View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5654_2D_high_8 (Length: 684)

Name: NF5654_2D_high_8
Description: NF5654_2D
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5654_2D_high_8
NF5654_2D_high_8
[»] chr5 (21 HSPs)
chr5 (59-684)||(7649736-7650360)
chr5 (264-684)||(14616428-14616847)
chr5 (265-684)||(34405675-34406094)
chr5 (390-684)||(22159571-22159867)
chr5 (268-684)||(33574915-33575331)
chr5 (362-684)||(26712437-26712761)
chr5 (362-684)||(26982175-26982499)
chr5 (265-684)||(15532200-15532619)
chr5 (267-684)||(15542384-15542801)
chr5 (265-352)||(21680634-21680721)
chr5 (265-352)||(33921372-33921459)
chr5 (265-352)||(2499762-2499850)
chr5 (273-346)||(1810198-1810272)
chr5 (393-531)||(11988991-11989133)
chr5 (619-678)||(11989171-11989230)
chr5 (272-348)||(36330999-36331075)
chr5 (527-641)||(23993320-23993434)
chr5 (265-307)||(9691083-9691125)
chr5 (265-307)||(25185699-25185741)
chr5 (20-61)||(7649606-7649647)
chr5 (278-329)||(19686465-19686517)
[»] chr7 (21 HSPs)
chr7 (265-684)||(24783235-24783654)
chr7 (265-684)||(6966974-6967393)
chr7 (265-684)||(17866353-17866772)
chr7 (373-684)||(17863202-17863513)
chr7 (265-684)||(36842937-36843356)
chr7 (265-684)||(9765619-9766046)
chr7 (432-684)||(46846479-46846731)
chr7 (391-678)||(23313384-23313673)
chr7 (468-684)||(294691-294907)
chr7 (364-684)||(11279319-11279639)
chr7 (394-684)||(23107814-23108106)
chr7 (364-684)||(23759706-23760027)
chr7 (364-684)||(33312821-33313143)
chr7 (364-684)||(36222406-36222721)
chr7 (391-611)||(3862029-3862244)
chr7 (264-352)||(17857879-17857968)
chr7 (265-352)||(38431669-38431757)
chr7 (273-352)||(3540932-3541011)
chr7 (273-352)||(6964563-6964643)
chr7 (274-348)||(28577687-28577761)
chr7 (364-423)||(294951-295008)
[»] chr1 (26 HSPs)
chr1 (265-684)||(13495814-13496232)
chr1 (265-684)||(13493089-13493508)
chr1 (265-601)||(10764829-10765165)
chr1 (265-684)||(32505857-32506273)
chr1 (265-684)||(39546069-39546486)
chr1 (391-684)||(34066171-34066466)
chr1 (390-684)||(27282230-27282526)
chr1 (265-658)||(16190179-16190575)
chr1 (459-672)||(15297171-15297383)
chr1 (445-684)||(1936454-1936691)
chr1 (478-672)||(22456705-22456897)
chr1 (471-684)||(21153082-21153295)
chr1 (539-684)||(23990362-23990507)
chr1 (545-672)||(22453415-22453542)
chr1 (478-584)||(49147825-49147930)
chr1 (265-352)||(34552438-34552525)
chr1 (577-684)||(22104683-22104788)
chr1 (275-352)||(18392669-18392747)
chr1 (278-345)||(15297492-15297559)
chr1 (157-220)||(48505874-48505937)
chr1 (391-462)||(8435284-8435357)
chr1 (265-352)||(49716647-49716735)
chr1 (289-352)||(49720129-49720192)
chr1 (273-346)||(6206164-6206237)
chr1 (273-352)||(50196723-50196803)
chr1 (157-197)||(48505811-48505851)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (265-684)||(14790445-14790864)
chr6 (265-684)||(14795473-14795892)
chr6 (261-684)||(1838301-1838724)
chr6 (409-684)||(32704398-32704673)
chr6 (266-684)||(19664667-19665083)
chr6 (390-683)||(20527285-20527580)
chr6 (265-642)||(15534925-15535300)
chr6 (393-677)||(16883509-16883795)
chr6 (364-684)||(13017287-13017608)
chr6 (264-536)||(27649077-27649347)
chr6 (478-672)||(12980705-12980898)
chr6 (478-684)||(12983592-12983797)
chr6 (265-684)||(22221550-22221967)
chr6 (265-684)||(22247385-22247802)
chr6 (471-684)||(7769594-7769814)
chr6 (265-531)||(32427281-32427544)
chr6 (376-610)||(30978321-30978557)
chr6 (572-684)||(15538048-15538160)
chr6 (270-503)||(15540578-15540809)
chr6 (393-462)||(11183962-11184033)
chr6 (606-684)||(32427193-32427271)
chr6 (263-346)||(33678939-33679025)
chr6 (520-570)||(15540529-15540579)
chr6 (265-352)||(11411039-11411127)
chr6 (158-265)||(32090663-32090777)
chr6 (265-352)||(12747086-12747173)
chr6 (278-329)||(34502636-34502688)
[»] chr4 (16 HSPs)
chr4 (273-684)||(647211-647622)
chr4 (273-684)||(650483-650894)
chr4 (265-684)||(26062690-26063112)
chr4 (476-684)||(26060414-26060622)
chr4 (265-684)||(12171809-12172218)
chr4 (265-684)||(2541711-2542128)
chr4 (263-352)||(15851450-15851539)
chr4 (265-352)||(19929155-19929242)
chr4 (280-348)||(21217350-21217418)
chr4 (265-352)||(33400075-33400163)
chr4 (391-453)||(11649329-11649393)
chr4 (140-221)||(52628956-52629036)
chr4 (476-528)||(11649444-11649496)
chr4 (157-213)||(31979285-31979341)
chr4 (64-130)||(31980626-31980692)
chr4 (391-453)||(26060668-26060732)
[»] chr2 (17 HSPs)
chr2 (265-684)||(23673345-23673763)
chr2 (264-682)||(36326751-36327172)
chr2 (263-684)||(16294726-16295145)
chr2 (265-684)||(32575685-32576105)
chr2 (364-684)||(13709897-13710218)
chr2 (364-684)||(31626376-31626698)
chr2 (265-684)||(31528216-31528635)
chr2 (364-681)||(40017807-40018126)
chr2 (265-352)||(24384925-24385014)
chr2 (289-352)||(29436025-29436088)
chr2 (273-340)||(38315809-38315876)
chr2 (157-207)||(40927916-40927966)
chr2 (157-213)||(27409395-27409451)
chr2 (278-329)||(1503204-1503256)
chr2 (278-329)||(1506408-1506460)
chr2 (476-592)||(8427144-8427259)
chr2 (293-341)||(13572070-13572118)
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (265-684)||(13979313-13979730)
chr3 (364-684)||(39563607-39563929)
chr3 (265-684)||(22626312-22626730)
chr3 (265-684)||(11138570-11138988)
chr3 (476-609)||(46731396-46731529)
chr3 (176-265)||(35091823-35091912)
chr3 (64-174)||(35091672-35091783)
chr3 (265-352)||(46731612-46731699)
chr3 (471-611)||(47412082-47412222)
chr3 (499-672)||(35366215-35366387)
chr3 (264-352)||(27055149-27055237)
chr3 (265-352)||(19869255-19869343)
chr3 (265-348)||(26822039-26822122)
chr3 (391-462)||(50096829-50096902)
chr3 (265-352)||(25492175-25492263)
chr3 (391-451)||(20536459-20536520)
chr3 (265-329)||(3306147-3306213)
chr3 (265-329)||(30157797-30157863)
chr3 (259-308)||(32366877-32366927)
chr3 (267-307)||(4225619-4225659)
chr3 (278-329)||(18883509-18883561)
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (273-684)||(12575308-12575718)
chr8 (432-683)||(13096849-13097099)
chr8 (265-531)||(14418445-14418707)
chr8 (391-637)||(41778866-41779113)
chr8 (471-684)||(44008128-44008335)
chr8 (265-352)||(39659712-39659799)
chr8 (265-352)||(9467341-9467429)
chr8 (265-352)||(453863-453951)
chr8 (391-453)||(41836318-41836382)
chr8 (476-528)||(41836433-41836485)
chr8 (288-352)||(13332365-13332429)
chr8 (274-308)||(22173710-22173744)
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (364-684)||(9689-10010)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (454-684)||(5999-6229)
[»] scaffold0352 (2 HSPs)
scaffold0352 (476-683)||(2814-3021)
scaffold0352 (265-352)||(2619-2706)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (505-684)||(7232-7411)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (265-684)||(24185-24602)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (265-531)||(11-273)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (505-684)||(2518-2699)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (265-352)||(33730-33817)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (273-352)||(19517-19596)
[»] scaffold0665 (1 HSPs)
scaffold0665 (622-684)||(1-63)
[»] scaffold0766 (1 HSPs)
scaffold0766 (274-352)||(3664-3739)
[»] scaffold0084 (2 HSPs)
scaffold0084 (265-308)||(19593-19636)
scaffold0084 (265-308)||(29672-29715)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (274-308)||(14094-14128)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 493; Significance: 0; HSPs: 21)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 493; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 59 - 684
Target Start/End: Original strand, 7649736 - 7650360
Alignment:
Q  59 gtgagtttcattaaaatctaattttctcacactaatcacaatactcgttaatctcacttaaagattttaagctagttgatcaaattcacacatgtaagaa 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7649736 gtgagtttcattaaaatctaattttctcacactaatcacaatacccgttaatcgcacgtaaagattttaagctagttgatcaaattcacacatgtaagaa 7649835  T
Q  159 cacaacaacaaaaagggaaaatcaatcggggtttcaattctcattctattgcatgccaatttctaattgctaattccaatttccttttattataattaga 258  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7649836 cacaacaacaaaaaggaaaaatcaatcggggtttcaattatcattctattgcatgccaatttctaattgctaattccaatttccttttattataattaga 7649935  T
Q  259 acctaatgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnn 358  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||          
T  7649936 acctaatgatagagatttgacaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcaacaa-tttct 7650034  T
Q  359 nnatcaaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaat 458  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7650035 ttatcaaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttgcttttaagaat 7650134  T
Q  459 attaaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgataga 558  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  7650135 attagagagaagtatggttaagacatttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagtttaaagataga 7650234  T
Q  559 ttaacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaa 658  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  7650235 ttaacaaggtaattctactcaatctctttacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttgagtgaattcgaaatcgctggaggttttaa 7650334  T
Q  659 cagaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
     |||| ||||||||||||||||||||    
T  7650335 tagaaggttaatccctatgtcataac 7650360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 264 - 684
Target Start/End: Original strand, 14616428 - 14616847
Alignment:
Q  264 atgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatc 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||    
T  14616428 atgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttcttt-atc 14616526  T
Q  364 aaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatattaa 463  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  14616527 aaaaaggatgtatgaatttatattgattaccctaggaagttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttgattttaagaatattag 14616626  T
Q  464 agataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaac 563  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  14616627 agagaagtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaattttcactcctaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaac 14616726  T
Q  564 aaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaa 663  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||    
T  14616727 aaagtaattctacccaatctcttgacctataattctccccgcaagtgacaagcccttaatctcttgagtgaattcgaaaccgttggaggttttaacaaaa 14616826  T
Q  664 cgttaatccctatgtcataac 684  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  14616827 cgttaatccatatgtcataac 14616847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 265 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 34406094 - 34405675
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatc 363  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||        |||    
T  34406094 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacaaggaccgttgttaatttctactcggcaatttcttt-atc 34405996  T
Q  364 aaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatattaa 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  34405995 aaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgttgtgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatattag 34405896  T
Q  464 agataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaac 563  Q
    ||| ||||||| ||||||||||  ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  34405895 agagaagtatggttaagaccttcaaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaac 34405796  T
Q  564 aaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaa 663  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||    
T  34405795 aaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctcctcgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaaccgttggaggttttaaaagaa 34405696  T
Q  664 cgttaatccctatgtcataac 684  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  34405695 cgttaatccctatctcataac 34405675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 390 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 22159867 - 22159571
Alignment:
Q  390 ttgccctaggcagttgagttg--ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatattaaagataagtatgattaagacctttg 487  Q
    ||||||||||||||||  |||  |||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||    
T  22159867 ttgccctaggcagttggattggtttttataaagtaaacgtaaataaaacaataaaaattggttttaagaatattagagagaaatatggttaagacctttg 22159768  T
Q  488 aatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagtaattatacccaatctcttt 587  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  22159767 aatcctccgaagttctcctatggtaaatcgcactcctagttcaatcaatgactatctagttcaacgatagattaacaaagtaactctacccaatctcttg 22159668  T
Q  588 acctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
    ||||| | |||||||| ||||| | ||| | |||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22159667 acctagagttctccccacaagtaacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggttttaacagaacgttaatccctatgtcataac 22159571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 268 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 33575331 - 33574915
Alignment:
Q  268 tagagatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatcaaa 366  Q
    |||| |||||||||||||||||||  | ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| | |||||        || |||    
T  33575331 tagaaatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaa-aaattcgttttcacgaggactgtatttaacttctatttagcaattttatt-attaaa 33575234  T
Q  367 aaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgtttt-gtaacataaacgtaaataaaacaataaa-agttggttttaagaatattaaa 464  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |   ||||||||||| | |||||||| |||| ||| |     
T  33575233 aaggatgtataaatttatattggt-gccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattga- 33575136  T
Q  465 gataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaatt-caatcaatgtttatctagtttaacgatagattaac 563  Q
    || ||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||  |||||||    
T  33575135 gagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctaattacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaac 33575036  T
Q  564 aaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaa 663  Q
      ||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||||  |||    
T  33575035 ttagtaattctacccaatctcttgatctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaa 33574936  T
Q  664 cgttaatccctatgtcataac 684  Q
     |||||||||||| |||||||    
T  33574935 tgttaatccctatatcataac 33574915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 362 - 684
Target Start/End: Original strand, 26712437 - 26712761
Alignment:
Q  362 tcaaaaaggatgtataaa-tttatattgattgccctaggcagttgagttg-ttttgtaacataaacgtaaataaaacaa-taaaag-ttggttttaagaa 457  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  || |||||  | |||||| ||||||||| |||    
T  26712437 tcaaaaaggatgtgtaaaatttatatt-agtgccctagacagttgagttgattttgtaacataaacaaaattaaaaatagtaaaagattggtttta-gaa 26712534  T
Q  458 tattaaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatag 557  Q
     ||   ||| ||| ||| ||||| | || ||||||| ||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||    
T  26712535 aatctgagagaagaatggttaagtctttcgaatcctccgacgctctcctatgataatttgcactcctaattcaatcaatgattatttagtttcacgacag 26712634  T
Q  558 attaacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggtttta 657  Q
    ||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||    
T  26712635 attaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtatta 26712734  T
Q  658 acagaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  26712735 aaagaacgttaatccctatgtcataac 26712761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 362 - 684
Target Start/End: Original strand, 26982175 - 26982499
Alignment:
Q  362 tcaaaaaggatgtataaa-tttatattgattgccctaggcagttgagttg-ttttgtaacataaacgtaaataaaacaa-taaaag-ttggttttaagaa 457  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  || |||||  | |||||| ||||||||| |||    
T  26982175 tcaaaaaggatgtgtaaaatttatatt-agtgccctagacagttgagttgattttgtaacataaacaaaattaaaaatagtaaaagattggtttta-gaa 26982272  T
Q  458 tattaaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatag 557  Q
     ||   ||| ||| ||| ||||| | || ||||||| ||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||    
T  26982273 aatctgagagaagaatggttaagtctttcgaatcctccgacgctctcctatgataatttgcactcctaattcaatcaatgattatttagtttcacgacag 26982372  T
Q  558 attaacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggtttta 657  Q
    ||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||    
T  26982373 attaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtatta 26982472  T
Q  658 acagaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  26982473 aaagaacgttaatccctatgtcataac 26982499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 265 - 684
Target Start/End: Original strand, 15532200 - 15532619
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatc 363  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||  | ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||  |||| ||||||| |||||        ||     
T  15532200 tgatagatatttggcatgtgaaccaaattcgatcgaagtaataaa-aaattcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcatt-att 15532297  T
Q  364 aaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgtttt-gtaacataaacgtaaataaaacaataaa-agttggtttt-aagaatat 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |   ||||||||||| | |||||||| ||||| ||    
T  15532298 aaaaaggatgtataaatttatattggt-gccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaat 15532396  T
Q  461 taaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaatt-caatcaatgtttatctagtttaacgatagat 559  Q
    | | || ||||||| ||||| |||| |||||||   ||| ||| || ||||||||||||||||||| | | ||||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  15532397 tga-gagaagtatggttaagtccttcgaatcctctaaagctctcctgtggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacagat 15532495  T
Q  560 taacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaac 659  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||| |||| |  ||||||| |||||    
T  15532496 taacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccaatggaggtattaac 15532595  T
Q  660 agaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
     |||||||||||||||| |||||||    
T  15532596 -gaacgttaatccctatatcataac 15532619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 267 - 684
Target Start/End: Original strand, 15542384 - 15542801
Alignment:
Q  267 atagagatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatcaa 365  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||  |||| ||||||| | |||        || ||    
T  15542384 atagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaa-aaattcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttaacaatttcatt-attaa 15542481  T
Q  366 aaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgtttt-gtaacataaacgtaaataaaacaataaa-agttggtttt-aagaatatta 462  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |   ||||||||||| | |||||||| ||||| |||     
T  15542482 aaaggatgtataaatttatattggt-gccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaattg 15542580  T
Q  463 aagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaatt-caatcaatgtttatctagtttaacgatagatta 561  Q
    | || ||||||| ||||| |||| |||||||   ||| ||| || ||||||||||||||||||| | | ||||||| |||| |||||| |||| ||||||    
T  15542581 a-gagaagtatggttaagtccttcgaatcctctaaagctctcctgtggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacagatta 15542679  T
Q  562 acaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacag 661  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | || ||||||| |||||||| |||| |  ||||||| ||||| |    
T  15542680 acttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttgatctcttaagtgaattcgaaaccaatggaggtattaac-g 15542778  T
Q  662 aacgttaatccctatgtcataac 684  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  15542779 aacgttaatccctatatcataac 15542801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 265 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 21680721 - 21680634
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaa 352  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21680721 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaactatcgaagtagtaataaagtttgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaa 21680634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 33921459 - 33921372
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaa 352  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  33921459 tgatagatattcggcaagtgtaccaaaactatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgtgaatttctacttagcaa 33921372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 265 - 352
Target Start/End: Original strand, 2499762 - 2499850
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaac-tatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaa 352  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2499762 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagatatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaa 2499850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 273 - 346
Target Start/End: Original strand, 1810198 - 1810272
Alignment:
Q  273 atttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctact 346  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1810198 atttgacaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtattcacgaggaccgttgttaatttctact 1810272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 393 - 531
Target Start/End: Original strand, 11988991 - 11989133
Alignment:
Q  393 ccctaggcagttgagttg--ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatattaaagataagtatgattaagacctttgaat 490  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |   ||||| ||||||| | | ||| |||| |||| ||| ||||| | |||||||||| ||||    
T  11988991 ccctaggcagttgagttgatttttgtaacataaacagattaaaaacgataaaagattgattttagaaaattagagagaagtaaggttaagaccttcgaat 11989090  T
Q  491 cctacgaagttcttctat--ggtaatttgcactcctaattcaa 531  Q
    ||| | ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  11989091 cctccaaagttctcctatatggtaatttgcactcctagttcaa 11989133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 619 - 678
Target Start/End: Original strand, 11989171 - 11989230
Alignment:
Q  619 ttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaacgttaatccctatgt 678  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  11989171 ttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaatagaacgttaatctctatgt 11989230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 36331075 - 36330999
Alignment:
Q  272 gatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactca 348  Q
    |||||| |||||| ||| || ||||||||||| |||  ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36331075 gatttgacaagtgtacctaatctatcgaagtaataataaaatttgcatccacgaggaccgttgttaatttctactca 36330999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 527 - 641
Target Start/End: Original strand, 23993320 - 23993434
Alignment:
Q  527 ttcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctc 626  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  | || ||||||||||||| ||||| ||  ||| ||  ||||  |||  ||||||| ||    
T  23993320 ttcaatcaatgtctacctagtttaacgatatattaacaaaacagttctacccaatctcttgacctagaaccctctcctaaagttttaatcctttaatttc 23993419  T
Q  627 ttgagtgaattagaa 641  Q
    || ||||||||||||    
T  23993420 ttaagtgaattagaa 23993434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 265 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 9691125 - 9691083
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaa 307  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  9691125 tgatagaaatttggcaagtgtaccaaaaccatcgaagtagtaa 9691083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 265 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 25185741 - 25185699
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaa 307  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25185741 tgatagatatttgacaagtgtaccaaaactatcgaagtagtaa 25185699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 61
Target Start/End: Original strand, 7649606 - 7649647
Alignment:
Q  20 aaataagctaatttaacatgtgactgttctcttttaggggtg 61  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  7649606 aaataagctgatttatcatgcgactgttctcttttaggggtg 7649647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 19686517 - 19686465
Alignment:
Q  278 gcaagtgaaccaaaactatcgaagtagt-aaataaattcgtattcacgaggac 329  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  19686517 gcaagtgtactaaaactatcgaagtagtaaaataagttcgtatccacgaggac 19686465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 21)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 265 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 24783654 - 24783235
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatca 364  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||    
T  24783654 tgatagagatttgacaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaatttgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttcttttatca 24783555  T
Q  365 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatattaaa 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24783554 aaaaggatgtataaatttatattgattgtccaaggcagttgagttgttttgtaacataaacttaaataaaacaataaaagttggttttaagaatattaga 24783455  T
Q  465 gataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaaca 564  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  24783454 gagaagtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcatatggtaattttcattcctaattcaatcaatgattatctagtttaacgagagattaaca 24783355  T
Q  565 aagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaac 664  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| | |||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  24783354 aagtaattatacccaatctcttgacctagaattctctccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggagattttaacagaac 24783255  T
Q  665 gttaatccctatgtcataac 684  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24783254 gttaatccctatgtcataac 24783235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 265 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 6967393 - 6966974
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatc 363  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||    
T  6967393 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttcttt-atc 6967295  T
Q  364 aaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatattaa 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  6967294 aaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatattag 6967195  T
Q  464 agataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaac 563  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6967194 agagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgatagattaac 6967095  T
Q  564 aaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaa 663  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| | |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  6967094 aaagtaattctacccaatctcttaacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaa 6966995  T
Q  664 cgttaatccctatgtcataac 684  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6966994 cgttaatccctatgtcataac 6966974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 265 - 684
Target Start/End: Original strand, 17866353 - 17866772
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatc 363  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||    
T  17866353 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttcttt-atc 17866451  T
Q  364 aaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatattaa 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  17866452 aaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagctgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatattag 17866551  T
Q  464 agataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaac 563  Q
    ||| ||||||| || ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  17866552 agagaagtatggtttagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaac 17866651  T
Q  564 aaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaa 663  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| | |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  17866652 aaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaa 17866751  T
Q  664 cgttaatccctatgtcataac 684  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  17866752 cgttaatccctatgtcataac 17866772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 373 - 684
Target Start/End: Original strand, 17863202 - 17863513
Alignment:
Q  373 gtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatattaaagataagta 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  17863202 gtataaatttatattgattgccctaggcagttgagctgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatattagagagaagta 17863301  T
Q  473 tgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagtaatt 572  Q
    || |||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17863302 tggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaatt 17863401  T
Q  573 atacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaacgttaatcc 672  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| | |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17863402 ctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgttaatcc 17863501  T
Q  673 ctatgtcataac 684  Q
    ||||||||||||    
T  17863502 ctatgtcataac 17863513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 265 - 684
Target Start/End: Original strand, 36842937 - 36843356
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatca 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||        |||     
T  36842937 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaattatcgaagtaataaataagatcgaatccacaaggaccgttgttaatttctactcagcaatttcgtt-atcg 36843035  T
Q  365 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttg--ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatatta 462  Q
    ||| |||||||| || ||  || | ||||||||||||||||  |||  |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36843036 aaa-ggatgtattaaattcaatggtttgccctaggcagttggattggtttttataaagtaaacgtaaataaaacaataaaagttggttttatgaatatta 36843134  T
Q  463 aagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaa 562  Q
     ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  36843135 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaattcgcactcctacttcaatcaatgattatctagttcaacgacagattaa 36843234  T
Q  563 caaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacaga 662  Q
    |||| ||| | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| | ||| | |||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  36843235 caaattaactctacccaatctcttgacctagagttctccccgcaagtaacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggttttaacaga 36843334  T
Q  663 acgttaatccctatgtcataac 684  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  36843335 acgttaatccctatgtcataac 36843356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 265 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 9766046 - 9765619
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatca 364  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||| || ||  ||| |||||||||||||||||||||||         |||     
T  9766046 tgatagatatttggcaagttaaccaaaactatcgaagtaataaataagatcgaatccataagggccgttgttaatttctactcagca-ttttctttatcg 9765948  T
Q  365 aaaaggatgtat-aaatttatattgattgccctaggcagttgagttg--ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatatt 461  Q
    |||||||||||| |||||| |   | ||||||||||||||||  |||  |||| |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9765947 aaaaggatgtattaaatttct---ggttgccctaggcagttggattggtttttataaagtaaacataaataaaataataaaagttggttttaagaatatt 9765851  T
Q  462 aaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacga------- 554  Q
    | ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||           
T  9765850 agagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttcacgagtttcac 9765751  T
Q  555 --tagattaacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggagg 652  Q
       ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |   | |||||||||| |||||||| |||| | || ||||    
T  9765750 ggcagattaacaaagtaactctacccaatctcttgacctataattctccctgcaagtaaaatacccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattagagg 9765651  T
Q  653 ttttaacagaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
    |||||||| ||| ||| ||| |||||||||||    
T  9765650 ttttaacaaaacattagtccttatgtcataac 9765619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 432 - 684
Target Start/End: Original strand, 46846479 - 46846731
Alignment:
Q  432 aaaacaataaaag-ttggttttaagaatattaaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattca 530  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||| | || ||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46846479 aaaacaataaaagattggtttttagaaaattga-gagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagttcttctatggtaatttgcactcctagttca 46846577  T
Q  531 atcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttga 630  Q
    ||||||| |||| |||||| |||| ||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |    
T  46846578 atcaatgattatttagtttcacgacagattaacctaataattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaa 46846677  T
Q  631 gtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
     |||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  46846678 ctgaattcgaaaacgttggaggttttaaaagatcgttaatccctatgtcataac 46846731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 391 - 678
Target Start/End: Original strand, 23313384 - 23313673
Alignment:
Q  391 tgccctaggcagttgagttg--ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaag-ttggttttaagaatattaaagataagtatgattaagacctttg 487  Q
    ||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||| |   |||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  23313384 tgccctaggtagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagaatggtttt-agaaaattagagagaagtatggttaagacctttg 23313482  T
Q  488 aatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagtaattatacccaatctcttt 587  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| || || | | |||||||  |||| | |||||||||||||     
T  23313483 aatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactactaattcaaacaatgattatctaggttcacaacatattaacactgtaactctacccaatctcttg 23313582  T
Q  588 acctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaacgttaatccctatgt 678  Q
     |||| |||||||||||||||||  ||| | |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23313583 gcctagaattctccccgcaagtggaaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaatcgttggaggttttaacagaacgttaacccctatgt 23313673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 468 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 294907 - 294691
Alignment:
Q  468 aagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaag 567  Q
    ||||||| ||||| | || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  294907 aagtatggttaagtctttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatgcaatcaatgattatctaattcaacgacagattaacaaag 294808  T
Q  568 taattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaacgtt 667  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||  |||||| ||| | |||||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  294807 taattatacccaatctcttgaactagaattctccccataagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaactgttggatgttttaacaaaacgtt 294708  T
Q  668 aatccctatgtcataac 684  Q
    |||||||||||||||||    
T  294707 aatccctatgtcataac 294691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 364 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 11279639 - 11279319
Alignment:
Q  364 aaaaaggatgtataaa-tttatattgattgccctaggcagttgagttg-ttttgtaacataaacgtaaataaaac-aataaaagttggttttaagaatat 460  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |   ||||| ||||||  |||||||| |||| ||    
T  11279639 aaaaaggatgtataaaatttatattggt-gccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacgaataaagattggtttttagaagat 11279541  T
Q  461 taaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagatt 560  Q
    | | || ||||||| ||||| |||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||| |||||    
T  11279540 tga-gagaagtatggttaagtccttcgaatctttcgaagttctcctctggtaatttgcactcctagttcaataaatgattatttagtttcacgacagatt 11279442  T
Q  561 aacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaaca 660  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||  |||| |||||||||| ||||      
T  11279441 aacttagtaattctacccaatctcttgacctaggattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaatctgaaaccgttggaggtattaa-t 11279343  T
Q  661 gaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  11279342 gaacgttaatctctatgtcataac 11279319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 394 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 23108106 - 23107814
Alignment:
Q  394 cctaggcagttgagttgtt--ttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaag-ttggttttaagaatattaaagataagtatgattaagacctttgaat 490  Q
    ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| |   ||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||| || | || |||||||||| ||||    
T  23108106 cctagacagttgagttgatgtttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattggtttta-gaaaattagagagaaatgtggttaagaccttcgaat 23108008  T
Q  491 cctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagtaattatacccaatctctttacc 590  Q
    | | ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| || | ||||||||  ||||| | ||||||||  ||| | |    
T  23108007 catccgaagctctcctatggtaatttgcactcctagttcaaacaatgattatttagtttcacaacagattaacttagtaactctacccaattccttgagc 23107908  T
Q  591 tataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23107907 tataattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaattgtttgaggtattaaaagaacgttaatccctatgtcataac 23107814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 364 - 684
Target Start/End: Original strand, 23759706 - 23760027
Alignment:
Q  364 aaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgtttt-gtaacataaacgtaaataaaacaataaa-agttggtttt-aagaatat 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |   ||||||||||| | |||||||| ||||| ||    
T  23759706 aaaaaggatgtataaatttatattggt-gccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaat 23759804  T
Q  461 taaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaatt-caatcaatgtttatctagtttaacgatagat 559  Q
      | || ||||||| ||||| |||| ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||| |||||| ||||  |||    
T  23759805 cga-gagaagtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggat 23759903  T
Q  560 taacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaac 659  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||  ||| | |||||||| |||||    
T  23759904 taacttagtaattctacccaatctcttgccctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaaccattggaggtattaac 23760003  T
Q  660 agaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
     |||||||||||||||| |||||||    
T  23760004 -gaacgttaatccctatatcataac 23760027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 364 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 33313143 - 33312821
Alignment:
Q  364 aaaaaggatgtataaa-tttatattgattgccctaggcagttgagttg-ttttgtaacataaacgtaaataaaac-aataaaag-ttggttttaagaata 459  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||  |||||| | ||||||||| ||| |    
T  33313143 aaaaaggatgtgtaaaatttatattggt-gccctaggcagttgagttgattttgtaacataaacggaattaaaaataataaaggattggtttta-gaaaa 33313046  T
Q  460 ttaaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagat 559  Q
    |   ||| ||  ||| ||||| |||| |||||||  |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||   ||    
T  33313045 tctgagagaaaaatggttaagtccttcgaatcctctgaagctctcctatggtaatttgctttcctaattcaatcaatgattatttagtttcacgacgaat 33312946  T
Q  560 taacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaac 659  Q
    ||||  ||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||| | |||||| |||| ||  |||||| ||||     
T  33312945 taacttagtaattctacccaatcttttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaaatgaattcgaaaccggcggaggtattaaa 33312846  T
Q  660 agaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  33312845 agaacgttaatccatatgtcataac 33312821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 364 - 684
Target Start/End: Original strand, 36222406 - 36222721
Alignment:
Q  364 aaaaaggatgtataaa-tttatattgattgccctaggcagttgagttg-ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaag-ttggttttaagaatat 460  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |   |||||||  |||| |||||||| |||| ||    
T  36222406 aaaaaggatgtataaaatttatattggt-gccctaggcagttgagttgattttctaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagat 36222504  T
Q  461 taaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagatt 560  Q
    | | || ||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||| || | | |||    
T  36222505 tga-gagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaattttcactcctagttcaatcaatgattatttagtttcactacaaatt 36222603  T
Q  561 aacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaaca 660  Q
    |||  ||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||     ||||| ||| | |||||||||| |||||||| |||| ||||||| || || | |    
T  36222604 aacttagtaattttacctaatctcttgacctagaattctcc-----agtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtattta-a 36222697  T
Q  661 gaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  36222698 gaacgttaatctctatgtcataac 36222721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 391 - 611
Target Start/End: Original strand, 3862029 - 3862244
Alignment:
Q  391 tgccctaggcagttgagttg---ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaag-ttggttttaagaatattaaagataagtatgattaagaccttt 486  Q
    |||||||||||||| | |||   |||||||||||||||  |   ||||||||||||| |||||||||  || |||| ||| ||||||||||||||||||     
T  3862029 tgccctaggcagttcaattgattttttgtaacataaactgattaaaaacaataaaagattggttttataaa-attagagagaagtatgattaagaccttc 3862127  T
Q  487 gaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagtaattatacccaatctctt 586  Q
    ||||||| ||||||||| |||||        ||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3862128 gaatccttcgaagttctcctatg--------cactcctaattcaagaaatgattatctagttcaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctctt 3862219  T
Q  587 tacctataattctccccgcaagtga 611  Q
     ||||| ||||||||||||||||||    
T  3862220 gacctagaattctccccgcaagtga 3862244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 264 - 352
Target Start/End: Original strand, 17857879 - 17857968
Alignment:
Q  264 atgatagagatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaa 352  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17857879 atgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaaatagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaa 17857968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 265 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 38431757 - 38431669
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaa 352  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  || ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38431757 tgatagatatttggaaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccatgaggaccgttgttaatttctacttagcaa 38431669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 352
Target Start/End: Original strand, 3540932 - 3541011
Alignment:
Q  273 atttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaa 352  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  3540932 atttggcaagtgtaccaaaactatcaaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgtgaacttctacttagcaa 3541011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 273 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 6964643 - 6964563
Alignment:
Q  273 atttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaa 352  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  6964643 atttggtaagtgtaccaaaaactatcgaagtagtaatgaagttcgtatccacgagggccgttgttaatttctacttagcaa 6964563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 348
Target Start/End: Original strand, 28577687 - 28577761
Alignment:
Q  274 tttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactca 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | |||  |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  28577687 tttggcaagtgtaccaaaactatcgaagcaataatcaaattcatatctacgaggaccgttgttaacttctactca 28577761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 295008 - 294951
Alignment:
Q  364 aaaaaggatgta-taaatttatattgattgccctaggcagttgagttgttttgtaacataa 423  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  295008 aaaaaggatgtaataaatttatattgat-gcccgaggcagt--agttgttttgtaacataa 294951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 26)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 265 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 13496232 - 13495814
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatca 364  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||    
T  13496232 tgatagagatttgacaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttcttt-atca 13496134  T
Q  365 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatattaaa 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  13496133 aaaaggatgtataaatttatattgattgtcctaggcagttgaattgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttgattttaagaatattaga 13496034  T
Q  465 gataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaaca 564  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |    
T  13496033 gagaagtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctactttaacgacagattaaga 13495934  T
Q  565 aagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaac 664  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  13495933 aagtaattatatccaatctcttgacctagaattctacccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttagcagaac 13495834  T
Q  665 gttaatccctatgtcataac 684  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13495833 gttaatccctatgtcataac 13495814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 265 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 13493508 - 13493089
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatc 363  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||    
T  13493508 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttcttt-atc 13493410  T
Q  364 aaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatattaa 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  13493409 aaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatattag 13493310  T
Q  464 agataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaac 563  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  13493309 agagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaac 13493210  T
Q  564 aaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaa 663  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| | |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  13493209 aaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaacagaa 13493110  T
Q  664 cgttaatccctatgtcataac 684  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13493109 cgttaatccctatgtcataac 13493089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 265 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 10765165 - 10764829
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatc 363  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||    
T  10765165 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttcttt-atc 10765067  T
Q  364 aaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatattaa 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  10765066 aaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatattag 10764967  T
Q  464 agataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaac 563  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  10764966 agagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaacttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaac 10764867  T
Q  564 aaagtaattatacccaatctctttacctataattctcc 601  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10764866 aaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctcc 10764829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 265 - 684
Target Start/End: Original strand, 32505857 - 32506273
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttg----ttaatttctactcagcaannnnnnnn 360  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||| |||    |||| ||||||||  |||            
T  32505857 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataagatcgtatccacgaggaccattgcatgttaacttctactcgacaatttcttt- 32505955  T
Q  361 atcaaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatat 460  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||     |||| ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32505956 atcaaaaaggatgtataaatttatattgat-gcgtgaggcagttg-----ttttctaacataaacgaattaaaaacaataaaagttggttttaagaatat 32506049  T
Q  461 taaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagatt 560  Q
    || ||| |||| || |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  32506050 tatagagaagtgtggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagatt 32506149  T
Q  561 aacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaaca 660  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  32506150 aacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtattaaca 32506249  T
Q  661 gaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  32506250 gaacgttaatccctatgtcataac 32506273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 265 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 39546486 - 39546069
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatca 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||  |||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||        |||     
T  39546486 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaattattgaagtaataaataagatcgtat-cacgaggaccattgttaacttttactcagcaatttcatt-atcg 39546389  T
Q  365 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttg--ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatatta 462  Q
    ||| |||||||| || ||  |||| ||||||||||||||||  |||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39546388 aaa-ggatgtattaaattcaattg-ttgccctaggcagttggattggtttttgtaacgtaaacgcaaataaaacaataaaagttggttttaaaaatatta 39546291  T
Q  463 aagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaa 562  Q
     ||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  39546290 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcatatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttcacgacagattaa 39546191  T
Q  563 caaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacaga 662  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  39546190 caaagtaactctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtaacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaatcgttggaggttttaataga 39546091  T
Q  663 acgttaatccctatgtcataac 684  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  39546090 acgttaatccctatgtcataac 39546069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 391 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 34066466 - 34066171
Alignment:
Q  391 tgccctaggcagttgagttg--ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaag-ttggttttaagaatattaaagataagtatgattaagacctttg 487  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||| ||||||| |||||||||| |    
T  34066466 tgccctaggcagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattggtttta-gaaaattagagagaagtatggttaagaccttcg 34066368  T
Q  488 aatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagtaattatacccaatctcttt 587  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  34066367 aatcctccgaagttctcctatgataatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagtttaacgatagattaacaaagtaattctacccaatctcttg 34066268  T
Q  588 acctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
    ||||  ||||||| |||||||||| ||| | |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34066267 accttgaattctctccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaacagaacgttaatctctatgtcataac 34066171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 390 - 684
Target Start/End: Original strand, 27282230 - 27282526
Alignment:
Q  390 ttgccctaggcagttgagttg--ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatattaaagataagtatgattaagacctttg 487  Q
    ||||||||||||||||  |||  |||| |||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| || |    
T  27282230 ttgccctaggcagttggattggtttttataaagtaaatgtaaataaaacaattaaaattggttttatgaatattagagagaagtatggttaagactttcg 27282329  T
Q  488 aatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagtaattatacccaatctcttt 587  Q
    ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||     
T  27282330 aattctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagttcaacgaccgattaacaaagtaattctacccaatctcttg 27282429  T
Q  588 acctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27282430 acctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaatcgttggaggttttaaaagaacgttaatccctatgtcataac 27282526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 265 - 658
Target Start/End: Original strand, 16190179 - 16190575
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatca 364  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||  |||        |  |    
T  16190179 tgatggagatttgacaagtgaatcaaaactatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggactgttgttaatttttattcgacaaaaacgttaaa-a 16190277  T
Q  365 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgtt--ttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatatta 462  Q
     ||||||||||| || ||  || |  ||||||||| | |||||||| |  |||||||||||||| |   |||||||||||  ||||||||| ||| ||||    
T  16190278 taaaggatgtattaaattcaatgg--tgccctaggaaattgagttgatgtttgtaacataaacgaattaaaaacaataaagattggtttta-gaaaatta 16190374  T
Q  463 aagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaa 562  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  16190375 aagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatgataatttgcactcttaattcaagcaatgattatctagtttaacgacaaattaa 16190474  T
Q  563 caaagtaat-tatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataac----tctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggtttta 657  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||    |  |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16190475 caaaataatatatacccaatctcttgacccataattctccccacgagtgacaaccccttaattaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtttta 16190574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 459 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 15297383 - 15297171
Alignment:
Q  459 attaaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgataga 558  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  15297383 attaaagagaaatatgattaagaccttcgaatcctccgatgttcttccacggtaatttgcacccc-aattcaatcaatattcatctagtttaacgacaga 15297285  T
Q  559 ttaacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaa 658  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||| ||| ||| |||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  15297284 ttaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctctctgcaagtgacaacccttaaatctcttaagtgaatttgaaactgttggaggttttaa 15297185  T
Q  659 cagaacgttaatcc 672  Q
    |||  |||||||||    
T  15297184 cagtccgttaatcc 15297171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 445 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 1936691 - 1936454
Alignment:
Q  445 ttggttttaagaatattaaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatct 544  Q
    ||||||||| ||| |||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  1936691 ttggtttta-gaaaattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatct 1936593  T
Q  545 agtttaacgatagattaacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatc 644  Q
    || || |||| ||||||||||||||| | |||| |||||||| |  |||| |||||||||||||| | ||  | |||||||||| |||||||| |||| |    
T  1936592 agcttcacgaaagattaacaaagtaactctaccaaatctcttgatttatagttctccccgcaagtaacaatcccttaatctcttaagtgaatttgaaa-c 1936494  T
Q  645 gttggaggttttaacagaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
    ||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  1936493 gtttgaggttttaaaagaatgttattccctatgtcataac 1936454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 478 - 672
Target Start/End: Original strand, 22456705 - 22456897
Alignment:
Q  478 aagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagtaattatacc 577  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||| || |||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  22456705 aagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggaaatttgtaccccta-ttcaatcaatgttcgtctagtttaacgacagactaacaaagtaattctacc 22456803  T
Q  578 caatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaacgttaatcc 672  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||    
T  22456804 caatctcttgacctagaattctctccgcaagtgacaactc-ttaatctcttaagtgaattcgaaactgttggaggttttaacagtccgttaatcc 22456897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 471 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 21153295 - 21153082
Alignment:
Q  471 tatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagtaa 570  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||| | ||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21153295 tatggttaagaccttcgaatcctccgatgctcttaaatggtaatttgcacccccaattcaatcaatgttcatttagtttaacgacagattaacacagtaa 21153196  T
Q  571 ttatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaacgttaat 670  Q
    || ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| | |||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| ||  |||||||    
T  21153195 ttctactcaatctcttgacctagaattctctccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaatttgaaacctttggaggttttaatagtccgttaat 21153096  T
Q  671 ccctatgtcataac 684  Q
    |||||  |||||||    
T  21153095 ccctaaatcataac 21153082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 539 - 684
Target Start/End: Original strand, 23990362 - 23990507
Alignment:
Q  539 ttatctagtttaacgatagattaacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaatta 638  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||||||     
T  23990362 ttatctagttcaacgacagattaacaaagtaattctacccaatcacttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaaactcttaagtgaattc 23990461  T
Q  639 gaaatcgttggaggttttaacagaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23990462 gaaaccgttggaggttttaacagaacgttaatccctatgtcataac 23990507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 545 - 672
Target Start/End: Original strand, 22453415 - 22453542
Alignment:
Q  545 agtttaacgatagattaacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatc 644  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| | |||||||||| |||||||| ||||      
T  22453415 agtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctctccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaact 22453514  T
Q  645 gttggaggttttaacagaacgttaatcc 672  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||    
T  22453515 gttggaggttttaacagtccgttaatcc 22453542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 478 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 49147930 - 49147825
Alignment:
Q  478 aagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagtaattatacc 577  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||| || |||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  49147930 aagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggaaatttgtaccccta-ttcaatcaatgttcgtctagtttaacgacagattaacaaagtaattctacc 49147832  T
Q  578 caatctc 584  Q
    |||||||    
T  49147831 caatctc 49147825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 265 - 352
Target Start/End: Original strand, 34552438 - 34552525
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaa 352  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34552438 tgatagatatttgacaagtgtaccaaaactatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaa 34552525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 577 - 684
Target Start/End: Original strand, 22104683 - 22104788
Alignment:
Q  577 ccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaacgttaatccctat 676  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22104683 ccaatctcttgacctagaattctccccgtaagtga-cagaccttaatctcttaagtgaattcaaaatcgttggaggtattaa-agaacgttaatccctat 22104780  T
Q  677 gtcataac 684  Q
    ||||||||    
T  22104781 gtcataac 22104788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18392747 - 18392669
Alignment:
Q  275 ttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaa 352  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18392747 ttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaa 18392669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15297559 - 15297492
Alignment:
Q  278 gcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctac 345  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  15297559 gcaagtgtaccaaaactatcgaagtagtaaatgaattcatatccacggggaccgttgttaacttctac 15297492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Original strand, 48505874 - 48505937
Alignment:
Q  157 aacacaacaacaaaaagggaaaatcaatcggggtttcaattctcattctattgcatgccaattt 220  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48505874 aacacaaaaacaaaatgggaaaatcaattagggtttcaattctcattctattgcatgtcaattt 48505937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 391 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 8435357 - 8435284
Alignment:
Q  391 tgccctaggcagttgagttg--ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatatta 462  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  8435357 tgccctaggcagttgagttgatttttgtaacataaacataataaaaacaataaaagttggtttttagaaaatta 8435284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 49716735 - 49716647
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaa 352  Q
    ||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49716735 tgatagataattgacaagtgtaccaaaaactatcgaagtaataataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaa 49716647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 49720192 - 49720129
Alignment:
Q  289 aaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaa 352  Q
    ||||||||||||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49720192 aaaactatcgaagtaataataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaa 49720129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 273 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 6206237 - 6206164
Alignment:
Q  273 atttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctact 346  Q
    |||| ||||||| || |||| ||||||||||||||  || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  6206237 atttagcaagtgtactaaaattatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgagaaccgttgttaatttctact 6206164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 273 - 352
Target Start/End: Original strand, 50196723 - 50196803
Alignment:
Q  273 atttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaa 352  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||  ||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  50196723 atttggcaagtgtaccaaaaactattgaagtaataataaaatttgtatccacgaggaccgttgttaatctcaacttagcaa 50196803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 197
Target Start/End: Original strand, 48505811 - 48505851
Alignment:
Q  157 aacacaacaacaaaaagggaaaatcaatcggggtttcaatt 197  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  48505811 aacacaaaaacaaaaagggaaaatcaattagggtttcaatt 48505851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 265 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 14790864 - 14790445
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatc 363  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||    
T  14790864 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttcttt-atc 14790766  T
Q  364 aaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatattaa 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  14790765 aaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatattag 14790666  T
Q  464 agataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaac 563  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  14790665 agagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaac 14790566  T
Q  564 aaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaa 663  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| | |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  14790565 aaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaa 14790466  T
Q  664 cgttaatccctatgtcataac 684  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14790465 cgttaatccctatgtcataac 14790445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 265 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 14795892 - 14795473
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatc 363  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  || ||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||        |||    
T  14795892 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtacctacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttcttt-atc 14795794  T
Q  364 aaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatattaa 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  14795793 aaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatattag 14795694  T
Q  464 agataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaac 563  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  14795693 agagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaac 14795594  T
Q  564 aaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaa 663  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| | |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  14795593 aaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaa 14795494  T
Q  664 cgttaatccctatgtcataac 684  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14795493 cgttaatccctatgtcataac 14795473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 261 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 1838724 - 1838301
Alignment:
Q  261 ctaatgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnn 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||            
T  1838724 ctaatgatagagatttggcaagtgaaccaaaattatcgaagtaataaataaattcgtatccacaaggaccgttgttaatttctactcggcaatttcttt- 1838626  T
Q  361 atcaaaaaggatgtataaatttatattgattgc-cctaggcagttgagttg--ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaa 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||  |||  |||| |||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  1838625 atcaaaaaggatgtataaatttatattgatttttcctagacagttggattggtttttataaagtaaacgtaa-taaaagaataaaagttggttttaagaa 1838527  T
Q  458 tattaaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatag 557  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||| | |||| ||||| ||||| ||    
T  1838526 tattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatg-taattcgcactcctagttcaatcaacgattatttagttcaacgacag 1838428  T
Q  558 attaacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggtttta 657  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||| |||| | |||||| |||||    
T  1838427 attaacaaagtaactctacccaatctcttgacctagagttctccccgcaagtaacaactccttaatctcttaagtgaatttgaaaccattggagatttta 1838328  T
Q  658 acagaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1838327 acataacgttaatccctatgtcataac 1838301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 409 - 684
Target Start/End: Original strand, 32704398 - 32704673
Alignment:
Q  409 tgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatattaaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctat 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||||| ||||    
T  32704398 tgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctat 32704497  T
Q  509 ggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaag 608  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |  || ||||||||||||| |    
T  32704498 ggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaacagagtaattctacccaatctcttgaaatagaattctccccgcatg 32704597  T
Q  609 tgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
    ||| ||| | |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32704598 tgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgttaatccctatgtcataac 32704673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 266 - 684
Target Start/End: Original strand, 19664667 - 19665083
Alignment:
Q  266 gatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatcaa 365  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||        |||||    
T  19664667 gataaagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaatttgtatccacgaggaccgttgtttatttctactcaacaatttcttt-atcaa 19664765  T
Q  366 aaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgtt--ttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatattaa 463  Q
    ||||||||||| || ||  |  | ||||||||||||||||  ||| |  |||||| ||||||| |   ||||||||||||||| | |||||||| ||||     
T  19664766 aaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggtatttgtaaaataaacggattaaaaacaataaaagtttggtttaagaaaattag 19664863  T
Q  464 agataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaac 563  Q
    ||| | ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||    
T  19664864 agagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctag-ttcacgacagattaac 19664962  T
Q  564 aaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaa 663  Q
    ||||||| | |||||||| |||| ||||| | |||||||||||||| | | | | |||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||| ||||    
T  19664963 aaagtaactctacccaatatcttgacctagagttctccccgcaagtaacatccccttaatctcttaagtgaattcgaaatcattggagattttaatagaa 19665062  T
Q  664 cgttaatccctatgtcataac 684  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19665063 cgttaatccctatgtcataac 19665083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 390 - 683
Target Start/End: Original strand, 20527285 - 20527580
Alignment:
Q  390 ttgccctaggcagttgagttg--ttttgtaacataaacgtaaataaaa-caataaaagttggttttaagaatattaaagataagtatgattaagaccttt 486  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||     
T  20527285 ttgccctaggcagttgaattgatttttgtaacgtaaacataaataaaaacaataaaagttggttttaagaatattagagagaagtatggttaagaccttc 20527384  T
Q  487 gaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagtaattatacccaatctctt 586  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  20527385 gaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctaacttcacgacagattaacaaattaactttacccaatctctt 20527484  T
Q  587 tacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaacgttaatccctatgtcataa 683  Q
     ||||| |||||||||||||||| | ||| | |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20527485 gacctagaattctccccgcaagtaacaac-ccttaatctcttaagtgaatttgaaaccgttggaggttttaacagaacgttaatccctatgtcataa 20527580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 265 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 15535300 - 15534925
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatca 364  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |        || |    
T  15535300 tgatggagatttcgcatgtgaaccaaaattatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaacttctactcagccatttcttt-ataa 15535202  T
Q  365 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttg-ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatattaa 463  Q
    |||||||||||| || ||  |  | ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||   |   ||||||||||||||| | ||| | || |||||    
T  15535201 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttgagttgattttgtaaaacaaatagattaaaaacaataaaagtttggttttacaaaattaa 15535104  T
Q  464 agataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaac 563  Q
    ||  | ||||| ||||||||||  |||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  15535103 agtgatgtatggttaagaccttcaaatcctccgaagttttcctatggtaatttgcattcctaattcaatcaatgattatctagttcaacgacagattaac 15535004  T
Q  564 aaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaa 642  Q
    ||||||| | || |||||||||| ||||| | |||||||||||||| | |||   |||||||||| |||||||| ||||    
T  15535003 aaagtaactctaaccaatctcttgacctagagttctccccgcaagtaacaacctcttaatctcttaagtgaattcgaaa 15534925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 393 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 16883795 - 16883509
Alignment:
Q  393 ccctaggcagttgagttg--ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaag-ttggttttaagaatattaaagataagtatgattaagacctttgaa 489  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||| || |||    
T  16883795 ccctaggcagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattggtttta-gaaaattagagagaagtatggttaagacattcgaa 16883697  T
Q  490 tcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagtaattatacccaatctctttac 589  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||  || |||| ||||||||| | |||   ||||||||||||| ||    
T  16883696 tccttcgaagttctcctatggtaatttgcactactaattcaaacaatgattatctatgttcacgaaagattaacacaataaccctacccaatctcttgac 16883597  T
Q  590 ctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaacgttaatccctatg 677  Q
    ||| |||||||||| ||||||  ||| | ||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16883596 ctagaattctccccacaagtggcaaccccttaatctcttatgtgaattcaaaaccgttggaggttttaacagaacattaatccctatg 16883509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 364 - 684
Target Start/End: Original strand, 13017287 - 13017608
Alignment:
Q  364 aaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgtttt-gtaacataaacgtaaataaaacaataaa-agttggtttta-agaatat 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |   ||||||||||| | ||||||||  |||| ||    
T  13017287 aaaaaggatgtataaatttatattggt-gccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttcagaaaat 13017385  T
Q  461 taaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattca-atcaatgtttatctagtttaacgatagat 559  Q
    | | || ||||||| ||||| |||| ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||| |||||| ||||  |||    
T  13017386 tga-gagaagtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatatgatcaatgattatttagtttcacgacggat 13017484  T
Q  560 taacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaac 659  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||| |||| | |||||||| |||||    
T  13017485 taacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaac 13017584  T
Q  660 agaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
     |||||||||||||||| |||||||    
T  13017585 -gaacgttaatccctatatcataac 13017608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 264 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 27649347 - 27649077
Alignment:
Q  264 atgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatc 363  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||         ||    
T  27649347 atgatagagatttggcaagtgaactaaaactatcgaagtaataaataagatcgaatccacgaggaccgttgttaattcctactcagcaatttctttc-tc 27649249  T
Q  364 aaaaaggatgtat-aaatttatattgattgccctaggcagttgagttg--ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatat 460  Q
     ||| ||||| || ||||||   ||| | ||||||||||||||  |||  |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27649248 gaaa-ggatgcattaaattt---ttggtcgccctaggcagttggattggtttttataacataaacgtagatgaaacaataaaagttggttttaagaaaat 27649153  T
Q  461 taaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaat 536  Q
    || ||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27649152 tagagcgaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcacttctaattcaagcaat 27649077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 478 - 672
Target Start/End: Original strand, 12980705 - 12980898
Alignment:
Q  478 aagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagtaattatacc 577  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||  |||||| || |||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12980705 aagaccttcgaatcctccgaagttctcctatgaaaatttgtaccccta-ttcaatcaatgttcgtctagtttaacgacagattaacaaagtaattctacc 12980803  T
Q  578 caatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaacgttaatcc 672  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||   |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  12980804 caatctcttgacctagaattctctccgcaagtgacaaccgcttaatctcttaagtgaattcgaaattgttggaggttttaacagtccgttaatcc 12980898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 478 - 684
Target Start/End: Original strand, 12983592 - 12983797
Alignment:
Q  478 aagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagtaattatacc 577  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||  ||| || || |||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12983592 aagaccttcgaatcctccgaagttctcctatgaaaatctgtaccccta-ttcaatcaatgttcgtctagtttaacgacagattaacaaagtaattctacc 12983690  T
Q  578 caatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaacgttaatccctatg 677  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| |||||||||| ||| | |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||| | ||    
T  12983691 caatctcttgaccttgaattctctccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaacagtccgttaatccatgtg 12983790  T
Q  678 tcataac 684  Q
    |||||||    
T  12983791 tcataac 12983797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 265 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 22221967 - 22221550
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatc 363  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||  |  |||  ||||||| |||||        ||     
T  22221967 tgatagaaatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaa-taaattcgtttccacgaggactatatttagcttctactaagcaatttcatt-att 22221870  T
Q  364 aaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgtttt-gtaacataaacgtaaataaaa-caataaa-agttggttttaagaatat 460  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| ||| ||||| ||||||| | |||||||| |||| ||    
T  22221869 aaaaaggatgtataaattattattggt-gccctaggcagttgagttgatttagtaa--taaac-taattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaat 22221774  T
Q  461 taaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaatt-caatcaatgtttatctagtttaacgatagat 559  Q
    | | || ||| ||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||| |||| | ||||  |||    
T  22221773 tga-gagaagcatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcttaaatacaatcaatgattatttagtatcacgacggat 22221675  T
Q  560 taacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaac 659  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||  |||||||| |||| | || ||||  ||||     
T  22221674 taacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctctcaagtgaattcgaaaccattagaggaattaaa 22221575  T
Q  660 agaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
      ||||||||||| ||| |||||||    
T  22221574 caaacgttaatccatatatcataac 22221550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 265 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 22247802 - 22247385
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatc 363  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||  |  |||  ||||||| |||||        ||     
T  22247802 tgatagaaatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaa-taaattcgtttccacgaggactatatttagcttctactaagcaatttcatt-att 22247705  T
Q  364 aaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgtttt-gtaacataaacgtaaataaaa-caataaa-agttggttttaagaatat 460  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| ||| ||||| ||||||| | |||||||| |||| ||    
T  22247704 aaaaaggatgtataaattattattggt-gccctaggcagttgagttgatttagtaa--taaac-taattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaat 22247609  T
Q  461 taaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaatt-caatcaatgtttatctagtttaacgatagat 559  Q
    | | || ||| ||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||| |||| | ||||  |||    
T  22247608 tga-gagaagcatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcttaaatacaatcaatgattatttagtatcacgacggat 22247510  T
Q  560 taacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaac 659  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||  |||||||| |||| | || ||||  ||||     
T  22247509 taacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctctcaagtgaattcgaaaccattagaggaattaaa 22247410  T
Q  660 agaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
      ||||||||||| ||| |||||||    
T  22247409 caaacgttaatccatatatcataac 22247385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 471 - 684
Target Start/End: Original strand, 7769594 - 7769814
Alignment:
Q  471 tatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagtaa 570  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||    
T  7769594 tatggttaagaccttcgaatcctccgatgctcttatatggtaatttgcaccctcaattcaatcaatgttcatttagtttaacgacatattaacaaagtaa 7769693  T
Q  571 ttatacccaatctctt----tacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgag---tgaattagaaatcgttggaggttttaacagaa 663  Q
    || ||| |||||| ||    || ||||||||||| | ||||||| |||| | |||||||||| ||   |||||| |||||| ||||||||||||||||      
T  7769694 ttctactcaatcttttgacctagctataattctctctgcaagtgctaaccccttaatctcttcagtgatgaattcgaaatctttggaggttttaacagtc 7769793  T
Q  664 cgttaatccctatgtcataac 684  Q
    ||||||||||||  |||||||    
T  7769794 cgttaatccctaaatcataac 7769814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 265 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 32427544 - 32427281
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatca 364  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||        ||||    
T  32427544 tgatagatatttggtaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaatttgtatctacgaggaccgttgttaa-ttctactcagcaa-tttctttatca 32427447  T
Q  365 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttg--ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatatta 462  Q
    |||| ||||||| || ||  |  | |||||||| |||||||  |||   ||||||| ||||||| |   |||||||| |||||| | ||| |||| ||||    
T  32427446 aaaaagatgtattaaattcaa--ggttgcccta-gcagttggattggtatttgtaaaataaacgaattaaaaacaatgaaagtttggttttagaaaatta 32427350  T
Q  463 aagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaa 531  Q
     ||| | || |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32427349 gagagatgtttgattaagacctttgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaa 32427281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 376 - 610
Target Start/End: Original strand, 30978321 - 30978557
Alignment:
Q  376 taaatttatattgattgccctaggcagttgagttgtttt-gtaacataaacgtaaataaaacaataaa-agttggtttt-aagaatattaaagataagta 472  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |   ||||||||||| | |||||||| ||||| ||| | || |||||    
T  30978321 taaatttatattggt-gccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaattga-gagaagta 30978418  T
Q  473 tgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaatt-caatcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagtaat 571  Q
    || ||||| |||| ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||| |||||| ||||  |||||||  ||||||    
T  30978419 tggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaat 30978518  T
Q  572 tatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtg 610  Q
    | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30978519 tctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtg 30978557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 572 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 15538160 - 15538048
Alignment:
Q  572 tatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaacgttaatc 671  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| | ||| | |||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15538160 tatacccaatctcttgacctagagttctccccgcaagtaacaacaccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggttttaacagaacgttaatc 15538061  T
Q  672 cctatgtcataac 684  Q
    |||||||||||||    
T  15538060 cctatgtcataac 15538048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 270 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 15540809 - 15540578
Alignment:
Q  270 gagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatcaaaaag 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||   ||||| ||||||| |||||||||||||        |||||||||    
T  15540809 gagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaatttgtaaccaatcggaccattgttaacttctactcagcaa-tttctatatcaaaaag 15540711  T
Q  370 gatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttg-ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatattaaagata 468  Q
    ||||||| || ||  |  | || |||||||||||||||||| |||| ||| ||||| | |   |||||||||||||||   ||| |||| |||||||| |    
T  15540710 gatgtattaaattcaa--ggtttccctaggcagttgagttgattttctaaaataaagggattaaaaacaataaaagtttagttttagaaaattaaagaga 15540613  T
Q  469 agtatgattaagacctttgaatcctacgaagttct 503  Q
      |||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15540612 tttatggttaagaccttcgaatcctccgaagttct 15540578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 393 - 462
Target Start/End: Original strand, 11183962 - 11184033
Alignment:
Q  393 ccctaggcagttgagttg--ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatatta 462  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11183962 ccctaggcagttgagttgatttttgtaacataaacgtaataaaaacaataaaagttggtttttagaaaatta 11184033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 606 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 32427271 - 32427193
Alignment:
Q  606 aagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32427271 aagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaaccgttggaggtattaacagaatgttaatccctatgtcataac 32427193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 346
Target Start/End: Original strand, 33678939 - 33679025
Alignment:
Q  263 aatgatagagatttggcaagtgaaccaaaa---ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctact 346  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||   || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33678939 aatgataaatatttggcaagtgtaccaaaaaaactatcgaagtagtactaaagttcatatccacgaggaccgttgttaatttctact 33679025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 520 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 15540579 - 15540529
Alignment:
Q  520 ctcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagtaa 570  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15540579 ctcctaatttaatcaatgattatctagttcaacgacagattaacaaagtaa 15540529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 11411127 - 11411039
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaa 352  Q
    ||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||  || ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  11411127 tgatagataattgacaagtgtaccaaaaactatcgaagtaataataaagttcgtatccacgagtaccattgttaatttctacttagcaa 11411039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 32090777 - 32090663
Alignment:
Q  158 acacaacaacaaaaagggaaaatcaatcggggtttcaattctcattctattgcatgccaattt-------ctaattgctaattccaatttccttttatta 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||       |||||||| ||||| | || ||||||  ||    
T  32090777 acacaccaacaaaaagggaaaatcagttagggtttcaatttttgttctattgcatgtcaatttccttatcctaattgcaaattcaagttcccttttgcta 32090678  T
Q  251 taattagaacctaat 265  Q
    |||||||||||||||    
T  32090677 taattagaacctaat 32090663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 12747173 - 12747086
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaa 352  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  || ||||||| ||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  12747173 tgatagatatttgacaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacaaggactgtt-tcaatttctactcggcaa 12747086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 34502688 - 34502636
Alignment:
Q  278 gcaagtgaaccaaaactatcgaagtagt-aaataaattcgtattcacgaggac 329  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  34502688 gcaagtgtactaaaactatcgaagtagtaaaataagttcgtatccacgaggac 34502636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 16)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 273 - 684
Target Start/End: Original strand, 647211 - 647622
Alignment:
Q  273 atttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatcaaaaagga 371  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  || || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||||||||||    
T  647211 atttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagtttgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttcttt-atcaaaaagga 647309  T
Q  372 tgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatattaaagataagt 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  647310 tgtataaatttatattgattgccctaggcatttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatattagagagaagt 647409  T
Q  472 atgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagtaat 571  Q
    ||| |||||| ||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  647410 atggttaagatcttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaat 647509  T
Q  572 tatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaacgttaatc 671  Q
    | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| | |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  647510 tctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgttaatc 647609  T
Q  672 cctatgtcataac 684  Q
    |||||||||||||    
T  647610 cctatgtcataac 647622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 273 - 684
Target Start/End: Original strand, 650483 - 650894
Alignment:
Q  273 atttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatcaaaaagga 371  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  || || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||||||||||    
T  650483 atttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagtttgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctat-atcaaaaagga 650581  T
Q  372 tgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatattaaagataagt 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||    
T  650582 tgtataaatttatattgattgccctaggcatttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcataatattagagagaagt 650681  T
Q  472 atgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagtaat 571  Q
    ||| |||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  650682 atggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaat 650781  T
Q  572 tatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaacgttaatc 671  Q
    | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| | |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  650782 tctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgttaatc 650881  T
Q  672 cctatgtcataac 684  Q
    |||||||||||||    
T  650882 cctatgtcataac 650894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 265 - 684
Target Start/End: Original strand, 26062690 - 26063112
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggacc--gttgttaatttctactcagcaannnnnnnnat 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| |||        ||    
T  26062690 tgataaagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaaataataaataaattcgtatccacgaggaccccgttgttaacttctactcaacaatttcttt-at 26062788  T
Q  363 caaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgtt--ttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatat 460  Q
    |||||||||||||| || ||  |  | |||||||||| |||||  ||| |  |||||| ||||||| |   ||||||||||||||| | ||| |||| ||    
T  26062789 caaaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggtagttggattggtatttgtaaaataaacggattaaaaacaataaaagtttggttttagaaaat 26062886  T
Q  461 taaagataa--gtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgataga 558  Q
    || ||| |   ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  26062887 tagagagagatgtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagttcaacgacaga 26062986  T
Q  559 ttaacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaa 658  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| | ||| | |||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||    
T  26062987 ttaacaaagtaactctacccaatctcttgacctagagttctccccgcaagtaacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggttttaa 26063086  T
Q  659 cagaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||    
T  26063087 cagaacgtttatccatatgtcataac 26063112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 476 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 26060622 - 26060414
Alignment:
Q  476 ttaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagtaattata 575  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||    
T  26060622 ttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagcttcccgatagattaacaaagtaactcta 26060523  T
Q  576 cccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaacgttaatcccta 675  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | | ||| | ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26060522 cccaatctcttgacctagaattctccctgcaaataacaaccccttaatgtcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaatagaacgttaatcccta 26060423  T
Q  676 tgtcataac 684  Q
    |||||||||    
T  26060422 tgtcataac 26060414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 265 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 12172218 - 12171809
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatc 363  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||  |||| | ||||||||| ||  |||| ||||||| |||||        ||     
T  12172218 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaaaaagatcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcatt-att 12172120  T
Q  364 aaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgtttt-gtaacataaacgtaaataaaacaataaa-agttggttttaagaatatt 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |   ||||||||||| | |||||||  ||||        
T  12172119 aaaaaggatgtataaatttatattggt-gccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagatttggtttctagaa---- 12172025  T
Q  462 aaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaatt-caatcaatgtttatctagtttaacgatagatt 560  Q
            ||||| ||||| |||| ||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||  ||||    
T  12172024 --------gtatggttaagtccttggaatcttccgaagctcgcctatggtaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggatt 12171933  T
Q  561 aacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaaca 660  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||||      
T  12171932 aacttagtaattctacccaatctcttgacctacaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaac 12171833  T
Q  661 gaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  12171832 gaacgttaatccctatatcataac 12171809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 265 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 2542128 - 2541711
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatc 363  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||| ||||||| |||||        ||     
T  2542128 tgatagatatttggcaagtgtaccaaagtcaatcgaagtaataaataa-ttcgtatccacgaggactgtatttaacttctactgagcaatttcatt-att 2542031  T
Q  364 aaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgttt--tgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagtt-ggttttaagaatat 460  Q
    ||||||||||||| || ||  || |  |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |   ||||||||||||  | ||||||  ||| ||    
T  2542030 aaaaaggatgtattaaattcaatgg--tgccctaggcagttgagtttattcttgtaacataaacggattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaat 2541933  T
Q  461 taaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagatt 560  Q
    ||||||   ||||| |||||||||| |||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  2541932 taaagag--gtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcttatggtaatttgtactcctatttcaagcaatgattatctagttaaacgacagatt 2541835  T
Q  561 aacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaaca 660  Q
    |||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||| | || || | | ||  | |||||||||| | ||||||  ||| | ||| |||||||||||    
T  2541834 aacaaagtaattttatccaatctcttgacctaaaattcttctcggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcaaaaccattgaaggttttaaca 2541735  T
Q  661 gaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
    |  ||||||||||||| |||||||    
T  2541734 gtccgttaatccctatatcataac 2541711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15851539 - 15851450
Alignment:
Q  263 aatgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaa 352  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15851539 aatgataaagatttggcaagtgtaccaaaactatcgaagtaatagtaaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaa 15851450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 19929242 - 19929155
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaa-aactatcgaagtagtaaataaat-tcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaa 352  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19929242 tgatagatatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaa-taaatatcgt-tccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaa 19929155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 280 - 348
Target Start/End: Original strand, 21217350 - 21217418
Alignment:
Q  280 aagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactca 348  Q
    ||||| || ||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21217350 aagtgtactaaaactatcaaagtaataataaaattcgtattcacgaggaccgttattaatttctactca 21217418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 352
Target Start/End: Original strand, 33400075 - 33400163
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaa 352  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||  || ||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  33400075 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaggtagtaataaagttcgtatccacgagaaccgttgttaatttctgcttagcaa 33400163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 391 - 453
Target Start/End: Original strand, 11649329 - 11649393
Alignment:
Q  391 tgccctaggcagttgagttg--ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggtttta 453  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  11649329 tgccctaggcagttgagttgacttttgtaatataaacgaaataaaaacaataaaagttggtttta 11649393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 52629036 - 52628956
Alignment:
Q  140 aaattcacacatgtaagaacacaacaacaaaaagggaaaatcaatcggggtttcaattctcattctattgcatgccaatttc 221  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   || ||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  52629036 aaatccacacatgtaacaacacaataacaaaaagggaaaatcaactaggttttcaatcctcattc-attgcatgtcaatttc 52628956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 528
Target Start/End: Original strand, 11649444 - 11649496
Alignment:
Q  476 ttaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaatt 528  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  11649444 ttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcataatt 11649496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31979341 - 31979285
Alignment:
Q  157 aacacaacaacaaaaagggaaaatcaatcggggtttcaattctcattctattgcatg 213  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  31979341 aacacaacaacaaaaaggttaaatcaattagggtttcaattatcattctattgcatg 31979285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 31980692 - 31980626
Alignment:
Q  64 tttcattaaaatctaattttctcacactaatcacaatactcgttaatctcacttaaagattttaagc 130  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||| |||| |||| ||||    
T  31980692 tttcattaaaacctaattttctcatactaatcacaatacacattgatctcacataaatatttcaagc 31980626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 391 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 26060732 - 26060668
Alignment:
Q  391 tgccctaggcagttgagttg--ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggtttta 453  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||||||    
T  26060732 tgccctaggcaggtgagttgatttttgtaatataaatgaaataaaaacaataaaagttggtttta 26060668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 17)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 265 - 684
Target Start/End: Original strand, 23673345 - 23673763
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatca 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||        ||||    
T  23673345 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcaacaatttcttt-atca 23673443  T
Q  365 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgt--tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatatta 462  Q
    |||||||||||| || ||  |  | ||||||||||||||||  |||   ||||||| ||||||| |   ||||||||||||||| | ||| |||| ||||    
T  23673444 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 23673541  T
Q  463 aagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaa 562  Q
     ||| | ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  23673542 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagtttaacgacaaattaa 23673641  T
Q  563 caaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacaga 662  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| | |||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  23673642 caaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaacagttggaggttttaacaga 23673741  T
Q  663 acgttaatccctatgtcataac 684  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23673742 acgttaatccctatgtcataac 23673763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 264 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 36327172 - 36326751
Alignment:
Q  264 atgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatc 363  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||        |||    
T  36327172 atgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaacttctactctgcaatttcttt-atc 36327074  T
Q  364 aaaaaggatgtat-aaatttatattgattgccctaggcagtt-gagttgt-tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatat 460  Q
    ||||| ||||||| ||||| | | |   ||||||||| |||| || | || ||||||| ||||||| |   ||||||||||||||| | ||| |||| ||    
T  36327073 aaaaaagatgtattaaattcaaagt---tgccctaggaagttagattggtatttgtaaaataaacggattaaaaacaataaaagtttggttttagaaaat 36326977  T
Q  461 taaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagatt 560  Q
    || ||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  36326976 tagagagatgtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcatatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctaatttaacgatagatt 36326877  T
Q  561 aacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaatta----gaaatcgttggaggtttt 656  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||||  ||||||||| ||    
T  36326876 aacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccctgcaagtgacaactccttaatctcttaagtgaattaatttgaaactgttggaggtatt 36326777  T
Q  657 aacagaacgttaatccctatgtcata 682  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  36326776 aacagaacgttaatccctgtgtcata 36326751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 263 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 16295145 - 16294726
Alignment:
Q  263 aatgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnat 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||        ||    
T  16295145 aatgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataagatcaaatccacgaggaccgttgttaatttctactcagcaatttcgtt-at 16295047  T
Q  363 caaaaaggatgtataaa-tttatattgattgccctaggcagttgagttg-ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaag-ttggttttaagaata 459  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |   |||||||  |||| || ||||| |||| |    
T  16295046 cgaaa-ggatgtataaaatttatattgat-gccctaggcagttgagttgattttgtatcataaaccgattaaaaacaaataaagattagttttcagaaaa 16294949  T
Q  460 ttaaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagat 559  Q
    || | || ||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  16294948 ttga-gagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctagtttaatcaatgattatttagtttcacgacagat 16294850  T
Q  560 taacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaac 659  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||     
T  16294849 taacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtattaa- 16294751  T
Q  660 agaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16294750 agaacgttaatccctatgtcataac 16294726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 265 - 684
Target Start/End: Original strand, 32575685 - 32576105
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatca 364  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |        || |    
T  32575685 tgatagatatttggcaagtgaaccaacactattgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaacttctactcaacgatttcgtt-ataa 32575783  T
Q  365 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgttttg-taacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatattaa 463  Q
     ||| ||||||| || ||  |||| || |||||||||||||  |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32575784 taaatgatgtattaaattcaattg-ttaccctaggcagttggattgtttttataaagtaaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatattag 32575882  T
Q  464 agata--agtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagatta 561  Q
    ||| |  |||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||  |||| |||| |||||| |||| ||||||    
T  32575883 agaaagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagctctcctatgataatttgcactcctagttcaaaaaatgattatttagtttcacgacagatta 32575982  T
Q  562 acaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacag 661  Q
    ||  ||||| | |||| |||| ||| ||||| |||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| ||    
T  32575983 acttagtaactctaccaaatcccttgacctagaattctccccacaagtgacaaccccttaatctcttgactgaattcgaaattgttggaggtattaaaag 32576082  T
Q  662 aacgttaatccctatgtcataac 684  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  32576083 aacgttaatccctatgtcgtaac 32576105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 364 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 13710218 - 13709897
Alignment:
Q  364 aaaaaggatgtataaa-tttatattgattgccctaggcagttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaag-ttggttttaagaatatt 461  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||| ||||||||||  |||||||||||||| |   ||||||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  13710218 aaaaaggatgtataaaatttatattgat-gcctgaggaagttgagttgagttgtaacataaacggattaaaaacaataaaagattggtttta-gaaaatt 13710121  T
Q  462 aaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaa-gttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagatt 560  Q
      ||| ||||||| ||||||||||  |||| |  ||| | ||| ||||| |||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||| | |||||    
T  13710120 tgagagaagtatggttaagaccttcaaatcatctgaaagctctcctatgataatttgcactcctaatttaggcaatgattatctagttcaacaacagatt 13710021  T
Q  561 aacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaaca 660  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||| |  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13710020 aacaaagtaattctacccgatctcttgacccataattctcccctcaagtgacaaccccataatctctttagtgaattcgaaatcgttggaggttttaaca 13709921  T
Q  661 gaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  13709920 aaacgttaatccctatgtcataac 13709897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 364 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 31626698 - 31626376
Alignment:
Q  364 aaaaaggatgtataaa-tttatattgattgccctaggcagttgagttg-ttttgtaacataaacgtaaataaaac-aataaaag-ttggttttaagaata 459  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||  |||||| | ||||||||| ||| |    
T  31626698 aaaaaggatgtgtaaaatttatattggt-gccctaggcagttgagttgattttgtaacataaaaggaattaaaaataataaaggattggtttta-gaaaa 31626601  T
Q  460 ttaaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagat 559  Q
    |   ||| ||| ||| ||||| | || ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||| ||||    
T  31626600 tctgagagaagaatggttaagtcattcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaattattatttagtttcacgacagat 31626501  T
Q  560 taacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaac 659  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  31626500 taacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccctgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaatcgttggaggtattaaa 31626401  T
Q  660 agaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||    
T  31626400 agaacgttaatccttatgttataac 31626376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 265 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 31528635 - 31528216
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatc 363  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||| || | ||||||||| ||  |||| ||||||| |||||        ||     
T  31528635 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaa-aaatttgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcatt-att 31528538  T
Q  364 aaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgtttt-gtaacataaacgtaaataaaacaataaa-agttggtttt-aagaatat 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |   ||||||||||| | |||||||| ||||| ||    
T  31528537 aaaaaggatgtataaatttatattggt-gccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaat 31528439  T
Q  461 taaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaatt-caatcaatgtttatctagtttaacgatagat 559  Q
    | | || ||||||| ||||| |||| |||||||   ||| ||| || ||||||||||||||||||| | | ||||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  31528438 tga-gagaagtatggttaagtccttcgaatcctctaaagctctcctgtggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacagat 31528340  T
Q  560 taacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaac 659  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||| |||| |  ||||||| |||||    
T  31528339 taacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccaatggaggtattaac 31528240  T
Q  660 agaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
     |||||||||||||||| |||||||    
T  31528239 -gaacgttaatccctatatcataac 31528216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 364 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 40018126 - 40017807
Alignment:
Q  364 aaaaaggatgtataaa-tttatattgattgccctaggcagttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatatta 462  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   |||||||||| ||   | |||||||| | |     
T  40018126 aaaaaggatgtataaaatttatattgat-gccctaggcagttgagttgatttgtaacataaacggattaaaaacaataagagactggtttaagaaaaatt 40018028  T
Q  463 aagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatct---agtttaacgatagat 559  Q
     ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |   ||||| |||| ||||    
T  40018027 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactctcctatggtaatttgcactcctaattcaaccaatgattatttataagttttacgacagat 40017928  T
Q  560 taacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaac 659  Q
    ||||  |||| || | |||||||  || ||||| |||||||||||||||||| ||| | ||| |||||| |||||||| ||||  ||||||||| ||||     
T  40017927 taactcagtacttctccccaatcctttgacctagaattctccccgcaagtgacaac-ccttattctcttaagtgaattcgaaactgttggaggtattaaa 40017829  T
Q  660 agaacgttaatccctatgtcat 681  Q
    ||||||||||| | ||||||||    
T  40017828 agaacgttaattcatatgtcat 40017807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 352
Target Start/End: Original strand, 24384925 - 24385014
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaa--taaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaa 352  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||    
T  24384925 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaactatcgaagtaataaaattaaattcgtattcacgatgactgttattaatttctacttagcaa 24385014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 29436088 - 29436025
Alignment:
Q  289 aaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaa 352  Q
    ||||||||||||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29436088 aaaactatcgaagtaataataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaa 29436025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 340
Target Start/End: Original strand, 38315809 - 38315876
Alignment:
Q  273 atttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatt 340  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38315809 atttggtaagtgtatcaaaactatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatt 38315876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 40927966 - 40927916
Alignment:
Q  157 aacacaacaacaaaaagggaaaatcaatcggggtttcaattctcattctat 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  40927966 aacacaaaaacaaaaagggaaaatcaattagggtttcaattctcattctat 40927916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 213
Target Start/End: Original strand, 27409395 - 27409451
Alignment:
Q  157 aacacaacaacaaaaagggaaaatcaatcggggtttcaattctcattctattgcatg 213  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27409395 aacacaacaacaaaaaggttaaatcaattagggtttcaattatcattctattgcatg 27409451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 329
Target Start/End: Original strand, 1503204 - 1503256
Alignment:
Q  278 gcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaa-taaattcgtattcacgaggac 329  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  1503204 gcaagtgtactaaaactatcgaagtaataaaataaattcgtatccacgaggac 1503256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 329
Target Start/End: Original strand, 1506408 - 1506460
Alignment:
Q  278 gcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaa-taaattcgtattcacgaggac 329  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  1506408 gcaagtgtactaaaactatcgaagtaataaaataaattcgtatccacgaggac 1506460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 476 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 8427259 - 8427144
Alignment:
Q  476 ttaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagtaattata 575  Q
    ||||||| || ||||| | ||| |||||| | ||||||||||||| |||  |||||||||||| | ||||||||||| | ||||||| ||| |  || ||    
T  8427259 ttaagacattcgaatcatccgatgttcttatttggtaatttgcacccctg-ttcaatcaatgtctttctagtttaacaacagattaataaaatggttcta 8427161  T
Q  576 cccaatctctttaccta 592  Q
    | ||||||||| |||||    
T  8427160 ctcaatctcttgaccta 8427144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 341
Target Start/End: Original strand, 13572070 - 13572118
Alignment:
Q  293 ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaattt 341  Q
    |||||||||||||||  || |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13572070 ctatcgaagtagtaataaagttcgtatctacgaggaccgttgttaattt 13572118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 165; Significance: 7e-88; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 265 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 13979730 - 13979313
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatca 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||        |||     
T  13979730 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaaatcgaatccacgaggactgctgttaatttctactcagcaatttcttt-atcg 13979632  T
Q  365 aaaaggatgtataaatttatat-tgattgccctaggcagttgagttgttttg--taacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatatt 461  Q
    ||| |||||||| ||   |||| || |||||| |||||||||  ||| |||   |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13979631 aaa-ggatgtattaa---atatctggttgcccaaggcagttggattggttttaataaagtaaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatatt 13979536  T
Q  462 aaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagatta 561  Q
    | ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||| |||||| | || ||||||    
T  13979535 agagagaagtatggttaagacctttgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactccaagttcaaacaatgattatttagtttcatgacagatta 13979436  T
Q  562 acaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacag 661  Q
    ||  ||||| | || |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||   |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||| ||    
T  13979435 acttagtaactctatccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaacctcttaatctcttaagtgaattcgaaatcgttcgaggtattaaaag 13979336  T
Q  662 aacgttaatccctatgtcataac 684  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  13979335 aacgttaatccctatgtcataac 13979313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 364 - 684
Target Start/End: Original strand, 39563607 - 39563929
Alignment:
Q  364 aaaaaggatgtataaa-tttatattgattgccctaggcagttgagttg-ttttgtaacataaacgtaaataaaacaa-taaaag-ttggttttaagaata 459  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||  | |||||| ||||||||| ||| |    
T  39563607 aaaaaggatgtgtaaaatttatatt-agtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaacaaaattaaaaatagtaaaagattggtttta-gaaaa 39563704  T
Q  460 ttaaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagat 559  Q
    |   ||| ||| ||| ||||| |||| ||||||| ||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  39563705 tctgagagaagaatggttaagtccttcgaatcctccgacgctctcctatgataatttgcactcctaattcaatcaatggttatttagtttcacgacagat 39563804  T
Q  560 taacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaac 659  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||     
T  39563805 taacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtattaaa 39563904  T
Q  660 agaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  39563905 agaacgttaatccctatgtcataac 39563929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 265 - 684
Target Start/End: Original strand, 22626312 - 22626730
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatc 363  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||| |||| || ||||| | ||||||||| ||  |||| ||||||| |||||        ||     
T  22626312 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaa-aagttcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcatt-att 22626409  T
Q  364 aaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgtttt-gtaacataaacgtaaataaaacaataaa-agttggttttaagaatatt 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |   ||||||||||| | |||| |||| ||| |||    
T  22626410 aaaaaggatgtataaatttatattggt-gccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggattta-gaaaatt 22626507  T
Q  462 aaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaatt-caatcaatgtttatctagtttaacgatagatt 560  Q
     | || ||||||| ||||| |||| ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||| |||||| ||||  ||||    
T  22626508 ga-gagaagtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggatt 22626606  T
Q  561 aacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaaca 660  Q
    |||  ||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||||      
T  22626607 aacttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaac 22626706  T
Q  661 gaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  22626707 gaacgttaatccctatatcataac 22626730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 265 - 684
Target Start/End: Original strand, 11138570 - 11138988
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatc 363  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||| |||| || ||||| | ||||||||| ||  |||| ||||||| |||||        ||     
T  11138570 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaa-aagttcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcatt-att 11138667  T
Q  364 aaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgtttt-gtaacataaacgtaaataaaacaataaa-agttggttttaagaatatt 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |   ||||||||| | | |||| || | ||| |||    
T  11138668 aaaaaggatgtataaatttatattggt-gccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaatatagaattggattca-gaaaatt 11138765  T
Q  462 aaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaatt-caatcaatgtttatctagtttaacgatagatt 560  Q
     | || ||||||| ||||| |||| ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||| |||||| ||||  ||||    
T  11138766 ga-gagaagtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggatt 11138864  T
Q  561 aacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaaca 660  Q
    |||  ||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||| | | |||||| ||||      
T  11138865 aacttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaactccttaatctcttaagtgaattcgaaaccataggaggtattaaac 11138964  T
Q  661 gaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  11138965 gaacgttaatccctatatcataac 11138988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 476 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 46731529 - 46731396
Alignment:
Q  476 ttaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagtaattata 575  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| | ||    
T  46731529 ttaagaccttcgaatcctccgaagttctcatatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagttcaacgacatattaacaaagtaactcta 46731430  T
Q  576 cccaatctctttacctataattctccccgcaagt 609  Q
    ||||||||||| ||||  | ||||||||||||||    
T  46731429 cccaatctcttgacctggagttctccccgcaagt 46731396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 176 - 265
Target Start/End: Original strand, 35091823 - 35091912
Alignment:
Q  176 aaaatcaatcggggtttcaattctcattctattgcatgccaatttctaattgctaattccaatttccttttattataattagaacctaat 265  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  35091823 aaaatcaattagggtttcagttctcattctattgcatgtcaatttctaattgctaattccagttcccttttattataattagaacctaat 35091912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Original strand, 35091672 - 35091783
Alignment:
Q  64 tttcattaaaatctaattttctcacactaatcacaatactcgttaatctcacttaaagattttaagc-tagttgatcaaattcacacatgtaagaacaca 162  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| || ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35091672 tttcattaaaacttaattttctcatactaatcacaatacccattaatctaacataaagtttttgagcctaattgatcaaattcacacatgtaagaacaca 35091771  T
Q  163 acaacaaaaagg 174  Q
    ||||||||||||    
T  35091772 acaacaaaaagg 35091783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 46731699 - 46731612
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaa 352  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46731699 tgatagagatttggcaagtgaacaaaaactatcgaagtaatgaataaatttgtatccacgaggaccgttgttaacttctactcagcaa 46731612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 471 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 47412222 - 47412082
Alignment:
Q  471 tatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagtaa 570  Q
    |||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||   |||    
T  47412222 tatgattaagacctttgaatcctctaatgttcttctacggtaatttgcacccacaattcaatcaatgttcatctaatttaacaacagattaacacgataa 47412123  T
Q  571 ttatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtga 611  Q
    || ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  47412122 ttctactcaatctcttgacctagaattctctccgcaagtga 47412082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 499 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 35366387 - 35366215
Alignment:
Q  499 gttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagtaattatacccaatctctttacctataattc 598  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||  ||||| ||| ||||||||| ||||| || ||    
T  35366387 gttcttctacggtaatttgcacccc-aattcaatcaatgttcatataatttaacgacaaattaacaagataattctactcaatctcttgacctagaactc 35366289  T
Q  599 tccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaacgttaatcc 672  Q
    || |||| ||||| ||  | |||||||||| ||||||||  | |   ||||||||||||||||  |||||||||    
T  35366288 tctccgcgagtgacaatcccttaatctcttaagtgaattcaagactcttggaggttttaacagtccgttaatcc 35366215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 264 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 27055237 - 27055149
Alignment:
Q  264 atgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaa 352  Q
    |||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27055237 atgataaatatttggcaagcataccaaaactatcgaagtagtaataaatttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaa 27055149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 265 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 19869343 - 19869255
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaa 352  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||| ||||| |||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19869343 tgatagatatttggcaagtgtactaaaatctatcaaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaa 19869255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 348
Target Start/End: Original strand, 26822039 - 26822122
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactca 348  Q
    |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  26822039 tgatagacttttggaaagtgtaccaaaactatcgaagtaataataaaattcgtatccacaaggaccgctgttaatttttactca 26822122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 50096902 - 50096829
Alignment:
Q  391 tgccctaggcagttgagttg--ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatatta 462  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  50096902 tgccctaagcagttgagttgatttttgtaacataaacgtaataaaaacagtaaaagttggtttttagaaaatta 50096829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 25492263 - 25492175
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaa 352  Q
    ||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  25492263 tgatagataattgacaagtgtaccaaaagctatcaaaatagtaataaagttcgtatccacgaggatcgttgttaatttctacttagcaa 25492175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 391 - 451
Target Start/End: Original strand, 20536459 - 20536520
Alignment:
Q  391 tgccctaggcagttgagttg--ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttt 451  Q
    ||||||||||||||| ||||  || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20536459 tgccctaggcagttgggttgacttgtgtaacacaaacgtaa-taaaacaataaaagttggttt 20536520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 265 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 3306213 - 3306147
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaa-aactatcgaagtagtaaa-taaattcgtattcacgaggac 329  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||    
T  3306213 tgatagatatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtaataaattaagttcgtatccacgaggac 3306147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 265 - 329
Target Start/End: Original strand, 30157797 - 30157863
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaa-aactatcgaagtagtaaa-taaattcgtattcacgaggac 329  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||    
T  30157797 tgatagaaatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtaataaattaagttcgtatccacgaggac 30157863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 259 - 308
Target Start/End: Original strand, 32366877 - 32366927
Alignment:
Q  259 acctaatgatagagatttggcaagtgaaccaaa-actatcgaagtagtaaa 308  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  32366877 acctaatgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaa 32366927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 307
Target Start/End: Original strand, 4225619 - 4225659
Alignment:
Q  267 atagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaa 307  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  4225619 atagatatttggcaagtgtaccaatactatcgaagtagtaa 4225659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 18883561 - 18883509
Alignment:
Q  278 gcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaa-taaattcgtattcacgaggac 329  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18883561 gcaagtgtactaaaactatcaaagtagtaaaataagttcgtattcacgaggac 18883509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 130; Significance: 5e-67; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 273 - 684
Target Start/End: Original strand, 12575308 - 12575718
Alignment:
Q  273 atttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatcaaaaagga 371  Q
    |||||||||||| ||||||  | ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||        || ||||||||    
T  12575308 atttggcaagtgtaccaaattcaatcgaagtaataaataa-ttcgtatccacgaggactgttgttaacttctactcaacaagttcatt-attaaaaagga 12575405  T
Q  372 tgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttg--ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaag-ttggttttaagaatattaaagata 468  Q
    ||||| || ||  || |  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   |   ||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||| |    
T  12575406 tgtattaaattcaatgg--tgccctaggcagttgagttgatttttgtaacataaattgattaaaaacaataaaagattggtttt-agaaaattagagaga 12575502  T
Q  469 agtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagt 568  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  12575503 agtatggttaagaccattgaatcctccgaagttttcttatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgataatctagtttaacgacagattaacaaagt 12575602  T
Q  569 aattatacccaatctctt-tacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaacgtt 667  Q
    |||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||| | ||| | |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||    
T  12575603 aattctacctaatctcttaaacctagaattctccccgcaagtaacaac-ccttaatctcttaagtgaattagaaaccattggaggttttaacaatacgtt 12575701  T
Q  668 aatccctatgtcataac 684  Q
    ||||| ||| |||||||    
T  12575702 aatccttatatcataac 12575718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 432 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 13097099 - 13096849
Alignment:
Q  432 aaaacaataaaag-ttggttttaagaatattaaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattca 530  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||| |||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |    
T  13097099 aaaacaataaaagattagtttta-gaaaattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttatcctatg-taatttgcactcctaattta 13097002  T
Q  531 atcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttga 630  Q
    | ||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| | ||||| |||| |    
T  13097001 agcaatgattatctagttcaatgaaagattaacaaagtaattctacccaatctcttggcctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatgtcttaa 13096902  T
Q  631 gtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaacgttaatccctatgtcataa 683  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13096901 gtgaatttgaaaccgtgggaggttttaacagaacgtaaatccctatgtcataa 13096849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 265 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 14418707 - 14418445
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatca 364  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| | | ||| |||||        ||||    
T  14418707 tgatagatttttggcaagtgaaccaaagctatcgaagtagtaaataa-ttcgt-tccacgaggaccgttgttaactacaacttagcaatttcttt-atca 14418611  T
Q  365 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatattaaa 464  Q
    |||||||| | | || ||  || | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14418610 aaaaggatatgttaaattcaatgg-ttgccctaggcagttgagttggtttttaacataaacaaattaaaaacaataaaagttggttttaagaatattaga 14418512  T
Q  465 gataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaa 531  Q
    || ||||||| ||||||| || ||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14418511 gagaagtatggttaagacattcgaatcctccgaatttctcctatgataatttgcactcctaattcaa 14418445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 391 - 637
Target Start/End: Original strand, 41778866 - 41779113
Alignment:
Q  391 tgccctaggcagttgagttg--ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatattaaagataagtatgattaagacctttga 488  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |   ||||||||||||| | | |||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||  |    
T  41778866 tgccctaggcagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattgattta-gaagattaaagagaagtatggttaagaccttcaa 41778964  T
Q  489 atcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagtaattatacccaatctcttta 588  Q
    ||| | ||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||| | ||| | ||||||||||||| |    
T  41778965 atcttccgaagttctcctatgctaatttgcactagtaattcaaacaatgattatctaggttcacgacagattaacacaataactctacccaatctcttga 41779064  T
Q  589 cctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaatt 637  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| | ||||| |||| ||||||||    
T  41779065 cctagaattctccccgcaagtggcaaccccttaatatcttaagtgaatt 41779113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 471 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 44008335 - 44008128
Alignment:
Q  471 tatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagtaa 570  Q
    |||| ||| |||||| ||||||| ||||| ||  || ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||     ||||    
T  44008335 tatggttatgaccttcgaatcctccgaagctcgcctttggtaatctgcactcctagttcaaacaatgattatttagtttcacgatagatta-----gtaa 44008241  T
Q  571 ttatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaacgttaat 670  Q
     | |||| |||| ||  ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  44008240 ctctaccaaatccctcgacctagaattctccc-gcaagtgacaactccttaatctcataagtgaatttgaaatcgttggaggtattaaaagaacgttaat 44008142  T
Q  671 ccctatgtcataac 684  Q
    |||| |||| ||||    
T  44008141 ccctgtgtcgtaac 44008128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 352
Target Start/End: Original strand, 39659712 - 39659799
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaa 352  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  39659712 tgatagatatttggcaagtgtaccgaaactatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccattgttaatttctacttagcaa 39659799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 265 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 9467429 - 9467341
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaa 352  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  9467429 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttcttcttagcaa 9467341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 453951 - 453863
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaa 352  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  453951 tgatagatatttgacaagtgtaccaaaaactatggaagtactaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaa 453863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 391 - 453
Target Start/End: Original strand, 41836318 - 41836382
Alignment:
Q  391 tgccctaggcagttgagttg--ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggtttta 453  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  41836318 tgccctaggcagttgagttgacttttgtaatataaacgaaataaaaacaataaaagttggtttta 41836382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 528
Target Start/End: Original strand, 41836433 - 41836485
Alignment:
Q  476 ttaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaatt 528  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  41836433 ttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcataatt 41836485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 13332429 - 13332365
Alignment:
Q  288 caaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaa 352  Q
    ||||||||||||||||||||  || || |||| || |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  13332429 caaaactatcgaagtagtaataaagtttgtatccatgaggaccgttgttaatttatacttagcaa 13332365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 274 - 308
Target Start/End: Original strand, 22173710 - 22173744
Alignment:
Q  274 tttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaa 308  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22173710 tttggcaagtgtaccaaaactatcgaagtagtaaa 22173744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 364 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 10010 - 9689
Alignment:
Q  364 aaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgtttt-gtaacataaacgtaaataaaacaataaa-agttggttttaagaatatt 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |   ||||||||||| | |||||||| |||| |||    
T  10010 aaaaaggatgtataaatttatattggtc-ccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaataattggtttttagaaaatt 9912  T
Q  462 aaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaatt-caatcaatgtttatctagtttaacgatagatt 560  Q
     | || ||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||  ||||    
T  9911 ga-gagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggatt 9813  T
Q  561 aacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaaca 660  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||||      
T  9812 aacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaac 9713  T
Q  661 gaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  9712 gaacgttaatccctatatcataac 9689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 454 - 684
Target Start/End: Original strand, 5999 - 6229
Alignment:
Q  454 agaatattaaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacg 553  Q
    |||| |||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| || |||    
T  5999 agaaaattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaggttctcctatggtaatttgcactactaattcaaacaatgattatctaggttcacg 6098  T
Q  554 atagattaacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggt 653  Q
    | ||||||||| | ||| | ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||  ||| | |||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||    
T  6099 acagattaacacaataactctacccaatctcttgatctagaattctccccgcaagtggcaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaatcattggaggt 6198  T
Q  654 tttaacagaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6199 tttaacagaacgttaaaccctatgtcataac 6229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 476 - 683
Target Start/End: Original strand, 2814 - 3021
Alignment:
Q  476 ttaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagtaattata 575  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||   ||||||| ||    
T  2814 ttaagacctttgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatatagtttcacgaaagattaaggtagtaattcta 2913  T
Q  576 cccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaacgttaatcccta 675  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||  |||   |||||||| |||| ||||||||||||| |     
T  2914 ccaaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaactattggaggtattaaaagaacgttaatccttg 3013  T
Q  676 tgtcataa 683  Q
    ||||||||    
T  3014 tgtcataa 3021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 352
Target Start/End: Original strand, 2619 - 2706
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaa 352  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2619 tgatggagatttggcaagtggaccaaaactatcgaagtaataaataagatcgtatccacgaggaccgttgttaacttctactcagcaa 2706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 505 - 684
Target Start/End: Original strand, 7232 - 7411
Alignment:
Q  505 ctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccg 604  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||  ||||||| ||  ||||||||| || || |||||||||||    
T  7232 ctatggtaatttgtactcctaattcaatcaatgattatttagtttcacgacagattaacttagtaattctattcaatctcttgacttagaattctccccg 7331  T
Q  605 caagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
    ||||||| ||| | |||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7332 caagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtattaaaagaacgttaatccctatgtcataac 7411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 265 - 684
Target Start/End: Original strand, 24185 - 24602
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatc 363  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| || | ||||||||| ||  |||| ||||||||| |||        ||     
T  24185 tgatagaaatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaa-taaatttgtttccacgaggactgtatttaacttctactcaacaatttcatt-att 24282  T
Q  364 aaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgtttt-gtaacataaacgtaaataaaacaataaa-agttggttttaagaatatt 461  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||  |   ||||||||||| | |||||||| |||| |||    
T  24283 aaaaaggatgtataaattattattggt-gccctaggcagttgagttgatttagtaa--taaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt 24379  T
Q  462 aaagataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaatt-caatcaatgtttatctagtttaacgatagatt 560  Q
     | || ||| ||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||| |||| | ||||  ||||    
T  24380 ga-gagaagcatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacaataaatgattatttagtatcacgacggatt 24478  T
Q  561 aacaaagtaattatacccaatctctttacctataattctccccgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaaca 660  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||| |||| | |||||||  ||||      
T  24479 aacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttatgtgaattcgaaaccattggaggaattaaat 24578  T
Q  661 gaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  24579 aaacgttaatccctatatcataac 24602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 90; Significance: 4e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 265 - 531
Target Start/End: Original strand, 11 - 273
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaannnnnnnnatca 364  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| | | ||| |||||        ||||    
T  11 tgatagatttttggcaagtgaaccaaagctatcgaagtagtaaataa-ttcgt-tccacgaggaccgttgttaactacaacttagcaatttcttt-atca 107  T
Q  365 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatattaaa 464  Q
    |||||||| | | || ||  || | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  108 aaaaggatatgttaaattcaatgg-ttgccctaggcagttgagttggtttttaacataaacaaattaaaaacaataaaagttggttttaagaatattaga 206  T
Q  465 gataagtatgattaagacctttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaa 531  Q
    || ||||||| ||||||| || ||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  207 gagaagtatggttaagacattcgaatcctccgaatttctcctatgataatttgcactcctaattcaa 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 505 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 2699 - 2518
Alignment:
Q  505 ctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgtttatctagtttaacgatagattaacaaagtaat--tatacccaatctctttacctataattctccc 602  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||  ||||||  | ||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  2699 ctatggtaacttgcactcctaattcaatcaatgattatttagtttcacgacagattaacttagtaatattctactcaatctcttgacctagaattctccc 2600  T
Q  603 cgcaagtgataactctttaatctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
    ||||||||| ||| | | |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  2599 cgcaagtgacaacccctaaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtattaaaagaacgttgatccctatgtcataac 2518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 265 - 352
Target Start/End: Original strand, 33730 - 33817
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaa 352  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33730 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaactatcgaagtagtaataaagtttgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaa 33817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 273 - 352
Target Start/End: Original strand, 19517 - 19596
Alignment:
Q  273 atttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaa 352  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19517 atttggcaagtgtaccaaaactgtcaaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaa 19596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0665 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0665
Description:

Target: scaffold0665; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 622 - 684
Target Start/End: Original strand, 1 - 63
Alignment:
Q  622 atctcttgagtgaattagaaatcgttggaggttttaacagaacgttaatccctatgtcataac 684  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1 atctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgttaatccctatgtcataac 63  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0766 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0766
Description:

Target: scaffold0766; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 3739 - 3664
Alignment:
Q  274 tttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcagcaa 352  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||   ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3739 tttggcaagtgtaccaattctatcgaagtaataaa---atttgtatccacgaggaccgttgttaacttctactcagcaa 3664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 19636 - 19593
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaa 308  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19636 tgatagatttttggcaagtgtaccaaaactatcgaagtagtaaa 19593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 29715 - 29672
Alignment:
Q  265 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaa 308  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29715 tgatagatttttggcaagtgtaccaaaactatcgaagtagtaaa 29672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 274 - 308
Target Start/End: Original strand, 14094 - 14128
Alignment:
Q  274 tttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtagtaaa 308  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14094 tttggcaagtgtaccaaaactatcgaagtagtaaa 14128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University