View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5666_low_20 (Length: 227)

Name: NF5666_low_20
Description: NF5666
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5666_low_20
NF5666_low_20
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (1-227)||(16883266-16883492)
chr6 (1-227)||(20527592-20527818)
chr6 (1-221)||(14790214-14790434)
chr6 (1-221)||(14795242-14795462)
chr6 (1-221)||(32704684-32704903)
chr6 (1-221)||(1838069-1838290)
chr6 (1-221)||(19665093-19665314)
chr6 (1-221)||(32426964-32427182)
chr6 (1-221)||(15534684-15534905)
chr6 (1-221)||(13017619-13017839)
chr6 (1-217)||(22247158-22247374)
chr6 (1-217)||(22221323-22221539)
chr6 (1-184)||(12983808-12983994)
chr6 (1-166)||(12980921-12981089)
chr6 (133-221)||(15537879-15537966)
chr6 (47-110)||(15537971-15538034)
chr6 (1-202)||(7769825-7770031)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (1-227)||(13492852-13493078)
chr1 (1-221)||(13495583-13495803)
chr1 (1-221)||(27282537-27282757)
chr1 (1-227)||(34065934-34066160)
chr1 (1-227)||(16190601-16190832)
chr1 (1-227)||(1936217-1936443)
chr1 (2-221)||(32506285-32506503)
chr1 (4-227)||(23990521-23990743)
chr1 (1-151)||(22104799-22104949)
chr1 (124-221)||(10759717-10759814)
chr1 (1-202)||(21152871-21153071)
chr1 (1-102)||(15297047-15297148)
chr1 (21-202)||(22456940-22457123)
chr1 (1-77)||(22453565-22453641)
chr1 (1-84)||(39545975-39546058)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (1-227)||(6240-6465)
[»] chr5 (11 HSPs)
chr5 (1-227)||(11989247-11989473)
chr5 (1-190)||(7650380-7650566)
chr5 (1-221)||(14616858-14617078)
chr5 (1-221)||(34405444-34405664)
chr5 (1-218)||(22159342-22159560)
chr5 (1-217)||(26712775-26712991)
chr5 (1-217)||(26982513-26982729)
chr5 (1-221)||(33574684-33574904)
chr5 (1-221)||(15532630-15532850)
chr5 (1-221)||(15542812-15543032)
chr5 (1-202)||(23993462-23993665)
[»] chr2 (8 HSPs)
chr2 (1-221)||(23673774-23673994)
chr2 (1-221)||(40017573-40017793)
chr2 (1-221)||(36326520-36326738)
chr2 (1-191)||(13709696-13709886)
chr2 (1-221)||(31527985-31528205)
chr2 (1-217)||(32576116-32576331)
chr2 (1-166)||(16294550-16294715)
chr2 (1-151)||(31626215-31626365)
[»] chr7 (16 HSPs)
chr7 (1-221)||(17863524-17863744)
chr7 (1-221)||(17866783-17867003)
chr7 (1-221)||(6966743-6966963)
chr7 (42-227)||(23313672-23313857)
chr7 (1-221)||(11279088-11279308)
chr7 (21-221)||(24783001-24783201)
chr7 (1-221)||(294460-294680)
chr7 (1-219)||(36843367-36843585)
chr7 (1-207)||(23107597-23107803)
chr7 (1-221)||(46846742-46846959)
chr7 (1-218)||(33312593-33312810)
chr7 (1-221)||(9765393-9765608)
chr7 (1-186)||(36222732-36222918)
chr7 (1-221)||(23760038-23760258)
chr7 (88-208)||(35773047-35773168)
chr7 (115-227)||(3862439-3862551)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (1-221)||(647633-647853)
chr4 (4-221)||(26063126-26063343)
chr4 (1-207)||(26060197-26060403)
chr4 (1-221)||(650905-651126)
chr4 (1-217)||(12171582-12171798)
chr4 (1-227)||(2541475-2541700)
chr4 (115-191)||(16927170-16927245)
[»] scaffold0665 (1 HSPs)
scaffold0665 (1-221)||(74-294)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (1-218)||(2290-2507)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (1-218)||(7422-7639)
[»] chr8 (5 HSPs)
chr8 (1-217)||(12575729-12575945)
chr8 (1-208)||(44007911-44008117)
chr8 (1-221)||(13096626-13096837)
chr8 (112-213)||(41779217-41779318)
chr8 (1-53)||(41779164-41779216)
[»] chr3 (6 HSPs)
chr3 (3-221)||(22626744-22626962)
chr3 (1-215)||(39563940-39564153)
chr3 (1-227)||(13979080-13979302)
chr3 (1-221)||(11138999-11139218)
chr3 (1-202)||(47411806-47412006)
chr3 (1-193)||(35366002-35366192)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (1-227)||(3033-3263)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (3-131)||(24615-24743)
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (1-70)||(9609-9678)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16883492 - 16883266
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16883492 tctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagttcagagtcaaaagtgagggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgcatatt 16883393  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16883392 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaagataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggagtt 16883293  T
Q  201 caacaaatcagggttcccataaaatta 227  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16883292 caacaaattagggttctcataaaatta 16883266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 20527592 - 20527818
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20527592 tctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagttcagagtcaaaagccagggttagtggtcattcaatctctaaaatcaatttgcatatt 20527691  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20527692 cataaagctagggttaggagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaatataaagtaatatgaataaagattagactttcattgatattcaaaggagtt 20527791  T
Q  201 caacaaatcagggttcccataaaatta 227  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||    
T  20527792 caacacattaaggttcccataaaatta 20527818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14790434 - 14790214
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14790434 tctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcatttaatctctaagatcagtttgcatatt 14790335  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  14790334 cataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatgatattcaaaggagtt 14790235  T
Q  201 caacaaatcagggttcccata 221  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  14790234 caacaaattagggttcccata 14790214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14795462 - 14795242
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14795462 tctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcatttaatctctaagatcagtttgcatatt 14795363  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  14795362 cataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatgatattcaaaggagtt 14795263  T
Q  201 caacaaatcagggttcccata 221  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  14795262 caacaaattagggttcccata 14795242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 32704684 - 32704903
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  32704684 tctatctctatcttgattacttaggttaaacttattacttagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcatttaatctctaagatcagtttgcatatt 32704783  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32704784 cataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaaacattaaacataaagtaa-ttgacttaaaactagactttcattgatattcaaaggagtt 32704882  T
Q  201 caacaaatcagggttcccata 221  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  32704883 caacaaattagggttcccata 32704903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1838290 - 1838069
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1838290 tctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagatcagagtcaaaagtcagggttagtggtcattcaatctctaacatcaatttgcatatt 1838191  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaac-atacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggatt 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |    
T  1838190 cataaagttagggttagtagtcgatgataaacaatacaaaaagcatttaacacaaagtaatatgaataaaaactagactttcattgacattcaaaggagt 1838091  T
Q  200 tcaacaaatcagggttcccata 221  Q
    |||| |||| ||||||||||||    
T  1838090 tcaataaattagggttcccata 1838069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 19665093 - 19665314
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||| || || | ||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19665093 tctatctctatcttgattacttaggttaaacctattacctagatcagaattaaaagtcagggttagtgatcattcaatctctaacatcaatttgcatatt 19665192  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaac-atacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggatt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |    
T  19665193 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacaatacaaaaagcatttaacacaaagtaatatgaataaaaactagactttcattgacattcaaatgagt 19665292  T
Q  200 tcaacaaatcagggttcccata 221  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  19665293 tcaacaaattagggttcccata 19665314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32427182 - 32426964
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    ||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  32427182 tctatctctagattgattacttaggttaaacttattacctagatc--agtcaaaatccagagttagtggtcattcaatctctaagatcgatttgcatact 32427085  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32427084 cctaaagccagggttagtggtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatataaattaaaactagactttcattgatattcaaaggagtt 32426985  T
Q  201 caacaaatcagggttcccata 221  Q
    |||||||  ||||||| ||||    
T  32426984 caacaaactagggttctcata 32426964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15534905 - 15534684
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||| ||| |||||||  ||| ||||||| ||||||| || || |||| ||||| || | |||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15534905 tctatcactagcttgattacttatgttaaacctattaccaagatcagagttaaaagtcaagtttagtggtcactcaatctctaacatcaattttcatatt 15534806  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaac-atacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggatt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |    
T  15534805 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacaatacaaaaagcatttaacacaaagtaatatgaataaaaactagactttcattgacattcaaaggagt 15534706  T
Q  200 tcaacaaatcagggttcccata 221  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  15534705 tcaacaaattagggttcccata 15534684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 13017619 - 13017839
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  13017619 tctatctctaacttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaagagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatatt 13017718  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    ||||| |||||||||| ||||| || |||||| |||| || ||||||| || ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||    
T  13017719 cataacgctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcattaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaactttcatttatgttcaaaggagtt 13017818  T
Q  201 caacaaatcagggttcccata 221  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  13017819 caacaaattagggttcccata 13017839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22247374 - 22247158
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  22247374 tctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctggttcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatatt 22247275  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||| || |||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||| || ||    
T  22247274 cataaagctatggttaatagtctatcataaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaaccaaactttcattgatgttcaaaagagtt 22247175  T
Q  201 caacaaatcagggttcc 217  Q
    |||||||| ||||||||    
T  22247174 caacaaattagggttcc 22247158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22221539 - 22221323
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||  ||  || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  22221539 tctatctctagcttgattacttaggttaaacctattaccttttttagatttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatatt 22221440  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||| || |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| || ||    
T  22221439 cataaagctagggttaatagtctatcataaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaagagtt 22221340  T
Q  201 caacaaatcagggttcc 217  Q
    |||||||| ||||||||    
T  22221339 caacaaattagggttcc 22221323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 12983808 - 12983994
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  12983808 tctatctctagcttaattacttaggttaaacatattacctagatcagagtcaaaagtcagggctagtggtcattcaagttctaagatcagtttgcatatt 12983907  T
Q  101 cataaa-gctagggttagtagtc--gatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcatt 184  Q
    || ||| ||||| | ||||| ||   || ||||||||||| | ||||||||||| || |||| |||||| || ||||||||| ||||    
T  12983908 caaaaacgctagtgctagtactcaatataataaacatacagacagcattaaacacaaggtaatatgaattaaaactagacttccatt 12983994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 12980921 - 12981089
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  12980921 tctatctctagcttaattacttaggttaaacatattacctagatcagagtcaaaagtcagggctagtggtcattcaagttctaagatcagtttgcatatt 12981020  T
Q  101 cataaa-gctagggttagtagtc--gatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaat 166  Q
    || ||| ||||| | ||||||||   || ||||||||||| | | ||||||||| || |||| ||||||    
T  12981021 caaaaacgctagtgctagtagtcaatataataaacatacagacaacattaaacacaaggtaatatgaat 12981089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15537966 - 15537879
Alignment:
Q  133 atacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggatttcaacaaatcagggttcccata 221  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  15537966 atacaaaaagcattaa-cataaagtactatgaataaaaattagactttcattgacattcaaaggagttcaacaaattagggttcccata 15537879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 15538034 - 15537971
Alignment:
Q  47 gagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagcta 110  Q
    |||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  15538034 gagttaaaagcaagggttagtgatcattcaatctctaacatcaatttgcatattcataaaacta 15537971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 7769825 - 7770031
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagg----gttagtggttattcaa--tctctaagatcaatttg 94  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||| |||| ||||| || || |||||||||| |    | ||||||| ||||||  ||| |||||| |||||     
T  7769825 tctatctctaacttaattacttaggttaaacatatttcctagatcagattcaaaagccatgcatggctagtggtcattcaagttctataagataaattta 7769924  T
Q  95 catattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaa 194  Q
    || |||||  | ||||| | |||||||  || ||||||||||| |   ||||||||| || | || |||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  7769925 cacattcaagatgctagtgctagtagttaatcataaacatacatatgtcattaaacacaaggaaatatgaattaa-actagactttcattgatattcaag 7770023  T
Q  195 ggatttca 202  Q
    ||| ||||    
T  7770024 ggagttca 7770031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13493078 - 13492852
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13493078 tctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgcatatt 13492979  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13492978 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcattgatattcaaaggagtt 13492879  T
Q  201 caacaaatcagggttcccataaaatta 227  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||    
T  13492878 caacaaactagggttcccataagatta 13492852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13495803 - 13495583
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13495803 tctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagctagggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgcatatt 13495704  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13495703 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcattgatattcaaaggagtt 13495604  T
Q  201 caacaaatcagggttcccata 221  Q
    |||||||  ||||||||||||    
T  13495603 caacaaactagggttcccata 13495583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 27282537 - 27282757
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27282537 tctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaatccagggttagtggtcattcaatctctaagatcaattttcatatt 27282636  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  27282637 cataaagctagggttagtagtcgatgataaagatacaaaaaggattaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcattgatattcaaaggtgtt 27282736  T
Q  201 caacaaatcagggttcccata 221  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  27282737 caacaaattagggttcccata 27282757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34066160 - 34065934
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34066160 tctatctctaacttgattacttaggttaaacttattacctaggtcagagtcaaaagccagggttagtggtcatttaatctctaagatcaatttgcatatt 34066061  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||  | ||    
T  34066060 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacgtacaaaaagcattaaacataacgtaatatgaattaaaactagattttcattgatattcaaaaaagtt 34065961  T
Q  201 caacaaatcagggttcccataaaatta 227  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  34065960 caacaaattaggattcccataagatta 34065934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 16190601 - 16190832
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16190601 tctatctctaacttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagttaaaagccaaggttagtggtcatccaatctctaggatcaatttgcatatt 16190700  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattc-----aaag 195  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||     ||||    
T  16190701 cataaagctaaggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatataaattaaaactagactttcattgatattcaaattaaag 16190800  T
Q  196 gatttcaacaaatcagggttcccataaaatta 227  Q
    || |||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  16190801 gagttcaacaaattagggttcctataagatta 16190832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1936443 - 1936217
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||| | ||  | || ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  1936443 tctatctctagcatgattacttaggttaaacttattacctggatcaaattcgaaagccatggttagtggtcatttaatctctaagatcaattttcatatt 1936344  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  1936343 cataaagttagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaattaaaactagacttccattgatattcaaaggagtt 1936244  T
Q  201 caacaaatcagggttcccataaaatta 227  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||    
T  1936243 caacaaattatggttcccataagatta 1936217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 32506285 - 32506503
Alignment:
Q  2 ctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatattc 101  Q
    ||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32506285 ctatctctagcttgattacttaagttaaacttattacctagatcagagtcaaaagtcagggttagtggtcattcaatctctaagatcgatttgcatattc 32506384  T
Q  102 ataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattc--aaaggatt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||   | || |||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  32506385 ataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaaacattaaacataaagtaatat---ttaaaactagactttcattgatattcaaaaaggagt 32506481  T
Q  200 tcaacaaatcagggttcccata 221  Q
    ||||||||  ||||||||||||    
T  32506482 tcaacaaactagggttcccata 32506503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Original strand, 23990521 - 23990743
Alignment:
Q  4 atctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctc----taagatcaatttgcatat 99  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    | ||||||||||||||||    
T  23990521 atctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcattcaatctcttaattagatcaatttgcatat 23990620  T
Q  100 tcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggatt 199  Q
    |||||||||     ||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||  |||  ||||| || ||||||||||| |  ||||||| |||| |    
T  23990621 tcataaagc-----ttagtagtcaatgataaacatacaaaaaacattgaagataatataatgtgaattaaaactagactttcttaaatattcagaggagt 23990715  T
Q  200 tcaacaaatcagggttcccataaaatta 227  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||    
T  23990716 tcaacaaattagtgttcccataagatta 23990743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 22104799 - 22104949
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||  |||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  22104799 tctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacatagttcagagttaaaaaccagaattagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatatt 22104898  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaaca 151  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  22104899 cataaagctagagttagtagtcgatgataaacctacacaaaacattaaaca 22104949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10759814 - 10759717
Alignment:
Q  124 atgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggatttcaacaaatcagggttcccata 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  10759814 atgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccata 10759717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 21153071 - 21152871
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||||||||  |||| ||||| || |||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||| || |||    
T  21153071 tctatctctagcttaattacttaggttaaatatattccctagatcagagtcaaaagtcagggctagtggtcattcaagttctaagttcaatttacacatt 21152972  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    ||  | ||||| | |||||||| || ||||||||| ||| | ||||||||| || | || |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  21152971 caagatgctagtgctagtagtcaatcataaacatataaacaacattaaacagaaggaaatatgaattaa-actagactttcattgatattcaagggagtt 21152873  T
Q  201 ca 202  Q
    ||    
T  21152872 ca 21152871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 15297148 - 15297047
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||  |||||||||| || || ||||||||||| | ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15297148 tctatctctaacttaattacttaggttaaaactattacctagatcagattcaaaagccagagctagtggtcattcaagttctaagatcaatttgcatatt 15297049  T
Q  101 ca 102  Q
    ||    
T  15297048 ca 15297047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 202
Target Start/End: Original strand, 22456940 - 22457123
Alignment:
Q  21 ttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaa-gctagggttagta 119  Q
    ||||||||||| |||||||||   | |||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||| ||| ||||| | |||||    
T  22456940 ttaggttaaacctattacctaaaacagagtcaaaagtcagggctagtggtcattcaagttctaagatcagtttgcatattcaaaaacgctagtgctagta 22457039  T
Q  120 gtc--gatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggatttca 202  Q
    |||   || ||||||||||||| | |||| |||| || |||| |||||| || ||||||||| |||| | |||||| ||| ||||    
T  22457040 gtcaatataataaacatacaaacaacattgaaca-aaggtaatatgaattaaaactagacttccattaaaattcaagggagttca 22457123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 22453565 - 22453641
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaa 77  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22453565 tctatctctagcttaattacttaggttaaacctattacctaaatcagagtcaaaagccagggctagtggtcattcaa 22453641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 39546058 - 39545975
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaa 84  Q
    |||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||  |||||| || ||||| |||||||    
T  39546058 tctatctctagcttgattacttaagttaaacttattacctagatcagagtcaaaatccattgttagttgtcattcattctctaa 39545975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 6240 - 6465
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    ||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6240 tctatctctaggttgattacttagattaaacttattacctagttcagagtcaaaagtcagggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgcatatt 6339  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  6340 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaacact-gactttcattgatattcaaaggagtt 6438  T
Q  201 caacaaatcagggttcccataaaatta 227  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||    
T  6439 caacaaattaaggttcccataagatta 6465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 11)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 11989247 - 11989473
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||| || ||||||| || ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11989247 tctatctctaacttgattacataggttaaacctaatacctagatcagagtcaaaagcgaaggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgtatatt 11989346  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11989347 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaataaaaactagactttcattgatattcaaaggagtt 11989446  T
Q  201 caacaaatcagggttcccataaaatta 227  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  11989447 caacaaattagggttcccataaaatta 11989473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 7650380 - 7650566
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7650380 tctatctctagcttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagc---ggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 7650476  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatatt 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7650477 cataaagttagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaaacattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatatt 7650566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 14616858 - 14617078
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14616858 tctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccatggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgcatatt 14616957  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  14616958 cataaagttagggttagtattcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcattgatatttaaaggagtt 14617057  T
Q  201 caacaaatcagggttcccata 221  Q
    |||||||  ||||||| ||||    
T  14617058 caacaaactagggttctcata 14617078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34405664 - 34405444
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  34405664 tctatctctagcttgattacttaagttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcatttaatctctaagatcagtttgcatatt 34405565  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  34405564 cataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatgatattcaaaggagtt 34405465  T
Q  201 caacaaatcagggttcccata 221  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  34405464 caacaaattagggttcccata 34405444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22159560 - 22159342
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    ||||||||||  ||||||  ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22159560 tctatctctagtttgattacttaggttaaacctattacctagatcagagtcaaaagccagggttaatggtcattcaatctctaacatcaatttgtatatt 22159461  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaac-atacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggatt 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |    
T  22159460 cataaagctatggttagtagtcgatgataaacaatacaaaaagcattaaacacaaagtaatatgaataaaaactagactttcattgacattcaaaggagt 22159361  T
Q  200 tcaacaaatcagggttccc 218  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  22159360 tcaacaaattagggttccc 22159342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 26712775 - 26712991
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  26712775 tctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatatt 26712874  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  26712875 cataaagctagggttaatagtcaatgataaacatacataaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaactttcattgatgttcaaaggagtt 26712974  T
Q  201 caacaaatcagggttcc 217  Q
    |||||||| ||||||||    
T  26712975 caacaaattagggttcc 26712991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 26982513 - 26982729
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  26982513 tctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatatt 26982612  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  26982613 cataaagctagggttaatagtcaatgataaacatacataaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaactttcattgatgttcaaaggagtt 26982712  T
Q  201 caacaaatcagggttcc 217  Q
    |||||||| ||||||||    
T  26982713 caacaaattagggttcc 26982729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33574904 - 33574684
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  33574904 tctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagttagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatatt 33574805  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||| || |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  33574804 cataaagctagggttaatagtctatcataaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagtt 33574705  T
Q  201 caacaaatcagggttcccata 221  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  33574704 caacaaattagggttcccata 33574684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 15532630 - 15532850
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  15532630 tctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatatt 15532729  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    ||||| |||||||||| ||||| || |||||| |||| || ||||||| || ||||||| | ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  15532730 cataacgctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcattaagcacaaagtaataagaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagtt 15532829  T
Q  201 caacaaatcagggttcccata 221  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  15532830 caacaaattagggttcccata 15532850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 15542812 - 15543032
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  15542812 tctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatatt 15542911  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    ||||| |||||||||| ||||| || |||||| |||| || ||||||| || ||||||| | ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  15542912 cataacgctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcattaagcacaaagtaataagaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagtt 15543011  T
Q  201 caacaaatcagggttcccata 221  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  15543012 caacaaattagggttcccata 15543032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 23993462 - 23993665
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||| | |||| ||||| || || ||||||| || || ||||||| ||||||  |||||||||||| |  | |||    
T  23993462 tctatctctagcttaatttcttaggttaaccatatttcctagatcagattcaaaagtcatggctagtggtcattcaagttctaagatcaatctatacatt 23993561  T
Q  101 cataaagctaggg---ttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaagga 197  Q
    ||  | ||||| |    |||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||| | || ||||||||| |||| | ||| ||||| |||||| |||    
T  23993562 caagatgctagtgctagtagtagtcaatcataaacatacaaacaacattaaacataaggaaatatgaataaa-actatatttttattgagattcaaggga 23993660  T
Q  198 tttca 202  Q
     ||||    
T  23993661 gttca 23993665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 8)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 23673774 - 23673994
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23673774 tctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagtcagggatagtggtcattcaatctctaagatcaatttgcatatt 23673873  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23673874 cataaagttagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcattgatattcaaaggagtt 23673973  T
Q  201 caacaaatcagggttcccata 221  Q
    |||||||| | ||||||||||    
T  23673974 caacaaattaaggttcccata 23673994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40017793 - 40017573
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40017793 tctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagttcaaagtcaaaagccagggtcagtggtcattcaatctctacgatcaatttgcatatt 40017694  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  40017693 cataaagatagggtcagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaactttcattgaaattcaaaggagtt 40017594  T
Q  201 caacaaatcagggttcccata 221  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  40017593 caacaaattagggttcccata 40017573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 36326738 - 36326520
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36326738 tctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcaaagtcaaaagccagggttagtggtcattcaatctctaagatcgatttgcatatt 36326639  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  36326638 cataaagctagggttagtagtcgatgataaac--acaaaaagcattaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcattgatattcaaatgagtt 36326541  T
Q  201 caacaaatcagggttcccata 221  Q
    |||||||  ||||||||||||    
T  36326540 caacaaactagggttcccata 36326520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13709886 - 13709696
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    ||||| |||| |||||||  || |||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13709886 tctatatctagcttgattacttgggttaaacttatcacctaggtcagagtcaaaatccagggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttacatatt 13709787  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||    
T  13709786 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaattaaaattagactttcattgatattc 13709696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31528205 - 31527985
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  31528205 tctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatatt 31528106  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    ||||| |||||||||| ||||| || |||||| |||| || ||||||| || ||||||| | ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  31528105 cataacgctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcattaagcacaaagtaataagaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagtt 31528006  T
Q  201 caacaaatcagggttcccata 221  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  31528005 caacaaattagggttcccata 31527985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 32576116 - 32576331
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| |||| | ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  32576116 tctatctttagcttgattatttaggttaaacatattacctagttcatagtcaaaagacagggtcagtgatcattcaatctatacgatcaatttgcatatt 32576215  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  32576216 cataaagttaggatcagtagtcaatgataaacatgcaaaaagcatt-aacaaaaagtaatatggataaagactaaactttcattgaaattcaaaggagtt 32576314  T
Q  201 caacaaatcagggttcc 217  Q
    |||||||| ||||||||    
T  32576315 caacaaattagggttcc 32576331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 16294715 - 16294550
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  16294715 tctatctctaacttgattacttaggttaaacctattacatagttcagagttaaaagccagagttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatatt 16294616  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||    
T  16294615 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacacaaagcattaaacacaaggtaatatgaat 16294550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 31626365 - 31626215
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||| || |||||    
T  31626365 tctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctataatcaatatgtatatt 31626266  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaaca 151  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  31626265 cataaagctagggttaatagtcgatgataaacatacataaaacattaaaca 31626215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 16)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 17863524 - 17863744
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  17863524 tctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcatttaatctctaagatcagtttgcatatt 17863623  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  17863624 cataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatgatattcaaaggagtt 17863723  T
Q  201 caacaaatcagggttcccata 221  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  17863724 caacaaattagggttcccata 17863744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 17866783 - 17867003
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  17866783 tctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcatttaatctctaagatcagtttgcatatt 17866882  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  17866883 cataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatgatattcaaaggagtt 17866982  T
Q  201 caacaaatcagggttcccata 221  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  17866983 caacaaattagggttcccata 17867003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6966963 - 6966743
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  6966963 tctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcatttaatctctaagatcagtttgaatatt 6966864  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  6966863 cataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatgatattcaaaggagtt 6966764  T
Q  201 caacaaatcagggttcccata 221  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  6966763 caacaaattagggttcccata 6966743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 42 - 227
Target Start/End: Original strand, 23313672 - 23313857
Alignment:
Q  42 gttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaa 141  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23313672 gttcagagtcaaaagccaaggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggtttgtagtcgatgataaacatacaaaaa 23313771  T
Q  142 gcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggatttcaacaaatcagggttcccataaaatta 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| ||||    
T  23313772 gcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggagtttaacaaattagagttcccataagatta 23313857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11279308 - 11279088
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| ||    
T  11279308 tctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatgtt 11279209  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  11279208 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaagcacaaggtaatatgaataaagactaaactttcattgatattcaaaggagtt 11279109  T
Q  201 caacaaatcagggttcccata 221  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  11279108 caacaaattagggttcccata 11279088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24783201 - 24783001
Alignment:
Q  21 ttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggttagtag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24783201 ttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagctatggttagtag 24783102  T
Q  121 tcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggatttcaacaaatcagggttcccat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||    
T  24783101 tcgatgataaacatacaaaaagcatcaaacataaagtaatatggattaaaactagactttcattgatattcaaaggagttcaacaaactacggttcccat 24783002  T
Q  221 a 221  Q
    |    
T  24783001 a 24783001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 294680 - 294460
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  294680 tctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgcatatt 294581  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    |||||| |||| |||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || | || |||||||||||||||||||||| ||    
T  294580 cataaaactagagttaatagttcatgataaacatacaataagcattaaacataaagtaatatgaattaaaattatactttcattgatattcaaaggagtt 294481  T
Q  201 caacaaatcagggttcccata 221  Q
    |||||||  ||||||||||||    
T  294480 caacaaactagggttcccata 294460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 36843367 - 36843585
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36843367 tctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccaggattagtggtcattcaatctctaacatcaatttgcatatt 36843466  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaac-atacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggatt 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |    
T  36843467 cataaagctagggttagtagtcaatgataaacaatataaaaagcattaaacacaaagtaatatgaataaaaactagactttcattgacattcaaa-gagt 36843565  T
Q  200 tcaacaaatcagggttccca 219  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  36843566 tcaacaaattagagttccca 36843585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23107803 - 23107597
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23107803 tctatctctaacttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagtcaaaagtctgggtcagtggtcattcaatctctactatcaatttgcatatt 23107704  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    ||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  23107703 cataacgttagggttaatagtcgatgataaacatgcaaaaagcattaaacaaaaagtaatatgaataaagactaaactttcattgaaattcaaaggagtt 23107604  T
Q  201 caacaaa 207  Q
    |||||||    
T  23107603 caacaaa 23107597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 46846742 - 46846959
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| | ||||||| || | ||||||| ||||| ||    
T  46846742 tctatctctaacttgattacttaggttaaacctattacttagttcagagttaaaagtcagggttagtgatcattcaatttccatgatcaatatgcatgtt 46846841  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    ||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  46846842 ca---agctagggttaatagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaactttcattgatattcaaaggagtt 46846938  T
Q  201 caacaaatcagggttcccata 221  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  46846939 caacaaattagggttcccata 46846959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33312810 - 33312593
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  33312810 tctatctctagcttgattacttaggttaaacatattacctagttcagagttaaaagtcagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatatt 33312711  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| || |||| |||||||||||||| | ||||||| || ||||| ||| ||    
T  33312710 cataaagctagggttaatagtcgatgataaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaattttcattaatgttcaatggagtt 33312611  T
Q  201 caacaaatcagggttccc 218  Q
    |||||||| |||||||||    
T  33312610 caacaaattagggttccc 33312593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9765608 - 9765393
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||     |||||||||||||||     
T  9765608 tctatctctagcttgattacttaagttaaacttattacctagaccagagtcaaaagtcagggttagtggtcattcaatc-----gatcaatttgcatatc 9765514  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| | ||    
T  9765513 cataaagctagggttaatagtcgatggtaaacatgcaaaacgcattaaacataaagtaatatgaataaaaactagacttttattcatattcaaagaagtt 9765414  T
Q  201 caacaaatcagggttcccata 221  Q
    |||||||| ||||||| ||||    
T  9765413 caacaaattagggttctcata 9765393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 36222732 - 36222918
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||| || | ||||||| ||||| ||    
T  36222732 tctatctctaacttgattacttaggttaaatctattagctagttcagagttaaaagcgagggttagtggtcattcaatttccatgatcaatatgcatgtt 36222831  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaa-taaagactagactttcattga 186  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  36222832 cataaagctagggctagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaattaaagactaaactttcattga 36222918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 23760038 - 23760258
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  23760038 tctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcggagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatatt 23760137  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    ||  | |||||| ||| ||||| || |||||| |||| || | | ||| || ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||    
T  23760138 cacgacgctaggattaatagtctatcataaacgtacataaggtactaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaactttcattaatgttcaaaggagtt 23760237  T
Q  201 caacaaatcagggttcccata 221  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  23760238 caacaaattagggttcccata 23760258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 88 - 208
Target Start/End: Original strand, 35773047 - 35773168
Alignment:
Q  88 caatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaaca-tacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattga 186  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  35773047 caatttacatattcataaagttagggttagtagttgatgataaacaatacaaaaagcatttaacacaaagtaatatgaataaaaactaaactttcattga 35773146  T
Q  187 tattcaaaggatttcaacaaat 208  Q
     ||||||| || ||||||||||    
T  35773147 cattcaaatgagttcaacaaat 35773168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 227
Target Start/End: Original strand, 3862439 - 3862551
Alignment:
Q  115 tagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggatttcaacaaatcagggt 214  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||  | | || |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  3862439 tagtagtcaataataaacatacacaaagcattaaaaacaagatgatataaataaaaactagactttcattgatatttaaaggagttcaacaaattagggt 3862538  T
Q  215 tcccataaaatta 227  Q
    || ||||| ||||    
T  3862539 tctcataagatta 3862551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 647633 - 647853
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  647633 tctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggccatttaatctctaagatcagtttgcatatt 647732  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  647733 cataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatgatattcaaaggagtt 647832  T
Q  201 caacaaatcagggttcccata 221  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  647833 caacaaattagggttcccata 647853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 221
Target Start/End: Original strand, 26063126 - 26063343
Alignment:
Q  4 atctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatattcat 103  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26063126 atctctagcttgattacttaggttaacct-attacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcattcaatctctaacatcaatttgcatattcat 26063224  T
Q  104 aaagctagggttagtagtcgatgataaac-atacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggatttca 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  26063225 aaagctagggttattagtcgatgataaacaatacaaaaagcattaaacacaaagtaatatgaataaaaactagactttcattgacattcaaaggagttca 26063324  T
Q  203 acaaatcagggttcccata 221  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26063325 acaaatcagggttcccata 26063343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26060403 - 26060197
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||| ||||||| |||||||||| || |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26060403 tctatctctagcttgattacttaagttaaacatattacctagatcagagtcaaaagtcatggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgtatatt 26060304  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||    
T  26060303 catgaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaataaaatctagacttttattgatattcaaaagagtt 26060204  T
Q  201 caacaaa 207  Q
    |||||||    
T  26060203 caacaaa 26060197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 650905 - 651126
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  650905 tctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggccatttaatctctaagatcagtttgcatatt 651004  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    ||||||| ||||||||| |  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  651005 cataaagttagggttaggaaacaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatgatattcaaaggagtt 651104  T
Q  201 caacaaatca-gggttcccata 221  Q
    |||||||| | |||||||||||    
T  651105 caacaaattaggggttcccata 651126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12171798 - 12171582
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| ||  || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  12171798 tctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattaagaattaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatatt 12171699  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||| || |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  12171698 cataaagctagggttaatagtctatcataaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagtt 12171599  T
Q  201 caacaaatcagggttcc 217  Q
    ||||||||  |||||||    
T  12171598 caacaaatttgggttcc 12171582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2541700 - 2541475
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||||||||| |   ||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| | ||||  ||||||||||   |||| | |    
T  2541700 tctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagttcagagttaaaagccggtgttagtggtcaatcaagttctaagatcagcctgcaaact 2541601  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
     || ||||||||  | |||||| || |||||||||| |||| ||||||||| ||  ||| ||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||| ||    
T  2541600 tatcaagctaggacttgtagtcaataataaacatacgaaaatcattaaacacaagataatatgaataaaaactagacttttattgata-tgaaaggaatt 2541502  T
Q  201 caacaaatcagggttcccataaaatta 227  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||    
T  2541501 caacaaattagagttcccataagatta 2541475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Original strand, 16927170 - 16927245
Alignment:
Q  115 tagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattc 191  Q
    |||||||| || ||||||| ||||| | ||||||||||||   |||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16927170 tagtagtcaatcataaacaaacaaacatcattaaacataagtaaacatgaataaa-actagattttcattgatattc 16927245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0665 (Bit Score: 149; Significance: 7e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0665
Description:

Target: scaffold0665; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 74 - 294
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  74 tctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaaaccagggttagtagtcatttaatctctaagatcagtttgcatatt 173  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  174 cataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatgatattcaaaggagtt 273  T
Q  201 caacaaatcagggttcccata 221  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  274 caacaaattagggttcccata 294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 2507 - 2290
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  |||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||| ||||||| ||||||||    
T  2507 tctatctctagcttgattacttaggtcaaacctattacctagttcagagtaaaaagccagggttagtggtcatttattttctatgatcaatatgcatatt 2408  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||    
T  2407 cataaagctagggttaatagttgatgataaacatacataaagcattaaacacaaagtaatatgaataaagactaaactttcattgaagttcaaaggagtt 2308  T
Q  201 caacaaatcagggttccc 218  Q
    |||||||| |||||||||    
T  2307 caacaaattagggttccc 2290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 7422 - 7639
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||  |||| ||||||| ||||||||    
T  7422 tctatctctagctttattacttaggttaaacctattacctagttctgagtaaaaagccagggttagtggtcaatcaaattctatgatcaatatgcatatt 7521  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||    
T  7522 cataaagctagggttaatagtcgatgataaacatacataaagcattaaactcaaagtaatatgaataaaaactaaactttcatttatgttcaaaggagtt 7621  T
Q  201 caacaaatcagggttccc 218  Q
    |||||||| |||||||||    
T  7622 caacaaattagggttccc 7639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 5)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 12575729 - 12575945
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| | ||  |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12575729 tctatctctaacttgattacttatgttaaacctattaccttgatcaaagtcaaaagccaaggttagtagtcattcaatctctaagatcaatttgcatatt 12575828  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    ||||||| ||||| |||| || ||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12575829 cataaagttagggctagttgttgatgataaagatacaaaaagcgttgaacacaaagtaatatgaataaaaactagactttcattgatattcaaaggagtt 12575928  T
Q  201 caacaaatcagggttcc 217  Q
    |||||||| ||||||||    
T  12575929 caacaaattagggttcc 12575945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 44008117 - 44007911
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    ||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||| | |||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  44008117 tctatttctagcttgattagttaggttaaacttattacctagttcagaatcaaaagccagagtcagtgttcattcaatctctacggtcaatttgcatttt 44008018  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||    
T  44008017 cataaagctagggtcaatagtcgatgataaacata-aaaaagcattaaacaaagagtaataagaataaagactaaactttaattgaaattcaaaggagtt 44007919  T
Q  201 caacaaat 208  Q
    ||||||||    
T  44007918 caacaaat 44007911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13096837 - 13096626
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaag-ccagg-gttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcata 98  Q
    |||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  13096837 tctatctctagcttgattacttagcttaaacttattacctaggtcagagttaaaaggccaggagttagtgatcattcaatctctaagatcaatttgcata 13096738  T
Q  99 ttcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggat 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||          ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||     
T  13096737 ttcataaagctagggatagtagtcgatgataaacatac-aaaagcatta----------aacatcaattaaaactagactttcattgatattcaaaggag 13096649  T
Q  199 ttcaacaaatcagggttcccata 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  13096648 ttcaataaatcagggttcccata 13096626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 112 - 213
Target Start/End: Original strand, 41779217 - 41779318
Alignment:
Q  112 ggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggatttcaacaaatcag 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||    
T  41779217 ggttagtggtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatggataaagactaaactttcattgatatttaaaggagttcaacaaattag 41779316  T
Q  212 gg 213  Q
    ||    
T  41779317 gg 41779318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 41779164 - 41779216
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaa 53  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41779164 tctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagttcagagtcaa 41779216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 6)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Original strand, 22626744 - 22626962
Alignment:
Q  3 tatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatattca 102  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  22626744 tatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattca 22626843  T
Q  103 taaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggatttca 202  Q
    ||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22626844 taacgctagggttaatagtctatcataaacatacataaggcattaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttca 22626943  T
Q  203 acaaatcagggttcccata 221  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  22626944 acaaattagggttcccata 22626962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 39563940 - 39564153
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  39563940 tctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagatt-aaaagtcagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatatt 39564038  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||    
T  39564039 cataaagctagggttaatagtcaatgataaacatacataaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaaactttcattaatgttcaaaggagtt 39564138  T
Q  201 caacaaatcagggtt 215  Q
    |||||||| ||||||    
T  39564139 caacaaattagggtt 39564153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13979302 - 13979080
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||| |||||||||  ||| ||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  13979302 tctatctccaacttgattacttaagttaaaactattacctagttcagagtcgaaagtcagggtcagtggtcattcaatctctacgatcaatttgcat-tt 13979204  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||   ||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| ||    
T  13979203 cataaagctagggtcagtagtcgatgataa---tacgaaaaacattaaacaaaaagtaatatgaaaaaagactaaactttcatttaaattcaaaggagtt 13979107  T
Q  201 caacaaatcagggttcccataaaatta 227  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  13979106 caacaaattagggttcccataagatta 13979080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 11138999 - 11139218
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||||||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  11138999 tctatctctagcttgattactgaggttaaacctattac-tatttcagagttaaaagccagggttagtggccattcaatttctatgatcaatatgcatatt 11139097  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    ||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||| || ||||||| || ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  11139098 cataacgctagggttaatagtttatcataaacatacataaggcattaagcacaaagtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagtt 11139197  T
Q  201 caacaaatcagggttcccata 221  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  11139198 caacaaattagggttcccata 11139218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 47412006 - 47411806
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||  ||||| | ||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  47412006 tctatctctaacttaattacttaggttaaacctattacctagatcagagtcaaaaggcaggactagtgatcattcaagttctaagatcaattttcatatt 47411907  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggattt 200  Q
    ||  ||| ||| | |||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| || |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  47411906 caagaagttagtgctagtagtcaataataaacatacaaacaacattaaacacaaggtaatatgaattaa-actagactttcattgatattcaagggagtt 47411808  T
Q  201 ca 202  Q
    ||    
T  47411807 ca 47411806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 35366192 - 35366002
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| || ||||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||    
T  35366192 tctatctctaacttaattacttaggttaaacctattacctagatcagagtcaaaagccaaggctagtggtcattcaagttttaagatcaatttgcacatt 35366093  T
Q  101 cataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaa 193  Q
    ||  | ||||| | |||||||| || ||||||||| ||| | ||||||||| || |||| |||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  35366092 cacgatgctagtgctagtagtcaataataaacata-aaacaacattaaacacaaggtaatatgaattaa-actagtctttcattaatattcaa 35366002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 3033 - 3263
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatatt 100  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| | ||||||  |||  ||||||||||||||||    
T  3033 tctatctctagcttgattacttaggttaaacgtattacctagttcagagttgaaagccatggttagtgttcattcaaattctgtgatcaatttgcatatt 3132  T
Q  101 cat-aaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacata---aagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaagg 196  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||||| |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| |    
T  3133 cataaaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaaacattaaacacaaagaagtaatatgagtaaagactaaactttcatttaaattcaaatg 3232  T
Q  197 atttcaacaaatcagggttcccataaaatta 227  Q
    | |||||||||| ||| || |||||| ||||    
T  3233 agttcaacaaattaggatttccataagatta 3263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 131
Target Start/End: Original strand, 24615 - 24743
Alignment:
Q  3 tatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatattca 102  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  24615 tatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctggttcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattca 24714  T
Q  103 taaagctagggttagtagtcgatgataaa 131  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  24715 taaagctatggttaatagtctatcataaa 24743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 9678 - 9609
Alignment:
Q  1 tctatctctaacttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaagccagggttagtggt 70  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  9678 tctatctttagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggt 9609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University