View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5665-Insertion-2 (Length: 1023)

Name: NF5665-Insertion-2
Description: NF5665
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5665-Insertion-2
NF5665-Insertion-2
[»] chr4 (167 HSPs)
chr4 (441-1017)||(16931774-16932360)
chr4 (441-1017)||(16934128-16934714)
chr4 (441-1015)||(9176461-9177035)
chr4 (441-1017)||(22782723-22783317)
chr4 (441-1017)||(22780358-22780952)
chr4 (441-1017)||(18846923-18847500)
chr4 (499-1017)||(11008553-11009074)
chr4 (667-1017)||(44599823-44600174)
chr4 (641-1017)||(9174131-9174508)
chr4 (641-1017)||(11006222-11006603)
chr4 (641-1017)||(11434926-11435302)
chr4 (641-1017)||(22044376-22044752)
chr4 (641-1017)||(22046671-22047047)
chr4 (641-1017)||(51015217-51015593)
chr4 (641-1017)||(5198391-5198768)
chr4 (641-1017)||(9148222-9148600)
chr4 (667-1017)||(8631404-8631759)
chr4 (667-1017)||(2484858-2485209)
chr4 (667-1019)||(40637071-40637424)
chr4 (641-1005)||(38409170-38409540)
chr4 (708-1017)||(18709149-18709458)
chr4 (641-1015)||(24888767-24889142)
chr4 (641-1017)||(31849584-31849961)
chr4 (641-1017)||(37089357-37089736)
chr4 (641-1015)||(48486290-48486665)
chr4 (641-1023)||(7941290-7941677)
chr4 (641-1017)||(22802719-22803096)
chr4 (641-1019)||(22800845-22801224)
chr4 (667-1017)||(24348211-24348566)
chr4 (667-1011)||(22132383-22132735)
chr4 (667-1017)||(6764836-6765192)
chr4 (644-1019)||(40091398-40091774)
chr4 (644-1019)||(24878963-24879340)
chr4 (641-1019)||(24880422-24880802)
chr4 (667-1017)||(14633317-14633666)
chr4 (641-1017)||(47274698-47275073)
chr4 (667-1015)||(47868398-47868747)
chr4 (708-1017)||(22134603-22134909)
chr4 (641-1019)||(36919567-36919949)
chr4 (668-1019)||(38928160-38928513)
chr4 (641-1019)||(36921476-36921857)
chr4 (667-1019)||(17662228-17662574)
chr4 (668-1019)||(12395828-12396180)
chr4 (641-944)||(5637524-5637831)
chr4 (667-1019)||(36378289-36378643)
chr4 (668-1019)||(12400790-12401142)
chr4 (669-1019)||(33415471-33415821)
chr4 (668-1019)||(19095880-19096233)
chr4 (743-1017)||(26085962-26086236)
chr4 (667-1019)||(619431-619783)
chr4 (667-1005)||(14787426-14787769)
chr4 (669-1019)||(37313048-37313400)
chr4 (667-1019)||(16453306-16453660)
chr4 (667-994)||(47210761-47211082)
chr4 (641-946)||(3824627-3824935)
chr4 (669-995)||(56030443-56030766)
chr4 (674-1019)||(19322701-19323045)
chr4 (669-979)||(13543953-13544268)
chr4 (672-1007)||(41997494-41997830)
chr4 (668-979)||(18537498-18537806)
chr4 (667-1005)||(53405124-53405469)
chr4 (632-921)||(52942542-52942818)
chr4 (668-1007)||(18409342-18409681)
chr4 (668-899)||(3937314-3937543)
chr4 (746-1019)||(36380425-36380700)
chr4 (667-978)||(8756276-8756586)
chr4 (668-889)||(6132871-6133090)
chr4 (668-977)||(18534858-18535164)
chr4 (818-1019)||(13547302-13547504)
chr4 (783-1005)||(16455354-16455578)
chr4 (441-636)||(9174490-9174684)
chr4 (750-1007)||(38890219-38890476)
chr4 (865-1017)||(11437557-11437710)
chr4 (668-831)||(38270158-38270321)
chr4 (667-993)||(15032557-15032872)
chr4 (866-1017)||(5635461-5635614)
chr4 (668-831)||(24446756-24446914)
chr4 (848-1020)||(4215483-4215657)
chr4 (441-636)||(11006585-11006781)
chr4 (812-1019)||(2891433-2891642)
chr4 (753-1019)||(27499128-27499392)
chr4 (668-1007)||(12102088-12102427)
chr4 (443-588)||(51015042-51015187)
chr4 (669-1007)||(28453686-28454022)
chr4 (667-806)||(5100994-5101133)
chr4 (440-590)||(37089764-37089915)
chr4 (674-1007)||(9863712-9864051)
chr4 (440-558)||(7941132-7941251)
chr4 (668-787)||(2891314-2891434)
chr4 (440-558)||(11434768-11434887)
chr4 (675-995)||(10112876-10113196)
chr4 (758-1019)||(30136640-30136900)
chr4 (441-627)||(5637822-5638006)
chr4 (441-588)||(36919979-36920125)
chr4 (667-1007)||(16185829-16186173)
chr4 (443-588)||(22803125-22803270)
chr4 (441-589)||(3824964-3825112)
chr4 (667-1019)||(25357634-25357993)
chr4 (441-590)||(38408993-38409142)
chr4 (441-588)||(31849991-31850138)
chr4 (441-588)||(22044781-22044930)
chr4 (439-588)||(24888588-24888737)
chr4 (441-582)||(36921893-36922033)
chr4 (669-884)||(40999071-40999281)
chr4 (805-966)||(31983564-31983727)
chr4 (809-979)||(3982200-3982374)
chr4 (724-969)||(9022362-9022605)
chr4 (872-1019)||(5101130-5101278)
chr4 (806-921)||(47150977-47151092)
chr4 (464-558)||(22801262-22801356)
chr4 (821-979)||(11853549-11853705)
chr4 (446-579)||(52942869-52943002)
chr4 (527-588)||(5198300-5198361)
chr4 (441-588)||(48486113-48486260)
chr4 (939-1002)||(5269220-5269284)
chr4 (939-995)||(10047391-10047447)
chr4 (939-995)||(39246006-39246062)
chr4 (821-979)||(7050282-7050439)
chr4 (919-1019)||(47563010-47563111)
chr4 (527-579)||(9148140-9148192)
chr4 (528-588)||(22047076-22047135)
chr4 (939-995)||(36315258-36315314)
chr4 (939-995)||(36329467-36329523)
chr4 (821-973)||(4570094-4570245)
chr4 (821-884)||(5336903-5336964)
chr4 (824-979)||(8529270-8529424)
chr4 (824-979)||(18586969-18587123)
chr4 (824-979)||(31300427-31300580)
chr4 (889-1007)||(3578666-3578786)
chr4 (534-611)||(47868288-47868365)
chr4 (939-1002)||(5143263-5143327)
chr4 (939-995)||(5396700-5396756)
chr4 (939-995)||(6743444-6743500)
chr4 (750-864)||(10114412-10114520)
chr4 (667-739)||(16455284-16455356)
chr4 (824-884)||(16489352-16489410)
chr4 (441-525)||(22048491-22048575)
chr4 (891-966)||(24446678-24446754)
chr4 (824-884)||(25699752-25699810)
chr4 (909-1006)||(26557823-26557923)
chr4 (939-995)||(38152468-38152524)
chr4 (824-979)||(4556085-4556238)
chr4 (939-994)||(24333822-24333877)
chr4 (806-934)||(54906722-54906852)
chr4 (938-1019)||(6133105-6133187)
chr4 (824-979)||(15831144-15831298)
chr4 (856-894)||(38270120-38270158)
chr4 (940-994)||(39774335-39774389)
chr4 (545-590)||(619837-619882)
chr4 (534-611)||(16689303-16689380)
chr4 (940-993)||(34495853-34495906)
chr4 (538-610)||(4556422-4556494)
chr4 (824-884)||(4558314-4558372)
chr4 (824-884)||(15316961-15317019)
chr4 (939-995)||(16623322-16623378)
chr4 (939-1002)||(25862051-25862115)
chr4 (939-995)||(31985663-31985718)
chr4 (939-995)||(54867196-54867251)
chr4 (940-995)||(1983330-1983385)
chr4 (821-884)||(55822265-55822326)
chr4 (667-697)||(22134936-22134966)
chr4 (939-985)||(28468558-28468604)
chr4 (546-588)||(52942839-52942881)
chr4 (938-979)||(4884990-4885031)
chr4 (441-486)||(8528918-8528963)
chr4 (441-486)||(26086247-26086292)
chr4 (938-979)||(36769595-36769636)
[»] chr1 (149 HSPs)
chr1 (445-1017)||(16225891-16226461)
chr1 (441-1017)||(47179428-47180006)
chr1 (441-1017)||(47177078-47177655)
chr1 (641-1017)||(51749956-51750333)
chr1 (667-1017)||(9463231-9463588)
chr1 (641-1017)||(28840595-28840973)
chr1 (667-1017)||(9459404-9459761)
chr1 (667-1017)||(20302402-20302752)
chr1 (641-1017)||(10399815-10400192)
chr1 (641-1015)||(6822932-6823306)
chr1 (641-1017)||(13761754-13762130)
chr1 (641-1017)||(51752282-51752657)
chr1 (641-1019)||(15823463-15823842)
chr1 (644-1005)||(28842413-28842776)
chr1 (667-1017)||(31735508-31735863)
chr1 (641-1005)||(13214998-13215368)
chr1 (668-1015)||(2617460-2617808)
chr1 (667-1019)||(27336925-27337280)
chr1 (667-1005)||(20291400-20291738)
chr1 (716-1017)||(46431693-46431996)
chr1 (641-1019)||(38925466-38925842)
chr1 (667-1019)||(47906207-47906566)
chr1 (667-1019)||(27339116-27339472)
chr1 (667-1019)||(17324621-17324974)
chr1 (641-1019)||(41646837-41647216)
chr1 (670-1017)||(15294821-15295183)
chr1 (641-1019)||(39462436-39462815)
chr1 (668-1019)||(50307530-50307884)
chr1 (667-1019)||(12302490-12302848)
chr1 (670-967)||(21948226-21948526)
chr1 (667-1023)||(24325599-24325963)
chr1 (670-1017)||(39932017-39932368)
chr1 (667-1019)||(6995685-6996038)
chr1 (646-1019)||(14097954-14098329)
chr1 (667-1017)||(2510312-2510666)
chr1 (667-1019)||(16428596-16428950)
chr1 (668-1019)||(17186112-17186465)
chr1 (668-1019)||(11457460-11457812)
chr1 (669-1019)||(18307054-18307405)
chr1 (641-1019)||(28207053-28207430)
chr1 (791-1017)||(16231630-16231856)
chr1 (667-1019)||(28998238-28998591)
chr1 (667-1019)||(29003954-29004307)
chr1 (668-1019)||(50076657-50077009)
chr1 (668-1019)||(50078805-50079158)
chr1 (641-921)||(6823801-6824088)
chr1 (668-1019)||(18839531-18839884)
chr1 (669-1019)||(25251259-25251611)
chr1 (667-995)||(9241095-9241424)
chr1 (667-1019)||(2949217-2949569)
chr1 (644-1015)||(3579606-3579979)
chr1 (667-1019)||(6756470-6756824)
chr1 (667-946)||(48665114-48665400)
chr1 (668-1019)||(31489859-31490208)
chr1 (689-1019)||(31425000-31425335)
chr1 (708-1019)||(25127856-25128169)
chr1 (708-1019)||(4131360-4131676)
chr1 (632-995)||(47451556-47451913)
chr1 (668-1019)||(50248555-50248909)
chr1 (669-1019)||(17318838-17319183)
chr1 (820-1017)||(23785935-23786133)
chr1 (667-938)||(31422940-31423212)
chr1 (668-1005)||(17324009-17324346)
chr1 (668-1019)||(14183575-14183923)
chr1 (471-764)||(16231371-16231641)
chr1 (667-980)||(42922177-42922487)
chr1 (717-1019)||(40133937-40134241)
chr1 (667-980)||(15669418-15669729)
chr1 (667-980)||(8347297-8347607)
chr1 (816-1017)||(51757623-51757824)
chr1 (667-977)||(18800600-18800907)
chr1 (441-706)||(23783238-23783533)
chr1 (715-1019)||(16432396-16432692)
chr1 (669-980)||(8349076-8349385)
chr1 (441-627)||(51752104-51752291)
chr1 (809-1019)||(16429042-16429254)
chr1 (440-627)||(51749777-51749965)
chr1 (667-979)||(49495236-49495537)
chr1 (441-627)||(13761577-13761763)
chr1 (791-1015)||(25248540-25248766)
chr1 (866-1019)||(23816027-23816182)
chr1 (674-1007)||(13125453-13125787)
chr1 (804-1019)||(6115087-6115304)
chr1 (441-590)||(20302198-20302348)
chr1 (461-627)||(6823643-6823810)
chr1 (441-558)||(6822775-6822893)
chr1 (674-913)||(26520206-26520449)
chr1 (641-980)||(30790426-30790758)
chr1 (667-1007)||(27916440-27916782)
chr1 (441-588)||(10400222-10400369)
chr1 (806-967)||(155788-155950)
chr1 (669-763)||(25248756-25248850)
chr1 (806-1007)||(30738623-30738830)
chr1 (802-1007)||(16561544-16561753)
chr1 (441-585)||(15823286-15823430)
chr1 (806-1019)||(26613224-26613440)
chr1 (747-1019)||(28279292-28279565)
chr1 (441-546)||(20291280-20291386)
chr1 (440-588)||(28840417-28840565)
chr1 (824-979)||(21353373-21353525)
chr1 (929-1017)||(13358778-13358867)
chr1 (441-581)||(28842233-28842373)
chr1 (939-1002)||(16124545-16124609)
chr1 (806-882)||(26332613-26332688)
chr1 (534-611)||(13449919-13449996)
chr1 (441-627)||(39462258-39462445)
chr1 (821-979)||(2232597-2232747)
chr1 (674-825)||(13127813-13127959)
chr1 (939-995)||(13598410-13598466)
chr1 (806-884)||(14353047-14353126)
chr1 (897-979)||(15916562-15916646)
chr1 (939-995)||(29651823-29651879)
chr1 (939-995)||(47703965-47704021)
chr1 (821-884)||(4144804-4144865)
chr1 (940-995)||(19072940-19072995)
chr1 (940-995)||(19120830-19120885)
chr1 (940-995)||(47098854-47098909)
chr1 (438-523)||(47451402-47451488)
chr1 (724-849)||(26332719-26332836)
chr1 (942-995)||(3281720-3281773)
chr1 (940-993)||(32889453-32889506)
chr1 (939-995)||(9476273-9476329)
chr1 (943-995)||(26644930-26644982)
chr1 (939-1002)||(27104401-27104465)
chr1 (548-627)||(28207421-28207500)
chr1 (528-611)||(30790764-30790848)
chr1 (701-740)||(6115344-6115383)
chr1 (821-884)||(14997040-14997101)
chr1 (668-739)||(26613503-26613577)
chr1 (810-977)||(43104245-43104414)
chr1 (940-995)||(47102871-47102926)
chr1 (824-979)||(2401246-2401400)
chr1 (824-979)||(9526469-9526623)
chr1 (938-979)||(21536597-21536638)
chr1 (474-581)||(13214854-13214961)
chr1 (667-719)||(16431044-16431096)
chr1 (824-884)||(25134074-25134132)
chr1 (939-995)||(37069782-37069838)
chr1 (940-991)||(775688-775739)
chr1 (527-590)||(3580010-3580073)
chr1 (939-985)||(24202798-24202844)
chr1 (443-523)||(38925915-38925996)
chr1 (939-984)||(13604652-13604697)
chr1 (939-984)||(19358872-19358917)
chr1 (939-984)||(19361461-19361506)
chr1 (939-984)||(19380101-19380146)
chr1 (668-740)||(30738890-30738963)
chr1 (667-696)||(43104102-43104131)
chr1 (667-696)||(46432037-46432066)
[»] chr5 (150 HSPs)
chr5 (441-1017)||(31544798-31545374)
chr5 (440-1017)||(31542441-31543028)
chr5 (499-1008)||(31179365-31179896)
chr5 (641-1017)||(38882022-38882399)
chr5 (641-1017)||(2174836-2175212)
chr5 (641-1017)||(4236546-4236922)
chr5 (708-1017)||(15552229-15552539)
chr5 (641-1017)||(25921458-25921835)
chr5 (667-1019)||(39854427-39854779)
chr5 (667-1017)||(10529083-10529435)
chr5 (708-1005)||(34477050-34477349)
chr5 (642-1018)||(16776075-16776452)
chr5 (708-1017)||(34479403-34479714)
chr5 (641-1017)||(21684437-21684823)
chr5 (641-1019)||(21947944-21948322)
chr5 (670-1019)||(18511195-18511547)
chr5 (641-1019)||(2818318-2818698)
chr5 (708-1020)||(6745053-6745365)
chr5 (669-1005)||(18466625-18466966)
chr5 (668-1019)||(25904047-25904399)
chr5 (667-1023)||(6747247-6747604)
chr5 (708-1017)||(25804009-25804318)
chr5 (667-1019)||(40221465-40221819)
chr5 (441-704)||(10749505-10749767)
chr5 (667-1017)||(27912473-27912830)
chr5 (667-995)||(18468950-18469280)
chr5 (670-1019)||(18509301-18509652)
chr5 (667-1017)||(27910388-27910744)
chr5 (668-1005)||(17072827-17073166)
chr5 (671-1019)||(10474306-10474655)
chr5 (667-1019)||(26097676-26098027)
chr5 (668-1019)||(24126800-24127152)
chr5 (641-1019)||(36402311-36402689)
chr5 (668-1019)||(1189590-1189949)
chr5 (668-1019)||(31472595-31472948)
chr5 (667-1016)||(18596590-18596939)
chr5 (667-1019)||(6756437-6756788)
chr5 (708-1019)||(16092182-16092495)
chr5 (667-1005)||(37705777-37706116)
chr5 (676-1019)||(2954368-2954712)
chr5 (675-1020)||(17818474-17818817)
chr5 (791-1017)||(4410090-4410316)
chr5 (441-696)||(34477379-34477632)
chr5 (641-1019)||(31465972-31466340)
chr5 (668-1019)||(695833-696174)
chr5 (667-1017)||(10586782-10587126)
chr5 (639-1019)||(12555906-12556287)
chr5 (668-1019)||(39397976-39398327)
chr5 (668-921)||(34530749-34531001)
chr5 (441-708)||(15354777-15355065)
chr5 (441-708)||(15357053-15357341)
chr5 (668-883)||(20042994-20043208)
chr5 (820-1017)||(3373122-3373320)
chr5 (820-1017)||(10749796-10749993)
chr5 (746-1019)||(658339-658610)
chr5 (441-665)||(10756960-10757183)
chr5 (668-887)||(20044954-20045172)
chr5 (441-711)||(23664834-23665125)
chr5 (441-711)||(23793462-23793753)
chr5 (820-1017)||(15354560-15354757)
chr5 (820-1017)||(23665140-23665337)
chr5 (820-1017)||(23793250-23793447)
chr5 (820-1017)||(38960117-38960314)
chr5 (441-665)||(23667109-23667332)
chr5 (820-1017)||(10757273-10757469)
chr5 (820-1017)||(15356836-15357033)
chr5 (800-1017)||(39798123-39798341)
chr5 (673-1020)||(6661167-6661512)
chr5 (675-1019)||(21288715-21289057)
chr5 (827-1017)||(23741844-23742034)
chr5 (803-1019)||(20505826-20506041)
chr5 (667-876)||(26098379-26098587)
chr5 (791-1019)||(41585727-41585956)
chr5 (441-696)||(34479740-34479972)
chr5 (786-1019)||(2723964-2724189)
chr5 (441-711)||(38960334-38960604)
chr5 (669-978)||(9020167-9020473)
chr5 (667-800)||(20507665-20507798)
chr5 (439-627)||(38881843-38882031)
chr5 (711-1019)||(20053834-20054133)
chr5 (668-995)||(36208524-36208847)
chr5 (441-558)||(25921874-25921992)
chr5 (820-995)||(23667415-23667589)
chr5 (441-558)||(2174680-2174797)
chr5 (724-980)||(17413189-17413441)
chr5 (445-588)||(4236374-4236517)
chr5 (667-764)||(4410000-4410101)
chr5 (439-558)||(39797847-39797966)
chr5 (806-980)||(15143547-15143723)
chr5 (667-893)||(42770717-42770934)
chr5 (724-966)||(2144599-2144840)
chr5 (536-665)||(23742126-23742256)
chr5 (851-939)||(42770936-42771025)
chr5 (653-705)||(10757193-10757245)
chr5 (532-588)||(21684853-21684909)
chr5 (667-763)||(41585946-41586042)
chr5 (824-980)||(4897828-4897986)
chr5 (641-711)||(23742057-23742128)
chr5 (527-588)||(16775983-16776044)
chr5 (441-558)||(659713-659829)
chr5 (441-505)||(21684905-21684969)
chr5 (821-979)||(1170811-1170967)
chr5 (441-523)||(18186504-18186587)
chr5 (724-884)||(4754159-4754312)
chr5 (667-712)||(3373332-3373377)
chr5 (821-979)||(35385477-35385634)
chr5 (724-879)||(29748352-29748502)
chr5 (534-611)||(4409890-4409967)
chr5 (666-711)||(23667355-23667400)
chr5 (441-486)||(31179888-31179933)
chr5 (939-995)||(9353361-9353417)
chr5 (441-523)||(20504369-20504452)
chr5 (441-523)||(20507918-20508001)
chr5 (826-979)||(25445501-25445653)
chr5 (940-992)||(28832274-28832326)
chr5 (939-995)||(36932379-36932435)
chr5 (940-995)||(42127440-42127495)
chr5 (824-979)||(22672837-22672991)
chr5 (919-1019)||(26098271-26098373)
chr5 (938-995)||(11917000-11917057)
chr5 (855-1007)||(15445261-15445417)
chr5 (641-694)||(39798005-39798058)
chr5 (534-611)||(39854317-39854394)
chr5 (939-995)||(10281763-10281819)
chr5 (939-995)||(15464544-15464600)
chr5 (939-995)||(17003989-17004045)
chr5 (441-558)||(31466379-31466496)
chr5 (821-884)||(31782578-31782639)
chr5 (441-523)||(36402762-36402845)
chr5 (824-979)||(25452498-25452652)
chr5 (806-882)||(34033691-34033768)
chr5 (527-576)||(659850-659899)
chr5 (534-611)||(1240171-1240248)
chr5 (821-979)||(2298026-2298183)
chr5 (534-611)||(6744894-6744971)
chr5 (534-611)||(6747137-6747214)
chr5 (806-946)||(35430259-35430403)
chr5 (939-995)||(19588758-19588814)
chr5 (441-523)||(21947770-21947853)
chr5 (534-610)||(42238047-42238123)
chr5 (821-884)||(10627364-10627425)
chr5 (940-995)||(31300626-31300681)
chr5 (668-718)||(2723911-2723961)
chr5 (939-985)||(38192195-38192241)
chr5 (939-985)||(38219420-38219466)
chr5 (667-696)||(2144899-2144928)
chr5 (534-611)||(10529468-10529545)
chr5 (667-696)||(15552178-15552207)
chr5 (820-884)||(32520533-32520597)
chr5 (938-979)||(42238376-42238417)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (439-1017)||(5925-6502)
[»] chr3 (203 HSPs)
chr3 (441-1017)||(38210067-38210644)
chr3 (441-1017)||(50493676-50494273)
chr3 (441-1017)||(6063429-6064006)
chr3 (499-1017)||(25388655-25389179)
chr3 (641-1017)||(6065779-6066157)
chr3 (441-1017)||(38889757-38890314)
chr3 (667-1017)||(458203-458558)
chr3 (667-1017)||(746674-747031)
chr3 (641-1017)||(3859425-3859801)
chr3 (667-1017)||(455826-456181)
chr3 (708-1017)||(10621513-10621823)
chr3 (667-1019)||(4308262-4308615)
chr3 (641-1017)||(5191550-5191925)
chr3 (667-1017)||(4103879-4104233)
chr3 (641-1005)||(11170301-11170666)
chr3 (667-1019)||(43228214-43228567)
chr3 (641-910)||(35777318-35777587)
chr3 (641-1020)||(18099150-18099530)
chr3 (641-1019)||(45882836-45883216)
chr3 (667-1005)||(43226009-43226347)
chr3 (641-1017)||(5522610-5522975)
chr3 (667-1019)||(53917645-53917998)
chr3 (641-1017)||(10084372-10084753)
chr3 (641-1019)||(18096881-18097261)
chr3 (734-1010)||(28413022-28413299)
chr3 (667-1017)||(51726990-51727340)
chr3 (667-1019)||(1313333-1313685)
chr3 (641-1017)||(22114288-22114665)
chr3 (641-1017)||(10956010-10956387)
chr3 (641-1005)||(10958318-10958683)
chr3 (668-1019)||(1626664-1627016)
chr3 (8-253)||(38393631-38393876)
chr3 (668-1019)||(43423444-43423796)
chr3 (641-1019)||(18162561-18162939)
chr3 (667-1017)||(25533357-25533716)
chr3 (632-1019)||(24979595-24979984)
chr3 (641-1017)||(26720445-26720821)
chr3 (667-1019)||(27101162-27101519)
chr3 (708-1019)||(42990268-42990580)
chr3 (667-1019)||(9604588-9604946)
chr3 (668-1019)||(28101983-28102335)
chr3 (708-1019)||(30005805-30006117)
chr3 (669-1019)||(43421396-43421747)
chr3 (668-1019)||(3314608-3314961)
chr3 (644-1005)||(10191305-10191670)
chr3 (667-1019)||(53915477-53915830)
chr3 (441-722)||(53896475-53896754)
chr3 (641-978)||(32264060-32264403)
chr3 (641-1019)||(48361652-48362030)
chr3 (674-960)||(6561740-6562028)
chr3 (667-1019)||(51943294-51943646)
chr3 (668-1019)||(880432-880785)
chr3 (668-1020)||(5926745-5927097)
chr3 (748-1017)||(1321483-1321753)
chr3 (644-1019)||(12267956-12268323)
chr3 (667-973)||(35917971-35918283)
chr3 (668-1019)||(36011751-36012103)
chr3 (668-1019)||(53468434-53468788)
chr3 (708-965)||(29956650-29956907)
chr3 (708-1019)||(47148876-47149188)
chr3 (669-1019)||(51674747-51675087)
chr3 (766-1017)||(7606571-7606822)
chr3 (667-1019)||(28761408-28761762)
chr3 (667-939)||(39715393-39715664)
chr3 (641-1019)||(15780757-15781155)
chr3 (668-900)||(28100143-28100374)
chr3 (641-1019)||(32218992-32219361)
chr3 (667-1019)||(42992205-42992546)
chr3 (668-996)||(889778-890104)
chr3 (668-979)||(54691596-54691906)
chr3 (668-980)||(31151271-31151580)
chr3 (667-1019)||(23633383-23633729)
chr3 (668-905)||(28180948-28181182)
chr3 (668-1002)||(53591119-53591442)
chr3 (757-1019)||(6484372-6484636)
chr3 (805-1019)||(5886261-5886474)
chr3 (805-1019)||(5899734-5899947)
chr3 (441-701)||(5899457-5899717)
chr3 (441-701)||(5885983-5886242)
chr3 (641-812)||(11163047-11163218)
chr3 (669-921)||(23636952-23637199)
chr3 (667-980)||(53597164-53597473)
chr3 (668-893)||(28137415-28137628)
chr3 (667-980)||(13420207-13420506)
chr3 (795-1019)||(25688141-25688367)
chr3 (808-1017)||(11168165-11168375)
chr3 (669-1019)||(27635639-27635959)
chr3 (707-1019)||(4666488-4666790)
chr3 (674-995)||(36871306-36871624)
chr3 (792-1019)||(6231849-6232076)
chr3 (310-441)||(38393439-38393574)
chr3 (668-946)||(54884081-54884357)
chr3 (441-627)||(22114656-22114842)
chr3 (715-980)||(561796-562058)
chr3 (709-836)||(41849117-41849244)
chr3 (751-979)||(17795269-17795494)
chr3 (441-627)||(18099521-18099707)
chr3 (751-979)||(19103709-19103934)
chr3 (751-938)||(25635391-25635575)
chr3 (440-558)||(35777162-35777280)
chr3 (668-798)||(47701798-47701928)
chr3 (667-913)||(1673898-1674140)
chr3 (669-797)||(6231374-6231502)
chr3 (641-849)||(24177176-24177380)
chr3 (872-1020)||(47701651-47701801)
chr3 (442-588)||(5191374-5191520)
chr3 (806-980)||(1620482-1620657)
chr3 (641-744)||(1321338-1321441)
chr3 (667-885)||(4560401-4560599)
chr3 (565-716)||(6719396-6719546)
chr3 (669-787)||(3306724-3306842)
chr3 (822-1019)||(3306839-3307036)
chr3 (441-572)||(18097291-18097422)
chr3 (851-980)||(24181486-24181617)
chr3 (441-588)||(10956417-10956563)
chr3 (441-526)||(7606878-7606963)
chr3 (439-558)||(11162889-11163008)
chr3 (564-636)||(6066139-6066210)
chr3 (498-558)||(6066195-6066255)
chr3 (723-973)||(13419864-13420110)
chr3 (445-570)||(10192401-10192525)
chr3 (441-588)||(26720268-26720415)
chr3 (441-588)||(32264433-32264580)
chr3 (937-1017)||(53894040-53894121)
chr3 (806-939)||(14634504-14634638)
chr3 (824-979)||(29913980-29914132)
chr3 (440-588)||(1321160-1321308)
chr3 (534-588)||(10958713-10958767)
chr3 (543-627)||(3859350-3859434)
chr3 (445-570)||(10085481-10085605)
chr3 (441-556)||(11170145-11170260)
chr3 (821-979)||(10094100-10094256)
chr3 (929-1019)||(41849244-41849335)
chr3 (527-588)||(5523005-5523066)
chr3 (937-1017)||(35919098-35919179)
chr3 (939-995)||(1736324-1736380)
chr3 (939-995)||(18552902-18552958)
chr3 (939-995)||(30709809-30709865)
chr3 (821-979)||(10100117-10100273)
chr3 (821-979)||(10200980-10201136)
chr3 (751-849)||(25633930-25634024)
chr3 (436-486)||(6066246-6066296)
chr3 (441-558)||(6719532-6719651)
chr3 (824-979)||(10897008-10897162)
chr3 (939-993)||(48438228-48438282)
chr3 (824-979)||(54193229-54193383)
chr3 (441-486)||(25388618-25388663)
chr3 (806-991)||(7768632-7768819)
chr3 (939-995)||(8370505-8370561)
chr3 (838-980)||(11007544-11007679)
chr3 (806-884)||(11066652-11066731)
chr3 (939-1002)||(16264354-16264418)
chr3 (939-995)||(27974971-27975027)
chr3 (939-995)||(27986465-27986521)
chr3 (939-1002)||(32143325-32143389)
chr3 (939-995)||(33386685-33386741)
chr3 (940-995)||(1417510-1417565)
chr3 (821-979)||(6303310-6303466)
chr3 (821-979)||(10208026-10208182)
chr3 (821-979)||(27544273-27544429)
chr3 (940-1002)||(37466295-37466358)
chr3 (824-979)||(47878196-47878350)
chr3 (441-486)||(3859317-3859362)
chr3 (534-611)||(4308648-4308725)
chr3 (821-1005)||(5858546-5858728)
chr3 (667-732)||(6484308-6484373)
chr3 (821-979)||(22626009-22626166)
chr3 (441-516)||(32218836-32218912)
chr3 (939-995)||(21711235-21711291)
chr3 (939-995)||(27452970-27453026)
chr3 (824-884)||(27762107-27762165)
chr3 (939-995)||(47923925-47923981)
chr3 (441-508)||(48362119-48362186)
chr3 (821-884)||(16462203-16462264)
chr3 (940-1002)||(25795785-25795848)
chr3 (821-884)||(47883003-47883064)
chr3 (888-976)||(25634030-25634120)
chr3 (667-740)||(1618916-1618992)
chr3 (788-833)||(7606828-7606873)
chr3 (821-979)||(11079517-11079674)
chr3 (534-611)||(27101627-27101704)
chr3 (534-611)||(35918316-35918393)
chr3 (538-611)||(43228108-43228181)
chr3 (939-995)||(26299000-26299056)
chr3 (939-995)||(36029105-36029161)
chr3 (534-586)||(45882752-45882804)
chr3 (829-884)||(4535622-4535675)
chr3 (939-986)||(6794732-6794779)
chr3 (821-884)||(16996875-16996936)
chr3 (667-706)||(25690651-25690690)
chr3 (940-995)||(25929463-25929517)
chr3 (939-994)||(40844665-40844719)
chr3 (940-986)||(3323710-3323756)
chr3 (824-979)||(10612803-10612957)
chr3 (939-985)||(26928620-26928666)
chr3 (667-696)||(10621847-10621876)
chr3 (641-698)||(13893290-13893347)
chr3 (534-611)||(25690723-25690800)
chr3 (784-847)||(31021300-31021361)
chr3 (669-698)||(31021450-31021479)
chr3 (667-696)||(42990205-42990234)
chr3 (938-979)||(48390327-48390368)
chr3 (534-611)||(51727373-51727450)
[»] chr7 (144 HSPs)
chr7 (441-1015)||(1046912-1047503)
chr7 (667-1017)||(31155896-31156247)
chr7 (641-1015)||(1049283-1049657)
chr7 (667-1017)||(7351637-7351994)
chr7 (641-1017)||(40836728-40837104)
chr7 (667-1017)||(7349262-7349615)
chr7 (667-1017)||(38393935-38394290)
chr7 (641-1017)||(35556-35933)
chr7 (642-1015)||(25542459-25542830)
chr7 (668-1019)||(44724533-44724885)
chr7 (670-1017)||(7470007-7470359)
chr7 (667-1016)||(3035670-3036027)
chr7 (641-1017)||(44491-44868)
chr7 (641-1005)||(27306227-27306591)
chr7 (641-1017)||(3878498-3878881)
chr7 (670-1017)||(7471965-7472317)
chr7 (667-1017)||(48457602-48457957)
chr7 (670-1019)||(20625990-20626344)
chr7 (670-1019)||(20629881-20630235)
chr7 (670-1019)||(20642300-20642654)
chr7 (667-1019)||(13099457-13099812)
chr7 (667-1017)||(20297311-20297666)
chr7 (667-1017)||(20299407-20299764)
chr7 (646-1019)||(31435029-31435404)
chr7 (667-1017)||(40946277-40946632)
chr7 (708-1017)||(1849975-1850285)
chr7 (668-1019)||(20137092-20137444)
chr7 (667-1019)||(42330980-42331335)
chr7 (667-1017)||(18345490-18345845)
chr7 (667-1017)||(28487502-28487857)
chr7 (667-1019)||(443548-443902)
chr7 (668-1019)||(9680768-9681126)
chr7 (668-1019)||(11355212-11355564)
chr7 (668-1019)||(4295917-4296271)
chr7 (668-1019)||(24748548-24748901)
chr7 (668-994)||(21679981-21680307)
chr7 (669-1019)||(21990106-21990456)
chr7 (669-1018)||(37412109-37412462)
chr7 (667-1015)||(28485515-28485867)
chr7 (701-1019)||(21592126-21592445)
chr7 (668-995)||(21678020-21678347)
chr7 (668-1019)||(42223110-42223464)
chr7 (667-947)||(11757177-11757463)
chr7 (668-979)||(27832656-27832969)
chr7 (668-946)||(25276095-25276374)
chr7 (441-710)||(2935070-2935349)
chr7 (668-1019)||(39145969-39146322)
chr7 (667-1017)||(43253502-43253860)
chr7 (641-908)||(26804500-26804765)
chr7 (669-1015)||(9679009-9679361)
chr7 (441-711)||(9027396-9027687)
chr7 (441-711)||(22136878-22137169)
chr7 (674-979)||(24258423-24258732)
chr7 (441-711)||(40551905-40552196)
chr7 (820-1017)||(2935374-2935572)
chr7 (441-711)||(22107867-22108158)
chr7 (441-711)||(40549627-40549918)
chr7 (820-1017)||(1606486-1606683)
chr7 (820-1017)||(9027179-9027376)
chr7 (820-1017)||(22137184-22137381)
chr7 (667-921)||(22828716-22828969)
chr7 (820-1017)||(40552211-40552408)
chr7 (667-913)||(22251641-22251878)
chr7 (784-1017)||(7092198-7092431)
chr7 (670-980)||(24817376-24817682)
chr7 (820-1017)||(22108173-22108370)
chr7 (820-1017)||(40549933-40550130)
chr7 (667-980)||(7188496-7188806)
chr7 (667-970)||(20091580-20091877)
chr7 (792-1017)||(38396713-38396938)
chr7 (784-1017)||(7094445-7094678)
chr7 (646-832)||(18567545-18567731)
chr7 (743-1019)||(24813481-24813755)
chr7 (669-913)||(24465503-24465735)
chr7 (641-862)||(22392400-22392608)
chr7 (439-558)||(40837144-40837263)
chr7 (439-588)||(3878320-3878469)
chr7 (667-1007)||(6332179-6332516)
chr7 (441-558)||(26804345-26804462)
chr7 (724-1019)||(11081522-11081816)
chr7 (869-1019)||(22393876-22394029)
chr7 (441-585)||(27306624-27306767)
chr7 (806-1019)||(16297004-16297222)
chr7 (848-979)||(26295580-26295713)
chr7 (670-763)||(7094662-7094759)
chr7 (441-588)||(25542281-25542427)
chr7 (863-980)||(6046641-6046760)
chr7 (724-938)||(6048885-6049094)
chr7 (670-763)||(7092414-7092512)
chr7 (714-775)||(38396316-38396377)
chr7 (845-921)||(6348912-6348988)
chr7 (821-979)||(25351353-25351508)
chr7 (441-588)||(44314-44461)
chr7 (441-588)||(18567363-18567510)
chr7 (441-588)||(31435439-31435586)
chr7 (805-979)||(2120881-2121056)
chr7 (441-588)||(35379-35526)
chr7 (667-716)||(1606423-1606472)
chr7 (668-884)||(26210500-26210710)
chr7 (821-979)||(3320076-3320232)
chr7 (821-979)||(3324824-3324980)
chr7 (821-979)||(25405393-25405549)
chr7 (809-915)||(40281466-40281572)
chr7 (806-884)||(11084467-11084544)
chr7 (821-979)||(25357047-25357202)
chr7 (821-979)||(25410130-25410287)
chr7 (821-979)||(7069780-7069936)
chr7 (821-979)||(7074787-7074943)
chr7 (940-995)||(9190038-9190093)
chr7 (940-995)||(20284101-20284156)
chr7 (940-995)||(33332480-33332535)
chr7 (939-995)||(21983296-21983352)
chr7 (939-995)||(46516339-46516395)
chr7 (940-991)||(2580406-2580457)
chr7 (669-736)||(3677235-3677301)
chr7 (674-799)||(6348778-6348903)
chr7 (821-884)||(21369642-21369703)
chr7 (940-995)||(28617255-28617310)
chr7 (939-985)||(2647725-2647771)
chr7 (667-791)||(30906264-30906386)
chr7 (821-979)||(8378529-8378686)
chr7 (939-995)||(55960-56015)
chr7 (441-555)||(1049699-1049813)
chr7 (667-711)||(1849918-1849962)
chr7 (839-980)||(6067222-6067365)
chr7 (939-995)||(29159815-29159871)
chr7 (939-1002)||(35960820-35960884)
chr7 (940-995)||(9185195-9185250)
chr7 (951-1017)||(11759364-11759431)
chr7 (821-979)||(15541021-15541177)
chr7 (821-884)||(42006663-42006724)
chr7 (824-979)||(30246973-30247127)
chr7 (784-863)||(12310157-12310234)
chr7 (534-611)||(40946167-40946244)
chr7 (939-995)||(4796696-4796752)
chr7 (824-884)||(44512646-44512704)
chr7 (939-995)||(44848713-44848769)
chr7 (938-985)||(21639830-21639877)
chr7 (940-994)||(5817300-5817353)
chr7 (966-1019)||(26804762-26804816)
chr7 (938-979)||(34546905-34546946)
chr7 (667-696)||(38396239-38396268)
chr7 (938-979)||(44010775-44010816)
chr7 (824-873)||(44143997-44144045)
[»] chr8 (106 HSPs)
chr8 (440-1017)||(18810482-18811057)
chr8 (441-1017)||(43081722-43082323)
chr8 (441-1017)||(18812668-18813231)
chr8 (441-1017)||(44720617-44721193)
chr8 (641-1017)||(27829270-27829646)
chr8 (716-1017)||(43079650-43079952)
chr8 (641-1017)||(27826959-27827335)
chr8 (667-1008)||(24873175-24873523)
chr8 (641-968)||(14807724-14808051)
chr8 (641-1017)||(4423991-4424368)
chr8 (641-1019)||(28251550-28251929)
chr8 (667-1017)||(32339304-32339659)
chr8 (644-1019)||(15072686-15073063)
chr8 (667-1017)||(3874005-3874360)
chr8 (667-1017)||(15809214-15809568)
chr8 (641-1016)||(15067954-15068330)
chr8 (667-1017)||(28283206-28283561)
chr8 (668-1015)||(27106884-27107232)
chr8 (668-1019)||(30480486-30480838)
chr8 (677-1017)||(608735-609085)
chr8 (667-1017)||(22684638-22685002)
chr8 (667-1019)||(14419173-14419527)
chr8 (667-1019)||(1225165-1225519)
chr8 (667-1019)||(27911014-27911365)
chr8 (667-1019)||(27957433-27957784)
chr8 (667-1018)||(13858469-13858820)
chr8 (667-1019)||(41384744-41385096)
chr8 (667-1017)||(43530123-43530465)
chr8 (668-913)||(14477276-14477520)
chr8 (669-995)||(36865538-36865864)
chr8 (668-1019)||(25952521-25952873)
chr8 (667-1019)||(41382672-41383014)
chr8 (441-696)||(43079347-43079614)
chr8 (668-994)||(5372185-5372512)
chr8 (668-885)||(33541507-33541723)
chr8 (668-1007)||(21482322-21482651)
chr8 (667-1019)||(15185697-15186046)
chr8 (667-1020)||(31162212-31162565)
chr8 (668-865)||(5622877-5623073)
chr8 (667-846)||(26775200-26775378)
chr8 (701-995)||(21480547-21480830)
chr8 (758-1019)||(15956051-15956310)
chr8 (701-980)||(3005654-3005929)
chr8 (668-831)||(35872555-35872713)
chr8 (644-768)||(3886153-3886277)
chr8 (644-779)||(12517248-12517385)
chr8 (791-939)||(181622-181772)
chr8 (803-1007)||(31035252-31035461)
chr8 (701-887)||(37214317-37214512)
chr8 (445-588)||(14807552-14807695)
chr8 (441-588)||(27826782-27826929)
chr8 (441-588)||(27829093-27829240)
chr8 (806-980)||(31578300-31578476)
chr8 (641-849)||(2468261-2468460)
chr8 (667-763)||(181536-181632)
chr8 (669-837)||(31035068-31035235)
chr8 (724-884)||(31573847-31574000)
chr8 (441-588)||(12517418-12517565)
chr8 (806-980)||(17847661-17847831)
chr8 (875-1007)||(2468124-2468259)
chr8 (462-558)||(3886322-3886419)
chr8 (939-995)||(4696625-4696681)
chr8 (821-993)||(6376141-6376315)
chr8 (821-979)||(16757293-16757449)
chr8 (441-588)||(15067777-15067924)
chr8 (441-588)||(15072506-15072653)
chr8 (440-579)||(28251988-28252127)
chr8 (821-907)||(13985176-13985262)
chr8 (821-979)||(28327908-28328064)
chr8 (821-979)||(9021132-9021289)
chr8 (939-995)||(9765848-9765904)
chr8 (824-979)||(25684646-25684799)
chr8 (939-995)||(26403259-26403315)
chr8 (939-1002)||(31071258-31071322)
chr8 (441-558)||(4423835-4423952)
chr8 (940-1002)||(19752424-19752487)
chr8 (907-1019)||(33541393-33541507)
chr8 (824-979)||(29554810-29554964)
chr8 (824-979)||(33032657-33032811)
chr8 (939-1007)||(7412340-7412409)
chr8 (821-979)||(28895502-28895659)
chr8 (939-1002)||(19175783-19175847)
chr8 (939-995)||(23799606-23799662)
chr8 (891-966)||(35872477-35872553)
chr8 (821-979)||(4812513-4812669)
chr8 (806-883)||(13985933-13986011)
chr8 (821-884)||(16752643-16752704)
chr8 (821-979)||(28332631-28332787)
chr8 (821-884)||(30423212-30423274)
chr8 (939-985)||(1261983-1262029)
chr8 (958-1019)||(14808051-14808113)
chr8 (939-992)||(4456043-4456096)
chr8 (938-979)||(28890881-28890922)
chr8 (824-884)||(590797-590855)
chr8 (806-1007)||(3895957-3896164)
chr8 (939-995)||(5702512-5702568)
chr8 (939-1002)||(6127225-6127289)
chr8 (667-711)||(6375988-6376032)
chr8 (953-1015)||(37214251-37214314)
chr8 (938-1015)||(18870590-18870667)
chr8 (939-985)||(26287923-26287969)
chr8 (939-985)||(26301180-26301226)
chr8 (939-985)||(26313174-26313220)
chr8 (667-696)||(17847527-17847556)
chr8 (534-611)||(22685035-22685112)
chr8 (806-884)||(33839043-33839120)
[»] chr6 (110 HSPs)
chr6 (499-1017)||(4816216-4816748)
chr6 (667-1017)||(12195500-12195851)
chr6 (641-1005)||(20915353-20915720)
chr6 (642-1017)||(14507161-14507536)
chr6 (673-1017)||(19704552-19704905)
chr6 (641-1019)||(11983012-11983391)
chr6 (667-1017)||(28241306-28241657)
chr6 (667-1010)||(26932554-26932906)
chr6 (675-1017)||(14458752-14459093)
chr6 (667-1017)||(1230234-1230585)
chr6 (667-1017)||(2628871-2629226)
chr6 (641-1019)||(9019878-9020257)
chr6 (668-1019)||(13057173-13057526)
chr6 (667-1015)||(30034590-30034943)
chr6 (667-1017)||(30967176-30967530)
chr6 (641-1019)||(15541123-15541502)
chr6 (708-1019)||(26065005-26065312)
chr6 (708-1019)||(26084974-26085281)
chr6 (668-1019)||(3629848-3630199)
chr6 (641-1019)||(32279949-32280328)
chr6 (645-960)||(15530166-15530480)
chr6 (667-1019)||(3390357-3390711)
chr6 (641-979)||(15532706-15533043)
chr6 (668-1019)||(13039733-13040086)
chr6 (668-1019)||(25477253-25477613)
chr6 (641-1015)||(30728811-30729190)
chr6 (670-1015)||(3631926-3632271)
chr6 (788-1017)||(5273201-5273431)
chr6 (439-712)||(26068590-26068884)
chr6 (668-979)||(3233754-3234065)
chr6 (641-898)||(19227514-19227770)
chr6 (441-712)||(26066319-26066611)
chr6 (441-665)||(33310954-33311177)
chr6 (441-665)||(33308685-33308908)
chr6 (440-716)||(29754983-29755280)
chr6 (820-1017)||(33308988-33309185)
chr6 (820-1017)||(33311257-33311454)
chr6 (668-1015)||(24338435-24338783)
chr6 (820-1017)||(29754694-29754892)
chr6 (667-980)||(3027875-3028186)
chr6 (668-1019)||(12161541-12161889)
chr6 (820-1017)||(26066109-26066307)
chr6 (668-921)||(22490618-22490871)
chr6 (820-1017)||(26068380-26068578)
chr6 (641-813)||(1072067-1072239)
chr6 (724-1007)||(16455419-16455701)
chr6 (701-938)||(15719666-15719891)
chr6 (809-1019)||(1069701-1069913)
chr6 (668-1019)||(14466312-14466655)
chr6 (668-816)||(32447502-32447651)
chr6 (674-921)||(17012029-17012271)
chr6 (641-788)||(8995431-8995578)
chr6 (439-586)||(14507569-14507718)
chr6 (755-1019)||(15367101-15367362)
chr6 (441-627)||(19227761-19227948)
chr6 (667-1019)||(12186054-12186405)
chr6 (675-817)||(13870608-13870749)
chr6 (667-797)||(17852520-17852650)
chr6 (441-586)||(8995255-8995400)
chr6 (441-586)||(9019702-9019847)
chr6 (668-1007)||(19696420-19696761)
chr6 (445-588)||(11983421-11983562)
chr6 (724-1007)||(22857947-22858228)
chr6 (804-1007)||(26945258-26945465)
chr6 (667-834)||(15346369-15346524)
chr6 (865-1007)||(15346522-15346666)
chr6 (806-964)||(20526922-20527081)
chr6 (668-780)||(10584105-10584212)
chr6 (885-1019)||(25465574-25465710)
chr6 (807-980)||(28037749-28037927)
chr6 (653-701)||(33308918-33308966)
chr6 (653-701)||(33311187-33311235)
chr6 (821-978)||(12911471-12911629)
chr6 (821-979)||(13878727-13878883)
chr6 (821-979)||(16785919-16786075)
chr6 (806-882)||(11138423-11138499)
chr6 (929-1019)||(10584235-10584327)
chr6 (821-978)||(12937219-12937376)
chr6 (821-979)||(13883475-13883631)
chr6 (806-934)||(7542452-7542581)
chr6 (441-588)||(15530514-15530661)
chr6 (534-611)||(26084818-26084895)
chr6 (441-523)||(1072312-1072395)
chr6 (939-995)||(5757507-5757563)
chr6 (939-991)||(10077194-10077246)
chr6 (940-995)||(24436001-24436056)
chr6 (940-1002)||(31936591-31936654)
chr6 (940-995)||(31979525-31979580)
chr6 (806-1019)||(25078541-25078755)
chr6 (940-1001)||(21801374-21801435)
chr6 (866-980)||(30445699-30445816)
chr6 (939-991)||(5572270-5572322)
chr6 (824-979)||(17694877-17695030)
chr6 (939-995)||(21356048-21356104)
chr6 (821-979)||(26887252-26887406)
chr6 (829-884)||(5165936-5165989)
chr6 (821-884)||(31248835-31248896)
chr6 (821-884)||(35201447-35201508)
chr6 (441-486)||(4816740-4816786)
chr6 (527-588)||(30729220-30729281)
chr6 (821-884)||(3577636-3577696)
chr6 (824-884)||(17036058-17036116)
chr6 (667-711)||(18318004-18318048)
chr6 (939-1002)||(22709022-22709086)
chr6 (939-986)||(18232866-18232913)
chr6 (943-985)||(33335963-33336005)
chr6 (534-611)||(22352216-22352293)
chr6 (938-979)||(25941785-25941826)
chr6 (534-611)||(28241691-28241768)
chr6 (938-979)||(35201352-35201393)
[»] chr2 (131 HSPs)
chr2 (641-1017)||(42064408-42064785)
chr2 (641-1017)||(27104692-27105067)
chr2 (641-1017)||(13910030-13910406)
chr2 (641-1017)||(19504331-19504707)
chr2 (669-1017)||(19501996-19502345)
chr2 (667-1017)||(35215571-35215932)
chr2 (708-1017)||(35217948-35218258)
chr2 (641-1017)||(24162208-24162574)
chr2 (667-1017)||(23452222-23452577)
chr2 (667-1017)||(45279969-45280321)
chr2 (667-1017)||(42452702-42453050)
chr2 (644-1019)||(22287319-22287695)
chr2 (668-1019)||(19007560-19007912)
chr2 (641-1019)||(40032036-40032420)
chr2 (641-1019)||(21520676-21521057)
chr2 (667-1019)||(42923492-42923847)
chr2 (641-1019)||(43623563-43623930)
chr2 (641-1019)||(6264131-6264507)
chr2 (668-1019)||(28196557-28196907)
chr2 (641-1019)||(6258800-6259177)
chr2 (668-1019)||(11739542-11739895)
chr2 (676-1019)||(34979560-34979906)
chr2 (668-1019)||(17848365-17848712)
chr2 (669-913)||(15539566-15539809)
chr2 (668-1019)||(17849037-17849389)
chr2 (441-711)||(36559067-36559358)
chr2 (671-1019)||(3022086-3022444)
chr2 (668-1019)||(14837193-14837540)
chr2 (820-1017)||(36558849-36559047)
chr2 (820-1017)||(36561126-36561324)
chr2 (440-665)||(45332453-45332676)
chr2 (708-979)||(45239001-45239271)
chr2 (668-1019)||(44289050-44289403)
chr2 (820-1017)||(45332166-45332364)
chr2 (668-979)||(31732800-31733100)
chr2 (668-980)||(11578131-11578439)
chr2 (798-1019)||(5375329-5375550)
chr2 (641-1019)||(18800296-18800664)
chr2 (641-821)||(22407591-22407771)
chr2 (669-995)||(20146615-20146941)
chr2 (668-833)||(22163117-22163282)
chr2 (667-1019)||(22874061-22874403)
chr2 (667-1007)||(17897240-17897578)
chr2 (708-906)||(38020162-38020349)
chr2 (441-589)||(19502402-19502550)
chr2 (441-588)||(24162604-24162752)
chr2 (758-1019)||(28459173-28459435)
chr2 (440-579)||(36561539-36561678)
chr2 (441-589)||(19504736-19504884)
chr2 (544-711)||(36561344-36561532)
chr2 (862-1019)||(22407437-22407596)
chr2 (445-588)||(27104519-27104662)
chr2 (667-801)||(5377631-5377769)
chr2 (641-1019)||(35107193-35107568)
chr2 (804-1007)||(40699429-40699636)
chr2 (875-979)||(7462972-7463077)
chr2 (667-915)||(37963028-37963263)
chr2 (441-588)||(21521087-21521234)
chr2 (758-921)||(27136208-27136368)
chr2 (724-938)||(43139356-43139564)
chr2 (791-891)||(38414194-38414291)
chr2 (441-558)||(43623968-43624085)
chr2 (821-921)||(20589763-20589863)
chr2 (919-1019)||(22163005-22163106)
chr2 (669-762)||(38020064-38020157)
chr2 (885-1019)||(22707734-22707872)
chr2 (441-588)||(42064231-42064378)
chr2 (444-590)||(6259205-6259351)
chr2 (824-979)||(17943540-17943692)
chr2 (641-711)||(45332384-45332455)
chr2 (884-1019)||(23870951-23871088)
chr2 (806-884)||(17921754-17921833)
chr2 (821-979)||(2736205-2736361)
chr2 (821-979)||(2740941-2741097)
chr2 (533-588)||(13910436-13910491)
chr2 (667-739)||(12342673-12342746)
chr2 (939-995)||(14699036-14699092)
chr2 (821-979)||(17462436-17462592)
chr2 (821-884)||(28458949-28459011)
chr2 (821-979)||(39686983-39687139)
chr2 (805-882)||(26345661-26345738)
chr2 (824-979)||(27517664-27517818)
chr2 (805-938)||(15693958-15694094)
chr2 (821-979)||(20054790-20054947)
chr2 (807-864)||(27583479-27583535)
chr2 (939-995)||(10445473-10445529)
chr2 (939-995)||(13569340-13569396)
chr2 (939-995)||(20522232-20522288)
chr2 (806-884)||(34575230-34575308)
chr2 (441-523)||(40032503-40032586)
chr2 (939-994)||(33118149-33118204)
chr2 (446-558)||(6264546-6264658)
chr2 (824-979)||(30478997-30479151)
chr2 (938-995)||(34682362-34682419)
chr2 (939-995)||(8040072-8040128)
chr2 (939-995)||(28259206-28259262)
chr2 (954-1019)||(34575121-34575186)
chr2 (668-763)||(38414281-38414365)
chr2 (939-1002)||(39482935-39482999)
chr2 (820-882)||(10942634-10942696)
chr2 (820-882)||(10948503-10948565)
chr2 (821-884)||(22712637-22712698)
chr2 (821-884)||(22717346-22717407)
chr2 (821-884)||(45567409-45567470)
chr2 (806-882)||(7502975-7503052)
chr2 (824-979)||(12781246-12781400)
chr2 (669-711)||(20147040-20147082)
chr2 (939-985)||(25398517-25398563)
chr2 (939-985)||(25403655-25403701)
chr2 (806-912)||(30720703-30720811)
chr2 (938-979)||(33670992-33671033)
chr2 (766-882)||(35028595-35028707)
chr2 (938-979)||(45679838-45679879)
chr2 (940-1015)||(2838060-2838135)
chr2 (939-995)||(8390179-8390235)
chr2 (939-979)||(17865231-17865271)
chr2 (824-884)||(17932637-17932695)
chr2 (939-995)||(23078499-23078555)
chr2 (938-986)||(27149322-27149370)
chr2 (939-991)||(34388874-34388926)
chr2 (940-995)||(2869723-2869778)
chr2 (940-1002)||(31056048-31056111)
chr2 (821-979)||(39680045-39680201)
chr2 (540-611)||(45280354-45280425)
chr2 (941-995)||(1345572-1345626)
chr2 (939-985)||(3491772-3491818)
chr2 (939-993)||(42039698-42039752)
chr2 (527-588)||(22407801-22407862)
chr2 (939-976)||(25407653-25407690)
chr2 (667-716)||(40699229-40699278)
chr2 (724-765)||(41304627-41304667)
[»] scaffold0250 (2 HSPs)
scaffold0250 (641-1017)||(2806-3182)
scaffold0250 (441-588)||(2629-2776)
[»] scaffold0025 (5 HSPs)
scaffold0025 (641-1017)||(69277-69657)
scaffold0025 (641-819)||(73207-73389)
scaffold0025 (445-588)||(69686-69829)
scaffold0025 (445-558)||(73427-73540)
scaffold0025 (782-830)||(73160-73208)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (708-1017)||(34-344)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (667-1017)||(41468-41819)
scaffold0038 (534-611)||(41853-41930)
[»] scaffold0068 (3 HSPs)
scaffold0068 (641-1017)||(29087-29473)
scaffold0068 (532-588)||(29001-29057)
scaffold0068 (441-505)||(28941-29005)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (670-1019)||(79140-79490)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (667-1019)||(11456-11809)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (667-1017)||(183626-183975)
scaffold0005 (667-1005)||(51961-52304)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (641-1017)||(3923-4298)
[»] scaffold0131 (3 HSPs)
scaffold0131 (641-994)||(14945-15298)
scaffold0131 (680-1005)||(14379-14707)
scaffold0131 (442-588)||(14768-14915)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (667-967)||(1988-2293)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (668-1019)||(79812-80164)
scaffold0004 (821-884)||(188363-188424)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (782-1017)||(1438-1673)
[»] scaffold0140 (5 HSPs)
scaffold0140 (441-711)||(21915-22206)
scaffold0140 (441-711)||(24190-24481)
scaffold0140 (820-1017)||(22221-22418)
scaffold0140 (820-1017)||(24496-24693)
scaffold0140 (939-995)||(8448-8504)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (668-979)||(85184-85495)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (667-980)||(15844-16154)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (441-628)||(12868-13054)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (668-896)||(35593-35819)
scaffold0011 (938-1019)||(35817-35899)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (677-980)||(1665-1958)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (669-938)||(16716-16981)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (667-836)||(993-1167)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (674-980)||(4773-5077)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (949-1015)||(4666-4733)
[»] scaffold0006 (4 HSPs)
scaffold0006 (939-995)||(2504-2560)
scaffold0006 (939-995)||(5695-5751)
scaffold0006 (821-884)||(224819-224880)
scaffold0006 (939-984)||(133309-133354)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (939-1002)||(45257-45321)
[»] scaffold0087 (1 HSPs)
scaffold0087 (939-995)||(43990-44046)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (940-995)||(10741-10796)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (824-979)||(16328-16482)
[»] scaffold1050 (1 HSPs)
scaffold1050 (938-979)||(3095-3136)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (938-979)||(17011-17052)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (939-985)||(17981-18027)
scaffold0188 (939-985)||(24074-24120)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (942-995)||(85695-85748)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 472; Significance: 0; HSPs: 167)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 472; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 441 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 16932360 - 16931774
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16932360 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 16932261  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttt----- 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||         
T  16932260 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttt-gggagcagatttgttacagttttgttac 16932162  T
Q  636 ---tgtta--cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaag 730  Q
       | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16932161 agattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaag 16932062  T
Q  731 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 830  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16932061 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactatt 16931962  T
Q  831 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggta 930  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  16931961 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaa 16931862  T
Q  931 ctcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16931861 ctcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 16931774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 468; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 441 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 16934714 - 16934128
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16934714 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacatggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 16934615  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttt----- 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||         
T  16934614 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcctggcacgatggtgcgctgtcggataaaaataaaacgtattttt-gggagcagatttgttacagttttgttac 16934516  T
Q  636 ---tgtta--cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaag 730  Q
       | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16934515 agattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaag 16934416  T
Q  731 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 830  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16934415 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactatt 16934316  T
Q  831 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggta 930  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  16934315 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaa 16934216  T
Q  931 ctcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16934215 ctcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 16934128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 441 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 9177035 - 9176461
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9177035 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggttaggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttaggcaaggcactgga 9176936  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgtt 639  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| | |||| ||||||| ||| |||||||||||| |  |||        
T  9176935 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcagggaaaaacagaaacatattttt-gggtgcagatttgttataaatttaaag 9176837  T
Q  640 acagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 739  Q
     |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9176836 -cagatttgttacagtttttaagcaagacatttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 9176738  T
Q  740 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 839  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9176737 aagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 9176638  T
Q  840 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 939  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9176637 gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 9176538  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactg-gtcaacaaatttctttgtgtt 1015  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  9176537 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagagtcaacaaatttctttgtgtt 9176461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 441 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 22783317 - 22782723
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22783317 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggtacgatagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 22783218  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttt----- 635  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||         
T  22783217 aaaatcatggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttt-gggagcagatttgttacagttttgttac 22783119  T
Q  636 ---tgtta--cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggct 722  Q
       | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || ||  ||||        |||||||||||    
T  22783118 agattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaagctaatctaagagagagagagatagagggggct 22783019  T
Q  723 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 822  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22783018 gaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 22782919  T
Q  823 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 922  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782918 acactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 22782819  T
Q  923 taacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg-tcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22782818 taacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactggatcaacaaatatctttgtgttct 22782723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 441 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 22780952 - 22780358
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780952 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggtacgatagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 22780853  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttt----- 635  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||         
T  22780852 aaaatcatggcacgatggggtctcattgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttt-gggagcagatttgttacagttttgttac 22780754  T
Q  636 ---tgtta--cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggct 722  Q
       | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || ||  ||||        |||||||||||    
T  22780753 agattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaagctaatctaagagagagagagatagagggggct 22780654  T
Q  723 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 822  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780653 gaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 22780554  T
Q  823 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 922  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780553 acactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 22780454  T
Q  923 taacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22780453 taacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 22780358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 441 - 1017
Target Start/End: Original strand, 18846923 - 18847500
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggttt--ctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcact 537  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||| |||||||| ||||||  || ||||| |||    
T  18846923 tgtgagagttaacttaaaatcagatttttctgcagaatcgtggcacgattgttgggaatcgtggcacgattggaggtttcagttttgagg-caaggtact 18847021  T
Q  538 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacgtattttttgggagcagatttgttacagttttt 636  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||     
T  18847022 ggaaaaatcgtggtacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctcgcggggaaaaacagaaacatattttt-gggtgcagatttgttacaaattta 18847120  T
Q  637 gttacagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttta 736  Q
        |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18847121 aag-cagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaaacaaactttgagatagagggggttgaaacaagggttta 18847219  T
Q  737 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 836  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18847220 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagcatt 18847319  T
Q  837 ggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatc 936  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18847320 ggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatc 18847419  T
Q  937 atatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  18847420 atatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 18847500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 499 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 11009074 - 11008553
Alignment:
Q  499 gtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaa 597  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |  |||||    
T  11009074 gtggcacaatggaggtttcaatttttttaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcactggcagcaaaaaa 11008975  T
Q  598 ta-aaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgttacagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatca 696  Q
     | |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11008974 cagaaacatattttt-gggtgcagatttgttacagattttaag-cagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatca 11008877  T
Q  697 aagcaaacttt-----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaaca 791  Q
      || |  ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11008876 g-gctattttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaaca 11008778  T
Q  792 ctagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga 891  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11008777 ctagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 11008678  T
Q  892 cttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaa 991  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  11008677 cttattcttgtaacccattgatt--tctttgtaatggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 11008580  T
Q  992 ct-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||    
T  11008579 ctaggtcaacaaattcttttgtgttct 11008553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 44600174 - 44599823
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44600174 acttttactataaatatagaccttgtattaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 44600075  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44600074 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 44599975  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44599974 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 44599875  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  44599874 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 44599823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 9174508 - 9174131
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9174508 cagatttgttacagtttttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 9174409  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9174408 agcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaaacactattaggattgaag 9174309  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatat 940  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9174308 tctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacggtactcatcatat 9174209  T
Q  941 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9174208 agtggattggagggctgttctctgccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 9174131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 11006603 - 11006222
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt-----gagatagagggggctgaaacaagggttt 735  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |  ||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006603 cagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaga-ctattttgagagagagatagagggggctgaaacaagggttt 11006505  T
Q  736 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggat 835  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006504 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggat 11006405  T
Q  836 tggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcat 935  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11006404 tggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaatggtactcat 11006305  T
Q  936 catatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| ||||||||  ||||||||||    
T  11006304 catatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttct 11006222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Original strand, 11434926 - 11435302
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11434926 cagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 11435025  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11435026 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 11435124  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatat 940  Q
    |||| ||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11435125 tctcctggttaccggaagagtctaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatat 11435224  T
Q  941 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  11435225 agtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11435302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 22044752 - 22044376
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044752 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 22044653  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  22044652 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgggaaacactattaggatt-gag 22044554  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatat 940  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22044553 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatat 22044454  T
Q  941 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  22044453 agtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22044376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 22047047 - 22046671
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22047047 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcggagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 22046948  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22046947 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 22046849  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatat 940  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22046848 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatat 22046749  T
Q  941 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  22046748 agtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22046671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Original strand, 51015217 - 51015593
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015217 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 51015316  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51015317 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 51015415  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatat 940  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  51015416 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatat 51015515  T
Q  941 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  51015516 agtggatcggaggtctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 51015593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Original strand, 5198391 - 5198768
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5198391 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 5198490  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  5198491 ggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaaacactattaggatt-gag 5198589  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5198590 tcttttggttacgggaagagattggggctttgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcata 5198689  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactg-gtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  5198690 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgttct 5198768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Original strand, 9148222 - 9148600
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttaga 738  Q
    |||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  9148222 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaagcaagggtttaga 9148321  T
Q  739 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgg 838  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9148322 aaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg- 9148420  T
Q  839 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcat 938  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9148421 agtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcat 9148520  T
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  9148521 atagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 9148600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 8631759 - 8631404
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 762  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631759 actttcactataaatatagactttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 8631660  T
Q  763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 862  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  8631659 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggc 8631561  T
Q  863 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 961  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8631560 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 8631461  T
Q  962 ctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  8631460 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 8631404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 2485209 - 2484858
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga-gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 765  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2485209 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagctagaagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 2485110  T
Q  766 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 865  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  2485109 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgg 2485011  T
Q  866 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2485010 gactttgggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 2484911  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaactgg-tcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  2484910 cccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgttct 2484858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Original strand, 40637071 - 40637424
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637071 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 40637170  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40637171 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagga-tcgagtctcttggttacgggaagagattgag 40637269  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  40637270 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcc 40637369  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  40637370 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 40637424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 641 - 1005
Target Start/End: Original strand, 38409170 - 38409540
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtt 734  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||||||||||||||| ||||    
T  38409170 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaatggtt 38409269  T
Q  735 tagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga 834  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38409270 taaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga 38409369  T
Q  835 ttggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactca 934  Q
    || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38409370 tt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactca 38409468  T
Q  935 tcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatt 1005  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||    
T  38409469 tcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 38409540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 708 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 18709458 - 18709149
Alignment:
Q  708 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 807  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18709458 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagtt 18709359  T
Q  808 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 907  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18709358 gattcaccttgggaaacactattagggttg-agtctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc 18709260  T
Q  908 attgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaattt 1006  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18709259 attgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattt 18709160  T
Q  1007 ctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||    
T  18709159 ctttgtgttct 18709149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 641 - 1015
Target Start/End: Original strand, 24888767 - 24889142
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24888767 cagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 24888866  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24888867 ggcaacaacaaaactagggattgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 24888965  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||    
T  24888966 tctcttggttacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcata 24889065  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgtt 1015  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  24889066 tagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 24889142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 31849961 - 31849584
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31849961 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactagaaatataggtcttgtatcagagcaaactaggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 31849862  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt-gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 839  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31849861 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-a 31849763  T
Q  840 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 939  Q
    |||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31849762 gtctcttgcttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcata 31849663  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  31849662 tagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 31849584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 37089736 - 37089357
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt---gagatagagggggctgaaacaagggtttag 737  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089736 cagatttgttccaaattttaagcaaaacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaacttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttag 37089637  T
Q  738 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 837  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089636 aatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 37089537  T
Q  838 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatca 937  Q
     ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37089536 -agtctcttgattacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca 37089438  T
Q  938 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  37089437 tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 37089357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 641 - 1015
Target Start/End: Original strand, 48486290 - 48486665
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48486290 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaat 48486389  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48486390 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 48486488  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||    
T  48486489 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgaaatctcttttgtaacgttactcatcata 48486588  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgtt 1015  Q
    ||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  48486589 tagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattattttgtgtt 48486665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 641 - 1023
Target Start/End: Original strand, 7941290 - 7941677
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaac--tttgagatagagggggctgaaacaagggtttaga 738  Q
    |||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941290 cagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacgttgtatcagagcaaaccgggagagatagagggggctgaaacaagggtttaga 7941389  T
Q  739 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaa--cactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 836  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941390 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 7941489  T
Q  837 ggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcat 935  Q
     ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  7941490 -gagtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcat 7941588  T
Q  936 catatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctcttctt 1023  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  7941589 catatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttttctt 7941677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 22803096 - 22802719
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22803096 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaat 22802997  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22802996 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 22802898  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||    
T  22802897 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcata 22802798  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||  ||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  22802797 tagtggaacggagggtttctctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 22802719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 641 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 22801224 - 22800845
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22801224 cagatttgtttcaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaat 22801125  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  22801124 gacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gag 22801026  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    ||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  22801025 tctcttgattacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 22800926  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  22800925 tagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 22800845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Original strand, 24348211 - 24348566
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 762  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24348211 acttttactataaatatagaccttgtatcaagctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggttt 24348310  T
Q  763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 862  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  24348311 gtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggc 24348409  T
Q  863 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 961  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24348410 tgggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 24348509  T
Q  962 ctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  24348510 ctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 24348566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 667 - 1011
Target Start/End: Complemental strand, 22132735 - 22132383
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag---------ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag 757  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22132735 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttg 22132636  T
Q  758 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaa 857  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22132635 ggtttgtatagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaa 22132538  T
Q  858 gagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctg 957  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132537 gaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctg 22132438  T
Q  958 ctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttg 1011  Q
    |||||||||| | |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22132437 ctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttg 22132383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Original strand, 6764836 - 6765192
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6764836 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6764935  T
Q  767 agagtttgtctcttc-----ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 861  Q
    ||||||||||||||      ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  6764936 agagtttgtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactgttaggattg-agtctcttggttatgggaagagg 6765034  T
Q  862 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctc 960  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6765035 ctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagggctgctc 6765134  T
Q  961 tctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  6765135 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6765192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 644 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 40091774 - 40091398
Alignment:
Q  644 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 743  Q
    ||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40091774 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagac 40091675  T
Q  744 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtct 843  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  40091674 aacaacaaaactagggattgtttagagtttgtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgatt-gagtct 40091576  T
Q  844 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatag 942  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  40091575 cttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatag 40091476  T
Q  943 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    || |   |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  40091475 tgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 40091398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 644 - 1019
Target Start/End: Original strand, 24878963 - 24879340
Alignment:
Q  644 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 743  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  24878963 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatccgagtaaacttggagatagagggggctgaaactagggtttagaaagac 24879062  T
Q  744 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtct 843  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24879063 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtct 24879161  T
Q  844 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt-aacggtactcatcatata 941  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||| |||||||||    
T  24879162 cttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgatacacatcatata 24879261  T
Q  942 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||   |||||||||||    
T  24879262 gtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctct 24879340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 641 - 1019
Target Start/End: Original strand, 24880422 - 24880802
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  24880422 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcggagtaaacttggagatagagggggcgtaaactagggtttagaaa 24880521  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24880522 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaacactattaggatt-gag 24880620  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt-aacggtactcatcat 938  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||| ||||||    
T  24880621 tctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcat 24880720  T
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||   |||||||||||    
T  24880721 atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctct 24880802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 237; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Original strand, 14633317 - 14633666
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14633317 actttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 14633415  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14633416 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttac-ggaagagattggg 14633513  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  14633514 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 14633613  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    | ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  14633614 ctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14633666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Original strand, 47274698 - 47275073
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47274698 cagatttgtttcaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 47274797  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  47274798 ggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggatt-gag 47274895  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||    
T  47274896 tctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 47274995  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaa-ctggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||  ||||||||||    
T  47274996 tagtgaaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttct 47275073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 667 - 1015
Target Start/End: Original strand, 47868398 - 47868747
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47868398 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 47868497  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |    
T  47868498 agagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgag 47868596  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  47868597 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcc 47868696  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaactgg-tcaacaaatttctttgtgtt 1015  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  47868697 cccatactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgtt 47868747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 708 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 22134909 - 22134603
Alignment:
Q  708 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 807  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22134909 gagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttca-aacaaacactagggtttgtgggtt 22134812  T
Q  808 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 907  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134811 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 22134713  T
Q  908 attgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaattt 1006  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||    
T  22134712 attgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattt 22134614  T
Q  1007 ctttgtgttct 1017  Q
    |||||| ||||    
T  22134613 ctttgtcttct 22134603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 641 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 36919949 - 36919567
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttga--gatagagggggctgaaacaagggtttaga 738  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36919949 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgatagatatagggggctgaaacaagggtttaga 36919850  T
Q  739 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 837  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36919849 aaggcaacaacaaaactagggtttggataaagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 36919750  T
Q  838 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatc 936  Q
     ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||    
T  36919749 -agtctcttggttacgggaagaggctgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttattcatc 36919651  T
Q  937 atatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  36919650 atatagtggaatagatggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 36919567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 227; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 38928513 - 38928160
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38928513 cttttactataaatataggctttgtattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 38928414  T
Q  768 gagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38928413 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaaaagattggg 38928315  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  38928314 gctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtaaaacggagggctgctctctcc 38928215  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  38928214 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 38928160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 641 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 36921857 - 36921476
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttaga 738  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  36921857 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttacaataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagagatagaggggg-tgaaacaagggcttaga 36921759  T
Q  739 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 837  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36921758 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 36921659  T
Q  838 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatc 936  Q
     ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  36921658 -agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatc 36921560  T
Q  937 atatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| | |  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  36921559 atatagtggaacggatggctgctctctcccccagactagttaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 36921476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 17662574 - 17662228
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 762  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662574 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 17662475  T
Q  763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 862  Q
    ||           ||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  17662474 gt-----------ctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacaggaagagac 17662387  T
Q  863 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 961  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17662386 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 17662287  T
Q  962 ctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  17662286 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 17662228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 12396180 - 12395828
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || | |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396180 cttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 12396081  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12396080 gagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgtga 12395982  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  12395981 ctttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctccc 12395882  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaac-tggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||||    
T  12395881 ccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttctct 12395828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 641 - 944
Target Start/End: Complemental strand, 5637831 - 5637524
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggttta 736  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||    
T  5637831 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtataagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagagttta 5637732  T
Q  737 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 836  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637731 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 5637632  T
Q  837 ggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcat 935  Q
     |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  5637631 -gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcat 5637533  T
Q  936 catatagtg 944  Q
    |||||||||    
T  5637532 catatagtg 5637524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Original strand, 36378289 - 36378643
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36378289 acttttactataaatatagactttgtatcagaataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 36378388  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  36378389 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-aagtctcttagttacgggaagagattggg 36378487  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| | | ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  36378488 actttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctcttgtgaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctc 36378587  T
Q  965 ccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  36378588 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattattttgtgttctct 36378643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 12401142 - 12400790
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || | |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12401142 cttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 12401043  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12401042 gagtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatt-gagtctcttggttacgggaagagattgtga 12400944  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  12400943 ctttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctccc 12400844  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaac-tggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||||    
T  12400843 ccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttctct 12400790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 669 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 33415821 - 33415471
Alignment:
Q  669 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 768  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33415821 ttttactacaaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatag 33415722  T
Q  769 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggac 868  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  33415721 agtttgtctctt-ggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaaga-tcgagtctcttggttacgggaagagattgaggc 33415624  T
Q  869 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 967  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||     
T  33415623 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccct 33415524  T
Q  968 cagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||| ||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||  ||||||||||||    
T  33415523 caggctaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttctct 33415471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Original strand, 19095880 - 19096233
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  19095880 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtata 19095979  T
Q  768 gagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  19095980 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattaga 19096078  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||| |  |||| ||||||||||||    
T  19096079 gctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtgaaacggagagctgctctctcc 19096178  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  19096179 cccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 19096233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 743 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 26086236 - 26085962
Alignment:
Q  743 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 842  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26086236 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtc 26086138  T
Q  843 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatag 942  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26086137 tcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgttttctctttgtaacgatactcatcatatag 26086038  T
Q  943 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactg-gtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  26086037 tggatcggaaggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgttct 26085962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 619783 - 619431
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  619783 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaagacaacaacaaaactagggtttgcat 619684  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||    
T  619683 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gactgtcttggttaagggaagagattggg 619585  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
     |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||| | |||||||||||    
T  619584 tctttgggtagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctctcc 619485  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    || | |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  619484 ccta-actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctct 619431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 667 - 1005
Target Start/End: Complemental strand, 14787769 - 14787426
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 764  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14787769 acttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 14787670  T
Q  765 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 864  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14787669 atagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattg 14787571  T
Q  865 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctg--ctct 961  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||  ||||    
T  14787570 tgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 14787471  T
Q  962 ctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatt 1005  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||    
T  14787470 ctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaatt 14787426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 669 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 37313400 - 37313048
Alignment:
Q  669 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 768  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  37313400 ttttactataaatataggttttgtatcaaagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 37313301  T
Q  769 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggac 868  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  37313300 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggaaagagattgggat 37313202  T
Q  869 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  37313201 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttccc 37313102  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaactgg-tcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||| ||||  ||||| | || ||| ||||||||||  ||||| ||||||    
T  37313101 ccagactatgtcaatttggaccaaattggatcaacaaattcttttgttttctct 37313048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Original strand, 16453306 - 16453660
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  16453306 acttttgctataaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagagtttgtac 16453405  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16453406 aaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagagattggg 16453504  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |   || || |||||||||    
T  16453505 actttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggttgctctctc 16453604  T
Q  965 ccccagactaggtcagattggatcgaactg-gtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||| |||||  ||||||||||||    
T  16453605 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgccaaaaaattcttttgtgttctct 16453660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 667 - 994
Target Start/End: Complemental strand, 47211082 - 47210761
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 760  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47211082 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 47210983  T
Q  761 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 860  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  47210982 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg------------ttgggaaacactattaggattg-agtctcttagttacgggaagag 47210896  T
Q  861 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgct 959  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47210895 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgct 47210796  T
Q  960 ctctcccccagactaggtcagattggatcgaactg 994  Q
    |||||||||| ||||| |||  ||||| |||||||    
T  47210795 ctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactg 47210761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 641 - 946
Target Start/End: Complemental strand, 3824935 - 3824627
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaa-ctttgaga----tagagggggctgaaacaagggttt 735  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||||    |||||||||||||||||  |||||    
T  3824935 cagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtatttctttgagagagatagagggggctgaaaca--ggttt 3824838  T
Q  736 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggat 835  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824837 agaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 3824738  T
Q  836 tggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactca 934  Q
    | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  3824737 t-gagtctattggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactca 3824639  T
Q  935 tcatatagtgga 946  Q
    ||||||||||||    
T  3824638 tcatatagtgga 3824627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 669 - 995
Target Start/End: Original strand, 56030443 - 56030766
Alignment:
Q  669 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 768  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  56030443 ttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatag 56030542  T
Q  769 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggac 868  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  56030543 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggttacgggaagagattggagc 56030641  T
Q  869 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| ||||||||| || ||||||||   || |  ||||||||||||||||||    
T  56030642 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatttct-tttgtaacgttattcatcata---tgaaacggagggctgctctctccc 56030737  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    | |||||||||||  ||||| ||||||||    
T  56030738 ctagactaggtcaatttggaccgaactgg 56030766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 674 - 1019
Target Start/End: Original strand, 19322701 - 19323045
Alignment:
Q  674 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 773  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19322701 ctataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagttt 19322799  T
Q  774 gtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgg 873  Q
    | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19322800 g-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgg 19322895  T
Q  874 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccaga 971  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  19322896 gtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggatgctctctcccccaga 19322995  T
Q  972 ctaggtcag-attggatcgaactgg-tcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||  ||||| |||||||| | ||||||||  || |||||||||    
T  19322996 ctaggtcagttttggaccgaactggataaacaaattctttagtgttctct 19323045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 177; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 669 - 979
Target Start/End: Original strand, 13543953 - 13544268
Alignment:
Q  669 ttttactataaatatagaccttgtatca-aagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 763  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||    |||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13543953 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttg 13544052  T
Q  764 tatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 862  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  13544053 tatagagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagat 13544150  T
Q  863 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 961  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |  ||||  |||||||    
T  13544151 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctct 13544250  T
Q  962 ctcccccagactaggtca 979  Q
    ||  ||||||||||||||    
T  13544251 ctttcccagactaggtca 13544268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 672 - 1007
Target Start/End: Original strand, 41997494 - 41997830
Alignment:
Q  672 tactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 771  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  41997494 tactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagtgttcagaaaggaaacaacaaaactagagtttgtatagagt 41997593  T
Q  772 ttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttt 871  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| || |||    
T  41997594 ttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttagttacgggaaaagattgagatttt 41997692  T
Q  872 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctccccca 969  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||| | |||||||||| |||||| |  ||||||| ||||||| |||||    
T  41997693 gggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcatcatagtgaaacggagggccgctctct-cccca 41997791  T
Q  970 gactaggtcagattggatcgaactgg-tcaacaaatttc 1007  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||| | ||||||||||    
T  41997792 gactaggttaatttggaccgaactggataaacaaatttc 41997830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 668 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 18537806 - 18537498
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  18537806 cttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggtttgtat 18537709  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||| ||||| | ||||| |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  18537708 agagtttg-ctcttggcaacaaccactagggttgg--ggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgag 18537613  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  18537612 acttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctc 18537513  T
Q  965 ccccagactaggtca 979  Q
    ||||| | |||||||    
T  18537512 ccccataataggtca 18537498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 667 - 1005
Target Start/End: Original strand, 53405124 - 53405469
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga---gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 763  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53405124 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 53405223  T
Q  764 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt 863  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||  |    
T  53405224 tatagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagatt-gagtctcttggttacggaaagaggct 53405321  T
Q  864 gggactttgggtagaattaggcgggaga------cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggct 956  Q
    | |||||| |||||||||| ||||||||      ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||   ||| |||    
T  53405322 gagactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgtaacccattgatttctcttttgaaacgatactcatcatatagtggaacagagagct 53405421  T
Q  957 gctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg-tcaacaaatt 1005  Q
    |  ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||    
T  53405422 g--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatt 53405469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 632 - 921
Target Start/End: Complemental strand, 52942818 - 52942542
Alignment:
Q  632 tttttgttacagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtat--caaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaa 729  Q
    |||||| | |||||||||| || |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52942818 tttttggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatatcagactaaactttgagatagagggg-ctgaaacaa 52942720  T
Q  730 gggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactat 829  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  52942719 gggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactat 52942620  T
Q  830 taggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 921  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52942619 taggatt-gagtctcttggttacggg-------------tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 52942542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 668 - 1007
Target Start/End: Complemental strand, 18409681 - 18409342
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18409681 cttttactataaatatagaatttgtatcagtgtaaacaatgagatagagagg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 18409583  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| ||    
T  18409582 gagtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttcgggaacactattaggatt-gagtctcttagttataggaagagattgaga 18409484  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||| ||||| ||||||| |   ||| | ||||||||||    
T  18409483 cttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa-gttacccatcattatagtgaaacagagagttgctctctcc 18409385  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttc 1007  Q
    | ||||||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  18409384 ctcagactaggtcaatttggattgaactgggtaaacaaatttc 18409342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 152; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 668 - 899
Target Start/End: Complemental strand, 3937543 - 3937314
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3937543 cttttactataaatatagacttt-tatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagagtttgtata 3937445  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  3937444 gagtttgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt-ggaattgagtctcttggttacaggaagagattgagg 3937346  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattct 899  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3937345 ctttgggtagaattaggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 149; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 746 - 1019
Target Start/End: Original strand, 36380425 - 36380700
Alignment:
Q  746 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctct 845  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  36380425 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtatct 36380523  T
Q  846 tggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagt 943  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||| | ||||||||| ||||||    
T  36380524 tggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattatagt 36380623  T
Q  944 ggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||   ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  36380624 ggaactgagtgctgctctctcccccagactaggtcaatttggagcgaactgggtaaacaaattcttttgtgttctct 36380700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 145; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 667 - 978
Target Start/End: Complemental strand, 8756586 - 8756276
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 765  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||| |||| ||||||    
T  8756586 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattaggatttgta 8756488  T
Q  766 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctctt-ggttacgggaagagattg 864  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8756487 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactaggattg-agtctctttggtcacgggaagagattg 8756392  T
Q  865 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctc 962  Q
     ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | |||| |||| |||||||||  ||| || |||||||    
T  8756391 agactttgagtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactaatcattatagtggaacggatggttgctctc 8756292  T
Q  963 tcccccagactaggtc 978  Q
    ||| ||||||||||||    
T  8756291 tcctccagactaggtc 8756276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 668 - 889
Target Start/End: Original strand, 6132871 - 6133090
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   | |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6132871 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacattgagatagaggaggctgaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtata 6132969  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6132970 gagtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgaga 6133068  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcggga 889  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6133069 ctttgggtagaattaggcggga 6133090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 668 - 977
Target Start/End: Complemental strand, 18535164 - 18534858
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||   ||||||||| |||||||||||||    
T  18535164 cttttacaataaatatagacctcgattcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagtgtttaaaaaca-aacaacaaa-ctagggtttgtat 18535067  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |    
T  18535066 agagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgagaagagattgag 18534971  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   ||||||| | |||||||||  |||||| ||||||| |    
T  18534970 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaactactcataattatagtggaacggaggggtgctctccc 18534871  T
Q  965 ccccagactaggt 977  Q
    |||||||||||||    
T  18534870 ccccagactaggt 18534858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 818 - 1019
Target Start/End: Original strand, 13547302 - 13547504
Alignment:
Q  818 gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 917  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  13547302 gggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatat 13547400  T
Q  918 c-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgtt 1015  Q
    | ||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  13547401 cttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgtt 13547500  T
Q  1016 ctct 1019  Q
    ||||    
T  13547501 ctct 13547504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 783 - 1005
Target Start/End: Original strand, 16455354 - 16455578
Alignment:
Q  783 gaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaatta 882  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16455354 gaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaatta 16455452  T
Q  883 ggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag 980  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||| ||| ||||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||     
T  16455453 ggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcattatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaa 16455552  T
Q  981 attggatcgaact-ggtcaacaaatt 1005  Q
     ||||| |||||| ||||||||||||    
T  16455553 tttggaccgaactgggtcaacaaatt 16455578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 441 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 9174684 - 9174490
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  9174684 tgtgagagttaacttaaaatcaggtt-ctgcagaatcgtggcacgacggctaggcaacgtagcacgatggaggttttagtttattaggcaaggcactgga 9174586  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacgtattttttgggagcagatttgttacagttttt 636  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| | |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9174585 aaaatcatggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcagggaaaaacagaaacata-tttttgggtgcagatttgttacagttttt 9174490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 750 - 1007
Target Start/End: Complemental strand, 38890476 - 38890219
Alignment:
Q  750 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 849  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| |  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  38890476 aaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggttgg--ggttgattcatattgggaaacactattaggattg-agtctcttgat 38890381  T
Q  850 tacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggat 947  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||     
T  38890380 cacgggaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 38890281  T
Q  948 tggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggatcgaact-ggtcaacaaatttc 1007  Q
      |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  38890280 cagagggctgctctctccccaagattaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatttc 38890219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 865 - 1017
Target Start/End: Original strand, 11437557 - 11437710
Alignment:
Q  865 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11437557 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 11437656  T
Q  965 ccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||| |||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  11437657 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11437710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 668 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 38270321 - 38270158
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38270321 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaagaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgta 38270222  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatta 831  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38270221 gagtttgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 667 - 993
Target Start/End: Complemental strand, 15032872 - 15032557
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| || || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  15032872 acttttactataaatatagacttggtaccagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtat 15032774  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||| ||||| | ||||||          || || ||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||| ||||| ||    
T  15032773 agagtttg-ctctttgcaacaaa----------tgagg-ttgattcatatttggaaacactattaggattg-agtctcttggacacgagaaaagatttgg 15032687  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| || ||||||  | || |||||||||||    
T  15032686 acttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacgaagagctgctctctc 15032587  T
Q  965 ccccagactaggtcag-attggatcgaact 993  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  15032586 ccccaaactaggtcagtattggaccgaact 15032557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 866 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 5635614 - 5635461
Alignment:
Q  866 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5635614 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 5635515  T
Q  965 ccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  5635514 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5635461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 668 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 24446914 - 24446756
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||    
T  24446914 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaac-----tagggtttgtata 24446820  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatta 831  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24446819 gagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 24446756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 848 - 1020
Target Start/End: Original strand, 4215483 - 4215657
Alignment:
Q  848 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtgga 946  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4215483 gttacgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 4215582  T
Q  947 ttggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctctt 1020  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  4215583 acggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctt 4215657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 441 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 11006781 - 11006585
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-tacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  11006781 tgtgagagttaacttaaaatcaggttttatgcagaatcgtggcacgatcgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcaattttttaggcaaggcactgg 11006682  T
Q  540 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacgtattttttgggagcagatttgttacagttttt 636  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||| | |||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  11006681 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcaaaaaacagaaacata-tttttgggtgcagatttgttacagatttt 11006585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 812 - 1019
Target Start/End: Original strand, 2891433 - 2891642
Alignment:
Q  812 caccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 911  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  2891433 caccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattg 2891531  T
Q  912 atttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttct 1008  Q
    || |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |   || | |||||||||||||||||||||  ||  ||||| |||||| ||||||||||||  |    
T  2891532 atatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcccccagactagtacaacttggaccgaactgggtcaacaaattctt 2891631  T
Q  1009 ttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||||    
T  2891632 ttgtgttctct 2891642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 753 - 1019
Target Start/End: Original strand, 27499128 - 27499392
Alignment:
Q  753 actagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttac 852  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27499128 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggatt-gagtctattggttac 27499226  T
Q  853 gggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatca-tatagtggattgga 951  Q
    |  ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | || ||| ||||||| | ||||||||| |||| || |  | |    
T  27499227 gataagagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaacctaat-atctct-tttgtaaggttactcatcattatattgaaacgaa 27499324  T
Q  952 gggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  27499325 gggctgctct-ttccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 27499392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 668 - 1007
Target Start/End: Original strand, 12102088 - 12102427
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggg-ctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 765  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||    
T  12102088 cttttactataaatatagatcttgtatcagataaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggttt-ta 12102184  T
Q  766 tagag-tttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 864  Q
     |||| ||| |||   ||| | ||||  |||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||||    
T  12102185 gagagatttctctaagcgggagaaac--tagggttgttg--ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtatcttggtcatgggaaaagattg 12102279  T
Q  865 ggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctct 961  Q
    | ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  12102280 gaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctct 12102379  T
Q  962 ctcccccagactaggtcag-attggatcgaact-ggtcaacaaatttc 1007  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  12102380 ctcccccatactaggtcagttttggaccgaactaggtaaacaaatttc 12102427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 443 - 588
Target Start/End: Original strand, 51015042 - 51015187
Alignment:
Q  443 tgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaa 542  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||   ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  51015042 tgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcatgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttaggcaaggcactggaaa 51015141  T
Q  543 aatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51015142 aattgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 51015187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 669 - 1007
Target Start/End: Original strand, 28453686 - 28454022
Alignment:
Q  669 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |  ||| ||||| ||||| |  |||||| ||||||||||||| | |||||  |||||||||||||| |     
T  28453686 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtgaaccttgaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttagaa-gccaacactaaaactagggtttgca- 28453782  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
     ||||||| ||||| | || ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28453783 -gagtttg-ctcttggcaagaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactgttaggattg-agtctcttggttacgggaagagatttgg 28453877  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    || |||||||||||||||  | ||||| |||||||||| |  ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||  || |||||||    
T  28453878 accttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaacttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactactctctc 28453977  T
Q  965 ccccagactaggtcag-attggatcgaact-ggtcaacaaatttc 1007  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  28453978 ccccagactaggttagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 28454022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 667 - 806
Target Start/End: Original strand, 5100994 - 5101133
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  5100994 acttttactataaatatagaccttgaatcagggtaaaccttgagatagaggggactgaaacaaaggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 5101093  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 806  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  5101094 agagtttgtcactttggaacaaacactagggtttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 440 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 37089915 - 37089764
Alignment:
Q  440 ctgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatg-gaggttttagttttttgggcaaggcactg 538  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||   ||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||  ||||||||    
T  37089915 ctgtaagagttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatgagatgttttagttttttaggtgaggcactg 37089816  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcgg 590  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37089815 gaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcgg 37089764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 674 - 1007
Target Start/End: Original strand, 9863712 - 9864051
Alignment:
Q  674 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatag-agggggctgaaa--caagggtttagaaaggcaacaacaaaa-ctagggtttgtataga 769  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| || | |||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||  ||    
T  9863712 ctataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagatagtagagagctgaaaaacaagggtttagaa-gccaaaaacaaaaactagggtttgta--ga 9863808  T
Q  770 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggact 869  Q
    |||||| |||| | ||||||||||| |||| |  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  9863809 gtttgt-tcttggcaacaaacactaaggttgg--gtttgattcaccttgggaaaccctattaggattg-agtcttttggtcacgggaagagattgagact 9863904  T
Q  870 ttgggtagaatt-aggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatca----tatagtggattggagggctgctctct- 963  Q
    |||||||||||| ||   | ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||    |||||||||  |||| ||||||||||     
T  9863905 ttgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctctttgtaaagttactcatcatcattatagtggaacggagagctgctctctc 9864004  T
Q  964 -cccccagactaggtcag-attggatcgaact-ggtcaacaaatttc 1007  Q
     ||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  9864005 ccccccagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 9864051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 440 - 558
Target Start/End: Original strand, 7941132 - 7941251
Alignment:
Q  440 ctgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactg 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  7941132 ctgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactg 7941231  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatgg 558  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  7941232 gaaaaatggtggcacgatgg 7941251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 668 - 787
Target Start/End: Original strand, 2891314 - 2891434
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgta-tcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2891314 cttttactataaatatagacattgtaatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 2891413  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaaca 787  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  2891414 agagtttgtctctttggaaca 2891434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 440 - 558
Target Start/End: Original strand, 11434768 - 11434887
Alignment:
Q  440 ctgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactg 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  11434768 ctgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggtacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaagacactg 11434867  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatgg 558  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11434868 gaaaaatcgtggcacgatgg 11434887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 675 - 995
Target Start/End: Original strand, 10112876 - 10113196
Alignment:
Q  675 tataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 772  Q
    ||||||||||||| |||||||| | | |||| | |||| |||||| | ||||| ||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||  |||||    
T  10112876 tataaatatagacattgtatcagatgtaaacctcgagagagagggagttgaaaacaagggtttagaa-gccaacacaaaaactagggtttgta--gagtt 10112972  T
Q  773 tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg-aagagattgggacttt 871  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||    | |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  10112973 tg-ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcaccttaggaaacactattatgattg-agtctcttggtcacggggaagagattaggacttt 10113068  T
Q  872 gggtagaattag-gcgggagacttattcttgtaacc-cattgatttctctttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccccc 968  Q
    ||||||||||||    | ||||| ||||||||||||   ||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  10113069 gggtagaattagatttgaagactaattcttgtaacctttttgatatctctttgtaatgttactaatcattatagtggaatggagagctgctctctcccca 10113168  T
Q  969 agactaggtcag-attggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||    
T  10113169 agactaggttagtattggaccgaactgg 10113196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 758 - 1019
Target Start/End: Original strand, 30136640 - 30136900
Alignment:
Q  758 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaa 857  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||| |||    
T  30136640 ggtttgtatagagttta-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactatgattgg-gtctcttggtcacgagaa 30136735  T
Q  858 gagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggc 955  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||| |||| ||||||| | || |||||| ||||||| |   || |||    
T  30136736 gaaattgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagttaatcatcattatagtgaaacagatggc 30136835  T
Q  956 tgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg-tcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||| | | |||||||||  ||||| |||| ||| | ||||||||  ||||||||||||    
T  30136836 tgctctctcctcaatactaggtcaatttggaccgaattggataaacaaattcttttgtgttctct 30136900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 441 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 5638006 - 5637822
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||    
T  5638006 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcag-ttttgaggcaaggcactgga 5637908  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacgtattttttgggagcagatttgtt 627  Q
    |||||| || ||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||| |  ||||| | |||||||  ||||||| |||||||||||    
T  5637907 aaaatcatgtcacgatgggatcgcatcgtggcatgatggtgagctggcagcgaaaaacagaaacgta--ttttgggtgcagatttgtt 5637822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 441 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 36920125 - 36919979
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||  || |||| ||||||    
T  36920125 tgtgagagttaacttaaaatcaggtt-ctgcaaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcaattttgagg-caagtcactgg 36920028  T
Q  540 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36920027 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 36919979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 667 - 1007
Target Start/End: Complemental strand, 16186173 - 16185829
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct-gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 765  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||  ||    
T  16186173 acttttactataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagagagagggggctaaaaacaagggtttagaaa-caaacaac-aaactagggtt--ta 16186078  T
Q  766 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttg---tgggttgattcaccttg--ggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 860  Q
     |||| || |||||  |    | |||||| |||| |   ||  |||||||||||||    ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16186077 gagagatt-tctctaagcgggagacactaaggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactgttaggatt-gagtctcttggtcacgggaagag 16185980  T
Q  861 attgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgc 958  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| | ||||||||| |||||||||   |||||||||    
T  16185979 attggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgatatatctttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgc 16185880  T
Q  959 tctctcccccagactaggtcag-attggatcgaact-ggtcaacaaatttc 1007  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  16185879 tctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatttc 16185829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 443 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 22803270 - 22803125
Alignment:
Q  443 tgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactggaa 541  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||| || ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||  ||  ||||||||||||    
T  22803270 tgagagttaacttaaaatcaaatttctatagaatcgtggtacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttgagga-aaggcactggaa 22803172  T
Q  542 aaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22803171 aaatcgtggctcgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 22803125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 441 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 3825112 - 3824964
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||| || ||||  ||||| |||||||    
T  3825112 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtgacacgatggctgggcaacatggcacgattggaggtttcag-ttttgaggcaaagcactgg 3825014  T
Q  540 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcg 589  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  3825013 aaaaatcatggcacaatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgttggcg 3824964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Original strand, 25357634 - 25357993
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag-----ggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 760  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||     |||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||    
T  25357634 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgagagagagtgagaggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggt 25357731  T
Q  761 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 860  Q
    ||  | |||| || |||||  |    | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  25357732 tt--agagagatt-tctctaagtgggagacactagggtt-gtga-ttgattcaccttgggaaatactattaggatt-gagtctcttggtcatgggaagag 25357825  T
Q  861 attgggactttgg----gtagaatt-aggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagg 953  Q
    |||||||||||||     ||||||| ||   | ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||  |||      
T  25357826 attgggactttggatatatagaattaagtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggata 25357925  T
Q  954 gctgctctctcccccagactaggtcag-attggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||| ||| ||||||||| | ||||||||||    
T  25357926 gctgctctctcccctagactaggtcagtattggacctaactgggtaaacaaatttttgtgtgttctct 25357993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 441 - 590
Target Start/End: Original strand, 38408993 - 38409142
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 539  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||  | ||||||  |||||||||| |||||||| |  |||  || ||| |||||||    
T  38408993 tgtgagagttaacttaaaattagatttctgcagaatcgtggcacgattgctgggcatcgtggcacgattggaggtttcaagtttgagg-caaagcactgg 38409091  T
Q  540 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcgg 590  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  38409092 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgttggcgg 38409142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 441 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 31850138 - 31849991
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 538  Q
    |||||||||||||||||||||| | | || ||| ||| |||||||||  | ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  31850138 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaattgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttg-gggcaaggcactg 31850041  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31850040 gaaaaatcttggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 31849991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 441 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 22044930 - 22044781
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgg--gcaaggcact 537  Q
    |||||||||||||||||||||| | | || ||| |||||||||||||  |  |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |  ||||||||||    
T  22044930 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaatcgtggcacgattgaagggcaacgtggcacgatggaggtttcattttttttgaggcaaggcact 22044832  T
Q  538 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  22044831 ggaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgtgctggc 22044781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 439 - 588
Target Start/End: Original strand, 24888588 - 24888737
Alignment:
Q  439 actgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcact 537  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| || | ||||| |||||||||| |||||||| |  |||  || ||| |||||    
T  24888588 actgtaagagttaacttaaaatcagatttctgcagaattgtggcacgatggctaggcaacgtggcacgattggaggtttcaagtttgagg-caaagcact 24888686  T
Q  538 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  24888687 ggaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgtgctggc 24888737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 441 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 36922033 - 36921893
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||| || |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||  || |||| ||||||    
T  36922033 tgtgagagttaacttaaaatcaggtt-ctgcaaaatcgtggtacgatggctgggcaacatggcacgattggaggtttcagttttgagg-caagtcactgg 36921936  T
Q  540 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgc 582  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  36921935 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcattgtggcacgatggtgc 36921893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 669 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 40999281 - 40999071
Alignment:
Q  669 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| || |||| ||||| ||||| |  |||||| ||||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||    
T  40999281 ttttactataaatataaaccttatatcagagtaaaccttgaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttagac-gtcaacaagaaaactaggggttgtata 40999184  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||| |||||   ||||||||||||| ||    | ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  40999183 gagtttg-ctcttgacaacaaacactaggattga--gattgattcacctaggaaaacattattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagatcgaga 40999088  T
Q  868 ctttgggtagaattagg 884  Q
    |||||||||||||||||    
T  40999087 ctttgggtagaattagg 40999071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 805 - 966
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983564
Alignment:
Q  805 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagatta-agtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 31983629  T
Q  904 acccattgatttc-tctttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    |||| ||||| || | |||||||   ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  31983628 accctttgatatcttttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 31983564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 809 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 3982374 - 3982200
Alignment:
Q  809 attcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaatt-aggcgggagacttattcttgtaac 905  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||   | ||||| |||||||||||    
T  3982374 attcaccttggagaaacactattaggattg-agtttcttggtcacgggaagagatttgggactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaac 3982276  T
Q  906 ccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
     | ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  3982275 actttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcatactaggtca 3982200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 724 - 969
Target Start/End: Original strand, 9022362 - 9022605
Alignment:
Q  724 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-gaa 822  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||| ||   ||||| | ||||||||||| |||| |  | |||||||||||||| |||    
T  9022362 aaacaagggtttagaa-gtcaacatcaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttggagaa 9022455  T
Q  823 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac--ccattgatttctct 919  Q
    ||| ||||||||| | | | ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||   | ||||| |||||||||||  | |||||| |||||    
T  9022456 acagtattaggatagaatt-tcttggtcacgggaagagattgagactttgggttgaattaggtttgaagactaattcttgtaacctctattgatatctct 9022554  T
Q  920 ttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccccca 969  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||    
T  9022555 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacaaagggctgctctctccccca 9022605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 872 - 1019
Target Start/End: Original strand, 5101130 - 5101278
Alignment:
Q  872 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccag 970  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||   |||||||||||||||  |  ||||||||||| ||| ||||||    
T  5101130 gggtagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatcatatagtaaaacggagggctgctatct-ccccag 5101228  T
Q  971 actaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  5101229 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 5101278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 806 - 921
Target Start/End: Complemental strand, 47151092 - 47150977
Alignment:
Q  806 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 904  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||| || ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  47151092 ttgattcaccttgggaaacactgttaggatt-gagtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 47150994  T
Q  905 cccattgatttctcttt 921  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  47150993 ccctttgatatctcttt 47150977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 464 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 22801356 - 22801262
Alignment:
Q  464 gtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatgg 558  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22801356 gtttctacagaatcgtggcacgatggttgggcaacgtgacacgattggaggtttcag-ttttgaggcaaggaactggaaaaatcgtggcacgatgg 22801262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Original strand, 11853549 - 11853705
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  11853549 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctct 11853643  T
Q  920 ttgtaacggtactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11853644 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 11853705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 446 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 52943002 - 52942869
Alignment:
Q  446 gagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaa 544  Q
    ||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||  |||  |||||| ||||| | |      
T  52943002 gagttaacttaaaatcaggttttgcaaaaatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcacgattggaggtttcag-ctttgaggcaagtcactgaatatt 52942904  T
Q  545 tcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatgg 579  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  52942903 tcgtggcacgatggggtcacaacgtggcacgatgg 52942869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 527 - 588
Target Start/End: Original strand, 5198300 - 5198361
Alignment:
Q  527 ggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  5198300 ggcaaagctctggaaaaatcgtggcacgatgggatcacatcgtggcacgatggtgcgctggc 5198361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 441 - 588
Target Start/End: Original strand, 48486113 - 48486260
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaa-tcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| || || |||| |||||||||| |||||||| ||||||  || |||| |||||    
T  48486113 tgtgagagttaacttaaaatcaggtc-ctgcagaaatcgtggcacgatggctgagcaacgtggcacgattggaggtttcagttttgagg-caagtcactg 48486210  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    ||    |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||    
T  48486211 gatttttcgtggcacgatggggtcacaatgtggcacaatggtgcgctggc 48486260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 939 - 1002
Target Start/End: Original strand, 5269220 - 5269284
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaa 1002  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  5269220 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5269284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 10047447 - 10047391
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  10047447 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 10047391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 39246062 - 39246006
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  39246062 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 39246006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 7050439 - 7050282
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  7050439 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctct 7050345  T
Q  920 ttgtaacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||  |||| |||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7050344 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtca 7050282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 919 - 1019
Target Start/End: Original strand, 47563010 - 47563111
Alignment:
Q  919 tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaac-tggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  47563010 tttgtaaggttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctccccttgactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 47563109  T
Q  1018 ct 1019  Q
    ||    
T  47563110 ct 47563111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 527 - 579
Target Start/End: Original strand, 9148140 - 9148192
Alignment:
Q  527 ggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatgg 579  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9148140 ggcaaagcactggaaaaatcgtggcacgatggggttgcatcgtggcacgatgg 9148192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 528 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 22047135 - 22047076
Alignment:
Q  528 gcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  22047135 gcaaggcactggaaaaatc-tggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgtgctggc 22047076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 36315258 - 36315314
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  36315258 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 36315314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 36329467 - 36329523
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  36329467 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 36329523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 821 - 973
Target Start/End: Original strand, 4570094 - 4570245
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  4570094 aaacactattaggatcg-agtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctct 4570188  T
Q  920 ttgtaacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagact 973  Q
    |||||| |  ||||  |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  4570189 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagact 4570245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 821 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 5336964 - 5336903
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5336964 aaacactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattagg 5336903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 824 - 979
Target Start/End: Original strand, 8529270 - 8529424
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 922  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| ||   || ||||||||    
T  8529270 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctctttg 8529364  T
Q  923 taacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    ||| |  ||||  |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8529365 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 8529424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 824 - 979
Target Start/End: Original strand, 18586969 - 18587123
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 922  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || ||||  ||||||| || ||   || ||||||||    
T  18586969 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactggttcttgttactca---atatctctttg 18587063  T
Q  923 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    ||| |  ||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18587064 taaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 18587123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 824 - 979
Target Start/End: Original strand, 31300427 - 31300580
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 922  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  31300427 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 31300521  T
Q  923 taacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    ||| |  ||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31300522 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtca 31300580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 889 - 1007
Target Start/End: Complemental strand, 3578786 - 3578666
Alignment:
Q  889 agacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attgga 986  Q
    ||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  3578786 agactaattcttgtaacattttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagagctg-tctctcccccagactaggccagtattaga 3578688  T
Q  987 tcgaact-ggtcaacaaatttc 1007  Q
     |||||| ||| ||||||||||    
T  3578687 ccgaactgggtaaacaaatttc 3578666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 534 - 611
Target Start/End: Original strand, 47868288 - 47868365
Alignment:
Q  534 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttt 611  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||| |||||| |||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  47868288 cactggaaaaatcgtgccacgattggatctaatcgtgccacgatagtgcgattgaagataaaaataaaacgtattttt 47868365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 939 - 1002
Target Start/End: Complemental strand, 5143327 - 5143263
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaa 1002  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  5143327 atagtgggttggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5143263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 5396700 - 5396756
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  5396700 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgg 5396756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 6743444 - 6743500
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  6743444 atagtggattggagggctgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactgg 6743500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 750 - 864
Target Start/End: Original strand, 10114412 - 10114520
Alignment:
Q  750 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 849  Q
    ||||||||||||||||  |||| || ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10114412 aaaactagggtttgta--gagtctg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcactttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggt 10114505  T
Q  850 tacgggaagagattg 864  Q
     |||  |||||||||    
T  10114506 cacgataagagattg 10114520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 667 - 739
Target Start/End: Original strand, 16455284 - 16455356
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 739  Q
    |||||| |||| ||||||| | |||||||| |||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16455284 acttttgctattaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagataaagggggctgaaacaagggtttagaa 16455356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 824 - 884
Target Start/End: Original strand, 16489352 - 16489410
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  16489352 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 16489410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 441 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 22048575 - 22048491
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagtttttt 525  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |   |||||||||||||||  |  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22048575 tgtgagagttaacttaaaatcaagatccgcaagaatcgtggcacgattgaagggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttt 22048491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 891 - 966
Target Start/End: Complemental strand, 24446754 - 24446678
Alignment:
Q  891 acttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  24446754 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 24446678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 824 - 884
Target Start/End: Original strand, 25699752 - 25699810
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25699752 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagactgggacttt-ggtagaattagg 25699810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 909 - 1006
Target Start/End: Original strand, 26557823 - 26557923
Alignment:
Q  909 ttgatttctctttgtaacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggatcgaact-ggtcaacaaatt 1005  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  26557823 ttgatatctctttgtaaagttactcatcgttatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaagtcagtattggaccgaactaggtaaacaaatt 26557922  T
Q  1006 t 1006  Q
    |    
T  26557923 t 26557923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 38152468 - 38152524
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||    
T  38152468 atagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgg 38152524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 824 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 4556238 - 4556085
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 922  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  4556238 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 4556144  T
Q  923 taacggtactcat---catatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||  | ||||||     |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4556143 taa-agaactcatatgattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 4556085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 939 - 994
Target Start/End: Complemental strand, 24333877 - 24333822
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactg 994  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||    
T  24333877 atagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactg 24333822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 806 - 934
Target Start/End: Original strand, 54906722 - 54906852
Alignment:
Q  806 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg-gactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgt 902  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||   |||||| ||||||||||||   || |||| ||||||||    
T  54906722 ttgattcaccatggagaaacactattagaattg-agtctcttggtcactggaagagattcaagactttaggtagaattaggtttgaagactgattcttgt 54906820  T
Q  903 aacccattgatttctctttgtaacggtactca 934  Q
    ||| | ||||| ||||||||||| | ||||||    
T  54906821 aactctttgatatctctttgtaaagttactca 54906852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 938 - 1019
Target Start/End: Original strand, 6133105 - 6133187
Alignment:
Q  938 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||  ||| | |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  6133105 tatagtggaacggatgactgctctctcacccagactaggtcaatttggatcgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctct 6133187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 824 - 979
Target Start/End: Original strand, 15831144 - 15831298
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 922  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| | |||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||   || ||||||||    
T  15831144 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gcgtagaattaggtttgaagactgattcttggaactca---atatctctttg 15831238  T
Q  923 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    ||| |  ||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15831239 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 15831298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 856 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 38270158 - 38270120
Alignment:
Q  856 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagactt 894  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270158 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagactt 38270120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 940 - 994
Target Start/End: Original strand, 39774335 - 39774389
Alignment:
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactg 994  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  39774335 tagtggattggagagctgctctatcccccagagtaggtcatattggaccgaactg 39774389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 545 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 619882 - 619837
Alignment:
Q  545 tcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcgg 590  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  619882 tcgtggcacgatggggtcgcaacgtggcacaatggtgcgctggcgg 619837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 534 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 16689380 - 16689303
Alignment:
Q  534 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttt 611  Q
    |||||||||||||||| |||||||   || || ||||||||||||||||| | | ||||||||  |||||||||||||    
T  16689380 cactggaaaaatcgtgccacgatgaaatcgcaacgtggcacgatggtgcgattgaggataaaataaaaacgtattttt 16689303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 940 - 993
Target Start/End: Original strand, 34495853 - 34495906
Alignment:
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact 993  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||    
T  34495853 tagtggattggagggctgctctctcccccagagtaagtcatgttggaccgaact 34495906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 538 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 4556494 - 4556422
Alignment:
Q  538 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtatttt 610  Q
    |||||||||||| |||||||   || || ||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||    
T  4556494 ggaaaaatcgtgccacgatgaaatcgcaacgtggcacgatggtgcgattgaagataaaaataaaacgtatttt 4556422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 824 - 884
Target Start/End: Original strand, 4558314 - 4558372
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  4558314 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 4558372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 824 - 884
Target Start/End: Original strand, 15316961 - 15317019
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  15316961 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 15317019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 16623322 - 16623378
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||| | ||||||||    
T  16623322 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattgaaccgaactgg 16623378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 939 - 1002
Target Start/End: Original strand, 25862051 - 25862115
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactg-gtcaacaa 1002  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  25862051 atagtggattggagggccgctctcttccccatattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 25862115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 31985663 - 31985718
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  31985663 atagtggattggagagctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgg 31985718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 54867251 - 54867196
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  54867251 atagttgattgaagggctgctctctcccc-agactaggtcatattggaccgaactgg 54867196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 940 - 995
Target Start/End: Original strand, 1983330 - 1983385
Alignment:
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||    
T  1983330 tagtggattggagagctgctatctcccccatagtaggtcatattggaccgaactgg 1983385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 821 - 884
Target Start/End: Original strand, 55822265 - 55822326
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  55822265 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 55822326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 667 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 22134966 - 22134936
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaa 697  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134966 acttttactataaatatagaccttgtatcaa 22134936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 939 - 985
Target Start/End: Original strand, 28468558 - 28468604
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattgg 985  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  28468558 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattgg 28468604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 546 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 52942881 - 52942839
Alignment:
Q  546 cgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  52942881 cgtggcacgatggggtcacaacgtggcacgatgatgcgctggc 52942839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 938 - 979
Target Start/End: Original strand, 4884990 - 4885031
Alignment:
Q  938 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4884990 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 4885031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 441 - 486
Target Start/End: Original strand, 8528918 - 8528963
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacga 486  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||    
T  8528918 tgtgagagttaacttaaaatcagatttctggagaatcgtgtcacga 8528963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 441 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 26086292 - 26086247
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacga 486  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||    
T  26086292 tgtgagagttaacttaaaatcagaattctagagaatcgtgccacga 26086247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 938 - 979
Target Start/End: Original strand, 36769595 - 36769636
Alignment:
Q  938 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36769595 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 36769636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 472; Significance: 0; HSPs: 149)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 472; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 445 - 1017
Target Start/End: Original strand, 16225891 - 16226461
Alignment:
Q  445 agagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaa 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16225891 agagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggttgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaa 16225990  T
Q  545 tcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagttttt--gttaca 642  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||| ||||  ||   |    
T  16225991 tcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttt--gggtgcagatttgttacagattttaagt---a 16226085  T
Q  643 gatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagg 742  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  16226086 gatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggtctaaaacaagggtttagaaaag 16226185  T
Q  743 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 842  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16226186 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 16226285  T
Q  843 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatag 942  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16226286 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatag 16226385  T
Q  943 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16226386 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 16226461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 441 - 1017
Target Start/End: Original strand, 47179428 - 47180006
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47179428 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgaa 47179527  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagttttt--gt 638  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  47179528 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgcttgcggataaaaataaaacgtattttt-gggagcagatttgttacagattttaagt 47179626  T
Q  639 tacagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtt 734  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  47179627 ---agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtt 47179723  T
Q  735 tagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga 834  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47179724 tagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga 47179823  T
Q  835 ttggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactca 934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  47179824 ttggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactca 47179923  T
Q  935 tcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  47179924 tcatatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 47180006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 441 - 1017
Target Start/End: Original strand, 47177078 - 47177655
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  47177078 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacgactgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttt-gggcaagacactgga 47177176  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagttttt--gt 638  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  47177177 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacctattttt-gggagcagatttgttacagattttaagt 47177275  T
Q  639 tacagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtt 734  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  47177276 ---agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtt 47177372  T
Q  735 tagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga 834  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47177373 tagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga 47177472  T
Q  835 ttggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactca 934  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  47177473 tgggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactca 47177572  T
Q  935 tcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  47177573 tcatatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcagattggatcgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 47177655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Original strand, 51749956 - 51750333
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51749956 cagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 51750055  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51750056 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 51750154  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  51750155 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 51750254  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  51750255 tagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 51750333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 9463588 - 9463231
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 760  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9463588 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 9463489  T
Q  761 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 860  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9463488 ttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagag 9463389  T
Q  861 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctc 960  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9463388 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctc 9463289  T
Q  961 tctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9463288 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 9463231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Original strand, 28840595 - 28840973
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttaga 738  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||    
T  28840595 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatacagggggatgaaacaagggtttaga 28840694  T
Q  739 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgg 838  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28840695 aaggaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg- 28840793  T
Q  839 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcat 938  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28840794 agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcat 28840893  T
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  28840894 atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28840973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 9459761 - 9459404
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 760  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9459761 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagtcaacaacaaaactagggt 9459662  T
Q  761 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 860  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9459661 ttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagag 9459562  T
Q  861 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctc 960  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459561 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctc 9459462  T
Q  961 tctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9459461 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 9459404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Original strand, 20302402 - 20302752
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20302402 acttttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 20302501  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  20302502 agagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagagactagg 20302600  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||    
T  20302601 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcagatagtggatcggaggactactctctccc 20302700  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaac-tggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  20302701 ccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 20302752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 10400192 - 10399815
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10400192 cagatttgttccaaattttaagcgaaactttttctataaatatagaccttgtatcagagcaaactgggagatagagggggctgaaacaagggtttagaat 10400093  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10400092 gacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 10399994  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  10399993 tctcttggttacgggaagagattgggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 10399894  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  10399893 tagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 10399815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 641 - 1015
Target Start/End: Original strand, 6822932 - 6823306
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6822932 cagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 6823031  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  6823032 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattaggatt-gag 6823129  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  6823130 tctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgatactcatcata 6823229  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgtt 1015  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  6823230 tagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 6823306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Original strand, 13761754 - 13762130
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13761754 cagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaacaagggtttagaaa 13761853  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  13761854 ggcaacaacataactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaaacactattaggatt-gag 13761952  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatat 940  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13761953 tctcttggttacgggaagagtctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatat 13762052  T
Q  941 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  13762053 agtggaccggagggcttctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13762130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Original strand, 51752282 - 51752657
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51752282 cagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaa 51752381  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||    
T  51752382 ggtaacaacaaaattagggcttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaaacactatta-gatt-gag 51752479  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatat 940  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  51752480 tctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcaccatat 51752579  T
Q  941 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  51752580 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 51752657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 641 - 1019
Target Start/End: Original strand, 15823463 - 15823842
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15823463 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttagagataaagggggctgaaacaagggtttagaaa 15823562  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  15823563 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaatatt-gag 15823661  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacggtactcatcata 939  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  15823662 tctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaacgttactcatcata 15823761  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  15823762 tagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 15823842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 644 - 1005
Target Start/End: Original strand, 28842413 - 28842776
Alignment:
Q  644 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaag 741  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28842413 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataaaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 28842512  T
Q  742 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 841  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  28842513 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaaacactattaggatt-gagt 28842611  T
Q  842 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 941  Q
    || ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28842612 ctattggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatata 28842711  T
Q  942 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatt 1005  Q
    |||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||    
T  28842712 gtggaacggagggctaatctctcccccagactaggtcaatttggacagaactaggtcaacaaatt 28842776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 31735863 - 31735508
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttga----gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 762  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31735863 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaatgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 31735764  T
Q  763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 862  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||      
T  31735763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaaggtt-gagtctcttggttacgggaagaggc 31735665  T
Q  863 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 961  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31735664 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 31735565  T
Q  962 ctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  31735564 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 31735508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 641 - 1005
Target Start/End: Original strand, 13214998 - 13215368
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13214998 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 13215097  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  13215098 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgatt-gag 13215196  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga----tttctc-tttgtaacggtactcat 935  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||   |||||||    
T  13215197 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatttttctcttttgtaaatttactcat 13215296  T
Q  936 ca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactg-gtcaacaaatt 1005  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||    
T  13215297 cattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgtcaacaaatt 13215368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 668 - 1015
Target Start/End: Original strand, 2617460 - 2617808
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2617460 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 2617559  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  2617560 gagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctggga 2617658  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2617659 ctttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 2617758  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaactg-gtcaacaaatttctttgtgtt 1015  Q
     ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| |||||  ||||||||    
T  2617759 tcagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattattttgtgtt 2617808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 27337280 - 27336925
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 762  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337280 acttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 27337181  T
Q  763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 862  Q
     |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  27337180 ttataga-tttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgg-gtctcttggttacgggaagaggc 27337083  T
Q  863 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctc 962  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27337082 tgtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 27336983  T
Q  963 tcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  27336982 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 27336925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 667 - 1005
Target Start/End: Original strand, 20291400 - 20291738
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20291400 acttttactataaatatagaccttgtattagagcaaattttgagatagagggagatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 20291499  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  20291500 agagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagagactagg 20291598  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  20291599 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgattctcatcatatagtggatcggagggttgttctctccc 20291698  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatt 1005  Q
    ||| ||||| |||  ||||| |||||| ||||||||||||    
T  20291699 ccacactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 20291738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 716 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 46431996 - 46431693
Alignment:
Q  716 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 815  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431996 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 46431897  T
Q  816 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 915  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431896 ttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 46431798  T
Q  916 ctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct--cccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgt 1012  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  |||||    
T  46431797 ctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 46431698  T
Q  1013 gttct 1017  Q
    |||||    
T  46431697 gttct 46431693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 641 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 38925842 - 38925466
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    ||||||| || || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  38925842 cagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagagttcagaaa 38925743  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  38925742 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattg-ag 38925644  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcata 939  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  38925643 tctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 38925544  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactg-gtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
      ||  |  ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  38925543 --gtaaaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctct 38925466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Original strand, 47906207 - 47906566
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 760  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  47906207 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactatggt 47906306  T
Q  761 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 860  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47906307 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 47906405  T
Q  861 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgct 959  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  47906406 attggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgct 47906505  T
Q  960 ctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  47906506 ctctcccccagacttggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 47906566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 27339472 - 27339116
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 762  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27339472 acttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggcttagaaaggcaacaataaaactagggttt 27339373  T
Q  763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 862  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||      
T  27339372 gtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattacgattg-agtctcttagttacgggaagaggc 27339274  T
Q  863 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctc 962  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27339273 tgagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgatctc 27339174  T
Q  963 tcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  27339173 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctct 27339116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 17324974 - 17324621
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || || |||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17324974 acttttactataaatatagaccttgaaccagagtaaacctgaagatacagggggctaaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactggggtttgtat 17324875  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324874 agagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggg 17324776  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  17324775 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 17324676  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  17324675 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 17324621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 641 - 1019
Target Start/End: Original strand, 41646837 - 41647216
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41646837 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaa 41646936  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41646937 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 41647035  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  41647036 tcacttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 41647135  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||||||||   |||||||||||    
T  41647136 tagtgaaacggagggctgctctctccatcagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctct 41647216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 670 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 15295183 - 15294821
Alignment:
Q  670 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaact 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||              ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15295183 tttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagagagagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaact 15295084  T
Q  756 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 855  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15295083 agggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggg 15294985  T
Q  856 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggaggg 954  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  15294984 aagaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggaggg 15294885  T
Q  955 ctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  15294884 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 15294821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 641 - 1019
Target Start/End: Original strand, 39462436 - 39462815
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  39462436 cagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagaaggctgaaacaaaggtttagaaa 39462535  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39462536 tgcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 39462634  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||| || | || ||||||||    
T  39462635 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttgtaaccctttgatatctcttttgaaaagttattcatcata 39462734  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  39462735 tagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 39462815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 50307884 - 50307530
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50307884 cttttactataaatataagctttgtatcaaagtaaaccttgagatatatggggctgaaaaaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtata 50307785  T
Q  768 gagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50307784 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggg 50307686  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  50307685 gctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 50307586  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatt-tctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  50307585 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttttgtgttctct 50307530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 12302848 - 12302490
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 761  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12302848 acttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtt 12302749  T
Q  762 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 861  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12302748 tgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaga 12302650  T
Q  862 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctc 960  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  12302649 ttgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc 12302550  T
Q  961 tctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  12302549 tctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 12302490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 222; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 670 - 967
Target Start/End: Complemental strand, 21948526 - 21948226
Alignment:
Q  670 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 765  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948526 tttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 21948427  T
Q  766 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 865  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||    
T  21948426 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-ggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagacgctgg 21948329  T
Q  866 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21948328 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctc 21948229  T
Q  965 ccc 967  Q
    |||    
T  21948228 ccc 21948226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 222; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 667 - 1023
Target Start/End: Original strand, 24325599 - 24325963
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 758  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24325599 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtt-agaaaggcaacaacaaaactagg 24325697  T
Q  759 gtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaag 858  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24325698 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaag 24325796  T
Q  859 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctg 957  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| || | | |||||    
T  24325797 aggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcgaatggctg 24325896  T
Q  958 ctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctcttctt 1023  Q
    ||||||||||||||||| ||||  || || |||||| ||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  24325897 ctctctcccccagactaagtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtccttttctt 24325963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 222; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 670 - 1017
Target Start/End: Original strand, 39932017 - 39932368
Alignment:
Q  670 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39932017 tttactataaatatagaccttgtatgagacaaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 39932116  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||    
T  39932117 gagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattaaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgggaagagactgaga 39932215  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctc-tcc 965  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  39932216 ctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggagggctgctctcttcc 39932315  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||  ||||||||||    
T  39932316 cccatactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 39932368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 6996038 - 6995685
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6996038 acttttattataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggggccgaaacaacggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6995939  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6995938 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaagatt-gagtctcttggttacgggaagagattggg 6995840  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  |||| ||| ||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  6995839 gctttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactcattgacatctcttttataacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 6995740  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
     |||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  6995739 tccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctct 6995685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 646 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 14098329 - 14097954
Alignment:
Q  646 ttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaa 745  Q
    ||||| || |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  14098329 ttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcaaactaaactttgagatagaggggactgaaacaatggtttaaaaaggcaa 14098230  T
Q  746 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctct 845  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  14098229 ctacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctct 14098131  T
Q  846 tggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt-aacggtactcatcatatagt 943  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  14098130 tggttacgggaagagattagagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttactcatcatatagt 14098031  T
Q  944 ggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    | |  |||||||||||||||||| || |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  14098030 gaaacggagggctgctctctcccacaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 14097954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 2510666 - 2510312
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 762  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  2510666 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttataaaggcaaccacaaaactagggttt 2510567  T
Q  763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 862  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  2510566 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaaacactattaggatt-gagtcttttggttacgggaagagat 2510468  T
Q  863 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 961  Q
    | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |  ||| |||||||||    
T  2510467 ttggactttgggtagaattaggc-agagacttattcttgtaacccattgatttctctcttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatggctgctct 2510369  T
Q  962 ctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  2510368 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2510312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Original strand, 16428596 - 16428950
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16428596 acttttactataaatataggttttatatcagagcaaaccattagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 16428695  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16428696 agagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggg 16428794  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| | ||||| |  ||||||||||||||||    
T  16428795 actttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattttagtgaaacggagggctgctctctc 16428894  T
Q  965 ccccagactaggtcagattggatcgaactg-gtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  16428895 ccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctct 16428950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 17186465 - 17186112
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17186465 cttttaatataaatatagattttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 17186366  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  17186365 gagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatcaggatt-gagtctcttggttacgggaagagatttgaa 17186267  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||    
T  17186266 ctttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattataatggaacggagtgctgctctctcc 17186167  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  17186166 cccagactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattcttttgtgttctct 17186112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 11457812 - 11457460
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11457812 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 11457713  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    |||||||  |||| | |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||     
T  11457712 gagtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgcgaagagattgggg 11457614  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |  ||| | ||||||||||||    
T  11457613 gtttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatgtctgctctctccc 11457514  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaac-tggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  11457513 ccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctct 11457460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 669 - 1019
Target Start/End: Original strand, 18307054 - 18307405
Alignment:
Q  669 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 768  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18307054 ttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataa 18307153  T
Q  769 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggac 868  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18307154 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggggc 18307252  T
Q  869 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||| ||    
T  18307253 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctct-cc 18307351  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaactg-gtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||||  ||||||||||||    
T  18307352 ccagactaggtcaatttggaccgaacggagtcaacaaattcttttgtgttctct 18307405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 641 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 28207430 - 28207053
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28207430 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 28207331  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  28207330 gacaacaacaaaactagggtttgtgtaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttgggaaacactattaggatt-gtg 28207232  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||||||  |    
T  28207231 tctcttggttacaggaagagattggggctttgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc--a 28207134  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  28207133 tagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 28207053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 791 - 1017
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231856
Alignment:
Q  791 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggag 890  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggag 16231729  T
Q  891 acttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcga 990  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16231730 acttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccga 16231829  T
Q  991 actggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16231830 actggtcaacaaatatctttgtgttct 16231856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 28998591 - 28998238
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  28998591 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 28998492  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28998491 agagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagagattggg 28998393  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||| |||| |||||||||||| ||| |   ||||| || |||||||    
T  28998392 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctcc 28998293  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  28998292 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 28998238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 29004307 - 29003954
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  29004307 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 29004208  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29004207 agagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagagattggg 29004109  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||| |||| |||||||||||| ||| |   ||||| || |||||||    
T  29004108 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctcc 29004009  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  29004008 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 29003954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 50077009 - 50076657
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50077009 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaagggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 50076910  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50076909 aagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggga 50076811  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| |    
T  50076810 atttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-c 50076712  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  50076711 cccagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 50076657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 50079158 - 50078805
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||    
T  50079158 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgcata 50079059  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50079058 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-aagtctcttggttacgggaagagatttgga 50078960  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | || |||||| |||||||||   || |||||||||||||    
T  50078959 ctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatggctgctctctcc 50078860  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaa-ctggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||  |||| ||||||||  ||||||||||||    
T  50078859 cccagactaggtcaatttggaccgaatttggtaaacaaattcttttgtgttctct 50078805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 641 - 921
Target Start/End: Original strand, 6823801 - 6824088
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggg-gctgaaacaagggtttagaa 739  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6823801 cagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttagaa 6823900  T
Q  740 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 839  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  6823901 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattacgatt-ga 6823999  T
Q  840 gtctctt-------ggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 921  Q
     ||||||       |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6824000 atctcttggttacgggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggcagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 6824088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Original strand, 18839531 - 18839884
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18839531 cttttactataaatatagacattgtattattgtaaaccatgagatagagggggctgaaacaagggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtata 18839630  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||    
T  18839631 gagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagagaatgaga 18839729  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |   |||||||||||| |||    
T  18839730 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctttcc 18839829  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  || |||||||||    
T  18839830 cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttcgtgttctct 18839884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 669 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 25251611 - 25251259
Alignment:
Q  669 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 768  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  25251611 ttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataa 25251512  T
Q  769 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggac 868  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25251511 cgtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctctcggttacgggaagagattgggac 25251413  T
Q  869 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | || ||||||| | |||| |||| ||||||| |   ||||| |||||||||||    
T  25251412 tttgggtagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcattatagtgaaacagagggttgctctctccc 25251313  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    | | |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  25251312 caatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 25251259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 667 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 9241424 - 9241095
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 765  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| || |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9241424 acttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 9241326  T
Q  766 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 865  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9241325 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacattattaggatt-gagtctcttggttacgagaagagattgg 9241227  T
Q  866 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctct 963  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  9241226 ggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctct 9241127  T
Q  964 cccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||| |||||||||  ||||| ||||||||    
T  9241126 cccccatactaggtcaatttggaccgaactgg 9241095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 2949569 - 2949217
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| |||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  2949569 acttttacaataaatatagatattgaatccgagaaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtat 2949470  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  2949469 agagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttgtttacgagaatagattggg 2949371  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||    
T  2949370 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc 2949271  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||| ||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  2949270 ccc-gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 2949217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 644 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 3579979 - 3579606
Alignment:
Q  644 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggg--ctgaaacaagggtttagaaag 741  Q
    ||||||| || |||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  3579979 atttgttccaaattttaagcgatacttttactttaaatatagaccttgtatcagcgtaaaatttgagatagagggggggctgaaacaagggttcagaaag 3579880  T
Q  742 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 841  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  3579879 gcagcaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacacaattaggatt-gagt 3579781  T
Q  842 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatat 940  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||| |    
T  3579780 ctcttgattacggaaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat-t 3579682  T
Q  941 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgtt 1015  Q
    |||| |  ||| |  |||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  3579681 agtgaaacggatgattgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 3579606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Original strand, 6756470 - 6756824
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||   | |||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6756470 acttttgctataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaaatagaggggactgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6756569  T
Q  767 agagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 865  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| |||||||||||    
T  6756570 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag--tcttgattacgagaagagattgg 6756666  T
Q  866 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctct 963  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |  ||| | |||||||||    
T  6756667 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaagactgctctct 6756766  T
Q  964 -cccccagactaggtcagattggatcgaactgg-tcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
     ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  6756767 ccccccagactaggtcagtttggaccgaactggatcaacaaattcttttctgttctct 6756824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 667 - 946
Target Start/End: Original strand, 48665114 - 48665400
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggc------tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 760  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| || ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48665114 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 48665213  T
Q  761 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtta-cgggaaga 859  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  48665214 ttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttaccgggaaga 48665312  T
Q  860 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtgga 946  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48665313 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 48665400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Original strand, 31489859 - 31490208
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  31489859 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtat- 31489957  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||    
T  31489958 -agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gaatttcttggttacgggaagagattgaga 31490055  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | || ||||||||| ||| |  |||||||||||||| |||    
T  31490056 ctttggatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcatatggtgaaacggagggctgctctc-ccc 31490154  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||| | ||||||||||  ||||||||||||    
T  31490155 ccagactaggtcaatttggactgaactagatcaacaaattcttttgtgttctct 31490208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 689 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 31425335 - 31425000
Alignment:
Q  689 ttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aaca 787  Q
    ||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  31425335 ttgtatcaatgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaaca 31425236  T
Q  788 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-gag-tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggc 885  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31425235 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggc 31425136  T
Q  886 gggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagatt 983  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||| ||||| |||||||||  ||    
T  31425135 gggaggcttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaaggctgctctct-ccccatactaggtcaattt 31425037  T
Q  984 ggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  31425036 ggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 31425000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 708 - 1019
Target Start/End: Original strand, 25127856 - 25128169
Alignment:
Q  708 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 807  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  25127856 gagatagaggggcctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 25127955  T
Q  808 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 907  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  25127956 gattcaccttgtgaaacactatttggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaattc 25128054  T
Q  908 attgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaat 1004  Q
    |||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||| || |  |||||||||||||||| |||| |||||||||  | ||| |||||| |||||||||||    
T  25128055 attgatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacggagggctgctctctctcccatactaggtcaattaggaccgaactgggtcaacaaat 25128154  T
Q  1005 ttctttgtgttctct 1019  Q
    |  ||||||||||||    
T  25128155 tcttttgtgttctct 25128169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 708 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 4131676 - 4131360
Alignment:
Q  708 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 807  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  4131676 gagatagagggggctgaaacaaggatttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 4131577  T
Q  808 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 907  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  4131576 gatttaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgagaaacttattcttgtaaccc 4131479  T
Q  908 attga----tttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaac 1000  Q
    |||||    |||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||  ||||||    
T  4131478 attgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactatgtcaac 4131379  T
Q  1001 aaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||  ||||||||||||    
T  4131378 aaattcttttgtgttctct 4131360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 632 - 995
Target Start/End: Original strand, 47451556 - 47451913
Alignment:
Q  632 tttttgttacagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagg 731  Q
    |||||| | |||||||||| || || ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47451556 tttttggtgcagatttgttccaaatattaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggcttaaacaagg 47451655  T
Q  732 gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatta 831  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |         |||    
T  47451656 gtttggaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattag------tgttta 47451749  T
Q  832 ggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggta 930  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||    
T  47451750 ggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgtta 47451848  T
Q  931 ctcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| |  | | | ||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||    
T  47451849 ctcatcatatagtgaaacgaatgactgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgg 47451913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 50248909 - 50248555
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||    
T  50248909 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaaaggtttaaaaagacaacaacaaaactatgatttatata 50248810  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  50248809 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagagatcgaga 50248711  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctg--ctctctc 964  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| | |||||||||||||||| |   || || ||  |||||||    
T  50248710 ctttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagatggttgttctctctc 50248611  T
Q  965 ccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||| |||||||||||  ||||  |||| | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  50248610 ccctagactaggtcaatttggtccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctct 50248555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 669 - 1019
Target Start/End: Original strand, 17318838 - 17319183
Alignment:
Q  669 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 768  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17318838 ttttactataaatataggttttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtttag 17318937  T
Q  769 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggac 868  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17318938 agtttgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcaccttgggaaac------aggatt-gagtctcttggttacgggaacagattgggac 17319030  T
Q  869 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||| | | ||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||| ||    
T  17319031 tttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacttattgatatctcttttgttaagttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctct-cc 17319129  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    | |||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  17319130 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 17319183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 820 - 1017
Target Start/End: Original strand, 23785935 - 23786133
Alignment:
Q  820 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23785935 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 23786034  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23786035 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttccttgtgttct 23786133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 667 - 938
Target Start/End: Complemental strand, 31423212 - 31422940
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31423212 acttttactataaatataagcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatat 31423113  T
Q  767 agagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 865  Q
    |||||||||||||| || |  |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  31423112 agagtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagttgattcaccttgggaaacactattagaatt-gagtctcttggttacgggaagagattga 31423014  T
Q  866 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcat 938  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| | ||||||||||    
T  31423013 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcat 31422940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 668 - 1005
Target Start/End: Original strand, 17324009 - 17324346
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| | || |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||| ||||    
T  17324009 cttttattataaatatagactttgtattagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaagggttcagaaaggccacaacaaaact--gatttttata 17324106  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| |    
T  17324107 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttgaatatgggaagagattggaa 17324205  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | || |||||| ||||||| |  ||| ||||| |||||||    
T  17324206 ctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaacggaaggctggtctctcc 17324305  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatt 1005  Q
    ||  ||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||    
T  17324306 ccatgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 17324346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 158; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 14183923 - 14183575
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||   |||||||||||||||||    
T  14183923 cttttactataaatatagaccatgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaatg-caacac--aaactagggtttgtata 14183827  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| | |    
T  14183826 gaggttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattataattg-agtctcttggttacgggaagagattagaa 14183731  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||    
T  14183730 ttttgggtagaattaggcggaagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcc 14183631  T
Q  966 cccagactaggtcag-attggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||| ||||||||| |||||| |||||    
T  14183630 cccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatttttttgtggtctct 14183575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 158; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 471 - 764
Target Start/End: Original strand, 16231371 - 16231641
Alignment:
Q  471 cagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtg 570  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||                     |||    
T  16231371 cagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaagacactggaaaaatc---------------------gtg 16231449  T
Q  571 gcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgttacagatttgttacagattttaagcaggactt 670  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16231450 gcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatattttt-gggtgcagatttgttacagattttaag-cagatttgttacagattttaagcaagactt 16231547  T
Q  671 ttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 764  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16231548 ttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtctagaaaagcaacaagaaaactagggtttgt 16231641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 667 - 980
Target Start/End: Original strand, 42922177 - 42922487
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  42922177 acttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtat 42922275  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||| ||| | | ||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42922276 agagtttg-ctcctagcaacaaacactagggttga--ggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattggg 42922371  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| || ||||||  ||||| |||||||||     
T  42922372 actttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctg 42922471  T
Q  965 ccccagactaggtcag 980  Q
    |||| |||||||||||    
T  42922472 cccccgactaggtcag 42922487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 717 - 1019
Target Start/End: Original strand, 40133937 - 40134241
Alignment:
Q  717 ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacct 816  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40133937 ggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacgaaggtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 40134036  T
Q  817 tgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 916  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  40134037 tgggaaatactactaggatt-gagtctcttggtcacgggaagagattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatc 40134135  T
Q  917 tc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtg 1013  Q
    || ||||||| | ||||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || ||| ||| ||||||||  ||||||    
T  40134136 tcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccggactaggtaaacaaattcttttgtg 40134235  T
Q  1014 ttctct 1019  Q
    ||||||    
T  40134236 ttctct 40134241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 667 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 15669729 - 15669418
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 764  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || | | |||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||| | | |||| || ||||| ||||||||||    
T  15669729 acttttactataaatacagaccttgtagcagatgtaaacattgggatagagggggctgaaaactagggtttggga-ggcagca-caaaagtagggtttgt 15669632  T
Q  765 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 864  Q
    ||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15669631 ataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattg 15669536  T
Q  865 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctc 962  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  15669535 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtggaacggatggctgctctc 15669436  T
Q  963 tcccccagactaggtcag 980  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  15669435 tccccgagactaggtcag 15669418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 667 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 8347607 - 8347297
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 765  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  8347607 acttttactataaa-atagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgta 8347510  T
Q  766 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 865  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||| | |||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||     
T  8347509 tagagattg-ctcttggcaacaaacaccaaggttag--ggttgattcaccttaggaaacactattatgattg-agtctcttgatcacgggaagagattga 8347414  T
Q  866 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctct 963  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| | |||||||||  |||||| |||||| |    
T  8347413 gactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtggaacggagggatgctcttt 8347314  T
Q  964 cccccagactaggtcag 980  Q
    |||| ||||||||||||    
T  8347313 cccctagactaggtcag 8347297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 816 - 1017
Target Start/End: Original strand, 51757623 - 51757824
Alignment:
Q  816 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 915  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  51757623 ttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgattt 51757721  T
Q  916 ctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgt 1014  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  |||||||    
T  51757722 ctctttgtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 51757821  T
Q  1015 tct 1017  Q
    |||    
T  51757822 tct 51757824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 667 - 977
Target Start/End: Complemental strand, 18800907 - 18800600
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||    
T  18800907 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatacaaggggctgaaacaaaggtttagaa-gtcaacaagaaaactacggtttgtat 18800809  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||| ||||| |  ||||| ||||||||| |  |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||| |     
T  18800808 agagtttg-ctcttggccacaaatactagggttgg--ggttgattcaccctgagaaacactattaggattg-agtctctaggtcacgggtagagatttga 18800713  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||||    
T  18800712 actttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtatcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaagcggagaactgctctctc 18800613  T
Q  965 ccccagactaggt 977  Q
    ||||| |||||||    
T  18800612 ccccaaactaggt 18800600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 441 - 706
Target Start/End: Original strand, 23783238 - 23783533
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23783238 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 23783337  T
Q  541 aaa---------------------atcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagca 619  Q
    |||                     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23783338 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacata-tttttgggagca 23783436  T
Q  620 gatttgttacagtttt--------tgtta--cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactt 706  Q
    |||||||||||| |||        | |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23783437 gatttgttacagatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactt 23783533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 715 - 1019
Target Start/End: Original strand, 16432396 - 16432692
Alignment:
Q  715 agggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac 814  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16432396 agggggcagaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt-----------ctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcac 16432484  T
Q  815 cttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatt 914  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||     
T  16432485 cttgggaaacattattaggattgaa-tctcttggttatgggaagagattgaaactttgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgata 16432583  T
Q  915 tctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccccc-agactaggtcagattggatcgaac-tggtcaacaaatttcttt 1010  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |  || || |||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||  |||    
T  16432584 tctcttttgtaatgttactcatcattatagtgaaacggcggactgctctctcccccaagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctttt 16432683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 669 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 8349385 - 8349076
Alignment:
Q  669 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| | | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||||||||||    
T  8349385 ttttattataaatatagatcttgtattagatgcaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattaaggtttgtata 8349287  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||| ||||||||||||| |||    
T  8349286 gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggtttattcaccttgggaaacactattaggattg-agtttgatggtcacgggaagagattagga 8349191  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||| ||||| | | ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||    
T  8349190 ctttaggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaactcattggtatctcttttgttaagttactcatcattatagtggaatagagggttgttctctcc 8349091  T
Q  966 cccagactaggtcag 980  Q
    || |||||| |||||    
T  8349090 ccaagactatgtcag 8349076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 441 - 627
Target Start/End: Original strand, 51752104 - 51752291
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactgg 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  51752104 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactgg 51752203  T
Q  540 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacgtattttttgggagcagatttgtt 627  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  || || | ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  51752204 aaaaatcgtggcacgatggggccgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacataaacgta-tttttgggtgcagatttgtt 51752291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 809 - 1019
Target Start/End: Original strand, 16429042 - 16429254
Alignment:
Q  809 attcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 908  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16429042 attcaacttgggaaacactattaggattg-agtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaaccca 16429140  T
Q  909 ttgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatt 1005  Q
    ||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||    
T  16429141 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagcgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaatt 16429240  T
Q  1006 tctttgtgttctct 1019  Q
      ||||||||||||    
T  16429241 cttttgtgttctct 16429254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 440 - 627
Target Start/End: Original strand, 51749777 - 51749965
Alignment:
Q  440 ctgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactg 538  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  51749777 ctgtgagagttaacttaaaatcaagtttctgcagaatcgtggcacgatggttgggcaacgtggtacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactg 51749876  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacgtattttttgggagcagatttgtt 627  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  || || | ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  51749877 gaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatagtgcgctggcggcgaataacagaaacgta-tttttgggtgcagatttgtt 51749965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 667 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 49495537 - 49495236
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||          ||||||||||||| ||    
T  49495537 acttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaatc--------aaactagggtttgcat 49495446  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    | |||||| ||||| | ||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  49495445 atagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gagttgattcaccttgggaaacactaataaaattg-agtcttttggtcacggtaagagattggg 49495351  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |  | ||||||  ||||||    
T  49495350 gctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaagggcttatctctc 49495251  T
Q  965 ccccagactaggtca 979  Q
    ||| |||||| ||||    
T  49495250 cccaagactatgtca 49495236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 441 - 627
Target Start/End: Original strand, 13761577 - 13761763
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  13761577 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcatgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 13761676  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacgtattttttgggagcagatttgtt 627  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||  || || | ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  13761677 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgcggcacgatggtgtgctggcggcgaataacagaaacgta-tttttgggtgcagatttgtt 13761763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 791 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248540
Alignment:
Q  791 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggag 890  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatta-agtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggag 25248668  T
Q  891 acttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatc 988  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| | ||||||| |  ||||| |||||| |||||| |||||||||||  ||||| |    
T  25248667 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctccctcccctagactaggtcaatttggacc 25248568  T
Q  989 gaact-ggtcaacaaatttctttgtgtt 1015  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  25248567 gaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 25248540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 866 - 1019
Target Start/End: Original strand, 23816027 - 23816182
Alignment:
Q  866 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  23816027 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatggatcggagggatgctctctc 23816126  T
Q  965 ccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  23816127 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 23816182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 674 - 1007
Target Start/End: Complemental strand, 13125787 - 13125453
Alignment:
Q  674 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg-tatagagtt 772  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || |||  |||||| | |||||||||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  13125787 ctataaatagaaaccttgtatcagagtaaaacttgagagaaagggggctgaaacaagggttaagaa-gccaacaaggaaactagggtttggtatagagtt 13125689  T
Q  773 tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttg 872  Q
    || ||||| |  |||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  13125688 tg-ctcttggcgacaaacactagggttga--ggttgattcacattgggaaacgctgttaggattg-aggctcttggtcaagggaagagattgggactttg 13125593  T
Q  873 ggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccccca 969  Q
    ||||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  |||| | ||||||| |||||     
T  13125592 ggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagttgctctccccccct 13125493  T
Q  970 gactaggtcag-attggatcgaact-ggtcaacaaatttc 1007  Q
     |||||||||| || ||| |||||| ||| ||||||||||    
T  13125492 tactaggtcagtataggaccgaactaggtaaacaaatttc 13125453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 804 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 6115304 - 6115087
Alignment:
Q  804 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 903  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6115304 ggttgattcaccttgaaaaacactattaggattg-agtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgta 6115206  T
Q  904 acccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaac 1000  Q
    ||| |||||| |||| |||||||   ||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| |||    
T  6115205 accaattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaac 6115106  T
Q  1001 aaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||  ||||||||||||    
T  6115105 aaattattttgtgttctct 6115087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 441 - 590
Target Start/End: Original strand, 20302198 - 20302348
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactgg 539  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| || ||   ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20302198 tgtgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgcggcatgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactgg 20302297  T
Q  540 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcgg 590  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20302298 aaaaattgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcgg 20302348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 461 - 627
Target Start/End: Original strand, 6823643 - 6823810
Alignment:
Q  461 caggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggg 559  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6823643 caggtttttgcagaatcatggcacgatggttgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatggg 6823742  T
Q  560 gtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacgtattttttgggagcagatttgtt 627  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||  || || | ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  6823743 gtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacataaacgta-tttttgggtgcagatttgtt 6823810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 441 - 558
Target Start/End: Original strand, 6822775 - 6822893
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactgg 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6822775 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactgg 6822874  T
Q  540 aaaaatcgtggcacgatgg 558  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6822875 aaaaatcgtggcacgatgg 6822893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 674 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 26520449 - 26520206
Alignment:
Q  674 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag-ggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 771  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  26520449 ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagt 26520351  T
Q  772 ttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg------gttacgggaagagattgg 865  Q
    ||| ||||| | ||||||||||| | ||    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||      || |||||||||||||||    
T  26520350 ttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--gaggttgattcaccttgggaaacactattatgatt-gagtctcttggtcacagtcacgggaagagattgg 26520255  T
Q  866 gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 913  Q
    |||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  26520254 gactttgggtagaattaggtttggaaacttattcttgtaacccattgat 26520206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 641 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 30790758 - 30790426
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaa 739  Q
    |||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  30790758 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaa 30790659  T
Q  740 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 839  Q
    |  |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||    
T  30790658 a--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt-gtgg-ttgatttaccttgggaaacactgttaggat--ga 30790569  T
Q  840 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca 937  Q
    |||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||    
T  30790568 gtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca 30790469  T
Q  938 -tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag 980  Q
     ||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||    
T  30790468 ttatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcag 30790426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 667 - 1007
Target Start/End: Original strand, 27916440 - 27916782
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctg--aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 763  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | || | ||    |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||    
T  27916440 acttttactataaatatagacattgtatcaaatgtaaactgtgagaaacagagagccagaaaacaagggtttagaa-gccagcaagaaaactagggtttg 27916538  T
Q  764 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt 863  Q
    ||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |    |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||  |||||||||    
T  27916539 ta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggaa--ttgattcaccttggaaaacactattagaattg-agtctcttggtcacatgaagagatt 27916632  T
Q  864 gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc--cattgatttctctttgtaacggtactcatc-atatagtggattggagggctgct 959  Q
    | |||||||||| ||||||||   | ||||| |||||| |||||  | ||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||||||  |||||||||||    
T  27916633 gtgactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttttaaccttctttgatatctctttgtaaagttactcatcgttatagtggaacggagggctgct 27916732  T
Q  960 ctctcccccagactaggtcag-attggatcgaact-ggtcaacaaatttc 1007  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||| ||||||||||    
T  27916733 ctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattgggtaaacaaatttc 27916782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 441 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 10400369 - 10400222
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| |||||||| |  |||  || ||| |||||||    
T  10400369 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattggaggtttcaagtttgagg-caaagcactgg 10400271  T
Q  540 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10400270 aaatatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 10400222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 806 - 967
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155950
Alignment:
Q  806 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 904  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   | ||| | ||||||||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaa-tctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaagagtaattcttgtaa 155886  T
Q  905 cccattgatttctctttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccc 967  Q
    ||  ||| | ||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  155887 ccttttgttatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccc 155950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 669 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 25248850 - 25248756
Alignment:
Q  669 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 763  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25248850 tttttctagaaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 25248756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 806 - 1007
Target Start/End: Complemental strand, 30738830 - 30738623
Alignment:
Q  806 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 904  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  30738830 ttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 30738732  T
Q  905 cccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca---tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggatcgaac-tggtca 998  Q
    ||| ||||| |||| ||||||| | |||||||||   ||||||| |  |||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| | ||| |||| |    
T  30738731 ccctttgatgtctcttttgtaaagttactcatcatattatagtgaaacggagggatgctctctcacccatactaggtcagtattggaccaaacttggtaa 30738632  T
Q  999 acaaatttc 1007  Q
    |||||||||    
T  30738631 acaaatttc 30738623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 802 - 1007
Target Start/End: Original strand, 16561544 - 16561753
Alignment:
Q  802 tgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattctt 900  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| || |||||| |||||||||||||| ||||   | ||||||||||||    
T  16561544 tgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-aagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattctt 16561642  T
Q  901 gtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggatcgaactg-gt 996  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||| | ||||||||| || ||||||    |||| |||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  16561643 gtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacaaagggttgctctctcccatagactaggtcagtattggaccgaactgtgt 16561742  T
Q  997 caacaaatttc 1007  Q
     ||||||||||    
T  16561743 aaacaaatttc 16561753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 441 - 585
Target Start/End: Original strand, 15823286 - 15823430
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 538  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||| |  |||  || ||| |||||     
T  15823286 tgtgagagttaacttaaaatcaggat-ctgcaggaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcaagtttgagg-caaagcacta 15823383  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgct 585  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15823384 gaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgct 15823430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 806 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 26613440 - 26613224
Alignment:
Q  806 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 904  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  26613440 ttgattcaccttgggaaacactattcggatt-gagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 26613342  T
Q  905 cccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggatcgaact-ggtcaac 1000  Q
    ||| ||||| |||| |||| || | |||| |||| |||||||||   ||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||| || |||||| ||| |||    
T  26613341 ccctttgatatctcttttggaaagttactaatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagattaggtcagtatttgaccgaactgggtaaac 26613242  T
Q  1001 aaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||| | ||||||||||    
T  26613241 aaattt-tgtgtgttctct 26613224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 747 - 1019
Target Start/End: Original strand, 28279292 - 28279565
Alignment:
Q  747 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctct 845  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||| |||||   |||||||||||||||| |  | ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||  |||    
T  28279292 aacaaaattagggtttgta--gagtttg-ctcttgacaacaaacactagggttgg--gattgattccccttggagaaacactattaggattg-agcttct 28279385  T
Q  846 tggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatag 942  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||| |||||   |||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  28279386 tggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctcttttgtaaagttactcatcattatag 28279485  T
Q  943 tggattggagggctgctctctccccc-agactaggtcag-attggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||| | ||| | || ||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||    
T  28279486 tggaattgagagttgttctttccccctagactaggtcagtattagatcgaactgggtaaacaaatttttgtgtgttctct 28279565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 441 - 546
Target Start/End: Original strand, 20291280 - 20291386
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactgg 539  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||   ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  20291280 tgtgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacggtggaggtttcagttttttgaggcatggcactgg 20291379  T
Q  540 aaaaatc 546  Q
    |||||||    
T  20291380 aaaaatc 20291386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 440 - 588
Target Start/End: Original strand, 28840417 - 28840565
Alignment:
Q  440 ctgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcact 537  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| ||   ||||| |||||||||| |||||||| ||||||| || ||||| |||    
T  28840417 ctgtgaaagttaacttaaaatcaggat-ctgcaggaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttttagg-caaggtact 28840514  T
Q  538 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  28840515 ggaaaaattgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgtgctggc 28840565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 824 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 21353525 - 21353373
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 922  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  21353525 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 21353431  T
Q  923 taacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    ||| |  ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21353430 taaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 21353373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 929 - 1017
Target Start/End: Original strand, 13358778 - 13358867
Alignment:
Q  929 tactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  13358778 tactcttcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13358867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 441 - 581
Target Start/End: Original strand, 28842233 - 28842373
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 538  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||  || ||||||||||||| ||   ||| | |||||||||| |||||||| ||||||| || ||||| ||||    
T  28842233 tgtgaaagttaacttaaaatcaggat-ctgtaggaatcgtggcacgatggcaaggctacgtggcacgattggaggtttcagtttttagg-caaggtactg 28842330  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtg 581  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  28842331 gaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtg 28842373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 939 - 1002
Target Start/End: Original strand, 16124545 - 16124609
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactg-gtcaacaa 1002  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  16124545 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 16124609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 806 - 882
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332613
Alignment:
Q  806 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaatta 882  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggattt-agtctcttggtcacgagaagagattgagactttgtgtagaatta 26332613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 534 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 13449996 - 13449919
Alignment:
Q  534 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttt 611  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||  |||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  13449996 cactggaaaaatcgtgccacgattggatcgaatcgtgccacgatggtgcgatggtagataaaaataaaacgtattttt 13449919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 627
Target Start/End: Original strand, 39462258 - 39462445
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactg 538  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| | |||||||||| ||||||||| | ||||||| || ||||  |||||| || ||    
T  39462258 tgtgagagttaacttaaaatcagg-ttctgcagaaatcgtgacacaatggttgggcaacgtggcacgattagaggtttcag-ttttgaggcaagtcagtg 39462355  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacgtattttttgggagcagatttgtt 627  Q
    ||    ||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||||| || |  || || | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  39462356 gatttttcgtggcacgatgggattgcaatgtggcacgatggtgcgcttgcagtgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgtt 39462445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Original strand, 2232597 - 2232747
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  2232597 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctct 2232691  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||||    | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2232692 ttgtaaagaaactcat----tcgtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 2232747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 674 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 13127959 - 13127813
Alignment:
Q  674 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 773  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || |||| || ||| |||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  13127959 ctataaatataaaccttgtatcggagtaaacctttagagagaggggt-tgaaacaagggtttag-aagccaacaagaaaagtagggtttatatagagttt 13127862  T
Q  774 gtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaca 825  Q
      || || | ||||||||||||||||   || | ||||||||||||||||||    
T  13127861 -ccttttggcaacaaacactagggtt--gggatagattcaccttgggaaaca 13127813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 13598466 - 13598410
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  13598466 atagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 13598410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 806 - 884
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353126
Alignment:
Q  806 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg-gactttgggtagaattagg 884  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggattt-agtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattagg 14353126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 897 - 979
Target Start/End: Original strand, 15916562 - 15916646
Alignment:
Q  897 tcttgtaacccattgatttctctttg-taacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||| | ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15916562 tcttgtaacccattgatatctcttttataaagttactcgtcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 15916646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 29651879 - 29651823
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  29651879 atagtggattggagtgctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 29651823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 47703965 - 47704021
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  47703965 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 47704021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 821 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 4144865 - 4144804
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  4144865 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 4144804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 940 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 19072995 - 19072940
Alignment:
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  19072995 tagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 19072940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 940 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 19120885 - 19120830
Alignment:
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  19120885 tagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 19120830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 940 - 995
Target Start/End: Original strand, 47098854 - 47098909
Alignment:
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||    
T  47098854 tagtggattggagggctgctctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgg 47098909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 438 - 523
Target Start/End: Original strand, 47451402 - 47451488
Alignment:
Q  438 gactgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaa-tcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacga-tggaggttttagtttt 523  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  47451402 gactgtgagagttaacttcaaatcagattt-tgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaatgtggcacgattggaggtttcagtttt 47451488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 724 - 849
Target Start/End: Complemental strand, 26332836 - 26332719
Alignment:
Q  724 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 823  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||    
T  26332836 aaacaagggtttagaa-gccaaca-caaaaatagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggtttgattcaccttcggaaa 26332744  T
Q  824 cactattaggattggagtctcttggt 849  Q
    |||||||||||||  |||||||||||    
T  26332743 cactattaggatt-tagtctcttggt 26332719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 942 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 3281773 - 3281720
Alignment:
Q  942 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  3281773 gtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 3281720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 940 - 993
Target Start/End: Complemental strand, 32889506 - 32889453
Alignment:
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact 993  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  32889506 tagtggattggagagctgctctatcccccagactaggtcatattggaccgaact 32889453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 9476329 - 9476273
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  9476329 atagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgg 9476273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 943 - 995
Target Start/End: Original strand, 26644930 - 26644982
Alignment:
Q  943 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  26644930 tggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 26644982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 939 - 1002
Target Start/End: Original strand, 27104401 - 27104465
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactg-gtcaacaa 1002  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||||||||    
T  27104401 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggttatattggaccgaactgtgtcaacaa 27104465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 548 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 28207500 - 28207421
Alignment:
Q  548 tggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacgtattttttgggagcagatttgtt 627  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  || || | |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  28207500 tggcacgatggggtcacaacgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacataaacgt-ttttttgggtgcagatttgtt 28207421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 30790848 - 30790764
Alignment:
Q  528 gcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacgtattttt 611  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||    
T  30790848 gcaagtcactggaaaaaacgtggcacgatgggatcgcaatgtggcacgatggtgcgctggaggggaaaaacataaacgtattttt 30790764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 701 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 6115383 - 6115344
Alignment:
Q  701 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115383 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 6115344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 821 - 884
Target Start/End: Original strand, 14997040 - 14997101
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14997040 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagagattgagac-ttgggtagaattagg 14997101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 668 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 26613577 - 26613503
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt--gagatagagggggctg-aaacaagggtttagaa 739  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26613577 cttttgctataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagagatagagggggctgaaaacaagggtttagaa 26613503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 810 - 977
Target Start/End: Original strand, 43104245 - 43104414
Alignment:
Q  810 ttcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggaga-cttattcttgtaaccc 907  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| || |||||| ||||  ||||||||||||||||||   | |||  || ||||||||||||    
T  43104245 ttcaccttggaaaacactattagaattg-agtcttttggtcacaggaagacattgaaactttgggtagaattaggtttgaagatttttttcttgtaaccc 43104343  T
Q  908 attgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggt 977  Q
     ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  |||| | ||||||| | ||||||||||||    
T  43104344 tttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagatgctctc-ctcccagactaggt 43104414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 940 - 995
Target Start/End: Original strand, 47102871 - 47102926
Alignment:
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  47102871 tagtggattggatggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgg 47102926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 824 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 2401400 - 2401246
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 922  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  2401400 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 2401306  T
Q  923 taacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    ||| |  ||||  |||| |||||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  2401305 taaagaaactcatatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagactaggtca 2401246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 824 - 979
Target Start/End: Original strand, 9526469 - 9526623
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 922  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| ||   || ||||||||    
T  9526469 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctctttg 9526563  T
Q  923 taacggtact--catca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    ||| |  |||   |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9526564 taaagaaacttatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 9526623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 938 - 979
Target Start/End: Original strand, 21536597 - 21536638
Alignment:
Q  938 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  21536597 tatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtca 21536638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 474 - 581
Target Start/End: Original strand, 13214854 - 13214961
Alignment:
Q  474 aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggc 572  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||  |||||| |||||||    |||||||| |||||| |  || ||||||    
T  13214854 aatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcacgattggaggtttcag-ttttgaggcaagtcactggatttttcgtggcatgatgggattgcaacgtggc 13214952  T
Q  573 acgatggtg 581  Q
    |||||||||    
T  13214953 acgatggtg 13214961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 667 - 719
Target Start/End: Original strand, 16431044 - 16431096
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggg 719  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16431044 acttttactataaatataggttttgtatcagagcaaaccttgagatagagggg 16431096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 824 - 884
Target Start/End: Original strand, 25134074 - 25134132
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  25134074 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25134132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 37069838 - 37069782
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  37069838 atagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 37069782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 940 - 991
Target Start/End: Complemental strand, 775739 - 775688
Alignment:
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaa 991  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  775739 tagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaa 775688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 527 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 3580073 - 3580010
Alignment:
Q  527 ggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcgg 590  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||| |||| |  || ||||||||||||||||||||||||    
T  3580073 ggcaagtcattggaaaaatcgtggtacggtgggattgcaacgtggcacgatggtgcgctggcgg 3580010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 939 - 985
Target Start/End: Original strand, 24202798 - 24202844
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattgg 985  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  24202798 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 24202844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 443 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 38925996 - 38925915
Alignment:
Q  443 tgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacga-tggaggttttagtttt 523  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||| || ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  38925996 tgagagttaacttaaaatcagg-ttccgcagaaatcgtggtacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt 38925915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 939 - 984
Target Start/End: Original strand, 13604652 - 13604697
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattg 984  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  13604652 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattg 13604697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 939 - 984
Target Start/End: Original strand, 19358872 - 19358917
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattg 984  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  19358872 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattg 19358917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 939 - 984
Target Start/End: Original strand, 19361461 - 19361506
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattg 984  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  19361461 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattg 19361506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 939 - 984
Target Start/End: Original strand, 19380101 - 19380146
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattg 984  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  19380101 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattg 19380146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 668 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 30738963 - 30738890
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 740  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |  |||| |||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||    
T  30738963 cttttactataaacatagtccttgtatcagatgaaaccttgagatacaggtgactgaaaacaagggtttagaaa 30738890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 667 - 696
Target Start/End: Original strand, 43104102 - 43104131
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatca 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43104102 acttttactataaatatagaccttgtatca 43104131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 667 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 46432066 - 46432037
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatca 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46432066 acttttactataaatatagaccttgtatca 46432037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 459; Significance: 0; HSPs: 150)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 441 - 1017
Target Start/End: Original strand, 31544798 - 31545374
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31544798 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcaaaatcgtggcacgatagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 31544897  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgtt 639  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||| |||||||| |||||| ||||       
T  31544898 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgagacacgatggtgcgctggcggataaaaacagaaacatattttt-gggtgcagatttattacagattttaag 31544996  T
Q  640 acagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 739  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31544997 -cagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaa 31545095  T
Q  740 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 839  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31545096 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattaga 31545195  T
Q  840 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 939  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31545196 gtctcttggttacgggaagaaattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacagtactcatcata 31545295  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31545296 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 31545374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 440 - 1017
Target Start/End: Original strand, 31542441 - 31543028
Alignment:
Q  440 ctgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31542441 ctgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcaaaatcgtgacacgatagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 31542540  T
Q  540 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttt--- 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||       
T  31542541 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgagacacgatggtgcgctggcggataaaaacagaaacatattttt-gggtgcagatttgttacagatttgtt 31542639  T
Q  636 -----tgtta--cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaaca 728  Q
         | |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31542640 acagattttaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaaca 31542739  T
Q  729 agggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacacta 828  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31542740 agggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacacta 31542839  T
Q  829 ttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgg 928  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  31542840 ttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattgatttctctttgtaacag 31542938  T
Q  929 tactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31542939 tactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 31543028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 499 - 1008
Target Start/End: Complemental strand, 31179896 - 31179365
Alignment:
Q  499 gtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaat 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31179896 gtggcacgatggaggttttagttttttgggcaagacactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcgggtaaaaat 31179797  T
Q  599 aaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgttacagatttgttaca----------------------gattttaagcaggacttttacta 676  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                      |||||||||||||||||||||||    
T  31179796 aaaacgtattttt-gggagcagatttgttacagtttttgttacagatttgttacaaatttaaagcagatttgttatagattttaagcaggacttttacta 31179698  T
Q  677 taaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtc 776  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31179697 taaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtc 31179598  T
Q  777 tcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggta 876  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31179597 tcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggta 31179498  T
Q  877 gaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactagg 976  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31179497 gaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactagg 31179398  T
Q  977 tcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttct 1008  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  31179397 tcagattggaccgaactgggtcaacaaatttct 31179365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Original strand, 38882022 - 38882399
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggg-ctgaaacaagggtttagaa 739  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38882022 cagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaggggggctgaaacaagggtttagaa 38882121  T
Q  740 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 839  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38882122 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-a 38882220  T
Q  840 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 939  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38882221 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 38882320  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  38882321 tagtggatcggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 38882399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Original strand, 2174836 - 2175212
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2174836 cagatttgttccaaattttaagcgatgcttttactataaatacaggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 2174935  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  2174936 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgatt-gag 2175034  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatat 940  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  2175035 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttacttatcatat 2175134  T
Q  941 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  2175135 agtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2175212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Original strand, 4236546 - 4236922
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  4236546 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaa 4236645  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  4236646 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gag 4236744  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  4236745 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 4236844  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  4236845 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactggtcaataaattcttttgtgttct 4236922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 708 - 1017
Target Start/End: Original strand, 15552229 - 15552539
Alignment:
Q  708 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 807  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15552229 gagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 15552328  T
Q  808 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 907  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552329 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 15552428  T
Q  908 attgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaattt 1006  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15552429 attgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattt 15552528  T
Q  1007 ctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||    
T  15552529 ctttgtgttct 15552539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 25921835 - 25921458
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921835 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 25921736  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  25921735 gacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggatt-gag 25921637  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25921636 tctcttggttacgggaagaggctgggactctgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 25921537  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  25921536 tagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 25921458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Original strand, 39854427 - 39854779
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854427 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 39854525  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||     
T  39854526 agagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcatggttacgggaagagactgga 39854624  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39854625 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 39854724  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||| |||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  39854725 cccagactagatcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctct 39854779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 10529435 - 10529083
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  10529435 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttttat 10529336  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10529335 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggg 10529237  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  10529236 gctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggaaggctgctctctcc 10529137  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatt-tctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  10529136 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttttgtgttct 10529083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 708 - 1005
Target Start/End: Complemental strand, 34477349 - 34477050
Alignment:
Q  708 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 807  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477349 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34477250  T
Q  808 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc 906  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  34477249 gattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 34477150  T
Q  907 cattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatt 1005  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||    
T  34477149 cattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 34477050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 642 - 1018
Target Start/End: Original strand, 16776075 - 16776452
Alignment:
Q  642 agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaa-tatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    ||||||||| || |||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16776075 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaaatatagaccttgtatctgagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttacaaa 16776174  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16776175 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 16776273  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  16776274 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatttctcttttgtaacgttacttatcata 16776372  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctc 1018  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||  ||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  16776373 tagtggatcggagggctgctatctcccccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctc 16776452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 708 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 34479714 - 34479403
Alignment:
Q  708 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 807  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34479714 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34479615  T
Q  808 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc 906  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  34479614 gattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 34479515  T
Q  907 cattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatt 1005  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||    
T  34479514 cattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 34479415  T
Q  1006 tctttgtgttct 1017  Q
      ||||||||||    
T  34479414 cttttgtgttct 34479403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 21684823 - 21684437
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----------tagagggggctgaaacaag 730  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||          |||||||||||||||||||    
T  21684823 cagatttgttacaaattttaagcaaaacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaag 21684724  T
Q  731 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 830  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21684723 ggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactatt 21684624  T
Q  831 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggta 930  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  21684623 aggattg-agtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacaata 21684525  T
Q  931 ctcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  21684524 ctcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcgtttgtgttct 21684437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 641 - 1019
Target Start/End: Original strand, 21947944 - 21948322
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21947944 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaa 21948042  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21948043 gacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 21948141  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  21948142 tctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtggaattaggcgggagacttattcttgtaaccccttgatatctcttttgtaacgttactcatcata 21948241  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  21948242 tagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 21948322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 670 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 18511547 - 18511195
Alignment:
Q  670 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  18511547 tttaatataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtata 18511448  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511447 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggga 18511349  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  18511348 ctttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 18511249  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    | |||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  18511248 ctagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctct 18511195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 641 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 2818698 - 2818318
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2818698 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 2818599  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtggg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 839  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||    
T  2818598 ggtaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcaccttggaaaacactattacgatt-ga 2818500  T
Q  840 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcat 938  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||||||||    
T  2818499 gtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat 2818400  T
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaac-tggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  2818399 atagtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctct 2818318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 708 - 1020
Target Start/End: Original strand, 6745053 - 6745365
Alignment:
Q  708 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 807  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  6745053 gagataaagggggctgaaacaagtgtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggtt 6745151  T
Q  808 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 907  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745152 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 6745250  T
Q  908 attgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatt 1005  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||| ||||||||||||    
T  6745251 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 6745350  T
Q  1006 tctttgtgttctctt 1020  Q
      |||||||||||||    
T  6745351 cttttgtgttctctt 6745365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 222; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 669 - 1005
Target Start/End: Original strand, 18466625 - 18466966
Alignment:
Q  669 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 764  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18466625 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgg 18466724  T
Q  765 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 864  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||    
T  18466725 atagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggaaagaggctg 18466823  T
Q  865 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct 963  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||    
T  18466824 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgctctct 18466923  T
Q  964 cccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatt 1005  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||    
T  18466924 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 18466966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 222; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Original strand, 25904047 - 25904399
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25904047 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtata 25904146  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  25904147 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattaggg 25904245  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |  ||| | ||||||||||||    
T  25904246 ctttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctattgtaacgttacttatcatatagtgaaacggatgactgctctctccc 25904345  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  25904346 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattattttgtgttctct 25904399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 667 - 1023
Target Start/End: Original strand, 6747247 - 6747604
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt--gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 764  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  6747247 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaagagaaagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagagtttgt 6747346  T
Q  765 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 864  Q
    ||| | |||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  6747347 ataaaatttgtctctttgaaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagactg 6747444  T
Q  865 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6747445 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctttttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctc 6747544  T
Q  965 ccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctcttctt 1023  Q
     | ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6747545 tctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctcttctt 6747604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 708 - 1017
Target Start/End: Original strand, 25804009 - 25804318
Alignment:
Q  708 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 807  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  25804009 gagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 25804108  T
Q  808 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 907  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804109 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 25804207  T
Q  908 attgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatt 1005  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||    
T  25804208 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaatt 25804306  T
Q  1006 tctttgtgttct 1017  Q
      ||||||||||    
T  25804307 cttttgtgttct 25804318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Original strand, 40221465 - 40221819
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40221465 acttttactataaatatagacattgactcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 40221564  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40221565 agagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagagattggg 40221663  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||    
T  40221664 acttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctc 40221763  T
Q  965 ccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  |||||| |||||    
T  40221764 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgctctct 40221819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 441 - 704
Target Start/End: Original strand, 10749505 - 10749767
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749505 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 10749604  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 640  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749605 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacata-tttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 10749703  T
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaac 704  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749704 cagatttgttatagattttaagcaggacttttagtataaatatagaccttgtatcaaagcaaac 10749767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Original strand, 27912473 - 27912830
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 760  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912473 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 27912572  T
Q  761 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 860  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27912573 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagag 27912671  T
Q  861 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgct 959  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||   |||  |||||    
T  27912672 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacagagaactgct 27912771  T
Q  960 ctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  27912772 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27912830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 667 - 995
Target Start/End: Original strand, 18468950 - 18469280
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 762  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18468950 acttttactataaatatagaccttgtatcatgataaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 18469049  T
Q  763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 862  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  18469050 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggc 18469148  T
Q  863 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 961  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||  | || ||||||||    
T  18469149 tgggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatctagtggaacgaagagctgctct 18469248  T
Q  962 ctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||  ||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  18469249 ct--cccagactaggtcaatttggaccgaactgg 18469280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 670 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 18509652 - 18509301
Alignment:
Q  670 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag-ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 768  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18509652 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatag 18509553  T
Q  769 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggac 868  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18509552 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagaatgggac 18509454  T
Q  869 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct-ctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 967  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||  ||||||| | |||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  18509453 tttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgatatctattttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggtgggctgctctctcccc 18509354  T
Q  968 cagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
     |||||||||||  ||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  18509353 tagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctct 18509301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Original strand, 27910388 - 27910744
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag------ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 760  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||      ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  27910388 acttttactataaatatagaccttgtatcaggttaaactttgagagagagatagcgggggctgaaacaagg-tttaaaaaggcaacaacaaaactagggt 27910486  T
Q  761 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 860  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27910487 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgggaagag 27910585  T
Q  861 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgct 959  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||  |||| ||||||    
T  27910586 gctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgct 27910685  T
Q  960 ctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  27910686 ctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27910744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 668 - 1005
Target Start/End: Original strand, 17072827 - 17073166
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17072827 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 17072926  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||     
T  17072927 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttaggggaagagattgggg 17073025  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||  |  |||||||||||||||||    
T  17073026 ctttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctcc 17073125  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatt 1005  Q
    |||||||| |||||  ||||| |||||| ||||||||||||    
T  17073126 cccagactcggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 17073166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 671 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 10474655 - 10474306
Alignment:
Q  671 ttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 770  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10474655 ttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgaaatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagag 10474556  T
Q  771 tttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactt 870  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10474555 tttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaaacactattaagatt-gaatctcttggttacaggaagagattgggactt 10474457  T
Q  871 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccca 969  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||    
T  10474456 tgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttctaaggttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctccccca 10474357  T
Q  970 gactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
     |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  10474356 tactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctct 10474306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Original strand, 26097676 - 26098027
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  26097676 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttggat 26097775  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |   ||||    
T  26097776 agagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcacctt-ggaaacactattaggaat-gagtctcttggttacgggaaaatgctggg 26097873  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||   || |||||||||||||    
T  26097874 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacaga-ggctgctctctcc 26097972  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
     |||||||||||||  ||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  26097973 tccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 26098027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Original strand, 24126800 - 24127152
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24126800 cttttactataaatatagacattatatcagtgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 24126899  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    |||||||||||||   |||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24126900 gagtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaaacactattaggatt-aagtctcttggttacgggaagagattggga 24126998  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  24126999 ctttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 24127098  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  24127099 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 24127152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 641 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 36402689 - 36402311
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36402689 cagatttgtt-caaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttatatcagagtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaat 36402591  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    | |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||     
T  36402590 gacaatcacgaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggatt-gaa 36402492  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  36402491 tctcttggttacgggaggagattggaactttgggtaaaattaggctggagacttattattgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 36402392  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||| |   || | |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  36402391 tagtgaaacagatgtctgctctctcccccagactaggtcaatttagatcgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctct 36402311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 1189949 - 1189590
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 762  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1189949 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactacggttt 1189850  T
Q  763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 862  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  1189849 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacaggaagagat 1189751  T
Q  863 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctc 960  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | ||||||| | |||||||||  |||||| |||||    
T  1189750 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtggaacggagggatgctc 1189651  T
Q  961 tctcc-cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  1189650 tctcctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 1189590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 31472948 - 31472595
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31472948 cttttactataaatatggacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 31472849  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31472848 gagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagagattggga 31472750  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    |||| |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |  |||||| ||||||||||    
T  31472749 cttttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcc 31472650  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  31472649 cccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctct 31472595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 667 - 1016
Target Start/End: Original strand, 18596590 - 18596939
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18596590 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgggatagagggggctgaaacaagggtata--aagacaacaacaaaactagggtttgtat 18596687  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18596688 agagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggg 18596786  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||    
T  18596787 actttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctc 18596886  T
Q  965 ccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttc 1016  Q
    | |||||||||||||  ||||| |||||| |||||||| |||  |||||||||    
T  18596887 ctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacagattcttttgtgttc 18596939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Original strand, 6756437 - 6756788
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6756437 acttttactattaatatagatcttgtatcatattaaactttgagatagagggagctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtat 6756536  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  6756537 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattctccttgggaaacactattaggatt-gagtatcttggttacgggaagagattgag 6756635  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||| | ||| ||||| |||||| ||   |||||||||||||||    
T  6756636 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa--cattgatatcttttttgtaaggttacacatcattatagt-gaaacgagggctgctctctc 6756732  T
Q  965 ccccagactaggtcagattggatcgaactg-gtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||| |||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| |  ||||||||||||    
T  6756733 ccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaatcttttgtgttctct 6756788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 708 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 16092495 - 16092182
Alignment:
Q  708 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 807  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  16092495 gagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggtt 16092396  T
Q  808 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 907  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092395 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 16092297  T
Q  908 attgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg-tcaacaaat 1004  Q
    |||||  |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |  |||||| |||||||||| | |||||||||||  || ||  ||||||| |||||||||    
T  16092296 attgagatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcctctagactaggtcaatttagactgaactggatcaacaaat 16092197  T
Q  1005 ttctttgtgttctct 1019  Q
    |  ||||||||||||    
T  16092196 tcttttgtgttctct 16092182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 667 - 1005
Target Start/End: Complemental strand, 37706116 - 37705777
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37706116 acttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaaggcaacgacaaatctagggtttgtat 37706017  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    ||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  37706016 agactttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagg 37705918  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
      ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |  | | ||||  |||||||    
T  37705917 gttttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatggctattctctcc 37705818  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatt 1005  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||    
T  37705817 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 37705777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 182; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 676 - 1019
Target Start/End: Original strand, 2954368 - 2954712
Alignment:
Q  676 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 775  Q
    |||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || | |||||    
T  2954368 ataaatataggctttgtatcagtgtaaactttgagatagaggagtatgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgtgtataatttgt 2954467  T
Q  776 ctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttggg 874  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  2954468 ctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttggaaaacactattaggattg-agtctcttagttacgagaagagattgagactttggg 2954566  T
Q  875 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagacta 974  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||| ||||    
T  2954567 tagaattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctctttgtaaagttactcatcatatagtgaagcggagggatgctctctcccccaaacta 2954666  T
Q  975 ggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||  || || |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  2954667 ggtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 2954712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 675 - 1020
Target Start/End: Complemental strand, 17818817 - 17818474
Alignment:
Q  675 tataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 774  Q
    ||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  17818817 tataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagaaagagggg-ctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttcg 17818719  T
Q  775 tctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttggg 874  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  17818718 tctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaaacactattaagact-gagtctcttggttacgggaagagattgaggctttggg 17818620  T
Q  875 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagact 973  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| ||||||   |||||||  ||||||||||| |||    
T  17818619 tagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatacagtggaacagagggct--tctctcccccaaact 17818522  T
Q  974 aggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctctt 1020  Q
    ||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  17818521 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctt 17818474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 791 - 1017
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410316
Alignment:
Q  791 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggag 890  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggag 4410188  T
Q  891 acttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcga 990  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4410189 acttattcttgtaacctattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccga 4410288  T
Q  991 act-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  4410289 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 4410316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 441 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 34477632 - 34477379
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34477632 tgtgagagttaacttaaaatcaagtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttaggcaaggcactgga 34477533  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 640  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||       
T  34477532 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacata-tttttgggtgcagatttgttacagattttg-ag 34477435  T
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatca 696  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34477434 cagatttgttacagattttaagcgagacttttactataaaaatagaccttgtatca 34477379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 641 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 31466340 - 31465972
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||    
T  31466340 cagatttgttccaaattttaagcgacacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagataaaaggggctgaaacaaaggtttaaaaa 31466241  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  31466240 agtaacgacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggatt-gag 31466142  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct-ctttgtaacggtactcatcata 939  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||| | |||||||||||    
T  31466141 tctcttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcata 31466043  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |          |||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||||||    
T  31466042 t----------agggctgctctcacccccagactagttcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtattctct 31465972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 177; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Original strand, 695833 - 696174
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |  | |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  695833 cttttactatgaatatagacattgtatgagtgtaaaccttgagataaagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat- 695931  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
              ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  695932 ----------ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgaga 696019  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | || |||||| ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  696020 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcc 696119  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||| ||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  696120 cccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctct 696174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 177; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Original strand, 10586782 - 10587126
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag---ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 763  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||          
T  10586782 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactag------ 10586875  T
Q  764 tatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 862  Q
         |||||||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||    
T  10586876 -----agtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattc-agtctcttgcttacggaaagagat 10586969  T
Q  863 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctc 962  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10586970 tgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 10587069  T
Q  963 t-cccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    | ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  10587070 tccccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 10587126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 177; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 639 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 12556287 - 12555906
Alignment:
Q  639 tacagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttaga 738  Q
    |||||||||||| || | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12556287 tacagatttgtttcaaaatttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttaga 12556188  T
Q  739 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgg 838  Q
    | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12556187 atgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-g 12556089  T
Q  839 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacggtactcatc 936  Q
     ||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||  || ||| ||||||||| ||||||||    
T  12556088 tgtctcttggctacgggaagagatt-ggagttttggtagaattagacaagagactttttcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatc 12555990  T
Q  937 atatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
     || || | |  ||||||||||| ||||||||| ||||| |||  |||||  ||||| |||||| |||||  ||||||||||||    
T  12555989 ttaaagcgaaacggagggctgctatctcccccatactagttcaatttggactgaactgggtcaataaattcttttgtgttctct 12555906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 39398327 - 39397976
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |   | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39398327 cttttactataaatataaacattgtaccggtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 39398229  T
Q  768 gagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  39398228 gagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacggaaagagattgga 39398131  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||  || |||||||  |  ||| |||||||||||||    
T  39398130 actttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtgacgttaccaattatatagtaaaacggatggctgctctctcc 39398031  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    | ||||||||||||  ||||| |||||| |||||| | |||  ||||||||||||    
T  39398030 cacagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaaacattcttttgtgttctct 39397976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 668 - 921
Target Start/End: Complemental strand, 34531001 - 34530749
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34531001 cttttactgtaaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtata 34530902  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  34530901 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggctacgggaagagattagga 34530803  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 921  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  34530802 ctttgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaactcattgatatctcttt 34530749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 441 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 15355065 - 15354777
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355065 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 15354966  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 640  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15354965 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacata-tttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 15354867  T
Q  641 cagatttgttac----------------------agattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 708  Q
    ||||||||||||                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15354866 cagatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 15354777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 441 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 15357341 - 15357053
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357341 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 15357242  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 640  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357241 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacata-tttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 15357143  T
Q  641 cagatttgttac----------------------agattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 708  Q
    ||||||||||||                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357142 cagatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 15357053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 668 - 883
Target Start/End: Original strand, 20042994 - 20043208
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20042994 cttttactataaatataggctttgtatcatagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 20043093  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20043094 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgaga 20043192  T
Q  868 ctttgggtagaattag 883  Q
    |||||| |||||||||    
T  20043193 ctttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 820 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 3373320 - 3373122
Alignment:
Q  820 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3373320 gaaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 3373221  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3373220 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 3373122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 820 - 1017
Target Start/End: Original strand, 10749796 - 10749993
Alignment:
Q  820 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749796 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 10749895  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  10749896 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa-ttctttgtgttct 10749993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 166; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 746 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 658610 - 658339
Alignment:
Q  746 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctct 845  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  658610 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattagga-tcgagtctct 658512  T
Q  846 tggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtg 944  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  658511 tggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 658412  T
Q  945 gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
     |  ||| |||||||||   |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  658411 aaacggatggctgctct---ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 658339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 441 - 665
Target Start/End: Original strand, 10756960 - 10757183
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10756960 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtagcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 10757059  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 640  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10757060 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacata-tttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 10757158  T
Q  641 cagatttgttacagattttaagcag 665  Q
    || |||||||||| |||||| ||||    
T  10757159 caaatttgttacaaattttaggcag 10757183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 668 - 887
Target Start/End: Original strand, 20044954 - 20045172
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  20044954 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagacagagggggctgaaacaagggtttaggaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 20045053  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20045054 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttccgggaagagattggga 20045152  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgg 887  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20045153 ctttgggtagaattaggcgg 20045172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 158; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 441 - 711
Target Start/End: Original strand, 23664834 - 23665125
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||   | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23664834 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggagtttttatttttttgggaaaggcactgga 23664933  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 640  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23664934 aaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacata-tttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 23665032  T
Q  641 cagatttgttac----------------------agattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 711  Q
    ||||||||||||                      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23665033 cagatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23665125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 158; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 441 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 23793753 - 23793462
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||   | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23793753 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggagtttttatttttttgggaaaggcactgga 23793654  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 640  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23793653 aaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacata-tttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 23793555  T
Q  641 cagatttgttac----------------------agattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 711  Q
    ||||||||||||                      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23793554 cagatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23793462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 820 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 15354757 - 15354560
Alignment:
Q  820 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15354757 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15354659  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15354658 ttgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 15354560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 820 - 1017
Target Start/End: Original strand, 23665140 - 23665337
Alignment:
Q  820 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23665140 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23665238  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23665239 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 23665337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 820 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 23793447 - 23793250
Alignment:
Q  820 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23793447 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23793349  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23793348 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 23793250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 820 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 38960314 - 38960117
Alignment:
Q  820 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38960314 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 38960216  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38960215 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 38960117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 441 - 665
Target Start/End: Original strand, 23667109 - 23667332
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||   | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23667109 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggagtttttatttttttgggaaaggcactgga 23667208  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 640  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23667209 aaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacata-tttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 23667307  T
Q  641 cagatttgttacagattttaagcag 665  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||    
T  23667308 cagatttgttacaaattttaggcag 23667332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 820 - 1017
Target Start/End: Original strand, 10757273 - 10757469
Alignment:
Q  820 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10757273 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttct 10757371  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  10757372 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattagaccgaactgggtcaacaaa-ttctttgtgttct 10757469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 820 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 15357033 - 15356836
Alignment:
Q  820 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15357033 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15356935  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15356934 ttgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccggactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 15356836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 800 - 1017
Target Start/End: Original strand, 39798123 - 39798341
Alignment:
Q  800 tgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattct 899  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798123 tgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattct 39798221  T
Q  900 tgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtc 997  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||    
T  39798222 tgtaacccattgatttctcttttataatgatactcatcgtatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggatcgaactgggtc 39798321  T
Q  998 aacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  39798322 aacaaattcttttgtgttct 39798341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 145; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 673 - 1020
Target Start/End: Complemental strand, 6661512 - 6661167
Alignment:
Q  673 actataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 772  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  6661512 actataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattagggtatgtatagagtt 6661414  T
Q  773 tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttg 872  Q
    ||| |||| | |||||||||||| ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| || ||||    
T  6661413 tgt-tcttggcaacaaacactagagttgg--ggttgattcaccatgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaaattgagattttg 6661318  T
Q  873 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccag 970  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | | ||||| | |||||||||  ||| | |||||||||||| |||    
T  6661317 ggtacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttgctcataattatagtggaacggatgactgctctctccctcag 6661218  T
Q  971 actaggtcaga-ttggatcgaactgg-tcaacaaatttctttgtgttctctt 1020  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||  |||||||||||    
T  6661217 actaggtcagatttggaccgaactggataaacaaatttc-gtgtgttctctt 6661167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 675 - 1019
Target Start/End: Original strand, 21288715 - 21289057
Alignment:
Q  675 tataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 774  Q
    ||||||||||||||||| || | || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21288715 tataaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggttgaaataagggtttagaatagcaacaataaaaatagggtttgtatagagtttg 21288814  T
Q  775 tctcttcggaacaaacac------tagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggac 868  Q
    |||||| |||||||||||      ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21288815 tctctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcacctt-gaaaacactattaggatt-gagtatcttggttacgggaagagattaggac 21288912  T
Q  869 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 968  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| ||      ||| ||||||||| |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  21288913 tttggatagaattaagcgggagattttttcttgtaactca------tct-tttgtaacgttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctccccc 21289005  T
Q  969 agactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||||  || || |||||| ||||||||||||  ||||| ||||||    
T  21289006 agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttctct 21289057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 827 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 23742034 - 23741844
Alignment:
Q  827 tattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaac 926  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23742034 tattaggattggagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctttgtaac 23741936  T
Q  927 ggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23741935 gttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 23741844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 803 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 20506041 - 20505826
Alignment:
Q  803 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 902  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20506041 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 20505943  T
Q  903 aacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaac 1000  Q
    ||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||    
T  20505942 aacacattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctg--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 20505845  T
Q  1001 aaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||  ||||||||||||    
T  20505844 aaattcttttgtgttctct 20505826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 667 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 26098587 - 26098379
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  26098587 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaataagggtttagaatggcaacaagaagactagggtttgtat 26098488  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26098487 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgacaaacactattatgatt-gagtctcttggttacggaaagagattggg 26098389  T
Q  867 actttgggta 876  Q
      ||||||||    
T  26098388 gttttgggta 26098379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 791 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585727
Alignment:
Q  791 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggag 890  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattg-agtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggag 41585858  T
Q  891 acttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcg 989  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||    
T  41585857 acttatttttgtaagtcattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccg 41585758  T
Q  990 aact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  41585757 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 41585727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 441 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 34479972 - 34479740
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34479972 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttaggcaaggcactgga 34479873  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 640  Q
    |||||||||||||||                     ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||       
T  34479872 aaaatcgtggcacga---------------------tggtgcgctggcggataaaaataaaacata-tttttgggtgcagatttgttacagattttg-ag 34479796  T
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatca 696  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  34479795 cagatttgttacagattttaagcgagacctttactataaaaatagaccttgtatca 34479740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 786 - 1019
Target Start/End: Original strand, 2723964 - 2724189
Alignment:
Q  786 caaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggc 885  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||    
T  2723964 caaacactagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgg---------tagaattaggc 2724053  T
Q  886 gggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattg 984  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  2724054 gggtgatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttg 2724153  T
Q  985 gatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    || |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  2724154 gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 2724189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 441 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 38960604 - 38960334
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38960604 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggctttgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 38960505  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 640  Q
    |||||||||||||||                     ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38960504 aaaatcgtggcacga---------------------tggtgcgttggcggataaaaataaaacata-tttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 38960427  T
Q  641 cagatttgttac----------------------agattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 711  Q
    ||||||||||||                      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38960426 cagatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 38960334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 669 - 978
Target Start/End: Original strand, 9020167 - 9020473
Alignment:
Q  669 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| | | |||| ||| | ||||||| ||||||| ||||||||| | | ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9020167 ttttactataaatacataccttgtatcagatgtaaaccttgtgctagagggagctgaaaacaagggtttggga-ggcaaca-caaaagtagggtttgtat 9020264  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    ||||||   ||||| | ||||||||||||||||   |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||     
T  9020265 agagttg--ctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttggaaaacactattaagattg-agtttcttggtcacgggaagagattgga 9020359  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  9020360 gctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggatcggatggctgctctctc 9020459  T
Q  965 ccccagactaggtc 978  Q
    | ||| | ||||||    
T  9020460 ctccaaattaggtc 9020473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 667 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 20507798 - 20507665
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  20507798 acttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaattaaggtttgtat 20507699  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 800  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20507698 agagtttgtctctttggaacaaacacaagggttt 20507665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 439 - 627
Target Start/End: Original strand, 38881843 - 38882031
Alignment:
Q  439 actgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcact 537  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | || ||| |||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  38881843 actgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggttttagtttttgaggcaaggcact 38881941  T
Q  538 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacgtattttttgggagcagatttgtt 627  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || || | ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  38881942 ggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgta-tttttgggtgcagatttgtt 38882031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 711 - 1019
Target Start/End: Original strand, 20053834 - 20054133
Alignment:
Q  711 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 810  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||    |||||||    
T  20053834 atagagggcgctgaaacaagggtttagaa-ggcaacacaaaaactagagtttatataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--ggttgat 20053929  T
Q  811 tcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 910  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||       
T  20053930 tcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtt-----tggagattgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc--- 20054020  T
Q  911 gatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggatcgaactg-gtcaacaaattt 1006  Q
    ||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||     
T  20054021 gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggaaggctgctctctcctccatactaggtcagttttggaccgaactgcgtaaacaaattc 20054120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 668 - 995
Target Start/End: Original strand, 36208524 - 36208847
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||     
T  36208524 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggttt-tag 36208620  T
Q  767 agag-tttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 865  Q
    |||| ||| |||   ||| | ||||  |||||||  ||  |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  36208621 agagatttctctaagcgggagaaac--tagggttgttg--ttgattcaccttgggaaacattactaagattg-agtctcttggtaacgggaagagattga 36208715  T
Q  866 gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctc 962  Q
    |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |  || ||||||||||     
T  36208716 gactttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggcgggctgctct- 36208814  T
Q  963 tcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    | ||||| |||||||||  ||||| ||||||||    
T  36208815 ttccccatactaggtcaatttggaccgaactgg 36208847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 441 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 25921992 - 25921874
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactgg 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  25921992 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggttggacaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactgg 25921893  T
Q  540 aaaaatcgtggcacgatgg 558  Q
    |||||||||||||||||||    
T  25921892 aaaaatcgtggcacgatgg 25921874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 820 - 995
Target Start/End: Original strand, 23667415 - 23667589
Alignment:
Q  820 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||  | ||| || |||| |||||||||||||||||    
T  23667415 gaaacactataaggattggactctcttgcttacagaaagagattgggactttggaaagaattaggcgaaaaact-atgcttgcaacccattgatttctct 23667513  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23667514 ttgtaacgtcactcatcaaataatggatcggagggctgctctcttccccagactaggacagattggaccgaactgg 23667589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 441 - 558
Target Start/End: Original strand, 2174680 - 2174797
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||   ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2174680 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttaggcaaggcactgga 2174779  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatgg 558  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2174780 aaaatcgtggcacgatgg 2174797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 724 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 17413441 - 17413189
Alignment:
Q  724 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 823  Q
    |||||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||    
T  17413441 aaacaagggtttagaa-ggcagcactaaaactatggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaa 17413348  T
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 921  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||   | | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  17413347 cactattaggatt-gagtctcttggtcaagggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctctttt 17413249  T
Q  922 gtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag 980  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||   ||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  17413248 gtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctctcccccagagttggtcag 17413189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 445 - 588
Target Start/End: Original strand, 4236374 - 4236517
Alignment:
Q  445 agagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||||    
T  4236374 agagttaacttaaaatcagatttctgcagaattgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttaagg-caaggcactggaaaa 4236472  T
Q  544 atcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  4236473 atcgtggcacaatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 4236517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 667 - 764
Target Start/End: Original strand, 4410000 - 4410101
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 762  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410000 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 4410099  T
Q  763 gt 764  Q
    ||    
T  4410100 gt 4410101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 439 - 558
Target Start/End: Original strand, 39797847 - 39797966
Alignment:
Q  439 actgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactg 538  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| |    
T  39797847 actgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcataatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcatgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcaccg 39797946  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatgg 558  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  39797947 gaaaaatcatggcacgatgg 39797966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 806 - 980
Target Start/End: Original strand, 15143547 - 15143723
Alignment:
Q  806 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 904  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  15143547 ttgattcacctttggaagcactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 15143645  T
Q  905 cccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag 980  Q
    ||| ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  || | |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15143646 ccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggggagctgctttctcccctagactaggtcag 15143723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 667 - 893
Target Start/End: Original strand, 42770717 - 42770934
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 765  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| | | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||| ||| ||    
T  42770717 acttttactataaatataaactttgtatcga-gtaaaccttgagatagaggggactgaaaacaagggtttggaa-ggcaaca-caaaattagg-tttata 42770812  T
Q  766 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 865  Q
    |||| |||| ||||| | ||||||||||| |||| |  |||| ||||||| ||||||||  |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||     
T  42770813 tagaatttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttcattcaccatgggaaac--tattaggactg-agtctcttggtcacgggaagagattga 42770906  T
Q  866 gactttgggtagaattaggcgggagact 893  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||    
T  42770907 gactttgggtagaattagacgagagact 42770934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 724 - 966
Target Start/End: Complemental strand, 2144840 - 2144599
Alignment:
Q  724 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaa-acactagggtttgtgggttgattcaccttgg-ga 821  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |  | |||||||||||||| ||    
T  2144840 aaacaagggtttagaa-gccaacactaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaacacactagggttgg--gattgattcaccttggaga 2144747  T
Q  822 aacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc-cattgatttctc 918  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||   | ||||| ||||||||||||   || || ||||    
T  2144746 aacactattaggat-ggagtctcttggtcgcgggaagagattcaggactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttttatatctc 2144648  T
Q  919 tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2144647 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 2144599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 536 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 23742256 - 23742126
Alignment:
Q  536 ctggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcgg-ataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagttt 634  Q
    |||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  23742256 ctggaaaattcgtggcacgataggatcacatcgtggcacaatggtatcttggcgggataaaaataaaacaaattttttgggagcagattagttacagatt 23742157  T
Q  635 ttgttacagatttgttacagattttaagcag 665  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23742156 ttgttacagatttgttacaaattttaggcag 23742126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 851 - 939
Target Start/End: Original strand, 42770936 - 42771025
Alignment:
Q  851 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| | |||||||||||    
T  42770936 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 42771025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 653 - 705
Target Start/End: Original strand, 10757193 - 10757245
Alignment:
Q  653 agattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaact 705  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10757193 agattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaact 10757245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 532 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 21684909 - 21684853
Alignment:
Q  532 ggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21684909 ggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 21684853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 667 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 41586042 - 41585946
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 763  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  41586042 acttttactataaatataggttttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaataacaagaacaaaactagggtttg 41585946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 824 - 980
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4897986
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggc-gggagacttattcttgtaacccattgatttctct-tt 921  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  4897828 cactgttaggattg-agtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctatt 4897926  T
Q  922 gtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag 980  Q
    |||| | ||||||||| ||||| |||   | |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  4897927 gtaaagttactcatcattatagcggaacagtgggctgctttctcccccatactaggtcag 4897986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 641 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 23742128 - 23742057
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaa-gcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 711  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23742128 cagatttgttataggttttaaagcaggacttttactataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga 23742057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 527 - 588
Target Start/End: Original strand, 16775983 - 16776044
Alignment:
Q  527 ggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16775983 ggcaaagcactgaaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 16776044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 441 - 558
Target Start/End: Original strand, 659713 - 659829
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaa-tcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||| |||||||| |||||    |||||| |||||    
T  659713 tgtgagagttaacttaaaatcaggtt-ctgcagaaatcgtggcacgatggctaggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttga--ggcaagtcactg 659809  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatgg 558  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  659810 gaaaaatcgtggcacgatgg 659829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 441 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 21684969 - 21684905
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcac 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  21684969 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcac 21684905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Original strand, 1170811 - 1170967
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  1170811 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctct 1170905  T
Q  920 ttgtaacggtactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1170906 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 1170967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 441 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 18186587 - 18186504
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacga-tggaggttttagtttt 523  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18186587 tgtgagagttaacttaaaatcaagtttctgcagaatcgtggtacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt 18186504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 724 - 884
Target Start/End: Original strand, 4754159 - 4754312
Alignment:
Q  724 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 823  Q
    ||||||||||||| |||| |||||  || |||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||    | |||||||||||||  |||    
T  4754159 aaacaagggttta-aaagccaacacaaacactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcaccttgaaaaa 4754252  T
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4754253 cactattagaattg-agcctcttggtcactggaagagattgtgactttggatagaattagg 4754312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 667 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 3373377 - 3373332
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3373377 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 3373332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 35385634 - 35385477
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  35385634 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctct 35385540  T
Q  920 ttgtaacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||  |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35385539 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 35385477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 724 - 879
Target Start/End: Original strand, 29748352 - 29748502
Alignment:
Q  724 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-gaa 822  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||| |   |||||| | |||||||| |||||||   || |||||||  ||||| |||    
T  29748352 aaacaagggtttagaa-gccaacaagaaaactagggtttgtagagaat---tctcttggcaacaaacagtagggtt--aggattgattcgtcttggagaa 29748445  T
Q  823 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaa 879  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29748446 acactaataggatt-gagtctcttggtcacgggaatagattcgggactttgggtagaa 29748502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 534 - 611
Target Start/End: Original strand, 4409890 - 4409967
Alignment:
Q  534 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttt 611  Q
    |||||||||||||||| ||| || || ||  |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  4409890 cactggaaaaatcgtgccacaattggatcgaatcgtgccacgatggtgcgatggcagataaaaataaaacgtattttt 4409967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 666 - 711
Target Start/End: Original strand, 23667355 - 23667400
Alignment:
Q  666 gacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 711  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23667355 gactttaactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23667400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 31179933 - 31179888
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacga 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31179933 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacga 31179888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 9353361 - 9353417
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  9353361 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 9353417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 441 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 20504452 - 20504369
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacga-tggaggttttagtttt 523  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  20504452 tgtgagagttaacttaaaatcagg-ttctgcagaaatcgtggcacgatagctgggcaacgtggcacgattggaggttttagtttt 20504369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 441 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 20508001 - 20507918
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacga-tggaggttttagtttt 523  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  20508001 tgtgagagttaacttaaaatcagg-ttctgcagaaatcgtggcacgatagttgggcaacgtagcacgattggaggttttagtttt 20507918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 826 - 979
Target Start/End: Original strand, 25445501 - 25445653
Alignment:
Q  826 ctattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 924  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| |||||||| || ||   || ||||||||||    
T  25445501 ctattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctctttgta 25445595  T
Q  925 acggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    | |  ||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25445596 aagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 25445653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 940 - 992
Target Start/End: Complemental strand, 28832326 - 28832274
Alignment:
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaac 992  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  28832326 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaac 28832274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 36932379 - 36932435
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  36932379 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 36932435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 940 - 995
Target Start/End: Original strand, 42127440 - 42127495
Alignment:
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  42127440 tagtggattggggggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgg 42127495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 824 - 979
Target Start/End: Original strand, 22672837 - 22672991
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 922  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  || ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  22672837 cactattaggattg-agtctcttggtcacgagaagaggctgagactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 22672931  T
Q  923 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    ||| |  ||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22672932 taaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 22672991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 919 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 26098373 - 26098271
Alignment:
Q  919 tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctc-ccccagactaggtcagattggatcgaactg-gtcaacaaatttctttgtgttc 1016  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||    
T  26098373 tttgtaacgttactcatcatatggtgaaacggagggctgctctctccccccatactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttatgttc 26098274  T
Q  1017 tct 1019  Q
    |||    
T  26098273 tct 26098271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 938 - 995
Target Start/End: Original strand, 11917000 - 11917057
Alignment:
Q  938 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||    
T  11917000 tatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgg 11917057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 855 - 1007
Target Start/End: Complemental strand, 15445417 - 15445261
Alignment:
Q  855 gaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattgga 951  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||   || || | ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  | |    
T  15445417 gaagagattgagactttgagtagaattaggtttgaagaatgattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaa 15445318  T
Q  952 gggctgctctctcccccagactaggtcag-attggatcgaact-ggtcaacaaatttc 1007  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||    
T  15445317 gggctgctctct-tcccagactaggtcagtattggactgaactgggtaaacaaatttc 15445261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 641 - 694
Target Start/End: Original strand, 39798005 - 39798058
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtat 694  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798005 cagatttgttccaaattttaagcaaaacttttactataaatatagaccttgtat 39798058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 534 - 611
Target Start/End: Original strand, 39854317 - 39854394
Alignment:
Q  534 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttt 611  Q
    |||||||||||||||| |||| | |  || |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  39854317 cactggaaaaatcgtgtcacggttgaatcgcatcgtggcacgatggtgcgattgaagataaaaataaaacgtattttt 39854394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 10281819 - 10281763
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||    
T  10281819 atagtggattggagagctgctctctcccccagatcaggtcatattggaccgaactgg 10281763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 15464600 - 15464544
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||    
T  15464600 atagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattggaccgaactgg 15464544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 17003989 - 17004045
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  17003989 atagtggattgaagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 17004045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 441 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 31466496 - 31466379
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctaca-gaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatg-gaggttttagttttttgggcaaggcactg 538  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||  |  |||||| ||||||||||| || |||| || || |  |||||| |||||    
T  31466496 tgtgagagttaacttaaaatcaggttt-tgcaggaatcgtggcacgattgaagggcaacgtggcacgatgagatgtttcag-ttatgaggcaagtcactg 31466399  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatgg 558  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  31466398 gaaaaatcttggcacgatgg 31466379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 821 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 31782639 - 31782578
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31782639 aaacactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattggga-attgggtagaattagg 31782578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 441 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 36402845 - 36402762
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacga-tggaggttttagtttt 523  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||| || |||||||  | |||||| ||||||||| ||||||    
T  36402845 tgtgagagttaacttaaaattaggtttctgcagaatctaggcacgatggctgggcaacatagcacgattggaggtttcagtttt 36402762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 824 - 979
Target Start/End: Original strand, 25452498 - 25452652
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 922  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||| || ||   || ||||||||    
T  25452498 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctctttg 25452592  T
Q  923 taacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    ||| |  ||||  |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  25452593 taaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagaataggtca 25452652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 806 - 882
Target Start/End: Complemental strand, 34033768 - 34033691
Alignment:
Q  806 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaatta 882  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  34033768 ttgatttaccttggagaaacactattaggattg-agtctcttggtcgcgggaagagattcaggattttgggtagaatta 34033691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 527 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 659899 - 659850
Alignment:
Q  527 ggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacga 576  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  659899 ggcaagtcactggaaaaatcgtggcacgatgaggtcgcattgtggcacga 659850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 534 - 611
Target Start/End: Original strand, 1240171 - 1240248
Alignment:
Q  534 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttt 611  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||  |||||| |||||||||||  | |  ||||||||||||||||||||||    
T  1240171 cactggaaaaatcgtgccacgattggatcgaatcgtgccacgatggtgcaattgaagataaaaataaaacgtattttt 1240248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 2298183 - 2298026
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  2298183 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctct 2298089  T
Q  920 ttgtaacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    || ||| |  ||||  |||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2298088 ttataaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctcccccccagactaggtca 2298026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 534 - 611
Target Start/End: Original strand, 6744894 - 6744971
Alignment:
Q  534 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttt 611  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||  ||||||  ||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  6744894 cactggaaaaatcgtgccacgattggatcgaatcgtgctacgatggtgcgattgaagataaaaataaaacgtattttt 6744971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 534 - 611
Target Start/End: Original strand, 6747137 - 6747214
Alignment:
Q  534 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttt 611  Q
    |||||||||| ||||| |||||| || ||  |||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  6747137 cactggaaaagtcgtgccacgattggatcgaatcgtgccacgatggtgcgattgaagataaaaataaaacgtattttt 6747214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 806 - 946
Target Start/End: Original strand, 35430259 - 35430403
Alignment:
Q  806 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 902  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||   ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   | ||||| ||||||||    
T  35430259 ttgattcaccttggagaaacactattacaattg-agtctcttggtctagggaagagattcgggtctttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgt 35430357  T
Q  903 aa-cccattgatttctctttgtaacggtactcatca-tatagtgga 946  Q
    ||  |  ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  35430358 aattcttttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtgga 35430403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 19588814 - 19588758
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| ||||||||    
T  19588814 atagtggattggagggctgctctctccctaagattagttcatattggaccgaactgg 19588758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 441 - 523
Target Start/End: Original strand, 21947770 - 21947853
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacga-tggaggttttagtttt 523  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| || | ||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  21947770 tgtgagagttaacttaaaatcagg-ttctgcagaaatcgtggcacgatggctaggcaacgtgacacgattggaggtttcagtttt 21947853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 534 - 610
Target Start/End: Original strand, 42238047 - 42238123
Alignment:
Q  534 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtatttt 610  Q
    |||||||||||||||| |||||||   || || ||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||    
T  42238047 cactggaaaaatcgtgccacgatgaaatcgcaacgtggcacgatggtgcgattgaggataaaacaaaaacgtatttt 42238123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 821 - 884
Target Start/End: Original strand, 10627364 - 10627425
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  10627364 aaacactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagac-tagggtagaattagg 10627425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 940 - 995
Target Start/End: Original strand, 31300626 - 31300681
Alignment:
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  31300626 tagtggattggagagtttctctctccctcagactaggtcatattggaccgaactgg 31300681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 668 - 718
Target Start/End: Original strand, 2723911 - 2723961
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggg 718  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||    
T  2723911 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg 2723961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 939 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 38192241 - 38192195
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattgg 985  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  38192241 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 38192195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 939 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 38219466 - 38219420
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattgg 985  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  38219466 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 38219420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 667 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 2144928 - 2144899
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatca 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2144928 acttttactataaatatagaccttgtatca 2144899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 534 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 10529545 - 10529468
Alignment:
Q  534 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttt 611  Q
    |||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||| ||||||| |||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  10529545 cactggaaaaatcgtgccacgattagatcgaatcgtgccacgatgatgcgattgaagataaaaataaaacgtattttt 10529468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 667 - 696
Target Start/End: Original strand, 15552178 - 15552207
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatca 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552178 acttttactataaatatagaccttgtatca 15552207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 820 - 884
Target Start/End: Original strand, 32520533 - 32520597
Alignment:
Q  820 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg-gactttgggtagaattagg 884  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  32520533 gaaacactattaagattg-agtctctcgattacgggaagagattcatgactttgggtagaattagg 32520597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 938 - 979
Target Start/End: Original strand, 42238376 - 42238417
Alignment:
Q  938 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42238376 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 42238417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 448; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 439 - 1017
Target Start/End: Original strand, 5925 - 6502
Alignment:
Q  439 actgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactg 538  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||   | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5925 actgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttaggcaaggcactg 6024  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgt 638  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||       
T  6025 gaaaaatcgtggcatgatggggtctcatcatggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatattttt-gggtgcagatttgttacaaatttaaa 6123  T
Q  639 tacagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttaga 738  Q
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6124 g-cagatttgttacagtttttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttaga 6222  T
Q  739 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgg 838  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6223 aaagcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 6322  T
Q  839 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcat 938  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  6323 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcaa 6422  T
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactg-gtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6423 atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgagtcaacaaatttctttgtgttct 6502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 447; Significance: 0; HSPs: 203)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 441 - 1017
Target Start/End: Original strand, 38210067 - 38210644
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38210067 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 38210166  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 640  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38210167 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatagtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttt-gggagcagatttgttacagtttt-gtta 38210264  T
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt---gagatagagggggctgaaacaagggtttag 737  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  || |  ||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38210265 cagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatataggccttgtatcag-gctattttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttag 38210363  T
Q  738 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 837  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38210364 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 38210463  T
Q  838 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatca 937  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  38210464 gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacgaaactcatca 38210563  T
Q  938 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  38210564 tatagtggattggagagctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 38210644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 441 - 1017
Target Start/End: Original strand, 50493676 - 50494273
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50493676 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 50493775  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttt----- 635  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||         
T  50493776 aaaatcgtggcacgatggagtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttt-gggagcagatttgttacagttttgttac 50493874  T
Q  636 -----tgttacaga-----------tttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggg 719  Q
         |||||||||           ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  50493875 aaatttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggactttcactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactgagagatagagggg 50493974  T
Q  720 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg 819  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50493975 gctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg 50494074  T
Q  820 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50494075 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagggattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctct 50494174  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  50494175 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 50494273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 441 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 6064006 - 6063429
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||   ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6064006 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttatgcagaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacaatggaggttttagttttttgggcaaggcactgaa 6063907  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 640  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||        
T  6063906 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtggactggcggataaaaataaaacatattttt-gggtgcagatttgttacagattttaag- 6063809  T
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttaga 738  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  6063808 cagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttaga 6063709  T
Q  739 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgg 838  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6063708 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgg 6063609  T
Q  839 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcat 938  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  6063608 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcat 6063509  T
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  6063508 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtccacaaatttctttgtgttct 6063429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 499 - 1017
Target Start/End: Original strand, 25388655 - 25389179
Alignment:
Q  499 gtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaat 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25388655 gtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcagataaaaat 25388754  T
Q  599 aaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgttacagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaa 698  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  25388755 aaaacatattttt-gggagcagatttgttacagattttaag-cagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcag- 25388851  T
Q  699 gcaaacttt---------gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaa 789  Q
    || |  ||          |||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25388852 gctattttgagagagagagagagagagagagctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaa 25388951  T
Q  790 cactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga 889  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25388952 cactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga 25389050  T
Q  890 gacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcg 989  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  25389051 gacatattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccg 25389150  T
Q  990 aact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25389151 aactgggtcaacaaatttctttgtgttct 25389179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 6066157 - 6065779
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggg-ctgaaacaagggtttagaa 739  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6066157 cagatttgttacagattttaagcagaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttagaa 6066058  T
Q  740 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 839  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6066057 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 6065958  T
Q  840 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 939  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6065957 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 6065858  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6065857 tagtggattggatggctgctctctcccctagactaggtcagattggacagaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 6065779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 441 - 1017
Target Start/End: Original strand, 38889757 - 38890314
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggttt-ctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 539  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||| ||   ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  38889757 tgtgagagttaacttaaaattaggttttctgcagaatcgtggtacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttaggcaaggcattgg 38889856  T
Q  540 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgt 638  Q
    |||||||                     |||||||||||||||||||||||  || || | |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||      
T  38889857 aaaaatc---------------------gtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacatattttt-gggtgcagatttgttacagattttaa 38889934  T
Q  639 tacagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtt 734  Q
      |||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  38889935 g-cagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtat---agcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtt 38890030  T
Q  735 tagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga 834  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890031 tagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga 38890130  T
Q  835 ttggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactc 933  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  38890131 tt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactc 38890229  T
Q  934 atcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  38890230 atcatatagtggatcggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 38890314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Original strand, 458203 - 458558
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 762  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458203 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 458302  T
Q  763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 862  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458303 gtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 458402  T
Q  863 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctc 962  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458403 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 458502  T
Q  963 tcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  458503 tcccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 458558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Original strand, 746674 - 747031
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 760  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  746674 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 746773  T
Q  761 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 860  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746774 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 746873  T
Q  861 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctc 960  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  746874 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggaggactgctc 746973  T
Q  961 tctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  746974 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 747031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Original strand, 3859425 - 3859801
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859425 cagatttgtttcaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 3859524  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3859525 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 3859623  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatat 940  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3859624 tctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctctttgtaacaatactcatcatat 3859723  T
Q  941 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  3859724 agtggatcgtagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3859801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Original strand, 455826 - 456181
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 762  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  455826 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 455925  T
Q  763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 862  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  455926 gtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 456025  T
Q  863 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctc 962  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456026 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 456125  T
Q  963 tcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  456126 tcccccagactaggtcgggttggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 456181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 708 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 10621823 - 10621513
Alignment:
Q  708 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 807  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  10621823 gagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 10621724  T
Q  808 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 907  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621723 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 10621624  T
Q  908 attgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaattt 1006  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  10621623 attgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactagctcagattggaccgaactgggtcaacaaattt 10621524  T
Q  1007 ctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||    
T  10621523 ctttgtgttct 10621513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 4308615 - 4308262
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308615 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 4308516  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4308515 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggttggg 4308417  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4308416 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcc 4308317  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    || |||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  4308316 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 4308262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Original strand, 5191550 - 5191925
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191550 cagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagaccttgtatctaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 5191649  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5191650 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 5191748  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatat 940  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5191749 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatat 5191848  T
Q  941 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  5191849 agtggatcagagggctgttctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5191925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 4104233 - 4103879
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 762  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104233 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 4104134  T
Q  763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 862  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  4104133 gtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggc 4104035  T
Q  863 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctc 962  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  4104034 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctatc 4103935  T
Q  963 tcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  4103934 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4103879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 641 - 1005
Target Start/End: Original strand, 11170301 - 11170666
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11170301 cagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 11170400  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11170401 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 11170499  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11170500 tgtcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 11170599  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatt 1005  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||| ||||||||||||    
T  11170600 tagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgggccgaactgggtcaacaaatt 11170666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Original strand, 43228214 - 43228567
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43228214 actttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagcgtttgtat 43228313  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  43228314 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctggg 43228412  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43228413 actttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 43228512  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaactgg-tcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  43228513 cccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctct 43228567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 641 - 910
Target Start/End: Original strand, 35777318 - 35777587
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35777318 cagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 35777417  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35777418 agcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 35777517  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 910  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35777518 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 35777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 641 - 1020
Target Start/End: Complemental strand, 18099530 - 18099150
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt-gagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 739  Q
    |||||||||| || |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099530 cagatttgttccaaattttaagcgagacttttactataa-tatagaccttgtatcagagtaaacttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 18099432  T
Q  740 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 839  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18099431 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 18099333  T
Q  840 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcat 938  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  18099332 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacattactcatcat 18099233  T
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctctt 1020  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||   |||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  18099232 atagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatatggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctt 18099150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 641 - 1019
Target Start/End: Original strand, 45882836 - 45883216
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    ||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45882836 cagatttgttgaaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactatgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 45882935  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45882936 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 45883034  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  45883035 tctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 45883134  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctccccc-agactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  45883135 tagtggaacggagggctgctctctccccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 45883216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 667 - 1005
Target Start/End: Original strand, 43226009 - 43226347
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  43226009 actttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactacg-tttgtat 43226107  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  43226108 agagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctggg 43226206  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43226207 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 43226306  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatt 1005  Q
    || |||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||    
T  43226307 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 43226347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 5522975 - 5522610
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522975 cagatttgtttcaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 5522876  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    ||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5522875 ggcaacaacaaaactagggtttgt-----------ctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-ag 5522788  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatat 940  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5522787 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatat 5522688  T
Q  941 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  5522687 agtggatcggagggctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5522610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 53917998 - 53917645
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  53917998 acttttactataaatatagaccttgaatcagattaaaccttgagatggagggggctgaaacaatggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 53917899  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917898 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggg 53917800  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  53917799 attttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 53917700  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  53917699 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 53917645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 10084753 - 10084372
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggttta 736  Q
    |||||||||| || |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||    
T  10084753 cagatttgttccaaattttaagcgatgcttttactataaatatagaccttgtatcggagcaaactttgagagagatagagggggctggaacaagggttta 10084654  T
Q  737 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 836  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10084653 gaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga-t 10084555  T
Q  837 ggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcat 935  Q
     |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10084554 cgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttgatttctcttttgtaacgttactcat 10084455  T
Q  936 catatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  10084454 catatagtggatcggagggctgctctctccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 10084372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 641 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 18097261 - 18096881
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt-gagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 739  Q
    |||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18097261 cagatttgtttcaaattttaagcgagacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaacttgagagatagagggggctcaaacaagggtttagaa 18097162  T
Q  740 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 839  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18097161 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 18097063  T
Q  840 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcat 938  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  18097062 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttcccttttgtaacgttactcatcat 18096963  T
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaac-tggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  18096962 atagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacgaattcttttgtgttctct 18096881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 734 - 1010
Target Start/End: Complemental strand, 28413299 - 28413022
Alignment:
Q  734 ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 833  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28413299 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 28413200  T
Q  834 attggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactc 933  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  28413199 attgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactc 28413100  T
Q  934 atcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttcttt 1010  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  28413099 atcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaattaggtcaacaaatttcttt 28413022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 51727340 - 51726990
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51727340 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtatgtat 51727241  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |    
T  51727240 agagtttgtctctttggaacaaacact-gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggtaagaggctgag 51727143  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  51727142 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcc 51727043  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  51727042 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 51726990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Original strand, 1313333 - 1313685
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  1313333 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagg-tttacaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 1313431  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1313432 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttagttacgggaagagattggg 1313530  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  1313531 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 1313630  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  1313631 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 1313685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 22114665 - 22114288
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22114665 cagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaa 22114566  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22114565 ggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 22114467  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22114466 tctcttggttacgggaagaggctgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 22114367  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    || || || |||||| || ||||||||||| || | || |  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  22114366 taatgaatcggagggatgatctctcccccaaacaaagtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22114288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 10956387 - 10956010
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10956387 cagatttgttccaaattttaagcaatttttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacatgaagatagagggggctgaaacaagggtttagaat 10956288  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  10956287 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacattattaggatt-gag 10956189  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  10956188 tctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 10956089  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  10956088 tagtggaacggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 10956010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 641 - 1005
Target Start/End: Complemental strand, 10958683 - 10958318
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10958683 cagatttgttccaaattttaagcaatttttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacataaagatagagggggctgaaacaagggtttagaat 10958584  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10958583 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 10958485  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  10958484 tctcttggttatgggaagaggctgacactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcttcata 10958385  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatt 1005  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||    
T  10958384 tagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 10958318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 1627016 - 1626664
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1627016 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 1626917  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1626916 gagtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggggagagattggga 1626818  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |    
T  1626817 ctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcgc 1626718  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||||   ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  1626717 ccagactaggtcgatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctct 1626664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 8 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 38393876 - 38393631
Alignment:
Q  8 acttcaactaacaaagacaaagagagggaccaagacgactcatttgcaaaattagggtgttgaaagctcccactttttcaattttaagagattaacaaat 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38393876 acttcaactaacaaagacaaggagagggaccaacacgactcatttgcaaaattagggtgttgaaagctcccactttttcaattttaagagattaaaaaat 38393777  T
Q  108 atatttaagtgtcaatttatctcatcattaattaaaccttaagagattaaaaaatatatttgtgtcaatttgtcatcattaattaaacctacacattttc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38393776 atatttaagtgtcaatttatctcatcattaattaaaccttaagagattaaaaaatatatttgtgtcaatttgtcatcattaattaaacctacacattttg 38393677  T
Q  208 tatttgagaggaactatcaagaatgatccaaaaattaatgagtcag 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38393676 tatttgagaggaactatcaagaatgatccaaaaattaatgagtcag 38393631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 43423796 - 43423444
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43423796 cttttactataaatatagacattgtatcactgtaaaccttgagaaagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 43423697  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  43423696 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggg 43423598  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||| |||||||||||||    
T  43423597 ctttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaactgagagctgctctctccc 43423498  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
      |||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  43423497 tgagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 43423444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 641 - 1019
Target Start/End: Original strand, 18162561 - 18162939
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaa-agcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 739  Q
    |||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  18162561 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatgagtaaacttggagatagaggga--tgaaacaagggtttagaa 18162658  T
Q  740 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 839  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18162659 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 18162757  T
Q  840 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat-ttctctttgt-aacggtactcatca 937  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||| |||| |||||||||    
T  18162758 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatttattttgtaaacgttactcatca 18162857  T
Q  938 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactg-gtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18162858 tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga-cgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttctct 18162939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Original strand, 25533357 - 25533716
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 758  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533357 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 25533456  T
Q  759 gtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaag 858  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  25533457 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggttacgggaag 25533555  T
Q  859 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctg 957  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25533556 aggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctg 25533655  T
Q  958 ctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  25533656 ctctctcccctagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 25533716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 227; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 632 - 1019
Target Start/End: Original strand, 24979595 - 24979984
Alignment:
Q  632 tttttgttacagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagg 731  Q
    |||||| | |||||||||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24979595 tttttggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatataccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagg 24979694  T
Q  732 gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatta 831  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24979695 gtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactatta 24979794  T
Q  832 ggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttgt-aacggt 929  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| || || | ||||| |||| |    
T  24979795 ggatt-gagtctcttggttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacaaattaatatcttttttgtaaacgtt 24979893  T
Q  930 actcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  24979894 actcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 24979984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 227; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Original strand, 26720445 - 26720821
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26720445 cagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaataagggtttagaaa 26720544  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||    
T  26720545 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggtta-actattaggatt-gag 26720642  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  26720643 tttcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttttaaccctttgatttctcttttgtaacgatactcatcata 26720742  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||  ||| | ||||||||||||| ||| |||||||  ||||| |||||| ||||| ||||||  ||||||||||    
T  26720743 tagtggaacggatgactgctctctcccctagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaccaaattcttttgtgttct 26720821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 27101519 - 27101162
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaact----ttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 762  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101519 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaattgagatagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 27101420  T
Q  763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 862  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  27101419 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagagaa 27101321  T
Q  863 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 961  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  27101320 tgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgcaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctct 27101221  T
Q  962 ctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg-tcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  27101220 ctcccccagaataggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctct 27101162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 708 - 1019
Target Start/End: Original strand, 42990268 - 42990580
Alignment:
Q  708 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 807  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||    
T  42990268 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 42990367  T
Q  808 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 907  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42990368 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc 42990466  T
Q  908 attgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatt 1005  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||    
T  42990467 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatggtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 42990566  T
Q  1006 tctttgtgttctct 1019  Q
      ||||||||||||    
T  42990567 cttttgtgttctct 42990580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 9604946 - 9604588
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 760  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  9604946 actttcactataaatatagaccttgtattagagaaaactctgagagagagatagagggggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactaggat 9604848  T
Q  761 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 860  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9604847 ttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggaaagag 9604749  T
Q  861 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgct 959  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9604748 gttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 9604649  T
Q  960 ctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||||||||||||  || || |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  9604648 ctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctct 9604588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 28102335 - 28101983
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| | || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28102335 cttttactataaatataagcgttgtattagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 28102236  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  28102235 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggg 28102137  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  28102136 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttacttatcatatagtggaacggatggctgctctctccc 28102037  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    | |  ||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  28102036 caaagctaggtcaatttggaccaaactaggtcaacaaattcttttgtgttctct 28101983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 708 - 1019
Target Start/End: Original strand, 30005805 - 30006117
Alignment:
Q  708 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 807  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  30005805 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 30005904  T
Q  808 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 907  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30005905 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc 30006003  T
Q  908 attgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatt 1005  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| |||  ||||| |||||| ||||||||||||    
T  30006004 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagattagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 30006103  T
Q  1006 tctttgtgttctct 1019  Q
      ||||||||||||    
T  30006104 cttttgtgttctct 30006117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 669 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 43421747 - 43421396
Alignment:
Q  669 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 768  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43421747 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 43421648  T
Q  769 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggac 868  Q
     ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||      
T  43421647 tgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaatt-gagtctcttggttacgggaaaagattgggga 43421549  T
Q  869 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 967  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |   || |||||||||||||||    
T  43421548 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatggctgctctctcccc 43421449  T
Q  968 cagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  43421448 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 43421396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Original strand, 3314608 - 3314961
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3314608 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtata 3314707  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  3314708 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagagattgggg 3314806  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   || |||||| ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  3314807 ctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcc 3314906  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  3314907 cccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 3314961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 644 - 1005
Target Start/End: Complemental strand, 10191670 - 10191305
Alignment:
Q  644 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaa 739  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    |||||||| |||||||||||||||    
T  10191670 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcggagcaaactttgagagagataaagggggctggaacaagggtttagaa 10191571  T
Q  740 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 839  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  10191570 aggcaataacaaaactagggtttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga-tcga 10191472  T
Q  840 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcat 938  Q
    ||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  10191471 gtctcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttcatttctcttttgtaacgttactcatcat 10191373  T
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatt 1005  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||    
T  10191372 atagtggatcggagggctgctctctccctaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 10191305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 53915830 - 53915477
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  53915830 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttaggatgacaacaacaaaactagggtttgtat 53915731  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53915730 agattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgtgaaacattattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggg 53915632  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||    
T  53915631 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatttagtgaaacggagggctgctctctcc 53915532  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||||||  || ||  ||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  53915531 cccagactaggtcaattttgactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 53915477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 441 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 53896754 - 53896475
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53896754 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggtactgga 53896655  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 640  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||        
T  53896654 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgctcttgcggataaaaataaaacgtat-ttttgggagcagatttgttacagatttt-aag 53896557  T
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53896556 cagatttgttacagattttaagcaggactttcactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct 53896475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 641 - 978
Target Start/End: Complemental strand, 32264403 - 32264060
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca----aactttgagatagagggggctgaaacaagggttta 736  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32264403 cagatttgtttcaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattaactttgagatagagggggctcaaacaagggttta 32264304  T
Q  737 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 836  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32264303 gaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 32264204  T
Q  837 ggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacggtactca 934  Q
     |||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||    
T  32264203 -gagtctcttggttatgggaagaggctggaactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactca 32264105  T
Q  935 tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtc 978  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32264104 tcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtc 32264060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 641 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 48362030 - 48361652
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  48362030 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatacagggggctgaaacaagg-tttagaat 48361932  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  48361931 gacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggatt-gag 48361833  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||| |||| |||| ||||||| |||    
T  48361832 tctcttagttacgggaagagattggggcttttggtagaattaggcggaagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcataata 48361733  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||  |  |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  48361732 tagtaaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 48361652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 674 - 960
Target Start/End: Original strand, 6561740 - 6562028
Alignment:
Q  674 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 773  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6561740 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 6561839  T
Q  774 gtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgg 873  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6561840 gtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgg 6561938  T
Q  874 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctc 960  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  6561939 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctttttgtaaggtaactcatcattatagtggagcggagggctgctc 6562028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Original strand, 51943294 - 51943646
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51943294 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggtgctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 51943393  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51943394 agagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagagattggg 51943492  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||    
T  51943493 gctttaggtagaattaggcgggagactt-ttcttgtaactcattgacgtctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcc 51943591  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||   |||||||||||    
T  51943592 cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctct 51943646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 880785 - 880432
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  880785 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggtctgaaacaagagtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtata 880686  T
Q  768 gagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  880685 gagttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagcatt-gagtctcttggttacggaaagagattggg 880587  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
     |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  880586 gctttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtaaaatggagggctgctctctcc 880487  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    || |||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||  ||||||||||||    
T  880486 cctagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttctct 880432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 668 - 1020
Target Start/End: Complemental strand, 5927097 - 5926745
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5927097 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttgtata 5926998  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5926997 gagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggga 5926899  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||| | ||||||||||||| || |  ||| | ||||||||||||    
T  5926898 cttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatatcttttgtaaggttactcatcatataatgaaacggatgactgctctctccc 5926799  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctctt 1020  Q
     ||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  5926798 gcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttctttgtgttctctt 5926745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 748 - 1017
Target Start/End: Original strand, 1321483 - 1321753
Alignment:
Q  748 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 847  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1321483 acaaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttg 1321581  T
Q  848 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtgga 946  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1321582 gttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 1321681  T
Q  947 ttggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  1321682 tcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1321753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 644 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 12268323 - 12267956
Alignment:
Q  644 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 743  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  12268323 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaacttgtatcagagtaaactttgagatagagggagctgaaacaagagtttagaaagac 12268224  T
Q  744 aacaac-aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 841  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12268223 aacaacaaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcggaaacactattaggatt-gagt 12268125  T
Q  842 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 941  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  12268124 ctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac---------tct-tttgtaacgttactcatcatata 12268035  T
Q  942 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||| |   |||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  12268034 gtgaaacagagggctgctctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 12267956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 667 - 973
Target Start/End: Complemental strand, 35918283 - 35917971
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35918283 actttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 35918184  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacac------tagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 860  Q
    |||||||||||||| |||||||||||      ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  35918183 agagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgcgaaacactattagaattg-agtctcttggttacgagaagag 35918085  T
Q  861 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgct 959  Q
    | ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| ||||||    
T  35918084 actgggaatttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcattatatagtggaacggagagctgct 35917985  T
Q  960 ctctcccccagact 973  Q
    ||||||| ||||||    
T  35917984 ctctccctcagact 35917971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Original strand, 36011751 - 36012103
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  36011751 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacgaaactaaggtttgtata 36011850  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||    
T  36011851 gagtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgttgggaaacactattaggatt-gaatatcttggttacgggaagagattgtga 36011949  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||| |     
T  36011950 ctttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctcttct 36012049  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaactgg-tcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
     ||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  36012050 tcagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctct 36012103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 53468788 - 53468434
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  53468788 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctttagataaagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaaccagg-tttgtata 53468690  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  53468689 gagtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttgggaaacactattaggattgaa-tctcttggttacggggagagattggga 53468591  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |  |||||||||||||  ||    
T  53468590 ctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctaccc 53468491  T
Q  966 cccag--actaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||  |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  53468490 cccagacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 53468434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 708 - 965
Target Start/End: Original strand, 29956650 - 29956907
Alignment:
Q  708 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 807  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||    
T  29956650 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaattcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 29956749  T
Q  808 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 907  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29956750 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc 29956848  T
Q  908 attgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29956849 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcc 29956907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 708 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 47149188 - 47148876
Alignment:
Q  708 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaa-caaacactagggtttgtgggt 806  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||  |||    
T  47149188 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggt 47149089  T
Q  807 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 906  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47149088 tgattcaccttgg-aaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 47148991  T
Q  907 cattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaat 1004  Q
    ||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||| |   |||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||  |||||| |||||||||||    
T  47148990 cattgatatctcttttgtatcgttactcatcatatagtgaaacagaggactgctctctcccccagactatgtcaatttggcccgaactaggtcaacaaat 47148891  T
Q  1005 ttctttgtgttctct 1019  Q
    |  | ||||||||||    
T  47148890 tattctgtgttctct 47148876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 669 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 51675087 - 51674747
Alignment:
Q  669 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 768  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||        
T  51675087 ttttactataaatatagacgttgtatcaatgtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgt---- 51674992  T
Q  769 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggac 868  Q
           | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  51674991 -------ccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattgggat 51674900  T
Q  869 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 967  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  51674899 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatactgaaatggagggctgctctctcccc 51674800  T
Q  968 cagactaggtcagattggatcgaac-tggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    || || ||||||  ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  51674799 cataccaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctct 51674747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 766 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 7606822 - 7606571
Alignment:
Q  766 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 865  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  7606822 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgg 7606724  T
Q  866 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7606723 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctatttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctcc 7606624  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  7606623 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7606571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 28761762 - 28761408
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28761762 acttttactataaatatagactttgcatcagagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtat 28761663  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    | |||||| ||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  28761662 atagtttg-ctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagatattgag 28761565  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |  ||||| ||||||||||    
T  28761564 actttaggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaggactgctctctc 28761465  T
Q  965 ccccagactaggtc-agattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||||||    
T  28761464 ccccagactaggtcaattttggatcgaactgggtaaacaaattcttttgttttctct 28761408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 667 - 939
Target Start/End: Original strand, 39715393 - 39715664
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  39715393 acttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagagaggcaacaccaaaactagggtttgtat 39715491  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39715492 agagtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggg 39715590  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||    
T  39715591 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 39715664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 641 - 1019
Target Start/End: Original strand, 15780757 - 15781155
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15780757 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaat 15780856  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt-----------tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactat 829  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15780857 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactat 15780956  T
Q  830 taggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg----atttctc-tttgta 924  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||    
T  15780957 tacgatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatatttctcttttgta 15781055  T
Q  925 acggtactcatca-tatagtggattggaggg---ctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    | | || | |||| |||||||||  | ||||   ||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||||||    
T  15781056 aagttatttatcattatagtggaacgaagggcgcctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttctct 15781155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 668 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 28100374 - 28100143
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28100374 cttttactataaatataagcgttgtatcagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 28100275  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  28100274 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacgctattaggatt-gagtcttttggttacgggaagagattgggg 28100176  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattctt 900  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28100175 ctttgggtagaattaggcgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 641 - 1019
Target Start/End: Original strand, 32218992 - 32219361
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||| |  ||||| | |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32218992 cagatttgttccaaattttaagtaatactttcagtataaatatagaccttgtatctgactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaa 32219091  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||           |||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  32219092 ggcaacaacaaaactag-----------agtttgtctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattg-ag 32219179  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttgt-aacggtactcatcat 938  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || | ||||| |||| ||||||||||    
T  32219180 tctcttggttgcgggaagagattgggactttgggcagaattaggcggaagacttatttttgtaacccattgatatcttttttgtaaacgttactcatcat 32219279  T
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||| |  ||| |||||||||||| ||||||||| | ||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  32219280 atagtgaaacggatggctgctctctctcccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 32219361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Original strand, 42992205 - 42992546
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 762  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42992205 acttttactataaatatataccttgtatcatgctaaactttaagagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggttt 42992304  T
Q  763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 862  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  42992305 gtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagagag 42992403  T
Q  863 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 961  Q
    | |||||||||||||               ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| || || ||||||||||    
T  42992404 t-ggactttgggtag---------------ttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaatcggggggctgctct 42992487  T
Q  962 ctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  42992488 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttttttgtgttctct 42992546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 668 - 996
Target Start/End: Complemental strand, 890104 - 889778
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  | |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||    
T  890104 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggaagctgaaacaagggtttagaatggcaaca--aaacctagggtttgtata 890007  T
Q  768 gagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||| || || |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  890006 gagtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag-ttggg 889909  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
     |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||| | |||||    
T  889908 gctttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgatttctcc 889809  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaactggt 996  Q
    | ||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  889808 cgcagactaggtcaatttggaccgaactggt 889778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 668 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 54691906 - 54691596
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||| || |||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54691906 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggg-taaaacaaggttttagaaaggcgacaacaaaactagggtttgtata 54691808  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||| ||     
T  54691807 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gaattttttggttatgggaagagattaggg 54691709  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  54691708 ctttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctcttttgtaacgttacccatcatatagttaaacggagggctgctctctccc 54691609  T
Q  967 ccagactaggtca 979  Q
    | |||||| ||||    
T  54691608 ctagactatgtca 54691596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 668 - 980
Target Start/End: Original strand, 31151271 - 31151580
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 765  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  31151271 cttttactataaatatagactttgtatcagatgtaaacctcgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaat-caacaagaaaactagggtttgta 31151369  T
Q  766 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 865  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  31151370 tagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaaaagattgg 31151465  T
Q  866 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactca-tcatatagtggattggagggctgctctct 963  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||| | |||||| |  |||||||||  |||||||||||||||    
T  31151466 gactttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaaccc--tgatatctcttttgtaaagttactcattgttatagtggaacggagggctgctctct 31151563  T
Q  964 cccccagactaggtcag 980  Q
    |||||||||||||||||    
T  31151564 cccccagactaggtcag 31151580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Original strand, 23633383 - 23633729
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  23633383 acttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaaggatttagaa-gccaacaagaaaactagggtttgtat 23633481  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    || ||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  23633482 agtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgatttacc--gggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgag 23633575  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |    
T  23633576 actttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtgaaaaggagggctgctctct-c 23633674  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||||||  || || |||| | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  23633675 cccagactaggtcaatttagaccgaaatgggtaaacaaattcttttgtgttctct 23633729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 668 - 905
Target Start/End: Original strand, 28180948 - 28181182
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28180948 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaata--ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 28181045  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28181046 gagtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccattaggatt-gagtctattggttacgggaagagattggga 28181144  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 905  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28181145 ctttggatagaattaggcgggagacgtattcttataac 28181182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 668 - 1002
Target Start/End: Original strand, 53591119 - 53591442
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||       
T  53591119 cttttactataaatatagacattgtataagtgtaaaccttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt--- 53591215  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
            |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  53591216 --------ctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaattg-agtctcttggttacgagaatagatttgga 53591306  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  | |||| |||||||| ||    
T  53591307 ttttgggtagaattaggcgggagacttattcttctaatccattgatatctcatttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggatgctctct-cc 53591405  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaa 1002  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  53591406 ccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaacaa 53591442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 757 - 1019
Target Start/End: Original strand, 6484372 - 6484636
Alignment:
Q  757 gggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 855  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  6484372 gggtttgtgtagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttg-agtctcttggttacggg 6484470  T
Q  856 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttgtaacggtactcatcatatagtggattggaggg 954  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||    
T  6484471 aagagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatatcttttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggaggg 6484570  T
Q  955 ctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  6484571 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 6484636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 805 - 1019
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886474
Alignment:
Q  805 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 904  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886261 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttg-agtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 5886358  T
Q  905 cccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaa 1003  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||    
T  5886359 cccattgatttgtctttgaaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5886458  T
Q  1004 tttctttgtgttctct 1019  Q
    ||  ||||||||||||    
T  5886459 ttcttttgtgttctct 5886474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 805 - 1019
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899947
Alignment:
Q  805 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 904  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5899734 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttg-agtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 5899831  T
Q  905 cccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaa 1003  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||    
T  5899832 cccattgatttctctttgcaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5899931  T
Q  1004 tttctttgtgttctct 1019  Q
    ||  ||||||||||||    
T  5899932 ttcttttgtgttctct 5899947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 441 - 701
Target Start/End: Original strand, 5899457 - 5899717
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaact--taaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactg 538  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||| || |||| ||||||||  |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  5899457 tgtgagagttaactcttataatcaggtttctgcataatcatggcacgattgaagggcaacgtggcacgatggatgttttagttttttaggcaaggcactg 5899556  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgt 638  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||      
T  5899557 gaaaaatcatggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagataaaaataaaacgta-tttttgggtacagatttgttacagatttt-a 5899654  T
Q  639 tacagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 701  Q
      |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5899655 agcagatttgttacagattttaagcgagacttttactataaatatagaccttttatcagagca 5899717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 441 - 701
Target Start/End: Original strand, 5885983 - 5886242
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaat-gtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 539  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |  | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5885983 tgtgagagttaacttaaaattaggtttttacagaatcgtggcacgattgaagcgcaaacgtggcacgatggatgttttagttttttaggcaaggtactgg 5886082  T
Q  540 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgtt 639  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||       
T  5886083 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggtacgatggtgcgctggcagataaaaataaaacgta-tttttgggtgcaaatttgttacagatttt-aa 5886180  T
Q  640 acagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 701  Q
     |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5886181 gcagatttgttacagattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttttatcagagca 5886242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 641 - 812
Target Start/End: Original strand, 11163047 - 11163218
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11163047 cagatttgttccaaattttaagcgaaacttttacgataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 11163146  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattc 812  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11163147 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtggattgattc 11163218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 669 - 921
Target Start/End: Original strand, 23636952 - 23637199
Alignment:
Q  669 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 768  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||| || |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  23636952 ttttaatataaatatatactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctaaaacaagggtttagaa-gccaacaagaaaactagggtttgtatag 23637050  T
Q  769 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggac 868  Q
    ||| || ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| ||| ||||    
T  23637051 agtctg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgatttaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttgttcatgggaagatattaggac 23637146  T
Q  869 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 921  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23637147 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 23637199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 667 - 980
Target Start/End: Original strand, 53597164 - 53597473
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| ||||||    
T  53597164 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggga-tgaaacaagggtttataa-gtcaacaagaaaactaggggttgtat 53597261  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||| |||||| |    
T  53597262 agagttt-tctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcatgagaatagattgag 53597357  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    | |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  53597358 attttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagggttgctctctc 53597457  T
Q  965 ccccagactaggtcag 980  Q
    || || ||||||||||    
T  53597458 ccacaaactaggtcag 53597473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 668 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 28137628 - 28137415
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  28137628 cttttactataaatatatgcgttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag---------- 28137539  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  28137538 -agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattagga-tgaagtctcttggttacgggaagagattgggg 28137441  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagact 893  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  28137440 ctttgggtagaattaggcggaagact 28137415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 667 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 13420506 - 13420207
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||          ||  ||||||||||||||||    
T  13420506 acttttactataaatataggttttgtatcaaagcaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggttta----------aatcaaactagggtttgtat 13420417  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  13420416 agagttt-tctctaggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgag 13420322  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||| | |||| ||||  |||| ||||||||||     
T  13420321 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcattattataatggaacggagagctgctctct- 13420223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 795 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688141
Alignment:
Q  795 gggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagactt 894  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactt 25688269  T
Q  895 attcttgtaacccattgatttctc-tttgt-aacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaac 992  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  25688268 attcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaac 25688169  T
Q  993 t-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    | |||||| || ||  ||||||||||||    
T  25688168 tgggtcaaaaagttcttttgtgttctct 25688141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 808 - 1017
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168375
Alignment:
Q  808 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 907  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccc 11168263  T
Q  908 attgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaac-tggtcaacaaatt 1005  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||| |||||||||||||    
T  11168264 attgatttctcttttgtaacgttacttatcatatattggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaacttggtcaacaaatt 11168363  T
Q  1006 tctttgtgttct 1017  Q
      ||||||||||    
T  11168364 cttttgtgttct 11168375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 122; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 669 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 27635959 - 27635639
Alignment:
Q  669 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 768  Q
    |||||||| |||||||||||||| || | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  27635959 ttttactacaaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgcaaacaacaaaactagggtttgtatag 27635860  T
Q  769 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggac 868  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||                   ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||            |    
T  27635859 agtttgtctcttgggaacaaacactaggg-------------------tgggaaacaatattaagatt-gagtctcttggttacggg------------c 27635792  T
Q  869 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 967  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  27635791 tttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 27635692  T
Q  968 cagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  27635691 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 27635639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 707 - 1019
Target Start/End: Original strand, 4666488 - 4666790
Alignment:
Q  707 tgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 806  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||           |||||   |||| ||||||||||||| ||||    
T  4666488 tgagatagagggggctgaaagaagggtctagtaagacaacaacaaaaatagggtttgt-----------ctcttgacaacagacactagggtttgagggt 4666576  T
Q  807 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga--cttattcttgtaa 904  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4666577 tgattcatcttgggaaacactattatgattg-agtctctaggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgtaa 4666675  T
Q  905 cccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg-tcaaca 1001  Q
     |||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |  |||||||||||||   |||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||    
T  4666676 tccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctct---ccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaaca 4666772  T
Q  1002 aatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||  ||||||||||||    
T  4666773 aattcttttgtgttctct 4666790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 674 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 36871624 - 36871306
Alignment:
Q  674 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 773  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||| | | |  || ||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  36871624 ctataaatataaaccttgtatcatagtaaacctagggggag-gggggctgaaacaagggtttacaa-gccaacaagaaaactagggcttgtatagagttt 36871527  T
Q  774 gtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgg 873  Q
    | ||||| | ||||||||| |||||| |  | |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  36871526 g-ctcttggcaacaaacaccagggttag--gattgattcaccttggaaaacactgttaagattg-agtctcttggtcacggaaagagattgggactttgg 36871431  T
Q  874 gtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccaga 971  Q
    |||||||||||   | ||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| | || |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  36871430 gtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttatctctttgtaaagttaatcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccaga 36871331  T
Q  972 ctaggtcag-attggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||    
T  36871330 ctaggtcagtattggaccgaactgg 36871306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 792 - 1019
Target Start/End: Original strand, 6231849 - 6232076
Alignment:
Q  792 ctagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga 891  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6231849 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgttg-agtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattaggcgggaga 6231946  T
Q  892 cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcg 989  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| || ||| ||  ||||||||||| |||||||| || |||||||  ||||| ||    
T  6231947 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagctactcatcattacagt-gaacggagggctgctgtctccccccgattaggtcaatttggaccg 6232045  T
Q  990 aact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  6232046 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 6232076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 310 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 38393574 - 38393439
Alignment:
Q  310 accattagccaacaatttaattaattgttgcttctacattttcattcaacttaacttctcccttatttc----cttcttccaatagtgacttgcaaccaa 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||    
T  38393574 accattagccaacaatttaattaattgttgcttctacattttcattcaacttaacttctcccttatttaattacttcttccaatagtgacttgcaaccaa 38393475  T
Q  406 gtgatctctacgataattggcaactatgatatgact 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38393474 gtgatctctacgataattggcaactatgatatgact 38393439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 668 - 946
Target Start/End: Original strand, 54884081 - 54884357
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| ||||  | |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||      
T  54884081 cttttaccataaatataaacattggatcattgtaaaccttgagatagagggagctcgaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagaatttgta-- 54884178  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||  |    
T  54884179 gagtttgtttctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcatcttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacagaaagagattgaaa 54884277  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtgga 946  Q
    |||||  |||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  54884278 ctttgaatagaattaggagggagacttatt-ttgtaatctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 54884357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 441 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 22114842 - 22114656
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  22114842 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgtagaatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 22114743  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacgtattttttgggagcagatttgtt 627  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || || | ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22114742 aaaattgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgatggcggcgaataacagaaacgta-tttttgggtgcagatttgtt 22114656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 715 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 562058 - 561796
Alignment:
Q  715 agggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac 814  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    |||||||||||    
T  562058 agggggttgaaacaagggtttagaa-gtcaacatgaaa-ctagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttca--ggttgattcac 561964  T
Q  815 cttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatt 914  Q
     |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||     
T  561963 attgggaaacactattaggattt-agtctcttggtcacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgata 561865  T
Q  915 tc-tctttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc-ccagactaggtcag 980  Q
    || | ||||||| | ||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  561864 tcttttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctctccctccagactaggtcag 561796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 709 - 836
Target Start/End: Original strand, 41849117 - 41849244
Alignment:
Q  709 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 808  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  41849117 agatagagggggctgaaacaagggtttagaataacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttg 41849216  T
Q  809 attcaccttgggaaacactattaggatt 836  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41849217 attcaccttgggaaactctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 751 - 979
Target Start/End: Original strand, 17795269 - 17795494
Alignment:
Q  751 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 850  Q
    ||||||| || ||||||||||||| || || | ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  17795269 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattg-agtctcttggtc 17795363  T
Q  851 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggatt 948  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||| || |      
T  17795364 acggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaac 17795463  T
Q  949 ggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  17795464 ggaaggctgctctctcccctagactaggtca 17795494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 441 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 18099707 - 18099521
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||  || |||| ||||||    
T  18099707 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcaaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttgagg-caagacactgg 18099609  T
Q  540 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacgtattttttgggagcagatttgtt 627  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  18099608 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaacaatagaaacgta-tttttgggtgcagatttgtt 18099521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 751 - 979
Target Start/End: Original strand, 19103709 - 19103934
Alignment:
Q  751 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 850  Q
    ||||||| || ||||||||||||| || || | ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  19103709 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattg-agtctcttggtc 19103803  T
Q  851 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggatt 948  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||| || |      
T  19103804 acggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaac 19103903  T
Q  949 ggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19103904 ggaaggctgctctctcccctagactaggtca 19103934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 751 - 938
Target Start/End: Original strand, 25635391 - 25635575
Alignment:
Q  751 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 850  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  25635391 aaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattggttcaccttgggaaacactattaggattt-agtctcttggtc 25635486  T
Q  851 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct-ctttgtaacggtactcatcat 938  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| | ||||||||||    
T  25635487 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcat 25635575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 440 - 558
Target Start/End: Original strand, 35777162 - 35777280
Alignment:
Q  440 ctgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 539  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35777162 ctgtgagagttaacttaaaattagatttctgcagaatcgtggcacgacagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 35777261  T
Q  540 aaaaatcgtggcacgatgg 558  Q
    |||||||||||||||||||    
T  35777262 aaaaatcgtggcacgatgg 35777280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 668 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 47701928 - 47701798
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47701928 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 47701829  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 798  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  47701828 gagtttgtctatttggaacaaacaccagggt 47701798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 667 - 913
Target Start/End: Original strand, 1673898 - 1674140
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaac-aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 764  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||  ||||| |  ||||||  |||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||    
T  1673898 acttttactataaatatagaacttgtatcaaaagtaaaccttgatgtagagagt-ctgaaaataagggtttagaa-gttaacaagaaaactagtgtttgt 1673995  T
Q  765 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 864  Q
    ||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  1673996 atatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttag--gattgattcaccatgggaaacactattaggattg-agtctcttgatcacgggaagagattg 1674091  T
Q  865 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 913  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  1674092 ggactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgat 1674140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 669 - 797
Target Start/End: Original strand, 6231374 - 6231502
Alignment:
Q  669 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 768  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6231374 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagcgggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 6231473  T
Q  769 agtttgtctcttcggaacaaacactaggg 797  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  6231474 agtttgtctcttggcaacaaacactaggg 6231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 641 - 849
Target Start/End: Original strand, 24177176 - 24177380
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaa 739  Q
    |||||||||| || ||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  24177176 cagatttgttccaaattttaagggatacttttattataaatatagaccttgtatcatagtaaacattgagctagagggggctgaaaacaagagtttag-a 24177274  T
Q  740 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 839  Q
     | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  24177275 tgtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt--ggggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-ga 24177370  T
Q  840 gtctcttggt 849  Q
    ||||||||||    
T  24177371 gtctcttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 872 - 1020
Target Start/End: Complemental strand, 47701801 - 47701651
Alignment:
Q  872 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccag 970  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  47701801 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccag 47701702  T
Q  971 actaggtcagattggatcgaactgg-tcaacaaatttctttgtgttctctt 1020  Q
    | |||||||  |||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||    
T  47701701 attaggtcaatttggatcgaactggatcaacaaattcttttgcgttctctt 47701651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 442 - 588
Target Start/End: Original strand, 5191374 - 5191520
Alignment:
Q  442 gtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  | ||||||  |||||||||| |||||||| ||||||  || ||||| ||||||    
T  5191374 gtgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgattgctgggcatcgtggcacgattggaggtttcagttttgagg-caaggtactgga 5191472  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191473 aaaatcgtggcacgatgggatctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 5191520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 806 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 1620657 - 1620482
Alignment:
Q  806 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 904  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | || ||  |||||||||    
T  1620657 ttgattcaccttggaaaacactattaggattag-gtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaa 1620559  T
Q  905 cccattgatttctctttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag 980  Q
    ||| ||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1620558 ccctttgatatctctttgtaaacttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcag 1620482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 641 - 744
Target Start/End: Original strand, 1321338 - 1321441
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321338 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 1321437  T
Q  741 ggca 744  Q
    ||||    
T  1321438 ggca 1321441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 667 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 4560599 - 4560401
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||| ||||||| |||||||  ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||             
T  4560599 actttcactataagtatagactatgtatcatagtaaacattgagatagagggggctgaaacaatggtttataaaggtaacaacaaaactag--------- 4560509  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
      |||||||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||     
T  4560508 --agtttgtctct--------aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagcctgttggttaccggaagagattgga 4560420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 565 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 6719546 - 6719396
Alignment:
Q  565 atcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgttacagatttgttacagattttaagc 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || || | |||| ||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||    |||||||||||||||||||||||    
T  6719546 atcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacatattttt-gggtgcagatttgatacagattttaag-cagatttgttacagattttaagc 6719449  T
Q  664 aggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 716  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  6719448 aagacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagag 6719396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 669 - 787
Target Start/End: Original strand, 3306724 - 3306842
Alignment:
Q  669 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 768  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||    
T  3306724 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctagagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatacaacaacaaaactaggatttgaatag 3306823  T
Q  769 agtttgtctcttcggaaca 787  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  3306824 agtttgtctctttggaaca 3306842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 822 - 1019
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3307036
Alignment:
Q  822 aacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tt 920  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  3306839 aacactattaggattg-agtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttt 3306937  T
Q  921 tgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctc 1018  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||| |  ||| || ||||||||  || |||||||||||  ||||| |||||| ||| ||||||||  |||||||||||    
T  3306938 tgtaaagttactcatcattatagtgaaaaggatggttgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttctc 3307035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 441 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 18097422 - 18097291
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||||  ||    
T  18097422 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcaaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcag-ttttgaggcaaggcatagg 18097324  T
Q  540 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggc 572  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  18097323 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatagtggc 18097291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 851 - 980
Target Start/End: Original strand, 24181486 - 24181617
Alignment:
Q  851 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggatt 948  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| | ||||||||| |||||||||      
T  24181486 acgggaaaagattgggactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 24181585  T
Q  949 ggagggctgctctctcccccagactaggtcag 980  Q
    ||| | ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24181586 ggatgactgctctctcctccaaactaggtcag 24181617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 441 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 10956563 - 10956417
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 538  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||| | || ||| ||   ||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  10956563 tgtgagagttaacttaaaatcaggat-ctgcaggaatcgtggcac-atggctggacatcatggcacgattggaggtttcagttttg-gggcaaggcactg 10956467  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10956466 gaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 10956417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 441 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 7606963 - 7606878
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  7606963 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtgacacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttg 7606878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 439 - 558
Target Start/End: Original strand, 11162889 - 11163008
Alignment:
Q  439 actgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcact 537  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | || ||| |||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  11162889 actgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcact 11162987  T
Q  538 ggaaaaatcgtggcacgatgg 558  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  11162988 ggaaaaattgtggcacgatgg 11163008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 564 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 6066210 - 6066139
Alignment:
Q  564 catcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagttttt 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6066210 catcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaatgta-tttttgggagcagatttgttacagatttt 6066139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 498 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 6066255 - 6066195
Alignment:
Q  498 tgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatgg 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6066255 tgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaacatcgtggcacgatgg 6066195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 723 - 973
Target Start/End: Original strand, 13419864 - 13420110
Alignment:
Q  723 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 822  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||    
T  13419864 gaaacaaaggttta-aaagccaacaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaa 13419957  T
Q  823 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac-ccattgatttctctt 920  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||||||||   | ||||||||||||| ||  || ||| | ||| |||||||    ||||| ||||||    
T  13419958 acactattagga-tcaagtctcttggtcacggaaagagattcaaattttgggtagaatttggttggaagaataatttttgtaacatttttgatatctctt 13420056  T
Q  921 tgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagact 973  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||||| | | || || ||||||||||||||||    
T  13420057 tgtaaagttactcatcattatagtggaatagtggactcctctctcccccagact 13420110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 445 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 10192525 - 10192401
Alignment:
Q  445 agagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaa 544  Q
    |||||||||| |||||||| ||| | | ||||||||||||||  |   ||||| |||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||    
T  10192525 agagttaactgaaaatcagatttatgcggaatcgtggcacgatcgcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttgagg-caaggcactggaaaaa 10192427  T
Q  545 tcgtggcacgatggggtctcatcgtg 570  Q
    ||||||||||||||| || |||||||    
T  10192426 tcgtggcacgatgggatcgcatcgtg 10192401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 441 - 588
Target Start/End: Original strand, 26720268 - 26720415
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 538  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| || || |||| |||||| ||| |||||||| |  |||  || ||| ||||||    
T  26720268 tgtgagagttaacttaaaatcaggat-ctgcaggaatcgtggcacgatggctgagcaacgtggcaggattggaggtttcaagtttgagg-caaagcactg 26720365  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  26720366 gaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgtgctggc 26720415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 441 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 32264580 - 32264433
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaa-tcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 538  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || |||| || |||||||||| |||||||| |||||||  |||||| |||||    
T  32264580 tgtgagagttaacttaaaatcaggttt-tgcagaaatcgtggcacgatggctggg-aacgtggcacgattggaggtttcagtttttgaggcaagtcactg 32264483  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    ||    ||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||    
T  32264482 gatttttcgtggcacgatgggcttgcaacgtggcacgatggtgcgctggc 32264433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 937 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 53894121 - 53894040
Alignment:
Q  937 atatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  53894121 atatattggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 53894040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 806 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 14634638 - 14634504
Alignment:
Q  806 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 904  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||   | ||||| ||||||||||    
T  14634638 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggtagcattaggtttgaagactgattcttgtaa 14634540  T
Q  905 cccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
     || ||||| |||| ||||||| | |||||||||||    
T  14634539 acctttgatatctcttttgtaaagttactcatcata 14634504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 824 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 29914132 - 29913980
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 922  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  29914132 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 29914038  T
Q  923 taacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    ||| |  ||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  29914037 taaagaaactcatcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtca 29913980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 440 - 588
Target Start/End: Original strand, 1321160 - 1321308
Alignment:
Q  440 ctgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatg-gaggttttagttttttgggcaaggcact 537  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || ||| |||||||||||||  | ||||||| ||||||||||  ||||||| |  |||  || ||| |||||    
T  1321160 ctgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattagaggtttcaagtttgagg-caaagcact 1321257  T
Q  538 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  1321258 gaaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgtgctggc 1321308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 534 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 10958767 - 10958713
Alignment:
Q  534 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10958767 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 10958713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 543 - 627
Target Start/End: Original strand, 3859350 - 3859434
Alignment:
Q  543 aatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacgtattttttgggagcagatttgtt 627  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  3859350 aatcgtggcacgatggggtcacatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataatataaacgta-tttttgggtgcagatttgtt 3859434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 445 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 10085605 - 10085481
Alignment:
Q  445 agagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaa 544  Q
    |||||||||| |||||||| ||| | | ||||||||||| ||  |   ||||| |||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||    
T  10085605 agagttaactgaaaatcagatttatgcggaatcgtggcatgatcgcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttgagg-caaggcactggaaaaa 10085507  T
Q  545 tcgtggcacgatggggtctcatcgtg 570  Q
    ||||||||||||||| || |||||||    
T  10085506 tcgtggcacgatgggatcacatcgtg 10085481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 441 - 556
Target Start/End: Original strand, 11170145 - 11170260
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 539  Q
    |||||||||||||||||||||| | | || ||| ||||||||||||   | ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||    
T  11170145 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaatcgtggcacggttgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcggtttttgaggcaaggcactgg 11170243  T
Q  540 aaaaatcgtggcacgat 556  Q
    |||||||||||| ||||    
T  11170244 aaaaatcgtggctcgat 11170260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 10094256 - 10094100
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  10094256 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctct 10094162  T
Q  920 ttgtaacggtactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10094161 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 10094100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 929 - 1019
Target Start/End: Original strand, 41849244 - 41849335
Alignment:
Q  929 tactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  41849244 tactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 41849335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 527 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 5523066 - 5523005
Alignment:
Q  527 ggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  5523066 ggcaaggtactggaaaaatcgtggcacaatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 5523005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 937 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 35919179 - 35919098
Alignment:
Q  937 atatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  35919179 atatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 35919098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 1736324 - 1736380
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  1736324 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 1736380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 18552902 - 18552958
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  18552902 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 18552958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 30709809 - 30709865
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  30709809 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 30709865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 10100273 - 10100117
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  10100273 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtaaaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 10100179  T
Q  920 ttgtaacggtactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  |||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10100178 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 10100117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 10201136 - 10200980
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  10201136 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctct 10201042  T
Q  920 ttgtaacggtactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    ||| || |  ||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10201041 ttggaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 10200980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 751 - 849
Target Start/End: Original strand, 25633930 - 25634024
Alignment:
Q  751 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 849  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |   || |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25633930 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggct--gggattgattcaccttgggagacattattaggatt-gagtctcttggt 25634024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 436 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 6066296 - 6066246
Alignment:
Q  436 atgactgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacga 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  6066296 atgactgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaattgtggcacga 6066246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 441 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 6719651 - 6719532
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat---ggaggttttagttttttgggcaaggcact 537  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||  |  |||||  ||||||||||    ||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  6719651 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcttaatcgtggcacgattgaagggcatcgtggcacgattggagaggtttcag-tttttaggcaatgcact 6719553  T
Q  538 ggaaaaatcgtggcacgatgg 558  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6719552 ggaaaaatcgtggcacgatgg 6719532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 824 - 979
Target Start/End: Original strand, 10897008 - 10897162
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 922  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  10897008 cactattaggattg-attctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 10897102  T
Q  923 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    ||| |  ||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10897103 taaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 10897162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 939 - 993
Target Start/End: Complemental strand, 48438282 - 48438228
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact 993  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  48438282 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaact 48438228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 824 - 979
Target Start/End: Original strand, 54193229 - 54193383
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 922  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  54193229 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 54193323  T
Q  923 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    ||| |  || |||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54193324 taaagaaacccatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 54193383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 486
Target Start/End: Original strand, 25388618 - 25388663
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacga 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25388618 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacga 25388663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 806 - 991
Target Start/End: Original strand, 7768632 - 7768819
Alignment:
Q  806 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 904  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||   | ||||| |||||| |||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  7768632 ttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttgctcacgggctaaaattggaactttgagtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 7768730  T
Q  905 cccattgatttctctttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggatcgaa 991  Q
    ||  || || |  |||||||| | ||||||| | |||||||||  | |||| | ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  7768731 ccttttaatatacctttgtaaagttactcattattatagtggaacgaagggttactccctcccccatactaggtcagtattggatcgaa 7768819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 8370505 - 8370561
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  8370505 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 8370561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 838 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 11007679 - 11007544
Alignment:
Q  838 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatc 936  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||         | |||||||||| | ||||  |||| ||||||| | ||||||||    
T  11007679 gagtctcttggtcacaggaagagattgagactttgggtagaattagg---------ttttcttgtaactctttgacatctcttttgtaaagttactcatc 11007589  T
Q  937 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag 980  Q
    | ||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  11007588 attatagtggaatggggggctcctctctcccctagactaggtcag 11007544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 806 - 884
Target Start/End: Original strand, 11066652 - 11066731
Alignment:
Q  806 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 884  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11066652 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgaa-tcttttgatcacgggaagagattcgggactttgggtagaattagg 11066731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 939 - 1002
Target Start/End: Complemental strand, 16264418 - 16264354
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaa 1002  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  16264418 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 16264354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 27974971 - 27975027
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  27974971 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 27975027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 27986465 - 27986521
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  27986465 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 27986521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 939 - 1002
Target Start/End: Complemental strand, 32143389 - 32143325
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaa 1002  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  32143389 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 32143325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 33386685 - 33386741
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  33386685 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 33386741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 940 - 995
Target Start/End: Original strand, 1417510 - 1417565
Alignment:
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  1417510 tagtggattggagggatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 1417565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Original strand, 6303310 - 6303466
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| | |||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||    
T  6303310 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtatagttaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctct 6303404  T
Q  920 ttgtaacggtactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  |||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6303405 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 6303466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 10208182 - 10208026
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  10208182 aaacactattacgattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctct 10208088  T
Q  920 ttgtaacggtactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  10208087 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccgcagactaggtca 10208026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Original strand, 27544273 - 27544429
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  27544273 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagcgtggaac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctct 27544367  T
Q  920 ttgtaacggtactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  27544368 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccctcagactaggtca 27544429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 940 - 1002
Target Start/End: Complemental strand, 37466358 - 37466295
Alignment:
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactg-gtcaacaa 1002  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  37466358 tagtggattggagggctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgtgtcaacaa 37466295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 824 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 47878350 - 47878196
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 922  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  47878350 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 47878256  T
Q  923 taacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    ||| |  ||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  47878255 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtca 47878196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 441 - 486
Target Start/End: Original strand, 3859317 - 3859362
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacga 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  3859317 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcataatcgtggcacga 3859362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 534 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 4308725 - 4308648
Alignment:
Q  534 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttt 611  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||  |||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  4308725 cactggaaaaatcgtgccacgattggatcgaatcgtgccacgatggtgcgattgaagataaaaataaaacgtattttt 4308648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 821 - 1005
Target Start/End: Original strand, 5858546 - 5858728
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  5858546 aaacactattaggattg-agtct--tggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctct 5858638  T
Q  920 ttgtaacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggatcgaactggtcaacaaatt 1005  Q
    |||||| |  ||||||  ||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||| ||||||||    
T  5858639 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactggtaaacaaatt 5858728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 667 - 732
Target Start/End: Original strand, 6484308 - 6484373
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggg 732  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6484308 acttttgctataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaggg 6484373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 22626166 - 22626009
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | | ||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  22626166 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaaaactgattcttgaaactcat---tatctct 22626072  T
Q  920 ttgtaacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||  |||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  22626071 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagaactgctctctcccccagactaggtca 22626009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 441 - 516
Target Start/End: Original strand, 32218836 - 32218912
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacga-tggaggttt 516  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  32218836 tgtgagagttaacttaaaatcagg-ttctgcagaaatcgtggcacgatgattgggcaacgtggcacgattggaggttt 32218912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 21711291 - 21711235
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  21711291 atagtggatttgagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 21711235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 27453026 - 27452970
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||    
T  27453026 atagtggattggagagctgctctctcccccggattaggtcatattggaccgaactgg 27452970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 824 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 27762165 - 27762107
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27762165 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 27762107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 47923925 - 47923981
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  47923925 atagtagattgaagggctgctctctcccctagattaggtcatattggatcgaactgg 47923981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 441 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 48362186 - 48362119
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaa-tcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  48362186 tgtgagagttaacttaaaatcaggtt-ctgtagaaatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcacgat 48362119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 821 - 884
Target Start/End: Original strand, 16462203 - 16462264
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16462203 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16462264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 940 - 1002
Target Start/End: Complemental strand, 25795848 - 25795785
Alignment:
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaa 1002  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  25795848 tagtagattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 25795785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 821 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 47883064 - 47883003
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  47883064 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 47883003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 888 - 976
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634120
Alignment:
Q  888 gagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactagg 976  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |  | | ||||||||||||| ||||||||||    
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaatggctgctctctccaccagactagg 25634120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 667 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 1618992 - 1618916
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt--gagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 740  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || || |||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1618992 actttgactataaatatagaccttgtaccatagtaaaccttgagagacagagggggctgaaaacaagggtttagaaa 1618916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 788 - 833
Target Start/End: Complemental strand, 7606873 - 7606828
Alignment:
Q  788 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 833  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606873 aacagtaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 7606828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Original strand, 11079517 - 11079674
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||  |||||||| || ||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  11079517 aaacactatcaggattg-agtctcttggtcacgggaaaaggctgggacttagg-tagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctct 11079611  T
Q  920 ttgtaacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11079612 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 11079674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 534 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 27101704 - 27101627
Alignment:
Q  534 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttt 611  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||  |||||| || ||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  27101704 cactggaaaaatcgtgccacgattggatcgaatcgtgccaagatggtgcgattgaagataaaaataaaacgtattttt 27101627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 534 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 35918393 - 35918316
Alignment:
Q  534 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttt 611  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||  || ||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  35918393 cactggaaaaatcgtagcacgattggatcgaatagtgccacgatggtgcgattgaagataaaaataaaacgtattttt 35918316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 538 - 611
Target Start/End: Original strand, 43228108 - 43228181
Alignment:
Q  538 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttt 611  Q
    |||||||||||| |||||| || ||  |||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  43228108 ggaaaaatcgtgccacgattggatcgaatcgtgccacgatggtgcgattgaagataaaaataaaacgtattttt 43228181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 26299056 - 26299000
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| | ||||||||    
T  26299056 atagtagattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattgaaccgaactgg 26299000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 36029161 - 36029105
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  36029161 atagtggattggagagctgctttctcccccagattaggtcatattggacagaactgg 36029105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 534 - 586
Target Start/End: Original strand, 45882752 - 45882804
Alignment:
Q  534 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 586  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||||||||||||||    
T  45882752 cactggaaaaatcgtgccacgatgggattgcaacgtggcacgatggtgcgctg 45882804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 829 - 884
Target Start/End: Original strand, 4535622 - 4535675
Alignment:
Q  829 ttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  4535622 ttaggattg-agtctcttggttacgggaagaggttggga-attgggtagaattagg 4535675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 939 - 986
Target Start/End: Original strand, 6794732 - 6794779
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattgga 986  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  6794732 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgga 6794779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 821 - 884
Target Start/End: Original strand, 16996875 - 16996936
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16996875 aaacactgttaggattg-agtctcttggtcacggaaagaaattggga-tttgggtagaattagg 16996936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 667 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 25690690 - 25690651
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactt 706  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25690690 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactt 25690651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 940 - 995
Target Start/End: Original strand, 25929463 - 25929517
Alignment:
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||||||    
T  25929463 tagtggattggagggctgctctc-cccccagagtaggtcgtattggaccgaactgg 25929517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 939 - 994
Target Start/End: Complemental strand, 40844719 - 40844665
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactg 994  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  40844719 atagtggatttgagggctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactg 40844665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 940 - 986
Target Start/End: Original strand, 3323710 - 3323756
Alignment:
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattgga 986  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  3323710 tagtggattggagggctgttctctctcccagattaggtcatattgga 3323756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 824 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 10612957 - 10612803
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 922  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| |||||| |||| ||   || ||||||||    
T  10612957 cactattaagattg-agtttcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttataactca---atatctctttg 10612863  T
Q  923 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    ||| |  ||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10612862 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 10612803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 939 - 985
Target Start/End: Original strand, 26928620 - 26928666
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattgg 985  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  26928620 atagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattgg 26928666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 667 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 10621876 - 10621847
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatca 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621876 acttttactataaatatagaccttgtatca 10621847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 641 - 698
Target Start/End: Original strand, 13893290 - 13893347
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaa 698  Q
    |||||||||| || ||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13893290 cagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatatagacattgtatcaaa 13893347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 534 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 25690800 - 25690723
Alignment:
Q  534 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttt 611  Q
    |||||||||||||||| || ||| || ||  || ||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  25690800 cactggaaaaatcgtgccatgattggatcgaattgtgccacgatggtgcgattgaagataaaaataaaacgtattttt 25690723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 784 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 31021361 - 31021300
Alignment:
Q  784 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttg 847  Q
    |||||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31021361 aacaaacactagggttgg--gattgattcaccttggagaaacactattaggatt-gagtctcttg 31021300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 669 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 31021479 - 31021450
Alignment:
Q  669 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31021479 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa 31021450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 667 - 696
Target Start/End: Original strand, 42990205 - 42990234
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatca 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990205 acttttactataaatatagaccttgtatca 42990234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 938 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 48390368 - 48390327
Alignment:
Q  938 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48390368 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 48390327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 534 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 51727450 - 51727373
Alignment:
Q  534 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttt 611  Q
    |||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||| |||||||||| | | |  ||||||||||||||||||||||    
T  51727450 cactggaaaaatcgtgccacgatttgatcgaatcgtgccacgatggtgtgattgaagataaaaataaaacgtattttt 51727373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 413; Significance: 0; HSPs: 144)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 441 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 1047503 - 1046912
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047503 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 1047404  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttt----- 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||         
T  1047403 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttt-gggagcagatttgttacagttttgttac 1047305  T
Q  636 ---tgtta--cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggct 722  Q
       | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || ||  ||||        |||||||||||    
T  1047304 agattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaagctaatctaagagagagagagatagagggggct 1047205  T
Q  723 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 822  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047204 gaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 1047105  T
Q  823 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 922  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047104 acactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 1047006  T
Q  923 taacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgtt 1015  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  1047005 taacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 1046912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 31156247 - 31155896
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31156247 acttttactataaatatagagcttgtatcaaggcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 31156148  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31156147 agagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgggtacgggaagagattggg 31156048  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31156047 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcctatagtggattggagggctgctctctccc 31155948  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31155947 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 31155896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 641 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 1049657 - 1049283
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049657 cagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 1049558  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  1049557 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggatt-gag 1049459  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatat 940  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1049458 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatat 1049359  T
Q  941 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgtt 1015  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  1049358 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 1049283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 7351994 - 7351637
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 760  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7351994 acttttactataaatataaaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggct 7351895  T
Q  761 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 860  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7351894 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 7351795  T
Q  861 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctc 960  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7351794 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 7351695  T
Q  961 tctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7351694 tctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 7351637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 40837104 - 40836728
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  40837104 cagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaatttggagattgagggggctgaaagaagggtttagaaa 40837005  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40837004 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 40836906  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatat 940  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40836905 tctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatat 40836806  T
Q  941 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  40836805 agtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 40836728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 7349615 - 7349262
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 760  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7349615 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 7349516  T
Q  761 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 860  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7349515 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 7349416  T
Q  861 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctc 960  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7349415 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 7349316  T
Q  961 tctcccccagactaggtcagattggatcgaactggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||    
T  7349315 tctcccccagactaggtcagattggaccgaa---gtcaacaaatttctttgtgttct 7349262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Original strand, 38393935 - 38394290
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 762  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38393935 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38394034  T
Q  763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 862  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  38394035 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggc 38394133  T
Q  863 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 961  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38394134 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 38394233  T
Q  962 ctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  38394234 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 38394290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Original strand, 35556 - 35933
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35556 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaa 35655  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  35656 gacaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgatt-gag 35754  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  35755 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 35854  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg-tcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  35855 tagtggaacggagagctgctttctcccctagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatttttttgtgttct 35933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 642 - 1015
Target Start/End: Original strand, 25542459 - 25542830
Alignment:
Q  642 agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 741  Q
    |||||| || || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25542459 agatttattccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaaaggtttagaaag 25542557  T
Q  742 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 841  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  25542558 gtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaagactattaggattg-agt 25542655  T
Q  842 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 941  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25542656 ctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatata 25542755  T
Q  942 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgtt 1015  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  25542756 gtggatcggagagctgctctctcccctagactaggttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 25542830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Original strand, 44724533 - 44724885
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724533 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 44724632  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  44724633 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagaggctggga 44724731  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  44724732 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccc 44724831  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  44724832 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 44724885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 670 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 7470359 - 7470007
Alignment:
Q  670 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 765  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470359 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 7470260  T
Q  766 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 865  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||     
T  7470259 tagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctga 7470161  T
Q  866 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  7470160 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctccctc 7470061  T
Q  965 ccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  7470060 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7470007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 667 - 1016
Target Start/End: Original strand, 3035670 - 3036027
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 762  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035670 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 3035769  T
Q  763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga--- 859  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||       
T  3035770 ttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaaga 3035868  T
Q  860 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgc 958  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035869 ggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgcaacgatactcatcatatagtggattggagggctgc 3035968  T
Q  959 tctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttc 1016  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  3035969 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 3036027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Original strand, 44491 - 44868
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||  || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44491 cagatttgtaccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 44590  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  44591 ggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaaacactattatgatt-gag 44689  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  44690 tcttttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattatgtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 44789  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||  |||  |||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  44790 tagtggaacggatagctgctttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 44868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 641 - 1005
Target Start/End: Complemental strand, 27306591 - 27306227
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27306591 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 27306492  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27306491 ggcaacaacaaaactagggttt-tatagagtttgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 27306394  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  27306393 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 27306294  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatt 1005  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||    
T  27306293 tagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaatt 27306227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Original strand, 3878498 - 3878881
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaat----atagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtt 734  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3878498 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaattaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtt 3878597  T
Q  735 tagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga 834  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3878598 tagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggttgattcaccttggtaaacactattagga 3878697  T
Q  835 ttggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactc 933  Q
    || |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3878698 tt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactc 3878796  T
Q  934 atcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  3878797 atcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactatgttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3878881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 670 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 7472317 - 7471965
Alignment:
Q  670 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 765  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7472317 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 7472218  T
Q  766 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 865  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||    
T  7472217 tagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgg 7472119  T
Q  866 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  7472118 aactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctctc 7472019  T
Q  965 ccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  7472018 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7471965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Original strand, 48457602 - 48457957
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 762  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457602 actttcactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 48457701  T
Q  763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 862  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  48457702 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacctagggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggc 48457800  T
Q  863 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 961  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  48457801 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 48457900  T
Q  962 ctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  48457901 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 48457957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 670 - 1019
Target Start/End: Original strand, 20625990 - 20626344
Alignment:
Q  670 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 765  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20625990 tttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 20626089  T
Q  766 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 865  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||    
T  20626090 tagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgg 20626188  T
Q  866 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20626189 gactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 20626288  T
Q  965 ccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  20626289 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 20626344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 670 - 1019
Target Start/End: Original strand, 20629881 - 20630235
Alignment:
Q  670 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 765  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629881 tttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 20629980  T
Q  766 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 865  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||    
T  20629981 tagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgg 20630079  T
Q  866 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20630080 gactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 20630179  T
Q  965 ccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  20630180 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 20630235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 670 - 1019
Target Start/End: Original strand, 20642300 - 20642654
Alignment:
Q  670 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 765  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642300 tttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 20642399  T
Q  766 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 865  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||    
T  20642400 tagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgg 20642498  T
Q  866 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20642499 gactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 20642598  T
Q  965 ccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  20642599 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 20642654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 13099812 - 13099457
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13099812 acttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 13099713  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099712 agagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatt-gagtctcttggttacgggaagagattggg 13099614  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctct 963  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||    
T  13099613 gctttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctct 13099514  T
Q  964 cccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  13099513 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 13099457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Original strand, 20297311 - 20297666
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 762  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20297311 acttttactaaaaatatggaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaataaaactagggttt 20297410  T
Q  763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 862  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20297411 gtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagat 20297509  T
Q  863 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 961  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297510 tggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctct 20297609  T
Q  962 ctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||  ||||||||||    
T  20297610 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 20297666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Original strand, 20299407 - 20299764
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaa-gggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 761  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20299407 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtt 20299506  T
Q  762 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggg-tttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 860  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20299507 tgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 20299605  T
Q  861 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgct 959  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20299606 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggttgct 20299705  T
Q  960 ctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  20299706 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 20299764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 646 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 31435404 - 31435029
Alignment:
Q  646 ttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaa 745  Q
    ||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435404 ttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaa 31435305  T
Q  746 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctct 845  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31435304 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctct 31435206  T
Q  846 tggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagt 943  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||    
T  31435205 tggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagt 31435106  T
Q  944 ggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  31435105 ggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 31435029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Original strand, 40946277 - 40946632
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat----agagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 762  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40946277 actttcactataaatataaaccttgtttcatagcaaactttgagagggacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 40946376  T
Q  763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 862  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||      
T  40946377 gtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgatttactttggaaaacactattaggatt-gagtctcttagttacgggaagaggc 40946475  T
Q  863 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 961  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  40946476 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcgaagggctgctct 40946575  T
Q  962 ctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  40946576 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 40946632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 708 - 1017
Target Start/End: Original strand, 1849975 - 1850285
Alignment:
Q  708 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 807  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1849975 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggtt 1850074  T
Q  808 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 907  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1850075 gattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 1850173  T
Q  908 attgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatt 1005  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||    
T  1850174 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 1850273  T
Q  1006 tctttgtgttct 1017  Q
      ||||||||||    
T  1850274 cttttgtgttct 1850285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 20137444 - 20137092
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20137444 cttttactataaatattggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 20137345  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20137344 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatt-gagtctcttgattacgggaagagattggga 20137246  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |    
T  20137245 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctct-c 20137147  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  20137146 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 20137092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 222; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 42331335 - 42330980
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  42331335 acttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaaggtttgtat 42331236  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt--acgggaagagattg 864  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  42331235 agagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacacgggaagagattg 42331137  T
Q  865 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct 963  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||    
T  42331136 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattatatagtgaaacggagggctattctct 42331037  T
Q  964 cccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||| |||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  42331036 cccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 42330980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Original strand, 18345490 - 18345845
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgag----atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 762  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18345490 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctgaactttgagggagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 18345589  T
Q  763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 862  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||      
T  18345590 gtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagaggc 18345688  T
Q  863 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 961  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  18345689 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgttct 18345788  T
Q  962 ctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||  ||||||||||    
T  18345789 ctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttct 18345845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Original strand, 28487502 - 28487857
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 762  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28487502 acttttcctataaatatagaccatgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagagttt 28487601  T
Q  763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 862  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  28487602 gtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggttgattcacctttggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagagat 28487700  T
Q  863 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 961  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||    
T  28487701 tggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcagagggttgctct 28487800  T
Q  962 ctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg-tcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  28487801 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttct 28487857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Original strand, 443548 - 443902
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  443548 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggagctaaaacaatggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 443647  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  443648 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttgattacgggaagagattggg 443746  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct-c 964  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||| |  | ||||||||||||| |    
T  443747 actttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctcttttataacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctcc 443846  T
Q  965 ccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  443847 cccccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 443902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Original strand, 9680768 - 9681126
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 762  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  9680768 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggttgaaacaagggtttagaagggcaacaacaaaactatggttt 9680867  T
Q  763 gtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 861  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9680868 gtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaga 9680966  T
Q  862 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctc 960  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  9680967 ttgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctc 9681066  T
Q  961 tctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  9681067 tctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgttctct 9681126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Original strand, 11355212 - 11355564
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11355212 cttttactataaatataggctttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 11355311  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  11355312 gagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagagattgaga 11355410  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||| | ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||    
T  11355411 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaacgtttctcatcatatagtggaacagagagctgctctctccc 11355510  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    | |||||| ||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||    
T  11355511 ctagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttatgttctct 11355564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 4296271 - 4295917
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagacctt-gtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  4296271 cttttactataaatatagacatttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 4296172  T
Q  767 agagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 865  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4296171 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgg 4296073  T
Q  866 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||||| ||||    
T  4296072 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctatctc 4295973  T
Q  965 ccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||| |||||||||  ||||| |||||| ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  4295972 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtgaacaaattcttttgtgttctct 4295917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Original strand, 24748548 - 24748901
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24748548 cttttattataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgacttagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtata 24748647  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24748648 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattacgatt-gagtctcttggttccgggaagagattggga 24748746  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  24748747 ctttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcc 24748846  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaactg-gtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
     ||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  24748847 tccagattaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctct 24748901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 668 - 994
Target Start/End: Original strand, 21679981 - 21680307
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21679981 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 21680080  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21680081 gagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttaccggaagagattggga 21680179  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |   ||| |||||||||||||    
T  21680180 ctttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaacccaatgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagagctgctctctccc 21680279  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaactg 994  Q
    ||||||||||| |  ||||| |||||||    
T  21680280 ccagactaggtgaatttggaccgaactg 21680307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 669 - 1019
Target Start/End: Original strand, 21990106 - 21990456
Alignment:
Q  669 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 768  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||    
T  21990106 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactatgatttgtatag 21990204  T
Q  769 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggac 868  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  21990205 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattagaatt-gagtctcttggttacgggaagagattgaggc 21990303  T
Q  869 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 967  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  21990304 tttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctcccc 21990403  T
Q  968 cagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
     |||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  21990404 aagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 21990456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 669 - 1018
Target Start/End: Complemental strand, 37412462 - 37412109
Alignment:
Q  669 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 768  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37412462 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 37412363  T
Q  769 agtttgtctc-ttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  37412362 agtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagagactggga 37412264  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||    
T  37412263 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctc 37412164  T
Q  965 ccccagactaggtcagattggatcgaactgg-tcaacaaatttctttgtgttctc 1018  Q
    ||| ||||| |||||  ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||||||    
T  37412163 ccctagactgggtcaatttggaccgaactggatcaataaattcttttgtgttctc 37412109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 667 - 1015
Target Start/End: Original strand, 28485515 - 28485867
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 762  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485515 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 28485614  T
Q  763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 862  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28485615 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttgattcacctttggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagagat 28485713  T
Q  863 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 961  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||| ||||||    
T  28485714 tggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcagagggttgctct 28485813  T
Q  962 ctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgtt 1015  Q
    || || ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  28485814 ct-cctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 28485867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 701 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 21592445 - 21592126
Alignment:
Q  701 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 800  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21592445 aaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaatgcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt 21592346  T
Q  801 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 900  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21592345 gagggttgattcaccttggcaagcactattaggatt-tagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattctt 21592247  T
Q  901 gtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtca 998  Q
    ||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| |||||    
T  21592246 gtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtca 21592147  T
Q  999 acaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||  ||||||||||||    
T  21592146 acaaattcttttgtgttctct 21592126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 668 - 995
Target Start/End: Original strand, 21678020 - 21678347
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21678020 cttttactataaatatagatattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttgtata 21678119  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21678120 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagatattggga 21678218  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||| | |||| ||||||||||| |   | |||||||||||||||    
T  21678219 ctttgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcatatagtgaaacagtgggctgctctctccc 21678318  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    | ||||||||| |  ||||| ||||||||    
T  21678319 ctagactaggttaatttggaccgaactgg 21678347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Original strand, 42223110 - 42223464
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagg-gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42223110 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagatgtgggatgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 42223209  T
Q  767 agagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 865  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42223210 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgg 42223308  T
Q  866 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
      |||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  42223309 agctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggatggctgctctctc 42223408  T
Q  965 ccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||| |||||||||  || ||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||    
T  42223409 ccccatactaggtcaattttgatcgaactgggtcaacaaattcttttgttttctct 42223464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 667 - 947
Target Start/End: Original strand, 11757177 - 11757463
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaa-gggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 761  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11757177 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtt 11757276  T
Q  762 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggg-tttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 860  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11757277 tgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 11757375  T
Q  861 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggat 947  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11757376 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 11757463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 668 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 27832969 - 27832656
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggg-gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||| ||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27832969 cttttactataaatataggttgtgtatcagagcaaaccttgtgatagagtggagctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacagaactaaggtttgtat 27832870  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27832869 agagtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgag 27832771  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt-tgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||    
T  27832770 actttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttctgtaaagttactcatcattatagtgaaatggagggcttctctctc 27832671  T
Q  965 ccccagactaggtca 979  Q
    |||||||||||||||    
T  27832670 ccccagactaggtca 27832656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 668 - 946
Target Start/End: Original strand, 25276095 - 25276374
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25276095 cttttactataaatatatgctttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaataatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 25276194  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25276195 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgaga 25276293  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtgga 946  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  25276294 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 25276374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 441 - 710
Target Start/End: Original strand, 2935070 - 2935349
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2935070 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 2935169  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 640  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2935170 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacata-tttttgagagcagatttgttacagtttttgtta 2935268  T
Q  641 -----------cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgag 710  Q
               ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2935269 cagattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactctgag 2935349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 39146322 - 39145969
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  39146322 cttttactataaatatagacactgtatcagtgtaaaccttgagatggagggggctgaaacaagggtttagatagacaacaacaaaactagggtttgtata 39146223  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39146222 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattggaa 39146124  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |  || |||||||||| | |    
T  39146123 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggggggctgctcttttc 39146024  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    || | |||||||||  ||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  39146023 cctaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 39145969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 43253860 - 43253502
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggg--------ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 758  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||| |        ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  43253860 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagaaagagggctgaaacaaggttttagaatgacaacaacaaaactagg 43253761  T
Q  759 gtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaag 858  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  43253760 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacta-ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttgattacggaaag 43253663  T
Q  859 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctg 957  Q
    ||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  43253662 aggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctg 43253563  T
Q  958 ctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||| ||||||||||||  || || |||||| |||||| |||||  ||||||||||    
T  43253562 ctctctccctcagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 43253502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 641 - 908
Target Start/End: Original strand, 26804500 - 26804765
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804500 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtg----agtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 26804595  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacac---tagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 837  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26804596 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt- 26804694  T
Q  838 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 908  Q
     ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804695 tagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26804765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 669 - 1015
Target Start/End: Original strand, 9679009 - 9679361
Alignment:
Q  669 ttttactataaatatagaccttgtatca-aagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 763  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||    |||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  9679009 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttg 9679108  T
Q  764 tatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 862  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  9679109 tatagagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagat 9679206  T
Q  863 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 961  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |  ||||  |||||||    
T  9679207 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctct 9679306  T
Q  962 ctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgtt 1015  Q
    ||  ||||||||||||||  ||||| |  ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  9679307 ctttcccagactaggtcaatttggaccagactgggtcaacaaattcttttgtgtt 9679361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 441 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 9027687 - 9027396
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9027687 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 9027588  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 640  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9027587 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacata-tttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 9027489  T
Q  641 cagatttgttac----------------------agattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 711  Q
    ||||||||||||                      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9027488 cagatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 9027396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 441 - 711
Target Start/End: Original strand, 22136878 - 22137169
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136878 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 22136977  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 640  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136978 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacata-tttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 22137076  T
Q  641 cagatttgttac----------------------agattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 711  Q
    ||||||||||||                      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137077 cagatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 22137169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 674 - 979
Target Start/End: Original strand, 24258423 - 24258732
Alignment:
Q  674 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 773  Q
    ||||||||||||   |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24258423 ctataaatataggttttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagttt 24258522  T
Q  774 gtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgg 873  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  24258523 gtctcttggcaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttgg 24258621  T
Q  874 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca----tatagtggattggagggctgctctctccccc 968  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||   |    
T  24258622 atagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattatagtggaacggagggctgctctctctttc 24258721  T
Q  969 agactaggtca 979  Q
    |||||||||||    
T  24258722 agactaggtca 24258732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 441 - 711
Target Start/End: Original strand, 40551905 - 40552196
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40551905 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 40552004  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 640  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40552005 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacata-tttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 40552103  T
Q  641 cagatttgttac----------------------agattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 711  Q
    ||||||||||||                      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40552104 cagatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 40552196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 820 - 1017
Target Start/End: Original strand, 2935374 - 2935572
Alignment:
Q  820 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2935374 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 2935473  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2935474 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttccttgtgttct 2935572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 441 - 711
Target Start/End: Original strand, 22107867 - 22108158
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||   | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22107867 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatgcaggttttagttttttgggcaaggcactgga 22107966  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 640  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22107967 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacata-tttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 22108065  T
Q  641 cagatttgttac----------------------agattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 711  Q
    ||||||||||||                      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22108066 cagatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 22108158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 441 - 711
Target Start/End: Original strand, 40549627 - 40549918
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||   | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40549627 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatgcaggttttagttttttgggcaaggcactgga 40549726  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 640  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40549727 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacata-tttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 40549825  T
Q  641 cagatttgttac----------------------agattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 711  Q
    ||||||||||||                      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40549826 cagatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 40549918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 820 - 1017
Target Start/End: Original strand, 1606486 - 1606683
Alignment:
Q  820 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1606486 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 1606584  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1606585 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcagattggaccgaactgggtcaacaaatttccttgtgttct 1606683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 820 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 9027376 - 9027179
Alignment:
Q  820 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9027376 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 9027278  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  9027277 ttgtaacgttactcatcaaatagtggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctatgtgttct 9027179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 820 - 1017
Target Start/End: Original strand, 22137184 - 22137381
Alignment:
Q  820 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22137184 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22137282  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22137283 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 22137381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 667 - 921
Target Start/End: Complemental strand, 22828969 - 22828716
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22828969 acttttactataaatataggctttgtatccgagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtat 22828870  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||||| |||||  ||||||||||  || | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  22828869 agagtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagattagaaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagagattgag 22828771  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 921  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22828770 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 22828716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 820 - 1017
Target Start/End: Original strand, 40552211 - 40552408
Alignment:
Q  820 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40552211 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40552309  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  40552310 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 40552408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 158; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 667 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 22251878 - 22251641
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22251878 acttttactataaatataaaccttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 22251779  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22251778 agagtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggga--------taggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgag 22251688  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 913  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251687 gctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 22251641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 784 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 7092431 - 7092198
Alignment:
Q  784 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattag 883  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7092431 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattag 7092333  T
Q  884 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagat 982  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  7092332 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatt 7092234  T
Q  983 tggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  7092233 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7092198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 670 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 24817682 - 24817376
Alignment:
Q  670 tttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 768  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||    
T  24817682 tttaatataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagagaactagggtttgtatag 24817585  T
Q  769 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggac 868  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  24817584 agtttg-ctctttgcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttggaaagcagtattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagac 24817490  T
Q  869 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  24817489 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctccc 24817390  T
Q  967 ccagactaggtcag 980  Q
    ||| ||||||||||    
T  24817389 ccatactaggtcag 24817376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 820 - 1017
Target Start/End: Original strand, 22108173 - 22108370
Alignment:
Q  820 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22108173 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22108271  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22108272 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 22108370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 820 - 1017
Target Start/End: Original strand, 40549933 - 40550130
Alignment:
Q  820 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40549933 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40550031  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  40550032 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 40550130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 149; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 667 - 980
Target Start/End: Original strand, 7188496 - 7188806
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  7188496 acttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttag-aagtcaacaataaaaatagggtttgtat 7188594  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    || ||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  7188595 agggtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaatagattgag 7188690  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| | || ||||||| | || |||||| |||||||||  ||| |||||||||||     
T  7188691 actttgggtagaattaagcgggagacttatttttataacccattgatatttcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacggaaggctgctctctt 7188790  T
Q  965 ccccagactaggtcag 980  Q
    |||||| ||| |||||    
T  7188791 ccccagtctatgtcag 7188806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 667 - 970
Target Start/End: Complemental strand, 20091877 - 20091580
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 765  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||    
T  20091877 acttttactataaatatagactttttatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttcgga-ggcaaca-caaaactagggtttgta 20091780  T
Q  766 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 865  Q
    ||||||||| || || | |||||| | ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||     
T  20091779 tagagtttg-ctattggcaacaaagattagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaa-tctcttggtcacgggaagagattga 20091684  T
Q  866 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||    
T  20091683 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc--atagtggaacggagggctgctctctc 20091586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 792 - 1017
Target Start/End: Original strand, 38396713 - 38396938
Alignment:
Q  792 ctagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga 891  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396713 ctaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 38396811  T
Q  892 cttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaa 991  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||    
T  38396812 cttatttttgtaacccattgatttctctttgtaactttactcatcatatagtggatcggagggcttctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaa 38396911  T
Q  992 ct-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||    
T  38396912 ctgggtcaacaaattcttttgtgttct 38396938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 784 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 7094678 - 7094445
Alignment:
Q  784 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattag 883  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7094678 aacaaaca-tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattag 7094581  T
Q  884 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagat 982  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  7094580 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatt 7094481  T
Q  983 tggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||  ||||| |||||| |||||  ||||||||||    
T  7094480 tggactgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 7094445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 646 - 832
Target Start/End: Original strand, 18567545 - 18567731
Alignment:
Q  646 ttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaa 745  Q
    ||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18567545 ttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaa 18567644  T
Q  746 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattag 832  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18567645 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 18567731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 743 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 24813755 - 24813481
Alignment:
Q  743 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 842  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24813755 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaagcactattaggattg-agtc 24813661  T
Q  843 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct-ctttgtaacggtactcatca-tat 940  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| | ||||||||| |||    
T  24813660 tcttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttactcatcattat 24813561  T
Q  941 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| ||||||||| | ||||||||||    
T  24813560 agtggagcggatggctgctttctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaattt-tgtgtgttctct 24813481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 669 - 913
Target Start/End: Original strand, 24465503 - 24465735
Alignment:
Q  669 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||    
T  24465503 ttttactatagatatagactttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtata 24465594  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    | ||||| ||||| | ||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  24465595 gcgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gaattgattcaccttgggaaacaatattaggattg-agtctcttggtcatgggaagagattggga 24465689  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 913  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||    
T  24465690 ctttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaactcattgat 24465735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 641 - 862
Target Start/End: Original strand, 22392400 - 22392608
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || ||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  22392400 cagatttgttccaaattgtaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttata-- 22392497  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
          ||  ||||||||||||||||||| |||| || || | |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22392498 ------aatcaaactagggtttgtatagaatttg-ctattggcaacaaacactagggt---tgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 22392586  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagat 862  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  22392587 tctcttggtcacgggaagagat 22392608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 439 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 40837263 - 40837144
Alignment:
Q  439 actgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactg 538  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  40837263 actgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggtcggacaacgtggcacgatggaggtttcagttttttaggcaaggcactg 40837164  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatgg 558  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  40837163 gaaaaatcgtggcacgatgg 40837144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 439 - 588
Target Start/End: Original strand, 3878320 - 3878469
Alignment:
Q  439 actgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcact 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||| |   |||  ||||| |||||    
T  3878320 actgtgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttca-agtttgaggcaaagcact 3878418  T
Q  538 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  3878419 ggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtacgctggc 3878469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 667 - 1007
Target Start/End: Original strand, 6332179 - 6332516
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggca-acaacaaaactagggtttgt 764  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| || || ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||| | |||||||||      
T  6332179 acttttactataaatataaaacttgtatcagagtaacctt-gagagagagggggctggaaacaagggtttataaa--catacaacaga-ctagggttt-- 6332272  T
Q  765 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 864  Q
    |||||||||  ||||| | ||||||||||||| ||    | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||    
T  6332273 atagagttta-ctcttggcaacaaacactaggattga--gattgattcagtttggaaaacactattaagattg-agtctcttggtcacaagaagagattg 6332368  T
Q  865 ggactttgggtagaattaggc-gggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctct 961  Q
     |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| || || |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | ||| |||    
T  6332369 agactttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaagactgttct 6332468  T
Q  962 ctcccccagactaggtcag-attggatcgaact-ggtcaacaaatttc 1007  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  6332469 ctcccctagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 6332516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 441 - 558
Target Start/End: Original strand, 26804345 - 26804462
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||| ||||||||| || ||||  ||||||||| |||    
T  26804345 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggtacgattggaggtttcag-ttttgaggcaaggcagtgg 26804443  T
Q  540 aaaaatcgtggcacgatgg 558  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26804444 aaaaatcgtggcacgatgg 26804462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 724 - 1019
Target Start/End: Original strand, 11081522 - 11081816
Alignment:
Q  724 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 823  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||| | ||||||||||||||||    | ||||||||| ||||||||    
T  11081522 aaacaagggtttagaa-gccaacaacaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcactttgggaaa 11081615  T
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc--attgatttctctt 920  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||   | ||||| |||||||||||||   ||||| ||||||    
T  11081616 cactattaggatt-gagtctcttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttttgatatctctt 11081714  T
Q  921 -tgtaacggtactcatc-atatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtc-agattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttc 1016  Q
     ||||| | ||||||||  || | ||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  11081715 gtgtaaagttactcatctttaaaatggaacggatggttgctctctcccccagactaggtcaatattggaccgaactgggtaaacaaattt-tgtgtgttc 11081813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 869 - 1019
Target Start/End: Original strand, 22393876 - 22394029
Alignment:
Q  869 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |  |||||| || ||||||||    
T  22393876 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgttctctccc 22393975  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    | |||||||||||  ||||| | |||| ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  22393976 ctagactaggtcaatttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttctct 22394029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 441 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 27306767 - 27306624
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 539  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||| || ||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||  || |||| || |||    
T  27306767 tgtgagagttaacttaaaataaggttt-tgcaaaatcgtggcacgatggctggacaacgtggcacgattggaggtttcagttttgagg-caagtcattgg 27306670  T
Q  540 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgct 585  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  27306669 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcttcgtggcacgatggtgcgct 27306624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 806 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297004
Alignment:
Q  806 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattag-gcgggagacttattcttgtaa 904  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    | ||| | ||||||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagatttgaagattgattcttgtaa 16297124  T
Q  905 ccc-attgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggatcgaactg-gtcaa 999  Q
    |||  || || |||| |||| || | ||||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| || ||    
T  16297123 cccttttaatatctcttttgcaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcccctagactatgtcagtattggaccgaactgtgtaaa 16297024  T
Q  1000 caaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  16297023 caaatttccgtgtgttctct 16297004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 848 - 979
Target Start/End: Original strand, 26295580 - 26295713
Alignment:
Q  848 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtgg 945  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||     
T  26295580 gttacaggaagcgattgtgactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtga 26295679  T
Q  946 attggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |   || | ||||||||||| |||||||||||||    
T  26295680 aacagatgactgctctctcctccagactaggtca 26295713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 670 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 7094759 - 7094662
Alignment:
Q  670 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 763  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  7094759 tttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaacatagggtttg 7094662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 441 - 588
Target Start/End: Original strand, 25542281 - 25542427
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 539  Q
    |||||||||||||||||||||| | | || ||| |  |||||||||  | ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||  || ||||||||| |    
T  25542281 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaatgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttaagg-caaggcacttg 25542378  T
Q  540 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  25542379 aaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 25542427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 863 - 980
Target Start/End: Original strand, 6046641 - 6046760
Alignment:
Q  863 tgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctc 960  Q
    ||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  6046641 tgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaacctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaatgaagagctgctc 6046740  T
Q  961 tctcccccagactaggtcag 980  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6046741 tctcccccagactaggtcag 6046760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 724 - 938
Target Start/End: Original strand, 6048885 - 6049094
Alignment:
Q  724 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttg-ggaa 822  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||| |   |||||| | ||||||||||| |||||| || |||||||||||||  |||    
T  6048885 aaacaagggtttagaa-gccaacatcaaaactagggtttgtaaagaat---tctcttggcaacaaacacta-ggtttg-ggattgattcaccttgaagaa 6048978  T
Q  823 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 921  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||   | |||| ||||||| |||||| ||||| || ||||    
T  6048979 acactattaggatt-gaatctcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattaggtttgaagacgtattcttataaccctttgatatcccttt 6049077  T
Q  922 gtaacggtactcatcat 938  Q
    |||| | ||||||||||    
T  6049078 gtaaagttactcatcat 6049094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 670 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 7092512 - 7092414
Alignment:
Q  670 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa-actagggtttg 763  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  7092512 tttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatggagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaacactagggtttg 7092414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 714 - 775
Target Start/End: Original strand, 38396316 - 38396377
Alignment:
Q  714 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 775  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38396316 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgt 38396377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 845 - 921
Target Start/End: Original strand, 6348912 - 6348988
Alignment:
Q  845 ttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 921  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  6348912 ttggtcacgggaaaagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttt 6348988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Original strand, 25351353 - 25351508
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  25351353 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctct 25351447  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  25351448 ttgtaaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgttctctcccccagactaggtca 25351508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 441 - 588
Target Start/End: Original strand, 44314 - 44461
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 538  Q
    |||||||||||||||||||||| | | || ||| |||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||| |  |||   | ||| ||||||    
T  44314 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaatcgtggcacgatttctgggcaatgtggcacgattggaggtttcaagtttgacg-caaagcactg 44411  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44412 gaaaaatcatggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 44461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 441 - 588
Target Start/End: Original strand, 18567363 - 18567510
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaa-tcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 538  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||  || |||| |||||    
T  18567363 tgtgagagttgacttaaaatcaggtt-ctacagaaatcgtggcacgatagctgggcaaagtggcacgattggaggtttcagttttgagg-caagtcactg 18567460  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    ||    |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  18567461 gatttttcgtggcacgatggggtcacaacttggcacgatggtgcgctggc 18567510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 441 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 31435586 - 31435439
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaa-tcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 538  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||  || |||| |||||    
T  31435586 tgtgagagttgacttaaaatcaggtt-ctacagaaatcgtggcacgatagctgggcaaagtggcacgattggaggtttcagttttgagg-caagtcactg 31435489  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    ||    |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  31435488 gatttttcgtggcacgatggggtcacaacttggcacgatggtgcgctggc 31435439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 805 - 979
Target Start/End: Original strand, 2120881 - 2121056
Alignment:
Q  805 gttgattcaccttggg--aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttg 901  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||    
T  2120881 gttgattcaccttggacaaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttg 2120978  T
Q  902 taacccattgatttctctttgtaacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||| ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2120979 taactca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 2121056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 441 - 588
Target Start/End: Original strand, 35379 - 35526
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 538  Q
    |||||||||||||||||||||| | | || ||| |||||||||||||  | | ||||| |||||||||| |||||||| |  |||  || ||| ||||||    
T  35379 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaatcgtggcacgattgctaggcaacgtggcacgattggaggtttcaagtttgagg-caaagcactg 35476  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  35477 gaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcccgatcgtgcgctggc 35526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 667 - 716
Target Start/End: Original strand, 1606423 - 1606472
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1606423 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 1606472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 668 - 884
Target Start/End: Original strand, 26210500 - 26210710
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||| || |||||  ||||||||| |||||||   ||||  |||||||||||||||||     
T  26210500 cttttagtataaatatagaacttgtatcaaatgtaaaccttgagagag-gggggaggaaacaaggttttagaatc-caacctcaaaactagggtttgtag 26210597  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-g 864  Q
    ||| ||   ||||| | ||||| |||||||||| |||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |    
T  26210598 agaatt---ctcttggcaacaa-cactagggtt-gtga-ttgattcaccttggagaaatactattaggattg-agtctcttggtaacggaaagagattcg 26210690  T
Q  865 ggactttgggtagaattagg 884  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  26210691 ggactttcggtagaattagg 26210710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 3320232 - 3320076
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  3320232 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctct 3320138  T
Q  920 ttgtaacggtactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3320137 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 3320076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 3324980 - 3324824
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  3324980 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctct 3324886  T
Q  920 ttgtaacggtactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3324885 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 3324824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Original strand, 25405393 - 25405549
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  25405393 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctct 25405487  T
Q  920 ttgtaacggtactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25405488 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 25405549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 809 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 40281572 - 40281466
Alignment:
Q  809 attcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc 907  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  40281572 attcaccttgggaaacaccgttaggattg-agtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccc 40281474  T
Q  908 attgattt 915  Q
     |||||||    
T  40281473 tttgattt 40281466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 806 - 884
Target Start/End: Original strand, 11084467 - 11084544
Alignment:
Q  806 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  11084467 ttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgagaagagattcgaactttgggtaaaattagg 11084544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Original strand, 25357047 - 25357202
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  25357047 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctct 25357141  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||||||| ||||||||| | || | || |||||||||||||||||||||    
T  25357142 ttgtaaagaaactcatcattatagtggatcgaagagatgatctctcccccagactaggtca 25357202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Original strand, 25410130 - 25410287
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  25410130 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctct 25410224  T
Q  920 ttgtaacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||  |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25410225 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 25410287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Original strand, 7069780 - 7069936
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  7069780 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctct 7069874  T
Q  920 ttgtaacggtactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  7069875 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtca 7069936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Original strand, 7074787 - 7074943
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  7074787 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctct 7074881  T
Q  920 ttgtaacggtactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||| ||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  7074882 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgcactctcccccagactaggtca 7074943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 940 - 995
Target Start/End: Original strand, 9190038 - 9190093
Alignment:
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9190038 tagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgg 9190093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 940 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 20284156 - 20284101
Alignment:
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  20284156 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 20284101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 940 - 995
Target Start/End: Original strand, 33332480 - 33332535
Alignment:
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  33332480 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgg 33332535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 21983352 - 21983296
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  21983352 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 21983296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 46516339 - 46516395
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  46516339 atagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgg 46516395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 940 - 991
Target Start/End: Complemental strand, 2580457 - 2580406
Alignment:
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaa 991  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  2580457 tagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaa 2580406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 669 - 736
Target Start/End: Original strand, 3677235 - 3677301
Alignment:
Q  669 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttta 736  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3677235 ttttactataaatatagatcttgaatcagagtaaacttggagataga-ggggctgaaacaagggttta 3677301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 674 - 799
Target Start/End: Original strand, 6348778 - 6348903
Alignment:
Q  674 ctataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 771  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | | |||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |  || || ||||||||||||||||| ||||    
T  6348778 ctataaatataaaccttgtatcagatgtaaacattgagatagagaggactgaaaacaagggtttagaa-gtaaaaaagaaaactagggtttgtatcgagt 6348876  T
Q  772 ttgtctcttcggaacaaacactagggtt 799  Q
    ||| ||||| | |||||||| |||||||    
T  6348877 ttg-ctcttggcaacaaacattagggtt 6348903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 821 - 884
Target Start/End: Original strand, 21369642 - 21369703
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  21369642 aaacactattaggattg-agtctcttggttacggaaagagattgggac-ttgggtaaaattagg 21369703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 940 - 995
Target Start/End: Original strand, 28617255 - 28617310
Alignment:
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  28617255 tagtggattggagagctgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgg 28617310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 939 - 985
Target Start/End: Original strand, 2647725 - 2647771
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattgg 985  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  2647725 atagtggattggagggctgctctctcccccagaataggtcatattgg 2647771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 667 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 30906386 - 30906264
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 765  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | || |||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  |||  |  ||||||| |||||||    
T  30906386 acttttgctataaatatagaccttgtataagagtaaatcttgagatagagggggctgaaaacaagaatttagaaa--caaataacaaactagagtttgta 30906289  T
Q  766 tagagtttgtctcttcggaacaaaca 791  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  30906288 tagagtttg-ctcttagcaacaaaca 30906264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 8378686 - 8378529
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  8378686 aaacactattaagattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctct 8378592  T
Q  920 ttgtaacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||  |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  8378591 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagttgctctctcccccagactaggtca 8378529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 56015 - 55960
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  56015 atagtggattggagggctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgg 55960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 441 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 1049813 - 1049699
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 538  Q
    |||||||||||||||||||||| | | || ||| |||||||||||||  | ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||   | ||||| ||||    
T  1049813 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttgaag-caaggtactg 1049716  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacga 555  Q
    |||||||||||||||||    
T  1049715 gaaaaatcgtggcacga 1049699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 667 - 711
Target Start/End: Original strand, 1849918 - 1849962
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 711  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1849918 acttttactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgaga 1849962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 839 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 6067365 - 6067222
Alignment:
Q  839 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt-aacggtactcatc 936  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||   | ||||| |||||||||| ||  |||| ||||||||| || || |||| ||    
T  6067365 agtctcttggtcacgggaagagattgagacttt-gatagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctctgatatctctttgtaaaaggaactcgtc 6067267  T
Q  937 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag 980  Q
    | ||||||| |  |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6067266 attatagtgaaacggagagctgctctctcccccatactaggtcag 6067222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 29159871 - 29159815
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  29159871 atagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgg 29159815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 939 - 1002
Target Start/End: Complemental strand, 35960884 - 35960820
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaa 1002  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||    
T  35960884 atagtggtttggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactcggtcaacaa 35960820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 940 - 995
Target Start/End: Original strand, 9185195 - 9185250
Alignment:
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  9185195 tagtggattggagagcttctctctcccccagactaggttatattggaccgaactgg 9185250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 951 - 1017
Target Start/End: Original strand, 11759364 - 11759431
Alignment:
Q  951 agggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  11759364 agggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11759431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 15541177 - 15541021
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| |||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  15541177 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtataattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctct 15541083  T
Q  920 ttgtaacggtactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||| ||| ||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15541082 ttgtaaagaaactcattcattatagtgtatcgtagagctgctctctcccccagactaggtca 15541021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 821 - 884
Target Start/End: Original strand, 42006663 - 42006724
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  42006663 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 42006724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 824 - 979
Target Start/End: Original strand, 30246973 - 30247127
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 922  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||  ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  30246973 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagaccgattcttgtaactca---atatctctttg 30247067  T
Q  923 taacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    ||| |  ||||  |||| |||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  30247068 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctatctcccccagactaggtca 30247127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 784 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 12310234 - 12310157
Alignment:
Q  784 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt 863  Q
    |||||||||||||||| |  | |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  12310234 aacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgaacaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagatt 12310157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 534 - 611
Target Start/End: Original strand, 40946167 - 40946244
Alignment:
Q  534 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttt 611  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||  |||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||| |||||||    
T  40946167 cactggaaaaatcgtgtcacgattggatcgaatcgtgccacgatggtgcgattgaagataaaaataaaacatattttt 40946244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 4796696 - 4796752
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  4796696 atagtggatttgagggctgctttctcccccagattaggtcattttggaccgaactgg 4796752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 824 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 44512704 - 44512646
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  44512704 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 44512646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 44848713 - 44848769
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||| | ||||||||    
T  44848713 atagtggattggagagctgctctctcccccaggttaggtcatattgaaccgaactgg 44848769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 938 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 21639877 - 21639830
Alignment:
Q  938 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattgg 985  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  21639877 tatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 21639830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 940 - 994
Target Start/End: Original strand, 5817300 - 5817353
Alignment:
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactg 994  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  5817300 tagtggattggagagctgctctct-ccccagagtaggtcatattggaccgaactg 5817353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 966 - 1019
Target Start/End: Original strand, 26804762 - 26804816
Alignment:
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  26804762 cccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 26804816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 938 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 34546946 - 34546905
Alignment:
Q  938 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34546946 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 34546905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 667 - 696
Target Start/End: Original strand, 38396239 - 38396268
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatca 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396239 acttttactataaatatagaccttgtatca 38396268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 938 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 44010816 - 44010775
Alignment:
Q  938 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44010816 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 44010775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 824 - 873
Target Start/End: Complemental strand, 44144045 - 44143997
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgg 873  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  44144045 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg 44143997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 403; Significance: 0; HSPs: 106)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 440 - 1017
Target Start/End: Original strand, 18810482 - 18811057
Alignment:
Q  440 ctgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18810482 ctgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttatttttttaggcaaggcactgg 18810581  T
Q  540 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgtt 639  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||| |||||      
T  18810582 aaaaattgcggcacgatggggtcacatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacacattttt-gggtgcagatttgttacagattttgag 18810680  T
Q  640 acagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 739  Q
     ||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18810681 -cagatttgttacaaattttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 18810779  T
Q  740 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 839  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18810780 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 18810878  T
Q  840 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 939  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18810879 gtctcttggttacgggaataggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcata 18810978  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  18810979 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 18811057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 441 - 1017
Target Start/End: Original strand, 43081722 - 43082323
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43081722 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggcaaggcaaagtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 43081821  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttt----- 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||         
T  43081822 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtacgctggcggataaaaataaaacgta-tctttgggagcagatttgttatagttttgttac 43081920  T
Q  636 ---tgtta--cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----------------tag 714  Q
       | |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |  || ||||                |||    
T  43081921 agattttaagcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatc-aggctattttggagagagagatagagagagatag 43082019  T
Q  715 agggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac 814  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43082020 agggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac 43082119  T
Q  815 cttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatt 914  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43082120 cttgggaaacactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatt 43082219  T
Q  915 tctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtg 1013  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  43082220 tctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtg 43082319  T
Q  1014 ttct 1017  Q
    ||||    
T  43082320 ttct 43082323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 441 - 1017
Target Start/End: Original strand, 18812668 - 18813231
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18812668 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgaagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttaggcaaggcactgga 18812767  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 640  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||       
T  18812768 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacata-tttttgggtgcagatttgttacagattttg-ag 18812865  T
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    ||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18812866 cagatttgttacaaattttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaa 18812965  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    ||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18812966 ggcaacaacaaaac-----------tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 18813053  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatat 940  Q
    |||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18813054 tctcttgggtacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatat 18813153  T
Q  941 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  18813154 agtggattggagggctgctctctcccccatattaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 18813231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 441 - 1017
Target Start/End: Original strand, 44720617 - 44721193
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggttt-ctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 538  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||  | |||||| ||||||||| | |||||||| ||||||  || ||||| ||||    
T  44720617 tgtgagagttaacttaaaatcaggttttctgcagaatcgtggcatgattgctgggcattgtggcacgtttggaggtttcagttttgagg-caaggtactg 44720715  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgt 638  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||   |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||      
T  44720716 gaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcaaaaacagaaacatattttt-gggtgcagatttgttacagattttaa 44720814  T
Q  639 tacagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttaga 738  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44720815 g-cagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttatatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttaga 44720913  T
Q  739 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattg 837  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  44720914 aaggcaacaacaaaactatgttttgtatagagtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaacactattaggatt- 44721012  T
Q  838 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatca 937  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44721013 gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatca 44721112  T
Q  938 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44721113 tatagtggattggagagctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 44721193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Original strand, 27829270 - 27829646
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829270 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 27829369  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27829370 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 27829468  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatat 940  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27829469 tctcttggttacgggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatat 27829568  T
Q  941 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  27829569 agtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27829646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 716 - 1017
Target Start/End: Original strand, 43079650 - 43079952
Alignment:
Q  716 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 815  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43079650 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 43079749  T
Q  816 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 915  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43079750 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 43079849  T
Q  916 ctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgt 1014  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  43079850 ctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 43079949  T
Q  1015 tct 1017  Q
    |||    
T  43079950 tct 43079952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Original strand, 27826959 - 27827335
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27826959 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 27827058  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27827059 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 27827157  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatat 940  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27827158 tctcttggttacaggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatat 27827257  T
Q  941 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  27827258 agtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27827335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 667 - 1008
Target Start/End: Complemental strand, 24873523 - 24873175
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 760  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24873523 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 24873424  T
Q  761 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 860  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24873423 ttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagag 24873324  T
Q  861 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctc 960  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24873323 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccgattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 24873224  T
Q  961 tctcccccagactaggtcagattggatcgaactg-gtcaacaaatttct 1008  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  24873223 tctcccccatactaggtcagattggaccgaattgagtcaacaaatttct 24873175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 641 - 968
Target Start/End: Original strand, 14807724 - 14808051
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807724 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 14807823  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14807824 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 14807922  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  14807923 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 14808022  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctccccc 968  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14808023 tagtggaacggagggctgctctctccccc 14808051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Original strand, 4423991 - 4424368
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4423991 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatacagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaa 4424090  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  4424091 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaaacactattaggatt-gag 4424189  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||    
T  4424190 tctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttatcttttgtaacattactcatcata 4424289  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  4424290 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4424368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 641 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 28251929 - 28251550
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  28251929 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaat 28251830  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28251829 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 28251731  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  28251730 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttataacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcata 28251631  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  28251630 tagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 28251550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Original strand, 32339304 - 32339659
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 762  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339304 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 32339403  T
Q  763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 862  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32339404 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagat 32339502  T
Q  863 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 961  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32339503 tggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 32339602  T
Q  962 ctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| ||||||||  ||||||||||    
T  32339603 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggttaacaaattcttttgtgttct 32339659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 644 - 1019
Target Start/End: Original strand, 15072686 - 15073063
Alignment:
Q  644 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 743  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15072686 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 15072785  T
Q  744 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtct 843  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15072786 aacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtct 15072884  T
Q  844 cttggttacgggaaga-gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatata 941  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  15072885 cttggttacgagaagagggttgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcataca 15072984  T
Q  942 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  15072985 gtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctct 15073063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Original strand, 3874005 - 3874360
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 762  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  3874005 acttttactataaatatagactttgtatcaggctaaactttgagagagatagcgggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaagttt 3874104  T
Q  763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 862  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||      
T  3874105 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-tagtctcttggttacgggaagaggc 3874203  T
Q  863 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 961  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3874204 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 3874303  T
Q  962 ctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  3874304 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3874360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Original strand, 15809214 - 15809568
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 762  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809214 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 15809313  T
Q  763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 862  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  15809314 gtatagagtttgtct-tttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaaac 15809411  T
Q  863 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 961  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15809412 taggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 15809511  T
Q  962 ctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    || |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  15809512 cttccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 15809568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 641 - 1016
Target Start/End: Original strand, 15067954 - 15068330
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15067954 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataaaccttgtatcaacctaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaa 15068053  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  15068054 ggcaacaacaaaaccagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaatactattaggatt-gag 15068152  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  15068153 tcttttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 15068252  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttc 1016  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||| || |||||||||  |||||||||    
T  15068253 taatggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggccaacaaattcttttgtgttc 15068330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 227; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 28283561 - 28283206
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 760  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28283561 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggt 28283462  T
Q  761 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 860  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  28283461 ttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgggaagag 28283363  T
Q  861 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctc 960  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28283362 attggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 28283263  T
Q  961 tctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||| |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  28283262 tct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28283206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 668 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 27107232 - 27106884
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27107232 cttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 27107133  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27107132 gagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgtga 27107034  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||  | |||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||     
T  27107033 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatagatatctcttttgtagggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctatctcct 27106934  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgtt 1015  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||    
T  27106933 ccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgtt 27106884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 30480838 - 30480486
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  30480838 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtata 30480739  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  30480738 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagagattgagg 30480640  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  30480639 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaaatggatggctgctctctccc 30480540  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  30480539 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 30480486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 677 - 1017
Target Start/End: Original strand, 608735 - 609085
Alignment:
Q  677 taaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 768  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  608735 taaatatagaccttatatcatagcaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaattagggtttgtatag 608834  T
Q  769 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggac 868  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  608835 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgggac 608933  T
Q  869 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 967  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  608934 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc 609033  T
Q  968 cagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatt-tctttgtgttct 1017  Q
    ||||||| ||||  ||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  609034 cagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttttgtgttct 609085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 22685002 - 22684638
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 756  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||          |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22685002 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaacta 22684903  T
Q  757 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggga 856  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22684902 gggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggga 22684804  T
Q  857 agagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc---attgatttctct-ttgtaacggtactcatcatatagtggattggag 952  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  22684803 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccaatattgatttctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacggag 22684704  T
Q  953 ggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  22684703 ggctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22684638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 14419527 - 14419173
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14419527 acttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtat 14419428  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14419427 agagtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatt-gagtctcttggttacgggaagagattggg 14419329  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||| | ||||||||| ||||||| |   || ||||||||||||    
T  14419328 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatgtcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggctgctctctc 14419229  T
Q  965 ccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  14419228 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 14419173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Original strand, 1225165 - 1225519
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  1225165 acttttactataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 1225264  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1225265 agagtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggg 1225363  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||| ||| ||||||||    
T  1225364 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggccgctctctc 1225463  T
Q  965 ccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    || || |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  1225464 cctcatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctct 1225519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Original strand, 27911014 - 27911365
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27911014 acttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa-ggcaacaacaaaactagggtttgtat 27911112  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27911113 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggg 27911211  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||| |  |||||| |||||||| |    
T  27911212 actttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctct-c 27911310  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||| ||||  ||||| |||||| |||||| |||||  |||||| |||||    
T  27911311 cccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattcttttgtgctctct 27911365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Original strand, 27957433 - 27957784
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27957433 acttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa-ggcaacaacaaaactagggtttgtat 27957531  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27957532 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggg 27957630  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||| |  |||||| |||||||| |    
T  27957631 actttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctct-c 27957729  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||| ||||  ||||| |||||| |||||| |||||  |||||| |||||    
T  27957730 cccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattcttttgtgctctct 27957784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 667 - 1018
Target Start/End: Complemental strand, 13858820 - 13858469
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13858820 acttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 13858721  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13858720 agagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggttacgggaagagattggg 13858622  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||    
T  13858621 gctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagcccatt-atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctc 13858523  T
Q  965 ccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctc 1018  Q
    |||||||||||||||  |||||  ||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  13858522 ccccagactaggtcaatttggacagaactgggtaaacaaa-ttctttgtgttctc 13858469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Original strand, 41384744 - 41385096
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  41384744 acttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaaattgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtat 41384842  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  41384843 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacaccattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgga 41384941  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
     |||| |||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||    
T  41384942 gctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc 41385041  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||    
T  41385042 cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttctgttctct 41385096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Original strand, 43530123 - 43530465
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 762  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||                 
T  43530123 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaac------------- 43530209  T
Q  763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 862  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||      
T  43530210 gtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctctcggttacgggaagaggc 43530308  T
Q  863 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 961  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  43530309 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccattgatttctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctgt 43530408  T
Q  962 ctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  43530409 ctctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 43530465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 668 - 913
Target Start/End: Original strand, 14477276 - 14477520
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14477276 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 14477375  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
     |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14477376 aagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgaga 14477474  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 913  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14477475 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgat 14477520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 669 - 995
Target Start/End: Original strand, 36865538 - 36865864
Alignment:
Q  669 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36865538 ttttactataaatatagacattgtatcagatgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 36865637  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   | ||||||||||||||| |    
T  36865638 gagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctct---tcacgggaagagattggaa 36865733  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||    
T  36865734 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcc 36865833  T
Q  966 ccc-agactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||| |||||||||||  ||||| ||||||||    
T  36865834 cccaagactaggtcaatttggaccgaactgg 36865864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Original strand, 25952521 - 25952873
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  25952521 cttttactataaatataagctttgtatcagaggaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaataaaattaggg-ttgtata 25952619  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
     |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  25952620 tagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacaatattaggatt-gagtctcttggttacgagaagaaattgaga 25952718  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||   ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  25952719 cattgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcc 25952818  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||||| |  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  25952819 cccagactaggtaaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctct 25952873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 177; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Original strand, 41382672 - 41383014
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  41382672 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagatggggctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtat 41382771  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||           |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41382772 agaatttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacct-----------attatgattg-agtctcttggttacgggaagagattggg 41382859  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||    
T  41382860 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc 41382959  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  41382960 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctct 41383014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 441 - 696
Target Start/End: Original strand, 43079347 - 43079614
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43079347 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggcaaggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 43079446  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgtt- 639  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||     
T  43079447 aaaatcgtggtacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgta-tctttgggagcagatttgttatagttttttttt 43079545  T
Q  640 ------------acagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatca 696  Q
                 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43079546 tacagattttaagcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatca 43079614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 668 - 994
Target Start/End: Complemental strand, 5372512 - 5372185
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||  | |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  5372512 cttttactataattatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttatata 5372414  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5372413 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagagattggga 5372315  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctct-c 964  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||| | ||||||||| ||||||| |  |||||| | |||||| |    
T  5372314 ctttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttactctctcc 5372215  T
Q  965 ccccagactaggtcagattggatcgaactg 994  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  5372214 ccccagactaggtcaatttggaccgaactg 5372185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 668 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 33541723 - 33541507
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33541723 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 33541624  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33541623 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggatt-gagtatcttggttacgggaagagattggga 33541525  T
Q  868 ctttgggtagaattaggc 885  Q
    |||| |||||||||||||    
T  33541524 cttttggtagaattaggc 33541507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 668 - 1007
Target Start/End: Original strand, 21482322 - 21482651
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||    
T  21482322 cttttactataaatatagaatttgtatcagagtaaactttgagatagagtggactgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtata 21482413  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
     |||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  21482414 aagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgagtcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttatgggaagagattgggg 21482508  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||  | |  |||||||||||||||||    
T  21482509 ctttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataaagaaacggagggctgctctctcc 21482608  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttc 1007  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  21482609 cccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatttc 21482651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 15186046 - 15185697
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||| |||    
T  15186046 acttttactataaatataaactttgtatcagagtaaaccttgagataaaggtgactgaaacaagggtttagaaagaaaataacaaaactatggtttatat 15185947  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-gagtctcttggttacgggaagagattgg 865  Q
    | |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||        
T  15185946 aaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtaaaacactattagaattgagtctctcttggttacgggaagaga---- 15185851  T
Q  866 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctct 963  Q
       |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||||||| ||||||| |  ||||| ||| |||||    
T  15185850 ---tttgggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctcttttttaaggttactcatcattatagtgaaacggaggactgttctct 15185754  T
Q  964 cccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||| |||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||    
T  15185753 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttttgttctct 15185697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 667 - 1020
Target Start/End: Original strand, 31162212 - 31162565
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaa-caacaaaactagggtttgt 764  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||  ||| |||||||  ||| ||||||    
T  31162212 acttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaaccttgagaaagagggggctaaaaacaaaggtttagaaa--caagcaacaaat-tagtgtttgt 31162308  T
Q  765 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 864  Q
    ||| |||||| ||||| | |||||||||||  ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  31162309 ataaagtttg-ctcttggcaacaaacactaacgttag--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcaccggaagagattg 31162404  T
Q  865 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctc 962  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||   ||||||||| |||||||||   |||||||||||||    
T  31162405 ggactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacagagggctgctctc 31162504  T
Q  963 t--cccccagactaggtcag-attggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctctt 1020  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||  |||||||||||    
T  31162505 tcccccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc-gtgtgttctctt 31162565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 668 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 5623073 - 5622877
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5623073 cttttactataaatataggttttgtatcagaataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 5622974  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 865  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  5622973 gagtttgtctattgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctttggaaacattatttggatt-gagtctcttgattacgggaagagattgg 5622877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 667 - 846
Target Start/End: Original strand, 26775200 - 26775378
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26775200 acttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaatactagggtttgtat 26775299  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctctt 846  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  26775300 atagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttggaaaacactattagaatt-gagtctctt 26775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 701 - 995
Target Start/End: Original strand, 21480547 - 21480830
Alignment:
Q  701 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 800  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||| ||     
T  21480547 aaaccttgagatagatggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatggagtttg-ctcttggcaacaaacactaggttt- 21480636  T
Q  801 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 900  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21480637 --gggttgattcaccttgggaaacactattagaattg-agtctcttggttacgggaagatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttattctt 21480733  T
Q  901 gtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  21480734 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaacgaactgg 21480830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 758 - 1019
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956310
Alignment:
Q  758 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaa 857  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||| |||||||    
T  15956051 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaa-tcttttggtcacgggaa 15956145  T
Q  858 gagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggc 955  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |  ||||||     
T  15956146 gagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggt 15956245  T
Q  956 tgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    | ||||||||| |||| |||||||  |||||  ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||    
T  15956246 ttctctctccctcagattaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtattctct 15956310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 701 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 3005929 - 3005654
Alignment:
Q  701 aaactttgagatagagggggct-gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtt 799  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||  |  ||||||| |||||||||||||||| |||||   |||||||| ||||||     
T  3005929 aaaccttgagatagagggggctggaaacaagggtttagaaa--caaataacaaactagagtttgtatagagtttg-ctcttaacaacaaacaatagggt- 3005834  T
Q  800 tgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattct 899  Q
      ||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3005833 --tggattgattcactttggaaaacactattagcatt-gagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattct 3005737  T
Q  900 tgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag 980  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||| | | ||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  3005736 tgtaatccattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaacggaggggtgctctctcccccagaccaggtcag 3005654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 668 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 35872713 - 35872555
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||    
T  35872713 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaac-----tagggtttgtata 35872619  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatta 831  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35872618 gagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 35872555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 644 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 3886277 - 3886153
Alignment:
Q  644 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 743  Q
    ||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3886277 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 3886178  T
Q  744 aacaacaaaactagggtttgtatag 768  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3886177 aacaacaaaactagggtttgtatag 3886153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 644 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 12517385 - 12517248
Alignment:
Q  644 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaag 741  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12517385 atttgttccaaattttaagcgatacttttactatatatatataccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 12517286  T
Q  742 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 779  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12517285 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 12517248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 791 - 939
Target Start/End: Original strand, 181622 - 181772
Alignment:
Q  791 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt-aggattggagtctcttggttacg--ggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 887  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  181622 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatttaggatta-agtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcgg 181720  T
Q  888 gagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 939  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  181721 aagacttattcttgtaacccattgatatctctttgtaaagttactcatcata 181772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 803 - 1007
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035461
Alignment:
Q  803 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttg 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   || ||||||||||||    
T  31035252 gggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattg-agtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttg 31035350  T
Q  902 taacccattgatttctctttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagac--taggtcag-attggatcgaact-ggt 996  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||| |||    
T  31035351 taaccctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactataggtcagtattggaccgaactgggt 31035450  T
Q  997 caacaaatttc 1007  Q
     ||||||||||    
T  31035451 aaacaaatttc 31035461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 701 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 37214512 - 37214317
Alignment:
Q  701 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaact-------------------agggtttgtatagagtttgtctcttc 781  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   |||||||||||||||||||||||||     
T  37214512 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttggttacgggaagagattgagggtttgtatagagtttgtctcttt 37214413  T
Q  782 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaatt 881  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||          | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  37214412 ggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaaca----------ttgagtctcttggttacgggaagcgattggaactttgggtagaatt 37214323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 445 - 588
Target Start/End: Original strand, 14807552 - 14807695
Alignment:
Q  445 agagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||| |||||||| |  |||  || ||| |||||||||||    
T  14807552 agagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcatgatggttgggcaacgtgacacgattggaggtttcaagtttgagg-caaagcactggaaaa 14807650  T
Q  544 atcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  14807651 atcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacggtggtgcgctggc 14807695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 441 - 588
Target Start/End: Original strand, 27826782 - 27826929
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 539  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||   |||| |||||||    
T  27826782 tgtgagagttaacttaaaatcaggat-ctgcaggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcattttttgaagcaaagcactgg 27826880  T
Q  540 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27826881 aaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 27826929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 441 - 588
Target Start/End: Original strand, 27829093 - 27829240
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 539  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||||  ||||||    
T  27829093 tgtgagagttaacttaaaatcaggat-ctgcaggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcattttttgaggcaaaacactgg 27829191  T
Q  540 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27829192 aaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 27829240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 806 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578300
Alignment:
Q  806 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 904  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattg-agtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 31578378  T
Q  905 cccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag 980  Q
    ||  ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  31578377 ccttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctcccctagactaggtcag 31578300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 641 - 849
Target Start/End: Complemental strand, 2468460 - 2468261
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || || ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||      
T  2468460 cagatttgttccaaatgttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggagctgaaacaaggatttaga-- 2468363  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttg----tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 836  Q
          ||  |||||| ||||||    ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2468362 ------aatcaaactacggtttgtatatatagagtttg-ctcttggcaacaaatactagggt---tgggttgattcaccttgggaaacactattagaatt 2468273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 667 - 763
Target Start/End: Original strand, 181536 - 181632
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 763  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  181536 acttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggcttagaatggcaacaataaaactagggtttg 181632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 669 - 837
Target Start/End: Original strand, 31035068 - 31035235
Alignment:
Q  669 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga--tagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 764  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||  ||||| |  |||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  31035068 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaactttgagaggtagagagt-ctgaaaacaatggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgt 31035165  T
Q  765 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 837  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31035166 atagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--gggattgattcaccttgggaaacaccattaggattg 31035235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 724 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 31574000 - 31573847
Alignment:
Q  724 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 823  Q
    |||||| ||||||||| | |||||  ||||||||| ||||||  |||||| |||||| | ||||||||||| |||| |  | ||||||||||||||||||    
T  31574000 aaacaaaggtttagaa-gccaacacgaaaactaggatttgta--gagttt-tctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaa 31573907  T
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31573906 cactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 31573847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 441 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 12517565 - 12517418
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 538  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| ||   ||||| |||||||||| |||||||| ||||||  || ||| | ||||    
T  12517565 tgtgagagttaacttaaaatcaggat-ctgcaggaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttgagg-caatgtactg 12517468  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  12517467 gaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgtgctggc 12517418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 806 - 980
Target Start/End: Original strand, 17847661 - 17847831
Alignment:
Q  806 ttgattcaccttgg--gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 902  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||    
T  17847661 ttgattcaccttgaacgaaacactattaggattgaa-tctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 17847759  T
Q  903 aacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag 980  Q
    || || ||||| |||| |||||||    | ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17847760 aa-cctttgatatctcttttgtaa----aatcat--tatagtggaatggagggctgctctctcccccagactaggtcag 17847831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 875 - 1007
Target Start/End: Complemental strand, 2468259 - 2468124
Alignment:
Q  875 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagac 972  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| ||||||     
T  2468259 tagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctctctctcccagat 2468160  T
Q  973 taggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttc 1007  Q
    |||||||  |||||  ||||| ||| ||||||||||    
T  2468159 taggtcaatttggacagaactaggtaaacaaatttc 2468124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 462 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 3886419 - 3886322
Alignment:
Q  462 aggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatgg 558  Q
    |||||||| |||||||||| || || || ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  3886419 aggtttctgcagaatcgtgacatgatggctggacaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaagacactggaaaaatcgtggtacgatgg 3886322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 4696625 - 4696681
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4696625 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgg 4696681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 821 - 993
Target Start/End: Original strand, 6376141 - 6376315
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||  |||||||||||   || |||| |||||||| |||  ||||| |||||    
T  6376141 aaacactgttaagattg-agtctcttggtcacatgaagagattgagactttatgtagaattaggtttgaagactaattcttgttaccttttgatatctct 6376239  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggatcgaact 993  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||   || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  6376240 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacagaaggctgctctctccctcagactaggtcagtattggaccgaact 6376315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 16757449 - 16757293
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  16757449 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctct 16757355  T
Q  920 ttgtaacggtactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16757354 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 16757293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 441 - 588
Target Start/End: Original strand, 15067777 - 15067924
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 538  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||| || || |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||   | |||| |||||    
T  15067777 tgtgagtgttaacttaaaatcagattt-tgcaggaatcgtggcaagatggctgggcaacatggcacgattggaggtttcagttttgaag-caagccactg 15067874  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    |||||||| || ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  15067875 gaaaaatcatgccacgatgggatcgcaacgtggcacgatggtgcgctggc 15067924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 441 - 588
Target Start/End: Original strand, 15072506 - 15072653
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 538  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||| ||||| || ||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||   | |||| ||||     
T  15072506 tgtgagagttaacttaaaatcagatt-ctgcaggaatcgtgacacgatggctgggcaacgtgacacgattggaggtttcagttttgaag-caagccacta 15072603  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    ||||||||||| ||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||    
T  15072604 gaaaaatcgtgtcacgatgggatcgcaacgtggcatgatggtgcgctggc 15072653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 440 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 28252127 - 28251988
Alignment:
Q  440 ctgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcact 537  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| || | ||||| |||| ||||| |||||||| |  |||  || ||| |||||    
T  28252127 ctgttagagttaacttaaaatcaggat-ctgcaggaatcgtggcacgatggctaggcaacgtggtacgattggaggtttcaagtttgagg-caaagcact 28252030  T
Q  538 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatgg 579  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28252029 ggaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatgg 28251988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 821 - 907
Target Start/End: Complemental strand, 13985262 - 13985176
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 907  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  13985262 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaaactgattcttgtaaccc 13985176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Original strand, 28327908 - 28328064
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  28327908 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctct 28328002  T
Q  920 ttgtaacggtactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28328003 ttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 28328064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 9021289 - 9021132
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  9021289 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctct 9021195  T
Q  920 ttgtaacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||  |||| |||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  9021194 ttgtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctccaccagactaggtca 9021132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 9765848 - 9765904
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  9765848 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 9765904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 824 - 979
Target Start/End: Original strand, 25684646 - 25684799
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 922  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    ||||||||    
T  25684646 cactattaggattgaa-tctcttggtcacgggaagagacagggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctctttg 25684740  T
Q  923 taacggtactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    ||| |  |||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25684741 taaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 25684799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 26403259 - 26403315
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  26403259 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 26403315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 939 - 1002
Target Start/End: Original strand, 31071258 - 31071322
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaa 1002  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  31071258 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaacaa 31071322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 441 - 558
Target Start/End: Original strand, 4423835 - 4423952
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 538  Q
    |||||||||||||||||||||| | | || ||| ||||||||||| |  | ||||||| ||||||| || |||||||| ||||||  || ||||||||||    
T  4423835 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaatcgtggcacaattgctgggcaacgtggcacaattggaggtttcagttttaagg-caaggcactg 4423932  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatgg 558  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4423933 gaaaaatcgtggcacgatgg 4423952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 940 - 1002
Target Start/End: Original strand, 19752424 - 19752487
Alignment:
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaa 1002  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  19752424 tagtggattggagagctgctctctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 19752487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 907 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 33541507 - 33541393
Alignment:
Q  907 cattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaat 1004  Q
    ||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||| ||||    
T  33541507 cattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggaaggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaa-aaat 33541409  T
Q  1005 ttc-tttgtgttctct 1019  Q
    ||| ||||||||||||    
T  33541408 ttcttttgtgttctct 33541393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 824 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 29554964 - 29554810
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggag-acttattcttgtaacccattgatttctctttg 922  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||| |   ||  ||||||||||| ||| ||   || ||||||||    
T  29554964 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattatgtttgaatacttattcttggaactca---atatctctttg 29554870  T
Q  923 taacggtactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    ||| |  ||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29554869 taaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 29554810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 824 - 979
Target Start/End: Original strand, 33032657 - 33032811
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 922  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  33032657 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 33032751  T
Q  923 taacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    ||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  33032752 taaagaaactcatatcattatagtggaatggagagctgctctctctcctagactaggtca 33032811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 939 - 1007
Target Start/End: Complemental strand, 7412409 - 7412340
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttc 1007  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  7412409 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaattttc 7412340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Original strand, 28895502 - 28895659
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||| || ||   || |||||    
T  28895502 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctct 28895596  T
Q  920 ttgtaacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  28895597 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcctctagactaggtca 28895659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 939 - 1002
Target Start/End: Original strand, 19175783 - 19175847
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaa 1002  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  19175783 atagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 19175847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 23799606 - 23799662
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||| ||||||||    
T  23799606 atagtggattggagggctgctctctcctccaaattaggtcatattggaccgaactgg 23799662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 891 - 966
Target Start/End: Complemental strand, 35872553 - 35872477
Alignment:
Q  891 acttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  35872553 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 35872477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 4812669 - 4812513
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  4812669 aaacactattaggatt-gagtcttttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctct 4812575  T
Q  920 ttgtaacggtactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  | ||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  4812574 ttgtaaagaaaatcattcattatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtca 4812513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 806 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 13986011 - 13985933
Alignment:
Q  806 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattag 883  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  13986011 ttgattcaccttggagaaacactattaggatt-gagactcttaatcacgggaagagattcgggactttgggtataattag 13985933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 821 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 16752704 - 16752643
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16752704 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16752643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Original strand, 28332631 - 28332787
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  28332631 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgagaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctct 28332725  T
Q  920 ttgtaacggtactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  28332726 ttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtca 28332787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 821 - 884
Target Start/End: Original strand, 30423212 - 30423274
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  30423212 aaacacttttaggattg-agtctcttggtcgcgggaagagattggaactttggatagaattagg 30423274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 939 - 985
Target Start/End: Original strand, 1261983 - 1262029
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattgg 985  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  1261983 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgg 1262029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 958 - 1019
Target Start/End: Original strand, 14808051 - 14808113
Alignment:
Q  958 ctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  14808051 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 14808113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 939 - 992
Target Start/End: Complemental strand, 4456096 - 4456043
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaac 992  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||    
T  4456096 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggaccgaac 4456043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 938 - 979
Target Start/End: Original strand, 28890881 - 28890922
Alignment:
Q  938 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28890881 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 28890922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 824 - 884
Target Start/End: Original strand, 590797 - 590855
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  590797 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 590855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 806 - 1007
Target Start/End: Original strand, 3895957 - 3896164
Alignment:
Q  806 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagactt-attcttgta 903  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  ||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||   || | || |||||||||    
T  3895957 ttgattcactttggagaaacactattgcgattg-agtctcttcgtcacgggaagaaattgggactttgagtataattaggtttgaaaattaattcttgta 3896055  T
Q  904 acccat-tgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggatcgaactg-gtca 998  Q
    || | | |||| |||| ||||||| | ||||||||| || ||| ||  ||| ||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||| || || |    
T  3896056 actcttatgatatctcttttgtaaagttactcatcattaaagtagaacggatggctgctctctcccccatagtagatcagtattggatcgaattgagtaa 3896155  T
Q  999 acaaatttc 1007  Q
    |||||||||    
T  3896156 acaaatttc 3896164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 5702512 - 5702568
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||    
T  5702512 ataggggattggagggatgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgg 5702568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 939 - 1002
Target Start/End: Complemental strand, 6127289 - 6127225
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactg-gtcaacaa 1002  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  6127289 atagtggattggagagctgctctcttccccaaattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 6127225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 667 - 711
Target Start/End: Original strand, 6375988 - 6376032
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 711  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  6375988 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacattgaga 6376032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 953 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 37214314 - 37214251
Alignment:
Q  953 ggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgtt 1015  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  37214314 ggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 37214251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 938 - 1015
Target Start/End: Original strand, 18870590 - 18870667
Alignment:
Q  938 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgtt 1015  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||| |||||||||  ||||| |||||    
T  18870590 tatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggat-gaactgggtcaacaatcttcttggtgtt 18870667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 939 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 26287969 - 26287923
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattgg 985  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  26287969 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 26287923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 939 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 26301226 - 26301180
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattgg 985  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  26301226 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 26301180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 939 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 26313220 - 26313174
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattgg 985  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  26313220 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 26313174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 667 - 696
Target Start/End: Original strand, 17847527 - 17847556
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatca 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17847527 acttttactataaatatagaccttgtatca 17847556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 534 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 22685112 - 22685035
Alignment:
Q  534 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttt 611  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |  ||  |||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  22685112 cactggaaaaattgtgccacgatcgaatcgaatcgtgccacgatggtgcgattgaagataaaaataaaacgtattttt 22685035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 806 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 33839120 - 33839043
Alignment:
Q  806 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg-gactttgggtagaattagg 884  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  33839120 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattg-agtctcttggtca--ggaagagattcaagactttgggtagaattagg 33839043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 110)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 499 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 4816748 - 4816216
Alignment:
Q  499 gtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaa 597  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |  ||||     
T  4816748 gtggcacgattggaggtttcagttttgagg-caaggtactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgtgctggtagcaaaaac 4816650  T
Q  598 taaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgttacagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaa 697  Q
      |||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4816649 agaaacatattttttggt-gcagatttgttacagatttttaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcag 4816551  T
Q  698 agcaaactttgaga--------------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg 783  Q
       |||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816550 gctaaactttgagagagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg 4816451  T
Q  784 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattag 883  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  4816450 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 4816352  T
Q  884 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagat 982  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  4816351 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatt 4816252  T
Q  983 tggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  4816251 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4816216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 12195851 - 12195500
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12195851 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 12195752  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12195751 agagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 12195652  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12195651 actttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 12195552  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12195551 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaagtttctttgtgttct 12195500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 641 - 1005
Target Start/End: Complemental strand, 20915720 - 20915353
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt---gagatagagggggctgaaacaagggtttag 737  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915720 cagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcag-gctaaattgagagagatagagggggctgaaacaagggtttag 20915622  T
Q  738 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 837  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915621 aaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 20915522  T
Q  838 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatca 937  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915521 gagtctcttggttacgagaagagattgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatca 20915422  T
Q  938 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatt 1005  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||    
T  20915421 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 20915353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 642 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 14507536 - 14507161
Alignment:
Q  642 agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 741  Q
    ||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14507536 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaag 14507437  T
Q  742 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 841  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14507436 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 14507338  T
Q  842 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 941  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  14507337 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatacttatcatata 14507238  T
Q  942 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  14507237 gtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14507161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 673 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 19704905 - 19704552
Alignment:
Q  673 actataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag------ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19704905 actataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagatggagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 19704806  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19704805 agagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 19704706  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt--ctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19704705 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 19704606  T
Q  965 ccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  19704605 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 19704552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 641 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 11983391 - 11983012
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || ||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11983391 cagatttgtttcaaattttaaacgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaaaggcttagaaa 11983292  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11983291 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 11983193  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11983192 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 11983093  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  11983092 tagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 11983012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 28241657 - 28241306
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241657 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 28241558  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  28241557 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctggg 28241459  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  28241458 actttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcc 28241359  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||| |  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  28241358 cccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28241306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 667 - 1010
Target Start/End: Complemental strand, 26932906 - 26932554
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 758  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  26932906 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagagagatagagggggttgaaacaagggcttagaaaagcaataacaaaactagg 26932807  T
Q  759 gtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaag 858  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26932806 gtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaag 26932707  T
Q  859 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgc 958  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26932706 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgc 26932607  T
Q  959 tctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttcttt 1010  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26932606 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttcttt 26932554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 675 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 14459093 - 14458752
Alignment:
Q  675 tataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 774  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14459093 tataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 14458994  T
Q  775 tctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttggg 874  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14458993 tctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgatt--ccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 14458897  T
Q  875 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagact 973  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  14458896 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagact 14458797  T
Q  974 aggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  14458796 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14458752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 1230585 - 1230234
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230585 actttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaactttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 1230486  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||  ||||    
T  1230485 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gactctcttggttattggaagaggctggg 1230387  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  1230386 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcc 1230287  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  1230286 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1230234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 2629226 - 2628871
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag-----ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 761  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629226 acttttactataaatatagaccttgtatcatgttaaactttgagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 2629127  T
Q  762 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 861  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2629126 tgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaga 2629028  T
Q  862 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 961  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2629027 ttgggactttgggtagaattaggcggagaatttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggatcggagggctgctct 2628928  T
Q  962 ctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||  ||||||||||    
T  2628927 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 2628871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 237; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 641 - 1019
Target Start/End: Original strand, 9019878 - 9020257
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9019878 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaa 9019977  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9019978 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 9020076  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||    
T  9020077 tctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 9020176  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||| |  || |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  9020177 tagtgaaacggggggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 9020257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Original strand, 13057173 - 13057526
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13057173 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaactagggtttgtata 13057272  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13057273 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-aagtctcttggttacgggaagagattggga 13057371  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |  |||||||| ||||||||    
T  13057372 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctactctctcc 13057471  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  13057472 cccaaactaggtcaatttggaccgaactcggtcaacaaattcttttgtgttctct 13057526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 667 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 30034943 - 30034590
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 762  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30034943 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttaagagagatagagggagctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagagttt 30034844  T
Q  763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 862  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||      
T  30034843 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcaattggttaagggaagaggc 30034745  T
Q  863 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 961  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  30034744 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagcggatcggagggctgctct 30034645  T
Q  962 ctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgtt 1015  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  30034644 ctcccccagactgggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 30034590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Original strand, 30967176 - 30967530
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagc-aaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 761  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  30967176 acttttactataaatatagaccttgtat--aggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactatggtt 30967273  T
Q  762 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 861  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  30967274 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagg 30967372  T
Q  862 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctc 960  Q
     ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  30967373 ctgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctc 30967472  T
Q  961 tctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  30967473 tctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 30967530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 641 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 15541502 - 15541123
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15541502 cagatttgttccaaattttaagttacacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 15541403  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  15541402 ggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaatt-gag 15541304  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| | || ||||||||    
T  15541303 tctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtaggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcata 15541204  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||| |   ||  |||||||||||| ||||||||||| |  |||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  15541203 tagtgaaacagaaagctgctctctcctccagactaggttaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 15541123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 708 - 1019
Target Start/End: Original strand, 26065005 - 26065312
Alignment:
Q  708 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 807  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||    
T  26065005 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggtt 26065101  T
Q  808 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 907  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26065102 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 26065200  T
Q  908 attgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaattt 1006  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||     
T  26065201 attgacttctctttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatta 26065299  T
Q  1007 ctttgtgttctct 1019  Q
     ||||||||||||    
T  26065300 ttttgtgttctct 26065312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 708 - 1019
Target Start/End: Original strand, 26084974 - 26085281
Alignment:
Q  708 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 807  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||    
T  26084974 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggtt 26085070  T
Q  808 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 907  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26085071 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 26085169  T
Q  908 attgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaattt 1006  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||     
T  26085170 attgacttctctttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatta 26085268  T
Q  1007 ctttgtgttctct 1019  Q
     ||||||||||||    
T  26085269 ttttgtgttctct 26085281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 3630199 - 3629848
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3630199 cttttactataaatatagacattgtatcaatgtaaaacttgagatagagggggctgaaacatcggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 3630100  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  3630099 gagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgggaagagattgggg 3630001  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||| || |||||||| |   |||||||||||||| ||    
T  3630000 ctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactaataatatagtgaaactgagggctgctctct-cc 3629902  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  3629901 ccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 3629848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 641 - 1019
Target Start/End: Original strand, 32279949 - 32280328
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  32279949 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttcctatatatatagaccttgtatcatagtaaacttggagatagagggg-ctgaaacaagggtttaaaaa 32280047  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32280048 ggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 32280146  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatc-at 938  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||  |    
T  32280147 tctcttggttacgggaagagattgggacttcaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcgtt 32280246  T
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaac-tggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||||   |||||||||||    
T  32280247 atagtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaaaaaattctcttgtgttctct 32280328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 645 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 15530480 - 15530166
Alignment:
Q  645 tttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggca 744  Q
    |||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  15530480 tttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagagggggctgaagcaagggcttagaatggca 15530381  T
Q  745 acaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctc 844  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15530380 acaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctc 15530282  T
Q  845 ttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagt 943  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  15530281 ttggttacgggaagagattgaggctttgggttgaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagt 15530183  T
Q  944 ggattggagggctgctc 960  Q
    |||  ||||||||||||    
T  15530182 ggaacggagggctgctc 15530166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Original strand, 3390357 - 3390711
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390357 acttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 3390456  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3390457 agagtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacagaaagagattggg 3390555  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| || |||| |  ||||||||||||||||    
T  3390556 gctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtgaaacggagggctgctctctc 3390655  T
Q  965 ccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||| |||||||||  ||||| | || | ||||||||||||  |||||| |||||    
T  3390656 ccccatactaggtcaatttggaccaaattgggtcaacaaattcttttgtgatctct 3390711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 641 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 15533043 - 15532706
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15533043 cagatttgttccaaattttaagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 15532944  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  15532943 ggtaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gag 15532845  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||    
T  15532844 tctcttggtcatgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 15532745  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    ||||| |  ||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  15532744 tagtgaaacggagggctgctctat-ccctagactaggtca 15532706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Original strand, 13039733 - 13040086
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  | |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13039733 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttgtata 13039832  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13039833 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-aagtctcttggttacgggaagagattgaga 13039931  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  13039932 ctttgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcc 13040031  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    || |||||||||||  || || |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  13040032 cctagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 13040086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Original strand, 25477253 - 25477613
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25477253 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatata 25477352  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||     
T  25477353 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacggaaagagattgggg 25477451  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaa-------cggtactcatca-tatagtggattggagggctgc 958  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||       || ||||||||| ||||||| |   |||||||||    
T  25477452 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcgttactcatcattatagtgaaacagagggctgc 25477551  T
Q  959 tctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||  ||||| ||||||    
T  25477552 tctctcccccatactaggtcaatttggaccgaaatgggtcaacaaattcttttgtattctct 25477613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 641 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 30729190 - 30728811
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  30729190 cagatttgttccaaattttaagcggtacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtatcgaaa 30729091  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  30729090 gacaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gac 30728992  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga----tttctc-tttgtaacggtactcat 935  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    |||||| ||||||| | |||||||    
T  30728991 tctcttggttacgggaagaggctggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctttctcttttgtaaagttactcat 30728892  T
Q  936 catatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgtt 1015  Q
      |||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||    
T  30728891 attatagtggaacggaaggctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 30728811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 670 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 3632271 - 3631926
Alignment:
Q  670 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 769  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3632271 tttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 3632172  T
Q  770 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggact 869  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  3632171 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaaacactattaggatt-gagtctctttgttacggaaagagattgggact 3632073  T
Q  870 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccc 967  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||| |  ||    
T  3632072 ttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctgt--cc 3631975  T
Q  968 cagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgtt 1015  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  3631974 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 3631926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 788 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273201
Alignment:
Q  788 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 5273332  T
Q  888 gagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggat 987  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  5273331 gagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcttatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggac 5273232  T
Q  988 cgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  5273231 cgaactgggtcaacaaatttctcagtgttct 5273201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 439 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 26068884 - 26068590
Alignment:
Q  439 actgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactg 538  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068884 actgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggcaaggcaacgtggcatgatggaggttttagttttttgggcaaggcactg 26068785  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgt 638  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26068784 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtat-ttttgggagcagatttgttaccgtttttgt 26068686  T
Q  639 ta----------------------cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 712  Q
    ||                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068685 tacagatttgttacaaatttaaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 26068590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 668 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 3234065 - 3233754
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  3234065 cttttactataaatatagac-ttgtatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgtata 3233967  T
Q  768 gagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
     |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  3233966 tagtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgag 3233868  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||| | ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  3233867 gctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcaccgtatagtgaaacggagggctgctctctcc 3233768  T
Q  966 cccagactaggtca 979  Q
    |||| |||||||||    
T  3233767 cccacactaggtca 3233754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 641 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 19227770 - 19227514
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  19227770 cagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctcaaacaagggtttagaaa 19227671  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19227670 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 19227572  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 898  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227571 tctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 19227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 441 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 26066611 - 26066319
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26066611 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgtagaatcgtggcacgacggcaaggcaacgtggcacgatggaggttttagttatttgggcaaggcactgga 26066512  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 640  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066511 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacaatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtat-ttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 26066413  T
Q  641 c----------------------agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 712  Q
    |                      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066412 cagatttgttacaaatttaaagtagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 26066319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 441 - 665
Target Start/End: Original strand, 33310954 - 33311177
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33310954 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcttcgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 33311053  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 640  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33311054 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacata-tttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 33311152  T
Q  641 cagatttgttacagattttaagcag 665  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||    
T  33311153 cagatttgttacaaattttaggcag 33311177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 177; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 441 - 665
Target Start/End: Original strand, 33308685 - 33308908
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33308685 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcttcgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 33308784  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 640  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33308785 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacata-tttttgggagcagatttgttacattttttgtta 33308883  T
Q  641 cagatttgttacagattttaagcag 665  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||    
T  33308884 cagatttgttacaaattttaggcag 33308908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 440 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 29755280 - 29754983
Alignment:
Q  440 ctgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29755280 ctgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 29755181  T
Q  540 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgtt 639  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29755180 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacata-tttttgggagcagatttgttacagtttttgtt 29755082  T
Q  640 acagatttgttac----------------------agattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 716  Q
    |||||||||||||                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29755081 acagatttgttacaaatttaaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactctgagagagag 29754983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 820 - 1017
Target Start/End: Original strand, 33308988 - 33309185
Alignment:
Q  820 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33308988 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 33309086  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33309087 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 33309185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 820 - 1017
Target Start/End: Original strand, 33311257 - 33311454
Alignment:
Q  820 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33311257 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 33311355  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33311356 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctttctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 33311454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 668 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 24338783 - 24338435
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24338783 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgcata 24338684  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacacta-gggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
     ||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||| || ||||||||  |    
T  24338683 aagtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaaaacactattaagatt-gagtcttttggttatggaaagagattaag 24338585  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |  |||||||||  |||||    
T  24338584 actttgggtagaattagtcagaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctg--ctctc 24338487  T
Q  965 ccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgtt 1015  Q
    |||||||||| ||||  ||||| |||||| ||| ||||||| | ||||||||    
T  24338486 ccccagactatgtcaatttggaccgaactaggtaaacaaatatttttgtgtt 24338435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 820 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 29754892 - 29754694
Alignment:
Q  820 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29754892 gaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctct 29754793  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  29754792 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 29754694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 667 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 3028186 - 3027875
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 765  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  3028186 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccatgagataaaaggggctgaaaacaagggtttggaa-ggcaaca-caaaactagggtttgta 3028089  T
Q  766 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 865  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||     
T  3028088 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgtgaagagattga 3027993  T
Q  866 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctct 963  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |    
T  3027992 gactttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctcttt 3027893  T
Q  964 -cccccagactaggtcag 980  Q
     |||||||||||||||||    
T  3027892 ccccccagactaggtcag 3027875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 12161889 - 12161541
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12161889 cttttactttaaatatagacattgtatcattgtaaaccttgagataaagggg-ctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtata 12161791  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  12161790 gagtttgtctct--ggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacgttgggaaacactattaaga-tcgagtctattggttacgggaagagattgaga 12161694  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    |||| |||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||  | |||| ||||| ||||| ||    
T  12161693 ctttaggtataattaagtgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtaaaatggatggctgttctct-cc 12161595  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaactg-gtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    | | ||||||| |  ||||| |||||||  ||||||||||  ||||||||||||    
T  12161594 ctaaactaggttaatttggaccgaactgaatcaacaaattattttgtgttctct 12161541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 820 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 26066307 - 26066109
Alignment:
Q  820 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066307 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26066208  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26066207 ttgtaacgttacttatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 26066109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 668 - 921
Target Start/End: Original strand, 22490618 - 22490871
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttta-gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| || |  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22490618 cttttaccataaatatagacattgaattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttttgaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 22490717  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22490718 atagtttgcctctttggaacaaacactagggtttgaggaggtatacaccttgcgaaacactattaggattg-agtctcttggttacggaaagagattggg 22490816  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 921  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22490817 actttgggtagaattatgcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 22490871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 820 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 26068578 - 26068380
Alignment:
Q  820 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068578 gaaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26068479  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26068478 ttgtaacgttgctcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 26068380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 641 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 1072239 - 1072067
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1072239 cagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaactttgagatagaaggagctgaaacaagggtttagaaa 1072140  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattca 813  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1072139 ggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgagttgattca 1072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 724 - 1007
Target Start/End: Complemental strand, 16455701 - 16455419
Alignment:
Q  724 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 823  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16455701 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtacagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt-gtgg-ttgattcaccttgggaaa 16455606  T
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 922  Q
    |||| ||||||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  16455605 cactgttaggatta-agtctcttgctcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaaccctttgatatctcttttg 16455507  T
Q  923 taacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggatcgaactg-gtcaacaaatttc 1007  Q
    |||   ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||    
T  16455506 taaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccgaactgagtaaacaaatttc 16455419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 701 - 938
Target Start/End: Original strand, 15719666 - 15719891
Alignment:
Q  701 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 800  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||     
T  15719666 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt- 15719755  T
Q  801 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 900  Q
      | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15719756 --gagttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 15719852  T
Q  901 gtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcat 938  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||    
T  15719853 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 15719891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 809 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069701
Alignment:
Q  809 attcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 908  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 1069815  T
Q  909 ttgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactg-gtcaacaaatt 1005  Q
    ||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||| | |  ||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||| |||||||  ||||||||||    
T  1069814 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagagaaacggagggctgctctcttccccatactaggtcaatttggaccgaactgaatcaacaaatt 1069715  T
Q  1006 tctttgtgttctct 1019  Q
      ||| ||||||||    
T  1069714 cttttatgttctct 1069701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Original strand, 14466312 - 14466655
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| | |  |||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||              
T  14466312 cttttactatagatatagactttgtattagaataaaccttgagatagagagggttgaaacaagagtttagaaagacaacagcaaaactag---------- 14466401  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt-gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
     ||||||||| || | ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14466402 -agtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacggaaagagattggg 14466499  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    | |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | || |||||| ||||||| |  ||| | ||||| | ||    
T  14466500 agtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaccggatgactgctgtttc 14466599  T
Q  965 ccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||| ||||||   |||||||||||    
T  14466600 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcagcaaattctcttgtgttctct 14466655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 668 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 32447651 - 32447502
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32447651 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 32447552  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactag-ggtttgtgggttgattcacct 816  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  32447551 gagtttgtctcttggcaacaaacactagagttttgagggttgattcacct 32447502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 674 - 921
Target Start/End: Original strand, 17012029 - 17012271
Alignment:
Q  674 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaa-acaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 772  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17012029 ctataaatatagaccttgtatcggagtaaaccttgagatagaggggtctgaataaaagggtttagaa-gtaaacaacaaa-ctagggtttgtataaagtt 17012126  T
Q  773 tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttg 872  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||   ||||     
T  17012127 tg-ctcttggcaacaaacactagggttga--ggttgattcaccttctgaaacaatattaggattg-agtctcttggtcacgagaagagattgatgctttt 17012222  T
Q  873 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 921  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  17012223 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttt 17012271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 641 - 788
Target Start/End: Original strand, 8995431 - 8995578
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8995431 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaa 8995530  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaa 788  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8995531 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 8995578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 439 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 14507718 - 14507569
Alignment:
Q  439 actgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgg--gcaaggcac 536  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |   ||||||||    
T  14507718 actgtgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttttgatacaaggcac 14507619  T
Q  537 tggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 586  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14507618 tggaaaaatggtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctg 14507569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 755 - 1019
Target Start/End: Original strand, 15367101 - 15367362
Alignment:
Q  755 tagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgg 854  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||  |||    
T  15367101 taggggttgtattgtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttaggattg-agtctcttcgtcgcgg 15367195  T
Q  855 gaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagg 953  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| | || ||||||||||||| |  ||| |    
T  15367196 gaagagattgaaactttgggtaaaattaatcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaag 15367295  T
Q  954 gctgctctctc-ccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||| ||| ||||||||| | ||||||||||    
T  15367296 gctgctctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattt-tgtgtgttctct 15367362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 441 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 19227948 - 19227761
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 539  Q
    |||||||||||||||||||| | | | || ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||  |||||||||||||    
T  19227948 tgtgagagttaacttaaaattaagat-ctgcaggaatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcatgatggaggtttcaatttttgaggcaaggcactgg 19227850  T
Q  540 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacgtattttttgggagcagatttgtt 627  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || || | |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19227849 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacatattttttgggtgcagatttgtt 19227761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 12186405 - 12186054
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatca-aagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggca-acaacaaaactagggtttg 763  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  || |||||||| | ||| |||     
T  12186405 acttttactataaatataaaccttgtatcacatgtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaaa--cagacaacaaaccaaggtttta 12186308  T
Q  764 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt 863  Q
     | ||| ||| |||   ||| | ||  |||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  12186307 gagaga-tttctctaagcgggagaa--actagggttgtt--gttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttgttcacgggaagagatt 12186214  T
Q  864 gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctc 960  Q
    | ||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  12186213 gagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctc 12186114  T
Q  961 tctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||| || | ||||||||||  ||| | |||||| ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  12186113 tctgcctcggactaggtcaatttgaaccgaactgggtaaacaaattattttgtgttctct 12186054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 675 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 13870749 - 13870608
Alignment:
Q  675 tataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 774  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  13870749 tataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatataaagtttg 13870651  T
Q  775 tctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 817  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13870650 tctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcacctt 13870608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 667 - 797
Target Start/End: Original strand, 17852520 - 17852650
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  17852520 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtat 17852619  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactaggg 797  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17852620 agagtttgtctctttcgaacaaacactaggg 17852650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 441 - 586
Target Start/End: Original strand, 8995255 - 8995400
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 538  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||  || ||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  8995255 tgtgagagttaacttaaaatcaggat-ctgtaggaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-tgggcaaggcactg 8995352  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 586  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8995353 gaaaaatcgtggcacgatggggtcacatcgtggcacgatggtgcgctg 8995400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 441 - 586
Target Start/End: Original strand, 9019702 - 9019847
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 538  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||  || ||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  9019702 tgtgagagttaacttaaaatcaggat-ctgtaggaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-tgggcaaggcactg 9019799  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 586  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9019800 gaaaaatcgtggcacgatggggtcacatcgtggcacgatggtgcgctg 9019847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 668 - 1007
Target Start/End: Original strand, 19696420 - 19696761
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggg--ggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 764  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |  |||| |||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||   |||||||||  ||||||||||    
T  19696420 cttttactataaatatagaccttgtatatgatgaaaccttgagagagagggagggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaat-tagggtttgt 19696517  T
Q  765 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 864  Q
    |||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||      |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || | |||||||||    
T  19696518 atagagtttg-ctcttggcaacaatcactagggttcaaa--ttgattcaccttgggaaacactgttaggatt-gagtctctttgtcactgaaagagattg 19696613  T
Q  865 ggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctct 961  Q
     |||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||| | || |||||| |||||||||   ||  ||||||||    
T  19696614 agactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaatcctttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatagctgctct 19696713  T
Q  962 ctcccccagactaggtcag-attggatcgaact-ggtcaacaaatttc 1007  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  19696714 ctctcccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatttc 19696761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 445 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 11983562 - 11983421
Alignment:
Q  445 agagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaa 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| |  ||  |  ||||||||||||    
T  11983562 agagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggtacgatggttgggcaacatggtacgatggaggtttcagttgtgaggtaa--gcactggaaaaa 11983465  T
Q  545 tcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11983464 tcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 11983421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 724 - 1007
Target Start/End: Complemental strand, 22858228 - 22857947
Alignment:
Q  724 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 823  Q
    |||||||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||||  || ||| |||||| | ||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||    
T  22858228 aaacaagggtttagaa-gctaacacaaaaactagggtttgta--gaattt-tctcttggtaacaaacactagggttga--gattgattcaccttgggaaa 22858135  T
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccatt-gatttctcttt 921  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||| |||||   || |||| ||||||||||||| || ||| | |||||    
T  22858134 cactattatgattg-agtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagatttaggtttgaagactaattcttgtaacccttttgatatatcttt 22858036  T
Q  922 gtaacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggatcgaactg-gtcaacaaatttc 1007  Q
    |||| | |||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||    
T  22858035 gtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaaacaaatttc 22857947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 804 - 1007
Target Start/End: Original strand, 26945258 - 26945465
Alignment:
Q  804 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 902  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||    
T  26945258 ggttgagtcaccttgggaaacactattaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgt 26945356  T
Q  903 aacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggatcgaact-ggtca 998  Q
    ||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||  | ||||| |||||| |||||||| || |||| | ||||| |||||| ||| |    
T  26945357 aactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacgaagggcagctctcccccccagattatgtcaggtttggaccgaactgggtaa 26945456  T
Q  999 acaaatttc 1007  Q
    |||||||||    
T  26945457 acaaatttc 26945465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 667 - 834
Target Start/End: Original strand, 15346369 - 15346524
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||        |   ||||||||||||||||    
T  15346369 acttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaccaagggtttaga--------attcaaactagggtttgtat 15346460  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga 834  Q
    | | |||| ||||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15346461 aaaatttg-ctcttggcaacaaacactagggt---tgggttgattcaccttgggaaacactcttagga 15346524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 865 - 1007
Target Start/End: Original strand, 15346522 - 15346666
Alignment:
Q  865 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct 963  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||||| |  |||  ||||||||||    
T  15346522 ggactttgagtaaaattaagcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaagctgctctct 15346621  T
Q  964 cccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttc 1007  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  15346622 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatttc 15346666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 806 - 964
Target Start/End: Original strand, 20526922 - 20527081
Alignment:
Q  806 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 904  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||  |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  20526922 ttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacaagaagagattaagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 20527020  T
Q  905 cccattgatttctctttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    ||  ||||| ||||||||||| | || |||||| |||||||||  |||| |||||||||||    
T  20527021 ccttttgatatctctttgtaaagttattcatcattatagtggaacggagagctgctctctc 20527081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 668 - 780
Target Start/End: Original strand, 10584105 - 10584212
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||||||||||     |||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  10584105 cttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg-----aaacaaaggtttataaaagcaacaacaaaactagagtttgtata 10584199  T
Q  768 gagtttgtctctt 780  Q
    |||||||||||||    
T  10584200 gagtttgtctctt 10584212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 885 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 25465710 - 25465574
Alignment:
Q  885 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-at 982  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||| ||||| ||    
T  25465710 cgggagacttattcttgtacccctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctctcccatactatgtcagtat 25465611  T
Q  983 tggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||| | ||||||||||    
T  25465610 tggaccgaactgggtaaacaaattt-tgtgtgttctct 25465574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 807 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037749
Alignment:
Q  807 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga-cttattcttgtaac 905  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || |||||| |||||||||||||||||||    | | ||||||||||||||    
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggatt-gagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaac 28037829  T
Q  906 ccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcat-atagtgga---ttggagggctgctctctcccccagactaggtcag 980  Q
    || ||||| |||| ||||||| | |||||||||| ||||||||     | | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  28037828 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggacggacgaaaggctgctctctcccccagtctaggtcag 28037749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 653 - 701
Target Start/End: Original strand, 33308918 - 33308966
Alignment:
Q  653 agattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 701  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33308918 agattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 33308966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 653 - 701
Target Start/End: Original strand, 33311187 - 33311235
Alignment:
Q  653 agattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 701  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33311187 agattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 33311235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 821 - 978
Target Start/End: Complemental strand, 12911629 - 12911471
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || |||  || |||||| |||||| |||||| |||||   || | || ||||||||||||  || || |||||    
T  12911629 aaacactattaagattg-agtctcttagtcacgataatagattgagacttttggtagagttaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctct 12911531  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtc 978  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12911530 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtc 12911471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Original strand, 13878727 - 13878883
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  13878727 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctct 13878821  T
Q  920 ttgtaacggtactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13878822 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 13878883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Original strand, 16785919 - 16786075
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  16785919 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctct 16786013  T
Q  920 ttgtaacggtactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16786014 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 16786075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 806 - 882
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138499
Alignment:
Q  806 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaatta 882  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggattg-agtcacttggtcacgggaagagatggggactttaggtagaatta 11138499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 929 - 1019
Target Start/End: Original strand, 10584235 - 10584327
Alignment:
Q  929 tactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactg-gtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  10584235 tactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttctct 10584327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 821 - 978
Target Start/End: Complemental strand, 12937376 - 12937219
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||   || | || ||||||||||||  || || |||||    
T  12937376 aaacactattaagattg-agtctcttagtcacgagaatagattgaaacttttggtagaattaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctct 12937278  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtc 978  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12937277 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtc 12937219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Original strand, 13883475 - 13883631
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | |||||    
T  13883475 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaattcat---tatctct 13883569  T
Q  920 ttgtaacggtactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13883570 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 13883631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 806 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 7542581 - 7542452
Alignment:
Q  806 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgta 903  Q
    ||||||||| | | |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||   || |||| ||| |||||    
T  7542581 ttgattcacttggagaaacactattatgattg-agtctcttggtcacgggaagagatttgggaatttggatagaattaggtttgaagactaatttttgta 7542483  T
Q  904 acccattgatttctctttgtaacggtactca 934  Q
    |||| ||||| ||||||||||| | ||||||    
T  7542482 accctttgatatctctttgtaaagttactca 7542452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 15530661 - 15530514
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 538  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| || |||| || ||||||| || |||||||| |  |||  || ||| |||||     
T  15530661 tgtgagagttaacttaaaatcaggat-ctgcaggaatcgtggcacgatggctgggtaacgtggcacaattggaggtttcaagtttgagg-caaagcactc 15530564  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    ||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  15530563 gaaaattcgtggtacgatggggccgcatcgtggcacgatggtgtgctggc 15530514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 534 - 611
Target Start/End: Original strand, 26084818 - 26084895
Alignment:
Q  534 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttt 611  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  || |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  26084818 cactggaaaaatcgtgccacgattgaatcgcatcgtggcacgatggtgcgattgaagataaaaataaaacgtattttt 26084895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 441 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 1072395 - 1072312
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacga-tggaggttttagtttt 523  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  1072395 tgtgagagttaacttaaaatcagg-ttctgcagaaatcgtggtacgatggttgggcaacgtggcacgattggaggtttaagtttt 1072312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 5757507 - 5757563
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  5757507 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 5757563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 939 - 991
Target Start/End: Original strand, 10077194 - 10077246
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaa 991  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  10077194 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaa 10077246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 940 - 995
Target Start/End: Original strand, 24436001 - 24436056
Alignment:
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24436001 tagtggatcggagggctgctctctcccctagagtaggtcatattggatcgaactgg 24436056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 940 - 1002
Target Start/End: Complemental strand, 31936654 - 31936591
Alignment:
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaa 1002  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  31936654 tagtggattggagagctgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 31936591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 940 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 31979580 - 31979525
Alignment:
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||    
T  31979580 tagtggattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgg 31979525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 806 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 25078755 - 25078541
Alignment:
Q  806 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaa 904  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || |||  |||||||||||   || |||||||||||||||    
T  25078755 ttgattcaccttggtaaacaccgttaagattg-agtctcttggtcacggaaagagattgaga-tttaagtagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 25078658  T
Q  905 cccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggatcgaact-ggtcaac 1000  Q
    ||| ||||| |||| ||||||| | ||||| ||| || ||||||  ||||| ||||| |||  ||||| ||||||||| |||||| |||||| ||| |||    
T  25078657 ccctttgatatctcttttgtaaagttactcgtcattacagtggaacggaggactgctttct-tcccagtctaggtcagtattggaccgaactgggtaaac 25078559  T
Q  1001 aaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||| | ||||||||||    
T  25078558 aaattt-tgtgtgttctct 25078541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 940 - 1001
Target Start/End: Original strand, 21801374 - 21801435
Alignment:
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactggtcaaca 1001  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  21801374 tagtggattggagagctgctcgctcccccagattaggtcatattggactgaactggtcaaca 21801435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 866 - 980
Target Start/End: Original strand, 30445699 - 30445816
Alignment:
Q  866 gactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctc 962  Q
    |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||    
T  30445699 gactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctc 30445798  T
Q  963 tcccccagactaggtcag 980  Q
    ||| ||| ||||||||||    
T  30445799 tccaccatactaggtcag 30445816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 939 - 991
Target Start/End: Original strand, 5572270 - 5572322
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaa 991  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||    
T  5572270 atagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaa 5572322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 824 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 17695030 - 17694877
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 922  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  17695030 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 17694936  T
Q  923 taacggtact-catca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    ||| |  |||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  17694935 taaagaaactatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtca 17694877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 21356104 - 21356048
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  21356104 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgg 21356048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 26887406 - 26887252
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  26887406 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctct 26887312  T
Q  920 ttgtaacggtactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||| ||| |||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  26887311 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctg--ctctcccccagactaggtca 26887252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 829 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 5165989 - 5165936
Alignment:
Q  829 ttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5165989 ttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattagg 5165936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 821 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 31248896 - 31248835
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  31248896 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 31248835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 821 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 35201508 - 35201447
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  35201508 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 35201447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 441 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 4816786 - 4816740
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcagg-tttctacagaatcgtggcacga 486  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  4816786 tgtgagagttaacttaaaatcaggttttctgcagaatcgtggcacga 4816740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 527 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 30729281 - 30729220
Alignment:
Q  527 ggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    |||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  30729281 ggcaagtcactggaaatttcgtgccacgatggggtcacaacgtggcacgatagtgcgctggc 30729220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 821 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 3577696 - 3577636
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  3577696 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 3577636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 824 - 884
Target Start/End: Original strand, 17036058 - 17036116
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  17036058 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17036116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 667 - 711
Target Start/End: Original strand, 18318004 - 18318048
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 711  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  18318004 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgaga 18318048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 939 - 1002
Target Start/End: Complemental strand, 22709086 - 22709022
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaa 1002  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||| | |||||| |||||||||    
T  22709086 atagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattgaaccgaactaggtcaacaa 22709022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 939 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 18232913 - 18232866
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattgga 986  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18232913 atagtgaattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattgga 18232866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 943 - 985
Target Start/End: Original strand, 33335963 - 33336005
Alignment:
Q  943 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattgg 985  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  33335963 tggattggagagctgctctctcccccagattaggtcacattgg 33336005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 534 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 22352293 - 22352216
Alignment:
Q  534 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttt 611  Q
    |||||||||||| ||| |||||| || ||  |||||| |||||||||||| | |  |||||||| |||||||||||||    
T  22352293 cactggaaaaattgtgccacgattggatcgaatcgtgccacgatggtgcgattgaagataaaaacaaaacgtattttt 22352216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 938 - 979
Target Start/End: Original strand, 25941785 - 25941826
Alignment:
Q  938 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25941785 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 25941826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 534 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 28241768 - 28241691
Alignment:
Q  534 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttt 611  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  ||  |||||| |||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  28241768 cactggaaaaatcgtgccacgattgtatcgaatcgtgccacgatagtgcgattgaagataaaaataaaacgtattttt 28241691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 938 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 35201393 - 35201352
Alignment:
Q  938 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  35201393 tatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtca 35201352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 131)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Original strand, 42064408 - 42064785
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42064408 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggagctgaaacaagggtttagaaa 42064507  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42064508 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 42064606  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatat 940  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  42064607 tctcttggttacgggaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatat 42064706  T
Q  941 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaga-ttggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  42064707 agtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 42064785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Original strand, 27104692 - 27105067
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27104692 cagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagaaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaa 27104791  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27104792 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-ag 27104889  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatat 940  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27104890 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacattactcatcatat 27104989  T
Q  941 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  27104990 agtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27105067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 13910406 - 13910030
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910406 cagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 13910307  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  13910306 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaaacaatattaggatt-gag 13910208  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatat 940  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13910207 tctcttggttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatat 13910108  T
Q  941 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  13910107 agtggatcagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13910030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 19504707 - 19504331
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504707 cagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 19504608  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19504607 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 19504509  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19504508 tctcttggttac-ggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcata 19504410  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  19504409 tagtggatcggagggctgctatctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 19504331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 669 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 19502345 - 19501996
Alignment:
Q  669 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 768  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19502345 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtag 19502246  T
Q  769 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggac 868  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||    
T  19502245 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagac 19502147  T
Q  869 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 967  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  19502146 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcgaagggctgctctctcccc 19502047  T
Q  968 cagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  19502046 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 19501996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 35215932 - 35215571
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----------gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35215932 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaacta 35215833  T
Q  757 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggga 856  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35215832 gggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggga 35215733  T
Q  857 agagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggct 956  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  35215732 agagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggct 35215633  T
Q  957 gctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  35215632 gctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 35215571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 708 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 35218258 - 35217948
Alignment:
Q  708 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 807  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  35218258 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 35218159  T
Q  808 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 907  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35218158 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc 35218059  T
Q  908 attgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaattt 1006  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  35218058 gttgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatat 35217959  T
Q  1007 ctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||    
T  35217958 ctttgtgttct 35217948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 24162574 - 24162208
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24162574 cagatttgtttcaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 24162475  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  24162474 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaagatt-gag 24162376  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatat 940  Q
    |||||||||| |          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  24162375 tctcttggttgc----------tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaatgctactcatcatat 24162286  T
Q  941 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||  ||||||||||    
T  24162285 agtggattggatggctgctctctcccccggactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 24162208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 23452577 - 23452222
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 762  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452577 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 23452478  T
Q  763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 862  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  23452477 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggc 23452379  T
Q  863 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 961  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452378 tgggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctct 23452279  T
Q  962 ctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  23452278 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 23452222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 45280321 - 45279969
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag-gcaacaacaaaactagggtttgta 765  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  45280321 actttcactataaatatataccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 45280222  T
Q  766 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 865  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  45280221 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttgggatacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgg 45280123  T
Q  866 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45280122 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 45280023  T
Q  965 ccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  45280022 ccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 45279969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Original strand, 42452702 - 42453050
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42452702 acttttattataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 42452801  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    | |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |    
T  42452802 aaagtttgtctct--gtaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgag 42452898  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  42452899 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-c 42452997  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  42452998 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 42453050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 644 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 22287695 - 22287319
Alignment:
Q  644 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 743  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22287695 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtattaaagtaaactttgagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 22287596  T
Q  744 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtct 843  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  22287595 aacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacggtattaggatt-gagtct 22287497  T
Q  844 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatag 942  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22287496 cttagttacgggaagagattgacacttcgggtagaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatag 22287397  T
Q  943 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    || | |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  22287396 tgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 22287319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Original strand, 19007560 - 19007912
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19007560 cttttactataaatataggctttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattatggtttgtata 19007659  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  19007660 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattagaatt-gagtttcttggttatgggaagagattgggg 19007758  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||    
T  19007759 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctccc 19007858  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  19007859 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctct 19007912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 641 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 40032420 - 40032036
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| ||  ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40032420 cagatttgttccaagttttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 40032321  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40032320 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 40032222  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga----tttctc-tttgtaacggtactcat 935  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||| |||| || | |||||||    
T  40032221 tctcttggttacaggaagaggttaggactttgggtagaattaggcgtgagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgcaaagttactcat 40032122  T
Q  936 ca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    || ||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||||||    
T  40032121 cattatagtgaaacggagggccgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtattctct 40032036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 641 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 21521057 - 21520676
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttaga 738  Q
    |||||||||| || | |||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  21521057 cagatttgttccaaaatttaagcgatacttttactataaatataaaccttgtatcagactaaactttgagagatagatggggctgaaacaagggtttaga 21520958  T
Q  739 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgg 838  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  21520957 aaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-g 21520859  T
Q  839 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca 937  Q
    |||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  21520858 agtctcttggttacaggaagaggctaggactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca 21520759  T
Q  938 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaac-tggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||||  ||||||||||||    
T  21520758 tatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactttgtcaacaaattcttttgtgttctct 21520676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 42923847 - 42923492
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 764  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  42923847 acttttactataaatatagaccttgaatcatagtaaaccttgagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactaggatttgt 42923748  T
Q  765 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 864  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  42923747 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagagattg 42923649  T
Q  865 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct 963  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | ||||| |||||||||| |  |||||||||||||||    
T  42923648 gggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcatatagtgaaacggagggctgctctct 42923549  T
Q  964 cccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||| | |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  42923548 cccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 42923492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 641 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 43623930 - 43623563
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  43623930 cagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaaaatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagaggggggtgaaacaatggtttagaaa 43623831  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  43623830 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc------------actaggttttgagggttgattcaccttgggaaacaatattaggattg-ag 43623744  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  43623743 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 43623644  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  43623643 tagtggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctct 43623563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 641 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 6264507 - 6264131
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6264507 cagatttgttccaaattttaagcgatatttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaa 6264408  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  6264407 ggcaacaacaa----agggtttgtatagagtttgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-aag 6264313  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-t 938  Q
    |||||||||||||  || |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |    
T  6264312 tctcttggttacgataaaagattggggctttggatagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 6264213  T
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  6264212 atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 6264131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Original strand, 28196557 - 28196907
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28196557 cttttactataaatatatgctttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 28196656  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |     
T  28196657 gagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagagattgagg 28196755  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 966  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |  | | ||||||||||||||    
T  28196756 ctttgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacgaatggctgctctctccc 28196855  T
Q  967 ccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  28196856 ccagactaggtca-att-gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 28196907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 641 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 6259177 - 6258800
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||| ||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  6259177 cagacttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtattagactaaactttgagatagaggaggatgaaacaagagtttagaaa 6259078  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6259077 ggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 6258979  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-t 938  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| | |    
T  6258978 tctcttggttacggga--agattggggctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattatt 6258881  T
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||| |  ||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  6258880 atagtgaaacggagggctgctctct-ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 6258800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 11739895 - 11739542
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  11739895 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctggaacaagggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttgtatg 11739796  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||    
T  11739795 gagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gattctcttggttataggaagagattggga 11739697  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||| || | ||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||    
T  11739696 ctttgggtagaattaggcgggagaattattcttggaatccattgatatctcttttgaaaggttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc 11739597  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  11739596 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 11739542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 676 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 34979906 - 34979560
Alignment:
Q  676 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 775  Q
    |||||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  34979906 ataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagcgtttagaaaggtaacaaaaaaactagggtttgtataaagtttgt 34979807  T
Q  776 ctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggt 875  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  34979806 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatt-gagtctcttggttacgggaagagattcggactttcggt 34979708  T
Q  876 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctct-ctcccccagac 972  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| | | ||||||| |||||||||  | |||||| |||| | |||||| ||    
T  34979707 agaattaggcgggagacttattcttgtaatccatttatatctcttttgtaaggttcctcatcattatagtggaacgaagggctactctccccccccaaac 34979608  T
Q  973 taggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  34979607 taggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 34979560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Original strand, 17848365 - 17848712
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  | || | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17848365 cttttactataaatataggctttgtatca--gtaatccttgagatagagggggctcaaacgagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 17848462  T
Q  768 gagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17848463 gagtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcactttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgag 17848561  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
     |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||| | |||||||||||    
T  17848562 gctttgggtaga---aggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctctcc 17848657  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||| |||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  17848658 cccatactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 17848712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 177; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 669 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 15539809 - 15539566
Alignment:
Q  669 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 768  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15539809 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatatagggggttgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatag 15539710  T
Q  769 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggac 868  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||    
T  15539709 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gattctcttggttacgggaagagattgagac 15539611  T
Q  869 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 913  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539610 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 15539566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Original strand, 17849037 - 17849389
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||    
T  17849037 cttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagataacaacaaaactagagttcgtata 17849136  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  17849137 gagtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagatt-gagtctcttggttacggtaagagattgaga 17849235  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |  || ||||||||||||||    
T  17849236 ctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacgg-gggctgctctctcc 17849334  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    | || |||||||||  |||||    ||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  17849335 cacatactaggtcaatttggacaagactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 17849389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 441 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 36559358 - 36559067
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36559358 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 36559259  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 640  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36559258 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacata-tttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 36559160  T
Q  641 cagatttgttac----------------------agattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 711  Q
    ||||||||||||                      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36559159 cagatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 36559067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 671 - 1019
Target Start/End: Original strand, 3022086 - 3022444
Alignment:
Q  671 ttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 770  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3022086 ttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttataaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagag 3022185  T
Q  771 tttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactt 870  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |  ||    
T  3022186 tttgtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggttaccggaagagattgaggttt 3022284  T
Q  871 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatca----------tatagtggattggagggctgctc 960  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||||||||          |||| || |   || ||||||||    
T  3022285 taggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctttataaagttactcatcattatcatcgttataatgaaacagatggctgctc 3022384  T
Q  961 tctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  3022385 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 3022444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 172; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Original strand, 14837193 - 14837540
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  14837193 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggttaaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtaca 14837292  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      |||||||||||| ||    
T  14837293 tagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctctt------gggaagagattgaga 14837385  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |  ||| || ||||||||||    
T  14837386 ctttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggatggatgctctctcc 14837485  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaactg-gtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  14837486 cccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctct 14837540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 820 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 36559047 - 36558849
Alignment:
Q  820 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36559047 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 36558948  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  36558947 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 36558849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 820 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 36561324 - 36561126
Alignment:
Q  820 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36561324 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 36561225  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  36561224 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 36561126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 440 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 45332676 - 45332453
Alignment:
Q  440 ctgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45332676 ctgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggaactgg 45332577  T
Q  540 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgtt 639  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45332576 aaaaatcgtggaacgatggggtcacatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtat-ttttgggagcagatttgttacag-ttttgtt 45332479  T
Q  640 acagatttgttacagattttaagcag 665  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  45332478 acagatttgttacagattttaggcag 45332453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 708 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 45239271 - 45239001
Alignment:
Q  708 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 807  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || | |||||||||||||||||| |||||    
T  45239271 gagatagagggggctgaaacaatgatttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagactttctct-ttggcaacaaacactagggtttgagggtt 45239173  T
Q  808 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 907  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  45239172 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaaccc 45239074  T
Q  908 attgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45239073 attgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 45239001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 44289403 - 44289050
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44289403 cttttactataaatataggttttgtatcatagcaaaccttgatatagaggggactaaaacaaaggtttaggaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 44289304  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44289303 gagtctgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtcacttggttacgggaagagattggga 44289205  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    ||| ||||||||||| | || | ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||   |||||||||| |||||| |   || || |||||| |||    
T  44289204 cttagggtagaattaagtggaaaacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaagattactcatcattatagtgaaacagatggttgctctttcc 44289105  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaactgg-tcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  44289104 cccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 44289050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 820 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 45332364 - 45332166
Alignment:
Q  820 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45332364 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctct 45332265  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  45332264 ttgtaaaggtactcatcatatagtgaattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 45332166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 668 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 31733100 - 31732800
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31733100 cttttactataaatatagactttgtaacagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 31733001  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||            ||||||    
T  31733000 gagtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgttgggaaacactgttaggatt-gagtctcttggt------------ttggga 31732914  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||| ||| |  ||||| |||||||||||    
T  31732913 ctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattgtgaaacggaggactgctctctcc 31732814  T
Q  966 cccagactaggtca 979  Q
    ||||||||||||||    
T  31732813 cccagactaggtca 31732800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 668 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 11578439 - 11578131
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  11578439 cttttactataaatatagaccttatatcagggtaaatcttgagatagagtgggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaaaaaaactagggtttgtata 11578341  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    || ||| |||||| | |||||||  ||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11578340 gaatttttctcttggcaacaaac--tagggttgg--ggttgattcacctcgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattggga 11578246  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| |||    
T  11578245 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtcgaacggagggctgctctttcc 11578146  T
Q  966 cccagactaggtcag 980  Q
    |||||||||| ||||    
T  11578145 cccagactagatcag 11578131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 798 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 5375550 - 5375329
Alignment:
Q  798 tttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttatt 897  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5375550 tttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgg-agacttatt 5375453  T
Q  898 cttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-gg 995  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||    
T  5375452 cttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggg 5375353  T
Q  996 tcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||  ||||||||||||    
T  5375352 tcaacaaattcttttgtgttctct 5375329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 641 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 18800664 - 18800296
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || ||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18800664 cagatttgttccaaattttaaacgatacttttactataaatatagaccttgtatcagggtaaacatggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaa 18800565  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
              || ||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18800564 tc--------aagctagggtttgtatagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-ag 18800478  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-t 938  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| ||| |    
T  18800477 tctcttggtcacaggaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcatt 18800378  T
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||| |  |||||||| |||||| |||||||| |||||||  ||||| | |||| ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  18800377 atagtgaaacggagggctactctct-ccccagaccaggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttctct 18800296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 641 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 22407771 - 22407591
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    ||||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  22407771 cagatttgttcaaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgtgagatatagggtgctgaaacaagggtttagaaa 22407672  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggga 821  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22407671 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 22407591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 669 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 20146941 - 20146615
Alignment:
Q  669 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||| |     |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  20146941 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttaagaggtagagagtttgaaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtat 20146843  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||| | ||| | ||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  20146842 agagtttgcc-cttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacaatagtaggattg-agtctcttggtcacgggaaaagattgag 20146747  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  20146746 attttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctc 20146647  T
Q  965 ccccagactaggtcag-attggatcgaactgg 995  Q
    || ||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  20146646 cctcagactaagtcagtattggaccgaactgg 20146615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 668 - 833
Target Start/End: Complemental strand, 22163282 - 22163117
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22163282 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaacactagggtttgtata 22163183  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 833  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22163182 gagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagg 22163117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Original strand, 22874061 - 22874403
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    |||||| ||||||||| || | |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||    
T  22874061 acttttgctataaatacaggctttgtatcagagcaaacctggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtat 22874152  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |    
T  22874153 agagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gggttgattcaccttggaaaacagtattaggattg-agtctcttagtcacgggaagagattgag 22874247  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
     |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| |   ||| |||||||||||    
T  22874248 gctttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaactgagagctgctctctc 22874347  T
Q  965 ccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    || || |||||||||  ||||| |||| | ||| ||||||||   |||||||||||    
T  22874348 cctcatactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattctcttgtgttctct 22874403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 667 - 1007
Target Start/End: Complemental strand, 17897578 - 17897240
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctga-aacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 764  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||  ||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  17897578 acttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaacttgaggtagagagt-ctgagaacaagggtttagaa-gtcaacaataaaactagggtttgt 17897481  T
Q  765 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 864  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||| ||||||    
T  17897480 atagagtttg-ctcttcgcaacaaacactagg--ttgaga-ttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcatgagaaaagattg 17897386  T
Q  865 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct-ctttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctc 962  Q
     || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| | ||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||    
T  17897385 agattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatggctgctctc 17897286  T
Q  963 tcccccagactaggtcag-attggatcgaact-ggtcaacaaatttc 1007  Q
    | |||||||||||||||| |||||  |||||| ||| ||||||||||    
T  17897285 t-ccccagactaggtcagtattggtccgaactgggtaaacaaatttc 17897240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 708 - 906
Target Start/End: Original strand, 38020162 - 38020349
Alignment:
Q  708 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 807  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  38020162 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 38020261  T
Q  808 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 906  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||           ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38020262 gattcaccatggtaaacactattaggatt-gagtctcttggt-----------attgggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 38020349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 441 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 19502550 - 19502402
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||   ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19502550 tgtgatagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttaggcaaggcactgga 19502451  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcg 589  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19502450 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcg 19502402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 441 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 24162752 - 24162604
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactgg 539  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  24162752 tgtgagagttaacttaaaatcaagtttctgcagaatcgtggcacaatggttgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactgg 24162653  T
Q  540 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24162652 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgattgtgcgctggc 24162604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 758 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 28459435 - 28459173
Alignment:
Q  758 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaa 857  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28459435 ggtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaa 28459337  T
Q  858 gagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggc 955  Q
    ||| ||||| |||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  28459336 gagtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttttaaagttactcatcattatagtgaaacggagggc 28459237  T
Q  956 tgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    | ||||||  || |||||||||||  |||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||    
T  28459236 ttctctct-acctagactaggtcaatttggatcgaactagataaacaaattcttttgtgttctct 28459173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 440 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 36561678 - 36561539
Alignment:
Q  440 ctgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36561678 ctgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcacggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 36561579  T
Q  540 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatgg 579  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36561578 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatgg 36561539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 441 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 19504884 - 19504736
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||   ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  19504884 tgtgaaagttaacttaaaatcaggtttcagcagaatcatggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggttttaattttttaggcaaggcactgga 19504785  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcg 589  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19504784 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcg 19504736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 544 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 36561532 - 36561344
Alignment:
Q  544 atcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgttacag 643  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36561532 atcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacata-tttttgggagcagatttgttacagtttttgttacag 36561434  T
Q  644 atttgttac----------------------agattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 711  Q
    |||||||||                      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36561433 atttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 36561344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 862 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 22407596 - 22407437
Alignment:
Q  862 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctc 960  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  22407596 ttgggacttttggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc 22407497  T
Q  961 tctcccccagactaggtcagattggatcgaac-tggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  22407496 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctct 22407437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 445 - 588
Target Start/End: Original strand, 27104519 - 27104662
Alignment:
Q  445 agagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaa 544  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |  |||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  27104519 agagttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgattgaagggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaa 27104618  T
Q  545 tcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27104619 tcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 27104662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 667 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 5377769 - 5377631
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 762  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5377769 actttcactataaatatagaccttgtttcagagcaaactttgagagagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggttt 5377670  T
Q  763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttg 801  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5377669 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttg 5377631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 641 - 1019
Target Start/End: Original strand, 35107193 - 35107568
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaac-aagggtttagaa 739  Q
    |||||||||| || ||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||| ||||| |  || |||| ||| ||||||||    
T  35107193 cagatttgttccaaattttaagggatacttttactataaatatagacattgtatcatagtaaaccttgaggtagagagt-ctaaaaccaagagtttagaa 35107291  T
Q  740 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 839  Q
     | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    || ||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  35107292 -gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaaca----gggttg-ggattgattcaccttgagaaacattattaggattg-a 35107383  T
Q  840 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattag--gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatc 936  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||     | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||| | ||||||||    
T  35107384 gtctcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattagattttgaagacttattcttgtaa-cctttgttatctcttttgtaatgttactcatc 35107482  T
Q  937 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    | |||||||||  ||| || || |||||  ||||||||||||||| |||||| |||| | ||| ||||||| | ||||||||||||    
T  35107483 attatagtggaacggatggttgttctctttcccagactaggtcagtattggaccgaaataggtaaacaaatatttttgtgttctct 35107568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 804 - 1007
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699636
Alignment:
Q  804 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 902  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgt 40699527  T
Q  903 aacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggatcgaact-ggtca 998  Q
    || || ||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||   ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||| ||| |    
T  40699528 aatcctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggtcagtattagaccgaactaggtaa 40699627  T
Q  999 acaaatttc 1007  Q
    |||||||||    
T  40699628 acaaatttc 40699636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 875 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7462972
Alignment:
Q  875 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagact 973  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccattatatagtggatcggagggctgctctctcccccagact 7462978  T
Q  974 aggtca 979  Q
    ||||||    
T  7462977 aggtca 7462972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 667 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 37963263 - 37963028
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||        ||  |||||||||||||| |    
T  37963263 acttttactataaatatagactttgtataagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttaga--------aatcaaactagggtttgtgt 37963172  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    | |||||| |||||   ||||||||| | |||   || |||||||| |||| | ||||| ||||  |||| |||||||||||| ||  |||||||||| |    
T  37963171 atagtttg-ctcttgacaacaaacaccatggt---tgtgttgattccccttagaaaacattattgagatt-gagtctcttggtcacctgaagagattgag 37963077  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 915  Q
     |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37963076 gctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaatccattgattt 37963028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 441 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 21521234 - 21521087
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||   | |||| |||||    
T  21521234 tgtgagagttaacttaaaatcaggtt-ctacaggaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttgaag-caagccactg 21521137  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  21521136 gaaaaatcgtgccacgatgggatcgcaacgtggcacgatggtgcgctggc 21521087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 758 - 921
Target Start/End: Complemental strand, 27136368 - 27136208
Alignment:
Q  758 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaa 857  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||    
T  27136368 ggtttatatagagcttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaa-tctcttggtcacggaaa 27136273  T
Q  858 gagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 921  Q
    || |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27136272 gaaattgggactttgagtagaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttt 27136208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 724 - 938
Target Start/End: Original strand, 43139356 - 43139564
Alignment:
Q  724 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 823  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||| |||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||    | |||||||| |||||||||    
T  43139356 aaacaagggtttagaa-gccaacacaaaaacttgggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcatcttgggaaa 43139449  T
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 922  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |   ||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  43139450 cattattaggattg-agtctcttggtcacgggaagatattgagactttaggtagaattaggtctaaagactaattattgtaaccttttgatttctctttg 43139548  T
Q  923 taacggtactcatcat 938  Q
    ||| | ||||||||||    
T  43139549 taaagttactcatcat 43139564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 791 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414194
Alignment:
Q  791 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggag 890  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38414291 actagggtttgagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcac-ggaaaagattgggacttttggtagaattaggcgggag 38414195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 441 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 43624085 - 43623968
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 539  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||| || ||||  ||||||||||||     
T  43624085 tgtgaaagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcatggcacgatggctgggcaacatggcacgattggaggtttcag-ttttgaggcaaggcactga 43623987  T
Q  540 aaaaatcgtggcacgatgg 558  Q
    |||||||||||||||||||    
T  43623986 aaaaatcgtggcacgatgg 43623968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 821 - 921
Target Start/End: Original strand, 20589763 - 20589863
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  20589763 aaacactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctct 20589861  T
Q  920 tt 921  Q
    ||    
T  20589862 tt 20589863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 919 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 22163106 - 22163005
Alignment:
Q  919 tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  22163106 tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22163007  T
Q  1018 ct 1019  Q
    ||    
T  22163006 ct 22163005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 669 - 762
Target Start/End: Original strand, 38020064 - 38020157
Alignment:
Q  669 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 762  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||   | |||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38020064 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacctggagatagagggggttggaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38020157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 885 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 22707872 - 22707734
Alignment:
Q  885 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctg--ctctctcccccagactaggtcaga 981  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |   ||||||||  |||||||| |||||||||||||      
T  22707872 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctctcctccagactaggtcaat 22707773  T
Q  982 ttggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  22707772 ttggactgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctct 22707734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 441 - 588
Target Start/End: Original strand, 42064231 - 42064378
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactg 538  Q
    |||||||||||||||||||||| | | || ||| |||||||||||||  | ||||||| |||| |||| ||||||||| |  |||  || ||| ||||||    
T  42064231 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggtacgactggaggtttcaagtttgagg-caaagcactg 42064328  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  42064329 gaaaaatcgtggcacgatgggatcacatcgtggcacgatggtgcgctggc 42064378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 444 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 6259351 - 6259205
Alignment:
Q  444 gagagttaacttaaaatcaggtttctacagaa-tcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactggaa 541  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||| ||||||| || ||| |||| ||||||  ||  ||| ||||||||    
T  6259351 gagagttaacttaaaatcaggtt-ctgcagaaatcgtggcacgatggctgtgcaacgtggcactattggatgtttcagttttgagga-aagtcactggaa 6259254  T
Q  542 aaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcgg 590  Q
    |||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
T  6259253 aaatcgtggcacgatgggatcgcaacgtgacacgatggtgcgctggcgg 6259205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 824 - 979
Target Start/End: Original strand, 17943540 - 17943692
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 922  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  17943540 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctctttg 17943634  T
Q  923 taacggtactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    ||| |  ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17943635 taaagaaactcatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtca 17943692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 641 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 45332455 - 45332384
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagatttt-aagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 711  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45332455 cagatttgttatagatttttaagcagaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 45332384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 884 - 1019
Target Start/End: Original strand, 23870951 - 23871088
Alignment:
Q  884 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagat 982  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||  ||| |||||||  |    
T  23870951 gcggcagacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctctcccttagattaggtcaatt 23871050  T
Q  983 tggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||| |||| ||||||||||||  |||| |||||||    
T  23871051 tggatcaaactaggtcaacaaattcttttgagttctct 23871088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 806 - 884
Target Start/End: Original strand, 17921754 - 17921833
Alignment:
Q  806 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 884  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17921754 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattg-agtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattagg 17921833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Original strand, 2736205 - 2736361
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  2736205 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctct 2736299  T
Q  920 ttgtaacggtactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2736300 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 2736361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Original strand, 2740941 - 2741097
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||     ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  2740941 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattaggtttaaagactgattcttgaaactcat---tatctct 2741035  T
Q  920 ttgtaacggtactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2741036 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 2741097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 533 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 13910491 - 13910436
Alignment:
Q  533 gcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  13910491 gcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcattgtggcacgatggtgcgctggc 13910436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 667 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 12342746 - 12342673
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaac-aagggtttagaa 739  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12342746 acttttactataaatatacacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaagggtttagaa 12342673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 14699036 - 14699092
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  14699036 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 14699092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Original strand, 17462436 - 17462592
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| | |   | |||||    
T  17462436 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcct---tatctct 17462530  T
Q  920 ttgtaacggtactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17462531 ttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 17462592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 821 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 28459011 - 28458949
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28459011 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattagg 28458949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Original strand, 39686983 - 39687139
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||    
T  39686983 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctct 39687077  T
Q  920 ttgtaacggtactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39687078 ttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 39687139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 805 - 882
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345738
Alignment:
Q  805 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaatta 882  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaatta 26345738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 824 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 27517818 - 27517664
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 922  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||    
T  27517818 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 27517724  T
Q  923 taacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    ||| |  ||||  |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27517723 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 27517664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 805 - 938
Target Start/End: Original strand, 15693958 - 15694094
Alignment:
Q  805 gttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttg 901  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||    
T  15693958 gttgattcaccgtggagaaacactattaggataa-agtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttg 15694056  T
Q  902 taacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcat 938  Q
    |||||  ||||| |||| ||||||| | ||||||||||    
T  15694057 taaccttttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 15694094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 20054947 - 20054790
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  20054947 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctct 20054853  T
Q  920 ttgtaacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  ||||  |||| |||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  20054852 ttgtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctccaccagactaggtca 20054790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 807 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 27583535 - 27583479
Alignment:
Q  807 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 864  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27583535 tgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagagattg 27583479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 10445473 - 10445529
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  10445473 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 10445529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 13569396 - 13569340
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  13569396 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 13569340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 20522288 - 20522232
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  20522288 atagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 20522232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 806 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 34575308 - 34575230
Alignment:
Q  806 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 884  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34575308 ttgattcaccttggagaaacactattaggat-ggagtctcttggtctcgggaa-agattcgggactttgggtagaattagg 34575230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 441 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 40032586 - 40032503
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacga-tggaggttttagtttt 523  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  40032586 tgtgagagttaacttaaaatcagg-ttctgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt 40032503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 939 - 994
Target Start/End: Complemental strand, 33118204 - 33118149
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactg 994  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||    
T  33118204 atagtggattggagggctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactg 33118149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 6264658 - 6264546
Alignment:
Q  446 gagttaacttaaaatcaggtttctacagaa-tcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||| ||||||  || |||| ||||||||||    
T  6264658 gagttaacttaaaatcaggtt-ctgcagaaattgttgcacgatggttgggcaacgtggcatgattggatgtttcagttttgagg-caagtcactggaaaa 6264561  T
Q  544 atcgtggcacgatgg 558  Q
    |||||||||||||||    
T  6264560 atcgtggcacgatgg 6264546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 824 - 979
Target Start/End: Original strand, 30478997 - 30479151
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 922  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| ||   || ||||||||    
T  30478997 cactattaggattg-agtctcttgatcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctctttg 30479091  T
Q  923 taacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    ||| |  ||||  |||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30479092 taaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 30479151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 938 - 995
Target Start/End: Original strand, 34682362 - 34682419
Alignment:
Q  938 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||    
T  34682362 tatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgg 34682419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 8040128 - 8040072
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  8040128 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgg 8040072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 28259206 - 28259262
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||    
T  28259206 atagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgg 28259262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 954 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 34575186 - 34575121
Alignment:
Q  954 gctgctctctcccccagactaggtcag-attggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  34575186 gctgctctctcccccagactaggtcagcattggatcgaactaggtaaacaaatt--tttgtgttctct 34575121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 668 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 38414365 - 38414281
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 763  Q
    |||||||||||||||||| | |||||     | |||| ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38414365 cttttactataaatataggctttgta-----gtaaaccttgagatagagggggctgaaac------ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 38414281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 939 - 1002
Target Start/End: Complemental strand, 39482999 - 39482935
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaa 1002  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  39482999 atagtggattggaggcctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 39482935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 820 - 882
Target Start/End: Complemental strand, 10942696 - 10942634
Alignment:
Q  820 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaatta 882  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  10942696 gaaacactattaggattg-agtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10942634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 820 - 882
Target Start/End: Complemental strand, 10948565 - 10948503
Alignment:
Q  820 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaatta 882  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  10948565 gaaacactattaggattg-agtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10948503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 821 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 22712698 - 22712637
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  22712698 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22712637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 821 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 22717407 - 22717346
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  22717407 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22717346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 821 - 884
Target Start/End: Original strand, 45567409 - 45567470
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  45567409 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 45567470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 806 - 882
Target Start/End: Original strand, 7502975 - 7503052
Alignment:
Q  806 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga-ttgggactttgggtagaatta 882  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7502975 ttgatccaccttggagaaacactattaggatt-gagtatcttggtcaagggaagagatttgagactttgggtagaatta 7503052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 824 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 12781400 - 12781246
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 922  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | | ||| ||||||| ||| ||   || ||||||||    
T  12781400 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaaaactgattcttggaactca---atatctctttg 12781306  T
Q  923 taacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    ||| |  ||||  |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12781305 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 12781246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 669 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 20147082 - 20147040
Alignment:
Q  669 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 711  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  20147082 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgaga 20147040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 939 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 25398563 - 25398517
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattgg 985  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  25398563 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgg 25398517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 939 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 25403701 - 25403655
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattgg 985  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  25403701 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgg 25403655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 806 - 912
Target Start/End: Complemental strand, 30720811 - 30720703
Alignment:
Q  806 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 902  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |  ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||    
T  30720811 ttgattcatcttggagaaacactattaggattg-agtctctttggcacgagaagagattcgtgactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 30720713  T
Q  903 aacccattga 912  Q
    ||||| ||||    
T  30720712 aaccctttga 30720703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 938 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 33671033 - 33670992
Alignment:
Q  938 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33671033 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 33670992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 766 - 882
Target Start/End: Original strand, 35028595 - 35028707
Alignment:
Q  766 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 865  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    | ||||||| | |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| ||||||||||     
T  35028595 tagagtttg-ctcttggtaacaaacactagggttga--gattgattcgcattggaaaacactattatgattg-agtctcttgatcacgagaagagattga 35028690  T
Q  866 gactttgggtagaatta 882  Q
     ||||||||||||||||    
T  35028691 cactttgggtagaatta 35028707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 938 - 979
Target Start/End: Original strand, 45679838 - 45679879
Alignment:
Q  938 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45679838 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 45679879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 940 - 1015
Target Start/End: Original strand, 2838060 - 2838135
Alignment:
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgtt 1015  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  2838060 tagtggattggagatgtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaac-aatttcttggtgtt 2838135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 8390179 - 8390235
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||    
T  8390179 atagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaactgg 8390235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 939 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 17865271 - 17865231
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  17865271 atagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtca 17865231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 824 - 884
Target Start/End: Original strand, 17932637 - 17932695
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  17932637 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17932695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 23078499 - 23078555
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  23078499 atagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggatcgaactgg 23078555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 938 - 986
Target Start/End: Original strand, 27149322 - 27149370
Alignment:
Q  938 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattgga 986  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  27149322 tatagtggattggagagctgctctctcccccatagtaggtcatattgga 27149370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 939 - 991
Target Start/End: Complemental strand, 34388926 - 34388874
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaa 991  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34388926 atagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaa 34388874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 940 - 995
Target Start/End: Original strand, 2869723 - 2869778
Alignment:
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  2869723 tagtggattggagagctactctctcccctagagtaggtcatattggaccgaactgg 2869778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 940 - 1002
Target Start/End: Complemental strand, 31056111 - 31056048
Alignment:
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaa 1002  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||    
T  31056111 tagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattgaaccgaactaggtcaacaa 31056048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 821 - 979
Target Start/End: Original strand, 39680045 - 39680201
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  || ||||| |||||||||||||   || || | ||||||| ||| ||||    |||||    
T  39680045 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgagaagaggctgagactt-gggtagaattaggtttgaagattgattcttgaaactcatta---tctct 39680139  T
Q  920 ttgtaacggtactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||| |  |||||| ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39680140 ttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 39680201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 540 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 45280425 - 45280354
Alignment:
Q  540 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttt 611  Q
    |||||||||| |||||| || ||  |||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  45280425 aaaaatcgtgccacgattggatcgaatcgtgccacgatggtgcgattgaagataaaaataaaacgtattttt 45280354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 941 - 995
Target Start/End: Original strand, 1345572 - 1345626
Alignment:
Q  941 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  1345572 agtggatcggagaggtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgg 1345626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 939 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 3491818 - 3491772
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattgg 985  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  3491818 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 3491772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 939 - 993
Target Start/End: Original strand, 42039698 - 42039752
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact 993  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||    
T  42039698 atagtggattagagagctgctctctcccacagattaggtcatattggaccgaact 42039752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 527 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 22407862 - 22407801
Alignment:
Q  527 ggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    |||||| || || |||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||    
T  22407862 ggcaagtcagtgaaaaaattgtggcacgatgggatcacaacgtggcacgatggtgcgttggc 22407801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 939 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 25407690 - 25407653
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactagg 976  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  25407690 atagtggattggagagctgctctctcccccagattagg 25407653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 667 - 716
Target Start/End: Original strand, 40699229 - 40699278
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||| ||||    
T  40699229 acttttactataaatatagaccttgcatcagagtaaaccttgagagagag 40699278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 724 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 41304667 - 41304627
Alignment:
Q  724 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 765  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  41304667 aaacaagggtttagaa-gccaacaacaaaactagggtttgta 41304627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 2)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Original strand, 2806 - 3182
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2806 cagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaacttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 2905  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  2906 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gag 3004  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatat 940  Q
    ||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3005 tctcttggttatgggaagaggcttggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatat 3104  T
Q  941 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactg-gtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| |  ||||||||||    
T  3105 agtggattggagggctgctatctccccgagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaatattttgtgttct 3182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 441 - 588
Target Start/End: Original strand, 2629 - 2776
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 538  Q
    |||||||||||||||||||||| | | || ||| ||| ||| |||||  | | ||||| |||||||||| |||||||| ||||||  || ||||| ||||    
T  2629 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaattgtgacacgattgctaggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttgagg-caaggtactg 2726  T
Q  539 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  2727 gaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 2776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 5)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 69657 - 69277
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggttta 736  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  69657 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttacaataaatatagaccttatatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggttta 69558  T
Q  737 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 836  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69557 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 69458  T
Q  837 ggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatc 936  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  69457 g-agtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatc 69359  T
Q  937 atatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  69358 atatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 69277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 641 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 73389 - 73207
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggttta 736  Q
    |||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  73389 cagatttgttccaaattttaagagatacttttactataaatatagaccgtgtatcaaaggaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggttta 73290  T
Q  737 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg 819  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  73289 gaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 73207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 445 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 69829 - 69686
Alignment:
Q  445 agagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||||| |   |||  ||||| |||||||||||    
T  69829 agagttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgatggctaggcaacgtggcacgattggaggtttca-agtttgaggcaaagcactggaaaa 69731  T
Q  544 atcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    ||||| |||| ||||| || |||||| ||||||||||| ||||||    
T  69730 atcgtagcacaatgggatcgcatcgttgcacgatggtgtgctggc 69686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 445 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 73540 - 73427
Alignment:
Q  445 agagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||||| |   |||  ||||| |||||||||||    
T  73540 agagttaacttaaaatcagatttatgcagaatcgtggcacgatggctaggcaacgtggcacgattggaggtttca-agtttgaggcaaagcactggaaaa 73442  T
Q  544 atcgtggcacgatgg 558  Q
    || ||||||||||||    
T  73441 attgtggcacgatgg 73427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 782 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 73208 - 73160
Alignment:
Q  782 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 830  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  73208 ggaaaaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 73160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 708 - 1017
Target Start/End: Original strand, 34 - 344
Alignment:
Q  708 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 807  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggtt 133  T
Q  808 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 907  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  134 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaaccc 233  T
Q  908 attgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaattt 1006  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  234 attgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattt 333  T
Q  1007 ctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||    
T  334 ctttgtgttct 344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 41819 - 41468
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41819 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 41720  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  41719 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctggg 41621  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  41620 actttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcc 41521  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||||||| |  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  41520 cccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 41468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 534 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 41930 - 41853
Alignment:
Q  534 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttt 611  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  ||  |||||| |||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  41930 cactggaaaaatcgtgccacgattgtatcgaatcgtgccacgatagtgcgattgaagataaaaataaaacgtattttt 41853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 3)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Original strand, 29087 - 29473
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----------tagagggggctgaaacaag 730  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||          |||||||||||||||||||    
T  29087 cagatttgttacaaattttaagcaaaacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaag 29186  T
Q  731 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 830  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29187 ggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactatt 29286  T
Q  831 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggta 930  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  29287 aggatt-gagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacaata 29385  T
Q  931 ctcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  29386 ctcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcgtttgtgttct 29473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 532 - 588
Target Start/End: Original strand, 29001 - 29057
Alignment:
Q  532 ggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29001 ggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 29057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 441 - 505
Target Start/End: Original strand, 28941 - 29005
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcac 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  28941 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcac 29005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 240; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 670 - 1019
Target Start/End: Original strand, 79140 - 79490
Alignment:
Q  670 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 769  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79140 tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaacttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 79239  T
Q  770 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggact 869  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || || |    
T  79240 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagaat 79338  T
Q  870 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 968  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  79339 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccc 79438  T
Q  969 agactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  79439 agactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgttctct 79490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 667 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 11809 - 11456
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  11809 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaacagggatttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 11710  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11709 agagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggg 11611  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11610 actttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagagctgctctctcc 11511  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaa-ctggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  11510 cccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttctct 11456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 237; Significance: 1e-130; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 667 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 183975 - 183626
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  183975 actttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 183877  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  183876 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttac-ggaagagattggg 183779  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  183778 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 183679  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    | ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  183678 ctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 183626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 667 - 1005
Target Start/End: Original strand, 51961 - 52304
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 764  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51961 acttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 52060  T
Q  765 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 864  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52061 atagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattg 52159  T
Q  865 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctg--ctct 961  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||  ||||    
T  52160 tgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 52259  T
Q  962 ctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatt 1005  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||    
T  52260 ctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaatt 52304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 235; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 641 - 1017
Target Start/End: Original strand, 3923 - 4298
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3923 cagatttgtttcaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 4022  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  4023 ggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggatt-gag 4120  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||    
T  4121 tctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 4220  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaa-ctggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||  ||||||||||    
T  4221 tagtgaaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttct 4298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 3)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 641 - 994
Target Start/End: Original strand, 14945 - 15298
Alignment:
Q  641 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 740  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14945 cagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaatgatttagaaa 15044  T
Q  741 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggag 840  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15045 ggcaacaacaaaactagggtttttataaagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag 15143  T
Q  841 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcata 939  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||    
T  15144 tctcttggttacggaaagagattcagactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 15243  T
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactg 994  Q
    |||||||  ||| ||||||| |||||||||  ||||||||  ||||| |||||||    
T  15244 tagtggaacggaaggctgctgtctcccccatgctaggtcaatttggaccgaactg 15298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 680 - 1005
Target Start/End: Complemental strand, 14707 - 14379
Alignment:
Q  680 atatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 777  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14707 atatagaccttgttttagagcaaactttgagagatagagggggatgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 14608  T
Q  778 cttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 877  Q
    ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  14607 ctttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-tagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtag 14509  T
Q  878 aattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactagg 976  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14508 aattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagactagg 14409  T
Q  977 tcagattggatcgaact-ggtcaacaaatt 1005  Q
    |||  ||||| |||||| ||||||||||||    
T  14408 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 14379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 442 - 588
Target Start/End: Original strand, 14768 - 14915
Alignment:
Q  442 gtgagagttaacttaaaatcaggtttctacag-aatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatgg-aggttttagttttttgggcaaggcactgg 539  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  |  |||||| |||| ||||||| | |||| |||| |  || |||| ||||||    
T  14768 gtgagagttaacttaaaatcaggattctgcaggaatcgtggcacgattgaagggcaacgtggaacgatgggaagtttcagttatgagg-caagtcactgg 14866  T
Q  540 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 588  Q
    |||  ||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||    
T  14867 aaatttcgtggcacgatgggatcacaacgtgacacgatggtgcgctggc 14915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 667 - 967
Target Start/End: Original strand, 1988 - 2293
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 760  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1988 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagaaagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 2087  T
Q  761 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 860  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  2088 ttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaaaag 2185  T
Q  861 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgct 959  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || |||||||| ||    
T  2186 gctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattaatttctcttttgtaacgttcctcatcatatagtgaatcggagggctact 2285  T
Q  960 ctctcccc 967  Q
    ||||||||    
T  2286 ctctcccc 2293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 195; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 668 - 1019
Target Start/End: Original strand, 79812 - 80164
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  79812 cttttactataaatatagtttttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtata 79911  T
Q  768 gagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    ||||||||||||| || |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  79912 gagtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-aagtctcttggttacgggaagagattggg 80010  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
     |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  80011 gctttgggtag-attaggcaggagacttattcctgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 80109  T
Q  966 cccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||  |||||| |||||    
T  80110 cccagactaggtcaatttggattgaactgggtcaacaaattcttttgtgatctct 80164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 821 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 188424 - 188363
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  188424 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 188363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 185; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 782 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 1673 - 1438
Alignment:
Q  782 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaatt 881  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1673 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatt 1575  T
Q  882 aggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaga 981  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  1574 aggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat 1475  T
Q  982 ttggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  1474 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 170; Significance: 1e-90; HSPs: 5)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 441 - 711
Target Start/End: Original strand, 21915 - 22206
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21915 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 22014  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 640  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22015 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacata-tttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 22113  T
Q  641 cagatttgttac----------------------agattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 711  Q
    ||||||||||||                      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22114 cagatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 22206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 441 - 711
Target Start/End: Original strand, 24190 - 24481
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24190 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 24289  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 640  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24290 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacata-tttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 24388  T
Q  641 cagatttgttac----------------------agattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 711  Q
    ||||||||||||                      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24389 cagatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 24481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 820 - 1017
Target Start/End: Original strand, 22221 - 22418
Alignment:
Q  820 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22221 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 22319  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22320 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 22418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 820 - 1017
Target Start/End: Original strand, 24496 - 24693
Alignment:
Q  820 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 919  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24496 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 24594  T
Q  920 ttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttct 1017  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24595 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 24693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 8448 - 8504
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  8448 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 8504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 162; Significance: 6e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 668 - 979
Target Start/End: Original strand, 85184 - 85495
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||| | ||  ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  85184 cttttactataaatataggctttgtatcaaagtaaaccttgagatagaagagga-gaaacaaggatttaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 85282  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  85283 gagtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaaaacactactaggatt-gagtcttttggttacgagaagagattgtga 85381  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 965  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||    
T  85382 ctttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttcgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc 85481  T
Q  966 cccagactaggtca 979  Q
    ||||||||||||||    
T  85482 cccagactaggtca 85495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 153; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 667 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 16154 - 15844
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  16154 acttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtat 16056  T
Q  767 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 866  Q
    |||||||| ||| | | ||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16055 agagtttg-ctcctagcaacaaacactagggttga--ggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattggg 15960  T
Q  867 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 964  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| || ||||||  ||||| |||||||||     
T  15959 actttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctg 15860  T
Q  965 ccccagactaggtcag 980  Q
    |||| |||||||||||    
T  15859 cccccgactaggtcag 15844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 152; Significance: 6e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 441 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 13054 - 12868
Alignment:
Q  441 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgacggttgggcaatgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13054 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatgtcaaggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 12955  T
Q  541 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtattttttgggagcagatttgtta 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12954 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtat-ttttgggagcagatttgtta 12868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 149; Significance: 4e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 668 - 896
Target Start/End: Original strand, 35593 - 35819
Alignment:
Q  668 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   |||||   | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35593 cttttactataaatatagacattgtatcagtacaaaccgggtgatagaggcg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 35691  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  35692 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagggaaacactattaggatt-aagtctcttggttacgggaagaggctggga 35790  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttat 896  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35791 ctttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 938 - 1019
Target Start/End: Original strand, 35817 - 35899
Alignment:
Q  938 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaact-ggtcaacaaatttctttgtgttctct 1019  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  35817 tatagtggaacggagggctgctctcttccttagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattattttgtgttctct 35899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 143; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 677 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 1958 - 1665
Alignment:
Q  677 taaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 775  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  1958 taaatatagaccttgtatcagatgtaaacctagagatagaggtggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttc- 1861  T
Q  776 ctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggt 875  Q
            |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1860 --------aacaaacactagggtt-gtgg-ttgattcaccttgggaaacacaattaggattg-agtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggt 1772  T
Q  876 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagact 973  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||| |||    
T  1771 agaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgtagggctgctctctcccccatact 1672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 133; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 669 - 938
Target Start/End: Complemental strand, 16981 - 16716
Alignment:
Q  669 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 767  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16981 ttttaatataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctgaaaacaagggttt-gaaagacaaca-caaaactagggtttgtata 16884  T
Q  768 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 867  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  16883 gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtcacttggtgacgggaagagattgaga 16788  T
Q  868 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcat 938  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||    
T  16787 ctttgggtagaattaggccagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 16716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 107; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 667 - 836
Target Start/End: Complemental strand, 1167 - 993
Alignment:
Q  667 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 766  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1167 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 1068  T
Q  767 agagtttgtctc-----ttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 836  Q
    ||||||||||||     || ||||||||||||| | || | |||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  1067 agagtttgtctctttagtttggaacaaacactacgtttggagggttgatccaccttgcgaaatacttttaggatt 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 674 - 980
Target Start/End: Original strand, 4773 - 5077
Alignment:
Q  674 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggg-tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 772  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| || || ||||||| |  | ||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  4773 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggtctgaaaaaaaggatttagaa-gtaagcaacaaa-ctagggtttatatagcgtt 4870  T
Q  773 tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttg 872  Q
    | |||||  | |||||||||||| |||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||   ||||     
T  4871 t-tctctcagcaacaaacactagagttga--gtttgattcatgttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcatgagaagagattgaagctttt 4966  T
Q  873 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccccca 969  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||| |||||||||    ||  ||||||||| |||||    
T  4967 ggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctctttttgtaaagatactcatcattatagtggaacatagaactgctctctgcccca 5066  T
Q  970 gactaggtcag 980  Q
    |||||||||||    
T  5067 gactaggtcag 5077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 949 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 4733 - 4666
Alignment:
Q  949 ggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg-tcaacaaatttctttgtgtt 1015  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  4733 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgtt 4666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 41; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 4)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 2560 - 2504
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  2560 atagtggattggagggctgctgtctcccccagattaggtcatattggagcgaactgg 2504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 5751 - 5695
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  5751 atagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgg 5695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 821 - 884
Target Start/End: Original strand, 224819 - 224880
Alignment:
Q  821 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 884  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  224819 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 224880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 939 - 984
Target Start/End: Original strand, 133309 - 133354
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattg 984  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  133309 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattg 133354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 939 - 1002
Target Start/End: Complemental strand, 45321 - 45257
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactg-gtcaacaa 1002  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||||||    
T  45321 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactgagtcaacaa 45257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 939 - 995
Target Start/End: Original strand, 43990 - 44046
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||    
T  43990 atagtggattggagagctgctctctcccccagaatagatcatattggaccgaactgg 44046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 36; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 940 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 10796 - 10741
Alignment:
Q  940 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||    
T  10796 tagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgg 10741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 824 - 979
Target Start/End: Original strand, 16328 - 16482
Alignment:
Q  824 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 922  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| ||   || ||||||||    
T  16328 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttggaactca---atatctctttg 16422  T
Q  923 taacggtactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    ||| |  ||||  |||| |||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16423 taaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtca 16482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1050
Description:

Target: scaffold1050; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 938 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 3136 - 3095
Alignment:
Q  938 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3136 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 3095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 938 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 17052 - 17011
Alignment:
Q  938 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 979  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17052 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 17011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 939 - 985
Target Start/End: Original strand, 17981 - 18027
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattgg 985  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  17981 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 18027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 939 - 985
Target Start/End: Original strand, 24074 - 24120
Alignment:
Q  939 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattgg 985  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  24074 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 24120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 942 - 995
Target Start/End: Complemental strand, 85748 - 85695
Alignment:
Q  942 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggatcgaactgg 995  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  85748 gtggattggagagccgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgg 85695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University