View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF5659-Insertion-9 (Length: 1020)
Name: NF5659-Insertion-9
Description: NF5659
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF5659-Insertion-9 |
 | |
|
Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 880; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 880; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 1000
Target Start/End: Original strand, 6885993 - 6886982
Alignment:
| Q |
10 |
gatgatgtaattcgagttcctccaccatagctaggctggacttgtaaagagcttagattagaaggaattccattcttgatgtactcggaaaaaagcttcc |
109 |
Q |
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| T |
6885993 |
gatgacgtaattcgagttcctccaccatagctaggctggacttgtgaagagcttagattagaaggaattccattcttgatgtactcggaaaaaagcttcc |
6886092 |
T |
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| Q |
110 |
ccaaagtcatcttaacttttttcaacttctcctcactaatgagtgggtcaagtttttcataagcaaatttcaaaaagttaaacttatttggttggatcaa |
209 |
Q |
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| T |
6886093 |
ccaaagtcatcttaacttttttcaacttctcctcactagtgagtgggtcaagtttttcataagcaaatttcaaaaagttaaactt-tttggttggatcaa |
6886191 |
T |
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| Q |
210 |
gaacagccccaactgccaaaccaacattatagtcactccaatacttatcaaatttcaccttcatattttcagccattttttgaattaaaagatcttcact |
309 |
Q |
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| T |
6886192 |
gaacagccccaactgccaaaacaacattatagtcactccaatacttatcaaatttcaccttcatactttcagccatcttttgaatcaaaagatcttcact |
6886291 |
T |
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| Q |
310 |
tgttaaataagatcttatgaggcactcaatcttccatatttcaccaaagtacatatttgatgtaggatatgaagagccagatatcaagtttgtaatagtg |
409 |
Q |
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| T |
6886292 |
tctcaaataagatcttatgaggcactcaatcttccatatttcaccaaagtacagatttgatgtaggatatgaagagccggatatcaagtttgtaatagtg |
6886391 |
T |
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| Q |
410 |
aaaaatggcttcaaaatctcacacattatttcagcccttctccactcctcaattgtaggacaacacttaaaatttgaatcccgtaaacttaagctataaa |
509 |
Q |
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| T |
6886392 |
aaaaatggcttcaaaatctcacacattatttcagcccttctccactcctcacttgtaggacaacatttaaaatttgaatcccgtaaacttaagctataaa |
6886491 |
T |
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| Q |
510 |
atgcacgacgataaacaagcgcactctgtagcattataaaagtggaattccatcgagtaacacaatctaatctcaatcctatggttgtatcaatatcacc |
609 |
Q |
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6886492 |
atgcacgacgataaacaagcgcactctgtagcattataaaagtggaattccatcgagtaacacaatctaatctcaatcctatggttgtatcaatatcacc |
6886591 |
T |
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| Q |
610 |
aacagttctaacacattcggaaaaaagtagtgttctactttctgttaccctcacataagccacactttgtctaatcttatgcaaagcatcgctgattacc |
709 |
Q |
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| T |
6886592 |
aacagttctaacacattcggaaaaaagtagtgttctactttctgttaccctcacataagccacactttgtctaatcttatgcaaagcatcgctaactacc |
6886691 |
T |
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| Q |
710 |
ttgagtccatcttgaacaacgaggttcaagatgtgagctgagcatcttatatggaaaaattctccatcaagcaacaaactatttgataaccctagatgct |
809 |
Q |
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| T |
6886692 |
ttgagtccatcttgaacaatgaggttcaagatgtgagctgagcatcttatatggaaaaattctccatcaagcaacaaactatttgataaccctagatgct |
6886791 |
T |
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| Q |
810 |
ctttcaaaaagttagccatactgttgtttgcagaagcattatctaaagtgatgggaaaaaattttcttttcaatgccccaatcatctaacatttctaaaa |
909 |
Q |
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| T |
6886792 |
ctttcaaaaagttagccatactgttgtttgcagaagcattatctaaagtgat-ggaaaaaattttcttttcaatgccccaatcatctaacatttctaaaa |
6886890 |
T |
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| Q |
910 |
cctttcaagct-aatctcgcccactatgtgggggttccatgtgagcaaatgctaaaattttacgttccaactttcagtccacatcaacataa |
1000 |
Q |
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| T |
6886891 |
ccttcaaagctaaatctcgcccactatgtgggggttccatgtgagcaaatgctaaaattttactttccaacttccaattcacatcaacataa |
6886982 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 868; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 868; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 1000
Target Start/End: Original strand, 39490613 - 39491602
Alignment:
| Q |
10 |
gatgatgtaattcgagttcctccaccatagctaggctggacttgtaaagagcttagattagaaggaattccattcttgatgtactcggaaaaaagcttcc |
109 |
Q |
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| T |
39490613 |
gatgatgtaattcgagttcctccaccatagctaggctggacttgtgaagagcttagattagaaggaattccattcttgatgtactcggaaaaaagcttcc |
39490712 |
T |
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| Q |
110 |
ccaaagtcatcttaacttttttcaacttctcctcactaatgagtgggtcaagtttttcataagcaaatttcaaaaagttaaacttatttggttggatcaa |
209 |
Q |
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| T |
39490713 |
ccaaagtcatcttaacttttttcaacttctcctcacttgtgagtgggtcaagtttttcataagcaaatttcaaaaagttaaactt-tttggttggatcaa |
39490811 |
T |
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| Q |
210 |
gaacagccccaactgccaaaccaacattatagtcactccaatacttatcaaatttcaccttcatattttcagccattttttgaattaaaagatcttcact |
309 |
Q |
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| T |
39490812 |
gaacagccccaactgccaaaacaacattatagtcactccaatacttatcaaatttcaccttcatattttcagccattttttgaattaaaagatcttcact |
39490911 |
T |
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| Q |
310 |
tgttaaataagatcttatgaggcactcaatcttccatatttcaccaaagtacatatttgatgtaggatatgaagagccagatatcaagtttgtaatagtg |
409 |
Q |
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| T |
39490912 |
tgtcaaataagatcttatgaggcactcaatcttccatatttcaccaaagtacagatttgatgtaggatatgaagagccagatatcaagtttgtaatagtg |
39491011 |
T |
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| Q |
410 |
aaaaatggcttcaaaatctcacacattatttcagcccttctccactcctcaattgtaggacaacacttaaaatttgaatcccgtaaacttaagctataaa |
509 |
Q |
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| T |
39491012 |
aaaaatggcttcaaaatctcacacattatttcagcccttctccactcctcacttgtaggacaacacttaaaatttgaatcccgtaaacttaagctataaa |
39491111 |
T |
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| Q |
510 |
atgcacgacgataaacaagcgcactctgtagcattataaaagtggaattccatcgagtaacacaatctaatctcaatcctatggttgtatcaatatcacc |
609 |
Q |
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| T |
39491112 |
atgcacgacgataaacaagcgcactctgtagcattataaaagtggaattccatcgagtaacacaatctaatctcaatcctatggttgtatcaatatcacc |
39491211 |
T |
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| Q |
610 |
aacagttctaacacattcggaaaaaagtagtgttctactttctgttaccctcacataagccacactttgtctaatcttatgcaaagcatcgctgattacc |
709 |
Q |
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| T |
39491212 |
aacaattctaacacattcagaaaaaagtagtgttcgactttctgttaccctcacataagccacactttgcctaatcttatgcaaagcatcactaactacc |
39491311 |
T |
|
| Q |
710 |
ttgagtccatcttgaacaacgaggttcaagatgtgagctgagcatcttatatggaaaaattctccatcaagcaacaaactatttgataaccctagatgct |
809 |
Q |
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| T |
39491312 |
ttgagtccatcttgaacaatgaggttcaagatgtgagctgagcatcttatatggaaaaattctccatcaagcaacaaactatttgataaacctagatgct |
39491411 |
T |
|
| Q |
810 |
ctttcaaaaagttagccatactgttgtttgcagaagcattatctaaagtgatgggaaaaaattttcttttcaatgccccaatcatctaacatttctaaaa |
909 |
Q |
| |
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| T |
39491412 |
ctttcaaaaagttagccatactgttgtttgcagaagcattatctaaagtgat-ggaaaaaattttcttttcaatgccccaatcatctaacatttctaaaa |
39491510 |
T |
|
| Q |
910 |
cctttcaagct-aatctcgcccactatgtgggggttccatgtgagcaaatgctaaaattttacgttccaactttcagtccacatcaacataa |
1000 |
Q |
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| T |
39491511 |
ccttcaaagctaaatctcgcccactatgtgggggttccatgtgagcaaatgctaaaatcttactttctaacttccaattcacattaacataa |
39491602 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 860; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 860; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 1000
Target Start/End: Complemental strand, 12748424 - 12747435
Alignment:
| Q |
10 |
gatgatgtaattcgagttcctccaccatagctaggctggacttgtaaagagcttagattagaaggaattccattcttgatgtactcggaaaaaagcttcc |
109 |
Q |
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|
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| T |
12748424 |
gatgatgtaattcgagttcctccaccatagctaggctggacttgtgaagagcttagattagaaggaattccattcttgatgtactcggaaaaaagcttcc |
12748325 |
T |
|
| Q |
110 |
ccaaagtcatcttaacttttttcaacttctcctcactaatgagtgggtcaagtttttcataagcaaatttcaaaaagttaaacttatttggttggatcaa |
209 |
Q |
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| T |
12748324 |
ccaaagtcatcttaacttttttcaacttctcctcacttgtgagtgggtcaagtttttcataagcaaatttcaaaaagttaaactt-tttggttggatcaa |
12748226 |
T |
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| Q |
210 |
gaacagccccaactgccaaaccaacattatagtcactccaatacttatcaaatttcaccttcatattttcagccattttttgaattaaaagatcttcact |
309 |
Q |
| |
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| T |
12748225 |
gaacagccccaactgccaaaacaacattatagtcactccaatacttatcaaatttcaccttcatattttcagccattttttgaattaaaagatcttcact |
12748126 |
T |
|
| Q |
310 |
tgttaaataagatcttatgaggcactcaatcttccatatttcaccaaagtacatatttgatgtaggatatgaagagccagatatcaagtttgtaatagtg |
409 |
Q |
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| T |
12748125 |
tgtcaaataagatcttatgaggcactcaatcttccatatttcaccaaagtacagatttgatgtaggatatgaagagccagatatcaagtttgtaatagtg |
12748026 |
T |
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| Q |
410 |
aaaaatggcttcaaaatctcacacattatttcagcccttctccactcctcaattgtaggacaacacttaaaatttgaatcccgtaaacttaagctataaa |
509 |
Q |
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| T |
12748025 |
aaaaatggcttcaaaatctcacacattatttcagcccttctccactcctcacttgtaggacaacacttaaaatttgaatcccgtaaacttaagctataaa |
12747926 |
T |
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| Q |
510 |
atgcacgacgataaacaagcgcactctgtagcattataaaagtggaattccatcgagtaacacaatctaatctcaatcctatggttgtatcaatatcacc |
609 |
Q |
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| T |
12747925 |
atgcacgacgataaacaagcgcactttgtagcattataaaagtggaattccatcgagtaacacaatctaatctcaatcctatggttgtatcaatatcacc |
12747826 |
T |
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| Q |
610 |
aacagttctaacacattcggaaaaaagtagtgttctactttctgttaccctcacataagccacactttgtctaatcttatgcaaagcatcgctgattacc |
709 |
Q |
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| T |
12747825 |
aacaattctaacacattctgaaaaaagtagtgttcgactttctgttaccctcacataagccacactttgcctaatcttatgcaaagcatcactaactacc |
12747726 |
T |
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| Q |
710 |
ttgagtccatcttgaacaacgaggttcaagatgtgagctgagcatcttatatggaaaaattctccatcaagcaacaaactatttgataaccctagatgct |
809 |
Q |
| |
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|
|
| T |
12747725 |
ttgagtccatcttgaacaatgaggttcaagatgtgagctgagcatcttatatggaaaaattctccatcaagcaacaaactatttgataaacctagatgct |
12747626 |
T |
|
| Q |
810 |
ctttcaaaaagttagccatactgttgtttgcagaagcattatctaaagtgatgggaaaaaattttcttttcaatgccccaatcatctaacatttctaaaa |
909 |
Q |
| |
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|
| T |
12747625 |
ctttcaaaaagttagccatactgttgtttgcagaagcattatctaaagtgat-ggaaaaaaatttcttttcaatgccccaatcatctaacatttctaaaa |
12747527 |
T |
|
| Q |
910 |
cctttcaagct-aatctcgcccactatgtgggggttccatgtgagcaaatgctaaaattttacgttccaactttcagtccacatcaacataa |
1000 |
Q |
| |
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|
|
| T |
12747526 |
ccttcaaagctaaatctcgcccactatgtgggggttccatgtgagcaaatgctaaaatcttactttctaacttccaattcacattaacataa |
12747435 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 679; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 215 - 1000
Target Start/End: Complemental strand, 12759210 - 12758425
Alignment:
| Q |
215 |
gccccaactgccaaaccaacattatagtcactccaatacttatcaaatttcaccttcatattttcagccattttttgaattaaaagatcttcacttgtta |
314 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12759210 |
gccccaactgccaaaacaacattatagtcactccaatacttatcaaatttcaccttcatattttcagccattttttgaattaaaagatcttcacttgtca |
12759111 |
T |
|
| Q |
315 |
aataagatcttatgaggcactcaatcttccatatttcaccaaagtacatatttgatgtaggatatgaagagccagatatcaagtttgtaatagtgaaaaa |
414 |
Q |
| |
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| T |
12759110 |
aataagatcttatgaggcactcaatcttccatatttcaccaaagtacagatttgatgtaggatatgaagagccagatatcaagtttgtaatagtgaaaaa |
12759011 |
T |
|
| Q |
415 |
tggcttcaaaatctcacacattatttcagcccttctccactcctcaattgtaggacaacacttaaaatttgaatcccgtaaacttaagctataaaatgca |
514 |
Q |
| |
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|
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| T |
12759010 |
tggcttcaaaatctcacacattatttcagcccttctccactcctcacttgtaggacaacacttaaaatttgaatcccgtaaacttaagctataaaatgca |
12758911 |
T |
|
| Q |
515 |
cgacgataaacaagcgcactctgtagcattataaaagtggaattccatcgagtaacacaatctaatctcaatcctatggttgtatcaatatcaccaacag |
614 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12758910 |
cgacgataaacaagcgcactttgtagcattataaaagtggaattccatcgagtaacacaatctaatctcaatcctatggttgtatcaatatcaccaacaa |
12758811 |
T |
|
| Q |
615 |
ttctaacacattcggaaaaaagtagtgttctactttctgttaccctcacataagccacactttgtctaatcttatgcaaagcatcgctgattaccttgag |
714 |
Q |
| |
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| T |
12758810 |
ttctaacacattctgaaaaaagtagtgttcgactttctgttaccctcacataagccacactttgcctaatcttatgcaaagcatcactaactaccttgag |
12758711 |
T |
|
| Q |
715 |
tccatcttgaacaacgaggttcaagatgtgagctgagcatcttatatggaaaaattctccatcaagcaacaaactatttgataaccctagatgctctttc |
814 |
Q |
| |
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|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
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|
| T |
12758710 |
tccatcttgaacaatgaggttcaagatgtgagctgagcatcttatatggaaaaattctccatcaagcaacaaactatttgataaacctagatgctctttc |
12758611 |
T |
|
| Q |
815 |
aaaaagttagccatactgttgtttgcagaagcattatctaaagtgatgggaaaaaattttcttttcaatgccccaatcatctaacatttctaaaaccttt |
914 |
Q |
| |
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| T |
12758610 |
aaaaagttagccatactgttgtttgcagaagcattatctaaagtgat-ggaaaaaattttcttttcaatgccccaatcatctaacatttctaaaaccttc |
12758512 |
T |
|
| Q |
915 |
caagct-aatctcgcccactatgtgggggttccatgtgagcaaatgctaaaattttacgttccaactttcagtccacatcaacataa |
1000 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| || | ||||| ||||||| |
|
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| T |
12758511 |
aaagctaaatctcgcccactatgtgggggttccatgtgagcaaatgctaaaatcttactttctaacttccaattcacattaacataa |
12758425 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 1000
Target Start/End: Original strand, 37022954 - 37023918
Alignment:
| Q |
17 |
taattcgagttcctccaccatagctaggctggacttgtaaagagcttagattagaaggaattccattcttgatgtactcggaaaaaagcttccccaaagt |
116 |
Q |
| |
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||||||||||| |||| |||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||| |
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|
| T |
37022954 |
taattcgagtttctcctccatagctgggttggactgaagaagagatcggattagaaggaataccatttttgacttactcggcaaaaagcttctccaaagt |
37023053 |
T |
|
| Q |
117 |
catcttaacttttttcaacttctcc-tcactaatgagtgggtcaagtttttcataagcaaatttcaaaaagttaaacttatttggttggatcaagaacag |
215 |
Q |
| |
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|||| |||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||| |||| ||||||| || |||| || ||| |||| | |||||||||| || |
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| T |
37023054 |
catcctaaccattttcaacttctccctcactagtcagtggatcaagtttttgataaacaaatttaaataagtaaagctt-tttgttcggatcaagaatag |
37023152 |
T |
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| Q |
216 |
ccccaactgccaaaccaacattatagtcactccaatacttatcaaatttcaccttcatattttcagccattttttgaattaaaagatcttcacttgttaa |
315 |
Q |
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| T |
37023153 |
ccccaaatgccaagactag----tagtcatttcaatatttgtcaaatttttccttcatactttcagccattttttgaatcaaaagatcttcacttgtcaa |
37023248 |
T |
|
| Q |
316 |
ataagatcttatgaggcactcaatcttccatatttcaccaaagtacatatttgatgtaggatatgaagagccagatatcaagtttgtaatagtgaaaaat |
415 |
Q |
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||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |
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| T |
37023249 |
ataagat-ttataaggcactctatcttccatatttcaccgaagtacaaatttgatgtaggaaatgaagaaccagatatcaagtttgtaatattgtaaaat |
37023347 |
T |
|
| Q |
416 |
ggcttcaaaatctcacacattatttcagcccttctccactcctcaattgtaggacaacacttaaaatttgaatcccgtaaacttaagctataaaatgcac |
515 |
Q |
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| T |
37023348 |
ggcttcaaaatatcacacattgtttcagcccttctccactcatcacttgtaggacaaaacttaaaatttgaatcatgcaaacttaagctataaaaggcat |
37023447 |
T |
|
| Q |
516 |
gacgataaacaagcgcactctgtagcattataaaagtggaattccatcgagtaacacaatctaatctcaatcctatggttgtatcaatatcaccaacagt |
615 |
Q |
| |
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| T |
37023448 |
gataataattaatcgcactatcaagcattataaaagtggagttccatctagtaaca-----------caatccgattgttgtatcaatatcaccaacatt |
37023536 |
T |
|
| Q |
616 |
tctaacacattcggaaaaaagtagtgttctactttctgttaccctcacataagccacactttgtctaatcttatgcaaagcatcgctgattaccttgagt |
715 |
Q |
| |
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| T |
37023537 |
cctaacacatttaaaaaattgtagtgttctactt--tgtt-ccgtaacataagccacactttgtctaatcttatgcaatgcatcactaactaccttgagt |
37023633 |
T |
|
| Q |
716 |
ccatcttgaacaacgaggttcaagatgtgagctgagcatcttatatggaaaaattctccatcaagcaacaaactatttgataaccctagatgctctttca |
815 |
Q |
| |
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| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| || |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |
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| T |
37023634 |
ctatcttgaacaatgaggtttaagatttgagctgagcatcttatatgaaaaaactctccttcaaacaccaaactatttgacaaccctaaatgttctttca |
37023733 |
T |
|
| Q |
816 |
aaaagttagccatactgttgtttgcagaagcattatctaaagtgatgggaaaaaattttcttttcaatgccccaatcatctaacatttctaaaacctttc |
915 |
Q |
| |
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|
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| T |
37023734 |
aaaagttttgcatattgttgtttgaagatgcattatccaaagtgat-ggaaaaaactttctttttaatgccccaatcatctaacatttccagcaccttcg |
37023832 |
T |
|
| Q |
916 |
aagct-aatctcgcccactatgtgggggttccatgtgagcaaatgctaaaattttacgttccaactttcagtccacatcaacataa |
1000 |
Q |
| |
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| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||| || | |||||||||||| |
|
|
| T |
37023833 |
atgctaaatctcgcccactatgtagaggttccatgtgagcaaatgccaaaatcttactttgcaacttccaattaacatcaacataa |
37023918 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 46 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 37022615 - 37022086
Alignment:
| Q |
46 |
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145 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |
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|
| T |
37022615 |
tggacttgagaagagctcggattagaaggaatcccatttttgacatactcggcaaaaagattctccaaagtcatcctaaccattttcaacttctcctcac |
37022516 |
T |
|
| Q |
146 |
taatgagtgggtcaagtttttcataagcaaatttcaaaaagttaaacttatttggttggatcaagaacagccccaactgccaaaccaacattatagtcac |
245 |
Q |
| |
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||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| || | ||| |||| | |
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| T |
37022515 |
cggtgagtggatcaagtttttgataagcaaatttcaaaaagttaaactt-tttggttggatcaagaatagccccaaatgcaaagaccacaccgtagttaa |
37022417 |
T |
|
| Q |
246 |
tccaatacttatcaaatttcaccttcatattttcagccattttttgaattaaaagatcttcacttgttaaataagatcttatgaggcactcaatcttcca |
345 |
Q |
| |
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| T |
37022416 |
tccaatacttatcaaatgtttccttcatacttccagccatgttttgaatcaaaagatcttcatttgtcaaataagatcttataagacactctagcttcca |
37022317 |
T |
|
| Q |
346 |
tatttcaccaaagtacatatttgatgtaggatatgaagagccagatatcaagtttgtaatagtgaaaaatggcttcaaaatctcacacattatttcagcc |
445 |
Q |
| |
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| T |
37022316 |
tatttctccaaagtacaaatttgatggaggatatgaagagtcgcatatcaagtttgtaatattgtaaaatggcttcaaaatatcacacattgtttcagcc |
37022217 |
T |
|
| Q |
446 |
cttctccactcctcaattgtaggacaacacttaaaatttgaatcccgtaaacttaagctataaaatgcacgacgataaacaagcgcactctgtagcatta |
545 |
Q |
| |
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| T |
37022216 |
cttctccactcatcacttgtaggacaacacttaaaatttgaattgcgcaaacttaagctataaaaagcacgacgataattaatcgcactctgaagcattc |
37022117 |
T |
|
| Q |
546 |
taaaagtggaattccatcgagtaacacaatc |
576 |
Q |
| |
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| T |
37022116 |
taaaagtggagttccatctagtaacacaatc |
37022086 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 231 - 678
Target Start/End: Original strand, 24685622 - 24686057
Alignment:
| Q |
231 |
caacattatagtcactccaatacttatcaaatttcaccttcatattttcagccattttttgaattaaaagatcttcacttgttaaataagatcttatgag |
330 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||| |||| || ||||||||| ||||| |||||||| || |
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|
| T |
24685622 |
caacactatagtccctccaatacttatcaaatttatccttcatacttccagccacgttttgaatcaaaatatattcacttgtcaaatatgatcttataag |
24685721 |
T |
|
| Q |
331 |
gcactcaatcttccatatttcaccaaagtacatatttgatgtaggatatgaagagccagatatcaagtttgtaatagtgaaaaatggcttcaaaatctca |
430 |
Q |
| |
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| T |
24685722 |
acactctatcttccatattttgccaaagtacaaat------------atgaagagtcggatatcaagtttgtaatattgtagaatgacttcaaaatatca |
24685809 |
T |
|
| Q |
431 |
cacattatttcagcccttctccactcctcaattgtaggacaacacttaaaatttgaatcccgtaaacttaagctataaaatgcacgacgataaacaagcg |
530 |
Q |
| |
|
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|
| T |
24685810 |
cacattgtttcagcccttctccactcctcaattgtaggacaacacttaaaatttgaatcgcgcaaacttaagctataaaaggcacgacgatgaataatcg |
24685909 |
T |
|
| Q |
531 |
cactctgtagcattataaaagtggaattccatcgagtaacacaatctaatctcaatcctatggttgtatcaatatcaccaacagttctaacacattcgga |
630 |
Q |
| |
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| T |
24685910 |
cactctgaagcattaaaaaagtggaattccttcgagtaacacaatctgatctcaatctgatggttgtatcaatatcaccaacatttctaacacattcaga |
24686009 |
T |
|
| Q |
631 |
aaaaagtagtgttctactttctgttaccctcacataagccacactttg |
678 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
24686010 |
aaaaagtggtgttctactttctgttaccctcgcataagccacactttg |
24686057 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 583 - 1000
Target Start/End: Complemental strand, 37022015 - 37021603
Alignment:
| Q |
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caatcctatggttgtatcaatatcaccaacagttctaacacattcggaaaaaagtagtgttctactttctgttaccctcacataagccacactttgtcta |
682 |
Q |
| |
|
|||||| || || |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37022015 |
caatccgattgtagtatcaatatcaccaacattcctaacacattcaaaaaattgtaatgttctacttt--gtt-ctctaacataagccacactttgtcta |
37021919 |
T |
|
| Q |
683 |
atcttatgcaaagcatcgctgattaccttgagtccatcttgaacaacgaggttcaagatgtgagctgagcatcttatatggaaaaattctccatcaagca |
782 |
Q |
| |
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||||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
37021918 |
atcttatgcaatgcatcactaactaccttgagtctatcttgaacaatgaggttcaagatgtgagttgagcatcttatatgaaaaaactctccatcaaaca |
37021819 |
T |
|
| Q |
783 |
acaaactatttgataaccctagatgctctttcaaaaagttagccatactgttgtttgcagaagcattatctaaagtgatgggaaaaaattttcttttcaa |
882 |
Q |
| |
|
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|
| T |
37021818 |
acaaactatttgacaaccctaaatattctttcaaaaagttttgcatactgttgtttgaagatgcattatccaaagtgat-ggaaaaaactttcttttcaa |
37021720 |
T |
|
| Q |
883 |
tgccccaatcatctaacatttctaaaacctttcaagct-aatctcgcccactatgtgggggttccatgtgagcaaatgctaaaattttacgttccaactt |
981 |
Q |
| |
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| T |
37021719 |
tgcctcaatcatctaacgtttccagcagcttt-atgctaaatctcgcccactatgt-ggggttccatgtgagcaaatgcaaaaatcttactttgcaactt |
37021622 |
T |
|
| Q |
982 |
tcagtccacatcaacataa |
1000 |
Q |
| |
|
||| | ||||||| ||||| |
|
|
| T |
37021621 |
tcaattcacatcatcataa |
37021603 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 675 - 1000
Target Start/End: Original strand, 24686472 - 24686799
Alignment:
| Q |
675 |
tttgtctaatcttatgcaaagcat-cgctgattaccttgagtccatcttgaacaacgaggttcaagatgtgagctgagcatcttatatg-gaaaaattct |
772 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24686472 |
tttgtctaatcttatgcaatgcattcactaactaccttgagtccatcttgaacaatgaggttcaagatgtgagctaagcatcttatatgaaaaaaattct |
24686571 |
T |
|
| Q |
773 |
ccatcaagcaacaaactatttgataaccctagatgctctttcaaaaagttagccatactgttgtttgcagaagcattatctaaagtgatgggaaaaaatt |
872 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
24686572 |
ccatcaagcaacaaactatttgataaccctaaatgatctttcaaaaagttttgtatactgttgtttgaagaagcaatatctaaagtgat-ggaaaaaact |
24686670 |
T |
|
| Q |
873 |
ttcttttcaatgccccaatcatctaacatttctaaaacctttcaagct-aatctcgcccactatgtgggggttccatgtgagcaaatgctaaaattttac |
971 |
Q |
| |
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|
| T |
24686671 |
ttcttttcaatgccctagtcatccaacatttccaacaccttcaatgctaaatcccgctcagtatgtgggggttccatatgagcaaatgtcaaaatcttac |
24686770 |
T |
|
| Q |
972 |
gttccaactttcagtccacatcaacataa |
1000 |
Q |
| |
|
|| |||||| || | ||||||||||||| |
|
|
| T |
24686771 |
ttttcaacttccaattcacatcaacataa |
24686799 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 24683907 - 24684124
Alignment:
| Q |
17 |
taattcgagttcctccaccatagctaggctggacttgtaaagagcttagattagaaggaattccattcttgatgtactcggaaaaaagcttccccaaagt |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||| |||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24683907 |
taattcgagttcctcctccataactaggttggacttgtgaagagcttcgattcgaagcaatcccatttgtgacatactcggcaaaaagcttccccaaagt |
24684006 |
T |
|
| Q |
117 |
catcttaacttttttcaacttctcctcactaatgagtgggtcaagtttttcataagcaaatttcaaaaagttaaacttatttggttggatcaagaacagc |
216 |
Q |
| |
|
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|
| T |
24684007 |
catcttaacttttttcaacttctcctcactagtgattgggtcatgtttttcataaggaaaattcaaaaagtt-aagtttttttgttggatcaagaacaac |
24684105 |
T |
|
| Q |
217 |
cccaactgccaaaccaaca |
235 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
24684106 |
cccaaatgccaaacaaaca |
24684124 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 844; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 844; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 1000
Target Start/End: Original strand, 4697158 - 4698147
Alignment:
| Q |
10 |
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109 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4697158 |
gatgatgtaattcgagttcctccaccatagctaggctggacttgtgaagagcttagattagaaggaattccattcttgatgtactcggaaaaaagcttcc |
4697257 |
T |
|
| Q |
110 |
ccaaagtcatcttaacttttttcaacttctcctcactaatgagtgggtcaagtttttcataagcaaatttcaaaaagttaaacttatttggttggatcaa |
209 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
4697258 |
ccaaagtcatcttaacttttttcaacttctcctcacttgtgagcgggtcaagtttttcataagcaaatttcaaaaagttaaactt-tttggttggatcaa |
4697356 |
T |
|
| Q |
210 |
gaacagccccaactgccaaaccaacattatagtcactccaatacttatcaaatttcaccttcatattttcagccattttttgaattaaaagatcttcact |
309 |
Q |
| |
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|
|
| T |
4697357 |
gaacagccccaactgccaaaacaacattatagtcactccaatacttatcaaatttcaccttcatattttcagccattttttgaattaaaagatcttcact |
4697456 |
T |
|
| Q |
310 |
tgttaaataagatcttatgaggcactcaatcttccatatttcaccaaagtacatatttgatgtaggatatgaagagccagatatcaagtttgtaatagtg |
409 |
Q |
| |
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|
| T |
4697457 |
tgtcagataagatcttatgaggcactcaatcttccatatttcaccaaagtacagatttgatgtaggatatgaagagccagatatcaagtttgtaatagtg |
4697556 |
T |
|
| Q |
410 |
aaaaatggcttcaaaatctcacacattatttcagcccttctccactcctcaattgtaggacaacacttaaaatttgaatcccgtaaacttaagctataaa |
509 |
Q |
| |
|
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|
| T |
4697557 |
aaaaatggcttcaaaatctcacacattatttcagcccttctccactcctcacttgtaggacaacacttaaaatttgaatcccgtaaacttaagctataaa |
4697656 |
T |
|
| Q |
510 |
atgcacgacgataaacaagcgcactctgtagcattataaaagtggaattccatcgagtaacacaatctaatctcaatcctatggttgtatcaatatcacc |
609 |
Q |
| |
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| T |
4697657 |
atgcacgacgataaacaagcgcactctgtagcattatataagtggaattccatcgggtaacacaatctaatctcaatcctatggttgtatcaatgtcacc |
4697756 |
T |
|
| Q |
610 |
aacagttctaacacattcggaaaaaagtagtgttctactttctgttaccctcacataagccacactttgtctaatcttatgcaaagcatcgctgattacc |
709 |
Q |
| |
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|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |
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|
| T |
4697757 |
aacaattctaacacattcggaaaaaagtagtgttctaccttctgttaccctcacataagccacactttgtctaatcttatgcaaagcatcactaactacc |
4697856 |
T |
|
| Q |
710 |
ttgagtccatcttgaacaacgaggttcaagatgtgagctgagcatcttatatggaaaaattctccatcaagcaacaaactatttgataaccctagatgct |
809 |
Q |
| |
|
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|
| T |
4697857 |
ttcagtccatcttgaacaatgaggttcaagatgtgagctgagcatcttatatggaaaaattctccatcaagcaacaaactatttgataaacttagatgct |
4697956 |
T |
|
| Q |
810 |
ctttcaaaaagttagccatactgttgtttgcagaagcattatctaaagtgatgggaaaaaattttcttttcaatgccccaatcatctaacatttctaaaa |
909 |
Q |
| |
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|
| T |
4697957 |
ctttcaaaaagttagccatactattgtttgcagaagcattatctaaagtgat-ggaaaaaattttcttttcaatgccccaatcatctaacatttctaaaa |
4698055 |
T |
|
| Q |
910 |
cctttcaagct-aatctcgcccactatgtgggggttccatgtgagcaaatgctaaaattttacgttccaactttcagtccacatcaacataa |
1000 |
Q |
| |
|
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|
| T |
4698056 |
ccttcaaagctaaatctcgcccactatgtgggggttccatgtgagcaaatgctaaaatcttactttctaacttccaattcacattaacataa |
4698147 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 741; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 1000
Target Start/End: Original strand, 4971778 - 4972757
Alignment:
| Q |
17 |
taattcgagttcctccaccatagctaggctggacttgtaaagagcttagattagaaggaattccattcttgatgtactcggaaaaaagcttccccaaagt |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |
|
|
| T |
4971778 |
taattcgagttcctccaccatagttaggctggacttgtgaagagcttagattagaaggaattccattcttgatgtactcgggaaaaagcttccccaaaat |
4971877 |
T |
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117 |
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216 |
Q |
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4971976 |
T |
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217 |
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316 |
Q |
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T |
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416 |
Q |
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T |
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417 |
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516 |
Q |
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| T |
4972177 |
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4972275 |
T |
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517 |
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616 |
Q |
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4972375 |
T |
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| Q |
617 |
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716 |
Q |
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4972376 |
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4972474 |
T |
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717 |
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816 |
Q |
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4972475 |
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4972574 |
T |
|
| Q |
817 |
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916 |
Q |
| |
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| T |
4972575 |
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4972672 |
T |
|
| Q |
917 |
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1000 |
Q |
| |
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| T |
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agctaaatctcgcccactatgtgggggttccatgtgagcaaatgccaaaatcttattttgcaacttccaattcacatcaacataa |
4972757 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 874 - 1000
Target Start/End: Complemental strand, 35840785 - 35840658
Alignment:
| Q |
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972 |
Q |
| |
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T |
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Q |
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35840685 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 836; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 836; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 1000
Target Start/End: Original strand, 22190573 - 22191562
Alignment:
| Q |
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109 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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209 |
Q |
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| T |
22190673 |
ccaaagtcatcttaacttttttcaacttctcctcactagtgagtgggtcaagtttttcataagcaaatttcaaaaagttaaactt-tttggttggatcaa |
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T |
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| Q |
210 |
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309 |
Q |
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| T |
22190772 |
gaacagccacaactgccaaaacaacattatagtcactacaatacttatcaaatttcaccttcatactttcagccattttttgaattaaaagatcttcact |
22190871 |
T |
|
| Q |
310 |
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409 |
Q |
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| T |
22190872 |
tgtcaaataagatcttatgaggcactcaatcttccatatttcaccaaagtacagatttgatgtaggatatgaagagccagatatcaagtttgtaatagtg |
22190971 |
T |
|
| Q |
410 |
aaaaatggcttcaaaatctcacacattatttcagcccttctccactcctcaattgtaggacaacacttaaaatttgaatcccgtaaacttaagctataaa |
509 |
Q |
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| T |
22190972 |
aaaaatggcttcaaaatctcacacattatttcagcccttctccactcttcacttgtaggacaacgcttaaaatttgaatcccgtaaacttaagctataaa |
22191071 |
T |
|
| Q |
510 |
atgcacgacgataaacaagcgcactctgtagcattataaaagtggaattccatcgagtaacacaatctaatctcaatcctatggttgtatcaatatcacc |
609 |
Q |
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| T |
22191072 |
atgcacgacgataaacaagcgcactctgtagcattataaaagtggaattccatcgagtaacacaatctaatctcaatcctatggttgtatcaatatcacc |
22191171 |
T |
|
| Q |
610 |
aacagttctaacacattcggaaaaaagtagtgttctactttctgttaccctcacataagccacactttgtctaatcttatgcaaagcatcgctgattacc |
709 |
Q |
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| T |
22191172 |
aacagttctaacacattcagaaaaaagtagtgttctactttctgttaccctcacataagccacactttgtctaatcttatgcaaagcatcgctaactacc |
22191271 |
T |
|
| Q |
710 |
ttgagtccatcttgaacaacgaggttcaagatgtgagctgagcatcttatatggaaaaattctccatcaagcaacaaactatttgataaccctagatgct |
809 |
Q |
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| T |
22191272 |
ttgagtccatcttgaacaatgaggttcaagatgtgagctgagcatcttatatggaaaaattctccatcaagcaacaaactatttgataaccctaggtgtt |
22191371 |
T |
|
| Q |
810 |
ctttcaaaaagttagccatactgttgtttgcagaagcattatctaaagtgatgggaaaaaattttcttttcaatgccccaatcatctaacatttctaaaa |
909 |
Q |
| |
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| T |
22191372 |
ctttcaaaaagttagccatactgttgtttgcagaagcattatctaaagtgat-ggaaaaaaatttcttttcaatgccccaatcatctaacatttccaaaa |
22191470 |
T |
|
| Q |
910 |
cctttcaagct-aatctcgcccactatgtgggggttccatgtgagcaaatgctaaaattttacgttccaactttcagtccacatcaacataa |
1000 |
Q |
| |
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| T |
22191471 |
ccttcaaagctaaatctcgcccactatgtgggggttccatgtgagcaaatgccaaaatcttattttgcaacttccaattcacatcaacataa |
22191562 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 20142266 - 20141767
Alignment:
| Q |
10 |
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109 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20142266 |
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20142167 |
T |
|
| Q |
110 |
ccaaagtcatcttaacttttttcaacttctcctcactaatgagtgggtcaagtttttcataagcaaatttcaaaaagttaaacttatttggttggatcaa |
209 |
Q |
| |
|
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|
| T |
20142166 |
ccaaagtcatcttaacttttttcaacttctcctcactagtgagtgggtcaagtttttcataagcaaatttcaaaaagttaaactt-tttggttggatcaa |
20142068 |
T |
|
| Q |
210 |
gaacagccccaactgccaaaccaacattatagtcactccaatacttatcaaatttcaccttcatattttcagccattttttgaattaaaagatcttcact |
309 |
Q |
| |
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|
|
| T |
20142067 |
gaacagccgcaactgccaaaacaacattatagtcactacaatacttatcaaatttcaccttcatactttcagccattttttgaattaaaagatcttcact |
20141968 |
T |
|
| Q |
310 |
tgttaaataagatcttatgaggcactcaatcttccatatttcaccaaagtacatatttgatgtaggatatgaagagccagatatcaagtttgtaatagtg |
409 |
Q |
| |
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| T |
20141967 |
tgtcaaataagatcttatgaggcactcaatcttccatatttcaccaaaatacagatttgatgtaggatatgaagagccggatatcaagtttgtaatggtg |
20141868 |
T |
|
| Q |
410 |
aaaaatggcttcaaaatctcacacattatttcagcccttctccactcctcaattgtaggacaacacttaaaatttgaatcccgtaaacttaagctataaa |
509 |
Q |
| |
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|
| T |
20141867 |
aaaaatggcttcaaaatctcacacattgtttcagcccttctccactcctcacttgtaggacaacacttaaaatttgaatcccgtaaacttaagctataaa |
20141768 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 545 - 1000
Target Start/End: Complemental strand, 20141762 - 20141307
Alignment:
| Q |
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644 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
20141762 |
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20141663 |
T |
|
| Q |
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tactttctgttaccctcacataagccacactttgtctaatcttatgcaaagcatcgctgattaccttgagtccatcttgaacaacgaggttcaagatgtg |
744 |
Q |
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| T |
20141662 |
tactttcagttaccctcacataagccacactttgtctaatcttatgcaatgcatcactaaccaccttgagtccatcttgaacaatgaggttcaagatgtg |
20141563 |
T |
|
| Q |
745 |
agctgagcatcttatatggaaaaattctccatcaagcaacaaactatttgataaccctagatgctctttcaaaaagttagccatactgttgtttgcagaa |
844 |
Q |
| |
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| T |
20141562 |
agctgagcatcttatatggaaaaattctccatcaagcaacaaactatttgataaccctaggtgttctttcaaaaagttagccatactgttgtttgcagaa |
20141463 |
T |
|
| Q |
845 |
gcattatctaaagtgatgggaaaaaattttcttttcaatgccccaatcatctaacatttctaaaacctttcaagct-aatctcgcccactatgtgggggt |
943 |
Q |
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| T |
20141462 |
gcattatctaaagtgat-ggaaaaaaatttcttttcaatgccccaatcatctaacatttccaaaaccttcaaagctaaatctcgcccactatgtgggggt |
20141364 |
T |
|
| Q |
944 |
tccatgtgagcaaatgctaaaattttacgttccaactttcagtccacatcaacataa |
1000 |
Q |
| |
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| T |
20141363 |
tccatgtgagcaaatgccaaaatcttattttgcaacttccaattcacatcaacataa |
20141307 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 583; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 583; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 650
Target Start/End: Original strand, 3411265 - 3411901
Alignment:
| Q |
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
3411265 |
gatgatgtaattcgagttcctccaccatagctaggctggacttgtgaagagcttagattagaaggaattccattcttgatgtactcggaaaaaagcttcc |
3411364 |
T |
|
| Q |
110 |
ccaaagtcatcttaacttttttcaacttctcctcactaatgagtgggtcaagtttttcataagcaaatttcaaaaagttaaacttatttggttggatcaa |
209 |
Q |
| |
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| T |
3411365 |
ccaaagtcat---aacttttttcaacttctcctcactagtgagtgggtcaagtttttcataagcaaatttcaaaaagttaaactt-tttggttggatcaa |
3411460 |
T |
|
| Q |
210 |
gaacagccccaactgccaaaccaacattatagtcactccaatacttatcaaatttcaccttcatattttcagccattttttgaattaaaagatcttcact |
309 |
Q |
| |
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| T |
3411461 |
gaacagccccaactgccaaaacaacattatagtcactccaatacttatcaaatttcaccttcatactttcagccattttttgaattaaaagatcttcact |
3411560 |
T |
|
| Q |
310 |
tgttaaataagatcttatgaggcactcaatcttccatatttcaccaaagtacatatttgatgtaggatatgaagagccagatatcaagtttgtaatagtg |
409 |
Q |
| |
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| T |
3411561 |
tgtcaaataagatcttatgaggcactcaatcttccatatttcaccaaagtacagatttgatgtaggatatgaagagccagatatcaagtttgtaatagtg |
3411660 |
T |
|
| Q |
410 |
aaaaatggcttcaaaatctcacacattatttcagcccttctccactcctcaattgtaggacaacacttaaaatttgaatcccgtaaacttaagctataaa |
509 |
Q |
| |
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| T |
3411661 |
aaaaatggcttcaaaatctcacacattatttcagcccttctccactcttcacttgtaggacaacgcttaaaatttgaatcccgtaaacttaagctataaa |
3411760 |
T |
|
| Q |
510 |
atgcacgacgataaacaagcgcactctgtagcattataaaagtggaattccatcgagtaacacaatctaatctcaatcctatggttgtatcaatatcacc |
609 |
Q |
| |
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| T |
3411761 |
atgcacgacgataaacaagcgcactctgtagcattataaaagtggaattccatcgagtaacacaatctaatctcaatcctatggttgtatcaatatcacc |
3411860 |
T |
|
| Q |
610 |
aacagttctaacacattcggaaaaaagtagtgttctacttt |
650 |
Q |
| |
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|
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| T |
3411861 |
aacagttctaacacattcggaaaaaagtagtgttctacttt |
3411901 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 148; Significance: 1e-77; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 250 - 613
Target Start/End: Original strand, 8097887 - 8098250
Alignment:
| Q |
250 |
atacttatcaaatttcaccttcatattttcagccattttttgaattaaaagatcttcacttgttaaataagatcttatgaggcactcaatcttccatatt |
349 |
Q |
| |
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|
|
| T |
8097887 |
atacttgtcaaatttttccttcatagttctagccatgttttgaatcaacaaatcctcacttatcaaataagatcttacaatacactctatcttccatatt |
8097986 |
T |
|
| Q |
350 |
tcaccaaagtacatatttgatgtaggatatgaagagccagatatcaagtttgtaatagtgaaaaatggcttcaaaatctcacacattatttcagcccttc |
449 |
Q |
| |
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| T |
8097987 |
tctccaaaatacaaatttgatgcaggataagaagacggggatatcaagcttgtgatattgtaaaatggcttcaaaatctcacacattatttcaacccttc |
8098086 |
T |
|
| Q |
450 |
tccactcctcaattgtaggacaacacttaaaatttgaatcccgtaaacttaagctataaaatgcacgacgataaacaagcgcactctgtagcattataaa |
549 |
Q |
| |
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| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |
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| T |
8098087 |
ttcactcatcacttgtaggacaacacttaaaattgaaatcgcaaaaacttaagctataaaaagcacgacgataattaatcgcactctgaagcattataaa |
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T |
|
| Q |
550 |
agtggaattccatcgagtaacacaatctaatctcaatcctatggttgtatcaatatcaccaaca |
613 |
Q |
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agtggagtttcatctagtaacacaatccaatcttaatccaattgttgcattaatatcaccaaca |
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T |
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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 139
Target Start/End: Original strand, 8097662 - 8097787
Alignment:
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17 |
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Q |
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taattcgagttccttctccatagctaggttgcacttgtgaagatcttggattagaagaaggaatctcatgtttgacatactcgacaaaaagcttctccaa |
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T |
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114 |
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139 |
Q |
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T |
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