View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5649_low_14 (Length: 257)

Name: NF5649_low_14
Description: NF5649
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5649_low_14
NF5649_low_14
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (11-217)||(26704339-26704545)
chr6 (11-217)||(2837546-2837752)
chr6 (11-217)||(6086599-6086805)
chr6 (11-214)||(30691855-30692058)
chr6 (11-217)||(26946876-26947082)
chr6 (11-217)||(3347523-3347729)
chr6 (11-222)||(3955769-3955977)
chr6 (11-216)||(17261073-17261278)
chr6 (11-217)||(9459564-9459770)
chr6 (11-217)||(21893456-21893662)
chr6 (11-217)||(18613539-18613745)
chr6 (11-222)||(20726787-20726994)
chr6 (11-215)||(34887292-34887496)
chr6 (11-217)||(11167241-11167447)
chr6 (18-217)||(16307015-16307214)
chr6 (11-216)||(28199508-28199714)
chr6 (11-208)||(1153603-1153800)
chr6 (12-217)||(35198285-35198489)
chr6 (16-214)||(30698934-30699132)
chr6 (55-217)||(52837-52999)
chr6 (11-148)||(33464399-33464536)
chr6 (11-125)||(53001-53115)
chr6 (140-216)||(33463703-33463779)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (11-217)||(18594538-18594744)
chr8 (11-217)||(39206587-39206793)
chr8 (11-222)||(14422699-14422910)
chr8 (11-217)||(29938062-29938268)
chr8 (11-216)||(13110406-13110611)
chr8 (13-214)||(2042526-2042727)
chr8 (11-222)||(144390-144601)
chr8 (11-217)||(22260630-22260836)
chr8 (11-217)||(24113166-24113372)
chr8 (11-217)||(35118031-35118237)
chr8 (11-214)||(10836755-10836958)
chr8 (11-217)||(6144273-6144479)
chr8 (11-217)||(34842365-34842571)
chr8 (11-216)||(34998896-34999101)
chr8 (12-217)||(39218778-39218983)
chr8 (7-214)||(7774768-7774975)
chr8 (11-217)||(33278401-33278607)
chr8 (11-213)||(34679457-34679659)
chr8 (12-217)||(4035848-4036053)
chr8 (11-219)||(7791410-7791618)
chr8 (12-215)||(41575516-41575719)
chr8 (15-222)||(38167159-38167366)
chr8 (12-212)||(44804945-44805145)
chr8 (11-217)||(5320565-5320771)
chr8 (11-217)||(7811996-7812202)
chr8 (14-216)||(28639280-28639484)
chr8 (11-217)||(36491158-36491364)
chr8 (10-216)||(8021721-8021919)
chr8 (11-214)||(42571598-42571798)
chr8 (62-217)||(40117903-40118058)
chr8 (14-217)||(33287040-33287231)
chr8 (12-215)||(66180-66384)
chr8 (79-214)||(26783801-26783936)
chr8 (14-139)||(9807339-9807464)
chr8 (67-217)||(2322068-2322218)
chr8 (90-213)||(5005171-5005294)
chr8 (67-216)||(39220258-39220407)
chr8 (131-216)||(9806875-9806960)
[»] chr3 (40 HSPs)
chr3 (11-217)||(37698129-37698335)
chr3 (11-222)||(25999379-25999590)
chr3 (12-217)||(42307892-42308097)
chr3 (10-222)||(38856084-38856296)
chr3 (11-217)||(15520128-15520334)
chr3 (11-213)||(21581042-21581244)
chr3 (11-217)||(22174976-22175182)
chr3 (11-217)||(8042603-8042809)
chr3 (11-217)||(50528925-50529131)
chr3 (10-222)||(25494270-25494482)
chr3 (11-217)||(20842334-20842540)
chr3 (12-217)||(46452149-46452354)
chr3 (16-216)||(32244117-32244317)
chr3 (11-217)||(12117644-12117850)
chr3 (11-217)||(29445484-29445690)
chr3 (12-217)||(15520632-15520837)
chr3 (12-217)||(20699145-20699350)
chr3 (11-213)||(35226447-35226649)
chr3 (11-217)||(38933942-38934147)
chr3 (11-217)||(54534314-54534518)
chr3 (11-217)||(54870160-54870366)
chr3 (11-219)||(44609319-44609527)
chr3 (11-216)||(32359256-32359461)
chr3 (10-219)||(42104956-42105165)
chr3 (11-228)||(2895170-2895391)
chr3 (12-217)||(24835686-24835891)
chr3 (12-213)||(26122814-26123015)
chr3 (11-217)||(34700337-34700543)
chr3 (10-213)||(53028225-53028420)
chr3 (12-217)||(44688762-44688961)
chr3 (11-213)||(48924989-48925189)
chr3 (11-168)||(16354391-16354548)
chr3 (62-217)||(35643213-35643368)
chr3 (79-213)||(50529827-50529961)
chr3 (14-186)||(12915934-12916105)
chr3 (85-217)||(49128045-49128177)
chr3 (12-99)||(24366143-24366230)
chr3 (11-92)||(13696914-13696995)
chr3 (11-59)||(50528868-50528916)
chr3 (171-217)||(24366088-24366134)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (11-217)||(36704-36910)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (11-217)||(9008057-9008263)
chr5 (11-217)||(27679169-27679375)
chr5 (11-215)||(24105671-24105875)
chr5 (11-217)||(33491196-33491402)
chr5 (14-217)||(1579038-1579241)
chr5 (14-217)||(1605574-1605777)
chr5 (11-216)||(16069356-16069561)
chr5 (11-214)||(16737447-16737650)
chr5 (11-213)||(3386486-3386688)
chr5 (15-217)||(27420860-27421062)
chr5 (11-217)||(19358528-19358734)
chr5 (11-217)||(20992146-20992352)
chr5 (11-217)||(4120939-4121145)
chr5 (11-217)||(8374339-8374544)
chr5 (14-222)||(1165604-1165812)
chr5 (11-215)||(31883148-31883352)
chr5 (11-217)||(33991142-33991348)
chr5 (11-216)||(3921584-3921789)
chr5 (11-217)||(35782644-35782850)
chr5 (12-222)||(5202969-5203179)
chr5 (11-213)||(38598450-38598652)
chr5 (11-217)||(26602942-26603138)
chr5 (14-214)||(31410481-31410681)
chr5 (11-174)||(27025001-27025164)
chr5 (84-213)||(20992354-20992487)
chr5 (78-211)||(33284642-33284775)
chr5 (11-69)||(35420424-35420482)
chr5 (83-168)||(31638196-31638281)
chr5 (67-217)||(25634584-25634732)
chr5 (100-153)||(41818552-41818605)
chr5 (18-49)||(27024822-27024853)
[»] chr4 (66 HSPs)
chr4 (11-217)||(54189544-54189750)
chr4 (11-217)||(19913618-19913824)
chr4 (10-219)||(1756751-1756960)
chr4 (13-217)||(23776449-23776653)
chr4 (11-219)||(54412625-54412833)
chr4 (11-214)||(15241016-15241219)
chr4 (11-217)||(53717452-53717658)
chr4 (11-224)||(38055149-38055362)
chr4 (11-215)||(16700782-16700986)
chr4 (11-217)||(14987791-14987997)
chr4 (11-217)||(27488636-27488842)
chr4 (20-217)||(50055098-50055295)
chr4 (12-216)||(20877047-20877251)
chr4 (11-217)||(2481396-2481602)
chr4 (11-217)||(6611348-6611554)
chr4 (11-213)||(28032700-28032902)
chr4 (11-217)||(40428708-40428914)
chr4 (11-217)||(44784905-44785111)
chr4 (11-217)||(50353800-50354006)
chr4 (11-216)||(31969681-31969886)
chr4 (14-215)||(43289951-43290152)
chr4 (11-217)||(8932166-8932372)
chr4 (11-217)||(11639566-11639772)
chr4 (11-217)||(45424522-45424728)
chr4 (14-216)||(52139203-52139405)
chr4 (11-216)||(1617084-1617289)
chr4 (11-216)||(8591080-8591285)
chr4 (11-216)||(35490761-35490966)
chr4 (13-213)||(48909849-48910049)
chr4 (11-217)||(6688615-6688815)
chr4 (14-216)||(30423556-30423757)
chr4 (11-217)||(37464720-37464926)
chr4 (12-217)||(37968746-37968951)
chr4 (11-215)||(53875658-53875862)
chr4 (11-217)||(47632033-47632240)
chr4 (11-215)||(19164961-19165164)
chr4 (14-213)||(23704200-23704399)
chr4 (11-217)||(15669182-15669388)
chr4 (11-217)||(27536092-27536294)
chr4 (11-207)||(33703850-33704046)
chr4 (12-217)||(53353054-53353267)
chr4 (11-212)||(27583620-27583821)
chr4 (10-213)||(44379174-44379377)
chr4 (11-215)||(30171581-30171785)
chr4 (20-218)||(44375843-44376041)
chr4 (11-212)||(40680026-40680227)
chr4 (11-217)||(55344813-55345019)
chr4 (45-213)||(28360433-28360602)
chr4 (11-207)||(38071314-38071504)
chr4 (67-217)||(50053442-50053592)
chr4 (14-194)||(16703843-16704023)
chr4 (11-139)||(23269034-23269162)
chr4 (131-216)||(23265865-23265950)
chr4 (11-98)||(53408137-53408225)
chr4 (67-217)||(44548185-44548336)
chr4 (68-150)||(51780763-51780845)
chr4 (11-74)||(23261874-23261937)
chr4 (11-114)||(9595890-9595982)
chr4 (67-179)||(17493370-17493482)
chr4 (11-60)||(50055301-50055350)
chr4 (11-77)||(48748197-48748263)
chr4 (72-129)||(55344724-55344781)
chr4 (11-45)||(55344681-55344715)
chr4 (171-217)||(9595983-9596028)
chr4 (12-72)||(34615904-34615962)
chr4 (172-216)||(34615828-34615872)
[»] chr1 (48 HSPs)
chr1 (11-217)||(25897373-25897579)
chr1 (11-217)||(39260346-39260552)
chr1 (12-213)||(29078519-29078720)
chr1 (11-217)||(20089470-20089676)
chr1 (11-217)||(52753147-52753353)
chr1 (11-219)||(26663255-26663463)
chr1 (11-217)||(26580270-26580476)
chr1 (10-217)||(1168502-1168709)
chr1 (11-217)||(29288148-29288352)
chr1 (12-217)||(16052095-16052300)
chr1 (10-217)||(33510483-33510690)
chr1 (11-213)||(38829072-38829274)
chr1 (11-217)||(41928495-41928701)
chr1 (11-217)||(970524-970732)
chr1 (11-216)||(19715161-19715366)
chr1 (12-216)||(8079710-8079914)
chr1 (11-215)||(43905655-43905859)
chr1 (11-217)||(1940747-1940953)
chr1 (11-217)||(42370795-42371001)
chr1 (11-217)||(52696790-52696996)
chr1 (14-217)||(1170447-1170650)
chr1 (11-217)||(32671578-32671784)
chr1 (11-219)||(5215382-5215590)
chr1 (10-213)||(12682823-12683026)
chr1 (11-215)||(8120870-8121074)
chr1 (12-216)||(46760966-46761170)
chr1 (11-217)||(2347655-2347862)
chr1 (11-217)||(17591690-17591893)
chr1 (11-217)||(51359217-51359422)
chr1 (11-222)||(15203106-15203317)
chr1 (11-215)||(46409436-46409642)
chr1 (11-213)||(13996723-13996925)
chr1 (11-213)||(40092494-40092696)
chr1 (11-200)||(17587505-17587694)
chr1 (14-216)||(2473722-2473924)
chr1 (11-216)||(7145207-7145412)
chr1 (11-215)||(49146173-49146377)
chr1 (16-219)||(6765456-6765659)
chr1 (11-222)||(23498454-23498665)
chr1 (11-217)||(15554152-15554350)
chr1 (14-214)||(15717787-15717986)
chr1 (10-182)||(40149497-40149669)
chr1 (50-213)||(29695678-29695842)
chr1 (12-215)||(38171833-38172023)
chr1 (87-213)||(52086270-52086396)
chr1 (68-203)||(23322897-23323032)
chr1 (67-214)||(5217840-5217986)
chr1 (145-217)||(5675104-5675176)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (11-222)||(33359080-33359291)
chr7 (11-217)||(12101168-12101374)
chr7 (11-217)||(24792322-24792528)
chr7 (11-217)||(30181014-30181220)
chr7 (10-217)||(20346488-20346695)
chr7 (11-217)||(42964986-42965192)
chr7 (11-217)||(43067963-43068169)
chr7 (10-219)||(7164182-7164391)
chr7 (13-216)||(3511324-3511527)
chr7 (11-222)||(22649684-22649895)
chr7 (11-217)||(42204154-42204361)
chr7 (11-216)||(5280861-5281066)
chr7 (11-215)||(4477311-4477515)
chr7 (11-214)||(1803029-1803232)
chr7 (11-217)||(15655912-15656118)
chr7 (11-217)||(33846519-33846720)
chr7 (11-213)||(933289-933491)
chr7 (11-217)||(6394751-6394957)
chr7 (11-217)||(25748487-25748693)
chr7 (13-212)||(43156718-43156917)
chr7 (11-217)||(12097580-12097786)
chr7 (12-217)||(36890821-36891025)
chr7 (10-217)||(32041542-32041749)
chr7 (11-215)||(42673467-42673667)
chr7 (11-217)||(4347273-4347478)
chr7 (11-216)||(9452591-9452796)
chr7 (11-223)||(17753594-17753806)
chr7 (11-217)||(8630666-8630872)
chr7 (11-214)||(38866547-38866750)
chr7 (11-222)||(46891329-46891541)
chr7 (11-218)||(46134294-46134501)
chr7 (13-182)||(48865665-48865837)
chr7 (11-217)||(16894497-16894693)
chr7 (11-217)||(43021570-43021772)
chr7 (72-217)||(19828270-19828415)
chr7 (67-215)||(37005857-37006005)
chr7 (15-217)||(43405020-43405223)
chr7 (122-217)||(37704980-37705075)
chr7 (67-214)||(15655458-15655605)
chr7 (67-222)||(30075277-30075429)
chr7 (74-217)||(36849590-36849733)
chr7 (128-212)||(27691433-27691517)
chr7 (83-212)||(20163824-20163953)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (11-224)||(31517215-31517428)
chr2 (11-224)||(3873244-3873457)
chr2 (11-217)||(18806884-18807090)
chr2 (11-213)||(33906047-33906249)
chr2 (11-217)||(26323186-26323392)
chr2 (11-216)||(4016039-4016244)
chr2 (12-217)||(39635451-39635656)
chr2 (11-216)||(28329839-28330042)
chr2 (11-215)||(42937720-42937925)
chr2 (10-217)||(4232141-4232348)
chr2 (11-217)||(2178769-2178975)
chr2 (11-217)||(5733398-5733604)
chr2 (11-217)||(6174828-6175034)
chr2 (31-217)||(1108279-1108464)
chr2 (11-215)||(1482903-1483106)
chr2 (11-216)||(850997-851202)
chr2 (13-217)||(30420181-30420373)
chr2 (19-212)||(16066302-16066495)
chr2 (16-217)||(19901143-19901343)
chr2 (11-217)||(30270679-30270885)
chr2 (10-215)||(16588775-16588980)
chr2 (14-202)||(19383938-19384126)
chr2 (15-215)||(429817-430017)
chr2 (11-217)||(44947549-44947748)
chr2 (67-217)||(42446625-42446775)
chr2 (74-168)||(22101210-22101304)
chr2 (67-215)||(3585291-3585439)
chr2 (83-213)||(12517256-12517385)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (16-217)||(22956-23157)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (11-217)||(6-212)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (11-217)||(3709-3915)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (12-216)||(145246-145450)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (11-217)||(10237-10443)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (11-219)||(295-503)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (11-216)||(6-212)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 26704339 - 26704545
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26704339 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 26704438  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26704439 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataaaccaatcca 26704538  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  26704539 aacgggg 26704545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2837752 - 2837546
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  2837752 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatgagcagctc 2837653  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2837652 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 2837553  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  2837552 aacgggg 2837546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 6086599 - 6086805
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6086599 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 6086698  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6086699 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 6086798  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  6086799 aacgggg 6086805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30692058 - 30691855
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30692058 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 30691959  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30691958 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 30691859  T
Q  211 aacg 214  Q
    ||||    
T  30691858 aacg 30691855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 26946876 - 26947082
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26946876 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 26946975  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26946976 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatcca 26947075  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  26947076 aacgggg 26947082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 3347523 - 3347729
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3347523 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 3347622  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3347623 atgaaactatgataagctgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 3347722  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  3347723 aacgggg 3347729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Original strand, 3955769 - 3955977
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  3955769 cagagagaatcgaagg---ttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagttt 3955865  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3955866 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatcca 3955965  T
Q  211 aacggggtcata 222  Q
    ||||||||||||    
T  3955966 aacggggtcata 3955977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Original strand, 17261073 - 17261278
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17261073 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagctt 17261172  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17261173 atgaaaatattataagctatttttatttatttacccaaacacctttagaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 17261272  T
Q  211 aacggg 216  Q
    ||||||    
T  17261273 aacggg 17261278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9459770 - 9459564
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459770 cagagagaatcgaaggaggatacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 9459671  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  9459670 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatggaaatagataagctcacataaactcaaaataagccaatcca 9459571  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  9459570 aacgggg 9459564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21893662 - 21893456
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21893662 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagctt 21893563  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||    
T  21893562 atgaaactatgataagctatttttatatatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaatcgatcca 21893463  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  21893462 aacgggg 21893456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18613745 - 18613539
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18613745 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 18613646  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||    
T  18613645 atggaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccgcataagctcaaaataagtcaatcca 18613546  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  18613545 aacgggg 18613539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20726994 - 20726787
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20726994 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 20726895  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20726894 atgaaactatgataagttattttta----tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatcca 20726799  T
Q  211 aacggggtcata 222  Q
    ||||||| ||||    
T  20726798 aacggggccata 20726787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Original strand, 34887292 - 34887496
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  34887292 cagagagaatcgaaggaggtcacataaattcattagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagctt 34887391  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  34887392 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaggagataaacccacataagctcaaaataagtcaatcca 34887491  T
Q  211 aacgg 215  Q
    |||||    
T  34887492 aacgg 34887496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 11167447 - 11167241
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11167447 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggtgggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 11167348  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||   | || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11167347 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgaaaataaataagcacacataagctcaaaataagccaatcca 11167248  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  11167247 aacgggg 11167241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 217
Target Start/End: Original strand, 16307015 - 16307214
Alignment:
Q  18 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16307015 aatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 16307114  T
Q  118 tatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgggg 217  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16307115 tatgataagctgtttttatttatttatccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 16307214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Original strand, 28199508 - 28199714
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  28199508 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcat 28199606  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagta---gataagcccacgtaagctcaaaataagccaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  28199607 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat-ggagtagatgataagtccacataagctcaaaataagtcaat 28199705  T
Q  208 ccaaacggg 216  Q
    |||||||||    
T  28199706 ccaaacggg 28199714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 1153800 - 1153603
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1153800 cagagagaaacgaaggaggttacataaatacataagcaccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 1153701  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatc 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  1153700 atgaaactatgataatctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccaacataagcttaaaataagccaatc 1153603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 35198489 - 35198285
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 111  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35198489 agagagaatcgaatgagatcacataaattcataagttccttgttaagccggagagtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctta 35198390  T
Q  112 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  35198389 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa-gcttatggaagtagataagcccacataagttcaaaataagccaattcaa 35198291  T
Q  212 acgggg 217  Q
    ||||||    
T  35198290 acgggg 35198285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 30698934 - 30699132
Alignment:
Q  16 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  30698934 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctaataaa 30699033  T
Q  116 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||| ||| |||| |||||| |||||||||||    
T  30699034 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaataaataagctcacataaactcataataagtcaatccaaacg 30699132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 55 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 52999 - 52837
Alignment:
Q  55 taagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacct 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52999 taagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacct 52900  T
Q  155 ttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgggg 217  Q
    ||||||| ||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52899 ttaaaaatgcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 52837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 33464536 - 33464399
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33464536 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 33464437  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaa 148  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  33464436 atgaaactatgataaactatttttacttatttacccaa 33464399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 53115 - 53001
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53115 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 53016  T
Q  111 atgaaactatgataa 125  Q
    |||||||||||||||    
T  53015 atgaaactatgataa 53001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 140 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33463779 - 33463703
Alignment:
Q  140 tttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacggg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33463779 tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 33463703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18594744 - 18594538
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18594744 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 18594645  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18594644 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 18594545  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  18594544 aacgggg 18594538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 39206793 - 39206587
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39206793 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagctt 39206694  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39206693 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 39206594  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  39206593 aacgggg 39206587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14422910 - 14422699
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14422910 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 14422811  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14422810 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatcca 14422711  T
Q  211 aacggggtcata 222  Q
    ||||||| ||||    
T  14422710 aacggggccata 14422699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 29938268 - 29938062
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29938268 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 29938169  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29938168 atgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 29938069  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  29938068 aacgggg 29938062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13110611 - 13110406
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13110611 cagagagaatcgaaggaggttacataaactcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 13110512  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13110511 attaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcatatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 13110412  T
Q  211 aacggg 216  Q
    ||||||    
T  13110411 aacggg 13110406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 2042526 - 2042727
Alignment:
Q  13 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2042526 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttat 2042625  T
Q  113 gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaa 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2042626 gaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaa 2042725  T
Q  213 cg 214  Q
    ||    
T  2042726 cg 2042727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 144601 - 144390
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144601 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 144502  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||    
T  144501 atgaaactatgataaactatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacatatgctcaaaataagtcaatcca 144402  T
Q  211 aacggggtcata 222  Q
    ||||| ||||||    
T  144401 aacggagtcata 144390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 22260630 - 22260836
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22260630 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 22260729  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22260730 atgaaactaggataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagacttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatcca 22260829  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  22260830 aacgggg 22260836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 24113166 - 24113372
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24113166 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 24113265  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24113266 atgaaactatgataatctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagggttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcca 24113365  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  24113366 aacgggg 24113372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 35118031 - 35118237
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35118031 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 35118130  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35118131 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 35118230  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  35118231 aacgggg 35118237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Original strand, 10836755 - 10836958
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10836755 cagagataatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagttt 10836854  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10836855 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 10836954  T
Q  211 aacg 214  Q
    ||||    
T  10836955 aacg 10836958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 6144273 - 6144479
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6144273 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagctt 6144372  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  6144373 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacactgttaaaaaggcatatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagtcaatcca 6144472  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  6144473 aacgggg 6144479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 34842365 - 34842571
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34842365 cagagagaatcgaaggaggtcacataaattaataagctccttgttaagacggtgggtaagctggaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctt 34842464  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34842465 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 34842564  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  34842565 aacgggg 34842571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Original strand, 34998896 - 34999101
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34998896 cagagagaatcgaaggagattaaataaattcataagctccttgttaagccggagggcaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 34998995  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||    
T  34998996 atgaaactaagataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccgtataagctcaaaataagccaatcca 34999095  T
Q  211 aacggg 216  Q
     |||||    
T  34999096 tacggg 34999101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 39218983 - 39218778
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39218983 agagagaatcgaaggaggtcacataaattcatcagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctta 39218884  T
Q  112 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaa 211  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39218883 tgaagctatgataaaccatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 39218784  T
Q  212 acgggg 217  Q
    ||||||    
T  39218783 acgggg 39218778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7774975 - 7774768
Alignment:
Q  7 ggatcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagca 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  7774975 ggatcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttaataaaatatgacataagca 7774876  T
Q  107 gcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaa 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  7774875 gcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaacccgcataagctcaaaataagccaa 7774776  T
Q  207 tccaaacg 214  Q
    || |||||    
T  7774775 tctaaacg 7774768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 33278607 - 33278401
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33278607 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 33278508  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||   |||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||    
T  33278507 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgaaagtagataagtccatataaactcaaaataagccaatcca 33278408  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  33278407 aacgggg 33278401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 213
Target Start/End: Original strand, 34679457 - 34679659
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34679457 cagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagctt 34679556  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  34679557 atgaaactatgataaactatttttatttatttattcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatcca 34679656  T
Q  211 aac 213  Q
    |||    
T  34679657 aac 34679659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4036053 - 4035848
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4036053 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 4035954  T
Q  112 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||    
T  4035953 tgaaactatgataagctatttttatttgtttacccaaacacctttaataaaacttatgggagtagataagcccatataagctaaaaataaaccaatccaa 4035854  T
Q  212 acgggg 217  Q
    ||||||    
T  4035853 acgggg 4035848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7791618 - 7791410
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  7791618 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagctt 7791519  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  7791518 atgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatcca 7791419  T
Q  211 aacggggtc 219  Q
    |||||||||    
T  7791418 aacggggtc 7791410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41575719 - 41575516
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  41575719 agagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagctta 41575620  T
Q  112 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaa 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  41575619 tgaaactatgataagcaatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtctacataagctcaaaataagccaatccaa 41575520  T
Q  212 acgg 215  Q
    ||||    
T  41575519 acgg 41575516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 38167159 - 38167366
Alignment:
Q  15 gagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38167159 gagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 38167258  T
Q  115 aactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 214  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||     
T  38167259 aactatgataaactagttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataagcccacataaactcaaaataggccaatccaaaca 38167358  T
Q  215 gggtcata 222  Q
    ||| ||||    
T  38167359 gggccata 38167366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 212
Target Start/End: Original strand, 44804945 - 44805145
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44804945 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 44805044  T
Q  112 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||    
T  44805045 tgaaactatgataagctatttttatttatttatctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataaacctacataagctcaaaataagccaattcaa 44805144  T
Q  212 a 212  Q
    |    
T  44805145 a 44805145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 5320771 - 5320565
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||    
T  5320771 cagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagttgaaaatttaggcttattgaaacatgacataagcaactt 5320672  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  5320671 atgaaactatgataaattatttttatttatttaccaaaacaactttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatcca 5320572  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  5320571 aacgggg 5320565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7812202 - 7811996
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  7812202 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaagcttattgaaatatgacataagcagctt 7812103  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  7812102 atgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactaatggaagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatcaa 7812003  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  7812002 aacgggg 7811996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28639484 - 28639280
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28639484 agagaatcgaaggaggttacataa--tcataagctctatgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 28639387  T
Q  114 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggct----tataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcc 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |    
T  28639386 aaactatgataaactatttttatttatttaccaaaacacctttaaaaaagcttgtatataggagtagataagctcacataagcttaaaataagccaattc 28639287  T
Q  210 aaacggg 216  Q
    |||||||    
T  28639286 aaacggg 28639280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36491364 - 36491158
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  36491364 cagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagcttcttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaagtt 36491265  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  36491264 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaagacttatgcgattagataatcccacataagcttaaaataagccaatcca 36491165  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    || ||||    
T  36491164 aatgggg 36491158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8021919 - 8021721
Alignment:
Q  10 tcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagct 109  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8021919 tcagagagaatcgaagtaggttatataaactcataagctccttgttaagccgga--------tgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagct 8021828  T
Q  110 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcc 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8021827 tatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatcc 8021728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 42571798 - 42571598
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||    
T  42571798 cagagagaatcgaaagaggttgcataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggc--attgaaatatgacataagcagctt 42571701  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42571700 atgaaactatgataagctatttttatt-atttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatcca 42571602  T
Q  211 aacg 214  Q
    ||||    
T  42571601 aacg 42571598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 62 - 217
Target Start/End: Original strand, 40117903 - 40118058
Alignment:
Q  62 gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 161  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40117903 gagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaa 40118002  T
Q  162 ggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgggg 217  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40118003 ggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 40118058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 33287040 - 33287231
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33287040 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagct------------agagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 33287127  T
Q  114 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  33287128 aaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcatatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 33287227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Original strand, 66180 - 66384
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc-agagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  66180 agagagaatcgaaggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccgaaagggtaagctgaaaatttaaacttattgaaatatggcataagcagctt 66279  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||| |||||||||| ||  || ||||||||||||||||| |    
T  66280 atgaaactattataagttatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagacatatgggaatagataagcctacagaaactcaaaataagccaatcta 66379  T
Q  211 aacgg 215  Q
    |||||    
T  66380 aacgg 66384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 79 - 214
Target Start/End: Original strand, 26783801 - 26783936
Alignment:
Q  79 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagat 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26783801 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagat 26783900  T
Q  179 aagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26783901 aagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 26783936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 9807464 - 9807339
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 113  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9807464 agagaaacgaaggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 9807365  T
Q  114 aaactatgataagctatttttattta 139  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  9807364 aagctatgataagctatttttattta 9807339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 217
Target Start/End: Original strand, 2322068 - 2322218
Alignment:
Q  67 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 166  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2322068 taagcttaaaatttaggcttatcaaaatatgatataagcagcttatgaaattgtgataagctgtttttattgatttacccaaacacctttaaaaaagctt 2322167  T
Q  167 ataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgggg 217  Q
    ||   |||||||||  |||  |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2322168 atgttagtagataaatccatataagctccgaataagccaatccaaacgggg 2322218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 90 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5005294 - 5005171
Alignment:
Q  90 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgta 189  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||    
T  5005294 aaaatatagcataagcagtttatgagagtagcataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacata 5005195  T
Q  190 agctcaaaataagccaatccaaac 213  Q
    |||| || ||||||||||||||||    
T  5005194 agcttaagataagccaatccaaac 5005171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 39220407 - 39220258
Alignment:
Q  67 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 166  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| |   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |    
T  39220407 taagctcaaaatttgagcttattaaaatatagtatgagcagcttatgaaattggaataagctatttttattgatttactcaaacacctttaaaaagacat 39220308  T
Q  167 ataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacggg 216  Q
    || |  |||||||||  ||  ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  39220307 atggatgtagataagttcatataagctcaaaataagtcaattcaaacggg 39220258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 131 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9806960 - 9806875
Alignment:
Q  131 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacggg 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  9806960 ttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcatatgggagtagataagcacatataaactcaaaataagtcaatccaaacggg 9806875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 40)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 37698129 - 37698335
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37698129 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 37698228  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37698229 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 37698328  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  37698329 aacgggg 37698335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25999590 - 25999379
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25999590 cagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 25999491  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25999490 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 25999391  T
Q  211 aacggggtcata 222  Q
    ||||||| ||||    
T  25999390 aacggggccata 25999379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 42307892 - 42308097
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42307892 agagagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 42307991  T
Q  112 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42307992 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacgcctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 42308091  T
Q  212 acgggg 217  Q
    ||||||    
T  42308092 acgggg 42308097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 38856296 - 38856084
Alignment:
Q  10 tcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagct 109  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38856296 tcagagataatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagct 38856197  T
Q  110 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  38856196 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatcc 38856097  T
Q  210 aaacggggtcata 222  Q
    |||||||||||||    
T  38856096 aaacggggtcata 38856084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 15520128 - 15520334
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15520128 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagttt 15520227  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15520228 atgaaacgatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 15520327  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  15520328 aacgggg 15520334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21581244 - 21581042
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21581244 cagagagaatcgaaggatgttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 21581145  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21581144 atgaaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcca 21581045  T
Q  211 aac 213  Q
    |||    
T  21581044 aac 21581042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 22174976 - 22175182
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22174976 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 22175075  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22175076 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 22175175  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  22175176 aacgggg 22175182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8042809 - 8042603
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8042809 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 8042710  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8042709 atgaaactatgataaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataagcccatcca 8042610  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  8042609 aacgggg 8042603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 50529131 - 50528925
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50529131 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 50529032  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50529031 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 50528932  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  50528931 aacgggg 50528925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 222
Target Start/End: Original strand, 25494270 - 25494482
Alignment:
Q  10 tcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagct 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25494270 tcagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagcaggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagct 25494369  T
Q  110 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  25494370 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagtcaatcc 25494469  T
Q  210 aaacggggtcata 222  Q
    |||||||| ||||    
T  25494470 aaacggggccata 25494482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 20842334 - 20842540
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20842334 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcagctt 20842433  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20842434 atgaaactatgataagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatcca 20842533  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  20842534 aacgggg 20842540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 46452149 - 46452354
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46452149 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtgagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaactta 46452248  T
Q  112 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||    
T  46452249 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatccaa 46452348  T
Q  212 acgggg 217  Q
    ||||||    
T  46452349 acgggg 46452354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32244317 - 32244117
Alignment:
Q  16 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32244317 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 32244218  T
Q  116 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgg 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32244217 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 32244118  T
Q  216 g 216  Q
    |    
T  32244117 g 32244117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 12117644 - 12117850
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  12117644 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaactt 12117743  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  12117744 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaattca 12117843  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  12117844 aacgggg 12117850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 29445690 - 29445484
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  29445690 cagatagaatggaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataaacagctt 29445591  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29445590 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatcca 29445491  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  29445490 aacgggg 29445484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15520837 - 15520632
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15520837 agagagaatcgaaggaggttacaaaaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 15520738  T
Q  112 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaa 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15520737 tgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaa 15520638  T
Q  212 acgggg 217  Q
    ||||||    
T  15520637 acgggg 15520632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20699350 - 20699145
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20699350 agagagaatcgaaggaggttacaaaaattcctaagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 20699251  T
Q  112 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaa 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20699250 tgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 20699151  T
Q  212 acgggg 217  Q
    ||||||    
T  20699150 acgggg 20699145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 35226649 - 35226447
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35226649 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaggctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 35226550  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  35226549 atgaaactatgataagctgattttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataagcccacataagctcaaaataggccaatcca 35226450  T
Q  211 aac 213  Q
    |||    
T  35226449 aac 35226447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 38934147 - 38933942
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  38934147 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactggaaatttagacttattaaaatatgacataagcagctt 38934048  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  38934047 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataag-ccacataagctcaaaataagccaatcca 38933949  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  38933948 aacgggg 38933942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 54534314 - 54534518
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  54534314 cagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaa-tatggcataagcagctt 54534412  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54534413 at-aaaccatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 54534511  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  54534512 aacgggg 54534518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 54870160 - 54870366
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54870160 cagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 54870259  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  54870260 atgaaacgatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataaactcaaaataagccaatcca 54870359  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  54870360 aacgggg 54870366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 44609319 - 44609527
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44609319 cagagagaatcgaaagaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 44609418  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  44609419 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcaagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatcca 44609518  T
Q  211 aacggggtc 219  Q
    ||| |||||    
T  44609519 aacagggtc 44609527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32359461 - 32359256
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32359461 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 32359362  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| | | |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  32359361 atgaaactatgataaactatttttatttatttactcaaacacctttataaaagcttatggaaatagataaatccacataagctcaaaataagccaatcca 32359262  T
Q  211 aacggg 216  Q
    ||||||    
T  32359261 aacggg 32359256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Original strand, 42104956 - 42105165
Alignment:
Q  10 tcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagct 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42104956 tcagagggaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcatgagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagct 42105055  T
Q  110 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcc 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  42105056 tatgaaactatgataaactatttttatttttttatccaaacacctttaaaaatgtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcc 42105155  T
Q  210 aaacggggtc 219  Q
     || ||||||    
T  42105156 taatggggtc 42105165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2895391 - 2895170
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcata----agctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagca 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2895391 cagagagaatcgaaggaggttatataaattcatatataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagca 2895292  T
Q  107 gcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaa 206  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  2895291 gcttatgaaactatgataatttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaa 2895192  T
Q  207 tccaaacggggtcatattttga 228  Q
    | |||| |||| | ||||||||    
T  2895191 ttcaaatggggccctattttga 2895170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 24835686 - 24835891
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 111  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24835686 agagataatcgaaggagtttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctta 24835785  T
Q  112 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaa 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |  ||||||||||||||  ||||||||    
T  24835786 tgaaactataataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagttgataagtctatataagctcaaaataaatcaatccaa 24835885  T
Q  212 acgggg 217  Q
    ||||||    
T  24835886 acgggg 24835891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26123015 - 26122814
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 111  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  26123015 agagagaatcgaagaatgttacgtaaattcataagctacttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagctta 26122916  T
Q  112 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26122915 tgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctcatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaa 26122816  T
Q  212 ac 213  Q
    ||    
T  26122815 ac 26122814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 34700543 - 34700337
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34700543 cagagataatcaaaggaggttatataaattcataagcttcttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 34700444  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  34700443 atgaaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatggaagtaaataaacccacataagctcaaaataaaccaatcta 34700344  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  34700343 aacgggg 34700337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 53028420 - 53028225
Alignment:
Q  10 tcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagct 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  53028420 tcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtt 53028321  T
Q  110 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcc 209  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||        |||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  53028320 tatgaaaatatgataagctatttttatttattt--------acctctaaaaagacttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcc 53028229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 44688961 - 44688762
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44688961 agagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatg-cataagcagctta 44688863  T
Q  112 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||     |||||||||| |||    
T  44688862 tgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagc-----ataagccaattcaa 44688768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 213
Target Start/End: Original strand, 48924989 - 48925189
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  48924989 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctaaaaatttagacttattaaaatatgacataaacagctt 48925088  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||| | ||||||||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  48925089 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaa--acttttaaaaaagcttatggaagtagataaacccatataaactctaaataagccaatcca 48925186  T
Q  211 aac 213  Q
    |||    
T  48925187 aac 48925189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 16354548 - 16354391
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16354548 cagagataatcgcaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcaggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaacatggcattagcagctt 16354449  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 168  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16354448 atgaaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttat 16354391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 62 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 35643368 - 35643213
Alignment:
Q  62 gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 161  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35643368 gagggtaagctcaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaagcacctttaaaaa 35643269  T
Q  162 ggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgggg 217  Q
    ||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35643268 ggcttatggaagtagataagttcacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 35643213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 79 - 213
Target Start/End: Original strand, 50529827 - 50529961
Alignment:
Q  79 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagat 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50529827 ttaggctcattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagat 50529926  T
Q  179 aagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 213  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  50529927 aagtccacataaactcaaaataagtcaatccaaac 50529961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 12916105 - 12915934
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  12916105 agagaatcgaagggggttacataaattcataaactctttcttaaaccggagggtaagctgaaaacttaagcttatttaaatatgacataagcagtttatg 12916006  T
Q  114 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccac 186  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||    
T  12916005 aaattatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagatttat-ggagtaaataagcccac 12915934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 49128177 - 49128045
Alignment:
Q  85 ttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagccc 184  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49128177 ttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagttatttttattgatttacccaaacatctttaaaaagacttataggagtagataagccc 49128078  T
Q  185 acgtaagctcaaaataagccaatccaaacgggg 217  Q
    || |||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  49128077 acataagtttaaaataagtcaatccaaacgggg 49128045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 24366230 - 24366143
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggc 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24366230 agagagaatctaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggc 24366143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 13696995 - 13696914
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaa 92  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13696995 cagagagaatcaaaggaggttacacaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaa 13696914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Original strand, 50528868 - 50528916
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagc 59  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50528868 cagatagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagc 50528916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 24366134 - 24366088
Alignment:
Q  171 gagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgggg 217  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24366134 gagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaaagggg 24366088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36910 - 36704
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36910 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 36811  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36810 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 36711  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  36710 aacgggg 36704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 9008057 - 9008263
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9008057 cagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 9008156  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9008157 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 9008256  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  9008257 aacgggg 9008263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 27679169 - 27679375
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679169 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 27679268  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27679269 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 27679368  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  27679369 aacgggg 27679375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Original strand, 24105671 - 24105875
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24105671 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgataatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 24105770  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24105771 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 24105870  T
Q  211 aacgg 215  Q
    |||||    
T  24105871 aacgg 24105875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 33491196 - 33491402
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33491196 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcaaaagcagctt 33491295  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33491296 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatcca 33491395  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  33491396 aacgggg 33491402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1579241 - 1579038
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1579241 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 1579142  T
Q  114 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 213  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1579141 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaac 1579042  T
Q  214 gggg 217  Q
    ||||    
T  1579041 gggg 1579038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 1605574 - 1605777
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1605574 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 1605673  T
Q  114 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 213  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1605674 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaac 1605773  T
Q  214 gggg 217  Q
    ||||    
T  1605774 gggg 1605777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16069561 - 16069356
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16069561 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 16069462  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  16069461 atgaaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 16069362  T
Q  211 aacggg 216  Q
    ||||||    
T  16069361 aacggg 16069356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Original strand, 16737447 - 16737650
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16737447 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 16737546  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  16737547 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaattca 16737646  T
Q  211 aacg 214  Q
    ||||    
T  16737647 aacg 16737650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 213
Target Start/End: Original strand, 3386486 - 3386688
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386486 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataggctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 3386585  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3386586 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatcca 3386685  T
Q  211 aac 213  Q
    |||    
T  3386686 aac 3386688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27421062 - 27420860
Alignment:
Q  15 gagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27421062 gagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 27420963  T
Q  115 aactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 214  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  27420962 aactatgataaactatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacg 27420863  T
Q  215 ggg 217  Q
    |||    
T  27420862 ggg 27420860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19358734 - 19358528
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19358734 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagttggagggtaagctgaaaatttaggcttactaaaatatggcataagcagctt 19358635  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19358634 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataaggcaatcca 19358535  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  19358534 aacgggg 19358528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 20992146 - 20992352
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20992146 cagagagaatcgaagggggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataatcagctt 20992245  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  20992246 atgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagaccacataagctcaaaataagccaattca 20992345  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  20992346 aacgggg 20992352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4121145 - 4120939
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4121145 cagagagaatcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 4121046  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  4121045 atgaaactatgataaattatttttacttatttacccaaacacctttaaaagggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccattcca 4120946  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  4120945 aacgggg 4120939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 8374339 - 8374544
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8374339 cagagagaatcgaaggaggttacataaat-cataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 8374437  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  8374438 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagcttaaaataaggcaatcca 8374537  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  8374538 aacgggg 8374544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 222
Target Start/End: Original strand, 1165604 - 1165812
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1165604 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatg 1165703  T
Q  114 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  1165704 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataagtcaatccaaag 1165803  T
Q  214 ggggtcata 222  Q
     ||||||||    
T  1165804 agggtcata 1165812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 31883352 - 31883148
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31883352 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 31883253  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  31883252 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataagtcaatcca 31883153  T
Q  211 aacgg 215  Q
    |||||    
T  31883152 aacgg 31883148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 33991348 - 33991142
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33991348 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaactt 33991249  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| ||    
T  33991248 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacataaactcaaaataagtcaattca 33991149  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  33991148 aacgggg 33991142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3921789 - 3921584
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3921789 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcctttttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 3921690  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||  |||||||    
T  3921689 atgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccatataaactcaaaataaatcaatcca 3921590  T
Q  211 aacggg 216  Q
    ||||||    
T  3921589 aacggg 3921584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 35782644 - 35782850
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagc-cagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagct 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35782644 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgt-aagcacggagggtaggctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagct 35782742  T
Q  110 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  35782743 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataaggcaatcc 35782842  T
Q  210 aaacgggg 217  Q
    ||||||||    
T  35782843 aaacgggg 35782850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5203179 - 5202969
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 111  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5203179 agagagaatcgaagaaggtgacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctta 5203080  T
Q  112 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||| ||||||||||| ||||||||    
T  5203079 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaaccaacataaactcaaaataagtcaatccaa 5202980  T
Q  212 acggggtcata 222  Q
    |||||| ||||    
T  5202979 acggggccata 5202969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 213
Target Start/End: Original strand, 38598450 - 38598652
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38598450 cagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 38598549  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  38598550 atgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagctcacataagttcaaagtaagccaatcca 38598649  T
Q  211 aac 213  Q
    |||    
T  38598650 aac 38598652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 26602942 - 26603138
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26602942 cagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagagtaaactgaaaaattatgcttattaaaatatggcataagcagttt 26603041  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||          |||||||||||||||||||    
T  26603042 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataag----------ctcaaaataagccaatcca 26603131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31410681 - 31410481
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  31410681 agagaatcgaaggaggtcacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttata 31410582  T
Q  114 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||    
T  31410581 aaactatgataagctatttttatttgtttactcaaacacctttaaaaagacttatgggggtagataaacccatataaactcaaaataaatcaatccaaac 31410482  T
Q  214 g 214  Q
    |    
T  31410481 g 31410481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 27025164 - 27025001
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27025164 cagagagaatcgaaggaggttacataaatttataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaaatggcataagcagctt 27025065  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||    
T  27025064 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccgaacatctttaaaaagtcttatgggagt 27025001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 84 - 213
Target Start/End: Original strand, 20992354 - 20992487
Alignment:
Q  84 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcc 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20992354 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcc 20992453  T
Q  184 c----acgtaagctcaaaataagccaatccaaac 213  Q
    |    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  20992454 catgtacataagctcaaaataagccaatccaaac 20992487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 211
Target Start/End: Original strand, 33284642 - 33284775
Alignment:
Q  78 tttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtaga 177  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33284642 tttaggcttattgaaatatggtataagcagtttataaaactatgataagctatttttatttatttacttaaacacctttaaaaaggcttatgggagtaga 33284741  T
Q  178 taagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaa 211  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  33284742 taagcccatataagctcaaaataagtcaatccaa 33284775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 69
Target Start/End: Original strand, 35420424 - 35420482
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaa 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  35420424 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaa 35420482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 31638281 - 31638196
Alignment:
Q  83 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 168  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| | ||||||| |||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  31638281 gcttattaaaatatgacataagaagcttataaaattgtgataagttatttttatcgatttatccaaacacttttacaaaggcttat 31638196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25634732 - 25634584
Alignment:
Q  67 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 166  Q
    |||||| ||||||  || |||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||||||||||||   ||||||||||||||   ||| |||  ||||    
T  25634732 taagctcaaaattatggtttattaaaatatggtataagcggcttatgaaattgttataagctatttt--attatttacccaaacgtatttgaaagagctt 25634635  T
Q  167 ataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgggg 217  Q
    ||   ||||||||| | | | |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  25634634 atgttagtagataaactctcataagcttaaaataagccaatctaaacgggg 25634584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 153
Target Start/End: Original strand, 41818552 - 41818605
Alignment:
Q  100 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacc 153  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  41818552 ataagcagcttataaaaatatgataagctatttttattaatttacctaaacacc 41818605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 27024853 - 27024822
Alignment:
Q  18 aatcgaaggaggttacataaattcataagctc 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27024853 aatcgaaggaggttacataaattcataagctc 27024822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 66)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 54189750 - 54189544
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189750 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 54189651  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54189650 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 54189551  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  54189550 aacgggg 54189544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 19913618 - 19913824
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19913618 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 19913717  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19913718 atgaaactatgataagctgttttaatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 19913817  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  19913818 aacgggg 19913824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Original strand, 1756751 - 1756960
Alignment:
Q  10 tcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagct 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1756751 tcagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagct 1756850  T
Q  110 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcc 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1756851 tatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatcc 1756950  T
Q  210 aaacggggtc 219  Q
    ||||||||||    
T  1756951 aaacggggtc 1756960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 217
Target Start/End: Original strand, 23776449 - 23776653
Alignment:
Q  13 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23776449 gagagaatcgaagaaggttacataaattcataagatccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 23776548  T
Q  113 gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23776549 gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaa 23776648  T
Q  213 cgggg 217  Q
    |||||    
T  23776649 cgggg 23776653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 54412833 - 54412625
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  54412833 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcatatgctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattagaatatgacataagcagctt 54412734  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54412733 atgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 54412634  T
Q  211 aacggggtc 219  Q
    |||||||||    
T  54412633 aacggggtc 54412625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Original strand, 15241016 - 15241219
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15241016 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 15241115  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15241116 atgaaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatcca 15241215  T
Q  211 aacg 214  Q
    ||||    
T  15241216 aacg 15241219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 53717452 - 53717658
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53717452 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataagcagctt 53717551  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  53717552 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatcca 53717651  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  53717652 aacgggg 53717658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 38055362 - 38055149
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055362 cagagagaatcgatggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 38055263  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  38055262 atgaaactatgataaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcca 38055163  T
Q  211 aacggggtcatatt 224  Q
    ||||||| ||||||    
T  38055162 aacggggccatatt 38055149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16700986 - 16700782
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16700986 cagagagaatcgaaggaggttacataaatttataagctccttgttaagctagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 16700887  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16700886 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 16700787  T
Q  211 aacgg 215  Q
    |||||    
T  16700786 aacgg 16700782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14987997 - 14987791
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14987997 cagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagcaagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 14987898  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14987897 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaatggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 14987798  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  14987797 aacgggg 14987791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 27488636 - 27488842
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488636 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagctt 27488735  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||    
T  27488736 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagccaatcca 27488835  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  27488836 aacgggg 27488842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 217
Target Start/End: Original strand, 50055098 - 50055295
Alignment:
Q  20 tcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacta 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50055098 tcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacca 50055197  T
Q  120 tgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgggg 217  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055198 tgataagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 50055295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20877251 - 20877047
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20877251 agagagaatctaaggaggttacgtaaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 20877152  T
Q  112 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20877151 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 20877052  T
Q  212 acggg 216  Q
    |||||    
T  20877051 acggg 20877047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 2481396 - 2481602
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2481396 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcagctt 2481495  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2481496 atgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 2481595  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  2481596 aacgggg 2481602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 6611348 - 6611554
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  6611348 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatgacataaacagctt 6611447  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6611448 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaaccaatcca 6611547  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  6611548 aacgggg 6611554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 213
Target Start/End: Original strand, 28032700 - 28032902
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28032700 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagctt 28032799  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  28032800 atgatactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcta 28032899  T
Q  211 aac 213  Q
    |||    
T  28032900 aac 28032902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 40428708 - 40428914
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  40428708 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatggtataagcagctt 40428807  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  40428808 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaattca 40428907  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  40428908 aacgggg 40428914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 44784905 - 44785111
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44784905 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaagtttaggcttattaaaatatggcataagcaactt 44785004  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44785005 atgaaactatgataagctatttttatttgtttacccaaacacttttacaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 44785104  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  44785105 aacgggg 44785111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 50354006 - 50353800
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50354006 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagctt 50353907  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  50353906 atgaaactatcataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacagaagctcaaaataagccaatcca 50353807  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  50353806 aacgggg 50353800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31969886 - 31969681
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31969886 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagctt 31969787  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| ||    
T  31969786 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataaatcaattca 31969687  T
Q  211 aacggg 216  Q
    ||||||    
T  31969686 aacggg 31969681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 215
Target Start/End: Original strand, 43289951 - 43290152
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43289951 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttattaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 43290050  T
Q  114 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  43290051 aaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgtgagtagataagcacataaaagctcaaaataagccaatccaaac 43290150  T
Q  214 gg 215  Q
    ||    
T  43290151 gg 43290152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 8932166 - 8932372
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8932166 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagttccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagctt 8932265  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  8932266 atgaaactacgttaagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccgcataagctcaaaataagccaatcca 8932365  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  8932366 aacgggg 8932372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 11639566 - 11639772
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11639566 cagagagaatcaaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 11639665  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  11639666 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaaccaatcca 11639765  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  11639766 aacgggg 11639772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 45424522 - 45424728
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45424522 cagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 45424621  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  45424622 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagtcaatcca 45424721  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  45424722 aacgggg 45424728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 52139405 - 52139203
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52139405 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 52139306  T
Q  114 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  52139305 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaatagataaacccacataagttcaaaataagccaatccaaac 52139206  T
Q  214 ggg 216  Q
    |||    
T  52139205 ggg 52139203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1617289 - 1617084
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  1617289 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagctt 1617190  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1617189 atgaaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatcca 1617090  T
Q  211 aacggg 216  Q
    ||||||    
T  1617089 aacggg 1617084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Original strand, 8591080 - 8591285
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8591080 cagagagaaccgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaacatatggcataagcagctt 8591179  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||  ||    
T  8591180 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatagaagtagataaacccacataaactcaaaataagccaagtca 8591279  T
Q  211 aacggg 216  Q
    ||||||    
T  8591280 aacggg 8591285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Original strand, 35490761 - 35490966
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35490761 cagagagaatcgaaggtggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaactt 35490860  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35490861 atgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatgagagtggataagcccatataagctcaaaataagccaatcca 35490960  T
Q  211 aacggg 216  Q
    ||||||    
T  35490961 aacggg 35490966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 48910049 - 48909849
Alignment:
Q  13 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  48910049 gagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggtttgttaaaatatggcataagcagcttat 48909950  T
Q  113 gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48909949 gaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaa 48909850  T
Q  213 c 213  Q
    |    
T  48909849 c 48909849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 6688615 - 6688815
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  6688615 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagca---- 6688710  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  6688711 --gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatcca 6688808  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  6688809 aacgggg 6688815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 30423556 - 30423757
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30423556 agagaatcgaaggaggttacataaattc-taagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttatgcttattgaaatatggcataagcagcttatg 30423654  T
Q  114 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  30423655 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagccaatccaaac 30423754  T
Q  214 ggg 216  Q
    |||    
T  30423755 ggg 30423757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37464926 - 37464720
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37464926 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaaaccggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 37464827  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  37464826 atgaaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagcccacataagctcaaaataagccaattca 37464727  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  37464726 aacgggg 37464720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 37968746 - 37968951
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37968746 agagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctta 37968845  T
Q  112 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  37968846 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatctaa 37968945  T
Q  212 acgggg 217  Q
    | ||||    
T  37968946 atgggg 37968951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 53875862 - 53875658
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  53875862 cagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagctt 53875763  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  53875762 ataaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtatataagcccacataagcttaaaataagccaatcca 53875663  T
Q  211 aacgg 215  Q
    |||||    
T  53875662 aacgg 53875658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 47632240 - 47632033
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47632240 cagagagaattgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagctt 47632141  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacc-tttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcc 209  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  47632140 atgaaactatgagaagctatttttatttatttacccaaacaccttttaaaaaggtttatgagagtagataagtccacataaactcaaaataagccaatcc 47632041  T
Q  210 aaacgggg 217  Q
    ||||||||    
T  47632040 aaacgggg 47632033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Original strand, 19164961 - 19165164
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19164961 cagagaaaaacgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc-gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaa-tatggcataagcagctt 19165058  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacaccttt-aaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcc 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19165059 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcc 19165158  T
Q  210 aaacgg 215  Q
    ||||||    
T  19165159 aaacgg 19165164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Original strand, 23704200 - 23704399
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 113  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23704200 agagaatcaaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatg 23704299  T
Q  114 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 213  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23704300 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgtgagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaac 23704399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15669388 - 15669182
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  15669388 cagagagaatggaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggacggtaagctgaaaatttaggcttattaaagtatgacataagcagctt 15669289  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15669288 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagtcttatgtgattagataagctcacataagctcaaaataagccaatcca 15669189  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  15669188 aacgggg 15669182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 27536092 - 27536294
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27536092 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagttt 27536191  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    |||||   |||||||||||||||||||||||    
T  27536192 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgggagta----agcccgtataagctcaaaataagccaatcca 27536287  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  27536288 aacgggg 27536294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 33704046 - 33703850
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33704046 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 33703947  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaat 207  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  33703946 atgaaactatgataagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataaactcacataagctcaaaataagtcaat 33703850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 53353267 - 53353054
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttat----taaaatatggcataagcag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  53353267 agagagaatcgaaggaggttacataaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatatattaaaatatggcataagcag 53353168  T
Q  108 cttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagccc----acgtaagctcaaaataagc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    |  ||||||||||||||||    
T  53353167 cttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacatatgggagtagataagcccatataattaagctcaaaataagc 53353068  T
Q  204 caatccaaacgggg 217  Q
    ||||||||||||||    
T  53353067 caatccaaacgggg 53353054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 212
Target Start/End: Original strand, 27583620 - 27583821
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27583620 cagagagaattgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagctt 27583719  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  27583720 atgcaactatgataagttatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 27583819  T
Q  211 aa 212  Q
    ||    
T  27583820 aa 27583821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 213
Target Start/End: Original strand, 44379174 - 44379377
Alignment:
Q  10 tcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagct 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  44379174 tcagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaact 44379273  T
Q  110 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcc 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||    
T  44379274 tatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatggaagtagataagcctatataaactcaaaataagtcaatcc 44379373  T
Q  210 aaac 213  Q
    ||||    
T  44379374 aaac 44379377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 30171785 - 30171581
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30171785 cagagagaatcgaaggaggttaaataaattcataagctccttgttaaaccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggtataagcagctt 30171686  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  30171685 atgaaactatgataagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatggaataagataagctcacataagctcaaaataagccaatcca 30171586  T
Q  211 aacgg 215  Q
    |||||    
T  30171585 aacgg 30171581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 44376041 - 44375843
Alignment:
Q  20 tcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacta 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  44376041 tcgaaggaggttacataaattcataagctcttttttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaacta 44375942  T
Q  120 tgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacggggt 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  ||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44375941 tgataaactatttttatttatttacccgaacacctataaaaatggctattggaatagataagcccacataagcttaaaataagccaatccaaacggggt 44375843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 212
Target Start/End: Original strand, 40680026 - 40680227
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40680026 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagctt 40680125  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||||    
T  40680126 atgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaatacctttaaaaagacttatggaagtagataagctcacataaattcaaaataagtcaatcca 40680225  T
Q  211 aa 212  Q
    ||    
T  40680226 aa 40680227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 55344813 - 55345019
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||     
T  55344813 cagagagaatcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggatggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggtataaacaactc 55344912  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  55344913 atgcaaatatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaattca 55345012  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  55345013 aacgggg 55345019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28360602 - 28360433
Alignment:
Q  45 agctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaata-tggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttattta 143  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28360602 agctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttataaaaataatggcataagcagcttataaaactatgataaactatttttatttattta 28360503  T
Q  144 cccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  28360502 cccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagaaaagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 28360433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 207
Target Start/End: Original strand, 38071314 - 38071504
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38071314 cagagagaatcgaagg---ttacataaattcataagctccttgttaagcccc---gtaaactgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagctt 38071407  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaat 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  38071408 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggattatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaat 38071504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 67 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 50053592 - 50053442
Alignment:
Q  67 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 166  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  50053592 taagatgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacatttaaaaaggctt 50053493  T
Q  167 ataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgggg 217  Q
    || |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50053492 atgggagtagataagtccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 50053442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16704023 - 16703843
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16704023 agagaatcgaagggggttacataaatttataggctccttgttaagccggaggataaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 16703924  T
Q  114 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctc 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||  ||| |||||||    
T  16703923 aaactatgataaactatttttatttatttattcaaacaactttaaaaaagcttatggaagtagataagttcacataagctc 16703843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 139
Target Start/End: Original strand, 23269034 - 23269162
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23269034 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagctt 23269133  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttattta 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23269134 atgaaactatgataagctatttttattta 23269162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 131 - 216
Target Start/End: Original strand, 23265865 - 23265950
Alignment:
Q  131 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacggg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23265865 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 23265950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 53408225 - 53408137
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccag-agggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgg 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53408225 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgg 53408137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 67 - 217
Target Start/End: Original strand, 44548185 - 44548336
Alignment:
Q  67 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 166  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| || ||||| ||| | ||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44548185 taagcttaaaatttgggcttaataaaatagggcataaacaacttataaaattgtgataagatgtttttattgatttatccaaacacctttaaaaaggctt 44548284  T
Q  167 ataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataa-gccaatccaaacgggg 217  Q
    ||   ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  44548285 atgttagtagataagcccacataagctccaaataaggccaattcaaacgggg 44548336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 68 - 150
Target Start/End: Original strand, 51780763 - 51780845
Alignment:
Q  68 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaac 150  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  51780763 aagcttaaaatttgggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataagctatttttattgatttatccaaac 51780845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 74
Target Start/End: Original strand, 23261874 - 23261937
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctga 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23261874 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctga 23261937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 114
Target Start/End: Original strand, 9595890 - 9595982
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||           | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9595890 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggag-----------agtttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 9595978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17493482 - 17493370
Alignment:
Q  67 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 166  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||| ||||    
T  17493482 taagctcaaaatttgagcttattaaaacatggtataagcagcttataaaattagaataagatatttttattgatttactcaaacgcccttaaaaatgctt 17493383  T
Q  167 ataggagtagata 179  Q
    |||||||||||||    
T  17493382 ataggagtagata 17493370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 50055350 - 50055301
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055350 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc 50055301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 48748263 - 48748197
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaa 77  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||    
T  48748263 cagagagaattgaaggagattacataaattcataagctccttattaagacggagggtatgctgaaaa 48748197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 129
Target Start/End: Original strand, 55344724 - 55344781
Alignment:
Q  72 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagcta 129  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  55344724 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataaacaactcatgaaaatatgataagcta 55344781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 45
Target Start/End: Original strand, 55344681 - 55344715
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataa 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55344681 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataa 55344715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Original strand, 9595983 - 9596028
Alignment:
Q  171 gagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgggg 217  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  9595983 gagtagataagcccacataaactcaaa-taagccaatccaaacgggg 9596028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 34615962 - 34615904
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagct 72  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  34615962 agagaaaatcgaaggaggttacataaatt--taagctctttattaaggcagaggataagct 34615904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34615872 - 34615828
Alignment:
Q  172 agtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacggg 216  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  34615872 agtagataaacctacgtaagttcaaaataagccaattcaaacggg 34615828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 48)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25897579 - 25897373
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25897579 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 25897480  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  25897479 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatatgcccacataagctcaaaataagtcaatcca 25897380  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  25897379 aacgggg 25897373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 39260346 - 39260552
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39260346 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaactt 39260445  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39260446 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 39260545  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  39260546 aacgggg 39260552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29078720 - 29078519
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29078720 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagctta 29078621  T
Q  112 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29078620 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 29078521  T
Q  212 ac 213  Q
    ||    
T  29078520 ac 29078519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20089676 - 20089470
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20089676 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 20089577  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20089576 atgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 20089477  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  20089476 aacgggg 20089470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 52753147 - 52753353
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52753147 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagctt 52753246  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52753247 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 52753346  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  52753347 aacgggg 52753353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26663463 - 26663255
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26663463 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacagctt 26663364  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26663363 atgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 26663264  T
Q  211 aacggggtc 219  Q
    |||||||||    
T  26663263 aacggggtc 26663255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 26580270 - 26580476
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26580270 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 26580369  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26580370 atgaaactatgataagctatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 26580469  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  26580470 aacgggg 26580476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1168709 - 1168502
Alignment:
Q  10 tcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagct 109  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1168709 tcagagagaatcaaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagct 1168610  T
Q  110 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1168609 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcc 1168510  T
Q  210 aaacgggg 217  Q
    ||||||||    
T  1168509 aaacgggg 1168502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 29288352 - 29288148
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29288352 cagagagaatcgaaggaggttacata--ttcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 29288255  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  29288254 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcca 29288155  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  29288154 aacgggg 29288148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16052300 - 16052095
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16052300 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagctta 16052201  T
Q  112 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16052200 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagccaatccaa 16052101  T
Q  212 acgggg 217  Q
    ||||||    
T  16052100 acgggg 16052095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 33510690 - 33510483
Alignment:
Q  10 tcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagct 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33510690 tcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagct 33510591  T
Q  110 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcc 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  33510590 tatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatcc 33510491  T
Q  210 aaacgggg 217  Q
    ||||||||    
T  33510490 aaacgggg 33510483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38829274 - 38829072
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38829274 cagagagaatcgatggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcacaagcagctt 38829175  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  38829174 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccgacataagctcaaaataagccaatcca 38829075  T
Q  211 aac 213  Q
    |||    
T  38829074 aac 38829072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 41928495 - 41928701
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41928495 cagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagctt 41928594  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  41928595 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagtccacataagttcaaaataagccaatcca 41928694  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  41928695 aacgggg 41928701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 970524 - 970732
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  970524 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagctt 970623  T
Q  111 atgaaac--tatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatc 208  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  970624 atgaaactatatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatc 970723  T
Q  209 caaacgggg 217  Q
    |||||||||    
T  970724 caaacgggg 970732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Original strand, 19715161 - 19715366
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19715161 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 19715260  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19715261 atgaaacaatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataaaccaatcca 19715360  T
Q  211 aacggg 216  Q
    ||||||    
T  19715361 aacggg 19715366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Original strand, 8079710 - 8079914
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 111  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8079710 agagagaatcaaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccagagggtaagctgaaaacttaggcttattaaaatatggcataagtagctta 8079809  T
Q  112 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8079810 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 8079909  T
Q  212 acggg 216  Q
    |||||    
T  8079910 acggg 8079914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 43905859 - 43905655
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43905859 cagagacaatcgaaggaggttacgtaaattcataagctccttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 43905760  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  43905759 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccaaataagctcaaaataagccaatcca 43905660  T
Q  211 aacgg 215  Q
    |||||    
T  43905659 aacgg 43905655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 1940747 - 1940953
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  1940747 cagagagaattgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataaacaactt 1940846  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1940847 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatcca 1940946  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  1940947 aacgggg 1940953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 42370795 - 42371001
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  42370795 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagctt 42370894  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  42370895 atgaaactatgataagttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagtcaatcca 42370994  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  42370995 aacgggg 42371001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 52696996 - 52696790
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52696996 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 52696897  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52696896 atgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 52696797  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  52696796 aacgggg 52696790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 1170447 - 1170650
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1170447 agagaatcgaaggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 1170546  T
Q  114 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1170547 aaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacaaaagctcaaaataagccaatccaaac 1170646  T
Q  214 gggg 217  Q
    ||||    
T  1170647 gggg 1170650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 32671784 - 32671578
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32671784 cagagagaatcgaagggggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagctt 32671685  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  32671684 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatcca 32671585  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  32671584 aacgggg 32671578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5215590 - 5215382
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5215590 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaactt 5215491  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5215490 atgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgaaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 5215391  T
Q  211 aacggggtc 219  Q
    |||||||||    
T  5215390 aacggggtc 5215382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12683026 - 12682823
Alignment:
Q  10 tcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagct 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12683026 tcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctaaagatttaggcttatgaaaatatggcataagcagct 12682927  T
Q  110 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  12682926 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatcc 12682827  T
Q  210 aaac 213  Q
    ||||    
T  12682826 aaac 12682823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8121074 - 8120870
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8121074 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaaactgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagctt 8120975  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8120974 atgaaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatcca 8120875  T
Q  211 aacgg 215  Q
    |||||    
T  8120874 aacgg 8120870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 46761170 - 46760966
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46761170 agagagaatcgaaggaagttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagttta 46761071  T
Q  112 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||  |||| |||||||||| ||||||||    
T  46761070 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcaagtagataagctcatataagttcaaaataagtcaatccaa 46760971  T
Q  212 acggg 216  Q
    |||||    
T  46760970 acggg 46760966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2347862 - 2347655
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaa-tatggcataagcagct 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  2347862 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaatatgacataagcagct 2347763  T
Q  110 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcc 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| | |||||    
T  2347762 tatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccgcataaactcaaaataaacaaatcc 2347663  T
Q  210 aaacgggg 217  Q
    ||||||||    
T  2347662 aaacgggg 2347655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 17591893 - 17591690
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17591893 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctggaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 17591794  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  17591793 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataag-ccacataagctc--aataagccaatcca 17591697  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  17591696 aacgggg 17591690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 51359217 - 51359422
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51359217 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataaactccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcacctt 51359316  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  51359317 atgaaactatgataagctatttttaattatttacccaaa-acctttaagaaggcttatggcagtaaataagcccgcataagctcaaaataagccaatcca 51359415  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  51359416 aacgggg 51359422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15203317 - 15203106
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15203317 cagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggttggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagctt 15203218  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||| |||| ||    
T  15203217 atgaaactatgataagctatttttatttatttaccctaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacaaaagcttaaaataagtcaattca 15203118  T
Q  211 aacggggtcata 222  Q
    ||||||| ||||    
T  15203117 aacggggccata 15203106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 46409642 - 46409436
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaa--gccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagc 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46409642 cagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaattgtcgaagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagc 46409543  T
Q  109 ttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  46409542 ttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagattagataagtccacataagctcaaaataagtcaatc 46409443  T
Q  209 caaacgg 215  Q
    |||||||    
T  46409442 caaacgg 46409436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 213
Target Start/End: Original strand, 13996723 - 13996925
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13996723 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 13996822  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  13996823 atgaaaccattataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataatttcaaaataagccaatcca 13996922  T
Q  211 aac 213  Q
    |||    
T  13996923 aac 13996925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 40092696 - 40092494
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40092696 cagagaaaatcgaaaaaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 40092597  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||    
T  40092596 atgaaactatgataagatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataagtcaatcca 40092497  T
Q  211 aac 213  Q
    |||    
T  40092496 aac 40092494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 200
Target Start/End: Original strand, 17587505 - 17587694
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17587505 cagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 17587604  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaata 200  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  17587605 atgaaaatatgataagctgtttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagctcacataagctcaaaata 17587694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2473924 - 2473722
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 113  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2473924 agagactcgaaggaggtaacataaattcataagctccttgttaagtaggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatg 2473825  T
Q  114 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  2473824 aaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggcgtagataagcccacataagctcaaaataaaccgatccaaac 2473725  T
Q  214 ggg 216  Q
    |||    
T  2473724 ggg 2473722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7145412 - 7145207
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7145412 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 7145313  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctc-aaaataagccaatcc 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  7145312 atgaaactatgataaactatttttgtttatttaccc-aacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaatacacataagctcaaaaataagtcaatcc 7145214  T
Q  210 aaacggg 216  Q
    |||||||    
T  7145213 aaacggg 7145207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 49146377 - 49146173
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49146377 cagagagaatcgaatgacgttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagatgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctt 49146278  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||  |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  49146277 atgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtatataaatccacataagctcaaaataaaccaatcca 49146178  T
Q  211 aacgg 215  Q
    |||||    
T  49146177 aacgg 49146173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6765659 - 6765456
Alignment:
Q  16 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 115  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  6765659 agaatcgaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctcatgaa 6765560  T
Q  116 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgg 215  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6765559 aatatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataaaagtagataaattcacataaactcaaaataagccaatccaaacgg 6765460  T
Q  216 ggtc 219  Q
    ||||    
T  6765459 ggtc 6765456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23498665 - 23498454
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  23498665 cagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcaactt 23498566  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  23498565 atgaaactatgatgaactatttttatttatttacccaaacaccttgaaaaaggcttgtggaagtagataagcccacataagcttaaaataagccaattca 23498466  T
Q  211 aacggggtcata 222  Q
    ||| ||| ||||    
T  23498465 aacagggccata 23498454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 15554152 - 15554350
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  15554152 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcatcagcagttt 15554251  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||    
T  15554252 atgaa--------atgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatcca 15554343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15717986 - 15717787
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15717986 agagaattgaaggaggttacataaaatcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaattatggcataagcagcttatg 15717887  T
Q  114 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | |||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15717886 aaactatga-aagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgaaattagataggccaacataaactcaaaataagtcaatccaaac 15717788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 40149669 - 40149497
Alignment:
Q  10 tcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagct 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40149669 tcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagct 40149570  T
Q  110 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagc 182  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  40149569 tataaaactatgataaattatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 40149497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29695842 - 29695678
Alignment:
Q  50 cttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaa 149  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  29695842 cttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaattatttttatttatttatccaaa 29695743  T
Q  150 cacctttaaaaaggc-ttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 213  Q
    ||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29695742 cacctttaaaaaaaaattatgggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 29695678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 38172023 - 38171833
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||              |||||||||||||    
T  38172023 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattcttaagccggaggataagctgaaaatttaggca-------------cataagcagctta 38171937  T
Q  112 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaa 211  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  ||| |||  |||||||||| |||| |||    
T  38171936 tgaaactatgataaactgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgtgagtagataagttcacataaattcaaaataagtcaatgcaa 38171837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 87 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 52086396 - 52086270
Alignment:
Q  87 attaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccac 186  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||    
T  52086396 attaaattatggcataagcagcttatgaaattatgataagttatttttactgatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagcagataaacccac 52086297  T
Q  187 gtaagctcaaaataagccaatccaaac 213  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||    
T  52086296 ataagcttaaaataagtcaatccaaac 52086270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 203
Target Start/End: Original strand, 23322897 - 23323032
Alignment:
Q  68 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctta 167  Q
    ||||| |||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  ||||| |||| ||||| | |||    
T  23322897 aagcttaaaatttgcgcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaattatgataaactatttttattgatttattcaaacgccttaaaaaaagttta 23322996  T
Q  168 taggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagc 203  Q
    | |||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  23322997 tgggagtagataagcctatataagctcaaaataagc 23323032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 214
Target Start/End: Original strand, 5217840 - 5217986
Alignment:
Q  67 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 166  Q
    |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||||||    ||| |||  ||||    
T  5217840 taagctcaaaattatggcttataaaaatatggtataagcggcttatgaaattggtataagctattttta-ttatttacccaaatgtatttgaaagagctt 5217938  T
Q  167 ataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 214  Q
    ||   ||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5217939 atgttagtagataagctctcataagcttaaaataagccaatccaaacg 5217986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 5675176 - 5675104
Alignment:
Q  145 ccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgggg 217  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||   |||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5675176 ccaaacatctttcaaaaagcttatgttagtagataagctaacataagcttaaaataagccaatccaaacgggg 5675104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Original strand, 33359080 - 33359291
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33359080 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 33359179  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33359180 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 33359279  T
Q  211 aacggggtcata 222  Q
    ||||||| ||||    
T  33359280 aacggggccata 33359291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 12101168 - 12101374
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12101168 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccatagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 12101267  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12101268 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatcca 12101367  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    || ||||    
T  12101368 aatgggg 12101374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 24792322 - 24792528
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792322 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 24792421  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||    
T  24792422 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagccaatcca 24792521  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  24792522 aacgggg 24792528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 30181014 - 30181220
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30181014 cagagagaatcgaagggggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 30181113  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30181114 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 30181213  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  30181214 aacgggg 30181220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20346695 - 20346488
Alignment:
Q  10 tcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagct 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20346695 tcagagagaatcgaaggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagct 20346596  T
Q  110 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcc 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20346595 tatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcc 20346496  T
Q  210 aaacgggg 217  Q
    ||||||||    
T  20346495 aaacgggg 20346488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 42964986 - 42965192
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42964986 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 42965085  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42965086 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 42965185  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    || ||||    
T  42965186 aaagggg 42965192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 43067963 - 43068169
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  43067963 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagaagctt 43068062  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  43068063 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagtcaatcca 43068162  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  43068163 aacgggg 43068169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7164391 - 7164182
Alignment:
Q  10 tcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagct 109  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7164391 tcagatagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagct 7164292  T
Q  110 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  7164291 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatcc 7164192  T
Q  210 aaacggggtc 219  Q
    ||||||||||    
T  7164191 aaacggggtc 7164182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3511527 - 3511324
Alignment:
Q  13 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3511527 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 3511428  T
Q  113 gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  3511427 gaaactatgataagctatttttatctatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagacaatccaaa 3511328  T
Q  213 cggg 216  Q
    ||||    
T  3511327 cggg 3511324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Original strand, 22649684 - 22649895
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22649684 cagagaaaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 22649783  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  22649784 atgaaattatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaattca 22649883  T
Q  211 aacggggtcata 222  Q
    ||||||| ||||    
T  22649884 aacggggccata 22649895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 42204361 - 42204154
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42204361 cagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 42204262  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacaccttta-aaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42204261 atgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcc 42204162  T
Q  210 aaacgggg 217  Q
    ||||||||    
T  42204161 aaacgggg 42204154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5281066 - 5280861
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5281066 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctt 5280967  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  5280966 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgtgaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatcca 5280867  T
Q  211 aacggg 216  Q
    ||||||    
T  5280866 aacggg 5280861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Original strand, 4477311 - 4477515
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4477311 cagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctt 4477410  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4477411 atgaaaccatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttgaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 4477510  T
Q  211 aacgg 215  Q
    |||||    
T  4477511 aacgg 4477515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1803232 - 1803029
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  1803232 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatcgtataagcagctt 1803133  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  1803132 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcca 1803033  T
Q  211 aacg 214  Q
    ||||    
T  1803032 aacg 1803029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15656118 - 15655912
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15656118 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 15656019  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15656018 atgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagcagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 15655919  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  15655918 aacgggg 15655912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 33846519 - 33846720
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  33846519 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccc-----taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagttt 33846613  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33846614 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 33846713  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  33846714 aacgggg 33846720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 933491 - 933289
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  933491 cagagagattcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 933392  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||    
T  933391 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacatgagctcaaaataagccaattca 933292  T
Q  211 aac 213  Q
    |||    
T  933291 aac 933289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 6394957 - 6394751
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6394957 cagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctt 6394858  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  6394857 atgaaaccatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatcta 6394758  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  6394757 aacgggg 6394751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25748693 - 25748487
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25748693 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 25748594  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |  |||||||||  ||||||||||||    
T  25748593 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactaatataagctcaacttaagccaatcca 25748494  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  25748493 aacgggg 25748487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 43156917 - 43156718
Alignment:
Q  13 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||    
T  43156917 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagttctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatttgccataaacagcttat 43156818  T
Q  113 gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43156817 gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaa 43156718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 12097580 - 12097786
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12097580 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagtagctt 12097679  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  |||||||||  ||||||||||||    
T  12097680 atgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaacttaagccaatcca 12097779  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    || ||||    
T  12097780 aatgggg 12097786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 36890821 - 36891025
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  36890821 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaacttaggcttattgaaatatggcataagcaactta 36890920  T
Q  112 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||    
T  36890921 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctc-aaataagtcaatccaa 36891019  T
Q  212 acgggg 217  Q
    ||||||    
T  36891020 acgggg 36891025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 32041749 - 32041542
Alignment:
Q  10 tcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagct 109  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  32041749 tcagagagaatcgaataaggttacataaatttataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatgacataagcagct 32041650  T
Q  110 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  32041649 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatcc 32041550  T
Q  210 aaacgggg 217  Q
    ||||||||    
T  32041549 aaacgggg 32041542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42673667 - 42673467
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42673667 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 42673568  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  42673567 atgaaactatgataagctgtt----tttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctccaaataagtcaatcca 42673472  T
Q  211 aacgg 215  Q
    |||||    
T  42673471 aacgg 42673467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4347478 - 4347273
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4347478 cagagagaatagaagg-ggttacataaattcataagctccttgttaagctcgagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagctt 4347380  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  4347379 atgaaactatggtaagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagtttatgggagtagataagcccacataagcttaaaataagtcaatcca 4347280  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  4347279 aacgggg 4347273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9452796 - 9452591
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  9452796 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatagacagctt 9452697  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  9452696 atgaaactatgataaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagaatagataagttcacataagctcaaaataagtcaatcca 9452597  T
Q  211 aacggg 216  Q
    ||||||    
T  9452596 aacggg 9452591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17753806 - 17753594
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17753806 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagttgaagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 17753707  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||| ||||||    
T  17753706 atgaaactatgttaagctatttttatttatttacccaaacaccttctaaaaggcttataggagtagataagcttgtataagctcaaaataagctaatcca 17753607  T
Q  211 aacggggtcatat 223  Q
    |||||||||||||    
T  17753606 aacggggtcatat 17753594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8630872 - 8630666
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8630872 cagagagaatcgaaggggattacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 8630773  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||||| | ||||||    
T  8630772 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccgaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatcaacccacataacctcaaaataaacaaatcca 8630673  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  8630672 aacgggg 8630666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 38866750 - 38866547
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38866750 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataaacagctt 38866651  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  38866650 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaattatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagtcgatcca 38866551  T
Q  211 aacg 214  Q
    ||||    
T  38866550 aacg 38866547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Original strand, 46891329 - 46891541
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  46891329 cagagacaatcgaaggaggttacataaactcataagctccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggctaattaaaatatgacataagcagctt 46891428  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacaccttt-aaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcc 209  Q
    || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  46891429 ataaaactatgacaaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaggtttataggagtagataagcctatataagctcaaaataagccaatcc 46891528  T
Q  210 aaacggggtcata 222  Q
    ||||||| |||||    
T  46891529 aaacgggatcata 46891541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 218
Target Start/End: Original strand, 46134294 - 46134501
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  46134294 cagagagaatcgaatgaggttacataaattaataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcgtaaacagctt 46134393  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  46134394 atgaaactataataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagagttataggagtagataaactcacataagctcaaaataagtcaatcca 46134493  T
Q  211 aacggggt 218  Q
    ||||||||    
T  46134494 aacggggt 46134501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 48865837 - 48865665
Alignment:
Q  13 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48865837 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcctgatgttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 48865738  T
Q  113 gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacaccttta---aaaaggcttataggagtagataagc 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| | |||||||||||    
T  48865737 gaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaaggcttatggaagtagataagc 48865665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 16894497 - 16894693
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16894497 cagaaagaatcgaaggatgttacataaattcataagctccctgttaagttgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 16894596  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||          |||||||||||||||||||    
T  16894597 atgaaactatgataaactatttttatttgtttacccaaatacctttaaaaaagcttatgggagtagataag----------ctcaaaataagccaatcca 16894686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 43021570 - 43021772
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |  |    |||||| ||||||||||||    
T  43021570 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagagtaagctgaaaatttagaccga----aatatgccataagcagctt 43021665  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||    
T  43021666 atgaaactataataagttatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagacttattgaagtagataagtccacataaacttaaaataagccaatcca 43021765  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    || ||||    
T  43021766 aatgggg 43021772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19828415 - 19828270
Alignment:
Q  72 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatagg 171  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  19828415 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcaatttatgaaactatgataagctatttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatggg 19828316  T
Q  172 agtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgggg 217  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  19828315 agtagataagccaacataaactcaaaataagccaattcaaacgggg 19828270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 215
Target Start/End: Original strand, 37005857 - 37006005
Alignment:
Q  67 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 166  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||    
T  37005857 taagctaaaaaattagccttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagctatttttactgatttacccaaacgcctttaaaaaaactt 37005956  T
Q  167 ataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgg 215  Q
    |||| ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  37005957 atagaagtagataaactcacataagcttaaaataagccaatccaaacgg 37006005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 43405223 - 43405020
Alignment:
Q  15 gagaatcgaaggaggttacataaattc-ataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 113  Q
    ||||||||||||||||  | | ||||| ||||||||| || ||||||    | |||||| |||| || ||||||||||||||| | | || || ||||||    
T  43405223 gagaatcgaaggaggtcccttgaattccataagctccgtgataagccttgtgttaagctaaaaaattgggcttattaaaatatagtagaaacaacttatg 43405124  T
Q  114 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 213  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||| |||||    
T  43405123 aaattacgataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagacttataggagtagataagccaacataagcttaaaataagtcaattcaaac 43405024  T
Q  214 gggg 217  Q
    ||||    
T  43405023 gggg 43405020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 122 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37705075 - 37704980
Alignment:
Q  122 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  37705075 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaacccaaacgggg 37704980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 214
Target Start/End: Original strand, 15655458 - 15655605
Alignment:
Q  67 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 166  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| | || ||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||| |||    
T  15655458 taagctcaaaatttgagcttattaaaatttggtataagcagtttataaaattgtggtaagctatttttattgatttatccaaatagttttaaaaagactt 15655557  T
Q  167 ataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 214  Q
    ||   |||||| |||| ||| |||| | | ||||||||||||||||||    
T  15655558 atgttagtagacaagctcacataagtttagaataagccaatccaaacg 15655605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 222
Target Start/End: Original strand, 30075277 - 30075429
Alignment:
Q  67 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 166  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||   | | ||| |||||    
T  30075277 taagctcaaaattatggcttattaaaatatggtataagcggtttatgaaa-tat-ataagctatttttatt-atttacccaaacgtatctgaaagggctt 30075373  T
Q  167 ataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacggggtcata 222  Q
    ||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  30075374 atgttagtagataaactcacataagcttaaaataagtcaatccaaacggggccata 30075429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 217
Target Start/End: Original strand, 36849590 - 36849733
Alignment:
Q  74 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggag 173  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| | |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||  | |||   ||    
T  36849590 aaaatttgagcttattaaaatatgacataaacagtttatgaaattgtgataagctgattttattgatttatccaaacacctttaaaaaaacatatgttag 36849689  T
Q  174 tagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgggg 217  Q
    |||| || ||||| ||||||   |||||| ||||||||||||||    
T  36849690 tagacaaacccacataagcttcgaataagtcaatccaaacgggg 36849733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 212
Target Start/End: Original strand, 27691433 - 27691517
Alignment:
Q  128 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||  |||  ||||||||| ||||| ||||    
T  27691433 tatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagatttatgggagtagataagcccatataaattcaaaataaaccaattcaaa 27691517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20163953 - 20163824
Alignment:
Q  83 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagc 182  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||| | || | ||||| ||||    ||| ||||||    
T  20163953 gcttgttaaaatatgctataagcagcttatgaaactgtgataagctattttaattaattcacccaaacgcattcacaaaggattatgttggtaaataagc 20163854  T
Q  183 ccacgtaagctcaaaataagccaatccaaa 212  Q
     ||  ||||| ||||||||| |||||||||    
T  20163853 tcatataagcccaaaataagtcaatccaaa 20163824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 31517215 - 31517428
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31517215 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagttt 31517314  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31517315 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccaaataagctcaaaataagccaatcca 31517414  T
Q  211 aacggggtcatatt 224  Q
    ||||||| ||||||    
T  31517415 aacggggccatatt 31517428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 3873244 - 3873457
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3873244 cagagagaatcgaatgaggttatataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 3873343  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3873344 atgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 3873443  T
Q  211 aacggggtcatatt 224  Q
    |||| || ||||||    
T  3873444 aacgaggccatatt 3873457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 18806884 - 18807090
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18806884 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagctt 18806983  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  18806984 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatcca 18807083  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  18807084 aacgggg 18807090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 213
Target Start/End: Original strand, 33906047 - 33906249
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906047 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 33906146  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  33906147 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagttcaaaataagtcaatcca 33906246  T
Q  211 aac 213  Q
    |||    
T  33906247 aac 33906249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 26323186 - 26323392
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26323186 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 26323285  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26323286 atgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaagacttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaaccaatcca 26323385  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  26323386 aacgggg 26323392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4016244 - 4016039
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4016244 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagctt 4016145  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  4016144 atgaaactatgatacgttatttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatcca 4016045  T
Q  211 aacggg 216  Q
    ||||||    
T  4016044 aacggg 4016039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 39635656 - 39635451
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  39635656 agagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgacataagcagctta 39635557  T
Q  112 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaa 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  39635556 tgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataagctaatccaa 39635457  T
Q  212 acgggg 217  Q
    ||||||    
T  39635456 acgggg 39635451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Original strand, 28329839 - 28330042
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28329839 cagaaagaatcgaaggaggttacataaattcatatgctccttgttaagctag--ggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagttt 28329936  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28329937 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggtgtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcca 28330036  T
Q  211 aacggg 216  Q
    ||||||    
T  28330037 aacggg 28330042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42937925 - 42937720
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggctt-attaaaatatggcataagcagct 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42937925 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggctttattaaaatatggcataagcagct 42937826  T
Q  110 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcc 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  42937825 tatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataaactcacataagctcaaaataagccaatcc 42937726  T
Q  210 aaacgg 215  Q
    ||||||    
T  42937725 aaacgg 42937720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 217
Target Start/End: Original strand, 4232141 - 4232348
Alignment:
Q  10 tcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagct 109  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4232141 tcagagataatcgaatgaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttgtgaaaatatggcataagcagct 4232240  T
Q  110 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  4232241 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatcc 4232340  T
Q  210 aaacgggg 217  Q
    ||||||||    
T  4232341 aaacgggg 4232348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 2178769 - 2178975
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2178769 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 2178868  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| |||| ||| || |||||||  |||||||    
T  2178869 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgcgaatagataagtccacataaacttaaaataaatcaatcca 2178968  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  2178969 aacgggg 2178975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 5733604 - 5733398
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5733604 cagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 5733505  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  5733504 atgaaactatgataagttgtttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggctgatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatcta 5733405  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    || ||||    
T  5733404 aatgggg 5733398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 6174828 - 6175034
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  6174828 cagagagaatcgaaggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaatgaaatatgacataagcagctt 6174927  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  6174928 atgaaactatgataaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagctcacataagctcaaaataagccaatcca 6175027  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  6175028 aacgggg 6175034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 31 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1108464 - 1108279
Alignment:
Q  31 tacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctat 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1108464 tacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataaactat 1108365  T
Q  131 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgggg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1108364 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacgggg 1108279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Original strand, 1482903 - 1483106
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1482903 cagagagaatcgaaggatgttacataaattcataagctccttgttaagtcgaagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 1483002  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  1483003 atgaaacaataataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaagcttat-ggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcaa 1483101  T
Q  211 aacgg 215  Q
    |||||    
T  1483102 aacgg 1483106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 851202 - 850997
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  851202 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagctt 851103  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    || ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||    
T  851102 ataaaattatgataagctctatttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagcttaaaataagcaaatcca 851003  T
Q  211 aacggg 216  Q
    ||||||    
T  851002 aacggg 850997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 217
Target Start/End: Original strand, 30420181 - 30420373
Alignment:
Q  13 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30420181 gagagaatcgaagggggttacataaattcataagctccttgttaag------------ctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 30420268  T
Q  113 gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaa 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30420269 gaacctatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaa 30420368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 212
Target Start/End: Original strand, 16066302 - 16066495
Alignment:
Q  19 atcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaact 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16066302 atcgaaggaggttacataaattcataagctccttattaaatcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaact 16066401  T
Q  119 atgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||   || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  16066402 atgataagctatttttatttatttacccaaacactttaaaaaagacttatgaaagcagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaa 16066495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 217
Target Start/End: Original strand, 19901143 - 19901343
Alignment:
Q  16 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  19901143 agaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtgggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagtttatgaa 19901242  T
Q  116 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgg 215  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19901243 actatgataagctattttta-ttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagagaagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 19901341  T
Q  216 gg 217  Q
    ||    
T  19901342 gg 19901343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 30270679 - 30270885
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30270679 cagagataatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 30270778  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||  |||||| ||||||||||||||||    
T  30270779 atgaaactatgataaactattttattttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaactcatataagcttaaaataagccaatcca 30270878  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  30270879 aacgggg 30270885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 215
Target Start/End: Original strand, 16588775 - 16588980
Alignment:
Q  10 tcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagct 109  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16588775 tcagagataatcgacggaggttacattaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagct 16588874  T
Q  110 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcc 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||   ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  16588875 tatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacttctttaaaaagacttatgaaagtagataagcccacataaacacaaaataagccaatcc 16588974  T
Q  210 aaacgg 215  Q
    ||||||    
T  16588975 aaacgg 16588980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 202
Target Start/End: Original strand, 19383938 - 19384126
Alignment:
Q  14 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  19383938 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaacttatg 19384037  T
Q  114 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataag 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||  ||| |||||||||||    
T  19384038 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcatataaactcaaaataag 19384126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 430017 - 429817
Alignment:
Q  15 gagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  430017 gagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagtcgaattgtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatcgcataagcaacttatga 429918  T
Q  115 aactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacg 214  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  |||| |||  ||||||||||  ||| ||||||    
T  429917 aattatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataaatccacataaattcaaaataagggaattcaaacg 429818  T
Q  215 g 215  Q
    |    
T  429817 g 429817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 44947549 - 44947748
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||        ||||||||||||||||||||    
T  44947549 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataaacttcttgttaagccggagggtaaactgaaaatttagc-------aaatatggcataagcagctt 44947641  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| | | ||||||| | ||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  44947642 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaatgcttatggcactagataaactcacataagatcaaaataagccaataca 44947741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 67 - 217
Target Start/End: Original strand, 42446625 - 42446775
Alignment:
Q  67 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 166  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42446625 taagcttaaaatttgatcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttacctaaacacctttaaaaaggctt 42446724  T
Q  167 ataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgggg 217  Q
    ||   ||||||||||  | | ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  42446725 atgttagtagataagttcgcataaactccgaataagccaatccaaacgggg 42446775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 168
Target Start/End: Original strand, 22101210 - 22101304
Alignment:
Q  74 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  22101210 aaaatttgggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttatacaaatacctttaaaaaggcttat 22101304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3585439 - 3585291
Alignment:
Q  67 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 166  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||| ||||||| |||||| ||||| |||| ||    
T  3585439 taagctcataattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataaattgtttttattaatttaccaaaacacatttaataaggttt 3585340  T
Q  167 ataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgg 215  Q
    ||   ||| |||||  |||| ||||||   |||||||| ||||||||||    
T  3585339 atgttagtggataaatccacataagctttgaataagccgatccaaacgg 3585291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 213
Target Start/End: Original strand, 12517256 - 12517385
Alignment:
Q  83 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagc 182  Q
    |||| ||||||||| || ||||| |||||||||| || |||||||| |||| ||| |  || |||||||| ||||  || ||||||   |||||||||||    
T  12517256 gcttgttaaaatattgcttaagctgcttatgaaattaggataagctcttttaattaaggtatccaaacacttttaggaaagcttattttagtagataagc 12517355  T
Q  183 ccacgtaagctcaaaataagccaatccaaac 213  Q
     ||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  12517356 tcacataagct-taaataagccaatccaaac 12517385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 217
Target Start/End: Original strand, 22956 - 23157
Alignment:
Q  16 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22956 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 23055  T
Q  116 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacgg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23056 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgg 23155  T
Q  216 gg 217  Q
    ||    
T  23156 gg 23157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 6 - 212
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggattattaaaatatggcataagcagctt 105  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||||| ||    
T  106 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataaactcaacttaagccaataca 205  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  206 aacgggg 212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 3915 - 3709
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3915 cagagagaatcaaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 3816  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  3815 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaaccaatcca 3716  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  3715 aacgggg 3709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 216
Target Start/End: Original strand, 145246 - 145450
Alignment:
Q  12 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  145246 agagagaatcgaaggaggttacataaatttataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 145345  T
Q  112 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  145346 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagtccacataaactcaaaataagtcaatccaa 145445  T
Q  212 acggg 216  Q
    |||||    
T  145446 acggg 145450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10443 - 10237
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10443 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagctt 10344  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  10343 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgagagtagataaacccatataagctcaaaataagtcaatcca 10244  T
Q  211 aacgggg 217  Q
    |||||||    
T  10243 aacgggg 10237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 295 - 503
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  295 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagctt 394  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatcca 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  395 atgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatcca 494  T
Q  211 aacggggtc 219  Q
    |||||||||    
T  495 aacggggtc 503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Original strand, 6 - 212
Alignment:
Q  11 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  6 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcat 104  T
Q  111 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagta---gataagcccacgtaagctcaaaataagccaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  105 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat-ggagtagatgataagtccacataagctcaaaataagtcaat 203  T
Q  208 ccaaacggg 216  Q
    |||||||||    
T  204 ccaaacggg 212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University