q  722 tgaggatgtatagtatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatttgattaaaagtttatggctgagatt 810  Q
    |||||||||||  |||||||||||   | ||||||||||||| |||||||  ||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  286850 tgaggatgtatcatatgagaatgaactttttatatgagaatgatgagaatgcttatttaccattggattaaaattttatggctgagatt 286938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 502 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 2248909 - 2248853
Alignment:
Q  502 tgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2248909 tgaagagttactacttttggttctaaagtgattccattattttagaaatcaccaaca 2248853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 154
Target Start/End: Original strand, 31892721 - 31892776
Alignment:
Q  99 ccacactaacctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaa 154  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  31892721 ccacactaatcattaggttcgatttgtccccaccaataagtatatattggatgcaa 31892776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 513 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 37459748 - 37459703
Alignment:
Q  513 aacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  37459748 aacttttgattttaaagtgattccattattttaaaaatcactaaca 37459703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 722 - 765
Target Start/End: Original strand, 4180628 - 4180671
Alignment:
Q  722 tgaggatgtatagtatgagaatgacaatcttatatgagaatggt 765  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4180628 tgaggatgtatactatgagaatgacaattttatatgaaaatggt 4180671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 513 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 35352166 - 35352121
Alignment:
Q  513 aacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  35352166 aacttttgattctaaagtaatttcattatttcggaaatcaccaaca 35352121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 18609064 - 18608594
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18609064 tatataacttgattgttgggaagatgctgctgcacttgaaacctgaaaagtttgatggttatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgccacactaa 18608965  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||    
T  18608964 cctttaggttcaattcgcccccaccaataattgtatattggatgaaataggaatgaccagtaaatccccttcaggataatatgagttccttgatgtgtat 18608865  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  |||| ||||   ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18608864 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatcgttccgtcaattaactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaa 18608765  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattcttgtttctgtgtgtg-tcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatg 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  18608764 gagaatgagggagaattatgttgttaatgtaacaaaattcttgtttct-tgtgtgcccaaattaatgcctaaatgccaaacatttgtagtgcattatatg 18608666  T
Q  406 acccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaa 474  Q
    | |||||||    |||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18608665 a-ccttcacatgagagaaaacacccctttaacttgaatcaatgttatggttcattaagcacccctttgccaaa 18608594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Original strand, 34107997 - 34108337
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  34107997 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaaatcaaagcgtatggggttgccacactaa 34108096  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  34108097 cctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtat 34108196  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34108197 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataa 34108296  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
     ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34108297 tagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattct 34108337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 26982312 - 26981972
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  26982312 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaa 26982213  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  26982212 cctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtat 26982113  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26982112 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataa 26982013  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
     ||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26982012 tagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattct 26981972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14319031 - 14318711
Alignment:
Q  28 aagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgtcc 127  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14319031 aagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgccc 14318932  T
Q  128 ccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattgcacaaccacatcaagcgt 227  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14318931 ccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgt 14318832  T
Q  228 atctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaagagaatgagggagaattatg 326  Q
    |||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||    
T  14318831 atctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatg 14318732  T
Q  327 ttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  14318731 ttgttaatgtaacaaaattct 14318711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 28 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14315327 - 14315007
Alignment:
Q  28 aagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgtcc 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14315327 aagaagctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgccc 14315228  T
Q  128 ccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattgcacaaccacatcaagcgt 227  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14315227 ccaccaataaatgtatattggatgcaatagaaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgt 14315128  T
Q  228 atctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaagagaatgagggagaattatg 326  Q
    |||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||    
T  14315127 atctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatg 14315028  T
Q  327 ttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  14315027 ttgttaatgtaacaaaattct 14315007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 28 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 26987405 - 26987085
Alignment:
Q  28 aagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgtcc 127  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26987405 aagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaacttaaagcgtatgtggttgccacactaacctttaggttcgattcgccc 26987306  T
Q  128 ccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattgcacaaccacatcaagcgt 227  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  26987305 ccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgt 26987206  T
Q  228 atctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaagagaatgagggagaattatg 326  Q
    |||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||    
T  26987205 atctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatg 26987106  T
Q  327 ttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  26987105 ttgttaatgtaacaaaattct 26987085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 43957278 - 43956947
Alignment:
Q  15 cttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacctttag 114  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  43957278 cttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaattcaaagcgtatggggttgtcacactaacctttag 43957179  T
Q  115 gttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattgcacaa 214  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  43957178 gttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggattctatgagttctttgacgtgtattgcacaa 43957079  T
Q  215 ccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaagagaatg 313  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    ||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43957078 ccacaccaagcgtatctcctaacagtgttttacaaatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatg 43956979  T
Q  314 agggagaattatgttgttaatgcaacaaaatt 345  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43956978 atgaagaattatgttgttaatgcaacaaaatt 43956947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 10341385 - 10340921
Alignment:
Q  15 cttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacctttag 114  Q
    |||||||||| | |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||    
T  10341385 cttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacttgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcgcatgggattgccatactaacctt-ag 10341287  T
Q  115 gttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattgcacaa 214  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10341286 gttcgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaataggagtgatcggcgaatccccttcatgatactatgagttccttgacgtgtattgcacaa 10341187  T
Q  215 ccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaagagaatg 313  Q
    | ||| ||||||||||| |||||| |||||||| |  ||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  10341186 ctacaccaagcgtatctcctaacaatattttacagatttatgattccagcaattcactcatgcattagagaatttatggatgatttagagtaagagaatg 10341087  T
Q  314 agggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct-----------tgtttctgtgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattat 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||           | | | | | | |||| || ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  10341086 agggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtccaaaattgtatgtttttatatgtccaactaatgcccaaatgccaagcatttatggtgcattat 10340987  T
Q  403 atgacccttcac--gagaaaa--caccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccc 464  Q
    ||||| ||||||  |||||||  ||||  ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  10340986 atgactcttcacatgagaaaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatgattcattaagcaccc 10340921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25953593 - 25953255
Alignment:
Q  10 tataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacc 109  Q
    |||| ||| |||||| | ||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  25953593 tatatcttaattgttgggaagagactactgcacttgaaacctgaaaagtttgatggttaagcatgtaaaactcaaagtgcatggggttgccacactaacc 25953494  T
Q  110 tttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattg 209  Q
    |||| || ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  25953493 tttaagtacgattcgcccccaccaataactgtataatggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcagggtactatgagttccttgacgtgtattg 25953394  T
Q  210 cacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaaga 308  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||    ||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  25953393 cacaaccacacctagcgtatctcctaacagtattgtacatatttatggttcaagcaattcactcatgcattagacaattgatggatgatttagagtatga 25953294  T
Q  309 gaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25953293 gaatgatggagaattatgttgttaatgtaacaaaattct 25953255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 311
Target Start/End: Original strand, 18884832 - 18885136
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||| ||||||| |  ||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  18884832 tatatatcttgattgtttgaaaaaggatgttgcacttggaatctgaaaagtttaacggttatgcacataaaactcaaaacgtatggggttgccacactaa 18884931  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||| | ||||||||||  |||||    
T  18884932 catttaggttcgattcgcccccaccaattactgtagattggattcaatgggaatgaccagtgaacccccttcaggatactttaagttccttgatgtgtat 18885031  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||  |||||| ||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  18885032 tgcacaatcacaccaagcatatctcttaacaggattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagagtaa 18885131  T
Q  307 gagaa 311  Q
    |||||    
T  18885132 gagaa 18885136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 277 - 462
Target Start/End: Original strand, 1781877 - 1782066
Alignment:
Q  277 attagagaattgatggatgatttagactaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattcttgtttctgtgtgtgtcaaattaatgccca 376  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||  ||||  |||||    |||||||||| |||    
T  1781877 attagagaattggtggatgattttgagtaagagaatgagggataattatgttgttaatgtaacggaatttctgttgttgtgtcctccaaattaatgtcca 1781976  T
Q  377 aatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcac 462  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1781977 aatgtcaaacatttatagtgcagtatacgacctttcacatgagagaaaatactattttgacttgaatcaatgttatggttcattaagcac 1782066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 225 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18494395 - 18494272
Alignment:
Q  225 cgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaat-cactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaagagaatgagggagaatt 323  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||    
T  18494395 cgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaatt 18494296  T
Q  324 atgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  18494295 atgttgttaatgtaacaaaattct 18494272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 434 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 43956775 - 43956651
Alignment:
Q  434 ttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaaaggttctatgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgat 533  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  || ||||||   | | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  43956775 ttgaatcaatgtaaatgttcattaagcacctatttgccaaagattccaatgtatatgaaagatttccatgaagagttacaactcttgattctaaagtgat 43956676  T
Q  534 tccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    |||||||||||  ||||||||||||    
T  43956675 tccattattttaaaaatcaccaaca 43956651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 14318492 - 14318416
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14318492 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 14318416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 26981752 - 26981676
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26981752 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 26981676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 26986866 - 26986790
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26986866 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 26986790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Original strand, 34108558 - 34108634
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34108558 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 34108634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 18494054 - 18493978
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494054 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaattgattccattattttggaaatcaccaaca 18493978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 14314965 - 14314855
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||  ||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  14314965 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 14314866  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  14314865 cttttgccaaa 14314855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 14318669 - 14318559
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||  ||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  14318669 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 14318570  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  14318569 cttttgccaaa 14318559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 18494230 - 18494121
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| |||| |||| |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  18494230 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacc-ttttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacc 18494132  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  18494131 cttttgccaaa 18494121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 26981929 - 26981819
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  26981929 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 26981830  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  26981829 cttttgccaaa 26981819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Original strand, 34108381 - 34108491
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||  ||| |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  34108381 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacc 34108480  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  34108481 cttttgccaaa 34108491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 43956904 - 43956805
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| |||   ||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  43956904 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcactcatttgacttgaatcaatgctatgattcattaagcacc 43956805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 377 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 25953220 - 25953118
Alignment:
Q  377 aatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggcca 472  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || || ||||    
T  25953220 aatgccaaacatttatagtgcattatatgaccattcacatgagagaaaacacccatttgacttaaatcaattttatggttcattaagcatccttttgcca 25953121  T
Q  473 aaa 475  Q
    |||    
T  25953120 aaa 25953118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 26987043 - 26986933
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  26987043 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 26986944  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  26986943 cttttgccaaa 26986933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 14314788 - 14314712
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  14314788 atgtatacgaatggttcccattaagagttacaacttttggttctaaagtaattccattattttgaaaatcaccaaca 14314712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 723 - 791
Target Start/End: Original strand, 34190745 - 34190813
Alignment:
Q  723 gaggatgtatagtatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatttgatta 791  Q
    ||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  34190745 gaggatgtatcatatgagaatgaatatcttatatgagaatgatgagaataataatcaaccattagatta 34190813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 730 - 794
Target Start/End: Original strand, 1283337 - 1283401
Alignment:
Q  730 tatagtatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatttgattaaaa 794  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  1283337 tatactatgagaatgactattttatatgagaatgatgagaataattatcaatcattagataaaaa 1283401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 512 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 10340744 - 10340698
Alignment:
Q  512 caacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10340744 caacttttggttctaaagtgattccattatttgggaaatcaccaaca 10340698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 512 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 18608478 - 18608435
Alignment:
Q  512 caacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcacca 555  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18608478 caacttttagttctaaagtgattccattattttggaaatcacca 18608435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 723 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 35751701 - 35751630
Alignment:
Q  723 gaggatgtatagtatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatttgattaaaa 794  Q
    ||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||  || ||| ||||||||    
T  35751701 gaggatgtatcttatgagaatgactattttatatgagaatgatgagaatgattatggactattagattaaaa 35751630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 753 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 8826494 - 8826433
Alignment:
Q  753 atatgagaatggtgagaataattatcaaccatttgattaaaagtttatggctgagatttaaa 814  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| || |  |||| |||||||||||    
T  8826494 atatgagaatggtgagaatagttatcaaccattaaattacaaatagatggttgagatttaaa 8826433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 735 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 30959377 - 30959320
Alignment:
Q  735 tatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatttgattaa 792  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||    
T  30959377 tatgggaatgactattttatatgagaatgatgagaataattatcaccctttagattaa 30959320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 225; Significance: 1e-123; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 8 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 24509264 - 24508804
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||    
T  24509264 tatatatcttgattgttgggaagaggctgctgcacttgaaacttcaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaaacgcatggggttgccatactaa 24509165  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  24509164 cctttaggttcgattcgcccccaccaataactatatattggatgcaataggaatgatcggcgaatccccttcataatactatgagttccttgacgtgtat 24509065  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    ||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24509064 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaaatttatgattccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaa 24508965  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattcttgtttctgtgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatga 406  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||           | |||   ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||    
T  24508964 aagaatgatggagaattatgttgttaatgtaacataat-----------tttgtacaaaattaatgcccaaatgccaaacatttacagtacataatatga 24508876  T
Q  407 cccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaa 474  Q
    |||||| |    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  24508875 cccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatggttcattaagcacccttttgccaaa 24508804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 29 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 20752533 - 20752093
Alignment:
Q  29 agaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgtccc 128  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  20752533 agaggctgttgcacttgaaacctgaaatgtttaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgccatactaacctttaggttcgattcgcccc 20752434  T
Q  129 caccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattgcacaaccacatcaagcgta 228  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20752433 cacaaataactgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactacgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgta 20752334  T
Q  229 tctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaagagaatgagggagaattatgt 327  Q
    ||| ||||||||||||||| |  ||||||||| | ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||  | ||||||||||    
T  20752333 tctcctaacagtattttacagatttatggttccaacaattcactcatgcatcagagaattgatggatgacttatagtaagagaatggtgaagaattatgt 20752234  T
Q  328 tgttaatgcaacaaaattcttgtttc---tgtgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaa 420  Q
    |||||||| |||||||||||  || |     |||||||||| |||||||| ||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||||    ||||||    
T  20752233 tgttaatgtaacaaaattct--ttccaaaactgtgtgtcaagttaatgcctaaatgccaagtatttatagtgcattagatgacctttcacatgagagaaa 20752136  T
Q  421 acaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20752135 acactcatttgacttgaatcaatgttatggttcattaagcacc 20752093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Original strand, 21275541 - 21275881
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21275541 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaa 21275640  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  21275641 cctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtat 21275740  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21275741 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataa 21275840  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
     ||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21275841 tagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattct 21275881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 21937114 - 21936641
Alignment:
Q  10 tataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacc 109  Q
    |||| |||||||||| | || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||   || ||||| ||| |||||||    
T  21937114 tatatcttgattgttgggaacaggttgctgcacttgaaactcgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaagtgcatagggtttccatactaacc 21937015  T
Q  110 tttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattg 209  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  21937014 tttaggctcgattcgtccccaccaataattgtatattagatgcaataggaatggtcggagaatccccttcagaatactatgagttccttgatgtgtattg 21936915  T
Q  210 cacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaaga 308  Q
    |||||||||||| || |||||| |||| | |||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  21936914 cacaaccacatcgagtgtatctcctaataatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatagatgatttagagtatga 21936815  T
Q  309 gaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattc----------------ttgtttctgtgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttat 392  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||                |||||  ||| ||||| ||| |||||||||||||| || |||||||    
T  21936814 gaatgatggagaattatgttgttaatgtaacaaagttcagtccaaaattgtgtgttgttgttgt-tgtgttaaactaatgcccaaatgttaagcatttat 21936716  T
Q  393 agtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||||||||    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21936715 agtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatggtttattaagcacc 21936641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 345
Target Start/End: Original strand, 24509473 - 24509809
Alignment:
Q  10 tataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacc 109  Q
    |||| |||||||||| | |||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||    
T  24509473 tatatcttgattgttgggaagaggttgttgcacttgaaaccttaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaatcgcatggggttgccatactaacc 24509572  T
Q  110 tttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattg 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  24509573 tttaggttcgattcgcccccaccaataactatatattggatgcaataggaatgatcggcgaatccccttcataatactatgagttccttgatgtgtattg 24509672  T
Q  210 cacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaaga 308  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    ||||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  24509673 cacaaccacaccatgcgtatctcctaacagtattttacaaatttatggttccaacaattcactaatgcattagagaattgatggatgatttaaagtaaaa 24509772  T
Q  309 gaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaatt 345  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24509773 gaatgatggagaattatgttgttaatgtaacataatt 24509809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 474
Target Start/End: Original strand, 21937340 - 21937826
Alignment:
Q  10 tataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacc 109  Q
    |||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  21937340 tatatcttgattgttgggaagagactgttgcacttgaaacctgaaaagtttaatggtaatgcatataaaactcaaagcgcatggggtttccatactaacc 21937439  T
Q  110 tttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattg 209  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||   |||||||    
T  21937440 tttaggctcgattcgcccccaccaataaccatatattggatgcaataggaatgaccggcgaatcccctttaggatactatgagttccttgttgtgtattg 21937539  T
Q  210 cacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaaga 308  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||| |||| |||    ||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  21937540 cacaaccacaccaagcgtatctcgtaacaatattatacaaatttatggttccagcaattcactcatgcatttgagaattgatggatgttttagaataaga 21937639  T
Q  309 gaatgagggagaattatgttgttaatg--caa---------caaaattct-tgtttctgt-----gtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacattta 391  Q
    || ||| ||| ||||||||||||||||  |||         ||||||| | ||||  |||      ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21937640 gagtgatggaaaattatgttgttaatgtacaaaattatgtccaaaattgtgtgttgttgttgttgttgtgttaaactaatgcccaaatgccaaacattta 21937739  T
Q  392 tagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaa 474  Q
    |||||| ||||||||||||||||    ||||||| |||  |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| || ||||||    
T  21937740 tagtgcgttatatgacccttcacatgagagaaaatacccctttgacttgaatcaatgtgatggttcattaaacacccttttgccaaa 21937826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 345
Target Start/End: Original strand, 2887264 - 2887596
Alignment:
Q  10 tataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacc 109  Q
    |||| ||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||     
T  2887264 tatatcttgattgttgaaaagaagttgctgcacttgaaacctgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaactcaaagcgcatggggttgtcacactaaca 2887363  T
Q  110 tttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaata-ggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtatt 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||     | |||||||||||||| |||||||||   |||||| ||||| |||||||||| |||||| || ||||||    
T  2887364 tttaggttcgattcgcccccaccaat-----tttattggatgcaataaggaatgaccgacgaatcctcttcacgatactatgaattccttcacgtgtatt 2887458  T
Q  209 gcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaat-cactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaag 307  Q
    ||||||||||| |||   |||||  ||||| |||||||| |  ||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2887459 gcacaaccacaccaaatatatctcttaacactattttacagatttatgattccagcaattcactcatgcattagagagttgatggatgatttagagtaag 2887558  T
Q  308 agaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaatt 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2887559 agaatgagggagaattatgttggtaatggaacaaaatt 2887596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 345
Target Start/End: Original strand, 2888986 - 2889318
Alignment:
Q  10 tataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacc 109  Q
    |||| ||||||||||  ||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||     
T  2888986 tatatcttgattgttgaaaagaagttgctgcacttgaaatctggaaagtttaatggttatgaatgtaaaactcaaagcgcatggggttgtcacactaaca 2889085  T
Q  110 tttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaata-ggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtatt 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||     | |||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| |||||||||| |||||| || ||||||    
T  2889086 tttaggttcgattcgcccccaccaat-----tttattggatgcaataaggaatgaccggcgaatcctcttcacgatactatgaattccttcacgtgtatt 2889180  T
Q  209 gcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaat-cactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaag 307  Q
    ||||||||||| |||   |||||  ||||| |||||||| |  ||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  2889181 gcacaaccacaccaaatatatctcttaacactattttacagatttatgattccagcaattcactcatgcattagagagttgatgaatgatttagagtaag 2889280  T
Q  308 agaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaatt 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2889281 agaatgagggagaattatgttggtaatggaacaaaatt 2889318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 126 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 11183484 - 11183257
Alignment:
Q  126 ccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattgcacaaccacatcaagc 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  || ||||||| ||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||      
T  11183484 ccccaccaataactgtatattggatgtgatgggaatgatcagtgaatcccattcaagatattatgagttccttgatgtgtattacacaaccacaccaaat 11183385  T
Q  226 gtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaagagaatgagggagaatta 324  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  11183384 gtatctcctaacagtattttacaggtttatggtttcagcaatttactcatgcattagagaattgattgatgatttagagtaagagaatgagagagaatta 11183285  T
Q  325 tgttgttaatgcaacaaaattcttgttt 352  Q
    |||| ||| || |||||||||| |||||    
T  11183284 tgttattattgtaacaaaattcatgttt 11183257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 138
Target Start/End: Original strand, 12909401 - 12909527
Alignment:
Q  12 taacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacctt 111  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||| ||||||  ||||| |||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12909401 taacttgattgttgggaagaggcggctgcacttaaaacctgaaaaaattaatcgttatgcatgtaaacttcaaagcgcatggggttgccacactaacctt 12909500  T
Q  112 taggttcgattcgtccccaccaataac 138  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  12909501 taggttcgattcgcccccaccaataac 12909527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 138
Target Start/End: Original strand, 12934508 - 12934634
Alignment:
Q  12 taacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacctt 111  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||| ||||||  |||||  ||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12934508 taacttgattgttgggaagaggcggctgcacttaaaacctgaaaaaattaatcattatgcatgtaaacttcaaagcgcatggggttgccacactaacctt 12934607  T
Q  112 taggttcgattcgtccccaccaataac 138  Q
    || |||||||||| |||||||||||||    
T  12934608 tatgttcgattcgcccccaccaataac 12934634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 432 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 11183114 - 11182989
Alignment:
Q  432 acttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaaaggttctatgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtg 531  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||| | | | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| || |||| ||    
T  11183114 acttgaatcaaggctaaggttcattaagtacccctttgccaaatgttccaatgtatatgaaagatttccatgaagagttacaacatttggttctaaattg 11183015  T
Q  532 attccattattttggaaatcaccaac 557  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  11183014 attccattattttagaaatgaccaac 11182989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 724 - 825
Target Start/End: Original strand, 11434556 - 11434657
Alignment:
Q  724 aggatgtatagtatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatttgattaaaagtttatggctgagatttaaatgctcactt 823  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||    
T  11434556 aggatgtataatatgagaatgactatcttatatgagaattatgagaataatcatcaactatttgattaaaagctaatggttgagatttaaatgctcaatt 11434655  T
Q  824 aa 825  Q
    ||    
T  11434656 aa 11434657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 359 - 458
Target Start/End: Original strand, 24509841 - 24509944
Alignment:
Q  359 gtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttca 454  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  24509841 gtgttaaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgaaccttcacatgagagaaaacacccatttgacttgaatcaatgttatggttca 24509940  T
Q  455 ttaa 458  Q
    ||||    
T  24509941 ttaa 24509944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Original strand, 21276100 - 21276176
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21276100 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 21276176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 726 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 11436516 - 11436422
Alignment:
Q  726 gatgtatagtatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatttgattaaaagtttatggctgagatttaaatgctca 820  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||    
T  11436516 gatgtataatatgagaataactatcttatataaaaatggtgaaaataattatcaaccatttgattaaaagctaacggttgagatttaaatgctca 11436422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 765 - 843
Target Start/End: Original strand, 34243492 - 34243570
Alignment:
Q  765 tgagaataattatcaaccatttgattaaaagtttatggctgagatttaaatgctcacttaatatacaacatgcacctct 843  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||| || |||||||||    
T  34243492 tgagaataactatcaaccatttgattaaaagttaatggctgagatttaaatgctccattaaaataccacgtgcacctct 34243570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 432 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 20752006 - 20751881
Alignment:
Q  432 acttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaaaggttcta-tgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagt 530  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| || || ||| |||| || |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||| | |||||    
T  20752006 acttgaaccaatgctaaggtttattaagcacccatttgctaaa-ggttataatgtatatgaaaggttctcatgaagagttacaacttttgatct-aaagt 20751909  T
Q  531 gattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  20751908 gaatccattattttggaaatcaccaaca 20751881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 502 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 21936464 - 21936405
Alignment:
Q  502 tgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaacacaa 561  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21936464 tgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaacacaa 21936405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Original strand, 21275923 - 21276033
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  21275923 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 21276022  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  21276023 cttttgccaaa 21276033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 432 - 558
Target Start/End: Original strand, 21937902 - 21938028
Alignment:
Q  432 acttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaaaggttctatgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtg 531  Q
    |||||||||||||  || ||||||||| |||||||| || ||| | | | ||||||| |||  |||| ||||||||||| ||  || || || |||| ||    
T  21937902 acttgaatcaatgcaaatgttcattaaccacccctttgctaaatgttccaatgtatacgaaatattttcatgaagagttacatattatggttctaaaatg 21938001  T
Q  532 attccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  21938002 attccattattttggaaatcaccaaca 21938028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 502 - 556
Target Start/End: Original strand, 12909621 - 12909675
Alignment:
Q  502 tgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaa 556  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12909621 tgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttagaaatcaccaa 12909675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 502 - 556
Target Start/End: Original strand, 12934728 - 12934782
Alignment:
Q  502 tgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaa 556  Q
    ||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12934728 tgaagagttacaacttttggttctagagtgattccattattttggaaatcaccaa 12934782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 26910775 - 26910709
Alignment:
Q  20 ttgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaag 86  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||    
T  26910775 ttgttaggaagaggttgttgcacttgaaacctgaaaagattaaggattatgcatgtaaaattcaaag 26910709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 432 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 21936554 - 21936470
Alignment:
Q  432 acttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaaaggttc-tatgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaact 516  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||| ||||||||  |||||||| || ||||||||| ||||||| |||||    
T  21936554 acttgaatcaatgcaaaggttcattaagcacccatttgcc-aaaggttcaaatgtatataaaagatttccataaagagttacaact 21936470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 723 - 773
Target Start/End: Original strand, 1100001 - 1100051
Alignment:
Q  723 gaggatgtatagtatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataa 773  Q
    ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||    
T  1100001 gaggatgtatactatgagaatgacatgtttatatgagaatgatgagaataa 1100051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 516
Target Start/End: Original strand, 12909533 - 12909615
Alignment:
Q  434 ttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaaaggttctatgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaact 516  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||  || |||||| | | | ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||    
T  12909533 ttgaatcaatgctaaggttcattaaacacctttttgccaaaggttccaatgtatatgaatgattctcatgaaaagttacaact 12909615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 516
Target Start/End: Original strand, 12934640 - 12934722
Alignment:
Q  434 ttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaaaggttctatgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaact 516  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||  || |||||| | | | ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||    
T  12934640 ttgaatcaatgctaaggttcattaaacacctttttgccaaaggttccaatgtatatgaatgattctcatgaaaagttacaact 12934722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 47)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 10 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 44524452 - 44523933
Alignment:
Q  10 tataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacc 109  Q
    |||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||  ||||||||| |||||||||     
T  44524452 tatatcttgattgttgggaagatgctgctgcacttgaaacctgaaaagtgtaatggttatgcatgcaaaactcaaagcgcatggggttgtcacactaaca 44524353  T
Q  110 tttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattg 209  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||   ||||||||||||||||||  |||||||    
T  44524352 tttag-ttcgattcgcccccatcaataactgtatattggatgcaataggaatgatcgacgaatccccttcggaatactatgagttccttgatgtgtattg 44524254  T
Q  210 cacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaat-cactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaaga 308  Q
    ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  44524253 cacaaccaca---agcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttaaagtaaga 44524157  T
Q  309 gaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattcttgt----ttctgtg-tgt-----gtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgca 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |    || |||| |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44524156 gaatgatggagaattatgttgttaatgcaacaatattctgttcaaattgtgtgttgttgttgttcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgca 44524057  T
Q  399 ttatatgacccttcac------gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaaaggttctatgtatatgaa 492  Q
    ||||||||||||||||      | |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| | ||  |||||||||||    
T  44524056 ttatatgacccttcacatatgagggaaaacacccatttgacttgaatcaatgttatggttcattaagcacccctttgacaaaggtttaaatgtatatgaa 44523957  T
Q  493 tgatttccatgaagagttgcaact 516  Q
    ||||| |||||||||||| |||||    
T  44523956 tgattcccatgaagagttacaact 44523933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 15 - 473
Target Start/End: Original strand, 13654110 - 13654568
Alignment:
Q  15 cttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacctttag 114  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13654110 cttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgcttacgcatgtaaaattcaaagcgcatggggttgccacactaacctttag 13654209  T
Q  115 gttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattgcacaa 214  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13654210 gttcgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaataggagttaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaa 13654309  T
Q  215 ccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgattt--agactaagagaa 311  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||  |||||||    
T  13654310 ccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagaattaatggatgatttagagagcaagagaa 13654409  T
Q  312 tgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct-tgtttctgtgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgaccct 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||        |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  13654410 tgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctatccaaaattgtgtgtcaaattaatgc--------caagtatttatagtgcattatatgaccct 13654501  T
Q  411 tcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaa 473  Q
    ||||    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||    
T  13654502 tcacatgagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatggttcattaagtacccttttgccaa 13654568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 8 - 462
Target Start/End: Original strand, 16050974 - 16051433
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||  | ||||||||||||||||    
T  16050974 tatataacttgattgttgggaagatgctgctgcacttgaaacctgaaaaatttaatggttatgcatgtaaaactcagagcgcacggggttgccacactaa 16051073  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  16051074 cctttaggttcgattcgcccccaccaataactgtatatttgatgcaaaatgaatgactagcgaatacccttcaagatactatgagttccttgatgtgtat 16051173  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  16051174 tgcacagccacaccaagcgtatttcctaacagtattttacagatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttaaagtaa 16051273  T
Q  307 gagaatgagggagaattatg-ttgttaatgcaacaaaattcttgtttctgtgtgtgt-caaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatat 404  Q
    || ||||||  ||||  |||   ||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16051274 gaaaatgagtaagaa-aatgagggttaatgtaacaaaattcttgttcttgt-tgtgtccaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatat 16051371  T
Q  405 gacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcac 462  Q
    |||| |||||    | ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16051372 gaccattcacatgagtgaaaacacccttttgacttgaatcaatgatatggttcattaagcac 16051433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 26 - 464
Target Start/End: Original strand, 19310611 - 19311063
Alignment:
Q  26 gaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgt 125  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  19310611 gaaagaggctgttgtacttgaaacctgaaaagtttaatggttatgcatgtgaaactcaaagcgcatggggttgcaacactaacctttaggttcgattcac 19310710  T
Q  126 ccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattgcacaaccacatcaagc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  19310711 ccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagcgaatcccctt-agtatattatgagttccttgacgtgtattgcacaaccgcaccaagc 19310809  T
Q  226 gtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaagagaatgagggagaatta 324  Q
     ||||| |||| ||| |||||| |  ||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  19310810 atatctcctaatagtgttttacagatttatggttccagcaattcattcatgcattagagaattgatggatgatttatagtaagagaatgagggagaatta 19310909  T
Q  325 tgttgttaatgcaacaaaattct-----------tgtttctgtgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttca 413  Q
    | ||||||||| ||||||| |||           |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19310910 tattgttaatgtaacaaaactctgtccaaaattatgttgct-tttgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattacatgacccttca 19311008  T
Q  414 c----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccc 464  Q
    |    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19311009 catgagagaaagcacccctttgacttgaatcaatgttatagttcattaagcaccc 19311063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 8 - 474
Target Start/End: Original strand, 1187595 - 1188071
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaactt-gaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacacta 106  Q
    |||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||   |||||||||||||||||    
T  1187595 tatataactttattgttggaaatagactgctgcacttgaaacctagaaaaatttaatagttatgcatgtaaaactcaaagtgcatggggttgccacacta 1187694  T
Q  107 acctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgta 206  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  1187695 acctttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaataggaaagaccagcgaatctccttcatgatactatgagttccttgatgtgta 1187794  T
Q  207 ttgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagacta 305  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |  ||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  1187795 ttgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacaatattttacagatttatggttctaccaattcactcatgcattaaagaattgatggatgatttagagta 1187894  T
Q  306 agagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattcttgtttctgtg------tgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcat 399  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||      ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  || ||    
T  1187895 agagaatga-ggagatttatgttgttaatgtaacaaaattcttg-ttctgtgttttgttgtgtcaaattaatgcccaaatggcaagcacttattatggat 1187992  T
Q  400 tatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaa 474  Q
    |||||||| || |||    ||| |||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  1187993 tatatgactctacacatgagagtaaacacccctttgacttgaattaatgttatggttcattaaacacccatttgccaaa 1188071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Original strand, 28598077 - 28598417
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  28598077 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaa 28598176  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  28598177 cctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtat 28598276  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28598277 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataa 28598376  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
     ||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28598377 tagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattct 28598417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Original strand, 28574065 - 28574405
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  28574065 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaacttaaagcgtatggggttgccacactaa 28574164  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  28574165 cctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtat 28574264  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28574265 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataa 28574364  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
     ||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28574365 tagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattct 28574405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 39 - 347
Target Start/End: Original strand, 3465272 - 3465581
Alignment:
Q  39 gcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgtccccaccaataac 138  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3465272 gcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgtccccaccaataaa 3465371  T
Q  139 tctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattgcacaaccacatcaagcgtatctactaaca 238  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3465372 tgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaaca 3465471  T
Q  239 gtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaagagaatgagggagaattatgttgttaatgca 337  Q
    ||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||||||||||| |    
T  3465472 gtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgta 3465571  T
Q  338 acaaaattct 347  Q
    ||||||||||    
T  3465572 acaaaattct 3465581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 474
Target Start/End: Original strand, 43358521 - 43359003
Alignment:
Q  10 tataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacc 109  Q
    |||| |||||||||| | |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||     
T  43358521 tatatcttgattgttgggaagatgctgttgcacttgaaacctgaaaagtttaatgattatgcatgtaaaactcaaagcgcatgaggttgccacactaaca 43358620  T
Q  110 tttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatac--tatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||||    
T  43358621 tttaggttcgatttgcccccaccaataactgtatattggatgcaataggagtgaccggcgaatccccttcagaatactatatgagttccttgacgtgtat 43358720  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||| | ||||| |||||| | |||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  43358721 tgcacaaccacaccaaacatatctcctaacaattttttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggataatttagagtaa 43358820  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattc---------ttgt-ttctgt-gtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||         |||| |  ||| ||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  43358821 gagaatgagggagaattatgttgttaatgtaacaaaattcagtccaaaattgtgtgttgtagtgtgtccaactaatgcccaaatgccaagcatttatagt 43358920  T
Q  396 gcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaa 474  Q
    |||||||| ||| ||||||    |||||| |||   ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||    
T  43358921 gcattataggactcttcacatgagagaaagcactcatttgacttgaatcaatgctatgattcattaagcacccctttgccaaa 43359003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 10186992 - 10186532
Alignment:
Q  28 aagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgtcc 127  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10186992 aagatgctgttgcacttgaaacctgaaaagtttaatgattatacatgtaaaactcaaagcgcatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgccc 10186893  T
Q  128 ccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattgcacaaccacatcaagcgt 227  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||       |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  10186892 ccaccaataattgtatattggatgcaatagaaatgaccagtgaatcc-------gatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaaacgt 10186800  T
Q  228 atctactaaca----gtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaagagaatgagggagaat 322  Q
    |||| ||||||     |||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10186799 atctcctaacaatatttattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgatggagaat 10186700  T
Q  323 tatgttgttaatgcaacaaaattc--------------ttgtttctg----tgtgtgt-caaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattata 403  Q
    ||||||||||||| ||||||||||              |||||  ||    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10186699 tatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaaattatgttgttattgttcttctgtgttcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattata 10186600  T
Q  404 tgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacccctt 467  Q
    |||||||||||    |||||| ||||  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  10186599 tgacccttcacatgagagaaagcacccatttgacttgaaccaatgctatggttcattaagcacccctt 10186532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 267
Target Start/End: Original strand, 29681361 - 29681617
Alignment:
Q  10 tataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacc 109  Q
    |||| |||||| ||| | |||| |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||| | ||||||  |||||||||||| || ||||    
T  29681361 tatatcttgatcgttgggaagatgctgttgcacttgaaacctgaaaaatctaatggttatgcatgtaaact-caaagcgcatggggttgccataccaacc 29681459  T
Q  110 tttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaata-ggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtatt 208  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||| || | ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  29681460 tttaggttcgatttg-ccccaccaataactgtatattggatgcaataaggaatgaccggcaaatccctttgaggatactatgaggtccttgacgtgtatt 29681558  T
Q  209 gcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaat 267  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |  ||||||||| ||||||    
T  29681559 gcacaaccacaccaagcgtatctcctaacaatattttacagatttatggttccagcaat 29681617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 48366457 - 48366228
Alignment:
Q  38 tgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgtccccaccaataa 137  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||| | ||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  48366457 tgcacttgaaacctgaaaaatctaatggttatgcatgtaaact-caaagcgcatggggttgccataccaacctttaggttcgatttgcccccaccaataa 48366359  T
Q  138 ctctatattggatgcaata-ggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattgcacaaccacatcaagcgtatctactaa 236  Q
     | |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  48366358 ttgtatattggatgcaataaggaatgaccggcgaatccccttgaggatactatgaggtccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctccaaa 48366259  T
Q  237 cagtattttacgggattatggttcgagcaat 267  Q
    || |||||||| |  ||||||||| ||||||    
T  48366258 caatattttacagatttatggttccagcaat 48366228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 200
Target Start/End: Original strand, 35624793 - 35624977
Alignment:
Q  16 ttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacctttagg 115  Q
    ||||||||| | |||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||   |||||||| || |||||||||||||    
T  35624793 ttgattgttcggaagatgctactgcacttgaaacatgaaaaatttaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgcgtggggttgtcatactaacctttagg 35624892  T
Q  116 ttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttga 200  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35624893 ttcgattcgcccccaccaacaactgtatattggatgcaataggagtgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttga 35624977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 183 - 347
Target Start/End: Original strand, 3468010 - 3468175
Alignment:
Q  183 atactatgagttccttgacatgtattgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattag 281  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  3468010 atactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattag 3468109  T
Q  282 agaattgatggatgatttagactaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3468110 agaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattct 3468175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 274 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 21431841 - 21431625
Alignment:
Q  274 tgcattagagaattgatggatgatttagactaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattcttg-------tttctg----tgtgtgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||    | | |||    
T  21431841 tgcattagagaattgatggatgatttagattaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattcttgttcttgttttctgttgttctctgt 21431742  T
Q  363 caaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaaca-ccattttgacttgaatcaatgttaaggttcatta 457  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||| || ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21431741 ccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaagcaccccctttgacttaaatcaatgttatggttcatta 21431642  T
Q  458 agcaccccttggccaaa 474  Q
    ||||||| || ||||||    
T  21431641 agcacccttttgccaaa 21431625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 208 - 391
Target Start/End: Original strand, 35626140 - 35626329
Alignment:
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaat-cactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||  |  ||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35626140 tgcacaaccacatcgaacgtatctcctaatagtattttatagatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaa 35626239  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattcttgtttc-----tgtgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacattta 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||     | | | | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35626240 gagaatgagggagaattatgttgttaatgtaacaaaattctggtttctattgtctttttatcaaactaatgcccaaatgtcaaacattta 35626329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 252 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 17414728 - 17414576
Alignment:
Q  252 ttatggttcgagcaat-cactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattcttgt 350  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  17414728 ttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaacaaaattcatgt 17414629  T
Q  351 ttctgtgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac 414  Q
                |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17414628 -----------ccaaattgatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgaccattcac 17414576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 17415618 - 17415418
Alignment:
Q  11 ataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacct 110  Q
    ||||||||||||||   |||||| || ||| |||| ||  | |||||||||||||||||| | |||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| |    
T  17415618 ataacttgattgttgagaagaggttgttgcgcttgcaatgtaaaaagtttaatggttatgcacgtaaaaatcaaagtgtatggggttgtcacactaacat 17415519  T
Q  111 ttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattgc 210  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||||||||    
T  17415518 ttaggttcgatttgcccccaccaataattgtatattggatgaaataggaatgaccatcaaatcctcttcaggatactattagtttcttgatgtgtattgc 17415419  T
Q  211 a 211  Q
    |    
T  17415418 a 17415418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21432073 - 21431918
Alignment:
Q  37 ctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgtccccaccaata 136  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  21432073 ctgcacttgaaacctgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaatcgcatgaggttgccacactaacttttagattcgattcacccccaccaata 21431974  T
Q  137 actctatattggatgcaat-aggaatgaccagagaatccccttcatgatactatga 191  Q
    ||| |||||||  |||||| |||||||||| | |||||||||||  ||||||||||    
T  21431973 actatatattgtttgcaataaggaatgaccggtgaatccccttctggatactatga 21431918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Original strand, 28574624 - 28574700
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28574624 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 28574700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Original strand, 28598636 - 28598712
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28598636 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaattgattccattattttggaaatcaccaaca 28598712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Original strand, 43359129 - 43359205
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43359129 atgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactcttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 43359205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 432 - 558
Target Start/End: Original strand, 16051462 - 16051588
Alignment:
Q  432 acttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaaaggttctatgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtg 531  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| | || ||  ||||| | |   |||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||| || |||||||    
T  16051462 acttgaatcaatgctatggttcattaagtatccatttaccaaatgttataatgtatatgaatgattcccataaagagttataacttttggttctaaagtg 16051561  T
Q  532 attccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16051562 attccattattttagaaatcaccaaca 16051588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Original strand, 28574447 - 28574557
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||  ||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  28574447 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 28574546  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  28574547 cttttgccaaa 28574557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Original strand, 28598459 - 28598569
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||  ||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  28598459 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 28598558  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  28598559 cttttgccaaa 28598569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Original strand, 3468395 - 3468471
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || | ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3468395 atgtatatgaatggttcctatgaagaattacaacttttgattctaaaatgattccattattttggaaatcaccaaca 3468471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Original strand, 3468218 - 3468328
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| |||   ||| |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  3468218 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacatctttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacc 3468317  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  3468318 cttttgccaaa 3468328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 432 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 10186449 - 10186365
Alignment:
Q  432 acttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaaaggttctatgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaact 516  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  10186449 acttcaatcaatgataaggctcattaagcacccctttgctaaaagtttcaatgtatatgaaagattcccatgaagagttacaact 10186365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 432 - 516
Target Start/End: Original strand, 19311090 - 19311174
Alignment:
Q  432 acttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaaaggttctatgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaact 516  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | | | ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  19311090 acttgaatcaatgctaaggttcattatgcacccctttgccaaaggttccaatgtatatgaaagattcccatgaagagttacaact 19311174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 502 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 17414359 - 17414304
Alignment:
Q  502 tgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaac 557  Q
    ||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17414359 tgaagagttacaagttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaac 17414304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 502 - 560
Target Start/End: Original strand, 1188333 - 1188391
Alignment:
Q  502 tgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaacaca 560  Q
    |||| |||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1188333 tgaaaagttacaatttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaacaca 1188391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 502 - 556
Target Start/End: Original strand, 13654676 - 13654730
Alignment:
Q  502 tgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaa 556  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13654676 tgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaattaccaa 13654730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 502 - 552
Target Start/End: Original strand, 19311180 - 19311230
Alignment:
Q  502 tgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatca 552  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19311180 tgaagagttacaacttttggttataaagtgattccattattttggaaatca 19311230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 502 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 35653090 - 35653036
Alignment:
Q  502 tgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaa 556  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35653090 tgaagagttacaacttttggttccaaagtgattccattattttggaaatcaccaa 35653036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 35653363 - 35653204
Alignment:
Q  315 gggagaattatgttgttaatgcaacaaaattcttgtttct-gtgt-gtgtc-aaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgaccctt 411  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||| | || | ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||  ||  ||||||||||||    
T  35653363 gggagaattatgtcgttaatgtaacaaaattcctcttttttgtttcgtgtctaaattaatgcccaaatgtcaagtgtttataaggctatatatgaccctt 35653264  T
Q  412 cac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacccctt 467  Q
    |||    ||||||||||   ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  35653263 cacatgagagaaaacactcatttgaattgaatcaatgatatggttcattaagcactcctt 35653204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 502 - 547
Target Start/End: Original strand, 10186056 - 10186101
Alignment:
Q  502 tgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttgga 547  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10186056 tgaagagttacaacttttgattctaaagtgattccattattttgga 10186101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 735 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 26779781 - 26779702
Alignment:
Q  735 tatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatttgattaaaagtttatggctgagatttaaa 814  Q
    |||||||||||  || |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  26779781 tatgagaatgattattttatgtgagaatggtgagaatgattatgaaccattagatcaaaaatggatggctgagatttaaa 26779702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 504 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 3696165 - 3696111
Alignment:
Q  504 aagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  3696165 aagagttacaacttttgattccaaagtgattccattattttagaaattaccaaca 3696111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 432 - 510
Target Start/End: Original strand, 10185966 - 10186044
Alignment:
Q  432 acttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaaaggttctatgtatatgaatgatttccatgaagagtt 510  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || || ||| | ||| ||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  10185966 acttgaatcaacgctaaggttcattaagcacccatttgctaaaggtttcaatgtatatgaaagattcccataaagagtt 10186044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 730 - 811
Target Start/End: Original strand, 14761710 - 14761791
Alignment:
Q  730 tatagtatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatttgattaaaagtttatggctgagattt 811  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||  |||| || || ||||||||    
T  14761710 tatactatgagaatgactattttatatgagaattatgagaataataatcaaccattagatttcaagtatacggttgagattt 14761791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 482 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 3696207 - 3696167
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgat 522  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3696207 atgtatatgaatgattcccatgaaaagttgcaacttttgat 3696167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 3696654 - 3696403
Alignment:
Q  93 gggttgccacactaacctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgag 192  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| | || ||||| |||| |  ||||||||||||||| |||||| ||   |||| |||||| ||||||||||     
T  3696654 gggttgtcatactaacctttaggtttgatgcttctccaccgataattgaatattggatgcaata-gaatgatcaataaatctccttcaagatactatgaa 3696556  T
Q  193 ttccttgacatgtattgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatg 291  Q
    |||||||  |||| || ||||| |||| |||  ||||||  |||| |||||||||   |||||||||| | ||| ||| || | |   ||||||||||||    
T  3696555 ttccttg--atgtgtttcacaatcacagcaaaagtatctcttaaccgtattttac-aaattatggttccatcaattcattcattctgcagagaattgatg 3696459  T
Q  292 gatgatttagactaagag-aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattc 346  Q
    ||||||||| |  | ||| ||||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3696458 gatgatttatagaatgagaaatggaagagaattgtgttgttaatgtaacaaaattc 3696403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 502 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 10186359 - 10186307
Alignment:
Q  502 tgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcacc 554  Q
    |||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10186359 tgaagagttaaaacttttgagtctaaagtgattccattattttggaaagcacc 10186307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 737 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 18543718 - 18543679
Alignment:
Q  737 tgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataatta 776  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18543718 tgagaatgactatcttatatgagaattgtgagaataatta 18543679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 432 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 21431608 - 21431566
Alignment:
Q  432 acttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaa 474  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  21431608 acttgaatcaatgttaaggttcatcaagcacccatttgccaaa 21431566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 525 - 559
Target Start/End: Original strand, 35626558 - 35626592
Alignment:
Q  525 taaagtgattccattattttggaaatcaccaacac 559  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35626558 taaagtgattccattattttagaaatcaccaacac 35626592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 501 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 21430833 - 21430777
Alignment:
Q  501 atgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21430833 atgaagagttacaacttttgatctaaaa-tgattctattattttgaaaatcaccaaca 21430777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 15 - 473
Target Start/End: Original strand, 143871 - 144329
Alignment:
Q  15 cttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacctttag 114  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  143871 cttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgcttacgcatgtaaaattcaaagcgcatggggttgccacactaacctttag 143970  T
Q  115 gttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattgcacaa 214  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  143971 gttcgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaataggagttaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaa 144070  T
Q  215 ccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgattt--agactaagagaa 311  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||  |||||||    
T  144071 ccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagaattaatggatgatttagagagcaagagaa 144170  T
Q  312 tgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct-tgtttctgtgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgaccct 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||        |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  144171 tgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattctatccaaaattgtgtgtcaaattaatgc--------caagtatttatagtgcattatatgaccct 144262  T
Q  411 tcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaa 473  Q
    ||||    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||    
T  144263 tcacatgagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatggttcattaagtacccttttgccaa 144329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 502 - 556
Target Start/End: Original strand, 144437 - 144491
Alignment:
Q  502 tgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaa 556  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  144437 tgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaattaccaa 144491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 49)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 28 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 34279908 - 34279479
Alignment:
Q  28 aagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagttt-aatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgtc 126  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  34279908 aagaggcggctgcacttgaaacctgaaacgttttaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgcatgggattgtcacactaacctttagcttcgattcgcc 34279809  T
Q  127 cccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattgcacaaccacatcaagcg 226  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||   || |||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  34279808 cccaccaataactgtatattgaatgcaataggaatgaccgacgattccccttcaaaatactatgagtttcttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcg 34279709  T
Q  227 tatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaagagaatgagggagaattat 325  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  ||||||||  || || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  34279708 tatctcctaacagtattttacagatttatggtttcaggaattcactcatgcattagagaattgatggttgatttagagtaagagaacgaggaagaattat 34279609  T
Q  326 gttgttaatgcaacaaaattcttgtttctgtgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaa 421  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    
T  34279608 gttgttaatgtaacaaaattcatg-ttctgtgtgtgtcaaattaatgctcaaatgtcgagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaa 34279510  T
Q  422 caccattttgacttgaatcaatgttaaggtt 452  Q
    |||   |||||||||||||||||||| ||||    
T  34279509 cactcatttgacttgaatcaatgttatggtt 34279479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 10 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 32429718 - 32429244
Alignment:
Q  10 tataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacc 109  Q
    |||| |||||||||| | |||| |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  32429718 tatatcttgattgttgggaagatgtggctgcacttgaaacctgaaaattttaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgcatggggttgccacactaacc 32429619  T
Q  110 tttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaat-aggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtatt 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  32429618 tttaggttcgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaataaggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtatt 32429519  T
Q  209 gcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaag 307  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  32429518 gcacaaccacacaaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccaacaattcactcatgcattaaagaattgatggatgatttagagtaag 32429419  T
Q  308 agaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct-----------tgtttctgtgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtg 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||           ||| |   |||||||| || |||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  32429418 agaatgagggagaattatgttgttaatccaacaaaattctgtccaaaattgtgtgttgttgtgtgtccaactaatgcacaaatgccaagcatttatagtg 32429319  T
Q  397 cattatatgacccttca----cgagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacccctt 467  Q
    ||||||||||| |||||     |||||||||||  |||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||    
T  32429318 cattatatgactcttcaaatgagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccctt 32429244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Original strand, 35095796 - 35096136
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  35095796 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaa 35095895  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  35095896 cctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtat 35095995  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35095996 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataa 35096095  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
     ||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35096096 tagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattct 35096136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 460
Target Start/End: Original strand, 18670611 - 18671076
Alignment:
Q  10 tataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacc 109  Q
    |||| |||||||||| | |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  18670611 tatatcttgattgttgggaagttgctgctgcacttgaaacctgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaattcaaagcgcatggagttgccacactaacc 18670710  T
Q  110 tttaggttcgattc-gtccccaccaataactctatattggatgcaat-aggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  18670711 tttaggttcgattcacaccccaccaataactatatattgaatgcaataaggaatgaccggcgaat-cccttcaggatactatgagttcctt--catgtat 18670807  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||| |  ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18670808 tgcacaaccacaccaagtgtatctcctaacaatattttacagatttatggttccaacaagtcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaa 18670907  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattcttgtttct----------gtgtgtgt-caaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagt 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||           ||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  18670908 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacataattctggtttctattgtctttgttgtgtgtccaaattaattcccaaatgccaagcatttatagt 18671007  T
Q  396 gcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagc 460  Q
     ||||||||||||||||||    |||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  18671008 ccattatatgacccttcacatgagagaaagcacccatttgacttgaatcaatgctatggttcattaagc 18671076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 474
Target Start/End: Original strand, 47071176 - 47071651
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcactt-gaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacacta 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  47071176 tatataacttgattgttagaaagatgttgttgcactttgaaacctgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgcatggggttgccacacta 47071275  T
Q  107 acctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgta 206  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  47071276 acctttaggttcgattca-ccccatcaataattgtatatttgatgcaatatgaatgaccagcgaatccccttcatgatactatgagttccttgatgtgta 47071374  T
Q  207 ttgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagacta 305  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||  || |||||||||||    ||||||||| | ||| |||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  47071375 ttgcacaaccacaccaatcatatctcatatcagtattttacaaatttatggttcaaacaattcactcattcattagagaattgatagataatttagagta 47071474  T
Q  306 agagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattcttgtttctgtgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatg 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  47071475 agagaatgagggagaattatgttgttaatgtaacaaaatttctgttcttgt-tgt-ccaaattaatgcccaaatgttaaacatttatagtacattatatg 47071572  T
Q  406 acccttcac----------gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaa 474  Q
    |||||||||          ||||||||||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| || || ||||||    
T  47071573 acccttcacatgaacatgagagaaaacacttttttgacttgaatcaatgcaatggttcattaagcatccatttgccaaa 47071651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 18716256 - 18716597
Alignment:
Q  10 tataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacc 109  Q
    |||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18716256 tatatcttgattgttgggaagatgctgctgcacttgaaacctgaaaagtttaatggtaatgcatgtaaaactcaaagcgcatggggttgccacactaacc 18716355  T
Q  110 tttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaat-aggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtatt 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  18716356 tttaggttcgattcgcccccaccaataactatatattggatgcaataaagaatgaccggcgaatccccttcaggatactaagagttctttgacgtgtatt 18716455  T
Q  209 gcacaac--cacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagacta 305  Q
    |||||||  |||| ||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18716456 gcacaaccacacaccaagcgtatcttctaatagtattttacagatttatggttccagcaattcactcttgtattagagaattgatggatgatttagagta 18716555  T
Q  306 agagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18716556 agagaatgggggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 18716597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Original strand, 35090690 - 35091023
Alignment:
Q  15 cttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacctttag 114  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  35090690 cttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaatttaaagtgtatggggttgccacactaacctttag 35090789  T
Q  115 gttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattgcacaa 214  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35090790 gttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaa 35090889  T
Q  215 ccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaagagaatg 313  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||     
T  35090890 ccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatt 35090989  T
Q  314 agggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
      |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35090990 ttgatgaattatgttgttaatgtaacaaaattct 35091023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 75 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 54859525 - 54859121
Alignment:
Q  75 taaaattcaaagcatatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatcc 174  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  54859525 taaaactcaaagcgcatggggttgccacactaacctttatgttcaattcgtccc-accaataattgtatattggatgcaataggaattaccagcgaaacc 54859427  T
Q  175 ccttcatgatactatgagttccttgacatgtattgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcg 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||    
T  54859426 ccttcatgataatatgagttccttgatgtgtattacacaactacaccaaacgtatctcctaacagtattttacggatttatggttccagcaattcactcg 54859327  T
Q  274 tgcattagagaattgatggatgatttagactaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattcttgtttctgtgtgtgt-caaattaatg 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||   ||| ||  ||||| ||||||||||    
T  54859326 tgcattagagaattgatggatgatttagagcaagagaatgagggagaatcatgttgttaatgtgacaaaattc-catttttggttgtgtccaaattaatg 54859228  T
Q  373 cccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaaca-ccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacccctt 467  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||    
T  54859227 cccaaatatcaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacaccccctttgacttgaatcaatgttatggttcattaagcatccatt 54859128  T
Q  468 ggccaaa 474  Q
     ||||||    
T  54859127 tgccaaa 54859121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Original strand, 18736929 - 18737270
Alignment:
Q  10 tataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacc 109  Q
    |||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||| ||| |||| |||||||    
T  18736929 tatatcttgattgttgggaagatgctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgcatgaggtagccaaactaacc 18737028  T
Q  110 tttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaat-aggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtatt 208  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18737029 tttaggttcaattcgcccccaccaataactatatattagatgcaataaagaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtatt 18737128  T
Q  209 gcacaac--cacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagacta 305  Q
    |||||||  |||| |||||| |||| |||| |||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18737129 gcacaaccacacaccaagcgaatcttctaaaagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgaattagagaattgatggatgatttagagta 18737228  T
Q  306 agagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18737229 agagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 18737270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 30020279 - 30019946
Alignment:
Q  15 cttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacctttag 114  Q
    ||||||||||   |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||  |||||||| ||| | |||||||| |    
T  30020279 cttgattgttgagaagatgctgttgcacttgaaacctgaaaagttcaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgcatggggttaccatattaaccttt-g 30020181  T
Q  115 gttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaata-ggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattgcaca 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  30020180 gttcgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaataaggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcata 30020081  T
Q  214 accacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaat-cactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaagagaat 312  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||    ||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30020080 accacaccaaacgtatctcctaacagtatttcacatatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaat 30019981  T
Q  313 gagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
    |  | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30019980 ggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattct 30019946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 141 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 34128540 - 34128122
Alignment:
Q  141 tatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagt 240  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||  |    
T  34128540 tatattggatgcaaaaggaatgaccagcaaatctccttcaggatactatgagtttcatgaggtgtattgcacaaccacaccaaacatatctcctaaccat 34128441  T
Q  241 attttacgggattatggttcgagcaat-cactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaac 339  Q
    ||||||| |  ||||||||  | |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34128440 attttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagaaaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgcaac 34128341  T
Q  340 aaaattcttgtttctgtgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgactt 435  Q
    ||||||||||||||  |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||   ||||||||    
T  34128340 aaaattcttgtttc--ttagtgtcaaattaatggccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgacccttcacattagagaaaacactcatttgactt 34128243  T
Q  436 gaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaaaggttctatgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattc 535  Q
    ||||||||||||  ||||||||||   || || |||||| | | | || |||||||| ||||  ||   |||||| ||||||||| || |||| ||||||    
T  34128242 gaatcaatgttatagttcattaag---ccttttgccaaaggttccaatatatatgaaagattctcacagagagttacaacttttggttctaaaatgattc 34128146  T
Q  536 catta-ttttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||| | ||||||||||||||||||    
T  34128145 cataatttttggaaatcaccaaca 34128122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 38 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 3425106 - 3424718
Alignment:
Q  38 tgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgtccccaccaataa 137  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||| |||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3425106 tgcacttgaaacctgaaaagtttaattattatgcatgcaaaactcaaagcgcatgggattgtcacactaacctttaggttcgattctcccccaccaataa 3425007  T
Q  138 ctctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattgcacaaccacatcaagcgtatctactaac 237  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| | |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  3425006 ctgaatattggatgcaataggaatgaacagcgaatctcctttaggatactatgagttcattgatgtgtattgcacaaccacaccaaccgtatctcctaac 3424907  T
Q  238 agtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaagagaatgagggaga-attatgttgttaatg 335  Q
    |||||||||| |  ||||| ||| || || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  3424906 agtattttacagatttatgtttccagtaactcactcatgcattagagaattaatggatgatttagagtaagagaatgagggagatcttatgttgttaaag 3424807  T
Q  336 caacaaaattcttgtttctg---------tgtgtgtc-aaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac 414  Q
     ||||||| | |||||  ||         ||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3424806 taacaaaaattttgttcatgttgttgttctgtttgtctaaattaatgcccaaatatcaaatatttatagtgcattatatgacccttcac 3424718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3415586 - 3415336
Alignment:
Q  10 tataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacc 109  Q
    |||| |||||||||| | |||| | || |||||||||||| |||||||||||||  | ||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  3415586 tatatcttgattgttgggaagatgttgttgcacttgaaacctgaaaagtttaattatcatgcatgtaaaactcaaagcgcatgggattgccacactaacc 3415487  T
Q  110 tttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattg 209  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| ||||  |||||||    
T  3415486 tttaggttcaattcgcccccaccaataactgtatattggatgtaataggaatgaccaacgaatctccttcaggatactatgagttcattgatgtgtattg 3415387  T
Q  210 cacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttc 260  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |  |||||||||    
T  3415386 cacaaccacaccaaccgtatctcctaatagtattttacagatttatggttc 3415336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14646704 - 14646483
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  |||||||| ||||||| |    
T  14646704 tatatatcttgattgttaggatgaagctgctgcacttgaaatctgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaacttaaagctcatggggtttccacactga 14646605  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||| |  |||||    
T  14646604 cctttaggttcgatttgcccccactaataactgtatattggatgcaataggaatgacccgcgaatcccctttaggatactatgagttccttaatgtgtat 14646505  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtat 229  Q
    |||| ||||||| |||||||||    
T  14646504 tgcagaaccacaccaagcgtat 14646483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 276 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 14643897 - 14643696
Alignment:
Q  276 cattagagaattgatggatgatttagactaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattcttgtttctgt------gtgtgtcaaatta 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||       | ||| ||||||    
T  14643897 cattagagaattgatggatgatttagagtaagagaattaggaagaattatgttgttgatgtaacaaaattcttttttctgtattttgttatgttaaatta 14643798  T
Q  370 atgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacccc 465  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||     ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||    
T  14643797 atgcacaaatatcaaacatttatagcgcattatatgacccttcacatgatagaaaacacccatttgacttgaatcaatgctaaggttcattaaacactcc 14643698  T
Q  466 tt 467  Q
    ||    
T  14643697 tt 14643696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 432 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 34279381 - 34279254
Alignment:
Q  432 acttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaaaggttcta-tgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagt 530  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| || ||||||    
T  34279381 acttgaatcaatgctaaggttcattaagcacccatttgtcaaaagattctaatgtatatgaatgattcccatgaagaattgaaacttttggttctaaagt 34279282  T
Q  531 gattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34279281 gattccattattttggaaatcaccaaca 34279254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 267 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 3409778 - 3409552
Alignment:
Q  267 tcactcgtgcattagagaattgat----ggatgatttagactaagagaatgagggagaa-ttatgttgttaatgcaacaaaattcttgtttctgt----- 356  Q
    |||||| |||||||||||||| ||    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | | ||||||| |||||  |||         
T  3409778 tcactcatgcattagagaattaatatatggatgatttagagtaagagaatgagggagatcttatgttgttaaagtatcaaaatttttgttcatgttgttg 3409679  T
Q  357 ----gtgtgtc-aaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgtta 447  Q
        ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||   ||||||||||||||||| ||    
T  3409678 ttctgtgtgtctaaattaatgcccaaatgtcaaatatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacactcctttgacttgaatcaatgcta 3409579  T
Q  448 aggttcattaagcaccccttggccaaa 474  Q
     | ||||||||||||||||| ||||||    
T  3409578 tgattcattaagcacccctttgccaaa 3409552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 339 - 467
Target Start/End: Original strand, 22118826 - 22118960
Alignment:
Q  339 caaaattcttgtttctgtgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaa--acaccattttga 432  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||  |||||  |||||    
T  22118826 caaaattcctctttctgtgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaagcatttatagtatattatatgacccttcacatgagagaaaatacacccctttga 22118925  T
Q  433 cttgaatcaatgttaaggttcattaagcacccctt 467  Q
    ||||||| |||  || |||||||||||||||||||    
T  22118926 cttgaatgaataatatggttcattaagcacccctt 22118960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 32429110 - 32429034
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32429110 atgtatatgaatgatttccatgaagagttacaactcttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 32429034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 360 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 30019909 - 30019803
Alignment:
Q  360 tgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcat 455  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  30019909 tgtcaaactaatgcccaaatgccaaacatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaagcacccatttgacttgaatc-atgttatggttcat 30019811  T
Q  456 taagcacc 463  Q
    ||||||||    
T  30019810 taagcacc 30019803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 432 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 54859104 - 54858987
Alignment:
Q  432 acttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaaaggttctatgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtg 531  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||| | | | |||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||| || |||||||    
T  54859104 acttgaatcaatgttatgtttcattaagcacccttttgccaaaggttccaatgtatatgaatgattccaatgaagagttacaatttttggttgtaaagtg 54859005  T
Q  532 attccattattttggaaa 549  Q
    |||| |||||||||||||    
T  54859004 attctattattttggaaa 54858987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Original strand, 35091242 - 35091318
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35091242 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 35091318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 297 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 25618435 - 25618264
Alignment:
Q  297 tttagactaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattcttgtttctgt----------gtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaac 386  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||          || | ||||| ||||||||||||| ||| |    
T  25618435 tttagaataagagaatgagggagaattattttgttaatgcaacaaaattttggtttatgtttttgttgtagtctttcaaactaatgcccaaatgccaagc 25618336  T
Q  387 atttatagtgcattatatgacccttcacgagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagca 461  Q
    ||||||||||||||||||||  | | | |||||||||||  | |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  25618335 atttatagtgcattatatga--catga-gagaaaacacctctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagca 25618264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Original strand, 35096355 - 35096431
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35096355 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaactttttgttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 35096431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 432 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 14643672 - 14643588
Alignment:
Q  432 acttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaaaggttctatgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaact 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | | | |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  14643672 acttgaatcaatgttaaggttcattaagcacccttttgccaaaggttccaatgtatatgaatgattcccatgaatagttacaact 14643588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 432 - 516
Target Start/End: Original strand, 47071668 - 47071752
Alignment:
Q  432 acttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaaaggttctatgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaact 516  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| | | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  47071668 acttgaatcaatgttatggttcattaagcacccatttgccaaaggttccaatgtatatgaatgattttcatgaagagttacaact 47071752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 432 - 522
Target Start/End: Original strand, 22118984 - 22119074
Alignment:
Q  432 acttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaaaggttctatgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgat 522  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| | | | ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  22118984 acttgaatcaatgctaaggttcattaagcacccatttgccaaaggttccaatgtaaatgaatgattttcaggaagagttgcaactcttgat 22119074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 34128652 - 34128574
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaag 86  Q
    |||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  34128652 tatatatcttgattgttgggaagagactgctgcacttgaaaccttaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaag 34128574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 724 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 35318422 - 35318352
Alignment:
Q  724 aggatgtatagtatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatttgattaaaa 794  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  35318422 aggatgtataatatgagaatgactatcttatataagaatggtgagaatgatcatcaaccattagattaaaa 35318352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Original strand, 35091065 - 35091175
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  35091065 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 35091164  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  35091165 cttttgccaaa 35091175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Original strand, 35096178 - 35096288
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  35096178 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 35096277  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  35096278 cttttgccaaa 35096288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 502 - 558
Target Start/End: Original strand, 47071758 - 47071814
Alignment:
Q  502 tgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47071758 tgaagagttacaacttttggttgtaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 47071814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 726 - 794
Target Start/End: Original strand, 52305811 - 52305879
Alignment:
Q  726 gatgtatagtatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatttgattaaaa 794  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  52305811 gatgtatactgtgagaatgacaatcttatatgagaatgatgagaatgatcatcaaccattagattaaaa 52305879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 722 - 785
Target Start/End: Original strand, 35317614 - 35317677
Alignment:
Q  722 tgaggatgtatagtatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatt 785  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  35317614 tgaggatgtataatatgagaatgactatcttatatgagaatggtgaaaatgatcatcaaccatt 35317677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 500 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 3424172 - 3424114
Alignment:
Q  500 catgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3424172 catgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcacaaaca 3424114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 502 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 14643582 - 14643520
Alignment:
Q  502 tgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaacacaaggt 564  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14643582 tgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcaattattttgtaaatcaccaacacaaggt 14643520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 558
Target Start/End: Original strand, 22119073 - 22119130
Alignment:
Q  501 atgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22119073 atgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttgaaaatcaccaaca 22119130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 735 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 50464361 - 50464282
Alignment:
Q  735 tatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatttgattaaaagtttatggctgagatttaaa 814  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |  |||| |||||||||||    
T  50464361 tatgagaatgattatttcatatgagaatggtgagaataattatcaaccattagattacaaataaatggttgagatttaaa 50464282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 432 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 25618175 - 25618050
Alignment:
Q  432 acttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaaaggttctatgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtg 531  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| |||| || | |||| | | | ||||||||||| ||| || ||||| |||| ||||| ||  || |||||||    
T  25618175 acttgaatcaatgcaaaagttcattaagaacccttttgtcaaaggttacaatgtatatgaaagatctc-atgaacagttacaactcttagttctaaagtg 25618077  T
Q  532 attccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25618076 attccaatattttggaaatcaccaaca 25618050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 267 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 34602121 - 34602060
Alignment:
Q  267 tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaagagaatgagggagaattatgtt 328  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  34602121 tcactcatgcataagaaaattgatggatgatttagagtaaaagaatgagggagaattgtgtt 34602060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 438 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 34601965 - 34601886
Alignment:
Q  438 atcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaaaggttc-tatgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaactt 517  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  34601965 atcaatgttatggttcattaagcacccctttgcc-aaagattcaaatgtatatgaatgattctcatgaagagttacaactt 34601886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 722 - 794
Target Start/End: Original strand, 44348074 - 44348146
Alignment:
Q  722 tgaggatgtatagtatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatttgattaaaa 794  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  44348074 tgaggatgtatattatgagaatgagtattttatacgagaatgatgagaataatcatcaaccatcagattaaaa 44348146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 735 - 782
Target Start/End: Original strand, 48339548 - 48339595
Alignment:
Q  735 tatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaacc 782  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  48339548 tatgagaatgactatcttatatgagaatgatgagaatgattatcaacc 48339595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 512 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 3409375 - 3409329
Alignment:
Q  512 caacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409375 caacttttagttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 3409329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 502 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 30019692 - 30019638
Alignment:
Q  502 tgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30019692 tgaagagttacaactt--gattctaaagtgattccattattttagaaatcaccaaca 30019638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 735 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 52306699 - 52306640
Alignment:
Q  735 tatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatttgattaaaa 794  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| || |||||| || ||||||||    
T  52306699 tatgagaatgacaatcttatataagaattatgagaatacttctcaacccttagattaaaa 52306640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 432 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 25618234 - 25618192
Alignment:
Q  432 acttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaa 474  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  25618234 acttgaatcaatgttatggttcattaagcacccttttgccaaa 25618192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 749 - 794
Target Start/End: Original strand, 30057938 - 30057983
Alignment:
Q  749 tcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatttgattaaaa 794  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  30057938 tcttatatgagaatgatgagaataaatctcaaccattagattaaaa 30057983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 736 - 773
Target Start/End: Original strand, 39819416 - 39819453
Alignment:
Q  736 atgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataa 773  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  39819416 atgagaatgactaacttatatgagaatggtgagaataa 39819453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 75)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6853388 - 6853048
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    ||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6853388 tatataactagtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaa 6853289  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  6853288 cctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtat 6853189  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6853188 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagaataa 6853089  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
     ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6853088 tagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattct 6853048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5458448 - 5458108
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  5458448 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaa 5458349  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  5458348 cctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtat 5458249  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5458248 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataa 5458149  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
     ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5458148 tagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattct 5458108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5481924 - 5481584
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  5481924 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaa 5481825  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  5481824 cctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtat 5481725  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5481724 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataa 5481625  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
     ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5481624 tagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattct 5481584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Original strand, 8458079 - 8458419
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  8458079 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaa 8458178  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  8458179 cctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtat 8458278  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8458279 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataa 8458378  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
     ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8458379 tagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattct 8458419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Original strand, 8464518 - 8464858
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  8464518 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaa 8464617  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  8464618 cctttaggttcgattcgccccaaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtat 8464717  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8464718 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataa 8464817  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
     ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8464818 tagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattct 8464858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 10 - 463
Target Start/End: Original strand, 29827198 - 29827652
Alignment:
Q  10 tataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa-c 108  Q
    |||| |||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||| ||||||||| |    
T  29827198 tatatcttgattgttggaaagatactgctgcacttaaaacctgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgcatggggttaccacactaaac 29827297  T
Q  109 ctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtatt 208  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  29827298 ctttaggttcgattcgcctccaccaataattgtatattggatgcaataggagcgaccggcgaatccccttcaagatactatgagttccttgacgtgtatt 29827397  T
Q  209 gcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaag 307  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||      ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  29827398 gcacaaccacaccaagggtatctcctaacagtattttacagatttat-----cagcaattcactcatgcattagagaattgatgaatgatttagagtaag 29827492  T
Q  308 agaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattcttgtttctg-tgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatga 406  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  29827493 agaatgagggagaattaggttattaatgcaacaaaattcttgtttatgttttttgtcaaactaatgcccaaatgccaagcatttataatgcattatatga 29827592  T
Q  407 cccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
     | |||||     ||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  29827593 -ctttcacatgatagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacc 29827652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Original strand, 4049575 - 4049915
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  4049575 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatatttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaa 4049674  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  4049675 cctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtat 4049774  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4049775 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataa 4049874  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
     ||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4049875 tagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattct 4049915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6858491 - 6858151
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6858491 tatatatcttgtttgttgggaagaggatgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaa 6858392  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  6858391 cctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcaaatccccttcaagatactatgagttccttgacgtgtat 6858292  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6858291 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataa 6858192  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
     ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6858191 tagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattct 6858151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10591731 - 10591391
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  10591731 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaa 10591632  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  10591631 cctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttcattgacgtgtat 10591532  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10591531 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataa 10591432  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
     ||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10591431 tagaatgatgaggaattatgttgttaatgtaacaaaattct 10591391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10673354 - 10673034
Alignment:
Q  28 aagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgtcc 127  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10673354 aagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgccc 10673255  T
Q  128 ccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattgcacaaccacatcaagcgt 227  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  10673254 ccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgt 10673155  T
Q  228 atctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaagagaatgagggagaattatg 326  Q
    |||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||    
T  10673154 atctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatg 10673055  T
Q  327 ttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  10673054 ttgttaatgtaacaaaattct 10673034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10678469 - 10678149
Alignment:
Q  28 aagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgtcc 127  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10678469 aagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgccc 10678370  T
Q  128 ccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattgcacaaccacatcaagcgt 227  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  10678369 ccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgt 10678270  T
Q  228 atctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaagagaatgagggagaattatg 326  Q
    |||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||    
T  10678269 atctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatg 10678170  T
Q  327 ttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  10678169 ttgttaatgtaacaaaattct 10678149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 8 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1302681 - 1302343
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  1302681 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaa 1302582  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  1302581 cctttaggttcgatacgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtat 1302482  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1302481 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataa 1302382  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaatt 345  Q
     ||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  1302381 tagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaatt 1302343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31076838 - 31076498
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  31076838 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaa 31076739  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  31076738 cctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccgacgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtat 31076639  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31076638 tgcacaaccacaccaaacgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataa 31076539  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
     ||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31076538 tagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattct 31076498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31081943 - 31081603
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  31081943 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctaaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaa 31081844  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  31081843 cctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtat 31081744  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31081743 tgcacaaccacaccaaacgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataa 31081644  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
     ||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31081643 tagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattct 31081603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 33703036 - 33702696
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  33703036 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaa 33702937  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  33702936 cctttaggttcgattcgctcccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgactggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtat 33702837  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33702836 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacatatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataa 33702737  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
     ||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33702736 tagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattct 33702696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 7 - 345
Target Start/End: Original strand, 33703067 - 33703405
Alignment:
Q  7 atatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacacta 106  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  33703067 atatatatcttgtttgttggaaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacacta 33703166  T
Q  107 acctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgta 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  33703167 acctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaat-ccgttcaggatactatgagttccttgacgtgta 33703265  T
Q  207 ttgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagacta 305  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33703266 ttgcacaaccacaccaagcgtatctcctaatagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaata 33703365  T
Q  306 agagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaatt 345  Q
    | ||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  33703366 atagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaatt 33703405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Original strand, 4054709 - 4055049
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| || || |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  4054709 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctggaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaa 4054808  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  4054809 cctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccgacgaatccccttcaggatactatgagttccttaacgtgtat 4054908  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  4054909 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattaaagaattgatggatgatttagaataa 4055008  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
     ||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4055009 tagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattct 4055049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 414
Target Start/End: Original strand, 20890833 - 20891223
Alignment:
Q  12 taacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacctt 111  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20890833 taacttgattgttgggaagagactgctgcactttaaatctaaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctt 20890932  T
Q  112 taggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattgca 211  Q
    || ||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  20890933 taagtttgattcg-cgccaccaataactgtatattggatgcaatatgaatgactagtgaatccccttca-gatactatgagttccttgatgtgtattaca 20891030  T
Q  212 caaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaagaga 310  Q
    ||| ||||  ||||||||||  |||||||||||||  |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  20891031 caatcacacaaagcgtatctcttaacagtattttatagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagcga 20891130  T
Q  311 atgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattcttgtttctgtgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgaccct 410  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||           ||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20891131 atgagggagaattatgttgtttatgtaacaaagttcgtgt-----------tcaaattgatacccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgaccct 20891219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 10586618 - 10586384
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  10586618 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatgaggttgccacactaa 10586519  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  10586518 cctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtat 10586419  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtat 242  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  10586418 tgcacaaccacgccaagcgtatctcctaacagtat 10586384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 474
Target Start/End: Original strand, 49784281 - 49784746
Alignment:
Q  28 aagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgtcc 127  Q
    |||||| ||||||||||||||||     ||||||||| ||||| ||||||   |||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||    
T  49784281 aagaggttgctgcacttgaaact-----agtttaatgattatgcatgtaac--tcaaagcgcatggggttgtcaaactaacatttaggttcgattcgccc 49784373  T
Q  128 cc-------accaataactctatattggatgcaata-ggaatgaccagagaatccccttcatgatac--tatgagttccttgacatgtattgcacaacca 217  Q
    ||       |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||| |||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  49784374 cccccccccaccaataactgtatattggatgcaataaggaatgactggcgaatccccttcaagatacactatgagttctttgacgtgtattgcacaacca 49784473  T
Q  218 catcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaat-cactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaagagaatgagg 316  Q
     | ||| | ||||| |||||| |||||| | |  ||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||    
T  49784474 taccaaacatatctcctaacaatattttccagatttatggttccagcaattcactcatgaattagagaattgatagatgatttaaagtaaaagaatgagg 49784573  T
Q  317 gagaattatgttgttaatgcaacaaaattct-----------tgtttctgtgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatg 405  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||           ||| |   ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49784574 gggaattatgttgttaatgcaacaaaattctgtccaaaattgtgtgttgttgtatgtccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatg 49784673  T
Q  406 acccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaa 474  Q
    || ||||||    ||||||||||   |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||    
T  49784674 actcttcacatgagagaaaacactcatttgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccatttgccaaa 49784746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 38 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 3187858 - 3187546
Alignment:
Q  38 tgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgtccccaccaataa 137  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||  | ||| | |||||| ||||||  |||||||||| || ||||||||| |||||||||||| | || |||||||    
T  3187858 tgcacttgaaatttgaaaaatttaataataatgcacgtaaaagtcaaagtgtatggggttgtcatactaaccttaaggttcgattcg-ctccgccaataa 3187760  T
Q  138 ctctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattgcacaaccacatcaagcgtatctactaac 237  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| | ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||  |||  ||| ||||||  ||||    
T  3187759 ctatatattggatgcaataggaatgactggcgaatccccttaaggatac-atgagtttcttgatgtgtattgcacaattacacaaagtgtatctcttaac 3187661  T
Q  238 agtattttacgggattatggttcgagcaat-cactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaagagaatgagggagaattatgttgttaatgc 336  Q
    | |||||||| |  |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3187660 aatattttacagatttatggttcgagcaattcactcatgcattaaagaattgatagatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgt 3187561  T
Q  337 aacaaaattcttgtt 351  Q
     ||||||||| ||||    
T  3187560 cacaaaattcgtgtt 3187546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 141 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 18024450 - 18024188
Alignment:
Q  141 tatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagt 240  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||  || |  |||||||||||| |||| |||||||||||  ||||| |    
T  18024450 tatatttgatgcaataggaatgaccagcgaatatccttcaggatactatgagtttttt-atgtgtattgcacaatcacaccaagcgtatctgttaacaat 18024352  T
Q  241 attttacgggattatggttcgagcaat-cactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaac 339  Q
    ||||||| |  |||| |||| | |||| || || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18024351 attttacagatttattgttctaacaattcattcatgcattagagaattgatgaatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaac 18024252  T
Q  340 aaaattcttgtttctgtgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac 414  Q
    |||||  | || ||         |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18024251 aaaat--tagtatc---------caaattgatgaccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgacccttcac 18024188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Original strand, 49784873 - 49784949
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49784873 atgtatatgaatgatttccatgaagagttacaacttttggttttaaagtgattctattattttggaaatcaccaaca 49784949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 480 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 33702478 - 33702400
Alignment:
Q  480 ctatgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33702478 ctatgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 33702400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Original strand, 4050135 - 4050211
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4050135 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 4050211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Original strand, 4055269 - 4055345
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4055269 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 4055345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 5481365 - 5481289
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5481365 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 5481289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 6852829 - 6852753
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6852829 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 6852753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 6857932 - 6857856
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6857932 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 6857856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Original strand, 8465077 - 8465153
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8465077 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 8465153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 10584735 - 10584659
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10584735 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 10584659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 236 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10585066 - 10584954
Alignment:
Q  236 acagtattttacgggattatggttcgagcaat-cactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaagagaatgagggagaattatgttgttaat 334  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||||||||    
T  10585066 acagtattttacagatttatggttctagctattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaggaattatgttgttaat 10584967  T
Q  335 gcaacaaaattct 347  Q
    | |||||||||||    
T  10584966 gtaacaaaattct 10584954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 10672815 - 10672739
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10672815 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 10672739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 10677928 - 10677852
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10677928 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 10677852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 31076277 - 31076201
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31076277 atgtatatgaatggtttccatgaagagtcacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 31076201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 482 - 556
Target Start/End: Original strand, 20891476 - 20891550
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaa 556  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20891476 atgtatatgaatgattctcatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaa 20891550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 485 - 558
Target Start/End: Original strand, 269507 - 269580
Alignment:
Q  485 tatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  269507 tatatgaatggtttccataaagagctacaacttttgattctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 269580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Original strand, 8458639 - 8458715
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8458639 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttagttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 8458715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 482 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 10591172 - 10591100
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcacc 554  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10591172 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcacc 10591100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 31081384 - 31081308
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31081384 atgtatatgaatggttcccatgaagagtcacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 31081308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 485 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 1302118 - 1302045
Alignment:
Q  485 tatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1302118 tatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaattaccaaca 1302045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Original strand, 4049958 - 4050068
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||  ||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  4049958 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 4050057  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  4050058 cttttgccaaa 4050068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 5481542 - 5481432
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||  ||| |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  5481542 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctatttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacc 5481443  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  5481442 cttttgccaaa 5481432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 10584912 - 10584802
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||  ||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  10584912 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 10584813  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  10584812 cttttgccaaa 10584802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 368 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 5458065 - 5457956
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||  ||| |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  5458065 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctatttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacc 5457966  T
Q  464 ccttggccaa 473  Q
    | || |||||    
T  5457965 cttttgccaa 5457956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 724 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 7725722 - 7725652
Alignment:
Q  724 aggatgtatagtatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatttgattaaaa 794  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||    
T  7725722 aggatgtatagtatgagaatgactatcttatatgagaatggtgtgaatgatcatcaaccattagatcaaaa 7725652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 463
Target Start/End: Original strand, 8464900 - 8464999
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||  ||| |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  8464900 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacc 8464999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 1302298 - 1302188
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  1302298 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 1302199  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  1302198 cttttgccaaa 1302188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Original strand, 4055092 - 4055202
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  4055092 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 4055191  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  4055192 cttttgccaaa 4055202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 724 - 785
Target Start/End: Original strand, 7723967 - 7724028
Alignment:
Q  724 aggatgtatagtatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatt 785  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  7723967 aggatgtataatatgagaatgactatcttatatgagaatggtgagaatgatcatcaaccatt 7724028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 10672992 - 10672882
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  10672992 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 10672893  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  10672892 cttttgccaaa 10672882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 33702653 - 33702543
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  33702653 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 33702554  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  33702553 cttttgccaaa 33702543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 502 - 558
Target Start/End: Original strand, 29827829 - 29827885
Alignment:
Q  502 tgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29827829 tgaagagttacaacttttgattctaaagtgattccattcttttggaaatcaccaaca 29827885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 10591349 - 10591249
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  10591349 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 10591250  T
Q  464 c 464  Q
    |    
T  10591249 c 10591249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 6853006 - 6852896
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  | | ||||| |||||||    
T  6853006 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcatcaagcacc 6852907  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  6852906 cttttgccaaa 6852896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 6858109 - 6857999
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  | | ||||| |||||||    
T  6858109 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaatcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcatcaagcacc 6858010  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  6858009 cttttgccaaa 6857999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 31076456 - 31076346
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  31076456 taatgcccaaatgtcaagcatttataatgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 31076357  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  31076356 cttttgccaaa 31076346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 31081561 - 31081451
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  31081561 taatgcccaaatgtcaagcatttataatgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 31081462  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  31081461 cttttgccaaa 31081451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 5457888 - 5457817
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||     |||||||||||||||||||||||||||    
T  5457888 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttgattcta-----attccattattttggaaatcaccaaca 5457817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 507 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 18023965 - 18023914
Alignment:
Q  507 agttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18023965 agttacaacttttggttataaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 18023914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Original strand, 8458461 - 8458572
Alignment:
Q  368 taatgcccaaa-tgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcac 462  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||  ||| |||||||||||||  | | |||||||| |||    
T  8458461 taatgcccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaccac 8458560  T
Q  463 cccttggccaaa 474  Q
    || || ||||||    
T  8458561 ccttttgccaaa 8458572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 414
Target Start/End: Original strand, 33703450 - 33703496
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac 414  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33703450 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcac 33703496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 10678107 - 10677995
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattata--tgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagca 461  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||     ||||| |||| |||| |||||||||||||  | | |||||||||||    
T  10678107 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgtgactcttcacatgaaagaaagcacctttttaacttgaatcaatgccatgattcattaagca 10678008  T
Q  462 ccccttggccaaa 474  Q
    ||| || ||||||    
T  10678007 cccttttgccaaa 10677995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 723 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 9299841 - 9299780
Alignment:
Q  723 gaggatgtatagtatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccat 784  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  9299841 gaggaggtatattatgagaatgagtatcttatatgagaaatgtgagaataattattaaccat 9299780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 512 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 18023368 - 18023324
Alignment:
Q  512 caacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaa 556  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18023368 caactttcaattctaaagtgattccattattttggaaatcaccaa 18023324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 726 - 785
Target Start/End: Original strand, 23773333 - 23773392
Alignment:
Q  726 gatgtatagtatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatt 785  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  23773333 gatgtatcatatgagaatgactatcttatatgaaaatgatgaaaataattaccaaccatt 23773392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 723 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 35653098 - 35653011
Alignment:
Q  723 gaggatgtatagtatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatttgattaaaagtttatggctgagatt 810  Q
    ||||||||||  |||||||||||   | ||||||||||||| |||||||  ||||   ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  35653098 gaggatgtatcatatgagaatgaactttttatatgagaatgatgagaatgcttatttgccattggattaaaattttatggctgagatt 35653011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 735 - 785
Target Start/End: Original strand, 23706903 - 23706953
Alignment:
Q  735 tatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatt 785  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  23706903 tatgagaatgactatcttatatgaaaatgatgaaaataattaccaaccatt 23706953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 735 - 785
Target Start/End: Original strand, 23725359 - 23725409
Alignment:
Q  735 tatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatt 785  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  23725359 tatgagaatgactatcttatatgaaaatgatgaaaataattaccaaccatt 23725409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 735 - 785
Target Start/End: Original strand, 23743815 - 23743865
Alignment:
Q  735 tatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatt 785  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  23743815 tatgagaatgactatcttatatgaaaatgatgaaaataattaccaaccatt 23743865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 727 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 28723113 - 28723055
Alignment:
Q  727 atgtatagtatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatt 785  Q
    ||||||| ||||||||||   || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28723113 atgtatactatgagaatggttattttatatgagaatggtgagaataaaaatcaaccatt 28723055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 724 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 51469746 - 51469676
Alignment:
Q  724 aggatgtatagtatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatttgattaaaa 794  Q
    |||||||||  |||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||    
T  51469746 aggatgtatcttatgagaatgattatcttatgtgagaatggtgaaaatgattatgaaccattagatcaaaa 51469676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 730 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 9173734 - 9173693
Alignment:
Q  730 tatagtatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaat 771  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9173734 tatactatgagaatgacattcttacatgagaatggtgagaat 9173693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 723 - 784
Target Start/End: Original strand, 9299241 - 9299302
Alignment:
Q  723 gaggatgtatagtatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccat 784  Q
    ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||    
T  9299241 gaggatgtatactatgagaatgaatttcttatatgagaaccatgagaataattgtcaaccat 9299302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 736 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 43023345 - 43023296
Alignment:
Q  736 atgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatt 785  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||| |||||    
T  43023345 atgagaatgacaatcttatgtgaaaatgatgagaatacttatcacccatt 43023296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 37)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Original strand, 39903613 - 39903953
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  39903613 tatatatcttgtttgttggaaagaggctgctgcacttgaaacccgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaa 39903712  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  39903713 cctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtat 39903812  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39903813 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataa 39903912  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
     ||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39903913 tagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattct 39903953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Original strand, 39908726 - 39909066
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  39908726 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaa 39908825  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  39908826 cctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtat 39908925  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39908926 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataa 39909025  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
     ||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39909026 tagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattct 39909066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 464
Target Start/End: Original strand, 2022738 - 2023203
Alignment:
Q  15 cttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacctttag 114  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||||||||||    
T  2022738 cttgattgttgtaaagatgctgctgcacttgaaacctgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgcatgaggttgccatactaacctttag 2022837  T
Q  115 gttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaat-aggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattgcaca 213  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2022838 gttccattcgcccccaccaataactgtatatttgatgcaataaggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcaca 2022937  T
Q  214 accacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaagagaat 312  Q
    |||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2022938 accaaaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaat 2023037  T
Q  313 gagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct-----------tgtttctgtgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcatta 401  Q
    |  | |||||||||||||||||| |||||||||||           ||| |   |||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  2023038 ggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaaattatgtgttgttgtgtgtccaactaatgcccatatgtcaagcatttatagtgcatta 2023137  T
Q  402 tatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccc 464  Q
    |||||| ||||||    |||||| ||||  |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  2023138 tatgactcttcacatgagagaaagcacc-ctttgacttgaatcaatgttatgattcattaaacaccc 2023203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9877975 - 9877635
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  9877975 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagtgtatggggttgccacactaa 9877876  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  9877875 cctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtat 9877776  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9877775 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataa 9877676  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
     ||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9877675 tagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattct 9877635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9872860 - 9872520
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  9872860 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagtgtatggggttgccacactaa 9872761  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  9872760 cctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtat 9872661  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9872660 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataa 9872561  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
     |||||   | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9872560 tagaattgtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattct 9872520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 28 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 35369321 - 35368856
Alignment:
Q  28 aagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagc--atatgggg-ttgccacactaacctttaggttcgattcg 124  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35369321 aagagactgctgcacttgaaacctgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgcatatgggggttgccacactaatctttaggttcgattcg 35369222  T
Q  125 tccccaccaataactctatattggatg-----------caataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattgcaca 213  Q
      ||||||||||||| |||||||||||           |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  35369221 cacccaccaataactgtatattggatgtatattggatgcaataggaatgaccagcgaatccccctcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcaca 35369122  T
Q  214 accacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaagagaat 312  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35369121 accacaccaagcgtatctcctaatagtattttacagatttatggttacaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaat 35369022  T
Q  313 gagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattcttgtttctg-----------tgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcatta 401  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||           ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35369021 gaggaagaattatgtttttgatgcaacaaaattcttgtttttgttgtgtgttgttgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcatta 35368922  T
Q  402 tatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||  |||||    ||||||||||   |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  35368921 tatgacttttcacatgagagaaaacactcatttgacttgaatcaatgttatgattcattaaacacc 35368856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13556741 - 13556401
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  13556741 tatatatcttgtttgttgggaagaggttactgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaa 13556642  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  13556641 ccttttggctcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgatcgacgaatcccctttaggatactatgagttccttgacgtgtat 13556542  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13556541 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaaccgtattttacatatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataa 13556442  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13556441 gagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaacaaacttct 13556401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 43378207 - 43378491
Alignment:
Q  10 tataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacc 109  Q
    |||| |||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||     
T  43378207 tatatcttgattgttgggaagaagttgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgcatggggttgtcacactaaca 43378306  T
Q  110 tttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattg 209  Q
    |||||||||||||   |||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  43378307 tttaggttcgatttacccccaccaataattgtatatttgatgcaattggaatgacaagtgaatccccttcaggatattattagttccttgacgtgtattg 43378406  T
Q  210 cacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatgga 293  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||    
T  43378407 cacaatcacattaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactaatgcattaaagaattgatgga 43378491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 333
Target Start/End: Original strand, 25183882 - 25184186
Alignment:
Q  28 aagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatg----gggttgccacactaacctttaggttcgattc 123  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||||| | |||||  |||    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25183882 aagaggcttctgcacttgaaacctgaaatctttaatgattatgcatgtaaaactgaaagcgcatgggccgggttgccacactatcctttaggttcgattc 25183981  T
Q  124 gtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattgcacaaccacatcaa 223  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||    
T  25183982 tcccccaccaataactgtatattggatgcaataggagttaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtttattgcacaaccataccaa 25184081  T
Q  224 gcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaagagaatgagggagaat 322  Q
    |||||||| | |||| ||||||||  |||     ||| ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||     
T  25184082 gcgtatctccaaacaatattttac-agat-----ttctagcaattcactaatacattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatggtgaagaaa 25184175  T
Q  323 tatgttgttaa 333  Q
    |||||||||||    
T  25184176 tatgttgttaa 25184186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 273 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 43540929 - 43540737
Alignment:
Q  273 gtgcattagagaattgatggatgatttagactaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattcttgtttctgtgtgtgt-caaattaat 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||  | ||  ||| | ||| |||||||||    
T  43540929 gtgcattagagaattgatagatgatttagagtaagagaatgatggagaactatgttgttaatgtaacaaaatttctattcatgt-tatgtccaaattaat 43540831  T
Q  372 gcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac--gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||   |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  43540830 gcccagatgccaagtatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaacactcatttgacttgagtcaatgttatggttcattaagcacc 43540737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 407
Target Start/End: Original strand, 4555512 - 4555809
Alignment:
Q  100 cacactaacctttaggttcgattcgtcccc-accaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttcctt 198  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||| || |||| |||| || |||||| ||    
T  4555512 cacactaacttttaggtttgattcgtcccttaccaataactgtatattggatgcaataggaatgaccaacaaattcctttcaagatattacgagttcatt 4555611  T
Q  199 gacatgtattgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaat-cactcgtgcattagagaattgatggatgat 297  Q
    ||  ||||||||| || |||| ||| | ||| |  ||||| |||||||| |  ||||||| | |  ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  4555612 gatgtgtattgcaaaatcacaccaaacatatttcttaacattattttacagatttatggtaccaataattcactcatgcattagagaattaatggatgat 4555711  T
Q  298 ttagactaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattcttgtttctgtgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgc 397  Q
    ||||| ||| ||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||           ||||  |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4555712 ttagagtaatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaatt-----------gtgtc-caaatcgatgcccaaatgtcaagcatttatagtgc 4555799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 432 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 13556231 - 13556105
Alignment:
Q  432 acttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaaaggttctatgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtg 531  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||  || |||||| | | | ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  13556231 acttgaatcaatgcaaatgttcattaagcacctatttgccaaaggttccaatgtatatgaaagattcccatgaagagttacaactcttggttttaaagtg 13556132  T
Q  532 attccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  13556131 attccattattttggaaatcaccaaca 13556105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 726 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 24252400 - 24252291
Alignment:
Q  726 gatgtatagtatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatttgattaaaagtttatggctgagatttaaatgctcacttaa 825  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24252400 gatgtttactatgagaatgactatcttatataagaatggtgaaaatgattatcaaccatttgattaaaagttaatggctgagatttaaatggtcaattaa 24252301  T
Q  826 tatacaacat 835  Q
     |||| ||||    
T  24252300 aataccacat 24252291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 9872301 - 9872225
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9872301 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 9872225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 9877416 - 9877340
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9877416 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 9877340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Original strand, 39904172 - 39904248
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39904172 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcaattattttggaaatcaccaaca 39904248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Original strand, 39909285 - 39909361
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39909285 atgtatatgaatggtttacacgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 39909361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 13556358 - 13556259
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  13556358 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacccatttgacttgaatcaatgctatgattcattaagcacc 13556259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 104
Target Start/End: Original strand, 4553630 - 4553727
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgtt-agaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacac 104  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  4553630 tatatagcttgattgtttagaaaggggctgctacacttgaaatctaaaaagtttaatggttatgcacgtaaaattcaaagcgtatggggttgtcacac 4553727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 9872478 - 9872368
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  9872478 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 9872379  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  9872378 cttttgccaaa 9872368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 9877593 - 9877483
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  9877593 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 9877494  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  9877493 cttttgccaaa 9877483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Original strand, 39909108 - 39909218
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  39909108 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 39909207  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  39909208 cttttgccaaa 39909218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 722 - 794
Target Start/End: Original strand, 36423169 - 36423241
Alignment:
Q  722 tgaggatgtatagtatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatttgattaaaa 794  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  36423169 tgaggatgtatactatgagaatgagtattttatatgagaatgatgagaataattatcaatcatcagattaaaa 36423241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 432 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 43540710 - 43540626
Alignment:
Q  432 acttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaaaggttctatgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaact 516  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||| | | | |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  43540710 acttgaatcaatactaagattcattaagcacccctttgccaaaggttccaatgtatatgaataattaccatgaagagttacaact 43540626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 507 - 558
Target Start/End: Original strand, 4555967 - 4556018
Alignment:
Q  507 agttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4555967 agttacaacttttaattctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 4556018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 384 - 462
Target Start/End: Original strand, 43379554 - 43379631
Alignment:
Q  384 aacatttatagtgcattatatgacccttcacgagaaaacac-cattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcac 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  43379554 aacatttatagtgcattatatgacccttcac-ataaaacactcatttt-acttgaatcaatgttatgattcactaagcac 43379631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 43402200 - 43402092
Alignment:
Q  356 tgtgtgtc-aaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttca----cgagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaagg 450  Q
    |||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||      |||||||| || ||||| | |||||||||||| ||    
T  43402200 tgtgtgtctaaattaatgcctcaatgacaaacatttatagtgcattatatgatccttcatatgaaagaaaacatcaatttgattcgaatcaatgttatgg 43402101  T
Q  451 ttcattaag 459  Q
    |||||||||    
T  43402100 ttcattaag 43402092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 512 - 558
Target Start/End: Original strand, 2024421 - 2024467
Alignment:
Q  512 caacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2024421 caacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 2024467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 368 - 462
Target Start/End: Original strand, 39903995 - 39904093
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcac 462  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  39903995 taatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcac 39904093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 738 - 794
Target Start/End: Original strand, 14394667 - 14394723
Alignment:
Q  738 gagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatttgattaaaa 794  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||    
T  14394667 gagaatgactatcttatatgagaatggtgataataattatcaatcattagataaaaa 14394723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 502 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 43540620 - 43540564
Alignment:
Q  502 tgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43540620 tgaagagttacaacttttggttctaaattgattcaattattttggaaatcaccaaca 43540564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 482 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 24091865 - 24091794
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcac 553  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24091865 atgtatatgaaagattctcataaagagttacaactcttggttctaaagtgattctattattttggaaatcac 24091794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 501 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 35368680 - 35368623
Alignment:
Q  501 atgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  35368680 atgaaaagttacaacttttgattctaaagtgattccattcttttagaaattaccaaca 35368623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 735 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 10143207 - 10143148
Alignment:
Q  735 tatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatttgattaaaa 794  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  10143207 tatgagaatgactatcttatatatgaatgatgggaataattatcaactattagattaaaa 10143148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 36203262 - 36203227
Alignment:
Q  98 gccacactaacctttaggttcgattcgtccccacca 133  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36203262 gccacactaacctttaagttcgattcgtccccacca 36203227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 432 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 35368769 - 35368679
Alignment:
Q  432 acttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaaaggttctatgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgat 522  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| | || |||||| | | | ||||||||||| ||||  ||| ||||||| ||||| |||||    
T  35368769 acttaaatcaatgctaaggttcattaagcactcatttgccaaaggttccaatgtatatgaaagattctcataaagagttacaactcttgat 35368679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 735 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 7120957 - 7120908
Alignment:
Q  735 tatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccat 784  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  7120957 tatgagaatgactattttatatgaaaatggtgagaatgatcatcaaccat 7120908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 205; Significance: 1e-111; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14917818 - 14917478
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  14917818 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaa 14917719  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  14917718 cctttaggttcgattcgcctccaccaataaatgtatattggatgcaatagaaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtat 14917619  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14917618 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataa 14917519  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
     ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14917518 tagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattct 14917478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17720962 - 17720622
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  17720962 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacattaa 17720863  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  17720862 cctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtat 17720763  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaa 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17720762 tgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataa 17720663  T
Q  307 gagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
     ||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17720662 tagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattct 17720622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 10 - 460
Target Start/End: Original strand, 42779953 - 42780419
Alignment:
Q  10 tataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacc 109  Q
    |||| |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42779953 tatatcttgtttgttgggaagatgctgctgcacttgaaacctgaaaagtttaatgattatgcatgtaaaactcaaagcatatggggttaccacactaacc 42780052  T
Q  110 tttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaat-aggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtatt 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  42780053 tttaggttcgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaataacgaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtatt 42780152  T
Q  209 gcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaag 307  Q
    ||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||    ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42780153 gcacaaccacaccaaatgtatctcctaacagtattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaag 42780252  T
Q  308 agaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct-----------tgtttctgtgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtg 396  Q
    ||||||  | |||||||||| | ||||| |||||||||||           ||| |   |||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  42780253 agaatggtgaagaattatgtag-taatgtaacaaaattctgtccaaaattgtgtgttgttgtgtgtccaactaatgcccaactgtcaatcatttatagtg 42780351  T
Q  397 cattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagc 460  Q
    ||||||||||| ||||||    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42780352 cattatatgactcttcacatgagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatggttcattaagc 42780419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 28 - 347
Target Start/End: Original strand, 45120174 - 45120494
Alignment:
Q  28 aagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgtcc 127  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  45120174 aagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgactcgccc 45120273  T
Q  128 ccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattgcacaaccacatcaagcgt 227  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  45120274 ccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgt 45120373  T
Q  228 atctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaagagaatgagggagaattatg 326  Q
    |||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||    
T  45120374 atctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattggagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatg 45120473  T
Q  327 ttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  45120474 ttgttaatgtaacaaaattct 45120494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 360
Target Start/End: Original strand, 16284209 - 16284559
Alignment:
Q  13 aacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaaccttt 112  Q
    ||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||| | |||    
T  16284209 aacttaattgttgggaagatgctgctgcacttgaaacctgaaaagtttaatgattatgcatgtaaaactcaaagcgcatggggttgccacactacctttt 16284308  T
Q  113 aggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatcccc-ttcatgatactatgagttccttgacatgtattgca 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  16284309 aggttcgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaataggaatgaccagcgaatcccctttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgta 16284408  T
Q  212 caaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatga-tttagactaagag 309  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| |  ||||||||  ||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||    
T  16284409 caaccacaccaagcgtatctcctaatggtattttactgatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagagttgatgaatgattttagagtaagag 16284508  T
Q  310 aatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattcttgtttctgtgtgt 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16284509 aatgagggagaattatattgttaatgcaacaaaattcttgtttctgtgtgt 16284559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 76 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 30283809 - 30283394
Alignment:
Q  76 aaaattcaaagcatatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccc 175  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  30283809 aaaactcaaagcgtatgtggttgccacactaacctttaagttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccc 30283710  T
Q  176 cttcatgatactatgagttccttgacatgtattgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgt 274  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| |    
T  30283709 cttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaatagtattttacagatttatggttctagcaattcactcat 30283610  T
Q  275 gcattagagaattgatggatgatttagactaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct----------tgttt--ctgtgtgtgt 362  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||          |||||   ||||||| |    
T  30283609 gcattagagaattgattgatgatttagagtaagagaaggatggagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtttagttgtgtgttt 30283510  T
Q  363 caaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaa 458  Q
      || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||     ||||||||||  ||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  30283509 tcaactaatgcccaaatgccaaacatttatagtgcattatatgactcttcacatgaaagaaaacacccctttaacttgaatcaatattatggttcattaa 30283410  T
Q  459 gcaccccttggccaaa 474  Q
    |||||| || ||||||    
T  30283409 gcacccttttgccaaa 30283394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 39196308 - 39196121
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  39196308 tatatatcttgtttgttgggaagaggatgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaa 39196209  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttc 195  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  39196208 cctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttc 39196121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 203 - 463
Target Start/End: Original strand, 716230 - 716503
Alignment:
Q  203 tgtattgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaat-cactcgtgcattagagaattgatggatgatttag 301  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| |  ||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  716230 tgtattgtacaaccacaccaaacgtatctcctaactgtattttacagatttagggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttag 716329  T
Q  302 actaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattcttgtttctg--------tgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttata 393  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||        |||  |||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  716330 agtaagagaatgaaggagaattatgttgttaaagaagcaaaattcttgtttatgttttctgttgtcagtcacactaatgcccaaatgccaaacatttata 716429  T
Q  394 gtgcattatatgacccttca----cgagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||| ||||     ||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  716430 gtgcattatatgacctttcatatgagagaaaacatccctttgacttgaatcaatgttacggtccattaaacacc 716503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 726 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 39738912 - 39738813
Alignment:
Q  726 gatgtatagtatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatttgattaaaagtttatggctgagatttaaatgctcacttaa 825  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  39738912 gatgtatagtatgagaatgactatcttatatgagtatggtgagaataatcatcaaccatttaattaaaagctaatggttgagatttaaatgctcaattaa 39738813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 482 - 559
Target Start/End: Original strand, 45120714 - 45120791
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaacac 559  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45120714 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttaattctaaagtgattccattattttggaaatcaccaacac 45120791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 14917259 - 14917183
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14917259 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 14917183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Original strand, 716131 - 716229
Alignment:
Q  10 tataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaac 108  Q
    |||| |||||||||| | |||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  716131 tatatcttgattgttgggaagatgttgttgcacttgaaacctgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgcatggggttgccacactaac 716229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 17720076 - 17720000
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17720076 atgtatatgaatagttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 17720000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 17720403 - 17720327
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17720403 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaagtgattctattattttggaaatcaccaaca 17720327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Original strand, 39178926 - 39179002
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39178926 atgtatatgaatggttcccatgaagagttacaacttttagttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 39179002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Original strand, 45120537 - 45120647
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||  ||| |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  45120537 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacc 45120636  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  45120637 cttttgccaaa 45120647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 30283327 - 30283251
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30283327 atgtacatgaatggttcccatgaagagttacaacttttggttctaaaatgattccattattttggaaatcaccaaca 30283251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 14917436 - 14917326
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||| |  ||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  14917436 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacagctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 14917337  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  14917336 cttttgccaaa 14917326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 17720580 - 17720470
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||  ||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  17720580 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 17720481  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  17720480 cttttgccaaa 17720470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 362 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 20892409 - 20892305
Alignment:
Q  362 tcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcatta 457  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||   ||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  20892409 tcaaactaatgcccaaatgtcaagtatttatagtgcattatatgactcttcacacgagagaaaacactcatttgatttgaatcaatgtt-tggttcatta 20892311  T
Q  458 agcacc 463  Q
    ||||||    
T  20892310 agcacc 20892305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 432 - 520
Target Start/End: Original strand, 42780450 - 42780538
Alignment:
Q  432 acttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaaaggttctatgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttg 520  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  || || ||||| | | ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||    
T  42780450 acttgaatcaatgttatggttcattaagcacctatttgctaaaagttccaatgtatatgaaagattctcatgaagagttacaacttttg 42780538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 512 - 558
Target Start/End: Original strand, 42780550 - 42780596
Alignment:
Q  512 caacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42780550 caacttttggttctaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 42780596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 724 - 763
Target Start/End: Original strand, 43992336 - 43992375
Alignment:
Q  724 aggatgtatagtatgagaatgacaatcttatatgagaatg 763  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  43992336 aggatgtatattgtgagaatgacaatcttatatgagaatg 43992375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 512 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 20892144 - 20892110
Alignment:
Q  512 caacttttgattttaaagtgattccattattttgg 546  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20892144 caacttttggttttaaagtgattccattattttgg 20892110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223 (Bit Score: 137; Significance: 5e-71; HSPs: 4)
Name: scaffold0223
Description:

Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 128 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 2335 - 2115
Alignment:
Q  128 ccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattgcacaaccacatcaagcgt 227  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  2335 ccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgt 2236  T
Q  228 atctactaacagtattttacgggattatggttcgagcaa-tcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagactaagagaatgagggagaattatg 326  Q
    |||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||    
T  2235 atctcctaacagtattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatg 2136  T
Q  327 ttgttaatgcaacaaaattct 347  Q
    ||||||||| || ||||||||    
T  2135 ttgttaatgtaataaaattct 2115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 7413 - 7246
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||  |  ||  ||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  7413 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaatctttaatttttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaa 7314  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccc 175  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  7313 cctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccc 7246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 2073 - 1963
Alignment:
Q  368 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 463  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||  ||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  2073 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacc 1974  T
Q  464 ccttggccaaa 474  Q
    | || ||||||    
T  1973 cttttgccaaa 1963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 482 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 1896 - 1820
Alignment:
Q  482 atgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaaca 558  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1896 atgtatatgaatggttcccatgaagagatacaacttttggttctaaagtgattccattattttgaaaatcaccaaca 1820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 126; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 16375 - 16568
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16375 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaa 16474  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgac 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16475 cctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgac 16568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 94
Target Start/End: Original strand, 16280 - 16366
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggg 94  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  16280 tatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggg 16366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 118; Significance: 1e-59; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 229
Target Start/End: Original strand, 170586 - 170807
Alignment:
Q  8 tatataacttgattgttagaaagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacactaa 107  Q
    |||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  |||||||| ||||||| |    
T  170586 tatatatcttgattgttaggatgaagctgctgcacttgaaatctgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaacttaaagctcatggggtttccacactga 170685  T
Q  108 cctttaggttcgattcgtccccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatgtat 207  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||| |  |||||    
T  170686 cctttaggttcgatttgcccccactaataactgtatattggatgcaataggaatgacccgcgaatcccctttaggatactatgagttccttaatgtgtat 170785  T
Q  208 tgcacaaccacatcaagcgtat 229  Q
    |||| ||||||| |||||||||    
T  170786 tgcagaaccacaccaagcgtat 170807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 276 - 467
Target Start/End: Original strand, 173395 - 173596
Alignment:
Q  276 cattagagaattgatggatgatttagactaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattcttgtttctgt------gtgtgtcaaatta 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||       | ||| ||||||    
T  173395 cattagagaattgatggatgatttagagtaagagaattaggaagaattatgttgttgatgtaacaaaattcttttttctgtattttgttatgttaaatta 173494  T
Q  370 atgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcac----gagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacccc 465  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||     ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||    
T  173495 atgcacaaatatcaaacatttatagcgcattatatgacccttcacatgatagaaaacacccatttgacttgaatcaatgctaaggttcattaaacactcc 173594  T
Q  466 tt 467  Q
    ||    
T  173595 tt 173596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 432 - 516
Target Start/End: Original strand, 173620 - 173704
Alignment:
Q  432 acttgaatcaatgttaaggttcattaagcaccccttggccaaaaggttctatgtatatgaatgatttccatgaagagttgcaact 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | | | |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  173620 acttgaatcaatgttaaggttcattaagcacccttttgccaaaggttccaatgtatatgaatgattcccatgaatagttacaact 173704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 502 - 564
Target Start/End: Original strand, 173710 - 173772
Alignment:
Q  502 tgaagagttgcaacttttgattttaaagtgattccattattttggaaatcaccaacacaaggt 564  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  173710 tgaagagttacaacttttggttctaaagtgattcaattattttgtaaatcaccaacacaaggt 173772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0756 (Bit Score: 51; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0756
Description:

Target: scaffold0756; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 106
Target Start/End: Original strand, 3933 - 4011
Alignment:
Q  28 aagaggctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcatatggggttgccacacta 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3933 aagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacacta 4011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 724 - 814
Target Start/End: Original strand, 2759 - 2849
Alignment:
Q  724 aggatgtatagtatgagaatgacaatcttatatgagaatggtgagaataattatcaaccatttgattaaaagtttatggctgagatttaaa 814  Q
    |||||||||  |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||| |  ||||| ||||||||||    
T  2759 aggatgtattttatgagaatgattatcttatgtgagaatggtgagaatgattatgaaccattagatcaaaaatggatggccgagatttaaa 2849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University