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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5653-Insertion-2 (Length: 876)

Name: NF5653-Insertion-2
Description: NF5653
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5653-Insertion-2
NF5653-Insertion-2
[»] chr5 (11 HSPs)
chr5 (10-876)||(34231499-34232365)
chr5 (116-734)||(34239357-34239975)
chr5 (380-836)||(42129461-42129914)
chr5 (52-613)||(42124306-42124867)
chr5 (428-835)||(41712663-41713070)
chr5 (511-708)||(41571205-41571402)
chr5 (71-182)||(41570765-41570876)
chr5 (791-872)||(34240023-34240104)
chr5 (146-215)||(41712465-41712533)
chr5 (518-618)||(41432339-41432439)
chr5 (762-844)||(41571459-41571541)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (116-864)||(12249035-12249777)
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (52-692)||(25521758-25522398)
[»] chr3 (2 HSPs)
chr3 (259-836)||(8523613-8524190)
chr3 (75-174)||(8524203-8524302)
[»] chr4 (3 HSPs)
chr4 (112-410)||(11119079-11119377)
chr4 (516-609)||(11118949-11119042)
chr4 (18-150)||(11119555-11119687)
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (71-118)||(15590744-15590791)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 815; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 815; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 876
Target Start/End: Original strand, 34231499 - 34232365
Alignment:
Q  10 gacaatgtactcagtggtcaaatgccggattcttttcatctgtcaaacaaatttaaaataatagatttgagtggtaacaagattggaggtgaactaccaa 109  Q
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T  34231499 gacaatgtactcaatggtcaaatcccggattcttttcatctgtcaaacaaatttcaaataatagatttgagtggtaacaagattggaggtgaactaccaa 34231598  T
Q  110 catcactttcaaaccttcgccatctcattaacttggatctttcatacaattcattaagcagtcaaattccagatgtatttggcgggatgaccaaactgca 209  Q
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T  34231599 catcactttcaaaccttcgacatctcattaacttggatctttcatacaattcattaagcggtcaaattccagatgtatttggcgggatgaccaaactgca 34231698  T
Q  210 agaactccgtctatattcaaacaatttagtaggacaaattccactttccttatttaagatgactcaacttgttagattagattgttcatataataaatta 309  Q
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T  34231699 agaactccgtctatattcaaacaatttagtaggacaaattccactttccttatttaagttgactcaacttgttagattcgattgttcatataataaatta 34231798  T
Q  310 agaggtccattgccgaataaaattacaggttttcaacagctagttcattttcgtttaaatgacaaccgtctaaacggaacaattccttcctctttgttat 409  Q
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T  34231799 agaggtccattgccaaataaaattacaggttttcaacagctagttcgttttcgtttaaatgacaaccgtctaaacggaacaattccttcctctttgttat 34231898  T
Q  410 ctttgcctcgtttgctaaatttatatctatcaaacaatcaaattacagggcatatcagtgcaatctcgtcgtattcgttagaggctctaaatctaggcgg 509  Q
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T  34231899 ctttgcctcgtttgctaaatttatatctatcaaacaatcaacttacagggcatatcagtgcaatctcgtcctattcgttagaggctctaaatctaggcgg 34231998  T
Q  510 taacaagctacaaggcaatattccagaatcaattttcaaccttgtaaatttagctgtattagatctatcatcaaacaacttgagtggtgttgtcaatttt 609  Q
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T  34231999 taacaagctacaaggcaatattccagaatcaattttcaaccttgtaaatttagctgtattagatctatcatcaaacaacttgagtggtgttgtcaatttt 34232098  T
Q  610 caacactttggcaaacttcaaaatttgtattctttgtccctttcacagaatacacaattatcactaacctttgaatccaatgttagttacaatttttctc 709  Q
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T  34232099 caacactttggcaaacttcaaaatttgtattctttgtccctttcacagaatacacaattatcactaacctttgaatccaatgtcagttacaatttttctc 34232198  T
Q  710 atctaagggaattggatttatcttctatcaacttgacaaactttcccatattatcagaaaaattcctaagtttggattattttgatttgtccaataacaa 809  Q
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T  34232199 atctaagggaattggatttgtcttctatcaacttgacaaactttcccatattatcagaaaaattcctaagtttggattattttgatttgtccaataacaa 34232298  T
Q  810 tcttaatggaagggtgccaaattggttgtttgaaacagcagaatctttgaacctctctcaaaattgc 876  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34232299 tcttaatggaagggtgccaaattggttgtttgaaacagcagaatctttgaacctctctcaaaattgc 34232365  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 116 - 734
Target Start/End: Original strand, 34239357 - 34239975
Alignment:
Q  116 tttcaaaccttcgccatctcattaacttggatctttcatacaattcattaagcagtcaaattccagatgtatttggcgggatgaccaaactgcaagaact 215  Q
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T  34239357 tttcaaaccttcaaaatctcatccacttgtatctttcaggcaattcacttagcggtcaaatcccagatgtatttggtaggatgaccaaactgcaagtatt 34239456  T
Q  216 ccgtctatattcaaacaatttagtaggacaaattccactttccttatttaagatgactcaacttgttagattagattgttcatataataaattaagaggt 315  Q
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T  34239457 ctatctagcttctaacaaattagaaggacaaattccatcttcattatttaacttgaatcaacttgttgatttagattgtgcttataataaattagagggt 34239556  T
Q  316 ccattgccgaataaaattacaggttttcaacagctagttcattttcgtttaaatgacaaccgtctaaacggaacaattccttcctctttgttatctttgc 415  Q
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T  34239557 ccactacataataaaattgcaggttttcaaaagctaatttatttgaggttaaatgacaacttgctaaatggaacaattccttcctccttgttatctttgc 34239656  T
Q  416 ctcgtttgctaaatttatatctatcaaacaatcaaattacagggcatatcagtgcaatctcgtcgtattcgttagaggctctaaatctaggcggtaacaa 515  Q
    ||  |||| ||  | | |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||||  ||||  |||| ||   |||||    
T  34239657 cttctttggtacttctgtatctatcaaacaatcgacttacagggcctatcagtgaaatctcatcatattccttagagtatctatctctatgcaacaacaa 34239756  T
Q  516 gctacaaggcaatattccagaatcaattttcaaccttgtaaatttagctgtattagatctatcatcaaacaacttgagtggtgttgtcaattttcaacac 615  Q
    |||||||||  |||||||| | |||||||||||||||| |||  ||  |  | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34239757 gctacaaggtgatattccaaattcaattttcaaccttgcaaacctaattacactatgtctatcatcaaacaacttgagtggtgttgtcaattttcaagac 34239856  T
Q  616 tttggcaaacttcaaaatttgtattctttgtccctttcacagaatacacaattatcactaacctttgaatccaatgttagttacaatttttctcatctaa 715  Q
    |||   ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  34239857 tttacaaaacttcaaaaattggattctctgtccctttcacataatagccaattatcactaaactttgaatacaatgttacttaccatttttctcaactaa 34239956  T
Q  716 gggaattggatttatcttc 734  Q
       |||||||||| |||||    
T  34239957 caaaattggatttgtcttc 34239975  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 380 - 836
Target Start/End: Complemental strand, 42129914 - 42129461
Alignment:
Q  380 taaacggaacaattccttcctctttgttatctttgcctcgtttgctaaatttatatctatcaaacaatcaaattacagggcatatcagtgcaatctcgtc 479  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |  |||||  ||||||||| ||||   ||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  42129914 taaatggaacaattccttcctccttgttatctttgccgtctttggttcatttagttctatcaaataatcgtcttacaaggcatatcactgcaatctcatc 42129815  T
Q  480 gtattcgttagaggctctaaatctaggcggtaacaagctacaaggcaatattccagaatcaattttcaaccttgtaaatttagctgtattagatctatca 579  Q
     ||||| ||| ||   ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||| || |  |||||||||||    
T  42129814 atattccttaaagaagctagatctaagcggcaacaagctacaaggcaatattccaaaatctattttcaaccttgcaaacttaactttgctagatctatca 42129715  T
Q  580 tcaaacaacttgagtggtgttgtcaattttcaacactttggcaaacttcaaaatttgtattctttgtccctttcacagaatacacaattatcactaacct 679  Q
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T  42129714 tcaaacaacttgagtgatgttattgattttcaacacttttccaaacttcaatatttgaaaactctgtcactttcacataatagccaattatcattaacat 42129615  T
Q  680 ttgaatccaatgttagttacaatttttctcatctaagggaattggatttatcttctatcaacttgacaaactttcccatattatcagaaaaattcctaag 779  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||    |||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||   ||||||  ||| ||| |      
T  42129614 ttgaacccaatgtcaattacaatttttcttatctatcaaaattggatttgtcttctatcaatttgacagaatttccca---tatcagggaaagtcccatt 42129518  T
Q  780 tttggattattttgatttgtccaataacaatcttaatggaagggtgccaaattggtt 836  Q
     || |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  42129517 gttagattctcttgatttgtccaataacaaacttaatggaaaggtgccagattggtt 42129461  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 42124867 - 42124306
Alignment:
Q  52 tcaaacaaatttaaaataatagatttgagtggtaacaagattggaggtgaactaccaacatcactttcaaaccttcgccatctcattaacttggatcttt 151  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||||| |||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||     
T  42124867 tcaaacaaatttcaagaattagatttgagaggtaacaaaattgaaggtgagctgccaacatcactttcaaaccttcgacaactcattcacttggatcttg 42124768  T
Q  152 catacaattcattaagcagtcaaattccagatgtatttggcgggatgaccaaactgcaagaactccgtctatattcaaacaatttagtaggacaaattcc 251  Q
      |  |||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||  ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  42124767 ggtggaattcatttagtggtcaaatcccagatgtgtttggtgggatgaccaaactgcaagaactcgatttaacttccaacaatttagaaggacaaattcc 42124668  T
Q  252 actttccttatttaagatgactcaacttgttagattagattgttcatataataaattaagaggtccattgccgaataaaattacaggttttcaacagcta 351  Q
    |  |||  |||||||  ||||||| ||| | | ||||||||||  |  ||| ||||||   |||||  | || || |||||||||||  | ||| |||||    
T  42124667 atcttcactatttaacttgactcagcttttcacattagattgtagaggtaacaaattagagggtcccctacccaacaaaattacaggactccaaaagcta 42124568  T
Q  352 gttcattttcgtttaaatgacaaccgtctaaacggaacaattccttcctctttgttatctttgcctcgtttgctaaatttatatctatcaaacaatcaaa 451  Q
     |  ||||   |||||| ||||||   ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||  || |||| |||||||| | |||| |     
T  42124567 atgtatttgaatttaaaagacaacttgctaaatggaacagttccttcctccttgttatctttgccttctttggcaattttagatctatcatataatcgac 42124468  T
Q  452 ttacagggcatatcagtgcaatctcgtcgtattcgttagaggctctaaatctaggcggtaacaagctacaaggcaatattccagaatcaattttcaacct 551  Q
    |||||||||||||||||| ||| || || ||||| ||| |    |||| |||| ||   |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  42124467 ttacagggcatatcagtgaaatatcatcatattctttaaacatgctaactctaagcaacaacaggctacaaggcaatattcctgagtccattttcaacct 42124368  T
Q  552 tgtaaatttagctgtattagatctatcatcaaacaacttgagtggtgttgtcaattttcaac 613  Q
       |||  || ||   |||  |||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  42124367 aacaaaactatctcacttaattctatcttcgaacgacttgagtggtcttgtcaattttcaac 42124306  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 428 - 835
Target Start/End: Original strand, 41712663 - 41713070
Alignment:
Q  428 atttatatctatcaaacaatcaaattacagggcatatcagtgcaatctcgtcgtattcgttagaggctctaaatctaggcggtaacaagctacaaggcaa 527  Q
    ||||| |||||||||| || | | ||| ||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||  ||| |||||  ||| ||||| ||| |||||||    
T  41712663 atttagatctatcaaataaccgacttatagggcatatcattgcaatctcatcatattccttagaggagctatatctattcggcaacaaactagaaggcaa 41712762  T
Q  528 tattccagaatcaattttcaaccttgtaaatttagctgtattagatctatcatcaaacaacttgagtggtgttgtcaattttcaacactttggcaaactt 627  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||  || ||  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||   | |||||    
T  41712763 tattccagaatcaattttcaaacttataaacctaactagactagacctatcatcaaacaacttcagtggtgttgttgattttcaatacttctccgaactt 41712862  T
Q  628 caaaat-ttgtattctttgtccctttcacagaatacacaattatcactaacctttgaatccaatgttagttacaatttttctcatctaagggaattggat 726  Q
    |||||| | ||| ||| ||||||||||||  ||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  41712863 caaaatctagta-tctctgtccctttcacttaataatcaattgtcactaaactttgaatccattgtcaattacaatttttctcaactaatagaattggat 41712961  T
Q  727 ttatcttctatcaacttgacaaactttcccatattatcagaaaaattcctaagtttggattattttgatttgtccaataacaatcttaatggaagggtgc 826  Q
    ||||||||| | |  |||||    ||| | | |||||||| |||| |   || |||| | ||||||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||    
T  41712962 ttatcttctttgagtttgactcgattttcaaaattatcaggaaaactttcaaatttgaaatattttgatctgtctaataacaaaattaatggaagagtgc 41713061  T
Q  827 caaattggt 835  Q
    |||||||||    
T  41713062 caaattggt 41713070  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 511 - 708
Target Start/End: Original strand, 41571205 - 41571402
Alignment:
Q  511 aacaagctacaaggcaatattccagaatcaattttcaaccttgtaaatttagctgtattagatctatcatcaaacaacttgagtggtgttgtcaattttc 610  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||  || ||  | ||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  41571205 aacaagctacaaggcgatattcctgaatctattttcaaccttgtaaacctaactacactatgcctgtcatcaaacaacttgagtggtattgtcaatttta 41571304  T
Q  611 aacactttggcaaacttcaaaatttgtattctttgtccctttcacagaatacacaattatcactaacctttgaatccaatgttagttacaatttttct 708  Q
    || |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41571305 aatacttttccaaacttcaaaatttgaattctctgtccctttcacataatagtcaattatcaccgaactttgaatccaatgtcagttacaatttttct 41571402  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 182
Target Start/End: Original strand, 41570765 - 41570876
Alignment:
Q  71 tagatttgagtggtaacaagattggaggtgaactaccaacatcactttcaaaccttcgccatctcattaacttggatctttcatacaattcattaagcag 170  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||  |    
T  41570765 tagatttgagcggtaacaaaattggaggtgatcttccaacatcactttcaaaccttcaacatctcgttaatttagacctgtcatccaattcattcagtgg 41570864  T
Q  171 tcaaattccaga 182  Q
    ||||||||||||    
T  41570865 tcaaattccaga 41570876  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 791 - 872
Target Start/End: Original strand, 34240023 - 34240104
Alignment:
Q  791 ttgatttgtccaataacaatcttaatggaagggtgccaaattggttgtttgaaacagcagaatctttgaacctctctcaaaa 872  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| | ||||||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  34240023 ttgatttgtccaataacaaacttaatggaacagtgtccaattggttacttgaaacatcaagatctttgaacctctctcaaaa 34240104  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 215
Target Start/End: Original strand, 41712465 - 41712533
Alignment:
Q  146 atctttcatacaattcattaagcagtcaaattccagatgtatttggcgggatgaccaaactgcaagaact 215  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  41712465 atctttcattcaattcatttagcggtcaaataccagatgtgtttggtgggatgaccaaa-tgcaagaact 41712533  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 518 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 41432439 - 41432339
Alignment:
Q  518 tacaaggcaatattccagaatcaattttcaaccttgtaaatttagctgtattagatctatcatcaaacaacttgagtggtgttgtcaattttcaacactt 617  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||   ||   |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||    
T  41432439 tacaaggaaatattccagaatcacttttcaaccttgtaaaccttactaacttgtgtctatcttcaaataacttgagtggttttgtcaattttaaactctt 41432340  T
Q  618 t 618  Q
    |    
T  41432339 t 41432339  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 762 - 844
Target Start/End: Original strand, 41571459 - 41571541
Alignment:
Q  762 atcagaaaaattcctaagtttggattattttgatttgtccaataacaatcttaatggaagggtgccaaattggttgtttgaaa 844  Q
    ||||| ||||||||  ||||||   ||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  41571459 atcaggaaaattccctagtttgagatatcttgatttgtccaacaacaaactttatggaagagtgcccaattggttgcttgaaa 41571541  T

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Target: chr2 (Bit Score: 177; Significance: 6e-95; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 116 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 12249777 - 12249035
Alignment:
Q  116 tttcaaaccttcgccatctcattaacttggatctttcatacaattcattaagcagtcaaattccagatgtatttggcgggatgaccaaactgcaagaact 215  Q
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T  12249777 tttcaaaccttcaacgtctcattcacgtggatctttcattcaattcatttagcggtcaaataccagatgtgtttagtgcgatgaccaaactgcaagaact 12249678  T
Q  216 ccgtctatattcaaacaatttagtaggacaaattccactttccttatttaagatgactcaacttgttagattagattgttcatataataaattaagaggt 315  Q
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T  12249677 caatctagcttcaaacaaattacaaggacaaattccgttttcattatttaacttgactcaacttgttacattagattgttcgcataacaaattagaaggt 12249578  T
Q  316 -ccattgccgaataaaattacaggttttcaacagctagttcattttcgtttaaatgacaaccgtctaaacggaacaattccttcctctttgttatctttg 414  Q
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T  12249577 ccccttggc-aacaaaatcacagggtttcaaaagttaacttatttcagtttaagtgataactttctaaacggaacaattcctcccaccttgttatctttg 12249479  T
Q  415 cctcgtttgctaaatttatatctatcaaacaatcaaattacagggcatatcagtgcaatctcgtcgtattcgttagaggctctaaatctaggcggtaaca 514  Q
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T  12249478 ccttctttggaacatctagagctgtcaaacaatcgatttacaggacatatcagtgcaatctcatcgtattcgttagatacgctatatctatctggtaaca 12249379  T
Q  515 agctacaaggcaatattccagaatcaattttcaaccttgtaaatttagctgtattagatctatcatcaaacaacttgagtggtgttgtcaattttcaaca 614  Q
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T  12249378 agctacaaggcaatattccaaaatccattttcaaccttacaaccctaactagactagatttatcatcaaacaacttgagtggtgttgttgattttcaact 12249279  T
Q  615 ctttggcaaacttcaaaatttgtattctttgtccctttcacagaatacacaattatcactaacctttgaatccaatgttagttacaatttttctcatcta 714  Q
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T  12249278 cttttccaaacttcattggttgttttttctgtccctttcacataatagccaattatcactaacctttgaatccaatgtcagtttcatttactcccgacta 12249179  T
Q  715 agggaattggatttatcttctatcaacttgacaaactttcccatattatcaga-aaaattcctaagtttggattattttgatttgtccaataacaatctt 813  Q
    ||   |||| ||||  ||||| |||| |||||| | |||||||       |||   |||||| ||| || |||| | |||||||||| ||||| || |||    
T  12249178 agaatattgtattttccttctgtcaatttgacagaatttccca-------agattgaattcccaagattagattctcttgatttgtcaaataataaactt 12249086  T
Q  814 aatggaagggtgccaaattggttgtttgaaacagcagaatctttgaacctc 864  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||    
T  12249085 aatggaagcgtgcccaattggttgcttgaaatatcaggatctttgaacctc 12249035  T

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Target: chr6 (Bit Score: 134; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 52 - 692
Target Start/End: Original strand, 25521758 - 25522398
Alignment:
Q  52 tcaaacaaatttaaaataatagatttgagtggtaacaagattggaggtgaactaccaacatcactttcaaaccttcgccatctcattaacttggatcttt 151  Q
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T  25521758 tcaaacaaatttcaagtattagattttagttataacaaatttgaaggagaattgccaacatcactttcaaaccttcaacatctcattcgcttggatcttt 25521857  T
Q  152 catacaattcattaagcagtcaaattccagatgtatttggcgggatgaccaaactgcaagaactccgtctatattcaaacaatttagtaggacaaattcc 251  Q
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T  25521858 catacaattcatttagaggtcaaatcccagacgtgttcggtgggatgaccaaattgcaagaactcgatctatattttaacaaattagaaggacagattcc 25521957  T
Q  252 actttccttatttaagatgactcaacttgttagattagattgttcatataataaattaagaggtccattgccgaataaaattacaggttttcaacagcta 351  Q
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T  25521958 atcttcgttatttaaattgactggtcttaagttgttatattgttctaataataaattagagggtcctttacctaacaaaattatagggttccaaaagcta 25522057  T
Q  352 gttcattttcgtttaaatgacaaccgtctaaacggaacaattccttcctctttgttatctttgcctcgtttgctaaatttatatctatcaaacaatcaaa 451  Q
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T  25522058 actgatttaagtttacatgacaacttgttaaatggaacaattccttcctctttgttatctttgccttctttggtatatttatatctatctaacaatcgac 25522157  T
Q  452 ttacagggcatatcagtgcaatctcgtcgtattcgttagaggctctaaatctaggcggtaacaagctacaaggcaatattccagaatcaattttcaacct 551  Q
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T  25522158 ttacaggatctatcagtgcaacctcatcatattccttagagagtttaaatctatacaacaacaagctacaaggcaatattccagaatccattttcaatct 25522257  T
Q  552 tgtaaatttagctgtattagatctatcatcaaacaacttgagtggtgttgtcaattttcaacactttggcaaactt-caaaatttgtattctttgtccct 650  Q
    |  |||  || ||    ||  |||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  ||  ||| ||| |||||    
T  25522258 tacaaacctaactaatctaattctatctttaaacgacttgagtggttttgtcaattttcaacacttttccaaacttacaaatcttcgatt-tttatccct 25522356  T
Q  651 ttcacagaatacacaattatcactaacctttgaatccaatgt 692  Q
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T  25522357 ttcatggaatactcaattgtcactaaacttcgaatccaatgt 25522398  T

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Target: chr3 (Bit Score: 110; Significance: 6e-55; HSPs: 2)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 259 - 836
Target Start/End: Complemental strand, 8524190 - 8523613
Alignment:
Q  259 ttatttaagatgactcaacttgttagattagattgttcatataataaattaagaggtccattgccgaataaaattacaggttttcaacagctagttcatt 358  Q
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T  8524190 ttatttaacttgactcatcttgttactttagattgttctcataataaattagatggtcccttacccaacaaaactacaggtcttcaaaagctaactaatt 8524091  T
Q  359 ttcgtttaaatgacaaccgtctaaacggaacaattccttcctctttgttatctttgcctcgtttgctaaatttatatctatcaaacaatcaaattacagg 458  Q
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T  8524090 tgcgattaaatgacaacttgctaaatggtacaattcctccctccttgttatccttgccatttttgctagtattagatttatcaaataatcaacttacagg 8523991  T
Q  459 gcatatcagtgcaatctcgtcgtattcgttagaggctctaaatctaggcggtaacaagctacaaggcaatattccagaatcaattttcaaccttgtaaat 558  Q
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T  8523990 gaatatcagcgcaatctcatcatattccttagagtttctatctctaagtaacaacaggctacaaggcaatattccagaatccattttcaaccttgcaaac 8523891  T
Q  559 ttagctgtattagatctatcatcaaacaacttgagtggtgttgtcaattttcaacactttggcaaacttcaaaatttgtattctttgtccctttcacaga 658  Q
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T  8523890 ctaagtagactagatctatcatcaaacaacttgagtggtgttgtcaatttccaaaacatttccaaccttcaacatttgaaatttttgcagctttcagata 8523791  T
Q  659 atacacaattatcactaacctttgaatccaatgttagttacaatttttctcatctaagggaattggatttatcttctatcaacttgacaaactttcccat 758  Q
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T  8523790 atagccaattatcagtaaactttgaatccagtgtcaattatagtttttttgatctaatggaattgggtttgtcttctttgagtttgactgagtttcctaa 8523691  T
Q  759 attatcagaaaaattcctaagtttggattattttgatttgtccaataacaatcttaatggaagggtgccaaattggtt 836  Q
     || ||||||||| ||| ||  ||||  ||| ||||| |||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||    
T  8523690 cttctcagaaaaactcccaatgttggtatatcttgatctgtctaataacaaaattagtggaagtgtgccaaattggtt 8523613  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 8524302 - 8524203
Alignment:
Q  75 tttgagtggtaacaagattggaggtgaactaccaacatcactttcaaaccttcgccatctcattaacttggatctttcatacaattcattaagcagtcaa 174  Q
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T  8524302 tttgagtaataacaaaattgaaggtgagcttccaacatcactatcaaaccttcgtcatctcatttacttggatgtttcatacaattcatttagcggtcaa 8524203  T

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Target: chr4 (Bit Score: 63; Significance: 6e-27; HSPs: 3)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 112 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 11119377 - 11119079
Alignment:
Q  112 tcactttcaaaccttcgccatctcattaacttggatctttcatacaattcattaagcagtcaaattccagatgtatttggcgggatgaccaaactgcaag 211  Q
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T  11119377 tcactttcaaaccttcaacaacttattcacttggatatttcttccaatgcatttagcggtccaataccagatgtgtttggtgggatgacaaaactgcaag 11119278  T
Q  212 aactccgtctatattcaaacaatttagtaggacaaattccactttccttatttaagatgactcaacttgttagattagattgttcatataataaattaag 311  Q
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T  11119277 aactcgacttagattataacaagttagaaggacaaattccatcatcattatttaacttgactcaacttgttgcattaggttgttctaataataaattaga 11119178  T
Q  312 aggtccattgccgaataaaattacaggttttcaacagctagttcattttcgtttaaatgacaaccgtctaaacggaacaattccttcctctttgttatc 410  Q
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T  11119177 tggtcccctgcccaacaaaattacagggttccaaaagctaacaaatttgagattaaatgacaacttgataaatggaacaattccttcctccttgttatc 11119079  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 516 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 11119042 - 11118949
Alignment:
Q  516 gctacaaggcaatattccagaatcaattttcaaccttgtaaatttagctgtattagatctatcatcaaacaacttgagtggtgttgtcaatttt 609  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||   |||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11119042 gctacaaggcaatattccagaatgcattttcagcctaacaaagctagatgaactagatctatcatcaaacaacttgagtggtgttgtcaatttt 11118949  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 11119687 - 11119555
Alignment:
Q  18 actcagtggtcaaatgccggattcttttcatctgtcaaacaaatttaaaataatagatttgagtggtaacaagattggaggtgaactaccaacatcactt 117  Q
    ||||||||||| ||| ||  || | |||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||||  |||||| |||| |||||   | ||||||||| ||    
T  11119687 actcagtggtcgaattccaaatgcatttcagatgtcaaacaaatttcaaaaattagatttgagtcataacaaaattgaaggtgtggttccaacatcaatt 11119588  T
Q  118 tcaaaccttcgccatctcattaacttggatctt 150  Q
    ||||||||||  || |||||| |||||||||||    
T  11119587 tcaaaccttcaacaactcattcacttggatctt 11119555  T

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Target: chr1 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 15590791 - 15590744
Alignment:
Q  71 tagatttgagtggtaacaagattggaggtgaactaccaacatcacttt 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||    
T  15590791 tagatttgagtggtaacaaaattgaaggtgagctgccaacatcacttt 15590744  T

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