View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5646-Insertion-6 (Length: 629)

Name: NF5646-Insertion-6
Description: NF5646
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5646-Insertion-6
NF5646-Insertion-6
[»] chr8 (7 HSPs)
chr8 (8-629)||(38316512-38317133)
chr8 (9-553)||(38325433-38325977)
chr8 (9-628)||(38313104-38313723)
chr8 (8-556)||(38320680-38321228)
chr8 (9-556)||(38299935-38300482)
chr8 (28-544)||(38308594-38309110)
chr8 (28-629)||(38305784-38306372)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (9-629)||(38850213-38850833)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 614; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 614; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 38317133 - 38316512
Alignment:
Q  8 tgaagtaggatgcgttgtgtcattaatcatgttggcagtttcataaaaaggcagcaagaacgcacaaatcttttcaactcttttccactcatgtgctaaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38317133 tgaagtaggatgcgttgtgtcattaatcatgttggcagtttcataaaaaggcagcaagaacgcacaaatcttttcaactcttttccactcatgtgctaaa 38317034  T
Q  108 ggacataacaggtaattatcatcatacaagtgaaaactttcaaatacatgccgatatttaagagcactttcaagcatcacataagttgagttcagactca 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38317033 ggacataactggtaattatcatcatacaagtgaaaactttcaaatacatgccgatatttaagagcactttcaagcatcacataagttgagttcagactca 38316934  T
Q  208 tagacatgtccagatgcaggcgaacagaactatcaacaccaccaaccttttcaatgcactccttaaattttgtccttctattttttgaattcctcacaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38316933 tagacatgtccagatgcaggcaaacagaactatcaacaccaccaaccttttcaatgcactccttaaattttgtccttctattttttgaattcctcacaaa 38316834  T
Q  308 catgatgctgtctcgaattccatacacggcaccactaactagttttaacccctcttcagcaatcagttttaaaacgcatgcaaaacaatgagcatgaaag 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38316833 catgatgctgtctcgaattccatacacggcaccactaactagttttaacccctcttcagcaatcagttttaaaacgcatgcaaaacaatgagcatgaaag 38316734  T
Q  408 aactctccatcacataacaacccatttcgcaaacaaagttgatttttcaattgttctagcataacattattctcaaatgaatcatctaaagtgagagaga 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38316733 aactctccatcacataacaacccatttcgcaaacaaagttgatttttcaattgttctagcataacattattctcaaatgaatcatctaaagtgagagaga 38316634  T
Q  508 aaatctttttctctattccccaatcattcaacaattcaatcattctctccgaaatctccgctgcaataggagggtaaacaagacgaaagttgagaacctt 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38316633 aaatctttttctctattccccaatcattcaacaattcaatcattctctccgaaatctccgctgcaataggagggtaaacaagacgaaagttgagaacctt 38316534  T
Q  608 actattcaacttccaattcgcg 629  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  38316533 actattcaacttccaattcgcg 38316512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 9 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 38325977 - 38325433
Alignment:
Q  9 gaagtaggatgcgttgtgtcattaatcatgttggcagtttcataaaaaggcagcaagaacgcacaaatcttttcaactcttttccactcatgtgctaaag 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| | | |  |||    
T  38325977 gaagtaggatgcgttgtgtcattaatcatgttagcagtttcacaaaaaggcaacaagaatgcacagatcttttctactcttttctactcttctaccgaag 38325878  T
Q  109 gacataacaggtaattatcatcatacaagtgaaaactttcaaatacatgccgatatttaagagcactttcaagcatcacataagttgagttcagactcat 208  Q
    ||||||||   |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38325877 gacataactcataattatcctcatacaagtgaagactttcaaacacacgccgatatttaagagcactttcaagcatcaaataagttgagttcagactcat 38325778  T
Q  209 agacatgtccagatgcaggcgaacagaactatcaacaccaccaaccttttcaatgcactccttaaattttgtccttctattttttgaattcctcacaaac 308  Q
    ||||  |||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  38325777 agacgagtcctgatgcaagcgaacggaactatcgacaccaccaaccttttcaatgcattccttaaatttctcccttctactctttgaatgcctcacaaac 38325678  T
Q  309 atgatgctgtctcgaattccatacacggcaccactaactagttttaacccctcttcagcaatcagttttaaaacgcatgcaaaacaatgagcatgaaaga 408  Q
    |||||||| |||| ||||    |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| | ||||||||| ||  | |||||||    
T  38325677 atgatgctctctctaatttttgacacggcatcactaactagtttcaacccgtcttcaacaatcagatttaaaacacgtgcaaaacagtgcccgtgaaaga 38325578  T
Q  409 actctccatcacataacaacccatttcgcaaacaaagttgatttttcaattgttctagcataacattattctcaaatgaatcatctaaagtgagagagaa 508  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||  ||||||||||||| | | |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||    
T  38325577 actctccatcacacaacaacccattttgcaaaccaagatgagatttcaattgttcttgtagaacattattctcgactgaatcatctaaagtaagagaaaa 38325478  T
Q  509 aatctttttctctattccccaatcattcaacaattcaatcattct 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38325477 aatctttttctctattccccaatcattcaacaattcaatcattct 38325433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 9 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 38313723 - 38313104
Alignment:
Q  9 gaagtaggatgcgttgtgtcattaatcatgttggcagtttcataaaaaggcagcaagaacgcacaaatcttttcaactcttttccactcatgtgctaaag 108  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| || | |||   ||    
T  38313723 gaagtaggatgtgttgcgccattaatcatgttggcagtttcacaaaaaggtaacaagaatgcacaaatcttttctactcttttccagtcttctgccgcag 38313624  T
Q  109 gacataacaggtaattatcatcatacaagtgaaaactttcaaatacatgccgatatttaagagcactttcaagcatcacataagttgagttcagactcat 208  Q
    ||||| |    |||| ||||||||||||||||| |||||||||  || || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  38313623 gacatgaatcataatcatcatcatacaagtgaagactttcaaacgcacgctgatatttaagagcactttgaagcatcaaataagttgagttcactctcat 38313524  T
Q  209 agacatgtccagatgcaggcgaacagaactatcaacaccaccaaccttttcaatgcactccttaaattttgtccttctattttttgaattcctcacaaac 308  Q
    |||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||| |||| | || |||| ||| ||||||    
T  38313523 agacatatctagatgcaagcgaaccgaactatcaacaccaccaaccttttcaacgcactccttaaaaaatttccatctactcttggaatgccttacaaac 38313424  T
Q  309 atgatgctgtctcgaattccatacacggcaccact---aactagttttaacccctcttcagcaatcagttttaaaacgcatgcaaaacaatgagcatgaa 405  Q
    |  ||||| ||||  ||  | |||| | || ||||   ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||    
T  38313423 aaaatgctctctctgat--cttaca-gacaacactctcaactagttttaacccttcatcaacaatcaggtttaaaacgcgggcaaaacaatgcacatgaa 38313327  T
Q  406 agaactctccatcacataacaacccatttcgcaaacaaagttgatttttcaattgttctagcataacattattctcaaatgaatcatctaaagtgagaga 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38313326 agaactctccatcacataacaacccattttgcaaacaaagttgattttttaattgttcttgcaaaatgtcattctcagatgaatcatctaaagtgagaga 38313227  T
Q  506 gaaaatctttttctctattccccaatcattcaacaattcaatcattctctccgaaatctccgctgcaataggagggtaaacaagacgaaagttgagaacc 605  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||  | ||||| ||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  38313226 gaaaatctttttctctattccccaatcactcaaaaactcaaccattctctcacacatctcagctccagtaggagggtaaacaagacagaagttgagaact 38313127  T
Q  606 ttactattcaacttccaattcgc 628  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  38313126 ttactatttaacttccaattcgc 38313104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 8 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 38321228 - 38320680
Alignment:
Q  8 tgaagtaggatgcgttgtgtcattaatcatgttggcagtttcataaaaaggcagcaagaacgcacaaatcttttcaactcttttccactcatgtgctaaa 107  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | | |  ||    
T  38321228 tgaagtaggatgtgctgtgccattaatcatgttagcagtttcccttaaaggcaacaagaacacacaaatcttttcaactcttttccattcttctaccgaa 38321129  T
Q  108 ggacataacaggtaattatcatcatacaagtgaaaactttcaaatacatgccgatatttaagagcactttcaagcatcacataagttgagttcagactca 207  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  38321128 ggacataactcataattatcatcatacaagtgaagactttcaaacacacacctatatttaagagcactttcaagcatcaaataagttgagttcacagtca 38321029  T
Q  208 tagacatgtccagatgcaggcgaacagaactatcaacaccaccaaccttttcaatgcactccttaaattttgtccttctattttttgaattcctcacaaa 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | | ||||||| ||| | |||    
T  38321028 tagacatgtccagatgcaagcgaactgaactatcaacaccaccaaccttttcaacgcactccttaaatttttgccttcgactctttgaatccctaaaaaa 38320929  T
Q  308 catgatgctgtctcgaattccatacacggcaccactaactagttttaacccctcttcagcaatcagttttaaaacgcatgcaaaacaatgagcatgaaag 407  Q
    || |||||| | || ||||    |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| | |||| |||||||  | ||||||    
T  38320928 caagatgctctgtctaattttcgacacagcatcactaactagtttcaacccctcttcaacaatcaattttaaaacacgtgcataacaatgcccgtgaaag 38320829  T
Q  408 aactctccatcacataacaacccatttcgcaaacaaagttgatttttcaattgttctagcataacattattctcaaatgaatcatctaaagtgagagaga 507  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||| ||| ||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38320828 aactccccatcacataacaacccattttgcaaaccaagttgagttttcaatagttcttgcaaaatgtcattctcagatgaatcatctaaagtgagagaga 38320729  T
Q  508 aaatctttttctctattccccaatcattcaacaattcaatcattctctc 556  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||    
T  38320728 agatctttttctctattccccaatcactcaaaaactcaaccattctctc 38320680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 9 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 38300482 - 38299935
Alignment:
Q  9 gaagtaggatgcgttgtgtcattaatcatgttggcagtttcataaaaaggcagcaagaacgcacaaatcttttcaactcttttccactcatgtgctaaag 108  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| | | |  |||    
T  38300482 gaagtaggatgtgttgtggcattaatcatgttggcagtttcactaaaaggcaacaagaacacacaaatcttttgtactcttttccactcttctaccgaag 38300383  T
Q  109 gacataacaggtaattatcatcatacaagtgaaaactttcaaatacatgccgatatttaagagcactttcaagcatcacataagttgagttcagactcat 208  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||  ||  |    
T  38300382 gacataacacataactatcatcatacaagtgaagactttcaaacacacgccgatatttaagagcactttcaagcattgaataagttgagttcactctttt 38300283  T
Q  209 agacatgtccagatgcaggcgaacagaactatcaacaccaccaaccttttcaatgcactccttaaattttgtccttctattttttgaattcctcacaaac 308  Q
    || | |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||| | | ||||||| ||||||||||    
T  38300282 aggcgtgtccagatgcaagcgaacggaacaatcaacaccaccaacctttgcaatacactccttaaatttttcccttccactctttgaatgcctcacaaac 38300183  T
Q  309 atgatgctgtctcgaattccatacacggcaccactaactagttttaacccctcttcagcaatcagttttaaaacgcatgcaaaacaatgagcatgaaaga 408  Q
    |||||||| |||| ||||  | ||| | || | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||  | |||||||    
T  38300182 atgatgctatctctaattttacacaggacatccctaactagtttcaacccctcttcaacaatcagttttaaaatgcgtgcaaaacaatgcccgtgaaaga 38300083  T
Q  409 actctccatcacataacaacccatttcgcaaacaaagttgatttttcaattgttctagcataacattattctcaaatgaatcatctaaagtgagagagaa 508  Q
    |||| || |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||  |||| |||| ||| ||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  38300082 actccccgtcacataacaacccattatgcaaaacaagttgattttgaaatttttcttgcaaaattttattcttaaatgaatcttctaaagtgagagagaa 38299983  T
Q  509 aatctttttctctattccccaatcattcaacaattcaatcattctctc 556  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  38299982 aatcttttcctctattccccaatcattcaagaactcaaccattctctc 38299935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 28 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 38309110 - 38308594
Alignment:
Q  28 cattaatcatgttggcagtttcataaaaaggcagcaagaacgcacaaatcttttcaactcttttccactcatgtgctaaaggacataacaggtaattatc 127  Q
    |||| ||| |||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||   ||||||| |    |||  |||    
T  38309110 catttatcgtgttggcagtttcgctaaaaggcaacaagaatgcacaaatcttttctactcttttccactcttctgccgcaggacatgaatcataaccatc 38309011  T
Q  128 atcatacaagtgaaaactttcaaatacatgccgatatttaagagcactttcaagcatcacataagttgagttcagactcatagacatgtccagatgcagg 227  Q
     ||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||      
T  38309010 gtcatacaagtgaagactttcaaatgcaagctgatatttaagagcactttgaagcatcaaataagttgagttcactctcatagacatgtctagatgcaaa 38308911  T
Q  228 cgaacagaactatcaacaccaccaaccttttcaatgcactccttaaattttgtccttctattttttgaattcctcacaaacatgatgctgtctcgaattc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   | | |||||   |||||||||||||||||| | || |||      
T  38308910 cgaacagaactatcaacaccaccaaccttttcaatgcactccttaaatttttccctgtgactctttgatcgcctcacaaacatgatgctctttctaatct 38308811  T
Q  328 catacacggcaccactaactagttttaacccctcttcagcaatcagttttaaaacgcatgcaaaacaatgagcatgaaagaactctccatcacataacaa 427  Q
     ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38308810 tatacacggcaccactaactagtttacacccctcttcaacaatcagttttaaaacatgtgcaaaacaatgagcatgaaagaactctccatcacataacaa 38308711  T
Q  428 cccatttcgcaaacaaagttgatttttcaattgttctagcataacattattctcaaatgaatcatctaaagtgagagagaaaatctttttctctattccc 527  Q
    |||||||  ||||| ||||||| | |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||| ||||    
T  38308710 cccattttccaaaccaagttgagtcttcaattgttgttgcagaacattattctcaaatgaatcatctaaagtaaatgaaaaaatctttttctctactccc 38308611  T
Q  528 caatcattcaacaattc 544  Q
    |||||||||||| ||||    
T  38308610 caatcattcaaccattc 38308594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 28 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 38306372 - 38305784
Alignment:
Q  28 cattaatcatgttggcagtttcataaaaaggcagcaagaacgcacaaatcttttcaactcttttccactcatgtgctaaaggacataacaggtaattatc 127  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||          |||  |||||||  | |  |||| | |    
T  38306372 cattgatcatgttggcagtttcacgaaaaggcaacatgaatgcacaaatcttttccactcttt----------tgcagaaggacacgagacataatcacc 38306283  T
Q  128 atcatacaagtgaaaactttcaaatacatgccgatatttaagagcactttcaagcatcacataagttgagttcagactcatagacatgtccagatgcagg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |    
T  38306282 atcatacaagtgaaaactttcaaacacatgttgatatttaagagcactatcgagcatcaaataagttgagttcacagtcatagacatgtccatatgcaag 38306183  T
Q  228 cgaacagaactatcaacaccaccaaccttttcaatgcactccttaaattttgtccttctattttttgaattcctcacaaacatgatgctgtctcgaattc 327  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||     
T  38306182 cgaactgaactgtcaataccaccaaccttttcaacgcactccttaaattttttccttctactctttgaatccctcacaaacaagatgctctctctaattt 38306083  T
Q  328 catacacggcaccactaactagttttaacccctcttcagcaatcagttttaaaacgcatgcaaaacaatgagcatgaaagaactctccatcacataacaa 427  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  38306082 tagacacgtcaccactaactagttttaacccctcttcaacaatcagttttaaaacgcgtgcagaacaatgcctgtgaaagaactctccatcacataacaa 38305983  T
Q  428 cccatttcgcaaacaaagttgatttttcaattgttctagcataacattattctcaaatgaatcatctaaagtgagagagaaaatctttttctctattccc 527  Q
     ||||||  ||||| ||| |||  |||||| |||||| ||| ||  || | || |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38305982 accattttccaaaccaagatgagatttcaactgttcttgcaaaatgttgtccttaaatgagtcctctaaattgagagagaaaatctttttctctattccc 38305883  T
Q  528 caatcattcaacaattcaatcattctctccgaaatctccgctgcaataggagggt-aaacaagacgaaagttgagaaccttactattcaacttccaattc 626  Q
    |||||| |||| || |||| |||||||||  | ||||| ||| ||    | |||| |||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  38305882 caatcactcaaaaactcaaccattctctcacacatctcggctaca----gtgggtaaaacaacacagaagttgagaaccttactatttaacttccaatcc 38305787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 9 - 629
Target Start/End: Original strand, 38850213 - 38850833
Alignment:
Q  9 gaagtaggatgcgttgtgtcattaatcatgttggcagtttcataaaaaggcagcaagaacgcacaaatcttttcaactcttttccactcatgtgctaaag 108  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||  |||    
T  38850213 gaagtaggatgtgttgtgctattaatcatgttggcagtttcacaaaaaggcaacaggaatgcacaaatcttttctactcttttccactcttccgccgaag 38850312  T
Q  109 gacataacaggtaattatcatcatacaagtgaaaactttcaaatacatgccgatatttaagagcactttcaagcatcacataagttgagttcagactcat 208  Q
    |||||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||  ||| ||||||    
T  38850313 gacataaatcataactatcatcatacaagtgaaaactttcaaacgcacaccggtatttaagagctctttcaagcaacatataagttgaactcaaactcat 38850412  T
Q  209 agacatgtccagatgcaggcgaacagaactatcaacaccaccaaccttttcaatgcactccttaaattttgtccttctattttttgaattcctcacaaac 308  Q
    ||| || |||| ||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  38850413 agatatatccaaatgtaagtgaaccgaactatcaacaccaccaaccttttcaaagcactccttaaatttttccctcctactctttgaatgcctcacaaac 38850512  T
Q  309 atgatgctgtctcgaattccatacacggcaccactaactagttttaacccctcttcagcaatcagttttaaaacgcatgcaaaacaatgagcatgaaaga 408  Q
    ||||| || ||||  ||   || |||  |||  ||||||||||||||| | |||||| | ||| | |||||||||| |||||||||||   |||||||||    
T  38850513 atgatactctctctgatcttatgcacaccacagctaactagttttaacgcttcttcaactatctgatttaaaacgcgtgcaaaacaattcacatgaaaga 38850612  T
Q  409 actctccatcacataacaacccatttcgcaaacaaagttgatttttcaattgttctagcataacattattctcaaatgaatcatctaaagtgagagagaa 508  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| ||| ||  | ||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  38850613 actctccatcacataacaaaccattttgcaaaacaagttgagttttcaattgttcttgcaaaatctcattctcagatgaatcatcaatagtgagagagaa 38850712  T
Q  509 aatctttttctctattccccaatcattcaacaattcaatcattctctccgaaatctccgctgcaataggagggtaaacaagacgaaagttgagaacctta 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||| |   | ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||    
T  38850713 aatctttttctctattccccaatcattcaacaactcaaccattctctcacaaatctccccactagtaggaggataaacaagacggaaattgataacctta 38850812  T
Q  609 ctattcaacttccaattcgcg 629  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  38850813 ctatttaacttccaattcgcg 38850833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University