View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5658-Insertion-4 (Length: 997)

Name: NF5658-Insertion-4
Description: NF5658
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5658-Insertion-4
NF5658-Insertion-4
[»] chr7 (152 HSPs)
chr7 (384-980)||(38393683-38394282)
chr7 (384-980)||(20299155-20299756)
chr7 (384-980)||(3035415-3036020)
chr7 (384-980)||(7471973-7472574)
chr7 (384-980)||(20625734-20626334)
chr7 (384-980)||(20629625-20630225)
chr7 (384-980)||(20642044-20642644)
chr7 (384-980)||(7470015-7470621)
chr7 (384-980)||(18345237-18345837)
chr7 (383-980)||(28485260-28485861)
chr7 (384-984)||(7351640-7352246)
chr7 (383-920)||(11756924-11757465)
chr7 (384-980)||(28487249-28487849)
chr7 (384-961)||(7349285-7349867)
chr7 (384-984)||(31155899-31156500)
chr7 (384-980)||(1849665-1850277)
chr7 (384-980)||(37412118-37412716)
chr7 (383-980)||(42330990-42331594)
chr7 (384-980)||(21989853-21990446)
chr7 (488-980)||(20297163-20297658)
chr7 (464-980)||(43253510-43254035)
chr7 (453-980)||(13099467-13099996)
chr7 (635-980)||(48457601-48457949)
chr7 (392-961)||(24258166-24258744)
chr7 (636-980)||(1049289-1049631)
chr7 (636-980)||(40836736-40837078)
chr7 (636-980)||(1046918-1047268)
chr7 (612-980)||(3878501-3878873)
chr7 (612-979)||(27306224-27306588)
chr7 (637-980)||(44724533-44724875)
chr7 (636-980)||(25542484-25542824)
chr7 (635-980)||(40946276-40946624)
chr7 (612-976)||(35559-35921)
chr7 (634-980)||(31435039-31435385)
chr7 (597-980)||(443509-443892)
chr7 (384-736)||(7094662-7095015)
chr7 (634-980)||(44515-44860)
chr7 (384-736)||(7092414-7092768)
chr7 (613-980)||(20137102-20137467)
chr7 (613-980)||(11355189-11355554)
chr7 (384-689)||(38395986-38396292)
chr7 (384-684)||(1606171-1606471)
chr7 (622-976)||(9680753-9681112)
chr7 (622-980)||(4295927-4296286)
chr7 (637-980)||(24748548-24748891)
chr7 (638-980)||(9679009-9679355)
chr7 (637-980)||(21679981-21680326)
chr7 (682-980)||(21592136-21592437)
chr7 (637-979)||(21678020-21678361)
chr7 (384-653)||(21470614-21470883)
chr7 (637-980)||(42223110-42223454)
chr7 (637-980)||(39145979-39146322)
chr7 (757-980)||(7092206-7092431)
chr7 (765-980)||(38396713-38396930)
chr7 (383-580)||(47865327-47865524)
chr7 (612-879)||(26804503-26804765)
chr7 (637-980)||(25276095-25276426)
chr7 (693-979)||(27832631-27832916)
chr7 (757-980)||(7094453-7094678)
chr7 (612-934)||(22828672-22828993)
chr7 (612-976)||(7188472-7188833)
chr7 (612-963)||(24817362-24817708)
chr7 (793-976)||(2935374-2935560)
chr7 (612-938)||(20091583-20091901)
chr7 (636-917)||(22251602-22251878)
chr7 (384-709)||(3676997-3677301)
chr7 (716-993)||(24813478-24813755)
chr7 (793-977)||(22108173-22108359)
chr7 (793-977)||(22137184-22137370)
chr7 (793-977)||(40549933-40550119)
chr7 (793-977)||(40552211-40552397)
chr7 (793-976)||(1606486-1606671)
chr7 (793-976)||(9027191-9027376)
chr7 (634-805)||(18567564-18567731)
chr7 (384-532)||(443326-443474)
chr7 (840-980)||(22393876-22394019)
chr7 (387-511)||(40281863-40281989)
chr7 (634-832)||(22392424-22392606)
chr7 (682-976)||(24465544-24465829)
chr7 (837-979)||(26295598-26295743)
chr7 (697-994)||(11081522-11081820)
chr7 (779-976)||(6332311-6332514)
chr7 (794-979)||(25351353-25351539)
chr7 (778-979)||(2120881-2121087)
chr7 (779-976)||(16297018-16297222)
chr7 (794-979)||(25357047-25357233)
chr7 (794-979)||(25410130-25410318)
chr7 (794-975)||(3320049-3320232)
chr7 (794-975)||(3324797-3324980)
chr7 (794-975)||(25405393-25405576)
chr7 (697-994)||(6048885-6049185)
chr7 (797-979)||(44512520-44512704)
chr7 (794-984)||(7069780-7069972)
chr7 (687-748)||(38396316-38396377)
chr7 (836-961)||(6046643-6046772)
chr7 (837-909)||(6348933-6349006)
chr7 (794-949)||(7074787-7074943)
chr7 (394-467)||(10690684-10690756)
chr7 (394-447)||(20297108-20297161)
chr7 (922-980)||(11759364-11759423)
chr7 (794-975)||(8378502-8378686)
chr7 (794-855)||(42006663-42006724)
chr7 (910-970)||(55955-56015)
chr7 (724-976)||(13290470-13290723)
chr7 (794-975)||(15540994-15541177)
chr7 (797-855)||(30246973-30247031)
chr7 (782-886)||(40281466-40281572)
chr7 (779-832)||(11084467-11084520)
chr7 (936-980)||(26804762-26804806)
chr7 (797-949)||(44143892-44144045)
chr7 (910-973)||(46516339-46516403)
chr7 (911-973)||(9190038-9190101)
chr7 (911-973)||(20284093-20284156)
chr7 (409-467)||(12310542-12310600)
chr7 (797-855)||(34546984-34547042)
chr7 (392-438)||(43254023-43254069)
chr7 (757-832)||(12310160-12310234)
chr7 (464-513)||(12484974-12485023)
chr7 (464-513)||(12506405-12506454)
chr7 (910-973)||(21983288-21983352)
chr7 (779-855)||(26210631-26210710)
chr7 (910-973)||(29159807-29159871)
chr7 (911-973)||(2580394-2580457)
chr7 (797-979)||(7464513-7464697)
chr7 (911-973)||(5817300-5817362)
chr7 (794-832)||(21369642-21369680)
chr7 (464-513)||(12657598-12657647)
chr7 (332-372)||(2403451-2403491)
chr7 (910-973)||(2647725-2647789)
chr7 (910-973)||(4796696-4796760)
chr7 (909-979)||(34546874-34546946)
chr7 (328-372)||(42818563-42818607)
chr7 (431-462)||(6628853-6628884)
chr7 (911-973)||(9185195-9185258)
chr7 (431-462)||(12657667-12657698)
chr7 (911-973)||(28617255-28617318)
chr7 (911-973)||(33332480-33332543)
chr7 (910-973)||(47263682-47263744)
chr7 (464-550)||(12310442-12310528)
chr7 (431-461)||(12485044-12485074)
chr7 (431-461)||(12506475-12506505)
chr7 (930-984)||(26417440-26417494)
chr7 (935-973)||(27347947-27347985)
chr7 (334-372)||(30581276-30581314)
chr7 (935-973)||(41317434-41317472)
chr7 (636-665)||(2935306-2935335)
chr7 (636-665)||(9027411-9027440)
chr7 (636-665)||(22108114-22108143)
chr7 (636-665)||(22137125-22137154)
chr7 (636-665)||(40549874-40549903)
chr7 (636-665)||(40552152-40552181)
chr7 (936-973)||(43864375-43864412)
[»] chr1 (152 HSPs)
chr1 (384-980)||(31735516-31736115)
chr1 (384-980)||(27336935-27337532)
chr1 (384-984)||(9463234-9463840)
chr1 (384-980)||(47905956-47906556)
chr1 (383-980)||(27339126-27339731)
chr1 (384-984)||(9459407-9460013)
chr1 (384-980)||(24325347-24325949)
chr1 (383-980)||(39931761-39932360)
chr1 (411-939)||(21948225-21948756)
chr1 (384-980)||(15294829-15295439)
chr1 (384-980)||(17324631-17325227)
chr1 (384-980)||(28998248-28998844)
chr1 (384-980)||(29003964-29004560)
chr1 (496-980)||(46431701-46432207)
chr1 (384-980)||(2949227-2949815)
chr1 (506-980)||(2510320-2510801)
chr1 (612-980)||(28840598-28840965)
chr1 (636-980)||(51749982-51750325)
chr1 (612-978)||(28842413-28842778)
chr1 (611-980)||(20302378-20302744)
chr1 (636-984)||(47179652-47180003)
chr1 (612-980)||(15823466-15823832)
chr1 (636-980)||(13761780-13762122)
chr1 (636-984)||(47177301-47177652)
chr1 (636-980)||(10399823-10400166)
chr1 (637-976)||(2617460-2617798)
chr1 (636-980)||(51752308-51752649)
chr1 (636-980)||(6822958-6823300)
chr1 (635-980)||(12302500-12302849)
chr1 (634-980)||(38925476-38925818)
chr1 (636-984)||(16226110-16226458)
chr1 (612-980)||(13215001-13215372)
chr1 (636-980)||(20291400-20291742)
chr1 (609-980)||(6995695-6996065)
chr1 (612-978)||(41646840-41647204)
chr1 (597-917)||(48665075-48665400)
chr1 (614-980)||(14097964-14098329)
chr1 (622-980)||(50076667-50077024)
chr1 (612-980)||(39462439-39462805)
chr1 (637-980)||(50307541-50307884)
chr1 (638-980)||(18307054-18307395)
chr1 (682-980)||(4131370-4131675)
chr1 (612-980)||(3579612-3579979)
chr1 (681-980)||(16428637-16428940)
chr1 (612-980)||(28207063-28207427)
chr1 (620-980)||(50078815-50079175)
chr1 (682-980)||(18839572-18839874)
chr1 (622-980)||(11457470-11457827)
chr1 (612-980)||(9241080-9241448)
chr1 (637-980)||(17186122-17186465)
chr1 (638-980)||(25251269-25251611)
chr1 (637-980)||(31489859-31490198)
chr1 (677-980)||(25127852-25128159)
chr1 (682-980)||(31425010-31425315)
chr1 (612-980)||(6756446-6756814)
chr1 (637-980)||(50248565-50248909)
chr1 (682-980)||(17318878-17319173)
chr1 (612-980)||(31422855-31423236)
chr1 (383-576)||(48664851-48665044)
chr1 (637-979)||(17324009-17324349)
chr1 (636-892)||(6823827-6824088)
chr1 (634-971)||(47451589-47451919)
chr1 (612-976)||(42922153-42922514)
chr1 (613-980)||(40133856-40134231)
chr1 (789-980)||(51757623-51757816)
chr1 (764-984)||(16231630-16231853)
chr1 (384-576)||(4131690-4131882)
chr1 (384-569)||(6115532-6115718)
chr1 (384-574)||(45693834-45694024)
chr1 (793-976)||(23785935-23786121)
chr1 (637-976)||(14183589-14183923)
chr1 (688-980)||(16432396-16432682)
chr1 (612-962)||(8347284-8347631)
chr1 (764-980)||(25248546-25248766)
chr1 (782-980)||(16429042-16429244)
chr1 (721-949)||(15669419-15669648)
chr1 (384-572)||(6997214-6997395)
chr1 (612-938)||(18800610-18800930)
chr1 (837-980)||(23816027-23816172)
chr1 (384-499)||(46432521-46432636)
chr1 (612-979)||(49495206-49495561)
chr1 (612-994)||(8349032-8349411)
chr1 (777-976)||(6115101-6115304)
chr1 (422-580)||(6996067-6996219)
chr1 (383-537)||(16561130-16561284)
chr1 (526-884)||(26520206-26520572)
chr1 (697-976)||(27916500-27916780)
chr1 (779-951)||(155788-155963)
chr1 (688-938)||(13125495-13125746)
chr1 (777-974)||(30790401-30790602)
chr1 (797-979)||(21353342-21353525)
chr1 (900-980)||(13358778-13358859)
chr1 (775-976)||(16561544-16561751)
chr1 (779-976)||(30738625-30738830)
chr1 (779-994)||(26613220-26613440)
chr1 (394-550)||(13785662-13785835)
chr1 (464-550)||(11693580-11693666)
chr1 (638-736)||(25248756-25248850)
chr1 (868-976)||(15916562-15916674)
chr1 (636-737)||(16231544-16231641)
chr1 (526-585)||(6115479-6115538)
chr1 (394-465)||(32260746-32260817)
chr1 (794-975)||(2232597-2232774)
chr1 (797-979)||(2401215-2401400)
chr1 (797-979)||(2393277-2393461)
chr1 (697-821)||(26332719-26332836)
chr1 (720-917)||(28279292-28279489)
chr1 (797-975)||(9526469-9526650)
chr1 (467-550)||(14352759-14352842)
chr1 (421-467)||(10115509-10115555)
chr1 (797-855)||(25134074-25134132)
chr1 (794-855)||(4144804-4144865)
chr1 (783-947)||(43104245-43104414)
chr1 (451-503)||(13112047-13112099)
chr1 (779-938)||(14353047-14353208)
chr1 (779-853)||(26332613-26332688)
chr1 (464-511)||(32260833-32260880)
chr1 (797-855)||(9521718-9521776)
chr1 (612-712)||(26613503-26613601)
chr1 (910-973)||(9476265-9476329)
chr1 (910-973)||(13598402-13598466)
chr1 (910-973)||(16124545-16124609)
chr1 (910-973)||(37069774-37069838)
chr1 (910-973)||(47703965-47704029)
chr1 (394-461)||(11693686-11693753)
chr1 (911-973)||(19072932-19072995)
chr1 (911-973)||(19120822-19120885)
chr1 (911-973)||(47098854-47098917)
chr1 (911-973)||(47102871-47102934)
chr1 (612-666)||(43104078-43104132)
chr1 (890-976)||(13127685-13127774)
chr1 (947-980)||(13447268-13447301)
chr1 (909-973)||(21536597-21536662)
chr1 (910-970)||(29651818-29651879)
chr1 (612-713)||(30790658-30790755)
chr1 (690-821)||(13127790-13127917)
chr1 (612-684)||(16431020-16431092)
chr1 (914-973)||(26644930-26644990)
chr1 (384-423)||(6997388-6997427)
chr1 (431-462)||(16855265-16855296)
chr1 (779-821)||(49959129-49959172)
chr1 (935-973)||(834167-834205)
chr1 (913-970)||(3281715-3281773)
chr1 (636-670)||(13449852-13449886)
chr1 (794-832)||(14997040-14997078)
chr1 (935-973)||(28220226-28220264)
chr1 (935-973)||(28265554-28265592)
chr1 (935-973)||(45644354-45644392)
chr1 (838-976)||(46783189-46783331)
chr1 (339-372)||(2260858-2260891)
chr1 (636-665)||(23783494-23783523)
chr1 (331-372)||(26240881-26240922)
[»] chr8 (111 HSPs)
chr8 (384-980)||(15808962-15809560)
chr8 (384-980)||(3873750-3874352)
chr8 (382-980)||(28283214-28283815)
chr8 (384-980)||(43529871-43530457)
chr8 (383-980)||(608469-609076)
chr8 (384-980)||(41384493-41385086)
chr8 (597-980)||(32339265-32339651)
chr8 (385-980)||(41382420-41383004)
chr8 (612-980)||(27829273-27829638)
chr8 (597-976)||(24873178-24873562)
chr8 (612-980)||(27826962-27827327)
chr8 (612-980)||(14807727-14808103)
chr8 (612-980)||(28251560-28251926)
chr8 (636-980)||(18810707-18811049)
chr8 (636-984)||(44720842-44721190)
chr8 (612-980)||(4423994-4424360)
chr8 (612-976)||(15072686-15073049)
chr8 (635-980)||(22684646-22685003)
chr8 (612-980)||(15067957-15068323)
chr8 (637-976)||(27106894-27107232)
chr8 (689-984)||(43079650-43079949)
chr8 (677-984)||(43082009-43082320)
chr8 (612-980)||(27910990-27911355)
chr8 (612-980)||(27957409-27957774)
chr8 (636-980)||(18812892-18813223)
chr8 (613-980)||(14419183-14419549)
chr8 (622-980)||(30480496-30480853)
chr8 (635-980)||(1225164-1225509)
chr8 (613-984)||(13858473-13858842)
chr8 (682-978)||(36865579-36865877)
chr8 (637-976)||(5372173-5372512)
chr8 (682-980)||(25952562-25952863)
chr8 (612-980)||(15185707-15186070)
chr8 (637-884)||(14477276-14477520)
chr8 (637-980)||(33541403-33541723)
chr8 (384-542)||(32339094-32339252)
chr8 (731-980)||(15956051-15956300)
chr8 (637-976)||(21482322-21482649)
chr8 (613-832)||(5622882-5623096)
chr8 (682-967)||(21480555-21480832)
chr8 (612-976)||(31162188-31162551)
chr8 (682-979)||(3005624-3005921)
chr8 (611-818)||(26775175-26775378)
chr8 (535-736)||(181434-181632)
chr8 (384-501)||(3265635-3265752)
chr8 (622-804)||(35872555-35872728)
chr8 (776-976)||(31035252-31035459)
chr8 (764-910)||(181622-181772)
chr8 (612-752)||(12517248-12517385)
chr8 (779-994)||(31578256-31578476)
chr8 (611-739)||(3886155-3886278)
chr8 (682-858)||(37214317-37214504)
chr8 (846-976)||(2468126-2468259)
chr8 (794-975)||(16752522-16752704)
chr8 (638-813)||(31035068-31035238)
chr8 (794-979)||(9021101-9021289)
chr8 (697-906)||(31573794-31574000)
chr8 (794-975)||(16757266-16757449)
chr8 (634-821)||(2468261-2468436)
chr8 (794-975)||(4812486-4812669)
chr8 (794-975)||(28327908-28328091)
chr8 (794-975)||(28895502-28895686)
chr8 (919-980)||(37214257-37214319)
chr8 (794-992)||(6376141-6376345)
chr8 (794-975)||(28332631-28332814)
chr8 (862-980)||(35872446-35872553)
chr8 (797-949)||(29554810-29554964)
chr8 (394-465)||(13986304-13986374)
chr8 (794-979)||(17799418-17799606)
chr8 (797-855)||(590797-590855)
chr8 (797-855)||(33032657-33032715)
chr8 (797-975)||(25684646-25684826)
chr8 (797-979)||(23179555-23179740)
chr8 (794-878)||(13985176-13985262)
chr8 (779-966)||(17847661-17847848)
chr8 (394-465)||(30679186-30679256)
chr8 (797-855)||(3276347-3276405)
chr8 (612-666)||(17847504-17847557)
chr8 (910-973)||(4696625-4696689)
chr8 (612-680)||(6375964-6376032)
chr8 (910-973)||(9765848-9765912)
chr8 (910-973)||(23799606-23799670)
chr8 (910-973)||(26403259-26403323)
chr8 (333-372)||(202576-202615)
chr8 (333-372)||(317413-317452)
chr8 (464-550)||(11701364-11701447)
chr8 (911-973)||(19752424-19752487)
chr8 (635-689)||(14419780-14419834)
chr8 (935-980)||(14477547-14477593)
chr8 (636-670)||(43081957-43081991)
chr8 (935-984)||(10930188-10930237)
chr8 (911-967)||(28307571-28307628)
chr8 (910-973)||(7412345-7412409)
chr8 (930-970)||(18106084-18106124)
chr8 (909-975)||(28890881-28890949)
chr8 (910-973)||(31071258-31071322)
chr8 (779-854)||(13985933-13986011)
chr8 (779-821)||(33839077-33839120)
chr8 (329-372)||(40599882-40599925)
chr8 (935-973)||(15212916-15212954)
chr8 (334-372)||(19220913-19220951)
chr8 (794-979)||(21033870-21034057)
chr8 (935-973)||(27811408-27811446)
chr8 (794-855)||(30423212-30423274)
chr8 (935-973)||(33352280-33352318)
chr8 (935-973)||(40321210-40321248)
chr8 (935-972)||(4733836-4733873)
chr8 (779-831)||(11701102-11701155)
chr8 (860-974)||(16833769-16833886)
chr8 (436-465)||(27820149-27820178)
chr8 (636-665)||(43079585-43079614)
[»] chr4 (162 HSPs)
chr4 (384-976)||(22132389-22132987)
chr4 (384-980)||(24347959-24348558)
chr4 (384-976)||(22134615-22135219)
chr4 (384-980)||(17662238-17662826)
chr4 (384-984)||(44599826-44600428)
chr4 (384-979)||(14787423-14788021)
chr4 (384-969)||(56030189-56030770)
chr4 (597-984)||(18709152-18709546)
chr4 (635-980)||(8631412-8631760)
chr4 (636-980)||(37089365-37089710)
chr4 (612-980)||(22044384-22044749)
chr4 (612-980)||(22046679-22047044)
chr4 (612-980)||(38409173-38409544)
chr4 (636-980)||(11434952-11435294)
chr4 (612-980)||(51015220-51015585)
chr4 (636-980)||(11006230-11006577)
chr4 (513-980)||(53404999-53405473)
chr4 (612-980)||(9148225-9148592)
chr4 (635-977)||(2484869-2485210)
chr4 (597-969)||(47210756-47211121)
chr4 (636-980)||(11008561-11008906)
chr4 (636-980)||(18847150-18847492)
chr4 (634-980)||(47274722-47275065)
chr4 (384-779)||(5100743-5101133)
chr4 (634-980)||(22800855-22801200)
chr4 (635-980)||(40637070-40637414)
chr4 (612-980)||(22802727-22803093)
chr4 (612-980)||(24888770-24889136)
chr4 (612-980)||(31849592-31849958)
chr4 (636-980)||(7941316-7941663)
chr4 (612-980)||(36919577-36919946)
chr4 (612-980)||(36921486-36921854)
chr4 (611-980)||(40091408-40091775)
chr4 (612-980)||(5198394-5198760)
chr4 (612-976)||(48486293-48486655)
chr4 (635-980)||(6764835-6765184)
chr4 (635-980)||(14633316-14633658)
chr4 (636-984)||(16934131-16934479)
chr4 (635-980)||(47868397-47868741)
chr4 (611-978)||(24878962-24879328)
chr4 (612-978)||(24880425-24880790)
chr4 (639-984)||(9176462-9176807)
chr4 (636-984)||(9174134-9174482)
chr4 (636-984)||(22780361-22780717)
chr4 (636-984)||(22782726-22783082)
chr4 (636-984)||(16931777-16932125)
chr4 (612-915)||(5637524-5637828)
chr4 (613-980)||(38928170-38928536)
chr4 (622-980)||(19095865-19096223)
chr4 (624-980)||(12395838-12396193)
chr4 (613-980)||(33415481-33415845)
chr4 (491-980)||(19322547-19323035)
chr4 (612-976)||(36378265-36378629)
chr4 (624-980)||(12400800-12401155)
chr4 (716-980)||(26085970-26086236)
chr4 (612-917)||(3824627-3824932)
chr4 (634-976)||(619445-619785)
chr4 (682-980)||(16453348-16453650)
chr4 (682-980)||(37313058-37313360)
chr4 (638-953)||(13543953-13544272)
chr4 (641-976)||(41997494-41997828)
chr4 (8-209)||(21777152-21777353)
chr4 (612-892)||(52942542-52942806)
chr4 (613-976)||(18537470-18537829)
chr4 (637-976)||(18409344-18409681)
chr4 (719-980)||(36380425-36380690)
chr4 (756-979)||(16455354-16455581)
chr4 (836-980)||(11437557-11437702)
chr4 (634-994)||(8756230-8756588)
chr4 (400-585)||(30136331-30136516)
chr4 (637-870)||(3937314-3937543)
chr4 (837-980)||(5635469-5635614)
chr4 (384-967)||(10112626-10113198)
chr4 (384-534)||(47211158-47211308)
chr4 (726-980)||(27499128-27499382)
chr4 (637-860)||(6132871-6133090)
chr4 (613-976)||(18534828-18535187)
chr4 (820-980)||(4215483-4215646)
chr4 (723-976)||(38890221-38890476)
chr4 (791-976)||(13547302-13547490)
chr4 (785-980)||(2891433-2891632)
chr4 (637-804)||(38270158-38270321)
chr4 (612-963)||(15032557-15032896)
chr4 (384-578)||(38890524-38890701)
chr4 (622-804)||(24446756-24446929)
chr4 (384-578)||(9022060-9022246)
chr4 (778-976)||(12102221-12102425)
chr4 (643-976)||(9863712-9864049)
chr4 (843-980)||(5101130-5101268)
chr4 (697-976)||(28453742-28454020)
chr4 (731-980)||(30136640-30136890)
chr4 (794-976)||(16185831-16186018)
chr4 (384-502)||(9863499-9863617)
chr4 (386-485)||(19322410-19322510)
chr4 (637-760)||(2891314-2891434)
chr4 (778-976)||(31983524-31983727)
chr4 (612-976)||(25357610-25357979)
chr4 (782-962)||(3982186-3982374)
chr4 (797-976)||(31300427-31300608)
chr4 (697-938)||(9022362-9022603)
chr4 (384-455)||(14789500-14789571)
chr4 (890-980)||(47563010-47563101)
chr4 (797-979)||(15316961-15317145)
chr4 (794-992)||(11853549-11853749)
chr4 (779-994)||(47150872-47151092)
chr4 (794-975)||(55822265-55822447)
chr4 (394-467)||(38209186-38209259)
chr4 (697-933)||(40998990-40999226)
chr4 (797-979)||(8529270-8529455)
chr4 (909-979)||(14789422-14789495)
chr4 (797-979)||(18586969-18587154)
chr4 (797-949)||(16489352-16489505)
chr4 (794-949)||(7050282-7050439)
chr4 (797-979)||(16688934-16689119)
chr4 (864-981)||(49088791-49088912)
chr4 (400-462)||(5516771-5516833)
chr4 (862-980)||(24446647-24446754)
chr4 (464-550)||(54929094-54929180)
chr4 (909-980)||(6133105-6133177)
chr4 (910-973)||(31985663-31985726)
chr4 (922-973)||(54867188-54867239)
chr4 (797-855)||(4558314-4558372)
chr4 (797-855)||(47566496-47566554)
chr4 (797-979)||(4556054-4556238)
chr4 (935-980)||(52942481-52942526)
chr4 (797-979)||(4884877-4885062)
chr4 (910-973)||(10047383-10047447)
chr4 (723-821)||(10114412-10114505)
chr4 (797-949)||(15831144-15831298)
chr4 (910-973)||(39245998-39246062)
chr4 (794-938)||(4570094-4570239)
chr4 (794-980)||(5336773-5336964)
chr4 (464-543)||(10979676-10979755)
chr4 (880-976)||(26557823-26557922)
chr4 (794-979)||(36769479-36769667)
chr4 (779-905)||(54906722-54906852)
chr4 (938-994)||(3937253-3937309)
chr4 (612-713)||(16186099-16186197)
chr4 (398-467)||(29609914-29609983)
chr4 (910-973)||(5269220-5269284)
chr4 (910-973)||(5396700-5396764)
chr4 (860-976)||(3578668-3578786)
chr4 (910-972)||(6743444-6743507)
chr4 (797-978)||(15312319-15312503)
chr4 (797-855)||(25699752-25699810)
chr4 (910-972)||(36315258-36315321)
chr4 (910-972)||(36329467-36329530)
chr4 (794-979)||(36771396-36771584)
chr4 (418-465)||(54929198-54929245)
chr4 (797-855)||(13072102-13072160)
chr4 (910-973)||(16623322-16623386)
chr4 (910-973)||(38152468-38152532)
chr4 (637-713)||(12102088-12102162)
chr4 (464-503)||(14647175-14647214)
chr4 (469-511)||(5516705-5516747)
chr4 (935-973)||(12739550-12739588)
chr4 (935-973)||(26175636-26175674)
chr4 (612-666)||(28453660-28453714)
chr4 (612-682)||(36380347-36380417)
chr4 (935-973)||(36463389-36463427)
chr4 (935-973)||(48893638-48893676)
chr4 (637-666)||(52043736-52043765)
[»] chr3 (186 HSPs)
chr3 (384-984)||(746422-747028)
chr3 (384-980)||(4103887-4104483)
chr3 (384-980)||(25533107-25533708)
chr3 (384-984)||(457950-458555)
chr3 (384-984)||(455573-456178)
chr3 (384-984)||(10621516-10622127)
chr3 (386-980)||(42989954-42990570)
chr3 (384-980)||(1313082-1313675)
chr3 (384-980)||(53917655-53918250)
chr3 (384-980)||(53915487-53916082)
chr3 (384-976)||(42991953-42992532)
chr3 (384-978)||(51943042-51943634)
chr3 (383-980)||(27635649-27636213)
chr3 (384-809)||(41848804-41849244)
chr3 (636-980)||(3859451-3859793)
chr3 (636-980)||(5191576-5191917)
chr3 (636-980)||(38889962-38890306)
chr3 (635-980)||(4308272-4308616)
chr3 (612-976)||(10084384-10084750)
chr3 (612-976)||(10191305-10191670)
chr3 (636-980)||(11170327-11170670)
chr3 (636-980)||(18099161-18099504)
chr3 (635-980)||(43228213-43228557)
chr3 (635-979)||(43226008-43226350)
chr3 (638-980)||(10956018-10956359)
chr3 (634-980)||(45882860-45883206)
chr3 (636-980)||(18096891-18097235)
chr3 (638-980)||(10958314-10958655)
chr3 (636-980)||(5522618-5522949)
chr3 (635-980)||(51726998-51727341)
chr3 (636-984)||(6063432-6063782)
chr3 (636-984)||(25388821-25389176)
chr3 (636-984)||(6065782-6066131)
chr3 (677-980)||(30005801-30006107)
chr3 (636-984)||(38210291-38210641)
chr3 (636-980)||(22114296-22114639)
chr3 (635-980)||(9604598-9604947)
chr3 (636-984)||(50493922-50494270)
chr3 (635-980)||(27101172-27101520)
chr3 (637-980)||(1626674-1627016)
chr3 (637-980)||(43423454-43423796)
chr3 (721-980)||(1321483-1321745)
chr3 (612-980)||(26720448-26720813)
chr3 (682-980)||(28101993-28102294)
chr3 (612-980)||(24979607-24979974)
chr3 (634-973)||(32264035-32264379)
chr3 (622-980)||(3314593-3314951)
chr3 (638-980)||(43421406-43421747)
chr3 (597-931)||(6561695-6562028)
chr3 (637-984)||(5926751-5927097)
chr3 (728-980)||(7606579-7606831)
chr3 (612-976)||(18162564-18162925)
chr3 (707-976)||(28413027-28413299)
chr3 (622-980)||(880442-880800)
chr3 (677-936)||(29956646-29956907)
chr3 (637-980)||(36011751-36012093)
chr3 (637-976)||(47148890-47149233)
chr3 (612-980)||(12267966-12268323)
chr3 (612-980)||(48361662-48362027)
chr3 (637-980)||(53468444-53468788)
chr3 (612-980)||(15780760-15781145)
chr3 (635-971)||(35917944-35918284)
chr3 (613-980)||(28761418-28761784)
chr3 (612-980)||(32218995-32219351)
chr3 (635-980)||(39715392-39715731)
chr3 (636-881)||(35777344-35777587)
chr3 (612-980)||(23633359-23633719)
chr3 (622-965)||(889779-890119)
chr3 (638-980)||(51674757-51675087)
chr3 (623-973)||(53591105-53591442)
chr3 (637-980)||(54691565-54691906)
chr3 (778-980)||(5886261-5886464)
chr3 (778-980)||(5899734-5899937)
chr3 (730-980)||(6484372-6484626)
chr3 (768-980)||(25688151-25688367)
chr3 (781-980)||(11168165-11168367)
chr3 (637-871)||(28100143-28100374)
chr3 (622-978)||(31151256-31151609)
chr3 (682-980)||(4666490-4666780)
chr3 (637-876)||(28180948-28181182)
chr3 (765-980)||(6231849-6232066)
chr3 (615-967)||(53597143-53597491)
chr3 (724-967)||(13420189-13420432)
chr3 (612-892)||(23636926-23637199)
chr3 (688-976)||(561769-562058)
chr3 (724-994)||(17795269-17795539)
chr3 (724-994)||(19103709-19103979)
chr3 (637-864)||(28137415-28137628)
chr3 (689-976)||(36871295-36871583)
chr3 (682-927)||(54884122-54884367)
chr3 (636-785)||(11163073-11163218)
chr3 (724-976)||(25635391-25635644)
chr3 (843-980)||(47701662-47701801)
chr3 (795-980)||(3306839-3307026)
chr3 (637-771)||(47701798-47701928)
chr3 (717-976)||(1673975-1674227)
chr3 (638-770)||(6231374-6231502)
chr3 (612-821)||(24177179-24177380)
chr3 (779-974)||(1620457-1620657)
chr3 (287-383)||(48635868-48635963)
chr3 (836-976)||(24181500-24181644)
chr3 (797-979)||(29913949-29914132)
chr3 (384-458)||(6561613-6561687)
chr3 (899-980)||(41849243-41849325)
chr3 (612-856)||(4560401-4560623)
chr3 (908-980)||(35919106-35919179)
chr3 (797-979)||(47878165-47878350)
chr3 (797-975)||(54188512-54188692)
chr3 (638-760)||(3306724-3306842)
chr3 (612-832)||(13419775-13419994)
chr3 (794-975)||(10094073-10094256)
chr3 (797-979)||(10897008-10897193)
chr3 (908-977)||(53894051-53894121)
chr3 (394-467)||(53974124-53974197)
chr3 (612-717)||(1321341-1321441)
chr3 (794-975)||(10100090-10100273)
chr3 (794-975)||(10200953-10201136)
chr3 (794-975)||(10207999-10208182)
chr3 (779-927)||(14634486-14634638)
chr3 (859-976)||(25634030-25634150)
chr3 (794-975)||(27544273-27544456)
chr3 (797-975)||(54193229-54193410)
chr3 (394-467)||(11072644-11072717)
chr3 (794-975)||(22625982-22626166)
chr3 (724-821)||(25633930-25634024)
chr3 (794-949)||(6303310-6303466)
chr3 (794-855)||(16462203-16462264)
chr3 (794-855)||(47883003-47883064)
chr3 (802-979)||(4535622-4535803)
chr3 (612-713)||(1618916-1619016)
chr3 (797-979)||(10612772-10612957)
chr3 (798-949)||(10949285-10949438)
chr3 (416-467)||(54287576-54287627)
chr3 (394-467)||(11066255-11066329)
chr3 (910-973)||(1736324-1736388)
chr3 (794-949)||(5858546-5858701)
chr3 (797-979)||(10595028-10595213)
chr3 (910-973)||(18552902-18552966)
chr3 (910-973)||(30709809-30709873)
chr3 (794-949)||(11079517-11079674)
chr3 (933-980)||(42992605-42992652)
chr3 (836-976)||(46966645-46966788)
chr3 (797-855)||(20031439-20031497)
chr3 (797-855)||(27762107-27762165)
chr3 (779-819)||(7768632-7768672)
chr3 (910-973)||(8370505-8370569)
chr3 (779-855)||(11066652-11066731)
chr3 (910-973)||(27974971-27975035)
chr3 (910-973)||(27986465-27986529)
chr3 (757-819)||(31021300-31021361)
chr3 (911-973)||(1417510-1417573)
chr3 (467-550)||(11066346-11066429)
chr3 (794-853)||(38002869-38002928)
chr3 (910-973)||(40844656-40844719)
chr3 (334-372)||(55337-55375)
chr3 (860-979)||(15823641-15823763)
chr3 (334-372)||(18745380-18745418)
chr3 (612-666)||(25635319-25635373)
chr3 (919-965)||(28181192-28181238)
chr3 (469-511)||(53974035-53974077)
chr3 (464-513)||(5535880-5535929)
chr3 (636-689)||(6719392-6719445)
chr3 (761-806)||(7606828-7606873)
chr3 (910-970)||(48438221-48438282)
chr3 (910-973)||(16264354-16264418)
chr3 (336-372)||(18744622-18744658)
chr3 (910-973)||(21711227-21711291)
chr3 (911-967)||(25929463-25929519)
chr3 (384-424)||(27000083-27000123)
chr3 (933-984)||(29845141-29845193)
chr3 (886-949)||(31021185-31021248)
chr3 (910-973)||(32143325-32143389)
chr3 (910-973)||(33386685-33386749)
chr3 (467-539)||(54287487-54287559)
chr3 (934-973)||(5236457-5236496)
chr3 (911-973)||(37466295-37466358)
chr3 (333-372)||(53344016-53344055)
chr3 (464-534)||(11072731-11072801)
chr3 (935-973)||(32744436-32744474)
chr3 (935-973)||(40913423-40913461)
chr3 (935-973)||(44331675-44331713)
chr3 (612-653)||(1620710-1620751)
chr3 (635-705)||(6484307-6484373)
chr3 (464-513)||(12019220-12019269)
chr3 (794-855)||(16996875-16996936)
chr3 (935-984)||(30236255-30236304)
[»] chr2 (134 HSPs)
chr2 (381-980)||(23452230-23452832)
chr2 (384-980)||(42452449-42453042)
chr2 (384-984)||(35215574-35216184)
chr2 (384-984)||(35217951-35218565)
chr2 (384-980)||(42923502-42924094)
chr2 (636-980)||(27104718-27105059)
chr2 (612-980)||(42064411-42064777)
chr2 (636-980)||(13910038-13910380)
chr2 (638-980)||(19502004-19502345)
chr2 (636-980)||(19504339-19504681)
chr2 (634-980)||(21520686-21521033)
chr2 (635-980)||(45279977-45280322)
chr2 (636-980)||(24162216-24162548)
chr2 (634-980)||(40032046-40032396)
chr2 (634-980)||(6258810-6259153)
chr2 (611-980)||(22287329-22287696)
chr2 (637-980)||(19007560-19007902)
chr2 (612-980)||(43623573-43623927)
chr2 (612-980)||(6264141-6264504)
chr2 (637-980)||(11739552-11739895)
chr2 (613-980)||(28196534-28196897)
chr2 (613-980)||(17848342-17848702)
chr2 (622-980)||(17849022-17849379)
chr2 (645-980)||(34979570-34979906)
chr2 (622-977)||(31732772-31733115)
chr2 (640-980)||(3022086-3022434)
chr2 (622-950)||(45239000-45239331)
chr2 (637-980)||(14837193-14837530)
chr2 (771-980)||(5375339-5375550)
chr2 (638-884)||(15539566-15539809)
chr2 (684-980)||(44289060-44289360)
chr2 (637-976)||(11578104-11578439)
chr2 (793-977)||(36558860-36559047)
chr2 (793-977)||(36561137-36561324)
chr2 (634-980)||(18800306-18800640)
chr2 (793-984)||(45332169-45332364)
chr2 (634-976)||(17897242-17897580)
chr2 (624-976)||(20146604-20146955)
chr2 (682-994)||(22874103-22874407)
chr2 (637-818)||(22163106-22163282)
chr2 (731-980)||(28459183-28459435)
chr2 (682-877)||(38020163-38020349)
chr2 (634-794)||(22407591-22407747)
chr2 (384-585)||(27583713-27583907)
chr2 (394-550)||(28568584-28568740)
chr2 (836-980)||(22407447-22407593)
chr2 (635-774)||(5377631-5377770)
chr2 (846-970)||(7462950-7463077)
chr2 (384-511)||(27136370-27136505)
chr2 (777-976)||(40699429-40699634)
chr2 (612-976)||(37962938-37963287)
chr2 (856-980)||(22707744-22707872)
chr2 (391-479)||(34575608-34575696)
chr2 (890-980)||(22163015-22163106)
chr2 (612-975)||(35107196-35107553)
chr2 (697-909)||(43139356-43139564)
chr2 (855-980)||(23870951-23871078)
chr2 (797-979)||(17943540-17943723)
chr2 (794-979)||(20054759-20054947)
chr2 (394-550)||(15693583-15693755)
chr2 (757-904)||(27136195-27136343)
chr2 (794-909)||(20589763-20589881)
chr2 (794-975)||(2736205-2736388)
chr2 (394-459)||(28568346-28568411)
chr2 (794-975)||(17462436-17462619)
chr2 (779-949)||(17921754-17921927)
chr2 (794-975)||(39686983-39687166)
chr2 (797-979)||(27517633-27517818)
chr2 (764-862)||(38414194-38414291)
chr2 (394-467)||(41303549-41303623)
chr2 (638-735)||(38020064-38020157)
chr2 (797-949)||(37170778-37170931)
chr2 (794-949)||(2740941-2741097)
chr2 (794-979)||(20050015-20050204)
chr2 (794-855)||(22712637-22712698)
chr2 (794-855)||(22717346-22717407)
chr2 (794-855)||(45567409-45567470)
chr2 (780-832)||(27583483-27583535)
chr2 (797-920)||(17932637-17932759)
chr2 (797-979)||(30478997-30479182)
chr2 (797-855)||(12781342-12781400)
chr2 (465-550)||(7502638-7502723)
chr2 (778-909)||(15693958-15694094)
chr2 (794-975)||(39680045-39680228)
chr2 (910-973)||(14699036-14699100)
chr2 (910-973)||(21629948-21630011)
chr2 (778-832)||(26345661-26345715)
chr2 (779-855)||(34575230-34575308)
chr2 (912-984)||(1345572-1345645)
chr2 (612-665)||(20147055-20147108)
chr2 (421-462)||(39286911-39286952)
chr2 (612-689)||(40699205-40699282)
chr2 (910-973)||(8390179-8390243)
chr2 (910-973)||(13569332-13569396)
chr2 (910-973)||(20522224-20522288)
chr2 (464-535)||(39286971-39287042)
chr2 (794-837)||(38190997-38191040)
chr2 (634-712)||(12342673-12342748)
chr2 (935-973)||(17057369-17057407)
chr2 (935-973)||(17085352-17085390)
chr2 (794-855)||(28458949-28459011)
chr2 (464-542)||(41303457-41303535)
chr2 (909-973)||(34682362-34682427)
chr2 (930-979)||(42288105-42288154)
chr2 (927-990)||(2838076-2838140)
chr2 (910-973)||(8040064-8040128)
chr2 (910-973)||(10445473-10445537)
chr2 (332-372)||(20606931-20606971)
chr2 (910-973)||(28259206-28259270)
chr2 (909-975)||(45679838-45679906)
chr2 (397-448)||(7502582-7502633)
chr2 (793-853)||(10942634-10942696)
chr2 (793-853)||(10948503-10948565)
chr2 (949-980)||(15539522-15539553)
chr2 (803-855)||(27248021-27248075)
chr2 (860-938)||(33604062-33604141)
chr2 (682-736)||(38414281-38414329)
chr2 (464-543)||(41304806-41304884)
chr2 (935-973)||(723744-723782)
chr2 (779-832)||(7502975-7503029)
chr2 (935-973)||(11151591-11151629)
chr2 (616-666)||(27583632-27583681)
chr2 (935-973)||(34139770-34139808)
chr2 (935-973)||(39284966-39285004)
chr2 (394-467)||(41304898-41304964)
chr2 (637-666)||(20589581-20589610)
chr2 (909-949)||(33670992-33671033)
chr2 (797-830)||(33674551-33674584)
chr2 (636-665)||(36559082-36559111)
chr2 (636-665)||(36561359-36561388)
chr2 (697-738)||(41304627-41304667)
chr2 (335-372)||(44297424-44297461)
chr2 (612-665)||(45156947-45156999)
chr2 (636-665)||(45332399-45332428)
[»] chr6 (113 HSPs)
chr6 (383-980)||(30966922-30967522)
chr6 (384-980)||(30034596-30035196)
chr6 (383-980)||(2628879-2629480)
chr6 (384-973)||(12195515-12196104)
chr6 (384-976)||(19704564-19705165)
chr6 (384-976)||(26932559-26933158)
chr6 (636-980)||(4816224-4816581)
chr6 (612-980)||(14507169-14507534)
chr6 (636-984)||(20915345-20915694)
chr6 (636-980)||(11983022-11983365)
chr6 (635-980)||(28241314-28241658)
chr6 (644-980)||(14458760-14459093)
chr6 (635-976)||(26064958-26065298)
chr6 (635-976)||(26084927-26085267)
chr6 (635-980)||(1230242-1230586)
chr6 (612-980)||(9019881-9020247)
chr6 (612-980)||(15532675-15533040)
chr6 (637-980)||(13057173-13057516)
chr6 (612-980)||(15541133-15541499)
chr6 (622-980)||(3390343-3390701)
chr6 (637-980)||(3629858-3630199)
chr6 (639-980)||(3631932-3632271)
chr6 (637-980)||(13039733-13040076)
chr6 (635-980)||(30728817-30729165)
chr6 (637-980)||(25477253-25477603)
chr6 (612-978)||(32279952-32280316)
chr6 (613-931)||(15530166-15530480)
chr6 (386-907)||(17011781-17012287)
chr6 (392-770)||(17852275-17852650)
chr6 (384-661)||(18317751-18318029)
chr6 (637-980)||(3233718-3234065)
chr6 (384-585)||(5275727-5275928)
chr6 (761-976)||(5273213-5273431)
chr6 (636-869)||(19227514-19227744)
chr6 (637-975)||(24338446-24338783)
chr6 (637-976)||(12161555-12161889)
chr6 (384-976)||(22857949-22858536)
chr6 (793-984)||(26066112-26066307)
chr6 (793-984)||(26068383-26068578)
chr6 (793-984)||(33308988-33309182)
chr6 (634-976)||(3027848-3028188)
chr6 (793-977)||(29754705-29754892)
chr6 (793-984)||(33311257-33311451)
chr6 (782-980)||(1069711-1069913)
chr6 (682-909)||(22490659-22490889)
chr6 (682-976)||(15719674-15719961)
chr6 (728-994)||(15367101-15367366)
chr6 (634-976)||(16455421-16455762)
chr6 (637-994)||(14466312-14466659)
chr6 (778-976)||(12186068-12186271)
chr6 (612-786)||(1072067-1072236)
chr6 (386-550)||(20526548-20526708)
chr6 (637-789)||(32447502-32447651)
chr6 (612-761)||(8995434-8995578)
chr6 (836-976)||(15346522-15346664)
chr6 (637-976)||(19696420-19696759)
chr6 (777-976)||(26945258-26945463)
chr6 (644-790)||(13870608-13870749)
chr6 (856-994)||(25465570-25465710)
chr6 (779-935)||(20526922-20527081)
chr6 (779-993)||(25078538-25078755)
chr6 (794-975)||(13878727-13878910)
chr6 (794-975)||(16785919-16786102)
chr6 (794-975)||(26887225-26887406)
chr6 (892-976)||(10584227-10584313)
chr6 (794-976)||(12937190-12937376)
chr6 (613-807)||(15346347-15346524)
chr6 (797-979)||(17694846-17695030)
chr6 (794-975)||(13883475-13883658)
chr6 (794-975)||(35201325-35201508)
chr6 (780-976)||(28037722-28037927)
chr6 (409-550)||(30445246-30445404)
chr6 (797-979)||(22342795-22342980)
chr6 (866-976)||(12911442-12911555)
chr6 (794-855)||(31248835-31248896)
chr6 (394-467)||(30443022-30443097)
chr6 (779-905)||(7542452-7542581)
chr6 (797-979)||(13467461-13467642)
chr6 (797-855)||(17036058-17036116)
chr6 (797-855)||(22351973-22352031)
chr6 (797-979)||(26643179-26643362)
chr6 (797-979)||(26749145-26749328)
chr6 (837-965)||(30445699-30445832)
chr6 (909-979)||(3577484-3577555)
chr6 (794-837)||(3577653-3577696)
chr6 (637-753)||(10584105-10584212)
chr6 (910-973)||(22963704-22963767)
chr6 (910-973)||(23824626-23824689)
chr6 (797-979)||(33215830-33216015)
chr6 (779-832)||(11138423-11138477)
chr6 (801-855)||(12166267-12166321)
chr6 (611-665)||(28038012-28038066)
chr6 (797-853)||(19701985-19702041)
chr6 (910-973)||(5572270-5572334)
chr6 (910-973)||(5757507-5757571)
chr6 (910-973)||(10077194-10077258)
chr6 (910-973)||(21356040-21356104)
chr6 (911-973)||(31936591-31936654)
chr6 (911-973)||(31979517-31979580)
chr6 (613-666)||(15366992-15367044)
chr6 (911-967)||(24436001-24436058)
chr6 (800-837)||(25941650-25941687)
chr6 (909-979)||(25941785-25941857)
chr6 (860-976)||(28078191-28078310)
chr6 (613-667)||(26945104-26945157)
chr6 (935-973)||(33211185-33211223)
chr6 (802-855)||(5165936-5165989)
chr6 (636-665)||(26066335-26066364)
chr6 (636-665)||(26068606-26068635)
chr6 (636-665)||(29755003-29755032)
chr6 (909-976)||(30443537-30443606)
chr6 (636-665)||(33308932-33308961)
chr6 (636-665)||(33311201-33311230)
[»] chr5 (133 HSPs)
chr5 (383-980)||(25803706-25804310)
chr5 (384-980)||(18468698-18469295)
chr5 (384-980)||(27912219-27912822)
chr5 (384-980)||(27910135-27910736)
chr5 (384-984)||(15551925-15552536)
chr5 (386-980)||(18511205-18511800)
chr5 (387-980)||(18509311-18509904)
chr5 (404-980)||(10586549-10587118)
chr5 (464-980)||(18466453-18466970)
chr5 (384-980)||(26097421-26098017)
chr5 (384-980)||(18596326-18596932)
chr5 (636-980)||(38882048-38882391)
chr5 (612-980)||(2174839-2175204)
chr5 (384-832)||(26098395-26098841)
chr5 (612-980)||(25921466-25921832)
chr5 (612-980)||(4236549-4236914)
chr5 (636-977)||(21684448-21684797)
chr5 (612-980)||(21947947-21948312)
chr5 (635-980)||(39854426-39854769)
chr5 (612-980)||(16776077-16776443)
chr5 (636-984)||(31545023-31545371)
chr5 (677-978)||(34477048-34477353)
chr5 (635-980)||(10529092-10529436)
chr5 (636-984)||(31542678-31543025)
chr5 (677-980)||(34479411-34479718)
chr5 (677-980)||(6745049-6745354)
chr5 (636-976)||(31179368-31179707)
chr5 (612-980)||(2818328-2818695)
chr5 (635-980)||(6747246-6747590)
chr5 (637-980)||(1189600-1189949)
chr5 (526-976)||(40221349-40221805)
chr5 (637-976)||(25904047-25904385)
chr5 (383-665)||(3373348-3373631)
chr5 (637-980)||(17072827-17073170)
chr5 (637-980)||(24126800-24127142)
chr5 (639-980)||(16092192-16092537)
chr5 (719-980)||(658349-658610)
chr5 (640-980)||(10474316-10474655)
chr5 (622-980)||(31472605-31472963)
chr5 (612-980)||(6756414-6756778)
chr5 (635-980)||(17818485-17818826)
chr5 (635-979)||(37705774-37706117)
chr5 (634-980)||(36402321-36402666)
chr5 (645-980)||(2954368-2954702)
chr5 (634-980)||(12555916-12556261)
chr5 (637-980)||(39397986-39398327)
chr5 (764-980)||(4410090-4410308)
chr5 (637-976)||(695833-696160)
chr5 (636-980)||(31465982-31466314)
chr5 (776-980)||(20505836-20506041)
chr5 (637-917)||(34530722-34531001)
chr5 (793-984)||(10749796-10749990)
chr5 (773-980)||(39798123-39798333)
chr5 (620-976)||(6661181-6661533)
chr5 (644-980)||(21288715-21289047)
chr5 (384-567)||(21288529-21288713)
chr5 (764-980)||(41585737-41585956)
chr5 (793-984)||(10757273-10757466)
chr5 (682-854)||(20043035-20043208)
chr5 (793-977)||(23665140-23665326)
chr5 (793-977)||(23793261-23793447)
chr5 (759-980)||(2723964-2724179)
chr5 (637-858)||(20044954-20045172)
chr5 (793-984)||(3373125-3373320)
chr5 (793-977)||(15354571-15354757)
chr5 (793-984)||(38960120-38960314)
chr5 (793-977)||(15356847-15357033)
chr5 (800-977)||(23741855-23742034)
chr5 (637-994)||(36208524-36208875)
chr5 (391-536)||(17415748-17415893)
chr5 (685-980)||(9020211-9020506)
chr5 (684-980)||(20053834-20054123)
chr5 (634-773)||(20507665-20507800)
chr5 (697-938)||(17413202-17413441)
chr5 (635-737)||(4409999-4410101)
chr5 (384-488)||(6661929-6662033)
chr5 (779-976)||(15143547-15143750)
chr5 (793-977)||(23667415-23667601)
chr5 (597-736)||(41585946-41586081)
chr5 (697-937)||(2144599-2144840)
chr5 (384-463)||(40221282-40221361)
chr5 (890-980)||(26098281-26098373)
chr5 (794-975)||(1170811-1170994)
chr5 (612-864)||(42770693-42770934)
chr5 (464-580)||(15143262-15143371)
chr5 (797-984)||(4897828-4898021)
chr5 (866-976)||(15445263-15445376)
chr5 (799-979)||(25445501-25445684)
chr5 (797-979)||(22672837-22673022)
chr5 (794-975)||(35385450-35385634)
chr5 (384-438)||(18466411-18466465)
chr5 (837-910)||(42770951-42771025)
chr5 (394-467)||(5779144-5779217)
chr5 (797-976)||(17841246-17841428)
chr5 (797-979)||(25452498-25452683)
chr5 (384-438)||(15143220-15143274)
chr5 (697-920)||(4754159-4754380)
chr5 (794-949)||(1240428-1240585)
chr5 (794-855)||(2298122-2298183)
chr5 (927-980)||(20043222-20043276)
chr5 (797-979)||(28786407-28786592)
chr5 (779-976)||(34033563-34033768)
chr5 (612-829)||(29748261-29748479)
chr5 (800-853)||(40222769-40222822)
chr5 (910-973)||(9353361-9353425)
chr5 (910-973)||(36932379-36932443)
chr5 (797-855)||(11962554-11962612)
chr5 (911-973)||(28832263-28832326)
chr5 (612-666)||(2144898-2144952)
chr5 (334-372)||(33087476-33087514)
chr5 (909-973)||(11917000-11917065)
chr5 (794-855)||(31782578-31782639)
chr5 (910-973)||(10281755-10281819)
chr5 (910-973)||(15464536-15464600)
chr5 (794-854)||(16093413-16093473)
chr5 (910-973)||(17003989-17004053)
chr5 (910-973)||(19588750-19588814)
chr5 (909-979)||(42238376-42238448)
chr5 (637-684)||(2723911-2723958)
chr5 (911-973)||(31300626-31300689)
chr5 (431-465)||(2532750-2532784)
chr5 (794-832)||(10627364-10627402)
chr5 (616-666)||(15143411-15143460)
chr5 (935-973)||(19806493-19806531)
chr5 (935-973)||(32636954-32636992)
chr5 (636-670)||(34477374-34477408)
chr5 (636-665)||(10757207-10757236)
chr5 (636-665)||(15354789-15354818)
chr5 (636-665)||(15357065-15357094)
chr5 (636-665)||(23665081-23665110)
chr5 (636-665)||(23793477-23793506)
chr5 (636-665)||(38960349-38960378)
chr5 (331-372)||(39466882-39466923)
[»] scaffold0005 (5 HSPs)
scaffold0005 (384-979)||(51709-52307)
scaffold0005 (635-980)||(183634-183976)
scaffold0005 (384-455)||(50159-50230)
scaffold0005 (909-979)||(50235-50308)
scaffold0005 (464-503)||(170076-170115)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (384-980)||(11466-12061)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (384-976)||(78883-79476)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (384-939)||(1735-2294)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (612-980)||(69285-69654)
scaffold0025 (612-792)||(73207-73386)
scaffold0025 (755-803)||(73160-73208)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (635-980)||(41476-41820)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (634-980)||(3947-4290)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (636-974)||(2832-3168)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (636-977)||(29113-29462)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (636-984)||(6151-6499)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (649-979)||(14376-14707)
scaffold0131 (612-979)||(14948-15313)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (677-984)||(30-341)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (755-980)||(1446-1673)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (613-980)||(79789-80154)
scaffold0004 (794-855)||(188363-188424)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (612-976)||(15817-16178)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (613-980)||(85161-85526)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (693-867)||(35644-35819)
scaffold0011 (909-976)||(35817-35885)
[»] scaffold0468 (2 HSPs)
scaffold0468 (527-976)||(1638-2080)
scaffold0468 (385-499)||(2070-2184)
[»] scaffold0140 (5 HSPs)
scaffold0140 (793-977)||(22221-22407)
scaffold0140 (793-977)||(24496-24682)
scaffold0140 (910-973)||(8448-8512)
scaffold0140 (636-665)||(22162-22191)
scaffold0140 (636-665)||(24437-24466)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (638-976)||(16646-16981)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (384-532)||(4546-4694)
scaffold0133 (597-967)||(4728-5095)
[»] scaffold1674 (2 HSPs)
scaffold1674 (384-478)||(1-95)
scaffold1674 (939-980)||(1444-1485)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (635-809)||(993-1168)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (794-936)||(224819-224961)
scaffold0006 (910-973)||(5687-5751)
scaffold0006 (910-973)||(2496-2560)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (920-977)||(4675-4733)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (797-979)||(16980-17165)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (797-975)||(16328-16509)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (467-537)||(57836-57905)
[»] scaffold0533 (1 HSPs)
scaffold0533 (421-462)||(2232-2273)
[»] scaffold1050 (1 HSPs)
scaffold1050 (909-975)||(3068-3136)
[»] scaffold0087 (1 HSPs)
scaffold0087 (910-973)||(43990-44054)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (935-973)||(20415-20453)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 485; Significance: 0; HSPs: 152)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 485; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Original strand, 38393683 - 38394282
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38393683 tgttgtagtatgattctaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatatataagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatttatttatgg 38393782  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38393783 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatgttatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 38393882  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
     |         | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38393883 tgaaaaaataacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagag 38393982  T
Q  684 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38393983 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgat 38394082  T
Q  784 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394083 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 38394182  T
Q  883 atttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394183 atttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 38394282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 471; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Original strand, 20299155 - 20299756
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299155 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttatttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 20299254  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20299255 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 20299354  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    ||         | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20299355 agaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccatatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagag 20299454  T
Q  684 atagagggggctgaaacaa-gggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactaggg-tttgtgggttg 781  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  20299455 atagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttg 20299554  T
Q  782 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299555 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 20299654  T
Q  881 tgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 978  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299655 tgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 20299754  T
Q  979 tt 980  Q
    ||    
T  20299755 tt 20299756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Original strand, 3035415 - 3036020
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035415 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 3035514  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3035515 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 3035614  T
Q  584 agnnnnnnnnnca---tatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 680  Q
    ||          |   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035615 agaaagaaaaaaaacgtatcttcagtatggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 3035714  T
Q  681 tagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 780  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035715 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 3035814  T
Q  781 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg---gaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3035815 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaac 3035914  T
Q  877 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 974  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035915 ccattgatttctcttttgcaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 3036014  T
Q  975 ttcttt 980  Q
    ||||||    
T  3036015 ttcttt 3036020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 7472574 - 7471973
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472574 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 7472475  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  7472474 acaataaatatattattgtatcatatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaagg 7472375  T
Q  584 agnnnnnnnnnca--tatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagat 681  Q
    ||          |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  7472374 agaaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagag 7472275  T
Q  682 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 781  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7472274 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttg 7472175  T
Q  782 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7472174 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaacccat 7472075  T
Q  881 tgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 978  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472074 tgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 7471975  T
Q  979 tt 980  Q
    ||    
T  7471974 tt 7471973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Original strand, 20625734 - 20626334
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20625734 tgttctagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 20625833  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  20625834 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattttttcactgaagg 20625933  T
Q  584 agnnnnnnnnn-catatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagata 682  Q
    ||          | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  20625934 agcaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagaga 20626033  T
Q  683 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttga 782  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  20626034 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttga 20626133  T
Q  783 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 881  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20626134 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccatt 20626233  T
Q  882 gatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20626234 gatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 20626333  T
Q  980 t 980  Q
    |    
T  20626334 t 20626334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Original strand, 20629625 - 20630225
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629625 tgttctagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 20629724  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  20629725 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattttttcactgaagg 20629824  T
Q  584 agnnnnnnnnn-catatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagata 682  Q
    ||          | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  20629825 agcaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagaga 20629924  T
Q  683 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttga 782  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  20629925 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttga 20630024  T
Q  783 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 881  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20630025 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccatt 20630124  T
Q  882 gatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630125 gatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 20630224  T
Q  980 t 980  Q
    |    
T  20630225 t 20630225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Original strand, 20642044 - 20642644
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642044 tgttctagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 20642143  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  20642144 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattttttcactgaagg 20642243  T
Q  584 agnnnnnnnnn-catatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagata 682  Q
    ||          | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  20642244 agcaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagaga 20642343  T
Q  683 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttga 782  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  20642344 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttga 20642443  T
Q  783 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 881  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20642444 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccatt 20642543  T
Q  882 gatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642544 gatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 20642643  T
Q  980 t 980  Q
    |    
T  20642644 t 20642644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 7470621 - 7470015
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470621 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattattgctaaaaatataaaacatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 7470522  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  7470521 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaagg 7470422  T
Q  584 agnnnnnnnnnca-------tatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaacttt 676  Q
    ||          |       |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7470421 agaaaagaaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagactaaacttt 7470322  T
Q  677 gagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg 776  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7470321 gagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtg 7470222  T
Q  777 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 875  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470221 ggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 7470122  T
Q  876 cccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470121 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctccctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 7470022  T
Q  974 attcttt 980  Q
    |||||||    
T  7470021 attcttt 7470015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 442; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Original strand, 18345237 - 18345837
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  18345237 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctaaaaatatatttattg 18345336  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18345337 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaatggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 18345436  T
Q  584 agnnnnnnnnn-catatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagata 682  Q
    ||          | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  18345437 agaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctgaactttgaggga 18345536  T
Q  683 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttga 782  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||| |||| |||||||    
T  18345537 gatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttga 18345636  T
Q  783 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 881  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18345637 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 18345736  T
Q  882 gatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18345737 gatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattctt 18345836  T
Q  980 t 980  Q
    |    
T  18345837 t 18345837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 383 - 980
Target Start/End: Original strand, 28485260 - 28485861
Alignment:
Q  383 ctgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 482  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485260 ctgttgtagtatgattcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 28485359  T
Q  483 gacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgagg 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  28485360 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcaccgaag 28485459  T
Q  583 gagnnnnnnnnnca--tatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 680  Q
    |||         ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485460 gaggaaaaaaaacacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 28485559  T
Q  681 tagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 780  Q
     ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28485560 gagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggtt 28485659  T
Q  781 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 879  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  28485660 gattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatcca 28485759  T
Q  880 ttgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 978  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485760 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcagagggttgctctctcctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 28485859  T
Q  979 tt 980  Q
    ||    
T  28485860 tt 28485861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 7352246 - 7351640
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7352246 tgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatgg 7352147  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  7352146 acaataaatatatttttgtatcgcatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgaggcaaatattctttcactgaatg 7352047  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    ||         | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7352046 agaaaaaaaaacgtatcttcagtgtgatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatataaaccttgtatcaggctaaactttgagagag 7351947  T
Q  684 a--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 781  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7351946 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggctttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttg 7351847  T
Q  782 attcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 879  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7351846 attcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 7351747  T
Q  880 ttgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttc 977  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  7351746 ttgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttc 7351647  T
Q  978 tttgtgt 984  Q
    |||||||    
T  7351646 tttgtgt 7351640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 383 - 920
Target Start/End: Original strand, 11756924 - 11757465
Alignment:
Q  383 ctgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11756924 ctgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 11757023  T
Q  483 gacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgagg 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11757024 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaactatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 11757123  T
Q  583 gagnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagata 682  Q
    |||         | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11757124 gagaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagaga 11757223  T
Q  683 gatagagggggctgaaacaa-gggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactaggg-tttgtgggtt 780  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  11757224 gatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggtt 11757323  T
Q  781 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 879  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757324 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 11757423  T
Q  880 ttgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcg 920  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757424 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcg 11757465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Original strand, 28487249 - 28487849
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28487249 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgcttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 28487348  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28487349 acaataaatataattttgtatcgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 28487448  T
Q  584 agnnnnnnnnn-catatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagata 682  Q
    ||          | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  28487449 agaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttctaaatttatgagttatacttttcctataaatatagaccatgtatcaggctaaactttgagaga 28487548  T
Q  683 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttga 782  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  28487549 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggttga 28487648  T
Q  783 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 881  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28487649 ttcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 28487748  T
Q  882 gatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28487749 gatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcagagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattctt 28487848  T
Q  980 t 980  Q
    |    
T  28487849 t 28487849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 961
Target Start/End: Complemental strand, 7349867 - 7349285
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7349867 tgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatgg 7349768  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  7349767 acaataaatatatttttgtatcgcatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgaggcaaatattctttcactgaatg 7349668  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    ||         | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7349667 agaaaaaaaaacgtatcttcagtgtgatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagag 7349568  T
Q  684 a--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 781  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7349567 agatagagggggctgaaacaggggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttg 7349468  T
Q  782 attcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 879  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7349467 attcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 7349368  T
Q  880 ttgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaa 961  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  7349367 ttgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 7349285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 31156500 - 31155899
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31156500 tgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatgg 31156401  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31156400 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 31156301  T
Q  584 agnnnnnnnnn-catatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagata 682  Q
    ||          |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||    
T  31156300 agaaaaaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagctatacttttactataaatatagagcttgtatcaaggcaaactttgagata 31156201  T
Q  683 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttga 782  Q
    ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31156200 ga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttga 31156105  T
Q  783 ttcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 880  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31156104 ttcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgggtacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 31156005  T
Q  881 tgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttct 978  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31156004 tgatttctctttgtaacggtactcatcctatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttct 31155905  T
Q  979 ttgtgt 984  Q
    ||||||    
T  31155904 ttgtgt 31155899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Original strand, 1849665 - 1850277
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1849665 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 1849764  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  1849765 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcagatattctttcactgaagg 1849864  T
Q  584 agnnnnnnnnn-catatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagata 682  Q
    ||          |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    ||||||||||| |    
T  1849865 agaaaaaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagaga 1849964  T
Q  683 ga------------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactaggg 770  Q
    ||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1849965 gagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaggg 1850064  T
Q  771 tttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 869  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1850065 tttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattc 1850164  T
Q  870 ttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 967  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1850165 ttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggt 1850264  T
Q  968 caacaaattcttt 980  Q
    |||||||||||||    
T  1850265 caacaaattcttt 1850277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 37412716 - 37412118
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37412716 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 37412617  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  37412616 acaataaatataattatgtaacgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattcttccactgaagg 37412517  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    ||         | |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| | |    ||    
T  37412516 agaaaaaaaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatttatgagttatatttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctgg----ag 37412421  T
Q  684 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctc-ttcggaacaaacactagggtttgtgggttga 782  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||    
T  37412420 atatagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttga 37412321  T
Q  783 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 881  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37412320 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 37412221  T
Q  882 gatttctc--tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    ||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  37412220 gatatctctttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccctagactgggtcaatttggaccgaactggatcaataaattc 37412121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 383 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 42331594 - 42330990
Alignment:
Q  383 ctgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 482  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42331594 ctgttgtagtatgacttaaaatttgatgaatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 42331495  T
Q  483 gacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgagg 582  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  42331494 gacaataagtatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaag 42331395  T
Q  583 gagnnnnnnnnnca------tatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaacttt 676  Q
    |||          |      |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  42331394 gagaaagaaaaaaaaaaacgtatctttagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgtatcagactaaacttt 42331295  T
Q  677 gagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg 776  Q
    ||||||||    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  42331294 gagataga----gggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgag 42331199  T
Q  777 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt--acgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 873  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42331198 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 42331099  T
Q  874 aacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 971  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42331098 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcattatatagtgaaacggagggctattctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 42330999  T
Q  972 aaattcttt 980  Q
    |||||||||    
T  42330998 aaattcttt 42330990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Original strand, 21989853 - 21990446
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  21989853 tgttgtagtatgacccaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattgtgt--tgaaaatatatttatgg 21989950  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21989951 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 21990050  T
Q  584 agnnnnnnnnn-catatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagata 682  Q
    ||          | ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| | ||||||    
T  21990051 aggaaaaaaaaacgtatcttctgtgtggtattcgttccaaatttatgagttataattttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagata 21990150  T
Q  683 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttga 782  Q
    ||     ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  21990151 ga-----ggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactatgatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttga 21990245  T
Q  783 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 881  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  21990246 ttcaccttgagaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcatt 21990345  T
Q  882 gatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21990346 gatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 21990445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 488 - 980
Target Start/End: Original strand, 20297163 - 20297658
Alignment:
Q  488 taaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgagggagnn 587  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||      
T  20297163 taaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcaccgaaggagaa 20297262  T
Q  588 nnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatag 687  Q
           | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20297263 aaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttacgagttatacttttactaaaaatatggaccttgtatcaggctaaactttgagagagatag 20297362  T
Q  688 agggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  20297363 agggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgattcac 20297462  T
Q  788 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 886  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297463 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaacccattgattt 20297562  T
Q  887 ctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20297563 ctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttt 20297658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 464 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 43254035 - 43253510
Alignment:
Q  464 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgc 563  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43254035 tgctaaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgc 43253936  T
Q  564 aaatattctttcactgagggagnnnnnnnnnca---tatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttg 660  Q
    ||||||||||||||||| ||||          |   ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43253935 aaatattctttcactgaaggagaaaaaataagaaagtatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttg 43253836  T
Q  661 tatcaggctaaactttgagatagatagagg----gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcgg 756  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||     |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  43253835 tatcaggctaaactttgagagagagagagaaagagggctgaaacaaggttttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgg 43253736  T
Q  757 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattagg 855  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  43253735 aacaaacacta-ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacggaaagaggctgagactttggatagaattagg 43253637  T
Q  856 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc-cagactaggtcaattt 953  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43253636 cgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccctcagactaggtcaattt 43253537  T
Q  954 ggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
     |||||||||||||||| |||||||||    
T  43253536 agaccgaactgggtcaataaattcttt 43253510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 453 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 13099996 - 13099467
Alignment:
Q  453 aatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattat 552  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099996 aatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatattttcgtaccgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattat 13099897  T
Q  553 atttttgatgcaaatattctttcactgagggagnnnnnnnnn-catatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaata 651  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||          | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099896 atttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaata 13099797  T
Q  652 tagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctc 751  Q
    ||||||||| ||||   ||||| |||    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13099796 tagaccttgaatcaaagtaaaccttg----agatagagggggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc 13099701  T
Q  752 ttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaa 850  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||    
T  13099700 tttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaa 13099601  T
Q  851 ttaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactagg 946  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13099600 ttaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactagg 13099501  T
Q  947 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099500 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 13099467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 635 - 980
Target Start/End: Original strand, 48457601 - 48457949
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 734  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457601 tactttcactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 48457700  T
Q  735 tgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457701 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacctagggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 48457800  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 932  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48457801 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 48457900  T
Q  933 ct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457901 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 48457949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 392 - 961
Target Start/End: Original strand, 24258166 - 24258744
Alignment:
Q  392 tatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaa 491  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24258166 tatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaa 24258265  T
Q  492 tatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgagggagnnnnnn 591  Q
    ||||||||||||  |||||| | |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||          
T  24258266 tatatttttgtacagtatgaaggacgattga-tgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgtaaatattctttcactgaaggagaaaaaa 24258364  T
Q  592 nnnca------tatcttcagtctgg--tatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
        |      |||||||||| ||   |||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||   |||||||||  ||||| |||||||      
T  24258365 ataaagaaatgtatcttcagtgtgtgatattcgttccaaatttatgagttatatttct-ctataaatataggttttgtatcagagtaaacattgagat-- 24258461  T
Q  684 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 783  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  24258462 --agagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactatggtttgagggttgat 24258559  T
Q  784 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 882  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  || |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24258560 tcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttggatagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattg 24258659  T
Q  883 atttctc-tttgtaacgttactcatca----tatagtggatcggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaa 961  Q
    || |||| ||||||| |||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  24258660 atatctcttttgtaaagttactcatcattattatagtggaacggagggctgctctctctttcagactaggtcaatttggaccgaa 24258744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 1049631 - 1049289
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049631 acttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 1049536  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049535 gtatagagtttgtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 1049436  T
Q  836 -ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1049435 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctct 1049336  T
Q  935 -ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049335 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 1049289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 40837078 - 40836736
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||| || ||||| ||    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40837078 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaatttggagattga----gggggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 40836983  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40836982 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 40836883  T
Q  836 g-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40836882 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 40836783  T
Q  935 -ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40836782 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 40836736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 1047268 - 1046918
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagataga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 731  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1047268 acttttactataaatataaaccttgtatcaagctaatctaagagagagagagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagg 1047169  T
Q  732 gtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 831  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047168 gtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 1047069  T
Q  832 ggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 930  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1047068 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgct 1046969  T
Q  931 ctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1046968 ctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 1046918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Original strand, 3878501 - 3878873
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaat----atagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtt 707  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||    ||||||||||||||||   |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  3878501 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaattaatatagaccttgtatcagagcaaactttgaga--gatagagggggctgaaacaagggtt 3878597  T
Q  708 tagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga 807  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3878598 tagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggttgattcaccttggtaaacactattagga 3878697  T
Q  808 ttgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactca 905  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3878698 ttgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactca 3878797  T
Q  906 tcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3878798 tcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactatgttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 3878873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 612 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 27306588 - 27306224
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  27306588 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttaga 27306494  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27306493 aaggcaacaacaaaactagggttt-tatagagtttgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 27306395  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 909  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  27306394 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 27306295  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27306294 atagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattctt 27306224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 637 - 980
Target Start/End: Original strand, 44724533 - 44724875
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | |    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724533 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctgg----agatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 44724628  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct- 835  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  44724629 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctg 44724728  T
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44724729 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctct 44724828  T
Q  935 -ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724829 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 44724875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Original strand, 25542484 - 25542824
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||     ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25542484 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataga-----ggggctgaaacaaaggtttagaaaggtaacaacaaaactagggttt 25542578  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  25542579 gtatagagtttgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaagactattaggattgagtctcttggttacaggaagagact 25542677  T
Q  836 gg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25542678 gggactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctct 25542777  T
Q  935 cccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25542778 cccctagactaggttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 25542824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 635 - 980
Target Start/End: Original strand, 40946276 - 40946624
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 734  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||    |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40946276 tactttcactataaatataaaccttgtttcatagcaaactttgagagggacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 40946375  T
Q  735 tgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40946376 tgtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgatttactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggc 40946475  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 932  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40946476 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcgaagggctgctct 40946575  T
Q  933 ct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40946576 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 40946624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 612 - 976
Target Start/End: Original strand, 35559 - 35921
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||    
T  35559 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagat----agagggggctgaaacaagggttcaga 35653  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35654 aagacaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattga 35753  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 909  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35754 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 35853  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35854 atagtggaacggagagctgctttctcccctagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatt 35921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 634 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 31435385 - 31435039
Alignment:
Q  634 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 733  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435385 atacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaa----ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 31435290  T
Q  734 ttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 833  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435289 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 31435190  T
Q  834 ctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgct 930  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  31435189 ctggaactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgct 31435090  T
Q  931 ctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31435089 ctctcccccaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttt 31435039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 597 - 980
Target Start/End: Original strand, 443509 - 443892
Alignment:
Q  597 tatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctg 696  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||    ||| |||     
T  443509 tatcttcagtgtggaattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagataga----gggagcta 443604  T
Q  697 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 796  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  443605 aaacaatggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 443704  T
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 894  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |    
T  443705 cactattaggattgagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctcttttat 443804  T
Q  895 aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct--ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  443805 aacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctcccccccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 443892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 384 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 7095015 - 7094662
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7095015 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 7094916  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  7094915 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaagg 7094816  T
Q  584 a-gnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagata 682  Q
    | |         | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |    
T  7094815 aggaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagaga 7094716  T
Q  683 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  7094715 gatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaacatagggtttg 7094662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 237; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 634 - 980
Target Start/End: Original strand, 44515 - 44860
Alignment:
Q  634 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44515 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagat----agagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 44610  T
Q  734 ttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 833  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  44611 ttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtcttttggttacgggaagagg 44710  T
Q  834 ct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 931  Q
     | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||     
T  44711 ttgggactttgggtagaattatgtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatagctgctt 44810  T
Q  932 tct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44811 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 44860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 384 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 7092768 - 7092414
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7092768 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaagatatatttatgg 7092669  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7092668 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 7092569  T
Q  584 a-gnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagata 682  Q
    | |           |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |    
T  7092568 aggaaaaaaaattgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagaga 7092469  T
Q  683 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa-actagggtttg 736  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  7092468 gatggagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaacactagggtttg 7092414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 613 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 20137467 - 20137102
Alignment:
Q  613 tttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 712  Q
    |||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||| | | |||||||||  ||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  20137467 tttgttccaa-tttatgagggattcttttactataaatattggctttgtatcagagtaaaccttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaa 20137373  T
Q  713 aggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 812  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20137372 aggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgag 20137273  T
Q  813 tctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-t 909  Q
    ||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |    
T  20137272 tctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 20137173  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20137172 atagtgaaacggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 20137102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 613 - 980
Target Start/End: Original strand, 11355189 - 11355554
Alignment:
Q  613 tttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 712  Q
    |||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||| | |||||||||  ||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  11355189 tttgttccaa-tttatgagggattcttttactataaatataggctttgtatcagtgtaaaccttgagat----agagggggctgaaacaagggtttagaa 11355283  T
Q  713 aggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11355284 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 11355383  T
Q  813 tctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttgtaacgttactcatcata 910  Q
    |||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||| |||||||||    
T  11355384 tctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaacgtttctcatcata 11355483  T
Q  911 tagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11355484 tagtggaacagagagctgctctctcccctagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 11355554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 384 - 689
Target Start/End: Original strand, 38395986 - 38396292
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38395986 tgttgtagtatgactccaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgt 38396085  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38396086 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 38396185  T
Q  584 ag-nnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagata 682  Q
    ||          | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  38396186 agaaaaaaaaaacgtatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaattttgagaga 38396285  T
Q  683 gatagag 689  Q
    || ||||    
T  38396286 gagagag 38396292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 384 - 684
Target Start/End: Original strand, 1606171 - 1606471
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1606171 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatgg 1606270  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1606271 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 1606370  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    ||         |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  1606371 agaaaaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatag 1606470  T
Q  684 a 684  Q
    |    
T  1606471 a 1606471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 622 - 976
Target Start/End: Original strand, 9680753 - 9681112
Alignment:
Q  622 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggc-taaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaca 720  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  9680753 aatttatgagggatgcttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggttgaaacaagggtttagaagggcaaca 9680852  T
Q  721 acaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 819  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9680853 acaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttg 9680952  T
Q  820 gttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtgga 917  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  9680953 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcatatagtgaa 9681052  T
Q  918 tcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  9681053 atggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatt 9681112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 622 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 4296286 - 4295927
Alignment:
Q  622 aatttatgagttatacttttactataaatatagacctt-gtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaca 720  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  4296286 aatttatgagggatgcttttactataaatatagacatttgtatcagtgtaaaccttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaatgacaaca 4296191  T
Q  721 acaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 819  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4296190 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 4296091  T
Q  820 gttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtgga 917  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  4296090 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaa 4295991  T
Q  918 tcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
     | |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4295990 acagagggctgctatctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtgaacaaattcttt 4295927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 637 - 980
Target Start/End: Original strand, 24748548 - 24748891
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||    |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  24748548 cttttattataaatatagacattgtatcagtgtaaactttg----acttagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttg 24748643  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct- 835  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |     
T  24748644 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattacgattgagtctcttggttccgggaagagattg 24748743  T
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  24748744 ggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctc 24748843  T
Q  934 tcc-ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24748844 tcctccagattaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttt 24748891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 638 - 980
Target Start/End: Original strand, 9679009 - 9679355
Alignment:
Q  638 ttttactataaatatagaccttgtatcaggc-taaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  9679009 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttg 9679108  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    ||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  9679109 tatagagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 9679207  T
Q  836 -ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||    
T  9679208 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctctc 9679307  T
Q  934 -tccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
     | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9679308 tttcccagactaggtcaatttggaccagactgggtcaacaaattcttt 9679355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 637 - 980
Target Start/End: Original strand, 21679981 - 21680326
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21679981 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagat----agagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 21680076  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct- 835  Q
    ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |     
T  21680077 tatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattg 21680176  T
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||    
T  21680177 ggactttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaacccaatgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagagctgctctct 21680276  T
Q  935 -ccccagactaggtcaatttggaccgaa---ctgggtcaacaaattcttt 980  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| ||||    
T  21680277 cccccagactaggtgaatttggaccgaactgctgggtcaacaaatacttt 21680326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 682 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 21592437 - 21592136
Alignment:
Q  682 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 781  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  21592437 agatagagggggctgaaacaaaggtttagaaatgcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 21592338  T
Q  782 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 880  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  21592337 attcaccttggcaagcactattaggatttagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcat 21592238  T
Q  881 tgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 978  Q
    |||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21592237 tgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 21592138  T
Q  979 tt 980  Q
    ||    
T  21592137 tt 21592136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 637 - 979
Target Start/End: Original strand, 21678020 - 21678361
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||   ||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21678020 cttttactataaatatagatattgtatcaatgtaaaccttg----agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttg 21678115  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct- 835  Q
    ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |     
T  21678116 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagatattg 21678215  T
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||| ||||||||||| | | | ||||||||||||    
T  21678216 ggactttgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcatatagtgaaacagtgggctgctctct 21678315  T
Q  935 cccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21678316 cccctagactaggttaatttggaccgaactgggacaacaaattctt 21678361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 384 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 21470883 - 21470614
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21470883 tgttgtagtttgactccaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 21470784  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21470783 acaataaatatatttttatatcgtatgaagaacgatttgatgcgaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 21470684  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatata 653  Q
    ||         | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21470683 agaaaaaaaaacgtatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatata 21470614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 637 - 980
Target Start/End: Original strand, 42223110 - 42223454
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||  ||||| |||||||||||   | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42223110 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagat---gtgggatgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttg 42223206  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  42223207 tatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 42223306  T
Q  836 gga-ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||    
T  42223307 ggagctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggatggctgctctc 42223406  T
Q  934 t-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    | ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  42223407 tcccccatactaggtcaattttgatcgaactgggtcaacaaattcttt 42223454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 637 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 39146322 - 39145979
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||| ||||||| ||    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  39146322 cttttactataaatatagacactgtatcagtgtaaaccttgagatgga----gggggctgaaacaagggtttagatagacaacaacaaaactagggtttg 39146227  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 836  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  39146226 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 39146127  T
Q  837 g-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc-t 932  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||| |    
T  39146126 gaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggggggctgctctt 39146027  T
Q  933 ctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
     |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39146026 ttccctaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttt 39145979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 182; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 757 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 7092431 - 7092206
Alignment:
Q  757 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgga-ctttgggtagaattagg 855  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||    
T  7092431 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7092332  T
Q  856 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttg 954  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7092331 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttg 7092232  T
Q  955 gaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  7092231 gaccgaactgggtcaacaaattcttt 7092206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 765 - 980
Target Start/End: Original strand, 38396713 - 38396930
Alignment:
Q  765 ctagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagac 863  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38396713 ctaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagac 38396812  T
Q  864 ttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaac 962  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38396813 ttatttttgtaacccattgatttctctttgtaactttactcatcatatagtggatcggagggcttctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaac 38396912  T
Q  963 tgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||||||    
T  38396913 tgggtcaacaaattcttt 38396930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 383 - 580
Target Start/End: Original strand, 47865327 - 47865524
Alignment:
Q  383 ctgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 482  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47865327 ctgttgtagtatgactccaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 47865426  T
Q  483 gacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactga 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47865427 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactga 47865524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 172; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 612 - 879
Target Start/End: Original strand, 26804503 - 26804765
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||    |  |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26804503 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgt----gagtaaactttgagat----agagggggctgaaacaagggtttaga 26804593  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacac---tagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggat 808  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804594 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 26804693  T
Q  809 tgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 879  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804694 ttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26804765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 637 - 980
Target Start/End: Original strand, 25276095 - 25276426
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||   ||||||||||||    |||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25276095 cttttactataaatatatgctttgtatcagagcaaactttgagat----agagggggctaaaacaataatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 25276190  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 836  Q
    ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  25276191 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 25276290  T
Q  837 -gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||           |    
T  25276291 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgg-----------c 25276379  T
Q  934 tccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  25276380 tccccagactaagtcaatatggaccgaactggttaaacaaattcttt 25276426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 693 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 27832916 - 27832631
Alignment:
Q  693 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg 792  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27832916 gctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacagaactaaggtttgtatagagtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcaccttgg 27832817  T
Q  793 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 891  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27832816 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 27832717  T
Q  892 -tgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||||    
T  27832716 ctgtaaagttactcatcattatagtgaaatggagggcttctctctcccccagactaggtcaattt-----gaactgggtaaacaaattctt 27832631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 757 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 7094678 - 7094453
Alignment:
Q  757 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattagg 855  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  7094678 aacaaaca-tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7094580  T
Q  856 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaattt 953  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7094579 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaattt 7094480  T
Q  954 ggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||    
T  7094479 ggactgaactgggtcaataaattcttt 7094453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 612 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 22828993 - 22828672
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||| |  ||||| |||    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22828993 atttgttccagttttatgagggatacttttactataaatataggctttgtatccgagtaaaccttg----agatagagggggctgaaacaagagtttaga 22828898  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||   |||||||||||| |||||  ||||||||||  || | ||||||||||||||||||    
T  22828897 aaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagattagaaaacactattaggattga 22828798  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca- 908  Q
    |||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||| |     
T  22828797 gtctcttggttatgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcattat 22828698  T
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||    
T  22828697 tatagtgaaacagagggctgctctct 22828672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 612 - 976
Target Start/End: Original strand, 7188472 - 7188833
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  7188472 atttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataga----gggggctgaaacaagggtttaga 7188567  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    | | |||||| |||| |||||||||||| | ||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7188568 a-gtcaacaataaaaatagggtttgtatagggtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 7188663  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca- 908  Q
    |||||||||| ||||||| ||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| | || ||||||| |||| ||||||     
T  7188664 gtctcttggtcacgggaatagattgagactttgggtagaattaagcgggagacttatttttataacccattgatatttcttttgtaaagttattcatcat 7188763  T
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctc-tccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||| ||||  ||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  7188764 tatagtggaacggaaggctgctctcttccccagtctatgtcagttttggactgaactaggtaaacaaatt 7188833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 612 - 963
Target Start/End: Complemental strand, 24817708 - 24817362
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggc-taaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttag 710  Q
    ||||||| ||| ||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  24817708 atttgttacaattttatgagggatactttaa-tataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagataga-----ggggctgaaacaagggtttag 24817615  T
Q  711 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 810  Q
    || | |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  24817614 aa-gtcaacaagagaactagggtttgtatagagtttg-ctctttgcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttggaaagcagtattaggattg 24817520  T
Q  811 agtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 908  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  24817519 agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtctcttttgtaaagttactcatca 24817420  T
Q  909 -tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaact 963  Q
     ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  24817419 ttatagtggaacggatggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaact 24817362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 793 - 976
Target Start/End: Original strand, 2935374 - 2935560
Alignment:
Q  793 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 890  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2935374 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 2935473  T
Q  891 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  2935474 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 2935560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 612 - 938
Target Start/End: Complemental strand, 20091901 - 20091583
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaa-caagggtttag 710  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||| ||||||||||    ||||||||||| ||||||||| |    
T  20091901 atttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttttatcagagtaaaccttgagataga----gggggctgaaaacaagggtttcg 20091806  T
Q  711 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 810  Q
     | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || || | |||||| | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20091805 ga-ggcaaca-caaaactagggtttgtatagagtttg-ctattggcaacaaagattagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggatta 20091711  T
Q  811 agtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 908  Q
    | ||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||     
T  20091710 aatctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc- 20091612  T
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctctcccc 938  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20091611 -atagtggaacggagggctgctctctcccc 20091583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 636 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 22251878 - 22251602
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22251878 acttttactataaatataaaccttgaatcagagtaaactttgagataga----ggaggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagttt 22251783  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  22251782 gtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggga--------taggattgagtctcttggttacgggaagagatt 22251691  T
Q  836 g-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga----tttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtgga 917  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22251690 gaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 22251602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 384 - 709
Target Start/End: Original strand, 3676997 - 3677301
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  3676997 tgttgtagtatgactcaaaatttgatagatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaa----------- 3677085  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
            |||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3677086 --------tatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 3677177  T
Q  584 ag---nnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 680  Q
    ||            | |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| ||||    
T  3677178 agagaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatgagttatgtttttactataaatatagatcttgaatcagagtaaacttggaga 3677277  T
Q  681 tagatagagggggctgaaacaagggttta 709  Q
    ||||     ||||||||||||||||||||    
T  3677278 taga-----ggggctgaaacaagggttta 3677301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 716 - 993
Target Start/End: Complemental strand, 24813755 - 24813478
Alignment:
Q  716 caacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 815  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24813755 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtct 24813660  T
Q  816 cttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct-ctttgtaacgttactcatca-tata 912  Q
    |||||| |||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  24813659 cttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttactcatcattata 24813560  T
Q  913 gtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctttgtgtctctctctt 993  Q
    ||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||    
T  24813559 gtggagcggatggctgctttctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgt-tctctctt 24813478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 793 - 977
Target Start/End: Original strand, 22108173 - 22108359
Alignment:
Q  793 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 890  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22108173 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22108271  T
Q  891 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22108272 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 22108359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 793 - 977
Target Start/End: Original strand, 22137184 - 22137370
Alignment:
Q  793 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 890  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22137184 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22137282  T
Q  891 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22137283 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 22137370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 793 - 977
Target Start/End: Original strand, 40549933 - 40550119
Alignment:
Q  793 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 890  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40549933 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40550031  T
Q  891 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  40550032 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 40550119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 793 - 977
Target Start/End: Original strand, 40552211 - 40552397
Alignment:
Q  793 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 890  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40552211 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40552309  T
Q  891 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  40552310 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 40552397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 793 - 976
Target Start/End: Original strand, 1606486 - 1606671
Alignment:
Q  793 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 890  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1606486 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 1606584  T
Q  891 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1606585 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 1606671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 793 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 9027376 - 9027191
Alignment:
Q  793 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 890  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9027376 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 9027278  T
Q  891 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9027277 ttgtaacgttactcatcaaatagtggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 9027191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 634 - 805
Target Start/End: Original strand, 18567564 - 18567731
Alignment:
Q  634 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 733  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18567564 atacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaa----ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 18567659  T
Q  734 ttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattag 805  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18567660 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 18567731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 384 - 532
Target Start/End: Original strand, 443326 - 443474
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  443326 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 443425  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatat 532  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| || |||||||    
T  443426 acaataaatatatttttgtaccgtctgaagaacaatttgatgcaaatat 443474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 840 - 980
Target Start/End: Original strand, 22393876 - 22394019
Alignment:
Q  840 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc 937  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| || ||||||||    
T  22393876 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgttctctccc 22393975  T
Q  938 c-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22393976 ctagactaggtcaatttggaccaaactgggtaaacaaattcttt 22394019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 387 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 40281989 - 40281863
Alignment:
Q  387 tgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaata--ttgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgga 484  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40281989 tgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaagaatttgttgctaaaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatgga 40281890  T
Q  485 caataaatatatttttgtatcgtatga 511  Q
     |||||||||||||||||| |||||||    
T  40281889 aaataaatatatttttgtaccgtatga 40281863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 634 - 832
Target Start/End: Original strand, 22392424 - 22392606
Alignment:
Q  634 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||          ||||||||||    
T  22392424 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttataaatc--------aaactagggt 22392511  T
Q  734 ttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 832  Q
    |||||| || |||| || || | ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22392512 ttgtatagaatttg-ctattggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 22392606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 682 - 976
Target Start/End: Original strand, 24465544 - 24465829
Alignment:
Q  682 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 781  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||| | ||||| ||||| | ||||||||||||||||   |  |||    
T  24465544 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatagcgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gaattg 24465631  T
Q  782 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 880  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||    
T  24465632 attcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaactcat 24465731  T
Q  881 tgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    |||| | || ||||||| | ||||||||| |||| || | |||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| || ||||||||    
T  24465732 tgatatgtcttttgtaaag-tactcatcattataatgaaacgggtgactgctctctcccccagactagatcaatatgaaccgaactgagtaaacaaatt 24465829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 837 - 979
Target Start/End: Original strand, 26295598 - 26295743
Alignment:
Q  837 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | || | |||||||||    
T  26295598 gactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctct 26295697  T
Q  935 cc-ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  26295698 cctccagactaggtcaatttggactgaactggataaacaaattctt 26295743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 697 - 994
Target Start/End: Original strand, 11081522 - 11081820
Alignment:
Q  697 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 796  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  || ||   ||||| | ||||||||||||||||    | ||||||||| ||||||||    
T  11081522 aaacaagggtttagaa-gccaacaacaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcactttgggaaa 11081615  T
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc--attgatttctctt- 891  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  | ||| |||| ||| |||||||   | ||||| |||||||||||||   ||||| ||||||     
T  11081616 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttttgatatctcttg 11081715  T
Q  892 tgtaacgttactcatc-atatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattctttgtgtctct 988  Q
    ||||| ||||||||||  || | |||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||    
T  11081716 tgtaaagttactcatctttaaaatggaacggatggttgctctctcccccagactaggtcaatattggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgt-tct 11081814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 779 - 976
Target Start/End: Original strand, 6332311 - 6332514
Alignment:
Q  779 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggc-gggagacttattcttgtaac 876  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  6332311 ttgattcagtttggaaaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaac 6332410  T
Q  877 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 972  Q
    || || || |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  6332411 cctttaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaagactgttctctcccctagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 6332510  T
Q  973 aatt 976  Q
    ||||    
T  6332511 aatt 6332514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 794 - 979
Target Start/End: Original strand, 25351353 - 25351539
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||    
T  25351353 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt 25351449  T
Q  893 gtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    |||| |  |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  25351450 gtaaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgttctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25351539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 778 - 979
Target Start/End: Original strand, 2120881 - 2121087
Alignment:
Q  778 gttgattcaccttggg--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 874  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  2120881 gttgattcaccttggacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 2120980  T
Q  875 acccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtca 969  Q
    || ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||| ||||| |    
T  2120981 actca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaattgggtaa 2121077  T
Q  970 acaaattctt 979  Q
    ||||||||||    
T  2121078 acaaattctt 2121087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 779 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297018
Alignment:
Q  779 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattag-gcgggagacttattcttgtaac 876  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||    | ||| | |||||||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagatttgaagattgattcttgtaac 16297123  T
Q  877 cc-attgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaac 971  Q
    ||  || || |||| |||| || ||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||| || |||    
T  16297122 ccttttaatatctcttttgcaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcccctagactatgtcagtattggaccgaactgtgtaaac 16297023  T
Q  972 aaatt 976  Q
    |||||    
T  16297022 aaatt 16297018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 794 - 979
Target Start/End: Original strand, 25357047 - 25357233
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||    
T  25357047 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt 25357143  T
Q  893 gtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    |||| |  |||||||| |||||||||||| || | || ||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  25357144 gtaaagaaactcatcattatagtggatcgaagagatgatctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25357233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 794 - 979
Target Start/End: Original strand, 25410130 - 25410318
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||    
T  25410130 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt 25410226  T
Q  893 gtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    |||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  25410227 gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25410318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 794 - 975
Target Start/End: Complemental strand, 3320232 - 3320049
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||||    
T  3320232 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctcttt 3320136  T
Q  893 gtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    |||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  3320135 gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 3320049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 794 - 975
Target Start/End: Complemental strand, 3324980 - 3324797
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||||    
T  3324980 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctcttt 3324884  T
Q  893 gtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    |||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  3324883 gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 3324797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 794 - 975
Target Start/End: Original strand, 25405393 - 25405576
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||||    
T  25405393 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctcttt 25405489  T
Q  893 gtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    |||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  25405490 gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 25405576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 697 - 994
Target Start/End: Original strand, 6048885 - 6049185
Alignment:
Q  697 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-gaa 795  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||  || ||   ||||| | ||||||||||||| |||| || |||||||||||||  |||    
T  6048885 aaacaagggtttagaa-gccaacatcaaaactagggtttgtaaagaatt---ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggattgattcaccttgaagaa 6048978  T
Q  796 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 893  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||   || |||||||| ||||||||||   | |||| ||||||| |||||| ||||| || |||||    
T  6048979 acactattaggattgaatctcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattaggtttgaagacgtattcttataaccctttgatatccctttg 6049078  T
Q  894 taacgttactcatc---atatagtggatcggagggctgctc-tctccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattctttgtg-tctc 987  Q
    ||| ||||||||||   |||||||||| ||||| | ||||| || ||||| ||||| ||| |  ||||||||||| |||  ||||||||  |||| ||||    
T  6049079 taaagttactcatcattatatagtggaacggagagttgctcttccccccatactagctcagtaatggaccgaactaggtagacaaattccgtgtgttctc 6049178  T
Q  988 tctcttt 994  Q
    |||||||    
T  6049179 tctcttt 6049185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 797 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 44512704 - 44512520
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||    
T  44512704 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgta 44512608  T
Q  896 acgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    | |  ||||  |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  44512607 aagaaactcatatcattataggggaacggagagctgctctctccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 44512520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 794 - 984
Target Start/End: Original strand, 7069780 - 7069972
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||||    
T  7069780 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctcttt 7069876  T
Q  893 gtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctttgtgt 984  Q
    |||| |  ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  7069877 gtaaagaaactcattcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatattttgtgt 7069972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 687 - 748
Target Start/End: Original strand, 38396316 - 38396377
Alignment:
Q  687 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgt 748  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  38396316 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgt 38396377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 836 - 961
Target Start/End: Original strand, 6046643 - 6046772
Alignment:
Q  836 ggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  | || |||||||||    
T  6046643 ggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaacctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaatgaagagctgctctc 6046742  T
Q  934 t-ccccagactaggtcaat-ttggaccgaa 961  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  6046743 tcccccagactaggtcagtattggaccgaa 6046772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 837 - 909
Target Start/End: Original strand, 6348933 - 6349006
Alignment:
Q  837 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 909  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||    
T  6348933 gactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcat 6349006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 794 - 949
Target Start/End: Original strand, 7074787 - 7074943
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||||    
T  7074787 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctcttt 7074883  T
Q  893 gtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca 949  Q
    |||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  7074884 gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgcactctcccccagactaggtca 7074943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 394 - 467
Target Start/End: Original strand, 10690684 - 10690756
Alignment:
Q  394 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 467  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  10690684 tgactcaaaatttgatggagggagaagattgttgctaaaaatataaaag-tatgtttcaaatatattttgtgct 10690756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 394 - 447
Target Start/End: Original strand, 20297108 - 20297161
Alignment:
Q  394 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttg 447  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297108 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttg 20297161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 922 - 980
Target Start/End: Original strand, 11759364 - 11759423
Alignment:
Q  922 agggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11759364 agggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 11759423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 794 - 975
Target Start/End: Complemental strand, 8378686 - 8378502
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||||    
T  8378686 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctcttt 8378590  T
Q  893 gtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    |||| |  ||||  |||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  8378589 gtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagttgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 8378502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 794 - 855
Target Start/End: Original strand, 42006663 - 42006724
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg 855  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  42006663 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattagg 42006724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 910 - 970
Target Start/End: Complemental strand, 56015 - 55955
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 970  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  56015 atagtggattggagggctgctctctccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 55955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 724 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 13290723 - 13290470
Alignment:
Q  724 aaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggtt 822  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||| | ||||||||||||| || |  |  ||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||     
T  13290723 aaactagggtttgta--gagttt-tctcttggcaacaaacactaggcttgggag--tgattcaccttcgagaaacactattagaatttagtctcttggtc 13290629  T
Q  823 acgggaagaggctgga-ctttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatc 919  Q
    || ||||||   | || || ||||||||||||||   || || | ||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |    
T  13290628 acaggaagatattagaactctgggtagaattaggtttgaagaataattcttgtaaccttttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagcggaac 13290529  T
Q  920 ggagggctgctctctccc-cagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
     ||| ||| | ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  13290528 agagagctacactctccctcagacttggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 13290470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 794 - 975
Target Start/End: Complemental strand, 15541177 - 15540994
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||| |||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||||    
T  15541177 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtataattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctcttt 15541081  T
Q  893 gtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    |||| |  ||||| ||| ||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  15541080 gtaaagaaactcattcattatagtgtatcgtagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 15540994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 797 - 855
Target Start/End: Original strand, 30246973 - 30247031
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg 855  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  30246973 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattagg 30247031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 782 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 40281572 - 40281466
Alignment:
Q  782 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccca 879  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  || |||||| ||| ||||||||   | |||||||||||||||||||     
T  40281572 attcaccttgggaaacaccgttaggattgagtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccct 40281473  T
Q  880 ttgattt 886  Q
    |||||||    
T  40281472 ttgattt 40281466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 779 - 832
Target Start/End: Original strand, 11084467 - 11084520
Alignment:
Q  779 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 832  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  11084467 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagag 11084520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 936 - 980
Target Start/End: Original strand, 26804762 - 26804806
Alignment:
Q  936 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26804762 cccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttt 26804806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 797 - 949
Target Start/End: Complemental strand, 44144045 - 44143892
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  44144045 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggcagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 44143950  T
Q  895 aacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtca 949  Q
    ||    ||||  |||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  44143949 aaaaaaactcatatcattatagtggaacggagagttgctctctccccagactaggtca 44143892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 46516339 - 46516403
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  46516339 atagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 46516403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 911 - 973
Target Start/End: Original strand, 9190038 - 9190101
Alignment:
Q  911 tagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9190038 tagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9190101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 911 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 20284156 - 20284093
Alignment:
Q  911 tagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20284156 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20284093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 409 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 12310600 - 12310542
Alignment:
Q  409 tggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 467  Q
    |||||| |||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12310600 tggatgaagaagattgttgctactgatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 12310542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 797 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 34547042 - 34546984
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg 855  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||| |||||||    
T  34547042 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtaaaattagg 34546984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 43254069 - 43254023
Alignment:
Q  392 tatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatata 438  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43254069 tatgtctcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 43254023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 757 - 832
Target Start/End: Complemental strand, 12310234 - 12310160
Alignment:
Q  757 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 832  Q
    |||||||||||||||| |  | |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12310234 aacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgaacaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 12310160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 464 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 12485023 - 12484974
Alignment:
Q  464 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatg 513  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  12485023 tgctgaaaatatatttatggatagcaaatatatttttgtatcgtatgatg 12484974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 464 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 12506454 - 12506405
Alignment:
Q  464 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatg 513  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  12506454 tgctgaaaatatatttatggatagcaaatatatttttgtatcgtatgatg 12506405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 21983352 - 21983288
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21983352 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21983288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 779 - 855
Target Start/End: Original strand, 26210631 - 26210710
Alignment:
Q  779 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag--gctggactttgggtagaattagg 855  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||   | ||||||| ||||||||||||    
T  26210631 ttgattcaccttggagaaatactattaggattgagtctcttggtaacggaaagagattcgggactttcggtagaattagg 26210710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 29159871 - 29159807
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29159871 atagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 29159807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 911 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 2580457 - 2580394
Alignment:
Q  911 tagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  2580457 tagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 2580394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 797 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 7464697 - 7464513
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||   ||||||| |||||||   || || | ||||||||||| ||   || ||||||||||    
T  7464697 cactattaggattgagtctctttgtcacggggagaggctgggacttgggta-aattaggtttgaagagtgattcttgtaactca---atatctctttgta 7464602  T
Q  896 acgttactcat--cat-atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    | |  ||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  7464601 aagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctcttccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 7464513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 911 - 973
Target Start/End: Original strand, 5817300 - 5817362
Alignment:
Q  911 tagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  5817300 tagtggattggagagctgctctctccccagagtaggtcatattggaccgaactgagttaacaa 5817362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 794 - 832
Target Start/End: Original strand, 21369642 - 21369680
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 832  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21369642 aaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagag 21369680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 464 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 12657647 - 12657598
Alignment:
Q  464 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatg 513  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  12657647 tgctgaaaatatattcatggatagcaaatatatttttgtatcgtatgatg 12657598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 332 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 2403491 - 2403451
Alignment:
Q  332 taggtgaattctaggatgagggttcaatcaagtccctcacc 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2403491 taggtgaattctaggatgagggttcaactaagtccctcacc 2403451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 2647725 - 2647789
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||| ||||| |||||||||||    
T  2647725 atagtggattggagggctgctctctcccccagaataggtcatattgggccgaattgggtcaacaa 2647789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 4796696 - 4796760
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4796696 atagtggatttgagggctgctttctcccccagattaggtcattttggaccgaactgggttaacaa 4796760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 909 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 34546946 - 34546874
Alignment:
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  34546946 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 34546874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 328 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 42818607 - 42818563
Alignment:
Q  328 aatttaggtgaattctaggatgagggttcaatcaagtccctcacc 372  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  42818607 aattttggtgaattctagggtgagggttcaattaagtccctcacc 42818563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 462
Target Start/End: Original strand, 6628853 - 6628884
Alignment:
Q  431 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6628853 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 6628884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 911 - 973
Target Start/End: Original strand, 9185195 - 9185258
Alignment:
Q  911 tagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  9185195 tagtggattggagagcttctctctcccccagactaggttatattggaccgaactgggtcaacaa 9185258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 12657698 - 12657667
Alignment:
Q  431 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12657698 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 12657667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 911 - 973
Target Start/End: Original strand, 28617255 - 28617318
Alignment:
Q  911 tagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  28617255 tagtggattggagagctgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaa 28617318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 911 - 973
Target Start/End: Original strand, 33332480 - 33332543
Alignment:
Q  911 tagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  || || ||||||||||||||||    
T  33332480 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaa 33332543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 47263744 - 47263682
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  47263744 atagtggattggagagctgctctc-ccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47263682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 464 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 12310528 - 12310442
Alignment:
Q  464 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatatt 550  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| | |||||||||||||| ||||||| | | ||||| ||  ||||||||||| ||| ||||||||    
T  12310528 tgctgaaattatacttaaggacagttaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgtaaatatatttttaaaaggaatatt 12310442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 431 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 12485074 - 12485044
Alignment:
Q  431 aaaatataaaagatttgtttcaaatatattt 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12485074 aaaatataaaagatttgtttcaaatatattt 12485044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 431 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 12506505 - 12506475
Alignment:
Q  431 aaaatataaaagatttgtttcaaatatattt 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12506505 aaaatataaaagatttgtttcaaatatattt 12506475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 930 - 984
Target Start/End: Original strand, 26417440 - 26417494
Alignment:
Q  930 tctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttgtgt 984  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  26417440 tctctccccaggttaggtcaaattggaccaaactgggtcaacaatttcttggtgt 26417494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 935 - 973
Target Start/End: Original strand, 27347947 - 27347985
Alignment:
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27347947 ccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 27347985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 334 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 30581314 - 30581276
Alignment:
Q  334 ggtgaattctaggatgagggttcaatcaagtccctcacc 372  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  30581314 ggtgaattctagggtgagggttcaattaagtccctcacc 30581276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 935 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 41317472 - 41317434
Alignment:
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41317472 ccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 41317434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 636 - 665
Target Start/End: Original strand, 2935306 - 2935335
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatca 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2935306 acttttactataaatatagaccttgtatca 2935335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 636 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 9027440 - 9027411
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatca 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9027440 acttttactataaatatagaccttgtatca 9027411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 636 - 665
Target Start/End: Original strand, 22108114 - 22108143
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatca 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22108114 acttttactataaatatagaccttgtatca 22108143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 636 - 665
Target Start/End: Original strand, 22137125 - 22137154
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatca 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137125 acttttactataaatatagaccttgtatca 22137154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 636 - 665
Target Start/End: Original strand, 40549874 - 40549903
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatca 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40549874 acttttactataaatatagaccttgtatca 40549903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 636 - 665
Target Start/End: Original strand, 40552152 - 40552181
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatca 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40552152 acttttactataaatatagaccttgtatca 40552181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 936 - 973
Target Start/End: Original strand, 43864375 - 43864412
Alignment:
Q  936 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43864375 cccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 43864412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 481; Significance: 0; HSPs: 152)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 481; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 31736115 - 31735516
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31736115 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggaaggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 31736016  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31736015 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 31735916  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    ||         | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  31735915 agaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaatgag 31735816  T
Q  684 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 783  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31735815 atagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 31735716  T
Q  784 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 882  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31735715 tcaccttgggaaacactattaaggttgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattg 31735616  T
Q  883 atttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31735615 atttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 31735516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 27337532 - 27336935
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337532 tgttgtagtatgactccaaatttgatggatggggaatattgttgctaaaaatatataagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 27337433  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27337432 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttaactgaagg 27337333  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    |          | |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  27337332 aaaaaaaaaaacgtatcttcgatgtggtatttgttccaaatttatgcgttatacttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagag 27337233  T
Q  684 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337232 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttataga-tttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgat 27337134  T
Q  784 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 882  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337133 tcaccttgggaaacactattaggattgggtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 27337034  T
Q  883 atttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337033 atttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 27336935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 9463840 - 9463234
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9463840 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 9463741  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  9463740 acaataaatatatttttatatcgtatgaagaacaatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaagg 9463641  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    ||         | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9463640 agaaaaaaaaacgtatcttcattgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagag 9463541  T
Q  684 a--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 781  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  9463540 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttg 9463441  T
Q  782 attcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 879  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9463440 attcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaaccca 9463341  T
Q  880 ttgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttc 977  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  9463340 ttgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttc 9463241  T
Q  978 tttgtgt 984  Q
    |||||||    
T  9463240 tttgtgt 9463234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Original strand, 47905956 - 47906556
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47905956 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 47906055  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  47906056 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaagg 47906155  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    ||           |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47906156 agaaaaaaaaag-tatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagag 47906254  T
Q  684 a--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 781  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  47906255 agatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttg 47906354  T
Q  782 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 880  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906355 attcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 47906454  T
Q  881 tgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 978  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906455 tgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagacttggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 47906554  T
Q  979 tt 980  Q
    ||    
T  47906555 tt 47906556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 383 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 27339731 - 27339126
Alignment:
Q  383 ctgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatat----t 478  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |    
T  27339731 ctgttgtagtatgactccaaatttgacggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatatatt 27339632  T
Q  479 tatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcact 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27339631 tatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcact 27339532  T
Q  579 gagggagnnnnnnnnnca--tatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaacttt 676  Q
    || |||           |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27339531 gaaggaaaaaaaaaagaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtattaggctaaacttt 27339432  T
Q  677 gagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg 776  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27339431 gagagagatagagggggctgaaacaagggcttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtg 27339332  T
Q  777 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 875  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27339331 ggttgattcaccttgggaaatactattacgattgagtctcttagttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaa 27339232  T
Q  876 cccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 974  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27339231 cccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgatctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 27339132  T
Q  975 ttcttt 980  Q
    ||||||    
T  27339131 ttcttt 27339126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 9460013 - 9459407
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9460013 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 9459914  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  9459913 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaagg 9459814  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    ||         | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9459813 agaaaaaaaaacgtatcttcattgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagag 9459714  T
Q  684 a--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 781  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  9459713 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaagtcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttg 9459614  T
Q  782 attcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 879  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9459613 attcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaaccca 9459514  T
Q  880 ttgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttc 977  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  9459513 ttgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttc 9459414  T
Q  978 tttgtgt 984  Q
    |||||||    
T  9459413 tttgtgt 9459407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Original strand, 24325347 - 24325949
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24325347 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatgg 24325446  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24325447 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagtgaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 24325546  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    ||           |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||    
T  24325547 agaaaaaaaaatgtatctttagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagag 24325646  T
Q  684 a----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 779  Q
    |    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24325647 agagatagagggggctgaaacaagggtt-agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggt 24325745  T
Q  780 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 878  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24325746 tgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 24325845  T
Q  879 attgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24325846 attgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcgaatggctgctctctcccccagactaagtcaattttgaccgaactgggtcaacaaatt 24325945  T
Q  977 cttt 980  Q
    ||||    
T  24325946 cttt 24325949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 383 - 980
Target Start/End: Original strand, 39931761 - 39932360
Alignment:
Q  383 ctgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39931761 ctgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 39931860  T
Q  483 gacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgagg 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  39931861 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatacttttgatgcaaatattcttttattgaag 39931960  T
Q  583 gagnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagata 682  Q
    |||         | |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||      
T  39931961 gagaaaaaaaaacgtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatgagacaaaactttgaga-- 39932058  T
Q  683 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttga 782  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  39932059 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttga 39932158  T
Q  783 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 881  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39932159 ttaaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagactgagactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccatt 39932258  T
Q  882 gatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct--ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 978  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39932259 gatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggagggctgctctcttcccccatactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattct 39932358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 411 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 21948756 - 21948225
Alignment:
Q  411 gatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatg 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948756 gatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatg 21948657  T
Q  511 atgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgagggagnnnnnnnnnca--tatcttcagtct 608  Q
    | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||          |  |||||||||| |    
T  21948656 aagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcacagaaggaggaaaaaaaaaacgtatcttcagtgt 21948557  T
Q  609 ggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggttt 708  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21948556 ggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggttt 21948457  T
Q  709 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggat 808  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21948456 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-ggaaacactattaggat 21948358  T
Q  809 tgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcat 906  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21948357 tgagtctcttggttacgggaagacgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcat 21948258  T
Q  907 catatagtggatcggagggctgctctctcccca 939  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21948257 catatagtggaacggagggctgctctctcccca 21948225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 15295439 - 15294829
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15295439 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 15295340  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15295339 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagcgaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 15295240  T
Q  584 agnnnnnnnnnca-tatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagata 682  Q
    ||            |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |    
T  15295239 agaaaaaaaaaatgtatcttcagtgtggtattcgttcctaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagaga 15295140  T
Q  683 ga----------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtt 772  Q
    ||          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  15295139 gagagagagagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttt 15295040  T
Q  773 tgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 871  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  15295039 tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattctt 15294940  T
Q  872 gtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 969  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15294939 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 15294840  T
Q  970 acaaattcttt 980  Q
    |||||||||||    
T  15294839 acaaattcttt 15294829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 17325227 - 17324631
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  17325227 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgagttgaaaatatatttatgg 17325128  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  17325127 acaataaatatatttttgtaccgtatgaaaaacgatttgatgcaaatatattttgcaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaagg 17325028  T
Q  584 agnnnnnnnnn-catatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagata 682  Q
    ||          | |||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||| |   || |    
T  17325027 agaaaaaaaaaacgtatcttcagggtgatattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaaccagagtaaacct---ga-a 17324932  T
Q  683 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttga 782  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17324931 gatacagggggctaaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactggggtttgtatagagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttga 17324832  T
Q  783 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 881  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17324831 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 17324732  T
Q  882 gatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324731 gatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 17324632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 28998844 - 28998248
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998844 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaactataaaagatttgtttaaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 28998745  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| || |||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28998744 acaataaatacatttttgtaccgtacgaagaaatatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 28998645  T
Q  584 agnnnnnnnnnca-tatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagata 682  Q
    ||         |  ||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||    
T  28998644 agaaaaaaaaaccgtatatttagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagata 28998545  T
Q  683 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttga 782  Q
    ||    || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28998544 ga----ggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttga 28998449  T
Q  783 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 881  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  28998448 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcatt 28998349  T
Q  882 gatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    ||  |||| |||| ||||||||||||||||| ||| | | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998348 gacatctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 28998249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 29004560 - 29003964
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004560 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaactataaaagatttgtttaaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 29004461  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| || |||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29004460 acaataaatacatttttgtaccgtacgaagaaatatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 29004361  T
Q  584 agnnnnnnnnnca-tatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagata 682  Q
    ||         |  ||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||    
T  29004360 agaaaaaaaaaccgtatatttagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagata 29004261  T
Q  683 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttga 782  Q
    ||    || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  29004260 ga----ggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttga 29004165  T
Q  783 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 881  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  29004164 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcatt 29004065  T
Q  882 gatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    ||  |||| |||| ||||||||||||||||| ||| | | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004064 gacatctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 29003965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 496 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 46432207 - 46431701
Alignment:
Q  496 tttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgagggagnnnnnnnnn- 594  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||              
T  46432207 tttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaaaaa 46432108  T
Q  595 catatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagag----- 689  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||         
T  46432107 cgtatcttcactgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagagaga 46432008  T
Q  690 ------------ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgg 777  Q
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46432007 gagagagagatgggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgg 46431908  T
Q  778 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 876  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431907 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 46431808  T
Q  877 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct---ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431807 ccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 46431708  T
Q  974 attcttt 980  Q
    |||||||    
T  46431707 attcttt 46431701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 2949815 - 2949227
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2949815 tgttatagtatgactcaaaatttcatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 2949716  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |     
T  2949715 acaataaatatatttttgtattgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatacaaatattctttcactgaaga 2949616  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
               | ||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| |   |||| |||||||||    
T  2949615 gaaaaaaaaaacgtatctt------ggtattcgttccaaatttatgagttatacttttacaataaatatagatattgaatccgagaaaaccttgagatag 2949522  T
Q  684 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 783  Q
    |    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||    
T  2949521 a----gggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgat 2949426  T
Q  784 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  2949425 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgtttacgagaatagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattg 2949326  T
Q  883 atttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |  |||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2949325 acatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 2949227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 506 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 2510801 - 2510320
Alignment:
Q  506 gtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgagggagnnnnnnnnnca-----tatc 600  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||          |     |||     
T  2510801 gtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagggaaagaaaaaaaacgtatt 2510702  T
Q  601 ttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaac 700  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2510701 ttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaac 2510602  T
Q  701 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 800  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  2510601 aagggtttataaaggcaaccacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaaacact 2510502  T
Q  801 attaggattgagtctcttggttacgggaagag-gctggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacg 898  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  2510501 attaggattgagtcttttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggc-agagacttattcttgtaacccattgatttctctcttgtaaag 2510403  T
Q  899 ttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2510402 ttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 2510320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Original strand, 28840598 - 28840965
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28840598 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgaga--gatacagggggatgaaacaagggtttaga 28840694  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840695 aaggaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 28840794  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 910  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840795 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 28840894  T
Q  911 tagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840895 tagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 28840965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Original strand, 51749982 - 51750325
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51749982 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttgg----agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 51750077  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750078 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 51750177  T
Q  836 -ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750178 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 51750277  T
Q  934 t-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750278 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 51750325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 612 - 978
Target Start/End: Original strand, 28842413 - 28842778
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28842413 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatataaaccttgtatcagagcaaactttgaga--gatagagggggctgaaacaagggtttaga 28842509  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28842510 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaaacactattaggattga 28842609  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 910  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28842610 gtctattggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 28842709  T
Q  911 tagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 978  Q
    ||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28842710 tagtggaacggagggctaatctctcccccagactaggtcaatttggacagaactaggtcaacaaattct 28842778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 611 - 980
Target Start/End: Original strand, 20302378 - 20302744
Alignment:
Q  611 tatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttag 710  Q
    |||||||||||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  20302378 tatttgttccaaattt-taagtgaaacttttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagat----agagggggctgaaacaagggtttag 20302472  T
Q  711 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 810  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20302473 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 20302572  T
Q  811 agtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcat 909  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  20302573 agtctcttggttatgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcag 20302672  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20302673 atagtggatcggaggactactctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttt 20302744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 636 - 984
Target Start/End: Original strand, 47179652 - 47180003
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47179652 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 47179751  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  47179752 gtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 47179851  T
Q  835 tgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47179852 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 47179951  T
Q  934 tccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat-tctttgtgt 984  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47179952 tccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgt 47180003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Original strand, 15823466 - 15823832
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15823466 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactt----agagataaagggggctgaaacaagggtttaga 15823560  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  15823561 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaatattga 15823660  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacgttactcatcat 909  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15823661 gtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaacgttactcatcat 15823760  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15823761 atagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttt 15823832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Original strand, 13761780 - 13762122
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13761780 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttgg----agatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacataactagggttt 13761875  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13761876 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtct 13761975  T
Q  836 g-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  13761976 gtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggaccggagggcttctctct 13762075  T
Q  935 -ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13762076 cccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttt 13762122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 636 - 984
Target Start/End: Original strand, 47177301 - 47177652
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47177301 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 47177400  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggat-tgagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||      
T  47177401 gtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatgggagtctcttggttacgggaagagat 47177500  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47177501 tgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 47177600  T
Q  934 tccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat-tctttgtgt 984  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  47177601 tccccagactaggtcagattggatcgaactgggtcaacaaatatctttgtgt 47177652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 10400166 - 10399823
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||    |  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  10400166 actttttctataaatatagaccttgtatcagagcaaact----gggagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggttt 10400071  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  10400070 gtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 10399971  T
Q  836 -ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399970 gggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 10399871  T
Q  934 t-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399870 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 10399823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 637 - 976
Target Start/End: Original strand, 2617460 - 2617798
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2617460 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataga----ggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttg 2617555  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct- 835  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2617556 tatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 2617655  T
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2617656 ggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 2617755  T
Q  935 ccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  2617756 ccctcagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaatt 2617798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Original strand, 51752308 - 51752649
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  51752308 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttgg----agatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggtaacaacaaaattagggctt 51752403  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51752404 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaaacactatta-gattgagtctcttggttacgggaagaggct 51752502  T
Q  836 g-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  51752503 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctct 51752602  T
Q  935 -ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51752603 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 51752649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Original strand, 6822958 - 6823300
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6822958 acttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagat----agagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 6823053  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  6823054 gtatagagtttgtctcttaggaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttatgggaagagatt 6823152  T
Q  836 -ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823153 ggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 6823252  T
Q  934 t-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823253 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 6823300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 635 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 12302849 - 12302500
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggc-taaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12302849 tacttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggt 12302750  T
Q  734 ttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 833  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12302749 ttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 12302650  T
Q  834 ct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 931  Q
     | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12302649 ttgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc 12302550  T
Q  932 tct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302549 tctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 12302500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 634 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 38925818 - 38925476
Alignment:
Q  634 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38925818 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagataga----gggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaactagggt 38925723  T
Q  734 ttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 833  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38925722 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 38925623  T
Q  834 ctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 931  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||  | |||||||||||||    
T  38925622 ttgagactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtaaaacggagggctgctc 38925525  T
Q  932 tctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38925524 tctccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttt 38925476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 636 - 984
Target Start/End: Original strand, 16226110 - 16226458
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16226110 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg----agatagaggggtctaaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 16226205  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  16226206 gtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 16226305  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16226306 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 16226405  T
Q  934 t-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat-tctttgtgt 984  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16226406 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgt 16226458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Original strand, 13215001 - 13215372
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  13215001 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagat----agagggggctgaaacaagggtttaga 13215095  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13215096 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattga 13215195  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga----tttctc-tttgtaacgttactca 905  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||  |||||||    
T  13215196 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatttttctcttttgtaaatttactca 13215295  T
Q  906 tca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13215296 tcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgtcaacaaattcttt 13215372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Original strand, 20291400 - 20291742
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| ||||    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20291400 acttttactataaatatagaccttgtattagagcaaattttg----agatagagggagatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 20291495  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  20291496 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagact 20291595  T
Q  836 -ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20291596 aggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgattctcatcatatagtggatcggagggttgttctct 20291695  T
Q  935 -ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20291696 cccccacactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 20291742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 609 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 6996065 - 6995695
Alignment:
Q  609 ggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggttt 708  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||  |||    ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  6996065 ggtattcgttccaaatttatgagttatacttttattataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttg----agatagagggggccgaaacaacggttt 6995970  T
Q  709 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggat 808  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6995969 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaagat 6995870  T
Q  809 tgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcat 906  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||    
T  6995869 tgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactcattgacatctcttttataacgttactcat 6995770  T
Q  907 catatagtggatcggagggctgctctctcc-ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6995769 catatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttt 6995695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 612 - 978
Target Start/End: Original strand, 41646840 - 41647204
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||    
T  41646840 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagat----agagggggctgaaataagggtttaga 41646934  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41646935 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 41647034  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 909  Q
    ||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  41647035 gtcacttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 41647134  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcc-ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 978  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41647135 atagtgaaacggagggctgctctctccatcagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 41647204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 227; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 597 - 917
Target Start/End: Original strand, 48665075 - 48665400
Alignment:
Q  597 tatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatag--agggggc 694  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| || |||||||  |  ||||||     
T  48665075 tatcttcagtgtagtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggagggggt 48665174  T
Q  695 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggga 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  48665175 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgaga 48665274  T
Q  795 aacactattaggattgagtctcttggtta-cgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tt 891  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  48665275 aacactattaggattgagtctcttggttaccgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 48665374  T
Q  892 tgtaacgttactcatcatatagtgga 917  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  48665375 tgtaacgttactcatcatatagtgga 48665400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 222; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 614 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 14098329 - 14097964
Alignment:
Q  614 ttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 713  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||| ||||||||| |||||| |||    
T  14098329 ttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcaaactaaactttgagataga----ggggactgaaacaatggtttaaaaa 14098235  T
Q  714 ggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 813  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14098234 ggcaactacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagt 14098135  T
Q  814 ctcttggttacgggaagaggctgga-ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt-aacgttactcatcata 910  Q
    |||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14098134 ctcttggttacgggaagagattagagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttactcatcata 14098035  T
Q  911 tagtggatcggagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14098034 tagtgaaacggagggctgctctctcccacaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 14097964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 622 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 50077024 - 50076667
Alignment:
Q  622 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaa 721  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| ||    ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  50077024 aatttatgagggatgcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaag----ggctgaaacaaggatttagaaagacaacaa 50076929  T
Q  722 caaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 821  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50076928 caaaactagggtttgtataaagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 50076829  T
Q  822 tacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggat 918  Q
    |||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  50076828 tacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 50076729  T
Q  919 cggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50076728 cggatgactgctctctccccagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 50076667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Original strand, 39462439 - 39462805
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |     ||||||||||| ||||||||    
T  39462439 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagaa----ggctgaaacaaaggtttaga 39462533  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39462534 aatgcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 39462633  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 909  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||| || |||| |||||||    
T  39462634 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttgtaaccctttgatatctcttttgaaaagttattcatcat 39462733  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39462734 atagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 39462805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 637 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 50307884 - 50307541
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||   ||||| |||||||| ||    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50307884 cttttactataaatataagctttgtatcaaagtaaaccttgagatatat----ggggctgaaaaaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttg 50307789  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  50307788 tatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 50307689  T
Q  836 -ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  50307688 ggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc 50307589  T
Q  934 t-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50307588 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 50307541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 638 - 980
Target Start/End: Original strand, 18307054 - 18307395
Alignment:
Q  638 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 737  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18307054 ttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagat----agagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 18307149  T
Q  738 atggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-g 836  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  18307150 ataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 18307249  T
Q  837 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||    
T  18307250 ggctttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctct 18307349  T
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  18307350 ccccagactaggtcaatttggaccgaacggagtcaacaaattcttt 18307395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 682 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 4131675 - 4131370
Alignment:
Q  682 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 781  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4131675 agatagagggggctgaaacaaggatttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 4131576  T
Q  782 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 881  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4131575 atttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctggactttgggtagaattaggcgagaaacttattcttgtaacccatt 4131476  T
Q  882 ga----tttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 974  Q
    ||    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  4131475 gatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactatgtcaacaaa 4131376  T
Q  975 ttcttt 980  Q
    ||||||    
T  4131375 ttcttt 4131370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 3579979 - 3579612
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||    
T  3579979 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactttaaatatagaccttgtatcagcgtaaaatttgagataga--gggggggctgaaacaagggttcaga 3579883  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  3579882 aaggcagcaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacacaattaggattga 3579783  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 909  Q
    |||||||| |||||| |||||  | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  3579782 gtctcttgattacggaaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 3579683  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
     ||||| | |||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3579682 -tagtgaaacggatgattgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 3579612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 681 - 980
Target Start/End: Original strand, 16428637 - 16428940
Alignment:
Q  681 tagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| |||||| |||||    
T  16428637 tagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggtt 16428736  T
Q  781 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 879  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16428737 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccca 16428836  T
Q  880 ttgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16428837 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattttagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaatt 16428936  T
Q  977 cttt 980  Q
    ||||    
T  16428937 cttt 16428940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 28207427 - 28207063
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  28207427 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttaga 28207333  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  28207332 aagacaacaacaaaactagggtttgtgtaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttgggaaacactattaggattgt 28207233  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 909  Q
    ||||||||||||| |||||||  | || |||||  || ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||      
T  28207232 gtctcttggttacaggaagagattggggctttgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc-- 28207135  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28207134 atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 28207063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 620 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 50079175 - 50078815
Alignment:
Q  620 caaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaac 719  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  50079175 caaatttatgagggatgcttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaagacagc 50079080  T
Q  720 aacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 819  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  50079079 aacaaaactagggtttgcatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttg 50078980  T
Q  820 gttacgggaagag-gctggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtgg 916  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  50078979 gttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgg 50078880  T
Q  917 atcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    | | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  50078879 aacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaatttggtaaacaaattcttt 50078815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 682 - 980
Target Start/End: Original strand, 18839572 - 18839874
Alignment:
Q  682 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 781  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||  ||||||    
T  18839572 agatagagggggctgaaacaagggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggttg 18839671  T
Q  782 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18839672 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagaatgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 18839771  T
Q  881 tgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18839772 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctttcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 18839871  T
Q  978 ttt 980  Q
    |||    
T  18839872 ttt 18839874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 622 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 11457827 - 11457470
Alignment:
Q  622 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaa 721  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  11457827 aatttatgagggatgcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataga----gggggctgaaacaatggtttagaaagacaacaa 11457732  T
Q  722 caaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 821  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||| | |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11457731 caaaactagggtttgtatagagtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggt 11457632  T
Q  822 tacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatc 919  Q
    |||| ||||||  | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  11457631 tacgcgaagagattgggggtttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaac 11457532  T
Q  920 ggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11457531 ggatgtctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttt 11457470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 9241448 - 9241080
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||| || |||||||    |||||||||||||||| ||||||    
T  9241448 atttgttccaattttatgggggttacttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagag---gggggctgaaacaagg-tttaga 9241353  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9241352 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacattattaggattga 9241253  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca- 908  Q
    |||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||     
T  9241252 gtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 9241153  T
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9241152 tatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactggggaaacaaattcttt 9241080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 637 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 17186465 - 17186122
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||   |||| |||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17186465 cttttaatataaatatagattttgtatcagagcaaaccttg----agatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 17186370  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-gct 835  Q
    ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  17186369 tatagagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagagattt 17186270  T
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||    
T  17186269 gaactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattataatggaacggagtgctgctctc 17186170  T
Q  934 t-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17186169 tcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattcttt 17186122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 638 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 25251611 - 25251269
Alignment:
Q  638 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 737  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25251611 ttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataga----gggggctgaaacaaaggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 25251516  T
Q  738 atggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-g 836  Q
    ||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |    
T  25251515 ataacgtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagagattgg 25251416  T
Q  837 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||| |||| ||||||| | | ||||| ||||||||    
T  25251415 gactttgggtagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcattatagtgaaacagagggttgctctct 25251316  T
Q  935 cccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25251315 ccccaatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 25251269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 637 - 980
Target Start/End: Original strand, 31489859 - 31490198
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31489859 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagataga----gggggttgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttg 31489954  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 836  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||    
T  31489955 tat--agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatttcttggttacgggaagagattg 31490052  T
Q  837 -gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
     |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||     
T  31490053 agactttggatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcatatggtgaaacggagggctgctctcc 31490152  T
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  31490153 ccccagactaggtcaatttggactgaactagatcaacaaattcttt 31490198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 677 - 980
Target Start/End: Original strand, 25127852 - 25128159
Alignment:
Q  677 gagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg 776  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||| |    
T  25127852 gagagagatagaggggcctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgag 25127951  T
Q  777 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 875  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25127952 ggttgattcaccttgtgaaacactatttggattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 25128051  T
Q  876 cccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 972  Q
      ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25128052 ttcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacggagggctgctctctctcccatactaggtcaattaggaccgaactgggtcaaca 25128151  T
Q  973 aattcttt 980  Q
    ||||||||    
T  25128152 aattcttt 25128159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 682 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 31425315 - 31425010
Alignment:
Q  682 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggtt 780  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  31425315 agataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaacaaacactagggtttgagggtt 31425216  T
Q  781 gattcaccttgggaaacactattaggattgag---tctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 876  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31425215 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaggcttattcttgtaac 31425116  T
Q  877 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 974  Q
     ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31425115 tcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaaggctgctctctccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 31425016  T
Q  975 ttcttt 980  Q
    ||||||    
T  31425015 ttcttt 31425010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Original strand, 6756446 - 6756814
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||| ||| ||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||    | ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  6756446 atttgttacaattttatgagagttacttttgctataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttg----aaatagaggggactgaaacaagggcttaga 6756541  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6756542 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 6756641  T
Q  811 agtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 908  Q
    ||  ||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  6756642 ag--tcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatca 6756739  T
Q  909 -tatagtggatcggagggctgctctct--ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
     ||||||| | |||| | |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6756740 ttatagtgaaacggaagactgctctctccccccagactaggtcagtttggaccgaactggatcaacaaattcttt 6756814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 177; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 637 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 50248909 - 50248565
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||    ||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | |||     
T  50248909 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataga----gggagctgaaacaaaggtttaaaaagacaacaacaaaactatgattta 50248814  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-gct 835  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |     
T  50248813 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcg 50248714  T
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctg--ctct 932  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | || || ||  ||||    
T  50248713 agactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagatggttgttctct 50248614  T
Q  933 ctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  50248613 ctcccctagactaggtcaatttggtccgaattgggtcaacaaattcttt 50248565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 682 - 980
Target Start/End: Original strand, 17318878 - 17319173
Alignment:
Q  682 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 781  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||| |  |||||    
T  17318878 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtttagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggttg 17318977  T
Q  782 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 880  Q
    |||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  17318978 attcaccttgggaaaca------ggattgagtctcttggttacgggaacagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacttat 17319071  T
Q  881 tgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 978  Q
    |||| ||||||| || | |||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17319072 tgatatctcttttgttaagttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 17319171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 172; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 31423236 - 31422855
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  31423236 atttgttccaattttatgggagatacttttactataaatataagcattgtatcagtgtaaaccttgagataga----gggggctgaaacaagggtttaga 31423141  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 810  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31423140 aaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagttgattcaccttgggaaacactattagaattg 31423041  T
Q  811 agtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 908  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||    
T  31423040 agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatca 31422941  T
Q  909 -tata------------gtggatcggagggctgctctctcc-ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
     ||||            ||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  31422940 ttatagtgaaagagagggtgaaacagagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgagctgggtgaacaaattcttt 31422855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 383 - 576
Target Start/End: Original strand, 48664851 - 48665044
Alignment:
Q  383 ctgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48664851 ctgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 48664950  T
Q  483 gacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttca 576  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48664951 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcacatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttca 48665044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 637 - 979
Target Start/End: Original strand, 17324009 - 17324349
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||  ||||| |||||||||| ||    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||     
T  17324009 cttttattataaatatagactttgtattagagtaaaccttgagatagagag----ggctaaaacaagggttcagaaaggccacaacaaaact--gatttt 17324102  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 836  Q
    ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  ||    
T  17324103 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattg 17324202  T
Q  837 g-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||| | |||| ||||| ||||    
T  17324203 gaactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaacggaaggctggtctc 17324302  T
Q  934 tcccca-gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17324303 tccccatgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 17324349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 636 - 892
Target Start/End: Original strand, 6823827 - 6824088
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823827 acttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagag---gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 6823923  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt-------ggttacggga 828  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||       ||||||||||    
T  6823924 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattacgattgaatctcttggttacgggttacggga 6824023  T
Q  829 agaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    ||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6824024 agagattggggctttgggtagaattaggcggcagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 6824088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 634 - 971
Target Start/End: Original strand, 47451589 - 47451919
Alignment:
Q  634 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  47451589 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagat----agagggggcttaaacaagggtttggaatggcaacaacaaaactagggt 47451684  T
Q  734 ttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 833  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |         |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47451685 ttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattag------tgtttaggattgagtctcttggttacgggaagaga 47451778  T
Q  834 ct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 931  Q
     | || ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | || | | ||||||    
T  47451779 ttggggctttgggtaaaattaggcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaatgactgctc 47451878  T
Q  932 tct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 971  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47451879 tctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 47451919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 612 - 976
Target Start/End: Original strand, 42922153 - 42922514
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||     |||||||||||| ||||| ||||||||||     
T  42922153 atttgttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaacctt----aagatagagggggttgaaataagggtttag- 42922247  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| | | ||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  42922248 aagtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt--gaggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattga 42922344  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca- 908  Q
    |||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||     
T  42922345 gtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 42922444  T
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    || |||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  42922445 tagagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaatt 42922514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 613 - 980
Target Start/End: Original strand, 40133856 - 40134231
Alignment:
Q  613 tttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatag-----agggggctgaaacaagggtt 707  Q
    |||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||| | |||||||||  ||||  |||||||| |  |     | ||||||||||||||||||    
T  40133856 tttgttccaa-tttatgagggattcttttactataaatataggctttgtatcagagtaaatcttgagatataggggctgaaaggggctgaaacaagggtt 40133954  T
Q  708 tagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga 807  Q
    ||||| | |||||||||||| | ||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  40133955 tagaatgacaacaacaaaacgaaggtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactactagga 40134054  T
Q  808 ttgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactca 905  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  || |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  40134055 ttgagtctcttggtcacgggaagagattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaagttactca 40134154  T
Q  906 tca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||| ||||||| | |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  40134155 tcattatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccggactaggtaaacaaattcttt 40134231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 789 - 980
Target Start/End: Original strand, 51757623 - 51757816
Alignment:
Q  789 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 887  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  51757623 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgatttc 51757722  T
Q  888 tctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51757723 tctttgtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttt 51757816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 764 - 984
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231853
Alignment:
Q  764 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggag 861  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggag 16231729  T
Q  862 acttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccga 960  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  16231730 acttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccga 16231829  T
Q  961 actgggtcaacaaat-tctttgtgt 984  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||    
T  16231830 act-ggtcaacaaatatctttgtgt 16231853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 384 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 4131882 - 4131690
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4131882 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaacatatatttatgg 4131783  T
Q  484 ac-aataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttca 576  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4131782 acaaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattata-ttttgatgcaaatattctttca 4131690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 384 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 6115718 - 6115532
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaa-tttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 482  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115718 tgttgtaggatgactcaaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 6115619  T
Q  483 gacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatat 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6115618 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaatgacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatat 6115532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 384 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 45694024 - 45693834
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45694024 tgttgtactatgattcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctaaaaatatatttatgg 45693925  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattcttt 574  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  45693924 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaataatatattttttatgcaaatattcttt 45693834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 793 - 976
Target Start/End: Original strand, 23785935 - 23786121
Alignment:
Q  793 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 890  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23785935 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 23786034  T
Q  891 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23786035 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 23786121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 637 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 14183923 - 14183589
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||||||| | |||||   |||||||||||||    
T  14183923 cttttactataaatatagaccatgtatcagagtaaaccttgagatagagag----ggctgaaacaagggtttagaatg-caacac--aaactagggtttg 14183831  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct- 835  Q
    ||| ||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |     
T  14183830 tatagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattataattgagtctcttggttacgggaagagatta 14183734  T
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  14183733 gaattttgggtagaattaggcggaagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctc 14183634  T
Q  934 t-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14183633 tcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 14183589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 688 - 980
Target Start/End: Original strand, 16432396 - 16432682
Alignment:
Q  688 agggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac 787  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16432396 agggggcagaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-----------gtctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcac 16432484  T
Q  788 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 886  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  16432485 cttgggaaacattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactttgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgatat 16432584  T
Q  887 ctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccc--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16432585 ctcttttgtaatgttactcatcattatagtgaaacggcggactgctctctcccccaagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttt 16432682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 612 - 962
Target Start/End: Complemental strand, 8347631 - 8347284
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcag-gctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttag 710  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||| |||    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8347631 atttgttccaattttatgaggggtacttttactataaa-atagaccttgtatcagatgtaaaccttg----agatagagggggttgaaacaagggtttag 8347537  T
Q  711 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 810  Q
     ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| | ||||||||| | ||||   ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  8347536 -aagtcaacaagaaaactagggtttgtatagagattg-ctcttggcaacaaacaccaaggtt--agggttgattcaccttaggaaacactattatgattg 8347441  T
Q  811 agtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 908  Q
    ||||||||| | ||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |    
T  8347440 agtctcttgatcacgggaagagattgagactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatta 8347341  T
Q  909 -tatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtca-atttggaccgaac 962  Q
     ||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  8347340 ttatagtggaacggagggatgctctttcccctagactaggtcagttttggaccgaac 8347284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 764 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248546
Alignment:
Q  764 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggaga 862  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||  || |||||| |||||||||||||||||||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggaga 25248667  T
Q  863 cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccg 959  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| | ||||||| | |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  25248666 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctccctcccctagactaggtcaatttggaccg 25248567  T
Q  960 aactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25248566 aactgggtcaacaaattcttt 25248546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 782 - 980
Target Start/End: Original strand, 16429042 - 16429244
Alignment:
Q  782 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 880  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16429042 attcaacttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccat 16429141  T
Q  881 tgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16429142 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagcgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattc 16429241  T
Q  978 ttt 980  Q
    |||    
T  16429242 ttt 16429244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 721 - 949
Target Start/End: Complemental strand, 15669648 - 15669419
Alignment:
Q  721 acaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 820  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15669648 acaaaagtagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 15669552  T
Q  821 ttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacgttactcatca-tatagtgga 917  Q
    | ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | ||||||||| |||||||||    
T  15669551 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtgga 15669452  T
Q  918 tcggagggctgctctctcccc-agactaggtca 949  Q
     |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15669451 acggatggctgctctctccccgagactaggtca 15669419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 384 - 572
Target Start/End: Original strand, 6997214 - 6997395
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6997214 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattattgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctaaaaatata-ttatgg 6997312  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattct 572  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6997313 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacgatttgatgcaaa------ttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattct 6997395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 612 - 938
Target Start/End: Complemental strand, 18800930 - 18800610
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    |||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |     ||||||||||||| ||||||||    
T  18800930 attttttccaattttatgagg-atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatacaa----ggggctgaaacaaaggtttaga 18800836  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    | | |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |  ||||| ||||||||| |  |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18800835 a-gtcaacaagaaaactacggtttgtatagagtttg-ctcttggccacaaatactagggttgg--ggttgattcaccctgagaaacactattaggattga 18800740  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggctgga-ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca- 908  Q
    |||||| ||| ||||| ||||  | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||     
T  18800739 gtctctaggtcacgggtagagatttgaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtatcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 18800640  T
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctctcccc 938  Q
    ||||||| | |||||  |||||||||||||    
T  18800639 tatagtgaagcggagaactgctctctcccc 18800610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 837 - 980
Target Start/End: Original strand, 23816027 - 23816172
Alignment:
Q  837 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct- 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||     
T  23816027 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatggatcggagggatgctctctc 23816126  T
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23816127 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 23816172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 384 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 46432636 - 46432521
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46432636 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 46432537  T
Q  484 acaataaatatatttt 499  Q
    ||||||||||||||||    
T  46432536 acaataaatatatttt 46432521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 612 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 49495561 - 49495206
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    |||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||| |    
T  49495561 atttgttcgaattttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataga----gggggctgaaacaagggtttata 49495466  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    ||          ||||||||||||| ||  |||||| ||||| | ||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  49495465 aatc--------aaactagggtttgcatatagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gagttgattcaccttgggaaacactaataaaattga 49495378  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggctgga-ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca- 908  Q
    |||| ||||| |||| |||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||     
T  49495377 gtcttttggtcacggtaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 49495278  T
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    ||||||| | || ||||||  ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| || ||||||||    
T  49495277 tatagtgaaacgaagggcttatctctccccaagactatgtcaatttagaccgaactaggtaaagaaattctt 49495206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 612 - 994
Target Start/End: Complemental strand, 8349411 - 8349032
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcag--gctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggttta 709  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||  || |||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||||    
T  8349411 atttgttccaattttatgagggataattttattataaatatagatcttgtattagatgc-aaaccttgagatagagag----ggctgaaacaagggttta 8349317  T
Q  710 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 809  Q
    ||| | |||||| |||| || ||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8349316 gaa-gtcaacaagaaaattaaggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggtttattcaccttgggaaacactattaggatt 8349221  T
Q  810 gagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc 907  Q
    |||| |  |||| ||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||| ||||| | ||||||||||    
T  8349220 gagtttgatggtcacgggaagagattaggactttaggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaactcattggtatctcttttgttaagttactcatc 8349121  T
Q  908 a-tatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctttgtgtctctctcttt 994  Q
    | |||||||||   ||||| || ||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  8349120 attatagtggaatagagggttgttctctccccaagactatgtcagttttagaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgt-tctctcttt 8349032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 777 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 6115304 - 6115101
Alignment:
Q  777 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 875  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6115304 ggttgattcaccttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgtaa 6115205  T
Q  876 cccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 972  Q
    || |||||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6115204 ccaattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaaca 6115105  T
Q  973 aatt 976  Q
    ||||    
T  6115104 aatt 6115101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 6996067 - 6996219
Alignment:
Q  422 ttgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgattt 521  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  6996067 ttgttgctaaaaatataaaagacttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaatacatatatttttgtaccgtatgaagaacgattt 6996166  T
Q  522 aatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactga 580  Q
     ||  |||      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6996167 gatgtaaa------ttgaaagggaatattatatttttgttgcaaatattctttcactga 6996219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 383 - 537
Target Start/End: Original strand, 16561130 - 16561284
Alignment:
Q  383 ctgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 482  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16561130 ctgttgttgtatgattcaaaatttgttggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatt 16561229  T
Q  483 gacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatatttt 537  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| | |  |||| | |||||||||||||    
T  16561230 gacaataaatatctttttgtaccgtatgaaggaatatttgaaacaaatatatttt 16561284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 526 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 26520572 - 26520206
Alignment:
Q  526 caaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgagggagnnnnnnnnnca-------tatcttcagtctggtatttgtt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||          |       |||||||||| || |||| |||    
T  26520572 caaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcaccgaagaagaaaaaaacaaaagaaatgtatcttcagtgtgatattcgtt 26520473  T
Q  619 ccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggca 717  Q
    |||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||    |||||||| |||||| ||||||| ||| ||    
T  26520472 ccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataga---ggggggctgaaaacaacggtttag-aagtca 26520378  T
Q  718 acaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct 817  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||| | ||||||||||| | ||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26520377 acaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--gaggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctct 26520281  T
Q  818 tg------gttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 884  Q
    ||      || ||||||||||  | ||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  26520280 tggtcacagtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggaaacttattcttgtaacccattgat 26520206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 697 - 976
Target Start/End: Original strand, 27916500 - 27916780
Alignment:
Q  697 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 796  Q
    |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |    |||||||||||||| |||    
T  27916500 aaacaagggtttagaa-gccagcaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggaa--ttgattcaccttggaaaa 27916593  T
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacc--cattgatttctcttt 892  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||  || |||||||||| ||||||||   || |||| |||||| |||||  | ||||| |||||||    
T  27916594 cactattagaattgagtctcttggtcacatgaagagattgtgactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttttaaccttctttgatatctcttt 27916693  T
Q  893 gtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    |||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||    
T  27916694 gtaaagttactcatcgttatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattgggtaaacaaatt 27916780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 779 - 951
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155963
Alignment:
Q  779 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||   | ||| | |||||||||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaagagtaattcttgtaac 155887  T
Q  877 ccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaat 951  Q
    |  ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  155888 cttttgttatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctccccaaactaggtcaat 155963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 688 - 938
Target Start/End: Complemental strand, 13125746 - 13125495
Alignment:
Q  688 agggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg-tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattca 786  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |  |||||||||||||||    ||||||||||    
T  13125746 agggggctgaaacaagggttaagaa-gccaacaaggaaactagggtttggtatagagtttg-ctcttggcgacaaacactagggttga--ggttgattca 13125651  T
Q  787 ccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 884  Q
    | ||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| |||||    
T  13125650 cattgggaaacgctgttaggattgaggctcttggtcaagggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgat 13125551  T
Q  885 ttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccc 938  Q
     |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||| ||||    
T  13125550 atctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagttgctctcccccc 13125495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 777 - 974
Target Start/End: Complemental strand, 30790602 - 30790401
Alignment:
Q  777 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgta 874  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  30790602 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 30790504  T
Q  875 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 971  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||    
T  30790503 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaac 30790404  T
Q  972 aaa 974  Q
    |||    
T  30790403 aaa 30790401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 797 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 21353525 - 21353342
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||    
T  21353525 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgta 21353429  T
Q  896 acgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    | |  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  21353428 aagaaactcatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatctttagaccgaactgggtaaacaaattctt 21353342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 900 - 980
Target Start/End: Original strand, 13358778 - 13358859
Alignment:
Q  900 tactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13358778 tactcttcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 13358859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 775 - 976
Target Start/End: Original strand, 16561544 - 16561751
Alignment:
Q  775 tgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttg 872  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || ||  || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||    
T  16561544 tgggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttg 16561643  T
Q  873 taacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc-cagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtc 968  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||| |  |||| |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||| ||     
T  16561644 taaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacaaagggttgctctctcccatagactaggtcagtattggaccgaactgtgta 16561743  T
Q  969 aacaaatt 976  Q
    ||||||||    
T  16561744 aacaaatt 16561751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 779 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 30738830 - 30738625
Alignment:
Q  779 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 876  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  | ||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  30738830 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 30738731  T
Q  877 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca---tatagtggatcggagggctgctctctc-cccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 970  Q
    || ||||| |||| ||||||| |||||||||||   ||||||| | ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||| |||| ||| ||    
T  30738730 cctttgatgtctcttttgtaaagttactcatcatattatagtgaaacggagggatgctctctcacccatactaggtcagtattggaccaaacttggtaaa 30738631  T
Q  971 caaatt 976  Q
    ||||||    
T  30738630 caaatt 30738625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 779 - 994
Target Start/End: Complemental strand, 26613440 - 26613220
Alignment:
Q  779 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||  || | |||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  26613440 ttgattcaccttgggaaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 26613341  T
Q  877 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 972  Q
    || ||||| |||| |||| || |||||| |||| ||||||||| | ||| ||| |||||| ||||||| ||||||| | || ||||||||||||| ||||    
T  26613340 cctttgatatctcttttggaaagttactaatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagattaggtcagtatttgaccgaactgggtaaaca 26613241  T
Q  973 aattctttgtgtctctctcttt 994  Q
    |||| | ||||| |||||||||    
T  26613240 aattttgtgtgt-tctctcttt 26613220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 394 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 13785835 - 13785662
Alignment:
Q  394 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttg-----------------tgctgaaaatata 476  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                 |||||||||||||    
T  13785835 tgactcaaaaattgatggatggagaatattgtcgctaaaaatatgaaagatttgtttcaaatatattttgtgtttctagaatattgttgctgaaaatata 13785736  T
Q  477 tttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatatt 550  Q
    ||||| || | |||||||||||||||||||||||| | | ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||    
T  13785735 tttatagatagtaaatatatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaaaggaatatt 13785662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 464 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 11693666 - 11693580
Alignment:
Q  464 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatatt 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  11693666 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagggaatatt 11693580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 638 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 25248850 - 25248756
Alignment:
Q  638 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25248850 tttttctagaaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 25248756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 868 - 976
Target Start/End: Original strand, 15916562 - 15916674
Alignment:
Q  868 tcttgtaacccattgatttctctttg-taacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaa-tttggaccgaact 963  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15916562 tcttgtaacccattgatatctcttttataaagttactcgtcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaact 15916661  T
Q  964 gggtcaacaaatt 976  Q
    |||| ||||||||    
T  15916662 gggtaaacaaatt 15916674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 636 - 737
Target Start/End: Original strand, 16231544 - 16231641
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16231544 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg----agatagagggggctgaaacaagggtctagaaaagcaacaagaaaactagggttt 16231639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 526 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 6115538 - 6115479
Alignment:
Q  526 caaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgagggag 585  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  6115538 caaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaggag 6115479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 394 - 465
Target Start/End: Original strand, 32260746 - 32260817
Alignment:
Q  394 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 465  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  32260746 tgactcaaaatttgatggatgaagaagattgttgctaaaaatataaaagaattgtttaaaatatattttgtg 32260817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 794 - 975
Target Start/End: Original strand, 2232597 - 2232774
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||||    
T  2232597 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctcttt 2232693  T
Q  893 gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    |||| |  ||||||    | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  2232694 gtaaagaaactcat----tcgtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 2232774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 797 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 2401400 - 2401215
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||    
T  2401400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgta 2401304  T
Q  896 acgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    | |  ||||  |||| ||||||||| | ||| ||| |||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  2401303 aagaaactcatatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 2401215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 797 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 2393461 - 2393277
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||   ||||||||||||||    || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||||    
T  2393461 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagtctgggacttgggtagaattagatttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgta 2393365  T
Q  896 acgttactcat--cat-atagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    | |  ||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| | |||||||||||    
T  2393364 aagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccccagactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaattctt 2393277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 697 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 26332836 - 26332719
Alignment:
Q  697 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 796  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||    
T  26332836 aaacaagggtttagaa-gccaaca-caaaaatagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggtttgattcaccttcggaaa 26332744  T
Q  797 cactattaggattgagtctcttggt 821  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  26332743 cactattaggatttagtctcttggt 26332719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 720 - 917
Target Start/End: Original strand, 28279292 - 28279489
Alignment:
Q  720 aacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctctt 818  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||| |||||   |||||||||||||||| |  | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  28279292 aacaaaattagggtttgta--gagtttg-ctcttgacaacaaacactagggttgg--gattgattccccttggagaaacactattaggattgagcttctt 28279386  T
Q  819 ggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagt 914  Q
    ||| ||||||||||  | ||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||| |||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  28279387 ggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctcttttgtaaagttactcatcattatagt 28279486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 797 - 975
Target Start/End: Original strand, 9526469 - 9526650
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| ||   || ||||||||||    
T  9526469 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctctttgta 9526565  T
Q  896 acgttact--catca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    | |  |||   |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  9526566 aagaaacttatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 9526650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 467 - 550
Target Start/End: Original strand, 14352759 - 14352842
Alignment:
Q  467 tgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatatt 550  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||| | | ||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  14352759 tgaaaatatatttatgaatagtaaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagggaatatt 14352842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 421 - 467
Target Start/End: Original strand, 10115509 - 10115555
Alignment:
Q  421 attgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 467  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10115509 attgttgttaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 10115555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 797 - 855
Target Start/End: Original strand, 25134074 - 25134132
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg 855  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  25134074 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattagg 25134132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 794 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 4144865 - 4144804
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg 855  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||||    
T  4144865 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggacttgggtagaattagg 4144804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 783 - 947
Target Start/End: Original strand, 43104245 - 43104414
Alignment:
Q  783 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgga-ctttgggtagaattaggcggga-gacttatt-cttgtaaccca 879  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||   || | |||||||||||||||||   || || || || ||||||||||     
T  43104245 ttcaccttggaaaacactattagaattgagtcttttggtcacaggaagacattgaaactttgggtagaattaggtttgaagatttttttcttgtaaccct 43104344  T
Q  880 ttgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctccccagactaggt 947  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||  ||||||||||||    
T  43104345 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagatgctctcctcccagactaggt 43104414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 451 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 13112099 - 13112047
Alignment:
Q  451 caaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgta 503  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13112099 caaatgtattttatgctgaaaatatattcatggacaataaatatatttttgta 13112047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 779 - 938
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353208
Alignment:
Q  779 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag--gctggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 875  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||   |  |||||||||||||||||||   || || |||||||||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggatttagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattaggtttgaaac-tattcttgtaa 14353145  T
Q  876 cccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccc 938  Q
    ||| ||||  ||| ||||||| |||| |||||| ||||||||| || || ||  ||||||||||    
T  14353146 ccctttgaaatct-tttgtaaagttattcatcattatagtggaacgaagagccactctctcccc 14353208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 779 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332613
Alignment:
Q  779 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaatta 853  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  || ||||||| |||||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgtgtagaatta 26332613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 464 - 511
Target Start/End: Original strand, 32260833 - 32260880
Alignment:
Q  464 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatga 511  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  32260833 tgctgaaaatatatttatgaacaataaatatatttttgtaccgtatga 32260880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 797 - 855
Target Start/End: Original strand, 9521718 - 9521776
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg 855  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  9521718 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagaggctgggacttgggtagaattagg 9521776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 612 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 26613601 - 26613503
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctg-aaacaagggtttag 710  Q
    ||||||||||| ||| ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||   |||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26613601 atttgttccaatttt-tgagggattcttttgctataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgag--agatagagggggctgaaaacaagggtttag 26613505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 9476329 - 9476265
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9476329 atagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9476265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 13598466 - 13598402
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13598466 atagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13598402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 16124545 - 16124609
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  16124545 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 16124609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 37069838 - 37069774
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  37069838 atagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 37069774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 47703965 - 47704029
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  47703965 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47704029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 394 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 11693753 - 11693686
Alignment:
Q  394 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattt 461  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||    
T  11693753 tgactcaaaatttgatggatgaagaagattattgctaaaattataaaaattttgttttaaatatattt 11693686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 911 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 19072995 - 19072932
Alignment:
Q  911 tagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19072995 tagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 19072932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 911 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 19120885 - 19120822
Alignment:
Q  911 tagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19120885 tagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 19120822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 911 - 973
Target Start/End: Original strand, 47098854 - 47098917
Alignment:
Q  911 tagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  47098854 tagtggattggagggctgctctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47098917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 911 - 973
Target Start/End: Original strand, 47102871 - 47102934
Alignment:
Q  911 tagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  47102871 tagtggattggatggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47102934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 612 - 666
Target Start/End: Original strand, 43104078 - 43104132
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcag 666  Q
    ||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43104078 atttgttccagttttttgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcag 43104132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 890 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 13127774 - 13127685
Alignment:
Q  890 tttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctcc-ccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  13127774 tttgtaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcctccagactaggttagtattggaccgaaccgggtaaacaaatt 13127685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 947 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 13447301 - 13447268
Alignment:
Q  947 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13447301 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 13447268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 909 - 973
Target Start/End: Original strand, 21536597 - 21536662
Alignment:
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  21536597 tatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcattttttaccgaactgggtcaacaa 21536662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 910 - 970
Target Start/End: Complemental strand, 29651879 - 29651818
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 970  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  29651879 atagtggattggagtgctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 29651818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 612 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 30790755 - 30790658
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctg-aaacaagggtttag 710  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||    |||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  30790755 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttg----agatagagggagctgaaaacaagagtttag 30790661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 690 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 13127917 - 13127790
Alignment:
Q  690 ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacct 789  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||| ||| ||||||  || || | |||||||||||||||| |  | | |||||||||    
T  13127917 ggggttgaaacaagggtttagaa-gccaacaagaaaagtagggtttatatagagtttc-cttttggcaacaaacactagggttgg--gatagattcacct 13127822  T
Q  790 tgggaaacactattaggattgagtctcttggt 821  Q
    ||||||||| | || | ||| |||||||||||    
T  13127821 tgggaaacattgttggaattaagtctcttggt 13127790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 612 - 684
Target Start/End: Original strand, 16431020 - 16431092
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagataga 684  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||   |||| ||||||||||    
T  16431020 atttgttccaattttatgagggatacttttactataaatataggttttgtatcagagcaaaccttgagataga 16431092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 914 - 973
Target Start/End: Original strand, 26644930 - 26644990
Alignment:
Q  914 tggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26644930 tggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 26644990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 384 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 6997427 - 6997388
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatatt 423  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6997427 tgttgtagtatgactcaaaatatgatggatggagaatatt 6997388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 16855296 - 16855265
Alignment:
Q  431 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16855296 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 16855265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 779 - 821
Target Start/End: Original strand, 49959129 - 49959172
Alignment:
Q  779 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggt 821  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49959129 ttgattcaccttggagaaacactattaggaatgagtctcttggt 49959172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 935 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 834205 - 834167
Alignment:
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  834205 ccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 834167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 913 - 970
Target Start/End: Complemental strand, 3281773 - 3281715
Alignment:
Q  913 gtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 970  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  3281773 gtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 3281715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 636 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 13449886 - 13449852
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggcta 670  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13449886 actttcactataaatatagaccttgtatcaggcta 13449852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 794 - 832
Target Start/End: Original strand, 14997040 - 14997078
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 832  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14997040 aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagag 14997078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 935 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 28220264 - 28220226
Alignment:
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28220264 ccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28220226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 935 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 28265592 - 28265554
Alignment:
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28265592 ccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28265554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 935 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 45644392 - 45644354
Alignment:
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45644392 ccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 45644354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 838 - 976
Target Start/End: Original strand, 46783189 - 46783331
Alignment:
Q  838 actttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctc 935  Q
    ||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |  |||||||| ||||||||| | ||| |||| | ||||    
T  46783189 actttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctttttgtaaagaaactcatcattatagtggaacagagagctgttatctc 46783288  T
Q  936 c-ccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    | ||||| || |||||| ||||| |||||||| | ||||||||    
T  46783289 ctccagagtaagtcaatattggatcgaactggataaacaaatt 46783331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 372
Target Start/End: Original strand, 2260858 - 2260891
Alignment:
Q  339 attctaggatgagggttcaatcaagtccctcacc 372  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2260858 attctagggtgagggttcaatcaagtccctcacc 2260891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 636 - 665
Target Start/End: Original strand, 23783494 - 23783523
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatca 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23783494 acttttactataaatatagaccttgtatca 23783523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 331 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26240922 - 26240881
Alignment:
Q  331 ttaggtgaattctaggatgagggttcaatcaagtccctcacc 372  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  26240922 ttaggtggattctagggtgagggttcaattaagtccctcacc 26240881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 473; Significance: 0; HSPs: 111)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 473; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Original strand, 15808962 - 15809560
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15808962 tgttttagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatgg 15809061  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15809062 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 15809161  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    ||         | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15809162 agaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagag 15809261  T
Q  684 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 783  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809262 ataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct-tttggaacaaacactagggtttgtgggttgat 15809360  T
Q  784 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 882  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809361 tcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 15809460  T
Q  883 atttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc-tccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809461 atttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctcttccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 15809560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 465; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Original strand, 3873750 - 3874352
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3873750 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 3873849  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaa-cgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgagg 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3873850 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 3873949  T
Q  583 gagnnnnnnnnn--catatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 680  Q
    |||           ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3873950 gagaaaaaaaaaaacatatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgtatcaggctaaactttgaga 3874049  T
Q  681 tagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 780  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3874050 gagatagcgggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 3874149  T
Q  781 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 879  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3874150 gattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 3874249  T
Q  880 ttgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3874250 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 3874349  T
Q  978 ttt 980  Q
    |||    
T  3874350 ttt 3874352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 382 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 28283815 - 28283214
Alignment:
Q  382 cctgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttat 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283815 cctgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatatttttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttat 28283716  T
Q  482 ggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgag 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28283715 ggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagtgaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaa 28283616  T
Q  582 ggagnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagat 681  Q
    ||||         | |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28283615 ggagaaaaaaaaacgtatcttcagtgtaatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagag 28283516  T
Q  682 aga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 779  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28283515 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggt 28283416  T
Q  780 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgga-ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 878  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  28283415 tgattcacattgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaaccc 28283316  T
Q  879 attgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 978  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283315 attgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 28283216  T
Q  979 tt 980  Q
    ||    
T  28283215 tt 28283214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Original strand, 43529871 - 43530457
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43529871 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 43529970  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  43529971 acaataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgctaatattctttcactgaagg 43530070  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    ||           |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||    
T  43530071 agaaaaaaaaaagtatcttcagtgtggtatttattccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagag 43530170  T
Q  684 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||             || | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  43530171 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaac-------------gtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgat 43530257  T
Q  784 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43530258 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccattg 43530357  T
Q  883 atttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43530358 atttctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctgtctctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 43530457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 383 - 980
Target Start/End: Original strand, 608469 - 609076
Alignment:
Q  383 ctgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 482  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608469 ctgttgtagtatcactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 608568  T
Q  483 gacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgagg 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  608569 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatattttatgcaaatattctttcactgaag 608668  T
Q  583 gagnnnnnnnnn----catatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaacttt-- 676  Q
    |||             | ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||    |||||||      
T  608669 gagaaaaaaaaaagaacgtatcttcggtgtgatatttgttccaaatttatgagttata-tttcactgtaaatatagaccttatatcatagcaaactttga 608767  T
Q  677 --gagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttg 774  Q
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  608768 gagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttg 608867  T
Q  775 tgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 873  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608868 agggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 608967  T
Q  874 aacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 971  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  608968 aacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaac 609067  T
Q  972 aaattcttt 980  Q
    |||||||||    
T  609068 aaattcttt 609076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Original strand, 41384493 - 41385086
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  41384493 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcgaatatattttatactgaaaatatatttatgg 41384592  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||    
T  41384593 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt-atgcaaatattctttcattgaagg 41384691  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    |          | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||  |||||||||    
T  41384692 aaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaaattgagatag 41384791  T
Q  684 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 783  Q
    |     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  41384792 a-----ggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgat 41384886  T
Q  784 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgga-ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 882  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||    
T  41384887 tcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattg 41384986  T
Q  883 atttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |  |||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41384987 acatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 41385086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 597 - 980
Target Start/End: Original strand, 32339265 - 32339651
Alignment:
Q  597 tatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctg 696  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32339265 tatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctg 32339364  T
Q  697 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 796  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32339365 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggtaaa 32339464  T
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  32339465 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 32339564  T
Q  895 aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32339565 aacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggttaacaaattcttt 32339651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 385 - 980
Target Start/End: Original strand, 41382420 - 41383004
Alignment:
Q  385 gttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgga 484  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  41382420 gttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgttaaaaatataaaagatttgtttcgaatatattttatactgaaaatatatttatgga 41382519  T
Q  485 caataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggga 584  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  41382520 caataaatatatttttgtaccgtatgaacaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaatga 41382619  T
Q  585 g-nnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    |          | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||    
T  41382620 gaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatag 41382719  T
Q  684 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 783  Q
    ||    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  41382720 at----ggggctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagaatttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtt 41382815  T
Q  784 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 882  Q
    ||||           |||||| |||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  41382816 tcac-----------ctattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattg 41382904  T
Q  883 atttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |  |||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41382905 acatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttt 41383004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Original strand, 27829273 - 27829638
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829273 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttgg----agatagagggggctgaaacaagggtttaga 27829367  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829368 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 27829467  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 910  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27829468 gtctcttggttacgggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcata 27829567  T
Q  911 tagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829568 tagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 27829638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 597 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 24873562 - 24873178
Alignment:
Q  597 tatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagataga--tagagggggc 694  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  24873562 tatcttcagtgttgtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggc 24873463  T
Q  695 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggga 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24873462 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttgga 24873363  T
Q  795 aacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24873362 aacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccgattgatttctcttt 24873263  T
Q  893 gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||| || |||||||||||    
T  24873262 gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaattgagtcaacaaatt 24873178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Original strand, 27826962 - 27827327
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27826962 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttgg----agatagagggggctgaaacaagggtttaga 27827056  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827057 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 27827156  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 910  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27827157 gtctcttggttacaggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcata 27827256  T
Q  911 tagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827257 tagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 27827327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Original strand, 14807727 - 14808103
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  14807727 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagat----agagggggctgaaacaagggtttaga 14807821  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807822 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 14807921  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 909  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14807922 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 14808021  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctct-----------ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||| ||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14808022 atagtggaacggagggctgctctctccccctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 14808103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 28251926 - 28251560
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    | ||| |||||||||||||||||    
T  28251926 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagataga----gtgggttgaaacaagggtttaga 28251832  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251831 atggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 28251732  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 909  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  28251731 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttataacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcat 28251632  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251631 atagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 28251560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Original strand, 18810707 - 18811049
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18810707 acttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttgg----agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 18810802  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18810803 gtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaataggct 18810902  T
Q  836 -ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18810903 gggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggattggagggctgctctct 18811002  T
Q  935 -ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
     ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18811003 cccccagattaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttt 18811049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 636 - 984
Target Start/End: Original strand, 44720842 - 44721190
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  44720842 acttttactataaatatagaccttatatcaaagcaaactttg----agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatgtttt 44720937  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44720938 gtatagagtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 44721037  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  44721038 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagagctgctctc 44721137  T
Q  934 tccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttctttgtgt 984  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44721138 tcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 44721190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Original strand, 4423994 - 4424360
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4423994 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatacagaccttgtatcagagcaaactttgagat----agagggggctgaaacaaggatttaga 4424088  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4424089 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaaacactattaggattga 4424188  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggctgga-ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 909  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  4424189 gtctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttatcttttgtaacattactcatcat 4424288  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4424289 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 4424360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 612 - 976
Target Start/End: Original strand, 15072686 - 15073049
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  15072686 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagat----agagggggctgaaacaagggtttaga 15072780  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15072781 aaggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 15072880  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct--ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 908  Q
    |||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  15072881 gtctcttggttacgagaagagggttgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca 15072980  T
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15072981 tacagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 15073049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 635 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 22685003 - 22684646
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagataga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaact 728  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||      |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22685003 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaact 22684904  T
Q  729 agggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 828  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22684903 agggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 22684804  T
Q  829 agaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc---attgatttctct-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggag 923  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22684803 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccaatattgatttctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacggag 22684704  T
Q  924 ggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22684703 ggctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 22684646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Original strand, 15067957 - 15068323
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||    
T  15067957 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatataaaccttgtatcaacctaaactttgagatagaa----ggggctgaaacaagggtttaga 15068051  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15068052 aaggcaacaacaaaaccagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaatactattaggattga 15068151  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 909  Q
    |||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  15068152 gtcttttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 15068251  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15068252 ataatggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggccaacaaattcttt 15068323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 637 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 27107232 - 27106894
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27107232 cttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 27107137  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 836  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  27107136 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 27107037  T
Q  837 -gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  27107036 tgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatagatatctcttttgtagggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctatct 27106937  T
Q  935 cc-ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27106936 cctccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaatt 27106894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 689 - 984
Target Start/End: Original strand, 43079650 - 43079949
Alignment:
Q  689 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43079650 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 43079749  T
Q  789 ttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 886  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43079750 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 43079849  T
Q  887 ctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttctttgtgt 984  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43079850 ctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 43079949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 677 - 984
Target Start/End: Original strand, 43082009 - 43082320
Alignment:
Q  677 gagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg 776  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43082009 gagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg 43082108  T
Q  777 ggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 874  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43082109 ggttgattcaccttgggaaacactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgta 43082208  T
Q  875 acccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  43082209 acccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 43082308  T
Q  974 a-ttctttgtgt 984  Q
    | ||||||||||    
T  43082309 atttctttgtgt 43082320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Original strand, 27910990 - 27911355
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||| ||| ||||||||   ||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||     
T  27910990 atttgttccaattttatgggagatacttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttg----agatagagggggctgaaacaagggtttag- 27911084  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27911085 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 27911184  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacgttactcatcat 909  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  27911185 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcat 27911284  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27911285 atagtgaaacggagggttgctctctccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattcttt 27911355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Original strand, 27957409 - 27957774
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||| ||| ||||||||   ||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||     
T  27957409 atttgttccaattttatgggagatacttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttg----agatagagggggctgaaacaagggtttag- 27957503  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27957504 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 27957603  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacgttactcatcat 909  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  27957604 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcat 27957703  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27957704 atagtgaaacggagggttgctctctccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattcttt 27957774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Original strand, 18812892 - 18813223
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| ||||||||    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  18812892 acttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagataga----ggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag----- 18812982  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18812983 ------agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgggtacgggaagaggct 18813076  T
Q  836 g-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18813077 gtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggattggagggctgctctct 18813176  T
Q  935 -ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
     ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18813177 cccccatattaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttt 18813223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 613 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 14419549 - 14419183
Alignment:
Q  613 tttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 712  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  14419549 tttgttccaa-tttatgagtgatacttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaa 14419455  T
Q  713 aggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 812  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14419454 aggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgag 14419355  T
Q  813 tctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-t 909  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||||||||| |    
T  14419354 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatgtcttttgtaaggttactcatcatt 14419255  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||| | | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14419254 atagtgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 14419183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 622 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 30480853 - 30480496
Alignment:
Q  622 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaa 721  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30480853 aatttatgagggatgcttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagaa----ggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaa 30480758  T
Q  722 caaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 821  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30480757 caaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 30480658  T
Q  822 tacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatc 919  Q
     ||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |      
T  30480657 cacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaaat 30480558  T
Q  920 ggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30480557 ggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 30480496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 635 - 980
Target Start/End: Original strand, 1225164 - 1225509
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 734  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1225164 tacttttactataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagat----agagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 1225259  T
Q  735 tgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  1225260 tgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 1225359  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 931  Q
    | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||    
T  1225360 tggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggccgctc 1225459  T
Q  932 tctccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1225460 tctccctcatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttt 1225509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 613 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 13858842 - 13858473
Alignment:
Q  613 tttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 712  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||    
T  13858842 tttgttccaa-tttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataga----gggggatgaaacaagggtttagaa 13858748  T
Q  713 aggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13858747 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 13858648  T
Q  813 tctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-t 909  Q
    | ||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| || |||| ||||||| ||||||||||| |    
T  13858647 tttcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagcccatt-atatctcttttgtaaagttactcatcatt 13858549  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttgtgt 984  Q
    |||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13858548 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggacagaactgggtaaacaaattctttgtgt 13858473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 682 - 978
Target Start/End: Original strand, 36865579 - 36865877
Alignment:
Q  682 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 781  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||    
T  36865579 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttg 36865678  T
Q  782 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 880  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36865679 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctct---tcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 36865775  T
Q  881 tgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccc--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    | || |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36865776 taatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 36865875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 637 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 5372512 - 5372173
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  5372512 cttttactataattatagacattgtatcagtgtaaatcttgagataga-----ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggttta 5372418  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct- 835  Q
    ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |     
T  5372417 tatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattg 5372318  T
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| | |||||    
T  5372317 ggactttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttactctc 5372218  T
Q  934 t--ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  5372217 tccccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaatt 5372173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 682 - 980
Target Start/End: Original strand, 25952562 - 25952863
Alignment:
Q  682 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 781  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  25952562 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaataaaattagggtt-gtatatagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttg 25952660  T
Q  782 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 880  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||   || ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  25952661 attcaccttggaaaacaatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaattgagacattgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaactcat 25952760  T
Q  881 tgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    |||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25952761 tgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactaggtcaacaaattc 25952860  T
Q  978 ttt 980  Q
    |||    
T  25952861 ttt 25952863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 15186070 - 15185707
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||| |||||||| |    || | ||||||||||||||||||    
T  15186070 atttgttccaattttatgagggatacttttactataaatataaactttgtatcagagtaaaccttgagataaa----ggtgactgaaacaagggtttaga 15185975  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||  || |||||||||| ||||| |||  |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  15185974 aagaaaataacaaaactatggtttatataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtaaaacactattagaattga 15185875  T
Q  812 gt--ctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 908  Q
    ||  |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||    
T  15185874 gtctctcttggttacgggaagag------atttgggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctcttttttaaggttactcatca 15185781  T
Q  909 -tatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
     ||||||| | |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15185780 ttatagtgaaacggaggactgttctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 15185707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 637 - 884
Target Start/End: Original strand, 14477276 - 14477520
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||   |||| |||    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14477276 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttg----agatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 14477371  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 836  Q
    |||  |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  14477372 tataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 14477471  T
Q  837 -gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 884  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14477472 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgat 14477520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 637 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 33541723 - 33541403
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33541723 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacattgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 33541628  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct- 835  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |     
T  33541627 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattg 33541528  T
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
    ||||||| ||||||||||||                      ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  33541527 ggacttttggtagaattagg----------------------cattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggaaggctgctctct 33541450  T
Q  935 -ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  33541449 cccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaaaaatttcttt 33541403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 384 - 542
Target Start/End: Original strand, 32339094 - 32339252
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339094 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 32339193  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaag 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  32339194 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaag 32339252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 731 - 980
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956300
Alignment:
Q  731 ggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 830  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  15956051 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaag 15956146  T
Q  831 aggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggct 927  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| |    
T  15956147 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggtt 15956246  T
Q  928 gctctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
     ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15956247 tctctctccctcagattaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttt 15956300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 637 - 976
Target Start/End: Original strand, 21482322 - 21482649
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||    | || ||||||||||||||||||||          |||||||||||||    
T  21482322 cttttactataaatatagaatttgtatcagagtaaactttgagataga----gtggactgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttg 21482409  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct- 835  Q
    |||  |||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |     
T  21482410 tataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttatgggaagagattg 21482505  T
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||  | | |||||||||||||||    
T  21482506 gggctttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataaagaaacggagggctgctctc 21482605  T
Q  934 t-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21482606 tcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 21482649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 613 - 832
Target Start/End: Complemental strand, 5623096 - 5622882
Alignment:
Q  613 tttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 712  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  5623096 tttgttccaa-tttatgagtgattcttttactataaatataggttttgtatcagaataaaccttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaa 5623002  T
Q  713 aggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||    
T  5623001 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctattgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctttggaaacattatttggattgag 5622902  T
Q  813 tctcttggttacgggaagag 832  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  5622901 tctcttgattacgggaagag 5622882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 682 - 967
Target Start/End: Original strand, 21480555 - 21480832
Alignment:
Q  682 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 781  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||   ||||||    
T  21480555 agatagatggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatggagtttg-ctcttggcaacaaacactaggttt---gggttg 21480642  T
Q  782 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttg-ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 880  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21480643 attcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaacccat 21480742  T
Q  881 tgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 967  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21480743 tgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaacgaactgggt 21480832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 612 - 976
Target Start/End: Original strand, 31162188 - 31162551
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaa-caagggtttag 710  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||| |||    ||||||| ||| ||| |||||||    
T  31162188 atttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaaccttgagaaaga----gggggctaaaaacaaaggtttag 31162283  T
Q  711 aaaggcaa-caacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 809  Q
    |||  ||| |||||||  ||| ||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||  ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31162284 aaa--caagcaacaaat-tagtgtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactaacgttag--ggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 31162377  T
Q  810 gagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc 907  Q
    |||||||||||| || |||||||  | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||  |||||||||    
T  31162378 gagtctcttggtcaccggaagagattgggactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatc 31162477  T
Q  908 a-tatagtggatcggagggctgctctct---ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  31162478 attatagtggaacagagggctgctctctcccccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 31162551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 682 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 3005921 - 3005624
Alignment:
Q  682 agatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 780  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||  |  ||||||| |||||||| ||||||| |||||   |||||||| ||||||   ||| ||    
T  3005921 agatagagggggctggaaacaagggtttagaaa--caaataacaaactagagtttgtatagagtttg-ctcttaacaacaaacaatagggt---tggatt 3005828  T
Q  781 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 879  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3005827 gattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatcca 3005728  T
Q  880 ttgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    ||||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  3005727 ttgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaacggaggggtgctctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaat 3005628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 611 - 818
Target Start/End: Original strand, 26775175 - 26775378
Alignment:
Q  611 tatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttag 710  Q
    |||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||||| | |||||||||   |||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26775175 tatttgttacaattttatgagggttacttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttg----agatagagggggctgaaacaagggtttag 26775270  T
Q  711 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 810  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  26775271 aaaggcaacaacaatactagggtttgtatatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttggaaaacactattagaattg 26775370  T
Q  811 agtctctt 818  Q
    ||||||||    
T  26775371 agtctctt 26775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 535 - 736
Target Start/End: Original strand, 181434 - 181632
Alignment:
Q  535 tttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgagggagnnnnnnnnn-catatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagtt 633  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||          | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  181434 tttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactaaaggagaagaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagtt 181533  T
Q  634 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 733  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  181534 atacttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttg----agatagagggggctgaaacaagggcttagaatggcaacaataaaactagggt 181629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 384 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 3265752 - 3265635
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3265752 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 3265653  T
Q  484 acaataaatatatttttg 501  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  3265652 acaataaatatatgtttg 3265635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 622 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 35872728 - 35872555
Alignment:
Q  622 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaa 721  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35872728 aatttatgagggatgcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaa 35872633  T
Q  722 caaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatta 804  Q
    |     |||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35872632 c-----tagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 35872555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 776 - 976
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035459
Alignment:
Q  776 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgt 873  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   || |||||||||||||    
T  31035252 gggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttgt 31035351  T
Q  874 aacccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagac--taggtcaat-ttggaccgaactgggtc 968  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||     
T  31035352 aaccctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactataggtcagtattggaccgaactgggta 31035451  T
Q  969 aacaaatt 976  Q
    ||||||||    
T  31035452 aacaaatt 31035459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 764 - 910
Target Start/End: Original strand, 181622 - 181772
Alignment:
Q  764 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt-aggattgagtctcttggttacg--ggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcggg 859  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||||||     
T  181622 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcgga 181721  T
Q  860 agacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 910  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  181722 agacttattcttgtaacccattgatatctctttgtaaagttactcatcata 181772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 612 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 12517385 - 12517248
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||   |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12517385 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactatatatatataccttgtatcagagcaaactttgaga--gatagagggggctgaaacaagggtttaga 12517289  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctct 752  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12517288 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 12517248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 779 - 994
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578256
Alignment:
Q  779 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 876  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 31578377  T
Q  877 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 972  Q
    |  ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||| ||||    
T  31578376 cttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctcccctagactaggtcagtataggaccgaactgggtaaaca 31578277  T
Q  973 aattctttgtgtctctctcttt 994  Q
    |||| | |||| ||||||||||    
T  31578276 aattttgtgtg-ctctctcttt 31578256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 611 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 3886278 - 3886155
Alignment:
Q  611 tatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttag 710  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  3886278 tatttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttag 3886184  T
Q  711 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 739  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3886183 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 3886155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 682 - 858
Target Start/End: Complemental strand, 37214504 - 37214317
Alignment:
Q  682 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaact-------------------agggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaa 762  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  37214504 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttggttacgggaagagattgagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaa 37214405  T
Q  763 cactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgg 858  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||    
T  37214404 cactagggtttgagggttgattcaccttgggaaac---------attgagtctcttggttacgggaagcgattggaactttgggtagaattaggcgg 37214317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 846 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 2468259 - 2468126
Alignment:
Q  846 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctc-cccagac 942  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |   ||||||||||||||| ||||||     
T  2468259 tagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctctctctcccagat 2468160  T
Q  943 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  2468159 taggtcaatttggacagaactaggtaaacaaatt 2468126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 794 - 975
Target Start/End: Complemental strand, 16752704 - 16752522
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||||    
T  16752704 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctcttt 16752608  T
Q  893 gtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    |||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  16752607 gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctactctctccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 16752522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 638 - 813
Target Start/End: Original strand, 31035068 - 31035238
Alignment:
Q  638 ttttactataaatatagaccttgtatcaggc-taaactttgagatagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||  | ||||| |  |||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  31035068 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaactttgaga--ggtagagagt-ctgaaaacaatggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggttt 31035163  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 813  Q
    |||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31035164 gtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacaccattaggattgagt 31035238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 794 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 9021289 - 9021101
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||    
T  9021289 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt 9021193  T
Q  893 gtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctcc-ccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    |||| |  ||||  |||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  9021192 gtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctccaccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 9021101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 697 - 906
Target Start/End: Complemental strand, 31574000 - 31573794
Alignment:
Q  697 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 796  Q
    |||||| ||||||||| | |||||  ||||||||| ||||||  |||||| |||||| | ||||||||||| |||| |  | ||||||||||||||||||    
T  31574000 aaacaaaggtttagaa-gccaacacgaaaactaggatttgta--gagttt-tctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaa 31573907  T
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 893  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||  | ||||| |||| ||||    
T  31573906 cactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaattctttgatatctcttttg 31573807  T
Q  894 taacgttactcat 906  Q
    ||| |||||||||    
T  31573806 taaagttactcat 31573794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 794 - 975
Target Start/End: Complemental strand, 16757449 - 16757266
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||||    
T  16757449 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctcttt 16757353  T
Q  893 gtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    |||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  16757352 gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 16757266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 634 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 2468436 - 2468261
Alignment:
Q  634 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||||||          |||||| |||    
T  2468436 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagataga----gggagctgaaacaaggatttagaaatc--------aaactacggt 2468349  T
Q  734 ttgtatg----gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 821  Q
    ||||||     ||||||| ||||| | |||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2468348 ttgtatatatagagtttg-ctcttggcaacaaatactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 794 - 975
Target Start/End: Complemental strand, 4812669 - 4812486
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||||    
T  4812669 aaacactattaggattgagtcttttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctcttt 4812573  T
Q  893 gtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    |||| |  | ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||    
T  4812572 gtaaagaaaatcattcattatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcataattagaccgaactgggtaaacaaat 4812486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 794 - 975
Target Start/End: Original strand, 28327908 - 28328091
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||||    
T  28327908 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctcttt 28328004  T
Q  893 gtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    |||| |  ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  28328005 gtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 28328091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 794 - 975
Target Start/End: Original strand, 28895502 - 28895686
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| |||||||| || ||   || |||||||    
T  28895502 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctcttt 28895598  T
Q  893 gtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctcc-ccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    |||| |  ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  28895599 gtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcctctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 28895686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 919 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 37214319 - 37214257
Alignment:
Q  919 cggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37214319 cggatggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 37214257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 794 - 992
Target Start/End: Original strand, 6376141 - 6376345
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 891  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || ||||||  |||||||||||   | ||||| |||||||| |||  ||||| ||||||    
T  6376141 aaacactgttaagattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttatgtagaattaggtttgaagactaattcttgttaccttttgatatctctt 6376240  T
Q  892 tgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc-cagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattctttgtg-tctc 987  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  || |||||||| | |||| ||||    
T  6376241 tgtaaagttactcatcattatagtggaacagaaggctgctctctccctcagactaggtcagtattggaccgaacttagtaaacaaattttgtgtgttctc 6376340  T
Q  988 tctct 992  Q
    |||||    
T  6376341 tctct 6376345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 794 - 975
Target Start/End: Original strand, 28332631 - 28332814
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||||    
T  28332631 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctcttt 28332727  T
Q  893 gtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctcc-ccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    |||| |  ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  28332728 gtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 28332814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 862 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 35872553 - 35872446
Alignment:
Q  862 acttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccga 960  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||            |||||||||||    
T  35872553 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc------------atttggaccga 35872466  T
Q  961 actgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  35872465 actgggtcaacaaattcttt 35872446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 797 - 949
Target Start/End: Complemental strand, 29554964 - 29554810
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaatta-ggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||| |   | | ||||||||||| ||| ||   || ||||||||||    
T  29554964 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattatgtttgaatacttattcttggaactca---atatctctttgta 29554868  T
Q  896 acgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca 949  Q
    | |  ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  29554867 aagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 29554810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 394 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 13986374 - 13986304
Alignment:
Q  394 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 465  Q
    |||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13986374 tgactcaaaattttatggatgaagaagattgttgctaaaaatat-aaagatttgttttaaatatattttgtg 13986304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 794 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 17799606 - 17799418
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 891  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||   | ||||| |||||| |||| ||   || ||||||    
T  17799606 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgagtataattaggtttgaagactgattcttataactca---atatctctt 17799511  T
Q  892 tgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctc-cccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    ||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  17799510 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctctcccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 17799418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 797 - 855
Target Start/End: Original strand, 590797 - 590855
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg 855  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  590797 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattagg 590855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 797 - 855
Target Start/End: Original strand, 33032657 - 33032715
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg 855  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  33032657 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattagg 33032715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 797 - 975
Target Start/End: Original strand, 25684646 - 25684826
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||   |||||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    ||||||||||    
T  25684646 cactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagacagggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctctttgta 25684742  T
Q  896 acgttactcat-cat-atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    | |  |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  25684743 aagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 25684826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 797 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 23179740 - 23179555
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  23179740 cactattaggattgagtctcttggtcaccggaagaggctgtgacttt-ggtaaaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 23179645  T
Q  895 aacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  23179644 aaagaaactcatatcattatagtggaacggatagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 23179555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 794 - 878
Target Start/End: Complemental strand, 13985262 - 13985176
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag--gctggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 878  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||   | ||||||||||||||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  13985262 aaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaaactgattcttgtaaccc 13985176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 779 - 966
Target Start/End: Original strand, 17847661 - 17847848
Alignment:
Q  779 ttgattcaccttgg--gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 874  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||  || |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  17847661 ttgattcaccttgaacgaaacactattaggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 17847760  T
Q  875 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactggg 966  Q
    | || ||||| |||| |||||||    | ||||  |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  17847761 a-cctttgatatctcttttgtaa----aatcat--tatagtggaatggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccaaactggg 17847848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 394 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 30679256 - 30679186
Alignment:
Q  394 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 465  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  30679256 tgactcaaaatttgatggatgaagaatat-gttggtaaaaataaaaaagatttgttttagatatattttgtg 30679186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 797 - 855
Target Start/End: Original strand, 3276347 - 3276405
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg 855  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||   |||||||||||||||    
T  3276347 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggacttgggtagaattagg 3276405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 612 - 666
Target Start/End: Original strand, 17847504 - 17847557
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcag 666  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17847504 atttgttccaaattt-tgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcag 17847557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 4696625 - 4696689
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  4696625 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaa 4696689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 612 - 680
Target Start/End: Original strand, 6375964 - 6376032
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 680  Q
    |||| |||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  6375964 atttattccaattttatgcgggatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacattgaga 6376032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 9765848 - 9765912
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9765848 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9765912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 23799606 - 23799670
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcc-ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23799606 atagtggattggagggctgctctctcctccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 23799670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 26403259 - 26403323
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26403259 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 26403323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 333 - 372
Target Start/End: Original strand, 202576 - 202615
Alignment:
Q  333 aggtgaattctaggatgagggttcaatcaagtccctcacc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  202576 aggtgaattctaggatgagggttcaattaagtccctcacc 202615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 333 - 372
Target Start/End: Original strand, 317413 - 317452
Alignment:
Q  333 aggtgaattctaggatgagggttcaatcaagtccctcacc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  317413 aggtgaattctaggatgagggttcaattaagtccctcacc 317452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 464 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 11701447 - 11701364
Alignment:
Q  464 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatatt 550  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||  ||| || || ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  11701447 tgctgaaaatatatttatggtcagtaaatatatttttgtaccgtatg--gaa-gaattgatgtaaatatatttttaaagggaatatt 11701364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 911 - 973
Target Start/End: Original strand, 19752424 - 19752487
Alignment:
Q  911 tagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  19752424 tagtggattggagagctgctctctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 19752487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 635 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 14419834 - 14419780
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagag 689  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  14419834 tacttttgctataaatatagacattgtatcagggtaaaccttgagatagagagag 14419780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 935 - 980
Target Start/End: Original strand, 14477547 - 14477593
Alignment:
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactg-ggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14477547 ccccagactaggtcaatttggatcgaactgcggtcaacaaattcttt 14477593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 636 - 670
Target Start/End: Original strand, 43081957 - 43081991
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggcta 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43081957 acttttactataaatatagaccttgtatcaggcta 43081991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 935 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 10930237 - 10930188
Alignment:
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttgtgt 984  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10930237 ccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatttcttggtgt 10930188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 911 - 967
Target Start/End: Complemental strand, 28307628 - 28307571
Alignment:
Q  911 tagtggatcggagggctgctctc-tccccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 967  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  28307628 tagtggattggagagctgctctcatccccagagtaggtcattttggaccgaactgggt 28307571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 7412409 - 7412345
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  7412409 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 7412345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 930 - 970
Target Start/End: Complemental strand, 18106124 - 18106084
Alignment:
Q  930 tctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 970  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  18106124 tctctccccagaataggtcaagttggaccgaactgggtcaa 18106084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 909 - 975
Target Start/End: Original strand, 28890881 - 28890949
Alignment:
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  28890881 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 28890949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 31071258 - 31071322
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  31071258 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaacaa 31071322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 779 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 13986011 - 13985933
Alignment:
Q  779 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag--gctggactttgggtagaattag 854  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||   | |||||||||||| ||||||    
T  13986011 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagactcttaatcacgggaagagattcgggactttgggtataattag 13985933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 779 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 33839120 - 33839077
Alignment:
Q  779 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggt 821  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33839120 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggt 33839077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 372
Target Start/End: Original strand, 40599882 - 40599925
Alignment:
Q  329 atttaggtgaattctaggatgagggttcaatcaagtccctcacc 372  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40599882 attttggtggattctaggatgagggttcaaacaagtccctcacc 40599925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 935 - 973
Target Start/End: Original strand, 15212916 - 15212954
Alignment:
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15212916 ccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 15212954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 334 - 372
Target Start/End: Original strand, 19220913 - 19220951
Alignment:
Q  334 ggtgaattctaggatgagggttcaatcaagtccctcacc 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  19220913 ggtgaattctaggatgagggttcaattaagtccgtcacc 19220951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 794 - 979
Target Start/End: Original strand, 21033870 - 21034057
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||   |||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||    
T  21033870 aaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaag-ggctgggacttgggtagaaataggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctcttt 21033965  T
Q  893 gtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctc-tctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    |||| |  ||||  |||| ||||||||| |||||  |||||| | |||||| |||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  21033966 gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagatctgctcttttccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 21034057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 935 - 973
Target Start/End: Original strand, 27811408 - 27811446
Alignment:
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27811408 ccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 27811446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 794 - 855
Target Start/End: Original strand, 30423212 - 30423274
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattagg 855  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||| ||||||| ||||||||||    
T  30423212 aaacacttttaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattggaactttggatagaattagg 30423274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 935 - 973
Target Start/End: Original strand, 33352280 - 33352318
Alignment:
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33352280 ccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 33352318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 935 - 973
Target Start/End: Original strand, 40321210 - 40321248
Alignment:
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40321210 ccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40321248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 935 - 972
Target Start/End: Original strand, 4733836 - 4733873
Alignment:
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 972  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4733836 ccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 4733873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 779 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 11701155 - 11701102
Alignment:
Q  779 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 831  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  11701155 ttgattcaccttgaagaaacattattagaattgagtctcttggtcacgggaaga 11701102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 860 - 974
Target Start/End: Original strand, 16833769 - 16833886
Alignment:
Q  860 agacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttgga 956  Q
    ||||||| |||||||| |  ||||| ||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |     
T  16833769 agacttactcttgtaatcatttgatatctcttttgtaaagttactcaacattatagtggaacgaaaggctgctctctcccacagactaagtcacttttgg 16833868  T
Q  957 ccgaactgggtcaacaaa 974  Q
     |||||||||| ||||||    
T  16833869 acgaactgggtaaacaaa 16833886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 27820178 - 27820149
Alignment:
Q  436 ataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27820178 ataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 27820149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 636 - 665
Target Start/End: Original strand, 43079585 - 43079614
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatca 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43079585 acttttactataaatatagaccttgtatca 43079614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 469; Significance: 0; HSPs: 162)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 469; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 22132987 - 22132389
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132987 tgttgtagtatgattcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 22132888  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22132887 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 22132788  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    ||         | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22132787 agaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagag 22132688  T
Q  684 atagag-----ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtggg 778  Q
    | ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22132687 agagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgtggg 22132589  T
Q  779 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 877  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132588 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 22132489  T
Q  878 cattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132488 cattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 22132389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Original strand, 24347959 - 24348558
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24347959 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgc-gaaaatatatttatgg 24348057  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24348058 acaataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 24348157  T
Q  584 agnnnnnnnnnca-tatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagata 682  Q
    ||          | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  24348158 agaaaaaaaaaaagtatcttcaatgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaagctaaactttgagaga 24348257  T
Q  683 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttga 782  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  24348258 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttga 24348357  T
Q  783 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 881  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24348358 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaacccatt 24348457  T
Q  882 gatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348458 gatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 24348557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 22135219 - 22134615
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22135219 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 22135120  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  22135119 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgattcaaatattctttcactgaagg 22135020  T
Q  584 agnnnnnnnnn-catatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagata 682  Q
    ||          | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  22135019 agaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaagctaaactttgagaga 22134920  T
Q  683 gatagag-----------ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 771  Q
    || ||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22134919 gagagagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttca-aacaaacactagggt 22134821  T
Q  772 ttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattct 870  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134820 ttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattct 22134721  T
Q  871 tgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 970  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134720 tgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 22134621  T
Q  971 caaatt 976  Q
    ||||||    
T  22134620 caaatt 22134615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 17662826 - 17662238
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662826 tgttgtagtatgactacaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 17662727  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17662726 acaataaatatatttttgtaccgtacgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 17662627  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    ||           |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||    
T  17662626 agaaaaaaaaaagtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagag 17662527  T
Q  684 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  17662526 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt-----------ctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgat 17662438  T
Q  784 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 882  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662437 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 17662338  T
Q  883 atttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662337 atttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 17662238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 44600428 - 44599826
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44600428 tgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatgg 44600329  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44600328 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttaaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 44600229  T
Q  584 agnnnnnnnnncat--atcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagat 681  Q
    ||          |   ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||        
T  44600228 aggaaaaaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgtttcaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtattaaagcaaactttg---- 44600133  T
Q  682 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 781  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44600132 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 44600033  T
Q  782 attcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 879  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44600032 attcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 44599933  T
Q  880 ttgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat-tc 977  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  44599932 ttgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatc 44599833  T
Q  978 tttgtgt 984  Q
    |||||||    
T  44599832 tttgtgt 44599826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 14788021 - 14787423
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14788021 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaataatgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtggtgaaaatatatttatgg 14787922  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14787921 acaataaatatatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 14787822  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    ||         | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |    
T  14787821 agaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgaga--g 14787724  T
Q  684 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||    
T  14787723 atagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgat 14787624  T
Q  784 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  14787623 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattg 14787524  T
Q  883 atttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct---ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 978  Q
    |  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14787523 acatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattct 14787424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 969
Target Start/End: Original strand, 56030189 - 56030770
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56030189 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 56030288  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  56030289 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttggtgcaaatattctttcactgaagg 56030388  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    ||           ||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||  ||||| |||||||||    
T  56030389 agaaaaaaaaaagtatcttcggtgtggtattctttccaaatttatgagttatatttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatag 56030488  T
Q  684 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 783  Q
    |     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  56030489 aa----ggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgat 56030584  T
Q  784 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgga-ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  56030585 tcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattg 56030684  T
Q  883 --atttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtca 969  Q
      |||||| |||||||||||| ||||||||   || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56030685 acatttct-tttgtaacgttattcatcata---tgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 56030770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 294; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 597 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 18709546 - 18709152
Alignment:
Q  597 tatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagataga----tagagggg 692  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    ||||||||    
T  18709546 tatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagagagatagagggg 18709447  T
Q  693 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg 792  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18709446 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagttgattcaccttgg 18709347  T
Q  793 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 891  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18709346 gaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 18709247  T
Q  892 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttctttgtgt 984  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18709246 tgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 18709152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 635 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 8631760 - 8631412
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 734  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631760 tactttcactataaatatagactttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 8631661  T
Q  735 tgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631660 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 8631561  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 932  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631560 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 8631461  T
Q  933 ct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631460 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 8631412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 37089710 - 37089365
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37089710 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactt-gagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggttt 37089612  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37089611 gtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggct 37089512  T
Q  836 -ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37089511 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctct 37089412  T
Q  935 -ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089411 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 37089365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 22044749 - 22044384
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044749 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttgg----agatagagggggctgaaacaagggtttaga 22044655  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22044654 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgggaaacactattaggattga 22044555  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 910  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044554 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 22044455  T
Q  911 tagtggatcggagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044454 tagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 22044384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 22047044 - 22046679
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22047044 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatataggccttgtatcggagcaaacttgg----agatagagggggctgaaacaagggtttaga 22046950  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046949 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 22046850  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 910  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046849 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 22046750  T
Q  911 tagtggatcggagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046749 tagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 22046679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Original strand, 38409173 - 38409544
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagat--agatagagggggctgaaacaagggttta 709  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38409173 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaatggttta 38409271  T
Q  710 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 809  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38409272 aaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 38409371  T
Q  810 gagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca 908  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38409372 gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatca 38409471  T
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38409472 tatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 38409544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Original strand, 11434952 - 11435294
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11434952 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttgg----agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 11435047  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  11435048 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcctggttaccggaagagtct 11435147  T
Q  836 -ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435148 aggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 11435247  T
Q  935 cccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435248 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 11435294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Original strand, 51015220 - 51015585
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015220 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaacttgg----agatagagggggctgaaacaagggtttaga 51015314  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015315 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 51015414  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 910  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  51015415 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcata 51015514  T
Q  911 tagtggatcggagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015515 tagtggatcggaggtctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 51015585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 11006577 - 11006230
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006577 acttttactataaatatagaccttgtatcagactattttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 11006478  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11006477 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggc 11006378  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006377 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaatggtactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 11006278  T
Q  934 t-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  11006277 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttt 11006230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 513 - 980
Target Start/End: Original strand, 53404999 - 53405473
Alignment:
Q  513 gaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgagggagnnnnnnnnnca--tatcttcagtctgg 610  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||          |  ||| |||||| |||    
T  53404999 gaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaaaattatatttttgatgcaaatattctttcactaaaggagaaaaaaaaaaacgtattttcagtgtgg 53405098  T
Q  611 tatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttag 710  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53405099 tatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagataga-ggggctgaaacaagggtttag 53405197  T
Q  711 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 810  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  53405198 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattg 53405296  T
Q  811 agtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggaga------cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttac 902  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||      ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  53405297 agtctcttggttacggaaagaggctgagactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgtaacccattgatttctcttttgaaacgatac 53405396  T
Q  903 tcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53405397 tcatcatatagtggaacagagagctgctctc-ccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttt 53405473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Original strand, 9148225 - 9148592
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9148225 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaactttgaga--gatagagggggctgaagcaagggtttaga 9148321  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148322 aaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 9148421  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 910  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148422 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 9148521  T
Q  911 tagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148522 tagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttt 9148592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 635 - 977
Target Start/End: Complemental strand, 2485210 - 2484869
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 734  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2485210 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagctaga---agggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 2485114  T
Q  735 tgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2485113 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 2485014  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2485013 tgggactttgggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 2484914  T
Q  934 t-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2484913 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattc 2484869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 597 - 969
Target Start/End: Complemental strand, 47211121 - 47210756
Alignment:
Q  597 tatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagat--agatagagggggc 694  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  47211121 tatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagggagatagagggggc 47211022  T
Q  695 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggga 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||    
T  47211021 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg------------ttggga 47210934  T
Q  795 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47210933 aacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttt 47210834  T
Q  893 gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 969  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  47210833 gtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgagtca 47210756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 11008906 - 11008561
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11008906 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctattttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 11008807  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11008806 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggc 11008707  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11008706 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatt--tctttgtaatggtactcatcatatagtggattggagggctgctctc 11008609  T
Q  934 t-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11008608 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttt 11008561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Original strand, 18847150 - 18847492
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18847150 acttttactataaatatagaccttgtatcaaaacaaactttg----agatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 18847245  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||      
T  18847246 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagcattggagtctcttggttacgggaagagat 18847345  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18847346 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctc 18847445  T
Q  934 tccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18847446 tccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 18847492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 634 - 980
Target Start/End: Original strand, 47274722 - 47275065
Alignment:
Q  634 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47274722 atacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 47274817  T
Q  734 ttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 833  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47274818 ttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaag 47274916  T
Q  834 ct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 931  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  47274917 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc 47275016  T
Q  932 tctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47275017 tctccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttt 47275065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 384 - 779
Target Start/End: Original strand, 5100743 - 5101133
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5100743 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 5100842  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5100843 acaacaaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 5100942  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    ||         | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||    ||    
T  5100943 ag-aaaaaaaacgtatcttcaatctggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagggtaaaccttg----ag 5101037  T
Q  684 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 779  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  5101038 atagaggggactgaaacaaaggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcactttggaacaaacactagggtttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 634 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 22801200 - 22800855
Alignment:
Q  634 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  22801200 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagt 22801105  T
Q  734 ttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 833  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22801104 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagagg 22801005  T
Q  834 ctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 931  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22801004 ctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctc 22800905  T
Q  932 tct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22800904 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 22800855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 635 - 980
Target Start/End: Original strand, 40637070 - 40637414
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 734  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637070 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttgg----agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 40637165  T
Q  735 tgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  40637166 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagagat 40637265  T
Q  835 tg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 932  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  40637266 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctct 40637365  T
Q  933 ct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637366 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 40637414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 22803093 - 22802727
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  22803093 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttaga 22802999  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22802998 atggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 22802899  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 909  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  22802898 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcat 22802799  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22802798 atagtggaacggagggtttctctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttt 22802727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Original strand, 24888770 - 24889136
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24888770 atttgttccaaattt-taagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactt----agagatagagggggctgaaacaagggtttaga 24888864  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24888865 aaggcaacaacaaaactagggattgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 24888964  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 909  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  24888965 gtctcttggttacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcat 24889064  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24889065 atagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 24889136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 31849958 - 31849592
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||| ||||||||  ||||||||||   |||||  |    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31849958 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactagaaatataggtcttgtatcagagcaaactagg----agatagagggggctgaaacaagggtttaga 31849864  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacact-agggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31849863 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 31849764  T
Q  811 agtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcat 909  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31849763 agtctcttgcttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcat 31849664  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31849663 atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttt 31849592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Original strand, 7941316 - 7941663
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||   ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941316 acttttactataaatatagacgttgtatcagagcaaaccgggaga--gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 7941413  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaa--cactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 833  Q
    |||| |||||||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7941414 gtatagagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagg 7941513  T
Q  834 ct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 931  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7941514 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctc 7941613  T
Q  932 tct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941614 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 7941663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 36919946 - 36919577
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36919946 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttga--tagatatagggggctgaaacaagggtttaga 36919850  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 810  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36919849 aaggcaacaacaaaactagggtttggataaagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 36919750  T
Q  811 agtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 908  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  36919749 agtctcttggttacgggaagaggctgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttattcatca 36919650  T
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||||   || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36919649 tatagtggaatagatggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 36919577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 36921854 - 36921486
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  36921854 atttgttccaaattt-taagcgatacttttacaataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga--gatagaggggg-tgaaacaagggcttaga 36921759  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 810  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36921758 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 36921659  T
Q  811 agtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 908  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  36921658 agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatca 36921559  T
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36921558 tatagtggaacggatggctgctctctcccccagactagttaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 36921486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 611 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 40091775 - 40091408
Alignment:
Q  611 tatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttag 710  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  40091775 tatttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttag 40091681  T
Q  711 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 810  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40091680 aaagacaacaacaaaactagggattgtttagagtttgtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattg 40091581  T
Q  811 agtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 908  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  40091580 agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatca 40091481  T
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||| | | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40091480 tatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 40091408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Original strand, 5198394 - 5198760
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5198394 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagat----agagggggctgaaacaagggtttaga 5198488  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5198489 aaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattga 5198588  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 909  Q
    |||| ||||||||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5198589 gtcttttggttacgggaagagattggggctttgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcat 5198688  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5198689 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttt 5198760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 612 - 976
Target Start/End: Original strand, 48486293 - 48486655
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  48486293 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagat----agagggggctgaaacaagggtttaga 48486387  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48486388 atggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 48486487  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 909  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  48486488 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgaaatctcttttgtaacgttactcatcat 48486587  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    |||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48486588 atagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaatt 48486655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 635 - 980
Target Start/End: Original strand, 6764835 - 6765184
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 734  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6764835 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaa----ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 6764930  T
Q  735 tgtatggagtttgtctcttc-----ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 829  Q
    ||||| |||||||||||||      ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  6764931 tgtatagagtttgtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttatgggaa 6765030  T
Q  830 gaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggct 927  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6765031 gaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagggct 6765130  T
Q  928 gctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6765131 gctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 6765184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 635 - 980
Target Start/End: Original strand, 14633316 - 14633658
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 734  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14633316 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaa-----gggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtt 14633410  T
Q  735 tgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  14633411 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-ggaagagat 14633509  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 932  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  14633510 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 14633609  T
Q  933 ctccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14633610 ctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 14633658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 636 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 16934479 - 16934131
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16934479 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg----agatagagggggctgatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 16934384  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  16934383 gtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 16934284  T
Q  835 tg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16934283 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 16934184  T
Q  934 t-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttctttgtgt 984  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16934183 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 16934131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 635 - 980
Target Start/End: Original strand, 47868397 - 47868741
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 734  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||| |    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47868397 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttgg----agatagagagggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 47868492  T
Q  735 tgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47868493 tgtatagagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 47868592  T
Q  835 tg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 932  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  47868593 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatggctgctct 47868692  T
Q  933 ct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47868693 ctcccccatactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttt 47868741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 611 - 978
Target Start/End: Original strand, 24878962 - 24879328
Alignment:
Q  611 tatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttag 710  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24878962 tatttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatccgagtaaacttgg----agatagagggggctgaaactagggtttag 24879056  T
Q  711 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 810  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24879057 aaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 24879156  T
Q  811 agtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt-aacgttactcatc 907  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||| ||||    
T  24879157 agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgatacacatc 24879256  T
Q  908 atatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 978  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24879257 atatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 24879328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 612 - 978
Target Start/End: Original strand, 24880425 - 24880790
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |    |||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  24880425 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcggagtaaacttgg----agatagagggggcgtaaactagggtttaga 24880519  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24880520 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaacactattaggattga 24880619  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt-aacgttactcatca 908  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||    
T  24880620 gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatca 24880719  T
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 978  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24880720 tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 24880790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 639 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 9176807 - 9176462
Alignment:
Q  639 tttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 738  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    |||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9176807 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttgg----agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 9176712  T
Q  739 tggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctg- 836  Q
    |  |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||     
T  9176711 taaagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattga 9176612  T
Q  837 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-c 935  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  9176611 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 9176512  T
Q  936 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttctttgtgt 984  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  9176511 cccagactaggtcaatttggaccgaacagagtcaacaaatttctttgtgt 9176462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 636 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 9174482 - 9174134
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9174482 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttgg----agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 9174387  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  9174386 gtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagat 9174287  T
Q  835 tg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9174286 tgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgttctc 9174187  T
Q  934 t-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttctttgtgt 984  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9174186 tgccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 9174134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 636 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 22780717 - 22780361
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagataga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 731  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22780717 acttttactataaatataaaccttgtatcaagctaatctaagagagagagagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagg 22780618  T
Q  732 gtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaag 830  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22780617 gtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaag 22780518  T
Q  831 aggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 929  Q
    ||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22780517 agattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgc 22780418  T
Q  930 tctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat-tctttgtgt 984  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22780417 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgt 22780361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 636 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 22783082 - 22782726
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagataga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 731  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22783082 acttttactataaatataaaccttgtatcaagctaatctaagagagagagagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagg 22782983  T
Q  732 gtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaag 830  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22782982 gtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaag 22782883  T
Q  831 aggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 929  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22782882 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgc 22782783  T
Q  930 tctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat-tctttgtgt 984  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  22782782 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactggatcaacaaatatctttgtgt 22782726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 636 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 16932125 - 16931777
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16932125 acttttactataaatataaaccttgtatcaaagcaaactttg----agatagagggggctgatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 16932030  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  16932029 gtatagagtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 16931930  T
Q  835 tg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16931929 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 16931830  T
Q  934 t-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttctttgtgt 984  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16931829 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 16931777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 612 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 5637828 - 5637524
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5637828 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtataagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttaga 5637730  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637729 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 5637630  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 909  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5637629 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 5637530  T
Q  910 atagtg 915  Q
    ||||||    
T  5637529 atagtg 5637524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 613 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 38928536 - 38928170
Alignment:
Q  613 tttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 712  Q
    |||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||| | |||||| ||  ||||| ||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||    
T  38928536 tttgttccaa-tttatgagggattcttttactataaatataggctttgtattagagtaaaccttgagataga----gggggctgaaacaagagtttagaa 38928442  T
Q  713 aggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38928441 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 38928342  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 909  Q
    |||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  38928341 gtctcttggttacgggaaaagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat 38928242  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38928241 atagtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 38928170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 622 - 980
Target Start/End: Original strand, 19095865 - 19096223
Alignment:
Q  622 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaa 721  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  19095865 aatttatgagggatgcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaa 19095960  T
Q  722 caaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 820  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19095961 caaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttgg 19096060  T
Q  821 ttacgggaagaggctgga-ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggat 918  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |     
T  19096061 ttacgggaagagattagagctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtgaaa 19096160  T
Q  919 cggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19096161 cggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttt 19096223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 624 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 12396193 - 12395838
Alignment:
Q  624 tttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaca 723  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||| |   ||||| |||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12396193 tttatgagggatgcttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagat----ggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaaca 12396098  T
Q  724 aaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 823  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396097 aaactagggtttgtatagagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 12395998  T
Q  824 cgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcgg 921  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  12395997 cgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgg 12395898  T
Q  922 agggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12395897 ggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttt 12395838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 613 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 33415845 - 33415481
Alignment:
Q  613 tttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 712  Q
    |||||||||| ||||||||  ||  |||||||| |||||||| | |||||||||  ||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  33415845 tttgttccaa-tttatgagggatttttttactacaaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaa 33415751  T
Q  713 aggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 812  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  33415750 aggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt-ggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatcgag 33415652  T
Q  813 tctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcata 910  Q
    ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  33415651 tctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 33415552  T
Q  911 tagtggatcggagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33415551 tagtgaaacggagggctgctctctccctcaggctaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttt 33415481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 491 - 980
Target Start/End: Original strand, 19322547 - 19323035
Alignment:
Q  491 atatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgagggagnnnnn 590  Q
    |||||||||||||  |||| | | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         
T  19322547 atatatttttgtactgtataaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaa 19322646  T
Q  591 nnnnca---tatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatag 687  Q
         |   |||||||| | || ||||  |||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||       
T  19322647 aaagaaatgtatcttcaatgtgatattcattccaaatttatgagttatattcat-ctataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagataga--- 19322742  T
Q  688 agggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac 787  Q
     ||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19322743 -gggggatgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgattcac 19322837  T
Q  788 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 886  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  19322838 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatat 19322937  T
Q  887 ctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  19322938 ctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggatgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaattcttt 19323035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 612 - 976
Target Start/End: Original strand, 36378265 - 36378629
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||     ||||||||||||||||||||||    
T  36378265 atttgttacaattttatgagggttacttttactataaatatagactttgtatcagaataaaccttgagatagac----ggggctgaaacaagggtttaga 36378360  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  36378361 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattaa 36378460  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacgttactcatca- 908  Q
    ||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| | |||||||||||     
T  36378461 gtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctcttgtgaagttactcatcat 36378560  T
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36378561 tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 36378629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 624 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 12401155 - 12400800
Alignment:
Q  624 tttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaca 723  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||| |   ||||| |||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12401155 tttatgagggatgcttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagat----ggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaaca 12401060  T
Q  724 aaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 823  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12401059 aaactagggtttgtatagagtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggtta 12400960  T
Q  824 cgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcgg 921  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  12400959 cgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgg 12400860  T
Q  922 agggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12400859 ggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttt 12400800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 716 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 26086236 - 26085970
Alignment:
Q  716 caacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 815  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26086236 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 26086137  T
Q  816 cttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagt 914  Q
    |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26086136 cttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgttttctctttgtaacgatactcatcatatagt 26086037  T
Q  915 ggatcggagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26086036 ggatcggaaggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttt 26085970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 612 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 3824932 - 3824627
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaa-ctttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttag 710  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3824932 atttgttccaaattt-taagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtatttctttgagagagatagagggggctgaaaca--ggtttag 3824836  T
Q  711 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 810  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824835 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 3824736  T
Q  811 agtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 908  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3824735 agtctattggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca 3824636  T
Q  909 tatagtgga 917  Q
    |||||||||    
T  3824635 tatagtgga 3824627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 634 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 619785 - 619445
Alignment:
Q  634 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  619785 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttataaagacaacaacaaaactagggt 619690  T
Q  734 ttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 833  Q
    ||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||     
T  619689 ttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgactgtcttggttaagggaagaga 619590  T
Q  834 ct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 931  Q
     | || |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||    
T  619589 ttgggtctttgggtagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctc 619490  T
Q  932 tctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  619489 tctcccctaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 619445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 682 - 980
Target Start/End: Original strand, 16453348 - 16453650
Alignment:
Q  682 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 781  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  16453348 agatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagagtttgtacaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 16453447  T
Q  782 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16453448 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggactttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaacccat 16453547  T
Q  881 tgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  16453548 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgccaaaaaattc 16453647  T
Q  978 ttt 980  Q
    |||    
T  16453648 ttt 16453650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 682 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 37313360 - 37313058
Alignment:
Q  682 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 781  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||    
T  37313360 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagttg 37313261  T
Q  782 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 880  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37313260 attcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 37313161  T
Q  881 tgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    | || |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  37313160 taatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttcccccagactatgtcaatttggaccaaattggatcaacaaattc 37313061  T
Q  978 ttt 980  Q
    |||    
T  37313060 ttt 37313058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 638 - 953
Target Start/End: Original strand, 13543953 - 13544272
Alignment:
Q  638 ttttactataaatatagaccttgtatcaggc-taaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13543953 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttg 13544052  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    ||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  13544053 tatagagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 13544151  T
Q  836 -ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||    
T  13544152 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctctc 13544251  T
Q  934 -tccccagactaggtcaattt 953  Q
     | ||||||||||||||||||    
T  13544252 tttcccagactaggtcaattt 13544272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 641 - 976
Target Start/End: Original strand, 41997494 - 41997828
Alignment:
Q  641 tactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatg 740  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| |    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  41997494 tactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataaa----gggggctgaaacaagtgttcagaaaggaaacaacaaaactagagtttgtata 41997589  T
Q  741 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gac 839  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  || ||     
T  41997590 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaaaagattgagat 41997689  T
Q  840 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctccc 937  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||    
T  41997690 tttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcatcatagtgaaacggagggccgctctctccc 41997789  T
Q  938 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  41997790 cagactaggttaatttggaccgaactggataaacaaatt 41997828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 21777152 - 21777353
Alignment:
Q  8 ctgccatgtggccattttattaactcccaagacctaatctgccaaaaatcacatcgaaaccccacctaccatgcgatacgcaccaatttattgagcaacc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21777152 ctgccatgtggccattttattaactcccaagacctaacctgccaaaaatcacatcgaaaccccacccaccatgcgatatgcaccaatttattgagcaacc 21777251  T
Q  108 aagactactttcaatttctgctcctacaatgaccacactccctttccttcctcaaatctccaacaatggttttgatattttatgttttgctaacaatgac 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21777252 aagactattttcaatttctgctcttacaatgaccctactccctttccttcctcaaatctccaacaatcgttttgattttttatgttttgctaacaatgac 21777351  T
Q  208 ta 209  Q
    ||    
T  21777352 ta 21777353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 612 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 52942806 - 52942542
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtat--caggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggttta 709  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||    
T  52942806 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatatcagactaaactttgagataga-----ggggctgaaacaagggttta 52942713  T
Q  710 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 809  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942712 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatt 52942613  T
Q  810 gagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    ||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52942612 gagtctcttggttacggg------------tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 52942542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 613 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 18537829 - 18537470
Alignment:
Q  613 tttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaa-caagggtttaga 711  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||    
T  18537829 tttgttccaa-tttatgagtgatgcttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaacattgagataga----gggggctgaaaacaagggtttaga 18537735  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    ||   ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||| |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18537734 aaca-aacaacaaa-ctagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaccactagggttgg--ggttgattcaccttaggaaacactattaggattga 18537640  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca- 908  Q
    |||||||||| ||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||     
T  18537639 gtctcttggtcacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 18537540  T
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18537539 tatagtggaacggagggctgctctctcccccataataggtcattttttgaccgaactgggtaaacaaatt 18537470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 637 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 18409681 - 18409344
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||  ||||||||| ||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18409681 cttttactataaatatagaatttgtatcagtgtaaacaatgagatagagag-----gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 18409587  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 836  Q
    ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  ||    
T  18409586 tatagagtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttcgggaacactattaggattgagtctcttagttataggaagagattg 18409487  T
Q  837 -gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
     |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||| | | ||| | |||||||    
T  18409486 agacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa-gttacccatcattatagtgaaacagagagttgctctc 18409388  T
Q  934 tccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  18409387 tccctcagactaggtcaatttggattgaactgggtaaacaaatt 18409344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 719 - 980
Target Start/End: Original strand, 36380425 - 36380690
Alignment:
Q  719 caacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 818  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36380425 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatctt 36380524  T
Q  819 ggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtg 915  Q
    |||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  36380525 ggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattatagtg 36380624  T
Q  916 gatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    || | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  36380625 gaactgagtgctgctctctcccccagactaggtcaatttggagcgaactgggtaaacaaattcttt 36380690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 756 - 979
Target Start/End: Original strand, 16455354 - 16455581
Alignment:
Q  756 gaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattag 854  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||    
T  16455354 gaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattag 16455453  T
Q  855 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaat 951  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| | |||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16455454 gcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcattatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaat 16455553  T
Q  952 ttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16455554 ttggaccgaactgggtcaacaaattctt 16455581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 836 - 980
Target Start/End: Original strand, 11437557 - 11437702
Alignment:
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 935  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11437557 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 11437656  T
Q  936 ccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11437657 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 11437702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 634 - 994
Target Start/End: Complemental strand, 8756588 - 8756230
Alignment:
Q  634 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||     |||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||| ||||     
T  8756588 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaa----ggggctgaaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattagga 8756494  T
Q  733 tttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt-ggttacgggaaga 831  Q
    ||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  8756493 tttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactaggattgagtctctttggtcacgggaaga 8756397  T
Q  832 ggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctg 928  Q
    |  || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| |||| || ||    
T  8756396 gattgagactttgagtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactaatcattatagtggaacggatggttg 8756297  T
Q  929 ctctctcc-ccagactaggtc-aatttggaccgaactgggtcaacaaattctttgtgtctctctcttt 994  Q
    |||||||| ||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  8756296 ctctctcctccagactaggtcggttttggagcgaactgggtaaacaaattttgtgtgt-tctctcttt 8756230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 400 - 585
Target Start/End: Original strand, 30136331 - 30136516
Alignment:
Q  400 aaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttt 499  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30136331 aaaatttgatgaatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttt 30136430  T
Q  500 tgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgagggag 585  Q
    ||||  |||||| ||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  30136431 tgtactgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttaaaagagaatattatatttttgattcaaatattctttcattgaaggag 30136516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 637 - 870
Target Start/End: Complemental strand, 3937543 - 3937314
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||  ||||| ||||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3937543 cttttactataaatatagacttt-tatcagagtaaaccttgagataga----gggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagagtttg 3937449  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 836  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  3937448 tatagagtttgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattggaattgagtctcttggttacaggaagagattg 3937349  T
Q  837 -gactttgggtagaattaggcgggagacttattct 870  Q
     | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3937348 aggctttgggtagaattaggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 837 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 5635614 - 5635469
Alignment:
Q  837 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct- 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5635614 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 5635515  T
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5635514 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 5635469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 384 - 967
Target Start/End: Original strand, 10112626 - 10113198
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10112626 tgttgtagtatgacttaaaatttgttgaatgaagaatattgttgctaaaaatataaaag----gtttcaaatatattttgtgctgaaactatatttatgg 10112721  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||  ||||||| |||||||| |||||       ||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  10112722 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgtaaatata-tttgaaagagaata-------tttgatgcaaatattatttcactaaagg 10112813  T
Q  584 ag-nnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttata-cttttactataaatatagaccttgtatcag-gctaaactttgaga 680  Q
    ||            |||||||||  ||  ||  |||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||   ||||| | |       
T  10112814 agaaaaaaaaaatgtatcttcagcgtgaaatccgttccaaatttatgagttatatttttttttataaatatagacattgtatcagatgtaaacctcg--- 10112910  T
Q  681 tagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 779  Q
     ||| |||||| | || |||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||    | |    
T  10112911 -agagagagggagttgaaaacaagggtttag-aagccaacacaaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--gagat 10113003  T
Q  780 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-gggaagaggct-ggactttgggtagaattag-gcgggagacttattcttgtaac 876  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||    
T  10113004 tgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttggtcacggggaagagattaggactttgggtagaattagatttgaagactaattcttgtaac 10113103  T
Q  877 c-cattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttggaccgaactgggt 967  Q
    |   ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  10113104 ctttttgatatctctttgtaatgttactaatcattatagtggaatggagagctgctctctccccaagactaggttagtattggaccgaactgggt 10113198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 384 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 47211308 - 47211158
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47211308 tgttgtagtatgacttaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctcaaaatatatttatgg 47211209  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatat 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  47211208 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatat 47211158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 726 - 980
Target Start/End: Original strand, 27499128 - 27499382
Alignment:
Q  726 actagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg 825  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27499128 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggattgagtctattggttacg 27499227  T
Q  826 ggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggag 923  Q
      |||||  || | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | || ||| ||||||| ||||||||||| |||| || | || ||    
T  27499228 ataagagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaacctaat-atctct-tttgtaaggttactcatcattatattgaaacgaag 27499325  T
Q  924 ggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27499326 ggctgctctttccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttt 27499382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 637 - 860
Target Start/End: Original strand, 6132871 - 6133090
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  6132871 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacattg----agatagaggaggctg-aacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttg 6132965  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 836  Q
    ||| |||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  6132966 tatagagtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 6133065  T
Q  837 -gactttgggtagaattaggcggga 860  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  6133066 agactttgggtagaattaggcggga 6133090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 613 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 18535187 - 18534828
Alignment:
Q  613 tttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaa-caagggtttaga 711  Q
    |||||||||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||||| |  ||||  ||||| ||||||||||    ||||||||||| |||| ||||| |    
T  18535187 tttgttccaa-tttatgagggatgcttttacaataaatatagacctcgattcagagtaaaccttgagataga----gggggctgaaaacaagtgtttaaa 18535093  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    ||   ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18535092 aaca-aacaacaaa-ctagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattga 18534998  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca- 908  Q
    |||||||||| ||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   ||||||| |     
T  18534997 gtctcttggtcacgagaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaactactcataat 18534898  T
Q  909 tatagtggatcggagggctgctct-ctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||    
T  18534897 tatagtggaacggaggggtgctctcccccccagactaggtaagttttggaccgaacagggtaaacaaatt 18534828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 820 - 980
Target Start/End: Original strand, 4215483 - 4215646
Alignment:
Q  820 gttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtgga 917  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4215483 gttacgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 4215582  T
Q  918 tcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4215583 acggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 4215646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 723 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 38890476 - 38890221
Alignment:
Q  723 aaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 822  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||| ||||||| |  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  38890476 aaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggttgg--ggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatc 38890380  T
Q  823 acgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatc 919  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  38890379 acgggaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 38890280  T
Q  920 ggagggctgctctctcccc-agactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  38890279 agagggctgctctctccccaagattaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 38890221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 791 - 976
Target Start/End: Original strand, 13547302 - 13547490
Alignment:
Q  791 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  13547302 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatc 13547401  T
Q  890 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  13547402 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatt 13547490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 785 - 980
Target Start/End: Original strand, 2891433 - 2891632
Alignment:
Q  785 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 883  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2891433 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattga 2891532  T
Q  884 tttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | || | ||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2891533 tatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcccccagactagtacaacttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 2891632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 637 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 38270321 - 38270158
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270321 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataga-agagg---ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 38270226  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatta 804  Q
    | | |||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38270225 tgtagagtttgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 612 - 963
Target Start/End: Complemental strand, 15032896 - 15032557
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||| |||  ||||| |||||||| |    |||||||||||||||||||||||    
T  15032896 atttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagacttggtaccagagtaaaccttgagataaa----gggggctgaaacaagggtttaga 15032801  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    | | |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||          || || ||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  15032800 a-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctctttgcaacaaa----------tgagg-ttgattcatatttggaaacactattaggattga 15032714  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca- 908  Q
    |||||||||  ||| ||| ||  | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||     
T  15032713 gtctcttggacacgagaaaagatttggacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 15032614  T
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttggaccgaact 963  Q
    || |||||| || || |||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  15032613 tacagtggaacgaagagctgctctctcccccaaactaggtcagtattggaccgaact 15032557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 384 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 38890701 - 38890524
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  |||||    
T  38890701 tgttgtagcatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatt------------------tatgg 38890620  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaaggg-aatattatatttttgatgcaaatattctttcact 578  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890619 acaataaatatatttttgtattgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaaatattatatttttgatgcaaatattctttcact 38890524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 622 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 24446929 - 24446756
Alignment:
Q  622 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaa 721  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24446929 aatttatgagggatgcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaa 24446834  T
Q  722 caaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatta 804  Q
    |     |||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24446833 c-----tagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 24446756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 384 - 578
Target Start/End: Original strand, 9022060 - 9022246
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||   |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  9022060 tgttgtagtatgattcaaaattttatggatgagaaatattgttgttgaaaatataaatgatttgtttcaaatatattttttgctgaaaatatatttat-g 9022158  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcact 578  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||||    
T  9022159 acaataaatatatttttctaccgtatgaagaaagatttgatgcaaatatattttaaaagggaata-------tttgatgcaaatattctttcact 9022246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 778 - 976
Target Start/End: Original strand, 12102221 - 12102425
Alignment:
Q  778 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 875  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  12102221 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 12102320  T
Q  876 cccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 971  Q
    |||| |||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||    
T  12102321 cccactgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaactaggtaaac 12102420  T
Q  972 aaatt 976  Q
    |||||    
T  12102421 aaatt 12102425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 643 - 976
Target Start/End: Original strand, 9863712 - 9864049
Alignment:
Q  643 ctataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaa-ctagggtttgtatgg 741  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||| ||||| |     |||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||  |    
T  9863712 ctataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagatag-tagagagctgaaaaacaagggtttagaa-gccaaaaacaaaaactagggtttgta--g 9863807  T
Q  742 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gact 840  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||| |||| |  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || ||||    
T  9863808 agtttgt-tcttggcaacaaacactaaggttgg--gtttgattcaccttgggaaaccctattaggattgagtcttttggtcacgggaagagattgagact 9863904  T
Q  841 ttgggtagaatt-aggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca----tatagtggatcggagggctgctctct- 934  Q
    |||||||||||| ||   | ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||    ||||||||| ||||| ||||||||||     
T  9863905 ttgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctctttgtaaagttactcatcatcattatagtggaacggagagctgctctctc 9864004  T
Q  935 --ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
      |||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  9864005 ccccccagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 9864049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 843 - 980
Target Start/End: Original strand, 5101130 - 5101268
Alignment:
Q  843 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccaga 941  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||    
T  5101130 gggtagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatcatatagtaaaacggagggctgctatctccccaga 5101229  T
Q  942 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5101230 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 5101268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 697 - 976
Target Start/End: Original strand, 28453742 - 28454020
Alignment:
Q  697 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 796  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||| |  ||||||| ||||| | || ||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||    
T  28453742 aaacaagggtttagaa-gccaacactaaaactagggtttgca--gagtttg-ctcttggcaagaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaa 28453835  T
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-gctggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 894  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||||| |  ||||| |||| |||||    
T  28453836 cactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggaccttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaacttttgatatctcttttgt 28453935  T
Q  895 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||  || |||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||    
T  28453936 aaagttactcatcattatagtggaacggagaactactctctcccccagactaggttagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 28454020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 731 - 980
Target Start/End: Original strand, 30136640 - 30136890
Alignment:
Q  731 ggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 830  Q
    ||||||||| ||||||  ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||||    
T  30136640 ggtttgtatagagttta-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactatgattgggtctcttggtcacgagaag 30136736  T
Q  831 aggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggct 927  Q
    |   || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||| | | || ||||    
T  30136737 aaattgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagttaatcatcattatagtgaaacagatggct 30136836  T
Q  928 gctctctcc-ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  30136837 gctctctcctcaatactaggtcaatttggaccgaattggataaacaaattcttt 30136890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 794 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 16186018 - 16185831
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 891  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||| ||||| | ||||    
T  16186018 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgatatatctt 16185919  T
Q  892 tgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16185918 tgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 16185831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 384 - 502
Target Start/End: Original strand, 9863499 - 9863617
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  9863499 tgttgtaatatgactcaaaatttgttggatgaaatatattgttactaaaaatataaatgatttgtttcaaacatattttgtgctaaaaatatatttatga 9863598  T
Q  484 acaataaatatatttttgt 502  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9863599 acaataaatatatttttgt 9863617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 386 - 485
Target Start/End: Original strand, 19322410 - 19322510
Alignment:
Q  386 ttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgtt-gctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgga 484  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19322410 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattttttgctaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttatactgaaaatatatttatgga 19322509  T
Q  485 c 485  Q
    |    
T  19322510 c 19322510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 637 - 760
Target Start/End: Original strand, 2891314 - 2891434
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgt-atcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2891314 cttttactataaatatagacattgtaatcagtgtaaacctt----aagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 2891409  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaaca 760  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||    
T  2891410 gtatagagtttgtctctttggaaca 2891434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 778 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983524
Alignment:
Q  778 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 875  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||  || |||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaa 31983628  T
Q  876 cccattgatttc-tctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 972  Q
    ||| ||||| || | |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| | | || |||| |||||||| ||||    
T  31983627 ccctttgatatcttttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccaatactaggtaagtattagaccaaactgggtaaaca 31983528  T
Q  973 aatt 976  Q
    ||||    
T  31983527 aatt 31983524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 612 - 976
Target Start/End: Original strand, 25357610 - 25357979
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagag-ggggctgaaa-caagggttta 709  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||| |||  ||| |||||||||| ||||||||||    
T  25357610 atttgttccaattttacgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgagagagagtgagaggggctgaaaacaagggttta 25357709  T
Q  710 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 809  Q
    ||||   ||||||||| |||||||||  |  ||| || |||||  |    | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25357710 gaaaca-aacaacaaa-ctagggtttaga--gagatt-tctctaagtgggagacactagggtt-gtga-ttgattcaccttgggaaatactattaggatt 25357802  T
Q  810 gagtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggta----gaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttac 902  Q
    |||||||||||| | ||||||||  ||| ||||||| ||    |||||| |   || |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||    
T  25357803 gagtctcttggtcatgggaagagattgggactttggatatatagaattaagtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttac 25357902  T
Q  903 tcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    |||||| |||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||    
T  25357903 tcatcattatagtagaacggatagctgctctctcccctagactaggtcagtattggacctaactgggtaaacaaatt 25357979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 782 - 962
Target Start/End: Complemental strand, 3982374 - 3982186
Alignment:
Q  782 attcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct--ggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacc 877  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||||| |   || |||| |||||||||||     
T  3982374 attcaccttggagaaacactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaaca 3982275  T
Q  878 cattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctccc-cagactaggtcaat-ttggaccgaac 962  Q
    | ||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||    
T  3982274 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcatactaggtcactattggaccgaac 3982186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 797 - 976
Target Start/End: Original strand, 31300427 - 31300608
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||    
T  31300427 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgta 31300523  T
Q  896 acgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    | |  ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| ||||||||    
T  31300524 aagaaactcatatcattatagtggaacggagggctgctctctccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 31300608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 697 - 938
Target Start/End: Original strand, 9022362 - 9022603
Alignment:
Q  697 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-gaa 795  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||  || ||   ||||| | ||||||||||| |||| |  | |||||||||||||| |||    
T  9022362 aaacaagggtttagaa-gtcaacatcaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttggagaa 9022455  T
Q  796 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaccc--attgatttctctt 891  Q
    ||| ||||||||| || | ||||||| ||||||||||  || |||||||||| ||||||||   || |||| ||||||||||||   |||||| ||||||    
T  9022456 acagtattaggatagaatttcttggtcacgggaagagattgagactttgggttgaattaggtttgaagactaattcttgtaacctctattgatatctctt 9022555  T
Q  892 tgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccc 938  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  9022556 tgtaaagttactcatcattatagtggaacaaagggctgctctctcccc 9022603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 384 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 14789571 - 14789500
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaat 455  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14789571 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaataatgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaat 14789500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 890 - 980
Target Start/End: Original strand, 47563010 - 47563101
Alignment:
Q  890 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccca-gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47563010 tttgtaaggttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctccccttgactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttt 47563101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 797 - 979
Target Start/End: Original strand, 15316961 - 15317145
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||    
T  15316961 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctctttgta 15317057  T
Q  896 acgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    | |  ||||  |||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  15317058 aagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 15317145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 794 - 992
Target Start/End: Original strand, 11853549 - 11853749
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||||    
T  11853549 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctcttt 11853645  T
Q  893 gtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctttgtgtctct 988  Q
    |||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||   |||||| |||    
T  11853646 gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgtttct 11853745  T
Q  989 ctct 992  Q
    ||||    
T  11853746 ctct 11853749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 779 - 994
Target Start/End: Complemental strand, 47151092 - 47150872
Alignment:
Q  779 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 876  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||  || || ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  47151092 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 47150993  T
Q  877 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 972  Q
    || ||||| |||| ||| ||| ||| ||||||| ||||||||| | ||  | || | ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||     
T  47150992 cctttgatatctcttttctaaagttgctcatcattatagtggaacagatagatgttatctcccctagactaggtcaatattggaccgaattgggtaaact 47150893  T
Q  973 aattctttgtgtctctctcttt 994  Q
    ||||  |||||| |||||||||    
T  47150892 aatttcttgtgt-tctctcttt 47150872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 794 - 975
Target Start/End: Original strand, 55822265 - 55822447
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 891  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  55822265 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 55822360  T
Q  892 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  55822361 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 55822447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 394 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 38209259 - 38209186
Alignment:
Q  394 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 467  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38209259 tgactcaaaatttgatggatgaaaaatattgttgttaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttgtgct 38209186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 697 - 933
Target Start/End: Complemental strand, 40999226 - 40998990
Alignment:
Q  697 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 796  Q
    |||||||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||   ||||||||||||| ||    | ||||||||||| || |||    
T  40999226 aaacaagggtttagac-gtcaacaagaaaactaggggttgtatagagtttg-ctcttgacaacaaacactaggattga--gattgattcacctaggaaaa 40999131  T
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-gctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 893  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||||||   |||||||   | ||||||||| ||||| |||| ||||    
T  40999130 cattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatcgagactttgggtagaattaggtttggagactgtgttttgtaaccctttgatatctcttttg 40999031  T
Q  894 taacgttactcatc-atatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||| | ||||| |||||||    
T  40999030 taaagttactcatcgttatagtggaacagagggatgctctc 40998990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 797 - 979
Target Start/End: Original strand, 8529270 - 8529455
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| ||   || ||||||||||    
T  8529270 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctctttgta 8529366  T
Q  896 acgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    | |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  8529367 aagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 8529455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 909 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 14789495 - 14789422
Alignment:
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctctc---cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14789495 tatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 14789422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 797 - 979
Target Start/End: Original strand, 18586969 - 18587154
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | |||||  ||||||| || ||   || ||||||||||    
T  18586969 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactggttcttgttactca---atatctctttgta 18587065  T
Q  896 acgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    | |  ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  18587066 aagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 18587154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 797 - 949
Target Start/End: Original strand, 16489352 - 16489505
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||    
T  16489352 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgta 16489448  T
Q  896 acgttactcat---catatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtca 949  Q
    | |  ||||||    |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16489449 aagaaactcatatcaatatagtggaacggagagctgctctctccctagactaggtca 16489505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 794 - 949
Target Start/End: Complemental strand, 7050439 - 7050282
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||    
T  7050439 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt 7050343  T
Q  893 gtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca 949  Q
    |||| |  ||||  |||| ||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  7050342 gtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtca 7050282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 797 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 16689119 - 16688934
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||    
T  16689119 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgta 16689023  T
Q  896 acgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccc-cagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    | |  ||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  16689022 aagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccacaaactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 16688934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 864 - 981
Target Start/End: Original strand, 49088791 - 49088912
Alignment:
Q  864 ttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct--ccccagactaggtcaatttggaccg 959  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||   ||||||| |||| ||||||||||||| | | |||  || ||||||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  49088791 ttattcttgtaactcattgacatcttcttttgtaatgttagtcatcatatagtgaaacagagaactactctctccccccagactaggtcaatttgggccg 49088890  T
Q  960 aactgggtcaacaaattctttg 981  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  49088891 aactgggtcaacaaattctttg 49088912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 400 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 5516833 - 5516771
Alignment:
Q  400 aaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 462  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  5516833 aaaatttgatgaatggagaatattgttgctaaaaatataaatgaattgtttcaaatatatttt 5516771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 862 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 24446754 - 24446647
Alignment:
Q  862 acttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccga 960  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||            |||||||||||    
T  24446754 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc------------atttggaccga 24446667  T
Q  961 actgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24446666 actgggtcaacaaattcttt 24446647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 464 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 54929180 - 54929094
Alignment:
Q  464 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatatt 550  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | | ||||| || |||||||||||| ||  ||||||||    
T  54929180 tgctgaaaatatatttatggacaaaaaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaataggaatatt 54929094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 909 - 980
Target Start/End: Original strand, 6133105 - 6133177
Alignment:
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6133105 tatagtggaacggatgactgctctctcacccagactaggtcaatttggatcgaattgggtcaacaaattcttt 6133177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 31985663 - 31985726
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31985663 atagtggattggagagctgctctctccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31985726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 922 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 54867239 - 54867188
Alignment:
Q  922 agggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  54867239 agggctgctctctccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 54867188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 797 - 855
Target Start/End: Original strand, 4558314 - 4558372
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg 855  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  4558314 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattagg 4558372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 797 - 855
Target Start/End: Original strand, 47566496 - 47566554
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg 855  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  47566496 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagactggaatttgggtagaattagg 47566554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 797 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 4556238 - 4556054
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  4556238 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg-tagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 4556143  T
Q  895 aacgttactcat---catatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    || |  ||||||     ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||   ||  |||||||||||| |||||||||||    
T  4556142 aaag-aactcatatgattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattaaaccgaactgggtaaacaaattctt 4556054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 935 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 52942526 - 52942481
Alignment:
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52942526 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttt 52942481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 797 - 979
Target Start/End: Original strand, 4884877 - 4885062
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  4884877 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtataatcaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 4884972  T
Q  895 aacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    ||    ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  4884973 aaaaaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 4885062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 10047447 - 10047383
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10047447 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10047383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 723 - 821
Target Start/End: Original strand, 10114412 - 10114505
Alignment:
Q  723 aaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 821  Q
    ||||||||||||||||  |||| || ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10114412 aaaactagggtttgta--gagtctg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcactttaggaaacactattaggattgagtctcttggt 10114505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 797 - 949
Target Start/End: Original strand, 15831144 - 15831298
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| |||||||||||   | ||||| ||||||| ||| ||   || ||||||||||    
T  15831144 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgcgtagaattaggtttgaagactgattcttggaactca---atatctctttgta 15831240  T
Q  896 acgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca 949  Q
    | |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  15831241 aagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 15831298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 39246062 - 39245998
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  39246062 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 39245998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 794 - 938
Target Start/End: Original strand, 4570094 - 4570239
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||    
T  4570094 aaacactattaggatcgagtctcttggtcacgggaagaggttgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt 4570190  T
Q  893 gtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctcccc 938  Q
    |||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4570191 gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccc 4570239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 794 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 5336964 - 5336773
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||   |||||||||||||||   | ||||| |||||||||| ||  | || |||||||    
T  5336964 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggacttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctcttatatctcttt 5336865  T
Q  893 gt-aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    || || |  | |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  5336864 gtaaaagaaattcatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctatagtaggtcaatattggactgaactgattaaacaaattcttt 5336773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 464 - 543
Target Start/End: Original strand, 10979676 - 10979755
Alignment:
Q  464 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagg 543  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||| | | ||||| || |||||||||||| |||||    
T  10979676 tgctgaaaatatatttatggacaacaaatatatttttgtgctgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagg 10979755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 880 - 976
Target Start/End: Original strand, 26557823 - 26557922
Alignment:
Q  880 ttgatttctctttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  26557823 ttgatatctctttgtaaagttactcatcgttatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaagtcagtattggaccgaactaggtaaacaaatt 26557922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 794 - 979
Target Start/End: Original strand, 36769479 - 36769667
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 891  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  36769479 aaacactattaggatcgagtttcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtaaaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 36769574  T
Q  892 tgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    ||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||| | |||||||||||    
T  36769575 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaattctt 36769667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 779 - 905
Target Start/End: Original strand, 54906722 - 54906852
Alignment:
Q  779 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag--gctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 874  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||   |  |||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  54906722 ttgattcaccatggagaaacactattagaattgagtctcttggtcactggaagagattcaagactttaggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 54906821  T
Q  875 acccattgatttctctttgtaacgttactca 905  Q
    || | ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  54906822 actctttgatatctctttgtaaagttactca 54906852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 938 - 994
Target Start/End: Complemental strand, 3937309 - 3937253
Alignment:
Q  938 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc-tttgtgtctctctcttt 994  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  3937309 cagactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcatttgtgt-tctctcttt 3937253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 612 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 16186197 - 16186099
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggct-gaaacaagggtttag 710  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||    ||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  16186197 atttgttccaattttaggagggatacttttactataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttg----agagagagggggctaaaaacaagggtttag 16186102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 398 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 29609983 - 29609914
Alignment:
Q  398 tcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 467  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29609983 tcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaagtattcttgatttttttcaaatatattttgtgct 29609914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 5269220 - 5269284
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  5269220 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5269284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 5396700 - 5396764
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcc-ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5396700 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5396764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 860 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 3578786 - 3578668
Alignment:
Q  860 agacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctg-ctctctccccagactaggtcaat-ttgga 956  Q
    ||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||| |||| ||||| |||||||||||| || | || ||    
T  3578786 agactaattcttgtaacattttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagagctgtctctc-ccccagactaggccagtattaga 3578688  T
Q  957 ccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  3578687 ccgaactgggtaaacaaatt 3578668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 910 - 972
Target Start/End: Original strand, 6743444 - 6743507
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 972  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6743444 atagtggattggagggctgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 6743507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 797 - 978
Target Start/End: Original strand, 15312319 - 15312503
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 894  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  15312319 cactattaggattgagtcgcttggtcacgggaagatgctgtgac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 15312414  T
Q  895 aacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattct 978  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||   || ||||||||| ||| ||||||||||    
T  15312415 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctggtctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaattct 15312503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 797 - 855
Target Start/End: Original strand, 25699752 - 25699810
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattagg 855  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  25699752 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggacttt-ggtagaattagg 25699810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 910 - 972
Target Start/End: Original strand, 36315258 - 36315321
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 972  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  36315258 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 36315321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 910 - 972
Target Start/End: Original strand, 36329467 - 36329530
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 972  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  36329467 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 36329530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 794 - 979
Target Start/End: Original strand, 36771396 - 36771584
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 891  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  36771396 aaacactattatgattgagtctcttggtcatgggaagaggctgtgac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 36771491  T
Q  892 tgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    ||||| |  ||||  |||| ||||||||| | ||| |||||||||| | |||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||||||    
T  36771492 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctacgccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaattctt 36771584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 418 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 54929245 - 54929198
Alignment:
Q  418 aatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  54929245 aatattgttgctaaaaatataaaagatttgatttaaatgtattttgtg 54929198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 797 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 13072160 - 13072102
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg 855  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  13072160 cactattatgattgagtctcttggtcactggaagaggctgtgatttgggtagaattagg 13072102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 16623322 - 16623386
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcc-ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  16623322 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 16623386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 38152468 - 38152532
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  38152468 atagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 38152532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 637 - 713
Target Start/End: Original strand, 12102088 - 12102162
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 713  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| ||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||    
T  12102088 cttttactataaatatagatcttgtatcagataaaaccttgagataga---ggggggctgaaaacaagggtttagaaa 12102162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 464 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 14647214 - 14647175
Alignment:
Q  464 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgta 503  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  14647214 tgctgaaaatatattcatggacaacaaatatatttttgta 14647175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 469 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 5516747 - 5516705
Alignment:
Q  469 aaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatga 511  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5516747 aaaatatatttatagataataaatatatttttttatcgtatga 5516705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 935 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 12739588 - 12739550
Alignment:
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12739588 ccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12739550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 935 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 26175674 - 26175636
Alignment:
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26175674 ccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 26175636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 612 - 666
Target Start/End: Original strand, 28453660 - 28453714
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcag 666  Q
    ||||||||||| | | ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28453660 atttgttccaattatttgagggatatttttactataaatatagaccttgtatcag 28453714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 612 - 682
Target Start/End: Original strand, 36380347 - 36380417
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagata 682  Q
    ||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| ||||||||    
T  36380347 atttgttacaattttatgagggttacttttactataaatatggactttgtatcagagtaaaccttgagata 36380417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 935 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 36463427 - 36463389
Alignment:
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36463427 ccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 36463389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 935 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 48893676 - 48893638
Alignment:
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48893676 ccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 48893638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 637 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 52043765 - 52043736
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcag 666  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52043765 cttttactataaatatagaccttgtatcag 52043736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 469; Significance: 0; HSPs: 186)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 469; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 984
Target Start/End: Original strand, 746422 - 747028
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746422 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 746521  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  746522 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 746621  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    ||         | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  746622 agaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagag 746721  T
Q  684 a--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 781  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  746722 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttg 746821  T
Q  782 attcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 879  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746822 attcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 746921  T
Q  880 ttgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttc 977  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  746922 ttgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttc 747021  T
Q  978 tttgtgt 984  Q
    |||||||    
T  747022 tttgtgt 747028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 4104483 - 4103887
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  4104483 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatactttatgctgaaaatatatttatgg 4104384  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  4104383 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaagg 4104284  T
Q  584 agnnnnnnnnn-catatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagata 682  Q
    ||          | ||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4104283 agaaaaaaaaaacgtatc---agtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagaga 4104187  T
Q  683 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttga 782  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104186 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttga 4104087  T
Q  783 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 881  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104086 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 4103987  T
Q  882 gatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4103986 gatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctatctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 4103887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Original strand, 25533107 - 25533708
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25533107 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttttgctgaaaatatatttatgg 25533206  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25533207 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 25533306  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    ||         | |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25533307 agaaaaaaa--cgtatcttcagtgtgatatttgttctaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagag 25533404  T
Q  684 a----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 779  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  25533405 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggt 25533504  T
Q  780 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 878  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533505 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 25533604  T
Q  879 attgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25533605 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaatt 25533704  T
Q  977 cttt 980  Q
    ||||    
T  25533705 cttt 25533708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 984
Target Start/End: Original strand, 457950 - 458555
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  457950 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggggaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttgtgg 458049  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  458050 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 458149  T
Q  584 agnnnnnnnnn-catatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagata 682  Q
    ||          | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  458150 agaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagaga 458249  T
Q  683 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttga 782  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  458250 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttga 458349  T
Q  783 ttcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 880  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458350 ttcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 458449  T
Q  881 tgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat-tct 978  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  458450 tgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaaatatct 458549  T
Q  979 ttgtgt 984  Q
    ||||||    
T  458550 ttgtgt 458555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 984
Target Start/End: Original strand, 455573 - 456178
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  455573 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggggaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttgtgg 455672  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  455673 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 455772  T
Q  584 agnnnnnnnnn-catatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagata 682  Q
    ||          | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  455773 agaaaaaaaaaacgtatcttcagtgcggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagaga 455872  T
Q  683 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttga 782  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  455873 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttga 455972  T
Q  783 ttcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 880  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  455973 ttcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 456072  T
Q  881 tgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat-tct 978  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||    
T  456073 tgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcgggttggaccgaactgggtcaacaaatatct 456172  T
Q  979 ttgtgt 984  Q
    ||||||    
T  456173 ttgtgt 456178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 10622127 - 10621516
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  10622127 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaagatatatttatgg 10622028  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10622027 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 10621928  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    ||         | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10621927 agaaaaaaaa-cgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagag 10621829  T
Q  684 a--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgt 775  Q
    |        ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  10621828 agagagagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgt 10621729  T
Q  776 gggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 873  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621728 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 10621629  T
Q  874 aacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 972  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  10621628 aacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactagctcagattggaccgaactgggtcaaca 10621529  T
Q  973 aa-ttctttgtgt 984  Q
    || ||||||||||    
T  10621528 aatttctttgtgt 10621516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 386 - 980
Target Start/End: Original strand, 42989954 - 42990570
Alignment:
Q  386 ttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 485  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  42989954 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaaaatttgtttcaaatatattttttgctgaaagtatatttatggac 42990053  T
Q  486 aataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgagggag 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42990054 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 42990153  T
Q  586 nnnnnnnnnca-tatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagataga 684  Q
                |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  42990154 aaaaaaaaaatgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatgctaaactttgagagaga 42990253  T
Q  685 ------------------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacact 766  Q
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |    
T  42990254 gagactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacatt 42990353  T
Q  767 agggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagactt 865  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990354 aggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactt 42990453  T
Q  866 attcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaact 963  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990454 attcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatggtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 42990553  T
Q  964 gggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||||||||||||    
T  42990554 gggtcaacaaattcttt 42990570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Original strand, 1313082 - 1313675
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1313082 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaatgatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatgg 1313181  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1313182 acaataaatatatttctgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 1313281  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    ||           |||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||    
T  1313282 agaaaaaaaaag-tatctttagtgtgatattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatag 1313380  T
Q  684 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 783  Q
    |    |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1313381 a----gggggctgaaacaagg-tttacaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgat 1313475  T
Q  784 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 882  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1313476 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattg 1313575  T
Q  883 atttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1313576 atatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 1313675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 53918250 - 53917655
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  53918250 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaacatatatttatgg 53918151  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  53918150 acaataaatatatttttttaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaagg 53918051  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    ||         | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||| |    
T  53918050 agaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgtttcaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagattaaaccttgagatgg 53917951  T
Q  684 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 783  Q
    |    |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53917950 a----gggggctgaaacaatggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgat 53917855  T
Q  784 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917854 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 53917755  T
Q  883 atttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    || |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917754 atatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttt 53917655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 53916082 - 53915487
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53916082 tgttgtagtatgactcaaaatttgagggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 53915983  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  53915982 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 53915883  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    ||         | |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||     ||    
T  53915882 agaaaaaaaaacgtatcttgagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctt----aag 53915787  T
Q  684 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  53915786 atagagggggctgaaacaagggtttaggatgacaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgat 53915687  T
Q  784 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 882  Q
    | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53915686 ttaccttgtgaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 53915587  T
Q  883 atttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    || |||| ||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  53915586 atatctcttttgtaatgttactcatcatttagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttgactgaactgggtcaacaaattcttt 53915487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 976
Target Start/End: Original strand, 42991953 - 42992532
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42991953 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgttaaaaatataaaaggtttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 42992052  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42992053 acaataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 42992152  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    ||         | |||||||||| |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  42992153 agaaaaaaaaacgtatcttcagtgtaatattaattccaaatttatgagttatacttttactataaatatataccttgtatcatgctaaactttaagagag 42992252  T
Q  684 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  42992253 atagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgat 42992352  T
Q  784 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 883  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||               ||||||||||||| ||||||    
T  42992353 tcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagagtggactttgggtag---------------ttattcttgtaactcattga 42992437  T
Q  884 tttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42992438 tttctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaatcggggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 42992532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 978
Target Start/End: Original strand, 51943042 - 51943634
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51943042 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 51943141  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||    
T  51943142 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgtaaatattctttcattgaagg 51943241  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    ||         | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| | |    ||    
T  51943242 agaaagaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgatttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctgg----ag 51943337  T
Q  684 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 783  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51943338 atagagggtgctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgat 51943437  T
Q  784 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  51943438 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggcgggagactt-ttcttgtaactcattg 51943536  T
Q  883 atttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 978  Q
    |  |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51943537 acgtctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 51943634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 383 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 27636213 - 27635649
Alignment:
Q  383 ctgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 482  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27636213 ctgttgtagtatgatttaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaatattagtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 27636114  T
Q  483 gacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgagg 582  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27636113 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 27636014  T
Q  583 gagnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttata-cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagat 681  Q
    |||           |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| || ||  ||||| |||        
T  27636013 gagaaaaaaatg--tatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatattttttactacaaatatagaccttgaattagagtaaaccttg---- 27635920  T
Q  682 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 781  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||               
T  27635919 agatagagggggctgaaacaagggtttagaatgcaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaggg----------- 27635831  T
Q  782 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 881  Q
            ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||           ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27635830 --------tgggaaacaatattaagattgagtctcttggttacggg-----------ctttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcatt 27635750  T
Q  882 gatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27635749 gacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 27635650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 384 - 809
Target Start/End: Original strand, 41848804 - 41849244
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41848804 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 41848903  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  41848904 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaaggaatattatatttttgatgcaaatattctttaactgaaag 41849003  T
Q  584 ag---------nnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaact 674  Q
    ||                  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41849004 agaaaaaaaaaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagacattgtatcaggctaaact 41849103  T
Q  675 tt------gagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactag 768  Q
    ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41849104 ttgagagagagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaataacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactag 41849203  T
Q  769 ggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 809  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41849204 ggtttgagggttgattcaccttgggaaactctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Original strand, 3859451 - 3859793
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859451 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttgg----agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 3859546  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859547 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 3859646  T
Q  836 g-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3859647 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcgtagggctgctctct 3859746  T
Q  935 -ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859747 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 3859793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Original strand, 5191576 - 5191917
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatc-aggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 734  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191576 acttttactataaatatagaccttgtatctaagc-aaacttggagat----agagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 5191670  T
Q  735 tgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191671 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 5191770  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  5191771 tgggactttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcagagggctgttctc 5191870  T
Q  934 tccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191871 tccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 5191917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Original strand, 38889962 - 38890306
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38889962 acttttactataaatatagaccttgtata--gc-aaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggttt 38890058  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  38890059 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 38890158  T
Q  836 -ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890159 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 38890258  T
Q  934 tcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890259 tcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 38890306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 635 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 4308616 - 4308272
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 734  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308616 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 4308521  T
Q  735 tgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4308520 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggt 4308421  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 932  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4308420 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 4308321  T
Q  933 ctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308320 ctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 4308272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 612 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 10084750 - 10084384
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  || |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10084750 atttgttccaaattt-taagcgatgcttttactataaatatagaccttgtatcggagcaaactttgagagagatagagggggctggaacaagggtttaga 10084652  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10084651 aaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcga 10084552  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 909  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10084551 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttgatttctcttttgtaacgttactcatcat 10084452  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10084451 atagtggatcggagggctgctctctccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 10084384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 612 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 10191670 - 10191305
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  10191670 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcggagcaaactttgagagagataaagggggctggaacaagggtttaga 10191572  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10191571 aaggcaataacaaaactagggtttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcga 10191472  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcata 910  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10191471 gtctcttggttacaggaagaggctggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttcatttctcttttgtaacgttactcatcata 10191372  T
Q  911 tagtggatcggagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10191371 tagtggatcggagggctgctctctccctaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 10191305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Original strand, 11170327 - 11170670
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11170327 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagat----agagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 11170422  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11170423 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggct 11170522  T
Q  836 -ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11170523 gggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctc 11170622  T
Q  934 t-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11170623 tcccccagactaggtcaatttgggccgaactgggtcaacaaattcttt 11170670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 18099504 - 18099161
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18099504 acttttactataa-tatagaccttgtatcagagtaaactt---gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggttt 18099409  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099408 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 18099309  T
Q  836 -ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18099308 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctc 18099209  T
Q  934 tcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099208 tcccctagactaggtcaatatggaccgaactgggtcaacaaattcttt 18099161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 635 - 980
Target Start/End: Original strand, 43228213 - 43228557
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 734  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||   |||||| |    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43228213 tactttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttgg----agatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagcgtt 43228308  T
Q  735 tgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43228309 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 43228408  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 932  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43228409 tgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 43228508  T
Q  933 ct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43228509 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttt 43228557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 635 - 979
Target Start/End: Original strand, 43226008 - 43226350
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 734  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||   |||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  43226008 tactttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttgg----agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta-cgtt 43226102  T
Q  735 tgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43226103 tgtatagagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 43226202  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 932  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43226203 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 43226302  T
Q  933 ctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43226303 ctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 43226350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 638 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 10956359 - 10956018
Alignment:
Q  638 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 737  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10956359 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaac-atga---agatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 10956264  T
Q  738 atggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg- 836  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10956263 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 10956164  T
Q  837 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 935  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10956163 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctc 10956064  T
Q  936 c-ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956063 caccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 10956018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 634 - 980
Target Start/End: Original strand, 45882860 - 45883206
Alignment:
Q  634 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45882860 atacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactatg----agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 45882955  T
Q  734 ttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 833  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45882956 ttgtatagattttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 45883055  T
Q  834 ct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 931  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45883056 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctc 45883155  T
Q  932 tctcccc--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45883156 tctccccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 45883206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 18097235 - 18096891
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||   || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18097235 acttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactt---gagagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggttt 18097139  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18097138 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 18097039  T
Q  836 -ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18097038 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttcccttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctctc 18096939  T
Q  934 tcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18096938 tcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacgaattcttt 18096891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 638 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 10958655 - 10958314
Alignment:
Q  638 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 737  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||    | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10958655 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaac----ataaagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 10958560  T
Q  738 atggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg- 836  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  10958559 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctga 10958460  T
Q  837 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct- 934  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  10958459 cactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcttcatatagtggaacggagggctgctctctc 10958360  T
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10958359 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 10958314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 5522949 - 5522618
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522949 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 5522854  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    ||           |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522853 gt-----------ctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 5522765  T
Q  836 gg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522764 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 5522665  T
Q  935 ccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522664 cccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 5522618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 635 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 51727341 - 51726998
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 734  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  51727341 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataaa----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggta 51727246  T
Q  735 tgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51727245 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacact-gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggtaagaggc 51727147  T
Q  835 tg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 932  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  51727146 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctct 51727047  T
Q  933 ct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51727046 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttt 51726998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 636 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 6063782 - 6063432
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6063782 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 6063685  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    |||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  6063684 gtatagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 6063585  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6063584 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 6063485  T
Q  934 t-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttctttgtgt 984  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6063484 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtccacaaatttctttgtgt 6063432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 636 - 984
Target Start/End: Original strand, 25388821 - 25389176
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagaggggg------ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 729  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| |||| | |      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25388821 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctat--tttgagagagagagagagagagagagctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaacta 25388918  T
Q  730 gggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacggga 828  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25388919 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaacactattaggattggagtctcttggttacggga 25389017  T
Q  829 agaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggct 927  Q
    ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25389018 agagattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggct 25389117  T
Q  928 gctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttctttgtgt 984  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25389118 gctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 25389176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 636 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 6066131 - 6065782
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6066131 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag---gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 6066035  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  6066034 gtatagattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 6065935  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  6065934 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggatggctgctctc 6065835  T
Q  934 tcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttctttgtgt 984  Q
    ||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6065834 tcccctagactaggtcagattggacagaactgggtcaacaaatttctttgtgt 6065782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 677 - 980
Target Start/End: Original strand, 30005801 - 30006107
Alignment:
Q  677 gagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg 776  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  30005801 gagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgag 30005900  T
Q  777 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 875  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30005901 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 30006000  T
Q  876 cccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30006001 ctcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagattagatcaatttggaccgaactgggtcaacaa 30006100  T
Q  974 attcttt 980  Q
    |||||||    
T  30006101 attcttt 30006107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 636 - 984
Target Start/End: Original strand, 38210291 - 38210641
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38210291 acttttactataaatataggccttgtatcaggctat--tttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 38210388  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  38210389 gtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 38210488  T
Q  835 tg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  38210489 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagagctgctctc 38210588  T
Q  934 t-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat-tctttgtgt 984  Q
    | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38210589 tcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgt 38210641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 22114639 - 22114296
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22114639 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttgg----agatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggttt 22114544  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114543 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 22114444  T
Q  836 -ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||    
T  22114443 gggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcggagggatgatctc 22114344  T
Q  934 t-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    | ||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114343 tcccccaaacaaagtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 22114296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 635 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 9604947 - 9604598
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaacttt--gagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 732  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||   ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  9604947 tactttcactataaatatagaccttgtattagagaaaactctgagagagagatagagggggctgaaacaa-ggtttagaaaggcaacaacaaaactagga 9604849  T
Q  733 tttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 832  Q
    ||||||| ||||||||||||| | || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9604848 tttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagag 9604749  T
Q  833 gctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 930  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9604748 gttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 9604649  T
Q  931 ctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  9604648 ctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactaggtcaacaaattcttt 9604598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 636 - 984
Target Start/End: Original strand, 50493922 - 50494270
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50493922 actttcactataaatatagaccttgtatcaaagcaaact----gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 50494017  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  50494018 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagggat 50494117  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50494118 tgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 50494217  T
Q  934 t-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat-tctttgtgt 984  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50494218 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgt 50494270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 635 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 27101520 - 27101172
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 734  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| |  || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101520 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaattgagatagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 27101421  T
Q  735 tgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  27101420 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagaa 27101321  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 932  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  27101320 tgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgcaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctct 27101221  T
Q  933 ct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27101220 ctcccccagaataggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttt 27101172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 637 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 1627016 - 1626674
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1627016 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 1626921  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct- 835  Q
    ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |     
T  1626920 tatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggggagagattg 1626821  T
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1626820 ggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 1626721  T
Q  935 c-cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1626720 cgcccagactaggtcgatttggaccgaactaggtcaacaaattcttt 1626674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 637 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 43423796 - 43423454
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| |||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43423796 cttttactataaatatagacattgtatcactgtaaaccttg----agaaagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 43423701  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct- 835  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  43423700 tatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 43423601  T
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||    
T  43423600 gggctttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaactgagagctgctctct 43423501  T
Q  935 ccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43423500 ccctgagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 43423454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 721 - 980
Target Start/End: Original strand, 1321483 - 1321745
Alignment:
Q  721 acaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 820  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321483 acaaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 1321582  T
Q  821 ttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggat 918  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321583 ttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 1321682  T
Q  919 cggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321683 cggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 1321745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Original strand, 26720448 - 26720813
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |    |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26720448 atttgttccaaattt-taagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttgg----agatagagggggctgaaataagggtttaga 26720542  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  26720543 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggtta-actattaggattga 26720641  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 909  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  26720642 gtttcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttttaaccctttgatttctcttttgtaacgatactcatcat 26720741  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26720742 atagtggaacggatgactgctctctcccctagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaccaaattcttt 26720813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 682 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 28102294 - 28101993
Alignment:
Q  682 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 781  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  28102294 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttg 28102195  T
Q  782 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 880  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28102194 attcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 28102095  T
Q  881 tgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccaga-ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 978  Q
    |||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  28102094 tgatatctcttttgtaaagttacttatcatatagtggaacggatggctgctctctccccaaagctaggtcaatttggaccaaactaggtcaacaaattct 28101995  T
Q  979 tt 980  Q
    ||    
T  28101994 tt 28101993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Original strand, 24979607 - 24979974
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  24979607 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatataccttgtatcagagtaaactttgagat----agagggggctgaaacaagggtttaga 24979701  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24979702 aagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattga 24979801  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttgt-aacgttactcatca 908  Q
    ||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| || || | ||||| ||||||||||||||    
T  24979802 gtctcttggttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacaaattaatatcttttttgtaaacgttactcatca 24979901  T
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24979902 tatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttt 24979974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 634 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 32264379 - 32264035
Alignment:
Q  634 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaa----ctttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 729  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    ||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32264379 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattaactttgagataga----gggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 32264284  T
Q  730 gggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 829  Q
      |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32264283 aagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaa 32264184  T
Q  830 gaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggaggg 925  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  32264183 gaggctggaactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaggg 32264084  T
Q  926 ctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  32264083 ctgctctctcccccagactaggtctatttggaccaaactggatcaacaa 32264035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 622 - 980
Target Start/End: Original strand, 3314593 - 3314951
Alignment:
Q  622 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaa 721  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  3314593 aatttatgagggatgcttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagat----agagggggctgaaataagggtttagaaaggtaacaa 3314688  T
Q  722 caaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 821  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3314689 caaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 3314788  T
Q  822 tacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggat 918  Q
    ||| |||||||  | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||| |||||| ||||||| |     
T  3314789 tacaggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattattcatcattatagtgaaa 3314888  T
Q  919 cggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3314889 cggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 3314951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 638 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 43421747 - 43421406
Alignment:
Q  638 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 737  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43421747 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaa----ggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 43421652  T
Q  738 atggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-g 836  Q
    || | ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | |    
T  43421651 atagtgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 43421552  T
Q  837 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct- 934  Q
    |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||     
T  43421551 ggatttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatggctgctctctc 43421452  T
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43421451 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 43421406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 597 - 931
Target Start/End: Original strand, 6561695 - 6562028
Alignment:
Q  597 tatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctg 696  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    |||||||||||    
T  6561695 tatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatgagttatatttct-ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagat----agagggggctg 6561789  T
Q  697 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 796  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6561790 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaa 6561889  T
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttg 893  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||    
T  6561890 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctttttg 6561989  T
Q  894 taacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 931  Q
    ||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6561990 taaggtaactcatcattatagtggagcggagggctgctc 6562028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 637 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 5927097 - 5926751
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  5927097 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttg----agatagagagggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttg 5927002  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct- 835  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  5927001 tatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 5926902  T
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||||||    
T  5926901 ggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatatcttttgtaaggttactcatcatataatgaaacggatgactgctctct 5926802  T
Q  935 ccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttgtgt 984  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5926801 cccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttgtgt 5926751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 728 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 7606831 - 7606579
Alignment:
Q  728 tagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 827  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606831 tagggtttgta--gagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 7606734  T
Q  828 aagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 926  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7606733 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctatttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggc 7606634  T
Q  927 tgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606633 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 7606579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 612 - 976
Target Start/End: Original strand, 18162564 - 18162925
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggc-taaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttag 710  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||      ||| ||||||||||||||||    
T  18162564 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatgagtaaacttggagataga------gggatgaaacaagggtttag 18162656  T
Q  711 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 810  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18162657 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattg 18162756  T
Q  811 agtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat-ttctctttgt-aacgttactcatc 907  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||||||||    
T  18162757 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatttattttgtaaacgttactcatc 18162856  T
Q  908 atatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18162857 atatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga-cgaactgtgtcaacaaatt 18162925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 707 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 28413299 - 28413027
Alignment:
Q  707 ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 806  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28413299 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 28413200  T
Q  807 attg-agtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactc 904  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  28413199 attgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactc 28413100  T
Q  905 atcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||    
T  28413099 atcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaattaggtcaacaaatt 28413027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 622 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 880800 - 880442
Alignment:
Q  622 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaa 721  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  880800 aatttatgagggatgcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataga----ggggtctgaaacaagagtttagaatggcaacaa 880705  T
Q  722 caaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 820  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  880704 caaaactagggtttgtatagagttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagcattgagtctcttgg 880605  T
Q  821 ttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggat 918  Q
    |||||| |||||  | || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||  |     
T  880604 ttacggaaagagattggggctttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtaaaa 880505  T
Q  919 cggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  880504 tggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttt 880442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 677 - 936
Target Start/End: Original strand, 29956646 - 29956907
Alignment:
Q  677 gagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg 776  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |    
T  29956646 gagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaattcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgag 29956745  T
Q  777 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 875  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29956746 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 29956845  T
Q  876 cccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 936  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29956846 ctcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcc 29956907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 637 - 980
Target Start/End: Original strand, 36011751 - 36012093
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| |||||||| |    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  36011751 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagataaa----gggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacgaaactaaggtttg 36011846  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 836  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||    
T  36011847 tatagagtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgttgggaaacactattaggattgaatatcttggttacgggaagagattg 36011946  T
Q  837 -gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc- 933  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  36011947 tgactttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctct 36012046  T
Q  934 tccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36012047 tcttcagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttt 36012093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 637 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 47149233 - 47148890
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggc-taaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||  | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47149233 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaggccttgagggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 47149134  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  47149133 gtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggttgattcacctt-ggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 47149035  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 932  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| | | |||| |||||||    
T  47149034 tgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtatcgttactcatcatatagtgaaacagaggactgctct 47148935  T
Q  933 ct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  47148934 ctcccccagactatgtcaatttggcccgaactaggtcaacaaatt 47148890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 12268323 - 12267966
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    ||| ||||||||||| |||||||    
T  12268323 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaacttgtatcagagtaaactttgagataga----gggagctgaaacaagagtttaga 12268229  T
Q  712 aaggcaacaacaaaa-ctagggtttgtatggagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 809  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12268228 aagacaacaacaaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcggaaacactattaggatt 12268129  T
Q  810 gagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca 908  Q
    |||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||| |||||||||||||||||||    
T  12268128 gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac---------tct-tttgtaacgttactcatca 12268039  T
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||| | | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12268038 tatagtgaaacagagggctgctctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 12267966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 48362027 - 48361662
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |    |||||||||||||||| ||||||    
T  48362027 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagataca----gggggctgaaacaagg-tttaga 48361934  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48361933 atgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattga 48361834  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 909  Q
    ||||||| |||||||||||||  | || |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| ||    
T  48361833 gtctcttagttacgggaagagattggggcttttggtagaattaggcggaagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcataat 48361734  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||  | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48361733 atagtaaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttt 48361662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 637 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 53468788 - 53468444
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  53468788 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctt----tagataaagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaaccagg-tttg 53468694  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct- 835  Q
    ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |     
T  53468693 tatagagtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacggggagagattg 53468594  T
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctct- 932  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||     
T  53468593 ggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctcta 53468494  T
Q  933 ctccccag--actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53468493 ccccccagacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 53468444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Original strand, 15780760 - 15781145
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  15780760 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacttggagataga----gggggctgaaacaagggtttaga 15780854  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgt-----------ctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 800  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||           ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15780855 atggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 15780954  T
Q  801 attaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat----ttctcttt-gt 894  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||| ||    
T  15780955 attacgattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatatttctcttttgt 15781054  T
Q  895 aacgttactcatcat-atagtggatcggagggc---tgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    || |||| | ||||| |||||||| || |||||   |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15781055 aaagttatttatcattatagtggaacgaagggcgcctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 15781145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 635 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 35918284 - 35917944
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 734  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35918284 tactttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaattttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 35918189  T
Q  735 tgtatggagtttgtctcttcggaacaaacac------tagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 828  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||      ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  35918188 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgcgaaacactattagaattgagtctcttggttacgaga 35918089  T
Q  829 agaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 926  Q
    |||| || ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  35918088 agagactgggaatttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcattatatagtggaacggagagc 35917989  T
Q  927 tgctctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 971  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  35917988 tgctctctccctcagact-ggtcaatttagaccgaactggatcaac 35917944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 613 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 28761784 - 28761418
Alignment:
Q  613 tttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 712  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||    
T  28761784 tttgttccaa-tttatgagggatacttttactataaatatagactttgcatcagagtaaaccttgagataga----gggggttgaaacaagggtttagaa 28761690  T
Q  713 aggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 812  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28761689 agacaacaacaaaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaaacactattaggattgag 28761591  T
Q  813 tctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-t 909  Q
    |||||||||||| ||||||   || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |    
T  28761590 tctcttggttacaggaagatattgagactttaggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 28761491  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaa-tttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  28761490 atagtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaattttggatcgaactgggtaaacaaattcttt 28761418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Original strand, 32218995 - 32219351
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||    
T  32218995 atttgttccaaattt-taagtaatactttcagtataaatatagaccttgtatctgactaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggttcaga 32219089  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||||||           |||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32219090 aaggcaacaacaaaactag-----------agtttgtctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattga 32219178  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttgt-aacgttactcatca 908  Q
    ||||||||||| |||||||||  | |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||    
T  32219179 gtctcttggttgcgggaagagattgggactttgggcagaattaggcggaagacttatttttgtaacccattgatatcttttttgtaaacgttactcatca 32219278  T
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32219279 tatagtgaaacggatggctgctctctctcccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 32219351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 177; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 635 - 980
Target Start/End: Original strand, 39715392 - 39715731
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 734  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||     |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  39715392 tacttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataga-----ggggctgaaataagggtttagagaggcaacaccaaaactagggtt 39715486  T
Q  735 tgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    ||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  39715487 tgtatagagtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 39715586  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 932  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||  |||||| | | || || ||||||    
T  39715587 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc--atagtgaaacagatggttgctct 39715684  T
Q  933 ctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    | ||||| ||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  39715685 c-ccccatactagatcattttggaccaaactaggtcaacaaattcttt 39715731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 636 - 881
Target Start/End: Original strand, 35777344 - 35777587
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35777344 acttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttg----agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 35777439  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  35777440 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 35777539  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 881  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35777540 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 35777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 172; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Original strand, 23633359 - 23633719
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| ||    |||| |||||||| ||||||    
T  23633359 atttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagag----ggctaaaacaaggatttaga 23633454  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    | | |||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  23633455 a-gccaacaagaaaactagggtttgtatagtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgatttacc--gggaaacactattaggattga 23633548  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca-t 909  Q
    |||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  23633549 gtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctctttgtaaagttactcatcatt 23633648  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23633649 atagtgaaaaggagggctgctctctccccagactaggtcaatttagaccgaaatgggtaaacaaattcttt 23633719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 622 - 965
Target Start/End: Complemental strand, 890119 - 889779
Alignment:
Q  622 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaa 721  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||    ||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  890119 aatttatgagggatgcttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagataga----ggaagctgaaacaagggtttagaatggcaacaa 890024  T
Q  722 caaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 820  Q
      || ||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  890023 --aacctagggtttgtatagagtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 889926  T
Q  821 ttacgggaagaggctggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatc 919  Q
    ||||||||||||   || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  889925 ttacgggaagagttggggctttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaac 889826  T
Q  920 ggagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgg 965  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  889825 ggagggctgatttctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgg 889779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 638 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 51675087 - 51674757
Alignment:
Q  638 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 737  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  51675087 ttttactataaatatagacgttgtatcaatgtaaacgttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgt 51674992  T
Q  738 atggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-g 836  Q
               | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |    
T  51674991 -----------ccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgg 51674903  T
Q  837 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct- 934  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || |  |||||||||||||||     
T  51674902 gattttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatactgaaatggagggctgctctctc 51674803  T
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51674802 ccccataccaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttt 51674757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 623 - 973
Target Start/End: Original strand, 53591105 - 53591442
Alignment:
Q  623 atttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaac 722  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||||||    || |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  53591105 atttatgaggaatgcttttactataaatatagacattgtataagtgtaaaccttgagataga----ggaggctgaaacaagagtttagaaagacaacaac 53591200  T
Q  723 aaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 822  Q
    |||||||||||||           |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  53591201 aaaactagggttt-----------gtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctcttggtt 53591289  T
Q  823 acgggaagag-gctggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcg 920  Q
    ||| ||| ||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  53591290 acgagaatagatttggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttctaatccattgatatctcatttgtaacgttactcatcatatagtgaaacg 53591389  T
Q  921 gagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  53591390 aagggatgctctctccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaacaa 53591442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 637 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 54691906 - 54691565
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||  ||||| || |||||||     |||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54691906 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagataga-----gggggtaaaacaaggttttagaaaggcgacaacaaaactagggtttg 54691812  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct- 835  Q
    ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||  |     
T  54691811 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaattttttggttatgggaagagatta 54691712  T
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
    || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  54691711 gggctttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctcttttgtaacgttacccatcatatagttaaacggagggctgctctct 54691612  T
Q  935 cccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||| |||||| ||||||||| || ||||| |||| |||||||||||    
T  54691611 cccctagactatgtcaatttgaactgaactaggtcgacaaattcttt 54691565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 778 - 980
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886464
Alignment:
Q  778 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgga-ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 876  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886261 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5886359  T
Q  877 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886360 ccattgatttgtctttgaaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 5886459  T
Q  976 tcttt 980  Q
    |||||    
T  5886460 tcttt 5886464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 778 - 980
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899937
Alignment:
Q  778 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgga-ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 876  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5899734 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5899832  T
Q  877 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5899833 ccattgatttctctttgcaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 5899932  T
Q  976 tcttt 980  Q
    |||||    
T  5899933 tcttt 5899937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 730 - 980
Target Start/End: Original strand, 6484372 - 6484626
Alignment:
Q  730 gggtttgtatggagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 828  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6484372 gggtttgtgtagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacggga 6484471  T
Q  829 agaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 926  Q
    ||||  | ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  6484472 agagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatatcttttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggc 6484571  T
Q  927 tgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6484572 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 6484626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 768 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688151
Alignment:
Q  768 gggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagactta 866  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 25688268  T
Q  867 ttcttgtaacccattgatttctc-tttgt-aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaact 963  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688267 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 25688168  T
Q  964 gggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||| || ||||||    
T  25688167 gggtcaaaaagttcttt 25688151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 781 - 980
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168367
Alignment:
Q  781 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 879  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccca 11168264  T
Q  880 ttgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  11168265 ttgatttctcttttgtaacgttacttatcatatattggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaacttggtcaacaaattc 11168364  T
Q  978 ttt 980  Q
    |||    
T  11168365 ttt 11168367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 637 - 871
Target Start/End: Complemental strand, 28100374 - 28100143
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||  ||| | |||    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28100374 cttttactataaatataagcgttgtatcagagtaacccttg----agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 28100279  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct- 835  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |     
T  28100278 tatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacgctattaggattgagtcttttggttacgggaagagattg 28100179  T
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 871  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28100178 gggctttgggtagaattaggcgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 622 - 978
Target Start/End: Original strand, 31151256 - 31151609
Alignment:
Q  622 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggc-taaactttgagatagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaac 719  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||   ||||| | ||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  31151256 aatttatgagggatgcttttactataaatatagactttgtatcagatgtaaacctcgagataga----gggggctgaaaacaagggtttagaaat-caac 31151350  T
Q  720 aacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 819  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31151351 aagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 31151447  T
Q  820 gttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactca-tcatatagtgg 916  Q
    || ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||| |||||||| |  ||||||||    
T  31151448 gtcacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaaccc--tgatatctcttttgtaaagttactcattgttatagtgg 31151545  T
Q  917 atcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattct 978  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  31151546 aacggagggctgctctctcccccagactaggtcagttttgggctgaactgggtaaacaaattct 31151609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 682 - 980
Target Start/End: Original strand, 4666490 - 4666780
Alignment:
Q  682 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 781  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||           |||||||   |||| ||||||||||||| ||||||    
T  4666490 agatagagggggctgaaagaagggtctagtaagacaacaacaaaaatagggttt-----------gtctcttgacaacagacactagggtttgagggttg 4666578  T
Q  782 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggaga--cttattcttgtaaccc 878  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  4666579 attcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgtaatcc 4666678  T
Q  879 attgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4666679 attgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctg--ctctccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatt 4666776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 637 - 876
Target Start/End: Original strand, 28180948 - 28181182
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||    ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28180948 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataga----gggggctgaaata--ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttg 28181041  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct- 835  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |     
T  28181042 tatagagtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccattaggattgagtctattggttacgggaagagattg 28181141  T
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 876  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28181142 ggactttggatagaattaggcgggagacgtattcttataac 28181182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 765 - 980
Target Start/End: Original strand, 6231849 - 6232066
Alignment:
Q  765 ctagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattaggcgggagact 864  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  6231849 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagattgggatttgggtagaattaggcgggagact 6231948  T
Q  865 tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaa 961  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| || ||| || |||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  6231949 tattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagctactcatcattacagt-gaacggagggctgctgtctccccccgattaggtcaatttggaccgaa 6232047  T
Q  962 ctgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6232048 ctgggtcaacaaattcttt 6232066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 615 - 967
Target Start/End: Original strand, 53597143 - 53597491
Alignment:
Q  615 tgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 714  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||     |||| |||||||||||||||  |||    
T  53597143 tgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagataga-----ggggatgaaacaagggttta-taag 53597236  T
Q  715 gcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 814  Q
     |||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53597237 tcaacaagaaaactaggggttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggtt--gaagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 53597333  T
Q  815 tcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tat 911  Q
    ||||||| | | ||| ||  || || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||| ||||||||||| |||    
T  53597334 tcttggtcatgagaatagattgagattttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaagttactcatcattat 53597433  T
Q  912 agtggatcggagggctgctctctccc-cagactaggtcaat-ttggaccgaactgggt 967  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||| || ||||||||| | |||||||||| |||||    
T  53597434 agtggaatggagggttgctctctcccacaaactaggtcagtattggaccgaattgggt 53597491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 724 - 967
Target Start/End: Complemental strand, 13420432 - 13420189
Alignment:
Q  724 aaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 823  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||  | ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13420432 aaactagggtttgtatagagttt-tctctaggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtca 13420337  T
Q  824 cgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcg 920  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||| | |||| |||| ||    
T  13420336 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcattattataatggaacg 13420237  T
Q  921 gagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggt 967  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  13420236 gagagctgctctctcaccagactaggtcagttttggaccgaaatgggt 13420189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 612 - 892
Target Start/End: Original strand, 23636926 - 23637199
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||| ||| ||||||||  ||| ||||| |||||||||| || |||||||||  ||||| ||||||||||    || |||| |||||||||||||||    
T  23636926 atttgtttcaattttatgagggataattttaatataaatatatactttgtatcagagtaaaccttgagataga----ggaggctaaaacaagggtttaga 23637021  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    | | |||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  23637022 a-gccaacaagaaaactagggtttgtatagagtctg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgatttaccttgagaaacactattaggattga 23637117  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||| | | |||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23637118 gtctcttgttcatgggaagatattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 23637199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 688 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 562058 - 561769
Alignment:
Q  688 agggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac 787  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||    |||||||||||    
T  562058 agggggttgaaacaagggtttagaa-gtcaacatgaaa-ctagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttca--ggttgattcac 561964  T
Q  788 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 886  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  561963 attgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgatat 561864  T
Q  887 c-tctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcc--ccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    | | ||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||    
T  561863 cttttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctctccctccagactaggtcagttttggaccgaaccgggtaaacaaatt 561769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 724 - 994
Target Start/End: Original strand, 17795269 - 17795539
Alignment:
Q  724 aaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 823  Q
    ||||||| || ||||| ||||||| || || | ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  17795269 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtca 17795364  T
Q  824 cgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcg 920  Q
    ||| |||||  || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| || | ||    
T  17795365 cggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacg 17795464  T
Q  921 gagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct-ttgtgtctctctcttt 994  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  17795465 gaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgt-tctctcttt 17795539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 724 - 994
Target Start/End: Original strand, 19103709 - 19103979
Alignment:
Q  724 aaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 823  Q
    ||||||| || ||||| ||||||| || || | ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  19103709 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtca 19103804  T
Q  824 cgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcg 920  Q
    ||| |||||  || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| || | ||    
T  19103805 cggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacg 19103904  T
Q  921 gagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct-ttgtgtctctctcttt 994  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  19103905 gaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgt-tctctcttt 19103979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 637 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 28137628 - 28137415
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  28137628 cttttactataaatatatgcgttgtatcagagtaaaccttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag------ 28137539  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct- 835  Q
         |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |     
T  28137538 -----agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattg 28137444  T
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagact 864  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||    
T  28137443 gggctttgggtagaattaggcggaagact 28137415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 689 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 36871583 - 36871295
Alignment:
Q  689 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 788  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |  | ||||||||||    
T  36871583 gggggctgaaacaagggtttacaa-gccaacaagaaaactagggcttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttag--gattgattcacc 36871488  T
Q  789 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgattt 886  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||  | ||||||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||| ||| | |    
T  36871487 ttggaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttat 36871388  T
Q  887 ctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||    
T  36871387 ctctttgtaaagttaatcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatt 36871295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 682 - 927
Target Start/End: Original strand, 54884122 - 54884367
Alignment:
Q  682 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 781  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  54884122 agatagagggagctcgaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagaatttgta--gagtttgtttctttggaacaaacactagggtttgatggttg 54884219  T
Q  782 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 880  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||  ||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||| | ||    
T  54884220 attcatcttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaaactttgaatagaattaggagggagacttatt-ttgtaatctat 54884318  T
Q  881 tgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggct 927  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  54884319 tgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggct 54884367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 636 - 785
Target Start/End: Original strand, 11163073 - 11163218
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11163073 acttttacgataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagat----agagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 11163168  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattc 785  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11163169 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtggattgattc 11163218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 724 - 976
Target Start/End: Original strand, 25635391 - 25635644
Alignment:
Q  724 aaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 823  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  25635391 aaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtca 25635487  T
Q  824 cgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct-ctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcg 920  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||| ||| | |     
T  25635488 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcattatggtgaaaca 25635587  T
Q  921 gagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  25635588 gagggttgctctctcccctcggctaggccaatttggaccaaactgcgtaaacaaatt 25635644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 843 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 47701801 - 47701662
Alignment:
Q  843 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccag 940  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  47701801 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccag 47701702  T
Q  941 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  47701701 attaggtcaatttggatcgaactggatcaacaaattcttt 47701662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 795 - 980
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3307026
Alignment:
Q  795 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgga-ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||   ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  3306839 aacactattaggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctctttt 3306938  T
Q  893 gtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |  ||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  3306939 gtaaagttactcatcattatagtgaaaaggatggttgctctct-cctagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttt 3307026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 637 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 47701928 - 47701798
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47701928 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataaa----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 47701833  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 771  Q
    ||| |||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  47701832 tatagagtttgtctatttggaacaaacaccagggt 47701798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 717 - 976
Target Start/End: Original strand, 1673975 - 1674227
Alignment:
Q  717 aacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 816  Q
    ||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1673975 aacaagaaaactagtgtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttag--gattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctc 1674071  T
Q  817 ttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagt 914  Q
    ||| | ||||||||||  | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||| |||||        |  |    
T  1674072 ttgatcacgggaagagattgggactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgatatgtcttttgtaaagttac--------tttt 1674163  T
Q  915 ggatcggagggctgctctctcc-ccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||    
T  1674164 ggaacggatggctgctctctccaccagactaggtcagtattagaccgaactgggtaaacaaatt 1674227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 638 - 770
Target Start/End: Original strand, 6231374 - 6231502
Alignment:
Q  638 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 737  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  |||    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6231374 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaatcttg----agatagagcgggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 6231469  T
Q  738 atggagtttgtctcttcggaacaaacactaggg 770  Q
    || ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  6231470 atagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 6231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 612 - 821
Target Start/End: Original strand, 24177179 - 24177380
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctg-aaacaagggtttag 710  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||| |||    || |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24177179 atttgttccaaattt-taagggatacttttattataaatatagaccttgtatcatagtaaacattg----agctagagggggctgaaaacaagagtttag 24177273  T
Q  711 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 810  Q
     | | |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24177274 -atgtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt--ggggttgattcaccttggaaaacactattaggattg 24177369  T
Q  811 agtctcttggt 821  Q
    |||||||||||    
T  24177370 agtctcttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 779 - 974
Target Start/End: Complemental strand, 1620657 - 1620457
Alignment:
Q  779 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaac 876  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||   || | ||  ||||||||||    
T  1620657 ttgattcaccttggaaaacactattaggattaggtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaac 1620558  T
Q  877 ccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    || ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||| ||| |||||    
T  1620557 cctttgatatctctttgtaaacttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcagtattggaccaaactaggtgaacaa 1620458  T
Q  974 a 974  Q
    |    
T  1620457 a 1620457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 287 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 48635963 - 48635868
Alignment:
Q  287 atcttggactaaaattattaaaataaaaatttaatttattgaatttaggtgaattctaggatgagggttcaatcaagtccctcacctgaatttgacc 383  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48635963 atcttgggctaaaattattaaaataaaaatttaatctattgaatttaggtgaattctagggtgaggg-tcaatcaaatccctcacctgaatttgacc 48635868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 836 - 976
Target Start/End: Original strand, 24181500 - 24181644
Alignment:
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  24181500 ggactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctc 24181599  T
Q  934 tcc-ccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||| ||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24181600 tcctccaaactaggtcagttttggaccgaattgggtaaacaaatt 24181644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 797 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 29914132 - 29913949
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||    
T  29914132 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgta 29914036  T
Q  896 acgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    | |  |||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  29914035 aagaaactcatcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 29913949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 384 - 458
Target Start/End: Original strand, 6561613 - 6561687
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatata 458  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6561613 tgttgtagtatgactcgaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatata 6561687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 41849243 - 41849325
Alignment:
Q  899 ttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41849243 ttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 41849325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 612 - 856
Target Start/End: Complemental strand, 4560623 - 4560401
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    |||| |||||| |||| |||  ||||||| ||||||| |||||||  |||||||   ||||| ||||||||||    |||||||||||||| |||||| |    
T  4560623 atttattccaattttacgagggatactttcactataagtatagactatgtatcatagtaaacattgagataga----gggggctgaaacaatggtttata 4560528  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||| ||||||||||||||           |||||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4560527 aaggtaacaacaaaactag-----------agtttgtctct--------aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 4560447  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggctgga-ctttgggtagaattaggc 856  Q
    | || |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  4560446 gcctgttggttaccggaagagattggagctttgggtagaattaggc 4560401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 908 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 35919179 - 35919106
Alignment:
Q  908 atatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35919179 atatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 35919106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 797 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 47878350 - 47878165
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||    
T  47878350 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgta 47878254  T
Q  896 acgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctcc-ccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    | |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||    
T  47878253 aagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaattctt 47878165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 797 - 975
Target Start/End: Original strand, 54188512 - 54188692
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||||    
T  54188512 cactattagaattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgta 54188608  T
Q  896 acgttactcat--cat-atagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    | |  ||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  54188609 aagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 54188692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 638 - 760
Target Start/End: Original strand, 3306724 - 3306842
Alignment:
Q  638 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 737  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||     
T  3306724 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacct----agagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatacaacaacaaaactaggatttga 3306819  T
Q  738 atggagtttgtctcttcggaaca 760  Q
    || ||||||||||||| ||||||    
T  3306820 atagagtttgtctctttggaaca 3306842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 612 - 832
Target Start/End: Original strand, 13419775 - 13419994
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcag--gctaaacttt-gagataga--tagagggggctgaaacaagggt 706  Q
    |||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||||||  ||||||||  |||||      ||||||| |||    
T  13419775 atttgttctaattttatgagggatacttttactataaatatagaccttatatcagatgtaaaacttgagagatagaagtagagatccaggaaacaaaggt 13419874  T
Q  707 ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 806  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13419875 tta-aaagccaacaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattagg 13419968  T
Q  807 attgagtctcttggttacgggaagag 832  Q
    ||  ||||||||||| |||| |||||    
T  13419969 atcaagtctcttggtcacggaaagag 13419994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 794 - 975
Target Start/End: Complemental strand, 10094256 - 10094073
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||||    
T  10094256 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctcttt 10094160  T
Q  893 gtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    |||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  10094159 gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 10094073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 797 - 979
Target Start/End: Original strand, 10897008 - 10897193
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||    
T  10897008 cactattaggattgattctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgta 10897104  T
Q  896 acgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    | |  ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  10897105 aagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 10897193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 908 - 977
Target Start/End: Complemental strand, 53894121 - 53894051
Alignment:
Q  908 atatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53894121 atatattggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 53894051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 394 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 53974197 - 53974124
Alignment:
Q  394 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 467  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53974197 tgactcaaaatttgatggatgaagaatgttgttgttaaaaatataaaagatttgtttcaattatattttgtgct 53974124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 612 - 717
Target Start/End: Original strand, 1321341 - 1321441
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  1321341 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagat----agagggggctgaaacaagggtttaga 1321435  T
Q  712 aaggca 717  Q
    ||||||    
T  1321436 aaggca 1321441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 794 - 975
Target Start/End: Complemental strand, 10100273 - 10100090
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||| |||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||||    
T  10100273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtaaaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctcttt 10100177  T
Q  893 gtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    |||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  10100176 gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 10100090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 794 - 975
Target Start/End: Complemental strand, 10201136 - 10200953
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||||    
T  10201136 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctcttt 10201040  T
Q  893 gtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    | || |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  10201039 ggaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 10200953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 794 - 975
Target Start/End: Complemental strand, 10208182 - 10207999
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||||    
T  10208182 aaacactattacgattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctcttt 10208086  T
Q  893 gtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccc-cagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    |||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  10208085 gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccgcagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 10207999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 779 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 14634638 - 14634486
Alignment:
Q  779 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 876  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||  || |||||||||||| ||||||   | ||||| ||||||||||     
T  14634638 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggtagcattaggtttgaagactgattcttgtaaa 14634539  T
Q  877 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggct 927  Q
    || ||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  14634538 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggaacggatggct 14634486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 859 - 976
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634150
Alignment:
Q  859 gagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcc-ccagactaggtcaatttgg 955  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | || | ||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaatggctgctctctccaccagactaggacaatttgc 25634129  T
Q  956 accgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    |||||||| ||| ||||||||    
T  25634130 accgaactaggtaaacaaatt 25634150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 794 - 975
Target Start/End: Original strand, 27544273 - 27544456
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||||    
T  27544273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagcgtggaacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctcttt 27544369  T
Q  893 gtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccc-cagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    |||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  27544370 gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccctcagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 27544456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 797 - 975
Target Start/End: Original strand, 54193229 - 54193410
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||    
T  54193229 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgta 54193325  T
Q  896 acgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    | |  || |  |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  54193326 aagaaacccatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 54193410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 394 - 467
Target Start/End: Original strand, 11072644 - 11072717
Alignment:
Q  394 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 467  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  11072644 tgactcaaaatttgatggatgaagaagattgttgcaaaaaatataaatgatttgtttcaaatatatcttgtgct 11072717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 794 - 975
Target Start/End: Complemental strand, 22626166 - 22625982
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | | ||| ||||||| ||| |||   | |||||||    
T  22626166 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaaaactgattcttgaaactcat---tatctcttt 22626070  T
Q  893 gtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    |||| |  ||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  22626069 gtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagaactgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 22625982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 724 - 821
Target Start/End: Original strand, 25633930 - 25634024
Alignment:
Q  724 aaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 821  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||| | |  | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25633930 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggctgg--gattgattcaccttgggagacattattaggattgagtctcttggt 25634024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 794 - 949
Target Start/End: Original strand, 6303310 - 6303466
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||| | |||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||||    
T  6303310 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtatagttaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctcttt 6303406  T
Q  893 gtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca 949  Q
    |||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  6303407 gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 6303466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 794 - 855
Target Start/End: Original strand, 16462203 - 16462264
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg 855  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  16462203 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattagg 16462264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 794 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 47883064 - 47883003
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg 855  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  47883064 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattagg 47883003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 802 - 979
Target Start/End: Original strand, 4535622 - 4535803
Alignment:
Q  802 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgtt 900  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||| |      
T  4535622 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggaattgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgtaaagaa 4535718  T
Q  901 actc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctc--cccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    ||||  |||| ||||||||| | ||| |||||||||||  ||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  4535719 actcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcctcccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 4535803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 612 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 1619016 - 1618916
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctg-aaacaagggtttag 710  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||| |||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1619016 atttgttccaattttatgagggatactttgactataaatatagaccttgtaccatagtaaaccttgag--agacagagggggctgaaaacaagggtttag 1618919  T
Q  711 aaa 713  Q
    |||    
T  1618918 aaa 1618916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 797 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 10612957 - 10612772
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| |||||| |||| ||   || ||||||||||    
T  10612957 cactattaagattgagtttcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttataactca---atatctctttgta 10612861  T
Q  896 acgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    | |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  10612860 aagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 10612772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 798 - 949
Target Start/End: Complemental strand, 10949438 - 10949285
Alignment:
Q  798 actattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaa 896  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||||    
T  10949438 actattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggaacttgggttgaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgtaa 10949342  T
Q  897 cgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca 949  Q
     |  ||||  |||| |||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  10949341 agaaactcatatcattataatggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 10949285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 54287627 - 54287576
Alignment:
Q  416 agaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 467  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54287627 agaagattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatttcgtgct 54287576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 394 - 467
Target Start/End: Original strand, 11066255 - 11066329
Alignment:
Q  394 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgct-aaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 467  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  11066255 tgactcataatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaaagataaatgatttgtttcaaatatatcttgtgct 11066329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 1736324 - 1736388
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1736324 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1736388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 794 - 949
Target Start/End: Original strand, 5858546 - 5858701
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||    
T  5858546 aaacactattaggattgagtct--tggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt 5858640  T
Q  893 gtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca 949  Q
    |||| |  ||||  |||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  5858641 gtaaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtca 5858701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 797 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 10595213 - 10595028
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 894  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||| |||| ||   || |||||||||    
T  10595213 cactattaggattaagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttataactca---atatctctttgt 10595118  T
Q  895 aacgttactca--tca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    || |  |||||  ||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  10595117 aaagaaactcatgtcattatagtggaacggagagctgctctctcccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 10595028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 18552902 - 18552966
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18552902 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 18552966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 30709809 - 30709873
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30709809 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 30709873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 794 - 949
Target Start/End: Original strand, 11079517 - 11079674
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   || ||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||    
T  11079517 aaacactatcaggattgagtctcttggtcacgggaaaaggctgggacttaggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt 11079613  T
Q  893 gtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca 949  Q
    |||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  11079614 gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 11079674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 933 - 980
Target Start/End: Original strand, 42992605 - 42992652
Alignment:
Q  933 ctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  42992605 ctccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaaaaaattcttt 42992652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 836 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 46966788 - 46966645
Alignment:
Q  836 ggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    ||||||||||||||||||||   || |||| ||| ||||||||  ||||| ||||||||||| |  ||||||||| |||||||| | ||| ||||| |||    
T  46966788 ggactttgggtagaattaggtttgaagactaattattgtaaccatttgatatctctttgtaaagaaactcatcattatagtggaacagagagctgccctc 46966689  T
Q  934 tccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||| ||| | ||||||||    
T  46966688 tccccagagtaggtcaatattggactgaattggataaacaaatt 46966645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 797 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 20031497 - 20031439
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg 855  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||| |||||||    
T  20031497 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtaaaattagg 20031439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 797 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 27762165 - 27762107
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg 855  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||||    
T  27762165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggacttgggtagaattagg 27762107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 779 - 819
Target Start/End: Original strand, 7768632 - 7768672
Alignment:
Q  779 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 819  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7768632 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 7768672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 8370505 - 8370569
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8370505 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 8370569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 779 - 855
Target Start/End: Original strand, 11066652 - 11066731
Alignment:
Q  779 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag--gctggactttgggtagaattagg 855  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||   | ||||||||||||||||||||    
T  11066652 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgaatcttttgatcacgggaagagattcgggactttgggtagaattagg 11066731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 27974971 - 27975035
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27974971 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 27975035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 27986465 - 27986529
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27986465 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 27986529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 757 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 31021361 - 31021300
Alignment:
Q  757 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttg 819  Q
    |||||||||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31021361 aacaaacactagggttgg--gattgattcaccttggagaaacactattaggattgagtctcttg 31021300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 911 - 973
Target Start/End: Original strand, 1417510 - 1417573
Alignment:
Q  911 tagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1417510 tagtggattggagggatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1417573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 467 - 550
Target Start/End: Original strand, 11066346 - 11066429
Alignment:
Q  467 tgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatatt 550  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||| | |  |||| || |||||||||||| |||| |||||||    
T  11066346 tgaaaatacatttatggacaataaatatatttttttaccatatgaaggaatatttgatgcaaatatatttttaaagagaatatt 11066429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 794 - 853
Target Start/End: Original strand, 38002869 - 38002928
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaatta 853  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  38002869 aaacaccattaggtttgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaatta 38002928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 40844719 - 40844656
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||  |||||||    
T  40844719 atagtggatttgagggctgctctctccccagattaggtcatattggaccgaactgaatcaacaa 40844656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 55375 - 55337
Alignment:
Q  334 ggtgaattctaggatgagggttcaatcaagtccctcacc 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55375 ggtgaattctaggatgagggttcaattaagtccctcacc 55337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 860 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 15823763 - 15823641
Alignment:
Q  860 agacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctc-cccagactaggtcaat-ttgga 956  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||| |  |||| ||| ||||||||| || || ||||||||||| || ||| || |||||| |||||    
T  15823763 agactaattcttgtaaccctttgacatctctttgtaaagaaactcttcattatagtggaacgtagagctgctctctctccaagagtaagtcaatattgga 15823664  T
Q  957 ccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    ||||| ||||| |||||||||||    
T  15823663 ccgaattgggtaaacaaattctt 15823641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 18745418 - 18745380
Alignment:
Q  334 ggtgaattctaggatgagggttcaatcaagtccctcacc 372  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18745418 ggtgaattctagggtgagggttcaatcaagtccctcacc 18745380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 612 - 666
Target Start/End: Original strand, 25635319 - 25635373
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcag 666  Q
    ||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25635319 atttgttccaattttatgagggatgcttttactataaatatagactttgtatcag 25635373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 919 - 965
Target Start/End: Original strand, 28181192 - 28181238
Alignment:
Q  919 cggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgg 965  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  28181192 cggaaggctgctctctccctagactaggtcaatttggactgaactgg 28181238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 469 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 53974077 - 53974035
Alignment:
Q  469 aaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatga 511  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53974077 aaaatatatttatagacaataaatatatttttgtaccgtatga 53974035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 464 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 5535929 - 5535880
Alignment:
Q  464 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatg 513  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||    
T  5535929 tgctgaaaatatatttatggacagaaaagatatatttgtatcgtatgatg 5535880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 636 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 6719445 - 6719392
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagag 689  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||||    
T  6719445 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagag 6719392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 761 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 7606873 - 7606828
Alignment:
Q  761 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 806  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606873 aacagtaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 7606828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 910 - 970
Target Start/End: Complemental strand, 48438282 - 48438221
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 970  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||    
T  48438282 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaa 48438221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 16264418 - 16264354
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  16264418 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 16264354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 336 - 372
Target Start/End: Original strand, 18744622 - 18744658
Alignment:
Q  336 tgaattctaggatgagggttcaatcaagtccctcacc 372  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18744622 tgaattctaggatgagggtttaatcaagtccctcacc 18744658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 21711291 - 21711227
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21711291 atagtggatttgagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21711227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 911 - 967
Target Start/End: Original strand, 25929463 - 25929519
Alignment:
Q  911 tagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 967  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||    
T  25929463 tagtggattggagggctgctctccccccagagtaggtcgtattggaccgaactgggt 25929519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 384 - 424
Target Start/End: Original strand, 27000083 - 27000123
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattg 424  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27000083 tgttgtagtatgactgaaaatttgatggatggagaatattg 27000123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 933 - 984
Target Start/End: Original strand, 29845141 - 29845193
Alignment:
Q  933 ctccccagac-taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttgtgt 984  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  29845141 ctccccagacgtaggtcaatttgggccgaactgggtgaacaaagtctttgtgt 29845193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 886 - 949
Target Start/End: Complemental strand, 31021248 - 31021185
Alignment:
Q  886 tctctttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtca 949  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31021248 tctctttgtaaagttactcatcattatattgaa-cggagggctgctctcaccccagactaggtca 31021185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 32143389 - 32143325
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  32143389 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 32143325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 33386685 - 33386749
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  33386685 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 33386749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 467 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 54287559 - 54287487
Alignment:
Q  467 tgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttga 539  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| | |  |||| || ||||||||||||||    
T  54287559 tgaaaatatatttatggataataaatacatttttgtactgtatgaaggaatatttgatgcaaatatattttga 54287487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 934 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 5236496 - 5236457
Alignment:
Q  934 tccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5236496 tccccagattaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaa 5236457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 911 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 37466358 - 37466295
Alignment:
Q  911 tagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  37466358 tagtggattggagggctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgtgtcaacaa 37466295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 372
Target Start/End: Original strand, 53344016 - 53344055
Alignment:
Q  333 aggtgaattctaggatgagggttcaatcaagtccctcacc 372  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53344016 aggtggattctaggatgagggatcaatcaagtccctcacc 53344055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 464 - 534
Target Start/End: Original strand, 11072731 - 11072801
Alignment:
Q  464 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatat 534  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | | | ||||| || |||||||||    
T  11072731 tgctgaaaatacatttatggacaacaaatagatttttgtaccgtattacggaagatttgatgcaaatatat 11072801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 935 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 32744474 - 32744436
Alignment:
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32744474 ccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 32744436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 935 - 973
Target Start/End: Original strand, 40913423 - 40913461
Alignment:
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40913423 ccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40913461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 935 - 973
Target Start/End: Original strand, 44331675 - 44331713
Alignment:
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44331675 ccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 44331713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 612 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 1620751 - 1620710
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatata 653  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1620751 atttgttccaattttatgagggatacttttactataaatata 1620710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 635 - 705
Target Start/End: Original strand, 6484307 - 6484373
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaaggg 705  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||  ||||| |||    ||||||||||||||||||||||||    
T  6484307 tacttttgctataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttg----agatagagggggctgaaacaaggg 6484373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 464 - 513
Target Start/End: Original strand, 12019220 - 12019269
Alignment:
Q  464 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatg 513  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  12019220 tgctaaaattatatttatggacatcaaatatattttagtatcgtatgatg 12019269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 794 - 855
Target Start/End: Original strand, 16996875 - 16996936
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg 855  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||   |||  ||||||||||||||||    
T  16996875 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacggaaagaaattgggatttgggtagaattagg 16996936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 935 - 984
Target Start/End: Original strand, 30236255 - 30236304
Alignment:
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttgtgt 984  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  30236255 ccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaatttcttggtgt 30236304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 468; Significance: 0; HSPs: 134)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 468; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 381 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 23452832 - 23452230
Alignment:
Q  381 acctgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatattta 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23452832 acctgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttatgctgaaaataaattta 23452733  T
Q  481 tggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactga 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452732 tggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactga 23452633  T
Q  581 gggagnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 680  Q
     ||||           || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452632 aggagaaaaaaaaaagtaccttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 23452533  T
Q  681 tagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 780  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23452532 gagacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 23452433  T
Q  781 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 879  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23452432 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaaccca 23452333  T
Q  880 ttgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452332 ttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 23452233  T
Q  978 ttt 980  Q
    |||    
T  23452232 ttt 23452230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Original strand, 42452449 - 42453042
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452449 tgttgtagtatgacttaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 42452548  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42452549 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 42452648  T
Q  584 agnnnnnnnnnca-tatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagata 682  Q
    ||            ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||   |||||| |    |    
T  42452649 agaaaaaaaaaatgtatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttattataaatatagacattgtatcagagcaaacttgg----a 42452744  T
Q  683 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttga 782  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||    
T  42452745 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtataaagtttgtctct--gtaacaaacactagagtttgtgggttga 42452842  T
Q  783 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 881  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452843 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 42452942  T
Q  882 gatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452943 gatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 42453042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 35216184 - 35215574
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35216184 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 35216085  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  35216084 acaataaatatatttttgtatcgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcagatattctttcactgaagg 35215985  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    ||            |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35215984 agaaaaaaaaatgaatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagag 35215885  T
Q  684 a------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgg 777  Q
    |      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  35215884 agagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgg 35215785  T
Q  778 gttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 875  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35215784 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaa 35215685  T
Q  876 cccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 974  Q
    | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35215684 ctcattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 35215585  T
Q  975 t-tctttgtgt 984  Q
    | |||||||||    
T  35215584 tatctttgtgt 35215574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 35218565 - 35217951
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35218565 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 35218466  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35218465 acaataaatatatttttgtatcgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 35218366  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    ||         |  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  35218365 agaaaaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgctccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtataaggctaaactttgagagag 35218266  T
Q  684 a----------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 773  Q
    |          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  35218265 agagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttt 35218166  T
Q  774 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 871  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35218165 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattctt 35218066  T
Q  872 gtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 970  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  35218065 gtaacccgttgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaa 35217966  T
Q  971 caaat-tctttgtgt 984  Q
    ||||| |||||||||    
T  35217965 caaatatctttgtgt 35217951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 42924094 - 42923502
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42924094 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 42923995  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42923994 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaagaaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 42923895  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    ||           |||||||||    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||| ||||||  |    
T  42923894 agaacaaataag-tatcttcag----gtgttcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcatagtaaaccttgaga--g 42923802  T
Q  684 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 783  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42923801 atagaggaggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgat 42923702  T
Q  784 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 882  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42923701 tcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattg 42923602  T
Q  883 atttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    || |||| ||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42923601 atatctcttttgtaaagttactcgtcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 42923502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Original strand, 27104718 - 27105059
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27104718 acttttactataaatatagaccttgtatcagagaaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggttt 27104813  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104814 gtatagagtttgtctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 27104912  T
Q  836 gg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104913 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacattactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 27105012  T
Q  935 -ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27105013 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 27105059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Original strand, 42064411 - 42064777
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42064411 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttgg----agatagagggagctgaaacaagggtttaga 42064505  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064506 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 42064605  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 910  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  42064606 gtctcttggttacgggaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcata 42064705  T
Q  911 tagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtc-aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064706 tagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 42064777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 13910380 - 13910038
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910380 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttgg----agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 13910285  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13910284 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagagact 13910185  T
Q  836 gg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13910184 ggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcagatggctgctctct 13910085  T
Q  935 -ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910084 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 13910038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 638 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 19502345 - 19502004
Alignment:
Q  638 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 737  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19502345 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttgg----agataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 19502250  T
Q  738 atggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg- 836  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19502249 gtagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 19502150  T
Q  837 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct- 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  19502149 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcgaagggctgctctctc 19502050  T
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19502049 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 19502004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 19504681 - 19504339
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504681 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttgg----agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 19504586  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19504585 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-ggaagaggct 19504487  T
Q  836 -ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19504486 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctatc 19504387  T
Q  934 t-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504386 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 19504339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 634 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 21521033 - 21520686
Alignment:
Q  634 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 733  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21521033 atacttttactataaatataaaccttgtatcagactaaactttgaga--gatagatggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggc 21520936  T
Q  734 ttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 833  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21520935 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagg 21520836  T
Q  834 ct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 931  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  21520835 ctaggactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctc 21520736  T
Q  932 tct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21520735 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactttgtcaacaaattcttt 21520686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 635 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 45280322 - 45279977
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag-gcaacaacaaaactagggt 733  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  45280322 tactttcactataaatatataccttgtatcagagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaaagcaacaacaaaactagggt 45280227  T
Q  734 ttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 833  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45280226 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 45280127  T
Q  834 ct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 931  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45280126 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 45280027  T
Q  932 tct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45280026 tctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttt 45279977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 237; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 24162548 - 24162216
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24162548 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 24162453  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |             
T  24162452 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttgctg--------- 24162362  T
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct- 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||     
T  24162361 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaatgctactcatcatatagtggattggatggctgctctctc 24162262  T
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24162261 ccccggactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttt 24162216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 237; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 634 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 40032396 - 40032046
Alignment:
Q  634 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40032396 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 40032301  T
Q  734 ttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 833  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40032300 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagg 40032201  T
Q  834 ct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga----tttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggc 926  Q
     | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||| |||| || ||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  40032200 ttaggactttgggtagaattaggcgtgagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgcaaagttactcatcattatagtgaaacggagggc 40032101  T
Q  927 tgctctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40032100 cgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 40032046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 634 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 6259153 - 6258810
Alignment:
Q  634 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    || || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6259153 atacttttactataaatatagaccttgtattagactaaactttgagataga----ggaggatgaaacaagagtttagaaaggcaacaataaaactagggt 6259058  T
Q  734 ttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 833  Q
    |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  6259057 ttgtatagagtttgtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga-t 6258959  T
Q  834 ctggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 931  Q
      || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| | ||||||| | |||||||||||||    
T  6258958 tggggctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtgaaacggagggctgctc 6258859  T
Q  932 tctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6258858 tctccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 6258810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 611 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 22287696 - 22287329
Alignment:
Q  611 tatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttag 710  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||    
T  22287696 tatttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtattaaagtaaactttgagatata----gggggctgaaacaagggtttag 22287602  T
Q  711 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 810  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22287601 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacggtattaggattg 22287502  T
Q  811 agtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 908  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  22287501 agtctcttagttacgggaagagattgacacttcgggtagaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaacgttactcatca 22287402  T
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22287401 tatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 22287329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 637 - 980
Target Start/End: Original strand, 19007560 - 19007902
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||   ||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  19007560 cttttactataaatataggctttgtatcatagtaaaccttg----agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattatggtttg 19007655  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct- 835  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  |     
T  19007656 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtttcttggttatgggaagagattg 19007755  T
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  19007756 gggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctct 19007855  T
Q  935 -ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19007856 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttt 19007902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 43623927 - 43623573
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||    ||||| |||||||| ||||||||    
T  43623927 atttgttccaaattt-taagcaatacttttactataaaaatagaccttgtatcagagtaaactgggagataga----ggggggtgaaacaatggtttaga 43623833  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||            |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43623832 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc------------actaggttttgagggttgattcaccttgggaaacaatattaggattga 43623745  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 909  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  43623744 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 43623645  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43623644 atagtggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttt 43623573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 6264504 - 6264141
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||    
T  6264504 atttgttccaaattt-taagcgatatttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagataga----gggggctgaaacaaaggtttaga 6264410  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    ||||||||||||||    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6264409 aaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaa 6264314  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca- 908  Q
    ||||||||||||||  || ||  | || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||     
T  6264313 gtctcttggttacgataaaagattggggctttggatagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 6264214  T
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6264213 tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 6264141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 637 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 11739895 - 11739552
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11739895 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagataga----gggggctggaacaagggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttg 11739800  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct- 835  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||  |     
T  11739799 tatggagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttataggaagagattg 11739700  T
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||| || ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  11739699 ggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttggaatccattgatatctcttttgaaaggttactcatcattatagtggaacggatgactgctctc 11739600  T
Q  934 t-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11739599 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 11739552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 613 - 980
Target Start/End: Original strand, 28196534 - 28196897
Alignment:
Q  613 tttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 712  Q
    |||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| |||||||    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  28196534 tttgttccaa-tttatgagggattcttttactataaatatatgctttgtatcagagtaaacattgagat----agagggggctgaaacaaaggtttagaa 28196628  T
Q  713 aggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28196629 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 28196728  T
Q  813 tctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcata 910  Q
    ||||||||||| ||||||||  || | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  28196729 tctcttggttatgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcata 28196828  T
Q  911 tagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  28196829 tagtgaaacgaatggctgctctctcccccagactaggtcaatt--gaccgaactgggtcaacaaattcttt 28196897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 182; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 613 - 980
Target Start/End: Original strand, 17848342 - 17848702
Alignment:
Q  613 tttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 712  Q
    |||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||| | |||||||||  ||| | |||    |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  17848342 tttgttccaa-tttatgagggattcttttactataaatataggctttgtatcag--taatccttg----agatagagggggctcaaacgagggtttagaa 17848434  T
Q  713 aggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17848435 agacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattga 17848534  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 909  Q
    |||||||||||||||||||||  || | |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17848535 gtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtaga---aggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 17848630  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||| | |||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17848631 atagtgaaacggatgactgctctctcccccatactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttt 17848702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 182; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 622 - 980
Target Start/End: Original strand, 17849022 - 17849379
Alignment:
Q  622 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaa 721  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||  ||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  17849022 aatttatgagggatgcttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagat----agagggggctgaaacaagggtttagaaagataacaa 17849117  T
Q  722 caaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 821  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17849118 caaaactagagttcgtatagagtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggt 17849217  T
Q  822 tacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggat 918  Q
    ||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |     
T  17849218 tacggtaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaa 17849317  T
Q  919 cggagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  17849318 cgg-gggctgctctctcccacatactaggtcaatttggacaagactgggtcaacaaattcttt 17849379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 645 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 34979906 - 34979570
Alignment:
Q  645 ataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagt 744  Q
    |||||||||||| |||||| ||  ||||| |||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||    
T  34979906 ataaatatagacattgtattagtgtaaaccttg----agatagagggggctgaaacaagcgtttagaaaggtaacaaaaaaactagggtttgtataaagt 34979811  T
Q  745 ttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttg 843  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||     
T  34979810 ttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattcggactttc 34979711  T
Q  844 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctct--ctcccca 939  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||| || |||||| ||||  | |||||    
T  34979710 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccatttatatctcttttgtaaggttcctcatcattatagtggaacgaagggctactctcccccccca 34979611  T
Q  940 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34979610 aactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttt 34979570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 172; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 622 - 977
Target Start/End: Complemental strand, 31733115 - 31732772
Alignment:
Q  622 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaa 721  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31733115 aatttatgagggatgcttttactataaatatagactttgtaacagagtaaacattgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaa 31733020  T
Q  722 caaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 821  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31733019 caaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgttgggaaacactgttaggattgagtctcttggt 31732920  T
Q  822 tacgggaagaggctggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatc 919  Q
    |             |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| | |    
T  31732919 t-----------tgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattgtgaaac 31732831  T
Q  920 ggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  31732830 ggaggactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtaaacaaattc 31732772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 640 - 980
Target Start/End: Original strand, 3022086 - 3022434
Alignment:
Q  640 ttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 739  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| |    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3022086 ttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatata----ggaggctgaaacaagggtttataaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 3022181  T
Q  740 ggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-ga 838  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |     
T  3022182 agagtttgtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgagg 3022281  T
Q  839 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca----------tatagtggatcggagggctg 928  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||          |||| || | | || |||||    
T  3022282 ttttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctttataaagttactcatcattatcatcgttataatgaaacagatggctg 3022381  T
Q  929 ctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3022382 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 3022434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 622 - 950
Target Start/End: Complemental strand, 45239331 - 45239000
Alignment:
Q  622 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggc-taaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaca 720  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |  |||||   ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |    
T  45239331 aatttatgagggatgcttttactataaatatagaccattcatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaatgatttagaaagacaaaa 45239232  T
Q  721 acaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 820  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45239231 acaaaactagggtttgtatagactttctct-ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 45239133  T
Q  821 ttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggat 918  Q
    ||||||||||||  | ||  ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |     
T  45239132 ttacgggaagagattggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaa 45239033  T
Q  919 cggagggctgctctct-ccccagactaggtcaa 950  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45239032 cggagggctgctctctcccccagactaggtcaa 45239000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 637 - 980
Target Start/End: Original strand, 14837193 - 14837530
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||    ||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  14837193 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataga----gggagctgaaacaagggttaaaaaagacaacaacaaaactagggtttg 14837288  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 836  Q
    ||   |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||  ||    
T  14837289 tacatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------gggaagagattg 14837382  T
Q  837 -gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
     ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| || |||||||    
T  14837383 agactttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggatggatgctctc 14837482  T
Q  934 t-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14837483 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttt 14837530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 771 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 5375550 - 5375339
Alignment:
Q  771 tttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 869  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5375550 tttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc-ggagacttattc 5375452  T
Q  870 ttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 967  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5375451 ttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 5375352  T
Q  968 caacaaattcttt 980  Q
    |||||||||||||    
T  5375351 caacaaattcttt 5375339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 638 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 15539809 - 15539566
Alignment:
Q  638 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 737  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| |    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  15539809 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatata----gggggttgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgt 15539714  T
Q  738 atggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg- 836  Q
    || ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||     
T  15539713 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttacgggaagagattga 15539614  T
Q  837 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 884  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539613 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 15539566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 684 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 44289360 - 44289060
Alignment:
Q  684 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 783  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  44289360 atagaggggactaaaacaaaggtttaggaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtctgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgat 44289261  T
Q  784 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 882  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||| | || | ||||||||||||||||| |||    
T  44289260 tcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgggacttagggtagaattaagtggaaaacttattcttgtaacccgttg 44289161  T
Q  883 atttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    || |||| |||||||  |||||||||| ||||||| | | || || |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44289160 atatctcttttgtaagattactcatcattatagtgaaacagatggttgctctttcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 44289061  T
Q  980 t 980  Q
    |    
T  44289060 t 44289060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 637 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 11578439 - 11578104
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  11578439 cttttactataaatatagaccttatatcagggtaaatcttg----agatagagtgggctgaaacaagggtttag-aagtcaacaaaaaaactagggtttg 11578345  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct- 835  Q
    ||| || ||| |||||| | |||||  |||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |     
T  11578344 tatagaatttttctcttggcaacaa--actagggtt--ggggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattg 11578249  T
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||     
T  11578248 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtcgaacggagggctgctctt 11578149  T
Q  934 t-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    | ||||||||||| |||  ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  11578148 tcccccagactagatcagttttagaccgaactaggtaaacaaatt 11578104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 793 - 977
Target Start/End: Complemental strand, 36559047 - 36558860
Alignment:
Q  793 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 890  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36559047 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 36558948  T
Q  891 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  36558947 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 36558860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 793 - 977
Target Start/End: Complemental strand, 36561324 - 36561137
Alignment:
Q  793 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 890  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36561324 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 36561225  T
Q  891 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  36561224 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 36561137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 634 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 18800640 - 18800306
Alignment:
Q  634 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |    |||||||||||||||||||||||||          || |||||||    
T  18800640 atacttttactataaatatagaccttgtatcagggtaaacatggagatata----gggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aagctagggt 18800553  T
Q  734 ttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 833  Q
    |||||| ||| ||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||     
T  18800552 ttgtatagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagaga 18800457  T
Q  834 ct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgct 930  Q
     | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| | ||||||||| ||    
T  18800456 ttggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcattatagtgaaacggagggctact 18800357  T
Q  931 ctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18800356 ctctccccagaccaggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaattcttt 18800306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 793 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 45332364 - 45332169
Alignment:
Q  793 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 890  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45332364 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctct 45332265  T
Q  891 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat-tctttgtgt 984  Q
    |||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45332264 ttgtaaaggtactcatcatatagtgaattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgt 45332169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 634 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 17897580 - 17897242
Alignment:
Q  634 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggc-taaactttgagatagatagagggggctga-aacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||  ||||| |||| ||      |||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  17897580 atacttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaacttgaggtagagagt-----ctgagaacaagggtttagaa-gtcaacaataaaactagg 17897487  T
Q  732 gtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 831  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |    
T  17897486 gtttgtatagagtttg-ctcttcgcaacaaacactagg--ttgaga-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaaaa 17897391  T
Q  832 ggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct-ctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctg 928  Q
    |  || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| ||||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  17897390 gattgagattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatggctg 17897291  T
Q  929 ctctctccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||    
T  17897290 ctctctccccagactaggtcagtattggtccgaactgggtaaacaaatt 17897242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 624 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 20146955 - 20146604
Alignment:
Q  624 tttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaca 723  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| || |||  | ||||| |     |||||||||||||||| | |||||| |    
T  20146955 tttatgagggatatttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttaaga--ggtagagagtttgaaaacaagggtttagaa-gtcaacaaga 20146859  T
Q  724 aaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 823  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||| | ||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  20146858 aaactagggtttgtatagagtttgcc-cttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacaatagtaggattgagtctcttggtca 20146762  T
Q  824 cgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcg 920  Q
    |||||| ||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  20146761 cgggaaaagattgagattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacg 20146662  T
Q  921 gagggctgctctctccc-cagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||| ||| ||||    
T  20146661 gagggctgctctctccctcagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatt 20146604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 682 - 994
Target Start/End: Original strand, 22874103 - 22874407
Alignment:
Q  682 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 781  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   ||||||    
T  22874103 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gggttg 22874190  T
Q  782 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 880  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||  || | |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22874191 attcaccttggaaaacagtattaggattgagtctcttagtcacgggaagagattgaggctttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaacccat 22874290  T
Q  881 tgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22874291 tgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaactgagagctgctctctccctcatactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattc 22874390  T
Q  978 t-ttgtgtctctctcttt 994  Q
    | |||||| |||||||||    
T  22874391 tcttgtgt-tctctcttt 22874407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 637 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 22163282 - 22163106
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22163282 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgagataga----gggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaacactagggtttg 22163187  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 818  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22163186 tatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagg-ttgagtctctt 22163106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 731 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 28459435 - 28459183
Alignment:
Q  731 ggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 830  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28459435 ggtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 28459336  T
Q  831 aggctgga-ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggct 927  Q
    ||  |||  |||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  28459335 agtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttttaaagttactcatcattatagtgaaacggagggct 28459236  T
Q  928 gctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
     |||||| || |||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||    
T  28459235 tctctctacctagactaggtcaatttggatcgaactagataaacaaattcttt 28459183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 682 - 877
Target Start/End: Original strand, 38020163 - 38020349
Alignment:
Q  682 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 781  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  38020163 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttg 38020262  T
Q  782 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 877  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||         || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38020263 attcaccatggtaaacactattaggattgagtctcttggtattgg---------gggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 38020349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 634 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 22407747 - 22407591
Alignment:
Q  634 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22407747 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgtgagatata----gggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 22407652  T
Q  734 ttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggga 794  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22407651 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 22407591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 384 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 27583907 - 27583713
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27583907 tgttgtagtatgactcaaattttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaagatatatttatga 27583808  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| | |  |||| || |||||||||||||||| ||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27583807 acaataaatatatttttataccatatgaaggaatatttgatgcaaatatattttgaaaaggaata-------tttgatgcaaatattctttcactgaagg 27583715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 394 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 28568740 - 28568584
Alignment:
Q  394 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaata 493  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  28568740 tgactcaaaatttgatagatgaagaatattgttgctaaaactataaaagatttgtttcaaatatattttgttttgaaaatatatttatggacaataaata 28568641  T
Q  494 tatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatatt 550  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  28568640 tatttttgtatcgtgtgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 28568584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 836 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 22407593 - 22407447
Alignment:
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22407593 ggacttttggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 22407494  T
Q  935 -ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22407493 cccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttt 22407447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 635 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 5377770 - 5377631
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 734  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5377770 tactttcactataaatatagaccttgtttcagagcaaactttgagagagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtt 5377671  T
Q  735 tgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttg 774  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5377670 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttg 5377631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 846 - 970
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7462950
Alignment:
Q  846 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagact 943  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccattatatagtggatcggagggctgctctctcccccagact 7462978  T
Q  944 aggtcaa-tttggaccgaactgggtcaa 970  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7462977 aggtcaattttggaccgaactgggtcaa 7462950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 384 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 27136505 - 27136370
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaat--------at 475  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        ||    
T  27136505 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattggtgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatataaatat 27136406  T
Q  476 atttatggacaataaatatatttttgtatcgtatga 511  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  27136405 atttatggaaaataaatatatttttgtaccgtatga 27136370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 777 - 976
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699634
Alignment:
Q  777 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 874  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 40699528  T
Q  875 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 970  Q
    | || ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||| | ||||||||||||||| | || ||||||||| ||| ||    
T  40699529 atcctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggtcagtattagaccgaactaggtaaa 40699628  T
Q  971 caaatt 976  Q
    ||||||    
T  40699629 caaatt 40699634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 612 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 37963287 - 37962938
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  37963287 atttgttccaattttatgatggatacttttactataaatatagactttgtataagagtaaaccttgagataga----gggggctgaaacaagggtttaga 37963192  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    ||          |||||||||||||| |  |||||| |||||   ||||||||| | ||||   | |||||||| |||| | ||||| ||||  ||||||    
T  37963191 aatc--------aaactagggtttgtgtatagtttg-ctcttgacaacaaacaccatggtt---gtgttgattccccttagaaaacattattgagattga 37963104  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca-t 909  Q
    |||||||||| ||  ||||||  || | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||| |||| |||||| |    
T  37963103 gtctcttggtcacctgaagagattgaggctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaatccattgatt--tttttgtaaagttattcatcatt 37963006  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    |||||| | | | || ||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37963005 atagtgaaacagtggactgatctctctcccacactaggttaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 37962938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 856 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 22707872 - 22707744
Alignment:
Q  856 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc---agactaggtcaat 951  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||   |||||||||||||    
T  22707872 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctctcctccagactaggtcaat 22707773  T
Q  952 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22707772 ttggactgaactaggtcaacaaattcttt 22707744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 391 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 34575696 - 34575608
Alignment:
Q  391 gtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatattt 479  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34575696 gtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgttctaaatatattttgtgctgaaaatatattt 34575608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 890 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 22163106 - 22163015
Alignment:
Q  890 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22163106 tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttt 22163015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 612 - 975
Target Start/End: Original strand, 35107196 - 35107553
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaac-aagggtttag 710  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||| |||| ||      || |||| ||| ||||||    
T  35107196 atttgttccaaattt-taagggatacttttactataaatatagacattgtatcatagtaaaccttgaggtagagagt-----ctaaaaccaagagtttag 35107289  T
Q  711 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 810  Q
    || | |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||    || ||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  35107290 aa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaaca----gggttg-ggattgattcaccttgagaaacattattaggattg 35107382  T
Q  811 agtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattag--gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcat 906  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||     | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||| |||||||||    
T  35107383 agtctcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattagattttgaagacttattcttgtaa-cctttgttatctcttttgtaatgttactcat 35107481  T
Q  907 ca-tatagtggatcggagggctgctctc-tccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    || ||||||||| |||| || || |||| | |||||||||||||| | |||||||||| | ||| |||||||    
T  35107482 cattatagtggaacggatggttgttctctttcccagactaggtcagtattggaccgaaataggtaaacaaat 35107553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 697 - 909
Target Start/End: Original strand, 43139356 - 43139564
Alignment:
Q  697 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 796  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||| |||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||    | |||||||| |||||||||    
T  43139356 aaacaagggtttagaa-gccaacacaaaaacttgggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcatcttgggaaa 43139449  T
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 894  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||   || |||||| |||||||||||| |   ||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  43139450 cattattaggattgagtctcttggtcacgggaagatattgagactttaggtagaattaggtctaaagactaattattgtaaccttttgatttctctttgt 43139549  T
Q  895 aacgttactcatcat 909  Q
    || ||||||||||||    
T  43139550 aaagttactcatcat 43139564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 855 - 980
Target Start/End: Original strand, 23870951 - 23871078
Alignment:
Q  855 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc-cagactaggtcaatt 952  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||    
T  23870951 gcggcagacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctctcccttagattaggtcaatt 23871050  T
Q  953 tggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  23871051 tggatcaaactaggtcaacaaattcttt 23871078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 797 - 979
Target Start/End: Original strand, 17943540 - 17943723
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||    
T  17943540 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctctttgta 17943636  T
Q  896 acgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    | |  |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||||||    
T  17943637 aagaaactcatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaattctt 17943723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 794 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 20054947 - 20054759
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||    
T  20054947 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt 20054851  T
Q  893 gtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctcc-ccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    |||| |  ||||  |||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  20054850 gtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctccaccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 20054759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 394 - 550
Target Start/End: Original strand, 15693583 - 15693755
Alignment:
Q  394 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct-----------------gaaaatata 476  Q
    ||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||                 |||||||||    
T  15693583 tgacttaaaatttgatggatgaataatattgttgctaaaaatataaa-gatttgtttcaaatatattttgtgcttccaaaaacttgttgctgaaaatata 15693681  T
Q  477 tttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatatt 550  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  15693682 tttatgggcaataaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaaggggatatt 15693755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 757 - 904
Target Start/End: Complemental strand, 27136343 - 27136195
Alignment:
Q  757 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattagg 855  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||   | |||||||| |||||||||||    
T  27136343 aacaaacactagggttgg--ggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaagaaattgggactttgagtagaattagg 27136246  T
Q  856 -cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactc 904  Q
       ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  27136245 tttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactc 27136195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 794 - 909
Target Start/End: Original strand, 20589763 - 20589881
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 890  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  20589763 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctctt 20589862  T
Q  891 ttgtaacgttactcatcat 909  Q
    |||| | ||||||||||||    
T  20589863 ttgtgaagttactcatcat 20589881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 794 - 975
Target Start/End: Original strand, 2736205 - 2736388
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 891  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  2736205 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 2736300  T
Q  892 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  2736301 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 2736388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 394 - 459
Target Start/End: Original strand, 28568346 - 28568411
Alignment:
Q  394 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatat 459  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28568346 tgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgttaaaaatataaaagatttgtttcaaatatat 28568411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 794 - 975
Target Start/End: Original strand, 17462436 - 17462619
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| | |   | |||||||    
T  17462436 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcct---tatctcttt 17462532  T
Q  893 gtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    |||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  17462533 gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 17462619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 779 - 949
Target Start/End: Original strand, 17921754 - 17921927
Alignment:
Q  779 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag--gctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 874  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||||||||||||||||     | ||| ||||||| |    
T  17921754 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggttttaaaactgattcttgca 17921853  T
Q  875 acccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtca 949  Q
    |||| |||| |||| ||  ||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17921854 accctttga-ttct-ttcataaagttagtcatcattatagtggaacggagggctgctctctacccagactaggtca 17921927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 794 - 975
Target Start/End: Original strand, 39686983 - 39687166
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||||    
T  39686983 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctcttt 39687079  T
Q  893 gtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    |||| |  ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  39687080 gtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 39687166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 797 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 27517818 - 27517633
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||    
T  27517818 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgta 27517722  T
Q  896 acgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    | |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||||||    
T  27517721 aagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaacttggtaaacaaattctt 27517633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 764 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414194
Alignment:
Q  764 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggaga 862  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  38414291 actagggtttgagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcac-ggaaaagattgggacttttggtagaattaggcgggaga 38414194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 394 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 41303623 - 41303549
Alignment:
Q  394 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaa-tataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 467  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41303623 tgactcagaatttgatggatgaagaagattgttgctaaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 41303549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 638 - 735
Target Start/End: Original strand, 38020064 - 38020157
Alignment:
Q  638 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| | |    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38020064 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacctgg----agatagagggggttggaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38020157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 797 - 949
Target Start/End: Complemental strand, 37170931 - 37170778
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||| ||||||| ||   || ||||||||||    
T  37170931 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgatttttgtaactca---atatctctttgta 37170835  T
Q  896 acgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtca 949  Q
    | |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37170834 aagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccccagactaggtca 37170778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 794 - 949
Target Start/End: Original strand, 2740941 - 2741097
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||||     ||||| ||||||| ||| |||   | |||||||    
T  2740941 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggacttgggtagaattaggtttaaagactgattcttgaaactcat---tatctcttt 2741037  T
Q  893 gtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca 949  Q
    |||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  2741038 gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 2741097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 794 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 20050204 - 20050015
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctt 891  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| || || |||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  20050204 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagaggctaggactt-ggatataattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 20050109  T
Q  892 tgtaacgttactcat--cat-atagtggatcggagggctgctctct--ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    ||||| |  ||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  20050108 tgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctccccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 20050015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 794 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 22712698 - 22712637
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg 855  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  22712698 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattagg 22712637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 794 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 22717407 - 22717346
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg 855  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  22717407 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattagg 22717346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 794 - 855
Target Start/End: Original strand, 45567409 - 45567470
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg 855  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  45567409 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattagg 45567470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 780 - 832
Target Start/End: Complemental strand, 27583535 - 27583483
Alignment:
Q  780 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 832  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27583535 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 27583483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 797 - 920
Target Start/End: Original strand, 17932637 - 17932759
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||    
T  17932637 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgta 17932733  T
Q  896 acgttactcatca-tatagtggatcg 920  Q
    | |  |||||||| ||||||||||||    
T  17932734 aagaaactcatcattatagtggatcg 17932759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 797 - 979
Target Start/End: Original strand, 30478997 - 30479182
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| ||   || ||||||||||    
T  30478997 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagactgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctctttgta 30479093  T
Q  896 acgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    | |  ||||  |||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  30479094 aagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 30479182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 797 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 12781400 - 12781342
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg 855  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  12781400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattagg 12781342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 465 - 550
Target Start/End: Original strand, 7502638 - 7502723
Alignment:
Q  465 gctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatatt 550  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||   | ||||| || |||||||||||| ||||| ||||||    
T  7502638 gctgaaaatatatttatgaacaataaaaatatttttgtattgtatgacagaagatttgatgcaaatatatttttaaaggaaatatt 7502723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 778 - 909
Target Start/End: Original strand, 15693958 - 15694094
Alignment:
Q  778 gttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct--ggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 873  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||  |  ||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||    
T  15693958 gttgattcaccgtggagaaacactattaggataaagtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 15694057  T
Q  874 aacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 909  Q
    ||||  ||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  15694058 aaccttttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 15694094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 794 - 975
Target Start/End: Original strand, 39680045 - 39680228
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 891  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||| | ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  39680045 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagattgattcttgaaactcat---tatctctt 39680140  T
Q  892 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  39680141 tgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 39680228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 14699036 - 14699100
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14699036 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 14699100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 21630011 - 21629948
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  21630011 atagtggattggagagctgctctctccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaa 21629948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 778 - 832
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345715
Alignment:
Q  778 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 832  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagag 26345715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 779 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 34575308 - 34575230
Alignment:
Q  779 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacggg-aagaggctggactttgggtagaattagg 855  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||  | ||||||||||||||||||||    
T  34575308 ttgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtctcgggaaagattcgggactttgggtagaattagg 34575230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 912 - 984
Target Start/End: Original strand, 1345572 - 1345645
Alignment:
Q  912 agtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttgtgt 984  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1345572 agtggatcggagaggtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatttcttggtgt 1345645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 612 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 20147108 - 20147055
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatca 665  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20147108 atttgttccaattttatgaggaatatttttactataaatatagaccttgtatca 20147055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 421 - 462
Target Start/End: Original strand, 39286911 - 39286952
Alignment:
Q  421 attgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 462  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39286911 attgttgctaaaaatataaatgatttgtttcaaatatatttt 39286952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 612 - 689
Target Start/End: Original strand, 40699205 - 40699282
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagag 689  Q
    ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||| ||| ||||    
T  40699205 atttgttccaattttctgagggatacttttactataaatatagaccttgcatcagagtaaaccttgagagagagagag 40699282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 8390179 - 8390243
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8390179 atagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaactgggtcaacaa 8390243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 13569396 - 13569332
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13569396 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13569332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 20522288 - 20522224
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20522288 atagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20522224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 464 - 535
Target Start/End: Original strand, 39286971 - 39287042
Alignment:
Q  464 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatg-atgaacgatttaatacaaatatatt 535  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  39286971 tgcttaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccatatgaatgaa-gatttgatgcaaatatatt 39287042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 794 - 837
Target Start/End: Original strand, 38190997 - 38191040
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 837  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38190997 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgg 38191040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 634 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 12342748 - 12342673
Alignment:
Q  634 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaac-aagggtttagaa 712  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||| |||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12342748 atacttttactataaatatacacattgtatcagagtaaaccttg----agatagagggggctgaaacaaagggtttagaa 12342673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 935 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 17057407 - 17057369
Alignment:
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17057407 ccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17057369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 935 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 17085390 - 17085352
Alignment:
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17085390 ccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17085352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 794 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 28459011 - 28458949
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattagg 855  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | ||||||||||||||||||||    
T  28459011 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattagg 28458949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 464 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 41303535 - 41303457
Alignment:
Q  464 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaag 542  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||| | | || || || |||||||||||| ||||    
T  41303535 tgctgaaaatatatttatggacagtaaatataattttgtaccgtgtgaaggaagaattgattcaaatatatttttaaag 41303457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 909 - 973
Target Start/End: Original strand, 34682362 - 34682427
Alignment:
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| ||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  34682362 tatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 34682427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 930 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 42288154 - 42288105
Alignment:
Q  930 tctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  42288154 tctctccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaataatttctt 42288105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 927 - 990
Target Start/End: Original strand, 2838076 - 2838140
Alignment:
Q  927 tgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttgtgtctctct 990  Q
    |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  2838076 tgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatttcttggtgtttctct 2838140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 8040128 - 8040064
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  8040128 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaa 8040064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 10445473 - 10445537
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  10445473 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 10445537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 332 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 20606971 - 20606931
Alignment:
Q  332 taggtgaattctaggatgagggttcaatcaagtccctcacc 372  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20606971 taggtgaattctagggtgagggttcaattaagtccctcacc 20606931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 28259206 - 28259270
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28259206 atagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 28259270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 909 - 975
Target Start/End: Original strand, 45679838 - 45679906
Alignment:
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  45679838 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 45679906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 448
Target Start/End: Original strand, 7502582 - 7502633
Alignment:
Q  397 ctcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgt 448  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7502582 ctcaaaatttgatggatgaagaagattgttgctcaaagtataaaagatttgt 7502633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 793 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 10942696 - 10942634
Alignment:
Q  793 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag--aggctggactttgggtagaatta 853  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |  | ||||||||||||||||||    
T  10942696 gaaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10942634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 793 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 10948565 - 10948503
Alignment:
Q  793 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag--aggctggactttgggtagaatta 853  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |  | ||||||||||||||||||    
T  10948565 gaaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10948503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 949 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 15539553 - 15539522
Alignment:
Q  949 aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539553 aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 15539522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 803 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 27248075 - 27248021
Alignment:
Q  803 taggattgagtctcttggttacgggaagag--gctggactttgggtagaattagg 855  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||||||    
T  27248075 taggattgagtctcttggtcacgggaagagatccaggactttgggtagaattagg 27248021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 860 - 938
Target Start/End: Original strand, 33604062 - 33604141
Alignment:
Q  860 agacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccc 938  Q
    ||||| |||||| |||||  ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  33604062 agactaattcttctaaccttttgatatatctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 33604141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 682 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 38414329 - 38414281
Alignment:
Q  682 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38414329 agatagagggggctgaaac------ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 38414281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 464 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 41304884 - 41304806
Alignment:
Q  464 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagg 543  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| | | ||||| || |||||||||||| |||||    
T  41304884 tgctgacaatatatttatggatagtaaatatatttttgta-catatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagg 41304806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 935 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 723782 - 723744
Alignment:
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  723782 ccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 723744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 779 - 832
Target Start/End: Original strand, 7502975 - 7503029
Alignment:
Q  779 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 832  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  7502975 ttgatccaccttggagaaacactattaggattgagtatcttggtcaagggaagag 7503029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 935 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 11151629 - 11151591
Alignment:
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11151629 ccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 11151591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 616 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 27583681 - 27583632
Alignment:
Q  616 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcag 666  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  27583681 gttccaaatttatgagttata-tttctctataaatatagatcttgtatcag 27583632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 935 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 34139808 - 34139770
Alignment:
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34139808 ccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 34139770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 935 - 973
Target Start/End: Original strand, 39284966 - 39285004
Alignment:
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39284966 ccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 39285004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 394 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 41304964 - 41304898
Alignment:
Q  394 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 467  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||     |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41304964 tgactcaaaatttgatggatgaagaagatt-----taaaaatataaaagatttg--tcaaatatattttgtgct 41304898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 637 - 666
Target Start/End: Original strand, 20589581 - 20589610
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcag 666  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20589581 cttttactataaatatagaccttgtatcag 20589610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 909 - 949
Target Start/End: Complemental strand, 33671033 - 33670992
Alignment:
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca 949  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  33671033 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 33670992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 797 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 33674584 - 33674551
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaag 830  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33674584 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 33674551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 636 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 36559111 - 36559082
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatca 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36559111 acttttactataaatatagaccttgtatca 36559082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 636 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 36561388 - 36561359
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatca 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36561388 acttttactataaatatagaccttgtatca 36561359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 697 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 41304667 - 41304627
Alignment:
Q  697 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 738  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  41304667 aaacaagggtttagaa-gccaacaacaaaactagggtttgta 41304627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 44297461 - 44297424
Alignment:
Q  335 gtgaattctaggatgagggttcaatcaagtccctcacc 372  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  44297461 gtgaattctagggtgagggttcaattaagtccctcacc 44297424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 612 - 665
Target Start/End: Original strand, 45156947 - 45156999
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatca 665  Q
    ||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45156947 atttgttccaaattt-tgagggatgcttttactataaatatagaccttatatca 45156999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 636 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 45332428 - 45332399
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatca 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45332428 acttttactataaatatagaccttgtatca 45332399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 455; Significance: 0; HSPs: 113)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 383 - 980
Target Start/End: Original strand, 30966922 - 30967522
Alignment:
Q  383 ctgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 482  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30966922 ctgttgtagtatgactccaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttatttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 30967021  T
Q  483 gacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgagg 582  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30967022 gacaataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttaatgcaaatatattttgaaagcgaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 30967121  T
Q  583 gagnnnnnnnnn-catatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagat 681  Q
    |||          |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  30967122 gagaaaaaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtat-aggctaaactttgagag 30967220  T
Q  682 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 781  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30967221 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttg 30967320  T
Q  782 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30967321 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccat 30967420  T
Q  881 tgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 978  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30967421 tgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 30967520  T
Q  979 tt 980  Q
    ||    
T  30967521 tt 30967522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 30035196 - 30034596
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  30035196 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctaaaaatatatttatag 30035097  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  30035096 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcagatattctttcactgaagg 30034997  T
Q  584 agnnnnnnnnn-catatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagata 682  Q
    ||          | |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  30034996 agaaaataaaaacgtatcttcaatgtgatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttaagaga 30034897  T
Q  683 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttga 782  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30034896 gatagagggagctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagagtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttga 30034797  T
Q  783 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 881  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30034796 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtcaattggttaagggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 30034697  T
Q  882 gatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30034696 gatttctcttttgtaacgttactcatcatatagcggatcggagggctgctctctcccccagactgggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 30034597  T
Q  980 t 980  Q
    |    
T  30034596 t 30034596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 383 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 2629480 - 2628879
Alignment:
Q  383 ctgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629480 ctgttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 2629381  T
Q  483 gacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgagg 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2629380 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 2629281  T
Q  583 gagnnnnnnnnn-catatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagat 681  Q
    |||          | |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||     
T  2629280 gaggaaaaaaaaacgtatcttcagtgtagtatttgttccaaatttattagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatgttaaactttgagag 2629181  T
Q  682 agatagag-ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 780  Q
    ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||    
T  2629180 agagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggtt 2629081  T
Q  781 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 879  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  2629080 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggagaatttattcttgtaaccca 2628981  T
Q  880 ttgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 978  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2628980 ttgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattct 2628881  T
Q  979 tt 980  Q
    ||    
T  2628880 tt 2628879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 12196104 - 12195515
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12196104 tgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatgg 12196005  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12196004 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 12195905  T
Q  584 agnnnnnnnnn-catatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagata 682  Q
    ||          |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    |    
T  12195904 agaaaaaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg----a 12195809  T
Q  683 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttga 782  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12195808 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttga 12195709  T
Q  783 ttcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 880  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  12195708 ttcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccat 12195609  T
Q  881 tgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12195608 tgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 12195515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 19705165 - 19704564
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19705165 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaagatattttgtgctgaaaatatatttatgg 19705066  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  19705065 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaagg 19704966  T
Q  584 agnnnnnnnnnca---tatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 680  Q
    ||          |   |||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  19704965 agaaaaaaaagaaacgtatcttaagtgtgatattcgttccaaatttatgagttata-tttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgaga 19704867  T
Q  681 tagata--gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtggg 778  Q
     ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  19704866 gagagatggagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtggg 19704767  T
Q  779 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19704766 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 19704667  T
Q  877 ccattgatt--tctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19704666 ccattgatttctctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 19704567  T
Q  974 att 976  Q
    |||    
T  19704566 att 19704564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 26933158 - 26932559
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  26933158 tgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatattattatgg 26933059  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26933058 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 26932959  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaacttt----gag 679  Q
    ||         |  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||    |||||||    |||    
T  26932958 agaaaaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgggttatactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagag 26932859  T
Q  680 atagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 779  Q
    | |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  26932858 agagatagagggggttgaaacaagggcttagaaaagcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggt 26932759  T
Q  780 tgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 877  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26932758 tgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 26932659  T
Q  878 cattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  26932658 cattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 26932559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 4816581 - 4816224
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagataga----------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa 725  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816581 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa 4816482  T
Q  726 actagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg 825  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816481 actagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacg 4816382  T
Q  826 ggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggag 923  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  4816381 ggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacggtactcatcatatagtggattggag 4816282  T
Q  924 ggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816281 ggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 4816224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 14507534 - 14507169
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||    
T  14507534 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagataga----gggggctaaaacaagggtttaga 14507440  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507439 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 14507340  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 910  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14507339 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatacttatcata 14507240  T
Q  911 tagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507239 tagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 14507169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 636 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 20915694 - 20915345
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20915694 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaa--ttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggattt 20915597  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||      
T  20915596 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgagaagagat 20915497  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20915496 tgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctc 20915397  T
Q  934 t-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttgtgt 984  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20915396 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctctgtgt 20915345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 11983365 - 11983022
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983365 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttgg----agatagagggggctgaaacaaaggcttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 11983270  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983269 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 11983170  T
Q  836 -ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983169 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 11983070  T
Q  934 t-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983069 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 11983022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 635 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 28241658 - 28241314
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 734  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241658 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactt----agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 28241563  T
Q  735 tgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241562 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 28241463  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 932  Q
    | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28241462 tgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctct 28241363  T
Q  933 ct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241362 ctcccccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 28241314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 644 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 14459093 - 14458760
Alignment:
Q  644 tataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggag 743  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14459093 tataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataga----gggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 14458998  T
Q  744 tttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggacttt 842  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14458997 tttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgatt--ccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggacttt 14458900  T
Q  843 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccag 940  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14458899 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccag 14458800  T
Q  941 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14458799 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 14458760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 635 - 976
Target Start/End: Original strand, 26064958 - 26065298
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaa-ctttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 733  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||   ||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  26064958 tactttcactataaatatagaccttgtatcacagtatttcttggagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagt 26065057  T
Q  734 ttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 833  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26065058 ttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 26065154  T
Q  834 ctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 932  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  26065155 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctctttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctct 26065254  T
Q  933 ctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26065255 ctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 26065298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 635 - 976
Target Start/End: Original strand, 26084927 - 26085267
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaa-ctttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 733  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||   ||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  26084927 tactttcactataaatatagaccttgtatcacagtatttcttggagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagt 26085026  T
Q  734 ttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 833  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26085027 ttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 26085123  T
Q  834 ctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 932  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  26085124 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctctttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctct 26085223  T
Q  933 ctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26085224 ctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 26085267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 635 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 1230586 - 1230242
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 734  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230586 tactttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaactttg----agatagagagggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 1230491  T
Q  735 tgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  1230490 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttattggaagaggc 1230391  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 932  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  1230390 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctct 1230291  T
Q  933 ct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230290 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 1230242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Original strand, 9019881 - 9020247
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9019881 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaact----gagagatagagggggctaaaacaagggtttaga 9019975  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9019976 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 9020075  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 909  Q
    ||||||||||||  |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  9020076 gtctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 9020175  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9020176 atagtgaaacggggggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 9020247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 15533040 - 15532675
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  15533040 atttgttccaaattt-taagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttaga 15532946  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15532945 aaggtaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 15532846  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 909  Q
    |||||||||| | ||||||||  | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  15532845 gtctcttggtcatgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 15532746  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15532745 atagtgaaacggagggctgctctatccctagactaggtcaattttgactgaactaggtcaacaaattcttt 15532675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 227; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 637 - 980
Target Start/End: Original strand, 13057173 - 13057516
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13057173 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagat----agagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaactagggtttg 13057268  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct- 835  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |     
T  13057269 tatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattg 13057368  T
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  13057369 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctactctc 13057468  T
Q  934 t-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13057469 tcccccaaactaggtcaatttggaccgaactcggtcaacaaattcttt 13057516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 15541499 - 15541133
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  15541499 atttgttccaaattt-taagttacacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttaga 15541405  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15541404 aaggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattga 15541305  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 909  Q
    |||||||||| ||| ||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||    
T  15541304 gtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtaggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcat 15541205  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcc-ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||| | | ||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15541204 atagtgaaacagaaagctgctctctcctccagactaggttaatttggactgaactgggtcaacaaattcttt 15541133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 622 - 980
Target Start/End: Original strand, 3390343 - 3390701
Alignment:
Q  622 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaa 721  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390343 aatttatgagagatacttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagac----ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaa 3390438  T
Q  722 caaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 821  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390439 caaaactagggtttgtatagagtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 3390538  T
Q  822 tacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggat 918  Q
    ||| | |||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||| |     
T  3390539 tacagaaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtgaaa 3390638  T
Q  919 cggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  3390639 cggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccaaattgggtcaacaaattcttt 3390701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 637 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 3630199 - 3629858
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   ||||  |||    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3630199 cttttactataaatatagacattgtatcaatgtaaaacttg----agatagagggggctgaaacatcggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 3630104  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct- 835  Q
    ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |     
T  3630103 tatagagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattg 3630004  T
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| || |||||||| | | ||||||||||||||    
T  3630003 gggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactaataatatagtgaaactgagggctgctctct 3629904  T
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3629903 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 3629858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 639 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 3632271 - 3631932
Alignment:
Q  639 tttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 738  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3632271 tttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataga----gggagttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 3632176  T
Q  739 tggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gg 837  Q
    | ||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  | ||    
T  3632175 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctttgttacggaaagagattggg 3632076  T
Q  838 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctc 935  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |     
T  3632075 actttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctgt- 3631977  T
Q  936 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3631976 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 3631932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 637 - 980
Target Start/End: Original strand, 13039733 - 13040076
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||||| |    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  13039733 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatata----ggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttg 13039828  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 836  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  13039829 tatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattg 13039928  T
Q  837 -gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
     ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  13039929 agactttgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctc 13040028  T
Q  934 tcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13040029 tcccctagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttt 13040076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 635 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 30729165 - 30728817
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 734  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||    
T  30729165 tacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagataga----gggggctgaaacaagggtatcgaaagacaacaacaaaacttgggtt 30729070  T
Q  735 tgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30729069 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttacgggaagaggc 30728970  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga----tttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctg 928  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||| |||||    
T  30728969 tggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctttctcttttgtaaagttactcatattatagtggaacggaaggctg 30728870  T
Q  929 ctctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30728869 ctctctcccgcagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttt 30728817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 637 - 980
Target Start/End: Original strand, 25477253 - 25477603
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25477253 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagat----agagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttta 25477348  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct- 835  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |     
T  25477349 tatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattg 25477448  T
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaa-------cgttactcatca-tatagtggatcggagggc 926  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||       |||||||||||| ||||||| | | ||||||    
T  25477449 gggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcgttactcatcattatagtgaaacagagggc 25477548  T
Q  927 tgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25477549 tgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaaatgggtcaacaaattcttt 25477603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 612 - 978
Target Start/End: Original strand, 32279952 - 32280316
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||   ||||||| ||||||||     |||||||||||||||||||| |    
T  32279952 atttgttccaaattt-taagcgatacttttcctatatatatagaccttgtatcatagtaaacttggagataga-----ggggctgaaacaagggtttaaa 32280045  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32280046 aaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 32280145  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc-a 908  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||      
T  32280146 gtctcttggttacgggaagagattgggacttcaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcgt 32280245  T
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 978  Q
    ||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32280246 tatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaaaaaattct 32280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 613 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 15530480 - 15530166
Alignment:
Q  613 tttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 712  Q
    |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |  ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15530480 tttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaact----gggagatagagggggctgaagcaagggcttagaa 15530386  T
Q  713 aggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 812  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15530385 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 15530286  T
Q  813 tctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcata 910  Q
    ||||||||||||||||||||  || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  15530285 tctcttggttacgggaagagattgaggctttgggttgaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 15530187  T
Q  911 tagtggatcggagggctgctc 931  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  15530186 tagtggaacggagggctgctc 15530166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 386 - 907
Target Start/End: Original strand, 17011781 - 17012287
Alignment:
Q  386 ttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 485  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||    
T  17011781 ttgtagtatgacttaaaatttgatggatgaagaatattattgctaaaaatataaaag-tttgttttaaatat--tttgtgtagaaaatatatttatggac 17011877  T
Q  486 aataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgagggag 585  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  17011878 aataaatatatttttgtaccgtatgatggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactga----- 17011972  T
Q  586 nnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagat 685  Q
             | |||||||||  || | || ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |  ||||| |||    ||||    
T  17011973 aaaaaaaaacgtatcttcagagtgatgttcgttccaaatttatgagttata-tttctctataaatatagaccttgtatcggagtaaaccttg----agat 17012067  T
Q  686 agagggggctgaa-acaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgatt 784  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| | ||||||||||||||||    ||||||||    
T  17012068 agaggggtctgaataaaagggtttag-aagtaaacaac-aaactagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--gaggttgatt 17012162  T
Q  785 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 883  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17012163 caccttctgaaacaatattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgatgcttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattga 17012262  T
Q  884 tttctc-tttgtaacgttactcatc 907  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||    
T  17012263 tatctcttttgtaaagttactcatc 17012287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 392 - 770
Target Start/End: Original strand, 17852275 - 17852650
Alignment:
Q  392 tatgactcaaaatttgttggatggagaatattgt--tgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaata 489  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17852275 tatgactcaaaatttgatg-atggagaatattgtgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatat--tttatgctgaaaatatatttatggacaata 17852371  T
Q  490 aatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgagggagnnnn 589  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||        
T  17852372 aatatatttttgtaccttatgaagaactatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattatttcactgaaagagaaga 17852471  T
Q  590 nnnnnca---tatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagata 686  Q
          |   ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| |||    |||||    
T  17852472 aaaaaaaaagtatcttc-gtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttg----agata 17852566  T
Q  687 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactaggg 770  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17852567 gagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactaggg 17852650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 384 - 661
Target Start/End: Original strand, 18317751 - 18318029
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18317751 tgttgtagtatgactcaaaatttgaaggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 18317850  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  18317851 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaagg 18317950  T
Q  584 ag-nnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgt 661  Q
    ||          | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18317951 agaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatactttcactataaatatagaccttgt 18318029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 637 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 3234065 - 3233718
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||     ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3234065 cttttactataaatataga-cttgtatcagtgtaaacctt----aagatagagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactaaggtttg 3233971  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    |||  |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  3233970 tatatagtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 3233871  T
Q  836 g-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||    
T  3233870 gaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcaccgtatagtgaaacggagggctgctctc 3233771  T
Q  934 t-ccccagactaggtcaatttggacc-----gaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||    
T  3233770 tcccccacactaggtcaattttgaccgaactgaactgggtcaacaaattcttt 3233718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 384 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 5275928 - 5275727
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5275928 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttatttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 5275829  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5275828 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 5275729  T
Q  584 ag 585  Q
    ||    
T  5275728 ag 5275727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 761 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273213
Alignment:
Q  761 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgg 858  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 5273332  T
Q  859 gagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggac 957  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5273331 gagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcttatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggac 5273232  T
Q  958 cgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5273231 cgaactgggtcaacaaatt 5273213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 636 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 19227744 - 19227514
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||| |    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227744 acttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaactttgagataaa----gggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 19227649  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    |||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227648 gtatagagtttgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 19227549  T
Q  836 g-gactttgggtagaattaggcgggagacttattc 869  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227548 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 19227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 637 - 975
Target Start/End: Complemental strand, 24338783 - 24338446
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24338783 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 24338688  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacacta-gggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
     ||  ||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||  |    
T  24338687 cataaagtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaaaacactattaagattgagtcttttggttatggaaagagatt 24338588  T
Q  836 -ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctct 932  Q
      |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  24338587 aagactttgggtagaattagtcagaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctct 24338488  T
Q  933 ctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24338487 c-ccccagactatgtcaatttggaccgaactaggtaaacaaat 24338446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 637 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 12161889 - 12161555
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||| |     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12161889 cttttactttaaatatagacattgtatcattgtaaaccttgagataaa-----ggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttg 12161795  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 836  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||  ||    
T  12161794 tatagagtttgtctct--ggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacgttgggaaacactattaagatcgagtctattggttacgggaagagattg 12161697  T
Q  837 -gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
     |||||| |||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||  |  ||| ||||| |||||    
T  12161696 agactttaggtataattaagtgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtaaaatggatggctgttctct 12161597  T
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12161596 ccctaaactaggttaatttggaccgaactgaatcaacaaatt 12161555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 384 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 22858536 - 22857949
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22858536 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttaataaaaatataaaagatttgttttaaatatactttgtgctgaaaatatatttatgg 22858437  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   | ||||  || |||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  22858436 acaataaatatatttttgtaccgtatgaaagaagattagatgcaaatatattttgaaagggaa--------ttttgatgcaaatattctttcattgaagg 22858345  T
Q  584 ag--nnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagat 681  Q
    ||           | ||||||||   || |||  ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||   ||  | |||||     
T  22858344 agaaaaaaagaaacgtatcttcaacgtgatatacgttccaaatttatgagttata-tttctctataaatataaaccttgtatcagatgaatttgtgagag 22858246  T
Q  682 agatagagggggc--tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 779  Q
    |||||||| |  |    |||||||||||||| |||  ||||  ||||||||||||||||  || ||| |||||| | ||||||||||||||||    | |    
T  22858245 agatagagagaaccagaaaacaagggtttag-aagctaacacaaaaactagggtttgta--gaattt-tctcttggtaacaaacactagggtt--gagat 22858152  T
Q  780 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc 877  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |||||| |||||| |||||   | ||||| ||||||||||||    
T  22858151 tgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagatttaggtttgaagactaattcttgtaacc 22858052  T
Q  878 c-attgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |  ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||    
T  22858051 cttttgatatatctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaaacaa 22857952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 793 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 26066307 - 26066112
Alignment:
Q  793 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 890  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066307 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26066208  T
Q  891 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttctttgtgt 984  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26066207 ttgtaacgttacttatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 26066112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 793 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 26068578 - 26068383
Alignment:
Q  793 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 890  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068578 gaaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26068479  T
Q  891 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttctttgtgt 984  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26068478 ttgtaacgttgctcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 26068383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 793 - 984
Target Start/End: Original strand, 33308988 - 33309182
Alignment:
Q  793 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 890  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33308988 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 33309086  T
Q  891 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttctttgtgt 984  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33309087 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 33309182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 634 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 3028188 - 3027848
Alignment:
Q  634 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||  ||||||| |     |||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  3028188 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccatgagataaaa----ggggctgaaaacaagggtttggaa-ggcaaca-caaaactaggg 3028095  T
Q  733 tttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 832  Q
    ||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  3028094 tttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgtgaagag 3027998  T
Q  833 gctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 929  Q
      || ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  3027997 attgagactttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgc 3027898  T
Q  930 tc--tctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||  || |||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  3027897 tctttccccccagactaggtcagtttttgaccgaactggataaacaaatt 3027848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 793 - 977
Target Start/End: Complemental strand, 29754892 - 29754705
Alignment:
Q  793 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 890  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29754892 gaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctct 29754793  T
Q  891 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  29754792 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 29754705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 793 - 984
Target Start/End: Original strand, 33311257 - 33311451
Alignment:
Q  793 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 890  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33311257 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 33311355  T
Q  891 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttctttgtgt 984  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33311356 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctttctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 33311451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 782 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069711
Alignment:
Q  782 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 880  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 1069814  T
Q  881 tgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc-tccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1069813 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagagaaacggagggctgctctcttccccatactaggtcaatttggaccgaactgaatcaacaaattc 1069714  T
Q  978 ttt 980  Q
    |||    
T  1069713 ttt 1069711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 682 - 909
Target Start/End: Original strand, 22490659 - 22490889
Alignment:
Q  682 agatagagggggctgaaacaagggttta-gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 780  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||       
T  22490659 agatagagggggctgaaacaagggtttttgaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgcctctttggaacaaacactagggtttgaggagg 22490758  T
Q  781 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 879  Q
     || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22490759 tatacaccttgcgaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattatgcgagagacttattcttgtaaccca 22490858  T
Q  880 ttgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 909  Q
    ||||| |||| |||||||  |||||||||||    
T  22490859 ttgatatctcttttgtaagattactcatcat 22490889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 682 - 976
Target Start/End: Original strand, 15719674 - 15719961
Alignment:
Q  682 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 781  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||| ||||||| || || | ||||||||||||||||   | ||||    
T  15719674 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gagttg 15719761  T
Q  782 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 880  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15719762 attcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 15719861  T
Q  881 tgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc--tctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||| | |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15719862 tgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagagttgctctttccccccatactaggtcaatttggaccgaacttggtaaacaaatt 15719961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 728 - 994
Target Start/End: Original strand, 15367101 - 15367366
Alignment:
Q  728 tagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 827  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||    
T  15367101 taggggttgtattgtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcggg 15367196  T
Q  828 aagaggctgga-ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggaggg 925  Q
    |||||  || | ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||||||||||| | |||| ||    
T  15367197 aagagattgaaactttgggtaaaattaatcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaagg 15367296  T
Q  926 ctgctct--ctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttgtgtctctctcttt 994  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  15367297 ctgctctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgt-tctctcttt 15367366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 634 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 16455762 - 16455421
Alignment:
Q  634 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 732  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||  | ||||| |  |||||| ||||||||||||| | |||||  ||||||||||    
T  16455762 atacctttactataaatatataccttgtatcggtgtaaaccttgaga--ggtagagagt-ctgaaaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactaggg 16455667  T
Q  733 tttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 832  Q
    ||||||  |||||| |||||| | ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||| |||||    
T  16455666 tttgtacagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt-gtgg-ttgattcaccttgggaaacactgttaggattaagtctcttgctcacggaaagag 16455570  T
Q  833 gctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 929  Q
      ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16455569 attgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgc 16455470  T
Q  930 tctct-ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||    
T  16455469 tctctcccccatactaggtcagtattggaccgaactgagtaaacaaatt 16455421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 637 - 994
Target Start/End: Original strand, 14466312 - 14466659
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||  ||||| |||||||||| ||    || ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||          
T  14466312 cttttactatagatatagactttgtattagaataaaccttgagatagagag----ggttgaaacaagagtttagaaagacaacagcaaaactag------ 14466401  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt-gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
         ||||||||| || | ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  14466402 -----agtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagatt 14466496  T
Q  836 -ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctct 932  Q
     ||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||| | |||| | ||||| |    
T  14466497 gggagtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaccggatgactgctgt 14466596  T
Q  933 ct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct-ttgtgtctctctcttt 994  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  14466597 ttcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcagcaaattctcttgtgt-tctctcttt 14466659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 778 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 12186271 - 12186068
Alignment:
Q  778 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 875  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  || ||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  12186271 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaa 12186172  T
Q  876 cccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 972  Q
    | ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  12186171 ctcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctgcctcggactaggtcaatttgaaccgaactgggtaaaca 12186072  T
Q  973 aatt 976  Q
    ||||    
T  12186071 aatt 12186068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 612 - 786
Target Start/End: Complemental strand, 1072236 - 1072067
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||  |||    ||||||||||||||||||    
T  1072236 atttgttccaaattt-taagcaatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaactttgagatagaaggag----ctgaaacaagggtttaga 1072142  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattca 786  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1072141 aaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgagttgattca 1072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 386 - 550
Target Start/End: Original strand, 20526548 - 20526708
Alignment:
Q  386 ttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 485  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  20526548 ttgtagtatgactcaaaatttgatgggtgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttatgctgaaaatatatttatg--- 20526644  T
Q  486 aataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatata-ttttgaaagggaatatt 550  Q
      || ||||||||||||| ||||||| | | ||||| || |||||||| ||||||||| |||||||    
T  20526645 --tacatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttgaaagagaatatt 20526708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 637 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 32447651 - 32447502
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||  ||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32447651 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 32447556  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactag-ggtttgtgggttgattcacct 789  Q
    ||| ||||||||||||| | |||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  32447555 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagagttttgagggttgattcacct 32447502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 612 - 761
Target Start/End: Original strand, 8995434 - 8995578
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8995434 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaact----gagagatagagggggctaaaacaagggtttaga 8995528  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaa 761  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  8995529 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 8995578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 836 - 976
Target Start/End: Original strand, 15346522 - 15346664
Alignment:
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||| | ||||  ||||||||||    
T  15346522 ggactttgagtaaaattaagcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaagctgctctct 15346621  T
Q  935 cccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15346622 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 15346664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 637 - 976
Target Start/End: Original strand, 19696420 - 19696759
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |   |||| |||||| |||  |||||  |||||| ||||||||||||||   |||||||||  ||||||||    
T  19696420 cttttactataaatatagaccttgtatatgatgaaaccttgagagagagggaggg--ctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaat-tagggttt 19696515  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    |||| ||||||| ||||| | ||||| ||||||||||      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | |||||  |    
T  19696516 gtatagagtttg-ctcttggcaacaatcactagggttcaaa--ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctctttgtcactgaaagagatt 19696612  T
Q  836 g-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 931  Q
    | |||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||||| | ||  |||||||    
T  19696613 gagactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaatcctttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatagctgctc 19696712  T
Q  932 tctc-cccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  19696713 tctctcccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 19696759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 777 - 976
Target Start/End: Original strand, 26945258 - 26945463
Alignment:
Q  777 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 874  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  26945258 ggttgagtcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgta 26945357  T
Q  875 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctct-ctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 970  Q
    || ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||| || || ||||| ||||| | ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||    
T  26945358 actcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacgaagggcagctctcccccccagattatgtcaggtttggaccgaactgggtaaa 26945457  T
Q  971 caaatt 976  Q
    ||||||    
T  26945458 caaatt 26945463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 644 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 13870749 - 13870608
Alignment:
Q  644 tataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggag 743  Q
    ||||||||||| | |||||||||   |||| ||||||||||     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  13870749 tataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagataga-----ggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatataaag 13870655  T
Q  744 tttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 790  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13870654 tttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcacctt 13870608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 856 - 994
Target Start/End: Complemental strand, 25465710 - 25465570
Alignment:
Q  856 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctc-cccagactaggtcaat-t 952  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||| |||| | |    
T  25465710 cgggagacttattcttgtacccctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctctcccatactatgtcagtat 25465611  T
Q  953 tggaccgaactgggtcaacaaattctttgtgtctctctcttt 994  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  25465610 tggaccgaactgggtaaacaaattttgtgtgt-tctctcttt 25465570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 779 - 935
Target Start/End: Original strand, 20526922 - 20527081
Alignment:
Q  779 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 876  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  |  |||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  20526922 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaagaagagattaagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 20527021  T
Q  877 ccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctc 935  Q
    |  ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20527022 cttttgatatctctttgtaaagttattcatcattatagtggaacggagagctgctctctc 20527081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 779 - 993
Target Start/End: Complemental strand, 25078755 - 25078538
Alignment:
Q  779 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacc 877  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||| |||| |||||  ||   |||  |||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  25078755 ttgattcaccttggtaaacaccgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgagatttaagtagaattaggtttgaagacttattcttgtaacc 25078656  T
Q  878 cattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaa 974  Q
    | ||||| |||| ||||||| ||||||| ||| || |||||| |||||| ||||| ||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  25078655 ctttgatatctcttttgtaaagttactcgtcattacagtggaacggaggactgctttcttcccagtctaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaa 25078556  T
Q  975 ttctttgtgtctctctctt 993  Q
    || | ||||| ||||||||    
T  25078555 ttttgtgtgt-tctctctt 25078538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 794 - 975
Target Start/End: Original strand, 13878727 - 13878910
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||||    
T  13878727 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctcttt 13878823  T
Q  893 gtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    |||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  13878824 gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 13878910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 794 - 975
Target Start/End: Original strand, 16785919 - 16786102
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||||    
T  16785919 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctcttt 16786015  T
Q  893 gtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    |||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  16786016 gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 16786102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 794 - 975
Target Start/End: Complemental strand, 26887406 - 26887225
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||||    
T  26887406 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctcttt 26887310  T
Q  893 gtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    |||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  26887309 gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctc-ccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 26887225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 892 - 976
Target Start/End: Original strand, 10584227 - 10584313
Alignment:
Q  892 tgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctcc-ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10584227 tgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaatt 10584313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 794 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 12937376 - 12937190
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgga-ctttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctt 891  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||| ||  || | |||| ||||||||||||   || | || ||||||||||||  || || ||||||    
T  12937376 aaacactattaagattgagtctcttagtcacgagaatagattgaaacttttggtagaattaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctctt 12937277  T
Q  892 tgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtc-aatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  12937276 tgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccccagactaggtctgttttggaacgaaccgggtaaacaaatt 12937190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 613 - 807
Target Start/End: Original strand, 15346347 - 15346524
Alignment:
Q  613 tttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 712  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||    ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  15346347 tttgttccaa-tttatgagggatacttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttg----agatagagggggctgaaccaagggtttaga- 15346440  T
Q  713 aggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga 807  Q
           |   ||||||||||||||||  | |||| ||||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15346441 -------attcaaactagggtttgtataaaatttg-ctcttggcaacaaacactagggt---tgggttgattcaccttgggaaacactcttagga 15346524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 797 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 17695030 - 17694846
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||    
T  17695030 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgta 17694934  T
Q  896 acgttact-catca-tatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    | |  |||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  17694933 aagaaactatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 17694846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 794 - 975
Target Start/End: Original strand, 13883475 - 13883658
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | |||||||    
T  13883475 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaattcat---tatctcttt 13883571  T
Q  893 gtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    |||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  13883572 gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 13883658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 794 - 975
Target Start/End: Complemental strand, 35201508 - 35201325
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||||    
T  35201508 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctcttt 35201412  T
Q  893 gtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    | || |  ||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||    
T  35201411 gaaaagaaactaattcattatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaat 35201325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 780 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037722
Alignment:
Q  780 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggaga-cttattcttgtaacc 877  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| || ||  || |||||||||||||||||||    | | |||||||||||||||    
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaacc 28037828  T
Q  878 cattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat-atagtgga---tcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 970  Q
    | ||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    || | ||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| |||||| ||    
T  28037827 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggacggacgaaaggctgctctctcccccagtctaggtcagttttggaccgagctgggtaaa 28037728  T
Q  971 caaatt 976  Q
    ||||||    
T  28037727 caaatt 28037722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 409 - 550
Target Start/End: Original strand, 30445246 - 30445404
Alignment:
Q  409 tggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttg-----------------tgctgaaaatatatttatggacaataaa 491  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||                 ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30445246 tggatgaagaatattgttgctagaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgcttccagaatattgttgctgaaaatatatttatgaacaataaa 30445345  T
Q  492 tatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatatt 550  Q
    |||||||||||| | ||||| | | ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||    
T  30445346 tatatttttgtaccatatgaaggaagatttgatgcaaatatattttaaaaaggaatatt 30445404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 797 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 22342980 - 22342795
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||    
T  22342980 cactattaggattgcgtctcttggtcacgggaagaggctgggatttgggtagtattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgta 22342884  T
Q  896 acgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    | |  ||||  |||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  22342883 aagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 22342795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 866 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 12911555 - 12911442
Alignment:
Q  866 attcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtc-aatttggaccgaac 962  Q
    ||||||||||||  || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||||    
T  12911555 attcttgtaaccatttaatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtctgttttggaacgaac 12911456  T
Q  963 tgggtcaacaaatt 976  Q
     |||| ||||||||    
T  12911455 cgggtaaacaaatt 12911442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 794 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 31248896 - 31248835
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg 855  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  31248896 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattagg 31248835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 394 - 467
Target Start/End: Original strand, 30443022 - 30443097
Alignment:
Q  394 tgactcaaaatttgt--tggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 467  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  30443022 tgactcaaaatttatgatggatgaagaatattgttgttaaaaatataagagatttgtttcaaatatattttttgct 30443097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 779 - 905
Target Start/End: Complemental strand, 7542581 - 7542452
Alignment:
Q  779 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct--ggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 875  Q
    ||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |  ||| ||||| ||||||||||   | ||||| ||| ||||||    
T  7542581 ttgattcacttggagaaacactattatgattgagtctcttggtcacgggaagagatttgggaatttggatagaattaggtttgaagactaatttttgtaa 7542482  T
Q  876 cccattgatttctctttgtaacgttactca 905  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7542481 ccctttgatatctctttgtaaagttactca 7542452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 797 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 13467642 - 13467461
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||      | |||||||    
T  13467642 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgtgactt--ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctttgt 13467550  T
Q  895 aacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||||||    
T  13467549 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccccagactaggtcatgattagaccgaactaggtaaacaaattctt 13467461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 797 - 855
Target Start/End: Original strand, 17036058 - 17036116
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg 855  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  17036058 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattagg 17036116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 797 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 22352031 - 22351973
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg 855  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  22352031 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagatttgggtagaattagg 22351973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 797 - 979
Target Start/End: Original strand, 26643179 - 26643362
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||   |||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||    
T  26643179 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggacttgggtagaattaggttggaagactaattcttgtaactca---atatctctttgta 26643275  T
Q  896 acgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    | |  ||||  |||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||| ||||||  |||  |||||||||||| |||||||||||    
T  26643276 aagaaactcatatcattatagttgaacggagagctgctctc-ccccagaccaggtcatctttacaccgaactgggtaaacaaattctt 26643362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 797 - 979
Target Start/End: Original strand, 26749145 - 26749328
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||   |||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||    
T  26749145 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggacttgggtagaattaggttggaagactaattcttgtaactca---atatctctttgta 26749241  T
Q  896 acgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    | |  ||||  |||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||| ||||||  |||  |||||||||||| |||||||||||    
T  26749242 aagaaactcatatcattatagttgaacggagagctgctctc-ccccagaccaggtcatctttacaccgaactgggtaaacaaattctt 26749328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 837 - 965
Target Start/End: Original strand, 30445699 - 30445832
Alignment:
Q  837 gactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||    
T  30445699 gactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctc 30445798  T
Q  934 tcc-ccagactaggtcaat-ttggaccgaactgg 965  Q
    ||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||    
T  30445799 tccaccatactaggtcagtattggactgaactgg 30445832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 909 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 3577555 - 3577484
Alignment:
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  3577555 tatagtggaacggagagctgctctctccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 3577484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 794 - 837
Target Start/End: Complemental strand, 3577696 - 3577653
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 837  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3577696 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgg 3577653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 637 - 753
Target Start/End: Original strand, 10584105 - 10584212
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||  ||||| ||||||||||       ||  ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  10584105 cttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagataga-------gg--gaaacaaaggtttataaaagcaacaacaaaactagagtttg 10584195  T
Q  737 tatggagtttgtctctt 753  Q
    ||| |||||||||||||    
T  10584196 tatagagtttgtctctt 10584212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 22963767 - 22963704
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  22963767 atagtggattggagggctgctctctccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaa 22963704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 23824626 - 23824689
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  23824626 atagtggattggagggctgctctctccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaa 23824689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 797 - 979
Target Start/End: Original strand, 33215830 - 33216015
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||   |||| ||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||    
T  33215830 cactattaggattgagtctcttggtcacggcaagaggctgggacttggatagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgta 33215926  T
Q  896 acgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    | |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||| | ||||| |||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  33215927 aagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctatcccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 33216015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 779 - 832
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138477
Alignment:
Q  779 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 832  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtcacttggtcacgggaagag 11138477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 801 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 12166321 - 12166267
Alignment:
Q  801 attaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg 855  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  12166321 attaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattagg 12166267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 611 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 28038066 - 28038012
Alignment:
Q  611 tatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatca 665  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28038066 tatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagacattgtatca 28038012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 797 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 19702041 - 19701985
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaatta 853  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19702041 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaatta 19701985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 5572270 - 5572334
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  5572270 atagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 5572334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 5757507 - 5757571
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5757507 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5757571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 10077194 - 10077258
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  10077194 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 10077258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 21356104 - 21356040
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcc-ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21356104 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21356040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 911 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 31936654 - 31936591
Alignment:
Q  911 tagtggatcggagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  31936654 tagtggattggagagctgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 31936591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 911 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 31979580 - 31979517
Alignment:
Q  911 tagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31979580 tagtggattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31979517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 613 - 666
Target Start/End: Original strand, 15366992 - 15367044
Alignment:
Q  613 tttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcag 666  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15366992 tttgttccaa-tttatgagggatacttttactataaatatagacattgtatcag 15367044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 911 - 967
Target Start/End: Original strand, 24436001 - 24436058
Alignment:
Q  911 tagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggt 967  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||    
T  24436001 tagtggatcggagggctgctctctcccctagagtaggtcatattggatcgaactgggt 24436058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 800 - 837
Target Start/End: Original strand, 25941650 - 25941687
Alignment:
Q  800 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 837  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25941650 tattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgg 25941687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 909 - 979
Target Start/End: Original strand, 25941785 - 25941857
Alignment:
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  25941785 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25941857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 860 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 28078310 - 28078191
Alignment:
Q  860 agacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc-cagactaggtcaa-tttgg 955  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||   | | |||||||||||| || |||||||||| ||| |    
T  28078310 agacttattcttgtaa-cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggattataagactgctctctccctcatactaggtcaattttag 28078212  T
Q  956 accgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||||||| |||| ||||||||    
T  28078211 accgaacagggtaaacaaatt 28078191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 613 - 667
Target Start/End: Original strand, 26945104 - 26945157
Alignment:
Q  613 tttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagg 667  Q
    |||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26945104 tttgttccaa-tttatgaggaatgcttttactataaatataaaccttgtatcagg 26945157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 935 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 33211223 - 33211185
Alignment:
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33211223 ccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 33211185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 802 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 5165989 - 5165936
Alignment:
Q  802 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg 855  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||   |||||||||||||||    
T  5165989 ttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggacttgggtagaattagg 5165936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 636 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 26066364 - 26066335
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatca 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066364 acttttactataaatatagaccttgtatca 26066335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 636 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 26068635 - 26068606
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatca 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068635 acttttactataaatatagaccttgtatca 26068606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 636 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 29755032 - 29755003
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatca 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29755032 acttttactataaatatagaccttgtatca 29755003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 909 - 976
Target Start/End: Original strand, 30443537 - 30443606
Alignment:
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||    
T  30443537 tatagtgtaacggagagctgctctctccccgagactaggtaagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 30443606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 636 - 665
Target Start/End: Original strand, 33308932 - 33308961
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatca 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33308932 acttttactataaatatagaccttgtatca 33308961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 636 - 665
Target Start/End: Original strand, 33311201 - 33311230
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatca 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33311201 acttttactataaatatagaccttgtatca 33311230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 450; Significance: 0; HSPs: 133)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 383 - 980
Target Start/End: Original strand, 25803706 - 25804310
Alignment:
Q  383 ctgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25803706 ctgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 25803805  T
Q  483 gacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgagg 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25803806 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 25803905  T
Q  583 gagnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaacttt-----g 677  Q
    |||         | |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      |    
T  25803906 gagaaaaaaaaacgtatcttcagtgtaatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaatttgagagag 25804005  T
Q  678 agatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgg 777  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  25804006 agagagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagg 25804105  T
Q  778 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 876  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804106 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 25804205  T
Q  877 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25804206 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaat 25804305  T
Q  976 tcttt 980  Q
    |||||    
T  25804306 tcttt 25804310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Original strand, 18468698 - 18469295
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18468698 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatatttttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 18468797  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18468798 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 18468897  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    ||           |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  18468898 agaaaataaaaagtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatgataaactttgagagag 18468997  T
Q  684 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  18468998 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgat 18469097  T
Q  784 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18469098 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaacccattg 18469197  T
Q  883 atttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18469198 atttctcttttgtaacgatactcatcatctagtggaacgaagagctgctctct-cccagactaggtcaatttggaccgaactggattaacaaattcttt 18469295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Original strand, 27912219 - 27912822
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912219 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 27912318  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27912319 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaaaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 27912418  T
Q  584 agnnnnnnnnnca--tatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagat 681  Q
    ||          |  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27912419 agaaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtgatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagag 27912518  T
Q  682 aga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 779  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||| |||| ||||    
T  27912519 agagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggt 27912618  T
Q  780 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 878  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912619 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 27912718  T
Q  879 attgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912719 attgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacagagaactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 27912818  T
Q  977 cttt 980  Q
    ||||    
T  27912819 cttt 27912822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Original strand, 27910135 - 27910736
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910135 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattattgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 27910234  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27910235 acaataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 27910334  T
Q  584 agnnnnnnnnnca-tatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagata 682  Q
    ||          | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  27910335 agaaaaaaaaaaagtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggttaaactttgagaga 27910434  T
Q  683 ga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 780  Q
    ||  ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  27910435 gagatagcgggggctgaaacaagg-tttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 27910533  T
Q  781 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 879  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910534 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 27910633  T
Q  880 ttgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910634 ttgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 27910733  T
Q  978 ttt 980  Q
    |||    
T  27910734 ttt 27910736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 984
Target Start/End: Original strand, 15551925 - 15552536
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  15551925 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaagatatatttatgg 15552024  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15552025 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatgacatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 15552124  T
Q  584 agnnnnnnnnn-catatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagata 682  Q
    ||          | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15552125 agaaaaaaaaaacgtatcttcagcgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagaga 15552224  T
Q  683 ga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg 776  Q
    ||      |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15552225 gagagagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtg 15552324  T
Q  777 ggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 874  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552325 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 15552424  T
Q  875 acccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15552425 acccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 15552524  T
Q  974 a-ttctttgtgt 984  Q
    | ||||||||||    
T  15552525 atttctttgtgt 15552536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 386 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 18511800 - 18511205
Alignment:
Q  386 ttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 485  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511800 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcgaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 18511701  T
Q  486 aataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgagggag 585  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18511700 aataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 18511601  T
Q  586 nnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagat 685  Q
             | |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  18511600 aaaaaaaaacgtatctttagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttaatataaatatagaccttgtatcagactaaactttgaga--gat 18511503  T
Q  686 agagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattc 785  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18511502 agagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattc 18511403  T
Q  786 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 884  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18511402 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgat 18511303  T
Q  885 ttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
     |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18511302 atctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttt 18511205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 387 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 18509904 - 18509311
Alignment:
Q  387 tgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggaca 486  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18509904 tgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttatttcgaatatattttgtgctgaaaatatatttatggaca 18509805  T
Q  487 ataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgagggagn 586  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  18509804 ataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggaga 18509705  T
Q  587 nnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagata 686  Q
            | |||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  18509704 aaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcatcccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgaga--gata 18509607  T
Q  687 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattca 786  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18509606 gagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattca 18509508  T
Q  787 ccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatt 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||     
T  18509507 ccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagaatgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgata 18509408  T
Q  886 tct-ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18509407 tctattttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggtgggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttt 18509311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 404 - 980
Target Start/End: Original strand, 10586549 - 10587118
Alignment:
Q  404 tttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgta 503  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10586549 tttgatggatggggaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgta 10586648  T
Q  504 tcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgagggagnnnnnnnnn-catatctt 602  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||          | ||||||    
T  10586649 tcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaaaaacgtatctt 10586748  T
Q  603 cagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaa 702  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10586749 cagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggg-ctgaaacaa 10586847  T
Q  703 gggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacacta 801  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||           |||||||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10586848 gggtttagaatggcaacaacaaaactag-----------agtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttgggaaacacta 10586936  T
Q  802 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgtt 900  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10586937 ttaggattcagtctcttgcttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccattgatttctctttgtaacgtt 10587036  T
Q  901 actcatcatatagtggatcggagggctgctctct--ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10587037 actcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttt 10587118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 464 - 980
Target Start/End: Original strand, 18466453 - 18466970
Alignment:
Q  464 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgc 563  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466453 tgctaaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgc 18466552  T
Q  564 aaatattctttcactgagggagnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtat 663  Q
    ||||||||||||||| | ||||           |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18466553 aaatattctttcactaaaggagaaaaaaaag--tatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatatttttactataaatatagaccttgtat 18466650  T
Q  664 caggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaac 763  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||    
T  18466651 caggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttgaaacaaac 18466750  T
Q  764 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggaga 862  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18466751 actaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 18466850  T
Q  863 cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccga 960  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18466851 cttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccga 18466950  T
Q  961 actgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18466951 actgggtcaacaaattcttt 18466970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Original strand, 26097421 - 26098017
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26097421 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaaaatttgtttcaaatatattttgtactgaaaatatatttatgg 26097520  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaa--agggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgag 581  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26097521 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaagaaggaaatgttatatttttgatgcaaatattctttcactgaa 26097620  T
Q  582 ggagnnnnnnnnnca-tatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 680  Q
    ||||            |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  26097621 ggaggaaaaaaaaatgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaactttgaga 26097720  T
Q  681 tagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 780  Q
    |    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  26097721 t----agagggggctgaaataaaggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggtt 26097816  T
Q  781 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 879  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26097817 gattcacctt-ggaaacactattaggaatgagtctcttggttacgggaaaatgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 26097915  T
Q  880 ttgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc-ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26097916 ttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacaga-ggctgctctctcctccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattc 26098014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Original strand, 18596326 - 18596932
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18596326 tgttgtactatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatgg 18596425  T
Q  484 acaataaatata-----------tttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattct 572  Q
    ||||||||||||           |||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18596426 acaataaatataccataaatatatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatacaaatattct 18596525  T
Q  573 ttcactgagggagnnnnnnnnn-catatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaa 671  Q
     ||||||| ||||          | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  18596526 atcactgaaggagaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaa 18596625  T
Q  672 actttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 771  Q
    || |||     |||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||    
T  18596626 accttg----ggatagagggggctgaaacaaggg--tataaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaatatggt 18596719  T
Q  772 ttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattct 870  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  18596720 ttgagggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttt 18596819  T
Q  871 tgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcc-ccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 967  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18596820 tgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 18596919  T
Q  968 caacaaattcttt 980  Q
    ||||| |||||||    
T  18596920 caacagattcttt 18596932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Original strand, 38882048 - 38882391
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882048 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagag---gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38882144  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882145 gtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 38882244  T
Q  836 -ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882245 gggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 38882344  T
Q  935 cc-ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882345 cctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 38882391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Original strand, 2174839 - 2175204
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  || ||||||||||||||| || |||||||||||   |||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2174839 atttgttccaaattt-taagcgatgcttttactataaatacaggccttgtatcagagcaaacttgg----agatagagggggctgaaacaagggtttaga 2174933  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2174934 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattga 2175033  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 910  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2175034 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttacttatcata 2175133  T
Q  911 tagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2175134 tagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 2175204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 384 - 832
Target Start/End: Complemental strand, 26098841 - 26098395
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26098841 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattattgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 26098742  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||    
T  26098741 acaataaatatatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatacaaaaattctttcattgaagg 26098642  T
Q  584 ag--nnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagat 681  Q
    ||           | |||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| | |        
T  26098641 agaaataaaaaaacgtatcttcaatgtggtattcgttccaattttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctgg---- 26098546  T
Q  682 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 781  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  26098545 agatagagggggctgaaataagggtttagaatggcaacaagaagactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttg 26098446  T
Q  782 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 832  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  26098445 attcaccttgacaaacactattatgattgagtctcttggttacggaaagag 26098395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 25921832 - 25921466
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  25921832 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttaga 25921738  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25921737 aagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattga 25921638  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 909  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25921637 gtctcttggttacgggaagaggctgggactctgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 25921538  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921537 atagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 25921466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Original strand, 4236549 - 4236914
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |    ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4236549 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttgg----agataaagggggctgaaacaagagtttaga 4236643  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4236644 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 4236743  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 909  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4236744 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 4236843  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  4236844 atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaact-ggtcaataaattcttt 4236914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 636 - 977
Target Start/End: Complemental strand, 21684797 - 21684448
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagataga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21684797 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaacta 21684698  T
Q  730 gggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 829  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21684697 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 21684598  T
Q  830 gaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctg 928  Q
    |||| | || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21684597 gaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctg 21684498  T
Q  929 ctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21684497 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 21684448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Original strand, 21947947 - 21948312
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||     ||||||||||||||||||||||    
T  21947947 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagataga-----ggggctgaaacaagggtttaga 21948040  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948041 aagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 21948140  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 909  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21948141 gtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtggaattaggcgggagacttattcttgtaaccccttgatatctcttttgtaacgttactcatcat 21948240  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21948241 atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttt 21948312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 635 - 980
Target Start/End: Original strand, 39854426 - 39854769
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 734  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854426 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataga-----ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 39854520  T
Q  735 tgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  39854521 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcatggttacgggaagagac 39854620  T
Q  835 tgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 932  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854621 tggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctct 39854720  T
Q  933 ct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39854721 ctcccccagactagatcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttt 39854769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Original strand, 16776077 - 16776443
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaa-tatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttag 710  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16776077 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaaatatagaccttgtatctgagcaaactttg----agatagagggggctgaaacaagggtttac 16776171  T
Q  711 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 810  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16776172 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 16776271  T
Q  811 agtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 908  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16776272 agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatttctcttttgtaacgttacttatca 16776370  T
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16776371 tatagtggatcggagggctgctatctcccccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 16776443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 636 - 984
Target Start/End: Original strand, 31545023 - 31545371
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31545023 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg----agataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 31545118  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       
T  31545119 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattagagtctcttggttacgggaagaaat 31545218  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31545219 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacagtactcatcatatagtggattggagggctgctctc 31545318  T
Q  934 t-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttctttgtgt 984  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31545319 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 31545371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 677 - 978
Target Start/End: Complemental strand, 34477353 - 34477048
Alignment:
Q  677 gagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg 776  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477353 gagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg 34477254  T
Q  777 ggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 873  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  34477253 ggttgattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgt 34477154  T
Q  874 aacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 972  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477153 aacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 34477054  T
Q  973 aattct 978  Q
    ||||||    
T  34477053 aattct 34477048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 635 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 10529436 - 10529092
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 734  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10529436 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataga----gtgggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatt 10529341  T
Q  735 tgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  10529340 tttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 10529241  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 932  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10529240 tggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggaaggctgctct 10529141  T
Q  933 ct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10529140 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 10529092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 636 - 984
Target Start/End: Original strand, 31542678 - 31543025
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31542678 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg----agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 31542773  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  31542774 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 31542873  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31542874 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattgatttctctttgtaacagtactcatcatatagtggattggagggctgctctc 31542972  T
Q  934 t-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttctttgtgt 984  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31542973 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 31543025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 677 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 34479718 - 34479411
Alignment:
Q  677 gagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg 776  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34479718 gagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg 34479619  T
Q  777 ggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 873  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  34479618 ggttgattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgt 34479519  T
Q  874 aacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 972  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34479518 aacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 34479419  T
Q  973 aattcttt 980  Q
    ||||||||    
T  34479418 aattcttt 34479411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 677 - 980
Target Start/End: Original strand, 6745049 - 6745354
Alignment:
Q  677 gagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg 776  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  6745049 gagagagataaagggggctgaaacaagtgtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacacta-ggtttgag 6745147  T
Q  777 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 875  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745148 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 6745247  T
Q  876 cccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745248 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 6745347  T
Q  974 attcttt 980  Q
    |||||||    
T  6745348 attcttt 6745354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 636 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 31179707 - 31179368
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31179707 acttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttg----agatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 31179612  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  31179611 gtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 31179512  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31179511 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 31179412  T
Q  934 t-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  31179411 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 31179368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 2818695 - 2818328
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  2818695 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttaga 2818601  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtggg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattg 810  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  2818600 aaggtaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcaccttggaaaacactattacgattg 2818501  T
Q  811 agtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 908  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  2818500 agtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca 2818401  T
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2818400 tatagtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttt 2818328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 635 - 980
Target Start/End: Original strand, 6747246 - 6747590
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 734  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||    || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  6747246 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaaga--gaaagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagagtt 6747343  T
Q  735 tgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    |||||  | |||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6747344 tgtataaaatttgtctctttgaaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagac 6747442  T
Q  835 tgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6747443 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctttttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctc 6747542  T
Q  934 tc-cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6747543 tctctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 6747590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 227; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 637 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 1189949 - 1189600
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggc-taaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1189949 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactacggttt 1189850  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  1189849 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacaggaagagatt 1189750  T
Q  836 g-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctct 932  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||    
T  1189749 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtggaacggagggatgctct 1189650  T
Q  933 ctc--cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1189649 ctcctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 1189600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 227; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 526 - 976
Target Start/End: Original strand, 40221349 - 40221805
Alignment:
Q  526 caaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgagggagnnnnnnnnn--------catatcttcagtctggtatttgt 617  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||                 | |||||||||| || |||  ||    
T  40221349 caaatatattttgaaaaggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgcaggagaaggaaaaaacaaaaaacgtatcttcagtgtgatatccgt 40221448  T
Q  618 tccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggca 717  Q
    || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||  ||||  ||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40221449 tctaaatttatgagtta--cttttactataaatatagacattgactcagagtaaaccttg----agatagagggggctgaaacaagggtttagaatggca 40221542  T
Q  718 acaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct 817  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40221543 acaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctct 40221642  T
Q  818 tggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagt 914  Q
    ||||||| |||||||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  40221643 tggttacaggaagagattgggacttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagt 40221742  T
Q  915 ggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40221743 ggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 40221805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 637 - 976
Target Start/End: Original strand, 25904047 - 25904385
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  25904047 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagat----agagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattg 25904142  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct- 835  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  25904143 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatta 25904242  T
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
    || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||| | |||||||||    
T  25904243 gggctttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctattgtaacgttacttatcatatagtgaaacggatgactgctctct 25904342  T
Q  935 -ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25904343 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 25904385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 383 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 3373631 - 3373348
Alignment:
Q  383 ctgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 482  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3373631 ctgttgtagtatgactcagaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatg 3373532  T
Q  483 gacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgagg 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  3373531 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattttttcactgaag 3373432  T
Q  583 gag-nnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatca 665  Q
    |||          | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3373431 gagaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatca 3373348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 637 - 980
Target Start/End: Original strand, 17072827 - 17073170
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17072827 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagat----agagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttg 17072922  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct- 835  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |     
T  17072923 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttaggggaagagattg 17073022  T
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    || |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||    
T  17073023 gggctttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctc 17073122  T
Q  934 t-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17073123 tcccccagactcggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 17073170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 637 - 980
Target Start/End: Original strand, 24126800 - 24127142
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||  ||||| |||||||||||    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24126800 cttttactataaatatagacattatatcagtgtaaaccttgagatagat----ggggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttg 24126895  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct- 835  Q
    ||| |||||||||||||   |||||| |||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |     
T  24126896 tatagagtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattg 24126995  T
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24126996 ggactttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 24127095  T
Q  935 -ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24127096 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 24127142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 639 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 16092537 - 16092192
Alignment:
Q  639 tttactataaatatagaccttgtatcaggc-taaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 737  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||   ||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16092537 tttactagaaatatagactttgtatcagatgtaaactt-gtgagagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 16092439  T
Q  738 atggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg- 836  Q
    || |||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  16092438 atagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 16092339  T
Q  837 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||    
T  16092338 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgagatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctct 16092239  T
Q  935 cc-ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    || | ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16092238 cctctagactaggtcaatttagactgaactggatcaacaaattcttt 16092192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 719 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 658610 - 658349
Alignment:
Q  719 caacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 818  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  658610 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctctt 658511  T
Q  819 ggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtgg 916  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  658510 ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtga 658411  T
Q  917 atcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    | |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  658410 aacggatggctg--ctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 658349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 640 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 10474655 - 10474316
Alignment:
Q  640 ttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 739  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10474655 ttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttg----aaatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtat 10474560  T
Q  740 ggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gga 838  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  | |||    
T  10474559 agagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaaacactattaagattgaatctcttggttacaggaagagattggga 10474460  T
Q  839 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-cc 936  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||    
T  10474459 ctttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttctaaggttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctccc 10474360  T
Q  937 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10474359 ccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttt 10474316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 622 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 31472963 - 31472605
Alignment:
Q  622 aatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaa 721  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||| ||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31472963 aatttatgagggatgcttttactataaatatggacattgtattagtgtaaaccttgagataga----gggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaa 31472868  T
Q  722 caaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 821  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31472867 caaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 31472768  T
Q  822 tacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggat 918  Q
     ||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |     
T  31472767 cacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaa 31472668  T
Q  919 cggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31472667 cggagggttgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttt 31472605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Original strand, 6756414 - 6756778
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||   ||||||||||||||||    ||| |||||||||| ||||||||    
T  6756414 atttattccaaattt-taagttatacttttactattaatatagatcttgtatcatattaaactttgagataga----gggagctgaaacaatggtttaga 6756508  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6756509 aaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattctccttgggaaacactattaggattga 6756608  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttgtaacgttactcatca- 908  Q
    || ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||| ||||| |||||     
T  6756609 gtatcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa--cattgatatcttttttgtaaggttacacatcat 6756706  T
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  6756707 tatagtgaaac-gagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaatcttt 6756778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 635 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 17818826 - 17818485
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 734  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| |||     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17818826 tacttttgttataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagaaaga-----ggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtt 17818732  T
Q  735 tgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||      
T  17818731 tgtatagagttcgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaaacactattaagactgagtctcttggttacgggaagagat 17818632  T
Q  835 tg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 932  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||    
T  17818631 tgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatacagtggaacagagggcttctct 17818532  T
Q  933 ctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17818531 c-ccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 17818485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 635 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 37706117 - 37705774
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 734  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37706117 tacttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataga----gggggctgaaataaaggtttagaaaggcaacgacaaatctagggtt 37706022  T
Q  735 tgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    ||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  37706021 tgtatagactttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 37705922  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 932  Q
    | ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | || | ||||  |||    
T  37705921 tagggttttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatggctattct 37705822  T
Q  933 ct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37705821 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 37705774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 634 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 36402666 - 36402321
Alignment:
Q  634 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||| | |||  || ||||||||||    
T  36402666 atacttttactataaatatagaccttatatcagagtaaacgttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaatgacaatcacgaaactagggt 36402571  T
Q  734 ttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 833  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||     
T  36402570 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggattgaatctcttggttacgggaggaga 36402471  T
Q  834 ctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 931  Q
     ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | | || | ||||||    
T  36402470 ttggaactttgggtaaaattaggctggagacttattattgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatgtctgctc 36402371  T
Q  932 tct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  36402370 tctcccccagactaggtcaatttagatcgaactaggtcaacaaattcttt 36402321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 182; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 645 - 980
Target Start/End: Original strand, 2954368 - 2954702
Alignment:
Q  645 ataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagt 744  Q
    |||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||    || |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |  | |    
T  2954368 ataaatataggctttgtatcagtgtaaactttgagataga----ggagtatgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgtgtataat 2954463  T
Q  745 ttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gacttt 842  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || ||||||    
T  2954464 ttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagacttt 2954563  T
Q  843 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccaga 941  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||| |    
T  2954564 gggtagaattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctctttgtaaagttactcatcatatagtgaagcggagggatgctctctcccccaaa 2954663  T
Q  942 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2954664 ctaggtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttt 2954702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 182; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 634 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 12556261 - 12555916
Alignment:
Q  634 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  12556261 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagataga----gggggctgaaataagggtttagaatgacaacaacaaaactagagt 12556166  T
Q  734 ttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 833  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  12556165 ttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggctacgggaagaga 12556066  T
Q  834 ctggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 931  Q
     |||| ||| ||||||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||| || || | | ||||||||||||     
T  12556065 ttggagttttggtagaattagacaagagactttttcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcttaaagcgaaacggagggctgcta 12555966  T
Q  932 tct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12555965 tctcccccatactagttcaatttggactgaactgggtcaataaattcttt 12555916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 637 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 39398327 - 39397986
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| | |  ||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39398327 cttttactataaatataaacattgtaccggtgtaaaccttgagataga-----ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 39398233  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 835  Q
    ||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  39398232 tatagagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagatt 39398134  T
Q  836 gg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||  || |||||||  | |||| ||||||||||    
T  39398133 ggaactttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtgacgttaccaattatatagtaaaacggatggctgctctc 39398034  T
Q  934 tccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  39398033 tcccacagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaaacattcttt 39397986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 764 - 980
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410308
Alignment:
Q  764 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggaga 862  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 4410189  T
Q  863 cttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaa 961  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  4410190 cttattcttgtaacctattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 4410289  T
Q  962 ctgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4410290 ctgggtcaacaaattcttt 4410308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 177; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 637 - 976
Target Start/End: Original strand, 695833 - 696160
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||| |||||||| |    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  695833 cttttactatgaatatagacattgtatgagtgtaaaccttgagataaa----gggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 695928  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 836  Q
    |||           ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  695929 tat-----------ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 696016  T
Q  837 -gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  696017 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacggagggctgctctc 696116  T
Q  934 t-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  696117 tcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 696160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 172; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 636 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 31466314 - 31465982
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |     ||||||||||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||||    
T  31466314 acttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagataaaa----ggggctgaaacaaaggtttaaaaaagtaacgacaaaactagggttt 31466219  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-gc 834  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  31466218 gtatagagtttgtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 31466119  T
Q  835 tggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct-ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||          ||||||||||||    
T  31466118 tggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcatat----------agggctgctctc 31466030  T
Q  934 -tccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31466029 acccccagactagttcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttt 31465982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 776 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 20506041 - 20505836
Alignment:
Q  776 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 874  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20506041 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 20505942  T
Q  875 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20505941 acacattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 20505843  T
Q  974 attcttt 980  Q
    |||||||    
T  20505842 attcttt 20505836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 637 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 34531001 - 34530722
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34531001 cttttactgtaaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagataga----gggggctgaaacaagtgtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttg 34530906  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct- 835  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |     
T  34530905 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggctacgggaagagatta 34530806  T
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtgga 917  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  34530805 ggactttgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtgga 34530722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 793 - 984
Target Start/End: Original strand, 10749796 - 10749990
Alignment:
Q  793 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 890  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749796 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 10749895  T
Q  891 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttgtgt 984  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749896 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattctttgtgt 10749990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 773 - 980
Target Start/End: Original strand, 39798123 - 39798333
Alignment:
Q  773 tgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 871  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798123 tgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattctt 39798222  T
Q  872 gtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 969  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  39798223 gtaacccattgatttctcttttataatgatactcatcgtatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggatcgaactgggtca 39798322  T
Q  970 acaaattcttt 980  Q
    |||||||||||    
T  39798323 acaaattcttt 39798333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 620 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 6661533 - 6661181
Alignment:
Q  620 caaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaac 719  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||    || |||||||||||||||||| | ||||    
T  6661533 caaatttatgagttata-tttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagag----ggttgaaacaagggtttagaa-gtcaac 6661440  T
Q  720 aacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 819  Q
    || |||| |||||| ||||| |||||||| |||| | |||||||||||| ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6661439 aagaaaattagggtatgtatagagtttgt-tcttggcaacaaacactagagttgg--ggttgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttg 6661343  T
Q  820 gttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtgg 916  Q
    || |||||||||   || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||    
T  6661342 gtcacgggaagaaattgagattttgggtacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttgctcataattatagtgg 6661243  T
Q  917 atcggagggctgctctctccc-cagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    | |||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  6661242 aacggatgactgctctctccctcagactaggtcagatttggaccgaactggataaacaaatt 6661181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 644 - 980
Target Start/End: Original strand, 21288715 - 21289047
Alignment:
Q  644 tataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggag 743  Q
    ||||||||||||||||| || ||  ||||| ||||||||||    ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  21288715 tataaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagataga----gggggttgaaataagggtttagaatagcaacaataaaaatagggtttgtatagag 21288810  T
Q  744 tttgtctcttcggaacaaacactagggtt------tgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-g 836  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||      || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |    
T  21288811 tttgtctctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcaccttga-aaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattag 21288909  T
Q  837 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 936  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| |||      || |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21288910 gactttggatagaattaagcgggagattttttcttgtaactcat------ct-tttgtaacgttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctcc 21289002  T
Q  937 cc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21289003 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttt 21289047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 384 - 567
Target Start/End: Original strand, 21288529 - 21288713
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21288529 tgttgtagtataactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaataaaaaagatttgtttaaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 21288628  T
Q  484 acaataaatatatttt-tgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaat 567  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21288629 acaataaatatattttcggtaccgtatgaagaacgattttatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaat 21288713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 764 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585737
Alignment:
Q  764 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggaga 862  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||||| |||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggaga 41585857  T
Q  863 cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccga 960  Q
    |||||| ||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  41585856 cttatttttgtaagtcattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccga 41585757  T
Q  961 actgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  41585756 actgggtcaacaaattcttt 41585737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 793 - 984
Target Start/End: Original strand, 10757273 - 10757466
Alignment:
Q  793 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 890  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10757273 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttct 10757371  T
Q  891 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttgtgt 984  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10757372 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattagaccgaactgggtcaacaaattctttgtgt 10757466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 682 - 854
Target Start/End: Original strand, 20043035 - 20043208
Alignment:
Q  682 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 781  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  20043035 agatagagggggctgaaacaagtgtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttg 20043134  T
Q  782 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattag 854  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||    
T  20043135 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 793 - 977
Target Start/End: Original strand, 23665140 - 23665326
Alignment:
Q  793 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 890  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23665140 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23665238  T
Q  891 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc-tccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23665239 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 23665326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 793 - 977
Target Start/End: Complemental strand, 23793447 - 23793261
Alignment:
Q  793 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 890  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23793447 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23793349  T
Q  891 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc-tccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23793348 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 23793261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 759 - 980
Target Start/End: Original strand, 2723964 - 2724179
Alignment:
Q  759 caaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattaggcgg 858  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||        |||||||||||||    
T  2723964 caaacactagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg--------tagaattaggcgg 2724055  T
Q  859 gagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttgga 956  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2724056 gtgatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 2724155  T
Q  957 ccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  2724156 ccgaactgggtcaacaaattcttt 2724179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 637 - 858
Target Start/End: Original strand, 20044954 - 20045172
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||   |||| |||    ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  20044954 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttg----agacagagggggctgaaacaagggtttaggaaagcaacaacaaaactagggtttg 20045049  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct- 835  Q
    ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |     
T  20045050 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttccgggaagagattg 20045149  T
Q  836 ggactttgggtagaattaggcgg 858  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20045150 ggactttgggtagaattaggcgg 20045172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 793 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 3373320 - 3373125
Alignment:
Q  793 gaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 890  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3373320 gaaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 3373221  T
Q  891 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttctttgtgt 984  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3373220 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 3373125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 793 - 977
Target Start/End: Complemental strand, 15354757 - 15354571
Alignment:
Q  793 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 890  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15354757 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15354659  T
Q  891 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15354658 ttgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 15354571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 793 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 38960314 - 38960120
Alignment:
Q  793 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 890  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38960314 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 38960216  T
Q  891 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttctttgtgt 984  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38960215 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 38960120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 793 - 977
Target Start/End: Complemental strand, 15357033 - 15356847
Alignment:
Q  793 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 890  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15357033 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15356935  T
Q  891 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15356934 ttgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccggactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 15356847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 800 - 977
Target Start/End: Complemental strand, 23742034 - 23741855
Alignment:
Q  800 tattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaac 897  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23742034 tattaggattggagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctttgtaac 23741936  T
Q  898 gttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc-tccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23741935 gttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 23741855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 637 - 994
Target Start/End: Original strand, 36208524 - 36208875
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||    
T  36208524 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagataga----gggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggttt 36208617  T
Q  736 gtatggag-tttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
     ||  ||| ||| |||   ||| | ||||  |||||||  ||  |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||      
T  36208618 -tagagagatttctctaagcgggagaaac--tagggttgttg--ttgattcaccttgggaaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagat 36208712  T
Q  835 tg-gactttgggtagaattaggcggg-agacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgct 930  Q
    || |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||    
T  36208713 tgagactttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggcgggctgct 36208812  T
Q  931 ctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttgtgtctctctcttt 994  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  36208813 ctttccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattcttt-tgtttctctcttt 36208875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 391 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 17415893 - 17415748
Alignment:
Q  391 gtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataa 490  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17415893 gtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttttgctgaaaatatatttatggacaataa 17415794  T
Q  491 atatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattt 536  Q
    |||||||||||||  |||||| | |  |||| || |||||||||||    
T  17415793 atatatttttgtactgtatgaaggaaaatttgatgcaaatatattt 17415748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 685 - 980
Target Start/End: Original strand, 9020211 - 9020506
Alignment:
Q  685 tagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 783  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| | | ||||||| ||||| |||||||||||| |||||   ||||| | ||||||||||||||||   |  |||||    
T  9020211 tagagggagctgaaaacaagggtttggga-ggcaaca-caaaagtagggtttgtatagagttg--ctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgat 9020304  T
Q  784 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgga-ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 882  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9020305 tcaccttggaaaacactattaagattgagtttcttggtcacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattg 9020404  T
Q  883 atttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcc-ccagactaggtc-aatttggaccgaactgggtcaacaaattct 978  Q
    || |||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||   ||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  9020405 atatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggatcggatggctgctctctcctccaaattaggtctgttttggaccgaactggataaaccaattct 9020504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 684 - 980
Target Start/End: Original strand, 20053834 - 20054123
Alignment:
Q  684 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 783  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||| |||  |||||| ||||| | ||||||||||||||||    |||||||    
T  20053834 atagagggcgctgaaacaagggtttagaa-ggcaacacaaaaactagagtttatataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--ggttgat 20053929  T
Q  784 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 883  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||       |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||    
T  20053930 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtttggaga----ttgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc---ga 20054022  T
Q  884 tttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcc-ccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||    
T  20054023 tatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggaaggctgctctctcctccatactaggtcagttttggaccgaactgcgtaaacaaattctt 20054122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 634 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 20507800 - 20507665
Alignment:
Q  634 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 733  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||    
T  20507800 atacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaattaaggt 20507705  T
Q  734 ttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 773  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20507704 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacaagggttt 20507665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 697 - 938
Target Start/End: Complemental strand, 17413441 - 17413202
Alignment:
Q  697 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 796  Q
    |||||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||    
T  17413441 aaacaagggtttagaa-ggcagcactaaaactatggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaa 17413348  T
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 893  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  || |||||| ||||||||||||   | | ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  17413347 cactattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctcttttg 17413248  T
Q  894 taacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccc 938  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  17413247 taaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctctcccc 17413202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 635 - 737
Target Start/End: Original strand, 4409999 - 4410101
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 734  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4409999 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 4410098  T
Q  735 tgt 737  Q
    |||    
T  4410099 tgt 4410101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 384 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 6662033 - 6661929
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6662033 tgttgtagtatgacttaaaacttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatgg 6661934  T
Q  484 acaat 488  Q
    |||||    
T  6661933 acaat 6661929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 779 - 976
Target Start/End: Original strand, 15143547 - 15143750
Alignment:
Q  779 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-gctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 876  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  15143547 ttgattcacctttggaagcactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 15143646  T
Q  877 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 972  Q
    || ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| | || ||||||| ||||| ||||    
T  15143647 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggggagctgctttctcccctagactaggtcagtatttgaccgaaatgggtaaaca 15143746  T
Q  973 aatt 976  Q
    ||||    
T  15143747 aatt 15143750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 793 - 977
Target Start/End: Original strand, 23667415 - 23667601
Alignment:
Q  793 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 890  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| |||| | |||||  ||| |||||||  |||||||||||  | ||| || |||| |||||||||||||||||    
T  23667415 gaaacactataaggattggactctcttgcttacagaaagagattgggactttggaaagaattaggcgaaaaact-atgcttgcaacccattgatttctct 23667513  T
Q  891 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc-tccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23667514 ttgtaacgtcactcatcaaataatggatcggagggctgctctcttccccagactaggacagattggaccgaactgggccaacaaattc 23667601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 597 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 41586081 - 41585946
Alignment:
Q  597 tatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctg 696  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| |||    ||||| |||||||||    
T  41586081 tatcttcagtctggtattcgttccaaatctatgagttatacttttactataaatataggttttgtatcagagtaaaccttg----agataaagggggctg 41585986  T
Q  697 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  41585985 aaacaagggtttagaataacaagaacaaaactagggtttg 41585946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 697 - 937
Target Start/End: Complemental strand, 2144840 - 2144599
Alignment:
Q  697 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaa-acactagggtttgtgggttgattcaccttgg-ga 794  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |  | |||||||||||||| ||    
T  2144840 aaacaagggtttagaa-gccaacactaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaacacactagggttgg--gattgattcaccttggaga 2144747  T
Q  795 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag--gctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc-cattgatttctct 890  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||   | ||||||||||| ||||||||   | ||||| ||||||||||||   || || |||||    
T  2144746 aacactattaggatggagtctcttggtcgcgggaagagattcaggactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttttatatctct 2144647  T
Q  891 ttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc 937  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2144646 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 2144599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 384 - 463
Target Start/End: Original strand, 40221282 - 40221361
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttg 463  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40221282 tgttgtagtatgactcaaaatttaattgatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttg 40221361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 890 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 26098373 - 26098281
Alignment:
Q  890 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc--agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26098373 tttgtaacgttactcatcatatggtgaaacggagggctgctctctccccccatactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttt 26098281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 794 - 975
Target Start/End: Original strand, 1170811 - 1170994
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||||    
T  1170811 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctcttt 1170907  T
Q  893 gtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    |||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  1170908 gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 1170994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 612 - 864
Target Start/End: Original strand, 42770693 - 42770934
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaa-caagggtttag 710  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||  | ||||| ||||||||||    |||| |||||| ||||||||| |    
T  42770693 atttgttccaattttatgagggatacttttactataaatataaactttgtatcgag-taaaccttgagataga----ggggactgaaaacaagggtttgg 42770787  T
Q  711 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 810  Q
    || ||||||| ||||| |||| ||| ||| || |||| ||||| | ||||||||||| |||| |  |||| ||||||| ||||||||  |||||||| ||    
T  42770788 aa-ggcaaca-caaaattagg-tttatatagaatttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttcattcaccatgggaaac--tattaggactg 42770879  T
Q  811 agtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagact 864  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||| || ||||||    
T  42770880 agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgagagact 42770934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 464 - 580
Target Start/End: Original strand, 15143262 - 15143371
Alignment:
Q  464 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgc 563  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| | | ||||| || |||||||||||||||||||||||       ||||||||    
T  15143262 tgctaaaaatatatttatggacaataaatacatttttgtaccatatgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaata-------tttgatgc 15143354  T
Q  564 aaatattctttcactga 580  Q
    |||||||||||||||||    
T  15143355 aaatattctttcactga 15143371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 797 - 984
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4898021
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggc-gggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttg 893  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||  ||||| ||||| |||    
T  4897828 cactgttaggattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctattg 4897927  T
Q  894 taacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattctttgtgt 984  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| | | |||||||| ||| ||||| ||||||||| | || ||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  4897928 taaagttactcatcattatagcggaacagtgggctgctttctcccccatactaggtcagtattcgactgaactgggtaaacaaattttttgtgt 4898021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 866 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 15445376 - 15445263
Alignment:
Q  866 attcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaat-ttggaccgaac 962  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||    
T  15445376 attcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctcttcccagactaggtcagtattggactgaac 15445277  T
Q  963 tgggtcaacaaatt 976  Q
    ||||| ||||||||    
T  15445276 tgggtaaacaaatt 15445263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 799 - 979
Target Start/End: Original strand, 25445501 - 25445684
Alignment:
Q  799 ctattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaac 897  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| |||||||| || ||   || |||||||||||     
T  25445501 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctctttgtaaa 25445597  T
Q  898 gttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    |  ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  25445598 gaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25445684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 797 - 979
Target Start/End: Original strand, 22672837 - 22673022
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  22672837 cactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 22672932  T
Q  895 aacgttactcat--cat-atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    || |  ||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  22672933 aaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 22673022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 794 - 975
Target Start/End: Complemental strand, 35385634 - 35385450
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 891  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  35385634 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg-tagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 35385539  T
Q  892 tgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    ||||| |  ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  35385538 tgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 35385450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 384 - 438
Target Start/End: Original strand, 18466411 - 18466465
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatata 438  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466411 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 18466465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 837 - 910
Target Start/End: Original strand, 42770951 - 42771025
Alignment:
Q  837 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcata 910  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  42770951 gactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 42771025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 394 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 5779217 - 5779144
Alignment:
Q  394 tgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 467  Q
    ||||| |||||||| | |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5779217 tgacttaaaatttgatagatgaagaagattattgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 5779144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 797 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 17841428 - 17841246
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||    
T  17841428 cactattaggattgagtctctaggtcacgggaagaggctggaacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgta 17841332  T
Q  896 acgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    | |  ||||  |||| ||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| ||||||||    
T  17841331 aagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 17841246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 797 - 979
Target Start/End: Original strand, 25452498 - 25452683
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| |||||||| || ||   || ||||||||||    
T  25452498 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctctttgta 25452594  T
Q  896 acgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    | |  ||||  |||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  25452595 aagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagaataggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25452683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 384 - 438
Target Start/End: Original strand, 15143220 - 15143274
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatata 438  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15143220 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 15143274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 697 - 920
Target Start/End: Original strand, 4754159 - 4754380
Alignment:
Q  697 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 796  Q
    ||||||||||||| |||| |||||  || |||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||    | |||||||||||||  |||    
T  4754159 aaacaagggttta-aaagccaacacaaacactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcaccttgaaaaa 4754252  T
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc-cattgatttctctttg 893  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| || |||||||  || |||||||| ||||||||||   | || || ||||||||||||   || || ||||||||    
T  4754253 cactattagaattgagcctcttggtcactggaagagattgtgactttggatagaattaggtttgaaggctaattcttgtaaccttttttatatctctttg 4754352  T
Q  894 taacgttactcatc-atatagtggatcg 920  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4754353 taaagttactcatcaatatagtggatcg 4754380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 794 - 949
Target Start/End: Original strand, 1240428 - 1240585
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||  ||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||    
T  1240428 aaacactattaggattgagtctcttaggcacgggaagaggctgggatttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt 1240524  T
Q  893 gtaacgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctctc-cccagactaggtca 949  Q
    |||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  1240525 gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctctcccaaactaggtca 1240585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 794 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 2298183 - 2298122
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattagg 855  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  2298183 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 2298122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 927 - 980
Target Start/End: Original strand, 20043222 - 20043276
Alignment:
Q  927 tgctctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20043222 tgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattcttt 20043276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 797 - 979
Target Start/End: Original strand, 28786407 - 28786592
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||| |||||||||   | ||| | ||||||||||| ||   || ||||||||||    
T  28786407 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggcagaattaggtttgaagattgattcttgtaactca---atatctctttgta 28786503  T
Q  896 acgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    | |  ||||  |||| |||| |||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  28786504 aagaaactcatatcattataatggaacggagaactgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 28786592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 779 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 34033768 - 34033563
Alignment:
Q  779 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag--gctggactttgggtagaatt-aggcgggagacttattcttgta 874  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||   | ||| ||||||||||||| ||   | |||||| || | |||    
T  34033768 ttgatttaccttggagaaacactattaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattcaggattttgggtagaattaagtttgaagacttgttatggta 34033669  T
Q  875 acccatt-gatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 970  Q
    |||| || ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||  ||||| |  ||  ||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||| ||    
T  34033668 accccttcgatatctcttttgtaaagttactcatcattactgtggaacatagaactgctctctcccctgactaggtcagtattggatcgaactgggtaaa 34033569  T
Q  971 caaatt 976  Q
    ||||||    
T  34033568 caaatt 34033563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 612 - 829
Target Start/End: Original strand, 29748261 - 29748479
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcag-gctaaactttgagataga------tagagggggctgaaacaagg 704  Q
    ||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| |||      ||||| |     ||||||||    
T  29748261 atttgttccaaattt-tgagggatgcttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaacttttagagagaggcgagtagagagccagaaaacaagg 29748359  T
Q  705 gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-gaaacactatt 803  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||  || |   |||||| | |||||||| |||||||   || |||||||  ||||| ||||||||| |    
T  29748360 gtttag-aagccaacaagaaaactagggtttgtagagaat---tctcttggcaacaaacagtagggtt--aggattgattcgtcttggagaaacactaat 29748453  T
Q  804 aggattgagtctcttggttacgggaa 829  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  29748454 aggattgagtctcttggtcacgggaa 29748479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 800 - 853
Target Start/End: Original strand, 40222769 - 40222822
Alignment:
Q  800 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaatta 853  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  40222769 tattaggattgagtctcttgatcacgggaagaggctggaacttgggtagaatta 40222822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 9353361 - 9353425
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9353361 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9353425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 36932379 - 36932443
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36932379 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 36932443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 797 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 11962612 - 11962554
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattagg 855  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  11962612 cactattaggattgtgtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 11962554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 911 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 28832326 - 28832263
Alignment:
Q  911 tagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  28832326 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaaccgggtcaacaa 28832263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 612 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 2144952 - 2144898
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcag 666  Q
    ||||||||||| | | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2144952 atttgttccaattatttgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcag 2144898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 33087514 - 33087476
Alignment:
Q  334 ggtgaattctaggatgagggttcaatcaagtccctcacc 372  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33087514 ggtgaattctaggatgagggatcaatcaagtccctcacc 33087476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 909 - 973
Target Start/End: Original strand, 11917000 - 11917065
Alignment:
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11917000 tatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 11917065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 794 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 31782639 - 31782578
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg 855  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||   |||||||||||||||    
T  31782639 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggaattgggtagaattagg 31782578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 10281819 - 10281755
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10281819 atagtggattggagagctgctctctcccccagatcaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10281755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 15464600 - 15464536
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  15464600 atagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattggaccgaactgggtcaacaa 15464536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 794 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 16093473 - 16093413
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattag 854  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||   || |||||||||||    
T  16093473 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagtctgggacttaggtagaattag 16093413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 17003989 - 17004053
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17003989 atagtggattgaagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 17004053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 19588814 - 19588750
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  19588814 atagtggattggagggctgctctctccctaagattagttcatattggaccgaactgggtcaacaa 19588750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 909 - 979
Target Start/End: Original strand, 42238376 - 42238448
Alignment:
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  42238376 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 42238448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 637 - 684
Target Start/End: Original strand, 2723911 - 2723958
Alignment:
Q  637 cttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagataga 684  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||    
T  2723911 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataga 2723958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 911 - 973
Target Start/End: Original strand, 31300626 - 31300689
Alignment:
Q  911 tagtggatcggagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    |||||||| |||| | | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31300626 tagtggattggagagtttctctctccctcagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31300689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 431 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 2532784 - 2532750
Alignment:
Q  431 aaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2532784 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatcttgtg 2532750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 794 - 832
Target Start/End: Original strand, 10627364 - 10627402
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 832  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10627364 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagag 10627402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 616 - 666
Target Start/End: Original strand, 15143411 - 15143460
Alignment:
Q  616 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcag 666  Q
    ||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  15143411 gttacaaatttatgagttatatttct-ctataaatatagaccttgtatcag 15143460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 935 - 973
Target Start/End: Original strand, 19806493 - 19806531
Alignment:
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19806493 ccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 19806531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 935 - 973
Target Start/End: Original strand, 32636954 - 32636992
Alignment:
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32636954 ccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 32636992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 636 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 34477408 - 34477374
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggcta 670  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34477408 acttttactataaaaatagaccttgtatcaggcta 34477374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 636 - 665
Target Start/End: Original strand, 10757207 - 10757236
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatca 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10757207 acttttactataaatatagaccttgtatca 10757236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 636 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 15354818 - 15354789
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatca 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15354818 acttttactataaatatagaccttgtatca 15354789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 636 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 15357094 - 15357065
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatca 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357094 acttttactataaatatagaccttgtatca 15357065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 636 - 665
Target Start/End: Original strand, 23665081 - 23665110
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatca 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23665081 acttttactataaatatagaccttgtatca 23665110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 636 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 23793506 - 23793477
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatca 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23793506 acttttactataaatatagaccttgtatca 23793477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 636 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 38960378 - 38960349
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatca 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38960378 acttttactataaatatagaccttgtatca 38960349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 331 - 372
Target Start/End: Original strand, 39466882 - 39466923
Alignment:
Q  331 ttaggtgaattctaggatgagggttcaatcaagtccctcacc 372  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  39466882 ttaggtgaattctagggtgagggtccaattaagtccctcacc 39466923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 409; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 979
Target Start/End: Original strand, 51709 - 52307
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51709 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaataatgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtggtgaaaatatatttatgg 51808  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51809 acaataaatatatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 51908  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    ||         | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |    
T  51909 agaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgaga--g 52006  T
Q  684 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||    
T  52007 atagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgat 52106  T
Q  784 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  52107 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattg 52206  T
Q  883 atttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct---ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 978  Q
    |  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52207 acatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattct 52306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 635 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 183976 - 183634
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 734  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  183976 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaa-----gggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtt 183882  T
Q  735 tgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  183881 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-ggaagagat 183783  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 932  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  183782 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 183683  T
Q  933 ctccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183682 ctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 183634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 384 - 455
Target Start/End: Original strand, 50159 - 50230
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaat 455  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50159 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaataatgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaat 50230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 909 - 979
Target Start/End: Original strand, 50235 - 50308
Alignment:
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctctc---cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50235 tatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggacctaactgggtcaacaaattctt 50308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 464 - 503
Target Start/End: Original strand, 170076 - 170115
Alignment:
Q  464 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgta 503  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  170076 tgctgaaaatatattcatggacaacaaatatatttttgta 170115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 404; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 12061 - 11466
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12061 tgttgtagtatgattcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaaaatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 11962  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11961 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 11862  T
Q  584 agnnnnnnnnncatatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatag 683  Q
    ||         | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| | |    ||    
T  11861 agaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctgg----ag 11766  T
Q  684 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 783  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11765 atagagggggctgaaacagggatttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgat 11666  T
Q  784 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 882  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11665 tttccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattg 11566  T
Q  883 atttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11565 atttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttt 11466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 403; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 976
Target Start/End: Original strand, 78883 - 79476
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  78883 tgttgtagtatgacttaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtctcaaatatattttctgctaaaaatatatttatgg 78982  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  78983 ataataaatatatttttgtactgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 79082  T
Q  584 agnnnnnnnnncat--atcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagat 681  Q
    ||          ||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||  |||        
T  79083 aggaaaaaaaaaatgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacctttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaacttg---- 79178  T
Q  682 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 781  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  79179 agatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttg 79278  T
Q  782 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 880  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79279 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagaatttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 79378  T
Q  881 tgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  79379 tgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaatt 79476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 363; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 939
Target Start/End: Original strand, 1735 - 2294
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1735 tgttgtagtatgactcaaaatttgaaggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 1834  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaggg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  1835 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaagg 1934  T
Q  584 agnnnnnnnnn-catatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagata 682  Q
    ||          | |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    ||||||||||| |    
T  1935 agaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttataagttatactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagaga 2034  T
Q  683 --gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 780  Q
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  2035 aagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggtt 2133  T
Q  781 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 879  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2134 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaaccca 2233  T
Q  880 ttgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccca 939  Q
    || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2234 ttaatttctcttttgtaacgttcctcatcatatagtgaatcggagggctactctctcccca 2294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 612 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 69654 - 69285
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69654 atttgttccaaattt-taagcgatacttttacaataaatatagaccttatatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttaga 69556  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69555 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 69456  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 910  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69455 gtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 69356  T
Q  911 tagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69355 tagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 69285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 612 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 73386 - 73207
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73386 atttgttccaaattt-taagagatacttttactataaatatagaccgtgtatcaaaggaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttaga 73288  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg 792  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  73287 aaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 73207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 755 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 73208 - 73160
Alignment:
Q  755 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 803  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  73208 ggaaaaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 73160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 635 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 41820 - 41476
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 734  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41820 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactt----agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 41725  T
Q  735 tgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41724 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 41625  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 932  Q
    | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41624 tgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctct 41525  T
Q  933 ct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41524 ctcccccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 41476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 634 - 980
Target Start/End: Original strand, 3947 - 4290
Alignment:
Q  634 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947 atacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 4042  T
Q  734 ttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 833  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4043 ttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaag 4141  T
Q  834 ct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 931  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  4142 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc 4241  T
Q  932 tctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4242 tctccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttt 4290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 636 - 974
Target Start/End: Original strand, 2832 - 3168
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2832 acttttactataaatatagaacttgtatcagagcaaactttgagat----agagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 2927  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc- 834  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  2928 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct 3027  T
Q  835 tggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  3028 tggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctatct 3127  T
Q  935 cccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 974  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3128 ccccgagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaa 3168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 636 - 977
Target Start/End: Original strand, 29113 - 29462
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagataga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29113 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaacta 29212  T
Q  730 gggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 829  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29213 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 29312  T
Q  830 gaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctg 928  Q
    |||| | || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29313 gaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctg 29412  T
Q  929 ctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29413 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 29462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 636 - 984
Target Start/End: Original strand, 6151 - 6499
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 735  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6151 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg----agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaataaaactagggttt 6246  T
Q  736 gtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggc 834  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  6247 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagat 6346  T
Q  835 t-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6347 tgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctc 6446  T
Q  934 t-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttctttgtgt 984  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6447 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgagtcaacaaatttctttgtgt 6499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 649 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 14707 - 14376
Alignment:
Q  649 atatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgt 748  Q
    ||||||||||||| | ||   |||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14707 atatagaccttgttttagagcaaactttgaga--gatagagggggatgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 14610  T
Q  749 ctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggta 847  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14609 ctctttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggta 14510  T
Q  848 gaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactag 945  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  14509 gaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagactag 14410  T
Q  946 gtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409 gtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 14376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 612 - 979
Target Start/End: Original strand, 14948 - 15313
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    ||||||||||||||||| | ||||||    
T  14948 atttgttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagat----agagggggctgaaacaatgatttaga 15042  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15043 aaggcaacaacaaaactagggtttttataaagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 15142  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 909  Q
    ||||||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  15143 gtctcttggttacggaaagagattcagactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 15242  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15243 atagtggaacggaaggctgctgtctcccccatgctaggtcaatttggaccgaactgactcaacaaattctt 15313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 677 - 984
Target Start/End: Original strand, 30 - 341
Alignment:
Q  677 gagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg 776  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30 gagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtg 129  T
Q  777 ggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 874  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  130 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgta 229  T
Q  875 acccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  230 acccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 329  T
Q  974 a-ttctttgtgt 984  Q
    | ||||||||||    
T  330 atttctttgtgt 341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 755 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 1673 - 1446
Alignment:
Q  755 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaatta 853  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1673 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 1574  T
Q  854 ggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatt 952  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1573 ggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatt 1474  T
Q  953 tggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1473 tggaccgaactgggtcaacaaattcttt 1446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 613 - 980
Target Start/End: Original strand, 79789 - 80154
Alignment:
Q  613 tttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 712  Q
    |||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  79789 tttgttccaa-tttatgagggattcttttactataaatatagtttttgtatcagtgtaaaccttgagat----agagggggctgaaacaagggtttagaa 79883  T
Q  713 aggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  79884 agacaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaa 79983  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 909  Q
    |||||||||||||||||||||  | || |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  79984 gtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtag-attaggcaggagacttattcctgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat 80082  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  80083 atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggattgaactgggtcaacaaattcttt 80154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 794 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 188424 - 188363
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg 855  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  188424 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattagg 188363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 158; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 612 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 16178 - 15817
Alignment:
Q  612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttaga 711  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||     |||||||||||| ||||| ||||||||||     
T  16178 atttgttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaacctt----aagatagagggggttgaaataagggtttag- 16084  T
Q  712 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 811  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| | | ||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16083 aagtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt--gaggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattga 15987  T
Q  812 gtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca- 908  Q
    |||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||     
T  15986 gtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 15887  T
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    || |||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  15886 tagagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaatt 15817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 155; Significance: 9e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 613 - 980
Target Start/End: Original strand, 85161 - 85526
Alignment:
Q  613 tttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 712  Q
    |||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||| | ||||||||   ||||| |||||||||| ||||| |    |||||||| |||| ||    
T  85161 tttgttccaa-tttatgagggattcttttactataaatataggctttgtatcaaagtaaaccttgagataga-agaggag----aaacaaggatttaaaa 85254  T
Q  713 aggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 812  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  85255 agacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaaaacactactaggattgag 85354  T
Q  813 tctcttggttacgggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatca-t 909  Q
    ||| ||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |    
T  85355 tcttttggttacgagaagagattgtgactttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttcgtaaagttactcatcatt 85454  T
Q  910 atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||||||||    
T  85455 atagtggaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatttgaactgaaccaggtaaacaaattcttt 85526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 144; Significance: 3e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 693 - 867
Target Start/End: Original strand, 35644 - 35819
Alignment:
Q  693 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg 792  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  35644 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagg 35743  T
Q  793 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgggagacttat 867  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35744 gaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 909 - 976
Target Start/End: Original strand, 35817 - 35885
Alignment:
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35817 tatagtggaacggagggctgctctcttccttagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaatt 35885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 133; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 527 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 2080 - 1638
Alignment:
Q  527 aaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgagggagnnnnnnnnn------catatcttcagtctggtatttgttcc 620  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||               | |||||||||  || |||   ||||    
T  2080 aaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaaaaaggaaacctatcttcagcgtgatatccattcc 1981  T
Q  621 aaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggc-taaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaac 719  Q
    ||||||| |||||| | ||   || |||||||||||||||||||||   ||||| | ||||||||    || ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  1980 aaatttacgagttacattt---ctctaaatatagaccttgtatcagatgtaaacctagagataga----ggtggctgaaacaagggtttagaa-gtcaac 1889  T
Q  720 aacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 819  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||          |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  1888 aagaaaactagggtttgtatagagtttc---------aacaaacactagggtt-gtgg-ttgattcaccttgggaaacacaattaggattgagtttcttg 1800  T
Q  820 gttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtgg 916  Q
    || ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1799 gtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgg 1700  T
Q  917 atcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    | || ||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1699 aacgtagggctgctctctcccccatactaggtcagtttttgaccgaactgggtaaacaaatt 1638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 385 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 2184 - 2070
Alignment:
Q  385 gttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgga 484  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2184 gttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgga 2085  T
Q  485 caataaatatatttt 499  Q
    |||||||||||||||    
T  2084 caataaatatatttt 2070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 128; Significance: 1e-65; HSPs: 5)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 793 - 977
Target Start/End: Original strand, 22221 - 22407
Alignment:
Q  793 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 890  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22221 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 22319  T
Q  891 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22320 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 22407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 793 - 977
Target Start/End: Original strand, 24496 - 24682
Alignment:
Q  793 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 890  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24496 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 24594  T
Q  891 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24595 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 24682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 8448 - 8512
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8448 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 8512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 636 - 665
Target Start/End: Original strand, 22162 - 22191
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatca 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22162 acttttactataaatatagaccttgtatca 22191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 636 - 665
Target Start/End: Original strand, 24437 - 24466
Alignment:
Q  636 acttttactataaatatagaccttgtatca 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24437 acttttactataaatatagaccttgtatca 24466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 121; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 638 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 16981 - 16646
Alignment:
Q  638 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 736  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||    || |||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16981 ttttaatataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagataga----ggaggctgaaaacaagggttt-gaaagacaaca-caaaactagggtttg 16888  T
Q  737 tatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 836  Q
    ||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||    
T  16887 tatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttaggaaacactattaggattgagtcacttggtgacgggaagagattg 16791  T
Q  837 -gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctc 933  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  |  |||| |  ||||    
T  16790 agactttgggtagaattaggccagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgggacaaagggtttatctc 16691  T
Q  934 t-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 976  Q
    | |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16690 tcccccagaccaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 16646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 93; Significance: 9e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 384 - 532
Target Start/End: Original strand, 4546 - 4694
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 483  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4546 tgttgcagtataactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcgaatatatttcgtgctgaaaatatatttatgg 4645  T
Q  484 acaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatat 532  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||| | || |||| || |||||||    
T  4646 acaatatatatatttttgtactgtatgaaggacaatttgatgcaaatat 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 597 - 967
Target Start/End: Original strand, 4728 - 5095
Alignment:
Q  597 tatcttcagtctggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctg 696  Q
    |||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    |||| |||    
T  4728 tatcttcagtgtgatattcgtttcaaatttatgagttatatttct-ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagataga----ggggtctg 4822  T
Q  697 aaacaaggg-tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatggagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 795  Q
    ||| || || ||||||| |  | ||||||| ||||||||| ||| | |||| |||||  | |||||||||||| |||    | ||||||||  |||||||    
T  4823 aaaaaaaggatttagaa-gtaagcaacaaa-ctagggtttatatagcgttt-tctctcagcaacaaacactagagttga--gtttgattcatgttgggaa 4917  T
Q  796 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgga-ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--ttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||  || | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||    
T  4918 acactattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagcttttggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttt 5017  T
Q  893 gtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactgggt 967  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||| |  ||  ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  5018 gtaaagatactcatcattatagtggaacatagaactgctctctgccccagactaggtcagtattggaccgaattgggt 5095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 384 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 95 - 1
Alignment:
Q  384 tgttgtagtatgactcaaaatttgttggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatt 478  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  95 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 939 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1444
Alignment:
Q  939 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1485 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 1444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 83; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 635 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 1168 - 993
Alignment:
Q  635 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 734  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1168 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaa----ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 1073  T
Q  735 tgtatggagtttgtctc-----ttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 809  Q
    ||||| |||||||||||     || ||||||||||||| | || | |||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  1072 tgtatagagtttgtctctttagtttggaacaaacactacgtttggagggttgatccaccttgcgaaatacttttaggatt 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 48; Significance: 6e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 794 - 936
Target Start/End: Original strand, 224819 - 224961
Alignment:
Q  794 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||||    
T  224819 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctcttt 224915  T
Q  893 gtaacgttactca-tca-tatagtggatcggagggctgctctctcc 936  Q
    |||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  224916 gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcc 224961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 5751 - 5687
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5751 atagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 2560 - 2496
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  2560 atagtggattggagggctgctgtctcccccagattaggtcatattggagcgaactgggtcaacaa 2496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 47; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 920 - 977
Target Start/End: Complemental strand, 4733 - 4675
Alignment:
Q  920 ggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 977  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4733 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattc 4675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 45; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 797 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 17165 - 16980
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| |||  |||    |||||||||    
T  17165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaagctaggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaacttatta---tctctttgt 17070  T
Q  895 aacgttactcat--cat-atagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 979  Q
    || |  ||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  17069 aaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 16980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 797 - 975
Target Start/End: Original strand, 16328 - 16509
Alignment:
Q  797 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| ||   || ||||||||||    
T  16328 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgggtagaattaggtttgaagactaattcttggaactca---atatctctttgta 16424  T
Q  896 acgttactc--atca-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    | |  ||||  |||| ||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  16425 aagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 16509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 467 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 57905 - 57836
Alignment:
Q  467 tgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgatgaacgatttaatacaaatatatttt 537  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| || ||||||||||||    
T  57905 tgaaaatatatgtatgaacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaa-aatttgatgcaaatatatttt 57836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0533 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0533
Description:

Target: scaffold0533; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 421 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 2273 - 2232
Alignment:
Q  421 attgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 462  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2273 attgttgcagaaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 2232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1050
Description:

Target: scaffold1050; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 909 - 975
Target Start/End: Complemental strand, 3136 - 3068
Alignment:
Q  909 tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 975  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  3136 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 3068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 910 - 973
Target Start/End: Original strand, 43990 - 44054
Alignment:
Q  910 atagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  43990 atagtggattggagagctgctctctcccccagaatagatcatattggaccgaactgggtcaacaa 44054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 935 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 20453 - 20415
Alignment:
Q  935 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 973  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20453 ccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 20415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University