View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5667_low_1 (Length: 604)

Name: NF5667_low_1
Description: NF5667
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5667_low_1
NF5667_low_1
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (14-598)||(16254548-16255127)
chr4 (15-598)||(17150684-17151267)
chr4 (13-598)||(6693527-6694112)
chr4 (15-598)||(7844905-7845488)
chr4 (15-583)||(520375-520943)
chr4 (106-412)||(54698404-54698710)
chr4 (106-412)||(26813334-26813640)
chr4 (186-310)||(14933550-14933674)
chr4 (15-50)||(13791747-13791782)
[»] chr7 (16 HSPs)
chr7 (13-598)||(9543687-9544272)
chr7 (13-598)||(16140631-16141216)
chr7 (13-598)||(46498423-46499008)
chr7 (13-598)||(5389618-5390203)
chr7 (13-598)||(26304865-26305450)
chr7 (13-598)||(26361368-26361953)
chr7 (13-598)||(32099689-32100274)
chr7 (13-598)||(6535793-6536378)
chr7 (13-598)||(8502358-8502943)
chr7 (13-598)||(44898608-44899193)
chr7 (43-598)||(13283877-13284432)
chr7 (211-583)||(42596865-42597237)
chr7 (15-175)||(42596698-42596858)
chr7 (106-310)||(7582477-7582681)
chr7 (106-412)||(15175386-15175692)
chr7 (105-411)||(14643414-14643720)
[»] chr6 (12 HSPs)
chr6 (13-598)||(18161374-18161959)
chr6 (13-598)||(16899255-16899840)
chr6 (13-598)||(31358870-31359455)
chr6 (15-583)||(34766667-34767235)
chr6 (15-598)||(18704490-18705073)
chr6 (15-598)||(18710425-18711008)
chr6 (13-404)||(29541756-29542147)
chr6 (399-598)||(29561121-29561320)
chr6 (186-294)||(11375030-11375138)
chr6 (180-310)||(8996052-8996182)
chr6 (180-310)||(9005235-9005365)
chr6 (373-411)||(25895804-25895842)
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (13-598)||(18362586-18363171)
chr5 (13-598)||(26200772-26201357)
chr5 (13-598)||(27413457-27414042)
chr5 (13-598)||(33940629-33941214)
chr5 (15-583)||(20949166-20949734)
chr5 (22-582)||(23375368-23375920)
chr5 (105-411)||(5601579-5601885)
chr5 (106-412)||(30453229-30453535)
chr5 (106-412)||(30458307-30458613)
chr5 (106-412)||(24413672-24413978)
chr5 (105-411)||(24299224-24299530)
chr5 (267-530)||(22456358-22456621)
chr5 (15-88)||(19781874-19781947)
chr5 (105-313)||(21083025-21083233)
chr5 (105-220)||(24289908-24290023)
chr5 (186-310)||(15329397-15329521)
chr5 (186-310)||(18709238-18709362)
chr5 (105-546)||(20037084-20037526)
chr5 (105-177)||(22456711-22456783)
[»] chr8 (11 HSPs)
chr8 (12-598)||(14892199-14892785)
chr8 (13-598)||(21211417-21212002)
chr8 (86-596)||(22832121-22832631)
chr8 (105-404)||(25035989-25036288)
chr8 (105-404)||(25050026-25050325)
chr8 (105-411)||(18233759-18234065)
chr8 (105-411)||(18243210-18243516)
chr8 (105-409)||(33600536-33600840)
chr8 (105-411)||(12916388-12916694)
chr8 (105-313)||(23749925-23750133)
chr8 (186-310)||(45497845-45497969)
[»] chr3 (10 HSPs)
chr3 (13-598)||(8974155-8974740)
chr3 (13-598)||(6423616-6424201)
chr3 (13-598)||(9538444-9539029)
chr3 (13-519)||(12387297-12387802)
chr3 (105-411)||(48979673-48979979)
chr3 (106-412)||(28366704-28367010)
chr3 (105-412)||(4384222-4384529)
chr3 (106-164)||(28374773-28374831)
chr3 (106-164)||(28382595-28382653)
chr3 (22-71)||(11461143-11461192)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (13-598)||(16156192-16156777)
chr1 (15-583)||(1987651-1988219)
chr1 (73-568)||(22959697-22960190)
chr1 (105-343)||(14280754-14280992)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (13-598)||(52979-53562)
[»] chr2 (7 HSPs)
chr2 (13-598)||(45015662-45016247)
chr2 (13-598)||(18652527-18653112)
chr2 (13-598)||(9512211-9512796)
chr2 (15-583)||(27168448-27169016)
chr2 (15-598)||(22903455-22904033)
chr2 (105-411)||(1791955-1792261)
chr2 (180-304)||(24990450-24990574)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (13-598)||(148017-148602)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (15-583)||(6030-6598)
[»] scaffold0313 (2 HSPs)
scaffold0313 (15-583)||(7080-7648)
scaffold0313 (15-583)||(10862-11430)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (13-433)||(20084-20504)
scaffold0141 (429-598)||(27670-27839)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (22-582)||(16545-17097)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (180-469)||(1-290)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (73-568)||(189005-189498)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (387-596)||(1-210)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (429-598)||(86973-87142)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (106-412)||(102918-103224)
scaffold0028 (180-310)||(83027-83157)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (105-411)||(257898-258204)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (180-310)||(5060-5190)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 457; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 598
Target Start/End: Original strand, 16254548 - 16255127
Alignment:
Q  14 catcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactct 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16254548 catcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagttgtcacagaaaagagtacatggtcaacagatgaaaaagctcaagtattgttaaactct 16254647  T
Q  114 aaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatac 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  16254648 aaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtaagaatgctaaaga-----gggataccttgaaaatac 16254742  T
Q  214 atcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgagat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16254743 atcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagat 16254842  T
Q  314 ttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagt 413  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16254843 gtatgctagatttactacaatagtaaatgatatgagatctcttggaaaggcatattctactcatgatagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagt 16254942  T
Q  414 gtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtac 513  Q
     ||||  ||| |||||||||   ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16254943 atgtggagacctatggtcactgtaattacttaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtac 16255042  T
Q  514 ttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16255043 ttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgctgatgatgatgt 16255127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 598
Target Start/End: Original strand, 17150684 - 17151267
Alignment:
Q  15 atcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactcta 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  17150684 atcacagatggagactttgttccaacaaccaacgaaggaactgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaatgctcaggtattgttaaacttta 17150783  T
Q  115 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 214  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17150784 aagctagactctttctatcatttgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaataca 17150883  T
Q  215 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgagatt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  17150884 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagttagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 17150983  T
Q  315 tatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtg 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17150984 tatgctagatttactacaatagtaaattaaatgagatatcttgaaaaggcatattctactcatgtttgaattagaaaaatattaagatgtcttccaagtg 17151083  T
Q  415 tgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtact 514  Q
    | ||  ||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17151084 tttggagacctatggtcaatgcaattactcaggccaaagatttataatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtact 17151183  T
Q  515 tcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  17151184 tcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagtagctgatgatgatgt 17151267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 598
Target Start/End: Original strand, 6693527 - 6694112
Alignment:
Q  13 tcatcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 112  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  6693527 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 6693626  T
Q  113 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  6693627 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 6693726  T
Q  213 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgaga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6693727 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 6693826  T
Q  313 tttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 412  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  6693827 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 6693926  T
Q  413 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 512  Q
    | ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6693927 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 6694026  T
Q  513 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  6694027 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 6694112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 7845488 - 7844905
Alignment:
Q  15 atcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactcta 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  7845488 atcacagatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctataaaggaaaagaaggcatggtcaacagatgaaaaggctcatgtattactaaactcta 7845389  T
Q  115 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||  |||||||| |    
T  7845388 aagctagactttttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgagtgtaaaaatgccaaagaggtatgggacactctgaaaatata 7845289  T
Q  215 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgagatt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  7845288 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgatattggagtcagaaaatttgaagtttttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 7845189  T
Q  315 tatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtg 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7845188 tatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcttattctacttatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtg 7845089  T
Q  415 tgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtact 514  Q
    | ||  ||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  7845088 tatggagacctatggtcactgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaatctagaagatctcattggctcattgagagctcatgaagttgtact 7844989  T
Q  515 tcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  7844988 tcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaagacacttgcattgaaagcatctcaacaaagctcattagtagctgatgatgatgt 7844905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 520943 - 520375
Alignment:
Q  15 atcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactcta 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||     ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  520943 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 520844  T
Q  115 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  520843 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 520744  T
Q  215 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgagatt 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  520743 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 520644  T
Q  315 tatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtg 414  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  520643 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaaacatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagta 520544  T
Q  415 tgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtact 514  Q
    ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  520543 tgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 520444  T
Q  515 tcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 583  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  520443 tcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 520375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 54698710 - 54698404
Alignment:
Q  106 taaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacctt 205  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||| ||  |    
T  54698710 taaactctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtgtgggacactct 54698611  T
Q  206 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccatt 305  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| | || |||||||| ||| |||| | ||||    
T  54698610 aaaaattcatcatgaaggaactagccatgtaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatctttgaaatgaacgaagatgagaacatt 54698511  T
Q  306 gatgagatttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtc 405  Q
    ||||| || ||  | ||||| ||  | || || |||||| | ||||| ||||||||  | ||  | ||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  54698510 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcacttggaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaatcttaagatgtc 54698411  T
Q  406 ttccaag 412  Q
    |||||||    
T  54698410 ttccaag 54698404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 412
Target Start/End: Original strand, 26813334 - 26813640
Alignment:
Q  106 taaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacctt 205  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| |||||||| ||||| ||  |    
T  26813334 taaactccaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgttactgcaaaagaagtttgggacactct 26813433  T
Q  206 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccatt 305  Q
     ||||| ||||||||||| ||    || || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||| | ||||||||||| ||| |||| | ||||    
T  26813434 aaaaattcatcatgagggaactagccacgtaaaagaaacaagaatagatattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacatt 26813533  T
Q  306 gatgagatttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtc 405  Q
    ||||| || ||  | ||||| ||  | || || |||||| | ||||| || |||||  | ||  | ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  26813534 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcactgggaaaaacttataccactcatgatcgaataagaaaaattttaagatgtc 26813633  T
Q  406 ttccaag 412  Q
    |||||||    
T  26813634 ttccaag 26813640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Original strand, 14933550 - 14933674
Alignment:
Q  186 aaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaa 285  Q
    |||||| | |||||| | || |||||||||||||| |||||   ||| || |||||||| ||||||||||| || ||  |||||| |||| | |||||||    
T  14933550 aaagaaatttgggatgctttcaaaatacatcatgaaggtaccagtcacgtgaaagaaacaagaattgacatcggtgtacgaaaatatgaactattcgaaa 14933649  T
Q  286 tgaatgaaaatgaaaccattgatga 310  Q
    |||| ||||  |||||||| |||||    
T  14933650 tgaaggaaaccgaaaccatagatga 14933674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 13791782 - 13791747
Alignment:
Q  15 atcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaa 50  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13791782 atcaaagatggagactttgttccaacaaccaaagaa 13791747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 454; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 9544272 - 9543687
Alignment:
Q  13 tcatcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  9544272 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 9544173  T
Q  113 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9544172 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggataccctgaaaata 9544073  T
Q  213 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgaga 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9544072 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtttttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 9543973  T
Q  313 tttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 412  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  9543972 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactaagatgtcttccaag 9543873  T
Q  413 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 512  Q
    | ||||  ||| |||||||||  |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9543872 tatgtggagacctatggtcactgcaatcacccaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatcttattggttcactgagagctcatgaagttgta 9543773  T
Q  513 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||    
T  9543772 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaagctcatcagctgctgaagatgatgt 9543687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 16141216 - 16140631
Alignment:
Q  13 tcatcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  16141216 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 16141117  T
Q  113 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16141116 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 16141017  T
Q  213 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgaga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16141016 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 16140917  T
Q  313 tttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 412  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  16140916 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 16140817  T
Q  413 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 512  Q
    ||||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16140816 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 16140717  T
Q  513 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  16140716 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 16140631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 442; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 598
Target Start/End: Original strand, 46498423 - 46499008
Alignment:
Q  13 tcatcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  46498423 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 46498522  T
Q  113 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  46498523 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 46498622  T
Q  213 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgaga 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46498623 catcatgagggtacatttcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 46498722  T
Q  313 tttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 412  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  46498723 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 46498822  T
Q  413 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 512  Q
    ||||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46498823 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 46498922  T
Q  513 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||    
T  46498923 ctttaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaactccatcagttgctgatgaagatgt 46499008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 5390203 - 5389618
Alignment:
Q  13 tcatcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 112  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  5390203 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 5390104  T
Q  113 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5390103 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 5390004  T
Q  213 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgaga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5390003 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 5389904  T
Q  313 tttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 412  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  5389903 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 5389804  T
Q  413 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 512  Q
    | ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5389803 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 5389704  T
Q  513 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  5389703 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 5389618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 598
Target Start/End: Original strand, 26304865 - 26305450
Alignment:
Q  13 tcatcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 112  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  26304865 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 26304964  T
Q  113 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26304965 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 26305064  T
Q  213 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgaga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26305065 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 26305164  T
Q  313 tttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 412  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  26305165 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 26305264  T
Q  413 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 512  Q
    | ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26305265 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 26305364  T
Q  513 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  26305365 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 26305450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 26361953 - 26361368
Alignment:
Q  13 tcatcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 112  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  26361953 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 26361854  T
Q  113 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26361853 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 26361754  T
Q  213 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgaga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26361753 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 26361654  T
Q  313 tttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 412  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  26361653 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 26361554  T
Q  413 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 512  Q
    | ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26361553 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 26361454  T
Q  513 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  26361453 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 26361368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 598
Target Start/End: Original strand, 32099689 - 32100274
Alignment:
Q  13 tcatcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 112  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  32099689 tcatcacaaatggagattttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattattaaactc 32099788  T
Q  113 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  32099789 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 32099888  T
Q  213 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgaga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32099889 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 32099988  T
Q  313 tttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 412  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  32099989 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 32100088  T
Q  413 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 512  Q
    | ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32100089 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 32100188  T
Q  513 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  32100189 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 32100274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 598
Target Start/End: Original strand, 6535793 - 6536378
Alignment:
Q  13 tcatcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 112  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  6535793 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcagcagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 6535892  T
Q  113 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  6535893 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 6535992  T
Q  213 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgaga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6535993 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 6536092  T
Q  313 tttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 412  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  6536093 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 6536192  T
Q  413 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 512  Q
    | ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6536193 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 6536292  T
Q  513 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  6536293 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 6536378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 598
Target Start/End: Original strand, 8502358 - 8502943
Alignment:
Q  13 tcatcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 112  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  8502358 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 8502457  T
Q  113 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  8502458 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 8502557  T
Q  213 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgaga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  8502558 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaaa 8502657  T
Q  313 tttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 412  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  8502658 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 8502757  T
Q  413 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 512  Q
    | ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8502758 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 8502857  T
Q  513 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  8502858 cttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 8502943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 598
Target Start/End: Original strand, 44898608 - 44899193
Alignment:
Q  13 tcatcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 112  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  44898608 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 44898707  T
Q  113 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  44898708 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 44898807  T
Q  213 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgaga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  44898808 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtaaaaatgaaaccattgatgaga 44898907  T
Q  313 tttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 412  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  44898908 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 44899007  T
Q  413 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 512  Q
    | ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44899008 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 44899107  T
Q  513 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  44899108 cttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 44899193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 43 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 13284432 - 13283877
Alignment:
Q  43 ccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatg-gtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcac 141  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13284432 ccaaagaaggaaccatcaaagaaaagagtgcatgtgtcaacagatgaaaaatctcaagtattgttaaattctaaagctagactctttctattatgtgcac 13284333  T
Q  142 taaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaaga 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13284332 taaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaagaatgctaaagaggtatgggatactttgaaagtacatcatgaaggtacatctcatgtcaaaga 13284233  T
Q  242 aactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgagatttatgctagatttactacaatagtaaat 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13284232 aactagaattgacattggagtcaaaaagtttgaatcttt-gaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttactgcaatagtaaat 13284134  T
Q  342 gaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtgtgtgaggacatatggtcacaacaatta 441  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||  |||| |    
T  13284133 gaaatgagatctcttgggaaggcatactccactcatgagagaatcagaaaaatattaagatgccttccaagtatgtggagacctatggtcacttcaatca 13284034  T
Q  442 ctcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagataaaccagtgaagaaggt 541  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  13284033 ctcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcacttagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaactagtaaagaaggt 13283934  T
Q  542 aaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    |||  |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||   ||||||||||||    
T  13283933 aaagtcacttgccttgaaagcctctcagtaaacttcatcagtaactgatgatgatgt 13283877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 211 - 583
Target Start/End: Original strand, 42596865 - 42597237
Alignment:
Q  211 tacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatga 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  42596865 tacatcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaactataattgacattagagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgtgaatgaaaccattgatga 42596964  T
Q  311 gatttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttcca 410  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  42596965 gatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgccttcca 42597064  T
Q  411 agtgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttg 510  Q
    ||| |||   ||| |||||||||  |||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  42597065 agtatgtagagacctatggtcactgcaatcactgaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcatttgttcactgagagctcatgaagttg 42597164  T
Q  511 tacttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 583  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  42597165 tacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcaacaaacctcatcagt 42597237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 175
Target Start/End: Original strand, 42596698 - 42596858
Alignment:
Q  15 atcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactcta 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42596698 atcacagatggagactttgttccaaagaccaaaaaaggaaccatcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaactcta 42596797  T
Q  115 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatg 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42596798 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagaggtgatgaatg 42596858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 310
Target Start/End: Original strand, 7582477 - 7582681
Alignment:
Q  106 taaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacctt 205  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||| ||  |    
T  7582477 taaattctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtttgggacactct 7582576  T
Q  206 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccatt 305  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||| | |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||| ||| |||| | ||||    
T  7582577 aaaaattcatcatgaaggaactagccatttaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacatt 7582676  T
Q  306 gatga 310  Q
    |||||    
T  7582677 gatga 7582681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 412
Target Start/End: Original strand, 15175386 - 15175692
Alignment:
Q  106 taaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacctt 205  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |  || ||||| || ||||| ||  |    
T  15175386 taaactctaaagcttgactttttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgttacggcaaaagaggtttgggacactct 15175485  T
Q  206 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccatt 305  Q
     ||||| |||||||| |  ||    ||  | |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||| | ||||||||||| ||| |||| | ||||    
T  15175486 aaaaattcatcatgaagaaactagccacataaaagaaacaagaatagatattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacatt 15175585  T
Q  306 gatgagatttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtc 405  Q
    ||||| || ||  | ||||| ||  | || || |||||| | ||||| ||||||||  | ||  | ||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  15175586 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcacttggaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaatcttaagatgtc 15175685  T
Q  406 ttccaag 412  Q
    |||||||    
T  15175686 ttccaag 15175692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 14643720 - 14643414
Alignment:
Q  105 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 204  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||||| || |  || |||||| | |||||||| |    
T  14643720 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaactatggaggaaagtgaaagaatctatgaatgcactacggcaaaagaaatttgggatacgt 14643621  T
Q  205 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccat 304  Q
    | ||||| || ||||| || ||    ||||| |||||||| || || |||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||| |||  | |||| |||    
T  14643620 taaaaattcaccatgaaggaaccagccatgttaaagaaacaaggatagacattggcgtacgaaaatttgaaattttcgaaatgagtgatgaagaaaacat 14643521  T
Q  305 tgatgagatttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 404  Q
    |||||| || ||| |  |||| ||| | |||||||||||  | || ||  | |||||   ||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14643520 tgatgaaatgtattcacgattcacttctatagtaaatgagttaaggtcattgggaaaaatatactcccctcatgacagaattagaaaaatattaagatgt 14643421  T
Q  405 cttccaa 411  Q
    || ||||    
T  14643420 ctcccaa 14643414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 446; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 598
Target Start/End: Original strand, 18161374 - 18161959
Alignment:
Q  13 tcatcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  18161374 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 18161473  T
Q  113 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18161474 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 18161573  T
Q  213 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgaga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18161574 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 18161673  T
Q  313 tttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 412  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  18161674 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 18161773  T
Q  413 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 512  Q
    ||||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18161774 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 18161873  T
Q  513 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  18161874 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 18161959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 598
Target Start/End: Original strand, 16899255 - 16899840
Alignment:
Q  13 tcatcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 112  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  16899255 tcatcacagatggagactatgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 16899354  T
Q  113 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  16899355 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgagatactctgaaaata 16899454  T
Q  213 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgaga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16899455 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 16899554  T
Q  313 tttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 412  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  16899555 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattcaactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 16899654  T
Q  413 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 512  Q
    ||||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16899655 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 16899754  T
Q  513 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  16899755 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 16899840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 598
Target Start/End: Original strand, 31358870 - 31359455
Alignment:
Q  13 tcatcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 112  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  31358870 tcatcacaaatgaagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 31358969  T
Q  113 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  31358970 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 31359069  T
Q  213 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgaga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31359070 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 31359169  T
Q  313 tttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 412  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  31359170 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 31359269  T
Q  413 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 512  Q
    | ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31359270 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 31359369  T
Q  513 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  31359370 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 31359455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 583
Target Start/End: Original strand, 34766667 - 34767235
Alignment:
Q  15 atcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactcta 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||     ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34766667 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 34766766  T
Q  115 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  34766767 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 34766866  T
Q  215 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgagatt 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  34766867 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 34766966  T
Q  315 tatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtg 414  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  34766967 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagta 34767066  T
Q  415 tgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtact 514  Q
    ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34767067 tgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 34767166  T
Q  515 tcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 583  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  34767167 tcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 34767235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 18705073 - 18704490
Alignment:
Q  15 atcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactcta 114  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||    
T  18705073 atcacagatggagactttgttgcaacaaccaaataaggagctgtaaaggaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcatgtattactaaactcta 18704974  T
Q  115 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || ||  ||| | ||||    
T  18704973 aagctagactctttttatcatgtgcactgaccatggaagaaagtgcaagagttgatgagtgtaaaaatgccaaagaggtatgagacactctgagagtaca 18704874  T
Q  215 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgagatt 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18704873 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaattttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatt 18704774  T
Q  315 tatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtg 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||     
T  18704773 tatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggaatattccactcatgagagaatcagaaagattctaagatgtcttccaagta 18704674  T
Q  415 tgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtact 514  Q
    ||||  ||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18704673 tgtggagacctatggtcactgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgcagttgtact 18704574  T
Q  515 tcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||    
T  18704573 tcaaggagacaacccagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcttctcagcaaacctcataagtagctgatgatgatgt 18704490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 18711008 - 18710425
Alignment:
Q  15 atcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactcta 114  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||    
T  18711008 atcacagatggagactttgttgcaacaaccaaataaggagctgtaaaggaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcatgtattactaaactcta 18710909  T
Q  115 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || ||  ||| | ||||    
T  18710908 aagctagactctttttatcatgtgcactgaccatggaagaaagtgcaagagttgatgagtgtaaaaatgccaaagaggtatgagacactctgagagtaca 18710809  T
Q  215 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgagatt 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  18710808 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 18710709  T
Q  315 tatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtg 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||     
T  18710708 tatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggaatattccactcatgagagaatcagaaagattctaagatgtcttccaagta 18710609  T
Q  415 tgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtact 514  Q
    ||||  ||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18710608 tgtggagacctatggtcactgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgcagttgtact 18710509  T
Q  515 tcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||    
T  18710508 tcaaggagacaacccagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcttctcagcaaacctcataagtagctgatgatgatgt 18710425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 404
Target Start/End: Original strand, 29541756 - 29542147
Alignment:
Q  13 tcatcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29541756 tcatcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 29541855  T
Q  113 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29541856 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 29541955  T
Q  213 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgaga 312  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29541956 catcatgagggtcaatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagttagaaaatttgaagtctttaaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 29542055  T
Q  313 tttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 404  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29542056 tgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgaaatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 29542147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 399 - 598
Target Start/End: Original strand, 29561121 - 29561320
Alignment:
Q  399 agatgtcttccaagtgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagag 498  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29561121 agatgtctttcaagtgtgtgaggacatatggtcacaacaattacttaggccaaagatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagag 29561220  T
Q  499 ctcatgaagttgtacttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  29561221 ctcatgaagtcgtacttcaaggagataaaccagtgaagaatgtaaaaacacttgctttgaaagcatctcagcaaacctcatcagtagctgatgatgatgt 29561320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 294
Target Start/End: Original strand, 11375030 - 11375138
Alignment:
Q  186 aaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaa 285  Q
    |||||| | |||||||| || |||||||||||||| || ||   |||||| |||||||| ||||||||||| || ||  ||||||||||| | |||||||    
T  11375030 aaagaaatttgggatacattaaaaatacatcatgaaggaactagtcatgtgaaagaaacaagaattgacataggtgtacgaaaatttgaattattcgaaa 11375129  T
Q  286 tgaatgaaa 294  Q
    |||| ||||    
T  11375130 tgaaggaaa 11375138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Original strand, 8996052 - 8996182
Alignment:
Q  180 aatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttt 279  Q
    ||||| |||||| | ||||| || |||||  |||||||||| || ||   ||| || |||||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||| | |    
T  8996052 aatgccaaagaaatttgggacacattgaaggtacatcatgaaggcaccaatcacgtaaaagaaacaagaattgacattggtgttcgaaagtttgaactat 8996151  T
Q  280 tcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatga 310  Q
    |||||||||| ||||  |||||||| |||||    
T  8996152 tcgaaatgaaagaaaccgaaaccatagatga 8996182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Original strand, 9005235 - 9005365
Alignment:
Q  180 aatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttt 279  Q
    ||||| |||||| | ||||| || |||||  |||||||||| || ||   ||| || |||||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||| | |    
T  9005235 aatgccaaagaaatttgggacacattgaaggtacatcatgaaggcaccaatcacgtaaaagaaacaagaattgacattggtgttcgaaagtttgaactat 9005334  T
Q  280 tcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatga 310  Q
    |||||||||| ||||  |||||||| |||||    
T  9005335 tcgaaatgaaagaaaccgaaaccatagatga 9005365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 373 - 411
Target Start/End: Original strand, 25895804 - 25895842
Alignment:
Q  373 ctcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaa 411  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25895804 ctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgtctcccaa 25895842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 446; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 598
Target Start/End: Original strand, 18362586 - 18363171
Alignment:
Q  13 tcatcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  18362586 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 18362685  T
Q  113 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18362686 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 18362785  T
Q  213 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgaga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18362786 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 18362885  T
Q  313 tttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 412  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  18362886 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 18362985  T
Q  413 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 512  Q
    ||||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18362986 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 18363085  T
Q  513 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  18363086 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 18363171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 26201357 - 26200772
Alignment:
Q  13 tcatcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 112  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  26201357 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 26201258  T
Q  113 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26201257 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 26201158  T
Q  213 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgaga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26201157 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 26201058  T
Q  313 tttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 412  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  26201057 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 26200958  T
Q  413 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 512  Q
    | ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26200957 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 26200858  T
Q  513 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  26200857 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 26200772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 598
Target Start/End: Original strand, 27413457 - 27414042
Alignment:
Q  13 tcatcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||| |     
T  27413457 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaaggtcaggtattactaaattt 27413556  T
Q  113 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27413557 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 27413656  T
Q  213 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgaga 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27413657 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagttagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 27413756  T
Q  313 tttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 412  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  27413757 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 27413856  T
Q  413 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 512  Q
    ||||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27413857 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 27413956  T
Q  513 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  27413957 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgctttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 27414042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 598
Target Start/End: Original strand, 33940629 - 33941214
Alignment:
Q  13 tcatcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 112  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  33940629 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 33940728  T
Q  113 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  33940729 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 33940828  T
Q  213 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgaga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33940829 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 33940928  T
Q  313 tttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 412  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  33940929 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 33941028  T
Q  413 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 512  Q
    | ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33941029 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 33941128  T
Q  513 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  33941129 cttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 33941214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 583
Target Start/End: Original strand, 20949166 - 20949734
Alignment:
Q  15 atcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactcta 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||     ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20949166 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 20949265  T
Q  115 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20949266 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 20949365  T
Q  215 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgagatt 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  20949366 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 20949465  T
Q  315 tatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtg 414  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  20949466 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagta 20949565  T
Q  415 tgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtact 514  Q
    ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20949566 tgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaggatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 20949665  T
Q  515 tcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 583  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  20949666 tcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 20949734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 22 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 23375920 - 23375368
Alignment:
Q  22 atggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactctaaagctag 121  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  23375920 atggagactttgttccaaagactaaagaaggaaccatcaaacaaaagagtgcatggtcaatagatgacaaagctcatgtattgttaaactctaaacctag 23375821  T
Q  122 actctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgag 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||| |  || | | |||  |||||     
T  23375820 actctttttatcatgtgcactaaccatggaagaaaatgaaagagttgataaatgcaagaatgctaaagaggtatgggaaattttaagagtacgccatgaa 23375721  T
Q  222 ggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgagatttatgcta 321  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| | |||||| || ||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||  ||    
T  23375720 ggtacctctcatgtcaaggaaaccagaattaacataggagtcagaaagtgtgaagtctttgaaatgagtgagaatgaaactattgatgaaatgtatttta 23375621  T
Q  322 gatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtgtgtgagg 421  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| | ||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||     ||||| ||||  |    
T  23375620 gatttactacaatagtaaatgagatgaggtctcttcgaaaagtatattccactcatgaaagaatcagaaaaatattgagatg-----caagtatgtggag 23375526  T
Q  422 acatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaagga 521  Q
    || |||||      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  23375525 acctatgg---atgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaaccttgaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaaaa 23375429  T
Q  522 gataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcag 582  Q
    || ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  23375428 gacaaaccagtgaaaaaggtaaaatcactttccttgaaagcatctcaacaaacttcatcag 23375368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 105 - 411
Target Start/End: Original strand, 5601579 - 5601885
Alignment:
Q  105 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 204  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||| | || ||||||||      
T  5601579 ttaaattctaaagctcgactctttctatcatgtgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgatactgcaaaaaaggtgtgggatactc 5601678  T
Q  205 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccat 304  Q
    | ||| | |||||||| || |||   ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| | || ||||||| |||| |||||| |||    
T  5601679 tcaaagtccatcatgaaggaacaagccatgttaaagaaacaagaattgacattggtgtgagaaagtttgaaatctttgaaatgattgaagatgaaaacat 5601778  T
Q  305 tgatgagatttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 404  Q
    |||||| || ||  ||||||| ||  | |||||||||||| | ||||| ||||||||  | || ||||| || || ||||| ||||||||| ||||||||    
T  5601779 tgatgaaatgtactctagattcacatctatagtaaatgaactaagatcacttggaaaaacttattctacccacgacagaataagaaaaatactaagatgt 5601878  T
Q  405 cttccaa 411  Q
    |||||||    
T  5601879 cttccaa 5601885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 30453535 - 30453229
Alignment:
Q  106 taaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacctt 205  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||| ||  |    
T  30453535 taaactctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtgtgggacactct 30453436  T
Q  206 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccatt 305  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||| ||| |||| | ||||    
T  30453435 aaaaattcatcatgaaggaactagccatgtaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacatt 30453336  T
Q  306 gatgagatttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtc 405  Q
    ||||| || ||  | ||||| ||  | || || |||||| | ||||| ||||||||  | ||  | ||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  30453335 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcacttggaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaatcttaagatgtc 30453236  T
Q  406 ttccaag 412  Q
    |||||||    
T  30453235 ttccaag 30453229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 30458613 - 30458307
Alignment:
Q  106 taaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacctt 205  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||| ||  |    
T  30458613 taaactctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtgtgggacactct 30458514  T
Q  206 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccatt 305  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||| ||| |||| | ||||    
T  30458513 aaaaattcatcatgaaggaactagccatgtaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacatt 30458414  T
Q  306 gatgagatttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtc 405  Q
    ||||| || ||  | ||||| ||  | || || |||||| | ||||| ||||||||  | ||  | ||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  30458413 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcacttggaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaatcttaagatgtc 30458314  T
Q  406 ttccaag 412  Q
    |||||||    
T  30458313 ttccaag 30458307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 412
Target Start/End: Original strand, 24413672 - 24413978
Alignment:
Q  106 taaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacctt 205  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||| ||  |    
T  24413672 taaactctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtgtgggacactct 24413771  T
Q  206 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccatt 305  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||| ||| |||| | ||||    
T  24413772 aaaaattcatcatgaaggaactagccatgtaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacatt 24413871  T
Q  306 gatgagatttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtc 405  Q
    ||||| || ||  | ||||| ||  | || || |||||| | ||||| |||| |||  | ||  | ||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  24413872 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcacttgaaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaatcttaagatgtc 24413971  T
Q  406 ttccaag 412  Q
    |||||||    
T  24413972 ttccaag 24413978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 24299530 - 24299224
Alignment:
Q  105 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 204  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  || |||||| | |||||||| |    
T  24299530 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgtactacggcaaaagaaatttgggatacgt 24299431  T
Q  205 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccat 304  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||| ||| |||||||||||| |||| | ||||  ||    
T  24299430 taaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaattcgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaatat 24299331  T
Q  305 tgatgagatttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 404  Q
    |||||| || ||| |  |||| ||| | ||||| |||||  | |||||  | |||||   ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24299330 tgatgaaatgtattcatgattcacttctatagtgaatgagttaagatcattgggaaaaatatattcccctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgt 24299231  T
Q  405 cttccaa 411  Q
    || ||||    
T  24299230 ctcccaa 24299224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 267 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 22456621 - 22456358
Alignment:
Q  267 aaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgagatttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcat 366  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| | |||| ||||||||| || |||   ||||||||| | | |||||||||  |||| ||  | |||||   ||    
T  22456621 aaatttgaaatcttcgaaatgaatgaagaggaaaacattgatgaaatgtatttcagatttacttctaaagtaaatgagttgaggtcattgggaaaaatat 22456522  T
Q  367 aatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctat 466  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||  ||| |||||| |||  ||| ||||| |||||| ||||||| ||  |    
T  22456521 attctcctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgtcttcctaatatatggagacctatggttacagaaatcactcaagccaaagatttaaattcctt 22456422  T
Q  467 gaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagataaacca 530  Q
    |    |  |||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||    
T  22456421 ggctttagaagatctcattggaacactaagagctcatgaagttttgcttcaagaagacaaacca 22456358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 88
Target Start/End: Original strand, 19781874 - 19781947
Alignment:
Q  15 atcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatga 88  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19781874 atcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagttgtaaaggaaaatagtgcatggtccacagatga 19781947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 21083233 - 21083025
Alignment:
Q  105 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 204  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||| |||||||  ||| || |||||||  ||| ||||| || |||||||| | |||||||||  |||||||  |||    
T  21083233 ttaaactctaaagctcaactttttctaacatgtgctttaagcagggaagaatatgatagagtagaagaatgtacaactgctaaagagatatgggaagcct 21083134  T
Q  205 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccat 304  Q
    | ||||| |||||||| || |||  ||||||||| |||   ||||| ||||| ||||| |  |||||||||   ||||| ||||| |||| |||||||||    
T  21083133 taaaaattcatcatgaaggaacaagtcatgtcaaggaagaaagaatagacatgggagttaagaaatttgaaaccttcgagatgaaagaaagtgaaaccat 21083034  T
Q  305 tgatgagat 313  Q
    |||||||||    
T  21083033 tgatgagat 21083025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24290023 - 24289908
Alignment:
Q  105 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 204  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  || |||||| | |||||||| |    
T  24290023 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgtactacggcaaaagaaatttgggatacgt 24289924  T
Q  205 tgaaaatacatcatga 220  Q
    | ||||| ||||||||    
T  24289923 taaaaattcatcatga 24289908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15329521 - 15329397
Alignment:
Q  186 aaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaa 285  Q
    |||||| | |||||| |||| |||||||||||||| |||||   ||| || |||||||| ||||||||||| || ||  |||||| |||| | |||||||    
T  15329521 aaagaaatttgggattccttaaaaatacatcatgaaggtaccagtcacgtaaaagaaacaagaattgacatcggtgtacgaaaatatgaactattcgaaa 15329422  T
Q  286 tgaatgaaaatgaaaccattgatga 310  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||    
T  15329421 tgaaggaaaccgaaaccattgatga 15329397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Original strand, 18709238 - 18709362
Alignment:
Q  186 aaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaa 285  Q
    |||||| | |||||| |||| |||||||||||||| |||||   ||| || |||||||| ||||||||||| || ||  |||||| |||| | |||||||    
T  18709238 aaagaaatttgggattccttaaaaatacatcatgaaggtaccagtcacgtaaaagaaacaagaattgacatcggtgtacgaaaatatgaactattcgaaa 18709337  T
Q  286 tgaatgaaaatgaaaccattgatga 310  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||    
T  18709338 tgaaggaaaccgaaaccattgatga 18709362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 546
Target Start/End: Original strand, 20037084 - 20037526
Alignment:
Q  105 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 204  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |  || |||||| | |||||||| |    
T  20037084 ttaaaccctaaaactcaactctttttacaatgttcattaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgcactacggcaaaagaaatttgggatacgt 20037183  T
Q  205 tgaaaa-tacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaacca 303  Q
    | |||| | |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || |||||  |  ||||||| ||| |||| ||||||| |||| | |||| ||    
T  20037184 taaaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcatacgaaaattcgaaatttttgaaatgagtgaagaagaaaaca 20037283  T
Q  304 ttgatgagatttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatg 403  Q
    ||||||| || ||| |  |||| ||| | ||||| |||||  | || ||  | |||||   ||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20037284 ttgatgaaatgtattcacgattcacttctatagtgaatgagttaaggtcattgggaaaaatatattcccctcatgacagaatcagaaaaatattaagatg 20037383  T
Q  404 tcttccaagtgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcat 503  Q
    ||| ||||    |||  ||| |||||| |||||||| ||||| |||||  || |||| ||  ||    |  || ||||||||||  |||| |||||||||    
T  20037384 tctcccaaacacgtggagacctatggttacaacaatcactcaagccaacgatctaaattccttggctttagaaaatctcattggaacacttagagctcat 20037483  T
Q  504 gaagttgtacttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaa 546  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||| ||||| |||| |||||    
T  20037484 gaagttctactccaagaagataaaccggtgaaaaagggaaaaa 20037526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22456783 - 22456711
Alignment:
Q  105 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgta 177  Q
    ||||| || ||||||  ||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22456783 ttaaattccaaagctcaactctttttacaatgttcattaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgta 22456711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 443; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 14892785 - 14892199
Alignment:
Q  12 atcatcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaact 111  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  14892785 atcatcacatatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaatt 14892686  T
Q  112 ctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaat 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  14892685 ctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtaagaatgataaagaggtatgggataccttaaaaat 14892586  T
Q  212 acatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  14892585 acatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaactattgatgag 14892486  T
Q  312 atttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaa 411  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14892485 atgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttgaaaaggtatattctactcatgatagaattagaaaaatattgagatgtcttccaa 14892386  T
Q  412 gtgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgt 511  Q
    || ||||  ||| |||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14892385 gtatgtggagacctatggtcactgcaattactcaggcagaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgt 14892286  T
Q  512 acttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  14892285 acttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtgaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagctcatcagtagctgatgatgatgt 14892199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 21212002 - 21211417
Alignment:
Q  13 tcatcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 112  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  21212002 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 21211903  T
Q  113 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  21211902 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 21211803  T
Q  213 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgaga 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21211802 catcatgagggtacttctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 21211703  T
Q  313 tttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 412  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  21211702 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 21211603  T
Q  413 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 512  Q
    | ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21211602 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 21211503  T
Q  513 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  21211502 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgatgatgaagatgt 21211417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 86 - 596
Target Start/End: Original strand, 22832121 - 22832631
Alignment:
Q  86 tgaaaaggctcaggtattgttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgct 185  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||     
T  22832121 tgaaaaagctcaggtattactaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatgaaagaaagtgaaagagttgatgagtgtaaaaatgcc 22832220  T
Q  186 aaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaa 285  Q
    ||||| |||||||| || |||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| | || || ||||    
T  22832221 aaagaggtatgggacactttgagagtacatcatgaaggtacatctcatatcaaagaaactagaattgataatggagtcagaaagtttaaggtctttgaaa 22832320  T
Q  286 tgaatgaaaatgaaaccattgatgagatttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaat 385  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||    
T  22832321 tgagtgagaatgaaaccatttatgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttgaaaaggcatattccactcatgaaagaat 22832420  T
Q  386 cagaaaaatattaagatgtcttccaagtgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcatt 485  Q
    | |||| ||    ||||||||||||| | ||||  ||| ||| |||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  22832421 cggaaagattccgagatgtcttccaattatgtggagacctatcgtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaaccttgaagatctcatt 22832520  T
Q  486 ggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttg 585  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |    
T  22832521 ggttcactgagagctcctgaagtagtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagtag 22832620  T
Q  586 ttgatgatgat 596  Q
     ||||||||||    
T  22832621 ctgatgatgat 22832631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 25036288 - 25035989
Alignment:
Q  105 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 204  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |  || |||||| | |||||||| |    
T  25036288 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgcaccacggcaaaagaaatttgggatacat 25036189  T
Q  205 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccat 304  Q
    | |||||||||||||| || ||    |||||||||||||| || || |||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||| |||| | |||| |||    
T  25036188 taaaaatacatcatgaaggaactagccatgtcaaagaaacaaggatagacattggcgtacgaaaatttgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaacat 25036089  T
Q  305 tgatgagatttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 404  Q
    |||||| || ||| |  |||| ||  | |||||||||||  | || ||  | |||||   ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25036088 tgatgaaatgtattcacgattcacctctatagtaaatgagttaaggtcattgggaaaaatatattctcctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgt 25035989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 25050325 - 25050026
Alignment:
Q  105 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 204  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |  || |||||| | |||||||| |    
T  25050325 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgcaccacggcaaaagaaatttgggatacat 25050226  T
Q  205 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccat 304  Q
    | |||||||||||||| || ||    |||||||||||||| || || |||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||| |||| | |||| |||    
T  25050225 taaaaatacatcatgaaggaactagccatgtcaaagaaacaaggatagacattggcgtacgaaaatttgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaacat 25050126  T
Q  305 tgatgagatttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 404  Q
    |||||| || ||| |  |||| ||  | |||||||||||  | || ||  | |||||   ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25050125 tgatgaaatgtattcacgattcacctctatagtaaatgagttaaggtcattgggaaaaatatattctcctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgt 25050026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 411
Target Start/End: Original strand, 18233759 - 18234065
Alignment:
Q  105 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 204  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  || |||||| | |||||||| |    
T  18233759 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgtactacggcaaaagaaatttgggatacgt 18233858  T
Q  205 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccat 304  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||| ||| |||||||||||| |||| | ||||  ||    
T  18233859 taaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaattcgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaatat 18233958  T
Q  305 tgatgagatttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 404  Q
    |||||| || ||| |  |||| ||| | ||||| |||||  | |||||  | |||||   ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18233959 tgatgaaatgtattcacgattcacttctatagtgaatgagttaagatcattgggaaaaatatattcccctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgt 18234058  T
Q  405 cttccaa 411  Q
    || ||||    
T  18234059 ctcccaa 18234065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 411
Target Start/End: Original strand, 18243210 - 18243516
Alignment:
Q  105 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 204  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  || |||||| | |||||||| |    
T  18243210 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgtactacggcaaaagaaatttgggatacgt 18243309  T
Q  205 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccat 304  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||| ||| |||||||||||| |||| | ||||  ||    
T  18243310 taaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaattcgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaatat 18243409  T
Q  305 tgatgagatttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 404  Q
    |||||| || ||| |  |||| ||| | ||||| |||||  | |||||  | |||||   ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18243410 tgatgaaatgtattcacgattcacttctatagtgaatgagttaagatcattgggaaaaatatattcccctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgt 18243509  T
Q  405 cttccaa 411  Q
    || ||||    
T  18243510 ctcccaa 18243516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 33600840 - 33600536
Alignment:
Q  105 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 204  Q
    ||||| || ||||||  ||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||||||  | ||| |||||| | ||||| || |    
T  33600840 ttaaattccaaagctcaactctttctacaatgttcattaaccatggaagaaagtgaaaggatttatgaatgtagtactgcaaaagaaatttgggacacat 33600741  T
Q  205 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccat 304  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| ||||||||  | || || ||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||    
T  33600740 taaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaagaaacacggatagatattggcgtacgaaaatttgaaattttcgaaatgaatgaagaagaaaacat 33600641  T
Q  305 tgatgagatttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 404  Q
    |||||| || ||| | ||||||||  | |||||||||||| | || ||  | |||||   ||| ||| ||||||| ||||||||||||||  | ||||||    
T  33600640 tgatgaaatgtattccagatttacctctatagtaaatgaattaaggtcattgggaaaaatatactctcctcatgacagaatcagaaaaatcctcagatgt 33600541  T
Q  405 cttcc 409  Q
    |||||    
T  33600540 cttcc 33600536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 411
Target Start/End: Original strand, 12916388 - 12916694
Alignment:
Q  105 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 204  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |  || |||||| | |||||||| |    
T  12916388 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgcactacggcaaaagaaatttgggatacgt 12916487  T
Q  205 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccat 304  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||||||| |||| ||||||| |||  | |||| |||    
T  12916488 taaaaattcatcatgaaggaaccagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaatttgaaattttagaaatgagtgatgaagaaaacat 12916587  T
Q  305 tgatgagatttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 404  Q
    |||||| || ||| |  |||| ||| | ||||| |||||  | || ||  | |||||   ||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  12916588 tgatgaaatgtattcacgattcacttctatagtgaatgagttaaggtcattgggaaaaatatactcctctcatgacagaattagaaaaatattaagatgt 12916687  T
Q  405 cttccaa 411  Q
    || ||||    
T  12916688 ctcccaa 12916694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23750133 - 23749925
Alignment:
Q  105 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 204  Q
    ||||||| |||||||  ||| |||||| |||||||  ||| || |||||||  ||| ||||| || |||||||| | |||||||||  |||||||  |||    
T  23750133 ttaaactataaagctcaactttttctaacatgtgctttaagcagggaagaatatgatagagtagaagaatgtacaactgctaaagagatatgggaagcct 23750034  T
Q  205 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccat 304  Q
    | ||||| |||||||| || |||  ||||||||| |||   ||||| ||||| ||||| |  |||||||||   ||||| ||||| |||| |||||||||    
T  23750033 taaaaattcatcatgaaggaacaagtcatgtcaaggaagaaagaatagacatgggagttaagaaatttgaaaccttcgagatgaaagaaagtgaaaccat 23749934  T
Q  305 tgatgagat 313  Q
    |||||||||    
T  23749933 tgatgagat 23749925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 45497969 - 45497845
Alignment:
Q  186 aaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaa 285  Q
    |||||| | |||||| | ||||||||||||||||| |||||   ||| || |||||||| ||||||||||| || ||  |||||| |||| | |||||||    
T  45497969 aaagaaatttgggatgctttgaaaatacatcatgaaggtaccagtcacgtgaaagaaacaagaattgacatcggtgtacgaaaatatgaactattcgaaa 45497870  T
Q  286 tgaatgaaaatgaaaccattgatga 310  Q
    |||| ||||  |||||||| |||||    
T  45497869 tgaaggaaaccgaaaccatagatga 45497845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 442; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 442; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 598
Target Start/End: Original strand, 8974155 - 8974740
Alignment:
Q  13 tcatcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  8974155 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 8974254  T
Q  113 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8974255 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 8974354  T
Q  213 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgaga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8974355 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 8974454  T
Q  313 tttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 412  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  8974455 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 8974554  T
Q  413 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 512  Q
    ||||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8974555 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 8974654  T
Q  513 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  8974655 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaagacacttgccttaaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 8974740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 598
Target Start/End: Original strand, 6423616 - 6424201
Alignment:
Q  13 tcatcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  6423616 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaaatgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 6423715  T
Q  113 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6423716 taaagctagactctttctatcgtgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 6423815  T
Q  213 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgaga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6423816 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 6423915  T
Q  313 tttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 412  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||    
T  6423916 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaatgcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgaggtgtcttccaag 6424015  T
Q  413 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 512  Q
    ||||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6424016 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctataaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 6424115  T
Q  513 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  6424116 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 6424201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 598
Target Start/End: Original strand, 9538444 - 9539029
Alignment:
Q  13 tcatcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 112  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  9538444 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 9538543  T
Q  113 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  9538544 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaacaagtatgggatactctgaaaata 9538643  T
Q  213 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgaga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9538644 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 9538743  T
Q  313 tttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 412  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  9538744 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 9538843  T
Q  413 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 512  Q
    | ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9538844 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 9538943  T
Q  513 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  9538944 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 9539029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 13 - 519
Target Start/End: Original strand, 12387297 - 12387802
Alignment:
Q  13 tcatcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  12387297 tcatcacagatggagactttgttccaaaaaccaaagaaggaactgtcaaagaaaaaagtgcatggtcaacaaatgaaaaagctcaagtattaataaactc 12387396  T
Q  113 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||| | ||    
T  12387397 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaactgaaagagtttatgaatttaagaatgc-aaagaggtatgggataccttgatagta 12387495  T
Q  213 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgaga 312  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12387496 catcatgaagttacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattgaagtcataaagttggaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 12387595  T
Q  313 tttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 412  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12387596 tgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaataagatcttttggaaaggcatattccacttatgagagagtcagaaaaatattgagatgccttccaag 12387695  T
Q  413 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 512  Q
    | || || ||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  12387696 tatgcgaagacctatggtcactgcaattactcaggctaaatatttacaatatatgaacttggaagatctcattgattcactgatagctcatgaagttgta 12387795  T
Q  513 cttcaag 519  Q
    |||||||    
T  12387796 cttcaag 12387802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 105 - 411
Target Start/End: Original strand, 48979673 - 48979979
Alignment:
Q  105 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 204  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||| | || ||||||||      
T  48979673 ttaaattctaaagctcgactctttctatcatgtgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgatactgcaaaaaaggtgtgggatactc 48979772  T
Q  205 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccat 304  Q
    | ||| | |||||||| || |||   ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| | || ||||||| |||| |||||| |||    
T  48979773 tcaaagtccatcatgaaggaacaagccatgttaaagaaacaagaattgacattggtgtgagaaagtttgaaatctttgaaatgattgaagatgaaaacat 48979872  T
Q  305 tgatgagatttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 404  Q
    |||||| || ||  ||||||| ||  | |||||||||||| | ||||| ||||||||  | || ||||| || || ||||| ||||||||| ||||||||    
T  48979873 tgatgaaatgtactctagattcacatctatagtaaatgaactaagatcacttggaaaaacttattctacccacgacagaataagaaaaatactaagatgt 48979972  T
Q  405 cttccaa 411  Q
    |||||||    
T  48979973 cttccaa 48979979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 28367010 - 28366704
Alignment:
Q  106 taaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacctt 205  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| |||||||| ||||| ||  |    
T  28367010 taaactccaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtcactgcaaaagaagtttgggacactct 28366911  T
Q  206 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccatt 305  Q
     ||||| ||||||||||| ||    || || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||| | ||||||||||| ||| |||| | ||||    
T  28366910 aaaaattcatcatgagggaactagccacgtaaaagaaacaagaatagatattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacatt 28366811  T
Q  306 gatgagatttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtc 405  Q
    ||||| || ||  | ||||| ||  | || || |||||| | ||||| || |||||  | ||  | ||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  28366810 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcactgggaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaattttaagatgtc 28366711  T
Q  406 ttccaag 412  Q
    |||||||    
T  28366710 ttccaag 28366704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 4384529 - 4384222
Alignment:
Q  105 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 204  Q
    ||||| ||||||||| || ||| |||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||| | || || ||||| |    
T  4384529 ttaaattctaaagctcgagtctatctatcatgcagattaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgatactgcaaaaaaggtttgagatactt 4384430  T
Q  205 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccat 304  Q
    | |||||  ||||||| || |||   || || |||||||| ||||| || || || || |||||||||||| | ||||||||||||||| |  | | |||    
T  4384429 taaaaatcaatcatgaaggaacaaggcacgtaaaagaaacaagaatagatatcggtgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaatgaataaaataacat 4384330  T
Q  305 tgatgagatttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 404  Q
    |||||| || ||  ||||||| ||  | |||||||||||| | ||||| ||||| ||  | || ||| |  |||| | ||| | ||||||||||| ||||    
T  4384329 tgatgaaatgtactctagattcacatctatagtaaatgaattaagatcacttgggaaaacttattctgccgatgacataattaaaaaaatattaaaatgt 4384230  T
Q  405 cttccaag 412  Q
    ||||||||    
T  4384229 cttccaag 4384222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 28374831 - 28374773
Alignment:
Q  106 taaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaaga 164  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  28374831 taaactccaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaaga 28374773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 28382653 - 28382595
Alignment:
Q  106 taaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaaga 164  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  28382653 taaactccaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaaga 28382595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 71
Target Start/End: Original strand, 11461143 - 11461192
Alignment:
Q  22 atggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagt 71  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11461143 atggagattttgttcaaataaccaaagaaggagttgtcaaataaaagagt 11461192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 438; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 598
Target Start/End: Original strand, 16156192 - 16156777
Alignment:
Q  13 tcatcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  16156192 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 16156291  T
Q  113 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16156292 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 16156391  T
Q  213 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgaga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16156392 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 16156491  T
Q  313 tttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 412  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  16156492 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattctactcatgataaaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 16156591  T
Q  413 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 512  Q
    ||||||  ||| |||||||||  |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16156592 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggcaaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 16156691  T
Q  513 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  16156692 cttcaacgagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacacctgctttgaaagcatctcagcaaaccccatcagttgctgatgaagatgt 16156777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 1988219 - 1987651
Alignment:
Q  15 atcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactcta 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1988219 atcacagatggagactttgttccattaaccaaagaaggaatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 1988120  T
Q  115 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1988119 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 1988020  T
Q  215 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgagatt 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  1988019 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 1987920  T
Q  315 tatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtg 414  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||     
T  1987919 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgacttccaagta 1987820  T
Q  415 tgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtact 514  Q
    ||||  ||| |||||||||   ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1987819 tgtggagacctatggtcactgaaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaatctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtact 1987720  T
Q  515 tcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 583  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  1987719 tcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaatctcatcagt 1987651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 73 - 568
Target Start/End: Original strand, 22959697 - 22960190
Alignment:
Q  73 catggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatga 172  Q
    ||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||| ||||||| |||  | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22959697 catggacaactgatgaaaaagataaggtattgttaaattctaaagttagcttatttttatcatgtgcattaaccttggaagaaagtgaaagggttgatga 22959796  T
Q  173 atgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaattt 272  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||| |||||||||| || ||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  22959797 atgtacaaatgccaaagaagtgtgggacactttaaaagtacatcatgaaggaaccactcatgtcgaagaaacaagaattgacattggagtcag-aaagtt 22959895  T
Q  273 gaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgagatttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatcta 372  Q
    ||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| ||| || || | |||  | |    
T  22959896 gaaatctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaaatgtatgatagattcacaacaatagtgaatgaaatgagatatctgggcaaagtatatacca 22959995  T
Q  373 ctcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacct 472  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| | ||  ||| |||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| ||| |||   |    
T  22959996 ctcatgatagaatcaggaagatactaagatgtcttccaagtatatggagacctatggtcactgcaattactcaagccaaagatttaaactctttgacttt 22960095  T
Q  473 gaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctca 568  Q
    | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||| |||||    
T  22960096 ggaagaactca-tggttcactaagagctcatgaagttatactttaaggagataaaccagtgaggaaggtaaaatcacttaccttaaaagcttctca 22960190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14280992 - 14280754
Alignment:
Q  105 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 204  Q
    ||||||||||||||   ||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |  || |||||| | |||||||| |    
T  14280992 ttaaactctaaagcccaactctttttacaatgttcaataaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgcactacggcaaaagaaatttgggatacgt 14280893  T
Q  205 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccat 304  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||||||| |||||||||||| |||  | |||| |||    
T  14280892 taaaaattcatcatgaaggaaccagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaatttgaaattttcgaaatgagtgatgaagaaaacat 14280793  T
Q  305 tgatgagatttatgctagatttactacaatagtaaatga 343  Q
    |||||| || ||| |  |||| ||| ||||||| |||||    
T  14280792 tgatgatatgtattcacgattcacttcaatagtgaatga 14280754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 435; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 53562 - 52979
Alignment:
Q  13 tcatcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  53562 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaatagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 53463  T
Q  113 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  53462 taaagctagactctttctatcatgtgcattaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttaaaaata 53363  T
Q  213 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgaga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53362 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 53263  T
Q  313 tttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 412  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  53262 tgtatgctagatttactacaatagtaaatgatatgagatctcttggaaaggcatattctactcatgatagaatcagaaaaata--gagatgtcttccaag 53165  T
Q  413 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 512  Q
    | | ||  ||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  53164 tatatggagacctatggtcactgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctcgaagatctcattggatcactgagagctcatgaagttata 53065  T
Q  513 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  53064 cttcaaggagacaaactagtgaagaaggtgaaaacacttgccttgaaagcatctcatcaaagctcatcagtagctgatgatgatgt 52979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 434; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 598
Target Start/End: Original strand, 45015662 - 45016247
Alignment:
Q  13 tcatcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 112  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||    
T  45015662 tcattatagatgaagattttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactatactc 45015761  T
Q  113 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45015762 taaagctagagtctttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 45015861  T
Q  213 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgaga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45015862 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 45015961  T
Q  313 tttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 412  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  45015962 tgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaatgcatattctactcatgatagaattagaaaaatactgagatgtcttccaag 45016061  T
Q  413 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 512  Q
    | ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45016062 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 45016161  T
Q  513 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  45016162 cttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaaaacacttgccttaaaagcatctcagtcaagctcatcagttgctgatgatgatgt 45016247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 598
Target Start/End: Original strand, 18652527 - 18653112
Alignment:
Q  13 tcatcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 112  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  18652527 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 18652626  T
Q  113 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  18652627 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 18652726  T
Q  213 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgaga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18652727 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 18652826  T
Q  313 tttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 412  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  18652827 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 18652926  T
Q  413 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 512  Q
    | ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18652927 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 18653026  T
Q  513 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  18653027 cttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 18653112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 9512796 - 9512211
Alignment:
Q  13 tcatcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 112  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  9512796 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 9512697  T
Q  113 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  9512696 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgagtgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 9512597  T
Q  213 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgaga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9512596 catcatgagggtacatctcatgtcagagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 9512497  T
Q  313 tttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 412  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  9512496 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgatagaattagaaaaattctgagatgtcttccaag 9512397  T
Q  413 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 512  Q
    | ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9512396 tatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 9512297  T
Q  513 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  9512296 cttcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaagaacacttgccttgaaagcatctcagcaaacctcatcagttgctgatgaagatgt 9512211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 27169016 - 27168448
Alignment:
Q  15 atcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactcta 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||     ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27169016 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 27168917  T
Q  115 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  27168916 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 27168817  T
Q  215 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgagatt 314  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  27168816 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagagaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 27168717  T
Q  315 tatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtg 414  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  27168716 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagta 27168617  T
Q  415 tgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtact 514  Q
    ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27168616 tgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 27168517  T
Q  515 tcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 583  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  27168516 tcaaggagacaaaccagtaaagaaagtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 27168448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 598
Target Start/End: Original strand, 22903455 - 22904033
Alignment:
Q  15 atcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactcta 114  Q
    |||| |||| |||||||||||||||     ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22903455 atcacagatagagactttgttccaa-----aaagaaggaaccatcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaaactcaggtattgttaaactcta 22903549  T
Q  115 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  |||| | ||||    
T  22903550 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtattaatgctaaagatgtatgggatattttgatattaca 22903649  T
Q  215 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgagatt 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||     
T  22903650 tcatgatggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagttagaaagtttcaagtctttgaaatgagtgagaatgaaaccattgatgagatg 22903749  T
Q  315 tatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtg 414  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||     
T  22903750 tatgccagatttattacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaagacatatttcactcatgagataatcagaaaaatattgagttgccttccaagta 22903849  T
Q  415 tgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtact 514  Q
    ||||  ||| |||||| ||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22903850 tgtggagacctatggtaactgcaattactcaggccaaagatttgaaatctatgaacttggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 22903949  T
Q  515 tcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||    
T  22903950 tcaaggagacaaaccaatgaagaaggtaaagtcacttgccttaaaagcctctcagcaaacctcatcagtagctgaagatgatgt 22904033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 105 - 411
Target Start/End: Original strand, 1791955 - 1792261
Alignment:
Q  105 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 204  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||| | || ||||||||      
T  1791955 ttaaattctaaagctcgactctttctatcatgtgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgatactgcaaaaaaggtgtgggatactc 1792054  T
Q  205 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccat 304  Q
    | ||| | |||||||| || |||   ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| | || ||||||| |||| |||||| |||    
T  1792055 tcaaagtccatcatgaaggaacaagccatgttaaagaaacaagaattgacattggtgtgagaaagtttgaaatctttgaaatgattgaagatgaaaacat 1792154  T
Q  305 tgatgagatttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 404  Q
    |||||| || ||  ||||||| ||  | |||||||||||| | ||||| ||||||||  | || ||||| || || ||||| ||||||||| ||||||||    
T  1792155 tgatgaaatgtactctagattcacatctatagtaaatgaactaagatcacttggaaaaacttattctacccacgacagaataagaaaaatactaagatgt 1792254  T
Q  405 cttccaa 411  Q
    |||||||    
T  1792255 cttccaa 1792261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 304
Target Start/End: Original strand, 24990450 - 24990574
Alignment:
Q  180 aatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttt 279  Q
    ||||| |||||| | |||||||| || ||  |||||||||| || ||   ||| || |||||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||| | |    
T  24990450 aatgccaaagaaatttgggatacattaaaggtacatcatgaaggcaccggtcacgtaaaagaaacaagaattgacattggtgttcgaaagtttgaactat 24990549  T
Q  280 tcgaaatgaatgaaaatgaaaccat 304  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  24990550 tcgaaatgaaagaaactgaaaccat 24990574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 426; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 598
Target Start/End: Original strand, 148017 - 148602
Alignment:
Q  13 tcatcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||    
T  148017 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtaaaggaaaagagtgcatggtcaacaaatgaaaaagctcaggtattactaaactc 148116  T
Q  113 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 212  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  148117 ttaagctagactctttctatcatgtgcacttaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtaagaatgctaaagaggtatgtgataccttaaaaata 148216  T
Q  213 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgaga 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  148217 catcatgagggtacttctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaactattgatgaga 148316  T
Q  313 tttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 412  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  148317 tgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttgaaaaggcatattatactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 148416  T
Q  413 tgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgta 512  Q
    ||||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  148417 tgtgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttaaaatctatgaacctagaggatctcattggttcactgagagctcatgacgttgta 148516  T
Q  513 cttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  148517 cttcaaggagacaaaccagtgaagaaagtaaaaacacttaccttgaaagcatctcagcaaagctcatcagtagctgatgatgatgt 148602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 6598 - 6030
Alignment:
Q  15 atcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactcta 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||     ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6598 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 6499  T
Q  115 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6498 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 6399  T
Q  215 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgagatt 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  6398 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 6299  T
Q  315 tatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtg 414  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  6298 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagta 6199  T
Q  415 tgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtact 514  Q
    ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6198 tgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 6099  T
Q  515 tcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 583  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  6098 tcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 6030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313 (Bit Score: 381; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0313
Description:

Target: scaffold0313; HSP #1
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 583
Target Start/End: Original strand, 7080 - 7648
Alignment:
Q  15 atcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactcta 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||     ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7080 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 7179  T
Q  115 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  7180 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 7279  T
Q  215 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgagatt 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  7280 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 7379  T
Q  315 tatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtg 414  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  7380 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagta 7479  T
Q  415 tgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtact 514  Q
    ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7480 tgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 7579  T
Q  515 tcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 583  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  7580 tcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 7648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313; HSP #2
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 583
Target Start/End: Original strand, 10862 - 11430
Alignment:
Q  15 atcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactcta 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||     ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10862 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 10961  T
Q  115 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaataca 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  10962 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 11061  T
Q  215 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgagatt 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  11062 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 11161  T
Q  315 tatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtg 414  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  11162 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaagcatattccactcatgagagaatcagaaaaatattgagatgtcttccaagta 11261  T
Q  415 tgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtact 514  Q
    ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11262 tgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaacctggaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtact 11361  T
Q  515 tcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagt 583  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  11362 tcaaggagacaaaccagtaaagaaggtaaagtcacttgccttgaaagcctctcagcaaacctcatcagt 11430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 13 - 433
Target Start/End: Original strand, 20084 - 20504
Alignment:
Q  13 tcatcatagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactc 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||    
T  20084 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtaaaagaaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaatctcaggtattactaaactc 20183  T
Q  113 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaata 212  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  ||||  ||||| ||||| |||||||| ||  ||| | ||    
T  20184 caaagctagactctttctatcatgtgcactgactagggaagaaagtgaaagagttgatgtgtgtaaaaatgccaaagatgtatgggacactctgagagta 20283  T
Q  213 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgaga 312  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20284 catcataaaggtacatctcatgtcaaaggaactagaattgacattggagtcagaaagtttgaactctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 20383  T
Q  313 tttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaag 412  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  20384 tgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcatattccactcatgagagaatcagaaagattctaagatgtcttccaag 20483  T
Q  413 tgtgtgaggacatatggtcac 433  Q
      ||||  ||| |||||||||    
T  20484 aatgtggagacctatggtcac 20504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 429 - 598
Target Start/End: Original strand, 27670 - 27839
Alignment:
Q  429 gtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagataaac 528  Q
    ||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27670 gtcactacaattactcagatcaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcattgagagctcatgaagttatacttcaaggagacaaac 27769  T
Q  529 cagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  27770 cagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcttctcagcaaacctcatcagtagctgatgatgatgt 27839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 22 - 582
Target Start/End: Original strand, 16545 - 17097
Alignment:
Q  22 atggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactctaaagctag 121  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16545 atggagactttgttccaaagactaaagaaggaaccatcaaacaaaagagtgcatggtcaatagatgacaaagctcatgtattgttaaactctaaacctag 16644  T
Q  122 actctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgag 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||| |  || | | |||  |||||     
T  16645 actctttttatcatgtgcactaaccatggaagaaaatgaaagagttgataaatgcaagaatgctaaagaggtatgggaaattttaagagtacgccatgaa 16744  T
Q  222 ggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgagatttatgcta 321  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| | |||||| || ||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||  ||    
T  16745 ggtacctctcatgtcaaggaaaccagaattaacataggagtcagaaagtgtgaagtctttgaaatgagtgagaatgaaactattgatgaaatgtatttta 16844  T
Q  322 gatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtgtgtgagg 421  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| | ||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||     ||||| ||||  |    
T  16845 gatttactacaatagtaaatgagatgaggtctcttcgaaaagtatattccactcatgaaagaatcagaaaaatattgagatg-----caagtatgtggag 16939  T
Q  422 acatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaagga 521  Q
    || |||||      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  16940 acctatgg---atgcaattactcaggccaaagatttaaaatctatgaaccttgaagatctcattggttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaaaa 17036  T
Q  522 gataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcag 582  Q
    || ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  17037 gacaaaccagtgaaaaaggtaaaatcactttccttgaaagcatctcaacaaacttcatcag 17097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 174; Significance: 3e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 180 - 469
Target Start/End: Original strand, 1 - 290
Alignment:
Q  180 aatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttt 279  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  1 aatgctaaagaggtatgggatactttgaaagtacatcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagttagaaagtttgaagtct 100  T
Q  280 tcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgagatttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatga 379  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||    
T  101 ttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgaaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttagaaaagcatattccactcatga 200  T
Q  380 tagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaa 469  Q
     ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  201 aagaataagaaaaataatgagatgtcttccaagtatgtggagacctatggtcactgcaatcactcaggccaaagatttgaaatctatgaa 290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 168; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 73 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 189498 - 189005
Alignment:
Q  73 catggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatga 172  Q
    ||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||| ||||||| |||  | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  189498 catggacaactgatgaaaaagataaggtattgttaaattctaaagttagcttatttttatcatgtgcactaaccttggaagaaattgaaagggttgatga 189399  T
Q  173 atgtacgaatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaattt 272  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||| |||||||||| || || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  189398 atgtacaaatgccaaagaagtgtgggacactttaaaagtacatcatgaaggaacctctcatgtcgaagaaacaagaattgacattggagtcag-aaagtt 189300  T
Q  273 gaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatgagatttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatcta 372  Q
    ||| | || ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| ||| || || | |||    |    
T  189299 gaaatctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgataaaatatatgatagattcacaacaatagtgaatgaaatgagatatctgggcaaagtatatagca 189200  T
Q  373 ctcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtcttccaagtgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacct 472  Q
    ||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||   ||  | | |||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| ||| |||   |    
T  189199 ctcatgatagaattaggaagatactaagatgtcttccaagtacatggaggcctatggtcactgcaattactcaagccaaagatttaaactctttgacttt 189100  T
Q  473 gaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctca 568  Q
    | |||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  189099 ggaagtactca-tggttcactaagagctcatgaagttatactttaaggagataaaccaatgagaaaggtaaaatcacttgccttaaaagcttctca 189005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 150; Significance: 5e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 387 - 596
Target Start/End: Original strand, 1 - 210
Alignment:
Q  387 agaaaaatattaagatgtcttccaagtgtgtgaggacatatggtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattg 486  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||| |||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1 agaaaaatattgagatgtcttccaagtatttggagacctatggtcactgcaattacttaggccaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattg 100  T
Q  487 gttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagataaaccagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgt 586  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  101 gttcactgagagctcatgaagttgtacttcaaggagacaaaccagtgaagaaggtaaaaacactttccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgc 200  T
Q  587 tgatgatgat 596  Q
    ||||||||||    
T  201 tgatgatgat 210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 110; Significance: 4e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 429 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 87142 - 86973
Alignment:
Q  429 gtcacaacaattactcaggccaaaaatttaaaatctatgaacctgaaagatctcattggttcactaagagctcatgaagttgtacttcaaggagataaac 528  Q
    ||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  87142 gtcactacaattactcagatcaaagatttaaaatctatgaacctggaagatctcattggttcattgagagctcatgaagttatacttcaaggagacaaac 87043  T
Q  529 cagtgaagaaggtaaaaacacttgccttgaaagcatctcagcaaagttcatcagttgttgatgatgatgt 598  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  87042 cagtgaagaaggtaaaatcacttgccttgaaagcttctcagcaaacctcatcagtagctgatgatgatgt 86973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 103224 - 102918
Alignment:
Q  106 taaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacctt 205  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||| ||  |    
T  103224 taaactctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtgtgggacactct 103125  T
Q  206 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccatt 305  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| | || |||||||| ||| |||| | ||||    
T  103124 aaaaattcatcatgaaggaactagccatgtaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatctttgaaatgaacgaagatgagaacatt 103025  T
Q  306 gatgagatttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgtc 405  Q
    ||||| || ||  | ||||| ||  | || || |||||| | ||||| ||||||||  | ||  | ||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  103024 gatgaaatgtactccagattcacatctattgtgaatgaattaagatcacttggaaaaacttataccactcatgatcggataagaaaaatcttaagatgtc 102925  T
Q  406 ttccaag 412  Q
    |||||||    
T  102924 ttccaag 102918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Original strand, 83027 - 83157
Alignment:
Q  180 aatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttt 279  Q
    ||||| |||||| | |||||||| || ||  |||||||||| || ||   ||| || |||||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||| | |    
T  83027 aatgccaaagaaatttgggatacattaaacgtacatcatgaaggcaccaatcacgtaaaagaaacaagaattgacattggtgttcgaaagtttgaactat 83126  T
Q  280 tcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatga 310  Q
    |||||||||| ||||  |||||||| |||||    
T  83127 tcgaaatgaaagaaaccgaaaccatagatga 83157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 411
Target Start/End: Original strand, 257898 - 258204
Alignment:
Q  105 ttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacgaatgctaaagaagtatgggatacct 204  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  || |||||| |||||||||| |    
T  257898 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgtactacggcaaaagaaatatgggatacgt 257997  T
Q  205 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttttcgaaatgaatgaaaatgaaaccat 304  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||| ||| |||||||||||| |||| | ||||  ||    
T  257998 taaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaattcgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaatat 258097  T
Q  305 tgatgagatttatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatctcttggaaaggcataatctactcatgatagaatcagaaaaatattaagatgt 404  Q
    |||||| || ||| |  |||| ||| | ||||| |||||  | |||||  | |||||   ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  258098 tgatgaaatgtattcacgattcacttctatagtgaatgagttaagatcattgggaaaaatatattcccctcatgacagaatcagaaaaatattaagatgt 258197  T
Q  405 cttccaa 411  Q
    || ||||    
T  258198 ctcccaa 258204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Original strand, 5060 - 5190
Alignment:
Q  180 aatgctaaagaagtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagttt 279  Q
    ||||| |||||| | |||||||| || ||  |||||||||| || ||   ||| || |||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||| | |    
T  5060 aatgccaaagaaatttgggatacattaaaggtacatcatgaaggcaccagtcacgtaaaagaaacaagaattgacattggtgttcgaaaatttgaactat 5159  T
Q  280 tcgaaatgaatgaaaatgaaaccattgatga 310  Q
    | |||||||| ||||  |||||||| |||||    
T  5160 ttgaaatgaaagaaaccgaaaccatagatga 5190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University