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Alignment Overview

Query: NF5658-Insertion-3 (Length: 1020)

Name: NF5658-Insertion-3
Description: NF5658
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5658-Insertion-3
NF5658-Insertion-3
[»] chr3 (35 HSPs)
chr3 (6-298)||(48636291-48636583)
chr3 (723-1019)||(746422-746718)
chr3 (723-1019)||(10621832-10622127)
chr3 (723-1019)||(25533107-25533401)
chr3 (361-593)||(48635996-48636228)
chr3 (723-1019)||(457950-458247)
chr3 (723-1019)||(455573-455870)
chr3 (725-1019)||(42989954-42990249)
chr3 (723-996)||(53915810-53916082)
chr3 (723-1019)||(41848804-41849109)
chr3 (723-1019)||(4104189-4104483)
chr3 (723-1015)||(42991953-42992245)
chr3 (723-996)||(51943042-51943314)
chr3 (723-996)||(53917978-53918250)
chr3 (723-996)||(1313082-1313353)
chr3 (722-925)||(27636011-27636213)
chr3 (723-797)||(6561613-6561687)
chr3 (733-806)||(53974124-53974197)
chr3 (733-806)||(11072644-11072717)
chr3 (755-806)||(54287576-54287627)
chr3 (733-806)||(11066255-11066329)
chr3 (806-889)||(11066346-11066429)
chr3 (673-711)||(55337-55375)
chr3 (673-711)||(18745380-18745418)
chr3 (808-850)||(53974035-53974077)
chr3 (803-852)||(5535880-5535929)
chr3 (673-722)||(48635868-48635916)
chr3 (675-711)||(18744622-18744658)
chr3 (723-763)||(27000083-27000123)
chr3 (954-998)||(28761740-28761784)
chr3 (806-878)||(54287487-54287559)
chr3 (803-873)||(11072731-11072801)
chr3 (974-1019)||(12268256-12268302)
chr3 (673-711)||(53344017-53344055)
chr3 (803-852)||(12019220-12019269)
[»] chr7 (54 HSPs)
chr7 (722-1019)||(11756924-11757221)
chr7 (723-1019)||(20299155-20299451)
chr7 (723-1019)||(3035415-3035714)
chr7 (722-1019)||(28485260-28485559)
chr7 (723-1019)||(38395986-38396283)
chr7 (723-1019)||(38393683-38393979)
chr7 (723-1019)||(28487249-28487546)
chr7 (723-1019)||(7349571-7349867)
chr7 (723-1019)||(7351950-7352246)
chr7 (723-1018)||(18345237-18345533)
chr7 (723-1019)||(31156203-31156500)
chr7 (723-1004)||(1606171-1606452)
chr7 (723-1019)||(7472276-7472574)
chr7 (723-1019)||(20625734-20626031)
chr7 (723-1019)||(20629625-20629922)
chr7 (723-1019)||(20642044-20642341)
chr7 (723-996)||(1849665-1849938)
chr7 (723-1019)||(7092471-7092768)
chr7 (723-993)||(21470614-21470883)
chr7 (722-924)||(47865327-47865528)
chr7 (723-1019)||(7094718-7095015)
chr7 (723-1019)||(7470318-7470621)
chr7 (723-996)||(37412444-37412716)
chr7 (722-1019)||(42331291-42331594)
chr7 (723-996)||(21989853-21990124)
chr7 (731-925)||(24258166-24258358)
chr7 (803-1019)||(43253816-43254035)
chr7 (723-871)||(443326-443474)
chr7 (792-996)||(13099792-13099996)
chr7 (723-925)||(3676997-3677179)
chr7 (827-1019)||(20297163-20297355)
chr7 (726-850)||(40281863-40281989)
chr7 (733-806)||(10690684-10690756)
chr7 (733-786)||(20297108-20297161)
chr7 (940-998)||(443511-443570)
chr7 (748-806)||(12310542-12310600)
chr7 (731-777)||(43254023-43254069)
chr7 (803-852)||(12484974-12485023)
chr7 (803-852)||(12506405-12506454)
chr7 (803-852)||(12657598-12657647)
chr7 (975-1019)||(48457601-48457646)
chr7 (770-801)||(6628853-6628884)
chr7 (770-801)||(12657667-12657698)
chr7 (673-711)||(2403451-2403489)
chr7 (803-889)||(12310442-12310528)
chr7 (770-800)||(12485044-12485074)
chr7 (770-800)||(12506475-12506505)
chr7 (974-1019)||(18567564-18567610)
chr7 (974-1019)||(22392424-22392470)
chr7 (974-1019)||(27306521-27306567)
chr7 (673-711)||(30581276-30581314)
chr7 (974-1019)||(31435339-31435385)
chr7 (673-711)||(42818563-42818601)
chr7 (940-1019)||(3677196-3677277)
[»] chr4 (35 HSPs)
chr4 (723-1019)||(22132691-22132987)
chr4 (723-1019)||(22134922-22135219)
chr4 (723-1019)||(24347959-24348255)
chr4 (723-1019)||(14787725-14788021)
chr4 (723-1019)||(5100743-5101038)
chr4 (723-996)||(44600154-44600428)
chr4 (723-1019)||(17662530-17662826)
chr4 (723-1019)||(56030189-56030485)
chr4 (739-925)||(30136331-30136516)
chr4 (723-873)||(47211158-47211308)
chr4 (723-889)||(10112626-10112787)
chr4 (723-925)||(38890517-38890701)
chr4 (723-889)||(9022060-9022225)
chr4 (723-841)||(9863499-9863617)
chr4 (852-1019)||(53404999-53405168)
chr4 (725-824)||(19322410-19322510)
chr4 (940-1019)||(47211038-47211119)
chr4 (723-794)||(14789500-14789571)
chr4 (830-925)||(19322547-19322641)
chr4 (940-1019)||(18709463-18709544)
chr4 (733-806)||(38209186-38209259)
chr4 (739-801)||(5516771-5516833)
chr4 (803-889)||(54929094-54929180)
chr4 (803-882)||(10979676-10979755)
chr4 (737-806)||(29609914-29609983)
chr4 (757-804)||(54929198-54929245)
chr4 (954-1019)||(18537763-18537829)
chr4 (974-1019)||(47274722-47274768)
chr4 (803-842)||(14647175-14647214)
chr4 (976-1014)||(37089671-37089710)
chr4 (974-1019)||(619739-619785)
chr4 (808-850)||(5516705-5516747)
chr4 (974-1019)||(22801154-22801200)
chr4 (974-1019)||(22803026-22803072)
chr4 (974-1019)||(48486314-48486360)
[»] chr1 (44 HSPs)
chr1 (723-1017)||(31735821-31736115)
chr1 (723-1019)||(9463544-9463840)
chr1 (723-1019)||(47905956-47906251)
chr1 (723-1019)||(9459717-9460013)
chr1 (723-1019)||(24325347-24325643)
chr1 (722-1019)||(27339428-27339731)
chr1 (723-1019)||(27337236-27337532)
chr1 (722-1019)||(39931761-39932058)
chr1 (723-1019)||(15295142-15295439)
chr1 (722-922)||(48664851-48665050)
chr1 (750-1019)||(21948485-21948756)
chr1 (723-1019)||(28998547-28998844)
chr1 (723-1019)||(29004263-29004560)
chr1 (723-996)||(17324954-17325227)
chr1 (723-922)||(2949617-2949815)
chr1 (723-908)||(6115532-6115718)
chr1 (723-909)||(4131696-4131882)
chr1 (723-909)||(45693838-45694024)
chr1 (723-909)||(6997214-6997393)
chr1 (723-838)||(46432521-46432636)
chr1 (722-876)||(16561130-16561284)
chr1 (761-922)||(6996067-6996221)
chr1 (835-1019)||(46432022-46432207)
chr1 (845-1019)||(2510622-2510801)
chr1 (733-889)||(13785662-13785835)
chr1 (803-889)||(11693580-11693666)
chr1 (733-804)||(32260746-32260817)
chr1 (865-925)||(6115479-6115538)
chr1 (865-922)||(26520516-26520572)
chr1 (806-889)||(14352759-14352842)
chr1 (760-806)||(10115509-10115555)
chr1 (940-996)||(48665077-48665134)
chr1 (790-842)||(13112047-13112099)
chr1 (803-850)||(32260833-32260880)
chr1 (733-800)||(11693686-11693753)
chr1 (974-1019)||(28207360-28207406)
chr1 (960-996)||(6996018-6996054)
chr1 (960-995)||(2949550-2949585)
chr1 (723-762)||(6997388-6997427)
chr1 (770-801)||(16855265-16855296)
chr1 (974-1019)||(38925772-38925818)
chr1 (974-1019)||(41646861-41646907)
chr1 (974-1019)||(47451589-47451635)
chr1 (678-711)||(2260858-2260891)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (723-1019)||(15808962-15809258)
chr8 (721-1019)||(28283517-28283815)
chr8 (723-1019)||(3873750-3874049)
chr8 (723-1019)||(43529871-43530167)
chr8 (723-996)||(41384493-41384764)
chr8 (722-925)||(608469-608671)
chr8 (724-996)||(41382420-41382692)
chr8 (723-881)||(32339094-32339252)
chr8 (723-840)||(3265635-3265752)
chr8 (874-1019)||(181434-181580)
chr8 (940-1019)||(32339267-32339348)
chr8 (940-1019)||(24873479-24873560)
chr8 (733-804)||(13986304-13986374)
chr8 (733-804)||(30679186-30679256)
chr8 (954-1019)||(14419483-14419549)
chr8 (803-889)||(11701364-11701447)
chr8 (673-711)||(202577-202615)
chr8 (673-711)||(317414-317452)
chr8 (954-1019)||(13858776-13858842)
chr8 (974-1019)||(15072707-15072753)
chr8 (673-711)||(19220913-19220951)
chr8 (673-711)||(40599887-40599925)
chr8 (775-804)||(27820149-27820178)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (722-1011)||(25803706-25803995)
chr5 (723-1019)||(27912219-27912517)
chr5 (723-1019)||(18468698-18468994)
chr5 (723-1019)||(27910135-27910432)
chr5 (723-1019)||(15551925-15552222)
chr5 (722-1004)||(3373348-3373631)
chr5 (743-1019)||(10586549-10586826)
chr5 (725-1019)||(18511506-18511800)
chr5 (726-1019)||(18509611-18509904)
chr5 (723-1019)||(26097421-26097720)
chr5 (723-996)||(26098567-26098841)
chr5 (723-906)||(21288529-21288713)
chr5 (723-996)||(18596326-18596610)
chr5 (803-1019)||(18466453-18466667)
chr5 (730-875)||(17415748-17415893)
chr5 (723-827)||(6661929-6662033)
chr5 (723-802)||(40221282-40221361)
chr5 (803-889)||(15143262-15143348)
chr5 (723-777)||(18466411-18466465)
chr5 (733-806)||(5779144-5779217)
chr5 (723-777)||(15143220-15143274)
chr5 (865-925)||(40221349-40221408)
chr5 (940-994)||(41586024-41586079)
chr5 (976-1019)||(21684753-21684797)
chr5 (673-711)||(33087476-33087514)
chr5 (976-1019)||(31466270-31466314)
chr5 (770-804)||(2532750-2532784)
chr5 (974-1019)||(2818628-2818674)
chr5 (958-1019)||(6661474-6661535)
chr5 (974-1019)||(12556215-12556261)
chr5 (974-1019)||(20507754-20507800)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (720-1019)||(23452533-23452832)
chr2 (723-1019)||(35215888-35216184)
chr2 (723-1019)||(35218269-35218565)
chr2 (723-1005)||(42452449-42452732)
chr2 (723-925)||(42923893-42924094)
chr2 (723-925)||(27583713-27583907)
chr2 (733-889)||(28568584-28568740)
chr2 (723-850)||(27136370-27136505)
chr2 (730-818)||(34575608-34575696)
chr2 (733-889)||(15693583-15693755)
chr2 (733-798)||(28568346-28568411)
chr2 (733-806)||(41303549-41303623)
chr2 (804-889)||(7502638-7502723)
chr2 (760-801)||(39286911-39286952)
chr2 (803-874)||(39286971-39287042)
chr2 (960-996)||(42923827-42923863)
chr2 (803-881)||(41303457-41303535)
chr2 (736-787)||(7502582-7502633)
chr2 (803-882)||(41304806-41304884)
chr2 (974-1019)||(6259107-6259153)
chr2 (978-1019)||(6264437-6264479)
chr2 (673-711)||(20606931-20606969)
chr2 (974-1019)||(21520987-21521033)
chr2 (974-1019)||(40032350-40032396)
chr2 (733-806)||(41304898-41304964)
chr2 (674-711)||(44297424-44297461)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (722-1019)||(30966922-30967219)
chr6 (723-1004)||(12195822-12196104)
chr6 (723-1015)||(30034903-30035196)
chr6 (722-1019)||(2629182-2629480)
chr6 (723-925)||(5275727-5275928)
chr6 (723-996)||(26932886-26933158)
chr6 (723-996)||(18317751-18318024)
chr6 (723-925)||(19704964-19705165)
chr6 (725-921)||(17011781-17011973)
chr6 (731-998)||(17852275-17852542)
chr6 (723-886)||(22858373-22858536)
chr6 (725-889)||(20526548-20526708)
chr6 (748-889)||(30445246-30445404)
chr6 (733-806)||(30443022-30443097)
chr6 (953-1019)||(15532973-15533040)
chr6 (976-1019)||(4816537-4816581)
chr6 (953-1019)||(15541432-15541499)
chr6 (954-1019)||(15346347-15346413)
chr6 (954-1005)||(15366992-15367044)
chr6 (954-1005)||(3234037-3234088)
chr6 (957-1019)||(3390338-3390401)
chr6 (974-1019)||(1072169-1072215)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (723-1019)||(51709-52005)
scaffold0005 (723-794)||(50159-50230)
scaffold0005 (803-842)||(170076-170115)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
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[»] scaffold0031 (1 HSPs)
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[»] scaffold0511 (1 HSPs)
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[»] scaffold0468 (2 HSPs)
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[»] scaffold0133 (1 HSPs)
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[»] scaffold1674 (1 HSPs)
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[»] scaffold0068 (1 HSPs)
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[»] scaffold0339 (1 HSPs)
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[»] scaffold0008 (1 HSPs)
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[»] scaffold0533 (1 HSPs)
scaffold0533 (760-801)||(2232-2273)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 35)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 6 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 48636583 - 48636291
Alignment:
Q  6 catagaggacaatcgacagaactaccaaactcatcgcacaaattcacctccaaatcaaaagcattttttctggacgcaactaacctagactctaatgaat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48636583 catagaggacaatcgacagaactaccaaactcatcgcacaaattcacctccaaatcaaaagcattttttctggacgcaactaacctagactctaatgaat 48636484  T
Q  106 tactgaaataatcgcgtttgttactctttttcagctccgaaacaggagaagaacagacggtggaatcagagtctaacgtggaaggaacgaaatccaagct 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48636483 tactgaaataatcgcgtttgttactctttttcagctccgaaacaggagaagagaagacggtggaatcagagtctaacgtggaaggaacgaaatccaagct 48636384  T
Q  206 gctgttaccgatatcgtaaccttcgaaagggggaatgttctctttgccagggaacggtgtcgttttgttggttttgggtttcttggatggtcg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48636383 gctgttaccgatatcgtaaccttcgaaagggggaatgttctctttgccagggaacgatgtcgttttgttggttttgggtttcttggatggtcg 48636291  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Original strand, 746422 - 746718
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746422 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 746521  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  746522 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 746620  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||         | || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  746621 gagaaaaaaaaacgta-tcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 746718  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 10622127 - 10621832
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  10622127 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaagatatatttatgg 10622028  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10622027 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 10621929  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||         | || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10621928 gag-aaaaaaaacgta-tcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 10621832  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Original strand, 25533107 - 25533401
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25533107 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttttgctgaaaatatatttatgg 25533206  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25533207 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 25533305  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgttc-aaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||         | || |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25533306 gag--aaaaaaacgta-tcttcagtgtgatatttgttctaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 25533401  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 361 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 48636228 - 48635996
Alignment:
Q  361 gaacttcgaaatcatcgttgtcgttgttgtcgaactgagtgtgatctgaatcggccattgttgttggggtcggttgttctgtgagatcttgaagaagaag 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48636228 gaacttcgaaatcatcgttgtcgttgttgtcgaactgagtgtgatctgaatcggccattgttgttggggtcggttgttctgtgagatcttgaagaagaag 48636129  T
Q  461 ataatgatataataataacgcctttttcnnnnnnnnnntggtgggaaagtgaaattttgattctcttttgaatctccccctctatctcaatctgaatttg 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48636128 ataatgatataataataacgcctttttcaaaaaaaaaatggtgggaaagtgaaattttgattctcttttgaatctccccctctatctcaatctgaatttg 48636029  T
Q  561 ctacgggcctacagcgaatattggttcaataaa 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48636028 ctacgggcctacagcgaatattggttcaataaa 48635996  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Original strand, 457950 - 458247
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  457950 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggggaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttgtgg 458049  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  458050 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 458148  T
Q  923 gag-nnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||          | || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  458149 gagaaaaaaaaaacgta-tcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgaga 458247  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Original strand, 455573 - 455870
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  455573 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggggaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttgtgg 455672  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  455673 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 455771  T
Q  923 gag-nnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||          | || ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  455772 gagaaaaaaaaaacgta-tcttcagtgcggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgaga 455870  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 725 - 1019
Target Start/End: Original strand, 42989954 - 42990249
Alignment:
Q  725 ttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 824  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  42989954 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaaaatttgtttcaaatatattttttgctgaaagtatatttatggac 42990053  T
Q  825 aataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaagga 924  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42990054 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaagga 42990152  T
Q  925 gnnnnnnnnncatat-tcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |          || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  42990153 gaaaaaaaaa-atgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatgctaaactttgaga 42990249  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 723 - 996
Target Start/End: Complemental strand, 53916082 - 53915810
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53916082 tgttgtagtatgactcaaaatttgagggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 53915983  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53915982 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 53915884  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatatagac 996  Q
    |||         | || |||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53915883 gagaaaaaaaaacgta-tcttgagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagac 53915810  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Original strand, 41848804 - 41849109
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41848804 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 41848903  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||     
T  41848904 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaaggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttaactgaaa 41849002  T
Q  923 gagnnnnnnnnncata--------ttcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatatagac-ttgtatcaggctaaac 1012  Q
    |||          | |         |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41849003 gagaaaaaaaaaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagacattgtatcaggctaaac 41849102  T
Q  1013 tttgaga 1019  Q
    |||||||    
T  41849103 tttgaga 41849109  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 4104483 - 4104189
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  4104483 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatactttatgctgaaaatatatttatgg 4104384  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  4104383 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaata-ttctttcactgaag 4104285  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||          | |    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4104284 gagaaaaaaa---aaacgtatcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 4104189  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 723 - 1015
Target Start/End: Original strand, 42991953 - 42992245
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42991953 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgttaaaaatataaaaggtttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 42992052  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42992053 acaataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 42992151  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaacttt 1015  Q
    |||         | || |||||||| |  ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  42992152 gagaaaaaaaaacgta-tcttcagtgtaatattaattccaaatttatgagttatacttttactataaatatataccttgtatcatgctaaacttt 42992245  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 723 - 996
Target Start/End: Original strand, 51943042 - 51943314
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51943042 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 51943141  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  51943142 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgtaaata-ttctttcattgaag 51943240  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatatagac 996  Q
    |||         | || |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51943241 gagaaagaaaaacgta-tcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgatttatacttttactataaatatagac 51943314  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 723 - 996
Target Start/End: Complemental strand, 53918250 - 53917978
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  53918250 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaacatatatttatgg 53918151  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  53918150 acaataaatatatttttttaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcattgaag 53918052  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttg-ttcaaatttatgagttatacttttactataaatatagac 996  Q
    |||         | || |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53918051 gagaaaaaaaaacgta-tcttcagtgtggtattcgtttcaaatttatgagttatacttttactataaatatagac 53917978  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 723 - 996
Target Start/End: Original strand, 1313082 - 1313353
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1313082 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaatgatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatgg 1313181  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1313182 acaataaatatatttctgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 1313280  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatatagac 996  Q
    |||          |   |||| ||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1313281 gagaaaaaaaa--agtatctttagtgtgatattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagac 1313353  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 722 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 27636213 - 27636011
Alignment:
Q  722 ctgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 821  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27636213 ctgttgtagtatgatttaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaatattagtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 27636114  T
Q  822 gacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaa 921  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27636113 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaa 27636015  T
Q  922 ggag 925  Q
    ||||    
T  27636014 ggag 27636011  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 723 - 797
Target Start/End: Original strand, 6561613 - 6561687
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatata 797  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6561613 tgttgtagtatgactcgaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatata 6561687  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 733 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 53974197 - 53974124
Alignment:
Q  733 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 806  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53974197 tgactcaaaatttgatggatgaagaatgttgttgttaaaaatataaaagatttgtttcaattatattttgtgct 53974124  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 733 - 806
Target Start/End: Original strand, 11072644 - 11072717
Alignment:
Q  733 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 806  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  11072644 tgactcaaaatttgatggatgaagaagattgttgcaaaaaatataaatgatttgtttcaaatatatcttgtgct 11072717  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 755 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 54287627 - 54287576
Alignment:
Q  755 agaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 806  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54287627 agaagattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatttcgtgct 54287576  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 733 - 806
Target Start/End: Original strand, 11066255 - 11066329
Alignment:
Q  733 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgct-aaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 806  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  11066255 tgactcataatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaaagataaatgatttgtttcaaatatatcttgtgct 11066329  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 806 - 889
Target Start/End: Original strand, 11066346 - 11066429
Alignment:
Q  806 tgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatatt 889  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||| | |  |||| || |||||||||||| |||| |||||||    
T  11066346 tgaaaatacatttatggacaataaatatatttttttaccatatgaaggaatatttgatgcaaatatatttttaaagagaatatt 11066429  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 673 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 55375 - 55337
Alignment:
Q  673 ggtgaattctaggatgagggttcaatcaagtccctcacc 711  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55375 ggtgaattctaggatgagggttcaattaagtccctcacc 55337  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 673 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 18745418 - 18745380
Alignment:
Q  673 ggtgaattctaggatgagggttcaatcaagtccctcacc 711  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18745418 ggtgaattctagggtgagggttcaatcaagtccctcacc 18745380  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 808 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 53974077 - 53974035
Alignment:
Q  808 aaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatga 850  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53974077 aaaatatatttatagacaataaatatatttttgtaccgtatga 53974035  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 803 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 5535929 - 5535880
Alignment:
Q  803 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatg 852  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||    
T  5535929 tgctgaaaatatatttatggacagaaaagatatatttgtatcgtatgatg 5535880  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 673 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 48635916 - 48635868
Alignment:
Q  673 ggtgaattctaggatgagggttcaatcaagtccctcacctgaatttgacc 722  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48635916 ggtgaattctagggtgagggt-caatcaaatccctcacctgaatttgacc 48635868  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 675 - 711
Target Start/End: Original strand, 18744622 - 18744658
Alignment:
Q  675 tgaattctaggatgagggttcaatcaagtccctcacc 711  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18744622 tgaattctaggatgagggtttaatcaagtccctcacc 18744658  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 723 - 763
Target Start/End: Original strand, 27000083 - 27000123
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattg 763  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27000083 tgttgtagtatgactgaaaatttgatggatggagaatattg 27000123  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 954 - 998
Target Start/End: Complemental strand, 28761784 - 28761740
Alignment:
Q  954 tttgttcaaatttatgagttatacttttactataaatatagactt 998  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28761784 tttgttccaatttatgagggatacttttactataaatatagactt 28761740  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 806 - 878
Target Start/End: Complemental strand, 54287559 - 54287487
Alignment:
Q  806 tgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttga 878  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| | |  |||| || ||||||||||||||    
T  54287559 tgaaaatatatttatggataataaatacatttttgtactgtatgaaggaatatttgatgcaaatatattttga 54287487  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 803 - 873
Target Start/End: Original strand, 11072731 - 11072801
Alignment:
Q  803 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatat 873  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | | | ||||| || |||||||||    
T  11072731 tgctgaaaatacatttatggacaacaaatagatttttgtaccgtattacggaagatttgatgcaaatatat 11072801  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 974 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 12268302 - 12268256
Alignment:
Q  974 atacttttactataaatatag-acttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  12268302 atacttttactataaatatagaacttgtatcagagtaaactttgaga 12268256  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 673 - 711
Target Start/End: Original strand, 53344017 - 53344055
Alignment:
Q  673 ggtgaattctaggatgagggttcaatcaagtccctcacc 711  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53344017 ggtggattctaggatgagggatcaatcaagtccctcacc 53344055  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 803 - 852
Target Start/End: Original strand, 12019220 - 12019269
Alignment:
Q  803 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatg 852  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  12019220 tgctaaaattatatttatggacatcaaatatattttagtatcgtatgatg 12019269  T

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Target: chr7 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 54)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 722 - 1019
Target Start/End: Original strand, 11756924 - 11757221
Alignment:
Q  722 ctgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 821  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11756924 ctgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 11757023  T
Q  822 gacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaa 921  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11757024 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaactatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaa 11757122  T
Q  922 ggagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    ||||         | || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11757123 ggagaaaaaaaaacgta-tcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 11757221  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Original strand, 20299155 - 20299451
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299155 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttatttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 20299254  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20299255 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 20299353  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||         | || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20299354 gagaaaaaaaaacgta-tcttcagtgtggtatttgttccatatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 20299451  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Original strand, 3035415 - 3035714
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035415 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 3035514  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3035515 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 3035613  T
Q  923 gag---nnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttga 1017  Q
    |||            | || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3035614 gagaaagaaaaaaaacgta-tcttcagtatggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttga 3035712  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 722 - 1019
Target Start/End: Original strand, 28485260 - 28485559
Alignment:
Q  722 ctgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 821  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485260 ctgttgtagtatgattcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 28485359  T
Q  822 gacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaa 921  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  28485360 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcaccgaa 28485458  T
Q  922 ggagnnnnnnnnncatat-tcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgag 1018  Q
    ||||         ||  | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28485459 ggaggaaaaaaaacacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgag 28485558  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Original strand, 38395986 - 38396283
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38395986 tgttgtagtatgactccaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgt 38396085  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38396086 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 38396184  T
Q  923 gag-nnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||          | || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  38396185 gagaaaaaaaaaacgta-tcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaattttgaga 38396283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Original strand, 38393683 - 38393979
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38393683 tgttgtagtatgattctaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatatataagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatttatttatgg 38393782  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38393783 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatgttatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 38393881  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    | |         | || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38393882 gtgaaaaaataacgta-tcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 38393979  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Original strand, 28487249 - 28487546
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
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T  28487249 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgcttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 28487348  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28487349 acaataaatataattttgtatcgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 28487447  T
Q  923 gag-nnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgttc-aaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||          | || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28487448 gagaaaaaaaaaacgta-tcttcagtgtggtatttgttctaaatttatgagttatacttttcctataaatatagaccatgtatcaggctaaactttgaga 28487546  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 7349867 - 7349571
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
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T  7349867 tgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatgg 7349768  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||     
T  7349767 acaataaatatatttttgtatcgcatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgaggcaaata-ttctttcactgaat 7349669  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||         | || |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7349668 gagaaaaaaaaacgta-tcttcagtgtgatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 7349571  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 7352246 - 7351950
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
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T  7352246 tgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatgg 7352147  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||     
T  7352146 acaataaatatatttttgtatcgcatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgaggcaaata-ttctttcactgaat 7352048  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||         | || |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  7352047 gagaaaaaaaaacgta-tcttcagtgtgatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatataaaccttgtatcaggctaaactttgaga 7351950  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 723 - 1018
Target Start/End: Original strand, 18345237 - 18345533
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
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T  18345237 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctaaaaatatatttattg 18345336  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18345337 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaatggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 18345435  T
Q  923 gag-nnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgag 1018  Q
    |||          | || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18345436 gagaaaaaaaaaacgta-tcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctgaactttgag 18345533  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 31156500 - 31156203
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31156500 tgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatgg 31156401  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31156400 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 31156302  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||            | |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||    
T  31156301 gagaaaaaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagctatacttttactataaatatagagcttgtatcaaggcaaactttgaga 31156203  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 723 - 1004
Target Start/End: Original strand, 1606171 - 1606452
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1606171 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatgg 1606270  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1606271 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 1606369  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatca 1004  Q
    |||         |  | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1606370 gagaaaaaaaaac-gaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatca 1606452  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 7472574 - 7472276
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472574 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 7472475  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7472474 acaataaatatattattgtatcatatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcattgaag 7472376  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatat-tcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||          |  | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  7472375 gagaaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgaga 7472276  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Original strand, 20625734 - 20626031
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20625734 tgttctagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 20625833  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20625834 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattt-tttcactgaag 20625932  T
Q  923 gag-nnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||          | || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  20625933 gagcaaaaaaaaacgta-tcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgaga 20626031  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Original strand, 20629625 - 20629922
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629625 tgttctagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 20629724  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20629725 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattt-tttcactgaag 20629823  T
Q  923 gag-nnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||          | || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  20629824 gagcaaaaaaaaacgta-tcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgaga 20629922  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Original strand, 20642044 - 20642341
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642044 tgttctagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 20642143  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20642144 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattt-tttcactgaag 20642242  T
Q  923 gag-nnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||          | || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  20642243 gagcaaaaaaaaacgta-tcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgaga 20642341  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 723 - 996
Target Start/End: Original strand, 1849665 - 1849938
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1849665 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 1849764  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1849765 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcagata-ttctttcactgaag 1849863  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatatagac 996  Q
    |||            | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1849864 gagaaaaaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagac 1849938  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 7092768 - 7092471
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7092768 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaagatatatttatgg 7092669  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7092668 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 7092570  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||              |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||    
T  7092569 gaggaaaaaaaattgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgaga 7092471  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 177; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 723 - 993
Target Start/End: Complemental strand, 21470883 - 21470614
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21470883 tgttgtagtttgactccaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 21470784  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21470783 acaataaatatatttttatatcgtatgaagaacgatttgatgcgaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 21470685  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatata 993  Q
    |||         | || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21470684 gagaaaaaaaaacgta-tcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatata 21470614  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 722 - 924
Target Start/End: Original strand, 47865327 - 47865528
Alignment:
Q  722 ctgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 821  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47865327 ctgttgtagtatgactccaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 47865426  T
Q  822 gacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaa 921  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47865427 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaa 47865525  T
Q  922 gga 924  Q
    |||    
T  47865526 gga 47865528  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 7095015 - 7094718
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7095015 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 7094916  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  7094915 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaatattatattttttatgcaaata-ttctttcactgaag 7094817  T
Q  923 ga-gnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    || |         | || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||    
T  7094816 gaggaaaaaaaaacgta-tcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgaga 7094718  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 7470621 - 7470318
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470621 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattattgctaaaaatataaaacatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 7470522  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7470521 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcattgaag 7470423  T
Q  923 gagnnnnnnnnncata------ttcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactt 1014  Q
    |||          | |       |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  7470422 gagaaaagaaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagactaaactt 7470323  T
Q  1015 tgaga 1019  Q
    |||||    
T  7470322 tgaga 7470318  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 723 - 996
Target Start/End: Complemental strand, 37412716 - 37412444
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37412716 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 37412617  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37412616 acaataaatataattatgtaacgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttcttccactgaag 37412518  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatatagac 996  Q
    |||         | || |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37412517 gagaaaaaaaaacgta-tcttcagtgtgttattcgttccaaatttatgagttatatttttactataaatatagac 37412444  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 722 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 42331594 - 42331291
Alignment:
Q  722 ctgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 821  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42331594 ctgttgtagtatgacttaaaatttgatgaatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 42331495  T
Q  822 gacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaa 921  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  42331494 gacaataagtatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcattgaa 42331396  T
Q  922 ggagnnnnnnnnncata-----ttcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatatagac-ttgtatcaggctaaactt 1014  Q
    ||||          | |      |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  42331395 ggagaaagaaaaaaaaaaacgtatctttagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgtatcagactaaactt 42331296  T
Q  1015 tgaga 1019  Q
    |||||    
T  42331295 tgaga 42331291  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 723 - 996
Target Start/End: Original strand, 21989853 - 21990124
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  21989853 tgttgtagtatgacccaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattgtgt--tgaaaatatatttatgg 21989950  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21989951 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 21990049  T
Q  923 ga-gnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatatagac 996  Q
    || |         | || ||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21990050 gaggaaaaaaaaacgta-tcttctgtgtggtattcgttccaaatttatgagttataattttactataaatatagac 21990124  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 731 - 925
Target Start/End: Original strand, 24258166 - 24258358
Alignment:
Q  731 tatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaa 830  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24258166 tatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaa 24258265  T
Q  831 tatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaaggag 925  Q
    ||||||||||||  |||||| | |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24258266 tatatttttgtacagtatgaaggacga-ttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgtaaata-ttctttcactgaaggag 24258358  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 803 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 43254035 - 43253816
Alignment:
Q  803 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgc 902  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43254035 tgctaaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgc 43253936  T
Q  903 aaatatttctttcactgaaggagnnnnnnnnncata--ttcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-ctt 998  Q
    ||||| |||||||||||||||||          | |   ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43253935 aaata-ttctttcactgaaggagaaaaaataagaaagtatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagacctt 43253837  T
Q  999 gtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  43253836 gtatcaggctaaactttgaga 43253816  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 723 - 871
Target Start/End: Original strand, 443326 - 443474
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  443326 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 443425  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatat 871  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| || |||||||    
T  443426 acaataaatatatttttgtaccgtctgaagaacaatttgatgcaaatat 443474  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 792 - 996
Target Start/End: Complemental strand, 13099996 - 13099792
Alignment:
Q  792 aatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattat 891  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099996 aatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatattttcgtaccgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattat 13099897  T
Q  892 atttttgatgcaaatatttctttcactgaaggag-nnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaa 989  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||          | || |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099896 atttttgatgcaaata-ttctttcactgaaggagaaaaaaaaaacgta-tcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaa 13099799  T
Q  990 tatagac 996  Q
    |||||||    
T  13099798 tatagac 13099792  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 723 - 925
Target Start/End: Original strand, 3676997 - 3677179
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  3676997 tgttgtagtatgactcaaaatttgatagatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaa----------- 3677085  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
            |||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3677086 --------tatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 3677176  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 827 - 1019
Target Start/End: Original strand, 20297163 - 20297355
Alignment:
Q  827 taaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaaggagn 926  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||     
T  20297163 taaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcaccgaaggaga 20297261  T
Q  927 nnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
            | || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  20297262 aaaaaaaacgta-tcttcagtgtggtatttgttccaaatttacgagttatacttttactaaaaatatggaccttgtatcaggctaaactttgaga 20297355  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 726 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 40281989 - 40281863
Alignment:
Q  726 tgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaata--ttgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgga 823  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40281989 tgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaagaatttgttgctaaaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatgga 40281890  T
Q  824 caataaatatatttttgtatcgtatga 850  Q
     |||||||||||||||||| |||||||    
T  40281889 aaataaatatatttttgtaccgtatga 40281863  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 733 - 806
Target Start/End: Original strand, 10690684 - 10690756
Alignment:
Q  733 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 806  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  10690684 tgactcaaaatttgatggagggagaagattgttgctaaaaatataaaag-tatgtttcaaatatattttgtgct 10690756  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 733 - 786
Target Start/End: Original strand, 20297108 - 20297161
Alignment:
Q  733 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttg 786  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297108 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttg 20297161  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 940 - 998
Target Start/End: Original strand, 443511 - 443570
Alignment:
Q  940 tcttcagtctggtatttgttc-aaatttatgagttatacttttactataaatatagactt 998  Q
    |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  443511 tcttcagtgtggaattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactt 443570  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 748 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 12310600 - 12310542
Alignment:
Q  748 tggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 806  Q
    |||||| |||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12310600 tggatgaagaagattgttgctactgatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 12310542  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 731 - 777
Target Start/End: Complemental strand, 43254069 - 43254023
Alignment:
Q  731 tatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatata 777  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43254069 tatgtctcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 43254023  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 803 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 12485023 - 12484974
Alignment:
Q  803 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatg 852  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  12485023 tgctgaaaatatatttatggatagcaaatatatttttgtatcgtatgatg 12484974  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 803 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 12506454 - 12506405
Alignment:
Q  803 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatg 852  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  12506454 tgctgaaaatatatttatggatagcaaatatatttttgtatcgtatgatg 12506405  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 803 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 12657647 - 12657598
Alignment:
Q  803 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatg 852  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  12657647 tgctgaaaatatattcatggatagcaaatatatttttgtatcgtatgatg 12657598  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 975 - 1019
Target Start/End: Original strand, 48457601 - 48457646
Alignment:
Q  975 tacttttactataaatatagac-ttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48457601 tactttcactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 48457646  T

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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 770 - 801
Target Start/End: Original strand, 6628853 - 6628884
Alignment:
Q  770 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 801  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6628853 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 6628884  T

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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 770 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 12657698 - 12657667
Alignment:
Q  770 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 801  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12657698 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 12657667  T

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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 673 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 2403489 - 2403451
Alignment:
Q  673 ggtgaattctaggatgagggttcaatcaagtccctcacc 711  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2403489 ggtgaattctaggatgagggttcaactaagtccctcacc 2403451  T

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Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 803 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 12310528 - 12310442
Alignment:
Q  803 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatatt 889  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| | |||||||||||||| ||||||| | | ||||| ||  ||||||||||| ||| ||||||||    
T  12310528 tgctgaaattatacttaaggacagttaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgtaaatatatttttaaaaggaatatt 12310442  T

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Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 770 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 12485074 - 12485044
Alignment:
Q  770 aaaatataaaagatttgtttcaaatatattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12485074 aaaatataaaagatttgtttcaaatatattt 12485044  T

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Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 770 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 12506505 - 12506475
Alignment:
Q  770 aaaatataaaagatttgtttcaaatatattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12506505 aaaatataaaagatttgtttcaaatatattt 12506475  T

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Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 974 - 1019
Target Start/End: Original strand, 18567564 - 18567610
Alignment:
Q  974 atacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  18567564 atacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgaga 18567610  T

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Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 974 - 1019
Target Start/End: Original strand, 22392424 - 22392470
Alignment:
Q  974 atacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  22392424 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga 22392470  T

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Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 974 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 27306567 - 27306521
Alignment:
Q  974 atacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  27306567 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga 27306521  T

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Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 673 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 30581314 - 30581276
Alignment:
Q  673 ggtgaattctaggatgagggttcaatcaagtccctcacc 711  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  30581314 ggtgaattctagggtgagggttcaattaagtccctcacc 30581276  T

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Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 974 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 31435385 - 31435339
Alignment:
Q  974 atacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  31435385 atacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgaga 31435339  T

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Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 673 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 42818601 - 42818563
Alignment:
Q  673 ggtgaattctaggatgagggttcaatcaagtccctcacc 711  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  42818601 ggtgaattctagggtgagggttcaattaagtccctcacc 42818563  T

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Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 940 - 1019
Target Start/End: Original strand, 3677196 - 3677277
Alignment:
Q  940 tcttcagtctggtatttgttc-aaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||||||| || |||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| ||||    
T  3677196 tcttcagtgtgatattcgttccaaatttatgagttatgtttttactataaatatagatcttgaatcagagtaaacttggaga 3677277  T

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Target: chr4 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 35)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 22132987 - 22132691
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132987 tgttgtagtatgattcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 22132888  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22132887 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 22132789  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||         | || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22132788 gagaaaaaaaaacgta-tcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 22132691  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 22135219 - 22134922
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22135219 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 22135120  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  22135119 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgattcaaata-ttctttcactgaag 22135021  T
Q  923 gag-nnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||          | || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22135020 gagaaaaaaaaaacgta-tcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaagctaaactttgaga 22134922  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Original strand, 24347959 - 24348255
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24347959 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgc-gaaaatatatttatgg 24348057  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24348058 acaataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 24348156  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||          |   |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  24348157 gagaaaaaaaaaaagtatcttcaatgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaagctaaactttgaga 24348255  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 14788021 - 14787725
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14788021 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaataatgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtggtgaaaatatatttatgg 14787922  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14787921 acaataaatatatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 14787823  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||         | || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  14787822 gagaaaaaaaaacgta-tcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgaga 14787725  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Original strand, 5100743 - 5101038
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5100743 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 5100842  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5100843 acaacaaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 5100941  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||         | || |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||    
T  5100942 gag-aaaaaaaacgta-tcttcaatctggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagggtaaaccttgaga 5101038  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 723 - 996
Target Start/End: Complemental strand, 44600428 - 44600154
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44600428 tgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatgg 44600329  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44600328 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttaaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 44600230  T
Q  923 gagnnnnnnnnnca-tattcttcagtctggtatttg-ttcaaatttatgagttatacttttactataaatatagac 996  Q
    |||          |  | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44600229 gaggaaaaaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgtttcaaatttatgagttatacttttactataaatatagac 44600154  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 17662826 - 17662530
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662826 tgttgtagtatgactacaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 17662727  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17662726 acaataaatatatttttgtaccgtacgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 17662628  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||           || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||    
T  17662627 gagaaaaaaaaaagta-tcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgaga 17662530  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Original strand, 56030189 - 56030485
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56030189 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 56030288  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  56030289 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttggtgcaaata-ttctttcactgaag 56030387  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatt-tgttcaaatttatgagttatacttttactataaatatagac-ttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||           || ||||| || ||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||  ||||| ||||||    
T  56030388 gagaaaaaaaaaagta-tcttcggtgtggtattctttccaaatttatgagttatatttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgaga 56030485  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 739 - 925
Target Start/End: Original strand, 30136331 - 30136516
Alignment:
Q  739 aaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttt 838  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30136331 aaaatttgatgaatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttt 30136430  T
Q  839 tgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaaggag 925  Q
    ||||  |||||| ||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  30136431 tgtactgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttaaaagagaatattatatttttgattcaaata-ttctttcattgaaggag 30136516  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 723 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 47211308 - 47211158
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47211308 tgttgtagtatgacttaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctcaaaatatatttatgg 47211209  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatat 873  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  47211208 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatat 47211158  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 723 - 889
Target Start/End: Original strand, 10112626 - 10112787
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10112626 tgttgtagtatgacttaaaatttgttgaatgaagaatattgttgctaaaaatataaaag----gtttcaaatatattttgtgctgaaactatatttatgg 10112721  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatatt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  10112722 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgtaaatata-tttgaaagagaatatt 10112787  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 723 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 38890701 - 38890517
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  |||||    
T  38890701 tgttgtagcatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatt------------------tatgg 38890620  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaaggg-aatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaa 921  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  38890619 acaataaatatatttttgtattgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactaaa 38890521  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 723 - 889
Target Start/End: Original strand, 9022060 - 9022225
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||   |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  9022060 tgttgtagtatgattcaaaattttatggatgagaaatattgttgttgaaaatataaatgatttgtttcaaatatattttttgctgaaaatatatttat-g 9022158  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatatt 889  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  9022159 acaataaatatatttttctaccgtatgaagaaagatttgatgcaaatatattttaaaagggaatatt 9022225  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 723 - 841
Target Start/End: Original strand, 9863499 - 9863617
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  9863499 tgttgtaatatgactcaaaatttgttggatgaaatatattgttactaaaaatataaatgatttgtttcaaacatattttgtgctaaaaatatatttatga 9863598  T
Q  823 acaataaatatatttttgt 841  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9863599 acaataaatatatttttgt 9863617  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 852 - 1019
Target Start/End: Original strand, 53404999 - 53405168
Alignment:
Q  852 gaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaaggagnnnnnnnnnca--tattcttcagtct 949  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||          |  |||| |||||| |    
T  53404999 gaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaaaattatatttttgatgcaaatatt-ctttcactaaaggagaaaaaaaaaaacgtatt-ttcagtgt 53405096  T
Q  950 ggtatttgttc-aaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53405097 ggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 53405168  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 725 - 824
Target Start/End: Original strand, 19322410 - 19322510
Alignment:
Q  725 ttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgtt-gctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgga 823  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19322410 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattttttgctaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttatactgaaaatatatttatgga 19322509  T
Q  824 c 824  Q
    |    
T  19322510 c 19322510  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 940 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 47211119 - 47211038
Alignment:
Q  940 tcttcagtctggtatttgttc-aaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47211119 tcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 47211038  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 723 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 14789571 - 14789500
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaat 794  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14789571 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaataatgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaat 14789500  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 830 - 925
Target Start/End: Original strand, 19322547 - 19322641
Alignment:
Q  830 atatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaaggag 925  Q
    |||||||||||||  |||| | | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19322547 atatatttttgtactgtataaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaaggag 19322641  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 940 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 18709544 - 18709463
Alignment:
Q  940 tcttcagtctggtatttgttc-aaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18709544 tcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgaga 18709463  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 733 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 38209259 - 38209186
Alignment:
Q  733 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 806  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38209259 tgactcaaaatttgatggatgaaaaatattgttgttaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttgtgct 38209186  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 739 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 5516833 - 5516771
Alignment:
Q  739 aaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 801  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  5516833 aaaatttgatgaatggagaatattgttgctaaaaatataaatgaattgtttcaaatatatttt 5516771  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 803 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 54929180 - 54929094
Alignment:
Q  803 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatatt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | | ||||| || |||||||||||| ||  ||||||||    
T  54929180 tgctgaaaatatatttatggacaaaaaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaataggaatatt 54929094  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 803 - 882
Target Start/End: Original strand, 10979676 - 10979755
Alignment:
Q  803 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagg 882  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||| | | ||||| || |||||||||||| |||||    
T  10979676 tgctgaaaatatatttatggacaacaaatatatttttgtgctgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagg 10979755  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 737 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 29609983 - 29609914
Alignment:
Q  737 tcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 806  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29609983 tcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaagtattcttgatttttttcaaatatattttgtgct 29609914  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 757 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 54929245 - 54929198
Alignment:
Q  757 aatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 804  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  54929245 aatattgttgctaaaaatataaaagatttgatttaaatgtattttgtg 54929198  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 954 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 18537829 - 18537763
Alignment:
Q  954 tttgttcaaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||    
T  18537829 tttgttccaatttatgagtgatgcttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaacattgaga 18537763  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 974 - 1019
Target Start/End: Original strand, 47274722 - 47274768
Alignment:
Q  974 atacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  47274722 atacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgaga 47274768  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 803 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 14647214 - 14647175
Alignment:
Q  803 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgta 842  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  14647214 tgctgaaaatatattcatggacaacaaatatatttttgta 14647175  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 976 - 1014
Target Start/End: Complemental strand, 37089710 - 37089671
Alignment:
Q  976 acttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactt 1014  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37089710 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactt 37089671  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 974 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 619785 - 619739
Alignment:
Q  974 atacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  619785 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga 619739  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 808 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 5516747 - 5516705
Alignment:
Q  808 aaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatga 850  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5516747 aaaatatatttatagataataaatatatttttttatcgtatga 5516705  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 974 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 22801200 - 22801154
Alignment:
Q  974 atacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  22801200 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga 22801154  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 974 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 22803072 - 22803026
Alignment:
Q  974 atacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  22803072 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga 22803026  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 974 - 1019
Target Start/End: Original strand, 48486314 - 48486360
Alignment:
Q  974 atacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  48486314 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga 48486360  T

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Target: chr1 (Bit Score: 210; Significance: 1e-114; HSPs: 44)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 723 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 31736115 - 31735821
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31736115 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggaaggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 31736016  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31736015 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 31735917  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttga 1017  Q
    |||         | || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31735916 gagaaaaaaaaacgta-tcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttga 31735821  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 9463840 - 9463544
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9463840 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 9463741  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9463740 acaataaatatatttttatatcgtatgaagaacaatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcattgaag 9463642  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||         | || |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9463641 gagaaaaaaaaacgta-tcttcattgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 9463544  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Original strand, 47905956 - 47906251
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47905956 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 47906055  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  47906056 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcattgaag 47906154  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||          |   |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47906155 gagaaaaaaaa--agtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 47906251  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 9460013 - 9459717
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9460013 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 9459914  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9459913 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcattgaag 9459815  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||         | || |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9459814 gagaaaaaaaaacgta-tcttcattgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 9459717  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Original strand, 24325347 - 24325643
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24325347 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatgg 24325446  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24325447 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagtgaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 24325545  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||           || |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||    
T  24325546 gagaaaaaaaaatgta-tctttagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgaga 24325643  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 722 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 27339731 - 27339428
Alignment:
Q  722 ctgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatat----t 817  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |    
T  27339731 ctgttgtagtatgactccaaatttgacggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatatatt 27339632  T
Q  818 tatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcac 917  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27339631 tatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcac 27339533  T
Q  918 tgaaggagnnnnnnnnncatat-tcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactt 1014  Q
    |||||||           |  | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27339532 tgaaggaaaaaaaaaagaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactt 27339433  T
Q  1015 tgaga 1019  Q
    |||||    
T  27339432 tgaga 27339428  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 27337532 - 27337236
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337532 tgttgtagtatgactccaaatttgatggatggggaatattgttgctaaaaatatataagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 27337433  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27337432 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttaactgaag 27337334  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    ||          | || |||||  | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  27337333 gaaaaaaaaaaacgta-tcttcgatgtggtatttgttccaaatttatgcgttatacttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgaga 27337236  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 722 - 1019
Target Start/End: Original strand, 39931761 - 39932058
Alignment:
Q  722 ctgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 821  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39931761 ctgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 39931860  T
Q  822 gacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaa 921  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||    
T  39931861 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatacttttgatgcaaata-ttcttttattgaa 39931959  T
Q  922 ggagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    ||||         | || |||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||    
T  39931960 ggagaaaaaaaaacgta-tcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatgagacaaaactttgaga 39932058  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 15295439 - 15295142
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15295439 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 15295340  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15295339 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagcgaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 15295241  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatat-tcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||          || | |||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||    
T  15295240 gagaaaaaaaaa-atgtatcttcagtgtggtattcgttcctaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgaga 15295142  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 722 - 922
Target Start/End: Original strand, 48664851 - 48665050
Alignment:
Q  722 ctgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 821  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48664851 ctgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 48664950  T
Q  822 gacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaa 921  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  48664951 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcacatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcattgaa 48665049  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 750 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 21948756 - 21948485
Alignment:
Q  750 gatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatg 849  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948756 gatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatg 21948657  T
Q  850 atgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaaggagnnnnnnnnncatat-tcttcagtc 948  Q
    | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||          |  | ||||||||     
T  21948656 aagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcacagaaggaggaaaaaaaaaacgtatcttcagtg 21948558  T
Q  949 tggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  21948557 tggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgaga 21948485  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 28998844 - 28998547
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998844 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaactataaaagatttgtttaaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 28998745  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| || |||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28998744 acaataaatacatttttgtaccgtacgaagaaatatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 28998646  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatatagac-ttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||         |    | || ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||    
T  28998645 gagaaaaaaaaaccgtatatttagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgaga 28998547  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 29004560 - 29004263
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004560 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaactataaaagatttgtttaaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 29004461  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| || |||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29004460 acaataaatacatttttgtaccgtacgaagaaatatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 29004362  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatatagac-ttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||         |    | || ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||    
T  29004361 gagaaaaaaaaaccgtatatttagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgaga 29004263  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 723 - 996
Target Start/End: Complemental strand, 17325227 - 17324954
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  17325227 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgagttgaaaatatatttatgg 17325128  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17325127 acaataaatatatttttgtaccgtatgaaaaacgatttgatgcaaatatattttgcaagggaatattatattttttatgcaaata-ttctttcactgaag 17325029  T
Q  923 gag-nnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatatagac 996  Q
    |||          | || |||||||  || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17325028 gagaaaaaaaaaacgta-tcttcagggtgatattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagac 17324954  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 723 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 2949815 - 2949617
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2949815 tgttatagtatgactcaaaatttcatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 2949716  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2949715 acaataaatatatttttgtattgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatacaaata-ttctttcactgaag 2949617  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 723 - 908
Target Start/End: Complemental strand, 6115718 - 6115532
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaa-tttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 821  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115718 tgttgtaggatgactcaaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 6115619  T
Q  822 gacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatat 908  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6115618 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaatgacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatat 6115532  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 723 - 909
Target Start/End: Complemental strand, 4131882 - 4131696
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4131882 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaacatatatttatgg 4131783  T
Q  823 ac-aataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatt 909  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4131782 acaaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattata-ttttgatgcaaatatt 4131696  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 723 - 909
Target Start/End: Complemental strand, 45694024 - 45693838
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45694024 tgttgtactatgattcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctaaaaatatatttatgg 45693925  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatt 909  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  45693924 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaataatatattttttatgcaaatatt 45693838  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 723 - 909
Target Start/End: Original strand, 6997214 - 6997393
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6997214 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattattgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctaaaaatata-ttatgg 6997312  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatt 909  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6997313 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacgatttgatgcaaa------ttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatatt 6997393  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 723 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 46432636 - 46432521
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46432636 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 46432537  T
Q  823 acaataaatatatttt 838  Q
    ||||||||||||||||    
T  46432536 acaataaatatatttt 46432521  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 722 - 876
Target Start/End: Original strand, 16561130 - 16561284
Alignment:
Q  722 ctgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 821  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16561130 ctgttgttgtatgattcaaaatttgttggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatt 16561229  T
Q  822 gacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatatttt 876  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| | |  |||| | |||||||||||||    
T  16561230 gacaataaatatctttttgtaccgtatgaaggaatatttgaaacaaatatatttt 16561284  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 761 - 922
Target Start/End: Original strand, 6996067 - 6996221
Alignment:
Q  761 ttgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgattt 860  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  6996067 ttgttgctaaaaatataaaagacttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaatacatatatttttgtaccgtatgaagaacgattt 6996166  T
Q  861 aatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
     ||  |||      |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  6996167 gatgtaaa------ttgaaagggaatattatatttttgttgcaaata-ttctttcactgaag 6996221  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 835 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 46432207 - 46432022
Alignment:
Q  835 tttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaaggag-nnnnnnnn 933  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||             
T  46432207 tttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaaggagaaaaaaaaa 46432109  T
Q  934 ncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
     | || |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46432108 acgta-tcttcactgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 46432022  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 845 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 2510801 - 2510622
Alignment:
Q  845 gtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaaggagnnnnnnnnnca-----tat 939  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||          |     |||    
T  2510801 gtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatatt-ctttcactgaaggagggaaagaaaaaaaacgtat 2510703  T
Q  940 tcttcagtctggtatttgttc-aaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2510702 t-ttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 2510622  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 733 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 13785835 - 13785662
Alignment:
Q  733 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttg-----------------tgctgaaaatata 815  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                 |||||||||||||    
T  13785835 tgactcaaaaattgatggatggagaatattgtcgctaaaaatatgaaagatttgtttcaaatatattttgtgtttctagaatattgttgctgaaaatata 13785736  T
Q  816 tttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatatt 889  Q
    ||||| || | |||||||||||||||||||||||| | | ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||    
T  13785735 tttatagatagtaaatatatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaaaggaatatt 13785662  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 803 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 11693666 - 11693580
Alignment:
Q  803 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatatt 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  11693666 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagggaatatt 11693580  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 733 - 804
Target Start/End: Original strand, 32260746 - 32260817
Alignment:
Q  733 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 804  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  32260746 tgactcaaaatttgatggatgaagaagattgttgctaaaaatataaaagaattgtttaaaatatattttgtg 32260817  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 865 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 6115538 - 6115479
Alignment:
Q  865 caaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaaggag 925  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  6115538 caaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcattgaaggag 6115479  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 865 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 26520572 - 26520516
Alignment:
Q  865 caaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  26520572 caaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcaccgaag 26520516  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 806 - 889
Target Start/End: Original strand, 14352759 - 14352842
Alignment:
Q  806 tgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatatt 889  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||| | | ||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  14352759 tgaaaatatatttatgaatagtaaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagggaatatt 14352842  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 760 - 806
Target Start/End: Original strand, 10115509 - 10115555
Alignment:
Q  760 attgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 806  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10115509 attgttgttaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 10115555  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 940 - 996
Target Start/End: Original strand, 48665077 - 48665134
Alignment:
Q  940 tcttcagtctggtatttgttc-aaatttatgagttatacttttactataaatatagac 996  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48665077 tcttcagtgtagtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagac 48665134  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 790 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 13112099 - 13112047
Alignment:
Q  790 caaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgta 842  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13112099 caaatgtattttatgctgaaaatatattcatggacaataaatatatttttgta 13112047  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 803 - 850
Target Start/End: Original strand, 32260833 - 32260880
Alignment:
Q  803 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatga 850  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  32260833 tgctgaaaatatatttatgaacaataaatatatttttgtaccgtatga 32260880  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 733 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 11693753 - 11693686
Alignment:
Q  733 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattt 800  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||    
T  11693753 tgactcaaaatttgatggatgaagaagattattgctaaaattataaaaattttgttttaaatatattt 11693686  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 974 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 28207406 - 28207360
Alignment:
Q  974 atacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  28207406 atacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgaga 28207360  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 960 - 996
Target Start/End: Complemental strand, 6996054 - 6996018
Alignment:
Q  960 caaatttatgagttatacttttactataaatatagac 996  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6996054 caaatttatgagttatacttttattataaatatagac 6996018  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 960 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 2949585 - 2949550
Alignment:
Q  960 caaatttatgagttatacttttactataaatataga 995  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2949585 caaatttatgagttatacttttacaataaatataga 2949550  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 723 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 6997427 - 6997388
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatatt 762  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6997427 tgttgtagtatgactcaaaatatgatggatggagaatatt 6997388  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 770 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 16855296 - 16855265
Alignment:
Q  770 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 801  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16855296 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 16855265  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 974 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 38925818 - 38925772
Alignment:
Q  974 atacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  38925818 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga 38925772  T

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Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 974 - 1019
Target Start/End: Original strand, 41646861 - 41646907
Alignment:
Q  974 atacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  41646861 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga 41646907  T

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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 974 - 1019
Target Start/End: Original strand, 47451589 - 47451635
Alignment:
Q  974 atacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  47451589 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga 47451635  T

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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 678 - 711
Target Start/End: Original strand, 2260858 - 2260891
Alignment:
Q  678 attctaggatgagggttcaatcaagtccctcacc 711  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2260858 attctagggtgagggttcaatcaagtccctcacc 2260891  T

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Target: chr8 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Original strand, 15808962 - 15809258
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15808962 tgttttagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatgg 15809061  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15809062 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 15809160  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||         | || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15809161 gagaaaaaaaaacgta-tcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 15809258  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 721 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 28283815 - 28283517
Alignment:
Q  721 cctgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttat 820  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283815 cctgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatatttttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttat 28283716  T
Q  821 ggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactga 920  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28283715 ggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagtgaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactga 28283617  T
Q  921 aggagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgag 1018  Q
    |||||         | || |||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28283616 aggagaaaaaaaaacgta-tcttcagtgtaatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgag 28283518  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Original strand, 3873750 - 3874049
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3873750 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 3873849  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatg-aacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaa 921  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3873850 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaa 3873948  T
Q  922 ggagnnnnnnnnncatat-tcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatatagac-ttgtatcaggctaaactttgag 1018  Q
    ||||          | || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3873949 ggagaaaaaaaaaaacatatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgtatcaggctaaactttgag 3874048  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Original strand, 43529871 - 43530167
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43529871 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 43529970  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  43529971 acaataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgctaata-ttctttcactgaag 43530069  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||           || |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||    
T  43530070 gagaaaaaaaaaagta-tcttcagtgtggtatttattccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgaga 43530167  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 723 - 996
Target Start/End: Original strand, 41384493 - 41384764
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  41384493 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcgaatatattttatactgaaaatatatttatgg 41384592  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  41384593 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt-atgcaaata-ttctttcattgaag 41384690  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatatagac 996  Q
    ||          | || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41384691 gaaaaaaaaaaacgta-tcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagac 41384764  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 722 - 925
Target Start/End: Original strand, 608469 - 608671
Alignment:
Q  722 ctgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 821  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608469 ctgttgtagtatcactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 608568  T
Q  822 gacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaa 921  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  608569 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatattttatgcaaata-ttctttcactgaa 608667  T
Q  922 ggag 925  Q
    ||||    
T  608668 ggag 608671  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 724 - 996
Target Start/End: Original strand, 41382420 - 41382692
Alignment:
Q  724 gttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgga 823  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  41382420 gttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgttaaaaatataaaagatttgtttcgaatatattttatactgaaaatatatttatgga 41382519  T
Q  824 caataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaagg 923  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |    
T  41382520 caataaatatatttttgtaccgtatgaacaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaatattatattttttatgcaaata-ttctttcactgaatg 41382618  T
Q  924 ag-nnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatatagac 996  Q
    ||          | || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41382619 agaaaaaaaaaacgta-tcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagac 41382692  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 723 - 881
Target Start/End: Original strand, 32339094 - 32339252
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339094 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 32339193  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaag 881  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  32339194 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaag 32339252  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 723 - 840
Target Start/End: Complemental strand, 3265752 - 3265635
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3265752 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 3265653  T
Q  823 acaataaatatatttttg 840  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  3265652 acaataaatatatgtttg 3265635  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 874 - 1019
Target Start/End: Original strand, 181434 - 181580
Alignment:
Q  874 tttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaaggagnnnnnnnnn-catattcttcagtctggtatttgttc-aaatttatgag 971  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||          | ||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  181434 tttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatt-ctttcactaaaggagaagaaaaaaacgtat-cttcagtgtggtattcgttccaaatttatgag 181531  T
Q  972 ttatacttttactataaatatagac-ttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  181532 ttatacttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgaga 181580  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 940 - 1019
Target Start/End: Original strand, 32339267 - 32339348
Alignment:
Q  940 tcttcagtctggtatttgttc-aaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32339267 tcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 32339348  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 940 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 24873560 - 24873479
Alignment:
Q  940 tcttcagtctggtatttgttc-aaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24873560 tcttcagtgttgtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 24873479  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 733 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 13986374 - 13986304
Alignment:
Q  733 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 804  Q
    |||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13986374 tgactcaaaattttatggatgaagaagattgttgctaaaaatat-aaagatttgttttaaatatattttgtg 13986304  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 733 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 30679256 - 30679186
Alignment:
Q  733 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 804  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  30679256 tgactcaaaatttgatggatgaagaatat-gttggtaaaaataaaaaagatttgttttagatatattttgtg 30679186  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 954 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 14419549 - 14419483
Alignment:
Q  954 tttgttcaaatttatgagttatacttttactataaatatagac-ttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||    
T  14419549 tttgttccaatttatgagtgatacttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgaga 14419483  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 803 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 11701447 - 11701364
Alignment:
Q  803 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatatt 889  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||  ||| || || ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  11701447 tgctgaaaatatatttatggtcagtaaatatatttttgtaccgtatg--gaa-gaattgatgtaaatatatttttaaagggaatatt 11701364  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 673 - 711
Target Start/End: Original strand, 202577 - 202615
Alignment:
Q  673 ggtgaattctaggatgagggttcaatcaagtccctcacc 711  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  202577 ggtgaattctaggatgagggttcaattaagtccctcacc 202615  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 673 - 711
Target Start/End: Original strand, 317414 - 317452
Alignment:
Q  673 ggtgaattctaggatgagggttcaatcaagtccctcacc 711  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  317414 ggtgaattctaggatgagggttcaattaagtccctcacc 317452  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 954 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 13858842 - 13858776
Alignment:
Q  954 tttgttcaaatttatgagttatacttttactataaatatagac-ttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||    
T  13858842 tttgttccaatttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgaga 13858776  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 974 - 1019
Target Start/End: Original strand, 15072707 - 15072753
Alignment:
Q  974 atacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  15072707 atacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgaga 15072753  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 673 - 711
Target Start/End: Original strand, 19220913 - 19220951
Alignment:
Q  673 ggtgaattctaggatgagggttcaatcaagtccctcacc 711  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  19220913 ggtgaattctaggatgagggttcaattaagtccgtcacc 19220951  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 673 - 711
Target Start/End: Original strand, 40599887 - 40599925
Alignment:
Q  673 ggtgaattctaggatgagggttcaatcaagtccctcacc 711  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40599887 ggtggattctaggatgagggttcaaacaagtccctcacc 40599925  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 775 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 27820178 - 27820149
Alignment:
Q  775 ataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 804  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27820178 ataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 27820149  T

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Target: chr5 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 722 - 1011
Target Start/End: Original strand, 25803706 - 25803995
Alignment:
Q  722 ctgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 821  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25803706 ctgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 25803805  T
Q  822 gacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaa 921  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25803806 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaa 25803904  T
Q  922 ggagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaa 1011  Q
    ||||         | || |||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25803905 ggagaaaaaaaaacgta-tcttcagtgtaatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaa 25803995  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Original strand, 27912219 - 27912517
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912219 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 27912318  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27912319 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaaaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 27912417  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatat-tcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||          |  | |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27912418 gagaaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtgatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 27912517  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Original strand, 18468698 - 18468994
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18468698 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatatttttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 18468797  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18468798 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 18468896  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||           || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  18468897 gagaaaataaaaagta-tcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatgataaactttgaga 18468994  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Original strand, 27910135 - 27910432
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910135 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattattgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 27910234  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27910235 acaataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 27910333  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||          |   |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  27910334 gagaaaaaaaaaaagtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggttaaactttgaga 27910432  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Original strand, 15551925 - 15552222
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  15551925 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaagatatatttatgg 15552024  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15552025 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatgacatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 15552123  T
Q  923 gag-nnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||          | || |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15552124 gagaaaaaaaaaacgta-tcttcagcgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 15552222  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 722 - 1004
Target Start/End: Complemental strand, 3373631 - 3373348
Alignment:
Q  722 ctgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 821  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3373631 ctgttgtagtatgactcagaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatg 3373532  T
Q  822 gacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaa 921  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3373531 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattt-tttcactgaa 3373433  T
Q  922 ggag-nnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatca 1004  Q
    ||||          | || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3373432 ggagaaaaaaaaaacgta-tcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatca 3373348  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 743 - 1019
Target Start/End: Original strand, 10586549 - 10586826
Alignment:
Q  743 tttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgta 842  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10586549 tttgatggatggggaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgta 10586648  T
Q  843 tcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaaggag-nnnnnnnnncatattc 941  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||          | || ||    
T  10586649 tcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaaggagaaaaaaaaaacgta-tc 10586746  T
Q  942 ttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10586747 ttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 10586826  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 725 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 18511800 - 18511506
Alignment:
Q  725 ttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 824  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511800 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcgaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 18511701  T
Q  825 aataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaagga 924  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18511700 aataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaagga 18511602  T
Q  925 gnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |         | || |||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  18511601 gaaaaaaaaacgta-tctttagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttaatataaatatagaccttgtatcagactaaactttgaga 18511506  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 726 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 18509904 - 18509611
Alignment:
Q  726 tgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggaca 825  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18509904 tgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttatttcgaatatattttgtgctgaaaatatatttatggaca 18509805  T
Q  826 ataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaaggag 925  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18509804 ataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaaggag 18509706  T
Q  926 nnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgt-tcaaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
             | || |||||||| |||||||  |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  18509705 aaaaaaaaacgta-tcttcagtgtggtattcatcccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgaga 18509611  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Original strand, 26097421 - 26097720
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26097421 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaaaatttgtttcaaatatattttgtactgaaaatatatttatgg 26097520  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttga--aagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactga 920  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26097521 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaagaaggaaatgttatatttttgatgcaaata-ttctttcactga 26097619  T
Q  921 aggagnnnnnnnnncatat-tcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttga 1017  Q
    |||||          || | |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||    
T  26097620 aggaggaaaaaaaa-atgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaactttga 26097718  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 723 - 996
Target Start/End: Complemental strand, 26098841 - 26098567
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26098841 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattattgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 26098742  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||    
T  26098741 acaataaatatatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatacaaa-aattctttcattgaag 26098643  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatat-tcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatatagac 996  Q
    |||          |  | |||||| | ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26098642 gagaaataaaaaaacgtatcttcaatgtggtattcgttccaattttatgagttatacttttactataaatatagac 26098567  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 723 - 906
Target Start/End: Original strand, 21288529 - 21288713
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21288529 tgttgtagtataactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaataaaaaagatttgtttaaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 21288628  T
Q  823 acaataaatatatttt-tgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaat 906  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21288629 acaataaatatattttcggtaccgtatgaagaacgattttatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaat 21288713  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 723 - 996
Target Start/End: Original strand, 18596326 - 18596610
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18596326 tgttgtactatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatgg 18596425  T
Q  823 aca-----------ataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttc 911  Q
    |||           ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  18596426 acaataaatataccataaatatatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatacaaata-ttc 18596524  T
Q  912 tttcactgaaggag-nnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatatagac 996  Q
    | ||||||||||||          | || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18596525 tatcactgaaggagaaaaaaaaaacgta-tcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagac 18596610  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 803 - 1019
Target Start/End: Original strand, 18466453 - 18466667
Alignment:
Q  803 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgc 902  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466453 tgctaaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgc 18466552  T
Q  903 aaatatttctttcactgaaggagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgt 1000  Q
    ||||| |||||||||| ||||||          |   |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18466553 aaata-ttctttcactaaaggagaaaaaaaagta---tcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatatttttactataaatatagaccttgt 18466648  T
Q  1001 atcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18466649 atcaggctaaactttgaga 18466667  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 730 - 875
Target Start/End: Complemental strand, 17415893 - 17415748
Alignment:
Q  730 gtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataa 829  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17415893 gtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttttgctgaaaatatatttatggacaataa 17415794  T
Q  830 atatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattt 875  Q
    |||||||||||||  |||||| | |  |||| || |||||||||||    
T  17415793 atatatttttgtactgtatgaaggaaaatttgatgcaaatatattt 17415748  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 723 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 6662033 - 6661929
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6662033 tgttgtagtatgacttaaaacttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatgg 6661934  T
Q  823 acaat 827  Q
    |||||    
T  6661933 acaat 6661929  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 723 - 802
Target Start/End: Original strand, 40221282 - 40221361
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttg 802  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40221282 tgttgtagtatgactcaaaatttaattgatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttg 40221361  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 803 - 889
Target Start/End: Original strand, 15143262 - 15143348
Alignment:
Q  803 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatatt 889  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| | | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15143262 tgctaaaaatatatttatggacaataaatacatttttgtaccatatgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 15143348  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 723 - 777
Target Start/End: Original strand, 18466411 - 18466465
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatata 777  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466411 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 18466465  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 733 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 5779217 - 5779144
Alignment:
Q  733 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 806  Q
    ||||| |||||||| | |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5779217 tgacttaaaatttgatagatgaagaagattattgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 5779144  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 723 - 777
Target Start/End: Original strand, 15143220 - 15143274
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatata 777  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15143220 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 15143274  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 865 - 925
Target Start/End: Original strand, 40221349 - 40221408
Alignment:
Q  865 caaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaaggag 925  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  40221349 caaatatattttgaaaaggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgcaggag 40221408  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 940 - 994
Target Start/End: Complemental strand, 41586079 - 41586024
Alignment:
Q  940 tcttcagtctggtatttgttc-aaatttatgagttatacttttactataaatatag 994  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41586079 tcttcagtctggtattcgttccaaatctatgagttatacttttactataaatatag 41586024  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 976 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 21684797 - 21684753
Alignment:
Q  976 acttttactataaatatagac-ttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21684797 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 21684753  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 673 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 33087514 - 33087476
Alignment:
Q  673 ggtgaattctaggatgagggttcaatcaagtccctcacc 711  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33087514 ggtgaattctaggatgagggatcaatcaagtccctcacc 33087476  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 976 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 31466314 - 31466270
Alignment:
Q  976 acttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  31466314 acttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgaga 31466270  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 770 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 2532784 - 2532750
Alignment:
Q  770 aaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 804  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2532784 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatcttgtg 2532750  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 974 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 2818674 - 2818628
Alignment:
Q  974 atacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  2818674 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga 2818628  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 958 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 6661535 - 6661474
Alignment:
Q  958 ttcaaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||    
T  6661535 ttcaaatttatgagttata-tttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgaga 6661474  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 974 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 12556261 - 12556215
Alignment:
Q  974 atacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  12556261 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga 12556215  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 974 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 20507800 - 20507754
Alignment:
Q  974 atacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  20507800 atacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgaga 20507754  T

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Target: chr2 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 720 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 23452832 - 23452533
Alignment:
Q  720 acctgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatattta 819  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23452832 acctgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttatgctgaaaataaattta 23452733  T
Q  820 tggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactg 919  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23452732 tggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactg 23452634  T
Q  920 aaggagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttga 1017  Q
    ||||||           ||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23452633 aaggagaaaaaaaaaagta-ccttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttga 23452535  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 35216184 - 35215888
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35216184 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 35216085  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  35216084 acaataaatatatttttgtatcgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcagata-ttctttcactgaag 35215986  T
Q  923 gagnnnnnnnnncat-attcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||          || | ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35215985 gagaaaaaaaa--atgaatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 35215888  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 35218565 - 35218269
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35218565 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 35218466  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35218465 acaataaatatatttttgtatcgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 35218367  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttg-ttcaaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||         |  | |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  35218366 gagaaaaaaaaac-gaatcttcagtgtggtatttgctccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtataaggctaaactttgaga 35218269  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 723 - 1005
Target Start/End: Original strand, 42452449 - 42452732
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452449 tgttgtagtatgacttaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 42452548  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42452549 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 42452647  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatat-tcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatatagac-ttgtatcag 1005  Q
    |||          || | ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  42452648 gagaaaaaaaaa-atgtatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttattataaatatagacattgtatcag 42452732  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 723 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 42924094 - 42923893
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42924094 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 42923995  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42923994 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaagaaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 42923896  T
Q  923 gag 925  Q
    |||    
T  42923895 gag 42923893  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 723 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 27583907 - 27583713
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27583907 tgttgtagtatgactcaaattttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaagatatatttatga 27583808  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| | |  |||| || |||||||||||||||| ||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27583807 acaataaatatatttttataccatatgaaggaatatttgatgcaaatatattttgaaaaggaata-------tttgatgcaaata-ttctttcactgaag 27583716  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 733 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 28568740 - 28568584
Alignment:
Q  733 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaata 832  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  28568740 tgactcaaaatttgatagatgaagaatattgttgctaaaactataaaagatttgtttcaaatatattttgttttgaaaatatatttatggacaataaata 28568641  T
Q  833 tatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatatt 889  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  28568640 tatttttgtatcgtgtgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 28568584  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 723 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 27136505 - 27136370
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaat--------at 814  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        ||    
T  27136505 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattggtgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatataaatat 27136406  T
Q  815 atttatggacaataaatatatttttgtatcgtatga 850  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  27136405 atttatggaaaataaatatatttttgtaccgtatga 27136370  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 730 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 34575696 - 34575608
Alignment:
Q  730 gtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatattt 818  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34575696 gtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgttctaaatatattttgtgctgaaaatatattt 34575608  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 733 - 889
Target Start/End: Original strand, 15693583 - 15693755
Alignment:
Q  733 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct-----------------gaaaatata 815  Q
    ||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||                 |||||||||    
T  15693583 tgacttaaaatttgatggatgaataatattgttgctaaaaatataaa-gatttgtttcaaatatattttgtgcttccaaaaacttgttgctgaaaatata 15693681  T
Q  816 tttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatatt 889  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  15693682 tttatgggcaataaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaaggggatatt 15693755  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 733 - 798
Target Start/End: Original strand, 28568346 - 28568411
Alignment:
Q  733 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatat 798  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28568346 tgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgttaaaaatataaaagatttgtttcaaatatat 28568411  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 733 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 41303623 - 41303549
Alignment:
Q  733 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaa-tataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 806  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41303623 tgactcagaatttgatggatgaagaagattgttgctaaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 41303549  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 804 - 889
Target Start/End: Original strand, 7502638 - 7502723
Alignment:
Q  804 gctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatatt 889  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||   | ||||| || |||||||||||| ||||| ||||||    
T  7502638 gctgaaaatatatttatgaacaataaaaatatttttgtattgtatgacagaagatttgatgcaaatatatttttaaaggaaatatt 7502723  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 760 - 801
Target Start/End: Original strand, 39286911 - 39286952
Alignment:
Q  760 attgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 801  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39286911 attgttgctaaaaatataaatgatttgtttcaaatatatttt 39286952  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 803 - 874
Target Start/End: Original strand, 39286971 - 39287042
Alignment:
Q  803 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatg-atgaacgatttaatacaaatatatt 874  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  39286971 tgcttaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccatatgaatgaa-gatttgatgcaaatatatt 39287042  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 960 - 996
Target Start/End: Complemental strand, 42923863 - 42923827
Alignment:
Q  960 caaatttatgagttatacttttactataaatatagac 996  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42923863 caaatttatgagttatacttttactataaatatagac 42923827  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 803 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 41303535 - 41303457
Alignment:
Q  803 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaag 881  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||| | | || || || |||||||||||| ||||    
T  41303535 tgctgaaaatatatttatggacagtaaatataattttgtaccgtgtgaaggaagaattgattcaaatatatttttaaag 41303457  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 736 - 787
Target Start/End: Original strand, 7502582 - 7502633
Alignment:
Q  736 ctcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgt 787  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7502582 ctcaaaatttgatggatgaagaagattgttgctcaaagtataaaagatttgt 7502633  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 803 - 882
Target Start/End: Complemental strand, 41304884 - 41304806
Alignment:
Q  803 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagg 882  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| | | ||||| || |||||||||||| |||||    
T  41304884 tgctgacaatatatttatggatagtaaatatatttttgta-catatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagg 41304806  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 974 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 6259153 - 6259107
Alignment:
Q  974 atacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  6259153 atacttttactataaatatagaccttgtattagactaaactttgaga 6259107  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 978 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 6264479 - 6264437
Alignment:
Q  978 ttttactataaatatagac-ttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6264479 ttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgaga 6264437  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 673 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 20606969 - 20606931
Alignment:
Q  673 ggtgaattctaggatgagggttcaatcaagtccctcacc 711  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20606969 ggtgaattctagggtgagggttcaattaagtccctcacc 20606931  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 974 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 21521033 - 21520987
Alignment:
Q  974 atacttttactataaatatagac-ttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  21521033 atacttttactataaatataaaccttgtatcagactaaactttgaga 21520987  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 974 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 40032396 - 40032350
Alignment:
Q  974 atacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  40032396 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga 40032350  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 733 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 41304964 - 41304898
Alignment:
Q  733 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 806  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||     |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41304964 tgactcaaaatttgatggatgaagaagatt-----taaaaatataaaagatttg--tcaaatatattttgtgct 41304898  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 674 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 44297461 - 44297424
Alignment:
Q  674 gtgaattctaggatgagggttcaatcaagtccctcacc 711  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  44297461 gtgaattctagggtgagggttcaattaagtccctcacc 44297424  T

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Target: chr6 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 722 - 1019
Target Start/End: Original strand, 30966922 - 30967219
Alignment:
Q  722 ctgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 821  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30966922 ctgttgtagtatgactccaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttatttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 30967021  T
Q  822 gacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaa 921  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30967022 gacaataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttaatgcaaatatattttgaaagcgaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaa 30967120  T
Q  922 ggagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    ||||            | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  30967121 ggagaaaaaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtat-aggctaaactttgaga 30967219  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 723 - 1004
Target Start/End: Complemental strand, 12196104 - 12195822
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12196104 tgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatgg 12196005  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12196004 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 12195906  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatca 1004  Q
    |||            | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12195905 gagaaaaaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatca 12195822  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 723 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 30035196 - 30034903
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  30035196 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctaaaaatatatttatag 30035097  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  30035096 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcagata-ttctttcactgaag 30034998  T
Q  923 gag-nnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaacttt 1015  Q
    |||          | || |||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30034997 gagaaaataaaaacgta-tcttcaatgtgatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaacttt 30034903  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 722 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 2629480 - 2629182
Alignment:
Q  722 ctgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 821  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629480 ctgttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 2629381  T
Q  822 gacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaa 921  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2629380 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaa 2629282  T
Q  922 gga-gnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgag 1018  Q
    ||| |         | || |||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  2629281 ggaggaaaaaaaaacgta-tcttcagtgtagtatttgttccaaatttattagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatgttaaactttgag 2629183  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 723 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 5275928 - 5275727
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5275928 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttatttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 5275829  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5275828 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 5275730  T
Q  923 gag 925  Q
    |||    
T  5275729 gag 5275727  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 723 - 996
Target Start/End: Complemental strand, 26933158 - 26932886
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  26933158 tgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatattattatgg 26933059  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26933058 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 26932960  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatatagac 996  Q
    |||         |  | |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  26932959 gagaaaaaaaaac-gaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgggttatactttcactataaatatagac 26932886  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 723 - 996
Target Start/End: Original strand, 18317751 - 18318024
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18317751 tgttgtagtatgactcaaaatttgaaggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 18317850  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  18317851 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaata-ttctttcactgaag 18317949  T
Q  923 gag-nnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatatagac 996  Q
    |||          | || |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18317950 gagaaaaaaaaaacgta-tcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatactttcactataaatatagac 18318024  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 723 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 19705165 - 19704964
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19705165 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaagatattttgtgctgaaaatatatttatgg 19705066  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19705065 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaata-ttctttcactgaag 19704967  T
Q  923 gag 925  Q
    |||    
T  19704966 gag 19704964  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 725 - 921
Target Start/End: Original strand, 17011781 - 17011973
Alignment:
Q  725 ttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 824  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||    
T  17011781 ttgtagtatgacttaaaatttgatggatgaagaatattattgctaaaaatataaaag-tttgttttaaatat--tttgtgtagaaaatatatttatggac 17011877  T
Q  825 aataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaa 921  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17011878 aataaatatatttttgtaccgtatgatggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaa 17011973  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 731 - 998
Target Start/End: Original strand, 17852275 - 17852542
Alignment:
Q  731 tatgactcaaaatttgttggatggagaatattgt--tgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaata 828  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17852275 tatgactcaaaatttgatg-atggagaatattgtgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatat--tttatgctgaaaatatatttatggacaata 17852371  T
Q  829 aatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaaggagnnn 928  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||       
T  17852372 aatatatttttgtaccttatgaagaactatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttatttcactgaaagagaag 17852470  T
Q  929 nnnnnncata--ttcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatatagactt 998  Q
           | |   ||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17852471 aaaaaaaaaagtatcttc-gtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactt 17852542  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 723 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 22858536 - 22858373
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22858536 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttaataaaaatataaaagatttgttttaaatatactttgtgctgaaaatatatttatgg 22858437  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaat 886  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   | ||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  22858436 acaataaatatatttttgtaccgtatgaaagaagattagatgcaaatatattttgaaagggaat 22858373  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 725 - 889
Target Start/End: Original strand, 20526548 - 20526708
Alignment:
Q  725 ttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 824  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  20526548 ttgtagtatgactcaaaatttgatgggtgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttatgctgaaaatatatttatg--- 20526644  T
Q  825 aataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatata-ttttgaaagggaatatt 889  Q
      || ||||||||||||| ||||||| | | ||||| || |||||||| ||||||||| |||||||    
T  20526645 --tacatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttgaaagagaatatt 20526708  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 748 - 889
Target Start/End: Original strand, 30445246 - 30445404
Alignment:
Q  748 tggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttg-----------------tgctgaaaatatatttatggacaataaa 830  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||                 ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30445246 tggatgaagaatattgttgctagaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgcttccagaatattgttgctgaaaatatatttatgaacaataaa 30445345  T
Q  831 tatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatatt 889  Q
    |||||||||||| | ||||| | | ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||    
T  30445346 tatatttttgtaccatatgaaggaagatttgatgcaaatatattttaaaaaggaatatt 30445404  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 733 - 806
Target Start/End: Original strand, 30443022 - 30443097
Alignment:
Q  733 tgactcaaaatttgt--tggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 806  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  30443022 tgactcaaaatttatgatggatgaagaatattgttgttaaaaatataagagatttgtttcaaatatattttttgct 30443097  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 953 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 15533040 - 15532973
Alignment:
Q  953 atttgttcaaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  15533040 atttgttccaaattttaagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgaga 15532973  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 976 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 4816581 - 4816537
Alignment:
Q  976 acttttactataaatatagac-ttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4816581 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 4816537  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 953 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 15541499 - 15541432
Alignment:
Q  953 atttgttcaaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||||||| || || | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  15541499 atttgttccaaattttaagttacacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgaga 15541432  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 954 - 1019
Target Start/End: Original strand, 15346347 - 15346413
Alignment:
Q  954 tttgttcaaatttatgagttatacttttactataaatatagac-ttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||    
T  15346347 tttgttccaatttatgagggatacttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgaga 15346413  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 954 - 1005
Target Start/End: Original strand, 15366992 - 15367044
Alignment:
Q  954 tttgttcaaatttatgagttatacttttactataaatatagac-ttgtatcag 1005  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15366992 tttgttccaatttatgagggatacttttactataaatatagacattgtatcag 15367044  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 954 - 1005
Target Start/End: Complemental strand, 3234088 - 3234037
Alignment:
Q  954 tttgttcaaatttatgagttatacttttactataaatatagacttgtatcag 1005  Q
    ||||||| |||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3234088 tttgttccaatttatgaaggatgcttttactataaatatagacttgtatcag 3234037  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 957 - 1019
Target Start/End: Original strand, 3390338 - 3390401
Alignment:
Q  957 gttcaaatttatgagttatacttttactataaatatagac-ttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||    
T  3390338 gttccaatttatgagagatacttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgaga 3390401  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 974 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 1072215 - 1072169
Alignment:
Q  974 atacttttactataaatatagac-ttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  1072215 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaactttgaga 1072169  T

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Target: scaffold0005 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 723 - 1019
Target Start/End: Original strand, 51709 - 52005
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51709 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaataatgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtggtgaaaatatatttatgg 51808  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51809 acaataaatatatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 51907  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||         | || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  51908 gagaaaaaaaaacgta-tcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgaga 52005  T

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Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 723 - 794
Target Start/End: Original strand, 50159 - 50230
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaat 794  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50159 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaataatgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaat 50230  T

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Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 803 - 842
Target Start/End: Original strand, 170076 - 170115
Alignment:
Q  803 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgta 842  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  170076 tgctgaaaatatattcatggacaacaaatatatttttgta 170115  T

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Target: scaffold0154 (Bit Score: 184; Significance: 5e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 723 - 996
Target Start/End: Complemental strand, 12061 - 11789
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12061 tgttgtagtatgattcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaaaatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 11962  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11961 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 11863  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatatagac 996  Q
    |||         | || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11862 gagaaaaaaaaacgta-tcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagac 11789  T

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Target: scaffold0031 (Bit Score: 161; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 723 - 996
Target Start/End: Original strand, 78883 - 79157
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  78883 tgttgtagtatgacttaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtctcaaatatattttctgctaaaaatatatttatgg 78982  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  78983 ataataaatatatttttgtactgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaag 79081  T
Q  923 gagnnnnnnnnncatat-tcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatatagac 996  Q
    |||          || | |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  79082 gaggaaaaaaaaaatgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacctttactataaatatagac 79157  T

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Target: scaffold0511 (Bit Score: 157; Significance: 6e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 723 - 996
Target Start/End: Original strand, 1735 - 2008
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1735 tgttgtagtatgactcaaaatttgaaggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 1834  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaag 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  1835 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaata-ttctttcactgaag 1933  T
Q  923 gag-nnnnnnnnncatattcttcagtctggtatttgtt-caaatttatgagttatacttttactataaatatagac 996  Q
    |||          | || |||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1934 gagaaaaaaaaaacgta-tcttcagtgtggtattcgttccaaatttataagttatactttcactataaatatagac 2008  T

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Target: scaffold0468 (Bit Score: 111; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 724 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 2184 - 2070
Alignment:
Q  724 gttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgga 823  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2184 gttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgga 2085  T
Q  824 caataaatatatttt 838  Q
    |||||||||||||||    
T  2084 caataaatatatttt 2070  T

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Target: scaffold0468; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 866 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 2080 - 2022
Alignment:
Q  866 aaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatatttctttcactgaaggag 925  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2080 aaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaata-ttctttcactgaaggag 2022  T

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Target: scaffold0133 (Bit Score: 93; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 723 - 871
Target Start/End: Original strand, 4546 - 4694
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 822  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4546 tgttgcagtataactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcgaatatatttcgtgctgaaaatatatttatgg 4645  T
Q  823 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatat 871  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||| | || |||| || |||||||    
T  4646 acaatatatatatttttgtactgtatgaaggacaatttgatgcaaatat 4694  T

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Target: scaffold1674 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 723 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 95 - 1
Alignment:
Q  723 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatt 817  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  95 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatt 1  T

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Target: scaffold0068 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 976 - 1019
Target Start/End: Original strand, 29113 - 29157
Alignment:
Q  976 acttttactataaatatagac-ttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29113 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 29157  T

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Target: scaffold0339 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 974 - 1019
Target Start/End: Original strand, 3947 - 3993
Alignment:
Q  974 atacttttactataaatataga-cttgtatcaggctaaactttgaga 1019  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  3947 atacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgaga 3993  T

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Target: scaffold0008 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 806 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 57905 - 57836
Alignment:
Q  806 tgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatatttt 876  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| || ||||||||||||    
T  57905 tgaaaatatatgtatgaacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaa-aatttgatgcaaatatatttt 57836  T

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Target: scaffold0533 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0533
Description:

Target: scaffold0533; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 760 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 2273 - 2232
Alignment:
Q  760 attgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 801  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2273 attgttgcagaaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 2232  T

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