View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5627-Insertion-3 (Length: 806)

Name: NF5627-Insertion-3
Description: NF5627
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5627-Insertion-3
NF5627-Insertion-3
[»] chr5 (104 HSPs)
chr5 (53-806)||(14520097-14520855)
chr5 (63-806)||(11916453-11917204)
chr5 (62-763)||(12083658-12084363)
chr5 (54-806)||(9352807-9353559)
chr5 (188-802)||(36931956-36932574)
chr5 (188-806)||(15464401-15465012)
chr5 (311-806)||(17003689-17004188)
chr5 (147-806)||(38219266-38219937)
chr5 (188-806)||(11181437-11182063)
chr5 (372-806)||(19588614-19589051)
chr5 (355-806)||(28832128-28832580)
chr5 (355-664)||(10281765-10282078)
chr5 (189-656)||(35387684-35388164)
chr5 (311-745)||(31300325-31300764)
chr5 (53-656)||(24135870-24136485)
chr5 (370-745)||(3880229-3880610)
chr5 (101-449)||(13487828-13488174)
chr5 (119-449)||(42426432-42426762)
chr5 (135-449)||(32636481-32636795)
chr5 (155-447)||(13239430-13239721)
chr5 (437-806)||(42127266-42127638)
chr5 (358-501)||(24553304-24553448)
chr5 (488-806)||(38192041-38192365)
chr5 (125-401)||(37438793-37439072)
chr5 (117-309)||(16650958-16651151)
chr5 (101-449)||(42428627-42428963)
chr5 (216-366)||(19806144-19806294)
chr5 (357-479)||(42127146-42127268)
chr5 (247-449)||(533538-533740)
chr5 (276-449)||(28750852-28751025)
chr5 (334-664)||(7160656-7160986)
chr5 (219-447)||(25412503-25412731)
chr5 (54-447)||(26177466-26177860)
chr5 (219-447)||(36074243-36074471)
chr5 (580-806)||(24553506-24553735)
chr5 (219-447)||(13342802-13343030)
chr5 (163-447)||(30683119-30683390)
chr5 (219-447)||(30182329-30182558)
chr5 (361-656)||(31180236-31180537)
chr5 (124-296)||(5057478-5057650)
chr5 (54-447)||(18441839-18442233)
chr5 (119-295)||(31004691-31004868)
chr5 (361-656)||(30631428-30631730)
chr5 (119-254)||(40146691-40146825)
chr5 (370-745)||(33030728-33031110)
chr5 (226-404)||(16649863-16650043)
chr5 (147-447)||(26170450-26170751)
chr5 (188-296)||(27015025-27015133)
chr5 (533-741)||(6741784-6741997)
chr5 (54-447)||(9789415-9789809)
chr5 (54-271)||(16407641-16407859)
chr5 (119-201)||(212986-213068)
chr5 (582-656)||(15044708-15044781)
chr5 (54-271)||(16409077-16409295)
chr5 (581-656)||(43592301-43592375)
chr5 (581-656)||(43598746-43598820)
chr5 (581-656)||(43604238-43604312)
chr5 (581-656)||(43609730-43609804)
chr5 (279-353)||(535685-535758)
chr5 (333-446)||(39468749-39468862)
chr5 (372-441)||(3075863-3075931)
chr5 (581-656)||(31401838-31401913)
chr5 (581-656)||(1457151-1457225)
chr5 (581-656)||(27449836-27449910)
chr5 (581-647)||(27445001-27445066)
chr5 (62-199)||(27450265-27450402)
chr5 (150-200)||(28751027-28751077)
chr5 (62-199)||(30631804-30631941)
chr5 (272-449)||(42926687-42926864)
chr5 (218-271)||(535643-535696)
chr5 (593-666)||(2630243-2630316)
chr5 (372-449)||(5887613-5887689)
chr5 (583-656)||(37556613-37556685)
chr5 (583-656)||(37561435-37561507)
chr5 (581-656)||(2785397-2785472)
chr5 (316-447)||(16409321-16409452)
chr5 (54-271)||(29719965-29720184)
chr5 (62-114)||(31180771-31180823)
chr5 (581-656)||(31396981-31397056)
chr5 (226-266)||(38746535-38746575)
chr5 (62-114)||(43592795-43592847)
chr5 (355-449)||(537902-537996)
chr5 (54-109)||(15465070-15465125)
chr5 (62-112)||(1456645-1456695)
chr5 (610-664)||(4410237-4410291)
chr5 (62-199)||(27445422-27445559)
chr5 (62-112)||(29402557-29402607)
chr5 (216-266)||(39468912-39468962)
chr5 (62-112)||(43599261-43599311)
chr5 (62-112)||(43604753-43604803)
chr5 (62-112)||(43610245-43610295)
chr5 (553-656)||(28807533-28807635)
chr5 (414-449)||(19806320-19806355)
chr5 (162-201)||(30683269-30683308)
chr5 (372-425)||(5007446-5007497)
chr5 (610-664)||(15552460-15552514)
chr5 (725-805)||(24135718-24135796)
chr5 (610-664)||(31179381-31179435)
chr5 (610-664)||(31542949-31543003)
chr5 (610-664)||(31545295-31545349)
chr5 (63-129)||(37560955-37561021)
chr5 (149-198)||(28807170-28807219)
chr5 (725-806)||(35387532-35387611)
chr5 (63-112)||(37556133-37556182)
[»] chr2 (86 HSPs)
chr2 (51-806)||(23077941-23078701)
chr2 (62-806)||(10706733-10707482)
chr2 (147-800)||(28258743-28259400)
chr2 (44-806)||(33528087-33528850)
chr2 (149-806)||(34388727-34389380)
chr2 (61-806)||(20522088-20522839)
chr2 (62-806)||(21629818-21630561)
chr2 (62-806)||(13569196-13569946)
chr2 (62-806)||(8389631-8390382)
chr2 (282-806)||(36757463-36757990)
chr2 (134-806)||(33118004-33118680)
chr2 (101-806)||(14698529-14699227)
chr2 (53-806)||(3491621-3492378)
chr2 (293-806)||(17865071-17865589)
chr2 (54-656)||(40738865-40739457)
chr2 (374-789)||(39482815-39483237)
chr2 (355-806)||(31055910-31056369)
chr2 (355-806)||(8039928-8040390)
chr2 (355-806)||(34682104-34682563)
chr2 (62-319)||(39483235-39483493)
chr2 (482-806)||(42039570-42039898)
chr2 (518-806)||(10445379-10445674)
chr2 (63-467)||(25409842-25410257)
chr2 (62-656)||(9295869-9296476)
chr2 (62-656)||(11098394-11099002)
chr2 (62-656)||(14291510-14292118)
chr2 (86-266)||(17865590-17865770)
chr2 (292-657)||(40014946-40015311)
chr2 (150-396)||(2837093-2837339)
chr2 (149-447)||(36988274-36988572)
chr2 (370-770)||(2869481-2869888)
chr2 (465-806)||(25398363-25398710)
chr2 (465-806)||(25403501-25403848)
chr2 (142-449)||(36318206-36318513)
chr2 (117-449)||(39284536-39284856)
chr2 (465-647)||(25407653-25407837)
chr2 (355-492)||(10445241-10445379)
chr2 (219-447)||(2334616-2334844)
chr2 (334-666)||(15903642-15903974)
chr2 (219-447)||(5723453-5723681)
chr2 (370-664)||(2837816-2838113)
chr2 (54-441)||(30832921-30833309)
chr2 (149-449)||(29867551-29867840)
chr2 (163-447)||(45099440-45099724)
chr2 (580-806)||(16940207-16940438)
chr2 (580-806)||(17010872-17011103)
chr2 (119-296)||(35447451-35447627)
chr2 (282-446)||(38312045-38312208)
chr2 (71-447)||(4484529-4484906)
chr2 (370-470)||(1344333-1344435)
chr2 (248-441)||(6595211-6595404)
chr2 (219-447)||(4503331-4503559)
chr2 (370-477)||(35397710-35397817)
chr2 (54-447)||(32289148-32289542)
chr2 (219-447)||(36205862-36206092)
chr2 (292-449)||(17057566-17057722)
chr2 (292-449)||(17085549-17085705)
chr2 (538-664)||(27149251-27149377)
chr2 (355-441)||(42269606-42269695)
chr2 (147-336)||(6266367-6266557)
chr2 (124-201)||(17863839-17863916)
chr2 (380-459)||(41586349-41586429)
chr2 (581-656)||(44312613-44312687)
chr2 (582-656)||(32246810-32246883)
chr2 (582-656)||(39811978-39812051)
chr2 (119-201)||(45726448-45726530)
chr2 (372-449)||(11151788-11151864)
chr2 (372-449)||(11690396-11690472)
chr2 (372-449)||(42362247-42362323)
chr2 (372-461)||(3278217-3278307)
chr2 (372-449)||(33162647-33162723)
chr2 (372-449)||(34139968-34140044)
chr2 (580-664)||(1345538-1345624)
chr2 (62-112)||(32247295-32247345)
chr2 (62-112)||(39811484-39811534)
chr2 (62-112)||(44310478-44310528)
chr2 (372-449)||(14202604-14202680)
chr2 (149-201)||(6595439-6595491)
chr2 (581-656)||(19344443-19344518)
chr2 (581-656)||(19349301-19349376)
chr2 (56-112)||(36757419-36757475)
chr2 (53-112)||(28258668-28258727)
chr2 (414-449)||(36773498-36773533)
chr2 (610-664)||(35215596-35215650)
chr2 (610-664)||(35217973-35218027)
chr2 (216-270)||(40015315-40015369)
[»] chr1 (99 HSPs)
chr1 (51-806)||(3281576-3282334)
chr1 (54-806)||(37069636-37070392)
chr1 (76-806)||(29651678-29652417)
chr1 (186-806)||(21536175-21536798)
chr1 (54-806)||(26644373-26645126)
chr1 (61-806)||(13598264-13599018)
chr1 (147-806)||(13604188-13604852)
chr1 (54-806)||(19360912-19361664)
chr1 (355-806)||(47703706-47704166)
chr1 (282-806)||(19358533-19359074)
chr1 (311-806)||(32889307-32889805)
chr1 (54-574)||(19365768-19366300)
chr1 (311-806)||(47098555-47099052)
chr1 (407-806)||(16124340-16124746)
chr1 (355-806)||(19072794-19073254)
chr1 (355-806)||(19120684-19121144)
chr1 (355-735)||(9476200-9476585)
chr1 (311-806)||(47102569-47103069)
chr1 (355-805)||(24202539-24202995)
chr1 (428-806)||(19379917-19380304)
chr1 (150-404)||(49918022-49918276)
chr1 (355-609)||(40816587-40816842)
chr1 (117-449)||(28220423-28220756)
chr1 (89-449)||(31658850-31659209)
chr1 (150-449)||(10924896-10925194)
chr1 (117-449)||(28223618-28223951)
chr1 (89-449)||(44454771-44455131)
chr1 (216-662)||(22819444-22819893)
chr1 (163-447)||(3206671-3206956)
chr1 (311-501)||(27104131-27104322)
chr1 (535-806)||(27104333-27104597)
chr1 (163-449)||(1833207-1833493)
chr1 (150-441)||(3156540-3156829)
chr1 (218-449)||(30476645-30476876)
chr1 (163-447)||(20762357-20762641)
chr1 (593-806)||(775540-775757)
chr1 (330-479)||(9022655-9022804)
chr1 (119-449)||(4552834-4553175)
chr1 (219-447)||(13316517-13316745)
chr1 (361-656)||(24787137-24787439)
chr1 (167-249)||(16124245-16124327)
chr1 (89-277)||(37033656-37033844)
chr1 (277-449)||(37503751-37503922)
chr1 (300-447)||(3189154-3189300)
chr1 (300-447)||(3197971-3198117)
chr1 (135-296)||(193052-193213)
chr1 (52-271)||(51764988-51765208)
chr1 (150-261)||(37879494-37879604)
chr1 (150-271)||(11348174-11348294)
chr1 (219-449)||(46064659-46064889)
chr1 (54-336)||(9986785-9987068)
chr1 (372-449)||(41360807-41360886)
chr1 (712-806)||(40816867-40816962)
chr1 (61-131)||(16124187-16124257)
chr1 (53-131)||(21536111-21536189)
chr1 (189-271)||(29135762-29135843)
chr1 (372-449)||(834364-834440)
chr1 (163-266)||(3189036-3189140)
chr1 (163-266)||(3197853-3197957)
chr1 (188-277)||(13547676-13547763)
chr1 (188-277)||(13549587-13549674)
chr1 (370-434)||(17345350-17345414)
chr1 (303-441)||(37560074-37560211)
chr1 (582-656)||(25445079-25445152)
chr1 (582-656)||(41390603-41390676)
chr1 (582-656)||(41398258-41398331)
chr1 (372-449)||(197105-197181)
chr1 (372-449)||(13138171-13138247)
chr1 (61-198)||(25439405-25439542)
chr1 (151-336)||(40282055-40282242)
chr1 (372-449)||(3847318-3847394)
chr1 (62-336)||(21053547-21053823)
chr1 (372-449)||(23555462-23555538)
chr1 (61-198)||(25444598-25444735)
chr1 (63-112)||(41398764-41398813)
chr1 (372-449)||(45644552-45644628)
chr1 (60-112)||(39446025-39446077)
chr1 (581-656)||(43988452-43988527)
chr1 (60-112)||(44023382-44023434)
chr1 (536-666)||(9023794-9023924)
chr1 (54-180)||(24202251-24202377)
chr1 (62-113)||(24793673-24793724)
chr1 (582-656)||(39445522-39445594)
chr1 (582-656)||(44023864-44023936)
chr1 (216-277)||(16455384-16455445)
chr1 (63-112)||(41391128-41391177)
chr1 (60-112)||(1054519-1054571)
chr1 (54-209)||(20622666-20622821)
chr1 (226-257)||(15820055-15820086)
chr1 (101-180)||(30476892-30476971)
chr1 (414-449)||(50167372-50167407)
chr1 (582-656)||(1055002-1055074)
chr1 (605-651)||(9314667-9314713)
chr1 (610-664)||(9459429-9459483)
chr1 (610-664)||(9463256-9463310)
chr1 (610-664)||(16226382-16226436)
chr1 (610-664)||(16231778-16231832)
chr1 (690-751)||(17345631-17345693)
chr1 (672-770)||(50521199-50521298)
[»] chr4 (111 HSPs)
chr4 (62-806)||(3777418-3778165)
chr4 (54-806)||(5396164-5396903)
chr4 (62-719)||(16622774-16623435)
chr4 (53-732)||(36314702-36315384)
chr4 (53-732)||(36328911-36329593)
chr4 (164-790)||(8689079-8689696)
chr4 (134-806)||(5268751-5269423)
chr4 (62-806)||(10047247-10047982)
chr4 (52-806)||(38151908-38152669)
chr4 (53-806)||(5147545-5148303)
chr4 (147-806)||(5143127-5143793)
chr4 (54-745)||(6742888-6743583)
chr4 (87-806)||(25861538-25862251)
chr4 (52-806)||(54867050-54867805)
chr4 (62-549)||(16628353-16628839)
chr4 (188-806)||(31985240-31985861)
chr4 (311-806)||(42599305-42599806)
chr4 (355-806)||(24333679-24334137)
chr4 (316-806)||(28468261-28468755)
chr4 (150-447)||(37740299-37740595)
chr4 (309-664)||(39774032-39774388)
chr4 (123-447)||(9927656-9927983)
chr4 (62-656)||(24741962-24742570)
chr4 (544-803)||(16630642-16630906)
chr4 (165-449)||(34570611-34570894)
chr4 (142-449)||(5429345-5429650)
chr4 (343-664)||(5112251-5112573)
chr4 (533-806)||(3796470-3796750)
chr4 (357-656)||(29760663-29760969)
chr4 (54-447)||(13992484-13992879)
chr4 (150-449)||(26175833-26176119)
chr4 (580-806)||(39245861-39246093)
chr4 (188-441)||(54200111-54200363)
chr4 (149-449)||(52095559-52095857)
chr4 (369-664)||(1983088-1983383)
chr4 (219-449)||(52082854-52083084)
chr4 (206-441)||(29254222-29254457)
chr4 (247-441)||(12739755-12739949)
chr4 (247-441)||(12747961-12748155)
chr4 (119-449)||(12745633-12745942)
chr4 (135-261)||(54882480-54882605)
chr4 (219-404)||(52093905-52094091)
chr4 (315-653)||(18377384-18377716)
chr4 (89-296)||(6655349-6655557)
chr4 (355-493)||(3793851-3793993)
chr4 (162-296)||(27417518-27417652)
chr4 (162-282)||(41639032-41639151)
chr4 (247-449)||(48142810-48143013)
chr4 (247-447)||(56178835-56179035)
chr4 (370-449)||(6542378-6542457)
chr4 (163-277)||(50674433-50674546)
chr4 (121-296)||(26363691-26363866)
chr4 (239-447)||(30000004-30000212)
chr4 (355-449)||(51336940-51337035)
chr4 (163-296)||(40630452-40630585)
chr4 (163-367)||(35661907-35662098)
chr4 (54-367)||(31495589-31495902)
chr4 (247-441)||(5370291-5370486)
chr4 (711-806)||(16624143-16624238)
chr4 (54-295)||(28467977-28468219)
chr4 (152-271)||(46570119-46570237)
chr4 (370-449)||(48893839-48893920)
chr4 (140-300)||(3909760-3909919)
chr4 (370-449)||(4587849-4587929)
chr4 (581-745)||(34495822-34495990)
chr4 (372-479)||(37782062-37782170)
chr4 (177-296)||(50263265-50263383)
chr4 (581-656)||(51520479-51520553)
chr4 (581-656)||(56146700-56146774)
chr4 (582-656)||(3814046-3814119)
chr4 (582-656)||(5732687-5732760)
chr4 (372-434)||(6677362-6677424)
chr4 (163-277)||(36994246-36994359)
chr4 (216-449)||(24968848-24969083)
chr4 (593-656)||(9224408-9224470)
chr4 (593-656)||(9229195-9229257)
chr4 (54-112)||(5143809-5143867)
chr4 (62-199)||(9223906-9224043)
chr4 (62-199)||(9228693-9228830)
chr4 (582-656)||(45347807-45347880)
chr4 (582-656)||(45357286-45357359)
chr4 (333-449)||(52467551-52467668)
chr4 (150-202)||(2209175-2209227)
chr4 (56-112)||(8689038-8689094)
chr4 (60-112)||(18856252-18856304)
chr4 (60-112)||(18860464-18860516)
chr4 (62-112)||(3814548-3814598)
chr4 (62-112)||(5733190-5733240)
chr4 (582-656)||(18855749-18855821)
chr4 (62-112)||(51520993-51521043)
chr4 (62-112)||(56141518-56141568)
chr4 (372-449)||(5871715-5871791)
chr4 (62-118)||(9194158-9194215)
chr4 (372-449)||(13009628-13009704)
chr4 (59-112)||(45347321-45347374)
chr4 (117-201)||(12739983-12740066)
chr4 (117-201)||(12748189-12748272)
chr4 (53-109)||(31985126-31985182)
chr4 (226-266)||(39773982-39774022)
chr4 (66-113)||(29761181-29761228)
chr4 (414-449)||(45687380-45687415)
chr4 (163-201)||(5370520-5370558)
chr4 (610-664)||(16931799-16931853)
chr4 (610-664)||(16934153-16934207)
chr4 (610-664)||(22780383-22780437)
chr4 (610-664)||(22782748-22782802)
chr4 (328-449)||(36994375-36994495)
chr4 (610-664)||(44599848-44599902)
chr4 (163-201)||(56179069-56179107)
chr4 (51-112)||(5268688-5268749)
chr4 (164-201)||(39494682-39494719)
[»] chr3 (121 HSPs)
chr3 (119-806)||(16264217-16264908)
chr3 (101-802)||(8369998-8370702)
chr3 (62-806)||(36028973-36029709)
chr3 (86-804)||(35925352-35926083)
chr3 (62-803)||(48438085-48438832)
chr3 (61-806)||(40592251-40593002)
chr3 (53-743)||(21711154-21711827)
chr3 (62-806)||(30709266-30710010)
chr3 (147-806)||(27974507-27975168)
chr3 (54-806)||(33386137-33386885)
chr3 (54-594)||(39032017-39032555)
chr3 (86-686)||(47923397-47924006)
chr3 (115-706)||(1735828-1736423)
chr3 (149-806)||(32143191-32143852)
chr3 (53-459)||(27026925-27027332)
chr3 (54-664)||(27452972-27453581)
chr3 (216-806)||(24694789-24695382)
chr3 (53-459)||(27038270-27038667)
chr3 (87-806)||(40844520-40845246)
chr3 (147-806)||(27986031-27986663)
chr3 (311-806)||(6794434-6794931)
chr3 (92-622)||(8126686-8127217)
chr3 (282-656)||(26928290-26928666)
chr3 (71-449)||(40734091-40734469)
chr3 (53-480)||(37725873-37726300)
chr3 (54-806)||(1305819-1306604)
chr3 (355-806)||(26298850-26299311)
chr3 (355-806)||(3715762-3716221)
chr3 (355-745)||(25795709-25796106)
chr3 (423-745)||(18552716-18553041)
chr3 (355-792)||(3328120-3328561)
chr3 (355-745)||(37466220-37466618)
chr3 (355-806)||(1417254-1417708)
chr3 (120-441)||(29812705-29813026)
chr3 (355-657)||(3323454-3323756)
chr3 (71-307)||(40735022-40735259)
chr3 (220-479)||(25929023-25929282)
chr3 (62-656)||(40372263-40372870)
chr3 (358-595)||(47649653-47649893)
chr3 (355-656)||(2671353-2671661)
chr3 (89-449)||(5236653-5237013)
chr3 (62-656)||(8477384-8477995)
chr3 (594-806)||(39039995-39040210)
chr3 (54-441)||(37408036-37408422)
chr3 (355-656)||(9091068-9091376)
chr3 (142-446)||(23410529-23410833)
chr3 (355-656)||(8738830-8739138)
chr3 (119-449)||(29810509-29810839)
chr3 (62-656)||(7167266-7167875)
chr3 (54-447)||(23198136-23198530)
chr3 (121-271)||(46173160-46173308)
chr3 (119-358)||(44331735-44331974)
chr3 (163-447)||(45094849-45095134)
chr3 (163-447)||(7761950-7762235)
chr3 (54-447)||(23200335-23200729)
chr3 (140-395)||(44331232-44331473)
chr3 (119-447)||(51398467-51398783)
chr3 (124-277)||(54593133-54593285)
chr3 (101-296)||(4569357-4569552)
chr3 (119-271)||(31340635-31340787)
chr3 (219-447)||(5260522-5260750)
chr3 (370-461)||(4386755-4386846)
chr3 (163-447)||(5258343-5258627)
chr3 (124-277)||(55302552-55302703)
chr3 (89-261)||(49200054-49200226)
chr3 (163-347)||(7764137-7764321)
chr3 (370-636)||(21353604-21353875)
chr3 (256-449)||(23392106-23392300)
chr3 (219-447)||(9636325-9636555)
chr3 (135-261)||(6096203-6096328)
chr3 (694-803)||(27026816-27026925)
chr3 (694-803)||(27038161-27038270)
chr3 (86-295)||(43404301-43404512)
chr3 (150-271)||(34490687-34490807)
chr3 (388-656)||(28503664-28503939)
chr3 (98-277)||(40912739-40912918)
chr3 (119-242)||(36018285-36018408)
chr3 (162-277)||(43402377-43402491)
chr3 (76-336)||(800707-800968)
chr3 (533-764)||(4386869-4387106)
chr3 (52-232)||(26928078-26928258)
chr3 (388-634)||(28501497-28501750)
chr3 (62-180)||(24694655-24694775)
chr3 (581-656)||(22173184-22173258)
chr3 (712-806)||(1309724-1309816)
chr3 (582-656)||(18656457-18656530)
chr3 (584-745)||(25929435-25929600)
chr3 (372-449)||(32890998-32891074)
chr3 (372-449)||(39153558-39153634)
chr3 (712-806)||(1417134-1417227)
chr3 (372-447)||(40735278-40735352)
chr3 (715-806)||(47924000-47924088)
chr3 (54-112)||(32143870-32143928)
chr3 (610-664)||(38210565-38210619)
chr3 (188-336)||(7782450-7782599)
chr3 (581-656)||(2672919-2672994)
chr3 (581-656)||(2677075-2677150)
chr3 (581-656)||(8512239-8512314)
chr3 (581-656)||(8517119-8517194)
chr3 (581-656)||(32475507-32475580)
chr3 (581-656)||(32480365-32480438)
chr3 (62-336)||(6716092-6716365)
chr3 (62-112)||(18656972-18657022)
chr3 (62-112)||(22172669-22172719)
chr3 (54-112)||(27974433-27974491)
chr3 (372-435)||(5373118-5373180)
chr3 (372-449)||(9581178-9581254)
chr3 (372-449)||(19684086-19684162)
chr3 (62-114)||(8738549-8738601)
chr3 (62-114)||(9090787-9090839)
chr3 (62-122)||(47923327-47923387)
chr3 (151-198)||(6718365-6718412)
chr3 (414-449)||(29682295-29682330)
chr3 (414-449)||(44331481-44331516)
chr3 (163-201)||(3393292-3393330)
chr3 (610-664)||(6063454-6063508)
chr3 (62-112)||(28501159-28501209)
chr3 (62-112)||(28503326-28503376)
chr3 (610-664)||(50494194-50494248)
chr3 (62-111)||(25637020-25637069)
chr3 (610-659)||(28413045-28413094)
[»] scaffold0087 (3 HSPs)
scaffold0087 (147-806)||(36398-37061)
scaffold0087 (147-806)||(43527-44188)
scaffold0087 (52-112)||(36322-36382)
[»] chr8 (98 HSPs)
chr8 (63-806)||(4455896-4456624)
chr8 (61-806)||(5701958-5702712)
chr8 (119-795)||(19175270-19175971)
chr8 (54-806)||(7412205-7412952)
chr8 (227-806)||(23799221-23799807)
chr8 (203-789)||(4696249-4696808)
chr8 (51-806)||(26287771-26288520)
chr8 (51-806)||(26313022-26313771)
chr8 (51-656)||(26301180-26301777)
chr8 (370-806)||(26403015-26403459)
chr8 (391-806)||(31071035-31071457)
chr8 (355-806)||(19752168-19752622)
chr8 (370-806)||(6127087-6127533)
chr8 (149-656)||(1261509-1262029)
chr8 (117-449)||(15212425-15212757)
chr8 (216-636)||(3051162-3051584)
chr8 (140-449)||(43036086-43036394)
chr8 (140-441)||(30143005-30143305)
chr8 (355-656)||(4759841-4760150)
chr8 (355-656)||(33037575-33037881)
chr8 (355-656)||(36979399-36979706)
chr8 (163-447)||(12702837-12703121)
chr8 (154-449)||(4731335-4731629)
chr8 (361-656)||(30655668-30655970)
chr8 (356-656)||(10688908-10689218)
chr8 (221-449)||(33351893-33352121)
chr8 (355-657)||(18870328-18870638)
chr8 (172-404)||(34254569-34254802)
chr8 (343-664)||(5990324-5990643)
chr8 (226-447)||(17982401-17982622)
chr8 (163-447)||(31217942-31218226)
chr8 (355-656)||(18852934-18853243)
chr8 (343-664)||(28307575-28307898)
chr8 (163-447)||(1746417-1746701)
chr8 (89-277)||(42435578-42435766)
chr8 (163-404)||(34256745-34256987)
chr8 (140-338)||(4743500-4743699)
chr8 (150-449)||(27810971-27811249)
chr8 (384-620)||(7492976-7493212)
chr8 (355-479)||(9054193-9054318)
chr8 (163-271)||(40221232-40221339)
chr8 (300-447)||(42498017-42498163)
chr8 (226-404)||(19948562-19948741)
chr8 (610-806)||(9765848-9766049)
chr8 (138-271)||(11383449-11383581)
chr8 (226-447)||(44303602-44303823)
chr8 (135-271)||(22975974-22976109)
chr8 (282-447)||(4733610-4733778)
chr8 (361-656)||(6311319-6311622)
chr8 (61-180)||(23799098-23799217)
chr8 (54-446)||(2627318-2627711)
chr8 (355-449)||(9765624-9765720)
chr8 (533-748)||(6813608-6813829)
chr8 (282-447)||(19945559-19945722)
chr8 (372-449)||(19491895-19491974)
chr8 (142-300)||(1345714-1345873)
chr8 (533-658)||(9054789-9054914)
chr8 (154-261)||(4733502-4733608)
chr8 (581-656)||(7289915-7289989)
chr8 (140-338)||(10014822-10015020)
chr8 (582-656)||(25328268-25328341)
chr8 (62-209)||(4759541-4759688)
chr8 (163-266)||(19945719-19945822)
chr8 (372-446)||(3303870-3303943)
chr8 (188-266)||(4283039-4283116)
chr8 (62-199)||(10683746-10683883)
chr8 (355-468)||(13204565-13204670)
chr8 (62-199)||(30656138-30656275)
chr8 (62-199)||(33037294-33037431)
chr8 (725-805)||(1262101-1262179)
chr8 (581-656)||(10684252-10684327)
chr8 (62-114)||(10688625-10688677)
chr8 (341-447)||(11712200-11712308)
chr8 (610-666)||(18813152-18813208)
chr8 (119-194)||(33351812-33351888)
chr8 (581-656)||(35745413-35745488)
chr8 (372-447)||(38863765-38863841)
chr8 (60-112)||(39784330-39784382)
chr8 (372-434)||(3318761-3318823)
chr8 (62-199)||(6311791-6311928)
chr8 (62-199)||(18852634-18852771)
chr8 (62-112)||(18870028-18870078)
chr8 (62-112)||(25327671-25327721)
chr8 (62-199)||(36979870-36980007)
chr8 (582-656)||(39784813-39784885)
chr8 (377-446)||(4162400-4162468)
chr8 (372-449)||(5689166-5689242)
chr8 (333-448)||(18141675-18141791)
chr8 (610-659)||(24873196-24873245)
chr8 (372-448)||(29796520-29796596)
chr8 (413-449)||(4743400-4743436)
chr8 (260-340)||(31043113-31043193)
chr8 (372-428)||(41266862-41266918)
chr8 (414-449)||(18106275-18106310)
chr8 (62-113)||(25689568-25689619)
chr8 (62-112)||(7289434-7289484)
chr8 (610-664)||(43079873-43079927)
chr8 (610-664)||(43082244-43082298)
[»] chr7 (111 HSPs)
chr7 (54-806)||(2479207-2479960)
chr7 (53-806)||(21988774-21989532)
chr7 (87-803)||(2647203-2647923)
chr7 (92-806)||(33331960-33332679)
chr7 (88-806)||(4796175-4796899)
chr7 (86-806)||(46515834-46516540)
chr7 (347-806)||(47263548-47263997)
chr7 (54-806)||(18408634-18409399)
chr7 (54-806)||(18413511-18414275)
chr7 (311-806)||(9189735-9190236)
chr7 (138-449)||(49091918-49092232)
chr7 (355-806)||(29159671-29160131)
chr7 (62-432)||(79634-80005)
chr7 (54-656)||(21646028-21646643)
chr7 (311-806)||(2580256-2580756)
chr7 (311-806)||(20283957-20284456)
chr7 (188-470)||(44847732-44848014)
chr7 (417-806)||(49091530-49091924)
chr7 (464-805)||(44848567-44848913)
chr7 (355-805)||(21639679-21640135)
chr7 (420-806)||(21983150-21983544)
chr7 (355-806)||(23402787-23403242)
chr7 (54-392)||(21983541-21983867)
chr7 (355-806)||(9184948-9185391)
chr7 (432-806)||(55807-56195)
chr7 (119-449)||(47676333-47676663)
chr7 (101-449)||(14070030-14070378)
chr7 (101-449)||(14380058-14380406)
chr7 (311-744)||(3047186-3047622)
chr7 (121-449)||(47674140-47674468)
chr7 (355-656)||(1533211-1533519)
chr7 (120-449)||(4585804-4586132)
chr7 (117-449)||(18126284-18126615)
chr7 (149-447)||(23554711-23555009)
chr7 (219-449)||(1113397-1113628)
chr7 (188-441)||(2761507-2761759)
chr7 (417-806)||(35960682-35961078)
chr7 (62-656)||(2057987-2058597)
chr7 (355-746)||(5817043-5817439)
chr7 (150-449)||(48489103-48489402)
chr7 (188-441)||(48491289-48491542)
chr7 (54-327)||(47263994-47264267)
chr7 (352-656)||(20357312-20357622)
chr7 (89-446)||(26416925-26417284)
chr7 (163-447)||(4178460-4178744)
chr7 (96-299)||(27347542-27347745)
chr7 (163-449)||(43863947-43864215)
chr7 (219-447)||(24514959-24515187)
chr7 (219-447)||(35853654-35853884)
chr7 (150-338)||(4538858-4539046)
chr7 (147-366)||(25767234-25767453)
chr7 (397-604)||(9235398-9235605)
chr7 (278-404)||(30024973-30025099)
chr7 (119-281)||(32358419-32358580)
chr7 (119-271)||(2389716-2389867)
chr7 (226-447)||(29990803-29991024)
chr7 (150-277)||(6360499-6360625)
chr7 (149-317)||(19495641-19495811)
chr7 (54-292)||(39730933-39731172)
chr7 (247-449)||(31733166-31733361)
chr7 (533-738)||(28617177-28617386)
chr7 (667-806)||(9235646-9235786)
chr7 (53-271)||(48408397-48408616)
chr7 (216-441)||(6570331-6570557)
chr7 (66-271)||(43504503-43504709)
chr7 (312-456)||(19502013-19502156)
chr7 (293-353)||(2759072-2759131)
chr7 (582-656)||(19992335-19992408)
chr7 (582-656)||(24024316-24024389)
chr7 (162-255)||(30026391-30026482)
chr7 (372-449)||(38671419-38671495)
chr7 (312-447)||(39731211-39731346)
chr7 (593-656)||(4866752-4866814)
chr7 (581-656)||(12396933-12397007)
chr7 (581-656)||(16880095-16880169)
chr7 (581-656)||(16884951-16885025)
chr7 (63-198)||(21811747-21811882)
chr7 (117-180)||(34311285-34311348)
chr7 (62-199)||(21640279-21640416)
chr7 (54-293)||(24789426-24789664)
chr7 (582-656)||(31109573-31109646)
chr7 (142-188)||(35961457-35961503)
chr7 (372-449)||(24526094-24526170)
chr7 (409-449)||(12098056-12098096)
chr7 (725-805)||(21645877-21645955)
chr7 (581-656)||(24261311-24261386)
chr7 (581-656)||(24266190-24266265)
chr7 (52-112)||(44847617-44847677)
chr7 (150-202)||(48599939-48599991)
chr7 (581-656)||(12406353-12406427)
chr7 (62-112)||(4873664-4873714)
chr7 (610-664)||(7351662-7351716)
chr7 (62-112)||(12406800-12406850)
chr7 (62-112)||(20357035-20357085)
chr7 (150-242)||(29608207-29608299)
chr7 (303-447)||(48408629-48408772)
chr7 (291-323)||(2759009-2759041)
chr7 (233-296)||(3050492-3050556)
chr7 (60-112)||(31109075-31109127)
chr7 (372-404)||(40808485-40808517)
chr7 (414-450)||(41649206-41649242)
chr7 (54-109)||(1532884-1532939)
chr7 (149-208)||(1532998-1533057)
chr7 (219-300)||(496339-496421)
chr7 (62-112)||(12397435-12397485)
chr7 (66-199)||(24023830-24023963)
chr7 (355-449)||(31109392-31109489)
chr7 (610-664)||(31155921-31155975)
chr7 (361-430)||(4873329-4873398)
chr7 (610-659)||(7349288-7349337)
chr7 (414-447)||(41317633-41317666)
[»] chr6 (83 HSPs)
chr6 (147-806)||(5757044-5757705)
chr6 (61-806)||(31085952-31086691)
chr6 (61-806)||(5016975-5017701)
chr6 (87-806)||(31979381-31980108)
chr6 (150-806)||(22963567-22964226)
chr6 (150-806)||(23824167-23824826)
chr6 (154-659)||(5571837-5572319)
chr6 (397-806)||(21355906-21356318)
chr6 (61-427)||(18234334-18234701)
chr6 (54-805)||(22708888-22709645)
chr6 (101-657)||(24435490-24436047)
chr6 (311-806)||(31936456-31936942)
chr6 (51-417)||(10076661-10077027)
chr6 (423-806)||(18232713-18233101)
chr6 (355-806)||(21801115-21801579)
chr6 (52-656)||(5674227-5674845)
chr6 (443-806)||(10077030-10077394)
chr6 (150-438)||(21272558-21272846)
chr6 (420-745)||(4629882-4630211)
chr6 (147-402)||(23896628-23896864)
chr6 (219-447)||(33160552-33160781)
chr6 (163-449)||(9183228-9183492)
chr6 (220-447)||(31404872-31405100)
chr6 (226-447)||(5406397-5406618)
chr6 (226-447)||(5410722-5410943)
chr6 (163-449)||(33211382-33211666)
chr6 (163-367)||(5411512-5411716)
chr6 (119-296)||(21593090-21593267)
chr6 (163-367)||(5407187-5407391)
chr6 (219-441)||(30834741-30834964)
chr6 (219-447)||(16452528-16452756)
chr6 (348-479)||(31076702-31076834)
chr6 (370-666)||(14521686-14521984)
chr6 (219-327)||(16452758-16452867)
chr6 (167-261)||(26661421-26661514)
chr6 (167-261)||(26767392-26767485)
chr6 (162-271)||(603612-603720)
chr6 (155-261)||(3809312-3809414)
chr6 (164-320)||(24714730-24714885)
chr6 (188-328)||(26253702-26253843)
chr6 (278-441)||(5413597-5413758)
chr6 (54-271)||(2171886-2172104)
chr6 (581-656)||(11856996-11857070)
chr6 (582-656)||(14742426-14742499)
chr6 (581-656)||(22010686-22010760)
chr6 (582-656)||(14737566-14737639)
chr6 (219-300)||(26954648-26954730)
chr6 (62-199)||(30125025-30125162)
chr6 (219-271)||(5413823-5413875)
chr6 (62-209)||(11857413-11857560)
chr6 (553-656)||(28155529-28155632)
chr6 (581-656)||(33335930-33336005)
chr6 (152-336)||(411783-411969)
chr6 (372-449)||(28137605-28137681)
chr6 (54-336)||(3073060-3073343)
chr6 (581-656)||(6005439-6005514)
chr6 (62-114)||(14737092-14737144)
chr6 (584-656)||(28184527-28184598)
chr6 (581-656)||(33330433-33330508)
chr6 (62-113)||(5266595-5266646)
chr6 (53-111)||(5756950-5757008)
chr6 (582-656)||(6438523-6438595)
chr6 (62-112)||(14741933-14741983)
chr6 (62-112)||(22010196-22010246)
chr6 (54-131)||(24714919-24714997)
chr6 (760-806)||(26258182-26258228)
chr6 (581-645)||(16838777-16838841)
chr6 (594-659)||(27165702-27165767)
chr6 (316-447)||(2171729-2171860)
chr6 (391-479)||(5385794-5385881)
chr6 (188-271)||(6097789-6097873)
chr6 (720-806)||(5572739-5572825)
chr6 (361-449)||(14737392-14737482)
chr6 (62-113)||(16652723-16652774)
chr6 (54-109)||(26253589-26253644)
chr6 (150-197)||(26830696-26830743)
chr6 (610-664)||(12195525-12195579)
chr6 (54-112)||(23896899-23896957)
chr6 (533-666)||(31076893-31077026)
chr6 (409-446)||(3039103-3039140)
chr6 (343-404)||(3039157-3039218)
chr6 (87-124)||(5571781-5571818)
chr6 (149-198)||(28155165-28155214)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (61-806)||(5549-6303)
scaffold0006 (61-789)||(2377-3111)
scaffold0006 (147-806)||(132845-133509)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (188-806)||(8024-8648)
scaffold0140 (54-109)||(7911-7966)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (276-806)||(85553-86085)
scaffold0036 (76-201)||(86066-86189)
[»] scaffold0098 (2 HSPs)
scaffold0098 (150-505)||(45371-45727)
scaffold0098 (594-806)||(45123-45337)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (53-806)||(17430-18180)
scaffold0188 (355-806)||(23815-24273)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (355-806)||(10596-11057)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (142-741)||(17196-17767)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (140-449)||(20612-20920)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (51-447)||(11360-11756)
scaffold0491 (54-271)||(9091-9308)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (163-404)||(434217-434460)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (89-296)||(10951-11159)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (125-296)||(80850-81021)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (334-666)||(23540-23877)
[»] scaffold1519 (2 HSPs)
scaffold1519 (149-350)||(577-779)
scaffold1519 (414-447)||(853-886)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (163-404)||(114272-114517)
scaffold0016 (414-447)||(114539-114572)
[»] scaffold0510 (2 HSPs)
scaffold0510 (147-271)||(1176-1300)
scaffold0510 (54-112)||(1083-1141)
[»] scaffold1805 (1 HSPs)
scaffold1805 (737-806)||(1276-1344)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (381-445)||(33368-33432)
[»] scaffold0466 (2 HSPs)
scaffold0466 (188-296)||(6820-6929)
scaffold0466 (101-180)||(6754-6833)
[»] scaffold0355 (2 HSPs)
scaffold0355 (582-656)||(9632-9705)
scaffold0355 (62-112)||(3344-3394)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (370-419)||(5745-5794)
[»] scaffold0135 (2 HSPs)
scaffold0135 (593-656)||(35063-35125)
scaffold0135 (62-112)||(34561-34611)
[»] scaffold1455 (1 HSPs)
scaffold1455 (60-112)||(1714-1766)
[»] scaffold0665 (1 HSPs)
scaffold0665 (62-114)||(8214-8266)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (581-656)||(14297-14372)
[»] scaffold0464 (2 HSPs)
scaffold0464 (582-656)||(385-457)
scaffold0464 (60-112)||(888-940)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (581-656)||(2239-2314)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (581-656)||(148944-149019)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (610-664)||(265-319)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (610-659)||(11488-11537)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 525; Significance: 0; HSPs: 104)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 525; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 14520855 - 14520097
Alignment:
Q  53 ttgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggttt 152  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  14520855 ttgttgaaaattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgattttc-aggcagggagcatggttt 14520757  T
Q  153 g-cagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcg 251  Q
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14520756 ctcagggtgctcaatcgtgtcatgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcg 14520657  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttga 351  Q
    ||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14520656 tacgcattaatcgtgtcacgatttggaaaacgtgacacgattttgacagctggagactcctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttga 14520557  T
Q  352 agtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtag 451  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  14520556 agagagagaaacttagattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggatag 14520457  T
Q  452 tgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggt 551  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14520456 tgagatttcaccattggaaggatcaaaagcttccttttgtgtcttctctttagggttcataattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggt 14520357  T
Q  552 cttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcat 651  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| | ||||||||||    
T  14520356 cttgttcttgtgtaagcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattgaagagctgctctcccccctagattaggtcat 14520257  T
Q  652 attggaccaaact-----agcaatc--ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacac 744  Q
    |||||||| ||||     | |||||  ||||||||||||||||  ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14520256 attggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcc--tttctttcagtgcttatctttgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacac 14520159  T
Q  745 taag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    | || |||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14520158 ttagatctaggtct-gtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccactt 14520097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 63 - 806
Target Start/End: Original strand, 11916453 - 11917204
Alignment:
Q  63 ttggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgct 162  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  11916453 ttggcttcaaatttgtggtttgaaagaacagagaaatcgtgacacaatttcatcaacgtgtcacgattttccaggcagtgagtgtggtttgcagggtgct 11916552  T
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaat 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11916553 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtatgttttcaggatcaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaat 11916652  T
Q  263 cgtgccacgttttg-gaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaa 361  Q
    |||  |||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  11916653 cgtatcacgatttgagaaaacgtgacacgattttgacagttgaaaactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagtgagagaa 11916752  T
Q  362 acttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttca 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11916753 acttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtttctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttca 11916852  T
Q  462 ccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgttctt 560  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||  ||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11916853 ccattggaaggatcaaaaacttccttttgtgttttctc-ttagggttcatcgtt-tgagagtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttctt 11916950  T
Q  561 gtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggacc 659  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11916951 gtgtaagcttgcaaactattttcttgtaactcttttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggacc 11917050  T
Q  660 aaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tcta 752  Q
     ||||     | |||||| ||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| |  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11917051 gaactgggtcaacaatctcggtgtgtttgttcc--tttctctcattgcttatctttattgcactgtttatgcttgtggtgttgctctacactaagatcta 11917148  T
Q  753 ggtc--tattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||||  | |||||| || || |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  11917149 ggtctttttttttttttttttttgcttgaagacactttacacattgattaccactt 11917204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 763
Target Start/End: Original strand, 12083658 - 12084363
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgc 161  Q
    ||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12083658 attggctttaaatttatggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttacagggtgc 12083757  T
Q  162 tcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 261  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12083758 tcaattgtgtcacagttttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtatgcaccaa 12083857  T
Q  262 tcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaa 361  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  12083858 tcgtgtcacgatttggaaaacgtgacacaattttgacagttgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagctagaagtgagagaa 12083957  T
Q  362 acttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttca 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  12083958 acttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttatagtgaggatctcttgggttggtaaacattttaaacaccttgggtagtgagaattca 12084057  T
Q  462 cca-ttggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttctt 560  Q
    ||| |||||| ||| ||||| |||||||||||| || || ||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12084058 ccatttggaaggat-aaaagcttccttttgtgttttttc-ttaggattca-tattgtgagagtgggtgacacaaatgggtagaaattaggtcttgttctt 12084154  T
Q  561 gtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggacca 660  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||     
T  12084155 gtgtaagcttttaagttaatttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctgccccatattaggtcatagtggaccg 12084254  T
Q  661 aactag--ca-----atcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tcta 752  Q
    |||| |  ||     || ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  12084255 aactgggtcaacaatattttggtgtgtttgttcc--tttctttcattgcttatctttgtgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatcta 12084352  T
Q  753 ggtctattttt 763  Q
    ||||| |||||    
T  12084353 ggtctgttttt 12084363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 806
Target Start/End: Original strand, 9352807 - 9353559
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    || |||| ||||||||   |  || |||||| ||||||    
T  9352807 tgttgagatttggcttcaaatttgtggtttgaaagaacagagaaatcgtgacgcgattgtggcatcgtgacacgattttgtaatgccgtgagc-tggttt 9352905  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgt 252  Q
    ||||||||   ||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9352906 gcagggtgtcaaatcgtggcacgattctgtgaaatcgtgacacgattttcaaacttgctggttaagttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgt 9353005  T
Q  253 acgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaa 352  Q
    ||  | |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   ||||  ||||    
T  9353006 acatatcaatcgtggcacgatttggaaaacgtggcacgattttatcagctgaagactggtatttaagtgttcttgtgcagattttggg--agaggatgaa 9353103  T
Q  353 gtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagt 452  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9353104 gagagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttaagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagt 9353203  T
Q  453 gagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtc 552  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  9353204 gagatttcaccattggaaggatcaaaagcttccttttgtgtcttctctttaaggttcattattgagagagtgggaaacacaaatgggtagaaattagatc 9353303  T
Q  553 ttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcata 652  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9353304 ttgttcttgtgtaagcttgcaagcttttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcata 9353403  T
Q  653 ttggaccaaact-----agcaatc--ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacact 745  Q
    ||||||| ||||     | |||||  ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9353404 ttggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcc---ttctttcattgcttatctttgttctttgtatatgcttgtggtgttgctctacact 9353500  T
Q  746 aagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
     || ||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9353501 -agactaggtct-gtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgtttaccactt 9353559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 188 - 802
Target Start/End: Original strand, 36931956 - 36932574
Alignment:
Q  188 cgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgcc 287  Q
    |||||||||||||||||||||| | | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||  |||| ||| |||| |    
T  36931956 cgtgacacgattttcaaacttgcttgttaagttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgtatcaatcgtgacacaatttgaaaatcgtggc 36932055  T
Q  288 acgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaacttt 387  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  36932056 acgattttatcagctgaagactggtatttaagtgttcttgtgcagtttttggaggagagct-gaagagagagaaacttggattgcaaaggagggaacttt 36932154  T
Q  388 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttcctt 487  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  36932155 agggttgagtgtctttatagtgatgatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaagcttcctc 36932254  T
Q  488 ttgtgtcttct-ctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagtta-ttttctt 585  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  36932255 ttgtgtcttctgttttagggttcattattgagagagtgggaaacacaaatgggtagaaattaagtcttgttcttatgtaaacttgcaagctatttttctt 36932354  T
Q  586 gtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatc--ttggtgt 678  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     | |||||  |||||||    
T  36932355 gtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgt 36932454  T
Q  679 gtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcctg 778  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| ||    
T  36932455 gtttgttccttt---tttcattgcttatctttgttctttgtttatgcttgtggtgttgctctacact-agactaggtctgttttttgttgttgttgcttg 36932550  T
Q  779 gagacactttacacattgattacc 802  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  36932551 gagacactttacacattgattacc 36932574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 188 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 15465012 - 15464401
Alignment:
Q  188 cgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgcc 287  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||| |            | |||||||| |||| |||||||| |||| |    
T  15465012 cgtgacacgattttcaaacttgctggttaagttttcaggataaggttggtcgtacgt------------atcaatcgtgacacgatttggaaatcgtggc 15464925  T
Q  288 acgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaacttt 387  Q
    ||||||||  |||  |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15464924 acgattttatcagtagaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattttggaggagagcttgaagagagagaaacttggattacaaagaaggaaacttt 15464825  T
Q  388 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttcctt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15464824 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacatcgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaagcttcctt 15464725  T
Q  488 ttgtgtcttctc-tttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagtta-ttttctt 585  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15464724 ttgtgtcttctcttttagggttcattattgtgagagtgggaaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttttctt 15464625  T
Q  586 gtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatc--ttggtgt 678  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||     | |||||  |||||||    
T  15464624 gtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgt 15464525  T
Q  679 gtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcct 777  Q
    ||||||   || ||||||||||| |||||| |  || |||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||| |||| |    
T  15464524 gtttgt---ttcttctttcattgcttatctttattgttttggttatacttgtggtgttgctctacact-agactaggtct-gtttttgttgttgttgctt 15464430  T
Q  778 ggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15464429 ggagacactttacacattgattaccactt 15464401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 311 - 806
Target Start/End: Original strand, 17003689 - 17004188
Alignment:
Q  311 ctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtga 410  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17003689 ctatataagtgtttctttgcagattttgaaggagagctttgagagagagaaacttggattacaaaggagataactttagggttgaatgtctttgtagtga 17003788  T
Q  411 ggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaa-gtttccttttgtgtcttctctttagggttc 509  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  17003789 ggttctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttctctt-aggattc 17003887  T
Q  510 attattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttca 607  Q
    || |||| ||||||| || | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||| || |||||||    
T  17003888 at-attgtgagagtgagtgaaattaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgtaagttaattttttgtaactcttttgaaatactttca 17003986  T
Q  608 tcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattga 702  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  17003987 tcatagtggattgaagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tttctttcattgc 17004084  T
Q  703 ttatc-tgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgatta 800  Q
    ||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||    
T  17004085 ttatcttttttgctttgattatgcttgtggtgttgct-tacacttagatttaggtct-gtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgatta 17004182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 147 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 38219937 - 38219266
Alignment:
Q  147 tggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggt-tggtcgtacctt 245  Q
    ||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| | | || |||| || |||||||  ||||||||||||    
T  38219937 tggtttgtagggtgccaaatcgtgacacgatcttgggaaattgtgacacgattttcaaacttgcttgttaagtttccatgataaggactggtcgtacctt 38219838  T
Q  246 gggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtaga 345  Q
    | | ||||||  ||||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||  |||  |||| ||  ||     |||||||||||||||||||| || |||    
T  38219837 gtgacgtacgttccaatcgtgacacgatttggaaatcgtgacacaattttatcagaggaaggctagta-----gtgttcttgtgcagattttgaagaaga 38219743  T
Q  346 gctt----ga----agtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattg 435  Q
    ||||    ||    || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  38219742 gctttgaagagcttagagagagaaacttggattacaaaggagggaactctagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaaacattg 38219643  T
Q  436 taaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctc-tttagggttcattattgagagagt-gggtaacaca 533  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||    
T  38219642 taaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatctaaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttca-tattgtgagagtggggaaacaca 38219544  T
Q  534 aatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagtta-ttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctct 632  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38219543 aatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctct 38219444  T
Q  633 ctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatc---ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatc-tgtgtgctttgtttat 723  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |  ||||     | |||||   |||||||||||||||   || ||||| ||| ||||| ||| |||||||| |      
T  38219443 ctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc---ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattc 38219349  T
Q  724 gct--tgtggtgttgctctacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
     ||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38219348 tcttgtgtggtgttgctctacact-agtctagggct-gtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccactt 38219266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 188 - 806
Target Start/End: Original strand, 11181437 - 11182063
Alignment:
Q  188 cgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaa-cgtgc 286  Q
    ||||||||||||||| |  ||||| || |||| | |||||||||||||||| |||| ||||| ||||| | ||| |||| |||  |||||  || ||||     
T  11181437 cgtgacacgattttcgat-ttgtttggcacgtatacaagataaggttggtcataccgtgggttgtacgtatcaaccgtgtcacaatttggtcaatcgtga 11181535  T
Q  287 cacgattttgacagctga---agactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaa 383  Q
    |||  |||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11181536 cacattttttacagctgatgaagactgttatataagtgttctt-tgcagtttttgaagtagagcttgaagagagagaaacttggtttacaaaggaggtaa 11181634  T
Q  384 ctttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtt 482  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |    
T  11181635 ctttatggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgaaatttcaccattggaaggatcaaaaagct 11181734  T
Q  483 tccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaaca--caaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatt 580  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||   |||| ||| |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||  | | || |    
T  11181735 tccttttgtgttttctc-ttaggattc---attgtgagtgtgggtgacatgaaaatgggtagaaattaggtcttgttcatttgagagcttttaggctaat 11181830  T
Q  581 ttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctccccc-atattaggtcatattggaccaaactag----caatcttg 674  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||    | ||||||    
T  11181831 ttcttgtaactcatttgtatcactttcatcttagtggattggagggttgctctctccccctagagtaggtcatattagaccgaactaggttaccatcttg 11181930  T
Q  675 gtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtct-attttttgttgtta 771  Q
    ||||||||||||   |||||||||||| |||||| |  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || | || ||||  ||||||||||||     
T  11181931 gtgtgtttgttc--atttctttcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtattgctctacacttagatttaagtctgtttttttgttgttg 11182028  T
Q  772 ttgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  11182029 ttgcttggagacactttatctattgattaccactt 11182063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 372 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 19589051 - 19588614
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaat 471  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  19589051 caaaggaggtaattttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggcagtgagatttcaccattggaag 19588952  T
Q  472 gatcaaaagt-ttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagct 569  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||   |||||||  |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19588951 gatcaaaaatcttccttttgtgttttctc-ttaggattc---attgagattgtgggtgacacaaaaagggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagct 19588856  T
Q  570 tgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact---- 664  Q
    |  ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | ||||| |||||||||||| ||||        
T  19588855 tataaggtaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctccctaagattagttcatattggaccgaactgggt 19588756  T
Q  665 -agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattt 761  Q
     | ||||||| | |||||||||||  |||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||    
T  19588755 caacaatctttgagtgtttgttcc--tttctttcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtct-ttt 19588659  T
Q  762 tttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||   ||||||||||||||    
T  19588658 tttgttgttgttgcttggagacgctttatctattgattaccactt 19588614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 355 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 28832580 - 28832128
Alignment:
Q  355 gagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtga 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28832580 gagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagagttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtga 28832481  T
Q  455 gatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtggg---taacacaaatgggtagaaattagg 550  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||   |||||||| |||||   ||  | |||||||||||||||||     
T  28832480 gatttcaccattggaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttctc-ttaggattc---attgagagtgtgggtgatatgaaaaatgggtagaaattaga 28832385  T
Q  551 tcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtca 650  Q
     ||||||||| ||||  |||  ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  28832384 acttgttcttttgta--cttataagctaatttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtca 28832287  T
Q  651 tattggaccaaac-----tagcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacac 744  Q
    ||||||||| |||      | |||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||| |  || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28832286 tattggaccgaaccgggtcaacaatcttggtgtgtttgtt--tgtttctttcattgcttatctttattgatttgattatgcttgtggtgttgctctacac 28832189  T
Q  745 taagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    | ||  |||||||  ||||||||||| |||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  28832188 ttagattaggtct-gtttttgttgttgttgcttgaagacactttatccattgattaccactt 28832128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 355 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 10282078 - 10281765
Alignment:
Q  355 gagagaaacttg-gattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttg--ggttgggaaacattgtaaacatcttgggtag 451  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  10282078 gagagaaacttgagaatacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgtgaaacattgtaaacaccttgggtag 10281979  T
Q  452 tgagatttcaccattggaatgatcaaaa-gtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaa-tgggtagaaattag 549  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  10281978 tgagatttcaccattggaaggatcaaaaagctttcttttgtgttttctctt-aggattcat-attgtgagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattag 10281881  T
Q  550 gtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggt 648  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  10281880 gtcttgttcttgtgtaagcttgtaagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagatcaggt 10281781  T
Q  649 catattggaccaaact 664  Q
    ||||||||||| ||||    
T  10281780 catattggaccgaact 10281765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 189 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 35388164 - 35387684
Alignment:
Q  189 gtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggt-tggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgcc 287  Q
    ||||||||||||||||||||| | | || || | |  |||||||  ||||| ||||||||| ||||||  | ||||||| |||| | |||||| |||| |    
T  35388164 gtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggacgtacgttcaaatcgtgacacgatctggaaatcgtgac 35388065  T
Q  288 acgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaa--------gtgagagaaacttggattacaaaggag 379  Q
    ||||||||  |||  |||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |        | |||| ||||||||||||||||||||    
T  35388064 acgattttatcagaggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattttggaagagagcttggaagagcttagagagaaaaacttggattacaaaggag 35387965  T
Q  380 gtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaa 477  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  35387964 ggaactctagggttgagtgtctttgtagagagggtctcttgggttggaaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatcta 35387865  T
Q  478 aagtttccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgggtaa-cacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaag 575  Q
    ||  ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  35387864 aaacttcctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttattcttgtgtaagcttgcaag 35387766  T
Q  576 ttatttt-cttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  35387765 ctatttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 35387684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 311 - 745
Target Start/End: Original strand, 31300325 - 31300764
Alignment:
Q  311 ctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtga 410  Q
    ||||||||| |||  | ||||||||||| || |||| ||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31300325 ctatataagggtttctttgcagattttgaagaagaggttttagagagagaaacttggattgcaaaggaggtaactttaaggttgagtgtctttgtagtga 31300424  T
Q  411 ggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaa-gtttccttttgtgtcttctctttagggttc 509  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  31300425 ggttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaaggcttccttttgtgttttctc-ttaggattc 31300523  T
Q  510 attattgagagagtggg---taacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagtta-ttttcttgtaactctttgtaacacttt 605  Q
       |||||||| |||||   ||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| || |||||||||    
T  31300524 ---attgagagtgtgggtgatatgagaaatgggtagaaattaggacttgttcttgtgtaagcttgcaaactatttttcttgcaactcattataacacttt 31300620  T
Q  606 catcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcatt 700  Q
    |||| |||||||||||| || | ||||||||| || | |||||||||||||||| ||||     | |||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  31300621 catcttagtggattggagagtttctctctccctcagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tctctttcatt 31300718  T
Q  701 gattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacact 745  Q
    | |||||| |  || |||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  31300719 gcttatctttattgttttgattacacttgtggtgttgctctacact 31300764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 53 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 24136485 - 24135870
Alignment:
Q  53 ttgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggtt 151  Q
    ||||||| | |||| || |||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||   || |||| ||| |||||   | || |||||| | |||    
T  24136485 ttgttgatatttggtttcaaatttgtggtctggaagaacacagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacaatttcgtgatgccgtgagc-tagtt 24136387  T
Q  152 tgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggt-tggtcgtaccttgggtc 250  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | | || || | |  |||||||  ||||| ||||||||| |    
T  24136386 tgcagggtgccaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggac 24136287  T
Q  251 gtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataa-gtgttcttgtgcagattttggagtagagctt 349  Q
    |||||||  ||||||| |||| | |||||| |||| ||||||| |  |||  |||  ||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24136286 gtacgca--aatcgtgacacgatctggaaatcgtggcacgattgtatcagaggaaagctagtatataaagtgttcttgtgcat-ttttggagtagagctt 24136190  T
Q  350 g--------aagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaa 439  Q
    |        ||| |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||  ||||||||     
T  24136189 ggaagagctaagagagagaaacttggattacaaaggagggaaccaaagggttgagtgtctttgtagaaagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaat 24136090  T
Q  440 catcttgggtagtgag-atttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgggtaa-cacaaat 536  Q
    || ||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| || ||| ||     
T  24136089 caccttgggtagtgaggagttcaccattggaaggatctaaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcac-attgtgagagtggggaaacaccaaa 24135991  T
Q  537 gggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatttt-cttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctc 635  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24135990 gggtagaatctaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcttagtgcattggatagctgctctctc 24135891  T
Q  636 ccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  24135890 ccccagattaggccatattgg 24135870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 370 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 3880610 - 3880229
Alignment:
Q  370 tacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttg--ggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattg 467  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  3880610 tacaaaggaggtaacttgagagttgagtgtccttgtagtgaggttctcttgagggttgagaaacattgtaaacacattgggttgtgagatttcaccattg 3880511  T
Q  468 gaatgatcaaaa-gtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaa-tgggtagaaattaggtcttgttcttgtgta 565  Q
    ||| |||||||| | |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3880510 gaaggatcaaaaagcttccttttgttttttctcct-aggattcat-attgtgagagtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgta 3880413  T
Q  566 agcttgcaagttattttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    |||||| ||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||    
T  3880412 agcttgtaaactaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctgcctcagattaggtcatattggacagaact 3880313  T
Q  665 -----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacact 745  Q
         | ||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  3880312 gaatcaacaatcttggtgtg-ttgttcc--tttctttcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctttacact 3880229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 101 - 449
Target Start/End: Original strand, 13487828 - 13488174
Alignment:
Q  101 gtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccca-ggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgatt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||    
T  13487828 gtgacacgatttcatcaacgtgtcacgattttccttggcaatgagcatatttttcagggtgctcaatcgtgacacgattttgggaaaacag--cacgatt 13487925  T
Q  200 ttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg-ttttggaaaacgtgccacgattttgac 298  Q
    |||   |||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  13487926 ttcgg-cttgctgggcaagttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaaacgtgtcacgatttgggaaaacgtgacacaattttgac 13488024  T
Q  299 agctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagt 397  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||     
T  13488025 agctgaagactgttatataagtgtt-ttttgcagattttgaaggagagctagaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagg 13488123  T
Q  398 gtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||||||| | |   | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  13488124 gtctttg-attagagttctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggt 13488174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 119 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 42426762 - 42426432
Alignment:
Q  119 cgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggttt-gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtac 217  Q
    ||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    ||| |||| |     
T  42426762 cgtgtcatgattttctgggcagtgagcatggttttgcagggtgtccaatcgtgacacgattttgggaaaacgtgacacaattttcggt-ttgctgggcaa 42426664  T
Q  218 gttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatat 316  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42426663 gttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaaacatgtcacgatttgggaaaacgtgacacaattttgacagctgaagactgctatat 42426564  T
Q  317 aagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatc 415  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |   | ||    
T  42426563 aagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaaaagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagttc 42426466  T
Q  416 tcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  42426465 tcttagattgggaaacattgtaaacaccttgggt 42426432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 135 - 449
Target Start/End: Original strand, 32636481 - 32636795
Alignment:
Q  135 aggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacg-ttttcaagataaggt 233  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| | | |||||| ||||||||    
T  32636481 aggcagtgaacatgttttgcaaggtgtccaatcgtgacacgattttgggaaaacgtggcacgattttc-gacttgctgggcaagtttttcaggataaggt 32636579  T
Q  234 tggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg-ttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcag 332  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  32636580 tggtcgtaccttgggtcttacgcaccaaacgtgtcacgatttgggaaaacgtgacatgattttgacagctgaaaactgctatataagtgttctt-tgcag 32636678  T
Q  333 attttggagtagagcttgaagtgagagaaacttg-gattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaac 431  Q
    |||||| || |||||||| || |||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| || ||||||| | |   | |||||||||| | |||||    
T  32636679 attttgaaggagagcttggagagagagaaacttgagaaatcaaaggaggtaactttagggttaagggtctttg-attagagttctcttgggtagtgaaac 32636777  T
Q  432 attgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||||||| |||||||    
T  32636778 attgtaaacaccttgggt 32636795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 155 - 447
Target Start/End: Original strand, 13239430 - 13239721
Alignment:
Q  155 agggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtac 254  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||  | |||| |||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13239430 agggtgttcaatcgtgacaagattttgggtaaacgtgacacgatctttga-cttgctggacaagttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtac 13239528  T
Q  255 gcaccaatcgtgccacgttt--tggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaa 352  Q
    ||| |||||||| |||| ||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  13239529 gcatcaatcgtgacacgattgatggaaaacgtgacacaattttgac-gctgaagactgctatataagtgttctt-tgcagattttgaagtagagtttgaa 13239626  T
Q  353 gtgagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    | ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |   | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13239627 gagagagaaacttagaaaatcaaaggaggtaactttatggttgagggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 13239721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 437 - 806
Target Start/End: Original strand, 42127266 - 42127638
Alignment:
Q  437 aaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaa-gtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac--- 532  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||| ||||||| ||| ||||||   ||||| |||||| | |        
T  42127266 aaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaaagctttcttttgtgttttctctt-aggattcatt---gagagtgtgggtgatatgaa 42127361  T
Q  533 aaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctct 632  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||    
T  42127362 aaatgggtagaaagtaggacttgttcttttgtaagcttataagctaatttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggggggctgctct 42127461  T
Q  633 ctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgct 726  Q
    |||||||| ||||||||||||| || | ||||     | |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |  || |||| |||||||    
T  42127462 ctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tttctttcattgcttatctttattgttttgattatgct 42127559  T
Q  727 tgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||||||||||||||||| | || | || |||  | |||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  42127560 tgtggtgttgctctacaattagatttaagtc--tgttttgttgttgttgcttggagacactttatccattgattaccactt 42127638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 358 - 501
Target Start/End: Original strand, 24553304 - 24553448
Alignment:
Q  358 agaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagat 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24553304 agaaacttggattacaaaggaggtaacttaagggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagat 24553403  T
Q  458 ttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctt 501  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  24553404 ttcaccattagaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttctctt 24553448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 488 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 38192365 - 38192041
Alignment:
Q  488 ttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgggtaa-cacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatttt-ct 584  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  38192365 ttgtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttttct 38192267  T
Q  585 tgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatc---ttggt 676  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||||     | |||||   |||||    
T  38192266 tgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggt 38192168  T
Q  677 gtgtttgttcctttttctttcattgattatc-tgtgtgctttgtttatgct--tgtggtgttgctctacactaagtctaggtctattttttgttgttatt 773  Q
    ||||||||||   || ||||| ||| ||||| ||| |||||||| |   ||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| ||    
T  38192167 gtgtttgttc---ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacact-agtctagggct-gtttttgttgttgtt 38192074  T
Q  774 gcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38192073 gcttggagacactttacacatagattaccactt 38192041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 125 - 401
Target Start/End: Original strand, 37438793 - 37439072
Alignment:
Q  125 acgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacg-ttttc 223  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| | | |||||    
T  37438793 acgattttcaaggcagtgagcatggttttcagagtgtccaatcgtgacatgattttgggaaaacgtgacacgatttttgg-cttgttgggcaagattttc 37438891  T
Q  224 aagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaa----cgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataag 319  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || | ||||    |||| ||| |||||||  | ||||||||||||||||||    
T  37438892 aggataaggtttgtcgtaccttgggtcgtacgcatcaatcgtgacacgattggaaaaaaaaacgtgacacaattttgat-gttgaagactgctatataag 37438990  T
Q  320 tgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtct 401  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  37438991 tgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttggaaaatcaaatgaggtaactttagggttgagggtct 37439072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 117 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 16651151 - 16650958
Alignment:
Q  117 aacgtgtcacgatttcccaggcagtgagca-tggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggt 215  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||| || ||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  16651151 aacgtgacacgatttctgaggcagtgagcaatgtttttcagggtactcaatcatgacacgattttgggaaaacgtgacacgatttataa-cttgttgggt 16651053  T
Q  216 acgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagact 309  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16651052 acgttttcaggataaggttggtcgtaccttggatcgtacgcaccaaccgtgtcacgatttggcaaaatgtgacacgattttgacagctaaagact 16650958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 101 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 42428963 - 42428627
Alignment:
Q  101 gtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggttt-gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgatt 199  Q
    ||||||||||||  | | ||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42428963 gtgacacgatttagtaagcgtgtcacgattttctaggaagtgagcatggttttgcagggtgtccaatcgtgacacgattttgggaaaacgtgacacgatt 42428864  T
Q  200 ttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgtttt-ggaaaacgtgccacgattttgac 298  Q
    ||    |||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||            ||||||| |||| |||| ||| ||||||| || ||||||||||||    
T  42428863 tttgg-cttgctgggcaagtttttaggataaggttggtcgtac------------gcaccaaacgtgtcacgatttaggaaaacctgacacgattttgac 42428777  T
Q  299 agctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagt 397  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||||      
T  42428776 aactgaagactgctatataaatgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggagataactttagggttgaag 42428678  T
Q  398 gtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||||||| | |   | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  42428677 gtctttg-attagagttctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttgggt 42428627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 216 - 366
Target Start/End: Original strand, 19806144 - 19806294
Alignment:
Q  216 acgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctat 314  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19806144 acgtttttaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaaacgtgtcacgacttgggaaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctat 19806243  T
Q  315 ataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttg 366  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  19806244 ataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttg 19806294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 357 - 479
Target Start/End: Original strand, 42127146 - 42127268
Alignment:
Q  357 gagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgaga 456  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  42127146 gagaaacttggattacaaaggaggtaactttaaggttgagtatctttgtagtgaggttctcttgggttgagaaacattgtatacaccttgggtagtgaga 42127245  T
Q  457 tttcaccattggaatgatcaaaa 479  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  42127246 tttcaccattggaaggatcaaaa 42127268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 247 - 449
Target Start/End: Original strand, 533538 - 533740
Alignment:
Q  247 ggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtaga 345  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||    
T  533538 ggtcgtacgcaccaaacgtgtcacgatttgggaaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgtt-ttttgcagattttgaaggaga 533636  T
Q  346 gcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatct 444  Q
    | |||||| |||||||| || |||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |   | |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  533637 ggttgaagagagagaaatttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgggggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacct 533735  T
Q  445 tgggt 449  Q
    |||||    
T  533736 tgggt 533740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 276 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 28751025 - 28750852
Alignment:
Q  276 ggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaa 374  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||   |||    
T  28751025 ggaaaacgtgacacgattttgacagctgaagtctgctatataagtgttcttatgcagattttgaaagagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaa 28750926  T
Q  375 aggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | |   | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  28750925 aggaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgaaaacaccttgggt 28750852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 334 - 664
Target Start/End: Original strand, 7160656 - 7160986
Alignment:
Q  334 ttttggagtagagcttgaagtgagagaaacttgg-attacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaca 432  Q
    |||| ||| |||||||||||   |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  7160656 tttttgagaagagcttgaagaatgagaaatttgggattacaaatgaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttggattgggaaaca 7160755  T
Q  433 ttgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagag---agtgggta 528  Q
    |||||| || |||||  |||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||| |||| ||| ||||| ||||| |||   ||||||||   ||||  |     
T  7160756 ttgtaatcaccttggacagtgagatttcatcattggaaggatcaaaaagcttcattttatgttttctc-ttaggattc---attgagagtgtagtgactt 7160851  T
Q  529 acacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaa-ctctttgtaacactttcatcatagtggattggatagct 627  Q
    | | ||||  |||||||||| ||||||||||| ||| |||||  ||  || ||| |||||| | ||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  7160852 a-aaaaatatgtagaaattaagtcttgttctt-tgtgagctttaaatctaattttttgtaacccctttgtatcactttcatctgagtggattggagagct 7160949  T
Q  628 gctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||    
T  7160950 gatctctcccctatagtaggtcatattgaatcaaact 7160986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 219 - 447
Target Start/End: Original strand, 25412503 - 25412731
Alignment:
Q  219 ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatat 316  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| || ||  |||||||| |||||||| ||| || ||||||  ||||||    
T  25412503 ttttcaggataaggttggtcgtaccttggatcgtacgcatcaatcgtggcacgattggggaaaaacgtgacacgatttcgac-gcagaagacatctatat 25412601  T
Q  317 aagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatc 415  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||| ||| |||||||| || ||||||| | |   | ||    
T  25412602 aagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaacattagggtttagggtctttg-attagagttc 25412699  T
Q  416 tcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25412700 tcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 25412731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 447
Target Start/End: Original strand, 26177466 - 26177860
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||   || |||| |||||||||   | || |||||| ||||||    
T  26177466 tgttgagatttggcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagc-tggttt 26177564  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataagg-ttggtcgtaccttgggtcg 251  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||| | | || |||| || |||||||  ||||||||||||||| ||    
T  26177565 gcagggtgccaaatcgtgacacgatcatgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgggacg 26177664  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttga 351  Q
     |||||||||||||| ||||   |||||| |||| |||||||||  |||  || | ||  ||| |||||||||||| |||||||||| || |||| | ||    
T  26177665 gacgcaccaatcgtgacacgacctggaaatcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgcgcagattttgaag-agagttgga 26177763  T
Q  352 agtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    || ||||||||||| |||   ||||||  |||||| ||||||| || |||||||    |||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  26177764 agagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagtctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttgg 26177860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 219 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 36074471 - 36074243
Alignment:
Q  219 ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatat 316  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||| || ||  |||||||| || ||||||||| || |||||| |||||||    
T  36074471 ttttcaggataaggttggtcgtaccttggatcgtacgcatcaatcatggcacgattgggaaaaaacgtgacatgattttgac-gcagaagacagctatat 36074373  T
Q  317 aagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatc 415  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||| | |||||||||||| || ||||||| | |   | ||    
T  36074372 aagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggtctttg-attagagttc 36074275  T
Q  416 tcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36074274 tcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 36074243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 580 - 806
Target Start/End: Original strand, 24553506 - 24553735
Alignment:
Q  580 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaactag-----caatcttg 674  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||| |     ||||||||    
T  24553506 tttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggagtggag-gctgctctctcccatagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatcttg 24553604  T
Q  675 gtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgt-gctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttat 772  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||| | | |||||| |||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||  ||||||||| | |    
T  24553605 gtgtgtttgttccttt--ctttcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgtttctctacacttagatttaggtct-gtttttgttgatgt 24553701  T
Q  773 tgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  24553702 tgcttggagacactttatccattgattatcactt 24553735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 219 - 447
Target Start/End: Original strand, 13342802 - 13343030
Alignment:
Q  219 ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatat 316  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||| || ||  |||||||| |||||||||||  || |||||| |||||||    
T  13342802 ttttcaggataaggttggtcgtaccttagatcgtacgcatcaatcgtggcacgattggggaaaaacgtgacacgattttga-ggcagaagacagctatat 13342900  T
Q  317 aagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatc 415  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||| | |||||||||||| || |||| || | |   | ||    
T  13342901 aagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggtctctg-attagagttc 13342998  T
Q  416 tcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13342999 tcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 13343030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 163 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 30683390 - 30683119
Alignment:
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaat 262  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| | || | ||||||| |||||||||||||||||            ||| ||||    
T  30683390 caatcgtgacacaattttgggaaaacgtgacacgattttcga-cttgctaggcaagttttcaggataaggttggtcgtac------------gcatcaat 30683304  T
Q  263 cgtgccacgtttt--ggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagaga 360  Q
    |||| |||  |||  |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  30683303 cgtgacacaattttgggaaaacgtgacacgattttgac-gctgaaaactgctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagaga 30683206  T
Q  361 aacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    |||||||   | || ||||||||| |||||||||||| ||||||| | |   | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  30683205 aacttgggaaatcagaggaggtaattttagggttgagggtctttg-attagagttctcttgggttgcgaaacattgtaaacaccttgg 30683119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 219 - 447
Target Start/End: Original strand, 30182329 - 30182558
Alignment:
Q  219 ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg---aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctata 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| || ||   |||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||    
T  30182329 ttttcaggataaggttggtcgtaccttggatcgtacgcatcaatcgtggcacgattgggggaaaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctata 30182427  T
Q  316 taagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggat 414  Q
     |||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||| | |||||||||| | || ||||||| | |   | |    
T  30182428 aaagtgttctt-tgcagattttgaatgagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggattagggtctttg-attagagtt 30182525  T
Q  415 ctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  30182526 ctcttgggttgggaaacattgcaaacaccttgg 30182558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 361 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 31180537 - 31180236
Alignment:
Q  361 aacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacatcttgggtagtgag-at 457  Q
    ||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| |     
T  31180537 aacttggataacaaaggagggaaccaaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggag 31180438  T
Q  458 ttcacca-ttggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgggtaa-cacaaatgggtagaaattaggtctt 554  Q
    ||||  | |||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||| || ||| || ||||||||  ||||  ||    
T  31180437 ttcattagttggaaggatctaaagcttcctctagtgtcttctcttttatggttcat-attgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggttt 31180339  T
Q  555 gttcttgtgtaa-gcttgcaagttat--tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcat 651  Q
    || ||||||||| ||||| | | ||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  31180338 gt-cttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccctttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccat 31180241  T
Q  652 attgg 656  Q
    |||||    
T  31180240 attgg 31180236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 296
Target Start/End: Original strand, 5057478 - 5057650
Alignment:
Q  124 cacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttc 223  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| |||| |||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||| | | ||||||    
T  5057478 cacgattttctaggcaatgagcatagttttcagggtgtccaatcgtgacacgattttggtaaaacgtgacacaattttc-gacttgttgagcaagttttc 5057576  T
Q  224 aagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccac-gttttggaaaacgtgccacgattttg 296  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||  ||| |||||||||| ||||||||||    
T  5057577 aggataaggttggtcgtacctttggtcgtacgcatcaaccgtgtcacaatttgggaaaacgtgacacgattttg 5057650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 18442233 - 18441839
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | ||| ||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||   || |||| |||||||||   | || |||||| ||||||    
T  18442233 tgttgagatttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcatgatgccgtgagc-tggttt 18442135  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataagg-ttggtcgtaccttgggtcg 251  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| | | || |||| || |||||||  |||||||  |||||| ||    
T  18442134 gcagggtgccaaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtttcttgggacg 18442035  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttga 351  Q
     |||||||||||||| ||||   |||||| |||| |||||||||  |||  || | ||  ||| |||||||||||||||||| |||| || |||| | ||    
T  18442034 aacgcaccaatcgtgacacgacctggaaatcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgtgcaga-tttgaaggagagttgga 18441936  T
Q  352 agtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    || ||||||||||| |||   ||||||  |||||| ||||||| || |||||||    |||  |||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  18441935 agagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagtctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgg 18441839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 295
Target Start/End: Original strand, 31004691 - 31004868
Alignment:
Q  119 cgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttg-cagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtac 217  Q
    ||||||||||||| | || ||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| ||    
T  31004691 cgtgtcacgattttcaag-cagcgagcatggtttttcagagtgctcaatcgtgtcacgattgtgggaaaacgtgatacgatattcaa-cttgctgggcac 31004788  T
Q  218 gttttcaag-ataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgga-aaacgtgccacgatttt 295  Q
    |||||  || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| ||||    
T  31004789 gttttttaggataaggttggttgtactttgggtcgtacgcaccaatcgtgtcacgatttggacaaacgtgacacgttttt 31004868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 361 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 30631730 - 30631428
Alignment:
Q  361 aacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacatcttgggtagtga--ga 456  Q
    ||||||||| |||||||||| |||    ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||   ||    
T  30631730 aacttggataacaaaggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtggagga 30631631  T
Q  457 tttcacca-ttggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaa-cacaaatgggtagaaattaggtctt 554  Q
     ||||  | |||||| |||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| || ||||||||  || |  ||    
T  30631630 gttcattagttggaaggatctaaagcttcctctagtgacttctctttagggttcat-attgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctatggttt 30631532  T
Q  555 gttcttgtgtaa-gcttgcaagttat--tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcat 651  Q
    |||| ||||||| ||||| | | ||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||     
T  30631531 gttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccctttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccac 30631433  T
Q  652 attgg 656  Q
    |||||    
T  30631432 attgg 30631428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 119 - 254
Target Start/End: Original strand, 40146691 - 40146825
Alignment:
Q  119 cgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacg 218  Q
    |||| |||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||  |||    
T  40146691 cgtggcacgattttctaggcagtgaacatggttttcagggtgtccaatcgtgacacgattttgggaaaatgtgactcgattttc-agcttgttggtcacg 40146789  T
Q  219 ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtac 254  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  40146790 ttttcaggaaaaagttggtcgtaccttgggtcgtac 40146825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 370 - 745
Target Start/End: Original strand, 33030728 - 33031110
Alignment:
Q  370 tacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattgga 469  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  33030728 tacaaaagaggtaactttagggttgagtat-tttgtaacgaggttctcttgggttgagaaatattgtaatcatcttgggtagtgagatttcaccattg-- 33030824  T
Q  470 atgatcaaaagtttccttttgtgtct---tctct-ttagggttcattattgagagagtgggtaac---acaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgt 562  Q
    |  |  ||||| ||||||| |||| |   | ||| ||||| |||   |||||||| ||| || ||   | |||||||||||||||| || |||||||| |    
T  33030825 agaacaaaaagcttcctttagtgttttaatttctcttaggattc---attgagagtgtgagtgacttgaaaaatgggtagaaattatgttttgttctt-t 33030920  T
Q  563 gtaagcttgcaagttattttcttgtaa-ctctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaa 661  Q
    || |||||  ||| || |||||||||| | | ||| | |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||| |||| |    
T  33030921 gtgagcttttaagctaatttcttgtaaccccattgcatcactttcatcttagtgaattggagagctgctctctcccccagagtatgtcatatttgaccga 33031020  T
Q  662 ac-----tagcaatc-ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacact 745  Q
    ||     || ||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||| |  ||||||| |||| || ||||| ||||||||||||    
T  33031021 actgaattaacaatctttgatgtgtttgttcctttat-tttcattggttatctttattgctttgattattctcgtggtattgctctacact 33031110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 226 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 16650043 - 16649863
Alignment:
Q  226 gataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttc 324  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||| |||| ||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  16650043 gataaggttggtcgtaccttggatcgtacgcaccaaccgtgtcacgatttggcaaaatgtgacatgattttgacagctaaagactactatataagtgttt 16649944  T
Q  325 ttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttg 404  Q
     | ||||||||||| |  | || || ||| |||  |||||| |||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16649943 ctttgcagattttgaatgataggttcaagagaggaaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgatggtctttg 16649863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 447
Target Start/End: Original strand, 26170450 - 26170751
Alignment:
Q  147 tggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataagg-ttggtcgtacctt 245  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||  ||||||| |||||||  |||| |||||||| | | || |||| || |||||||  ||||||||||||    
T  26170450 tggtttgcagggtgccaaatcgtgacacgatcgtgggaaatcgtgacataatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtacctt 26170549  T
Q  246 gggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtaga 345  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||   |||| | |||| |||||||||  |||  || | ||  ||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  26170550 gggacggacgcaccaatcgtgacacgacctggatatcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgtgcagattttgaag-aga 26170648  T
Q  346 gcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatct 444  Q
    | | |||| ||||||||||| |||   ||||||  |||||| ||||||| || |||||||     ||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  26170649 gttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagtctttgattacagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacacct 26170748  T
Q  445 tgg 447  Q
    |||    
T  26170749 tgg 26170751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 188 - 296
Target Start/End: Original strand, 27015025 - 27015133
Alignment:
Q  188 cgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg-ttttggaaaacgtgc 286  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||     
T  27015025 cgtgacacgattttcag-cttgttgggcatgttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaaacgtgtcacgatttgggaaatcgtga 27015123  T
Q  287 cacgattttg 296  Q
    ||||||||||    
T  27015124 cacgattttg 27015133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 533 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 6741997 - 6741784
Alignment:
Q  533 aaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaac-tctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctc 631  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||| || ||||||||| ||||||||    
T  6741997 aaatgagtagaaattaggttttgttctt-tgtgagtttgcaagctaatttcttgtaacttctttgtatcacttccatcttaatggattggagagctgctc 6741899  T
Q  632 tctcccccatattaggtcatattggaccaaac-----tagcaatc-ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatg 724  Q
    | ||||||| | || ||||||||| ||| |||     ||  |||| |||||||||||||||   |||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||    
T  6741898 tatcccccagagtatgtcatattgaaccgaactgtgttaataatctttggtgtgtttgttc--atttctttcattgcttatctttattgctttgattatg 6741801  T
Q  725 cttgtggtgttgctcta 741  Q
    |||||||||||| ||||    
T  6741800 cttgtggtgttgttcta 6741784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 9789809 - 9789415
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | ||| ||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||   || |||| |||||||||   | || |||||| ||||||    
T  9789809 tgttgagatttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagc-tggttt 9789711  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataagg-ttggtcgtaccttgggtcg 251  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||| | | || |||| || |||||||  |||||||  |||| | ||    
T  9789710 gcagggtgccaaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgatttgaaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtttcttgcgacg 9789611  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttga 351  Q
     |||||||| ||||| ||||   || ||| |||| |||||||||  |||  || | ||  ||| |||||||||||||||||| |||| || |||| | ||    
T  9789610 aacgcaccattcgtgacacgacctgaaaatcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgtgcaga-tttgaaggagagttgga 9789512  T
Q  352 agtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    || ||||||||||| |||   ||||||  |||||| ||||||| || |||||||    |||  |||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  9789511 agagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagtctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgg 9789415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 271
Target Start/End: Original strand, 16407641 - 16407859
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||   || |||| ||||||||    | || |||||| ||||||    
T  16407641 tgttgagatttggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttgacatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagc-tggttt 16407739  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataagg-ttggtcgtaccttgggtcg 251  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| ||| | || ||||||||||||| |||||||| | | || |||| || |||||||   |||||||||||||| ||    
T  16407740 gcagggtgccaaatcgtgacacgatcttgaggaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggaccggtcgtaccttgggacg 16407839  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacg 271  Q
    ||||| ||||||||| ||||    
T  16407840 tacgctccaatcgtgacacg 16407859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 201
Target Start/End: Original strand, 212986 - 213068
Alignment:
Q  119 cgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgatttt 201  Q
    |||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212986 cgtgacacgattttctaggtagtgagcatggtttgcagggcgtccaatcgtgacacgattttgggaaaacgtgacacgatttt 213068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 582 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 15044781 - 15044708
Alignment:
Q  582 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15044781 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattgg 15044708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 271
Target Start/End: Original strand, 16409077 - 16409295
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacga-tttcccaggcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||   || |||| ||||| |||   | |  |||||| ||||||    
T  16409077 tgttgagatttggcttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgtcgtgagc-tggttt 16409175  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataagg-ttggtcgtaccttgggtcg 251  Q
    ||| |||||  ||| ||| |||||| ||| | || ||||||||||||| |||||||| | | || |||| || |||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  16409176 gcaaggtgccaaattgtgacacgatcttgaggaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtacattgggacg 16409275  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacg 271  Q
    ||||| ||||||||| ||||    
T  16409276 tacgctccaatcgtgacacg 16409295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 43592375 - 43592301
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  43592375 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 43592301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 43598820 - 43598746
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  43598820 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 43598746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 43604312 - 43604238
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  43604312 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 43604238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 43609804 - 43609730
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  43609804 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 43609730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 353
Target Start/End: Original strand, 535685 - 535758
Alignment:
Q  279 aaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaag 353  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||    
T  535685 aaacgtgtcacgattttgacagctgaagactgatatataattgttctt-tgcagattttgaaggagaggttgaag 535758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 39468862 - 39468749
Alignment:
Q  333 attttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaac 431  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |   | ||||||||||||||||||    
T  39468862 attttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtcttt-cattagagttctcttgggttgggaaac 39468764  T
Q  432 attgtaaacatcttg 446  Q
    |||||||||| ||||    
T  39468763 attgtaaacaccttg 39468749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 3075931 - 3075863
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaaca 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3075931 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttg-attaaagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 3075863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Original strand, 31401838 - 31401913
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  31401838 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccatattaggccacattgg 31401913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Original strand, 1457151 - 1457225
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  1457151 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg 1457225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 27449910 - 27449836
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  27449910 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggctatattgg 27449836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 581 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 27445066 - 27445001
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattagg 647  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27445066 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattagg 27445001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 27450402 - 27450265
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttc-ccaggcagtgagcatggtttgcagggtg 160  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   || |||| |||||||||    ||| |||||| | |||||||||  |    
T  27450402 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggggccgtgagc-tagtttgcaggacg 27450304  T
Q  161 ctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgatt 199  Q
    |  ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  27450303 ccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatt 27450265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 28751077 - 28751027
Alignment:
Q  150 tttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattt 200  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28751077 tttgcagggtgttcaatcgtgacacgattttgggaaaacgtgacacaattt 28751027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 30631941 - 30631804
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggtttgcagggtg 160  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   || |||| |||||||||   | || ||||||   |||||||||  |    
T  30631941 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagc-cagtttgcaggacg 30631843  T
Q  161 ctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgatt 199  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30631842 ccaaatcgtgacacgattttgggaaatcgtgacacgatt 30631804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 449
Target Start/End: Original strand, 42926687 - 42926864
Alignment:
Q  272 ttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggatt 370  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||  || ||| | |||| ||||||||  ||| |||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||| |||      
T  42926687 ttttggcaatcgtgacacgattttgacacttgcagagtactatttaagtgtttctgttcagattttggatgagagcttcaagagagaaaaacttgggaaa 42926786  T
Q  371 acaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
     |||| |||||||||||||| ||||  ||||||| | |   | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  42926787 tcaaatgaggtaactttaggattgatggtctttg-attagagttctcttggattgggaaacattgtaaacaccttgggt 42926864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 271
Target Start/End: Original strand, 535643 - 535696
Alignment:
Q  218 gttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg 271  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  535643 gttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtatgcaccaaacgtgtcacg 535696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 593 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 2630316 - 2630243
Alignment:
Q  593 tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaactag 666  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| || |  ||||||||||||||| ||||||    
T  2630316 tttgtatcactttcatcatagtggattgaagagctgctatctccctcaaagcaggtcatattggaccgaactag 2630243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 372 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 5887689 - 5887613
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||    |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5887689 caaaggaggtaactttagggttgagggtatttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 5887613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 583 - 656
Target Start/End: Original strand, 37556613 - 37556685
Alignment:
Q  583 cttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  37556613 cttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg 37556685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 583 - 656
Target Start/End: Original strand, 37561435 - 37561507
Alignment:
Q  583 cttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  37561435 cttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg 37561507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 2785472 - 2785397
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  2785472 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg 2785397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 447
Target Start/End: Original strand, 16409321 - 16409452
Alignment:
Q  316 taagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggat 414  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| | |||| |||||||||||||   | ||||||  |||||| ||||||| || |||||||    |||  |    
T  16409321 taagtgttcttgtgcagattttgaag-agagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagtctttgattagagctt 16409419  T
Q  415 ctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16409420 ctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttgg 16409452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 271
Target Start/End: Original strand, 29719965 - 29720184
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | ||| ||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||   || |||| |||||||||   | || |||||| | || |    
T  29719965 tgttgagatttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtggtgccgtgagc-tagtct 29720063  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgatt-ttcaaacttgttgggtacgttttcaagataagg-ttggtcgtaccttgggtc 250  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||| | | || |||| || |||||||  ||||| ||||||||| |    
T  29720064 gcagggtgccaaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgattgtgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcataccttgggac 29720163  T
Q  251 gtacgcaccaatcgtgccacg 271  Q
    | | |||||||||||| ||||    
T  29720164 ggatgcaccaatcgtgacacg 29720184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 31180823 - 31180771
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttca 114  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31180823 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgatttca 31180771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Original strand, 31396981 - 31397056
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  31396981 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg 31397056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 266
Target Start/End: Original strand, 38746535 - 38746575
Alignment:
Q  226 gataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtg 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38746535 gataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaaacgtg 38746575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 43592847 - 43592795
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttca 114  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43592847 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgatttca 43592795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 355 - 449
Target Start/End: Original strand, 537902 - 537996
Alignment:
Q  355 gagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |   | |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  537902 gagagaaacttggaaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagttctcttggcttgggaaacatcgtaaacaccttgggt 537996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 15465125 - 15465070
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacga 109  Q
    |||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15465125 tgttgagatttggcttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcgtgacacga 15465070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 112
Target Start/End: Original strand, 1456645 - 1456695
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1456645 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 1456695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 610 - 664
Target Start/End: Original strand, 4410237 - 4410291
Alignment:
Q  610 atagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  4410237 atagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaact 4410291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 27445559 - 27445422
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttc-ccaggcagtgagcatggtttgcagggtg 160  Q
    |||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||   || |||| |||||||||    ||| |||||| | |||||||||  |    
T  27445559 attggcttcaaatttgtggtctagaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggggccgtgagc-tagtttgcaggacg 27445461  T
Q  161 ctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgatt 199  Q
    |  ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  27445460 ccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatt 27445422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 112
Target Start/End: Original strand, 29402557 - 29402607
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  29402557 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 29402607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 39468962 - 39468912
Alignment:
Q  216 acgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtg 266  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  39468962 acgtttttaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtatgcaccaaacgtg 39468912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 43599311 - 43599261
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  43599311 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 43599261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 43604803 - 43604753
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  43604803 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 43604753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 43610295 - 43610245
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  43610295 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 43610245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 553 - 656
Target Start/End: Original strand, 28807533 - 28807635
Alignment:
Q  553 ttgttcttgtgtaa-gcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcat 651  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||| ||  ||||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||     
T  28807533 ttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagattcttgtaaccttttgtaacactt-ca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccac 28807630  T
Q  652 attgg 656  Q
    |||||    
T  28807631 attgg 28807635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 449
Target Start/End: Original strand, 19806320 - 19806355
Alignment:
Q  414 tctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19806320 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 19806355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 30683308 - 30683269
Alignment:
Q  162 tcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgatttt 201  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30683308 tcaatcgtgacacaattttgggaaaacgtgacacgatttt 30683269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 372 - 425
Target Start/End: Original strand, 5007446 - 5007497
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||    
T  5007446 caaaggaggtaactttagggttgagtatctttg--gtgaggttctcttgagttg 5007497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 610 - 664
Target Start/End: Original strand, 15552460 - 15552514
Alignment:
Q  610 atagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  15552460 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaact 15552514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 725 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 24135796 - 24135718
Alignment:
Q  725 cttgtggtgttgctctacactaagtctaggtctatttt-ttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccact 805  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||  |||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  24135796 cttgtggtgttgctctacact-agtctagggctgttttgttgttgt--ttgcttggagactctttactcatagattaccact 24135718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 610 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 31179435 - 31179381
Alignment:
Q  610 atagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  31179435 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaact 31179381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 610 - 664
Target Start/End: Original strand, 31542949 - 31543003
Alignment:
Q  610 atagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  31542949 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaact 31543003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 610 - 664
Target Start/End: Original strand, 31545295 - 31545349
Alignment:
Q  610 atagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  31545295 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaact 31545349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 129
Target Start/End: Original strand, 37560955 - 37561021
Alignment:
Q  63 ttggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgat 129  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| || | |||| ||||||    
T  37560955 ttggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagtaatcgtgacacgatttgataatcgtgacacgat 37561021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 198
Target Start/End: Original strand, 28807170 - 28807219
Alignment:
Q  149 gtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgat 198  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  28807170 gtttgcagggtgcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgat 28807219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 725 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 35387611 - 35387532
Alignment:
Q  725 cttgtggtgttgctctacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||  | ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  35387611 cttgtggagttgctctacacta-gactagggttgttttt-gttgttgttgcttggagacactttacacatagattatcactt 35387532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 112
Target Start/End: Original strand, 37556133 - 37556182
Alignment:
Q  63 ttggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  37556133 ttggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagtaatcgtgacacgattt 37556182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 510; Significance: 0; HSPs: 86)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 510; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 51 - 806
Target Start/End: Original strand, 23077941 - 23078701
Alignment:
Q  51 tattgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggt 150  Q
    |||||||| | |||||||| |||  | |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23077941 tattgttgcatattggcttcaaaattttggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatgga 23078040  T
Q  151 ttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtc 250  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  23078041 ttgtagggtgctcaattgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaggataaggttggtcgtatcttgggtc 23078140  T
Q  251 gtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttg 350  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23078141 gtacgcaccaatcgtgccacgatttggaaaacgtgacacaattttgacagttgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttg 23078240  T
Q  351 aagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggta 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23078241 aagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaacttttgggttgagtgtctttgtgatgagaatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggta 23078340  T
Q  451 gtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattagg 550  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23078341 gtgagatttcatcattggaaggatcaaaagcttccttttgtgtcttctc-ttagggttcatcattgagagtgtgggtaacacaaatgggtagaaattaag 23078439  T
Q  551 tcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtca 650  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  23078440 tcttgttcttgtgtaagcttgcaagctattttcttgtaactctttctaacactttcatcatagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtca 23078539  T
Q  651 tattggaccaaactag--caa-----tcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctaca 743  Q
    ||||||| | |||| |  |||     | ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23078540 tattggatcgaactgggtcaacattcttttggtgtgtttgttcc--attctttcattgcttatctttgtgctttgattatgcttgtggtgttgctctaca 23078637  T
Q  744 ctaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    || || ||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23078638 cttagatctaggtatgttttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccactt 23078701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 806
Target Start/End: Original strand, 10706733 - 10707482
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttg-cagggtg 160  Q
    |||||||| |||| ||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  |||||||    
T  10706733 attggcttcaaatttgttgtttggaagaacagagaaatcgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgattttc-aggcagggagcatggtttctcagggtg 10706831  T
Q  161 ctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcacca 260  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10706832 ctcaattgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgctggatacgttttaaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacacacca 10706931  T
Q  261 atcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagaga 360  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||    
T  10706932 atcgtgccacggtttggaaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaagaagagctggaagagagaga 10707031  T
Q  361 aacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttc 460  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  10707032 aacttagattacaaaggaggtaactttagggtttattatctttgtagtgaggatctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgggtagttagatttc 10707131  T
Q  461 accattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttct 559  Q
    |||||| ||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10707132 accattagaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttctc-ttaggattca-tattgtgagagtgggtgacacagatgggtagaaattaggtcttgttct 10707229  T
Q  560 tgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggac 658  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10707230 tgtgtaagcttgtaagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggac 10707329  T
Q  659 caaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tcta 752  Q
    | ||||     | |||||| ||||||||| |||   |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || ||||    
T  10707330 cgaactgggtcaacaatctcggtgtgtttattc--atttctttctttgcttatctttgtgctttgattatgcttgcagtgttgctctacacttagatcta 10707427  T
Q  753 ggtctatttt-ttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10707428 ggtatattttcttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccactt 10707482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 147 - 800
Target Start/End: Original strand, 28258743 - 28259400
Alignment:
Q  147 tggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttg 246  Q
    ||||||||||||||   ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28258743 tggtttgcagggtgtcaaatcgtggcacaattttgtgaaatcgtgacacgattttcaaacttgctggttaagttttcaggataaggttggtcgtaccttg 28258842  T
Q  247 ggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagag 346  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  28258843 ggtcgtacgcatcaatcgtggcacgatttggaaaacgtggcacgattttatcaactgaagactgctatataagtgttcttgtgtagattttgaagaagag 28258942  T
Q  347 cttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttg 446  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28258943 cttgaagagagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttatagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttg 28259042  T
Q  447 ggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaat 546  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28259043 ggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaagcttccttttgtgtcttctctttaggggtcattattgagagagtgggaaacacaaatgggtagaaat 28259142  T
Q  547 taggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattag 646  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28259143 tagatcttgttcttgtgtaagcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattag 28259242  T
Q  647 gtcatattggaccaaact-----agcaatc--ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctc 739  Q
    ||||||||||||| ||||     | |||||  |||||||||||||   || ||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  28259243 gtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgt---ttcttctttcattgcttatctttgttctttgtatatgcttgtggtgttgctc 28259339  T
Q  740 tacactaagtctaggtct-attttttgttgttattgcctggagacactttacacattgatta 800  Q
    |||||| || ||||||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28259340 tacact-agactaggtctgtttttttgttattgttgcttggagacactttacacattgatta 28259400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 44 - 806
Target Start/End: Original strand, 33528087 - 33528850
Alignment:
Q  44 tcatgggtattgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtga 143  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||    
T  33528087 tcatggttattgttgttaattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacaatttcatcaacgtatcatgattttc-aggcagtga 33528185  T
Q  144 gcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtacc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  33528186 gcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgctgggtacgttttcagaataaggttgatcgtacc 33528285  T
Q  244 ttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgga-aaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  33528286 ttgggtcgtacgcaccaatcgtgtcacgatttggacaaacgtgacacgattttaacaactgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaagg 33528385  T
Q  343 agagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacat 442  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33528386 agagcttgaagagagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacac 33528485  T
Q  443 cttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggt 540  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  33528486 attgggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttctc-ttaggattcattattgagagtttgggtgacacaaaatgggt 33528584  T
Q  541 agaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctccccc 639  Q
    ||||||||||||||||||||     |||||  ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||    
T  33528585 agaaattaggtcttgttctt-----agcttataagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctttccc 33528679  T
Q  640 atattaggtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtg 733  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     | |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |  ||||||| ||||||||||||||    
T  33528680 atattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tttctttcattgtttatctttattgctttgattatgcttgtggtg 33528777  T
Q  734 ttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||||||||| | || |||||||||  ||||||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  33528778 ttgctctacatttagatctaggtct-gtttttgttgttgttgcttggggacactttatccattgattaccactt 33528850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 149 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 34389380 - 34388727
Alignment:
Q  149 gtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttggg 248  Q
    |||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34389380 gttttcagggtgtccaatcgtgacacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgctgggtacgttttcaggataaggttggtcgtaccttggg 34389281  T
Q  249 tcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagct 348  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  34389280 tcgtacgcaccaatcgtgtcacgatttggaaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagct 34389181  T
Q  349 tgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttggg 448  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34389180 tgatgtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgtgtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggg 34389081  T
Q  449 tagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaat 546  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  34389080 tagtgagatttcaccattggaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttctc-ttaggattca-tattgtgagagtgggtgacacaaaatgggtagaaat 34388983  T
Q  547 taggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatatta 645  Q
    ||||||||||||||||||||||        || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  34388982 taggtcttgttcttgtgtaagc--------taatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcccccagatta 34388891  T
Q  646 ggtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctct 740  Q
    |||||||||||||| || |     | |||||| ||||||||||||||  |||||||| ||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  34388890 ggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctcggtgtgtttgttcc--tttctttctttgtttatctttgtgctttgattttgcttgtggtgttgctct 34388793  T
Q  741 acactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||||| || |||||||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  34388792 acacttagatctaggtct-gtttttgttgttgttgcttgaagacactttacatattgattaccactt 34388727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 20522839 - 20522088
Alignment:
Q  61 aattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttg-cagggt 159  Q
    ||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||    
T  20522839 aattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacataatttcatcaacgtgtcacgatttcc-aggcaatgagcatggtttttcagggt 20522741  T
Q  160 gctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcacc 259  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20522740 gctcaatcgtgtcacgattttgagaaaacgtgacacgattttcaa-cttgctgggcacgttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcacc 20522642  T
Q  260 aatcgtgccacgttttgga-aaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgaga 358  Q
    ||||||| |||  |||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| || ||||    
T  20522641 aatcgtgtcacaatttggacaaacgtgacacgattttgacagctaaaaactgctataaaagtgttcttctgcagattttgaaggtgagcttggagagaga 20522542  T
Q  359 gaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatt 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20522541 gaaacttagattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgagtatctcttgggttgggaagcattgtaaacaacttgggtagtgagatt 20522442  T
Q  459 tcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgt 556  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| || || |||||  ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  20522441 tcaccatttgaatgatcaaaaagcttccttttgtgttttttc-ttaggactcattattgagagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattaagtcttgt 20522343  T
Q  557 tcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattg 655  Q
    |||| |||||||||  ||  || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20522342 tcttttgtaagcttataatctaatttcttgtaacccttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattg 20522243  T
Q  656 gaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag- 748  Q
    |||| ||||     | |||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  20522242 gaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tttctttcatttcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttaga 20522145  T
Q  749 tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20522144 tctatgtct-ttttttgttgtttttgcttggagacactttatccattgattaccactt 20522088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 21630561 - 21629818
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgc-agggtg 160  Q
    |||||||| |||| ||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||    
T  21630561 attggcttcaaatttgtagtttggaagaacagagaaatcgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcc-aggcagtgagcatggttttttagggtg 21630463  T
Q  161 ctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcacca 260  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21630462 ctcaatcgtgtcacaattttgggaaaacatgacacgattttcaa-cttgctgggcacgttttcaggataaggttggtcgtactttgggtcgtacacacca 21630364  T
Q  261 atcgtgccacgttttgga-aaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagag 359  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  21630363 atcgtgtcacgatttggacaaacgtgacacgattttgacagctaaagactgctatataagtgttcttgtgtagattttgaaggagagcttgaagggagag 21630264  T
Q  360 aaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagattt 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21630263 aaacttggattacaaaggaggtaactttagtgttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagattt 21630164  T
Q  460 caccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgtt 557  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  21630163 caccattggaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttctc-ttaggattcattattgagagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattaagtcttgtt 21630065  T
Q  558 cttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||||||||  ||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21630064 cttgtgtaagcttataaactaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctct-ccccagattaggtcatattgg 21629966  T
Q  657 accaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-t 749  Q
    ||  ||||     | |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |  |||||||       |||||||| ||||||||||| || |    
T  21629965 actgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tttctttcattgcttatctttattgctttg-----aattgtggtgctgctctacacttagat 21629873  T
Q  750 ctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  21629872 ctaggtc--tgttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccactt 21629818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 13569946 - 13569196
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgc 161  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13569946 attggcttcaaatttgtggtttgaaagaacagaaaaatcatgacatgatttcatcaacgtatcacgatttcc-aggcagtgagcatggtttgcagggtgc 13569848  T
Q  162 tcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgtttt-caagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcacca 260  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  13569847 tcaatcgtgtcataattttggaaaaacgtgacacgattttcaaatttgctgggtacgtttttcaggataaggttg-tcgtaccttggatcgtaagcacca 13569749  T
Q  261 atcgtgccacgttttggaaaacgt-gccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttga-agtgaga 358  Q
    |||||| |||| |||||||||  | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  || ||||    
T  13569748 atcgtgtcacgatttggaaaaatttgacacgattttgacagctgaagactactatataagtgttcttgtgcagattttaaaggagagcttgggagagaga 13569649  T
Q  359 gaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatt 458  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  13569648 gaaacttggattacaaatgagataactttagggttaagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattataaacaccttggatagtgagatt 13569549  T
Q  459 tcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacaca-aatgggtagaaattaggtcttgt 556  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||    
T  13569548 tcaccattggaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttctc-ttaggattca-tattgtgagagtgggtgacaaacaaagggtagaaattaggtcttgt 13569451  T
Q  557 tcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattg 655  Q
    |||||||||| |||  ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13569450 tcttgtgtaaacttataagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattg 13569351  T
Q  656 gaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-t 749  Q
    |||| ||||     | |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| || |    
T  13569350 gaccgaactgggtcaacaattttggtgtgtttattcc--tttctttcattgattatctttgtgctttgattatgcttgtggtgtttctctatacttagat 13569253  T
Q  750 ctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||| | || |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13569252 ctaagcctgttttttgttgttgttgtttggagacactttacacattgattaccactt 13569196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 806
Target Start/End: Original strand, 8389631 - 8390382
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgc 161  Q
    |||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||     
T  8389631 attggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgatttcatcaacgtgtcaagatttcc-aggcagtgagtatgatttgcagggtgt 8389729  T
Q  162 tcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgtttt-caagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcacca 260  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8389730 tc--tcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgctgagtacgtttttcaggataaggttggacgtaccttgggtcgtacgcacca 8389827  T
Q  261 atcgtgccacgttttggaaaa-cgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagag 359  Q
    ||| || || | ||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  8389828 atcatgtcatgatttggaaaaacatgacacgattttgatagctgaagactgttatttaagtgttcctgtgcagattttgaagtagagctggaagagagag 8389927  T
Q  360 aaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagattt 459  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  8389928 aaacttggattacaaaggagataactttagggttgagggtctttgtagtgatgatctcttgggttaggaaacattgtaaacaccttggatagtgagattt 8390027  T
Q  460 caccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgtt 557  Q
     ||||||||||  ||| ||||| ||||| |||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8390028 taccattggaagaatcaaaaagcttcctcttgtgttttctc-ttaggattca-tattgtgagagtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgtt 8390125  T
Q  558 cttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||| ||||||| ||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  8390126 cttgtgcaagcttgtaagctaatttcttgtaactcttttttaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttgg 8390225  T
Q  657 accaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tc 750  Q
    ||| ||||     | |||| |||||||||||||||   |||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  8390226 accgaactgggtcaacaattttggtgtgtttgttc--atttctttcatcgcttatctttgtgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatc 8390323  T
Q  751 taggtc---tattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||||||   | ||| |||||||| |||  |||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  8390324 taggtctggtttttgttgttgttgttgtttggatacactttatccattgattaccactt 8390382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 282 - 806
Target Start/End: Original strand, 36757463 - 36757990
Alignment:
Q  282 cgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggt 381  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36757463 cgtgacacgattttgacagctgaagactgttatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagtgagagaaacttgaattacaaaggaggt 36757562  T
Q  382 aactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagt 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  36757563 aactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaagc 36757662  T
Q  482 ttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattt 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  36757663 ttccttttgtgtcttctctttagggttcatcattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggttttgttcttgtgtaagcttgaaagcttttt 36757762  T
Q  582 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatc--ttg 674  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| | || |||||| |||||||||||||||||| || |     | |||||  |||    
T  36757763 tcttataactctttgaaacactttcatcatactggattggagagctgttatcccccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttttg 36757862  T
Q  675 gtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaagtctaggtctattttttgttgttattg 774  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||    
T  36757863 gtgtgtttgttcc--tttctttcattgcttatctttgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaagtctaggtc--tgttttgttgttgttg 36757958  T
Q  775 cctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36757959 cttggagacactttacacattgattaccactt 36757990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 134 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 33118680 - 33118004
Alignment:
Q  134 caggcagtgagcatggtttg-cagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataagg 232  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||| || ||||||||||||||    
T  33118680 caggcagcgagcatggtttttcagggtgctcaatcgtgtcacgtttttaggaaaacgtgacacaattttcaa-cttgctgggcacattttcaagataagg 33118582  T
Q  233 ttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgga-aaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgca 331  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33118581 ttggccgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgtcacgatttggacaaacatgacacgattttgacaactgaagactgctatataagtgttcttgtgca 33118482  T
Q  332 gattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaac 431  Q
    ||||||| || |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33118481 gattttgaagaagagcttttagagagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggggaac 33118382  T
Q  432 attgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaac 530  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| ||| | |||   |||||||| | |||| ||    
T  33118381 attgtaaacaccttgggtagtgagatttcgccattggaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttctc-ttaagattc---attgagagtgagggtgac 33118286  T
Q  531 ac-aaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaact-ctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctg 628  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  33118285 acaaaatgggtagaaattaagtcttgttcttgtgtaagcttataagctaatttcttgtaactattttgtaactctttcatcatagtggattggagggctg 33118186  T
Q  629 ctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgttta 722  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     | |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |  | ||||| |||    
T  33118185 ctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagccaacaatcttggtgtgtttgttcc--tttctttcattgcttatctttattactttgatta 33118088  T
Q  723 tgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||  |||||||||||  ||  || ||||||||||   ||||||||||||||    
T  33118087 tgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtct-gtttttgttgttgatgtttgaagacactttatctattgattaccactt 33118004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 101 - 806
Target Start/End: Original strand, 14698529 - 14699227
Alignment:
Q  101 gtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattt 200  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||| |||| | |||||||||||||| ||| | || || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14698529 gtgacacgatttcctcatcgtgacacaattttctaggcagtgagcatgattttctggatgttcattcgtatcacgattttgggaaaacgtgacacgattt 14698628  T
Q  201 tcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgga-aaacgtgccacgattttgaca 299  Q
    |||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||| |||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  14698629 tcaa-cttgttgggcacattttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaaccatttcacgatttggacaaacgtgacacgattttgata 14698727  T
Q  300 gctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgt 399  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14698728 gttgaagactgctatataagtgttcttgtgtagattttgaaggagagcttttagagagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgt 14698827  T
Q  400 ctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttct 498  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  14698828 ctttgtagtgaggatctctcgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcactattggaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttct 14698927  T
Q  499 ctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttg 596  Q
    | ||||| |||   |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||| ||||    
T  14698928 c-ttaggattc---attgagagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagctaatttcttgtaactcttttg 14699023  T
Q  597 taacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttt 691  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     | |||||||||||||||||||||  ||    
T  14699024 taac-ctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tt 14699120  T
Q  692 tctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggt---ctattttttgttgttattgcctggagacactt 787  Q
    ||||||||            ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||   || ||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  14699121 tctttcat------------tgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgctttttgttgttgttgttgcttggagacactt 14699208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 53 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 3492378 - 3491621
Alignment:
Q  53 ttgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggtt 151  Q
    ||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||    | || |||||| |||||    
T  3492378 ttgttgagatttggcttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagc-tggtt 3492280  T
Q  152 tgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggtt-ggtcgtaccttgggtc 250  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||| | | || |||| || |||||||   |||||||||||| | |    
T  3492279 tgcagggtgccaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattctgaaacttgctcgttaagtttccaggataaggacaggtcgtaccttgtgac 3492180  T
Q  251 gtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttg 350  Q
    ||||| |||||||||| ||||  ||||||| |||| ||| |||||  |||  |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  3492179 gtacgtaccaatcgtgacacgacttggaaatcgtgacacaattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattttggagtaaagctt- 3492081  T
Q  351 aagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacatcttggg 448  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||    
T  3492080 -agagagagaaacttggattacaaaggagggaaatctagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggaaaaaacattgtaaacaccttggg 3491982  T
Q  449 tagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgggtaa-cacaaatgggtagaaat 546  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||      
T  3491981 tagtgagattccaccattggaaggatcttaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatc 3491883  T
Q  547 taggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatttt-cttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatatta 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  3491882 taggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagatta 3491783  T
Q  646 ggtcatattggaccaaact-----agcaatc--ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatc-tgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgc 737  Q
    || |||||||| |  ||||     | |||||  |||||||||||||||   || ||||| ||| ||||| ||  |||||| | | |||||||||||||||    
T  3491782 ggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttc---ttcctttc-ttgcttatcttggttgctttctatttgcttgtggtgttgc 3491688  T
Q  738 tctacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||||||| || ||||| ||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3491687 tctacact-agactagggct-gtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccactt 3491621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 293 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 17865589 - 17865071
Alignment:
Q  293 tttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggt 392  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17865589 tttgacagctaaagactgctatataagtgttcttgtgcaaattttgaagaagagcttgaagagacagaa-cttggattacaaaggaggtaactttagggt 17865491  T
Q  393 tgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgt 491  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||| |||| ||||| ||||||||||    
T  17865490 tgagtgtctttgtagtgaagatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcacaaatagaaggatcaaaaagcttccttttgt 17865391  T
Q  492 gtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaaca-caaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaac 590  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||| |||| | |||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||    
T  17865390 gttttctc-ttaggattcattattgagagtgtggatgacataaaataggtagaaattatgtcttgttcttgtgtaagcttataagctaatttcttgtaac 17865292  T
Q  591 tc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgt 684  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||     | ||||||||||||| ||||    
T  17865291 tcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattcgactgaactgggtcaacaatcttggtgtgattgt 17865192  T
Q  685 tcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggaga 782  Q
    |||  ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |  ||||||||||| |||  ||||||    
T  17865191 tcc--tttctttcattgattatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtat-gtttttgttgttgttggttggaga 17865095  T
Q  783 cactttacacattgattaccactt 806  Q
    || ||||  |||||||||||||||    
T  17865094 cattttatccattgattaccactt 17865071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 54 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 40739457 - 40738865
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||   || |||| ||||||||    | || |||||| ||||||    
T  40739457 tgttgagatttggcttcaaatttgtggtctggaagaacagacaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgttatgccgtgagc-tggttt 40739359  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggtt-ggtcgtaccttgggtcg 251  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| ||| | ||  ||||||| ||||||||||||| | | || ||||||| |||||||   |||||||||||| | ||    
T  40739358 gcagggtgccaaatcgtgacacgatcttgtggaattgtgacacaattttcaaacttgctcgttaagttttcaggataaggacaggtcgtaccttgtgacg 40739259  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagatttt-ggagtagagcttg 350  Q
    |||| | |||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  40739258 tacgtatcaatcgtgacacgatttggaaatcgtgacacgattttatcagttgaagacttgtatttaagtgttcttgtgcagttttttggagtagag-ttg 40739160  T
Q  351 aagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggta 450  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40739159 aag--agagaaacttggattacaaaggagggaactctagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggta 40739062  T
Q  451 gtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctc-tttagggttcattattgagagagt-gggtaacacaaatgggtagaaatta 548  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  40739061 atgagatttcaccattggaaggatcaaaagcttactattgtgtcttctcttttagggttca-tattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaacta 40738963  T
Q  549 ggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggt 648  Q
     | |||||||||||||||||||||||| ||||||        || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  40738962 agacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt--------tc-ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctc-cccccagattaggt 40738873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 374 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 39483237 - 39482815
Alignment:
Q  374 aaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatga 473  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39483237 aaggagataactttagggttgagtgtctttgttgtgaggatctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaatga 39483138  T
Q  474 tc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaaca-caaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttg 571  Q
    || ||||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39483137 tcaaaaaacttccttttgtgttttctc-ttaggattcattattgagagtgtgggtgacataaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagctta 39483039  T
Q  572 caagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaactag---- 666  Q
     ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||        
T  39483038 taagctaatttcttgtaactcttttgtaacattttcatcatagtggattggaggcctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactaggtca 39482939  T
Q  667 -caatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttt 763  Q
     |||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||| |||||    
T  39482938 acaatcttggtgtgtttgttcc--tctctttcattgtttatctttattgctttggttatgcttgtggtgttgttctacacttagatttaggtctgttttt 39482841  T
Q  764 tgttgttattgcctggagacacttta 789  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||    
T  39482840 tgttgttgttgtttggagacacttta 39482815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 355 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 31056369 - 31055910
Alignment:
Q  355 gagagaaacttgg-attacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttg--ggttgggaaacattgtaaacatcttgggtag 451  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31056369 gagagaaacttgggaatacaaaggaggtaacttgagggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaacattgtaaacaccttgggtag 31056270  T
Q  452 tgagatttcaccattggaatgatcaaaa-gtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaa-tgggtagaaattag 549  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||||   ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  31056269 tgagatttcaccattgaaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttctctt-aggattcatt---gagagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattag 31056174  T
Q  550 gtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggt 648  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  31056173 gtcttgttcttttgtaagcttataagctaatttattgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccctagattaggt 31056074  T
Q  649 catattggaccaaactag-----caatc-ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctcta 741  Q
    ||||||| ||| ||||||     ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31056073 catattgaaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgttcc-ttttctttcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctcta 31055975  T
Q  742 cactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||| || | |||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  31055974 cacttagatttaggtct-gtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccactt 31055910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 355 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 8040390 - 8039928
Alignment:
Q  355 gagagaaacttgg-attacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttg--ggttgggaaacattgtaaacatcttgggtag 451  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8040390 gagagaaacttggtaatacaaaggaggtaactttatggttgagtgtctttgtagtgaagttctcttgagggttgggaaacattgtaaacaccttgggtag 8040291  T
Q  452 tgagatttcaccattggaatgatcaaaa-gtttccttttgtgtcttctct-ttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaa-tgggtagaaatta 548  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || ||| ||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  8040290 tgagatttcaccattggaaggatcaaaaagcttccttttatgtttt-tctcttaggattcat-attgtgagagtgggtgacacaaaatgggtagaaatta 8040193  T
Q  549 ggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactct---ttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatatta 645  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8040192 ggtcttgttcttgtgtaagcttgtaagctaatttcttgtaactctcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagatta 8040093  T
Q  646 ggtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctc 739  Q
    |||||||||||||  ||||     | |||||||| ||| ||| ||||  | || ||||||| |||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8040092 ggtcatattggactgaactgggtcaacaatcttgatgtattttttcc--tctccttcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctc 8039995  T
Q  740 tacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||||| || | |||||||  ||||||||||| |||| || ||||||||||   ||||||||||||||    
T  8039994 tacacttagatttaggtct-gtttttgttgttgttgcttgaagacactttatctattgattaccactt 8039928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 355 - 806
Target Start/End: Original strand, 34682104 - 34682563
Alignment:
Q  355 gagagaaacttgg-attacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttggg--ttgggaaacattgtaaacatcttgggtag 451  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  34682104 gagagaaacttgggaatacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagagttggaaaacattgtaaacaccttgggtag 34682203  T
Q  452 tgagatttcaccattggaatgatcaaaa-gtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaa-tgggtagaaattag 549  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||   ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||     
T  34682204 tgagatttcaccacttgaaggatcaaaatgtttccttttgtgttttctctt-aggattcacc-ttgtgagagtgggtgacacaaaatgggtagaaattaa 34682301  T
Q  550 gtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggt 648  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  34682302 gtcttgttcttgtgtaagcctgtaagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgt 34682401  T
Q  649 catattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctac 742  Q
    ||||||||||| ||||     | |||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||| | |  |  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  34682402 catattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tctctttcattgcttatatttatttgtttgattatgcttgtggtgttgctctac 34682499  T
Q  743 actaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||| || | |||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  34682500 acttagatttaggtct-gtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccactt 34682563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 62 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 39483493 - 39483235
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttg-cagggtg 160  Q
    |||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||  |||||||    
T  39483493 attggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtctcacgatttccaag-cagcgagcatggtttttcagggtg 39483395  T
Q  161 ctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcacca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39483394 ctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcttacgcacca 39483295  T
Q  261 atcgtgccacgttttgga-aaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataag 319  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39483294 atcgtgtcacgatttggacaaacgtggcacaattttgacagctgaagactgctatataag 39483235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 482 - 806
Target Start/End: Original strand, 42039570 - 42039898
Alignment:
Q  482 ttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaa-tgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagtta-t 579  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  42039570 ttccttttatgttttctctt-aggattcat-attgtgagagtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgtttttgtgtaagcttgcaagctaat 42039667  T
Q  580 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaactag-----caatc--t 672  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||     |||||  |    
T  42039668 tttcttgtaactcttcgtaacactttcatcatagtggattagagagctgctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactagatcaacaatcttt 42039767  T
Q  673 tggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaagtctaggtctattttttgttgttat 772  Q
    ||||||| ||| |||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  ||||||||||| |    
T  42039768 tggtgtgcttgctcc--tttctttcattgcttatctttgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacacttaatctaggtat-gtttttgttgttgt 42039864  T
Q  773 tgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42039865 tgcttggagacactttacacattgattaccactt 42039898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 518 - 806
Target Start/End: Original strand, 10445379 - 10445674
Alignment:
Q  518 gagagtgggtaacacaaa-tgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtg 615  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  10445379 gagagtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagattgtaagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcataatagtg 10445478  T
Q  616 gattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt 710  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     | |||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||| |    
T  10445479 gattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tctctttcattgcttatcttt 10445576  T
Q  711 -gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
      ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  10445577 attgctttgattatgcttgtggttttgctctacacttagatttaggtctgttttttgttgttgttgcttggagacactttatccattgattaccactt 10445674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 63 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 25410257 - 25409842
Alignment:
Q  63 ttggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggtttgcagggtgc 161  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||   || |||| ||||||||    | || ||||| ||||||||||||||||    
T  25410257 ttggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgag-atggtttgcagggtgc 25410159  T
Q  162 tcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggt-tggtcgtaccttgggtcgtacgcacca 260  Q
      ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | | || || | |  |||||||  ||||||||||||| | |||||| ||||    
T  25410158 caaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtatccttgataaggaatggtcgtaccttgtgacgtacgtacca 25410059  T
Q  261 atcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaa-------- 352  Q
    |||||| ||||  ||||||| |||| ||| |||||  |||  ||||  || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |            
T  25410058 atcgtgacacgacttggaaatcgtgacacaattttatcagaggaaggatgatatttaagtgttcttgtgcagattttgaagtagagcttggaagagctta 25409959  T
Q  353 gtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacatcttgggta 450  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  25409958 gagagagaaacttggattacagaggagggaacactagggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaaacaccttgggta 25409859  T
Q  451 gtgagatttcaccattg 467  Q
    |||||||||||||||||    
T  25409858 gtgagatttcaccattg 25409842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 62 - 656
Target Start/End: Original strand, 9295869 - 9296476
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggtttgcagggtg 160  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   || |||| |||||||||   | || |||||| | ||||||||| ||    
T  9295869 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggtgccgtgagc-tagtttgcaggatg 9295967  T
Q  161 ctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggt-tggtcgtaccttgggtcgtacgcacc 259  Q
    |  ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||| |   || || | |  |||||||  ||||| |||||||||||| |||||      
T  9295968 ccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcattaagtatccttgataaggactggtcataccttgggtcggacgca-- 9296065  T
Q  260 aatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataa-gtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaa------ 352  Q
    ||||||| |||| | || ||| |||| |||||||    |||  |||||||  ||| ||| ||||||||||||   |||||||| |||||||| |          
T  9296066 aatcgtgacacgatctgaaaatcgtgacacgattgcttcagaggaagactagtatttaaagtgttcttgtgctt-ttttggaggagagcttggaagagct 9296164  T
Q  353 --gtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacatcttggg 448  Q
      | |||| ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||  |||||||| || ||||||    
T  9296165 tagagagaaaaacttggattacaaaggagggaaccaaagggttgagtgtctttgtagaaagtgtctattgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 9296264  T
Q  449 tagtgag-atttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgggtaa-cacaaatgggtagaaa 545  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || |||| ||||||||||     
T  9296265 tagtgaggagttcaccattggaaggatctaaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaat 9296363  T
Q  546 ttaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatat 643  Q
     |||| ||||||||||| |||||||| | | ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  9296364 ctagggcttgttcttgtataagcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccaaat 9296463  T
Q  644 taggtcatattgg 656  Q
    |||| ||||||||    
T  9296464 taggccatattgg 9296476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 62 - 656
Target Start/End: Original strand, 11098394 - 11099002
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggtttgcagggtg 160  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   ||  ||| |||||||||   | || |||||| | |||||||||  |    
T  11098394 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatagtgacacgatttcaaggtgccgtgagc-tagtttgcaggacg 11098492  T
Q  161 ctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggt-tggtcgtaccttgggtcgtacgcacc 259  Q
    |  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| | | || || |    |||||||  |||||  ||||||||| |||||||      
T  11098493 ccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatttagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggactggtcaaaccttgggttgtacgca-- 11098590  T
Q  260 aatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataa-gtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaa------ 352  Q
    ||||||| |||| | |||||| |||| ||||||||   |||  |||||||   |||||  |||||||||||||||||| | || |||||||| |          
T  11098591 aatcgtgacacgatctggaaatcgtggcacgatttcttcagaggaagactagcatatattgtgttcttgtgcagattt-gtagaagagcttggaagagct 11098689  T
Q  353 --gtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacatcttggg 448  Q
      | |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| || ||||||    
T  11098690 tagagagagaaacttggattacaaaggagggaaccaaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 11098789  T
Q  449 tagtgag-atttcacca-ttggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgggtaa-cacaaatgggtagaa 544  Q
    ||||||| | | ||  | |||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || ||| || ||||||||    
T  11098790 tagtgaggagtacattagttggaaggatctaaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaa 11098888  T
Q  545 attaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccata 642  Q
      ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  11098889 tctagggtttgttcttgtgtaagcttgcaagctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccaga 11098988  T
Q  643 ttaggtcatattgg 656  Q
    ||||| ||||||||    
T  11098989 ttaggccatattgg 11099002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 62 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 14292118 - 14291510
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggtttgcagggtg 160  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   || |||| |||||| ||   | || |||||| | |||||||||  |    
T  14292118 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatctcgaggtgccgtgagc-tagtttgcaggacg 14292020  T
Q  161 ctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggt-tggtcgtaccttgggtcgtacgcacc 259  Q
    |  ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||| | | || ||      |||||||  ||||| |||||||||| |||||||      
T  14292019 ccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtaccactgataaggactggtcataccttgggttgtacgca-- 14291922  T
Q  260 aatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataa-gtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaa------ 352  Q
    ||||||| |||| | |||||| |||| ||||||||   |||  |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |          
T  14291921 aatcgtgacacgatctggaaatcgtggcacgatttcttcagaggaagactagtatatattgtgttcttgtgcagattttagag-agagcttggaagagct 14291823  T
Q  353 --gtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacatcttggg 448  Q
      | |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||||||||||  |||||||| || ||||||    
T  14291822 tagagagagaaacttggattacaaaggagggaaccaaagggttgagcgtctttgtagatagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 14291723  T
Q  449 tagtgag-atttcacca-ttggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgggtaa-cacaaatgggtagaa 544  Q
    ||||||| | ||||  | |||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || |||| ||||||||||    
T  14291722 tagtgaggagttcattagttggaaggatctaaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaa 14291624  T
Q  545 attaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccata 642  Q
      |||| |||||||||||||||||||| | | ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  14291623 tctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccaga 14291524  T
Q  643 ttaggtcatattgg 656  Q
    ||||| ||||||||    
T  14291523 ttaggccatattgg 14291510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 86 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17865770 - 17865590
Alignment:
Q  86 aagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgc-agggtgctcaatcgtgtcacgattttggga 184  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17865770 aagaatagagaaatcgtgacatgatttcatcatcgtgtcacgattttc-aggcagtgagcatggttttttagggtgctcaatcatgtcacgattttggga 17865672  T
Q  185 aaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtg 266  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17865671 aaatgtgacacgattttcaaacttgctgggtacgttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtg 17865590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 292 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 40015311 - 40014946
Alignment:
Q  292 ttttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagg 390  Q
    |||||||||||| ||  | |||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  40015311 ttttgacagctgcagggtactatttaagtgtttctgttcagattttgaagtagagcttgaagagagagaaatttaggtttacaaaggaggtaactttagg 40015212  T
Q  391 gttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttcctttt 489  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  40015211 gttgagtgt-tttgtattgaggttctcttgggttgggaaacattgtaaacacattggatagtgagatttcaccattggaaggatcaaaaagcttcctttt 40015113  T
Q  490 gtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaaca--caaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgt 587  Q
    |||  || || ||||| |   |||||||||| |||||| |||   ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||  ||| || ||||| |     
T  40015112 gtgatttttc-ttaggat---ttattgagagtgtgggtgacatgaaaatgagtagaaattaggtcttgttcttttgtgagtttttaagctaatttctcgc 40015017  T
Q  588 aactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgga 657  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||  | || |||||||| || | || |||||||||||    
T  40015016 aactcatttgtatcactttcatcttagtggattggagggatgttctctccctcagagtatgtcatattgga 40014946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 150 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 2837339 - 2837093
Alignment:
Q  150 tttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggt 249  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2837339 tttgcagggtgtccaatcgtgacacgattttgggaaaacgtgacacgattttcac-cttgctgggtaagttttcaggataaggttggtcgtaccttgggt 2837241  T
Q  250 cgtacgcaccaatcgtgccacg-ttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagct 348  Q
    |||||||||||| |||| || | ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || |||| |    
T  2837240 cgtacgcaccaaacgtgtcatgatttgggaaaacgtaacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttctt-tgtaaattttgaaggagagtt 2837142  T
Q  349 tgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgag 396  Q
    ||||| ||||||||||| |||   |||||||||||| |||| |||||||    
T  2837141 tgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaattttaaggttgag 2837093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 149 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 36988572 - 36988274
Alignment:
Q  149 gtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgtttt-caagataaggttggtcgtaccttgg 247  Q
    |||| |||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  36988572 gttttcagggtgtccaatcgtgacatgattttgggaaaacgtgacacgattttcga-cttgctgggcaagtttttcaggataaggttggtcgtaccttgg 36988474  T
Q  248 gtcgtacgcaccaatcgtgccacgttt--tggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtaga 345  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| ||  ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||    
T  36988473 gtcgtacgcatcaattgtgacacgattgatggaaaatgtgacacgattttgac-gctgaagactgctatataagtgttctt-tgcatattttgaaggaga 36988376  T
Q  346 gcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatct 444  Q
    |||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |   | |||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  36988375 gcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaacatagtaaacacct 36988277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 370 - 770
Target Start/End: Original strand, 2869481 - 2869888
Alignment:
Q  370 tacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattgga 469  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2869481 tacaaaggagataactttacggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagttggaaaacattgtaaacacattgggtagtgagatttcgccattgga 2869580  T
Q  470 atgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaac---acaaatgggtagaaattagg-tcttgttcttgtgt 564  Q
    |  ||| ||||| |||| || |||| ||||| ||||| |||   |||||||| |||||| ||   | |||||||||||||||||| | |||||||| |||    
T  2869581 agaatcaaaaagcttccgttagtgttttctc-ttaggattc---attgagagtgtgggtgacttgaaaaatgggtagaaattaggtttttgttctt-tgt 2869675  T
Q  565 aagcttgcaagttattttcttgtaact-ctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaac 663  Q
     |||||  ||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| | | |||||||||||||||| |||    
T  2869676 gagcttttaagctaatttcttgtaactcctttgtatcactttcatcttagtggattggagagctactctctcccctagagtaggtcatattggaccgaac 2869775  T
Q  664 t-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtg-tgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtc 756  Q
    |     | |||| |||||||||||||| || || ||||  ||| |||||| || |||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||    
T  2869776 tgggtaaacaatattggtgtgtttgtt-ctcttcctttatttgcttatctttgttgctttgaatatgcttatggtgttgctctacacttagatttaggtc 2869874  T
Q  757 tattttttgttgtt 770  Q
    ||||| ||||||||    
T  2869875 tatttgttgttgtt 2869888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 465 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 25398710 - 25398363
Alignment:
Q  465 ttggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgg-gtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgt 562  Q
    |||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  25398710 ttggaaggatctaaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggagaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgt 25398612  T
Q  563 gtaagcttgcaagttatttt-cttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaa 661  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |    
T  25398611 gtaagcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgg-ctga 25398513  T
Q  662 act-----agcaatc---ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatc-tgtgtgctttgtttatgct--tgtggtgttgctctacactaagtc 750  Q
    |||     | |||||   |||||||||||||||   || ||||| ||| ||||| ||| |||||||| |   ||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  25398512 actgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc---ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacact-agtc 25398418  T
Q  751 taggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||| ||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25398417 tagggct-gtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccactt 25398363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 465 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 25403848 - 25403501
Alignment:
Q  465 ttggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgg-gtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgt 562  Q
    |||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  25403848 ttggaaggatctaaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggagaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgt 25403750  T
Q  563 gtaagcttgcaagttatttt-cttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaa 661  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |    
T  25403749 gtaagcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgg-ctga 25403651  T
Q  662 act-----agcaatc---ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatc-tgtgtgctttgtttatgct--tgtggtgttgctctacactaagtc 750  Q
    |||     | |||||   |||||||||||||||   || ||||| ||| ||||| ||| |||||||| |   ||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  25403650 actgagtcaacaatctttttggtgtgtttgttc---ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacact-agtc 25403556  T
Q  751 taggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||| ||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25403555 tagggct-gtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccactt 25403501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 142 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 36318513 - 36318206
Alignment:
Q  142 gagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgatttt-gggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgt 240  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||   |||| |||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  36318513 gagcatgttttgcagggtgtccaatcgtgacacgatttttggggaaacgtgacacgattttcgg-cttgctggccacgttttcaggataaggttggtcgt 36318415  T
Q  241 accttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgg 339  Q
    ||||||  ||||||||||||| |||| |||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  36318414 accttgaatcgtacgcaccaaccgtgtcacaatttgacaaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttctt-tgcagattttga 36318316  T
Q  340 agtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaa 438  Q
    || |||| |  ||| ||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |   | | ||||||||||||||| |||||||    
T  36318315 aggagaggtaaaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaatgtctttg-attagagttatcttgggttgggaaatattgtaa 36318217  T
Q  439 acatcttgggt 449  Q
    ||| |||||||    
T  36318216 acaccttgggt 36318206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 117 - 449
Target Start/End: Original strand, 39284536 - 39284856
Alignment:
Q  117 aacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggttt-gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggt 215  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||   |||| ||||     
T  39284536 aacgtgtcacgattttctaggcagtgagcatggtttcgcagggtgtcctatcgtgacacgattttgggaaaacgtgacacaattttcgg-cttgctggga 39284634  T
Q  216 acgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctat 314  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||            |||||||  ||| |||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  39284635 aagttttcaggataaggttggtcgtac------------gcaccaaatgtgtcacgatttgggaaaacgtgacatgattttgacagctgaagactgctat 39284722  T
Q  315 ataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgagga 413  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |   |     
T  39284723 ataagtgttctt-tgcagattttgaaggagaggttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagt 39284820  T
Q  414 tctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39284821 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 39284856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 25407837 - 25407653
Alignment:
Q  465 ttggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgg-gtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgt 562  Q
    |||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  25407837 ttggaaggatctaaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggagaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgt 25407739  T
Q  563 gtaagcttgcaagttatttt-cttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattagg 647  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  25407738 gtaagcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagg 25407653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 355 - 492
Target Start/End: Original strand, 10445241 - 10445379
Alignment:
Q  355 gagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtga 454  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10445241 gagagaaacttagattacaaaggaggtaactttagggttgaatgtctttgtagtgaggttctctcgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtga 10445340  T
Q  455 gatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtg 492  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  10445341 gatttcaccattggaaggatcaaaaagcttccttttgtg 10445379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 219 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 2334844 - 2334616
Alignment:
Q  219 ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatat 316  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||  |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  2334844 ttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacacatcaatcgtgacacgatttgggaaaaacgtgacacgatttcgac-gctgaagactgctatat 2334746  T
Q  317 aagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatc 415  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| || |||| | |   | ||    
T  2334745 aagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtatttg-attagagttc 2334648  T
Q  416 tcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2334647 tcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 2334616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 334 - 666
Target Start/End: Original strand, 15903642 - 15903974
Alignment:
Q  334 ttttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggatt-acaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaca 432  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15903642 ttttgaagtagagcttgaagagagagaaatttgggtttacaaatgaggtaacctttgggttgaatgtctttgtagtgaggttctcttgggttaggaaaca 15903741  T
Q  433 ttgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgat-caaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaac- 530  Q
    |||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||| |||||  |||| |||   |||||||| |||||| ||     
T  15903742 ttgtaaacacattggataatgagatttcaccattggaatgataaaaaagatttcttttgtgttttctc-ataggattc---attgagagtgtgggtgact 15903837  T
Q  531 --acaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaa-ctctttgtaacactttcatcatagtggattggatagct 627  Q
      | |||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||| ||| || |||||||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||| |  |    
T  15903838 tgaaaaatgggtagaaattagaatttgttctt-tgtgagcttgtaagcta-tttcttgtaacccctttgtatcacttttatcttagtggattggagattt 15903935  T
Q  628 gctctctcccccatattaggtcatattggaccaaactag 666  Q
     ||||||||  || | |||||||||||||| | ||||||    
T  15903936 tctctctccgtcagagtaggtcatattggatcgaactag 15903974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 219 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 5723681 - 5723453
Alignment:
Q  219 ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatat 316  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||  |||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  5723681 ttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcatcaatcgtggcacgattggggaaaaacgtgacacgatttcgac-gctgaagattgctatat 5723583  T
Q  317 aagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatc 415  Q
    || ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||  | ||||||| | |   | ||    
T  5723582 aaatgttctt-tgcagattttgaagaagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttggggtctttg-attagagttc 5723485  T
Q  416 tcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5723484 tcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 5723453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 370 - 664
Target Start/End: Original strand, 2837816 - 2838113
Alignment:
Q  370 tacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctctt--gggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgag-atttcaccatt 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  2837816 tacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaacattgtaaacaccttggatagtgagaatttcaccatt 2837915  T
Q  467 ggaatgatcaaaagt-ttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaac---acaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgt 562  Q
    |||| ||| |||| | ||||||| |||| ||||| ||||| |||   |||||||  |||||| ||   | ||||||| | |||||||||  ||||||| |    
T  2837916 ggaaggataaaaaatattcctttagtgttttctc-ttaggattc---attgagaaggtgggtgacatgaaaaatgggcaaaaattaggttgtgttctt-t 2838010  T
Q  563 gtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaa 661  Q
    || ||||       || ||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  2838011 gtgagctcttgtactaatttcttgtaactcatttgtatcactttcattttagtggattggagatgtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccga 2838110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 54 - 441
Target Start/End: Original strand, 30832921 - 30833309
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||   || |||| |||||||||   | || |||||| ||||||    
T  30832921 tgttgagatttggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacatgaatttgacatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagc-tggttt 30833019  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataagg-ttggtcgtaccttgggtcg 251  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | | || |||| || |||||||   |||||||||||| | ||    
T  30833020 gcagggtgccaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtttccaggataaggacaggtcgtaccttgtgacg 30833119  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttga 351  Q
    |||| |||||||||| ||||  ||||||| |||| |||||||||  |||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||    
T  30833120 tacgtaccaatcgtgacacgacttggaaatcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcaga-tttgaaggtgagctgga 30833218  T
Q  352 agtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaaca 441  Q
    || || |||||||| |||   ||||||  |||||| ||||||| || || ||||    |||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  30833219 agagaaagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggtttttgattagagcttatcttgggttgggaaacattgtaaaca 30833309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 149 - 449
Target Start/End: Original strand, 29867551 - 29867840
Alignment:
Q  149 gtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgtttt-caagataaggttggtcgtaccttgg 247  Q
    |||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||||| ||||||||||||||| ||||         
T  29867551 gttttcagggtgtccaatcgtgacacgattttgggaaaacgtgacacgattttcga-cttgctgggcaagtttttcaagataaggttggttgtac----- 29867644  T
Q  248 gtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtaga 345  Q
           ||||||| |||| |||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  |||    
T  29867645 -------gcaccaaacgtgtcacgatttgggaaaaacgtgacacgattttgacagatgaagactgctatataagtgttctt-tgcagtttttgaaagaga 29867736  T
Q  346 gcttgaagtgagagaaactt--ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatc 443  Q
    |||| ||| |||||||||||  ||| | ||||| |||||||| | |||||||| ||||||| | |   | |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29867737 gcttaaagagagagaaactttgggaat-caaagaaggtaactattgggttgagggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacc 29867834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 163 - 447
Target Start/End: Original strand, 45099440 - 45099724
Alignment:
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacg-ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 261  Q
    |||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||    |||| |||| | | |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  45099440 caatcgtgacacaattttgggaaattgtgacacgatttttgg-cttgctgggcaagattttcaggataaggttggtcgtaccttgaatcgtacgcatcaa 45099538  T
Q  262 tcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagag 359  Q
    ||||| |||| || ||  |||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||  |||||||||| |||||    
T  45099539 tcgtggcacgattggggaaaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctt-tgtagattttgaaggtgagcttgaagagagag 45099636  T
Q  360 aaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    |||||| |||   ||||||| | |||||||||||| || ||||||| | |   | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45099637 aaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 45099724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 580 - 806
Target Start/End: Original strand, 16940207 - 16940438
Alignment:
Q  580 tttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaactag-----caatctt 673  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| || | |     |||||||    
T  16940207 tttcttgtaattcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 16940306  T
Q  674 ggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgt-gctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgtta 771  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| | | |||||| |||||||| |||||| ||||| |||| || ||||||||| |||| |||||||     
T  16940307 ggtgtgtttgttccttt--ctttcattgcttatctttattgctttgattatgcttttggtgtcgctctgcacttagatctaggtctgtttt-tgttgttg 16940403  T
Q  772 ttgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||| | |||||||||||  |||||||||||||||    
T  16940404 ttgcatagagacactttattcattgattaccactt 16940438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 580 - 806
Target Start/End: Original strand, 17010872 - 17011103
Alignment:
Q  580 tttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaactag-----caatctt 673  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| || | |     |||||||    
T  17010872 tttcttgtaattcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 17010971  T
Q  674 ggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgt-gctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgtta 771  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| | | |||||| |||||||| |||||| ||||| |||| || ||||||||| |||| |||||||     
T  17010972 ggtgtgtttgttccttt--ctttcattgcttatctttattgctttgattatgcttttggtgtcgctctgcacttagatctaggtctgtttt-tgttgttg 17011068  T
Q  772 ttgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||| | |||||||||||  |||||||||||||||    
T  17011069 ttgcatagagacactttattcattgattaccactt 17011103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 119 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 35447627 - 35447451
Alignment:
Q  119 cgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacg 218  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||    |||| ||| | |    
T  35447627 cgtgtcatgattttctaggcagtgagcattgttttcagggtgttcaattgtaacacgattttgggaaaatgtgacacgattatcggt-ttgtcgggcaag 35447529  T
Q  219 ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttg 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||| |||| ||||||||||    
T  35447528 ttttcaagataaggttgctcgtaccttgggtcgtacgcaccaaacgtgtcacgattgggaaatcgtgacacgattttg 35447451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 282 - 446
Target Start/End: Original strand, 38312045 - 38312208
Alignment:
Q  282 cgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggagg 380  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||   |||||||||    
T  38312045 cgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaatttgggaaatcaaaggagg 38312143  T
Q  381 taactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttg 446  Q
    ||||||||||||||||  |||||| | |   | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  38312144 taactttagggttgaggttctttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgtatacaccttg 38312208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 71 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 4484906 - 4484529
Alignment:
Q  71 aaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgt 169  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||   || |||| |||||||||   | || |||||| | |||||||||||||  ||||||    
T  4484906 aaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcatgatgccgtgagc-tagtttgcagggtgccaaatcgt 4484808  T
Q  170 gtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggt-tggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgcc 268  Q
    | |||||| ||  | || ||||||||||||| |||||||| | | || ||||  | |||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  4484807 gacacgatcttaaggaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttctatgataaggactggtcgtaccttgggacgtacgtaccaatcgtgac 4484708  T
Q  269 acgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttgga 368  Q
    ||| | |||||| |||| |||||||||  |||  |||| ||  ||| |||||||||||||||||||||   || |||| | |||| |||||||||||||     
T  4484707 acgatctggaaatcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagatttgaaag-agagttggaagagagagaaacttggg 4484609  T
Q  369 tta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
      | ||||||  |||||| ||||||| || |||||||    |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4484608 aaatcaaagggagtaactctagggtttagggtctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 4484529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 370 - 470
Target Start/End: Original strand, 1344333 - 1344435
Alignment:
Q  370 tacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttg-ggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgag-atttcaccattg 467  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1344333 tacaaatgaggtaattttagggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgaggttgggaaacattgtaaacatcttcggtagtgagaatttcaccattg 1344432  T
Q  468 gaa 470  Q
    |||    
T  1344433 gaa 1344435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 248 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 6595404 - 6595211
Alignment:
Q  248 gtcgtacgcaccaatcgtgccacgttt--tggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtaga 345  Q
    |||||||||| ||||| || |||| ||  ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  6595404 gtcgtacgcatcaatcttgacacgattgatggaaaacgtgacacgattttgac-gttgaagactgctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggaga 6595307  T
Q  346 gcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaaca 441  Q
    |||||||| ||||||||||| |||   |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |   | ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  6595306 gcttgaagagagagaaacttaggaaatcaaatgaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagttctcttgggctgggaaaaattgtaaaca 6595211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 219 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 4503559 - 4503331
Alignment:
Q  219 ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatat 316  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||| || ||  |||||||| |||||||||||| |  ||||||  ||||||    
T  4503559 ttttcaggataaggttggtcgtaccttggatcgtacgcatcaattgtggcacgattggggaaaaacgtgacacgattttgac-gtagaagacaactatat 4503461  T
Q  317 aagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatc 415  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||| |||   ||||||| | |||||||||||| ||  |||||| | |   | ||    
T  4503460 aagtgttctt-tgcagattttgaaggagagctagaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttaggttctttg-attagagttc 4503363  T
Q  416 tcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4503362 tcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 4503331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 370 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 35397817 - 35397710
Alignment:
Q  370 tacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattgga 469  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  35397817 tacaaaggaggtcactttagggttgattgtctttgtagtgaggttcttctgggttggaaaacattgtaattaccttgggtagtgagatttcaccattgga 35397718  T
Q  470 atgatcaa 477  Q
    | ||||||    
T  35397717 aggatcaa 35397710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 447
Target Start/End: Original strand, 32289148 - 32289542
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||   || |||| ||||||||    | || |||||| ||||||    
T  32289148 tgttgagatttggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagc-tggttt 32289246  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggt-tggtcgtaccttgggtcg 251  Q
    |||||||||  |||| || |||||| ||| | || |||||||||||||  ||||||| | | || |||| || |||||||  ||||||||||||||| ||    
T  32289247 gcagggtgccaaatcttgacacgatcttgaggaatcgtgacacgatttgaaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgggacg 32289346  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttga 351  Q
    ||||| ||||||||| ||||   |||||| |||| |||||||||  |||  || | ||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||| | ||    
T  32289347 tacgctccaatcgtgacacgacctggaaatcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgtgcagattttgaag-ggagatgga 32289445  T
Q  352 agtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    || ||||||||||| |||   ||||||  |||||| ||||||| || |||||||    |||  ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  32289446 agagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagtctttgattagagcttctcttgggtttggaaacatggtaaacaccttgg 32289542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 219 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 36206092 - 36205862
Alignment:
Q  219 ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgc--tat 314  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||| |||| || ||  |||||||| |||||||||||| || |||||| ||  |||    
T  36206092 ttttcaggataaggttggtcgtaccttggattgtacgcatcaattgtggcacgattggggaaaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatat 36205994  T
Q  315 ataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgagga 413  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||   ||||||| | |||||||||||| || ||||||| | |   |     
T  36205993 ataagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggtctttg-attagagt 36205896  T
Q  414 tctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  36205895 tctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttgg 36205862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 292 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 17057722 - 17057566
Alignment:
Q  292 ttttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagag-aaacttggattacaaaggaggtaactttagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||| |||||   ||| |||||||||||||||    
T  17057722 ttttgacagctgaagactgctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagtttgaagagagagaaaatttggaaatcaacggaggtaactttagg 17057624  T
Q  391 gttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||  ||||||| | |   | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17057623 gttgaaggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttgggt 17057566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 292 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 17085705 - 17085549
Alignment:
Q  292 ttttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagag-aaacttggattacaaaggaggtaactttagg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||| |||||   ||| |||||||||||||||    
T  17085705 ttttgacagctgaagactgctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagtttgaagagagagaaaatttggaaatcaacggaggtaactttagg 17085607  T
Q  391 gttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||  ||||||| | |   | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17085606 gttgaaggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttgggt 17085549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 538 - 664
Target Start/End: Original strand, 27149251 - 27149377
Alignment:
Q  538 ggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcc 636  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||  ||| || |||||||| || | |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  27149251 ggtagaagttaagtcttgttctt-tgtgagcttttaaggtaatttcttgttacccctttgtatcactttcattatagtggattggagagctgctctctcc 27149349  T
Q  637 cccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  27149350 cccatagtaggtcatattggaccaaact 27149377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 355 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 42269695 - 42269606
Alignment:
Q  355 gagagaaacttgg-attacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctctt--gggttgggaaacattgtaaaca 441  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  42269695 gagagaaacttgggaatacaaaggaggtaactttaaggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaacattgtaaaca 42269606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 336
Target Start/End: Original strand, 6266367 - 6266557
Alignment:
Q  147 tggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataagg-ttggtcgtacctt 245  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||  | | || |||| || |||||||  |||||||  |||    
T  6266367 tggtttgcagggtgccaaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttactcgttaagtttccatgataaggaatggtcgtttctt 6266466  T
Q  246 gggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattt 336  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||   |||||| |||| |||||||||  |||  || | ||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  6266467 gggacgaacgcaccaatcgtgacacgacctggaaatcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgtgcagattt 6266557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 201
Target Start/End: Original strand, 17863839 - 17863916
Alignment:
Q  124 cacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgatttt 201  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17863839 cacgattttcaaggcagtgagcatggttttcagggtgtccaatcgtgacataattttgggaaaacgtgacacgatttt 17863916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 380 - 459
Target Start/End: Original strand, 41586349 - 41586429
Alignment:
Q  380 gtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaca-ttgtaaacatcttgggtagtgagattt 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  41586349 gtaactttagggttgagtgtctttggtgagagcttctcttgggttggaaaacagttgtaaacaccttgggtagtgagattt 41586429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Original strand, 44312613 - 44312687
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  44312613 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 44312687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 582 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 32246883 - 32246810
Alignment:
Q  582 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  32246883 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 32246810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 582 - 656
Target Start/End: Original strand, 39811978 - 39812051
Alignment:
Q  582 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  39811978 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 39812051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 201
Target Start/End: Original strand, 45726448 - 45726530
Alignment:
Q  119 cgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgatttt 201  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||  |||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  45726448 cgtgtcacgattttctaggcagtgagcatgattttcagggtgtccaattgtgacacgattttgggcaaatgtgacacgatttt 45726530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 11151864 - 11151788
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11151864 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 11151788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 449
Target Start/End: Original strand, 11690396 - 11690472
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |   | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11690396 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttg-attatagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 11690472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 449
Target Start/End: Original strand, 42362247 - 42362323
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42362247 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 42362323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 3278307 - 3278217
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaca-ttgtaaacatcttgggtagtgagatttca 461  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || |||  | |||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3278307 caaatgaggtaactttagggttgagtatcgttgatgagagattctcttgggttggaaaacatttgtaaacaccttggatagtgagatttca 3278217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 372 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 33162723 - 33162647
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |  || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  33162723 caaaggaggtaattttagggttgagggtctttg-attagggttctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttgggt 33162647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 372 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 34140044 - 34139968
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||    |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34140044 caaaggaggtaactttagggttgaaagtctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 34139968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 580 - 664
Target Start/End: Original strand, 1345538 - 1345624
Alignment:
Q  580 tttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcata-gtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||| || |||||| ||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  1345538 tttcttgcaactcatttgtatcactttcatcttaagtggatcggagaggtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaact 1345624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 32247345 - 32247295
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  32247345 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 32247295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 112
Target Start/End: Original strand, 39811484 - 39811534
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  39811484 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 39811534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 112
Target Start/End: Original strand, 44310478 - 44310528
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  44310478 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 44310528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14202680 - 14202604
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||    |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14202680 caaatgaggtaactttatggttgagggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 14202604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 149 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6595491 - 6595439
Alignment:
Q  149 gtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgatttt 201  Q
    |||| |||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6595491 gttttcagggtgtccaatcgtgacacaattttgggaaaacgtgacacgatttt 6595439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 19344518 - 19344443
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| || |||||    
T  19344518 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccctagattaggccacattgg 19344443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 19349376 - 19349301
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| || |||||    
T  19349376 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccctagattaggccacattgg 19349301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 112
Target Start/End: Original strand, 36757419 - 36757475
Alignment:
Q  56 ttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  36757419 ttgaaaattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagaaaaatcgtgacacgattt 36757475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 112
Target Start/End: Original strand, 28258668 - 28258727
Alignment:
Q  53 ttgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||| || || ||||||||||| ||||||||||||    
T  28258668 ttgttgaaatttggcttcaaatttgtggtttggaaaaacagagaaatcgtgacacgattt 28258727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 449
Target Start/End: Original strand, 36773498 - 36773533
Alignment:
Q  414 tctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36773498 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 36773533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 610 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 35215650 - 35215596
Alignment:
Q  610 atagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  35215650 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaact 35215596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 610 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 35218027 - 35217973
Alignment:
Q  610 atagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  35218027 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaact 35217973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 40015369 - 40015315
Alignment:
Q  216 acgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccac 270  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||    
T  40015369 acgttttcatgataatgttggtcgtaccttggatcgtaagcatcaatcgtgacac 40015315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 510; Significance: 0; HSPs: 99)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 510; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 51 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 3282334 - 3281576
Alignment:
Q  51 tattgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggt 150  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||  | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||| |||||    
T  3282334 tattgttgaaatttggcttcaaatttgtggttaggaagaacagaaaaatcgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgaatttc-aggcagggagtatggt 3282236  T
Q  151 ttg-cagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggt 249  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3282235 ttttcaaggtgctcaatcgtgtcacgattttgagaaaacgtgacacgattttcaaacttgctgggtacgttttcaagataaggttggtcataccttgggt 3282136  T
Q  250 cgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagctt 349  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  3282135 cgtacgcaccaatcgtgccacgatttgaaaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttatgcagattttgaaggagagctt 3282036  T
Q  350 gaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3282035 gaagtgagagaaacttggattacaaatgaggtaactttatggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 3281936  T
Q  450 agtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattag 549  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3281935 agtgagatttcaccattggaaggatcaaaagcttccttttgtgtcttctc-ttagggttcatcattgagagagtgggaaacacaaatgggtagaaattag 3281837  T
Q  550 gtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtc 649  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  3281836 gtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatcgtggattggagagctgctctctcccccagattaggtc 3281737  T
Q  650 atattggaccaaactag--caa-----tcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctac 742  Q
    |||||||||| |||| |  |||     | ||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3281736 atattggaccgaactgggtcaataatcttttgatgtgtttgttcc--tttctttcattgcttatctttgtgctttgtttattcttgtggtgttgctctac 3281639  T
Q  743 actaagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    || ||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3281638 acaaagtctatgtct-ttttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccactt 3281576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 37070392 - 37069636
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttg 153  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||     
T  37070392 tgttgaaaattggtttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgattttc-aggcagggagcatggtttc 37070294  T
Q  154 -cagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgt 252  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37070293 tcaaggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgt 37070194  T
Q  253 acgcaccaatcgtgccacgttttggaaaa-cgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttga 351  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  37070193 acgcaccaatcgtgccacgatttggaaaatcgtgacataattttgacagctaaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaagtagagctgga 37070094  T
Q  352 agtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtag 451  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  37070093 agagagagaaacttggattacaaaggaggtaactttatggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggataa 37069994  T
Q  452 tgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggt 551  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37069993 tgagatttcaccattggaaggatcaaaagcttccttttgtgtcttctctttatggttcattattgagtgagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggt 37069894  T
Q  552 cttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcat 651  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  37069893 cttgttcttgtgtaagcttgcaaactatt---ttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtcat 37069797  T
Q  652 attggaccaaact-----agcaatc--ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacac 744  Q
    |||||||| ||||     | |||||  ||||||||||||||||  ||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37069796 attggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcc--tttatttcgttgcttatctttgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacat 37069699  T
Q  745 taagtctaggtct-attttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||||||| ||||  |||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37069698 taagtctaagtctgtttttttttttttgttgcttggagacactttacacattgattaccactt 37069636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 76 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 29652417 - 29651678
Alignment:
Q  76 tgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacg 175  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29652417 tgtggtttggaagaacagagaaatcgtgatacgatttcatcaacgtgtcacgattttc-aggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacg 29652319  T
Q  176 attttgggaaaa-cgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgtttt-caagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgtt 273  Q
    ||||||| |||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  29652318 attttggaaaaaacgttatacgattttcaaatttgttgggtacgtttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacacaccaatcgtgtcacgat 29652219  T
Q  274 ttgga-aaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattac 372  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  29652218 ttggacaaacgtgacatgattttgacagctgaagactgctatataagtgtttttgtgcagattttgaaggagagcttgaaaagagagaaacttggattac 29652119  T
Q  373 aaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatg 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29652118 aaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatcttttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaagg 29652019  T
Q  473 atc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagctt 570  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29652018 atcaaaaagtttccttttgtgttttctc-ttaggattcattattgagagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagctt 29651920  T
Q  571 gcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact----- 664  Q
      |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||         
T  29651919 ataagttaatttcttgtaattcttttgtaacactttcatcatagtggattggagtgctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtc 29651820  T
Q  665 agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctatttt 762  Q
    |  ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||    
T  29651819 aaaaatcttggtgtgtttgttcc--tttctttcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaagtctgtttt 29651722  T
Q  763 ttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||||||| |||  |  ||||||||||  |||||||||||||||    
T  29651721 ttgttgttgttgattatagacactttattcattgattaccactt 29651678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 186 - 806
Target Start/End: Original strand, 21536175 - 21536798
Alignment:
Q  186 aacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtg 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  21536175 aacgtgacacgattttcaaacttgctgggtacgttttcaggatgaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccccgatttggaaaacgtg 21536274  T
Q  286 ccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaact 385  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21536275 acacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaact 21536374  T
Q  386 ttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttcc 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  21536375 ttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttaggttggaaaacattgtaaacaccttgggtagtaagatttcaccattggaaggatcgaaagcttcc 21536474  T
Q  486 ttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttctt 585  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21536475 ttttgtgtcttctc-ttagggttcatcattgagagagtgggtaacacaaacgggtagaaattaagtattgttcttgtgtaagcttgcaagctattttctt 21536573  T
Q  586 gtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatc--ttggtgt 678  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||| ||||     | |||||  |||||||    
T  21536574 gtaactctttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcattttttaccgaactgggtcaacaatcttttggtgt 21536673  T
Q  679 gtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcctg 778  Q
    |||||||||  |||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||  ||    
T  21536674 gtttgttcc--tttctttcatcgcttatctttgtgctttgtctatgcttgtggtgttgctctacagtaagtctaggtcta-tttttgttgttgttgattg 21536770  T
Q  779 gagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21536771 gagacactttacacattgattaccactt 21536798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 806
Target Start/End: Original strand, 26644373 - 26645126
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccca--ggcagtgagcatggtt 151  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||| |||| |||||||  ||| |||  ||||||||   |  | || ||||| |||||    
T  26644373 tgttaaaaattggctttaaatttgtggtttggaagaacagaggaatcgtgatacgattttgtcatcgtaacacgattttgtaatgtca-tgagc-tggtt 26644470  T
Q  152 tgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcg 251  Q
    |||| ||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||   |||||||    
T  26644471 tgcacggtgtcaaatcgtggcacgattttgtgaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtaccttttcagaataaggtcggtcgta---tgggtcg 26644567  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgga-gtagagcttg 350  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||| ||    
T  26644568 tacgcaccaatcgtggcacgatttggaaaacgtggcacgattttatcagctgaagactgctatataagtgttcttatgcagattttgaaaggagagcctg 26644667  T
Q  351 aagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggta 450  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  26644668 aagagagagaaacttggattacaaaggagataattttagggttgagtgtctttgtagtgaagatcttttgggttgggaaacattgtaaacaccttgagta 26644767  T
Q  451 gtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattagg 550  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  26644768 gtgagatttcaccattggaaggatcaaaagcttccttttgtgtcttctctt-agggttcatcattgagagagtgagaaacacaaatgggtagaaattagg 26644866  T
Q  551 tcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtca 650  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26644867 tcttgttcttgtgtaagcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcataatggattggagagctgctctctcccccagattaggtca 26644966  T
Q  651 tattggaccaaact-----agcaatc--ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctaca 743  Q
    ||||||||| ||||     | |||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26644967 tattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcc--tttctttcattgcttatctttgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctaca 26645064  T
Q  744 ctaagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  26645065 ctaagtctaggtct-gcttttgttgttgttgcttaaagacactttacacattgattaccactt 26645126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 13599018 - 13598264
Alignment:
Q  61 aattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttg-cagggt 159  Q
    ||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  || |||    
T  13599018 aattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttct-aggcagcgagcatggtttttcaaggt 13598920  T
Q  160 gctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcacc 259  Q
      |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13598919 attcaatcgtgtcatgattttgggaaaatgtgacacgattttcaaacttgctgggtacgttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcacc 13598820  T
Q  260 aatcgtgccacgttttgga-aaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgaga 358  Q
    ||||||| |||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  13598819 aatcgtgtcacaatttggacaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataaatgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagaga 13598720  T
Q  359 gaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatt 458  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13598719 gaaaattggattacaaaggaggtaactttatggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggcaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatt 13598620  T
Q  459 tcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgt 556  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  13598619 tcaccattggaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttctc-ttaggattcatcattgagagtgtgggtgacacaaaatgagtagaaattaagtcttgt 13598521  T
Q  557 tcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattg 655  Q
    ||||||||||||||  ||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13598520 tcttgtgtaagcttataagctaatttcttgtatctcttttgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattg 13598421  T
Q  656 gaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag- 748  Q
    |||| ||||     | |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  13598420 gaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tttctttcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgtttctctacacttaga 13598323  T
Q  749 tctaggtctatttt--ttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||||||||| ||||  |||||||| |||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  13598322 tctaggtctgtttttgttgttgttgttgtttggagacacttaac-tattgattaccactt 13598264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 147 - 806
Target Start/End: Original strand, 13604188 - 13604852
Alignment:
Q  147 tggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttg 246  Q
    |||||||||| |||   ||||||| |||||||||| | || ||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13604188 tggtttgcagtgtgtcaaatcgtgacacgattttgtggaatcgtgacatgattttcaaacttgctggttaagttttcaggataaggttggtcgtaccttg 13604287  T
Q  247 ggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagag 346  Q
    ||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13604288 ggtcgtacgtatcaatcgtgacacgatttggaaaacgtggcacgattttatcagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcaaattttggaggagag 13604387  T
Q  347 cttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttg 446  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13604388 cttaaagagagagaaacttggattacaaaggagggaactttagggttgagtatctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 13604487  T
Q  447 ggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaat 546  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13604488 ggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaagcttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggaaacacaaatgggtagaaat 13604587  T
Q  547 taggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagtta-ttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatatta 645  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13604588 taggtcttgttcttgtgtaagtttgcaagctatttttcttgtaactctttgtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatatta 13604687  T
Q  646 ggtcatattggaccaaact-----agcaatc--ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgc 737  Q
    |||||||||| ||| ||||     | |||||  ||||||||||||||||   ||||||||||  |||||| |  |||||||| |||||||||| ||||||    
T  13604688 ggtcatattgaacctaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcc---ttctttcattacttatctttattgctttgtatatgcttgtgatgttgc 13604784  T
Q  738 tctacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||| ||| || ||| |||| ||||   ||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13604785 tctatact-agactatgtctgttttgctttgttgttgtttggagacactttacacattgattatcactt 13604852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 54 - 806
Target Start/End: Original strand, 19360912 - 19361664
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    | |||| ||||||||    | || |||||| ||||||    
T  19360912 tgttgagatttggcttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggtatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagc-tggttt 19361010  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggtt-ggtcgtaccttgggtcg 251  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | | || |||| || |||||||   |||||||||||| | ||    
T  19361011 gcagggtgccaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtttccaggataaggacaggtcgtaccttgtgacg 19361110  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttga 351  Q
    |||| |||||||||| ||||                   |||||  |||  |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  19361111 tacgtaccaatcgtgacacg-------------------attttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattttggaggagagcttgg 19361191  T
Q  352 a--------gtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa-cattgtaaacat 442  Q
    |        | ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  19361192 aagagcttagagagagaaacttagattacaaaggagggaactctagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaacattgtaaacac 19361291  T
Q  443 cttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgggtaa-cacaaatgggt 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  19361292 cttgggtagtgagatttcaccattggaaggatctaaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcat-attgagagagtggggaaacacaaatgggt 19361390  T
Q  541 agaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatttt-cttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctccccc 639  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19361391 agaatctaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaaactatttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctccccc 19361490  T
Q  640 atattaggtcatattggaccaaact-----agcaatc--ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatc-tgtgtgctttgtttatgcttgtgg 731  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||     | |||||  |||||||||||||||   || ||||  ||| ||||| ||  |||||||| | |||||||||    
T  19361491 atattaggtcatatt-gactgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttc---ttccttttcttgcttatcttggttgctttgtatttgcttgtgg 19361586  T
Q  732 tgttgctctacactaagtctag----gtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||||||||||||| || ||||    || | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19361587 tgttgctctacact-agactagggctgtttttttttttttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccactt 19361664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 355 - 806
Target Start/End: Original strand, 47703706 - 47704166
Alignment:
Q  355 gagagaaacttg-gattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttg--ggttgggaaacattgtaaacatcttgggtag 451  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47703706 gagagaaacttgagaatacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaacattgtaaacaccttgggtag 47703805  T
Q  452 tgagatttcaccattggaatgatcaaaagt-ttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaa-tgggtagaaattag 549  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  47703806 tgagatttcaccattggaatgataaaaaaacttccttttgtgttttctctt-aggattcat-attgtgagagtgggtgacacaaaatgggtagaaattag 47703903  T
Q  550 gtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggt 648  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  47703904 gtcttgttcttgtgtaagcttgtaagctaatttcttgtaattcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggt 47704003  T
Q  649 catattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctac 742  Q
    ||||||||||| ||||     | |||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||| |  ||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  47704004 catattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgttttttcc--tttctttcattgcttatctttattgctttgattaaacttgtggtgttgctctac 47704101  T
Q  743 actaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  47704102 acttagatttaggtctattttttgttgttgctgcttggagacactttatctattgattaccactt 47704166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 282 - 806
Target Start/End: Original strand, 19358533 - 19359074
Alignment:
Q  282 cgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaa--------gtgagagaaacttggattaca 373  Q
    |||| |||||||||  |||  |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |        | |||||||||||||||||||    
T  19358533 cgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattttggaggagagcttggaagagcttagagagagaaacttggattaca 19358632  T
Q  374 aaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa-cattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatg 472  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19358633 aaggagggaactctagggttgagtgtctttgtagtgaggatcttttgggttgggaaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaagg 19358732  T
Q  473 atcaaaagtttccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgggtaa-cacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagctt 570  Q
    ||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19358733 atctaaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcat-attgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaagctt 19358831  T
Q  571 gcaagttatttt-cttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact----- 664  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||         
T  19358832 gcaagctatttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatatt-gactgaactgggtc 19358930  T
Q  665 agcaatc--ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatc-tgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaagtctaggtct---a 758  Q
    | |||||  ||| |||||||||||   || ||||  ||| ||||| ||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||        
T  19358931 aacaatcttttgatgtgtttgttc---ttccttttcttgcttatcttggttgctttgtatttgcttgtggtgttgctctacact-agactagggctgtat 19359026  T
Q  759 ttttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19359027 ttttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccactt 19359074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 311 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 32889805 - 32889307
Alignment:
Q  311 ctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtga 410  Q
    |||||||||||||  | |||| |||||| ||||||| ||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32889805 ctatataagtgtttctttgcatattttgaagtagagattttagagagagaaacttggattgcaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtga 32889706  T
Q  411 ggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttca 510  Q
    || | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||| ||||    
T  32889705 ggtttttttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggttcaaaagcttc-ttttgtgttttctctt-aggattca 32889608  T
Q  511 ttattgagagagtgggtaacac---aaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatttt-cttgtaactctttgtaacactttc 606  Q
    ||   ||||| |||||| | |    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  32889607 tt---gagagtgtgggtgatatgaaaaatgggtagaaattaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttttcttgtaactcattgtaacactttc 32889511  T
Q  607 atcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaactag-----caatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattg 701  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||     |||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  32889510 atcttagtggattggagagctgctctatcccccagactaggtcatattggaccgaactagatcaacaatcttggtgtgtttgttcctctct-tttcattg 32889412  T
Q  702 attatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgatt 799  Q
     |||||| |  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || | ||| ||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32889411 cttatctttattgctttggttatacttgtggtgttgctctacacttagatttagatc--tgttttgttgttattgcttggagacactttacacattgatt 32889314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 54 - 574
Target Start/End: Original strand, 19365768 - 19366300
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||   || |||| ||||||||    | || |||||| ||||||    
T  19365768 tgttgagatttgacttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagc-tggttt 19365866  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggtt-ggtcgtaccttgggtcg 251  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||  ||| || |||||||   |||||||| ||| | ||    
T  19365867 gcagggtgccaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaattttccaggataaggacaggtcgtacattgtgacg 19365966  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttga 351  Q
    |||| |||||||||| ||||  ||||||| |||| |||||||||  |||  |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  19365967 tacgtaccaatcgtgacacgacttggaaatcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattttggaggagagcttgg 19366066  T
Q  352 a--------gtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaaca 441  Q
    |        | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  19366067 aagagcttagagagagaaacttggattacaaaggagggaactctagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaaatattgtaaaca 19366166  T
Q  442 tcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctc-tttagggttcattattgagagagt-gggtaacacaaatggg 539  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19366167 ccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatctaaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttca-tattgagagagtggggaaacacaaatggg 19366265  T
Q  540 tagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaa 574  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19366266 tagaatctaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaa 19366300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 311 - 806
Target Start/End: Original strand, 47098555 - 47099052
Alignment:
Q  311 ctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtga 410  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47098555 ctatataagtgtttctttgcagattttgaatgagagcttttagagagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagcga 47098654  T
Q  411 ggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttc 509  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| || || ||||| |||    
T  47098655 ggttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttttc-ttaggtttc 47098753  T
Q  510 attattgagagagtgggtaa--cacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttca 607  Q
       |||||||| |||||| |     |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47098754 ---attgagagtgtgggtgatgtgaaaatgggtagaaattaggacttgttcttttgtaagcttataagctaatttcttgtaactcattgtaacactttca 47098850  T
Q  608 tcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattga 702  Q
    || ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||     | |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||     
T  47098851 tcttagtggattggagggctgctctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tttctttgattgc 47098948  T
Q  703 ttatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgatta 800  Q
    |||||| |  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||  | |||||||||| || | |||||||||||||   ||||||||    
T  47098949 ttatctttattgctttgattatacttgtggtgttgctctacacttagatttaggtc--tgttttgttgttgttacttggagacactttatctattgatta 47099046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 407 - 806
Target Start/End: Original strand, 16124340 - 16124746
Alignment:
Q  407 gtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagg 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  16124340 gtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttctc-ttagg 16124438  T
Q  506 gttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacact 603  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  16124439 attcattattgaaagtgtgggtaacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttatgtaagcttataagctaatttcttgtaactcttttgtaacact 16124538  T
Q  604 ttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttca 698  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16124539 ttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttggtgtgtttgttcc-ttttctttca 16124637  T
Q  699 ttgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattg 796  Q
    | | |||||| |  ||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||  ||||||||||| |||| |||| ||| ||||  |||||    
T  16124638 tagcttatctttattgctttgattatgtttgtggtgttgctctacatttagatctaggtct-gtttttgttgttgttgcttggacacattttattcattg 16124736  T
Q  797 attaccactt 806  Q
    ||||||||||    
T  16124737 attaccactt 16124746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 355 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 19073254 - 19072794
Alignment:
Q  355 gagagaaacttgg-attacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttg--ggttgggaaacattgtaaacatcttgggtag 451  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  19073254 gagagaaacttgggaatacaaaggaggtaacttgagggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaacattgtaaacaccttggatag 19073155  T
Q  452 tgagatttcaccattggaatgatcaaaa-gtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaa-tgggtagaaattag 549  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  19073154 tgagatttcaccattggaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttctctt-agggttcatt--tgagagtgtgagtgacacaaaatgggtagaaattag 19073058  T
Q  550 gtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggt 648  Q
    || |||||||| |||||||||  ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  19073057 gtattgttcttttgtaagcttataagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggt 19072958  T
Q  649 catattggaccaaact-----agcaatc-ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctcta 741  Q
    ||||||||||| ||||     | ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  19072957 catattggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcc--tttctttcattgcttatctttattgttttgattatgcttgtggtgttgctcta 19072860  T
Q  742 cactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||| || | |||||||  ||||||||||| |||| | |||||||||||   ||||||||| ||||    
T  19072859 cacttagatttaggtctgatttttgttgttgttgcttcgagacactttatctattgattactactt 19072794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 355 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 19121144 - 19120684
Alignment:
Q  355 gagagaaacttgg-attacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttg--ggttgggaaacattgtaaacatcttgggtag 451  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  19121144 gagagaaacttgggaatacaaaggaggtaacttgagggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaacattgtaaacaccttggatag 19121045  T
Q  452 tgagatttcaccattggaatgatcaaaa-gtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaa-tgggtagaaattag 549  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  19121044 tgagatttcaccattggaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttctctt-agggttcatt--tgagagtgtgagtgacacaaaatgggtagaaattag 19120948  T
Q  550 gtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggt 648  Q
    || |||||||| |||||||||  ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  19120947 gtattgttcttttgtaagcttataagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggt 19120848  T
Q  649 catattggaccaaact-----agcaatc-ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctcta 741  Q
    ||||||||||| ||||     | ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  19120847 catattggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcc--tttctttcattgcttatctttattgttttgattatgcttgtggtgttgctcta 19120750  T
Q  742 cactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||| || | |||||||  ||||||||||| |||| | |||||||||||   ||||||||| ||||    
T  19120749 cacttagatttaggtctgatttttgttgttgttgcttcgagacactttatctattgattactactt 19120684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 355 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 9476585 - 9476200
Alignment:
Q  355 gagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtga 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9476585 gagagaaacttggattacaaaggaggtaacttttgggttgaatgtctttgtagtgaggttctctttggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtga 9476486  T
Q  455 gatttcaccattggaatgatcaaaa-gtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaa-tgggtagaaattaggtc 552  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||  ||||  |||| ||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||    
T  9476485 gatttcaccatttgaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttctcttaaga-ttcac-attgtgagagtgagtgacacaaaatggatagaaattaggtc 9476388  T
Q  553 ttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcat 651  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  9476387 ttgttcttgtgtaagcttgtaagctaatttcttataactcttttgtaatactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcat 9476288  T
Q  652 attggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatc-tgtgtgctttgtttatgcttgtggtgtt 735  Q
    |||||||| ||||     | |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| | | ||||||| ||||||||||| ||||    
T  9476287 attggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tttctttcattgtttatcttttttgctttgattatgcttgtgatgtt 9476200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 311 - 806
Target Start/End: Original strand, 47102569 - 47103069
Alignment:
Q  311 ctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtga 410  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47102569 ctatataagtgtttctttgcagattttgaatgagagcttttagagagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtga 47102668  T
Q  411 ggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttc 509  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| || ||||||||| || || ||||| |||    
T  47102669 ggttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcatcattggaaggatcaaaaagctttcttttgtgttttttc-ttaggattc 47102767  T
Q  510 attattgagagagtg---ggtaacacaaatggg--tagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactt 604  Q
       |||||||| |||   | ||  | |||||||  ||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  47102768 ---attgagagtgtgagtgatatgaaaaatgggtatagaaattaggacttgttcttttgtatgcttataagttaatttcttgtaactcattgtaacattt 47102864  T
Q  605 tcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcat 699  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||     | |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  47102865 tcatcttagtggattggatggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaattttggtgtgtttgttcc--tttctttgat 47102962  T
Q  700 tgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattga 797  Q
    || |||||| |  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||  | |||||||||| |||| | |||||||||||   |||||    
T  47102963 tgcttatctttattgctttgattatacttgtggtgttgctctacacttagatttaggtc--tgttttgttgttgttgctttgagacactttatctattga 47103060  T
Q  798 ttaccactt 806  Q
    |||||||||    
T  47103061 ttaccactt 47103069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 355 - 805
Target Start/End: Original strand, 24202539 - 24202995
Alignment:
Q  355 gagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacatcttgggtagt 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||    
T  24202539 gagagaaacttggattacaaaggagggaactttagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagt 24202638  T
Q  453 gagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgggtaa-cacaaatgggtagaaattagg 550  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||  ||||    
T  24202639 gagatctcaccattggaaggatctaaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctagg 24202737  T
Q  551 tcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatttt-cttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtc 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  24202738 tcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggcc 24202837  T
Q  650 atattggaccaaactag-----caatctt---ggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatct-gtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctct 740  Q
    ||||||| |  |||| |     |||||||   |||||||||||||   || ||||| ||| |||||| || |||||||| |   ||||||||||||||||    
T  24202838 atattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc---ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctct 24202932  T
Q  741 acactaagtctaggtctatttt-ttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccact 805  Q
    |||||| || |||| || |||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24202933 acacta-gtttagggctgttttgttgttgtt--tgcttggagacactttacacatagattaccact 24202995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 428 - 806
Target Start/End: Original strand, 19379917 - 19380304
Alignment:
Q  428 aaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtggg 526  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19379917 aaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatctaaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcat-attgagagagtggg 19380015  T
Q  527 taa-cacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatttt-cttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggata 624  Q
     || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19380016 gaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaaactatttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggaga 19380115  T
Q  625 gctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatc--ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatc-tgtgtgctt 716  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||     | |||||  |||||||||||||||   || ||||  ||| ||||| ||  |||||    
T  19380116 gctgctctctcccccatattaggtcatatt-gactgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttc---ttccttttcttgcttatcttggttgctt 19380211  T
Q  717 tgtttatgcttgtggtgttgctctacactaagtctag----gtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||    || | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19380212 tgtatttgcttgtggtgttgctctacact-agactagggctgtttttttttttttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccactt 19380304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 150 - 404
Target Start/End: Original strand, 49918022 - 49918276
Alignment:
Q  150 tttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggt 249  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  49918022 tttgcagggtgcccaatcgtgacacgattttcgaaaaacgtgacacgatttttaa-cttgctgggcacgttttcaggataaggttggtcataccttgggt 49918120  T
Q  250 cgtacgcaccaatcgtgccacg-ttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagct 348  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  49918121 cgtacacaccaatcgtgtcacgatttgggaaaatgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttctt-tgcagattttgaagtagagct 49918219  T
Q  349 tgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttg 404  Q
    ||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  49918220 tgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaaggtctttg 49918276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 355 - 609
Target Start/End: Original strand, 40816587 - 40816842
Alignment:
Q  355 gagagaaacttgg-attacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttg--ggttgggaaacattgtaaacatcttgggtag 451  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40816587 gagagaaacttgggaatacaaaggaggtaacttgagggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaacattgtaaacaccttgggtag 40816686  T
Q  452 tgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattagg 550  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||   |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  40816687 tgagatttcaccattggaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttctc-ttaggattc---attgagagtgtgggtgacacaaatgagtagaaattagg 40816782  T
Q  551 tcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatc 609  Q
    |||||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40816783 tcttgttcttttgtaagcttataagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatc 40816842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 117 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 28220756 - 28220423
Alignment:
Q  117 aacgtgtcacgatttcccaggcagtgagca-tggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggt 215  Q
    ||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||   |      
T  28220756 aacgtgtcatgattttcttggcagtgagcactgttttgcagggtgcccaatcgtgacacgattttgggaaaacgtgacacgattttcggctttgcacgac 28220657  T
Q  216 acgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctat 314  Q
    | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28220656 aagtatttaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcacaaaacgtgtcacgatttgggaaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctat 28220557  T
Q  315 ataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgagga 413  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |   |     
T  28220556 ataagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagt 28220459  T
Q  414 tctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  28220458 tctcttgggttgggaagcattgaaaacaccttgggt 28220423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 89 - 449
Target Start/End: Original strand, 31658850 - 31659209
Alignment:
Q  89 aacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaa 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||  ||  |  | |||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  31658850 aacagagaaatcgtgacacgatttcataggcgtgtcacgattttgcaatgtcgagagc-tgttttgcagggtgcccaatcgtgacacgattttgggaaaa 31658948  T
Q  188 cgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgc 286  Q
    |||||||| |||||    |||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||| |||     
T  31658949 cgtgacacaattttttg-cttgctgggaaagttttcaggataaggttggttgtaccttgggtcgtacgcaccaaacgtgtcacgatttggtaaaatgtga 31659047  T
Q  287 cacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttg-gagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaac 384  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||    
T  31659048 cacgattttgacagttgaagactgctatataagtgttctt-tgcagattttgagag-agagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaac 31659145  T
Q  385 tttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||||||||| ||||||| | |   | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  31659146 tttagggttgagggtctttg-attagagttctcttgggttcggaaacattgtaaacaccttgggt 31659209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 150 - 449
Target Start/End: Original strand, 10924896 - 10925194
Alignment:
Q  150 tttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggt 249  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||   |||| | || | |||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  10924896 tttgcagggtacccaatcgtgacacgattttggaaaaatgtgacacgattttcgg-cttggtaggcaagttttcaaaataaagttggtcataccttgggt 10924994  T
Q  250 cgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagct 348  Q
    | |||||| ||| |||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  10924995 catacgcatcaaccgtgtcacgatttggcaaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgttatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagct 10925093  T
Q  349 tgaagtgagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |   | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10925094 tgaagagagagaaacttggaaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttg-attatagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 10925192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 117 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 28223951 - 28223618
Alignment:
Q  117 aacgtgtcacgatttcccaggcagtgagca-tggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggt 215  Q
    ||||||||| ||||| |  ||||||||| | || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||   |      
T  28223951 aacgtgtcatgattttcttggcagtgagaactgttttgcagggtgcccaatcgtgacacgattttgggaaaacgtgacacgattttcggctttgcacgac 28223852  T
Q  216 acgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctat 314  Q
    | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28223851 aagtatttaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcacaaaacgtgtcacaatttgggaaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctat 28223752  T
Q  315 ataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgagga 413  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |   |     
T  28223751 ataagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagt 28223654  T
Q  414 tctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  28223653 tctcttgggttgggaaacattgaagacaccttgggt 28223618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 89 - 449
Target Start/End: Original strand, 44454771 - 44455131
Alignment:
Q  89 aacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaa 187  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||  | | || | ||||||| ||| | | |||  |||||||| |||||||||||| |||    
T  44454771 aacaaagaaatcgtgacacgatttcataagcgtgtcacgatttggctatgccgagagcatgtttt-ctgagtgtccaatcgtgacacgattttggggaaa 44454869  T
Q  188 cgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgc 286  Q
    |||||||||||||||   |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||| ||||||||     
T  44454870 cgtgacacgattttcgg-cttgctgggcaagttttcaagataaggttggttgtaccttgggtcgtacgcactaaacgtgtcacgatttggcaaaacgtgg 44454968  T
Q  287 cacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttgg-attacaaaggaggtaact 385  Q
    |||||||||||||| || ||  | |||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| || ||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  44454969 cacgattttgacagttgcagggtactatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagagagagaaacttggtaaatcaaaggaggtaact 44455068  T
Q  386 ttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||||||||||| ||||||| | |   | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44455069 ttagggttgagggtctttg-attagagttttcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 44455131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 216 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 22819893 - 22819444
Alignment:
Q  216 acgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg-ttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctat 314  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||  |||  |||||  || |||| ||||||||||| ||||  |   | | ||    
T  22819893 acgttttcagaataagtttggtcgtaccttgggtcgtacgcatcgaccgtaacacaattttgccaatcgtgacacgattttgatagctatatggtacaat 22819794  T
Q  315 ataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggatt-acaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgagga 413  Q
     ||||||||  ||| || |||||| || |||| ||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||     
T  22819793 ttaagtgtttctgttcaaattttgaaggagagtttgaag--agagaaacttgggtttacaaaggaggtaactttaggatttagtgtctttgtagtgaggt 22819696  T
Q  414 tctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctct-ttagggttcat 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| || ||| ||||| |||      
T  22819695 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagttacatttcaccattggaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttttctcttaggattc-- 22819598  T
Q  512 tattgagagagtgggtaac---acaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttca 607  Q
     |||||||| |||||| ||   | |||||| ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||   ||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22819597 -attgagagtgtgggtgacttgaaaaatggttagaaattatgtcttattctt-tgtgagctaaaaagctaatttcttgtaactcatttgtatcactttca 22819500  T
Q  608 tcatagtggattggatagctgctctct-cccccatattaggtcatattggaccaaa 662  Q
    || | ||||||||||  ||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  22819499 tcttggtggattggagggctactctctccccccagagtaggtcatattggaccaaa 22819444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 163 - 447
Target Start/End: Original strand, 3206671 - 3206956
Alignment:
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacg-ttttcaagataaggttggtcg-taccttgggtcgtacgcacca 260  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| | | |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  3206671 caatcgtgacacaattttgggaaaacgtgacacgattttc-gacttgctgggcaagttttttaggataaggttggtcgttaccttgggtcgtacgcatca 3206769  T
Q  261 atcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgaga 358  Q
    |||||| |||  |||||  |||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  3206770 atcgtgacacaatttgggaaaaacgtgacacgatttcgac-gctgaagattgctatataagtgttctt-tgaagattttgaaggagagcatgaagagaga 3206867  T
Q  359 gaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3206868 gaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttg-attaaagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 3206956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 311 - 501
Target Start/End: Original strand, 27104131 - 27104322
Alignment:
Q  311 ctatataagtgttcttgtgcagattttggagt-agagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtg 409  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||| |||  |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27104131 ctatttaagtgtttctttgcagatttttgagagagagcttttagagagagaaacttggattacaaaggaggtaactttaaggttgagtgtctttgtagtg 27104230  T
Q  410 aggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctt 501  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  27104231 agg-tctcttgggttgggaaacattataagcaccttgggtagtgagatttcaccattggaagaatcaaaaagcttccttttgtgttttctctt 27104322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 535 - 806
Target Start/End: Original strand, 27104333 - 27104597
Alignment:
Q  535 atgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctc 633  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27104333 atgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagct--------aatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctc 27104424  T
Q  634 tcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgctt 727  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||||     | |||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||| |  ||||||| ||||||||    
T  27104425 tcccccagattaggttatattggaccgaactgtgtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tttatttcattgcttatctttattgctttgattatgctt 27104522  T
Q  728 gtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||| ||     ||||| |||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  27104523 gtggtgttgctctacacttagatttaggtctgtt-----ttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccactt 27104597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 163 - 449
Target Start/End: Original strand, 1833207 - 1833493
Alignment:
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgtttt-caagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 261  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||    |||| || |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  1833207 caatggtgacacgattttgggaaaacataacacgatttttgg-cttgctgagtacatttttcaagataaggttggtcataccttgggttgtacgcaccaa 1833305  T
Q  262 tcgtgccacgttttg-gaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagaga 360  Q
     |||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||| |||||| ||||||    
T  1833306 acgtgtcacgatttgcgaaaacgtgacacgattttgacagctgaagactcctatataagtattctt-tgcagattttgaatgagagattgaagagagaga 1833404  T
Q  361 aactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||||| |||   |||||||| |||||||| ||||||| ||||||| | |   | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  1833405 aacttgggaaatcaaaggagataactttaaggttgagggtctttg-attagagttctcttggattgggaaacattgtaaacaccttgggt 1833493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 150 - 441
Target Start/End: Original strand, 3156540 - 3156829
Alignment:
Q  150 tttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggt 249  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||     ||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  3156540 tttgcagggtgccaaatcgtgacacgattttgggaaaacataacacgatttttggt-ttgctggacacgttttcaggataaggttggtcgtaccttgg-t 3156637  T
Q  250 cgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagct 348  Q
    | ||| |||||| |||| |||  ||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  3156638 catacacaccaaacgtgtcaccgtttggcaaaacgtaacacaattttgacagctgaagactgttatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagct 3156736  T
Q  349 tgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaaca 441  Q
     |||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |   | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3156737 ggaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagttctcttgggtttggaaacattgtaaaca 3156829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 218 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 30476876 - 30476645
Alignment:
Q  218 gttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatat 316  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30476876 gttttcaagataaggttggttgaaccttgggtcgtacacaccaaacgtgtcacgatttgggaaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatat 30476777  T
Q  317 aagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatc 415  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||   |||| || ||||  |||||| |||| || |||| | |   | ||    
T  30476776 aagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaatgatgtaatgttagggctgagggtatttg-attagagttc 30476679  T
Q  416 tcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30476678 tcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 30476645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 163 - 447
Target Start/End: Original strand, 20762357 - 20762641
Alignment:
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacg-ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||    
T  20762357 caatcgtgacacgattttgggaaatcgtgacacgatttttgg-cttgttgggcaagattttcaggataaggttggtcgtacctttgatcgaacgcatcaa 20762455  T
Q  262 tcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagag 359  Q
    ||||| |||| || ||  |||||||| |||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  20762456 tcgtggcacgattggggaaaaacgtgacacgatttcgac-gcagaagacagctatataagtgttctt-tgcagattttgaaagagagcttgaagagagag 20762553  T
Q  360 aaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    |||||| |||   ||||||| | |||||||||||| || ||||||| | |   | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20762554 aaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 20762641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 593 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 775757 - 775540
Alignment:
Q  593 tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaactag-----caatcttggtgtgtttgttcc 687  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || | |     |||||||| ||||||||||||    
T  775757 tttgtaacactttcatcttagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttgatgtgtttgttcc 775658  T
Q  688 tttttctttcattgattatctgtgt-gctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacac 785  Q
    |||  ||||||||| |||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||  ||||||||||| |||| |||||||||    
T  775657 ttt--ctttcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtct-gtttttgttgttgttgcttggagacac 775561  T
Q  786 tttacacattgattaccactt 806  Q
    ||||   |||| |||||||||    
T  775560 tttatctattggttaccactt 775540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 330 - 479
Target Start/End: Original strand, 9022655 - 9022804
Alignment:
Q  330 cagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggatt-acaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggga 428  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  9022655 cagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggtttacaaaggaggtatcttttgg-ttgaatgtctttgtagtgaggttctcttgggttgaga 9022753  T
Q  429 aacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaa 479  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  9022754 aacattgtaaacacctttcgtagtgagatttcaccattggaaggataaaaa 9022804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 119 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 4553175 - 4552834
Alignment:
Q  119 cgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtac 217  Q
    |||||||||||||| ||  || |||| |||| ||||||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||| |  ||    
T  4553175 cgtgtcacgatttcgcaatgccgtgaacatgttttgcagggtatccaatcgtgacacgattttgagaaaacgtgatatgattttcga-cttgtttgacac 4553077  T
Q  218 gttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatat 316  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| | || |||||||||| ||| |||| |||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  4553076 gttttcaggataaggttagtcgtatcgtgagtcgtacgcatcaaccgtgtcacgatttggcaaaacgtgacacgtttttgacagctgaagactgttatat 4552977  T
Q  317 aagtgttcttgtgcagattttggag----------tagagcttgaagtgagagaaacttgg---attacaaaggaggtaactttagggttgagtgtcttt 403  Q
    |||||||  | ||||||||||| ||           ||||||| ||| |||   |||||||   |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4552976 aagtgtttctttgcagattttgaagggtggttcaagagagcttcaagagaggagaacttgggaaatt--aaaggaggtaactttagggttgagggtcttt 4552879  T
Q  404 gtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
      | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  4552878 -aattgaggttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgggt 4552834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 219 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 13316745 - 13316517
Alignment:
Q  219 ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatat 316  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||  | ||  |||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||    
T  13316745 ttttcaggataaggttggtcgtaccttggatcgtacgcatcaatcgtggcacgagtggggaaaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatat 13316647  T
Q  317 aagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatc 415  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||   ||||||  | |||||||||||| || ||||||| | |   | ||    
T  13316646 aagtgttctt-tgcagattttgaagatgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggtagcaactttagggtttagggtctttg-attagagttc 13316549  T
Q  416 tcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13316548 tcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 13316517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 361 - 656
Target Start/End: Original strand, 24787137 - 24787439
Alignment:
Q  361 aacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacatcttgggtagtgag-at 457  Q
    ||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||| ||| || |||||| |||||| |     
T  24787137 aacttggataacaaaggagggaaccaaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattataatcaccttgggcagtgaggag 24787236  T
Q  458 ttcacca-ttggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagt-gggtaacacaaatgggtagaaattaggtctt 554  Q
    ||||  | |||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||| ||||| || ||||||||  ||||  ||    
T  24787237 ttcattagttggaaggatctaaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagttgggaaacaccaaagggtagaatctaggattt 24787335  T
Q  555 gttcttgtgtaa-gcttgcaagttatt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcat 651  Q
    |||||||||||| ||||| | | ||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||    
T  24787336 gttcttgtgtaatgcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctcccccccagattaggccat 24787434  T
Q  652 attgg 656  Q
    |||||    
T  24787435 attgg 24787439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 167 - 249
Target Start/End: Original strand, 16124245 - 16124327
Alignment:
Q  167 cgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggt 249  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16124245 cgtgtcacgattttcggaaaacgtgacacgattttcaaactttttgggtacgttttcaggataaggttggtcgtaccttgggt 16124327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 89 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 37033844 - 37033656
Alignment:
Q  89 aacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaa 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||  ||  |  ||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||| || |||    
T  37033844 aacagagaaatcgtgacacgatttcataggcgtgtcacgattttgcaatgtcgtgagcatgttttgcagggtgtccaatcgtgacacgattttcgggaaa 37033745  T
Q  188 cgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg 277  Q
    | |||||||||||||   ||||  ||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  37033744 catgacacgattttcgc-cttgcagggcaagttttcaggataaggttggttgtaccttgggtcgtacgcaccaaacgtgtcacgatttgg 37033656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 277 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 37503922 - 37503751
Alignment:
Q  277 gaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaa 375  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| |||   ||||    
T  37503922 gaaaacgtgacacgatttttacagctgaagactgatatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagaggttgaagagagagaaacttgggaaatcaaa 37503824  T
Q  376 ggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| | |   | ||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  37503823 ggaggtgactttagggttgagggtctttg-attagagttctattgggttggaaaatattgtaaacaccttgggt 37503751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 300 - 447
Target Start/End: Original strand, 3189154 - 3189300
Alignment:
Q  300 gctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtg 398  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  3189154 gctgaagattgctatataagtgttctt-tgaagattttgaaggagagcatgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggg 3189252  T
Q  399 tctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    |||||| | | | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3189253 tctttg-attaaagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 3189300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 300 - 447
Target Start/End: Original strand, 3197971 - 3198117
Alignment:
Q  300 gctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtg 398  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  3197971 gctgaagattgctatataagtgttctt-tgaagattttgaaggagagcatgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggg 3198069  T
Q  399 tctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    |||||| | | | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3198070 tctttg-attaaagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 3198117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 296
Target Start/End: Original strand, 193052 - 193213
Alignment:
Q  135 aggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggtt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||| ||||||| ||||||||| || ||||||   |||| |||| | ||||| | |||||| ||    
T  193052 aggcagtgagcatggtttgcagggtgtccaatcatgacacaattttggaaaaacgtgataccattttc-ggcttgctgggcaagtttttaggataagatt 193150  T
Q  235 ggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg-ttttggaaaacgtgccacgattttg 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  193151 ggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaaacgtgtcgcgatttgggaaatcgtgacacgattttg 193213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 271
Target Start/End: Original strand, 51764988 - 51765208
Alignment:
Q  52 attgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttc-ccaggcagtgagcatggt 150  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||   || |||| |||||||||   | || |||||| ||||    
T  51764988 attgttgagatttggctttaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttgacatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagc-tggt 51765086  T
Q  151 ttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataagg-ttggtcgtaccttgggt 249  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||| ||| | || ||||||||||||| |||||||| | | || |||| || |||||||  ||||| ||||||| |     
T  51765087 ttgcagggtgccaaatcgtgacacgatcttgaggaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcataccttgtga 51765186  T
Q  250 cgtacgcaccaatcgtgccacg 271  Q
    |||||| |||||||||| ||||    
T  51765187 cgtacgtaccaatcgtgacacg 51765208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 150 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 37879604 - 37879494
Alignment:
Q  150 tttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggt 249  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||  |||  | ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  37879604 tttgcagggtgctcaatcgtgacacgattttggaaaaatgtgacacgattttc-agcttactggacaagtttttaggataaggttggtcgtaccttgggt 37879506  T
Q  250 cgtacgcaccaa 261  Q
    || |||||||||    
T  37879505 cgcacgcaccaa 37879494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 150 - 271
Target Start/End: Original strand, 11348174 - 11348294
Alignment:
Q  150 tttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggt 249  Q
    |||||||||||   ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  11348174 tttgcagggtgtctaatcgtgacacgattttggagaaacgtgacacgattttcgg-cttgttgggcaagttttcaggataaggttggtcgtacattggat 11348272  T
Q  250 cgtacgcaccaatcgtgccacg 271  Q
    |||||||||||| |||| ||||    
T  11348273 cgtacgcaccaaacgtgtcacg 11348294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 219 - 449
Target Start/End: Original strand, 46064659 - 46064889
Alignment:
Q  219 ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatata 317  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||| |||||  || | || |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  46064659 ttttcaggataaagttggtcgtaccttgggtcgtacgtatcaaccgtgacacgatttggccaatcatgtcacgattttgacagctgaagactgttattta 46064758  T
Q  318 agtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatct 416  Q
    |||||||   | || |||||  || ||||||| ||| |||| |||||| |||   ||||| |||||||||||  |||||| ||||||| | |  || |||    
T  46064759 agtgttccaattca-atttttaaggagagcttcaagagagaaaaacttgggaaatcaaagaaggtaactttattgttgagggtctttg-attatggttct 46064856  T
Q  417 cttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  46064857 cttggggtggaaaacattgtaaacaccttgggt 46064889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 336
Target Start/End: Original strand, 9986785 - 9987068
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | ||| ||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||   || |||  |||||||||   | || |||||| |||| |    
T  9986785 tgttgagatttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttgacatcgtaacacgatttcgtggtgccgtgagc-tggtct 9986883  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataagg-ttggtcgtaccttgggtcg 251  Q
    |||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | | || |||| ||  ||||||  ||||| ||||||||| ||    
T  9986884 gcagtgtgccaaatcgtgacacgattttgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccataataaggactggtcataccttgggacg 9986983  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattt 336  Q
     | |||||||||||| |||| | |||||| |||| ||| |||||  |||  || | ||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  9986984 gatgcaccaatcgtgacacgatctggaaatcgtgacacaattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgtgcagattt 9987068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 449
Target Start/End: Original strand, 41360807 - 41360886
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctctt--gggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41360807 caaaggaggtaactttagggttgagtgcatgtgtagtgaggttctcttgagggttgggaaacatcgtaaacatcttgggt 41360886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 712 - 806
Target Start/End: Original strand, 40816867 - 40816962
Alignment:
Q  712 tgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  40816867 tgctttgattatgctcgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgttttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccactt 40816962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 131
Target Start/End: Original strand, 16124187 - 16124257
Alignment:
Q  61 aattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgattt 131  Q
    |||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16124187 aattggttttaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgatacgatttcatcaacgtgtcacgattt 16124257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 131
Target Start/End: Original strand, 21536111 - 21536189
Alignment:
Q  53 ttgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgattt 131  Q
    |||||| || ||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21536111 ttgttgtaatttggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgatttcatcaacgtgacacgattt 21536189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 271
Target Start/End: Original strand, 29135762 - 29135843
Alignment:
Q  189 gtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg 271  Q
    |||||| ||||||||  |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  29135762 gtgacatgattttcag-cttgctgggcacgttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaaacgtgtcacg 29135843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 372 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 834440 - 834364
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  834440 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttg-attaaagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 834364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 266
Target Start/End: Original strand, 3189036 - 3189140
Alignment:
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacg-ttttcaagataaggttggtcg-taccttgggtcgtacgcacca 260  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| | | |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  3189036 caatcgtgacacaattttgggaaaacgtgacacgattttc-gacttgctgggcaagttttttaggataaggttggtcgttaccttgggtcgtacgcatca 3189134  T
Q  261 atcgtg 266  Q
    ||||||    
T  3189135 atcgtg 3189140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 266
Target Start/End: Original strand, 3197853 - 3197957
Alignment:
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacg-ttttcaagataaggttggtcg-taccttgggtcgtacgcacca 260  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| | | |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  3197853 caatcgtgacacaattttgggaaaacgtgacacgattttc-gacttgctgggcaagttttttaggataaggttggtcgttaccttgggtcgtacgcatca 3197951  T
Q  261 atcgtg 266  Q
    ||||||    
T  3197952 atcgtg 3197957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 188 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13547763 - 13547676
Alignment:
Q  188 cgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg 277  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  13547763 cgtgacacaattttcag-cttgctgggcacgttttcaa-ataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaaccgtgtcacgatttgg 13547676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 188 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13549674 - 13549587
Alignment:
Q  188 cgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg 277  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  13549674 cgtgacacaattttcag-cttgctgggcacgttttcaa-ataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaaccgtgtcacgatttgg 13549587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 370 - 434
Target Start/End: Original strand, 17345350 - 17345414
Alignment:
Q  370 tacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacatt 434  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  17345350 tacaaaggaggtacatttagggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagttgagaaacatt 17345414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 37560211 - 37560074
Alignment:
Q  303 gaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttg-gattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtct 401  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||   |||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  37560211 gaagactcctgtataagtgttctt-tgcagattttgaagtaaagcttgaagagagagaaacttgagaaatcaaatgaggtaactttaaggttgagggtct 37560113  T
Q  402 ttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaaca 441  Q
    ||| | |   | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  37560112 ttg-attagagttctcttgggtttgaaaacattgtaaaca 37560074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 582 - 656
Target Start/End: Original strand, 25445079 - 25445152
Alignment:
Q  582 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  25445079 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 25445152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 582 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 41390676 - 41390603
Alignment:
Q  582 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  41390676 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 41390603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 582 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 41398331 - 41398258
Alignment:
Q  582 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  41398331 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 41398258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 197181 - 197105
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  197181 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 197105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 13138247 - 13138171
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  13138247 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttg-attagggttctcttggggtgggaaacattgtaaacaccttgggt 13138171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 198
Target Start/End: Original strand, 25439405 - 25439542
Alignment:
Q  61 aattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtg 160  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  | | |||| ||||||||   | || ||||||   ||||||||| ||    
T  25439405 aattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagcaatcgtgacacgatttggtaatcgtgacacgatttgagatgccgtgagccaagtttgcaggatg 25439504  T
Q  161 ctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgat 198  Q
    |  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  25439505 caaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgat 25439542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 336
Target Start/End: Original strand, 40282055 - 40282242
Alignment:
Q  151 ttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgatt-ttcaaacttgttgggtacgttttcaagataagg-ttggtcgtaccttggg 248  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| | |||||||| | | || |||| || |||||||  ||||| |||||||||    
T  40282055 ttgcagggtgccaaatcgtgacacgattgtggtaaatcgtgacacgattgtgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcataccttggg 40282154  T
Q  249 tcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattt 336  Q
     || | |||||||||||| |||| |  ||||| |||| |||||||||  |||  |||| |   ||| |||||||||||||||||||||    
T  40282155 acggatgcaccaatcgtgacacgatcaggaaatcgtgacacgattttatcagtggaaggcatgtatttaagtgttcttgtgcagattt 40282242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 372 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 3847394 - 3847318
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3847394 caaaggaggtaactttagggtcgagggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 3847318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 336
Target Start/End: Original strand, 21053547 - 21053823
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggtttgcagggtg 160  Q
    |||| ||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||   || |||| |||||||||   | ||||||||| | |  |||| ||||    
T  21053547 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtggtgcagtgagc-tagaatgcaaggtg 21053645  T
Q  161 ctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgatt-ttcaaacttgttgggtacgttttcaagataagg-ttggtcgtaccttgggtcgtacgcac 258  Q
    |  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||| | | || |||| || |||||||  ||||| ||||||| | || | ||||    
T  21053646 ccaaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgattgtgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcataccttgagacggatgcac 21053745  T
Q  259 caatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattt 336  Q
    |||||||| |||| |  ||||| |||| |||||||||  |||  |||| |   ||| |||||||||||||||||||||    
T  21053746 caatcgtgacacgatcaggaaatcgtgacacgattttatcagtggaaggcatgtatttaagtgttcttgtgcagattt 21053823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 372 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 23555538 - 23555462
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||| | | | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23555538 caaaggaggtaacttcagggttgaggatctttg-attaaagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 23555462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 198
Target Start/End: Original strand, 25444598 - 25444735
Alignment:
Q  61 aattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtg 160  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  | | |||| ||||||||   | || ||||||   ||||| ||| ||    
T  25444598 aattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagcaatcgtgacacgatttggtaatcgtgacacgatttgagatgccgtgagccaagtttgtaggatg 25444697  T
Q  161 ctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgat 198  Q
    |  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  25444698 caaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgat 25444735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 41398813 - 41398764
Alignment:
Q  63 ttggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41398813 ttggcttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcgtgacacgattt 41398764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 372 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 45644628 - 45644552
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |  || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45644628 caaaggagataactttagggttgagggtctttg-attagggttctcttaggttggaaaacattgtaaacatcttgggt 45644552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 39446077 - 39446025
Alignment:
Q  60 aaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  39446077 aaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 39446025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Original strand, 43988452 - 43988527
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  43988452 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg 43988527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 112
Target Start/End: Original strand, 44023382 - 44023434
Alignment:
Q  60 aaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  44023382 aaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 44023434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 536 - 666
Target Start/End: Original strand, 9023794 - 9023924
Alignment:
Q  536 tgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctct 634  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  | | || ||| ||||| | | |||||| |||||||||| |||||||||||| |||| || | |    
T  9023794 tgggtagaaattaggtcttattctt-tgtgagcttttatgctaatttattgtatcccatttgtatcactttcatcttagtggattggagagctactatat 9023892  T
Q  635 cccccatattaggtcatattggaccaaactag 666  Q
     ||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  9023893 tccccataataggtcatattggagcgaactag 9023924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 180
Target Start/End: Original strand, 24202251 - 24202377
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttc-ccaggcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||   || |||| |||||||||   | || |||||| ||||||    
T  24202251 tgttgagatttggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagc-tggttt 24202349  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgatttt 180  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||    
T  24202350 gcagggtgccaaatcgtgacacgatttt 24202377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 62 - 113
Target Start/End: Original strand, 24793673 - 24793724
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttc 113  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  24793673 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgatttc 24793724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 582 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 39445594 - 39445522
Alignment:
Q  582 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  39445594 tcttgtaaccttttgtaacactt-ca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 39445522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 582 - 656
Target Start/End: Original strand, 44023864 - 44023936
Alignment:
Q  582 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  44023864 tcttgtaaccttttgtaacactt-ca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 44023936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 277
Target Start/End: Original strand, 16455384 - 16455445
Alignment:
Q  216 acgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg 277  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||    
T  16455384 acgttttcaggataagtttgctcgtaccttgggtcgtacgcatcaaccgtgacacgatttgg 16455445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 41391177 - 41391128
Alignment:
Q  63 ttggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  41391177 ttggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 41391128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 112
Target Start/End: Original strand, 1054519 - 1054571
Alignment:
Q  60 aaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  1054519 aaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgtcacgattt 1054571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20622821 - 20622666
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | ||| ||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||   || |||| |||||||||   | || |||||| | || |    
T  20622821 tgttgagatttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtggtgccgtgagc-tagtct 20622723  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttg 209  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  20622722 gcagggtgccaaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgattgtgaaacttg 20622666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 257
Target Start/End: Original strand, 15820055 - 15820086
Alignment:
Q  226 gataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgca 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15820055 gataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgca 15820086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 30476971 - 30476892
Alignment:
Q  101 gtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgatttt 180  Q
    ||||||||||||  | | ||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||   ||||||| |||||||||    
T  30476971 gtgacacgatttagtaagcgtgtcacgattttctaggcagtgggcatgttttgcagggtgtctaatcgtgacacgatttt 30476892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 50167407 - 50167372
Alignment:
Q  414 tctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50167407 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 50167372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 582 - 656
Target Start/End: Original strand, 1055002 - 1055074
Alignment:
Q  582 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  1055002 tcttgtaaccttttgtaacactt-ca-catattggattggagagttgctctctcccccagattaggccatattgg 1055074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 605 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 9314713 - 9314667
Alignment:
Q  605 tcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcat 651  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9314713 tcattatagtggaacggatagctgctctctcccccatagtaggtcat 9314667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 610 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 9459483 - 9459429
Alignment:
Q  610 atagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  9459483 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaact 9459429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 610 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 9463310 - 9463256
Alignment:
Q  610 atagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  9463310 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaact 9463256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 610 - 664
Target Start/End: Original strand, 16226382 - 16226436
Alignment:
Q  610 atagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  16226382 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaact 16226436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 610 - 664
Target Start/End: Original strand, 16231778 - 16231832
Alignment:
Q  610 atagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  16231778 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaact 16231832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 690 - 751
Target Start/End: Original strand, 17345631 - 17345693
Alignment:
Q  690 tttctttcattgattatctgtgtg-ctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaagtct 751  Q
    |||||||||||| |||||| | || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17345631 tttctttcattgcttatctttatggctttgattatgcttatggtgttgttctacactaagtct 17345693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 672 - 770
Target Start/End: Original strand, 50521199 - 50521298
Alignment:
Q  672 ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgt-gctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaagtc-taggtctatttt-ttgttg 768  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| || ||| | | |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||| ||||||    
T  50521199 ttggtgtgtttgttccttt--ctttcattgtttctctttattgctttgattatgtttgtggtgttgttctacactaggacttaggtctattttgttgttg 50521296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 482; Significance: 0; HSPs: 111)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 3778165 - 3777418
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgc 161  Q
    |||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  3778165 attggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattacatcaacgtgtcacgattttccaagcagcgagcatggtttgcagggtgc 3778066  T
Q  162 tcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3778065 tcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaatttgctcggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 3777966  T
Q  262 tcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  3777965 tcgtgccacgttttggaaaacttgacatgattttgacagctgaagactgctatataaatgttcttgtgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaa 3777866  T
Q  362 acttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttca 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3777865 acttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttca 3777766  T
Q  462 ccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgttct 559  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||| ||||| |||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3777765 ccattggaatgatcaaaaagcttccttttgtattttctc-ttaggattca-tattgtgagagtgggtgacacaaaatgggtagaaattagatcttgttct 3777668  T
Q  560 tgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggacc 659  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | | ||||||| ||||||||||    
T  3777667 tgtgtaagtttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcctctagattaggttatattggacc 3777568  T
Q  660 aaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctag 753  Q
     ||||     | |||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || |||||    
T  3777567 gaactgggtcaacaatctcggtgtgtttgttcc--tttctttcattgcttatctttgtgctttgattatgcttgtggttttgttctacacttagatctag 3777470  T
Q  754 gtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3777469 gtct-gtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccactt 3777418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 806
Target Start/End: Original strand, 5396164 - 5396903
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttg 153  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | || ||| |||||||||||     
T  5396164 tgttgaaaattagcttcaaatttgtggtttgaaagaacagagaaatcgtg-cacgatttcatcaacgtgtcatgattttcaag-cagggagcatggtttc 5396261  T
Q  154 -cagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgt 252  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  5396262 tcaggttgctcaatcgtgtcacgattttggaaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtatgttttcaggataaggttgatcgtaccttgggtcgt 5396361  T
Q  253 acgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaa 352  Q
    ||||||||||||||                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||    
T  5396362 acgcaccaatcgtg-------------------ccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgagcagattttgaaggagagctggaa 5396442  T
Q  353 gtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagt 452  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5396443 gagagagaaacttggattacaaaggaggttactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagt 5396542  T
Q  453 gagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtc 552  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5396543 gagatttcaccattggaagaatcaaaagctttcttttgtgtcttctctttagggttcatcattgagagagtgagtaacacaaatgggtagaaattaggtc 5396642  T
Q  553 ttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcata 652  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5396643 ttgttcttgtgtaagcttgcaagctattttcttgtaactctttgcaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcata 5396742  T
Q  653 ttggaccaaact-----agcaatc--ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacact 745  Q
    ||||||| ||||     | |||||  ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5396743 ttggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttcttcc--tttctttcattgcttatctttgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacact 5396840  T
Q  746 a---agtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |   |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5396841 aattagtctaggtct-gtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccactt 5396903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 719
Target Start/End: Original strand, 16622774 - 16623435
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgc 161  Q
    |||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||  ||||    
T  16622774 attggcttaaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgattttc-aggtagtgagcatggtttgcattgtgc 16622872  T
Q  162 tcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgtttt-caagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcacca 260  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16622873 tcaattgtgtcacaattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgctaggtacgtttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcacca 16622972  T
Q  261 atcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagaga 360  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||| ||||||    
T  16622973 atcgtgtcacgatttggaaaacgtgacacgattttgacaggtgaaggctgctatataagtgtttttgtgcagattttgaaggagagctagaagagagaga 16623072  T
Q  361 aacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttc 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16623073 aacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttc 16623172  T
Q  461 accattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgttct 559  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16623173 accattggaaggatcaaaagcttccttttgtgttttct-tttaggattca-tattgtgagagtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttct 16623270  T
Q  560 tgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggac 658  Q
    | |||||||||   || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  16623271 tctgtaagcttattagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattgaac 16623370  T
Q  659 caaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgt 719  Q
    | ||||     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16623371 cgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc-ttttctttcattgcttatctttgtgctttgt 16623435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 732
Target Start/End: Original strand, 36314702 - 36315384
Alignment:
Q  53 ttgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| ||||| |||| |||| |||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||    
T  36314702 ttgttgtaaattagcttcaaatttgtggtttcgaagaatagagaaatcgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgattttc-aggcagggagcatagttt 36314800  T
Q  153 g-cagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcg 251  Q
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36314801 ctcaggatgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaa-cttgctgggcacgttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcg 36314899  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacgttttgga-aaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttg 350  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  36314900 tacgcaccaatcgtgtcacgatttggacaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttg 36314999  T
Q  351 aagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggta 450  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  36315000 aagagagataaacttggattacaaaggaggtaactttagggtttagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacacattgggta 36315099  T
Q  451 gtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattagg 550  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36315100 gtgagatttaaccattggaaggatcaaaagcttccttttgtgttttttc-gtaggattcattattgagagtgtgggtaacacaaatgggtagaaattagg 36315198  T
Q  551 tcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtca 650  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  36315199 tcttgctcttgtgtaagcttctaagctaatttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtca 36315298  T
Q  651 tattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggt 732  Q
    ||||||||| ||||     | || ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||    
T  36315299 tattggaccgaactgggtcaacattcttggtgtgtttgttcc--tttctttcattgtttatctctattgctttgattatgcttgtggt 36315384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 732
Target Start/End: Original strand, 36328911 - 36329593
Alignment:
Q  53 ttgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| ||||| |||| |||| |||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||    
T  36328911 ttgttgtaaattagcttcaaatttgtggtttcgaagaatagagaaatcgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgattttc-aggcagggagcatagttt 36329009  T
Q  153 g-cagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcg 251  Q
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36329010 ctcaggatgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaa-cttgctgggcacgttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcg 36329108  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacgttttgga-aaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttg 350  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  36329109 tacgcaccaatcgtgtcacgatttggacaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttg 36329208  T
Q  351 aagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggta 450  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  36329209 aagagagataaacttggattacaaaggaggtaactttagggtttagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacacattgggta 36329308  T
Q  451 gtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattagg 550  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36329309 gtgagatttaaccattggaaggatcaaaagcttccttttgtgttttttc-gtaggattcattattgagagtgtgggtaacacaaatgggtagaaattagg 36329407  T
Q  551 tcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtca 650  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  36329408 tcttgctcttgtgtaagcttctaagctaatttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtca 36329507  T
Q  651 tattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggt 732  Q
    ||||||||| ||||     | || ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||    
T  36329508 tattggaccgaactgggtcaacattcttggtgtgtttgttcc--tttctttcattgtttatctctattgctttgattatgcttgtggt 36329593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 164 - 790
Target Start/End: Original strand, 8689079 - 8689696
Alignment:
Q  164 aatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatc 263  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8689079 aatcgtgacacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgctgggtacgttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatc 8689178  T
Q  264 gtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaac 363  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  8689179 gtgccacgatttggaaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagtgagagaaac 8689278  T
Q  364 ttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcacc 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  8689279 ttggattacaaaggaggtaactttagggtttagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattttaaacaccttggatagtgagatttcacc 8689378  T
Q  464 attggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtg 563  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8689379 attggaaggatcaaaagtttccttttgtgtcttctc-ttagggttcatcattgagagagtgggaaacacaaattggtagaaattaggtcttgttcttgtg 8689477  T
Q  564 taagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaac 663  Q
    |||||||||||| |||||||          ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  8689478 taagcttgcaagctattttc----------ttgtaacactttcatcatagtggataggagagct--cctctcccccatattagatcatattggaccgaac 8689565  T
Q  664 t-----agcaatc--ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaagtctaggtc 756  Q
    |     | |||||  |||||||||||||| |  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  8689566 tggatcaacaatcttttggtgtgtttgttac--tttctttcattgcttatctttgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctgcattaagtctaggtc 8689663  T
Q  757 tattttttgttgttattgcctggagacactttac 790  Q
    |  ||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  8689664 t-gtttttgttgttgttacttggagacactttac 8689696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 134 - 806
Target Start/End: Original strand, 5268751 - 5269423
Alignment:
Q  134 caggcagtgagcatggtttg-cagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataagg 232  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5268751 caggcagcgagcatggtttttcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaggataagg 5268850  T
Q  233 ttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgga-aaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgca 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5268851 ttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgtcacgatttggacaaacgtgacacgattttaacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgca 5268950  T
Q  332 gattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaac 431  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5268951 gattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaac 5269050  T
Q  432 attgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaac 530  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  5269051 attgtaaacaccttggatagtgagatttcaccattggaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttctc-ttaggattcattattgagagtgtgggtgac 5269149  T
Q  531 aca-aatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgc 629  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  5269150 acacaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagctaatttc----------ttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgc 5269239  T
Q  630 tctctcccccatattaggtcatattggaccaaactag-----caatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttat 723  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||     |||||||| ||||||||||||  |||||||||||  |||| | |  ||||||| ||||    
T  5269240 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttgttgtgtttgttcc--tttctttcatttcttatatttattgctttgattat 5269337  T
Q  724 gcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctatttt--ttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  |||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5269338 gcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtatatttttgttgttgttgttgcttggagacactttatccattgattaccactt 5269423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 10047982 - 10047247
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttg--cagggt 159  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||   ||||||    
T  10047982 attggcttcaaatttgtggtttggaagaacagataaatcgtgacacgatttcatcaacgtgtcgcgatttcc-aggcagcgagcatggttttttcagggt 10047884  T
Q  160 gctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcacc 259  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||            |||||    
T  10047883 gctcaaccgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgatttgcaaacttgatgggtacgttttcaggataaggttggtcgtac------------gcacc 10047796  T
Q  260 aatcgtgccacgttttgga-aaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgaga 358  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||     |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  10047795 aatcgtgtcacgatttggacaaacgtgacacgattttgacagttgaagact-----ataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagaga 10047701  T
Q  359 gaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatt 458  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10047700 gaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtaatgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatt 10047601  T
Q  459 tcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgt 556  Q
    |||||||||||| |||| ||||  |||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10047600 tcaccattggaaggatcaaaaaacttccttttgtgttttgtc-ttaggattcattattgagagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgt 10047502  T
Q  557 tcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattg 655  Q
    ||||||||||||||  ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10047501 tcttgtgtaagcttataagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattg 10047402  T
Q  656 gaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag- 748  Q
    |||| ||||     | |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  10047401 gaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tttctttcattgtttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttaga 10047304  T
Q  749 tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  10047303 tctatgtcta-tttttgttgttattgcttggagacactttatccattgattaccactt 10047247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 52 - 806
Target Start/End: Original strand, 38151908 - 38152669
Alignment:
Q  52 attgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtt 151  Q
    ||||||| | |||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||    
T  38151908 attgttgtatattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgatttcatcaacgtgtcacaatttcc-aggcagtgagtacggtt 38152006  T
Q  152 tgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgtttt-caagataaggttggtcgtaccttgggtc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||    
T  38152007 tgcagggtgctcaatcgtgtcacaaatttgggaaaacgtgacacaattttcaaacttgctggatacgtttttccggataaggttggtcgtaccttggatc 38152106  T
Q  251 gtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaac-gtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagctt 349  Q
    ||||||| |||||||   || ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||     
T  38152107 gtacgcatcaatcgttttacattttgaaaaaatgtgacacgattttgacagctgaatactgctatataagtgttcctgtgcagattttgaaa-agagctg 38152205  T
Q  350 gaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttggg 448  Q
    |||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  38152206 gaagagagagaaaatttggattacaaatgaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggatgggaaatattgtaaacaccttggg 38152305  T
Q  449 tagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaatt 547  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||    
T  38152306 tagtgacaattcaccattggaaggatcaaaagcttccatttgtgttttctc-ttaggattcattattgagagtgtgggtgacacaaaattggtagaaatt 38152404  T
Q  548 aggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattag 646  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  38152405 aggtcttgttcttgtgtaagcttataagctaatttcttataactcttttgtaacactttcaccatagtggattggagagctgctctctcccccagattat 38152504  T
Q  647 gtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctcta 741  Q
    ||||||||||||| ||||     | |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  38152505 gtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tttctttcattgcttatctttgtgctttgattatgcttgtggtgttgctata 38152602  T
Q  742 cactaag-tctaggtctatttt-ttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||| || ||||||||| |||| |||||||| |||| |||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  38152603 cacttagatctaggtctgttttattgttgttgttgcttggaaacacttcatacattgattaccactt 38152669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 5148303 - 5147545
Alignment:
Q  53 ttgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggtt 151  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||  |  |||||| | |||    
T  5148303 ttgttgaaaattggcttcaaatttgtggtttggaagaatagagaaatcgtgacacgattttatcaccgtgacacgattttgcaatgtcgtgagc-tagtt 5148205  T
Q  152 tgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcg 251  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5148204 tgcagggtgaccaatcgtggcacgattttgtgaaaacttgacacgattttcaaacttactggatacgttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcg 5148105  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttga 351  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||| ||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  5148104 tacgcaccaatcgtgtcacgatttgcaaaacgtgacacgatcttatcagtttaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttga 5148005  T
Q  352 agtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtag 451  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||     
T  5148004 aatgagagaaacttggattacacaggaggtaactttagggtttagtgtctttgtagtaaggatctcttgagttgggaaacattgtaaacacattggataa 5147905  T
Q  452 tgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattagg 550  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  5147904 tgagatttcaccattggaaggatcataagcttccttttgtgttttctctttagggttca-tattgtgagaatgggtgacacaaaatgggtagaaattagg 5147806  T
Q  551 tcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaact-ctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtc 649  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  5147805 ccttgttcttgtgtaagcttgcaagctattttcttgtaactattttgtaacactttcatcataatggactggagagctgctccctcccccaaattaggtc 5147706  T
Q  650 atattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctaca 743  Q
    |||||||||| ||||     | |||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |  || |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5147705 atattggaccgaactgggtcaacaatctcggtgtgtttgttcc--tttctttcattgcttatctctattgttttgattatgtttgtggtgttgctctaca 5147608  T
Q  744 ctaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    || || | |||||||  || |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5147607 cttagatttaggtct-gttattgttgttgtttcttggagacactttacacattgattaccactt 5147545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 147 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 5143793 - 5143127
Alignment:
Q  147 tggtttgcaggg-tgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtacctt 245  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5143793 tggtttgcaggggtgaccaatcgtggcacgattttgtgaaaatgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaggataaggttggtcgcacctt 5143694  T
Q  246 gggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttga-cagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtag 344  Q
    |||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  5143693 gggttgtgcgcaccaatcgtgtcacgatttggaaaacgtgacacgatttttatctactgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggag 5143594  T
Q  345 agcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatct 444  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  5143593 agcttgaagtaagagaaacttggattacagaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttggattgggaaactttgtaaacacct 5143494  T
Q  445 tgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtaga 543  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||| | |||| ||||| |||||    
T  5143493 taggtagtgagatttcaccattggaaggatcataagcttccttttgtgttttctctttagggttca-tattctgagagtggctgacacaaaatgagtaga 5143395  T
Q  544 aattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgt-aactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccata 642  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  5143394 aattaggtcttgttcttgtgtatgcttgcaagctattttcttgtaaattttttgtaacactttcatcatagtgggttggagagctgctctctcccccaga 5143295  T
Q  643 ttaggtcatattggaccaaactag-----caatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttg 736  Q
    ||||||||||||||||| ||||||     ||||||  |||||||||||||  |||||||||||| |||||| |  || |||| ||||| |||||||||||    
T  5143294 ttaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctcagtgtgtttgttcc--tttctttcattgcttatctctattgttttgattatgtttgtggtgttg 5143197  T
Q  737 ctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
     |||||||| || | |||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5143196 ttctacacttagatttaggtct-gtttttgttgttgttgtttggagacactttacacattgattaccactt 5143127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 745
Target Start/End: Original strand, 6742888 - 6743583
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggttt 152  Q
    ||||| |||||||||| |||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |  | |||| || |||    
T  6742888 tgttgtaaattggcttcaaatttatggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgattttgcaacgtcgagagc-tgtttt 6742986  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgt 252  Q
     ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  6742987 tcagggtgcctaatcgtggcacgtttttgggaaaacgtgacacgatttt-aaacttgttgggcacgttttcaggataaggttggtcgtaccttgggacgt 6743085  T
Q  253 acgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttga 351  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||| ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6743086 acgcactaatcgtgtcacgatttgggaaaacttgacacaattttgacagttgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaagtagagcttga 6743185  T
Q  352 agtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtag 451  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  6743186 agagagagaaacttggattacaaaggaggtaacttgaggtttgagtgtctttgtagcgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtaa 6743285  T
Q  452 tgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattagg 550  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6743286 tgagatttcaccattggaaggatcaaaaacttccttttgtgttttctc-ttaggattcattattgagagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattagg 6743384  T
Q  551 tcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtc 649  Q
    |||||||||| ||||||| |  ||| || ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | ||||||||    
T  6743385 tcttgttcttttgtaagc-tataagctaattttttgtagctcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccgtagattaggtc 6743483  T
Q  650 atattggaccaaactag--ca--atcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgatta--tctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctaca 743  Q
    |||||||||| |||| |  ||  |||||||||||||||||||  |||||| ||||  |||  ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6743484 atattggaccgaactgggtcaacatcttggtgtgtttgttcc--tttcttccatttcttatctctatatgctttgattatgcttgtggtgttgctctaca 6743581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 806
Target Start/End: Original strand, 25861538 - 25862251
Alignment:
Q  87 agaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatgg-tttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaa 185  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25861538 agaacagagaaatcgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcc-aggcagtgagcatggcttttcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaa 25861636  T
Q  186 aa-cgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgga-aaacg 283  Q
    || ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||    
T  25861637 aaacgtgacacgattttcaa-cttgctgggcatgttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcatcaatcgtgtcacgatttggacaaacg 25861735  T
Q  284 tgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaa 383  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25861736 tgacacgattttgacagttgaagacttctatataagtgtttctttgcagattttgaaggagagcttttagagagagaaacttggattacaaagaaggtaa 25861835  T
Q  384 ctttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtt 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |    
T  25861836 ctttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgagtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaaaact 25861935  T
Q  483 tccttttgtg-tcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatt 580  Q
    |||||||||| | ||||| ||||| |||   |||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| || |    
T  25861936 tccttttgtgtttttctc-ttaggattc---attgagagtgtgggtgacacaaaatgggtaggaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagctaat 25862031  T
Q  581 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatcttgg 675  Q
    |||          |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||     | |||||||||    
T  25862032 ttc----------ttgtaacactttcatcatagtggattggagggccgctctcttccccatattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttgg 25862121  T
Q  676 tgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttatt 773  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||  ||||||||||| ||    
T  25862122 tgtgtttattcc--tttctttcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtct-gtttttgttgttgtt 25862218  T
Q  774 gcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    || |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  25862219 gcttggagacactttatctattgattaccactt 25862251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 52 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 54867805 - 54867050
Alignment:
Q  52 attgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtt 151  Q
    |||||||  ||||||||| |||| |||||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||    
T  54867805 attgttgctaattggcttcaaatttgtggtttggaagaatagagaagtcgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgattttcg-ggcagcgagcatggtt 54867707  T
Q  152 tg-cagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtc 250  Q
    |  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||    
T  54867706 tttcaggatgctcaatcgtgtcacaattttgggaaaacgtgacacgattttcaa-cttgctgggcacgtttttcggataaggttggtcgtaccttggatc 54867608  T
Q  251 gtacgcaccaatcgtgccacgttttgga-aaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagctt 349  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54867607 gtacgcaccaatcgtgtcacgatttggacaaacgtgacacgattttgacagctgaagactactatataagtgttcttgtgcagattttggaggagagctt 54867508  T
Q  350 gaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    |||||||||   |||||    
T  54867507 gaagagagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgagaatctcttgggttggaag---ttgtaaacactatgggt 54867411  T
Q  450 agtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctct-ttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaat 546  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| || ||| ||||| ||||||     ||| |||| | |||| ||||||||||||||    
T  54867410 agtgagatttcaccattggaaggatcaaaaagctttcttttttgtgttttctcttaggattcatt-----gagtgtggatgacacaaaatgggtagaaat 54867316  T
Q  547 taggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaact-ctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatatta 645  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||||| | ||    
T  54867315 taggtattgttcttgtgtaagcttataagctaatttcttataactattttgtaacattttcatcatagttgattgaagggctgctctct-ccccagacta 54867217  T
Q  646 ggtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctc 739  Q
    |||||||||||||| ||||     | |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |  | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  54867216 ggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tttctttcattgcttatctttattactttgattatgcttgtggtgttgctc 54867119  T
Q  740 tacactaag-tctaggtct-attttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||||| || |||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  54867118 tacacttagatctatgtctgtttttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccactt 54867050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 62 - 549
Target Start/End: Original strand, 16628353 - 16628839
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgc 161  Q
    |||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16628353 attggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgatttcatcaatgtgtcacgattttc-aggcagtgagcatgctttgcagggtgc 16628451  T
Q  162 tcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgtttt-caagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcacca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16628452 tcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgcttgttacttttttcatgataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcacca 16628551  T
Q  261 atcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagaga 360  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| |||| ||||||    
T  16628552 atcgtgtcacgatttggaaaacgtgacacgattttgacagatgaaggctgctatataagtgtttttgttcagattttgaaggagagctagaagagagaga 16628651  T
Q  361 aacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttc 460  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16628652 aaattggattgcaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttc 16628751  T
Q  461 accattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattag 549  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  16628752 accattggaaggatcaaaagcttccttttgtgttttct-tttaggattca-tattgtgagagtgggtgacacaaaatgggtagaaattag 16628839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 188 - 806
Target Start/End: Original strand, 31985240 - 31985861
Alignment:
Q  188 cgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggt-tggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgc 286  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||  ||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||     
T  31985240 cgtgacacgattttcaaacttgctggttaagttttcaggataaggactggtcgtaccttgtgacgtacgcatcaatcgtgacacgatttggaaatcgtgg 31985339  T
Q  287 cacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactt 386  Q
    |||||||||  ||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31985340 cacgattttatcagttgaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattttgaagt-gagcttgaagagagagaaacttggattacaaaggagggaactt 31985438  T
Q  387 tagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttcct 486  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  31985439 tagggttgagtgtttttgtattgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgaaatttcaccatgggaaggatcaaaagcttcct 31985538  T
Q  487 tttgtgtcttctc-tttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagtta-ttttct 584  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  31985539 tttgtgtcttctcttttagggttca-cattgtgagagtgggaaacacaaatgggtagaaattaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttttct 31985637  T
Q  585 tgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatc--ttggtg 677  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||     | |||||  ||||||    
T  31985638 tgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtg 31985736  T
Q  678 tgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcc 776  Q
    |||||||||   || ||||| ||| |||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||     
T  31985737 tgtttgttc---ttcctttc-ttgcttatctttattgctttgtatatgcttgtggagttgctctacact-agactaggtctgttttttgttgttgttgct 31985831  T
Q  777 tggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31985832 tggagacactttacacatagattaccactt 31985861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 311 - 806
Target Start/End: Original strand, 42599305 - 42599806
Alignment:
Q  311 ctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtga 410  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42599305 ctatataagtgtttctttgcagattttgaaggagagcttttagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagg-ttgagtgtctttgtagtga 42599403  T
Q  411 ggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgat-caaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttc 509  Q
    || |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||  |||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  42599404 ggttctcttcggttgggaaacattctaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggataaaaaaacttccttttgtgttttctc-ttaggattc 42599502  T
Q  510 attattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcat 608  Q
       |||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  42599503 ---attgagagtgcgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttttgtaagcttataagctaatttcttgtaactcattgtaacattttcat 42599599  T
Q  609 catagtggattggatagctg--ctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattg 701  Q
    | ||||||||||||  | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  || |     | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  42599600 cttagtggattggagggttgctctctctcccccatattatgtcatattggactgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tttctttcattg 42599697  T
Q  702 attatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctatt--ttttgttgttattgcctggagacactttacacattga 797  Q
     |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||| | ||  |||||||||| |||| ||||| |||||||   |||||    
T  42599698 cttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacatttagatctaggtttgtttgttttgttgttgttgcttggagtcactttatctattga 42599797  T
Q  798 ttaccactt 806  Q
    |||||||||    
T  42599798 ttaccactt 42599806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 355 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 24334137 - 24333679
Alignment:
Q  355 gagagaaacttgg-attacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttg--ggttgggaaacattgtaaacatcttgggtag 451  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24334137 gagagaaacttgggaatacaaagaaggtaactttagggttgagagtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaacattgtaaacaccttgggtag 24334038  T
Q  452 tgagatttcaccattggaatgatcaaaa-gtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaa-tgggtagaaattag 549  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  24334037 tgagatttcaccattggaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttctctt-aggattcat-attgtgagagtggctgacacaaaatgggtagaaattag 24333940  T
Q  550 gtcttgtt-cttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattagg 647  Q
    || || || |||||||||||||| ||| || ||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  24333939 gttttttttcttgtgtaagcttgtaagctaattttttataactcttttgtaacacgttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattagg 24333840  T
Q  648 tcatattggaccaaac-----tagcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctcta 741  Q
    |||||||||||| |||     || |||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||| |  ||||||| ||||||||   |||||||||||    
T  24333839 tcatattggaccgaactgagttaacaatcttggtgtgtttgtt--tctttctttcattgcttatctttattgctttgattatgctt---gtgttgctcta 24333745  T
Q  742 cactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  24333744 cacttagatctaggtctgttttttgttgttgttgtttggagacactttatctattgattaccactt 24333679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 316 - 806
Target Start/End: Original strand, 28468261 - 28468755
Alignment:
Q  316 taagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaa--------gtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtag 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |        | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  28468261 taagtgttcttgtgcagattttggaggagagcttggaagagcttagagagagaaacttggattacaaaggagggaactctagggttaagtgtctttgtag 28468360  T
Q  408 tgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctc-tttag 504  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  28468361 tgaggatctcttgggttgggaaaaatattgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatctaaagcttcctcttgtgtcttctcttttag 28468460  T
Q  505 ggttcattattgagagagt-gggtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacact 603  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||        |  ||||||||||    
T  28468461 ggttca-tattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttattgtgtaagcttgcaaactatttt--------ttcttgtaacact 28468551  T
Q  604 ttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatc--ttggtgtgtttgttcctttttcttt 696  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |  ||||     | |||||  |||||||||||||||   || ||||    
T  28468552 ttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttc---ttccttt 28468647  T
Q  697 cattgattatc-tgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacatt 795  Q
    | ||| ||||| ||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||     
T  28468648 c-ttgcttatcttggttgctttgtatttgcttgtggtgttgctctacact-agactagggct-gtttttgttgttgttgcttggagacactttacacata 28468744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 150 - 447
Target Start/End: Original strand, 37740299 - 37740595
Alignment:
Q  150 tttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggt 249  Q
    |||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||  ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37740299 tttgtagggtgcccaatcgtaacacgattttgggaaaacgtgacatgattttcgg-cttgcagggcaagttttcaggataaggttggtcgtaccttgggt 37740397  T
Q  250 cgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagct 348  Q
    ||||| ||||||  ||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||     
T  37740398 cgtacacaccaaatgtgtcacgatttgggaaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagca 37740496  T
Q  349 tgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    ||||| ||||||||||| |||   |||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |   | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37740497 tgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaagtttagggttgagggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 37740595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 309 - 664
Target Start/End: Original strand, 39774032 - 39774388
Alignment:
Q  309 tgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggatt-acaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtag 407  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||     
T  39774032 tgctatataagtgtttatgttcagattttgaagtagagtttaaagagagagaaacttgggtttacaaaggaggtaactttagggttgagattatttgtaa 39774131  T
Q  408 tgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttaggg 506  Q
     |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||  |||    
T  39774132 cgaggttctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagttttcaccattggaatgatcaaaaagcttccttttgtattttctctt--ggg 39774229  T
Q  507 ttcattattgagagagtgggtaaca--caaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaa-ctctttgtaacact 603  Q
     |  | |||||||| ||| || |||   |||| ||||||||||||||||||||  | ||| |||||  ||| || |||||||||| || |||||| ||||    
T  39774230 at--tcattgagagtgtgagtgacatgaaaattggtagaaattaggtcttgtttctttgtgagcttttaagctaatttcttgtaacctatttgtatcact 39774327  T
Q  604 ttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  39774328 ttcattttagtggattggagagctgctctatcccccagagtaggtcatattggaccgaact 39774388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 123 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 9927983 - 9927656
Alignment:
Q  123 tcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgtttt 222  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||  | |||||    
T  9927983 tcacgattttctaggcagtgaacatgttttgcagggtgttcaatcgtgacacgattttgggaaaatgtgacacgattttcgg-cttgctggacaagtttt 9927885  T
Q  223 caagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg-ttttggaaaacgtgccac-gattttgacagc---tgaagactgctatata 317  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||| |||  |||||| ||||   |||||||||||| |||    
T  9927884 caggataaggttggtcgttccttgggtcgtacgcaccaaacgtgtcacgatttgggaaaacgtgacacaaattttggcagctgatgaagactgctaaata 9927785  T
Q  318 agtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatct 416  Q
    ||||||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | | | |||    
T  9927784 agtgttc-tctgcagattttgaaggagggcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttg-attaaagttct 9927687  T
Q  417 cttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9927686 cttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 9927656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 62 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 24742570 - 24741962
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggtttgcagggtg 160  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   || |||| |||||||||   | || |||||| | |||||||||  |    
T  24742570 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagc-tagtttgcaggacg 24742472  T
Q  161 ctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggt-tggtcgtaccttgggtcgtacgcacc 259  Q
    |  ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||| | | || || | |  |||||||  ||||| ||||| ||  || |||||      
T  24742471 ccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcatacctgggaacggacgca-- 24742374  T
Q  260 aatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataa-gtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaa------ 352  Q
    |||||||||||| | |||||| |||| ||||||||   |||  |||||||  ||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||| |          
T  24742373 aatcgtgccacgatctggaaatcgtgacacgatttcttcagaggaagactagtatatattgtgttcttgtgcagattt-gtaggagagcttggaagagct 24742275  T
Q  353 --gtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacatcttggg 448  Q
      | |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| || ||||||    
T  24742274 tagagagagaaacttggattacaaaggagggaaccaaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 24742175  T
Q  449 tagtgag-atttcacca-ttggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgggtaa-cacaaatgggtagaa 544  Q
    ||||||| | ||||  | |||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || ||| || ||||||||    
T  24742174 tagtgaggagttcattagttggaaggatctaaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaa 24742076  T
Q  545 attaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccata 642  Q
      ||||  ||||||||||||||||||| | | ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  24742075 tctagggtttgttcttgtgtaagcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccaga 24741976  T
Q  643 ttaggtcatattgg 656  Q
    ||||| ||||||||    
T  24741975 ttaggccatattgg 24741962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 544 - 803
Target Start/End: Original strand, 16630642 - 16630906
Alignment:
Q  544 aattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccata 642  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |    
T  16630642 aattagatcttgttcttgtgtaagcttataagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgttctctcctccaga 16630741  T
Q  643 ttaggtcatattggaccaaactag-----caatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgc 737  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||     ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16630742 ttatgtcatattggaccgaactaggtcaacaaccttggtgtgtttgttcc-ttttctttcattgcttatctttgttctttgattatgcttgtggtgttgc 16630840  T
Q  738 tctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattacca 803  Q
    | |||||| || ||||||| |  |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16630841 tttacacttagatctaggt-ttgtttttgttgttgctgcttggagacactttacacattgattacca 16630906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 165 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 34570894 - 34570611
Alignment:
Q  165 atcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcg 264  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||  | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  34570894 atcgtgacacgattttgggaaaacgtgacacgattttcgg-cttgctggacaagttttcaggataaggttggttgtaccttgggtcgtacgcaccaaacg 34570796  T
Q  265 tgccacg-ttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaac 363  Q
    || |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||| |||  |||||||||    
T  34570795 tgtcacgatttgggaaaacgtgacacgattttgacagctgaagactactatatatgtgttctt-tgcagattttgaaggagagctggaacagagagaaac 34570697  T
Q  364 tt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    || |||   ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |   | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34570696 ttgggaaatcaaaggaggtagctttagggttgagggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgaaaacatcttgggt 34570611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 142 - 449
Target Start/End: Original strand, 5429345 - 5429650
Alignment:
Q  142 gagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgta 241  Q
    ||||||| |||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||  | ||||||| | |||| |||||||||    
T  5429345 gagcatgttttgcagggtgtctaatcgtgacacgattttgggaaaacgtgatacgattttc-agcttgttggacaagttttcaggttaagattggtcgta 5429443  T
Q  242 ccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg-ttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgga 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||| |    
T  5429444 ccttgggtcgtacgcaccaatcgtgtcacgatgtgggaaaacatgacacgattttgac-gctgaaaactgctatataagtgttctt-tgcagaccttgaa 5429541  T
Q  341 gtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaa 439  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |   | ||||||||||||||||||||||||||    
T  5429542 ggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagtaactttagggttgagggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaa 5429640  T
Q  440 catcttgggt 449  Q
    || |||||||    
T  5429641 caccttgggt 5429650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 343 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 5112573 - 5112251
Alignment:
Q  343 agagcttgaagtgagagaaacttg-gattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaaca 441  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5112573 agagcttgaagagagagaaacttgagattacaaaggaggtaattttaggtttgagtgtctttgttgtgaggttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 5112474  T
Q  442 tcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaac---acaaatg 537  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||   |||| ||| ||| || ||   | ||||     
T  5112473 ccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaaagcttccttttatgttttctc-ttaggattc---attgtgagtgtgagtgacttaaaaaata 5112378  T
Q  538 ggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcc 636  Q
    |||| ||||||||||| ||| || | | || ||  ||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||    
T  5112377 ggtacaaattaggtctcgtt-ttttatgagtttttaagctaatttcttgtaacccatttgtaacactttcatattagtggattggagagctgctctcacc 5112279  T
Q  637 cccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    |||| | ||| |||||||||||| ||||    
T  5112278 cccaaagtagatcatattggaccgaact 5112251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 533 - 806
Target Start/End: Original strand, 3796470 - 3796750
Alignment:
Q  533 aaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  3796470 aaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgcaagcttgtaagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattagagagttgctc 3796569  T
Q  632 tctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatc-ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatg 724  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||     | ||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| |||||| |  ||||||| |||||    
T  3796570 tctcccccatattaggtcatattggacggaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcc--tctctttcattgcttatctttattgctttgattatg 3796667  T
Q  725 cttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||||| |||| ||||||||| || | |||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||   |||||||| |||||    
T  3796668 cttgtgatgttactctacacttagatttaggtctgatttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattatcactt 3796750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 357 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 29760969 - 29760663
Alignment:
Q  357 gagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa---cattgtaaacatcttgggtagtg 453  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||   |||||||| || |||||||||||    
T  29760969 gagaaacttggattacaaaggagggaaccaaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaaacattgtaatcaccttgggtagtg 29760870  T
Q  454 ag-atttcacca-ttggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaa-cacaaatgggtagaaattagg 550  Q
    || | ||||  | |||||| |||| |||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| | || ||||||||| || ||| || ||||||||  ||||    
T  29760869 aggagttcattagttggaaggatctaaagcttcctctagtgtcttctctt-agggttcat-agtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagg 29760772  T
Q  551 tcttgtt-cttgtgtaagcttgcaagttatt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattagg 647  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  29760771 tcttgtttcttgtgtaagcttgcaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagg 29760672  T
Q  648 tcatattgg 656  Q
     ||||||||    
T  29760671 ccatattgg 29760663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 54 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 13992879 - 13992484
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||   || |||| |||||||||   | |  |||||| ||||||    
T  13992879 tgttgagatttggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgtcgtgagc-tggttt 13992781  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggt-tggtcgtaccttgggtcg 251  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | || ||||||| |||||||  ||||| ||||||| | ||    
T  13992780 gcagggtgccaaatcgtgacacgattttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagttttcatgataaggactggtcataccttgtgacg 13992681  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttga 351  Q
    |||| | |||||||| |||| | |||||| |||| |||||||||  |||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |  | |||||||||    
T  13992680 tacgtatcaatcgtgacacgatctggaaatcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagcttga 13992581  T
Q  352 agtgagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    || |||||||||||||   | ||||||  | |||||||||||| || |||||||    |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13992580 agagagagaaacttgggaaatcaaaggtagcaactttagggtttagggtctttgattagagtctctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 13992484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 150 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 26176119 - 26175833
Alignment:
Q  150 tttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggt 249  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||   |||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||           
T  26176119 tttgcagggtgcccaaccgtgacacaattttgggaaaacgtgacacgattttcgg-cttgatgggcaagttttcaggataaggttggtcgtac------- 26176028  T
Q  250 cgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagct 348  Q
         ||||||| |||| || | ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  26176027 -----gcaccaaacgtgtcatgatttagcaaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagct 26175934  T
Q  349 tgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    ||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||| | | | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26175933 tgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagagttgagggtctttg-attaaagttctgttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 26175835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 580 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 39246093 - 39245861
Alignment:
Q  580 tttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatctt 673  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     | |||||||    
T  39246093 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 39245994  T
Q  674 ggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgtta 771  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |  || |||| |||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||     
T  39245993 ggtgtgtttgttcc--tttctttcattgcttatctttattgttttgattatgcctgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgttttttgttgttg 39245896  T
Q  772 ttgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||  |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  39245895 ttgtttggagacactttatctattgattaccactt 39245861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 188 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 54200363 - 54200111
Alignment:
Q  188 cgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg-ttttggaaaacgtgc 286  Q
    |||||||||||||||   |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||| ||| |||||| |||     
T  54200363 cgtgacacgattttcgg-cttgctgggcaagttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaaactagtcacgatttgggaaaatgtga 54200265  T
Q  287 cacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaact 385  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||  ||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||    
T  54200264 cacgattttgatagctgaagactgctatataagtgttctt-tgtagtttttgaagaagagctgaaagagagagaaacttaggaaatcaaaggaggtaact 54200166  T
Q  386 ttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaaca 441  Q
    ||||||||||| ||||||| | |   | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54200165 ttagggttgagggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 54200111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 149 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 52095857 - 52095559
Alignment:
Q  149 gtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacg-ttttcaagataaggttggtcgtaccttgg 247  Q
    |||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52095857 gttttcagggtgtccaatcgtgacacgattttgggaaaacgtgacacgatttttgg-cttgctgggcaagattttcaggataaggttggtcgtaccttgg 52095759  T
Q  248 gtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtaga 345  Q
    |||||| ||| |||||||| |||| | | |  ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || | |    
T  52095758 gtcgtaagcatcaatcgtgacacgatataggaaaaacgtg--acgatttcgac-gctgaagactgctatataagtgttctt-tgtagattttgaaggaca 52095663  T
Q  346 gcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatct 444  Q
    |||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |   | |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52095662 gcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggactttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacct 52095564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 369 - 664
Target Start/End: Original strand, 1983088 - 1983383
Alignment:
Q  369 ttacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgaga-tttcaccattg 467  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| | ||| |||| ||| |||||||||||    
T  1983088 ttacaaagaaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggttatcttgggttgtgtaacattgtaaacaccctggttagtaagattttcaccattg 1983187  T
Q  468 gaatgat-caaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaac--acaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgt 564  Q
    ||| |||  ||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||   |||||||| || ||| ||    ||| || ||||||||| || |||||||| |||    
T  1983188 gaaggataaaaaagcttccttttgggttttctc-ttaggattc---attgagagtgtaggtgacttgaaaaaggatagaaattatgttttgttctt-tgt 1983282  T
Q  565 aagcttgcaagttattttcttgtaa-ctctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaac 663  Q
     |||||||||| || |||||||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  1983283 gagcttgcaagctaatttcttgtaacccctttgtatcactttgatcctagtggattggagagctgctatctcccccatagtaggtcatattggaccgaac 1983382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 219 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 52083084 - 52082854
Alignment:
Q  219 ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatat 316  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||  |||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  52083084 ttttcaggataaggttggtcataccttgggtcgtaagcatcaatcgtgacacgatttgggaaaaacgtgacacgatttcgac-gctgaagactcctatat 52082986  T
Q  317 aagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatc 415  Q
    |||||||||| |||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |   | ||    
T  52082985 aagtgttctt-tgcaaattttgaaggacagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagttc 52082888  T
Q  416 tcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52082887 tcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 52082854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 206 - 441
Target Start/End: Original strand, 29254222 - 29254457
Alignment:
Q  206 cttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaa-cgtgccacgattttgacagctga 304  Q
    ||||||||| | || ||||  |||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  29254222 cttgttgggcaagtattcagaataaggttggtcgtattttggatcgtacgcaccaaacgtgtcacgatttggaaaaacgtgacacgattttgacagctga 29254321  T
Q  305 agactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtcttt 403  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||| ||| || ||||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  29254322 agactgctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggtgaggttgtagagagagaaacttgggaaatcaaaggagataactttagggttgaaggtcttt 29254420  T
Q  404 gtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaaca 441  Q
    | |||   | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29254421 g-agtagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 29254457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 247 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 12739949 - 12739755
Alignment:
Q  247 ggtcgtacgcaccaatcgtgccacg-ttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtaga 345  Q
    ||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||    
T  12739949 ggtcgtacgcaccaatcgtgttatgattttggaaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttctt-tacagattttgaagtgga 12739851  T
Q  346 gcttgaagtgagagaaacttg-gattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaaca 441  Q
    | |||||| |||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |   | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12739850 ggttgaagagagagaaacttgagaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 12739755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 247 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 12748155 - 12747961
Alignment:
Q  247 ggtcgtacgcaccaatcgtgccacg-ttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtaga 345  Q
    ||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||    
T  12748155 ggtcgtacgcaccaatcgtgttatgattttggaaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttctt-tacagattttgaagtgga 12748057  T
Q  346 gcttgaagtgagagaaacttg-gattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaaca 441  Q
    | |||||| |||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |   | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12748056 ggttgaagagagagaaacttgagaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 12747961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 119 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 12745942 - 12745633
Alignment:
Q  119 cgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacg 218  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||| || || ||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||| | |    
T  12745942 cgtgacacgattttctaggcagtgagc-tgtttggcagggtgtccaatcgtgacatgattttgggaaaacgtgacacgattttcgg-cttgctgggcaag 12745845  T
Q  219 ttttcaag-ataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatata 317  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||                   |||||||||||||||||||||||||||    
T  12745844 ttttccaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcgccaatcgtgtcacg-------------------attttgacagctgaagactgctatata 12745764  T
Q  318 agtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatct 416  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |   | |||    
T  12745763 agtgttctt-tgcagattttgaagttgaggttgaagagagagaaacttgggaaaaaaaaggaggtaactttagagttgagggtctttg-attagagttct 12745666  T
Q  417 cttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  12745665 cttggtttgggaaacaatgtaaacaccttgggt 12745633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 135 - 261
Target Start/End: Original strand, 54882480 - 54882605
Alignment:
Q  135 aggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggtt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  54882480 aggcagtgagcatggtttgcagggtgtccaatcgtgacacgattttgggaaaacgtgacacgattttc-ggcttgttggacacgttttcaggataaggtt 54882578  T
Q  235 ggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 261  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  54882579 gatcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 54882605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 219 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 52094091 - 52093905
Alignment:
Q  219 ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatat 316  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||  |||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  52094091 ttttcaggataaggttggtcataccttgggtcgtaagcatcaatcgtgacacgatttgggaaaaacgtgacacgatttcgac-gctgaagactcctatat 52093993  T
Q  317 aagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttg 404  Q
    |||||||||| |||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52093992 aagtgttctt-tgcaaattttgaaggacagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttg 52093905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 315 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 18377716 - 18377384
Alignment:
Q  315 ataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggat 414  Q
    |||||||||  ||| ||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||      |||||| |||||||||||| |    
T  18377716 ataagtgtttctgttcagtttttgaaggagagcttgaagagaaagaaacttggattacaaaggagttaacttt------gagtgtatttgtagtgaggtt 18377623  T
Q  415 ctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcatta 513  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| |||||||| || || ||||| |||   |    
T  18377622 ctcttgggatggaaaacattgtaaaccccttgggtaatgagattttaccattggaaggatcaaaaagcttcattttgtgttttttc-ttaggattc---a 18377527  T
Q  514 ttgagagagtgggtaaca--caaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatca 610  Q
    |||  || |||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||  | ||| |||||  ||| |  |||||| |||| | |||||| ||||||||||     
T  18377526 ttgtaagtgtgggtgacatgaaaatgggtagaaattagggcttgtttctttgtgagcttttaagctgatttcttataacccatttgtatcactttcatct 18377427  T
Q  611 tagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatat 653  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  18377426 tagtggaatggagggctgctctctcctccagagtaggtcatat 18377384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 89 - 296
Target Start/End: Original strand, 6655349 - 6655557
Alignment:
Q  89 aacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaa 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||  ||  || ||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||    
T  6655349 aacagagaaatcgtgacacgatttcataggcgtgtcacgattttgcaatgccgtgagcatgttttgcagggtgtccaatcgtgacacgattttggggaaa 6655448  T
Q  188 cgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg-ttttggaaaacgtgc 286  Q
     ||||||||||||||    ||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||     
T  6655449 tgtgacacgattttc-ggtttgctgggcaagttttcaggataaggttggtcgtacattgggtcgtacgcaccaaacgtgtcacgatttgggaaatcgtga 6655547  T
Q  287 cacgattttg 296  Q
    ||||||||||    
T  6655548 cacgattttg 6655557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 355 - 493
Target Start/End: Original strand, 3793851 - 3793993
Alignment:
Q  355 gagagaaacttgg-attacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctctt--gggttgggaaacattgtaaacatcttgggtag 451  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3793851 gagagaaacttgggaatataaaggaggtaactttagggttgagtgtctttatagtgaggttctcttgagggttggaaaacattgtaaacaccttgggtag 3793950  T
Q  452 tgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgt 493  Q
    |||||||||||||| | || |||| ||||| ||||||||||||    
T  3793951 tgagatttcaccatagaaaggatcaaaaagcttccttttgtgt 3793993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 162 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 27417652 - 27417518
Alignment:
Q  162 tcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 261  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27417652 tcaatcgtgacacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaa-cttgttcggcacggtttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcatcaa 27417554  T
Q  262 tcgtgccacg-ttttggaaaacgtgccacgattttg 296  Q
     |||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  27417553 ccgtgtcacgatttgggaaatcgtgacacgattttg 27417518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 162 - 282
Target Start/End: Original strand, 41639032 - 41639151
Alignment:
Q  162 tcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 261  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41639032 tcaatcgtgacacgattttggaaaaacgtgacacgattttcaa-cttgttgggcacgttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcatcaa 41639130  T
Q  262 tcgtgccacgttttggaaaac 282  Q
      ||| |||| ||||| ||||    
T  41639131 ctgtgtcacgatttgggaaac 41639151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 247 - 449
Target Start/End: Original strand, 48142810 - 48143013
Alignment:
Q  247 ggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagt-a 343  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |    
T  48142810 ggtcgtacgcatcaatcgtgacacgatttgggaaaaacgtgacacgatttcgac-gctgaagtctgctatataagtgttctt-tgcagtttttgaagaga 48142907  T
Q  344 gagcttgaagtgagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacat 442  Q
    ||||| |||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |   | ||||||||||||||||||||||||||||     
T  48142908 gagctagaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacac 48143006  T
Q  443 cttgggt 449  Q
    |||||||    
T  48143007 cttgggt 48143013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 247 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 56179035 - 56178835
Alignment:
Q  247 ggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtag 344  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| | |||  |||| ||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |  ||    
T  56179035 ggtcgtacgcatcaatcgtgacacgatctgggaaaaatgtgacacgatttcgac-gctgaagactgttatataagtgttctt-tgcagattttgaaagag 56178938  T
Q  345 agcttgaagtgagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatc 443  Q
    ||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |   | |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  56178937 agcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaaggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacc 56178839  T
Q  444 ttgg 447  Q
    ||||    
T  56178838 ttgg 56178835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 370 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 6542457 - 6542378
Alignment:
Q  370 tacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6542457 tacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtaatgaggttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 6542378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 163 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 50674546 - 50674433
Alignment:
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaat 262  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  50674546 caatcgtgttacgattttgggaaaacgtgacatgattttcag-cttgctgggcacgttttcaggataaggttggttgtaccttgggtcgtacgcaccaaa 50674448  T
Q  263 cgtgccacgttttgg 277  Q
    |||| |||| |||||    
T  50674447 cgtgtcacgatttgg 50674433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 296
Target Start/End: Original strand, 26363691 - 26363866
Alignment:
Q  121 tgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgtt 220  Q
    |||||||||||   ||||||||| ||| ||||  ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || | | |||    
T  26363691 tgtcacgattttttaggcagtgaacattgtttttagggtgtccaatcgtgacacgattttgggaaaacgtgacacgattttc-ggcttgctgagcaagtt 26363789  T
Q  221 ttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccac-gttttggaaaacgtgccacgattttg 296  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||  ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  26363790 ttcaggataaggttggtcataccttgggtcgtacgcaccaaacgtgtcacaatttgggaaatcgtgacacgattttg 26363866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 239 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 30000212 - 30000004
Alignment:
Q  239 gtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattt 336  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||  |||| ||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  30000212 gtaccttgggtcgtacgcatcaatcgtggcacgattggggaaaaatgtgacacgatttcgac-gctgaagattgctatataagtgttttt-tgcagattt 30000115  T
Q  337 tggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattg 435  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||  |||||||||||| || ||||||| | |   | ||||||||||| ||||||||||    
T  30000114 tgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggagacaactttagggtttagggtctttg-attagagttctcttgggtttggaaacattg 30000016  T
Q  436 taaacatcttgg 447  Q
    |||||| |||||    
T  30000015 taaacaccttgg 30000004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 355 - 449
Target Start/End: Original strand, 51336940 - 51337035
Alignment:
Q  355 gagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  51336940 gagagaaacttaggaatacaaaggaagtaactttagggttgaatgtctttgtagtgaggttctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggt 51337035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 163 - 296
Target Start/End: Original strand, 40630452 - 40630585
Alignment:
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaat 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | || || ||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||     
T  40630452 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttc-agcttgctaggcacattttcagaataaggttggtcgtaccttgggtcatatgcaccaaa 40630550  T
Q  263 cgtgccacg-ttttggaaaacgtgccacgattttg 296  Q
    |||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  40630551 cgtgtcacgatttgggaaatcgtgacacgattttg 40630585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Original strand, 35661907 - 35662098
Alignment:
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaat 262  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||            |||||||     
T  35661907 caatcgtgacacgattttgggaaaatgtgtcacgattttcgg-cttgttgggcacgttttcaggataaggttggtcgtac------------gcaccaac 35661993  T
Q  263 cgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaa 361  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||| |||||| |||| ||    
T  35661994 cgtgtcacgatttggcaaaacgtgatacaattttgacaactgaagactgctatataagtgttctt-tgcagattttgatggagaggttgaagagagaaaa 35662092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 31495902 - 31495589
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | ||| ||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||   || |||| |||||||||   | || |||||| ||||||    
T  31495902 tgttgagatttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagc-tggttt 31495804  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataagg-ttggtcgtaccttgggtcg 251  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| | | || |||| || |||||||  |||||||  |||||| ||    
T  31495803 gcagggtgccaaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtttcttgggacg 31495704  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttga 351  Q
     |||||||||||||| |||    |||||| |||| |||||||||  |||  || | ||  ||| |||||||||||||||||| |||| || |||| | ||    
T  31495703 aacgcaccaatcgtgacacaacctggaaatcgtgacacgattttatcagtggagggctaatatttaagtgttcttgtgcaga-tttgaaggagagttgga 31495605  T
Q  352 agtgagagaaacttgg 367  Q
    || |||||||||||||    
T  31495604 agagagagaaacttgg 31495589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 247 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 5370486 - 5370291
Alignment:
Q  247 ggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg---aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagta 343  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| || ||   |||||||| |||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  5370486 ggtcgtacgcatcaatcgtggcacgattggggaaaaaacgtgacacgatttcgac-gctgaagacaactatataagtgttctt-tgcagattttgaagga 5370389  T
Q  344 gagcttgaagtgagagaaacttg-gattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaaca 441  Q
    || ||||||| |||||||||||| ||   ||||||||  |||||||||||| || ||||||| | |   | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5370388 gaacttgaagagagagaaacttgagaaatcaaaggagacaactttagggtttagggtctttg-attatagttctcttgggctgggaaacattgtaaaca 5370291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 711 - 806
Target Start/End: Original strand, 16624143 - 16624238
Alignment:
Q  711 gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacact-aagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16624143 gtgctttgattattcttgtggtgttgctctacacttaaatctaggtctgtttt-tgttgttgttgcttggagacactttacacattgattatcactt 16624238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 295
Target Start/End: Original strand, 28467977 - 28468219
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | ||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||   || |||  ||||||||    | || |||||| ||||||    
T  28467977 tgttgagatttggcttcaaatttgtggtatggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtaacacgattttgtgatgccgtgagc-tggttt 28468075  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataagg-ttggtcgtaccttgggtcg 251  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| | | || ||||  | |||||||  ||||||||||||| | ||    
T  28468076 gcagggtgccaaatcgtgacacgatcttggaaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtttctatgataaggactggtcgtaccttgtgacg 28468175  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgatttt 295  Q
    |||| || ||||||| ||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  28468176 tacgtacaaatcgtgacacgacttggaaatcgtgacacgatttt 28468219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 46570237 - 46570119
Alignment:
Q  152 tgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcg 251  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||   |||| |||| |  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  46570237 tgcagggtgcccaatcgtgacaagattttgggaaaacgtgacacaattttc-ggcttgctgggcaaattttcaggataaggttggtcgtactttgggtcg 46570139  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacg 271  Q
    |||||| ||| |||| ||||    
T  46570138 tacgcatcaaacgtgtcacg 46570119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 370 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 48893920 - 48893839
Alignment:
Q  370 tacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctctt--gggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  48893920 tacaaaggaggtaatttgagggttgagtgtctttgtagtgaggttctctttagggtttggaaacattgtaaacaccttgggt 48893839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 300
Target Start/End: Original strand, 3909760 - 3909919
Alignment:
Q  140 gtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcg 239  Q
    ||||||||| |||||| ||||   ||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||    | |||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  3909760 gtgagcatgttttgcacggtgtcaaatcgtgacacgatttttggaaaacatgacactatttttgg-catgtttggcacgtttt-aagataaggttggtcg 3909857  T
Q  240 taccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg-ttttggaaaacgtgccacgattttgacag 300  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||| || |||||||||||    
T  3909858 taccttgagtcgtacgcatcaaccgtgtcacgattttagaaaacgtgacatgattttgacag 3909919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 370 - 449
Target Start/End: Original strand, 4587849 - 4587929
Alignment:
Q  370 tacaaaggaggtaactttagggttgagtgtcttt-gtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4587849 tacaaatgagataactttagggttaagtgtcttttgtagtgaggttctcatgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 4587929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 581 - 745
Target Start/End: Original strand, 34495822 - 34495990
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaactag----caatcttgg 675  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||| ||||||| ||||||    | |||||||    
T  34495822 ttcttgtaacccatttgtatcactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagagtaagtcatgttggaccgaactaggttaccatcttgg 34495921  T
Q  676 tgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacact 745  Q
    ||||||||||  | |||||||||||| || | |   ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||    
T  34495922 tgtgtttgtt-ttctttctttcattgcttgttttattgctttgattatgcttgtgttgatgctttacact 34495990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 372 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 37782170 - 37782062
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacatt-gtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaa 470  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  | |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  37782170 caaatgaggtaactttagagttgaatatctttggtgagaggctctcttgggttggaaaacatttgtaaacaccttgggtagtgagatttcattattggaa 37782071  T
Q  471 tgatcaaaa 479  Q
      |||||||    
T  37782070 gaatcaaaa 37782062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 50263383 - 50263265
Alignment:
Q  177 ttttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccac-gtttt 275  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   |||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||||     
T  50263383 ttttgggaaaacgtaacacgattttcgg-cttggtgggtaagttttcagaataaggttggtcgtacctt-ggtcgtacgcaccaaatgtgtcacggtttg 50263286  T
Q  276 ggaaaacgtgccacgattttg 296  Q
    ||||| |||| ||||||||||    
T  50263285 ggaaatcgtgacacgattttg 50263265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 51520553 - 51520479
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  51520553 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 51520479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Original strand, 56146700 - 56146774
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  56146700 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 56146774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 582 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 3814119 - 3814046
Alignment:
Q  582 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  3814119 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 3814046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 582 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 5732760 - 5732687
Alignment:
Q  582 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  5732760 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 5732687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 372 - 434
Target Start/End: Original strand, 6677362 - 6677424
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacatt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||    
T  6677362 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgttcaggggttctcttgggttgggaaacatt 6677424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 277
Target Start/End: Original strand, 36994246 - 36994359
Alignment:
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaat 262  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||| ||| ||||||   |||| | || |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||     
T  36994246 caatcgtgacacaatttttggaaaacgtgtcacaattttcgg-cttgctaggcacgttttctagataaggttgatcgtaccttaggtcgtacgcaccaac 36994344  T
Q  263 cgtgccacgttttgg 277  Q
    |||| |||| |||||    
T  36994345 cgtgtcacgatttgg 36994359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 216 - 449
Target Start/End: Original strand, 24968848 - 24969083
Alignment:
Q  216 acgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg-ttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctat 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| || | |||||  || |||| |||||| ||||||| ||  |  | ||||    
T  24968848 acgttttcaggataaggttggtcgtacattgggtcgtacgcttcaatcgtgacatgattttgccaatcgtgacacgatattgacagttgttgggtactat 24968947  T
Q  315 ataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgagga 413  Q
     ||||||||  ||| ||||||||  |  ||| ||| ||| |||| |||||| |||   ||||||||||||||||| ||||||  ||||||| | |   |     
T  24968948 ttaagtgtttctgttcagattttttatgagaacttcaagagagaaaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttaaggttgacggtctttg-attagagt 24969046  T
Q  414 tctcttgggttgggaaaca-ttgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24969047 tctcttgggttgggaaacatttgtaaacaccttgggt 24969083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 593 - 656
Target Start/End: Original strand, 9224408 - 9224470
Alignment:
Q  593 tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9224408 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 9224470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 593 - 656
Target Start/End: Original strand, 9229195 - 9229257
Alignment:
Q  593 tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9229195 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 9229257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 5143867 - 5143809
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  5143867 tgttgaaaattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 5143809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 199
Target Start/End: Original strand, 9223906 - 9224043
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttc-ccaggcagtgagcatggtttgcagggtg 160  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   || |||| |||||||||    ||| |||||| | |||||||||  |    
T  9223906 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagtggccgtgagc-tagtttgcaggacg 9224004  T
Q  161 ctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgatt 199  Q
    |  ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  9224005 ccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatt 9224043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 199
Target Start/End: Original strand, 9228693 - 9228830
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttc-ccaggcagtgagcatggtttgcagggtg 160  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   || |||| |||||||||    ||| |||||| | |||||||||  |    
T  9228693 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagtggccgtgagc-tcgtttgcaggacg 9228791  T
Q  161 ctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgatt 199  Q
    |  ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  9228792 ccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatt 9228830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 582 - 656
Target Start/End: Original strand, 45347807 - 45347880
Alignment:
Q  582 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  45347807 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaagccatattgg 45347880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 582 - 656
Target Start/End: Original strand, 45357286 - 45357359
Alignment:
Q  582 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  45357286 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattatgccatattgg 45357359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 52467668 - 52467551
Alignment:
Q  333 attttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaac 431  Q
    ||||| |||| |||||| ||| |||||||||| || | | |||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  52467668 atttttgagtggagcttcaagagagagaaactagggtaatcaaaggaggtaattttagggttgagggtctttg-attagggttctcttgggttgggaaac 52467570  T
Q  432 a-ttgtaaacatcttgggt 449  Q
    | ||||||||| |||||||    
T  52467569 atttgtaaacaccttgggt 52467551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 202
Target Start/End: Original strand, 2209175 - 2209227
Alignment:
Q  150 tttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttc 202  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2209175 tttgcagagtgcccaatcgtgacacgattttggggaaacgtgacacgattttc 2209227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 112
Target Start/End: Original strand, 8689038 - 8689094
Alignment:
Q  56 ttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  8689038 ttgaaaattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 8689094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 18856304 - 18856252
Alignment:
Q  60 aaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18856304 aaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 18856252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 18860516 - 18860464
Alignment:
Q  60 aaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18860516 aaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 18860464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 3814598 - 3814548
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  3814598 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 3814548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 5733240 - 5733190
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5733240 attggcttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcatgacacgattt 5733190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 582 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 18855821 - 18855749
Alignment:
Q  582 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18855821 tcttgtaaccttttgtaacactt-ca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 18855749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 51521043 - 51520993
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  51521043 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 51520993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 112
Target Start/End: Original strand, 56141518 - 56141568
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  56141518 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 56141568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 449
Target Start/End: Original strand, 5871715 - 5871791
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||    |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5871715 caaaggaggtaactttagggttatgggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 5871791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 9194215 - 9194158
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtct-gaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaa 118  Q
    |||||||| |||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9194215 attggcttcaaatttgtggttttggaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaa 9194158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 13009704 - 13009628
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||    |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13009704 caaatgaggtaactttagggttaagggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 13009628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 112
Target Start/End: Original strand, 45347321 - 45347374
Alignment:
Q  59 aaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  45347321 aaaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacaaagaaatcgtgacacgattt 45347374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12740066 - 12739983
Alignment:
Q  117 aacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgatttt 201  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||||  ||| || | ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  12740066 aacgtgtcacgattttctaggcactgagc-tgttttgcagggtgtccaaccgcgacacgattttgggaaaacgtaacacaatttt 12739983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12748272 - 12748189
Alignment:
Q  117 aacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgatttt 201  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||||  ||| || | ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  12748272 aacgtgtcacgattttctaggcactgagc-tgttttgcagggtgtccaaccgcgacacgattttgggaaaacgtaacacaatttt 12748189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 109
Target Start/End: Original strand, 31985126 - 31985182
Alignment:
Q  53 ttgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacga 109  Q
    ||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31985126 ttgttgagatttggcttcaaatttgtgatctgaaagaacagagaaatcgtgacacga 31985182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 266
Target Start/End: Original strand, 39773982 - 39774022
Alignment:
Q  226 gataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtg 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  39773982 gataaggttggtcgtaccttgggtcatacgcatcaatcgtg 39774022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 29761228 - 29761181
Alignment:
Q  66 gctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttc 113  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  29761228 gcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgatttc 29761181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 45687415 - 45687380
Alignment:
Q  414 tctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45687415 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 45687380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5370558 - 5370520
Alignment:
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgatttt 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5370558 caatcgtgacacgattttgggaaatcgtgacacgatttt 5370520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 610 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 16931853 - 16931799
Alignment:
Q  610 atagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  16931853 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaact 16931799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 610 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 16934207 - 16934153
Alignment:
Q  610 atagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  16934207 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaact 16934153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 610 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 22780437 - 22780383
Alignment:
Q  610 atagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  22780437 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaact 22780383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 610 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 22782802 - 22782748
Alignment:
Q  610 atagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  22782802 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaact 22782748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 449
Target Start/End: Original strand, 36994375 - 36994495
Alignment:
Q  328 tgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgg 426  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||| | |   | |||||||  ||||    
T  36994375 tgcagattttgaaggagaggttgaagagagagaaacttggaaaatcaaaggaggtaacttt-tggttgagggtctttg-attagagttctcttgatttgg 36994472  T
Q  427 gaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
     |||||||||||||| |||||||    
T  36994473 caaacattgtaaacaccttgggt 36994495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 610 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 44599902 - 44599848
Alignment:
Q  610 atagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  44599902 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaact 44599848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 56179107 - 56179069
Alignment:
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgatttt 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  56179107 caatcgtgacacgattttgggaaaacgtgacatgatttt 56179069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 112
Target Start/End: Original strand, 5268688 - 5268749
Alignment:
Q  51 tattgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||||| |||||    
T  5268688 tattgttgttaattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacaggattt 5268749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 201
Target Start/End: Original strand, 39494682 - 39494719
Alignment:
Q  164 aatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgatttt 201  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  39494682 aatcgtgtcacgattttgtaaaaacgtgacacgatttt 39494719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 478; Significance: 0; HSPs: 121)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 119 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 16264908 - 16264217
Alignment:
Q  119 cgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacg 218  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16264908 cgtgacacgatttcccagatggtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaactagctgggtacg 16264809  T
Q  219 ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataa 318  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16264808 ttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtggtacgcaccaatcgtgccacgatttggaaagcgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataa 16264709  T
Q  319 gtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctct 418  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16264708 gtgttcttgtgcagtttttgaaggagagcttgaagtaagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtaatgaggatctct 16264609  T
Q  419 tgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgag 518  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16264608 tgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaagcttccttttgtgtcttctc-ttagggttcatcattgag 16264510  T
Q  519 agagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggat 618  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16264509 agagtgggtaacacaaatgtgtagaaattaggtcttgttcttgtggaagcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggat 16264410  T
Q  619 tggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaactag-----caatc--ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtg 711  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||     |||||  || |||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||    
T  16264409 tggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctttttgtgtgtttgttcc--tttctttcattgtttatctttg 16264312  T
Q  712 tgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||  |  ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16264311 tgctttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatctagg-attgtttttgttgttgtttcttggagacactttacacattgattaccactt 16264217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 476; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 101 - 802
Target Start/End: Original strand, 8369998 - 8370702
Alignment:
Q  101 gtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8369998 gtgacacgatttcatcaacgtttcatgatttttcaggtagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattt 8370097  T
Q  201 tcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacag 300  Q
    ||||| ||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  8370098 tcaaaattgctgggaacgtttttaggataaggttggtcgtaccttgggttgtacgcaccaatcgtgtcacgatttggaaaacgtgacacgattttgacaa 8370197  T
Q  301 ctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtc 400  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8370198 ctgaagactgctatataagcgttcttgtgcagattttgaagaagagcttgaagagagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtc 8370297  T
Q  401 tttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctct 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  8370298 tttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaagtttccttttgtgttttctc- 8370396  T
Q  501 ttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaac 600  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  8370397 ttaggattca-tattgtgagagtgggtgacacaaatgggtagaaattatgtcttgttcttgtgtaagcttttaagctaatttcttgtaactctttgtaac 8370495  T
Q  601 actttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatc--ttggtgtgtttgttcctttttc 693  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     | |||||  ||||||||||||||||  ||||    
T  8370496 actttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcc--tttc 8370593  T
Q  694 tttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacac 792  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  8370594 tttcattgcttatctttgtgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtct-gtttttgttgttgttgcttggagacactttacac 8370692  T
Q  793 attgattacc 802  Q
    ||||||||||    
T  8370693 attgattacc 8370702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 36029709 - 36028973
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgc 161  Q
    |||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||    
T  36029709 attggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattttatcaacgtgtcacgattttc-aggcagcgaacatggtttgcagggtgc 36029611  T
Q  162 tcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 261  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36029610 ttaatcgtgtcacgattttggaaaaacgtgacacgattttcaaacttgctgggtacgttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 36029511  T
Q  262 tcgtgccacgttttggaaaa-cgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagaga 360  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  36029510 tcgtgtcacggtttagaaaaacgtgacacaattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagtaagaga 36029411  T
Q  361 aacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttc 460  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36029410 aacttggattacaaaggaggtaaatttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttc 36029311  T
Q  461 accattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgttct 559  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||  ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36029310 accattggaaggatcaaaagcttccttttgtgttttctc-ttaggattca-tattttgagagtgagtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttct 36029213  T
Q  560 tgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggac 658  Q
    |||||||| ||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  36029212 tgtgtaagtttgtaagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctttctcccccagattaggtcatattggac 36029113  T
Q  659 caaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tcta 752  Q
      ||||     | |||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||           ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  36029112 agaactgggtcaacaatctcggtgtgtttgttcc--tttctttcattgcttatc-----------tttatgcttgtggtgttgctctatacttagatcta 36029026  T
Q  753 ggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36029025 ggtct-gtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccactt 36028973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 86 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 35926083 - 35925352
Alignment:
Q  86 aagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaa 185  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  35926083 aagaacagagaaatcgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgagtttgagaa 35925984  T
Q  186 aacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-------- 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||            
T  35925983 aacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaggataaggttggtcgtacattgagatgtacgcaccaatcgtgccacgttttggccacgttt 35925884  T
Q  278 ---aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaa 374  Q
       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35925883 tggaaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagtttttgaaggtgagcttaaagtgagagaaacttggattacaa 35925784  T
Q  375 aggag--gtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatg 472  Q
    |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35925783 aggagatgtaactttagggttgaatgtctttgtagtgaggatcttttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaagg 35925684  T
Q  473 atcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgc 572  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||      
T  35925683 atcaaaagcttccttttgtgttttctc-ttaggattca-tattgtgagagtgggtgacacaaatgggtagaaattaggttttgttctagtgtaagcttat 35925586  T
Q  573 aagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaactag-----c 667  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||   | | |||| |||||||||||||||||| ||||||     |    
T  35925585 aaactaatttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagaactgc---ccctcccaaattaggtcatattggaccgaactaggtcaac 35925489  T
Q  668 aatc--ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctatttttt 764  Q
    ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||    
T  35925488 aatcttttggtgtgtttgttc--ttttctttcattgctcatctttgtgttttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtct-gttttt 35925392  T
Q  765 gttgttattgcctggagacactttacacattgattaccac 804  Q
    |||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  35925391 gttgttgttacttggagacattttacacattgattaccac 35925352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 48438832 - 48438085
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttg-cagggtg 160  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||  |||||||    
T  48438832 attggctttaaatttgtggtttgtaagaacagagaaatcgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccaag-caacgagcatggtttttcagggtg 48438734  T
Q  161 ctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcacca 260  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  48438733 ctcaaccgtgtcacgattttggggaaacgtgacacgattttcaaacttgatgggtacgttttcaggataaggttggttgtaccttggatcgtacgcacca 48438634  T
Q  261 atcgtgccacgttttgga-aaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagag 359  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||    
T  48438633 atcgtgtcacgatttggacaaacgtgacacgattttaacagccgaagactgctatataagtgttcttgtgcaaattttgaaggagagcttgaatagagag 48438534  T
Q  360 aaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagattt 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48438533 aaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtaaggatctctt-ggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagattt 48438435  T
Q  460 caccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgtt 557  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48438434 caccattggaatgatcaaaaagcttccttttgtgttttctc-ttaggattcattattgagagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgtt 48438336  T
Q  558 cttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||||||||  | | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48438335 cttgtgtaagcttatatgctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgg 48438236  T
Q  657 accaaactag-----caatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-t 749  Q
    ||| ||||||      ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| |  || |||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  48438235 accgaactaggtcaataatcttggtgtgtttgttcc--tttctgtcattgtttatctttattgttttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagat 48438138  T
Q  750 ctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattacca 803  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||| |||||| ||||||   |||||||||||    
T  48438137 ctaggtct-gtttttgttgttgttgcttggagatactttatctattgattacca 48438085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 806
Target Start/End: Original strand, 40592251 - 40593002
Alignment:
Q  61 aattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttg-cagggt 159  Q
    ||||||||| |||| |||||| || |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||  |||||     
T  40592251 aattggcttcaaatttgtggtttggaagaacggagaaatcgtgacatgatttcatcaacgtgtcacaatttcc-aggcaacgagcatggtttttcaggga 40592349  T
Q  160 gctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcacc 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  40592350 gctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaa-cttgctggacacgttttcaggataaggttggtcgtaccttggatcgtacacacc 40592448  T
Q  260 aatcgtgccacgttttgga-aaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgaga 358  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||    
T  40592449 aatcgtgtcacgatttggacaaacgtgacacgattttgacagctgaagaccgctatataagtgttcttgtgcagattttgaatgagagcttgaagagaga 40592548  T
Q  359 gaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatt 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40592549 gaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatt 40592648  T
Q  459 tcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgt 556  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  40592649 tcaccattggaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttctc-ttaggattca-tattgtgagagtgggtgacacaaaatgggtagaaattagattttgt 40592746  T
Q  557 tcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattg 655  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  40592747 tcttgtgtaagcttgtaagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtcgattggagagcttctctctcccacagattaggtcatattg 40592846  T
Q  656 gaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag- 748  Q
    |||| ||||     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  40592847 gaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc-ttttctttcattgcttatctatattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttaga 40592945  T
Q  749 tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    | |||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  40592946 tttaggtct-gtttttgttgttgttgcttggagacattttatccattgattaccactt 40593002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 743
Target Start/End: Complemental strand, 21711827 - 21711154
Alignment:
Q  53 ttgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21711827 ttgttgtaaattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgatttcttcaacgtgtcacgattttccaggcagtgagcatggttt 21711728  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgt 252  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  21711727 tcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacaattttcaaacttgctgagtacgttttccggataaggttggtcgtaccttgggtcgt 21711628  T
Q  253 acgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaa 352  Q
    |||||||||||||| |||| |||||                   |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21711627 acgcaccaatcgtgtcacgatttgg-------------------acagttgcagactgctatgtaagtgttcttgtgcagattttgaag-agagcttgaa 21711548  T
Q  353 gtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagt 452  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21711547 gagagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgagtagt 21711448  T
Q  453 gagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtc 552  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711447 gagatttcaccattggaaggatcaaaagcttccttttgtgttttctc-ttaggattcattattgagagtgtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtc 21711349  T
Q  553 ttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcata 652  Q
    ||| ||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21711348 ttgctcttgtgtaagcttttaagctaatttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggatttgagagctgctctctcccccagattaggtcata 21711249  T
Q  653 ttggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctaca 743  Q
    ||||||| ||||     | |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  21711248 ttggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tttctttcattgcttatctctattgctttgattatgcctatggtgttgctctaca 21711154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 806
Target Start/End: Original strand, 30709266 - 30710010
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgc 161  Q
    |||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||     
T  30709266 attggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgatttcatcaacgtgtcacaattttc-aggtagtgagcatggtttgcagggtgt 30709364  T
Q  162 tcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgtttt-caagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcacca 260  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  30709365 tcaatcgtgtcacgattttgagaaaacgtgacacaattttcaaacttgctgggtacgtttttcaggataagattggtcttaccttgggtcgtacgcacca 30709464  T
Q  261 atcgtgccacgttttggaaaa-cgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagag 359  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||    
T  30709465 atcgtgtcacgatttggaaaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagacag 30709564  T
Q  360 aaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagattt 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  30709565 aaacttggattacaaaggaggtaactttagagttgagtgtc--------gatgatcttttgggttgggaaacattgtaaacaccttggggagtgagattt 30709656  T
Q  460 caccattggaatgatcaaa-agtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaa-atgggtagaaattaggtcttgtt 557  Q
    || |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  30709657 catcattggaatgatcaaatagcttccttttgtgttttctc-ttaggattcattattgagagtgtgggtgacacaagatgggtagaaattaggtcttgct 30709755  T
Q  558 cttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30709756 cttgtgtaagcttataagctaatttcttgtaactcttttgtaacaatttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgg 30709855  T
Q  657 accaaact-----agcaatc--ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag- 748  Q
    ||| ||||     | |||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||     
T  30709856 accgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcc--tttctttcattgcttatctttgtgctttgattatgcttatggtgttgctctaaacttaga 30709953  T
Q  749 tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30709954 tctaggtct-gtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccactt 30710010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 147 - 806
Target Start/End: Original strand, 27974507 - 27975168
Alignment:
Q  147 tggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttg 246  Q
    ||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||  ||| | ||||| |||||||||||||| ||| ||  |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27974507 tggtttgcagggtgtcaaatcgtggcacgattgtgttaaatcttgacatgattttcaaacttgctggttaaattttcatgataaggttggttgtaccttg 27974606  T
Q  247 ggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagag 346  Q
    ||||||||| | |||||||| || | ||||||||  ||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  27974607 ggtcgtacgtatcaatcgtgacatgatttggaaattgtggcacgattttatcagctgaagactgttatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagag 27974706  T
Q  347 cttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttg 446  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27974707 cttgaagagagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggtcgggaaacattgtaaacaccttg 27974806  T
Q  447 ggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaat 546  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  27974807 ggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaagcttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagaatgggaaacacaaatgggtagaaat 27974906  T
Q  547 taggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagtta-ttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatatta 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27974907 taggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagatta 27975006  T
Q  646 ggtcatattggaccaaact-----agcaatc--ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgct 738  Q
    |||||||||||||| ||||     | |||||  ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  27975007 ggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcc---ttctttcattgcttatctttgttctttatttatgcttgtggtgttgct 27975103  T
Q  739 ctacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||||||| ||  ||||||  | ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27975104 ctacact-agattaggtc--tgttttgctgttgttgcttggagacactttacacattgattatcactt 27975168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 806
Target Start/End: Original strand, 33386137 - 33386885
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||   || |||| ||||||||    | || |||||| ||||||    
T  33386137 tgttgagatttggcttcaaatttgtggtccgaaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagc-tggttt 33386235  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgt 252  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  33386236 gcagggtgccaaatcgtgacacgattttgtggaatcgtgacacgattttcaaacttgctggttaagttttcaggataaggttggtcgtatcttgggtcgt 33386335  T
Q  253 acgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaa 352  Q
    ||| | |||||||| |||| ||||||||  ||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33386336 acgtatcaatcgtgacacgatttggaaattgtggcacgattttatcagctgaagactggtatttaagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaa 33386435  T
Q  353 gtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagt 452  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  33386436 gagagagaaacttggattacaaaggagagaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgggtagt 33386535  T
Q  453 gagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctc-tttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggt 551  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  33386536 gagatttcaccattggaaggatcaaaagcttccttttgtgtcttctcttttagggttcattattgagagagtgggaaacacaaatgggtagaaattagga 33386635  T
Q  552 cttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcat 651  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||        || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33386636 cttgttcttgtgtaagcttgcaaactatttt--------tc-ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcat 33386726  T
Q  652 attggaccaaact-----agcaatc--ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctaca 743  Q
    |||||||| ||||     | |||||  |||||||||||||   || ||||||||||| |||||| |  || |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  33386727 attggaccgaactggatcaacaatcttttggtgtgtttgt---ttcttctttcattgcttatctttattgttttggttatacttgtggtgttgctctaca 33386823  T
Q  744 ctaagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    || || |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33386824 ct-agactaggtctgttttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccactt 33386885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 594
Target Start/End: Original strand, 39032017 - 39032555
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttg 153  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||     
T  39032017 tgttgaaaattggcttcaaatttgttgtttggaagaacagagaaatcgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgattttc-aggcagggagcatggtttc 39032115  T
Q  154 -cagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgt 252  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  39032116 tcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaatgtgacacgattttcaaacttgctgggtacgttttcaggataaagttggtcgtaccttgggtcgt 39032215  T
Q  253 acgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaa 352  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  39032216 acgcaccaatcgtgccacgatttgaaaatcgtgacacgattttgacagctgaagattgctatataagtgttcttgtgcagtttttgaagtagagcttgaa 39032315  T
Q  353 gtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagt 452  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  39032316 gagagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtga-gatctcttgggttggtaaacattgtaaacaccttgggtagt 39032414  T
Q  453 gagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtc 552  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||||||| ||    
T  39032415 gagatttcaccattggaaggatcaaaagcttccttttgtgtcttctc-ttagggttcatcattgagagagtgagaaacataaatggatagaaattagatc 39032513  T
Q  553 ttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctt 594  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39032514 ttgctcttgcgtaagcttgcaagctattttcttgtaactctt 39032555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 86 - 686
Target Start/End: Original strand, 47923397 - 47924006
Alignment:
Q  86 aagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaa 185  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  47923397 aagaacagagaaatcgtgacaaaatttcatcaacgtgtcacgatgtcc-aggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacatttttgggaa 47923495  T
Q  186 aacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgtttt-caagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgga-aaacg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |||||    
T  47923496 aacgtgacacgattttcaaacttgctgggtacgtttttcaggataaggttggtcgtaccttgggttgtacgcatcaatcgtgtcacgatttggacaaacg 47923595  T
Q  284 tgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaa 383  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47923596 tgacacgattttgacaactgaagagtgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttggattacaaaggaggtaa 47923695  T
Q  384 ctttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtt 482  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |    
T  47923696 ctttaggattgagtgtctttgtagtgagaatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaaagct 47923795  T
Q  483 tccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgttc-ttgtgtaagcttgcaagttatt 580  Q
    ||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||| |||| | |||| ||||||||| ||||||||| ||| || |||||||| |||  ||| || |    
T  47923796 tccttttgtgttttctc-gtaggattcattattgagagtgtggatgacacaaaatgggtataaattaggttttgctctttgtgtaaacttttaagctaat 47923894  T
Q  581 ttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatcttg 674  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||     | ||||||||    
T  47923895 ttcttgtaactcttttgtagcactttcatcatagtagattgaagggctgctctctcccctagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatcttg 47923994  T
Q  675 gtgtgtttgttc 686  Q
    ||||||||||||    
T  47923995 gtgtgtttgttc 47924006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 706
Target Start/End: Original strand, 1735828 - 1736423
Alignment:
Q  115 tcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatgg-tttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgg 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |    
T  1735828 tcaacgtgtcacgattttc-aggcagtgagcatggcttttcagggtgctcaatcgtg-cacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaa-cttgaatg 1735924  T
Q  214 gtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgga-aaacgtgccacgattttgacagctgaagactgct 312  Q
      || |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1735925 acacatttttaggataaggttggtcgtaccttgggttgtacgcaccaatcgtgtcacgatttggacaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgct 1736024  T
Q  313 atataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgagg 412  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1736025 atataagtgttcttatgcagattttgaaggagagtttggagagagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgagg 1736124  T
Q  413 atctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcat 511  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  1736125 atctattgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaaagcttctttttgtgttttctc-ttaggattcat 1736223  T
Q  512 tattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatc 609  Q
    ||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1736224 tattgagagtgttggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagttaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatc 1736323  T
Q  610 atagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgatt 704  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     | |||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  1736324 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatattggtgtgtttgttcc--tttctttcattgctt 1736421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 149 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 32143852 - 32143191
Alignment:
Q  149 gtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggtt-ggtcgtaccttgg 247  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||| ||| | || |||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||   ||||||||||||     
T  32143852 gtttgcagggtgccaaatcgtgacacgatcttgtggaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagttttcaagataaggacaggtcgtaccttgt 32143753  T
Q  248 gtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagc 347  Q
    | |||||| | |||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  32143752 gacgtacgtatcaatcgtgacacgatttggaaatcgtgacacgattttatcagttgaagacttgtatttaagtgttcttgtgcagattttggaggagag- 32143654  T
Q  348 ttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  32143653 ttgaagagagagaaatttggattacaaaggagggaactctagggttgagtgtctttgtagtgatgatctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgg 32143554  T
Q  448 gtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctc-tttagggttcattattgagagagt-gggtaacacaaatgggtagaaa 545  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||     
T  32143553 gtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttca-tattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaat 32143455  T
Q  546 ttaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagtta-ttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatatt 644  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  32143454 ctaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagatt 32143355  T
Q  645 aggtcatattggaccaaactag-----caatc--ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttg 736  Q
    ||||||||||||||| ||||||     |||||  |||||||||||||||   || ||||| ||| |||||| |  |||||||| | ||||||||||||||    
T  32143354 aggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttttggtgtgtttgttc---ttcctttc-ttgcttatctttattgctttgtatttgcttgtggtgttg 32143259  T
Q  737 ctctacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||||||||| || ||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32143258 ctctacact-agactaggtct-gtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccactt 32143191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 53 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 27027332 - 27026925
Alignment:
Q  53 ttgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggttt 152  Q
    ||||||||||| | ||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27027332 ttgttgaaaatagacttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgatttcatcaacgtaacacgatttcccaggcagtgagcatggttt 27027233  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgtttt-caagataaggttggtcgtaccttgggtcg 251  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  27027232 gcagagtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgctggctacatttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcg 27027133  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttga 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||    
T  27027132 tacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtaatcttgtgcagattttgaagaagagcttga 27027033  T
Q  352 agtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtag 451  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27027032 agagagaaaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtactgaggatctcttggatagggaaacattgtaaacaccttgggtag 27026933  T
Q  452 tgagattt 459  Q
    ||||||||    
T  27026932 tgagattt 27026925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 54 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 27453581 - 27452972
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||   || |||| ||||||||    | || |||||| ||||||    
T  27453581 tgttgagatttggcttcaaatttgtggtctgaaagagcagagaaattgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagc-tggttt 27453483  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgt 252  Q
    | |||||||  ||||||| || |||| || | || |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  27453482 gtagggtgccaaatcgtgacatgattgtgtggaatcgtgacacgattttcaaacttgctggttaagttttcaggataaggttggtcgtaccttgtgacgt 27453383  T
Q  253 acgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaa 352  Q
    ||| | |||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||  | | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  27453382 acgtatcaatcgtgacacgatttggaaatcgtggcacgattttatcagttgaagactagtttttaagtgttcttgtgcagtttttgaag-agagcttgaa 27453284  T
Q  353 gtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagt 452  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27453283 gagagagaaacttggattacaaaggagggaactttagggttgagtgtct--gtagtgaggatctcttgggttggcaaacattgtaaacaccttgggtagt 27453186  T
Q  453 gagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctc-tttagggttcattattgagagagt-gggtaacacaaatgggtagaaattagg 550  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  27453185 gagatttcaccattggaaggatcaaaagcttccttttgtgtcttctcttttagggttca-tattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaaaatagg 27453087  T
Q  551 tcttgttcttgtgtaagcttgcaagtta-ttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtc 649  Q
      ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  27453086 aattgttcttgtgtaagcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccggattaggtc 27452987  T
Q  650 atattggaccaaact 664  Q
    |||||||||| ||||    
T  27452986 atattggaccgaact 27452972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 216 - 806
Target Start/End: Original strand, 24694789 - 24695382
Alignment:
Q  216 acgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgga-aaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctat 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24694789 acgttttcaggataaggttggtcgtaccttgggttgtacgcaccaatcgtgtcacgatttggacaaacgtaacacgattttgacaactgaagactgctat 24694888  T
Q  315 ataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggat 414  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24694889 ataagtgttcttgtgcagattttgaagaagagcttgaagagagagaaatttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggat 24694988  T
Q  415 ctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcatta 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||| |||   |    
T  24694989 ctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtggtgagatttcaccattggaatgatcaaaaagcttccttttgtgttttct-tttaggattc---a 24695084  T
Q  514 ttgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcat 611  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24695085 ttgagagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttttgtaagtttataagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcat 24695184  T
Q  612 agtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaactag-----caatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattat 706  Q
    || ||||| ||  | |||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||    
T  24695185 agcggattagagggttgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttggtgtgtttgttc--atttctttcattgtttat 24695282  T
Q  707 ctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccac 804  Q
    || |  ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| || | ||| |||  ||||||||||| |||| || ||||| ||||   ||||||||||||    
T  24695283 ctttattgctttgattatgcttgt-gtgttgctctatacttagatttagctct-gtttttgttgttgttgcttgaagacattttatctattgattaccac 24695380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 53 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 27038667 - 27038270
Alignment:
Q  53 ttgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggttt 152  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27038667 ttgttgaaaattggcttcaagtttgtggtttggaaaaacagagaaatcgtgacacgatttcatcaacgtgacacgatttcccaggcagtgagcatggttt 27038568  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgt 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27038567 gcagggtgctcaatcatgtcacgattttgggaaaatgtgacacgattttcaaacttgttgggtatgttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgt 27038468  T
Q  253 acgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaa 352  Q
    ||||||||||||||||||         |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  27038467 acgcaccaatcgtgccac---------aacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgtagattttgaagaagagcttgaa 27038377  T
Q  353 gtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagt 452  Q
    | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27038376 gagagaaaaacttggattacaaaggagataactttagggttgagtgcctttgtagtgaggatctcttgggtagggaaacattgtaaacaccttgggtggt 27038277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 87 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 40845246 - 40844520
Alignment:
Q  87 agaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttg-cagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaa 185  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||   |||||||||||    
T  40845246 agaacagagaaatcgtgacacgattttatcaacatgtcatgattttctaggcagtgagcatgatttttcagggtgctcaatcatgttgagattttgggaa 40845147  T
Q  186 aacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaag-ataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgga-aaacg 283  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  40845146 aacgtgacacgattttcaa-cgtgctggacacgttttttaggataaggttggtcgtaccttgggttgtacgcaccaatcgtgtcacgatttggacaaacg 40845048  T
Q  284 tgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaa 383  Q
    || ||| |||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| || |||| || |||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  40845047 tgacacaatttagatagctgaagactgctata--agtgttcttgtgcaaattttgaaggagagttttaagatagagaaacttagattacaaaggaggtaa 40844950  T
Q  384 ctttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatt-----tcaccattggaatgatc-aa 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||     | |||||||||| |||| ||    
T  40844949 ctttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctattgggttgagaaacattgtaaacaccttgagtaatgagatttgacctgaccattggaaggatcaaa 40844850  T
Q  478 aagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagt 576  Q
    ||| |||||||||||| ||||| ||||| |||   |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  40844849 aagcttccttttgtgttttctc-ttaggattc---attgagagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagc 40844754  T
Q  577 tattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaat 670  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||     | ||||    
T  40844753 taatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggatttgagggctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgaatcaacaat 40844655  T
Q  671 cttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttg 768  Q
    ||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || | ||||| |  |||||||||    
T  40844654 cttggtgtgttcgttc--atttctttcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtagtgttgctctacacttagatttaggt-ttgtttttgttg 40844558  T
Q  769 ttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    || |||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  40844557 ttgttgcttggagacactttatctattgattaccactt 40844520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 147 - 806
Target Start/End: Original strand, 27986031 - 27986663
Alignment:
Q  147 tggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttg 246  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||| || | || |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27986031 tggtttgcagggtgccaaatcgtgacacgattgtgtggaatcgtgacacgattttcaaacttgctggttaagttttcaggataaggttggtcgtatcttg 27986130  T
Q  247 ggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagag 346  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||                   |||||| | || |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  27986131 ggtcgtacgtatcaatcgtgacacg-------------------attttgtccgcagaagacaggtatttaagtgttcttgtgcagatttggaag-agag 27986210  T
Q  347 cttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttg 446  Q
     | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27986211 ttggaagagagagaaacttggattacaaaggagggaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 27986310  T
Q  447 ggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctc-tttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaa 545  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27986311 ggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaagcttccttttgtgtcttctcttttagggttga-tattgagagagtgggaaacacaaatgggtagaaa 27986409  T
Q  546 ttaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatatta 645  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||        || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27986410 ttaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctttttt--------tc-ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagatta 27986500  T
Q  646 ggtcatattggaccaaact-----agcaatc--ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgc 737  Q
    |||||||||||||| ||||     | |||||  |||||||||||||||    ||||||| ||| |||||| |  |||||||| |||||||||||||||||    
T  27986501 ggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttc---attctttc-ttgcttatctttattgctttgtatatgcttgtggtgttgc 27986596  T
Q  738 tctacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  27986597 tctacact-agactaggtcta-tttttgttgttgttgcttgaagacactttacacatagattaccactt 27986663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 311 - 806
Target Start/End: Original strand, 6794434 - 6794931
Alignment:
Q  311 ctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtga 410  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||| || |||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6794434 ctatataagtgtttctttgcagattttgaaggagaggttttagagagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtcattgtagtga 6794533  T
Q  411 ggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttca 510  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  6794534 ggttctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaatgaacaaaagcttccttttgtattttctc-ttagggttca 6794632  T
Q  511 ttattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaag-ttattttcttgtaactctttgtaacactttcatc 609  Q
     ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6794633 -tattgtgagagtgggtgacacaaatgggtagaaattaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctaattttcttgtaactctttgtaacactttcatc 6794731  T
Q  610 atagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaac-----tagcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgatt 704  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      | |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  6794732 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggacctaaccgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tttctttcattgctt 6794829  T
Q  705 atctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattacc 802  Q
    |||| |  ||||||| ||||||||||| || | ||||||||| || | ||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||    ||||||||||    
T  6794830 atctctattgctttgattatgcttgtgatgctactctacacttagatttaggtc--tgttttgttgttgttgcttggagacactttttctattgattacc 6794927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 92 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 8127217 - 8126686
Alignment:
Q  92 agagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggt-ttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgt 190  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  8127217 agagaaatcgtgacaagatttcatcaacgtatcacgattttttaggcagtgagcatgggctttcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaagtgt 8127118  T
Q  191 gacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgga-aaacgtgccac 289  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| ||||||| |||    
T  8127117 gacacgattttcaa-cttgctaggtacgttttcaggataaggttggtcgtatcttgggtcgtacacaccaaccgtgtcacgatttggacaaacgtgacac 8127019  T
Q  290 gattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttag 389  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||| ||  || |||||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  8127018 gattttgacagttgaagactgctatataagtgtttatttgcagattttgaaggagagtttttagagagagaaacttggattacaaagaaagtaactttac 8126919  T
Q  390 ggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttt 488  Q
     |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||| |||    
T  8126918 agttgagtgtctttgtagtgaggttttcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcatcattggaaggatcaaaaagcttctttt 8126819  T
Q  489 tgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac--aaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttg 586  Q
    ||||| ||||| ||| | |||   |||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| || |||||||    
T  8126818 tgtgttttctc-ttaagattc---attgagagtgtgggtgacacaaaaatgggtagaaattaagtattgttcttttgtaagcttataagctaatttcttg 8126723  T
Q  587 taactc-tttgtaacactttcatcatagtggattgga 622  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8126722 taactcttttgtaacactttcatcgtagtggattgga 8126686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 282 - 656
Target Start/End: Original strand, 26928290 - 26928666
Alignment:
Q  282 cgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggt 381  Q
    |||| |||||||||  ||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||     
T  26928290 cgtgacacgattttatcagttgaagacttgtatttaagtgttcttgtgcagattttggaggagag-ttgaagagagaaaaacttggattacaaacgaggg 26928388  T
Q  382 aactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagt 481  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  26928389 aactctagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtaatgagatttcaccattggaaggatcaaaagc 26928488  T
Q  482 ttccttttgtgtcttctc-tttagggttcattattgagagagt-gggtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagtta- 578  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  26928489 ttcctcttgtgtcttctcttttagggttca-tattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctat 26928587  T
Q  579 -ttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26928588 tttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattgg 26928666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 71 - 449
Target Start/End: Original strand, 40734091 - 40734469
Alignment:
Q  71 aaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtg 170  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40734091 aaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgatttcatcaacatgtcacgatttccaag-cagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtg 40734189  T
Q  171 tcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtac-gttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgcca 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  40734190 tcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttggctacatttttcaggataaggttggtcgtaccttggatcgtacgcatcaatcgtgtca 40734289  T
Q  270 cgttttgga-aaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttgga 368  Q
    || |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  40734290 cgatttggacaaacgtgacacaattttgacagctgaagactgctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagacagaaacttgga 40734388  T
Q  369 tta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
      | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |   | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40734389 aaatcaaaggagataactttagggttgagggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 40734469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 53 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 37726300 - 37725873
Alignment:
Q  53 ttgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacga-tttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggt 150  Q
    ||||||| | ||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||| || | |||| ||||||||    | || |||||| ||||    
T  37726300 ttgttgagatttggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttgat-atcgtgacacgattttgtgatgccgtgagc-tggt 37726203  T
Q  151 ttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtc 250  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  37726202 ttgcagggtgtcaaatcgtgacacgattttgtggaatcgtgacacgattttcaaacttgttggttaagttttcaggataaggttggtcgtacattgggtc 37726103  T
Q  251 gtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttg 350  Q
    ||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  37726102 gtacgtatcaatcgtgacacgatttggaaaacgtggcacgattttatcagctgcaaactgctatataagtgttcttgtgcagattttggaagtgagcttg 37726003  T
Q  351 aagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggta 450  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||    
T  37726002 aagagagagaaacttggattacaaaggaggaaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggtggggaaacattataaacaccttggata 37725903  T
Q  451 gtgagatttcaccattggaatgatcaaaag 480  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  37725902 gtgagatttcaccattgaaaggatcaaaag 37725873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 54 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 1306604 - 1305819
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | ||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| |||||| || ||   || |||| |||||||||   | |  |||||| ||||||    
T  1306604 tgttgagatttggcttcaaatttatggtctggaagaacagagaaatcgtgacatgaatttggcatcgtgacacgatttcgtggtgtcgtgagc-tggttt 1306506  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataagg-ttggtcgtaccttgggtcg 251  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| | | || |||| || |||||||   |||||||||||| | ||    
T  1306505 gcagggtgccaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattctcaaacttgctcgttaagtttccaggataaggacaggtcgtaccttgtgacg 1306406  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacg--tt-----------------ttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcag 332  Q
    |||| |||||||||| ||||  ||                 ||||||| |||| |||||||||  |||  |||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  1306405 tacgtaccaatcgtgacacgacttggaaatcgtgacacgacttggaaatcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcag 1306306  T
Q  333 attttggagtagagcttg--------aagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggtt 424  Q
     |||||||| ||||||||         || ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1306305 tttttggaggagagcttggaagagcttagagagagaaacttggattataaaggagggaactctagagttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggtt 1306206  T
Q  425 ggg--aaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctc-tttagggttcattattgagaga 521  Q
    |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1306205 gggaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatcttaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttca-tattgagaga 1306107  T
Q  522 gt-gggtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagtta-ttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggatt 619  Q
    || ||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  1306106 gtggggaaacacaaatgggtagaaactatgacttgttcttgtgtaagcttgcaaactatttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcgtagtggatt 1306007  T
Q  620 ggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatc--ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatc-tgtg 711  Q
    ||| ||||||| ||||||| | |||||| |||||||| |  ||||     | |||||  |||||||||||||||   || ||||| ||| ||||| ||      
T  1306006 ggagagctgctatctcccctagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttc---ttcctttc-ttgcttatcttggt 1305912  T
Q  712 tgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1305911 tgctttgtatttgcttgtggtgttgctctacact-agactagggct-gtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccactt 1305819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 355 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 26299311 - 26298850
Alignment:
Q  355 gagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtga 454  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26299311 gagagaaacttggattataaaggaggtaactttagggttgaatgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtga 26299212  T
Q  455 gatttcaccattggaatgatc-aaaagtttcc-ttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggt 551  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||| ||||| ||||| |   | |||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  26299211 gatttcaccattggaattatcaaaaagcttcctttttgtgttttctc-ttaggat---taattgagattgtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggt 26299116  T
Q  552 cttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtca 650  Q
    ||||||||||| |||| ||  ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||| ||||    
T  26299115 cttgttcttgtctaagtttataagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtagattggagggctgctctctcccccagattatgtca 26299016  T
Q  651 tattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacac 744  Q
    ||||| ||| ||||     | |||||||||||||||||||||  | |||||| ||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26299015 tattgaaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tctctttcgttgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacac 26298918  T
Q  745 taag-tctaggtctatttt-----ttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    | || | ||||||| ||||     |||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26298917 ttagatttaggtctgtttttgttgttgttgttgttgtttggagacactttatccattgattaccactt 26298850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 355 - 806
Target Start/End: Original strand, 3715762 - 3716221
Alignment:
Q  355 gagagaaacttg-gattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttg--ggttgggaaacattgtaaacatcttgggtag 451  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3715762 gagagaaacttgagaatacaaaggaggtaactttagggttgaatgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaacattgtaaacaccttgggtag 3715861  T
Q  452 tgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattag 549  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||     
T  3715862 tgagatttcaccattggaaggatcaaaaagctttcttttgtgttttctc-ttaggattca-tattgtgaaagtgggtgacacaaaatgggtagaaattaa 3715959  T
Q  550 gtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggt 648  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || | |||||||    
T  3715960 gtcttgttcttgtgtaagtttgtaagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtagattggagagctgctctctctcctagattaggt 3716059  T
Q  649 catattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctac 742  Q
    ||||||||||| ||||     | |||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||| |  || | || |||||||||||||||||||||||    
T  3716060 catattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tctctttcattgcttatctttattgttgtgattatgcttgtggtgttgctctac 3716157  T
Q  743 actaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||| || | || ||||  ||||||||||| |||| || ||||||||||   ||||||||||||||    
T  3716158 acttagatttatgtct-gtttttgttgttgttgcttgtagacactttatctattgattaccactt 3716221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 355 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 25796106 - 25795709
Alignment:
Q  355 gagagaaacttgg-attacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttg--ggttgggaaacattgtaaacatcttgggtag 451  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  25796106 gagagaaacttgggaatacaaaggaggtaacttgagggttgagtgtctttgtagtgaggctctcttgagggttgggaaacaatgtaaacaccttgggtag 25796007  T
Q  452 tgagatttcaccattggaatgatcaaaa-gtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaa-tgggtagaaattag 549  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| ||||||| ||| ||||||   ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  25796006 tgagatttcaccattggaaggatcaaaaagcttccttttatgttttctctt-aggattcatt---gagagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattag 25795911  T
Q  550 gtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggt 648  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25795910 gtcttgttcttttgtaagcttataagctaatttcttgtaactctttcgtaacactttcatcttagtagattggagagctgctctctcccccagattaggt 25795811  T
Q  649 catattggaccaaactag-----caatc-ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctcta 741  Q
    ||||||||||| ||||||     ||||| |||||||||||||||   |||||||||||| |||| | |  || |||  ||||||||||||||||||||||    
T  25795810 catattggaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgttc--atttctttcattgcttatttttattgtttttattatgcttgtggtgttgctcta 25795713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 423 - 745
Target Start/End: Original strand, 18552716 - 18553041
Alignment:
Q  423 ttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagt-ttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagaga 521  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| ||||||| ||| ||||||   |||||     
T  18552716 ttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaaaacttccttttgtgttttctctt-aggattcatt---gagagt 18552811  T
Q  522 gtgggtaacacaaa-tgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggatt 619  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18552812 gtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggatt 18552911  T
Q  620 ggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtg 713  Q
    |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     | |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |  ||    
T  18552912 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtatttgttcc--tttctttcattgattatctttattg 18553009  T
Q  714 ctttgtttatgcttgtggtgttgctctacact 745  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18553010 ctttgattatgtttgtggtgttgctctacact 18553041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 355 - 792
Target Start/End: Original strand, 3328120 - 3328561
Alignment:
Q  355 gagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtga 454  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  3328120 gagagaaacttggattagaaaggagataactttagggttgaatgtctttgtagtgagcttctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtagtga 3328219  T
Q  455 gatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtggg---taacacaaatgggtagaaattagg 550  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||  |||||||||||| ||||| ||||| | |   |||||||| |||||   ||  | ||||||||||||||||||    
T  3328220 gatttcagcattggaaggatcaaaaaacttccttttgtgttttctc-ttaggatac---attgagagtgtgggtgatatgaaaaatgggtagaaattagg 3328315  T
Q  551 tcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtca 650  Q
     ||||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||| | | |||||||||    
T  3328316 acttgttcttttgtaagcttataagctaatttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattgaagggctgctctctcctctagattaggtca 3328415  T
Q  651 tattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacac 744  Q
    |||||||   ||||     | |||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||| |  || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3328416 tattggaatgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tctctttcattgcttatctttattgttttgattatgcttgtggtgttgctctacac 3328513  T
Q  745 taag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacac 792  Q
    | || | |||||||  ||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  3328514 ttagatttaggtct-gtttttgttgttgtttcttggagacactttacac 3328561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 355 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 37466618 - 37466220
Alignment:
Q  355 gagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtga 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  37466618 gagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagagctgagtgtctttgtagtgaggttctcttaggttgggaaacattgtaaacactttgggttgtga 37466519  T
Q  455 gatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtggg-------taacacaaatgggtagaaat 546  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| || | |||||| |||   |||||||| | |||       ||  | ||||||||||||||    
T  37466518 gatttcaccattggaaagatcgaaaagcttccttttgtgttttat-tttaggattc---attgagagtgcgggtgagtgatatgaaaaatgggtagaaat 37466423  T
Q  547 taggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattag 646  Q
    |||| ||||||||| |||||||||  || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||    
T  37466422 taggacttgttcttttgtaagcttataaattaatttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggagggctactctctcccccagattag 37466323  T
Q  647 gtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctct 740  Q
    ||||||||||||| ||||     | ||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| |  ||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  37466322 gtcatattggaccgaactgtgtcaacaatcttggtgtgtttgttc--atttctttcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtaatgttgctct 37466225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 355 - 806
Target Start/End: Original strand, 1417254 - 1417708
Alignment:
Q  355 gagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtga 454  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  1417254 gagaaaaacttgaattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggttatcttgggttgggaaacattgtaaacactttaggtagtga 1417353  T
Q  455 gatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtggg---taacacaaatgggtagaaattagg 550  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||   |||| ||| |||||   ||  | ||||||||||||||||||    
T  1417354 gatttcaccattgaaaggatcaaaaagttttcttttgtgttttctc-ttaggattc---attgggagtgtgggtgatatgaaaaatgggtagaaattagg 1417449  T
Q  551 tcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtca 650  Q
     ||||||||| |||||| ||  ||| || |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||    
T  1417450 acttgttcttttgtaagtttataagctaatttcttataactcattgtaacactttcttcttagtggattggagggatgctctctcccccagattaggtca 1417549  T
Q  651 tattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacac 744  Q
    ||||||||| ||||     | |||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||| |  ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  1417550 tattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tctctttcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtgatgttactctacac 1417647  T
Q  745 taag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    | || | ||  | ||| |||||||||| |||| || ||||||||||   ||||||||||||||    
T  1417648 ttagattta--tgtatgttttgttgttgttgcttgaagacactttatctattgattaccactt 1417708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 120 - 441
Target Start/End: Original strand, 29812705 - 29813026
Alignment:
Q  120 gtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggttt-gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacg 218  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| | |    
T  29812705 gtgtcacgattttctaggcagtgagcatggttttgcagggtgtccaatcgtgacacgattttgggaaaacgtgacacgatttttgt-cttgctgggcaag 29812803  T
Q  219 ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatata 317  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29812804 ttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaaacgtgtcacgatttggaaaaacgtgacacgattttgaccgctgaagactgctatata 29812903  T
Q  318 agtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatct 416  Q
    ||||||||| || |||||||| || |||| |||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | | | |||    
T  29812904 agtgttctt-tgtagattttgaagaagaggttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttg-attaaagttct 29813001  T
Q  417 cttgggttgggaaacattgtaaaca 441  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  29813002 cttgggttgggaagcattgtaaaca 29813026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 355 - 657
Target Start/End: Original strand, 3323454 - 3323756
Alignment:
Q  355 gagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtga 454  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3323454 gagacaaacttcgattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttatagtgaggttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtga 3323553  T
Q  455 gatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtggg---taacacaaatgggtagaaattagg 550  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||   |||||||| |||||   ||  |  ||||||||||||||| |    
T  3323554 gatttcaccattggaatgatcaaaaagcttccttttgtgttttctc-ttagaattc---attgagagtgtgggtgatatgaacaatgggtagaaattatg 3323649  T
Q  551 tcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtca 650  Q
     ||||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||| |||| |||||||||    
T  3323650 acttgttcttttgtaagcttataagctaatttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggagggctgttctctctcccagattaggtca 3323749  T
Q  651 tattgga 657  Q
    |||||||    
T  3323750 tattgga 3323756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 71 - 307
Target Start/End: Original strand, 40735022 - 40735259
Alignment:
Q  71 aaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtg 170  Q
    |||| |||||| || | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40735022 aaatttgtggtttggatgaacagataaatcgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccaag-cagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtg 40735120  T
Q  171 tcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtac-gttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgcca 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  40735121 tcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgctggctacatttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgtta 40735220  T
Q  270 cgttttgga-aaacgtgccacgattttgacagctgaaga 307  Q
     | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40735221 tgatttggacaaacgtgacacgattttgacagctgaaga 40735259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 220 - 479
Target Start/End: Original strand, 25929023 - 25929282
Alignment:
Q  220 tttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaa-cgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataa 318  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||  ||| |||||  || |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  25929023 tttcaggataaggttggtcgtacattggatcgtacgtaccaaccgtgttacgatttggccaatcgtgacacgattttgacagctgaagatttctatataa 25929122  T
Q  319 gtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctct 418  Q
    |||||  | || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25929123 gtgtttctttgtagattttgaagtagagtttgaagtgagagaaacttagattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggttctct 25929222  T
Q  419 tgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaa 479  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  25929223 tgagttggaaaacattgtaaaca-cttgggtagtgagatttcaccatcggaaggatcaaaa 25929282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 62 - 656
Target Start/End: Original strand, 40372263 - 40372870
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggtttgcagggtg 160  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   || |||| |||||||||   | || |||||| | |||||||||  |    
T  40372263 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagc-tagtttgcaggacg 40372361  T
Q  161 ctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggt-tggtcgtaccttgggtcgtacgcacc 259  Q
    |  ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||| | | || || | |  |||||||  ||||| ||||| ||  || |||||      
T  40372362 ccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcatacctgggaacggacgca-- 40372459  T
Q  260 aatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataa-gtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaa------ 352  Q
    |||||||||||| | |||||| |||| ||||||||   |||  |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||   || |||||||| |          
T  40372460 aatcgtgccacgatctggaaatcgtgacacgatttcttcagaggaagactagtatatattgtgttcttgtgcagatttgtaag-agagcttggaagagct 40372558  T
Q  353 --gtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacatcttggg 448  Q
      | |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| || ||||||    
T  40372559 tagagagagaaacttggattacaaaggagggaaccaaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 40372658  T
Q  449 tagtgag-atttcacca-ttggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgggtaa-cacaaatgggtagaa 544  Q
    ||||||| | ||||  | |||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| || |||| ||||||||||    
T  40372659 tagtgaggagttcattagttggaaggatctaaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcat-attatgagagtggggaaacacatatgggtagaa 40372757  T
Q  545 attaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatttt-cttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatat 643  Q
      |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  40372758 tctagggcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagat 40372857  T
Q  644 taggtcatattgg 656  Q
    |||| ||||||||    
T  40372858 taggccatattgg 40372870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 358 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 47649893 - 47649653
Alignment:
Q  358 agaaacttgg-attacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttg--ggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtga 454  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  47649893 agaaacttgggaatacaaaggagataactttagggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtta 47649794  T
Q  455 gatttcaccattggaatgatcaaaa-gtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaa-tgggtagaaattaggtc 552  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  47649793 gatttcaccatttgaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttctctt-aggattcat-attgcgagagtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtc 47649696  T
Q  553 ttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactcttt 595  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  47649695 ttgttcttgtggaagcttgtaagttaatttcttgtaactcttt 47649653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 355 - 656
Target Start/End: Original strand, 2671353 - 2671661
Alignment:
Q  355 gagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacatcttgggtagt 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||    
T  2671353 gagagaaacttggattacaaaggagggaaccaaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagt 2671452  T
Q  453 gag-atttcacca-ttggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgggtaa-cacaaatgggtagaaatta 548  Q
    ||| | ||||  | |||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || |||| ||||||||||  ||    
T  2671453 gaggagttcattagttggaaggatctaaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatcta 2671551  T
Q  549 ggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattag 646  Q
    || |||| ||||||||||||||||||  ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  2671552 gggcttggtcttgtgtaagcttgcaatctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattag 2671651  T
Q  647 gtcatattgg 656  Q
    | ||||||||    
T  2671652 gccatattgg 2671661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 89 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 5237013 - 5236653
Alignment:
Q  89 aacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaa 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||  | | || | ||||||| ||| | | |||  |||||||| ||| ||||||||||||    
T  5237013 aacagagaaatcgtgacacgatttcataagcgtgtcacgatttggctatgccgagagcatgtttt-ctgagtgtccaatcgtgacacaattttgggaaaa 5236915  T
Q  188 cgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgc 286  Q
    |||||||||||||||   |||| |||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||     
T  5236914 cgtgacacgattttcgg-cttgctgggaaagttttcaggataagtttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaaacgtgtcacgatttggcaaaacgtga 5236816  T
Q  287 cacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggatta-caaaggaggtaact 385  Q
    |||||||||||||  || ||  | |||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||   | | ||||||||||||    
T  5236815 cacgattttgacacttgcagggtactatttaagtgttcttgtgcagattttgaagtggggcttgaagagagagaaacttgggaaatcgaaggaggtaact 5236716  T
Q  386 ttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||||||||||| ||||||| | |   | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5236715 ttagggttgagggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 5236653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 62 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 8477995 - 8477384
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggtttgcagggtg 160  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   || |||| |||||||||   | || |||||| | |||||| || ||    
T  8477995 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaattgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagc-tagtttgctggatg 8477897  T
Q  161 ctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggt-tggtcgtaccttgggtcgtacgcacc 259  Q
    |  ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||| | | || || | |  |||||||  ||||| |||||||||| |||||||      
T  8477896 ccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgca-- 8477799  T
Q  260 aatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagatttt-ggagtagagcttgaa------ 352  Q
    ||||||| |||| | |||||| |||| |||||||    |||  |||| ||  ||| ||||||||||||||   ||||| |||  |||||||| |          
T  8477798 aatcgtgacacgatctggaaatcgtgacacgattgcttcagaggaaggctagtatttaagtgttcttgtgttcatttttggaagagagcttggaagagct 8477699  T
Q  353 --gtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacatcttggg 448  Q
      | ||||||||||||||||||| |||||| |||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| || ||||||    
T  8477698 tagagagagaaacttggattacagaggagggaaccaaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 8477599  T
Q  449 tagtgag-atttcacca-ttggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgggt--aacacaaatgggtaga 543  Q
    ||||||| | ||||  | |||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||   ||||| || |||||||    
T  8477598 tagtgaggagttcattagttggaaggatctaaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtgggggaaacaccaaagggtaga 8477500  T
Q  544 aattaggtcttgttc-ttgtgtaagcttgcaagttatt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctccccca 640  Q
    |  |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  8477499 atctaggtcttgtttattgtgtaagcttgcaagctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctccccca 8477400  T
Q  641 tattaggtcatattgg 656  Q
     |||||| ||||||||    
T  8477399 gattaggccatattgg 8477384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 594 - 806
Target Start/End: Original strand, 39039995 - 39040210
Alignment:
Q  594 ttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaactag-----caatctt--ggtgtgtttgttc 686  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||     |||||||  |||||||||||||    
T  39039995 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgttctcttccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttttggtgtgtttgttc 39040094  T
Q  687 ctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacact 786  Q
    ||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||    
T  39040095 cttt--ctttcattgcttatctttgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaagtctaggtc--tgttttgttgttgttgcttggagacact 39040190  T
Q  787 ttacacattgattaccactt 806  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  39040191 ttacacattgattaccactt 39040210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 54 - 441
Target Start/End: Original strand, 37408036 - 37408422
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | ||||||| |||| |||||| || ||||||| |||||| |||||||||||    || |||| ||||||||   || || |||||| ||||||    
T  37408036 tgttgagatttggcttcaaatttgtggtttggaagaacaaagaaatcgtgacacgattgtggcatcgtgacacgattttgtagtgccgtgagc-tggttt 37408134  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgt 252  Q
    ||||||||   ||||||| ||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37408135 gcagggtgtcaaatcgtggcacgattgtgt-aaatcgtgacacgattttcaaacttgttggttaagttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgt 37408233  T
Q  253 acgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaa 352  Q
    ||| | |||||||| |||| |||||||| |||  || ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  37408234 acgtatcaatcgtggcacgatttggaaatcgtaacaagattttatctgctgaagactggtatataagtgttcttgtgaagattttgaaggtgagcttgaa 37408333  T
Q  353 gtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaaca 441  Q
    | ||||||||||| |||   ||||||||| |||||||||||| |  ||||||| | |   | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37408334 gagagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttatggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 37408422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 355 - 656
Target Start/End: Original strand, 9091068 - 9091376
Alignment:
Q  355 gagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacatcttgggtagt 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||    
T  9091068 gagagaaacttggattacaaaggagggaaccaaagggttgagtgtctttgtagagagtatctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagt 9091167  T
Q  453 gag-atttcacca-ttggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctt-tagggttcattattgagagagtgggtaac-acaaatgggtagaaatta 548  Q
    ||| | ||||  | ||| || |||| |||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||  ||    
T  9091168 gaggagttcattagttgaaaggatctaaagcttcctctagtgtcttctcttctagggttcat-attgtgagagtggggaaatacatatgggtagaatcta 9091266  T
Q  549 ggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattag 646  Q
    ||  ||||||||||||||||||| | | ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9091267 gggattgttcttgtgtaagcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattag 9091366  T
Q  647 gtcatattgg 656  Q
    | ||||||||    
T  9091367 gccatattgg 9091376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 142 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 23410833 - 23410529
Alignment:
Q  142 gagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgta 241  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| ||| ||||||| |||||||| ||| ||||| |   ||| | | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23410833 gagcatgttttgcagggtgtccaatcgtgacacaattttggaaaaacgtgtcacaatttttatg-ttgcttgatacgttttcaagataagtttggtcgta 23410735  T
Q  242 ccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgga 340  Q
    |||||||| || | |||||| |||| |||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| ||    
T  23410734 ccttgggttgttcacaccaaccgtgtcacgatttggcaaaacgtgacacaattt-gacagctgaagactgctatataagtgtttctttgcagttttttga 23410636  T
Q  341 -gtagagcttgaagtgagagaaacttgg-attacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaa 438  Q
     | |||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  23410635 aggagagct-gaagagagagaaacttgggattgcaaaggagagaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggaaaacattgtaa 23410537  T
Q  439 acatcttg 446  Q
    ||| ||||    
T  23410536 acaccttg 23410529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 355 - 656
Target Start/End: Original strand, 8738830 - 8739138
Alignment:
Q  355 gagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacatcttgggtagt 452  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||    
T  8738830 gagagaaacttggattgcaaaggagggaaccaatgggttgagtgtctttgtagagagtatctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagt 8738929  T
Q  453 gag-atttcacca-ttggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctt-tagggttcattattgagagagtgggtaac-acaaatgggtagaaatta 548  Q
    ||| | ||||  | ||| || |||| |||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||  ||    
T  8738930 gaggagttcattagttgaaaggatctaaagcttcctctagtgtcttctcttctagggttcat-attgtgagagtggggaaatacatatgggtagaatcta 8739028  T
Q  549 ggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattag 646  Q
    ||  ||||||||||||||||||| | | ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8739029 gggattgttcttgtgtaagcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattag 8739128  T
Q  647 gtcatattgg 656  Q
    | ||||||||    
T  8739129 gccatattgg 8739138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 119 - 449
Target Start/End: Original strand, 29810509 - 29810839
Alignment:
Q  119 cgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggttt-gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtac 217  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| | |||||||  ||| |||||    |||| |||  |     
T  29810509 cgtgtcacaattttctaggcattgagcatggttttgcagggtgtccaatcgtgacacgattttagaaaaacgtagcacaatttttgg-cttgctggacaa 29810607  T
Q  218 gttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatat 316  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29810608 attttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaaacgtgtcacgatttgggaaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatat 29810707  T
Q  317 aagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatc 415  Q
    |||||||||| |||| |||||| || | || ||||||  ||| |||||| |||   |||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |   | ||    
T  29810708 aagtgttctt-tgcatattttgaagaaaaggttgaagaaagaaaaacttgggaaatcaaaggaggtaattttagggttgagggtctttg-attagagttc 29810805  T
Q  416 tcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29810806 ttttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 29810839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 62 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 7167875 - 7167266
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggtttgcagggtg 160  Q
    |||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||   || |||| ||| |||||   | || |||||| | |||||||||  |    
T  7167875 attggcttcaaatttgtgttctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacaatttcaaggtgccgtgagc-tagtttgcaggacg 7167777  T
Q  161 ctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataagg-ttggtcgtaccttgggtcgtacgcacc 259  Q
    |  ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||| | | || || |    |||||||  ||||| |||||||||||  |||||      
T  7167776 ccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggactggtcataccttgggtcagacgca-- 7167679  T
Q  260 aatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatata-agtgttcttgtgcagattttggagtagagcttg-------- 350  Q
    ||||||| |||| |||| ||| | || ||||||||   |||  |||||||  ||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||            
T  7167678 aatcgtgacacgatttgaaaatcatggcacgatttcttcagaggaagactagtatatattgtgttcttgtgcagatttggga-tagagcttggaagagct 7167580  T
Q  351 aagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacatcttgg 447  Q
     || ||||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||   ||||||||||| || |||||    
T  7167579 tagagagagaaacttggataacaaaggagggaaccaaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaaacattgtaatcaccttgg 7167480  T
Q  448 gtagtga-gatttcacca-ttggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctc-tttagggttcattattgagagagt-gggtaacacaaatgggtaga 543  Q
    ||||||| || ||||  | |||||| |||| |||| ||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| || || || |||||||    
T  7167479 gtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttca-tattgtgagagtggggaaataccaaagggtaga 7167381  T
Q  544 aattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttat--tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccat 641  Q
    |  ||||  ||||||||||||||||||| | | |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  7167380 atctagggtttgttcttgtgtaagcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccag 7167281  T
Q  642 attaggtcatattgg 656  Q
    |||||| ||||||||    
T  7167280 attaggccatattgg 7167266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 23198530 - 23198136
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||   || |||| ||||||||    | || |||||| ||||||    
T  23198530 tgttgagatttggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttgacatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagc-tggttt 23198432  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggt-tggtcgtaccttgggtcg 251  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||| | | || ||||||||||||| |||||||| | | || |||| || |||||||  ||||||||||||| | ||    
T  23198431 gcagggtgccaaatcgtgacacgatttggaggaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccaggataaggactggtcgtaccttgtgacg 23198332  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttga 351  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||  |||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| || |||| | ||    
T  23198331 tacgtaccaatcgtgacacgatttggaaatcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattttgaag-agagttgga 23198233  T
Q  352 agtgagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    || ||||||||||||||  | ||||||  | |||| ||||||| || |||||||    |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23198232 agagagagaaacttggaaaatcaaagggagcaactctagggtttagggtctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 23198136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 121 - 271
Target Start/End: Original strand, 46173160 - 46173308
Alignment:
Q  121 tgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgtt 220  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |   ||||||||| |||||    
T  46173160 tgtcacgatttccaaggcagtgagcatggtttgcagggtgtccaatcgtgacacgattttgggaaaacatgacacgatt--ccggcttgttgggcacgtt 46173257  T
Q  221 ttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg 271  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  46173258 ttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaaccgtgtcacg 46173308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 119 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 44331974 - 44331735
Alignment:
Q  119 cgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtac 217  Q
    |||||||||||||| ||  || ||||| ||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    |||  |||||||    
T  44331974 cgtgtcacgatttcgcaatgccgtgagtatgttttgcagggtgtccaatcgtgacacgattttggaaaaacgtgacacgatttttgg-cttcctgggtac 44331876  T
Q  218 gttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg-ttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatat 316  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| ||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  44331875 gttttcaagataaagttagtcgtaccttgggtcgtacacaccaaatgtgtcacgatttggggaaacgtggcatgattttgacagctgaagactgctatat 44331776  T
Q  317 aagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgaga 358  Q
    | ||||| || ||||||||||| || ||||||| ||| ||||    
T  44331775 atgtgttatt-tgcagattttgaaggagagcttaaagagaga 44331735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 163 - 447
Target Start/End: Original strand, 45094849 - 45095134
Alignment:
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacg-ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 261  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  45094849 caatcgtgacacaattttgggaaatcgtgacacgatttttgg-cttgttgggcaagattttcaggataaggttggtcgtaccttggaacgtacgcatcaa 45094947  T
Q  262 tcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagag 359  Q
    ||||| |||| || ||  |||||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||    
T  45094948 tcgtgacacgattggggaaaaacgtgacacgatttcgaacgctgaagattgctatataagtgttctt-tgcagattttgaagatgagcttgaagagagag 45095046  T
Q  360 aaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    |||||| |||   |||| |||| |||||||||||| || ||||||| | |   | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45095047 aaacttgggaaatcaaaagaggcaactttagggtttagggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 45095134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 163 - 447
Target Start/End: Original strand, 7761950 - 7762235
Alignment:
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacg-ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    |||| |||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7761950 caatcgtgacacgattttgggaaa-cgtgacacgatttttgg-cttgctgggcaagattttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcatcaa 7762047  T
Q  262 tcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagag 359  Q
    ||||| |||| || ||  |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || | ||||||||| |||||    
T  7762048 tcgtgacacgattggggaaaaacgtgacacgatttagac-gctgaagactgctatataagtgttctt-tgcaaattttgaaggaaagcttgaagagagag 7762145  T
Q  360 a--aacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    |  |||||||   | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |   | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  7762146 agaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaatattgtgaacaccttgg 7762235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 54 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 23200729 - 23200335
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||   || |||| ||||||||    | || |||||| ||||||    
T  23200729 tgttgagatttggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgctgtgagc-tggttt 23200631  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggt-tggtcgtaccttgggtcg 251  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||| | | || ||||||||||||| |||||||| | | || |||| || |||||||  ||||||||||||| | |     
T  23200630 gcagggtgccaaatcgtgacacgatttggaggaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccaggataaggactggtcgtaccttgtgact 23200531  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttga 351  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||  |||  |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| || |||| | ||    
T  23200530 tacgtaccaatcgtgacacgatttggaaatcgtgacacgattttatcagtggaagactggtatttaagtgtttttgtgcagattttgaag-agagttgga 23200432  T
Q  352 agtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    || ||||||||||| |||   ||||||  | |||| ||||||| || |||||||    |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23200431 agagagagaaacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggtctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 23200335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 140 - 395
Target Start/End: Original strand, 44331232 - 44331473
Alignment:
Q  140 gtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcg 239  Q
    ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44331232 gtgagtatgttttgctgggtgttcaatcgtgacacgattttgggaaaaagtgacacgatttttgg-cttgctgggtacgttttcaggataaggttggtcg 44331330  T
Q  240 taccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgg 339  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |           |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||     
T  44331331 taccttgggtcgtacgcaccaaacttgtc-----------aacgtgacatgattttgacagctgaagactgctatataaatgttctt-tgtaga-tttga 44331417  T
Q  340 agtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttga 395  Q
    || |||||||| || ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  44331418 aggagagcttg-agagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttga 44331473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 119 - 447
Target Start/End: Original strand, 51398467 - 51398783
Alignment:
Q  119 cgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggttt-gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtac 217  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||| |     
T  51398467 cgtgtcacgattttctaggtagtgagcatggttttgcagggtgtccaattgtgacacgattttgggaaaacgtgacacaattttcggt-ttgttgggcaa 51398565  T
Q  218 gttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatat 316  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||            ||||||| |||| |||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51398566 gtttttaggatatggttggtcgtac------------gcaccaaacgtgtcacgatttgggaaaatgtgacacgattttgacagctgaagattgctatat 51398653  T
Q  317 aagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatc 415  Q
    |||||||||| || |||||||| || |||| |||||| || |||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |   | |     
T  51398654 aagtgttctt-tgtagattttgaaggagaggttgaagagatagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagagtctttg-attagagttt 51398751  T
Q  416 tcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  51398752 tcttgggttgggaaatattgtaaacaccttgg 51398783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 124 - 277
Target Start/End: Original strand, 54593133 - 54593285
Alignment:
Q  124 cacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttc 223  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| || |||  ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  54593133 cacgattttctaggcagtgagcatggttttcatggtattcaatcgtgactcaattttgggaaaacgtgacacgattttcaa-cttgctgggcacgttttc 54593231  T
Q  224 aagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg 277  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  54593232 aggataaggttggtcgtacattgggtcgtacgcaccaaacgtgtcacgatttgg 54593285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 101 - 296
Target Start/End: Original strand, 4569357 - 4569552
Alignment:
Q  101 gtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattt 200  Q
    ||||||||||||   || |||| ||| |||| | |||||||| |||||||||  ||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  4569357 gtgacacgattttggcatcgtggcacaattttctaggcagtgcgcatggtttttagggtgtccaatcgtgacatgattttgggaaaacgtgacacgattt 4569456  T
Q  201 tcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccac-gttttggaaaacgtgccacgattttg 296  Q
    ||   |||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4569457 tc-ggcttgctgggcaagttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaaccgtgtcacggttgtggaaaacgtgacacgattttg 4569552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 119 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 31340787 - 31340635
Alignment:
Q  119 cgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaa-cgtgacacgattttcaaacttgttgggtac 217  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||  |||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||   ||||||||| |     
T  31340787 cgtgtcacgattttctaggcagtgagcatggttttcagggtgtccaatcgtgacatgattttgggaaaaacatgacacgattttcgg-cttgttgggcaa 31340689  T
Q  218 gttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg 271  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  31340688 gttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaaacgtgacacg 31340635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 219 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 5260750 - 5260522
Alignment:
Q  219 ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatat 316  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| |||| || ||  ||||| || |||||||||||| || |||||| |||||||    
T  5260750 ttttcaggataaggttggtcgtactttggatcgtacgcatcaattgtggcacgattggggaaaaacatgacacgattttgac-gcagaagacagctatat 5260652  T
Q  317 aagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatc 415  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||| |||||||||||| || ||||||| | |   | ||    
T  5260651 aagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggtctttg-attagagttc 5260554  T
Q  416 tcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5260553 tcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 5260522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 370 - 461
Target Start/End: Original strand, 4386755 - 4386846
Alignment:
Q  370 tacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttca 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  4386755 tacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttgggaaacattgtaatcaccttgagtagtgagatttca 4386846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 163 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 5258627 - 5258343
Alignment:
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacg-ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    |||| |||| | | |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |    
T  5258627 caatcgtgacacgattttgggaaatcgtgacacgatttttgg-cttgctgggcaagattttcaggataaggttggtcgtaccttgaatcgtacgcatcga 5258529  T
Q  262 tcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagag 359  Q
    | ||| |||| || ||  |||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||| |||| |||||    
T  5258528 ttgtggcacgattggggaaaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatatacgtgttctt-tgcagattttgaaggagagctagaagagagag 5258431  T
Q  360 aaacttg-gattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    ||||||| ||   ||||||  | |||||||||||| || ||||||| | |   | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5258430 aaacttgagaaatcaaagggagaaactttagggtttagggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 5258343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 124 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 55302703 - 55302552
Alignment:
Q  124 cacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttc 223  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||   |||| |||| | ||||||    
T  55302703 cacgattttctaggcagtgagcattgttttcagggtgttcaatcgtgacacgattt-gggaaaacgtgatacgattttcgg-cttgctgggcaagttttc 55302606  T
Q  224 aagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg 277  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  55302605 aggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaaacgtgtcacgatttgg 55302552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 89 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 49200226 - 49200054
Alignment:
Q  89 aacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaa 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |    |||||||||||||  ||  || ||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| ||||| |||    
T  49200226 aacagagaaatcgtgacacgattttacaggcgtgtcacgattttgcaatgccgtgagcatgttttgcagggtgtccaatcgtgacacgatgttggggaaa 49200127  T
Q  188 cgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 261  Q
    |||||||||||||||   |||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49200126 cgtgacacgattttcgg-cttgctgggcatgttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 49200054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 163 - 347
Target Start/End: Original strand, 7764137 - 7764321
Alignment:
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacg-ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| | | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7764137 caatcgtgacacgattttgggaaaacgtgacacgatttttgg-cttgttgggcaagatttttaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcatcaa 7764235  T
Q  262 tcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagc 347  Q
    ||||| || | || ||  |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||    
T  7764236 tcgtgacatgattggggaaaaacgtgacacgatttaga-tgctgaagactgctatataagtgttctt-tgcaaattttgaaggagagc 7764321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 370 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 21353875 - 21353604
Alignment:
Q  370 tacaaaggaggtaactttagggtt--gagtgtctttgtagtgaggatctcttg--ggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgag-atttcacca 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  21353875 tacaaaggaggtaactttagggttttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaacatcgtaaacactttgggtagtgagaatgtcacca 21353776  T
Q  465 ttggaatgat-caaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattat-tgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgt 562  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||| ||| | |||||| |  | | |||| || |  | |||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  21353775 ttggaaggatccaaaagtttcctttagtgttttctc-ttaagattcattgtaagtgtgagt-ggcatgaaaaatgggtagaaattaggttgtgttctt-t 21353679  T
Q  563 gtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcc 636  Q
    || ||||     | || ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  21353678 gtgagctcttgtgctaatttcttgtaactcatttgtatcactttcatcttagtggattggagaggtgctctctcc 21353604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 256 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 23392300 - 23392106
Alignment:
Q  256 caccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgga-gtagagcttgaag 353  Q
    |||||| |||| |||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||  | ||||| |||| || | |||||| ||||    
T  23392300 caccaaccgtgtcacgatttggcaaaacgtgacacaattttaacatctgaa-actgttatataagtgtttctttgcagttttttgaaggagagct-gaag 23392203  T
Q  354 tgagagaaacttgg-attacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
     ||||||||||||| | | ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23392202 agagagaaacttgggactgcaaaggagagaaatttagggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 23392106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 219 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 9636555 - 9636325
Alignment:
Q  219 ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatat 316  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| || ||  |||||||| |||||||||||| || |||| | |||||||    
T  9636555 ttttcaggataaggttggtcgtaccttggatcgtacgcatcaatcgtggcacgattggggaaaaacgtgacacgattttgac-gcagaaggcagctatat 9636457  T
Q  317 aagtgttcttgtgcagattttg--gagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgagga 413  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||| ||| | |||| ||||||||||| |||   ||||||| | |||||||||||| || |||||||    |||      
T  9636456 aagtgttctt-tgcagattttgaagagt-gagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagaaactttagggtttagggtctttgattagagtc 9636359  T
Q  414 tctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  9636358 tctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttgg 9636325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 135 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 6096328 - 6096203
Alignment:
Q  135 aggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggtt 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||  |  |||||| |||||||||    
T  6096328 aggcactgagcatggtttgcagggtgtccaattgtgacacgattttgggaaaacgtgacacgattttc-ggcttattggacaaattttcaggataaggtt 6096230  T
Q  235 ggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  6096229 ggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 6096203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 694 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 27026925 - 27026816
Alignment:
Q  694 tttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacac 792  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  27026925 tttcattgcttatctttgtgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtct-gtttttcttgttgttgcttggagacactttacac 27026827  T
Q  793 attgattacca 803  Q
    |||||||||||    
T  27026826 attgattacca 27026816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 694 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 27038270 - 27038161
Alignment:
Q  694 tttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacac 792  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||  ||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  27038270 tttcattgcttatctttgtgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatctagatct-gtttttgttgttgttgcttgaagacactttacac 27038172  T
Q  793 attgattacca 803  Q
    |||||||||||    
T  27038171 attgattacca 27038161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 43404512 - 43404301
Alignment:
Q  86 aagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacga--tttcccag-gcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgg 182  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||  |||   || || | |||||| |||| | || || ||||||||| |||||||||||    
T  43404512 aagaacagagaaatcgtgacacgatttcataagcctgtcacgatttttggtagtgccgagagcat-gttttctggatgttcaatcgtgacacgattttgg 43404414  T
Q  183 gaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg-ttttggaaaa 281  Q
    | ||||||||||||||||||   |||| || | | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||     
T  43404413 ggaaacgtgacacgattttc-ggcttgctgagcaagttttcaggataaggtcggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaaacgtgtcacgatttgggaaat 43404315  T
Q  282 cgtgccacgatttt 295  Q
    |||| |||||||||    
T  43404314 cgtgacacgatttt 43404301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 150 - 271
Target Start/End: Original strand, 34490687 - 34490807
Alignment:
Q  150 tttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggt 249  Q
    ||||||||||   |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   ||| ||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34490687 tttgcagggtatccaatcgtgacacgattttggaaaaacgtgacacgattttcgg-cttattgggcaagttttcaggataaggttggttgtaccttgggt 34490785  T
Q  250 cgtacgcaccaatcgtgccacg 271  Q
    |||||||||||| |||| ||||    
T  34490786 cgtacgcaccaaacgtgtcacg 34490807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 388 - 656
Target Start/End: Original strand, 28503664 - 28503939
Alignment:
Q  388 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacat--tgtaaacatcttgggtagtgag-atttcacca-ttggaatgatcaaaagttt 483  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||| | ||||  | |||||| |||| |||| ||    
T  28503664 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaatattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaagctt 28503763  T
Q  484 ccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgggtaa-cacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagttat- 579  Q
    ||| | ||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || ||| || ||||||||  ||||  || ||||||||||| ||||| | | ||      
T  28503764 cctctagtgacttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttattcttgtgtaaagcttgaaggctaga 28503862  T
Q  580 -tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
     |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  28503863 gtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctcttccccagattaggccatattgg 28503939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 98 - 277
Target Start/End: Original strand, 40912739 - 40912918
Alignment:
Q  98 attgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtt---tgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgaca 194  Q
    |||||||||||||||    | |||||||||||||  ||||||||||||||||||   || || ||  |||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  40912739 attgtgacacgatttgtgtaccgtgtcacgatttggcaggcagtgagcatggttccttgaagtgt--tcaatcgtgatacaattttgggaaaacgtgaca 40912836  T
Q  195 cgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg 277  Q
    ||||||||   ||||||||| | ||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  40912837 cgattttcgg-cttgttgggcaagttttctggataaggctggtcgtatcttggatcgtacgcaccaaacgtgtcacgatttgg 40912918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 242
Target Start/End: Original strand, 36018285 - 36018408
Alignment:
Q  119 cgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttg-cagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtac 217  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||  |||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||   |||| |||| ||    
T  36018285 cgtgtcacgattttctaggcagtgagcatattttttctgggtgctcaatcgtgacacgattttgggaaaacgtgacacaattttc-ggcttgctgggcac 36018383  T
Q  218 gttttcaagataaggttggtcgtac 242  Q
    ||||| | |||||||||||||||||    
T  36018384 gtttttaggataaggttggtcgtac 36018408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 43402491 - 43402377
Alignment:
Q  162 tcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 261  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||   |||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  43402491 tcaatcgtgacacgattttggagaaacgtgacacgattttcgg-cttgctgggcaagttttcaggataaggttggttgtatcttgggtcgtacgcaccaa 43402393  T
Q  262 tcgtgccacgttttgg 277  Q
     |||| |||| |||||    
T  43402392 acgtgtcacgatttgg 43402377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 76 - 336
Target Start/End: Original strand, 800707 - 800968
Alignment:
Q  76 tgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcac 174  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||   || |||| |||||||||   | || |||||| |||||||| ||||||  ||||||| |||    
T  800707 tgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagc-tggtttgcggggtgccaaatcgtgacac 800805  T
Q  175 gattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataagg-ttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgtt 273  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| | | || |||| || |||||||  |||||||  |||||| || |||||||||||||| ||||      
T  800806 gattgtgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggaatggtcgtttcttgggacgaacgcaccaatcgtgacacggc 800905  T
Q  274 ttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattt 336  Q
     |||||| |||| |||||||||  |||  || | ||  ||| |||||||||||||||| ||||    
T  800906 ctggaaatcgtgacacgattttatcagtagagggctaatatttaagtgttcttgtgcatattt 800968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 533 - 764
Target Start/End: Original strand, 4386869 - 4387106
Alignment:
Q  533 aaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctc 631  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| | |||||| |||||| ||| || ||||||||| ||||||||    
T  4386869 aaatgagtagaaattaggttttgttctt-tgtgagcttttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcacttttatcttattggattggagagctgctc 4386967  T
Q  632 tctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatc-ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatg 724  Q
    ||||||||| | ||||||||| || || |||||     | ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||| |  || |||| |||||    
T  4386968 tctcccccagagtaggtcatactgaactaaactgggtaaacaatctttgatgtgtttgttcc--tttctttcattgcttatctttattgttttgattatg 4387065  T
Q  725 cttgtggtgttgctctacactaagtc-taggtctatttttt 764  Q
    | ||||| |||| |||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  4387066 catgtggcgttgttctacattaagacttaggtctttttttt 4387106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 232
Target Start/End: Original strand, 26928078 - 26928258
Alignment:
Q  52 attgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacga-tttcccaggcagtgagcatggt 150  Q
    |||||||| | ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||   || |||| ||||| |||   | || |||||| ||||    
T  26928078 attgttgagatttggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgttatgccgtgagc-tggt 26928176  T
Q  151 ttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataagg 232  Q
    |||||||||||  ||||||| ||| || ||| | || |||||||||||||||||||||| | | || ||||||| |||||||    
T  26928177 ttgcagggtgccaaatcgtgacacaatcttgtggaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagttttcaggataagg 26928258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 388 - 634
Target Start/End: Original strand, 28501497 - 28501750
Alignment:
Q  388 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacatcttgggtagtga-gatttcacca-ttggaatgatcaaaagttt 483  Q
    |||| ||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||| || ||||  | |||||| |||| |||| ||    
T  28501497 agggatgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaagctt 28501596  T
Q  484 ccttttgtgtcttctc-tttagggttcattattgagagagt-gggtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgt-aagcttgcaagtt--a 578  Q
    ||| | ||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| || ||||||||  ||||  || ||||||||| ||||||| | | |  |    
T  28501597 cctctagtgacttctcttttagggttca-tattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttattcttgtgtaaagcttgaaggctaga 28501695  T
Q  579 ttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctct 634  Q
     |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  28501696 gtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct 28501750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 180
Target Start/End: Original strand, 24694655 - 24694775
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtct-gaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacga-tttcccaggcagtgagcatggtttgcagggt 159  Q
    |||||||| |||| |||||| | | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| | | |  ||||||||| ||||||||||    
T  24694655 attggcttcaaatttgtggttttggaagaacagagaaatcgtgatacgatttcatcaacgtgtcacgattttgcaatgtcgtgagcatgttttgcagggt 24694754  T
Q  160 gctcaatcgtgtcacgatttt 180  Q
    |  ||||||| ||||||||||    
T  24694755 gtccaatcgtatcacgatttt 24694775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Original strand, 22173184 - 22173258
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22173184 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 22173258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 712 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 1309816 - 1309724
Alignment:
Q  712 tgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  1309816 tgctttgtatttgcttgtggtgttgctctacacta-gactagggctgttttt-gttgttgttgcttgaagacactttacacatagattaccactt 1309724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 582 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 18656530 - 18656457
Alignment:
Q  582 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18656530 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 18656457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 584 - 745
Target Start/End: Original strand, 25929435 - 25929600
Alignment:
Q  584 ttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaactag----caatcttggtgt 678  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||| | |||||| ||||||||| |||| |    | ||||||||||    
T  25929435 ttgtaactcatttgtatcactttcatcttagtggattggagggctgctctc-cccccagagtaggtcgtattggaccgaactgggttaccatcttggtgt 25929533  T
Q  679 gtttgttcctttttctttcattgattatctgtg-tgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacact 745  Q
    |||||||  | |||||| | ||  |||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  25929534 gtttgtttttctttcttgc-tttcttatctttgttgctttgattatgtttgtggtgttgctctacact 25929600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 449
Target Start/End: Original strand, 32890998 - 32891074
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  32890998 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttg-attagggttctcttggggtgggaaacattgtaaacaccttgggt 32891074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 39153634 - 39153558
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39153634 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 39153558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 712 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 1417227 - 1417134
Alignment:
Q  712 tgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||||||| ||||||||||| || | ||||||||| || | ||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1417227 tgctttgattatgcttgtgatgctactctacacttagatttaggtctgtttt--gttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccactt 1417134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 372 - 447
Target Start/End: Original strand, 40735278 - 40735352
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | | | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  40735278 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttg-attaaagttctcttgggttaggaaacattgtaaacaccttgg 40735352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 715 - 806
Target Start/End: Original strand, 47924000 - 47924088
Alignment:
Q  715 tttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||    ||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  47924000 tttgttcatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggtctgttt----ttgttgttgcttggagacactttatccattgattaccactt 47924088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 32143928 - 32143870
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32143928 tgttgagatttggcttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcgtgacacgattt 32143870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 610 - 664
Target Start/End: Original strand, 38210565 - 38210619
Alignment:
Q  610 atagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  38210565 atagtggattggagagctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaact 38210619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 7782599 - 7782450
Alignment:
Q  188 cgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataagg-ttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgc 286  Q
    ||||||||||||| |||||||| | | || |||| || |||||||  ||||||| ||||||| || ||| |||||||||| |||| | |||||| ||||     
T  7782599 cgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtgccttgggacgaacgtaccaatcgtgacacgatctggaaatcgtga 7782500  T
Q  287 cacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattt 336  Q
    |||||||||  |||  || | ||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  7782499 cacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgtgcagattt 7782450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Original strand, 2672919 - 2672994
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  2672919 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg 2672994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Original strand, 2677075 - 2677150
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  2677075 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg 2677150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 8512314 - 8512239
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  8512314 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg 8512239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 8517194 - 8517119
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  8517194 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg 8517119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 32475580 - 32475507
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  32475580 ttcttgtaactctttgtaa-acattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg 32475507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 32480438 - 32480365
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  32480438 ttcttgtaactctttgtaa-acattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg 32480365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 336
Target Start/End: Original strand, 6716092 - 6716365
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggtttgcagggtg 160  Q
    |||| ||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    | |||| |||||||||   | || ||||||  |||| ||||||||    
T  6716092 attgtcttgaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctaggtt-gcagggtg 6716190  T
Q  161 ctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataagg-ttggtcgtaccttgggtcgtacgcacc 259  Q
    |  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  | ||||||| | | || || | |  |||||||  |||||||  ||||||| |||||  |     
T  6716191 caaaatcgtgtcacgattgtgggaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggtacg--cg 6716288  T
Q  260 aatcgtgccacgttttggaaaa-cgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattt 336  Q
     |||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||  ||||  |||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  6716289 gatcgtgacacgatttggaaaatcgtgacacgatttcaacagaggaagactagtata-aagtgttcttgtgcagattt 6716365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 18657022 - 18656972
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18657022 attggcttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcatgacacgattt 18656972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 112
Target Start/End: Original strand, 22172669 - 22172719
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22172669 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 22172719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 112
Target Start/End: Original strand, 27974433 - 27974491
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  27974433 tgttgaaatttggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 27974491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 435
Target Start/End: Original strand, 5373118 - 5373180
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtg-aggatctcttgggttgggaaacattg 435  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  5373118 caaaggaggtaactttaaggttgagagtctttg--gtgaaggttctcttgggttgggaaacattg 5373180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 449
Target Start/End: Original strand, 9581178 - 9581254
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||||| ||||||||||||| || |||||||    |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9581178 caaaggagttaactttagggttaagggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 9581254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 19684162 - 19684086
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||||| ||||||||||||| || |||||||    |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19684162 caaaggagttaactttagggttaagggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 19684086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 114
Target Start/End: Original strand, 8738549 - 8738601
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttca 114  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  8738549 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacatgatttca 8738601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 114
Target Start/End: Original strand, 9090787 - 9090839
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttca 114  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  9090787 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacatgatttca 9090839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 122
Target Start/End: Original strand, 47923327 - 47923387
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtg 122  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  47923327 attggcttcaaatttgtggtttgaaaaaacagagaaatcgtgacaaaatttcatcaacgtg 47923387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Original strand, 6718365 - 6718412
Alignment:
Q  151 ttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgat 198  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  6718365 ttgcagggtgcaaaatcgtgtcacgattgtgggaaatcgtgacacgat 6718412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 449
Target Start/End: Original strand, 29682295 - 29682330
Alignment:
Q  414 tctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29682295 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 29682330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 449
Target Start/End: Original strand, 44331481 - 44331516
Alignment:
Q  414 tctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44331481 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 44331516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 201
Target Start/End: Original strand, 3393292 - 3393330
Alignment:
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgatttt 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3393292 caatcgtgacacgattttgggaaatcgtgacacgatttt 3393330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 610 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 6063508 - 6063454
Alignment:
Q  610 atagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  6063508 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaact 6063454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 112
Target Start/End: Original strand, 28501159 - 28501209
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  28501159 attggcttcaaatttgtggcctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 28501209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 112
Target Start/End: Original strand, 28503326 - 28503376
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  28503326 attggcttcaaatttgtggcctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 28503376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 610 - 664
Target Start/End: Original strand, 50494194 - 50494248
Alignment:
Q  610 atagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  50494194 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaact 50494248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 111
Target Start/End: Original strand, 25637020 - 25637069
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatt 111  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  25637020 attgtctttaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgatt 25637069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 610 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 28413094 - 28413045
Alignment:
Q  610 atagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggacc 659  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  28413094 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggacc 28413045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 445; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 147 - 806
Target Start/End: Original strand, 36398 - 37061
Alignment:
Q  147 tggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttg 246  Q
    ||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36398 tggtttgcagggtgtcaaatcgtggcacgattttgtgaaaacgtgacacaattttcaaacttgctgggtacgttttcaggataaggttggtcgtaccttg 36497  T
Q  247 ggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagag 346  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  36498 ggtcgtacgcaccaatcatggcacgatttggaaaacgtggcacgattttatcagctgaagactgctataaaagtgttcttgtgcagattttgaaggagag 36597  T
Q  347 cttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttg 446  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  36598 cttgaagagagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttg 36697  T
Q  447 ggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaat 546  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36698 ggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaagcttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggaaacacaaatgggtagaaat 36797  T
Q  547 taggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattag 646  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||| | |||||    
T  36798 catgtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtgggttggcgagctgctctcttccctagattag 36897  T
Q  647 gtcatattggaccaaact-----agcaatc--ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctc 739  Q
    ||||||||||||| ||||     | |||||  ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  36898 gtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcc--tttcttttattgcttatctttgtgctttgtttatacttgtggtgttggtc 36995  T
Q  740 tacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36996 tacaccaagtctaggtct-gtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccactt 37061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 147 - 806
Target Start/End: Original strand, 43527 - 44188
Alignment:
Q  147 tggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttg 246  Q
    |||||| |||||||   |||||||  ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43527 tggtttacagggtgtcaaatcgtggtacgattttgtgaaatcgtgacatgattttcaaacttgctggttaagttttcaggataaggttggtcgtaccttg 43626  T
Q  247 ggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagag 346  Q
    ||||||| | | |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  43627 ggtcgtatgtatcaatcgtggcacgatttggaaaacgtggcacgattttatcagctgaatactgctatataagtgtttttgtgcagattttggaggagag 43726  T
Q  347 cttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttg 446  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43727 ctggaagagagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatcttttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 43826  T
Q  447 ggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaat 546  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  43827 ggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaagcttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagagtggaacacaaatgggtagaaat 43926  T
Q  547 taggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattag 646  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  43927 taggtcttgttcttgtataagcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagaatag 44026  T
Q  647 gtcatattggaccaaact-----agcaatc--ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctc 739  Q
     |||||||||||| ||||     | |||||  ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44027 atcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcc---ttctttcattgcttatctttgttctttgtttatgcttgtggtgttgctc 44123  T
Q  740 tacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||||| ||  |||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44124 tacact-agattaggtct-gtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccactt 44188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 36322 - 36382
Alignment:
Q  52 attgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||    
T  36322 attgttgaaaattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcatgatacgattt 36382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 440; Significance: 0; HSPs: 98)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 63 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 4456624 - 4455896
Alignment:
Q  63 ttggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttg-cagggtgc 161  Q
    ||||||| |||| |||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  ||||||||    
T  4456624 ttggcttcaaatttgtggtttggaagaacaaagaaatcgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgattttc-aggcagggagcatggtttctcagggtgc 4456526  T
Q  162 tcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 261  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  4456525 tcaatcgtgtcacgaatttgggaaaacgtgacgtgattttcaaacttgctgaatacgttttcacgataaggttggtcgtattttgggtcgtacgcactaa 4456426  T
Q  262 tcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaa 361  Q
    | |||||||                   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  4456425 ttgtgccac-------------------gattttgacagctgaagacggctatataagtgttcttgtgcagattttgaagaagagcttgaagagagagaa 4456345  T
Q  362 acttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttca 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4456344 acttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctctgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttca 4456245  T
Q  462 ccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttg 561  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4456244 ccattagaaggatcaaaagcttccttttgtgtcttctctttagggttcatcattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattatgtcttgttcttg 4456145  T
Q  562 tgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaa 661  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  4456144 tgtaagcttgccagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggaccga 4456045  T
Q  662 ac-----tagcaatc--ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaagtctagg 754  Q
    ||      |||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  4456044 accgggtcagcaatcttttggtgtgtttgttcc--tttctttcattgcttatctttgtgctttgtttatgcttgttgtgttgctctacactaagtccagg 4455947  T
Q  755 tctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||  |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4455946 tct-gtttttgctgttgttgcttggagacactttacacattgattaccactt 4455896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 806
Target Start/End: Original strand, 5701958 - 5702712
Alignment:
Q  61 aattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggttt-gcagggt 159  Q
    ||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| | || | ||||||||||||| |||||||    
T  5701958 aattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgatttcatcaacgtgtcttgattttctagacggtgagcatggttttgcagggt 5702057  T
Q  160 gctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcacc 259  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  5702058 gctcaatcgtgtcacgattttggaaaaacgtgacacgattttcaaacttgctgggtacattttcaggataaggttggtcgtaccttggattgtacgcacc 5702157  T
Q  260 aatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgaga 358  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||    
T  5702158 aatcgtgtcacgatttggcaaaacgtgtcacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgaagagaga 5702257  T
Q  359 gaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatt 458  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  5702258 gaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttgggtagtgagatt 5702357  T
Q  459 tcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtg-tcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttg 555  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||| |||    
T  5702358 tcaccattggaatgatcaaaaagcttccttttgtgtttttctc-ttaggattcattattgagagtgtgggtgactcaaaatgggtagaaattaggttttg 5702456  T
Q  556 ttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatatt 654  Q
     ||||||||||||||  ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5702457 ctcttgtgtaagcttataagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcataggggattggagggatgctctctcccccatattaggtcatatt 5702556  T
Q  655 ggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag 748  Q
    ||||| ||||     | |||||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||||| |  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  5702557 ggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tttccttcatagcttatctctattgctttaattatgcttgtggtgatgctctacacttag 5702654  T
Q  749 -tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
     |||||||||  ||||||||||| ||||  ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5702655 atctaggtct-gtttttgttgttgttgctaggagacactttattcattgattaccactt 5702712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 119 - 795
Target Start/End: Original strand, 19175270 - 19175971
Alignment:
Q  119 cgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttg-cagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtac 217  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  19175270 cgtgtcacgattttc-aggcagggagcatggtttctcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacatgattttcaaacttgctgggtac 19175368  T
Q  218 gttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattt-------------------tgac 298  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||                   ||||    
T  19175369 gttttcaggataaggttggttataccttgggtcgtatgcaccaatcgtgccacgatttggaaaacgtgatacgatttggaaaacgtgatacgattttgac 19175468  T
Q  299 agctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtaga---gcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttga 395  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| || |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19175469 agctgaagactgttatataagtgttcttgtacagtttttgaaggagatcagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttga 19175568  T
Q  396 gtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtct 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19175569 gtgtctttgtagtgaggatctcttggattgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcactattggaaggatcaaaagtttccttttgtgtct 19175668  T
Q  496 tctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagtta-ttttcttgtaactctt 594  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  19175669 tctc-ttagggttcatcattgagagagtgggaaacacaaatgtgtagaagttaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaggctatttttcttgtaactctt 19175767  T
Q  595 tgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaactag-----caatc--ttggtgtgtttgttcc 687  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||     |||||  || |||||||||||||    
T  19175768 tgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctttttgtgtgtttgttcc 19175867  T
Q  688 tttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactt 787  Q
      |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||| |||||||||||    
T  19175868 --tttctttcattgcttatctttgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaagtctaggtc--tgctttgttgttgttgcttggagacactt 19175963  T
Q  788 tacacatt 795  Q
    ||||||||    
T  19175964 tacacatt 19175971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 7412952 - 7412205
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatt-tcccaggcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||||| ||| ||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||   || |||| ||||||| |   | || |||||| ||||||    
T  7412952 tgttgaaatttgacttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgattctgtaatgccgtgagc-tggttt 7412854  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgt 252  Q
    ||||||||   |||||||  || |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |            
T  7412853 gcagggtgtcaaatcgtggtacaattttgtgaaatcgtgacacgattttcaaacttgctggttaagttttcaggataacgttggtcgtacgt-------- 7412762  T
Q  253 acgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaa 352  Q
        | ||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  7412761 ----atcaatcatggcacgatttggaaaacgtggcacgattttatcagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaa 7412666  T
Q  353 gtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagt 452  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7412665 gagagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagt 7412566  T
Q  453 gagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtc 552  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7412565 gagatttcaccattgaaaggatcaaaagcttccttttatgtcttctc-ttagggttcattattgagagagtgggaaacacaaatgggtagaaattaggtc 7412467  T
Q  553 ttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcata 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7412466 ttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcata 7412367  T
Q  653 ttggaccaaactag--caa------tcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacac 744  Q
    ||||||| |||| |  |||      || |||||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7412366 ttggaccgaactgggtcaacaattttcatggtgtgtttgttcc---ttctttcattgcttatctttgttctttgtatatgcttgtggtgttgctctacac 7412270  T
Q  745 taagtctaggtc----tattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    | || |||||||    | |||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7412269 t-agactaggtctgtttttttttttttttttttgcttggagacactttacacattcattaccactt 7412205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 227 - 806
Target Start/End: Original strand, 23799221 - 23799807
Alignment:
Q  227 ataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgga-aaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttct 325  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23799221 ataaggttggtcgtacgttgggtcgtacgcaccaattgtgtcacgatttggacaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttct 23799320  T
Q  326 tgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttg 425  Q
    |||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23799321 tgtgcatattttgaaggatagcttgaagagagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttg 23799420  T
Q  426 ggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtg 524  Q
    || ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||| ||||| || ||||    
T  23799421 gggaacattgtaaacaccttgagtagggagatttcaccattggaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttc-ccttaggattca-tattgtgacagtg 23799518  T
Q  525 ggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattgga 622  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23799519 ggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgtaagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattgga 23799618  T
Q  623 tagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctt 716  Q
      |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||     | |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |  |||||    
T  23799619 gggctgctctctcctccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tttctttcattgcttatctctattgctt 23799716  T
Q  717 tgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    || ||||| |||||||  | ||||||||| || |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||   |||||||| |||||    
T  23799717 tgattatgtttgtggtacttctctacacttagatctaggtctattttttgttgttgtttcttggagacactttatctattgattaacactt 23799807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 203 - 789
Target Start/End: Original strand, 4696249 - 4696808
Alignment:
Q  203 aaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagct 302  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   ||||| ||||||||||||||||    
T  4696249 aaacttgttgggcacgttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa-------------------acgtgacacgattttgacagct 4696329  T
Q  303 gaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctt 402  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4696330 gaagaccgttatataagggttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttggattacaaaggagataactttagggttgagtgtctt 4696429  T
Q  403 tgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaa-gtttccttttgtgtcttctctt 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  4696430 tgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaaagatcaaaaagcttccttttgtgttttctctt 4696529  T
Q  502 tagggttcattattgagagagtgggtaacacaaa-tgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaac 600  Q
     ||| |||| |   ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||||             
T  4696530 -aggattcaat---gagagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgcgtaagcttataagctaatttcttgtaact--------- 4696616  T
Q  601 actttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctt 695  Q
     |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||     | ||||||||||||||||||||   ||||||    
T  4696617 -ctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttc--atttctt 4696713  T
Q  696 tcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacacttta 789  Q
    |||||| |||||| |  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || | || ||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  4696714 tcattgcttatctttattgctttgattatgtttgtggtgttgctctacacttagatttatgtct-gtttttgttgttgttgcttggagacacttta 4696808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 51 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 26288520 - 26287771
Alignment:
Q  51 tattgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatgg 149  Q
    ||||||||| | ||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||   || |||| || |||||    | || |||||| |||    
T  26288520 tattgttgagacttgacttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacatgattttgtgatgccgtgagc-tgg 26288422  T
Q  150 tttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggt-tggtcgtaccttggg 248  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||| | | || |||| || |||||||  ||||||||||||| |    
T  26288421 tttgcagggtgccaaatcgtgacacaatcttgggaaatcgtgacacaattttcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgtg 26288322  T
Q  249 tcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagct 348  Q
     ||||||  ||||| ||| ||||   |||||| |||| |||||||||  |||  |||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26288321 acgtacgttccaatagtgtcacgacctggaaatcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattttggagaagagct 26288222  T
Q  349 tgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacatcttg 446  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||    
T  26288221 t--agagagagaaacttggattacaaaggggggaactctagggttgaatgtctttgtagagagaatctcttgagttgggaaaaacattgtaaacaccttg 26288124  T
Q  447 ggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctc-tttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaa 545  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26288123 ggtagtgagatttcaccattggaaggatctaaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttca-tattgtgagagtggggaacacaaatgggtagaaa 26288025  T
Q  546 ttaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatatta 645  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||        || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  26288024 ctaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt--------tc-ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagatta 26287934  T
Q  646 ggtcatattggaccaaact-----agcaatc---ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatc-tgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttg 736  Q
    || |||||||| |  ||||     | |||||   |||||||||||||||   || ||||| ||| ||||| ||  |||||||| | ||||||||||||||    
T  26287933 ggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc---ttcctttc-ttgcttatcttggttgctttgtatttgcttgtggtgttg 26287839  T
Q  737 ctctacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||||||||| || ||||| ||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26287838 ctctacact-agactagggct-gtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccactt 26287771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 51 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 26313771 - 26313022
Alignment:
Q  51 tattgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatgg 149  Q
    ||||||||| | ||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||   || |||| || |||||    | || |||||| |||    
T  26313771 tattgttgagacttgacttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacatgattttgtgatgccgtgagc-tgg 26313673  T
Q  150 tttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggt-tggtcgtaccttggg 248  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||| | | || |||| || |||||||  ||||||||||||| |    
T  26313672 tttgcagggtgccaaatcgtgacacaatcttgggaaatcgtgacacaattttcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgtg 26313573  T
Q  249 tcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagct 348  Q
     ||||||  ||||| ||| ||||   |||||| |||| |||||||||  |||  |||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26313572 acgtacgttccaatagtgtcacgacctggaaatcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattttggagaagagct 26313473  T
Q  349 tgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacatcttg 446  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||    
T  26313472 t--agagagagaaacttggattacaaaggggggaactctagggttgaatgtctttgtagagagaatctcttgagttgggaaaaacattgtaaacaccttg 26313375  T
Q  447 ggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctc-tttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaa 545  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26313374 ggtagtgagatttcaccattggaaggatctaaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttca-tattgtgagagtggggaacacaaatgggtagaaa 26313276  T
Q  546 ttaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatatta 645  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||        || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  26313275 ctaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt--------tc-ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagatta 26313185  T
Q  646 ggtcatattggaccaaact-----agcaatc---ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatc-tgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttg 736  Q
    || |||||||| |  ||||     | |||||   |||||||||||||||   || ||||| ||| ||||| ||  |||||||| | ||||||||||||||    
T  26313184 ggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc---ttcctttc-ttgcttatcttggttgctttgtatttgcttgtggtgttg 26313090  T
Q  737 ctctacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||||||||| || ||||| ||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26313089 ctctacact-agactagggct-gtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccactt 26313022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 51 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 26301777 - 26301180
Alignment:
Q  51 tattgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatgg 149  Q
    ||||||||| | ||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||   || |||| || |||||    | || |||||| |||    
T  26301777 tattgttgagacttgacttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacatgattttgtgatgccgtgagc-tgg 26301679  T
Q  150 tttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggt-tggtcgtaccttggg 248  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||| | | || |||| || |||||||  ||||||||||||| |    
T  26301678 tttgcagggtgccaaatcgtgacacaatcttgggaaatcgtgacacaattttcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgtg 26301579  T
Q  249 tcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagct 348  Q
     ||||||  ||||| ||| ||||   |||||| |||| |||||||||  |||  |||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26301578 acgtacgttccaatagtgtcacgacctggaaatcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattttggagaagagct 26301479  T
Q  349 tgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacatcttg 446  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||    
T  26301478 t--agagagagaaacttggattacaaaggggggaactctagggttgaatgtctttgtagagagaatctcttgagttgggaaaaacattgtaaacaccttg 26301381  T
Q  447 ggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctc-tttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaa 545  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26301380 ggtagtgagatttcaccattggaaggatctaaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttca-tattgtgagagtggggaacacaaatgggtagaaa 26301282  T
Q  546 ttaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatatta 645  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||        || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  26301281 ctaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt--------tc-ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagatta 26301191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 370 - 806
Target Start/End: Original strand, 26403015 - 26403459
Alignment:
Q  370 tacaaaggaggtaacttt-agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttg--ggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccatt 466  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26403015 tacaaaggaggtaacttttagggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccatt 26403114  T
Q  467 ggaatgatcaaaa-gtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaa-tgggtagaaattaggtcttgttcttgtgt 564  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| | | ||||| |||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  26403115 ggaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttctctt-atgattcat-attgtgagagtgagtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgc 26403212  T
Q  565 aagcttgcaagttattttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaac 663  Q
    ||||||| ||| || |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  26403213 aagcttgtaagctaatttcctataactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaac 26403312  T
Q  664 t-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtc 756  Q
    |     | ||||||||||||||||||||||  |  |||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  26403313 tgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctcgt--tttcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtc 26403410  T
Q  757 tattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||    
T  26403411 t-gtttttgttgttattgcttggagacacattatctattgattaccactt 26403459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 391 - 806
Target Start/End: Original strand, 31071035 - 31071457
Alignment:
Q  391 gttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttt 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||| |    
T  31071035 gttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatcttaagcttcctct 31071134  T
Q  489 tgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgggtaa-cacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatttt-ctt 585  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  31071135 tgtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttttctt 31071233  T
Q  586 gtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatc---ttggtg 677  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     | |||||   ||||||    
T  31071234 gtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaacaatctttttggtg 31071333  T
Q  678 tgtttgttcctttttctttcattgattatc-tgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcc 776  Q
    |||||||||   || ||||| ||| ||||| ||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||| ||||     
T  31071334 tgtttgttc---ttcctttc-ttgcttatcttggttgctttgtatttgcttgtggtgttgctctacact-agactagggct-gtttttgttgttgttgct 31071427  T
Q  777 tggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31071428 tggagacactttacacatagattaccactt 31071457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 355 - 806
Target Start/End: Original strand, 19752168 - 19752622
Alignment:
Q  355 gagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtga 454  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19752168 gagagaaacttggatcgcaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttgtgaaatattgtaaacaccttgggtagtga 19752267  T
Q  455 gatttcaccattggaatgatcaaaa-gtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac---aaatgggtagaaattagg 550  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| | ||||||| |||| ||||||| ||| ||||||   ||||| |||||| | |    ||||||||||||||||||    
T  19752268 gatttcatcattggaaggatcaaaaagcttccttt-gtgttttctctt-aggattcatt---gagagtgtgggtgatatgaaaaatgggtagaaattagg 19752362  T
Q  551 tcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatttt-cttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtc 649  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||    
T  19752363 acttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccctagactaggtc 19752462  T
Q  650 atattggaccaaactag-----caatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctaca 743  Q
    |||||||||| ||||||     |||||||||||||||||||||  | |||||||||  |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  19752463 atattggaccgaactaggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tctctttcattacttatctctattgctttgattatgcttgtggtgttgcactaca 19752560  T
Q  744 ctaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    || || | ||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  19752561 cttagatttaggtc--tgttttgttgttgttgcttggagacactttatatattgattaccactt 19752622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 370 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 6127533 - 6127087
Alignment:
Q  370 tacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttg--ggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattg 467  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6127533 tacaaaagagataacttgagggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaacattgtaaacattttgggtagtgagatttcaccattg 6127434  T
Q  468 gaatgatcaaaa-gtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaa-tgggtagaaattaggtcttgttcttgtgta 565  Q
    ||| |||||||| | || ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6127433 gaaggatcaaaaagctttcttttgtgttttctctt-aggattcattattgagagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttttgta 6127335  T
Q  566 agcttgcaagttattttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6127334 agcttataagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctcttccccaaattaggtcatattggaccgaact 6127235  T
Q  665 -----agcaat-cttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacac-taagtctaggtc 756  Q
         | ||||  ||| |||||||||||   | |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||  ||    
T  6127234 gagtcaacaatatttgatgtgtttgttc--atctctttcattgcttatctttagtgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttaaatttatatc 6127137  T
Q  757 tattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  6127136 tgttttttgttgttgttgcttggagacacttaatctattgattaccactt 6127087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 149 - 656
Target Start/End: Original strand, 1261509 - 1262029
Alignment:
Q  149 gtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggt-tggtcgtaccttgg 247  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | | || || | |  |||||||  ||||| ||||||||    
T  1261509 gtttgcagggtgccaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgg 1261608  T
Q  248 gtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataa-gtgttcttgtgcagattttggagtagag 346  Q
    | | ||||  | ||||||| |||| | |||||| |||| |||||||||  |||  |||| ||  ||| ||| ||||||||||||   ||||| || ||||    
T  1261609 gacatacgttcaaatcgtgacacgatctggaaatcgtgacacgattttatcagaggaaggctagtatttaaagtgttcttgtgctt-ttttgaaggagag 1261707  T
Q  347 cttgaa--------gtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgt 436  Q
    |||| |        | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  1261708 cttggaagagcttagagagagaaacttggattacaaaggagggaactctagggttgagtgtctttgtagagagggtctcttgggttgggaaaaacattgt 1261807  T
Q  437 aaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgggtaa-cacaa 534  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || |||||    
T  1261808 aatcaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatctaaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacaa 1261906  T
Q  535 atgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatttt-cttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctc 633  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1261907 atgggtagaatctaggtcttgtacttgtgtaagcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctc 1262006  T
Q  634 tcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  1262007 tcccccagattaggtcatattgg 1262029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 117 - 449
Target Start/End: Original strand, 15212425 - 15212757
Alignment:
Q  117 aacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggttt-gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggt 215  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || |     
T  15212425 aacgtgtcacgattttctaggcagtgagcatggttttgcagggtgtccaatcgtgacacgattttgggaaaacgtgacacgattttcgg-cttgctgagc 15212523  T
Q  216 acgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg-ttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctat 314  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15212524 aagttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaaacgtgtcacgatttaggaaaatgtgacacgattgtgacagctgaagactgctat 15212623  T
Q  315 ataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgagga 413  Q
    |||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||   |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |   |     
T  15212624 ataagtgttctt-tacagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaatgaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagt 15212721  T
Q  414 tctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15212722 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 15212757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 216 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 3051584 - 3051162
Alignment:
Q  216 acgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgt-tttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||  ||||| || |||| ||| ||||||| ||||| ||| | ||||    
T  3051584 acgttttcaagataaggttggtcgtacattgggtcgtatgcatcaatcgtgacacgaatttggcaatcgtgacacaattttgatagctgcagagtactat 3051485  T
Q  315 ataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttgg-attacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgagga 413  Q
    |||||||||  | ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  3051484 ataagtgtttctatgcagattttgaaagagagcttgaagagagagaaacttgggactataaaggagagaactttagggttgagtgtctttgtagtggggt 3051385  T
Q  414 tctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcatt 512  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  ||||| ||||| |||       
T  3051384 tctcttgagttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaaagatcaaaaagcttccttttgtgctttctc-ttaggattc--- 3051289  T
Q  513 attgagagagtgggtaac---acaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcat 608  Q
    |||||||| ||  || ||   | |||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||   | | || ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  3051288 attgagagtgtaagtgacatgaaaaatgggtagaaattaagttttgttctt-tgtgagctcttatgctaatttcttgtaactcatttgtatcactttcat 3051190  T
Q  609 catagtggattggatagctgctctctcc 636  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||    
T  3051189 cttagtggattggagaggtgctctctcc 3051162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 140 - 449
Target Start/End: Original strand, 43036086 - 43036394
Alignment:
Q  140 gtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcg 239  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| |||    
T  43036086 gtgagcatgttttgcagggtgtccaatcgtgacacgattttggaaaaacgtgacacgattttc-gacttgttgggcaagttttcaggataaggttgatcg 43036184  T
Q  240 taccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg-ttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttg 338  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  43036185 taccttggatcgtacgcaccaaacgtgtcacgatttgggaaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgttatataagtgttctt-tgcagattttg 43036283  T
Q  339 gagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgta 437  Q
     |  |||| |||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |   | ||||||||||||||||||||||||    
T  43036284 aatgagaggttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgta 43036382  T
Q  438 aacatcttgggt 449  Q
    |||| |||||||    
T  43036383 aacaccttgggt 43036394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 140 - 441
Target Start/End: Original strand, 30143005 - 30143305
Alignment:
Q  140 gtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcg 239  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||  | ||||| | ||||||||||||||    
T  30143005 gtgagcatgttttgcagggtgtccaatcgtgacacgattttgggaaaatgtgacacgattttcgg-cttgctggacaagttttaaggataaggttggtcg 30143103  T
Q  240 taccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttg 338  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  30143104 tactttgggtcgtacgcaccaaccgtgtcacgatttggcaaaacgtgacacgattttgacaactgaagactgctatataagtgttctt-tgtagattttg 30143202  T
Q  339 gagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgta 437  Q
     || ||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |   | ||||||||||||||||||||||||    
T  30143203 aaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgta 30143301  T
Q  438 aaca 441  Q
    ||||    
T  30143302 aaca 30143305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 355 - 656
Target Start/End: Original strand, 4759841 - 4760150
Alignment:
Q  355 gagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa---cattgtaaacatcttgggtag 451  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||   |||||||| || |||||||||    
T  4759841 gagagaatcttggattgcaaaggaggtaaccaaagggttgagtgtctttgtagagagagtctcttgggttgggaaaaaacattgtaatcaccttgggtag 4759940  T
Q  452 tgag-atttcacca-ttggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgggtaa-cacaaatgggtagaaatt 547  Q
    |||| | ||||  | |||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || |||| ||||||||||  |    
T  4759941 tgaggagttcattagttggaaggatctaaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatct 4760039  T
Q  548 aggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatatta 645  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | | ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4760040 agggcttgttcttgtgtaagcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccatatta 4760139  T
Q  646 ggtcatattgg 656  Q
    || ||||||||    
T  4760140 ggccatattgg 4760150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 355 - 656
Target Start/End: Original strand, 33037575 - 33037881
Alignment:
Q  355 gagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacatcttgggtagt 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||    
T  33037575 gagagaaacttggattacaaaggagggaaccaaagggttgagtgtcttcgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagt 33037674  T
Q  453 gag-atttcacca-ttggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaa-cacaaatgggtagaaattag 549  Q
    ||| | ||||  | |||||| |||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||| ||||||||||  |||    
T  33037675 gaggagttcattagttggaaggatctaaagcttcctctagtgtcttctctttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctag 33037773  T
Q  550 gtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattagg 647  Q
    |  ||||||||||||||||||| | | ||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33037774 ggtttgttcttgtgtaagcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattagg 33037872  T
Q  648 tcatattgg 656  Q
     ||||||||    
T  33037873 ccatattgg 33037881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 355 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 36979706 - 36979399
Alignment:
Q  355 gagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa-cattgtaaacatcttgggtagtg 453  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  36979706 gagagaaacttggattacaaagaagggaaccaaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttaggttgggaaaacattgtaatcaccttgggtagtg 36979607  T
Q  454 ag-atttcacca-ttggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgggtaa-cacaaatgggtagaaattag 549  Q
    || | ||||  | |||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || ||| || ||||||||  |||    
T  36979606 aggagttcattagttggaaggatctaaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctag 36979508  T
Q  550 gtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattagg 647  Q
    |  ||||||||||||||||||| | | ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  36979507 ggtttgttcttgtgtaagcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagg 36979408  T
Q  648 tcatattgg 656  Q
     ||||||||    
T  36979407 ccatattgg 36979399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 163 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 12703121 - 12702837
Alignment:
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaat 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  | | | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  12703121 caatcgtgacacgattttgggaaaacgtgacacgattttcag-cttgctaagcaagctttcaggataaggttggtcgtacattgggtcgtacgcaccata 12703023  T
Q  263 cgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagaga 360  Q
    |||| |||| |||||  |||||||| |||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||| ||||||    
T  12703022 cgtgtcacgatttgggaaaaacgtgacacgattttgacagttgaagattgttatgtaagtgttctt-tgcatattttgaaggagagcttgaagagagaga 12702924  T
Q  361 aactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    ||||| |||   |||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |   | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12702923 aacttgggaaatcaaaggaggtaaatttagggttgagggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 12702837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 154 - 449
Target Start/End: Original strand, 4731335 - 4731629
Alignment:
Q  154 cagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgta 253  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||   |||| |||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4731335 cagggtgtccaatcgtgacacgattttgggaaaacatgacatgattttcgg-cttgctggacacgttttcagaataagattggtcgtaccttgggccgta 4731433  T
Q  254 cgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaa 352  Q
     |||||||  ||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| || || | |||||    
T  4731434 ggcaccaactgtgtcacgatttggcaaaacgtgacacgattttgatagctgaagactactatataagtgttctt-tgtagattttgaaggagcggttgaa 4731532  T
Q  353 gtgagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    | |||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |   | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4731533 gagagagaaacttgaaaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 4731629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 361 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 30655970 - 30655668
Alignment:
Q  361 aacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacatcttgggtagtgag-at 457  Q
    ||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| |     
T  30655970 aacttggataacaaaggagggaaccaaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggag 30655871  T
Q  458 ttcacca-ttggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgggtaa-cacaaatgggtagaaattaggtctt 554  Q
    ||||  | |||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || ||| || ||||||||  ||||  ||    
T  30655870 ttcattagttggaaggatctaaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggttt 30655772  T
Q  555 gttcttgtgtaagcttgcaagttatt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcata 652  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  30655771 gttcttgtgtaagcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattagattggagagctgctctctcccccagattaggccata 30655672  T
Q  653 ttgg 656  Q
    ||||    
T  30655671 ttgg 30655668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 356 - 656
Target Start/End: Original strand, 10688908 - 10689218
Alignment:
Q  356 agagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacatcttgggtagtg 453  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||    
T  10688908 agagaaacttggataacaaaggagggaaccaaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtg 10689007  T
Q  454 ag-atttcaccatt---ggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgggtaac--acaaatgggtagaaat 546  Q
    || | ||||  | |   || | |||| |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||   ||| ||||||||||      
T  10689008 aggagttcattagttgggggaggatctaaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacaacatatgggtagaatc 10689106  T
Q  547 taggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatatt 644  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | | ||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  10689107 tagggcttgttcttgtgtaagcttgaaggctattgtttcttgtaaccctctgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagatt 10689206  T
Q  645 aggtcatattgg 656  Q
    ||| ||||||||    
T  10689207 aggccatattgg 10689218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 221 - 449
Target Start/End: Original strand, 33351893 - 33352121
Alignment:
Q  221 ttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataag 319  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33351893 ttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcatacgcaccaaacgtgtcatgatttgggaaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataag 33351992  T
Q  320 tgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctct 418  Q
    | ||||| |||| |||||| ||  ||| | |||| ||||||||||| |||   ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |   | |||||    
T  33351993 ttttctt-tgcaaattttgaaggtgaggtggaagagagagaaacttgggaaatcaaagaaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagttctct 33352090  T
Q  419 tgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33352091 tgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 33352121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 355 - 657
Target Start/End: Original strand, 18870328 - 18870638
Alignment:
Q  355 gagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacatcttgggtagt 452  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||   |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||    
T  18870328 gagagaaacatggataacaaaggagggaaccaaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagt 18870427  T
Q  453 gag-atttcacca-ttggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgggtaac-acaaatgggtagaaatta 548  Q
    ||| | ||||  | |||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||  || || ||||||||  ||    
T  18870428 gaggagttcattagttggaaggatctaaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatcta 18870526  T
Q  549 ggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatt--ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatatta 645  Q
    ||  ||||||||||||||||||| | | ||||  |||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18870527 gggtttgttcttgtgtaagcttgaatgctattgtttcttgtaacccttttgtaacactttcattatattggattggagagctgctctctcccccagatta 18870626  T
Q  646 ggtcatattgga 657  Q
    || |||||||||    
T  18870627 ggccatattgga 18870638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 172 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 34254802 - 34254569
Alignment:
Q  172 cacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacg-ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccac 270  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||| |||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  34254802 cacgattttgggaaatcgtgacacgatttttgga-ttgctgggcaagattttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcatcaatcgtggcac 34254704  T
Q  271 gttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-gg 367  Q
    | || ||  |||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  34254703 gattggggaaaaacgtgacacgatttcgac-gctgaagattgctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttggg 34254606  T
Q  368 attacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttg 404  Q
    |   ||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  34254605 aaatcaaaggaggcaactttagggtttagggtctttg 34254569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 343 - 664
Target Start/End: Original strand, 5990324 - 5990643
Alignment:
Q  343 agagcttgaagtgagagaaacttggat-tacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaaca 441  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5990324 agagctagaagagagagaaacttggaaatacaaagacggtaactttagggttgagtgtcttt--agtgaggttctcttgggttgggaaacattgtaatca 5990421  T
Q  442 tcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaac---acaaatg 537  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||| | || ||||| || |||| |||| ||||| ||||| |||   ||||| || |||||| ||   | |||||    
T  5990422 tcttggtttgtgagatttcaccattcgaaaggtcaaaaagctttctttagtgttttctc-ttaggattc---attgaaagtgtgggtgacttgaaaaatg 5990517  T
Q  538 ggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaac-tctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcc 636  Q
    |||  |||| ||||| ||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  |||||| ||| |||||||||    
T  5990518 ggtgaaaatgaggtcgtgttctt-tgtgagcttttaagctaatttcttgtaacatctttgtatcactttcatcttagt-aattggagagccgctctctcc 5990615  T
Q  637 cccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    |||| | || ||||||||||||||||||    
T  5990616 cccacaatatgtcatattggaccaaact 5990643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 226 - 447
Target Start/End: Original strand, 17982401 - 17982622
Alignment:
Q  226 gataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| || ||  |||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  17982401 gataaggttggtcgtaccttggatcgtacgcatcaatcgtggcacgattggggaaaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgtt 17982499  T
Q  324 cttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttggg 422  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||| | |||||||||||| || ||||||| | |   | |||||||||    
T  17982500 ctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggtctttg-attagagttctcttggg 17982597  T
Q  423 ttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  17982598 ttgggaaacattgtaaacaccttgg 17982622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 163 - 447
Target Start/End: Original strand, 31217942 - 31218226
Alignment:
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacg-ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 261  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||| | | |||| | |||||||||||||||||||||| || |||||| |||    
T  31217942 caattgtgacacgattttgggaaatcgtgacacgatttttgg-cttgttgggcaagatttttaggataaggttggtcgtaccttggatcatacgcatcaa 31218040  T
Q  262 tcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagag 359  Q
    ||||| |||| || ||  |||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  31218041 tcgtgacacgattgggaaaaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctt-tgtagattttgaagaagagcttgaagagagag 31218138  T
Q  360 aaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    |||||| |||   ||||||| | |||||||||||| || ||||||| | |   | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31218139 aaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 31218226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 355 - 656
Target Start/End: Original strand, 18852934 - 18853243
Alignment:
Q  355 gagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacat--tgtaaacatcttgggtagt 452  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||    
T  18852934 gagagaaacttggataacaaaggagggaaccaaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaatattgtaatcaccttgggtagt 18853033  T
Q  453 gag-atttcacca-ttggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgggtaac-acaaatgggtagaaatta 548  Q
    ||| | ||||  | |||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||  || || ||||| ||  ||    
T  18853034 gaggagttcattagttggaaggatctaaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaataccaaagggtaaaatcta 18853132  T
Q  549 ggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatt--ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatatta 645  Q
    ||  ||||||||||||||||||| | | ||||  |||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18853133 gggtttgttcttgtgtaagcttgaatgctattgtttcttgtaacccttttgtaacactttcattatattggattggagagctgctctctcccccagatta 18853232  T
Q  646 ggtcatattgg 656  Q
    || ||||||||    
T  18853233 ggccatattgg 18853243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 343 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 28307898 - 28307575
Alignment:
Q  343 agagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaaca 441  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  28307898 agagcttgaagagagagaaacttaggattacaaaggaggtaactttagagttgagtgtctttgtagcacggttctcttaggttgggaaacattgttaaca 28307799  T
Q  442 tcttgggtagtgagatttcaccattggaatgat-caaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaac---acaaatg 537  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||| || ||||||||| |||| |||||| |||   | |||||| |||||| ||   | |||||    
T  28307798 ccttgggtagtgagatttcacaattggaaggataaaaaagctttcttttgtgttttct-tttaggattc---agtgagagtgtgggtgacttgagaaatg 28307703  T
Q  538 ggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagc-ttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctc 635  Q
     ||||||| |||||||||||||| | | ||| ||  ||  || ||||||||||| | | ||||  |||| |||| |||||||||||| ||||||||||      
T  28307702 tgtagaaagtaggtcttgttctt-tatgagcttttaaaactaatttcttgtaacccatgtgtattacttccatcttagtggattggagagctgctctcat 28307604  T
Q  636 ccccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    ||||| | |||||||| ||||||| ||||    
T  28307603 ccccagagtaggtcattttggaccgaact 28307575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 163 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 1746701 - 1746417
Alignment:
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacg-ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    |||| |||| | | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  1746701 caatcgtgacacgattttgggaaatcgtgacacgatttttgg-cttgctgggcaagattttcaggataaggttggtcgtaccttggatcgtacgcatcaa 1746603  T
Q  262 tcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagag 359  Q
    ||||| |||| || ||  |||||||| |||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| |||||    
T  1746602 tcgtggcacgattggggaaaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacaactatataagtgttctt-tgcagattttgaagaagagctggaagagagag 1746505  T
Q  360 aaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    |||||| |||   ||||||| | |||||||||||| || ||| ||| | |   | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1746504 aaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggtccttg-attagagttctctttggttgggaaacattgtaaacaccttgg 1746417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 89 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 42435766 - 42435578
Alignment:
Q  89 aacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaa 187  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||||||||  ||  || ||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||    
T  42435766 aacagagaaatcgtgacacaatttcataggcgtgtcacgattttgcaatgccgtgagcatgttttgcagggtgtccaatcgtgacacgattttggggaaa 42435667  T
Q  188 cgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg 277  Q
    |||||||||||||||   |||| | || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  42435666 cgtgacacgattttc-gtcttgcttggcaagttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaaacgtgtcacgatttgg 42435578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 163 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 34256987 - 34256745
Alignment:
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacg-ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    |||| || | | | |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  34256987 caatcgtgacacgattttgggaaatcgtgacacgatttttgg-cttgctgagcaagattttcaggataagattggttgtaccttgggtcgtacgcatcaa 34256889  T
Q  262 tcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagag 359  Q
    ||||| |||| || ||  |||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||  |||     
T  34256888 tcgtggcacgattggggaaaaacgtgacacgatttcgac-gctgaagattgctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagaaagat 34256791  T
Q  360 aaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttg 404  Q
    |||||| |||   ||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  34256790 aaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggtctttg 34256745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 140 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 4743699 - 4743500
Alignment:
Q  140 gtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacg-ttttcaagataaggttggtc 238  Q
    ||||||||| |||| ||||||  |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| | || ||| |||||| |||||||||||||    
T  4743699 gtgagcatgttttgaagggtgtccaatcgtgacacgattttgaggaaacgtgacacgattttc-gacttgcttggcacgtttttcaggataaggttggtc 4743601  T
Q  239 gtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagatttt 337  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||| |||  ||||| |||||||  ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  4743600 gtaccgtgggtcgtacgcatcaaccgtgtcacaatttggcaaaacgtcacacgtatttgacagatgaagactgctatataagtgtttctttgcagatttt 4743501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 150 - 449
Target Start/End: Original strand, 27810971 - 27811249
Alignment:
Q  150 tttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggt 249  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||   |||| |||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27810971 tttgcagggtgtccaatcgtgacacgattttgagaaaatgtgacacgattttcgg-cttgctgggcaagttttcaggataaggttggtcgtatcttgggt 27811069  T
Q  250 cgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagctt 349  Q
     |||||||||||                   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || | ||||     
T  27811070 tgtacgcaccaa-------------------acgtgtcacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttctt-tgcatattttgaaggaaagctg 27811149  T
Q  350 gaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttggg 448  Q
    |||| |||||||| || |||   |||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |   | |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27811150 gaagagagagaaaattgggaaatcaaaggaggtaaatttagggttgagggtctttg-attagagttctcttaggttggaaaacattgtaaacaccttggg 27811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 384 - 620
Target Start/End: Original strand, 7492976 - 7493212
Alignment:
Q  384 ctttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtt 482  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||| |    
T  7492976 ctttagggttgagagcatttgtagtgaggttctcttggattgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcacaattagaaggatcaaaaagct 7493075  T
Q  483 tccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaac---acaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttat 579  Q
    |||||| |||| || || ||||| |   |||||||||| |||||| ||   | |||  |||||||||||||| |||||| ||||| |||||  | ||||     
T  7493076 tcctttagtgttttttc-ttaggat---ttattgagagtgtgggtgacttgaaaaacaggtagaaattaggttttgttc-tgtgtgagcttttatgttaa 7493170  T
Q  580 tttcttgtaac-tctttgtaacactttcatcatagtggattg 620  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  7493171 tttcttataacttctttgtatcactttcatcttagtggattg 7493212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 355 - 479
Target Start/End: Original strand, 9054193 - 9054318
Alignment:
Q  355 gagagaaacttggat-tacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtg 453  Q
    ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||    
T  9054193 gagagaaacttggaaatacaaataaggtaactttaggattgagtgtttttgtagtgagattctcttgggttggaaaacattataatcaccttgggtagtg 9054292  T
Q  454 agatttcaccattggaatgatcaaaa 479  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  9054293 agatttcaccattggaaggatcaaaa 9054318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 163 - 271
Target Start/End: Original strand, 40221232 - 40221339
Alignment:
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaat 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  40221232 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttc-agcttgttggacacgttttcaggataaggtttgtcgtgccttgggtcgtacgcaccaaa 40221330  T
Q  263 cgtgccacg 271  Q
    |||| ||||    
T  40221331 cgtgtcacg 40221339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 300 - 447
Target Start/End: Original strand, 42498017 - 42498163
Alignment:
Q  300 gctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtg 398  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  42498017 gctgaagactgctatataactgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggg 42498115  T
Q  399 tctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    |||||| | | | | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  42498116 tctttg-attaaagttctcttgggttgggaaacgttgtaaacaccttgg 42498163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 226 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 19948741 - 19948562
Alignment:
Q  226 gataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgtt 323  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| || ||  |||||||| |||||||||||| || ||||||  |||||||||||||    
T  19948741 gataagtttggtcgtaccttggatcgtacgcatcaatcgtggcacgattggggaaaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacaactatataagtgtt 19948643  T
Q  324 cttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttg 404  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||| | |||||||||||| || |||||||    
T  19948642 ctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagagtctttg 19948562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 610 - 806
Target Start/End: Original strand, 9765848 - 9766049
Alignment:
Q  610 atagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatc-ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgat 703  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     | ||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |    
T  9765848 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcattggtgtgtttgttcc--cttctttcattgct 9765945  T
Q  704 tatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattac 801  Q
    ||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |  ||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||     
T  9765946 tatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggt-ttgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattat 9766044  T
Q  802 cactt 806  Q
    |||||    
T  9766045 cactt 9766049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 138 - 271
Target Start/End: Original strand, 11383449 - 11383581
Alignment:
Q  138 cagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggt 237  Q
    |||||||||||||||  ||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |  |||||||||||||||||||    
T  11383449 cagtgagcatggtttttagggtgtccaattgtgacacgattttgggaaaacgtgacacgattttc-agcttgctgggcaaattttcaagataaggttggt 11383547  T
Q  238 cgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg 271  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  11383548 cgtactttgggtcgtacgcatcaaccgtgtcacg 11383581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 226 - 447
Target Start/End: Original strand, 44303602 - 44303823
Alignment:
Q  226 gataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||| |||| || ||  ||| |||| |||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||    
T  44303602 gataaggttggtcgtaccttggatcatacgcatcaattgtggcacgattggggaaaatcgtgacacgatttcgac-gcagaagacagctatataagtgtt 44303700  T
Q  324 cttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttg-gattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttggg 422  Q
    ||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||| ||   |||||||   |||||||||||| || ||||||| | |   | |||||||||    
T  44303701 ctt-tgcagattttgaaagagagcttgaagagagagaaacttgagaaatcaaaggaaacaactttagggtttagggtctttg-attagagttctcttggg 44303798  T
Q  423 ttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  44303799 ttgggaaacattgtaaacaccttgg 44303823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 271
Target Start/End: Original strand, 22975974 - 22976109
Alignment:
Q  135 aggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggtt 234  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |  | ||||||| |||||||||    
T  22975974 aggcagtgggcatggttttcagggtgtccaatcgtgacacgattttgggaaaacgtgacacgattttc-agcttgcttgacaagttttcaggataaggtt 22976072  T
Q  235 ggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg 271  Q
     ||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  22976073 tgtcgtacattgggtcgcacgcaccaaacgtgtcacg 22976109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 282 - 447
Target Start/End: Original strand, 4733610 - 4733778
Alignment:
Q  282 cgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgt-gcagattttggagtagagcttgaagtgagaga--aacttggatta-caaagg 377  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||| |||||| ||||||  |||||||   | |||| |    
T  4733610 cgtgtcacgattttgacagttgaagactactatataagtgttctttttgcagattttgaaggagaggttgaagagagagagaaacttgggaaatcaaaag 4733709  T
Q  378 aggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | |   | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4733710 aggtaactttagggttgagggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 4733778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 361 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 6311622 - 6311319
Alignment:
Q  361 aacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacatcttgggtagtgag-at 457  Q
    |||||||||  ||||||||| |||   |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| |     
T  6311622 aacttggatagcaaaggagggaaccaaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggag 6311523  T
Q  458 ttcacca-ttggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctcttt---agggttcattattgagagagtgggtaa-cacaaatgggtagaaattaggtc 552  Q
    ||||  | |||||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||||   |||||||||  ||| ||||||||| || ||| || ||||||||  ||||      
T  6311522 ttcattagttggaaggatcaaaagcttcctctagtgacttctcttttttagggttcatc-ttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggt 6311424  T
Q  553 ttgttcttgtgtaa-gcttgcaagttat--tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtc 649  Q
    |||| ||||||||| ||||| | | ||   |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  6311423 ttgt-cttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcc 6311326  T
Q  650 atattgg 656  Q
    |||||||    
T  6311325 atattgg 6311319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 61 - 180
Target Start/End: Original strand, 23799098 - 23799217
Alignment:
Q  61 aattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggttt-gcagggt 159  Q
    |||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||  || |||    
T  23799098 aattggtttcaaatttgtggtttgaaagaacagagaaatcgtaacacgatttcatcaacgtgtcacaattt-tcaggcagcgagcatggtttctcaaggt 23799196  T
Q  160 gctcaatcgtgtcacgatttt 180  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  23799197 gctcaatcgtgtcacgttttt 23799217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 446
Target Start/End: Original strand, 2627318 - 2627711
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||   || |||| |||||||||   |  | |||||| ||||||    
T  2627318 tgttgagatttggcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgattccgtgagc-tggttt 2627416  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataagg-ttggtcgtaccttgggtcg 251  Q
    ||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | | || |||| || ||||||| ||||||||  |||| | ||    
T  2627417 gcatggtgccaaatcgtgacacgattttgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggattggtcgtttcttgtgacg 2627516  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttga 351  Q
    ||||||||| | ||| |||| | || ||| |||| |||||||||  |    || | ||  ||| |||||||||||||||||| |||| || |||| | ||    
T  2627517 tacgcaccatttgtgacacgatctgtaaatcgtgacacgattttatcgttggagggctagtatttaagtgttcttgtgcaga-tttgaaggagagttgga 2627615  T
Q  352 agtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttg 446  Q
    || ||||||||||| |||   ||||||  |||||| ||||||| || |||||||    |||  |||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  2627616 agagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagtctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttg 2627711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 355 - 449
Target Start/End: Original strand, 9765624 - 9765720
Alignment:
Q  355 gagagaaacttgg-attacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctctt--gggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9765624 gagagaaacttgggaatacaaaggaggtaacttgagggttgagtgtctttg-agtgaggttctcttgagggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 9765720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 533 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 6813829 - 6813608
Alignment:
Q  533 aaatgggtagaaa-ttaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgct 630  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||| | |||||  |||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  6813829 aaatgggtagaaaattaggttttgttctt-tgtgagcttgcaagctaatttcttgtaacccctttgtgtcactttcatcttattggattggagagctgct 6813731  T
Q  631 ctctcccccatattaggtcatattggaccaaac-----tagcaatc-ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttat 723  Q
    |||||||| |   ||||| |||||||||| |||     || ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  |||||| |  ||||||| ||||    
T  6813730 ctctcccctagtgtaggttatattggaccgaactgggttaacaatctttggtatgtttgttcc--tttctttcatttcttatctttattgctttgattat 6813633  T
Q  724 gcttgtggtgttgctctacactaag 748  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||    
T  6813632 gcttgtgatgttgttctacactaag 6813608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 282 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 19945722 - 19945559
Alignment:
Q  282 cgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggagg 380  Q
    |||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| |||   ||||||| |    
T  19945722 cgtggcacgattttgac-gcagaagacagctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagacaaacttgggaaatcaaaggaag 19945625  T
Q  381 taactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
     |||||||||||| || ||||||| | |   | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19945624 caactttagggtttagagtctttg-attagagttctcttgggtcgggaaacattgtaaacaccttgg 19945559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 372 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 19491974 - 19491895
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctctt--gggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19491974 caaaggaggtaactttagggttgagtgcatgtgtagtgaggttctcttgagggttgggaaacatcgtaaacatcttgggt 19491895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1345873 - 1345714
Alignment:
Q  142 gagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgt- 240  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| | |  ||||||||| |||||||||||||||     
T  1345873 gagcatgttctgcagggtgttcaatcgtgacacgattt-gagaaaatgtgacacaattttcag-cttgcttgacacgttttcaggataaggttggtcgta 1345776  T
Q  241 -accttgggtcgtacgcaccaatcgtgccac-gttttggaaaacgtgccacgattttgacag 300  Q
     ||||||||||||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  1345775 caccttgggtcgtacgcatcaaccatgtcacggttttaggaaacgtgacacgattttgacag 1345714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 533 - 658
Target Start/End: Original strand, 9054789 - 9054914
Alignment:
Q  533 aaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaact-ctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctc 631  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||  ||| || |||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  9054789 aaatgggtagaaattagattttgttctt-tgtgcgcttttaagctaatttcttgtaaccactttgtatcactttcatcttagtggattagagagctgctc 9054887  T
Q  632 tctcccccatattaggtcatattggac 658  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||    
T  9054888 tctcctccagagtaggtcatattggac 9054914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 261
Target Start/End: Original strand, 4733502 - 4733608
Alignment:
Q  154 cagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgta 253  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||  |    ||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  4733502 cagggtgttcaatcgtgacacgattttgggaaaacgtgacacgattttc-ggctttctaaacacgttttcaggatacagtttgtcgtaccttgggtcgta 4733600  T
Q  254 cgcaccaa 261  Q
    ||||||||    
T  4733601 cgcaccaa 4733608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Original strand, 7289915 - 7289989
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  7289915 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 7289989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 338
Target Start/End: Original strand, 10014822 - 10015020
Alignment:
Q  140 gtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcg 239  Q
    ||||||||| ||| ||||||   |||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||    | || | || |||||| || ||||||||||||||    
T  10014822 gtgagcatgtttttcagggtttccaatcgtgacacgattttgggcaatcatgacacgatttttgg-catgcttggcacgtttacaggataaggttggtcg 10014920  T
Q  240 taccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttg-gaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttg 338  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||   ||  ||| |||  |||||||| |||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||    
T  10014921 taccttgggtcgtatgcatcaatcgtgtcacgatttgaccaattgtgacacatttttgacaactgaagactgatatgtaagtgtttctttgcagattttg 10015020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 582 - 656
Target Start/End: Original strand, 25328268 - 25328341
Alignment:
Q  582 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  25328268 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 25328341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 62 - 209
Target Start/End: Original strand, 4759541 - 4759688
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggtttgcagggtg 160  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   || |||| |||||||||   | || |||||| | |||||||||  |    
T  4759541 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttgacatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagc-tagtttgcaggacg 4759639  T
Q  161 ctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttg 209  Q
    |  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  4759640 ccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatttagaaacttg 4759688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19945822 - 19945719
Alignment:
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacg-ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    ||||||||| | | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  19945822 caatcgtgacacgattttaggaaatcgtgacacgatttttgg-cttgttggggaagattttcaggataaggttgatcgtaccttggatcgtacgcatcaa 19945724  T
Q  262 tcgtg 266  Q
    |||||    
T  19945723 tcgtg 19945719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 3303943 - 3303870
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttg 446  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3303943 caaaggaggtaactttacggttgagggtctttg-attagggttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 3303870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 266
Target Start/End: Original strand, 4283039 - 4283116
Alignment:
Q  188 cgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtg 266  Q
    |||||||||||||||   |||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  4283039 cgtgacacgattttcgg-cttgctgggcaagttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtatgcaccaaacgtg 4283116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 199
Target Start/End: Original strand, 10683746 - 10683883
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggtttgcagggtg 160  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   || |||| |||||||||   | || |||||| | |||||||||  |    
T  10683746 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggtgccgtgagc-tagtttgcaggacg 10683844  T
Q  161 ctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgatt 199  Q
    |  ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10683845 ccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatt 10683883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 468
Target Start/End: Original strand, 13204565 - 13204670
Alignment:
Q  355 gagagaaacttggat-tacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtg 453  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | || | |||||||||| ||||| |||||||||         |||||||||| |||||||||||    
T  13204565 gagagaaacttggaaatacaaaggaggtaactttatgtttaaatgtctttgtaatgaggttctcttggg---------attgtaaacaccttgggtagtg 13204655  T
Q  454 agatttcaccattgg 468  Q
    |||||||||| ||||    
T  13204656 agatttcaccgttgg 13204670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 30656275 - 30656138
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggtttgcagggtg 160  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   || |||| |||||||||   | || |||||| | |||||||||  |    
T  30656275 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggtgccgtgagc-tagtttgcaggacg 30656177  T
Q  161 ctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgatt 199  Q
    |  ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  30656176 ccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatt 30656138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 199
Target Start/End: Original strand, 33037294 - 33037431
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggtttgcagggtg 160  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   || |||| |||||||||   | || |||||| | |||||||||  |    
T  33037294 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagc-tagtttgcaggacg 33037392  T
Q  161 ctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgatt 199  Q
    |  ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  33037393 ccaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgatt 33037431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 725 - 805
Target Start/End: Original strand, 1262101 - 1262179
Alignment:
Q  725 cttgtggtgttgctctacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccact 805  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  1262101 cttgtggtgttgctctacacta-gactagggctgtttt-tgttgttgttgcttggagacactttactcatagattaccact 1262179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Original strand, 10684252 - 10684327
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  10684252 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg 10684327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 114
Target Start/End: Original strand, 10688625 - 10688677
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttca 114  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10688625 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgatttca 10688677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 11712308 - 11712200
Alignment:
Q  341 gtagagcttgaagtgagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaca-ttgtaa 438  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||| | |||||||||  ||| || ||||||    
T  11712308 gtagagcttcaagagagagaaacttagggtatcaaatgaggtaactttagggttgagtgtctttggtgagaggttttcttgggttccgaagcatttgtaa 11712209  T
Q  439 acatcttgg 447  Q
    |||||||||    
T  11712208 acatcttgg 11712200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 610 - 666
Target Start/End: Original strand, 18813152 - 18813208
Alignment:
Q  610 atagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaactag 666  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  18813152 atagtggattggagggctgctctctcccccatattaggtcaatttggaccgaactag 18813208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 194
Target Start/End: Original strand, 33351812 - 33351888
Alignment:
Q  119 cgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggttt-gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgaca 194  Q
    |||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  33351812 cgtgtcacgattttttaggcagtgaacatggttttgcagggtgtccaatcgtgacacgattttgggaaaacatgaca 33351888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 35745488 - 35745413
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  35745488 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg 35745413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 447
Target Start/End: Original strand, 38863765 - 38863841
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgagga--tctcttgggttgggaaaca-ttgtaaacatcttgg 447  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38863765 caaatgagctaactttaaggttgagtgtcttt--agtgaggagttctcttgggttgggaaacatttgtaaacatcttgg 38863841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 112
Target Start/End: Original strand, 39784330 - 39784382
Alignment:
Q  60 aaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  39784330 aaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 39784382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 372 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 3318823 - 3318761
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacatt 434  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||  | |||| ||||||||||| |||||||||    
T  3318823 caaatgaggtaactttagggttgagggtctttggtgggaggttctcttgggttaggaaacatt 3318761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 6311928 - 6311791
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggtttgcagggtg 160  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||   || |||| |||||||||   | || |||||| | |||||||||  |    
T  6311928 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcatgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggtgccgtgagc-tagtttgcaggacg 6311830  T
Q  161 ctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgatt 199  Q
    |  ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  6311829 ccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatt 6311791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 199
Target Start/End: Original strand, 18852634 - 18852771
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggtttgcagggtg 160  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||   || |||| |||||||||   | || |||||| | |||||||||  |    
T  18852634 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgatacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggtgccgtgagc-tagtttgcaggacg 18852732  T
Q  161 ctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgatt 199  Q
    |  ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18852733 ccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatt 18852771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 112
Target Start/End: Original strand, 18870028 - 18870078
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18870028 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 18870078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 112
Target Start/End: Original strand, 25327671 - 25327721
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  25327671 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 25327721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 36980007 - 36979870
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggtttgcagggtg 160  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   || |||| |||||||||   | || |||||| | |||||||||  |    
T  36980007 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagc-tagtttgcaggacg 36979909  T
Q  161 ctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgatt 199  Q
    |  ||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  36979908 ccaaatcgtggcacgatcttggaaaatcgtgacacgatt 36979870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 582 - 656
Target Start/End: Original strand, 39784813 - 39784885
Alignment:
Q  582 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  39784813 tcttgtaaccttttgtaacactt-ca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 39784885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 377 - 446
Target Start/End: Original strand, 4162400 - 4162468
Alignment:
Q  377 gaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttg 446  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |  || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4162400 gaggtaactttagggttgagggtctttg-attagggttctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttg 4162468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 449
Target Start/End: Original strand, 5689166 - 5689242
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |  || ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  5689166 caaaggagataactttagggttgagggtctttg-attagggttctcttgagtttggaaacattgtaaacaccttgggt 5689242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 448
Target Start/End: Original strand, 18141675 - 18141791
Alignment:
Q  333 attttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaac 431  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | | |||||||||| |||||||||||| ||||||| | |  || |||||| |||||||||||    
T  18141675 atttttgagtagagcttcaagagagagaaactaggaaaatcgaaggaggtaattttagggttgagggtctttg-attagggttctcttaggttgggaaac 18141773  T
Q  432 a-ttgtaaacatcttggg 448  Q
    | ||||||||| ||||||    
T  18141774 atttgtaaacaccttggg 18141791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 610 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 24873245 - 24873196
Alignment:
Q  610 atagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggacc 659  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24873245 atagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggacc 24873196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 29796596 - 29796520
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaca-ttgtaaacatcttggg 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||  | | || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29796596 caaaggaggtaactttagggttgaggatctttggcgag-ggttctcttgggttgggaaacatttgtaaatatcttggg 29796520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 413 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 4743436 - 4743400
Alignment:
Q  413 atctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4743436 atctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 4743400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 340
Target Start/End: Original strand, 31043113 - 31043193
Alignment:
Q  260 aatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgga 340  Q
    ||||||| ||||  ||||||| |||| |||||||||  |||  |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31043113 aatcgtgacacgacttggaaatcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattttgga 31043193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 372 - 428
Target Start/End: Original strand, 41266862 - 41266918
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggga 428  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||    
T  41266862 caaatgaggtaactttagggttgaatgtctttggtgagaggttctcttgggttggga 41266918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 18106310 - 18106275
Alignment:
Q  414 tctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18106310 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 18106275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 113
Target Start/End: Original strand, 25689568 - 25689619
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttc 113  Q
    |||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  25689568 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgatttc 25689619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 112
Target Start/End: Original strand, 7289434 - 7289484
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  7289434 attgacttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatagtgacacgattt 7289484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 610 - 664
Target Start/End: Original strand, 43079873 - 43079927
Alignment:
Q  610 atagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  43079873 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaact 43079927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 610 - 664
Target Start/End: Original strand, 43082244 - 43082298
Alignment:
Q  610 atagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  43082244 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaact 43082298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 420; Significance: 0; HSPs: 111)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 2479960 - 2479207
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||   || |||| |||||||| | |  || |||||| ||||||    
T  2479960 tgttgaaatttggcttcaaatttgtggtttgtaagaacagagaaattgtgacacgattttggcatcgtgacacgattttctaatgccgtgagc-tggttt 2479862  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgt 252  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2479861 gcagggtgtcaaatcgtgtcacgattttgtgaaatcgttacacgattttcaaacttgttggttaagttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgt 2479762  T
Q  253 acgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaa 352  Q
    ||||| ||||| || || | ||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2479761 acgcatcaatcatggcatgatttggaaaacgtggcacgattttatcagttgaagactagtatataagtgttcttgtgcagattttggagaagagcttgaa 2479662  T
Q  353 gtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagt 452  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2479661 gagagagaaacttggattacaaaggagggaactttagggttgagtgtctttatagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagt 2479562  T
Q  453 gagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtc 552  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  2479561 gagatttcaccattggaaggatcaaaagcttccttttatatcttctctttagggttcattattgagagagtgggaaacacacatgggtagaaattaggtc 2479462  T
Q  553 ttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcata 652  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| | |||||||||||    
T  2479461 ttgttcttgtgtaagcttgcaagctattttcttataactctttgtaacactttcatcatagtggatttgagagctgctctc-cccctagattaggtcata 2479363  T
Q  653 ttggaccaaact-----agcaatc--ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacact 745  Q
    ||| ||| ||||     | |||||  |||||||||||||   || ||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2479362 ttgaaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgt---ttcttctttcattgcttatctttgttctttgtatatgcttgtggtgttgctctacact 2479266  T
Q  746 aagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
     || ||||||||  ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2479265 -agactaggtct-gtttttgttgttgttgcttagagacactttacacattgattaccactt 2479207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 21989532 - 21988774
Alignment:
Q  53 ttgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggtt 151  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||  |  |||||| |||||    
T  21989532 ttgttgaaagttggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacaagatttcatcatcgtgacacgattttgcaatgtcgtgagc-tggtt 21989434  T
Q  152 tgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcg 251  Q
    ||||||| |  |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||     
T  21989433 tgcagggcgaccaatcgtggcacgattttgtgaaa-cgtgacacgattttccaacttgatgggtacgttttcaggataaggttgatcgtaccttgggtca 21989335  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttga 351  Q
    |||||| |||||||| || | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  21989334 tacgcagcaatcgtgtcatgatttggaaaatgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttga 21989235  T
Q  352 agtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtag 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21989234 agtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttaggtttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtag 21989135  T
Q  452 tgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattagg 550  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||  ||| |||||||||||||||| ||||   ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  21989134 tgagattttaccattggaaggatcataagcttcctttattgttttctctttagggttca-tatttttagagtgggtgacacaaaatgggtagaaactagg 21989036  T
Q  551 tcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc--tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggt 648  Q
    | || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  |||||| ||| |||||||    
T  21989035 ttttattcttgtataagcttgcaatctattttcttgtaactctttttgtaacactttcatcaaagtggattggagagttg--ctctcctccagattaggt 21988938  T
Q  649 catattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctac 742  Q
    ||||||||||| ||||     | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21988937 catattggaccgaactgggtcaacaatctcggtgtgtttgttcc-ttttctttcattgcttatctttattgctttgattatgtttgtggtgttgctctac 21988839  T
Q  743 actaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||  || | |||||||    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21988838 acccagatttaggtctggagtttgttgttgttgcttggtgacactttacacattgattaccactt 21988774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 803
Target Start/End: Original strand, 2647203 - 2647923
Alignment:
Q  87 agaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgc-agggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaa 185  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2647203 agaacagagaaatcgtaacacgatttcatcaacgtgtcaggattttc-aggcagcgagcatggtttttgagggtgcttaatcgtgtcacgattttgggaa 2647301  T
Q  186 aacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgga-aaacgt 284  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  2647302 aacgtgacatgattttcaa-cttgctgggcacgttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgtcacgatttggacaaacgt 2647400  T
Q  285 gccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaac 384  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||  || |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  2647401 gatacgattttgagagctgaagactgctataaaagtgttcttgtgcagattttgaaggagagattttagagagagaaacttggactacaaaggagataac 2647500  T
Q  385 tttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagttt 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||    
T  2647501 tttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacatggtaagcaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaaaactt 2647600  T
Q  484 ccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatttt 582  Q
    | |||||||| ||||| ||||| |||   |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||    
T  2647601 cattttgtgttttctc-ttaggattc---attgagagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagctaattt 2647696  T
Q  583 cttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatcttggt 676  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||| || || |     | |||||||| |    
T  2647697 cttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagaataggtcatattgggccgaattgggtcaacaatcttgat 2647796  T
Q  677 gtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattg 774  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||| |||||||||||| |||    
T  2647797 gtgtttgttcc--tttctttcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctaaacttagatttaggtctgttttttgttgttgttg 2647894  T
Q  775 cctggagacactttacacattgattacca 803  Q
      |||||| | ||||   |||||||||||    
T  2647895 tttggagatattttatctattgattacca 2647923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 92 - 806
Target Start/End: Original strand, 33331960 - 33332679
Alignment:
Q  92 agagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgc-agggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgt 190  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  33331960 agagaaatcgtgacatgatttcatcaacgtgtcacgattttttaggcagtgagcatggttttttagggtgctcaattgtgtcacgattttggaaaaacgt 33332059  T
Q  191 gacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaac-gtgccac 289  Q
    |||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||  ||| |||    
T  33332060 gacacgattttcaa-cttgctgggcacattttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgtcacgatttggacaattgtgacac 33332158  T
Q  290 gattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttag 389  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||| || |||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33332159 gattttgacagttgaagactgctatattagtgtttctttgcagattttgaaggagagctttgagagatagaaacttggattacaaaggaggtaactttag 33332258  T
Q  390 ggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttt 488  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||    
T  33332259 ggttgagtgtttttgtagtaaggttctcttgggttgagaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaaagcttccctt 33332358  T
Q  489 tgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggt--aacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttg 586  Q
    ||||| ||||| |||||    || |||||||| ||| ||   ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| || |||||||    
T  33332359 tgtgttttctc-ttagg---aatcattgagagtgtgcgtgatacaaaaatgagtagaaattaggtcttgttcttttgtaagcttataagctaatttcttg 33332454  T
Q  587 taactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgt 680  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||     | ||||||||||||||    
T  33332455 taactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatcttggtgtgt 33332554  T
Q  681 ttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctg 778  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||| |  || |||| |||||||| ||||||||||||||||| || | ||||| |  ||||||||||| |||  ||    
T  33332555 ttgttcc--tttctttcattgcttatctttattgatttgattatgcttatggtgttgctctacacttagatttaggt-ttgtttttgttgttgttgtttg 33332651  T
Q  779 gagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    || ||||||||   ||||||||||||||    
T  33332652 gatacactttatctattgattaccactt 33332679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 88 - 806
Target Start/End: Original strand, 4796175 - 4796899
Alignment:
Q  88 gaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc--aggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaa 185  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     | |  | |||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  4796175 gaacaaagaaatcgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgattttggtaatgtcgagagt-tgttttgcagggtgctcaatcgtgacacgattttggaaa 4796273  T
Q  186 aacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgga-aaacgt 284  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||  ||  |||  ||| || ||||||    
T  4796274 aacgtgacacgattttcaa-cttgatgggcacgttttcaggatagagttggtcgtaccttggatcgtacgcaccaaatgtatcacaatttagacaaacgt 4796372  T
Q  285 gccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaac 384  Q
    | ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4796373 gacacgattttgatagttgaagattgctatataagtgttcctgtgtagattttgaagaagagcttggagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaac 4796472  T
Q  385 tttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagttt 483  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  4796473 tttagg-ttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaaagctt 4796571  T
Q  484 ccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatttt 582  Q
    | |||||||| ||||| ||||| |||   |||||||  || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||| || |||    
T  4796572 ctttttgtgttttctc-ttaggattc---attgagaatgtaggtgacacaaaatgggtataaatgaggtcttgttcttgtgtaagcttataagctaattt 4796667  T
Q  583 cttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaac-----tagcaatcttggt 676  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||     || ||||||||||    
T  4796668 cttgtaactcttttgtaacaatttcatcatagtggatttgagggctgctttctcccccagattaggtcattttggaccgaactgggttaacaatcttggt 4796767  T
Q  677 gtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtc--tattttttgttgttat 772  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||  | |||||||||||| |    
T  4796768 gtgtttgttcc--tttctctcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtctgttttttttgttgttgt 4796865  T
Q  773 tgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||| |||||| ||||||   ||||||||||||||    
T  4796866 tgcttggagaaactttatctattgattaccactt 4796899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 86 - 806
Target Start/End: Original strand, 46515834 - 46516540
Alignment:
Q  86 aagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttg-cagggtgctcaatcgtgtcacgattttggga 184  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  46515834 aagaacagagaaatcgtgacacgatttcattaacgtgtcacgattttc-aggcagcgagcatggtttttcagggtgctcaatcgtgtcacgatttttgg- 46515931  T
Q  185 aaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacg 283  Q
                         ||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | || |||| ||||| ||||||    
T  46515932 ---------------------cttgttgggcacgttttcaggataaggttggtcacaccttgggtcgtatgcaccaagcatgtcacgatttggcaaaacg 46516010  T
Q  284 tgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaa 383  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46516011 tgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggggagctt--agagagagaaacttggattacaaaggaggtaa 46516107  T
Q  384 ctttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtt 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |    
T  46516108 ctttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaaagct 46516207  T
Q  483 tccttttgtgtcttctctttagggttcattatt---gagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagtta 578  Q
    || |||||||| ||||| ||| | ||||||  |   | | | |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  46516208 tcattttgtgttttctc-ttaagattcattggtggagtgtgtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattatgtcttgttcttgtgtaagcttttaagcta 46516306  T
Q  579 ttttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatct 672  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||     | ||||||    
T  46516307 atttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 46516406  T
Q  673 tggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgtt 770  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || | || |||| ||||||||||||    
T  46516407 tggtgtgtttgttcc--tttctttcattgtttatctctattgctttgattatgcttttggtgttgctttacacttagatttaagtctgttttttgttgtt 46516504  T
Q  771 attgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
     |||  |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  46516505 gttgtttggagacactttatctattgattaccactt 46516540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 347 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 47263997 - 47263548
Alignment:
Q  347 cttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttg 446  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||    
T  47263997 cttgaagagagagaaacttggattataaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgagaatctcttcggttgggaaacattgtaaataccttg 47263898  T
Q  447 ggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaat 546  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  47263897 ggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaagcttccttttgtgtcttctatttagggttcattattgagagagtgggaaacacaaatggatagaaat 47263798  T
Q  547 taggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattag 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||          || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  47263797 taggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctattttc----------ttataacactttcatcatagtggattggagagctg--ctctcccccatattag 47263710  T
Q  647 gtcatattggaccaaact-----agcaatc--ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctc 739  Q
    ||||||||||||| ||||     | |||||  |||||||||||||   || || |||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  47263709 gtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgt---ttcttatttcattgcttatctttattctttgtttatgcttgtggtgttgctc 47263613  T
Q  740 tacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47263612 tacact-agactaggtcta-tttttgtttttgttgcttggagacactttacacattgattaccactt 47263548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 54 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 18409399 - 18408634
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | ||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||| || |||||| ||   || |||| ||||||||    | || |||||| ||||||    
T  18409399 tgttgagatttggcttcaaatttgtgttctggaagaacagagaaatcgtaacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtggtgccgtgagc-tggttt 18409301  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggt-tggtcgtaccttgggtcg 251  Q
    |||||||||  |||| || |||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||| | | || |||| || |||||||  ||||||||||||| | ||    
T  18409300 gcagggtgccaaatcatgacacgatcttgagaaatcgtgacacgattctcaaacttgcttgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgtgacg 18409201  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttga 351  Q
    |||| |||||||||| ||||  ||||||| |||| |||||||||  |||  |||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  18409200 tacgtaccaatcgtgacacgacttggaaatcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttctcgtgcagattttggaggagagcttgg 18409101  T
Q  352 a--------gtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaaca 441  Q
    |        | ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18409100 aagagcttagagagagaaacttagattacaaaggagggaactctagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaaaca 18409001  T
Q  442 tcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagt-gggtaacacaaatgggt 540  Q
     ||||||||||||||||||||||||  || ||||  ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  18409000 ccttgggtagtgagatttcaccattaaaaggatcttaagcttcctcttgtgtcttccttttagggttca-tattgtgagagtggggaaacacaaatgggt 18408902  T
Q  541 agaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagtta-ttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctccccc 639  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18408901 agaaactaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagttatttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatactggattggagagctgctctctccccc 18408802  T
Q  640 atattaggtcatattggaccaaact-----agcaatc--ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatc-tgtgtgctttgtttatgcttgtgg 731  Q
    | |||||| |||||||| |  ||||     | |||||  |||||||||||||||   |||||||| ||| ||||| ||| |||||||| | || ||||||    
T  18408801 agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttc---tttctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtatttgtttgtgg 18408707  T
Q  732 tgttgctctacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||||||||||||| || ||| | ||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18408706 tgttgctctacact-agactacggct-gtttttgttgttgttgcgtggagacactttacacatagattaccactt 18408634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 54 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 18414275 - 18413511
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | ||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||   || |||| ||||||||    | || |||||| ||||||    
T  18414275 tgttgagatttggcttcaaatttatggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtggcacgattttgtggtgccgtgagc-tggttt 18414177  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggt-tggtcgtaccttgggtcg 251  Q
    |||||| ||  ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||| | | || |||| || |||||||  ||||||||||||| | ||    
T  18414176 gcagggcgccaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtaacacgattctcaaacttgcttgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgtgacg 18414077  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttga 351  Q
    |||| |||||||||| ||||  ||||||| |||| ||| |||||  ||   |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  18414076 tacgtaccaatcgtgacacgacttggaaatcgtgacacaattttatcattggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattttggaggagagcttgg 18413977  T
Q  352 a--------gtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaaca 441  Q
    |        | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  18413976 aagagcttagagagagaaacttggattacaaaggagggaactctagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaaacaatgtaaaca 18413877  T
Q  442 tcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagt-gggtaacacaaatgggt 540  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  18413876 ccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatcttaagcttcctcttgtgtcttccttttagggttca-tattgtgagagtggggaaacacaaatgggt 18413778  T
Q  541 agaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagtta-ttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctccccc 639  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18413777 agaaactaggacttgttcttgtgtaagcttgcaatctatttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctct-cccc 18413679  T
Q  640 atattaggtcatattggaccaaact-----agcaatc--ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatc-tgtgtgctttgtttatgcttgtgg 731  Q
    | |||||| |||||||| |  ||||     | |||||  |||||||||||||||   |||||||| ||| ||||| ||  |||||||| | |||||||||    
T  18413678 agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttc---tttctttc-ttgcttatcttggttgctttgtatttgcttgtgg 18413584  T
Q  732 tgttgctctacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18413583 tgttgctctacact-agactagggct-gtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccactt 18413511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 311 - 806
Target Start/End: Original strand, 9189735 - 9190236
Alignment:
Q  311 ctatataagtgttcttgtgcagattttggagt-agagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgt-ctttgtagt 408  Q
    |||||||||||||  | |||||||||| |||  |||| ||  || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9189735 ctatataagtgtttctttgcagatttttgagagagaggttttagagagagaaacttggattgcaaaggagataactttagggttgagtgttctttgtagt 9189834  T
Q  409 gaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggt 507  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  9189835 aaggttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaaagcttccttgtgtgttttctc-ttaggat 9189933  T
Q  508 tcattattgagagagtggg---taacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagtta-ttttcttgtaactctttgtaacact 603  Q
    ||||||   |||| |||||   ||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  9189934 tcatta---agagtgtgggtgatatgaaaaatgggtagaaattaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttttcttgtaactcattgtaacact 9190030  T
Q  604 ttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttca 698  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||     | |||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  9190031 ttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tctctttca 9190128  T
Q  699 ttgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattg 796  Q
    ||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  | | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  9190129 ttgcttatctttattgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacacttagatctagg--tttgttttgttgttgttgcttggagacactttacacattg 9190226  T
Q  797 attaccactt 806  Q
    ||||||||||    
T  9190227 attaccactt 9190236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 138 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 49092232 - 49091918
Alignment:
Q  138 cagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgtttt-caagataaggttgg 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  49092232 cagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaatgtgacacgattttcgaacttgctgggtacgtttttcaggataaggttgg 49092133  T
Q  237 tcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgga--aaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagat 334  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49092132 tcgtaccttggatcgtatgcaccaatagtgacacgatttgaacaaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagat 49092033  T
Q  335 tttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacatt 434  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  49092032 tttgaaggagagcttgaagagagagaaacttggattacaaaggaggtaactttaaggttgagtgtctttgtactgaggatatcttgggttgggaaacatt 49091933  T
Q  435 gtaaacatcttgggt 449  Q
    | ||||| |||||||    
T  49091932 gaaaacaccttgggt 49091918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 355 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 29160131 - 29159671
Alignment:
Q  355 gagagaaacttgg-attacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttg--ggttgggaaacattgtaaacatcttgggtag 451  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29160131 gagagaaacttgggaatacaaaggaggtaacttttgggttgagtgtctttatagtgaggttctcttgagggttgggaaacattgtaaacaccttgggtag 29160032  T
Q  452 tgagatttcaccattggaatgatcaaaa-gtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaa--tgggtagaaatta 548  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  29160031 tgagatttcaacattggaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttctctt-aggattcat-attgtgagagtgggtgacacaaaaatgggtagaaatta 29159934  T
Q  549 ggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattagg 647  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  29159933 ggtcttgttcttgtgtaagcttgtaagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattagg 29159834  T
Q  648 tcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctcta 741  Q
    |||||||||||| ||||     | |||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29159833 tcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tctctttcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctcta 29159736  T
Q  742 cactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||| || | |||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  29159735 cacttagatttaggtct-gtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccactt 29159671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 62 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 80005 - 79634
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgc 161  Q
    |||||||| |||| |||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  80005 attggcttcaaatttgtgatttggaagaacagagaaatcgtgacacgatttcattaacgtgtcacgatttcc-aggcagtgagcatggtttgcagg-tgc 79908  T
Q  162 tcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgtttt-caagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcacca 260  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  79907 tcaatcgtgtcacgattttggaaaaatgtgacaagattttcaaacttgctgggtacgtttttcaggataaggttggtcgtacattgggtcatatgcacca 79808  T
Q  261 atcgtgccacgttttgga--aaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgaga 358  Q
    |||  | |||| ||||||  ||| ||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  79807 atcacgtcacgatttggacaaaatgtgacacgattctgacagttgaagactactatatatgtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagaga 79708  T
Q  359 gaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaca 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  79707 gaaacttggattacaaaggaggtaactttaagattgagtgtctttgtagtgaggatcttttgggttggaaaaca 79634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 54 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 21646643 - 21646028
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | ||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||| | ||   || |||| |||||||||   | || |||||| ||||||    
T  21646643 tgttgacatttggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacaaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagc-tggttt 21646545  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggt-tggtcgtaccttgggtcg 251  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| | | || || | |  ||||||   ||||| ||||||||| ||    
T  21646544 gcagggtgccaaatcgtgacacgatcttggaaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtatccttgataagaactggtcataccttgggacg 21646445  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttga 351  Q
    ||||  | |||||||||||| | |||||| |||| |||||||||  |||  |||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  21646444 tacgttcaaatcgtgccacgatctggaaatcgtgacacgattttatcagaggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattttggggaagagcttgg 21646345  T
Q  352 a--------gtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaaca 441  Q
    |        | ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21646344 aagagcttagagagagaaacttagattacaaaggaggaaactctagggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaaaca 21646245  T
Q  442 tcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctc-tttagggttcattattgagagagt-gggtaacacaaatggg 539  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  21646244 ccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatctaaatcttcctctagtgtcttctcttttagggttca-tattgtgagagtggggaaacacaaatggg 21646146  T
Q  540 tagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagtta-ttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccc 638  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  21646145 tagaatctaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttttcttgtaaccctttttaacactttcatcatagtggattggagagctgctctcttccc 21646046  T
Q  639 catattaggtcatattgg 656  Q
     | |||||| ||||||||    
T  21646045 tagattaggccatattgg 21646028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 311 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 2580756 - 2580256
Alignment:
Q  311 ctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtga 410  Q
    |||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||| ||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2580756 ctatttaagtgtttctttgcagattttgaagtagaggttttagagagagaaacttggattgcaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgt-gtga 2580658  T
Q  411 ggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttc 509  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  2580657 ggttctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattgaaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttctc-ttaggattc 2580559  T
Q  510 attattgagagagtggg---taacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttc 606  Q
       |||||||| |||||   ||  | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2580558 ---attgagagtgtgggtgatatgaaaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctattttcttgtaactcattgtaacactttc 2580462  T
Q  607 atcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcct-ttttctttcatt 700  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |     | |||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  2580461 atcttagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcctctcttttttcatt 2580362  T
Q  701 gattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgat 798  Q
    | |||||| |  ||||||| |||| ||||||||||  ||||||||| || | ||||||  | |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  2580361 gcttatctttattgctttggttatacttgtggtgtatctctacacttagatttaggtc--tgttttgttgttgttgcttgaagacactttacacattgat 2580264  T
Q  799 taccactt 806  Q
    ||||||||    
T  2580263 taccactt 2580256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 311 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 20284456 - 20283957
Alignment:
Q  311 ctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtga 410  Q
    |||||||||||||  | |||| |||||| || |||| ||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20284456 ctatataagtgtttctttgcaaattttgaaggagagttttgagagagagaaacttggattataaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtga 20284357  T
Q  411 ggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttc 509  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  20284356 ggttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttctc-ttaggattc 20284258  T
Q  510 attattgagagagtggg---taacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttc 606  Q
       |||||||| |||||   ||  | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||| | |||||||||||||    
T  20284257 ---attgagagtgtgggtgatatgaaaaaagggtagaaattaggacttgttcttttgtaagcttataagctaatttcttgtaacgcattgtaacactttc 20284161  T
Q  607 atcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattg 701  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     | |||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  20284160 atcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tttctttcattt 20284063  T
Q  702 attatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgatt 799  Q
     |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||  ||||||||||| || | |||||||||||||  ||||||||    
T  20284062 cttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatttaggtct-gtttttgttgttgtttcttggagacactttatccattgatt 20283964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 188 - 470
Target Start/End: Original strand, 44847732 - 44848014
Alignment:
Q  188 cgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgcc 287  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  44847732 cgtggcacaattttcaaacttgttggttaagttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgtatcaatcgtggcacgatttggaaaacgtggc 44847831  T
Q  288 acgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaacttt 387  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44847832 acgattttatcagctgaagacggctatataagtgttcttgtgtagattttggtgaagagcttgaagagagagaaacttggattataaaggaggtaacttt 44847931  T
Q  388 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaa 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44847932 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggatagtgagatttcaccattggaa 44848014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 417 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 49091924 - 49091530
Alignment:
Q  417 cttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaa-gtttccttttgtgtcttctctttagggttcattatt 515  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||     
T  49091924 cttgggttgggaaacattgaaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttctctt-aggattcattatg 49091826  T
Q  516 gagagagtgggtaacaca-aatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatag 613  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49091825 gagagtgtgggtgacacagaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataaggtaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatag 49091726  T
Q  614 tggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatct 708  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||     | ||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  49091725 tggattggagagttgctctcttccccagattaggtcatattggactaaactgggtcaacaatcttggtgcgtttgttcc--tttctttcattgcttatct 49091628  T
Q  709 gtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacac-taagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  49091627 ttgtgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttaaatctaggtct-gtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccactt 49091530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 464 - 805
Target Start/End: Original strand, 44848567 - 44848913
Alignment:
Q  464 attggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtg 563  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44848567 attggaaggatcaaaagcttccttttgtgtcttctctttagagttcattattgagagagtgggaaacacaaatgggtagaaattaggtcttattcttgtg 44848666  T
Q  564 taagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaac 663  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||    
T  44848667 taagcttgcaagcttttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaggttaggtcatattgaaccgaac 44848766  T
Q  664 t-----agcaatc--ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaagtctaggtc 756  Q
    |     | |||||  ||||||||| ||||||   ||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  44848767 tgggtcaacaatcttttggtgtgtatgttcc---ttctttcattgcttatctttgttctttgtatatgcttgtggtgttgctctacact-agactaggtc 44848862  T
Q  757 --tattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccact 805  Q
      | |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  44848863 tgttttttttgttgttgttgcttggagacactttgcacattgattagcact 44848913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 355 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 21640135 - 21639679
Alignment:
Q  355 gagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacatcttgggtagt 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  21640135 gagagaaacttggattacaaaggagggaactctagggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaaacaccttgggtagt 21640036  T
Q  453 gagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctc-tttagggttcattattgagagagt-gggtaacacaaatgggtagaaattagg 550  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||  ||||    
T  21640035 gagatttcaccattggaaggatctaaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttca-tattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctagg 21639937  T
Q  551 tcttgttcttgtgtaagcttgcaagtta-ttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtc 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  21639936 tcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggcc 21639837  T
Q  650 atattggaccaaact-----agcaatc---ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatc-tgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctct 740  Q
    ||||||| |  ||||     | |||||   |||||||||||||||   || ||||| ||| ||||| ||| |||||||| |   ||||||||||||||||    
T  21639836 atattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc---ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttgtggtgttgctct 21639742  T
Q  741 acactaagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccact 805  Q
    ||||| || ||||| ||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21639741 acact-agactagggct-gtttttgttgttgttgcttggagacactttactcatagattaccact 21639679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 420 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 21983544 - 21983150
Alignment:
Q  420 gggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgaga 519  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||    
T  21983544 gggtggggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatcataagcttccttttgtgttttctctttagggttca-tattttga 21983446  T
Q  520 gagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc--tttgtaacactttcatcatagtgg 616  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21983445 gagtgggtgacacaaaatgggtagaaactaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctattttcttgtaactctttttgtaacactttcatcatagtgg 21983346  T
Q  617 attggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt- 710  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     | |||||| ||||  |||||||| ||||||||| ||| |||||| |     
T  21983345 attggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctcggtgcatttgttcc-ttttctttcgttgcttatctcta 21983247  T
Q  711 gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
     ||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||    ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21983246 ttgctttgattatgtttgtggtgttgctctacacccagatttaggtctggagtttgttgttgttgcttggagatactttacacattgattaccactt 21983150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 355 - 806
Target Start/End: Original strand, 23402787 - 23403242
Alignment:
Q  355 gagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtga 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23402787 gagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtga 23402886  T
Q  455 gatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaa---cacaaatgggtagaaattagg 550  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||   |||||||| ||| || |    | ||||||||||||||||||    
T  23402887 gatttcaccattggaatgatcaaaaagcttccttttgtgttttctc-ttaggattc---attgagagtgtgagtgatgtgaaaaatgggtagaaattagg 23402982  T
Q  551 tcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtca 650  Q
     ||||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||| ||||| || |||||||||    
T  23402983 acttgttcttttgtaagcttataagctaatttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtagattggagggctgctcactccctcagattaggtca 23403082  T
Q  651 tattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacac 744  Q
    |||| |||| || |     | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||| | |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23403083 tattagaccgaattgggtcaacaatcttagtgtgtttgttcc--tttctttcattgcttatatttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacac 23403180  T
Q  745 -taagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
     ||  | |||||||  ||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||    
T  23403181 ttacatttaggtct-gtttttgttgttgttgcttggaaacactttatccattgattatcactt 23403242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 54 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 21983867 - 21983541
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||  |  |||||| ||||||    
T  21983867 tgttgaaaattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgatttcatcatcgtgacacgattttgcaatgtcgtgagc-tggttt 21983769  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgt 252  Q
    ||||||||  |||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21983768 gcagggtgaccaatcgcggcatgattttgtgaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgt 21983669  T
Q  253 acgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaa 352  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||            |||||    
T  21983668 acgcaccaattgtgtcacgatttggaaaacgtgacacgattttgaccgctgaagacagctatataagtgttcttgtgcagatt------------ttgaa 21983581  T
Q  353 gtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21983580 gtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggt 21983541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 355 - 806
Target Start/End: Original strand, 9184948 - 9185391
Alignment:
Q  355 gagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtga 454  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9184948 gagagaaacattgattgcaaaggaggtaactttagggttgagtatctttgtagtaaggttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtga 9185047  T
Q  455 gatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtggg---taacacaaatgggtagaaattagg 550  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||   |||| |||||   ||  | ||||||||||||||||||    
T  9185048 gatttcaccattggaaggatcaaaaagcttccttgtgtgttttctc-ttaggattcatta---agagtgtgggtgatatgaaaaatgggtagaaattagg 9185143  T
Q  551 tcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtca 650  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||        || |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| |    
T  9185144 acttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt--------tc-ttgtaacactttcatcttagtggattggagagcttctctctcccccagactaggtta 9185234  T
Q  651 tattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacac 744  Q
    ||||||||| ||||     | ||||||||  |||||||||||  | |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9185235 tattggaccgaactgggtcaacaatcttg--gtgtttgttcc--tctctttcattgcttatctttattgctttgtttatgcttgtggtgtttctctacac 9185330  T
Q  745 taag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    | || ||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9185331 ttagatctaggtc--tgttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccactt 9185391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 432 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 56195 - 55807
Alignment:
Q  432 attgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaa-gtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaac 530  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  56195 attgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaaagcttctttttgtgttttctctt-aggattcattattgagagtgtgggtgac 56097  T
Q  531 acaaa-tgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctg 628  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  56096 acaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctg 55997  T
Q  629 ctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttat 723  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||     |  |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  55996 ctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatcttggtgtgtttgttcc-tttccttccattgcttatctttgtgctttgattat 55899  T
Q  724 gcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctatt--------ttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||        |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55898 gcttgtggtgttgctctatacttagatctaggtctgtttttttttattttattgttgttgcttggagacactttacacattgattaccactt 55807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 119 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 47676663 - 47676333
Alignment:
Q  119 cgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggttt-gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtac 217  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||| |     
T  47676663 cgtgtcacgattttctaggcagtgagcatggttttgcagggtgtccaatcgtgacacgattttgggaaaacgtgacacgattttcgg-cttgctgggcaa 47676565  T
Q  218 gttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg-ttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatat 316  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  47676564 gttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaaacgtgtcacgattttggaaaacgtgacacaattttgacagttgaagactgatatat 47676465  T
Q  317 aagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatc 415  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |   | ||    
T  47676464 aagtgttctt-tgcagattttgaagaggagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggagataactttagggttgagggtctttg-attagagttc 47676367  T
Q  416 tcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47676366 tcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 47676333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 101 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14070378 - 14070030
Alignment:
Q  101 gtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattt 200  Q
    ||||||||||||   || |||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14070378 gtgacacgattttggcatcgtggcacgattttcaaggcagtgagcatggttttcagggtgttcaatcgtgacacgattttgggaaaacgtgacacgattt 14070279  T
Q  201 tcaaacttgttgggtacg-ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg-ttttggaaaacgtgccacgattttgac 298  Q
    ||  ||||| | || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  14070278 tc-gacttgctaggcaagtttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtatgcaccaaacgtgtcacgatttgggaaaacgtgacacgattttgac 14070180  T
Q  299 agctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagt 397  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||  || || |||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| ||||     
T  14070179 agctgaagactgttatataagtgttctt-tgccgattttaaaggagggcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggctgagg 14070081  T
Q  398 gtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||||||| | |   | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14070080 gtctttg-attagagttctcttgggttgggtaacattgtaaacaccttgggt 14070030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 101 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14380406 - 14380058
Alignment:
Q  101 gtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattt 200  Q
    ||||||||||||   || |||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14380406 gtgacacgattttggcatcgtggcacgattttcaaggcagtgagcatggttttcagggtgttcaatcgtgacacgattttgggaaaacgtgacacgattt 14380307  T
Q  201 tcaaacttgttgggtacg-ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg-ttttggaaaacgtgccacgattttgac 298  Q
    ||  ||||| | || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  14380306 tc-gacttgctaggcaagtttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtatgcaccaaacgtgtcacgatttgggaaaacgtgacacgattttgac 14380208  T
Q  299 agctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagt 397  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||  || || |||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| ||||     
T  14380207 agctgaagactgttatataagtgttctt-tgccgattttaaaggagggcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggctgagg 14380109  T
Q  398 gtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||||||| | |   | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14380108 gtctttg-attagagttctcttgggttgggtaacattgtaaacaccttgggt 14380058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 311 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 3047622 - 3047186
Alignment:
Q  311 ctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttgg-attacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtg 409  Q
    |||||||||||||   || ||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3047622 ctatataagtgtttcagttcagattttgaagaagagctttaagagagagaaacttgggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtg 3047523  T
Q  410 aggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggtt 508  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||| || || ||| | ||    
T  3047522 aggttctcttgggttgggaaacactataatcatcttgggtagtgagatttcatcattggaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttatc-ttaagatt 3047424  T
Q  509 cattattgagagagtgggtaac--acaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacacttt 605  Q
    |   |||||||| |||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||  ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  3047423 c---attgagagtgtgggtgacttaaaaatgggtagaaattaggtcttgttctt-tgtgagcttttaagttgatttcttgtaactcatttgtaccacttt 3047328  T
Q  606 catcatagtggattggatagctgctctct-cccccatattaggtcatattggaccaaactag----caatcttggtgtgtttgttcctttttctttcatt 700  Q
    |||  |||||||||||||| | ||||||| |||||| |  ||||||||||||||| |||| |    | |||||||||||||||||  | |||||| | ||    
T  3047327 catattagtggattggataacggctctctccccccagagcaggtcatattggaccgaactgggttacgatcttggtgtgtttgtt-ttctttcttgc-tt 3047230  T
Q  701 gattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacac 744  Q
     |||||||   || |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  3047229 tattatcttgttgatttgattatgcttgtggtgttgctttacac 3047186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 121 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 47674468 - 47674140
Alignment:
Q  121 tgtcacgatttcccaggcagtgagcatggttt-gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgt 219  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||| | ||    
T  47674468 tgtcacgattttccaggcagtgagcatggttttgcagggtgtccaatcgtgacacgattttgggaaaacgtgacacgattttc-ggcttgctgggcaagt 47674370  T
Q  220 tttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg-ttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataa 318  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  47674369 tttcaggataaggttggtcgtaccttgggttgtacgcaccaaacgtgtcacgattttggaaaacatgacatgattttgacagctgaagactgctatatag 47674270  T
Q  319 gtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctc 417  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||| | ||||||  ||||||| | |   | ||||    
T  47674269 gtgttctt-tgcagattttgaagaggagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaacttcaaggttgaaggtctttg-attagagttctc 47674172  T
Q  418 ttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  47674171 ttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggt 47674140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 355 - 656
Target Start/End: Original strand, 1533211 - 1533519
Alignment:
Q  355 gagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacatcttgggtagt 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||    
T  1533211 gagagaaacttggattacaaaggagggaaccaaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagt 1533310  T
Q  453 gag-atttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgggtaa-cacaaatgggtagaaattag 549  Q
    ||| | ||||||||||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || ||| || ||||||||  |||    
T  1533311 gaggagttcaccattggaaggatctaaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtgggaaaacaccaaagggtagaatctag 1533409  T
Q  550 gtcttgtt-cttgtgtaagcttgcaagttatt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattag 646  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  1533410 gtcttgtttcttgtgtaagcttgcaagctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagatgctctctcccccagattag 1533509  T
Q  647 gtcatattgg 656  Q
    | ||||||||    
T  1533510 gccatattgg 1533519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 120 - 449
Target Start/End: Original strand, 4585804 - 4586132
Alignment:
Q  120 gtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgt 219  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||| ||    
T  4585804 gtgtcacgattttctaggcagtgagcatgttttgcagggtgtccaatcgtgacactattttgggaaaacgtgacaagatttttgg-cttgttgggtaagt 4585902  T
Q  220 tttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg-ttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataa 318  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  4585903 tttcaatataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaaacatgtcacgatttgggaaaatgtgacacgattttgacagctaaagactgttatataa 4586002  T
Q  319 gtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctc 417  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||| | |||| |||| |||||| |||   ||||||| |||||||||||||||||  |||||| | |   | ||||    
T  4586003 gtgttctt-tgcagattttgaaggagagttagaagagagaaaaacttgggaaatcaaaggatgtaactttagggttgaggctctttg-attagagttctc 4586100  T
Q  418 ttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4586101 ttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 4586132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 117 - 449
Target Start/End: Original strand, 18126284 - 18126615
Alignment:
Q  117 aacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggttt-gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggt 215  Q
    ||||||||| ||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||   |||||||||     
T  18126284 aacgtgtcatgattttctaggtagtgagtatggttttgcagggtgtccaatcgtg-cacgattttggaaaaacgtgatacgattttcgg-cttgttgggc 18126381  T
Q  216 acgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttg-gaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctat 314  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  18126382 aagttttcaggataatgttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaaacgtgtcacgatttgagaaaacgtgacacgattttgacagctaaagactgatat 18126481  T
Q  315 ataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgagga 413  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |   |     
T  18126482 ataagtgttctt-tgcagattttgaagaagagcttgaatagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagt 18126579  T
Q  414 tctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18126580 tctcatgggttgggaaacattgtaaacaacttgggt 18126615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 149 - 447
Target Start/End: Original strand, 23554711 - 23555009
Alignment:
Q  149 gtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacg-ttttcaagataaggttggtcgtaccttgg 247  Q
    |||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| | | |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23554711 gttttcagggtgtccaatcgtgacacgattttgggaaaacgtgacacgattttc-gacttgctgggcaagtttttcaggataaggttggtcgtacattgg 23554809  T
Q  248 gtcgtacgcaccaatcgtgccacgttt--tggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtaga 345  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  23554810 gtcgtacgcatcaatcgtgacacgattaatggaaaacgtgacacgattttgac-gctgaagactgctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggaga 23554907  T
Q  346 gcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatct 444  Q
    |||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| | |   | ||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  23554908 gcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaacttcagggttgaaggtctttg-attagagttctcttgagttgggaaacattgtaaacacct 23555006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 219 - 449
Target Start/End: Original strand, 1113397 - 1113628
Alignment:
Q  219 ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatata 317  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  1113397 ttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaaacgtgtcacgtattggcaaaacgtgacacgattttgacagctgaatactgttatata 1113496  T
Q  318 agtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatct 416  Q
    ||||||  ||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |   | |||    
T  1113497 agtgtttctgtgcagattttgaagaagaggttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagtaactttagggttgagggtctttg-attagagttct 1113595  T
Q  417 cttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1113596 cttgggttgggaaacattgtaaacaacttgggt 1113628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 188 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 2761759 - 2761507
Alignment:
Q  188 cgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgc 286  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||     
T  2761759 cgtgacacgattttcag-cttgctgggcaagttttcaggataagattggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaaacgtgtcacgatttgggaaaacgtga 2761661  T
Q  287 cacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaact 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| |||   ||||||||||||||    
T  2761660 cacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagataaacttgggaaatcaaaggaggtaact 2761562  T
Q  386 ttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaaca 441  Q
    ||||||||||   | |||| | |   | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2761561 ttagggttgatgatatttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 2761507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 417 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 35961078 - 35960682
Alignment:
Q  417 cttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaa-gtttccttttgtgtcttctctttagggttcattatt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||||| ||  |||||  ||    
T  35961078 cttgggttgggaaacattgtaaacaccttaggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaaagcttccttttgcgttttctcttaaga-ttcatcttt 35960980  T
Q  516 gagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagt 614  Q
    ||| | | | |  |   ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35960979 gagtgtgggtgatatgaaaatgggtagaaattaggtattgttcttttgtaagcttataagctaatttcttctaactcatttgtaacactttcatcatagt 35960880  T
Q  615 ggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctg 709  Q
    || |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||     | ||||||||||||||||||||   |||| || |||  ||||||     
T  35960879 ggtttggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactcggtcaacaatcttggtgtgtttgttc--atttcattaatttcttatctt 35960782  T
Q  710 t-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctatttt-ttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |  |||||| |||||||| |||||||| ||||||||| || | |||| || |||| |||||||| |||| |||| ||||||||   ||||||||||||||    
T  35960781 tattgctttatttatgctggtggtgtttctctacacttagatttaggcctgttttgttgttgttgttgcttggaaacactttatctattgattaccactt 35960682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 2058597 - 2057987
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgc 161  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   || |||| ||||||||     || |||||| | |||||||||  ||    
T  2058597 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttgaggtgccgtgagc-tagtttgcaggacgc 2058499  T
Q  162 tcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggt-tggtcgtaccttgggtcgtacgcacca 260  Q
      ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||| | | || || | |  |||||||  ||||| |||||||||| |||||||  |    
T  2058498 caaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgca--a 2058401  T
Q  261 atcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataa-gtgttcttgtgcagattttggagtagagcttg-aagtg--- 355  Q
    |||||| |||| | |||||| |||| |||||||    |||  |||| ||  ||||||  ||||||||||||||||||   |  |||||||| ||| |       
T  2058400 atcgtgacacgatctggaaatcgtggcacgattgcttcagaggaaggctagtatatattgtgttcttgtgcagatttgaaaagagagcttggaagagctt 2058301  T
Q  356 --agaga-aacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacatcttgggta 450  Q
      ||||| |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||    
T  2058300 agagagagaacttggattacaaaggagggaaccaaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggta 2058201  T
Q  451 gtgag-atttcaccatt---ggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgggtaac--acaaatgggtaga 543  Q
    ||||| | ||||  | |   || | |||| |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||   ||| |||||||||    
T  2058200 gtgaggagttcattagttgggggaggatctaaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacaacatatgggtaga 2058102  T
Q  544 aattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccat 641  Q
    |  |||| |||||||||||||||||||| | | ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  2058101 atctagggcttgttcttgtgtaagcttgaatgctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccag 2058002  T
Q  642 attaggtcatattgg 656  Q
    |||||| ||||||||    
T  2058001 attaggccatattgg 2057987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 355 - 746
Target Start/End: Original strand, 5817043 - 5817439
Alignment:
Q  355 gagagaaacttgg-attacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtg 453  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  5817043 gagagaaacttgggaatacaaaggaggtaactttatggttgagtgtctttgtagtgaggttctatttggttgggaaacattgtaaataccttggggagtg 5817142  T
Q  454 agatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaac---acaaatgggtagaaattag 549  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| || || ||||| |||   |||||||| ||| || ||   | |||||| ||||||||||    
T  5817143 agatttcaccattggaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttttc-ttaggattc---attgagagtgtgagtgacttgaaaaatggatagaaattag 5817238  T
Q  550 gtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaa-ctctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggt 648  Q
    || |||||||| ||| ||||   | |  | |||||||||| | ||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||    
T  5817239 gttttgttctt-tgtgagctcttatgcaaatttcttgtaacccctttgtatcactttcatattagtggattggagagctgctctct-ccccagagtaggt 5817336  T
Q  649 catattggaccaaac-----tagcaatc-ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatc-tgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctcta 741  Q
    ||||||||||| |||     || ||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||| |   ||  ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  5817337 catattggaccgaactgagttaacaatctttggtgtgtttgttcc--tttcttacattgcttatcattattgtgttgattatgcttgtggtgttgttcta 5817434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 150 - 449
Target Start/End: Original strand, 48489103 - 48489402
Alignment:
Q  150 tttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggt 249  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    |||| |||| | | || || ||||||||||||| ||||||||||    
T  48489103 tttgcagggtgttcaaccgtgacacgatttagggaaaacgtgacacggtttttgg-cttgctgggcatgcttccaggataaggttggtcataccttgggt 48489201  T
Q  250 cgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagct 348  Q
     |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||  | |||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |    
T  48489202 tgtacgcaccaatcgtgtcacgatttggcaaaacgtgacatgattttgacagttgcagggtactatttaagtgttcttgtgcagattttgaagaagagat 48489301  T
Q  349 tgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    |||||  |||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |   | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48489302 tgaagatagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgatggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 48489400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 188 - 441
Target Start/End: Original strand, 48491289 - 48491542
Alignment:
Q  188 cgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgc 286  Q
    |||||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||     
T  48491289 cgtgacacgattttcgg-cttgttgggcacgctttcaagattaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaaccgtgtcacgatttggcaaaacgtga 48491387  T
Q  287 cacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggatta--caaaggaggtaac 384  Q
    || |||||||| || || ||  | |||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||    
T  48491388 catgattttgatagttgcagggtactatttaagtgttcttgtgcagattttgaagaagaggttgaagagagagaaacttg-ataaatcaaaggaggtaac 48491486  T
Q  385 tttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaaca 441  Q
    |||||||||||| ||||||| | |   | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48491487 tttagggttgagggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaaca 48491542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 47264267 - 47263994
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||   || |||| ||||||||   |  |  |||||| ||||||    
T  47264267 tgttgaaatttggcttcaaatttgtggtttggaagaatagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgattttgtaatgtcgtgagc-tggttt 47264169  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgt 252  Q
    | ||||||   ||||||| ||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  47264168 gtagggtgtcaaatcgtggcacaattgtgtgaaatcgtgacacgattttcaaacttgctggttaagttttcaggataaggttggtcgtatcttgggtcgt 47264069  T
Q  253 acgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttg 327  Q
    ||| | ||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47264068 acgtatcaatcttgacacgatttggaaaacgtggcacgattttatcagctgaagactgctatataagtgttcttg 47263994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 352 - 656
Target Start/End: Original strand, 20357312 - 20357622
Alignment:
Q  352 agtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| || |||||||    
T  20357312 agtgagagaa-cttggataacaaaggagggaaccaaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 20357410  T
Q  450 agtgag-atttcacca-ttggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgggtaa-cacaaatgggtagaaa 545  Q
    |||||| | ||||  | |||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || |||| ||||||||||     
T  20357411 agtgaggagttcattagttggaaggatctaaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacacatatgggtagaat 20357509  T
Q  546 ttaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagttatt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccata 642  Q
     |||| | ||||||||||||| ||||| | | ||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  20357510 ctagggcatgttcttgtgtaaagcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccaaa 20357608  T
Q  643 ttaggtcatattgg 656  Q
    ||||| ||||||||    
T  20357609 ttaggccatattgg 20357622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 89 - 446
Target Start/End: Original strand, 26416925 - 26417284
Alignment:
Q  89 aacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaa 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    | || | ||||||| ||| | | |||  |||| ||| |||||||||||| |||    
T  26416925 aacagagaaatcgtgacacgatttcataagcgtgtcacgatttggttatgccgagagcatgtttt-ctgagtgtccaattgtgacacgattttggggaaa 26417023  T
Q  188 cgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgc 286  Q
     ||||||||||||| |   |||||||  | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||  || ||||     
T  26417024 tgtgacacgatttttagt-ttgttggacaagttttcagggtaaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaaccgtgtcacgatttggccaatcgtga 26417122  T
Q  287 cacgattttgacagctgaagactgctatataagtg-----ttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttg-gattacaaaggagg 380  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||     ||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||| ||||||| ||   |||||||||    
T  26417123 cacgattttgacggttgaagactgctatataagtgttaatttctt-tgcagattttgaagaagagcttgaa--gagataaacttgagaaatcaaaggagg 26417219  T
Q  381 taactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttg 446  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |   | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  26417220 taactttagggttgagggtctttg-attagagttctcttggattgggaaacattgtaaacaccttg 26417284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 163 - 447
Target Start/End: Original strand, 4178460 - 4178744
Alignment:
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacg-ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||| || | | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  4178460 caatcgtgacacgattttgggaaatcgtgacacgatttttgg-cttgttaggcaagattttcaggataaggttggtcgtaccttggatcgtacgcatcaa 4178558  T
Q  262 tcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagag 359  Q
    ||||| || | || ||  |||||||| |||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||    
T  4178559 tcgtggcaagattggggaaaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctataaaagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagag 4178656  T
Q  360 aaacttg-gattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    ||||||| ||   ||||||| | |||||||||||| || ||||||| | |   | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4178657 aaacttgagaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 4178744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 96 - 299
Target Start/End: Original strand, 27347542 - 27347745
Alignment:
Q  96 aaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagca-tggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgaca 194  Q
    |||| ||||||||||||  | | ||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27347542 aaatcgtgacacgatttgctaagcgtgtcacgattttctaggcagtgagcactgttttgcagggtgcccaatcgtgacacgattttgggaaaac-tgaca 27347640  T
Q  195 cgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccac-gttttggaaaacgtgccacgatt 293  Q
     |||||||   |||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||| ||| |||||||    
T  27347641 tgattttcgg-cttgctgggcaagttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaaacgtgtcacggtttgggaaaatgtgacacgatt 27347739  T
Q  294 ttgaca 299  Q
    ||||||    
T  27347740 ttgaca 27347745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 163 - 449
Target Start/End: Original strand, 43863947 - 43864215
Alignment:
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaat 262  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43863947 caatcgtgacacgattttgggaaaacgtgacacgattttcggt-ttgttaggaaagttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa- 43864044  T
Q  263 cgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctata---taagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagag 359  Q
                      ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| |||||    
T  43864045 ------------------acgtgacacaattttgacagttgaagactgctataatataagtgttctt-tgtagattttgaagaatagcttgaagagagag 43864125  T
Q  360 aaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||||||||   | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43864126 aaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttg-attaaagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 43864215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 219 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 24515187 - 24514959
Alignment:
Q  219 ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatat 316  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| || ||  |||||| | |||||||| ||| || |||||| |||||||    
T  24515187 ttttcaggataaggttggtcgtaccttggatcgtacgcatcaatcgtggcacgattggggaaaaacgcgacacgatttagac-gcagaagacagctatat 24515089  T
Q  317 aagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatc 415  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||   ||||||| | |||||||||||| || ||||||| | |   | ||    
T  24515088 aagtgttctt-tgcagattttgaaggggagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggtctttg-attagagttc 24514991  T
Q  416 tcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24514990 tcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 24514959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 219 - 447
Target Start/End: Original strand, 35853654 - 35853884
Alignment:
Q  219 ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg----aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctat 314  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| || |     |||||||| |||||||||||| || |||||| |||||    
T  35853654 ttttcaggataaggtcggtcgtaccttggatcgtacgcatcaatcgtggcacgattggagaaaaaaacgtgacacgattttgac-gcagaagacagctat 35853752  T
Q  315 ataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgagga 413  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||  | |||||||||||| || |||||||   ||||      
T  35853753 ataagtgttctt-tgcagattttgaagaagagcttgaagagagagaaacttaggaaatcaaaggtagcaactttagggtttagggtctttgatttgagt- 35853850  T
Q  414 tctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35853851 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 35853884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 150 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 4539046 - 4538858
Alignment:
Q  150 tttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggt 249  Q
    |||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    ||| |  | | ||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  4539046 tttgaagggtgcctaatcgtgacacgattttgggaaaacgtgacacgattttcggt-ttgctaagcaagttttcaggacaaggttggtcgtaccttggat 4538948  T
Q  250 cgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttg 338  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||| ||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  4538947 cgtacgcaccaaacgtgtcacgatttggcaaaatatgacacgattttgacagctaaagactgctatataagtgtttctttgcagattttg 4538858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 147 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 25767453 - 25767234
Alignment:
Q  147 tggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataagg-ttggtcgtacctt 245  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | || ||||  | |||||||   |||||| ||||    
T  25767453 tggtttgcagggtgccaaatcgtgacacgattttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtttctaggataaggacaggtcgtgcctt 25767354  T
Q  246 gggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtaga 345  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||  ||||||| |||| |||||||||  ||   |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  25767353 gtgacgtacgtaccaatcgtgacacgacttggaaatcgtgacacgattttatcaatggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggaga 25767254  T
Q  346 gcttgaagtgagagaaacttg 366  Q
    || ||||| ||||||||||||    
T  25767253 gc-tgaagagagagaaacttg 25767234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 397 - 604
Target Start/End: Original strand, 9235398 - 9235605
Alignment:
Q  397 tgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtct 495  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||| |    
T  9235398 tgtcttcgtagtgagattctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggatagtgatatttcaccattgcaaggatcaaaaagcttccttttgtgttt 9235497  T
Q  496 tctctttagggttcattattgagagagtggg---taacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc 592  Q
    |||| ||||| |||    ||||||| | |||   ||  | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||| || |||||||||||||    
T  9235498 tctc-ttaggattc---gttgagagtgcgggtgatatgaaaaatgggtagaaattaggacttgttcttttgtaagcttataagctaatttcttgtaactc 9235593  T
Q  593 tttgtaacactt 604  Q
     |||||||||||    
T  9235594 attgtaacactt 9235605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 278 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 30025099 - 30024973
Alignment:
Q  278 aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaag 376  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||   |||||    
T  30025099 aaaacgtgacacgattttgacagctgaagactactatataagtgttctt-tgcagattttgaatgagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaag 30025001  T
Q  377 gaggtaactttagggttgagtgtctttg 404  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  30025000 gaggtaactttagggttgagggtctttg 30024973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 32358580 - 32358419
Alignment:
Q  119 cgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacg 218  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||   ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||| |||    
T  32358580 cgtgacacgattttctaggcagtgagcatggttttcagggtatccaatcgtgatacgattttgggaaaacgtgacacaattttc-agcttgctgggcacg 32358482  T
Q  219 ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaa 281  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| || | |||||||||    
T  32358481 ttttcaggataaagttgatcgtaccttggatcgtacgcaccaaacgtgtcatgatttggaaaa 32358419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 271
Target Start/End: Original strand, 2389716 - 2389867
Alignment:
Q  119 cgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacg 218  Q
    |||| |||||||| | || |||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||| |||| |||    
T  2389716 cgtggcacgattttctagacagtgagcatggtttttagggtgtccaatcgtgacacgattttgagaaaatgtgacacgattttc-agcttgctgggaacg 2389814  T
Q  219 ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg 271  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||    
T  2389815 ttttcaggataaggttggtcgtaccttggatcgtacacaccaaacgtgtcacg 2389867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 226 - 447
Target Start/End: Original strand, 29990803 - 29991024
Alignment:
Q  226 gataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgtt 323  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||| || ||  |||| ||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  29990803 gataagattgatcgtaccttgagtcgtacgcatcaatcgtggcacgattggggaaaaatgtgacacgatttcgac-gctgaagattgctatataagtgtt 29990901  T
Q  324 cttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttggg 422  Q
    ||| ||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||||||| |||   ||||||||  |||||||||||| || ||||||| | |   | |||||||||    
T  29990902 ctt-tgcagattttgaaggtgagtttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggagacaactttagggtttagggtctttg-attagagttctcttggg 29990999  T
Q  423 ttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  29991000 ttgggaaacattgtaaacaccttgg 29991024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 150 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6360625 - 6360499
Alignment:
Q  150 tttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggt 249  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  6360625 tttgcagggtgcccaattgtgacacgattttggggaaacgtgacacgattttcgg-cttgttgggcaagttttcaggataatgttggtcgtatcttgggt 6360527  T
Q  250 cgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg 277  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||    
T  6360526 cgtacgcaccaaacgtgtcacgatttgg 6360499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 149 - 317
Target Start/End: Original strand, 19495641 - 19495811
Alignment:
Q  149 gtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacg-ttttcaagataaggttggtcgtaccttgg 247  Q
    |||| |||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19495641 gttttcagggtgtccaatcgtgacacaattttgggaaaacgtgccacgattttttggcttgctgggcaagattttcaggataaggttggtcgtaccttgg 19495740  T
Q  248 gtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatata 317  Q
    |||||||||| |||||||| |||| | |||  |||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  19495741 gtcgtacgcatcaatcgtgacacgatctgggaaaaacgtgacacgatttcgac-gctgaagactgatatata 19495811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 54 - 292
Target Start/End: Original strand, 39730933 - 39731172
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||   || |||| ||||||||    | || |||||| ||||||    
T  39730933 tgttgagatttggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagc-tggttt 39731031  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataagg-ttggtcgtaccttgggtcg 251  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| ||| | || ||||||||||||| |||||||| | | || |||| || |||||||  ||||||||||||||| ||    
T  39731032 gcagggtgccaaatcgtgacacgatcttgaggaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgggacg 39731131  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgat 292  Q
    |||| |||||||||| |||| | |||||| |||| ||||||    
T  39731132 tacgtaccaatcgtgacacgatctggaaatcgtgacacgat 39731172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 247 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 31733361 - 31733166
Alignment:
Q  247 ggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtaga 345  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| ||||| |||||||| |||||||||||       |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |    
T  31733361 ggtcgtacgcaccaaacgtgtaacgatttgggaaaacgtgacacgattttga-------agactgctatataagtgttctt-tgcagattttgaagaaaa 31733270  T
Q  346 gcttgaagtgagagaaacttg-gattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatct 444  Q
    ||| |||| |||||||||||| ||   |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| | |   | |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31733269 gctggaagagagagaaacttgagaaatcaaaagaggtaactttagagttgagggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacct 31733171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 533 - 738
Target Start/End: Original strand, 28617177 - 28617386
Alignment:
Q  533 aaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactct-ttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctc 631  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28617177 aaataggtagaaattaggttttgttctt-tgtgagcttttaagctaatttcttgtaaccccattgtatcactttcatcttagtggattggagagctgctc 28617275  T
Q  632 tctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtg-tgctttgtttatgc 725  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| ||||     | |||| ||||||||||||||  || ||| ||  ||| |||||| || |||||||  |||||    
T  28617276 tctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaatattggtgtgtttgtt--ttcttcctttcttgcttatctttgttgctttgaatatgc 28617373  T
Q  726 ttgtggtgttgct 738  Q
    |||||||||||||    
T  28617374 ttgtggtgttgct 28617386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 667 - 806
Target Start/End: Original strand, 9235646 - 9235786
Alignment:
Q  667 caatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgt-gctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctatttt-t 763  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||| | || | ||||||| |||| |    
T  9235646 caatcttggtgtgtttgttcattt--ctttcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctctacatttagatttaggtctgtttttt 9235743  T
Q  764 tgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9235744 tgttgttgttgcttggagacactttatccattgattaccactt 9235786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 53 - 271
Target Start/End: Original strand, 48408397 - 48408616
Alignment:
Q  53 ttgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggtt 151  Q
    ||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||   || |||| ||||||||    | || |||||| |||||    
T  48408397 ttgttgagatttggcttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagc-tggtt 48408495  T
Q  152 tgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataagg-ttggtcgtaccttgggtc 250  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||| | | || ||||  | |||||||  |||||||||||||   |    
T  48408496 tgcagggtgccaaatcgtgacacgatcttgagaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttctaggataaggactggtcgtaccttgtaac 48408595  T
Q  251 gtacgcaccaatcgtgccacg 271  Q
    ||||| |||||||||| ||||    
T  48408596 gtacgtaccaatcgtgacacg 48408616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 216 - 441
Target Start/End: Original strand, 6570331 - 6570557
Alignment:
Q  216 acgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaa-cgtgccacgattttgacagctgaagactgctat 314  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| |||||  || |||| |||| |||||||| ||||| |||  | |    
T  6570331 acgtttttaggataaggttgatcgtaccttgggtcatacgcatcaaccgtgtcacgatttggccaatcgtgacacgtttttgacaactgaaaactattgt 6570430  T
Q  315 ataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttg-gattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgagga 413  Q
     ||||||||  | |||| |||||| || ||||||| ||| | |  ||||||| ||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  ||     
T  6570431 ttaagtgtttctttgcatattttgaaggagagcttaaagaggggaaaacttgagaaatcaaaggaggtaactttaggattgagtgtctttg-actagggt 6570529  T
Q  414 tctcttgggttgggaaacattgtaaaca 441  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6570530 tctcttggggtgggaaacattgtaaaca 6570557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 43504709 - 43504503
Alignment:
Q  66 gctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggtttgcagggtgctca 164  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||   || |||| |||||||||   | || |||||| |||||||||||||||  |    
T  43504709 gcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagc-tggtttgcagggtgccaa 43504611  T
Q  165 atcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataagg-ttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatc 263  Q
    |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||| | | || |||| || |||||||  ||||||||||||||| |  | |||||||||    
T  43504610 atcgtgacacgatcgtgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgggacagatgcaccaatc 43504511  T
Q  264 gtgccacg 271  Q
    ||| ||||    
T  43504510 gtgacacg 43504503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 312 - 456
Target Start/End: Original strand, 19502013 - 19502156
Alignment:
Q  312 tatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttg-gattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtga 410  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||||||| ||   |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |      
T  19502013 tatataaatgttctt-tgcagattttgaaggagagcttaaagagagacaaacttgagaaatcaaatgaggtaactttagggttgagggtctttg-attag 19502110  T
Q  411 ggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgaga 456  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  19502111 agttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaga 19502156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 293 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 2759131 - 2759072
Alignment:
Q  293 tttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaag 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  2759131 tttgacagctgaagactgctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaag 2759072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 582 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 19992408 - 19992335
Alignment:
Q  582 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  19992408 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 19992335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 582 - 656
Target Start/End: Original strand, 24024316 - 24024389
Alignment:
Q  582 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  24024316 tcttgtaacattttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 24024389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 30026482 - 30026391
Alignment:
Q  162 tcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacg 255  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||  ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30026482 tcaatcgtgacatgattttggggaaacgtgacacgattttc-agcttgccgggcacg-tttcaggataaggttggtcgtaccttgagtcgtacg 30026391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 38671495 - 38671419
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38671495 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 38671419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 312 - 447
Target Start/End: Original strand, 39731211 - 39731346
Alignment:
Q  312 tatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtga 410  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| || |||| | |||| |||||||||||||   | ||||||  |||||| ||||||| || |||||||    ||    
T  39731211 tatttaagtgttcttgtgcagattttgaag-agagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggtctttgattaga 39731309  T
Q  411 ggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39731310 gcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 39731346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 593 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 4866814 - 4866752
Alignment:
Q  593 tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  4866814 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 4866752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 12397007 - 12396933
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  12397007 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgttctctcccccagattaggccatattgg 12396933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 16880169 - 16880095
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  16880169 ttcttgtaactctttgtaaaacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg 16880095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 16885025 - 16884951
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  16885025 ttcttgtaactctttgtaaaacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg 16884951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 198
Target Start/End: Original strand, 21811747 - 21811882
Alignment:
Q  63 ttggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgct 162  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||   || |||| |||||| |   | || |||||||  |||||||||||||     
T  21811747 ttggcttcaaatttgtggtctggaagaacagaggaatcgtgtcacgattttgccatcgtgacacgatctgagatgccgtgagcaatgtttgcagggtgca 21811846  T
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgat 198  Q
     ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  21811847 aaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgat 21811882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 34311348 - 34311285
Alignment:
Q  117 aacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgatttt 180  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||    
T  34311348 aacgtgtcacgattttctaggcagtgagcatggtttgcagggtgtccaatcatgacacgatttt 34311285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21640416 - 21640279
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggtttgcagggtg 160  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   || |||| |||||||||   | || |||||| | |||||||||  |    
T  21640416 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagc-tagtttgcaggacg 21640318  T
Q  161 ctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgatt 199  Q
    |  ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21640317 ccaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgatt 21640279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 293
Target Start/End: Original strand, 24789426 - 24789664
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | ||| ||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||   || |||| |||||||||   | || |||||| | ||||    
T  24789426 tgttgagatttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtggtgccgtgagc-tagttt 24789524  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataagg-ttggtcgtaccttgggtcg 251  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||| | | || || | |  |||||||  ||||| |||||||||| |    
T  24789525 gcagggtgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttg 24789624  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgatt 293  Q
    ||||||  |||| || |||| |||||||| |||| |||||||    
T  24789625 tacgca--aatcttgacacgatttggaaatcgtgacacgatt 24789664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 582 - 656
Target Start/End: Original strand, 31109573 - 31109646
Alignment:
Q  582 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  31109573 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccctagattaggccatattgg 31109646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 35961503 - 35961457
Alignment:
Q  142 gagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaac 188  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35961503 gagcatgtttttcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaac 35961457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 372 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 24526170 - 24526094
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |  || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24526170 caaaggagataactttagggttgagggtctttg-attatggttctcttaggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 24526094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 409 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 12098096 - 12098056
Alignment:
Q  409 gaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12098096 gaggttctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 12098056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 725 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 21645955 - 21645877
Alignment:
Q  725 cttgtggtgttgctctacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccact 805  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21645955 cttgtggtgttgctctacacta-gactagggctgttttt-gttgttgttgcttggagacactttactcatagattaccact 21645877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Original strand, 24261311 - 24261386
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  24261311 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg 24261386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Original strand, 24266190 - 24266265
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  24266190 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg 24266265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 44847617 - 44847677
Alignment:
Q  52 attgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44847617 attgttgaaatttggcttcaaatttgtggtttaaaagaacagagaaatcgtgacacgattt 44847677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 48599991 - 48599939
Alignment:
Q  150 tttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttc 202  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  48599991 tttgcagggtgcacaatcgtgacacgattatggggaaacgtgacacgattttc 48599939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 12406427 - 12406353
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  12406427 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctattctctcccccagattaggccatattgg 12406353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 4873714 - 4873664
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  4873714 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 4873664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 610 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 7351716 - 7351662
Alignment:
Q  610 atagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  7351716 atagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaact 7351662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 12406850 - 12406800
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  12406850 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 12406800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 112
Target Start/End: Original strand, 20357035 - 20357085
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  20357035 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 20357085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 242
Target Start/End: Original strand, 29608207 - 29608299
Alignment:
Q  150 tttgcagggtgctcaatcgtgtcacgatttt-gggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtac 242  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||| ||| ||| |||| || |||||| | ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  29608207 tttgcagggtgtccaatcgtgacacgatttttggggaaaagtgatacaattttcga-cttgttgggcaagttttcaggataaggttggtcgtac 29608299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 447
Target Start/End: Original strand, 48408629 - 48408772
Alignment:
Q  303 gaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtct 401  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| |||||||||||||   | ||||||  | |||| ||||||| || ||||    
T  48408629 gaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattttgaag-agagcg-gaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggtct 48408726  T
Q  402 ttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    |||    |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48408727 ttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 48408772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 2759041 - 2759009
Alignment:
Q  291 attttgacagctgaagactgctatataagtgtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2759041 attttgacagctgaagactgctatataagtgtt 2759009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 233 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 3050556 - 3050492
Alignment:
Q  233 ttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaa-cgtgccacgattttg 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||| |||| ||||||||||    
T  3050556 ttggtcgtaccttgggtcgtacgcatcaatcgtgacatcatttggaaaatcgtgacacgattttg 3050492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 112
Target Start/End: Original strand, 31109075 - 31109127
Alignment:
Q  60 aaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  31109075 aaattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 31109127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 372 - 404
Target Start/End: Original strand, 40808485 - 40808517
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttg 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40808485 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttg 40808517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 414 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 41649242 - 41649206
Alignment:
Q  414 tctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggta 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41649242 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggta 41649206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 109
Target Start/End: Original strand, 1532884 - 1532939
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacga 109  Q
    |||||| | ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1532884 tgttgatatttggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacga 1532939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 208
Target Start/End: Original strand, 1532998 - 1533057
Alignment:
Q  149 gtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaactt 208  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  1532998 gtttgcagggtgccaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattgtgaaactt 1533057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 219 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 496421 - 496339
Alignment:
Q  219 ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg-ttttggaaaacgtgccacgattttgacag 300  Q
    |||||| |||||||||||   ||||||| |||||||||| ||| |||| |||| |||||| |||||||  |||||||||||||    
T  496421 ttttcaggataaggttggatttaccttgagtcgtacgcatcaaccgtgtcacgattttgggaaacgtgatacgattttgacag 496339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 12397485 - 12397435
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  12397485 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgcgacacgattt 12397435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 66 - 199
Target Start/End: Original strand, 24023830 - 24023963
Alignment:
Q  66 gctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttc-ccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctca 164  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    || |||| |||||||||    ||||| |||| | |||||||||  ||  |    
T  24023830 gcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattgtggcatcgtggcacgatttcaagtggcagagagc-tagtttgcaggacgccaa 24023928  T
Q  165 atcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgatt 199  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24023929 atcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatt 24023963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 355 - 449
Target Start/End: Original strand, 31109392 - 31109489
Alignment:
Q  355 gagagaaacttggattacaaaggaggtaacttta-gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||| |||  || ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||    
T  31109392 gagaaaaacttggatagcaaaggagggaaccatatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 31109489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 610 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 31155975 - 31155921
Alignment:
Q  610 atagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  31155975 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaact 31155921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 4873398 - 4873329
Alignment:
Q  361 aacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa 430  Q
    ||||||||| |||||||||| |||    ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||    
T  4873398 aacttggataacaaaggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa 4873329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 610 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 7349337 - 7349288
Alignment:
Q  610 atagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggacc 659  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  7349337 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggacc 7349288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 41317666 - 41317633
Alignment:
Q  414 tctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41317666 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 41317633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 410; Significance: 0; HSPs: 83)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 147 - 806
Target Start/End: Original strand, 5757044 - 5757705
Alignment:
Q  147 tggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttg 246  Q
    ||||||||||||||   |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  5757044 tggtttgcagggtgtcaaatcgtggtacgattttgtgaaatcgtgacacgattttcaaacttgctggttaagttttcaggataaggttggtcgtaccttt 5757143  T
Q  247 ggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagag 346  Q
    ||||||| | | |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  5757144 ggtcgtatgtatcaatcgtggcacgatttggaaaacgtggcacgattttatcagctgaagactgctaaataagtgtttttgtgcagattttggaggagag 5757243  T
Q  347 cttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttg 446  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5757244 ctggaagagagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtatttaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 5757343  T
Q  447 ggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaat 546  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  5757344 ggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaagcttccttccgtgtcttctctttagggttcattattgagagagagtggaacacaaatgggtagaaat 5757443  T
Q  547 taggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattag 646  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5757444 taggtcttgttcttgtataagcttgcaagctattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattag 5757543  T
Q  647 gtcatattggaccaaact-----agcaatc--ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctc 739  Q
    ||||||||||||| ||||     | |||||  ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5757544 gtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcc---ttctttcattgcttatctttgttctttgtttatgcttgtggtgttgctc 5757640  T
Q  740 tacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||||| ||  |||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757641 tacact-agattaggtct-gtttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccactt 5757705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 806
Target Start/End: Original strand, 31085952 - 31086691
Alignment:
Q  61 aattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtg 160  Q
    ||||||||| |||| |||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31085952 aattggcttcaaatttgtggtttagaagaacagagaaatcgtgacacgatttcatcagcgtgtcatgatttcc-aggcagtgagcatggtttgcagggtg 31086050  T
Q  161 ctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgtttt-caagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcacc 259  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31086051 ctcaatcgtgtcacgattttggaaaaacgtgacacgattttcaaacttgctaggtacgtttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcacc 31086150  T
Q  260 aatcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgag 357  Q
    ||||||| |||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||| |||    
T  31086151 aatcgtgtcacgatttggcaaaaacgtgacacgattttgatagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggtgagctggaagagag 31086250  T
Q  358 agaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagat 457  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  31086251 agaaacttggattacaaagggggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttaggttgagaaacattgtaaacaccttgggttgtgagat 31086350  T
Q  458 ttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgt 556  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||||  ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||     
T  31086351 ttcaccattggaaggatcaaaagcttctttttatgttttctc-ttaggattcattatt--gagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgc 31086447  T
Q  557 tcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaact-ctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattg 655  Q
    ||||||||||||||  ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  31086448 tcttgtgtaagcttataagctaatttcttgtaactcctttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccctagattagatcatattg 31086547  T
Q  656 gaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-t 749  Q
    |||  ||||     | |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||          ||||| |||||||||||||| || |    
T  31086548 gactgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tttctttcattgcttatctttgtgct----------ttgtgatgttgctctacacttagat 31086635  T
Q  750 ctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
     || ||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31086636 ttatgtct-gtttttgttgtttttgcttggagacactttatccattgattaccactt 31086691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 806
Target Start/End: Original strand, 5016975 - 5017701
Alignment:
Q  61 aattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtg 160  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5016975 aattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagaaaaatcgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccaag-cagtgagcatggtttgcagggtg 5017073  T
Q  161 ctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgtttt-caagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcacc 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5017074 ctcaatcgtgtcacgattttgagaaaacgtgacacgattttcaaacttactgggtacatttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcacc 5017173  T
Q  260 aatcgtgccacgttttggaaaac-gtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgaga 358  Q
    ||||||| |||| |||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    |||  |||    
T  5017174 aatcgtgtcacgatttgaaaaaatgtgacacgattttgacagctgaagaccgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggaaaaagaaaga 5017273  T
Q  359 gaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatt 458  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  5017274 gaaacttggattacaaacgagataactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtaatgagatt 5017373  T
Q  459 tcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgt 556  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||                   |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5017374 tcaccattggaaggatcgaaaagcttcctt-------------------ttcattattgagagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgt 5017454  T
Q  557 tcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||||||  ||| || ||||          ||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  5017455 tcttgtgtaagcttataagctaatttc----------ttgtaacactttcatcatagtagattggagggttgctctctcccctagattaggtcatatttg 5017544  T
Q  657 accaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tc 750  Q
    ||| ||||     | |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  5017545 accgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tttctttcattgcttatctttgtgctttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatc 5017642  T
Q  751 taggtc---tattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||||||   | |||||| ||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5017643 taggtctgttttttttttttgttgttgcttggagacactttatccattgattaccactt 5017701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 87 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 31980108 - 31979381
Alignment:
Q  87 agaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttg-cagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaa 185  Q
    ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  31980108 agaacagagaaatcgaagcacgatttcatcaacgtgtcacgattttc-aggcagtgagcatggtttttcagggtgatcaatcgtgtcacgattttggaaa 31980010  T
Q  186 aacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgga-aaacgt 284  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  31980009 aacgtgacacaattttcaa-cttgctgggcacgttttcaggataaggttggtcgtactttgagtcgtacgcaccaatcgtgtcacgatttggacaaacgt 31979911  T
Q  285 gccacgattttgacagctgaagactgctatata----agtgttct-tgtgcagattttg-gagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaagga 378  Q
    | |||||||||||||  ||||||||||||||||    |||||| | | | ||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||| | |||||||    
T  31979910 gacacgattttgacaattgaagactgctatatatataagtgttttctttccagattttgagag-agagcttttagagagagaaacttggactgcaaagga 31979812  T
Q  379 ggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaa 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31979811 ggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggttcttttgggttgagaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaa 31979712  T
Q  479 agtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac--aaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagt 576  Q
    || |||||||||||| ||||| ||||| |||   |||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  31979711 agcttccttttgtgttttctc-ttaggattc---attgagagtgtgggtgacacaaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttttgtaagcttataagt 31979616  T
Q  577 tattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaat 670  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||     | ||||    
T  31979615 taatttcttgtaactcttttgcaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaat 31979516  T
Q  671 cttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttg 768  Q
    |||||||||||||||||  | | |||||||| |||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||  |||||||||    
T  31979515 cttggtgtgtttgttcc--tctatttcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtgatgttgctctacacttagatttaggtct-gtttttgttg 31979419  T
Q  769 ttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    || |||| || ||||||||||   ||||||||||||||    
T  31979418 ttgttgcttgaagacactttatctattgattaccactt 31979381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 150 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 22964226 - 22963567
Alignment:
Q  150 tttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||  | ||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  22964226 tttgcagggtgttcaatcgtgatacgattttgggaaaacgtgacacgatttttgg-cttgctggacaagttttcaggataaggttggtcgtaccttgtat 22964128  T
Q  250 cgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagct 348  Q
    ||||||| |||| |||| |||  ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  22964127 cgtacgcgccaaacgtgtcacaatttgggaaaacgtgacacgattttgacggctgaagactgctatataagtgttctt-tgcagattttgaactagagct 22964029  T
Q  349 tgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttggg 448  Q
    ||||  ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  22964028 tgaaaagagagaaactttgattacaaaagagctaactttagggttgagtgtctttgtagtgaagatctcttggattgggaaacattgtaaacaccttggg 22963929  T
Q  449 tagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaac-acaaatgggtagaaatt 547  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| || || | |||||||||||||||    
T  22963928 tagtgagatttcaccattggaaggatcaaaaatttccctttgtgttttct-tttaggattcattattgagagtgtgagtgacaaaaaatgggtagaaatt 22963830  T
Q  548 aggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattag 646  Q
    | | |||||| ||||||||| ||  ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||| |    
T  22963829 acggcttgtt-ttgtgtaaggttataagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctct-ccccagatttg 22963732  T
Q  647 gtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctct 740  Q
    ||||||||| ||| ||||     | |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22963731 gtcatattgcaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tttctttcatagcttatctctattgctttgattatgcttgtggtgttgctct 22963634  T
Q  741 acactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  22963633 acacttagatctaggtctgttttttgttgttgttgcttggagacactttattaattgattaccactt 22963567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 150 - 806
Target Start/End: Original strand, 23824167 - 23824826
Alignment:
Q  150 tttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggt 249  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||  | ||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  23824167 tttgcagggtgttcaatcgtgatacgattttgggaaaacgtgacacgatttttgg-cttgctggacaagttttcaggataaggttggtcgtaccttgtat 23824265  T
Q  250 cgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagct 348  Q
    ||||||| |||| |||| |||  ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  23824266 cgtacgcgccaaacgtgtcacaatttgggaaaacgtgacacgattttgacggctgaagactgctatataagtgttctt-tgcagattttgaactagagct 23824364  T
Q  349 tgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttggg 448  Q
    ||||  ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  23824365 tgaaaagagagaaactttgattacaaaagagctaactttagggttgagtgtctttgtagtgaagatctcttggattgggaaacattgtaaacaccttggg 23824464  T
Q  449 tagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaac-acaaatgggtagaaatt 547  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| || || | |||||||||||||||    
T  23824465 tagtgagatttcaccattggaaggatcaaaaatttccctttgtgttttct-tttaggattcattattgagagtgtgagtgacaaaaaatgggtagaaatt 23824563  T
Q  548 aggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattag 646  Q
    | | |||||| ||||||||| ||  ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||| |    
T  23824564 acggcttgtt-ttgtgtaaggttataagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctct-ccccagatttg 23824661  T
Q  647 gtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctct 740  Q
    ||||||||| ||| ||||     | |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23824662 gtcatattgcaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tttctttcatagcttatctctattgctttgattatgcttgtggtgttgctct 23824759  T
Q  741 acactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  23824760 acacttagatctaggtctgttttttgttgttgttgcttggagacactttattaattgattaccactt 23824826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 154 - 659
Target Start/End: Original strand, 5571837 - 5572319
Alignment:
Q  154 cagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgta 253  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  5571837 caggatgctcaatcgtgtcacgattttgagaaaacgtgacacgattttcaa-cttgctgggcacgtttttaggttaaggttggtcgtaccttgggtcgta 5571935  T
Q  254 cgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaag 353  Q
    ||||||||||||| ||||                   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| | |    
T  5571936 cgcaccaatcgtgacacg-------------------attttgacaactgaagactgctatataagtgttcttgtggagtttttgaaggagagcttta-g 5572015  T
Q  354 tgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtg 453  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5572016 agagagaaacttggattacaatggaggtaactttagggttgggtgtctttgtagtggggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtg 5572115  T
Q  454 agatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtc 552  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||   |||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  5572116 agatttcactattggaatgatcaaaagcttccttttgtgttttctc-ttaggattc---attgagagtgtgggtgacacaaaatgcgtagaaattaggtc 5572211  T
Q  553 ttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcat 651  Q
    ||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||    
T  5572212 ttgttcttgtgtaagcttataagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcat 5572311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 397 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 21356318 - 21355906
Alignment:
Q  397 tgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtctt 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  21356318 tgtctttgtagtgaggatctcttgggttaggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcatcattggaagaatcaaaagcttccttttgtgtctt 21356219  T
Q  497 ctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagtta-ttttcttgtaactcttt 595  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  21356218 ttctttagggttcattattgagagagtgagaaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatttttcttgtaactctta 21356119  T
Q  596 gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatc--ttggtgtgtttgttcct 688  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||     | |||||  |||||||||||||   |    
T  21356118 gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgt---t 21356022  T
Q  689 ttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacacttt 788  Q
    | ||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||| |||| || |||||||||    
T  21356021 tcttctttcattgcttatctttgttctttgtatatgcttgtggtgttgctctacact-agactaggtct-gtttttgttgttgttgcttgaagacacttt 21355924  T
Q  789 acacattgattaccactt 806  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21355923 acacattgattaccactt 21355906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 61 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 18234701 - 18234334
Alignment:
Q  61 aattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggt-ttgcagggt 159  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||  || |||  |||||||| || ||||||    
T  18234701 aattggctttaaatttgtggtttggaagaacagagaaatgttgacacgatttcatcaacgtgttatgatttct-agacagcaagcatggtgtttcagggt 18234603  T
Q  160 gctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcacc 259  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18234602 gctcaatcgtgtcaggattttgggaaaacgtgatacgattttcaaacttgctgggtacgttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcacc 18234503  T
Q  260 aatcgtgccacgttttgga-aaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgaga 358  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |    
T  18234502 aatcgtgtcacgatttggacaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagtttttgaaggagagcttgaagagaaa 18234403  T
Q  359 gaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18234402 gaaacttggattacaaaggaggtagctttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg 18234334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 54 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 22709645 - 22708888
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||   ||||||| ||||||||    | ||  ||||| ||||||    
T  22709645 tgttgagatttggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcatgacacgaatttggcaacgtgacacgattttgtgatgccatgagc-tggttt 22709547  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggt-tggtcgtaccttgggtcg 251  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | | || |||| || |||||||  ||||||||||||| | ||    
T  22709546 gcagggtgccaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgtgacg 22709447  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttg- 350  Q
    |||  || ||||||| ||||  ||||||| |||| |||||||||   ||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  22709446 tacatacaaatcgtgacacgacttggaaatcgtgacacgattttattagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattttggagtagagtttgg 22709347  T
Q  351 ---------aagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaaca 441  Q
             ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22709346 aagagtttgaagagagaaaaacttggattacaaaggagggaactctagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaaca 22709247  T
Q  442 tcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctc-tttagggttcattattgagagagt-gggtaacacaaatggg 539  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  22709246 ccttggatagtgagatttcaccattggaaggatcaaaaacttcctcttgtgtcttctcttttagggttca-tattgtgagagtggggaaacacaaatggg 22709148  T
Q  540 tagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctccccc 639  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||        || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22709147 tagaaactaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt--------tc-ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctccccc 22709057  T
Q  640 atattaggtcatattggaccaaactag--caa-----tcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtgg 731  Q
    | ||||| |||||||| ||| ||||||  |||     | |||||||||||||||   || ||||| ||| |||||| |  |||||||  ||  |||||||    
T  22709056 agattagatcatattgaaccgaactaggtcaacaattttttggtgtgtttgttc---ttcctttc-ttgcttatctttattgctttggatacacttgtgg 22708961  T
Q  732 tgttgctctacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccact 805  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22708960 tgttgctctacattagatctaggtct-gtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccact 22708888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 101 - 657
Target Start/End: Original strand, 24435490 - 24436047
Alignment:
Q  101 gtgacacgatttcatcaacgtgtcacgattt--cccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgat 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||  |||||| | |||| ||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24435490 gtgacacgatttcctcaacgtgtcacgatttttccatggcagttaacatgtttttctgggtgctgaatcgtgtcatgattttgggaaaacgtgacacgat 24435589  T
Q  199 tttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaa-cgtgccacgattttga 297  Q
    |||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||  || |||| ||||| |||||    
T  24435590 tttcaa-cttgtttggcacgttttcaggataaggttggtcgtaccttgggttgtacgcaccaaccgtgtcacgatttggccaatcgtgacacgaatttga 24435688  T
Q  298 cagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagt 397  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  | |||| |||||| || | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24435689 cagttgaagactgctatataagtgtttgtttgcaaattttgaagaatagcttgaagagagagaaactaggattacaaaggagataactttagggttgagt 24435788  T
Q  398 gtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtctt 496  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||    
T  24435789 gtctttgt-gtgaggttctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaaagcttccttttgtgtttt 24435887  T
Q  497 ctctttagggttcattattgagagagtgggt--aacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-t 593  Q
    ||| ||||| ||||||||   ||  ||||||   | | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||| || |||||||||| || |    
T  24435888 ctc-ttaggattcattat---gaatgtgggtgatataaaaatgggtagaaattaggtcttgtttttttgtaagcttataagctaatttcttgtaattcat 24435983  T
Q  594 ttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgga 657  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||  |||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  24435984 ttgtaacattttcatcctagtggatcggagggctgctctctcccctagagtaggtcatattgga 24436047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 311 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 31936942 - 31936456
Alignment:
Q  311 ctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtga 410  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| ||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31936942 ctatataagtgtttctttgcagattttgaagtagaggttttagagagagaaacttggattgcaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtga 31936843  T
Q  411 ggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttc 509  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  31936842 ggatctattgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaaagcttc--tttgtgttttctc-ttaggattc 31936746  T
Q  510 attattgagagagtggg---taacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttc 606  Q
       |||||||| |||||   ||  | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||          |||||||||||||    
T  31936745 ---attgagagtgtgggtgatatgaaaaatgggtagaaattaggatttgttcttgtgtaagcttgcaagctattttc----------ttgtaacactttc 31936659  T
Q  607 atcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaactag-----caatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattg 701  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||     |||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  31936658 atattagtggattggagagctgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tatctttcattg 31936561  T
Q  702 attatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgatt 799  Q
     |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  |||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  31936560 cttatctttattgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactttgattaaggtc--tgttttgttgttgttgcttggagacactttacacattgatt 31936463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 51 - 417
Target Start/End: Original strand, 10076661 - 10077027
Alignment:
Q  51 tattgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatgg 149  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||  ||  |  | |||| ||     
T  10076661 tattgttgttaattggctttaaatttgtgttttgaaagaacagaaaaatcgtgacatgatttcatcagcgtgtcacgattttgcaatgtcgagagc-tgt 10076759  T
Q  150 tttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggt 249  Q
    |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10076760 tttgcagggtgcccaatcatgatacgattttgggaaaacgtgatacgatttttaa-cttgctgattacgttttcaggataaggttggtcgtaccttgggt 10076858  T
Q  250 cgtacgcaccaatcgtgccacgttttgga-aaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagct 348  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  10076859 cgtacgcaccaatcgtgtcacgatttggacaaacgtgacacgactttgacagctgaagattgctatatatatgttcttgtgcagattttgaaggagagct 10076958  T
Q  349 tgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctc 417  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10076959 ttaagagagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctc 10077027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 423 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 18233101 - 18232713
Alignment:
Q  423 ttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagag 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  18233101 ttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaagcttccttttgtgttttctc-ttaggattcattattgagagtg 18233003  T
Q  523 tgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattg 620  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18233002 tgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagctgatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtgaattg 18232903  T
Q  621 gatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgc 714  Q
    ||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |     | |||||||||||||||||||||  | |||||||| | |||||| |  |||    
T  18232902 gagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgatttgagtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tctctttcatcgcttatctttattgc 18232805  T
Q  715 tttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |  ||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  18232804 tttgattatgcttgtggtgttgctctacacttagatctaggt-ttgtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccactt 18232713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 355 - 806
Target Start/End: Original strand, 21801115 - 21801579
Alignment:
Q  355 gagagaaacttg-gattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttg--ggttgggaaacattgtaaacatcttgggtag 451  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21801115 gagagaaacttgagaatacaaagcaggtaacttgagggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaacattgtaaacaccttgggtag 21801214  T
Q  452 tgagatttcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattag 549  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||     
T  21801215 tgagatttcaacattggaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttctc-ttagggttcat--ttgagagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattaa 21801311  T
Q  550 gtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggt 648  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  21801312 gtcttgttcttttgtaagcttataagataatttcttgtaactcttttgtaacacttttatcttagtggattggagagctgctcgctcccccagattaggt 21801411  T
Q  649 catattggaccaaactag-ca--------atc-ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgc 737  Q
    ||||||||||  |||| | ||        ||| ||||||||||||||||  |||||||||||  |||||| |  ||||||| ||||| ||||||| |||     
T  21801412 catattggactgaactggtcaacacttttatctttggtgtgtttgttcc--tttctttcattacttatctttattgctttgattatgattgtggtattgt 21801509  T
Q  738 tctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||||||| || | |||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  21801510 tctacacttagatttaggtctgatttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccactt 21801579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 52 - 656
Target Start/End: Original strand, 5674227 - 5674845
Alignment:
Q  52 attgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggt 150  Q
    |||||||| | ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||   || |||| || |||||    | || |||||| ||||    
T  5674227 attgttgatagttggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacatgaatttggcatcgtgacatgattttgtgatgccgtgagc-tggt 5674325  T
Q  151 ttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggt-tggtcgtaccttgggt 249  Q
    |||||||||||  ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||| | | || || | |  |||||||  ||||| |||||||||     
T  5674326 ttgcagggtgccaaatcgtgacacaatcttgggaaatcgtgacacgattttgaaacttgctcgttaagtatccgtgataaggactggtcataccttggga 5674425  T
Q  250 cgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataa-gtgttcttgtgcagattttggagtagagct 348  Q
    ||||||||  ||||||| |||| | |||||| |||| ||||||| |  |||  |||| ||  ||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  5674426 cgtacgca--aatcgtgacacgatctggaaatcgtgacacgattgtatcagaggaaggctagtatttaaagtgttcttgtgcagattt-ggaggagagct 5674522  T
Q  349 tgaa--------gtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaa 438  Q
    || |        | |||| ||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  5674523 tggaagagcttagagagataaacttggattacaaaggagggaaccaaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaa 5674622  T
Q  439 acatcttgggtagtgag-atttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgggtaa-cacaaa 535  Q
     || ||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || ||| ||    
T  5674623 tcaccttgggtagtgaggagttcaccattggaaggatctaaagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaacaccaa 5674721  T
Q  536 tgggtagaaattaggtcttgtt-cttgtgtaagcttgcaagttatt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctct 632  Q
     ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  5674722 agggtagaatctaggtcttgtttcttgtgtaagcttgcaagctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctct 5674821  T
Q  633 ctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||| |||||| ||||||||    
T  5674822 ctcccccagattaggccatattgg 5674845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 443 - 806
Target Start/End: Original strand, 10077030 - 10077394
Alignment:
Q  443 cttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaa-gtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaa-tgggt 540  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||| || |||| ||| ||||||     ||| |||||| ||||||| |||||    
T  10077030 cttgggtagtgagatttgaccattggaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttatctt-aggattcatt-----gagtgtgggtgacacaaaatgggt 10077123  T
Q  541 agaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctccccc 639  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  10077124 agaaattaggtcttgttcttttgtaagcttataagctaatttcttgtaacttttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctccccc 10077223  T
Q  640 atattaggtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtg 733  Q
    | |||||||||||||||||| || |     | |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |  ||||||| ||||||||||||||    
T  10077224 agattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tttctttcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtg 10077321  T
Q  734 ttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||||||||||| || | |||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  10077322 ttgctctacacttagatttaggtct-gtttttgttgttgttgcttggagacactttatctattgattaccactt 10077394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 150 - 438
Target Start/End: Original strand, 21272558 - 21272846
Alignment:
Q  150 tttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggt 249  Q
    |||| ||||||  |||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||  | | |||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  21272558 tttgaagggtgtccaatcgtgacacgattttgggtaatcgtgtcacgatttttga-catgtttggcacgttttcaggataaggttggtcataccttggat 21272656  T
Q  250 cgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaa-cgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagct 348  Q
    |||||||||||| |||| || | |||||  || |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||| ||    
T  21272657 cgtacgcaccaaccgtgtcaagatttggccaatcgtgacacaattttgacaactgaagactgctatataagtgtttctttgcagtttttgaagtagaact 21272756  T
Q  349 tgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaa 438  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21272757 tgaagtgagagaaactttgattacaaagggggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttgcgaaacattgtaa 21272846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 420 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 4630211 - 4629882
Alignment:
Q  420 gggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgaga 519  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||  ||||||    
T  4630211 gggttgggaaacattttaaacacattgggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaagcttccttttgtgttttctc-ttaggattcat--ttgaga 4630115  T
Q  520 gagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaact-ctttgtaacactttcatcatagtgga 617  Q
    |  ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  4630114 gtttgggtgacacaaaataggtagaaattaggtcttgttcttttgtaagcttataagttaatttcttgtaactattttgtaacactttcatcttagtgga 4630015  T
Q  618 ttggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatc-ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt- 710  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||  ||||     | ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||| |     
T  4630014 ttggagagctgctctcttccctagattaggtcatattggactgaactgagtcaacaatctttgatgtgtttgttcc--tttctttcattgcttatcttta 4629917  T
Q  711 gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacact 745  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4629916 ttgctttgattatgcttgtggtgttgctctacact 4629882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 147 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 23896864 - 23896628
Alignment:
Q  147 tggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttg 246  Q
    ||||||||||||||   |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  23896864 tggtttgcagggtgtcaaatcgtggtacgattttgtgaaatcgtgacacgatttttaaacttgctggttaagttttcaggataaggttggtcgtaccttc 23896765  T
Q  247 ggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagag 346  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||                   |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||    
T  23896764 ggtcgtacgtatcaatcgtggcacg-------------------attttatcagctgaagactgctatataagagttcttgtgcatattttgaagaagag 23896684  T
Q  347 cttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctt 402  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23896683 cttgaagagagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagagttgagtgtctt 23896628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 219 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 33160781 - 33160552
Alignment:
Q  219 ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttt--tggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatat 316  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  33160781 ttttcaggataaggttggtcgtacattgggtcgtacgcatcaatcgtgacacgattgatggaaaacgtgacacaattttgac-gctgaagactgctatat 33160683  T
Q  317 aagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaa-cttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggat 414  Q
    |||||||||| |||||||||||  | |||||| |||| |||||||| |||||   | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |   | |    
T  33160682 aagtgttctt-tgcagattttgatggagagctggaagagagagaaaacttggggaatcaaaggaggtaactttagggttgagagtctttg-attagagtt 33160585  T
Q  415 ctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33160584 ctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 33160552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 163 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 9183492 - 9183228
Alignment:
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaat 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9183492 caatcgtgacacgattttgggaaaacgtgacacgatttttga-cttgctgggcaagttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcatcaat 9183394  T
Q  263 cgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaa 362  Q
                       |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  9183393 -------------------cgtgacacgattttgac-gctgaagactactatataagttttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaa 9183315  T
Q  363 ctt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||| |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |   | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9183314 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagttctcctgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 9183228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 220 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 31405100 - 31404872
Alignment:
Q  220 tttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatata 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| || ||  |||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  31405100 tttcaggataaggttggtcgtaccttaggtcgtacgcatcaatcgtggcacgattggggaaaaacgtgacacgatttcgac-gctgaagacagctatata 31405002  T
Q  318 agtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatct 416  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||| |||||||||||| || ||||||  | |   | |||    
T  31405001 agtgttatt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggtcttttgattagagttct 31404903  T
Q  417 cttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  31404902 cttgggttggaaaacattgtaaacaccttgg 31404872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 226 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 5406618 - 5406397
Alignment:
Q  226 gataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||  |||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  5406618 gataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcatcaatcgtggcacgattggggaaaaacgtgacacgatttcgac-gctgaagattgctatataagtgtt 5406520  T
Q  324 cttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttggg 422  Q
     || ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||| |||||||||||| || ||||||| | |   | ||||| |||    
T  5406519 att-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggtctttg-attagagttctctcggg 5406422  T
Q  423 ttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  5406421 ttgggaaacattgtaaacaccttgg 5406397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 226 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 5410943 - 5410722
Alignment:
Q  226 gataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||  |||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  5410943 gataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcatcaatcgtggcacgattggggaaaaacgtgacacgatttcgac-gctgaagattgctatataagtgtt 5410845  T
Q  324 cttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttggg 422  Q
     || ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||| |||||||||||| || ||||||| | |   | ||||| |||    
T  5410844 att-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggtctttg-attagagttctctcggg 5410747  T
Q  423 ttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  5410746 ttgggaaacattgtaaacaccttgg 5410722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 163 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 33211666 - 33211382
Alignment:
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaat 262  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||| || ||||||    ||||||||| ||||||| | |||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||     
T  33211666 caatcgtaacacgattttggaaaaacgtgtcatgattttgg--cttgttgggcacgtttttaggatatggtttatcgtactttgggtcgtacgcaccaac 33211569  T
Q  263 cgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaa 361  Q
    | || |||| ||||  ||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || || |||  |||||| |||||||    
T  33211568 catgtcacgatttgacaaaacatgacacgattttgacagctcaatactgctatataagtgttctt-tgcagattgtgaaggagaagttgaagagagagaa 33211470  T
Q  362 actt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||| |||   |||||||||||||||||  |||||| ||||||| | |   | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33211469 acttgggaaatcaaaggaggtaactttacagttgagggtctttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 33211382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 5411716 - 5411512
Alignment:
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacg-ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 261  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||    |||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5411716 caatcgtgacacgattttggaaaatcgtgacac-attttttggcttgctgggcaagattttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcatcaa 5411618  T
Q  262 tcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagag 359  Q
    ||||| |||| || ||  |||| ||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||    
T  5411617 tcgtggcacgattggggaaaaatgtgacacgatttcgac-gctgaagattgctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagag 5411520  T
Q  360 aaacttgg 367  Q
    ||||||||    
T  5411519 aaacttgg 5411512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 119 - 296
Target Start/End: Original strand, 21593090 - 21593267
Alignment:
Q  119 cgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacg 218  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||   |||| |||| | |    
T  21593090 cgtgtcacgattttctaggtagtgagcatggttttcagggtgtccaatcgtgacacaattttgggaaaacgtgacacgattttc-ggcttgctgggcatg 21593188  T
Q  219 ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg-ttttggaaaacgtgccacgattttg 296  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||| ||| |||||| ||| ||||||||||    
T  21593189 tttttaggataaggttggtcgtaccttgggtcgttcgtaccaaccgtgtcacgatttgggaaaatgtgacacgattttg 21593267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 163 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 5407391 - 5407187
Alignment:
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacg-ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 261  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||    |||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5407391 caatcgtgacacgattttggaaaatcgtgacac-attttttggcttgctgggcaagattttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcatcaa 5407293  T
Q  262 tcgtgccacgttt--tggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagag 359  Q
    ||||| |||| ||   | |||| ||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||    
T  5407292 tcgtgacacgattgaagaaaaatgtgacacgatttcgac-gctgaagattgctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagag 5407195  T
Q  360 aaacttgg 367  Q
    ||||||||    
T  5407194 aaacttgg 5407187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 219 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 30834964 - 30834741
Alignment:
Q  219 ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg---aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctata 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| || ||   |||||||| ||||||||||||| | ||||||  |||||    
T  30834964 ttttcaggataaggttggtcgtaccttggatcgtacgcatcaatcgtggcacgattggggaaaaaacgtgacacgattttgaca-cagaagacaactata 30834866  T
Q  316 taagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttg-gattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggat 414  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||   ||||||| | |||||||||||| |  ||||||| | |   | |    
T  30834865 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgagaaatcaaaggaagcaactttagggtttatggtctttg-attagagtt 30834768  T
Q  415 ctcttgggttgggaaacattgtaaaca 441  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  30834767 ctcttgggttgagaaacattgtaaaca 30834741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 219 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 16452756 - 16452528
Alignment:
Q  219 ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatat 316  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| || ||  |||||||| |||||||| ||| | ||||||| |||||||    
T  16452756 ttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcatcaatcatggcacgattggggaaaaacgtgacacgatttagac-gatgaagacagctatat 16452658  T
Q  317 aagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatc 415  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||   ||||| | | |||||||| ||| || ||||||| | |   | ||    
T  16452657 aagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaagtaagcaactttagagtttagggtctttg-attagagttc 16452560  T
Q  416 tcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16452559 tcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgg 16452528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 348 - 479
Target Start/End: Original strand, 31076702 - 31076834
Alignment:
Q  348 ttgaagtgagagaaacttgg-attacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttg 446  Q
    |||||| || |||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||| ||||| ||||||||| |||     
T  31076702 ttgaagagaaagaaacttgggaatacaaaggagataactatagggttgagtgtctttgtagtgacgttgccttgggttgagaaactttgtaaacacctta 31076801  T
Q  447 ggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaa 479  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31076802 ggtattgagatttcaccattggaatgatcaaaa 31076834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 370 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 14521984 - 14521686
Alignment:
Q  370 tacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttg--ggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgag-atttcaccatt 466  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  14521984 tacaaatgaggtaactttagggtttaatgtctttgtagttaggttctcttgagggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagaatttcaccatt 14521885  T
Q  467 ggaatgatcaaaagt-ttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaac---acaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgt 562  Q
    |||| ||| |||| | |||||||  ||| ||||| ||||| |   |||||||||| |||||| ||   | ||||| |||||||||||||  ||||||| |    
T  14521884 ggaaggataaaaaatcttcctttaatgttttctc-ttaggat---ttattgagagtgtgggtgacatgaaaaatgtgtagaaattaggttgtgttctt-t 14521790  T
Q  563 gtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaa 661  Q
    || ||||     | || ||| ||||||||| |||||| |||||||||| || || |||||| || |||||||||| | | | |||||||||||||||| |    
T  14521789 gtgagctcttgtgctaattt-ttgtaactcatttgtatcactttcatcttattgaattggagaggtgctctctcctcgagagtaggtcatattggaccga 14521691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16452867 - 16452758
Alignment:
Q  219 ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatat 316  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||  |||||||| |||||||| ||| | ||||||| |||||||    
T  16452867 ttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcatcaatcgtggcacgattggggaaaaacgtgacacgatttagac-gatgaagacagctatat 16452769  T
Q  317 aagtgttcttg 327  Q
    |||||||||||    
T  16452768 aagtgttcttg 16452758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 261
Target Start/End: Original strand, 26661421 - 26661514
Alignment:
Q  167 cgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 261  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||| |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26661421 cgtgacacgattttgggaaaatgtgacaagattttcga-cttgctggactcgttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 26661514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 261
Target Start/End: Original strand, 26767392 - 26767485
Alignment:
Q  167 cgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 261  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||| |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26767392 cgtgacacgattttgggaaaatgtgacaagattttcga-cttgctggactcgttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 26767485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 603720 - 603612
Alignment:
Q  162 tcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 261  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||| | ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  603720 tcaatcgtgacacgattttgggaaaacgtgacatgattttc-ggcttgctgggcaagttttcaggataaggttgatcgtatcttggatcgtacgcaccaa 603622  T
Q  262 tcgtgccacg 271  Q
     |||| ||||    
T  603621 acgtgtcacg 603612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 3809414 - 3809312
Alignment:
Q  155 agggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtac 254  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3809414 agggtgcccaatcgtgacacgattttggggaaacgtgacacgattttcggc----ttgggaaagttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtac 3809319  T
Q  255 gcaccaa 261  Q
    | |||||    
T  3809318 gtaccaa 3809312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 24714885 - 24714730
Alignment:
Q  164 aatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatc 263  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| ||||  |||| |    
T  24714885 aatcgtgccacgattt-ggaaaaacgtgacacgattttcaa-cttgctgggcacgttttcaggataagattggtcgtactgtgggtcatacgatccaacc 24714788  T
Q  264 gtgccacgttttggaaaa-cgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagt 320  Q
    ||| |||| | |||  || |||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24714787 gtgtcacgatatggccaatcgtgacacaattttgactgctggagactgctatataagt 24714730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 328
Target Start/End: Original strand, 26253702 - 26253843
Alignment:
Q  188 cgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggt-tggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgc 286  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||  ||||||||| ||| | |||||| | |||||||| |||| |||||||| ||||     
T  26253702 cgtgacacgattttcaaacttgctggttaagttttcaggataaggactggtcgtactttgtgacgtacgtatcaatcgtgacacgatttggaaatcgtgg 26253801  T
Q  287 cacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgt 328  Q
    |||||||||  ||| || |||||  ||| |||||||||||||    
T  26253802 cacgattttatcagttggagacttgtatttaagtgttcttgt 26253843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 278 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 5413758 - 5413597
Alignment:
Q  278 aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaactt-ggattacaaag 376  Q
    |||||||  |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||| |||   |||||    
T  5413758 aaaacgttacacgatttcgac-gctgaagattgctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagatagagaaacttgggaaatcaaag 5413661  T
Q  377 gaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaaca 441  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| | |   | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5413660 gaggcaactttagggtttagggtctttg-attagagttctctcgggttgggaaacattgtaaaca 5413597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 2172104 - 2171886
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | |||| || |||| ||||||||| |||||||||||||| | |||| || ||   || |||| |||||||||   | || |||||| ||||||    
T  2172104 tgttgagatttggtttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgggacatgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagc-tggttt 2172006  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataagg-ttggtcgtaccttgggtcg 251  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||| | | || |||| ||||||||||   |||||||||||| | ||    
T  2172005 gcagggtgccaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattgtaaaacttgctcgttaagtttccaagataaggacaggtcgtaccttgtgacg 2171906  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacg 271  Q
    |||| |||||||||| ||||    
T  2171905 tacgtaccaatcgtgacacg 2171886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 11857070 - 11856996
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11857070 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattgg 11856996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 582 - 656
Target Start/End: Original strand, 14742426 - 14742499
Alignment:
Q  582 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14742426 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattgg 14742499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Original strand, 22010686 - 22010760
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22010686 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 22010760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 582 - 656
Target Start/End: Original strand, 14737566 - 14737639
Alignment:
Q  582 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  14737566 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 14737639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26954730 - 26954648
Alignment:
Q  219 ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg-ttttggaaaacgtgccacgattttgacag 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||| |||| || |||||| |||||||    
T  26954730 ttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcatcaaccgtgtcacgattttgggaaacatgacacgatcttgacag 26954648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 199
Target Start/End: Original strand, 30125025 - 30125162
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggtttgcagggtg 160  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   || |||| |||||||||   | || |||||| | |||||||||  |    
T  30125025 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagc-tagtttgcaggacg 30125123  T
Q  161 ctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgatt 199  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30125124 ccaaatcgtggcacgattttgggaaatcgtgacacgatt 30125162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 219 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 5413875 - 5413823
Alignment:
Q  219 ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg 271  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  5413875 ttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcatcaatcgtggcacg 5413823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 62 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11857560 - 11857413
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttc-ccaggcagtgagcatggtttgcagggtg 160  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   || |||| |||||||||    ||| |||||| | |||||||||  |    
T  11857560 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagtggccgtgagc-tagtttgcaggacg 11857462  T
Q  161 ctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttg 209  Q
    |  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  11857461 ccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatttagaaacttg 11857413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 553 - 656
Target Start/End: Original strand, 28155529 - 28155632
Alignment:
Q  553 ttgttcttgtgtaa-gcttgcaagttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcat 651  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||| ||  ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||     
T  28155529 ttgttcatgtgtaaagcttgaaagctaaattcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccac 28155627  T
Q  652 attgg 656  Q
    |||||    
T  28155628 attgg 28155632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Original strand, 33335930 - 33336005
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  33335930 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggtcacattgg 33336005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 336
Target Start/End: Original strand, 411783 - 411969
Alignment:
Q  152 tgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgatt-ttcaaacttgttgggtacgttttcaagataagg-ttggtcgtaccttgggt 249  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||| | | || |||| || |||||||  ||||| |||||||||     
T  411783 tgcagggtgccaaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgattgtgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcataccttggga 411882  T
Q  250 cgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattt 336  Q
    || | |||||||||||| |||  |  ||||| |||| |||||||||  |||  |||| |   ||| |||||||||||||||||||||    
T  411883 cggatgcaccaatcgtgacacaatcaggaaatcgtgacacgattttatcagtggaaggcatgtatttaagtgttcttgtgcagattt 411969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 372 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 28137681 - 28137605
Alignment:
Q  372 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||    |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28137681 caaaggagttaactttagggttgagggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggt 28137605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 3073343 - 3073060
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | ||| ||| |||| ||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||   || |||| |||||||||   | || |||||| |||| |    
T  3073343 tgttgagatttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacaggaaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagc-tggtct 3073245  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataagg-ttggtcgtaccttgggtcg 251  Q
     ||||||||  ||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||| | | || |||| || |||||||  ||||| |||||||||  |    
T  3073244 acagggtgccaaatcgtgacacgattgttggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcataccttgggatg 3073145  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattt 336  Q
     | |||| ||||||  |||| | |||||| |||| |||||||||  |||  || | ||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  3073144 gatgcactaatcgttacacgatctggaaatcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgtgcagattt 3073060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 6005514 - 6005439
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  6005514 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg 6005439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 114
Target Start/End: Original strand, 14737092 - 14737144
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttca 114  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14737092 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgatttca 14737144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 584 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 28184598 - 28184527
Alignment:
Q  584 ttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  28184598 ttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 28184527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Original strand, 33330433 - 33330508
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  33330433 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg 33330508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 62 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 5266646 - 5266595
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttc 113  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5266646 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgatttc 5266595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 111
Target Start/End: Original strand, 5756950 - 5757008
Alignment:
Q  53 ttgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatt 111  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5756950 ttgttgaaatttggctttaaatttatggtttaaaagaatagagaaattgtgacacgatt 5757008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 582 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 6438595 - 6438523
Alignment:
Q  582 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  6438595 tcttgtaaccttttgtaacactt-ca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 6438523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 112
Target Start/End: Original strand, 14741933 - 14741983
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  14741933 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 14741983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 112
Target Start/End: Original strand, 22010196 - 22010246
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22010196 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 22010246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 24714997 - 24714919
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatct-gtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgattt 131  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  24714997 tgttgaaaattggcttcaaattttgtggtttggaaaaacagagaaatcgtgacacgatttcataagtgtgtcacgattt 24714919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 760 - 806
Target Start/End: Original strand, 26258182 - 26258228
Alignment:
Q  760 tttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26258182 tttttgttgttgttgcttggagacactttacacattggttaccactt 26258228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 581 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 16838841 - 16838777
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatatta 645  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16838841 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagatta 16838777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 594 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 27165767 - 27165702
Alignment:
Q  594 ttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggacc 659  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  27165767 ttgtatcactttcatcttagttgattggagggctactctgtcccccatagtaggtcatattggacc 27165702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 2171860 - 2171729
Alignment:
Q  316 taagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggatta-caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggat 414  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  ||||| |||| |||||||||||||   | ||||||  | |||| ||||||| || |||||||    |||  |    
T  2171860 taagtgttcttgtgcagattt-gaaggtgagctagaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggtctttgattagagttt 2171762  T
Q  415 ctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2171761 ctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 2171729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 391 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 5385881 - 5385794
Alignment:
Q  391 gttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaa 479  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||| || || |||  ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  5385881 gttgagtgtctttgtagtgaggttca-ttgggttaagaaacattgcaatcaccttaagtagtgagatttcaccattagaaggataaaaa 5385794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 6097873 - 6097789
Alignment:
Q  188 cgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggt-tggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg 271  Q
    ||||||||||||| |||||||| | | || |||| || |||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  6097873 cgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtacctggggacgtacgcaccaatcgtgacacg 6097789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 720 - 806
Target Start/End: Original strand, 5572739 - 5572825
Alignment:
Q  720 ttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | || ||||  |||||| |||| |||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  5572739 ttatgcttgtggtgttgctctacacttagatttatgtct-gtttttgctgttgttgcttggagacactttatctattgattaccactt 5572825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 449
Target Start/End: Original strand, 14737392 - 14737482
Alignment:
Q  361 aacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacatcttgggt 449  Q
    ||||||||| |||||||||| |||    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||    
T  14737392 aacttggataacaaaggagggaaccaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 14737482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 113
Target Start/End: Original strand, 16652723 - 16652774
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttc 113  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16652723 attgtcttcaaatttgtggtctgaaagaacagggaaatcgtgacacgatttc 16652774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 109
Target Start/End: Original strand, 26253589 - 26253644
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacga 109  Q
    |||||| | ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26253589 tgttgagatttgtcttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcgtgacacga 26253644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 26830743 - 26830696
Alignment:
Q  150 tttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacga 197  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  26830743 tttgtagggtgctcaatcgtgacacgattttggagaaacgtgacacga 26830696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 610 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 12195579 - 12195525
Alignment:
Q  610 atagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  12195579 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaact 12195525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 23896957 - 23896899
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||| ||| ||| |||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  23896957 tgttgaaatttgccttcaaatttgtggtttgaaagaacagaaaaatcgtgacacgattt 23896899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 533 - 666
Target Start/End: Original strand, 31076893 - 31077026
Alignment:
Q  533 aaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctc 631  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| ||| | ||   ||| || ||| ||||||| | |||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||     
T  31076893 aaatggataaaaattaggtcttgttctt-tgtgaactcttaagctaatttattgtaacccatttgtatcacttttatcttagtggattggagagctgcta 31076991  T
Q  632 tctcccccatattaggtcatattggaccaaactag 666  Q
    |||||   | | ||||||||||||||| |||||||    
T  31076992 tctcctagagagtaggtcatattggactaaactag 31077026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 409 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 3039140 - 3039103
Alignment:
Q  409 gaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttg 446  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3039140 gaggttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 3039103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 3039218 - 3039157
Alignment:
Q  343 agagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttg 404  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3039218 agagcttcaagagagaaaaacttgggaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttg 3039157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 124
Target Start/End: Original strand, 5571781 - 5571818
Alignment:
Q  87 agaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtc 124  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5571781 agaatagagaaatcgtgacacgatttcatcaacgtgtc 5571818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 198
Target Start/End: Original strand, 28155165 - 28155214
Alignment:
Q  149 gtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgat 198  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  28155165 gtttgcagggtgcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgat 28155214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 402; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 6303 - 5549
Alignment:
Q  61 aattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttg-cagggt 159  Q
    ||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  || |||    
T  6303 aattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttct-aggcagcgagcatggtttttcaaggt 6205  T
Q  160 gctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcacc 259  Q
      |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6204 attcaatcgtgtcatgattttgggaaaatgtgacacgattttcaaacttgctgggtacgttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcacc 6105  T
Q  260 aatcgtgccacgttttgga-aaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgaga 358  Q
    ||||||| |||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  6104 aatcgtgtcacaatttggacaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataaatgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagaga 6005  T
Q  359 gaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatt 458  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6004 gaaaattggattacaaaggaggtaactttatggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggcaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatt 5905  T
Q  459 tcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgt 556  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  5904 tcaccattggaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttctc-ttaggattcatcattgagagtgtgggtgacacaaaatgagtagaaattaagtcttgt 5806  T
Q  557 tcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattg 655  Q
    ||||||||||||||  ||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5805 tcttgtgtaagcttataagctaatttcttgtatctcttttgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattg 5706  T
Q  656 gaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag- 748  Q
    |||| ||||     | |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  5705 gaccgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tttctttcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgtttctctacacttaga 5608  T
Q  749 tctaggtctatttt--ttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||||||||| ||||  |||||||| |||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  5607 tctaggtctgtttttgttgttgttgttgtttggagacacttaac-tattgattaccactt 5549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 3111 - 2377
Alignment:
Q  61 aattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgc-agggt 159  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||   |||||    
T  3111 aattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcatgacacgatttcatcaacgtgtaacgatttcc-aggcagcgagcatggttttttagggt 3013  T
Q  160 gctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcacc 259  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3012 actcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacccgattttcaaacttgctgggtatgttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcacc 2913  T
Q  260 aatcgtgccacgttttgga-aaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgaga 358  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  2912 aatcgtgtcacgatttggacaaacgtgacacgattttaacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagaga 2813  T
Q  359 gaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatt 458  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  2812 gaaa-ttggattacaaaaaaggtaactttagggttaagtttctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgcgtagtgagatt 2714  T
Q  459 tcaccattggaatgatc-aaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgt 556  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  2713 tcaccattggaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttatc-ttaggattcatcattgagagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattagttcttgt 2615  T
Q  557 tcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattg 655  Q
    ||||||||||||||  ||| || |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  2614 tcttgtgtaagcttataagctaatttcttataattcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctgtctcccccagattaggtcatattg 2515  T
Q  656 gaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag- 748  Q
    || | ||||     | |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  2514 gagcgaactgggtcaacaatcttggtgtgtttgttcc--tttctttcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgttctacacttaga 2417  T
Q  749 tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacacttta 789  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2416 tctaggtct-gtttttgttgttgttgcttggagacacttta 2377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 147 - 806
Target Start/End: Original strand, 132845 - 133509
Alignment:
Q  147 tggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttg 246  Q
    |||||||||| |||   ||||||| |||||||||| | || ||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  132845 tggtttgcagtgtgtcaaatcgtgacacgattttgtggaatcgtgacatgattttcaaacttgctggttaagttttcaggataaggttggtcgtaccttg 132944  T
Q  247 ggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagag 346  Q
    ||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  132945 ggtcgtacgtatcaatcgtgacacgatttggaaaacgtggcacgattttatcagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcaaattttggaggagag 133044  T
Q  347 cttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttg 446  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  133045 cttaaagagagagaaacttggattacaaaggagggaactttagggttgagtttctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 133144  T
Q  447 ggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaat 546  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  133145 ggtagtgagatttcaccattggaaggatcaaaagcttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggaaacacaaatgggtagaaat 133244  T
Q  547 taggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagtta-ttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatatta 645  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  133245 taggtcttgttcttgtgtaagtttgcaagctatttttcttgtaactctttgtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatatta 133344  T
Q  646 ggtcatattggaccaaact-----agcaatc--ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgc 737  Q
    |||||||||| ||| ||||     | |||||  ||||||||||||||||   ||||||||||  |||||| |  |||||||| |||||||||| ||||||    
T  133345 ggtcatattgaacctaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcc---ttctttcattacttatctttattgctttgtatatgcttgtgatgttgc 133441  T
Q  738 tctacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||| ||| || ||| |||| ||||   ||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  133442 tctatact-agactatgtctgttttgctttgttgttgtttggagacactttacacattgattatcactt 133509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 188 - 806
Target Start/End: Original strand, 8024 - 8648
Alignment:
Q  188 cgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgcc 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||| |||| |    
T  8024 cgtgacacgattttcaaacttgttggttaagttttcaggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgtatcaatcgtgacacgatttgaaaatcgtggc 8123  T
Q  288 acgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaacttt 387  Q
    | ||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8124 atgattttatcagctgaagactggtatttaagtgttcgtgtgcagttttcggaggagagctggaagagagagaaacttggattacaaaggagggaacttt 8223  T
Q  388 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttcctt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  8224 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgagatttcaccattggaaggattaaaagcttcctt 8323  T
Q  488 ttgtgtcttctc-tttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagtta-ttttctt 585  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  8324 ttgtgtcttctcttttagggttcattattgagagagtgggaaacacaaatacgtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttttctt 8423  T
Q  586 gtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatc--ttggtgt 678  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     | |||||  |||||||    
T  8424 gtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgt 8523  T
Q  679 gtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcct 777  Q
    ||||||   || ||||||||||| |||||| |  || |||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  8524 gtttgt---ttcttctttcattgcttatctttattgttttggttatacttgtggtgttgctctacact-agactaggtctgttttttgttgttattgctt 8619  T
Q  778 ggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8620 ggagacactttacacattgattaccactt 8648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 109
Target Start/End: Original strand, 7911 - 7966
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacga 109  Q
    |||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7911 tgttgagatttggcttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcgtgacacga 7966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 297; Significance: 1e-166; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 276 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 86085 - 85553
Alignment:
Q  276 ggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagagaaacttggattacaaa 375  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  86085 ggaaaacgtgacacgattttgacaactgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggatagcttgaagtgagagaaacttggattacaaa 85986  T
Q  376 ggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatc 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  85985 ggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacactttgggtagtgagatttcaccattggaaggatc 85886  T
Q  476 aaaagtttccttttgtg-tcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgca 573  Q
    ||||  ||||||||||| | ||||| ||||  |||| ||||| | |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  85885 aaaaacttccttttgtgtttttctc-ttagaattca-tattgtgggagtgggagacacaaaatgggtagaaattaggtcttgctcttgtgtaagctttta 85788  T
Q  574 agttattttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agca 668  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||     | ||    
T  85787 agctaatttcttgtaactctttgtaacactttcatcatggtggattggagagccgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaaca 85688  T
Q  669 atcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaag-tctaggtctattttttgtt 767  Q
    |||| | |||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||    
T  85687 atctagatgtgtttgttc--ttttctttcattgcttatctttgtgctttggttatgcttgtgatgttgctctacacttagatctaggtc--tgttttatt 85592  T
Q  768 gttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85591 gttgttgcttggagacactttacacattgattaccactt 85553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 86189 - 86066
Alignment:
Q  76 tgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacg 175  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  86189 tgtggtttggaagaatagagaaatcgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgattt-ccaggcagggagcatggtttgcagggtgctcaatcatg-cacg 86092  T
Q  176 attttgggaaaacgtgacacgatttt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  86091 attttgggaaaacgtgacacgatttt 86066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 225; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 150 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 45727 - 45371
Alignment:
Q  150 tttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggt 249  Q
    |||||||||||   ||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45727 tttgcagggtgtcaaatcgtggcacgattctgtgaaatcgtgacacgattttcaaacttgctggctaagttttcaggataaggttggtcgtaccttgggt 45628  T
Q  250 cgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagctt 349  Q
    |||||  | |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  45627 cgtacatatcaatcgtgacacgatttggaaaacgtggcacgattttatcagctgaagattggtatttaagtgttcttgtgcaaattttggaaaagagctt 45528  T
Q  350 gaagtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtc-tttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttggg 448  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  45527 gaagagagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgaatgtcttttgtagtgaggatctcttgggttgtgaaacattgtaaacaccttggg 45428  T
Q  449 tagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagg 505  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45427 tagtgagatttcaccattggaaggatcaaaagcttccttttgtgtcttctctttagg 45371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 594 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 45337 - 45123
Alignment:
Q  594 ttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatctt--ggtgtgtttgttc 686  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||     | |||||||  |||||||||||||    
T  45337 ttgtaacgctttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactgagtcaacaatcttttggtgtgtttgttc 45238  T
Q  687 ctttttctttcattgattatctgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctctacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacact 786  Q
     ||   ||||||||| |||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  45237 att---ctttcattgcttatctttgttctttgtatatgtttgtggtgttgctctacacta-gacttggtctgttttt-gttgttgttgcttggagacact 45143  T
Q  787 ttacacattgattaccactt 806  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  45142 ttacacattgattaccactt 45123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 53 - 806
Target Start/End: Original strand, 17430 - 18180
Alignment:
Q  53 ttgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggtt 151  Q
    ||||||| | ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||   || |||| |||||||||   | || |||||| |||||    
T  17430 ttgttgagatttggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagc-tggtt 17528  T
Q  152 tgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataagg-ttggtcgtaccttgggtc 250  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| | | || || | |  ||||||| |||||||||||||| | |    
T  17529 tgcagggtgccaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacatgattttcaaacttgctcgttaagtatccttgataaggattggtcgtaccttgtgac 17628  T
Q  251 gtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttg 350  Q
    |||||  ||||||||| ||||                   |||||  |||  |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17629 gtacgttccaatcgtgacacg-------------------attttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttg 17709  T
Q  351 aa--------gtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaac 440  Q
     |        | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  17710 gaagagcttagagagagaaacttggattacaaaggagggaactctagggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaatc 17809  T
Q  441 atcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctc-tttagggttcattattgagagagt-gggtaacacaaatgg 538  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  17810 accttgggtagtgagatttcaccattggaaggatctaaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttca-tattgtgagagtggggaaacacaaatgg 17908  T
Q  539 gtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagtta-ttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctccc 637  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17909 gtagaaactatgacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctccc 18008  T
Q  638 ccatattaggtcatattggaccaaact-----agcaatc---ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatc-tgtgtgctttgtttatgcttg 728  Q
    ||| |||||| |||||||| |  ||||     | |||||   |||||||||||||||   || ||||| ||| ||||| ||| |||||||| |   ||||    
T  18009 ccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc---ttcctttc-ttgcttatcttgtttgctttgtattctcttg 18103  T
Q  729 tggtgttgctctacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18104 tggtgttgctctacact-agtctagggctggtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccactt 18180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 355 - 806
Target Start/End: Original strand, 23815 - 24273
Alignment:
Q  355 gagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacatcttgggtagt 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||    
T  23815 gagagaaacttggattacaaaggagggaactctagggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagt 23914  T
Q  453 gagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctc-tttagggttcattattgagagagt-gggtaacacaaatgggtagaaattagg 550  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| || |    
T  23915 gagatttcaccattggaaggatctaaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttca-tattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactatg 24013  T
Q  551 tcttgttcttgtgtaagcttgcaagtta-ttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtc 649  Q
     |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  24014 acttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggcc 24113  T
Q  650 atattggaccaaact-----agcaatc---ttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatc-tgtgtgctttgtttatgcttgtggtgttgctct 740  Q
    ||||||| |  ||||     | |||||   |||||||||||||||   || ||||| ||  ||||| ||| | |||||| |   ||||||||||||||||    
T  24114 atattgg-ctgaactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc---ttcctttc-tttcttatcttgttttctttgtattctcttgtggtgttgctct 24208  T
Q  741 acactaagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||||| |||||||| ||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24209 acact-agtctagggctggtttttgttgttgttgcttggagacactttacacatagattaccactt 24273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 184; Significance: 4e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 355 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 11057 - 10596
Alignment:
Q  355 gagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttg--ggttgggaaacattgtaaacatcttgggtag 451  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11057 gagagaaactttggaatacaaaggaggtaactttatggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaacattgtaaacaccttgggtag 10958  T
Q  452 tgagatttcaccattggaatgatcaaaa-gtttccttttg-tgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacacaaa-tgggtagaaatta 548  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||  ||| ||||||| ||| ||||| ||   |||||||||| ||||||| | | |||||||||    
T  10957 tgagatttcaccattggaaggatcaaaaagcttcttttttctgttttctctt-aggattcat-atcatgagagtgggtgacacaaaatagatagaaatta 10860  T
Q  549 ggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattagg 647  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10859 ggtcttgttcttgtgtaagcttgtaaactaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccaaattagg 10760  T
Q  648 tcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggtgttgctcta 741  Q
    |||||||||||| ||||     |  ||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10759 tcatattggaccgaactgggtcaataatcttggtgtgtttgttcc--tctctttcattgcttatctttattgctttgattatgcttgtggtgttgctcta 10662  T
Q  742 cactaag-tctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    |||| || | ||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||   || |||||||||||    
T  10661 cacttagatttaggtctgttttttgttgttgttgcttggagtaactttatctatcgattaccactt 10596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 142 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 17767 - 17196
Alignment:
Q  142 gagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgta 241  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| | | ||||| ||||||||||||||||    
T  17767 gagcatgttttgcagggtgtccaaccgtgacacgattttgggaaaacgtgacacgatttttgg-cttgctgggcaagctttcatgataaggttggtcgta 17669  T
Q  242 ccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggag 341  Q
    || || ||||||||||||||                   ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  17668 ccctgagtcgtacgcaccaa-------------------acgtgtcacgattttgacagctgaaaactgctatataagtgttctt-tgtagattttgaag 17589  T
Q  342 tagagcttgaa-gtgagagaaacttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaac 440  Q
    || |||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17588 tatagcttgaaagagagagaaccttggattacataggaggtaactttacggttgagtgtctttgtagtggagatctcttggattgggaaacattgtaaac 17489  T
Q  441 atcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaagtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaacac-aaatggg 539  Q
    | |||||||||||||||||||||          ||||||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||||   |||| ||| || |||| |||| ||    
T  17488 accttgggtagtgagatttcacc----------tcaaaaacttccttttgtgttttctc-ttaggattcatta---agagtgtgagtgacacaaaatagg 17403  T
Q  540 tagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccc 638  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||  ||    
T  17402 tagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcataatggattggagggttgctctctttcc 17303  T
Q  639 catattaggtcatattggaccaaact-----agcaatcttggtgtgtttgttcctttttctttcattgattatctgt-gtgctttgtttatgcttgtggt 732  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||     | |||| |||||||||||| |||  |||||||||||  |||||| |  ||||||  |||||||||||||    
T  17302 catattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaattttggtgtgtttgctcc--tttctttcatttcttatctttattgctttaattatgcttgtggt 17205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 140 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 20920 - 20612
Alignment:
Q  140 gtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcg 239  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | ||||| |  |||||||||||||    
T  20920 gtgagcatgttttgcagggtgtccaatcatgacacgattttgggaaaacgtgacacgattttc-ggcttgttgggaaagtttttagaataaggttggtcg 20822  T
Q  240 taccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttgg-aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttg 338  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20821 taccttgggtcgtacgcactaaacgtgtcacgatttggcaaaacgtaacacgattttgatagctgaaaactgttatataagtgttctt-tgcagattttg 20723  T
Q  339 gagtagagcttgaagtgagagaaac-ttggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgta 437  Q
     || |||||| |||| ||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |   | | ||||||||||||| ||||||||    
T  20722 aaggagagctagaagagagagaaactttggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttg-attagagttatcttgggttgggagacattgta 20624  T
Q  438 aacatcttgggt 449  Q
    |||| |||||||    
T  20623 aacaccttgggt 20612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 100; Significance: 5e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 51 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 11756 - 11360
Alignment:
Q  51 tattgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatgg 149  Q
    ||||||||| | ||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||   || |||| |||||||||   | || |||||| |||    
T  11756 tattgttgagatttggcttcaaaattgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcatgatgccgtgagc-tgg 11658  T
Q  150 tttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggt-tggtcgtaccttggg 248  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| | | || |||| || |||||||  |||||||||||||||    
T  11657 tttgcagggtgccaaatcgtgacacgattt-gggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttggg 11559  T
Q  249 tcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagct 348  Q
     ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| |||||||||  |||  |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |    
T  11558 acgtacgcaccaatcgtgacacgatctggaaatcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattttgaag-agagtt 11460  T
Q  349 tgaagtgagagaaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
     |||| ||||||||||| |||   ||||||  |||||| ||||||| |  |||||||    |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11459 ggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttatggtctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 11360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 9308 - 9091
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttccc-aggcagtgagcatggttt 152  Q
    |||||| | ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||   || |||| |||||||||   | || |||||| ||||||    
T  9308 tgttgagatttggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagc-tggttt 9210  T
Q  153 gcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggt-tggtcgtaccttgggtcg 251  Q
    |||||||||  ||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| | | || |||| || |||||||  ||||||||||||||| ||    
T  9209 gcagggtgccaaatcgtgacatgattt-gggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgggacg 9111  T
Q  252 tacgcaccaatcgtgccacg 271  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  9110 tacgcaccaatcgtgacacg 9091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 79; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 163 - 404
Target Start/End: Original strand, 434217 - 434460
Alignment:
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacg-ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    |||| |||| | | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  434217 caatcgtgacacgattttgggaaatcgtgacacgattttttggcttgctgggcaagattttcaggataaggttggtcgtaccttggatcgtacgcataaa 434316  T
Q  262 tcgtgccacgttttgg--aaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtgagag 359  Q
    ||||| |||| || ||  |||||||| |||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||    
T  434317 tcgtggcacgattggggaaaaacgtggcacgattttgac-gcagaagaccgctataaaagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagag 434414  T
Q  360 aaactt-ggattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttg 404  Q
    |||||| |||   ||||||| | |||||||||||| || |||||||    
T  434415 aaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggtctttg 434460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 78; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 89 - 296
Target Start/End: Original strand, 10951 - 11159
Alignment:
Q  89 aacagagaaattgtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccag-gcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaa 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||  ||  || ||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||    
T  10951 aacagagaaatcgtgacacgatttcataggcgtgtcacgattttgcaatgccgtgagcatgttttgcagggtgtccaatcgtgacacgattttggggaaa 11050  T
Q  188 cgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg-ttttggaaaacgtgc 286  Q
     ||||||||||||||    ||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||     
T  11051 tgtgacacgattttc-ggtttgctgggcaagttttcaggataaggttggtcgtacattgggtcgtacgcaccaaacgtgtcacgatttgggaaatcgtga 11149  T
Q  287 cacgattttg 296  Q
    ||||||||||    
T  11150 cacgattttg 11159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 77; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 125 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 81021 - 80850
Alignment:
Q  125 acgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttca 224  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| |||| | |||||||    
T  81021 acgattttctaggcagtgagcattgttttcagggtatccaatcgtgacacgattttgggaaaacgtggcacgattttcgg-cttgctgggcaagttttca 80923  T
Q  225 agataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg-ttttggaaaacgtgccacgattttg 296  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||    
T  80922 ggataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaaacgtgtcacgatttgggaaatcgtgacacgattttg 80850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 71; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 334 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 23877 - 23540
Alignment:
Q  334 ttttggagtagagcttgaagtgagagaaacttg-gattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaca 432  Q
    ||||| || ||| ||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||| ||| |    
T  23877 ttttgaagaagatctttaagagagagaaacttgagattacaatggaggtaactttaaggttgagcgtctttatagtgaggttctattgggttggaaaaaa 23778  T
Q  433 ttgtaaacatcttgggtagtgagatttcaccattggaatgatcaaaa--gtttccttttgtgtcttctctttagggttcattattgagagagtgggtaac 530  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||  |  || |||||||| ||||| ||||| |||   |||| ||| |||  | ||    
T  23777 ttgtaatcaccttgggtagtgagatgtcaccattagaaggataaaaaaggcatcattttgtgttttctc-ttaggattc---attgtgagtgtgtctgac 23682  T
Q  531 a--caaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttattttcttgtaa-----ctctttgtaacactttcatcatagtggattggat 623  Q
    |   ||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||  |||  | ||||||||||     || |||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  23681 atgaaaatgggtagaaattagatcttgtt-ttttgtgagcttctaagaaaatttcttgtaattaacctatttgtatcactttcatcttagtgaattggat 23583  T
Q  624 agctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaactag 666  Q
    |||| || ||||||| | | |||||||||||||||| ||||||    
T  23582 agcttctttctcccctaaagtaggtcatattggaccgaactag 23540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 149 - 350
Target Start/End: Original strand, 577 - 779
Alignment:
Q  149 gtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggt-tggtcgtaccttgg 247  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||| ||| | || |||||||||||||||||| ||| | | || |||| || |||| ||  |||||||||||||     
T  577 gtttgcagggtgccaaatcgtgacacgatcttgaggaatcgtgacacgattttcaaatttgctcgttaagtttccaggatagggactggtcgtaccttgt 676  T
Q  248 gtcgtacgcaccaatcgtgccacgttttggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttggagtagagc 347  Q
    | |||||| |||||| ||| |||| |||||||| |||| |||||||||  |||  |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  677 gacgtacgtaccaattgtgacacgatttggaaatcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattttggaggagagc 776  T
Q  348 ttg 350  Q
    |||    
T  777 ttg 779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 447
Target Start/End: Original strand, 853 - 886
Alignment:
Q  414 tctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  853 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 163 - 404
Target Start/End: Original strand, 114272 - 114517
Alignment:
Q  163 caatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacg-ttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaa 261  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    |||| |||| |   |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||     
T  114272 caatcatgacacgatattgggaaaacgtgacacgattttgg--cttgctgggcaaaattttcaggataaggttggtggtaccttgggtcgtacgcatcac 114369  T
Q  262 tcgtgccacgttt--tggaaaacgtgccacgattttgacagctgaagactgctatataagtgt----tcttgtgcagattttggagtagagcttgaagtg 355  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||    |||| ||||||||||| |   |||||||||| |    
T  114370 tcgtgacacgattgatggaaaacgtgacacgatttcga-tgctgaaggctgctatataagtgttagatctt-tgcagattttgaatgtgagcttgaagag 114467  T
Q  356 agagaaacttg-gattacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttg 404  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  114468 agagaaacttgagaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggtctttg 114517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 447
Target Start/End: Original strand, 114539 - 114572
Alignment:
Q  414 tctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  114539 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 114572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510 (Bit Score: 61; Significance: 9e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0510
Description:

Target: scaffold0510; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 271
Target Start/End: Original strand, 1176 - 1300
Alignment:
Q  147 tggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgattttgggaaaacgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttg 246  Q
    ||||||||||||||   |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  1176 tggtttgcagggtgtcaaatcgtggtacgattttgtgaaatcgtgacacgatttttaaacttgctggttaagttttcaggataaggttggtcgtaccttc 1275  T
Q  247 ggtcgtacgcaccaatcgtgccacg 271  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||    
T  1276 ggtcgtacgtatcaatcgtggcacg 1300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 112
Target Start/End: Original strand, 1083 - 1141
Alignment:
Q  54 tgttgaaaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||| ||| ||| |||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1083 tgttgaaatttgccttcaaatttgtggtttgaaagaacagaaaaatcgtgacacgattt 1141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1805 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1805
Description:

Target: scaffold1805; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 737 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 1344 - 1276
Alignment:
Q  737 ctctacactaagtctaggtctattttttgttgttattgcctggagacactttacacattgattaccactt 806  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1344 ctctacactaagtctaggtctgttttt-gttgttgttgcttggagacactttacacattgattaccactt 1276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 381 - 445
Target Start/End: Original strand, 33368 - 33432
Alignment:
Q  381 taactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacatctt 445  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  33368 taactttagggttgaatgtctttgtagtgacgatctcttgggttggaaaacattataaacatctt 33432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 48; Significance: 5e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 188 - 296
Target Start/End: Original strand, 6820 - 6929
Alignment:
Q  188 cgtgacacgattttcaaacttgttgggtacgttttcaagataaggttggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacg--ttttggaaaacgtg 285  Q
    ||||||||||||||||| |||| | || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||  || |||||||||||    
T  6820 cgtgacacgattttcaa-cttgctaggaacgttttcaggataaggttggttgtaccttgggtcgtacgcaccaaccatgtcacgatttgtggaaaacgtg 6918  T
Q  286 ccacgattttg 296  Q
      |||||||||    
T  6919 atacgattttg 6929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 180
Target Start/End: Original strand, 6754 - 6833
Alignment:
Q  101 gtgacacgatttcatcaacgtgtcacgatttcccaggcagtgagcatggtttgcagggtgctcaatcgtgtcacgatttt 180  Q
    ||||||||||||   || |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  6754 gtgacacgattttggcatcgtggcacgattttctaggcagtgagcatggtttgcagggtgtccaatcgtgacacgatttt 6833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 582 - 656
Target Start/End: Original strand, 9632 - 9705
Alignment:
Q  582 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9632 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 9705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 112
Target Start/End: Original strand, 3344 - 3394
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  3344 attggcttcaaatttgtggtctggaagaaaagagaaatcgtgacacgattt 3394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 419
Target Start/End: Original strand, 5745 - 5794
Alignment:
Q  370 tacaaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgaggatctctt 419  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5745 tacaaaggaggtaacttgagggttgagtgtctttgtagtgaggttctctt 5794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 593 - 656
Target Start/End: Original strand, 35063 - 35125
Alignment:
Q  593 tttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  35063 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 35125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 112
Target Start/End: Original strand, 34561 - 34611
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  34561 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 34611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1455 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1455
Description:

Target: scaffold1455; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 112
Target Start/End: Original strand, 1714 - 1766
Alignment:
Q  60 aaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1714 aaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 1766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0665 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0665
Description:

Target: scaffold0665; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 8266 - 8214
Alignment:
Q  62 attggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgatttca 114  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8266 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgatttca 8214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Original strand, 14297 - 14372
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  14297 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg 14372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 582 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 457 - 385
Alignment:
Q  582 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  457 tcttgtaaccttttgtaacactt-ca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 940 - 888
Alignment:
Q  60 aaattggctttaaatctgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgattt 112  Q
    |||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  940 aaattggcttcaaatttgtggtatggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Original strand, 2239 - 2314
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| || |||||    
T  2239 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctactctctcccccagattaggccacattgg 2314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 581 - 656
Target Start/End: Original strand, 148944 - 149019
Alignment:
Q  581 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 656  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| || |||||    
T  148944 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctactctctcccccagattaggccacattgg 149019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 610 - 664
Target Start/End: Original strand, 265 - 319
Alignment:
Q  610 atagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccaaact 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  265 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaact 319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 610 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 11537 - 11488
Alignment:
Q  610 atagtggattggatagctgctctctcccccatattaggtcatattggacc 659  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||  |||||||    
T  11537 atagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggacc 11488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University